RU2736786C1 - Strain "a/chicken/primorsk/419/2018 h9n2" of avian influenza virus of genus alphainfluenzavirus type influenza a virus subtype h9 for controlling antigenic and immunogenic activity of vaccines for avian influenza and for making biopreparations for diagnosis and specific prevention of avian influenza type a subtype h9 - Google Patents

Strain "a/chicken/primorsk/419/2018 h9n2" of avian influenza virus of genus alphainfluenzavirus type influenza a virus subtype h9 for controlling antigenic and immunogenic activity of vaccines for avian influenza and for making biopreparations for diagnosis and specific prevention of avian influenza type a subtype h9 Download PDF

Info

Publication number
RU2736786C1
RU2736786C1 RU2020115194A RU2020115194A RU2736786C1 RU 2736786 C1 RU2736786 C1 RU 2736786C1 RU 2020115194 A RU2020115194 A RU 2020115194A RU 2020115194 A RU2020115194 A RU 2020115194A RU 2736786 C1 RU2736786 C1 RU 2736786C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
avian influenza
subtype
virus
strain
chicken
Prior art date
Application number
RU2020115194A
Other languages
Russian (ru)
Inventor
Ольга Сергеевна Осипова
Николай Геннадьевич Зиняков
Илья Александрович Чвала
Виктория Юрьевна Сосипаторова
Марина Алексеевна Волкова
Дмитрий Борисович Андрейчук
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ")
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ") filed Critical Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ")
Priority to RU2020115194A priority Critical patent/RU2736786C1/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2736786C1 publication Critical patent/RU2736786C1/en

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N7/00Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof

Abstract

FIELD: biotechnology.
SUBSTANCE: invention relates to biotechnology and concerns a novel avian influenza virus strain type A subtype H9 family Orthomyxoviridae, genus Alphainfluenzavirus, deposited in FGBU "VNIIZZH" collection under registration number: N113 - dep / 19-3 - Collections of strains of microorganisms FGBU "VNIIZHZ". Presented strain reproduced in 10-day old embryonated SPF chicken hens, where it reaches the infectious titer of at least 10.13 lg EID50/cm3. In the composition of the inactivated vaccine, the strain exhibits evident antigenic and immunogenic properties, inducing production of specific antibodies trapped in ELISA and HIR.
EFFECT: presented strain can be used for controlling antigenic and immunogenic activity of avian influenza vaccines and for making biopreparations for diagnosis and specific prevention of avian influenza type A subtype H9.
1 cl, 5 tbl, 5 ex, 1 dwg

Description

Изобретение относится к области ветеринарной вирусологии и биотехнологии, в частности к новому штамму рода Alphainfluenzavirus вида Influenza A virus подтипа Н9 и может быть использовано для контроля антигенной и иммуногенной активности вакцин против гриппа птиц подтипа Н9, а также при разработке и изготовлении средств диагностики и специфической профилактики гриппа птиц подтипа Н9.The invention relates to the field of veterinary virology and biotechnology, in particular to a new strain of the genus Alphainfluenzavirus of the type Influenza A virus subtype H9 and can be used to control the antigenic and immunogenic activity of vaccines against avian influenza of the subtype H9, as well as in the development and manufacture of diagnostic tools and specific prevention avian influenza subtype H9.

Грипп птиц (ГП) представляет собой острую инфекционную вирусную болезнь птиц, характеризующуюся поражением органов пищеварения, дыхания, высокой летальностью. Различные штаммы вируса гриппа птиц могут вызывать от 10 до 100% гибели среди инфицированных и поражать одновременно несколько видов птиц.Avian influenza (AF) is an acute infectious viral disease of birds, characterized by damage to the digestive system, respiration, and high mortality. Different strains of avian influenza virus can cause 10 to 100% death among those infected and simultaneously affect several species of birds.

Согласно международной классификации International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) релиз Master Species List 2018b.v2 вирусы гриппа отнесены к семейству Orthomyxoviridae (по классификации ICTV - 00.046, по классификации The National Center for Biotechnology Information (NCBI) ID: 11308), включающего 7 родов: Alphainfluenzavirus (A), Betainfluenzavirus (B), Deltainfluenzavirus (D), Gammainfluenzavirus (C), Isavirus, Quaranjavirus, Thogovirus. Вирус гриппа птиц относится к роду Alphainfluenzavirus (ID: 197911), виду Influenza A virus (ID 00.046.0.01.001).According to the international classification of the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), the release of Master Species List 2018b.v2, influenza viruses are assigned to the Orthomyxoviridae family (according to the ICTV classification - 00.046, according to the classification of The National Center for Biotechnology Information (NCBI) ID: 11308), including 7 genera: Alphainfluenzavirus (A), Betainfluenzavirus (B), Deltainfluenzavirus (D), Gammainfluenzavirus (C), Isavirus, Quaranjavirus, Thogovirus. The avian influenza virus belongs to the genus Alphainfluenzavirus (ID: 197911), the species Influenza A virus (ID 00.046.0.01.001).

Принадлежность штамма вируса гриппа к роду определяется консервативными элементами генома, задающими антигенные характеристики нуклеокапсидов.The belonging of a strain of the influenza virus to a genus is determined by conservative elements of the genome, which set the antigenic characteristics of nucleocapsids.

Вирионы вируса гриппа имеют наружную липопротеиновую оболочку, чаще сферической формы. Диаметр сферических форм 60-180 нм. Встречаются нитевидные формы вирионов до 200-350 нм. Вирусные частицы содержат РНК - 1%, белки - 70%, жиры - 20%, углеводы - до 8%.Influenza virus virions have an outer lipoprotein membrane, often spherical in shape. The diameter of the spherical shapes is 60-180 nm. There are filamentous forms of virions up to 200-350 nm. Viral particles contain RNA - 1%, proteins - 70%, fats - 20%, carbohydrates - up to 8%.

В настоящее время вирусы гриппа птиц (ВГП) разделяют на 16 подтипов по гемагглютинину (H1-H16) и 9 подтипов по нейраминидазе (N1-N9) (13). Вирусы гриппа всех подтипов были выделены от птиц с различными комбинациями гемагглютинина (НА) и нейраминидазы (NA). Однако, в 2012 и в 2013 гг. появились данные о двух новых подтипах гемагглютинина и нейраминидазы - H17N10 и H18N11. В Гватемале (Северная Америка) было выделено несколько изолятов вируса гриппа подтипа H17N10 от летучих мышей (4), и в Перу (Южная Америка) выделили изолят вируса гриппа H18N11 также от летучей мыши (14). Согласно литературным данным, от птиц вирус гриппа указанных подтипов не выделяли.Currently, avian influenza viruses (AIV) are divided into 16 subtypes for hemagglutinin (H1-H16) and 9 subtypes for neuraminidase (N1-N9) (13). Influenza viruses of all subtypes were isolated from birds with various combinations of hemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA). However, in 2012 and 2013. data appeared on two new subtypes of hemagglutinin and neuraminidase - H17N10 and H18N11. In Guatemala (North America), several isolates of the H17N10 influenza virus subtype were isolated from bats (4), and in Peru (South America), an isolate of the H18N11 influenza virus was also isolated from a bat (14). According to the literature, no influenza virus of the indicated subtypes was isolated from birds.

Вирусы гриппа обладают огромной экологической пластичностью за счет высоких темпов эволюции, связанных с изменчивостью их генома (11). Естественными носителями вируса птичьего гриппа являются дикие водоплавающие и морские птицы, являющиеся резервуаром почти всех подтипов гриппа за исключением H17N10 и H18N1, которые были найдены у рукокрылых (5). Взаимоотношение различных подтипов вирусов гриппа у диких птиц существенно не отражается на состоянии популяции хозяев, но занос вируса в неадаптированные популяции сельскохозяйственных птиц приводит к тяжелым эпизоотиям с экономическим ущербом. Прежде всего это относится к вирусу гриппа птиц подтипов Н5, Н7 и Н9 (2, 16).Influenza viruses possess enormous ecological plasticity due to the high rates of evolution associated with the variability of their genome (11). The natural carriers of the avian influenza virus are wild waterfowl and seabirds, which are the reservoir of almost all influenza subtypes with the exception of H17N10 and H18N1, which were found in bats (5). The relationship between different subtypes of influenza viruses in wild birds does not significantly affect the state of the host population, but the introduction of the virus into unadapted populations of farm birds leads to severe epizootics with economic damage. First of all, this refers to the avian influenza virus of the H5, H7, and H9 subtypes (2, 16).

Вирус гриппа типа А подтипа Н9 (А/Н9), относящийся к низковирулентным вирусам гриппа, был впервые выделен в 1966 году от птиц в США в штате Висконсин. С тех пор он не только распространился по всему миру, но и значительно расширил круг хозяев (6, 7). С середины 90-х годов прошлого века он стал вызывать вспышки заболевания среди домашней птицы. В материковой части Китая вирус гриппа А/Н9 впервые был выделен в 1994 году и в последнее десятилетие стал наиболее распространенным подтипом вируса гриппа среди домашней птицы (12, 17). Хотя вирусы гриппа А/Н9 классифицируются как низковирулентные, но их широкое распространение среди птиц привело к большим экономическим потерям в птицеводстве из-за значительного понижения яйценоскости и высокой смертности, вызванной ко-инфекцией с другими патогенами (6, 12).Influenza virus type A, subtype H9 (A / H9), a low-virulent influenza virus, was first isolated in 1966 from birds in the United States in Wisconsin. Since then, it has not only spread all over the world, but also significantly expanded the range of hosts (6, 7). It has been causing outbreaks in poultry since the mid-1990s. In mainland China, the A / H9 influenza virus was first isolated in 1994 and has become the most common influenza virus subtype among poultry in the last decade (12, 17). Although influenza A / H9 viruses are classified as low-virulent, their wide distribution among birds has led to large economic losses in poultry farming due to a significant decrease in egg production and high mortality caused by co-infection with other pathogens (6, 12).

В Российской Федерации в феврале 2012 года в одном из птицеводческих хозяйств Дальневосточного региона РФ наблюдалась вспышка респираторной болезни с повышенным отходом, вызванная вирусом гриппа птиц А/Н9 (2). В течение 2012-2017 гг. периодически выявляли антитела к антигену Н9 от диких птиц (Республика Тыва). В 2017 году были выявлены антитела в сыворотках крови диких птиц из Кировской области. Также в 2017-18 гг. был обнаружен вирус гриппа птиц у диких перелетных птиц в Томской области и в Хабаровском крае. В 2018 году на птицефабрике в Приморском крае, в Амурской области у диких уток и в 2019 году на территории Челябинской области был выявлен вирус гриппа А/Н9. Все эти случаи свидетельствуют о циркуляции вируса гриппа подтипа Н9 в популяциях домашних и диких птиц на Дальнем Востоке. Следует отметить, что Приморский край граничит непосредственно с Китаем, являющимся лидером по количеству вспышек гриппа птиц подтипа H9N2 (2). В настоящее время на территории России установлена циркуляция вируса подтипа А/Н9 всех трех генетических сублиний (G1, Y280, Y439), относящихся к европейской линии.In the Russian Federation, in February 2012, in one of the poultry farms in the Far Eastern region of the Russian Federation, an outbreak of respiratory disease with increased mortality caused by the avian influenza A / H9 virus was observed (2). During 2012-2017. periodically, antibodies to the H9 antigen from wild birds (Republic of Tyva) were detected. In 2017, antibodies were detected in the blood serum of wild birds from the Kirov region. Also in 2017-18. avian influenza virus was detected in wild migratory birds in the Tomsk region and in the Khabarovsk Territory. In 2018, at a poultry farm in the Primorsky Territory, in the Amur Region in wild ducks and in 2019 in the Chelyabinsk Region, the influenza A / H9 virus was detected. All these cases indicate the circulation of the H9 subtype influenza virus in the populations of domestic and wild birds in the Far East. It should be noted that Primorsky Krai borders directly on China, which is the leader in the number of outbreaks of avian influenza of the H9N2 subtype (2). At present, the circulation of the virus of the A / H9 subtype of all three genetic sublines (G1, Y280, Y439) belonging to the European lineage has been established in Russia.

Известны штаммы вируса гриппа птиц, используемые для изготовления диагностических и вакцинных препаратов (3-12).Known strains of the avian influenza virus are used for the manufacture of diagnostic and vaccine preparations (3-12).

Известен штамм A/chicken/Israel/215/2007 вируса гриппа птиц, используемый для изготовления диагностических и вакцинных препаратов (3).The known strain A / chicken / Israel / 215/2007 of the avian influenza virus is used for the manufacture of diagnostic and vaccine preparations (3).

Известен штамм A/turkey/Wisconsin/1/1966 вируса гриппа птиц, используемый для изготовления диагностических и вакцинных препаратов (6).The known strain A / turkey / Wisconsin / 1/1966 of the avian influenza virus is used for the manufacture of diagnostic and vaccine preparations (6).

Известен штамм A/Quail/Hong Kong/G1/1997 вируса гриппа птиц, используемый для изготовления диагностических и вакцинных препаратов (12).The known strain A / Quail / Hong Kong / G1 / 1997 of the avian influenza virus is used for the manufacture of diagnostic and vaccine preparations (12).

Известен штамм A/Chicken/Beijing/1/1994 вируса гриппа птиц, используемый для изготовления диагностических и вакцинных препаратов (12).The known strain A / Chicken / Beijing / 1/1994 of the avian influenza virus is used for the manufacture of diagnostic and vaccine preparations (12).

Известен штамм A/chicken/HongKong/Y439/1997 вируса гриппа птиц, используемый для изготовления диагностических и вакцинных препаратов (12).The known strain A / chicken / HongKong / Y439 / 1997 of the avian influenza virus is used for the manufacture of diagnostic and vaccine preparations (12).

Известен штамм A/chicken/Shanghai/F/1998 (Ck/SH/F/98) вируса гриппа птиц, используемый для изготовления диагностических и вакцинных препаратов (9).The known strain A / chicken / Shanghai / F / 1998 (Ck / SH / F / 98) of the avian influenza virus is used for the manufacture of diagnostic and vaccine preparations (9).

Известен штамм A/Chicken/Hong Kong/G9/1997 вируса гриппа птиц, используемый для изготовления диагностических и вакцинных препаратов (8).The known strain A / Chicken / Hong Kong / G9 / 1997 of the avian influenza virus is used for the manufacture of diagnostic and vaccine preparations (8).

Известен штамм A/Chicken/Shandong/01/2008 вируса гриппа птиц, используемый для изготовления диагностических и вакцинных препаратов (18).The known strain A / Chicken / Shandong / 01/2008 of the avian influenza virus is used for the manufacture of diagnostic and vaccine preparations (18).

Таким образом, для производства диагностических и вакцинных препаратов используются штаммы вируса гриппа птиц, относящиеся к линиям G1 (A/Quail/Hong Kong/G1/1997, A/chicken/Israel/215/2007), Y280 (A/chicken/Shanghai/F/1998) и Y439 (A/chicken/HongKong/Y439/1997). Однако все они имеют ряд недостатков. Основная масса штаммов вирусов была выделена более десяти лет назад и антигенно отличается от ныне существующих вариантов.Thus, for the production of diagnostic and vaccine preparations, strains of the avian influenza virus belonging to the G1 lines (A / Quail / Hong Kong / G1 / 1997, A / chicken / Israel / 215/2007), Y280 (A / chicken / Shanghai / F / 1998) and Y439 (A / chicken / HongKong / Y439 / 1997). However, they all have several disadvantages. The bulk of virus strains was isolated more than ten years ago and antigenically differs from the currently existing variants.

Техническая проблема заключается в расширении арсенала штаммов вируса гриппа птиц типа А подтипа Н9, обладающих инфекционной, антигенной и иммуногенной активностью, сохраняющих иммуногенные свойства после инактивации, обеспечивая тем самым получение чувствительных и высокоспецифичных диагностикумов и вакцинных препаратов, создающих эффективную защиту домашней птицы против гомологичного вируса.The technical problem is to expand the arsenal of strains of avian influenza virus type A, subtype H9, possessing infectious, antigenic and immunogenic activity, retaining immunogenic properties after inactivation, thereby providing sensitive and highly specific diagnostics and vaccine preparations that create effective protection of poultry against a homologous virus.

Указанная проблема решена путем получения штамма A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса гриппа птиц, используемого для контроля иммуногенной и антигенной активности вакцин и изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики гриппа птиц подтипа Н9.This problem was solved by obtaining the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain of the avian influenza virus, which is used to control the immunogenic and antigenic activity of vaccines and the manufacture of biological products for the diagnosis and specific prevention of avian influenza of the H9 subtype.

Вирусный изолят, послуживший источником для получения штамма A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2, был выделен в ФГБУ «ВНИИЗЖ» в 2018 г. из проб, поступивших из птицефабрики Приморского края РФ. Вследствие вирусовыделения из гомогената внутренних органов от кур был получен штамм A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса гриппа птиц.The viral isolate, which served as a source for obtaining the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain, was isolated at FGBI ARRIAH in 2018 from samples received from a poultry farm in the Primorsky Territory of the Russian Federation. Due to virus isolation from the homogenate of internal organs from chickens, the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain of the avian influenza virus was obtained.

Штамм прошел 3 пассажа на 10-суточных СПФ-куриных эмбрионах. Способен вызывать гибель эмбрионов кур в течение 48-72 ч инкубации.The strain passed 3 passages on 10-day-old SPF-chicken embryos. Able to cause the death of chicken embryos within 48-72 hours of incubation.

Подтип H9N2 идентифицирован методами полимеразно-цепной реакции (ПЦР), нуклеотидного секвенирования, в РТГА (реакция торможения гемагглютинации) и РИНА (реакция ингибиции нейраминидазной активности).The H9N2 subtype has been identified by polymerase chain reaction (PCR), nucleotide sequencing, RTGA (hemagglutination inhibition reaction) and RINA (neuraminidase inhibition reaction).

При проведении филогенетического анализа нуклеотидной последовательности фрагмента гена НА участка 1414-1572 п.н. было установлено, что исследуемый изолят принадлежит к генетической линии Y-280/G9-like, широко распространенной на территории Китая и сопредельных государств Юго-Восточной Азии.When conducting phylogenetic analysis of the nucleotide sequence of the HA gene fragment of the region 1414-1572 bp. it was found that the investigated isolate belongs to the Y-280 / G9-like genetic line, which is widespread in China and neighboring countries of Southeast Asia.

По фрагменту гена НА наиболее генетически близкими оказались последовательности вирусов гриппа птиц подтипа H9N2, выделенные в Китае (98,2-99,0% совпадений), а также последовательности вирусов гриппа птиц подтипа H9N2, выделенные на территории стран Юго-Восточной Азии (98-99% совпадений).In terms of the HA gene fragment, the sequences of avian influenza viruses of the H9N2 subtype isolated in China (98.2-99.0% matches), as well as the sequences of avian influenza viruses of the H9N2 subtype, isolated in the territory of Southeast Asia (98- 99% match).

Сайт расщепления гемагглютинина содержит основные аминокислоты и имеет структуру RSSR/GLF, что позволяет охарактеризовать вирус как потенциально низковирулентный.The hemagglutinin cleavage site contains basic amino acids and has an RSSR / GLF structure, which allows the virus to be characterized as potentially low-virulent.

Штамм A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса ГП типа А, подтипа H9N2, депонирован 10 апреля 2019 г. в Коллекцию штаммов микроорганизмов ФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных» под регистрационным номером №113 - деп/ 19-3 - КШМ ФГБУ «ВНИИЗЖ».Strain A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 of the HP virus type A, subtype H9N2, was deposited on April 10, 2019 in the Collection of microorganism strains of the Federal Center for Animal Health under registration number No. 113 - dep / 19-3 - KShM FGBI "ARRIAH".

Экспериментально подтверждена возможность использования штамма A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса гриппа птиц для контроля иммуногенной и антигенной активности вакцин и для приготовления биопрепаратов для специфической профилактики и диагностики гриппа птиц.The possibility of using the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain of the avian influenza virus has been experimentally confirmed to control the immunogenic and antigenic activity of vaccines and for the preparation of biological products for specific prevention and diagnosis of avian influenza.

Сущность изобретения пояснена на графическом изображении (фиг. 1). На фиг. 1 представлена дендрограмма, отражающая филогенетические взаимоотношения штамма A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 с эпизоотическими и вакцинными штаммами вируса гриппа птиц подтипа Н9. Дендрограмма основана на сравнении нуклеотидных последовательностей участка гена гемагглютинина.The essence of the invention is illustrated in a graphical representation (Fig. 1). FIG. 1 shows a dendrogram reflecting the phylogenetic relationship of the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain with epizootic and vaccine strains of the H9 subtype avian influenza virus. The dendrogram is based on a comparison of the nucleotide sequences of the hemagglutinin gene region.

Показано, что исследуемый штамм A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 принадлежит к обширной линии штаммов Y280, впервые выявленных на территории Юго-Восточной Азии в 1997 г.It was shown that the investigated strain A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 belongs to the extensive line of Y280 strains, first identified in Southeast Asia in 1997.

Сущность изобретения пояснена следующим перечнем последовательностей:The essence of the invention is illustrated by the following sequence listing:

SEQ ID №1: представляет последовательность нуклеотидов фрагмента гена гемагглютинина штамма A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2;SEQ ID No. 1: represents the nucleotide sequence of the hemagglutinin gene fragment of strain A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2;

SEQ ID №2: представляет последовательность аминокислот фрагмента гемагглютинина штамма A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2.SEQ ID NO: 2: represents the amino acid sequence of the hemagglutinin fragment of strain A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2.

Исследования основывались на определении первичной структуры фрагмента гена гемагглютинина (НА) испытуемого образца штамма A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 с последующим анализом филогенетического родства с другими штаммами и изолятами вируса гриппа птиц подтипа H9N2. В результате секвенирования была определена нуклеотидная (273 н.о.) и аминокислотная (91 а.о.) последовательности фрагмента гена НА штамма A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2. Сайт расщепления гемагглютинина штамма A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса гриппа птиц имеет структуру RSSR/GLF, что позволяет охарактеризовать вирус как потенциально низковирулентный.The studies were based on the determination of the primary structure of the hemagglutinin (HA) gene fragment of the test sample of the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain with subsequent analysis of the phylogenetic relationship with other strains and isolates of the avian influenza virus of the H9N2 subtype. As a result of sequencing, the nucleotide (273 nt) and amino acid (91 aa) sequences of the HA gene fragment of the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain were determined. The hemagglutinin cleavage site of the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain of the avian influenza virus has an RSSR / GLF structure, which allows the virus to be characterized as potentially low-virulent.

Штамм A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса гриппа птиц характеризуется следующими признаками и свойствами.The A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 avian influenza virus strain is characterized by the following traits and properties.

Морфологическая характеристикаMorphological characteristics

Штамм A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса гриппа птиц относится к семейству Orthomyxoviridae, роду Alphainfluenzavirus, виду Influenza A virus, подтипу H9N2 и обладает морфологическими признаками, характерными для вируса гриппа типа А.The A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 avian influenza virus belongs to the Orthomyxoviridae family, the Alphainfluenzavirus genus, the Influenza A virus species, the H9N2 subtype and has morphological features characteristic of the type A influenza virus.

Вирионы вируса гриппа - оболочечные, плеоморфные. Диаметр сфероподобных частиц около 100 нм; нитевидные частицы около 17 нм в диаметре, длиной 250 нм и более. На поверхности вириона находятся шипообразные выступы (до 14 нм), образованные гомотримерами НА. В промежутках между кластерами НА у вирусов типа А размещаются молекулы NA.Influenza virus virions are enveloped, pleomorphic. The diameter of the spherical particles is about 100 nm; filamentary particles about 17 nm in diameter, 250 nm long or more. On the surface of the virion there are spike-like projections (up to 14 nm) formed by HA homotrimers. In type A viruses, NA molecules are located between the HA clusters.

Липидная мембрана окружает петлеобразные филаменты нуклеокапсидов с восемью фрагментами вирусного генома, каждый из которых представлен линейной одноцепочечной антисмысловой РНК.The lipid membrane surrounds loop-shaped filaments of nucleocapsids with eight fragments of the viral genome, each of which is represented by a linear single-stranded antisense RNA.

Общая длина генома составляет около 13600 нуклеотидов (нт). Наиболее крупный фрагмент (№1) содержит около 2350 н.о.; №2 - чуть менее 2350 н.о.; №3, как правило, - 2250 н.о.; №4 - 1780 н.о.; №5 - 1575 н.о.; №6 - 1420 н.о.; №7 - 1050 н.о.; №8 - 900 н.о.The total genome length is about 13,600 nucleotides (nt). The largest fragment (No. 1) contains about 2350 bp; No. 2 - a little less than 2350 n.d .; No. 3, as a rule, - 2250 ND; No. 4 - 1780 n.d .; No. 5 - 1575 n.d .; No. 6 - 1420 n.d .; No. 7 - 1050 n.d .; No. 8 - 900 n.a.

На обоих концах каждой геномной цепи РНК содержатсяBoth ends of each genomic RNA strand contain

повторяющиеся отрезки, причем повторы 5' -концевого участка (у вирусов типа А они имеют вид 5' -AGUAGAAACAAGG) комплементарны инвертированным повторам, расположенным на 3' -конце. Кроме того, 3' -концевые участки некоторых фрагментов генома содержат консервативные отрезки, типичные для вирусных штаммов, поражающих субъектов определенного биологического вида [ICTV-International Committee on Taxonomy of Viruses].repeating segments, and the repeats of the 5 '-end region (in type A viruses they look like 5' -AGUAGAAACAAGG) are complementary to inverted repeats located at the 3 '-end. In addition, the 3 '-terminal regions of some fragments of the genome contain conservative stretches typical of viral strains that infect subjects of a particular biological species [ICTV-International Committee on Taxonomy of Viruses].

Антигенные свойстваAntigenic properties

По своим антигенным свойствам штамм A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса гриппа птиц относится к семейству Orthomyxoviridae, роду Alphainfluenzavirus, виду Influenza A virus, типу А, подтипу H9N2.By its antigenic properties, the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain of the avian influenza virus belongs to the Orthomyxoviridae family, the Alphainfluenzavirus genus, the Influenza A virus species, type A, the H9N2 subtype.

Гемагглютинирующая активность штамма A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 подавляется специфической сывороткой к вирусу гриппа птиц подтипа H9N2 («IZSVe», Италия), что подтверждает принадлежность штамма A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса гриппа птиц к подтипу Н9. Титр специфической сыворотки составил 6 log2. Нейраминидазная активность штамма подавляется специфической сывороткой к вирусу гриппа птиц (ВГП) подтипа H5N2 («IZSVe», Италия).The hemagglutinating activity of the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain is suppressed by a specific serum for avian influenza virus subtype H9N2 (IZSVe, Italy), which confirms that the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 avian influenza virus belongs to the H9 subtype ... The specific serum titer was 6 log 2 . The neuraminidase activity of the strain is suppressed by a specific serum to the avian influenza virus (AIV) of the H5N2 subtype (IZSVe, Italy).

Биотехнологические свойстваBiotechnological properties

Инактивированный вирус индуцирует антитела, выявляемые методами реакции торможения гемагглютинирующей активности (РТГА) и иммуноферментным анализом (ИФА). Так, через 14 и 28 дней после двухкратной иммунизации цыплят инактивированной вакциной из штамма A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса гриппа птиц в прививном объеме 1,0 см3/гол средний титр антител по группе к НА, обеспечивающим реакцию торможения гемагглютинации, составил 3,2 log2 и 7,3 log2, соответственно; титр антител, определяемых методом ИФА, составил 3500 и 10262, соответственно (таблица 5).The inactivated virus induces antibodies that are detected by methods of inhibition of hemagglutinating activity (RTGA) and enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). So, 14 and 28 days after two-fold immunization of chickens with an inactivated vaccine from the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain of the avian influenza virus in an inoculated volume of 1.0 cm 3 / head, the average titer of antibodies in the HA group, providing a hemagglutination inhibition reaction , was 3.2 log 2 and 7.3 log 2 , respectively; the titer of antibodies determined by ELISA was 3500 and 10262, respectively (table 5).

Гено- и хемотаксономическая характеристикиGeno- and chemotaxonomic characteristics

Штамм A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса гриппа птиц типа А подтипа Н9 является РНК-содержащим вирусом с молекулярной массой 250×106 Д.Strain A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 of avian influenza virus type A subtype H9 is an RNA-containing virus with a molecular weight of 250 × 10 6 D.

Геном вируса гриппа представлен однонитевой РНК негативной полярности в виде 8 нитей (сегментов) в комплексе с белком нуклеопротеина (NP).The genome of the influenza virus is represented by single-stranded RNA of negative polarity in the form of 8 strands (segments) in a complex with a nucleoprotein (NP) protein.

Вирионы вируса гриппа имеют наружную липопротеиновую оболочку, чаще сферической формы. Диаметр сферических форм около 100 нм. Вирусные частицы содержат РНК - 1%, белки - 70%, жиры - 20%, углеводы - до 8%.Influenza virus virions have an outer lipoprotein membrane, often spherical in shape. The diameter of the spherical shapes is about 100 nm. Viral particles contain RNA - 1%, proteins - 70%, fats - 20%, carbohydrates - up to 8%.

Антигенная вариабельность и таксономическая классификация вируса основана на идентификации двух основных поверхностных белков -гемагглютинина и нейраминидазы.Antigenic variability and taxonomic classification of the virus is based on the identification of two major surface proteins, hemagglutinin and neuraminidase.

Устойчивость к внешним факторамResistance to external factors

Штамм A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса ГП чувствителен к детергентам, формальдегиду, бета-пропиолактону, производным азиридина, быстро инактивируется при прогревании (56°С), ультрафиолетовом облучении и при рН ниже 5,0.The strain A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 of the HP virus is sensitive to detergents, formaldehyde, beta-propiolactone, aziridine derivatives, and is rapidly inactivated upon heating (56 ° C), ultraviolet irradiation and at pH below 5.0.

Дополнительные признаки и свойстваAdditional signs and properties

Иммуногенная активность - иммуногенен в составе инактивированной вакцины.Immunogenic activity - immunogenic as part of an inactivated vaccine.

Реактогенность - реактогенными свойствами не обладает. Иммунизация цыплят дозой, в два раза превышающей прививную, не вызывает видимых клинических изменений в общем состоянии птицы, а также локальных поражений ткани в месте введения.Reactogenicity - does not possess reactogenic properties. Immunization of chickens with a dose twice the inoculated dose does not cause visible clinical changes in the general condition of the bird, as well as local tissue damage at the injection site.

Патогенные свойстваPathogenic properties

Вирулентность - низкая (не вызывает гибель зараженной птицы в дозе 107,0 ЭЛД50).Virulence - low (does not cause death of infected birds at a dose of 10 7.0 ELD 50 ).

Контагиозность - контагиозен. Неиммунные цыплята заражаются при совместном содержании с зараженными.Contagiousness - contagious. Non-immune chickens become infected when they are kept together with infected ones.

Сущность предлагаемого изобретения пояснена примерами его использования, которые не ограничивают объем изобретения.The essence of the invention is illustrated by examples of its use, which do not limit the scope of the invention.

Пример 1.Example 1.

Определение подтиповой антигенной характеристики штамма проводили с помощью перекрестной реакции торможения гемагглютинации (РТГА) и реакции ингибиции нейраминидазной активности (РИНА) с референтными гипериммунными сыворотками к антителам 16 Н-типов вируса ГП и с референтными сыворотками против гриппа птиц подтипов N1-N2 по нейраминидазе. Образцы вирусной суспензии исследовали предварительно в реакции гемагглютинации (РГА) для определения гемагглютинирующей активности вируса. Активность штамма ВГП A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 в РГА составила 9 log2. В качестве отрицательного контроля использовали нормальную сыворотку крови кур производства ФГБУ «ВНИИЗЖ». Результаты представлены в таблице 1 и таблице 2.Determination of the subtype antigenic characteristic of the strain was carried out using a cross reaction of inhibition of hemagglutination (RTGA) and a reaction of inhibition of neuraminidase activity (RINA) with reference hyperimmune sera to antibodies of 16 H types of HP virus and with reference sera against avian influenza of subtypes N1-N2 for neuraminide. Samples of the viral suspension were preliminarily investigated in the hemagglutination reaction (RHA) to determine the hemagglutinating activity of the virus. The activity of the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 AIV strain in the RHA was 9 log 2 . As a negative control, we used normal blood serum of hens produced by FGBI "ARRIAH". The results are shown in Table 1 and Table 2.

В РТГА гемагглютинирующая активность испытуемого образца подавлялась специфической сывороткой к вирусу гриппа птиц подтипа H9N2 («IZSVe», Италия), что подтверждает принадлежность образца штамма A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса гриппа птиц к подтипу Н9. Титр сыворотки составил 6 log2.In RTGA, the hemagglutinating activity of the test sample was suppressed by a specific serum for avian influenza virus subtype H9N2 (IZSVe, Italy), which confirms that the sample of the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 avian influenza virus belongs to the H9 subtype. The serum titer was 6 log 2 .

В РИНА нейраминидазная активность испытуемого образца подавлялась специфической сывороткой к ВГП подтипа H5N2 («IZSVe», Италия).In RINA, the neuraminidase activity of the test sample was inhibited by a specific serum to AIV of the H5N2 subtype (IZSVe, Italy).

Согласно результатам серологических исследований штамм A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 был отнесен к вирусу гриппа птиц подтипа H9N2.According to the results of serological studies, the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain was assigned to the avian influenza virus subtype H9N2.

Для выявления генома вируса ГП из проб тканей птиц и экстраэмбриональной жидкости (ЭЭЖ) зараженных эмбрионов кур выделяли общую РНК, которую использовали для постановки обратно-транскриптазной полимеразной цепной реакции (ОТ-ПЦР). Первичную индикацию гена М проводили методом ОТ-ПЦР в режиме реального времени (ОТ-ПЦР-РВ), используя праймеры M25F, M124R и флуоресцентно-меченный олигонуклеотидный зонд М64. С помощью классической ОТ-ПЦР амплифицировали фрагмент гена НА. Методом секвенирования была определена нуклеотидная последовательность фрагмента (273 н.о.) гена НА штамма вируса гриппа птиц A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 и соответствующая ей аминокислотная последовательность (91 а. о.). Было установлено, что по фрагменту гена НА к штамму вируса гриппа птиц A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 наиболее близкими оказались последовательности вирусов гриппа А птиц подтипа Н9, выделенные на территории стран Юго-Восточной Азии (98-99% совпадений). Сайт расщепления гемагглютинина штамма вируса гриппа птиц A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 имеет структуру RSSR/GLF, что позволяет охарактеризовать вирус как потенциально низковирулентный.To identify the GP virus genome, total RNA was isolated from samples of avian tissue and extraembryonic fluid (EEF) of infected chicken embryos, which was used for staging reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR). The primary indication of the M gene was performed by real-time RT-PCR (RT-PCR-RT) using primers M25F, M124R and a fluorescently labeled oligonucleotide probe M64. A fragment of the HA gene was amplified using classical RT-PCR. Sequencing was used to determine the nucleotide sequence of a fragment (273 nt) of the HA gene of the avian influenza A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain and the corresponding amino acid sequence (91 aa). It was found that, for the HA gene fragment to the avian influenza A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain, the sequences of avian influenza A viruses of the H9 subtype, isolated in the territory of Southeast Asia (98-99% matches), turned out to be the closest. The hemagglutinin cleavage site of the avian influenza A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain has an RSSR / GLF structure, which makes it possible to characterize the virus as potentially low-virulent.

Таким образом, на основании серологических и молекулярно-биологических исследований установлена принадлежность штамма A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 семейству Orthomyxoviridae, роду Alphainfluenzavirus, виду Influenza A virus, типу А, подтипу H9N2.Thus, on the basis of serological and molecular biological studies, it was established that the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain belongs to the Orthomyxoviridae family, the Alphainfluenzavirus genus, the Influenza A virus species, type A, and the H9N2 subtype.

Пример 2.Example 2.

Для использования штаммов вируса в качестве контрольных штаммов при заражении в целях контроля антигенной и иммуногенной активности вакцин, а также для использования в качестве диагностического и производственного необходимо получить штамм вируса с высокой инфекционной активностью. Для определения инфекционной активности из вирусного материала готовили ряд десятикратных последовательных разведений (от 10-1 до 10-10). Каждое разведение вируса инокулировали в аллантоисную полость четырем 10-суточным СПФ-куриным эмбрионам (КЭ) в объеме 0,2 см3. Четырем эмбрионам контрольной группы вводили ФБР тем же способом в объеме 0,2 см3. Специфичность гибели подтверждали в реакции гемагглютинирующей активности (РГА) исследованием экстраэмбриональной жидкости (ЭЭЖ) от каждого зараженного эмбриона. Титр вируса в образце определяли по методу Кербера и выражали в единицах ЭИД50/см (таблица 3).To use virus strains as control strains during infection in order to control the antigenic and immunogenic activity of vaccines, as well as for use as a diagnostic and industrial one, it is necessary to obtain a virus strain with high infectious activity. To determine infectious activity, a series of tenfold serial dilutions (from 10 -1 to 10 -10 ) was prepared from the viral material. Each dilution of the virus was inoculated into the allantoic cavity of four 10-day-old SPF-chicken embryos (EC) in a volume of 0.2 cm 3 . Four embryos of the control group were injected with PBS in the same way in a volume of 0.2 cm 3 . The specificity of death was confirmed in the reaction of hemagglutinating activity (HAA) by examining the extraembryonic fluid (EEF) from each infected embryo. The titer of the virus in the sample was determined by the Kerber method and expressed in units of EID 50 / cm (Table 3).

Таким образом, инфекционная (in vivo) активность штамма A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса гриппа птиц при 10-кратном титровании в СПФ-КЭ составила 10,13 lg ЭИД50/см3.Thus, the infectious (in vivo) activity of the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain of the avian influenza virus with 10-fold titration in SPF-CE was 10.13 lg EID 50 / cm 3 .

Пример 3.Example 3.

Для использования штамма для контроля антигенной и иммуногенной активности, а так же для приготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики гриппа птиц подтипа Н9 необходимо получить штамм, свободный от контаминации чужеродными вирусами, бактериями и грибами. Подтверждение отсутствия контаминации бактериальной и грибной микрофлорой проводили в соответствии с ГОСТ 28085-89 «Препараты биологические. Метод контроля стерильности». Отсутствие контаминации микоплазмами проводили в соответствии с требованиями ГФ XIV, том 1, с. 1201-1222.To use the strain to control antigenic and immunogenic activity, as well as to prepare biological products for the diagnosis and specific prevention of avian influenza of the H9 subtype, it is necessary to obtain a strain free from contamination by foreign viruses, bacteria and fungi. Confirmation of the absence of contamination with bacterial and fungal microflora was carried out in accordance with GOST 28085-89 “Biological preparations. Sterility control method ". The absence of mycoplasma contamination was carried out in accordance with the requirements of the State Pharmacopoeia XIV, volume 1, p. 1201-1222.

В результате исследований установлено, что штамм A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса гриппа птиц не контаминирован бактериями, грибами и микоплазмами. В результате испытаний с применением методов полимеразной цепной реакции (ПЦР) и полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) было установлено, что штамм A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса гриппа птиц не контаминирован вирусами ньюкаслской болезни (НБ), инфекционного бронхита кур (ИБК), инфекционного ларинготрахеита птиц (ИЛТ), инфекционной бурсальной болезни (ИББ), реовирусом птиц и содержит в своем составе только геном вируса гриппа птиц типа А подтипа H9N2.As a result of the research, it was established that the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain of the avian influenza virus is not contaminated with bacteria, fungi and mycoplasmas. As a result of tests using the methods of polymerase chain reaction (PCR) and polymerase chain reaction with reverse transcription (RT-PCR), it was found that the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain of the avian influenza virus is not contaminated with Newcastle disease (NB) viruses , infectious chicken bronchitis (IBC), infectious avian laryngotracheitis (ILT), infectious bursal disease (IBD), avian reovirus and contains only the genome of avian influenza virus type A subtype H9N2.

Пример 4.Example 4.

Изучали патогенные свойства штамма A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса гриппа птиц на цыплятах 40-суточного возраста. В опыте использовали птицу яичного кросса. Штамм A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса гриппа птиц вводили цыплятам внутримышечно в объеме 1,0 см3 с инфекционной активностью 107 ЭИД50/см3. В результате эксперимента характерных клинических признаков заболевания (угнетенное состояние, взъерошенность оперения, отказ от корма и т.д.) у цыплят не наблюдалось, гибели зараженной птицы не было отмечено.The pathogenic properties of the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain of the avian influenza virus were studied on 40-day-old chickens. An egg cross bird was used in the experiment. The A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain of the avian influenza virus was injected into chickens intramuscularly in a volume of 1.0 cm 3 with an infectious activity of 10 7 EID 50 / cm 3 . As a result of the experiment, no characteristic clinical signs of the disease (depression, ruffled plumage, refusal to feed, etc.) were observed in chickens, and the death of an infected bird was not noted.

Таким образом, штамм A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса гриппа птиц является низковирулентным.Thus, the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain of the avian influenza virus is low-virulent.

Пример 5.Example 5.

Для получения иммунных сывороток крови к штамму A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 приготовили вакцину. Для изготовления вакцины использовали адъювант Montanide ISA 70 (SEPPIC, Франция). Для приготовления антигена использовали экстраэмбриональную жидкость зараженных СПФ-КЭ с инфекционной активностью 10,13 ЭИД50/см3, при этом гемагглютинирующая активность составляла значение 6 log2. Для инактивации инфекционных свойств вируса гриппа птиц использовали бета-пропиолактон (БПЛ). Для этого из исходного раствора БПЛ готовили рабочий 10%-ный раствор на стерильной деминерализованной воде. В сосуд с вируссодержащей жидкостью вносили рабочий раствор БПЛ до конечной концентрации 0,05%. Сосуд с содержимым инкубировали при температуре (18-26)°С в течение 24 ч при постоянном перемешивании на шейкере. После окончания процесса инактивации вирусный материал помещали в бытовой холодильник (4-8)°С, предварительно из сосуда отбирали пробу материала в объеме 5,0 см3 для проведения исследований по определению полноты инактивации вируса и стерильности материала. После подтверждения полноты инактивации готовили серию лабораторного образца вакцины. Для этого смешивали 30 частей антигена с заданными характеристиками и 70 частей адъюванта. Эмульсию получали на гомогенизаторе 3000 об/мин. Провели иммунизацию цыплят 40-суточного возраста внутримышечно в прививном объеме 1,0 см3 на голову. На 14 и 28 сутки после вакцинации у иммунизированных птиц отбирали кровь и исследовали на наличие специфических антител к вирусу гриппа птиц типа А подтипа Н9 в ИФА и РТГА (таблица 4, 5).A vaccine was prepared to obtain immune blood sera to the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain. The adjuvant Montanide ISA 70 (SEPPIC, France) was used to prepare the vaccine. To prepare the antigen, the extraembryonic fluid of infected SPF-CE with an infectious activity of 10.13 EID 50 / cm 3 was used , while the hemagglutinating activity was 6 log 2 . Beta propiolactone (BPL) was used to inactivate the infectious properties of the avian influenza virus. For this, a working 10% solution was prepared from the initial solution of BPL in sterile demineralized water. In a vessel with vaccinated liquid, a working solution of the LTP was introduced to a final concentration of 0.05%. The vessel with the contents was incubated at a temperature of (18-26) ° C for 24 h with constant stirring on a shaker. After the end of the inactivation process, the viral material was placed in a household refrigerator (4-8) ° C, a 5.0 cm 3 sample of the material was previously taken from the vessel to conduct studies to determine the completeness of the virus inactivation and the sterility of the material. After confirming the completeness of inactivation, a series of laboratory vaccine samples was prepared. For this, 30 parts of the antigen with the given characteristics and 70 parts of the adjuvant were mixed. The emulsion was prepared on a 3000 rpm homogenizer. Chickens of 40 days of age were immunized intramuscularly in a grafted volume of 1.0 cm 3 per head. On the 14th and 28th days after vaccination, the immunized birds were bled and examined for the presence of specific antibodies to the avian influenza virus type A subtype H9 in ELISA and RTGA (Table 4, 5).

Результаты исследований свидетельствуют о выраженной антигенной активности лабораторного образца вакцины на основе штамма A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2 вируса гриппа птиц рода Alphainfluenzavirus вида Influenza A virus подтипа Н9, т.к. установлено наличие специфических антител к вирусу гриппа типа А в ИФА и антигемагглютининов к вирусу гриппа подтипа H9N2.The research results indicate a pronounced antigenic activity of a laboratory sample of a vaccine based on the A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 strain of the avian influenza virus of the Alphainfluenzavirus genus Influenza A virus, subtype H9, because the presence of specific antibodies to influenza type A virus in ELISA and antihemagglutinins to influenza virus subtype H9N2 was established.

Источники информации, принятые во внимание при составлении описания изобретения к заявке на выдачу патента РФ на изобретение «Штамм «A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2» вируса гриппа птиц рода Alphainfluenzavirus вида Influenza A virus подтипа Н9 для контроля антигенной и иммуногенной активности вакцин против гриппа птиц и для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики гриппа птиц типа А подтипа Н9»:Sources of information taken into account in the preparation of the description of the invention to the application for the grant of a patent of the Russian Federation for the invention "Strain" A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2 "of the avian influenza virus of the genus Alphainfluenzavirus of the species Influenza A virus subtype H9 to control antigenic and immunogenic activity of vaccines against avian influenza and for the manufacture of biological products for the diagnosis and specific prevention of avian influenza type A, subtype H9 ":

1. Каверин Н.В., Львов Д.К., Щелканов М.Ю. / Ортомиксовирусы. Руководство по вирусологии. - М.: МИА, 2013. С. 307-313.1. Kaverin N.V., Lvov D.K., Shchelkanov M.Yu. / Orthomyxoviruses. Guide to Virology. - M .: MIA, 2013.S. 307-313.

2. Низкопатогенный грипп птиц, вызванный вирусом подтипа Н9. Обзор литературы. / Варкентин А.В., Волков М.С., Ирза В.Н. - В.: Труды федерального центра охраны здоровья животных, 2014, Т. 12 (1). С. 41-53.2. Low pathogenic avian influenza caused by H9 virus subtype. Literature review. / Varkentin A.V., Volkov M.S., Irza V.N. - V .: Proceedings of the Federal Center for Animal Health, 2014, T. 12 (1). S. 41-53.

3. Antigenic Cartography of Н9 Avian Influenza Virus and Its Application to Vaccine Selection/ Y. Wang, I. Davidson, R. Fouchier, E. Spackman - Avian Diseases, 2015. Vol. 60(1s). - P. 218-225.3. Antigenic Cartography of H9 Avian Influenza Virus and Its Application to Vaccine Selection / Y. Wang, I. Davidson, R. Fouchier, E. Spackman - Avian Diseases, 2015. Vol. 60 (1s). - P. 218-225.

4. Avian Influenza Virus. Springer Protocols / E. Spackman - L.: Methods in Molecular Biology, 2014. Vol. 1161. - P. 425.4. Avian Influenza Virus. Springer Protocols / E. Spackman - L .: Methods in Molecular Biology, 2014. Vol. 1161 .-- P. 425.

5. A distinct lineage of influenza A virus from bats. Proc Natl Acad Sci USA Tong SX, Li Y, Rivailler P, Conrardy C, Castillo DAA, et al., 2012. V 109. P. 4269-4274.5. A distinct lineage of influenza A virus from bats. Proc Natl Acad Sci USA Tong SX, Li Y, Rivailler P, Conrardy C, Castillo DAA, et al. 2012. V 109. P. 4269-4274.

6. A Global Perspective on H9N2 Avian Influenza Virus / T. P. Peacock, J. James, J. E. Sealy and M. Iqbal. - Viruses, 2019. Vol. 11. - P. 620- 628.6. A Global Perspective on H9N2 Avian Influenza Virus / T. P. Peacock, J. James, J. E. Sealy and M. Iqbal. - Viruses, 2019. Vol. 11. - P. 620-628.

7. A novel genotype H9N2 influenza virus possessing human H5N1 internal genomes has been circulating in poultry in eastern China since 1998 / Zhang P., Tang Y., Liu X.. - J. Virol, 2009. Vol. 83. - P. 8428-8438.7. A novel genotype H9N2 influenza virus possessing human H5N1 internal genomes has been circulating in poultry in eastern China since 1998 / Zhang P., Tang Y., Liu X .. - J. Virol, 2009. Vol. 83. - P. 8428-8438.

8. Evolution and Molecular Epidemiology of H9N2 Influenza A Viruses from Quail in Southern China, 2000 to 2005./ K. M. Xu, K. S. Li, G. J. D. Smith, J. W. Li, H. Tai, J. X. Zhang, R. G. Webster, J. S. M. Peiris, H. Chen and Y. Guan. - Journal of Virology, 2007/ Vol. 81(6), p. 2635-2645.8. Evolution and Molecular Epidemiology of H9N2 Influenza A Viruses from Quail in Southern China, 2000 to 2005./ KM Xu, KS Li, GJD Smith, JW Li, H. Tai, JX Zhang, RG Webster, JSM Peiris, H. Chen and Y. Guan. - Journal of Virology, 2007 / Vol. 81 (6), p. 2635-2645.

9. Evolution of H9N2 avian influenza virus in embryonated chicken eggs with or without homologous vaccine antibodies./ Jin H., Wang W., Yang X., Su H., Fan J., Zhu R., Wang S., Shi H., Liu X. - Veterinary Research, 2018. Vol. 14 (71). P. 2-11.9. Evolution of H9N2 avian influenza virus in embryonated chicken eggs with or without homologous vaccine antibodies./ Jin H., Wang W., Yang X., Su H., Fan J., Zhu R., Wang S., Shi H ., Liu X. - Veterinary Research, 2018. Vol. 14 (71). P. 2-11.

10. Genetic characterization of HA gene of low pathogenic H9N2 influenza viruses isolated in Israel during 2006-2012 periods / I. Shkoda, N. Golender, [et al.]. - Virus Genes, 2013. Vol. 46. - P. 255-263.10. Genetic characterization of HA gene of low pathogenic H9N2 influenza viruses isolated in Israel during 2006-2012 periods / I. Shkoda, N. Golender, [et al.]. - Virus Genes, 2013. Vol. 46. - P. 255-263.

11. Genome sequencing and phylogenetic analysis of three avian influenza H9N2 subtypes in Guangxi / Xie Z., Dong J., Tang X., [et al.]. - Virol. Sin. 2009. Vol. 24. - P. 2985-2988.11. Genome sequencing and phylogenetic analysis of three avian influenza H9N2 subtypes in Guangxi / Xie Z., Dong J., Tang X. [et al.]. - Virol. Sin. 2009. Vol. 24. - P. 2985-2988.

12. Genotypic evolution and epidemiological characteristics of H9N2 influenza virus in Shandong Province, China./ Li Y., Liu M., Sun Q., Zhang H., Zhang H., Jiang S., Liu S., Huang Y. - Poultry Science, 2019. Vol. 98(9), P. 3288-3495.12. Genotypic evolution and epidemiological characteristics of H9N2 influenza virus in Shandong Province, China./ Li Y., Liu M., Sun Q., Zhang H., Zhang H., Jiang S., Liu S., Huang Y. - Poultry Science, 2019. Vol. 98 (9), P. 3288-3495.

13. Infection with avian influenza viruses / OIE. Terrestrial Animal Health Code, 2019. Chapter 10.4. - URL: https://www.oie.int/standard-setting/terrestrial-code/access-online.13. Infection with avian influenza viruses / OIE. Terrestrial Animal Health Code, 2019. Chapter 10.4. - URL: https://www.oie.int/standard-setting/terrestrial-code/access-online.

14. Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals / OIE. Avian influenza (infection with avian influenza viruses), 2018. Chapter 3.3.4. URL: https://www.oie.int/fileadmin/Home/eng/Health_standards/tahm/3.03.04_AI.pdf14. Manual of Diagnostic Tests and Vaccines for Terrestrial Animals / OIE. Avian influenza (infection with avian influenza viruses), 2018. Chapter 3.3.4. URL: https://www.oie.int/fileadmin/Home/eng/Health_standards/tahm/3.03.04_AI.pdf

15. New World Bats Harbor Diverse Influenza A Viruses./ Suxiang Tong, Xueyong Zhu, Yan Li, Mang Shi, Jing Zhang,et al. PLoS Pathog., 2013 V 9(10), P. 1-12.15. New World Bats Harbor Diverse Influenza A Viruses. / Suxiang Tong, Xueyong Zhu, Yan Li, Mang Shi, Jing Zhang, et al. PLoS Pathog. 2013 V 9 (10) P. 1-12.

16. Phylogenetic analysis of influenza A viruses of H9 haemagglutinin subtype / Banks J., Speidel E.C., Harris P.A., Alexander D.J. - Avian Pathol., 2000. Vol. 29. - P. 353-360.16. Phylogenetic analysis of influenza A viruses of H9 haemagglutinin subtype / Banks J., Speidel E.C., Harris P.A., Alexander D.J. - Avian Pathol., 2000. Vol. 29. - P. 353-360.

17. Summary of avian influenza activity in Europe, Asia, Africa, and Australasia, 2002-2006 / Alexander D.J. - Avian Diseases, 2007. Vol. 51. - P. 161-166.17. Summary of avian influenza activity in Europe, Asia, Africa, and Australasia, 2002-2006 / Alexander D.J. - Avian Diseases, 2007. Vol. 51. - P. 161-166.

18. The PA Subunit of the Influenza Virus Polymerase Complex Affects Replication and Airborne Transmission of the H9N2 Subtype Avian Influenza Virus. /Mengchan Hao, Shaojie Han, Dan Meng, Rong Li, Jing Lin, Meng Wang, Tong Zhou and Tongjie Ch.. -Viruses., 2019 V 11(1), P. 2-12.18. The PA Subunit of the Influenza Virus Polymerase Complex Affects Replication and Airborne Transmission of the H9N2 Subtype Avian Influenza Virus. / Mengchan Hao, Shaojie Han, Dan Meng, Rong Li, Jing Lin, Meng Wang, Tong Zhou and Tongjie Ch .. -Viruses., 2019 V 11 (1), P. 2-12.

Figure 00000001
Figure 00000001

Figure 00000002
Figure 00000003
Figure 00000002
Figure 00000003

Figure 00000004
Figure 00000004

Figure 00000005
Figure 00000005

--->--->

Перечень последовательностейSequence listing

<110> Федеральное государственное бюджетное учреждение «Федеральный центр охраны здоровья животных (ФГБУ «ВНИИЗЖ») Federal Governmental Budgetary Institution «Federal Center for Animal Health» (FGBI « ARRIAH»)<110> Federal Governmental Budgetary Institution “Federal Center for Animal Health” (FGBI “ARRIAH”)

<120> Штамм «A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2» вируса гриппа птиц рода Alphainfluenzavirus вида Influenza А virus подтипа Н9 для контроля антигенной и иммуногенной активности вакцин против гриппа птиц и для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики гриппа птиц типа А подтипа Н9<120> Strain "A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2" of the avian influenza virus of the genus Alphainfluenzavirus of the species Influenza A virus subtype H9 for the control of antigenic and immunogenic activity of vaccines against avian influenza and for the manufacture of biological products for the diagnosis and specific prevention of avian influenza type A subtype H9

<160> 2<160> 2

<210> 1<210> 1

<211> 273<211> 273

<212> РНК<212> RNA

<213> вирус гриппа птиц<213> avian influenza virus

<400> 1<400> 1

AATCTAATAG CTCCATGGTA TGGATACATT CTTTCAGGAA AGAGCCATGG CAGAATTCTG 60AATCTAATAG CTCCATGGTA TGGATACATT CTTTCAGGAA AGAGCCATGG CAGAATTCTG 60

AAGACTGATT TAAAAAGGGG TAGCTGCACA GTGCAATGTC AGACAGAGAA AGGTGGCTTA 120AAGACTGATT TAAAAAGGGG TAGCTGCACA GTGCAATGTC AGACAGAGAA AGGTGGCTTA 120

AACACAACAC TGCCATTCCA AAATGTAAGT AAGTATGCAT TTGGAAACTG CTCAAAATAC 180AACACAACAC TGCCATTCCA AAATGTAAGT AAGTATGCAT TTGGAAACTG CTCAAAATAC 180

ATTGGCATAA AGAGTCTCAA ACTTGCAGTT GGTCTGAGGA ATGTGCCTTC TAGATCTAGT 240ATTGGCATAA AGAGTCTCAA ACTTGCAGTT GGTCTGAGGA ATGTGCCTTC TAGATCTAGT 240

AGAGGACTAT TCGGGGCCAT AGCAGGGTTT ATA 273 AGAGGACTAT TCGGGGCCAT AGCAGGGTTT ATA 273

<210> 2<210> 2

<211> 91<211> 91

<212> ПРТ<212> PRT

<213> вирус гриппа птиц<213> avian influenza virus

<400> 2<400> 2

Asn Leu Ile Ala Pro Trp Tyr Gly Tyr Ile Leu Ser Gly Lys Ser 15Asn Leu Ile Ala Pro Trp Tyr Gly Tyr Ile Leu Ser Gly Lys Ser 15

His Gly Arg Ile Leu Lys Thr Asp Leu Lys Arg Gly Ser Cys Thr 30His Gly Arg Ile Leu Lys Thr Asp Leu Lys Arg Gly Ser Cys Thr 30

Val Gln Cys Gln Thr Glu Lys Gly Gly Leu Asn Thr Thr Leu Pro 45Val Gln Cys Gln Thr Glu Lys Gly Gly Leu Asn Thr Thr Leu Pro 45

Phe Gln Asn Val Ser Lys Tyr Ala Phe Gly Asn Cys Ser Lys Tyr 60Phe Gln Asn Val Ser Lys Tyr Ala Phe Gly Asn Cys Ser Lys Tyr 60

Ile Gly Ile Lys Ser Leu Lys Leu Ala Val Gly Leu Arg Asn Val 75 Ile Gly Ile Lys Ser Leu Lys Leu Ala Val Gly Leu Arg Asn Val 75

Pro Ser Arg Ser Ser Arg Gly Leu Phe Gly Ala Ile Ala Gly Phe 90Pro Ser Arg Ser Ser Arg Gly Leu Phe Gly Ala Ile Ala Gly Phe 90

Ile 91Ile 91

<---<---

Claims (1)

Штамм вируса гриппа птиц A/chicken/Primorsk/419/2018 H9N2, сем. Orthomyxoviridae, род Alphainfluenzavirus вида Influenza A virus подтипа Н9, депонированный в коллекцию штаммов микроорганизмов ФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных» под регистрационным номером: №113 - деп / 19-3 - КШМ ФГБУ «ВНИИЗЖ», для контроля антигенной и иммуногенной активности вакцин против гриппа птиц и для изготовления биопрепаратов для диагностики и специфической профилактики гриппа птиц типа А подтипа Н9.Avian influenza virus strain A / chicken / Primorsk / 419/2018 H9N2, family. Orthomyxoviridae, genus Alphainfluenzavirus of the species Influenza A virus, subtype H9, deposited in the collection of microorganism strains of the Federal Center for Animal Health Protection under registration number: No. 113 - dep / 19-3 - KShM FGBU "ARRIAH", to control the antigenic and immunogenic activity of vaccines against avian influenza and for the manufacture of biological products for the diagnosis and specific prevention of avian influenza type A, subtype H9.
RU2020115194A 2020-04-16 2020-04-16 Strain "a/chicken/primorsk/419/2018 h9n2" of avian influenza virus of genus alphainfluenzavirus type influenza a virus subtype h9 for controlling antigenic and immunogenic activity of vaccines for avian influenza and for making biopreparations for diagnosis and specific prevention of avian influenza type a subtype h9 RU2736786C1 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2020115194A RU2736786C1 (en) 2020-04-16 2020-04-16 Strain "a/chicken/primorsk/419/2018 h9n2" of avian influenza virus of genus alphainfluenzavirus type influenza a virus subtype h9 for controlling antigenic and immunogenic activity of vaccines for avian influenza and for making biopreparations for diagnosis and specific prevention of avian influenza type a subtype h9

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2020115194A RU2736786C1 (en) 2020-04-16 2020-04-16 Strain "a/chicken/primorsk/419/2018 h9n2" of avian influenza virus of genus alphainfluenzavirus type influenza a virus subtype h9 for controlling antigenic and immunogenic activity of vaccines for avian influenza and for making biopreparations for diagnosis and specific prevention of avian influenza type a subtype h9

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2736786C1 true RU2736786C1 (en) 2020-11-20

Family

ID=73461019

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2020115194A RU2736786C1 (en) 2020-04-16 2020-04-16 Strain "a/chicken/primorsk/419/2018 h9n2" of avian influenza virus of genus alphainfluenzavirus type influenza a virus subtype h9 for controlling antigenic and immunogenic activity of vaccines for avian influenza and for making biopreparations for diagnosis and specific prevention of avian influenza type a subtype h9

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2736786C1 (en)

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2767359C1 (en) * 2021-05-04 2022-03-17 Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ") Strain "a/chicken/chelyabinsk/314-1/2020 h9n2" of avian influenza virus of genus alphainfluenzavirus of species influenza a virus subtype h9 for control of antigenic and immunogenic activity of vaccines against avian influenza and for production of biopreparations for diagnosis and specific prevention of avian influenza type a subtype h9
CN116875564A (en) * 2023-09-07 2023-10-13 天津瑞普生物技术股份有限公司 H9 subtype avian influenza virus strain and culture method thereof

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
МАРЧЕНКО В.Ю и др., Обзор эпидемиологической ситуации по высокопатогенному вирусу гриппа птиц в России в 2018 г. Проблемы особо опасных инфекций, 2019, 1, с.42-49. YUXIN ZHAO et al, Phylogenetic analysis of hemagglutinin cenes of H9N2 Fvian influenza viruses isolated from chickens in Shandong, China, between 1998 and 2013, Hindawi publiching corporation Biomed research international, 2015, p. 1-6, ID: 267520, doi: 10.1155/2015/267520. JIN H et al, Evolution of H9N2 avian influenza virus in embryonated chicken eggs with or without homologous vaccine antibodies., Veterinary Research, 2018. Vol. 14 (71), p. 2-11. *

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2767359C1 (en) * 2021-05-04 2022-03-17 Федеральное государственное бюджетное учреждение "Федеральный центр охраны здоровья животных" (ФГБУ "ВНИИЗЖ") Strain "a/chicken/chelyabinsk/314-1/2020 h9n2" of avian influenza virus of genus alphainfluenzavirus of species influenza a virus subtype h9 for control of antigenic and immunogenic activity of vaccines against avian influenza and for production of biopreparations for diagnosis and specific prevention of avian influenza type a subtype h9
CN116875564A (en) * 2023-09-07 2023-10-13 天津瑞普生物技术股份有限公司 H9 subtype avian influenza virus strain and culture method thereof
CN116875564B (en) * 2023-09-07 2023-12-01 天津瑞普生物技术股份有限公司 H9 subtype avian influenza virus strain and culture method thereof

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Bello et al. Diagnostic and vaccination approaches for Newcastle disease virus in poultry: The current and emerging perspectives
Liu et al. Preparation of a standardized, efficacious agricultural H5N3 vaccine by reverse genetics
Horimoto et al. The development and characterization of H5 influenza virus vaccines derived from a 2003 human isolate
TWI485247B (en) Method for producing the flu virus
Xu et al. Phylogenetic classification of hemagglutinin gene of H9N2 avian influenza viruses isolated in China during 2012–2016 and evaluation of selected candidate vaccine strains
Kilany et al. Protective efficacy of H5 inactivated vaccines in meat turkey poults after challenge with Egyptian variant highly pathogenic avian influenza H5N1 virus
CN104232594B (en) Recombination classes fowl type H1N1 inactivated influenza virus vaccines strain (JS40/PR8) and its preparation method and application
RU2318871C1 (en) Strain of influenza virus gkv 2389 for production of living intranasal and inactivated influenza vaccine
RU2736786C1 (en) Strain &#34;a/chicken/primorsk/419/2018 h9n2&#34; of avian influenza virus of genus alphainfluenzavirus type influenza a virus subtype h9 for controlling antigenic and immunogenic activity of vaccines for avian influenza and for making biopreparations for diagnosis and specific prevention of avian influenza type a subtype h9
CN103328629A (en) Novel vaccines against the a/H1N1 pandemic flu virus
CN104611299B (en) H9N2 avian flus strain, preparation method, vaccine combination and its application of a kind of artificial recombination
CN108888761B (en) Recombinant baculovirus inactivated vaccine for expressing H7N9 subtype avian influenza virus hemagglutinin protein and preparation method and application thereof
Hassan et al. Distribution of avian influenza H5N1 viral RNA in tissues of AI-vaccinated and unvaccinated contact chickens after experimental infection
RU2315101C2 (en) Vaccine strain of influenza virus a/17/california/04/6 (h3n2) and attenuation donor a/leningrad/134/17/k7/57 (h2n2) for its preparing
RU2736788C1 (en) Strain a/chiken/kostroma/3175/17 h5n2 of avian influenza virus subtype h5n2 infuenza a virus of genus alphainfluenzavirus to control antigenic and immunogenic activity of avian influenza vaccines and for making antigen-containing diagnosticums
Abid et al. Characterization and phylogenetic analysis of avian influenza virus subtype H9N2 in Pakistan
Wang et al. Isolation of a reassortant H1N2 swine Flu strain of type “Swine-Human-Avian” and its genetic variability analysis
CN104073470A (en) Spinner-flask culture method for H9N2 subtype of avian influenza virus
CN105802918B (en) Chicken&#39;s infectious bronchitis nephritis strain and its vaccine composition, preparation method and application
Hamid et al. Pathogenicity of an avian influenza H9N2 virus isolated from broiler chickens in Egypt.
Jin et al. Inactivated H5 antigens of H5N8 protect chickens from lethal infections by the highly pathogenic H5N8 and H5N6 avian influenza viruses
Nomura et al. An H9N2 influenza virus vaccine prepared from a non-pathogenic isolate from a migratory duck confers protective immunity in mice against challenge with an H9N2 virus isolated from a girl in Hong Kong
Song et al. Investigation of the biological indicator for vaccine efficacy against highly pathogenic avian influenza (HPAI) H5N1 virus challenge in mice and ferrets
RU2767359C1 (en) Strain &#34;a/chicken/chelyabinsk/314-1/2020 h9n2&#34; of avian influenza virus of genus alphainfluenzavirus of species influenza a virus subtype h9 for control of antigenic and immunogenic activity of vaccines against avian influenza and for production of biopreparations for diagnosis and specific prevention of avian influenza type a subtype h9
CN102234637B (en) Preparation for reconstruction influenza A H1N1 virus inactivated vaccine strain (SC/PR8), and use thereof