RU2811753C1 - Method of predicting risk of developing diabetic foot syndrome in residents of central russia with type 2 diabetes mellitus based on genotyping of rs7517862 polymorphism of atf6 gene - Google Patents
Method of predicting risk of developing diabetic foot syndrome in residents of central russia with type 2 diabetes mellitus based on genotyping of rs7517862 polymorphism of atf6 gene Download PDFInfo
- Publication number
- RU2811753C1 RU2811753C1 RU2023130592A RU2023130592A RU2811753C1 RU 2811753 C1 RU2811753 C1 RU 2811753C1 RU 2023130592 A RU2023130592 A RU 2023130592A RU 2023130592 A RU2023130592 A RU 2023130592A RU 2811753 C1 RU2811753 C1 RU 2811753C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- type
- diabetic foot
- foot syndrome
- diabetes mellitus
- residents
- Prior art date
Links
- 208000008960 Diabetic foot Diseases 0.000 title claims abstract description 36
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 title claims abstract description 36
- 208000001072 type 2 diabetes mellitus Diseases 0.000 title claims abstract description 36
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 18
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title abstract description 7
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 title description 5
- 101000905751 Homo sapiens Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha Proteins 0.000 claims abstract 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims description 14
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims description 14
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims description 4
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 claims description 3
- 238000007400 DNA extraction Methods 0.000 claims description 2
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 abstract description 15
- 239000003814 drug Substances 0.000 abstract description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 2
- 230000003449 preventive effect Effects 0.000 abstract description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 108010085405 Activating Transcription Factor 6 Proteins 0.000 description 19
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 12
- 102000007481 Activating Transcription Factor 6 Human genes 0.000 description 11
- 238000011161 development Methods 0.000 description 8
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 8
- NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N insulin Chemical compound N1C(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(NC(=O)CN)C(C)CC)CSSCC(C(NC(CO)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CSSCC(NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2C=CC(O)=CC=2)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(C)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2NC=NC=2)NC(=O)C(CO)NC(=O)CNC2=O)C(=O)NCC(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)NC(C(C)O)C(=O)N3C(CCC3)C(=O)NC(CCCCN)C(=O)NC(C)C(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(O)=O)=O)NC(=O)C(C(C)CC)NC(=O)C(CO)NC(=O)C(C(C)O)NC(=O)C1CSSCC2NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(N)CC=1C=CC=CC=1)C(C)C)CC1=CN=CN1 NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 7
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 6
- 108010000178 IGF-I-IGFBP-3 complex Proteins 0.000 description 5
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 5
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 102000004877 Insulin Human genes 0.000 description 4
- 108090001061 Insulin Proteins 0.000 description 4
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 4
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 4
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 4
- 239000012154 double-distilled water Substances 0.000 description 4
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 4
- 229940125396 insulin Drugs 0.000 description 4
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 3
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 101150056950 Ntrk2 gene Proteins 0.000 description 3
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 3
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 3
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 3
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 3
- 229940124645 emergency medicine Drugs 0.000 description 3
- 210000003141 lower extremity Anatomy 0.000 description 3
- 235000012054 meals Nutrition 0.000 description 3
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 3
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 2
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 2
- 210000002237 B-cell of pancreatic islet Anatomy 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000238557 Decapoda Species 0.000 description 2
- 208000032131 Diabetic Neuropathies Diseases 0.000 description 2
- 208000030814 Eating disease Diseases 0.000 description 2
- 208000019454 Feeding and Eating disease Diseases 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- 102000017011 Glycated Hemoglobin A Human genes 0.000 description 2
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L Magnesium chloride Chemical compound [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 108091005682 Receptor kinases Proteins 0.000 description 2
- DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M Sodium laurylsulphate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 102000005937 Tropomyosin Human genes 0.000 description 2
- 108010030743 Tropomyosin Proteins 0.000 description 2
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 2
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 2
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 2
- DDRJAANPRJIHGJ-UHFFFAOYSA-N creatinine Chemical compound CN1CC(=O)NC1=N DDRJAANPRJIHGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 201000009101 diabetic angiopathy Diseases 0.000 description 2
- 201000002249 diabetic peripheral angiopathy Diseases 0.000 description 2
- 201000002342 diabetic polyneuropathy Diseases 0.000 description 2
- 235000014632 disordered eating Nutrition 0.000 description 2
- 235000019441 ethanol Nutrition 0.000 description 2
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 2
- 108091005995 glycated hemoglobin Proteins 0.000 description 2
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 2
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 2
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 2
- 230000003595 spectral effect Effects 0.000 description 2
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 2
- 230000004906 unfolded protein response Effects 0.000 description 2
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 1
- 108091093088 Amplicon Proteins 0.000 description 1
- 206010059245 Angiopathy Diseases 0.000 description 1
- 230000004568 DNA-binding Effects 0.000 description 1
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 1
- 230000006782 ER associated degradation Effects 0.000 description 1
- 108010067770 Endopeptidase K Proteins 0.000 description 1
- 206010071602 Genetic polymorphism Diseases 0.000 description 1
- 206010018429 Glucose tolerance impaired Diseases 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- 206010052341 Impaired insulin secretion Diseases 0.000 description 1
- 108010006519 Molecular Chaperones Proteins 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 1
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007984 Tris EDTA buffer Substances 0.000 description 1
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 210000000227 basophil cell of anterior lobe of hypophysis Anatomy 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 210000004204 blood vessel Anatomy 0.000 description 1
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 230000006037 cell lysis Effects 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 230000036755 cellular response Effects 0.000 description 1
- 230000001684 chronic effect Effects 0.000 description 1
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 1
- 229940109239 creatinine Drugs 0.000 description 1
- 230000007850 degeneration Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000008367 deionised water Substances 0.000 description 1
- 229910021641 deionized water Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 235000005911 diet Nutrition 0.000 description 1
- 230000037213 diet Effects 0.000 description 1
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 1
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 1
- 230000020595 eating behavior Effects 0.000 description 1
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 description 1
- 230000003511 endothelial effect Effects 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 239000003925 fat Substances 0.000 description 1
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 1
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 1
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000013632 homeostatic process Effects 0.000 description 1
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 1
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 1
- 201000001421 hyperglycemia Diseases 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 230000002045 lasting effect Effects 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 239000012139 lysis buffer Substances 0.000 description 1
- 229910001629 magnesium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 238000000816 matrix-assisted laser desorption--ionisation Methods 0.000 description 1
- 238000001840 matrix-assisted laser desorption--ionisation time-of-flight mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 208000030159 metabolic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 238000011328 necessary treatment Methods 0.000 description 1
- 210000005036 nerve Anatomy 0.000 description 1
- 230000001272 neurogenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010984 neurological examination Methods 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 description 1
- 125000003835 nucleoside group Chemical group 0.000 description 1
- 235000016709 nutrition Nutrition 0.000 description 1
- 230000035764 nutrition Effects 0.000 description 1
- 210000003463 organelle Anatomy 0.000 description 1
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 235000021317 phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 150000003013 phosphoric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 230000037081 physical activity Effects 0.000 description 1
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 description 1
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 1
- -1 potassium cations Chemical class 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 235000019833 protease Nutrition 0.000 description 1
- 230000009145 protein modification Effects 0.000 description 1
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 1
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 description 1
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 1
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 1
- 230000016914 response to endoplasmic reticulum stress Effects 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 239000013049 sediment Substances 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 230000026683 transduction Effects 0.000 description 1
- 238000010361 transduction Methods 0.000 description 1
- 108091005703 transmembrane proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000035160 transmembrane proteins Human genes 0.000 description 1
- 230000024883 vasodilation Effects 0.000 description 1
- 235000013311 vegetables Nutrition 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
Abstract
Description
Изобретение относится к области медицинской диагностики, может быть использовано для прогнозирования риска развития синдрома диабетической стопы у жителей Центральной России с сахарным диабетом 2 типа.The invention relates to the field of medical diagnostics and can be used to predict the risk of developing diabetic foot syndrome in residents of Central Russia with type 2 diabetes.
Сахарный диабет 2 типа (СД2) является одним из наиболее распространенных метаболических нарушений во всем мире, и его развитие в первую очередь обусловлено сочетанием двух основных факторов: нарушением секреции инсулина β-клетками поджелудочной железы и неспособностью инсулинзависимых тканей реагировать на инсулин [Roden M, Shulman GI. The integrative biology of type 2 diabetes. Nature. 2019 Dec;576(7785):51-60]. Инсулин – это белковый гормон с молекулярной массой 5800 Да, который вырабатывается β-клетками поджелудочной железы, и обеспечивает регуляцию метаболизма глюкозы, жирных кислот, аминокислот. Эндоплазматический ретикулум (ЭР) является основной органеллой, ответственной за фолдинг инсулина и контроль его качества. Для поддержания гомеостаза ЭР во время стресса клетки активируют путь внутриклеточной трансдукции, называемый клеточным ответом на неупакованные белки или unfolded protein response (UPR) [Roden M, Shulman GI. The integrative biology of type 2 diabetes. Nature. 2019 Dec;576(7785):51-60. doi: 10.1038/s41586-019-1797-8]. В этом клеточном ответе принимает участие активирующий транскрипционный фактор 6, кодируемый геном ATF6, который инициирует транскрипцию генов-мишеней, а именно, генов шаперонов, ферментов модификации белков и биосинтеза липидов, компонентов ассоциированной с ЭР деградации, в результате чего увеличивается размер ЭР, активность фолдинга и деградация неправильно свернутых белков во время стресса ЭР [Haze K, Yoshida H, Yanagi H, Yura T, Mori K. Mammalian transcription factor ATF6 is synthesized as a transmembrane protein and activated by proteolysis in response to endoplasmic reticulum stress. Mol Biol Cell. 1999 Nov;10(11):3787-99. doi: 10.1091/mbc.10.11.3787; Papa F. R. Endoplasmic reticulum stress, pancreatic β-cell degeneration, and diabetes / F. R. Papa // Cold Spring Harbor perspectives in medicine. – 2012. – Vol. 2, Iss. 9. – Art. a00766.]. Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is one of the most common metabolic disorders worldwide, and its development is primarily due to a combination of two main factors: impaired insulin secretion by pancreatic β-cells and the inability of insulin-dependent tissues to respond to insulin [Roden M, Shulman G.I. The integrative biology of type 2 diabetes. Nature. 2019 Dec;576(7785):51-60]. Insulin is a protein hormone with a molecular weight of 5800 Da, which is produced by β-cells of the pancreas and regulates the metabolism of glucose, fatty acids, and amino acids. The endoplasmic reticulum (ER) is the main organelle responsible for insulin folding and quality control. To maintain ER homeostasis during stress, cells activate an intracellular transduction pathway called the cellular unfolded protein response (UPR) [Roden M, Shulman GI. The integrative biology of type 2 diabetes. Nature. 2019 Dec;576(7785):51-60. doi:10.1038/s41586-019-1797-8]. This cellular response involves activating transcription factor 6, encoded by the ATF6 gene, which initiates the transcription of target genes, namely, chaperone genes, protein modification enzymes and lipid biosynthesis, components of ER-associated degradation, resulting in an increase in ER size and folding activity and degradation of misfolded proteins during ER stress [Haze K, Yoshida H, Yanagi H, Yura T, Mori K. Mammalian transcription factor ATF6 is synthesized as a transmembrane protein and activated by proteolysis in response to endoplasmic reticulum stress. Mol Biol Cell. 1999 Nov;10(11):3787-99. doi: 10.1091/mbc.10.11.3787; Papa FR Endoplasmic reticulum stress, pancreatic β-cell degeneration, and diabetes / FR Papa // Cold Spring Harbor perspectives in medicine. – 2012. – Vol. 2, Iss. 9. – Art. a00766.].
Согласно ресурсу GTEx portal , полиморфный вариант rs7517862 гена ATF6 снижает экспрессию ATF6 в различных тканях, что может способствовать поражению нервов и сосудов в условиях хронической гипергликемии, провоцируя развитие синдрома диабетической стопы при сахарном диабете 2 типа [Chu WS, Das SK, Wang H, Chan JC, Deloukas P, Froguel P, Baier LJ, Jia W, McCarthy MI, Ng MC, Damcott C, Shuldiner AR, Zeggini E, Elbein SC. Activating transcription factor 6 (ATF6) sequence polymorphisms in type 2 diabetes and pre-diabetic traits. Diabetes. 2007 Mar;56(3):856-62. doi: 10.2337/db06-1305]. According to the GTEx portal resource, the rs7517862 polymorphic variant of the ATF6 gene reduces the expression of ATF6 in various tissues, which can contribute to damage to nerves and blood vessels under conditions of chronic hyperglycemia, provoking the development of diabetic foot syndrome in type 2 diabetes mellitus [Chu WS, Das SK, Wang H, Chan JC, Deloukas P, Froguel P, Baier LJ, Jia W, McCarthy MI, Ng MC, Damcott C, Shuldiner AR, Zeggini E, Elbein SC. Activating transcription factor 6 (ATF6) sequence polymorphisms in type 2 diabetes and pre-diabetic traits. Diabetes. 2007 Mar;56(3):856-62. doi:10.2337/db06-1305].
Известен способ диагностики синдрома диабетической стопы (RU 2 750 361 C1 от 28.06.2021), включающий биохимическое исследование венозной крови у лиц с сахарным диабетом 2 типа. Согласно способу, у пациентов женского пола в возрасте 64 года и старше, страдающих сахарным диабетом 2 типа более 18 лет, при увеличении показателя креатинина 83 мкмоль/л и выше диагностируют синдром диабетической стопы.There is a known method for diagnosing diabetic foot syndrome (RU 2 750 361 C1 dated June 28, 2021), including a biochemical study of venous blood in individuals with type 2 diabetes mellitus. According to the method, in female patients aged 64 years and older, suffering from type 2 diabetes mellitus for more than 18 years, with an increase in creatinine of 83 µmol/l and above, diabetic foot syndrome is diagnosed.
Недостатком метода является то, что способ диагностики синдрома диабетической стопы применим только для женщин в возрасте от 64 лет и не может быть использован для мужчин и пациентов с сахарным диабетом 2 типа младше 64 лет.The disadvantage of the method is that the method for diagnosing diabetic foot syndrome is applicable only to women over the age of 64 years and cannot be used for men and patients with type 2 diabetes mellitus under 64 years of age.
Известен способ прогнозирования развития синдрома диабетической стопы у женщин с СД2 (RU 2 791 697 C1, дата публикации 13.03.2023). Для этого у пациентов женского пола с СД2 определяют возраст, длительность сахарного диабета, тип нарушения пищевого поведения (ПП), индексы вазодилатации в эндотелиальном (Kэ) и нейрогенном диапазоне (Kn). При сочетании таких факторов, как возраст старше 56,3 лет, стаж диабета более 9,1 лет, Ке ниже 0,86 и Кn ниже 1,6, показатель ограничительного пищевого поведения выше 3,11 - прогнозируют риск развития синдрома диабетической стопы у женщин с сахарным диабетом 2 типа. There is a known method for predicting the development of diabetic foot syndrome in women with T2DM (RU 2 791 697 C1, publication date 03/13/2023). For this purpose, age, duration of diabetes mellitus, type of eating disorder (ED), vasodilation indices in the endothelial (Ke) and neurogenic range (Kn) are determined in female patients with T2DM. When a combination of factors such as age over 56.3 years, diabetes experience more than 9.1 years, Ke below 0.86 and Kn below 1.6, restrictive eating behavior rate above 3.11, the risk of developing diabetic foot syndrome in women is predicted with type 2 diabetes mellitus.
Данное изобретение позволяет проводить диагностику только у пациентов женского пола, что является существенным недостатком.This invention allows diagnosis only in female patients, which is a significant drawback.
Известен способ прогнозирования тяжелого течения диабетической полинейропатии и развития синдрома диабетической стопы (RU 2687978 C1, дата публикации 17.05.2019), включающий исследование сывороточного уровня тропомиозинового рецептора киназы (TrkB) методом твердофазного иммуноферментного анализа у пациента с сахарным диабетом, дополнительно определяют уровень гликированного гемоглобина в крови. В последующем высчитывают коэффициент по формуле регрессионной модели K=0,3*HbA1C+0,4*TrkB, где K - коэффициент, 0,3 - константа регрессии, HbAlC - уровень гликированного гемоглобина, 0,4 - константа регрессии, TrkB - сывороточный уровень тропомиозинового рецептора киназы типа В. Коэффициент K>5 свидетельствует о высокой вероятности тяжелого течения диабетической полинейропатии и высоком риске развития синдрома диабетической стопы. There is a known method for predicting the severe course of diabetic polyneuropathy and the development of diabetic foot syndrome (RU 2687978 C1, publication date 05/17/2019), including the study of the serum level of tropomyosin receptor kinase (TrkB) by enzyme-linked immunosorbent assay in a patient with diabetes mellitus, additionally determining the level of glycated hemoglobin in blood. Subsequently, the coefficient is calculated using the regression model formula K=0.3*HbA1C+0.4*TrkB, where K is the coefficient, 0.3 is the regression constant, HbAlC is the level of glycated hemoglobin, 0.4 is the regression constant, TrkB is serum level of tropomyosin receptor kinase type B. Coefficient K>5 indicates a high probability of severe diabetic polyneuropathy and a high risk of developing diabetic foot syndrome.
Данный метод не является специфичным для сахарного диабета 2 типа и не учитывает генетико-этнические особенности пациентов.This method is not specific for type 2 diabetes mellitus and does not take into account the genetic and ethnic characteristics of patients.
Наиболее близок по результату исследования способ прогнозирования риска развития диабетической ангиопатии нижних конечностей у больных сахарным диабетом 2 типа по патенту на изобретение RU 2507520 C1 (дата публикации 20.02.2014). Данный способ включает выделение ДНК из периферической венозной крови, анализ полиморфизма -308G/A гена фактора некроза опухоли α и при выявлении аллеля -308A TNFα прогнозируют повышенный риск развития ангиопатии нижних конечностей у больных сахарным диабетом 2 типа. The closest study result is the method for predicting the risk of developing diabetic angiopathy of the lower extremities in patients with type 2 diabetes mellitus according to the invention patent RU 2507520 C1 (publication date 02/20/2014). This method involves isolating DNA from peripheral venous blood, analyzing the -308G/A polymorphism of the tumor necrosis factor α gene, and by identifying the -308A TNFα allele, predicting an increased risk of developing angiopathy of the lower extremities in patients with type 2 diabetes mellitus.
Однако данный способ выявляет предрасположенность к развитию диабетической ангиопатии нижних конечностей, а не синдрома диабетической стопы у больных с сахарным диабетом 2 типа.However, this method reveals a predisposition to the development of diabetic angiopathy of the lower extremities, and not diabetic foot syndrome in patients with type 2 diabetes mellitus.
Технический результат заключается в получении критериев оценки риска формирования синдрома диабетической стопы у жителей Центральной России с сахарным диабетом 2 типа по данным о генетическом полиморфизме rs7517862 (G>C) гена ATF6. The technical result consists in obtaining criteria for assessing the risk of developing diabetic foot syndrome in residents of Central Russia with type 2 diabetes mellitus based on data on the genetic polymorphism rs7517862 (G>C) of the ATF6 gene.
Технический результат достигается тем, что после экстракции ДНК проводят анализ полиморфного варианта гена ATF6 rs7517862 (G>С) и прогнозируют повышенный риск формирования синдрома диабетической стопы у жителей Центральной России с сахарным диабетом 2 типа при выявления генотипа rs7517862-С/С, а при обнаружении генотипов rs7517862-G/G или rs7517862-G/C – низкий риск развития синдрома диабетической стопы у жителей Центральной России с сахарным диабетом 2 типа.The technical result is achieved by the fact that after DNA extraction, the polymorphic variant of the gene is analyzedATF6 rs7517862 (G>C) and predict an increased risk of developing diabetic foot syndrome in residents of Central Russia with type 2 diabetes mellitus when the rs7517862-C/C genotype is detected, and when genotypes rs7517862-G/G or rs7517862-G/C are detected, a low risk of developing diabetic foot syndrome in residents Central Russia with type 2 diabetes mellitus.
Способ осуществляют следующим образом:The method is carried out as follows:
1. Выделение ДНК из периферической венозной крови. На первом этапе к 0,5 мл крови добавляли 0,5 мл PBS и центрифугировали 10 мин при 12 тыс. об/мин. Надосадочную жидкость сливали, добавляли 1 мл PBS и вновь центрифугировали при тех же условиях. Надосадочную жидкость сливали, добавляли 200 мкл ТЕ-буфера, пипетировали до растворения осадка и затем последовательно добавляли 10 мкл 1% раствора додецилсульфата натрия SDS и 5 мкл протеиназы К. Пробирки инкубировали в термостате при t=37˚C 12 ч. В ходе второго этапа проводили четыре последовательных центрифугирования с фенолом и хлороформом согласно протоколу методики (10 мин, 8 тыс. об/мин), после чего ДНК осаждали ледяным раствором 95% этилового спирта и центрифугировали 10 мин при 14,3 тыс. об/мин. По испарении спирта ДНК растворяли в 100 мкл деионизированной дистиллированной воды. Получаемый раствор ДНК в воде имел чистоту в диапазоне А260/280=1,5-2,0 и среднюю концентрацию около 180-200 нг/мкл.1. Isolation of DNA from peripheral venous blood. At the first stage, 0.5 ml of PBS was added to 0.5 ml of blood and centrifuged for 10 min at 12 thousand rpm. The supernatant was discarded, 1 ml of PBS was added and centrifuged again under the same conditions. The supernatant was discarded, 200 μl of TE buffer was added, pipetted until the sediment dissolved, and then 10 μl of 1% sodium dodecyl sulfate SDS solution and 5 μl of proteinase K were successively added. The tubes were incubated in a thermostat at t = 37˚C for 12 hours. During the second stage Four successive centrifugations with phenol and chloroform were performed according to the protocol (10 min, 8 thousand rpm), after which the DNA was precipitated with an ice-cold solution of 95% ethyl alcohol and centrifuged for 10 min at 14.3 thousand rpm. After the alcohol had evaporated, the DNA was dissolved in 100 μl of deionized distilled water. The resulting DNA solution in water had a purity in the range A260/280=1.5-2.0 and an average concentration of about 180-200 ng/μl.
Экстракция геномной ДНК из цельной крови колоночным методом проводилась с помощью набора QIAamp DNA blood mini kit (QIAGEN, Германия) на автоматической станции QiaCube (QIAGEN, Германия). Роботизированный протокол продолжительностью 58 минут включал этап лизиса клеток 0,2 мл цельной крови с помощью лизирующего буфера и протеиназы к QIAGEN, инкубирование, перенос лизата в колонку, связывание ДНК с мембраной колонки, центрифугирование, двукратное промывание колонки буфером AW1 и AW2, центрифугирование колонки и, наконец, элюирование очищенной ДНК. Получаемый раствор ДНК в воде имел идеальную чистоту А260/280=1,7-1,9 и среднюю концентрацию около 40-50 нг/мкл. Экстрагированные из крови образцы ДНК хранились в морозильниках Thermo Fisher Scientific (США) при -20˚С. Extraction of genomic DNA from whole blood by the column method was carried out using the QIAamp DNA blood mini kit (QIAGEN, Germany) on a QiaCube automatic station (QIAGEN, Germany). The robotic protocol lasting 58 minutes included the stage of cell lysis of 0.2 ml of whole blood using lysis buffer and proteinase to QIAGEN, incubation, transfer of the lysate to the column, DNA binding to the column membrane, centrifugation, washing the column twice with buffer AW1 and AW2, centrifugation of the column and finally eluting the purified DNA. The resulting DNA solution in water had ideal purity A260/280 = 1.7-1.9 and an average concentration of about 40-50 ng/μl. DNA samples extracted from blood were stored in Thermo Fisher Scientific (USA) freezers at -20˚C.
2. Подготовка образцов ДНК к масс-спектрометрическому анализу. Качество выделенной ДНК оценивали по степени чистоты и концентрации раствора на спектрофотометре NanoDrop (Thermo Fisher Scientific, США). Все анализируемые образцы ДНК были разведены деионизированной водой до концентрации 10 нг/мкл при А260/280=1,5-2,0. 2. Preparation of DNA samples for mass spectrometric analysis. The quality of the isolated DNA was assessed by the degree of purity and concentration of the solution using a NanoDrop spectrophotometer (Thermo Fisher Scientific, USA). All analyzed DNA samples were diluted with deionized water to a concentration of 10 ng/μl at A260/280=1.5-2.0.
3. Анализ полиморфизма гена ATF6 - генотипирование методом матрично-активированной лазерной десорбционно-ионизационной масс-спектрометрии MALDI-TOF. Использовали следующие последовательности праймеров: прямой F: 5`- ACGTTGGATGCTCGGCAGAGTAAGTCCTAA -3`, обратный R: 5`- ACGTTGGATGAAACCCCACCTCTAGTAATC -3`, праймер удлинения E: 5`- GGCAGAGTAAGTCCTAAATAAATGTT -3`. Для приготовления ПЦР-микса (в расчете на один спектральный чип) в центрифужную микропробирку вносили 80,6 мкл ddH2O, 50,4 мкл 10x буфера, 40,3 мкл MgCl2 (концентрация 25 ммоль/л), 10,1 мкл смеси дНТФ (концентрация 25 ммоль/л), 100,8 мкл смеси ПЦР-праймеров (концентрация 0,5 мкмоль/л) и 20,16 мкл HotStartTaq полимеразы (концентрация 5 ЕД/мкл). Смесь вортексировали и раскапывали в 96-луночный ПЦР-планшет по 3 мкл в лунку, после чего с помощью восьмиканального дозатора вносили по 2 мкл ДНК (концентрация 10 нг/мкл). Планшет заклеивали, центрифугировали 20 сек при 1000 об/мин и загружали в термоциклер CFX96 Bio-Rad на 125 мин при следующем режиме: денатурация 2 мин при 95°С, амплификация 44 цикла, состоящая из денатурации 30 сек при 95°С, отжига 30 сек при 56°С и элонгации 60 сек при 72°С. После чего пробы инкубировали 5 мин при 72°С. Не прореагировавшие в ходе ПЦР дНТФ удаляли с помощью реакции SAP (shrimp alkaline phosphatase), в ходе которой щелочная фосфатаза креветки гидролизовала дНТФ до нуклеозидов и фосфатов. Для приготовления SAP-микса в микропробирке смешивали 161,6 мкл ddH2O, 18 мкл 10хTS буфера и 31,7 мкл SAP фермента. Далее вносили по 2 мкл SAP-смеси в каждую лунку, планшет заклеивали, центрифугировали 20 сек при 1000 об/мин и загружали в термоциклер CFX96 Bio-Rad на 55 мин при следующем режиме: 45 мин при 37°С и 10 мин при 85°С. Для проведения третьей реакции iPLEX готовили Е-праймер-микс из расчета 8,8 мкл праймеров Е1-Е9, 11,7 мкл праймеров Е10-Е18, 14,6 мкл праймеров Е19-Е27, 17,5 мкл праймеров Е28-Е35 и 45,1 мкл ddH2O. После масс-спектрометрической оценки интенсивности пиков Е-праймеров в полученной смеси, в микс добавляли Е-праймеры в количествах, необходимых для достижения одинаковой интенсивности сигнала. Для приготовления iPLEX-микса в микропробирке смешивали 65,4 мкл ddH2O, 21,2 мкл iPLEX буфера, 21,2 мкл терминирующей смеси, 99,3 мкл Е-праймер-микса и 4,33 мкл iPLEX-фермента, вортексировали и раскапывали в лунки по 2 мкл. Планшет заклеивали, центрифугировали 20 секунд при 1000 об/мин и загружали в термоциклер CFX96 Bio-Rad на 135 мин при следующем режиме: денатурация 30 сек при 94°С, затем 40 циклов, состоящие из денатурации 5 сек при 94°С, отжига 5 сек при 52°С, элонгации 5 сек при 80°С, с последующим инкубированием в течение 3 мин при 72°С. По завершении реакции iPLEX, планшет охлаждали до +4˚С, добавляли по 30 мкл воды во все лунки, центрифугировали 1 мин при 1000 об/мин и загружали в масс-спектрометр. Ввиду того, что небольшие полярные молекулы и положительно заряженные катионы натрия и калия могут образовывать аддукты с олигонуклеотидами и создавать серию контаминантных пиков, ампликоны были подвергнуты роботизированному обессоливанию путем их обработки смолой SpectroCLEAN (Agena Bioscience). Перенос образцов на спектральный чип с матрицей для ионизации осуществлялся в автоматическом режиме на рабочей станции Nanodispenser. 3. Analysis of ATF6 gene polymorphism - genotyping using matrix-assisted laser desorption ionization mass spectrometry MALDI-TOF. The following primer sequences were used: forward F: 5'- ACGTTGGATGCTCGGCAGAGTAAGTCCTAA -3', reverse R: 5'- ACGTTGGATGAAACCCCACCTCTAGTAATC -3', extension primer E: 5'- GGCAGAGTAAGTCCTAAATAAAATGTT -3'. To prepare the PCR mix (per spectral chip), 80.6 µl ddH2O, 50.4 µl 10x buffer, 40.3 µl MgCl2 (concentration 25 mmol/l), 10.1 µl dNTP mixture ( concentration 25 mmol/l), 100.8 μl of PCR primer mixture (concentration 0.5 μmol/l) and 20.16 μl HotStartTaq polymerase (concentration 5 U/μl). The mixture was vortexed and pipetted into a 96-well PCR plate (3 μl per well), after which 2 μl of DNA (concentration 10 ng/μl) was added using an eight-channel dispenser. The plate was sealed, centrifuged for 20 sec at 1000 rpm and loaded into a CFX96 Bio-Rad thermal cycler for 125 min under the following regime: denaturation 2 min at 95°C, amplification 44 cycles, consisting of denaturation 30 sec at 95°C, annealing 30 sec at 56°C and elongation 60 sec at 72°C. Then the samples were incubated for 5 min at 72°C. The dNTPs that did not react during PCR were removed using the SAP (shrimp alkaline phosphatase) reaction, during which shrimp alkaline phosphatase hydrolyzed the dNTPs to nucleosides and phosphates. To prepare the SAP mix, 161.6 μl of ddH2O, 18 μl of 10xTS buffer and 31.7 μl of SAP enzyme were mixed in a microtube. Next, 2 μl of the SAP mixture was added to each well, the plate was sealed, centrifuged for 20 sec at 1000 rpm and loaded into a CFX96 Bio-Rad thermal cycler for 55 min in the following mode: 45 min at 37°C and 10 min at 85°C WITH. To carry out the third iPLEX reaction, an E-primer mix was prepared at the rate of 8.8 μl of primers E1-E9, 11.7 μl of primers E10-E18, 14.6 μl of primers E19-E27, 17.5 μl of primers E28-E35 and 45 .1 µl ddH2O. After mass spectrometric assessment of the intensity of the E-primer peaks in the resulting mixture, E-primers were added to the mix in the quantities necessary to achieve the same signal intensity. To prepare the iPLEX mix, 65.4 μl of ddH2O, 21.2 μl of iPLEX buffer, 21.2 μl of termination mixture, 99.3 μl of E-primer mix and 4.33 μl of iPLEX enzyme were mixed in a microtube, vortexed and dispensed into wells 2 µl. The plate was sealed, centrifuged for 20 seconds at 1000 rpm and loaded into a CFX96 Bio-Rad thermal cycler for 135 minutes under the following conditions: denaturation for 30 seconds at 94°C, then 40 cycles consisting of denaturation for 5 seconds at 94°C, annealing for 5 sec at 52°C, elongation for 5 sec at 80°C, followed by incubation for 3 min at 72°C. Upon completion of the iPLEX reaction, the plate was cooled to +4˚С, 30 μl of water was added to all wells, centrifuged for 1 min at 1000 rpm and loaded into the mass spectrometer. Because small polar molecules and positively charged sodium and potassium cations can form adducts with oligonucleotides and create a series of contaminant peaks, the amplicons were robotically desalted by treating them with SpectroCLEAN resin (Agena Bioscience). The transfer of samples to a spectral chip with a matrix for ionization was carried out automatically on a Nanodispenser workstation.
Статистические расчеты проводили с помощью программы SNPStats (Solé, X., Guinó, E., Valls, J., Iniesta, R., & Moreno, V. (2006). SNPStats: a web tool for the analysis of association studies. Bioinformatics, 22(15), 1928-1929). Statistical calculations were performed using the SNPStats program (Solé, X., Guinó, E., Valls, J., Iniesta, R., & Moreno, V. (2006). SNPStats: a web tool for the analysis of association studies. Bioinformatics , 22(15), 1928-1929).
4. Прогнозирование повышенного риска формирования синдрома диабетической стопы в случае выявления генотипа rs7517862-С/С ATF6, и пониженного риска развития этого осложнения сахарного диабета 2 типа при выявлении генотипов rs7517862-G/G или rs7517862-G/C гена ATF6.4. Prediction of an increased risk of developing diabetic foot syndrome if the rs7517862-C/C ATF6 genotype is identified, and a reduced risk of developing this complication of type 2 diabetes mellitus if the rs7517862-G/G or rs7517862-G/C genotypes of the ATF6 gene are identified.
Возможность использования предложенного способа для определения риска развития синдрома диабетической стопы у жителей Центральной России подтверждает анализ результатов наблюдений 1579 пациентов с СД2, у 105 из которых установлен синдром диабетической стопы. В исследование включались лица славянской национальности Центральной России. Диагноз СД2 был установлен врачами-эндокринологами ОБУЗ КГК БСМП на основе клинического и лабораторно-инструментального обследования. Установлено, что генотипы rs7517862-G/G и rs7517862-G/С значимо чаще встречались у пациентов без синдрома диабетической стопы (93%) по сравнению с больными СД2, имеющими данное осложнение основного заболевания (76%). Носительство генотипа rs7517862-С/С ATF6 ассоциировалось с повышенным риском развития синдрома диабетической стопы: OR=4,02, 95% CI 1,76-9,16, P=0,0033 (таблица 1). The possibility of using the proposed method to determine the risk of developing diabetic foot syndrome in residents of Central Russia is confirmed by an analysis of the results of observations of 1579 patients with T2DM, 105 of whom were diagnosed with diabetic foot syndrome. The study included persons of Slavic nationality in Central Russia. The diagnosis of T2DM was established by endocrinologists of the Regional Clinical Hospital of the Emergency Hospital on the basis of clinical and laboratory-instrumental examination. It was found that the rs7517862-G/G and rs7517862-G/C genotypes were significantly more common in patients without diabetic foot syndrome (93%) compared to patients with T2DM who have this complication of the underlying disease (76%). Carriage of the rs7517862-C/C ATF6 genotype was associated with an increased risk of developing diabetic foot syndrome: OR=4.02, 95% CI 1.76-9.16, P=0.0033 (Table 1).
Таблица 1Table 1
Ассоциация полиморфного варианта rs7517862 гена ATF6 с синдромом диабетической стопы у пациентов с сахарным диабетом 2 типаAssociation of the rs7517862 polymorphic variant of the ATF6 gene with diabetic foot syndrome in patients with type 2 diabetes mellitus
(SNP ID)Gene
(SNP ID)
типGeno-
type
(95% CI)2 OR
(95% CI) 2
(n=115)No diabetic foot syndrome
(n=115)
(n=1239)With diabetic foot syndrome
(n=1239)
2Отношения шансов и 95% доверительный интервал с поправками на ковариаты – возраст, пол и индекс массы тела. 1 Level of significance of association adjusted for covariates – age, gender and body mass index;
2 Odds ratios and 95% confidence intervals adjusted for covariates age, sex and body mass index.
В качестве примеров конкретного применения разработанного способа приведено генетическое обследование пациентов Центральной России, не являющихся родственниками между собой: проведено генетическое обследование по локусу rs7517862 (G>С) гена ATF6. As examples of a specific application of the developed method, a genetic examination of patients in Central Russia who are not related to each other is given: a genetic examination was carried out at the rs7517862 (G>C) locus of the ATF6 gene.
Пациентка С., 67 лет, находилась на стационарном лечении в ОБУЗ КГКБ СМП г. Курска с 09.10.2018 по 19.10.2018. Диагноз: сахарный диабет, 2 тип, фаза декомпенсации 09.10.2018, фаза компенсации от 19.10.2018. Индивидуальный целевой уровень HbA1c<7,5%. Целевой уровень гликемии плазмы натощак <7,5 ммоль/л, через 2 ч после еды <11,0 ммоль/л. У пациентки была взята венозная кровь, при генотипировании полиморфного локуса rs7517862 (G>С) был выявлен генотип rs7517862-С/G ATF6, что позволило отнести пациентку в группу больных с низким риском развития синдрома диабетической стопы. Дальнейшее наблюдение не подтвердило диагноз синдром диабетической стопы.Patient S., 67 years old, was treated as an inpatient at the Regional Clinical Hospital for Emergency Medicine in Kursk from 10/09/2018 to 10/19/2018. Diagnosis: diabetes mellitus, type 2, decompensation phase on 10/09/2018, compensation phase from 10/19/2018. Individual target HbA1c level <7.5%. The target level of plasma glycemia on an empty stomach is <7.5 mmol/l, 2 hours after a meal <11.0 mmol/l. Venous blood was taken from the patient, and genotyping of the rs7517862 (G>C) polymorphic locus revealed the rs7517862-C/G ATF6 genotype, which allowed the patient to be included in the group of patients with a low risk of developing diabetic foot syndrome. Further observation did not confirm the diagnosis of diabetic foot syndrome.
Пациент П.., 65 лет, находился на стационарном лечении в ОБУЗ КГКБ СМП г. Курска с 24.01.2019 по 04.02.2019. Диагноз: сахарный диабет, 2 тип, фаза декомпенсации от 04.02.2019, фаза компенсации от 04.02.2019. Индивидуальный целевой уровень HbA1c<7,5%. Целевой уровень гликемии плазмы натощак <7,5 ммоль/л, через 2 ч после еды <10,0 ммоль/л. У пациента была взята венозная кровь, при генотипировании полиморфного локуса rs7517862 (G>С) был выявлен генотип rs7517862-С/С ATF6, что позволило отнести пациента в группу больных с высоким риском развития синдрома диабетической стопы. Углубленное неврологическое исследование подтвердило наличие у мужчины данного заболевания.Patient P.., 65 years old, was treated as an inpatient at the Regional Clinical Hospital for Emergency Medicine in Kursk from 01/24/2019 to 02/04/2019. Diagnosis: diabetes mellitus, type 2, decompensation phase from 02/04/2019, compensation phase from 02/04/2019. Individual target HbA1c level <7.5%. The target level of plasma glycemia on an empty stomach is <7.5 mmol/l, 2 hours after a meal <10.0 mmol/l. Venous blood was taken from the patient, and genotyping of the rs7517862 (G>C) polymorphic locus revealed the rs7517862-C/C ATF6 genotype, which allowed the patient to be classified as a group of patients at high risk of developing diabetic foot syndrome. An in-depth neurological examination confirmed the presence of this disease in the man.
Пациентка Ш., 83 года, находилась на стационарном лечении в ОБУЗ КГКБ СМП г. Курска с 22.02.2017 по 03.07.2017. Диагноз: сахарный диабет, 2 тип, фаза декомпенсации от 22.02.2017, фаза компенсации от 07.03.2017. Индивидуальный целевой уровень HbA1c<8,0%. Целевой уровень гликемии плазмы натощак <8,0 ммоль/л, через 2 ч после еды <11,0 ммоль/л. У пациентки Ш. была взята венозная кровь, при генотипировании полиморфного локуса rs7517862 (G>С) был выявлен генотип rs7517862-G/G ATF6, что позволило отнести пациентку в группу больных с низким риском развития синдрома диабетической стопы. Дальнейшее наблюдение не подтвердило диагноз синдром диабетической стопы.Patient Sh., 83 years old, was treated as an inpatient at the Regional Clinical Hospital for Emergency Medicine in Kursk from 02/22/2017 to 07/03/2017. Diagnosis: diabetes mellitus, type 2, decompensation phase from 02/22/2017, compensation phase from 03/07/2017. Individual target HbA1c level <8.0%. The target level of plasma glycemia on an empty stomach is <8.0 mmol/l, 2 hours after a meal <11.0 mmol/l. Venous blood was taken from patient Sh.; genotyping of the polymorphic locus rs7517862 (G>C) revealed the genotype rs7517862-G/G ATF6 , which allowed the patient to be included in the group of patients with a low risk of developing diabetic foot syndrome. Further observation did not confirm the diagnosis of diabetic foot syndrome.
Применение данного способа позволит на доклиническом этапе формировать среди больных диабетом 2 типа группы риска и своевременно реализовывать в этих группах необходимые лечебно-профилактические мероприятия по предупреждению развития синдрома диабетической стопы.The use of this method will make it possible at the preclinical stage to form risk groups among patients with type 2 diabetes and timely implement in these groups the necessary treatment and preventive measures to prevent the development of diabetic foot syndrome.
Резюме Summary
Таким образом, полученные данные свидетельствуют о том, что генотип rs7517862-С/С гена ATF6 является генетическим фактором риска развития синдрома диабетической стопы у пациентов с сахарным диабетом 2 типа (OR=4,02).Thus, the data obtained indicate that the rs7517862-C/C genotype of the ATF6 gene is a genetic risk factor for the development of diabetic foot syndrome in patients with type 2 diabetes mellitus (OR=4.02).
Использование предложенного способа позволит прогнозировать развитие синдрома диабетической стопы у пациентов с сахарным диабетом 2 типа, что даст возможность осуществлять мероприятия по профилактике данного заболевания – диспансерное наблюдение, регулярный осмотр невролога, контроль уровня глюкозы в крови, нормализацию массы тела, достаточную физическую активность, правильное питание с ежедневным включением в рацион свежих овощей и фруктов и ограничением рафинированных углеводов и жиров.The use of the proposed method will make it possible to predict the development of diabetic foot syndrome in patients with type 2 diabetes mellitus, which will make it possible to implement measures to prevent this disease - clinical observation, regular examination by a neurologist, monitoring blood glucose levels, normalizing body weight, sufficient physical activity, proper nutrition with daily inclusion of fresh vegetables and fruits in the diet and limitation of refined carbohydrates and fats.
Claims (1)
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2811753C1 true RU2811753C1 (en) | 2024-01-16 |
Family
ID=
Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP2626704B1 (en) * | 2012-02-08 | 2015-11-18 | Mehmet Ali Soylemez | Diagnosis of pancreatic diabetes in patients with normal blood leucocyte counts using procalcitonin |
| RU2787273C1 (en) * | 2022-03-04 | 2023-01-09 | Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Курский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации | Method for predicting the risk of developing diabetic distal polyneuropathy in women with type 2 diabetes mellitus based on rs7784465 genotyping of the rac1 gene polymorphism rs7784465 |
Patent Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP2626704B1 (en) * | 2012-02-08 | 2015-11-18 | Mehmet Ali Soylemez | Diagnosis of pancreatic diabetes in patients with normal blood leucocyte counts using procalcitonin |
| RU2787273C1 (en) * | 2022-03-04 | 2023-01-09 | Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Курский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации | Method for predicting the risk of developing diabetic distal polyneuropathy in women with type 2 diabetes mellitus based on rs7784465 genotyping of the rac1 gene polymorphism rs7784465 |
| RU2791697C1 (en) * | 2022-07-18 | 2023-03-13 | Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Пермский государственный медицинский университет имени академика Е.А. Вагнера" Министерства здравоохранения Российской Федерации | Method for predicting a risk of diabetic foot syndrome in women with type 2 diabetes |
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| CHU W.S et al. Activating transcription factor 6 (ATF6) sequence polymorphisms in type 2 diabetes and pre-diabetic traits, Diabetes, 2007, Vol. 56(3), pp. 856-862. * |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Berezina et al. | Prevalence, risk factors, and genetic traits in metabolically healthy and unhealthy obese individuals | |
| Takagi et al. | Association of a 5178C→ A (Leu237Met) polymorphism in the mitochondrial DNA with a low prevalence of myocardial infarction in Japanese individuals | |
| Ohashi et al. | Adiponectin I164T mutation is associated with the metabolic syndrome and coronary artery disease | |
| Ye et al. | Variations in the vitamin D-binding protein (Gc locus) and risk of type 2 diabetes mellitus in French Caucasians | |
| RU2287158C1 (en) | Method for predicting the dvelopment for hypertonic disease according to genetic risk factors | |
| Nikolova et al. | Association between IL-6 and MMP3 common genetic polymorphisms and idiopathic scoliosis in Bulgarian patients: a case-control study | |
| Zhu et al. | Associations between INSR and MTOR polymorphisms in type 2 diabetes mellitus and diabetic nephropathy in a Northeast Chinese Han population | |
| Shimomura et al. | A missense mutation of the muscle glycogen synthase gene (M416V) is associated with insulin resistance in the Japanese population | |
| RU2811753C1 (en) | Method of predicting risk of developing diabetic foot syndrome in residents of central russia with type 2 diabetes mellitus based on genotyping of rs7517862 polymorphism of atf6 gene | |
| Marjani et al. | Investigating Visfatin gene Polymorphism rs4730153 with Insulin Resistance and Non-Alcoholic Fatty Liver Diseases in Iranian Population | |
| RU2809905C1 (en) | METHOD OF PREDICTING RISK OF DEVELOPING DIABETIC DISTAL POLYNEUROPATHY IN RESIDENTS OF CENTRAL RUSSIA WITH TYPE 2 DIABETES MELLITUS BASED ON GENOTYPING OF rs1043618 POLYMORPHISM OF HSPA1A GENE | |
| Iqbal et al. | Association of Vitamin D binding protein polymorphism with risk of type 2 diabetes mellitus in a Pakistani urban population: A case control study | |
| RU2809443C1 (en) | METHOD OF PREDICTING RISK OF DEVELOPING DIABETIC NEPHROPATHY IN PATIENTS WITH TYPE 2 DIABETES MELLITUS AND NORMAL BODY WEIGHT BASED ON GENOTYPING OF rs9920421 AND rs4932143 POLYMORPHISMS OF ANPEP GENE | |
| RU2809444C1 (en) | METHOD OF PREDICTING RISK OF DEVELOPING CHRONIC HEART FAILURE IN MEN WITH TYPE 2 DIABETES MELLITUS BASED ON GENOTYPING OF rs4932143 POLYMORPHISM OF ANPEP GENE | |
| RU2803637C1 (en) | METHOD FOR PREDICTING THE RISK OF DEVELOPING TYPE 2 DIABETES IN RESIDENTS OF CENTRAL RUSSIA BASED ON GENOTYPING OF THE rs755892 POLYMORPHISM OF THE DNAJB1 GENE | |
| RU2786820C1 (en) | Method for predicting the risk of developing diabetic retinopathy in men with type 2 diabetes mellitus based on rs836478 polymorphism genotyping in the rac1 gene | |
| Xu et al. | Renal function and klotho gene polymorphisms among Uygur and Kazak populations in Xinjiang, China | |
| RU2803636C1 (en) | METHOD FOR PREDICTING THE RISK OF DEVELOPING TYPE 2 DIABETES IN RESIDENTS OF CENTRAL RUSSIA BASED ON GENOTYPING OF THE rs11073891 POLYMORPHISM OF THE ANPEP GENE | |
| Al-Hakeem | Implication of SH2B1 gene polymorphism studies in gestational diabetes mellitus in Saudi pregnant women | |
| Al Hannan et al. | Associations between single-nucleotide polymorphisms of ADIPOQ, serum adiponectin and increased type 2 diabetes mellitus risk in Bahraini individuals | |
| RU2787273C1 (en) | Method for predicting the risk of developing diabetic distal polyneuropathy in women with type 2 diabetes mellitus based on rs7784465 genotyping of the rac1 gene polymorphism rs7784465 | |
| RU2626670C2 (en) | Method prediction of therapy effeciency for patients with type 2 sugar diabetes | |
| Errouagui et al. | Relationship between vitamin d receptor (VDR) gene polymorphisms and susceptibility to Type 2 diabetes mellitus in Moroccans population | |
| Alharbi | Angiotensin I converting enzyme gene polymorphism in type 2 diabetes mellitus with nephropathy in Saudi population | |
| Kozarova et al. | Association of+ 1245 A/G MT1A and-209 A/G MT2A polymorphysms with coronary artery disease and diabetes mellitus in Bulgarian cohort |