RU2716746C2 - Преобразование информации в цифровой патологии - Google Patents

Преобразование информации в цифровой патологии Download PDF

Info

Publication number
RU2716746C2
RU2716746C2 RU2018105702A RU2018105702A RU2716746C2 RU 2716746 C2 RU2716746 C2 RU 2716746C2 RU 2018105702 A RU2018105702 A RU 2018105702A RU 2018105702 A RU2018105702 A RU 2018105702A RU 2716746 C2 RU2716746 C2 RU 2716746C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
slide
control
slice
annotation
reference image
Prior art date
Application number
RU2018105702A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2018105702A (ru
RU2018105702A3 (ru
Inventor
Елте Петер ВИНК
Руд ВЛЮТТЕРС
Анке ПИРИК
Бас ХУЛСКЕН
Райнхольд ВИМБЕРГЕР-ФРИДЛЬ
Зиглинде НЕЕРКЕН
Original Assignee
Конинклейке Филипс Н.В.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Конинклейке Филипс Н.В. filed Critical Конинклейке Филипс Н.В.
Publication of RU2018105702A publication Critical patent/RU2018105702A/ru
Publication of RU2018105702A3 publication Critical patent/RU2018105702A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2716746C2 publication Critical patent/RU2716746C2/ru

Links

Images

Classifications

    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T11/002D [Two Dimensional] image generation
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T19/00Manipulating 3D models or images for computer graphics
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T7/00Image analysis
    • G06T7/0002Inspection of images, e.g. flaw detection
    • G06T7/0012Biomedical image inspection
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T7/00Image analysis
    • G06T7/10Segmentation; Edge detection
    • G06T7/11Region-based segmentation
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T7/00Image analysis
    • G06T7/30Determination of transform parameters for the alignment of images, i.e. image registration
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T7/00Image analysis
    • G06T7/30Determination of transform parameters for the alignment of images, i.e. image registration
    • G06T7/33Determination of transform parameters for the alignment of images, i.e. image registration using feature-based methods
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T7/00Image analysis
    • G06T7/30Determination of transform parameters for the alignment of images, i.e. image registration
    • G06T7/33Determination of transform parameters for the alignment of images, i.e. image registration using feature-based methods
    • G06T7/337Determination of transform parameters for the alignment of images, i.e. image registration using feature-based methods involving reference images or patches
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T2200/00Indexing scheme for image data processing or generation, in general
    • G06T2200/24Indexing scheme for image data processing or generation, in general involving graphical user interfaces [GUIs]
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T2207/00Indexing scheme for image analysis or image enhancement
    • G06T2207/20Special algorithmic details
    • G06T2207/20092Interactive image processing based on input by user
    • G06T2207/20104Interactive definition of region of interest [ROI]
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T2207/00Indexing scheme for image analysis or image enhancement
    • G06T2207/30Subject of image; Context of image processing
    • G06T2207/30004Biomedical image processing
    • G06T2207/30024Cell structures in vitro; Tissue sections in vitro
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T2207/00Indexing scheme for image analysis or image enhancement
    • G06T2207/30Subject of image; Context of image processing
    • G06T2207/30004Biomedical image processing
    • G06T2207/30096Tumor; Lesion
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T2207/00Indexing scheme for image analysis or image enhancement
    • G06T2207/30Subject of image; Context of image processing
    • G06T2207/30204Marker
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T2219/00Indexing scheme for manipulating 3D models or images for computer graphics
    • G06T2219/004Annotating, labelling

Landscapes

  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Computer Vision & Pattern Recognition (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Quality & Reliability (AREA)
  • Radiology & Medical Imaging (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Computer Graphics (AREA)
  • Software Systems (AREA)
  • Computer Hardware Design (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Sampling And Sample Adjustment (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Microscoopes, Condenser (AREA)
  • Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)
  • Investigating Or Analysing Materials By Optical Means (AREA)
  • Image Analysis (AREA)

Abstract

Настоящее изобретение относится к демонстрации аннотации на контрольном предметном стекле. Техническим результатом заявленного изобретения является копирование аннотации, создаваемой на эталонном предметном стекле, на контрольное предметное стекло. Технический результат достигается посредством устройства, содержащего блок создания эталона, создающего цифровое эталонное изображение эталонного предметного стекла и цифровую аннотацию в эталонном изображении; блок создания образца, создающего цифровое контрольное изображение контрольного предметного стекла; блок распознавания, выполняющего распознавания между эталонным изображением и контрольным изображением для создания пространственной связи между эталонным изображением и контрольным изображением; блок определения, определяющего положения аннотации для аннотации на контрольном предметном стекле, и блок демонстрации, демонстрирующий аннотации в положении аннотации на контрольном предметном стекле. 5 н. и 9 з.п. ф-лы, 14 ил.

Description

ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИ, К КОТОРОЙ ОТНОСИТСЯ ИЗОБРЕТЕНИЕ
Изобретение относится к цифровой патологии и относится, в частности, к преобразованию аннотации между предметными стеклами, содержащими срезы биологического материала.
УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Патолог играет центральную роль в диагностической части цикла лечения. При взятии образца биологического материала у пациента во время биопсии обычно именно патолог ставит окончательный диагноз относительно характера и тяжести потенциального заболевания путем микроскопического исследования ткани и клеток по результатам биопсии.
В одном из примеров предметное стекло для микроскопического исследования может быть подготовлено в несколько следующих этапов. Сначала образец биологического материала может быть помещен в формалин для фиксирования, а затем преобразован в парафиновый блок, из которого нарезаются тонкие - толщиной около 5 мкм - срезы. Один из этих срезов затем помещается на подложку предметного стекла, в частности, на стеклянную подложку, после чего могут наноситься одно или более окрашивающих веществ, в результате чего соответствующие части клетки или ткани становятся видимыми с помощью микроскопа. После этого к срезу может добавляться иммерсионная жидкость и/или фиксатор. Далее сверху на срез может помещаться тонкое - толщиной около 170 мкм - прозрачное покровное стекло, благодаря чему срез герметизируется. Это обеспечивает возможность долговременного хранения - в частности, более 10 лет - предметного стекла, содержащего срез.
Несмотря на то, что патология, главным образом, является аналоговой профессией, недавно произошел переход к цифровой патологии с целью повышения эффективности и качества диагностики. Цифровая патология означает оцифровывание необходимой информации для анализа биологического материала, в частности, среза в области биологии, гистологии и/или патологии. В частности, цифровая патология означает цифровую молекулярную диагностику срезов, которые ранее были вырезаны из образца биологического материала.
В одном из примеров применение цифровой патологии приводит к тому, что патолог физически больше не имеет дело с предметными стеклами, а вместо этого работает с цифровыми изображениями, которые могут быть получены с предметных стекол и прочей клинической информации для постановки диагноза.
При использовании подходящей процедуры диссекции, например, микродиссекции с помощью лазера один или несколько небольших образцов ткани могут быть вырезаны из среза, находящегося на подложке предметного стекла. Указанные небольшие образцы ткани могут подвергаться дополнительному молекулярному тестированию, такому как генотипирование ДНК или анализ профиля РНК-транскрипта. Как правило, патолог выбирает в срезе одну или несколько интересующих областей, которые могут подвергаться рассмотренной выше процедуре диссекции. Часто такой выбор делается маркировкой на задней стороне предметного стекла. Оператор может затем использовать cфокусированный лазерный луч для разреза вдоль линии маркировки, которая разделяет интересующую область и окружающий участок образца ткани. Отделенный образец ткани после этого извлекается, чтобы подвергаться дополнительной молекулярной диагностике.
US 2012/0045790 A1 относится к способу микродиссекции и системе обработки информации. Для обеспечения этапов выбора интересующей области в образце биологического материала и извлечения образца ткани в интересующей области предусмотрено определение интересующей области в контрольном срезе на основе интересующей области в цифровом изображении, причем, контрольная ткань извлекается из контрольного среза в соответствующей интересующей области.
Практическое обращение со срезами показало, что срез может иметь более одной интересующей области. Такие интересующие области, как правило, расположены на некотором расстоянии друг от друга. С целью идентификации различных интересующих областей предметное стекло может быть снабжено аннотациями, в частности, на задней стороне предметного стекла. Следовательно, аннотация, связанная с интересующей областью, может содержать идентификатор для идентификации интересующей области. Предметное стекло может быть снабжено дополнительными аннотациями, в частности, комментариями в отношении среза, заметки о процентной величине применительно к оценке опухолевых клеток или любой иной информацией, которая может быть релевантной в контексте диагностической информации. Как правило, патолог аннотирует так называемое эталонное предметное стекло, на котором маркируется указанная, по меньшей мере, одна интересующая область. Кроме того, предусмотрены так называемые контрольные предметные стекла, каждое из которых содержит контрольный срез. Предпочтительно эталонный срез эталонного предметного стекла и контрольные срезы контрольных предметных стекол вырезаются из биологического материала, который может иметь блочную форму. Эталонный срез и контрольные срезы, как правило, отправляются в лабораторию, в которой лаборант обычно вручную идентифицирует на основе информации эталонного предметного стекла область в указанном, по меньшей мере, одном контрольном предметном стекле, соответствующую интересующей области эталонного предметного стекла. Следовательно, при обращении с контрольными предметными стеклами имеется сделанная вручную запись аннотаций.
СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Может существовать необходимость в обеспечении преобразования информации, представляемой на эталонном предметном стекле, на контрольное предметное стекло, причем, эталонное предметное стекло и контрольное предметное стекло содержат срезы одного и того же блока биологического материала.
Цель изобретения достигается с помощью объекта изобретения в независимых пунктах, причем, дополнительные варианты осуществления включены в зависимые пункты.
В соответствии с первым аспектом изобретения, предлагается устройство, содержащее блок создания эталона, блок создания образца, блок распознавания, блок определения и блок демонстрации. Блок создания эталона выполнен с возможностью создания цифрового эталонного изображения эталонного предметного стекла, содержащего эталонный срез объекта, который содержит биологический материал, и создания цифровой аннотации в эталонном изображении. Контрольный срез и эталонный срез вырезаются из одного и того же объекта. Блок создания образца выполнен с возможностью создания цифрового контрольного изображения контрольного предметного стекла, содержащего контрольный срез объекта. Блок распознавания выполнен с возможностью выполнения распознавания между эталонным изображением и контрольным изображением для создания пространственной связи между эталонным изображением и контрольным изображением. Блок определения выполнен с возможностью определения - на основе пространственной связи - положения аннотации для аннотации на контрольном предметном стекле. Блок демонстрации выполнен с возможностью физической демонстрации аннотации в положении аннотации на контрольном предметном стекле.
Для обеспечения обращения с контрольным предметным стеклом и/или диссекцией контрольной ткани контрольного среза, находящегося на контрольном предметном стекле, устройство дает преимущество, состоящее в том, что соответствующая аннотация наглядно видна непосредственно на предметном стекле, причем, расположение аннотации на контрольном предметном стекле соответствует расположению аннотации на эталонном предметном стекле. Следовательно, взаимосвязи в отношении формы предметного стекла или любых иных признаков предметного стекла, в частности, с интересующей областью могут сохраняться. Например, в случае, когда аннотация расположена вблизи интересующей области на эталонном предметном стекле с целью достижения взаимосвязи между интересующей областью и аннотацией, соответствующая аннотация может предусматриваться на контрольном предметном стекле в аналогичном расположении. В случае, когда интересующая область также обеспечивается на контрольном предметном стекле, может также возникать близкое расположение. В частности, можно идентифицировать необходимую взаимосвязь между аннотацией и интересующей областью с помощью аннотации. Следовательно, диссекция контрольной ткани от контрольного среза контрольного предметного стекла упрощается, поскольку лаборант без труда может идентифицировать необходимую интересующую область. Кроме того, аннотация может использоваться с целью проверки.
В одном из примеров устройство относится к устройству для диагностики, в частности, для молекулярной диагностики, предпочтительно в области биологии, гистологии и/или патологии.
Еще в одном примере устройство используется для микроскопа или с микроскопом.
Объект, содержащий биологический материал, относится к образцу биологического материала, в частности, образующему блок материала. Следовательно, «объект» может также называться «образцом объекта», «образцом материала» или «блоком объекта».
Термин «срез» относится к части материала образца объекта, в частности, в виде среза из объекта в форме предпочтительно тонкого (например, около 5 мкм) среза.
В одном из примеров предметное стекло относится к подставке, предусмотренной для поддержания и/или удержания среза, в частности, для диагностических целей. Предметное стекло может также быть выполнено в целях архивирования, в частности, для хранения среза.
В одном из примеров термин «пространственная связь» означает правило преобразования между признаками эталонного изображения и признаками контрольного изображения.
В одном из примеров цифровое эталонное изображение означает цифровое изображение эталонного предметного стекла, содержащего эталонный срез.
В одном из примеров цифровое контрольное изображение означает цифровое изображение контрольного предметного стекла, содержащего контрольный срез.
В одном из примеров аннотация относится по меньшей мере, к одному из заметки, маркировки, текста, графики, чертежа, знака, рисунка, символа и/или пиктограммы.
В одном из примеров термин «физическая демонстрация аннотации» относится к фактическому или реальному виду аннотации.
В соответствии с одним из примеров осуществления, эталонный срез представляет собой окрашенный срез объекта, а контрольный срез представляет собой неокрашенный или иначе окрашенный срез объекта.
Термин «окрашенный» относится к расцвечиванию. Окрашивание может увеличивать контраст среза и/или подчеркивает конкретные интересующие признаки среза.
Термин «неокрашенный» относится к срезу, который не использовался при химическом взаимодействии с окрашивающим веществом.
Термин «иначе окрашенный» относится к иному химическому окрашивающему веществу, используемому для окрашивания. Например, г/э-окрашенный срез и г-окрашенный срез окрашены различным образом.
В случае, если контрольный срез не окрашен или иначе окрашен, соответствующие клетки или соответствующие части контрольного среза могут быть не видны. Однако благодаря физической демонстрации аннотации на контрольном предметном стекле и тем самым, в частности, на контрольном срезе информация, представляемая с аннотацией, может упрощать обращение с контрольным предметным стеклом. В одном из примеров демонстрация может помогать идентифицировать соответствующие области контрольного предметного стекла или контрольного среза. Еще в одном примере демонстрация аннотации может представлять соответствующую информацию, связанную с интересующей областью контрольного среза.
В соответствии с одним из примеров осуществления, блок демонстрации дополнительно выполнен с возможностью физической демонстрации аннотации на контрольном срезе контрольного предметного стекла.
В результате этого аннотация может быть наглядно видна непосредственно на контрольном срезе. Это может упрощать диссекцию контрольной ткани контрольного среза.
В соответствии с одним из примеров осуществления, блок демонстрации содержит проектор или дисплей для проецирования света на контрольное предметное стекло для наглядной демонстрации аннотации и/или области перемещения.
В результате этого аннотация может быть наглядно видна непосредственно на контрольном срезе без изменения состояния контрольного предметного стекла или контрольного среза. Следовательно, условно неизменившаяся контрольная ткань может быть отделена от контрольного среза.
В соответствии с одним из примеров осуществления, блок демонстрации содержит блок нанесения краски для нанесения краски на контрольное предметное стекло для физической демонстрации аннотации на контрольном предметном стекле и/или области перемещения на контрольном предметном стекле.
В результате этого аннотация может быть наглядно видна непосредственно на контрольном срезе. При перемещении контрольного среза после нанесения краски аннотация удерживается на контрольном предметном стекле. Такое удержание обеспечивает качество диссекции контрольной ткани контрольного среза, поскольку диссекция может выполняться соскабливанием. Смещения при соскабливании контрольной ткани не изменят положения аннотации на контрольном предметном стекле.
В соответствии со вторым аспектом изобретения, предлагается система, которая содержит устройство генерирования изображений предметного стекла и устройство в соответствии с одним из предыдущих примеров. Устройство генерирования изображений предметного стекла выполнено с возможностью генерирования цифрового эталонного изображения эталонного предметного стекла и генерирования цифрового контрольного изображения контрольного предметного стекла.
В результате этого система может автоматически копировать аннотацию эталонного предметного стекла на контрольное предметное стекло.
В соответствии с третьим аспектом изобретения, предлагается способ демонстрации аннотации. Способ включает в себя следующие этапы:
а) создание цифрового эталонного изображения для эталонного предметного стекла, содержащего эталонный срез объекта, который содержит биологический материал,
b) создание цифровой аннотации в эталонном изображении,
с) создание контрольного изображения контрольного предметного стекла, содержащего контрольный срез объекта, причем, контрольный срез и эталонный срез вырезаются из одного и того же объекта,
d) выполнение распознавания между эталонным изображением и контрольным изображением для создания пространственной связи между эталонным изображением и контрольным изображением,
е) определение - на основе пространственной связи - положения аннотации для аннотации на контрольном предметном стекле, и
f) физическая демонстрация аннотации в положении аннотации на контрольном предметном стекле.
В результате этого аннотация эталонного предметного стекла может копироваться на указанное, по меньшей мере, одно контрольное предметное стекло. В случае, если предусмотрено несколько контрольных предметных стекол, аннотация эталонного предметного стекла может копироваться на каждое из контрольных предметных стекол. Следовательно, данный способ снижает усилия на аннотирование контрольных предметных стекол и повышает точность аннотации на контрольном предметном стекле.
В одном из примеров осуществления этап f) демонстрации включает в себя: физическую демонстрацию аннотации на контрольном срезе контрольного предметного стекла.
В результате этого диссекция контрольной ткани контрольного среза может быть упрощена.
В соответствии с четвертым аспектом изобретения, предлагается элемент компьютерной программы для управления устройством в соответствии с одним из предыдущих примеров, который при исполнении блоком обработки выполнен с возможностью выполнения одного из этапов способа в соответствии с одним из предыдущих примеров.
В соответствии с пятым аспектом изобретения, предлагается машиночитаемая среда, хранящая элемент программы в соответствии с предыдущим аспектом изобретения.
В соответствии с шестым аспектом изобретения, предлагается предметное стекло для поддержания контрольного среза, содержащее опорную структуру для удержания контрольного среза и машиночитаемую среду, хранящую аннотацию и/или область перемещения на контрольном срезе.
В соответствии с одним из аспектов изобретения, предлагается способ демонстрации аннотации. Целью способа является копирование аннотации, создаваемой на эталонном предметном стекле, на контрольное предметное стекло. Как правило, эталонное изображение эталонного предметного стекла создается, в частности, путем сканирования эталонного предметного стекла. Эталонное изображение вследствие этого содержит информацию об эталонном срезе, который удерживается эталонным предметным стеклом. Кроме того, эталонное предметное стекло маркируется интересующей областью и аннотацией, которая может быть связана с интересующей областью. Если такое эталонное предметное стекло сканируется, соответствующее эталонное изображение содержит информацию о маркированной интересующей области, а также об аннотации. Кроме того, контрольное предметное стекло, удерживающее контрольный срез, может сканироваться с целью получения контрольного изображения. Контрольный срез и эталонный срез вырезаются из одного и того же объекта биологического материала. В частности, контрольный срез вырезается непосредственно после того, как выполнено вырезание блока материала для обеспечения эталонного среза. Поскольку эталонный срез и контрольный срез - из одного и того же объекта, их признаки, весьма вероятно, похожи. Ввиду их похожих признаков может выполняться распознавание изображений для получения правила преобразования между эталонным изображением и контрольным изображением. Предпочтительно, чтобы правило преобразования формировало пространственную связь между эталонным предметным стеклом и контрольным предметным стеклом. На основе пространственной связи любая информация о положении пикселя, признака или любой точки в эталонном изображении может быть преобразована в соответствующее положение на контрольном изображении. Следовательно, предпочтительно определять положение аннотации на контрольном изображении в тех случаях, когда та же аннотация, создаваемая в эталонном изображении, может копироваться на контрольное изображение. Таким образом, положение аннотации на контрольном изображении представляет собой положение, в котором предпочтительно должна находиться аннотация на контрольном предметном стекле. Следовательно, благодаря определению положения аннотации на контрольном изображении определяется также положение аннотации на контрольном предметном стекле. На основе определенного положения аннотации аннотация, в частности, текст или любой иной знак, цвет или текстура, известная по эталонному изображению, физически наносится на контрольное предметное стекло. Например, аннотация может непосредственно наноситься на контрольное предметное стекло путем проецирования света проектора. В качестве альтернативы, аннотация может печататься краской непосредственно на контрольном предметном стекле, в частности, на контрольном срезе контрольного предметного стекла.
Эти и другие аспекты изобретения станут понятными из описываемых ниже вариантов осуществления и объяснены со ссылкой на них.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ЧЕРТЕЖЕЙ
Примеры осуществления изобретения описываются ниже со ссылкой на следующие чертежи:
на фиг. 1 схематически изображен блок объекта;
на фиг. 2 схематически изображена последовательность предметных стекол;
на фиг. 3 изображен пример эталонного изображения;
на фиг. 4 изображен пример контрольного изображения;
на фиг. 5 изображена схема установки первого примера устройства в соответствии с изобретением;
на фиг. 6 изображена схема установки второго примера устройства в соответствии с изобретением;
на фиг. 7 изображен дополнительный пример эталонного изображения;
на фиг. 8 изображен дополнительный пример контрольного изображения;
на фиг. 9 изображен дополнительный пример эталонного изображения;
на фиг. 10 схематически изображен пример контрольного среза, расположенного на дисплее;
на фиг. 11 изображена схема установки третьего примера устройства в соответствии с изобретением;
на фиг. 12 изображена схема установки четвертого примера устройства в соответствии с изобретением;
на фиг. 13 изображена схема установки пятого примера устройства в соответствии с изобретением;
на фиг. 14 изображена схема последовательности операций для примера способа в соответствии с настоящим изобретением.
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ ВАРИАНТОВ ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ
Если не указано иное, одинаковые или похожие ссылочные позиции, появляющиеся на различных чертежах, обозначают одинаковые или похожие компоненты.
Настоящее изобретение относится к освещению аннотации на контрольном предметном стекле. Освещение аннотации может увеличивать эффективность и/или качество последовательности действий, которая обеспечивает анализ в области цифровой патологии, в частности, в случае молекулярной диагностики. Соответствующий анализ может оказаться затруднительным и может потребовать детального анализа тонкой структуры биологического материала, в частности, клеток и/или их морфологии. Следовательно, классификация ткани на нормальный тип и опухолевый тип может оказаться столь же затруднительной. Освещение аннотации на контрольном предметном стекле может ускорить выполнение последовательности действий.
На фиг. 1 изображен пример объекта 10.
Объект 10 содержит биологический материал. В одном из примеров объект 10 относится к образцу биологического материала, в частности, образующего блок биологического материала.
Поэтому объект 10 может также называться «образцом объекта», «образцом материала» или «блоком объекта».
В одном из примеров последовательность срезов 16, 18 вырезается из объекта 10. Один из этих срезов предпочтительно окрашивается, в частности, гематоксилином и эозином (г/э). Как правило, для окрашивания могут использоваться различные вещества.
В одном из примеров окрашивание среза позволяет проводить различие, например, между клетками, тканью и соединениями, в частности, между мышечными волокнами, соединительной тканью, клеточными элементами крови и/или органеллами внутри отдельных клеток.
В одном из примеров термин «окрашивание» относится к расцвечиванию. Следовательно, окрашивание предпочтительно увеличивает контраст биологического материала среза и/или предпочтительно подчеркивает, например, конкретные интересующие признаки биологического материала среза.
На фиг. 2 изображена последовательность предметных стекол 12, 14. Впереди последовательности расположен пример эталонного предметного стекла 12. За эталонным предметным стеклом 12 расположены примеры контрольных предметных стекол 14.
Эталонное предметное стекло 12 содержит эталонный срез 16 объекта 10. Каждое из контрольных предметных стекол 14 содержит соответствующий контрольный срез 18 (не показан). Срезы 16, 18 предпочтительно последовательно вырезаются из объекта 10. Следовательно, они могут иметь похожую форму или контур.
После анализа контрольного среза 16 контрольного предметного стекла 12 может быть идентифицирована интересующая область 20 на контрольном срезе 16. Интересующая область 20 может быть обведена кружком на контрольном срезе 16. В частности, маркировка интересующей области 20 может выполняться патологом. В одном из примеров интересующая область 20 относится к участку эталонного среза 16, на котором оцениваются конкретные клетки, например, опухолевые клетки.
Кроме того, аннотация 22 может наноситься на эталонное предметное стекло 12.
В одном из примеров предметное стекло 12, 14 относится к подставке, предусмотренной для поддержания и/или удержания среза 16, 18 для диагностических целей, в частности, также в целях хранения среза 16, 18.
Еще в одном примере предметное стекло 12, 14 содержит прозрачную подложку 24, например, стеклянную подложку 24, на которой может предусматриваться срез 16, 18.
В одном из примеров покровное стекло (не показано), например, тонкий слой стекла или прозрачная пластина может предусматриваться на срезе 16, 18 и подложке 24 для защиты и/или поддержания среза 16, 18.
В одном из примеров аннотация 22 может наноситься на заднюю поверхность прозрачной подложки 24 эталонного предметного стекла 12. В частности, патолог может использовать ручку для нанесения аннотации 22 на заднюю поверхность подложки 24. В качестве альтернативы, аннотация 22 может наноситься на переднюю поверхность эталонного предметного стекла 12. Например, аннотация 22 может наноситься на переднюю сторону прозрачной подложки 24 эталонного предметного стекла 12 и/или на покровное стекло эталонного предметного стекла 12.
В одном из примеров аннотация 22 относится, по меньшей мере, к одному из заметки, маркировки, текста, графики, чертежа, знака, рисунка, символа и/или пиктограммы.
В одном из примеров аннотация может относиться к интересующей области 20. В альтернативном примере аннотация может не относиться к интересующей области 20 или может не маркировать ее, в частности, участок на котором оцениваются опухолевые клетки.
В одном из примеров интересующая область 20 относится к области среза 12, 14, которая считается подлежащей перемещению для дополнительных целей, например, формирования анализируемой ткани.
В одном из примеров термин «интересующая область» может называться «областью перемещения».
В соответствии с фиг. 1 срезы, в частности, эталонный срез 16 и/или контрольный срез 18 могут последовательно вырезаться из объекта 10. Следовательно, срезы 16, 18 могут иметь похожую форму или контур.
В одном из примеров эталонный срез 16 и контрольный срез 18 являются смежными перед вырезанием из одного и того же объекта 10.
На фиг. 3 изображено эталонное изображение 26 эталонного предметного стекла 12.
Эталонное изображение 26 показывает предпочтительно вид сверху эталонного предметного стекла 12. Следовательно, эталонное изображение 26 частично содержит изображение эталонного среза 16. Кроме того, эталонное изображение 26 содержит аннотацию 22 в цифровой форме. Следовательно, эталонное изображение 26 содержит цифровую аннотацию 22.
В одном из примеров эталонное изображение 26 показывает обведенную кружком область, соответствующую интересующей области 20. Следовательно, эталонное изображение 26 может содержать цифровую интересующую область 20.
В одном из примеров эталонный срез 16 окрашивается, в частности, при генерировании эталонного изображения 26.
В одном из примеров патолог в цифровой форме выбирает интересующую область 20 на эталонном изображении 26.
В одном из примеров интересующая область 20 на эталонном изображении 26 основана на морфологии или на контуре окрашивания эталонного среза 16.
На фиг. 4 изображен пример контрольного изображения 28 контрольного предметного стекла 14.
Контрольное изображение 28 предпочтительно относится к виду сверху контрольного предметного стекла 14.
В одном из примеров контрольное предметное стекло 14 содержит прозрачную подложку 30, которая удерживает контрольный срез 18.
В одном из примеров контрольный срез 18 является неокрашенным и/или парафинированным, в частности, при генерировании контрольного изображения 28.
На фиг. 5 изображен первый пример устройства 32 в соответствии с одним из вариантов осуществления настоящего изобретения. Устройство 32 содержит блок 34 создания эталона, блок 36 создания образца и блок 44 демонстрации.
Блок 34 создания эталона выполнен с возможностью создания цифрового эталонного изображения 26 эталонного предметного стекла 12, содержащего эталонный срез 16 объекта 10, который содержит биологический материал, и создания цифровой аннотации 22 в эталонном изображении 26.
Термин «цифровое эталонное изображение» также именуется как «эталонное изображение».
Термин «цифровая аннотация» может также именоваться как «аннотация».
Блок 36 создания образца выполнен с возможностью создания цифрового контрольного изображения 28 контрольного предметного стекла 14, содержащего контрольный срез 18 объекта 10.
Термин «цифровое контрольное изображение» может также именоваться как «контрольное изображение».
Блок 38 распознавания выполнен с возможностью выполнения распознавания между эталонным изображением 26 и контрольным изображением 28 для создания пространственной связи между эталонным изображением 26 и контрольным изображением 28.
Блок 40 определения выполнен с возможностью определения - на основе пространственной связи - положения 42 аннотации для аннотации 22 на контрольном предметном стекле 14.
Блок 44 демонстрации выполнен с возможностью физической демонстрации аннотации 22 в положении 42 аннотации на контрольном предметном стекле 14.
В результате этого аннотация может быть наглядно видна непосредственно на контрольном предметном стекле 14. Такая видимость упрощает обращение с контрольным предметным стеклом 14, поскольку лицу, обращающемуся с контрольным предметным стеклом 14, не приходится постоянно проверять аннотацию на эталонном предметном стекле.
В одном из примеров аннотация 22 на контрольном предметном стекле 14 соответствует аннотации 22 на эталонном изображении 26. В частности, аннотация 22 на контрольном предметном стекле 14 может являться видимой и/или реальной копией цифровой аннотации 22 эталонного изображения 26.
В одном из примеров блок 40 определения выполнен с возможностью определения положения 42 аннотации, по меньшей мере, в два этапа. На первом этапе из указанных, по меньшей мере, двух этапов блок 40 определения может быть выполнен с возможностью определения - на основе пространственной связи - положения аннотации для аннотации 22 на контрольном изображении 28. Аннотация 22 на контрольном изображении 28 может являться цифровой копией цифровой аннотации 22 в эталонном изображении 26. На втором этапе из указанных, по меньшей мере, двух этапов блок 40 определения может быть выполнен с возможностью определения - на основе положения аннотации 22 на контрольном изображении 28 - положения 42 аннотации для аннотации 22 на контрольном предметном стекле 14. Аннотация 22 на контрольном предметном стекле 14 может являться видимой и/или реальной копией цифровой аннотации 22 на контрольном изображении 28.
В одном из примеров цифровое контрольное изображение 28 означает цифровое изображение контрольного предметного стекла 14, удерживающего контрольный срез 18.
В одном из примеров блок 34 создания эталона содержит интерфейс, выполненный с возможностью приема эталонного изображения 26 в цифровой форме.
В одном из примеров блок 36 создания образца может быть соединен с камерой 46, причем, камера 46 выполнена с возможностью генерирования цифрового контрольного изображения 28 контрольного предметного стекла 14. Соединение между блоком 36 создания образца и камерой 36 может представлять собой информационное соединение, выполненное с возможностью передачи данных цифрового контрольного изображения 28 камеры 46 в блок 36 создания образца.
Камера 46 может быть любого подходящего типа, выполненного с возможностью генерирования цифрового контрольного изображения 28.
В одном из примеров цифровое контрольное изображение 28 означает цифровое изображение контрольного предметного стекла 14, удерживающего контрольный срез 18.
В одном из примеров блок 34 создания эталона содержит интерфейс, выполненный с возможностью приема эталонного изображения 26 в цифровой форме.
В одном из примеров блок 34 создания эталона может быть соединен с камерой (не показана). Соединение может представлять собой информационное соединение для передачи данных, соответствующих цифровому эталонному изображению 26. Камера может быть выполнена с возможностью генерирования цифрового эталонного изображения 26.
Еще в одном примере блок 34 создания эталона может быть соединен (не показано) с той же цифровой камерой 46, что и блок 36 создания образца.
Еще в одном примере блок 34 создания эталона и блок 36 создания образца объединены или выполнены в общем блоке.
Еще в одном примере блок 34 создания эталона и блок 36 создания представляют собой один и тот же блок, который может именоваться как «блок создания».
В одном из примеров распознавание между эталонным изображением 26 и контрольным изображением 28 обеспечивается с помощью распознавания изображений или регистрации изображений.
В одном из примеров эталонный срез 16 и контрольный срез 18 вырезаются из одного и того же объекта 10, в частности, последовательно. Следовательно, весьма вероятно, что эталонный срез 16 и контрольный срез 18 имеют похожую форму, контур и/или иные признаки.
В одном из примеров распознавание между эталонным изображением 26 и контрольным изображением 28 предусматривает правило преобразования между признаками эталонного изображения 26 и контрольного изображения 28. Признаки могут относиться к форме соответствующего среза 16, 18 и/или контуру соответствующих срезов 16, 18.
В одном из примеров термин «пространственная связь» означает правило преобразования между признаками эталонного изображения 26 и контрольного изображения 28.
В одном из примеров правило преобразования предусматривает правило для преобразования положения на эталонном изображении в соответствующее положение на контрольном изображении.
В одном из примеров пространственная связь может применяться к цифровой аннотации 22. Следовательно, пространственная связь может применяться к положению цифровой аннотации 22 в эталонном изображении 26 для создания положения 42 аннотации для копии аннотации 22 на контрольном изображении 28. В одном из примеров блок 40 определения может быть выполнен с возможностью определения вышеупомянутого этапа.
В одном из примеров блок 40 определения выполнен с возможностью определения положения аннотации 22 на контрольном изображении 28 на основе пространственной связи и выполнен с возможностью отображения положения аннотации после этого на контрольное предметное стекло 14.
В одном из примеров на основе положения аннотации 22 на контрольном изображении 28 определяется положение 42 аннотации для аннотации 22 на контрольном предметном стекле 14. Блок 40 определения может быть выполнен с возможностью выполнения этого определения.
В одном из примеров положение аннотации относится к положению на контрольном изображении 28 для аннотации.
В одном из примеров положение 42 аннотации относится к положению на контрольном предметном стекле 14 для демонстрации аннотации 22.
В одном из примеров положение 42 аннотации относится к положению для демонстрации аннотации на поверхности контрольного предметного стекла 14 или контрольного среза 16, удерживаемого контрольным предметным стеклом 14. Иными словами, блок 40 определения может быть выполнен с возможностью определения положения 42 аннотации для аннотации 22 на контрольном изображении 28 на основе пространственной связи и выполнен с возможностью отображения положения 42 аннотации после этого на контрольное предметное стекло 14.
На фиг. 5 изображена схема установки примера устройства 32.
В одном из примеров блок 44 демонстрации, изображенный на фиг. 5, выполнен с возможностью демонстрации аннотации 22 путем проецирования света в положении 42 аннотации на контрольном предметном стекле 14.
В одном из примеров термин «в контрольном предметном стекле» может также именоваться как «на контрольном предметном стекле».
В одном из примеров блок 44 демонстрации выполнен с возможностью физической демонстрации аннотации 22 в положении 42 аннотации на контрольном предметном стекле 14. В частности, аннотация 22 физически демонстрируется на поверхности контрольного предметного стекла 14. Поверхность контрольного предметного стекла 14 может быть образована, по меньшей мере, частично поверхностью подложки 30 контрольного предметного стекла 14 и/или, по меньшей мере, частично поверхностью контрольного среза 18.
В одном из примеров демонстрация может осуществляться с использованием света и/или краски.
В одном из примеров термин «в контрольном предметном стекле» может также именоваться как «внутри контрольного предметного стекла».
В одном из примеров блок 44 демонстрации выполнен с возможностью физической демонстрации аннотации 22 в положении 42 аннотации на контрольном предметном стекле 14.
В одном из примеров физическая демонстрации аннотации 22 может осуществляться в подложке 30 контрольного предметного стекла 14 и/или в контрольном срезе 18, удерживаемом подложкой 30 контрольного предметного стекла 14. Предпочтительно подложка 30 контрольного предметного стекла 14 является прозрачной.
В одном из примеров блок 44 демонстрации выполнен с возможностью физической демонстрации интересующей области 20 на контрольном предметном стекле 14.
В одном из примеров эталонное предметное стекло 12 может сканироваться для создания цифрового изображения эталонного предметного стекла 12, причем, после этого, по меньшей мере, одна аннотация 22 может в цифровой форме наноситься на цифровое изображение эталонного предметного стекла 12 с целью формирования цифрового эталонного изображения 26 эталонного предметного стекла 12, содержащего его цифровую аннотацию 22.
В одном из примеров эталонное предметное стекло 12 содержит подложку 24, в частности, прозрачную подложку 24, причем, подложка 24 удерживает эталонный срез 16. Кроме того, эталонное предметное стекло 12 может содержать покровное стекло, которое расположено на эталонном срезе 16 таким образом, что эталонный срез 16 расположен между подложкой 24 и покровным стеклом.
Еще в одном примере контрольное предметное стекло 14 содержит подложку 30, в частности, прозрачную подложку 30, причем, подложка 30 удерживает контрольный срез 18. Предпочтительно, чтобы контрольное предметное стекло 14 было непокрытым. Таким образом, контрольное предметное стекло 14 может не иметь покровного стекла для покрытия контрольного среза 18. Без покровного стекла биологический материал контрольного среза 18 может быть без труда отделен для последующего анализа или иных целей.
Устройство 32, в частности, камера 46 устройства 32 может быть выполнено с возможностью генерирования цифровых контрольных изображений 28 нескольких контрольных предметных стекол 14.
В одном из примеров устройство 32 может быть выполнено с возможностью идентификации эталонного предметного стекла 12 и/или контрольного предметного стекла 14. Это обеспечивает распределение между эталонным предметным стеклом 12 и контрольным предметным стекло 14, в частности, в том случае, когда несколько контрольных предметных стекол 14 могут быть выделены одному и тому же эталонному предметному стеклу 12.
В одном из примеров каждое из эталонного предметного стекла 12 и контрольного предметного стекла 14 содержит информационный носитель, например, штрих-код и/или электронный носитель информации, в частности, чип радиочастотной идентификации (RFID).
В одном из примеров информационный носитель эталонного предметного стекла 12 и/или информационные носители контрольного предметного стекла 14, соответственно, могут использоваться в целях идентификации. Например, если контрольное предметное стекло 14 идентифицируется и может распределяться с эталонным предметным стеклом 12, устройство 32 может быть выполнено с возможностью демонстрации аннотации 22, которая соответствует цифровой аннотации 22 в эталонном изображении 26 эталонного предметного стекла 12, на контрольном предметном стекле 14.
Благодаря использованию устройства 32 лаборант, желающий проанализировать, по меньшей мере, часть биологического материала контрольного среза 18 контрольного предметного стекла 14, не нуждается в постоянной проверке эталонного предметного стекла 12 на наличие информации, представленной на эталонном предметном стекле 12, поскольку аннотация 22 может физически демонстрироваться на контрольном предметном стекле 14. Следовательно, лаборант не нуждается в переключении от эталонного предметного стекла 12 к предметному стеклу 14. Тем самым значительно снижается вероятная частота появления ошибок во время последовательности действий анализа биологического материала объекта 10, в частности, контрольного среза 18.
Еще в одном примере эталонный срез 16 представляет собой окрашенный срез объекта 10, а контрольный срез 18 представляет собой неокрашенный или иначе окрашенный срез объекта 10.
В одном из примеров окрашивание относится к расцвечиванию признаков среза. Например, окрашивание может увеличивать контраст среза и/или подчеркивает конкретные интересующие признаки среза.
В одном из примеров эталонный срез 16 и/или контрольный срез 18 может являться зафиксированным в формалине и залитым парафином (FFPE).
В одном из примеров в качестве окрашивающего вещества для окрашивания среза может применяться гематоксилин (г), эозин (э) или комбинация гематоксилина и эозина (г/э).
В одном из примеров окрашивание среза позволяет проводить различие, например, между клетками, тканью и соединениями, в частности, между мышечными волокнами, соединительной тканью, клеточными элементами крови и/или органеллами в отдельных клетках.
В одном из примеров окрашивание может быть вызвано химическим взаимодействием между биологическим материалом среза и окрашивающим веществом, используемым для окрашивания.
Термин «неокрашенный» относится к срезу, который не использовался при химическом взаимодействии с окрашивающим веществом. Следовательно, контрольный срез 18 мог не применяться к химическому взаимодействию с окрашивающим веществом.
Термин «иначе окрашенный» может относиться к иному химическому окрашивающему веществу для контрольного среза 18, как и в случае с окрашиванием эталонного среза 16. Например, эталонный срез 16 может быть окрашен гематоксилином и эозином (г/э), а контрольный срез может быть окрашен только гематоксилином, тем самым являясь г-окрашенным. В этом случае эталонный срез и 16 и контрольный срез 18 окрашены различным образом.
В одном из примеров эталонный срез 16 окрашивается таким образом, чтобы требуемая интересующая область могла быть идентифицирована.
В одном из примеров интересующая область, которая может означать область перемещения, в эталонном срезе 16 основана на морфологии и/или контуре окрашивания эталонного среза 16.
В одном из примеров интересующая область может идентифицироваться в эталонном изображении 26, которое, в частности, является снимком эталонного предметного стекла 12, содержащего окрашенный эталонный срез 16.
На фиг. 6 изображен еще один пример устройства 32.
В одном из примеров блок 44 демонстрации дополнительно выполнен с возможностью физической демонстрации аннотации 22 в положении 42 образца в контрольном срезе 18 контрольного предметного стекла 14.
В одном из примеров термин «в срезе» может также именоваться как «на срезе». В частности, аннотация может физически демонстрироваться на верхней поверхности контрольного среза 18.
Еще в одном примере термин «в срезе» может также именоваться как «внутри среза».
В одном из примеров аннотация 22 может физически освещаться и тем самым физически демонстрироваться внутри контрольного среза 18. Это может осуществляться блоком 44 демонстрации, содержащим проектор.
В одном из примеров блок 44 демонстрации может содержать лазерный проектор. Лазерный проектор может быть выполнен таким образом, что лазерный луч может демонстрировать аннотацию 22 в контрольном срезе 18.
В соответствии с еще одним примером, распознавание включает в себя распознавание признаков эталонного изображения 26 в контрольном изображении 28.
Распознавание изображений в целом известно на существующем уровне техники. Распознавание признаков эталонного изображения 26 в контрольном изображении 28 может выполняться для генерирования правила преобразования между признаками эталонного изображения 26 и соответствующими признаками контрольного изображения 28.
В соответствии с еще одним примером, распознавание включает в себя регистрацию изображений из числа эталонного изображения 26 и контрольного изображения 28 для создания пространственной связи между зарегистрированными признаками A, B, C, D эталонного изображения 26 и зарегистрированными признаками A', B', C', D' контрольного изображения 28.
Зарегистрированные признаки A, B, C, D эталонного изображения 26 для примера показаны на фиг. 7.
Зарегистрированные признаки A', B', C', D' контрольного изображения 28 для примера показаны на фиг. 8.
В одном из примеров для регистрации изображений, по меньшей мере, некоторые признаки A, B, C, D эталонного изображения 26 проецируются на аналогичные признаки A', B', C', D' контрольного изображения 28.
В одном из примеров для регистрации изображений определяются эталонные положения указанных, по меньшей мере, некоторых признаков A, B, C, D эталонного изображения 26 и эталонные векторы в эталонные положения, определяются контрольные положения указанных, по меньшей мере, некоторых признаков A', B', C', D' контрольного изображения 28 и контрольные векторы в контрольные положения, и на основе совпадения положений и векторов, соответственно, определяется правило пространственного преобразования в виде пространственной связи. Предпочтительно блок 40 определения выполнен с возможностью выполнения таких определений.
Еще в одном примере контраст совмещения эталонного изображения 26 и контрольного изображения 28 максимизируется для определения правила пространственного преобразования в виде пространственной связи. Предпочтительно блок 40 определения выполнен с возможностью выполнения данного определения.
Еще в одном примере блок регистрации может включать в себя контур эталонного изображения 26 для совпадения с контрольным изображением 28 с целью определения правила пространственного преобразования в виде пространственной связи. Предпочтительно блок 40 определения выполнен с возможностью выполнения такого определения.
В одном из примеров регистрация приводит к пространственному совпадению эталонного кадра эталонного изображения 26 с контрольным кадром контрольного изображения 28.
В одном из примеров эталонные координаты определяются для эталонного предметного стекла 12, при этом эталонные координаты переносятся в контрольные координаты для контрольного предметного стекла 14 с целью определения на основе пространственной связи на основе преобразования. Предпочтительно блок 40 определения выполнен с возможностью выполнения данного определения.
В соответствии с еще одним примером, блок 34 создания эталона выполнен с возможностью создания области перемещения эталона в эталонном изображении 26. В этом случае цифровая аннотация 22 предпочтительно представляет собой цифровую заметку, представляющую дополнительную информацию в отношении области 48 перемещения эталона.
На фиг. 9 приведен еще один пример эталонного изображения 26. Эталонное изображение 26 соответствует снимку вида сверху эталонного предметного стекла 12. Эталонное предметное стекло 12 содержит эталонный срез 16. Кроме того, изображена область 48 перемещения.
В одном из примеров область 48 перемещения относится к части эталонного среза 16.
В одном из примеров область 48 перемещения относится к области в эталонном изображении 26 или на эталонном срезе 16, которая считается подлежащей перемещению для дополнительных целей, например, формирования анализируемой ткани биологического материала. Поэтому вместо этого может использоваться термин «область перемещения».
Как показано в качестве примера на фиг. 9, термин «20%» может соответствовать цифровой аннотации 22 и тем самым является цифровой заметкой. Цифровая заметка содержит дополнительную информацию в отношении области 48 перемещения эталона. В частности, патолог отметил «20%» как вероятность того, что опухолевые клетки расположены в области 48 перемещения.
В одном из примеров цифровая аннотация 22 может находиться снаружи от эталонного среза 16, в частности, на верхней поверхности подложки 24 эталонного предметного стекла 12.
В одном из примеров и, в частности, в отношении объясненного выше контекста цифровая аннотация 22 может не относиться к области 48 перемещения. Предпочтительно область 48 перемещения относится к участку в эталонном изображении 26, изображающему эталонный срез 16. Кроме того, предпочтительно цифровая аннотация 22 размещается в эталонном изображении 26 на участке снаружи от участка, изображающего эталонный срез 16.
В одном из примеров цифровая заметка относится, по меньшей мере, к одному из маркировки, текста, графики, чертежа, цвета, знака, рисунка, символа и/или пиктограммы.
Еще в одном примере могут использоваться различные цвета. Например, различные цвета могут использоваться для маркировки различных участков на контрольном срезе. В вариантах осуществления один цвет краски может использоваться для выделения интересующего опухолевого участка, а второй цвет краски может использоваться для маркировки интересующего эталонного участка (например, здоровой ткани).
В соответствии с еще одним примером, блок 40 определения дополнительно выполнен с возможностью определения - на основе пространственной связи - положения перемещения для области 48 перемещения на контрольном предметном стекле 14.
В одном из примеров блок 40 определения выполнен с возможностью определения - на основе пространственной связи - положения перемещения для области перемещения, которая может являться копией эталонной области 48 перемещения, на контрольном изображении 28. Кроме того, предпочтительно блок 40 определения может быть выполнен с возможностью определения - на основе положения перемещения на контрольном изображении 28 - соответствующего положения перемещения для области перемещения на контрольном предметном стекле 14.
В одном из примеров блок 44 демонстрации дополнительно выполнен с возможностью демонстрации области 48 перемещения, в частности, области перемещения, соответствующей области 48 перемещения в эталонном изображении 26, физически в положении 50 перемещения на контрольном предметном стекле 14.
На фиг. 10 изображен пример контрольного среза 18, расположенного на дисплее 52.
В одном из примеров блок 44 демонстрации содержит дисплей 52 для проецирования света на контрольное предметное стекло 14 для наглядной демонстрации аннотации 22 и/или области 48 перемещения.
В одном из примеров дисплей 52 может быть выполнен в виде жидкокристаллического дисплея.
В одном из примеров контрольное предметное стекло 14 расположено на дисплее 52, в частности, на верхней поверхности 54 дисплея 52. В качестве альтернативы, контрольное предметное стекло 14 может быть расположено перед дисплем 52, в частности, на верхней поверхности 54 дисплея 52. Взаимное расположение контрольного предметного стекла 14 и дисплея 52 может быть закрепленным. В одном из примеров дисплей 52 может подчеркивать область 56, в которой должно размещаться контрольное предметное стекло 14.
Еще в одном примере дисплей 52 может проецировать свет на контрольное предметное стекло 14 таким образом, что аннотация 22 и/или область 48 перемещения отображаются в контрольном предметном стекле или на нем. Предпочтительно контрольный срез 18 расположен на прозрачной подложке 30 контрольного предметного стекла 14. Дисплей 52 может вследствие этого быть выполнен с возможностью освещения аннотации 22 и/или области 48 перемещения на контрольном срезе 18.
В одном из примеров блок 44 демонстрации выполнен с возможностью проецирования света непосредственно на контрольное предметное стекло 14 или в контрольный срез 18.
В соответствии с еще одним примером, блок 44 демонстрации содержит проектор для проецирования света на контрольное предметное стекло 14 для наглядной демонстрации аннотации 22 или области 48 перемещения.
Еще в одном примере дисплей 52 расположен на задней стороне прозрачной подложки 30 контрольного предметного стекла 14.
В одном из примеров контрольное предметное стекло 14 прикреплено с возможностью съема к дисплею 52. Тем самым может достигаться механическая юстировка между контрольным предметным стеклом 14 и дисплеем 52.
В соответствии с еще одним примером, блок 44 демонстрации содержит блок 58 нанесения краски для нанесения краски на контрольное предметное стекло 14 для физической демонстрации аннотации 22 на контрольном предметном стекле 14 и/или для демонстрации области 50 перемещения контрольного предметного стекла 14.
На фиг. 11 изображена схема установки еще одного примера устройства 32.
Устройство 32 может использоваться с микроскопом (не показан). В одном из примеров устройство 32 содержит держатель 60 для предметного стекла 16, 18.
В одном из примеров держатель 60 предметного стекла выполнен для поддержания с возможностью съема и/или удержания контрольного предметного стекла 14.
В одном из примеров держатель является неподвижно закрепленным относительно дисплея 52 или проектора соответственно.
В одном из примеров блок 44 демонстрации содержит блок 58 нанесения краски для нанесения краски на контрольное предметное стекло 14 для физической демонстрации аннотации 22 на контрольном предметном стекле 14 и/или для демонстрации области 50 перемещения контрольного предметного стекла 14.
В одном из примеров устройство 32 содержит заднюю подсветку, которая расположена на задней стороне держателя 60.
В одном из примеров блок 58 нанесения краски расположен на верхней стороне держателя 60. Следовательно, держатель 60 может быть расположен между блоком 58 нанесения краски и задней подсветкой 62. В том случае, когда контрольное предметное стекло 14 поддерживается держателем 60, контрольное предметное стекло 14 может размещаться между блоком 58 нанесения краски и задней подсветкой 62.
В одном из примеров держателем 60 образуется небольшая щель, в которую может вставляться контрольное предметное стекло 14.
В одном из примеров задняя подсветка выполнена с возможностью создания освещения на поверхности контрольного предметного стекла 14, в частности, на контрольном срезе 18, удерживаемом прозрачной подложкой 30 контрольного предметного стекла 14.
В одном из примеров контрольный срез 18 может быть заделан в парафин 64.
В одном из примеров блок 58 нанесения краски выполнен с возможностью нанесения краски на контрольное предметное стекло 14. Предпочтительно краска наносится таким образом, что аннотация 22 печатается в положении 42 аннотации на контрольном предметном стекле 14.
В одном из примеров контрольное предметное стекло 14 расположено на держателе 60 таким образом, что контрольный срез 18 расположен между прозрачной подложкой 30 контрольного предметного стекла 14 и задней подсветкой 62. Следовательно, блок 58 нанесения краски выполнен с возможностью печати аннотации 22 на задней стороне подложки 30 контрольного предметного стекла 14. Иными словами, блок 44 демонстрации может быть выполнен с возможностью нанесения краски на поверхность контрольного предметного стекла 14, повернутую в сторону от контрольного среза 18.
На фиг. 12 изображена схема установки еще одного примера устройства 32. При этом упоминается объяснение к фиг. 11 за исключением тех объяснений, которые относятся к ориентации контрольного предметного стекла 14.
В одном из примеров контрольное предметное стекло 14 может поддерживаться держателем 60 таким образом, что подложка 30 контрольного предметного стекла 14 расположена между контрольным срезом 18 контрольного предметного стекла 14 и задней подсветкой 62.
В одном из примеров и, в частности, в том случае, когда используются распарафинированные контрольные предметные стекла 14, краска может наноситься блоком 58 нанесения краски непосредственно на контрольный срез 18.
На фиг. 13 изображена схема установки еще одного примера устройства 32. При этом упоминается объяснение к фиг. 12 за исключением блока 58 нанесения краски. В этом случае блок 58 нанесения краски представляет собой графопостроитель, по меньшей мере, с одним пером.
В одном из примеров краска, наносимая блоком 58 нанесения краски, может наноситься графопостроителем с помощью пера. Графическое изображение может наноситься непосредственно на контрольное предметное стекло 14.
В одном из примеров графическое изображение может наноситься на заднюю сторону прозрачной подложки 30 контрольного предметного стекла 14. В качестве альтернативы и в соответствии с еще одним примером, графическое изображение может наноситься непосредственно на контрольный срез 18 контрольного предметного стекла 14.
В соответствии с еще одним примером, предлагается система, содержащая устройство генерирования изображений предметного стекла и устройство в соответствии с одним из предыдущих примеров. Устройство генерирования изображений предметного стекла предпочтительно выполнено с возможностью генерирования цифрового эталонного изображения 26 эталонного предметного стекла 12 и генерирования цифрового контрольного изображения 28 контрольного предметного стекла 14.
В одном из примеров устройство генерирования изображений предметного стекла представляет собой камеру 46.
В одном из примеров устройство генерирования изображений предметного стекла содержит блок обращения с предметным стеклом и цифровую камеру 46. Камера 46 может быть выполнена с возможностью получения данных цифровых изображений среза, временно поддерживаемого блоком обращения, и выдает данные в блок обработки, например, образуемый блоком 34 создания эталона и/или блоком 36 создания образца. Блок обработки может также содержать блок 38 распознавания и/или блок 40 определения.
На фиг. 14 изображен способ 65 в соответствии с настоящим изобретением. Способ 65 включает в себя следующее:
На первом этапе 66 создания, называемом также этапом а), создается цифровое эталонное изображение 26 эталонного предметного стекла 12, содержащего эталонный срез 16 объекта 10, содержащего биологический материал.
На втором этапе 68 создания, называемом также этапом b), создается цифровая аннотация 22 в эталонном изображении 26.
На третьем этапе 70 создания, называемом также этапом с), создается контрольное изображение 28 контрольного предметного стекла 14, содержащего контрольный срез 18 объекта 10.
На этапе 72 выполнения, называемом также этапом d), выполняется распознавание между эталонным изображением 26 и контрольным изображением 28 для создания пространственной связи между эталонным изображением 26 и контрольным изображением 28.
На этапе 74 определения, называемом также этапом е), на основе пространственной связи определяется положение 42 аннотации для аннотации 22 на контрольном предметном стекле 14.
На этапе 76 демонстрации, называемом также этапом f), аннотация 22 физически демонстрируется в положении 42 аннотации на контрольном предметном стекле 14.
В соответствии с одним из примеров, демонстрация включает в себя физическую демонстрацию аннотации 22 в контрольном срезе 18 контрольного предметного стекла 14.
В одном из примеров распознавание включает в себя распознавание признаков эталонного изображения 26 и контрольного изображения 28 и/или регистрацию эталонного изображения 26 и контрольного изображения 28 для создания пространственной связи между зарегистрированными признаками эталонного изображения 26 и зарегистрированными признаками контрольного изображения.
Один из примеров отличается тем, что этап b) включает в себя подэтап b1) создания эталонной области 48 перемещения в эталонном изображении, и отличается тем, что аннотация 22 представляет собой цифровую заметку, представляющую дополнительную информацию в отношении эталонной области 48 перемещения.
Один из примеров отличается тем, что этап e) включает в себя подэтап e1) определения - на основе пространственной связи - положения 50 перемещения для области 48 перемещения на контрольном предметном стекле 14.
Один из примеров отличается тем, что этап f) включает в себя подэтап f1) физической демонстрации области 50 перемещения в положении 50 перемещения на контрольном предметном стекле 14.
В одном из примеров аннотация 22 и/или область 48 перемещения демонстрируются на контрольном предметном стекле 14 с помощью проецируемого света.
В одном из примеров свет непосредственно проецируется на контрольное предметное стекло или контрольный срез.
В одном из примеров дисплей 42, в частности, жидкокристаллический дисплей или проектор используется для проецирования света.
В одном из примеров демонстрация аннотации 22 включает в себя оптическое подчеркивание аннотации 22 на контрольном предметном стекле 14 и/или в контрольном срезе 18.
В одном из примеров демонстрация области 48 перемещения включает в себя оптическое подчеркивание области 48 перемещения на контрольном предметном стекле 14 и/или в контрольном срезе 18.
В одном из примеров аннотация 22 подчеркивается оптически ярче или темнее, чем область, непосредственно примыкающая к аннотации 22 на контрольном предметном стекле 14 и/или в контрольном срезе 18.
В одном из примеров область 48 перемещения подчеркивается оптически ярче или темнее, чем область, непосредственно примыкающая к области 48 перемещения на контрольном предметном стекле 14 и/или в контрольном срезе 18.
Один из примеров отличается тем, что этап f) включает в себя нанесение краски на контрольное предметное стекло 14 для физической демонстрации аннотации 22 на контрольном предметном стекле 14 и/или области 50 перемещения на контрольном предметном стекле 14.
В одном из примеров контрольный срез 18 снабжен прозрачной подложкой 30 контрольного предметного стекла 14, причем, для демонстрации аннотации 22 аннотация 22 печатается на задней стороне подложки 30.
В одном из примеров аннотация 22 печатается снаружи от области 48 перемещения.
В одном из примеров для демонстрации области 48 перемещения краска наносится в виде линии, описывающей участок на контрольном предметном стекле 14, который является точным совпадением с областью 48 перемещения на контрольном срезе 18.
В одном из примеров краска наносится в виде линии, описывающей область 50 перемещения на поверхности контрольного среза 18.
Один из примеров отличается тем, что дополнительно предусматривается: этап g), перемещающий, по меньшей мере, часть биологического материала в области 50 перемещения контрольного среза 18, и этап h), представляющий перемещенный биологический материал для дальнейших целей.
Необходимо отметить, что варианты осуществления изобретения описываются применительно к различным объектам изобретения. В частности, некоторые варианты осуществления описываются применительно к устройству, в то время как другие варианты осуществления описываются применительно к способу. Однако специалисту в данной области техники из вышеизложенного будет ясно, что за исключением случаев, когда предусмотрено иное, помимо любой комбинации признаков, принадлежащих одному объекту изобретения, любая комбинация признаков, относящихся к различным объектам изобретения, также считается описанной в данной заявке. Однако все признаки могут комбинироваться, обеспечивая синергические эффекты, которые представляют собой более, чем простое суммирование признаков.
Несмотря на то, что изобретение подробно иллюстрировано и описано на чертежах и в предшествующем описании, такое иллюстрирование и описание следует рассматривать как иллюстративное или наглядное, а не ограничительное. Изобретение не ограничено описанными вариантами осуществления. При реализации заявляемого изобретения по результатам изучения чертежей, описания и зависимых пунктов формулы изобретения специалистами в данной области техники могут быть поняты и осуществлены другие модификации описанных вариантов осуществления.
В формуле изобретения слово «включающий в себя» не исключает иные элементы или этапы, а неопределенный артикль не исключает множества. Отдельный срез или иной блок может выполнять функции нескольких элементов, излагаемых в формуле изобретения. Само по себе то обстоятельство, что некоторые критерии излагаются в различных зависимых пунктах формулы изобретения, не означает, что совокупность этих критериев не может использоваться с пользой. Любые ссылочные позиции в формуле изобретения не должны толковаться как ограничивающие объем изобретения.

Claims (28)

1. Устройство (32) для демонстрации аннотации интересующей области среза, содержащее:
- блок (34) создания эталона, выполненный с возможностью создания цифрового эталонного изображения (26) эталонного предметного стекла (12), содержащего эталонный срез (16) объекта (10), который содержит биологический материал, и создания цифровой аннотации (22) в эталонном изображении;
- блок (36) создания образца, выполненный с возможностью создания цифрового контрольного изображения (28) контрольного предметного стекла (14), содержащего контрольный срез (18) упомянутого объекта, причем, контрольный срез и эталонный срез вырезаются из одного и того же объекта (10);
- блок (38) распознавания, выполненный с возможностью выполнения распознавания между эталонным изображением и контрольным изображением для создания пространственной связи между эталонным изображением и контрольным изображением;
- блок (40) определения, выполненный с возможностью определения - на основе пространственной связи - положения (42) аннотации для аннотации на контрольном предметном стекле; и
- блок (44) демонстрации, выполненный с возможностью физической демонстрации аннотации в положении аннотации на контрольном предметном стекле.
2. Устройство по п. 1, в котором эталонный срез представляет собой окрашенный срез объекта, а контрольный срез представляет собой неокрашенный или иначе окрашенный срез объекта.
3. Устройство по одному из пп. 1 или 2, в котором блок демонстрации дополнительно выполнен с возможностью физической демонстрации аннотации на срезе контрольного предметного стекла.
4. Устройство по одному из пп. 1-3, в котором распознавание включает в себя: распознавание признаков эталонного изображения в контрольном изображении и/или регистрацию эталонного изображения и контрольного изображения для создания пространственной связи между зарегистрированными признаками эталонного изображения и зарегистрированными признаками контрольного изображения.
5. Устройство по одному из пп. 1-4, в котором блок создания эталона выполнен с возможностью создания области (48) перемещения эталона в эталонном изображении, причем, цифровая аннотация представляет собой цифровую заметку, представляющую дополнительную информацию в отношении области перемещения эталона.
6. Устройство по п. 5, в котором блок определения дополнительно выполнен с возможностью определения - на основе пространственной связи - положения (50) перемещения для области перемещения на контрольном предметном стекле; а блок демонстрации дополнительно выполнен с возможностью физической демонстрации области перемещения в положении перемещения на контрольном предметном стекле.
7. Устройство по одному из пп. 1-6, в котором блок демонстрации содержит проектор или дисплей (52) для проецирования света на контрольное предметное стекло для наглядной демонстрации аннотации и/или области перемещения.
8. Устройство по одному из пп. 1-7, в котором блок демонстрации содержит блок (58) нанесения краски для нанесения краски на контрольное предметное стекло для физической демонстрации аннотации на контрольном предметном стекле и/или области перемещения на контрольном предметном стекле.
9. Устройство по одному из предыдущих пунктов, в котором устройство выполнено с возможностью использования информационного носителя эталонного предметного стекла (12) и/или информационного носителя контрольного предметного стекла (14) для идентификации предметного стекла.
10. Система для демонстрации аннотации интересующей области среза, содержащая:
- устройство генерирования изображений предметного стекла; и
- устройство для демонстрации аннотации интересующей области среза по одному из предыдущих пунктов;
в котором устройство генерирования изображений предметного стекла выполнено с возможностью генерирования цифрового эталонного изображения эталонного предметного стекла и генерирования цифрового контрольного изображения контрольного предметного стекла.
11. Способ (65) демонстрации аннотации интересующей области среза, содержащий следующие этапы:
а) создание (66) цифрового эталонного изображения для эталонного предметного стекла, содержащего эталонный срез объекта, который содержит биологический материал;
b) создание (68) цифровой аннотации в эталонном изображении;
с) создание (70) контрольного изображения контрольного предметного стекла, содержащего контрольный срез объекта, причем, контрольный срез и эталонный срез вырезаются из одного и того же объекта (10);
d) выполнение (72) распознавания между эталонным изображением и контрольным изображением для создания пространственной связи между эталонным изображением и контрольным изображением;
е) определение (74) - на основе пространственной связи - положения аннотации для аннотации на контрольном предметном стекле; и
f) физическая демонстрация (76) аннотации в положении аннотации на контрольном предметном стекле.
12. Способ по п. 11, в котором демонстрация включает в себя физическую демонстрацию аннотации на срезе контрольного предметного стекла.
13. Машиночитаемый носитель, имеющий сохраненный на нем элемент компьютерной программы, который при исполнении блоком обработки выполнен с возможностью выполнения одного из этапов способа по п. 11 или 12.
14. Предметное стекло для поддержания контрольного среза, содержащее опорную структуру для удержания контрольного среза и машиночитаемый носитель по п. 13, хранящий аннотацию и/или область перемещения на контрольном срезе.
RU2018105702A 2015-07-16 2016-07-12 Преобразование информации в цифровой патологии RU2716746C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP15176980 2015-07-16
EP15176980.9 2015-07-16
PCT/EP2016/066540 WO2017009337A1 (en) 2015-07-16 2016-07-12 Information transformation in digital pathology

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2018105702A RU2018105702A (ru) 2019-08-16
RU2018105702A3 RU2018105702A3 (ru) 2019-10-07
RU2716746C2 true RU2716746C2 (ru) 2020-03-16

Family

ID=53673794

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2018105702A RU2716746C2 (ru) 2015-07-16 2016-07-12 Преобразование информации в цифровой патологии

Country Status (6)

Country Link
US (1) US10867443B2 (ru)
EP (1) EP3323107B1 (ru)
JP (1) JP6840719B2 (ru)
CN (1) CN108027968B (ru)
RU (1) RU2716746C2 (ru)
WO (1) WO2017009337A1 (ru)

Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2016120434A1 (en) * 2015-01-31 2016-08-04 Roche Diagnostics Gmbh Systems and methods for meso-dissection
WO2016120433A1 (en) 2015-01-31 2016-08-04 Roche Diagnostics Gmbh Systems and methods for meso-dissection
EP3538863B1 (en) 2016-11-09 2022-12-21 F. Hoffmann-La Roche AG Automated tissue dissection instrument and methods of using the same
AU2019389908A1 (en) * 2018-11-29 2021-06-10 La Trobe University Method of identifying a structure
EP3761032A1 (en) 2019-07-03 2021-01-06 Xyall B.V. Determining region(s) for tissue dissection in pathology slides
CN113155510B (zh) * 2021-04-16 2024-05-10 伊达生物有限公司 组织细胞分割采样系统和方法
CN117192145B (zh) * 2023-10-12 2024-10-18 福州迈新生物技术开发有限公司 一种全自动病理染色系统的智能化试剂加样方法

Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20120045790A1 (en) * 2009-04-28 2012-02-23 Koninklijke Philips Electronics N.V. Microdissection method and information processing system
US20120076390A1 (en) * 2010-09-28 2012-03-29 Flagship Bio Methods for feature analysis on consecutive tissue sections
WO2014140070A2 (en) * 2013-03-14 2014-09-18 Ventana Medical Systems, Inc. Whole slide image registration and cross-image annotation devices, systems and methods
RU2540453C2 (ru) * 2010-10-29 2015-02-10 Кэнон Кабусики Кайся Микроскоп, устройство получения изображения и система получения изображения
WO2015049233A1 (en) * 2013-10-01 2015-04-09 Ventana Medical Systems, Inc. Line-based image registration and cross-image annotation devices, systems and methods
WO2015052128A1 (en) * 2013-10-07 2015-04-16 Ventana Medical Systems, Inc. Systems and methods for comprehensive multi-assay tissue analysis

Family Cites Families (16)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA2132138C (en) * 1993-09-29 2004-01-06 Shih-Ping Wang Computer-aided diagnosis system and method
US7006674B1 (en) * 1999-10-29 2006-02-28 Cytyc Corporation Apparatus and methods for verifying the location of areas of interest within a sample in an imaging system
US7369304B2 (en) * 1999-10-29 2008-05-06 Cytyc Corporation Cytological autofocusing imaging systems and methods
AU2883702A (en) * 2000-11-03 2002-05-15 Cytyc Corp Cytological imaging systems and methods
US20040085443A1 (en) * 2000-12-13 2004-05-06 Kallioniemi Olli P Method and system for processing regions of interest for objects comprising biological material
JP2007093450A (ja) * 2005-09-29 2007-04-12 Olympus Corp 検査システムおよびこの検査対象物の保持具
JP2008033049A (ja) * 2006-07-28 2008-02-14 Ricoh Co Ltd 対象物指示装置
EP2188661B1 (de) * 2008-04-01 2014-07-30 Bauhaus-Universität Weimar Verfahren und beleuchtungsvorrichtung zur optischen kontrastverstärkung
EP2450667B1 (en) * 2010-11-09 2016-11-02 Harman Becker Automotive Systems GmbH Vision system and method of analyzing an image
WO2012102779A2 (en) * 2011-01-24 2012-08-02 Adey Nils B Devices, systems, and methods for extracting a material from a material sample
JP5692818B2 (ja) * 2012-07-24 2015-04-01 東芝テック株式会社 標本スライド撮像装置
CN113406077A (zh) 2012-10-03 2021-09-17 皇家飞利浦有限公司 组合的样品检查
WO2014054016A1 (en) 2012-10-03 2014-04-10 Koninklijke Philips N.V. Sample isolation unit
US20160131559A1 (en) * 2013-05-15 2016-05-12 Koninklijke Philips N.V. Tissue separation from a sample
CN105578983B (zh) * 2013-09-24 2021-01-22 皇家飞利浦有限公司 计算外科手术介入规划的方法
US9990723B2 (en) 2013-10-18 2018-06-05 Koninklijke Philips N.V. Image based ROI tracking for MDX

Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20120045790A1 (en) * 2009-04-28 2012-02-23 Koninklijke Philips Electronics N.V. Microdissection method and information processing system
US20120076390A1 (en) * 2010-09-28 2012-03-29 Flagship Bio Methods for feature analysis on consecutive tissue sections
RU2540453C2 (ru) * 2010-10-29 2015-02-10 Кэнон Кабусики Кайся Микроскоп, устройство получения изображения и система получения изображения
WO2014140070A2 (en) * 2013-03-14 2014-09-18 Ventana Medical Systems, Inc. Whole slide image registration and cross-image annotation devices, systems and methods
WO2015049233A1 (en) * 2013-10-01 2015-04-09 Ventana Medical Systems, Inc. Line-based image registration and cross-image annotation devices, systems and methods
WO2015052128A1 (en) * 2013-10-07 2015-04-16 Ventana Medical Systems, Inc. Systems and methods for comprehensive multi-assay tissue analysis

Also Published As

Publication number Publication date
JP6840719B2 (ja) 2021-03-10
RU2018105702A (ru) 2019-08-16
US20180225872A1 (en) 2018-08-09
JP2018528405A (ja) 2018-09-27
CN108027968B (zh) 2022-05-27
US10867443B2 (en) 2020-12-15
EP3323107A1 (en) 2018-05-23
RU2018105702A3 (ru) 2019-10-07
EP3323107B1 (en) 2021-03-10
CN108027968A (zh) 2018-05-11
WO2017009337A1 (en) 2017-01-19

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2716746C2 (ru) Преобразование информации в цифровой патологии
RU2553078C2 (ru) Способ микродиссекции и система обработки информации
EP3732611B1 (en) Method for creating histopathological ground truth masks using slide restaining
EP3752952B1 (en) Pathology predictions on unstained tissue
RU2690224C2 (ru) Обследующее устройство для обработки и анализа изображения
EP2930635A1 (en) Automated cytology/histology viewers and related methods
US20150262329A1 (en) Combined sample examinations
CN107624159B (zh) 用于检查和处理显微的样本的方法和检查系统
EP3250900B1 (en) Systems and methods for meso-dissection
JP6843121B2 (ja) 組織マイクロアレイ分析
CN107209092A (zh) 用于中间解剖的系统和方法
US20090304244A1 (en) Method and a system for presenting sections of a histological specimen
WO2014054016A1 (en) Sample isolation unit
CN117017262A (zh) 空间组学采样方法、系统、装置和电子设备
Cruz et al. Three‐Dimensional Reconstruction of Tissues