TH112714A

TH112714A - จุลชีพชนิดใหม่สำหรับการผลิตของ 1,2-โพรเพนไดออลที่ได้มาโดยการผสมผสานกันของการวิวัฒนาการ และ การออกแบบเชิงอัตราส่วน

Info

Publication number: TH112714A
Application number: TH801001447A
Authority: TH
Inventors: โวเอลเกอร์ นายฟรังซัวส์; ซูคาย นายฟิลิปเป; ฟิกเก นายเรเนอร์
Original assignee: นางดารานีย์ วัจนะวุฒิวงศ์; นางสาวสนธยา สังขพงศ์; เมทาโบลิค เอ็กซ์พลอเรอร์
Filing date: 2008-03-24
Publication date: 2012-03-12

Abstract

DC60 (18/06/51) การประดิษฐ์ปัจจุบันเกี่ยวข้องกับวิธีการในการผสมผสานการวิวัฒนาการ และการออกแบบเชิง อัตราส่วนสำหรับการเตรียมของสายพันธุ์ของจุลชีพสำหรับการผลิตของ 1,2-โพรเพนไดออลจากแหล่ง คาร์บอน, ซึ่งวิธีการดังกล่าวประกอบด้วย: - การเลี้ยงสายพันธุ์เริ่มต้นภายใต้ความดันคัดเลือกในอาหารเลี้ยงเชื้อที่ให้การเจริญที่เหมาะสม ซึ่งสายพันธุ์ของแบคทีเรียเริ่มต้นดังกล่าวประกอบด้วยการหยุดของการแสดงออกของยีน tpiA และการ หยุดของการแสดงออกของอย่างน้อยหนึ่งยีนที่เกี่ยวข้องกับการแปลงผันของเมธิลไกลออกซอลไปเป็น แลคเตต เพื่อสนับสนุนการวิวัฒนาการในสายพันธุ์เริ่มต้นดังกล่าว - จากนั้น ทำการคัดเลือก และการแยกเดี่ยวสายพันธุ์วิวัฒน์ที่มีอัตราการผลิต 1,2-โพรเพนได ออลเพิ่มขึ้น - จากนั้นปรับโครงสร้างใหม่ต่อยีน tpiA ในสายพันธุ์วิวัฒน์ การประดิษฐ์ปัจจุบันยังเกี่ยวข้องกับสายพันธุ์วิวัฒน์ดังเช่นที่ได้มา ซึ่งอาจถูกดัดแปลงทาง พันธุกรรมเพิ่มเติมเพื่อปรับการแปลงผันของแหล่งคาร์บอนให้เป็น 1,2-โพรพานอล โดยปราศจาก ผลิตภัณฑ์พลอยได้ และ ด้วยผลได้ที่เป็นไปได้ที่มากที่สุด การประดิษฐ์ปัจจุบันเกี่ยวข้องกับวิธีการในการผสมผสานการวิวัฒนาการ และการออกแบบเชิง อัตราส่วนสำหรับการเตรียมของสายพันธุ์ของจุลชีพสำหรับการผลิตของ 1,2-โพรเพนไดออลจากแหล่ง คาร์บอน, ซึ่งวิธีการดังกล่าวประกอบด้วย: - การเลี้ยงสายพันธุ์เริ่มต้นภายใต้ความดันคัดเลือกในอาหารเลี้ยงเชื้อที่ให้การเจริญที่เหมาะสม ซึ่งสายพันธุ์ของแบคทีเรียเริ่มต้นดังกล่าวประกอบด้วยการหยุดของการแสดงออกของยีน tpiA และการ หยุดของการแสดงออกของอย่างน้อยหนึ่งยีนที่เกี่ยวข้องกับการแปลงผันของเมธิลไกลออกซอลไปเป็น แลคเตต เพื่อสนับสนุนการวิวัฒนาการในสายพันธุ์เริ่มต้นดังกล่าว - จากนั้น ทำการคัดเลือก และการแยกเดี่ยวสายพันธุ์วิวัฒน์ที่มีอัตราการผลิต 1,2-โพรเพนได ออลเพิ่มขึ้น - จากนั้นปรับโครงสร้างใหม่ต่อยีน tpiA ในสายพันธุ์วิวัฒน์ การประดิษฐ์ปัจจุบันยังเกี่ยวข้องกับสายพันธุ์วิวัฒน์ดังเช่นที่ได้มา ซึ่งอาจถูกดัดแปลงทาง พันธุกรรมเพิ่มเติมเพื่อปรับการแปลงผันของแหล่งคาร์บอนให้เป็น 1,2-โพรพานอล โดยปราศจาก ผลิตภัณฑ์พลอยได้ และ ด้วยผลได้ที่เป็นไปได้ที่มากที่สุด

Claims

ข้อถือสิทธฺ์ (ทั้งหมด) ซึ่งจะไม่ปรากฏบนหน้าประกาศโฆษณา :แก้ไข 08/03/2560 1. วิธีการสำหรับการเตรียมของสายพันธุ์วิวัฒน์ของจุลชีพสำหรับการผลิตของ 1,2-โพรเพนได ออกจากแหล่งคาร์บอน, ซึ่งวิธีการดังกล่าวประกอบด้วย: - การเลี้ยงสายพันธุ์เริ่มต้นภายใต้ความดันคัดเลือกในอาหารเลี้ยงเชื้อที่ให้การเจริญที่เหมาะสม ซึ่งสายพันธุ์ของแบคทีเรียเริ่มต้นดังกล่าวประกอบด้วยการหยุดของการแสดงออกของยีน tpiA และการ หยุดของการแสดงออกของอย่างน้อยหนึ่งยีนที่เกี่ยวข้องกับการแปลงผันของเมธิลไกลออกซอลไปเป็น แลคเตต เพื่อสนับสนุนการวิวัฒนาการในสายพันธุ์เริ่มต้นดังกล่าว - จากนั้น ทำการคัดเลือก และการแยกเดี่ยวสายพันธุ์วิวัฒน์ที่มีอัตราการผลิต 1,2-โพรเพนได ออลเพิ่มขึ้น - จากนั้นปรับโครงสร้างใหม่ต่อยีน tpiA ในสายพันธุ์วิวัฒน์ 2. วิธีการของข้อถือสิทธิที่ 1 โดยที่ยีนซึ่งเกี่ยวข้องกับการแปลงผันของเมธิลไกลออกซอล ไป เป็น แลคเตต ถูกเลือกจากกลุ่มที่ประกอบด้วย: gloA, aldA และ aldB และการรวมกันของสิ่งนั้น 3. วิธีการของข้อถือสิทธิที่ 1 ถึง 2 โดยที่สายพันธุ์เริ่มต้นประกอบอีกด้วยการหยุดลงของการ แสดงออกของอย่างน้อยหนึ่งในยีนซึ่งถูกเลือกท่ามกลางกลุ่มที่ประกอบด้วย ldhA, pflA, pflB, adhE, edd และ eda 4. วิธีการของข้อถือสิทธิที่ 1 ถึง 3 โดยที่สายพันธุ์เริ่มต้นประกอบอีกด้วย การหยุดลงของอย่าง น้อยหนึ่งยีนซึ่งถูกเลือกท่ามกลางกลุ่มที่ประกอบด้วย arcA และ ndh 5. วิธีการของข้อใดข้อหนึ่งของข้อถือสิทธิที่ 1 ถึง 4 โดยที่สายพันธุ์วิวัฒน์ถูกเลือก และ ถูกแยก เดี่ยวบนพื้นฐานของอัตราการผลิต 1,2-โพรเพนไดออลของมัน, ซึ่งถูกทำให้เพิ่มขึ้นอย่างน้อย 20% เมื่อ เทียบกับอัตราการผลิตของสายพันธุ์เริ่มต้น 6. วิธีการของข้อใดข้อหนึ่งของข้อถือสิทธิที่ 1 ถึง 5 โดยที่สายพันธุ์เริ่มต้นถูกเลือกจากกลุ่มที่ ประกอบด้วยแบคทีเรีย, ยีสต์ และ รา 7. วิธีการของข้อถือสิทธิที่ 6 โดยที่สายพันธุ์เริ่มต้นถูกเลือกจากกลุ่มที่ประกอบด้วย Enterobacteriaceae, Bacillaceae, Clostridiaceae, Streptomycetaceae และ Corynebacteriaceae 8. วิธีการของข้อถือสิทธิที่ 7 โดยที่สายพันธุ์เริ่มต้นเป็นได้ไม่ว่าจะเป็น Escherichia coli หรือ Clostridium acetobutylicum ------------------ 1. วิธีการสำหรับการเตรียมของสายพันธุ์ของจุลชีพสำหรับการผลิตของ 1,2-โพรเพนได ออลจากแหล่งคาร์บอน, ซึ่งวิธีการดังกล่าวประกอบด้วย: - การเลี้ยงสายพันธุ์เริ่มต้นภายใต้ความดันคัดเลือกในอาหารเลี้ยงเชื้อที่ให้การเจริญที่เหมาะสม ซึ่งสายพันธุ์ของแบคทีเรียเริ่มต้นดังกล่าวประกอบด้วยการหยุดของการแสดงออกของยีน tpiA และการ หยุดของการแสดงออกของอย่างน้อยหนึ่งยีนที่เกี่ยวข้องกับการแปลงผันของเมธิลไกลออกซอลไปเป็น แลคเตต เพื่อสนับสนุนการวิวัฒนาการในสายพันธุ์เริ่มต้นดังกล่าว - จากนั้น ทำการคัดเลือก และการแยกเดี่ยวสายพันธุ์วิวัฒน์ที่มีอัตราการผลิต 1,2-โพรเพนได ออลเพิ่มขึ้น - จากนั้นปรับโครงสร้างใหม่ต่อยีน tpiA ในสายพันธุ์วิวัฒน์ 2. วิธีการของข้อถือสิทธิที่ 1 โดยที่ยีนซึ่งเกี่ยวข้องกับการแปลงผันของเมธิลไกลออกซอล เป็น แลคเตต ถูกเลือกจากกลุ่มที่ประกอบด้วย : gloA, aldA และ aldB และการรวมกันของสิ่งนั้น 3. วิธีการของข้อถือสิทธิที่ 1 ถึง 2 โดยที่สายพันธุ์เริ่มต้นประกอบอีกด้วยการหยุดลงของการ แสดงออกของอย่างน้อยหนึ่งในยีนซึ่งถูกเลือกท่ามกลางกลุ่มที่ประกอบด้วย ldhA, pflA, pftB, adnE, edd และ eda 4. วิธีการของข้อถือสิทธิที่ 1 ถึง 3 โดยที่สายพันธุ์เริ่มต้นประกอบอีกด้วย การหยุดลงของอย่าง น้อยหนึ่งยีนซึ่งถูกเลือกท่ามกลางกลุ่มที่ประกอบด้วย arcA และ ndh 5. วิธีการของข้อใดข้อหนึ่งของข้อถือสิทธิที่ 1 ถึง 4 โดยที่สายพันธุ์วิวัฒน์ถูกเลือก และ ถูกแยก เดี่ยวบนพื้นฐานของอัตราการผลิต 1, 2-โพรเพนไดออลของมัน, ซึ่งถูกทำให้เพิ่มขึ้นอย่างน้อย 20% เมื่อ เทียบกับอัตราการผลิตของสายพันธุ์เริ่มต้น 6. วิธีการของข้อใดข้อหนึ่งของข้อถือสิทธิที่ 1 ถึง 5 โดยที่สายพันธุ์เริ่มต้นถูกเลือกจากกลุ่มที่ ประกอบด้วยแบคทีเรีย, ยีสต์ และ รา 7. วิธีการของข้อถือสิทธิที่ 6 โดยที่สายพันธุ์เริ่มต้นถูกเลือกจากกลุ่มที่ประกอบด้วย Enterobacteriaceae, Bacillaceae, Clostridiaceae, Streptomycetaceac และ Corynebacteriaceae 8. วิธีการของข้อถือสิทธิที่ 7 โดยที่สายพันธุ์เริ่มต้นเป็นได้ไม่ว่าจะเป็น Escherichia coli หรือ Clostridium acetobutylicum 9. สายพันธุ์วิวัฒน์ของจุลชีพที่ไวซึ่งถูกทำให้ได้มาโดยวิธีการของข้อใดข้อหนึ่งของข้อถือสิทธิ ที่ 1 ถึง 8 1 0. สายพันธุวิวัฒน์ตามข้อถือสิทธิที่ 9 โดยที่การทำหน้าที่ของ กลีเซอรัลดีไฮด์ 3 ฟอสเฟต ดี ไฮโดรจีเนส ถูกทำให้หยุดลง 1 1. สายพันธุวิวัฒน์ตามข้อถือสิทธิที่ 10 โดยที่การแสดงออกของยีน gapA ถูกทำให้หยุดลง 1 2. สายพันธุวิวัฒน์ของข้อใดข้อหนึ่งของข้อถือสิทธิที่ 9 ถึง 11 โดยที่ประสิทธิผลของการ นำเข้าน้ำตาลถูกทำให้เพิ่มขึ้น 1 3. สายพันธุวิวัฒน์ตามข้อถือสิทธิที่ 12 โดยที่ระบบการนำเข้าน้ำตาลที่ไม่ขึ้นกับฟอสโฟอีนอล ไพรูเวตได้ถูกนำมาใช้ 1 4. สายพันธุวิวัฒน์ตามข้อถือสิทธิที่ 13 โดยที่การแสดงออกของอย่างน้อยหนึ่งยีนซึ่งถูกเลือก จากบรรดา galP และ glk ถูกทำให้เพิ่มขึ้น 1 5. สายพันธุวิวัฒน์ตามข้อถือสิทธิที่ 12 โดยที่ประสิทธิผลของระบบน้ำตาล-ฟอสโฟทราส เฟอเรสถูกปรับปรุงโดยการเพิ่มการมีอยู่ของสารเมทาบอไลต์ ฟอสโฟอีนอลไพรูเวต 1 6. สายพันธุวิวัฒน์ตามข้อถือสิทธิที่ 15 โดยที่ การทำหน้าที่ของอย่างน้อยหนึ่งไพรูเวต ไคเนสถูกทำให้หยุดลง 1 7. สายพันธุวิวัฒน์ตามข้อถือสิทธิที่ 16 โดยที่การแสดงออกมาอย่างน้อยหนึ่งยีนซึ่งถูกเลือก ท่ามกลาง pykA และ pylF ถูกทำให้หยุดลง 1 8. สายพันธุวิวัฒน์ของข้อใดข้อหนึ่งของข้อถือสิทธิที่ 15 ถึง 17 โดยที่ การทำหน้าที่ของฟอส โฟอีนอลไพรูเวต ซินเทสถูกทำให้เพิ่มขึ้น 1 9. สายพันธุวิวัฒน์ตามข้อถือสิทธิที่ 18 โดยที่การแสดงออกของยีน ppsA ถูกทำให้เพิ่มขึ้น 2 0. สายพันธุวิวัฒน์ของข้อใดข้อหนึ่งของข้อถือสิทธิที่ 9 ถึง 19 โดยที่เอนไซม์ที่ชอบการเผา ผลาญของไพรูเวต ให้เป็น อะเซติล-CoA มีความไวที่ต่ำต่อการยับยั้งโดย NADH กว่าเอนไซม์ที่มิได้ถูก ดัดแปลง 2

1. สายพันธุวิวัฒน์ของข้อใดข้อหนึ่งของข้อถือสิทธิที่ 9 ถึง 20 โดยที่ยีน lpd มีการกลายพันธุ์ เฉพาะจุดที่นำไปสู่การแทนที่อะลานีน 55 โดยวาลีน 2

2. สายพันธุวิวัฒน์ของข้อใดข้อหนึ่งของข้อถือสิทธิที่ 9 ถึง 21 โดยที่การทำหน้าที่ของอย่าง น้อยหนึ่งเอนไซม์ซึ่งเกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์อะซีเตตถูกทำให้หยุดลง 2

3. สายพันธุวิวัฒน์ตามข้อถือสิทธิที่ 22 โดยที่การแสดงออกของอย่างน้อยหนึ่งยีนซึ่งถูกเลือก จาก ackA, pta, poxB ได้ถูกทำให้หยุดลง 2

4. วิธีการสำหรับการเตรียม 1,2-โพรเพนไดออล โดยที่สายพันธุ์วิวัฒน์ของข้อใดข้อหนึ่งของ ข้อถือสิทธิที่ 9 ถึง 23 ถูกเพาะเลี้ยงในอาหารเลี้ยงเชื้อที่ให้การเจริญที่เหมาะสมประกอบด้วยแหล่ง คาร์บอน และ 1,2- โพรเพนไดออลซึ่งถูกผลิตขึ้นได้ถูกฟื้นฟูกลับ 2

5. วิธีการตามข้อถือสิทธิที่ 24 โดยที่สายพันธุ์วิวัฒน์ของ Escherichia coli ถูกเพาะเลี้ยงใน อาหารเลี้ยงเชื้อที่ให้การเจริญที่เหมาะสมประกอบด้วยแหล่งคาร์บอนอย่างง่าย และ 1,2-โพรเพนไดออล ซึ่งถูกผลิตขึ้นได้ถูกฟื้นฟูกลับ 2

6. วิธีการตามข้อถือสิทธิที่ 24 โดยที่สายพันธุ์วิวัฒน์ของ Clostridium acetobutylicum ถูก เพาะเลี้ยงในอาหารเลี้ยงเชื้อที่ให้การเจริญที่เหมาะสม ที่ประกอบด้วยแหล่งคาร์บอนอย่างง่ายหรือ เชิงซ้อน และ 1,2-โพรเพนไดออล ได้ถูกฟื้นฟูกลับมา 2

7. วิธีการของข้อใดข้อหนึ่งของข้อถือสิทธิที่ 24 ถึง 26 โดยที่ 1,2-โพรเพนไดออลซึ่งถูกฟื้นฟู กลับถูกทำให้บริสุทธิ์เพิ่มเติม