RU2694050C1 - Циклический пептид, подложка для аффинной хроматографии, меченое антитело, конъюгат антитела и лекарственного средства и фармацевтический препарат - Google Patents
Циклический пептид, подложка для аффинной хроматографии, меченое антитело, конъюгат антитела и лекарственного средства и фармацевтический препарат Download PDFInfo
- Publication number
- RU2694050C1 RU2694050C1 RU2018114690A RU2018114690A RU2694050C1 RU 2694050 C1 RU2694050 C1 RU 2694050C1 RU 2018114690 A RU2018114690 A RU 2018114690A RU 2018114690 A RU2018114690 A RU 2018114690A RU 2694050 C1 RU2694050 C1 RU 2694050C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- amino acid
- residue
- amino
- chloroacetyl
- cyclic peptide
- Prior art date
Links
- 108010069514 Cyclic Peptides Proteins 0.000 title claims abstract description 391
- 102000001189 Cyclic Peptides Human genes 0.000 title claims abstract description 391
- 229940079593 drug Drugs 0.000 title claims abstract description 76
- 239000003814 drug Substances 0.000 title claims abstract description 75
- 239000000758 substrate Substances 0.000 title claims abstract description 59
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 title claims abstract description 14
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 title abstract description 11
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims abstract description 141
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims description 368
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 claims description 271
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 claims description 271
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 264
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 123
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 107
- FFFHZYDWPBMWHY-VKHMYHEASA-N L-homocysteine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCS FFFHZYDWPBMWHY-VKHMYHEASA-N 0.000 claims description 96
- VVNCNSJFMMFHPL-GSVOUGTGSA-N L-penicillamine Chemical compound CC(C)(S)[C@H](N)C(O)=O VVNCNSJFMMFHPL-GSVOUGTGSA-N 0.000 claims description 79
- UKAUYVFTDYCKQA-VKHMYHEASA-N L-homoserine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCO UKAUYVFTDYCKQA-VKHMYHEASA-N 0.000 claims description 68
- XUJNEKJLAYXESH-UWTATZPHSA-N D-Cysteine Chemical compound SC[C@@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UWTATZPHSA-N 0.000 claims description 60
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 claims description 60
- 229960001153 serine Drugs 0.000 claims description 60
- MTCFGRXMJLQNBG-UWTATZPHSA-N D-Serine Chemical compound OC[C@@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UWTATZPHSA-N 0.000 claims description 58
- 229930195710 D‐cysteine Natural products 0.000 claims description 56
- 229930195711 D-Serine Natural products 0.000 claims description 54
- 230000003100 immobilizing effect Effects 0.000 claims description 52
- 239000004201 L-cysteine Substances 0.000 claims description 47
- 235000013878 L-cysteine Nutrition 0.000 claims description 47
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 claims description 46
- 229960001639 penicillamine Drugs 0.000 claims description 39
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 claims description 38
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 claims description 38
- UKAUYVFTDYCKQA-UHFFFAOYSA-N -2-Amino-4-hydroxybutanoic acid Natural products OC(=O)C(N)CCO UKAUYVFTDYCKQA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 34
- FFFHZYDWPBMWHY-UHFFFAOYSA-N L-Homocysteine Natural products OC(=O)C(N)CCS FFFHZYDWPBMWHY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 33
- UKAUYVFTDYCKQA-GSVOUGTGSA-N D-homoserine Chemical compound OC(=O)[C@H](N)CCO UKAUYVFTDYCKQA-GSVOUGTGSA-N 0.000 claims description 32
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-N L-arginine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 26
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims description 26
- 239000003446 ligand Substances 0.000 claims description 26
- 229930064664 L-arginine Natural products 0.000 claims description 25
- 235000014852 L-arginine Nutrition 0.000 claims description 25
- 125000002668 chloroacetyl group Chemical group ClCC(=O)* 0.000 claims description 25
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 claims description 23
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 claims description 22
- YOHUBSGWLQBGKD-YFKPBYRVSA-N (2s)-2-amino-5-[(2-chloroacetyl)amino]pentanoic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCCNC(=O)CCl YOHUBSGWLQBGKD-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 21
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 20
- FFFHZYDWPBMWHY-GSVOUGTGSA-N D-Homocysteine Chemical compound OC(=O)[C@H](N)CCS FFFHZYDWPBMWHY-GSVOUGTGSA-N 0.000 claims description 19
- ODKSFYDXXFIFQN-SCSAIBSYSA-N D-arginine Chemical compound OC(=O)[C@H](N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-SCSAIBSYSA-N 0.000 claims description 19
- 238000002372 labelling Methods 0.000 claims description 19
- 229960004799 tryptophan Drugs 0.000 claims description 19
- 229930028154 D-arginine Natural products 0.000 claims description 17
- AUDCRNWWEUIBPQ-BYPYZUCNSA-N (2S)-2-amino-4-[(2-chloroacetyl)amino]butanoic acid Chemical compound N[C@H](C(=O)O)CCNC(CCl)=O AUDCRNWWEUIBPQ-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 15
- FOJRYNHRKWPSMC-VKHMYHEASA-N (2s)-2-amino-3-[(2-chloroacetyl)amino]propanoic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CNC(=O)CCl FOJRYNHRKWPSMC-VKHMYHEASA-N 0.000 claims description 15
- 125000002061 L-isoleucyl group Chemical group [H]N([H])[C@]([H])(C(=O)[*])[C@](C([H])([H])[H])([H])C(C([H])([H])[H])([H])[H] 0.000 claims description 15
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 15
- AUDCRNWWEUIBPQ-SCSAIBSYSA-N (2R)-2-amino-4-[(2-chloroacetyl)amino]butanoic acid Chemical compound N[C@@H](C(=O)O)CCNC(CCl)=O AUDCRNWWEUIBPQ-SCSAIBSYSA-N 0.000 claims description 13
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 13
- FOJRYNHRKWPSMC-GSVOUGTGSA-N (2R)-2-amino-3-[(2-chloroacetyl)amino]propanoic acid Chemical compound N[C@@H](C(=O)O)CNC(CCl)=O FOJRYNHRKWPSMC-GSVOUGTGSA-N 0.000 claims description 12
- 125000003440 L-leucyl group Chemical group O=C([*])[C@](N([H])[H])([H])C([H])([H])C(C([H])([H])[H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 12
- 125000003798 L-tyrosyl group Chemical group [H]N([H])[C@]([H])(C(=O)[*])C([H])([H])C1=C([H])C([H])=C(O[H])C([H])=C1[H] 0.000 claims description 12
- 125000003412 L-alanyl group Chemical group [H]N([H])[C@@](C([H])([H])[H])(C(=O)[*])[H] 0.000 claims description 11
- 125000002066 L-histidyl group Chemical group [H]N1C([H])=NC(C([H])([H])[C@](C(=O)[*])([H])N([H])[H])=C1[H] 0.000 claims description 11
- 125000001176 L-lysyl group Chemical group [H]N([H])[C@]([H])(C(=O)[*])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C(N([H])[H])([H])[H] 0.000 claims description 11
- 125000003630 glycyl group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C(*)=O 0.000 claims description 11
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 claims description 10
- 229960002989 glutamic acid Drugs 0.000 claims description 10
- 125000002059 L-arginyl group Chemical group O=C([*])[C@](N([H])[H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])N([H])C(=N[H])N([H])[H] 0.000 claims description 9
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 claims description 8
- 125000003580 L-valyl group Chemical group [H]N([H])[C@]([H])(C(=O)[*])C(C([H])([H])[H])(C([H])([H])[H])[H] 0.000 claims description 8
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 claims description 8
- 125000000393 L-methionino group Chemical group [H]OC(=O)[C@@]([H])(N([H])[*])C([H])([H])C(SC([H])([H])[H])([H])[H] 0.000 claims description 7
- 125000000769 L-threonyl group Chemical group [H]N([H])[C@]([H])(C(=O)[*])[C@](O[H])(C([H])([H])[H])[H] 0.000 claims description 7
- 229930182844 L-isoleucine Natural products 0.000 claims description 6
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 claims description 6
- 125000002842 L-seryl group Chemical group O=C([*])[C@](N([H])[H])([H])C([H])([H])O[H] 0.000 claims description 5
- 229960005190 phenylalanine Drugs 0.000 claims description 5
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- FFEARJCKVFRZRR-SCSAIBSYSA-N D-methionine Chemical compound CSCC[C@@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-SCSAIBSYSA-N 0.000 claims 4
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 88
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 15
- 230000009471 action Effects 0.000 abstract description 4
- 125000002777 acetyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 74
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 72
- 125000003396 thiol group Chemical group [H]S* 0.000 description 67
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 64
- 125000005179 haloacetyl group Chemical group 0.000 description 48
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 40
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 30
- 239000000562 conjugate Substances 0.000 description 27
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 26
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 24
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 23
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 23
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 23
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 23
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 description 22
- 238000000034 method Methods 0.000 description 22
- CKLJMWTZIZZHCS-UWTATZPHSA-N D-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-UWTATZPHSA-N 0.000 description 19
- 229940027941 immunoglobulin g Drugs 0.000 description 19
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 18
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 18
- PWKSKIMOESPYIA-UHFFFAOYSA-N 2-acetamido-3-sulfanylpropanoic acid Chemical compound CC(=O)NC(CS)C(O)=O PWKSKIMOESPYIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 17
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 17
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 16
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 14
- 230000008859 change Effects 0.000 description 14
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N Butyric acid Chemical compound CCCC(O)=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 12
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 229910052801 chlorine Inorganic materials 0.000 description 12
- 125000001309 chloro group Chemical group Cl* 0.000 description 12
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 12
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 11
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 11
- 150000008575 L-amino acids Chemical class 0.000 description 10
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N dimethylselenoniopropionate Natural products CCC(O)=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 9
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 9
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 9
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 9
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 9
- 229960002898 threonine Drugs 0.000 description 9
- CKLJMWTZIZZHCS-UHFFFAOYSA-N D-OH-Asp Natural products OC(=O)C(N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- KDXKERNSBIXSRK-RXMQYKEDSA-N D-lysine Chemical compound NCCCC[C@@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-RXMQYKEDSA-N 0.000 description 8
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- -1 L-alanine O Chemical class 0.000 description 8
- 125000003338 L-glutaminyl group Chemical group O=C([*])[C@](N([H])[H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C(=O)N([H])[H] 0.000 description 8
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 8
- 229960005261 aspartic acid Drugs 0.000 description 8
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 8
- 125000005843 halogen group Chemical group 0.000 description 8
- 229960004295 valine Drugs 0.000 description 8
- 229940049595 antibody-drug conjugate Drugs 0.000 description 7
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 7
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 7
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 7
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 7
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 7
- WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N Bromine atom Chemical group [Br] WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 6
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 6
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 6
- WPLOVIFNBMNBPD-ATHMIXSHSA-N subtilin Chemical compound CC1SCC(NC2=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(=O)NC(C(=O)NC(CCCCN)C(=O)NC(C(C)CC)C(=O)NC(=C)C(=O)NC(CCCCN)C(O)=O)CSC(C)C2NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C1NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(NC(=O)C1NC(=O)C(=C/C)/NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(C)NC(=O)CNC(=O)C(NC(=O)C(NC(=O)C2NC(=O)CNC(=O)C3CCCN3C(=O)C(NC(=O)C3NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(=C)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(CCCCN)NC(=O)C(N)CC=4C5=CC=CC=C5NC=4)CSC3)C(C)SC2)C(C)C)C(C)SC1)CC1=CC=CC=C1 WPLOVIFNBMNBPD-ATHMIXSHSA-N 0.000 description 6
- GMKMEZVLHJARHF-UHFFFAOYSA-N 2,6-diaminopimelic acid Chemical compound OC(=O)C(N)CCCC(N)C(O)=O GMKMEZVLHJARHF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- PECYZEOJVXMISF-UHFFFAOYSA-N 3-aminoalanine Chemical group [NH3+]CC(N)C([O-])=O PECYZEOJVXMISF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- OBMZMSLWNNWEJA-XNCRXQDQSA-N C1=CC=2C(C[C@@H]3NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](NC(=O)N(CC#CCN(CCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](CC4=CC=CC=C4)NC3=O)C(=O)N)CC=C)NC(=O)[C@@H](N)C)CC3=CNC4=C3C=CC=C4)C)=CNC=2C=C1 Chemical compound C1=CC=2C(C[C@@H]3NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](NC(=O)N(CC#CCN(CCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](CC4=CC=CC=C4)NC3=O)C(=O)N)CC=C)NC(=O)[C@@H](N)C)CC3=CNC4=C3C=CC=C4)C)=CNC=2C=C1 OBMZMSLWNNWEJA-XNCRXQDQSA-N 0.000 description 5
- 150000008574 D-amino acids Chemical class 0.000 description 5
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- OYIFNHCXNCRBQI-BYPYZUCNSA-N L-2-aminoadipic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCCC(O)=O OYIFNHCXNCRBQI-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 5
- 239000003513 alkali Substances 0.000 description 5
- 239000000611 antibody drug conjugate Substances 0.000 description 5
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 5
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 5
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 5
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 5
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 5
- 125000003700 epoxy group Chemical group 0.000 description 5
- 238000005755 formation reaction Methods 0.000 description 5
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 5
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 5
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 5
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 5
- 235000019260 propionic acid Nutrition 0.000 description 5
- IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N quinbolone Chemical compound O([C@H]1CC[C@H]2[C@H]3[C@@H]([C@]4(C=CC(=O)C=C4CC3)C)CC[C@@]21C)C1=CCCC1 IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N 0.000 description 5
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 5
- OGNSCSPNOLGXSM-UHFFFAOYSA-N 2,4-diaminobutyric acid Chemical compound NCCC(N)C(O)=O OGNSCSPNOLGXSM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 2-Aminoethan-1-ol Chemical compound NCCO HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 4
- OYIFNHCXNCRBQI-SCSAIBSYSA-N D-2-aminoadipic acid Chemical compound OC(=O)[C@H](N)CCCC(O)=O OYIFNHCXNCRBQI-SCSAIBSYSA-N 0.000 description 4
- 125000004077 D-glutamic acid group Chemical group [H]N([H])[C@@]([H])(C(=O)[*])C([H])([H])C([H])([H])C(N([H])[H])=O 0.000 description 4
- 125000003301 D-leucyl group Chemical group N[C@@H](C(=O)*)CC(C)C 0.000 description 4
- AYFVYJQAPQTCCC-STHAYSLISA-N D-threonine Chemical compound C[C@H](O)[C@@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-STHAYSLISA-N 0.000 description 4
- 229930182822 D-threonine Natural products 0.000 description 4
- OUYCCCASQSFEME-MRVPVSSYSA-N D-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-MRVPVSSYSA-N 0.000 description 4
- 229930195709 D-tyrosine Natural products 0.000 description 4
- 125000002849 D-tyrosine group Chemical group [H]N([H])[C@@]([H])(C(=O)[*])C([H])([H])C1=C([H])C([H])=C(O[H])C([H])=C1[H] 0.000 description 4
- 235000019766 L-Lysine Nutrition 0.000 description 4
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 4
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 4
- 239000000945 filler Substances 0.000 description 4
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 4
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 4
- 239000000463 material Substances 0.000 description 4
- 125000000325 methylidene group Chemical group [H]C([H])=* 0.000 description 4
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 4
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 4
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 4
- 229960004441 tyrosine Drugs 0.000 description 4
- PECYZEOJVXMISF-REOHCLBHSA-N 3-amino-L-alanine Chemical compound [NH3+]C[C@H](N)C([O-])=O PECYZEOJVXMISF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 3
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-M Acrylate Chemical compound [O-]C(=O)C=C NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 125000000030 D-alanine group Chemical group [H]N([H])[C@](C([H])([H])[H])(C(=O)[*])[H] 0.000 description 3
- WHUUTDBJXJRKMK-GSVOUGTGSA-N D-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-GSVOUGTGSA-N 0.000 description 3
- 229930182847 D-glutamic acid Natural products 0.000 description 3
- 125000002437 D-histidyl group Chemical group N[C@@H](C(=O)*)CC=1N=CNC1 0.000 description 3
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 3
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 3
- 125000000570 L-alpha-aspartyl group Chemical group [H]OC(=O)C([H])([H])[C@]([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 3
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 3
- NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N N-Hydroxysuccinimide Chemical compound ON1C(=O)CCC1=O NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 3
- 125000003172 aldehyde group Chemical group 0.000 description 3
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 3
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 3
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 3
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 3
- 239000002131 composite material Substances 0.000 description 3
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 3
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 3
- PMMYEEVYMWASQN-UHFFFAOYSA-N dl-hydroxyproline Natural products OC1C[NH2+]C(C([O-])=O)C1 PMMYEEVYMWASQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000012377 drug delivery Methods 0.000 description 3
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 3
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 description 3
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 3
- 238000007363 ring formation reaction Methods 0.000 description 3
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 3
- 238000002198 surface plasmon resonance spectroscopy Methods 0.000 description 3
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 3
- 230000002123 temporal effect Effects 0.000 description 3
- 150000007970 thio esters Chemical class 0.000 description 3
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 3
- LMDZBCPBFSXMTL-UHFFFAOYSA-N 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide Chemical compound CCN=C=NCCCN(C)C LMDZBCPBFSXMTL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FUOOLUPWFVMBKG-UHFFFAOYSA-N 2-Aminoisobutyric acid Chemical compound CC(C)(N)C(O)=O FUOOLUPWFVMBKG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RDFMDVXONNIGBC-UHFFFAOYSA-N 2-aminoheptanoic acid Chemical compound CCCCCC(N)C(O)=O RDFMDVXONNIGBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SNDPXSYFESPGGJ-UHFFFAOYSA-N 2-aminopentanoic acid Chemical compound CCCC(N)C(O)=O SNDPXSYFESPGGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WADSJYLPJPTMLN-UHFFFAOYSA-N 3-(cycloundecen-1-yl)-1,2-diazacycloundec-2-ene Chemical compound C1CCCCCCCCC=C1C1=NNCCCCCCCC1 WADSJYLPJPTMLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- YYROPELSRYBVMQ-UHFFFAOYSA-N 4-toluenesulfonyl chloride Chemical compound CC1=CC=C(S(Cl)(=O)=O)C=C1 YYROPELSRYBVMQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SLXKOJJOQWFEFD-UHFFFAOYSA-N 6-aminohexanoic acid Chemical compound NCCCCCC(O)=O SLXKOJJOQWFEFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 2
- 125000001433 C-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 2
- 125000002038 D-arginyl group Chemical group N[C@@H](C(=O)*)CCCNC(=N)N 0.000 description 2
- 125000002237 D-aspartyl group Chemical group [H]OC(=O)[C@]([H])(N([H])[H])C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 2
- 125000000197 D-threonyl group Chemical group N[C@@H](C(=O)*)[C@H](C)O 0.000 description 2
- BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N Hydrazine Chemical compound NN OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JUQLUIFNNFIIKC-YFKPBYRVSA-N L-2-aminopimelic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCCCC(O)=O JUQLUIFNNFIIKC-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- AHLPHDHHMVZTML-BYPYZUCNSA-N L-Ornithine Chemical compound NCCC[C@H](N)C(O)=O AHLPHDHHMVZTML-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- AGPKZVBTJJNPAG-UHNVWZDZSA-N L-allo-Isoleucine Chemical compound CC[C@@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHNVWZDZSA-N 0.000 description 2
- 229930182816 L-glutamine Natural products 0.000 description 2
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- 239000004395 L-leucine Substances 0.000 description 2
- 235000019454 L-leucine Nutrition 0.000 description 2
- LRQKBLKVPFOOQJ-YFKPBYRVSA-N L-norleucine Chemical compound CCCC[C@H]([NH3+])C([O-])=O LRQKBLKVPFOOQJ-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- AHLPHDHHMVZTML-UHFFFAOYSA-N Orn-delta-NH2 Natural products NCCCC(N)C(O)=O AHLPHDHHMVZTML-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UTJLXEIPEHZYQJ-UHFFFAOYSA-N Ornithine Natural products OC(=O)C(C)CCCN UTJLXEIPEHZYQJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229920001218 Pullulan Polymers 0.000 description 2
- 239000004373 Pullulan Substances 0.000 description 2
- 239000012506 Sephacryl® Substances 0.000 description 2
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 2
- PPBRXRYQALVLMV-UHFFFAOYSA-N Styrene Chemical compound C=CC1=CC=CC=C1 PPBRXRYQALVLMV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RHQDFWAXVIIEBN-UHFFFAOYSA-N Trifluoroethanol Chemical compound OCC(F)(F)F RHQDFWAXVIIEBN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002250 absorbent Substances 0.000 description 2
- 230000002745 absorbent Effects 0.000 description 2
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 2
- 125000000304 alkynyl group Chemical group 0.000 description 2
- 230000009876 antimalignant effect Effects 0.000 description 2
- 239000003125 aqueous solvent Substances 0.000 description 2
- 239000002585 base Substances 0.000 description 2
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 2
- 230000032823 cell division Effects 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- XVOYSCVBGLVSOL-UHFFFAOYSA-N cysteic acid Chemical compound OC(=O)C(N)CS(O)(=O)=O XVOYSCVBGLVSOL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010057085 cytokine receptors Proteins 0.000 description 2
- 229940021745 d- arginine Drugs 0.000 description 2
- YSMODUONRAFBET-UHFFFAOYSA-N delta-DL-hydroxylysine Natural products NCC(O)CCC(N)C(O)=O YSMODUONRAFBET-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 2
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 2
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 2
- UHBYWPGGCSDKFX-VKHMYHEASA-N gamma-carboxy-L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(C(O)=O)C(O)=O UHBYWPGGCSDKFX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- 229940127121 immunoconjugate Drugs 0.000 description 2
- 229940099472 immunoglobulin a Drugs 0.000 description 2
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960003136 leucine Drugs 0.000 description 2
- 239000000693 micelle Substances 0.000 description 2
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 2
- 229960003104 ornithine Drugs 0.000 description 2
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 2
- 229920001343 polytetrafluoroethylene Polymers 0.000 description 2
- 239000004810 polytetrafluoroethylene Substances 0.000 description 2
- 235000019423 pullulan Nutrition 0.000 description 2
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 2
- 239000012487 rinsing solution Substances 0.000 description 2
- FSYKKLYZXJSNPZ-UHFFFAOYSA-N sarcosine Chemical compound C[NH2+]CC([O-])=O FSYKKLYZXJSNPZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- BJBUEDPLEOHJGE-UHFFFAOYSA-N (2R,3S)-3-Hydroxy-2-pyrolidinecarboxylic acid Natural products OC1CCNC1C(O)=O BJBUEDPLEOHJGE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VZQHRKZCAZCACO-PYJNHQTQSA-N (2s)-2-[[(2s)-2-[2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-amino-5-(diaminomethylideneamino)pentanoyl]amino]propanoyl]amino]prop-2-enoylamino]-3-methylbutanoyl]amino]propanoic acid Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)C(=C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N VZQHRKZCAZCACO-PYJNHQTQSA-N 0.000 description 1
- DAZBILQQVFBVPE-XKKUQSFHSA-N (2s)-4-amino-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-1-[(2s)-4-amino-2-[[2-[[(2r)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-1-[(2s)-6-amino-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s,3r)-2-amino-3-hydroxybutanoyl]amino]-4-methylsulfanylbutanoyl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)pentanoyl]amino]hexan Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)CCC1 DAZBILQQVFBVPE-XKKUQSFHSA-N 0.000 description 1
- BNIFSVVAHBLNTN-XKKUQSFHSA-N (2s)-4-amino-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-1-[(2s)-4-amino-2-[[2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-1-[(2s)-6-amino-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s,3r)-2-amino-3-hydroxybutanoyl]amino]-4-methylsulfanylbutanoyl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)pentanoyl]amino]hexan Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)CCC1 BNIFSVVAHBLNTN-XKKUQSFHSA-N 0.000 description 1
- JPOKAKNGULMYHZ-UILVTTEASA-N (2s)-6-amino-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-6-amino-2-[[(2s)-2-[[(2s)-6-amino-2-[[(2s)-6-amino-2-[[(2s)-2-amino-5-(diaminomethylideneamino)pentanoyl]amino]hexanoyl]amino]hexanoyl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]hexanoyl]amino]-3-(4-hydroxyp Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(N)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N)C1=CC=C(O)C=C1 JPOKAKNGULMYHZ-UILVTTEASA-N 0.000 description 1
- LJRDOKAZOAKLDU-UDXJMMFXSA-N (2s,3s,4r,5r,6r)-5-amino-2-(aminomethyl)-6-[(2r,3s,4r,5s)-5-[(1r,2r,3s,5r,6s)-3,5-diamino-2-[(2s,3r,4r,5s,6r)-3-amino-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-6-hydroxycyclohexyl]oxy-4-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]oxyoxane-3,4-diol;sulfuric ac Chemical compound OS(O)(=O)=O.N[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](N)C[C@@H](N)[C@@H]2O)O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)N)O[C@@H]1CO LJRDOKAZOAKLDU-UDXJMMFXSA-N 0.000 description 1
- XABCFXXGZPWJQP-BYPYZUCNSA-N (S)-3-aminoadipic acid Chemical compound OC(=O)C[C@@H](N)CCC(O)=O XABCFXXGZPWJQP-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- BYEAHWXPCBROCE-UHFFFAOYSA-N 1,1,1,3,3,3-hexafluoropropan-2-ol Chemical compound FC(F)(F)C(O)C(F)(F)F BYEAHWXPCBROCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CXCHEKCRJQRVNG-UHFFFAOYSA-N 2,2,2-trifluoroethanesulfonyl chloride Chemical compound FC(F)(F)CS(Cl)(=O)=O CXCHEKCRJQRVNG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MAEDLSNGVQYGPK-UHFFFAOYSA-N 2,2-diaminoacetic acid Chemical compound NC(N)C(O)=O MAEDLSNGVQYGPK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BLCJBICVQSYOIF-UHFFFAOYSA-N 2,2-diaminobutanoic acid Chemical group CCC(N)(N)C(O)=O BLCJBICVQSYOIF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MUSGYEMSJUFFHT-UWABRSFTSA-N 2-[(4R,7S,10S,13S,19S,22S,25S,28S,31S,34R)-34-[[(2S,3S)-2-[[(2R)-2-amino-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]-3-methylpentanoyl]amino]-4-[[(2S,3S)-1-amino-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]-methylcarbamoyl]-25-(3-amino-3-oxopropyl)-7-(3-carbamimidamidopropyl)-10-(1H-imidazol-5-ylmethyl)-19-(1H-indol-3-ylmethyl)-13,17-dimethyl-28-[(1-methylindol-3-yl)methyl]-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-decaoxo-31-propan-2-yl-1,2-dithia-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-decazacyclopentatriacont-22-yl]acetic acid Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@H]1CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](Cc2cnc[nH]2)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN(C)C(=O)[C@H](Cc2c[nH]c3ccccc23)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](Cc2cn(C)c3ccccc23)NC(=O)[C@@H](NC1=O)C(C)C)C(=O)N(C)[C@@H]([C@@H](C)CC)C(N)=O MUSGYEMSJUFFHT-UWABRSFTSA-N 0.000 description 1
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LRQKBLKVPFOOQJ-UHFFFAOYSA-N 2-aminohexanoic acid Chemical compound CCCCC(N)C(O)=O LRQKBLKVPFOOQJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XABCFXXGZPWJQP-UHFFFAOYSA-N 3-aminoadipic acid Chemical compound OC(=O)CC(N)CCC(O)=O XABCFXXGZPWJQP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- ALYNCZNDIQEVRV-UHFFFAOYSA-N 4-aminobenzoic acid Chemical compound NC1=CC=C(C(O)=O)C=C1 ALYNCZNDIQEVRV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940117976 5-hydroxylysine Drugs 0.000 description 1
- ODHCTXKNWHHXJC-VKHMYHEASA-N 5-oxo-L-proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCC(=O)N1 ODHCTXKNWHHXJC-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- ODHCTXKNWHHXJC-UHFFFAOYSA-N 5-oxoproline Chemical compound OC(=O)C1CCC(=O)N1 ODHCTXKNWHHXJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001136792 Alle Species 0.000 description 1
- 201000004384 Alopecia Diseases 0.000 description 1
- CKAJHWFHHFSCDT-WHFBIAKZSA-N Asp-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O CKAJHWFHHFSCDT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- CPELXLSAUQHCOX-UHFFFAOYSA-M Bromide Chemical compound [Br-] CPELXLSAUQHCOX-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 101100129088 Caenorhabditis elegans lys-2 gene Proteins 0.000 description 1
- 229920001747 Cellulose diacetate Polymers 0.000 description 1
- 229920002284 Cellulose triacetate Polymers 0.000 description 1
- PTHCMJGKKRQCBF-UHFFFAOYSA-N Cellulose, microcrystalline Chemical compound OC1C(O)C(OC)OC(CO)C1OC1C(O)C(O)C(OC)C(CO)O1 PTHCMJGKKRQCBF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920002101 Chitin Polymers 0.000 description 1
- 229920001661 Chitosan Polymers 0.000 description 1
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 1
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 1
- OABOXRPGTFRBFZ-IMJSIDKUSA-N Cys-Cys Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O OABOXRPGTFRBFZ-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-CRCLSJGQSA-N D-allo-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-CRCLSJGQSA-N 0.000 description 1
- MNQZXJOMYWMBOU-VKHMYHEASA-N D-glyceraldehyde Chemical compound OC[C@@H](O)C=O MNQZXJOMYWMBOU-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 229930182845 D-isoleucine Natural products 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-RXMQYKEDSA-N D-leucine Chemical compound CC(C)C[C@@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-RXMQYKEDSA-N 0.000 description 1
- 229930182819 D-leucine Natural products 0.000 description 1
- 125000000734 D-serino group Chemical group [H]N([H])[C@@]([H])(C(=O)[*])C(O[H])([H])[H] 0.000 description 1
- 206010012742 Diarrhoea infectious Diseases 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- BRLQWZUYTZBJKN-UHFFFAOYSA-N Epichlorohydrin Chemical compound ClCC1CO1 BRLQWZUYTZBJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 1
- PMMYEEVYMWASQN-DMTCNVIQSA-N Hydroxyproline Chemical compound O[C@H]1CN[C@H](C(O)=O)C1 PMMYEEVYMWASQN-DMTCNVIQSA-N 0.000 description 1
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 1
- OGNSCSPNOLGXSM-VKHMYHEASA-N L-2,4-diaminobutyric acid Chemical compound NCC[C@H](N)C(O)=O OGNSCSPNOLGXSM-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- RHGKLRLOHDJJDR-BYPYZUCNSA-N L-citrulline Chemical compound NC(=O)NCCC[C@H]([NH3+])C([O-])=O RHGKLRLOHDJJDR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- QJPWUUJVYOJNMH-VKHMYHEASA-N L-homoserine lactone Chemical compound N[C@H]1CCOC1=O QJPWUUJVYOJNMH-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 229930182821 L-proline Natural products 0.000 description 1
- ZKZBPNGNEQAJSX-REOHCLBHSA-N L-selenocysteine Chemical compound [SeH]C[C@H](N)C(O)=O ZKZBPNGNEQAJSX-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- 229930182853 L-selenocysteine Natural products 0.000 description 1
- 244000137850 Marrubium vulgare Species 0.000 description 1
- 230000006181 N-acylation Effects 0.000 description 1
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000729 N-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- RHGKLRLOHDJJDR-UHFFFAOYSA-N Ndelta-carbamoyl-DL-ornithine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=O RHGKLRLOHDJJDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000244206 Nematoda Species 0.000 description 1
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 1
- 102000003992 Peroxidases Human genes 0.000 description 1
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- 239000004372 Polyvinyl alcohol Substances 0.000 description 1
- 108010077895 Sarcosine Proteins 0.000 description 1
- 244000191761 Sida cordifolia Species 0.000 description 1
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 description 1
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 1
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710120037 Toxin CcdB Proteins 0.000 description 1
- QYKIQEUNHZKYBP-UHFFFAOYSA-N Vinyl ether Chemical compound C=COC=C QYKIQEUNHZKYBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NNLVGZFZQQXQNW-ADJNRHBOSA-N [(2r,3r,4s,5r,6s)-4,5-diacetyloxy-3-[(2s,3r,4s,5r,6r)-3,4,5-triacetyloxy-6-(acetyloxymethyl)oxan-2-yl]oxy-6-[(2r,3r,4s,5r,6s)-4,5,6-triacetyloxy-2-(acetyloxymethyl)oxan-3-yl]oxyoxan-2-yl]methyl acetate Chemical compound O([C@@H]1O[C@@H]([C@H]([C@H](OC(C)=O)[C@H]1OC(C)=O)O[C@H]1[C@@H]([C@@H](OC(C)=O)[C@H](OC(C)=O)[C@@H](COC(C)=O)O1)OC(C)=O)COC(=O)C)[C@@H]1[C@@H](COC(C)=O)O[C@@H](OC(C)=O)[C@H](OC(C)=O)[C@H]1OC(C)=O NNLVGZFZQQXQNW-ADJNRHBOSA-N 0.000 description 1
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 229960003767 alanine Drugs 0.000 description 1
- 230000009435 amidation Effects 0.000 description 1
- 238000007112 amidation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010976 amide bond formation reaction Methods 0.000 description 1
- 229960004050 aminobenzoic acid Drugs 0.000 description 1
- 229960002684 aminocaproic acid Drugs 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000011091 antibody purification Methods 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 1
- IVRMZWNICZWHMI-UHFFFAOYSA-N azide group Chemical group [N-]=[N+]=[N-] IVRMZWNICZWHMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001540 azides Chemical class 0.000 description 1
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 1
- UCMIRNVEIXFBKS-UHFFFAOYSA-N beta-alanine Chemical compound NCCC(O)=O UCMIRNVEIXFBKS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 238000006664 bond formation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 125000003917 carbamoyl group Chemical group [H]N([H])C(*)=O 0.000 description 1
- 150000001718 carbodiimides Chemical class 0.000 description 1
- 235000010980 cellulose Nutrition 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- BJBUEDPLEOHJGE-IUYQGCFVSA-N cis-3-hydroxy-D-proline zwitterion Chemical compound O[C@H]1CCN[C@H]1C(O)=O BJBUEDPLEOHJGE-IUYQGCFVSA-N 0.000 description 1
- 229960002173 citrulline Drugs 0.000 description 1
- 235000013477 citrulline Nutrition 0.000 description 1
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 1
- 238000009833 condensation Methods 0.000 description 1
- 230000005494 condensation Effects 0.000 description 1
- 239000007859 condensation product Substances 0.000 description 1
- 238000006352 cycloaddition reaction Methods 0.000 description 1
- 108010004073 cysteinylcysteine Proteins 0.000 description 1
- 102000003675 cytokine receptors Human genes 0.000 description 1
- 229940021746 d- serine Drugs 0.000 description 1
- GYZLOYUZLJXAJU-UHFFFAOYSA-N diglycidyl ether Chemical compound C1OC1COCC1CO1 GYZLOYUZLJXAJU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002228 disulfide group Chemical group 0.000 description 1
- 208000001848 dysentery Diseases 0.000 description 1
- 230000009881 electrostatic interaction Effects 0.000 description 1
- 239000002158 endotoxin Substances 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- YSMODUONRAFBET-UHNVWZDZSA-N erythro-5-hydroxy-L-lysine Chemical compound NC[C@H](O)CC[C@H](N)C(O)=O YSMODUONRAFBET-UHNVWZDZSA-N 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 1
- 125000002485 formyl group Chemical group [H]C(*)=O 0.000 description 1
- 238000006170 formylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 210000000442 hair follicle cell Anatomy 0.000 description 1
- 208000024963 hair loss Diseases 0.000 description 1
- 230000003676 hair loss Effects 0.000 description 1
- 229960002885 histidine Drugs 0.000 description 1
- QJPWUUJVYOJNMH-UHFFFAOYSA-N homoserine lactone Chemical compound NC1CCOC1=O QJPWUUJVYOJNMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940098197 human immunoglobulin g Drugs 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- 229920001477 hydrophilic polymer Polymers 0.000 description 1
- 229960002591 hydroxyproline Drugs 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 1
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 1
- 238000010324 immunological assay Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- BRHPBVXVOVMTIQ-ZLELNMGESA-N l-leucine l-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O.CC(C)C[C@H](N)C(O)=O BRHPBVXVOVMTIQ-ZLELNMGESA-N 0.000 description 1
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 1
- HWYHZTIRURJOHG-UHFFFAOYSA-N luminol Chemical compound O=C1NNC(=O)C2=C1C(N)=CC=C2 HWYHZTIRURJOHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 230000010534 mechanism of action Effects 0.000 description 1
- 229940126601 medicinal product Drugs 0.000 description 1
- CSHFHJNMIMPJST-HOTGVXAUSA-N methyl (2s)-2-[[(2s)-2-[[2-[(2-aminoacetyl)amino]acetyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoate Chemical compound NCC(=O)NCC(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)OC)CC1=CC=CC=C1 CSHFHJNMIMPJST-HOTGVXAUSA-N 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- ZIUHHBKFKCYYJD-UHFFFAOYSA-N n,n'-methylenebisacrylamide Chemical compound C=CC(=O)NCNC(=O)C=C ZIUHHBKFKCYYJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 230000006320 pegylation Effects 0.000 description 1
- YYCZLGUOLIWZAW-GVETXGJZSA-N peptide 75 Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)C1=CC=CC=C1 YYCZLGUOLIWZAW-GVETXGJZSA-N 0.000 description 1
- 229940125863 peptide 78 Drugs 0.000 description 1
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 229940127557 pharmaceutical product Drugs 0.000 description 1
- 239000002798 polar solvent Substances 0.000 description 1
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 1
- 229920000058 polyacrylate Polymers 0.000 description 1
- 229920000573 polyethylene Polymers 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 229920000193 polymethacrylate Polymers 0.000 description 1
- 229920002451 polyvinyl alcohol Polymers 0.000 description 1
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 1
- 239000000047 product Substances 0.000 description 1
- 229960002429 proline Drugs 0.000 description 1
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 1
- 238000006268 reductive amination reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 239000012488 sample solution Substances 0.000 description 1
- 229940043230 sarcosine Drugs 0.000 description 1
- BHRZNVHARXXAHW-UHFFFAOYSA-N sec-butylamine Chemical compound CCC(C)N BHRZNVHARXXAHW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 1
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 1
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 1
- 238000011191 terminal modification Methods 0.000 description 1
- NBOMNTLFRHMDEZ-UHFFFAOYSA-N thiosalicylic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1S NBOMNTLFRHMDEZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YSMODUONRAFBET-WHFBIAKZSA-N threo-5-hydroxy-L-lysine Chemical compound NC[C@@H](O)CC[C@H](N)C(O)=O YSMODUONRAFBET-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- 230000005944 tissue migration Effects 0.000 description 1
- 125000000391 vinyl group Chemical group [H]C([*])=C([H])[H] 0.000 description 1
- 229920002554 vinyl polymer Polymers 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K17/00—Carrier-bound or immobilised peptides; Preparation thereof
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K7/50—Cyclic peptides containing at least one abnormal peptide link
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K7/50—Cyclic peptides containing at least one abnormal peptide link
- C07K7/54—Cyclic peptides containing at least one abnormal peptide link with at least one abnormal peptide link in the ring
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/395—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/30—Macromolecular organic or inorganic compounds, e.g. inorganic polyphosphates
- A61K47/42—Proteins; Polypeptides; Degradation products thereof; Derivatives thereof, e.g. albumin, gelatin or zein
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K47/00—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient
- A61K47/50—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates
- A61K47/51—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent
- A61K47/62—Medicinal preparations characterised by the non-active ingredients used, e.g. carriers or inert additives; Targeting or modifying agents chemically bound to the active ingredient the non-active ingredient being chemically bound to the active ingredient, e.g. polymer-drug conjugates the non-active ingredient being a modifying agent the modifying agent being a protein, peptide or polyamino acid
- A61K47/65—Peptidic linkers, binders or spacers, e.g. peptidic enzyme-labile linkers
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01D—SEPARATION
- B01D15/00—Separating processes involving the treatment of liquids with solid sorbents; Apparatus therefor
- B01D15/08—Selective adsorption, e.g. chromatography
- B01D15/26—Selective adsorption, e.g. chromatography characterised by the separation mechanism
- B01D15/38—Selective adsorption, e.g. chromatography characterised by the separation mechanism involving specific interaction not covered by one or more of groups B01D15/265 - B01D15/36
- B01D15/3804—Affinity chromatography
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/13—Labelling of peptides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/14—Extraction; Separation; Purification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/14—Extraction; Separation; Purification
- C07K1/16—Extraction; Separation; Purification by chromatography
- C07K1/22—Affinity chromatography or related techniques based upon selective absorption processes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K19/00—Hybrid peptides, i.e. peptides covalently bound to nucleic acids, or non-covalently bound protein-protein complexes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K7/04—Linear peptides containing only normal peptide links
- C07K7/06—Linear peptides containing only normal peptide links having 5 to 11 amino acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K7/04—Linear peptides containing only normal peptide links
- C07K7/08—Linear peptides containing only normal peptide links having 12 to 20 amino acids
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/58—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/395—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum
- A61K39/39516—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum from serum, plasma
- A61K39/39525—Purification
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Immunology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Inorganic Chemistry (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicinal Preparation (AREA)
- Treatment Of Liquids With Adsorbents In General (AREA)
- Solid-Sorbent Or Filter-Aiding Compositions (AREA)
Abstract
Изобретение относится к циклическому пептиду, который обладает свойствами связывания антитела и улучшенной устойчивостью к химическому воздействию, а также к подложке для аффинной хроматографии, содержащей циклический пептид. 5 н. и 4 з.п. ф-лы, 8 табл., 83 пр.
Description
УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ, ПРЕДШЕСТВУЮЩИЙ ИЗОБРЕТЕНИЮ
1. Область изобретения
[0001] Настоящее изобретение относится к циклическому пептиду, подложка для аффинной хроматографии, меченое антитело, конъюгат антитела и лекарственного средства и фармацевтический препарат.
2. Описание предшествующего уровня техники
[0002] В настоящее время лекарственные средства на основе антител привлекают внимание как наиболее надежные молекулярно-направленные лекарственные средства и быстро расширяют область применения новых фармацевтических продуктов. В большей части лекарственных средств на основе антител, которые разрабатываются или используются в настоящее время, используют антитела, принадлежащие к классу иммуноглобулин G (IgG).
[0003] В известном уровне техники для очистки антител IgG используют белки, такие как белок A или белок G, получаемые из Staphylococcus aureus. Вследствие того, что эти белки также связываются с IgG мыши и кролика, белки часто использовали для очистки IgG на уровне реагентов для исследования. В последние годы в фармацевтической области использовали лекарственные средства на основе антител, главным образом применяя IgG1 человека, и таким образом, дополнительно возросла важная роль лекарственных средств на основе антител в промышленном и фармацевтическом применении. В частности, колонка с белком A играет ключевую роль в очистке лекарственного средства на основе антитела, и многие производители лекарственных средств на основе антител адаптируют систему очистки в основном с использованием этой колонки.
[0004] Тем не менее, для колонки с белком A были выявлены определенные проблемы. Одной из проблем является то, что белок A смешивают с очищенными антителами. Белок A представляет собой белок, получаемый из бактерий, и характеризуется высокой иммуногенностью после введения в организм человека, и существует вопросы безопасности, связанные со смешиванием эндотоксина с этим белком. Для аффинного лиганда, такого как белок A, в качестве лиганда, используемого для очистки фармацевтических препаратов, во избежание смешивания нежелательных веществ, требуется высокая степень очистки. Таким образом, увеличивается стоимость колонки с белком A, используемой для очистки фармацевтических препаратов.
[0005] Для решения проблемы разрабатывают новую систему очистки антитела IgG.
[0006] Например, в патенте США номер заявки 2004/0087765 описан связывающий иммуноглобулин полипептид, который содержит аминокислотную последовательность R1-X01-X02-X03-X04-X05-X06-X07-X08-X09-X10-X11-X12-X13-R2 и содержит приблизительно от 11 до 13 остатков. В патенте США номер заявки 2004/0087765 описано, что полипептид может представлять собой циклический пептид, циклизированный посредством образования дисульфидной связи (в случае, когда X02=X12=C) или амидной связи (в случае, когда один из X02 и X12 представляет собой Dpr, Dab, K или Orn, а другой представляет собой D или E; здесь Dab представляет собой диаминобутановую кислоту, Dpr представляет собой диаминопропионовую кислоту, и Orn представляет собой орнитин) между X02 и X12 ([0017]-[0034]).
[0007] Кроме того, например, в WO2013/027796A описан связывающий IgG полипептид, который предоставлен (X1-3)-C-(X2)-H-R-G-(Xaa1)-L-V-W-C-(X1-3) и содержит от 13 до 17 аминокислотных остатков. В WO2013/027796A описано, что полипептид может представлять собой циклический пептид, в котором дисульфидная связь образуется между двумя остатками цистеина (C) ([0042]-[0044]).
[0008] Кроме того, например, в JP2007-289200A описан связывающий IgG-Fc пептид, который имеет формулу Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4-Cys-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Gly-Glu-Leu-Val-Trp-Cys-Xaa9-Xaa10-Xaa11-Xaa12-Xaa13 и содержит от 11 до 20 аминокислот (пункт формулы изобретения 39). В JP2007-289200A описано, что пептид может циклизироваться посредством образования дисульфидной связи или лактамной связи, где остатки, которые могут образовывать дисульфидную связь включают Cys, Pen, Mpr, Mpp и т.п., и остатки, которые могут образовывать лактамную связь включают Asp, Glu, Lys, Orn, αβ-диаминомасляную кислоту, диаминоуксусную кислоту, аминобензойную кислоту, меркаптобензойную кислоту и т.п. ([0039]).
СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ
[0010] Уделив особое внимание улучшению свойств связывания антитела путем регуляции пространственной структуры, автор настоящего изобретения исследовал активность связывания и устойчивость к химическому воздействию связывающих антитело циклических пептидов, описанных в патенте США номер заявки 2004/0087765, WO2013/027796A и JP2007-289200A. В результате, автор изобретения выявил, что активность связывания и устойчивость к химическому воздействию пептидов необходимо дополнительно улучшать.
[0011] Целью настоящего изобретения является предоставление циклического пептида, обладающего очень хорошими свойствами связывания антитела и улучшенной устойчивостью к химическому воздействию, подложки для аффинной хроматографии, меченого антитела, конъюгата антитела и лекарственного средства и фармацевтического препарата.
[0012] Для достижения указанной выше цели автор настоящего изобретения повторно проводил глубокие исследования. В результате, автор изобретения выявил, что аминокислотные остатки в поперечно-сшитых участках играют важные роли в устойчивости к химическому воздействию, и выполнил настоящее изобретение.
[0013] Таким образом, настоящее изобретение относится к [1]-[50], описанным ниже.
[1] Циклический пептид, представленной формулой (I).
RN-Xg-[Xi-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xj]k-Xh-RC (I)
В формуле (I) RN представляет собой N-концевую группу; RC представляет собой C-концевую группу; X1 представляет собой остаток L-лейцина, остаток L-изолейцина, остаток L-метионина, остаток L-лизина или остаток L-аргинина; X2 представляет собой остаток L-валина или остаток L-изолейцина; X3 представляет собой остаток L-триптофана; каждый из Xa и Xb независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-цистеина и D-цистеина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи, и они связаны друг с другом дисульфидной связью, или, один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-цистеина и D-цистеина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи, а другой представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи, и Xa и Xb связаны друг с другом посредством тиоэфирной связи; каждый из Xg, Xh, Xi, Xj, Xm и Xn представляет собой g последовательных X; h последовательных X, i последовательных X, j последовательных X, m последовательных X и n последовательных X; X представляет собой аминокислотный остаток, и в случае, когда присутствует множество X, множество X может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; каждый из g, h, i и j независимо представляет собой целое число равное или больше 0; m и n представляют собой целые числа, удовлетворяющие 0≤m≤9, 0≤n≤9 и 3≤m+n≤9 одновременно; и k представляет собой целое число равное или больше 1, и в случае, когда k≥2, каждый из X1, X2, X3, Xa, Xb, Xi, Xj, Xm и Xn в повторяющейся единице [Xi-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xj] может являться одинаковым или различным в повторяющихся единицах.
[2] Циклический пептид, описанный в [1], который представлен формулой (IA).
RN-Xg-[Xp2-X4 r-Xp1-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xq1-X5s-Xq2]k-Xh-RC (IA)
В формуле (IA), RN, RC, X1, X2, X3, Xa, Xb, Xg, Xh, Xm, Xn, X, g, h, m, n и k имеют такие же определения как определения в формуле (I); каждый из X4 r, X5 s, Xp1, Xp2, Xq1 и Xq2 представляет собой r последовательных X4, s последовательных X5, p1 последовательных X, p2 последовательных X, q1 последовательных X и q2 последовательных X; каждый из X4 и X5 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи, или аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X4 или X5, множество X4 или X5 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; каждый из p1, p2, q1 и q2 независимо представляет собой целое число, равное или больше 0; каждый из r и s независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤r≤5, 0≤s≤5 и 1≤Max (r, s)≤5, где Max (r, s) представляет собой большее число из двух чисел, представленных r и s, в случае, когда r≠s и представляет собой r или s, в случае, когда r=s; и в случае, когда k≥2, каждый из X1, X2, X3, Xa, Xb, X4 r, X5 s, Xm, Xn, Xp2, Xp1, Xq1 и Xq2 в повторяющейся единице [Xp2-X4 r-Xp1-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xq1-X5 s -Xq2] может являться одинаковым или различным в повторяющихся единицах.
[3] Циклический пептид, описанный в [1], который представлен формулой (IB).
RN-Xv1-X6 t-Xv2-[Xi-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xj]k-Xw2-X7 u-Xw1-RC (IB)
В формуле (IB), RN, RC, X1, X2, X3, Xa, Xb, Xi, Xj, Xm, Xn, X, i, j, m, n и k имеют такие же определения как определения в формуле (I); каждый из X6 t, X7 u, Xv1, Xv2, Xw1 и Xw2 представляет собой t последовательных X6, u последовательных X7, v1 последовательных X, v2 последовательных X, w1 последовательных X и w2 последовательных X; каждый из X6 и X7 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X6 или X7, множество X6 или X7 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; каждый из t и u независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤t≤5, 0≤u≤5 и 1≤Max (t,u)≤5, где Max (t,u) представляет собой большее число из двух чисел, представленных t и u в случае, когда t≠u и представляет собой t или u в случае, когда t=u; каждый из v1, v2, w1 и w2 независимо представляет собой целое число, равное или больше 0; и в случае, когда k≥2, каждый из X1, X2, X3, Xa, Xb, Xi, Xj, Xm и Xn в повторяющейся единице [Xi-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xj] может являться одинаковым или различным в повторяющихся единицах.
[4] Циклический пептид, описанный в любом из пунктов [1]-[3], который представлен формулой (IC).
RN-Xv1-X6 t-Xv2-[Xp2-X4 r-Xp1-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xq1-X5 s -Xq2]k-Xw2-X7 u-Xw1-RC (IC)
В формуле (IC), RN, RC, X1, X2, X3, Xa, Xb, Xm, Xn, X, m, n и k имеют такие же определения как определения в формуле (I);
Каждый из Xp1, Xp2, Xq1, Xq2, X4 r, X5 s, X6 t, X7 u, Xv1, Xv2, Xw1 и Xw2 представляет собой p1 последовательных X, p2 последовательных X, q1 последовательных X, q2 последовательных X, r последовательных X4, s последовательных X5, t последовательных X6, u последовательных X7, v1 последовательных X, v2 последовательных X, w1 последовательных X и w2 последовательных X; каждый из X4 и X5 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи, или аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X4 или X5, множество X4 или X5 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; каждый из X6 и X7 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X6 или X7, множество X6 или X7 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; каждый из p1, p2, q1 и q2 независимо представляет собой целое число, равное или больше 0; каждый из r и s независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤r≤5, 0≤s≤5 и 1≤Max (r, s)≤5, где Max (r, s) представляет собой большее число из двух чисел, представленное r и s в случае, когда r≠s и представляет собой r или s в случае, когда r=s; каждый из t и u независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤t≤5, 0≤u≤5 и 1≤Max (t,u)≤5, где Max (t,u) представляет собой большее число из двух чисел представленных t и u в случае, когда t≠u и представляет собой t или u в случае, когда t=u; каждый из v1, v2, w1 и w2 независимо представляет собой целое число, равное или больше 0; и в случае, когда k≥2, каждый из X1, X2, X3, Xa, Xb, X4 r, X5 s, Xm, Xn, Xp2, Xp1, Xq1 и Xq2 в повторяющейся единице [Xp2-X4 r-Xp1-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xq1-X5 s -Xq2] может являться одинаковым или различным в повторяющихся единицах.
[5] Циклический пептид, описанный в [1], где 8≤g+h+k×(i+j+m+n+5)≤50.
[6] Циклический пептид, описанный в [2], где 8≤g+h+k×(m+n+p1+p2+q1+q2+5)≤50.
[7] Циклический пептид, описанный в [3], где 8≤v1+v2+w1+w2+t+u+k×(i+j+m+n+5)≤50.
[8] Циклический пептид, описанный в [4], где 8≤v1+v2+w1+w2+t+u+k×(m+n+p1+p2+q1+q2+5)≤50.
[9] Циклический пептид, описанный в [2], [4], [6] или [8], где аминокислота, содержащая карбоксигруппу в боковой цепи относится по меньшей мере к одному типу аминокислоты, выбранной из группы, состоящей из L-аспарагиновой кислоты, D-аспарагиновой кислоты, L-глутаминовой кислоты, D-глутаминовой кислоты, L-гомоглутаминовой кислоты и D-гомоглутаминовой кислоты, и аминокислота, содержащая гидроксигруппу в боковой цепи, относится по меньшей мере к одному типу аминокислоты, выбранной из группы, состоящей из L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-тирозина, D-тирозина, L-треонина, D-треонина, L-аллотреонина и D-аллотреонина.
[10] Циклический пептид, описанный в [9], где аминокислота, содержащая карбоксигруппу в боковой цепи, представляет собой L-аспарагиновую кислоту, и аминокислота, содержащая гидроксигруппу в боковой цепи, представляет собой L-треонин.
[11] Циклический пептид, описанный в [3], [4], [7] или [8], где имобилизирующая функциональная группа представляет собой аминогруппу или тиоловую группу.
[12] Циклический пептид, описанный в [3], [4], [7] или [8], где аминокислота, содержащая иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, относится по меньшей мере к одному типу аминокислоты, выбранной из группы, состоящей из L-лизина, D-лизина, L-цистеина, D-цистеина, L-гомоцистеина и D-гомоцистеина.
[13] Циклический пептид, описанный в любом из пунктов [1]-[12], где Xa представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей хлорацетильную группу в боковой цепи, выбранную из группы, состоящей из (2S)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2R)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2S)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, (2R)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, N-δ-хлорацетил-L-орнитина, N-δ-хлорацетил-D-орнитина, N-ε-хлорацетил-L-лизина и N-ε-хлорацетил-D-лизина, Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-гомоцистеина или D-гомоцистеина, и Xa и Xb связаны друг с другом посредством тиоэфирной связи.
[14] Циклический пептид, описанный в любом из пунктов [1]-[12], где Xa представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-гомоцистеина или D-гомоцистеина, Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей хлорацетильную группу в боковой цепи, выбранной из группы, состоящей из (2S)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2R)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2S)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, (2R)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, N-δ-хлорацетил-L-орнитина, N-δ-хлорацетил-D-орнитина, N-ε-хлорацетил-L-лизина и N-ε-хлорацетил-D-лизина, и Xa и Xb связаны друг с другом посредством тиоэфирной связи.
[15] Циклический пептид, описанный в любом из пунктов [1]-[14], где неполная аминокислотная последовательность Xm-X1-X2-X3-Xn в формуле (I), (IA), (IB) или (IC) и аминокислотная последовательность (SEQ ID NO:1), представленная формулой (1), обладают гомологией последовательности, равной или более 70%.
A-Y-H-L-G-E-L-V-W (1)
В формуле (1) A представляет собой остаток L-аланина; Y представляет собой остаток L-тирозина; H представляет собой остаток L-гистидина; L представляет собой остаток L-лейцина; G представляет собой остаток глицина; E представляет собой остаток L-глутаминовой кислоты; V представляет собой остаток L-валина, и W представляет собой остаток L-триптофана.
[16] Циклический пептид, описанный в любом из пунктов [1]-[15], где в формуле (I), (IA), (IB) или (IC) k=1.
[17] Циклический пептид, описанный в [1], который представлен формулой (II).
RN-Xv0-X6 t0-Xe0-X4 r0-Xp0-Xa-A-Y-H-X8-G-E-L-V-W-Xb-Xq0-X5 s0-Xf0-X7 u0-Xw0-RC (II)
В формуле (II) Xa, Xb, X, RN и RC имеют такие же определения как определения в формуле (I); каждый из X4 и X5 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи, или аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X4 или X5, множество X4 или X5 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; каждый из X6 и X7 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X6 или X7, множество X6 или X7 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; X8 представляет собой остаток L-лейцина, остаток D-лейцина, остаток L-аргинина или остаток D-аргинина; каждый из e0 и f0 независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤e0≤10 и 0≤f0≤10; каждый из p0 и q0 независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤p0≤5 и 0≤q0≤5; каждый из r0 и s0 независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤r0≤5 и 0≤s0≤5; каждый из t0 и u0 независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤t0≤5 и 0≤u0≤5; каждый из v0 и w0 независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤v0≤5 и 3≤w0≤5; p0, q0, r0, s0, t0, u0, v0 и w0 удовлетворяют 0≤p0+q0+r0+s0+t0+u0+v0+w0≤39; A представляет собой остаток L-аланина или остаток D-аланина; Y представляет собой остаток L-тирозина или остаток D-тирозина; H представляет собой остаток L-гистидина или остаток D-гистидина; G представляет собой остаток глицина; E представляет собой остаток L-глутаминовой кислоты или остаток D-глутаминовой кислоты; L представляет собой остаток L-лейцина; V представляет собой остаток L-валина, и W представляет собой остаток L-триптофана.
[18] Циклический пептид, описанный в [17], где каждый из X6 и X7 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, выбранной из группы, состоящей из L-лизина, D-лизина, L-цистеина, D-цистеина, L-гомоцистеина и D-гомоцистеина
[19] Циклический пептид, описанный в [17] или [18], где Xa представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей хлорацетильную группу в боковой цепи, выбранной из группы, состоящей из (2S)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2R)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2S)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, (2R)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, N-δ-хлорацетил-L-орнитина, N-δ-хлорацетил-D-орнитина, N-ε-хлорацетил-L-лизина и N-ε-хлорацетил-D-лизина, Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-гомоцистеина или D-гомоцистеина, и Xa и Xb связаны друг с другом посредством тиоэфирной связи.
[20] Циклический пептид, описанный в [17] или [18], где Xa представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-гомоцистеина или D-гомоцистеина, Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей хлорацетильную группу в боковой цепи, выбранной из группы, состоящей из (2S)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2R)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2S)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, (2R)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, N-δ-хлорацетил-L-орнитина, N-δ-хлорацетил-D-орнитина, N-ε-хлорацетил-L-лизина и N-ε-хлорацетил-D-лизина, и Xa и Xb связаны друг с другом посредством тиоэфирной связи.
[21] Циклический пептид, представленный формулой (I')
RN-Xg-[Xi-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xj]k-Xh-RC (I')
В формуле (I') RN представляет собой N-концевую группу; RC представляет собой C-концевую группу; X1 представляет собой остаток L-лейцина, остаток L-изолейцина, остаток L-метионина, остаток L-лизина или остаток L-аргинина; X2 представляет собой остаток L-валина или остаток L-изолейцина; X3 представляет собой остаток L-триптофана; один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, а другой представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи, и Xa и Xb связаны друг с другом посредством тиоэфирной связи, или один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, а другой представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи, и Xa и Xb связаны друг с другом посредством тиоэфирной связи; каждый из Xg, Xh, Xi, Xj, Xm, и Xn представляет собой g последовательных X, h последовательных X, i последовательных X, j последовательных X, m последовательных X и n последовательных X; в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, X представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-аргинина и D-аргинина в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, X представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, и в случае, когда присутствует множество X, множество X может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; каждый из g, h, i и j независимо представляет собой целое число равное или больше 0; m и n представляют собой целые числа, удовлетворяющие одновременно 0≤m≤9, 0≤n≤9 и 3≤m+n≤9; и k представляет собой целое число равное или больше 1, и в случае, когда k≥2, каждый из X1, X2, X3, Xa, Xb, Xi, Xj, Xm, и Xn в повторяющейся единице [Xi-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xj] может являться одинаковым или различным в повторяющихся единицах.
[22] Циклический пептид, описанный в [21], который представлен формулой (I'A).
RN-Xg-[Xp2-X4 r-Xp1-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xq1-X5 s-Xq2]k-Xh-RC (I'A)
В формуле (I'A) RN, RC, X1, X2, X3, Xa, Xb, Xg, Xh, Xm, Xn, g, h, m, n и k имеют такие же определения как определения в формуле (I'); каждый из X4 r, X5 s, Xp1, Xp2, Xq1, и Xq2 представляет собой r последовательных X4, s последовательных X5, p1 последовательных X, p2 последовательных X, q1 последовательных X и q2 последовательных X; в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, X представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-аргинина и D-аргинина, в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, X представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, и в случае, когда присутствует множество X, множество X может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, каждый из X4 и X5 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи, или аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина и D-гомосерина, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи, в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, каждый из X4 и X5 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи, или аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина или D-серина, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X4 или X5, множество X4 или X5 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; каждый из p1, p2, q1 и q2 независимо представляет собой целое число, равное или больше 0; каждый из r и s независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤r≤5, 0≤s≤5 и 1≤Max (r, s)≤5, где Max (r, s) представляет собой большее число из двух чисел, представленное r и s в случае, когда r≠s и представляет собой r или s в случае, когда r=s; и в случае, когда k≥2, каждый из X1, X2, X3, Xa, Xb, X4 r, X5 s, Xm, Xn, Xp2, Xp1, Xq1 и Xq2 в повторяющейся единице [Xp2-X4 r-Xp1-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xq1-X5 s -Xq2] может являться одинаковым или различным в повторяющихся единицах.
[23] Циклический пептид, описанный в [21], который представлен формулой (I'B).
RN-Xv1-X6 t-Xv2-[Xi-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xj]k-Xw2-X7 u-Xw1-RC (I'B)
В формуле (I'B) RN, RC, X1, X2, X3, Xa, Xb, Xi, Xj, Xm, Xn, i, j, m, n и k имеют такие же определения как определения в формуле (I'); каждый из X6 t, X7 u, Xv1, Xv2, Xw1, и Xw2 представляет собой t последовательных X6, u последовательных X7, v1 последовательных X, v2 последовательных X, w1 последовательных X и w2 последовательных X; в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, X представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-аргинина и D-аргинина, в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, X представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, и в случае, когда присутствует множество X, множество X может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, каждый из X6 и X7 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-аргинина и D-аргинина, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, или каждый из них независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, каждый из X6 и X7 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X6 или X7, множество X6 или X7 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; каждый из t и u независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤t≤5, 0≤u≤5 и 1≤Max (t,u)≤5, где Max (t,u) представляет собой большее число из двух чисел представленных t и u в случае, когда t≠u и представляет собой t или u в случае, когда t=u; каждый из v1, v2, w1 и w2 независимо представляет собой целое число, равное или больше 0; и в случае, когда k≥2, каждый из X1, X2, X3, Xa, Xb, Xi, Xj, Xm и Xn в повторяющейся единице [Xi-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xj] может являться одинаковым или различным в повторяющихся единицах.
[24] Циклический пептид, описанный в любом из пунктов [21]-[23], который представлен формулой (I'C).
RN-Xv1-X6 t-Xv2-[Xp2-X4 r-Xp1-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xq1-X5 s -Xq2]k-Xw2-X7 u-Xw1-RC (I'C)
В формуле (I'C) RN, RC, X1, X2, X3, Xa, Xb, Xm, Xn, m, n и k имеют такие же определения как определения в формуле (I'); каждый из Xp1, Xp2, Xq1, Xq2, X4 r, X5 s, X6 t, X7 u, Xv1, Xv2, Xw1 и Xw2 представляет собой p1 последовательных X, p2 последовательных X, q1 последовательных X, q2 последовательных X, r последовательных X4, S последовательных X5, t последовательных X6, u последовательных X7, v1 последовательных X, v2 последовательных X, w1 последовательных X и w2 последовательных X; в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, X представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-аргинина и D-аргинина в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, X представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, и в случае, когда присутствует множество X, множество X может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, каждый из X4 и X5 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи, или аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина и D-гомосерина, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи, в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, каждый из X4 и X5 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи, или аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серин и D-серин, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X4 или X5, множество X4 или X5 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, каждый из X6 и X7 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-аргинина и D-аргинина, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, или каждый их них независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, каждый из X6 и X7 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X6 или X7, множество X6 или X7 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; каждый из p1, p2, q1 и q2 независимо представляет собой целое число, равное или больше 0; каждый из r и s независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤r≤5, 0≤s≤5 и 1≤Max (r, s)≤5, где Max (r, s) представляет собой большее число из двух чисел, представленное r и s в случае, когда r≠s и представляет собой r или s в случае, когда r=s; каждый из t и u независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤t≤5, 0≤u≤5 и 1≤Max (t,u)≤5, где Max (t,u) представляет собой большее число из двух чисел представленных t и u в случае, когда t≠u и представляет собой t или u в случае, когда t=u; каждый из v1, v2, w1 и w2 независимо представляет собой целое число, равное или больше 0; и в случае, когда k≥2, каждый из X1, X2, X3, Xa, Xb, X4 r, X5 s, Xm, Xn, Xp2, Xp1, Xq1 и Xq2 в повторяющейся единице [Xp2-X4 r-Xp1-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xq1-X5 s -Xq2] может являться одинаковым или различным в повторяющихся единицах.
[25] Циклический пептид, описанный в [21], где 8≤g+h+k×(i+j+m+n+5)≤50.
[26] Циклический пептид, описанный в [22], где 8≤g+h+k×(m+n+p1+p2+q1+q2+5)≤50.
[27] Циклический пептид, описанный в [23], где 8≤v1+v2+w1+w2+t+u+k×(i+j+m+n+5)≤50.
[28] Циклический пептид, описанный в [24], где 8≤v1+v2+w1+w2+t+u+k×(m+n+p1+p2+q1+q2+5)≤50.
[29] Циклический пептид, описанный в [22], [24], [26] или [28], где аминокислота, содержащая карбоксигруппу в боковой цепи относится по меньшей мере к одному типу аминокислоты, выбранной из группы, состоящей из L-аспарагиновой кислоты, D-аспарагиновой кислоты, L-глутаминовой кислоты, D-глутаминовой кислоты, L-гомоглутаминовой кислоты и D-гомоглутаминовой кислоты, в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, аминокислота отличная от L-серина, D-серина, L-гомосерина и D-гомосерина, содержащая гидроксигруппу в боковой цепи, относится по меньшей мере к одному типу аминокислоты, выбранной из группы, состоящей из L-тирозина, D-тирозина, L-треонина, D-треонина, L-аллореонина и D-аллотреонина и в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, аминокислота отличная от L-серина и D-серина, содержащая гидроксигруппу в боковой цепи относится по меньшей мере к одному типу аминокислоты, выбранной из группы, состоящей из L-гомосерина, D-гомосерина, L-тирозина, D-тирозина, L-треонина, D-треонина, L-аллотреонина и D-аллотреонина.
[30] Циклический пептид, описанный в [22], [24], [26] или [28], где аминокислота, содержащая карбоксигруппу в боковой цепи, представляет собой L-аспарагиновую кислоту, и аминокислота отличная от L-серина, D-серина, L-гомосерина и D-гомосерина, содержащая гидроксигруппу в боковой цепи и аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи, представляют собой L-треонин.
[31] Циклический пептид, описанный в [23], [24], [27] или [28], где иммобилизирующая функциональная группа представляет собой аминогруппу или тиоловую группу.
[32] Циклический пептид, описанный в [23], [24], [27] или [28], где аминокислота отличная от L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-аргинина и D-аргинина, содержащая иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, и аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, содержащий иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, относятся по меньшей мере к одному типу аминокислоты, выбранной из группы, состоящей из L-лизина, D-лизина, L-цистеина, D-цистеина, L-гомоцистеина и D-гомоцистеина.
[33] Циклический пептид, описанный в любом из пунктов [21]-[32], где Xa представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей хлорацетильную группу в боковой цепи, выбранной из группы, состоящей из (2S)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2R)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2S)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, (2R)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, N-δ-хлорацетил-L-орнитина, N-δ-хлорацетил-D-орнитина, N-ε-хлорацетил-L-лизина и N-ε-хлорацетил-D-лизина, Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, или аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, и Xa и Xb связаны друг с другом посредством тиоэфирной связи.
[34] Циклический пептид, описанный в любом из пунктов [21]-[32, где Xa представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, или аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей хлорацетильную группу в боковой цепи, выбранной из группы, состоящей из (2S)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2R)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2S)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, (2R)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, N-δ-хлорацетил-L-орнитина, N-δ-хлорацетил-D-орнитина, N-ε-хлорацетил-L-лизина и N-ε-хлорацетил-D-лизина, и Xa и Xb связаны друг с другом посредством тиоэфирной связи.
[35] Циклический пептид, описанный в любом из пунктов [21]-[34], где неполная аминокислотная последовательность Xm-X1-X2-X3-Xn в формуле (I'), (I'A), (I'B) или (I'C) и аминокислотная последовательность (SEQ ID NO:1), представленная формулой (1), обладают общей гомологией последовательности равной 70% или выше.
A-Y-H-L-G-E-L-V-W (1)
В формуле (1) A представляет собой остаток L-аланина; Y представляет собой остаток L-тирозина; H представляет собой остаток L-гистидина; L представляет собой остаток L-лейцина; G представляет собой остаток глицина; E представляет собой остаток L-глутаминовой кислоты; V представляет собой остаток L-валина, и W представляет собой остаток L-триптофана.
[36] Циклический пептид, описанный в любом из пунктов [21]-[35], где в формуле (I'), (I'A), (I'B) или (I'C) k=1.
[37] Циклический пептид, описанный в [21], который представлен формулой (II').
RN-Xv0-X6 t0-Xe0-X4 r0-Xp0-Xa-A-Y-H-X8-G-E-L-V-W-Xb-Xq0-X5 s0-Xf0-X7 u0-Xw0-RC (II')
В формуле (II') Xa, Xb, X, RN и RC имеют такие же определения как определения в формуле (I'); в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, каждый из X4 и X5 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи, или аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина и D-гомосерина, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи, в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, каждый из X4 и X5 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи, или аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X4 или X5, множество X4 или X5 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, каждый из X6 и X7 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-аргинина и D-аргинина, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, или каждый из них независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, каждый из X6 и X7 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X6 или X7, множество X6 или X7 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, X8 представляет собой остаток L-лейцина или остаток D-лейцина, в случае, когда один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, X8 представляет собой остаток L-лейцина, остаток D-лейцина, остаток L-аргинина, или остаток D-аргинина; каждый из e0 и f0 независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤e0≤10 и 0≤f0≤10; каждый из p0 и q0 независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤p0≤5 и 0≤q0≤5; каждый из r0 и s0 независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤r0≤5 и 0≤s0≤5; каждый из t0 и u0 независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤t0≤5 и 0≤u0≤5; каждый из v0 и w0 независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤v0≤5 и 3≤w0≤5; p0, q0, r0, s0, t0, u0, v0 и w0 удовлетворяет 0≤p0+q0+r0+s0+t0+u0+v0+w0≤39; A представляет собой остаток L-аланина или остаток D-аланина; Y представляет собой остаток L-тирозина или остаток D-тирозина; H представляет собой остаток L-гистидина или остаток D-гистидина; G представляет собой остаток глицина; E представляет собой остаток L-глутаминовой кислоты или остаток D-глутаминовой кислоты; L представляет собой остаток L-лейцина; V представляет собой остаток L-валина, и W представляет собой остаток L-триптофана.
[38] Циклический пептид, описанный в [37], где каждый из X6 и X7 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, выбранной из группы, состоящей из L-лизина, D-лизина, L-цистеина, D-цистеина, L-гомоцистеина и D-гомоцистеина.
[39] Циклический пептид, описанный в [37] или [38], где Xa представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей хлорацетильную группу в боковой цепи, выбранной из группы, состоящей из (2S)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2R)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2S)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, (2R)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, N-δ-хлорацетил-L-орнитина, N-δ-хлорацетил-D-орнитина, N-ε-хлорацетил-L-лизина и N-ε-хлорацетил-D-лизина, Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, или аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, и Xa и Xb связаны друг с другом посредством тиоэфирной связи.
[40] Циклический пептид, описанный в [37] или [38], где Xa представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, или аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей хлорацетильную группу в боковой цепи, выбранной из группы, состоящей из (2S)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2R)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2S)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, (2R)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, N-δ-хлорацетил-L-орнитина, N-δ-хлорацетил-D-орнитина, N-ε-хлорацетил-L-лизина и N-ε-хлорацетил-D-лизина, и Xa и Xb связаны друг с другом посредством тиоэфирной связи.
[41] Циклический пептид, описанный в любом из пунктов [1]-[40], который представляет собой связывающий антитело лиганд.
[42] Циклический пептид, описанный в любом из пунктов [1]-[40], который представляет собой линкер для мечения антитела.
[43] Циклический пептид, описанный в любом из пунктов [1]-[40], который представляет собой линкер для конъюгатов антител c лекарственными средствами.
[44] Циклический пептид, описанный в любом из пунктов [1]-[40], который представляет собой носитель для лекарственного средства.
[45] Подложка для аффинной хроматографии, содержащий нерастворимую в воде подложку и циклический пептид, описанный в любом из пунктов [1]-[40], где нерастворимая в воде подложка и циклический пептид непосредственно или опосредованно связаны друг с другом.
[46] Меченое антитело, содержащее антитело, метящее соединение и циклический пептид, описанный в любом из пунктов [1]-[40], где антитело и метящее соединение связаны друг с другом посредством циклического пептида.
[47] Конъюгат антитела c лекарственным средством, содержащий антитело, лекарственное средство и циклический пептид, описанный в любом из пунктов [1]-[40], где антитело и лекарственное средство связаны друг с другом посредством циклического пептида.
[48] Конъюгат антитела c лекарственным средством, описанный в [47], где лекарственное средство представляет собой лекарственное средство, подвергнутое инкапсуляции в липосому, мицеллообразованию с использованием полимеров или пэгилированию.
[49] Фармацевтический препарат, содержащий лекарственное средство и циклический пептид, описанный в любом из пунктов [1]-[40], где лекарственное средство и циклический пептид являются непосредственно или опосредованно связанными друг с другом.
[50] Фармацевтический препарат, описанный в [49], где лекарственное средство представляет собой лекарственное средство, подвергнутое инкапсуляции в липосому, мицеллообразованию с использованием полимеров или пэгилированию.
[0014] По настоящему изобретению предоставлены циклический пептид, обладающий превосходными свойствами связывания и улучшенной устойчивостью к химическому воздействию, подложка для аффинной хроматографии, меченое антитело, конъюгат антитела и лекарственного средства и фармацевтический препарат.
ОПИСАНИЕ ПРЕДПОЧТИТЕЛЬНЫХ ВАРИАНТОВ ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ
[0015] [Циклический пептид по настоящему изобретению]
Сначала будут описаны характеристики по настоящему изобретению, которые не встречаются в предшествующем уровне техники.
В патенте США номер заявки 2004/0087765, WO2013/027796A, и JP2007-289200A описаны циклические пептиды, циклизированные посредством образования дисульфидной связи между двумя остатками цистеина. Согласно результатам оценки относительной активности связывания и устойчивости к химическому воздействию в сравнительном примере 2, который будет описан ниже, несмотря на то, что свойства связывания антитела циклических пептидов, циклизованных посредством образования дисульфидной связи между двумя остатками цистеина, являются превосходными, их устойчивость к химическому воздействию является слабой, и, таким образом, невозможно получать желаемых характеристик.
В патенте США номер заявки 2004/0087765 описан циклический пептид, циклизованный в результате образования амидной связи между двумя аминокислотными остатками в результате реакции между аминогруппой боковой цепи и карбоксигруппой боковой цепи. В JP2007-289200A описан циклический пептид, циклизованный посредством образования лактамной связи (амидной связь) между N-концевой аминогруппой или аминогруппой боковой цепи и карбоксигруппой боковой цепи. Согласно результатам оценки относительной активности связывания и устойчивости к химическому воздействию в сравнительном примере 1, который будет описан ниже, несмотря на то, что устойчивость к химическому воздействию циклического пептида, циклизованного посредством амидной связи между аминогруппой боковой цепи и карбоксигруппой боковой цепи, является улучшенной, его связывания антитела являются слабыми, и, таким образом, невозможно получать желаемых характеристик.
С другой стороны, в настоящем изобретении, вследствие того, что применяли конструкции, которые будут описаны ниже, можно получать циклический пептид, обладающий превосходными свойствами связывания антитела и улучшенной устойчивостью к химическому воздействию.
[0016] В настоящем описании, в случае, когда "до" используют для диапазона числовых значений, числовые значения, перечисленные с левой и правой сторон от "до" входят в диапазон числовых значений.
[0017] <Аминокислота и аминокислотный остаток>
В настоящем изобретении в основном аминокислоты описаны с использованием названий, кодов и т.п., принятых Объединенная комиссией по биохимической номенклатуре (JCBN) Международного союза теоретической и прикладной химии и Международного союза биохимии и молекулярной биологии IUPAC-IUB. Кроме того, аминокислотные остатки описаны с использованием кодов аминокислот, из которых получают аминокислотные остатки. Аминокислотные остатки включают N-концевые аминокислоты (N-концевые остатки) и C-концевые аминокислоты (C-концевые остатки).
[0018] Если не указано иное, аминокислотную последовательность (обозначаемую как "первичная структура") пептида или белка описывают путем выравнивания аминокислотных остатков в линию, таким образом, что левый конец линии становится N-концом, а правый конец линии становится C-концом. В случае, когда аминокислотный остаток в аминокислотной последовательности пептида или белка идентифицирован, включая его положение, в некоторых случаях число, показывающее, какое положение занимает аминокислотный остаток со стороны N-конца, помещают с правой стороны от кода аминокислотного остатка. Например, в некоторых случаях второй L-лизин от N-конца описывают как Lys2.
[0019] В случае, когда аминокислоту описывают с использованием ее названия, и аминокислота включает изомеры с энантиомерным соотношением, другими словами, в случае, когда аминокислота включает L-изомер и D-изомер, за исключением случаев, когда L-изомер и D-изомер можно четко отделять друг от друга, аминокислота представляет собой в основном L-изомер. Например, "изолейцин" представляет собой "L-изолейцин", и энантиомер "изолейцин" представляет собой "D-изолейцин". Тоже справедливо и для аминокислотных остатков.
[0020] В случае, когда аминокислоту описывают с использованием ее кода (трехбуквенный код или однобуквенный код), и аминокислота включает изомеры с энантиомерным соотношением, т.е. в случае, когда аминокислота включает L-изомер и D-изомер, за исключением случаев, когда L-изомер и D-изомер четко отличаются друг от друга, в основном аминокислота представляет собой L-изомер. Здесь "X", представляющий любую аминокислоту не является ограниченным ей. Например, "Lys" и "L-Lys" представляют собой "L-лизин", и "D-Lys" представляет собой "D-лизин". Тоже справедливо и для аминокислотных остатков.
[0021] В случае, когда аминокислоту описывают с использованием ее названия, и аминокислота включает изомеры с диастереомерным соотношением, изомеры не входят в аминокислоту, указанную ее названием. Диастереомер описывают с использованием приставки "алло" и рассматривают как другой тип аминокислоты. Например, "треонин" и "L-треонин" не включают "L-аллотреонин", и "D-треонин" не включает "D-аллотреонин". Тоже справедливо и для аминокислотных остатков.
[0022] В таблице 1 приведены названия и коды (однобуквенный код и трехбуквенный код) аминокислот с официально общепризнанными однобуквенными кодами и трехбуквенными кодами.
[0023] Таблица 1
Однобуквенный код | Трехбуквенный код | Название | Однобуквенный код | Трехбуквенный код | Название | |
A | Ala | L-аланин | O | Pyl | L-пирролизин | |
B | Asx | L-аспарагиновая кислота или L-аспарагин | P | Pro | L-пролин | |
C | Cys | L-цистеин | Q | Gln | L-глутамин | |
D | Asp | L-аспарагиновая кислота | R | Arg | L-аргинин | |
E | Glu | L-глутаминовая кислота | S | Ser | L-серин | |
F | Phe | L-фенилаланин | T | Thr | L-треонин | |
G | Gly | Глицин | U | Сек | L-селеноцистеин | |
H | His | L-гистидин | V | Val | L-валин | |
I | Ile | L-изолейцин | W | Trp | L-триптофан | |
K | Lys | L-лизин | X | Xaa | аминокислота | |
L | Leu | L-лейцин | Y | Tyr | L-тирозин | |
M | Met | L-метионин | Z | Glx | L-глутаминовая кислота или L-глутамин | |
N | Asn | L-аспарагин |
[0024] Аминокислоты не являются ограниченными аминокислотами, приведенным в таблице 1, и также можно использовать аминокислоты, обозначаемый как нестандартные аминокислота. Примеры нестандартных аминокислот приведены в таблице 2, представленной ниже, но настоящее изобретение не ограничено ими.
[0025] Таблица 2
Трехбуквенный код | Название | Трехбуквенный код | Название | |
Aad | гомоглутаминовая кислота | Dpr | 2,3-диаминопропионовая кислота | |
bAad | 3-аминоадипинов кислота | Gla | 4-карбоксиглутаминовая кислота | |
Abu | 2-аминобутанов кислота | Glp | 5-оксопролин | |
A2bu | 2,4-диаминобутановая кислота | Hcy | гомоцистеин | |
Ahx | 2-аминогексановая кислота | Hse | гомосерин | |
Ahe | 2-аминогептановая кислота | Hsl | гомосеринлактон | |
Aib | 2-аминоизомасляная кислота | 5Hyl | 5-гидроксилизин (Hyl) | |
eAhx | 6-аминогексановая кислота | aHyl | аллогидроксилизин | |
bAla | b-аланин | 3Hyp | 3-гидроксипролин | |
Ape | 2-аминопентановая кислота | 4Hyp | 4-гидроксипролин | |
A2pr | 2,3-диаминопропионовая кислота | alle | аллоизолейцин | |
Apm | 2-аминопимелиновая кислота | Nle | норлейцин | |
A2pm | 2,6-диаминопимелиновая кислота | Nva | норвалин | |
Cit | цитруллин | Orn | орнитин | |
Cya | цистеиновая кислота | Sar | саркозин | |
Dbu | 2,4-диаминобутановая кислота | aThr | аллотреонин | |
Dpm | 2,6-диаминопимелиновая кислота | Thx | тироксин | |
Pen | пеницилламин |
[0026] Структура циклического пептида (I) по настоящему изобретению
Далее в настоящем описании будет подробно описан циклический пептид по настоящему изобретению.
Циклический пептид по настоящему изобретению представляет собой циклический пептид, представленный формулой (I).
RN-Xg-[Xi-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xj]k-Xh-RC (I)
[0027] В формуле (I), например, Xn означает, что n X связаны друг с другом. Другими словами, Xn означает -(X)n-. Xg, Xh, Xi, Xj, и Xm означает тоже самое что и Xn.
[0028] Циклическая часть, линейная часть, сшитая часть и антителосвязывающая часть
В отношении циклического пептида по настоящему изобретению в полипептидной цепи кольцевую часть, закрытую сшиванием, обозначают как циклическая часть, а часть, которая не входит в циклическую часть обозначают как линейная часть. Кроме того, в циклической части часть, формирующую сшитую структуру в молекуле циклического пептида по настоящему изобретению, обозначают как сшитая часть, и часть, в значительной степени определяющая свойства связывания антитела циклического пептида по настоящему изобретению, обозначают как антителосвязывающая часть.
В циклическом пептиде, представленном формулой (I), "Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb" является циклической частью, "Xg", "Xh", "Xi" и "Xj" являются линейными частями, "Xa" и "Xb" являются сшитыми частями, и "X1-X2-X3" представляет собой антителосвязывающую часть.
В формуле (1) в некоторых случаях [Xi-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xj] обозначают как повторяющуюся часть.
[0029] N-концевая группа
В формуле (I) RN представляет собой N-концевую группу.
Примеры N-концевой группы включают аминогруппу, и аминогруппа может претерпевать N-концевую модификацию, такую как N-ацетилирование, N-формилирование или N-ацилирование.
[0030] C-концевая группа
В формуле (I) RC представляет собой C-концевую группу.
Примеры C-концевой группы включают карбоксигруппу, и карбоксигруппа может претерпевать модификацию на C-конце, такую как амидирование.
[0031] X1, X2 и X3
В формуле (I) X1 представляет собой остаток L-лейцина, остаток L-изолейцина, остаток L-метионина, остаток L-лизина или остаток L-аргинина. X1 предпочтительно представляет собой остаток L-лейцина или остаток L-изолейцина и более предпочтительно остаток L-лейцина.
В формуле (I) X2 представляет собой остаток L-валина или остаток L-изолейцина и предпочтительно остаток L-валина.
В формуле (I) X3 представляет собой остаток L-триптофана.
[0032] Xa и Xb
В формуле (I) Xa и Xb являются такими, как объясняют в первом-четвертом вариантах осуществления, описанных ниже.
[0033] Первый вариант осуществления
В формуле (I) каждый из Xa и Xb независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-цистеина и D-цистеина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи, и они связаны друг с другом дисульфидной связью.
[0034] Type аминокислоты и аминокислотного остатка
Аминокислота, отличная от L-цистеина и D-цистеина, содержащая тиоловую группу в боковой цепи, конкретно не ограничена при условии, что она представляет собой аминокислоту, отличную от L-цистеина и D-цистеина, содержащую тиоловую группу в боковой цепи. Примеры аминокислоты включают аминокислоту, представленную следующей ниже формулой.
[0036] В указанной выше формуле n представляет собой целое число равное или больше 2. N предпочтительно представляет собой целое число, удовлетворяющее 2≤n≤4, более предпочтительно число, удовлетворяющее 2≤n≤3, и даже более предпочтительно 2.
Аминокислота, представленная указанной выше формулой, может представлять собой L-изомер или D-изомер и предпочтительно представляет собой L-изомер.
[0037] В частности, примеры аминокислоты, отличной от L-цистеина и D-цистеина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи, включают L-гомоцистеин, D-гомоцистеин, L-бисгомоцистеин, D-бисгомоцистеин и т.п., но аминокислота не является ограниченной ими.
Аминокислота, отличная от L-цистеина и D-цистеина, содержащая тиоловую группу в боковой цепи, предпочтительно представляет собой L-гомоцистеин или D-гомоцистеин и более предпочтительно L-гомоцистеин.
[0038] Примеры аминокислотных остатков, получаемых из аминокислоты, отличной от L-цистеина и D-цистеина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи, включают аминокислотный остаток, представленный следующей ниже формулой.
[0039]
[0040] В указанной выше формуле n представляет собой целое число равное или больше 2. N предпочтительно представляет собой число, удовлетворяющее 2≤n≤4, более предпочтительно число, удовлетворяющее 2≤n≤3, и даже более предпочтительно 2; и * представляет собой точку связывания.
Аминокислотный остаток, представленный указанной выше формулой, можно получать из L-аминокислоты или D-аминокислоты и предпочтительно получают из L-аминокислоты.
[0041] В частности, примеры аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, отличной от L-цистеина и D-цистеина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи, включают аминокислотные остатки, получаемые из L-гомоцистеина, D-гомоцистеина, L-бисгомоцистеина, D-бисгомоцистеина и т.п., но аминокислотный остаток не ограничен ими.
Аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-цистеина и D-цистеина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи, предпочтительно представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-гомоцистеина или D-гомоцистеина, и более предпочтительно аминокислотный остаток, получаемый из L-гомоцистеина.
[0042] Дисульфидная связь
В первом варианте осуществления циклического пептида по настоящему изобретению между Xa и Xb сшитая структура образуется посредством дисульфидной связи, образованной между дисульфидными группами боковых цепей. Таким образом, дисульфидная связь образована между тиоловой группой боковой цепи первого аминокислотного остатка, который получают из аминокислоты, отличной от L-цистеина и D-цистеина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи, и тиоловой группой второго аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, отличной от L-цистеина и D-цистеина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи.
[0043] Следующая ниже формула демонстрирует пример сшитой структуры сформированной в результате образования дисульфидной связи между тиоловыми группами боковой цепи двух аминокислотных остатков, получаемых из аминокислоты, отличной от L-цистеина и D-цистеина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи.
[0045] В указанной выше формуле m представляет собой целое число равное или больше 2, предпочтительно число, удовлетворяющее 2≤m≤4, более предпочтительно число, удовлетворяющее 2≤m≤3, и даже более предпочтительно 2; n представляет собой целое число равное или больше 2, предпочтительно число, удовлетворяющее 2≤n≤4, более предпочтительно число, удовлетворяющее 2≤n≤3, и даже более предпочтительно 2; в частности, предпочтительно m=n=2; и * представляет собой точку связывания.
[0046] Второй вариант осуществления
В формуле (I) один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-цистеина, D-цистеина, L-пеницилламина и D-пеницилламина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи, а другой представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи, и Xa и Xb связаны друг с другом посредством тиоэфирной связи.
[0047] Тип аминокислоты и аминокислотного остатка
Аминокислота, отличная от L-цистеина, D-цистеина, L-пеницилламина и D-пеницилламина, содержащая тиоловую группу в боковой цепи конкретно не ограничена при условии, что она представляет собой аминокислоту, отличную от L-цистеина, D-цистеина, L-пеницилламина и D-пеницилламина, содержащую тиоловую группу в боковой цепи. Примеры таких аминокислот включают аминокислоту, представленную следующей ниже формулой.
[0049] В указанной выше формуле n представляет собой целое число равное или больше 2, предпочтительно число, удовлетворяющее 2≤n≤4, более предпочтительно число, удовлетворяющее 2≤n≤3, и даже более предпочтительно 2.
Аминокислота, представленная указанной выше формулой, может представлять собой L-изомер или D-изомер, и предпочтительно представляет собой L-изомер.
[0050] В частности, примеры аминокислоты, отличной от L-цистеина, D-цистеина, L-пеницилламина и D-пеницилламина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи, включают L-гомоцистеин, D-гомоцистеин, L-бисгомоцистеин, D-бисгомоцистеин и т.п., но аминокислота не ограничена ими.
С точки зрения экономической эффективности аминокислота, отличная от L-цистеина, D-цистеина, L-пеницилламина и D-пеницилламина, содержащая тиоловую группу в боковой цепи, предпочтительно представляет собой L-гомоцистеин или D-гомоцистеин и более предпочтительно L-гомоцистеин.
[0051] Примеры аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, отличной от L-цистеина, D-цистеина, L-пеницилламина и D-пеницилламина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи, включают аминокислотный остаток, представленный следующей ниже формулой.
[0053] В указанной выше формуле n представляет собой целое число равное или больше 2, предпочтительно число, удовлетворяющее 2≤n≤4, более предпочтительно число, удовлетворяющее 2≤n≤3, и даже более предпочтительно 2; и * представляет собой точку связывания.
Аминокислотный остаток, представленный указанной выше формулой, можно получать из L-аминокислоты или D-аминокислота, и предпочтительно его получают из L-аминокислоты.
[0054] В частности, примеры аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, отличной от L-цистеина, D-цистеина, L-пеницилламина и D-пеницилламина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи, включают аминокислотные остатки, получаемые из L-гомоцистеина, D-гомоцистеина, L-бисгомоцистеина, D-бисгомоцистеина и т.п., но аминокислотный остаток не ограничен ими.
С точки зрения экономической эффективности аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-цистеина, D-цистеина, L-пеницилламина и D-пеницилламина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи, предпочтительно представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-гомоцистеина или D-гомоцистеина, и более предпочтительно аминокислотный остаток, получаемый из L-гомоцистеина.
[0055] Аминокислота, содержащая галоацетильную группу в боковой цепи, конкретно не ограничена при условии, что она представляет собой аминокислоту, содержащую галоацетильную группу в боковой цепи. Примеры такой аминокислоты включают аминокислоту, представленную следующей ниже формулой.
[0057] В указанной выше формуле m представляет собой целое число равное или больше 1, предпочтительно число, удовлетворяющее 1≤m≤4, более предпочтительно число, удовлетворяющее 3≤m≤4, и даже более предпочтительно 4; и X представляет собой атом галогена, предпочтительно представляет собой атом хлора или атом брома и более предпочтительно представляет собой атом хлора.
Аминокислота, представленная указанной выше формулой, может представлять собой L-изомер или D-изомер и предпочтительно представляет собой L-изомер.
[0058] В случае, когда n=1, указанная выше формула представляет собой N3-галоацетил-2,3-диаминопропионовая кислота[2-амино-3-[(2-галоацетил)амино]пропионовая кислота]; в случае, когда n=2, указанная выше формула представляет собой N4-галоацетил-2,4-диаминобутановая кислота[2-амино-4-[(2-галоацетил)амино]бутановой кислоты]; в случае, когда n=3, указанная выше формула представляет собой N-δ-галоацетилорнитин; и в случае, когда n=4, указанная выше формула представляет собой N-ε-галоацетиллизин.
В настоящем описании аминокислота, содержащая галоацетильную группу в боковой цепи, не ограничена ими.
[0059] Примеры аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи, включают аминокислотный остаток, представленный следующей ниже формулой.
[0061] В указанной выше формуле m представляет собой целое число равное или больше 1, предпочтительно число, удовлетворяющее 1≤m≤4, более предпочтительно число, удовлетворяющее 3≤m≤4, и даже более предпочтительно 4; X представляет собой атом галогена, предпочтительно представляет собой атом хлора или атом брома, и более предпочтительно представляет собой атом хлора; и * представляет собой точку связывания.
Аминокислотный остаток, представленный указанной выше формулой, можно получать из L-аминокислоты или D-аминокислоты, и предпочтительно его получают из L-аминокислоты.
[0062] В частности, примеры аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи, включают аминокислотные остатки, получаемые из (2S)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2R)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2S)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, (2R)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, N-δ-хлорацетил-L-орнитина, N-δ-хлорацетил-D-орнитина, N-ε-хлорацетил-L-лизина, N-ε-хлорацетил-D-лизина и т.п., но аминокислотный остаток не ограничен ими.
С точки зрения экономической эффективности аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи, предпочтительно представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из N-δ-хлорацетил-L-орнитина, N-δ-хлорацетил-D-орнитина, N-ε-хлорацетил-L-лизина или N-ε-хлорацетил-D-лизина, и более предпочтительно аминокислотный остаток, получаемый из N-ε-хлорацетил-D-лизина.
[0063] Тиоэфирная связь
Во втором варианте осуществления циклического пептида по настоящему изобретению между Xa и Xb сшитая структура образована тиоэфирной связью, образованной между тиоловой группой боковой цепи и галоацетильной группой боковой цепи. Таким образом, тиоэфирная связь образуется между тиоловой группой первого аминокислотного остатка, получаемый из аминокислоты, отличной от L-цистеина, D-цистеина, L-пеницилламина и D-пеницилламина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи, и галоацетильной группой второго аминокислотного остатка, который получают из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи.
[0064] Следующие ни же формулы демонстрируют примеры тиоэфирной связи, образованной между тиоловой группой боковой цепи аминокислотного остатка, который получают из аминокислоты, отличная от L-цистеина, D-цистеина, L-пеницилламина и D-пеницилламина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи, и галоацетильной группой боковой цепи аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи.
[0067] В указанной выше формуле m представляет собой целое число равное или больше 1, предпочтительно число, удовлетворяющее 1≤m≤4, более предпочтительно число, удовлетворяющее 3≤m≤4, и даже более предпочтительно 4; n представляет собой целое число равное или больше 2, предпочтительно число, удовлетворяющее 2≤n≤4, более предпочтительно число, удовлетворяющее 2≤n≤3, и даже более предпочтительно 2; особенно предпочтительно m=4 и n=2; и * представляет собой точку связывания.
[0068] Касательно Xa и Xb, Xa может представлять собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи, и Xb может представлять собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-цистеина, D-цистеина, L-пеницилламина и D-пеницилламина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи; или Xa может представлять собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-цистеина, D-цистеина, L-пеницилламина и D-пеницилламина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи, и Xb может представлять собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи.
[0069] Известно, что тиоэфирная связь является более стабильной связью, чем дисульфидная связь.
[0070] Третий вариант осуществления
В формуле (I) один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, а другой представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи, и Xa и Xb связаны друг с другом посредством тиоэфирной связи.
[0071] Тип аминокислоты и аминокислотного остатка
Аминокислота, содержащая галоацетильную группу в боковой цепи, конкретно не ограничена при условии, что она представляет собой аминокислоту, содержащую галоацетильную группу в боковой цепи. Примеры такой аминокислоты включают аминокислоту, представленную следующей ниже формулой.
[0072] Четвертый вариант осуществления
В формуле (I) один из Xa и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, а другой представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи, и Xa и Xb связаны друг с другом посредством тиоэфирной связи.
[0074] В указанной выше формуле m представляет собой целое число равное или больше 1, предпочтительно число, удовлетворяющее 1≤m≤4, более предпочтительно число, удовлетворяющее 3≤m≤4, и даже более предпочтительно 4; и X представляет собой атом галогена, предпочтительно представляет собой атом хлора или атом брома, и даже более предпочтительно представляет собой атом хлора.
Аминокислота, представленная указанной выше формулой, может представлять собой L-изомер или D-изомер, и предпочтительно представляет собой L-изомер.
[0075] В случае, когда n= 1, указанная выше формула представляет собой N3-галоацетил-2,3-диаминопропионовая кислота[2-амино-3-[(2-галоацетил)амино]пропионовую кислоту]; в случае, когда n=2, указанная выше формула представляет собой N4-галоацетил-2,4-диаминобутановая кислота[2-амино-4-[(2-галоацетил)амино]бутановую кислоту]; в случае, когда n=3, указанная выше формула представляет собой N-δ-галоацетилорнитин; и в случае, когда n=4, указанная выше формула представляет собой N-ε-галоацетиллизин.
В настоящем описании аминокислота, содержащая галоацетильную группу в боковой цепи, не ограничена ими.
[0076] Примеры аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи, включают аминокислотный остаток, представленный следующей ниже формулой.
[0078] В указанной выше формуле m представляет собой целое число равное или больше 1, предпочтительно число, удовлетворяющее 1≤m≤4, более предпочтительно число, удовлетворяющее 3≤m≤4, и даже более предпочтительно 4; X представляет собой атом галогена, более предпочтительно представляет собой атом хлора или атом брома, и даже более предпочтительно представляет собой атом хлора; и * представляет собой точку связывания.
Аминокислотный остаток, представленный указанной выше формулой, можно получать из L-аминокислоты или D-аминокислоты, и предпочтительно его получают из L-аминокислоты.
[0079] В частности, примеры аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи, включают аминокислотные остатки, получаемые из (2S)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2R)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2S)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, (2R)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, N-δ-хлорацетил-L-орнитина, N-δ-хлорацетил-D-орнитина, N-ε-хлорацетил-L-лизина, N-ε-хлорацетил-D-лизина и т.п., но аминокислотный остаток не ограничен ими.
С точки зрения экономической эффективности аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи, предпочтительно представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из N-δ-хлорацетил-L-орнитина, N-δ-хлорацетил-D-орнитина, N-ε-хлорацетил-L-лизина или N-ε-хлорацетил-D-лизина, и более предпочтительно аминокислотный остаток, получаемый из N-ε-хлорацетил-D-лизина.
[0080] Тиоэфирная связь
В третьем варианте осуществления циклического пептида по настоящему изобретению между Xa и Xb, сшитая структура образована тиоэфирной связью, образованной между тиоловой группой боковой цепи и галоацетильной группой боковой цепи. Таким образом, тиоэфирная связь образуется между тиоловой группой первого аминокислотного остатка, получаемого из L-цистеина или D-цистеина, и галоацетильной группой второго аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи.
[0081] Следующие ниже формулы демонстрируют примеры тиоэфирной связи, образованной между тиоловой группой боковой цепи аминокислотного остатка, получаемого из L-цистеина или D-цистеина, и галоацетильной группой боковой цепи аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи.
[0084] В указанной выше формуле m представляет собой целое число равное или больше 1, предпочтительно число, удовлетворяющее 1≤m≤4, более предпочтительно число, удовлетворяющее 3≤m≤4, и даже более предпочтительно 4; и * представляет собой точку связывания.
[0085] Касательно Xa и Xb, Xa может представлять собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи, и Xb может представлять собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина; или Xa может представлять собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, и Xb может представлять собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи.
[0086] Известно, что тиоэфирная связь является более стабильной связью, чем дисульфидная связь.
[0087] Тип аминокислоты и аминокислотного остатка
Аминокислота, содержащая галоацетильную группу в боковой цепи, конкретно не ограничена при условии, что она представляет собой аминокислоту, содержащую галоацетильную группу в боковой цепи. Примеры такой аминокислоты включают аминокислоту, представленную следующей ниже формулой.
[0089] В указанной выше формуле m представляет собой целое число равное или больше 1, предпочтительно число, удовлетворяющее 1≤m≤4, более предпочтительно число, удовлетворяющее 3≤m≤4, и даже более предпочтительно 4; и X представляет собой атом галогена, предпочтительно представляет собой атом хлора или атом брома, и более предпочтительно представляет собой атом хлора.
Аминокислота, представленная указанной выше формулой, может представлять собой L-изомер или D-изомер, и предпочтительно представляет собой L-изомер.
[0090] В случае, когда n= 1, указанная выше формула представляет собой N3-галоацетил-2,3-диаминопропионовая кислота[2-амино-3-[(2-галоацетил)амино]пропионовую кислоту]; в случае, когда n=2, указанная выше формула представляет собой N4-галоацетил-2,4-диаминобутановая кислота[2-амино-4-[(2-галоацетил)амино]бутановую кислоту]; в случае, когда n=3, указанная выше формула представляет собой N-δ-галоацетилорнитин; и в случае, когда n=4, указанная выше формула представляет собой N-ε-галоацетиллизин.
В настоящем описании аминокислота, содержащая галоацетильную группу в боковой цепи, не ограничена ими.
[0091] Примеры аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи, включают аминокислотный остаток, представленный следующей ниже формулой.
[0093] В указанной выше формуле m представляет собой целое число равное или больше 1, предпочтительно число, удовлетворяющее 1≤m≤4, более предпочтительно число, удовлетворяющее 3≤m≤4, и даже более предпочтительно 4; X представляет собой атом галогена, предпочтительно представляет собой атом хлора или атом брома, и более предпочтительно представляет собой атом хлора; и * представляет собой точку связывания.
Аминокислотный остаток, представленный указанной выше формулой, можно получать из L-аминокислоты или D-аминокислоты, и предпочтительно получают из L-аминокислоты.
[0094] В частности, примеры аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи, включают аминокислотные остатки, получаемые из (2S)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2R)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2S)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, (2R)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, N-δ-хлорацетил-L-орнитина, N-δ-хлорацетил-D-орнитина, N-ε-хлорацетил-L-лизина, N-ε-хлорацетил-D-лизина и т.п., но аминокислотный остаток не ограничен ими.
С точки зрения экономической эффективности аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи предпочтительно представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из N-δ-хлорацетил-L-орнитина, N-δ-хлорацетил-D-орнитина, N-ε-хлорацетил-L-лизина или N-ε-хлорацетил-D-лизина, и более предпочтительно аминокислотный остаток, получаемый из N-ε-хлорацетил-D-лизина.
[0095] Тиоэфирная связь
В четвертом варианте осуществления циклического пептида по настоящему изобретению между Xa и Xb сшитая структура образована тиоэфирной связью, образованной между тиоловой группой боковой цепи и галоацетильной группой боковой цепи. Таким образом, тиоэфирная связь образуется между тиоловой группой первого аминокислотного остатка, получаемого из L-пеницилламина или D-пеницилламина, и галоацетильной группы второго аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи.
[0096] Следующие ниже формулы демонстрируют примеры тиоэфирной связи, образованной между тиоловой группой боковой цепи аминокислотного остатка, получаемого из L-пеницилламина или D-пеницилламина, и галоацетильной группой боковой цепи аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи.
[0099] В указанной выше формуле m представляет собой целое число равное или больше 1, предпочтительно число, удовлетворяющее 1≤m≤4, более предпочтительно число, удовлетворяющее 3≤m≤4, и даже более предпочтительно 4; и * представляет собой точку связывания.
[0100] Касательно Xa и Xb, Xa может представлять собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи, и Xb может представлять собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина; или Xa может представлять собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, и Xb может представлять собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей галоацетильную группу в боковой цепи.
[0101] Известно, что тиоэфирная связь является более стабильной связью, чем дисульфидная связь.
[0102] Xg, Xh, Xi, Xj, Xm и Xn
В формуле (I) каждый из Xg, Xh, Xi, Xj, Xm и Xn представляет собой g последовательных X, h последовательных X, i последовательных X, j последовательных X, m последовательных X и n последовательных X.
[0103] В формуле (I) в случае, когда X представляет собой аминокислотный остаток, и t в настоящем описании представляет собой множество X, множество X может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов.
В формуле (I) X конкретно не ограничен при условии, что он представляет собой аминокислотный остаток. X предпочтительно представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, выбранной из группы, состоящей из аминокислот (за исключением B, Z и X), приведенных в таблице 1, и аминокислот, приведенных в таблице 2, и более предпочтительно аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, выбранной из группы, состоящей из аминокислот (за исключением B, Z и X), приведенных в таблице 1. В случае, когда t в настоящем описании представляет собой энантиомер или диастереомер этих аминокислот, X может представлять собой аминокислотный остаток, получаемый из энантиомера или диастереомера.
[0104] В формуле (I) каждый из g, h, i и j независимо представляет собой целое число равное или больше 0.
g предпочтительно удовлетворяет 0≤g≤20, более предпочтительно удовлетворяет 0≤g≤10 и даже более предпочтительно удовлетворяет 0≤g≤5.
h предпочтительно удовлетворяет 0≤h≤20, более предпочтительно удовлетворяет 0≤h≤10 и даже более предпочтительно удовлетворяет 0≤h≤5.
i предпочтительно удовлетворяет 0≤i≤20, более предпочтительно удовлетворяет 0≤i≤10 и даже более предпочтительно удовлетворяет 0≤i≤5.
j предпочтительно удовлетворяет 0≤j≤20, более предпочтительно удовлетворяет 0≤j≤10 и даже более предпочтительно удовлетворяет 0≤j≤5.
[0105] В формуле (I) m и n представляют собой целые числа, удовлетворяющие 0≤m≤9 и 0≤n≤9. m и n удовлетворяют 3≤m+n≤9, предпочтительно удовлетворяют 4≤m+n≤8 и более предпочтительно удовлетворяют 5≤m+n≤7.
[0106] Количество аминокислотных остатков в циклической части
В формуле (I) количество аминокислотных остатков [остатки (m+n+5)] в циклической части [Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb] составляет от 8 до 14, предпочтительно от 9 до 13 и более предпочтительно от 10 до 12.
В случае, когда количество аминокислотных остатков в циклической части находится в указанном выше диапазоне, внутримолекулярное напряжение циклического пептида не увеличивается очень сильно, и структура высокого порядка, такая как α-спираль, стабилизируется. Таким образом, свойства связывания антитела циклического пептида по настоящему изобретению становятся превосходными.
[0107] Количество повторяющихся единиц
k представляет собой число, удовлетворяющее k≥1. k предпочтительно удовлетворяет 1≤k≤3, более предпочтительно удовлетворяет 1≤k≤2 и даже более предпочтительно удовлетворяет k=1.
Несмотря на то, что количество повторяющихся единиц конкретно не ограничено, чем больше количество повторяющихся единиц, тем больше циклических частей можно ввести в циклический пептид. Таким образом, возможно улучшать свойства связывания антитела циклического пептида. Чем меньше количество повторяющихся единиц, тем большее общее количество аминокислотных остатков можно восстанавливать. Таким образом, возможно ингибировать антигенность циклического пептида. С точки зрения экономических затрат на синтез циклического пептида предпочтительно, чтобы количество аминокислотных остатков и количество повторяющихся единиц являлись небольшими.
[0108] В случае, когда k≥2, таким образом, в случае, когда циклический пептид, представленный формулой (I) содержит две или более повторяющихся единиц [Xi-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xj], каждый их X1, X2, X3, Xa, Xb, Xi, Xj, Xm и Xn в повторяющейся единице может являться одинаковым или различным в повторяющихся единицах.
[0109] Общее количество аминокислотных остатков в циклическом пептиде
Общее количество аминокислотных остатков в циклическом пептиде, представленном формулой (I), предпочтительно представляет собой от 8 до 50, более предпочтительно от 9 до 40, даже более предпочтительно от 10 до 30 и еще более предпочтительно от 10 до 20.
Таким образом, в формуле (I) g, h, i, j, m, n и k предпочтительно удовлетворяют 8≤g+h+(i+j+m+n+5)×k≤50, более предпочтительно удовлетворяют 9≤g+h+(i+j+m+n+5)×k≤40, даже более предпочтительно удовлетворяют 10≤g+h+(i+j+m+n+5)×k≤30, и еще более предпочтительно удовлетворяют 10≤g+h+(i+j+m+n+5)×k≤20.
Как правило, чем больше количество аминокислотных остатков, тем выше экономические затраты на производство. Таким образом, с точки зрения экономической эффективности предпочтительно, чтобы общее количество аминокислотных остатков являлось небольшим.
[0110] Молекулярная масса циклического пептида
Молекулярная масса циклического пептида, представленного формулой (I), конкретно не ограничена. Однако с точки зрения антигенности молекулярная масса циклического пептида по настоящему изобретению предпочтительно приблизительно равна или является меньше 5000, более предпочтительно приблизительно равна или является меньше 4000, даже более предпочтительно приблизительно равна или является меньше 3000, и наиболее предпочтительно приблизительно равна или является меньше 2000. "Приблизительно" означает, что молекулярная масса включает предел ±2%.
[0111] Исключение в третьем варианте осуществления
В третьем варианте осуществления настоящего изобретения X в формуле (I) представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-аргинина и D-аргинина, и в случае, когда присутствует множество X, множество X может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов.
В третьем варианте осуществления настоящего изобретения вследствие такого различия в некоторых случаях формулу (I) обозначают как формула (I').
[0112] Исключение в четвертом варианте осуществления
В четвертом варианте осуществления настоящего изобретения X в формуле (I) представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, и в случае, когда присутствует множество X, множество X может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов.
В четвертом варианте осуществления настоящего изобретения вследствие такого различия в некоторых случаях формулу (I) обозначают как формула (I').
[0113] Структура циклического пептида (IA) по настоящему изобретению
Циклический пептид по настоящему изобретению предпочтительно представляет собой циклический пептид, представленный формулой (IA).
RN-Xg-[Xp2-X4 r-Xp1-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xq1-X5 s -Xq2]k-Xh-RC (IA)
[0114] В формуле (IA) все RN, RC, X1, X2, X3, Xa, Xb, Xg, Xh, Xm, Xn, X, g, h, m, n и k имеют такие же определения как определения в формуле (I).
В формуле (IA) аналогично Xn в формуле (I) Xn означает, что n X являются связанными друг с другом. Тоже справедливо для Xm, Xp1, Xp2, Xq1 и Xq2.
В формуле (IA) каждый из X4 r и X5 s означает, что r X4 являются связанными друг с другом, и s X5 являются связанными друг с другом.
[0115] Циклическая часть, линейная часть, сшитая часть и антителосвязывающая часть
В циклическом пептиде, представленном формулой (IA), "Xg", "Xh", "Xp2-X4 r-Xp1" и "Xq1-X5 s -Xq2" являются линейными частями. Циклическая часть, сшитая часть и антителосвязывающая часть являются такими же ка части в циклическом пептиде, представленном формулой (I).
В формуле (IA) [Xp2-X4 r-Xp1-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xq1-X5 s -Xq2] представляет собой повторяющуюся единицу.
[0116] X4 r и X5 s
В формуле (IA) каждый из X4 r и X5 s означает r последовательных X4 и s последовательных X5.
[0117] В формуле (IA) каждый из X4 и X5 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи, или аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи.
В случае, когда t в настоящем описании представляет собой множество X4 или X5, множество X4 или X5 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов.
[0118] В формуле (IA) каждый из r и s независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤r≤5, 0≤s≤5 и 1≤Max (r, s)≤5. Каждый из r и s предпочтительно независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤r≤4, 0≤s≤4 и 1≤Max (r, s)≤4, и более предпочтительно каждый независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤r≤3, 0≤s≤3 и 1≤Max (r, s)≤3.
Max (r, s) представляет собой большее число из двух чисел, представленных r и s в случае, когда r≠s, и представляет собой r или s в случае, когда r=s.
[0119] Аминокислота, содержащая карбоксигруппу в боковой цепи
Примеры аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи, включают L-аспарагиновую кислоту, D-аспарагиновую кислоту, L-глутаминовую кислоту, D-глутаминовую кислоту, L-гомоглутаминовую кислоту, D-гомоглутаминовую кислоту и т.п.
[0120] Аминокислота, содержащая гидроксигруппу в боковой цепи
Примеры аминокислоты, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи, включают L-серин, D-серин, L-гомосерин, D-гомосерин, L-тирозин, D-тирозин, L-треонин, D-треонин, L-аллотреонин, D-аллотреонин и т.п.
[0121] Предпочтительные аминокислотные остатки
Каждый из X4 и X5 предпочтительно независимо представляет собой аминокислотный остаток, выбранный из группы, состоящей из остатка L-серина, остатка D-серина, остатка L-гомосерина, остатка D-гомосерина, остатка L-аспарагиновой кислоты, остатка D-аспарагиновой кислоты, остатка L-глутаминовой кислоты, остатка D-глутаминовой кислоты, остатка L-гомоглутаминовая кислота, остатка D-гомоглутаминовой кислоты, остатка L-тирозина, остатка D-тирозина, остатка L-гомотирозина, остатка D-гомотирозина, остатка L-треонина, остатка D-треонина, остатка L-аллотреонина и остатка D-аллотреонина, и более предпочтительно каждый независимо представляет собой аминокислотный остаток, выбранный из группы, состоящей из остатка L-аспарагиновой кислоты, остатка D-аспарагиновой кислоты, остатка L-треонина и остатка D-треонина. Даже более предпочтительно X4 представляет собой остаток L-аспарагиновой кислоты, и X5 представляет собой остаток L-треонин.
[0122] Полагают, что в случае, когда каждый из X4 и X5 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи, или аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи, вследствие водородной связи и/или электростатического взаимодействия, взаимодействие между антителосвязывающей части циклической части и антителом может становиться сильнее, и, таким образом, свойства связывания антитела улучшаются.
[0123] Xp1, Xp2, Xq1 и Xq2
В формуле (IA) каждый из Xp1, Xp2, Xq1 и Xq2 представляет собой p1 последовательных X, p2 последовательных X, q1 последовательных X и q2 последовательных X.
В формуле (IA) каждый из p1, p2, q1 и q2 независимо представляет собой целое число, равное или больше 0.
p1 предпочтительно удовлетворяет 0≤p1≤20, более предпочтительно удовлетворяет 0≤p1≤10, даже более предпочтительно удовлетворяет 0≤p1≤5 и еще более предпочтительно удовлетворяет 0≤p1≤2.
p2 предпочтительно удовлетворяет 0≤p2≤20, более предпочтительно удовлетворяет 0≤p2≤10, даже более предпочтительно удовлетворяет 0≤p2≤5 и еще более предпочтительно удовлетворяет 0≤p2≤2.
q1 предпочтительно удовлетворяет 0≤q1≤20, более предпочтительно удовлетворяет 0≤q1≤10, даже более предпочтительно удовлетворяет 0≤q1≤5 и еще более предпочтительно удовлетворяет 0≤q1≤2.
q2 предпочтительно удовлетворяет 0≤q2≤20, более предпочтительно удовлетворяет 0≤q2≤10, даже более предпочтительно удовлетворяет 0≤q2≤5 и еще более предпочтительно удовлетворяет 0≤q2≤2.
[0124] Количество аминокислотных остатков в циклической части
В формуле (IA) количество аминокислотных остатков [остатки (m+n+5)] в циклической части [Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb] составляет от 8 до 14, предпочтительно от 9 до 13 и более предпочтительно от 10 до 12, аналогично формуле (I).
В случае, когда количество аминокислотных остатков в циклической части находится в указанном выше диапазоне, внутримолекулярное напряжение циклического пептида значительно не увеличивается, и структура высшего порядка, такая как α-спираль, стабилизируется. Таким образом, свойства связывания антитела циклического пептида по настоящему изобретению становятся превосходными.
[0125] Количество повторяющихся единиц
Таким образом, в случае, когда k≥2, в случае, когда циклический пептид, представленный формулой (IA), содержит две или более повторяющихся единиц [Xp2-X4 r-Xp1-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xq1-X5 s -Xq2], каждый из X1, X2, X3, Xa, Xb, X4 r, X5 s, Xm, Xn, Xp2, Xp1, Xq1 и Xq2 в повторяющейся единице может являться одинаковым или различным в повторяющихся единицах.
[0126] Общее количество аминокислотных остатков в циклическом пептиде
Общее количество аминокислотных остатков в циклическом пептиде, представленном формулой (IA), предпочтительно представляет собой от 8 до 50, более предпочтительно от 9 до 40, даже более предпочтительно от 10 до 30 и еще более предпочтительно от 10 до 20.
Таким образом, в формуле (IA) g, h, m, n, p1, p2, q1, q2, r, s, и k предпочтительно удовлетворяют 8≤g+h+(m+n+p1+p2+q1+q2+r+s+5)×k≤50, более предпочтительно удовлетворяют 9≤g+h+(m+n+p1+p2+q1+q2+r+s+5)×k≤40, даже более предпочтительно удовлетворяют 10≤g+h+(m+n+p1+p2+q1+q2+r+s+5)×k≤30 и еще более предпочтительно удовлетворяют 10≤g+h+(m+n+p1+p2+q1+q2+r+s+5)×k≤20.
Как правило, чем больше количество аминокислотных остатков, тем выше стоимость производства. Таким образом, с точки зрения экономической эффективности предпочтительно, чтобы общее количество аминокислотных остатков являлось небольшим.
[0127] Исключение в третьем варианте осуществления
В третьем варианте осуществления настоящего изобретения X в формуле (IA) представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-аргинина и D-аргинина, и в случае, когда присутствует множество X, множество X может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; каждый из X4 и X5 в формуле (IA) независимо представляет собой "аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи" или "аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, "за исключением L-серина, D-серина, L-гомосерина и D-гомосерина", содержащей гидроксигруппу в боковой цепи", и в случае, когда присутствует множество X4 или X5, множество X4 или X5 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов.
В третьем варианте осуществления настоящего изобретения вследствие этих различий в некоторых случаях формулу (IA) обозначают как формула(I'A).
[0128] Исключение в четвертом варианте осуществления
В четвертом варианте осуществления настоящего изобретения X в формуле (IA) представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, и в случае, когда присутствует множество X, множество X может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; каждый из X4 и X5 в формуле (IA) независимо представляет собой "аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи" или "аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, "за исключением L-серина и D-серина", содержащий гидроксигруппу в боковой цепи", и в случае, когда присутствует множество X4 или X5, множество X4 или X5 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов.
В четвертом варианте осуществления настоящего изобретения вследствие этих различий в некоторых случаях формулу (IA) обозначают как формула(I'A).
[0129] Структура циклического пептида (IB) по настоящему изобретению
Циклический пептид по настоящему изобретению предпочтительно представляет собой циклический пептид, представленный формулой (IB).
RN-Xv1-X6 t-Xv2-[Xi-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xj]k-Xw2-X7 u-Xw1-RC (IB)
[0130] В формуле (IB) все RN, RC, X1, X2, X3, Xa, Xb, Xi, Xj, Xm, Xn, X, i, j, m, n и k имеют такие же определения как определения в формуле (I).
В формуле (IB) аналогично Xn в формуле (I) Xn означает, что n X являются связанными друг с другом. Тоже справедливо для Xm, Xv1, Xv2, Xw1 и Xw2.
В формуле (IB) каждый из X6 t и X7 u означает, что t X6 являются связанными друг с другом, и u X7 являются связанными друг с другом.
[0131] Циклическая часть, линейная часть, сшитая часть и антителосвязывающая часть
В циклическом пептиде, представленном формулой (IB), "Xi", "Xj", "Xv1-X6 t-Xv2" и "Xw2-X7 u-Xw1" являются линейными частями. Циклическая часть, сшитая часть и антителосвязывающая часть являются такими же как части в циклическом пептиде, представленном формулой (I).
В формуле (IB) [Xi-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xj] представляет собой повторяющуюся единицу, аналогично формуле (I).
[0132] X6 t и X7 u
В формуле (IB) каждый из X6 t и X7 u представляет собой t последовательных X6 и u последовательных X7.
[0133] В формуле (IB) каждый из X6 и X7 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи.
В случае, когда t в настоящем описании представляет собой множество X6 или X7, множество X6 или X7 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов.
[0134] В формуле (IB) каждый из t и u независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤t≤5, 0≤u≤5 и 1≤Max (t,u)≤5, предпочтительно каждый независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤t≤4, 0≤u≤4 и 1≤Max (t,u)≤4, и более предпочтительно каждый независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤t≤3, 0≤u≤3 и 1≤Max (t,u)≤3.
Max (t,u) представляет собой большее число из двух чисел представленных t и u в случае, когда t≠u и представляет собой t или u в случае, когда t=u.
[0135] Иммобилизирующая функциональная группа
Указанная выше "иммобилизирующая функциональная группа" представляет собой функциональную группу, которая может образовывать ковалентную связь в результате взаимодействия с функциональной группой на подложке (описанном ниже).
Примеры иммобилизирующей функциональной группы включают аминогруппу, карбоксигруппу, гидроксигруппу, тиоловую группу, альдегидную группу (формильную группу), карбамоильную группу, азидную группу, алкинильную группу и т.п.
Примеры комбинации иммобилизирующей функциональной группы, которую содержит циклический пептид по настоящему изобретению, и функциональной группы на подложке включают аминогруппу и карбоксигруппу (реакция образования амидной связи), аминогруппу и альдегидную группу (реакция восстановительного аминирования), аминогруппу и эпоксигруппу, гидроксигруппу и эпоксигруппу, карбоксигруппу и гидроксигруппу (реакция образования сложноэфирной связи), тиоловую группу и тиоловую группу (дисульфидная связь), тиоловую группу и эпоксигруппу, азидную группу и алкинильную группу (реакция циклоприсоединения Хьюсгена) и т.п.
В случае, когда иммобилизирующая функциональная группа, которую содержит циклический пептид по настоящему изобретению, и функциональная группа на подложке образуют ковалентную связь, взаимодействуя друг с другом, циклический пептид по настоящему изобретению является иммобилизованным на подложке. По меньшей мере определенные иммобилизирующие функциональные группы, которые содержит циклический пептид по настоящему изобретению, могут образовывать ковалентную связь, взаимодействуя с функциональной группой на подложке, и необязательно, что все иммобилизирующие функциональные группы взаимодействуют с функциональной группой на подложке.
[0136] В указанной выше аминокислоте, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, иммобилизирующая функциональная группа предпочтительно представляет собой по меньшей мере один тип функциональной группы, выбранной из группы, состоящей из аминогруппы, тиоловой группы и альдегидной группы, и более предпочтительно по меньшей мере один тип функциональной группы, выбранной из группы, состоящей из аминогруппы и тиоловой группы.
[0137] Аминокислота, содержащая иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи
Аминокислота, содержащая иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, предпочтительно представляет собой по меньшей мере один тип аминокислоты, выбранной из группы, состоящей из L-лизина, D-лизина, L-цистеина, D-цистеина, L-гомоцистеина и D-гомоцистеина.
[0138] В случае, когда в качестве иммобилизирующей функциональной группы используют аминогруппу, аминогруппу можно связывать с карбоксигруппой на подложке посредством амидной связи, и циклический пептид по настоящему изобретению можно легко иммобилизовать в качестве аффинного лиганда.
[0139] В случае, когда в качестве иммобилизирующей функциональной группы используют тиоловую группу, тиоловую группу можно связывать с эпоксигруппой на подложке посредством ковалентной связи, и циклический пептид по настоящему изобретению можно легко иммобилизовать в качестве аффинного лиганда.
[0140] Примеры аминокислоты, содержащей аминогруппу в боковой цепи, включают L-лизин, D-лизин и т.п., и примеры аминокислоты, содержащей тиоловую группу в боковой цепи, включают L-цистеин и D-цистеин. Вследствие т ого, что эти аминокислоты являются относительно недорогими, затраты на производство циклического пептида по настоящему изобретению можно снижать. Таким образом, с точки зрения экономической эффективности эти аминокислоты являются предпочтительными.
[0141] Подложка
В настоящем изобретении "подложка" относится к субстрату, на котором можно иммобилизовать циклический пептид по настоящему изобретению. Подложка содержит функциональную группу, которая может образовывать ковалентную связь, взаимодействуя с иммобилизирующей функциональной группой, которую содержит циклический пептид по настоящему изобретению. Функциональную группу соответствующим образом выбирают в зависимости от иммобилизирующей функциональной группы.
[0142] Вещества, из которых состоит подложка
Примеры веществ, из которых состоит подложка, включают полисахариды, таких как агароза, декстран, крахмал, целлюлоза, пуллулан, хитин, хитозан, триацетат целлюлозы и диацетат целлюлоз, их производные, полимеры на основе винила, такие как полиакриламид, полиметакриламид, полиакрилат, полиметакрилат, полиалкилвиниловый эфир и поливиниловый спирт, и т.п. Эти вещества могут образовывать сшитую структуру, вследствие этого можно обеспечивать механическую прочность. Предпочтительно подложка сформирована из одного типа вещества или двух или более типов веществ из перечисленных.
Подложка предпочтительно является пористой, более предпочтительно пористой пленкой или пористой частицей, и даже более предпочтительно пористой частицей.
[0143] Xv1, Xv2, Xw1 и Xw2
В формуле (IB) каждый из Xv1, Xv2, Xw1 и Xw2 представляет собой v1 последовательных X, v2 последовательных X, w1 последовательных X и w2 последовательных X.
В формуле (IB) каждый из v1, v2, w1 и w2 независимо представляет собой целое число равное или больше 0.
v1 предпочтительно удовлетворяет 0≤v1≤20, более предпочтительно удовлетворяет 0≤v1≤10, даже более предпочтительно удовлетворяет 0≤v1≤5 и еще более предпочтительно удовлетворяет 0≤v1≤2.
v2 предпочтительно удовлетворяет 0≤v2≤20, более предпочтительно удовлетворяет 0≤v2≤10, даже более предпочтительно удовлетворяет 0≤v2≤5 и еще более предпочтительно удовлетворяет 0≤v2≤2.
w1 предпочтительно удовлетворяет 0≤w1≤20, более предпочтительно удовлетворяет 0≤w1≤10, даже более предпочтительно удовлетворяет 0≤w1≤5 и еще более предпочтительно удовлетворяет 0≤w1≤2.
w2 предпочтительно удовлетворяет 0≤w2≤20, более предпочтительно удовлетворяет 0≤w2≤10, даже более предпочтительно удовлетворяет 0≤w2≤5 и еще более предпочтительно удовлетворяет 0≤w2≤2.
[0144] Количество аминокислотных остатков в циклической части
В формуле (IB) количество аминокислотных остатков [остатки (m+n+5)] в циклической части [Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb] составляет от 8 до 14, предпочтительно от 9 до 13 и более предпочтительно от 10 до 12 аналогично формуле (I).
В случае, когда количество аминокислотных остатков в циклической части находится в указанном выше диапазоне, внутримолекулярное напряжение циклического пептида значительно не увеличивается, и структура высшего порядка, такая как α-спираль, стабилизируется. Таким образом, свойства связывания антитела циклического пептида по настоящему изобретению становятся превосходными.
[0145] Количество повторяющихся единиц
В случае, когда k≥2, таким образом, в случае, когда циклический пептид, представленный формулой (IB) содержит две или более повторяющиеся единицы [Xi-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xj], каждый из X1, X2, X3, Xa, Xb, Xm, Xn, Xi и Xj в повторяющейся единице может являться одинаковым или различным в повторяющихся единицах.
[0146] Общее количество аминокислотных остатков в циклическом пептиде
Общее количество аминокислотных остатков в циклическом пептиде, представленном формулой (IB), предпочтительно составляет от 8 до 50, более предпочтительно от 9 до 40, даже более предпочтительно от 10 до 30 и еще более предпочтительно от 10 до 20.
Таким образом, в формуле (IB) i, j, m, n, t, u, v1, v2, w1, w2 и k предпочтительно удовлетворяют 8≤(i+j+m+n+5)×k+t+u+v1+v2+w1+w2≤50, более предпочтительно удовлетворяют 9≤(i+j+m+n+5)×k+t+u+v1+v2+w1+w2≤40, даже более предпочтительно удовлетворяют 10≤(i+j+m+n+5)×k+t+u+v1+v2+w1+w2≤30 и еще более предпочтительно удовлетворяют 10≤(i+j+m+n+5)×k+t+u+v1+v2+w1+w2≤20.
Как правило, чем больше количество аминокислотных остатков, тем выше стоимость производства. Таким образом, с точки зрения экономической эффективности, предпочтительно, чтобы общее количество аминокислотных остатков являлось небольшим.
[0147] Исключение в третьем варианте осуществления
В третьем варианте осуществления настоящего изобретения X в формуле (IB) представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-аргинина и D-аргинина, в случае, когда присутствует множество X, множество X может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; и каждый из X6 и X7 в формуле (IB) независимо представляет собой "аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, "отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-аргинина и D-аргинина", содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи", и в случае, когда присутствует множество X6 и X7, множество X6 или X7 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов.
В третьем варианте осуществления настоящего изобретения вследствие этих различий в некоторых случаях формулу (IB) обозначают как формула (I'B).
[0148] Исключение в четвертом варианте осуществления
В четвертом варианте осуществления настоящего изобретения X в формуле (IB) представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, и в случае, когда присутствует множество X, множество X может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; и каждый из X6 и X7 в формуле (IB) независимо представляет собой "аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, "отличной от L-серина и D-серина", содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X6 или X7, множество X6 или X7 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов.
В четвертом варианте осуществления настоящего изобретения вследствие этих различий, в некоторых случаях формулу (IB) обозначают как формула (I'B).
[0149] Структура циклического пептида (IC) по настоящему изобретению
Циклический пептид по настоящему изобретению более предпочтительно представляет собой циклический пептид, представленный формулой (IC).
RN-Xv1-X6 t-Xv2-[Xp2-X4 r-Xp1-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xq1-X5 s -Xq2]k-Xw2-X7 u-Xw1-RC (IC)
[0150] В формуле (IC) все RN, RC, X1, X2, X3, Xa, Xb, Xm, Xn, X, m, n и k имеют такие же определения как определения в формуле (I) all of X4, X5, p1, p2, q1, q2, r и s имеют такие же определения как определения в формуле (IA), и все X6, X7, t, u, v1, v2, w1 и w2 имеют такие же определения как определения в формуле (IB).
В формуле (IC) аналогично Xn в формуле (I) Xn означает, что n X являются связанными друг с другом. Тоже справедливо для Xm, Xp1, Xp2, Xq1, Xq2, Xv1, Xv2, Xw1 и Xw2.
В формуле (IC) каждый из X4 r, X5 s, X6 t и X7 u означает, что r X4 являются связанными друг с другом, s X5 являются связанными друг с другом, t X6 являются связанными друг с другом и u X7 являются связанными друг с другом.
[0151] Циклическая часть, линейная часть, сшитая часть и антителосвязывающая часть
В циклическом пептиде, представленном формулой (IC), "Xv1-X6 t-Xv2", "Xw2-X7 u-Xw1", "Xp2-X4 r-Xp1" и "Xq1-X5 s -Xq2" являются линейными частями. Циклическая часть, сшитая часть и антителосвязывающая часть являются такими же, как в циклическом пептиде, представленном формулой (I).
В формуле (IC) [Xp2-X4 r-Xp1-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xq1-X5 s -Xq2] представляет собой повторяющуюся единицу аналогично формуле (IA).
[0152] Количество аминокислотных остатков в циклической части
В формуле (IC) количество аминокислотных остатков [остатки (m+n+5)] в циклической части [Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb] составляет от 8 до 14, предпочтительно от 9 до 13 и даже более предпочтительно от 10 до 12, аналогично формуле (I).
В случае, когда количество аминокислотных остатков в циклической части находится в указанном выше диапазоне, внутримолекулярное напряжение циклического пептида значительно не увеличивается, и структура высшего порядка, такая как α-спираль, стабилизируется. Таким образом, свойства связывания антитела циклического пептида по настоящему изобретению становятся превосходными.
[0153] Количество повторяющихся единиц
В случае, когда k≥2, таким образом, в случае, когда циклический пептид, представленный формулой (IC) содержит две или более повторяющиеся единицы [Xp2-X4 r-Xp1-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xn-Xb-Xq1-X5 s -Xq2], каждый из X1, X2, X3, Xa, Xb, X4 r, X5 s, Xm, Xn, Xp2, Xp1, Xq1 и Xq2 в повторяющейся единице может являться одинаковым или различным в повторяющихся единицах.
[0154] Общее количество аминокислотных остатков в циклическом пептиде
Общее количество аминокислотных остатков в циклическом пептиде, представленном формулой (IC), предпочтительно составляет от 8 до 50, более предпочтительно от 9 до 40, даже более предпочтительно от 10 до 30 и еще более предпочтительно от 10 до 20.
Таким образом, в формуле (IC) m, n, p1, p2, q1, q2, r, s, t, u, v1, v2, w1, w2 и k предпочтительно удовлетворяют 8≤(m+n+p1+p2+q1+q2+r+s+5)×k+t+u+v1+v2+w1+w2≤50, более предпочтительно удовлетворяют 9≤(m+n+p1+p2+q1+q2+r+s+5)×k+t+u+v1+v2+w1+w2≤40, даже более предпочтительно удовлетворяют 10≤(m+n+p1+p2+q1+q2+r+s+5)×k+t+u+v1+v2+w1+w2≤30, и еще более предпочтительно удовлетворяют 10≤(m+n+p1+p2+q1+q2+r+s+5)×k+t+u+v1+v2+w1+w2≤20.
Как правило, чем больше количество аминокислотных остатков, тем выше стоимость производства. Таким образом, с точки зрения экономической эффективности, предпочтительно, чтобы общее количество аминокислотных остатков являлось небольшим.
[0155] Исключение в третьем варианте осуществления
В третьем варианте осуществления настоящего изобретения X в формуле (IC) представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-аргинина и D-аргинина, и в случае, когда присутствует множество X, множество X может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; каждый из X4 и X5 в формуле (IC) независимо представляет собой "аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи" или "аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, "отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина и D-гомосерина", содержащей гидроксигруппу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X4 или X5, множество X4 или X5 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; и каждый из X6 и X7 в формуле (IC) независимо представляет собой "аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, "отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-аргинина и D-аргинина", содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи", и в случае, когда присутствует множество X6 или X7, множество X6 или X7 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов.
В третьем варианте осуществления настоящего изобретения вследствие этих различий в некоторых случаях формулу (IC) обозначают как формула (I'C).
[0156] Исключение в четвертом варианте осуществления
В четвертом варианте осуществления настоящего изобретения X в формуле (IC) представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, и в случае, когда присутствует множество X, множество X может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; каждый из X4 и X5 в формуле (IC) независимо представляет собой "аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи" или "аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, "отличной от L-серина и D-серина", содержащей гидроксигруппу в боковой цепи", и в случае, когда присутствует множество X4 или X5, множество X4 или X5 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; и каждый из X6 и X7 в формуле (IC) независимо представляет собой "аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, "отличной от L-серина и D-серина", содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи", и в случае, когда присутствует множество X6 или X7, множество X6 или X7 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов.
В четвертом варианте осуществления настоящего изобретения вследствие этих различий в некоторых случаях формулу (IC) обозначают как формула (I'C).
[0157] Предпочтительная неполная аминокислотная последовательность
Неполная аминокислотная последовательность Xm-X1-X2-X3-Xn в формуле (I) (IA), (IB) или (IC) и аминокислотная последовательность (SEQ ID NO:1), представленная формулой (1), предпочтительно обладают общей гомологией последовательности равной или более 70%, более предпочтительно обладают общей гомологией последовательности равной или более 75%, даже более предпочтительно обладают общей гомологией последовательности равной или более 85% и еще более предпочтительно обладают общей гомологией последовательности равной или более 90%.
A-Y-H-L-G-E-L-V-W (1)
В формуле (1) A представляет собой остаток L-аланина; Y представляет собой остаток L-тирозина; H представляет собой остаток L-гистидина; L представляет собой остаток L-лейцина; G представляет собой остаток глицина; E представляет собой остаток L-глутаминовой кислоты; V представляет собой остаток L-валина, и W представляет собой остаток L-триптофана.
[0158] Неполная аминокислотная последовательность Xm-X1-X2-X3-Xn в формуле (I) (IA), (IB) или (IC) и аминокислотная последовательность (SEQ ID NO:2), представленная формулой (2), предпочтительно обладают общей гомологией последовательности равной или более 70%, более предпочтительно обладают общей гомологией последовательности равной или более 75%, даже более предпочтительно обладают общей гомологией последовательности равной или более 85% и еще более предпочтительно обладают общей гомологией последовательности равной или более 90%.
A-Y-H-R-G-E-L-V-W (2)
В формуле (2) A представляет собой остаток L-аланина; Y представляет собой остаток L-тирозина; H представляет собой остаток L-гистидина; R представляет собой остаток L-аргинина; G представляет собой остаток глицина; E представляет собой остаток L-глутаминовой кислоты; L представляет собой остаток L-лейцина; V представляет собой остаток L-валина, и W представляет собой остаток L-триптофана.
[0159] Гомологичность последовательности двух аминокислотных последовательностей определяют так, как указано ниже.
(i) Проведение выравниваний двух аминокислотных последовательностей
Присваивая балл +1 для совпадений, балл -1 для несоответствий и балл -1 для пропусков, проводят выравнивание, таким образом, чтобы балл выравнивания был максимальным.
(ii) Вычисление гомологии последовательности
На основании получаемого выравнивания рассчитывают гомологию последовательности по следующему уравнению.
Гомология последовательности [%]=(число совпадающих положений/общее число положений)×100 [%]
Общее число положений является длиной выравнивания и число совпадающих положений представляет собой число положений, по которым типы аминокислот совпадают.
Совпадают или не совпадают типы аминокислотных остатков, определяют, исходя из того является или не является структура белковой цепи аминокислоты (боковой цепи аминокислоты), и которых получают аминокислотные остатки, одинаковой. Структуры боковых цепей аминокислот с энантиомерным соотношением не совпадают друг с другом.
(iii) Пример расчета гомологии последовательности
Например, допустим, что присутствуют аминокислотные последовательности, приведенные ниже.
Последовательность A AYHRGELVW
Последовательность B AWHLGELVW
В случае, когда выравнивание проводят в описанных выше условиях, получают следующий ниже результат. В настоящем описании участки, где типы аминокислот (остатков) являются одинаковыми в последовательностях A и B, отмечают символьной строкой гомологии "⏐", таким образом, участки можно легко распознавать. Кроме того, "-" является пропуском.
Баллы такого представляют собой такие совпадения(+1)×7+несоответствия(-1)×1+пропуски(-1)×1=5.
В этом примере общее число положений составляет 9, число совпадающих положений составляет 7. Таким образом, гомология последовательности, рассчитанная указанному выше уравнению, составляет 7/9×100=77,8%.
[0160] Предпочтительное количество повторяющихся единиц
В настоящем изобретении,k в формуле (I)-(IC) предпочтительно представляет собой 1.
[0161] В случае, когда циклический пептид содержит одну часть, содержащую циклическую часть, общая длина циклического пептида может уменьшаться, и, таким образом, циклический пептид легко синтезировать. Кроме того, посредством реакции Хьюсгена во время циклизации возможно предотвращать образование поперечной сшивки в нежелательном участке.
[0162] Структура циклического пептида (II) по настоящему изобретению
Циклический пептид по настоящему изобретению is конкретно особенно предпочтительно представляет собой циклический пептид, представленный формулой (II).
RN-Xv0-X6 t0-Xe0-X4 r0-Xp0-Xa-A-Y-H-X8-G-E-L-V-W-Xb-Xq0-X5 s0-Xf0-X7 u0-Xw0-RC (II)
В формуле (II) Xa, Xb, RN и RC имеют такие же определения как определения в формуле (I).
[0163] Циклическая часть, линейная часть, сшитая часть и антителосвязывающая часть
В циклическом пептиде, представленном формулой (II), "Xa-A-Y-H-X8-G-E-L-V-W-Xb" представляет собой циклическую часть, "Xv0-X6 t0-Xe0-X4 r0-Xp0-" и "Xq0-X5 s0-Xf0-X7 u0-Xw0" являются линейными частями, "Xa" и "Xb" представляют собой сшитые части, и "L-V-W" является антителосвязывающей частью.
[0164] X4 r0 и X5 s0
В формуле (II) каждый из X4 r0 и X5 s0 представляет собой r0 последовательных X4 и s0 последовательных X5.
В формуле (II) X4 и X5 имеют такие же определения как определения в формуле (IA).
В формуле (II) каждый из r0 и s0 независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤r0≤5 и 0≤s0≤5.
r0 предпочтительно удовлетворяет 0≤r0≤3 и более предпочтительно удовлетворяет 0≤r0≤2.
s0 предпочтительно удовлетворяет 0≤s0≤3 и более предпочтительно удовлетворяет 0≤s0≤2.
[0165] X6 t0 и X7 u0
В формуле (II) каждый из X6 t0 и X7 u0 представляет собой t0 последовательных X6 и u0 последовательных X7.
В формуле (II) X6 и X7 имеют такие же определения как определения в формуле (IB).
В формуле (II) каждый из t0 и u0 независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤t0≤5 и 0≤u0≤5.
t0 предпочтительно удовлетворяет 0≤t0≤3 и более предпочтительно удовлетворяет 0≤t0≤2.
u0 предпочтительно удовлетворяет 0≤u0≤3 и более предпочтительно удовлетворяет 0≤u0≤2.
[0166] Xe0, Xf0, Xp0, Xq0, Xv0 и Xw0
Каждый из Xe0, Xf0, Xp0, Xq0, Xv0 и Xw0 представляет собой e0 последовательных X, f0 последовательных X, p0 последовательных X, q0 последовательных X, v0 последовательных X и w0 последовательных X.
X имеют такое же определение как в формуле (I).
Каждый из e0 и f0 независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤e0≤10 и 0≤f0≤10.
e0 предпочтительно удовлетворяет 0≤e0≤5, более предпочтительно удовлетворяет 0≤e0≤3 и даже более предпочтительно удовлетворяет 0≤e0≤2.
f0 предпочтительно удовлетворяет 0≤f0≤5, более предпочтительно удовлетворяет 0≤f0≤3 и даже более предпочтительно удовлетворяет 0≤f0≤2.
Каждый из p0 и q0 независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤p0≤5 и 0≤q0≤5.
p0 предпочтительно удовлетворяет 0≤p0≤3 и более предпочтительно удовлетворяет 0≤p0≤2.
q0 предпочтительно удовлетворяет 0 q0≤3 и более предпочтительно удовлетворяет 0≤q0≤2.
Каждый из v0 и w0 независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤v0≤5 и 3≤w0≤5.
v0 предпочтительно удовлетворяет 0≤v0≤3 и более предпочтительно удовлетворяет 0≤v0≤2.
w0 предпочтительно удовлетворяет 0 w0≤3 и более предпочтительно удовлетворяет 0≤w0≤2.
[0167] X8 представляет собой остаток L-лейцина, остаток D-лейцина, остаток L-аргинина или остаток D-аргинина.
[0168] В формуле (II) A представляет собой остаток L-аланина или остаток D-аланина; Y представляет собой остаток L-тирозина или остаток D-тирозина; H представляет собой остаток L-гистидина или остаток D-гистидина; G представляет собой остаток глицина; E представляет собой остаток L-глутаминовой кислоты или остаток D-глутаминовой кислоты; L представляет собой остаток L-лейцина; V представляет собой остаток L-валина, и W представляет собой остаток L-триптофана.
[0169] Общее количество аминокислотных остатков в циклическом пептиде
В формуле (II) общее количество аминокислотных остатков в циклическом пептиде составляет от 11 до 50, предпочтительно от 11 до 40, более предпочтительно от 11 до 30 и даже более предпочтительно от 11 до 20.
Таким образом, в формуле (II) e0, f0, p0, q0, r0, s0, t0, u0, v0 и w0 удовлетворяют 0≤e0+f0+p0+q0+r0+s0+t0+u0+v0+w0≤39, предпочтительно удовлетворяют 0≤e0+f0+p0+q0+r0+s0+t0+u0+v0+w0≤29, более предпочтительно удовлетворяют 0≤e0+f0+p0+q0+r0+s0+t0+u0+v0+w0≤19 и даже более предпочтительно удовлетворяют 0≤e0+f0+p0+q0+r0+s0+t0+u0+v0+w0≤9.
[0170] Свойства связывания антитела
Циклический пептид по настоящему изобретению обладает прекрасными свойствами связывания антитела. Свойства связывания антитела относятся к активности связывания в отношении антител и/или производных антитела. Чем выше активность связывания, больше антител адсорбируется на циклическом пептиде в случае, когда циклический пептид используют в качестве аффинного лиганда для аффинной хроматографии для очистки антител, и, таким образом, большое количество антител можно очищать за один раз. Антитело относится к иммуноглобулину или аналогу, фрагменту или конъюгату антитела. Аналог относится к природному белку или конъюгату белка или к искусственно полученному белку или конъюгату белка, который сохраняет структуру или функцию иммуноглобулина по меньшей мере в его части. Фрагмент относится к белку, который получают ферментативной обработкой или конструируют генетической инженерией, и который содержит неполную структуру иммуноглобулина. Конъюгат относится к белку, получаемому слиянием функциональной части белков, обладающих биологической активностью, таких как различные цитокины или рецепторы цитокинов, с полным иммуноглобулином или частью иммуноглобулина посредством генетической инженерии. Антитело предпочтительно представляет собой моноклональное антитело или конъюгат, содержащий Fc-область иммуноглобулина, и более предпочтительно моноклональное антитело. В настоящем изобретении иммуноглобулин может являться иммуноглобулином любого из пяти классов (изотипов), включая иммуноглобулин G (IgG), иммуноглобулин M (IgM), иммуноглобулин A (IgA), иммуноглобулин D (IgD) и иммуноглобулин E (IgE). Среди них предпочтительным является IgG или IgM, и наиболее предпочтительным является IgG.
[0171] Устойчивость к щелочи
Циклический пептид по настоящему изобретению обладает прекрасной временной стабильностью или устойчивостью к химическому воздействию. В частности, циклический пептид по настоящему изобретению обладает прекрасной устойчивостью щелочи. Вследствие того, что циклический пептид обладает прекрасной устойчивостью к химическому воздействию, например, в случае, когда подложка для аффинной хроматографии, в которой циклический пептид по настоящему изобретению используют в качестве аффинного лиганда, используют для очистки антитела, даже если подложка повторно промывают химическим препаратом, в частности, щелочью, свойства связывания антитела сохраняются. Таким образом, можно дополнительно снижать стоимость очистки антитела.
[0172] Исключение в третьем варианте осуществления
В третьем варианте осуществления настоящего изобретения X в формуле (II) представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-аргинина и D-аргинина, и в случае, когда присутствует множество X, множество X может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; каждый из X4 и X5 в формуле (II) независимо представляет собой "аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи", или "аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, "отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина и D-гомосерина", содержащей гидроксигруппу в боковой цепи", и в случае, когда присутствует множество X4 или X5, множество X4 или X5 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; каждый из X6 и X7 в формуле (II) независимо представляет собой "аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, "отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-аргинина и D-аргинина", содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X6 или X7, множество X6 или X7 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; и X8 в формуле (II) представляет собой остаток L-лейцина или остаток D-лейцина.
В третьем варианте осуществления настоящего изобретения вследствие этих различий в некоторых случаях формулу (II) обозначают как формула (II').
[0173] Исключение в четвертом варианте осуществления
В четвертом варианте осуществления настоящего изобретения X в формуле (II) представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, в случае, когда присутствует множество X, множество X может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; каждый из X4 и X5 в формуле (II) независимо представляет собой "аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи", или "аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, "отличной от L-серина и D-серина", содержащей гидроксигруппу в боковой цепи", и в случае, когда присутствует множество X4 или X5, множество X4 или X5 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов; и каждый из X6 и X7 в формуле (II) независимо представляет собой "аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, "отличной от L-серина и D-серина", содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи", и в случае, когда присутствует множество X6 или X7, множество X6 или X7 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов.
В четвертом варианте осуществления настоящего изобретения вследствие этих различий, формула (II) обозначают как формула (II') в некоторых случаях.
[0174] Способ синтеза циклического пептида
Способ синтеза циклического пептида по настоящему изобретению конкретно не ограничен. Например, циклический пептид можно синтезировать способом пептидного синтеза на основе синтетической органической химии или способом пептидного синтеза на основе генетической инженерии.
В качестве способа пептидного синтеза на основе синтетической органической химии можно использовать любой способ жидкофазного синтеза и способ твердофазного синтеза. В качестве способа синтеза полипептида по настоящему изобретению предпочтительным является способ твердофазного синтеза, в котором используют устройство пептидного синтеза, т.к. этот способ является общепринятым.
Способ пептидного синтеза на основе генетической инженерии представляет собой способ синтеза пептида путем введения гена в клетку. В качестве клетки используют бактерии, клетки нематоды, клетки насекомых, клетки млекопитающих, клетки животных и т.п.
Например, циклический пептид можно синтезировать путем введения неприродный аминокислоты в клетку с помощью способа на основании кодона из 4 оснований. Кроме того, путем синтеза линейного пептида и индукции реакцией сшивания функциональной группы в боковой цепи аминокислотного остатка, вводимого в циклическую часть, циклический пептид можно синтезировать.
В случае, когда должна образовываться дисульфидная связь, например, в результате взаимодействия тиоловых групп боковых цепей двух аминокислотных остатков, которые получают из аминокислоты, содержащей тиоловую группу в боковой цепи, в восстановительных условиях может образовываться дисульфидная связь. Конкретно, например, путем образования дисульфидной связи между тиоловыми группами боковой цепи двух остатки L-гомоцистеина, линейный полипептид можно циклизовать.
В случае, когда необходимым является образование тиоэфирной связи, например, в результате взаимодействия тиоловой группы аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты содержащей тиоловую группу в боковой цепи, с хлорацетильной группой боковой цепи аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, содержащей хлорацетильную группу в боковой цепи, тиоэфирная связь может образовываться. Конкретно, например, путем образования тиоэфирной связи между тиоловой группой остатка L-гомоцистеина и хлорацетильной группой боковой цепи остатка N-ε-хлорацетил-L-лизина, линейный полипептид циклизоваться.
Вместо аминокислоты, содержащей галоацетильную группу, такую как хлорацетильная группа в боковой цепи, можно использовать аминокислоту, содержащую галоалканоильную группу, такую как хлорпропиониловая группа, которая содержит больше метиленовых единиц по сравнению с галоацетильной группой, в боковой цепи. Однако предпочтительно использовать аминокислоту, содержащую галоацетильную группу в боковой цепи, т.к. чем меньше количество метиленовых единиц, тем выше эффективность циклизации. Например, из галопропионилой группы (-C(=O)-(CH2)2-X; X представляет собой атом галогена, содержащей две метиленовые единицы), и ацетильной группы (-C(=O)-CH2-X; X представляет собой атом галогена, содержащей одну метиленовую единицу), ацетильная группа является предпочтительной вследствие того, что она обладает большей эффективностью циклизации.
[0175] Использование циклического пептида по настоящему изобретению
Циклический пептид по настоящему изобретению можно использовать в качестве связывающего антитела лиганда, линкера для мечения антител, линкера для конъюгата антитела и лекарственного средства, носителя лекарственного средства (линкера для фармацевтических препаратов) и т.п., однако использование циклического пептида по настоящему изобретению не ограничено указанным выше.
[0176] Связывающий антитело лиганд и подложка для аффинной хроматографии
Циклический пептид по настоящему изобретению можно использовать в качестве связывающего антитела лиганда в области техники аффинной хроматографии.
Примеры применений циклического пептида по настоящему изобретению, используемого в качестве связывающего антитела лиганда, включают адсорбирующий антитело или производное антитела материал, в котором циклический пептид по настоящему изобретению иммобилизован на нерастворимой в воде подложке и подложке для аффинной хроматографии.
[0177] "Нерастворимая в воде подложка" относится к подложке, которая является по существу нерастворимой в воде. Примеры такой подложки включают полисахариды, такие как кристаллическая целлюлоза, сшитая целлюлоза, сшитая агароза, сшитый декстран и сшитый пуллулан, органические подложки, такие как полимер на основе акрилата и полимер на основе стирола, неорганические подложки, такие как стеклянные гранулы и силикагель, композитные подложки, такие как композитная подложка на основе органическое вещество-органическое вещество и композитная подложка на основе органическое вещество-неорганическое вещество, получаемые объединением указанных выше подложек и т.п. С точки зрения устойчивости к щелочи в качестве нерастворимой в воде подложки полисахариды или полимер на основе акрилата является наиболее предпочтительным, и полисахариды, такие как агароза или целлюлоза, являются наиболее предпочтительными. Примеры коммерческих продуктов, которые можно использовать в качестве нерастворимой в воде подложки, включают гель на основе пористой целлюлозы, такой как Cellufine GCL2000 (выпускаемый JNC Corporation) (CELLUFINE является зарегистрированным товарным знаком) и Cellfine MAX (выпускаемый JNC Corporation), Sephacryl S-1000 SF (выпускаемый GE Healthcare), получаемый сшиванием аллилдекстрана с метиленбисакриламидом посредством ковалентной связи (SEPHACRYL является зарегистрированным товарным знаком), подложки на основе акрилата, такие как TOYOPEARL (выпускаемый Tosoh Corporation) (TOYOPEARL является зарегистрированным товарным знаком), TOYOPEARL AF-Carboxy-650 (выпускаемый Tosoh Corporation) и TOYOPEARL GigaCap CM-650 (выпускаемый Tosoh Corporation), сшитая подложка на основе агарозы, такой как Sepharose CL4B (выпускаемый GE Healthcare) (SEPHAROSE является зарегистрированным товарным знаком), полиметилакриламид, активированная эпоксигруппой, такой как Eupergit C250l (выпускаемый Sigma-Aldrich Co., LLC.) (EUPERGIT является зарегистрированным товарным знаком) и т.п. В настоящем описании нерастворимая в воде подложка в настоящем изобретении не ограничена подложками или активированными подложками, описанными выше. С учетом цели использования исходного адсорбирующего материала и пути использования исходного абсорбирующего вещества, предпочтительно, чтобы нерастворимая в воде подложка, используемая в настоящем изобретении, имела большую площадь поверхности и являлась пористой подложкой с рядом пор подходящего размера. Форма подложки конкретно не ограничена. Подложка может быть любой из гранулоподобной подложки, волокнистой подложки, пленкообразной подложки и полой волокнистой подложки, и возможно выбирать любую форму.
[0178] Способ иммобилизации циклического пептида по настоящему изобретению на нерастворимой в воде подложке конкретно не ограничен. Например, как правило, можно применять способ, который применяют в случае, когда белок или полипептид иммобилизуют на подложке.
Например, циклический пептид можно иммобилизовать способом активации подложки посредством взаимодействия подложки с бромистым цианом, эпихлоргидрином, диглицидиловым простым эфиром, тозилхлоридом, трезилхлоридом, гидразином и т.п. или введения реакционноспособной функциональной группы на поверхность подложки и иммобилизации подложки посредством взаимодействия подложки с соединением, иммобилизованным как лиганд, или способом, вызывающим конденсацию в результате добавления конденсирующего реагента, такого как карбодиимид, или реагента, содержащего множество функциональных групп в молекуле, такого как глицеральдегид, с системой, содержащей подложку и соединение, иммобилизованное в качестве лиганда, и сшивания продукта конденсации.
[0179] В настоящем изобретении "лиганд" относится к молекуле, которая обладает определенной степенью аффинности к конкретному веществу и связывается с веществом. Конкретное вещество конкретно не ограничено, и предпочтительно представляет собой антитело или производное антитела. Участок связывания, в котором лиганд связывается с антителом или производным антитела, конкретно не ограничен. С точки зрения разнообразия, участок связывания предпочтительно представляет собой константную область антитела или производного антитела. Константная область конкретно не ограничена, и предпочтительно представляет собой область кристаллизующегося (Fc) фрагмента, константные области легкой цепи (CL-области) или константные области тяжелой цепи (CH-области). В настоящем изобретении лиганд, который может связываться с антителом или производным антитела, в некоторых случаях обозначают как "связывающий антитело лиганд".
[0180] В момент времени иммобилизации лиганда на подложке предпочтительно растворят (диспергировать) лиганд в водном растворителе (водной диспергирующей среде) или в органическом растворителе (органической диспергирующей среде). Водный растворитель (водная диспергирующая среда) конкретно не ограничен, и его примеры включают буферный раствор 4-(2-гидроксиэтил)-1-пиперазинэтансульфоновой кислоты (HEPES), буферный раствор уксусной кислоты, буферный раствор фосфорной кислоты, буферный раствор лимонной кислоты, буферный раствор трис-соляной кислоты и т.п. Органический растворитель (органическая диспергирующая среда) конкретно не ограничен. Органический растворитель особенно предпочтительно представляет собой органический полярный растворитель, такой как диметилсульфоксид (DMSO), N,N-диметилформамид (DMF) или спирт, и его примеры включают метанол, этанол, изопропиловый спирт (IPA), 2,2,2-трифторэтанол (TFE), 1,1,1,3,3,3-гексафтор-2-пропанол (HFIP) и т.п.
Условия pH в момент времени иммобилизации лиганд конкретно не ограничен, и можно применять любую из кислой, нейтральной и щелочных условий. Например, условие pH можно соответствующим образом подбирать в зависимости от используемого растворителя (диспергирующая среда).
Например, в случае, когда условия pH необходимо делать щелочными, можно добавлять основание, такое как диазабициклоундецен (DBU), к диметилсульфоксиду (DMSO) или спирту.
[0181] В случае, когда указанный выше адсорбирующий материал используют в качестве наполнителя для аффинной хроматографии, плотность связывающих антитело лигандов конкретно не ограничена. Однако плотность предпочтительно составляет от 0,1 до 1,000 ммоль/1 л наполнителя, более предпочтительно от 0,1 до 100 ммоль/1 л наполнителя, и даже более предпочтительно от 0,5 до 20 ммоль/1 л наполнителя. В случае, когда плотность находится в указанном выше диапазоне, количество используемого связывающего антитело лиганда и характеристики очистки антитела являются хорошо уравновешенными, и можно эффективно очищать антитела при низких показателях стоимости.
[0182] Линкер для мечения антител и меченое антитело
В области техники иммунологического анализа циклический пептид по настоящему изобретению можно использовать в качестве линкера для мечения антител.
Примеры применений циклического пептида по настоящему изобретению, используемого в качестве линкера для мечения антител, включают меченое антитело, которое включает антитело, метящее соединение и циклический пептид по настоящему изобретению, и где антитело и метящее соединение связаны друг с другом посредством циклического пептида по настоящему изобретению.
Иммунологический анализ представляет собой способ анализа детекции или количественного определения следового вещества с использованием иммунного ответа (реакции антиген-антитело), и характеризуется высокой специфичностью и высокой чувствительностью.
В иммунологическом анализе для детекции антитела (первичного антитела), связанного со следовым веществом (антигеном), способ прямого мечения первичного антитела, способ мечения антитела (вторичного антитела), связанного с первичным антителом и т.п. Циклический пептид по настоящему изобретению можно использовать в качестве линкера для обеспечения связывания метящего вещества с первичным антителом или в качестве линкера для обеспечения связывания метящего вещества со вторичным антителом. Циклический пептид по настоящему изобретению обладает свойствами связывания антитела (свойства связывания иммуноглобулина G (IgG)). Таким образом, меченый циклический пептид по настоящему изобретению также можно использовать вместо меченого вторичного антитела.
Существует различные метки. Система, в которой используют радиоактивный изотоп в качестве метки, называется радиоиммунологическим анализом (RIA), система, в которой используют фермент, такой как пероксидаза, в качестве метки, называется ферментативным иммунологическим анализом (EIA), система, в которой используют хемилюминесцентное вещество, такое как люминол, в качестве метки, называется хемилюминесцентным иммунологическим анализом (CLIA), и система, в которой флуоресцентное вещество (флуоресцентный краситель), такое как флуоресцеинизотиоцианат (FITC), используют в качестве метящего вещества, называется флуоресцентным иммунологическим анализом (FIA). Циклический пептид по настоящему изобретению можно использовать в качестве линкера для мечения антител в любой из систем.
Для улучшения чувствительности детекции иммунологического анализа к одной молекуле антитела необходимо присоединить несколько меток. С линкером для мечения антител предшествующего уровня техники, в случае, когда несколько линкеров связываются с антителом, ухудшается активность связывания антитела. Таким образом, специфичность и чувствительность, которые являются преимуществом иммунологического анализа, вероятно будут ослаблены. В противоположность этому, в соответствии с циклическим пептидом по настоящему изобретению даже в случае, когда несколько циклических пептидов связываются с антителом, структурную целостность антитела может сохраняться, и активность связывания антитела не снижается. Таким образом, даже в случае, когда несколько циклических пептидов связываются с антителом, можно улучшать чувствительность детекции без ухудшения специфичности и чувствительности, которые являются преимуществом иммунологического анализа. Кроме того, вследствие того, что циклический пептид связывается с антителом в результате взаимодействия антиген-антитело, можно проводить отделение циклического пептида после мечения, что было трудно проводить в предшествующем уровне техники, и, таким образом, можно проводить обратимое мечение.
[0183] Линкер для конъюгатов антител c лекарственными средствами и конъюгата антитела и лекарственного средства
В области техники конъюгатов антител c лекарственными средствами циклический пептид по настоящему изобретению можно использовать в качестве линкера для конъюгатов антител c лекарственными средствами.
Примеры применений циклического пептида по настоящему изобретению, используемого в качестве линкера для конъюгатов антител c лекарственными средствами, включают конъюгат антитела и лекарственного средства, который содержит антитело, лекарственное средство и циклический пептид по настоящему изобретению, и в котором антитело связывается с лекарственным средством через циклический пептид по настоящему изобретению.
Конъюгат антитела c лекарственным средством (ADC) также называют другим названием "заряженное антитело". ADC представляет собой лекарственное средство, получаемое путем связывания антитела, распознающего клетку, с лекарственным средством (низкомолекулярным лекарственным средством), которое является основным активным компонентом, с использованием подходящего линкера. Механизм действия конъюгата антитела и лекарственного средства приблизительно является таким, как указано ниже.
(1) Участок антитела конъюгата антитела и лекарственного средства связывается с молекулой-мишенью на поверхности клетки-мишени.
(2) Конъюгат антитела c лекарственным средством проникает в клетку.
(3) Линкер конъюгата антитела и лекарственного средства отщепляется в клетке.
(4) Лекарственное средство (низкомолекулярное лекарственное средство) проявляет свою эффективность в клетке.
С использованием конъюгата антитела и лекарственного средства, вследствие того, что эффективность проявляется только в клетке, экспрессирующей молекулу, которая направленно воздействует на антитело, можно ингибировать системные побочные эффекты и обеспечивать проявление эффективность в основном в клетке-мишени. Таким образом, конъюгат антитела и лекарственного средства является более эффективным и вызывает меньше побочных эффектов по сравнению с простыми лекарственными средствами. Например, средство против злокачественных опухолей, разрабатываемое для атаки на злокачественные клетки, в которой активно происходит клеточное деление, а также атаковать клетки, в которых клеточное деление происходит активно, как в злокачественных клетках, но сохраняется их функция, в частности, клетки, ответственные за иммунитет, клетки желудочно-кишечного тракта, клетки волосяных фолликул и т.п. Таким образом, в качестве побочных эффектов, в некоторых случаях наблюдают симптомы, такие как восприимчивость к инфекционным заболеваниям, диарея и потеря волос. Однако с использованием конъюгата антитела и лекарственного средства, средство против злокачественных опухолей можно селективно для направленного воздействия на злокачественные клетки, и, таким образом, можно ингибировать побочные эффекты, возникающие в случае, когда средство против злокачественных опухолей атакует клетки, отличные от клеток-мишеней.
[0184] Линкер для конъюгатов антитела c лекарственными средствами является необходимым для связывания участка антитела конъюгатов антител c лекарственными средствами с участком лекарственного средства, должен являться стабильным в крови и отщеплять лекарственное средство от антитела в клетке, таким образом, что высвобождается лекарственное средство. Кроме того, линкер для конъюгатов антител c лекарственными средствами также не должен нарушать активность связывания антитела. Для улучшения эффективности доставки лекарственного средства ряд лекарственных средств необходимо прикреплять к одной молекуле антитела. Однако с использованием линкера для конъюгатов антитела c лекарственными средствами предшествующего уровня техники, в случае, когда ряд линкеров связывается с антителом, активность связывания антитела ухудшается. В результате, селективность, которая является преимуществом конъюгата антитела и лекарственного средства, ухудшается, и лекарственное средство, вероятно, доставляется в клетки-мишени с низкой эффективностью. Однако с циклическим пептидом по настоящему изобретению, даже в случае, когда несколько циклических пептидов связывается с антителом, структурная целостность антитела может сохраняться, и активность связывания антитела не уменьшается. Таким образом, даже в случае, когда несколько циклических пептидов связывается с антителом, селективность, которая является преимуществом конъюгата антитела и лекарственного средства, не ухудшается, и лекарственное средство можно доставлять в клетки-мишени с улучшенной эффективностью. Кроме того, вследствие того, что временная стабильность циклического пептида по настоящему изобретению является выше, чем временная стабильность циклического пептида предшествующего уровня техники, можно улучшать стабильность циклического пептида в крови. Кроме того, модификацией части боковой цепи дисульфидной связи, которая является циклической частью, свойства высвобождения лекарственного средства в клетке можно регулировать.
[[0185] Лекарственное средство может представлять собой инкапсулированное в липосому лекарственное средство, инкапсулированное в полимерную мицеллу лекарственное средство или полиэтиленгликолированное (пегилированное) лекарственное средство.
Путем инкапсулирования в липосому, инкапсулирования в полимерную мицеллу или PEG-гилирования лекарственного средства, во многих случаях, может улучшать стабильность in vivo активных компонентов, фармакокинетику, включая профиль миграции ткани, внутриклеточную фармакокинетику и т.п.
[0186] Носитель лекарственного средства и фармацевтический препарат
Циклический пептид по настоящему изобретению можно использовать в качестве лекарственное средство носитель в системах доставки лекарственных средств.
Примеры применений циклического пептида по настоящему изобретению, используемого в качестве носителя лекарственного средства, включают фармацевтический препарат, который содержит лекарственное средство и циклический пептид по настоящему изобретению, и в котором лекарственное средство и циклический пептид по настоящему изобретению являются непосредственно или опосредованно связанными друг с другом.
В случае, когда циклический пептид по настоящему изобретению связывается с IgG, присутствующему в биологическом организме, можно получать такие же эффекты, как эффекты, вызываемые указанным выше конъюгатом антитела и лекарственного средства. Лекарственное средство может связываться с циклическим пептидом в том качестве как оно есть или связываться с циклическим пептидом в качестве лекарственного средства после того, как подвергнется инкапсуляции в липосому, образованию мицелл с использованием полимера или полиэтиленгликолированию (пэгилированию). Кроме того, лекарственное средство может связываться с циклическим пептидом через полисахариды, такие как декстран или гидрофильный полимер.
[0187] В качестве способа связывания лекарственного средства с циклическим пептидом по настоящему изобретению можно рассматривать использование дисульфидной связи между аминокислотными остатками в сшитой части.
В частности, это является способом восстановления дисульфидной связи (-S-S-) вследствие того, что расщепляют (-S-S--) и добавляют два иона к соединению посредством сшивания.
В качестве такого способа известен, например, ThioBridge (торговое наименование).
Примеры
[0188] Далее в настоящем описании настоящее изобретение будет более конкретно описано на основании примеров, но настоящее изобретение не ограничено примерами.
[0189] Пример 1
(1) Синтез циклического пептида
Циклический пептид (SEQ ID NO:3; далее в настоящем описании в некоторых случаях этот циклический пептид обозначают как "циклический пептид 1"), представленный формулой (3), синтезировали с использованием полностью автоматического устройства пептидного синтеза (PSSM-8, выпускаемый Shimadzu Corporation).
DXaAYHRGELVWXbTKK (3)
Xa представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из N-ε-хлорацетил-L-лизина, и Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-гомоцистеина. Между Xa и Xb тиоэфирная связь образуется в результате взаимодействия хлорацетильноы группы боковой цепи N-ε-хлорацетил-L-лизина с тиоловой группой L-гомоцистеина.
[0190] (2) Иммобилизация лиганда
Коммерчески доступный сенсорный чип CM5 (типа введения карбоксиметилдекстрана, выпускаемый GE Healthcare) устанавливали в Biacore 3000 (Biacore является зарегистрированным товарным знаком) в качестве устройства поверхностнго плазмонного резонанса, производимого GE Healthcare, буферный раствор 4-(2-гидроксиэтил)-1-пиперазинэтансульфоновой кислоты (HEPES) (20 мМ HEPES-HCl, 150 мМ NaCl, pH 7,4) для поверхностного плазмонного резонанса (SPR) стабилизировали при скорости потока 10 мл/мин, и добавляли к нему 70 мл 0,2 M смешанного с водой раствора 1-(3-диметиламинопропил)-3-этилкарбодиимида (EDC) и 0,04 M N-Гидроксисукцинимида (NHS). Затем, наносили 100 мл раствора образца циклического пептида 1, который разбавляли буферным раствором HEPES при 0,2 г/л и фильтровали через политетрафторэтилен (PTFE) (выпускаемый Advantec MFS, Inc.) с диаметром 0,20 мм, на сенсорный чип, затем проводили блокирующую обработку с использованием раствора этаноламина, и промывали сенсорный чип водным раствором гидроксида натрия, таким образом, проводя иммобилизацию. Подобным образом, добавляли 70 мл смешанного с водой раствора 0,2 M EDC и 0,04 M NHS к тому же сенсорному чипу без иммобилизирующего образца в другой поточный канал, а затем проводили блокирующую обработку и обработку промыванием. Далее в настоящем описании получаемый иммобилизованный сенсорный будет обозначен как "иммобилизованный сенсорный чип A".
[0191] (3) Оценка активности связывания
При 25°C добавляли 3000 нМ иммуноглобулина человека G (антитела IgG) в течение 10 минут к иммобилизованному сенсорному чипу A, получаемому на этапе (1), описанном выше. Сразу после добавления измеряли количество связывания антитела и на основании разницы количества связывания антитела между поточным каналом, в котором циклический пептид был иммобилизован, и поточным каналом, в котором циклический пептид не был иммобилизован, и количества иммобилизованного циклического пептида рассчитывали активность циклического пептида. Кроме того, принимая активность циклического пептида 5 в сравнительном примере 1 за 1, рассчитывали относительную активность связывания по отношению к антителу IgG человека.
Стандарты оценки относительной активности связывания
Относительная активность связывания являлась выше на 2000% активности связывания циклического пептида 5. ⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅ S
Относительная активность связывания являлась выше на 800% активности связывания циклического пептида 5. ⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅ A
Относительная активность связывания являлась выше на 400% и была равна или ниже на 800% активности связывания циклического пептида 5. ⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅ B
Относительная активность связывания являлась выше на 200% и была равна или ниже на 400% активности связывания циклического пептида 5. ⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅ C
Относительная активность связывания являлась выше на 100% и была равна или ниже на 200% активности связывания циклического пептида 5. ⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅ D
Относительная активность связывания была равна или ниже на 100% активности связывания циклического пептида 5. ⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅ E
Профили A, B и C демонстрируют, что иммобилизация приводит к достаточному улучшающему действию, и профили D и E демонстрируют, что достаточная активность не проявляется. Профиль S демонстрирует, что циклический пептид приводит к особенно превосходному улучшающему действию среди циклических пептидов, относящихся к профилю A, и такой циклический пептид описывают как "A (S)".
В случае, когда используют циклический пептид, проявляющий достаточную активность связывания, циклический пептид может специфически связываться с антителами, антитела более эффективно очищают, и можно уменьшать затраты на очистку антител.
[0192] (4) Иммобилизация лиганда
1 мл активированной HiTrap NHS HP Columns (колонки для связывания для иммобилизации лиганда, выпускаемый GE Healthcare) (HITRAP является зарегистрированным товарным знаком) взаимодействовал с 1 мл 10 мг/мл раствор циклического пептида, который получали растворением циклического пептида 1 в буфера для иммобилизации (200 мМ NaHCO3, 500 мМ NaCl, pH 8,3), в течение 1 часа при 25°C. Продукт реакции блокировали водным раствором этаноламина и промывали, таким образом, получая иммобилизованную подложку с циклическим пептидом 1. Далее в настоящем описании получаемую иммобилизованную подложку обозначают как "иммобилизованная подложка A".
[0193] (5) Оценка устойчивости к химическому воздействию
Иммобилизованную подложку A, получаемую на этапе (4), описанном выше, присоединяли к хроматографической системе AKTA avant 25 (выпускаемой Healthcare) (AKTAAVANT является зарегистрированным товарным знаком), и измеряли способность связывания антитела. Колонки уравновешивали с использованием уравновешивающего раствора (20 мМ буфера фосфорной кислоты, 150 мМ NaCl, pH 7,4), а затем добавляли 15 мл раствора антитела IgG человека, концентрацию которого доводили так, чтобы она составляла 5 мг/мл, с использованием стандартного буфера (20 мМ буфера фосфорной кислоты, 150 мМ NaCl, pH 7,4) при скорости потока 0,21 мл/мин. Затем отмывали колонки 5 мл раствора для промывки после внесения образца (20 мМ буфер фосфорной кислоты, 150 мМ NaCl, pH 7,4), прогоняя его при той же скорости потока, а затем промывали 5 мл раствора для промывания перед элюированием образца (20 мМ буфер фосфорной кислоты, 1 M NaCl, pH 7,4) при той же скорости потока. Затем 5 мл элюирующего раствора (100 мМ буфер лимонной кислоты, pH 3,2) прогоняли при той же скорости потока. Затем прогоняли 5 мл раствора для безразборной мойки (CIP) (0,1 M гидроксида натрия) при той же скорости потока, а затем прогоняли 5 мл уравновешивающего раствора (20 мМ буфер фосфорной кислоты, 150 мМ NaCl, pH 7,4) при той же скорости потока. На этот раз с использованием пика элюирирования иммуноглобулина G (IgG), получаемого посредством мониторинга оптической плотности при 280 нм, измеряли количество антител, связанных с подложкой, до тех пор, пока 10% исходного раствора антитела не вытекали из подложки, как способность связывания антитела. Затем иммобилизованную подложку A наполняли 0,2 M водным раствором NaOH в течение 6 часов при 25°C и оставляли уравновешиваться, аналогичным образом измеряли способность связывать антитело подложки и рассчитывали на основании количества связывания антитела до обработки щелочью и после нее.
Стандарты оценки скорости связывания в количестве связывания
Скорость изменения количества связывания являлась выше на 90% ⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅- A
Скорость изменения количества связывания являлась выше на 80% и была равна или ниже на 90% ⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅ B
Скорость изменения количества связывания являлась выше на 70% и была равна или ниже на 80% ⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅ C
Скорость изменения количества связывания являлась выше на 50% и была равна или ниже на 70% ⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅ D
Скорость изменения количества связывания была равна или ниже на 50% ⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅ E
Профили A, B и C демонстрируют, что устойчивость к химическому воздействию является достаточной, и профили D и E демонстрируют, что достаточная устойчивость к химическому воздействию не проявляется. В случае, когда используют циклический пептид, обладающий достаточной устойчивостью к химическому воздействию, циклический пептид может повторно специфически связываться с антителами даже после отмывки, антитела можно очищать в течение длительного периода времени, и можно уменьшать затраты на очистку антител.
[0194] В таблице 3 приведены структуры циклических пептидов из примера 1 и результаты оценки относительной активности связывания и устойчивости к химическому воздействию.
[0195] Примеры 2 и 6
На основании примера 1 синтезировали циклический пептид 2 и циклический пептид 6 и оценивали относительную активность связывания и устойчивость к химическому воздействию.
Указанный код в таблице 3 означает указанное ниже вещество.
Hcy: аминокислотный остаток, получаемый из L-гомоцистеина
Вследствие взаимодействия между тиоловыми группами боковой цепи образуется дисульфидная связь между аминокислотными остатками в сшитой части, и, таким образом, аминокислотные остатки являются сшитыми.
В таблице 3 приведены структуры циклических пептидов из примера 2 и примера 6 и результаты оценки относительной активности связывания и устойчивости к химическому воздействию.
[0196] Примеры 3-5
На основании примера 1 синтезировали циклические пептиды 3-5 и оценивали относительную активность связывания и устойчивость к химическому воздействию.
Указанные коды в таблице 3 означают указанные ниже вещества.
Hcy: аминокислотный остаток, получаемый из L-гомоцистеина
Orn (ацетил): аминокислотный остаток, получаемый из N-δ-хлорацетил-L-орнитина
Lys (ацетил): аминокислотный остаток, получаемый из N-ε-хлорацетил-L-лизина
Вследствие взаимодействия между хлорацетильной группой и тиоловой группой в сшитой части образуется тиоэфирная связь, и, таким образом, аминокислотные остатки являются сшитыми.
В таблице 3 продемонстрированы структуры циклических пептидов из примеров 3-5 и результаты оценки относительной активности связывания и устойчивости к химическому воздействию.
[0197] Примеры 7-12
На основании примера 1 синтезировали циклические пептиды 7-12 и оценивали относительную активность связывания и устойчивость к химическому воздействию.
Указанные коды в таблице 3 означают указанные ниже вещества.
Dap (ацетил): аминокислотный остаток, получаемый из N3-галоацетил-L-2,3-диаминопропионовая кислота[(2S)-2-амино-3-[(2-галоацетил)амино]пропионовой кислоты]
Dab (ацетил): аминокислотный остаток, получаемый из N4-галоацетил-L-2,4-диаминобутановая кислота[(2S)-2-амино-4-[(2-галоацетил)амино]бутановой кислоты]
Orn (ацетил): аминокислотный остаток, получаемый из N-δ-хлорацетил-L-орнитина
Lys (ацетил): аминокислотный остаток, получаемый из N-ε-хлорацетил-L-лизина
Hcy: аминокислотный остаток, получаемый из L-гомоцистеина
Вследствие взаимодействия между хлорацетильной группой и тиоловой группой в сшитой части образуется тиоэфирная связь, и, таким образом, аминокислотные остатки являются сшитыми.
В таблице 3 продемонстрированы структуры циклических пептидов из примеров 7-12 и результаты оценки относительной активности связывания и устойчивости к химическому воздействию.
[0198] Таблица 3
Циклический пептид | Оценка характеристик | SEQ ID NO: | ||||||||
Идентификационное название | Аминокислотная последовательность (N-конец→C-конец) |
Аминокислотный остаток в сшитой части | Конкретный аминокислотный остаток | Сшитая структура | Относительная активность связывания | Устойчивость к химическому воздействию | ||||
Xa | Xb | Xα | ||||||||
Пример | 1 | Циклический пептид 1 | DXaAYHRGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 3 |
2 | Циклический пептид 2 | DXaAYHRGELVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | A | B | 4 | |
3 | Циклический пептид 3 | DXaAYHRGELVWXbTKK | Hcy | Orn (ацетил) | - | Тиоэфирная связь | A | A | 5 | |
4 | Циклический пептид 4 | KKDXaAYHRGELVWXbT | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 6 | |
5 | Циклический пептид 5 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 7 | |
6 | Циклический пептид 6 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | A | A | 8 | |
7 | Циклический пептид 7 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Dap (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 9 | |
8 | Циклический пептид 8 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Dab (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 10 | |
9 | Циклический пептид 9 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Orn (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 11 | |
10 | Циклический пептид 10 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Hcy | Dab (ацетил) | - | Тиоэфирная связь | A | A | 12 | |
11 | Циклический пептид 11 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Hcy | Orn (ацетил) | - | Тиоэфирная связь | A | A | 13 | |
12 | Циклический пептид 12 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Hcy | Lys (ацетил) | - | Тиоэфирная связь | A | A | 14 |
[0199] Примеры 13-22
На основании примера 1 синтезировали циклические пептиды 13-22 и оценивали относительную активность связывания и устойчивость к химическому воздействию.
Указанные коды в таблице 4 означают указанные ниже вещества.
Lys (ацетил): аминокислотный остаток, получаемый из N-ε-хлорацетил-L-лизина
Hcy: аминокислотный остаток, получаемый из L-гомоцистеина
HmS: аминокислотный остаток, получаемый из L-гомосерина
HmY: аминокислотный остаток, получаемый из L-гомотирозина
Вследствие взаимодействия между хлорацетильной группой и тиоловой группой в сшитой части образуется тиоэфирная связь, и, таким образом, аминокислотные остатки являются сшитыми.
В таблице 4 продемонстрированы структуры циклических пептидов из примеров 13-22 и результаты оценки относительной активности связывания и устойчивости к химическому воздействию.
[0200] Таблица 4
Циклический пептид | Оценка характеристик | SEQ ID NO: | ||||||||
Идентификационное название | Аминокислотная последовательность (N-конец→C-конец) |
Аминокислотный остаток в сшитой части | Конкретный аминокислотный остаток | Сшитая структура | Относительная активность связывания | Устойчивость к химическому воздействию | ||||
Xa | Xb | Xα | ||||||||
Пример | 13 | Циклический пептид 13 | DXaAYHLGELVWXbSKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | B | 15 |
14 | Циклический пептид 14 | DXaAYHLGELVWXbXαKK | Lys (ацетил) | Hcy | HmS | Тиоэфирная связь | A | A | 16 | |
15 | Циклический пептид 15 | DXaAYHLGELVWXbDKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 17 | |
16 | Циклический пептид 16 | DXaAYHLGELVWXbEKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 18 | |
17 | Циклический пептид 17 | DXaAYHLGELVWXbYKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 19 | |
18 | Циклический пептид 18 | DXaAYHLGELVWXbXαKK | Lys (ацетил) | Hcy | HmY | Тиоэфирная связь | A | A | 20 | |
19 | Циклический пептид 19 | SXaAYHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | B | 21 | |
20 | Циклический пептид 20 | TXaAYHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 22 | |
21 | Циклический пептид 21 | XαXaAYHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | HmS | Тиоэфирная связь | A | A | 23 | |
22 | Циклический пептид 22 | EXaAYHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 24 |
[0201] Примеры 23-53
На основании примера 1 синтезировали циклические пептиды 23-53 и оценивали относительную активность связывания и устойчивость к химическому воздействию.
Указанные коды в таблице 5 означают указанные ниже вещества.
Lys (ацетил): аминокислотный остаток, получаемый из N-ε-хлорацетил-L-лизина
Hcy: аминокислотный остаток, получаемый из L-гомоцистеина
Вследствие взаимодействия между хлорацетильной группой и тиоловой группой в сшитой части образуется тиоэфирная связь, и, таким образом, аминокислотные остатки являются сшитыми.
В Таблице 5 продемонстрированы структуры циклических пептидов из примеров 23-53 и результаты оценки относительной активности связывания и устойчивости к химическому воздействию.
[0202] Таблица 5
Циклический пептид | Оценка характеристик | SEQ ID NO: | ||||||||
Идентификационное название | Аминокислотная последовательность (N-конец→C-конец) |
Аминокислотный остаток в сшитой части | Конкретный аминокислотный остаток | Сшитая структура | Относительная активность связывания | Устойчивость к химическому воздействию | ||||
Xa | Xb | Xα | ||||||||
Пример | 23 | Циклический пептид 23 | DXaAAYHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 25 |
24 | Циклический пептид 24 | DXaAAAYHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 26 | |
25 | Циклический пептид 25 | DXaAAAAYHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | B | A | 27 | |
26 | Циклический пептид 26 | DXaSYHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | B | 28 | |
27 | Циклический пептид 27 | DXaTYHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 29 | |
28 | Циклический пептид 28 | DXaAFHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 30 | |
29 | Циклический пептид 29 | DXaAHHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 31 | |
30 | Циклический пептид 30 | DXaAVHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 32 | |
31 | Циклический пептид 31 | DXaAMHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 33 | |
32 | Циклический пептид 32 | DXaAYYLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 34 | |
33 | Циклический пептид 33 | DXaAYWLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 35 | |
34 | Циклический пептид 34 | DXaAYHMGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 36 | |
35 | Циклический пептид 35 | DXaAYHFGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 37 | |
36 | Циклический пептид 36 | DXaAYHHGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 38 | |
37 | Циклический пептид 37 | DXaAYHVGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 39 | |
38 | Циклический пептид 38 | DXaAYHIGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 40 | |
39 | Циклический пептид 39 | DXaAYHNGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 41 | |
40 | Циклический пептид 40 | DXaAYHWGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 42 | |
41 | Циклический пептид 41 | DXaAYHLDELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 43 | |
42 | Циклический пептид 42 | DXaAYHLEELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 44 | |
43 | Циклический пептид 43 | DXaAYHLGDLVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 45 | |
44 | Циклический пептид 44 | DXaAYHLGKLVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 46 | |
45 | Циклический пептид 45 | DXaAYHLGRLVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 47 | |
46 | Циклический пептид 46 | DXaAYHLGHLVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 48 | |
47 | Циклический пептид 47 | DXaAYHLGMLVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 49 | |
48 | Циклический пептид 48 | DXaAYHLGNLVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 50 | |
49 | Циклический пептид 49 | DXaAYHLGEIVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 51 | |
50 | Циклический пептид 50 | DXaAYHLGEMVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 52 | |
51 | Циклический пептид 51 | DXaAYHLGEKVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 53 | |
52 | Циклический пептид 52 | DXaAYHLGERVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | B | B | 54 | |
53 | Циклический пептид 53 | DXaAYHLGELIWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | - | Тиоэфирная связь | A | A | 55 |
[0203] Примеры 54-71
На основании примера 1 синтезировали циклические пептиды 54-71 и оценивали относительную активность связывания и устойчивость к химическому воздействию.
Указанный ниже код в таблице 6 означает указанное ниже вещество.
Hcy: аминокислотный остаток, получаемый из L-гомоцистеина
Вследствие взаимодействия между тиоловыми группами боковой цепи, образуется дисульфидная связь между аминокислотными остатками в сшитой части, и, таким образом, аминокислотные остатки являются сшитыми.
В таблице 6 продемонстрированы структуры циклических пептидов из примеров 54-71 и результаты оценки относительной активности связывания и устойчивости к химическому воздействию.
[0204] Сравнительный пример 1
На основании примера 1 синтезировали циклический пептид 91 и оценивали относительную активность связывания и устойчивость к химическому воздействию.
Указанные коды в таблице 6 означают указанные ниже вещества.
Glu: аминокислотный остаток, получаемый из L-глутаминовой кислоты
Lys: аминокислотный остаток, получаемый из L-лизина
Вследствие взаимодействия карбоксигруппы и аминогруппы образуется амидная связь между аминокислотными остатками в сшитой части, и, таким образом, аминокислотные остатки являются сшитыми.
В таблице 6 продемонстрирована структура циклического пептида сравнительного примера 1 и результаты оценки относительной активности связывания и устойчивости к химическому воздействию.
[0205] Сравнительный пример 2
На основании примера 1 синтезировали циклический пептид 92 и оценивали относительную активность связывания и устойчивость к химическому воздействию.
Указанный ниже код в таблице 6 означает указанное ниже вещество.
Cys: аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина
Вследствие взаимодействия между тиоловыми группами боковой цепи образуется дисульфидная связь между аминокислотными остатками в сшитой части, и, таким образом, аминокислотные остатки являются сшитыми.
В таблице 6 продемонстрирована структура циклического пептида сравнительного примера 2 и результаты оценки относительной активности связывания и устойчивости к химическому воздействию.
[0206] Таблица 6
Циклический пептид | Оценка характеристик | SEQ ID NO: | ||||||||
Идентификационное название | Аминокислотная последовательность (N-конец→C-конец) |
Аминокислотный остаток в сшитой части | Конкретный аминокислотный остаток | Сшитая структура | Относительная активность связывания | Устойчивость к химическому воздействию | ||||
Xa | Xb | Xα | ||||||||
Пример | 54 | Циклический пептид 54 | DXaSYHLGELVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | A | B | 56 |
55 | Циклический пептид 55 | DXaTYHLGELVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | A | B | 57 | |
56 | Циклический пептид 56 | DXaAWHLGELVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | A | A | 58 | |
57 | Циклический пептид 57 | DXaAFHLGELVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | A | A | 59 | |
58 | Циклический пептид 58 | DXaAHHLGELVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | B | A | 60 | |
59 | Циклический пептид 59 | DXaAYYLGELVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | A | A | 61 | |
60 | Циклический пептид 60 | DXaAYHMGELVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | A | A | 62 | |
61 | Циклический пептид 61 | DXaAYHFGELVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | A | A | 63 | |
62 | Циклический пептид 62 | DXaAYHHGELVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | A | A | 64 | |
63 | Циклический пептид 63 | DXaAYHLGDLVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | A | A | 65 | |
64 | Циклический пептид 64 | DXaAYHLGMLVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | A | A | 66 | |
65 | Циклический пептид 65 | DXaAYHLGHLVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | A | A | 67 | |
66 | Циклический пептид 66 | DXaAYHLGNLVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | A | A | 68 | |
67 | Циклический пептид 67 | DXaAYHLGEIVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | A | A | 69 | |
68 | Циклический пептид 68 | DXaAYHLGEMVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | A | A | 70 | |
69 | Циклический пептид 69 | DXaAYHLGEKVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | B | A | 71 | |
70 | Циклический пептид 70 | DXaAYHLGERVWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | B | B | 72 | |
71 | Циклический пептид 71 | DXaAYHLGELIWXbTKK | Hcy | Hcy | - | Дисульфидная связь | B | A | 73 | |
Сравнительный пример | 1 | Циклический пептид 91 | DXaAYHRGELVWXbTKK | Glu | Lys | - | Амидн связь | E (standard) | D | 86 |
2 | Циклический пептид 92 | DXaAYHRGELVWXbTKK | Cys | Cys | - | Дисульфидная связь | A | E | 87 |
[0207] Примеры 72-75 и сравнительный пример 3
На основании примера 1 синтезировали циклические пептиды 72-75 и циклический пептид 93 и оценивали относительную активность связывания и устойчивость к химическому воздействию.
Указанные коды в таблице 7 означают указанные ниже вещества.
Lys (ацетил): аминокислотный остаток, получаемый из N-ε-хлорацетил-L-лизина
Pen: аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина
HmS: аминокислотный остаток, получаемый из L-гомосерина
Вследствие взаимодействия хлорацетильной группы с тиоловой группой в сшитой части образуется тиоэфирная связь, и, таким образом, аминокислотные остатки являются сшитыми.
В таблице 7 продемонстрированы структуры циклических пептидов из примеров 72-75 и сравнительного примера 3 и результаты оценки относительной активности связывания и устойчивости к химическому воздействию.
[0208] Примеры 76-83 и сравнительные примеры 4-6
На основании примера 1 синтезировали циклические пептиды 78-91 и оценивали относительную активность связывания и устойчивость к химическому воздействию.
Указанные коды в таблице 7 означают указанные ниже вещества.
Dap (ацетил): аминокислотный остаток, получаемый из N3-галоацетил-L-2,3-диаминопропионовая кислота[(2S)-2-амино-3-[(2-галоацетил)амино]пропионовой кислоты]
Dab (ацетил): аминокислотный остаток, получаемый из N4-галоацетил-L-2,4-диаминобутановая кислота[(2S)-2-амино-4-[(2-галоацетил)амино]бутановой кислоты]
Orn (ацетил): аминокислотный остаток, получаемый из N-δ-хлорацетил-L-орнитина
Lys (ацетил): аминокислотный остаток, получаемый из N-ε-хлорацетил-L-лизина
HmS: аминокислотный остаток, получаемый из L-гомосерина
Вследствие взаимодействия хлорацетильной группы с тиоловой группой в сшитой части образуется тиоэфирная связь, и, таким образом, аминокислотные остатки являются сшитыми.
В таблице 7 продемонстрированы структуры циклических пептидов из примеров 72, 73, 74 и 75 и сравнительного примера 3 и результаты оценки относительной активности связывания и устойчивости к химическому воздействию.
[0209] Таблица 7
Циклический пептид | Оценка характеристик | SEQ ID NO: | ||||||||
Идентификационное название | Аминокислотная последовательность (N-конец→C-конец) |
Аминокислотный остаток в сшитой части | Конкретный аминокислотный остаток | Сшитая структура | Относительная активность связывания | Устойчивость к химическому воздействию | ||||
Xa | Xb | Xα | ||||||||
Пример | 72 | Циклический пептид 72 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Pen | - | Тиоэфирная связь | A (S) | A | 74 |
73 | Циклический пептид 73 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Pen | K (ацетил) | - | Тиоэфирная связь | A | A | 75 | |
74 | Циклический пептид 74 | DXaAYHRGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Pen | - | Тиоэфирная связь | A (S) | B | 76 | |
75 | Циклический пептид 75 | DXaAYHLGELVWXbXαKK | Lys (ацетил) | Pen | HmS | Тиоэфирная связь | A (S) | B | 77 | |
76 | Циклический пептид 76 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Dap (ацетил) | Cys | - | Тиоэфирная связь | A (S) | B | 78 | |
77 | Циклический пептид 77 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Dab (ацетил) | Cys | - | Тиоэфирная связь | A (S) | B | 79 | |
78 | Циклический пептид 78 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Orn (ацетил) | Cys | - | Тиоэфирная связь | A | B | 80 | |
79 | Циклический пептид 79 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Cys | - | Тиоэфирная связь | A (S) | B | 81 | |
80 | Циклический пептид 80 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Cys | Dap (ацетил) | - | Тиоэфирная связь | A (S) | B | 82 | |
81 | Циклический пептид 81 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Cys | Dab (ацетил) | - | Тиоэфирная связь | A (S) | B | 83 | |
82 | Циклический пептид 82 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Cys | Orn (ацетил) | - | Тиоэфирная связь | A | B | 84 | |
83 | Циклический пептид 83 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Cys | Lys (ацетил) | - | Тиоэфирная связь | A (S) | B | 85 | |
Сравнительный пример | 3 | Циклический пептид 93 | DXaSYHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Pen | - | Тиоэфирная связь | A | D | 88 |
4 | Циклический пептид 94 | DXaSYHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Cys | - | Тиоэфирная связь | A | E | 89 | |
5 | Циклический пептид 95 | DXaAYHRGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Cys | - | Тиоэфирная связь | A | E | 90 | |
6 | Циклический пептид 96 | XαXaAYHRGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Cys | HmS | Тиоэфирная связь | A | E | 91 |
[0210] Описание результатов примеров и сравнительных примеров
Примеры 1-6
Все циклические пептиды 1-6 примеров 1-6 относили к классу A по оценке относительной активности связывания, и они обладали прекрасной относительной активностью связывания.
За исключением циклического пептида 2 из примера 2 циклические пептиды 1-6 из примеров 1-6 относили к классу A по оценке устойчивости к химическому воздействию, и они обладали прекрасной устойчивостью к химическому воздействию.
Несмотря на то, что циклический пептид 2 из примера 2 и циклический пептид 6 из примера 6 обладали сшитой структурой, образованной дисульфидной связью, они характеризовались различием, которое заключалось в том, что циклический пептид 2 относили к классу B по оценке устойчивости к химическому воздействию, тогда как циклический пептид 6 относили к классу A по оценке устойчивости к химическому воздействию. Вероятно, это обусловлено тем, что циклический пептид 2 обладал аминокислотной последовательностью AYHRGELVW в циклической части, тогда как циклический пептид 6 обладал аминокислотной последовательностью AYHLGELVW в циклической части. На данный момент времени механизм, который обуславливает различные уровни устойчивости к химическому воздействию циклических пептидов, невозможно четко объяснить.
[0211] Примеры 7-12
Примеры 7-9 и примеры 10-12 получают изменением типа аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, содержащей хлорацетильную группу в боковой цепи. Примеры 7-9 и примеры 10-12 имеют зависимость, получаемую в результате изменения положений аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, содержащей хлорацетильную группу в боковой цепи, и аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, отличной от L-цистеина и D-цистеина, содержащей тиоловую группу в боковой цепи.
Все циклические пептиды 7-12 из примеров 7-12 относили к классу A по оценке относительной активности связывания и устойчивости к химическому воздействию, и они обладали прекрасной относительной активностью связывания и устойчивостью к химическому воздействию.
[0212] Примеры 13-22
Циклические пептиды 13-22 из примеров 13-22 являются примерами, получаемыми заменой аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи вне циклической части, или аминокислотного остатка, получаемого из аминокислоты, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи.
Циклический пептид 13 (пример 13), содержащий аминокислотный остаток, получаемый из L-серина (аминокислоты, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи) со стороны C-конца циклической части, и циклический пептид 19 (пример 19), содержащий такой же аминокислотный остаток со стороны N-конца, относили к классу B по оценке устойчивости к химическому воздействию. За исключением этих циклических пептидов все циклические пептиды 14-18 (примеры 14-18) и циклические пептиды 20-22 (примеры 20-22) относили к классу A по оценке относительной активности связывания и устойчивости к химическому воздействию, и эти циклические пептиды обладали прекрасной относительной активностью связывания и устойчивостью к химическому воздействию.
[0213] Примеры 23-53
Циклические пептиды 23-53 из примеров 23-53 являются примерами, получаемыми заменой типа аминокислотного остатка внутри циклической части в случае, когда сшитая структура является тиоэфирной связью.
[0214] Примеры 54-71
Циклические пептиды 54-71 из примеров 54-71 являются примеры, получаемыми заменой типа аминокислотного остатка внутри циклической части в случае, когда сшитая структура является тиоэфирной связью.
[0215] Примеры 72-75 и сравнительный пример 3
Циклические пептиды 72-75 из примеров 72-75 и циклический пептид 93 сравнительного примера 3 являются примеры, получаемыми в случае, когда сшитая структура является тиоэфирной связью. В этих циклических пептидах аминокислота, содержащая тиоловую группу в боковой цепи, представляет собой L-пеницилламин.
Циклический пептид 93 сравнительного примера 3, содержащий L-серин в циклической части, относили к классу A по оценке относительной активности связывания, но относили к классу D по оценке устойчивости к химическому воздействию.
[0216] Примеры 76-83 и сравнительные примеры 4-6
Циклические пептиды 76-83 из примеров 76-83 и циклические пептиды 94-96 сравнительных примеров 4-6 являются примеры, получаемыми в случае, когда сшитая структура является тиоэфирной связью. В этих циклических пептидах, аминокислота, содержащая тиоловую группу в боковой цепи, представляет собой L-цистеин.
Все примеры из сравнительного примера 4, содержащего L-серин в циклической части, сравнительного примера 5, содержащего L-аспарагиновую кислоту в циклической части, и сравнительного примера 6, содержащего L-гомосерин вне циклической части со стороны N-конца, относили к классу E по оценке устойчивости к химическому воздействию, и они обладали слабой устойчивостью к химическому воздействию.
Вероятно, это обусловлено тем, что гидроксигруппа или карбоксигруппа или гидроксигруппа и карбоксигруппа в боковой цепи аминокислотного остатка оказывают влияние. Однако на данный момент времени невозможно четко объяснить, почему устойчивость к химическому воздействию указанных выше примеров значительно хуже, чем устойчивость к химическому воздействию примеров 76-83.
[0217] Обобщение
Обобщая, таким образом, сшитая структура, тиоэфирная связь, в которой участвует остаток L-гомоцистеина, как правило, проявляет самую высокую стабильность, дисульфидная связь между остатками L-гомоцистеина, как правило, обладает второй самой высокой стабильностью, тиоэфирная связь, в которой участвует L-пеницилламин, как правило, обладает третьей самой высокой стабильностью, и тиоэфирная связь, в которой участвует L-цистеин, как правило, обладает четвертой самой высокой стабильностью.
[0218] Пример A
Результаты эксперимента, проводимого с использованием плазмы человека
Оценка стабильности в плазме
Оценивали стабильность циклического пептида 5, получаемого в примере 5 с использованием плазмы человека (выпускаемого ProMedDX).
Каждый из пептидов получали в виде 5 мМ водного раствора и 2 мл каждого из водных растворов добавляли к 20 мл плазмы человека, и оставляли уравновешиваться в течение 20 минут при комнатной температуре. Через 20 минут к ним добавляли 100 мл метанола (выпускаемого Wako Pure Chemical Industries, Ltd.), таким образом, чтобы остановить реакцию. После перемешивания раствор подвергали центрифугированию и собирали супернатант, и называли как образец 20-минут. При этом 100 мл метанола добавляли к 20 мл плазмы человека, к нему добавляли 2 мл водного раствор пептида, раствор перемешивали и подвергали центрифугированию, и собирали супернатант. Собранный супернатант называли образец 0-минут.
Каждый из образцов количественно определяли с использованием масс-спектрометра TRIPLE QUAD 5500 (выпускаемого AB Sciex Pte. Ltd.). Принимая количественное значение образца 0-минут как 100%, рассчитывали количественное значение образца 20-минут как остаточная скорость.
[0219] Стандарты оценки для остаточной скорости
Скорость изменения количества связывания являлась выше на 90% ⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅ A
Скорость изменения количества связывания являлась выше на 80% и была равна или ниже на 90% ⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅ B
Скорость изменения количества связывания являлась выше на 70% и была равна или ниже на 80% ⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅ C
Скорость изменения количества связывания являлась выше на 50% и была равна или ниже на 70% ⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅ D
Скорость изменения количества связывания была равна или ниже на 50% ⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅⋅ E
Структура циклического пептида и результат оценки приведены в соответствующем столбце в таблице 8.
[0220] Пример B
Стабильность циклического пептида 6, получаемого в примере 6 в плазме человека, оценивали таким же образом, как в примере A. Структура циклического пептида и результат оценки приведены в соответствующем столбце в таблице 8.
[0221] Сравнительный пример C
Стабильность циклического пептида 91, получаемого в сравнительном примере 1 в плазме человека, оценивали таким же образом, как в примере A. Структура циклического пептида и результат оценки приведены в соответствующем столбце в таблице 8.
[0222] Таблица 8
Циклический пептид | Изменение показателя количества связывания (оценка) |
SEQ ID NO: | |||||
Идентификационное название | Аминокислотная последовательность (N-конец→C-конец) | Аминокислотный остаток в сшитой части | Сшитая структура | ||||
Xa | Xb | ||||||
Пример A | Циклический пептид 5 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Lys (ацетил) | Hcy | Тиоэфирная связь | A | 7 |
Пример B | Циклический пептид 6 | DXaAYHLGELVWXbTKK | Hcy | Hcy | Дисульфидная связь | A | 8 |
Сравнительный пример C | Циклический пептид 91 | DXaAYHRGELVWXbTKK | Glu | Lys | Амидн связь | E | 86 |
[0223] Описание результатов
Скорость изменения количества связывания (остаточная скорость) циклического пептида 5 (пример A) и циклического пептида 6 (пример B) в плазме человека являлась выше на 90%. Циклический пептиды 5 и 6 характеризовались высокой стабильностью в плазме человека.
В противоположность этому, скорость изменения количества связывания (остаточная скорость) циклического пептида 91 (сравнительный пример C) была равна или ниже на 50%. Циклический пептид 91 обладал слабой стабильностью в плазме человека.
Стабильность в плазме человека является характеристикой, которая является важной в случае, когда циклический пептид по настоящему изобретению используют в качестве конъюгата антитела и лекарственного средства или фармацевтического препарата. Чем выше скорость изменения количества связывания (остаточная скорость), тем труднее циклическому пептиду диссоциировать из лекарственного средства в крови. Таким образом, высокая остаточная скорость является предпочтительной для точной доставки лекарственного средства в мишень и для ингибирования побочных эффектов.
Список последовательностей
Международная патентная заявка № W-5923PCT в соответствии с международным сотрудничеством в области патентов, циклический пептид, аффинность ChroJP16081353 20161021----00260157151602210379normal20161021161101201609151052110950_P1AP101_W-_25.app
Claims (144)
1. Циклический пептид, представленный формулой (IC)
RN-X6 t-X4 r-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xb-X5 s-X7 u-RC, (IC)
в формуле (IC)
RN представляет собой аминогруппу;
RC представляет собой карбоксигруппу;
X1 представляет собой остаток L-лейцина, остаток L-изолейцина, остаток L-метионина, остаток L-лизина или остаток L-аргинина;
X2 представляет собой представляет собой остаток L-валина или остаток L-изолейцина;
X3 представляет собой остаток L-триптофана;
Xa представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей хлорацетильную группу в боковой цепи, выбранной из группы, состоящей из (2S)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2R)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2S)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, (2R)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, N-δ-хлорацетил-L-орнитина, N-δ-хлорацетил-D-орнитина, N-ε-хлорацетил-L-лизина и N-ε-хлорацетил-D-лизина;
Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-гомоцистеина или D-гомоцистеина;
Xa и Xb связаны друг с другом посредством тиоэфирной связи;
Xm выбран из группы, состоящей из A-Y-H-R-G-E, A-Y-H-L-G-E, A-A-Y-H-L-G-E, A-A-A-Y-H-L-G-E, A-A-A-A-Y-H-L-G-E, S-Y-H-L-G-E, T-Y-H-L-G-E, A-F-H-L-G-E, A-H-H-L-G-E, A-V-H-L-G-E, A-M-H-L-G-E, A-Y-Y-L-G-E, A-Y-W-L-G-E, A-Y-H-M-G-E, A-Y-H-F-G-E, A-Y-H-H-G-E, A-Y-H-V-G-E, A-Y-H-I-G-E, A-Y-H-N-G-E, A-Y-H-W-G-E, A-Y-H-L-D-E, A-Y-H-L-E-E, A-Y-H-L-G-D, A-Y-H-L-G-K, A-Y-H-L-G-R, A-Y-H-L-G-H, A-Y-H-L-G-M, A-Y-H-L-G-N и A-W-H-L-G-E;
каждый из X4 и X5 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи, или аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X4 или X5, множество X4 или X5 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов;
каждый из X6 и X7 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X6 или X7, множество X6 или X7 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов;
каждый из r и s независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤r≤5, 0≤s≤5 и 1≤Max (r, s)≤5, где Max (r, s) представляет собой большее число из двух чисел, представленных r и s в случае, когда r≠s, и представляет собой r или s в случае, когда r=s;
каждый из t и u независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤t≤5, 0≤u≤5 и 1≤Max (t,u)≤5, где Max (t,u) представляет собой большее число из двух чисел, представленных t и u в случае, когда t≠u, и представляет собой t или u в случае, когда t=u;
A представляет собой остаток L-аланина;
Е представляет собой остаток L-глутаминовой кислоты;
F представляет собой остаток L-фенилаланина;
G представляет собой остаток глицина;
H представляет собой остаток L-гистидина;
I представляет собой остаток L-изолейцина;
K представляет собой остаток L-лизина;
L представляет собой остаток L-лейцина;
М представляет собой остаток L-метионина;
N представляет собой остаток L-аспарагина;
R представляет собой остаток L-аргинина;
S представляет собой остаток L-серина;
Т представляет собой остаток L-треонина;
V представляет собой остаток L-валина;
W представляет собой остаток L-триптофана; и
Y представляет собой остаток L-тирозина.
2. Циклический пептид, представленный формулой (IC)
RN-X6 t-X4 r-Xa-Xm-X1-X2-X3-Xb-X5 s-X7 u-RC, (IC)
в формуле (IC)
RN представляет собой аминогруппу;
RC представляет собой карбоксигруппу;
X1 представляет собой остаток L-лейцина, остаток L-изолейцина, остаток L-метионина, остаток L-лизина или остаток L-аргинина;
X2 представляет собой остаток L-валина или остаток L-изолейцина;
X3 представляет собой остаток L-триптофана;
Xa представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-гомоцистеина или D-гомоцистеина;
Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей хлорацетильную группу в боковой цепи, выбранной из группы, состоящей из (2S)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2R)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2S)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, (2R)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, N-δ-хлорацетил-L-орнитина, N-δ-хлорацетил-D-орнитина, N-ε-хлорацетил-L-лизина и N-ε-хлорацетил-D-лизина;
Xa и Xb связаны друг с другом посредством тиоэфирной связи;
Xm выбран из группы, состоящей из A-Y-H-R-G-E, A-Y-H-L-G-E, A-A-Y-H-L-G-E, A-A-A-Y-H-L-G-E, A-A-A-A-Y-H-L-G-E, S-Y-H-L-G-E, T-Y-H-L-G-E, A-F-H-L-G-E, A-H-H-L-G-E, A-V-H-L-G-E, A-M-H-L-G-E, A-Y-Y-L-G-E, A-Y-W-L-G-E, A-Y-H-M-G-E, A-Y-H-F-G-E, A-Y-H-H-G-E, A-Y-H-V-G-E, A-Y-H-I-G-E, A-Y-H-N-G-E, A-Y-H-W-G-E, A-Y-H-L-D-E, A-Y-H-L-E-E, A-Y-H-L-G-D, A-Y-H-L-G-K, A-Y-H-L-G-R, A-Y-H-L-G-H, A-Y-H-L-G-M, A-Y-H-L-G-N и A-W-H-L-G-E;
каждый из X4 и X5 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи, или аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X4 или X5, множество X4 или X5 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов;
каждый из X6 и X7 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, и в случае, когда присутствует множество X6 или X7, множество X6 или X7 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов;
каждый из r и s независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤r≤5, 0≤s≤5 и 1≤Max (r, s)≤5, где Max (r, s) представляет собой большее число из двух чисел, представленных r и s в случае, когда r≠s, и представляет собой r или s в случае, когда r=s;
каждый из t и u независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤t≤5, 0≤u≤5 и 1≤Max (t,u)≤5, где Max (t,u) представляет собой большее число из двух чисел, представленных t и u в случае, когда t≠u, и представляет собой t или u в случае, когда t=u;
A представляет собой остаток L-аланина;
Е представляет собой остаток L-глутаминовой кислоты;
F представляет собой остаток L-фенилаланина;
G представляет собой остаток глицина;
H представляет собой остаток L-гистидина;
I представляет собой остаток L-изолейцина;
K представляет собой остаток L-лизина;
L представляет собой остаток L-лейцина;
М представляет собой остаток L-метионина;
N представляет собой остаток L-аспарагина;
R представляет собой остаток L-аргинина;
S представляет собой остаток L-серина;
Т представляет собой остаток L-треонина;
V представляет собой остаток L-валина;
W представляет собой остаток L-триптофана; и
Y представляет собой остаток L-тирозина.
3. Циклический пептид, который представлен формулой (I'C)
RN-X6 t-X4 rXa-Xm-X1-X2-X3-Xb-X5 sX7 u-RC, (I'C)
в формуле (I'C)
RN представляет собой аминогруппу;
RC представляет собой карбоксигруппу;
X1 представляет собой остаток L-лейцина, остаток L-изолейцина, остаток L-метионина, остаток L-лизина или остаток L-аргинина;
X2 представляет собой остаток L-валина или остаток L-изолейцина;
X3 представляет собой остаток L-триптофана;
Xa представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей хлорацетильную группу в боковой цепи, выбранной из группы, состоящей из (2S)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2R)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2S)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, (2R)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, N-δ-хлорацетил-L-орнитина, N-δ-хлорацетил-D-орнитина, N-ε-хлорацетил-L-лизина и N-ε-хлорацетил-D-лизина;
Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-гомоцистеина или D-гомоцистеина;
Xa и Xb связаны друг с другом посредством тиоэфирной связи;
Xm выбран из группы, состоящей из A-Y-H-R-G-E, A-Y-H-L-G-E, A-A-Y-H-L-G-E, A-A-A-Y-H-L-G-E, A-A-A-A-Y-H-L-G-E, S-Y-H-L-G-E, T-Y-H-L-G-E, A-F-H-L-G-E, A-H-H-L-G-E, A-V-H-L-G-E, A-M-H-L-G-E, A-Y-Y-L-G-E, A-Y-W-L-G-E, A-Y-H-M-G-E, A-Y-H-F-G-E, A-Y-H-H-G-E, A-Y-H-V-G-E, A-Y-H-I-G-E, A-Y-H-N-G-E, A-Y-H-W-G-E, A-Y-H-L-D-E, A-Y-H-L-E-E, A-Y-H-L-G-D, A-Y-H-L-G-K, A-Y-H-L-G-R, A-Y-H-L-G-H, A-Y-H-L-G-M, A-Y-H-L-G-N и A-W-H-L-G-E;
в случае, когда Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, каждый из X4 и X5 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи, или аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина и D-гомосерина, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи,
в случае, когда Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, каждый из X4 и X5 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи, или аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи, и
в случае, когда присутствует множество X4 или X5, множество X4 или X5 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов;
в случае, когда Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, каждый из X6 и X7 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-аргинина и D-аргинина, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, или каждый независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи,
в случае, когда Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, каждый из X6 и X7 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, и
в случае, когда присутствует множество X6 или X7, множество X6 или X7 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов;
каждый из r и s независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤r≤5, 0≤s≤5 и 1≤Max (r, s)≤5, где Max (r, s) представляет собой большее число из двух чисел, представленных r и s в случае, когда r≠s, и представляет собой r или s в случае, когда r=s;
каждый из t и u независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤t≤5, 0≤u≤5 и 1≤Max (t,u)≤5, где Max (t,u) представляет собой большее число из двух чисел, представленных t и u в случае, когда t≠u, и представляет собой t или u в случае, когда t=u;
A представляет собой остаток L-аланина;
Е представляет собой остаток L-глутаминовой кислоты;
F представляет собой остаток L-фенилаланина;
G представляет собой остаток глицина;
H представляет собой остаток L-гистидина;
I представляет собой остаток L-изолейцина;
K представляет собой остаток L-лизина;
L представляет собой остаток L-лейцина;
М представляет собой остаток L-метионина;
N представляет собой остаток L-аспарагина;
R представляет собой остаток L-аргинина;
S представляет собой остаток L-серина;
Т представляет собой остаток L-треонина;
V представляет собой остаток L-валина;
W представляет собой остаток L-триптофана; и
Y представляет собой остаток L-тирозина.
4. Циклический пептид, который представлен формулой (I'C)
RN-X6 t-X4 rXa-Xm-X1-X2-X3-Xb-X5 sX7 u-RC, (I'C)
в формуле (I'C)
RN представляет собой аминогруппу;
RC представляет собой карбоксигруппу;
X1 представляет собой остаток L-лейцина, остаток L-изолейцина, остаток L-метионина, остаток L-лизина или остаток L-аргинина;
X2 представляет собой остаток L-валина или остаток L-изолейцина;
X3 представляет собой остаток L-триптофана;
Xa представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, или аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина;
Xb представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей хлорацетильную группу в боковой цепи, выбранной из группы, состоящей из (2S)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2R)-2-амино-3-[(2-хлорацетил)амино]пропионовой кислоты, (2S)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, (2R)-2-амино-4-[(2-хлорацетил)амино]бутановой кислоты, N-δ-хлорацетил-L-орнитин, N-δ-хлорацетил-D-орнитина, N-ε-хлорацетил-L-лизина и N-ε-хлорацетил-D-лизина;
Xa и Xb связаны друг с другом посредством тиоэфирной связи;
Xm выбран из группы, состоящей из A-Y-H-R-G-E, A-Y-H-L-G-E, A-A-Y-H-L-G-E, A-A-A-Y-H-L-G-E, A-A-A-A-Y-H-L-G-E, S-Y-H-L-G-E, T-Y-H-L-G-E, A-F-H-L-G-E, A-H-H-L-G-E, A-V-H-L-G-E, A-M-H-L-G-E, A-Y-Y-L-G-E, A-Y-W-L-G-E, A-Y-H-M-G-E, A-Y-H-F-G-E, A-Y-H-H-G-E, A-Y-H-V-G-E, A-Y-H-I-G-E, A-Y-H-N-G-E, A-Y-H-W-G-E, A-Y-H-L-D-E, A-Y-H-L-E-E, A-Y-H-L-G-D, A-Y-H-L-G-K, A-Y-H-L-G-R, A-Y-H-L-G-H, A-Y-H-L-G-M, A-Y-H-L-G-N и A-W-H-L-G-E;
в случае, когда Xa представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, каждый из X4 и X5 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи, или аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина и D-гомосерина, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи,
в случае, когда Xa представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, каждый из X4 и X5 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей карбоксигруппу в боковой цепи, или аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, содержащей гидроксигруппу в боковой цепи, и
в случае, когда присутствует множество X4 или X5, множество X4 или X5 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов;
в случае, когда Xa представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-цистеина или D-цистеина, каждый из X6 и X7 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина, D-серина, L-гомосерина, D-гомосерина, L-аргинина и D-аргинина, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, или каждый независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи,
в случае, когда Xa представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из L-пеницилламина или D-пеницилламина, каждый из X6 и X7 независимо представляет собой аминокислотный остаток, получаемый из аминокислоты, отличной от L-серина и D-серина, содержащей иммобилизирующую функциональную группу в боковой цепи, и
в случае, когда присутствует множество X6 или X7, множество X6 или X7 может состоять из одинаковых или отличающихся друг от друга элементов;
каждый из r и s независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤r≤5, 0≤s≤5 и 1≤Max (r, s)≤5, где Max (r, s) представляет собой большее число из двух чисел, представленных r и s в случае, когда r≠s, и представляет собой r или s в случае, когда r=s;
каждый из t и u независимо представляет собой целое число, удовлетворяющее 0≤t≤5, 0≤u≤5 и 1≤Max (t,u)≤5, где Max (t,u) представляет собой большее число из двух чисел, представленных t и u в случае, когда t≠u, и представляет собой t или u в случае, когда t=u;
A представляет собой остаток L-аланина;
Е представляет собой остаток L-глутаминовой кислоты;
F представляет собой остаток L-фенилаланина;
G представляет собой остаток глицина;
H представляет собой остаток L-гистидина;
I представляет собой остаток L-изолейцина;
K представляет собой остаток L-лизина;
L представляет собой остаток L-лейцина;
М представляет собой остаток L-метионина;
N представляет собой остаток L-аспарагина;
R представляет собой остаток L-аргинина;
S представляет собой остаток L-серина;
Т представляет собой остаток L-треонина;
V представляет собой остаток L-валина;
W представляет собой остаток L-триптофана; и
Y представляет собой остаток L-тирозина.
5. Циклический пептид по любому из пп. 1-4, который представляет собой связывающий антитело лиганд.
6. Циклический пептид по любому из пп. 1-4, который представляет собой линкер для мечения антител.
7. Циклический пептид по любому из пп. 1-4, который представляет собой линкер для конъюгатов антител c лекарственными средствами.
8. Циклический пептид по любому из пп. 1-4, который представляет собой носитель для лекарственного средства.
9. Подложка для аффинной хроматографии, содержащая
нерастворимую в воде подложку и
циклический пептид по любому из пп. 1-4,
где нерастворимая в воде подложка и циклический пептид являются непосредственно или опосредованно связанными друг с другом.
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2015-209030 | 2015-10-23 | ||
JP2015209030 | 2015-10-23 | ||
JP2016206753A JP6554452B2 (ja) | 2015-10-23 | 2016-10-21 | 環状ペプチド、アフィニティクロマトグラフィー担体、標識化抗体、抗体薬物複合体、および医薬製剤 |
PCT/JP2016/081353 WO2017069269A1 (ja) | 2015-10-23 | 2016-10-21 | 環状ペプチド、アフィニティクロマトグラフィー担体、標識化抗体、抗体薬物複合体、および医薬製剤 |
JP2016-206753 | 2016-10-21 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2694050C1 true RU2694050C1 (ru) | 2019-07-09 |
Family
ID=58803678
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2018114690A RU2694050C1 (ru) | 2015-10-23 | 2016-10-21 | Циклический пептид, подложка для аффинной хроматографии, меченое антитело, конъюгат антитела и лекарственного средства и фармацевтический препарат |
Country Status (10)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US10703778B2 (ru) |
EP (1) | EP3366693B1 (ru) |
JP (1) | JP6554452B2 (ru) |
KR (1) | KR102139057B1 (ru) |
CN (1) | CN108137651B (ru) |
AU (1) | AU2016340472B2 (ru) |
BR (1) | BR112018008117A2 (ru) |
CA (1) | CA3000979A1 (ru) |
RU (1) | RU2694050C1 (ru) |
SG (1) | SG11201803001WA (ru) |
Families Citing this family (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR102243870B1 (ko) | 2016-09-30 | 2021-04-22 | 후지필름 가부시키가이샤 | 환상 펩타이드, 어피니티 크로마토그래피 담체, 표지화 항체, 항체 약물 복합체 및 의약 제제 |
EP3865515A4 (en) * | 2018-10-10 | 2022-02-16 | Kagoshima University | IGG-BINDING PEPTIDE COMPRISING A SOLID-PHASE SUPPORT, AND METHOD FOR SEPARATION OF IGG |
KR20220029571A (ko) * | 2019-05-24 | 2022-03-08 | 아비타이드 엘엘씨 | Aav9 친화성 제제 |
WO2020250855A1 (ja) * | 2019-06-11 | 2020-12-17 | 富士フイルム株式会社 | 環状ペプチド、細胞足場材、細胞分離材、及び、培地 |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20040087765A1 (en) * | 2000-11-08 | 2004-05-06 | Wofgang Ronspeck | Peptides, the production and use thereof for binding immunoglobulins |
EP2180054A1 (en) * | 1999-12-24 | 2010-04-28 | Genentech, Inc. | Methods and compositions for prolonging elimination half-times of bioactive compounds |
Family Cites Families (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5817752A (en) | 1996-06-06 | 1998-10-06 | La Jolla Pharmaceutical Company | Cyclic polypeptides comprising a thioether linkage and methods for their preparation |
US6303576B1 (en) | 1999-04-21 | 2001-10-16 | Adherex Technologies Inc. | Compounds and methods for modulating β-catenin mediated gene expression |
CA2444680A1 (en) | 2001-04-18 | 2002-10-31 | Dyax Corp. | Binding molecules for fc-region polypeptides |
US7335723B2 (en) | 2001-08-08 | 2008-02-26 | Merck & Co., Inc. | Melanin-concentrating hormone antagonists |
KR20040087765A (ko) | 2003-04-09 | 2004-10-15 | 주식회사 일산 | 관체 성형방법 및 그 장치 |
CA2813049A1 (en) * | 2010-09-23 | 2012-03-29 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Modified compstatin with improved stability and binding properties |
WO2013027796A1 (ja) | 2011-08-24 | 2013-02-28 | 大塚化学株式会社 | IgG結合性ペプチド及びそれによるIgGの検出および精製方法 |
CN105612174A (zh) * | 2013-07-25 | 2016-05-25 | 诺华股份有限公司 | 用于治疗心力衰竭的二硫化物环状多肽 |
-
2016
- 2016-10-21 KR KR1020187009948A patent/KR102139057B1/ko active IP Right Grant
- 2016-10-21 BR BR112018008117-5A patent/BR112018008117A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2016-10-21 CN CN201680061489.0A patent/CN108137651B/zh active Active
- 2016-10-21 AU AU2016340472A patent/AU2016340472B2/en active Active
- 2016-10-21 EP EP16857582.7A patent/EP3366693B1/en active Active
- 2016-10-21 JP JP2016206753A patent/JP6554452B2/ja active Active
- 2016-10-21 SG SG11201803001WA patent/SG11201803001WA/en unknown
- 2016-10-21 CA CA3000979A patent/CA3000979A1/en active Pending
- 2016-10-21 RU RU2018114690A patent/RU2694050C1/ru active
-
2018
- 2018-04-10 US US15/949,769 patent/US10703778B2/en active Active
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP2180054A1 (en) * | 1999-12-24 | 2010-04-28 | Genentech, Inc. | Methods and compositions for prolonging elimination half-times of bioactive compounds |
US20040087765A1 (en) * | 2000-11-08 | 2004-05-06 | Wofgang Ronspeck | Peptides, the production and use thereof for binding immunoglobulins |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
BR112018008117A2 (pt) | 2018-11-06 |
EP3366693B1 (en) | 2023-08-16 |
KR102139057B1 (ko) | 2020-07-29 |
AU2016340472A1 (en) | 2018-05-10 |
JP2017095443A (ja) | 2017-06-01 |
KR20180041243A (ko) | 2018-04-23 |
CN108137651A (zh) | 2018-06-08 |
JP6554452B2 (ja) | 2019-07-31 |
EP3366693A1 (en) | 2018-08-29 |
CN108137651B (zh) | 2022-02-22 |
US20180230184A1 (en) | 2018-08-16 |
EP3366693A4 (en) | 2018-12-05 |
CA3000979A1 (en) | 2017-04-27 |
AU2016340472B2 (en) | 2019-02-28 |
US10703778B2 (en) | 2020-07-07 |
SG11201803001WA (en) | 2018-05-30 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2694050C1 (ru) | Циклический пептид, подложка для аффинной хроматографии, меченое антитело, конъюгат антитела и лекарственного средства и фармацевтический препарат | |
US10450344B2 (en) | Antibody-binding polypeptide, antibody-binding fusion polypeptide, and adsorption material | |
CN110267969B (zh) | 含有IgG结合肽的固相载体以及IgG的分离方法 | |
CN112789295B (zh) | 包含IgG结合肽的固相担载体及IgG的分离方法 | |
US11066446B2 (en) | Cyclic peptide, affinity chromatography support, labeled antibody, antibody drug conjugate, and pharmaceutical preparation | |
US11565240B2 (en) | Mixed mode affinity chromatography carrier | |
WO2017069269A1 (ja) | 環状ペプチド、アフィニティクロマトグラフィー担体、標識化抗体、抗体薬物複合体、および医薬製剤 | |
US10927188B2 (en) | Method for producing short-chain peptide-immobilized carrier, and short-chain peptide-immobilized carrier |