RU2563257C1 - СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ 9-(БЕТА-D-АРАБИНОФУРАНОЗИЛ)-6-(Nα-L-СЕРИЛАМИДО)-2-ХЛОРПУРИНА - Google Patents

СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ 9-(БЕТА-D-АРАБИНОФУРАНОЗИЛ)-6-(Nα-L-СЕРИЛАМИДО)-2-ХЛОРПУРИНА Download PDF

Info

Publication number
RU2563257C1
RU2563257C1 RU2014144731/04A RU2014144731A RU2563257C1 RU 2563257 C1 RU2563257 C1 RU 2563257C1 RU 2014144731/04 A RU2014144731/04 A RU 2014144731/04A RU 2014144731 A RU2014144731 A RU 2014144731A RU 2563257 C1 RU2563257 C1 RU 2563257C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
beta
chloropurine
serylamido
arabinofuranosyl
nucleoside
Prior art date
Application number
RU2014144731/04A
Other languages
English (en)
Inventor
Ирина Дмитриевна Константинова
Барбара Златковна Елецкая
Елена Викторовна Дорофеева
Илья Владимирович Фатеев
Мария Яновна Берзина
Ольга Ивановна Лутонина
Анатолий Иванович Мирошников
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН (ИБХ РАН)
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН (ИБХ РАН) filed Critical Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН (ИБХ РАН)
Priority to RU2014144731/04A priority Critical patent/RU2563257C1/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2563257C1 publication Critical patent/RU2563257C1/ru

Links

Images

Classifications

    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02PCLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P20/00Technologies relating to chemical industry
    • Y02P20/50Improvements relating to the production of bulk chemicals
    • Y02P20/55Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups

Landscapes

  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)

Abstract

Изобретение относится к новому способу получения противоопухолевого препарата - 9-(бета-D-арабинофуранозил)-6-(Nα-L-сериламидо)-2-хлорпурина. Способ заключается в том, что 9-(бета-D-арабинофуранозил)-6-(Nα-L-сериламидо)-2-хлорпурин получают посредством конденсации метилового эфира L-серина с 2,6-дихлор-9-(2′,3′,5′-три-O-ацетил-бета-D-рибофуранозил)пурином с последующим удалением защитных групп и реакции транс-арабинозилирования полученного нуклеозида с 1-бета-D-арабинофуранозилурацилом в присутствии каталитических количеств уридин фосфорилазы и пуриннуклеозидфосфорилазы. Предложен эффективный способ ценного противоопухолевого препарата. 3 пр., 2 ил.

Description

Изобретение относится к биотехнологии, в частности к получению противоопухолевого пуринового нуклеозида бета-D-арабинофуранозы, содержащий по С2 положению атом хлора, по С6 положению пуринового основания остаток природной аминокислоты L-серина (соединение (1), рис. 1) - 9-(бета-D-арабинофуранозил)-6-(Nα-L-сериламидо)-2-хлорпурина (САП).
Модифицированный нуклеозид САП (1) синтезирован впервые, в литературе не описан. Относится к классу антиметаболитов. Исследования резистентности опухолевых клеток линии MOLT-4 и U937 к препарату САП показали, что данное соединение обладает дозозависимым цитотоксическим эффектом in vitro. Цитотоксическая активность препарата САП сопоставима с активностью коммерчески доступного препарата неларабина, используемого для терапии Т-лимфобластных лейкозов.
Изобретение решает задачу разработки эффективного способа синтеза САП за счет использования химико-ферментативного подхода, приведенного на схеме 1 (рис. 2). В качестве исходного соединения был выбран 2,6-дихлор-9-(2′,3′,5′-три-O-ацетил-β-D-рибофуранозил)пурин (соединение 2, рис. 2), синтез которого описан в патенте [Берзин В.Б., Дорофеева Е.В., Леонов В.К, Лутонина О.И., Мирошников А.И. Способ получения 2,6-дихлор-9-(2′,3′,5′-три-O-ацетил-β-D-рибофуранозил)пурина. Патент РФ №2324699 от 05.02.2008 г.].
На первой стадии синтеза проводили конденсацию нуклеозида (2) (рис. 2)с метиловым эфиром L-серина [Синтез пептидов. Реагенты и методы. А.А. Гершкович, Кибирев В.К. Изд. «Наукова думка», Киев, 1987, с. 171-172]. В отличие от описанных ранее способов конденсации аминокислот, синтез проводили в ацетонитриле при комнатной температуре без нагревания реакционной смеси, чтобы избежать изомеризации L-серина в D-серин. После удаления защитных групп нуклеозида (3) (рис. 2) получали рибозид (4) (рис. 2). На следующей стадии синтеза использовали генно-инженерные ферменты нуклеозидфосфорилазы, которые осуществляют перенос остатка арабинозы с 1-бета-D-арабинофуранозилурацила (соединение (5), рис. 2) на основание, полученное при фосфоролизе нуклеозида (4). В качестве генно-инженерных ферментов используют пуриннуклеозидфосфорилазу (ПНФ, КФ 2.4.2.1) и уридинфосфорилазу (УФ, КФ 2.4.2.3).
Изобретение иллюстрируют рисунки:
Рисунок 1. Структурная формула 9-(бета-D-арабинофуранозил)-6-(Nα-L-сериламидо)-2-хлорпурина (САП).
Рисунок 2. Схема получения 9-(бета-D-арабинофуранозил)-6-(Nα-L-сериламидо)-2-хлорпурина.
Изобретение иллюстрируют примеры.
Пример 1.
Синтез 9-(2′,3′,5′-три-O-ацетил-бета-D-рибофуранозил)-6-(Nα-L-метоксисерил)-2-хлорпурина (соединение 3, рис. 2).
К раствору 2.00 г (4.5 ммоль) 2,6-дихлор-защищенного нуклеозида (2) и метилового эфира L-серина 0.996 г (6.4 ммоль) в 60 мл ацетонитрила при перемешивании на магнитной мешалке добавляют 1.76 мл (12.8 ммоль) триэтиламина, смесь перемешивают при комнатной температуре 18 ч. Контроль прохождения реакции осуществляют по ТСХ на силуфоле в системе хлороформ-метанол, 20:1. После окончания реакции отфильтровывают кристаллы хлоргидрата Et3N. Растворитель удаляют в вакууме при 40°C, полученный маслообразный продукт распределяют между 100 мл хлороформа и 100 мл воды. Органический слой промывают 60 мл воды, сушат над сульфатом магния безв., растворитель удаляют в вакууме. Получают продукт (3) в количестве 2.25 г (95%), чистотой 95.14%, Rt=6.86 мин (метод 30-100% В за 20 мин, далее во всех случаях: хроматограф Waters, Breeze (США), колонка Nova-Pak С18, 4.6×150 мм, 4 мкм, детекцию осуществляют при 254 нм, элюент А - вода с 0.1% ТФУ, элюент В - 70% ацетонитрила в воде с 0.1% ТФУ). Масс-спектр (3), m/z: [М+Н]+=530.1293, расч.=530.1284; Cl37 [М+Н]+=532.1258; [основание +Н]+=272.0543, расч.=272.0545, Cl37 [М+Н]+=274.0513.
Пример 2.
Синтез 9-(бета-D)-рибофуранозил)-6-(Nα-L-сериламидо)-2-хлорпурина (соединение 4, рис. 2).
2.25 г (4.0 ммоль) нуклеозида (3) растворяют в 60 мл абс. метанола, охлаждают в ледяной бане до +4°C, насыщенной NH3, оставляют на 24 ч при +4°C. Контроль - ТСХ хлороформ-метанол, 10:1. Реакционную смесь концентрируют до 5 мл, остаток кипятят с 20 мл смеси хлороформ-метанол (3:2). Осадок отфильтровают, получают 1.53 г технического продукта нуклеозида (4) (93%) с чистотой 91%, Rt=9.041 мин (метод 0-30% В за 20 мин). Далее технический продукт кристаллизуют из смеси ацетонитрил-метанол (8:1), получают 1.35 г продукта (83%) с чистотой 95.86%, Rt=8.872 мин (метод 0-30% В за 20 мин, 254 нм), т.пл. 168-170°C. Масс-спектр, m/z: [М+Н]+=389.0953, расч. 389.0971; Cl37 [М+Н]+=391.0927.
Пример 3.
Синтез 9-(бета-D-арабинофуранозил)-6-(Nα-L-сериламидо)-2-хлор-пурина (соединение 1, рис. 2).
Рибозид (4) 0.8 г (20.0 ммоль) растворяют в 1 л воды в полученном растворе при небольшом нагревании растворяют 2.5 г (0.1 моль) 1-бета-0-арабинофуранозилурацила (соед. 5, рис. 1) и 1.4 г (0.1 моль) дигидроортофосфата калия. Доводят рН реакционной смеси до 7.0. В реакционную смесь добавляют 1610 ед. пуриннуклеозидфосфорилазы и 930 ед. уридинфосфорилазы. Раствор термостатируют при 55°C. Реакцию проводят до тех пор пока конверсия нуклеозида (4) в целевое соединение (1) не составит 81%. По окончании процесса реакционную смесь концентрируют в вакууме (15 мм.рт.ст.) до объема 30 мл и хроматографируют на обращеннофазовом сорбенте Octadecyl=Si 100polyol (0.03 mm), размеры колонки: 30×220 мм. Целевое соединение элюируют 10% ацетонитрила в воде. Фракции содержащие продукт объединяют, растворитель удаляют в вакууме (15 мм.рт.ст.). Продукт сушат в вакууме (5 мм.рт.ст.) над пятиокисью фосфора. Выход: 0.58 г (75%). Чистота продукта по данным ВЭЖХ 99.27% (Rt=4.624 мин, градиент элюента В 0-100% за 20 минут).
λmax249 нм, 204 нм. Масс-спектр, m/z: [М+Н]+=389.1007, расч. 389.0971; [ α ] D 25
Figure 00000001
43.6 (с 0.5, H2O).
1Н-ЯМР (WM-700 Bruker, США, dmso-d6, 30°C): 8.27, (с, 1Н, Н8), 7.54 (д, 1H, NH (J=6.2 Гц)), 7.47 (м, 2Н2, NH2), 6.17 (д, 1Н, H1, (J=5.1 Гц)), 4.51 (м, 1Н, Н2,), 4.12 (м, 1Н, H3,), 3.8 (м, 1Н, Н4,), 3.68, 3.64 (2 м, 2Н, Н5), 5.64 (уш. д, 1Н, 2′-ОН), 5.51 (уш. д, 1Н, 3′-ОН), 5.05 (м, 1H, 5′-ОН), 4.62 (т, 1Н, NHCH), 3.80 (м, 2Н, СН2ОН);
13С-ЯМР: 171.85 (CONH2), 150.21 (С4), 141.37 (С8), 118.41 (С5), 84.55 (С4,), 84.17 (С1,), 75.95 (С2,), 75.07 (С3,), 62.02 (СН2ОН), 61.08 (С5,), 56.35 (NHCH),
15N-ЯМР: 104.62 (NH2), 90.67 (NH).

Claims (1)

  1. Способ получения противоопухолевого препарата нуклеозидной природы 9-(бета-D-арабинофуранозил)-6-(Nα-L-сериламидо)-2-хлорпурина, включающий конденсацию метилового эфира L-серина с 2,6-дихлор-9-(2′,3′,5′-три-O-ацетил-бета-D-рибофуранозил)пурином с последующим удалением защитных групп и реакцию транс-арабинозилирования полученного нуклеозида с 1-бета-D-арабинофуранозилурацилом в присутствии каталитических количеств уридин фосфорилазы и пуриннуклеозидфосфорилазы.
RU2014144731/04A 2014-11-07 2014-11-07 СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ 9-(БЕТА-D-АРАБИНОФУРАНОЗИЛ)-6-(Nα-L-СЕРИЛАМИДО)-2-ХЛОРПУРИНА RU2563257C1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2014144731/04A RU2563257C1 (ru) 2014-11-07 2014-11-07 СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ 9-(БЕТА-D-АРАБИНОФУРАНОЗИЛ)-6-(Nα-L-СЕРИЛАМИДО)-2-ХЛОРПУРИНА

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2014144731/04A RU2563257C1 (ru) 2014-11-07 2014-11-07 СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ 9-(БЕТА-D-АРАБИНОФУРАНОЗИЛ)-6-(Nα-L-СЕРИЛАМИДО)-2-ХЛОРПУРИНА

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2563257C1 true RU2563257C1 (ru) 2015-09-20

Family

ID=54147757

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2014144731/04A RU2563257C1 (ru) 2014-11-07 2014-11-07 СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ 9-(БЕТА-D-АРАБИНОФУРАНОЗИЛ)-6-(Nα-L-СЕРИЛАМИДО)-2-ХЛОРПУРИНА

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2563257C1 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2624023C2 (ru) * 2015-11-06 2017-06-30 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН (ИБХ РАН) Способ получения пуриновых нуклеозидов ряда β-D-арабинофуранозы

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB2006185A (en) * 1977-08-10 1979-05-02 Ajinomoto Kk Method for producing purine arabinosides
US4371613A (en) * 1977-08-10 1983-02-01 Ajinomoto Company Incorporated Method for producing purine arabinosides
RU2324699C1 (ru) * 2007-02-05 2008-05-20 Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Россиийской Академии Наук СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ 2,6-ДИХЛОР-9-(2,3,5-ТРИ-O-АЦЕТИЛ-β-D-РИБОФУРАНОЗИЛ)ПУРИНА

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB2006185A (en) * 1977-08-10 1979-05-02 Ajinomoto Kk Method for producing purine arabinosides
US4371613A (en) * 1977-08-10 1983-02-01 Ajinomoto Company Incorporated Method for producing purine arabinosides
RU2324699C1 (ru) * 2007-02-05 2008-05-20 Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Россиийской Академии Наук СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ 2,6-ДИХЛОР-9-(2,3,5-ТРИ-O-АЦЕТИЛ-β-D-РИБОФУРАНОЗИЛ)ПУРИНА

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2624023C2 (ru) * 2015-11-06 2017-06-30 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН (ИБХ РАН) Способ получения пуриновых нуклеозидов ряда β-D-арабинофуранозы

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP6477464B2 (ja) モルフォリノオリゴヌクレオチドの製造方法
CA2971460A1 (en) Synthesis of a bruton's tyrosine kinase inhibitor
Sahnoun et al. A site selective C–H arylation of free-(NH 2) adenines with aryl chlorides: Application to the synthesis of 6, 8-disubstituted adenines
WO2018137679A1 (en) Process for the Preparation of (10R) -7- (2-aminoacetyl) amino-12-fluoro-2, 10, 16-trimethyl-15-oxo-10, 15, 16, 17-tetrahydro-2H-8, 4- (metheno) pyrazolo [4, 3-h] [2, 5, 11] -benzoxadiazacyclotetradecine-3-carbonitrile
JP5717752B2 (ja) ピリピロペン誘導体の製造法
WO2010131676A9 (ja) ピリピロペン誘導体の製造法
Sun et al. An improved P (V)-N activation strategy for the synthesis of nucleoside diphosphate 6-deoxy-l-sugars
RU2563257C1 (ru) СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ 9-(БЕТА-D-АРАБИНОФУРАНОЗИЛ)-6-(Nα-L-СЕРИЛАМИДО)-2-ХЛОРПУРИНА
CA2944122A1 (en) Sialic acid derivatives
Zlatev et al. δ-Di-carboxybutyl phosphoramidate of 2′-deoxycytidine-5′-monophosphate as substrate for DNA polymerization by HIV-1 reverse transcriptase
WO2014068589A2 (en) Novel process for the preparation of (1-{9-[(4s, 2r, 3r, 5r)-3, 4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl) oxolan-2-yl)-6-aminopurin-2-yl} pyrazole-4-yl)-n-methylcarboxamide
CN109641931B (zh) 核糖核酸h-磷酸酯单体的合成方法和使用了该单体的寡核苷酸合成
CN115215921A (zh) 一种连接基药物偶联物的制备方法及其中间体
CN116897149A (zh) 一种连接基药物偶联物的制备方法及其中间体
US20230212178A1 (en) Method of producing photoreactive nucleotide analog
Bhushan et al. Synthesis of conformationally restricted 2′, 3′-exo-Methylene carbocyclic nucleosides built on a bicyclo [3.1. 0] hexane template
Yang et al. Efficient synthesis and resolution of tenofovir alafenamide
Tănase et al. New carbocyclic nucleoside analogues with a bicyclo [2.2. 1] heptane fragment as sugar moiety; synthesis, X-ray crystallography and anticancer activity
Kore et al. Ionic-tag-assisted synthesis of nucleoside triphosphates
EP2880044B1 (en) New method of polyphosphate synthesis
Tardibono Jr et al. Enantioselective syntheses of carbocyclic nucleosides 5′-homocarbovir, epi-4′-homocarbovir, and their cyclopropylamine analogs using facially selective Pd-mediated allylations
Szakonyi et al. Carbocyclic nucleosides from enantiomeric, α-pinane-based aminodiols
Roy et al. Carbanucleosides: synthesis of both enantiomers of 2-(6-chloro-purin-9-yl)-3, 5-bishydroxymethyl cyclopentanol from D-glucose
Kuchař et al. Synthesis of substituted 6-cyclopropylpurine bases and nucleosides by cross-coupling reactions or cyclopropanations
Vince et al. 6-Deoxycarbovir: a xanthine oxidase activated prodrug of carbovir