RU2781446C1 - Chimeric porcine reproductive and respiratory syndrome virus and vaccine using said virus - Google Patents
Chimeric porcine reproductive and respiratory syndrome virus and vaccine using said virus Download PDFInfo
- Publication number
- RU2781446C1 RU2781446C1 RU2021120433A RU2021120433A RU2781446C1 RU 2781446 C1 RU2781446 C1 RU 2781446C1 RU 2021120433 A RU2021120433 A RU 2021120433A RU 2021120433 A RU2021120433 A RU 2021120433A RU 2781446 C1 RU2781446 C1 RU 2781446C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- regulations
- virus
- replaced
- chimeric
- mutations
- Prior art date
Links
- 241000700605 Viruses Species 0.000 title claims abstract description 140
- 108091006028 chimera Proteins 0.000 title claims abstract description 112
- 241001135989 Porcine reproductive and respiratory syndrome virus Species 0.000 title claims abstract description 66
- 229960005486 vaccines Drugs 0.000 title claims abstract description 63
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims abstract description 48
- 229920000023 polynucleotide Polymers 0.000 claims abstract description 23
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims abstract description 23
- 108091007521 restriction endonucleases Proteins 0.000 claims abstract description 18
- 201000009910 diseases by infectious agent Diseases 0.000 claims abstract description 11
- 230000036039 immunity Effects 0.000 claims abstract description 4
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 claims description 167
- 229920001850 Nucleic acid sequence Polymers 0.000 claims description 88
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 claims description 63
- 229920003013 deoxyribonucleic acid Polymers 0.000 claims description 25
- 229920000160 (ribonucleotides)n+m Polymers 0.000 claims description 18
- 108010061543 Neutralizing Antibodies Proteins 0.000 claims description 15
- 230000000120 cytopathologic Effects 0.000 claims description 10
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 claims description 8
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 7
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 7
- 239000000969 carrier Substances 0.000 claims description 4
- 210000002540 Macrophages Anatomy 0.000 claims description 3
- 230000000240 adjuvant Effects 0.000 claims description 3
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 claims description 3
- 101700055840 NSP1N Proteins 0.000 claims 3
- 102100000625 SH2D3A Human genes 0.000 claims 3
- 101710013590 SH2D3A Proteins 0.000 claims 3
- 101710035770 TFS1 Proteins 0.000 claims 3
- 210000004072 Lung Anatomy 0.000 claims 2
- 229960000643 Adenine Drugs 0.000 claims 1
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Natural products NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N adenosine Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 claims 1
- 208000005342 Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Diseases 0.000 abstract description 56
- 230000028327 secretion Effects 0.000 abstract description 9
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 8
- 230000002265 prevention Effects 0.000 abstract description 6
- 201000010099 disease Diseases 0.000 abstract description 5
- 108090001123 antibodies Proteins 0.000 abstract description 4
- 102000004965 antibodies Human genes 0.000 abstract description 4
- 230000001264 neutralization Effects 0.000 abstract 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 195
- 230000002238 attenuated Effects 0.000 description 31
- 210000004027 cells Anatomy 0.000 description 28
- 241000282898 Sus scrofa Species 0.000 description 15
- 230000002062 proliferating Effects 0.000 description 15
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 14
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 12
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 12
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 11
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 11
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 11
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 1-[(1S,2R,3R,4S,5R,6R)-3-carbamimidamido-6-{[(2R,3R,4R,5S)-3-{[(2S,3S,4S,5R,6S)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-(methylamino)oxan-2-yl]oxy}-4-formyl-4-hydroxy-5-methyloxolan-2-yl]oxy}-2,4,5-trihydroxycyclohexyl]guanidine Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 10
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 9
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 8
- 230000002708 enhancing Effects 0.000 description 7
- 230000002458 infectious Effects 0.000 description 7
- 230000003612 virological Effects 0.000 description 7
- 241000347972 Caucasus prunus virus Species 0.000 description 6
- 210000001132 Macrophages, Alveolar Anatomy 0.000 description 6
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 6
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 6
- 239000012091 fetal bovine serum Substances 0.000 description 6
- 229940049954 Penicillin Drugs 0.000 description 5
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 5
- 210000002966 Serum Anatomy 0.000 description 5
- 229960005322 Streptomycin Drugs 0.000 description 5
- 238000011166 aliquoting Methods 0.000 description 5
- 229960000626 benzylpenicillin Drugs 0.000 description 5
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 5
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 5
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 5
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 4
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 4
- 102000038129 antigens Human genes 0.000 description 4
- 108091007172 antigens Proteins 0.000 description 4
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 4
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 4
- HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L magnesium stearate Chemical compound [Mg+2].CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O.CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 4
- 239000002609 media Substances 0.000 description 4
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 4
- 229940064005 Antibiotic throat preparations Drugs 0.000 description 3
- 229940083879 Antibiotics FOR TREATMENT OF HEMORRHOIDS AND ANAL FISSURES FOR TOPICAL USE Drugs 0.000 description 3
- 229940042052 Antibiotics for systemic use Drugs 0.000 description 3
- 229940042786 Antitubercular Antibiotics Drugs 0.000 description 3
- 229940093922 Gynecological Antibiotics Drugs 0.000 description 3
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 3
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 3
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 3
- 101710043203 P23p89 Proteins 0.000 description 3
- 239000006146 Roswell Park Memorial Institute medium Substances 0.000 description 3
- 229940024982 Topical Antifungal Antibiotics Drugs 0.000 description 3
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 3
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 3
- 230000003115 biocidal Effects 0.000 description 3
- 230000000875 corresponding Effects 0.000 description 3
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 3
- 229940079866 intestinal antibiotics Drugs 0.000 description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 3
- 229940005935 ophthalmologic Antibiotics Drugs 0.000 description 3
- 230000002829 reduced Effects 0.000 description 3
- 230000000241 respiratory Effects 0.000 description 3
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 3
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 3
- 239000000829 suppository Substances 0.000 description 3
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N D-sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 2
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 2
- 101700013246 GK Proteins 0.000 description 2
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 2
- 206010064571 Gene mutation Diseases 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-UUNJERMWSA-N Lactose Natural products O([C@@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)O[C@@H]1CO)[C@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O1 GUBGYTABKSRVRQ-UUNJERMWSA-N 0.000 description 2
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 2
- CZMRCDWAGMRECN-GDQSFJPYSA-N Sucrose Natural products O([C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O1)[C@@]1(CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-GDQSFJPYSA-N 0.000 description 2
- 210000001744 T-Lymphocytes Anatomy 0.000 description 2
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N Thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000001756 Virus Disease Diseases 0.000 description 2
- 239000003429 antifungal agent Substances 0.000 description 2
- 239000003125 aqueous solvent Substances 0.000 description 2
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 2
- VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L calcium carbonate Chemical compound [Ca+2].[O-]C([O-])=O VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 2
- 230000004637 cellular stress Effects 0.000 description 2
- -1 coatings Substances 0.000 description 2
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 2
- 231100000676 disease causative agent Toxicity 0.000 description 2
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 2
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 2
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 2
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 2
- 230000002068 genetic Effects 0.000 description 2
- 239000008187 granular material Substances 0.000 description 2
- 230000017555 immunoglobulin mediated immune response Effects 0.000 description 2
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 2
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 235000019359 magnesium stearate Nutrition 0.000 description 2
- 230000002688 persistence Effects 0.000 description 2
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 2
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 2
- 230000002335 preservative Effects 0.000 description 2
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 2
- DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N propylene glycol Chemical compound CC(O)CO DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101700030147 rep Proteins 0.000 description 2
- 230000001850 reproductive Effects 0.000 description 2
- 239000008247 solid mixture Substances 0.000 description 2
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 2
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 2
- 238000010254 subcutaneous injection Methods 0.000 description 2
- 239000007929 subcutaneous injection Substances 0.000 description 2
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 2
- 239000006188 syrup Substances 0.000 description 2
- 235000020357 syrup Nutrition 0.000 description 2
- 239000003826 tablet Substances 0.000 description 2
- 239000000454 talc Substances 0.000 description 2
- 229910052623 talc Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000012222 talc Nutrition 0.000 description 2
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 2
- 230000003313 weakening Effects 0.000 description 2
- 239000000080 wetting agent Substances 0.000 description 2
- LNAZSHAWQACDHT-XIYTZBAFSA-N (2R,3R,4S,5R,6S)-4,5-dimethoxy-2-(methoxymethyl)-3-[(2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trimethoxy-6-(methoxymethyl)oxan-2-yl]oxy-6-[(2R,3R,4S,5R,6R)-4,5,6-trimethoxy-2-(methoxymethyl)oxan-3-yl]oxyoxane Chemical compound CO[C@@H]1[C@@H](OC)[C@H](OC)[C@@H](COC)O[C@H]1O[C@H]1[C@H](OC)[C@@H](OC)[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](OC)[C@H](OC)O[C@@H]2COC)OC)O[C@@H]1COC LNAZSHAWQACDHT-XIYTZBAFSA-N 0.000 description 1
- 101710030546 2.5 Proteins 0.000 description 1
- 101710024197 24 Proteins 0.000 description 1
- 206010000234 Abortion spontaneous Diseases 0.000 description 1
- 244000215068 Acacia senegal Species 0.000 description 1
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N Ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 1
- 206010059512 Apoptosis Diseases 0.000 description 1
- 241001292006 Arteriviridae Species 0.000 description 1
- 101710028599 At3g57050 Proteins 0.000 description 1
- 210000003719 B-Lymphocytes Anatomy 0.000 description 1
- 101710033070 B0361.4 Proteins 0.000 description 1
- 101700055598 BCAR3 Proteins 0.000 description 1
- 101710037611 BMLF1 Proteins 0.000 description 1
- APKFDSVGJQXUKY-INPOYWNPSA-N BRL-49594 Chemical compound O[C@H]1[C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](C)O[C@H]1O[C@H]1/C=C/C=C/C=C/C=C/C=C/C=C/C=C/[C@H](C)[C@@H](O)[C@@H](C)[C@H](C)OC(=O)C[C@H](O)C[C@H](O)CC[C@@H](O)[C@H](O)C[C@H](O)C[C@](O)(C[C@H](O)[C@H]2C(O)=O)O[C@H]2C1 APKFDSVGJQXUKY-INPOYWNPSA-N 0.000 description 1
- 101710026304 Ba71V-133 Proteins 0.000 description 1
- 206010060945 Bacterial infection Diseases 0.000 description 1
- 101710028923 Bcer98_0019 Proteins 0.000 description 1
- 210000004369 Blood Anatomy 0.000 description 1
- 101710034418 C05D10.4 Proteins 0.000 description 1
- 101700068305 COP1 Proteins 0.000 description 1
- 229960003563 Calcium Carbonate Drugs 0.000 description 1
- JHLNERQLKQQLRZ-UHFFFAOYSA-N Calcium silicate Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[O-][Si]([O-])([O-])[O-] JHLNERQLKQQLRZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000907509 Cowbone Ridge virus Species 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KAZBKCHUSA-N D-Mannitol Natural products OC[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KAZBKCHUSA-N 0.000 description 1
- UNXHWFMMPAWVPI-QWWZWVQMSA-N D-Threitol Natural products OC[C@@H](O)[C@H](O)CO UNXHWFMMPAWVPI-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 1
- 101700070522 DHKR Proteins 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 239000004386 Erythritol Substances 0.000 description 1
- 229940009714 Erythritol Drugs 0.000 description 1
- UNXHWFMMPAWVPI-ZXZARUISSA-N Erythritol Chemical compound OC[C@H](O)[C@H](O)CO UNXHWFMMPAWVPI-ZXZARUISSA-N 0.000 description 1
- LVGKNOAMLMIIKO-QXMHVHEDSA-N Ethyl oleate Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCC(=O)OCC LVGKNOAMLMIIKO-QXMHVHEDSA-N 0.000 description 1
- 101710034370 F31E3.4 Proteins 0.000 description 1
- 101700011083 FLNB Proteins 0.000 description 1
- 208000007212 Foot-and-Mouth Disease Diseases 0.000 description 1
- CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N Gentamicin Chemical compound O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N 0.000 description 1
- 229960002743 Glutamine Drugs 0.000 description 1
- 229920000084 Gum arabic Polymers 0.000 description 1
- 229920002459 Intron Polymers 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 101710028877 LBL_0065 Proteins 0.000 description 1
- 101700072470 LEF-2 Proteins 0.000 description 1
- 101710025348 LLNZ_01795 Proteins 0.000 description 1
- 241000710788 Lelystad virus Species 0.000 description 1
- 101710031330 MDV004 Proteins 0.000 description 1
- 101710018099 MDV066 Proteins 0.000 description 1
- 101710027015 MIMI_R382 Proteins 0.000 description 1
- 101710008521 MIMI_R441 Proteins 0.000 description 1
- 101710028809 MPN_048 Proteins 0.000 description 1
- 101710028221 MPN_148 Proteins 0.000 description 1
- 101710039901 MPN_205 Proteins 0.000 description 1
- 101700038420 MVP Proteins 0.000 description 1
- VQHSOMBJVWLPSR-WUJBLJFYSA-N Maltitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]([C@H](O)CO)O[C@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O VQHSOMBJVWLPSR-WUJBLJFYSA-N 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 1
- OSWPMRLSEDHDFF-UHFFFAOYSA-N Methyl salicylate Chemical compound COC(=O)C1=CC=CC=C1O OSWPMRLSEDHDFF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920000168 Microcrystalline cellulose Polymers 0.000 description 1
- 101700000852 NSP2 Proteins 0.000 description 1
- 210000003928 Nasal Cavity Anatomy 0.000 description 1
- 241001292005 Nidovirales Species 0.000 description 1
- 102000004873 Nucleocapsid Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108090001074 Nucleocapsid Proteins Proteins 0.000 description 1
- 101710003000 ORF1/ORF2 Proteins 0.000 description 1
- 101700045069 ORF4 Proteins 0.000 description 1
- 101710032992 ORF83 Proteins 0.000 description 1
- 101710032900 ORF91 Proteins 0.000 description 1
- 101710008446 PHG004 Proteins 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- 241000202347 Porcine circovirus Species 0.000 description 1
- 208000005107 Premature Birth Diseases 0.000 description 1
- 206010036590 Premature baby Diseases 0.000 description 1
- QELSKZZBTMNZEB-UHFFFAOYSA-N Propylparaben Chemical compound CCCOC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 QELSKZZBTMNZEB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010037660 Pyrexia Diseases 0.000 description 1
- 101700051775 Q0010 Proteins 0.000 description 1
- 101700071923 Q0092 Proteins 0.000 description 1
- 101710008993 R02471 Proteins 0.000 description 1
- 101700080017 REV Proteins 0.000 description 1
- 239000007759 RPMI Media 1640 Substances 0.000 description 1
- 102100003552 RTN2 Human genes 0.000 description 1
- 101700054825 RTN2 Proteins 0.000 description 1
- 101710017579 RWDD2B Proteins 0.000 description 1
- 108060006943 RdRp Proteins 0.000 description 1
- 101710044383 SIFV0006 Proteins 0.000 description 1
- 101710012468 SPAC17C9.14 Proteins 0.000 description 1
- 101710015361 SPAC977.04 Proteins 0.000 description 1
- 101710013701 SPBC216.04c Proteins 0.000 description 1
- 101710023234 Segment 5 Proteins 0.000 description 1
- 101710033766 Segment-10 Proteins 0.000 description 1
- 101710040639 Smp_194770 Proteins 0.000 description 1
- 206010041232 Sneezing Diseases 0.000 description 1
- 208000002254 Stillbirth Diseases 0.000 description 1
- 230000024932 T cell mediated immunity Effects 0.000 description 1
- 210000003283 T-Lymphocytes, Helper-Inducer Anatomy 0.000 description 1
- 101710028880 TC_0064 Proteins 0.000 description 1
- 229940113082 Thymine Drugs 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H Tricalcium phosphate Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 229940035893 Uracil Drugs 0.000 description 1
- 101710015310 VI Proteins 0.000 description 1
- 101700065756 XYN4 Proteins 0.000 description 1
- HEBKCHPVOIAQTA-SCDXWVJYSA-N Xylitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO HEBKCHPVOIAQTA-SCDXWVJYSA-N 0.000 description 1
- 229960002675 Xylitol Drugs 0.000 description 1
- 101700023741 YC04 Proteins 0.000 description 1
- 101700023711 YC06 Proteins 0.000 description 1
- 101700043615 YCB6 Proteins 0.000 description 1
- 101700055561 YCR4 Proteins 0.000 description 1
- 101700019878 YDH4 Proteins 0.000 description 1
- 101710031342 YE0063 Proteins 0.000 description 1
- 101700009367 YGL5 Proteins 0.000 description 1
- 101700028292 YHV4 Proteins 0.000 description 1
- 101700049857 YI24 Proteins 0.000 description 1
- 101700023747 YLC6 Proteins 0.000 description 1
- 101700057052 YMP5 Proteins 0.000 description 1
- 101700072611 YNIU Proteins 0.000 description 1
- 101700061814 YNIW Proteins 0.000 description 1
- 101700085496 YNIX Proteins 0.000 description 1
- 101700076901 YNOL Proteins 0.000 description 1
- 101700039083 YNR3 Proteins 0.000 description 1
- 101700078359 YO04 Proteins 0.000 description 1
- 101700055209 YO05 Proteins 0.000 description 1
- 101700077907 YO06 Proteins 0.000 description 1
- 101700070546 YOR5 Proteins 0.000 description 1
- 101700074007 YOR6 Proteins 0.000 description 1
- 101700006512 YPC5 Proteins 0.000 description 1
- 101700016729 YPC6 Proteins 0.000 description 1
- 101700038611 YPE4 Proteins 0.000 description 1
- 101700059617 YPH4 Proteins 0.000 description 1
- 101700078751 YPH5 Proteins 0.000 description 1
- 101700052173 YPS1 Proteins 0.000 description 1
- 101700068842 YSC6 Proteins 0.000 description 1
- 101700070922 YSO4 Proteins 0.000 description 1
- 101700050619 YTH4 Proteins 0.000 description 1
- 101700048983 YTH5 Proteins 0.000 description 1
- 101710036780 ZNHIT2 Proteins 0.000 description 1
- 239000003070 absorption delaying agent Substances 0.000 description 1
- 239000000205 acacia gum Substances 0.000 description 1
- 235000010489 acacia gum Nutrition 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 239000000443 aerosol Substances 0.000 description 1
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 1
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 1
- 229940072056 alginate Drugs 0.000 description 1
- 235000010443 alginic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229920000615 alginic acid Polymers 0.000 description 1
- 229960003942 amphotericin B Drugs 0.000 description 1
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 1
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 1
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 1
- 239000007900 aqueous suspension Substances 0.000 description 1
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M buffer Substances [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229910000019 calcium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 239000000378 calcium silicate Substances 0.000 description 1
- 229910052918 calcium silicate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000012241 calcium silicate Nutrition 0.000 description 1
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 1
- 235000010980 cellulose Nutrition 0.000 description 1
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001684 chronic Effects 0.000 description 1
- 229940110456 cocoa butter Drugs 0.000 description 1
- 235000019868 cocoa butter Nutrition 0.000 description 1
- 108060001877 cpoB Proteins 0.000 description 1
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 101710032222 d335 Proteins 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing Effects 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 239000007884 disintegrant Substances 0.000 description 1
- 239000002612 dispersion media Substances 0.000 description 1
- UWLPCYBIJSLGQO-UHFFFAOYSA-N dodecanoic acid;propane-1,2,3-triol Chemical compound OCC(O)CO.CCCCCCCCCCCC(O)=O UWLPCYBIJSLGQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002552 dosage form Substances 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 235000019414 erythritol Nutrition 0.000 description 1
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 1
- 229940093471 ethyl oleate Drugs 0.000 description 1
- 230000003203 everyday Effects 0.000 description 1
- 230000002349 favourable Effects 0.000 description 1
- 108060002873 feoA Proteins 0.000 description 1
- 108060002874 feoC Proteins 0.000 description 1
- 239000000945 filler Substances 0.000 description 1
- 239000000796 flavoring agent Substances 0.000 description 1
- 235000013355 food flavoring agent Nutrition 0.000 description 1
- 235000003599 food sweetener Nutrition 0.000 description 1
- 238000005755 formation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 1
- 229960002518 gentamicin Drugs 0.000 description 1
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N glycol Chemical compound OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710006842 gra-orf4 Proteins 0.000 description 1
- 101710013352 gra-orf5 Proteins 0.000 description 1
- 101710013350 gra-orf6 Proteins 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 1
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 1
- 239000000367 immunologic factor Substances 0.000 description 1
- 239000007943 implant Substances 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000036512 infertility Effects 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000010255 intramuscular injection Methods 0.000 description 1
- 239000007927 intramuscular injection Substances 0.000 description 1
- 238000010253 intravenous injection Methods 0.000 description 1
- 239000007951 isotonicity adjuster Substances 0.000 description 1
- 230000021633 leukocyte mediated immunity Effects 0.000 description 1
- 229940057995 liquid paraffin Drugs 0.000 description 1
- 101710022417 llmg_1573 Proteins 0.000 description 1
- 239000000314 lubricant Substances 0.000 description 1
- 229960003511 macrogol Drugs 0.000 description 1
- 239000000845 maltitol Substances 0.000 description 1
- 235000010449 maltitol Nutrition 0.000 description 1
- 229940035436 maltitol Drugs 0.000 description 1
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 1
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 1
- 229920000609 methyl cellulose Polymers 0.000 description 1
- 239000001923 methylcellulose Substances 0.000 description 1
- 235000010981 methylcellulose Nutrition 0.000 description 1
- 230000000813 microbial Effects 0.000 description 1
- 235000019813 microcrystalline cellulose Nutrition 0.000 description 1
- 239000008108 microcrystalline cellulose Substances 0.000 description 1
- 229940016286 microcrystalline cellulose Drugs 0.000 description 1
- 239000002480 mineral oil Substances 0.000 description 1
- 235000010446 mineral oil Nutrition 0.000 description 1
- 101710030661 mms6 Proteins 0.000 description 1
- 101700016844 modF Proteins 0.000 description 1
- 101700045377 mvp1 Proteins 0.000 description 1
- 230000003472 neutralizing Effects 0.000 description 1
- 230000003000 nontoxic Effects 0.000 description 1
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 1
- 108060005621 nudF Proteins 0.000 description 1
- 235000008390 olive oil Nutrition 0.000 description 1
- 239000004006 olive oil Substances 0.000 description 1
- 101700049633 p24 Proteins 0.000 description 1
- 238000007911 parenteral administration Methods 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic Effects 0.000 description 1
- 239000006187 pill Substances 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 1
- 239000001267 polyvinylpyrrolidone Substances 0.000 description 1
- 229920000036 polyvinylpyrrolidone Polymers 0.000 description 1
- 235000013855 polyvinylpyrrolidone Nutrition 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 239000000047 product Substances 0.000 description 1
- 229960003415 propylparaben Drugs 0.000 description 1
- 230000001681 protective Effects 0.000 description 1
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 1
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 1
- 101710028969 sll0005 Proteins 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- 235000010356 sorbitol Nutrition 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 238000005507 spraying Methods 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 231100000803 sterility Toxicity 0.000 description 1
- 231100000537 stillbirth Toxicity 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 1
- 230000002459 sustained Effects 0.000 description 1
- 239000003765 sweetening agent Substances 0.000 description 1
- 201000010874 syndrome Diseases 0.000 description 1
- 230000002194 synthesizing Effects 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic Effects 0.000 description 1
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 1
- 235000015112 vegetable and seed oil Nutrition 0.000 description 1
- 239000008158 vegetable oil Substances 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- 230000004584 weight gain Effects 0.000 description 1
- 235000019786 weight gain Nutrition 0.000 description 1
- 239000000811 xylitol Substances 0.000 description 1
- 235000010447 xylitol Nutrition 0.000 description 1
- 101700016484 y07B Proteins 0.000 description 1
- 108060009570 ycf70 Proteins 0.000 description 1
- 101700008689 yckD Proteins 0.000 description 1
- 101700043807 ycxA Proteins 0.000 description 1
- 101700044617 ycxB Proteins 0.000 description 1
- 101700002983 ylxP Proteins 0.000 description 1
- 101700050631 yqxI Proteins 0.000 description 1
- 101700058496 yqxJ Proteins 0.000 description 1
- 101700046773 yscR Proteins 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N β-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
Images
Abstract
Description
ОБЛАСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯFIELD OF THE INVENTION
Настоящее изобретение относится к химерному вирусу репродуктивно-респираторного синдрома свиней (PRRSV), который может быть использован в качестве вакцины, и химерный вирус по настоящему изобретению имеет низкую патогенность и высокую безопасность по сравнению с его исходным штаммом. Химерный PRRSV-вирус по настоящему изобретению может усиливать секрецию нейтрализующих антител, связанных с перекрестным иммунитетом, и обеспечить вакцину, которая сможет обеспечить эффективную защиту от репродуктивно-респираторного синдрома свиней.The present invention relates to a chimeric porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) that can be used as a vaccine, and the chimeric virus of the present invention has low pathogenicity and high safety compared to its parent strain. The chimeric PRRSV virus of the present invention can enhance the secretion of neutralizing antibodies associated with cross-immunity and provide a vaccine that can provide effective protection against porcine reproductive and respiratory syndrome.
ПРЕДШЕСТВУЮЩИЙ УРОВЕНЬ ТЕХНИКИPRIOR ART
Репродуктивно-респираторный синдром свиней (называемый далее PRRS) представляет собой инфекционное заболевание, наносящее наибольший ущерб свиноводству, наряду с цирковирусной инфекцией свиней и ящуром. PRRS приводит к стерильности у беременных свиней, репродуктивным расстройствам, таким как невынашивание, преждевременные роды или мертворождение, и к респираторным симптомам, таким как чихание, лихорадка и тому подобное, у молочных поросят и свиней в завершающей стадии откорма. Обычно тяжелые респираторные симптомы вызваны вторичными бактериальными или тому подобными инфекциями, развивающимися после инфицирования вирусом, но в случае хронической инфекции происходят уменьшение прибавки веса и повышение смертности без характерных клинических симптомов.Porcine Reproductive Respiratory Syndrome (hereinafter referred to as PRRS) is an infectious disease that causes the greatest damage to pig production, along with porcine circovirus infection and foot-and-mouth disease. PRRS results in sterility in pregnant pigs, reproductive disorders such as miscarriage, premature birth or stillbirth, and respiratory symptoms such as sneezing, fever and the like in suckling pigs and finishing pigs. Generally, severe respiratory symptoms are caused by secondary bacterial infections or the like following infection with the virus, but in the case of chronic infection, there is a decrease in weight gain and an increase in mortality without characteristic clinical symptoms.
Это вирусное заболевание было впервые обнаружено в 1987 г. в Соединенных Штатах Америки, затем в Европе и в начале 90-х годов XX века было выявлено в Азии. До настоящего времени PRRS был эндемичен для стран с развитым свиноводством и распространился по всему миру, приводя к колоссальным экономическим потерям каждый год.This viral disease was first discovered in 1987 in the United States of America, then in Europe and in the early 1990s in Asia. Until now, PRRS has been endemic in developed swine countries and has spread throughout the world, causing huge economic losses every year.
Возбудителем PRRS является вирус PRRS, принадлежащий к роду Arterivirus, семейству Arteriviridae и порядку Nidovirales. Вирус PRRS имеет геном из положительной смысловой одноцепочечной РНК и размер приблизительно 15,4 тысяч пар оснований (т.п.о.). В геноме вируса PRRS есть девять открытых рамок считывания (ORF) (Conzelmann et al., 1993; Meulenberg et al, 1993). Из них ORF1a и ORF1b, кодирующие неструктурные белки (NSP), составляют приблизительно 80% генома вируса (Bautista et al, 2002; Meulenberg et al., 1993; Snijder and Meulenberg, 1998, 2001). Известно, что из этих неструктурных белков NSP1-альфа, NSP1-бета и NSP2-NSP8 расположены в ORF1a, a NSP9-NSP12 - в ORF1b. ORF2-7, составляющие оставшиеся 20%, кодируют гликозилированные структурные белки GP2, GP3, GP4 и GP5, негликозилированный мембранный белок (М) и белок нуклеокапсида (N). Малые структурные белки GP2, GP3 и GP4 образуют гетеротримеры и действуют при проникновении вируса в клетку-хозяина, а большие структурные белки GP5 и М образуют гетеродимеры и действуют, повышая инфекционность вируса.The causative agent of PRRS is the PRRS virus belonging to the genus Arterivirus, family Arteriviridae and order Nidovirales. The PRRS virus has a positive-sense single-stranded RNA genome and is approximately 15.4 kb in size. There are nine open reading frames (ORFs) in the PRRS virus genome (Conzelmann et al., 1993; Meulenberg et al, 1993). Of these, ORF1a and ORF1b encoding non-structural proteins (NSPs) comprise approximately 80% of the virus genome (Bautista et al, 2002; Meulenberg et al., 1993; Snijder and Meulenberg, 1998, 2001). Of these non-structural proteins, NSP1-alpha, NSP1-beta and NSP2-NSP8 are known to be located in ORF1a and NSP9-NSP12 in ORF1b. ORF2-7, making up the remaining 20%, encode the glycosylated structural proteins GP2, GP3, GP4, and GP5, the non-glycosylated membrane protein (M), and the nucleocapsid protein (N). The small structural proteins GP2, GP3, and GP4 form heterotrimers and act when the virus enters the host cell, while the large structural proteins GP5 and M form heterodimers and act to increase the infectivity of the virus.
PRRS-вирус сильно мутирует ввиду его РНК-вирусной природы, поэтому между вирусами есть множество различий. PRRS-вирус разделяют главным образом на североамериканский тип и европейский тип. Существует тип I (Лелистадский вирус, LV), являющийся представителем европейского типа, и тип II, являющийся представителем североамериканского типа вирусного штамма (североамериканского штамма) АТСС VR2332 (последовательность генома VR2332 приведена в GenBank под регистрационным номером AY150564) (Murtaugh et al., Arch Virol. 1995; 140:1451-1460).The PRRS virus mutates heavily due to its RNA viral nature, so there are many differences between viruses. The PRRS virus is mainly divided into the North American type and the European type. There is type I (Lelystad virus, LV), which is a representative of the European type, and type II, which is a representative of the North American type of virus strain (North American strain) ATCC VR2332 (the genome sequence of VR2332 is listed in GenBank under accession number AY150564) (Murtaugh et al., Arch Virol 1995; 140:1451-1460).
Известно, что степень различия генов североамериканского типа и европейского типа достигает 40%, поэтому перекрестная защита от обоих типов невозможна. Кроме того, часто не удается получить перекрестную защиту даже от мутантных штаммов, принадлежащих к одному и тому же типу (Meng, X.J. et al., 2000). Поэтому для каждого типа была изготовлена вакцина на основе стандартного мутантного штамма, но это не позволяет эффективно предупреждать PRRS из-за ее недостаточной способности обеспечивать перекрестную защиту. Для решения этой проблемы были предприняты различные попытки изготовить вакцину, эффективно обеспечивающую безопасность, иммуногенность и защиту.It is known that the degree of difference between the genes of the North American type and the European type reaches 40%, so cross protection against both types is impossible. In addition, it is often not possible to obtain cross protection even against mutant strains belonging to the same type (Meng, X.J. et al., 2000). Therefore, a vaccine based on a standard mutant strain was made for each type, but this does not effectively prevent PRRS due to its insufficient ability to provide cross protection. To solve this problem, various attempts have been made to produce a vaccine that is effective in providing safety, immunogenicity and protection.
В силу тяжести данного заболевания на протяжении приблизительно 20 лет, начиная с открытия вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней (PRRSV), являющегося возбудителем репродуктивно-респираторного синдрома свиней (PRRS), значительные усилия были вложены в разработку метода предупреждения инфекции, вызываемой данным вирусом, однако методы ее предупреждения и лечения до настоящего времени не разработаны. Для контроля над репродуктивно-респираторым синдромом свиней (PRRS) были разработаны различные вакцины, такие как инактивированные вакцины и ослабленные живые вакцины, но было обнаружено, что только ослабленные вакцины, обладающие инфекционной способностью, приводят к желаемому уровню защитного эффекта. Тем не менее, обеспечить защиту от разных вирусов репродуктивно-респираторного синдрома свиней (PRRSV) с использованием одной вакцины затруднительно ввиду отсутствия перекрестного иммунитета к разным типам вирусов из-за широкого разнообразия вирусов репродуктивно-респираторного синдрома свиней (PRRSV). Кроме того, существующие ослабленные вакцины могут быть получены только последовательным пассажем из 100-200 или более пассажей в клеточных линиях других видов животных, что приводит к продолжительному периоду разработки, и при этом трудно гарантировать эффективность и безопасность. Поэтому для каждого типа была изготовлена вакцина на основе стандартного мутантного штамма, но это не позволяет эффективно предупреждать PRRS из-за ее недостаточной способности обеспечивать перекрестную защиту.Due to the severity of the disease, in the approximately 20 years since the discovery of the porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV), which is the causative agent of porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS), significant efforts have been invested in the development of a method for preventing infection with this virus, however methods for its prevention and treatment have not yet been developed. Various vaccines have been developed to control porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS), such as inactivated vaccines and attenuated live vaccines, but only attenuated vaccines with infectivity have been found to produce the desired level of protective effect. However, it is difficult to provide protection against different porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRSV) viruses using a single vaccine due to the lack of cross-immunity to different types of viruses due to the wide variety of porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRSV) viruses. In addition, existing attenuated vaccines can only be obtained by passage passage of 100-200 or more passages in cell lines of other animal species, resulting in a long development period and it is difficult to guarantee efficacy and safety. Therefore, a vaccine based on a standard mutant strain was made for each type, but this does not effectively prevent PRRS due to its insufficient ability to provide cross protection.
Для решения этой проблемы были предприняты различные попытки изготовить вакцину, эффективно обеспечивающую безопасность, иммуногенность и защиту (заявка №10-2011-7004020; название изобретения: «Вакцина от высоко патогенного репродуктивно-респираторного синдрома свиней (HP-PRRS)»).To solve this problem, various attempts have been made to produce a vaccine that effectively provides safety, immunogenicity and protection (application No. 10-2011-7004020; title of the invention: "Vaccination against highly pathogenic porcine reproductive and respiratory syndrome (HP-PRRS)").
ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯDESCRIPTION OF THE INVENTION
Техническая задачаTechnical task
Настоящее изобретение относится к химерному вирусу репродуктивно-респираторного синдрома свиней (PRRSV), который имеет низкую патогенность и высокую безопасность и усиливает секрецию нейтрализующих антител, к вакцине, содержащей указанный вирус, и к способу ее получения.The present invention relates to a chimeric porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) that has low pathogenicity and high safety and enhances the secretion of neutralizing antibodies, a vaccine containing said virus, and a method for producing the same.
В одном примере химерный вирус может содержатьIn one example, the chimeric virus may comprise
(1) нуклеиновокислотную последовательность открытой рамки считывания 1а (ORF1a) и ORF1b, имеющую происхождение из мутантного штамма LMY ver2 с регистрационным номером KСТС 13394 ВР, или нуклеиновокислотную последовательность, на 70% или более гомологичную указанной нуклеиновокислотной последовательности, сохраняющую в то же время функциональную эквивалентность указанной последовательности, и(1) a nucleic acid sequence of open reading frame 1a (ORF1a) and ORF1b originating from the mutant strain LMY ver2 with accession number KSTS 13394 BP, or a nucleic acid sequence 70% or more homologous to said nucleic acid sequence while maintaining functional equivalence specified sequence, and
(2) нуклеиновокислотную последовательность областей ORF2-ORF7 выделенного штамма ВР2017-2, имеющего регистрационный номер KCTC 13393 ВР, или нуклеиновокислотную последовательность, на 70% или более гомологичную указанной нуклеиновокислотной последовательности, сохраняющую в то же время функциональную эквивалентность указанной последовательности.(2) the nucleic acid sequence of the ORF2-ORF7 regions of the isolated BP2017-2 strain having accession number KCTC 13393 BP, or a nucleic acid sequence that is 70% or more homologous to said nucleic acid sequence while maintaining functional equivalence to said sequence.
Техническое решениеTechnical solution
Настоящее изобретение относится к химерному вирусу репродуктивно-респираторного синдрома свиней (PRRSV), который может быть использован в качестве вакцины. Химерный PRRSV-вирус по настоящему изобретению является ослабленным и поэтому имеет низкую патогенность и высокую безопасность по сравнению с его исходным штаммом и усиливает секрецию нейтрализующих антител, связанных с перекрестным иммунитетом, значительно усиливая посредством этого иммунитет у свиней. Соответственно, он может быть использован в качестве эффективной вакцины для предупреждения и лечения PRRS-заболевания.The present invention relates to a chimeric porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) that can be used as a vaccine. The chimeric PRRSV virus of the present invention is attenuated and therefore has low pathogenicity and high safety compared to its parent strain, and enhances the secretion of neutralizing antibodies associated with cross-immunity, thereby greatly enhancing immunity in pigs. Accordingly, it can be used as an effective vaccine for the prevention and treatment of PRRS disease.
Далее настоящее изобретение будет описано более подробно.Hereinafter, the present invention will be described in more detail.
При использовании здесь «ослабленный вирус» относится к нетоксичному вирусу, способному индуцировать иммунный ответ у целевого млекопитающего, не приводя к клиническим признакам PRRS-заболевания, и также относится к уменьшению клинических признаков у животных, инфицированных ослабленным вирусом или не получающих ослабленный вирус, или к уменьшению тяжести признаков по сравнению с «контрольными» животными, инфицированными неослабленным вирусом PRRS. В данном контексте термин «уменьшение/уменьшенный» означает уменьшение по меньшей мере на 10%, предпочтительно 25%, более предпочтительно 50% или, наиболее предпочтительно, 100% или более по сравнению с контролем, как определено выше.As used herein, "attenuated virus" refers to a non-toxic virus capable of inducing an immune response in a target mammal without resulting in clinical signs of PRRS disease, and also refers to a reduction in clinical signs in animals infected with or not receiving an attenuated virus, or a reduction in the severity of symptoms compared to "control" animals infected with unattenuated PRRS virus. In this context, the term "reduction/reduced" means a reduction of at least 10%, preferably 25%, more preferably 50%, or most preferably 100% or more compared to a control as defined above.
При использовании здесь «вакцинная композиция» может представлять собой химерный вирус PRRS или любой его иммуногенный фрагмент или участок, предпочтительно ослабленный химерный вирус PRRS, например, химерный вирус PRRS по настоящему изобретению. Это приводит к «иммунному ответу», такому как клеточный и/или антитело-опосредованный иммунный ответ на PRRSV. Предпочтительно, чтобы вакцинная композиция была способна обеспечивать профилактический иммунитет от PRRSV-инфекции и связанных с ней клинических признаков.As used herein, a "vaccine composition" may be a chimeric PRRS virus, or any immunogenic fragment or region thereof, preferably an attenuated chimeric PRRS virus, such as the chimeric PRRS virus of the present invention. This results in an "immune response", such as a cellular and/or antibody-mediated immune response to PRRSV. Preferably, the vaccine composition is capable of conferring prophylactic immunity against PRRSV infection and associated clinical signs.
При использовании здесь «иммунный ответ» означает любой клеточно- и/или антитело-опосредованный иммунный ответ на химерный вирус или вакцину при их введении животному, которому вводят химерный PRRSV-вирус по настоящему изобретению или вакцинную композицию, содержащую указанный вирус. Обычно «иммунный ответ» включает, без ограничения, один или более из следующих эффектов: появление или активацию антигенов, входящих в состав соответствующей композиции или вакцины, или антител, В-клеток, хелперных Т-клеток, ингибирующих Т-клеток, и/или цитотоксических Т-клеток, и/или у5 Т-клеток, специфично индуцированных против антигенов. Предпочтительно, чтобы хозяин демонстрировал терапевтический или профилактический иммунный ответ, улучшающий резистентность к новой инфекции и/или уменьшающий клиническую тяжесть заболевания по сравнению с контролем, не получающим иммуногенную композицию или вакцину. Это предупреждение будет продемонстрировано, в наиболее благоприятном случае, отсутствием симптомов, связанных с указанной выше инфекцией у хозяина, и, включая это, уменьшением частоты или тяжести.As used herein, "immune response" means any cell- and/or antibody-mediated immune response to a chimeric virus or vaccine when administered to an animal that is administered a chimeric PRRSV virus of the present invention or a vaccine composition containing said virus. Typically, an "immune response" includes, without limitation, one or more of the following: the appearance or activation of antigens that are part of the corresponding composition or vaccine, or antibodies, B cells, helper T cells, inhibitory T cells, and/or cytotoxic T cells, and/or 5 T cells specifically induced against antigens. Preferably, the host exhibits a therapeutic or prophylactic immune response that improves resistance to a new infection and/or reduces the clinical severity of the disease compared to a control not receiving the immunogenic composition or vaccine. This warning will be demonstrated, in the most favorable case, by the absence of symptoms associated with the above infection in the host, and, including this, by a decrease in frequency or severity.
При использовании здесь «свиньи», «свинья» и «поросята» могут быть использованы совместимым образом.When used here, "pigs", "pig" and "pigs" can be used in a compatible manner.
«Приведение в контакт с вакциной» или «введение вакцины» означает введение химерного PRRSV-вируса или вакцины, содержащей указанный химерный PRRSV-вирус, описанный здесь, до воздействия, приводящего к PRRS-заболеванию."Bringing into contact with the vaccine" or "administration of the vaccine" means the introduction of a chimeric PRRSV virus or a vaccine containing the specified chimeric PRRSV virus described here, prior to exposure leading to PRRS disease.
«Предупреждать» или «предупреждение» означает уменьшение частоты клинического проявления PRRS или тяжести или частоты симптомов в результате введения PRRSV-вируса или вакцинной композиции, содержащей указанный PRRSV-вирус, по настоящему изобретению. Уменьшение тяжести или частоты является результатом сравнения с животным или группой животных без введения химерного PRRSV-вируса или вакцинной композиции, содержащей указанный PRRSV-вирус, по настоящему изобретению. Предпочтительно, животное может представлять собой свинью."Prevent" or "prevention" means a reduction in the incidence of clinical manifestations of PRRS or the severity or frequency of symptoms as a result of the administration of a PRRSV virus or a vaccine composition containing said PRRSV virus of the present invention. The reduction in severity or frequency is the result of comparison with an animal or group of animals without administration of a chimeric PRRSV virus or a vaccine composition containing said PRRSV virus of the present invention. Preferably, the animal may be a pig.
Для удобства последовательности, указанные здесь, описаны, исходя из ДНК-нуклеотидов, и в случае полинуклеотидов РНК-типа это означает последовательность, где весь тимин (Т) нуклеотидной последовательности или его часть заменены на урацил (U).For convenience, the sequences indicated herein are described in terms of DNA nucleotides, and in the case of RNA-type polynucleotides, this means a sequence where all or part of the thymine (T) of the nucleotide sequence is replaced by uracil (U).
Здесь «состоящий из последовательности» применительно к определенной нуклеотидной последовательности и/или аминокислоте включает все из содержащего указанную последовательность, по существу содержащего указанную последовательность и/или состоящего из указанной последовательности, и, по необходимости, они могут быть соответствующим образом заменены и использованы.Here, "consisting of a sequence" in relation to a particular nucleotide sequence and/or amino acid includes all of containing the specified sequence, essentially containing the specified sequence and/or consisting of the specified sequence, and, if necessary, they can be appropriately replaced and used.
Согласно настоящему изобретению предложен ослабленный химерный вирус репродуктивно-респираторного синдрома свиней (PRRSV), представляющего собой вирусное заболевание, поражающее свиней.The present invention provides an attenuated chimeric porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) which is a viral disease affecting pigs.
Для решения указанной задачи, согласно настоящему изобретению, предложен полинуклеотид, содержащий структуру структурной формулы 1:To solve this problem, according to the present invention, a polynucleotide is proposed containing the structure of the structural formula 1:
[структурная формула 1][structural formula 1]
5'-[X]-[Y]-3'.5'-[X]-[Y]-3'.
В указанной формуле [X] представляет собой нуклеиновокислотную последовательность генов областей ORF1a и ORF1b мутантного штамма LMY ver2, имеющего регистрационный номер 13394 ВР, или нуклеиновокислотную последовательность, на 70% или более гомологичную нуклеиновокислотной последовательности генов областей ORF1a и ORF1b, содержащую нуклеиновокислотную последовательность генов NSP1 (гена NSP1-альфа и гена NSP1-бета) мутантного штамма LMY ver2, имеющего регистрационный номер KСТС 13394 ВР, или нуклеиновокислотную последовательность, гомологичную на 70% или более в диапазоне, позволяющем сохранять функцию, равную функции указанной нуклеиновокислотной последовательности, например, содержащуюIn this formula, [X] represents the nucleic acid sequence of the genes of the ORF1a and ORF1b regions of the mutant strain LMY ver2, having the registration number 13394 BP, or a nucleic acid sequence that is 70% or more homologous to the nucleic acid sequence of the genes of the ORF1a and ORF1b regions, containing the nucleic acid sequence of the NSP1 genes ( NSP1-alpha gene and NSP1-beta gene) of the mutant strain LMY ver2 having the accession number KSTC 13394 BP, or a nucleic acid sequence homologous by 70% or more in the range allowing to maintain a function equal to the function of the specified nucleic acid sequence, for example, containing
нуклеиновокислотную последовательность генов NSP1 мутантного штамма LMY ver2, или нуклеиновокислотную последовательность, гомологичную на 70% или более в диапазоне, позволяющем сохранять функцию, равную функции указанной нуклеиновокислотной последовательности, и [Y] представляет собой нуклеиновокислотную последовательность генов областей ORF2-ORF7 мутантного штамма ВР2017-2, имеющего регистрационный номер KСТС 13393 BP, или нуклеиновокислотную последовательность, гомологичную на 70% или более в диапазоне, позволяющем сохранять функцию, равную функции указанной нуклеиновокислотной последовательности. При использовании здесь «равная функция» может означать функцию, такую же, как желаемая функция, или качественно (активность) и/или количественно (уровень) сходную с ней. Например, аминокислотная последовательность белка, кодируемого рассматриваемым геном, может быть такой же, как аминокислотная последовательность белка, кодируемого геном дикого типа.the nucleic acid sequence of the NSP1 genes of the mutant strain LMY ver2, or a nucleic acid sequence that is 70% or more homologous in a range that allows it to maintain a function equal to the function of the specified nucleic acid sequence, and [Y] is the nucleic acid sequence of the genes of the ORF2-ORF7 regions of the mutant strain BP2017-2 , having the registration number KSTS 13393 BP, or a nucleic acid sequence homologous by 70% or more in the range that allows you to maintain a function equal to the function of the specified nucleic acid sequence. As used herein, "equal function" may mean a function that is the same as the desired function, or qualitatively (activity) and/or quantitatively (level) similar to it. For example, the amino acid sequence of the protein encoded by the gene in question may be the same as the amino acid sequence of the protein encoded by the wild-type gene.
В одном примере [X] может содержать все виды точковых мутаций (молчащая мутация) в диапазоне, позволяющем сохранять аминокислотную последовательность белка NSP1, кодируемого геном NSP1, в нуклеиновокислотной последовательности гена NSP1, состоящей из нуклеотидной последовательности SEQ ID NO: 11, и, например, он может быть выбран и использован свободным образом в диапазоне, направленном на уменьшение СВР-показателя гена NSP1.In one example, [X] may contain all kinds of point mutations (silent mutation) in the range allowing the amino acid sequence of the NSP1 protein encoded by the NSP1 gene to be conserved in the nucleic acid sequence of the NSP1 gene consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11, and, for example, it can be freely selected and used in a range aimed at reducing the CBP index of the NSP1 gene.
Например, [X] может представлять собой мутацию, где заменены одно или более, 25 или более, 66 или более, 80 или более или все из 91 основания, выбранные из группы, состоящей из положения 222, положения 225, положения 237, положения 240, положения 252, положения 306, положения 309, положения 312, положения 315, положения 324, положения 327, положения 330, положения 333, положения 336, положения 339, положения 342, положения 345, положения 357, положения 363, положения 366, положения 378, положения 379, положения 381, положения 393, положения 396, положения 543, положения 546, положения 549, положения 555, положения 558, положения 561, положения 573, положения 579, положения 582, положения 588, положения 612, положения 618, положения 621, положения 627, положения 633, положения 639, положения 654, положения 673, положения 675, положения 678, положения 681, положения 684, положения 705, положения 708, положения 729, положения 735, положения 738, положения 741, положения 744, положения 747, положения 771, положения 786, положения 789, положения 792, положения 810, положения 825, положения 828, положения 838, положения 840, положения 846, положения 849, положения 858, положения 867, положения 879, положения 882, положения 885, положения 891, положения 900, положения 903, положения 906, положения 924, положения 936, положения 939, положения 948, положения 954, положения 963, положения 966, положения 1026, положения 1029, положения 1038, положения 1047, положения 1053, положения 1066, положения 1068, положения 1086, положения и положения 1110 нуклеиновокислотной последовательности гена NSP1, состоящей из нуклеотидной последовательности SEQ ID NO: 11.For example, [X] may be a mutation where one or more, 25 or more, 66 or more, 80 or more, or all of the 91 bases selected from the group consisting of position 222, position 225, position 237, position 240 are replaced , regulations 252, regulations 306, regulations 309, regulations 312, regulations 315, regulations 324, regulations 327, regulations 330, regulations 333, regulations 336, regulations 339, regulations 342, regulations 345, regulations 357, regulations 363, regulations 366, regulations 378, regulation 379, regulation 381, regulation 393, regulation 396, regulation 543, regulation 546, regulation 549, regulation 555, regulation 558, regulation 561, regulation 573, regulation 579, regulation 582, regulation 588, regulation 612, regulation 618, regulations 621, regulations 627, regulations 633, regulations 639, regulations 654, regulations 673, regulations 675, regulations 678, regulations 681, regulations 684, regulations 705, regulations 708, regulations 729, regulations 735, regulations 738, regulations 741, regulations 744 , provisions 747 , regulations 771, regulations 786, regulations 789, regulations 792, regulations 810, regulations 825, regulations 828, regulations 838, regulations 840, regulations 846, regulations 849, regulations 858, regulations 867, regulations 879, regulations 882, regulations 885, regulations 891, regulation 900, regulation 903, regulation 906, regulation 924, regulation 936, regulation 939, regulation 948, regulation 954, regulation 963, regulation 966, regulation 1026, regulation 1029, regulation 1038, regulation 1047, regulation 1053, regulation 1066, positions 1068, positions 1086, positions and positions 1110 of the nucleic acid sequence of the NSP1 gene, consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11.
В одном примере [X] может содержать, в нуклеиновокислотной последовательности гена NSP1, состоящей из нуклеотидной последовательности SEQ ID NO: 11, одну или более, 25 или более, 66 или более, 80 или более или все из 91 мутации, выбранные из группы, состоящей из мутации, где G в положении 222 заменен на С, мутации, где С в положении 225 заменен на А, мутации, где Т в положении 327 заменен на С, мутации, где А в положении 240 заменен на Т, мутации, где Т в положении 252 заменен на С, мутации, где А в положении 306 заменен на С, мутации, где Т в положении 309 заменен на С, мутации, где G в положении 312 заменен на А, мутации, где С в положении 315 заменен на А, мутации, где Т в положении 324 заменен на С, мутации, где С в положении 327 заменен на G, мутации, где G в положении 330 заменен на А, мутации, где С в положении 333 заменен на Т, мутации, где С в положении 336 заменен на G, мутации, где Т в положении 339 заменен на С, мутации, где А в положении 342 заменен на Т, мутации, где Т в положении 345 заменен на А, мутации, где А в положении 357 заменен на G, мутации, где Т в положении 363 заменен на А, мутации, где Т в положении 366 заменен на С, мутации, где С в положении 378 заменен на Т, мутации, где С в положении 379 заменен на А, мутации, где С в положении 381 заменен на G, мутации, где Т в положении 393 заменен на С, мутации, где Т в положении 396 заменен на А, мутации, где Т в положении 543 заменен на С, мутации, где Т в положении 546 заменен на С, мутации, где С в положении 549 заменен на А, мутации, где Т в положении 555 заменен на С, мутации, где Т в положении 558 заменен на С, мутации, где Т в положении 561 заменен на А, мутации, где С в положении 573 заменен на Т, мутации, где Т в положении 579 заменен на С, мутации, где G в положении 582 заменен на Т, мутации, где Т в положении 588 заменен на С, мутации, где Т в положении 612 заменен на С, мутации, где G в положении 618 заменен на С, мутации, где Т в положении 621 заменен на С, мутации, где А в положении 627 заменен на Т, мутации, где Т в положении 633 заменен на С, мутации, где Т в положении 639 заменен на G, мутации, где С в положении 654 заменен на Т, мутации, где С в положении 673 заменен на Т, мутации, где С в положении 675 заменен на А, мутации, где С в положении 678 заменен на Т, мутации, где С в положении 681 заменен на G, мутации, где С в положении 684 заменен на G, мутации, где G в положении 705 заменен на С, мутации, где С в положении 708 заменен на Т, мутации, где А в положении 729 заменен на С, мутации, где Т в положении 735 заменен на С, мутации, где G в положении 738 заменен на Т, мутации, где Т в положении 741 заменен на С, мутации, где Т в положении 744 заменен на С, мутации, где Т в положении 747 заменен на А, мутации, где Т в положении 771 заменен на С, мутации, где Т в положении 786 заменен на С, мутации, где С в положении 789 заменен на Т, мутации, где Т в положении 792 заменен на G, мутации, где С в положении 810 заменен на Т, мутации, где Т в положении 825 заменен на С, мутации, где С в положении 828 заменен на Т, мутации, где Т в положении 838 заменен на С, мутации, где G в положении 840 заменен на С, мутации, где С в положении 846 заменен на G, мутации, где G в положении 849 заменен на А, мутации, где А в положении 858 заменен на G, мутации, где Т в положении 867 заменен на С, мутации, где Т в положении 879 заменен на С, мутации, где С в положении 882 заменен на G, мутации, где С в положении 885 заменен на Т, мутации, где С в положении 891 заменен на Т, мутации, где Т в положении 900 заменен на С, мутации, где С в положении 903 заменен на А, мутации, где Т в положении 906 заменен на С, мутации, где G в положении 924 заменен на Т, мутации, где Т в положении 936 заменен на С, мутации, где Т в положении 939 заменен на С, мутации, где А в положении 948 заменен на С, мутации, где А в положении 954 заменен на С, мутации, где А в положении 963 заменен на Т, мутации, где Т в положении 966 заменен на С, мутации, где А в положении 1026 заменен на G, мутации, где G в положении 1029 заменен на С, мутации, где С в положении 1038 заменен на Т, мутации, где Т в положении 1047 заменен на С, мутации, где Т в положении 1053 заменен на С, мутации, где А в положении 1066 заменен на С, мутации, где А в положении 1068 заменен на С, мутации, где С в положении 1086 заменен на Т, и мутации, где Т в положении 1110 заменен на С.In one example, [X] may contain, in the nucleic acid sequence of the NSP1 gene, consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11, one or more, 25 or more, 66 or more, 80 or more, or all of 91 mutations selected from the group, consisting of a mutation where G at position 222 is replaced by C, a mutation where C at position 225 is replaced by A, a mutation where T at position 327 is replaced by C, a mutation where A at position 240 is replaced by T, a mutation where T at position 252 is replaced by C, mutations where A at position 306 is replaced by C, mutations where T at position 309 is replaced by C, mutations where G at position 312 is replaced by A, mutations where C at position 315 is replaced by A , mutations where T at position 324 is replaced by C, mutations where C at position 327 is replaced by G, mutations where G at position 330 is replaced by A, mutations where C at position 333 is replaced by T, mutations where C is at position 336 is replaced by G, mutations where T at position 339 is replaced by C, mutations where A at position 342 is replaced by T, mutations where T in position 345 is replaced by A, mutations where A at position 357 is replaced by G, mutations where T at position 363 is replaced by A, mutations where T at position 366 is replaced by C, mutations where C at position 378 is replaced by T, mutations where C at position 379 is replaced by A, mutations where C at position 381 is replaced by G, mutations where T at position 393 is replaced by C, mutations where T at position 396 is replaced by A, mutations where T at position 543 is replaced by C, mutations where T at position 546 is replaced by C, mutations where C at position 549 is replaced by A, mutations where T at position 555 is replaced by C, mutations where T at position 558 is replaced by C, mutations where T at position 561 is replaced by A, mutations where C at position 573 is replaced by T, mutations where T at position 579 is replaced by C, mutations where G at position 582 is replaced by T, mutations where T at position 588 replaced by C, mutations where T at position 612 is replaced by C, mutations where G at position 618 is replaced by C, mutations where T at position 621 is replaced by C, mutations where A at position 627 replaced by T, mutations where T at position 633 is replaced by C, mutations where T at position 639 is replaced by G, mutations where C at position 654 is replaced by T, mutations where C at position 673 is replaced by T, mutations where C at position 675 is replaced by A, mutations where C at position 678 is replaced by T, mutations where C at position 681 is replaced by G, mutations where C at position 684 is replaced by G, mutations where G is at position 705 replaced by C, mutations where C at position 708 is replaced by T, mutations where A at position 729 is replaced by C, mutations where T at position 735 is replaced by C, mutations where G at position 738 is replaced by T, mutations, where T at position 741 is replaced by C, mutations where T at position 744 is replaced by C, mutations where T at position 747 is replaced by A, mutations where T at position 771 is replaced by C, mutations where T at position 786 is replaced to C, mutations where C at position 789 is replaced by T, mutations where T at position 792 is replaced by G, mutations where C at position 810 is replaced by T, mutations where T at position 825 is replaced n to C, mutations where C at position 828 is replaced by T, mutations where T at position 838 is replaced by C, mutations where G at position 840 is replaced by C, mutations where C at position 846 is replaced by G, mutations, where G at position 849 is replaced by A, mutations where A at position 858 is replaced by G, mutations where T at position 867 is replaced by C, mutations where T at position 879 is replaced by C, mutations where C at position 882 is replaced to G, mutations where C at position 885 is replaced by T, mutations where C at position 891 is replaced by T, mutations where T at position 900 is replaced by C, mutations where C at position 903 is replaced by A, mutations where T at position 906 is replaced by C, mutations where G at position 924 is replaced by T, mutations where T at position 936 is replaced by C, mutations where T at position 939 is replaced by C, mutations where A at position 948 is replaced by C, mutations where A at position 954 is replaced by C, mutations where A at position 963 is replaced by T, mutations where T at position 966 is replaced by C, mutations where A at position 1026 is replaced by G, m mutations where G at position 1029 is replaced by C, mutations where C at position 1038 is replaced by T, mutations where T at position 1047 is replaced by C, mutations where T at position 1053 is replaced by C, mutations where A at position 1066 is replaced by C, mutations where A at position 1068 is replaced by C, mutations where C at position 1086 is replaced by T, and mutations where T at position 1110 is replaced by C.
Например, [X] может представлять собой нуклеиновокислотную последовательность гена NSP1 (SEQ ID NO: 12) и/или NSPl-бета (SEQ ID NO: 1; участок из 609 5'-концевых оснований SEQ ID NO: 12) мутантного штамма LMY ver2, имеющего регистрационный номер 13394 ВР, или нуклеиновокислотную последовательность, гомологичную на 70% или более, 75% или более, 80% или более, 85% или более, 90% или более, 95% или более, 96% или более, 97% или более, 98% или более, 99% или более или 99,5% или более в диапазоне, позволяющем сохранять функцию, равную функции указанной нуклеиновокислотной последовательности.For example, [X] may be the nucleic acid sequence of the NSP1 gene (SEQ ID NO: 12) and/or NSPl-beta (SEQ ID NO: 1; a region of 609 5' bases of SEQ ID NO: 12) of the LMY ver2 mutant strain having accession number 13394 BP, or a nucleic acid sequence that is 70% or more homologous, 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 96% or more, 97% or more, 98% or more, 99% or more, or 99.5% or more in the range that allows you to maintain a function equal to the function of the specified nucleic acid sequence.
Кроме того, [Y] может представлять собой нуклеиновокислотную последовательность генов областей ORF2-ORF7 мутантного штамма ВР2017-2, имеющего регистрационный номер KСТС 13393 ВР, или нуклеиновокислотную последовательность, гомологичную на 70% или более, 75% или более, 80% или более, 85% или более, 90% или более, 95% или более, 96% или более, 97% или более, 98% или более, 99% или более или 99,5% или более в диапазоне, позволяющем сохранять функцию, равную функции указанной нуклеиновокислотной последовательности.In addition, [Y] may be the nucleic acid sequence of the genes of the ORF2-ORF7 regions of the mutant strain BP2017-2 having the registration number KSTC 13393 BP, or a nucleic acid sequence homologous by 70% or more, 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 96% or more, 97% or more, 98% or more, 99% or more, or 99.5% or more in the range to keep the function equal to the function specified nucleic acid sequence.
Согласно одному примеру настоящего изобретения, возможно также присутствие [А]n на 3'-конце [Y] структурной формулы 1. Указанное n представляет собой количество нуклеотидов, содержащих основание А, и может представлять собой целое число от 10 до 100. Предпочтительно, оно может представлять собой целое число от 10 до 80, от 10 до 70, от 10 до 60, от 10 до 50, от 10 до 40, от 10 до 30, от 15 до 80, от 15 до 70, от 15 до 60, от 15 до 50, от 15 до 40, от 15 до 30, от 20 до 30, от 20 до 26.According to one example of the present invention, the presence of [A]n at the 3' end of the [Y] of
Полинуклеотид может представлять собой РНК, обратный транскриптом РНК (ДНК) или их комбинацию. Указанный полинуклеотид может функционировать как геном химерного PRRSV-вируса.The polynucleotide may be RNA, reverse transcriptome RNA (DNA), or a combination thereof. Said polynucleotide can function as the chimeric PRRSV virus genome.
Соответственно, согласно другому примеру настоящего изобретения предложен химерный вирус репродуктивно-респираторного синдрома свиней (PRRSV), содержащий полинуклеотид, имеющий структуру структурной формулы 1. Геном химерного PRRSV-вируса может представлять собой ДНК или РНК, предпочтительно РНК.Accordingly, according to another example of the present invention, there is provided a chimeric porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) containing a polynucleotide having the structure of
[X] соответствует области гена NSP1, содержащей NSP1-бета мутантного штамма LMY ver2, имеющего регистрационный номер 13394 ВР, и может представлять собой генный фрагмент, полученный обработкой генома мутантного штамма LMY ver2 рестриктазами AscI и PacI, и, например, может содержать нуклеиновокислотную последовательность SEQ ID NO: 1 и/или SEQ ID NO: 12 или нуклеиновокислотную последовательность, гомологичную на 70% или более, 75% или более, 80% или более, 85% или более, 90% или более, 95% или более, 96% или более, 97% или более, 98% или более, 99% или более или 99,5% или более в диапазоне, позволяющем сохранять функцию, равную функции указанной нуклеотидной последовательности.[X] corresponds to the region of the NSP1 gene containing the NSP1-beta mutant strain LMY ver2 having accession number 13394 BP, and may be a gene fragment obtained by processing the genome of the mutant strain LMY ver2 with restriction enzymes AscI and PacI, and, for example, may contain a nucleic acid sequence SEQ ID NO: 1 and/or SEQ ID NO: 12, or nucleic acid sequence 70% or more homologous, 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more homologous, 96 % or more, 97% or more, 98% or more, 99% or more, or 99.5% or more in the range that allows you to maintain a function equal to the function of the specified nucleotide sequence.
[Y] соответствует областям ORF2-ORF7 мутантного штамма ВР2017-2, имеющего регистрационный номер KСТС 13393 ВР, и может представлять собой генный фрагмент, полученный обработкой генома мутантного штамма ВР2017-2 рестриктазами AscI и PacI, и, например, может содержать нуклеиновокислотную последовательность SEQ ID NO: 2 или нуклеиновокислотную последовательность, гомологичную на 70% или более, 75% или более, 80% или более, 85% или более, 90% или более, 95% или более, 96% или более, 97% или более, 98% или более, 99% или более или 99,5% или более в диапазоне, позволяющем сохранять функцию, равную функции указанной нуклеиновокислотной последовательности.[Y] corresponds to the ORF2-ORF7 regions of the mutant strain BP2017-2, having the registration number KSTC 13393 BP, and may be a gene fragment obtained by processing the genome of the mutant strain BP2017-2 with restriction enzymes AscI and PacI, and, for example, may contain the nucleic acid sequence SEQ ID NO: 2 or nucleic acid sequence 70% or more homologous, 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 96% or more, 97% or more homologous, 98% or more, 99% or more, or 99.5% or more in the range that allows you to maintain a function equal to the function of the specified nucleic acid sequence.
В одном примере структурная формула 1 может содержать нуклеиновокислотную последовательность SEQ ID NO: 4 или нуклеиновокислотную последовательность, гомологичную на 70% или более, 75% или более, 80% или более, 85% или более, 90% или более, 95% или более, 96% или более, 97% или более, 98% или более, 99% или более или 99,5% или более в диапазоне, позволяющем сохранять функцию, равную функции указанной нуклеиновокислотной последовательности. Например, она может представлять собой нуклеиновокислотную последовательность SEQ ID NO: 4.In one example,
В Таблице 1 ниже часть, выделенная полужирным шрифтом, в нуклеотидной последовательности гена NSP1 LMY ver2 представляет собой область NSP1-бета.In Table 1 below, the bold portion of the nucleotide sequence of the NSP1 gene, LMY ver2 is the NSP1 beta region.
(В приведенной таблице полинуклеотид (РНК), предложенный здесь, может содержать нуклеиновокислотную последовательность, где в последовательности, показанной в SEQ ID NO: 1-4, Т заменены на U.)(In the following table, a polynucleotide (RNA) provided herein may contain a nucleic acid sequence where, in the sequence shown in SEQ ID NOs: 1-4, T has been replaced by U.)
Согласно настоящему изобретению, предложен химерный PRRSV-вирус, содержащий полинуклеотид структурной формулы 1 в качестве генома. Химерный PRRSV-вирус может включать вирусное потомство, культивированное в 1-80 пассажах, 1-70 пассажах, 1-60 пассажах, 1-50 пассажах, 1-40 пассажах, 1-30 пассажах, 1-20 пассажах или 1-10 пассажах.The present invention provides a chimeric PRRSV virus containing a polynucleotide of
[структурная формула 1][structural formula 1]
5'-[X]-[Y]-3'.5'-[X]-[Y]-3'.
В приведенной формуле [X] представляет собой нуклеиновокислотную последовательность гена NSP1 и/или NSP1-бета мутантного штамма LMY ver2, имеющего регистрационный номер 13394 ВР, или нуклеиновокислотную последовательность, на 70% или более гомологичную указанной нуклеиновокислотной последовательности, и [Y] представляет собой нуклеиновокислотную последовательность генов областей ORF2-ORF7 мутантного штамма ВР2017-2, имеющего регистрационный номер KCTC 13393 ВР, или нуклеиновокислотную последовательность, на 70% или более гомологичную указанной нуклеиновокислотной последовательности.In the above formula, [X] represents the nucleic acid sequence of the NSP1 gene and/or NSP1 beta mutant strain LMY ver2 having accession number 13394 BP, or a nucleic acid sequence 70% or more homologous to the specified nucleic acid sequence, and [Y] represents the nucleic acid the gene sequence of the ORF2-ORF7 regions of the BP2017-2 mutant strain having the registration number KCTC 13393 BP, or a nucleic acid sequence that is 70% or more homologous to the specified nucleic acid sequence.
Например, [X] может представлять собой нуклеиновокислотную последовательность гена NSP1 и/или NSP1-бета мутантного штамма LMY ver2, имеющего регистрационный номер 13394 ВР, или нуклеиновокислотную последовательность, на 70% или более, 75% или более, 80% или более, 85% или более, 90% или более, 95% или более, 96% или более, 97% или более, 98% или более, 99% или более или 99,5% или более гомологичную указанной нуклеиновокислотной последовательности.For example, [X] may be the nucleic acid sequence of the NSP1 gene and/or NSP1 beta mutant strain LMY ver2 having accession number 13394 BP, or the nucleic acid sequence of 70% or more, 75% or more, 80% or more, 85 % or more, 90% or more, 95% or more, 96% or more, 97% or more, 98% or more, 99% or more, or 99.5% or more homologous to the specified nucleic acid sequence.
Кроме того, [Y] может представлять собой нуклеиновокислотную последовательность генов областей ORF2-ORF7 мутантного штамма ВР2017-2, имеющего регистрационный номер KСТС 13393 ВР, или нуклеиновокислотную последовательность, на 70% или более, 75% или более, 80% или более, 85% или более, 90% или более, 95% или более, 96% или более, 97% или более, 98% или более, 99% или более или 99,5% или более гомологичную указанной нуклеиновокислотной последовательности.In addition, [Y] may be the nucleic acid sequence of the genes of the ORF2-ORF7 regions of the mutant strain BP2017-2 having the accession number KSTC 13393 BP, or the nucleic acid sequence of 70% or more, 75% or more, 80% or more, 85 % or more, 90% or more, 95% or more, 96% or more, 97% or more, 98% or more, 99% or more, or 99.5% or more homologous to the specified nucleic acid sequence.
Согласно одному примеру настоящего изобретения, возможно также присутствие [А]n на 3'-конце [Y] структурной формулы 1. Указанное n представляет собой количество нуклеотидов, содержащих основание А, и может представлять собой целое число от 10 до 100, и, например, может представлять собой целое число от 10 до 80, от 10 до 70, от 10 до 60, от 10 до 50, от 10 до 40, от 10 до 30, от 15 до 80, от 15 до 70, от 15 до 60, от 15 до 50, от 15 до 40, от 15 до 30, от 20 до 30, от 20 до 26.According to one example of the present invention, the presence of [A]n at the 3' end of the [Y] of
Полинуклеотид может представлять собой РНК, обратный транскриптом РНК (ДНК) или их комбинацию. Указанный полинуклеотид может функционировать как геном химерного PRRSV-вируса. Соответственно, согласно другому примеру настоящего изобретения, предложен химерный вирус репродуктивно-респираторного синдрома свиней (PRRSV), содержащий полинуклеотид, имеющий структуру структурной формулы 1. Геном химерного PRRSV-вируса может представлять собой ДНК или РНК, предпочтительно РНК.The polynucleotide may be RNA, reverse transcriptome RNA (DNA), or a combination thereof. Said polynucleotide can function as the chimeric PRRSV virus genome. Accordingly, according to another example of the present invention, there is provided a chimeric porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) containing a polynucleotide having the structure of
[X] соответствует области гена NSP1, содержащей NSP1-бета мутантного штамма LMY ver2, имеющего регистрационный номер 13394 ВР, и может представлять собой генный фрагмент, полученный обработкой генома мутантного штамма LMY ver2 рестриктазами AscI и PacI, и, например, может содержать нуклеиновокислотную последовательность SEQ ID NO: 1 или нуклеиновокислотную последовательность, гомологичную на 70% или более, 75% или более, 80% или более, 85% или более, 90% или более, 95% или более, 96% или более, 97% или более, 98% или более, 99% или более или 99,5% или более в диапазоне, позволяющем сохранять функцию, равную функции указанной нуклеотидной последовательности.[X] corresponds to the region of the NSP1 gene containing the NSP1-beta mutant strain LMY ver2 having accession number 13394 BP, and may be a gene fragment obtained by processing the genome of the mutant strain LMY ver2 with restriction enzymes AscI and PacI, and, for example, may contain a nucleic acid sequence SEQ ID NO: 1 or nucleic acid sequence 70% or more homologous, 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 96% or more, 97% or more homologous , 98% or more, 99% or more, or 99.5% or more in the range that allows you to keep the function equal to the function of the specified nucleotide sequence.
[Y] соответствует областям ORF2-ORF7 мутантного штамма ВР2017-2, имеющего регистрационный номер KСТС 13393 ВР, и может представлять собой генный фрагмент, полученный обработкой генома мутантного штамма ВР2017-2 рестриктазами AscI и PacI, и, например, может содержать нуклеиновокислотную последовательность SEQ ID NO:2 или нуклеиновокислотную последовательность, гомологичную на 70% или более, 75% или более, 80% или более, 85% или более, 90% или более, 95% или более, 96% или более, 97% или более, 98% или более, 99% или более или 99,5% или более в диапазоне, позволяющем сохранять функцию, равную функции указанной нуклеиновокислотной последовательности.[Y] corresponds to the ORF2-ORF7 regions of the mutant strain BP2017-2, having the registration number KSTC 13393 BP, and may be a gene fragment obtained by processing the genome of the mutant strain BP2017-2 with restriction enzymes AscI and PacI, and, for example, may contain the nucleic acid sequence SEQ ID NO:2 or nucleic acid sequence 70% or more homologous, 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 96% or more, 97% or more homologous, 98% or more, 99% or more, or 99.5% or more in the range that allows you to maintain a function equal to the function of the specified nucleic acid sequence.
В одном примере структурная формула 1 может содержать нуклеиновокислотную последовательность SEQ ID NO: 4 или нуклеиновокислотную последовательность, гомологичную на 70% или более, 75% или более, 80% или более, 85% или более, 90% или более, 95% или более, 96% или более, 97% или более, 98% или более, 99% или более или 99,5% или более в диапазоне, позволяющем сохранять функцию, равную функции указанной нуклеиновокислотной последовательности. Например, она может представлять собой нуклеиновокислотную последовательность SEQ IN NO: 4.In one example,
Согласно одному конкретному примеру, предложен химерный PRRSV-вирус, содержащий нуклеиновокислотную последовательность, содержащую полинуклеотид SEQ ID NO: 4, в качестве генома, названный LMY+BP2017. Вирус LMY+BP2017 может представлять собой вирус, имеющий регистрационный номер KCTC 13394 ВР.According to one specific example, a chimeric PRRSV virus is provided, containing a nucleic acid sequence containing a polynucleotide of SEQ ID NO: 4, as a genome, named LMY+BP2017. The LMY+BP2017 virus may be a virus with accession number KCTC 13394 BP.
Мутантный штамм LMY ver2, являющийся каркасом химерного вируса LMY+BP2017, может представлять собой мутантный штамм PRRSV, содержащий мутантный NSP1-бета, где заменено по меньшей мере одно основание неструктурного белка 1-го типа (NSP1) SEQ ID NO: 5 исходного штамма LMY (регистрационный номер в GenBank DQ473474.1.).The mutant strain LMY ver2, which is the backbone of the chimeric virus LMY+BP2017, may be a mutant strain PRRSV containing a mutant NSP1-beta, where at least one base of the non-structural protein type 1 (NSP1) SEQ ID NO: 5 of the original LMY strain is replaced (registration number in GenBank DQ473474.1.).
Нуклеотидная последовательность, подлежащая замене, в нуклеотидной последовательности гена, кодирующего NSP1 и/или NSPl-бета штамма LMY, может быть выбрана с использованием известной программы SAVE (Synthetic Attenuated Virus Engineering) и, предпочтительно, может быть выбрана с использованием программы SAVE, разработанной авторами настоящего изобретения. Конкретно, она может представлять собой деоптимизированную нуклеотидную последовательность, полученную анализом генетически высокостабильной области NSP1 в геноме исходного штамма LMY с использованием программы SAVE, разработанной авторами настоящего изобретения, с последующим выбором и заменой части или всей нуклеотидной последовательности, демонстрирующей относительно высокое предпочтение пар кодонов (Codon Pair Bias, СРВ). Деоптимизированная нуклеотидная последовательность может содержать, в гене, кодирующем белок NSP1 штамма LMY, состоящем из нуклеотидной последовательности SEQ ID NO: 11, одну или более, 25 или более, 66 или более, 80 или более или все из 91 мутации, выбранные из группы, состоящей из мутации, где G в положении 222 заменен на С, мутации, где С в положении 225 заменен на А, мутации, где Т в положении 327 заменен на С, мутации, где А в положении 240 заменен на Т, мутации, где Т в положении 252 заменен на С, мутации, где А в положении 306 заменен на С, мутации, где Т в положении 309 заменен на С, мутации, где G в положении 312 заменен на А, мутации, где С в положении 315 заменен на А, мутации, где Т в положении 324 заменен на С, мутации, где С в положении 327 заменен на G, мутации, где G в положении 330 заменен на А, мутации, где С в положении 333 заменен на Т, мутации, где С в положении 336 заменен на G, мутации, где Т в положении 339 заменен на С, мутации, где А в положении 342 заменен на Т, мутации, где Т в положении 345 заменен на А, мутации, где А в положении 357 заменен на G, мутации, где Т в положении 363 заменен на А, мутации, где Т в положении 366 заменен на С, мутации, где С в положении 378 заменен на Т, мутации, где С в положении 379 заменен на А, мутации, где С в положении 381 заменен на G, мутации, где Т в положении 393 заменен на С, мутации, где Т в положении 396 заменен на А, мутации, где Т в положении 543 заменен на С, мутации, где Т в положении 546 заменен на С, мутации, где С в положении 549 заменен на А, мутации, где Т в положении 555 заменен на С, мутации, где Т в положении 558 заменен на С, мутации, где Т в положении 561 заменен на А, мутации, где С в положении 573 заменен на Т, мутации, где Т в положении 579 заменен на С, мутации, где G в положении 582 заменен на Т, мутации, где Т в положении 588 заменен на С, мутации, где Т в положении 612 заменен на С, мутации, где G в положении 618 заменен на С, мутации, где Т в положении 621 заменен на С, мутации, где А в положении 627 заменен на Т, мутации, где Т в положении 633 заменен на С, мутации, где Т в положении 639 заменен на G, мутации, где С в положении 654 заменен на Т, мутации, где С в положении 673 заменен на Т, мутации, где С в положении 675 заменен на А, мутации, где С в положении 678 заменен на Т, мутации, где С в положении 681 заменен на G, мутации, где С в положении 684 заменен на G, мутации, где G в положении 705 заменен на С, мутации, где С в положении 708 заменен на Т, мутации, где А в положении 729 заменен на С, мутации, где Т в положении 735 заменен на С, мутации, где G в положении 738 заменен на Т, мутации, где Т в положении 741 заменен на С, мутации, где Т в положении 744 заменен на С, мутации, где Т в положении 747 заменен на А, мутации, где Т в положении 771 заменен на С, мутации, где Т в положении 786 заменен на С, мутации, где С в положении 789 заменен на Т, мутации, где Т в положении 792 заменен на G, мутации, где С в положении 810 заменен на Т, мутации, где Т в положении 825 заменен на С, мутации, где С в положении 828 заменен на Т, мутации, где Т в положении 838 заменен на С, мутации, где G в положении 840 заменен на С, мутации, где С в положении 846 заменен на G, мутации, где G в положении 849 заменен на А, мутации, где А в положении 858 заменен на G, мутации, где Т в положении 867 заменен на С, мутации, где Т в положении 879 заменен на С, мутации, где С в положении 882 заменен на G, мутации, где С в положении 885 заменен на Т, мутации, где С в положении 891 заменен на Т, мутации, где Т в положении 900 заменен на С, мутации, где С в положении 903 заменен на А, мутации, где Т в положении 906 заменен на С, мутации, где G в положении 924 заменен на Т, мутации, где Т в положении 936 заменен на С, мутации, где Т в положении 939 заменен на С, мутации, где А в положении 948 заменен на С, мутации, где А в положении 954 заменен на С, мутации, где А в положении 963 заменен на Т, мутации, где Т в положении 966 заменен на С, мутации, где А в положении 1026 заменен на G, мутации, где G в положении 1029 заменен на С, мутации, где С в положении 1038 заменен на Т, мутации, где Т в положении 1047 заменен на С, мутации, где Т в положении 1053 заменен на С, мутации, где А в положении 1066 заменен на С, мутации, где А в положении 1068 заменен на С, мутации, где С в положении 1086 заменен на Т, и мутации, где Т в положении 1110 заменен на С, без ограничения указанными вариантами.The nucleotide sequence to be replaced in the nucleotide sequence of the gene encoding NSP1 and/or NSPl-beta strain LMY can be selected using the well-known SAVE (Synthetic Attenuated Virus Engineering) program, and preferably can be selected using the SAVE program developed by the authors of the present invention. Specifically, it may be a de-optimized nucleotide sequence obtained by analyzing the genetically highly stable region of NSP1 in the genome of the original LMY strain using the SAVE program developed by the authors of the present invention, followed by selection and replacement of part or all of the nucleotide sequence showing a relatively high preference for codon pairs (Codon Pair Bias, SRV). The deoptimized nucleotide sequence may contain, in the gene encoding the NSP1 protein of the LMY strain, consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11, one or more, 25 or more, 66 or more, 80 or more, or all of the 91 mutations selected from the group, consisting of a mutation where G at position 222 is replaced by C, a mutation where C at position 225 is replaced by A, a mutation where T at position 327 is replaced by C, a mutation where A at position 240 is replaced by T, a mutation where T at position 252 is replaced by C, mutations where A at position 306 is replaced by C, mutations where T at position 309 is replaced by C, mutations where G at position 312 is replaced by A, mutations where C at position 315 is replaced by A , mutations where T at position 324 is replaced by C, mutations where C at position 327 is replaced by G, mutations where G at position 330 is replaced by A, mutations where C at position 333 is replaced by T, mutations where C is at position 336 is replaced by G, mutations where T at position 339 is replaced by C, mutations where A at position 342 is replaced by T, mutations where T at position 345 is replaced by A, mutations where A at position 357 is replaced by G, mutations where T at position 363 is replaced by A, mutations where T at position 366 is replaced by C, mutations where C at position 378 is replaced by T, mutations where C at position 379 is replaced by A, mutations where C at position 381 is replaced by G, mutations where T at position 393 is replaced by C, mutations where T at position 396 is replaced by A , mutations where T at position 543 is replaced by C, mutations where T at position 546 is replaced by C, mutations where C at position 549 is replaced by A, mutations where T at position 555 is replaced by C, mutations where T in position 558 is replaced by C, mutations where T at position 561 is replaced by A, mutations where C at position 573 is replaced by T, mutations where T at position 579 is replaced by C, mutations where G at position 582 is replaced by T, mutations where T at position 588 is replaced by C, mutations where T at position 612 is replaced by C, mutations where G at position 618 is replaced by C, mutations where T at position 621 is replaced by C, mutations and where A at position 627 is replaced by T, mutations where T at position 633 is replaced by C, mutations where T at position 639 is replaced by G, mutations where C at position 654 is replaced by T, mutations where C at position 673 is replaced by T, mutations where C at position 675 is replaced by A, mutations where C at position 678 is replaced by T, mutations where C at position 681 is replaced by G, mutations where C at position 684 is replaced by G, mutations where G at position 705 is replaced by C, mutations where C at position 708 is replaced by T, mutations where A at position 729 is replaced by C, mutations where T at position 735 is replaced by C, mutations where G at position 738 replaced by T, mutations where T at position 741 is replaced by C, mutations where T at position 744 is replaced by C, mutations where T at position 747 is replaced by A, mutations where T at position 771 is replaced by C, mutations, where T at position 786 is replaced by C, mutations where C at position 789 is replaced by T, mutations where T at position 792 is replaced by G, mutations where C at position 810 is replaced by T, mutations where T is at position 825 is replaced by C, mutations where C at position 828 is replaced by T, mutations where T at position 838 is replaced by C, mutations where G at position 840 is replaced by C, mutations where C at position 846 is replaced by G, mutations where G at position 849 is replaced by A, mutations where A at position 858 is replaced by G, mutations where T at position 867 is replaced by C, mutations where T at position 879 is replaced by C, mutations where C at position 882 replaced by G, mutations where C at position 885 is replaced by T, mutations where C at position 891 is replaced by T, mutations where T at position 900 is replaced by C, mutations where C at position 903 is replaced by A, mutations where T at position 906 is replaced by C, mutations where G at position 924 is replaced by T, mutations where T at position 936 is replaced by C, mutations where T at position 939 is replaced by C, mutations where A is at position 948 replaced by C, mutations where A at position 954 is replaced by C, mutations where A at position 963 is replaced by T, mutations where T at position 966 is replaced by C, mutations where A at position 1026 replaced by G, mutations where G at position 1029 is replaced by C, mutations where C at position 1038 is replaced by T, mutations where T at position 1047 is replaced by C, mutations where T at position 1053 is replaced by C, mutations , where A at position 1066 is replaced by C, mutations where A at position 1068 is replaced by C, mutations where C at position 1086 is replaced by T, and mutations where T at position 1110 is replaced by C, without limitation to these options.
При использовании программы SAVE можно провести количественную оценку СРВ, представляющего собой предпочтение, формирующееся при образовании пар кодонов в вирусных генах, с использованием компьютерного алгоритма, и, поскольку пролиферативные свойства вируса уменьшаются при уменьшении показателя СРВ (деоптимизации) и его ослаблении (Virus Attenuation by Genome-Scale Changes in Codon Pair Bias, Science, 2008, J. Robert Coleman et al), ослабленный мутантный штамм LMY ver2, используемый для получения химерного вируса по настоящему изобретению, может быть получен заменой части нуклеотидной последовательности с высоким показателем СРВ на нуклеотидную последовательность с низким показателем СРВ или, предпочтительно, проведением молчащих мутаций в соответствии с принципом деоптимизации пар кодонов. Мутантный штамм LMY ver2 может содержать ген, кодирующий белок NSP1-бета, состоящий из нуклеотидной последовательности SEQ ID NO:6, или ген, кодирующий белок NSP1, состоящий из нуклеотидной последовательности SEQ ID NO: 12.Using the SAVE program, it is possible to quantify the CPV, which is a preference formed during the formation of codon pairs in viral genes, using a computer algorithm, and since the proliferative properties of the virus decrease with a decrease in the CPV index (deoptimization) and its weakening (Virus Attenuation by Genome -Scale Changes in Codon Pair Bias, Science, 2008, J. Robert Coleman et al), the attenuated LMY ver2 mutant strain used to produce the chimeric virus of the present invention can be obtained by replacing a portion of the nucleotide sequence with a high CRP score with a nucleotide sequence with a low CPV or, preferably, by conducting silent mutations in accordance with the principle of deoptimization of codon pairs. The LMY ver2 mutant strain may contain a gene encoding an NSP1-beta protein consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO:6 or a gene encoding an NSP1 protein consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO:12.
Кроме того, согласно настоящему изобретению, может быть предложена клетка, содержащая геном химерного PRRSV-вируса по настоящему изобретению. Клетка относится к клетке, трансфицированной геномом химерного вируса (ДНК, РНК или вектором, содержащим указанную ДНК или РНК) или химерным вирусом, содержащим указанный геном, для получения большого количества химерного вируса, и тип клетки не ограничен, если она соответствует поставленной задаче.In addition, according to the present invention, a cell containing the genome of the chimeric PRRSV virus of the present invention can be provided. A cell refers to a cell transfected with a chimeric virus genome (DNA, RNA, or a vector containing the specified DNA or RNA) or a chimeric virus containing the specified genome to obtain a large amount of the chimeric virus, and the cell type is not limited as long as it is suitable for the task.
Согласно одному примеру настоящего изобретения, может быть предложена вакцинная композиция от вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней, содержащая химерный PRRSV-вирус или его субкультивированное потомство.According to one example of the present invention, a porcine reproductive and respiratory syndrome virus vaccine composition comprising a chimeric PRRSV virus or subcultured progeny thereof can be provided.
Субкультивированное потомство может включать вирусное потомство, субкультивированное в 1-80 пассажах, 1-70 пассажах, 1-60 пассажах, 1-50 пассажах, 1-40 пассажах, 1-30 пассажах, 1-20 пассажах или 1-10 пассажах.Subcultured progeny may include viral progeny subcultured at passages 1-80, passages 1-70, passages 1-60, passages 1-50, passages 1-40, passages 1-30, passages 1-20, or passages 1-10.
Согласно одному примеру настоящего изобретения, вакцина может представлять собой живую вакцину или инактивированную вакцину, но, предпочтительно, она представляет собой живую вакцину. Конкретно, ослабленный химерный вирус PRRS, описанный здесь, может представлять собой модифицированную живую вакцину, содержащую один или более чем один из указанных выше вирусных штаммов в жизнеспособном состоянии в фармацевтически приемлемом носителе. Более того или альтернативно, для изготовления инактивированной вакцины может быть использован инактивированный вирус.According to one example of the present invention, the vaccine may be a live vaccine or an inactivated vaccine, but preferably it is a live vaccine. Specifically, the attenuated chimeric PRRS virus described herein may be a modified live vaccine containing one or more of the above viral strains in a viable state in a pharmaceutically acceptable carrier. Moreover, or alternatively, an inactivated virus can be used to make an inactivated vaccine.
Вакцина может дополнительно содержать одно или более, выбранное из группы, состоящей из носителей, разбавителей, эксципиентов и адъювантов. Тип фармацевтически приемлемого носителя не ограничен, но может включать все и любые растворители, дисперсионные среды, покрытия, стабилизаторы, консерванты, антибиотики и противогрибковые агенты, изотонические агенты, агенты, замедляющие всасывание, и тому подобное.The vaccine may further contain one or more selected from the group consisting of carriers, diluents, excipients and adjuvants. The type of pharmaceutically acceptable carrier is not limited, but may include any and all solvents, dispersion media, coatings, stabilizers, preservatives, antibiotics and antifungal agents, isotonic agents, absorption delaying agents, and the like.
С другой стороны, эффективная доза ослабленного химерного вируса по настоящему изобретению, присутствующая в вакцинной композиции, может представлять собой такое количество вируса, которое приводит или может привести к иммунному ответу у животного, которому вводят указанную эффективную дозу вируса. Эффективное количество может зависеть от компонентов вакцины и схемы введения. Доза вакцинной композиции может входить в диапазон от 2 до 6, предпочтительно от 3 до 4 цитопатических доз 50% (TCID50), и может варьировать в зависимости от типа субъекта, без ограничения указанными вариантами.On the other hand, an effective dose of an attenuated chimeric virus of the present invention present in a vaccine composition may be that amount of virus that results or can result in an immune response in an animal administered with said effective dose of virus. The effective amount may depend on the components of the vaccine and the administration schedule. The dose of the vaccine composition may range from 2 to 6, preferably 3 to 4 cytopathic doses of 50% (TCID 50 ), and may vary depending on the type of subject, without being limited to these options.
Геном химерного вируса LMY-BP2017 по настоящему изобретению и вакцинная композиция, содержащая указанный геном, могут быть использованы для предупреждения эффектов PRRS-заболевания у свиней. Кроме того, для предупреждения эффектов PRRS-заболевания у свиней могут быть использованы субъединицы, содержащие иммуногенные фрагменты или участки химерного вируса PRRS. Ослабленный химерный вирус по настоящему изобретению или вакцинная композиция, содержащая указанный вирус, могут быть введены профилактически до контакта свиньи со штаммом вируса PRRS, вызывающего PRRS, и могут быть введены свинье одновременно с контактом свиньи с таким штаммом вируса, и могут быть введены терапевтически после контакта рассматриваемой свиньи с таким штаммом вируса.The genome of the chimeric LMY-BP2017 virus of the present invention and the vaccine composition containing said genome can be used to prevent the effects of PRRS disease in pigs. In addition, subunits containing immunogenic fragments or regions of a chimeric PRRS virus can be used to prevent the effects of PRRS disease in pigs. The attenuated chimeric virus of the present invention, or a vaccine composition containing said virus, may be administered prophylactically prior to exposure of a pig to a strain of PRRS virus that causes PRRS, and may be administered to a pig simultaneously with exposure of a pig to such a virus strain, and may be administered therapeutically after exposure. the pig in question with that virus strain.
Вакцинная композиция, предложенная согласно настоящему изобретению, может быть использована для предупреждения репродуктивно-респираторного синдрома свиней (PRRS), например, для предупреждения PRRS, вызванного североамериканским типом PRRSV. В одном примере североамериканский тип PRRSV может представлять собой штамм вируса II-го типа VR2332.The vaccine composition of the present invention can be used to prevent porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS), for example, to prevent PRRS caused by the North American type of PRRSV. In one example, the North American type of PRRSV may be the type II virus strain VR2332.
Ослабленный химерный PRRSV-вирус по настоящему изобретению или вакцинная композиция, содержащая указанный вирус, могут быть введены посредством перорального, парентерального, подкожного, внутримышечного, внутрикожного, сублингвального, трансдермального, ректального введения, введения через слизистую оболочку, ингаляционного введения, исходя из площади поверхности, трансбуккального введения или их комбинаций. Кроме того, ослабленный химерный вирус PRRS может быть введен в форме имплантата, способного к длительному высвобождению ослабленного вируса.The attenuated chimeric PRRSV virus of the present invention or a vaccine composition containing said virus can be administered by oral, parenteral, subcutaneous, intramuscular, intradermal, sublingual, transdermal, rectal, mucosal, inhalation, based on surface area, buccal administration or combinations thereof. In addition, the attenuated chimeric PRRS virus may be administered in the form of an implant capable of sustained release of the attenuated virus.
Ослабленный химерный PRRSV-вирус по настоящему изобретению или вакцинная композиция, содержащая указанный вирус, могут быть введены инъекцией, ингаляцией или трансплантацией, и инъекция особенно предпочтительна. В зависимости от желаемого периода и эффективности вакцинации или лечения, ослабленный химерный PRRSV-вирус или вакцинную композицию, содержащую указанный вирус, можно вводить один или несколько раз и периодически, например, на протяжении нескольких суток, нескольких недель или нескольких месяцев, в разных дозах каждый день. Инъекционное введение может быть проведено инъекцией в желаемом количестве, или подкожной инъекцией, или распылением в носовой полости, или, альтернативно, непрерывной инъекцией.The attenuated chimeric PRRSV virus of the present invention or a vaccine composition containing said virus can be administered by injection, inhalation or transplantation, and injection is particularly preferred. Depending on the desired period and the effectiveness of vaccination or treatment, the attenuated chimeric PRRSV virus or a vaccine composition containing said virus can be administered one or more times and periodically, for example, over several days, several weeks or several months, at different doses each. day. Injection administration can be carried out by injection in the desired amount, or by subcutaneous injection, or by spraying into the nasal cavity, or, alternatively, by continuous injection.
Согласно одному примеру настоящего изобретения, химерный PRRSV-вирус по настоящему изобретению может представлять собой вирус, имеющий показатель TCID50, составляющий от 0,01 до 0,1 по сравнению с показателем TCID50 исходного штамма, который представляет собой показатель TCID50 вируса, измеренный приведением свиных альвеолярных макрофагов в контакт с химерным вирусом и его исходным штаммом (регистрационный номер в GenBank DQ473474.1.). Предпочтительно, измерение проводят после 2 суток и показатель TCID50 может составлять от 0,05 до 0,1. Химерный PRRSV-вирус по настоящему изобретению имеет показатель TCID50, меньше, чем у исходного штамма, меньшие пролиферативные свойства и является ослабленным.According to one example of the present invention, the chimeric PRRSV virus of the present invention may be a virus having a TCID 50 value of 0.01 to 0.1 compared to the TCID 50 value of the parent strain, which is the TCID 50 value of the virus measured bringing porcine alveolar macrophages into contact with the chimeric virus and its parent strain (GenBank accession number DQ473474.1.). Preferably, the measurement is taken after 2 days and the TCID 50 value may be between 0.05 and 0.1. The chimeric PRRSV virus of the present invention has a TCID 50 less than the parent strain, less proliferative properties, and is attenuated.
Кроме того, предложен вирус, где мутантный штамм имеет содержание нейтрализующих антител, измеренное введением химерного PRRSV-вируса по настоящему изобретению и его исходного штамма (регистрационный номер в GenBank DQ473474.1.) свинье, от 2 до 8 относительно исходного штамма, предпочтительно от 2 до 4. Измерение предпочтительно проводят через 28 суток. Нейтрализующее антитело означает антитело, обладающее нейтрализующей способностью против VR2332, типичного штамма североамериканского типа PRRSV. Соответственно, при введении ослабленного химерного вируса по настоящему изобретению или вакцинной композиции, содержащей указанный вирус, свинье у свиньи происходит увеличение титра нейтрализующих антител и экспрессии иммунных факторов, благодаря чему эффект иммунизации от PRRS может быть существенно увеличен.In addition, a virus is provided, wherein the mutant strain has a neutralizing antibody content, measured by introducing a chimeric PRRSV virus of the present invention and its parent strain (GenBank accession number DQ473474.1.) to a pig, from 2 to 8 relative to the parent strain, preferably from 2 up to 4. The measurement is preferably carried out after 28 days. Neutralizing antibody means an antibody having a neutralizing ability against VR2332, a representative strain of the North American type of PRRSV. Accordingly, when an attenuated chimeric virus of the present invention or a vaccine composition containing said virus is administered to a pig, the pig will experience an increase in neutralizing antibody titer and expression of immune factors, so that the effect of immunization against PRRS can be significantly increased.
Согласно одному конкретному примеру, показатель СРВ химерного PRRSV-вируса LMY+BP2017 по настоящему изобретению, описанного выше, меньше, чем у исходного штамма LMY (регистрационный номер в GenBank DQ473474.1.), и может предпочтительно составлять от -0,39 до 0, более предпочтительно от -0,35 до -0.20, подходящим образом от -0,35 до -0,26, например, -0,2393184052058128. При показателе СРВ менее -0,39 получение вируса затруднительно, а когда он превышает 0, проблема состоит в том, что его можно получить, но пролиферативные свойства не будут уменьшены и, таким образом, он не будет ослабленным. Соответственно, предпочтительно, чтобы ослабленный химерный вирус LMY+BP2017 по настоящему изобретению имел показатель СРВ, указанный выше.According to one specific example, the CPV value of the chimeric PRRSV virus LMY+BP2017 of the present invention described above is less than that of the parent LMY strain (GenBank accession number DQ473474.1.), and may preferably be from -0.39 to 0 , more preferably -0.35 to -0.20, suitably -0.35 to -0.26, for example -0.2393184052058128. When the CPV is less than -0.39, it is difficult to obtain a virus, and when it is greater than 0, the problem is that it can be obtained, but the proliferative properties will not be reduced and thus it will not be attenuated. Accordingly, it is preferable that the attenuated LMY+BP2017 chimeric virus of the present invention has a CPB value as indicated above.
Кроме того, согласно настоящему изобретению предложен химерный вирус LMY+BP2017, имеющий показатели CpG, Up А, составляющие от 1,0 до 3,0 относительно исходного штамма (регистрационный номер в GenBank DQ473474.L). Изменение отношения CpG, UpA является необходимым результатом деоптимизации, и увеличение показателей CpG, UpA эукариотических генов приводит к клеточному стрессу, и поэтому происходит уменьшение пролиферативных свойств вируса и, таким образом, возможно ослабление вируса. Химерный вирус LMY+BP2017 по настоящему изобретению имеет более высокие показатели CpG, UpA, чем исходный штамм, и, предпочтительно, его показатели больше в 1,0-3,0 раза, и, например, ослабленный химерный вирус по настоящему изобретению может иметь CpG 1,1753 и UpA 1,03.In addition, according to the present invention, a chimeric LMY+BP2017 virus is provided, having CpG, Up A values ranging from 1.0 to 3.0 relative to the original strain (GenBank registration number DQ473474.L). A change in the ratio of CpG, UpA is a necessary result of deoptimization, and an increase in the CpG, UpA of eukaryotic genes leads to cellular stress, and therefore there is a decrease in the proliferative properties of the virus and, thus, weakening of the virus is possible. The LMY+BP2017 chimeric virus of the present invention has higher CpG, UpA than the parent strain, and preferably 1.0 to 3.0 times greater, and for example, the attenuated chimeric virus of the present invention may have CpG 1.1753 and UpA 1.03.
Согласно одному примеру настоящего изобретения, предложен способ получения химерного вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней, включающий обработку генома мутантного штамма LMY ver2, имеющего регистрационный номер 13394 ВР, рестриктазами AscI и PacI с получением полинуклеотидного фрагмента, обработку генома мутантного штамма ВР2017-2, имеющего регистрационный номер KСТС 13393 ВР, рестриктазами AscI и PacI с получением полинуклеотидного фрагмента и рекомбинацию полинуклеотидного фрагмента LMY ver2 и полинуклеотидного фрагмента ВР2017-2 с получением инфекционного клона.According to one example of the present invention, a method for obtaining a chimeric porcine reproductive and respiratory syndrome virus is proposed, including processing the genome of the mutant strain LMY ver2, having the registration number 13394 BP, with AscI and PacI restrictases to obtain a polynucleotide fragment, processing the genome of the mutant strain BP2017-2, having the registration number KSTC number 13393 BP, restriction enzymes AscI and PacI to obtain a polynucleotide fragment and recombination of the LMY ver2 polynucleotide fragment and the BP2017-2 polynucleotide fragment to obtain an infectious clone.
Полинуклеотидный фрагмент, полученный обработкой генома мутантного штамма LMY ver2 рестриктазами AscI и PacI, может содержать область, кодирующую NSP1-бета.The polynucleotide fragment obtained by processing the genome of the LMY ver2 mutant strain with restriction enzymes AscI and PacI may contain a region encoding NSP1-beta.
Полинуклеотидный фрагмент, полученный обработкой генома мутантного штамма ВР2017-2 рестриктазами AscI и PacI, может содержать области ORF2-ORF7.The polynucleotide fragment obtained by processing the genome of the mutant strain BP2017-2 with restriction enzymes AscI and PacI may contain ORF2-ORF7 regions.
При рекомбинации фрагментов может быть использована лигаза, и химерный вирус может быть получен введением полученного инфекционного клона в клетку.When recombining the fragments, a ligase can be used, and a chimeric virus can be obtained by introducing the resulting infectious clone into a cell.
Клетка обозначает клетку, трансфицированную с использованием ДНК или РНК химерного вируса или вектором, содержащим указанную ДНК или РНК, инфекционным клоном или химерным вирусом, для получения большого количества химерного вируса, и тип клетки не ограничен.Cell refers to a cell transfected with a DNA or RNA of a chimeric virus or a vector containing said DNA or RNA, an infectious clone or a chimeric virus to obtain a large amount of the chimeric virus, and the cell type is not limited.
Кроме того, согласно одному примеру настоящего изобретения может быть предложена композиция для предупреждения или лечения вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней, содержащая указанную вакцинную композицию.In addition, according to one example of the present invention, a composition for the prevention or treatment of porcine reproductive and respiratory syndrome virus containing the specified vaccine composition can be provided.
В предпочтительной форме композиция для предупреждения или лечения вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней по настоящему изобретению может содержать дополнительный компонент, известный специалистам в данной области, и может дополнительно содержать подходящие носители, эксципиенты и разбавители, обычно используемые для изготовления фармацевтической композиции.In a preferred form, the composition for the prevention or treatment of porcine reproductive and respiratory syndrome virus of the present invention may contain an additional component known to those skilled in the art, and may additionally contain suitable carriers, excipients and diluents commonly used for the manufacture of a pharmaceutical composition.
Более того, она может быть использована как изготовленная в форме для перорального введения, такой как порошки, гранулы, таблетки, капсулы, суспензия, эмульсия, сироп, аэрозоли и тому подобное, препарата для наружного применения, суппозитория и стерильного раствора для инъекций. Предпочтительно использование подходящей композиции, известной в данной области, как раскрыто в соответствующем документе (Remington's Pharmaceutical Science, recently, Mack Publishing Company, Easton PA).Moreover, it can be used as an oral administration form such as powders, granules, tablets, capsules, suspension, emulsion, syrup, aerosols and the like, an external preparation, a suppository and a sterile injection. Preferably, the use of a suitable composition known in the art, as disclosed in the relevant document (Remington's Pharmaceutical Science, recently, Mack Publishing Company, Easton PA).
Носители, эксципиенты и разбавители, которые могут быть включены в фармацевтическую композицию по настоящему изобретению, включают лактозу, декстрозу, сахарозу, сорбит, маннит, ксилит, эритрит, мальтит, крахмал, аравийскую камедь, альгинат, желатин, фосфат кальция, силикат кальция, целлюлозу, метилцеллюлозу, микрокристаллическую целлюлозу, поливинилпирролидон, воду, метилгидроксибензоат, пропилгидроксибензоат, тальк, стеарат магния и минеральное масло. При изготовлении композиции она может быть изготовлена с использованием разбавителя или эксципиента, такого как наполнитель, разбавитель, связывающий агент, увлажняющий агент, разрыхлитель, поверхностно-активное вещество и тому подобное. Твердые композиции для перорального введения включают таблетки, пилюли, порошок, гранулы, капсулы и тому подобное, и эти твердые композиции изготавливают смешиванием по меньшей мере одного эксципиента, например, крахмала, карбоната кальция, сахарозы, лактозы, желатина и тому подобного, с композицией. Кроме того, в дополнение к простому эксципиенту, смазывающий агент, такой как стеарат магния и тальк. Жидкие композиции для перорального введения включают суспензию, жидкость для перорального введения, эмульсию, сироп и тому подобное, и, в дополнение к обычно используемым простым разбавителям, воде и жидкому парафину, могут содержать различные эксципиенты, например, увлажняющий агент, подсластитель, ароматизатор, консервант и тому подобное. Композиции для парентерального введения включают стерильный водный раствор, неводные растворители, суспензию, эмульсию, лиофилизированные композиции и суппозитории. В качестве неводного растворителя и суспензии могут быть использованы пропиленгликоль, полиэтиленгликоль, растительное масло, такое как оливковое масло, сложный эфир, подходящий для инъекционного введения, такой как этилолеат, и тому подобное. В качестве основы суппозиториев могут быть использованы Витепсол, Макрогол, Tween 61, масло какао, лаурин (laurinum), глицерожелатин и тому подобное.Carriers, excipients and diluents that may be included in the pharmaceutical composition of the present invention include lactose, dextrose, sucrose, sorbitol, mannitol, xylitol, erythritol, maltitol, starch, gum arabic, alginate, gelatin, calcium phosphate, calcium silicate, cellulose , methylcellulose, microcrystalline cellulose, polyvinylpyrrolidone, water, methylhydroxybenzoate, propylhydroxybenzoate, talc, magnesium stearate and mineral oil. In making the composition, it may be made using a diluent or excipient such as a filler, diluent, binder, wetting agent, disintegrant, surfactant, and the like. Solid compositions for oral administration include tablets, pills, powder, granules, capsules, and the like, and these solid compositions are made by mixing at least one excipient, for example, starch, calcium carbonate, sucrose, lactose, gelatin, and the like, with the composition. In addition, in addition to a simple excipient, a lubricating agent such as magnesium stearate and talc. Liquid compositions for oral administration include suspension, oral liquid, emulsion, syrup, and the like, and, in addition to commonly used simple diluents, water, and liquid paraffin, may contain various excipients, for example, wetting agent, sweetener, flavoring agent, preservative. etc. Compositions for parenteral administration include sterile aqueous solution, non-aqueous solvents, suspension, emulsion, lyophilized compositions and suppositories. As the non-aqueous solvent and suspension, propylene glycol, polyethylene glycol, vegetable oil such as olive oil, an injectable ester such as ethyl oleate, and the like can be used. Witepsol, Macrogol, Tween 61, cocoa butter, laurin (laurinum), glycerogelatin and the like can be used as the basis of suppositories.
Предпочтительная доза композиции по настоящему изобретению варьирует в зависимости от состояния и массы тела субъекта, тяжести заболевания, лекарственной формы и пути и периода введения, но может быть подходящим образом выбрана специалистами в данной области. Например, для предпочтительного эффекта, композицию по настоящему изобретению можно вводить в количестве от 0,0001 до 1000 мг/кг (массы тела) в сутки. Введение композиции можно проводить один раз в сутки или разделять на несколько раз.The preferred dosage of the composition of the present invention varies depending on the condition and body weight of the subject, the severity of the disease, the dosage form, and the route and period of administration, but may be suitably selected by those skilled in the art. For example, for a preferred effect, the composition of the present invention can be administered in an amount of 0.0001 to 1000 mg/kg (body weight) per day. The introduction of the composition can be carried out once a day or divided into several times.
Композиция по настоящему изобретению может быть введена субъекту различными способами. Можно предполагать любые способы введения.The composition of the present invention may be administered to a subject in a variety of ways. Any route of administration may be contemplated.
Согласно другому примеру настоящего изобретения, может быть предложен способ предупреждения или лечения репродуктивно-респираторного синдрома свиней, включающий введение свинье вакцинной композиции по настоящему изобретению.According to another example of the present invention, a method for preventing or treating porcine reproductive and respiratory syndrome can be provided, comprising administering to a pig a vaccine composition of the present invention.
Введение вакцинной композиции, содержащей геном химерного вируса по настоящему изобретению, свинье позволяет усилить иммунный ответ свиньи на антигены PRRSV и, благодаря усилению иммунного ответа свиньи на антигены PRRSV, может быть предложен способ предупреждения или лечения репродуктивно-респираторного синдрома свиней. Предпочтительно, он может происходить предупреждение.Administration of a vaccine composition containing the genome of the chimeric virus of the present invention to a pig can enhance the pig's immune response to PRRSV antigens, and by enhancing the pig's immune response to PRRSV antigens, a method for preventing or treating porcine reproductive and respiratory syndrome can be provided. Preferably, it may occur a warning.
Конкретно, способ может включать введение композиции подкожной инъекцией, внутривенной инъекцией, внутрикожной инъекцией, парентеральной инъекцией, внутримышечной инъекцией, безыгольной инъекцией, электропорацией, посредством пероральной доставки, интраназальной доставки, ороназальной доставки или любой их комбинацией.Specifically, the method may include administering the composition by subcutaneous injection, intravenous injection, intradermal injection, parenteral injection, intramuscular injection, needleless injection, electroporation, oral delivery, intranasal delivery, oronasal delivery, or any combination thereof.
Согласно настоящему изобретению, может быть предложен набор для осуществления любого из указанных выше способов. Данный набор может содержать контейнер, вакцинную композицию, предпочтительно содержащую ослабленный химерный вирус PRRS по настоящему изобретению, фармацевтически приемлемый носитель, адъювант и инструкции по введению иммуногенной композиции животному, нуждающемуся в этом, для уменьшения клинических признаков или эффектов PRRS-инфекции, предпочтительно частоты или тяжести PRRS. Набор может также содержать средства для проведения инъекции и/или других типы средств для введения. Кроме того, набор может содержать растворитель. Ослабленная вакцина может быть лиофилизирована и восстановлена растворителем с получением раствора для инъекции и/или ингаляции. Растворитель может представлять собой воду, физиологический раствор, буферный раствор или усиливающий растворитель. Набор может содержать отдельные контейнеры, содержащие ослабленный вирус, растворитель и/или фармацевтически приемлемый носитель. Инструкции могут представлять собой этикетки и/или распечатанные инструкции, прикрепленные к одному или более чем к одному контейнеру.According to the present invention, a kit may be provided for carrying out any of the above methods. This kit may contain a container, a vaccine composition preferably containing an attenuated chimeric PRRS virus of the present invention, a pharmaceutically acceptable carrier, an adjuvant, and instructions for administering the immunogenic composition to an animal in need thereof to reduce the clinical signs or effects of PRRS infection, preferably the frequency or severity PRRS. The kit may also contain means for injection and/or other types of means for administration. In addition, the kit may contain a solvent. The attenuated vaccine may be lyophilized and reconstituted with a solvent to form a solution for injection and/or inhalation. The solvent may be water, saline, buffer, or enhancement solvent. The kit may contain separate containers containing the attenuated virus, diluent and/or pharmaceutically acceptable carrier. The instructions may be labels and/or printed instructions attached to one or more containers.
Полезные эффектыUseful effects
Химерный PRRSV-вирус по настоящему изобретению может быть использован для эффективного предупреждения PRRS, существенно усиливая секрецию нейтрализующих антител при его введении свиньям, и может быть полезным образом использован в качестве вакцины для лечения PRRS.The chimeric PRRSV virus of the present invention can be used to effectively prevent PRRS by substantially enhancing the secretion of neutralizing antibodies when administered to pigs, and can be usefully used as a vaccine for the treatment of PRRS.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ГРАФИЧЕСКИХ МАТЕРИАЛОВBRIEF DESCRIPTION OF GRAPHICS
На ФИГ. 1 показана общая геномная структура вируса PRRS.FIG. 1 shows the general genomic structure of the PRRS virus.
На ФИГ. 2 представлено схематическое изображение, на котором показана геномная структура химерного вируса LMY+BP2017, синтезированного вырезанием части клона вируса LMY ver2 и вируса ВР2017-2, соответственно, и их лигированием.FIG. 2 is a schematic diagram showing the genomic structure of a chimeric LMY+BP2017 virus synthesized by excising part of a clone of the LMY ver2 virus and the BP2017-2 virus, respectively, and ligating them.
На ФИГ. 3 показано филогенетическое дерево PRRSV-вируса LMY ver2 и химерного вируса LMY+BP2017.FIG. 3 shows the phylogenetic tree of the PRRSV virus LMY ver2 and the chimeric virus LMY+BP2017.
На ФИГ. 4 показаны различия пролиферативных свойств PRRSV-вируса LMY ver2 и химерного вируса LMY+BP2017 в свиных альвеолярных макрофагах (РАМ-клетках).FIG. 4 shows the differences in the proliferative properties of PRRSV virus LMY ver2 and chimeric virus LMY+BP2017 in porcine alveolar macrophages (PAM cells).
На ФИГ. 5 приведено сравнение различий секреции нейтрализующих антител после введения свиньям PRRSV LMY, химерного вируса LMY+BP2017 и фосфатно-солевого буферного раствора (PBS).FIG. Figure 5 compares differences in neutralizing antibody secretion after administration of PRRSV LMY, LMY+BP2017 chimeric virus, and phosphate buffered saline (PBS) to pigs.
ВАРИАНТ ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ ИЗОБРЕТЕНИЯEMBODIMENT OF THE INVENTION
Далее настоящее изобретение будет описано подробно посредством примеров. Тем не менее, последующие примеры приведены лишь для пояснения настоящего изобретения, и настоящее изобретение не ограничено последующими примерами.Hereinafter, the present invention will be described in detail by way of examples. However, the following examples are provided only to explain the present invention, and the present invention is not limited to the following examples.
Поскольку РНК легко разрушается, после проведения всех действий посредством ее преобразования в ДНК клетки трансфицировали, синтезируя РНК из полученной ДНК.Since RNA is easily degraded, after all the actions were carried out by converting it into DNA, the cells were transfected, synthesizing RNA from the resulting DNA.
Пример 1: Получение химерного вируса 1-1.Example 1: Obtaining a chimeric virus 1-1.
Конструирование химерного вирусаConstruction of a chimeric virus
Был сконструирован химерный вирус PRRS, содержащий область неструктурного белка (неструктурный белок 1-го типа, NSP1; SEQ ID NO: 11) мутантного штамма штамма LMY и областей ORF2, ORF3, ORF4, ORF5, ORF6 и ORF7 ВР2017-2, выделенного в 2017 г.A chimeric PRRS virus was constructed containing a non-structural protein region (
1-2. Получение ослабленного мутантного штамма LMY1-2. Obtaining an attenuated mutant strain of LMY
Мутантный штамм LMY ver2 был получен заменой 91 основания нуклеотидной последовательности гена области NSP1 с использованием штамма LMY (регистрационный номер в GenBank DQ473474.1.), представляющего собой PRRS-штамм, выделенный традиционным Агентством по карантину. В гене области NSP1 были заменены 25 оснований области NSP1-альфа и 66 оснований области NSP1-бета.The LMY ver2 mutant strain was obtained by replacing the 91 bases of the nucleotide sequence of the NSP1 region gene using the LMY strain (GenBank accession number DQ473474.1.), which is a PRRS strain isolated by the traditional Quarantine Agency. In the NSP1 region gene, 25 bases of the NSP1-alpha region and 66 bases of the NSP1-beta region were replaced.
Конкретно, рекомбинантный штамм LMY ver2 был получен посредством молчащей мутации части нуклеотидной последовательности в соответствии с принципом деоптимизации пар кодонов (Таблица 3) с применением общеизвестной программы SAVE (Synthetic Attenuated Virus Engineering [конструирование синтетических ослабленных вирусов]) или программы SAVE (Synthetic Attenuated Virus Engineering), разработанной авторами настоящего изобретения. Сначала программу SAVE использовали для количественной оценки показателя СРВ (предпочтения пар кодонов), представляющего собой предпочтение, формирующееся при взаимодействии кодонов гена вируса LMY, когда происходит образование их пар, с применением компьютерного алгоритма. Показатель СРВ изменяется при замене некоторых нуклеотидных последовательностей генов вируса LMY на другие нуклеотидные последовательности и тесно связан с пролиферативными свойствами вируса. Пролиферативные свойства вируса уменьшаются и ослабевают при деоптимизации показателя СРВ посредством замен в нуклеотидной последовательности (Virus Attenuation by Genome-Scale Changes in Codon Pair Bias, Science, 2008, J. Robert Coleman et al.). Авторы настоящего изобретения выбрали область NSP1 (NSP1-альфа и NSP1-бета, SEQ ID NO: 11) с высокой генетической стабильностью в геноме исходного штамма LMY, проанализировали ее программой SAVE и выбрали 25 оснований в области NSP1-альфа и 66 в области NSP1-бета, в общей сложности 91 основание, из областей оснований с относительно высокими показателями СРВ для получения мутантного штамма вируса LMY. Мутантный штамм вируса LMY с мутацией 91 нуклеотида в последовательности NSP1 (SEQ ID NO: 12), полученный описанным методом, был назван LMY ver2, и его нуклеотидная последовательность показана в Таблице 3 ниже. LMY ver2 имеет регистрационный номер 13394 ВР.Specifically, the recombinant LMY ver2 strain was obtained by silently mutating a portion of the nucleotide sequence according to the principle of codon pair deoptimization (Table 3) using the well-known SAVE (Synthetic Attenuated Virus Engineering) program or the SAVE (Synthetic Attenuated Virus Engineering) program. ) developed by the authors of the present invention. First, the SAVE program was used to quantify the CPW (Codon Pair Preference), which is a preference formed by the codon interaction of the LMY gene when they are paired, using a computer algorithm. The CRV index changes when some nucleotide sequences of the LMY virus genes are replaced with other nucleotide sequences and is closely related to the proliferative properties of the virus. The proliferative properties of the virus are reduced and weakened by deoptimization of the CPB index through substitutions in the nucleotide sequence (Virus Attenuation by Genome-Scale Changes in Codon Pair Bias, Science, 2008, J. Robert Coleman et al.). The present inventors selected an NSP1 region (NSP1-alpha and NSP1-beta, SEQ ID NO: 11) with high genetic stability in the genome of the original LMY strain, analyzed it with the SAVE program, and selected 25 bases in the NSP1-alpha region and 66 bases in the NSP1- beta, a total of 91 bases, from base regions with relatively high CPB values to obtain a mutant strain of the LMY virus. A mutant strain of LMY virus with a 91 nucleotide mutation in the sequence of NSP1 (SEQ ID NO: 12) obtained by the described method was named LMY ver2, and its nucleotide sequence is shown in Table 3 below. LMY ver2 has registration number 13394 BP.
(В Таблице 3 участки последовательностей гена NSP1 LMY ver2, выделенные подчеркнутым полужирным шрифтом, представляют собой участки с мутациями оснований гена NSP1 LMY или гена NSP1-бета LMY.)(In Table 3, regions of the NSP1 LMY ver2 gene sequences highlighted in bold underlined characters represent regions with base mutations in the NSP1 LMY gene or the NSP1-beta LMY gene.)
Затем, для подтверждения степени ослабления мутантного штамма LMY ver2 измеряли показатель СРВ. Измеренный показатель СРВ NSP1 исходного штамма LMY составлял приблизительно 0,0139, и измеренный показатель СРВ NSP1-бета составлял приблизительно 0,016, но измеренный показатель СРВ мутантного штамма LMY ver2 по настоящему изобретению составлял приблизительно -0,2393 для NSP1 и приблизительно -0,33 для NSP1-бета. Исходя из этого был сделан вывод об уменьшении пролиферативных свойств мутантного штамма LMY ver2 по настоящему изобретению в сравнении с традиционным исходным штаммом и о том, что данный штамм является ослабленным.Then, to confirm the degree of attenuation of the LMY ver2 mutant strain, the CRP was measured. The measured CPV of NSP1 of the original LMY strain was approximately 0.0139 and the measured CPB of NSP1-beta was approximately 0.016, but the measured CPB of the LMY ver2 mutant strain of the present invention was approximately -0.2393 for NSP1 and approximately -0.33 for NSP1-beta. Based on this, it was concluded that the mutant strain LMY ver2 of the present invention decreased in proliferative properties compared to the traditional parent strain and that this strain is attenuated.
Затем получали инфекционный клон LMY ver2.Then received infectious clone LMY ver2.
Сначала проводили разделение полноразмерной генной последовательности штамма LMY (регистрационный номер в GenBank DQ473474.1.) на 7 фрагментов и их синтез, соответственно. Из этих 7 фрагментов фрагмент 1 представлял собой область NSP1, и эту область синтезировали как фрагмент ДНК (SEQ ID NO: 12) с заменой 91 основания в генной нуклеотидной последовательности области NSP1 штамма LMY. Синтезированный генный фрагмент последовательно разрезали рестриктазами, показанными в Таблице 5 ниже, и лигировали лигазой с получением одного инфекционного клона.First, the full-length gene sequence of the LMY strain (registration number in GenBank DQ473474.1.) was divided into 7 fragments and synthesized, respectively. Of these 7 fragments,
1-3. Конструирование химерного вирусного клона1-3. Construction of a chimeric viral clone
Согласно схематическому изображению на ФИГ. 1, вирус PRRS содержит в общей сложности 8 ORF, а именно ORF1a, ORF1b и ORF2-7.According to the schematic representation in FIG. 1, the PRRS virus contains a total of 8 ORFs, namely ORF1a, ORF1b and ORF2-7.
Из геномной области, содержащей полноразмерный структурный ген мутантного штамма LMY ver2, амплифицированный в Примере 1-1, области ORF2-ORF7 вырезали с использованием рестриктаз AscI и PacI. Затем геномную область штамма ВР2017, тот ее участок, который соответствует областям ORF2-ORF7 мутантного штамма LMY ver2, разрезали теми же рестриктазами AscI и PacI, и после этого участок ORF1a и ORF1b мутантного штамма LMY ver2 и участок, соответствующий областям ORF2-ORF7 штамма ВР2017, лигировали лигазой с получением рекомбинантного инфекционного клона, названного LMY+BP2017. Использованные рестриктазы показаны в Таблице 6 ниже.From the genomic region containing the full-length structural gene of the LMY mutant strain ver2 amplified in Example 1-1, the ORF2-ORF7 regions were excised using AscI and PacI restriction enzymes. Then, the genomic region of the BP2017 strain, that region corresponding to the regions of ORF2-ORF7 of the mutant strain LMY ver2, was cut with the same restrictases AscI and PacI, and then the region of ORF1a and ORF1b of the mutant strain LMY ver2 and the region corresponding to the regions of ORF2-ORF7 of the strain BP2017 , were ligated with ligase to obtain a recombinant infectious clone named LMY+BP2017. The restriction enzymes used are shown in Table 6 below.
Готовый инфекционный клон вводили в вектор с большим числом копий, в который были введены промотор CMV и ген устойчивости к ампициллину, затем трансфицировали им клетки ВНК (Корейский банк клеточных линий) с использованием липофектамина и в результате получали химерный вирус LMY+BP2017 по настоящему изобретению.The finished infectious clone was introduced into a high copy number vector into which the CMV promoter and ampicillin resistance gene were introduced, and then transfected with BHK (Korean Cell Line Bank) cells using lipofectamine, and as a result, the chimeric LMY+BP2017 virus of the present invention was obtained.
Химерный вирус LMY+BP2017 был депонирован в Микробном ресурсном центре Корейского исследовательского института биологических наук и биотехнологии (Microbial Resource Center of Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) 24 октября 2018 г. с присвоением регистрационного номера KCTC13675 ВР.The LMY+BP2017 chimeric virus was deposited at the Microbial Resource Center of Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology on October 24, 2018 with registration number KCTC13675 BP.
Пример 2. Измерение показателей CpG и UpA химерного вируса LMY+BP2017Example 2 Measurement of CpG and UpA of LMY+BP2017 chimeric virus
Для оценки пролиферативных свойств химерного вируса LMY+BP2017, полученного в Примере 1, измеряли отношения CpG и UpA гена NSP1 химерного вируса LMY+BP2017 и показатели CpG и UpA гена NSP1-бета исходного штамма LMY.To assess the proliferative properties of the LMY+BP2017 chimeric virus obtained in Example 1, the CpG and UpA ratios of the NSP1 gene of the LMY+BP2017 chimeric virus and the CpG and UpA values of the NSP1-beta gene of the original LMY strain were measured.
Изменение отношений CpG и UpA вирусного гена является неизбежным результатом деоптимизации, и увеличение показателей CpG и UpA данного гена приводит к клеточному стрессу и уменьшению пролиферативных свойств вируса. Отношения CpG и UpA гена NSP1-бета химерного вируса LMY+BP2017 и вируса LMY измеряли с использованием программы SSE (версии 1.2), и полученные результаты показаны в Таблице 7 ниже.A change in the CpG and UpA ratios of the viral gene is an inevitable result of deoptimization, and an increase in the CpG and UpA values of this gene leads to cellular stress and a decrease in the proliferative properties of the virus. The ratios of CpG and UpA of the NSP1-beta gene of the LMY+BP2017 chimeric virus and the LMY virus were measured using the SSE program (version 1.2) and the results are shown in Table 7 below.
Как показано в Таблице 7, было подтверждено, что показатели CpG и UpA химерного вируса LMY+BP2017 увеличивались по сравнению с исходным штаммом LMY, и, исходя из этого, удалось подтвердить значительное уменьшение пролиферативных свойств химерного вируса LMY+BP2017 по сравнению с исходным штаммом LMY.As shown in Table 7, it was confirmed that the CpG and UpA of the LMY+BP2017 chimeric virus were increased compared to the original LMY strain, and based on this, it was possible to confirm a significant decrease in the proliferative properties of the LMY+BP2017 chimeric virus compared to the original LMY strain. .
Пример 3. Идентификация химерного штамма LMY+BP2017 3-1. Идентификация химерного штамма LMY+BP2017Example 3. Identification of the chimeric strain LMY+BP2017 3-1. Identification of the chimeric strain LMY+BP2017
Для идентификации химерного штамма LMY+BP2017 секвенировали области NSP1 химерного штамма LMY+BP2017, синтезированного в Примере 1, и штамма LMY (регистрационный номер в GenBank DQ473474.1.).To identify the chimeric strain LMY+BP2017, the NSP1 regions of the chimeric strain LMY+BP2017 synthesized in Example 1 and the LMY strain (GenBank accession number DQ473474.1.) were sequenced.
Конкретно, ПЦР проводили с использованием набора праймеров, приведенных в Таблице 8, позволяющего выявлять 1-1654 нуклеотиды, включая область NSP1, вируса LMY и набор для одностадийной ОТ-ПЦР (Intron) и, конкретно, после начальной ОТ при 45°С на протяжении 30 минут и 95°С на протяжении 5 минут, реакцию проводили при 94°С на протяжении 30 секунд, при 61°С на протяжении 30 секунд и при 72°С на протяжении 2 минут, повторяя этот цикл 38 раз. Затем продукты, амплифицированные в результате ПЦР, секвенировали, завершая идентификацию каждого штамма.Specifically, PCR was performed using the primer set shown in Table 8, allowing detection of 1-1654 nucleotides, including the NSP1 region, of the LMY virus and a one-step RT-PCR kit (Intron) and, specifically, after an initial RT at 45°C for 30 minutes and 95°C for 5 minutes, the reaction was carried out at 94°C for 30 seconds, at 61°C for 30 seconds and at 72°C for 2 minutes, repeating this cycle 38 times. The PCR amplified products were then sequenced, completing the identification of each strain.
3-2. Сравнение гомологии с другими штаммами и филогенетическое дерево3-2. Comparison of homology with other strains and phylogenetic tree
Для подтверждения генетических различий между рекомбинантным вирусным штаммом LMYver2 по настоящему изобретению, полученным в Примере 1, и известным штаммом вируса PRRS измеряли идентичность последовательностей каждого штамма в области NSP1 с использованием программы Bio Edit, и результаты сравнения гомологии показаны в Таблице 9.To confirm genetic differences between the recombinant LMYver2 virus strain of the present invention obtained in Example 1 and the known PRRS virus strain, the sequence identity of each strain in the NSP1 region was measured using the Bio Edit program, and the homology comparison results are shown in Table 9.
Как показано в Таблице 9, из результатов сравнения гомологии видно, что химерный вирус LMY+BP имеет уникальную последовательность, отличающуюся от других PRRS-штаммов.As shown in Table 9, it can be seen from the results of the homology comparison that the LMY+BP chimeric virus has a unique sequence different from other PRRS strains.
Исходя из результатов сравнения гомологии, анализировали филогенетическое дерево с использованием программы BioEdit, повторяя анализ («Bootstrap») 1000 раз. На основании этого было построено приблизительное филогенетическое дерево химерного вируса LMY+BP2017 и LMY, показанное на ФИГ. 3. Исходя из филогенетического дерева, представленного на ФИГ. 3, можно определить систематическое положение настоящего вируса.Based on the homology comparison results, a phylogenetic tree was analyzed using the BioEdit program, repeating the analysis ("Bootstrap") 1000 times. Based on this, an approximate phylogenetic tree of the chimeric virus LMY+BP2017 and LMY was constructed, shown in FIG. 3. Based on the phylogenetic tree shown in FIG. 3, the systematic position of the present virus can be determined.
3-3. Исследование клеточного пассажа3-3. Cell passage study
Было проведено подтверждение продолжительности сохранения модифицированной области при пассаже химерного вируса LMY+BP2017, полученного в Примере 1. Химерный вирус LMY+BP2017 по настоящему изобретению стабилизировали 30-кратным пассажем в клетках MARC-145, являющихся известной клеточной линией, восприимчивой к вирусу PRRS, и для подтверждения мутаций гена каждые 10 пассажей проводили секвенирование с применением того же метода, что в Примере 3-1.The persistence of the modified region during passage of the LMY+BP2017 chimeric virus obtained in Example 1 was confirmed. to confirm gene mutations, sequencing was performed every 10 passages using the same method as in Example 3-1.
В результате подтверждающего секвенирования было подтверждено, что область замен в гене настоящего вируса оставалась неизменной даже после стабилизации 30 пассажами. В Таблице 10 ниже показаны число мутаций оснований (изменения нуклеотидов), сайты мутаций и аминокислотные мутации (изменения аминокислот) после каждого числа пассажей.As a result of confirmatory sequencing, it was confirmed that the region of substitutions in the gene of the present virus remained unchanged even after stabilization by 30 passages. Table 10 below shows the number of base mutations (nucleotide changes), mutation sites, and amino acid mutations (amino acid changes) after each number of passages.
Как подтверждено в Таблице 10, даже при проведении более чем 30 пассажей мутации генов NSP1a или NSP1b ORF1a оставались неизменными и были выявлены только мутации белка NSP2 или ORF2a. Таким образом, было подтверждено сохранение мутаций гена, кодирующего белок NSP1, у вируса, полученного в Примере 1, даже после 40 пассажей.As confirmed in Table 10, even after more than 30 passages, the NSP1a or NSP1b ORF1a gene mutations remained unchanged and only NSP2 or ORF2a protein mutations were detected. Thus, the persistence of mutations in the gene encoding the NSP1 protein in the virus obtained in Example 1 was confirmed even after 40 passages.
Пример 4: Сравнение пролиферативных свойств LMY и химерного LMY+BPExample 4: Comparison of proliferative properties of LMY and chimeric LMY+BP
Для подтверждения пролиферативных свойств химерного вируса LMY+BP2017, полученного в Примере 1, количество вируса, полученного после приведения макрофагов (РАМ, Porcine Alveolar Macrophage [свиной альвеолярный макрофаг]) в контакт с химерным вирусом LMY+BP2017 и его исходным штаммом, подтверждали, измеряя TCID50.To confirm the proliferative properties of the LMY+BP2017 chimeric virus obtained in Example 1, the amount of virus obtained after bringing macrophages (PAM, Porcine Alveolar Macrophage [porcine alveolar macrophage]) into contact with the LMY+BP2017 chimeric virus and its parental strain was confirmed by measuring TCID 50 .
Конкретно, РАМ-клетки аликвотировали по 2×106 клеток на лунку в 6-луночном планшете, содержавшем 2 мл среды RPMI (содержавшей 10% фетальной бычьей сыворотки (FBS), 1% пенициллина и стрептомицина). Затем вносили LMY и химерный вирус LMY+BP2017 в разные лунки, соответственно, при отношении MOI 0,01, через 1 час после внесения весь супернатант удаляли и аликвотировали по 2 мл раствора поддерживающей среды RPMI (содержавшей 10% FBS, 1% пенициллина и стрептомицина). Через 2 суток после аликвотирования собирали супернатант из каждой лунки и измеряли TCID50. Применительно к клеткам, использованным в последующем эксперименте, клетки MARC-145 сорбировали на лунки 96-луночного планшета по 2×105 клеток на лунку аликвотированием со 100 мкл среды Игла, модифицированной по способу Дульбекко (DMEM) (10% (об./об.) FBS, 1% (масс./об.) пенициллина, стрептомицин) заранее, за день до измерения TCID50.Specifically, PAM cells were aliquoted at 2×10 6 cells per well in a 6-well plate containing 2 ml of RPMI medium (containing 10% fetal bovine serum (FBS), 1% penicillin and streptomycin). LMY and LMY+BP2017 chimeric virus were then added to different wells, respectively, at an MOI ratio of 0.01, 1 hour after the addition, the entire supernatant was removed and aliquoted with 2 ml of RPMI maintenance medium solution (containing 10% FBS, 1% penicillin and streptomycin ). Two days after aliquoting, the supernatant was collected from each well and the TCID 50 was measured. For the cells used in the subsequent experiment, MARC-145 cells were adsorbed to the wells of a 96-well plate at 2×10 5 cells per well by aliquoting with 100 μl of Dulbecco's Modified Eagle's Medium (DMEM) (10% (v/v .) FBS, 1% (w/v) penicillin, streptomycin) in advance, the day before the TCID 50 measurement.
Вносимый вирус подготавливали следующим образом. В крайнюю левую лунку ряда 96-луночного планшета аликвотировали 200 мкл супернатанта, собранного заранее, а в другие лунки аликвотировали по 180 мкл среды DMEM (FBS без добавления антибиотиков). Затем с использованием мультипипетки из каждой лунки, начиная слева, отбирали по 20 мкл и проводили десятикратное разведение, аликвотируя их в лунку справа. Разведение проводили последовательно, меняя наконечники, и последнюю 12-ю лунку оставляли как отрицательный контроль. Полученный разведенный раствор вируса вносили в планшет, на который были сорбированы клетки MARC-145. Затем весь культуральный раствор клеток MARC-145 удаляли, в каждую лунку аликвотировали по 200 мкл PBS и удаляли его, повторяя промывку 3 раза. После этого вносили полученный раствор вируса, аликвотируя по 100 мкл в каждую лунку, и через 2 часа после внесения весть внесенный раствор удаляли и аликвотировали по 100 мкл нового поддерживающего раствора (среда DMEM, 10% FBS, 1% пенициллина, стрептомицин).The introduced virus was prepared as follows. The leftmost well of a row of a 96-well plate was aliquoted with 200 μl of the pre-collected supernatant, and 180 μl of DMEM (FBS without antibiotics) was aliquoted into the other wells. Then, using a multipipette, 20 µl were taken from each well, starting from the left, and a tenfold dilution was carried out, aliquoting them into the well on the right. The dilution was carried out sequentially, changing the tips, and the last 12th well was left as a negative control. The obtained diluted solution of the virus was added to the plate, on which MARC-145 cells were adsorbed. Then the entire culture solution of MARC-145 cells was removed, 200 μl of PBS was aliquoted into each well and removed by repeating
На протяжении приблизительно 7 суток после аликвотирования в клетках подтверждали агрегацию и апоптоз, являющиеся разновидностями СРЕ (цитопатогенного эффекта), и, в завершение, рассчитывали коэффициент разведения, при котором СРЕ присутствовал в 4 лунках, представляющих собой половину из 8 растворов, в которые был внесен вирус, исходя из коэффициента разведения непосредственно перед лункой без СРЕ. Окончательное значение рассчитывали умножением на 10, исходя из 1 мл.For approximately 7 days after aliquoting, aggregation and apoptosis, which are varieties of CPE (cytopathogenic effect), were confirmed in cells, and finally, the dilution factor at which CPE was present in 4 wells, representing half of the 8 solutions in which virus based on the dilution factor just before the well without CPE. The final value was calculated by multiplying by 10, based on 1 ml.
Химерный штамм LMY+BP2017 и исходный штамм LMY были приведены в контакт со свиными альвеолярными макрофагами (РАМ-клетками), и показатели TCID50, измеренные за 1-2 суток, показаны в Таблице 11 ниже и на ФИГ. 4.The LMY+BP2017 chimeric strain and the original LMY strain were contacted with porcine alveolar macrophages (PAM cells), and TCID 50 values measured over 1-2 days are shown in Table 11 below and in FIG. four.
Как видно из Таблицы 11 и ФИГ. 4, согласно показателю ТСID50, измеренному на 2 сутки внесения штамма, когда вирус начинает образовываться в больших количествах, химерный LMY+BP2017 продемонстрировал в 100 раз меньший показатель TCID50, чем LMY. Исходя из этого, можно было видеть, что пролиферативные свойства химерного вируса LMY+BP2017 по настоящему изобретению в РАМ-клетках (свиных альвеолярных макрофагах), являющихся основными инфицированными клетками при PRRS, были как минимум в 10 раз меньше, чем у LMY, и удалось подтвердить, что химерный вирус LMY+BP2017 по настоящему изобретению был ослабленным, поскольку его пролиферативные свойства были меньше, чем у исходного штамма LMY.As can be seen from Table 11 and FIG. 4, according to the TCID 50 measured on the 2nd day of strain introduction, when the virus begins to form in large quantities, the chimeric LMY+BP2017 showed a 100-fold lower TCID 50 than LMY. Based on this, it could be seen that the proliferative properties of the LMY+BP2017 chimeric virus of the present invention in PAM cells (porcine alveolar macrophages), which are the main infected cells in PRRS, were at least 10 times less than that of LMY, and it was possible to confirm that the chimeric LMY+BP2017 virus of the present invention was attenuated because its proliferative properties were less than that of the original LMY strain.
Пример 4: Подтверждение паттерна секреции нейтрализующих антителExample 4: Confirmation of the Secretion Pattern of Neutralizing Antibodies
Для подтверждения паттерна секреции нейтрализующих антител после введения химерного вируса по настоящему изобретению 12 свиней в возрасте 3 недель разделяли на 3 группы, по четыре свиньи в каждой, и вводили им LMY (105 TCID50), химерный вирус LMY+BP2017 (105 ТСID50) и PBS, по 2 мл каждое. Через 4 недели у свиней из каждой группы получали венозную кровь, выделяли по 2 мл сыворотки и измеряли количество нейтрализующих антител в сыворотке.To confirm the secretion pattern of neutralizing antibodies after administration of the chimeric virus of the present invention, 12 pigs at 3 weeks of age were divided into 3 groups of four pigs each and injected with LMY (10 5 TCID 50 ), chimeric virus LMY+BP2017 (10 5 TCID 50 ) and PBS, 2 ml each. After 4 weeks, venous blood was obtained from pigs from each group, 2 ml of serum was isolated, and the amount of neutralizing antibodies in the serum was measured.
Конкретно, анализ проводили общеизвестным методом. До начала анализа все образцы сыворотки инактивировали нагреванием до 56°С на протяжении 45 минут. Инактивированную сыворотку добавляли к среде RPMI 1640 (10% FCS, 20 мМ L-глутамина, смесь антибиотиков и противогрибковых агентов: 100 МЕ/мл пенициллина, 100 мкг/мл стрептомицина, 50 мкг/мл гентамицина, 0,25 мкг/мл амфотерицина В) и затем проводили двукратное разведение. После этого отбирали по 100 мкл каждой разведенной сыворотки и смешивали со 100 мкл подготовленного заранее штамма VR2332, 200 ТСID50/мл, инкубировали при 37°С на протяжении 1 часа и затем приводили в контакт с монослоем клеток Marc-145, культивированных за день до этого. Затем, после инкубации при 37°С на протяжении одного часа, все внесенные растворы удаляли и заменяли на 200 мкл культурального раствора RPMI. После этого цитопатический эффект (СРЕ) проверяли каждый день, проводя культивирование при 37°С, и в каждой лунке СРЕ подтверждали после 5 суток культивирования. В лунках без СРЕ рост вируса подтверждали, проводя окрашивание антителом SDOW 17. Титр нейтрализующих антител измеряли, рассчитывая реципрокное значение максимального коэффициента разведения без признаков роста вируса, и результаты измерений показаны в Таблице 11 ниже и на ФИГ. 5.Specifically, the analysis was performed by a publicly known method. Prior to analysis, all serum samples were inactivated by heating to 56°C for 45 minutes. Inactivated serum was added to RPMI 1640 medium (10% FCS, 20 mM L-glutamine, a mixture of antibiotics and antifungal agents: 100 IU/ml penicillin, 100 µg/ml streptomycin, 50 µg/ml gentamicin, 0.25 µg/ml amphotericin B ) and then a two-fold dilution was performed. After that, 100 μl of each diluted serum was taken and mixed with 100 μl of the previously prepared VR2332 strain, 200 TCID 50 /ml, incubated at 37°C for 1 hour and then brought into contact with a monolayer of Marc-145 cells cultured the day before. this. Then, after incubation at 37° C. for one hour, all added solutions were removed and replaced with 200 μl of RPMI culture solution. Thereafter, the cytopathic effect (CPE) was checked every day by culturing at 37°C, and in each well, the CPE was confirmed after 5 days of culturing. In wells without CPE, virus growth was confirmed by staining with SDOW 17 antibody. Neutralizing antibody titer was measured by calculating the reciprocal maximum dilution factor without evidence of virus growth, and the measurement results are shown in Table 11 below and in FIG. 5.
Как показано в Таблице 11 и на ФИГ. 5, удалось подтвердить, что химерный вирус LMY+BP2017 приводил к значимо высокой секреции нейтрализующих антител клетками по сравнению с исходным штаммом LMY.As shown in Table 11 and FIG. 5, it was possible to confirm that the LMY+BP2017 chimeric virus resulted in a significantly higher secretion of neutralizing antibodies by the cells compared to the original LMY strain.
--->--->
Перечень последовательностейSequence listing
<110> BioPoA, Inc.<110> BioPoA, Inc.
REPUBLIC OF KOREA(Animal and Plant Quarantine Agency) REPUBLIC OF KOREA(Animal and Plant Quarantine Agency)
<120> Chimeric virus of porcine reproductive and respiratory syndrome<120> Chimeric virus of porcine reproductive and respiratory syndrome
virus, and vaccine using same virus, and vaccine using the same
<130> OPP20194438KR<130>OPP20194438KR
<150> KR 10-2018-0171306<150> KR 10-2018-0171306
<151> 2018-12-27<151> 2018-12-27
<150> KR 10-2019-0145389<150> KR 10-2019-0145389
<151> 2019-11-13<151> 2019-11-13
<160> 12<160> 12
<170> KoPatentIn 3.0<170> KoPatentIn 3.0
<210> 1<210> 1
<211> 609<211> 609
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<223> NSP1-бета LMY ver2<223> NSP1-beta LMY ver2
<400> 1<400> 1
gctgctgtct acgatgttgg tcatggcgcc gtcatgtatg tggccgatga gagagtctcc 60gctgctgtct acgatgttgg tcatggcgcc gtcatgtatg tggccgatga gagagtctcc 60
tgggcccctc gcggcgggga cgaagttaga ttcgaaacgg tcccacagga gcttaagtcg 120tgggcccctc gcggcgggga cgaagttaga ttcgaaacgg tcccacagga gcttaagtcg 120
gttgcgaacc aactctgcac gtcgttccca ccccaccacg tagtcgatat gtctaagttc 180gttgcgaacc aactctgcac gtcgttccca ccccaccacg tagtcgatat gtctaagttc 180
gcctttaccg cccccggttg cggcgtatct atgcgggtcg aacgtcaata cggctgtctc 240gcctttaccg cccccggttg cggcgtatct atgcgggtcg aacgtcaata cggctgtctc 240
cccgccgata cggtccccga aggcaactgc tggtggagct tgttcgattc gctcccactc 300cccgccgata cggtccccga aggcaactgc tggtggagct tgttcgattc gctcccactc 300
gaagtgcaag gcaaagagat tcgccacgct aaccaattcg ggtatcagac taagcatggc 360gaagtgcaag gcaaagagat tcgccacgct aaccaattcg ggtatcagac taagcatggc 360
gtatccggta agtacctaca gcggaggctg caaattaacg gtctccgcgc agtcgctgac 420gtatccggta agtacctaca gcggaggctg caaattaacg gtctccgcgc agtcgctgac 420
cctaacggac ctttcgtcgt acagtacttc tccgtcaagg agagttggat ccgccacttg 480cctaacggac ctttcgtcgt acagtacttc tccgtcaagg agagttggat ccgccacttg 480
aaactagcgg aagaacctag ttaccccggg ttcgaggacc tcctccgcat aagggttgag 540aaactagcgg aagaacctag ttacccgggg ttcgaggacc tcctccgcat aagggttgag 540
tctaacacgt caccattggc taacaaggac gaaaaaattt tccggtttgg cagtcataag 600tctaacacgt caccattggc taacaaggac gaaaaaattt tccggtttgg cagtcataag 600
tggtacggc 609tggtacggc 609
<210> 2<210> 2
<211> 3188<211> 3188
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<223> ORF2-ORF7 BP2017-2<223> ORF2-ORF7 BP2017-2
<400> 2<400> 2
atgaaatggg gtccatgcaa agcctttttt acaaaattgg ccaacttttt gtggatgctt 60atgaaatggg gtccatgcaa agcctttttt acaaaattgg ccaacttttt gtggatgctt 60
tcacggagtt cttggtgtcc attgttgata tcattatatt tttggccatt ttgtttggct 120tcacggagtt cttggtgtcc attgttgata tcattatatt tttggccatt ttgtttggct 120
tcaccatcgc cggttggctg gtggtctttt gcatcagatt ggtttgctcc gcgatactcc 180tcaccatcgc cggttggctg gtggtctttt gcatcagatt ggtttgctcc gcgatactcc 180
gtacgcgccc tgccattcac tctgagcaat tacagaagat cttatgaggc ctttctttcc 240gtacgcgccc tgccattcac tctgagcaat tacagaagat cttatgaggc ctttctttcc 240
cagtgccaag tggacattcc cacctgggga actaaacatc ctttggggat gctttggcac 300cagtgccaag tggacattcc cacctgggga actaaacatc ctttggggat gctttggcac 300
cataaggtgt caaccctgat tgatgaaatg gtgtcgcgtc gaatgtaccg catcatggaa 360cataaggtgt caaccctgat tgatgaaatg gtgtcgcgtc gaatgtaccg catcatggaa 360
aaagcagggc aggctgcctg gaaacaggtg gtgagcgagg ctacgctgtc tcgcattagt 420aaagcagggc aggctgcctg gaaacaggtg gtgagcgagg ctacgctgtc tcgcattagt 420
agtttggatg tggtggctca ttttcagcat ctagccgcca ttgaagccga gacctgtaaa 480agtttggatg tggtggctca ttttcagcat ctagccgcca ttgaagccga gacctgtaaa 480
tatttggcct cccggctgcc catgctacac aacctgcgca tgacaggttc aaatgtaacc 540tatttggcct cccggctgcc catgctacac aacctgcgca tgacaggttc aaatgtaacc 540
atagtgtata atagcacttt gaatcaggtg tttgctattt ttccaacccc tggttcccgg 600atagtgtata atagcacttt gaatcaggtg tttgctattt ttccaacccc tggttcccgg 600
ccaaagcttc atgattttca gcaatggtta atagctgtac attcctccat attttcctct 660ccaaagcttc atgattttca gcaatggtta atagctgtac attcctccat attttcctct 660
gttgcagctt cttgtactct ttttgttgtg ctgtggttgc gggttccaat actacgtact 720gttgcagctt cttgtactct ttttgttgtg ctgtggttgc gggttccaat actacgtact 720
gtttttggtt tccgctggtt aggggcaatt tttctttcga actcacagtg aattacacgg 780gtttttggtt tccgctggtt aggggcaatt tttctttcga actcacagtg aattacacgg 780
tgtgtccacc ttgcctcacc cggcaagcag ccacagagat ctacgaaccc ggtaggtctc 840tgtgtccacc ttgcctcacc cggcaagcag ccacagagat ctacgaaccc ggtaggtctc 840
tttggtgcag gatagggtat gaccgatgtg aggaggatga tcatgacgag ctagggttta 900tttggtgcag gatagggtat gaccgatgtg aggaggatga tcatgacgag ctagggttta 900
tggtaccgcc tggcctctcc agcgaaggcc acttgactag tgtttacgcc tggttggcgt 960tggtaccgcc tggcctctcc agcgaaggcc acttgactag tgtttacgcc tggttggcgt 960
tcttgtcctt cagctacacg gcccagttcc atcccgagat attcgggata gggaatgtga 1020tcttgtcctt cagctacacg gcccagttcc atcccgagat attcgggata gggaatgtga 1020
gtcgagttta tgttgacatc aaacatcaac tcatctgcgc cgaacatgac gggcagaaca 1080gtcgagttta tgttgacatc aaacatcaac tcatctgcgc cgaacatgac gggcagaaca 1080
ccaccttgcc tcgtcatgac aacatttcag ccgtgtttca gacctattac caacatcaag 1140ccaccttgcc tcgtcatgac aacatttcag ccgtgtttca gacctattac caacatcaag 1140
tcgacggcgg caattggttt cacctagaat ggcttcgtcc cttcttttcc tcgtggttgg 1200tcgacggcgg caattggttt cacctagaat ggcttcgtcc cttcttttcc tcgtggttgg 1200
ttttaaatgt ctcttggttt ctcaggcgtt cgcctgcaaa ccatgtttca gttcgagtct 1260ttttaaatgt ctcttggttt ctcaggcgtt cgcctgcaaa ccatgtttca gttcgagtct 1260
tgcagatatt aagaccaaca ccaccgcagc ggcaagcttt gctgtcctcc aagacatcag 1320tgcagatatt aagaccaaca ccaccgcagc ggcaagcttt gctgtcctcc aagacatcag 1320
ttgccttagg catcgcgact cggcctctga ggcgattcgc aaaatccctc agtgccgtac 1380ttgccttagg catcgcgact cggcctctga ggcgattcgc aaaatccctc agtgccgtac 1380
ggcgataggg acacccgtgt atgttaccat cacagccaat gtgacagatg agaattattt 1440ggcgataggg acacccgtgt atgttaccat cacagccaat gtgacagatg agaattattt 1440
acattcttct gatctcctca tgctttcttc ttgccttttc tatgcttctg agatgagtga 1500acattcttct gatctcctca tgctttcttc ttgccttttc tatgcttctg agatgagtga 1500
aaagggattt aaggtggtat ttggcaatgt gtcaggcatc gtggctgtgt gtgtcaattt 1560aaagggattt aaggtggtat ttggcaatgt gtcaggcatc gtggctgtgt gtgtcaattt 1560
taccagctac gtccaacatg tcaaggagtt tacccaacgc tccctggtgg tcgaccatgt 1620taccagctac gtccaacatg tcaaggagtt tacccaacgc tccctggtgg tcgaccatgt 1620
gcggttgctc catttcatga cacctgagac catgaggtgg gcaactgttt tagcctgtct 1680gcggttgctc catttcatga cacctgagac catgaggtgg gcaactgttt tagcctgtct 1680
ttttgccatt ctgttggcaa tttgaatgtt taagtatgtt ggagaaatgc ttgaccgcgg 1740ttttgccatt ctgttggcaa tttgaatgtt taagtatgtt ggagaaatgc ttgaccgcgg 1740
gctgttgctc gcaattgctt tctttgtggt gtatcgtgcc gttctgtttt gctgtgctcg 1800gctgttgctc gcaattgctt tctttgtggt gtatcgtgcc gttctgtttt gctgtgctcg 1800
ccaacgccag caacgacagc agctcccatc tacagctgat ttacaacttg acgctatgtg 1860ccaacgccag caacgacagc agctcccatc tacagctgat ttacaacttg acgctatgtg 1860
agctgaatgg cacagattgg ctagctaaca aatttgattg ggcagtggag agttttgtca 1920agctgaatgg cacagattgg ctagctaaca aatttgattg ggcagtggag agttttgtca 1920
tctttcccgt tttgactcac attgtctcct atggtgccct cactaccagc catttccttg 1980tctttcccgt tttgactcac attgtctcct atggtgccct cactaccagc catttccttg 1980
acacagtcgc tttagtcact gtgtctaccg ccgggtttgt tcacgggcgg tatgtcctaa 2040acacagtcgc tttagtcact gtgtctaccg ccgggtttgt tcacgggcgg tatgtcctaa 2040
gtagcatcta cgcggtctgt gccctggctg cgttgacttg cttcgtcatt aggtttgcaa 2100gtagcatcta cgcggtctgt gccctggctg cgttgacttg cttcgtcatt aggtttgcaa 2100
agaattgcat gtcctggcgc tacgcgtgta ccagatatac caactttctt ctggacacta 2160agaattgcat gtcctggcgc tacgcgtgta ccagatatac caactttctt ctggacacta 2160
agggcggact ctatcgttgg cggtcgcctg tcatcataga gaaaaggggc aaagttgagg 2220agggcggact ctatcgttgg cggtcgcctg tcatcataga gaaaaggggc aaagttgagg 2220
tcgaaggtca tctgatcgac ctcaaaagag ttgtgcttga tggttccgtg gcaaccccta 2280tcgaaggtca tctgatcgac ctcaaaagag ttgtgcttga tggttccgtg gcaaccccta 2280
taaccagagt ttcagcggaa caatggggtc gtccttagat gacttctgtc atgatagcac 2340taaccagagt ttcagcggaa caatggggtc gtccttagat gacttctgtc atgatagcac 2340
ggctccagaa aaggtgcttt tggcgttttc tattacctac acgccagtga tgatatatgc 2400ggctccagaa aaggtgcttt tggcgttttc tattacctac acgccagtga tgatatatgc 2400
cctaaaggtg agtcgcggcc gactgctagg gcttctgcac cttttgatct tcctgaattg 2460cctaaaggtg agtcgcggcc gactgctagg gcttctgcac cttttgatct tcctgaattg 2460
tgctttcacc ttcgggtaca tgactttcgc gcactttcag agtacaaata aggtcgcgct 2520tgctttcacc ttcgggtaca tgactttcgc gcactttcag agtacaaata aggtcgcgct 2520
cactatggga gcagtagttg cactcctttg gggggtgtac tcagccatag aaacctggaa 2580cactatggga gcagtagttg cactcctttg gggggtgtac tcagccatag aaacctggaa 2580
attcatcacc tccagatgcc gtttgtgctt gctaggccgc aagtacattc tggcccctgc 2640attcatcacc tccagatgcc gtttgtgctt gctaggccgc aagtacattc tggcccctgc 2640
ccaccacgtt gaaagtgccg caggctttca tccgattgcg gcaaatgata accacgcatt 2700ccaccacgtt gaaagtgccg caggctttca tccgattgcg gcaaatgata accacgcatt 2700
tgtcgtccgg cgtcccggct ccactacggt caacggcaca ttggtgcccg ggttaaaaag 2760tgtcgtccgg cgtcccggct ccactacggt caacggcaca ttggtgcccg ggttaaaaag 2760
cctcgtgttg ggtggcagaa aagctgttaa acagggagtg gtaaaccttg tcaaatatgc 2820cctcgtgttg ggtggcagaa aagctgttaa acagggagtg gtaaaccttg tcaaatatgc 2820
caaataacaa cggcaagcag cagaagagaa agaaggggga tggccagcca gtcaatcagc 2880caaataacaa cggcaagcag cagaagagaa agaaggggga tggccagcca gtcaatcagc 2880
tgtgccagat gctgggtaag atcatcgctc agcaaaacca gtccagaggc aagggaccgg 2940tgtgccagat gctgggtaag atcatcgctc agcaaaacca gtccagaggc aagggaccgg 2940
gaaagaaaaa taagaagaaa aacccggaga agccccattt tcctctagcg actgaagatg 3000gaaagaaaaa taagaagaaa aacccggaga agccccattt tcctctagcg actgaagatg 3000
atgtcagaca tcactttacc cctagtgagc ggcaattgtg tctgtcgtca atccagaccg 3060atgtcagaca tcactttacc cctagtgagc ggcaattgtg tctgtcgtca atccagaccg 3060
cctttaatca aggcgctggg acttgcaccc tgtcagattc agggaggata agttacactg 3120cctttaatca aggcgctgggg acttgcaccc tgtcagattc agggaggata agttacactg 3120
tggagtttag tttgcctacg catcatactg tgcgcctgat ccgcgtcaca gcatcaccct 3180tggagtttag tttgcctacg catcatactg tgcgcctgat ccgcgtcaca gcatcaccct 3180
cagcatga 3188cagcatga 3188
<210> 3<210> 3
<211> 24<211> 24
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<223> [A]n<223> [A]n
<400> 3<400> 3
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaa 24aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 24
<210> 4<210> 4
<211> 15443<211> 15443
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<223> Последовательность химерного вируса LMY-BP2017<223> Chimeric LMY-BP2017 virus sequence
<400> 4<400> 4
atgacgtata ggtgttggct ctatgccttg acatttgtat tgtcaggagc tgtgaccatt 60atgacgtata ggtgttggct ctatgccttg acatttgtat tgtcaggagc tgtgaccatt 60
ggcacagtcc aaaacttgct gcgcagaaac acccttctgc gacagcctcc ttcaggggag 120ggcacagtcc aaaacttgct gcgcagaaac acccttctgc gacagcctcc ttcaggggag 120
cttggggtct atccctagca ccttgcttct ggagttgcac tgctttacgg tctctccacc 180cttggggtct atccctagca ccttgcttct ggagttgcac tgctttacgg tctctccacc 180
cctttaacca tgtctgggat acttgatcgg tgcacgtgta cccccaatgc cagggtgttt 240cctttaacca tgtctgggat acttgatcgg tgcacgtgta cccccaatgc cagggtgttt 240
atggcggagg gccaagttta ctgcacacga tgtctcagtg cacggtctct ccttcccctg 300atggcgggagg gccaagttta ctgcacacga tgtctcagtg cacggtctct ccttcccctg 300
aatctccaag tttctgagct cggggtgctg ggcctattct acaggcccga agagccactc 360aatctccaag tttctgagct cggggtgctg ggcctattct acaggcccga agagccactc 360
cggtggacgt tgccacgtgc attccccact gttgagtgct cccccgccgg ggcctgctgg 420cggtggacgt tgccacgtgc attccccact gttgagtgct cccccgccgg ggcctgctgg 420
ctttctgcaa tctttccaat tgcacgaatg accagtggaa acctaaactt ccaacaaaga 480ctttctgcaa tctttccaat tgcacgaatg accagtggaa acctaaactt ccaacaaaga 480
atggtacggg tcgcagctga gatctacaga gttggccagc tcacccctgc agttttgaag 540atggtacggg tcgcagctga gatctacaga gttggccagc tcacccctgc agttttgaag 540
gctctacaag tttatgagcg gggttgccgc tggtatccca ttgttggacc tgtccctgga 600gctctacaag tttatgagcg gggttgccgc tggtatccca ttgttggacc tgtccctgga 600
gtggccgttt tcgccaactc cctgcatgtg agtgatagac ctttcccggg agcaactcac 660gtggccgttt tcgccaactc cctgcatgtg agtgatagac ctttcccggg agcaactcac 660
gtattaacca acctgccact cccgcagaga cccaagcctg aggacttttg ccccttcgag 720gtattaacca acctgccact cccgcagaga cccaagcctg aggacttttg ccccttcgag 720
tgtgctatgg ctgctgtcta cgatgttggt catggcgccg tcatgtatgt ggccgatgag 780tgtgctatgg ctgctgtcta cgatgttggt catggcgccg tcatgtatgt ggccgatgag 780
agagtctcct gggcccctcg cggcggggac gaagttagat tcgaaacggt cccacaggag 840agagtctcct gggcccctcg cggcggggac gaagttagat tcgaaacggt cccacaggag 840
cttaagtcgg ttgcgaacca actctgcacg tcgttcccac cccaccacgt agtcgatatg 900cttaagtcgg ttgcgaacca actctgcacg tcgttcccac cccaccacgt agtcgatatg 900
tctaagttcg cctttaccgc ccccggttgc ggcgtatcta tgcgggtcga acgtcaatac 960tctaagttcg cctttaccgc ccccggttgc ggcgtatcta tgcgggtcga acgtcaatac 960
ggctgtctcc ccgccgatac ggtccccgaa ggcaactgct ggtggagctt gttcgattcg 1020ggctgtctcc ccgccgatac ggtccccgaa ggcaactgct ggtggagctt gttcgattcg 1020
ctcccactcg aagtgcaagg caaagagatt cgccacgcta accaattcgg gtatcagact 1080ctcccactcg aagtgcaagg caaagagatt cgccacgcta accaattcgg gtatcagact 1080
aagcatggcg tatccggtaa gtacctacag cggaggctgc aaattaacgg tctccgcgca 1140aagcatggcg tatccggtaa gtacctacag cggaggctgc aaattaacgg tctccgcgca 1140
gtcgctgacc ctaacggacc tttcgtcgta cagtacttct ccgtcaagga gagttggatc 1200gtcgctgacc ctaacggacc tttcgtcgta cagtacttct ccgtcaagga gagttggatc 1200
cgccacttga aactagcgga agaacctagt taccccgggt tcgaggacct cctccgcata 12601260
agggttgagt ctaacacgtc accattggct aacaaggacg aaaaaatttt ccggtttggc 1320agggttgagt ctaacacgtc accattggct aacaaggacg aaaaaatttt ccggtttggc 1320
agtcataagt ggtacggcgc tggtaagaga gcaaggaaag cacgctctcg tgcgactaat 1380agtcataagt ggtacggcgc tggtaagaga gcaaggaaag cacgctctcg tgcgactaat 1380
acagtcgctg accgcgcttt gtccgttcgt gaaatctggc aggccaagga gcatgaggtt 1440acagtcgctg accgcgcttt gtccgttcgt gaaatctggc aggccaagga gcatgaggtt 1440
accggcgcca ataaggctga gcacctcaaa cactactccc cacctgccga agggaattgt 1500accggcgcca ataaggctga gcacctcaaa cactactccc cacctgccga agggaattgt 1500
ggttggcact gcatttccgc catcgtcaac cggatggtta attccaaatt tgaaaccacc 1560ggttggcact gcatttccgc catcgtcaac cggatggtta attccaaatt tgaaaccacc 1560
cttcccgaaa gagtgagacc tccagatgac tgggctaccg acgaggatct tgcgaatgcc 1620cttcccgaaa gagtgagacc tccagatgac tgggctaccg acgaggatct tgcgaatgcc 1620
atccaaatcc tcagactccc tgcggcctta gacaggaacg gtgcttgtgc tagcgccaag 1680atccaaatcc tcagactccc tgcggcctta gacaggaacg gtgcttgtgc tagcgccaag 1680
tacgtactta agctggaagg tgagcattgg actgtcactg tgacccctgg gatgtcccct 1740tacgtactta agctggaagg tgagcattgg actgtcactg tgacccctgg gatgtcccct 1740
tctttgctcc ctcttgaatg tgttcagggc tgttgtgggc acaagggcgg tcttggttcc 1800tctttgctcc ctcttgaatg tgttcaggggc tgttgtgggc acaagggcgg tcttggttcc 1800
ccagacgcag tcgaggtctc cggatttgac cctgcctgcc ttgaccgtct ggctgaggtg 1860cggacgcag tcgaggtctc cggatttgac cctgcctgcc ttgaccgtct ggctgaggtg 1860
atgcacctgc ctagcagtgc tatcccagcc gctctggccg aaatgtctgg tgattccgat 1920atgcacctgc ctagcagtgc tatcccagcc gctctggccg aaatgtctgg tgattccgat 1920
cgttcggctt ctccggtcac caccgtgtgg actgtttcgc agttctttgc ccgtcacagc 1980cgttcggctt ctccggtcac caccgtgtgg actgtttcgc agttctttgc ccgtcacagc 1980
ggaggaaatc accctgacca agtgcgctta gggaaaatca tcagcctttg tcaggtgatt 2040ggaggaaatc accctgacca agtgcgctta gggaaaatca tcagcctttg tcaggtgatt 2040
gaggactgct gctgttccca gaacaaaacc aaccgggtca ccccggagga ggttgcagca 2100gaggactgct gctgttccca gaacaaaacc aaccgggtca ccccggagga ggttgcagca 2100
aagattgacc tgtacctccg cggtgcaaca aatcttgaag aatgcttggc caggctcgag 2160aagattgacc tgtacctccg cggtgcaaca aatcttgaag aatgcttggc caggctcgag 2160
aaagcgcgcc cgccacgggt aatcgacacc ttctttgatt gggacgttgt gctccctggg 2220aaagcgcgcc cgccacgggt aatcgacacc ttctttgatt gggacgttgt gctccctggg 2220
gttgaggcag caacccaaac gaccaagctg ccccaggtca accagtgtcg tgctctggtc 2280gttgaggcag caacccaaac gaccaagctg ccccaggtca accagtgtcg tgctctggtc 2280
cctgttgtga ctcaaaagtc cttggacaac aactcggtcc ccctgaccgc cttttcactg 2340ccctgttgtga ctcaaaagtc cttggacaac aactcggtcc ccctgaccgc cttttcactg 2340
gctaactact actaccgcgc gcaaggtgac gaagtttgtc accgtgaaag acttaatgcc 2400gctaactact actaccgcgc gcaaggtgac gaagtttgtc accgtgaaag acttaatgcc 2400
gtgctttcca agctggaaga ggttgtccga gaagagtacg ggctcatgcc taccgggcct 2460gtgctttcca agctggaaga ggttgtccga gaagagtacg ggctcatgcc taccggggcct 2460
ggcccacggc ccacattgcc acgcgggctc gacgaactca aagaccagat ggaggtggac 2520ggccccggc ccacattgcc acgcgggctc gacgaactca aagaccagat ggaggtggac 2520
ttgctgaaac tggctaacgc ccaggcgact tctgacatga tggcttgggc agtcgagcag 2580ttgctgaaac tggctaacgc ccaggcgact tctgacatga tggcttgggc agtcgagcag 2580
gttgacctaa aaacttgggt caagaactac ccgcggtgga tgccaccacc tcctccgcca 2640gttgacctaa aaacttgggt caagaactac ccgcggtgga tgccaccacc tcctccgcca 2640
aaagttcggc ctcgaaaaac gaagcctgtc aagagcttgc cagagggaaa gcccgccccc 2700aaagttcggc ctcgaaaaac gaagcctgtc aagagcttgc cagagggaaa gcccgccccc 2700
gcccctcgca ggagggttgg gactggttgt ggcagcccga cttcattggg cgatgatgtt 2760gcccctcgca ggagggttgg gactggttgt ggcagcccga cttcattggg cgatgatgtt 2760
cttaacagtt gggaagattt ggctgttggc agcccctcgg gtctcccgac cccccctgag 2820cttaacagtt gggaagattt ggctgttggc agcccctcgg gtctcccgac cccccctgag 2820
ccggcaacac cttcgagtga gccagtggtt gtgtcagcac cgcagtgcat cttcagaccg 2880ccggcaacac cttcgagtga gccagtggtt gtgtcagcac cgcagtgcat cttcagaccg 2880
gcgacgccct tgagtgagcc gaccccaatt cccgcacccc gtgggactgc gtctcgacca 2940gcgacgccct tgagtgagcc gaccccaatt cccgcacccc gtgggactgc gtctcgacca 2940
gtgacacctt tgagcgagcc gatccctgtg cctgcaccgc ggcgtaaatt tcagcaggcg 3000gtgacacctt tgagcgagcc gatccctgtg cctgcaccgc ggcgtaaatt tcagcaggcg 3000
agaaagttga gttcggcggt ggtaattccg ccgtaccagg acgagcccct ggatttgtcc 3060agaaagttga gttcggcggt ggtaattccg ccgtaccagg acgagcccct ggatttgtcc 3060
gcttcctcgc tgactgaata tgaagccctt cctctagcgc cgccgcaaag cgagggcgct 3120gcttcctcgc tgactgaata tgaagccctt cctctagcgc cgccgcaaag cgagggcgct 3120
ctaagagtgg aggggcatga agttgaggaa gccctgagtg aaatctcaga catgtcgggt 3180ctaagagtgg aggggcatga agttgaggaa gccctgagtg aaatctcaga catgtcgggt 3180
ggcactaaac ctgcgcccgt atcatcaagc agctccttgt ccagcgtgag aatcacacgc 3240ggcactaaac ctgcgcccgt atcatcaagc agctccttgt ccagcgtgag aatcacacgc 3240
ccaaaacact cagctcaagc catcatcgac tcggtcgggc cctgcagtgg gcatctccaa 3300ccaaaacact cagctcaagc catcatcgac tcggtcgggc cctgcagtgg gcatctccaa 3300
gaggtgaagg agatatgcct tagtgtcatg cgcgaggcat gtgatgcgac taagctcaat 3360gaggtgaagg agatatgcct tagtgtcatg cgcgaggcat gtgatgcgac taagctcaat 3360
gaccccgcta cgcaggaatg gctctctcgc atgtgggatc gggtggacat gctgacttgg 3420gaccccgcta cgcaggaatg gctctctcgc atgtgggatc gggtggacat gctgacttgg 3420
cgcaacacgt ctgcttacca gacgcttagc accttaggtg gctggtcaag gttcctccca 3480cgcaacacgt ctgcttacca gacgcttagc accttaggtg gctggtcaag gttcctccca 3480
aaattgatac ttgagacacc gccgccctac ccgtgtgagt ttgtgatgat gccttacacg 35403540
cctgcacctt ccgtgggtgc ggagagcgac ctcaccattg gctcagttgc tactgaggat 3600cctgcacctt ccgtgggtgc ggagagcgac ctcaccattg gctcagttgc tactgaggat 3600
gttccacgca tccttgagaa catggagaat gtcggcgaga tgactaacca gggacccttg 36603660
gccttctccg aggataaacc ggtggatgac caaccttccg aagacctccg gacatcgtcg 3720gccttctccg aggataaacc ggtggatgac caaccttccg aagacctccg gacatcgtcg 3720
caaggacctg acgggagcac atcagctccg tccgcagata cagctggcgc cggctcatcc 3780caaggacctg acgggagcac atcagctccg tccgcagata cagctggcgc cggctcatcc 3780
accgatttgc cgtcttcagg cggcgtggat gcggacggag ggggaccgct tcgggcggta 3840accgatttgc cgtcttcagg cggcgtggat gcggacggag ggggaccgct tcgggcggta 3840
aaaagaaaaa ccgaacggct ctttgaccaa ctgagtcgtc aggtttttga cctcgtctcc 3900aaaagaaaaa ccgaacggct ctttgaccaa ctgagtcgtc aggtttttga cctcgtctcc 3900
catctcccta ttttcttctc acgcctcttc aaccctggcg gtggttactc tccgggtgat 3960catctcccta ttttcttctc acgcctcttc aaccctggcg gtggttactc tccgggtgat 3960
tggggttttg cagcttttac tctattgtgc ctctttttat gttacagtta cccagcattt 4020tggggttttg cagcttttac tctattgtgc ctctttttat gttacagtta cccagcattt 4020
ggcatcgttc ccctcttggg tgtattttct gggtcttctc ggcgcgtgcg aatgggggtt 4080ggcatcgttc ccctcttggg tgtattttct gggtcttctc ggcgcgtgcg aatgggggtt 4080
tttggctgct ggttggcttt tgctgttggt ctgttcaagc ctgtgtccga cccagtcggc 4140tttggctgct ggttggcttt tgctgttggt ctgttcaagc ctgtgtccga cccagtcggc 4140
gctgcttgtg agtttgactc gccagaatgc agaaacatcc ttcattcttt tgagcttctc 4200gctgcttgtg agtttgactc gccagaatgc agaaacatcc ttcattcttt tgagcttctc 4200
aaaccttggg accctgttcg cagccttgtt gtgggccccg tcggtctcgg ttttgccatt 4260aaaccttggg accctgttcg cagccttgtt gtgggccccg tcggtctcgg ttttgccatt 4260
cttggcaggc tactgggcgg ggcacgcagc atctggcact ttttgcttag gcttggcatt 4320cttggcaggc tactggggcgg ggcacgcagc atctggcact ttttgcttag gcttggcatt 4320
gttgcagact gtgtcttggc tggagcttat gtgctttctc aaggtaggtg caaaaagtgt 4380gttgcagact gtgtcttggc tggagcttat gtgctttctc aaggtaggtg caaaaagtgt 4380
tggggatctt gtataagaac cgctcctaat gaggtcgctt tcaacgtgtt tccttttacg 4440tggggatctt gtataagaac cgctcctaat gaggtcgctt tcaacgtgtt tccttttacg 4440
cgtgcaacca ggtcgtcact tgttgacctt tgcgatcggt tttgtgcgcc gagaggcatg 4500cgtgcaacca ggtcgtcact tgttgacctt tgcgatcggt tttgtgcgcc gagaggcatg 4500
gaccccattt ttctcgccac tgggtggcgt ggatgctggg ccggtcggag ccccattgag 4560gaccccattt ttctcgccac tgggtggcgt ggatgctggg ccggtcggag ccccattgag 4560
caaccctctg aaaaacccat cgcgtttgcc caattggatg aaaagaagat tacggctagg 4620caaccctctg aaaaacccat cgcgtttgcc caattggatg aaaagaagat tacggctagg 4620
actgtggtcg cccagcctta tgatcccaac caagccgtaa agtgcctgcg ggtattgcag 4680actgtggtcg cccagcctta tgatcccaac caagccgtaa agtgcctgcg ggtattgcag 4680
gcgggagggg cgatggtggc tgaggcggtc ccaaaagtgg tcagggtttc cgctgttcca 4740gcgggagggg cgatggtggc tgaggcggtc ccaaaagtgg tcagggtttc cgctgttcca 4740
tttcgagccc ccttttttcc taccggagtg aaggttgacc ctgaatgtag agtagtggtt 4800tttcgagccc ccttttttcc taccggagtg aaggttgacc ctgaatgtag agtagtggtt 4800
gaccctgaca ctttcactgc agctctccgg tctggttact ccaccacaaa cctcgtcctc 4860gaccctgaca ctttcactgc agctctccgg tctggttact ccaccacaaa cctcgtcctc 4860
ggtgtggggg actttgccca gctgaatgga ttaaaaatca ggcaaatttc taagccttca 4920ggtgtggggg actttgccca gctgaatgga ttaaaaatca ggcaaatttc taagccttca 4920
ggggggggcc cacatctcat ggctgccctg catgttgcct gctcgatgat tttgcacatg 4980ggggggggcc cacatctcat ggctgccctg catgttgcct gctcgatgat tttgcacatg 4980
tttgctggga tttatgtgac tgcggtgggt tcttgcggca ccggcaccaa cgatccgtgg 5040tttgctggga tttatgtgac tgcggtgggt tcttgcggca ccggcaccaa cgatccgtgg 5040
tgcgcaaacc catttgccgt ccctggctac ggacctggct ccctctgcac gtccagattg 5100tgcgcaaacc catttgccgt ccctggctac ggacctggct ccctctgcac gtccagattg 5100
tgtatttccc agcacggcct taccctgccc ttgacagcac ttgtggcggg attcggcatc 5160tgtatttccc agcacggcct taccctgccc ttgacagcac ttgtggcggg attcggcatc 5160
caggaaattg ccttagtcgc tttgatcttt gtttccatcg gaggcattgc tcataggttg 5220caggaaattg ccttagtcgc tttgatcttt gtttccatcg gaggcattgc tcataggttg 5220
agttgtaaag ctgacatgct gtgtgttttg cttgcaattg ccagctatgt ttgggtacct 5280agttgtaaag ctgacatgct gtgtgttttg cttgcaattg ccagctatgt ttgggtacct 5280
cttacctggt tactttgtgt ttttccttgc tggttgcgct ggttttcttt gcatcccctt 5340cttacctggt tactttgtgt ttttccttgc tggttgcgct ggttttcttt gcatcccctt 5340
accgtcctat ggttggtgtt tttcttgatt tctgtgaata tgccttcagg aatcttggcc 5400accgtcctat ggttggtgtt tttcttgatt tctgtgaata tgccttcagg aatcttggcc 5400
atggtgttgt tagtttctct ttggcttctt ggtcgttata ctaatgtcgc cggtcttgtc 5460atggtgttgt tagtttctct ttggcttctt ggtcgttata ctaatgtcgc cggtcttgtc 5460
actccctacg acattcatca ttacaccagt ggcccccgcg gtgttgccgc attggctact 5520actccctacg acattcatca ttacaccagt ggcccccgcg gtgttgccgc attggctact 5520
gcaccagatg gaacctactt agccgctgtt cgccgcgctg cgttgactgg ccgcaccatg 5580gcaccagatg gaacctactt agccgctgtt cgccgcgctg cgttgactgg ccgcaccatg 5580
ttgttcaccc cgtcccagct tgggtctctt cttgagggcg ctttcagaac tcgaaagccc 5640ttgttcaccc cgtcccagct tgggtctctt cttgagggcg ctttcagaac tcgaaagccc 5640
tcactgaaca ccgtcaatgt ggtcgggtcc tccatgggct ctggcggggt gtttaccatt 5700tcactgaaca ccgtcaatgt ggtcgggtcc tccatgggct ctggcggggt gtttaccatt 5700
gacgggaaag tcaggtgcgt gactgccaca catgtcctta cgggtaactc agccagggtt 5760gacgggaaag tcaggtgcgt gactgccaca catgtcctta cgggtaactc agccagggtt 5760
tccggaaccg gcttcaatca aatgcttgac tttgacgtaa aaggggattt cgctatagcc 5820tccggaaccg gcttcaatca aatgcttgac tttgacgtaa aaggggattt cgctatagcc 5820
gattgcccga attggcaagg ggctgccccc aaaacccaat tctgcgagga tggatggact 5880gattgcccga attggcaagg ggctgccccc aaaacccaat tctgcgagga tggatggact 5880
ggccgtgcct attggctaac atcctctggc gtcgaacccg gcgtcattgg gaaaggattc 5940ggccgtgcct attggctaac atcctctggc gtcgaacccg gcgtcattgg gaaaggattc 5940
gccttctgct tcaccgcgtg cggcgattcc gggtccccag tgatcaccga ggccggtgag 6000gccttctgct tcaccgcgtg cggcgattcc gggtccccag tgatcaccga ggccggtgag 6000
cttgtcggtg ttcacacggg atcgaataaa caaggggggg gtattgtcac acgcccctca 6060cttgtcggtg ttcacacgggg atcgaataaa caaggggggg gtattgtcac acgcccctca 6060
ggccagtttt gtaatgtggc acccatcaag ctgagcgaat taagtgaatt ctttgctggg 6120ggccagtttt gtaatgtggc acccatcaag ctgagcgaat taagtgaatt ctttgctggg 6120
cctaaggtcc cgctcggtga tgtgaaggtt ggcagccaca taatcaaaga cacaagcgag 61806180
gtgccttcag atctttgtgc cttgcttgct gccaaacctg aactggaagg aggtctctcc 6240gtgccttcag atctttgtgc cttgcttgct gccaaacctg aactggaagg aggtctctcc 6240
accgtccaac ttctgtgtgt gtttttcctt ctgtggagaa tgatgggaca tgcctggacg 6300accgtccaac ttctgtgtgt gttttttcctt ctgtggagaa tgatgggaca tgcctggacg 6300
cccttggttg ctgtgggttt ctttattttg aatgagattc tcccggccgt cctggtccgg 63606360
agtattttct cctttggaat gtttgtgcta tcctggctca cgccatggtc tgcgcaagtt 6420agtattttct cctttggaat gtttgtgcta tcctggctca cgccatggtc tgcgcaagtt 6420
ctgatgatca ggctcctgac agcagctctt aacaggaata gatgttcact tgcctttttc 6480ctgatgatca ggctcctgac agcagctctt aacaggaata gatgttcact tgcctttttc 6480
agcctcggtg cagtgaccgg ttttgttgca gatcttgcgg ctactcaggg gcatccgttg 6540agcctcggtg cagtgaccgg ttttgttgca gatcttgcgg ctactcaggg gcatccgttg 6540
caggcagtga tgaatttgag cacctatgca ttcctgcctc gggtaatggt tgtgacttca 6600caggcagtga tgaatttgag cacctatgca ttcctgcctc gggtaatggt tgtgacttca 6600
ccagtcccag tgatcgcgtg tggtgttgtg cacctactcg ccatcattct gtacctgttt 6660ccagtcccag tgatcgcgtg tggtgttgtg cacctactcg ccatcattct gtacctgttt 6660
aaataccgta gcctgcacca tatccttgtt ggcgatggag tgttctcttc ggccttcttc 6720aaataccgta gcctgcacca tatccttgtt ggcgatggag tgttctcttc ggccttcttc 6720
ctgcgatatt ttgccgaagg aaagttgagg gaaggggtgt cacaatcctg cggaatgaat 6780ctgcgatatt ttgccgaagg aaagttgagg gaaggggtgt cacaatcctg cggaatgaat 6780
catgagtctc tgactggtgc cctcgctatg agactcaatg acgaggactt ggatttcctc 6840catgagtctc tgactggtgc cctcgctatg agactcaatg acgaggactt ggatttcctc 6840
atgaaatgga ctgattttaa gtgcttcgtt tctgcgtcca acatgaggaa tgcagcgggt 6900atgaaatgga ctgattttaa gtgcttcgtt tctgcgtcca acatgaggaa tgcagcgggt 6900
caatttatcg aggctgcata tgctaaagca cttagagttg aactggccca gttggtgcag 6960caatttatcg aggctgcata tgctaaagca cttagagttg aactggccca gttggtgcag 6960
gttgataagg ttcgaggtac tatggccaaa cttgaagctt ttgctgatac tgtggcacct 70207020
caactctcgc ccggtgatat tgttgtcgct ctcggccaca cgcctgttgg cagtatcttc 7080caactctcgc ccggtgatat tgttgtcgct ctcggccaca cgcctgttgg cagtatcttc 7080
gacttaaagg ttggtagcac caagcatacc ctccaagcca ttgagaccag ggttcttgct 7140gacttaaagg ttggtagcac caagcatacc ctccaagcca ttgagaccag ggttcttgct 7140
gggtccaaaa tgaccgtggc gcgcgtcgtc gacccgaccc ccacgccccc acccgcgccc 7200gggtccaaaa tgaccgtggc gcgcgtcgtc gacccgaccc ccacgccccc acccgcgccc 7200
gtgcccatcc ccctcccacc gaaagttctg gagaatggcc ccaacgcttg gggggatgag 7260gtgcccatcc ccctcccacc gaaagttctg gagaatggcc ccaacgcttg gggggatgag 7260
gaccgtttga ataagaagaa aagacgcagg atggaagccc tcggcatcta tgttatgggc 7320gaccgtttga ataagaagaa aagacgcagg atggaagccc tcggcatcta tgttatgggc 7320
gggaaaaagt accagaaatt ttgggacaag aactccggtg atgtgtttta tgaggaggtc 7380gggaaaaagt accagaaatt ttgggacaag aactccggtg atgtgtttta tgaggaggtc 7380
cataacaaca cagatgagtg ggagtgtctc acagttggcg accctgccga ctttgaccct 7440cataacaaca cagatgagtg ggagtgtctc acagttggcg accctgccga ctttgaccct 7440
gagaagggaa ccctgtgtgg acatgtcacc attgacaaca aggcttacca tgtttacacc 7500gagaagggaa ccctgtgtgg acatgtcacc attgacaaca aggcttacca tgtttacacc 7500
tcctcatctg gtaagaagtt cttggttccc gtcaacccag agaacggaag agttcaatgg 7560tcctcatctg gtaagaagtt cttggttccc gtcaacccag agaacggaag agttcaatgg 7560
gaagctgcaa agctttccgt ggagcaggcc ctaggcatga tgaatgtcga cggcgaactg 7620gaagctgcaa agctttccgt ggagcaggcc ctaggcatga tgaatgtcga cggcgaactg 7620
actgccaagg aactggagaa actgaaaaga ataattgaca aactccaggg cctgactaag 7680actgccaagg aactggagaa actgaaaaga ataattgaca aactccaggg cctgactaag 7680
gagcagtgtt taaactgcta gccgccagcg acttgacccg ctgtggtcgc ggcggcttgg 7740gagcagtgtt taaactgcta gccgccagcg acttgacccg ctgtggtcgc ggcggcttgg 7740
ttgttactga gacagcggtg aaaatagtca aatttcacaa tcggactttc actctggggc 7800ttgttactga gacagcggtg aaaatagtca aatttcacaa tcggactttc actctggggc 7800
ctgtgaattt aaaagtggcc agtgaggttg agctaaaaga tgcggttgag cacaaccaac 7860ctgtgaattt aaaagtggcc agtgaggttg agctaaaaga tgcggttgag cacaaccaac 7860
acccggttgc gaggccgatc gatggtggag ttgtgctcct gcgttccgcg gttccctcgc 7920acccggttgc gaggccgatc gatggtggag ttgtgctcct gcgttccgcg gttccctcgc 7920
ttatagacgt cttgatctcc ggtgctgaca catctcccaa gttacttgcc cttcacgggc 7980ttatagacgt cttgatctcc ggtgctgaca catctcccaa gttacttgcc cttcacgggc 7980
cgggaaacac tgggatcgat ggcacgctct gggatttcga gtccgaagcc actaaagagg 8040cgggaaacac tgggatcgat ggcacgctct gggatttcga gtccgaagcc actaaagagg 8040
aagtcgcact cagtgcgcaa ataatacagg cttgtgacat taggcgtggc gacgctcctg 8100aagtcgcact cagtgcgcaa ataatacagg cttgtgacat taggcgtggc gacgctcctg 8100
aaattggtct cccttataag ctgtaccctg ttaggggcaa ccctgagcgg gtgaaaggag 8160aaattggtct cccttataag ctgtaccctg ttaggggcaa ccctgagcgg gtgaaaggag 8160
ttctgcagaa tacaaggttt ggagacatac cctacaaaac ccctagtgac accgggagcc 8220ttctgcagaa tacaaggttt ggagacatac cctacaaaac ccctagtgac accggggagcc 8220
cagtgcacgc ggctgcctgc cttacgccca acgccactcc tgtgactgat gggcgttccg 8280cagtgcacgc ggctgcctgc cttacgccca acgccactcc tgtgactgat gggcgttccg 8280
tcttggctac aaccatgccc cccgggtttg agttatatgt accgaccata ccagcgtctg 83408340
tccttgatta ccttgactct aggcctgact gccctaaaca gctgacagag cacggctgcg 8400tccttgatta ccttgactct aggcctgact gccctaaaca gctgacagag cacggctgcg 8400
aagacgccgc actgaaagac ctctctaaat atgacttatc tacccaaggc tttgtcttac 8460aagacgccgc actgaaagac ctctctaaat atgacttatc tacccaaggc tttgtcttac 8460
ctggggttct tcgccttgtg cggaaatacc tgtttgccca tgtaggtaaa tgtccacccg 8520ctggggttct tcgccttgtg cggaaatacc tgtttgccca tgtaggtaaa tgtccacccg 8520
ttcatcggcc ttctatttac cccgctaaga attctatggc tggaataaat gggaacaggt 8580ttcatcggcc ttctatttac ccgctaaga attctatggc tggaataaat gggaacaggt 8580
tcccaaccaa agacatccag agcgttcctg aaatcgacgt tctgtgcgca caggctgtgc 8640tcccaaccaa agacatccag agcgttcctg aaatcgacgt tctgtgcgca caggctgtgc 8640
gggaaaactg gcaaactgtc accccttgta ctcttaagaa acagtattgc gggaagaaga 8700gggaaaactg gcaaactgtc accccttgta ctcttaagaa acagtattgc gggaagaaga 8700
agaccaggac catactcggc accaataact tcattgcact ggcccaccga gcagtgttga 8760agaccaggac catactcggc accaataact tcattgcact ggcccaccga gcagtgttga 8760
gtggtgtcac ccagggcttc atgaaaaagg cgttcaactc gcccatcgcc ctcggaaaga 8820gtggtgtcac ccagggcttc atgaaaaagg cgttcaactc gcccatcgcc ctcggaaaga 8820
acaagttcaa ggagctacag actccggtcc tgggcaggtg ccttgaagct gacctcgcat 8880acaagttcaa ggagctacag actccggtcc tgggcaggtg ccttgaagct gacctcgcat 8880
cctgtgatcg atccacgcct gcaattgttc gctggtttgc tgccaacctt ctttatgaac 8940cctgtgatcg atccacgcct gcaattgttc gctggtttgc tgccaacctt ctttatgaac 8940
ttgcctgtgc tgaagagtat ctaccgtcgt atgtgctgaa ctgctgccac gacttactag 9000ttgcctgtgc tgaagagtat ctaccgtcgt atgtgctgaa ctgctgccac gacttactag 9000
tcacgcagtc cggcgcagtg actaagagag gtggcctgtc gtctggcgac ccgatcacct 9060tcacgcagtc cggcgcagtg actaagagag gtggcctgtc gtctggcgac ccgatcacct 9060
ctgtgtctaa caccatttac agtttggtga tctatgcaca gcacatggtg cttagttact 9120ctgtgtctaa caccatttac agtttggtga tctatgcaca gcacatggtg cttagttact 9120
ttaaaagtgg tcacccccat ggccttctgt tcttacaaga ccagctaaag tttgaggaca 9180ttaaaagtgg tcacccccat ggccttctgt tcttacaaga ccagctaaag tttgaggaca 9180
tgctcaaggt tcaacccctg atcgtctatt cggacgatct cgtgctgtat gccgagtctc 9240tgctcaaggt tcaacccctg atcgtctatt cggacgatct cgtgctgtat gccgagtctc 9240
ccaccatgcc aaattatcac tggtgggttg agcatctgaa tttgatgctg gggtttcaga 9300ccaccatgcc aaattatcac tggtgggttg agcatctgaa tttgatgctg gggtttcaga 9300
cggacccaaa aaaaacagca ataacagatt cgccatcatt tctgggctgt agaataatga 9360cggacccaaa aaaaacagca ataacagatt cgccatcatt tctgggctgt agaataatga 9360
atgggcgcca gctagtcccc aaccgtgaca ggatcctcgc ggccctcgcc tatcacatga 9420atgggcgcca gctagtcccc aaccgtgaca ggatcctcgc ggccctcgcc tatcacatga 9420
aggcaagtaa tgtttctgaa tactatgcct cagcggctgc aatactcatg gacagctgtg 9480aggcaagtaa tgtttctgaa tactatgcct cagcggctgc aatactcatg gacagctgtg 9480
cttgtttgga gtatgatcct gaatggtttg aagaacttgt agttggaata gcgcagtgcg 9540cttgtttgga gtatgatcct gaatggtttg aagaacttgt agttggaata gcgcagtgcg 9540
cccgcaagga tggctacagc tttcccggca cgccgttctt catgtccatg tgggaaaaac 9600cccgcaagga tggctacagc tttcccggca cgccgttctt catgtccatg tgggaaaaac 9600
tcaggtccaa ttatgagggg aagaagtcga gagtgtgcgg gtactgcggg gccccggccc 9660tcaggtccaa ttatgagggg aagaagtcga gagtgtgcgg gtactgcggg gccccggccc 9660
cgtacgctac tgcctgtggc ctcgacgtct gcatctacca cacccacttc caccagcatt 9720cgtacgctac tgcctgtggc ctcgacgtct gcatctacca cacccacttc caccagcatt 9720
gtccagtcac aatctggtgt ggccatccag cgggttctgg ttcttgtagt gagtgcaaat 9780gtccagtcac aatctggtgt ggccatccag cgggttctgg ttcttgtagt gagtgcaaat 9780
cccctgtagg gaaaggcaca aaccctttag acgaggtgct ggaacaagtc ccgtataagc 9840cccctgtagg gaaaggcaca aaccctttag acgaggtgct ggaacaagtc ccgtataagc 9840
ccccacggac cgttatcatg catgtagagc agggtctcac cccccttgat ccaggtagat 9900ccccacggac cgttatcatg catgtagagc agggtctcac cccccttgat ccaggtagat 9900
accaaactcg ccgcggatta gtttccgtta ggcgtggaat taggggaaat gaagttgaac 9960accaaactcg ccgcggatta gtttccgtta ggcgtggaat taggggaaat gaagttgaac 9960
taccagacgg tgattatgct agcaccgcct tgctccctac ctgcaaagag atcaacatgg 10020taccagacgg tgattatgct agcaccgcct tgctccctac ctgcaaagag atcaacatgg 10020
tcgctgtcgc ttccaatgta ttgcgcagca ggttcatcat cggcccaccc ggtgcaggga 10080tcgctgtcgc ttccaatgta ttgcgcagca ggttcatcat cggcccaccc ggtgcaggga 10080
aaacatactg gctccttcaa caggtccagg acggtgatgt tatttacaca ccaactcacc 10140aaacatactg gctccttcaa caggtccagg acggtgatgt tatttacaca ccaactcacc 10140
agaccatgct tgacatgatc agggctttgg ggacgtgccg gttcaacgtc ccggcaggca 10200agaccatgct tgacatgatc agggctttgg ggacgtgccg gttcaacgtc ccggcaggca 10200
caacgctgca attccctgtc ccctcccgca ccggtccgtg ggttcgcatc ctggccggcg 10260caacgctgca attccctgtc ccctcccgca ccggtccgtg ggttcgcatc ctggccggcg 10260
gttggtgtcc tggcaagaat tccttcctag atgaagcagc gtattgcaac caccttgatg 10320gttggtgtcc tggcaagaat tccttcctag atgaagcagc gtattgcaac caccttgatg 10320
ttttgaggct tcttagcaaa actaccctca cctgtctagg agacttcaag caactccacc 10380ttttgaggct tcttagcaaa actaccctca cctgtctagg agacttcaag caactccacc 10380
cagtgggttt tgattctcat tgttatgttt ttgacatcat gcctcaaact caactgaaga 10440cagtgggttt tgattctcat tgttatgttt ttgacatcat gcctcaaact caactgaaga 10440
ccatctggag gttcggacag aatatctgtg atgccatcca gccagattac agggacaagc 10500ccatctggag gttcggacag aatatctgtg atgccatcca gccagattac agggacaagc 10500
tcatgtccat ggtcaacaca acccgtgtga cctacgtgga aagacctgtc aggtatgggc 1056010560
aggtcctcac cccctaccac agggaccgag aggacgacgc catcactatt gactccagtc 10620aggtcctcac cccctaccac agggaccgag aggacgacgc catcactatt gactccagtc 10620
aaggcgccac attcgatgtg gtcacattgc atttgcccac taaagattca ctcaacaggc 10680aaggcgccac attcgatgtg gtcacattgc atttgcccac taaagattca ctcaacaggc 10680
aaagagccct tgttgccatc accagggcta gacacgctat ctttgtgtat gacccacaca 10740aaagagccct tgttgccatc accagggcta gacacgctat ctttgtgtat gacccacaca 10740
ggcagctgca gagcttgttt gatcttcctg caaaaggcac acccgtcaac cttgcagtgc 10800ggcagctgca gagcttgttt gatcttcctg caaaaggcac acccgtcaac cttgcagtgc 10800
accgcgacgg gcagctgatc gtacttgata gaaataacaa agaatgcacg gttgctcagg 10860accgcgacgg gcagctgatc gtacttgata gaaataacaa agaatgcacg gttgctcagg 10860
ctctaggcaa cggggataaa ttcagggcca cagacaagcg tgttgcagat tcactccgcg 10920ctctaggcaa cggggataaa ttcaggggcca cagacaagcg tgttgcagat tcactccgcg 10920
ccatttgtgc tgatctagaa gggtcgagtt ctccgctccc caaggtcgca cacaacttgg 10980ccatttgtgc tgatctagaa gggtcgagtt ctccgctccc caaggtcgca cacaacttgg 10980
ggttttattt ctcacctgac ttaacacaat ttgccaaact cccagtggaa cttgcacctc 11040ggttttattt ctcacctgac ttaacacaat ttgccaaact cccagtggaa cttgcacctc 11040
attggcccgt ggtgacaacc cagaacaatg aaaagtggcc agatcggctg gtcgccagcc 11100attggcccgt ggtgacaacc cagaacaatg aaaagtggcc agatcggctg gtcgccagcc 11100
ttcgccctat ccataaatac agccgcgcgt gcatcggtgc cggctatatg gtgggccctt 11160ttcgccctat ccataaatac agccgcgcgt gcatcggtgc cggctatatg gtgggccctt 11160
cggtgtttct aggcactcct ggggtcgtat catactttct tacaaaattt gttaaaggcg 11220cggtgtttct aggcactcct ggggtcgtat catactttct tacaaaattt gttaaaggcg 11220
aggctcaaat gcttccagaa acagtcttca gcaccggccg aattgaggtg gattgccggg 11280aggctcaaat gcttccagaa acagtcttca gcaccggccg aattgaggtg gattgccggg 11280
aatatcttga cgatcgggag cgggaagttg ctgcatccct cccacacgcc tttattggcg 11340aatatcttga cgatcgggag cgggaagttg ctgcatccct cccacacgcc tttattggcg 11340
acgtcaaagg caccaccgtt ggcggatgtc atcatgtcac ctccaggtac cttcctcgct 11400acgtcaaagg caccaccgtt ggcggatgtc atcatgtcac ctccaggtac cttcctcgct 11400
tccttcccaa agagtcagtt gcggtagtcg gggtctcaag ccccgggaaa gccgcgaagg 11460tccttcccaa agagtcagtt gcggtagtcg gggtctcaag ccccgggaaa gccgcgaagg 11460
caatgtgcac actgacagat gtgtacctcc cagatcttga agcctatctc cacccggaga 11520caatgtgcac actgacagat gtgtacctcc cagatcttga agcctatctc cacccggaga 11520
cccagtccag gtgctggaaa atgatgttgg acttcaaaga agttcgactg atggtctgga 11580cccagtccag gtgctggaaa atgatgttgg acttcaaaga agttcgactg atggtctgga 11580
aagacaaaac ggcctatttc caacttgagg gtcgttattt cacctggtat cagctcgcta 1164011640
gttatgcctc gtacgtccgt gttcctgtca actccacggt gtacttggac ccctgcatgg 11700gttatgcctc gtacgtccgt gttcctgtca actccacggt gtacttggac ccctgcatgg 11700
gcccagccca ttgcaacaga cgagttgtcg ggtccactca gtggggagct gacctcgcaa 11760gcccagccca ttgcaacaga cgagttgtcg ggtccactca gtggggagct gacctcgcaa 11760
tcacccccta tgattatggc gccaagatca ttttgtctag cgcatatcac ggtgaaatgc 11820tcacccccta tgattatggc gccaagatca ttttgtctag cgcatatcac ggtgaaatgc 11820
cccctgggta caagattctg gcgtgtgcgg agttctcatt ggatgacccg gtcagataca 11880cccctgggta caagattctg gcgtgtgcgg agttctcatt ggatgacccg gtcagataca 11880
aacacacctg gggatttgag tcggatacag cgtacctgta cgagttcact ggaaatggtg 1194011940
aggattggga agattataat gatgcgtttc gtgcgcgcca gaaagggaaa atttataagg 12000aggattggga agattataat gatgcgtttc gtgcgcgcca gaaagggaaa atttataagg 12000
ccactgccac cagcttgaag ttttatttcc ctccgggccc tgtcgttgaa ccaactttgg 12060ccactgccac cagcttgaag ttttatttcc ctccgggccc tgtcgttgaa ccaactttgg 12060
gcctgaactg aaggcgcgcc atgaaatggg gtccatgcaa agcctttttt acaaaattgg 12120gcctgaactg aaggcgcgcc atgaaatggg gtccatgcaa agcctttttt acaaaattgg 12120
ccaacttttt gtggatgctt tcacggagtt cttggtgtcc attgttgata tcattatatt 12180ccaacttttt gtggatgctt tcacggagtt cttggtgtcc attgttgata tcattatatt 12180
tttggccatt ttgtttggct tcaccatcgc cggttggctg gtggtctttt gcatcagatt 12240tttggccatt ttgtttggct tcaccatcgc cggttggctg gtggtctttt gcatcagatt 12240
ggtttgctcc gcgatactcc gtacgcgccc tgccattcac tctgagcaat tacagaagat 12300ggtttgctcc gcgatactcc gtacgcgccc tgccattcac tctgagcaat tacagaagat 12300
cttatgaggc ctttctttcc cagtgccaag tggacattcc cacctgggga actaaacatc 12360cttatgaggc ctttctttcc cagtgccaag tggacattcc cacctgggga actaaacatc 12360
ctttggggat gctttggcac cataaggtgt caaccctgat tgatgaaatg gtgtcgcgtc 12420ctttggggat gctttggcac cataaggtgt caaccctgat tgatgaaatg gtgtcgcgtc 12420
gaatgtaccg catcatggaa aaagcagggc aggctgcctg gaaacaggtg gtgagcgagg 12480gaatgtaccg catcatggaa aaagcagggc aggctgcctg gaaacaggtg gtgagcgagg 12480
ctacgctgtc tcgcattagt agtttggatg tggtggctca ttttcagcat ctagccgcca 12540ctacgctgtc tcgcattagt agtttggatg tggtggctca ttttcagcat ctagccgcca 12540
ttgaagccga gacctgtaaa tatttggcct cccggctgcc catgctacac aacctgcgca 12600ttgaagccga gacctgtaaa tatttggcct cccggctgcc catgctacac aacctgcgca 12600
tgacaggttc aaatgtaacc atagtgtata atagcacttt gaatcaggtg tttgctattt 12660tgacaggttc aaatgtaacc atagtgtata atagcacttt gaatcaggtg tttgctattt 12660
ttccaacccc tggttcccgg ccaaagcttc atgattttca gcaatggtta atagctgtac 12720ttccaacccc tggttcccgg ccaaagcttc atgattttca gcaatggtta atagctgtac 12720
attcctccat attttcctct gttgcagctt cttgtactct ttttgttgtg ctgtggttgc 1278012780
gggttccaat actacgtact gtttttggtt tccgctggtt aggggcaatt tttctttcga 12840gggttccaat actacgtact gtttttggtt tccgctggtt aggggcaatt tttctttcga 12840
actcacagtg aattacacgg tgtgtccacc ttgcctcacc cggcaagcag ccacagagat 12900actcacagtg aattacacgg tgtgtccacc ttgcctcacc cggcaagcag ccacagagat 12900
ctacgaaccc ggtaggtctc tttggtgcag gatagggtat gaccgatgtg aggaggatga 1296012960
tcatgacgag ctagggttta tggtaccgcc tggcctctcc agcgaaggcc acttgactag 13020tcatgacgag ctagggttta tggtaccgcc tggcctctcc agcgaaggcc acttgactag 13020
tgtttacgcc tggttggcgt tcttgtcctt cagctacacg gcccagttcc atcccgagat 1308013080
attcgggata gggaatgtga gtcgagttta tgttgacatc aaacatcaac tcatctgcgc 13140attcgggata gggaatgtga gtcgagttta tgttgacatc aaacatcaac tcatctgcgc 13140
cgaacatgac gggcagaaca ccaccttgcc tcgtcatgac aacatttcag ccgtgtttca 13200cgaacatgac gggcagaaca ccaccttgcc tcgtcatgac aacatttcag ccgtgtttca 13200
gacctattac caacatcaag tcgacggcgg caattggttt cacctagaat ggcttcgtcc 13260gacctattac caacatcaag tcgacggcgg caattggttt cacctagaat ggcttcgtcc 13260
cttcttttcc tcgtggttgg ttttaaatgt ctcttggttt ctcaggcgtt cgcctgcaaa 1332013320
ccatgtttca gttcgagtct tgcagatatt aagaccaaca ccaccgcagc ggcaagcttt 13380ccatgtttca gttcgagtct tgcagatatt aagaccaaca ccaccgcagc ggcaagcttt 13380
gctgtcctcc aagacatcag ttgccttagg catcgcgact cggcctctga ggcgattcgc 13440gctgtcctcc aagacatcag ttgccttagg catcgcgact cggcctctga ggcgattcgc 13440
aaaatccctc agtgccgtac ggcgataggg acacccgtgt atgttaccat cacagccaat 13500aaaatccctc agtgccgtac ggcgataggg acacccgtgt atgttaccat cacagccaat 13500
gtgacagatg agaattattt acattcttct gatctcctca tgctttcttc ttgccttttc 13560gtgacagatg agaattattt acattcttct gatctcctca tgctttcttc ttgccttttc 13560
tatgcttctg agatgagtga aaagggattt aaggtggtat ttggcaatgt gtcaggcatc 1362013620
gtggctgtgt gtgtcaattt taccagctac gtccaacatg tcaaggagtt tacccaacgc 1368013680
tccctggtgg tcgaccatgt gcggttgctc catttcatga cacctgagac catgaggtgg 13740tccctggtgg tcgaccatgt gcggttgctc catttcatga cacctgagac catgaggtgg 13740
gcaactgttt tagcctgtct ttttgccatt ctgttggcaa tttgaatgtt taagtatgtt 13800gcaactgttt tagcctgtct ttttgccatt ctgttggcaa tttgaatgtt taagtatgtt 13800
ggagaaatgc ttgaccgcgg gctgttgctc gcaattgctt tctttgtggt gtatcgtgcc 13860ggagaaatgc ttgaccgcgg gctgttgctc gcaattgctt tctttgtggt gtatcgtgcc 13860
gttctgtttt gctgtgctcg ccaacgccag caacgacagc agctcccatc tacagctgat 13920gttctgtttt gctgtgctcg ccaacgccag caacgacagc agctcccatc tacagctgat 13920
ttacaacttg acgctatgtg agctgaatgg cacagattgg ctagctaaca aatttgattg 13980ttacaacttg acgctatgtg agctgaatgg cacagattgg ctagctaaca aatttgattg 13980
ggcagtggag agttttgtca tctttcccgt tttgactcac attgtctcct atggtgccct 14040ggcagtggag agttttgtca tctttcccgt tttgactcac attgtctcct atggtgccct 14040
cactaccagc catttccttg acacagtcgc tttagtcact gtgtctaccg ccgggtttgt 1410014100
tcacgggcgg tatgtcctaa gtagcatcta cgcggtctgt gccctggctg cgttgacttg 1416014160
cttcgtcatt aggtttgcaa agaattgcat gtcctggcgc tacgcgtgta ccagatatac 14220cttcgtcatt aggtttgcaa agaattgcat gtcctggcgc tacgcgtgta ccagatatac 14220
caactttctt ctggacacta agggcggact ctatcgttgg cggtcgcctg tcatcataga 14280caactttctt ctggacacta agggcggact ctatcgttgg cggtcgcctg tcatcataga 14280
gaaaaggggc aaagttgagg tcgaaggtca tctgatcgac ctcaaaagag ttgtgcttga 14340gaaaaggggc aaagttgagg tcgaaggtca tctgatcgac ctcaaaagag ttgtgcttga 14340
tggttccgtg gcaaccccta taaccagagt ttcagcggaa caatggggtc gtccttagat 14400tggttccgtg gcaaccccta taaccagagt ttcagcggaa caatggggtc gtccttagat 14400
gacttctgtc atgatagcac ggctccagaa aaggtgcttt tggcgttttc tattacctac 14460gacttctgtc atgatagcac ggctccagaa aaggtgcttt tggcgttttc tattacctac 14460
acgccagtga tgatatatgc cctaaaggtg agtcgcggcc gactgctagg gcttctgcac 14520acgccagtga tgatatatgc cctaaaggtg agtcgcggcc gactgctagg gcttctgcac 14520
cttttgatct tcctgaattg tgctttcacc ttcgggtaca tgactttcgc gcactttcag 14580cttttgatct tcctgaattg tgctttcacc ttcgggtaca tgactttcgc gcactttcag 14580
agtacaaata aggtcgcgct cactatggga gcagtagttg cactcctttg gggggtgtac 14640agtacaaata aggtcgcgct cactatggga gcagtagttg cactcctttg gggggtgtac 14640
tcagccatag aaacctggaa attcatcacc tccagatgcc gtttgtgctt gctaggccgc 14700tcagccatag aaacctggaa attcatcacc tccagatgcc gtttgtgctt gctaggccgc 14700
aagtacattc tggcccctgc ccaccacgtt gaaagtgccg caggctttca tccgattgcg 14760aagtacattc tggcccctgc ccaccacgtt gaaagtgccg caggctttca tccgattgcg 14760
gcaaatgata accacgcatt tgtcgtccgg cgtcccggct ccactacggt caacggcaca 14820gcaaatgata accacgcatt tgtcgtccgg cgtcccggct ccactacggt caacggcaca 14820
ttggtgcccg ggttaaaaag cctcgtgttg ggtggcagaa aagctgttaa acagggagtg 14880ttggtgcccg ggttaaaaag cctcgtgttg ggtggcagaa aagctgttaa acagggagtg 14880
gtaaaccttg tcaaatatgc caaataacaa cggcaagcag cagaagagaa agaaggggga 14940gtaaaccttg tcaaatatgc caaataacaa cggcaagcag cagaagagaa agaaggggga 14940
tggccagcca gtcaatcagc tgtgccagat gctgggtaag atcatcgctc agcaaaacca 15000tggccagcca gtcaatcagc tgtgccagat gctgggtaag atcatcgctc agcaaaacca 15000
gtccagaggc aagggaccgg gaaagaaaaa taagaagaaa aacccggaga agccccattt 1506015060
tcctctagcg actgaagatg atgtcagaca tcactttacc cctagtgagc ggcaattgtg 15120tcctctagcg actgaagatg atgtcagaca tcactttacc cctagtgagc ggcaattgtg 15120
tctgtcgtca atccagaccg cctttaatca aggcgctggg acttgcaccc tgtcagattc 15180tctgtcgtca atccagaccg cctttaatca aggcgctggg acttgcaccc tgtcagattc 15180
agggaggata agttacactg tggagtttag tttgcctacg catcatactg tgcgcctgat 15240agggaggata agttacactg tggagtttag tttgcctacg catcatactg tgcgcctgat 15240
ccgcgtcaca gcatcaccct cagcatgatg ggctggcatt cttgaggcat ctcagtgttt 15300ccgcgtcaca gcatcaccct cagcatgatg ggctggcatt cttgaggcat ctcagtgttt 15300
gaattggaag aatgtgtggt gaatggcact gattgacatt gtgcctctaa gtcacctatt 15360gaattggaag aatgtgtggt gaatggcact gattgacatt gtgcctctaa gtcacctatt 15360
caattagggc gaccgtgtgg gggtgagatt taattggcga gaaccatgcg gccgaaatta 15420caattagggc gaccgtgtgg gggtgagatt taattggcga gaaccatgcg gccgaaatta 15420
aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaa 15443aaaaaaaaaaaaaaaaaaa 15443
<210> 5<210> 5
<211> 609<211> 609
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<223> Последовательность NSP1-бета LMY<223> NSP1-beta sequence LMY
<400> 5<400> 5
gctgctgtct acgatgttgg tcatggcgcc gtcatgtatg tggccgatga gagagtctcc 60gctgctgtct acgatgttgg tcatggcgcc gtcatgtatg tggccgatga gagagtctcc 60
tgggcccctc gtggcgggga tgaagtaaga tttgaaactg tcccacagga gctcaagtcg 120tgggcccctc gtggcgggga tgaagtaaga tttgaaactg tcccacagga gctcaagtcg 120
gttgcgaacc aactctgcac ctccttccca ccccaccacg tagtggacat gtctaagttc 180gttgcgaacc aactctgcac ctccttccca ccccaccacg tagtggacat gtctaagttc 180
gcctttacag cccctgggtg tggtgtttct atgcgggtcg aacgtcaata tggctgtctc 240gcctttacag cccctgggtg tggtgtttct atgcgggtcg aacgtcaata tggctgtctc 240
cccgctgaca ctgtccccga aggcaactgc tggtggagct tgtttgactc gctcccattg 300cccgctgaca ctgtccccga aggcaactgc tggtggagct tgtttgactc gctcccattg 300
gaagtccagg gcaaagaaat tcgccatgct aaccaatttg gctaccagac caagcatggt 360gaagtccagg gcaaagaaat tcgccatgct aaccaatttg gctaccagac caagcatggt 360
gtctctggta agtacctaca gcggaggctg caaattaatg gtctccgagc agtagctgac 420gtctctggta agtacctaca gcggaggctg caaattaatg gtctccgagc agtagctgac 420
ccaaatggac ctttcgtcgt acagtacttc tccgtcaagg agagttggat ccgccacttg 480ccaaatggac ctttcgtcgt acagtacttc tccgtcaagg agagttggat ccgccacttg 480
aaactagcgg aagaacccag ttaccctggg tttgaggacc tcctcagaat aagggttgag 540aaactagcgg aagaacccag ttaccctggg tttgaggacc tcctcagaat aagggttgag 540
tctaacacgt caccattggc taacaaggat gaaaaaattt tccggtttgg cagtcataag 600tctaacacgt caccattggc taacaaggat gaaaaaattt tccggtttgg cagtcataag 600
tggtacggc 609tggtacggc 609
<210> 6<210> 6
<211> 609<211> 609
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<223> Последовательность NSP1-бета LMY ver2<223> NSP1-beta sequence LMY ver2
<400> 6<400> 6
gccgccgtat acgacgtcgg acatggcgcc gttatgtacg ttgccgacga gagagtctcc 60gccgccgtat acgacgtcgg acatggcgcc gttatgtacg ttgccgacga gagagtctcc 60
tgggcccctc gcggcggcga cgaagttaga ttcgaaacgg tcccacagga gcttaagtcg 120tgggcccctc gcggcggcga cgaagttaga ttcgaaacgg tcccacagga gcttaagtcg 120
gttgcgaacc aattatgtac gtcgttccca ccccaccacg tagtcgatat gtctaagttc 180gttgcgaacc aattatgtac gtcgttccca ccccaccacg tagtcgatat gtctaagttc 180
gcctttaccg cccccggttg cggcgtatct atgcgggtcg aacgtcaata cggctgtctc 240gcctttaccg cccccggttg cggcgtatct atgcgggtcg aacgtcaata cggctgtctc 240
cccgccgata cggtccccga aggcaactgt tggtggagct tgttcgattc gctcccactc 300cccgccgata cggtccccga aggcaactgt tggtggagct tgttcgattc gctcccactc 300
gaagtgcaag gcaaagagat tcgccacgct aaccaattcg ggtatcagac taagcatggc 360gaagtgcaag gcaaagagat tcgccacgct aaccaattcg ggtatcagac taagcatggc 360
gtatccggta agtacctaca gcgtaggctg caaatcaacg gtctccgcgc agtcgctgac 420gtatccggta agtacctaca gcgtaggctg caaatcaacg gtctccgcgc agtcgctgac 420
cctaacggac ctttcgtcgt acagtacttc tccgtcaagg agagttggat ccgccacttg 480cctaacggac ctttcgtcgt acagtacttc tccgtcaagg agagttggat ccgccacttg 480
aaactggccg aagaacctag ttaccccggg ttcgaggacc tcctccgcat aagggttgag 540aaactggccg aagaacctag ttacccgggg ttcgaggacc tcctccgcat aagggttgag 540
tctaatacgt caccattggc taacaaggac gaaaaaattt tccggtttgg cagtcataag 600tctaatacgt caccattggc taacaaggac gaaaaaattt tccggtttgg cagtcataag 600
tggtacggc 609tggtacggc 609
<210> 7<210> 7
<211> 8<211> 8
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<223> Сайт распознавания рестриктазы AscI<223> AscI restriction enzyme recognition site
<400> 7<400> 7
ggcgcgcc 8ggcgcgcc 8
<210> 8<210> 8
<211> 8<211> 8
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<223> Сайт распознавания рестриктазы PacI<223> PacI restriction enzyme recognition site
<400> 8<400> 8
ttaattaa 8ttaattaa 8
<210> 9<210> 9
<211> 23<211> 23
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<223> Прямой ПЦР-праймер для амплификации ДНК LMY<223> Direct PCR primer for LMY DNA amplification
<400> 9<400> 9
atgacgtata ggtgttggct cta 23atgacgtata ggtgttggct cta 23
<210> 10<210> 10
<211> 20<211> 20
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<223> Обратный ПЦР-праймер для амплификации ДНК LMY<223> Reverse PCR primer for LMY DNA amplification
<400> 10<400> 10
ctgaggattt ggatggcatt 20ctgaggattt ggatggcatt 20
<210> 11<210> 11
<211> 1149<211> 1149
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<223> Ген NSP1 LMY<223> NSP1 LMY gene
<400> 11<400> 11
atgtctggga tacttgatcg gtgcacgtgt acccccaatg ccagggtgtt tatggcggag 60atgtctggga tacttgatcg gtgcacgtgt acccccaatg ccagggtgtt tatggcggag 60
ggccaagttt actgcacacg atgtctcagt gcacggtctc tccttcccct gaatctccaa 120ggccaagttt actgcacacg atgtctcagt gcacggtctc tccttcccct gaatctccaa 120
gtttctgagc tcggggtgct gggcctattc tacaggcccg aagagccact ccggtggacg 180gtttctgagc tcggggtgct gggcctattc tacaggcccg aagagccact ccggtggacg 180
ttgccacgtg cattccccac tgttgagtgc tcccccgccg gggcctgctg gctttctgca 240ttgccacgtg cattccccac tgttgagtgc tcccccgccg gggcctgctg gctttctgca 240
atctttccaa ttgcacgaat gaccagtgga aacctaaact tccaacaaag aatggtacgg 300atctttccaa ttgcacgaat gaccagtgga aacctaaact tccaacaaag aatggtacgg 300
gtcgcagctg agatctacag agttggccag ctcacccctg cagttttgaa ggctctacaa 360gtcgcagctg agatctacag agttggccag ctcacccctg cagttttgaa ggctctacaa 360
gtttatgagc ggggttgccg ctggtatccc attgttggac ctgtccctgg agtggccgtt 420gtttatgagc ggggttgccg ctggtatccc attgttggac ctgtccctgg agtggccgtt 420
ttcgccaact ccctgcatgt gagtgataga cctttcccgg gagcaactca cgtattaacc 480ttcgccaact ccctgcatgt gagtgataga cctttcccgg gagcaactca cgtattaacc 480
aacctgccac tcccgcagag acccaagcct gaggactttt gccccttcga gtgtgctatg 540aacctgccac tcccgcagag acccaagcct gaggactttt gccccttcga gtgtgctatg 540
gctgctgtct acgatgttgg tcatggcgcc gtcatgtatg tggccgatga gagagtctcc 600gctgctgtct acgatgttgg tcatggcgcc gtcatgtatg tggccgatga gagagtctcc 600
tgggcccctc gtggcgggga tgaagtaaga tttgaaactg tcccacagga gctcaagtcg 660tgggcccctc gtggcgggga tgaagtaaga tttgaaactg tcccacagga gctcaagtcg 660
gttgcgaacc aactctgcac ctccttccca ccccaccacg tagtggacat gtctaagttc 720gttgcgaacc aactctgcac ctccttccca ccccaccacg tagtggacat gtctaagttc 720
gcctttacag cccctgggtg tggtgtttct atgcgggtcg aacgtcaata tggctgtctc 780gcctttacag cccctgggtg tggtgtttct atgcgggtcg aacgtcaata tggctgtctc 780
cccgctgaca ctgtccccga aggcaactgc tggtggagct tgtttgactc gctcccattg 840cccgctgaca ctgtccccga aggcaactgc tggtggagct tgtttgactc gctcccattg 840
gaagtccagg gcaaagaaat tcgccatgct aaccaatttg gctaccagac caagcatggt 900gaagtccagg gcaaagaaat tcgccatgct aaccaatttg gctaccagac caagcatggt 900
gtctctggta agtacctaca gcggaggctg caaattaatg gtctccgagc agtagctgac 960gtctctggta agtacctaca gcggaggctg caaattaatg gtctccgagc agtagctgac 960
ccaaatggac ctttcgtcgt acagtacttc tccgtcaagg agagttggat ccgccacttg 1020ccaaatggac ctttcgtcgt acagtacttc tccgtcaagg agagttggat ccgccacttg 1020
aaactagcgg aagaacccag ttaccctggg tttgaggacc tcctcagaat aagggttgag 1080aaactagcgg aagaacccag ttaccctggg tttgaggacc tcctcagaat aagggttgag 1080
tctaacacgt caccattggc taacaaggat gaaaaaattt tccggtttgg cagtcataag 1140tctaacacgt caccattggc taacaaggat gaaaaaattt tccggtttgg cagtcataag 1140
tggtacggc 1149tggtacggc 1149
<210> 12<210> 12
<211> 1149<211> 1149
<212> DNA<212> DNA
<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence
<220><220>
<223> Ген NSP1 LMY ver2<223> NSP1 gene LMY ver2
<400> 12<400> 12
atgtctggga tacttgatcg gtgcacgtgt acccccaatg ccagggtgtt tatggcggag 60atgtctggga tacttgatcg gtgcacgtgt acccccaatg ccagggtgtt tatggcggag 60
ggccaagttt actgcacacg atgtctcagt gcacggtctc tccttcccct gaatctccaa 120ggccaagttt actgcacacg atgtctcagt gcacggtctc tccttcccct gaatctccaa 120
gtttctgagc tcggggtgct gggcctattc tacaggcccg aagagccact ccggtggacg 180gtttctgagc tcggggtgct gggcctattc tacaggcccg aagagccact ccggtggacg 180
ttgccacgtg cattccccac tgttgagtgc tcccccgccg gcgcatgctg gctttccgct 240ttgccacgtg cattccccac tgttgagtgc tcccccgccg gcgcatgctg gctttccgct 240
atctttccaa tcgcacgaat gaccagtgga aacctaaact tccaacaaag aatggtacgg 300atctttccaa tcgcacgaat gaccagtgga aacctaaact tccaacaaag aatggtacgg 300
gtcgccgccg aaatatacag agtcgggcaa cttacgcccg ctgtattgaa ggctctgcaa 360360
gtatacgagc ggggttgtag gtggtatccc atcgtaggac ctgtccctgg agtggccgtt 420gtatacgagc ggggttgtag gtggtatccc atcgtaggac ctgtccctgg agtggccgtt 420
ttcgccaact ccctgcatgt gagtgataga cctttcccgg gagcaactca cgtattaacc 480ttcgccaact ccctgcatgt gagtgataga cctttcccgg gagcaactca cgtattaacc 480
aacctgccac tcccgcagag acccaagcct gaggactttt gccccttcga gtgtgctatg 540aacctgccac tcccgcagag acccaagcct gaggactttt gccccttcga gtgtgctatg 540
gccgccgtat acgacgtcgg acatggcgcc gttatgtacg ttgccgacga gagagtctcc 600gccgccgtat acgacgtcgg acatggcgcc gttatgtacg ttgccgacga gagagtctcc 600
tgggcccctc gcggcggcga cgaagttaga ttcgaaacgg tcccacagga gcttaagtcg 660tgggcccctc gcggcggcga cgaagttaga ttcgaaacgg tcccacagga gcttaagtcg 660
gttgcgaacc aattatgtac gtcgttccca ccccaccacg tagtcgatat gtctaagttc 720gttgcgaacc aattatgtac gtcgttccca ccccaccacg tagtcgatat gtctaagttc 720
gcctttaccg cccccggttg cggcgtatct atgcgggtcg aacgtcaata cggctgtctc 780gcctttaccg cccccggttg cggcgtatct atgcgggtcg aacgtcaata cggctgtctc 780
cccgccgata cggtccccga aggcaactgt tggtggagct tgttcgattc gctcccactc 840cccgccgata cggtccccga aggcaactgt tggtggagct tgttcgattc gctcccactc 840
gaagtgcaag gcaaagagat tcgccacgct aaccaattcg ggtatcagac taagcatggc 900gaagtgcaag gcaaagagat tcgccacgct aaccaattcg ggtatcagac taagcatggc 900
gtatccggta agtacctaca gcgtaggctg caaatcaacg gtctccgcgc agtcgctgac 960gtatccggta agtacctaca gcgtaggctg caaatcaacg gtctccgcgc agtcgctgac 960
cctaacggac ctttcgtcgt acagtacttc tccgtcaagg agagttggat ccgccacttg 10201020
aaactggccg aagaacctag ttaccccggg ttcgaggacc tcctccgcat aagggttgag 1080aaactggccg aagaacctag ttacccgggg ttcgaggacc tcctccgcat aagggttgag 1080
tctaatacgt caccattggc taacaaggac gaaaaaattt tccggtttgg cagtcataag 1140tctaatacgt caccattggc taacaaggac gaaaaaattt tccggtttgg cagtcataag 1140
tggtacggc 1149tggtacggc 1149
<---<---
Claims (18)
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR10-2018-0171306 | 2018-12-27 | ||
KR10-2019-0145389 | 2019-11-13 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2781446C1 true RU2781446C1 (en) | 2022-10-12 |
Family
ID=
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN116036253A (en) * | 2022-11-24 | 2023-05-02 | 畜科生物工程有限公司 | Live vaccine for porcine reproductive and respiratory syndrome and preparation method thereof |
RU2825899C1 (en) * | 2024-01-12 | 2024-09-02 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" ФГБУ "ВНИИЗЖ" | Live cultural dry vaccine against porcine reproductive-respiratory syndrome and method for preparing vaccine |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7608272B2 (en) * | 2005-08-30 | 2009-10-27 | Board Of Regents Of The University Of Nebraska | Methods and compositions for vaccination of animals with PRRSV antigens with improved immunogenicity |
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7608272B2 (en) * | 2005-08-30 | 2009-10-27 | Board Of Regents Of The University Of Nebraska | Methods and compositions for vaccination of animals with PRRSV antigens with improved immunogenicity |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
Data Basa online GenBank, DQ473474.1, 25 сентября 2006 г. Найдено в интернет 23.12.21 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/DQ473474.1?report=genbank&log$=nuclalign&blast_rank=1&RID=WK9VBFJE016 ), SEQ ID NO: 4;. Инструкция по применению вакцины Прогрессис от вируса репродуктивно-респираторного синдрома свиней, 11.07.2017, стр. 1. http://trionisvet.ru/upload/iblock/e72/e72991fa7af50bd998a10a96931a374c.pdf), весь документ. * |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN116036253A (en) * | 2022-11-24 | 2023-05-02 | 畜科生物工程有限公司 | Live vaccine for porcine reproductive and respiratory syndrome and preparation method thereof |
RU2825899C1 (en) * | 2024-01-12 | 2024-09-02 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" ФГБУ "ВНИИЗЖ" | Live cultural dry vaccine against porcine reproductive-respiratory syndrome and method for preparing vaccine |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US11911454B2 (en) | Effective vaccination against porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) virus prior to weaning | |
US11904011B2 (en) | North American porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) virus and uses thereof | |
CA2599322C (en) | N protein mutants of porcine reproductive and respiratory syndrome virus | |
US9315781B2 (en) | Infectious CDNA clone of european PRRS virus and uses thereof | |
KR102335864B1 (en) | Chimeric strain of porcine reproductive and respiratory syndrome virus and antiviral vaccines including the same | |
KR102193460B1 (en) | Vaccine composition for preventing porcine reproductive and respiratory syndrome and preventing method thereof | |
RU2781446C1 (en) | Chimeric porcine reproductive and respiratory syndrome virus and vaccine using said virus | |
EP4098741A1 (en) | Mutant strain of european porcine reproductive and respiratory syndrome virus and vaccine composition comprising same | |
KR20240019014A (en) | Chimeric strains of North American and European porcine reproductive and respiratory syndrome viruses | |
KR20240019015A (en) | Method for preparing chimeras of North American and European porcine reproductive and respiratory syndrome viruses |