RU2803949C1 - Method for crm197 protein expression - Google Patents
Method for crm197 protein expression Download PDFInfo
- Publication number
- RU2803949C1 RU2803949C1 RU2022108470A RU2022108470A RU2803949C1 RU 2803949 C1 RU2803949 C1 RU 2803949C1 RU 2022108470 A RU2022108470 A RU 2022108470A RU 2022108470 A RU2022108470 A RU 2022108470A RU 2803949 C1 RU2803949 C1 RU 2803949C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- crm197
- expression
- protein
- dna
- crm197 protein
- Prior art date
Links
Images
Abstract
Description
Область техникиField of technology
[1] Настоящее изобретение относится к сигнальной последовательности для экспрессии белка CRM197 в Е. coli и секреции белка CRM197 в периплазму и ее применению и, более конкретно, к сигнальной последовательности для экспрессии белка CRM197, нуклеиновой кислоте, кодирующей указанную сигнальную последовательность, конструкции нуклеиновой кислоты или вектору экспрессии, содержащему нуклеиновую кислоту и ген белка CRM197, рекомбинантному микроорганизму, в который введена конструкция нуклеиновой кислоты или вектор экспрессии, и способу получения белка CRM197, включающему культивирование рекомбинантного микроорганизма.[1] The present invention relates to a signal sequence for expression of CRM197 protein in E. coli and secretion of CRM197 protein into the periplasm and its use, and more particularly to a signal sequence for expression of CRM197 protein, a nucleic acid encoding said signal sequence, nucleic acid constructs or an expression vector containing a nucleic acid and a CRM197 protein gene, a recombinant microorganism into which the nucleic acid construct or expression vector is introduced, and a method for producing the CRM197 protein, including cultivating the recombinant microorganism.
[2][2]
Уровень техникиState of the art
[3] Дифтерийный токсин (DT) представляет собой белковый экзотоксин, синтезируемый и секретируемый патогенным штаммом Corynebacterium diphtheriae. Дифтерийный токсин представляет собой АДФ-рибозилирующий фермент, который секретируется в виде профермента, состоящего из 535 остатков и разделенного на два фрагмента (фрагменты А и В) обработкой трипсиноподобной протеазой. Фрагмент А представляет собой каталитически активную область и представляет собой НАД-зависимую АДФ-рибозилтрансферазу, которая специфически нацелена на фактор синтеза белка EF-2, тем самым инактивируя EF-2 и прерывая синтез белка в клетках. [3] Diphtheria toxin (DT) is a protein exotoxin synthesized and secreted by the pathogenic strain Corynebacterium diphtheriae. Diphtheria toxin is an ADP-ribosylating enzyme that is secreted as a 535-residue proenzyme that is divided into two fragments (fragments A and B) by treatment with a trypsin-like protease. Fragment A is the catalytically active region and is an NAD-dependent ADP-ribosyltransferase that specifically targets the protein synthesis factor EF-2, thereby inactivating EF-2 and interrupting protein synthesis in cells.
[4] CRM197 был обнаружен путем выделения различных нетоксичных форм и частично токсичных иммунологически перекрестно-реактивных форм (CRM или перекрестно-реактивные вещества) дифтерийного токсина (Uchida et al., Journal of Biological Chemistry 248, 3845-3850, 1973). Предпочтительно CRM может иметь заданный размер и состав, включающий все или часть DT.[4] CRM197 was discovered by isolating various non-toxic forms and partially toxic immunologically cross-reactive forms (CRMs or cross-reactive substances) of diphtheria toxin (Uchida et al., Journal of Biological Chemistry 248, 3845-3850, 1973). Preferably, the CRM may be of a predetermined size and composition, including all or part of the DT.
[5] CRM197 представляет собой ферментативно крайне неактивную и нетоксичную форму дифтерийного токсина, которая содержит одну аминокислотную замену (G52E). Эта мутация придает внутреннюю гибкость петле активного сайта, расположенной перед сайтом связывания НАД, тем самым снижая аффинность связывания CRM197 с НАД и устраняя токсичность DT (Malito et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 109 (14): 5229-342012). CRM197, как и DT, имеет две дисульфидные связи. Одна дисульфидная связь связывает Cys186 с Cys201, тем самым связывая фрагмент А с фрагментом В. Другая дисульфидная связь связывает Cys461 с Cys471 во фрагменте В. DT и CRM197 обладают нуклеазной активностью, приобретенной от фрагмента A (Bruce et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87, 2995-8, 1990).[5] CRM197 is an enzymatically highly inactive and nontoxic form of diphtheria toxin that contains a single amino acid substitution (G52E). This mutation imparts intrinsic flexibility to the active site loop located upstream of the NAD binding site, thereby reducing the binding affinity of CRM197 to NAD and eliminating DT toxicity (Malito et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 109 (14): 5229-342012 ). CRM197, like DT, has two disulfide bonds. One disulfide bond links Cys186 to Cys201, thereby linking fragment A to fragment B. Another disulfide bond links Cys461 to Cys471 in fragment B. DT and CRM197 have nuclease activity acquired from fragment A (Bruce et al., Proc. Natl. Acad Sci. USA 87, 2995-8, 1990).
[6] Ряд антигенов обладает низкой иммуногенностью, особенно у младенцев и детей младшего возраста, если только они химически не связаны с белками и, таким образом, образуются в виде конъюгатов или конъюгированных вакцин. В этих конъюгированных вакцинах белковый компонент также называют «белком-носителем». CRM197 обычно используют в качестве белка-носителя в конъюгации белок-углевод и конъюгации гаптен-белок. CRM197, как белок-носитель, имеет несколько преимуществ по сравнению с дифтерийным токсоидом, а также другими токсоидными белками (Shinefield Vaccine, 28: 4335, 2010).[6] A number of antigens have low immunogenicity, especially in infants and young children, unless they are chemically bound to proteins and thus formulated as conjugates or conjugate vaccines. In these conjugate vaccines, the protein component is also called the “carrier protein.” CRM197 is commonly used as a carrier protein in protein-carbohydrate conjugation and hapten-protein conjugation. CRM197, as a carrier protein, has several advantages over diphtheria toxoid as well as other toxoid proteins (Shinefield Vaccine, 28: 4335, 2010).
[7] Способы получения дифтерийного токсина (DT) хорошо известны в данной области техники. Например, DT можно получить путем очистки токсина из культуры Corynebacterium diphtheriae с последующей химической детоксикацией или путем очистки рекомбинантного или генетически детоксицированного аналога токсина.[7] Methods for producing diphtheria toxin (DT) are well known in the art. For example, DT can be produced by purifying the toxin from a culture of Corynebacterium diphtheriae followed by chemical detoxification, or by purifying a recombinant or genetically detoxified analogue of the toxin.
[8] Обилие белков сделало невозможным массовое производство дифтерийных токсинов, таких как CRM197, для использования в вакцинах. Эту проблему ранее решали путем экспрессии CRM197 в Е. coli (Bishai, et al., J. Bacteriol. 169: 5140-5151), и Bishai et al. сообщили о рекомбинантном слитом белке, содержащем токсин (включая сигнальную последовательность токсина), приводящем к продукции деградированных белков.[8] The abundance of proteins made it impossible to mass produce diphtheria toxins such as CRM197 for use in vaccines. This problem was previously addressed by expressing CRM197 in E. coli (Bishai, et al., J. Bacteriol. 169: 5140-5151), and Bishai et al. reported a recombinant fusion protein containing a toxin (including the toxin signal sequence) resulting in the production of degraded proteins.
[9] По сравнению с цитоплазматической продукцией, продукция бактериальных токсинов в периплазме характеризуется тем, что i) белок продуцируется в зрелой форме после расщепления сигнального пептида, или ii) периплазма Е. coli является окислительной средой, что позволяет образовывать дисульфидные связи, которые могут содействовать продукции растворимых, правильно свернутых белков, iii) периплазма Е. coli содержит меньше протеазы, чем цитоплазма, что помогает избежать протеолитического расщепления экспрессируемых белков, и iv) периплазма также содержит меньшее количество белков, что позволяет получать рекомбинантный белок более высокой чистоты.[9] Compared to cytoplasmic production, the production of bacterial toxins in the periplasm is characterized by the fact that i) the protein is produced in a mature form after cleavage of the signal peptide, or ii) the E. coli periplasm is an oxidizing environment, which allows the formation of disulfide bonds, which can promote production of soluble, correctly folded proteins, iii) the periplasm of E. coli contains less protease than the cytoplasm, which helps avoid proteolytic degradation of the expressed proteins, and iv) the periplasm also contains a smaller amount of proteins, which allows for the production of recombinant protein of higher purity.
[10] В общем, присутствие сигнальных последовательностей на белках облегчает транспортировку (прокариотические хозяева) или секрецию (эукариотические хозяева) белков в периплазму. У прокариотических хозяев сигнальные последовательности координируют новообразованные белки с периплазмой через внутреннюю мембрану, а затем расщепляются. То есть важен поиск сигнальных последовательностей, способных более эффективно массово продуцировать коммерчески необходимые белки, и необходимо разрабатывать рекомбинантные микроорганизмы.[10] In general, the presence of signal sequences on proteins facilitates the transport (prokaryotic hosts) or secretion (eukaryotic hosts) of proteins into the periplasm. In prokaryotic hosts, signal sequences coordinate newly formed proteins with the periplasm across the inner membrane and are then cleaved. That is, the search for signal sequences that can more efficiently mass produce commercially needed proteins is important, and it is necessary to develop recombinant microorganisms.
[11][eleven]
[12] Соответственно, в результате значительных усилий по разработке способа получения белка CRM197 эффективным и экономичным способом, авторы настоящего изобретения выбрали конкретные сигнальные последовательности, сконструировали нуклеотидные последовательности, комбинируя кодоновый контекст со вторичной структурой, для того, чтобы оптимизировать трансляцию в Е. coli, оптимизировать экспрессию в Е. coli нуклеотидных последовательностей CRM197, кодирующих белок CRM197, и обнаружено, что CRM197 эффективно экспрессируется в Е. coli и эффективно секретируется в периплазму без изменения рН при их использовании, тем самым завершая настоящее изобретение.[12] Accordingly, as a result of significant efforts to develop a method for producing the CRM197 protein in an efficient and economical manner, the present inventors selected specific signal sequences, designed nucleotide sequences, combining codon context with secondary structure, in order to optimize translation in E. coli, optimize the expression in E. coli of CRM197 nucleotide sequences encoding the CRM197 protein, and found that CRM197 is efficiently expressed in E. coli and efficiently secreted into the periplasm without changing the pH when used, thereby completing the present invention.
[13][13]
[14] Информация, раскрытая в этом разделе «Уровень техники», предоставлена только для лучшего понимания предыстории настоящего изобретения, и поэтому она может не включать информацию, формирующую предшествующий уровень техники, которая уже очевидна для специалистов в данной области техники.[14] The information disclosed in this “Background of the Art” section is provided only to better understand the background of the present invention, and therefore it may not include information constituting prior art that is already apparent to those skilled in the art.
[15][15]
Краткое описание сущности изобретенияBrief description of the invention
[16] Одной из целей настоящего изобретения является обеспечение сигнальной последовательности для экспрессии белка CRM197, имеющего специфическую последовательность, нуклеиновой кислоты, кодирующей сигнальную последовательность, и способа получения белка CRM197 с использованием нуклеиновой кислоты для максимизации экспрессии белка CRM197 при минимизации токсичности белка CRM197 по отношению к Е. coli за счет секреции белка CRM197 в периплазму Е. coli.[16] One of the objects of the present invention is to provide a signal sequence for the expression of a CRM197 protein having a specific sequence, a nucleic acid encoding the signal sequence, and a method for producing the CRM197 protein using the nucleic acid to maximize the expression of the CRM197 protein while minimizing the toxicity of the CRM197 protein to E. coli by secretion of the CRM197 protein into the E. coli periplasm.
[17][17]
[18] Для достижения целей настоящее изобретение обеспечивает сигнальную последовательность для экспрессии белка CRM197, представленную любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 13 - SEQ ID NO: 21.[18] To achieve the objects, the present invention provides a signal sequence for expression of the CRM197 protein represented by any of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 13 to SEQ ID NO: 21.
[19] Настоящее изобретение также относится к нуклеиновой кислоте, кодирующей сигнальную последовательность для экспрессии белка CRM197.[19] The present invention also provides a nucleic acid encoding a signal sequence for expression of the CRM197 protein.
[20] Настоящее изобретение также относится к конструкции нуклеиновой кислоты или вектору экспрессии, содержащему нуклеиновую кислоту и ген белка CRM197, рекомбинантному микроорганизму, в который введена конструкция нуклеиновой кислоты или вектор экспрессии, и способу получения белка CRM197, включающему культивирование рекомбинантного микроорганизма.[20] The present invention also relates to a nucleic acid construct or expression vector containing a nucleic acid and a CRM197 protein gene, a recombinant microorganism into which the nucleic acid construct or expression vector is introduced, and a method for producing CRM197 protein, including cultivating the recombinant microorganism.
[21][21]
Краткое описание графических материаловBrief description of graphic materials
[22] На ФИГ. 1 представлена схематическая диаграмма, иллюстрирующая модуль экспрессии TPB1TV1.3, где Ptrc обозначает промотор trc, RBS обозначает богатый A/U энхансер + SD, λtR2 и Т7Те, a rrnB T1T2 обозначает терминаторы транскрипции, a Bsal и Dral обозначают сайты ферментов рестрикции, используемые для клонирования.[22] In FIG. 1 is a schematic diagram illustrating the TPB1TV1.3 expression module, where Ptrc denotes the trc promoter, RBS denotes the A/U-rich enhancer + SD, λtR2 and T7Te, and rrnB T 1 T 2 denotes transcription terminators, and Bsal and Dral denote restriction enzyme sites , used for cloning.
[23] ФИГ. 2 иллюстрирует экспрессионную плазмиду E. coli рНех1.3, где Ori (pBR322) обозначает точку начала репликации pBR322, KanR обозначает маркер канамицина, lacI обозначает ген lacI, а другие символы являются такими же, как на ФИГ. 1.[23] FIG. 2 illustrates the E. coli expression plasmid pHex1.3, where Ori (pBR322) denotes the pBR322 origin of replication, KanR denotes the kanamycin marker, lacI denotes the lacI gene, and other symbols are the same as in FIG. 1.
[24] На ФИГ. 3 представлена схематическая диаграмма, иллюстрирующая получение экспрессионной плазмиды CRM197, где Т1 обозначает терминатор транскрипции λtR2 и Т7Те, Т2 обозначает терминатор транскрипции rrnB Т1Т2, стрелки обозначают праймеры для ПЦР, буквенные символы А, В, С и D обозначают гомологичные области для LIC, а остальные символы являются такими же, как на ФИГ. 1.[24] In FIG. 3 is a schematic diagram illustrating the preparation of the CRM197 expression plasmid, where T1 denotes the transcription terminator λtR2 and T7Te, T2 denotes the transcription terminator rrnB T 1 T 2 , arrows denote PCR primers, letters A, B, C and D denote homologous regions for LIC , and the remaining symbols are the same as in FIG. 1.
[25] ФИГ. 4 иллюстрирует поведение экспрессии слияния CRM 197 с L3 и L5 в различных штаммах Е. coli, а также результаты окрашивания Кумасси (слева) и Вестерн-блоттинга (справа) после SDS-PAGE всех клеток Е. coli, где С обозначает С2894Н, В обозначает BL21 (DE3), W обозначает W3110-1, О обозначает Origami™ 2, S обозначает «перетасовку», C-v представляет собой С2984Н, содержащую рНех1.3, используемую в качестве отрицательного контроля, L3 и L5 представляют собой слитые сигнальные последовательности, a CRM197 представляет собой эталонный CRM197, и клетки загружают в каждую лунку при плотности, соответствующей OD600, равной 0,025, для окрашивания Кумасси и при плотности, соответствующей OD600, равной 0,0005, для Вестерн-блоттинга.[25] FIG. 4 illustrates the expression behavior of the CRM 197 fusion with L3 and L5 in various E. coli strains, as well as the results of Coomassie staining (left) and Western blotting (right) after SDS-PAGE of all E. coli cells, where C is C2894H, B is BL21 (DE3), W is W3110-1, O is Origami™ 2, S is shuffle, Cv is C2984H containing pHex1.3 used as a negative control, L3 and L5 are signal sequence fusions, and CRM197 is the CRM197 reference and cells are loaded into each well at a density corresponding to an OD600 of 0.025 for Coomassie staining and at a density corresponding to an OD600 of 0.0005 for Western blotting.
[26] ФИГ. 5 иллюстрирует влияние типа и концентрации индуктора на экспрессию CRM197, индуцированную L5, и иллюстрирует случаи окрашивания Кумасси (слева) и Вестерн-блоттинга (справа) после SDS-PAGE, где количества загруженных клеток представляют собой такие же, как на ФИГ. 4, I обозначает нерастворимую фракцию, S обозначает растворимую фракцию, (А) показывает культуру при 25°С, а (В) показывает культуру при 30°С.[26] FIG. 5 illustrates the effect of inducer type and concentration on L5-induced CRM197 expression and illustrates Coomassie staining (left) and Western blot (right) cases after SDS-PAGE, where the numbers of loaded cells are the same as in FIG. 4, I indicates the insoluble fraction, S indicates the soluble fraction, (A) shows the culture at 25°C, and (B) shows the culture at 30°C.
[27] На ФИГ. 6 показано положение белка CRM197, индуцированного слиянием с L5, где вверху показано окрашивание Кумасси после SDS-PAGE, внизу показан Вестерн-блоттинг, Cr представляет собой эталонный CRM197, стрелка показывает положение зрелого CRM197, Р1 обозначает супернатант, полученный после обработки буфером для индукции плазматической мембраны, Р2 обозначает периплазматическую фракцию, а Су обозначает цитоплазматическую фракцию.[27] In FIG. Figure 6 shows the position of the CRM197 protein induced by fusion with L5, where Coomassie staining after SDS-PAGE is shown at the top, Western blotting is shown at the bottom, Cr represents the reference CRM197, the arrow shows the position of mature CRM197, P1 indicates the supernatant obtained after treatment with plasmatic induction buffer membranes, P2 denotes the periplasmic fraction, and Cy denotes the cytoplasmic fraction.
[28] ФИГ. 7 иллюстрирует влияние типа и концентрации индуктора на экспрессию CRM197, индуцированную L3, где (А) показывает культуру при 25°С, а (В) показывает культуру при 30°С.[28] FIG. 7 illustrates the effect of inducer type and concentration on L3-induced CRM197 expression, where (A) shows a culture at 25°C and (B) shows a culture at 30°C.
[2 9] На ФИГ. 8 показано положение белка CRM197, индуцированное слиянием с L3.[2 9] In FIG. Figure 8 shows the position of the CRM197 protein induced by fusion with L3.
[30] На ФИГ. 9 показаны изменения рН штамма L3, температуры, скорости лопастной мешалки и растворенного кислорода (DO), а также время добавления индуктора экспрессии, где (А) показывает случай, когда температуру поддерживают на уровне 30°С, а (В) показывает случай, когда перед индукцией экспрессии температуру снижают до 25°С.[30] In FIG. 9 shows the changes in strain L3 pH, temperature, paddle speed and dissolved oxygen (DO), as well as the time of addition of the expression inducer, where (A) shows the case when the temperature is maintained at 30°C, and (B) shows the case when Before induction of expression, the temperature is reduced to 25°C.
[31] На ФИГ. 10 показаны изменения рН штамма L5, температуры, скорости лопастной мешалки и растворенного кислорода (DO), а также время добавления индуктора экспрессии.[31] In FIG. Figure 10 shows changes in strain L5 pH, temperature, paddle speed, and dissolved oxygen (DO), as well as the time of addition of the expression inducer.
[32] На ФИГ. 11 показано изменение экспрессии белка CRM197 до и после добавления индуктора экспрессии во время культивирования, где (А) показывает экспрессию штамма L3, индуцированную при 30°С, (В) показывает экспрессию штамма L3, индуцированную при 25°С, (С) показывает экспрессию штамма L5, индуцированную при 25°С. 200 нг эталонного CRM197 загружали в линии 3 и 10 в (А), линии 4 и 10 в (В) и линии 3 и 9 в (С). Линии 1 и 2 в (А), линии 1, 2 и 3 в (В) и линии 1 и 2 в (С) представляют собой растворы клеточных культур перед добавлением индуктора экспрессии, а линия 16 в (А) и линия 16 в (В) представляют собой супернатанты после окончания культивирования, последующие линии представляют собой растворы клеточных культур, отбираемые каждые 2 часа после добавления индуктора. Величина загрузки является такой же, как на ФИГ. 4.[32] In FIG. 11 shows the change in CRM197 protein expression before and after the addition of an expression inducer during culture, where (A) shows expression of strain L3 induced at 30°C, (B) shows expression of strain L3 induced at 25°C, (C) shows expression strain L5, induced at 25°C. 200 ng of reference CRM197 was loaded into
[33] ФИГ. 12 иллюстрирует характер экспрессии и разделения белка CRM197 в штаммах L3/L5, где (А) иллюстрирует поведение белка при разделении в культуре с использованием L3, (В) иллюстрирует поведение белка при разделении в культуре с использованием L5, в линию 1 загружали 200 нг эталонного CRM197, линия 2 представляет собой общий раствор клеточной культуры после завершения культивирования, линия 3 представляет собой супернатант после обработки буфером для индукции плазматической мембраны, линии 4 и 7 представляют собой периплазматические фракции (линия 7 содержит в 4 раза больше белка, чем линия 4), а линии 5 и 6 представляют собой цитоплазматические фракции.[33] FIG. 12 illustrates the expression and partitioning behavior of the CRM197 protein in L3/L5 strains, where (A) illustrates the behavior of the protein when partitioned in culture using L3, (B) illustrates the behavior of the protein when partitioned in culture using L5,
[34] ФИГ. 13 иллюстрирует результат SDS-PAGE образцов, очищенных с помощью DEAE-хроматографии (А) и НА-хроматографии (В). В (А) линия 1 обозначает CRM 197, продуцируемый Corynebacterium, линия 2 обозначает белок, присутствующий в выделенной периплазматической фракции, линия 3 обозначает образец перед загрузкой в DEAE-хроматографию, который дважды концентрируют после ультрафильтрации, линии 4 и 5 используют для обнаружения примесных белков, за исключением CRM197, с использованием проточного режима хроматографии с DEAE и промывными растворами, линия 6 представляет собой элюированный образец, из которого были удалены примеси, линия 7 представляет собой образец, элюированный с использованием высококонцентрированной соли для удаления всех белков, связанных со смолой. НА Elu в (В) представляет собой CRM197, элюированный после удаления белка, не связанного со смолой НА.[34] FIG. 13 illustrates the result of SDS-PAGE of samples purified by DEAE chromatography (A) and HA chromatography (B). In (A),
[35] ФИГ. 14 иллюстрирует результат анализа SEC-HPLC конечного очищенного CRM197, где чистота составляла 99% или более.[35] FIG. 14 illustrates the result of SEC-HPLC analysis of the final purified CRM197 where the purity was 99% or more.
[36] На ФИГ. 15 показаны результаты SDS-PAGE (слева) и Вестерн-блоттинга (справа). Линия 1 представляет собой CRM197, продуцируемый Corynebacterium, а линия 2 представляет собой CRM 197, продуцируемый Е. coli (L3). Оба CRM 197 показали полосы в одном и том же положении.[36] In FIG. Figure 15 shows the results of SDS-PAGE (left) and Western blotting (right).
[37] ФИГ. 16 иллюстрирует результат анализа молекулярной массы интактного белка с использованием ЖХ/МС, где молекулярная масса составляет 58409 Да, что соответствует теоретической молекулярной массе.[37] FIG. 16 illustrates the result of an intact protein molecular weight analysis using LC/MS, where the molecular weight is 58409 Da, which is the theoretical molecular weight.
[38] ФИГ. 17 иллюстрирует результат анализа кругового дихроизма (CD) и указывает на отсутствие различий в структуре более высокого порядка между CRM197 (•), продуцируемым Corynebacterium, и CRM197 (Х), продуцируемым Е. coli pHex-L3.[38] FIG. 17 illustrates the result of circular dichroism (CD) analysis and indicates that there is no difference in higher order structure between CRM197 ( • ) produced by Corynebacterium and CRM197 ( X ) produced by E. coli pHex-L3.
[39] ФИГ. 18 иллюстрирует результат анализа спектра флуоресценции, где CRM197 (•), продуцируемый Corynebacterium, и CRM197 (сплошная линия), продуцируемый Е. coli pHex-L3, имели одинаковую максимальную длину волны излучения 338 нм.[39] FIG. 18 illustrates the result of fluorescence spectrum analysis where CRM197 ( • ) produced by Corynebacterium and CRM197 (solid line) produced by E. coli pHex-L3 had the same maximum emission wavelength of 338 nm.
[40][40]
Подробное описание и предпочтительные варианты осуществления изобретенияDetailed Description and Preferred Embodiments of the Invention
[41] Если не указано иное, все технические и научные термины, используемые в данном документе, имеют те же значения, что и подразумевают специалисты в области, к которой относится настоящее изобретение. В общем, используемая в настоящей заявке номенклатура хорошо известна в данной области техники и обычно используется.[41] Unless otherwise specified, all technical and scientific terms used herein have the same meaning as understood by those skilled in the art to which the present invention relates. In general, the nomenclature used herein is well known in the art and is commonly used.
[42][42]
[43] В одном варианте осуществления настоящего изобретения 9 сигнальных последовательностей сливали с белком CRM197 для индукции его экспрессии. Для каждой сигнальной последовательности были сконструированы нуклеотидные последовательности (SEQ ID NO: 4 - SEQ ID NO: 12), оптимизированные для трансляции, с учетом кодонового контекста и вторичной структуры мРНК. Эти конструкции встраивали в экспрессионную плазмиду рНех1.3, и экспрессию CRM197 наблюдали в пяти штаммах Е. coli, чтобы найти оптимальный штамм Е. coli для каждой конструкции. Кроме того, в выбранной Е. coli устанавливали температуру культивирования, а также тип и концентрацию индуктора. В результате трансформации различных штаммов Е. coli конструкциями белок CRM197 мог экспрессироваться в растворимой форме даже в штаммах, у которых не сконструированы гены (trxB, gor), связанные с окислительно-восстановительным потенциалом, и мог секретироваться в периплазме.[43] In one embodiment of the present invention, 9 signal sequences are fused to the CRM197 protein to induce its expression. For each signal sequence, nucleotide sequences (SEQ ID NO: 4 - SEQ ID NO: 12) optimized for translation were designed, taking into account the codon context and secondary structure of the mRNA. These constructs were inserted into the expression plasmid pHex1.3, and CRM197 expression was observed in five E. coli strains to find the optimal E. coli strain for each construct. In addition, the culture temperature of the selected E. coli was determined, as well as the type and concentration of the inducer. As a result of transformation of various E. coli strains with constructs, the CRM197 protein could be expressed in a soluble form even in strains in which genes (trxB, gor) associated with redox potential were not constructed, and could be secreted in the periplasm.
[44][44]
[45] Таким образом, в одном аспекте настоящее изобретение направлено на сигнальную последовательность для экспрессии белка CRM197, представленную любой из аминокислотных последовательностей от SEQ ID NO: 13 по SEQ ID NO: 21.[45] Thus, in one aspect, the present invention is directed to a signal sequence for expression of the CRM197 protein represented by any of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 13 through SEQ ID NO: 21.
[46] В другом аспекте настоящее изобретение направлено на нуклеиновую кислоту, кодирующую сигнальную последовательность для экспрессии белка CRM197.[46] In another aspect, the present invention is directed to a nucleic acid encoding a signal sequence for expression of the CRM197 protein.
[47] В настоящем изобретении нуклеиновая кислота может быть представлена любой из нуклеотидных последовательностей от SEQ ID NO: 4 по SEQ ID NO: 12, предпочтительно представлена последовательностями нуклеотидов SEQ ID NO: 6 или SEQ ID NO: 8, но не ограничивается этим.[47] In the present invention, the nucleic acid may be represented by any of the nucleotide sequences of SEQ ID NO: 4 to SEQ ID NO: 12, preferably represented by the nucleotide sequences of SEQ ID NO: 6 or SEQ ID NO: 8, but is not limited to it.
[48] Используемый в контексте данного документа термин «сигнальная последовательность для экспрессии белка CRM197» означает сигнальную последовательность для экспрессии белка CRM197 и секреции белка CRM197 в периплазму.[48] As used herein, the term “signal sequence for expression of CRM197 protein” means a signal sequence for expression of CRM197 protein and secretion of CRM197 protein into the periplasm.
[49] В одном варианте осуществления настоящего изобретения были выбраны сигнальная последовательность белка, нацеленного на внешнюю мембрану Е. coli, и сигнальная последовательность, полученная из фага М13 (Таблица 3), чтобы секретировать белок CRM197 в периплазму. Нуклеотидные последовательности (от SEQ ID NO: 4 по SEQ ID NO: 12) были сконструированы путем объединения кодонового контекста со вторичной структурой для оптимизации трансляции выбранной сигнальной последовательности в Е. coli.[49] In one embodiment of the present invention, a signal sequence of a protein targeting the outer membrane of E. coli and a signal sequence derived from phage M13 (Table 3) were selected to secrete the CRM197 protein into the periplasm. Nucleotide sequences (SEQ ID NO: 4 through SEQ ID NO: 12) were designed by combining codon context with secondary structure to optimize translation of the selected signal sequence in E. coli.
[50][50]
[51] В другом аспекте настоящее изобретение направлено на конструкцию нуклеиновой кислоты, содержащую нуклеиновую кислоту, кодирующую сигнальную последовательность для экспрессии белка CRM197, и ген белка CRM197.[51] In another aspect, the present invention is directed to a nucleic acid construct comprising a nucleic acid encoding a signal sequence for expression of a CRM197 protein and a CRM197 protein gene.
[52] В другом аспекте настоящее изобретение относится к вектору экспрессии, содержащему нуклеиновую кислоту, кодирующую сигнальную последовательность для экспрессии белка CRM197, и ген белка CRM197.[52] In another aspect, the present invention provides an expression vector comprising a nucleic acid encoding a signal sequence for expression of the CRM197 protein and a CRM197 protein gene.
[53] В одном варианте осуществления настоящего изобретения последовательность ДНК, кодирующая аминокислотную последовательность белка CRM197 (SEQ ID NO: 3), также была оптимизирована для экспрессии Е. coli (SEQ ID NO: 2). Фрагмент ДНК каждой сконструированной сигнальной последовательности и оптимизированный фрагмент ДНК CRM197 встраивали в плазмиду рНех1.3 (ФИГ. 3).[53] In one embodiment of the present invention, the DNA sequence encoding the amino acid sequence of the CRM197 protein (SEQ ID NO: 3) has also been optimized for expression of E. coli (SEQ ID NO: 2). The DNA fragment of each designed signal sequence and the optimized DNA fragment of CRM197 were inserted into the pHex1.3 plasmid (FIG. 3).
[54] В настоящем изобретении можно использовать любой ген белка CRM197 без ограничений, если он представляет собой ген, кодирующий белок CRM197. Ген белка CRM197 предпочтительно может быть представлен нуклеотидной последовательностью SEQ ID NO: 2, но не ограничивается этим.[54] In the present invention, any CRM197 protein gene can be used without limitation as long as it is a gene encoding a CRM197 protein. The CRM197 protein gene may preferably be represented by the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2, but is not limited to this.
[55] Используемый в настоящей заявке термин «трансформация» означает введение в клетки цепи специфической чужеродной ДНК извне. Микроорганизм-хозяин, содержащий введенную цепь ДНК, называют «трансформированным микроорганизмом». Используемый в настоящей заявке термин «трансформация», означающий введение ДНК в хозяина и придание ДНК реплицируемости внехромосомным фактором или хромосомной интеграцией, указывает на то, что вектор, содержащий полинуклеотид, кодирующий целевой белок, вводят в клетку-хозяина, или полинуклеотид, кодирующий целевой белок, интегрируют в хромосому клетки-хозяина для экспрессии белка, кодируемого полинуклеотидом в клетке-хозяине. Трансформированный полинуклеотид включает как трансформированный полинуклеотид, вставленный в хромосому клетки-хозяина и расположенный внутри нее, так и трансформированный полинуклеотид, расположенный вне хромосомы, при условии, что он может экспрессироваться в клетке-хозяине.[55] The term “transformation” as used in this application means the introduction into cells of a specific foreign DNA chain from the outside. The host microorganism containing the introduced DNA strand is called a "transformed microorganism". As used herein, the term “transformation,” meaning the introduction of DNA into a host and rendering the DNA replicable by an extrachromosomal factor or chromosomal integration, indicates that a vector containing a polynucleotide encoding a target protein is introduced into a host cell, or a polynucleotide encoding a target protein , are integrated into the host cell chromosome to express the protein encoded by the polynucleotide in the host cell. The transformed polynucleotide includes both a transformed polynucleotide inserted into and located within the chromosome of a host cell, and a transformed polynucleotide located outside the chromosome, provided that it can be expressed in the host cell.
[56] Используемый в настоящей заявке термин «конструкция нуклеиновой кислоты» включает как конструкцию нуклеиновой кислоты, встроенную в хромосому клетки-хозяина и расположенную внутри нее, так и конструкцию нуклеиновой кислоты, расположенную вне хромосомы, при условии, что она может экспрессироваться в хромосоме клетки-хозяина.[56] As used herein, the term “nucleic acid construct” includes both a nucleic acid construct inserted into and located within the chromosome of a host cell, and a nucleic acid construct located outside of the chromosome, provided that it can be expressed on the chromosome of the cell -the owner.
[57] Кроме того, используемый в настоящем документе термин «полинуклеотид» используется взаимозаменяемо с термином «нуклеиновая кислота» и включает ДНК и РНК, кодирующие целевой белок. Полинуклеотид может быть введен в любой форме при условии, что он может быть введен в клетку-хозяина и экспрессирован в ней. Например, полинуклеотид может быть введен в клетку-хозяина в виде кассеты экспрессии, которая представляет собой генную конструкцию, содержащую все элементы, необходимые для самоэкспрессии. Кассета экспрессии обычно содержит промотор, сигнал терминации транскрипции, сайт связывания рибосомы и сигнал терминации трансляции, который функционально связан с нуклеиновой кислотой. Кассета экспрессии может содержать вектор экспрессии, обеспечивающий саморепликацию. Полинуклеотид также может быть введен в клетку-хозяина в его нативной форме и функционально связан с последовательностью, необходимой для экспрессии в клетке-хозяине.[57] Additionally, as used herein, the term “polynucleotide” is used interchangeably with the term “nucleic acid” and includes DNA and RNA encoding the target protein. The polynucleotide can be introduced in any form, provided that it can be introduced into and expressed in a host cell. For example, the polynucleotide can be introduced into a host cell in the form of an expression cassette, which is a gene construct containing all the elements necessary for self-expression. An expression cassette typically contains a promoter, a transcription termination signal, a ribosome binding site, and a translation termination signal that is operably linked to a nucleic acid. The expression cassette may contain an expression vector that allows for self-replication. The polynucleotide may also be introduced into a host cell in its native form and operably linked to a sequence required for expression in the host cell.
[58] Используемый в настоящей заявке термин «вектор» означает продукт ДНК, содержащий последовательность ДНК, функционально связанную с подходящей регуляторной последовательностью, способной экспрессировать ДНК в подходящем хозяине. Векторы могут представлять собой плазмиды, фаговые частицы или простые потенциальные геномные вставки. При трансформации в подходящего хозяина векторы могут реплицироваться или выполнять функции, независимые от геномов хозяина, или некоторые из них могут быть интегрированы с геномами. Плазмиды в настоящее время являются наиболее часто используемой формой вектора. Таким образом, термины «плазмида» и «вектор» используются взаимозаменяемо.[58] As used herein, the term “vector” means a DNA product containing a DNA sequence operably linked to a suitable regulatory sequence capable of expressing the DNA in a suitable host. Vectors can be plasmids, phage particles, or simple potential genomic inserts. When transformed into a suitable host, the vectors may replicate or perform functions independent of the host genomes, or some of them may be integrated with the genomes. Plasmids are currently the most commonly used form of vector. Thus, the terms "plasmid" and "vector" are used interchangeably.
[59] С учетом целей настоящего изобретения использование плазмидного вектора является предпочтительным. Типичные плазмидные векторы, которые можно использовать для достижения задач, включают (а) точку начала репликации для эффективного проведения репликации, чтобы включать несколько или несколько сотен плазмидных векторов в каждой клетке-хозяине, (b) ген устойчивости к антибиотикам для скрининга клеток-хозяев, трансформированных плазмидными векторами и (с) сайт расщепления ферментом рестрикции, в который вставлен фрагмент чужеродной ДНК. Даже если соответствующий сайт расщепления ферментом рестрикции отсутствует, вектор и чужеродная ДНК могут быть легко лигированы с использованием синтетического олигонуклеотидного адаптера или линкера в соответствии с обычным способом.[59] Considering the purposes of the present invention, the use of a plasmid vector is preferred. Typical plasmid vectors that can be used to achieve objectives include (a) an origin of replication to efficiently carry out replication to include several or several hundred plasmid vectors in each host cell, (b) an antibiotic resistance gene for host cell screening, transformed with plasmid vectors and (c) a restriction enzyme cleavage site into which a fragment of foreign DNA is inserted. Even if a corresponding restriction enzyme cleavage site is missing, the vector and foreign DNA can be easily ligated using a synthetic oligonucleotide adapter or linker according to a conventional method.
[60] Кроме того, когда ген выровнен с другой последовательностью нуклеиновой кислоты на основе функциональной взаимосвязи между ними, говорят, что он «функционально связан» с ней. Это могут быть ген(ы) и регуляторная(ые) последовательность(и), связанные таким образом, чтобы обеспечить экспрессию гена, когда подходящая молекула (например, белок-активатор транскрипции) связана с регуляторной(ыми) последовательностью(ями). Например, ДНК препоследовательности или секреторного лидера функционально связана с ДНК полипептида, когда она экспрессируется в виде препротеина, участвующего в секреции полипептида; промотор или энхансер функционально связан с кодирующей последовательностью, когда он влияет на транскрипцию последовательности; сайт связывания рибосомы функционально связан с кодирующей последовательностью, когда он влияет на транскрипцию последовательности; или сайт связывания рибосомы функционально связан с кодирующей последовательностью, когда он расположен для облегчения трансляции.[60] Additionally, when a gene is aligned with another nucleic acid sequence based on the functional relationship between them, it is said to be “functionally linked” to it. These may be gene(s) and regulatory sequence(s) linked in such a way as to allow expression of the gene when a suitable molecule (eg, a transcription activator protein) is linked to the regulatory sequence(s). For example, the DNA of a presequence or secretory leader is operably linked to the DNA of a polypeptide when expressed as a preprotein involved in the secretion of the polypeptide; a promoter or enhancer is operably linked to a coding sequence when it influences transcription of the sequence; a ribosome binding site is operably linked to a coding sequence when it affects transcription of the sequence; or the ribosome binding site is operably linked to the coding sequence when positioned to facilitate translation.
[61] Как правило, термин «функционально связанный» означает, что связанная последовательность ДНК находится в контакте или что секреторный лидер находится в контакте с ней и присутствует в рамке считывания. Однако энхансер не должен контактировать с ними. Связывание этих последовательностей осуществляется путем лигирования в удобных сайтах рестрикционных ферментов. Когда такого сайта не существует, используют синтетический олигонуклеотидный адаптер или линкер в соответствии с обычным способом.[61] Generally, the term "operably linked" means that the linked DNA sequence is in contact or that the secretory leader is in contact with it and is present in frame. However, the enhancer should not come into contact with them. Linking of these sequences is accomplished by ligation at convenient restriction enzyme sites. When such a site does not exist, a synthetic oligonucleotide adapter or linker is used in accordance with the usual method.
[62] В настоящем изобретении вектор экспрессии может дополнительно содержать промотор Trc.[62] In the present invention, the expression vector may further comprise a Trc promoter.
[63] В настоящем изобретении вектор экспрессии может представлять собой рНех1.3, но не ограничивается этим.[63] In the present invention, the expression vector may be pHex1.3, but is not limited to it.
[64] Известно, что CRM197 является высокотоксичным для Е. coli из-за его нуклеазной активности. Таким образом, экспрессия CRM197 в нежелательных условиях может отрицательно сказаться на росте Е. coli. Экспрессионная плазмида рНех1.3 Е. coli содержит ген Lacl и может подавлять фоновую экспрессию промотора trc, а встроенный в эту плазмиду модуль экспрессии TPB1Tv1.3 (ФИГ. 1) предназначен для подавления экспрессии CRM197, транскрибируемого с промотора, полученного из плазмиды, путем встраивания терминатора транскрипции tR2, полученного из фага λ, и терминатора транскрипции Те, полученного из фага Т7, в вышерасположенную часть экспрессируемого гена CRM197, и терминатора транскрипции rrnB Т1Т2, полученного из Е. coli, в нижерасположенную его часть.[64] CRM197 is known to be highly toxic to E. coli due to its nuclease activity. Thus, expression of CRM197 under undesirable conditions may negatively affect the growth of E. coli. The E. coli expression plasmid pHex1.3 contains the Lacl gene and can suppress the background expression of the trc promoter, and the TPB1Tv1.3 expression module built into this plasmid (FIG. 1) is designed to suppress the expression of CRM197, transcribed from the promoter obtained from the plasmid, by inserting transcription terminator tR2, obtained from phage λ, and transcription terminator Te, obtained from phage T7, into the upstream part of the expressed CRM197 gene, and transcription terminator rrnB T1T2, obtained from E. coli, into its downstream part.
[65][65]
[66] В другом аспекте настоящее изобретение направлено на рекомбинантный микроорганизм, в который введена конструкция нуклеиновой кислоты или вектор экспрессии.[66] In another aspect, the present invention is directed to a recombinant microorganism into which a nucleic acid construct or expression vector has been introduced.
[67] В настоящем изобретении рекомбинантный микроорганизм может представлять собой Escherichia coli, но не ограничивается этим.[67] In the present invention, the recombinant microorganism may be Escherichia coli, but is not limited to it.
[68] В качестве рекомбинантного микроорганизма обычно используют клетки-хозяева, обладающие высокой эффективностью введения ДНК и высокой эффективностью экспрессии введенной ДНК, все бактерии, дрожжи, плесень и т.д., то есть все микроорганизмы, включая прокариотические и эукариотические клетки, доступны, и в примере по настоящему изобретению использовали Е. coli, но настоящее изобретение не ограничивается ими, и можно использовать любой тип микроорганизмов при условии, что белок CRM197 может быть экспрессирован в достаточной степени.[68] As the recombinant microorganism, host cells having high DNA introduction efficiency and high expression efficiency of the introduced DNA are usually used, all bacteria, yeast, mold, etc., that is, all microorganisms including prokaryotic and eukaryotic cells are available, and in the example of the present invention, E. coli was used, but the present invention is not limited to them, and any type of microorganism can be used as long as the CRM197 protein can be expressed sufficiently.
[69] Следует понимать, что не все векторы функционируют одинаково при экспрессии последовательностей ДНК согласно настоящему изобретению. Точно так же не все хозяева одинаково функционируют для одной и той же системы экспрессии. Однако специалисты в данной области техники смогут сделать соответствующий выбор среди различных векторов, последовательностей, регулирующих экспрессию, и хозяев без чрезмерного бремени экспериментов и без отклонения от объема настоящего изобретения. Например, выбор вектора следует проводить с учетом хозяина, поскольку вектор должен реплицироваться в нем. Также следует учитывать количество репликатов вектора, возможность контролировать количество репликатов вектора и экспрессию других белков, кодируемых соответствующим вектором, таких как экспрессия антибиотических маркеров.[69] It should be understood that not all vectors function equally in expressing the DNA sequences of the present invention. Likewise, not all hosts function equally for the same expression system. However, those skilled in the art will be able to make appropriate selections among various vectors, expression control sequences, and hosts without undue experimental burden and without departing from the scope of the present invention. For example, vector selection should be based on the host, since the vector must replicate within it. The number of vector replicates, the ability to control the number of vector replicates, and the expression of other proteins encoded by the corresponding vector, such as the expression of antibiotic markers, should also be considered.
[70] Трансформированный рекомбинантный микроорганизм может быть получен любым известным способом трансформации.[70] The transformed recombinant microorganism can be obtained by any known transformation method.
[71] В настоящем изобретении способ встраивания гена в хромосому клеток-хозяев может быть выбран из общеизвестных способов генетических манипуляций, например, способов с использованием ретровирусных векторов, аденовирусных векторов, аденоассоциированных вирусных векторов, векторов вирусов простого герпеса, поксвирусных векторов, лентивирусных векторов или невирусных векторов.[71] In the present invention, the method of inserting a gene into the chromosome of host cells can be selected from well-known methods of genetic manipulation, for example, methods using retroviral vectors, adenoviral vectors, adeno-associated viral vectors, herpes simplex virus vectors, poxviral vectors, lentiviral vectors or non-viral vectors.
[72] Кроме того, трансформацию можно осуществить путем прямой вставки конструкции нуклеиновой кислоты в хромосому клеток-хозяев в дополнение к использованию векторов экспрессии.[72] Alternatively, transformation can be accomplished by direct insertion of a nucleic acid construct into the host cell chromosome in addition to the use of expression vectors.
[73] В целом, можно использовать электропорацию, липофекцию, баллистическую доставку, виросомы, липосомы, иммунолипосомы, поликатионы или конъюгаты липид:нуклеиновая кислота, «голую» ДНК, искусственные вирионы, химически стимулированный приток ДНК, осаждение фосфата кальция (CaPO4), осаждение хлорида кальция (CaCl2), микроинъекцию, метод ацетата лития-ДМСО и т.д.[73] In general, electroporation, lipofection, ballistic delivery, virosomes, liposomes, immunoliposomes, polycations or lipid:nucleic acid conjugates, naked DNA, artificial virions, chemically stimulated DNA influx, calcium phosphate (CaPO 4 ) precipitation can be used. calcium chloride ( CaCl2 ) precipitation, microinjection, lithium acetate-DMSO method, etc.
[74] Сонопорация, например, способы с использованием системы Sonitron 2000 (Rich-Mar), также могут быть использованы для доставки нуклеиновых кислот, а другие репрезентативные системы доставки нуклеиновых кислот включают Amaxa Biosystems (Cologne, Germany), Maxcyte, Inc. (Rockville, Maryland) и BTX Molecular System (Holliston, Mass.). Способы липофекции раскрыты в патенте США №5049386, патенте США №4946787 и патенте США №4897355, а реагенты для липофекции являются коммерчески доступными, например, TRANSFECTAM™ и LIPOFECTIN™. Катионные или нейтральные липиды, подходящие для эффективной распознающей рецептор липофекции полинуклеотидов, включают липиды Фельгнера (WO 91/17424 и WO 91/16024), которые могут быть доставлены в клетки посредством трансдукции ех-vivo и в ткани-мишени посредством трансдукции in vivo. Способы получения комплекса липид : нуклеиновая кислота, содержащего целевую липосому, такую как иммунолипидный комплекс, хорошо известны в данной области техники (Crystal, Science., 270: 404-410, 1995; Blaese et al., Cancer Gene Ther., 2: 291-297, 1995; Behr et al., Bioconjugate Chem., 5: 382389, 1994; Remy et al., Bioconjugate Chem., 5: 647-654, 1994; Gao et al., Gene Therapy., 2: 710-722, 1995; Ahmad et al., Cancer Res., 52: 4817-4820, 1992; патент США №4186183; патент США №4217344; патент США №4235871; патент США №4261975; патент США №4485054, патент США №4501728, патент США №4774085, патент США №4837028, патент США №4946787).[74] Sonoporation, such as methods using the Sonitron 2000 system (Rich-Mar), can also be used to deliver nucleic acids, and other representative nucleic acid delivery systems include Amaxa Biosystems (Cologne, Germany), Maxcyte, Inc. (Rockville, Maryland) and BTX Molecular System (Holliston, Mass.). Methods for lipofection are disclosed in US Pat. No. 5,049,386, US Pat. No. 4,946,787, and US Pat. No. 4,897,355, and lipofection reagents are commercially available, such as TRANSFECTAM™ and LIPOFECTIN™. Cationic or neutral lipids suitable for efficient receptor-recognition lipofection of polynucleotides include Felgner lipids (WO 91/17424 and WO 91/16024), which can be delivered to cells via ex-vivo transduction and to target tissues via in-vivo transduction. Methods for preparing a lipid:nucleic acid complex containing a target liposome, such as an immunolipid complex, are well known in the art (Crystal, Science., 270: 404-410, 1995; Blaese et al., Cancer Gene Ther., 2: 291 -297, 1995; Behr et al., Bioconjugate Chem., 5: 382389, 1994; Remy et al., Bioconjugate Chem., 5: 647-654, 1994; Gao et al., Gene Therapy., 2: 710- 722, 1995; Ahmad et al., Cancer Res., 52: 4817-4820, 1992; US Patent No. 4186183; US Patent No. 4217344; US Patent No. 4235871; US Patent No. 4261975; US Patent No. 4485054; US Patent No. 4501728 , US Patent No. 4774085, US Patent No. 4837028, US Patent No. 4946787).
[75] В одном варианте осуществления настоящего изобретения в результате трансформации различных штаммов Е. coli полученным плазмидным вектором (Таблица 4), для слияния с L3 CRM197 экспрессировался во всех штаммах, и для слияния с L5 CRM197 экспрессировался в штаммах, за исключением Origami™ 2 (ФИГ. 4). Гибриды L3 и L5 были способны экспрессировать белок CRM197 в растворимой форме даже в штаммах, в которых гены (trxB, gor), связанные с окислительно-восстановительным потенциалом, не были сконструированы, и белок имел те же физико-химические/иммунологические свойства, что и белок, выделенный из родительских штаммов. Кроме того, в случае слияния с L3 белок CRM197 может экспрессироваться в растворимой форме как при 25°С, так и при 30°С (ФИГ. 7 и 12А).[75] In one embodiment of the present invention, by transforming various E. coli strains with the resulting plasmid vector (Table 4), for L3 fusion, CRM197 was expressed in all strains, and for L5 fusion, CRM197 was expressed in strains except Origami™ 2 (FIG. 4). The L3 and L5 hybrids were able to express the CRM197 protein in a soluble form even in strains in which the redox-related genes (trxB, gor) were not engineered and the protein had the same physicochemical/immunological properties as protein isolated from parental strains. In addition, when fused to L3, the CRM197 protein can be expressed in a soluble form at both 25°C and 30°C (FIGS. 7 and 12A).
[76] Предыдущий отчет показал, что при культивировании при рН от 6,5 до 6,8 и последующем изменении рН до 7,5 во время индукции секреция CRM197 в периплазму улучшается. Напротив, было обнаружено, что штамм, полученный в соответствии с настоящим изобретением, эффективно секретирует CRM197 в периплазму без изменения рН среды (ФИГ. 12). В случае слияния с L5 в высококонцентрированной культуре без смещения рН продуктивность CRM197 составляла 3,7 г/л, а в периплазму секретировалось 2 г/л и более CRM197.[76] A previous report showed that when cultured at pH 6.5 to 6.8 and then changed to pH 7.5 during induction, secretion of CRM197 into the periplasm was improved. In contrast, the strain prepared according to the present invention was found to efficiently secrete CRM197 into the periplasm without changing the pH of the medium (FIG. 12). In the case of fusion with L5 in a highly concentrated culture without a pH shift, the productivity of CRM197 was 3.7 g/L, and 2 g/L or more of CRM197 was secreted into the periplasm.
[77][77]
[78] В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу получения белка CRM197, включающему (а) культивирование рекомбинантного микроорганизма, в который введена конструкция нуклеиновой кислоты или вектор экспрессии, для получения белка CRM197, и (b) выделение полученного белка CRM197.[78] In another aspect, the present invention provides a method for producing CRM197 protein, comprising (a) cultivating a recombinant microorganism into which a nucleic acid construct or expression vector has been introduced to produce CRM197 protein, and (b) isolating the resulting CRM197 protein.
[79] В настоящем изобретении стадия (b) может включать выделение белка CRM197, секретируемого в периплазму.[79] In the present invention, step (b) may include isolating the CRM197 protein secreted into the periplasm.
[80][80]
[81] Далее настоящее изобретение будет описано более подробно со ссылкой на примеры. Однако специалистам в данной области техники будет очевидно, что эти примеры представлены только для иллюстрации настоящего изобретения и не должны рассматриваться как ограничивающие объем настоящего изобретения.[81] Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to examples. However, it will be apparent to those skilled in the art that these examples are presented only to illustrate the present invention and should not be construed as limiting the scope of the present invention.
[82][82]
[83] Пример 1: Получение сверхэкспрессионной плазмиды CRM197[83] Example 1: Preparation of CRM197 Overexpression Plasmid
[84] Пример 1.1: Конструкция плазмиды рНех1.3[84] Example 1.1: Construction of plasmid pHex1.3
[85] Экспрессионная плазмида Е. coli рНех1.3 была получена следующим образом. После двойного расщепления ptrc99a (Amann et al., Gene. 69, 301-15, 1988) Sspl и Dral фрагмент ДНК размером примерно 3,2 т.п.н. очищали с помощью электрофореза в агарозе. Ген устойчивости к канамицину амплифицировали с помощью ПЦР. Используемая в настоящем документе матрица представляла собой плазмиду pCR2.1, а используемые в настоящем документе праймеры представляли собой KF2 и KR (Таблица 1).[85] The expression plasmid of E. coli pHex1.3 was obtained as follows. Following double cleavage of ptrc99a (Amann et al., Gene. 69, 301-15, 1988) Sspl and Dral, an approximately 3.2 kb DNA fragment is formed. purified by agarose electrophoresis. The kanamycin resistance gene was amplified by PCR. The template used herein was plasmid pCR2.1, and the primers used herein were KF2 and KR (Table 1).
[86][86]
[88][88]
[89] Реакционный раствор для ПЦР готовили с использованием 2,5 мМ каждого dNTP, 10 пмоль каждого праймера, от 200 до 500 нг матричной ДНК, 1,25 Ед ДНК-полимеразы PrimeSTAR HS (Takara Bio Inc., Япония) и 50 мкл реакционного объема, и ПЦР проводили в течение 30 циклов, каждый из которых включал три стадии при 98°С в течение 10 секунд, при 60°С в течение 5 секунд и при 72°С мин/т.п.н. После двойного расщепления фрагмента ДНК размером примерно 0,8 т.п.н., полученного в условиях ПЦР с использованием SamHI и HindIII, фрагмент ДНК дополняли фрагментом Кленова с образованием тупого конца, а затем лигировали с фрагментом ДНК размером 3,2 т.п.н., полученным в предыдущем процессе, используя ДНК-лигазу Т4. Этот реакционный раствор трансформировали в E. coli С2984Н для получения рНех1.1, в котором маркер селекции был заменен с Amp на Km.[89] The PCR reaction solution was prepared using 2.5 mM of each dNTP, 10 pmol of each primer, 200 to 500 ng of template DNA, 1.25 U of PrimeSTAR HS DNA polymerase (Takara Bio Inc., Japan) and 50 μl reaction volume, and PCR was performed for 30 cycles, each of which included three steps at 98°C for 10 seconds, 60°C for 5 seconds, and 72°C min/kb. After double cleavage of the approximately 0.8 kb DNA fragment obtained by PCR using SamHI and HindIII, the DNA fragment was complemented with a Klenow fragment to form a blunt end and then ligated with the 3.2 kb DNA fragment. .n. obtained in the previous process using T4 DNA ligase. This reaction solution was transformed into E. coli C2984H to produce pHex1.1, in which the selection marker was changed from Amp to Km.
[90] Модуль экспрессии TPB1Bv1.3, включающий промоторы, RBS и терминаторы транскрипции (ФИГ. 1), был синтезирован в Bioneer (SEQ ID NO: 1). Процесс загрузки модуля экспрессии TPB1Bv1.3 на рНех1.3 выглядит следующим образом. Фрагмент ДНК (1255 п.н.), полученный с помощью ПЦР-амплификации с использованием модуля экспрессии TPB1Bv1.3 в качестве матрицы и TPB_F и TPB_R в качестве праймеров (Таблица 1), был собран in vitro с фрагментом ДНК (4561 п.н.), полученным с помощью ПЦР-амплификации с использованием рНех1.1. в качестве матрицы и pHex_F и pHex_R в качестве праймеров посредством независимого от лигирования клонирования (LIC; Jeong et al., Appl Environ Microbiol. 78, 5440-3, 2012) в условиях, показанных в Таблице 2, и полученный продукт трансформировали в Е. coli С2984Н для получения рНех1.3 (ФИГ. 2).[90] The expression module TPB1Bv1.3, including promoters, RBS and transcription terminators (FIG. 1), was synthesized in Bioneer (SEQ ID NO: 1). The process of loading the TPB1Bv1.3 expression module on pHex1.3 is as follows. A DNA fragment (1255 bp) obtained by PCR amplification using the TPB1Bv1.3 expression module as a template and TPB_F and TPB_R as primers (Table 1) was assembled in vitro with a DNA fragment (4561 bp .), obtained by PCR amplification using pHex1.1. as template and pHex_F and pHex_R as primers by ligation-independent cloning (LIC; Jeong et al., Appl Environ Microbiol. 78, 5440-3, 2012) under the conditions shown in Table 2, and the resulting product was transformed into E. coli C2984H to obtain pHex1.3 (FIG. 2).
[91][91]
[93][93]
[94] Условия LIC реакции: Векторы расщепляли рестрикционными ферментами или получали линейные фрагменты ДНК с помощью ПЦР. Вставки готовили с помощью ПЦР. Векторы смешивали со вставками, как показано в таблице выше, а затем обеспечивали реакцию при комнатной температуре в течение 2 минут и 30 секунд.[94] LIC reaction conditions: Vectors were digested with restriction enzymes or linear DNA fragments were obtained by PCR. Inserts were prepared by PCR. The vectors were mixed with the inserts as shown in the table above and then allowed to react at room temperature for 2 minutes and 30 seconds.
[95][95]
[96] Пример 1.2: Конструкция гена CRM197[96] Example 1.2: Construction of the CRM197 gene
[97] Нуклеотидная последовательность (CRM197ec) CRM197, оптимально экспрессируемая в Е. coli, была синтезирована в GenScript (SEQ ID NO: 2). Аминокислотная последовательность, кодируемая CRM197ec, представляет собой SEQ ID NO: 3.[97] The nucleotide sequence (CRM197ec) of CRM197 optimally expressed in E. coli was synthesized in GenScript (SEQ ID NO: 2). The amino acid sequence encoded by CRM197ec is SEQ ID NO: 3.
[98][98]
[99] Пример 1.3: Конструирование гена сигнальной последовательности[99] Example 1.3: Signal sequence gene construction
[100] Сигнальные последовательности, используемые для секреции белка CRM197 в периплазму Е. coli, показаны в Таблице 3 ниже (SEQ ID NO: 13-21). Для оптимизации экспрессии в Е. coli синтезировали ДНК с SEQ ID NO: 4-12 с учетом кодонового контекста и вторичной структуры (Таблица 3).[100] The signal sequences used for secretion of the CRM197 protein into the periplasm of E. coli are shown in Table 3 below (SEQ ID NO: 13-21). To optimize expression in E. coli, DNA with SEQ ID NO: 4-12 was synthesized taking into account codon context and secondary structure (Table 3).
[101][101]
[103][103]
[104] Пример 1.4: Конструирование плазмиды для сверхэкспрессии CRM197[104] Example 1.4: Construction of a plasmid for overexpression of CRM197
[105] Плазмиды для сверхэкспрессии CRM 197 в Е. coli и секреции CRM 197 в периплазму получали, как показано на ФИГ. 3. После двойного расщепления рНех1.3 с помощью BsaI и DraI с помощью электрофореза в агарозе был выделен фрагмент ДНК длиной примерно 5 т.п.н. Сигнальные последовательности L1-L9 амплифицировали с помощью ПЦР с использованием праймеров и матриц, показанных в Таблице 1. Фрагмент ДНК CRM197 для слияния гена CRM197 с каждой сигнальной последовательностью с использованием метода LIC амплифицировали с помощью ПЦР с использованием праймеров и матриц, показанных в Таблице 1. рНех1.3, расщепленный BsaI и DraI, каждый фрагмент сигнальной последовательности и совместимый с ним фрагмент CRM197 собирали in vitro с использованием описанных выше условий LIC, а затем полученный продукт трансформировали в Е. coli С2984Н для получения плазмид pHex-L1-CRM, pHex-L2-CRM, pHex-L3-CRM, pHex-L4-CRM, pHex-L5-CRM, pHex-L6-CRM, pHex-L7-CRM, pHex-L8-CRM и pHex-L9-CRM, содержащих CRM197, слитый с соответствующими сигнальными последовательностями.[105] Plasmids for overexpression of CRM 197 in E. coli and secretion of CRM 197 into the periplasm were prepared as shown in FIG. 3. After double digestion of pHex1.3 with BsaI and DraI, a DNA fragment of approximately 5 kb was isolated by agarose electrophoresis. The L1-L9 signal sequences were amplified by PCR using the primers and templates shown in Table 1. The CRM197 DNA fragment for fusion of the CRM197 gene with each signal sequence using the LIC method was amplified by PCR using the primers and templates shown in Table 1. pHex1.3, digested with BsaI and DraI, each signal sequence fragment and its compatible CRM197 fragment were assembled in vitro using the LIC conditions described above, and then the resulting product was transformed into E. coli C2984H to obtain plasmids pHex-L1-CRM, pHex- L2-CRM, pHex-L3-CRM, pHex-L4-CRM, pHex-L5-CRM, pHex-L6-CRM, pHex-L7-CRM, pHex-L8-CRM and pHex-L9-CRM containing CRM197, fused with the corresponding signal sequences.
[106][106]
[107] Пример 2: Экспрессия белка CRM197 в Е. coli[107] Example 2: Expression of CRM197 protein in E. coli
[108] pHex-L3-CRM и pHex-L5-CRM были выбраны из плазмид, полученных в Примере 1, с учетом уровня экспрессии и степени клеточного роста. После трансформации pHex-L3-CRM и pHex-L5-CRM в штамм E.coli из Таблицы 4 ниже оценивали экспрессию и положение экспрессии белка CRM197.[108] pHex-L3-CRM and pHex-L5-CRM were selected from the plasmids obtained in Example 1, taking into account the level of expression and the degree of cell growth. After transforming pHex-L3-CRM and pHex-L5-CRM into the E. coli strain of Table 4 below, the expression and expression position of CRM197 protein were evaluated.
[109][109]
[111][111]
[112] Способ культивирования заключается в следующем. Колонию, полученную на твердой среде (10 г/л сойтона, 5 г/л дрожжевого экстракта, 10 г/л NaCl, 15 г/л агара), культивировали при встряхивании в жидкой среде LB, содержащей 100 мМ фосфата калия (рН 7,5), км 50 мкг/мл и 0,2% лактозы, все клетки подвергали SDS-PAGE, а затем анализировали экспрессию CRM197 с использованием окрашивания Кумасси и вестерн-блоттинга (ФИГ. 4). Для слияния с L3 белок CRM197 экспрессировали во всех используемых штаммах, тогда как для слияния L5 рост был невозможен в жидкой среде при трансформации в Origami™ 2. В других штаммах наблюдалась экспрессия белка CRM197.[112] The cultivation method is as follows. The colony obtained on solid medium (10 g/l soyton, 5 g/l yeast extract, 10 g/l NaCl, 15 g/l agar) was cultured with shaking in liquid LB medium containing 100 mM potassium phosphate (
[113][113]
[114] Пример 2.1: Экспрессия CRM197 с помощью L5[114] Example 2.1: Expression of CRM197 by L5
[115] BL21 (DE3), содержащий pHex-L5-CRM, культивировали в жидкой среде LB (колба с перегородкой 50 мл/500 мл), содержащей 100 мМ фосфата калия (рН 7,5) и 50 мкг/мл km, пока OD600 не достигла 0,4-0,6. Затем в качестве индуктора для индукции экспрессии добавляли 0,2, 0,4 или 0,6% лактозы или 0,02, 0,2 или 2 мМ IPTG (изопропил-β-D-1-тиогалактопианозида). Температура культуры составляла 25°С или 30°С. После культивирования клетки извлекали, суспендировали в 50 мМ фосфате калия (рН 7,0) и затем разрушали ультразвуком. После разрушения проводили центрифугирование для отделения супернатанта (растворимая фракция) от осадка (нерастворимая фракция). После SDS-PAGE каждого образца экспрессию белка CRM197 анализировали с использованием окрашивания Кумасси и вестерн-блоттинга (ФИГ. 5). Когда добавляли индуктор (лактозу, IPTG) и затем проводили культивирование при 25°С, большая часть экспрессированного белка CRM197 присутствовала в растворимой форме и имела ту же молекулярную массу, что и эталонный CRM197, что указывает на то, что экспрессированный белок был зрелым CRM197, из которого была удалена сигнальная последовательность L5 (ФИГ. 5А). С другой стороны, когда в качестве индуктора использовали лактозу и проводили культивирование при 30°С, примерно 50% белка CRM197 было обнаружено в нерастворимой фракции, а когда в качестве индуктора добавляли IPTG, большая часть белка CRM197 была обнаружена в нерастворимой фракции (ФИГ. 5В).[115] BL21 (DE3) containing pHex-L5-CRM was cultured in liquid LB medium (50 mL/500 mL baffled flask) containing 100 mM potassium phosphate (pH 7.5) and 50 μg/mL km until OD 600 did not reach 0.4-0.6. Then, 0.2, 0.4, or 0.6% lactose or 0.02, 0.2, or 2 mM IPTG (isopropyl-β-D-1-thiogalactopianoside) was added as an inducer to induce expression. The culture temperature was 25°C or 30°C. After culture, the cells were removed, suspended in 50 mM potassium phosphate (pH 7.0) and then disrupted by ultrasound. After destruction, centrifugation was performed to separate the supernatant (soluble fraction) from the sediment (insoluble fraction). After SDS-PAGE of each sample, CRM197 protein expression was analyzed using Coomassie staining and Western blotting (FIG. 5). When an inducer (lactose, IPTG) was added and then cultured at 25°C, most of the expressed CRM197 protein was present in soluble form and had the same molecular weight as the reference CRM197, indicating that the expressed protein was mature CRM197. from which the L5 signal sequence was removed (FIG. 5A). On the other hand, when lactose was used as an inducer and culture was performed at 30°C, approximately 50% of the CRM197 protein was found in the insoluble fraction, and when IPTG was added as an inducer, most of the CRM197 protein was found in the insoluble fraction (FIG. 5B ).
[116] Периплазматическая фракция была извлечена с помощью осмотического шока для определения места, в котором экспрессировался CRM197. Процесс заключается в следующем. BL21 (DE3), содержащий pHex-L5-CRM, культивировали при 25°С и затем центрифугировали для выделения клеток. Клетки ресуспендировали в буфере для индукции плазматической мембраны [30 мМ Tris-HCI (рН 8,0), 20% сахарозы, 1 или 10 мМ ЭДТА, 1 мМ PMSF (фенилметилсульфонилфторид)] до тех пор, пока концентрация клеток не достигала OD600, равной 10, и перемешивали при комнатной температуре от 0,5 до 1 часа. Затем клетки собирали центрифугированием при 4000 × g в течение 15 минут и добавляли такое же количество 30 мМ холодного (4°С или ниже) Tris-HCI (рН 8,0) с последующим перемешиванием при комнатной температуре в течение 0,5-1 часа. Затем клетки центрифугировали при 4000 g в течение 15 минут для получения супернатанта (периплазматическая фракция, Р2). После обработки буфером для индукции плазматической мембраны супернатант (Р1), периплазматическую фракцию (Р2) и цитоплазматическую фракцию проявляли с помощью SDS-PAGE, а затем оценивали экспрессию CRM197 и положение экспрессированного CRM197 с использованием окрашивания Кумасси и вестерн-блоттинга (ФИГ. 5). Было обнаружено, что L5 может успешно секретировать CRM197 в периплазму (ФИГ. 6). ЭДТА в качестве буфера для индукции плазматической мембраны была более эффективной при 10 мМ, чем при 1 мМ.[116] The periplasmic fraction was extracted using osmotic shock to determine the location where CRM197 was expressed. The process is as follows. BL21 (DE3) containing pHex-L5-CRM was cultured at 25°C and then centrifuged to isolate cells. Cells were resuspended in plasma membrane induction buffer [30 mM Tris-HCI (pH 8.0), 20% sucrose, 1 or 10 mM EDTA, 1 mM PMSF (phenylmethylsulfonyl fluoride)] until the cell concentration reached OD 600 . equal to 10, and stirred at room temperature for 0.5 to 1 hour. Cells were then collected by centrifugation at 4000 × g for 15 minutes and the same amount of 30 mM cold (4°C or lower) Tris-HCI (pH 8.0) was added, followed by stirring at room temperature for 0.5-1 hour . The cells were then centrifuged at 4000 g for 15 minutes to obtain the supernatant (periplasmic fraction, P2). After treatment with plasma membrane induction buffer, the supernatant (P1), periplasmic fraction (P2) and cytoplasmic fraction were developed by SDS-PAGE, and then the expression of CRM197 and the position of expressed CRM197 was assessed using Coomassie staining and Western blotting (FIG. 5). It was found that L5 could successfully secrete CRM197 into the periplasm (FIG. 6). EDTA as a buffer for plasma membrane induction was more effective at 10 mM than at 1 mM.
[117][117]
[118] Пример 2.2: Экспрессия CRM197 с помощью L3[118] Example 2.2: Expression of CRM197 by L3
[119] BL21 (DE3), содержащий pHex-L3-CRM, экспрессировали в тех же условиях, что и в примере 2.1. Было обнаружено, что CRM197, индуцированный L3, в отличие от L5, присутствовал в растворимой форме при любых условиях (ФИГ. 7) и секретировался в периплазму (ФИГ. 8).[119] BL21 (DE3) containing pHex-L3-CRM was expressed under the same conditions as in example 2.1. It was found that CRM197 induced by L3, unlike L5, was present in soluble form under all conditions (FIG. 7) and secreted into the periplasm (FIG. 8).
[120][120]
[121] Пример 3: Культура Е. coli BL21 (DE3)[121] Example 3: Culture of E. coli BL21 (DE3)
[122] Штамм BL21 (DE3), содержащий pHex-L3-CRM или pHex-L5-CRM, культивировали с использованием следующего метода. Во время основного культивирования питание осуществляли с использованием метода рН stat, а рН поддерживали на уровне 7,3 с помощью питательного раствора (600 г/л глюкозы, 30 г/л дрожжевого экстракта) и раствора щелочи (14-15% аммиака). Составы растворов и сред, используемых для культивирования, показаны в Таблицах 5 и 6.[122] Strain BL21 (DE3) containing pHex-L3-CRM or pHex-L5-CRM was cultured using the following method. During the main culture, feeding was carried out using the pH stat method, and the pH was maintained at 7.3 using a nutrient solution (600 g/L glucose, 30 g/L yeast extract) and alkali solution (14-15% ammonia). The compositions of solutions and media used for cultivation are shown in Tables 5 and 6.
[123][123]
[125][125]
[125][125]
[127][127]
[128] Одиночная колония, образованная в модифицированной агаровой среде LB [модифицированный агар Луриа-Бертани (LB): 10 г/л сойтона, 5 г/л дрожжевого экстракта, 10 г/л натрия хлорида, 15 г/л агара, 50 мг /л канамицина] инокулировали в посевную культуральную среду с последующей инкубацией при 30°С в течение 18 часов. Полученную посевную культуру снова инокулировали в соотношении 1% (об./об.) в основную культуральную среду (ферментер 3 л/5 л) и культивировали при 30°С. Основную питательную среду получали добавлением 0,1% стерилизованного пеногасителя к посевной питательной среде. После того как оптическая плотность культурального раствора достигала 30-40, температуру снижали до 25°С. Затем добавляли 10 мМ IPTG и культивирование прекращали после того, как поглощение культурального раствора достигало 100-120.[128] Single colony formed on modified LB agar medium [modified Luria-Bertani (LB) agar: 10 g/L soyton, 5 g/L yeast extract, 10 g/L sodium chloride, 15 g/L agar, 50 mg /l kanamycin] were inoculated into the seed culture medium, followed by incubation at 30°C for 18 hours. The resulting seed culture was again inoculated at a ratio of 1% (v/v) into the main culture medium (fermenter 3 L/5 L) and cultured at 30°C. The basic nutrient medium was prepared by adding 0.1% sterilized defoamer to the inoculum nutrient medium. After the optical density of the culture solution reached 30-40, the temperature was reduced to 25°C. Then 10 mM IPTG was added and cultivation was stopped after the absorbance of the culture solution reached 100-120.
[12 9] Поведение культуры Е. coli BL21 (DE3), содержащей pHex-L3-CRM, в ферментере объемом 5 л показано на ФИГ. 9, а поведение культуры Е. coli BL21 (DE3), содержащей pHex-L5-CRM, показано на ФИГ. 10. Характер экспрессии CRM197 при ферментации в ферментере объемом 5 л показан на ФИГ. 11, а выход экспрессии составлял от 1,1 до 1,2 г/л для слияния с L3 и от 3,0 до 3,7 г/л для слияния с L5. Количество CRM197 измеряли путем сравнения относительного количества с эталонным CRM197 с использованием денситометра (GS-900™, Bio-Rad Laboratories Ins., Hercules, California) после окрашивания SDS-PAGE/Кумасси.[12 9] The behavior of an E. coli BL21 (DE3) culture containing pHex-L3-CRM in a 5 L fermenter is shown in FIG. 9, and the behavior of an E. coli BL21 (DE3) culture containing pHex-L5-CRM is shown in FIG. 10. The expression pattern of CRM197 during fermentation in a 5 L fermenter is shown in FIG. 11, and the expression yield was 1.1 to 1.2 g/L for the L3 fusion and 3.0 to 3.7 g/L for the L5 fusion. The amount of CRM197 was measured by comparing the relative amount with reference CRM197 using a densitometer (GS-900™, Bio-Rad Laboratories Ins., Hercules, California) after SDS-PAGE/Coomassie staining.
[130][130]
[131] Пример 4: Очистка белка[131] Example 4: Protein Purification
[132] Пример 4.1: Получение периплазматической фракции из клеточной культуры[132] Example 4.1: Preparation of the periplasmic fraction from cell culture
[133] Процедура выделения периплазматической фракции из клеток, культивируемых в 5-литровом ферментере, выглядит следующим образом. Среду для культивирования клеток центрифугировали при 4°С и 4000 × g в течение 15 минут для осаждения клеток. Осадок клеток ресуспендировали в буфере для индукции плазматической мембраны (Таблица 7) с модифицированным белком, исходя из коэффициента поглощения 100, и перемешивали при комнатной температуре от 0,5 до 1 часа.[133] The procedure for isolating the periplasmic fraction from cells cultured in a 5-liter fermenter is as follows. The cell culture medium was centrifuged at 4°C and 4000 × g for 15 minutes to pellet the cells. The cell pellet was resuspended in plasma membrane induction buffer (Table 7) with modified protein based on an absorbance of 100 and stirred at room temperature for 0.5 to 1 hour.
[134][134]
[136][136]
[137] Затем клетки собирали центрифугированием при 4.000 × g в течение 15 минут и добавляли такое же количество 30 мМ холодного (4°С или ниже) Tris-HCI (рН 8,0) с последующим перемешиванием при комнатной температуре в течение 0,5-1 часа. Затем клетки центрифугировали при 4000 g в течение 15 минут для получения супернатанта, и удаляли примеси с помощью MF. Анализ SDS-PAGE периплазматической фракции, извлеченной из Е, coli BL21 (DE3), содержащей рНех-L3-CRM, посредством описанного выше процесса, показан на ФИГ. 12 (А), а анализ SDS-PAGE периплазматической фракции, извлеченной из Е. coli BL21 (DE3), содержащей pHex-L5-CRM, показан на ФИГ. 12(B). Было обнаружено, что количество белка CRM197, присутствующего в периплазматической фракции, составляет 1,2 г/л для штамма L3 и 2,3 г/л для штамма L5 (Таблица 8).[137] Cells were then collected by centrifugation at 4,000 × g for 15 minutes and the same amount of 30 mM cold (4°C or lower) Tris-HCI (pH 8.0) was added, followed by stirring at room temperature for 0.5 -1 hour. The cells were then centrifuged at 4000 g for 15 minutes to obtain the supernatant, and contaminants were removed using MF. SDS-PAGE analysis of the periplasmic fraction recovered from E, coli BL21 (DE3) containing pHex-L3-CRM by the process described above is shown in FIG. 12 (A), and SDS-PAGE analysis of the periplasmic fraction extracted from E. coli BL21 (DE3) containing pHex-L5-CRM is shown in FIG. 12(B). The amount of CRM197 protein present in the periplasmic fraction was found to be 1.2 g/L for strain L3 and 2.3 g/L for strain L5 (Table 8).
[138][138]
[140][140]
[141] Пример 4.2: Очистка белка CRM197[141] Example 4.2: Purification of CRM197 protein
[142] Периплазматическую фракцию культуральной среды pHex-L3-CRM дважды концентрировали с использованием мембраны с отсечкой 10 кДа, используя систему TFF, и проводили ультрафильтрацию с использованием десяти объемов 10 мМ растворителя фосфата натрия (рН 7,2). Очистку проводили с помощью двухколоночных процессов с использованием системы AKTA pure (GE Healthcare). Первый колоночный процесс представлял собой анионообменную хроматографию (смола диэтиламиноэтилсефарозы с быстрым потоком, DEAE) и использовался для удаления нуклеиновых кислот и примесных белков. Смола DEAE заряжена отрицательно (-) и связана с положительно заряженным (+) белком. Несвязанные белки и примеси в первую очередь экстрагировали и удаляли из ультрафильтрованного образца с помощью DEAE-хроматографии, а затем неочищенные белки с низкой связывающей способностью, за исключением CRM197, удаляли с помощью последующего процесса промывки в зависимости от концентрации соли. Затем при увеличении концентрации соли элюировали только CRM197. Анализ образца в SDS-PAGE проводили во время процесса очистки с использованием DEAE-хроматографии, и результаты показаны на ФИГ. 13(A). Во-первых, несвязанные примеси и белки в первую очередь удаляли проточным способом из образца, подвергнутого DEAE-хроматографии с использованием хроматографии на гидроксиапатите (НА), и CRM197 элюировали растворителями 100 мМ фосфата калия и 100 мМ NaCI. Результат SDS-PAGE элюированного CRM197 показан на ФИГ. 13(B).[142] The periplasmic fraction of pHex-L3-CRM culture medium was concentrated twice using a 10 kDa cutoff membrane using a TFF system and ultrafiltrated using ten volumes of 10 mM sodium phosphate solvent (pH 7.2). Purification was carried out using two-column processes using the AKTA pure system (GE Healthcare). The first column process was anion exchange chromatography (fast flow diethylaminoethyl sepharose resin, DEAE) and was used to remove nucleic acids and contaminating proteins. DEAE resin is negatively charged (-) and bound to a positively charged (+) protein. Unbound proteins and impurities were firstly extracted and removed from the ultrafiltered sample by DEAE chromatography, and then crude proteins with low binding capacity, except CRM197, were removed by a subsequent washing process depending on the salt concentration. Then, with increasing salt concentration, only CRM197 was eluted. SDS-PAGE analysis of the sample was performed during the purification process using DEAE chromatography, and the results are shown in FIG. 13(A). First, unbound impurities and proteins were first flow-removed from the DEAE-chromatography sample using hydroxyapatite (HA) chromatography, and CRM197 was eluted with solvents of 100 mM potassium phosphate and 100 mM NaCl. The SDS-PAGE result of eluted CRM197 is shown in FIG. 13(B).
[143][143]
[144] Пример 5: Сравнение с CRM197, полученным с использованием Corynebacterium[144] Example 5: Comparison with CRM197 produced using Corynebacterium
[145] Были проанализированы качество и характеристики конечного очищенного CRM197. В результате анализа SEC-HPLC было обнаружено, что чистота составляла 99% или более (ФИГ. 14). SDS-PAGE и вестерн-блоттинг показали, что полоса появилась в том же положении, что и у CRM197, полученного с использованием Corynebacterium (ФИГ. 15).[145] The quality and characteristics of the final purified CRM197 were analyzed. As a result of SEC-HPLC analysis, the purity was found to be 99% or more (FIG. 14). SDS-PAGE and Western blotting showed that the band appeared at the same position as CRM197 obtained using Corynebacterium (FIG. 15).
[146] Кроме того, вся последовательность из 535 аминокислот, составляющих CRM197, оказалась на 100% идентичной, а в результате измерения молекулярной массы был идентифицирован основной пик 58 409 Да, что соответствовало теоретической молекулярной массе (ФИГ. 16). Структуру более высокого порядка идентифицировали с помощью анализа кругового дихроизма (CD), и было обнаружено, что не было различий в структуре более высокого порядка с CRM197, полученным с использованием Corynebacterium (ФИГ. 17). Анализ спектра флуоресценции показал, что максимальная длина волны испускания составляла 338 нм, что было таким же, как у CRM197, полученного с использованием Corynebacterium (ФИГ. 18).[146] In addition, the entire 535 amino acid sequence comprising CRM197 was found to be 100% identical, and molecular weight measurements identified a major peak at 58,409 Da, consistent with the theoretical molecular weight (FIG. 16). The higher order structure was identified by circular dichroism (CD) analysis and it was found that there was no difference in the higher order structure with CRM197 produced using Corynebacterium (FIG. 17). Analysis of the fluorescence spectrum showed that the maximum emission wavelength was 338 nm, which was the same as that of CRM197 obtained using Corynebacterium (FIG. 18).
[147] Результаты, описанные выше, показали, что CRM197, полученный с использованием штамма Е. coli pHex-L3, был физико-химически и иммунологически таким же, как CRM197, полученный с использованием Corynebacterium.[147] The results described above showed that CRM197 produced using E. coli strain pHex-L3 was physicochemically and immunologically the same as CRM197 produced using Corynebacterium.
[148][148]
Промышленная применимостьIndustrial applicability
[149] Настоящее изобретение очень походит для продукции белка CRM197, поскольку белок CRM197, обладающий такими же физико-химическими/иммунологическими свойствами, что и белок, выделенный из исходных бактерий, может экспрессироваться в обычной Е. coli, в которой окислительно-восстановительный потенциал не регулируется, и CRM197 белок, обладающий высокой эффективностью секреции в периплазму, может быть получен без смещения рН среды для увеличения секреции в периплазму.[149] The present invention is very suitable for the production of CRM197 protein, since the CRM197 protein, having the same physicochemical/immunological properties as the protein isolated from the parent bacteria, can be expressed in normal E. coli, in which the redox potential is not regulated, and CRM197 protein, which has a high efficiency of secretion into the periplasm, can be obtained without shifting the pH of the environment to increase secretion into the periplasm.
[150][150]
[151] Несмотря на подробное описание конкретных конфигураций настоящего изобретения, специалистам в данной области техники будет понятно, что это описание представлено для изложения предпочтительных вариантов осуществления в иллюстративных целях и не должно рассматриваться как ограничивающее объем настоящего изобретения. Таким образом, существенный объем настоящего изобретения определяется прилагаемой формулой изобретения и ее эквивалентами.[151] Although specific configurations of the present invention have been described in detail, those skilled in the art will appreciate that this description is provided to set forth preferred embodiments for illustrative purposes and should not be construed as limiting the scope of the present invention. Thus, the essential scope of the present invention is defined by the appended claims and their equivalents.
[152][152]
Перечень последовательностей в форме свободного текстаList of sequences in free text form
[153] Файл в электронном виде приложен.[153] The electronic file is attached.
--->--->
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙLIST OF SEQUENCES
<110> Genofocus, Inc.<110> Genofocus, Inc.
<120> СПОСОБ ЭКСПРЕССИИ БЕЛКА CRM197<120> PROTEIN EXPRESSION METHOD CRM197
<130> P19-B209<130> P19-B209
<160> 56<160> 56
<170> KoPatentIn 3.0<170> KoPatentIn 3.0
<210> 1<210> 1
<211> 1226<211> 1226
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> TPB1Tv1.3<223> TPB1Tv1.3
<400> 1<400> 1
tactgagcta ataacaggcc tgctggtaat cgcaggcctt tttatttctg gctcaccttc 60tactgagcta ataacaggcc tgctggtaat cgcaggcctt tttatttctg gctcaccttc 60
gggtgggcct ttctgcgttt acggttctgg caaatattct gaaatgagct gttgacaatt 120gggtgggcct ttctgcgttt acggttctgg caaatattct gaaatgagct gttgacaatt 120
aatcatccgg ctcgtataat gtgtggaatt gtgagcggat aacaatttac tgctctttaa 180aatcatccgg ctcgtataat gtgtggaatt gtgagcggat aacaatttac tgctctttaa 180
caatttatca gatccaattg gaggaacaat atgggagacc acgcgcgcga ggtctcatct 240caatttatca gatccaattg gaggaacaat atgggagacc acgcgcgcga ggtctcatct 240
gcggcggcag cagggggatc gatgagcaaa ggtgaagagc tgtttaccgg tgtggtgccg 300gcggcggcag cagggggatc gatgagcaaa ggtgaagagc tgtttaccgg tgtggtgccg 300
attctggttg aactggatgg cgacgttaac ggccataaat tcagcgtcag cggcgagggc 360attctggttg aactggatgg cgacgttaac ggccataaat tcagcgtcag cggcgagggc 360
gaaggggatg ccacctacgg taaactgacc ctgaagttta tttgcaccac cggcaaatta 420gaaggggatg ccacctacgg taaactgacc ctgaagttta tttgcaccac cggcaaatta 420
ccggttccgt ggccgacgct ggtgacgacc tttagctatg gcgtgcagtg cttttcccgt 480ccggttccgt ggccgacgct ggtgacgacc tttagctatg gcgtgcagtg cttttcccgt 480
tatccggacc atatgaaaca gcatgatttt tttaaaagcg cgatgccgga aggctatgtt 540tatccggacc atatgaaaca gcatgatttt tttaaaagcg cgatgccgga aggctatgtt 540
caggaacgta ccattttctt taaggatgac ggcaattaca aaacccgcgc ggaagtgaaa 600caggaacgta ccattttctt taaggatgac ggcaattaca aaacccgcgc ggaagtgaaa 600
tttgaaggtg ataccctggt caaccgcatt gaactgaaag gcattgattt caaagaagat 660tttgaaggtg ataccctggt caaccgcatt gaactgaaag gcattgattt caaagaagat 660
ggtaatattc tcggtcataa gctggaatat aactacaaca gccataacgt ttatatcatg 720ggtaatattc tcggtcataa gctggaatat aactacaaca gccataacgt ttatatcatg 720
gcggataaac aaaaaaacgg tattaaagtg aactttaaaa ttcgccataa tatcgaagat 780gcggataaac aaaaaaacgg tattaaagtg aactttaaaa ttcgccataa tatcgaagat 780
ggtagcgtgc aactggcgga tcattatcag cagaacaccc caattggcga tggcccggtg 840ggtagcgtgc aactggcgga tcattatcag cagaacaccc caattggcga tggcccggtg 840
ttgctgccgg ataaccacta tctgagcacc cagtcggcgc tgagtaaaga tccgaacgaa 900ttgctgccgg ataaccacta tctgagcacc cagtcggcgc tgagtaaaga tccgaacgaa 900
aaacgcgatc acatggtgct gctggagttt gtcaccgccg ccggtatcac ccacggcatg 960aaacgcgatc acatggtgct gctggagttt gtcaccgccg ccggtatcac ccacggcatg 960
gatgaactgt ataaataatg atttaaagcg gatatcaaat aaaacgaaag gctcagtcga 1020gatgaactgt ataaataatg atttaaagcg gatatcaaat aaaacgaaag gctcagtcga 1020
aagactgggc ctttcgtttt atctgttgtt tgtcggtgaa cgctctcctg agtaggacaa 1080aagactgggc ctttcgtttt atctgttgtt tgtcggtgaa cgctctcctg agtaggacaa 1080
atccgccggg agcggatttg aacgttgcga agcaacggcc cggagggtgg cgggcaggac 1140atccgccggg agcggatttg aacgttgcga agcaacggcc cggagggtgg cgggcaggac 1140
gcccgccata aactgccagg catcaaatta agcagaaggc catcctgacg gatggccttt 1200gcccgccata aactgccagg catcaaatta agcagaaggc catcctgacg gatggccttt 1200
ttgcgtttct acaaactctt tttgtt 1226ttgcgtttct acaaactctt tttgtt 1226
<210> 2<210> 2
<211> 1625<211> 1625
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> CRM197ec<223> CRM197ec
<400> 2<400> 2
gaagacacgg cgctgacgat gttgttgaca gcagcaagag ctttgttatg gagaatttca 60gaagacacgg cgctgacgat gttgttgaca gcagcaagag ctttgttatg gagaatttca 60
gcagctatca cggcaccaaa ccgggctatg ttgacagcat tcagaaaggc atccaaaagc 120gcagctatca cggcaccaaa ccgggctatg ttgacagcat tcagaaaggc atccaaaagc 120
cgaaaagcgg tacccagggc aactacgacg atgactggaa agagttttat agcaccgata 180cgaaaagcgg tacccagggc aactacgacg atgactggaa agagttttat agcaccgata 180
acaagtacga cgcggcgggc tatagcgttg ataacgaaaa cccgctgagc ggtaaagcgg 240acaagtacga cgcggcgggc tatagcgttg ataacgaaaa cccgctgagc ggtaaagcgg 240
gtggcgtggt taaggtgacc tacccgggtc tgaccaaagt gctggcgctg aaggttgaca 300gtggcgtggt taaggtgacc tacccgggtc tgaccaaagt gctggcgctg aaggttgaca 300
acgcggaaac catcaagaaa gagctgggcc tgagcctgac cgaaccgctg atggagcagg 360acgcggaaac catcaagaaa gagctgggcc tgagcctgac cgaaccgctg atggagcagg 360
ttggtaccga ggaattcatt aagcgttttg gtgatggtgc gagccgtgtg gttctgagcc 420ttggtaccga ggaattcatt aagcgttttg gtgatggtgc gagccgtgtg gttctgagcc 420
tgccgttcgc ggaaggtagc agcagcgtgg agtacatcaa caactgggaa caagcgaaag 480tgccgttcgc ggaaggtagc agcagcgtgg agtacatcaa caactgggaa caagcgaaag 480
cgctgagcgt ggagctggaa attaacttcg aaacccgtgg caagcgtggc caggatgcga 540cgctgagcgt ggagctggaa attaacttcg aaacccgtgg caagcgtggc caggatgcga 540
tgtacgaata tatggcgcaa gcgtgcgcgg gtaaccgtgt gcgtcgtagc gttggtagca 600tgtacgaata tatggcgcaa gcgtgcgcgg gtaaccgtgt gcgtcgtagc gttggtagca 600
gcctgagctg cattaacctg gattgggacg ttatccgtga caagaccaaa accaagatcg 660gcctgagctg cattaacctg gattgggacg ttatccgtga caagaccaaa accaagatcg 660
aaagcctgaa agagcacggt ccgattaaaa acaagatgag cgagagcccg aacaagaccg 720aaagcctgaa agagcacggt ccgattaaaa acaagatgag cgagagcccg aacaagaccg 720
tgagcgagga aaaagcgaag cagtacctgg aggaatttca ccaaaccgcg ctggagcacc 780tgagcgagga aaaagcgaag cagtacctgg aggaatttca ccaaaccgcg ctggagcacc 780
cggaactgag cgagctgaaa accgtgaccg gcaccaaccc ggttttcgcg ggtgcgaact 840cggaactgag cgagctgaaa accgtgaccg gcaccaaccc ggttttcgcg ggtgcgaact 840
atgcggcgtg ggcggtgaac gttgcgcagg tgatcgatag cgaaaccgcg gacaacctgg 900atgcggcgtg ggcggtgaac gttgcgcagg tgatcgatag cgaaaccgcg gacaacctgg 900
aaaagaccac cgcggcgctg agcatcctgc cgggtattgg cagcgtgatg ggcatcgcgg 960aaaagaccac cgcggcgctg agcatcctgc cgggtattgg cagcgtgatg ggcatcgcgg 960
atggtgcggt tcaccacaac accgaggaaa tcgtggcgca gagcattgcg ctgagcagcc 1020atggtgcggt tcaccacaac accgaggaaa tcgtggcgca gagcattgcg ctgagcagcc 1020
tgatggttgc gcaagcgatc ccgctggttg gtgagctggt tgacattggt ttcgcggcgt 1080tgatggttgc gcaagcgatc ccgctggttg gtgagctggt tgacattggt ttcgcggcgt 1080
acaactttgt ggaaagcatc attaacctgt tccaggtggt tcacaacagc tacaaccgtc 1140acaactttgt ggaaagcatc attaacctgt tccaggtggt tcacaacagc tacaaccgtc 1140
cggcgtatag cccgggccac aaaacccaac cgtttctgca cgatggttat gcggtgagct 1200cggcgtatag cccggggccac aaaacccaac cgtttctgca cgatggttat gcggtgagct 1200
ggaacaccgt tgaggacagc atcattcgta ccggtttcca gggcgagagc ggtcacgata 1260ggaacaccgt tgaggacagc atcattcgta ccggtttcca gggcgagagc ggtcacgata 1260
tcaagattac cgcggaaaac accccgctgc cgattgcggg cgttctgctg ccgaccattc 1320tcaagattac cgcggaaaac accccgctgc cgattgcggg cgttctgctg ccgaccattc 1320
cgggtaaact ggacgttaac aaaagcaaga cccacattag cgtgaacggc cgtaagatcc 1380cgggtaaact ggacgttaac aaaagcaaga cccacattag cgtgaacggc cgtaagatcc 1380
gtatgcgttg ccgtgcgatt gatggtgacg tgaccttttg ccgtccgaaa agcccggtgt 1440gtatgcgttg ccgtgcgatt gatggtgacg tgaccttttg ccgtccgaaa agcccggtgt 1440
acgttggtaa cggcgtgcac gcgaacctgc acgttgcgtt ccaccgtagc agcagcgaga 1500acgttggtaa cggcgtgcac gcgaacctgc acgttgcgtt ccaccgtagc agcagcgaga 1500
agatccacag caacgaaatt agcagcgaca gcatcggcgt tctgggttat caaaaaaccg 1560agatccacag caacgaaatt agcagcgaca gcatcggcgt tctgggttat caaaaaaccg 1560
tggatcatac caaagtgaat agcaagctga gcctgttctt cgagattaaa agctctgagg 1620tggatcatac caaagtgaat agcaagctga gcctgttctt cgagattaaa agctctgagg 1620
tcttc 1625
<210> 3<210> 3
<211> 535<211> 535
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> CRM197<223> CRM197
<400> 3<400> 3
Gly Ala Asp Asp Val Val Asp Ser Ser Lys Ser Phe Val Met Glu AsnGly Ala Asp Asp Val Val Asp Ser Ser Lys Ser Phe Val Met Glu Asn
1 5 10 15 1 5 10 15
Phe Ser Ser Tyr His Gly Thr Lys Pro Gly Tyr Val Asp Ser Ile GlnPhe Ser Ser Tyr His Gly Thr Lys Pro Gly Tyr Val Asp Ser Ile Gln
20 25 30 20 25 30
Lys Gly Ile Gln Lys Pro Lys Ser Gly Thr Gln Gly Asn Tyr Asp AspLys Gly Ile Gln Lys Pro Lys Ser Gly Thr Gln Gly Asn Tyr Asp Asp
35 40 45 35 40 45
Asp Trp Lys Glu Phe Tyr Ser Thr Asp Asn Lys Tyr Asp Ala Ala GlyAsp Trp Lys Glu Phe Tyr Ser Thr Asp Asn Lys Tyr Asp Ala Ala Gly
50 55 60 50 55 60
Tyr Ser Val Asp Asn Glu Asn Pro Leu Ser Gly Lys Ala Gly Gly ValTyr Ser Val Asp Asn Glu Asn Pro Leu Ser Gly Lys Ala Gly Gly Val
65 70 75 80 65 70 75 80
Val Lys Val Thr Tyr Pro Gly Leu Thr Lys Val Leu Ala Leu Lys ValVal Lys Val Thr Tyr Pro Gly Leu Thr Lys Val Leu Ala Leu Lys Val
85 90 95 85 90 95
Asp Asn Ala Glu Thr Ile Lys Lys Glu Leu Gly Leu Ser Leu Thr GluAsp Asn Ala Glu Thr Ile Lys Lys Glu Leu Gly Leu Ser Leu Thr Glu
100 105 110 100 105 110
Pro Leu Met Glu Gln Val Gly Thr Glu Glu Phe Ile Lys Arg Phe GlyPro Leu Met Glu Gln Val Gly Thr Glu Glu Phe Ile Lys Arg Phe Gly
115 120 125 115 120 125
Asp Gly Ala Ser Arg Val Val Leu Ser Leu Pro Phe Ala Glu Gly SerAsp Gly Ala Ser Arg Val Val Leu Ser Leu Pro Phe Ala Glu Gly Ser
130 135 140 130 135 140
Ser Ser Val Glu Tyr Ile Asn Asn Trp Glu Gln Ala Lys Ala Leu SerSer Ser Val Glu Tyr Ile Asn Asn Trp Glu Gln Ala Lys Ala Leu Ser
145 150 155 160 145 150 155 160
Val Glu Leu Glu Ile Asn Phe Glu Thr Arg Gly Lys Arg Gly Gln AspVal Glu Leu Glu Ile Asn Phe Glu Thr Arg Gly Lys Arg Gly Gln Asp
165 170 175 165 170 175
Ala Met Tyr Glu Tyr Met Ala Gln Ala Cys Ala Gly Asn Arg Val ArgAla Met Tyr Glu Tyr Met Ala Gln Ala Cys Ala Gly Asn Arg Val Arg
180 185 190 180 185 190
Arg Ser Val Gly Ser Ser Leu Ser Cys Ile Asn Leu Asp Trp Asp ValArg Ser Val Gly Ser Ser Leu Ser Cys Ile Asn Leu Asp Trp Asp Val
195 200 205 195 200 205
Ile Arg Asp Lys Thr Lys Thr Lys Ile Glu Ser Leu Lys Glu His GlyIle Arg Asp Lys Thr Lys Thr Lys Ile Glu Ser Leu Lys Glu His Gly
210 215 220 210 215 220
Pro Ile Lys Asn Lys Met Ser Glu Ser Pro Asn Lys Thr Val Ser GluPro Ile Lys Asn Lys Met Ser Glu Ser Pro Asn Lys Thr Val Ser Glu
225 230 235 240 225 230 235 240
Glu Lys Ala Lys Gln Tyr Leu Glu Glu Phe His Gln Thr Ala Leu GluGlu Lys Ala Lys Gln Tyr Leu Glu Glu Phe His Gln Thr Ala Leu Glu
245 250 255 245 250 255
His Pro Glu Leu Ser Glu Leu Lys Thr Val Thr Gly Thr Asn Pro ValHis Pro Glu Leu Ser Glu Leu Lys Thr Val Thr Gly Thr Asn Pro Val
260 265 270 260 265 270
Phe Ala Gly Ala Asn Tyr Ala Ala Trp Ala Val Asn Val Ala Gln ValPhe Ala Gly Ala Asn Tyr Ala Ala Trp Ala Val Asn Val Ala Gln Val
275 280 285 275 280 285
Ile Asp Ser Glu Thr Ala Asp Asn Leu Glu Lys Thr Thr Ala Ala LeuIle Asp Ser Glu Thr Ala Asp Asn Leu Glu Lys Thr Thr Ala Ala Leu
290 295 300 290 295 300
Ser Ile Leu Pro Gly Ile Gly Ser Val Met Gly Ile Ala Asp Gly AlaSer Ile Leu Pro Gly Ile Gly Ser Val Met Gly Ile Ala Asp Gly Ala
305 310 315 320 305 310 315 320
Val His His Asn Thr Glu Glu Ile Val Ala Gln Ser Ile Ala Leu SerVal His His Asn Thr Glu Glu Ile Val Ala Gln Ser Ile Ala Leu Ser
325 330 335 325 330 335
Ser Leu Met Val Ala Gln Ala Ile Pro Leu Val Gly Glu Leu Val AspSer Leu Met Val Ala Gln Ala Ile Pro Leu Val Gly Glu Leu Val Asp
340 345 350 340 345 350
Ile Gly Phe Ala Ala Tyr Asn Phe Val Glu Ser Ile Ile Asn Leu PheIle Gly Phe Ala Ala Tyr Asn Phe Val Glu Ser Ile Ile Asn Leu Phe
355 360 365 355 360 365
Gln Val Val His Asn Ser Tyr Asn Arg Pro Ala Tyr Ser Pro Gly HisGln Val Val His Asn Ser Tyr Asn Arg Pro Ala Tyr Ser Pro Gly His
370 375 380 370 375 380
Lys Thr Gln Pro Phe Leu His Asp Gly Tyr Ala Val Ser Trp Asn ThrLys Thr Gln Pro Phe Leu His Asp Gly Tyr Ala Val Ser Trp Asn Thr
385 390 395 400 385 390 395 400
Val Glu Asp Ser Ile Ile Arg Thr Gly Phe Gln Gly Glu Ser Gly HisVal Glu Asp Ser Ile Ile Arg Thr Gly Phe Gln Gly Glu Ser Gly His
405 410 415 405 410 415
Asp Ile Lys Ile Thr Ala Glu Asn Thr Pro Leu Pro Ile Ala Gly ValAsp Ile Lys Ile Thr Ala Glu Asn Thr Pro Leu Pro Ile Ala Gly Val
420 425 430 420 425 430
Leu Leu Pro Thr Ile Pro Gly Lys Leu Asp Val Asn Lys Ser Lys ThrLeu Leu Pro Thr Ile Pro Gly Lys Leu Asp Val Asn Lys Ser Lys Thr
435 440 445 435 440 445
His Ile Ser Val Asn Gly Arg Lys Ile Arg Met Arg Cys Arg Ala IleHis Ile Ser Val Asn Gly Arg Lys Ile Arg Met Arg Cys Arg Ala Ile
450 455 460 450 455 460
Asp Gly Asp Val Thr Phe Cys Arg Pro Lys Ser Pro Val Tyr Val GlyAsp Gly Asp Val Thr Phe Cys Arg Pro Lys Ser Pro Val Tyr Val Gly
465 470 475 480 465 470 475 480
Asn Gly Val His Ala Asn Leu His Val Ala Phe His Arg Ser Ser SerAsn Gly Val His Ala Asn Leu His Val Ala Phe His Arg Ser Ser Ser
485 490 495 485 490 495
Glu Lys Ile His Ser Asn Glu Ile Ser Ser Asp Ser Ile Gly Val LeuGlu Lys Ile His Ser Asn Glu Ile Ser Ser Asp Ser Ile Gly Val Leu
500 505 510 500 505 510
Gly Tyr Gln Lys Thr Val Asp His Thr Lys Val Asn Ser Lys Leu SerGly Tyr Gln Lys Thr Val Asp His Thr Lys Val Asn Ser Lys Leu Ser
515 520 525 515 520 525
Leu Phe Phe Glu Ile Lys SerLeu Phe Phe Glu Ile Lys Ser
530 535 530 535
<210> 4<210> 4
<211> 85<211> 85
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> PelB (L1)<223>PelB (L1)
<400> 4<400> 4
ggtctcatat gaaatatctg ttaccgaccg ccgctgccgg actgctgtta ctggcggcgc 60ggtctcatat gaaatatctg ttaccgaccg ccgctgccgg actgctgtta ctggcggcgc 60
agccggcgat ggcgggcgag agacc 85agccggcgat ggcgggcgag agacc 85
<210> 5<210> 5
<211> 88<211> 88
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> G8 (L2)<223>G8 (L2)
<400> 5<400> 5
ggtctcatat gaaaaaaagc ctggttctga aagcgtctgt tgcggtggcg acgctggtgc 60ggtctcatat gaaaaaaagc ctggttctga aagcgtctgt tgcggtggcg acgctggtgc 60
cgatgctgtc gtttgccggc gagagacc 88cgatgctgtc gtttgccggc gagagacc 88
<210> 6<210> 6
<211> 73<211> 73
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Wp (L3)<223> Wp (L3)
<400> 6<400> 6
ggtctcatat gcgttctgtg attgttgcct tcctgtttgc ctgtagcttt tgcgtgagcg 60ggtctcatat gcgttctgtg attgttgcct tcctgtttgc ctgtagcttt tgcgtgagcg 60
ccggcgagag acc 73ccggcgagag acc 73
<210> 7<210> 7
<211> 79<211> 79
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> OmpT (L4)<223> OmpT (L4)
<400> 7<400> 7
ggtctcatat gcgtgcgaaa ctgctcggca ttgttctgac caccccgatt gccatttcca 60ggtctcatat gcgtgcgaaa ctgctcggca ttgttctgac caccccgatt gccatttcca 60
gctttgccgg cgagagacc 79gctttgccgg cgagagacc 79
<210> 8<210> 8
<211> 82<211> 82
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> OmpA (L5)<223> OmpA (L5)
<400> 8<400> 8
ggtctcatat gaaaaaaacc gccatcgcca ttgccgttgc cctcgctggc tttgccaccg 60ggtctcatat gaaaaaaacc gccatcgcca ttgccgttgc cctcgctggc tttgccaccg 60
tggcgcaggc gggcgagaga cc 82tggcgcaggc gggcgagaga cc 82
<210> 9<210> 9
<211> 82<211> 82
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> G4 (L6)<223>G4 (L6)
<400> 9<400> 9
ggtctcatat gaaactgctg aacgtgatca actttgtttt cctgatgttt gtcagcagca 60ggtctcatat gaaactgctg aacgtgatca actttgtttt cctgatgttt gtcagcagca 60
gtagttttgc cggcgagaga cc 82gtagttttgc cggcgagaga cc 82
<210> 10<210> 10
<211> 73<211> 73
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> G3 (L7)<223> G3 (L7)
<400> 10<400> 10
ggtctcatat gaaaaaactg ctgtttgcca ttccgctggt tgtaccgttt tacagccaca 60ggtctcatat gaaaaaactg ctgtttgcca ttccgctggt tgtaccgttt tacagccaca 60
gcggcgagag acc 73gcggcgagag acc 73
<210> 11<210> 11
<211> 79<211> 79
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Lpp (L8)<223> Lpp (L8)
<400> 11<400> 11
ggtctcatat gaaagcgacg aaactggtgc tgggtgctgt gattctgggc agcacgctgc 60ggtctcatat gaaagcgacg aaactggtgc tgggtgctgt gattctgggc agcacgctgc 60
tggcgggcgg cgagagacc 79tggcgggcgg cgagagacc 79
<210> 12<210> 12
<211> 88<211> 88
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Gsp (L9)<223> Gsp (L9)
<400> 12<400> 12
ggtctcatat gaaaggtctg aataaaatta cctgctgttt actggcggcg ctgctgatgc 60ggtctcatat gaaaggtctg aataaaatta cctgctgttt actggcggcg ctgctgatgc 60
cgtgcgcggg tcatgcgggc gagagacc 88cgtgcgcggg tcatgcgggc gagagacc 88
<210> 13<210> 13
<211> 22<211> 22
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> PelB (L1)<223>PelB (L1)
<400> 13<400> 13
Met Lys Tyr Leu Leu Pro Thr Ala Ala Ala Gly Leu Leu Leu Leu AlaMet Lys Tyr Leu Leu Pro Thr Ala Ala Ala Gly Leu Leu Leu Leu Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Ala Gln Pro Ala Met AlaAla Gln Pro Ala Met Ala
20 20
<210> 14<210> 14
<211> 23<211> 23
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> G8 (L2)<223>G8 (L2)
<400> 14<400> 14
Met Lys Lys Ser Leu Val Leu Lys Ala Ser Val Ala Val Ala Thr LeuMet Lys Lys Ser Leu Val Leu Lys Ala Ser Val Ala Val Ala Thr Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Val Pro Met Leu Ser Phe AlaVal Pro Met Leu Ser Phe Ala
20 20
<210> 15<210> 15
<211> 18<211> 18
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Wp (L3)<223> Wp (L3)
<400> 15<400> 15
Met Arg Ser Val Ile Val Ala Phe Leu Phe Ala Cys Ser Phe Cys ValMet Arg Ser Val Ile Val Ala Phe Leu Phe Ala Cys Ser Phe Cys Val
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser AlaSer Ala
<210> 16<210> 16
<211> 20<211> 20
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> OmpT (L4)<223> OmpT (L4)
<400> 16<400> 16
Met Arg Ala Lys Leu Leu Gly Ile Val Leu Thr Thr Pro Ile Ala IleMet Arg Ala Lys Leu Leu Gly Ile Val Leu Thr Thr Pro Ile Ala Ile
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ser Phe AlaSer Ser Phe Ala
20 20
<210> 17<210> 17
<211> 21<211> 21
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> OmpA (L5)<223> OmpA (L5)
<400> 17<400> 17
Met Lys Lys Thr Ala Ile Ala Ile Ala Val Ala Leu Ala Gly Phe AlaMet Lys Lys Thr Ala Ile Ala Ile Ala Val Ala Leu Ala Gly Phe Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Thr Val Ala Gln AlaThr Val Ala Gln Ala
20 20
<210> 18<210> 18
<211> 21<211> 21
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> G4 (L6)<223>G4 (L6)
<400> 18<400> 18
Met Lys Leu Leu Asn Val Ile Asn Phe Val Phe Leu Met Phe Val SerMet Lys Leu Leu Asn Val Ile Asn Phe Val Phe Leu Met Phe Val Ser
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Ser Ser Phe AlaSer Ser Ser Phe Ala
20 20
<210> 19<210> 19
<211> 18<211> 18
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> G3 (L7)<223> G3 (L7)
<400> 19<400> 19
Met Lys Lys Leu Leu Phe Ala Ile Pro Leu Val Val Pro Phe Tyr SerMet Lys Lys Leu Leu Phe Ala Ile Pro Leu Val Val Pro Phe Tyr Ser
1 5 10 15 1 5 10 15
His SerHis Ser
<210> 20<210> 20
<211> 20<211> 20
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Lpp (L8)<223> Lpp (L8)
<400> 20<400> 20
Met Lys Ala Thr Lys Leu Val Leu Gly Ala Val Ile Leu Gly Ser ThrMet Lys Ala Thr Lys Leu Val Leu Gly Ala Val Ile Leu Gly Ser Thr
1 5 10 15 1 5 10 15
Leu Leu Ala GlyLeu Leu Ala Gly
20 20
<210> 21<210> 21
<211> 23<211> 23
<212> ПРТ<212> PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Gsp (L9)<223> Gsp (L9)
<400> 21<400> 21
Met Lys Gly Leu Asn Lys Ile Thr Cys Cys Leu Leu Ala Ala Leu LeuMet Lys Gly Leu Asn Lys Ile Thr Cys Cys Leu Leu Ala Ala Leu Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Met Pro Cys Ala Gly His AlaMet Pro Cys Ala Gly His Ala
20 20
<210> 22<210> 22
<211> 34<211> 34
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 22<400> 22
gcggatccaa gagacaggat gaggatcgtt tcgc 34gcggatccaa gagacaggat gaggatcgtt tcgc 34
<210> 23<210> 23
<211> 40<211> 40
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 23<400> 23
cggatatcaa gcttggaaat gttgaatact catactcttc 40cggatatcaa gcttggaaat gttgaatact catactcttc 40
<210> 24<210> 24
<211> 30<211> 30
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 24<400> 24
gagatccgga gcttatactg agctaataac 30gagatccgga gcttatactg agctaataac 30
<210> 25<210> 25
<211> 29<211> 29
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 25<400> 25
gaaaaataaa caaaaacaaa aagagtttg 29gaaaaataaa caaaaacaaa aagagtttg 29
<210> 26<210> 26
<211> 31<211> 31
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 26<400> 26
tacaaactct ttttgttttt gtttattttt c 31tacaaactct ttttgttttt gtttattttt c 31
<210> 27<210> 27
<211> 34<211> 34
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 27<400> 27
cctgttatta gctcagtata agctccggat ctcg 34cctgttatta gctcagtata agctccggat ctcg 34
<210> 28<210> 28
<211> 26<211> 26
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 28<400> 28
aattggagga acaatatgaa atatct 26aattggagga acaatatgaa atatct 26
<210> 29<210> 29
<211> 29<211> 29
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 29<400> 29
aacatcgtca gcgcccgcca tcgccggct 29aacatcgtca gcgcccgcca tcgccggct 29
<210> 30<210> 30
<211> 27<211> 27
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 30<400> 30
ttggaggaac aatatgaaaa aaagcct 27ttggaggaac aatatgaaaa aaagcct 27
<210> 31<210> 31
<211> 30<211> 30
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 31<400> 31
aacatcgtca gcgccggcaa acgacagcat 30aacatcgtca gcgccggcaa acgacagcat 30
<210> 32<210> 32
<211> 26<211> 26
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 32<400> 32
ttggaggaac aatatgcgtt ctgtga 26ttggaggaac aatatgcgtt ctgtga 26
<210> 33<210> 33
<211> 28<211> 28
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 33<400> 33
aacatcgtca gcgccggcgc tcacgcaa 28aacatcgtca gcgccggcgc tcacgcaa 28
<210> 34<210> 34
<211> 27<211> 27
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 34<400> 34
ttggaggaac aatatgcgtg cgaaact 27ttggaggaac aatatgcgtg cgaaact 27
<210> 35<210> 35
<211> 30<211> 30
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 35<400> 35
aacatcgtca gcgccggcaa agctggaaat 30aacatcgtca gcgccggcaa agctggaaat 30
<210> 36<210> 36
<211> 25<211> 25
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 36<400> 36
ttggaggaac aatatgaaaa aaacc 25ttggaggaac aatatgaaaa aaacc 25
<210> 37<210> 37
<211> 30<211> 30
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 37<400> 37
aacatcgtca gcgcccgcct gcgccacggt 30aacatcgtca gcgcccgcct gcgccacggt 30
<210> 38<210> 38
<211> 26<211> 26
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 38<400> 38
ttggaggaac aatatgaaac tgctga 26ttggaggaac aatatgaaac tgctga 26
<210> 39<210> 39
<211> 30<211> 30
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 39<400> 39
aacatcgtca gcgccggcaa aactactgct 30aacatcgtca gcgccggcaa aactactgct 30
<210> 40<210> 40
<211> 25<211> 25
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 40<400> 40
ttggaggaac aatatgaaaa aactg 25ttggaggaac aatatgaaaa aactg 25
<210> 41<210> 41
<211> 29<211> 29
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 41<400> 41
acatcgtcag cgccgctgtg gctgtaaaa 29acatcgtcag cgccgctgtg gctgtaaaa 29
<210> 42<210> 42
<211> 28<211> 28
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 42<400> 42
ttggaggaac aatatgaaag cgacgaaa 28ttggaggaac aatatgaaag cgacgaaa 28
<210> 43<210> 43
<211> 30<211> 30
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 43<400> 43
aacatcgtca gcgccgcccg ccagcagcgt 30aacatcgtca gcgccgcccg ccagcagcgt 30
<210> 44<210> 44
<211> 27<211> 27
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 44<400> 44
ttggaggaac aatatgaaag gtctgaa 27ttggaggaac aatatgaaag gtctgaa 27
<210> 45<210> 45
<211> 30<211> 30
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 45<400> 45
aacatcgtca gcgcccgcat gacccgcgca 30aacatcgtca gcgcccgcat gacccgcgca 30
<210> 46<210> 46
<211> 27<211> 27
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 46<400> 46
agccggcgat ggcgggcgct gacgatg 27agccggcgat ggcgggcgct gacgatg 27
<210> 47<210> 47
<211> 28<211> 28
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 47<400> 47
atgctgtcgt ttgccggcgc tgacgatg 28atgctgtcgt ttgccggcgc tgacgatg 28
<210> 48<210> 48
<211> 26<211> 26
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 48<400> 48
ttgcgtgagc gccggcgctg acgatg 26ttgcgtgagc gccggcgctg acgatg 26
<210> 49<210> 49
<211> 27<211> 27
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 49<400> 49
tttccagctt tgccggcgct gacgatg 27tttccagctt tgccggcgct gacgatg 27
<210> 50<210> 50
<211> 28<211> 28
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 50<400> 50
accgtggcgc aggcgggcgc tgacgatg 28accgtggcgc aggcgggcgc tgacgatg 28
<210> 51<210> 51
<211> 28<211> 28
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 51<400> 51
agcagtagtt ttgccggcgc tgacgatg 28agcagtagtt ttgccggcgc tgacgatg 28
<210> 52<210> 52
<211> 28<211> 28
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 52<400> 52
ttttacagcc acagcggcgc tgacgatg 28ttttacagcc acagcggcgc tgacgatg 28
<210> 53<210> 53
<211> 24<211> 24
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 53<400> 53
tgctggcggg cggcgctgac gatg 24tgctggcggg cggcgctgac gatg 24
<210> 54<210> 54
<211> 26<211> 26
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 54<400> 54
cgcgggtcat gcgggcgctg acgatg 26cgcgggtcat gcgggcgctg acgatg 26
<210> 55<210> 55
<211> 36<211> 36
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 55<400> 55
gatatccgct tttcattagc ttttaatctc gaagaa 36gatatccgct tttcattagc ttttaatctc gaagaa 36
<210> 56<210> 56
<211> 30<211> 30
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> праймер<223> primer
<400> 56<400> 56
ggcgcaagcg tgcgcgggta accgtgtgcg 30ggcgcaagcg tgcgcgggta accgtgtgcg 30
<---<---
Claims (11)
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR10-2019-0108892 | 2019-09-03 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2803949C1 true RU2803949C1 (en) | 2023-09-22 |
Family
ID=
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2011123139A1 (en) * | 2010-03-30 | 2011-10-06 | Pfenex, Inc. | High level expression of recombinant crm197 |
WO2013178974A1 (en) * | 2012-06-01 | 2013-12-05 | Fujifilm Diosynth Biotechnologies Uk Limited | Process for expression of crm197 |
WO2015134402A1 (en) * | 2014-03-03 | 2015-09-11 | Scarab Genomics, Llc | Enhanced production of recombinant crm197 in e. coli |
RU2575621C1 (en) * | 2015-01-13 | 2016-02-20 | Общество С Ограниченной Ответственностью "Рд-Биотех" (Ооо "Рд-Биотех") | STRAIN-PRODUCER OF METHIONINE-FREE CRM197 BASED ON CELLS E. coli BL21 (DE3) |
EP3087088A2 (en) * | 2013-12-23 | 2016-11-02 | University Of Rochester | Methods and compositions for ribosomal synthesis of macrocyclic peptides |
Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2011123139A1 (en) * | 2010-03-30 | 2011-10-06 | Pfenex, Inc. | High level expression of recombinant crm197 |
WO2013178974A1 (en) * | 2012-06-01 | 2013-12-05 | Fujifilm Diosynth Biotechnologies Uk Limited | Process for expression of crm197 |
EP3087088A2 (en) * | 2013-12-23 | 2016-11-02 | University Of Rochester | Methods and compositions for ribosomal synthesis of macrocyclic peptides |
WO2015134402A1 (en) * | 2014-03-03 | 2015-09-11 | Scarab Genomics, Llc | Enhanced production of recombinant crm197 in e. coli |
RU2575621C1 (en) * | 2015-01-13 | 2016-02-20 | Общество С Ограниченной Ответственностью "Рд-Биотех" (Ооо "Рд-Биотех") | STRAIN-PRODUCER OF METHIONINE-FREE CRM197 BASED ON CELLS E. coli BL21 (DE3) |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
База данных UniProt P45758 GSPD_ECOLI, 11.07.2001. Putative secretin GspD. Найдено онлайн: https://www.uniprot.org/uniprotkb/P45758/entry Дата обращения 28.02.2023. База данных UniProt P03664 G4P_BPFD, 21.07.1986. Virion export protein. Найдено онлайн: https://www.uniprot.org/uniprotkb/P03664/entry Дата обращения 28.02.2023. * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN113528575B (en) | Signal peptide related sequence and application thereof in protein synthesis | |
JP5794985B2 (en) | Vector containing mannose promoter and mannose promoter | |
JP2016512266A (en) | A new method for protein purification. | |
EP2189531B1 (en) | Novel dna fragment, recombinant vector containing the same, transformant transformed therewith and utilization of the same | |
CN114107353A (en) | Plasmid for efficiently expressing polypeptide toxin and preparation method and application thereof | |
KR101841264B1 (en) | Recombinant Vector Including Gene of Autopahgy Activation Protein and Crystallizing Method for Recombinant Protein Using Thereof | |
US11060123B2 (en) | Production of soluble recombinant protein without n-terminal methionine | |
US5459051A (en) | Methods and vectors for over-expression of ubiquitin fusion proteins in host cells | |
KR102142255B1 (en) | Expression Method of CRM197 Protein | |
KR101373297B1 (en) | Expression Vector Comprising Gene coding for E. coli Phosphoglycerate kinase As a Novel Fusion Partner | |
RU2803949C1 (en) | Method for crm197 protein expression | |
TW201111505A (en) | Fermentation process | |
JP7507292B2 (en) | CRM197 Protein Expression Method | |
RU2502803C2 (en) | PLASMID FOR EXPRESSION IN CELLS OF BACTERIUM BELONGING TO Escherichia CLASS, NON-ACTIVE PREDECESSOR OF DNase I OF HUMAN OR ITS MUTEINS; BACTERIUM BELONGING TO Escherichia CLASS, - PRODUCER OF NON-ACTIVE PREDECESSOR OF RECOMBINANT DNase I OF HUMAN OR ITS MUTEIN; PREDECESSOR OF RECOMBINANT DNase I OF HUMAN OR ITS MUTEIN; METHOD FOR OBTAINING RECOMBINANT DNase I OF HUMAN OR ITS MUTEIN; METHOD FOR OBTAINING CONJUGATES OF POLYETHYLENE GLYCOL AND RECOMBINANT MUTEIN OF HUMAN DNase I, FERMENTATIVE ACTIVE CONJUGATE OF MUTEIN OF RECOMBINANT DNase I OF HUMAN | |
RU2435863C2 (en) | Method for producing protein | |
KR101658081B1 (en) | Method for Preparing Recombinant Protein Using CysQ as a Fusion Expression Partner | |
US12104161B2 (en) | Production of soluble recombinant proteins without N-terminal methionine in E-coli | |
KR20230102682A (en) | Method for Expressing Target Protein | |
JP3060019B2 (en) | Plasmid containing maltotetraose synthase gene, microorganism having the plasmid, and method for producing maltotetraose synthase using the microorganism | |
CN117587041A (en) | Recombinant uricase, and preparation method and application thereof | |
JPH0779781A (en) | Protein-exhaustion gene |