RU2758060C1 - Штамм Bacillus subtilis - продуцент низкомолекулярного антимикробного пептида и способ получения низкомолекулярного антимикробного пептида - Google Patents

Штамм Bacillus subtilis - продуцент низкомолекулярного антимикробного пептида и способ получения низкомолекулярного антимикробного пептида Download PDF

Info

Publication number
RU2758060C1
RU2758060C1 RU2020134132A RU2020134132A RU2758060C1 RU 2758060 C1 RU2758060 C1 RU 2758060C1 RU 2020134132 A RU2020134132 A RU 2020134132A RU 2020134132 A RU2020134132 A RU 2020134132A RU 2758060 C1 RU2758060 C1 RU 2758060C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
strain
antimicrobial peptide
mixture
water
bacillus subtilis
Prior art date
Application number
RU2020134132A
Other languages
English (en)
Inventor
Иван Алексеевич Дятлов
Виктор Данилович Похиленко
Владимир Владимирович Перелыгин
Игорь Анатольевич Дунайцев
Тимур Ахмерович Калмантаев
Ирина Анатольевна Чукина
Алексей Николаевич Сомов
Константин Владимирович Детушев
Александр Геннадьевич Богун
Original Assignee
Федеральное бюджетное учреждение науки "Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное бюджетное учреждение науки "Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека filed Critical Федеральное бюджетное учреждение науки "Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Priority to RU2020134132A priority Critical patent/RU2758060C1/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2758060C1 publication Critical patent/RU2758060C1/ru

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/20Bacteria; Culture media therefor
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P21/00Preparation of peptides or proteins

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

Группа изобретений относится к биотехнологии. Предложен штамм Bacillus subtilis П19, синтезирующий антимикробный пептид (АМП) с активностью на патогенные бактерии - Bacillus anthracis, B. cereus, Listeria monocytogenes и некоторые штаммы Staphylococcus aureus. Штамм, депонированный в «ГКПМ – Оболенск» под номером В-8711, и способ получения низкомолекулярного антимикробного пептида, предусматривающий культивирование штамма Bacillus subtilis П19 на питательной среде при 360°С в течение 20 ч, отбор культуральной жидкости, закисление культуральной жидкости концентрированной соляной кислотой до рН 2,5, отделение осадка центрифугированием с охлаждением, рессуспендирование осадка в воде в соотношении 1:10, восстановление рН до 7,0±0,2 0,25 М раствором едкого натра, обработка полученной клеточной взвеси смесью этанола и ацетонитрила (CH3CN) в соотношении объемов 1,0:0,9:0,1 путем перемешивания в течение 20 мин при комнатной температуре с дальнейшим центрифугированием с получением преципитата, полученный преципитат растворяют в воде с получением смеси пептидов с последующим выделением пептида молекулярной массой 3,4 кДа путем смешивания смеси пептидов с бутанолом в соотношении 1:0,25 с последующим сбором бутанольной фракции, упариванием в сушильном шкафу при температуре 70°С с последующим растворением полученного преципитата в воде. Группа изобретений позволяет повысить выход целевого продукта. 2 н.п. ф-лы, 7 ил., 5 табл., 4 пр.

Description

Настоящее изобретение относится к биотехнологии в частности к выделенному из растения штамму Bacillus subtilis П19, производящему антимикробное вещество пептидной природы (бактериоцин), способу его получения и заключения в липосомы.
Предшествующий уровень техники
Бесконтрольное применение антибиотиков привело к глобальной проблеме множественной лекарственной устойчивости среди микроорганизмов, создавая трудности при лечении инфицированных больных. Одним из подходов к решению данной проблемы является применение натуральных пробиотиков, и противомикробных веществ, лишенных деструктивного влияния на кишечный микробном, особенно свойственного традиционным антибиотикам.
Наиболее доступным и экономически оправданным источником антимикробных веществ натурального происхождения являются микроорганизмы. На сегодня известны многие тысячи таких соединений и наиболее перспективные из них теперь могут быть синтезированы химически [Nguyen, 2018]. Чтобы определить, какие из антимикробных веществ могут принести практическую пользу, а какие нет, необходимо их предварительно изучить. К числу наиболее интересных с потенциалом терапевтического применения, как считают большинство исследователей, относятся противомикробные пептиды [Cotter et al. 2005]. Исследование противомикробных пептидов включает их скрининг на предмет спектра антимикробной, антигрибковой, противовирусной, иммуномодулирующей, иммуносупрессирующей, противовоспалительной и противоопухолевой активностей.
Противомикробные пептиды это четыре разнородных класса веществ, отличающиеся молекулярной массой, химическим строением, устойчивостью и спектром бактериоцидного действия [Drider et. al., 2006; Klaenhammer, 2008; Abriouel et. al., 2011; Cochranea et. al., 2016; Olishevska et. al., 2019].. Наиболее изученными являются низкомолекулярные пептиды или лантибиотики [Parisot et. al., 2008; Spies et. al., 2015]. Лантибиотики обладают летальным действием на патогенные грамположительные бактерии (например, бациллы группы В. cereus-thuringiensis) и некоторые плесневые грибки (например, Aspergillus flavus), вызывающие пищевые отравления. Этот класс пептидов наиболее часто находит применение в качестве биоконсервантов для защиты скоропортящихся пищевых продуктов от микробной контаминации, для подавления патогенных бактерий и предотвращения инфекций у людей и животных. Наряду с лантибиотиками непатогенные виды Bacillus способны продуцировать и полезные вторичные метаболиты. Например, это сурфактин и микосубтилизин, представляющие собой амфифильные липопептиды, которые способны снижать поверхностное натяжение среды обитания, разрушая тем самым клеточные мембраны организмов. Эти свойства делают их очень сильными противовирусными и антимикробными соединениями.
У представителей рода Bacillus выделены и описаны такие лантибиотики как субтилин, субтилозин А, эрицин, мерцацидин, субтиломицин, субланцин, эпидермин [Parisot J., et al., 2008; Сидорова T.M. и др., 2018]. Технология их выделения базируется, в основном на методах мембранной фильтрации, экстракции в системе органических растворителей и хроматографии [Патент РФ №2553547]. У каждого из них имеются преимущества и недостатки. Так, преимуществом мембранных методов выделения целевого вещества является сокращение времени проведения процессов, а главными недостатками - сложности в подборе мембран с требуемым отсечением по молекулярному весу, вариабельность свойств, существенные физические потери и падение активности продукта. Методы экстракции в органических растворителях дают возможность выделять вещество из значительного объема ферментата, но при этом экстрактивные субстанции часто могут быть токсичными как для оператора, окружающей среды, так и конечного потребителя препарата прочно встраиваясь в его структуру.
Известен способ получения субтилозина, основанный на обработке н-бутанолом бесклеточного ферментата Bacillus subtilis [Babasaki, K. et al., 1985; Huang Т., et al., 2009]. Супернатант культуральной жидкости (500 мл) экстрагируют добавлением четверти объема н-бутанола (125 мл) и встряхиванием в течение 1 ч, а полученную смесь оставляют на ночь в делительной воронке. Образуемый органический слой концентрируют с образованием желтого остатка, который ресуспендируют в метаноле (5 мл). Грубый субтилозин очищают методом высокоэффективной жидкостной хроматографии с использованием колонки Waters Bondapak С18. Смыв с колонки начинают с 20% до 80% и заканчивают 20% ацетонитрилом (CH3CN) в течение 40 мин. Чистый продукт лиофилизируют, получая 3 мг субтилозина на 1 л среды культивирования.
Наиболее близким к предлагаемому изобретению является метод концентрирования бактериоцина на поверхности клеток молочнокислых бактерий при кислых значениях рН с последующей их экстракцией [Yang R., et al., 1992]. К недостаткам этого способа можно отнести сильное варьирование выхода и чистоты целевых продуктов, применение NaCl и, в связи с этим, использование малопроизводительного метода диализа солевого раствора бактериоцина.
Техническим результатом является получение летально действующего на патогенные бактерии грамположительной природы - В. anthracis, В. cereus, L. monocytogenes и некоторые штаммы Staphylococcus aureus за счет выработки им низкомолекулярного антимикробного пептида (АМП).
Технический результат достигается тем, что предложен штамм Bacillus subtilis П19, который вырабатывает низкомолекулярный антимикробный пептид, обладающий активностью против патогенных микроорганизмов грамположительной природы, а также способ получения низкомолекулярного антимикробного пептида из культуральной жидкости штамма Bacillus subtilis П19 путем концентрирования на клетках штамма-продуцента, с дальнейшим его сбором с клеточной поверхности, очисткой и стабилизацией, причем способ осуществляется закислением культуральной жидкости до рН 2,5 с последующим выделением, ресуспендированием осадка клеточной массы в воде (1:10/объемы) с восстановлением концентрированной взвеси клеточной массы до нейтральных значений рН (7,0±0,2), обработкой концентрата смесью 96° этанола и ацетонитрила в соотношении объемов (1,0:0,9:0,1 / соответственно), дальнейшим осаждением, сбором супернатанта, его упариванием и растворением получаемого преципитата в воде, молекулярная масса АМП составляет 3,4 кДа.
Технический результат также достигается тем, что предложен инкапсулированный в липосомы препарат, содержащий низкомолекулярный пептид АМП 0,5-1,0 мг, липиды 4,2-4,8 мг, поливинилпирролидон 3,8 мг, соли фосфатов и натрий 5,0-5,5 мг.
Отличием и преимуществом предлагаемого изобретения является прием концентрирования бактериоцина на клетках штамма-продуцента из рода Bacillus с последующей его экстракцией этанолом и ацетонитрилом (9:1), что существенно (в разы) сокращает временные и материальные затраты на его выделение из культуральной жидкости.
Штамм Bacillus subtilis П19 нами выделен из растительного сырья страстоцвета (Passiflora edulis). Штамм Bacillus subtilis П19, обладающий антагонистическим действием на некоторые представители патогенных микроорганизмов, в частности, на листерии, бациллы и кокки, депонирован в «ГКПМ - Оболенск» под № В-8711.
Описание графических материалов
На фиг. 1 представлены суточные колонии штамм В. subtilis П19, выращенные при 36°С при высокой (около 500 КОЕ/мл, а) и низкой (15 КОЕ/мл, б) концентрации клеток в посевах на ГРМ-агаре.
На фиг. 2 суточные колонии штамм В. subtilis П19 выращенные при 36°С в ГРМ-бульоне
На фиг. 3 приведена схема получения грубой фракции бактериоцина.
На фиг. 4. чашки с индикаторый штаммом с результатами определения титра антимикробной активности пробы полученного экстракта клеточной поверхности (ЭКП) до и после обработки бутанолом.
На фиг. 5 гель-электрофорез пептида в системе Tris-tricine SDS-PAGE (18%) с последующим биотестированием гелевой пластины индикаторным штаммом, позволяющим определить наличие и молекулярную массу активной фракции. Использовали пептидные маркеры PageRuler™ Low Range, кДа; а - ПААГ с BS после окраски Coomassie brilliant blue G250.
На фиг. 6 приведены данные масс-спектроскопии методом MALDI-TOFF в процессе выделения бактериоцина после экстракции этанолом (А) и после дополнительной обработки полученного раствора бутанолом (Б), демонстрирующие наличие пика в 3,4 кДа, который соответствует субтилозину.
На фиг. 7 представлены флаконы, содержащие лиофилизированный препарат АМП на основе штамма В. subtilis П19, заключенный в липосомы (а), размером 10-50 мкм, вид липосом под микроскопом (1600х) после регидратации содержимого флакона (б), а также результаты определения титра активности липосомированного препарата, который равен 1600 АЕ/мл в отношении L. monocytogenes 766 (в).
Получение и свойства штамма продуцента АМП
Изоляты микроорганизмов были выделены из растительного сырья - страстоцвета (Passiflora edulis), обычно используемого для приготовления иммуномодуляторной пищевой добавки «Пассифлора». Изначально получили 9 антагонистически активных изолятов бациллярной природы, обозначенные как П13…П21. Наиболее активный из них далее был назван как П19. После идентификации штамма на основе культурально-морфологических, биохимических признаков он был отнесен к виду subtilis из рода Bacillus. На основании MALDI Biotyper штамм определен с высокой долей вероятности (2,32-2,357) как Bacillus subtilis. Видовая принадлежность штамма была также подтверждена методом генотипирования по 16S РНК.
Штамм В. subtilis П19, хорошо растет на агаризованных питательных средах промышленного изготовления, включая ГРМ-агар («Питательные среды», Оболенск), крахмальный агар («HiMedia», India). Оптимум роста составляет 36±1°С. Рекомендованная продолжительность глубинного выращивания в колбах при 120-150 об/мин составляет 18 ч. Суточные колонии штамма выпуклой округлой формы, светло-бежевые (фиг. 1а) и они легко снимаются с поверхности агара при помощи бактериологической петли. Одиночные колонии быстро разрастаются на питательном агаре, достигая 10-12 мм в диаметре (фиг. 1б). При этом они не высыхают, оставаясь на вид увлажненными. Клетки штамма предпочитают расти в аэробных условиях с интенсивной продукцией каталазы.
Клетки палочковидные, грамположительные, имеют размер 2-4×0,4-0,6 мкм, после деления, остаются соединенными в короткие цепи (фиг. 2). В клетках просматриваются проспоры, которые не раздувают клетки и располагаются в ее центре. Клетки подвижные с перитрихиальным расположением жгутиков. Споры овальные, не превышающие размер клетки, расположены преимущественно центрально.
Культура ферментирует глюкозу, сахарозу, маннит и мальтозу. Дает положительную реакцию Фогес-Проскауэра, гидролизует крахмал, желатину, не гидролизует мочевину, утилизирует цитрат натрия с глюкозой, не использует пропионат и малонат натрия, не расщепляет тирозин. Вырабатывает каталазу, протеазы, амилазу. Не образует лецитиназу, уреазу и липазу. Редуцирует нитраты, не образует газ на среде с нитратами в анаэробных условиях. Не образует индол и сероводород. В процессе аэробного культивирования клетки выделяют в окружающую среду соединения, ингибирующие рост некоторых штаммов грамположительных микроорганизмов - Listeria, Micrococcus, Staphylococcus, Streptococcus и Enterococcus. Штамм устойчив в полимиксину, лизоциму, чувствителен к пенициллину, стрептомицину, эритромицину, тетрациклину и новобиоцину.
Согласно санитарно-эпидемиологическому правилу СП 1.3.2322-08 «Безопасность работы с микроорганизмами III-IV групп патогенности (опасности) и возбудителями паразитарных болезней» (приложение №1) Bacillus subtilis не относится к патогенным для человека микроорганизмам. Вирулентность для лабораторных животных: в тесте на белых мышах и цыплятах не установлена.
Штамм может храниться без потери свойств при температуре 5-10°С на ГРМ-агаре не менее 6 месяцев с обязательным пересевом не реже 1 раза в 2 месяца, в замороженном виде при (-10)°С не менее 12 месяцев. Для длительного хранения штамма предпочтительна лиофилизация. Для регидратации культуры используется 0,9% физиологический раствор.
Выращивание штамма- продуцента, выделение АМП из культуральной жидкости и тестирование активности
Часть суточной колонии штамма В. subtilis П19, выращенной при 36°С на ГРМ-агаре, при помощи бактериологической петли переносят в 750 мл качалочную колбу Эрленмейера со 100 мл питательного бульона в составе (г/л): ферментативный гидролизат казеина - 7,0…10,0; дрожжевой экстракт - 5,0; сахароза - 11,0; магния сульфат - 1,0. Колб/у(ы) с инокулятом помещают в ячейку платформы термостатируемой качалки, устанавливают температуру на 36°С, задают качение в 135 оборотов/мин и время культивирования 20 ч. По завершению культивирования отбирают пробы культуральной жидкости (далее КЖ) на определение биологической чистоты (однородности), показателей кислотности (рН), концентрации живых клеток и антимикробной активности. Если показатели рН находятся в пределах 6,5-7,5 ед., в мазках при микроскопии отсутствуют посторонние микроорганизмы, а при добавлении 6% перекиси водорода к ферментату (1:1) происходит интенсивное выделение водорода в виде пенообразования, что соответствует наличию высокой каталазной активности, то КЖ берут в дальнейшую работу.
Для выделения антимикробного пептида последовательно проводят следующие процедуры (фиг. 3). Первое. КЖ с помощью концентрированной соляной кислоты (HCl, 38%) закисляют до рН 2,5 с последующим разделением смеси в поле центробежных сил (4000 об/мин, 30 мин) на центрифуге с охлаждением. Второе. Супернатант отбрасывают, а осадок клеточной массы (КМ) ресуспендируют в воде (1:10/объемы) с последующим восстановлением у концентрированной взвеси (КВ) КМ нейтральных значений рН (7,0±0,2) с помощью 0,25 М раствора едкого натра (NaOH). Третье. КВ обрабатывают смесью 96° этанола (С2Н5ОН -Эт) и ацетонитрила (CH3CN - Ацн) в соотношении объемов (1,0:0,9:0,1 / КВ: Эт: Ацн) путем перемешивания в течение 20 мин при комнатной температуре с дальнейшим осаждением на центрифуге (4000 об/мин, 10 мин) и сбором супернатанта. Четвертое. Супернатант водно-спиртового экстракта клеточной поверхности упаривают на роторном вакуумном испарителе при температуре 50-55°С, а преципитат растворяют в воде (10-15 мл), получая смесь пептидов (фиг. 5а). Пятое. Для выделения из смеси только пептида с молекулярной массой 3,4 кДа водный раствор смыва/экстракта клеточной поверхности (СКП/ЭКП) обрабатывают бутанолом (1:0,25/объемы) путем смешивания с последующим отстаиванием на холоде в течение ночи, сбором бутанольной фракции и упариванием в сушильной шкафу при температуре 70°С; преципитат растворяют в 3-5 мл воды, переливают во флакон.
Далее определяют титр активности против листерий образцов АМП до и после бутанольной экстракции (фиг. 4), молекулярную массу методами электрофореза в системе Tris-tricine SDS-PAG (18%) с пептидными маркерами PageRuler™LowRange и масс-спектроскопии по MALDI-TOFF (фиг. 5 и 6). Обработка ЭКП бутанолом позволяет выделить из смеси пептидов (фиг. 5а) активный против грамположительных бактерий пептид (фиг. 5б), который по молекулярной массе в 3,4 кДа соответствует субтилозину - бактериоцину из группы лантибиотиков. Изучение баланса образцов АМП по активности указывает на то, что выход целевого вещества в виде водного раствора до обработки бутанолом составляет 89,6% (табл. 1).
Figure 00000001
Получение липосомальной формы АМП П19
Для приготовления липосомальной суспензии используют метод гидратации липидной пленки. Для этого в ламинарном боксе готовят смесь липидов в стерильном стеклянном стаканчике емкостью 20-50 мл, последовательно внося мл раствора POPE (50 мг липида), 0,9 мл раствора холестерола (90 мг), 1 мл раствора лецитина (100 мг) и 0,6 мл раствора СтПЭГ400 (60 мг), и на выходе получая 300 мг липидов в 7,5 мл легколетучего органического растворителя. В круглодонную колбу от ротационного испарителя, выдавливают липосомальную суспензию через фильтр, обеспечивая стерилизацию липидов. Колбу подсоединяют колбу к приемному патрубку ротационного испарителя, включают вращение, затем вакуум, избегая вскипания жидкости в колбе. При полном высыхании на стенках колбы образуется полупрозрачная пленка липидов. По окончании сушки выключают вакуумный насос, вращение и в установку напускают воздух через стерилизующий фильтр, колбу снимают и закрывают пробкой.
Загрузка АМП в липосомы. Раствор АМП смешивают со стерильным фосфатно-солевым буфером (ФСБ) в соотношении от 1:10 до 10:1 в зависимости от желаемой активности препарата. Полученные 15-25 мл раствора переносят в круглодонную колбу с липидной пленкой. Колбу переносят в термостатируемую качалку, устанавливая режим: температура +42°С, скорость 150 об/мин. Полное смывание липидов раствором АМП занимает от 1 до 2 часов. В процессе образуется грубая суспензия липидных везикул с включенными в них АМП (фиг. 7б)..
Полученные липосомы с АМП с подтвержденным тестом на активность (титр не менее 800 АЕ/мл, фиг. 7в) разливают по 1 мл в стеклянные флаконы, которые могут храниться в холодильнике в течение 6 месяцев. При необходимости они могут быть лиофилизированы (фиг. 7а), что дает возможность их транспортировки не опасаясь потери активности.
Пример 1. Для выбора компонентного состава среды при глубинном культивировании штамма В. subtilis П19 готовят 4 варианта питательного бульона (табл. 2).
Figure 00000002
Засев 4 качал очных колб на 750 мл со 100 мл стерильного бульона указанного состава (табл. 2) проводят петлей с одной свежей колонии штамма В. subtilis П19. Посевы культивируют на качалке при 36°С, 135 об/мин в течение 21 ч. После съема колб определяют рН в КЖ и с помощью 1Н HCl снижают рН до 2,5 ед. Пробы закисленной КЖ разделяют центрифугированием (4000 об/мин, 35 мин) со сбором осадка клеточной массы (КМ) продуцента для дальнейшей работы. Осадки КМ ресуспендируют водой до 10 мл и поднимают рН до 6-7 ед. с помощью 0,1 М NaOH. Взвеси КМ обрабатывают смесью этанола с ацетонитрилом (9:1) и осаждают центрифугированием (4000 об/мин, 10 мин). Осадки отбрасывают, а супернатанты высушивают (+70°С). Получаемые преципитаты регидратируют добавлением по 2 мл воды и переливают во флаконы для проверки противимикробной активности. Алгоритм получения и показатели образцов, включая и значения их активностей против индикаторного штамма L. monocytogenes 766, приведены в табл. 3. Питательный бульон на основе гидролизата казеина (ГК), судя по представленным данным, обеспечивает получение АМП с наибольшей противимикробной активностью.
Figure 00000003
Пример 2. Для получения целевого вещества из смеси пептидов (фиг. 6А) наработку штамма-продуцента В. subtilis П19 проводят в питательном бульоне на основе гидролизата казеина со всеми последующими стадиями выделения АМП как в примере №1 (табл. 3). Для этого 2 мл водной взвеси в стеклянном флаконе на 20 мл, имеющую активность 6400 АЕ/мл против L. monocytogenes 766, разводят до 10 мл и гомогенизируют в течение 5 мин с помощью вортекса - вибрационного прибора для пробирок. Во флакон вносят 2,5 мл н-бутанола и полученную смесь тщательно (не менее 20 мин) гомогенизируют на вортексе -вибрационном приборе для пробирок. Полученную смесь центрифугируют (4000 об/мин) при субнулевой температуре в течение 30 мин. Образуемый органический слой собирают пипеткой и высушивают в стеклянной чашке при 70°С с образованием желтого остатка, который ресуспендируют в 2 мл диметилсульфоксида ((СН3)2SO - ДМСО) с водой (1:1). Полученный раствор дополнительно очищают методом высокоэффективной жидкостной хроматографии с использованием колонки Waters Bondapak С18 (WAT015814; 10 м, 125 Å, 25 на 100 мм). Элюирование начинают с 20% ацетонитрила (Ацн) в течение 5 мин, затем увеличивают до 50% Ацн в течение 20 мин и в конце снижают до 20% Ацн в течение 5 мин.
Получаемый на выходе продукт представляет собой по данным MALDI-TOFF (фиг. 6Б) пептид с молекулярной массой 4,3 кДа, как у субтилозина A [Babasaki, K. et al., 1985; Huang Т., et al., 2009].
Пример 3. Для определения активности и устойчивости АМП В. subtilis П19 его нарабатывают в процессе глубинного культивирования в колбе на 2 л с 500 мл питательного бульона в составе (г/л): гидролизат казеина - 7; дрожжевой экстракт - 5; магния сульфат - 0,5; сахароза - 10. Засев проводят предварительно 30 мл выращенной 18 ч КЖ с использованием питательного бульона на основе гидролизата казеина. Режимы культивирования: температура - 36°С; перемешивание - 120 об/мин; время - 20 ч.
После окончания выращивания штамма в КЖ с помощью 1Н HCl снижают рН до 2,5 ед. и затем проводят ее центрифугирование (4000 об/мин, 35 мин) со сбором осадка клеточной массы (КМ) для дальнейшей работы. Осадок КМ ресуспендируют водой до 20 мл и поднимают рН до 6-7 ед. с помощью 0,1 М NaOH. Взвесь КМ обрабатывают смесью этанола с ацетонитрилом (9:1) и осаждают центрифугированием (4000 об/мин, 10 мин). Собирают и высушивают супернатант (+70°С), а преципитат регидратируют добавлением 10 мл воды и переливают во флакон для проверки противимикробной активности. Из флакона отбирают 5 мл и переливают во вторую емкость для выделения пептида с помощью н-бутанола, как описано в примере 2.
Полученные пробы АМП в виде сырого экстракта (смыва) клеточной поверхности (ЭКП) до и после обработки н-бутанолом исследуют на противомикробную активность, устойчивость к протеазам и нагреву.
Результаты тестирования ЭКП П19 приведены в табл. 4 и 5. Из данных табл.4 следует, что пробы ЭКП активны в отношении всех штаммов исследованных бактерий родов Bacillus, Listeria, Micrococcus luteus и некоторых штаммов Staphylococcus aureus. В то же время АМП из В. subtilis П-19 на грамотрицательные микроорганизмы не действует.
Figure 00000004
Figure 00000005
Из данных табл. 5 видно, что АМП В. subtilis П-19 выдерживает кипячение (10 мин), сухожаровой нагрев (+105°С, 20 мин), но разрушается в условиях имитирующих физиолого-биохимические параметры процесса пищеварения человека и животных [Дармов И.В. и др., 2011; Marques M.R., et al., 2011].
Figure 00000006
Пример 4. Для наработки АМП с целью использования в качестве антилистериозного средства культивирование штамма и выделение АМП в виде ЭКП проводят, как описано в примере 3. Всю последующую работу проводят с 10 мл ЭКМ, полученного с помощью этанольной обработки клеточной массы продуцента. При этом пробу ЭКМ для получения стойкой взвеси АМП дополнительно озвучивают на ультразвуковом дезинтеграторе Bandelin SonoPulse GM3400 и проводят определение титра активности против индикаторного штамма листерий, что важно для расчета количественного состава рецептурной формы препарата.
Для приготовления липосомальной суспензии используют метод гидратации липидной пленки. Для этого в ламинарном боксе ЛБ-2К готовят смесь липидов в стерильном стеклянном стаканчике на 50 мл, последовательно внося 2,5 мл раствора POPE (50 мг липида), 0,9 мл раствора холестерола (90 мг), 1 мл раствора лецитина (100 мг) и 0,6 мл раствора СтПЭГ400 (60 мг), получая 300 мг липидов в 5 мл легколетучего органического растворителя (смесь этанола и трихлорметана). В круглодонную колбу от ротационного испарителя выдавливают через бактериальный фильтр (0,2 мкм) липосомальную суспензию, тем самым обеспечивая ее холодную стерилизацию. Колбу подсоединяют к приемному патрубку ротационного испарителя, включают вращение, затем вакуум, избегая вскипания жидкости. При полном высыхании на стенках колбы образуется полупрозрачная пленка липидов. Для загрузки АМП в липосомы раствор АМП смешивают со стерильным ФСБ в соотношении, обеспечивающего активность в препарате не менее 1600 АЕ/мл. Полученные 15-25 мл раствора переносят в круглодонную колбу с липидной пленкой и запускают качалку на скорости 150 об/мин при температуре +42°С, смывая липиды. Полное смывание липидов раствором АМП занимает от 1 до 2 часов. В процессе образуется грубая суспензия липидных везикул с включениями АМП (фиг. 7б). Грубую суспензию обрабатывают ультразвуком на установке Bandelin SonoPulse GM3400 в режиме 900 Вт 3×10 с, получая тонкую устойчивую дисперсию липосом с АМП. Включение АМП в липосомы контролируют с помощью спектрофотометра Shimadzu UV-1601 (Япония).
Перед лиофилизацией к липосомированному АМП добавляют равный объем полимерного стабилизатора-криопротектора в составе: 0,75…1,0% поливинилпирролидон молекулярной массой 25…500 кД в фосфатно-солевом буферном растворе и полученную смесь разливают по 1 мл в стеклянные флаконы емкостью 3 мл. Флаконы замораживают при (-50…-70°С не менее 5 ч и переносят в камеру лиофилизатора Virtis BT-4k (США). После перекрытия доступа воздуха в камеру сразу же включают вакуумный насос.Лиофилизацию проводят в течение 20 ч, включающую на завершающем этапе процесса досушивание в течение не менее 3 ч. Сброс вакуума проводят напуском аргона в камеру лиофилизатора. Высушенные флаконы закрывают резиновыми пробками и герметизируют обжиманием алюминиевыми колпачками при помощи кримпера (рис. 7а). Контроль активности лиофилизированного липосомального препарата проводят путем регидратации содержимого, и нанесением последовательных разведений препарата по 10 мкл на ГРМ-агар со свежезасеянным газоном индикаторного штамма (фиг. 7в). Титр активности препарата не должен быть менее 1600 АЕ/мл.

Claims (2)

1. Штамм Bacillus subtilis П19 - продуцент низкомолекулярного антимикробного пептида, обладающий активностью против патогенных микроорганизмов грамположительной природы, депонированный в «ГКПМ – Оболенск» под № В-8711.
2. Способ получения низкомолекулярного антимикробного пептида (АМП) из культуральной жидкости штамма Bacillus subtilis П19 по п.1 путем концентрирования на клетках продуцента с дальнейшим его сбором с клеточной поверхности, очисткой и стабилизацией, отличающийся тем, что способ осуществляется закислением культуральной жидкости 38 % соляной кислотой до рН 2,5 с последующим разделением смеси 30 мин на центрифуге 4000 об/мин с охлаждением , затем осадок клеточной массы ресуспендируют в воде 1:10, с последующим восстановлением у концентрированной взвеси нейтральных значений рН с помощью 0,25 М раствора едкого натра до 7±0,2, добавляют к клеточной взвеси 96° этанола (С2Н5ОН) и ацетонитрила (CH3CN) в соотношении объемов 1,0:0,9:0,1 и перемешивают в течение 20 мин при комнатной температуре с дальнейшим осаждением на центрифуге (4000 об/мин, 10 мин), супернатант водно-спиртового экстракта собирают и упаривают, а преципитат растворяют в 10-15 мл воды, смесь пептидов смешивают с бутанолом 1:0,25, с последующим сбором бутанольной фракции и упариванием в сушильном шкафу при температуре 70°С, полученный преципитат АМП, молекулярная масса которого составляет 3,4 кДа, растворяют в 3-5 мл воды и собирают во флакон.
RU2020134132A 2020-10-19 2020-10-19 Штамм Bacillus subtilis - продуцент низкомолекулярного антимикробного пептида и способ получения низкомолекулярного антимикробного пептида RU2758060C1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2020134132A RU2758060C1 (ru) 2020-10-19 2020-10-19 Штамм Bacillus subtilis - продуцент низкомолекулярного антимикробного пептида и способ получения низкомолекулярного антимикробного пептида

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2020134132A RU2758060C1 (ru) 2020-10-19 2020-10-19 Штамм Bacillus subtilis - продуцент низкомолекулярного антимикробного пептида и способ получения низкомолекулярного антимикробного пептида

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2758060C1 true RU2758060C1 (ru) 2021-10-26

Family

ID=78289562

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2020134132A RU2758060C1 (ru) 2020-10-19 2020-10-19 Штамм Bacillus subtilis - продуцент низкомолекулярного антимикробного пептида и способ получения низкомолекулярного антимикробного пептида

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2758060C1 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2825156C1 (ru) * 2023-12-08 2024-08-21 Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина" Способ получения фунгистатических липопептидов

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2336705C2 (ru) * 2004-04-15 2008-10-27 Кр.Хансен А/С Способ производства ферментированного пищевого продукта, штамм pediococcus acidilactici dsm 10313 - продуцент бактериоцина, его применение и содержащий его пищевой продукт
RU2409661C2 (ru) * 2009-02-12 2011-01-20 Федеральное государственное учреждение науки Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии (ФГУН ГНЦ ПМБ) Штамм enterococcus faecium lvp1073, продуцент бактериоцина против бактериальных патогенов, бактериоцин e1073 против бактериальных патогенов, штамм lactobacillus plantarum 1 lvp7 - индуктор синтеза бактериоцина e1073, сигнальный пептид сп1073 - регулятор синтеза бактериоцина e1073, способ получения бактериоцина e1073

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2336705C2 (ru) * 2004-04-15 2008-10-27 Кр.Хансен А/С Способ производства ферментированного пищевого продукта, штамм pediococcus acidilactici dsm 10313 - продуцент бактериоцина, его применение и содержащий его пищевой продукт
RU2409661C2 (ru) * 2009-02-12 2011-01-20 Федеральное государственное учреждение науки Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии (ФГУН ГНЦ ПМБ) Штамм enterococcus faecium lvp1073, продуцент бактериоцина против бактериальных патогенов, бактериоцин e1073 против бактериальных патогенов, штамм lactobacillus plantarum 1 lvp7 - индуктор синтеза бактериоцина e1073, сигнальный пептид сп1073 - регулятор синтеза бактериоцина e1073, способ получения бактериоцина e1073

Non-Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
PRADIP K SINGH et.al. A non-pediocin low molecular weight antimicrobial peptide produced by Pediococcus pentosaceus strain IE-3 shows increased activity under reducing environment, BMC Microbiology, 2014, 14, 226, p. 1-9. *
RONGGUANG YANG, MONTY C. JOHNSON et.al. Novel method to extract large amounts of bacteriocins from lactic acid bacteria, Applied and Environmetal Microbiology, 1992, p. 3355-3359. *
БИСЕНОВА Г.Н. и др. Изучение бактериоцин-продуцирующей активности изолятов и коллекционных культур молочнокислых бактерий. Новости науки Казахстана. Биология, 2016, N1 (127), с. 86-98. *
БИСЕНОВА Г.Н. и др. Изучение бактериоцин-продуцирующей активности изолятов и коллекционных культур молочнокислых бактерий. Новости науки Казахстана. Биология, 2016, N1 (127), с. 86-98. PRADIP K SINGH et.al. A non-pediocin low molecular weight antimicrobial peptide produced by Pediococcus pentosaceus strain IE-3 shows increased activity under reducing environment, BMC Microbiology, 2014, 14, 226, p. 1-9. RONGGUANG YANG, MONTY C. JOHNSON et.al. Novel method to extract large amounts of bacteriocins from lactic acid bacteria, Applied and Environmetal Microbiology, 1992, p. 3355-3359. *
ЗИМИНА М.И., ПРОСЕКОВ А.Ю. и др. Определение оптимальных условий культивирования для синтеза бактериоцинов штаммами Bacillus endopheticus и Bacillus licheniformis и изучение их стабильности. Техника и технология пищевых производств, 2016, Т. 41, N 4, с. 22-28. *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2825156C1 (ru) * 2023-12-08 2024-08-21 Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина" Способ получения фунгистатических липопептидов

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Jiang et al. Self-assembly of cationic multidomain peptide hydrogels: supramolecular nanostructure and rheological properties dictate antimicrobial activity
US20150045290A1 (en) Bacillus Sp. Biosurfactants, Composition Including Same, Method for Obtaining Same, and Use Thereof
US20140309162A1 (en) Novel antibacterial and fungicidal peptide in which lysine and tryptophan residues are repeated, and use thereof
WO2008091416A2 (en) Antibiotic antimicrobial agents and methods of their use
CN111019866B (zh) 一种普洱茶树叶片内生芽孢杆菌及其应用
CN107058421A (zh) 一种336型金黄色葡萄球菌中荚膜多糖的提取纯化方法
RU2409661C2 (ru) Штамм enterococcus faecium lvp1073, продуцент бактериоцина против бактериальных патогенов, бактериоцин e1073 против бактериальных патогенов, штамм lactobacillus plantarum 1 lvp7 - индуктор синтеза бактериоцина e1073, сигнальный пептид сп1073 - регулятор синтеза бактериоцина e1073, способ получения бактериоцина e1073
Bhuvaneswari et al. Antibacterial activity of spirulina (Arthospira platensis geitler) against bacterial pathogens in Aquaculture
TWI403330B (zh) 低血球溶解性之抗微生物胜肽、醫藥組成物及其用途
WO2017221274A2 (en) Antimicrobial peptide and its use thereof
RU2758060C1 (ru) Штамм Bacillus subtilis - продуцент низкомолекулярного антимикробного пептида и способ получения низкомолекулярного антимикробного пептида
Chen et al. A novel bacteriocin against multiple foodborne pathogens from Lacticaseibacillus rhamnosus isolated from juice ferments: ATF perfusion-based preparation of viable cells, characterization, antibacterial and antibiofilm activity
CN110156875A (zh) 抗菌肽H5-p5及其制备方法和应用
JP2013523661A (ja) 低赤血球溶解性の抗微生物ペプチド、医薬組成物およびその使用
CN115850409B (zh) 一种抗多种病原菌的无前导肽细菌素subticin A3及制备方法与应用
RU2532227C1 (ru) Штамм enterоcoccus mundtii, продуцирующий субстанцию пептидной природы с антилистериозной активностью
KR101779262B1 (ko) 항생제 내성을 갖는 슈도모나스 균속을 용균하는 박테리오파지
CN110615830B (zh) 抗菌肽在抗分枝杆菌感染药物中的应用
CN116003453B (zh) 一种基于双1,4-消除反应的可逆环化肽及其应用
RU2530552C1 (ru) ШТАММ Bacillus lentus - ПРОДУЦЕНТ БАКТЕРИОЦИНОПОДОБНОЙ СУБСТАНЦИИ АНТИМИКРОБНОГО ДЕЙСТВИЯ И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ БАКТЕРИОЦИНОПОДОБНОЙ СУБСТАНЦИИ
KR100536522B1 (ko) 인간 피부 유래의 신규한 박테리오신 및 여드름치료제로서의 용도
RU2492231C2 (ru) Способ выделения бактериоцинов
CN111116723B (zh) 野生稻抗菌肽OrR214及其应用
CN111116722B (zh) 野生稻抗菌肽OrR935及其应用
CN118064312A (zh) 一种贝莱斯芽孢杆菌及其在制备抗肠杆菌十三肽中的生产方法和应用