TH128628A - กรรมวิธีการจำแนกเชื้อกลุ่มแลคติกแอซิดแบคทีเรียด้วยดีเอ็นเอไมโครอะเรย์ - Google Patents
กรรมวิธีการจำแนกเชื้อกลุ่มแลคติกแอซิดแบคทีเรียด้วยดีเอ็นเอไมโครอะเรย์Info
- Publication number
- TH128628A TH128628A TH802002936F TH0802002936F TH128628A TH 128628 A TH128628 A TH 128628A TH 802002936 F TH802002936 F TH 802002936F TH 0802002936 F TH0802002936 F TH 0802002936F TH 128628 A TH128628 A TH 128628A
- Authority
- TH
- Thailand
- Prior art keywords
- probe specific
- lactobacillus
- lactic acid
- acid bacteria
- probe
- Prior art date
Links
Abstract
OCR 09WP 12/11/2567 การประดิษฐ์นี้เกี่ยวข้องกับกรรมวิธีการจำแนกเชื้อกลุ่มแลคติกแอซิดแบคทีเรียด้วยดีเอ็นเอไม โครอะเรย์ ซึ่งการประดิษฐ์นี้ได้พัฒนา ขั้นตอนการตรวจจำแนกเชื้อแบคทีเรียเป้าหมาย โดยการใช้ดีเอ็นเอ โพรบที่ประดิษฐ์ขึ้นให้มีความจำเพาะต่อเชื้อดังกล่าวสูง และมีเสถียรภาพดีเมื่อจุดลงบนแผ่นสไลด์ที่ เคลือบด้วยสารที่มีประจุบวก กรรมวิธีในการประดิษฐ์นี้จึงสามารถตรวจจำแนกเชื้อกลุ่มแลคติกแอซิดได้ รวดเร็ว ทั้งยังสามารถจำแนกได้ถึงระดับสายพันธุ์โดยไม่ต้องผ่านการหาลำดับนิวคลีโอไทด์ กรรมวิธีนี้ ใช้ปริมาณสารในขั้นตอนต่าง ๆ น้อย มีราคาถูก รวดเร็ว ง่ายต่อการวิเคราะห์ผล และสามารถพัฒนาไป เป็นผลิตภัณฑ์ชุดตรวจเพื่อใช้ในเชิงพาณิชย์ได้
Claims (5)
1. กรรมวิธีการจำแนกเชื้อกลุ่มแลคติกแอซิดแบคทีเรียด้วยดีเอ็นเอไมโครอะเรย์ ประกอบด้วยขั้นตอน ดังนี้ การเคลือบแผ่นวัสดุพื้นผิวเรียบ การสร้างดีเอ็นเอโพรบให้มีคุณสมบัติจำเพาะต่อยีน 16 เอส อาร์ อาร์เอ็นเอ ของเชื้อแลคติกแอซิดแบคทีเรียเป้าหมาย การพิมพ์ดีเอ็นเอโพรบบนแผ่นวัสดุผิวเรียบ การ ป้องกันการเกิดปฏิกิริยาแบบไม่จำเพาะ การเตรียมตัวอย่างที่ต้องการตรวจ และการตรวจวัดสัญญาณ และการแปลผล ที่ซึ่งลำดับนิวคลีโอไทด์ของโพรบที่จำเพาะต่อแลคติกแอซิดแบคทีเรียต้องมีความแตกต่างอย่าง น้อย 25% จากลำดับนิวคลีโอไทด์ของแบคทีเรียชนิดอื่นๆ และในส่วนที่เหมือนกับลำดับนิวคลีโอ ไทด์ของแบคทีเรียชนิดอื่นๆ ต้องไม่ติดกันเกิน 15 เบส โพรบดังกล่าวต้องมีความยาวอย่างน้อย 40 เบส สามารถเพิ่มความยาวได้โดยการเติมโพลี ดีที (poly dT) และต้องมีค่าอุณหภูมิหลอมเหลวอย่าง น้อย 50 องศาเซลเซียส
2. กรรมวิธีการจำแนกเชื้อกลุ่มแลคติกแอซิดแบคทีเรียตามข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่ง ลำดับนิวคลีโอไทด์ของ โพรบที่จำเพาะต่อแลคติกแอซิดแบคทีเรีย คือ (1) 5' TGTGTTATCCCCCGCTTCTGG 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus plantarum) (2) 5' TCCACCTGTATCCATGTCCCC 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus plantarum) (3) 5' CACCCGTTCGCCACTCAACTCTTTATCGGTGAGTGCAAGCACTCGGTGAT 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus animalis) (4) 5' TGACGGCTGACTCCCGAAGGTTATCT 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus brevis) (5) 5' TAACAATGAAGCAGTGGCGA 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus brevis) (6) 5' TCGGCTGACTCCCGAAGGTTA 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus brevis) (7) 5' TCCTTAGACGGCTGACTCCCG 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus brevis) (8) 5'TTCGGCTGGCTCCCCGAAGG 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus sakei) (9) 5' TGTCGGCTATGCATCACGGTC 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus sakei) (10) 5' TTCCGCGGGTCCATCCTAAAGT 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus sakei) (11) 5' TTCCGTCCGCCACTCACTCAAA 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus sakei) (12) 5' TGGTTGGATACCGTCACTACC 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus sakei) (13) 5' TCAACCCTACACCATGCGGTG 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus sakei) (14) 5' TAGCTCCGGCACTGAAGGGCG 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus fermentum) (15) 5' TCCGCAGGTCCATCCAGAAGT 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus fermentum) (16) 5' TGCGCAAGATGTCAAGACCTG 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus fermentum) (17) 5' TGAAAACCGCCTGCACTCTCT 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus fermentum) (18) 5' TTCCGATGCAGTTCCACGG 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus delbrueckii) (19) 5' TAAGTCGAGCGAGCT GAATTCAAAGA 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus delbrueckii) (20) 5' TTCAGCTCGCTCGACTTGCAT 3' (โพรบจำเพาะต่อ Lactobacillus delbrueckii) (21) 5' TTCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATA 3' (โพรบจำเพาะต่อทุกแบคทีเรีย)
3. กรรมวิธีการตรวจจำแนกเชื้อกลุ่มแลคติกแอซิดแบคทีเรีย ตามข้อถือสิทธิที่ 1 หรือที่ 2 ที่ซึ่งสาร เคลือบแผ่นวัสดุพื้นผิวเรียบคือสารประจุบวก ได้แก่ สารออแกโนเอมีน (organoamine) หรือสาร อะมิโนไซเลน (aminosilane) ที่เหมาะสมที่สุดคือ สารอะมิโนไซเลน
4. กรรมวิธีการตรวจจำแนกเชื้อกลุ่มแลคติกแอซิดแบคทีเรีย ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ถึง 3 ข้อใดข้อหนึ่ง ที่ซึ่ง เชื้อกลุ่มแลคติกแอซิดแบคทีเรียคือสายพันธุ์ L. plantarum, L. animalis, L. brevis, L. sakei, L. fermentum และ L. delbrueckii
5. กรรมวิธีการตรวจจำแนกเชื้อกลุ่มแลคติกแอซิดแบคทีเรียตามข้อถือสิทธิที่ 1 ถึง 4 ข้อใดข้อหนึ่ง ที่ซึ่ง การตรวจวัดสัญญาณ มีลักษณะเฉพาะคือ บ่มแผ่นสไลด์ที่หยดตัวอย่างแล้วที่อุณหภูมิ 57 องศา เซลเซียส อย่างน้อย 8 ชั่วโมง
Publications (4)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| TH105042S TH105042S (th) | 2010-11-27 |
| TH37476S1 TH37476S1 (th) | 2013-10-10 |
| TH128628A true TH128628A (th) | 2013-10-24 |
| TH105042B TH105042B (th) | 2024-11-22 |
Family
ID=
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| WO2011156434A3 (en) | Nucleic acid detection and quantification by post-hybridization labeling and universal encoding | |
| Ebenezer et al. | Molecular detection, quantification, and diversity evaluation of microalgae | |
| Mou et al. | Multiple genotyping based on multiplex PCR and microarray | |
| EP2794915B1 (en) | Method of dna detection and quantification by single-molecule hybridization and manipulation | |
| WO2009039549A3 (de) | Verfahren zur bestimmung von mikroorganismen | |
| WO2009094597A3 (en) | Use of nucleic acid probes to detect nucleotide sequences of interest in a sample | |
| Jiang et al. | Rapid and multiplex microRNA detection on graphically encoded silica suspension array | |
| CN103740824B (zh) | 一种两核苷酸实时合成测序图谱鉴定微生物种群的方法 | |
| Rajawat | Transcriptomics | |
| EP3478416A1 (en) | High resolution systems, kits, apparatus, and methods using magnetic beads for high throughput microbiology applications | |
| Venkataraman et al. | A new microarray platform for whole-genome expression profiling of Mycobacterium tuberculosis | |
| JP2012507291A5 (th) | ||
| TH105042B (th) | กรรมวิธีการจำแนกเชื้อกลุ่มแลคติกแอซิดแบคทีเรียด้วยดีเอ็นเอไมโครอะเรย์ | |
| WO2016118618A1 (en) | On-chip platform for single-molecule electrical conductance measurements | |
| Rodrigo et al. | Electrochemical microarray for identification pathogens: a review | |
| US9499814B2 (en) | Methods for identifying drug effects on a cell by determining changes in the cell's spliced message profile | |
| WO2005017488A3 (en) | Method and system for identifying biological entities in biological and environmental samples | |
| WO2008086094A3 (en) | Microarray-based lineage analysis as a diagnostic for current and emerging strains of influenza b | |
| Saini et al. | Molecular tools for microbial diversity analysis | |
| KR101790021B1 (ko) | 항바이러스 활성 또는 면역증진 활성을 갖는 락토바실러스 균주 판별용 조성물 및 스크리닝 방법 | |
| Zhao et al. | Molecular methods of studying microbial diversity in soil environments | |
| Rathnayaka et al. | Rapid Detection of Food Pathogens Using Molecular Methods | |
| US20250034636A1 (en) | Single-cell culture and sequencing with lipid-modified oligos | |
| TH128628B (th) | กรรมวิธีการจำแนกเชื้อกลุ่มแลคติกแอซิดแบคทีเรียด้วยดีเอ็นเอไมโครอะเรย์ | |
| Gunda et al. | Microspot with integrated wells (msiw) for the detection of e. coli |