SK109997A3 - Eukaryotic initiation factor 5a (eif-5a) mutants - Google Patents
Eukaryotic initiation factor 5a (eif-5a) mutants Download PDFInfo
- Publication number
- SK109997A3 SK109997A3 SK1099-97A SK109997A SK109997A3 SK 109997 A3 SK109997 A3 SK 109997A3 SK 109997 A SK109997 A SK 109997A SK 109997 A3 SK109997 A3 SK 109997A3
- Authority
- SK
- Slovakia
- Prior art keywords
- eif
- protein
- gene
- sequence
- cdna sequence
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
- A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- A61K38/17—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
- A61P37/04—Immunostimulants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N5/00—Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
- C12N5/10—Cells modified by introduction of foreign genetic material
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Toxicology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Virology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Description
Oblasť techniky
Vynález sa týka mutantných proteínov, spôsobu ich prípravy, farmaceutických prostriedkov, ktoré ich obsahujú a ich použitia.
Doterajší stav techniky
Replikácia vírusu ľudskej imunodeficiencie (HIV) závisí na funkcii vírusového transaktivačného proteínu Rev. Proteín Rev je akumulovaný v, jadrovom priestore hostiteľskej bunky a viaže sa priamo a špecificky na vysoko štruktúrovanú sekvenciu RNA, nazývanú odozvový element Rev (RRE), ktorý sa vyskytuje na každej neúplne zostrihnutej vírusovej mRNA. Po naviazaní, molekuly proteínu Rev konglomerujú práve na RRE a'.spájajú sa s hostiteľským kofaktorom nutným na transaktiváciu Rev, nazývaným eukaryotický iniciačný faktor 5A (eIF-5A; starší názov: eIF-4D). Výsledkom tohto spojenia je jadrovo-cytoplazmatická translokácia neúplne zostrihnutej vírusovej mRNA, následne umožňujúce expresiu vírusových štruktúrnych proteínov (napr. Gag, Pol, Env) a ďalej replikáciu vírusu.
Mutantné proteíny Rev s transdominantnými (dominantne negatívnymi) fenotypmi, ktoré boli opísané (viď napr. WO 90/14427). Títo mutanti Rev sú ďalej schopní väzby na RRE RNA, nie sú však schopní funkčného spojenia s ich bunkovým kofaktorom, a to kvôli mutácii v aktivačnej doméne proteínu Rev.
eIF-5A je endogénny proteín, potrebný na. normálnu funkciu bunky. Už bolo pripravených niekoľko jeho rôznych variantov (napr. J. Biol. Chem. 264 (1989) 18527 - 18530; Mol. Celí. Biol. 11 (1991) 3105 - 3114) a všetky tieto varianty vykazujú nežiaduci vplyv na normálne bunkové funkcie, napr. na bunkový rast.
Podstata vynálezu teraz sa zistilo, že možno pripraviť také mutantné formy proteínu eIF-5A, ktoré neblokujú endogénnu funkciu natívneho elF5A, a normálne nevykazujú aktivitu proteínu eIF-5A, inhibujú však funkciu proteínu Rev; majú teda vzhladom na funkciu proteínu Rev inhibujúci fenotyp.
Toto zistenie je velmi prekvapivé, nakoľko sa nepredpokladalo, že faktor, ktorý je neaktívny v bunkovom prostredí prirodzenom pre jeho nemutovanú formu, by mohol vykazovať inhibičný efekt voči metabolickým pochodom začatým vonkajším mikroorganizmom, akým je vírus. Tiež sa nepredpokladalo, že takéto mutantné formy proteínu eIF-5A, vrátane génov tohto proteínu, by vôbec mohli existovať, pretože proteín eIF-5A je nevyhnutný na bunkovú reguláciu (Biofactors 4 (1993) 95 - 104; TIBS 18 (1993) 475 - 479. Predpokladalo sa, že takéto proteíny vrátane ich génov by boli toxické voči bunke, .zatiaľ čo gény a. proteíny, ktoré sú predmetom tohto vynálezu (najmä M13, M14 a Μ13Δ) sú neaktívne, netoxické a inhibujú proteín Rev, napríklad jeho funkciu v rámci vírusu HIV, a tým i replikáciu HIV.
Predmetom tohto vynálezu sú mutantné formy proteínu eIF-5A, ktorým chýba ich prirodzená bunková aktivita eIF-5A ( v texte nazývaná - endogénna funkcia eIF-5A) a zároveň inhibujú funkciu proteínu Rev, a majú teda inhibičný fenotyp vzhladom na funkciu Rev; ďalej sú predmetom tohto vynálezu im zodpovedajúce gény a príslušné sekvencie DNA a cDNA, ktoré ich kódujú.
Výhodné sú mutanty, ktoré sú podstatne zbavené endogénnej funkcie eIF-5A. Tu uvádzaným eIF-5A je výhodne ľudský eIF-5A a jeho mutácie sú výhodne založené na ľudskej natívnej forme eIF-5A. Tu uvádzaným vírusom HIV je výhodne jeho forma HIV-1.
Mutantnými proteínmi sa podlá vynálezu rozumejú polypeptidy vrátane svojich modifikovaných foriem, ako sú alelické modifikácie alebo ich fragmenty či deriváty schopné inhibovať funkciu proteinu Rev a ktoré výhodne nedisponujú žiadnou endogénnou funkciou eIF-5A. Na farmaceutické účely sa s výhodou používajú vo vysoko čistej forme, teda podstatne zbavenej extraktu z vnútrobunkového prostredia.
Mutácie zahŕňajú výhodne úsek alebo viac úsekov na polypeptidickom reťazci, začínajúce približne na úrovni zodpovedajúcej aminokyseline č. 130 v natívnom genóme eIF-5A (obr. 3, identifikačné č. sekvencie - 17), najmä v úseku približne medzi aminokyselinou č. 135 a koncom molekuly, predovšetkým však medzi č. 135 a č. 139.
Zodpovedajúce gény, alebo sekvencie DNA alebo cDNA sú ukázané napríklad v tabuľke č. 2, predovšetkým pre mutanty eIF-5AM13, elF5AM14 a eIF-5AM13A; ďalej nimi môžu byť také gény či sekvencie, ktoré za prísnych podmienok hybridizujú so sekvenciami kódujúcimi, zmienené proteiny alebo gény či sekvencie, ktoré s nimi nehybridizujú iba v dôsledku degenerácie genetického kódu a zároveň výhodne nehybridizujú s génmi a sekvenciami zodpovedajúcimi natívnym formám.
Predmetom vynálezu sú ďalej prokaryotické a eukaryotické hostiteľské bunky, do ktorých sú transformované alebo transfekované gény alebo sekvencie DNA alebo cDNA definované vyššie, a to tak, že hostiteľská bunka je schopná uskutočniť expresiu týchto génov alebo sekvencii DNA alebo cDNA. Ďalej sú predmetom vynálezu biologicky funkčné plazmidové alebo vírusové vektory DNA, obsahujúce gén alebo sekvenciu DNA alebo cDNA definované vyššie. Predmetom vynálezu sú tiež prokaryotické a eukaryotické hostiteľské bunky, ktoré sú stabilne transformované alebo transfekované vektormi DNA vyššie uvedenými.
Predmetom tohto vynálezu je ďalej spôsob prípravy génov alebo sekvencií DNA alebo cDNA definovaných vyššie, a to vrátane izolácie príslušného natívneho génu zo zodpovedajúceho expresného systému, jeho naklonovania do príslušného systému, uskutočnenie požadovanej genetickej mutácie a izolácia výsledného mutanta z klonu z požadovanou mutáciou.
Vynález ďalej zahŕňa spôsob produkcie vyššie definovaných proteínov, ktorý zahŕňa kultiváciu prokaryotických alebo eukaryotických hostiteľských buniek za prítomnosti vhodných živín a za vhodných kultivačných podmienok, transformovaných alebo transfekovaných génmi alebo sekvenciami DNA alebo cDNA definovanými vyššie, a to takým spôsobom, ktorý umožňuje hostiteľským bunkám produkciu proteínu a poprípade izoláciu výsledného polypeptidického produktu expresie.
Vynález rovnako zahŕňa farmaceutické prostriedky obsahujúce vyššie definované proteíny, spoločne aspoň s jedným farmaceutický vhodným nosičom, s pomocnou -látkou alebo iba s riedidlom.Nosičom môžu byť rovnako bunky izolované z pacientovho tela a upravené in vitro pred ich aplikáciou. Vynález ďalej zahŕňa použitie vyššie definovaných proteínov alebo génov či sekvencií DNA alebo cDNA kódujúcich tieto proteíny pri liečení ochorení vyvolaných retrovirusmi, u ktorých funkcia ich proteínu Rev závisí od funkcie eIF-5A, akými sú vírusy HIV, HTLV-I a HTLV-II. Predmetom vynálezu je tiež ich použitie ako liečiva a ich použitie na prípravu liečiva na liečenie ochorení spôsobených retrovirusmi, u ktorých funkcia ich proteínu Rev závisí od funkcie ; eIF-5A, akými sú vírusy HIV, HTLV-I a HTLV-II.
Postupy a metódy nutné na uskutočnenie tu uvedeného vynálezu sú v odbore známe. Hoci ich príprava tu nie je konkrétne uvedená, zlúčeniny, reakčné činidlá, vektory, bunkové línie a pod., ktoré sú potrebné na uskutočnenie tohto vynálezu, sú všeobecne známe a bežne dostupné alebo ich možno získať už konvenčnými metódami zo známych a bežne dostupných zdrojov alebo im podobné zdroje môžu byť pripravené konvenčnými metódami z iných všeobecne známych a bežne dostupných zdrojov.
Príklady uskutočnenia vynálezu
a) Príprava mutantov eIF-5A
Ľudská cDNA kódujúca eIF-5A (J. Celí Biol. 123/6, 1309 - 1320 /(1993)) bola vložená ako HindlII fragment do jediného reštrikčného miesta HindlII vektora M13mpl8 (Pharmacia, Švédsko). Zodpovedajúca j ednoreťazcová DNA bola použitá na mutagenézu metódou „oligonukleotidom riadenej mutagenézy in vitro, verzia 2 (Amersham, UK).
Sekvencie všetkých mutantov boli určené sekvenovanim DNA za použitia Sequenase
2.0 z United States
Biochemicals. Ďalej bola v bunkách cos všetkých mutovaných, génov kódujúcich eIF-5A ktorej nasledovala imunoprecipitačná analýza uskutočnená expresia (viď Tabuľka č. 1), po špecifická pre eIF-5A, ktorou bola potvrdená prítomnosť požadovaného produktu expresie.
Tabuľka 1
Mutanti eIF-5A
Mutant
Pozícia
Mutácia väzba Rev kômplamentácia (ak) (ak) in vitro v kvasinkách
peIF-5AMl | 4,5,6 | D,L,D-4EJD,L | nz. |
peIF-5AM2 | 9,10 | T.G-^DX | nz. |
peIF-5AM3 | 15,16,17 | S, A,T—> AJ) L | nz. |
peIF-5AM4 | 22,23,24 | C,S,A->GJDX | - |
peIF-5AM5 | 43,44,45 | M.S,T->U)L | |
peIF-5AM6 | 46,47,48 | S,K,T->UDX | |
peIF-5AM7 | 64,65 | F.T-4DL | |
peIF-5AM8 | 69,70 | ||
peIF-5AM9 | 75,76 | S,T-»DL | |
peIF-5AM10 | 98,99,100 | ,YL,S-»LDX | |
peIF-5AMl 1 | 104,105,106 | D,S,G'->QJ)L | nz. |
peIF-5AM12 | 126,127 | K,Y->DX | nz. |
peIF-5AM13 | 135,136 | I,T-+DJL | + |
peIF-5AM14 | 138,139 | L,S,—>DJ. | + |
peIF-5AM15 | 141,142,143 | M,T^-»LDX | nz. |
peIF-5AM16 | 149,150 | LK-»D,L | |
peIF-5AM13A* 135 | DLCCLP-STOP | + |
áno áno áno nie nie nie nie nie nie nie áno áno nie nie áno nie nie *peIF-5A13A je protein so 140 aminokyselinami (ak) po delécii Cterminálnej časti proteínu peIF-5A. Jeho sekvencia je: natívny od aminokyseliny č. 1 až po č. 134 a ďalej aminokyseliny: DLCCLP. Všetky ostatné mutanty vznikli substitúciou aminokyselín.
+ označuje aktivitu natívnu, - označuje žiadnu aktivitu, nz.
označuje nestanovované.
Nukleotidové sekvencie špecifických oligonukleotidov použitých na prípravu uvedených 17 mutantov sú uvedené v Tabuľke 2 (identifikačné č. sekvencie 1 až 16) . Posledný mutant, Μ13Δ, bol pripravený za použitia rovnakého oligonukleotidu ako M13; chyba v postupe mutagenézy však spôsobila vznik mutanta Μ13Δ.
Je nutné vziať na zreteľ, že uvedené sekvencie nukleotidov sú iba reprezentatívnymi ukážkami pre 17 pripravených mutantov, a že je možné pripraviť identické mutanty z celého radu iných sekvencii, ak vezmeme do úvahy napríklad odchýlky od štandardného genetického kódu.
Tabuľka 2
Oligonukleotidy použité na prípravu mutantov eIF-5A
Ml : | 5 ' - | GGC | AGA | TGA | AGA | TCT | CTT | CGA | GAC | AGG | -3 ' |
M2 : | 5 ' - | CTT | GGA | CTT | CGA | AGA | TCT | AGA | TGC | AGG | -3 ' |
M3 : | 5 ' - | GCA | GGG | GCC | GCA | GAT | CTC | TTC | CCA | ATG | C -3 ’ |
M4 : | 5 ' - | CCC | AAT | GCA | GGG | AGA | TCT | ATT | ACG | TAA | G -3 ’ |
M5 : | 5 ' - | CGT | CGA | GAT | AGA | TCT | TTC | GAA | GAC | TGG | -3 ' |
M6 : | 5 ' - | CGA | GAT | GTC | TAC | ΊΤΤ | AGA | TCT | TGG | CAA | GCA CG -3' |
M7 : | 5 ’ - | GGT | ATT | GAC | ATA | GAT | CTT | GGG | AAG | AAA | TAT G -3 * |
M8 : | 5 ' - | GGG | AAG | AAA | GAT | CTA | GAT | ATC | TGC | CCG | -3 1 |
M9 : | 5 ' - | GAT | ATC | TGC | CCA | GAT | CTT | CAT | AAT | ATG | G -3 ' |
M10 : | 5 ' - | GGC | ATC | CAG | GAT | GGG | TTA | GAT | CTA | CTG | CTC CAG GAC |
AGC | G -ľ | 5 ' | |||||||||
Mll : | 5 ' - | CTG | CTC | CAG | GAA | GAT | CTG | GAG | GTA | CGA | G -3 1 |
M12 : | 5 1 - | GAG | ATT | GAG | CAA | GAT | CTC | GAC | TGT | GGA | G -3 ' |
M13 : | 5 ’ - | GAA | GAG | ATC | CTA | GAT | CTG | GTG | CTG | TCT | GCC -3’ |
M14 : | 5 ' - | CCT | GAT | CAC | GGT | AGA | TCT | TGC | CAT | GAC | AGA GG -3' |
M15 : | 5 ' - | GCT | GTC | TGC | CAT | AGA | TCT | GGA | GGC | AGC | TG -3 ’ |
M16 : | 5 1 - | GCA | GCT | GTT | GCA | GAT | CTG | GCC | ATG | GC | -3 1 |
b) Testovanie bunkovej aktivity eIF-5A mutantov eIF-5A v kvasinkách Saccharomyces cerevisiae
Sekvencie kódujúce eIF-5A boli vložené do reštrikčných miest BamHI a Xbal kvasinkového shuttle-vektora pRSGAL s použitím technológie polymerázovej reťazovej reakcie (PCR). Na účely testovania komplementačnej kapacity rôznych mutantov eIF-5A v kvasinkovom kmeni Saccharomyces cerevisiae neobsahujúcom eIF-5A bola použitá plazmidová technológia publikovaná v Mol. Gen. Genet. 244, 646 - 652 (1994) . Výsledky sú zhrnuté v Tabuľke 1; niekoľko mutantov eIF-5A, najmä od peIF-5AM4 až po peIF-5AM10 a ďalej peľF5AM13, peIF-5AM16 a peIF-5AM13Ä bolo identifikovaných ako nefunkčné mutanty proteinu eIF-5A.
c) Väzba in vitro nefunkčných mutovaných proteinov eIF-5A k tránsaktivačnému proteinu Rev vírusu HIV ‘za použitia testu zmeny pohyblivosti na géli
Gény natívnej a všetkých nefunkčných foriem proteinu eIF-5A boli vložené medzi reštrikčné miesta BamHI a EcoRI prokaryotického expresného vektora pGEX-3X (Pharmacia) za použitia polymerázovej reťazovej reakcie a ďalej bola uskutočnená ich expresia vo forme rôznych fúznych proteinov obsahujúcich glutation-S-transferázu (GST) v Escherichia coli, po ktorej nasledovala purifikácia. Rôzne fúzne proteíny GST-eIF-5A boli ďalej použité v testoch zmeny pohyblivosti na géli spolu s RRE RNA označenou izotopom 32P a s rekombinantným proteínom Rev (Náture 342, 816-819 (1989)), podľa postupu opísaného v časopise Biochemistry 32, 10497-10505 (1993).
Ako prvý bol testovaný vplyv natívneho proteinu GST-eIF-5A na komplex RRE:Rev. Ako je ukázané na obrázku IA, prídavok proteinu
GST-eIF-5A do reakčnej zmesi RRE RNA obsahujúcej Rev umožnil detekciu komplexu s vyššou molekulovou hmotnosťou a s jednoznačne zníženou pohyblivosťou (Obr. IA, pruhy 5 a 4) . Tento nebol detekovateľný počas inkubácie RRE RNA spolu s GST alebo so samotným GST-eIF-5A (Obr. IA, pruhy 2 a 3) .
Ďalej sa testovalo, či odpoveď špecifická pre tento proteín eIF-5A závisí od prítomnosti aktivačnej domény v transaktivačnom proteíne Rev. Za účelom tohto zistenia boli použité už skôr opísané mutantné proteíny Rev9A14 a RevllA14 (Biochemistry 32, 8945-8954 (1993)) . Oba tieto proteíny obsahujú vnútornú deléciu v blízkosti C-terminálneho konca a vykazujú voči RRE RNA špecifickú väzbovú afinitu a špecificitu, ktorá je porovnateľná s natívnou formou Rev. Dôležité je, že z proteínu Rev9A14 bola celkom odstránená aktivačná doména, ktorá však v proteíne RevllA14 bola zachovaná. Nižšia molekulová hmotnosť oboch proteínov spôsobila posun prúžkov komplexu RRE:proteín, ktorý bolo ťažko určiť pri teste zmeny pohyblivosti na géli. Výsledky však jednoznačne ukazujú, že mutant s odstránenou áktivačnou doménou Re'v9AÍ4 nie t je schopný interakcie s GST-eIF-5A (Obr. IA, pruhy 6 a 7). Oproti tomu pridanie GST-elF5A k reakčnej zmesi RRE:RevllA14 spôsobil nový výsledok (Obr. IA, pruhy 8 a 9; pomalšie sa pohybujúci bod v pruhu 9), ktorý indikuje interakciu eIF-5A s aktivačnou doménou Rev.
Nakoniec boli podľa rovnakého postupu testované väzbové schopnosti rôznych nefunkčných mutantných proteínov eIF-5A. Ako vyplýva z obrázka 1B, väčšina mutantných proteínov GST-eIF-5A stratila schopnosť rozlišovať komplex RRE:Rev (pruhy 4 až 10 a pruh 13) . Tri nefunkčné mutantné proteíny : GST-eIF-5AM13, GST-eIF-5AM14 a GST-eIF-5AM13A, však dokazujú väzbu, ktorá je porovnateľná s väzbou natívneho proteínu eIF-5A (Obr. 1B, pruh 3 a 11, 12 a 14).
Výsledky teda ukazujú, že mutanty eIF-5AM13, GST-eIF-5AM14 a GST-eIF-5AM13A vyhovujú požiadavkám na inhibítory funkcie HIV-1 Rev, a to vzhľadom:
(1) k strate endogénnej funkcie proteínu eIF-5A (viď komplementáciu v kvasinkách, Tabuľka I), a (2) k väzbovej aktivite voči proteínu HIV-1 Rev (viď väzba Rev in vitro; Tabuľka I a Obrázok 1B) .
d) Konštitutívna inhibicia replikácie HIV-1 v ľudských T-bunkách retrovírusom sprostredkovaným génovým transferom transdominantných mutantov eIF-5A.
Na účely testovania inhibičných fenotypov proteínov eIF-5AM13, eIF-5AM14 a eIF-5AM13A boli príslušné sekvencie kódujúce eIF-5A vložené do reštrikčného miesta Xhol retrovírusového vektora pBC140, zbalené in vitro za použitia bunkovej línie Aml2 a prenesené do ľudských T-buniek CEM na konštitutívnu expresiu, ako je opísané v Proc. Natl. Acad. Sci. 89, 9870-9874 (1992). Expresia natívneho génu eIF-5A, génu kódujúceho eIF-5AM9 a samotného retrovírusového vektora sa využila na 1 'referenčné porovnávanie v týchto experimentoch. Rovnako boli uskutočnené experimenty s HIV-1, a to s použitím TCID s hodnotou 2000/ml kmeňa HIV-1 SF2. Desiaty deň po infekcii SF2 boli odobraté vzorky z kultivačného média na test replikácie HIV-1 pomocou stanovenia proteínu p24 Gag s použitím testu ELISA. Ako je ukázané na Obrázku 2, replikácia HIV-1 bola podstatne znížená v každej z troch nezávisle klonovaných bunkových línií CEM (označenej ako A, B, C) produkujúcich eIF-5AM13, elF5AM14 alebo eIF-5AM13Á (Obrázky 2C, 2D a 2E; vľavo) , a to v porovnaní s bunkami CEM, produkujúcimi mutantný proteín eIF-5AM9 (CEM-eIF-5AM9; Obr. 2B) . Maximálna vírusová replikácia bola zistená v bunkách CEM produkujúcich parentálny vektor pBC140 (vektor CEM; Obr. 2A) alebo natívny proteín eIF-5A, (CEM-eIF-5Awt; Obr. 2A) . Pozorované inhibujúce vlastnosti neboli spôsobené všeobecnou inhibíciou bunkovej proliferácie, čo dokladujú porovnateľné počty buniek v experimentoch (Obr. 2; vpravo). Záverom tieto experimenty dokazujú, že (1) konštitutívna expresia proteinov eIF-5AM13, eIF-5AM14 alebo eIF-5AM13A nemá v ľudských T-bunkách CEM toxické účinky a (2) že eIF-5AM13, elF5AM14 a eIF-5AM13A sú inhibítormi replikácie HIV-1.
HIV je predominantným etiologickým pôvodcom AIDS (syndrómu získanej imunodeficiencie); HTLV-I spôsobuje okrem iného ATL (leukémiu T-buniek dospelých); HTLV-II súvisí etiologicky s niektorými prípadmi variantnej leukémie hairy T-buniek. Bolo zistené, že transaktivátory HIV Rev a HTLV-I Rex sú dôležité na replikáciu vírusu v médiu. Ďalej bolo dokázané, že HTLV-I Rex je schopný funkčne nahradiť proteín Rev v HIV. Navyše, Rev a Rex sú preto možnými cieľmi pre terapeutickú intervenciu u postihnutých pacientov. Mutantné formy eIF-5A podľa vynálezu účinkujú ako efektívne kompetitívne inhibitory natívnej formy Rev alebo/a funkcie natívneho Rex v dôsledku schopnosti Rex funkčne nahradiť rev v Hiv. Vzhľadom ' na to, ' tieto mutantné formy eIF-5A môžu byť tiež efektívnymi inhibítormi replikácie HIV alebo/a HTLV-I alebo/a HTLV-II. Môžu byť teda použité na ochranu lymfoidných alebo/a myeloidných buniek pacientov vystavených infekcii a preto môžu byť použité na liečenie ochorení spôsobených HTLV-I a HTLV-II alebo HIV, a to vrátane AIDS a ARS alebo ARC (syndrómu alebo komplexu súvisiaceho s AIDS). Tiež môžu byť použité na liečenie ochorení spôsobených AIDS, pretože sú schopné inhibovať činnosť proteinov HTLV-I Rex a HIV Rev. Táto vlastnosť môže byť obzvlášť prospešná u pacientov infikovaných viac než jedným vírusovým patogénom a ďalej u tých, u ktorých nie je zistené, ktorým z týchto dvoch pôvodcov sú infikovaní.
Tento vynález je teda určený na profylaxiu a terapiu vírusových a obzvlášť retrovírusových ochorení, ako sú ATL, AIDS, ARS (alebo ARC), infekcie spôsobené vírusmi ako sú SIV (opičí vírus deficitu imunity), ako je SIVmac, FIV (mačací vírus deficitu imunity), EIAV (konský vírus infekčnej anémie), vírus visna, vírus deficitu imunity hovädzieho dobytka a najmä ľudské retrovírusové ochorenia, najmä ľudské retrovírusové ochorenia spôsobené patogénni regulovanými génmi Rex alebo Rev alebo ich ekvivalentami, ako je ATL, AIDS a ARS (alebo ARC). Zvláštnu pozornosť si zasluhuje multivalentné využitie represorového efektu, nakoľko toto využitie je výhodné pri liečení násobných, obzvlášť podvojných vírusových infekcií, ako možno často pozorovať napríklad u osôb užívajúcich intravenózne drogy a infikovaných súčasne HIV a HTLV-I alebo pri liečení infekcií spôsobených jedným patogénom za zvýšeného rizika ďalšej infekcie, ako je infekcia HIV či v prípade profylaxie za takýchto situácií, keď je potrebná ochrana proti infekcii spôsobenej spektrom rôznych vírusových kmeňov.
Terapeutické možnosti tohto vynálezu sú celkom zrejmé, lebo potlačenie napríklad funkcie Rex u HTLV-I a funkcie Rev i HIV blokuje .vírusovú •replikáciu, a tak zabránením tvorby infekčných vírusových častíc znižuje vírusovú záťaž a predpokladá sa teda, že predlžuje latentné obdobie infekcie. Bunky osôb infikovaných vírusom HIV, majúce vo svojom genórae zaintegrovaný gén kódujúci mutantný represor eIF-5A, zostanú funkčné a tieto osoby budú neobmedzene dlho uchránené pred prejavom symptómov ochorenia bez potreby ďalšej dlhodobej terapie.
Z tohto pohľadu sú gény podľa vynálezu sami o sebe liečivami určenými na jednorázové alebo viacrazové dávkovanie buďto priamo in vivo alebo nepriamo in vitro, výhodne ako súčasť vektora, napríklad retrovirálneho alebo plazmidového, a to vo forme vhodnej na dosiahnutie prenosu vo funkčnej forme do cieľových cicavčích buniek. Napríklad inzercia génov kódujúcich tieto inhibítory vírusovej replikácie môže byť uskutočnená in vitro do buniek pacientov priamou implantáciou do genómu lymfoidných alebo/a myeloidných buniek odobratých z týchto pacientov a tieto bunky môžu byť pacientovi dodané na uskutočnenie inzercie. Vzhľadom na to, že HTLV-I a HTLV-II, rovnako tak, ako aj HIV, sa replikujú v rôznych typoch T-buniek, potom ochorenia, ktoré spôsobujú, budú vhodne liečené. T-bunky sú preto požadovanými cieľovými bunkami na genetickú modifikáciu využívajúcu gény podľa vynálezu. Ďalej monocytárne a makrofágové bunky, ktoré sú cieľovými bunkami na infekciu HIV, sú tiež vhodnými cieľovými bunkami na túto modifikáciu. Výhodne sa uskutočňuje modifikácia hematopoetických kmeňových buniek, čím sa zaistí dlhodobá ochrana bunkového potomstva násobného hematopoetického rodu.
Jedno využitie uvedeného súvisí s konceptom génovej terapie uverejneným T. Friedmanom v Science, 244, (1989), 1275 alebo P. M.
Lehnom v Bone Marrow Transplant 1 (1987) 243. Hematopoetické kmeňové bunky sú izolované napríklad z pacientov postihnutých AIDS/ATL, kultivované in vitro a mutantné gény podľa vynálezu, kódujúce inhibítor funkcie, ktorá má byť 'potlačená, menovite funkcie Rev/Rex, sú implantované so týchto buniek s použitím retrovírusových vektorov. Tieto bunky, teraz už rezistentné voči vírusom, sú vrátené do imunitného systému pôvodného pacienta, kde sa očakáva ich proliferácia vzhľadom na ich získanú imunitnú výhodu v porovnaní s ostatnými kmeňovými bunkami. V požadovanom čase sa bude populácia hematopoetických buniek skladať výhradne z buniek produkujúcich represný faktor a bude rezistentný voči vírusom.
Postupy na dosiahnutie uvedeného sú už v odbore známe, viď napríklad USP 4,868,116. Vektory, napríklad retrovirusové alebo plazmidové vektory, na prenos mutovaných génov podľa vynálezu do cieľových cicavčích buniek, ako sú bunky kostnej drene, sú uverejnené alebo k nim existujú odkazy, napríklad v Science 244 (1989) 1275. Napríklad rôzne transdominantné gény kódujúce Rev alebo/a rex už boli vložené do retrovírusových vektorových systémov. Po prenose génu prostredníctvom retrovirusov do ľudských bunkových línii infikovaných napríklad HIV je inhibičný efekt mutantov zrejmý na inhibíciu produkcie vírusov. Zmienený terapeutický koncept je príkladom intracelulárnej imunizácie vysvetlenej v práci D. Baltimora v Náture, 335, (1988), 395. Súhrnne povedané, tento koncept zahŕňa inzerciu génu, ktorý kóduje represor niektorej životne dôležitej funkcie zvoleného vírusu, do príslušných cieľových buniek, ktoré tento vírus infikuje (napr. určité T-bunky a monocytárne a makrofágové bunky v prípade vírusu vyvolávajúceho AIDS). Použitie tohto konceptu pri terapii represorom ktoréhokoľvek vírusu je viazané na podmienku, že použité vektory pre gény kódujúce tieto mutantné proteíny a použité metódy na inzerciu týchto vektorov do príslušných buniek, identifikované ako modely, budú predstavovať efektívny a bezpečný intrabunkový systém prenos na využitie u ľudí aj u zvierat. Pred experimentálnym overením tohto konceptu teda stoja iba etické prekážky, ktoré v súčasnej zabraňujú génovej terapii. Prvý takéto experimenty na osobách už však boli začaté, a to so zameraním na bezpečnosť a vlastnú terapiu (viď G.T,Nabel, Human Gene Therapy, 5, (1994), 7982) . Očakáva sa, že vo veľmi krátkej dobe po overení neškodnosti tohto postupu budú tieto priekopnícke experimenty nasledované podobnými experimentmi s terapeutickými cieľmi, a to predovšetkým za stavov ohrozujúcich život, ako je ochorenie AIDS a že tento vynález sa ukáže ako veľmi vhodný na využitie počas týchto experimentov (viď napr. T. Friedman, Science 244, (1989), 1279, druhý stĺpec: „Infekčné ochorenia).
Ďalším spôsobom využitia tohto vynálezu je inzercia nie génu, ale priamo represného proteínu podľa vynálezu do cieľových buniek. Orálne alebo parenterálne podanie sa uskutočňuje bežným spôsobom umožňujúcim intracelulárnu penetráciu, a to napríklad prostredníctvom lipozómov. V prípadoch takéhoto využitia bude presná dávka samozrejme závisieť na použitej zlúčenine, spôsobe podania a požadovanom liečení; určenie najvhodnejšej dávky v danej situácii je v možnostiach kvalifikovaného odborníka.
Je treba vziať na zreteľ, že v predchádzajúcom texte uvedený vynález môže podliehať rôznym kombináciám alebo zmenám jeho formy, či jednotlivých detailov bez toho, aby došlo k odklonu od rozsahu tohto vynálezu. Tiež je nutné vziať na zreteľ, že do rozsahu tohto vynálezu spadajú tiež ďalšie mutanty okrem tu uvedených, a to vrátane mutantov patriacich medzi mutanty tu uvedené, ktoré však zatiaľ neboli charakterizované, ale môžu byť charakterizované po detailnejšom skúmaní ako inhibujúce alebo/a multivalentné, a ďalej ďalšie mutanty, ktoré zodpovedajú vyššie uvedeným princípom, ale nie sú tu špecificky uvedené.
Prehľad obrázkov na výkresoch:
Obrázok 1:
Obrázok 2:
Obrázok 3:
In vitro experiment posunu RNA na géli.
FP = voľná sonda;' eIF-5A (-) = bez eIF-5A.
Experimenty s HIV-1. Hodnoty p24Gag sú ukázané vľavo. Počty buniek v príslušných experimentoch sú ukázané napravo:
A: | CEM-vektor / eIF-5A wt |
B: | CEM-eIF-5AM9 |
C: | CEM-eIF-5AM13 |
D: | CEM-eIF-5AM14 |
E: CEM-eIF-5AM13Á (Sekvencia č. 17): Sekvencia cDNA a aminokyselín natívneho ľudského eIF-5A (J. Biol. Chem. 264, (1989), 1581) (Sekvencia č. 17); aminokyselina lyzín znázornená na pozícií č. 50 je posttranslačne zmodifikovaná na hypusín. Aminokyseliny natívneho eIF-5A, ktoré boli zmutované podlá prehľadu v Tabuľke 1 sú uvedené kurzívou. Špecifické použité oligonukleotidy (Tabuľka 2, Sekvencia č. 1 až č. 16) zodpovedajú nasledovným pozíciám nukleotidov na Obrázku 3 (Sekvencia č. 17):
Ml: | 3-29 | (27 nukleotidov) |
M2: | 12-38 | (27 nukleotidov) |
M3: | 34-61 | (28 nukleotidov) |
M4 : | 54-81 | (28 nukleotidov) |
M5: | 120-146 | (27 nukleotidov) |
M6: | 123-154 | (32 nukleotidov) |
M7 : | 178-208 | (31 nukleotidov) |
M8 : | 196-222 | (27 nukleotidov) |
M9: | 211-238 | (28 nukleotidov) |
M10 | : 277 -316 | (40 nukleotidov) |
Mll | : 301 - 328 | (28 nukleotidov) |
M12 | : 364 - 391 | (28 nukleotidov) |
Ml 3 | : 391 - 420 | (30 nukleotidov) |
Ml 4 | : 399 - 430 | (32 nukleotidov) |
Ml 5 | : 411 - 439 | (29 nukleotidov) |
Ml 6 | : 433 - 458 | (26 nukleotidov) |
Μ13Δ: 391 -421 | (30 nukleotidov, pozícia č. 409 | |
je : | bez translácie, | a je nasledovaná STOP kodónom na |
pozíciách 422-424), výsledkom sú zmeny aminokyselín uvedené v Tabuľke 1 v sekvencii natívneho proteinu.
Zoznam sekvencii
Informácie o sekvencii č. 1 (Ml):
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) Dĺžka: 27 párov báz (B) Typ:
(C) Reťazec: dvojitý (D) Topológia: lineárna (ii) Druh molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: nie (iii) Antisense: nie (vi) Pôvodný zdroj:
(A) Organizmus: syntetický (x) Informácie o zverejnení:
(H) Číslo dokumentu: - (I) Dátum podania: - (J) Dátum 'zverejnenia: - , .
(xi) Opis sekvencie: Sekvencia č. 1:
GGC AGA TGA AGA TCT CTT CGA GAC AGG
Informácie o sekvencii č. 2 (M2):
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) Dĺžka: 27 párov báz (B) Typ:
(C) Reťazec: dvojitý (D) Topológia: lineárna (ii) Druh molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: nie (iii) Antisense: nie (vi) Pôvodný zdroj:
(A) Organizmus: syntetický (x) Informácie o zverejnení:
(H) Číslo dokumentu: - (I) Dátum podania: - (J) Dátum zverejnenia: - (xi) Opis sekvencie: Sekvencia č. 2:
CTT GGA CTT CGA AGA TCT AGA TGC
Informácie o sekvencii č. 3 (M3):
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | Dĺžka: 28 | párov báz |
(B) | Typ: | |
(C) | Reťazec: | dvoj itý |
(D) | Topológia | : lineárna |
Druh | molekuly: | cDNA , · |
(iii) Hypotetický: nie (iii) Antisense: nie (vi) Pôvodný zdroj:
(A) Organizmus: syntetický (x) Informácie o zverejnení:
(H) Číslo dokumentu: - (I) Dátum podania: - (J) Dátum zverejnenia: - (xi) Opis sekvencie: Sekvencia č. 3:
GCA GGG GCC GCA GAT CTC TTC CCA
Informácie o sekvencii č. 4 (M4):
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) Dĺžka: 28 párov báz
AGG
ATG C (B) Typ:
(C) Reťazec: dvojitý (D) Topológia: lineárna (ii) Druh molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: nie (iii) Antisense: nie (vi) Pôvodný zdroj:
(A) Organizmus: syntetický (x) Informácie o zverejnení:
(H) Číslo dokumentu: - (I) Dátum podania: - (J) Dátum zverejnenia: - (xi) Opis sekvencie: Sekvencia č. 4:
CCC AAT GCA GGG AGA TCT ATT ACG
Informácie o sekvencii č., 5 (M5) (i) Charakteristika sekvencie:
(A) Dĺžka: 27 párov báz (B) Typ:
(C) Reťazec: dvojitý (D) Topológia: lineárna (ii) Druh molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: nie (iii) Antisense: nie (vi) Pôvodný zdroj:
(A) Organizmus: syntetický (x) Informácie o zverejnení:
(H) Číslo dokumentu: - (I) Dátum podania: - (J) Dátum zverejnenia: - (xi) Opis sekvencie: Sekvencia č. 5:
TAA G
CGT CGA GAT AGA TCT TTC GAA GAC TGG
Informácie o sekvencii č. 6 (M6) :
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) Dĺžka: 32 párov báz (B) Typ:
(C) Reťazec: dvojitý (D) Topológia: lineárna (ii) Druh molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: nie (iii) Antisense: nie (vi) Pôvodný zdroj:
(A) Organizmus: syntetický (x) Informácie o zverejnení:
(H) Číslo dokumentu: - (I) Dátum podania: - ' , (J) Dátum zverejnenia: - (xi) Opis sekvencie: Sekvencia č. 6:
CGA GAT GTC TAC TTT AGA TCT TGG CAA GCA CG
Informácie o sekvencii č. 7 (M7) :
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) Dĺžka: 31 párov báz (B) Typ:
(C) Reťazec: dvojitý (D) Topológia: lineárna (ii) Druh molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: nie (iii) Antisense: nie (vi) Pôvodný zdroj:
(A) Organizmus: syntetický (x) Informácie o zverejnení:
(H) Číslo dokumentu: - (I) Dátum podania: - (J) Dátum zverejnenia: -
(xi) | Opis | sekvencie | : Sekvencia č. 7: |
GGT | AT T | GAC ATA | GAT CTT GGG AAG |
Informácie o sekvencii č. 8 (M8) : (i) Charakteristika sekvencie: (A) Dĺžka: 27 párov báz (B) Typ: (C) Reťazec: dvojitý (D) Topológia: lineárna (ii) Druh molekuly: cDNA |
;(ϋί) Hypotetický: nie ‘ (iii) Antisense: nie (vi) Pôvodný zdroj:
(A) Organizmus: syntetický (x) Informácie o zverejnení:
(H) Číslo dokumentu: - (I) Dátum podania: - (J) Dátum zverejnenia: - (xi) Opis sekvencie: Sekvencia č. 8:
GGG AAG AAA GAT CTA GAT ATC TGC CCG
Informácie o sekvencii č. 9 (M9) :
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) Dĺžka: 28 párov báz (B) Typ:
(C) Reťazec: dvojitý (D) Topológia: lineárna (ii) Druh molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: nie (iii) Antisense: nie (vi) Pôvodný zdroj:
(A) Organizmus: syntetický (x) Informácie o zverejnení:
(H) Číslo dokumentu: - (I) Dátum podania: - (J) Dátum zverejnenia: - (xi) Opis sekvencie: Sekvencia č. 9:
GAT ATC TGC CCA GAT CTT CAT AAT
Informácie o sekvencii č. 10 (M10):
(i) Charakteristika, sekvencie:
ATG G
(A) | Dĺžka: 40 | párov báz |
(B) | Typ: | |
(C) | Reťazec: | dvoj itý |
(D) | Topológia | : lineárna |
Druh | molekuly: | cDNA |
(iii) Hypotetický: nie (iii) Antisense: nie (vi) Pôvodný zdroj:
(A) Organizmus: syntetický (x) Informácie o zverejnení:
(H) Číslo dokumentu: - (I) Dátum podania: - (J) Dátum zverejnenia: - (xi) Opis sekvencie: Sekvencia č. 10:
GGC ATC CAG GAT GGG TTA GAT CTA CTG CTC CAG GAC AGC G
Informácie o sekvencii č. 11 (Mll):
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) Dĺžka: 28 párov báz (B) Typ:
(C) Reťazec: dvojitý (D) Topológia: lineárna (ii) Druh molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: nie (iii) Antisense: nie (vi) Pôvodný zdroj:
(A) Organizmus: syntetický (x) Informácie o zverejnení:
(H) Číslo dokumentu: - (I) Dátum podania: - (J) Dátum zve'rejnenia: - , .
(xi) Opis sekvencie: Sekvencia č. 11:
CTG CTC CAG GAA GAT CTG GAG GTA CGA G
Informácie o sekvencii č. 12 (M12):
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) Dĺžka: 28 párov báz (B) Typ:
(C) Reťazec: dvojitý (D) Topológia: lineárna (ii) Druh molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: nie (iii) Antisense: nie (vi) Pôvodný zdroj:
(A) Organizmus: syntetický (x) Informácie o zverejnení:
(H) Čislo dokumentu: - (I) Dátum podania: - (J) Dátum zverejnenia: - (xi) Opis sekvencie: Sekvencia č. 12:
GAG ATT GAG CAA GAT CTC GAC TGT GGA G
Informácie o sekvencii č. 13 (M13):
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) Dĺžka: 30 párov báz (B) Typ:
(C) Reťazec: dvojitý (D) Topológia: lineárna (ii) Druh molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: nie . > ‘ (iii) Antisense: nie (vi) Pôvodný zdroj:
(A) Organizmus: syntetický (x) Informácie o zverejnení:
(H) Číslo dokumentu: - (I) Dátum podania: - (J) Dátum zverejnenia: - (xi) Opis sekvencie: Sekvencia č. 13;
GAA GAG ATC CTA GAT CTG GTG CTG TCT GCC
Informácie o sekvencii č. 14 (M14):
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) Dĺžka: 32 párov báz (B) Typ:
(C) Reťazec: dvojitý (D) Topológia: lineárna (ii) Druh molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: nie (iii) Antisense: nie (vi) Pôvodný zdroj:
(A) Organizmus: syntetický (x) Informácie o zverejnení:
(H) Číslo dokumentu: - (I) Dátum podania: - (J) Dátum zverejnenia: - (xi) Opis sekvencie: Sekvencia č. 14:
CCT GAT CAC GGT AGA TCT TGC CAT GAC AGA GG
Informácie o sekvencii č. 15 (M15):
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) | Dĺžka: 29 párov báz | |
(B) | Typ: | ' 1 |
(C) | Reťazec: | dvojitý |
(D) | Topológia | : lineárna |
(ii) Druh | molekuly: | CDNA |
(iii) Hypotetický: nie (iii) Antisense: nie (vi) Pôvodný zdroj:
(A) Organizmus: syntetický (x) Informácie o zverejnení:
(H) Číslo dokumentu: - (I) Dátum podania: - (J) Dátum zverejnenia: - (xi) Opis sekvencie: Sekvencia č. 15:
GCT GTC TGC CAT AGA TCT GGA GGC AGC TG
Informácie o sekvencii č. 16 (M16):
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) Dĺžka: 26 párov báz (B) Typ:
(C) Reťazec: dvojitý (D) Topológia: lineárna (ii) Druh molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: nie (iii) Antisense: nie (vi) Pôvodný zdroj:
(A) Organizmus: syntetický (x) Informácie o zverejnení:
(H) Číslo dokumentu: - (I) Dátum podania: - (J) Dátum zverejnenia: - (xi) Opis sekvencie.: Sekvencia č. 16: ' · 1
GCA GCT GTT GCA GAT CTG GCC ATG GC
Informácie o sekvencii č. 17 (wt) :
(i) Charakteristika sekvencie:
(A) Dĺžka: 4 65 párov báz ( a 154 aminokyselinových zvyškov) (B) Typ: cDNA (C) Reťazec: dvojitý (D) Topológia: lineárna (ii) Druh molekuly: cDNA (iii) Hypotetický: nie (iii) Antisense: nie (vi) Pôvodný zdroj:
(A) Organizmus: Homo sapiens (x) Informácie o zverejnení:
(H) Číslo dokumentu: J. Biol. Chem. 264 (1989) 1578-1583 (I) Dátum podania: - (J) Dátum zverejnenia: 1989 (xi) Opis sekvencie: Sekvencia č. 17:
10 | TTC GAG | ACA Thr | 30 GGA GAT GCA GGG GCC | TCA Ser | GCC Ala | 50 ACC Thr | |||||||
ATG GCA GAT Met Ala Asp 1 | GAC Asp | TTG GAC | |||||||||||
Leu | Asp | Phe | Glu | Gly Asp 10 | Ala | Gly | Ala | ||||||
70 | 90 | ||||||||||||
TTC CCA ATG | CAG | TGC | TCA | GCA | TTA | CGT | AAG AAT | GGC | TTT | GTG | GTG | CTC | AAA |
Phe Pro Met | Gin | Cys | Ser | Ala | Leu | Arg | Lys Asn | Gly | Phe | Val | Val | Leu | Lys |
20 | |||||||||||||
110 | 130 | 150 | |||||||||||
GGC CGG CCA | TGT | AAG | ATC | GTC | GAG | ATG | TCT ACT | TCG | AAG | ACT | GGC | AAG | CAC |
Gly Arg Pro | Cys | Lys | íle | Val | Glu | Met | Ser Thr | Ser | Lys | Thr | Gly | Lys | His |
40 | 50 | ||||||||||||
170 | 190 | ||||||||||||
GGC CAC GCC | AAG | GTC | CAT | CTG | GTT | GGT | ATT GAC | ATC | TTT | ACT | GGG | AAG | AAA |
Gly His Ala | Lys | Val | His | Leu | Val | Gly | íle Asp | íle | Phe | Thr | Gly | Lys | Lys |
60 | |||||||||||||
210 | 230 | 250 | |||||||||||
’TAT gaa ,GAŤ | ATC | TGC | CCG | TCA | ACT | CAT | AAT ATG | GAT | GTC | ccc | AAC | ATC | AAA |
Tyr Glu Asp | íle | Cys | Pro | Ser | Thr | His | Asn Met | Asp | Val | Pro | Asn | íle | Lys |
70 | 80 | ||||||||||||
270 | 290 | ||||||||||||
AGG AAT 'GAC | TTC | CAG | CTG | ATT | GGC | ATC | CAG GAT | GGG | TAC | CTA | TCA | CTG | CTC |
Arg Asn Asp | Phe | Gin | Leu | íle | Gly | íle | Gin Asp | Gly | Tyr | Leu | Ser | Leu | Leu |
90 | 100 | ||||||||||||
310 | 330 | 350 | |||||||||||
CAG GAC AGC | GGG | GAG | GTA | CGA | GAG | GAC | CTT CGT | CTC | CCT | GAG | GGA | GAC | CTT |
Gin Asp Ser | Gly | Glu | Val | Arg | Glu | Asp | Leu Arg | Leu | Pro | Glu | Gly | Asp | Leu |
110 | |||||||||||||
370 | 390 | 4 | |||||||||||
GGC AAG GAG | ATT | GAG | CAG | AAG | TAC | GAC | TGT GGA | GAA | GAG | ATC | CTG | ATC | ACG |
Gly Lys Glu | íle | Glu | Gin | Lys | Tyr | Asp | Cys Gly | Glu | Glu | íle | Leu | íle | Thr |
120 | 130 | ||||||||||||
10 | 430 | 450 | |||||||||||
GTG CTG TCT | GCC | ATG | ACA | GAG | GAG | GCA | GCT GTT | GCA | ATC | AAG | GCC | ATG | GCA |
Val Leu Ser | Ala | Met | Thr | Glu | Glu | Ala | Ala Val | Ala | íle | Lys | Ala | Met | Ala |
140 | 150 |
AAA TAA Lys End
Claims (13)
1. Mutantný proteín eIF-5A, ktorý inhibuje funkciu Rev, a tým vykazuje inhibičný fenotyp vzhľadom na funkciu Rev alebo gén alebo sekvencia DNA alebo sekvencia cDNA kódujúca tento proteín.
2. Proteín podľa nároku 1, ktorý nedisponuje podstatnou endogénnou funkciou eIF-5A alebo gén alebo sekvencia DNA alebo sekvencia cDNA kódujúca tento proteín.
3. Proteín podľa nároku 1 alebo 2, ktorým je proteín eIF-5AM13, eIF-5AM14 alebo eIF-5AM13A alebo gén alebo sekvencia DNA alebo sekvencia cDNA kódujúca tento proteín.
i
4. Prokaryotická alebo eukaryotická hostiteľská bunka, v .y z n ačujúca sa tým, že je transformovaná alebo transfekovaná génom alebo sekvenciou DNA alebo sekvenciou cDNA podľa nároku 1 alebo 2, a to takým spôsobom, ktorý hostiteľskej bunke umožňuje expresiu tohto génu alebo sekvencie alebo sekvencie cDNA.
5. Biologicky funkčný plazmid alebo vírusový vektor DNA, vyznačujúca sa tým, že obsahuje gén alebo sekvenciu DNA alebo sekvenciu cDNA podľa nároku 1 alebo 2.
6. Prokaryotická alebo eukaryotická hostiteľská bunka, vyznačujúca sa tým, že je stabilne transformovaná alebo transfekovaná biologicky funkčným plazmidom alebo vírusovým vektorom DNA obsahujúcim gén alebo sekvenciu cDNA podľa nároku 1 alebo 2.
7. Spôsob prípravy génu alebo sekvencie DNA alebo sekvencie cDNA podlá nároku 1 alebo 2, vyznačujúci sa tým, že zahŕňa izoláciu zodpovedajúceho natívneho génu z príslušného expresného systému, inzerciu tohto génu do príslušného klonovacieho systému, uskutočnenie požadovanej genetickej mutácie a získanie výsledného mutanta z klonov obsahujúcich požadovanú mutáciu.
8. Spôsob produkcie proteínu podlá nároku 1 alebo 2, vyznačujúci sa tým, že zahŕňa kultiváciu prokaryotických alebo eukaryotických buniek transformovaných alebo transfekovaných génom alebo sekvenciou DNA alebo sekvenciou cDNA podľa nároku 1 alebo 2 za vhodných kultivačných podmienok, a to tak, že hostiteľskej bunke je umožnená expresia proteínu a poprípade tiež izolácia požadovaného polypeptidického produktu expresie.
9. Farmaceutický prostriedok, vyznačujúci sa tým, že zahŕňa proteín podľa nároku Ί alebo 2 spolu s , aspoň, jedným ·. farmaceutický prijateľným nosičom, s pomocnou látkou alebo s riedidlom alebo vo forme buniek odobratých z pacientovho tela a spracovaných in vitro pred ich navrátením do tela.
10. Použitie proteínu podlá nároku 1 alebo 2 alebo génu alebo sekvencie DNA alebo sekvencie cDNA kódujúcej tento proteín pri liečení ochorení spôsobených retrovírusmi, ktorých funkcia Rev závisí na eIF-5A.
11. Použitie proteínu podlá nároku 1 alebo 2 alebo génu alebo sekvencie DNA alebo sekvencie cDNA kódujúcej tento proteín pri liečení ochorení spôsobených HIV, HTLV-I alebo/a HTLV-II.
12. Protein podlá nároku 1 alebo 2 alebo gén alebo sekvencia DNA alebo sekvencia cDNA kódujúca tento protein na použitie ako liečivo.
13. Použitie proteinu podlá nároku 1 alebo 2 na prípravu liečiva na liečenie ochorení spôsobených retrovírusmi, ktorých funkcia Rev závisí od eIF-5A.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
GBGB9502771.0A GB9502771D0 (en) | 1995-02-13 | 1995-02-13 | Organic compounds |
GBGB9513505.9A GB9513505D0 (en) | 1995-07-03 | 1995-07-03 | Organic compounds |
PCT/EP1996/000585 WO1996025492A1 (en) | 1995-02-13 | 1996-02-12 | EUKARYOTIC INITIATION FACTOR 5A (eIF-5A) MUTANTS |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
SK109997A3 true SK109997A3 (en) | 1998-04-08 |
Family
ID=26306494
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SK1099-97A SK109997A3 (en) | 1995-02-13 | 1996-02-12 | Eukaryotic initiation factor 5a (eif-5a) mutants |
Country Status (15)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP0811060A1 (sk) |
JP (1) | JPH10509327A (sk) |
KR (1) | KR19980702160A (sk) |
CN (1) | CN1173897A (sk) |
AU (1) | AU4665196A (sk) |
BR (1) | BR9606951A (sk) |
CA (1) | CA2210538A1 (sk) |
CZ (1) | CZ255397A3 (sk) |
FI (1) | FI972763A (sk) |
HU (1) | HUP9801681A3 (sk) |
IL (1) | IL117113A0 (sk) |
NO (1) | NO973679L (sk) |
PL (1) | PL321239A1 (sk) |
SK (1) | SK109997A3 (sk) |
WO (1) | WO1996025492A1 (sk) |
Families Citing this family (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1999001551A2 (en) * | 1997-06-30 | 1999-01-14 | MAX-PLANCK-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. | Novel inhibitor of cellular proliferation |
US7166467B2 (en) | 2001-07-23 | 2007-01-23 | Senesco Technologies, Inc. | Nucleic acids, polypeptides, compositions, and methods for modulating apoptosis |
US7968523B2 (en) | 2001-07-23 | 2011-06-28 | Senesco Technologies, Inc. | Method for inducing apoptosis using apoptosis-specific EIF5-A |
US7381708B2 (en) | 2001-07-23 | 2008-06-03 | Sensco Technologies, Inc. | Suppression of eIF5A1 expression by the use of antisense oligonucleotides for the prevention of retinal cell death in the glaucomatous eye |
US6867237B1 (en) * | 2001-07-23 | 2005-03-15 | Senesco Technologies, Inc. | DNA encoding apoptosis-induced eucaryotic initiation factor-5A and deoxyhypusine synthase and a method for controlling apoptosis in animals and humans |
US7217517B2 (en) * | 2001-07-23 | 2007-05-15 | Senesco Technologies, Inc. | Nucleic acids, polypeptides, and methods for modulating apoptosis |
TW200427695A (en) | 2003-03-05 | 2004-12-16 | Senesco Technologies Inc | Use of antisense oligonucleotides or sirna to suppress expression of eif-5a1 |
EP1636364A2 (en) * | 2003-06-06 | 2006-03-22 | Senesco Technologies, Inc. | INHIBITION OF APOPTOSIS-SPECIFIC ELF-5A ( EIF-5A1) WITH ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDES AND siRNAs AS ANTI-INFLAMMATORY THERAPEUTICS |
EP2265717A4 (en) | 2008-03-07 | 2012-09-12 | Senesco Technologies Inc | USE OF RNSI TO OBTAIN NEGATIVE REGULATION OF ENDOGENOUS GENE IN COMBINATION WITH THE USE OF SENS BUILDING PRODUCT TO OBTAIN EXPRESSION OF DESIRED POLYNUCLEOTIDE |
US8445638B2 (en) | 2008-09-03 | 2013-05-21 | Senesco Technologies, Inc. | Use of a truncated eIF-5A1 polynucleotide to induce apoptosis in cancer cells |
-
1996
- 1996-02-12 HU HU9801681A patent/HUP9801681A3/hu unknown
- 1996-02-12 AU AU46651/96A patent/AU4665196A/en not_active Abandoned
- 1996-02-12 WO PCT/EP1996/000585 patent/WO1996025492A1/en not_active Application Discontinuation
- 1996-02-12 SK SK1099-97A patent/SK109997A3/sk unknown
- 1996-02-12 PL PL96321239A patent/PL321239A1/xx unknown
- 1996-02-12 EP EP96902265A patent/EP0811060A1/en not_active Withdrawn
- 1996-02-12 JP JP8524649A patent/JPH10509327A/ja active Pending
- 1996-02-12 CZ CZ972553A patent/CZ255397A3/cs unknown
- 1996-02-12 IL IL11711396A patent/IL117113A0/xx unknown
- 1996-02-12 CN CN96191901A patent/CN1173897A/zh active Pending
- 1996-02-12 BR BR9606951A patent/BR9606951A/pt not_active Application Discontinuation
- 1996-02-12 CA CA002210538A patent/CA2210538A1/en not_active Abandoned
- 1996-02-12 KR KR1019970705555A patent/KR19980702160A/ko not_active Application Discontinuation
-
1997
- 1997-06-26 FI FI972763A patent/FI972763A/fi unknown
- 1997-08-11 NO NO973679A patent/NO973679L/no unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JPH10509327A (ja) | 1998-09-14 |
FI972763A0 (fi) | 1997-06-26 |
HUP9801681A3 (en) | 2000-10-30 |
KR19980702160A (ko) | 1998-07-15 |
NO973679D0 (no) | 1997-08-11 |
NO973679L (no) | 1997-10-13 |
IL117113A0 (en) | 1996-06-18 |
MX9705757A (es) | 1998-07-31 |
CN1173897A (zh) | 1998-02-18 |
BR9606951A (pt) | 1997-10-28 |
EP0811060A1 (en) | 1997-12-10 |
FI972763A (fi) | 1997-10-10 |
AU4665196A (en) | 1996-09-04 |
CA2210538A1 (en) | 1996-08-22 |
PL321239A1 (en) | 1997-11-24 |
WO1996025492A1 (en) | 1996-08-22 |
CZ255397A3 (cs) | 1998-02-18 |
HUP9801681A2 (hu) | 1998-10-28 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US8197821B2 (en) | Human immunodeficiency virus integrase—Transportin—SR protein—protein interactions | |
KR20180023911A (ko) | Hiv 감염의 rna-가이드된 치료를 위한 방법 및 조성물 | |
US7838648B2 (en) | Purified SR-p70 protein | |
Saksela | HIV-1 Nef and host cell protein kinases | |
SK109997A3 (en) | Eukaryotic initiation factor 5a (eif-5a) mutants | |
US6338949B1 (en) | Nucleic acids encoding receptor recognition factor stat4 and methods of use thereof | |
SK34596A3 (en) | Nucleotide sequence, vector containing this nucleotide sequence, pharmaceutical agent containing this sequence or this vector and application of this nucleotide sequence | |
EP2004680B1 (en) | N-terminal vdac variants and uses thereof | |
US5869247A (en) | Natural resistance associated macrophage protein and uses thereof | |
AU8072194A (en) | Receptor recognition factors, protein sequences and methods of use thereof | |
WO2000018426A1 (fr) | Inducteurs d'apoptose | |
JP5346216B2 (ja) | 治療 | |
JPH08507204A (ja) | Ras関連gap蛋白質 | |
US6605442B1 (en) | Methods of testing drugs or agents that modulate the activity of receptor recognition factors | |
CA2227508A1 (en) | Paip, a novel human protein which bridges the 3' and 5' end of mrna, and use thereof as a target for translational modulation to treat human disease | |
US20060084600A1 (en) | Human homologues of fused gene | |
JP2023520897A (ja) | 新規免疫調節剤 | |
Levy-Strumpf | Molecular mechanisms underlying negative growth control | |
JP2004089053A (ja) | Aids治療薬のスクリーニング方法 | |
WO2012156825A1 (en) | Peptide-based hiv pre-integration complex inhibitors |