RU2674675C2 - Method for predicting the clinical outcome of locally advanced forms of cervical cancer - Google Patents
Method for predicting the clinical outcome of locally advanced forms of cervical cancer Download PDFInfo
- Publication number
- RU2674675C2 RU2674675C2 RU2018104661A RU2018104661A RU2674675C2 RU 2674675 C2 RU2674675 C2 RU 2674675C2 RU 2018104661 A RU2018104661 A RU 2018104661A RU 2018104661 A RU2018104661 A RU 2018104661A RU 2674675 C2 RU2674675 C2 RU 2674675C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- hpv
- dna
- cervical cancer
- integration
- patients
- Prior art date
Links
- 208000006105 Uterine Cervical Neoplasms Diseases 0.000 title claims abstract description 76
- 201000010881 cervical cancer Diseases 0.000 title claims abstract description 75
- 206010008342 Cervix carcinoma Diseases 0.000 title claims abstract description 74
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 55
- 230000010354 integration Effects 0.000 claims abstract description 81
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims abstract description 76
- 241000341655 Human papillomavirus type 16 Species 0.000 claims abstract description 51
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims abstract description 44
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims abstract description 44
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 claims abstract description 18
- 108700005077 Viral Genes Proteins 0.000 claims abstract description 17
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 claims abstract description 4
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 claims abstract description 3
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims description 18
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 17
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 claims description 16
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims description 12
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 10
- 108091005904 Hemoglobin subunit beta Proteins 0.000 claims description 8
- 102100021519 Hemoglobin subunit beta Human genes 0.000 claims description 8
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 claims description 7
- 238000011088 calibration curve Methods 0.000 claims description 6
- 101150082674 E2 gene Proteins 0.000 claims description 5
- 101150013359 E7 gene Proteins 0.000 claims description 5
- 101000899111 Homo sapiens Hemoglobin subunit beta Proteins 0.000 claims description 4
- 210000003679 cervix uteri Anatomy 0.000 claims description 4
- 230000000711 cancerogenic effect Effects 0.000 claims description 3
- 231100000315 carcinogenic Toxicity 0.000 claims description 3
- 210000002919 epithelial cell Anatomy 0.000 claims description 3
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 claims description 3
- 230000002411 adverse Effects 0.000 abstract description 13
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 6
- 239000003814 drug Substances 0.000 abstract description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 88
- 241000341657 Human papillomavirus type 18 Species 0.000 description 42
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 31
- 208000022361 Human papillomavirus infectious disease Diseases 0.000 description 30
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 26
- 238000001325 log-rank test Methods 0.000 description 9
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 8
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 7
- 241000701806 Human papillomavirus Species 0.000 description 7
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 description 7
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 7
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 6
- 238000010837 poor prognosis Methods 0.000 description 6
- 238000011127 radiochemotherapy Methods 0.000 description 6
- 108020005202 Viral DNA Proteins 0.000 description 5
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 5
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 5
- 230000008569 process Effects 0.000 description 5
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 5
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 4
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 4
- 238000011160 research Methods 0.000 description 4
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 4
- 102000016938 Catalase Human genes 0.000 description 3
- 108010053835 Catalase Proteins 0.000 description 3
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 3
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 description 3
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 3
- 230000030570 cellular localization Effects 0.000 description 3
- 208000019065 cervical carcinoma Diseases 0.000 description 3
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 3
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 3
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 3
- 206010008347 Cervix carcinoma stage III Diseases 0.000 description 2
- 206010053172 Fatal outcomes Diseases 0.000 description 2
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 2
- 238000003149 assay kit Methods 0.000 description 2
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 2
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 2
- 238000012937 correction Methods 0.000 description 2
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 2
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 2
- 230000003902 lesion Effects 0.000 description 2
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 description 2
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 2
- 238000007790 scraping Methods 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 2
- 102000013563 Acid Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108010051457 Acid Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 206010008346 Cervix carcinoma stage II Diseases 0.000 description 1
- 239000003298 DNA probe Substances 0.000 description 1
- 101150071673 E6 gene Proteins 0.000 description 1
- 108010054147 Hemoglobins Proteins 0.000 description 1
- 102000001554 Hemoglobins Human genes 0.000 description 1
- 241001631646 Papillomaviridae Species 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 description 1
- 238000004820 blood count Methods 0.000 description 1
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 210000003756 cervix mucus Anatomy 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 238000010219 correlation analysis Methods 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 238000013277 forecasting method Methods 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 230000002489 hematologic effect Effects 0.000 description 1
- 230000000642 iatrogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 1
- 238000007901 in situ hybridization Methods 0.000 description 1
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 1
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 1
- 230000035987 intoxication Effects 0.000 description 1
- 231100000566 intoxication Toxicity 0.000 description 1
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 description 1
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000007403 mPCR Methods 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 210000000440 neutrophil Anatomy 0.000 description 1
- 230000002023 papillomaviral effect Effects 0.000 description 1
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 1
- 238000012950 reanalysis Methods 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 210000004994 reproductive system Anatomy 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 230000000192 social effect Effects 0.000 description 1
- 239000002594 sorbent Substances 0.000 description 1
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002485 urinary effect Effects 0.000 description 1
- 210000001635 urinary tract Anatomy 0.000 description 1
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
Предлагаемое изобретение относится к области медицины, а именно к онкогинекологии, и может быть использовано для прогнозирования клинического исхода местнораспространенного рака шейки матки (II-III стадии).The present invention relates to medicine, namely to gynecological oncology, and can be used to predict the clinical outcome of locally advanced cervical cancer (stage II-III).
Рак шейки матки (РШМ) по частоте встречаемости продолжает занимать одну из ведущих позиций среди злокачественных новообразований репродуктивной системы (Состояние онкологической помощи населению России в 2015 году // Под редакцией А.Д. Каприна, В.В. Старинского, Г.В. Петровой, Москва, 2016 - 235 с.).According to the frequency of occurrence, cervical cancer (Cervical cancer) continues to occupy one of the leading positions among malignant neoplasms of the reproductive system (The status of cancer care for the population of Russia in 2015 // Edited by A.D. Kaprin, V.V. Starinsky, G.V. Petrova , Moscow, 2016 - 235 p.).
Выявление факторов прогноза первичного РШМ до начала специализированной терапии неуклонно интегрируется в лечебно-диагностический процесс. Традиционно наиболее используемыми критериями являются объем и линейные размеры опухоли, степень распространения опухолевого процесса, поражение регионарных лимфатических узлов, степень дифференцировки опухоли, а также сопутствующие изменения периферической крови (показатель гемоглобина) в сочетании с нарушениями функции органов мочевыделительной системы, возраст, продолжительность курса лечения и др. (Крикунова Л.И. Лучевая терапия рака шейки матки // Практ. онкология. - 2002. - Т. 3, №3. - С. 194-199; Урманчеева А.Ф. Эпидемиология и диагностика рака шейки матки // Акушерство и гинекология. - 2001. - №1. - С 80-86; Кайрбаев М.Р. Факторы прогноза местнораспространенного рака шейки матки // Сиб. онкол. журн. - 2009. - №4(34). - С. 32-35).The identification of prognostic factors for primary cervical cancer before the start of specialized therapy is steadily integrated into the diagnostic and treatment process. Traditionally, the most used criteria are the volume and linear dimensions of the tumor, the degree of spread of the tumor process, the defeat of regional lymph nodes, the degree of differentiation of the tumor, as well as the accompanying changes in peripheral blood (hemoglobin index) in combination with impaired function of the urinary system, age, duration of treatment, and etc. (Krikunova L.I. Radiation therapy of cervical cancer // Pract. Oncology. - 2002. - T. 3, No. 3. - P. 194-199; Urmancheeva A.F. Epidemiology and diagnosis cancer of the cervix uteri // Obstetrics and Gynecology. - 2001. - No. 1. - P 80-86; Kayrbaev MR. Factors for the prognosis of locally advanced cervical cancer // Sib. Oncol.Journal. - 2009. - No. 4 (34) . - S. 32-35).
Высокий процент выявления местнораспространенных форм заболевания (II-III стадия) с большими линейными размерами первичного очага и/или наличием регионарного метастазирования опухолевого процесса диктует необходимость поиска новых диагностических критериев, которые позволят выбрать адекватную тактику специализированного лечения, оптимально используя все возможные компоненты противоопухолевого воздействия.A high percentage of detection of locally prevalent forms of the disease (stage II-III) with large linear dimensions of the primary focus and / or the presence of regional metastasis of the tumor process necessitates the search for new diagnostic criteria that will allow you to choose the appropriate tactics of specialized treatment, optimally using all possible components of the antitumor effect.
Известен способ оценки эффективности противоопухолевой терапии для прогнозирования эффективности противоопухолевых воздействий и их коррекции во время лечения злокачественных опухолей шейки матки RU 2151399 С1. Способ заключается в том, что в нейтрофилах периферической крови больного до и в процессе лечения определяют уровень активности кислой и щелочной фосфатаз и их соотношение, изменение которого по сравнению с исходным дает возможность прогнозировать эффективность проводимого лечения, а снижение и отсутствие изменения в соотношении показателей является сигналом необходимости коррекции проводимой терапии.There is a method of evaluating the effectiveness of antitumor therapy to predict the effectiveness of antitumor effects and their correction during the treatment of malignant cervical tumors RU 2151399 C1. The method consists in the fact that the level of activity of acid and alkaline phosphatases and their ratio are determined in the neutrophils of the patient’s peripheral blood before and during treatment, the change of which compared to the initial one makes it possible to predict the effectiveness of the treatment, and the decrease and absence of changes in the ratio of indicators is a signal the need for correction of ongoing therapy.
Известен способ прогнозирования периода безрецидивной выживаемости при раке шейки матки путем определения активности каталазы в плазме крови RU 2483308. Прогнозирование периода безрецидивной выживаемости при местноограниченном раке шейки матки (Ib-IIa стадии по FIGO) осуществляют путем определения активности каталазы в плазме крови. При активности каталазы в плазме крови от 0,041 до 0,113 ммоль/мин/л у пациента прогнозируют 18-ти месячный период безрецидивной выживаемости (ПБВ) с вероятностью 50%, а при активности от 0,008 до 0,035 ммоль/мин/л - с вероятностью 80%.A known method for predicting the period of relapse-free survival in cervical cancer by determining the activity of catalase in blood plasma RU 2483308. Prediction of the period of relapse-free survival in locally limited cervical cancer (Ib-IIa stage according to FIGO) is carried out by determining the activity of catalase in blood plasma. With plasma catalase activity from 0.041 to 0.113 mmol / min / l, the patient is predicted to have a 18-month period of relapse-free survival (PBB) with a probability of 50%, and with an activity of 0.008 to 0.035 mmol / min / l - with a probability of 80% .
Известен способ прогнозирования неблагоприятного течения местнораспространенных форм рака шейки матки, ассоциированного с вирусом папилломы человека RU 2504326 С1. В этом способе в качестве дополнительных прогностических факторов эффективности лечения ВПЧ-ассоцированных местнораспространенных форм рака шейки матки используют иммунологические критерии - абсолютное количество лимфоцитов (лим_аб), TNFα (TNFα_к) и IL-10 (IL-10_к) в периферической крови, а также TNFα (TNFα_c) и IL-4 (IL-4_c) в цервикальной слизи. На основании полученных данных вычисляют показатель F(x): F(x)=9,265+1,749×(лим_аб)+0,013×(IL-4_c)+0,005×(IL-10_к)-0,410×(TNFα_к)-0,206×(TNFα_c). При значении F(x) больше 0,555 прогнозируют неблагоприятное течение опухолевого процесса, а если меньше - благоприятное течение.A known method for predicting the adverse course of locally advanced forms of cervical cancer associated with human papillomavirus RU 2504326 C1. In this method, immunological criteria — the absolute number of lymphocytes (lim_ab), TNFα (TNFα_k) and IL-10 (IL-10_k) in the peripheral blood, as well as TNFα (as well as TNFα) are used as additional prognostic factors for the treatment of HPV-associated locally advanced forms of cervical cancer. TNFα_c) and IL-4 (IL-4_c) in cervical mucus. Based on the data obtained, the indicator F (x) is calculated: F (x) = 9.265 + 1.749 × (lim_ab) + 0.013 × (IL-4_c) + 0.005 × (IL-10_k) -0.410 × (TNFα_k) -0.206 × (TNFα_c ) With a value of F (x) greater than 0.555, an unfavorable course of the tumor process is predicted, and if less, a favorable course is predicted.
Общими недостатками всех вышеперечисленных способов прогноза эффективности противоопухолевого лечения является использование гематологических, биохимических и иммунологических показателей, которые могут изменяться при наличии любого воспалительного процесса в организме, в том числе обусловленного и химиолучевым воздействием. Интоксикационный синдром, диспепсические явления, лучевые реакции со стороны кишечника и мочевыводящих путей, неизменно сопутствующие противоопухолевому лечению, могут вызывать значительные колебания показателей крови, что снижает эффективность их использования для оценки динамики развития рака шейки матки и прогноза прогрессирования заболевания.Common disadvantages of all of the above methods for predicting the effectiveness of antitumor treatment is the use of hematological, biochemical and immunological parameters, which can change in the presence of any inflammatory process in the body, including due to chemoradiation. Intoxication syndrome, dyspeptic symptoms, radiation reactions from the intestines and urinary tract, which are invariably associated with antitumor treatment, can cause significant fluctuations in blood counts, which reduces the effectiveness of their use for assessing the dynamics of cervical cancer and predicting the progression of the disease.
Известен способ прогнозирования на основе модели интеграции ДНК вируса папилломы человека US 2016201149 A1 (US 20160201149 A1 Joo-Young Kim, Hye-Jin SHIN, Jung Nam Joo, Bo Ram PARK «Method for prediction of prognosis by human papillomavirus DNA integration pattern», 2016 («Способ прогнозирования на основе модели интеграции ДНК вируса папилломы человека»). Способ заключается в прогнозировании клинического исхода РШМ на основе сведений об интеграции ДНК вируса папилломы человек (ВПЧ) в геном опухолевых клеток до лучевого или химиолучевого лечения. При этом проводят оценку внутриклеточной локализации вируса на срезах опухолевой ткани ШМ методом гибридизации in situ. Для этого подготовленные срезы опухолевой ткани инкубируют с ДНК-зондами, специфичными к консервативной зоне ДНК ВПЧ; далее обрабатывают соответствующими реактивами, позволяющими визуально идентифицировать полученные ДНК-ДНК гибриды по темной окраске. По интенсивности и характеру окраски оценивают наличие или отсутствие вируса в клетке и его внутриклеточную локализацию. В зависимости от внутриклеточной локализации различают ВПЧ с разными вариантами интеграции вирусной ДНК в клеточный геном и эписомальную форму ВПЧ (интеграция ДНК ВПЧ в геном клетки отсутствует). Далее в соответствии с этими показателями вируса формируют группы повышенного риска неблагоприятного исхода заболевания.A known forecasting method based on the integration model of human papillomavirus DNA US 2016201149 A1 (US20160201149 A1 Joo-Young Kim, Hye-Jin SHIN, Jung Nam Joo, Bo Ram PARK "Method for prediction of prognosis by human papillomavirus DNA integration pattern", 2016 (“A prediction method based on a human papillomavirus DNA integration model.”) The method consists in predicting the clinical outcome of cervical cancer based on information about the integration of human papillomavirus DNA (HPV) into the genome of tumor cells before radiation or chemoradiation treatment. In this case, an assessment of intracellular localization is carried out. virus cut CMM tumor tissue by in situ hybridization: For this, prepared sections of tumor tissue are incubated with DNA probes specific for the HPV DNA conservative zone, then treated with appropriate reagents to visually identify the obtained DNA-DNA hybrids by dark color. the presence or absence of the virus in the cell and its intracellular localization. Depending on the intracellular localization, HPV is distinguished with different options for the integration of viral DNA into the cellular genome and the episomal form of HPV (there is no integration of HPV DNA into the cell genome). Further, in accordance with these indicators of the virus, groups of increased risk of an unfavorable outcome of the disease are formed.
Основным недостатком способа является субъективная оценка результатов лишь по визуальным критериям. Кроме того, использование высокоинвазивной процедуры получения образцов опухолевой ткани (биопсия шейки матки) может приводить к попаданию опухолевых клеток в кровяное русло и повысить вероятность метастазирования, что является дополнительным ятрогенным фактором плохого прогноза. При этом относительный риск неблагоприятного клинического исхода заболевания рассчитан только на сроке 2 года.The main disadvantage of this method is the subjective assessment of results only by visual criteria. In addition, the use of a highly invasive procedure for obtaining tumor tissue samples (cervical biopsy) can lead to the entry of tumor cells into the bloodstream and increase the likelihood of metastasis, which is an additional iatrogenic factor in poor prognosis. In this case, the relative risk of an adverse clinical outcome of the disease is calculated only for a period of 2 years.
Прототипом предлагаемого изобретения является работа «Физический статус вируса папилломы человека связан с клиническим исходом радиотерапии больных раком шейки матки», в котором риск неблагоприятного клинического исхода РШМ оценивают по соотношению пороговых циклов вирусных генов Е2 и Е6 (Hye-Jin Shin, Jungnam Joo, Ji Hyun Yoon et al. Physical Status of Human Papillomavirus Integration in Cervical Cancer Is Associated with Treatment Outcome of the Patients Treated with Radiotherapy // PLOS ONE. - 2014. - Vol. 9(1). - e78995.), при этом:The prototype of the invention is the work "The physical status of the human papillomavirus is associated with the clinical outcome of radiotherapy for patients with cervical cancer," in which the risk of an adverse clinical outcome of cervical cancer is assessed by the ratio of the threshold cycles of the viral genes E2 and E6 (Hye-Jin Shin, Jungnam Joo, Ji Hyun Yoon et al. Physical Status of Human Papillomavirus Integration in Cervical Cancer Is Associated with Treatment Outcome of the Patients Treated with Radiotherapy // PLOS ONE. - 2014 .-- Vol. 9 (1). - e78995.), Wherein:
- выделяют ДНК ВПЧ из биопсийного материала опухолей больных РШМ II-IV стадий;- isolate HPV DNA from the biopsy material of tumors of patients with cervical cancer II-IV stages;
- проводят полимеразную цепную реакцию (ПЦР) в режиме реального времени и амплифицируют Е2, Е6 - гены ВПЧ 16, 18 и 58 типа;- carry out polymerase chain reaction (PCR) in real time and amplify E2, E6 - HPV genes 16, 18 and 58 type;
- оценивают величины пороговых циклов амплификации (Ct) гена Е2 и гена Е6;- evaluate the magnitude of the threshold cycles of amplification (C t ) of the E2 gene and the E6 gene;
- по соотношению величин пороговых циклов амплификации Ct формируют 4 группы больных с различным физическим статусом вирусной ДНК: 1 группа - ДНК ВПЧ частично интегрирована в геном клетки-хозяина (Ct(E2)/Ct(E6) значимо >1); 2 группа - ДНК ВПЧ находится в интегрированной форме без эписомальных компонентов (Ct(E2)/Ct(E6)=0); 3 группа - мультикопийная тандемно повторяющаяся интеграция ДНК ВПЧ ((Ct(E2)/Ct(E6) близко к единице); 4 группа - вирусные гены Е2 и Е6 не выявляется (ВПЧ-отрицательные пациентки);- 4 groups of patients with different physical status of viral DNA are formed according to the ratio of threshold amplification threshold cycles C t : group 1 - HPV DNA is partially integrated into the genome of the host cell (C t (E2) / C t (E6) significantly>1); Group 2 - HPV DNA is in integrated form without episomal components (C t (E2) / C t (E6) = 0); Group 3 - multicopy tandem repeat integration of HPV DNA ((C t (E2) / C t (E6) close to unity); group 4 - viral genes E2 and E6 are not detected (HPV-negative patients);
- из перечисленных 4-х групп формируют 3 группы, при этом вышеупомянутые группы 2 и 3 объединяют, группы 1 и 4 оставляют без изменений;- of the 4 groups listed, 3 groups are formed, while the
- оценивают безрецидивную выживаемость на сроке 2 года после окончания лечения;- evaluate relapse-free survival for a period of 2 years after the end of treatment;
- по результатам анализа выявляют значимое снижение показателей безрецидивной выживаемости больных в ряду 1 группа 
- на основании полученных результатов делают вывод о возможности использования сведений о физическом статусе вируса для прогноза клинического исхода РИТМ.- on the basis of the results obtained, it is concluded that it is possible to use information about the physical status of the virus to predict the clinical outcome of RITM.
К недостаткам данного способа относится:The disadvantages of this method include:
- включение в исследуемую группу больных с IV стадией РШМ, при которой определяющее значение для клинического исхода имеет именно распространенность процесса, независимо от других факторов прогноза. В связи с этим, объединение больных местнораспространенным РШМ (II и III стадии) и РШМ IV стадии может привести к некорректной трактовке результатов анализа;- inclusion in the study group of patients with stage IV cervical cancer, in which the prevalence of the process is crucial for the clinical outcome, regardless of other prognosis factors. In this regard, the combination of patients with locally advanced cervical cancer (stage II and III) and stage IV cervical cancer may lead to an incorrect interpretation of the analysis results;
- оценка физического статуса ВПЧ по соотношению пороговых циклов амплификации вирусных генов Е6 и Е2 может приводить к неточным результатам. Пороговый цикл отражает наличие гена, но не его количество. Количество необходимо рассчитывать по стандартной калибровочной кривой для каждого гена;- assessment of the physical status of HPV according to the ratio of threshold cycles of amplification of the viral genes E6 and E2 can lead to inaccurate results. The threshold cycle reflects the presence of a gene, but not its quantity. The amount must be calculated according to the standard calibration curve for each gene;
- выявление одинакового числа копий генов Е2 и Е6 (т.е. соотношение Ct(E2)/Ct(E6)=1) в группе 3 интерпретируется исключительно как наличие мультикопийной тандемно повторяющейся интеграции ДНК вируса, хотя это может трактоваться и как отсутствие интеграции (эписомальная форма вируса) (Maelle Saunier, Sylvain Monnier-Benoit, Frederic Mauny et al. Analysis of Human Papillomavirus Type 16 (HPV16) DNA Load and Physical State for Identification of HPV16-Infected Women with High-Grade Lesions or Cervical Carcinoma // J Clin Microbiol. - 2008. - Vol. 46(11). - P. 3678-3685; Wei Li, Wei Wang, Mani Si. et al. The physical state of HPV16 infection and its clinical significance in cancer precursor lesion and cervical carcinoma // J Cancer Res Clin Oncol. - 2008. - Vol. 134. - P. 1355-1361);- the identification of the same number of copies of the E2 and E6 genes (i.e., the ratio C t (E2) / C t (E6) = 1) in
- относительный риск неблагоприятного клинического исхода заболевания рассчитан только на сроке 2 года.- the relative risk of an adverse clinical outcome of the disease is calculated only for a period of 2 years.
Технический результат предлагаемого изобретения заключается в повышении точности оценки клинического исхода местнораспространенного РШМ (II и III стадии) до проведения специализированного радикального лечения.The technical result of the invention is to increase the accuracy of assessing the clinical outcome of locally advanced cervical cancer (stage II and III) before conducting specialized radical treatment.
Указанный технический результат при осуществлении заявляемого способа изобретения достигается за счет того, что так же как и в известном способе делают забор эпителиальных клеток из цервикального канала и наружной поверхности шейки матки, полученные образцы исследуют на наличие ДНК ВПЧ высокого канцерогенного риска (ВКР) и определяют его генотип методом ПЦР.The specified technical result in the implementation of the inventive method of the invention is achieved due to the fact that, just as in the known method, epithelial cells are taken from the cervical canal and the external surface of the cervix, the obtained samples are examined for the presence of high-risk carcinogenic virus (HPV) DNA and determined genotype by PCR.
Особенность заявляемого способа заключается в том, что отбирают биологические образцы с ВПЧ-отрицательным, ВПЧ 16- и ВПЧ18-позитивным РШМ II-III стадии, в ВПЧ 16/18-позитивных образцах определяют количество вирусных генов Е7 и Е2 и параллельно оценивают количество ДНК b-глобина человека: анализ проводят методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени, в каждом опыте одновременно амплифицируют в нескольких повторах клинические образцы и стандартные образцы с известной концентрацией ДНК ВПЧ и ДНК β-глобина человека, необходимые для построения калибровочных кривых, определяют количество ДНК вирусных генов Е7, Е2 и клеточного гена β-глобина по калибровочным кривым, оценивают наличие интеграции ДНК вируса в геном клетки-хозяина по величине среднего значения соотношения количества гена Е7 к количеству гена Е2 (Е7/Е2) для нескольких повторов с учетом коэффициента вариации (CV) и стандартного отклонения (SD), далее методом ROC-анализа устанавливают дискриминационный уровень, разделяющий опухоли на две группы:A feature of the proposed method is that biological samples are taken with HPV-negative, HPV 16- and HPV18-positive cervical cancer of the II-III stage, in the HPV 16/18-positive samples the number of viral genes E7 and E2 is determined and the amount of DNA b is evaluated in parallel β-globin of human: the analysis is carried out by the method of polymerase chain reaction in real time, in each experiment, clinical samples and standard samples with known concentrations of HPV DNA and human β-globin DNA are amplified simultaneously in several repetitions the construction of calibration curves, determine the amount of DNA of the viral genes E7, E2 and the β-globin cell gene from the calibration curves, evaluate the presence of integration of the virus DNA into the genome of the host cell by the average value of the ratio of the number of E7 gene to the amount of E2 gene (E7 / E2) for several repetitions, taking into account the coefficient of variation (CV) and standard deviation (SD), then the method of ROC analysis establishes the discriminatory level that divides tumors into two groups:
I - объединяет РШМ, у которых выявлено наличие интеграции ДНК ВПЧ 16 или 18 типа и ВПЧ-отрицательные РШМ,I - combines cervical cancer, in which the presence of integration of HPV DNA type 16 or 18 and HPV-negative cervical cancer,
II - ВПЧ 16- и ВПЧ18-позитивые РШМ, у которых наличие интеграции ДНК вируса не выявлено, после чего классифицируют пациенток в зависимости от наличия или отсутствия вируса, наличия или отсутствия интеграции ДНК в ВПЧ 16- или ВПЧ 18-позитивных образцах, и если:II - HPV 16- and HPV18-positive cervical cancer, in which the presence of virus DNA integration was not detected, after which patients are classified according to the presence or absence of the virus, the presence or absence of DNA integration in HPV 16- or HPV 18-positive samples, and if :
- ВПЧ ВКР не обнаружен, то прогнозируют неблагоприятный клинический исход заболевания;- HPV VCR is not detected, then an unfavorable clinical outcome of the disease is predicted;
- соотношение вирусных генов Е7/Е2≥1,3 при CV≤10% или (Е7/Е2-2,5SD)≥1 при CV>10% у ВПЧ16/18-позитивных пациенток, что соответствует наличию интеграции ДНК вируса в клеточный геном, то прогнозируют неблагоприятный клинический исход заболевания;- the ratio of the viral genes E7 / E2≥1.3 at CV≤10% or (E7 / E2-2.5SD) ≥1 at CV> 10% in HPV16 / 18-positive patients, which corresponds to the presence of the integration of virus DNA into the cellular genome then predict an unfavorable clinical outcome of the disease;
- соотношение вирусных генов Е7/Е2<1,3 при CV≤10% - у ВПЧ16/18-позитивных пациенток, что соответствует отсутствию интеграции ДНК вируса в клеточный геном, то прогнозируют благоприятный клинический исход заболевания.- the ratio of viral genes E7 / E2 <1.3 with CV≤10% - in HPV16 / 18-positive patients, which corresponds to the lack of integration of virus DNA into the cellular genome, a favorable clinical outcome of the disease is predicted.
Изобретение поясняется подробным описанием, клиническими примерами, таблицами и иллюстрациями на которых изображено:The invention is illustrated by a detailed description, clinical examples, tables and illustrations which depict:
Фиг. 1. Сравнительное исследование количества и степени интеграции ДНК ВПЧ16/18 в образцах с наличием интегрированной формы вируса.FIG. 1. A comparative study of the amount and degree of integration of HPV16 / 18 DNA in samples with the presence of an integrated form of the virus.
Фиг. 2. Диаграмма: безрецидивная выживаемость больных РШМ II-III стадии по тестам Каплан-Мейер и log-rank, р<0,00001;FIG. 2. Chart: relapse-free survival of patients with cervical cancer of the II-III stage according to the Kaplan-Meyer and log-rank tests, p <0.00001;
Фиг. 3. Диаграмма: общая выживаемость больных РШМ II-III стадии по тестам Каплан-Мейер и log-rank, р<0,0001;FIG. 3. Chart: overall survival of patients with cervical cancer of the II-III stage according to the Kaplan-Meyer and log-rank tests, p <0.0001;
Фиг. 4. Диаграмма: безрецидивная выживаемость больных РШМ II стадии по тестам Каплан-Мейер и log-rank, р=0,003;FIG. 4. Diagram: relapse-free survival of patients with stage II cervical cancer according to the Kaplan-Meyer and log-rank tests, p = 0.003;
Фиг. 5. Диаграмма: общая выживаемость больных РШМ II стадии по тестам Каплан-Мейер и log-rank, р=0,005;FIG. 5. Chart: overall survival of patients with stage II cervical cancer according to the Kaplan-Meyer and log-rank tests, p = 0.005;
Фиг. 6. Диаграмма: безрецидивная выживаемость больных РШМ III стадии по тестам Каплан-Мейер и log-rank, р<0,0001;FIG. 6. Chart: relapse-free survival of patients with stage III cervical cancer according to the Kaplan-Meyer and log-rank tests, p <0.0001;
Фиг. 7. Диаграмма: общая выживаемость больных РШМ III стадии по тестам Каплан-Мейер и log-rank, р=0,004;FIG. 7. Chart: overall survival of patients with stage III cervical cancer according to the Kaplan-Meyer and log-rank tests, p = 0.004;
Способ осуществляют следующим образом:The method is as follows:
1. Подготавливают биологический материал: у больных РШМ цитощеткой берут совместный соскоб эпителиальных клеток из цервикального канала и наружной поверхности шейки матки.1. Prepare biological material: in patients with cervical cancer, a combined scraping of epithelial cells from the cervical canal and the external surface of the cervix is taken by a cytobrush.
2. Из полученного биологического материала выделяют ДНК сорбентным методом с применением наборов, например «ДНК-сорб АМ» (ФГУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора (ФГУН ЦНИИЭ), Россия) или аналогичных наборов других фирм.2. DNA is extracted from the obtained biological material by the sorbent method using kits, for example, DNA sorb AM (Federal State Research Institute of Epidemiology of Rospotrebnadzor (Federal State Scientific Research Institute of Epidemiology), Russia) or similar sets of other companies.
3. Полученные образцы исследуют на наличие ДНК 14 типов (16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, 68) вируса высокого канцерогенного риска (ВКР) и определяют его генотип методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с использованием комплекта реагентов, например «АмплиСенс ВПЧ ВКР скрин-титр-FL» и «АмплиСенс ВПЧ ВКР генотип-титр FL» ФГУН ЦНИИЭ или аналогичных наборов других фирм.3. The obtained samples are examined for the presence of DNA of 14 types (16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, 68) of a high carcinogenic risk virus (SRS) and its genotype is determined by polymerase chain reaction (PCR) using a set of reagents, for example, “AmpliSens HPV SRS genotype-titer-FL” and “AmpliSens HPV SRS genotype-titer FL” FSIHU TsNIIE or similar sets of other companies.
4. Отбирают образцы с отрицательными результатами на наличие вируса - ВПЧ-отрицательные образцы.4. Take samples with negative results for the presence of the virus - HPV-negative samples.
5. Отбирают образцы с ВПЧ16- или ВПЧ-18-положительными результатами;5. Take samples with HPV16- or HPV-18-positive results;
6. В ВПЧ16/18-позитивных образцах методом мультиплексной ПЦР в режиме реального времени определяют количество ДНК вирусных генов Е7 и Е2. Параллельно оценивают количество ДНК b-глобина человека - внутреннего контроля реакции амплификации.6. In HPV16 / 18-positive samples, the amount of DNA of the viral genes E7 and E2 is determined in real-time by multiplex PCR. At the same time, the amount of human b-globin DNA is estimated - the internal control of the amplification reaction.
7. Все три мишени - Е7, Е2 и β-глобин амплифицируют в одной пробирке. Одновременно в каждом опыте амплифицируют стандартные образцы с известной концентрацией ДНК ВПЧ и ДНК β-глобина человека.7. All three targets - E7, E2 and β-globin are amplified in one tube. At the same time, standard samples with a known concentration of HPV DNA and human β-globin DNA are amplified in each experiment.
8. Каждый клинический образец и стандартные образцы исследуют в нескольких повторах, анализ проводят на амплификаторе, например, "Rotor Gene" ("Corbett Research", Австралия) или аналогичных приборах других фирм.8. Each clinical sample and standard samples are examined in several repetitions, the analysis is carried out on a thermocycler, for example, Rotor Gene (Corbett Research, Australia) or similar instruments of other companies.
9. Количество ДНК вирусных генов Е7, Е2 и клеточного гена β-глобина определяют по калибровочным кривым. Калибровочные кривые получают на стандартных образцах (п. 6) в соответствии с программой амплификатора ("Rotor Gene" или аналогичных приборов других фирм).9. The amount of DNA of the viral genes E7, E2 and the β-globin cell gene is determined by calibration curves. Calibration curves are obtained on standard samples (p. 6) in accordance with the program of the amplifier ("Rotor Gene" or similar instruments from other companies).
10. Наличие интеграции ДНК вируса в геном клетки-хозяина оценивают по величине среднего значения соотношения количества гена Е7 к количеству гена Е2 (Е7/Е2) для нескольких повторов (известно, что ген Е7 сохраняется интактным и при наличии интеграции ДНК ВПЧ в геном клетки, и при ее отсутствии, а ген Е2 при интеграции ДНК ВПЧ разрушается и выявляется только при ее отсутствии).10. The presence of integration of viral DNA into the genome of the host cell is estimated by the average value of the ratio of the amount of the E7 gene to the amount of the E2 gene (E7 / E2) for several repeats (it is known that the E7 gene remains intact even if there is an integration of HPV DNA in the cell genome, and in its absence, and the E2 gene during the integration of HPV DNA is destroyed and detected only in its absence).
11. Методом ROC-анализа устанавливают дискриминационный уровень разделяющий опухоли на две группы: 1-ая объединяет РШМ, у которых выявлено наличие интеграции ДНК ВПЧ 16 или 18 типа и ВПЧ-отрицательные РШМ; 2-ая - ВПЧ 16- и ВПЧ18-позитивые РШМ, у которых наличие интеграции ДНК вируса не выявлено;11. Using the method of ROC analysis, a discriminatory level is established that separates tumors into two groups: the first combines cervical cancer, which revealed the presence of integration of HPV DNA type 16 or 18 and HPV-negative cervical cancer; 2nd - HPV 16- and HPV18-positive cervical cancer, in which the presence of virus DNA integration was not detected;
12. Классифицируют пациенток в зависимости от наличия или отсутствия вируса, наличия или отсутствия интеграции ДНК в ВПЧ 16- или ВПЧ 18-позитивных образцах.12. Patients are classified according to the presence or absence of the virus, the presence or absence of DNA integration in HPV 16- or HPV 18-positive samples.
13. Выявляют пациенток с неблагоприятным прогнозом, у которых ВПЧ ВКР не обнаружен (ВПЧ-отрицательные) или присутствует ВПЧ 16/18 с наличием интеграции ДНК вируса в клеточный геном.13. Identify patients with a poor prognosis in which HPV SRS is not detected (HPV-negative) or HPV 16/18 is present with the integration of virus DNA into the cellular genome.
14. Выявляют пациенток с благоприятным прогнозом, у которых обнаружен ВПЧ 16/18 с отсутствием ДНК вируса в клеточный геном.14. Identify patients with a favorable prognosis in whom HPV 16/18 with the absence of virus DNA in the cellular genome was detected.
Примеры конкретного использования предлагаемого способа.Examples of specific uses of the proposed method.
Пример 1. Выявление пациенток с ВПЧ-отрицательным, ВПЧ16/18-позитивными РШМ.Example 1. Identification of patients with HPV-negative, HPV16 / 18-positive cervical cancer.
У 194 первичных больных отделения лучевых и комбинированных методов лечения гинекологических заболеваний МРНЦ им. А.Ф. Цыба - филиала ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России с морфологически верифицированным РШМ I-IV стадий до лечения брали соскобы из цервикального канала и наружной поверхности ШМ. Из полученных образцов выделяли ДНК с использованием тест-наборов, описанных выше. Методом ПЦР в режиме реального времени на "Rotor Gene" ("Corbet Research", Австралия) проводили исследование на наличие ВПЧ ВКР и генотипирование ДНК вируса с использованием тест-наборов в соответствии с заявляемой методикой, подробно описанной выше.In 194 primary patients of the Department of Radiation and Combined Methods of Treatment of Gynecological Diseases, MRNTs im. A.F. Tsyba, a branch of the Federal State Budgetary Institution Scientific Research Center for Radiology of the Ministry of Health of the Russian Federation with morphologically verified cervical cancer of stages I-IV, scrapings were taken from the cervical canal and the external surface of the cervical cancer before treatment. DNA was isolated from the obtained samples using the test kits described above. Real-time PCR using the Rotor Gene (Corbet Research, Australia) carried out a study for the presence of HPV SRS and genotyping of virus DNA using test kits in accordance with the claimed method described in detail above.
У 24 пациенток выявлен ВПЧ-отрицательный РШМ, у 170 - ВПЧ-позитивный. При анализе результатов согласно стадиям заболевания обнаружено, что при РШМ II стадии: ВПЧ-отрицательный наблюдался у 3-х больных, ВПЧ16-позитивный - у 40, ВПЧ 18-позитивные - у 11; и при РШМ III стадии: ВПЧ-отрицательный - у 16, ВПЧ16-позитивный - у 45 и ВПЧ 18-позитивный - у 7 пациенток.In 24 patients, HPV-negative cervical cancer was detected, in 170 - HPV-positive. When analyzing the results according to the stages of the disease, it was found that with stage II cervical cancer: HPV-negative was observed in 3 patients, HPV16-positive in 40, HPV 18-positive in 11; and with stage III cervical cancer: HPV-negative - in 16, HPV16-positive - in 45 and HPV 18-positive - in 7 patients.
Пример 2. Анализ количества ДНК ВПЧ 16 или 18 типа и наличия интеграции ДНК ВПЧ 16/18 в биологических образцах.Example 2. Analysis of the amount of HPV DNA type 16 or 18 and the presence of integration of HPV 16/18 DNA in biological samples.
У 135 больных РШМ II-III стадии с выявленной ВПЧ 16/18 инфекцией (109 - ВПЧ 16, 26 - ВПЧ 18) проведено исследование количества ДНК и физического статуса вируса (наличие или отсутствие интеграции вирусной ДНК в клеточный геном). В соответствии с заявляемым способом (п. 9) число копий ДНК ВПЧ в клетке оценивали по соотношению количества гена Е7 вируса и β-глобина клетки (Е7/β-глобин) и нормировали эту величину на 100 тыс. клеток (1 клетка содержит 2 β-глобина). Наличие интеграции ДНК вируса в геном клетки-хозяина оценивали в соответствии с заявляемым способом (п. 10) по соотношению количества вирусных генов Е7/Е2 с учетом коэффициента вариации (CV) и стандартного отклонения (SD) для трех повторов согласно разработанному алгоритму. При CV≤10% и Е7/Е2≥1,3 - интеграция обнаружена, если Е7/Е2<1,3 - интеграция не обнаружена. При CV>10% образец характеризуется наличием интеграции только в случае, когда (Е7/Е2-2,5 SD)≥1. Если (Е7/Е2-2,5 SD)<1, результат - неопределенный, требуется повторный анализ.In 135 patients with stage II-III cervical cancer with a detected HPV 16/18 infection (109 - HPV 16, 26 - HPV 18), the amount of DNA and the physical status of the virus (the presence or absence of integration of viral DNA into the cellular genome) were studied. In accordance with the claimed method (p. 9), the number of copies of HPV DNA in a cell was estimated by the ratio of the number of the E7 gene of the virus and the β-globin of the cell (E7 / β-globin) and normalized to 100 thousand cells (1 cell contains 2 β -globin). The presence of integration of viral DNA into the genome of the host cell was evaluated in accordance with the claimed method (p. 10) by the ratio of the number of viral genes E7 / E2 taking into account the coefficient of variation (CV) and standard deviation (SD) for three repeats according to the developed algorithm. With CV≤10% and E7 / E2≥1.3 - integration is detected, if E7 / E2 <1.3 - integration is not detected. At CV> 10%, the sample is characterized by the presence of integration only when (E7 / E2-2.5 SD) ≥1. If (E7 / E2-2.5 SD) <1, the result is uncertain, reanalysis is required.
Наличие интеграции ДНК ВПЧ 16/18 обнаружено у 26 больных РШМ II стадии и у 28 - III стадии. У 24 больных РШМ II стадии и у 26 - III стадии интеграция ДНК ВПЧ 16/18 не выявлена.The presence of HPV 16/18 DNA integration was found in 26 patients with stage II cervical cancer and in stage 28 - III. In 24 patients with stage II cervical cancer and in stage 26 - III, the integration of HPV 16/18 DNA was not detected.
Пример 3. Сравнительное исследование количества ДНК ВПЧ 16 и 18 типа, наличия интеграции ДНК вируса и ее степени у ВПЧ 16/18-позитивных больных.Example 3. A comparative study of the amount of HPV DNA type 16 and 18, the presence of integration of the virus DNA and its degree in HPV 16/18-positive patients.
Проведено сравнение данных по количеству и степени интеграции ДНК ВПЧ 16/18 в образцах биоматериала больных с интегрированной формой вируса (98 человек), полученных в соответствии с заявляемым способом.Comparison of data on the number and degree of integration of HPV 16/18 DNA in samples of the biomaterial of patients with the integrated form of the virus (98 people) obtained in accordance with the claimed method.
Коэффициент корреляции R=-0,67 при уровне значимости р<0,000001, n=98 (Фиг. 1). Корреляционный анализ проведен с использованием пакета программ "Statistica-10".The correlation coefficient R = -0.67 at a significance level of p <0.000001, n = 98 (Fig. 1). Correlation analysis was carried out using the software package "Statistica-10".
Выраженная обратная корреляция количества ВПЧ 16/18 со степенью интеграции ДНК вируса свидетельствует о том, что одной из причин невыявления ВПЧ (ВПЧ-отрицательные образцы, п. 4) может быть очень низкое количество его копий (ниже порога чувствительности определения) при высокой степени интеграции вируса. Подобные ситуации неоднократно обсуждались в литературе [Kim JY, Park S, Nam BH et al. Low Initial Human Papilloma Viral Load Implicates Worse Prognosis in Patients With Uterine Cervical Cancer Treated With Radiotherapy // J. of Clinical Oncology. - 2009. - Vol. 27(30). - P. 5088-5093; Rodriguez-Carunchio L, Soveral I, Steenbergen RDM et al. HPV-negative carcinoma of uterine cervix: a distinct type of cervical cancer with poor prognosis // BJOG. - 2015. - V. 122(1). - P. 119-127). Известно, что при интеграции ДНК ВПЧ в клеточный геном нарушается репликация вируса, и его количество может очень сильно снижаться (Vozenin МС, Lord HK, Hart D et al. Unrevelling the biology papillomavirus (HPV) related tumours to enhance their radiosensitivity. // Cancer Treatment Review. - 2010. - V. 36. - P. 629-636).The pronounced inverse correlation of the number of HPV 16/18 with the degree of integration of the DNA of the virus indicates that one of the reasons for the non-detection of HPV (HPV-negative samples, paragraph 4) may be a very low number of copies (below the detection threshold) with a high degree of integration the virus. Similar situations have been repeatedly discussed in the literature [Kim JY, Park S, Nam BH et al. Low Initial Human Papilloma Viral Load Implicates Worse Prognosis in Patients With Uterine Cervical Cancer Treated With Radiotherapy // J. of Clinical Oncology. - 2009. - Vol. 27 (30). - P. 5088-5093; Rodriguez-Carunchio L, Soveral I, Steenbergen RDM et al. HPV-negative carcinoma of uterine cervix: a distinct type of cervical cancer with poor prognosis // BJOG. - 2015 .-- V. 122 (1). - P. 119-127). It is known that the integration of HPV DNA into the cellular genome disrupts the replication of the virus, and its number can be very much reduced (Vozenin MC, Lord HK, Hart D et al. Unrevelling the biology papillomavirus (HPV) related tumours to enhance their radiosensitivity. // Cancer Treatment Review. - 2010. - V. 36. - P. 629-636).
Полученные данные являются основанием для объединения образцов с интегрированной ДНК ВПЧ16/18 и ВПЧ-отрицательных в одну группу.The data obtained are the basis for combining samples with integrated HPV16 / 18 DNA and HPV-negative in one group.
Пример 4. Сравнительное исследование клинического исхода заболевания РШМ II-III стадии у пациенток с интегрированной ДНК ВПЧ16/18 и ВПЧ-отрицательных.Example 4. A comparative study of the clinical outcome of stage II-III cervical cancer in patients with integrated HPV16 / 18 DNA and HPV-negative.
Проведено сравнение данных по клиническому исходу заболевания у пациенток с интегрированной ДНК ВПЧ16/18 и пациенток, у которых вирус не выявлен (ВПЧ-отрицательных), полученных согласно заявляемому способу и приведенных в примерах 2 и 1, соответственно. Больные получали специализированное лечение по радикальным программам - лучевую или химиолучевую терапию.A comparison of data on the clinical outcome of the disease in patients with integrated HPV16 / 18 DNA and patients in whom the virus was not detected (HPV-negative) obtained according to the claimed method and are given in examples 2 and 1, respectively. Patients received specialized treatment according to radical programs - radiation or chemoradiotherapy.
Оценка частоты неблагоприятного клинического исхода проводилась по фактору прогрессирования заболевания и изучалась на сроках 2 г, 3 г, 5 л и 8 л после лечения. Анализ результатов показал отсутствие значимых отличий: согласно критерию Фишера (пакет программ «Statistica-10») р=0,71; 0,61; 0,43 и 0,80 соответственно при II стадии, р=0,22; 0,29; 0,62 и 0,73 - при III стадии РШМ.The frequency of adverse clinical outcome was assessed by the progression factor of the disease and was studied at 2 g, 3 g, 5 l and 8 l after treatment. The analysis of the results showed the absence of significant differences: according to the Fisher criterion (Statistica-10 software package) p = 0.71; 0.61; 0.43 and 0.80, respectively, at stage II, p = 0.22; 0.29; 0.62 and 0.73 - in stage III of cervical cancer.
Полученные данные являются основанием для объединения образцов с наличием интеграции ДНК ВПЧ16/18 типа и ВПЧ-отрицательных в одну группу.The data obtained are the basis for combining samples with the integration of HPV16 / 18 type DNA and HPV-negative into one group.
Пример 5. Относительный риск (relative risk - RR) плохого клинического исхода заболевания в группе больных РШМ II-III стадии.Example 5. The relative risk (relative risk - RR) of the poor clinical outcome of the disease in the group of patients with cervical cancer II-III stage.
В соответствии с заявляемым способом 123 первичных больных с морфологически верифицированным РШМ II-III стадии были разделены на группы с относительно благоприятными (ВПЧ16/18-позитивный с отсутствием интеграции вируса) и неблагоприятными (ВПЧ-отрицательный (невыявление вируса) или ВПЧ16/18-позитивный с наличием интеграции ДНК вируса) факторами. Больным проводились радикальные курсы химиолучевого или лучевого лечения. На сроках 2 г, 3 г, 5 л и 8 л после окончания лечения в указанных группах проводили оценку эффективности проведенной терапии по показателям прогрессирования заболевания в соответствии с критерием Фишера (пакет программ «Statistica-10", Реброва О.Ю. Статистический анализ медицинских данных. Применение пакета программ "Statistica 6.0" // МедиаСфера, Москва 2006). Рассчитывали величину и доверительный интервал относительного риска (RR) плохого клинического исхода заболевания, величину и доверительный интервал AUC - интегрального показателя, объединяющего такие характеристики как чувствительность и специфичность теста [пакет программ «MedCalc», Рубанович А.В., Хромов-Борисов Н.Н. Теоретический анализ показателей предсказательной эффективности бинарных генетических тестов // Экологическая генетика. - 2013. - Т. 11. - №1. - С. 77-90).In accordance with the claimed method, 123 primary patients with morphologically verified cervical cancer of the II-III stage were divided into groups with relatively favorable (HPV16 / 18 positive with no virus integration) and adverse (HPV negative (non-detection of the virus) or HPV16 / 18 positive with the presence of virus DNA integration) factors. Patients received radical courses of chemoradiation or radiation treatment. On the terms of 2 g, 3 g, 5 l and 8 l after the end of treatment, the indicated groups evaluated the effectiveness of the therapy according to the disease progression indicators in accordance with the Fisher criterion (Statistica-10 software package, O. Rebrova. Statistical analysis of medical The use of the Statistica 6.0 software package // MediaSfera, Moscow 2006). The magnitude and confidence interval of the relative risk (RR) of the poor clinical outcome of the disease, the magnitude and confidence interval of AUC, an integral indicator combining such characteristics as sensitivity and specificity of the test [MedCalc software package, Rubanovich AV, Khromov-Borisov NN Theoretical analysis of indicators of predictive effectiveness of binary genetic tests // Ecological genetics. - 2013. - V. 11. - No. 1 . - S. 77-90).
В соответствии с полученными результатами относительный риск (RR) плохого клинического исхода заболевания в несколько раз выше у больных с неблагоприятными факторами: невыявление вируса или наличие интеграции ДНК ВПЧ16/18 типа в клеточный геном при ВПЧ16/18-позитивных формах РШМ (см. таблицу 1).In accordance with the results, the relative risk (RR) of poor clinical outcome of the disease is several times higher in patients with adverse factors: non-detection of the virus or the presence of integration of HPV type 16/18 DNA into the cellular genome with HPV16 / 18-positive forms of cervical cancer (see table 1 )
Высокий уровень показателя AUC на всех сроках наблюдения после лечения свидетельствует о высокой прогностической эффективности выбранного биомаркера - невыявление вируса или наличие интеграции ДНК ВПЧ16/18 в геном клетки-хозяина.A high level of AUC in all follow-up periods after treatment indicates a high prognostic effectiveness of the selected biomarker - non-detection of the virus or the presence of integration of HPV16 / 18 DNA into the genome of the host cell.
Пример 6. Относительный риск (relative risk - RR) плохого клинического исхода заболевания в группе больных РШМ II стадии с неблагоприятными факторами.Example 6. The relative risk (RR) of the poor clinical outcome of the disease in a group of patients with stage II cervical cancer with unfavorable factors.
В соответствии с заявляемым способом больные РШМ II стадии (53 человека) были разделены на группы с относительно благоприятными (отсутствие интеграции ДНК вируса у ВПЧ16/18-позитивных пациенток) и неблагоприятными (невыявление вируса или наличие интеграции ДНК вируса у ВПЧ16/18-позитивных пациенток) факторами. На сроках 2 г, 3 г, 5 л и 8 л после окончания химиолучевого или лучевого лечения в указанных группах проводили сравнение частоты прогрессирования заболевания, рассчитывали величину и доверительный интервал относительного риска (RR) плохого клинического исхода заболевания, величину и доверительный интервал AUC по той же схеме, что и в примере 5 (см. таблицу 2).In accordance with the claimed method, patients with stage II cervical cancer (53 people) were divided into groups with relatively favorable (lack of virus DNA integration in HPV16 / 18-positive patients) and adverse (non-detection of the virus or presence of virus DNA integration in HPV16 / 18-positive patients ) factors. On the terms of 2 g, 3 g, 5 l and 8 l after the end of chemoradiation or radiation treatment in these groups, we compared the rate of disease progression, calculated the magnitude and confidence interval of the relative risk (RR) of the poor clinical outcome of the disease, the magnitude and confidence interval of AUC for the same scheme as in example 5 (see table 2).
* Рассчитать относительный риск неблагоприятного исхода заболевания на сроках 2 и 3 г у больных с РШМ II стадии не представляется возможным, поскольку в знаменатель формулы расчета попадает ноль из-за отсутствия в группе с благоприятными факторами случаев прогрессирования заболевания.* It is not possible to calculate the relative risk of an unfavorable outcome of the disease at periods of 2 and 3 g in patients with stage II cervical cancer, since zero falls into the denominator of the calculation formula because there are no cases of disease progression in the group with favorable factors.
Пример 7. Относительный риск (relative risk - RR) плохого клинического исхода заболевания в группе больных РШМ III стадии.Example 7. The relative risk (relative risk - RR) of the poor clinical outcome of the disease in the group of patients with stage III cervical cancer.
В соответствии с заявляемым способом 70 больных РШМ III стадии были разделены на группы с относительно благоприятными (ВПЧ16/18-позитивные с отсутствием интеграции вируса) и неблагоприятными (ВПЧ-отрицательные (невыявление вируса) или ВПЧ16/18-позитивные с наличием интеграции ДНК вируса) факторами. На сроках 2 г, 3 г, 5 л и 8 л после окончания химиолучевого или лучевого лечения в указанных группах проводили сравнение частоты прогрессирования заболевания, рассчитывали величину и доверительный интервал относительного риска (RR) плохого клинического исхода заболевания, величину и доверительный интервал AUC по той же схеме, что и в примере №5 и 6 (см. таблицу 3).In accordance with the inventive method, 70 patients with stage III cervical cancer were divided into groups with relatively favorable (HPV16 / 18 positive with no virus integration) and unfavorable (HPV negative (non-detection of the virus) or HPV16 / 18 positive with the presence of virus DNA integration) factors. On the terms of 2 g, 3 g, 5 l and 8 l after the end of chemoradiation or radiation treatment in these groups, we compared the rate of disease progression, calculated the magnitude and confidence interval of the relative risk (RR) of the poor clinical outcome of the disease, the magnitude and confidence interval of AUC for the same scheme as in example No. 5 and 6 (see table 3).
Пример 8. Безрецидивная и общая выживаемость больных РШМ II-III стадии.Example 8. Relapse-free and overall survival of patients with cervical cancer II-III stage.
В соответствии с заявляемым способом (п. 11) пациентки с РШМ II-III стадии были разделены на группы с относительно благоприятными факторами (ВПЧ16/18-позитивные с отсутствием интеграции вируса) и неблагоприятными факторами (ВПЧ-отрицательные - невыявление вируса) или ВПЧ16/18-позитивные с наличием интеграции ДНК вируса). В этих группах проводили сравнительную оценку выживаемости больных методом Каплан-Мейера и log-rank теста на сроках 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 и 8 лет после лечения (Фиг. 2, 3). Установлено, что вероятность прожить до 8 лет без прогрессирования заболевания у пациенток прогностически благоприятной группы (безрецидивная выживаемость) статистически значимо выше, чем в прогностически неблагоприятной (р<0,00001, log-rank). Вероятность летального исхода (общая выживаемость) на момент окончания наблюдения (8 лет) в прогностически благоприятной группе значимо ниже, чем в прогностически неблагоприятной (р<0,0001, log-rank).In accordance with the claimed method (p. 11), patients with stage II-III cervical cancer were divided into groups with relatively favorable factors (HPV16 / 18-positive with no integration of the virus) and adverse factors (HPV-negative - non-detection of the virus) or HPV16 / 18-positive with the presence of virus DNA integration). In these groups, a comparative assessment of the survival of patients by the Kaplan-Meier method and the log-rank test at 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, and 8 years after treatment was performed (Fig. 2, 3). It was established that the probability of living up to 8 years without disease progression in patients of a prognostically favorable group (relapse-free survival) is statistically significantly higher than in a prognostically unfavorable group (p <0.00001, log-rank). The probability of a fatal outcome (overall survival) at the end of the observation (8 years) in the prognostically favorable group is significantly lower than in the prognostically unfavorable group (p <0.0001, log-rank).
Пример 9. Безрецидивная и общая выживаемость больных РШМ II стадии.Example 9. Relapse-free and overall survival of patients with stage II cervical cancer.
В соответствии с заявляемым способом (п. 11) пациентки с РШМ II стадии были разделены на группы с относительно благоприятными факторами (ВПЧ16/18-позитивные с отсутствием интеграции вируса) и неблагоприятными факторами (ВПЧ-отрицательные - невыявление вируса) или ВПЧ16/18-позитивные с наличием интеграции ДНК вируса). В этих группах проводили сравнительную оценку выживаемости больных методом Каплан-Мейера и log-rank теста на сроках 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 и 8 лет после лечения (Фиг. 4, 5). Установлено, что вероятность прожить до 8 лет без прогрессирования заболевания у пациенток прогностически благоприятной группы (безрецидивная выживаемость) статистически значимо выше, чем в прогностически неблагоприятной (р=0,003, log-rank). Вероятность летального исхода (общая выживаемость) на момент окончания наблюдения (8 лет) в прогностически благоприятной группе значимо ниже, чем в прогностически неблагоприятной (р=0,005, log-rank).In accordance with the claimed method (p. 11), patients with stage II cervical cancer were divided into groups with relatively favorable factors (HPV16 / 18-positive with no virus integration) and adverse factors (HPV-negative - non-detection of the virus) or HPV16 / 18- positive with the presence of virus DNA integration). In these groups, a comparative assessment of the survival of patients by the Kaplan-Meyer method and the log-rank test at 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, and 8 years after treatment was performed (Fig. 4, 5). It was established that the probability of living up to 8 years without disease progression in patients of a prognostically favorable group (disease-free survival) is statistically significantly higher than in a prognostically unfavorable group (p = 0.003, log-rank). The probability of death (overall survival) at the time of observation (8 years) in the prognostically favorable group is significantly lower than in the prognostically unfavorable (p = 0.005, log-rank).
Пример 10. Безрецидивная и общая выживаемость больных РШМ III стадии.Example 10. Relapse-free and overall survival of patients with stage III cervical cancer.
В соответствии с заявляемым способом (п. 11) пациентки с РШМ III стадии были разделены на группы с относительно благоприятными факторами (ВПЧ16/18-позитивные с отсутствием интеграции вируса) и неблагоприятными факторами (ВПЧ-отрицательные - невыявление вируса) или ВПЧ16/18-позитивные с наличием интеграции ДНК вируса). В этих группах проводили сравнительную оценку выживаемости больных методом Каплан-Мейера и log-rank теста на сроках 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 и 8 лет после лечения (Фиг. 6, 7).In accordance with the claimed method (p. 11), patients with stage III cervical cancer were divided into groups with relatively favorable factors (HPV16 / 18 positive with no integration of the virus) and adverse factors (HPV negative - non-detection of the virus) or HPV16 / 18- positive with the presence of virus DNA integration). In these groups, a comparative assessment of the survival of patients by the Kaplan-Meier method and the log-rank test at 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, and 8 years after treatment was performed (Fig. 6, 7).
Установлено, что вероятность прожить до 8 лет без прогрессирования заболевания у пациенток прогностически благоприятной группы (безрецидивная выживаемость) статистически значимо выше, чем в прогностически неблагоприятной (р<0,0001, log-rank). Вероятность летального исхода (общая выживаемость) на момент окончания наблюдения (8 лет) в прогностически благоприятной группе значимо ниже, чем в прогностически неблагоприятной (р=0,004, log-rank).It was established that the probability of living up to 8 years without disease progression in patients of a prognostically favorable group (relapse-free survival) is statistically significantly higher than in a prognostically unfavorable group (p <0.0001, log-rank). The probability of a fatal outcome (overall survival) at the time of observation (8 years) in the prognostically favorable group is significantly lower than in the prognostically unfavorable group (p = 0.004, log-rank).
Все вышеперечисленные примеры подтверждают достижение технического результата:All of the above examples confirm the achievement of the technical result:
Пример 1 - свидетельствует о доле больных РШМ II и III стадии, инфицированных ВПЧ 16 или 18 типа, и «ВПЧ-отрицательных» (ВПЧ ВКР не выявлен), к которым применяется заявляемый способ прогнозирования клинического исхода заболевания.Example 1 - indicates the proportion of patients with cervical cancer of stage II and III infected with HPV type 16 or 18, and "HPV-negative" (HPV SRS not detected), to which the claimed method is used to predict the clinical outcome of the disease.
Пример 2 - свидетельствует о доле больных РШМ II и III стадии с наличием интегрированной ДНК ВПЧ16 или 18 типа и больных, у которых интеграция ДНК вируса не обнаружена, к которым применяется заявляемый способ прогнозирования клинического исхода заболевания.Example 2 - indicates the proportion of patients with cervical cancer of stage II and III with the presence of integrated HPV DNA type 16 or 18 and patients whose integration of the DNA of the virus is not detected, to which the claimed method is used to predict the clinical outcome of the disease.
Пример 3 - демонстрирует возможную причину невыявления вируса (ВПЧ-отрицательные образцы) - очень низкое количество копий вируса (ниже порога чувствительности определения) при высокой степени интеграции ДНК ВПЧ в клеточный геном, тем самым обосновывая объединение ВПЧ-отрицательных образцов и образцов с высокоинтегрированной ДНК ВПЧ16 или 18 в одну группу.Example 3 - demonstrates a possible cause of non-detection of the virus (HPV-negative samples) - a very low number of virus copies (below the detection threshold) with a high degree of integration of HPV DNA into the cell genome, thereby justifying the combination of HPV-negative samples and highly integrated HPV DNA16 or 18 in one group.
Пример 4 - свидетельствует об отсутствии значимых различий по клиническому исходу заболевания у пациенток с наличием интеграции ДНК ВПЧ16/18 и ВПЧ-отрицательных, обосновывая объединение ВПЧ-отрицательных случаев и случаев с интегрированной ДНК ВПЧ16 или 18 в одну группу.Example 4 - indicates the absence of significant differences in the clinical outcome of the disease in patients with the integration of HPV16 / 18 DNA and HPV-negative, justifying the combination of HPV-negative cases and cases with integrated HPV16 or 18 DNA in one group.
Пример 5 - проспективно доказывает эффективность заявляемого способа раннего выявления больных местнораспространенным РШМ (II-III стадии) с высоким риском плохого клинического исхода. Установлены критерии, соответствующие плохому клиническому исходу заболевания: невыявление ВПЧ ВКР или наличие интеграции ДНК ВПЧ16 или 18 типа в клеточный геном.Example 5 - prospectively proves the effectiveness of the proposed method for the early detection of patients with locally advanced cervical cancer (II-III stage) with a high risk of poor clinical outcome. Criteria have been established that correspond to the poor clinical outcome of the disease: non-detection of HPV SRS or the presence of integration of HPV16 or type 18 DNA into the cellular genome.
Пример 6 - проспективно доказывает эффективность заявляемого способа раннего выявления больных РШМ II стадии с высоким риском плохого клинического исхода. Установлены критерии, соответствующие плохому клиническому исходу заболевания: невыявление ВПЧ ВКР или наличие интеграции ДНК ВПЧ16 или 18 типа в клеточный геном. Пример 6 доказывает, что установленные критерии являются фактором прогноза плохого клинического исхода независимо от стадии заболевания.Example 6 prospectively proves the effectiveness of the proposed method for the early detection of patients with stage II cervical cancer with a high risk of poor clinical outcome. Criteria have been established that correspond to the poor clinical outcome of the disease: non-detection of HPV SRS or the presence of integration of HPV16 or type 18 DNA into the cellular genome. Example 6 proves that the established criteria are a factor in predicting a poor clinical outcome, regardless of the stage of the disease.
Пример 7 - проспективно доказывает эффективность заявляемого способа раннего выявления больных РШМ III стадии с высоким риском плохого клинического исхода. Установлены критерии, соответствующие плохому клиническому исходу заболевания: невыявление ВПЧ ВКР или наличие интеграции ДНК ВПЧ16 или 18 типа в клеточный геном. Пример 7 доказывает, что установленные критерии являются фактором прогноза плохого клинического исхода независимо от стадии заболевания.Example 7 - prospectively proves the effectiveness of the proposed method for the early detection of cervical cancer stage III with a high risk of poor clinical outcome. Criteria have been established that correspond to the poor clinical outcome of the disease: non-detection of HPV SRS or the presence of integration of HPV16 or type 18 DNA into the cellular genome. Example 7 proves that the established criteria are a predictor of poor clinical outcome, regardless of the stage of the disease.
Пример 8 - доказывает эффективность заявляемого способа раннего выявления больных местнораспространенным РШМ (II-III стадии) с высоким риском плохого клинического исхода заболевания. В соответствии с установленными критериями неблагоприятного прогноза (невыявление ВПЧ ВКР или наличие интеграции ДНК ВПЧ16 или 18 типа в клеточный геном) в группе пациенток с плохим прогнозом статистически значимо ниже как безрецидивная, так и общая выживаемость на сроках до 8 лет.Example 8 - proves the effectiveness of the proposed method for the early detection of patients with locally advanced cervical cancer (stage II-III) with a high risk of poor clinical outcome of the disease. In accordance with the established criteria for an unfavorable prognosis (non-detection of HPV VCR or the presence of integration of HPV16 or type 18 DNA into the cellular genome) in the group of patients with a poor prognosis, both disease-free and overall survival for periods up to 8 years are statistically significantly lower.
Пример 9 - доказывает эффективность заявляемого способа раннего выявления больных РШМ II стадии с высоким риском плохого клинического исхода заболевания. В соответствии с установленными критериями неблагоприятного прогноза (невыявление ВПЧ ВКР или наличие интеграции ДНК ВПЧ16 или 18 типа в клеточный геном) в группе пациенток с плохим прогнозом статистически значимо ниже как безрецидивная, так и общая выживаемость на сроках до 8 лет. Пример 9 доказывает, что установленные критерии являются фактором прогноза плохого клинического исхода независимо от стадии заболевания.Example 9 - proves the effectiveness of the proposed method for early detection of cervical cancer stage II with a high risk of poor clinical outcome of the disease. In accordance with the established criteria for an unfavorable prognosis (non-detection of HPV VCR or the presence of integration of HPV16 or type 18 DNA into the cellular genome) in the group of patients with a poor prognosis, both disease-free and overall survival for periods up to 8 years are statistically significantly lower. Example 9 proves that the established criteria are a predictor of poor clinical outcome, regardless of the stage of the disease.
Пример 10 - доказывает эффективность заявляемого способа раннего выявления больных РШМ III стадии с высоким риском плохого клинического исхода заболевания. В соответствии с установленными критериями неблагоприятного прогноза (невыявление ВПЧ ВКР или наличие интеграции ДНК ВПЧ16 или 18 типа в клеточный геном) в группе пациенток с плохим прогнозом статистически значимо ниже как безрецидивная, так и общая выживаемость на сроках до 8 лет. Пример 10 доказывает, что установленные критерии являются фактором прогноза плохого клинического исхода независимо от стадии заболевания.Example 10 - proves the effectiveness of the proposed method for the early detection of cervical cancer stage III with a high risk of poor clinical outcome of the disease. In accordance with the established criteria for an unfavorable prognosis (non-detection of HPV VCR or the presence of integration of HPV16 or type 18 DNA into the cellular genome) in the group of patients with a poor prognosis, both disease-free and overall survival for periods up to 8 years are statistically significantly lower. Example 10 proves that the established criteria are a predictor of poor clinical outcome, regardless of the stage of the disease.
Использование в клинической практике заявляемого способа позволяет сформировать среди больных местнораспространенным РШМ группы повышенного риска плохого клинического исхода заболевания. Заявленный способ применим и доступен в лабораториях обычных клиник, несложен в исполнении и имеет медицинский, экономический и социальный эффект.Use in clinical practice of the proposed method allows to form groups among patients with locally advanced cervical cancer with an increased risk of a poor clinical outcome of the disease. The claimed method is applicable and available in laboratories of conventional clinics, is simple to implement and has a medical, economic and social effect.
Claims (6)
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2018104661A RU2674675C2 (en) | 2018-02-07 | 2018-02-07 | Method for predicting the clinical outcome of locally advanced forms of cervical cancer |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2018104661A RU2674675C2 (en) | 2018-02-07 | 2018-02-07 | Method for predicting the clinical outcome of locally advanced forms of cervical cancer |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2018104661A RU2018104661A (en) | 2018-04-26 |
| RU2018104661A3 RU2018104661A3 (en) | 2018-10-24 |
| RU2674675C2 true RU2674675C2 (en) | 2018-12-12 |
Family
ID=62044378
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2018104661A RU2674675C2 (en) | 2018-02-07 | 2018-02-07 | Method for predicting the clinical outcome of locally advanced forms of cervical cancer |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2674675C2 (en) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2694834C1 (en) * | 2018-08-06 | 2019-07-17 | Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Томский национальный исследовательский медицинский центр" Российской академии наук ("Томский НИМЦ") | Method for recurrence-free survival and overall survival in hpv 16-positive cervical cancer patients |
Citations (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2504326C1 (en) * | 2012-12-13 | 2014-01-20 | Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Челябинская государственная медицинская академия" Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации (ГБОУ ВПО ЧелГМА Минздравсоцразвития России) | Method of predicting unfavourable course of locally spread forms of human papilloma virus-associated cervical cancer |
-
2018
- 2018-02-07 RU RU2018104661A patent/RU2674675C2/en active
Patent Citations (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2504326C1 (en) * | 2012-12-13 | 2014-01-20 | Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Челябинская государственная медицинская академия" Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации (ГБОУ ВПО ЧелГМА Минздравсоцразвития России) | Method of predicting unfavourable course of locally spread forms of human papilloma virus-associated cervical cancer |
Non-Patent Citations (5)
| Title |
|---|
| HYE-JIN SHIN et al. Physical Status of Human Papillomavirus Integration in Cervical Cancer Is Associated with Treatment Outcome of the Patients Treated with Radiotherapy // PLOS ONE. 2014. Vol. 9(1), e78995. * |
| HYE-JIN SHIN et al. Physical Status of Human Papillomavirus Integration in Cervical Cancer Is Associated with Treatment Outcome of the Patients Treated with Radiotherapy // PLOS ONE. 2014. Vol. 9(1), e78995. КАЙРБАЕВ М.Р. Факторы прогноза местнораспространенного рака шейки матки. Сибирский онкологический журнал. 2009. N4 (34), с. 32-35. * |
| MORENO-ACOSTA P et al. Novel predictive biomarkers for cervical cancer prognosis. Mol Clin Oncol. 2016 Dec;5(6):792-796. PMID: 28101358. * |
| КАЙРБАЕВ М.Р. Факторы прогноза местнораспространенного рака шейки матки. Сибирский онкологический журнал. 2009. N4 (34), с. 32-35. ЧУРУКСАЕВА О. Н. и др. Онкотропная папилломавирусная инфекция и прогноз течения рака шейки матки. Сибирский онкологический журнал. 2013. N 1 (55), с. 82-87. MORENO-ACOSTA P et al. Novel predictive biomarkers for cervical cancer prognosis. Mol Clin Oncol. 2016 Dec;5(6):792-796. PMID: 28101358. * |
| ЧУРУКСАЕВА О. Н. и др. Онкотропная папилломавирусная инфекция и прогноз течения рака шейки матки. Сибирский онкологический журнал. 2013. N 1 (55), с. 82-87. * |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| RU2018104661A3 (en) | 2018-10-24 |
| RU2018104661A (en) | 2018-04-26 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| AU2010230417B2 (en) | Method for diagnosis of cancer and monitoring of cancer treatments | |
| WO2020220994A1 (en) | Microrna marker combination for diagnosing gastric cancer and diagnostic kit | |
| Nakagawa et al. | Type of human papillomavirus is related to clinical features of cervical carcinoma | |
| CN111172279B (en) | Model for diagnosing lung cancer by combined detection of peripheral blood methylation gene and IDH1 | |
| Zheng et al. | Expression and clinical implications of homeobox gene Six1 in cervical cancer cell lines and cervical epithelial tissues | |
| KR102067607B1 (en) | Application of Y Chromosome Methylation Site as a Prognostic Cancer Diagnostic Marker | |
| Manawapat-Klopfer et al. | TMEM45A, SERPINB5 and p16INK4A transcript levels are predictive for development of high-grade cervical lesions | |
| Frega et al. | Assessment of HPV-mRNA test to predict recurrent disease in patients previously treated for CIN 2/3 | |
| Brewer et al. | A study of biomarkers in cervical carcinoma and clinical correlation of the novel biomarker MN | |
| Bruno et al. | A prospective study of women with ASCUS or LSIL pap smears at baseline and HPV E6/E7 mRNA positive: a 3-year follow-up | |
| Nowak et al. | Multiple HPV infections among men who have sex with men engaged in anal cancer screening in Abuja, Nigeria | |
| Jentschke et al. | Evaluation of a new multiplex real-time polymerase chain reaction assay for the detection of human papillomavirus infections in a referral population | |
| RU2674675C2 (en) | Method for predicting the clinical outcome of locally advanced forms of cervical cancer | |
| US20110171628A1 (en) | Cervical screening algorithms | |
| RU2572340C1 (en) | Method of predicting progression of mild intraepithelial neoplasia in women of young and first period of mature age | |
| RU2503960C1 (en) | Method for assessing conditions of proliferative cervical diseases | |
| Capo-Chichi et al. | Diversity of high risk human papilloma viruses in women treated with antiretroviral and in healthy controls and discordance with cervical dysplasia in the South of Benin | |
| RU2719581C1 (en) | Method for predicting the risk of recurrence in hpv16-positive patients with squamous intraepithelial high-grade disease on the basis of determining the physical status of the virus | |
| JP7239973B2 (en) | Method for assisting prediction of presence or absence of precancerous lesion or cancer | |
| Kong et al. | Cytological DNA methylation for cervical cancer screening: a validation set | |
| RU2532344C2 (en) | Diagnostic technique for hyperproliferative conditions and method for assessing risk of cervical cancer accompanying cervical intraepithelial neoplasia and papilloma virus carrier state by determinig mrna of functional human gene complex | |
| WO2020135422A1 (en) | Health risk assessment method | |
| RU2694834C1 (en) | Method for recurrence-free survival and overall survival in hpv 16-positive cervical cancer patients | |
| Hu et al. | The role of FH detection combined with HPV screening on the diagnostic significance of cervical cancer and precancerous lesions. | |
| Bicskei et al. | A comparison of the Linear Array and the Automated INNO-LiPA HPV Genotyping Systems on Pathological Specimens |