RU2779840C1 - Способ микробиологического анализа на основе оптического метода и портативный микробиологический анализатор - Google Patents
Способ микробиологического анализа на основе оптического метода и портативный микробиологический анализатор Download PDFInfo
- Publication number
- RU2779840C1 RU2779840C1 RU2021111818A RU2021111818A RU2779840C1 RU 2779840 C1 RU2779840 C1 RU 2779840C1 RU 2021111818 A RU2021111818 A RU 2021111818A RU 2021111818 A RU2021111818 A RU 2021111818A RU 2779840 C1 RU2779840 C1 RU 2779840C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- microbiological
- microorganisms
- analyzer
- medium
- samples
- Prior art date
Links
- 230000002906 microbiologic Effects 0.000 title claims abstract description 64
- 230000003287 optical Effects 0.000 title claims abstract description 29
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 title claims abstract description 19
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 45
- PLXBWHJQWKZRKG-UHFFFAOYSA-N Resazurin Chemical compound C1=CC(=O)C=C2OC3=CC(O)=CC=C3[N+]([O-])=C21 PLXBWHJQWKZRKG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 21
- 210000004027 cells Anatomy 0.000 claims description 19
- 230000004907 flux Effects 0.000 claims description 18
- 238000005286 illumination Methods 0.000 claims description 14
- 230000003993 interaction Effects 0.000 claims description 11
- 238000005259 measurement Methods 0.000 claims description 10
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 9
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 claims description 5
- 230000032823 cell division Effects 0.000 claims description 5
- 238000009629 microbiological culture Methods 0.000 claims description 5
- 230000003851 biochemical process Effects 0.000 claims description 4
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 claims description 4
- 230000004044 response Effects 0.000 claims description 4
- 210000004460 N cell Anatomy 0.000 claims description 3
- 230000000712 assembly Effects 0.000 claims description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 6
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 abstract description 3
- 230000000813 microbial Effects 0.000 abstract description 2
- 238000004450 types of analysis Methods 0.000 abstract 1
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 33
- 239000002609 media Substances 0.000 description 21
- 108010054147 Hemoglobins Proteins 0.000 description 9
- 102000001554 Hemoglobins Human genes 0.000 description 9
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 4
- 230000000875 corresponding Effects 0.000 description 4
- HSSLDCABUXLXKM-UHFFFAOYSA-N resorufin Chemical compound C1=CC(=O)C=C2OC3=CC(O)=CC=C3N=C21 HSSLDCABUXLXKM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 208000007502 Anemia Diseases 0.000 description 3
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 3
- 210000004544 DC2 Anatomy 0.000 description 3
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 3
- 238000011161 development Methods 0.000 description 3
- 230000002530 ischemic preconditioning Effects 0.000 description 3
- 230000031700 light absorption Effects 0.000 description 3
- 238000004451 qualitative analysis Methods 0.000 description 3
- 238000004445 quantitative analysis Methods 0.000 description 3
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 2
- 210000003743 Erythrocytes Anatomy 0.000 description 2
- 210000004080 Milk Anatomy 0.000 description 2
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 2
- 102000004965 antibodies Human genes 0.000 description 2
- 108090001123 antibodies Proteins 0.000 description 2
- 244000052616 bacterial pathogens Species 0.000 description 2
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 2
- 235000013365 dairy product Nutrition 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 2
- 229940079593 drugs Drugs 0.000 description 2
- 230000032686 female pregnancy Effects 0.000 description 2
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 2
- 235000013336 milk Nutrition 0.000 description 2
- 239000008267 milk Substances 0.000 description 2
- 238000010606 normalization Methods 0.000 description 2
- 238000006213 oxygenation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000035935 pregnancy Effects 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- IVGPGQSSDLDOLH-UHFFFAOYSA-M sodium;10-oxido-7-oxophenoxazin-10-ium-3-olate Chemical compound [Na+].C1=CC(=O)C=C2OC3=CC([O-])=CC=C3[N+]([O-])=C21 IVGPGQSSDLDOLH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- XOHUEYCVLUUEJJ-UHFFFAOYSA-N 2,3-DPG Chemical compound OP(=O)(O)OC(C(=O)O)COP(O)(O)=O XOHUEYCVLUUEJJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000006673 Asthma Diseases 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N D-Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 240000001046 Lactobacillus acidophilus Species 0.000 description 1
- 229940039695 Lactobacillus acidophilus Drugs 0.000 description 1
- 235000013956 Lactobacillus acidophilus Nutrition 0.000 description 1
- 108010064719 Oxyhemoglobins Proteins 0.000 description 1
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 1
- 238000000862 absorption spectrum Methods 0.000 description 1
- 238000004164 analytical calibration Methods 0.000 description 1
- 230000002238 attenuated Effects 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial Effects 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 238000011088 calibration curve Methods 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 238000001516 cell proliferation assay Methods 0.000 description 1
- 230000003833 cell viability Effects 0.000 description 1
- 235000013339 cereals Nutrition 0.000 description 1
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 230000005670 electromagnetic radiation Effects 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 238000003891 environmental analysis Methods 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic Effects 0.000 description 1
- 235000013312 flour Nutrition 0.000 description 1
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 1
- 238000005755 formation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 239000001963 growth media Substances 0.000 description 1
- 238000000968 medical method and process Methods 0.000 description 1
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 238000000424 optical density measurement Methods 0.000 description 1
- 238000000399 optical microscopy Methods 0.000 description 1
- MYMOFIZGZYHOMD-UHFFFAOYSA-N oxygen Chemical compound O=O MYMOFIZGZYHOMD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 1
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 1
- 238000006479 redox reaction Methods 0.000 description 1
- 230000035806 respiratory chain Effects 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 230000003595 spectral Effects 0.000 description 1
- 238000002798 spectrophotometry method Methods 0.000 description 1
- 231100000747 viability assay Toxicity 0.000 description 1
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 1
- 230000003313 weakening Effects 0.000 description 1
- 239000012224 working solution Substances 0.000 description 1
Images
Abstract
Изобретение относится к области анализа материалов с использованием оптических средств, а именно к способам и устройствам микробиологических анализов, и может быть использовано в качестве основного инструмента для оценки динамики популяций микроорганизмов в исследуемой среде. 2 н.п. ф-лы, 2 ил., 1 пр.
Description
Заявляемое в качестве изобретения техническое решение относится к области анализа материалов с использованием оптических средств, а именно к способам и устройствам для проведения микробиологических анализов и может быть использовано в качестве основного инструмента для оценки динамики популяций микроорганизмов в исследуемой среде.
В настоящее время современные серийно выпускаемые фотометры, рассчитанные на работу с наиболее распространенными микробиологическими планшетами, такие как, например, Микропланшетный фотометр Immunochem-2100 [url: http://www.intermedika.ru/catalog/katalog/laboratornoe-oborudovanie/oborudovanie-dlja-ifa/immunochem-2100] или Фотометр для микропланшетов iMark [url: https://all-pribors.ru/opisanie/68941-17-mark-isp-imark-78423] - предназначены для измерений оптической плотности в лунках стандартного 96-луночногопланшета при проведении различного рода исследований (иммуноферментный анализ, биохимические исследования).Принцип действия фотометров основан на измерении оптической плотности анализируемых проб в 96-луночных планшетах. Для коррекции нестабильности источника света используется опорный световой канал. Выделение необходимой длины волны в световомпотоке производится при помощи узкополосных интерференционных фильтров. Световой поток падает через верхний блок линз сверху, на лунку с измеряемым образцом. Ослабленный пробой световой поток регистрируется фотодетектором, расположенным под образцом. В момент измерения каретка с микропланшетом перемещается относительно светового потока. Достоинствами вышеперечисленных фотометров, предлагаемых на рынке, является то, что эти приборы многофункциональны, пригодны для проведения всех методов иммуноферментного анализа, причем встроенная система управления объединяет в себе все основные функции и не требует дополнительного подключения к компьютеру.
Общим признаком фотометра с заявляемым техническим решением является принцип действия, основанный на измерении оптической плотности.
Однако предлагаемые серийно выпускаемые фотометры характеризуются высокой стоимостью, громоздкостью (характерные габаритные размеры составляют несколько десятков сантиметров; вес – от нескольких до более чем десяти килограммов), необходимостью постоянного подключения для работы к сети 220 В, необходимостью наличия специализированного проприетарного программного обеспечения для обработки снимаемых сигналов.
Предшествующий уровень техники в отношении устройств микробиологического анализа характеризуется известными альтернативными техническими решениями, среди которых можно отметить следующие.
Патент Канады № CA2291122C от 22.05.1998г., МПК: G01N21 / 6452, опубликованный 26.11.1998г., защищающий устройство и способ автоматизированного микробиологического анализа (Automated microbiological testing apparatus and methods therefor). Недостатками данного технического решения являются: - наличие движущихся частей в виде карусели, обеспечивающей последовательное освещение ячеек микробиологических планшетов одним линейным источником света; - регистрация светопропускания единственным светоприемником, что требует дополнительной постобработки полученных изображений для выделения сигнала с каждой из ячеек; - громоздкий размер агрегата с характерными размерами в несколько десятков сантиметров.
Другим примером развития техники является техническое решение по патенту РФ №2103369 от 06.05.1996г., МПК: C12Q 1/06, опубликованному 27.01.1998 г. и защищающему экспресс-анализатор концентрации бактерий в водной среде. Экспресс-анализатор содержит светонепроницаемый кожух, кювету или проточную оптическую ячейку, фотоприемник – телевизионную камеру, блок сравнения, программируемый блок памяти темно-красного цвета, электрический счетчик количества бактерий кишечной палочки розового цвета, электрический счетчик прозрачных бактерий кишечной палочки, сумматор-вычислитель коли-индекса, вычислитель коли-титра, блок индикации, цифро-аналоговый преобразователь.
Общими признаками являются наличие источника и приемника света, устройства управления, блока анализа.
Недостатками технического решения по патенту РФ №2103369 являются использование громоздкого компонента-фотоприемника – телевизионной камеры, возможность работы только с одной кюветой большого объема, т.е. несовместимость с микробиологическим планшетом, вывод результатов измерений в цифровом виде для последующей компьютерной обработки, узкая специализация анализатора в диапазонах длин волн, типичных для окрашенных бактерий кишечной палочки.
Известен способ оценки угрозы развития анемии на третьем триместре гестации (прототип) по патенту России на изобретение №2553361 от 19.06.2014г., МПК: G01N 33/50, опубликованному 10.06.2015г., включающий определение титра антител к цитомегаловирусу, содержания в эритроцитах 2,3 ДФГ (2,3-дифосфоглицерата), оксигемоглобина. При увеличении титра антител к цитомегаловирусу до 1:1600, нарастании 2,3 ДФГ до 6,7±0,3 мкмоль/мл, содержании HbO2 95,0±1,7%, при снижении удельной оптической плотности гемоглобина до 0,70±0,01 делают вывод о формировании угрозы развития анемии. Способ позволяет изучить характер нарушения оксигенации гемоглобина с помощью определения удельной оптической плотности.
В прототипе целью разработки является нахождение и разработка нового способа оценки степени оксигенации гемоглобина методом измерения удельной оптической плотности. Как выявлено в прототипе, электронная структура молекул предполагает способность поглощать электромагнитное излучение, при этом весьма характерны спектры поглощения гемоглобина, что и используется для количественной оценки степени насыщения гемоглобина кислородом. Поглощение света молекулами проявляется в ослаблении светового потока после его прохождения через объект, т.е. поглощение света объектом тем выше, чем выше его плотность. Это выведено законом Бугера-Ламберга-Бера и измеряется показателем удельной оптической плотности, которая является достаточно точной характеристикой. Способ и устройство прототипа позволяет определять фотометрические параметры клеток для диагностики заболеваний, в описании прототипа одно из исследований этим аппаратом было проведено на больных бронхиальной астмой для определения гемоглобина в эритроцитах периферической крови.
Техническое решение прототипа обладает признаками сходства с заявляемым техническим решением, такими как применение измерения оптической плотности, автоматизированная работа созданного на основе предложенного способа цитофотометрического, индивидуальный анализ конкретных микробиологических образцов.
Недостатками прототипа являются: относительно узкий диапазон применения, разработанная формула предназначена только для анализа клеток гемоглобина при определении угрозы развития анемии на третьем триместре гестации. Кроме того, критикуемые в прототипе особенности спектрофотометрического метода, тем не менее, не приводят к ясности в отношении сущности предлагаемого способа оценки. Авторы технического решения прототипа пишут в описании, что при гомогенном строении вещества (таком как гемоглобин) интенсивность света во всех точках оптического пути одинакова, однако это утверждение неправильно, т.к. интенсивность светового потока при прохождении через вещество одинакова и интенсивность поглощения света веществом будет в этом случае одинакова. Скорость изменения интенсивности будет одинакова в описанных условиях анализа такого вещества как гемоглобин.
Следовательно, способ-прототип не позволяет проводить измерение оптической плотности в условиях конкретных параметров широкого спектра анализируемых образцов. Применение метода, использованного в прототипе, в частности, затруднительно при исследовании бактериальных культур.
Заявляемое техническое решение позволяет придать универсальность задаче проведения микробиологического анализа, а его применение позволяет осуществлять работу портативного анализатора даже в условиях отсутствия возможности подключения сетевого электропитания к измерительному устройству, при этом применение заявляемого способа позволяет проводить как качественный, так и количественный анализ.
Заявляемые способ и устройство работают с применением резазуринового теста.
Резазуриновый тест является одним из современных методов микробиологического анализа как в фундаментальных, так и в прикладных исследованиях, что подтверждают литературные источники в узкой специальной области:
- Präbst K., Engelhardt H., Ringgeler S., Hübner H. Basic colorimetric proliferation assays: MTT, WST, and Resazurin // Cell Viability Assays: Methods and Protocols / Eds.: D. F. Gilbert and O. Friedrich. Springer Science+Business Media. 2017. P. 1–17;
- ГОСТ 32901–2014 Молоко и молочная продукция. Методы микробиологического анализа. Введен 01.01.2016. М.: Стандартинформ, 2015. 28 с.
Резазуриновый тест основан на способности живых клеток в процессе дыхания восстанавливать резазурин (7-гидрокси-3Н-феноксазин-3-он-10-оксид), индикатор, имеющих голубой цвет сазурина (пиковое поглощение 605 нм) в резоруфин (7-гидрокси-3Н-феноксазин-3-он), имеющий розовый цвет (пиковое поглощение 573 нм).
Помимо качественного анализа, основанного на сравнении цвета микробиологической пробы, приготовленной в присутствии резазуриново-натриевой соли, со стандартизированной колориметрической шкалой, используются также методы количественного анализа, основанного как на изменении оптической плотности меняющего цвет раствора, так и на спектрофотометрической регистрации сигнала, так как резоруфин, в отличие от резазурина, является флуоресцентным.
Однако проблема заключается в том, что большинство спектрофотометров являются громоздкими и сложными в обращении устройствами, что исключает их широкое применение вне специально оборудованных лабораторий, а также в полевых условиях. Аналогичная проблема существует в практической реализации методов измерения оптической плотности на основе промышленных фотометров, примеры которых приведены нами выше, предназначенных для работы со стандартными микробиологическими планшетами.
Помимо этого, проведение резазуринового теста при исследовании патогенных микроорганизмов, в частности, его широкое распространение для исследования роста культуры микобактерий, как в клинических пробах, так при анализе их лекарственной чувствительности требует регулярного перемещения микробиологического планшета из помещения в зоне биологической опасности, в которой осуществляется непосредственное выращивание культур в условиях повышенной температуры и влажности, в место размещения спектро- или фотометра, что приводит к повышению опасности контаминации. Примеры таких процессов описаны в источнике: Palomino, J. C., Martin, A., Camacho, M., Guerra, H., Swings, J., Portaels, F. Resazurinmicrotiterassayplate: simpleandinexpensivemethodfordetectionofdrugresistanceinMycobacteriumtuberculosis // Antimicrobialagentsandchemotherapy. 2002. V. 46. P. 2720-2722.
Заявляемое техническое решение призвано решить вышеуказанные проблемы.
Цель разработки заявляемого технического решения – автоматизация процесса микробиологического анализа на основе оптического метода, создание портативного прибора для микробиологического исследования роста микроорганизмов в условиях, приближенных к реальным лечебно-диагностическим процессам.
Техническая задача заявляемого изобретения заключается в разработке оптимальных параметров эффективного способа и портативного автономного устройства, которые позволят проводить микробиологические исследования жизнедеятельности и роста микроорганизмов на основе получения количественных характеристик изменения оптической плотности исследуемой культурной среды, содержащей индикатор, вследствие изменения её окраски.
Техническим результатом заявленного изобретения является применение на практике способа микробиологического анализа на основе оптического метода с качественной и количественной оценкой динамики популяций микробиологических культур; расчет и визуализация, на основе полученных данных, кривой популяционного роста; обеспечение возможности количественной оценки динамики популяций микробиологических культур при помощи редуктазной пробы с резазурином, в том числе в условиях отсутствия возможности подключения сетевого электропитания к измерительному устройству, а также при наличии массогабаритных ограничений к нему.
В результате решения поставленной задачи доказана возможность применения редуктазной пробы с резазурином для количественной оценки динамики популяции микроорганизмов при помощи разрабатываемого портативного микробиологического анализатора. Испытания подтвердили возможность применения заявляемого устройства, технический результат был достигнут.
Сущность заявляемого технического решения – способа состоит в том, что способ микробиологического анализа на основе оптического метода с качественной и количественной оценкой динамики популяций микробиологических культур включает подключение источника питания к узлу управления, установление режима работы, передачу сигнала включения/отключения осветительного узла, излучение начального светового потока, оценку прошедшего светового потока через микробиологический планшет с пробами исследуемой среды, при этом осветительный узел формирует световой поток в полосе излучения 600-605 нм, при этом пробы исследуемой среды содержат микроорганизмы и раствор резазурина, а микробиологический планшет с пробами исследуемой среды помещают в анализатор и при помощи элементов взаимодействия с оператором задают режимы работы устройства, а именно определяют продолжительность проведения эксперимента, частоту включения анализирующих элементов в единицу времени, вид исследуемых микроорганизмов, количество N активных ячеек, в которые помещены образцы исследуемой среды, и после задания всех начальных условий запускают процесс измерения оптической плотности исследуемых растворов, а далее по каналу передачи данных отправляют полученные при оценке данные на узел управления, который обрабатывает их и на основе градуировочных данных, рассчитывает оптическую плотность среды и конвертирует её в количество содержащихся в ней микроорганизмов; далее передают данные о количестве микроорганизмов в среде при помощи внешних интерфейсов передачи данных, считывают по внешним интерфейсам передачи данных данные о количестве микроорганизмов в среде, передают данные о количестве микроорганизмов в среде на элементы взаимодействия с оператором; при качественной оценке количества микроорганизмов, основанной на том факте, что максимальное значение освещенности датчиков фотоприемников соответствует максимальному количеству микроорганизмов, находящихся в растворе, строят фотометрическую кривую, согласованную с математической моделью отклика биохимического процесса в индикаторной среде на динамику роста популяции микроорганизмов, а количественные измерения проводят на основе данных об изменении интенсивности светового потока в ходе изменения количества микроорганизмов в среде, полученных с анализирующего узла портативного микробиологического анализатора, проводя их усреднение по набору кривых от ячеек микробиологического планшета с последующей обработкой выборки по времени скользящим фильтром с целью удаления шумовых компонентов, а далее полученную сглаженную кривую приводят к виду, типичному для кривой популяционного роста, позволяющей определить соответствующие параметры, характеризующие величину времени клеточного деления.
Сущность заявляемого технического решения – устройства состоит в том, что портативный микробиологический анализатор включает соединенные между собой при помощи проводного монтажа осветительный узел в формате печатной платы со светодиодами на N ячеек, разделенными на независимые каналы, размещенный между осветительным и анализирующим узлами микробиологический планшет с пробами исследуемой среды, а также анализирующий узел с датчиками для оценки освещенности, конвертирующими уровень прошедшего излучения в цифровой сигнал при помощи аналого-цифрового преобразователя, передающего полученный с N датчиков оценки освещенности результат, коммутируемый в одну цифровую сигнальную линию, на узел управления, осуществляющий выбор активного канала; анализатор также включает узел автономного энергоснабжения, обеспечивающий автономный режим работы микробиологического анализатора при его отключении от источника питания, а также элементы взаимодействия с оператором и внешние интерфейсы передачи данных, причем данные функциональные элементы реализуются в формате печатных узлов, на которые установлены управляющий микроконтроллер, источник и приёмник оптического излучения, аккумуляторы, активные и пассивные радиоэлектронные изделия.
Применением заявляемых способа и устройства достигается возможность непрерывного измерения оптической плотности, что позволяет количественно изучать динамику изменения исследуемых микроорганизмов. На практике это означает, что в режиме реального времени можно видеть, как именно действует или не действует примененное лекарственное средство на патогенные микроорганизмы.
Новым является предложенный принцип качественного анализа с переходом от освещенности датчиков фотоприемников к фотометрической кривой, согласованной с математической моделью отклика биохимического процесса в среде с индикатором и принцип количественного анализа на основе данных об изменении интенсивности прошедшего через исследуемую среду светового потока в ходе изменения популяции микроорганизмов, полученных с анализирующего узла портативного микробиологического анализатора с проведением их усреднения по набору кривых от каждой из ячеек микробиологического планшета и приведения полученной сглаженной кривой к виду, типичному для кривой популяционного роста, позволяющему определить соответствующие параметры, характеризующие величину времени клеточного деления.
Заявляемый способ проиллюстрирован графиком фиг.1, на котором изображена зависимость кривой популяционного роста от времени. Показана голубым кривая обработанного сигнала анализатора и черным сглаженная кривая популяционного роста по модели Ферхюльста.
На Фиг.2 представлена блок-схема работы заявляемого устройства, где:
1 – узел осветительный;
2 – узел анализирующий;
3 – узел управления;
4 – узел автономного энергоснабжения;
5 – источник питания;
6 – элементы взаимодействия с оператором;
7 – внешние интерфейсы передачи данных;
8 – микробиологический планшет с пробами исследуемой среды с микроорганизмами и раствором резазурина (не является составной частью портативного микробиологического анализатора).
ПРИМЕР конкретного выполнения заявляемого способа
Заявляемое техническое решение было апробировано в лабораторных условиях. Заявляемое устройство было использовано для определения динамики популяции микроорганизмов (дрожжей Saccharomyces cerevisiae и лактобактерий Lactobacillus acidophilus) на основе получения количественных характеристик изменения оптической плотности (и как следствие окраски) раствора, содержащего внесенный в культурную среду индикатор. В качестве питательной среды для дрожжей использовался раствор глюкозы с добавлением в него индикатора (рабочего раствора резазурино-натриевой соли, полученного согласно ГОСТ 32901-2014 Молоко и молочная продукция. Методы микробиологического анализа). После этого полученный раствор вносился в ячейки кюветы и помещался в портативный микробиологических анализатор.
Фотоприемники микробиологического анализатора регистрировали изменение светового потока, прошедшего через ячейки микрокюветы в течение времени, превышающего в несколько раз характерный период деления клеток исследуемых микроорганизмов. Вследствие того, что спектральная характеристика осветительных светодиодов согласована с полосой поглощения в видимом свете индикаторного раствора при переходе резазурина в резоруфин в ходе жизнедеятельности растущих и размножающихся микроорганизмов, сопровождающегося изменением цвета раствора с голубого на малиновый, датчики освещенности зарегистрировали уменьшение напряжения, пропорционального увеличению их освещенности. Полученные кривые имеют сигмоидальную форму, характерную для кривой роста плотности популяции микроорганизмов, так как максимальное значение освещенности датчиков соответствует максимальному количеству микроорганизмов, находящихся в растворе. Данный факт свидетельствует о качественном согласовании полученной фотометрической кривой с математической моделью отклика биохимического процесса в индикаторной среде на динамику роста популяции микроорганизмов.
Количественное подтверждение базируется на следующих операциях: на основе данных об изменении интенсивности светового потока в ходе изменения популяции микроорганизмов, полученных с анализирующего узла портативного микробиологического анализатора, проводится их усреднение по набору кривых от каждой из ячеек микробиологического планшета с последующей обработкой выборки по времени скользящим фильтром с целью удаления шумовых компонентов; полученная сглаженная кривая приводится к виду, типичному для кривой популяционного роста; проводится регрессия полученной кривой при помощи функций, типичных для моделей микробиологического роста (модели Ферхюльста, Гомперца) и определяются соответствующие параметры модели, отвечающие величине времени клеточного деления (Фиг.1). Показано, что найденные значения согласуются с величинами, типичными для исследуемых микроорганизмов, что является количественным подтверждением адекватности метода исследования биофизических процессов для данных объектов.
Найденные таким образом параметры популяционного роста позволяют получить величину количественного увеличения численности микроорганизмом в относительных единицах (при условии введенной нормировки их максимального (стационарного) количества на единицу объема). При необходимости абсолютная величина определяется путем использования нормировочного множителя, найденного на основании градуировочной кривой, сформированной независимо методом оптической микроскопии и/или микротитрования выборки образца из ячеек микробиологического планшета.
Раскрытие конструкции и работы заявляемого устройства.
Портативный микробиологический анализатор реализуется в формате печатных узлов, на которые установлены радиоэлектронные изделия и включает в себя: узел осветительный 1; узел анализирующий 2; узел управления 3; узел автономного энергоснабжения 4; источник питания 5; элементы взаимодействия с оператором 6; внешние интерфейсы передачи данных 7 и микробиологический планшет с пробами исследуемой среды с микроорганизмами и раствором резазурина 8.
Портативный микробиологический анализатор работает следующим образом. Микробиологический планшет 8 с пробами исследуемой среды с микроорганизмами и раствором резазурина на N (N = 1, 2, 3...) ячеек помещают в анализатор и при помощи элементов взаимодействия с оператором 6 задают режимы работы устройства: определяют продолжительность проведения эксперимента; частоту включения анализирующих элементов в единицу времени; вид исследуемых микроорганизмов; количество активных ячеек, в которые помещены образцы исследуемой среды. После задания всех начальных условий пользователь запускает процесс измерения. В качестве элементов взаимодействия с оператором могут выступать любые источники/приёмники визуальной, звуковой информации, а также электрических и радиочастотных сигналов. Узел осветительный 1 формирует световой поток в полосе излучения 600-605 нм. Данный элемент анализатора реализован в формате печатной платы со светодиодами на N ячеек, разделенными на независимые каналы. Управление данным узлом осуществляется при помощи цифрового сигнала (приходящим с узла управления 3), который включает/отключает питание узла и осуществляет выбор активного канала.
Помещенный между узлом осветительным 1 и узлом анализирующим2 микробиологический планшет 8 с пробами исследуемой среды с микроорганизмами и раствором резазурина частично поглощает данное излучение, причем интенсивность поглощения напрямую связана с концентрацией резазурина в растворе и как следствие динамики популяции микроорганизмов, содержащихся в среде. Прошедшее излучение затем попадает на датчики для оценки освещенности, размещенные на узле анализирующем 2, которые конвертируют уровень прошедшего излучения в цифровой сигнал при помощи АЦП (аналого-цифрового преобразователя). Далее, полученный с N датчиков для оценки освещенности результат коммутируется в одну цифровую сигнальную линию и передается на узел управления 3. В качестве датчиков могут использоваться любые аппаратно-программные средства для оценки освещенности.
Пришедшие по каналу передачи данных значения освещенности с датчиков для оценки освещенности записываются во внутреннюю память микроконтроллера, который обрабатывает их и на основе градуировочных данных определяет количество микроорганизмов, содержащихся в исследуемой среде. Полученный результат микроконтроллер передает по внешним интерфейсам передачи данных 7. В качестве данных интерфейсов могут выступать любые аппаратно-программные средства передачи, хранения и визуализации данных.
Кроме функции обработки данных, узел управления 3 выполняет следующие функции: стабилизирует входное постоянное напряжение, приходящее с узла автономного энергоснабжения 4 и источника питания 5, в линию питания для работы всех функциональных узлов; обрабатывает информацию, полученную от пользователя через элементы взаимодействия с оператором 6; координирует работу всех функциональных узлов устройства; защищает входные цепи питания от неправильного включения полярности питающего напряжения и отключает узел автономного энергоснабжения 4 от нагрузки при слишком сильном разряде его аккумуляторов.
Узел автономного энергосбережения 4 обеспечивает работу устройства при отключении его от сети переменного напряжения на время необходимо для проведения эксперимента. Зарядка аккумуляторных элементов данного узла происходит в автоматическом режиме при помощи источника питания 5.
Микробиологический планшет с пробами исследуемой среды с микроорганизмами и раствором резазурина 8 не является составной частью портативного микробиологического анализатора. В качестве ёмкости для разведения микроорганизмов может быть использован любой стандартный микробиологический планшет. Поэтому в качестве исследуемых биологических объектов могут выступать микроорганизмы, метаболиты дыхательной цепи которых в ходе жизнедеятельности вступают в окислительно-восстановительные реакции с резазурином.
Таким образом была доказана возможность применения редуктазной пробы с резазурином для количественной оценки динамики популяции микроорганизмов при помощи разрабатываемого портативного микробиологического анализатора.
Апробация показала, что заявляемое устройство позволило получить количественные оценки динамики популяций микробиологических культур на паритетном уровне с современными профессиональными микробиологическими анализаторами и при этом с меньшими массогабаритными характеристиками. Также за счет того, что заявляемое устройство обладает портативностью и автономностью, независимостью съема и вывода фотометрического сигнала с каждой ячейки кюветы, использование заявляемых способа и устройства осуществимо на практике для самого широкого спектра микробиологических измерений.
Заявляемое техническое решение может найти широкое практическое применение не только в пищевой, химической, мукомольно-крупяной, комбикормовой и медицинской отраслях промышленности, но и в микробиологических лабораториях центров экологического анализов и расчетов, профильных вузов и медицинских учреждений.
Подобное сочетание универсальности способа микробиологического анализа на основе оптического метода и портативности устройства микробиологического анализатора с относительной простотой использования, в современных аналогах и в прототипе не достигнуто.
Исходя из вышеизложенного, можно сделать вывод о том, что заявляемое техническое решение соответствует критериям «новизна», «изобретательский уровень» и «промышленная применимость».
Claims (2)
1. Портативный микробиологический анализатор, включающий соединенные между собой при помощи проводного монтажа осветительный узел в формате печатной платы со светодиодами на N ячеек, разделенными на независимые каналы, размещенный между осветительным и анализирующим узлами микробиологический планшет с пробами исследуемой среды, а также анализирующий узел с датчиками для оценки освещенности, конвертирующими уровень прошедшего излучения в цифровой сигнал при помощи аналого-цифрового преобразователя, передающего полученный с N датчиков оценки освещенности результат, коммутируемый в одну цифровую сигнальную линию, на узел управления, осуществляющий выбор активного канала; анализатор также включает узел автономного энергоснабжения, обеспечивающий автономный режим работы портативного микробиологического анализатора при отключении источника питания, а также элементы взаимодействия с оператором и внешние интерфейсы передачи данных, причем данные функциональные элементы реализуются в формате печатных узлов, на которые установлены управляющий микроконтроллер, источник и приёмник оптического излучения, аккумуляторы, активные и пассивные радиоэлектронные изделия.
2. Способ микробиологического анализа на основе оптического метода с качественной и количественной оценкой динамики популяций микробиологических культур с использованием портативного микробиологического анализатора по п.1, включающий подключение источника питания к узлу управления, установление режима работы, передачу сигнала включения/отключения осветительного узла, излучение начального светового потока, оценку прошедшего светового потока через микробиологический планшет с пробами исследуемой среды, при этом осветительный узел формирует световой поток в полосе излучения 600-605 нм, при этом пробы исследуемой среды содержат микроорганизмы и раствор резазурина, а микробиологический планшет с пробами исследуемой среды помещают в анализатор и при помощи элементов взаимодействия с оператором задают режимы работы устройства, а именно определяют продолжительность проведения эксперимента, частоту включения анализирующих элементов в единицу времени, вид исследуемых микроорганизмов, количество N активных ячеек, в которые помещены образцы исследуемой среды, и после задания всех начальных условий запускают процесс измерения, а далее по каналу передачи данных передают полученные при оценке данные на узел управления, который обрабатывает их и на основе градуировочных данных рассчитывает оптическую плотность среды и конвертирует оптическую плотность среды в количество содержащихся в ней микроорганизмов; далее передают данные о количестве микроорганизмов в среде при помощи внешних интерфейсов передачи данных, считывают по внешним интерфейсам передачи данных данные о количестве микроорганизмов в среде, передают данные о количестве микроорганизмов в среде на элементы взаимодействия с оператором; при качественной оценке количества микроорганизмов, основанной на том факте, что максимальное значение освещенности датчиков фотоприемников соответствует максимальному количеству микроорганизмов, находящихся в растворе, строят фотометрическую кривую, согласованную с математической моделью отклика биохимического процесса в индикаторной среде на динамику роста популяции микроорганизмов, а количественное измерение проводят на основе данных об изменении интенсивности светового потока в ходе изменения количества микроорганизмов в среде, полученных с анализирующего узла портативного микробиологического анализатора, проводя их усреднение по набору кривых от каждой из ячеек микробиологического планшета с последующей обработкой выборки по времени скользящим фильтром с целью удаления шумовых компонентов, а далее полученную сглаженную кривую приводят к виду, типичному для кривой популяционного роста, позволяющей определить параметры, характеризующие величину времени клеточного деления.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
PCT/RU2022/000138 WO2022231470A1 (ru) | 2021-04-26 | 2022-04-25 | Способ микробиологического анализа на основе оптического метода |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2779840C1 true RU2779840C1 (ru) | 2022-09-13 |
Family
ID=
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2553361C1 (ru) * | 2014-06-19 | 2015-06-10 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Дальневосточный научный центр физиологии и патологии дыхания" Сибирского отделения РАМН | Способ оценки угрозы развития анемии на третьем триместре гестации при обострении цитомегаловирусной инфекции путем измерения удельной оптической плотности гемоглобина в эритроцитах периферической крови при нарушении оксигенации |
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2553361C1 (ru) * | 2014-06-19 | 2015-06-10 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Дальневосточный научный центр физиологии и патологии дыхания" Сибирского отделения РАМН | Способ оценки угрозы развития анемии на третьем триместре гестации при обострении цитомегаловирусной инфекции путем измерения удельной оптической плотности гемоглобина в эритроцитах периферической крови при нарушении оксигенации |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
PRÄBST K. et al., Basic colorimetric proliferation assays: MTT, WST, and Resazurin, Cell Viability Assays: Methods and Protocols, 2017, Vol.1601, pp.1-17. * |
КИТАЕВА М.П., Выбор метода для определения цитостатического действия экстрактов клеточной культуры Podophyllum peltatum, ИЗВЕСТИЯ ГГТУ. МЕДИЦИНА, ФАРМАЦИЯ, 2020. * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Liu et al. | Point-of-care testing based on smartphone: The current state-of-the-art (2017–2018) | |
CN112074725B (zh) | 基于精确比色法的检测试纸读取器系统 | |
US3833864A (en) | Digital direct reading colorimeter | |
Wu et al. | Clinical chemistry measurements with commercially available test slides on a smartphone platform: Colorimetric determination of glucose and urea | |
Han et al. | Low-cost point-of-care biosensors using common electronic components as transducers | |
US20230314331A1 (en) | Optical Sensor System for Quantitative Colorimetric Liquid Analysis | |
TW201414830A (zh) | 微生物之檢查方法及其裝置 | |
Luo et al. | A smartphone-based multi-wavelength photometer for on-site detection of the liquid colorimetric assays for clinical biochemical analyses | |
CN115836210A (zh) | 使用光学反应表征来自感兴趣区域的化验的系统和方法 | |
Xing et al. | A cellphone-based colorimetric multi-channel sensor for water environmental monitoring | |
CN201788153U (zh) | 一种集成微型电子天平的农药残留检测仪 | |
RU2779840C1 (ru) | Способ микробиологического анализа на основе оптического метода и портативный микробиологический анализатор | |
WO2022231470A1 (ru) | Способ микробиологического анализа на основе оптического метода | |
Sasidharan et al. | A low-cost DIY device for high resolution, continuous measurement of microbial growth dynamics | |
CN106769907B (zh) | 定量分析仪 | |
Schlebusch et al. | Analytical performance of a portable critical care blood gas analyzer | |
CN104792707A (zh) | 一种皮革蛋白奶便携式测定仪及其测定方法 | |
RU93990U1 (ru) | Устройство для мультисубстратной флуоресцентной идентификации биологических микрообъектов и их биологических свойств | |
CN115046922A (zh) | 基于发光细菌的便携式水质综合毒性分析仪及检测方法 | |
Palekar et al. | Biochemical blood sensing platform with CMOS image sensor and software-based wavelength filter | |
CN106872341A (zh) | 一种基于智能手机的移动即时微生物诊断仪 | |
Cheng et al. | A low-cost compact blood enzyme analyzer based on optical sensing for point-of-care liver function testing | |
CN206248539U (zh) | 定量分析仪 | |
Niculescu et al. | Portable biochemistry analyzer based on image acquisition algorithm | |
JP3995888B2 (ja) | 微生物計量方法および微生物計量装置 |