SU1741610A3 - Method for obtaining human @@@-dismutase - Google Patents

Method for obtaining human @@@-dismutase Download PDF

Info

Publication number
SU1741610A3
SU1741610A3 SU884355336A SU4355336A SU1741610A3 SU 1741610 A3 SU1741610 A3 SU 1741610A3 SU 884355336 A SU884355336 A SU 884355336A SU 4355336 A SU4355336 A SU 4355336A SU 1741610 A3 SU1741610 A3 SU 1741610A3
Authority
SU
USSR - Soviet Union
Prior art keywords
ebi
dna
xho
dismutase
plasmid
Prior art date
Application number
SU884355336A
Other languages
Russian (ru)
Inventor
Хекль Конрад
Спевак Вальтер
Остерманн Элинборг
Цефель Андреас
Крыстек Эдельтрауд
Маурер-Фоги Ингрид
Йозефа Вихе-Кастанон Мария
Стратова Кристиан
Гауптманн Рудольф
Original Assignee
Берингер Ингельгейм Интернациональ Гмбх (Фирма)
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Берингер Ингельгейм Интернациональ Гмбх (Фирма) filed Critical Берингер Ингельгейм Интернациональ Гмбх (Фирма)
Application granted granted Critical
Publication of SU1741610A3 publication Critical patent/SU1741610A3/en

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0089Oxidoreductases (1.) acting on superoxide as acceptor (1.15)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/62DNA sequences coding for fusion proteins
    • C12N15/625DNA sequences coding for fusion proteins containing a sequence coding for a signal sequence
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004Oxidoreductases (1.)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/02Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a signal sequence
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/01Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
    • C07K2319/07Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a mitochondrial localisation signal

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Abstract

The present invention relates to a genetic engineering method for the preparation of human Mn superoxide dismutase (hMn-SOD), to the DNA sequences which code for this enzyme, to suitable vectors which contain these DNA sequences, and to host cells which are able to express these DNA sequences, as well as to the enzyme hMn-SOD itself. Proposed uses of this enzyme are also described.

Description

Изобретение относитс  к биотехнологии и генетимеской инженерии, в частности к способам получени  человеческой MnOjr-дисмутазы дл  терапевтических целей, например, в качестве антивоспалительного средства.The invention relates to biotechnology and genetic engineering, in particular, to methods for producing human MnOjr dismutase for therapeutic purposes, for example, as an anti-inflammatory agent.

Способ заключаетс  в том, что из плацентарной или печеночной ткани человека выдел ют мРНК, получают поли (А)+РНК, синтезируют двунитевую кДНК, конструируют банк кДНК, выдел ютThe method consists in the fact that mRNA is isolated from human placental or hepatic tissue, poly (A) + RNA is obtained, a double-stranded cDNA is synthesized, a cDNA bank is constructed,

последовательность ДНК, кодирующую Мп-О-дисмутазу, при помощи зондо| DNA sequence encoding Mn-O-dismutase using probe |

i С С С S -TGITA ТТ ТС TCIGTIACITT-3 i С С С S -TGITA ТТ ТС TCIGTIACITT-3

,и Т- Т Тand T - T T

АСАASA

S TCIGTIAC тт ТСССА TTIAT-J S TCIGTIAC tt TCCA TTIAT-J

G Т GG T G

или последовательности кДНК гена Мп02-дисмутазы человека, последова- тельлость ДНК достраивают до стартового кодона или стоп-кодона, непосредственно за стартовым кодоном гена размещают митохондриальную лидерную /ш ;иГнальнУ последовательность ДНК Мп02-дисмутазы S.cerevisiae или человека, последовательность ДНК. ко Дирующую Мп02-дисмутазУ используют , Дл  конструировани  вектора экспресо оor cDNA sequences of the human MnO2 dysmutase gene, the DNA sequence is extended to the start codon or stop codon, the mitochondrial leader / W is placed directly behind the start codon of the gene, the DNA sequence of S.cerevisiae or human DNA sequence. The Mp02 Dismutase is used to construct the expression vector.

СА)SA)

317 И6104317 I6104

сии, состо щего из промоторов ADHI ЁВ1 1161/EBI 1164 + EBI 1167/EBI 1160 ADHII, пар олигонуклеотидов формулыthese, consisting of promoters ADHI EV1 1161 / EBI 1164 + EBI 1167 / EBI 1160 ADHII, pairs of oligonucleotides of the formula

EBI 1161 Sph I 5«EBI 1161 Sph I 5 "

CCTATCACATATAAATAGAGTGCCAGTAGCGACTTTTTTCACACTCG GTACGGATAGTGTATATTTATCTCACGGTCATCGCTGAAAAAAGTGTGAGl СCCTATCACATATAAATAGAGTGCCAGTAGCGACTTTTTTCACACTCG GTACGGATAGTGTATATTTATCTCACGGTCATCGCTGAAAAAAGTGTGAGl

AAATACTCTTACTACTGCTCTCTTGTTGTTTTTATCACTTCTTGTTTCTTCT TTTATGAGAATGATGACGAGAGAACAACAAAAATAGTGAAGAACAAAAAATACTCTTACTACTGCTCTCTTGTTGTTTTTATCACTTCTTGTTTCTTCT TTTATGAGAATGATGACGAGAGAACAACAAAAATAGTGAAGAACAAA

EBI 1164 5 TGEBI 1164 5 TG

EBI 1167 5EBI 1167 5

GTAAATAGAATATCAAGCTACAAAAAGCATACAATCAACTA GAAGAACCATTTATCTTATAGTTCGATGTTTTTCGTATGTTAGTTGAT ТСААСТАТТААС AGTTGATAATTGAGCT 5 EBI 1160GTAAATAGAATATCAAGCTACAAAAAGCATACAATCAACTA GAAGAACCATTTATCTTATAGTTCGATGTTTTTCGTATGTTAGTTGAT TSAASTATTAAS AGTTGATAATTGAGCT5 EBI 1160

Xho IXho I

EBI 1161/EBI 1164 + EBI 1159/EBI 1168 формулы EBI 1161EBI 1161 / EBI 1164 + EBI 1159 / EBI 1168 formulas EBI 1161

5five

CCTATCACATATAAATAGAGTGCCAGTAGCGACTTTTTTCACACTCG GTACGGATAGTGTATATTTATCTCACGGTCATCGCTGAAAAAAGTGTGAG С - «CCTATCACATATAAATAGAGTGCCAGTAGCGACTTTTTTCACACTCG GTACGGATAGTGTATATTTATCTCACGGTCATCGCTGAAAAAAGTGTGAG C - "

AAATACTCTTACTACTGCTCTCTTGTTGTTTTTATCACTTCTTGTTTCTTCT TTTATGAGAATGATGACGAGAGAACAACAAAAAiAGTGAAGAACAAAAAATACTCTTACTACTGCTCTCTTGTTGTTTTTATCACTTCTTGTTTCTTCT TTTATGAGAATGATGACGAGAGAACAACAAAAAiAGTGAAGAACAAA

EBI 1164 5 TGEBI 1164 5 TG

EBI 1159 5EBI 1159 5

GTAAATAGAATATCAAGCTACAAAAAGCATACAATCAACTA. GAAGAACCATTTTATCTTATAGTTCGATGTtTTTCGTATGTTAGTTGAT TCAACTATTAACTATATCfGTAAATAGAATATCAAGCTACAAAAAGCATACAATCAACTA. GAAGAACCATTTTATCTTATAGTTCGATGTtTTTCGTATGTTAGTTGAT TCAACTATTAACTATATCC

AGTTGATAATTGATATAGAGCT5 EBI 1168AGTTGATAATTGATATAGAGCT5 EBI 1168

Xho IXho I

EBI 1161/EBI 1164 + EBI 1165/EBI 1166 формулы EBI 1161 5EBI 1161 / EBI 1164 + EBI 1165 / EBI 1166 of the formula EBI 1161 5

CCTATCACATATAAATAGAGTGCCAGTAGCGACTTTTTTCACACTCG GTACGGATAGTGTATATTTATCTCACGGTCATCGCTGAAAAAAGTGTGAG СCCTATCACATATAAATAGAGTGCCAGTAGCGACTTTTTTCACACTCG GTACGGATAGTGTATATTTATCTCACGGTCATCGCTGAAAAAAGTGTGAG C

AAATATTCTTACTACTGCTCTCTTGTTGTTTTTATCACTTCTTGTTTCTTCT TTTATGAGAATGATGACGAGAGAACAACAAAAATAGTGAAGAACAAAAAATTCTTACTACTGCTCTCTTGTTGTTTTTATCACTTCTTGTTTCTTCT TTTATGAGAATGATGACGAGAGAACAACAAAAATAGTGAAGAACAAA

EBI 1164 5 TGEBI 1164 5 TG

EBI 1165 5EBI 1165 5

GTAAATAGAATATCAAGCTACAAAAAGCATACAATCAACTA GAAGAACCATTATCXTATAGTTCGATGTTTTTCGTATGTTAGTTGAT TCAACTATTAACTATATCGTAATACGTAAATAGAATATCAAGCTACAAAAAGCATACAATCAACTA GAAGAACCATTATCXTATAGTTCGATGTTTTTCGTATGTTAGTTGAT TCAACTATTAACTATATCGTAATAC

AGTTGATAATTGATATAGCATTATGAGCT 5 EBI 1166 Xho IAGTTGATAATTGATATAGCATTATGAGCT 5 EBI 1166 Xho I

или CUP1, сигнала инициировани  стоп-кодона и терминатора ADHII, по- митохондриальной лидерной или- - лученными векторами экспресии pWS550A, сигнальной последовательности. Saccha- или pWS4$OA, или рИ8491А, или готчусев cerevisiae или человека pWS371A, или pWS372A или pWS373A, or CUP1, a signal for initiating a stop codon and an ADHII terminator, a mitochondrial leader, or a-derived expression vectors pWS550A, a signal sequence. Saccha- or pWS4 $ OA, or rI8491A, or Gotchusev cerevisiae or human pWS371A, or pWS372A or pWS373A,

или - АВ, или рЕ025 - АС, или рЕ02Т - AD, или , или pEOAl, или , или , или рЈОМ, или , или рЕ050, или pЈ05t трансформируют штаммы Saccharomyces cerevi- siae или плазмиду pSV2 dhfr -SOD1 или pSV2 dhfr, которой трансформируют штаммы культивируемых клеток, культивируют трансформированные клетки, выдел ют и очищают целевой продукт путем экстракции, осаждени  и хроматографии ,or - AB, or pE025 - AU, or pE02T - AD, or, or pEOAl, or, or, or pЈOM, or, or pE050, or pЈ05t transform Saccharomyces cerevisiae strains or plasmid pSV2 dhfr -SOD1 or pSV2 dhfr, which transform the strains of cultured cells, cultivate the transformed cells, isolate and purify the target product by extraction, precipitation and chromatography,

При осуществлении предлагаемого способа используют промотор ADHI (pES103), регистрационный номер DSM 013 (фрагмент Ваш Hl/XhoI с длиной 1500 п.о. (пар оснований); ускоренный промотор ADHI, регистрационный номер DSM 4016 (pWS 323E) (фрагмент Bam HI/Xho I с длиной М)0 ПлО.);When implementing the proposed method, the ADHI promoter (pES103), registration number DSM 013 (fragment Your Hl / XhoI with a length of 1500 bp (base pairs); accelerated promoter ADHI, registration number DSM 4016 (pWS 323E) (fragment Bam HI / Xho I with a length of M) 0 PLO.);

терминатор AIHII (pGD2), регистрационный номер DSM 4014, (фрагментterminator AIHII (pGD2), registration number DSM 4014, (fragment

ХЪа I/Hind III с длиной 336 п„о.); буфер Bam HI: 150 мй NaCl, 6 мМ трис-HCl, рН 7,9, 6 мМ MgCl2, 100 мкл/мл альбумина сыворотки крупного рогатого скота (АСКРС); буфер Коре: 50 мМ трис-HCl, рН 8,0, 10 мМ MgClft, 50 мН NaCl; раствор денатурации: 0,5 М NaOH, 1,5 М NaCl;Xa I / Hind III with a length of 336 n "o.); Bam HI buffer: 150 ppm NaCl, 6 mM Tris-HCl, pH 7.9, 6 mM MgCl2, 100 μl / ml of cattle serum albumin (ASKRS); Core buffer: 50 mM Tris-HCl, pH 8.0, 10 mM MgClft, 50 mN NaCl; denaturation solution: 0.5 M NaOH, 1.5 M NaCl;

раствор Денхардта (50х}:.1 г поливини л пи рроли дона с мол,массой ЗбОООО, 1 г Фиколла, 1 г АСКРС, до 100 мл;Denhardt's solution (50x}: 1 g of polyvine l pyrroli don with a mole, weight ZBOOOO, 1 g Ficoll, 1 g ASKRS, up to 100 ml;

E.coli С 600: F, sup Е44, thil, thrl, leuB6, lac YT, ton A21tfTATCC 3372);E.coli C 600: F, sup E44, thil, thrl, leuB6, lac YT, ton A21tfTATCC 3372);

E.coli IM fOlrsup E, thiA (lac-pro AB), F, tra B36 pro AB, lac , Д15;E. coli IM fOlrsup E, thiA (lac-pro AB), F, tra B36 pro AB, lac, D15;

буфер X: 100 мМ NaCl, 50 мМ трис-HCl, pH 7,5, 10 мМ MgClfc, 1 мМ дитиотрие- тола (ДТТ);buffer X: 100 mM NaCl, 50 mM Tris-HCl, pH 7.5, 10 mM MgClfc, 1 mM dithiotrietol (DTT);

буфер Y: 10 мМ трис-HCl, рН J,5, 60 мМ NaCl, 10 мМ MgCl4 1 мМ каптоэтанола, 100 мкг/мл АСКРС - -- раствор гибридизации соответствует - раствору предварительной гиЬ 0иди$аг1Л ции, но без ДНК из спермы лосос  содержащий фрагмент Кленова реакцией ный раствор 22 мкл ДНК/Н20, 2,5 мкл 10-буфера НТР (0,5 М трис-HClг рН 7,2, 0,1 M MgS04, 1 мМ ДТТ, 500 мк / /мл АСКРС} по 1 мкл 2 мМ dATP, dCfPY buffer: 10 mM Tris-HCl, pH J, 5, 60 mM NaCl, 10 mM MgCl4 1 mM captoethanol, 100 μg / ml ASKRS - - hybridization solution corresponds to - a solution of preliminary hygiene synthesis, but without DNA from sperm salmon containing the Klenov fragment, a reaction solution of 22 μl of DNA / H20, 2.5 μl of 10-buffer NTP (0.5 M Tris-HCl g pH 7.2, 0.1 M MgS04, 1 mM DTT, 500 μm / ml ARMS } on 1 mkl 2 mM dATP, dCfP

dTTP, 2,5 ед. фрагмента Кленова (0,5 мкл);dTTP, 2.5 units fragment maple (0.5 μl);

17 1161017,11610

00

5five

00

- Л-буфер: 100 мМ трис, рН 7,5, 0 мМ MgCJ4, 1 мМ этилендинитрилотетраук- сусной кислоты ЭДТУК); агар ЛБ: жидка  среда ЛБ, 15 г/л бак- тоагара;- L buffer: 100 mM Tris, pH 7.5, 0 mM MgCJ4, 1 mM ethylenedinitrilotetraacetic acid (EDTA); agar LB: liquid medium LB, 15 g / l baktoagara;

жидка  среда ЛБ: 10 г/л бактотрипто- на, 5 г/л дрожжевого экстракта, 5 г/л NaCl, 10 М NaOH до рН 7, раствор лигировани : 66 мМ трис-НС1, рН 7,6, 10 мМ MgCl2, 5 мМ ДТТ, 1 мМ АТР, 1 ед. Т -ДНК-лигазы; раствор нейтрализации: 0,5 М трис- HCl, рН 7,50,t,5 M NaCl; буфер Z:50 мМ КС1, 50 мМ NaCl, 50 мМ трис-HCl, рН 8,0, 10 мМ MgCla; раствор предварительной гибридизации: 5 ч буфер SSC, 5 раствор Денхардта , 50 мМ натрий-фосфатного буфера, рН 6,8, 1 мМ Na2P407, 100 мкМ АТР, 0,1% додецилсульфата натри ( 100 (50) мкг/мл денатурированной обработанной ультразвуком ДНК из спермы лосос ;liquid LB medium: 10 g / l bactotryptone, 5 g / l yeast extract, 5 g / l NaCl, 10 M NaOH to pH 7, ligation solution: 66 mM Tris-HCl, pH 7.6, 10 mM MgCl2, 5 mM DTT, 1 mM ATP, 1 unit. T-DNA ligase; neutralization solution: 0.5 M Tris-HCl, pH 7.50, t, 5 M NaCl; Z buffer: 50 mM KCl, 50 mM NaCl, 50 mM Tris-HCl, pH 8.0, 10 mM MgCla; pre-hybridization solution: 5 h SSC buffer, 5 Denhardt solution, 50 mM sodium phosphate buffer, pH 6.8, 1 mM Na2P407, 100 µM ATP, 0.1% sodium dodecyl sulfate (100 (50) µg / ml, and denatured by ultrasound DNA from salmon sperm;

5 pURA3 регистрационный номер ISM 4015; S.cerevisiae DBY47:a,leu 2, his 3, trpl Ura 3;5 pURA3 ISM 4015 registration number; S.cerevisiae DBY47: a, leu 2, his 3, trpl Ura 3;

среда СЦ-УРА: 0,67 % BYNB(Difco), 2% глюкозы, 2% 50 смеси аминокислот (г/л): гистидин 1; лейцин 6; триптофан 2,5; лизин ; аденин 1,2; аргинин 2; меТионин t, фенилаланин 6; треонин 5; изолейцин 6; буфер Sma I: 10 мМ трис-HCl, рН 8,0, 20 мМ КС1, 10 мМ MgClЈ, 10 мМ 2-мер- каптоэтзнола, 100 мкг/мл АСКРС; буфер Sph I: 10 мМ трис-HCl, рН 7,5, 100 мМ NaCl, 10 мМ MgCl, 10 мМ 2- меркаптоэтанола, 100 мкг/мл АСКРС; SSC (20X): 3,0 М NaCl, 0,3 М Na3- цитрата, рН 7,0;Wednesday SC-URA: 0.67% BYNB (Difco), 2% glucose, 2% 50 mixture of amino acids (g / l): histidine 1; leucine 6; tryptophan 2.5; lysine; adenine 1,2; arginine 2; methionine t, phenylalanine 6; threonine 5; isoleucine 6; Sma I buffer: 10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 20 mM KCl, 10 mM MgClЈ, 10 mM 2-mercaptoetznol, 100 μg / ml ASKRS; Sph I buffer: 10 mM Tris-HCl, pH 7.5, 100 mM NaCl, 10 mM MgClI, 10 mM 2-mercaptoethanol, 100 μg / ml ASKRS; SSC (20X): 3.0 M NaCl, 0.3 M Na3-citrate, pH 7.0;

SSPE (20X): 3,6 М NaCl, 0,2 М NatHP04. 20 мМ ЭДТУК, NaOH (Юн.) до рН 7,; буфер ТЕ: 10 мМ трис-HCl, рН 8,0, 1 мМ ЭДТУК;SSPE (20X): 3.6 M NaCl, 0.2 M NatHP04. 20 mM EDTA, NaOH (Yun.) To pH 7; TE buffer: 10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 1 mM EDTA;

буфер Tha l: 50 мМ трис-НС1„ рН 8,0, 10 мМ MgClЈ;Tha l buffer: 50 mM Tris-HC1 „pH 8.0, 10 mM MgClЈ;

топ-агароза: жидка  среда ЛБ, 0,7% агарозы;top agarose: liquid medium LB, 0.7% agarose;

раствор предварительной промывки: IM NaCb50 мМ трис-HCl, рН 8,0, 1 мМ ЭДТУК, 0,1$ ДСН„ Пример,pre-washing solution: IM NaCb50 mM Tris-HCl, pH 8.0, 1 mM EDTA, $ 0.1 SDS Example,

Конструирование генобанка кДНК. X Свежую человеческую плаценту подвергают быстрому замораживанию в жидком азоте, растирают в порошок при температуре ниже -80 С, экстрагируют РНК, из которой получают поли(А)РНК.Construction of genebanks cDNA. X Fresh human placenta is subjected to rapid freezing in liquid nitrogen, triturated at temperatures below -80 ° C, extracted with RNA, from which poly (A) RNA is obtained.

00

5five

00

5five

00

5five

10ten

2020

Синтезируют ДНК, клонируют ее в EcoRI gtlO, использу  E.coli СбОО. Титр кДНК фaгoв gt 10 составл ет 1, бл шкообразующих ед. мл, а число независимых клонов Synthesize DNA, clone it in EcoRI gtlO using E. coli SOO. The titer of the cDNA of gt 10 is 1, forming units. ml and the number of independent clones

П р и м е р 2 о Амплификаци  гено- банка %t 10.EXAMPLE 2 Gene amplification of the% t 10 gene.

Штамм-реципиент E.coli {например, С 600, Генотип F, , sup E44. thill, thrl, leu B6, lac YI, ton А2ЦГвы- ращивают при в течение ночи в среде Л&, содержащей 0,2% мальтозы.Strain recipient E. coli {for example, C 600, Genotype F,, sup E44. thill, thrl, leu B6, lac YI, ton A2CG are grown at overnight in L & n medium containing 0.2% maltose.

Культуру центрифугируют и суспендируют в 10 мМ раствора сульфата маг-j5 ни  до оптической плотности ,0 при ЬОО нм. Полученные Mg -клеткихран т при 4° С а Клетки смешивают с суспензией фагов (по 50000 бл шкообразующих единиц генобанка ДНК на пластину ) и инкубируют в течение 20 мин при 37°С. Затем добавл ют расплавленную и доведенную до топ-агарозу (содержащую 10 мМ сульфата магни ), смешивают, выливают на предварительно 25 нагретые ЛБ-агаровые пластинки (диа- метром 13,5 см), содержащие 10 мМ сульфата магни , и инкубируют в течение 6 - 12 ч при 37°С«The culture was centrifuged and suspended in 10 mM mag-j5 sulphate solution or to optical density, 0 at bLnnm. The obtained Mg -cellulars at 4 ° C and the cells are mixed with a suspension of phages (50,000 plaque-forming units of DNA gene-bank per plate) and incubated for 20 minutes at 37 ° C. Then melted and brought to top agarose (containing 10 mM magnesium sulfate) are added, mixed, poured onto preheated 25 LB-agar plates (13.5 cm in diameter) containing 10 mM magnesium sulfate, and incubated for 6 - 12 hours at 37 ° C

ПримерЗ. Первичный скрининг дл  идентификации рекомбинантных -фагов.Example Primary screening to identify recombinant α-phages.

а). Обработка нитроцеллюлозных фильтров.but). Processing nitrocellulose filters.

Пластинки по окончании инкубации охлаждают до А°С. Нитроцеллюлозные фильтры кладут на поверхность пластинок . Через 1 мин после пропитки фильтры осторожно удал ют, кладут в раствор денатуратора и инкубируют в течение одной минуты при комнатной температуре., Нейтрализацию осуществл ют в растворе нейтрализатора в течение 5 мин при комнатной темпера- туре, затем инкубируют в течение 30 с в буфере при той же температуре. С пластины изготовл ют копии. Фильтры высушивают, ДНК фиксируют при 80°С,tThe plates at the end of incubation are cooled to A ° C. Nitrocellulose filters are placed on the surface of the plates. After 1 min after the impregnation, the filters are carefully removed, put into the solution of the denaturer and incubated for one minute at room temperature. Neutralization is carried out in a neutralizer solution for 5 min at room temperature, then incubated for 30 seconds in a buffer at same temperature. Copies are made from the plate. Filters are dried, DNA is fixed at 80 ° C, t

б). Получение Р-маркированных зондов ДНК оb). Obtaining P-labeled DNA probes

Синтез олигонуклеотидов провод т на синтезаторе 381 А. Олигонуклео- тиды очищают электрофорезом в поли- акриламидном геле (20&-в 8 М мочевине ) с последующим обессоливанием на , Сефадексе G-50, Синтезированные та- ким образом ДНК-зонды комплементарны последовательност м оснований РНК,The synthesis of oligonucleotides is carried out on the synthesizer 381 A. The oligonucleotides are purified by polyacrylamide gel electrophoresis (20 & 8 M urea), followed by desalting on Sephadex G-50, thus synthesized DNA probes are complementary to the sequence of bases RNA

; ;

5five

30thirty

55 55

3535

4040

4545

5050

10ten

2020

j5 25 j5 25

,  ,

610 8610 8

; кодирующим аминокислоты 39 b(a) и 200 - 207(6): Они имеют следующие последовательности оснований:; coding for amino acids 39 b (a) and 200 to 207 (6): They have the following base sequences:

5five

-f-f

,1,one

g

30thirty

С С СC C C

а)5r TG ITA ТТ ТС ТС IGT IAC ITTa) 5r TG ITA TT TS TS IGT IAC ITT

Т Т ТT T T

АСАASA

б)51 ТС IGT IAC ТТ ТС CCA TT IATb) 51 TS IGT IAC TT TC CCA TT IAT

G Т GG T G

в). Гибридизаци  in situ.at). In situ hybridization.

С целью удалени  с нитроцеллюлозы остатков агарозы и бактерий фильтры инкубируют в растворе предварительной промывки при 65°С в течение нескольких часов при перемешивании. Фильтры инкубируют в течение 1 - 12 ч при температуре 37 С в растворе предварительной гибридизации, который подвергают предварительной вакуумной дегазации.In order to remove residues of agarose and bacteria from nitrocellulose, the filters are incubated in a prewash solution at 65 ° C for several hours with stirring. Filters are incubated for 1-12 hours at 37 ° C in a preliminary hybridization solution, which is subjected to preliminary vacuum degassing.

Используемые дл  гибридизации радиоактивно меченные ДНК-зонды (около срм/мкг) добавл ют к нагретому до 37°С и дегазированному раствору гибридизации. Дл  поддержани  на высоком уровне концентрации ДНК в растворе гибридизации используют минимальное количество жидкости. Гибридизацию осуществл ют в течение 12 - 18 ч при 37°С.Radioactively labeled DNA probes used for hybridization (about cpm / µg) are added to the degassed hybridization solution heated to 37 ° C. To maintain a high level of DNA concentration in the hybridization solution, a minimal amount of liquid is used. Hybridization is carried out for 12-18 hours at 37 ° C.

Нитроцеллюлозные фильтры три раза промывают в буфере и 0,05% ДСН (t°C), два раза в течение 30 мин при °С, а также в свежеприготовленном растворе, содержащем 3 И хлорида тетраметиламмони , 50 мМ трис-HCi, рН 8,22 мН ЭДТУК и 0.05S ДСН следующим образом: три раза при комнатной температуре, два раза в течение 30 мин при комнатной температуре и три раза в течение 30 мин при 9°С, после чего сушат на воздухе . Рентгеновскую пленку .экспонируют в течение 2-8 дней при - 70°С.Nitrocellulose filters are washed three times in buffer and 0.05% SDS (t ° C), twice for 30 minutes at ° C, as well as in a freshly prepared solution containing 3 AND tetramethylammonium chloride, 50 mM Tris-HCi, pH 8, 22 mN EDTA and 0.05S SDS as follows: three times at room temperature, two times for 30 minutes at room temperature and three times for 30 minutes at 9 ° C, then dried in air. The X-ray film is exposed for 2-8 days at - 70 ° C.

Пример1. Очистка бл шек.Example1. Cleaning blinks.

После про влени  авторадиограмм из агаровой пластинки выдел ют те участки, которые дают положительный сигнал гибридизации на обоих нитроцеллюлозных фильтрах. Дл  этого желаемое место удал ют из агара и перевод т в 0,3 - 0,6 мл fl-буфера. 55 Добавл ют по одной капле хлороформа, фагам дают диффундировать из агара в течение ночи при 1°С и каждую отдель-, ную фаговую суспензию в виде несколь- . ких разбавлений нанос т на пластинки. After the autoradiograms are developed, the areas that give a positive hybridization signal on both nitrocellulose filters are isolated from the agar plate. For this, the desired site is removed from the agar and transferred to 0.3-0.6 ml of fl buffer. 55 One drop of chloroform is added, the phages are allowed to diffuse from the agar overnight at 1 ° C and each individual phage suspension is in the form of several. These dilutions are applied to the plates.

3535

4040

4545

5050

Пластинки, имеющие 300 - 1000 бл шек снова используют дл  изготовлени  копии нитроцеллюлозного фильтра, который подвергают гибридизации с использованием обоих ДНК-зондов, Этот процесс повтор ют до тех пор, пока все бл шки одной пластинки не дадут положительный сигнал гибридизации.Plates having 300-1000 plaques are again used to make a copy of a nitrocellulose filter, which is hybridized using both DNA probes. This process is repeated until all plaques of one plate give a positive hybridization signal.

П р.1и м е р 5 о Анализ полученных фаговых клонов, . а). Титрование 71-фагов.P.1i mep 5 o Analysis of phage clones obtained,. but). Titration of 71 phages.

Суспензии фагов разбавл ютfl-буфером в соотношении Т:10, смешивают и нанос т на пластинки„ После инкубации при 37 С определ ют титр в бл шкообразующих единицах. Дл  очищенных фаговых суспензий титр составл ют 2,2 - 8,6М010 ед. мл„Phage suspensions are diluted with fl buffer in a T: 10 ratio, mixed and applied to plates. After incubation at 37 ° C, the titer is determined in plate-forming units. For purified phage suspensions, the titer is 2.2-8.6 M010 units. ml „

б), Получение fl-фаговой ДНК„b) Obtaining fl-phage DNA „

После выделени  и титровани  гомогенных фаговых клонов их нанос т плотностью единиц ( см чашки Петри с культуральной средой следующего состава: 1,5% агарозы, 10 г/л триптофана, 5 г/л дрожжевого экстракта, 5 г/л NaCl, 10 мМ MgS(4 и 0,2% глюкозы) вместе с 200 мкл Mg- клеток E.coli С 600 (оптическа  плотность Ц при 600 нм), инкубируют вAfter isolation and titration of homogeneous phage clones, they are applied to density units (see Petri dishes with culture medium of the following composition: 1.5% agarose, 10 g / l tryptophan, 5 g / l yeast extract, 5 g / l NaCl, 10 mM MgS (4 and 0.2% glucose) together with 200 µl of E.coli C 600 Mg cells (optical density C at 600 nm), are incubated in

течение 5 ч приfor 5 hours at

37°С37 ° C

и затем охлаждают до Ц С, Элюцию фагов осуществл ют переслаиванием пластинок 8 мл Д-оуфера и несколькими капл ми хлороформа при слабом качании при 4°С в течение ночи. Очищенную центрифугированием надосадочную жидкость удал ют и фаги центрифугируют при 5000 об/мин, в течение 30 мин при комнатной температуре. После добавлени  500 мкл -буфера и инкубации с рибо- нуклеазой А (10 мкг/мл) и дезоксириб нуклеазой (1 мкг/мл) в течение 30 ми при 37 С и концентрацию соли повыг шают добавлением 25 мкл 0,5 М ЭДТУК, 12 мкл 1 М трис-HCl, рН 8;0 и 6,5 мкл 20% ДСН и инкубируют при 70вС в течение 15 мин. После экстракции фенолом и двукратной экстракции смесью хлороформа и изоамилового спирта () ДНК осаждают добавлением 0,1 объема ЗМ ацетата натри  с рН 5,2 и 2 объемов спирта, центрифугируют, промывают 70%-ным спиртом, сушат и, раствор ют.в 50 мкг буфере ТЕ.and then cooled to C C, the elution of the phages is carried out by peeling the plates with 8 ml of D-oufer and a few drops of chloroform with weak rocking at 4 ° C overnight. The supernatant purified by centrifugation was removed and the phages were centrifuged at 5000 rpm for 30 minutes at room temperature. After adding 500 µl of buffer and incubating with ribonuclease A (10 µg / ml) and deoxyrib nuclease (1 µg / ml) for 30 minutes at 37 ° C and the salt concentration is increased by adding 25 µl of 0.5 M EDTA, 12 µl of 1 M Tris-HCl, pH 8; 0 and 6.5 µl of 20% SDS and incubated at 70 ° C for 15 minutes. After extraction with phenol and double extraction with a mixture of chloroform and isoamyl alcohol (), the DNA is precipitated by adding 0.1 volume ZM of sodium acetate with a pH of 5.2 and 2 volumes of alcohol, centrifuged, washed with 70% alcohol, dried and, dissolved. µg TE buffer.

в). Рестрикционный анализ.at). Restriction analysis.

По 2 мкл раствора ДНК инкубируют с 5 ед. EcoRI в буфере X в течение 2 ч при 37 С, полученные фрагменты2 μl of the DNA solution is incubated with 5 units. EcoRI in buffer X for 2 h at 37 ° C, fragments obtained

00

5five

раздел ют в 1%-ном агароэном геле. Фрагменты длиной 500 - 1000 п.о, элю- ируют из гел  и подвергают анализу.separated on a 1% agaroen gel. Fragments of a length of 500 to 1000 bp, eluted from the gel and analyzed.

г). Анализ последовательностей.d). Sequence analysis

100 нг фрагментов встраивают в соответственно приготовленную форму дзДНК (репликативна  форма, 50 нг) вектора путем инкубации в течение 2 - 12 ч при Й°С в И) мкл раствора лигировани . Рекомбинантной конструкцией с обозначени ми BS3, BS5, BS8, BS9, BSJ2. BSt3, BSXIII трансформируют компетентные клетки E.coli (штамм Ш 101).100 ng of fragments are inserted into a suitably prepared form of dsDNA (replicative form, 50 ng) of the vector by incubating for 2 to 12 h at 10 ° C in I) μl of the ligation solution. Recombinant construction with the designations BS3, BS5, BS8, BS9, BSJ2. BSt3, BSXIII transform competent E. coli cells (strain W 101).

Выдел ют однонитееую ДНК реком- бинантных фагов и провод т анализ последовательностей по Сангеру при использовании вычислительных программ о,The single-stranded DNA of recombinant phages was isolated and Sanger sequence analysis was performed using computational programs on

Выделенный клон 8 (BS8) содержит кодирующую последовательность аминокислоты 22 зрелого энзима.Selected clone 8 (BS8) contains the coding sequence of amino acid 22 of the mature enzyme.

П р и м е р 6. Конструкци  эксп- рессионной кассеты.PRI me R 6. Design of the Expression Cassette.

Дл  экспрессии человеческой МпОд- лисмутазы (чМп-д) в дрожжах используют промотор ADHI первоначальной длиной около 1500 п.о., укороченный 0 промотор ADHI длиной около 400 п.о. и ADHII терминатор,For the expression of human MpO-lysmutase (cpd-d) in yeast, an ADHI promoter with an initial length of about 1500 bp is used, an ADHI promoter of about 400 bp shortened by 0. and ADHII terminator,

а). Пополнение гена.but). Replenishment of the gene.

Так как у выделенного клона 8 кДНК на N-конце отсутствует участок, соответствующий 21 аминокислоте, дл  пополнени  гена конструируют и синтезируют с учетом выбора дрожжевого ко- дона 2 пары олигонуклеотидов (фрагмент XhoI/Xbal) согласно формуле (ОП1):Since the isolated clone 8 cDNA does not have a segment corresponding to 21 amino acids at the N-terminus, to replenish the gene, 2 oligonucleotide pairs (XhoI / Xbal fragment) are constructed and synthesized according to the choice of yeast codon:

00

5five

5five

00

5five

00

5five

5 TCGAGTATACAATGAAGCACTCTTTGCCAGACTTG 3 CATATGTTACTTCGTGAGAAACGGTCTGAAG Xho I5 TCGAGTATACAATGAAGCACTCTTTGCCAGACTTG 3 CATATGTTACTTCGTGAGAAACGGTCTGAAG Xho I

CCATACGAGTACGGTGCT GGTATGCTGATGCCACGAGATC Xba I CCATACGAGTACGGTGCT GGTATGCTGATGCCACGAGATC Xba I

и (фрагмент Xba I/Ncol согласно формуле (ОП 2):and (fragment Xba I / Ncol according to the formula (OP 2):

5 CTAGAACCACACATCAATGCTCAAATCATGCAA 3 TTGGTGTGTAGTTGCGAGTTTAGTACGTT Xba I5 CTAGAACCACACATCAATGCTCAAATCATGCAA 3 TTGGTGTGTAGTTGCGAGTTTAGTACGTT Xba I

TTGCACCACTCTAAGCAC AACGTGGTGAGA TTCGTGGTACTTGCACCACTCTAAGCAC AACGTGGTGAGA TTCGTGGTAC

Nco I iNco i i

ОП1 вставл ют через Xho I/Xba IOP1 is inserted through Xho I / Xba I

в плазмиду VI7 (полученную из pUCl8 после рестрикции Hinc II и введени to plasmid VI7 (obtained from pUCl8 after restriction of Hinc II and introduction

11eleven

линкеров Xho I (dCCTCGAGG) и рестрикции Smal полученной плазмиды pES102 с последующим выделением линкеров Nco I (dCCCATGGG), а ОП2 через Xba I/Nco I следующим образом. Xho I linkers (dCCTCGAGG) and Smal restriction of the resulting plasmid pES102, followed by isolation of Nco I linkers (dCCCATGGG), and OP2 via Xba I / Nco I as follows.

По 4 мкг ДНК VI7 переваривают 10 ед. Xba I и NcoЛ или Xho I и Xba I в течение 2 ч при 37&С и очищают путем гельэлектрофореза (0.7% агарозы). По 5 мкл синтезированных нитей ОПТ и ОП2 (каждый раз 10 рМ/4 µg of VI7 DNA is digested 10 units. Xba I and Nicole or Xho I and Xba I for 2 hours at 37 ° C and purified by gel electrophoresis (0.7% agarose). 5 μl of the synthesized OPT and OP2 threads (each time 10 pM /

/мкл) перемешивают, инкубируют в/ µl) stirred, incubated in

mi6io mi6io

плаэмиду PKHI, соответственно РКН2 через Xho I/Eco RI.plamid PKHI, respectively PKN2 through Xho I / Eco RI.

В плазмиду РЕЗ 103, содержащую промотор ADHI в качестве фрагмента Bam I/ Xho I длиной 1500 п.о. в PES 102 (PES 102 представл ет собой производное , которое в месте разреза Hinc II содержит линкер Ю Xho 1У, ввод т линкер Bgl II  осле рестрикции Sma I (1 мкг плазмиды подвергают перевариванию 5 ед. Sma I в буфере Sma I в течение 2 чIn plasmid REZ 103, containing the ADHI promoter as a fragment of Bam I / Xho I length of 1500 p. O. in PES 102 (PES 102 is a derivative that, at the site of the Hinc II cut, contains the linker U Xho 1U, the Bgl II linker is introduced after restriction Sma I (1 μg of plasmid is digested 5 units of Sma I in Sma I buffer for 2 h

течение 10 мин при температуре 65 С и медленно охлаждают до комнатной температуры. По 1/ТО полученного объема подвергают лигированию с 50 разрезанного ХНо I и Xba I вектора (в случае ОП1) или разрезанногоfor 10 min at 65 ° C and slowly cooled to room temperature. The 1 / TO of the obtained volume is ligated with 50 sliced XNO I and Xba I vectors (in the case of OP1) or cut

при 37°С), очистки и выделени . По- 15 лученную таким образом плазмидуat 37 ° C), purification and isolation. Plasmid thus obtained

превращают в плазмиду Р15 #рестрик- нг цией инкубацией с фрагментом Кле- нова и повторным лигированием.Plasmid P15 # is transformed by restriction by incubation with Klenow fragment and re-ligation.

После переваривани  Xho I и HindAfter digesting Xho I and Hind

Xba I и Nco I вектора (в случае ОП2)„ 20 IJI 8 буфере Коре в плазмиду pES103Xba I and Nco I vectors (in the case of OP2) „20 IJI 8 buffer Kore in plasmid pES103

После двойного переваривани  Sea I и Xba I в буфере Коре в течение 2 ч при 37 С, очистки и выделени  разрезанных векторов путем гельэлектрофореза USOD2 и HSOD3 Подвергают лигированию (клонирование олигонук- леотидных пар-ОП1 и ОП2) с получением плазмиды HSODY, которую гидролизугот рестриктазой Nco I, инкубируют с фрагментом Кленова и гидролизуют рестриктазой Eco RI. При этом 5 мкг ДНК инкубируют с 18 ед. Nco I в течение нескольких часов в 50 мкл буфера X при 37°С, разрезанную ДНК очищают гельэлектрофорезом и половину инкубируют с фрагментом Кленова.After double digestion of Sea I and Xba I in Kora buffer for 2 hours at 37 ° C, purification and isolation of the cut vectors by USEL2 and HSOD3 gel electrophoresis. Ligated (cloning oligonucleotide pairs OP1 and OP2) to obtain the HSODY plasmid, which is digested with restriction enzyme Nco I, incubated with a fragment maple and hydrolyzed with restriction enzyme Eco RI. At the same time, 5 μg of DNA is incubated with 18 units. Nco I for several hours in 50 μl of buffer X at 37 ° C, the cut DNA is purified by gel electrophoresis and half is incubated with Klenow fragment.

ДНК очищают гельэлектрофорезом, выдел ют и гидролизуют 7,5 ед. Eco RI в 20. мкл буфера X, еще раз очищают и выдел ют. Плазмидой BS8, содержащей выделенный клон 8 кДНК, трансформируют компетентные клетки E.coli .(штам IM101) и получают плазмиду.The DNA is purified by gel electrophoresis, 7.5 units are isolated and hydrolyzed. Eco RI in 20. µl of buffer X is cleansed and isolated once more. A BS8 plasmid containing the isolated cDNA clone 8 was transformed into competent E. coli cells (strain IM101) and a plasmid was obtained.

10 мкг плазмиды переваривают с 25 единицами Tha I в 0 мкл буфера Thai в течение 8 ч при 6и°С, фрагмент длиной 75У п.о., гидролизуют с помощью ECO RI с последующей очисткой гельэлектрофорезом. Фрагмент Tha I/ /Eco RI объедин ют с плазмидой HSOD4, получа  HSOD6 Плазмида HSOD6 содержит полную кДНК дл  , включа  Met г При этом сохран етс  рамка считывани .10 μg of the plasmid is digested with 25 units of Tha I in 0 μl of Thai buffer for 8 hours at 6 ° C, a fragment of 75 U. p. In length, hydrolyzed with ECO RI, followed by purification using gel electrophoresis. The Tha I / Eco RI fragment is combined with the HSOD4 plasmid to produce HSOD6. The HSOD6 plasmid contains the complete cDNA for, including Metg. The reading frame is thus maintained.

б). Конструкци  экспрессионной кассеты.b). Expression cassette design.

Плазмиду HSOD6 переваривают с Xho I и Eco RI в буфере Коре, вы- детимат фрагмент Xho I и ввод т вPlasmid HSOD6 is digested with Xho I and Eco RI in the Core buffer, excreted the Xho I fragment and introduced into

2525

30thirty

3535

вставл ют синтезированный линкер - Xho I, Eco RI, Xba I, Hind III. Этот линкер имеет следующую последовательность:insert the synthesized linker — Xho I, Eco RI, Xba I, Hind III. This linker has the following sequence:

TCGAGGAATTCTCTAGAATCGAGGAATTCTCTAGAA

CCTTAAGAGATCTTTCGA, В плазмиду р150/1 (после переваривани  Xba I/Hind III в буфере Коре вставл ют терминатор ADHII, получа  плазмиду 150/2. Терминатор ADHII получают следующим образом. Плазмиду pMW5 ADHII переваривают сначала Hind III затем Spn I и фрагмент длиной 605 ПсОо клонируют в вектор VI8 и в место разреза Hindi вставл ют линкер Xba I (CTCTAGAG). Фрагмент Xba I/Sph I длиной 335 п.о. ввод т в pUCIS (pGD2),CCTTAAGAGATCTTTCGA, P150 / 1 plasmid (after digestion of Xba I / Hind III, an ADHII terminator was inserted into the Core buffer, obtaining a 150/2 plasmid. The ADHII terminator was prepared as follows. The Xba I linker (CTCTAGAG) is inserted into the vector of VI8 and the Hindi cut is inserted at the site of the cut.The Xba I / Sph I fragment of 335 bp is introduced into pUCIS (pGD2),

Вектор VI8 получают за счет того, что в pUd8 ввод т линкер Hind III по сайту Sma I. Место мультиклонировани  в VI8 содержит Eco RI, Sst I, Kpn I, Hind III, Bam. HI, Xba I, Sall Pst, Sphl. После переваривани  Xba IThe vector VI8 is obtained by introducing the Hind III linker at Sma I site into pUd8. The site of multi-cloning in VI8 contains Eco RI, Sst I, Kpn I, Hind III, Bam. HI, Xba I, Sall Pst, Sphl. After digesting Xba I

45 и Hind III терминатор ADHII выде- л юто Таким образом, за исключением вводимого через Xho I Eco RI гена плазмида р150/2 содержит необходимые дл  экспрессии гена промотор длиной около 1500 и.о., линкер Xho I длиной 7 п.о, линкер Eco RI длиной. 6 п.о., линкер Xba I длиной 7 п.о., терминатор длиной 329 ПоО. Эти единицы вста л ют через Bam Hi/Hind III в вектор45 and Hind III, the ADHII terminator is isolated. Thus, except for the p150 / 2 plasmid introduced through Xho I Eco RI, it contains the promoter of about 1500 i.e., 7 p.o linker, the linker Eco RI long. 6 bp, linker Xba I, 7 bp long, terminator, 329 PoO length. These units are inserted through Bam Hi / Hind III into the vector

55 . В получаемой плазмиде рКН1 замен ют промотор ADHI на укороченны промотор ADHIk из фрагмента Bam HI/ /Xho I (длиной Й12 п.о.) плазмиды рКН2.55. In the resulting plasmid pKH1, the ADHI promoter is replaced with the shortened ADHIk promoter from the Bam HI / / Xho I fragment (H12 bp long) of the pKH2 plasmid.

4040

5050

i6io i6io

плаэмиду PKHI, соответственно РКН2 через Xho I/Eco RI.plamid PKHI, respectively PKN2 through Xho I / Eco RI.

В плазмиду РЕЗ 103, содержащую промотор ADHI в качестве фрагмента Bam I/ Xho I длиной 1500 п.о. в PES 102 (PES 102 представл ет собой производное , которое в месте разреза Hinc II содержит линкер Ю Xho 1У, ввод т линкер Bgl II  осле рестрикции Sma I (1 мкг плазмиды подвергают перевариванию 5 ед. Sma I в буфере Sma I в течение 2 чIn plasmid REZ 103, containing the ADHI promoter as a fragment of Bam I / Xho I length of 1500 p. O. in PES 102 (PES 102 is a derivative that, at the site of the Hinc II cut, contains the linker U Xho 1U, the Bgl II linker is introduced after restriction Sma I (1 μg of plasmid is digested 5 units of Sma I in Sma I buffer for 2 h

при 37°С), очистки и выделени . По- 15 лученную таким образом плазмидуat 37 ° C), purification and isolation. Plasmid thus obtained

превращают в плазмиду Р15 #рестрик- цией инкубацией с фрагментом Кле- нова и повторным лигированием.was transformed into plasmid P15 # by restriction by incubation with Klenow fragment and repeated ligation.

После переваривани  Xho I и HindAfter digesting Xho I and Hind

5five

00

5five

вставл ют синтезированный линкер - Xho I, Eco RI, Xba I, Hind III. Этот линкер имеет следующую последовательность:insert the synthesized linker — Xho I, Eco RI, Xba I, Hind III. This linker has the following sequence:

TCGAGGAATTCTCTAGAATCGAGGAATTCTCTAGAA

CCTTAAGAGATCTTTCGA, В плазмиду р150/1 (после переваривани  Xba I/Hind III в буфере Коре) вставл ют терминатор ADHII, получа  плазмиду 150/2. Терминатор ADHII получают следующим образом. Плазмиду pMW5 ADHII переваривают сначала Hind III затем Spn I и фрагмент длиной 605 ПсОо клонируют в вектор VI8 и в место разреза Hindi вставл ют линкер Xba I (CTCTAGAG). Фрагмент Xba I/Sph I длиной 335 п.о. ввод т в pUCIS (pGD2),CCTTAAGAGATCTTTCGA, P150 / 1 plasmid (after digestion of Xba I / Hind III in Kore buffer), an ADHII terminator was inserted to obtain plasmid 150/2. The ADHII terminator is prepared as follows. The pMW5 ADHII plasmid was first digested with Hind III, then Spn I, and a fragment of 605 PsOo cloned into vector VI8 and the Xba I linker (CTCTAGAG) was inserted at the site of the Hindi cut. Fragment Xba I / Sph I length 335 p. introduced into pUCIS (pGD2),

Вектор VI8 получают за счет того, что в pUd8 ввод т линкер Hind III по сайту Sma I. Место мультиклонировани  в VI8 содержит Eco RI, Sst I, Kpn I, Hind III, Bam. HI, Xba I, Salll, Pst, Sphl. После переваривани  Xba IThe vector VI8 is obtained by introducing the Hind III linker at Sma I site into pUd8. The site of multi-cloning in VI8 contains Eco RI, Sst I, Kpn I, Hind III, Bam. HI, Xba I, Salll, Pst, Sphl. After digesting Xba I

5 и Hind III терминатор ADHII выде- л юто Таким образом, за исключением вводимого через Xho I Eco RI гена плазмида р150/2 содержит необходимые дл  экспрессии гена промотор длиной около 1500 и.о., линкер Xho I длиной 7 п.о, линкер Eco RI длиной. 6 п.о., линкер Xba I длиной 7 п.о., терминатор длиной 329 ПоО. Эти единицы вставл ют через Bam Hi/Hind III в вектор5 and Hind III, the ADHII terminator is isolated. Thus, with the exception of the p150 / 2 plasmid introduced through Xho I Eco RI, it contains the promoter of about 1500 pp length, the 7 pb linker, the linker Eco RI long. 6 bp, linker Xba I, 7 bp long, terminator, 329 PoO length. These units are inserted through Bam Hi / Hind III into the vector

5 . В получаемой плазмиде рКН1 замен ют промотор ADHI на укороченный промотор ADHIk из фрагмента Bam HI/ /Xho I (длиной Й12 п.о.) плазмиды рКН2.five . In the resulting plasmid pKH1, the ADHI promoter is replaced with the shortened ADHIk promoter from the Bam HI / / Xho I fragment (length H12 bp) of the plasmid pKH2.

00

00

1313

В обе плазмиды вставл ют по сайтам Xho I/Eco RI полный ген кДНК, вырезанный из HSOD6,, Получаемые плазмиды HSOD7/1 и HSOD7/2 отличаютс  друг от  руга только различными промоторами ADHI и ADHIk, После двойного переваривани  Bglll/Hind III и выделени  экспрессионных фрагментов изготовленные экспрессионные кассеты вставл ют в соответственно подготовленные дрожжевые трансформационные векторы YHp13 (ATCC 37 115 PIDB207 (DSM J181) pEAS102 YIpb (ATCC ) через места разреза Bam HI и Hind III,In both plasmids, the complete cDNA gene cut out from HSOD6, is inserted into the Xho I / Eco RI sites. The resulting plasmids HSOD7 / 1 and HSOD7 / 2 differ from each other only by different ADHI and ADHIk promoters. After double digestion of Bglll / Hind III and isolation expression fragments manufactured expression cassettes are inserted into respectively prepared yeast transformation vectors YHp13 (ATCC 37 115 PIDB207 (DSM J181) pEAS102 YIpb (ATCC)) through the cut sites of Bam HI and Hind III,

Пример. Получение пригодного дл  экспрессии дрожжевого мутанта .Example. Preparation of the yeast mutant suitable for expression.

Ген дрожжевого мутанта содержитс  в качестве фрагмента Bam HI в векторе PL41. После рестрикции Bam HI фрагмент длиной п„о. очищают гельэлектрофорезом,, выдел ют и субклонируют по сайту Bam HI в вектор VO.The yeast mutant gene is contained as a Bam HI fragment in vector PL41. After restriction Bam HI fragment of length n "o. cleaned by gel electrophoresis, are isolated and subcloned by the Bam HI site into the VO vector.

Вектор VO получают за счет того, что%1 мкг pVC18 гидролизуют рестрик- тазой Hind in, фрагмент выдел ют из гел , выступающие концы пополн ют полимеразой Кленова и лигируют лигазойThe VO vector is obtained due to the fact that% 1 µg of pVC18 is hydrolyzed with Hind in restriction enzyme, the fragment is isolated from the gel, the protruding ends are supplemented with Klenow polymerase and ligated with ligase

Полученную плазмиду SODY1 превращают в SODYJ путем гидролиза рест- риктазой Nrv1 и встраиванием линкера Hind III (CAAGCTTG). В место разреза вставл ют ген URA3, полученный из pURA3. SODY3 переваривают с Hind III идефосфорилируют в следующих услови х , К 0 мкл реакционной смеси добавл ют 0 мкл hjO, 10 мкл 1 мМ ЭДТУ 5 мкл трис-HCl, рН 9,5, 1 мкл 100 мМ спермидина и 1 мкл (1 мг/мл ) щелочной фосфатазы кишечника теленка (ФТК) и инкубируют при 36°С. По истечении 15 мин еще раз добавл ют 1 мкл ФТК и инкубируют в течение 15 мин. Дефосфорилированный вектор очищают электрофорезом в агаровом геле. 2 мкг плазмиды pVRA3 режут Hind III и фрагмент длиной 1,2 т.п.о содержащий дрожжевой ген VRA3, выдел ют и вставл ют в подготовленный вектор.The resulting SODY1 plasmid is converted to SODYJ by hydrolysis with Nrv1 restriction enzyme and insertion of the Hind III linker (CAAGCTTG). The URA3 gene obtained from pURA3 is inserted into the incision site. SODY3 was digested with Hind III and idephosphorylated under the following conditions. To a 0 µl reaction mixture, 0 µl hjO, 10 µl 1 mM EDTA, 5 µl Tris-HCl, pH 9.5, 1 µl 100 mM spermidine and 1 µl (1 mg / ml) calf intestine alkaline phosphatase (FTC) and incubated at 36 ° C. After 15 minutes, 1 µl of PTK is added again and incubated for 15 minutes. The dephosphorylated vector is purified by agar gel electrophoresis. 2 µg of pVRA3 plasmid was cut with Hind III and the 1.2 kb fragment, containing the yeast VRA3 gene, was isolated and inserted into the prepared vector.

Получаемые таким ооразом плазмиды SODY7 и SOUY8 содержат ген UKA3 в дрожжевом гене Mn-Д и различаютс  ориентацией гена UKA относительно ,гена Мп-ДThe plasmids SODY7 and SOUY8 produced by this oraoma contain the UKA3 gene in the yeast Mn-D gene and are distinguished by the orientation of the UKA gene relative to the Mn-D gene.

,  ,

10ten

1515

2020

2525

30thirty

3535

4040

4545

5050

610I610I

Ориентацию гена URA3 относительно, гена Mn-Л можно устанавливать, так как ген URA3 содержит асимметричное место Pst IoThe orientation of the URA3 gene is relative; the Mn-L gene can be established, since the URA3 gene contains an asymmetric Pst Io location.

Плазмидой SODY7 и SODY8 трансформируют штамм DBY 7 7 (генотип а, leu 2, his 3, trpl, ura3) следующим образом. 2 мкг SODY7 и SODY8 режут 50 ед. Bam HI в 200 мкл буфера Bam HI (150 мМ NaCl, 6 мМ трис-НС1, рН 7,9, 6 мМ MgCIa, 1 мМ ДТТ) и всю смесь (без отделени  части pUC) экстрагируют фенолом и осаждают этанолом . ДНК раствор ют в воде и используют дл  трансформации дрожжей.Plasmid SODY7 and SODY8 transform the strain DBY 7 7 (genotype a, leu 2, his 3, trpl, ura3) as follows. 2 micrograms of SODY7 and SODY8 cut 50 units. Bam HI in 200 µl of Bam HI buffer (150 mM NaCl, 6 mM Tris-HCl, pH 7.9, 6 mM MgCIa, 1 mM DTT) and the entire mixture (without separating part of the pUC) is extracted with phenol and precipitated with ethanol. The DNA is dissolved in water and used to transform the yeast.

Трансформанты выращивают в среде SC-VRA в течение ночи при 28°С. Клетки отдел ют центрифугированием, разрушают и исследует на содержание в них Mn-Д/ При этом дл  определени Transformants are grown in SC-VRA medium overnight at 28 ° C. The cells were separated by centrifugation, destroyed and examined for the content of Mn-D /. In order to determine

Mn-Д, с одной стороны, и Cu/Zn fl, с другой стороны, работают по известным методикам с использованием гель- электрофореза путем разделени  протеинов с последующим окрашиванием нитросиник тетразолием,, Повысить чувствительность можно путем окрашивани  дианизидино м„ Дл  обеспечени  дальнейшего анализа примен ют спектрометрический метод с использованием щелочного диметилсульфоксида в качестве выдел ющей кислород системы и цитохрома С в качестве восстановител , Мп Л и Cu/Zn-Д можно различать путем добавлени  KCNt Штаммы SUDY/72, SODY7/6, SODY7/8 и SODY7/10 не про вл ют активности Мп-Д.Mn-D, on the one hand, and Cu / Zn fl, on the other hand, work by known methods using gel electrophoresis by separating proteins, followed by staining with nitrosinic tetrazolium,. Sensitivity can be increased by staining with dianisidine spectrometric method using alkaline dimethyl sulfoxide as an oxygen-releasing system and cytochrome C as a reducing agent, Mp L and Cu / Zn-D can be distinguished by adding KCNt Strains SUDY / 72, SODY7 / 6, SODY7 / 8 and SODY7 / 10 show activity Mn-D.

П р и м е р 8, Получение экспрессионных векторов.PRI me R 8, Obtaining expression vectors.

Из плазмид HSOD7/1 и HSOD7/2 вырезают фрагменты Bg III Hind III. Плазмиды YEp13, pIDB и pEAS 102 также гидролизуют Hind III и Bam HI о По 50 мкг векторной ДНК и 200 мкг вставки лигируют и трансформируют в штамм E.coli HB 101Plasmids HSOD7 / 1 and HSOD7 / 2 cut out the Bg III Hind III fragments. Plasmids YEp13, pIDB and pEAS 102 also hydrolyze Hind III and Bam HI o 50 μg of vector DNA and 200 μg of the insert are ligated and transformed into E. coli HB 101 strain

В табл,1 приведено обозначение соответствующих плазмид.Table 1 shows the designation of the corresponding plasmids.

5555

Таблица 1 Вектор (Вставка HSOD7/1 IHSOD7/2Table 1 Vector (Insert HSOD7 / 1 IHSOD7 / 2

IIII

pWS 550A pWS 490A pVV 491ApWS 550A pWS 490A pVV 491A

pVV 371A pWS 372A pWS 373ApVV 371A pWS 372A pWS 373A

Примеру, Получение пригодного дл  трансформации дрожжевого штамма (WS30-5g).For example, Preparation of a yeast strain suitable for transformation (WS30-5g).

Получают дрожжевой штамм, который кроме описанных дл  штамма SOUY/2 генетических маркеров, дополнительно содержит мутацию в одной из лизосо- мальных основных протеаз и, таким образом, при разрушении дрожжевых клеток выдел ет меньше протеаз.A yeast strain is obtained, which in addition to the genetic markers described for the SOUY / 2 strain, additionally contains a mutation in one of the lysosomal basic proteases and, thus, when yeast cells are destroyed, they release less proteases.

Дл  этого дефицитный -Mn-Д штамм SODY7/2 скрещивают с дефицитным по протеазам штаммом (a, Ieu2, his3, trpt, ura3, рер4) „ Штамм WS30-5g можно трансформировать, он отвечает соответствующим требовани мFor this, the deficient -Mn-D strain of SODY7 / 2 is crossed with the protease-deficient strain (a, Ieu2, his3, trpt, ura3, pep4) “The strain WS30-5g can be transformed, it meets the relevant requirements

Такие скрещивани  можно с успехом осуществл ть с другими известными дрожжевыми штаммами, например, с 20 В-12.Such crosses can be successfully performed with other known yeast strains, for example, with 20 V-12.

Пример 10. Трансформаци  дрожжей и экспресси  в дрожжах.Example 10. Yeast transformation and expression in yeast.

Штамм SODY/2 трансформируют плаз- мидами pWS371A, pWS372A n pWS373A. Трансформанты исследуют на экспрессию . Трансформанты выращивают в жидкой среде SC-lleu при встр хивании. ( 100 мкл культуры инокупируют в k мл YP5%D (% дрожжевого экстракта, 2% пептона, 5% глюкозы) и выращивают в течение ночи, клетки отдел ют и расщепл ют согласно примеру 7. На активирующий гель нанос т такое количество сырой жидкости клеток, ко- торое соответствует 1 мл культуры. Опыт по определению активности провод т по примеру 7о IThe SODY / 2 strain is transformed with plasmids pWS371A, pWS372A n pWS373A. Transformants are examined for expression. Transformants are grown in liquid SC-lleu with shaking. (100 µl of the culture is inoculated into k ml of YP5% D (% yeast extract, 2% peptone, 5% glucose) and grown overnight, the cells are separated and split according to example 7. Such amount of crude liquid is applied to the activating gel which corresponds to 1 ml of culture. The activity determination test is carried out according to example 7o I

Дрожжевой штамм WS30-5g (Ieu2,Yeast strain WS30-5g (Ieu2,

his3, trpl, pep4, sodt) также трансформируют плазмидами pWS550A, pWS490A, PW491A,his3, trpl, pep4, sodt) also transform with plasmids pWS550A, pWS490A, PW491A,

Измеренное в дрожжах в этих ус- , лови х количество-Мп-Д соответствуетMeasured in yeast in these conditions, the amount of Mn-D corresponds to

примерно 0,5 мг/л культуры.approximately 0.5 mg / l of culture.

Пример Т1„ Синтез линкера.Example T1 “Linker synthesis.

Изготавливают шесть различных олигонуклеотидов EBI656, EBI636, EBI643, ЕВ1643 ЕВ1646, EBI660 и EBI638 со следующей последовательностью и длинойSix different oligonucleotides EBI656, EBI636, EBI643, EB1643 EB1646, EBI660 and EBI638 are made with the following sequence and length

EBJ, 5EBJ, 5

656:.656:

TCOAGTATACMTGTTCGCGAAAACAGCTGCAGCTAATTTATCOAGTATACMTGTTCGCGAAAACAGCTGCAGCTAATTTA

EBI 536: 5EBI 536: 5

TCTTGGTTAAATTAGCTGCAGCTGTTTTCGCGAACATTGTATAC -TCTTGGTTAAATTAGCTGCAGCTGTTTTCGCGAACATTGTATAC -

М п.о.M p.

EBI 643: 5EBI 643: 5

AACAAGMGGGTGGTTTGTCATTGCTCTCCACCACAGGAAGGAGAACCAACAAGMGGGTGGTTTGTCATTGCTCTCCACCACGAGAGGAAC

W п.о.W p.

EBI 646: .5EBI 646: .5

Г AGTGCTTGGTTCTCCTTGCTGTGGTGGAGAGCAATGACAAACCACCCT , EBI 660: ЦВ п.о.Mr. AGTGCTTGGTTCTCCTTGCTGTGGTGGAGAGCAATGACAAACCACCCT, EBI 660: CV b.

3  3

AAGUACTCTTTGCCAGACTTGCCATACGAGTACGGTGCT EBI 638:,„ п .AAGUACTCTTTGCCAGACTTGCCATACGAGTACGGTGCT EBI 638 :, „p.

/JJ П.О./ JJ P.O.

CTAGAGCACCGTAGTCGTATGGCAAGTCTGGCAAAGCTAGAGCACCGTAGTCGTATGGCAAGTCTGGCAAAG

36 п.о.36 b.p.

Олигонуклеотиды EBI636, EBI643, EBI646 и EBI660 фосфорилируют с 5 -концов в следующих услови х.Oligonucleotides EBI636, EBI643, EBI646 and EBI660 are phosphorylated from the 5 ends under the following conditions.

Исходна  реакционна  смесь № 1 содержит 2 мкл EBI 636 (100 пмоль), 1 амкл Юхлинкерного буфера киназы, 3 мк  10 мМ АТР, 1 мкл Т -полинукThe initial reaction mixture No. 1 contains 2 µl of EBI 636 (100 pmol), 1 amkl of Juchlinker kinase buffer, 3 µm of 10 mM ATP, 1 µl of T-Polynuk

33

4141

ПгО .Pgo.

33

33

W п.о.W p.

33

леотидкиназы (10 ед./мкл), 3 мкл воды.leotidkinase (10 units / μl), 3 μl of water.

Исходна  реакционна  смесь V2 аналогична- смеси N t, но с 2 мкл (100 пмоль EBI 660.The initial reaction mixture V2 is similar to the mixture Nt, but with 2 μl (100 pmol EBI 660.

Исходна  реакционна  смесь If 3 содержит 2 мкл олигонуклеотида EBI 643The initial reaction mixture of If 3 contains 2 µl of EBI 643 oligonucleotide

лигазы ДНК (7 ед./мкл). Реакцию осуществл ют а течение 15 ч при .DNA ligase (7 units / μl). The reaction is carried out a for 15 hours at.

ДНК раздел ют в 1%-ном агарозном геле и фрагмент ДНК длиной 128 п.о. выдел ют из гел  путем элюцииThe DNA was separated on a 1% agarose gel and the DNA fragment was 128 bp long. isolated from the gel by elution

П р и м е р 12, Конструкци  экс- рессионных векторов.PRI me R 12, Construction of expression vectors.

Плазмиду HSOD6 переваривают рест (100 пмоль), 1 мкл Шлинкерного буфера киназы,. 3 мкл 10 мМ АТР, 1 мкл Тй-полинуклеотидкинэзы (10 ед./ /мкл, 1 мкл воды)„Plasmid HSOD6 was digested with rest (100 pmol), 1 μl of kinkase Schlinker buffer ,. 3 μl of 10 mM ATP, 1 μl of Tp-polynucleotide kinase (10 units / μl, 1 μl of water) „

10 линкерный буфер киназы состоит из 0,7 М трис-HCl, рН 7,6, 0,1 М , MgClj, 0,05 М ДТТ.10 kinase linker buffer consists of 0.7 M Tris-HCl, pH 7.6, 0.1 M, MgCl, 0.05 M DTT.

Реакцию осуществл ют в течениеThe reaction is carried out for

30 мин при 37°С. Затем Т -полинуклео- ю риктазами Xho I и ХЬа I и вставл ют тидкиназу инактивируют путем нагрева в нее линкер длиной 128 и.о. (Xho I - до 100°С.митохондриальный лидер - ХЬа I) иэОлигонуклеотиды EBI 656 и EBI 638, вестным методом (pE022-Ah Ген чМп-Л, которые образуют 5 -концы готовой снабженный митохондриальной дрожжевой вставки ДНК длиной 128 п.о, t5 лидерной последовательностью ДНК,30 min at 37 ° C. Then, T-polynucleotide with Xho I and XBa I rithases and inserted tidkinase inactivate by heating into it a linker of a length of 128 and. (Xho I - up to 100 ° C. The mitochondrial leader is XBa I) and the EBI 656 and EBI 638 oligonucleotides, by the well-known method (pE022-Ah Gene hMp-L, which form the 5 ends of the finished DNA supplied with a mitochondrial yeast insert 128 bp in length, t5 leader DNA sequence

р Т1 подвергают двойному перевариваниюp T1 is subjected to double digestion

xh° „Xho I и Eco RI и через Xho I - Eco RIxh ° „Xho I and Eco RI and through Xho I - Eco RI

5 л5 l

СтартStart

вставл ют в рКН1 (рЕ023 А). TCGAGTAfACAATGTTCGCGAAAACAGCTGCAGCTAA Изготовленную таким образом экс- CATATGTTACAAGCGCTTTTGTCGACGTCGATT20 прессионную кассету вставл ют аналогично примеру 8 через Bgl II/Hind III TTTAACCAAGAAGGGTGGTTTGTCATTGCTC AAATTGGTTCTTCCCACCAAACAGTAACGAGinserted into pKH1 (pE023 A). TCGAGTAfACAATGTTCGCGAAAACAGCTGCAGCTAA The thus prepared ex-CATATGTTACAAGCGCTTTGTGACGTCGATT20 press cassette is inserted in a manner analogous to Example 8 via the Bgl II / Hind III TTTAACCAAGAAGGGTGGTTTTTTTTTCTTTCTTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTGTGTGTTAGTAGTAATAACTAAAACACACTAGTGAGCCAAAACAGCTGCAGCCTAA.

в дрожжевые трансформационные векторы. YEpl3 pIDB207 и pEAS102 по сайтам Вага HI и Hind III,into yeast transformation vectors. YEpl3 pIDB207 and pEAS102 on Waga HI and Hind III sites,

ЛизинLysine

TCCACCACAGCAAGGAGAACCAAGCACTCTTT AGGTGGTGTCGTTCCTCTTGGTTCGTGAGAAA ITCCACCACAGCAAGGAGAACCAAGCACTCTTT AGGTGGTGTCGTTCCTCTTGGTTCGTGAGAAA I

GCCAGACTTGCCATACGACTACGGTGCT 3 CGGTCTGAACGGTATGCTGATGCCACGAGCCAGACTTGCCATACGACTACGGTGCT 3 CGGTCTGAACGGTATGCTGATGCCACGA

Xba IXba I

не фосфорилируют, чтобы избежать образовани  мультимерных вставок ДНК на последующей стадии реакции лигирова- ни .do not phosphorylate to avoid the formation of multimeric DNA inserts in the subsequent ligation reaction stage.

Линкер конструируют из отдельных олигонуклеотидов по схеме:The linker is constructed from individual oligonucleotides according to the scheme:

5 Щ656 Р ЕВ|6АЗ JLI5I6.6. 35 Shch656 P EB | 6AZ JLI5I6.6. 3

3 55Ш6... LJIIi6.6. Ј 1§1§38 53 55Ш6 ... LJIIi6.6. Ј 1§1§38 5

К реакционной смеси № 1 добавл ют 2 мкл (100 пмоль) EBI656, а к реакционной смеси № 2 - 2 мкл EBI 6382 µl (100 pmol) of EBI656 is added to the reaction mixture No. 1, and 2 µl of EBI 638 to the reaction mixture No. 2

25 Лример13° Трансформаци  дрожжей и экспресси  в дрожжах,25 Lreemer13 ° Transformation of yeast and expression in yeast,

Дрожжевой штамм WS30-5g (пример трансформируют полученными плаэмида ми и трансформанты исследуют на их Yeast strain WS30-5g (an example is transformed with the resulting plasmids and transformants are examined for their

30 экспрессию (пример 10),30 expression (example 10),

Штамм WS30-5g выращивают в культуре следующего состава, г/л: дрожжевой экстракт 6,7; глюкоза 10; аргинин 0,16; лизин 0,25; триптофанStrain WS30-5g grown in a culture of the following composition, g / l: yeast extract 6,7; glucose 10; arginine 0.16; lysine 0.25; tryptophan

35 0,06; метионин 0,08; цистеин 0,03 гистидин 0,10; тирозин 0,16; фенйл- аланин 0,17; треонин 0,16; изолейци на 0,18; валин 0,21; глутаминова  кислота 0,0; глицин 0,21; цистеин35 0.06; methionine 0.08; cysteine 0.03 histidine 0.10; tyrosine 0.16; fenil-alanine 0.17; threonine 0.16; isoleucus by 0.18; valine 0.21; glutamic acid 0,0; glycine 0.21; cysteine

40 0,02; эланин 0,15; аспарагинова  кислота 0,20; пролин 0,20; серин 0,15; аспарагин 0,10; глутамин 0,20 аденин 0,025; урацил 0,050, Процесс выращивани  осуществл ют при аэра (100 пмоль) и провод т реакцию гиб- 45 ции до достижени  оптической плотридизации олигонуклеотидов друг с другом,40 0.02; Alanin 0.15; aspartic acid 0.20; proline 0.20; serine 0.15; asparagine 0.10; glutamine 0.20 adenine 0.025; uracil 0.050, the growing process is carried out at an aera (100 pmol) and a gibration reaction is carried out until optical oligonucleotides are optically reached with each other,

В исходной реакционной смеси содержатс  уже 2 комплементарных олигонуклеотида (EBI 643, EBI 646). 3 смеси нагревают в течение 2 мин при 100 С и медленно охлаждают.Already 2 complementary oligonucleotides are present in the initial reaction mixture (EBI 643, EBI 646). 3 mixtures are heated for 2 minutes at 100 ° C and slowly cooled.

Получаемые в реакци х № 1 - 3 короткие двухнитевые фрагменты ДНК литируют друг с другом следующим образом: 10 мкл смеси №1 (EBI 636 + EBI 656)| 10 мкл смеси № 2 (EBI 660 EBI 638)} 10 мкл смеси К 3 (EBI 643 EBI 646); 3 мкл 10 мМ АТР; 1 мклThe short double-stranded DNA fragments obtained in reactions No. 1–3 are lithiated with each other as follows: 10 µl of Mixture No. 1 (EBI 636 + EBI 656) | 10 μl of mixture No. 2 (EBI 660 EBI 638)} 10 μl of mixture K 3 (EBI 643 EBI 646); 3 μl of 10 mM ATP; 1 µl

лигазы ДНК (7 ед./мкл). Реакцию осуществл ют а течение 15 ч при .DNA ligase (7 units / μl). The reaction is carried out a for 15 hours at.

ДНК раздел ют в 1%-ном агарозном геле и фрагмент ДНК длиной 128 п.о. выдел ют из гел  путем элюцииThe DNA was separated on a 1% agarose gel and the DNA fragment was 128 bp long. isolated from the gel by elution

П р и м е р 12, Конструкци  экс- рессионных векторов.PRI me R 12, Construction of expression vectors.

Плазмиду HSOD6 переваривают рестриктазами Xho I и ХЬа I и вставл ют в нее линкер длиной 128 и.о. (Xho I - митохондриальный лидер - ХЬа I) иэвставл ют в рКН1 (рЕ023 А). Изготовленную таким образом экс- прессионную кассету вставл ют аналогично примеру 8 через Bgl II/Hind III Plasmid HSOD6 was digested with Xho I and XBa I restrictases and inserted into it a linker 128 long, i.e. (Xho I is the mitochondrial leader — XBa I) and inserted into pKH1 (pE023 A). The expression cassette thus prepared is inserted as in Example 8 via Bgl II / Hind III.

в дрожжевые трансформационные векторы. YEpl3 pIDB207 и pEAS102 по сайтам Вага HI и Hind III,into yeast transformation vectors. YEpl3 pIDB207 and pEAS102 on Waga HI and Hind III sites,

Лример13° Трансформаци  дрожжей и экспресси  в дрожжах,Lrimer13 ° Yeast transformation and expression in yeast,

Дрожжевой штамм WS30-5g (пример 9) трансформируют полученными плаэмида- ми и трансформанты исследуют на их The yeast strain WS30-5g (Example 9) is transformed with the resulting plamides and the transformants are examined for their

экспрессию (пример 10),expression (example 10),

Штамм WS30-5g выращивают в культуре следующего состава, г/л: дрожжевой экстракт 6,7; глюкоза 10; аргинин 0,16; лизин 0,25; триптофанStrain WS30-5g grown in a culture of the following composition, g / l: yeast extract 6,7; glucose 10; arginine 0.16; lysine 0.25; tryptophan

0,06; метионин 0,08; цистеин 0,03 гистидин 0,10; тирозин 0,16; фенйл- аланин 0,17; треонин 0,16; изолейци- на 0,18; валин 0,21; глутаминова  кислота 0,0; глицин 0,21; цистеин0.06; methionine 0.08; cysteine 0.03 histidine 0.10; tyrosine 0.16; fenil-alanine 0.17; threonine 0.16; isoleucine 0.18; valine 0.21; glutamic acid 0,0; glycine 0.21; cysteine

0,02; эланин 0,15; аспарагинова  кислота 0,20; пролин 0,20; серин 0,15; аспарагин 0,10; глутамин 0,20; аденин 0,025; урацил 0,050, Процесс выращивани  осуществл ют при аэра0.02; Alanin 0.15; aspartic acid 0.20; proline 0.20; serine 0.15; asparagine 0.10; glutamine 0.20; adenine 0.025; Uracil 0.050, the growing process is carried out with aera

ности 0,01 при нм с испбльзо- ванием магнитной мешалки0.01 at nm with the use of a magnetic stirrer

Основную культуру состава: 8,0 г/ /л {Ш4)г.504; 2,56 г/л (The main culture of the composition: 8.0 g / / l {Ш4) g. 504; 2.56 g / l (

1,16 г/л КС1; 0,60 г/Л MgS04-7H20;1.16 g / l KC1; 0.60 g / L MgS04-7H20;

0,56 г/л СаС12«2Н20; 0,04 мг/л биотина; 80 мг/л м-инозита; 40 мг/л Са- пантотената; 8 мг/л тиамина; 2 мг/л пиридоксина; 3,1 мг/л CuS040.56 g / l of CaC12 "2H20; 0.04 mg / l biotin; 80 mg / l m-inositol; 40 mg / l Sapantothenate; 8 mg / l thiamine; 2 mg / l pyridoxine; 3.1 mg / l CuS04

Х5НгО; 19 мг/л FeCl3 6HZ0; 12 мг/л ZnSO4 7%0; 14мг/л MnS04 HzO; 3 мг/ /л Ы3бО,; 1 мг/л KI; 2 мг/л Na2MgS04x 2НгО; -1 г/л дрожжевого экстракта ; 0,2 г/л урацила; 0,1 г/л аденина;H5Ngo; 19 mg / l FeCl3 6HZ0; 12 mg / l ZnSO4 7% 0; 14mg / l MnS04 HzO; 3 mg / l Y3bO; 1 mg / l KI; 2 mg / l Na2MgS04x 2HgO; -1 g / l yeast extract; 0.2 g / l uracil; 0.1 g / l adenine;

19nineteen

10ten

0,5 г/л литонной кислоты; 15 г/л ) глутаминраой кислоты; 0,2 г/л гис- тидина; 0,5 г/л триптофана; 100 г/л глюкозы, получают в ферментере емкостью 20 л. В качестве инокул та используют 5% количества предварительной . Выращивание осуществл ют аэрацией при размешивании (100 об/мин) и посто нном значении рН 5,0 при 28°С.0.5 g / l of litonic acid; 15 g / l) glutamine acid; 0.2 g / l of histidine; 0.5 g / l tryptophan; 100 g / l glucose, get in a fermenter with a capacity of 20 liters. The inoculum used is 5% of the amount of pretreatment. The cultivation is carried out by aeration with stirring (100 rpm) and a constant pH value of 5.0 at 28 ° C.

После снижени  содержани  глюкозы до 50 г/л еще раз добавл ют 50 г/л глюкозы и продолжают ферментацию до тех пор, пока содержание глюкозы не составит 10 г/л (примерно через kS ч) охлаждают, центрифугируют и биомассу замораживают с Выход биомассы 18 г/л влажных клеток.After reducing the glucose content to 50 g / l, 50 g / l of glucose is added again and the fermentation is continued until the glucose content is 10 g / l (approximately after kS h) is cooled, centrifuged and the biomass is frozen with Biomass yield 18 g / l wet cells.

П р и м е р И с Получение дрожжевых митохондрийPRI me R I C Obtaining yeast mitochondria

Дл  того чтобы установить приводит ли введение дрожжевой мито- хондрйа/тьной лидерной л,оследователь- ности перед геном чМп-Д к импорту протеина в митохондрии, изготовл ют дрожжевые митохондрии и определ ют активность Mn-Д в митохондри х и цитоплазмеIn order to establish whether the introduction of yeast mitochondria / leader leader results in sequencing before the PMP-D gene to import protein into mitochondria, yeast mitochondria are prepared and the activity of Mn-D in mitochondria and cytoplasm is determined.

Культуру выращивают путем встр хивани  (300 об/мин) при 28°С в течение ночи, инокулируют в 225 мл среды YPD и выращивают в указанных услови х в течение ночи. После достижени  оптической плотности 5 - 7 при 6000 нм клетки центрифугируют при 6500 об/мин в течение 5 мин. Клетки промывают водой, суспендируют в1 Мманни-та,.The culture is grown by shaking (300 rpm) at 28 ° C overnight, inoculated into 225 ml of YPD medium, and grown under these conditions overnight. After reaching an optical density of 5-7 at 6000 nm, the cells are centrifuged at 6500 rpm for 5 minutes. Cells are washed with water, suspended in 1 of Manmann ,.

исследовать активность Mn-Д. Красн коричневый, центрифугат промывают б фером (белые цитоплазматические ко поненты выливают) и затем митохонд суспендируют в 2,5 мл того же буфе Загр знени  еще раз удал ют путем центрифугировани  при 000 об/мин течение 5 мин. Митохондрии удал ют из насадочной жидкости путем повто ного центрифугировани  (при 122000 об/мин в течение 10 мин). Митохонд разрушают при помощи стекл нных ша , ри ков и, использу  активирующий ге 15 их исс ледуют на содержание Мп-Д.investigate the activity of Mn-D. Red brown, centrifuged, washed with b fer (white cytoplasmic components are poured out) and then the mitochond is suspended in 2.5 ml of the same buffer. The contaminants are again removed by centrifugation at 000 rpm for 5 minutes. Mitochondria are removed from the packed liquid by repeated centrifugation (at 122000 rpm for 10 minutes). The mitochond is destroyed with the help of glass globes, ricks and, using an activating gene of 15, their studies are examined for the content of Mn-D.

П р и м е р 15. Очистка чМп-Д. - Стади  1: разрушение клеток.PRI me R 15. Cleaning PMC-D. - Stage 1: Cell Disruption.

II

Клетки (пример 13) промывают в 10 мл дистиллированной воды на 1 г влажной массы и центрифугируют при 16000 об/мин в течение 15 мин Оса повторно суспендируют в натриево- калиевом фосфатном буфере (50 мМ, рН 7,0) при соотношении 1:3- Затем клетки разрушают в мельнице при по щи стекл нных шариков диаметром 0,1 мм при расходе 6 л/ч„ Экстракт клеток центрифугируют в течение 30 15 мин (16000 об/мин °С) и осадок удал ютоCells (Example 13) are washed in 10 ml of distilled water per g wet weight and centrifuged at 16000 rpm for 15 minutes. Wasp is resuspended in sodium-potassium phosphate buffer (50 mM, pH 7.0) at a ratio of 1: 3 - Then the cells are destroyed in the mill with glass beads with a diameter of 0.1 mm at a flow rate of 6 l / h. The cell extract is centrifuged for 30–15 min (16000 rpm), and the precipitate is removed

Стади  2: осаждение полиэтилени мином.Step 2: precipitation of polyethylene by min.

К надосадочной жидкости первой ,5 стадии добавл ют 5%-ный водный рас вор полиэтиленимина (рН 8,0) конеч концентрации 0,5& Затем продолжаю размешивать еще в течение 30 мин и осадок удал ют центрифугированиемA 5% aqueous solution of polyethylenimine (pH 8.0) of a final concentration of 0.5 & Then continue stirring for another 30 minutes and the precipitate is removed by centrifugation.

2020

2525

20 мМ КР;(КНгР04/КгНРОл), рН 7,,20 mM KR; (KNgP04 / KgNROL), pH 7 ,,

добавл ют 1 мг/мл цимолазы с мол. мас- 40 ПРИ 1боо° об/мин в течение 30 мин. } сой 500 и 2 ч встр хивают (50 об/мин) при 28 С, получа  сферопласты. Их1 mg / ml tsimolazy mol. MAS- 40 AT 1 ° C / min for 30 minutes. } Soi 500 and 2 hours shake (50 rpm) at 28 ° C to obtain spheroplasts. Their

центрифугируют при 3000 об/мин в течение 5 мин, промывают растворомcentrifuged at 3000 rpm for 5 minutes, washed with a solution

Стади  3: осаждение путем термо обработки сStage 3: deposition by heat treatment with

Надосадочную жидкость второй ста дии при перемешивании нагревают доThe supernatant of the second stage with heating is heated to

1 М маннита, 20 мМ КР; , рН 7,, 1 мМ 45 6 О С в вод ной бане с температурой1 M mannitol, 20 mM CR; , pH 7 ,, 1 mM 45 6 О С in a water bath with temperature

„ . . . ОпО Г . w “. . . OP G. w

фторида фенилметилсульфонила (ФФМС) Надосадочную жидкость удал ют и добавл ют стекл нные шарики диаметром 0,1 мм в количестве, соответствующем 1 - 2 объема промытых клеток.phenylmethylsulfonyl fluoride (FFMS) The supernatant is removed and glass beads with a diameter of 0.1 mm are added in an amount corresponding to 1-2 volumes of the washed cells.

Клетки разрушают, суспендируют в 2,5 мл 0,65 М маннита, 1 мМ ЭДТУК, 1 мМ ФФМС, центрифугируют при 2000 об/мин в течение 5 мин„ Митохондрии выдел ют из надосадочной жидкости путем центрифугировани  при 12000 об/ /мин в течение 10 мин. Надосалоч- на  жидкость содержит цитоплазму и поэтому ее хран т с тем, чтобы потомThe cells are disrupted, suspended in 2.5 ml of 0.65 M mannitol, 1 mM EDTA, 1 mM PFMS, centrifuged at 2000 rpm for 5 minutes. The mitochondria are separated from the supernatant by centrifugation at 12000 rpm for 12 minutes. 10 min. The supernatant contains the cytoplasm and is therefore stored so that

80°С, наход щейс  в стальных стака нах. Затем в лед ной бане охлаждаю до комнатной температуры. Выпавший протеин удал ют центрифугированием 50 ™ об/мин в течение 10 мин пр гС)„80 ° C, located in steel stacks. Then in an ice bath, cool to room temperature. The precipitated protein is removed by centrifuging at 50 ™ rpm for 10 min.

Стади  k: осаждение сульфатом аммони „Stage k: ammonium sulfate precipitation

Надосадочную жидкость стадии 3 55 сыщакгг сульфатом аммони  до 20% и осадок отдел ют центрифугированием О 0000 об/мин в течение 15 мин при 4 С). Затем концентрацию сульфата аммони  повышают до 90$ и осадокThe supernatant of stage 3 is 55 with ammonium sulphate up to 20% and the precipitate is separated by centrifugation (about 0000 rpm for 15 minutes at 4 ° C). Then the concentration of ammonium sulfate is increased to $ 90 and the precipitate

10ten

..

и а ,.and a,

7М610207M61020

исследовать активность Mn-Д. Красно- коричневый, центрифугат промывают буфером (белые цитоплазматические компоненты выливают) и затем митохондрии суспендируют в 2,5 мл того же буфера. Загр знени  еще раз удал ют путем центрифугировани  при 000 об/мин в течение 5 мин. Митохондрии удал ют из насадочной жидкости путем повторного центрифугировани  (при 122000 об/мин в течение 10 мин). Митохондрии разрушают при помощи стекл нных ша- , ри ков и, использу  активирующий гель, 15 их исс ледуют на содержание Мп-Д.investigate the activity of Mn-D. Red-brown, centrifuged washed with buffer (white cytoplasmic components are poured) and then mitochondria are suspended in 2.5 ml of the same buffer. The contaminants are again removed by centrifuging at 000 rpm for 5 minutes. Mitochondria are removed from the packed liquid by re-centrifugation (at 122000 rpm for 10 minutes). Mitochondria are destroyed with the help of glass hats, ribs and, using an activating gel, 15 of them are examined for the content of Mn-D.

П р и м е р 15. Очистка чМп-Д. - Стади  1: разрушение клеток.PRI me R 15. Cleaning PMC-D. - Stage 1: Cell Disruption.

II

Клетки (пример 13) промывают в 10 мл дистиллированной воды на 1 г влажной массы и центрифугируют при 16000 об/мин в течение 15 мин Осадок повторно суспендируют в натриево- калиевом фосфатном буфере (50 мМ, рН 7,0) при соотношении 1:3- Затем клетки разрушают в мельнице при помощи стекл нных шариков диаметром 0,1 мм при расходе 6 л/ч„ Экстракт клеток центрифугируют в течение 30 15 мин (16000 об/мин °С) и осадок удал ютоCells (Example 13) are washed in 10 ml of distilled water per g wet weight and centrifuged at 16000 rpm for 15 minutes. The precipitate is resuspended in sodium-potassium phosphate buffer (50 mM, pH 7.0) at a ratio of 1: 3 - Then the cells are destroyed in the mill using glass beads with a diameter of 0.1 mm at a flow rate of 6 l / h. The cell extract is centrifuged for 30–15 minutes (16000 rpm ° C) and the precipitate is removed

Стади  2: осаждение полиэтилени- мином.Stage 2: precipitation with polyethyleneimine.

К надосадочной жидкости первой ,5 стадии добавл ют 5%-ный водный раствор полиэтиленимина (рН 8,0) конечной концентрации 0,5& Затем продолжают размешивать еще в течение 30 мин и осадок удал ют центрифугированиемTo the supernatant of the first, 5th stage, add a 5% aqueous solution of polyethyleneimine (pH 8.0) with a final concentration of 0.5 & Then continue stirring for another 30 minutes and the precipitate is removed by centrifugation.

2020

2525

ПРИ 1боо° об/мин в течение 30 мин. At 1 ° r / min for 30 min.

Стади  3: осаждение путем термообработки сStage 3: Deposition by Heat Treatment

Надосадочную жидкость второй стадии при перемешивании нагревают доThe supernatant of the second stage is heated to

6 О С в вод ной бане с температурой6 ° C in a water bath with temperature

6 О С в вод ной бане с температурой6 ° C in a water bath with temperature

ОпО Г . wOP G. w

80°С, наход щейс  в стальных стаканах . Затем в лед ной бане охлаждают до комнатной температуры. Выпавший протеин удал ют центрифугированием ™ об/мин в течение 10 мин при гС)„80 ° C in steel glasses. Then in an ice bath, cool to room temperature. The precipitated protein is removed by centrifuging ™ rpm for 10 min at rc).

Стади  k: осаждение сульфатом аммони „Stage k: ammonium sulfate precipitation

Надосадочную жидкость стадии 3 на- сыщакгг сульфатом аммони  до 20% и осадок отдел ют центрифугированием О 0000 об/мин в течение 15 мин при 4 С). Затем концентрацию сульфата аммони  повышают до 90$ и осадокThe supernatant of stage 3 is saturated with ammonium sulfate to 20% and the precipitate is separated by centrifugation (O 0000 rpm for 15 min at 4 ° C). Then the concentration of ammonium sulfate is increased to $ 90 and the precipitate

21172117

отдел ют центрифугированием (10000 об/мин в течение 15 мин при гС), Осадок поглощают в незначительном количестве (50 мМ, рН 6,0) буфера мор- фолиноэтансульфоната - 2-морфолино- этансульфоновой кислоты (буфер МЭС) и диализуют в течение ночи с использованием того же буфера.separated by centrifugation (10,000 rpm for 15 min at gC), the precipitate is absorbed in an insignificant amount (50 mM, pH 6.0) of 2-morpholinoethanesulfonic acid morpholinoethanesulfonate buffer (MES buffer) and dialyzed overnight using the same buffer.

Стади  5: хроматографи  на катио- ните.Stage 5: chromatography on cation exchanger.

Колонку, содержащую катионит мо- но-S-HR 5/5 уравновешивают 5 объемами буфера МЭС. После подачи экстракта наThe column containing the mono-S-HR 5/5 cation exchanger is equilibrated with 5 volumes of MES buffer. After filing the extract on

колонку несв занные протеины промывают объемами буфера МЭС. Затем чМп-,1 элюируют 20 объемами буфера МЭС с линейным градиентом от 0 до 50 мМ NaCl. Фракции, содержащие активность Mn-Д, объедин ют и диали- зуюТ с использованием натриево-ка- лиевого фосфатного буфера (5 мМ, рН 7,0).the column unbound proteins are washed with MES buffer volumes. Then PMPT, 1 is eluted with 20 volumes of MES buffer with a linear gradient from 0 to 50 mM NaCl. The fractions containing the activity of Mn-D are combined and dialysis-T using sodium-potassium phosphate buffer (5 mM, pH 7.0).

Стади  6: хроматографи  на гид- роксилапатите,Stage 6: hydroxylapatite chromatography,

На уравновешенную фосфатным буфером (5 мМ, рН 7,0) колонку гидро силапатита подают диализат стадии и чМп-Д элюируют 20 объемами нат- риево-калиевого фосфатного буфера рН 7,0 с линейным градиентом от 5 до 300 мМ указанных солей. За степенью очистки чМп-Д наблюдают при помощи электрофореза в полиакрил- амид ном геле с использованием ДСН.A phosphate buffer equilibrated with (5 mM, pH 7.0) hydrosilatapite column is supplied to the dialysate of the stage, and the CMP-D is eluted with 20 volumes of sodium-potassium phosphate buffer pH 7.0 with a linear gradient from 5 to 300 mM of the indicated salts. The purity of cpd-D is monitored by polyacrylamide gel electrophoresis using SDS.

В результате очистки получают 21 мг (1,16 мг/клетки) чМпО2-дисмуТЭЗЫоAs a result of the purification, 21 mg (1.16 mg / cell) are obtained. HMnO2-dismuTESYo

Пример1б, Характеристика чМп-Д.Example1b, Characteristics chmp-D.

Очищенную чМп-Д анализируют при помощи жидкостной-гельхроматографии под давлением, жидкостной хроматографии с обратной фазой под давлением, гельэлектрофореза с использованием ДСН, нативного гель- электрофореза и изоэлектрического фокусировани  и сравнивают с естественной чМп-Д.Purified hMAP-D is analyzed using pressure gel chromatography under pressure, reverse phase liquid chromatography under pressure, gel electrophoresis using LTOs, native gel electrophoresis, and isoelectric focusing and compared with natural CMP-D.

а). Жидкостна  гельхроматографил под давлениемbut). Liquid gelchromatografil under pressure

т t

Колонка: Уотерс Протеин Пак I 125,2Х(7,.мм), диаметр частиц гел  10 мкм; элюент: 0,5 М , 0,02 М NaH/jLP04, рН 7,0, 0,04% Теин 20, 25% пропиленгликол ; скорость подачи 0,5 мл/мин; детекци : поглощение УФ, 21 нм„Column: Waters Protein Pak I 125.2X (7, .mm), gel particle diameter 10 microns; eluent: 0.5 M, 0.02 M NaH / jLP04, pH 7.0, 0.04% Thein 20, 25% propylene glycol; feed rate 0.5 ml / min; detection: UV absorption, 21 nm „

2222

Естественна  и получаема  предлагаемым способом чМп-Д показывает главный пик тетрамера энзима при мол. массе 70000 и 76000 соответст0Natural and obtained by the proposed method CMP-D shows the main peak of the enzyme tetramer at mol. mass 70,000 and 76,000 respectively

5five

00

5five

00

л ют с использованием четырех стандартных протеиновоare made using four standard protein proteins.

б). Жидкостна  хроматографи  с обратной фазой под давлением.b). Liquid chromatography with reverse phase under pressure.

Колонка: Бакербонд Bfl , 4,6 t 250 мм, 5 мкм диаметра частиц, диаметр пор: 30 нм; элюент А: 0,1%-на  трифторуксусна  кислота в воде; элюент Б: 0,1%-на  трифторуксусна  кислота в ацетонитриле; градиент: 20% Б в течение 2 мин, 20 - 68% Б в течение 2k мин, 68% Б в течение 10 мин, 68 - 20% Б в течение 1 мин; скорость подачи 1,0 мл/мин; детекци : поглощение УФ, 21ft нм и 280 нм,Column: Backerbond Bfl, 4.6 t 250 mm, 5 μm particle diameter, pore diameter: 30 nm; eluent A: 0.1% trifluoroacetic acid in water; Eluent B: 0.1% trifluoroacetic acid in acetonitrile; gradient: 20% B for 2 min, 20 - 68% B for 2k min, 68% B for 10 min, 68 - 20% B for 1 min; feed rate 1.0 ml / min; detection: UV absorption, 21ft nm and 280 nm,

Естественна  и получаема  предлагаемым способом чМп-ДП про вл ют врем  удерживани  около 21 мин (20,7 и 5 20,9 мин, соответственно),Natural and obtained by the proposed method chimp-DP exhibit a retention time of about 21 minutes (20.7 and 5–20.9 minutes, respectively),

в). Гельэлектрофорез с использованием ДСН,at). Gel electrophoresis using SDS,

Разделительный гель - 15% акрил- амида; стекинг-гель -ft% акриламида; 0 окраска серебром; величина гел  0,75 мм (8хЮ см); режим: 60 мин, 150 В,Separating gel - 15% acrylamide; stacking gel-ft% acrylamide; 0 silver color; gel size 0.75 mm (8 x U cm); mode: 60 min, 150 V,

При подготовке проб дл  чМп-Д пробы смешивают с ДТТ в качестве восстановител  и кип т т. В геле ДСН обнаруживаетс  мономер чМп-Д с мол„. массой около 25000, В зависимости от степени полноты реакции восстановлени  можно доказать также наличие тетрамера с мол, массой около 90000,In the preparation of samples for PMTP, the samples are mixed with DTT as a reducing agent and boiled. In the LTO gel, the CMP D monomer is found with a mole. weighing about 25,000, depending on the degree of completeness of the reduction reaction, the presence of a tetramer with a mole weighing about 90,000 can also be proved,

г), Нативный гельэлектрофорез.g) Native gel electrophoresis.

Разделительный гель - 7,5% поли- акриламидный гель; стекинг-гель - 2% акриламида + сахароза; величина ге- 5 л  0,75 мм ( см); режим: 75 мин, 150 Bj окрашивание кумасси голубым,Separating gel - 7.5% polyacrylamide gel; stacking gel - 2% acrylamide + sucrose; the value of g- 5 liters 0.75 mm (cm); mode: 75 min, 150 Bj Coomassie blue staining,

Получаема  после хроматографии на гидроксилапатите чМп-Д про вл ет после электрофореза как после окра- 0 шивани  кумассисиним (нанесенноеAfter chromatography on hydroxylapatite, cAMP-D, after electrophoresis, appears as after staining with Kumasissin (applied

количество чМп-Д 0,3 мкг), так и после активирующего окрашивани  о-диани- зидином единую и наход щуюс  в том же положении полосуthe amount of chMp-D is 0.3 µg), and after the activating staining with o-dianisidine, a single band in the same position

д). Изоэлектрическое фокусирование ,d). Isoelectric focusing,

Пределы значени  рН 3,5 - 9,5; ге евые пластинки LKB (1 мм( см); электродные растворы: 1 М фосфорна The range of pH values is 3.5-9.5; LKB gay plates (1 mm (cm); electrode solutions: 1 M phosphoric

2323

кислота (анод), 1 М натриевый щелок (катод); температура охлаждени  объем проб 4,0 и 6,5 мкг соответственно; режим: предварительное фокусирование 500 Вч; фокусирование 3000 Вм в-целом;; окраска: кумасси - голубой, о-дианизидйНоacid (anode), 1 M sodium lye (cathode); cooling temperature sample volume of 4.0 and 6.5 µg, respectively; mode: pre-focusing 500 HF; focusing 3000 Wm in general ;; coloring: Kumasi - blue, o-dianizidNo

В качестве изоэлектрической точки определ ют ,15.As the isoelectric point, 15 is determined.

Пример 17 Конструкци  кДНК- генобанка из печеночной ткани человека .Example 17 Constructing a cDNA genobank from human liver tissue.

1717

Реакцию ведут в течение 1 ч при 14°С и прекращают добавлением 5 мкл 250 мН ЭДТУК. Несв занную радиоактивность удал ют на колонке с биогеАналогично примеру 1 из свежей ne-.„„™«,,i, ,Ма.™. па ™j. t ииоге- ченочной ткани (приблизительно 1 кг) Sлем P6-DG. В качестве элюента ис- выдел ют Р.НК, получают поли (А) РНК ипользуют буфер ТЕ. Гибридизацию осу- „, „nut/ п.,.,.,, л „« 1 п.ществл ют согласно примеру 3.The reaction is carried out for 1 h at 14 ° C and stopped by the addition of 5 μl of 250 mN EDTA. Unbound radioactivity is removed on a bio-analog column of Example 1 from fresh ne -. „„ ™ “,, i,, Ma. ™. pa ™ j. t iiogecular tissue (approximately 1 kg) by Plem P6-DG. P.NA was isolated as eluent, poly (A) RNA was obtained, and TE buffer was used. Hybridization of one-, -in-nut / se.,.,., Ln-1 pp is found according to example 3.

Пример 19. Включение мито- хондриальной человеческой лидерной 20 ДНК-последовательности MnOj-дисмута- зы перед геном МпО -дисмутазы.Example 19. Inclusion of the mitochondrial human leader 20 DNA sequence of MnOj dismutase before the MpO -dismutase gene.

Совместной гибридизацией двух синтезированных олигонуклеотидов (EBI 917, EBI 919) получают ДНК- фрагмент длиной 122 п.о. с Xho I/ /Xba I выступающими концами. Этот фрагмент соответствует приведенной в примере 6 формуле ОП1, с той разницей , что между стартовым кодономJoint hybridization of two synthesized oligonucleotides (EBI 917, EBI 919) produces a DNA fragment with a length of 122 bp. with Xho I / / Xba I protruding ends. This fragment corresponds to the formula OP1 given in Example 6, with the difference that between the start codon

синтезируют кДНК. Получениеflgt10- генобанка осуществл ют аналогично примеру t.synthesize cDNA. The preparation of the flgt10 genebank is carried out analogously to example t.

П р и м е р 18о Использование гена Мп02-дисмутазы в качестве ДНК- зонда .PRI me R 18o Using the MnO2 dismutase gene as a DNA probe.

Полна  кДНК гена МпО -дисмутазы (пример 6) используетс  в качестве радиоактивно маркированного ДНК- зонда. 5 мг плазмидной ДНК HSOD6 гидролизуют рестриктазами EcoRI и Xho I. После раздел ют в 1%-ном ага25The complete cDNA of the MpO -dismutase gene (Example 6) is used as a radioactively labeled DNA probe. 5 mg of plasmid HSOD6 DNA is hydrolyzed with restrictase EcoRI and Xho I. After it is separated in 1% aga25

.-.-..I-W f Vf- J % r ,/f4 .-.- .. I-W f Vf- J% r, / f4

розном геле из гел  выдел ют ДНК-фраг-30 АТС и кодоном дл  лизина AAG вклюмент с длиной 600 п.о., содержащий ген- Мп04-дисмутазы, его радиоактивно мет т и используют в качестве ДНК-зонда.DNA frag-30 ATC and a codon for lysine AAG, including a 600 bp length containing the Mn04-dismutase gene, were isolated from the gel from the gel, it was radioactively labeled and used as a DNA probe.

Реакционна  смесь: 5 мкл трансл ционного буфера; 10 мк  ДНКчают человеческую лидерную ДНК-пос- ледовательност ь.Reaction mix: 5 µl translation buffer; 10 uM DNA is generated from human leader DNA sequence.

ДНК -последова тельност ь, сод ержа - ща  вставку с человеческим геном 35 МпО -дисмутазы, имеет следующую . структуру.The DNA sequence containing the 35 MpO -dismutase human gene insert has the following. structure.

Xho IXho I

Pvu IIPvu ii

СтартStart

EBI 9t7 S ICGAGTATACAATGTTGAGCCGGGCAGTGTGCGGCACCAGCAGGCAGCTGCCTCCGEBI 9t7 S ICGAGTATACAATGTTGAGCCGGGCAGTGTGCGGCACCAGCAGGCAGCTGCCTCCG

CATATGTTACAACTCGGCCCGTCACACGCCGTGGTCGTCCGTCGACGGAGGC CATATGTTACAACTCGGCCCGTCACACGCCGTGGTCGTCCGTCGACGGAGGC

EBI 919 3EBI 919 3

LysLys

GTTTTGGGGTATCTGGGeTCCAGGCAGAAGCACTCTTTGCCAGACTTGCCATACGACTACGGTGCT CAAAACCCCATAGACCCGAGGTCCGTCTTCGTGAGAAACGGTCTCAACGGTATGCTGATGCCACGAGTTTTGGGGTATCTGGGeTCCAGGCAGAAGCACTCTTTGCCAGACTTGCCATACGACTACGGTGCT CAAAACCCCATAGACCCGAGGTCCGTCTTCGTGAGAAACGGTCTCAACGGTATGCTGATGCCACGA

Плазмиду HSOD6 гидролизуют рестриктазами Xho I и Xba I и вставл ют линкер с длиной 122 п„о„ (Xhol-чело- веческий митохондриальный лидер - Xba I), Получают плазмиду рКН22-А, переваривают ее pecfpnKTasaMH Xho I и Eco RI (по 5 ед. мкг ДНК) и вставл ют в рКН 1. Получают плазмиду РКН23-А.Plasmid HSOD6 is hydrolyzed with Xho I and Xba I restrictases and inserted with a length of 122 nc (linker) (Xhol-human mitochondrial leader Xba I). The plasmid pKH22-A is prepared, digested with pecfpnKTasaMH Xho I and Eco RI (5 units μg of DNA) and inserted into pKN 1. The plasmid PKH23-A is obtained.

Полученную таким образом экспрес- сионную кассету аналогично примеру 12 по сайтам Bglll/Hind III(после двойного переваривани  плазмид иThe expression cassette thus obtained is analogous to Example 12 at the Bglll / Hind III sites (after double digestion of plasmids and

16102k16102k

фрагмента; 15 мкл0Г Р 1СТР/3000 Cf (ммоль, водный раствор); 1 мкл 1 мМ dATP{ 1 мкл ТТР; 1 мкл 1 мМ dCTP; 5 ед ДНК полимеразы 1; вода до. 50 мкл.fragment; 15 μl 0 G P 1STR / 3000 Cf (mmol, aqueous solution); 1 μl 1 mM dATP {1 μl TTP; 1 μl 1 mM dCTP; 5 units of DNA polymerase 1; water up to. 50 μl

трансл ционный буфер содержит 0,5 М трис-HCl, рН 7,2; 0,1 м MgS04; 1 ММ дитиотреитола; 500 мкг/мл альбумина из сыворот- Ю ки крупного рогатого скота.  the translation buffer contains 0.5 M Tris-HCl, pH 7.2; 0.1 m MgSO4; 1MM dithiothreitol; 500 μg / ml of serum albumin from cattle.

Реакцию ведут в течение 1 ч при 14°С и прекращают добавлением 5 мкл 250 мН ЭДТУК. Несв занную радиоактивность удал ют на колонке с биоге .„„™«,,i, ,Ма.™. па ™j. t ииоге- Sлем P6-DG. В качестве элюента ис- пользуют буфер ТЕ. Гибридизацию осу- ществл ют согласно примеру 3.The reaction is carried out for 1 h at 14 ° C and stopped by the addition of 5 μl of 250 mN EDTA. Unbound radioactivity is removed on a column of bioge. „„ ™ “,, i,, Ma. ™. pa ™ j. t iiogem P6-DG. Buffer TE is used as eluent. Hybridization is carried out according to Example 3.

30 АТС и кодоном дл  лизина AAG включают человеческую лидерную ДНК-пос- ледовательност ь.30 ATCs and a lysine codon for AAG include the human leader DNA sequence.

ДНК -последова тельност ь, сод ержа - ща  вставку с человеческим геном 35 МпО -дисмутазы, имеет следующую . структуру.The DNA sequence containing the 35 MpO -dismutase human gene insert has the following. structure.

00

выделени  экспрессионной кассеты) вставл ют векторы YEp13, pIDB207 и pEAS102 no сайтам Ban HI и Hind III. Y В табл.2 указаны соответствующие плазмиды.expression cassette isolates) insert the vectors YEp13, pIDB207 and pEAS102 to the Ban HI and Hind III sites. Y Table 2 shows the corresponding plasmids.

Таблица2 Получаема  плазмидаTable 2 The resulting plasmid

ВекторVector

5five

II

PIDB207 PEAS102 YEP13PIDB207 PEAS102 YEP13

РКН24-АВ РКН25-АС РКН26-АRKN24-AV RKN25-AS RKN26-A

Дрожжевой штамм WS3C-5g аналогично примеру 10 .трансформируют экс- прессионной плазмидой рКН The yeast strain WS3C-5g, analogously to Example 10, is transformed with the expression plasmid pKH

Экспрессию плазмиды в 5 штамме WS30-5g подтверждают, использу  методику примера 13.The expression of the plasmid in strain 5 WS30-5g confirmed using the method of example 13.

Дл  подтверждени  того, приводит ли введение дрожжевой митохондриаль- ной лидермой последовательности перед ш геном МпО -дисмутазы к тому, что протеин вводитс  в митохондрии, получают дрожжевые митохондрии согласно примеру И и анализируют активность МпО -дисмутазы в митохондри х, а так- 15 де в цитоплазмеTo confirm whether the introduction of a yeast mitochondrial lederma sequence before the MpO -dismutase gene gene leads to the fact that the protein is introduced into the mitochondria, yeast mitochondria are obtained according to example I and analyze the activity of MpO -dismutase in the mitochondria, as well as 15 cytoplasm

Пример 200Example 200

Конструкци  экспрессионной кассеты с промотором ADHII (спиртовой дегид- рогеназы II)„20Construction of the expression cassette with the ADHII promoter (alcohol dehydrogenase II) “20

В экспрессионной кассете рКН1 (пример 66) промотор ADHI замен ют промотором ADHII по сайтам Xho I/ /Вата HI. Промотор ADHII выдел ют из плазмиды pMW 5 - ADH II/B/X, Плазмида 25 pMW 5-ADHII В/Х содержит фрагмент Bam Hi/Hind III, содержащий промотор ADHII и имеющий участок гена ADHII 760 п.о, EcoRI-сайт рестрикции в начале кодирующего участка с помощью 30 линкера превращают в Xho I-сзйт рестрикции , причем получают два Bam HI- сайта, расположенные с обеих сторон EBI 1161 SphIIn the pKH1 expression cassette (Example 66), the ADHI promoter is replaced by the ADHII promoter at Xho I / / Vata HI sites. The ADHII promoter was isolated from the plasmid pMW 5 - ADH II / B / X, Plasmid 25 pMW 5-ADHII B / X contains the Bam Hi / Hind III fragment containing the ADHII promoter and having an ADHII 760 bp gene fragment, an EcoRI restriction site at the beginning of the coding region, 30 linkers are converted into Xho I-szyt restriction, and two Bam HI sites are obtained, located on both sides of the EBI 1161 SphI

Xho I-сайта Sph I « Xh содержащий стыковое мес промотором и геном, зам нукпеотидными ларами дл удалить кодирующий учас ADHII и вставить правил к гену MnOg-дисмутазы. 3 различные олигонуклео OL1, OL2 и OL3 аналогич или 36, которые незначит чаютс  длиной нуклеотид вательности промоторной The Xho I site of the Sph I "Xh containing the butt-site promoter and gene, is replaced by nucleotide cars to remove the encoding part of ADHII and insert rules for the MnOg dismutase gene. 3 different oligonucleo OL1, OL2 and OL3 analogue or 36, which are not long nucleotide sequence promoter

Согласно примеру 11 о реакции гибридизации ком олигонуклеотидов:According to example 11 about the reaction of hybridization of com oligonucleotides:

W 1 EBI 1161/EBI 1164 № 2 EBI 1I67/EBI 1160 № 3 EBI 1159/EBI 1168 № 4 EBI 1165/EBI 1166W 1 EBI 1161 / EBI 1164 No. 2 EBI 1I67 / EBI 1160 No. 3 EBI 1159 / EBI 1168 No. 4 EBI 1165 / EBI 1166

Синтезы EBI И64, EBI 11 EBI 1165 и лигирование о тидовSynthesis of EBI I64, EBI 11 EBI 1165 and ligation of types

№ 1 + № 2 OL1No. 1 + No. 2 OL1

№ 1 -f If 3 OL2No. 1 -f If 3 OL2

№ 1 + м i| « QL3№ 1 + m i | "QL3

с тем, чтобы получить тр леотидные пары OL1, OL2 следующими ДНК-последоваin order to obtain three pairs of OL1, OL2 pairs following DNA sequence

Олигонуклеотидна  пар из EBI 1161/EBI 1164 + E /EBI 1160Oligonucleotide pairs from EBI 1161 / EBI 1164 + E / EBI 1160

5f5f

CCTATCACATATAAATAGAGTGCCAGTAGCGACTTTTTTCACACTCGCCTATCACATATAAATAGAGTGCCAGTAGCGACTTTTTTCACACTCG

GTACGGATAGTGTATATTTATCTCACGGTCATCGCTGAAAAAAGTGTGAGGTACGGATAGTGTATATTTATCTCACGGTCATCGCTGAAAAAAGTGTGAG

ЈJ

AAATACTCTTACTACTGCTCTCTTGTTGTTTTTATCACTTCTTGTTTCTTCT TTTATGAGAATGATGACGAGAGAACAACAAAAATAGTGAAGAACAAAAAATACTCTTACTACTGCTCTCTTGTTGTTTTTATCACTTCTTGTTTCTTCT TTTATGAGAATGATGACGAGAGAACAACAAAAATAGTGAAGAACAAA

EBI 1164 5EBI 1164 5

TG EBITG EBI

rtrt

11671167

GTAAATAGAATATCAAGCTACAAAAAGCATACAATCAACTA GAAGAACCATTTATCTTATAGTTCGATGTTTTTCGTATGTTAGTTGATGTAAATAGAATATCAAGCTACAAAAAGCATACAATCAACTA GAAGAACCATTTATCTTATAGTTCGATGTTTTTCGTATGTTAGTTGAT

TCAACTATTAAGTCAACTATTAAG

AGTTGATAATTGAGCT 5 EBI 1160AGTTGATAATTGAGCT 5 EBI 1160

Xho I Олигонуклеотидна  пара № 2 (OL2) изXho I Oligonucleotide pair number 2 (OL2) of

EBI 1161EBI 1161

5 five

II

CCTATCACATATAAATAGAGTGCCAGTAGCGACTTTTTTCACACTCGCCTATCACATATAAATAGAGTGCCAGTAGCGACTTTTTTCACACTCG

GTACGGATAGTGTATATTTATCTCACGGTCATGGCTGAAAAAAGTGTGAG ГGTACGGATAGTGTATATTTATCTCACGGTCATGGCTGAAAAAAGTGTGAG G

Xho I-сайта Sph I « Xho I-фрагмент содержащий стыковое место между промотором и геном, замен ют олиго- нукпеотидными ларами дл  того, чтоб удалить кодирующий участок гена ADHII и вставить правильный переход к гену MnOg-дисмутазы. Конструируют 3 различные олигонуклеотидные пары OL1, OL2 и OL3 аналогично примеру 1 или 36, которые незначительно отличаютс  длиной нуклеотидной последовательности промоторной части.The Xho I site of the Sph I "Xho I fragment containing the junction between the promoter and the gene is replaced with oligonucleotide lars in order to remove the coding region of the ADHII gene and insert the correct transition to the MnOg dismutase gene. Three different oligonucleotide pairs, OL1, OL2 and OL3, are constructed analogously to Example 1 or 36, which are slightly different in the length of the nucleotide sequence of the promoter part.

Согласно примеру 11 осуществл ют реакции гибридизации комплементарных олигонуклеотидов:According to Example 11, hybridization reactions of complementary oligonucleotides are carried out:

W 1 EBI 1161/EBI 1164 № 2 EBI 1I67/EBI 1160 № 3 EBI 1159/EBI 1168 № 4 EBI 1165/EBI 1166W 1 EBI 1161 / EBI 1164 No. 2 EBI 1I67 / EBI 1160 No. 3 EBI 1159 / EBI 1168 No. 4 EBI 1165 / EBI 1166

Синтезы EBI И64, EBI 1167, EBI 1159 EBI 1165 и лигирование о игонуклео- тидовSynthesis of EBI I64, EBI 1167, EBI 1159 EBI 1165 and ligation of igonucleotides

№ 1 + № 2 OL1No. 1 + No. 2 OL1

№ 1 -f If 3 OL2No. 1 -f If 3 OL2

№ 1 + м i| « QL3№ 1 + m i | "QL3

с тем, чтобы получить три олигонуклеотидные пары OL1, OL2 и OL3 со следующими ДНК-последовательност ми:in order to obtain three oligonucleotide pairs OL1, OL2 and OL3 with the following DNA sequences:

Олигонуклеотидна  пара IP 1(OLf) из EBI 1161/EBI 1164 + EBI 1167/ /EBI 1160Oligonucleotide pair IP 1 (OLf) of EBI 1161 / EBI 1164 + EBI 1167 / / EBI 1160

EBI 1161/EBI 1164 + EBI П59/ЕВ1 1168EBI 1161 / EBI 1164 + EBI П59 / ЕВ1 1168

.it.it

AAATACTCTTACTACTGCTCTCTTGTTGTTTTTATCACTTCTTGTTTCTTCT TTTATGAGAATGATGACGAGAGAACAACAAAAATAGCGAAGAACAAAAAATACTCTTACTACTGCTCTCTTGTTGTTTTTATCACTTCTTGTTTCTTCT TTTATGAGAATGATGACGAGAGAACAACAAAAATAGCGAAGAACAAA

EBI 1164 5 TGEBI 1164 5 TG

EBI 1159 5EBI 1159 5

GTAAATAGAATATCAAGCTACAAAAAGCATACAATCAACTA GAAGAACCATTTTATCTTATAGTTCGATGTTTTTCGTATGTTAGTTGAT TCAACTATTAACTATATC AGTTGATAATTGATATAGAGCT 5 EBI 1168 Xho IGTAAATAGAATATCAAGCTACAAAAAGCATACAATCAACTA GAAGAACCATTTTATCTTATAGTTCGATGTTTTTCGTATGTTAGTTGAT TCAACTATTAACTATATCC AGTTGATAATTGATATAGAGCT 5 EBI 1168 Xho I

Оли гону клеотидна  пара М 3 (OL3) /EBI 1166 из EBI И61/ЕВ1 1164 + EBI 1165/ t5 Oli gon gluotid pair M 3 (OL3) / EBI 1166 of EBI I61 / EB1 1164 + EBI 1165 / t5

EBI 1161EBI 1161

5five

CCTATCACATATAAATAGAGTGCCAGTAGCGACTTTTTTCACACTCGCCTATCACATATAAATAGAGTGCCAGTAGCGACTTTTTTCACACTCG

GTACGGATAGTGTATATTTATCTCACGGTCATCGCTGAAAAAAGTGTGAG СGTACGGATAGTGTATATTTATCTCACGGTCATCGCTGAAAAAAGTGTGAG C

AAATACTCTTACTACTGCTCTCTTGTTGTTTTTATCACTTCTTGTTTCTTCT TTTATGAGAATGATGACGAGAGAACAACAAAAATAGTGAAGAACAAA ,AAATACTCTTACTACTGCTCTCTTGTTGTTTTTATCACTTCTTGTTTCTTCT TTTATGAGAATGATGACGAGAGAACAACAAAAATAGTGAAGAACAAA,

EBI H64 5 TGADHII - промоторную часть выдел ют путем последовательного гидролиза рестриктазами переваривани  Xho I и Bam HI и вместо ADHI-промо- тора ввод т в экспрессионную кассету рКН1. В результате использовани  тре различных олигонуклеотидных пар получают три различные экспрессионные кассеты:The EBI H64 5 TGADHII - promoter part was isolated by sequential hydrolysis of Xho I and Bam HI digestion digests and, instead of the ADHI promoter, was introduced into the pKH1 expression cassette. As a result of using three different oligonucleotide pairs, three different expression cassettes are obtained:

рКН1 - ADHII-OL1pKH1 - ADHII-OL1

pKHI - ADHII-OL2pKHI - ADHII-OL2

рКН2 - ADHII-OL3pKH2 - ADHII-OL3

Ген MnOg -дисмутазы выдел ют из плазмиды рЕ022-А (пример 12) в виде Xho I - Есо RI-фрагмента и лигируют во все три АШИ-экспрессонные кассеты . Снабженные геном ЙпО -дисмутазы экспрессионные кассеты.вырезают с помощью Bg1II и Hind III и через сайты рестрикции Bam HI и Hind III лигированием ввод т в дрожжевые векторы pID207 и YEp13 аналогично примеру 8.The MnOg -dismutase gene was isolated from the plasmid pE022-A (Example 12) as an Xho I-Eco RI fragment and ligated into all three ASHI-expresson cassettes. Expression cassettes equipped with Ypo-dismutase genome are cut with Bg1II and Hind III and, via ligation, introduced into the yeast vectors pID207 and YEp13 via the restriction sites Bam HI and Hind III.

5050

Промотор CUP1 аналоги 20путем замены ADHII-пр встраивают в pKHI по сай рикции Bam HI и Xho I. Д промотор CUP1 лигируют с нуклеотидами, синтезиров логично примеру 36 или 1The CUP1 promoter analogs 20, by replacing the ADHII-pr, are inserted into pKHI by Bam HI and Xho I digestion. The D CUP1 promoter is ligated with nucleotides, synthesizing as in Example 36 or 1

Дрожжевые экспрессионные плазмиды с промотором ADHII приведены вYeast expression plasmids with the ADHII promoter are listed in

ТабЛ 3 EBI1691 йат HITabL 3 EBI1691 yat HI

5five

GATCCCATTACCGACATTTGGGCGCTATACGTGCATATGTTCATGTATGTA TCTGTATTTAAAACACTTrTGTATTATTTTTCCTCATATATGTGTATAGG TTTATACGGATGATTTAATTATTACTTCA EBI 1692GATCCCATTACCGACATTTGGGCGCTATACGTGCATATGTTCATGTATGTA TCTGTATTTAAAACACTTrTGTATTATTTTTTCCTCATATATGTGTATAGG TTTATACGGATGATTTAATTATTACTTCA EBI 1692

.it.it

CT CT

ТаблицаЗTable3

Вектор + промоторVector + promoter

Экспр ессионна  плазмидаExpression Plasmid

PIDB207-ADHII-OL1рЕ040PIDB207-ADHII-OL1pE040

PIDB207-ADHII-OL2рЕ041PIDB207-ADHII-OL2pE041

PIDB207-ADHII-OL3рЕ042PIDB207-ADHII-OL3рЕ042

YEP13-ADHII-OL1рЕ043YEP13-ADHII-OL1рЕ043

YEP13-ADHII-OL2.рЕ044YEP13-ADHII-OL2.pE044

YEP13-ADHII-OL3 рЕ045YEP13-ADHII-OL3 pE045

Дрожжевой штамм WS30-5g трансформируют экспрессионнымиплаэмидами, указанными в табл.3, и продукты трансформации аналогично примеру 13 исслелуют на экспрессиюсThe yeast strain WS30-5g is transformed with expression plaemides listed in Table 3, and the transformation products, as in Example 13, will be examined for expression

П р и м е р 21„PRI me R 21 „

Конструкци  экспрессионной кассеты с промотором тионеина/меди (CUP1).Construction of the expression cassette with the thionein / copper promoter (CUP1).

Промотор CUP1 аналогично примеру 20путем замены ADHII-промотора встраивают в pKHI по сайтам рестрикции Bam HI и Xho I. Дрожжевой промотор CUP1 лигируют с 8 олиго- нуклеотидами, синтезированными аналогично примеру 36 или 11.The CUP1 promoter, analogously to Example 20, is inserted into the pKHI via the Bam HI and Xho I restriction sites by replacing the ADHII promoter. The CUP1 yeast promoter is ligated to 8 oligonucleotides synthesized analogously to Example 36 or 11.

29-17М6103°29-17M6103 °

j j

5/five/

GGGTGGTGAAGTAATAATTAAATCATCCGTATAAACCTATACACATATAGGGTGGTGAAGTAATAATTAAATCATCCGTATAAACCTATACACATATA

TGAGGAAAAATAATACAAAAGTGTTTTAAATACAGATACATACATGA TGAGGAAAAATAATACAAAAGTGTTTTAAATACAGATACATACATGA

ACATATGCACGTATAGCGCCCAAATGTCGGTAATGGACATATGCACGTATAGCGCCCAAATGTCGGTAATGG

EBI 1696EBI 1696

5 CCACCCTTTATTTCAGGCTGATATCTTAGCCTTGTTACTAGTTAGAAAAAG5 CCACCCTTTATTTCAGGCTGATATCTTAGCCTTGTTACTAGTTAGAAAAAG

ACATTTTTGCTGTCAGTCACTGTCAAGAGATTCTTTTGCTGGCATT1CTTACATTTTTGCTGTCAGTCACTGTCAAGAGATTCTTTTGCTGGCATT1CTT

EBI 1704 5 EBI 1704 5

CTAGAAGAAATGCCAGCAAAAGAATCTCTTGACAGTGACTGACAGCAAACTAGAAGAAATGCCAGCAAAAGAATCTCTTGACAGTGACTGACAGCAAA

AATGTCTTTTTCTAACTAGTAACAAGGCTAAGATATCAGCCTGAAATAAAATGTCTTTTTCTAACTAGTAACAAGGCTAAGATATCAGCCTGAAATAA

AA

EBI 1711EBI 1711

Xba IXba I

5five

CTAGAAGCAAAAAGAGCGATGCGTCTTTTCCGCTGAACCGTTCCAGCAAACTAGAAGCAAAAAGAGCGATGCGTCTTTTCCGCTGAACCGTTCCAGCAAA

AMOACTACCMCGCMTATGGATTGTCAGAATCATATAAAAGAGAAGAMOACTACCMCGCMTATGGATTGTCAGAATCATATAAAAGAGAAG

CAAATAACAAATAA

EBI 1710EBI 1710

5five

CAAGGAGTTATTTGCTTCTCTTTTATATGATTCTGACAATCCATATTGCGTCAAGGAGTTATTTGCTTCTCTTTTATATGATTCTGACAATCCATATTGCGT

TGGTAGTCTTTTTTGCTGGAACGGTTCAGCGGAAAAGACGCATCGCTGTTTTGGTAGTCTTTTTTTGTGGAACGGTTCAGCGGAAAAGACGCATCGCTGTTT

TTGCTTTTGCTT

Xba IXba I

EBI 1716EBI 1716

5five

CTCCTTGTCTTGTATCMTTGCATTATAATATCTTCTTGTTAGTGCAATATCTCCTTGTCTTGTATCMTTGCATTATAATATCTTCTTGTTAGTGCAATAT

CATATAGAAGTCATCGAAATAGATATTAAGAAAAACAAACTGTACAACATATAGAAGTCATCGAAATAGATATTAAGAAAAACAAACTGTACAA

TCAATCAATCAATCATCTCAATCAATCAATCATC

Xho I EBI 1717 5Xho I EBI 1717 5

TCGAGATGAITGATTGATTGATTGTACAGTTTGTTTTTCTTAATATCTAT TTCGATGACTTCTATATGATATTGCACTAACAAGAAGATATTATAATGCTCGAGATGAITGATTGATTGATTGTACAGTTTGTTTTTCTTAATATCTAT TTCGATGACTTCTATATGATATTGCACTAACAAGAAGATATTATAATGC

Дл  достижени  желаемого сочета- олигонуклеотидами EBI 1691/1692/ ни  CUP1-промотора с отдельными /1696/1704/1711/1710/1716 по схеме:To achieve the desired combination of oligonucleotides EBI 1691/1692 / CUP1 promoter with individual / 1696/1704/1711/1710/1716 according to the scheme:

Bam HIXba IBam HIXba I

GATCC EBI 1631 EBI 1696 EBI 1711 EBI 1716GATCC EBI 1631 EBI 1696 EBI 1711 EBI 1716

EBI 1692 EBI 1704 CTAG EBI 1710 EBI 1717 AGTCEBI 1692 EBI 1704 CTAG EBI 1710 EBI 1717 AGTC

II

50 ., осуществл ют: лигирование олигонуклеотидов50., Carried out: ligation of oligonucleotides

1)синтез олигонуклеотидов EBI ,с олигонуклеотидами If 1 и 2, соглас- 1692, EBI 1704, EBI 1710, EBI 1716 но примеру 11; ДНК-фрагмент элюи2 )реакции гибридизации олигонук- . из 2%-ного агарозного гел  и по леотидов . 55 сайтам Bam HI - Xba I ввод т в pES102v1) synthesis of oligonucleotides EBI, with oligonucleotides If 1 and 2, according to 1692, EBI 1704, EBI 1710, EBI 1716 but example 11; DNA fragment elui2) oligonuch hybridization reaction-. from 2% agarose gel and polypeptides. 55 Bam HI - Xba I sites are entered into pES102v

N 1EBI 1691/EBI 1692 (пример 6а). Получают, плазмиду рЕОЧЬ,N 1EBI 1691 / EBI 1692 (Example 6a). Get, plasmid rOOCH,

If 2EBI 1696/EBI 1704Олигонуклеотиды К 3 и k лигируютIf 2EBI 1696 / EBI 1704 oligonucleotides K 3 and k are ligated

If 3EBI 1711/EBI 1710друг с другом, ДНК-фрагмент элюируют .If 3EBI 1711 / EBI 1710 with a friend, the DNA fragment is eluted.

(f 4EBI 1716/EBI 1717из 2%-н ого агарозного гел  и ввод т (f 4EBI 1716 / EBI 1717 from a 2% agarose gel and administered

3117ЈЯ6103117ЈЯ610

по сайтам Xba I - Xho I в Получают плазмиду Теперь весь CUP 1-промотор можно лигировать в рКН1 по сайтам Bam H1 и Xho I, Получаемую экспрессионную кассету называют рЕОй8by Xba I - Xho I sites Get a plasmid Now the whole CUP 1 promoter can be ligated into pKH1 via the Bam H1 and Xho I sites, the resulting expression cassette is called pOO8

Ген МпО -дисмутазы выдел ют из плазмиды рЕ022-А (пример 12) с помощью рестрикции энзимами Xho I иЕсо RI и лигируют в экспрессионную кассету . Снабженную геном МпОг-дисмута- зы экспрессионную кассету гидролизуют рестриктазой Bglll и аналогично примеру 8 по сайтам Bam HI и Hind III ввод т в дрожжевые векторы pIDB207 и 15 уЕр13.The MpO -dismutase gene was isolated from the plasmid pE022-A (Example 12) by restriction with the enzymes Xho I and Eco RI and ligated into an expression cassette. The expression cassette equipped with the MpOg dismutase gene is hydrolyzed with the Bglll restriction enzyme and analogously to Example 8, the Bam HI and Hind III sites are introduced into the yeast vectors pIDB207 and 15 uEp13.

Дрожжевые экспрессионные плазмиды с CUP 1-промотором приведены в таблЛоYeast expression plasmids with the CUP 1 promoter are shown in Table.

10ten

20 д 25 20 d 25

Т а б л и ц а 4T a b l and c a 4

AGCTTACAAGCAATGTCTTCAGAAAACCTAGGGTCCAAGGTTAAGCCATAAGCTTACAAGCAATGTCTTCAGAAAACCTAGGGTCCAAGGTTAAGCCATA

TCCCAGCTCAGTAAAGCCAGGAGCATCCTCATTTCCCAATGTCCCAGCTCAGTAAAGCCAGGAGCATCCTCATTTCCCAATG

OL40:OL40:

5five

AAATGAGGATGCTCCTGGCTTTACTGAGCTGGGATATGGCTTAACCTrGGAAAATGAGGATGCTCCTGGCTTTACTGAGCTGGATATGGCTTAACCTrGGA

CCCTAGGTTTTCTGAAGACATTGCTTGTACCCTAGGTTTTCTGAAGACATTGCTTGTA

OL 41: OL 41:

5five

GCCC7CCTGTTCCCTCTACTGGCAGCCCTAGTGATGACCAGCTATAGCCCTGGCCC7CCTGTTCCCTCTACTGGCAGCCCTAGTGATGACCAGCTATAGCCCTG

TGGATCTCTGGGCAAGCACAGCCTCCCCGACCTGCCCTACGACTACGGTGCTTGGATCTCTGGGCAAGCACAGCCTCCCCGACCTGCCCTACGACTACGGTGCT

OL42:OL42:

5five

CTAGAGCACCGTAGTCGTAGGGCAGGTCGGGGAGGCTGTGCTTGCCCAGAGACTAGAGCACCGTAGTCGTAGGGCAGGTCGGGGAGGCTGTGCTTGCCCAGAGA

TCCAACAGGGCTATAGCTGGTCATCACTAGGGGTGCCAGTAGAGGGAACAGTCCAACAGGGCTATAGCTGGTCATCACTAGGGGTGCCAGTAGAGGGAACAG

GAGGGCCATTGGGGAGGGCCATTGGG

получают фрагмент ДНК длиной 192 л„о с выступающими концами Hind III/get a DNA fragment length of 192 l „o with protruding ends Hind III /

Hind IIICAP сайтHind IIICAP website

5five

AGCTTACAAGCAATGTCTTCAGAAAACCTAGGGTCCAAGGTTAAGCCATA ATGTTCGTTACAGAAGTCTTTTGGATCCCAGGTTCCAATTCGGTATAGCTTACAAGCAATGTCTTCAGAAAACCTAGGGTCCAAGGTTAAGCCATA ATGTTCGTTACAGAAGTCTTTGGATCCCAGGTTCCAATTCGGTAT

лидер leader

TCCCAGCTCAGTAAAGCCAGGAGCATCCTCATTTCCCAATGGCCCTCCTGTT CCTCCCAGCTCAGTAAAGCCAGGAGCATCCTCATTTCCCAATGGCCCTCCTGTT CC

AGGGTCGAGTCATtTCGGTCCTCGTAGGAGTAAAGGGTTACCGGGAGGACAAGGGTCGAGTCATtTCGGTCCTCGTAGGAGTAAAGGGTTACCGGGAGGACA

3232

5 five

Дрожжевой штамм WS30-5g трансформируют аналогично примеру 13 экспрес-1 сионными плазмидами, указанными в табл., и продукты трансформации исследуют на экспрессиюThe yeast strain WS30-5g was transformed analogously to example 13 with express-1 sionic plasmids listed in the table., And the transformation products were examined for expression

П р и м е р 22. Экспресси  МпО,- дисмутазы в эукариотических клетках животного происхождени  оEXAMPLE 22: Expression of MnO, dysmutase in eukaryotic cells of animal origin

а)о Конструкци  экспрессионных плазмид.a) o Construction of expression plasmids.

Ген MnOg- дисмутазы с помощью синтетических олигонуклеотидов снабжают на конце 5 соответствующими контрольными и лидерными последовательност ми . Необходимыми контрольными последовательност ми  вл ютс  сайт САР и стартовый сигнал АТС. Дл  секреции в среде используют ли- 0 дерную последовательность омега- интерферона (СО-ИФ)«, Дл  внутриклеточной продукции используют человеческую митохондриальную лмдерную последовательность МпОг-дисмутазы. 5 Путем сочетани  четырех синтетических олигонуклеотидов 01,39,, OL40, OL41, OL42, получаемых согласно примеру 36 или 11:The MnOg dismutase gene is supplied with synthetic oligonucleotides at the end of 5 with the corresponding control and leader sequences. The necessary control sequences are the CAP site and the start signal of the exchange. For secretion in the medium, an omega-interferon (CO-IF) sequence is used. For intracellular production, the human mitochondrial immune sequence of MnOg dismutase is used. 5 By combining four synthetic oligonucleotides 01.39 ,, OL40, OL41, OL42, obtained according to example 36 or 11:

/Xba I./ Xba I.

3317М6Ю343317M6YU34

AGGAGG

CTCTACTGGCAGCCCTAGTGATGACCAGCTATAGCCCTGTTGGATCTCTGGGCTCTACTGGCAGCCCTAGTGATGACCAGCTATAGCCCTGTTGGATCTCTGGG

GAGATGACCGTCGGGATCACTACTGGTCGATATCGGGACAACCTAGAGACC СGAGATGACCGTCGGGATCACTACTGGTCGATATCGGGACAACCTAGAGACC C

-ys-старт Мп02-дисмутазы-ys-start Mp02-dismutase

Xba IXba I

CAAGCACAGCCTCCCCGACCTGCCCTACGACTACGGTGCT GTTCGTGTCGGAGGGGCTGGACGGGATGCTGATGCCACGAGATCCAAGCACAGCCTCCCCGACCTGCCCTACGACTACGGTGCT GTTCGTGTCGGAGGGGCTGGACGGATGTGATGCCACGAGATC

Этот фрагмент ДНК представл ет собой 5 -нетранслируемый участок (0-ИФ с .сайтом САР, стартовым сигналом АТС,СО-ИФ-лидерной последовательностью (21 аминокислота) и ко- This DNA fragment is a 5-untranslated region (0-IF with an ATS site, a starting ATC signal, a CO-IF-leader sequence (21 amino acids) and

дирующий участок первых тринадцатиfirst thirteen section

«"

OL43:OL43:

с Iwith I

TTGAGCCGGGCAGTGTGCGGCACCAGCAGGGAGCTGCCTCCGGTTTTGGGGTA TCTGGGCTCCAGGCAGAAGCACAGCCTCCCCGACCTGCCCTACGACTACGGTGTTGAGCCGGGCAGTGTGCGGCCCAGCAGGGAGCTGCCTCCGGTTTGGGGTA TCTGGGCTCCAGGCAGAAGCACAGCCTCCCCGACCTGCCCTACGACTACGGTG

СТST

OL44:OL44:

5five

CTAGAGCACCGTAGTCGTAGGGCAGGTCGGGGAGGCTGTGCTTCTGCCTGGACTAGAGCACCGTAGTCGTAGGGCAGGTCGGGGAGGCTGTGCTTCTGCCTGGA

GCCCAGATACCCCAAAACCGGAGGCAGCTGCCTGCTGGTGCCGCACAGTGCCCGCCCAGATACCCCAAAACCGGAGGCAGCTGCCTGCTGGTGCCGCACAGTGCCC

GGCTCAACATTGGGGGCTCAACATTGGG

получают ДНК-фрагмент длиной 196 п. о с выступающими концами Hind III/get a DNA fragment length of 196 p. with protruding ends of Hind III /

САР сайтSAR website

Hind HI 5Hind HI 5

AGCTTACAAGCAATGTCTTCAGAAAACCTAGGGTCCAAGGTTAAGCCATA ATGTTCGTTACAGAAGTCTTTTGGATCCCAGGTTCCAATTCGGTATAGCTTACAAGCAATGTCTTCAGAAAACCTAGGGTCCAAGGTTAAGCCATA ATGTTCGTTACAGAAGTCTTTGGATCCCAGGTTCCAATTCGGTAT

старт лидера МпОг-дисмутMpOg dismount start

TCCCAGCTCAGTAAAGCCAGGAGCATCCTCATTTCCCAATGTTGAGCCGGGC ATCCCAGCTCAGTAAAGCCAGGAGCATCCTCATTTCCCAATGTTGAGCCGGGC A

AGGGTCGAGTCATTTCGGTCCTCGTAGGAGTAAAGGGTTACAACTCGGCCC GTAGGGTCGAGTCATTTCGGTCCTCGTAGGAGTAAAGGGTTACAACTCGGCCC GT

GTGTGCGGCACCAGCAGGCAGCTGCCTCCGGTTTTGGGGTATCTGGGCTCCAG CACACGCCGTGGTCGTTCGTCGACGGAGGCCAAAACCCCATAGACCCGAGGT СGTGTGCGGCACCAGCAGGCAGCTGCCTCCGGTTTTGGGGTATCTGGGCTCCAG CACACGCCGTGGTCGTTCGTCGACGGGGCCAAAACCCCATAGACCCGAGGT C

Lys-старт протеина Мп02-дисмутазы ,Xba ILys-start protein Mn02-dismutase, Xba I

GCAGAAGCACAGCCTCCCCGACCTGCCCTACGACTACGGTGCT CCGTCTTCGTGTCGGAGGGGCTGGACGGGATGCTGATGCCACGAGATCGCAGAAGCACAGCCTCCCCGACCTGCCCTACGACTACGGTGCT CCGTCTTCGTGTCGGAGGGGCTGGACGGGATGCTGATGCCACGAGATC

Этот ДНК-фрагмент представл ет .. собой часть нетраислироваиного $ - участка СО-ИФ с сайтом САР и стартовым сигналом АТС, а также с мито- хондриальной лидерной последовательностью МпОг-дисмутазы человека (2k аминокислоты) дл  внутриклеточной продукции Мп02-дисмутазы и кодирующего участка первых тринадцати аминокислот дисмутазы. This DNA fragment is .. a part of the untied $ - site of CO-IF with the ATS site and the ATC start signal, as well as the mitochondrial leader sequence of human MnOg dismutase (2k amino acids) for intracellular production of MnO2 dismutase and the coding region first thirteen amino acids of dismutase.

аминокислот МпСи-дисмутаэы (от лизина до аланинаТamino acids Mpci-dismutaei (from lysine to alanineT

Путем сочетани  синтетических олигонуклеотизов OL39, OL40 указанных формул и синтетических олигонук- леотидов OL43 и OLA4By combining the synthetic oligonucleotides OL39, OL40 of the indicated formulas and the synthetic oligonucleotides OL43 and OLA4

УХЬа I.UHB I.

ьs

Олигонуклеотиды OL39, OLA2 и OL44 фосфорилируют на Ь1-конце при помощи Т -полинуклеотидной киназы с тем, чтобы обеспечить осуществле- ние последующей реакции лигировани .Oligonucleotides OL39, OLA2 and OL44 are phosphorylated at the B1-end using T-polynucleotide kinase in order to ensure the implementation of the subsequent ligation reaction.

Реакционна  смесь: 2 мкл олиго- нуклеотида (100 пмоль); 1 мкл фер линкерной кинаэы; j мкл 10 мМ АТР; 1 мкл ТА-полинуклеотидной киназь, 10 ед/мкл.,Reaction mixture: 2 µl oligonucleotide (100 pmol); 1 μl fer linker kinae; j μl 10 mM ATP; 1 μl of TA polynucleotide kinase, 10 units / μl.,

3535

10 буфера линкерной киназы содержит 0,7 М трис-HCl, рН 7,6; 0,1 М MgClj ; 0,05 М дитиотреитола.10 buffer linker kinase contains 0.7 M Tris-HCl, pH 7.6; 0.1 M MgCl1; 0.05 M dithiothreitol.

Реакцию ведут 30 мин при 37°С, энзим инактивируют путем нагревани  до 100°СсThe reaction is carried out for 30 minutes at 37 ° C, the enzyme is inactivated by heating to 100 ° C.

Олигоиуклеотиды OL40, OLA1 и OL43 образующие 5 концы готовых ДНК- фрагментов, не фосфорилируют во избежание образовани  мультимерных ДНК-вставок при последующей реакции лигировани .Oligonucleotides OL40, OLA1 and OL43 forming the 5 ends of the finished DNA fragments do not phosphorylate to avoid the formation of multimeric DNA inserts during the subsequent ligation reaction.

Гибридизацию комплементарных оли- гонуклеотидов друг с другом осуществл ют следующим образом:Hybridization of the complementary oligonucleotides with each other is carried out as follows:

Олигонуклеотиды А и Б представл ют собой комплементарные олиго- нуклеотидыоOligonucleotides A and B are complementary oligonucleotides.

Реагенты: № 1 : А OL39 № 2 : А N 3 : А 01ЛЗ Реакционна  смесь:Reagents: № 1: А OL39 № 2: А N 3: А 01ЛЗ Reaction mixture:

Б 01ЛО Б Б OIM 1 мкл олигонуклеотида А (100 пмоль); 1 мкл оли- гонуклеотида Б (100 пмоль); 8 мкл воды„B 01LO B B OIM 1 μl of oligonucleotide A (100 pmol); 1 μl of oligonucleotide B (100 pmol); 8 μl of water „

Реакционные смеси № 1 - 3 нагревают при 100°С в течение 2 мин и-медленно охлаждают в вод ной бане до комнатной температуры,,The reaction mixtures No. 1 - 3 are heated at 100 ° С for 2 min and are slowly cooled in a water bath to room temperature,

Получаемые результаты реакций 1 - 3-короткие двунитевые фрагменты ДНК лигируют друг с другом следующим образом:The results obtained for reactions of 1 to 3 short DNA strand DNA fragments are ligated to each other as follows:

ЛидерW-ИФ: 5 мкл реакционной смеси № 1; 5 мкл реакционной смеси № 2; 1,5 мкл/мл 10 мМ АТР; 0,5 мкл/ /мл ДНК-лигэзы (7 ед/мкл)оLiderW-IF: 5 μl of the reaction mixture No. 1; 5 μl of the reaction mixture No. 2; 1.5 μl / ml 10 mM ATP; 0.5 µl / / ml DNA ligase (7 units / µl) o

Митохондриальна  лидерна  после- довательность МпО -дисмутазы: 5 мкл реакционной смеси № 1; 5 мкл реакционной смеси If 3; 1,5 мкл 10 мМ АТР 0,5 мкл ДНК-лигазы (7 ед.КMitochondrial leader sequence of MpO -dismutase: 5 µl of the reaction mixture No. 1; 5 μl of If 3 reaction mixture; 1.5 μl 10 mM ATP 0.5 μl DNA ligase (7 units

Реакции протекают в течение 15 ч при температуре 4°С,The reactions proceed for 15 hours at 4 ° С,

ДНК раздел ют по размерам на 2%-ном агарозном геле и желаемые ДНК-фрагменты длмной 192 и 196 п.о„ элюируют из гел .The DNA was sized for 2% agarose gel and the desired DNA fragments for a length of 192 and 196 bp were eluted from the gel.

Готовый ДНК-фрагмент длиной 192 п.о, с лидером О)-ИФ дл  секреции МпО -дисмутазы в среду- лигируют в HgOD6 по сайтам Hind III и Xba I. Получают плазмиду HSODJ U Плазмиду гидролизуют по сайтам Eco R1 и обрабатывают фрагментом Кленова с обра- зованием тупых концов Затем переваривают Hind III и большой ДНКМ The finished DNA fragment, 192 bp long, with the O) -IF leader for secretion of MpO -dismutase, is ligated to HgOD6 on Hind III and Xba I sites. The plasmid HSODJ U is obtained. forming blunt ends then digest hind iii and large dncm

17 16103617 161036

фрагмент длиной приблизительно 700 п ; fragment approximately 700 p;

00

5five

о. выдел ют из 1,5%-ного агарозного гел , ДНК-фрагмент лигируют в эука- риотический вектор pSV2 gptdhfr, который получают из pBR 322 dhfr разрезанием Esp I и Hind III, заполнением фрагментом Кленова и лигировани- ем в вектор pSVigpt по сайтам Eco RI - Bam HI, заполненным фрагментом Кленова и обработанным щелочной1 фасфата- зой„about. were isolated from a 1.5% agarose gel, the DNA fragment was ligated into the eukaryotic vector pSV2 gptdhfr, which was obtained from pBR 322 dhfr by cutting Esp I and Hind III, filling it with the Klenow fragment and ligating into pSVigpt vector at Eco sites RI - Bam HI, filled with a fragment of Klenow and processed by alkaline 1 fatase

Лигирование выделившегос  большого ДНК-фрагмента, имеющего приблизи- 5 тельно 700 п.о. в вектор pSV2gptdhfr осуществл ют после предварительного гидролиза вектора с помощью Ара I, заполнени  сайта рестрикции фрагментом Кленова и дополнительного гидролиза с помощью Hind III Таким образом , ген gpt замен ют в векторе на ген МпО -дисмутазы„ Смесь лигировани  используют дл  трансформации E.coli НВ101с После рестрикционного анализа плазмидной ДНК положительных клонов получают экспрессионную плаэмиду, которую обозначают как pSV2dhfrSOD1.Ligation of an isolated large DNA fragment having approximately 700 bp. into the vector pSV2gptdhfr carried out after preliminary hydrolysis of the vector with Ara I, filling the restriction site with the Klenow fragment and additional hydrolysis with Hind III. Thus, the gpt gene in the vector is replaced with the MpO-dismutase gene. The ligation mixture is used to transform E. coli HB101c After restriction analysis of the plasmid DNA of positive clones, an expression plasmid is obtained, which is designated as pSV2dhfrSOD1.

Аналогично ДНК-фрагмент с мито- хондриэльным лидером Мп02-дисмутазы длиной 196 Лео по сайтам Hind III - Xbalлигируют в HS016, Получают плазмиду HSOD12 Ген с регул торными последовательност ми.клонируют в эукариотический вектор pSV2gptdhfr по сайтам рестрикции Hind III - Eco RI после предварительного заполнени  выступающих концов Eco RI энзимом Кленова с Получаемую экспрессионную плазмиду обозначают как pSV2dhfrSOD2c Экспрессию pSV2dhfrSOD1 и pSV2dhfrSOD2 осуществл ют в клетках СНО с дефицитом дегидрофолатредуктазы, которые культивируют вв -МЕМ-средё (10% эмбриональной тел чьей сывооот- i ки , гипоксантин, тимидин) „ Транс- фекцию клеток СНО экспрессионными плазмидами pSV2dhfrSOD1/D2 осуществл ют известным образомо За день до трансфекции клеток подают на питательные пластинкиSimilarly, the DNA fragment with the mitochondrial leader MnO2 dismutase 196 Leo in length by Hind III – X sites is diversified in HS016. The HSOD12 Gene with regulatory sequences is obtained. The plasmid mi is cloned into the eukaryotic vector pSV2gptdhfr by Hind III – Eco RI restriction digest. Eco RI ends of the Klenow enzyme with the resulting expression plasmid is designated as pSV2dhfrSOD2c The expression of pSV2dhfrSOD1 and pSV2dhfrSOD2 is carried out in CHO cells with a dehydrofolate reductase deficiency, which are cultured in order-I-I-I-I, I-I-I-I-I-I lines, I-I-I, I-I-I, I-Ie lines, I, I, I, I, will be able to do this. ooot- i ki, hypoxanthine, thymidine) "Trans fektsiyu CHO cell expression plasmids pSV2dhfrSOD1 / D2 effected known obrazomo The day before transfection, cells fed on nutrient plates

Клетки обрабатывают продуктом осаждени  фосфатом кальци , содержащим до 10 мкг плазмидной ДНК, при 37°С в течение k ч. Затем среду от- А сасывают и замен ют селекционной 55 средой 06-МЕМ, содержащей 10% эмбриональной тел чей сыворотки, которую каждые два дн  замен ют. Колонии трансформированных клеток по вл ютс The cells are treated with calcium phosphate precipitation product, containing up to 10 µg of plasmid DNA, at 37 ° C for k hours. Then the medium is А-sucked and replaced with 55 selection medium 06-MEM containing 10% fetal calf serum, which every two days are replaced. Colonies of transformed cells appear

00

5five

00

4S4S

5050

3737

по истечении 12-16 дней. Надоса- дочную жидкость (среду) исследуют на наличие активности МпО/,-дисмутазыafter 12-16 days. The supernatant (medium) is examined for the presence of MpO /, - dismutase

П р и м е р 23. Очистка Мп02-дис- мутазы,PRI me R 23. Purification of Mn02 dismutase,

а)Разрушение клеток. Аналогично примеру 15 клеточнуюa) Cell disruption. Analogously to example 15 cellular

массу промывают дистиллированной водой и в концентрации 30% суспендируют в 50 мМ трис-уксусной кислоты, рН 8,5. Клетки разрушают в мельнице , содержащей стекл нные шарики диаметром 0,5 0,5 мм„ Экстракт клеток центрифугируют (16000 об/мин, 15 мин, °С и осадок удал ют).the mass is washed with distilled water and at a concentration of 30% is suspended in 50 mM Tris-acetic acid, pH 8.5. The cells are destroyed in a mill containing glass beads with a diameter of 0.5 0.5 mm. The cell extract is centrifuged (16000 rpm, 15 min, ° C and the precipitate is removed).

б)Осаждение нагреванием и кис лотой оb) Precipitation by heating and acid

Надосадочную жидкость со стадииSupernatant from stage

II- НII-N

а нагревают до 60 С, в лед ной бане охлаждают до 20°С, добавлением t М уксусной кислоты рН среды устанавливают до 5,5, центрифугируют при 16000 об/мин и подвергают диализу с помощью трис-уксусной кислоты (60 мМ. рН 5,5). and heated to 60 ° C., cooled in an ice bath to 20 ° C., the pH was adjusted to 5.5 by addition of tM acetic acid, centrifuged at 16000 rpm and dialyzed with tris-acetic acid (60 mM. pH 5 ,five).

в)Катионообменна  хроматографи  Содержащий MnOg-дисмутазу диализат со стадии б подают на колонку с СМ-сефарозой, уравновешенную 60 мМ трис-уксусной кислотой, рН 5,5, элюируют линейным градиентом, (15 объемов колонки) от 60 мМ трис-уксус ,ной кислоты до 0,12 М ацетата натри c) Cation exchange chromatography The dialysate containing MnOg dismutase from step b is fed to a CM Sepharose column, equilibrated with 60 mM Tris-acetic acid, pH 5.5, eluted with a linear gradient (15 column volumes) from 60 mM Tris-acetic acid acids to 0.12 M sodium acetate

г)Гельпроникающа  хроматографи . Фракции с активностью МпО -дисмутазы со стадии в собирают и подают на колонку, содержащую сефакрил S 300 HR или суперозу 12, уравнорешен- ную 0,1 М фосфатным буфером, ,8.d) Gel Permeation Chromatography. The fractions with MpO -dismutase activity from step C are collected and fed to a column containing sephacryl S 300 HR or superose 12, equalized with 0.1 M phosphate buffer,, 8.

EBI 1161 Sph I 5«EBI 1161 Sph I 5 "

CCTATCACATATAAATAGAGTGCCAGTAGCGACTTTTTTCACACTCG GTACGGATAGTGTATATTTATCTCACGGTCATCGCTGAAAAAAGTGTGXG СCCTATCACATATAAATAGAGTGCCAGTAGCGACTTTTTTCACACTCG GTACGGATAGTGTATATTTATCTCACGGTCATCGCTGAAAAAAGTGTGXG C

AAATACTCTTACTACTGCTCTCTTGTTGTTTTTATCACTTCTTGTTTCTT TTTATGAGAATGATGACGAGAGAACAACAAAAATAGTGAAGAACAAAAAATACTCTTACTACTGCTCTCTTGTTGTTTTTATCACTTCTTGTTTCTT TTTATGAGAATGATGACGAGAGAACAACAAAAATAGTGAAGAACAAA

EBI 1164 5 TGEBI 1164 5 TG

EBI 1167 5EBI 1167 5

GTAAATAGAATATCAAGCTACAAAAAGCATACAATCAACTA GAAGAACCATTTATCTTATAGTrCGATGTTTTTCGTATGTTAGTTGAT ТСААСТАТТААС AGxrGATAATTGAGCT 5 EBI GTAAATAGAATATCAAGCTACAAAAAGCATACAATCAACTA GAAGAACCATTTATCTTATAGTrCGATGTTTTTCGTATGTTAGTTGAT TSAASTATTAAS AGxrGATAATTGAGCT 5 EBI

16103#16103 #

Элюцию провод т тем же буфером.The elution is carried out with the same buffer.

Получают 20 мг 0,1 мг/r клетки) чМпОг-дисмутазы.Obtain 20 mg of 0.1 mg / r cell) NMO3 dismutase.

s s

Claims (1)

Формула изобретени Invention Formula Способ получени  человеческой JQ MnO -дисмутазы, заключающийс  в том, что из плацентарной или печеночной ткани человека выдел ют мРНК, получают поли(А), синтезируют двуни- тевую кДНК, конструируют генбанк 15 кДНК, далее выдел ют последовательность ДНК, кодирующую Mn-0-дисмута- зу, при помощи зондов:The method of obtaining human JQ MnO -dismutase, which consists in the fact that mRNA is isolated from human placental or hepatic tissue, poly (A) is obtained, two-stranded cDNA is synthesized, 15 cDNA genebank is constructed, then the DNA sequence encoding Mn-0 is extracted -dismutase with probes: С С С 20 5( TGITA ТТ ТС TCIGTIACITT , С С С 5 5 (TGITA ТТ ТС TCIGTIACITT, Т Т Т ИАСА , T T T IASA, S TCIGTIAC гг ТСССА TTIAT з с т сS TCIGTIAC gg. TCCA TTIAT гg или последовательности кДНК гена дисмутазы человека, последовательность ДНК достраивают до стартового кодона или стоп-кодона, непосредстг венно за стартовым кодоном гена размещают митохондриальную лидерную или сигнальную последовательность ДНК МпО -дисмутазы S,cerevisiae или человека, затем последовательность ДНК, кодирующу  МпОг-дисмутазу, используют дл  конструировани  вектора экспрессии, состо щего из промоторов ADHI или ADHII, пар олигонуклео- тидов EBI 1161/EBI 1164 + EBI 1167/ /EBI 1160 формулыor cDNA sequences of the human dysmutase gene, the DNA sequence is extended to the start codon or stop codon, the mitochondrial leader or signal sequence of the MpO -dismutase S DNA, cerevisiae or human is placed directly behind the start codon of the gene, then the DNA sequence encoding MnO dismutase is used for constructing an expression vector consisting of ADHI or ADHII promoters, oligonucleotide pairs EBI 1161 / EBI 1164 + EBI 1167 / / EBI 1160 of the formula 39 1741610 Ю 39 1741610 U Xho IXho I EBI 1161/EBI 1164 + EBI 1159/EBI 1168 формулы EBI 1161 5EBI 1161 / EBI 1164 + EBI 1159 / EBI 1168 of the formula EBI 1161 5 CCTATCACATATAMTAGAGTGCCAGTAGCGACTTTTTTCACACTCG GTACGGATAGTGTATATTTATCTCACGGTCATCGCTGAAAAAAGTGTGAG ; С.CCTATCACATATAMTAGAGTGCCAGTAGCGACTTTTTTCACACTCG GTACGGATAGTGTATATTTATCTCACGGTCATCGCTGAAAAAAGTGTGAG; WITH. AAATACTCTTACTACTGCTCTCTTGTTGTTTTTATCACTTCTTGTTTCTTCT TTTATGAGAATGATGACGAGAGAACAACAAAAATAGTGAAGAACAAAAAATACTCTTACTACTGCTCTCTTGTTGTTTTTATCACTTCTTGTTTCTTCT TTTATGAGAATGATGACGAGAGAACAACAAAAATAGTGAAGAACAAA EBI 1164 5EBI 1164 5 TG .Tg. EBI 1159 EBI 1159 5five GTAAATAGAATATCAAGCTACAAAAAGCATACAATCAACTA GAAGAACCATTTTATCTTATAGTTCGATGTTTTTCGTATGTTAGTTGAT TCAACTATAACTATATC AGTTGATAATTGATATAGAGCT 5 EBI 1168 .GTAAATAGAATATCAAGCTACAAAAAGCATACAATCAACTA GAAGAACCATTTTATCTTATAGTTCGATGTTTTTCGTATGTTAGTTGAT TCAACTATAACTATATC AGTTGATAATTGATATAGAGCT 5 EBI 1168. Xho IXho I EBI 1161/EBI 1164 + EBI 1165/EBI 1166 формулы EBI 1161 5EBI 1161 / EBI 1164 + EBI 1165 / EBI 1166 of the formula EBI 1161 5 CCTATCACATATAAATAGAGTGCCAGTAGCGACTTTTTTCACACTCG GTACGGATAGTGTATATTTATCTCACGG TCATCGCTGAAAAAAGTGTGAG СCCTATCACATATAAATAGAGTGCCAGTAGCGACTTTTTTCACACTCG GTACGGATAGTGTATATTTATCTCACGG TCATCGCTGAAAAAAGTGTGAG C AAATACTCTTACTACTGCTCTCTTGTTGTTTTTATCACTTCTTGTTTCTTCT TTTATGAGAATCATGACGAGAGAACAACAAAAATAGTGAAGAACAAAAAATACTCTTACTACTGCTCTCTTGTTGTTTTTATCACTTCTTGTTTCTTCT TTTATGAGAATCATGACGAGAGAACAACAAAAATAGTGAAGAACAAA EBI 1164 5 TGEBI 1164 5 TG EBI 1165 EBI 1165 5five GTAAATAGAATATCAAGCTACAAAAAGCATACAATCAACTA GAAGAACCATTATCTTATAGTTCGATGTTTTTCGTATGTTAGTTGAT TCAACTATTAACTATATCGTAATAC AGTTGATAATTGATATAGCATTATGAGCT 5 EBI 1166GTAAATAGAATATCAAGCTACAAAAAGCATACAATCAACTA GAAGAACCATTATCTTATAGTTCGATGTTTTTCGTATGTTAGTTGAT TCAACTATTAACTATATCGTAATAC AGTTGATAATTGATATAGCATTATGAGCT 5 EBI 1166 Xho IXho I II или CVP1, сигнала или pE042, или , или , или инициировани , митохондриальной ли- , или рЕФ50, или рЕ051, которой дерной или сигнальной последователь- 0 трансформируют штаммы Saccharomyces . ности Saccharomyces cerevisiae или cerevisiae, или плазмиду pSV2dhfrSODt человека, стоп-кодона и терминатора ( или pSV2dhfrSOD2. которой трансфор- ADHII, далее конструируют плазмиду мируют штаммы культивируемых клеток, PWS550A, или pWS490A, или pWS491A, культивируют трансформированные клет- или PWS371A, или PWS372A, или pWS373A, 4$ Ки, выдел ют и очищают целевой про,- или рЕ02Ч - АВ,.или рЕ025 - АС, или , дукт путем .экстракции, осаждени  и - AD, или рЕОЧО; или , хроматографии.or CVP1, a signal of either pE042, or, or, or initiation, of a mitochondrial ly-, or rEF50, or pE051, with which a nuclear or signal sequence 0 is transformed by Saccharomyces strains. Scythian Creature or other codwheels; , or pWS373A, 4 $ Ki, isolate and purify the target pro, - or pE02CH - AB,. or pE025 - AC, or, by extraction, precipitation, and - AD, or rOECHO; or, chromatography.
SU884355336A 1987-03-14 1988-03-14 Method for obtaining human @@@-dismutase SU1741610A3 (en)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE19873708306 DE3708306A1 (en) 1987-03-14 1987-03-14 Human manganese superoxide dismutase (hMn-SOD)

Publications (1)

Publication Number Publication Date
SU1741610A3 true SU1741610A3 (en) 1992-06-15

Family

ID=6323067

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
SU884355336A SU1741610A3 (en) 1987-03-14 1988-03-14 Method for obtaining human @@@-dismutase

Country Status (4)

Country Link
DE (1) DE3708306A1 (en)
SU (1) SU1741610A3 (en)
UA (1) UA19318A (en)
ZA (1) ZA881743B (en)

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Аналогов в научно-технической и патентной литератуое не обнаружено, ( СПОСОЬ ПОЛУЧЕНИЯ ЧЕЛОВЕЧЕСКОЙ МпОг-ДИСМУТАЗЫ *

Also Published As

Publication number Publication date
DE3708306A1 (en) 1988-09-22
ZA881743B (en) 1989-11-29
UA19318A (en) 1997-12-25

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CA1341387C (en) Human manganese superoxide dismutase (hmn-sod)
Aalto et al. Cloning and sequencing of the yeast Saccharomyces cerevisiae SEC1 gene localized on chromosome IV
FI86079C (en) Process for producing ethanol and a protein or peptide which is heterologous to yeast
Makino et al. Stability-increasing mutants of glucose dehydrogenase from Bacillus megaterium IWG3
Cheng et al. The maltose permease encoded by the MAL61 gene of Saccharomyces cerevisiae exhibits both sequence and structural homology to other sugar transporters.
CA2352609C (en) Expression of alkaline phosphatase in yeast
EP0862640A2 (en) Production of gad65 in methylotrophic yeast
JPH02476A (en) Kluyveromyces as host cell
JP2002514049A (en) Production of auxotrophic mutants of Pichia methanolica
CN100529085C (en) Preparation method of recombinant human plasminogen Kringle 5(hk5)
Sakai et al. High-frequency transformation of a methylotrophic yeast, Candida boidinii, with autonomously replicating plasmids which are also functional in Saccharomyces cerevisiae
SU1741610A3 (en) Method for obtaining human @@@-dismutase
Black et al. Structural basis for the kinetic differences between flavocytochromes b 2 from the yeasts Hansenula anomala and Saccharomyces cerevisiae
US5260204A (en) Human manganese superoxide dismutase (hMn-SOD)
JPS63296689A (en) Urokinase type plasminogen activating factor and its production
Kubelik et al. The Neurospora crassa cyt-20 gene encodes cytosolic and mitochondrial valyl-tRNA synthetases and may have a second function in addition to protein synthesis
US5965426A (en) Protein disulfide isomerase gene derived from strain of methylotrophic yeast
Yu et al. Acetylglutamate synthase from Neurospora crassa: structure and regulation of expression
EP0134773A1 (en) Yeast copper-metallothionein gene
Cox et al. Amino acid substitutions in the ε-subunit of the F1F0-ATPase of Escherichia coli
KR100419530B1 (en) Method for mass-producing human ferritin using recombinant methylotropic yeasts
CA2012025C (en) Dna for expression and secretion
Li et al. Expression of Cu, Zn-superoxide dismutase gene from Saccharomyces cerevisiae in Pichia pastoris and its resistance to oxidative stress
JPH022362A (en) Novel glutathione-peroxidase gene and its use
CA2169567A1 (en) The recombinant production of proteins in yeast