RU2655635C1 - Method of early genetic diagnostics of risk for developing type 2 diabetes mellitus - Google Patents
Method of early genetic diagnostics of risk for developing type 2 diabetes mellitus Download PDFInfo
- Publication number
- RU2655635C1 RU2655635C1 RU2017108884A RU2017108884A RU2655635C1 RU 2655635 C1 RU2655635 C1 RU 2655635C1 RU 2017108884 A RU2017108884 A RU 2017108884A RU 2017108884 A RU2017108884 A RU 2017108884A RU 2655635 C1 RU2655635 C1 RU 2655635C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- diabetes
- risk
- type
- glp
- polymorphism
- Prior art date
Links
- 208000001072 type 2 diabetes mellitus Diseases 0.000 title claims abstract description 40
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 title claims abstract description 7
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 14
- 108010086246 Glucagon-Like Peptide-1 Receptor Proteins 0.000 claims abstract description 21
- 239000000859 incretin Substances 0.000 claims abstract description 9
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims abstract description 7
- 102100032882 Glucagon-like peptide 1 receptor Human genes 0.000 claims abstract description 6
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 claims abstract description 6
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 claims abstract description 5
- MGXWVYUBJRZYPE-YUGYIWNOSA-N incretin Chemical class C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC(O)=CC=1)[C@@H](C)O)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(O)C=C1 MGXWVYUBJRZYPE-YUGYIWNOSA-N 0.000 claims abstract description 3
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 claims abstract description 3
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 claims abstract description 3
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 claims description 4
- 238000011161 development Methods 0.000 claims description 3
- 238000000605 extraction Methods 0.000 claims description 2
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 abstract description 12
- 239000003814 drug Substances 0.000 abstract description 4
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 2
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 abstract description 2
- 206010071602 Genetic polymorphism Diseases 0.000 abstract 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 15
- NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N insulin Chemical compound N1C(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(NC(=O)CN)C(C)CC)CSSCC(C(NC(CO)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CSSCC(NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2C=CC(O)=CC=2)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(C)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2NC=NC=2)NC(=O)C(CO)NC(=O)CNC2=O)C(=O)NCC(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)NC(C(C)O)C(=O)N3C(CCC3)C(=O)NC(CCCCN)C(=O)NC(C)C(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(O)=O)=O)NC(=O)C(C(C)CC)NC(=O)C(CO)NC(=O)C(C(C)O)NC(=O)C1CSSCC2NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(N)CC=1C=CC=CC=1)C(C)C)CC1=CN=CN1 NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 10
- 208000004611 Abdominal Obesity Diseases 0.000 description 6
- 206010065941 Central obesity Diseases 0.000 description 6
- 102000004877 Insulin Human genes 0.000 description 6
- 108090001061 Insulin Proteins 0.000 description 6
- 229940125396 insulin Drugs 0.000 description 6
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 5
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 4
- 208000001145 Metabolic Syndrome Diseases 0.000 description 4
- 201000000690 abdominal obesity-metabolic syndrome Diseases 0.000 description 4
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 4
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 4
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 4
- 101100337060 Caenorhabditis elegans glp-1 gene Proteins 0.000 description 3
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 3
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 3
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 3
- 101150102822 glp-1 gene Proteins 0.000 description 3
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 3
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 description 3
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 3
- 230000004044 response Effects 0.000 description 3
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 3
- 208000032928 Dyslipidaemia Diseases 0.000 description 2
- 208000017170 Lipid metabolism disease Diseases 0.000 description 2
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 2
- HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N cholesterol Chemical compound C1C=C2C[C@@H](O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]1(C)CC2 HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N 0.000 description 2
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 2
- 238000013399 early diagnosis Methods 0.000 description 2
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 description 2
- XZWYZXLIPXDOLR-UHFFFAOYSA-N metformin Chemical compound CN(C)C(=N)NC(N)=N XZWYZXLIPXDOLR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960003105 metformin Drugs 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 2
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- 108010076365 Adiponectin Proteins 0.000 description 1
- 101100478237 Caenorhabditis elegans ost-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 1
- 238000007400 DNA extraction Methods 0.000 description 1
- 238000007399 DNA isolation Methods 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 1
- 101150082239 G gene Proteins 0.000 description 1
- DTHNMHAUYICORS-KTKZVXAJSA-N Glucagon-like peptide 1 Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(N)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC=1N=CNC=1)[C@@H](C)O)[C@@H](C)O)C(C)C)C1=CC=CC=C1 DTHNMHAUYICORS-KTKZVXAJSA-N 0.000 description 1
- 101800000224 Glucagon-like peptide 1 Proteins 0.000 description 1
- 206010020772 Hypertension Diseases 0.000 description 1
- 206010022489 Insulin Resistance Diseases 0.000 description 1
- 208000008589 Obesity Diseases 0.000 description 1
- 238000010222 PCR analysis Methods 0.000 description 1
- 102100040918 Pro-glucagon Human genes 0.000 description 1
- IRERQBUNZFJFGC-UHFFFAOYSA-L azure blue Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[Na+].[Na+].[Na+].[Na+].[Na+].[Al+3].[Al+3].[Al+3].[Al+3].[Al+3].[Al+3].[S-]S[S-].[O-][Si]([O-])([O-])[O-].[O-][Si]([O-])([O-])[O-].[O-][Si]([O-])([O-])[O-].[O-][Si]([O-])([O-])[O-].[O-][Si]([O-])([O-])[O-].[O-][Si]([O-])([O-])[O-] IRERQBUNZFJFGC-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 1
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 1
- 235000012000 cholesterol Nutrition 0.000 description 1
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 239000003925 fat Substances 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 1
- 230000006870 function Effects 0.000 description 1
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 1
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 1
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 1
- 238000012528 insulin ELISA Methods 0.000 description 1
- 210000004153 islets of langerhan Anatomy 0.000 description 1
- 238000003771 laboratory diagnosis Methods 0.000 description 1
- 229910052667 lazurite Inorganic materials 0.000 description 1
- 229920001684 low density polyethylene Polymers 0.000 description 1
- 239000004702 low-density polyethylene Substances 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 239000000155 melt Substances 0.000 description 1
- 208000030159 metabolic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 1
- 210000004457 myocytus nodalis Anatomy 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 235000020824 obesity Nutrition 0.000 description 1
- 239000003538 oral antidiabetic agent Substances 0.000 description 1
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 1
- 101150015442 ost-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 1
- 230000029537 positive regulation of insulin secretion Effects 0.000 description 1
- 230000000291 postprandial effect Effects 0.000 description 1
- GCYXWQUSHADNBF-AAEALURTSA-N preproglucagon 78-108 Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC=1N=CNC=1)[C@@H](C)O)[C@@H](C)O)C(C)C)C1=CC=CC=C1 GCYXWQUSHADNBF-AAEALURTSA-N 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- ABDKAPXRBAPSQN-UHFFFAOYSA-N veratrole Chemical compound COC1=CC=CC=C1OC ABDKAPXRBAPSQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/58—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances
- G01N33/582—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances with fluorescent label
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6804—Nucleic acid analysis using immunogens
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6827—Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6858—Allele-specific amplification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
Настоящее изобретение относится к медицине, а именно к медицинской генетике, и позволяет прогнозировать риск развития СД 2 типа.The present invention relates to medicine, namely to medical genetics, and allows to predict the risk of type 2 diabetes.
В современной медицине проблема абдоминального ожирения является одной из наиболее приоритетных и социально значимых. Абдоминальное ожирение (АО) и сахарный диабет 2 типа (СД 2 типа) занимают лидирующие позиции среди причин смертности населения [1]. Известно, что отягощенная наследственность является основным фактором риска развития СД 2 типа [2]. Выявление пациентов с предрасположенностью к АО и СД 2 типа имеет большую клиническую значимость, поскольку это заболевание может быть обратимым, а при ранней диагностике и лечении можно снизить выраженность основных его проявлений.In modern medicine, the problem of abdominal obesity is one of the most priority and socially significant. Abdominal obesity (AO) and type 2 diabetes mellitus (type 2 diabetes) occupy a leading position among the causes of mortality [1]. It is known that burdened heredity is the main risk factor for the development of type 2 diabetes [2]. The identification of patients with a predisposition to AO and type 2 diabetes is of great clinical significance, since this disease can be reversible, and with early diagnosis and treatment, the severity of its main manifestations can be reduced.
На продукцию инсулина, помимо постпрандиальной стимуляции глюкозой, влияют гормоны желудочно-кишечного тракта - инкретины [3]. Глюкагоноподобный пептид-1 (GLP-1) секретируется в ответ на пероральное поступление жиров и углеводов [4]. Одна из основных функций инкретинов - стимуляция секреции инсулина Р-клетками островков Лангерганса поджелудочной железы [5]. Согласно данным научной периодики у пациентов с СД 2 типа снижается чувствительность клеток к инсулину и нарушается его секреция в ответ на стимуляцию питательными веществами [6]. Так, доклинические исследования показали, что снижение ответа на инкретиновую терапию может быть связано с пониженной экспрессией или дефектами их рецепторов [7].In addition to postprandial glucose stimulation, insulin production is also affected by hormones of the gastrointestinal tract - incretins [3]. Glucagon-like peptide-1 (GLP-1) is secreted in response to oral intake of fats and carbohydrates [4]. One of the main functions of incretins is the stimulation of insulin secretion by P-cells of the pancreatic islets of Langerhans [5]. According to the scientific periodical data, in patients with type 2 diabetes, the sensitivity of cells to insulin decreases and its secretion is impaired in response to stimulation by nutrients [6]. Thus, preclinical studies have shown that a decrease in the response to incretin therapy may be associated with reduced expression or defects in their receptors [7].
Лучшее понимание функционирования инкретинов открывает возможности индивидуально подобранной терапии и профилактики ожирения, ассоциированного с СД 2 типа и его осложнений.A better understanding of the functioning of incretins opens up the possibility of individually selected therapy and prevention of obesity associated with type 2 diabetes and its complications.
Из уровня техники известен ряд способов определения риска развития СД 2 типа «Способ лабораторной диагностики гипертонической болезни и сахарного диабета» (RU 2007116611 А), основанный на исследовании состава и структурных свойств ротовой жидкости.A number of methods are known from the prior art for determining the risk of developing type 2 diabetes mellitus "Method for the laboratory diagnosis of hypertension and diabetes mellitus" (RU 2007116611 A), based on a study of the composition and structural properties of oral fluid.
Принципиально похожим изобретением является «Способ прогнозирования развития сахарного диабета 2 типа у больных» (патент RU 2264170 С2, 7 А61В 10/00, G01N 33/92 (2005.11.20)), согласно которому рассчитывается коэффициент метаболической дислипидемии по формуле (ТГ+ХС-ЛПНП)/ХС_ЛПВП и антропометрический коэффициент - ИМТ/ОТ/ОБ и при ИМТ менее 37,9 кг/м2 и коэффициенте дислипидемии более 9,2 у.е. прогнозируется наибольший риск развития заболевания. Недостатком данного решения является недостаточный учет многих информативных показателей при прогнозировании, в том числе генетических особенностей.A fundamentally similar invention is the “Method for predicting the development of type 2 diabetes mellitus in patients” (patent RU 2264170 C2, 7 AB 10/00, G01N 33/92 (2005.11.20)), according to which the metabolic dyslipidemia coefficient is calculated by the formula (TG + XC -LDPE) / cholesterol and HDL and anthropometric coefficient - BMI / OT / OB and with a BMI of less than 37.9 kg / m 2 and a dyslipidemia coefficient of more than 9.2 cu the greatest risk of developing the disease is predicted. The disadvantage of this solution is the lack of consideration of many informative indicators in predicting, including genetic characteristics.
Схожим изобретением является «Способ прогнозирования риска развития метаболического синдрома (МС) у пациента с абдоминальным ожирением» (патент Россия RU 2010149541 А, МПК G01N 33/50 (2006.01)), основанный на выделении ДНК с последующим проведением полимеразной цепной реакции (ПЦР) и рестрикционного анализа для идентификации полиморфизма T-45G гена адипонектина. Недостатками данного способа является длительное выполнение этапов исследования, в отличие от способа детекции ПЦР в режиме реального времени, а также диагностика целого кластера метаболических нарушений, подразумевающих МС, а не его компонентов.A similar invention is a "Method for predicting the risk of developing metabolic syndrome (MS) in a patient with abdominal obesity" (Russian patent RU 2010149541 A, IPC G01N 33/50 (2006.01)), based on DNA isolation followed by polymerase chain reaction (PCR) and restriction analysis to identify the T-45G polymorphism of the adiponectin gene. The disadvantages of this method is the long execution of the research steps, in contrast to the real-time PCR detection method, as well as the diagnosis of a whole cluster of metabolic disorders, implying MS, and not its components.
Аналогом заявляемому является «Способ прогнозирования эффективности терапии пероральным сахароснижающим препаратом метформином у больных сахарным диабетом 2 типа» (патент RU 2602663), который выявляет полиморфизм А>С rs622342 гена ОСТ1. Способ подразумевает диагностику эффективности приема метформина для терапии СД 2 типа. Недостатком данной методики является использование только одного полиморфного варианта гена, и она не учитывает комплексное влияние других генетических особенностей показателей: отягощенная наследственность, биохимические показатели крови.An analogue of the claimed is the "Method for predicting the effectiveness of therapy with the oral hypoglycemic drug metformin in patients with type 2 diabetes mellitus" (patent RU 2602663), which reveals the polymorphism A> C rs622342 of the OST1 gene. The method involves the diagnosis of the effectiveness of metformin for the treatment of type 2 diabetes. The disadvantage of this technique is the use of only one polymorphic variant of the gene, and it does not take into account the complex effect of other genetic characteristics of the indicators: burdened heredity, biochemical blood parameters.
Задачей, на решение которой направлено заявляемое изобретение, является ранняя диагностика риска развития СД 2 типа методом ПЦР.The task to which the invention is directed is the early diagnosis of the risk of type 2 diabetes by PCR.
Поставленная задача решается за счет того, что способ ранней генетической диагностики риска развития сахарного диабета 2 (СД) типа, включающий экстракцию ДНК из периферической крови с последующим проведением полимеразной цепной реакции в режиме реального времени, характеризуется тем, что проводят анализ полиморфизма гена рецептора к инкретинам GLP-1R и прогнозируют пониженный риск развития СД 2 типа в результате выявления генотипа GG полиморфизма rs6923761 гена GLP-1R.The problem is solved due to the fact that the method of early genetic diagnosis of the risk of developing type 2 diabetes mellitus (DM), including the extraction of DNA from peripheral blood and subsequent polymerase chain reaction in real time, is characterized by the analysis of receptor gene polymorphism for incretins GLP-1R and predict a reduced risk of type 2 diabetes as a result of the identification of the GG genotype of the rs6923761 polymorphism of the GLP-1R gene.
Детекция однонуклеотидных полиморфизмов может быть осуществлена методом ПЦР в режиме реального времени.Detection of single nucleotide polymorphisms can be carried out by real-time PCR.
Способ осуществляется следующим образом.The method is as follows.
Геномную ДНК выделяют из цельной крови пациента при помощи набора «ДНК-Экстран-1», согласно протоколу производителя (ЗАО «Синтол»), либо другим известным методом. Генотипирование проводят методом ПЦР в режиме реального времени с использованием праймеров, фланкирующих полиморфизм, и конкурирующих TaqMan-зондов. На 3'-конце зонда находится флуоресцентная метка - флуорофор (FAM, HEX), а на 5'-конце «гаситель» флуоресценции (RTQ1; BHQ-1). При близком расположении «гасителя» и флуорофора энергия, которая поглощена флуорофором, по принципу флуоресцентно-резонансного переноса переходит на «гаситель». Вследствие этого сигнал флуоресценции отсутствует. В процессе ПЦР при повышении температуры до 95°С происходит плавление ДНК и праймерами с зондами, отжигаются на комплементарном участке ДНК при 63°С. В процессе амплификации ДНК-полимераза расщепляет зонд, при этом расстояние между «гасителем» и флуорофором увеличивается, как и флуоресценция. В этот момент можно зарегистрировать флуоресцентный сигнал от флюорофора. Зонд с меткой FAM соответствует аллелю G, зонд с красителем НЕХ-аллелю А для полиморфизма rs6923761 гена GLP-1R. Анализ полиморфизмов производят с использованием наборов для определения полиморфизма rs6923761 гена GLP-1R (ЗАО «Синтол»). В эппендорф/лунку объемом 0,2 мкл вносят 20 мкл смеси, включающей 10 мкл реакционной смеси, 10 мкл разбавителя, и 0,5 мкл (2,5 Ед) Taq-полимеразы, и 5 мкл ДНК образца. Емкость помещают в блок амплификатора LightCycler 480 Instrument II ("Roche", Швейцария) в котором проводят считывание результатов ПЦР. Протокол ПЦР состоит из следующих этапов: нагрев реакционной смеси при 95°С - 3 мин и амплификация в течение 40 циклов в следующем режиме: 95°С - 15 сек, 63°С - 40 сек.Genomic DNA is isolated from the patient’s whole blood using the DNA-Extran-1 kit, according to the manufacturer’s protocol (Syntol CJSC), or other known method. Genotyping is carried out by real-time PCR using primers flanking the polymorphism and competing TaqMan probes. At the 3'-end of the probe is a fluorescent label - fluorophore (FAM, HEX), and at the 5'-end of the "quencher" of fluorescence (RTQ1; BHQ-1). With a close arrangement of the “quencher” and the fluorophore, the energy that is absorbed by the fluorophore, by the principle of fluorescence-resonance transfer, is transferred to the “quencher”. As a result, there is no fluorescence signal. During PCR, when the temperature rises to 95 ° C, the DNA melts with primers with probes and anneals on the complementary DNA site at 63 ° C. During amplification, DNA polymerase cleaves the probe, while the distance between the “quencher” and the fluorophore increases, as does fluorescence. At this point, you can register a fluorescent signal from the fluorophore. The probe labeled FAM corresponds to the G allele, the probe with the dye HEX allele A for the rs6923761 polymorphism of the GLP-1R gene. The analysis of polymorphisms is carried out using kits for determining the polymorphism rs6923761 of the GLP-1R gene (ZAO Syntol). 20 μl of the mixture, including 10 μl of the reaction mixture, 10 μl of diluent, and 0.5 μl (2.5 U) of Taq polymerase, and 5 μl of sample DNA, are added to an 0.2 ml / ml Eppendorf / well. The container is placed in a LightCycler 480 Instrument II amplification unit (Roche, Switzerland) in which PCR results are read. The PCR protocol consists of the following steps: heating the reaction mixture at 95 ° C for 3 minutes and amplification for 40 cycles in the following mode: 95 ° C for 15 sec, 63 ° C for 40 sec.
Таким образом, образец считается положительным на наличие полиморфного аллеля G rs6923761 гена GLP-1R, если выявлено увеличение флуоресценции по каналу HEX (зонда, специфичного для аллеля А).Thus, the sample is considered positive for the presence of the polymorphic G allele rs6923761 of the GLP-1R gene if an increase in fluorescence is detected through the HEX channel (probe specific for allele A).
- Если в результате ПЦР зарегистрирована флуоресценция по каналу FAM, то генотип гомозиготен по аллелю G (GG), при этом регистрируют генотип GG в участке rs6923761 гена GLP-1R.- If, as a result of PCR, fluorescence is detected by the FAM channel, then the genotype is homozygous for the G (GG) allele, and the GG genotype is recorded in the rs6923761 region of the GLP-1R gene.
- Если в результате ПЦР зарегистрирована флуоресценция по каналам FAM и HEX, генотип гетерозиготен (GA), при этом регистрируют генотип GA в участке rs6923761 гена GLP-1R.- If, as a result of PCR, fluorescence is recorded on the FAM and HEX channels, the genotype is heterozygous (GA), while the GA genotype is recorded in the rs6923761 region of the GLP-1R gene.
- Если в результате ПЦР зарегистрирована флуоресценция по каналу HEX, то генотип гомозиготен по аллелю А (АА), при этом регистрируют генотип АА в участке rs6923761 гена GLP-1R.- If, as a result of PCR, fluorescence was recorded on the HEX channel, then the genotype is homozygous for the A allele (AA), while the AA genotype is recorded in the rs6923761 region of the GLP-1R gene.
Оборудование: амплификатор LightCycler 480 Instrument II ("Roche", Швейцария) со стандартным программным обеспечением, дозаторы на 10 мкл, 100 мкл, 200 мкл, 1000 мкл (Biohit, Финляндия); эппендорфы на 0,2 мл, 1,5 мл. Реактивы: набор для выделения ДНК «ДНК-Экстран-1»; набор реагентов для определения однонуклеотидного полиморфизма rs6923761 G/A гена GLP-1R, состоящий из реагентов: 2,5х Разбавитель, 2,5× Реакционная смесь, Taq ДНК-полимераза, отрицательный контроль и положительный контроль для генотипов G/G, G/A А/А. Реактивы хранят при температуре -20°С.Equipment: Amplifier LightCycler 480 Instrument II ("Roche", Switzerland) with standard software, dispensers for 10 μl, 100 μl, 200 μl, 1000 μl (Biohit, Finland); eppendorfs per 0.2 ml, 1.5 ml. Reagents: DNA extraction kit “DNA-Extran-1”; set of reagents for determination of single-nucleotide polymorphism rs6923761 G / A of the GLP-1R gene, consisting of reagents: 2.5x Diluent, 2.5 × Reaction mixture, Taq DNA polymerase, negative control and positive control for genotypes G / G, G / A A / A. Reagents are stored at a temperature of -20 ° C.
В исследование было включено 87 пациентов в возрасте от 32 до 58 лет с метаболическим синдромом (ИМТ от 30 до 48,8 кг/м2) и СД 2 типа, диагноз которого был установлен согласно критериям Международной федерации диабета (Alberti K.G., et al., 2005). Контрольную группу составили 109 здоровых донора в возрасте от 29 до 51 года с нормальными антропометрическими и биохимическими показателями. Набор пациентов в группы исследования проводился на базе областной клинической больницы г. Калининграда. Данные группы были сопоставимы по возрастным и тендерным характеристикам. Все лица, принимавшие участие в эксперименте, относились к славянской популяции, со всеми было подписано информированное согласие. Получено разрешение на проведение исследования в локальном этическом комитете (протокол №4 заседания Локального этического комитета Инновационного парка БФУ им. И. Канта от 23 октября 2013 года).The study included 87 patients aged 32 to 58 years with metabolic syndrome (BMI from 30 to 48.8 kg / m 2 ) and type 2 diabetes, the diagnosis of which was established according to the criteria of the International Diabetes Federation (Alberti KG, et al. , 2005). The control group consisted of 109 healthy donors aged 29 to 51 years with normal anthropometric and biochemical parameters. Patients were recruited to study groups at the regional clinical hospital in Kaliningrad. These groups were comparable in age and gender characteristics. All persons who participated in the experiment belonged to the Slavic population, informed consent was signed with all. Permission has been obtained to conduct research at the local ethics committee (protocol No. 4 of the meeting of the Local Ethics Committee of the I. Kant BFU Innovation Park dated October 23, 2013).
Материалом для исследования служила венозная кровь, из которой были выделены образцы геномной ДНК с использованием коммерческих наборов «ДНК-Экстран-1» согласно протоколу производителя (ЗАО «Синтол»). Генотипирование проводилось методом ПЦР в режиме реального времени с использованием амплификатора LightCycler 480 Instrument II ("Roche", Швейцария) и наборов для определения полиморфизма rs6923761 гена GLP-1R с праймерами GLP1R_Forw (CGCACTCTCCTTCTCT) GLP1R Rev (GTTGGGCTGCTTCATTCCTC) и зондами GLP1R_Wt (FAM-CCTCGGCTTCAGGTAAGGT-RTQ1) и GLP1R M (R6G-GATCCTCCTCAGCTTCA-BHQ2) (ЗАО «Синтол»).The material for the study was venous blood, from which genomic DNA samples were isolated using commercial DNA-Extran-1 kits according to the manufacturer's protocol (Synthol CJSC). Genotyping was performed by PCR in real time thermocycler using LightCycler 480 Instrument II ( "Roche", Switzerland) and kits for detecting the polymorphism rs6923761 GLP1R gene with primers GLP1R_Forw (CGCACTCTCCTTCTCT) GLP1R Rev (GTTGGGCTGCTTCATTCCTC) and probes GLP1R_Wt (FAM-CCTCGGCTTCAGGTAAGGT -RTQ1) and GLP1R M (R6G-GATCCTCCTCAGCTTCA-BHQ2) (Syntol CJSC).
Для оценки инсулинорезистентности рассчитывали индекс HOMA-IR по формуле: HOMA-IR = (Инс × Гл)/22,5, где Инс - инсулин (мкЕД/мл); Гл - глюкоза сыворотки натощак (ммоль/л). Сывороточные уровни инсулина определяли методом иммуноферментного анализа на автоматическом анализаторе Lazurite при помощи тест-систем DRG® Insulin ELISA (EIA-2935). Биохимические показатели исследовались на автоматическом биохимическом анализаторе Furuno СА-180 («Furuno Electric Company», Япония) с применением тест-систем DiaSys («DiaSys Diagnostic Systems», Германия).To assess insulin resistance, the HOMA-IR index was calculated by the formula: HOMA-IR = (Ins × Hl) / 22.5, where Ins is insulin (μED / ml); Hl - fasting serum glucose (mmol / L). Serum insulin levels were determined by enzyme-linked immunosorbent assay on a Lazurite automated analyzer using DRG® Insulin ELISA test systems (EIA-2935). Biochemical parameters were studied on a Furuno CA-180 automatic biochemical analyzer (Furuno Electric Company, Japan) using DiaSys test systems (DiaSys Diagnostic Systems, Germany).
Статистическая обработка полученных результатов была осуществлена с помощью программы Statistica 10. Проверку на соответствие распределению частот генотипов равновесию Харди-Вайнберга, а также сравнение частот аллелей и генотипов в выборках проводили с применением критерия χ2, принимая уровень статистической значимости за 95% (р<0,05). Об ассоциации аллелей или генотипов (частоты которых в группах обследуемых достоверно отличались) с риском развития СД 2 типа судили по величине отношения шансов (OR) с 95% доверительным интервалом (95%С1). Значения OR рассчитывали с помощью программы «Калькулятор для расчета отношения шансов» (http://gen-exp.ru/calculator_or.php). Ассоциация с высоким риском определялась, если значение OR было больше (>) 1, соответственно, при величине OR меньше (<1) аллель или генотип был ассоциирован с пониженным риском развития СД 2 типа.Statistical processing of the obtained results was carried out using the Statistica 10 program. Verification of the correspondence of the distribution of genotype frequencies to Hardy-Weinberg equilibrium, as well as comparison of allele and genotype frequencies in the samples, was carried out using the χ2 criterion, taking the level of statistical significance as 95% (p <0, 05). The association of alleles or genotypes (whose frequencies in the groups of subjects differed significantly) with the risk of developing type 2 diabetes was judged by the odds ratio (OR) with a 95% confidence interval (95% C1). OR values were calculated using the program "Calculator for calculating the odds ratio" (http://gen-exp.ru/calculator_or.php). A high-risk association was determined if the OR value was greater than (>) 1, respectively, with an OR value less than (<1), an allele or genotype was associated with a reduced risk of type 2 diabetes.
В группе с СД 2 типа уровень глюкозы натощак составил 7,80 (6,64-10,39) ммоль/л, уровень инсулина 39,15 (25,41-56,01) мкЕД/мл, HbA1c=7,94±2,1%, индекс HOMA-IR=12,4(9,7-23,5) усл. ед. В контрольной группе уровень глюкозы натощак составил 5,23 (4,90-5,45) ммоль/л, инсулина 18,63 (10,93-20,70) мкЕД/мл, HbA1c=5,6±0,7%, HOMA-IR=1,17 (0,79-1,65) усл. ед.In the group with type 2 diabetes, the fasting glucose level was 7.80 (6.64-10.39) mmol / l, insulin level 39.15 (25.41-56.01) μED / ml, HbA1c = 7.94 ± 2.1%, HOMA-IR index = 12.4 (9.7-23.5) conv. units In the control group, the fasting glucose level was 5.23 (4.90-5.45) mmol / L, insulin 18.63 (10.93-20.70) μED / ml, HbA1c = 5.6 ± 0.7% , HOMA-IR = 1.17 (0.79-1.65) conv. units
При сравнении всех пациентов с СД 2 типа (87 человек) с группой здоровых доноров (109 человек) была установлена взаимосвязь полиморфизма rs6923761 гена GLP-1 с риском развития СД 2 типа.When comparing all patients with type 2 diabetes (87 people) with a group of healthy donors (109 people), a relationship was found between the rs6923761 polymorphism of the GLP-1 gene and the risk of developing type 2 diabetes.
В группе пациентов, страдающих СД 2 типа, были получены следующие частоты аллелей полиморфизма rs6923761 гена GLP-1 G - 62,7% А - 37,3% и генотипов: GG - 44,8%, GA - 35,8%, АА - 19,4%, что соответствовало равновесию Харди-Вайнберга (χ2=3,68, р=0,06). У группы здоровых доноров распределение частот аллелей оказалось G - 73,9% А - 26,1% и генотипов составило: GG - 55,4%, GA - 37,0%, АА - 7,6%, что соответствовало равновесию Харди-Вайнберга (χ2=0,16, р=0,69).In the group of patients suffering from type 2 diabetes, the following alleles of rs6923761 polymorphism of the GLP-1 G gene were obtained - 62.7% A - 37.3% and genotypes: GG - 44.8%, GA - 35.8%, AA - 19.4%, which corresponded to Hardy-Weinberg equilibrium (χ2 = 3.68, p = 0.06). In the group of healthy donors, the distribution of allele frequencies turned out to be G - 73.9%, A - 26.1%, and genotypes: GG - 55.4%, GA - 37.0%, AA - 7.6%, which corresponded to Hardy-equilibrium Weinberg (χ2 = 0.16, p = 0.69).
В ходе анализа распределения частот аллелей и генотипов полиморфизма rs6923761 гена GLP-1R выявлено, что в группе пациентов с СД 2 типа чаще, чем в контрольной встречается аллель А. Установлена ассоциация аллеля A (OR=1,69, 95% CI: 1,04-2,73, р=0,03) и генотипа АА (OR=2,92, 95% CI: 1,10-7,79, р=0,026) полиморфизма rs6923761 гена GLP-1 с повышенным риском развития СД 2 типа.An analysis of the frequency distribution of alleles and genotypes of rs6923761 polymorphism of the GLP-1R gene revealed that in the group of patients with type 2 diabetes more often than in the control one, the allele A was found. Association of the allele A was established (OR = 1.69, 95% CI: 1, 04-2.73, p = 0.03) and AA genotype (OR = 2.92, 95% CI: 1.10-7.79, p = 0.026) of the rs6923761 polymorphism of the GLP-1 gene with an increased risk of developing type 2 diabetes type.
Носители генотипа GG в группе пациентов с АО без СД 2 типа встречались чаще, чем в группе с СД 2 типа. При сравнении пациентов с и без СД 2 типа был установлен пониженный риск развития СД 2 типа при наличии генотипа GG (OR=0,52, 95% CI: 0,27-0,99, р=0,046) SNP rs6923761 гена GLP-1R, тогда как с генотипом АА связан повышенный риск (OR=2,75, 95% CI: 1,03-7,34, р=0,027) развития СД 2 типа.Carriers of the GG genotype in the group of patients with AO without type 2 diabetes were more common than in the group with type 2 diabetes. When comparing patients with and without type 2 diabetes, a reduced risk of developing type 2 diabetes was established in the presence of the GG genotype (OR = 0.52, 95% CI: 0.27-0.99, p = 0.046) SNP rs6923761 of the GLP-1R gene while the AA genotype is associated with an increased risk (OR = 2.75, 95% CI: 1.03-7.34, p = 0.027) of type 2 diabetes.
Таким образом, приведенные результаты исследования подтверждают то, что определение полиморфизма rs6923761 в гене GLP-1R позволяет прогнозировать риск развития СД 2 типа.Thus, the results of the study confirm that the determination of rs6923761 polymorphism in the GLP-1R gene allows us to predict the risk of type 2 diabetes.
При этом было обнаружено, что наличие аллеля А и генотипа АА полиморфизма rs6923761 гена GLP-1 ассоциировано с повышенным риском развития СД 2 типа (в два раза) (OR=1,69; OR=2,92; OR=2,75), а генотипа GG - с пониженным (в два раза) (OR=0,52).It was found that the presence of the A allele and the AA genotype of the rs6923761 polymorphism of the GLP-1 gene is associated with an increased risk of developing type 2 diabetes (twice) (OR = 1.69; OR = 2.92; OR = 2.75) , and the genotype GG - with a reduced (twice) (OR = 0.52).
Сущность изобретения заключается в определении полиморфизма гена рецептора к инкретинам GLP-1R и прогнозе пониженного риска развития СД 2 типа в случае выявления генотипа GG полиморфизма rs6923761 гена GLP-1R.The essence of the invention is to determine the polymorphism of the receptor gene for incretins GLP-1R and the prediction of a reduced risk of developing type 2 diabetes in the case of revealing the genotype GG polymorphism rs6923761 of the GLP-1R gene.
Способ прост в осуществлении, в его основе лежит ПЦР анализ полиморфизмов генов рецепторов к инкретинам с последующим расчетом отношения шансов развития СД 2 типа, что позволяет разрабатывать тактику лечения СД 2 типа с учетом индивидуальных (генетических) особенностей пациента.The method is simple to implement, it is based on PCR analysis of polymorphisms of receptor genes for incretins, followed by calculation of the odds ratio of type 2 diabetes, which allows developing tactics for the treatment of type 2 diabetes taking into account the individual (genetic) characteristics of the patient.
Список использованной литературыList of references
1. World Health Organization - database [electronic resource]. Available from: http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs312/ru. (cited 08.05.2016).1. World Health Organization - database [electronic resource]. Available from: http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs312/en. (cited 05/08/2016).
2. Polychronakos C., Alriyami M. Diabetes in the post-GWAS era // Nat Genet. - 2015. - Vol. 47, №12. - P. 1373-4.2. Polychronakos C., Alriyami M. Diabetes in the post-GWAS era // Nat Genet. - 2015. - Vol. 47, No. 12. - P. 1373-4.
3. Shestakova E.A., Il'in A.V., Shestakova M.V, Dedov I.I. Secretion of incretin hormones in people having risk factors for type 2 diabetes mellitus // Ter Arkh. - 2014. - Vol. 86, №10. - P. 10-4.3. Shestakova E.A., Il'in A.V., Shestakova M.V., Dedov I.I. Secretion of incretin hormones in people having risk factors for type 2 diabetes mellitus // Ter Arkh. - 2014 .-- Vol. 86, No. 10. - P. 10-4.
4. Baggio L.L., Drucker D.J. Biology of incretins: GLP-1 and GIP // Gastroenterology. - 2007. - Vol. 132, №6. - P. 2131-57.4. Baggio L.L., Drucker D.J. Biology of incretins: GLP-1 and GIP // Gastroenterology. - 2007. - Vol. 132, No. 6. - P. 2131-57.
5. Campbell J.E., Ussher J.R., Mulvihill E.E., Kolic J., Baggio L.L., Cao X., Liu Y., Lamont B.J., Morii Т., Streutker C.J., Tamarina N., Philipson L.H., Wrana J.L., MacDonald P.E., Drucker D.J. TCF1 links GIPR signaling to the control of beta cell function and survival // Nat Med. - 2016. - Vol. 22, №1. - P. - 84-90.5. Campbell JE, Ussher JR, Mulvihill EE, Kolic J., Baggio LL, Cao X., Liu Y., Lamont BJ, Morii T., Streutker CJ, Tamarina N., Philipson LH, Wrana JL, MacDonald PE, Drucker DJ TCF1 links GIPR signaling to the control of beta cell function and survival // Nat Med. - 2016. - Vol. 22, No. 1. - P. - 84-90.
6. Nielsen S.T., Janum S., Krogh-Madsen R., Solomon T.P., 
7. Yabe D, Seino Y. Incretin actions beyond the pancreas: lessons from knockout mice // Curr Opin Pharmacol. - 2013. - Vol. 13, №6. - P. 946 - 53.7. Yabe D, Seino Y. Incretin actions beyond the pancreas: lessons from knockout mice // Curr Opin Pharmacol. - 2013 .-- Vol. 13, No. 6. - P. 946 - 53.
Claims (1)
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2017108884A RU2655635C1 (en) | 2017-03-16 | 2017-03-16 | Method of early genetic diagnostics of risk for developing type 2 diabetes mellitus |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2017108884A RU2655635C1 (en) | 2017-03-16 | 2017-03-16 | Method of early genetic diagnostics of risk for developing type 2 diabetes mellitus |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2655635C1 true RU2655635C1 (en) | 2018-05-29 |
Family
ID=62559963
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2017108884A RU2655635C1 (en) | 2017-03-16 | 2017-03-16 | Method of early genetic diagnostics of risk for developing type 2 diabetes mellitus |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2655635C1 (en) |
Cited By (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2679653C1 (en) * | 2018-08-01 | 2019-02-12 | Общество с ограниченной ответственностью "Формула гена" | SET OF REACTIVES FOR IDENTIFICATION OF Ph-NEGATIVE MYELOPROLIFERATIVE BLASTOMA AND A METHOD OF DIAGNOSTICS BASED ON IT |
| CN114317710A (en) * | 2021-12-24 | 2022-04-12 | 廊坊诺道中科医学检验实验室有限公司 | Primer probe combination for detecting SNP typing of polymorphic site of GLP1R gene, kit and application thereof |
| RU2803637C1 (en) * | 2023-03-06 | 2023-09-18 | Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Курский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации | METHOD FOR PREDICTING THE RISK OF DEVELOPING TYPE 2 DIABETES IN RESIDENTS OF CENTRAL RUSSIA BASED ON GENOTYPING OF THE rs755892 POLYMORPHISM OF THE DNAJB1 GENE |
Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2011050052A2 (en) * | 2009-10-20 | 2011-04-28 | Georgia State University Research Foundation, Inc. | Protein agent for diabetes treatment and beta cell imaging |
| RU2602663C1 (en) * | 2015-06-23 | 2016-11-20 | федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБОУ ВО СЗГМУ им. И.И. Мечникова Минздрава России) | Method for predicting the effectiveness of therapy using oral hypoglycemic agent metformin in patients with type 2 diabetes |
| RU2015136673A (en) * | 2013-01-31 | 2017-03-10 | Каприон Протеомикс Инк. | SUGAR DIABETES BIOMARKERS TYPE 2 AND THEIR APPLICATION |
-
2017
- 2017-03-16 RU RU2017108884A patent/RU2655635C1/en active
Patent Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2011050052A2 (en) * | 2009-10-20 | 2011-04-28 | Georgia State University Research Foundation, Inc. | Protein agent for diabetes treatment and beta cell imaging |
| RU2015136673A (en) * | 2013-01-31 | 2017-03-10 | Каприон Протеомикс Инк. | SUGAR DIABETES BIOMARKERS TYPE 2 AND THEIR APPLICATION |
| RU2602663C1 (en) * | 2015-06-23 | 2016-11-20 | федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБОУ ВО СЗГМУ им. И.И. Мечникова Минздрава России) | Method for predicting the effectiveness of therapy using oral hypoglycemic agent metformin in patients with type 2 diabetes |
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| DE LUIS D.A. et al. Role of rs6923761 gene variant in glucagon-like peptide 1 receptor in basal GLP-1 levels, cardiovascular risk factor and serum adipokine levels in naive type 2 diabetic patients. J Endocrinol Invest. 2015 Feb; 38(2): 143-7. Epub 2014 Sep 9. * |
Cited By (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2679653C1 (en) * | 2018-08-01 | 2019-02-12 | Общество с ограниченной ответственностью "Формула гена" | SET OF REACTIVES FOR IDENTIFICATION OF Ph-NEGATIVE MYELOPROLIFERATIVE BLASTOMA AND A METHOD OF DIAGNOSTICS BASED ON IT |
| CN114317710A (en) * | 2021-12-24 | 2022-04-12 | 廊坊诺道中科医学检验实验室有限公司 | Primer probe combination for detecting SNP typing of polymorphic site of GLP1R gene, kit and application thereof |
| RU2803637C1 (en) * | 2023-03-06 | 2023-09-18 | Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Курский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации | METHOD FOR PREDICTING THE RISK OF DEVELOPING TYPE 2 DIABETES IN RESIDENTS OF CENTRAL RUSSIA BASED ON GENOTYPING OF THE rs755892 POLYMORPHISM OF THE DNAJB1 GENE |
| RU2803636C1 (en) * | 2023-03-06 | 2023-09-18 | Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Курский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации | METHOD FOR PREDICTING THE RISK OF DEVELOPING TYPE 2 DIABETES IN RESIDENTS OF CENTRAL RUSSIA BASED ON GENOTYPING OF THE rs11073891 POLYMORPHISM OF THE ANPEP GENE |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Vialard et al. | Prenatal BACs‐on‐Beads™: a new technology for rapid detection of aneuploidies and microdeletions in prenatal diagnosis | |
| Ebbert et al. | Population-based analysis of Alzheimer’s disease risk alleles implicates genetic interactions | |
| KR101591738B1 (en) | Diagnostic biomarkers of diabetes | |
| CA2902006A1 (en) | Methods and compositions for assessing renal status using urine cell free dna | |
| JP2019527039A (en) | Biomarkers for inflammatory bowel disease | |
| Liguori et al. | The FTO gene polymorphism (rs9939609) is associated with metabolic syndrome in morbidly obese subjects from southern Italy | |
| Dolcini et al. | Mitochondria and aging in older individuals: an analysis of DNA methylation age metrics, leukocyte telomere length, and mitochondrial DNA copy number in the VA normative aging study | |
| Karmelić et al. | Adiponectin level and gene variability are obesity and metabolic syndrome markers in a young population | |
| Chen et al. | Diagnosis of neonatal intrahepatic cholestasis caused by citrin deficiency using high-resolution melting analysis and a clinical scoring system | |
| Lamot et al. | Aberrant expression of shared master-key genes contributes to the immunopathogenesis in patients with juvenile spondyloarthritis | |
| RU2655635C1 (en) | Method of early genetic diagnostics of risk for developing type 2 diabetes mellitus | |
| Liang et al. | Gestational diabetes mellitus screening based on the gene chip technique | |
| Dallali et al. | Genetic characterization of suspected MODY patients in Tunisia by targeted next-generation sequencing | |
| Montazeri et al. | Association between polymorphisms in human tumor necrosis factor-alpha (− 308) and-beta (252) genes and development of gestational diabetes mellitus | |
| Chen et al. | Associations between genetic variants and the severity of metabolic syndrome in subjects with type 2 diabetes | |
| Hussain et al. | Heritability of genetic variants of resistin gene in patients with coronary artery disease: a family-based study | |
| Baclig et al. | Genetic variation I148M in patatin-like phospholipase 3 gene and risk of non-alcoholic fatty liver disease among Filipinos | |
| US7572576B2 (en) | Method of predicting genetic risk for hypertension | |
| Eising et al. | Type 1 diabetes risk analysis on dried blood spot samples from population‐based newborns: design and feasibility of an unselected case–control study | |
| Xu et al. | Type 2 diabetes risk allele UBE2E2 is associated with decreased glucose-stimulated insulin release in elderly Chinese Han individuals | |
| Francaite-Daugeliene et al. | Genetic variants of TCF7L2 gene and its coherence with metabolic parameters in Lithuanian (Kaunas district) women population with previously diagnosed gestational diabetes mellitus compared to general population | |
| Kouremenos et al. | Genes and genetic variations involved in the development of hypertension: focusing on a Greek patient cohort | |
| Bani-Wais et al. | A novel intergenic variant, rs2004339 A/G, of the gene encoding interleukin-40, C17orf99, is associated with risk of rheumatoid arthritis in Iraqi women | |
| EP3315613A2 (en) | Methods and kits for diagnosing or assessing the risk of cervical cancer | |
| Chiou et al. | Detection of common sequence variations of familial hypercholesterolemia in Taiwan using DNA mass spectrometry |