RU2719581C1 - Method for predicting the risk of recurrence in hpv16-positive patients with squamous intraepithelial high-grade disease on the basis of determining the physical status of the virus - Google Patents

Method for predicting the risk of recurrence in hpv16-positive patients with squamous intraepithelial high-grade disease on the basis of determining the physical status of the virus Download PDF

Info

Publication number
RU2719581C1
RU2719581C1 RU2019118923A RU2019118923A RU2719581C1 RU 2719581 C1 RU2719581 C1 RU 2719581C1 RU 2019118923 A RU2019118923 A RU 2019118923A RU 2019118923 A RU2019118923 A RU 2019118923A RU 2719581 C1 RU2719581 C1 RU 2719581C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
hpv
risk
recurrence
hpv16
cervical
Prior art date
Application number
RU2019118923A
Other languages
Russian (ru)
Inventor
Марина Константиновна Ибрагимова
Ольга Николаевна Чуруксаева
Ольга Владимировна Шпилева
Максим Михайлович Цыганов
Ирина Валерьевна Дерюшева
Лариса Александровна Коломиец
Николай Васильевич Литвяков
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Томский национальный исследовательский медицинский центр" Российской академии наук ("Томский НИМЦ")
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Томский национальный исследовательский медицинский центр" Российской академии наук ("Томский НИМЦ") filed Critical Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Томский национальный исследовательский медицинский центр" Российской академии наук ("Томский НИМЦ")
Priority to RU2019118923A priority Critical patent/RU2719581C1/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2719581C1 publication Critical patent/RU2719581C1/en

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6806Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/686Polymerase chain reaction [PCR]
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

FIELD: medicine.
SUBSTANCE: invention refers to medicine, particularly to oncology, and aims at predicting the risk of recurrence in HPV16-positive patients with severe squamous intraepithelial involvement. DNA is extracted from biological material of epithelial scrapings of cervical canal and external part of cervical uteri. Real-time PCR is performed. Presence and typing of human papilloma virus (HPV) is determined. Physical status of type 16 HPV is analyzed. If observing an episomal form of type 16 HPV, a favorable outcome of the disease is predicted. If the integrated form is present, a recurrence of the disease is predicted.
EFFECT: invention provides higher accuracy and information value of a method for prediction of risk of recurrent cervical intraepithelial neoplasia of severe degree in HPV16-positive patients.
1 cl, 1 dwg, 2 ex

Description

Изобретение относится к области медицины, конкретно к онкологии, и может быть использовано для прогнозирования риска рецидивирования у ВПЧ16-позитивных больных с плоскоклеточным интраэпителиальным поражением тяжелой степени.The invention relates to medicine, specifically to oncology, and can be used to predict the risk of recurrence in HPV16-positive patients with severe squamous intraepithelial lesion.

На сегодняшний день достоверно установлено, что вирус папилломы человека (ВПЧ) высокого канцерогенного риска (ВКР) является важнейшим фактором канцерогенеза шейки матки [1]. Данный вирус является эпителиотропным, и, при проникновении в организм, инфицирует базальный слой эпителия шейки матки. При этом главной мишенью для воздействия онкогенных типов вируса является зона трансформации шейки матки. Как следствие инфицирования ВПЧ ВКР наблюдаются морфологические изменения эпителия шейки матки, что приводит к развитию цервикальных интраэпителиальных неоплазий различной степени тяжести - LSIL (Low grade squamous intraepitelial lesion, низкая степень интраэпителиального повреждения плоского эпителия) и HSIL (High grade squamous intraepitelial lesion, высокая степень интраэпителиального повреждения плоского эпителия) с возможным последующим озлокачествлением [2]. Согласно данным мировой литературы, именно пациенткам с высокой степенью интраэпителиального повреждения плоского эпителия (HSIL) необходимо максимально четкое и быстрое назначение терапевтического и проведение хирургического лечения с учетом всех сопутствующих клинических показателей. Кроме того, именно у этих пациентов существует высокий риск рецидивирования и малигнизации, а прогнозирование этого риска является актуальной задачей.To date, it has been reliably established that the human papillomavirus (HPV) of high carcinogenic risk (SRS) is the most important factor in carcinogenesis of the cervix [1]. This virus is epithelial, and when it enters the body, it infects the basal layer of the cervical epithelium. Moreover, the main target for exposure to oncogenic types of the virus is the cervical transformation zone. As a result of HPV infection with SRS, morphological changes in the cervical epithelium are observed, which leads to the development of cervical intraepithelial neoplasias of varying severity - LSIL (Low grade squamous intraepitelial lesion, low degree of intraepithelial damage to squamous epithelium) and HSIL (High grade squamous intraepitelial lesion, high degree damage to the squamous epithelium) with possible subsequent malignancy [2]. According to the world literature, it is precisely patients with a high degree of intraepithelial damage to squamous epithelium (HSIL) who need the most clear and fast therapeutic and surgical treatment, taking into account all the accompanying clinical indicators. In addition, it is in these patients that there is a high risk of recurrence and malignancy, and predicting this risk is an urgent task.

В качестве стандартного показателя инфицирования вирусом применяется оценка вирусной нагрузки ВПЧ ВКР. Многократно показано, что клинически значимая вирусная нагрузка (>3 lg) - статистически чаще наблюдается у больных с высокой степенью интраэпителиального повреждения плоского эпителия, по сравнению с пациентами с LSIL. Более того, подобная закономерность прослеживается и при уже сформировавшейся злокачественной патологии шейки матки - у больных раком шейки матки (РШМ) статистически чаще наблюдается клинически значимая вирусная нагрузка, чем у пациентов с интраэпителиальной неоплазией [3]. Однако, согласно результатам собственных предыдущих исследований, вирусная нагрузка не может выступать в качестве прогностического фактора при раке шейки матки и с ее помощью нельзя прогнозировать безрецидивную выживаемость [4]. Другим показателем вирусной инфекции, который исследуется в настоящее время, является физический статус вируса. Согласно современным литературным данным, ВПЧ после проникновения в клетку, может существовать в 3-х различных функциональных состояниях: эписомальная (свободная) форма (вне хромосом клетки), интегрированная (встроенная) (встроена в геном клетки) и смешанная форма (одновременное наличие свободного и встроенного в ДНК клетки-хозяина вируса) [5]. Нами было показано, что физический статус является прогностическим фактором при РШМ и с помощью его определения можно прогнозировать исход у больных РШМ [4]. Таким образом, для формирования групп риска и планирования терапии прогноз возникновения рецидивов важен не только при опухолевых заболеваниях шейки матки, но и при интраэпителиальной неоплазий с высокой степенью интраэпителиального повреждения плоского эпителия - HSIL.As a standard indicator of virus infection, an assessment of the viral load of HPV SRS is used. It has been repeatedly shown that clinically significant viral load (> 3 lg) is statistically more often observed in patients with a high degree of intraepithelial damage to squamous epithelium, compared with patients with LSIL. Moreover, a similar pattern can be observed even with the already formed malignant pathology of the cervix uteri - clinically significant viral load is statistically more often observed in patients with cervical cancer (cervical cancer) than in patients with intraepithelial neoplasia [3]. However, according to the results of our previous studies, the viral load cannot act as a prognostic factor in cervical cancer, and it cannot be used to predict relapse-free survival [4]. Another indicator of a viral infection that is currently under investigation is the physical status of the virus. According to modern literature data, HPV after penetrating the cell can exist in 3 different functional states: episomal (free) form (outside the chromosomes of the cell), integrated (built-in) (built into the cell genome) and mixed form (simultaneous presence of free and embedded in the DNA of the host cell of the virus) [5]. We have shown that physical status is a prognostic factor in cervical cancer and with the help of its determination it is possible to predict the outcome in patients with cervical cancer [4]. Thus, for the formation of risk groups and treatment planning, the prognosis of relapse is important not only for tumor diseases of the cervix, but also for intraepithelial neoplasia with a high degree of intraepithelial damage to squamous epithelium - HSIL.

Наиболее близкими к предлагаемому является способ оценки риска прогрессирования интраэпителиальной цервикальной неоплазий и развития рака шейки матки на основе определения уровней мРНК генов человека (патент RU 2660360 С2, опубликован 05.07.2018 года). Согласно указанному способу, в образцах из мест поражений измеряют уровень экспрессии мРНК генов человека MKI67, CDKN2A, CCNB1, BIRC5, AURKA, ESR1, PGR, BCL2, ВАХ, BAG1, NDRG1, PTEN, CD68, SCUBE, PTGS2. Полученные в ходе реакции значения подставляют в формулу. Если значение p менее или равно пороговому значению (p≤cut-off), делают заключение об отсутствии риска прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазий. Если значение p>cut-off, делают заключение о высоком риске прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазий. Изобретение позволяет оценить вероятность риска прогрессии цервикальной интраэпителиальной неоплазий и последующей малигнизации. Однако область способ недостат043Ено точен и информативен, что обусловлено тем, что не учитываются вирусологические показатели заболевания, как важного этиологического фактора РШМ. Кроме того, анализ ассоциативных связей не представляется возможным из-за малочисленности групп исследования, не прослежены отдаленные результаты, не проведена валидация полученных результатов на независимой выборке.Closest to the proposed one is a method for assessing the risk of progression of intraepithelial cervical neoplasia and the development of cervical cancer based on determining the mRNA levels of human genes (patent RU 2660360 C2, published 05.07.2018). According to the specified method, the level of mRNA expression of human genes MKI67, CDKN2A, CCNB1, BIRC5, AURKA, ESR1, PGR, BCL2, BAC, BAG1, NDRG1, PTEN, CD68, SCUBE, PTGS2 is measured in samples from the lesion sites. The values obtained during the reaction are substituted into the formula. If the p value is less than or equal to the threshold value (p≤cut-off), conclude that there is no risk of progression of cervical intraepithelial neoplasia. If p> cut-off, conclude that there is a high risk of progression of cervical intraepithelial neoplasia. The invention allows to assess the likelihood of a risk of progression of cervical intraepithelial neoplasia and subsequent malignancy. However, the area lacking method is 043It is accurate and informative, due to the fact that virological indicators of the disease, as an important etiological factor in cervical cancer, are not taken into account. In addition, the analysis of associative relations is not possible due to the small number of study groups, long-term results are not traced, and the results are not validated on an independent sample.

Новый технический результат - повышение точности и информативности способа прогнозирования риска рецидивирования цервикальных интраэпителиальных неоплазий тяжелой степени у ВПЧ16-позитивных больных.A new technical result is an increase in the accuracy and informativeness of the method for predicting the risk of recurrence of severe cervical intraepithelial neoplasia in HPV16-positive patients.

Для достижения нового технического результата в способе прогнозирования риска рецидивирования у ВПЧ16-позитивных больных с плоскоклеточным интраэпителиальным поражением тяжелой степени на основе определения физического статуса вируса, включающем молекулярно-генетическое исследование биологический материала соскобов эпителия цервикального канала и наружной части шейки матки и последующий расчет диагностического показателя, исследование биологического материала проводят с помощью проведения ПЦР в режиме реального времени с последующим выделением ДНК, далее определяют наличие и типирование вируса папилломы человека (ВПЧ), осуществляют анализ внутриклеточного статуса ВПЧ 16 типа и при определении эписомальной формы ВПЧ 16 типа прогнозируют благоприятный исход заболевания, при наличии интегрированной формы прогнозируют возникновение рецидива заболевания.To achieve a new technical result in a method for predicting the risk of recurrence in HPV16-positive patients with severe squamous intraepithelial lesions based on the determination of the physical status of the virus, including a molecular genetic study of the biological material of scrapings of the epithelium of the cervical canal and the outer part of the cervix and the subsequent calculation of the diagnostic indicator, the study of biological material is carried out using real-time PCR from the last blowing DNA isolation, it is further determined presence and typing of human papillomavirus (HPV) is carried out analysis of the intracellular status of HPV types 16 and determining episomal forms of HPV type 16 predicts a favorable outcome of disease, the presence of integrated forms predict the occurrence of disease recurrence.

Способ осуществляют следующим образом.The method is as follows.

Для молекулярно-генетических исследований используют - биологический материал (соскоб эпителия цервикального канала и наружной части шейки матки).For molecular genetic studies use - biological material (scraping the epithelium of the cervical canal and the outer part of the cervix).

Забор соскоба эпителия цервикального канала и наружной части шейки матки осуществляют стандартными методами (методические рекомендации по технике сбора и транспортирования биоматериалов в микробиологические лаборатории МУ 4.2.2039-05 от 01.07.2006 г.). Соскоб помещают в реагент для транспортировки и хранения клинического материала «Транспортная среда с муколитиком (ТСМ)» (ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, Россия) в пробирку типа эппендорф на 1.5 мл (с 0,5 мл транспортной среды). Пробирка помещают в холодильник на +4°С.The scraping of the cervical canal epithelium and the external part of the cervix is carried out using standard methods (guidelines for the collection and transportation of biomaterials in microbiological laboratories MU 4.2.2039-05 from 01.07.2006). The scraping is placed in a reagent for transporting and storing the clinical material “Transport medium with mucolytic (TSM)” (FBUN Central Research Institute of Epidemiology of Rospotrebnadzor, Russia) in a 1.5 ml eppendorf tube (with 0.5 ml of transport medium). The tube is placed in a refrigerator at + 4 ° C.

Биологический материал должен быть обработан не позднее, чем через 1 сутки. Если обработка задерживается более чем на сутки, то пробирки с образцами следует поместить в морозильную камеру с температурой не выше минус 20°С. Допускается использование свежего/замороженного биологического материала. В случае заморозки, разморозить пробирку с образцом, отделить 100 мкл соскоба простым центрифурированием.Biological material should be processed no later than 1 day. If the treatment is delayed for more than a day, then the tubes with samples should be placed in the freezer with a temperature not exceeding minus 20 ° С. Fresh / frozen biological material may be used. In case of freezing, defrost the tube with the sample, and separate 100 µl of scraping by simple centrifugation.

Выделение ДНК осуществляют в соответствии с инструкцией к набору реагентов для выделения ДНК из клинического материала «ДНК-сорб-АМ» (http://www.interlabservice.ru/catalog/reagents/?sid=1402&id=8692). Концентрацию и чистоту выделения ДНК оценивают на спектрофотометре NanoDrop-2000 (Thermo Scientific, USA). Концентрация ДНК должна быть не менее 50 нг/мкл, А260280 не менее 2,10; А260230 не менее 2,15. Целостность ДНК оценивают при помощи капиллярного электрофореза на приборе TapeStation (Agilent Technologies, USA) ДНК должна иметь массу более 48 kbp.DNA isolation is carried out in accordance with the instructions for the set of reagents for DNA extraction from the clinical material "DNA-sorb-AM"(http://www.interlabservice.ru/catalog/reagents/?sid=1402&id=8692). The concentration and purity of DNA extraction was evaluated on a NanoDrop-2000 spectrophotometer (Thermo Scientific, USA). DNA concentration should be at least 50 ng / μl, A 260 / A 280 at least 2.10; A 260 / A 230 at least 2.15. DNA integrity is assessed by capillary electrophoresis on a TapeStation instrument (Agilent Technologies, USA). DNA should have a mass of more than 48 kbp.

ПЦР-анализ проводят при помощи набора реагентов «Amplisens®» ВПЧ ВКР скрин-титр-FL» (с дифференциацией 16 генотипа), кат# R-V31-F (Москва, Россия) в соответствии с инструкцией производителя http://www.interlabservice.ru/catalog/reagents/?sid=1418&id=6002, если выделенная ДНК показала высокое качество при исследовании на спектрофотометре и капиллярном электрофорезе.PCR analysis is carried out using the Amplisens® HPV HRS screen titer-FL reagent kit (with differentiation of genotype 16), cat # R-V31-F (Moscow, Russia) in accordance with the manufacturer's instructions http: // www. interlabservice.ru/catalog/reagents/?sid=1418&id=6002, if the extracted DNA showed high quality when tested on a spectrophotometer and capillary electrophoresis.

Анализ результатов исследования ДНК биологического материала осуществляют при помощи программы, заложенной в стандартную инструкцию к набору реагентов «Amplisens®» ВПЧ ВКР скрин-титр-FL» (с дифференциацией 16 генотипа) (http://www.interlabservice.ru/catalog/reagents/?sid=1402&id=8692).Analysis of the DNA test results of biological material is carried out using the program included in the standard instruction for the Amplisens® HPV HRS screen-titer-FL reagent kit (with differentiation of the 16th genotype) (http://www.interlabservice.ru/catalog/reagents /? sid = 1402 & id = 8692).

Обработка полученных данных в указанной выше программе позволяет оценить вирусную нагрузку и физическое состояние (степень интеграции) для ВПЧ 16 генотипа. При выявлении в соскобе цервикального канала и шейки матки только интегрированной формы ВПЧ16, прогнозируют высокий риск возникновения рецидива заболевания (57%), в случае определения только эписомальных форм вируса риск рецидивирования отсутствует, больные со смешанной формой ВПЧ16 типа имеют промежуточный риск возникновения рецидива (25%) в течение 5 лет с момента возникновения первичного очага диспластических изменений HSIL.Processing the obtained data in the above program allows us to assess the viral load and physical condition (degree of integration) for HPV 16 genotype. If only the integrated form of HPV16 is detected in the scraping of the cervical canal and cervix, a high risk of recurrence of the disease is predicted (57%), if only episomal forms of the virus are detected, there is no risk of relapse, patients with a mixed form of HPV16 have an intermediate risk of relapse (25% ) within 5 years from the occurrence of the primary focus of dysplastic changes in HSIL.

Предлагаемый способ основан на анализе данных молекулярно-вирусологического метода исследования биологического материала, анализе амбулаторных и медицинских карт стационарного больного.The proposed method is based on the analysis of the molecular virological method for the study of biological material, the analysis of outpatient and medical records of an inpatient.

В исследование была включена 131 пациентка с наличием высокой степени интраэпителиального повреждения плоского эпителия (HSIL) (средний возраст 33,1±0,4 лет), проходивших обследование и лечение в Томском НИИ онкологии. Всем пациенткам было проведено комплексное обследование, которое включало следующие этапы: гинекологический осмотр, кольпоскопию, проведение цитологического и гистологического исследования для последующей верификации диагноза. После проведения генотипирования ДНК ВПЧ, среди всех обследованных пациенток была выделена группа с носительством ВПЧ 16 генотипа (n=112).The study included 131 patients with a high degree of intraepithelial damage to the squamous epithelium (HSIL) (mean age 33.1 ± 0.4 years) who underwent examination and treatment at the Tomsk Oncology Research Institute. All patients underwent a comprehensive examination, which included the following stages: gynecological examination, colposcopy, cytological and histological examination for subsequent verification of the diagnosis. After genotyping of HPV DNA, a group with HPV carriage of genotype 16 (n = 112) was identified among all examined patients.

Материалом для исследования служили соскобы эпителия цервикального канала и наружной части шейки матки. Выявление и генотипирование ДНК ВПЧ проводили методом мультиплексной полимеразной цепной реакции (ПЦР) в режиме реального времени на приборе RotorGene 6000 («Corbett Research)), Австралия) с использованием комплектов реагентов фирмы «Amplisens®» ("АмплиСенс® ВПЧ ВКР скрин-титр-FL", кат# R-V31-T-4x (RG,iQ,Mx); "АмплиСенс® ВПЧ ВКР генотип-FL", кат# R-V25(RG,iQ,Mx)) (Москва, Россия). Физический статус ДНК ВПЧ16 определялся с использованием набора реагентов «Amplisens®» ВПЧ ВКР скрин-титр-FL» (с дифференциацией 16 генотипа), кат# R-V31-F (Москва, Россия). Значение вирусной нагрузки рассчитывали в геномных эквивалентах ДНК ВПЧ/105 клеток, порог релевантного количества вируса принимали равным 3 lg ДНК ВПЧ/105 клеток в соскобе.The material for the study was scrapings of the epithelium of the cervical canal and the outer part of the cervix. HPV DNA was identified and genotyped by multiplex polymerase chain reaction (PCR) in real time using a RotorGene 6000 instrument (Corbett Research), Australia) using Amplisens® reagent kits (Amplisens® HPV Raman screen-titer- FL ", cat # R-V31-T-4x (RG, iQ, Mx);" AmpliSens® HPV SRS genotype-FL ", cat # R-V25 (RG, iQ, Mx)) (Moscow, Russia). The physical status of HPV16 DNA was determined using the Amplisens® HPV HRS screen-titer-FL reagent kit (with differentiation of genotype 16), cat # R-V31-F (Moscow, Russia). The value of the viral load was calculated in the genomic equivalents of HPV DNA / 10 5 cells, the threshold of the relevant amount of the virus was taken equal to 3 lg of HPV DNA / 10 5 cells in scraping.

Для оценки статистической значимости различий в распределении частот качественных признаков между группами использовали двусторонний критерий Фишера калькулятор http://vassarstats.net/fisher2×3.html был использован для таблицы 2×3 (тест хи-квадрат). Для оценки влияния внутриклеточного статуса ВПЧ 16, вирусной нагрузки и тяжести дисплазии на частоту рецидивирования применяли лог-ранговый критерий, для построения прогностической модели риска развития рецидивов использовали критерий Кокса.To assess the statistical significance of the differences in the frequency distribution of qualitative characteristics between groups, the Fisher two-sided criterion was used. The http://vassarstats.net/fisher2Ч3.html calculator was used for the 2 × 3 table (chi-square test). To assess the effect of the intracellular status of HPV 16, viral load, and the severity of dysplasia on the recurrence rate, the log-rank criterion was used, and the Cox criterion was used to build a prognostic model of the risk of relapse.

В ходе нашего исследования был проведен анализ частоты возникновения рецидивов при HSIL в зависимости от изученных вирусологических показателей. Было проанализировано влияние на частоту рецидивирования следующих показателей: внутриклеточный статус ВПЧ (физический статус) и вирусная нагрузка. Статистический анализ (log rank test) показал, что среди HSIL ВПЧ16-позитивных пациентов частота рецидивирования зависит от формы интеграции вируса (р=0,000) (на Фиг 1 представлена частота рецидивирования интраэпителиальной неоплазий в зависимости от внутриклеточного статуса ВПЧ).In the course of our study, an analysis was made of the incidence of relapse in HSIL, depending on the virological parameters studied. The effect of the following indicators on the recurrence rate was analyzed: the intracellular status of HPV (physical status) and viral load. Statistical analysis (log rank test) showed that among HSIL HPV16-positive patients, the recurrence rate depends on the form of virus integration (p = 0.000) (Figure 1 shows the recurrence rate of intraepithelial neoplasia depending on the intracellular status of HPV).

Было проведено сравнение основных клинико-патологических параметров у больных всех 3-х представленных групп (эписомальной, смешанной и интегрированной формой вируса), не установлено статистически значимых различий в распределении параметров (данные не представлены). Это показывает, что физический статус ВПЧ является независимым фактором риска рецидивирования при цервикальных интраэпителиальных неоплазиях тяжелой степени.A comparison was made of the main clinical and pathological parameters in patients of all 3 presented groups (episomal, mixed and integrated forms of the virus), no statistically significant differences were found in the distribution of parameters (data not shown). This shows that the physical status of HPV is an independent risk factor for relapse in severe cervical intraepithelial neoplasia.

В результате проведенного исследования, были получены данные о частоте рецидивирования при плоскоклеточном интраэпителиальном поражении тяжелой степени (HSIL) в зависимости от физического статуса ВПЧ16+ больных. Было показано, что наилучший прогноз имеют ВПЧ16+ пациентки с эписомальной формой вируса, наихудший - ВПЧ16+ пациентки с интегрированной формой с 57% вероятностью рецидивирования.As a result of the study, data were obtained on the frequency of relapse in severe squamous intraepithelial lesion (HSIL) depending on the physical status of HPV16 + patients. It was shown that the best prognosis is for HPV16 + patients with an episomal form of the virus, the worst is for HPV16 + patients with an integrated form with a 57% chance of recurrence.

Таким образом, проведение с помощью предлагаемого способа возможно корректировать оптимальный выбор персонализированной терапии для данной категории больных.Thus, carrying out using the proposed method it is possible to adjust the optimal choice of personalized therapy for this category of patients.

Примеры на осуществление способа.Examples of the method.

Пример 1. Больная Р., 31 год в августе 2013 поступила на лечение в клиники НИИ онкологии Томского НИМЦ с диагнозом HSIL шейки матки. По результатам клинического опроса, установлены следующие особенности - эрозия шейки матки, количество родов - 2, количество абортов - 3, количество выкидышей - 0, в качестве сопутствующих заболеваний выявлено наличие варикозное расширение вен нижних конечностей. Было проведено оперативное лечение в объеме радиоволновой резекции шейки матки с выскабливанием цервикального канала. С целью определения прогноза исхода заболевания было проведено исследование согласно предлагаемому способу, в результате чего было показано, что у пациентки присутствует ВПЧ 16 типа эписомальной формы. Вывод: прогнозировали благоприятный исход. При динамическом наблюдении данной пациентки (60 месяцев) не было выявлено рецидива HSIL.Example 1. Patient R., 31 years old in August 2013, was admitted for treatment at the clinic of the Oncology Research Institute of Tomsk Scientific Research Center with a diagnosis of cervical HSIL. According to the results of a clinical survey, the following features were established - cervical erosion, the number of births - 2, the number of abortions - 3, the number of miscarriages - 0, as the accompanying diseases revealed the presence of varicose veins of the lower extremities. Surgical treatment was performed in the amount of radio wave resection of the cervix with curettage of the cervical canal. In order to determine the prognosis of the outcome of the disease, a study was carried out according to the proposed method, as a result of which it was shown that the patient has HPV type 16 episomal form. Conclusion: predicted a favorable outcome. Dynamic monitoring of this patient (60 months) did not reveal a relapse of HSIL.

Пример 2 Больная Д., 38 лет в мае 2012 поступила на лечение в клиники НИИ онкологии Томского НИМЦ с диагнозом HSIL шейки матки. По результатам клинического опроса, установлены следующие особенности - наличие воспалительных заболеваний малого таза, эрозия шейки матки, количество родов - 0, количество абортов - 0, в качестве сопутствующих заболеваний выявлено наличие хронической почечной недостаточности, эссенциальная (первичная) гипертензия и ожирение. Было проведено оперативное лечение в объеме радиоволновой резекции шейки матки с выскабливанием цервикального канала. С целью определения прогноза исхода заболевания было проведено исследование согласно предлагаемому способу, по результатам которого прогнозировали риск развития рецидива с 57% вероятностью. В реальной ситуации у пациентки зарегистрировано возникновение рецидива заболевания в течение 14 месяцев с момента проведения лечения.Example 2 Patient D., 38 years old, in May 2012 was admitted for treatment at the clinic of the Oncology Research Institute of Tomsk Scientific Research Center with a diagnosis of cervical HSIL. According to the results of a clinical survey, the following features were established - the presence of pelvic inflammatory diseases, cervical erosion, the number of births - 0, the number of abortions - 0, the presence of chronic renal failure, essential (primary) hypertension and obesity were identified as concomitant diseases. Surgical treatment was performed in the amount of radio wave resection of the cervix with curettage of the cervical canal. In order to determine the prognosis of the disease outcome, a study was conducted according to the proposed method, according to the results of which the risk of relapse was predicted with a 57% probability. In a real situation, the patient has registered a relapse within 14 months from the date of treatment.

Таким образом, предлагаемый способ с высокой долей достоверности и информативности позволяет прогнозировать возникновение рецидивов при цервикальных интраэпителиальных неоплазиях тяжелой степени, что позволит для больных HSIL оптимизировать выбор персонализированной терапии.Thus, the proposed method with a high degree of reliability and informativeness allows predicting the occurrence of relapses in severe cervical intraepithelial neoplasia, which will allow HSIL patients to optimize the choice of personalized therapy.

Источники информации, принятые во внимание при составлении описания:Sources of information taken into account when compiling the description:

1. BoschFX. Human papillomavirus: science and technologies for the elimination of cervical cancer. Expert opinion on pharmacotherapy. 2011; 12 (14): 2189-2204.1. BoschFX. Human papillomavirus: science and technologies for the elimination of cervical cancer. Expert opinion on pharmacotherapy. 2011; 12 (14): 2189-2204.

2. Apgar BS, Zoschnick L, Wright TC Jr. The 2001 Bethesda System terminology. American family physician. 2003; 68 (10): 1992-1998.2. Apgar BS, Zoschnick L, Wright TC Jr. The 2001 Bethesda System terminology. American family physician. 2003; 68 (10): 1992-1998.

3. Bruni L, Diaz M,

Figure 00000001
M, Ferrer E, Bosch FX, de
Figure 00000002
S. Cervical human papillomavirus prevalence in 5 continents: meta-analysis of 1 million women with normal cytological findings. Journal of Infectious Diseases. 2010; 202 (12): 1789-1799.3. Bruni L, Diaz M,
Figure 00000001
M, Ferrer E, Bosch FX, de
Figure 00000002
S. Cervical human papillomavirus prevalence in 5 continents: meta-analysis of 1 million women with normal cytological findings. Journal of Infectious Diseases. 2010; 202 (12): 1789-1799.

4. Ibragimova M, Tsyganov M, Shpileva O, Churuksaeva O, Bychkov V, Kolomiets L, Litviakov N. HPV status and its genomic integration affect survival of patients with cervical cancer//Neoplasma. 2018; 65 (3):441-4484. Ibragimova M, Tsyganov M, Shpileva O, Churuksaeva O, Bychkov V, Kolomiets L, Litviakov N. HPV status and its genomic integration affect survival of patients with cervical cancer // Neoplasma. 2018; 65 (3): 441-448

5. Jiang M, Baseman JG, Koutsky LA, Feng Q, Mao C, Kiviat NB, Xi LF. Sequence variation of human papillomavirus type 16 and measurement of viral integration by quantitative PCR. Journal of clinical microbiology. 2009; 47 (3): 521-526.5. Jiang M, Baseman JG, Koutsky LA, Feng Q, Mao C, Kiviat NB, Xi LF. Sequence variation of human papillomavirus type 16 and measurement of viral integration by quantitative PCR. Journal of clinical microbiology. 2009; 47 (3): 521-526.

Приложениеapplication

Фиг. 1 Частота рецидивирования HSIL в зависимости от внутриклеточного статуса ВПЧ (р=0,000).FIG. 1 HSIL relapse rate depending on intracellular HPV status (p = 0,000).

Claims (1)

Способ прогнозирования риска рецидивирования у ВПЧ16-позитивных больных с плоскоклеточным интраэпителиальным поражением тяжелой степени на основе определения физического статуса вируса, включающий выделение ДНК из биологического материала соскобов эпителия цервикального канала и наружной части шейки матки, молекулярно-генетическое исследование биологического материала с помощью ПЦР в режиме реального времени, определение наличия и типирование вируса папилломы человека (ВПЧ), анализ внутриклеточного статуса ВПЧ 16 типа и при определении эписомальной формы ВПЧ 16 типа прогнозируют благоприятный исход заболевания, при наличии интегрированной формы прогнозируют возникновение рецидива заболевания.A method for predicting the risk of recurrence in HPV16-positive patients with severe squamous intraepithelial lesions based on the determination of the physical status of the virus, including the extraction of DNA from the biological material of scrapings of the cervical canal and the outer part of the cervix, molecular genetic study of biological material using real-time PCR time, determination of the presence and typing of human papillomavirus (HPV), analysis of the intracellular status of HPV type 16 and when determining enii episomal forms of HPV type 16 predicts a favorable outcome of disease, the presence of integrated forms predict the occurrence of disease recurrence.
RU2019118923A 2019-06-17 2019-06-17 Method for predicting the risk of recurrence in hpv16-positive patients with squamous intraepithelial high-grade disease on the basis of determining the physical status of the virus RU2719581C1 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2019118923A RU2719581C1 (en) 2019-06-17 2019-06-17 Method for predicting the risk of recurrence in hpv16-positive patients with squamous intraepithelial high-grade disease on the basis of determining the physical status of the virus

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2019118923A RU2719581C1 (en) 2019-06-17 2019-06-17 Method for predicting the risk of recurrence in hpv16-positive patients with squamous intraepithelial high-grade disease on the basis of determining the physical status of the virus

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2719581C1 true RU2719581C1 (en) 2020-04-21

Family

ID=70415396

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2019118923A RU2719581C1 (en) 2019-06-17 2019-06-17 Method for predicting the risk of recurrence in hpv16-positive patients with squamous intraepithelial high-grade disease on the basis of determining the physical status of the virus

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2719581C1 (en)

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2766719C1 (en) * 2021-09-20 2022-03-15 Виталия Геннадьевна Ануфриева Method for prediction of progression of low-grade cervical squamous intraepithelial lesion with underlying human papillomavirus infection
RU2773799C1 (en) * 2021-04-21 2022-06-09 Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение дополнительного профессионального образования «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Министерства здравоохранения Российской Федерации Method for predicting the effectiveness of the conducted treatment of i-ii degree cervical intraepithelial neoplasias

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2660360C2 (en) * 2015-02-02 2018-07-05 Общество с ограниченной ответственностью "Научно-производственная фирма ДНК-Технология" Method for assessing the risk of progression of intraepithelial cervical neoplasia and development of cervical cancer by determining the levels of human mrna genes

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2660360C2 (en) * 2015-02-02 2018-07-05 Общество с ограниченной ответственностью "Научно-производственная фирма ДНК-Технология" Method for assessing the risk of progression of intraepithelial cervical neoplasia and development of cervical cancer by determining the levels of human mrna genes

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
MANAWAPAT-KLOPFER A. et al. HPV16 viral load and physical state measurement as a potential immediate triage strategy for HR-HPV-infected women: a study in 644 women with single HPV16 infections. Am J Cancer Res. 2018 Apr 1; 8(4): 715-722. *
ИБРАГИМОВА М.К. и др. Интегративная и эписомальная формы генотипа 16 вируса папилломы человека при цервикальных интраэпителиальных неоплазиях и раке шейки матки. Вопросы вирусологии. 2016; 61(6): 270-274. *
ИБРАГИМОВА М.К. и др. Интегративная и эписомальная формы генотипа 16 вируса папилломы человека при цервикальных интраэпителиальных неоплазиях и раке шейки матки. Вопросы вирусологии. 2016; 61(6): 270-274. MANAWAPAT-KLOPFER A. et al. HPV16 viral load and physical state measurement as a potential immediate triage strategy for HR-HPV-infected women: a study in 644 women with single HPV16 infections. Am J Cancer Res. 2018 Apr 1; 8(4): 715-722. *

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2773799C1 (en) * 2021-04-21 2022-06-09 Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение дополнительного профессионального образования «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Министерства здравоохранения Российской Федерации Method for predicting the effectiveness of the conducted treatment of i-ii degree cervical intraepithelial neoplasias
RU2766719C1 (en) * 2021-09-20 2022-03-15 Виталия Геннадьевна Ануфриева Method for prediction of progression of low-grade cervical squamous intraepithelial lesion with underlying human papillomavirus infection

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Sandri et al. Comparison of HE4, CA125 and ROMA algorithm in women with a pelvic mass: correlation with pathological outcome
Mirghani et al. Human papilloma virus testing in oropharyngeal squamous cell carcinoma: what the clinician should know
Crocetto et al. Liquid biopsy in bladder cancer: State of the art and future perspectives
Dinh et al. Single-cell transcriptomics identifies gene expression networks driving differentiation and tumorigenesis in the human fallopian tube
Monsonego et al. Performance of the Roche AMPLICOR® Human papillomavirus (HPV) test in prediction of cervical intraepithelial neoplasia (CIN) in women with abnormal PAP smear
Pinto et al. Prognostic significance of lymph node variables and human papillomavirus DNA in invasive vulvar carcinoma
AU2018203361B2 (en) Methods for detecting human papillomavirus and providing prognosis for head and neck squamous cell carcinoma
Manawapat-Klopfer et al. TMEM45A, SERPINB5 and p16INK4A transcript levels are predictive for development of high-grade cervical lesions
WO2017054325A1 (en) Breast cancer combined diagnosis markers and detection kit
CN113249491A (en) Biomarker for diagnosing endometrial cancer and product and application thereof
Wang et al. Prevalence of type-specific oncogenic human papillomavirus infection assessed by HPV E6/E7 mRNA among women with high-grade cervical lesions
Jun et al. Comparison of DRY and WET vaginal swabs with cervical specimens in Roche Cobas 4800 HPV and Abbott RealTime High Risk HPV tests
RU2719581C1 (en) Method for predicting the risk of recurrence in hpv16-positive patients with squamous intraepithelial high-grade disease on the basis of determining the physical status of the virus
Kim et al. HPV E6/E7, hTERT, and Ki67 mRNA RT‐qPCR Assay for Detecting High‐Grade Cervical Lesion with Microscope Slides
Medeiros et al. Hierarchical evaluation of histology and p16-labeling can improve the risk assessment on cervical intraepithelial neoplasia progression
Yang et al. Preliminary study of the use of E6/E7mRNA detection in screening and triage management of HR-HPV infection during pregnancy
Vallvé-Juanico et al. External validation of putative biomarkers in eutopic endometrium of women with endometriosis using NanoString technology
Lu et al. Detection of high‑risk human papillomavirus DNA in sentinel lymph nodes of patients with cervical cancer
EP2844776B1 (en) Cancer blood test using bc200 rna isolated from peripheral blood for diagnosis and treatment of invasive breast cancer
RU2503960C1 (en) Method for assessing conditions of proliferative cervical diseases
JP2011530287A (en) Prostate cancer methylation analysis
WO2019095541A1 (en) Composition and method for diagnosing and predicting breast cancer bone metastases
RU2660360C2 (en) Method for assessing the risk of progression of intraepithelial cervical neoplasia and development of cervical cancer by determining the levels of human mrna genes
Siegler et al. Positive correlation between clearance of high-risk human papillomavirus and lack of residual disease after loop excision of the transformation zone in early stage cervical cancer
RU2694834C1 (en) Method for recurrence-free survival and overall survival in hpv 16-positive cervical cancer patients