RU2550044C2 - ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ФЬЮЖН-КОНСТРУКЦИЯ ДЛЯ ОБЕСПЕЧЕНИЯ ЭКСПРЕССИИ МУЛЬТИФЕРМЕНТНОГО КОМПЛЕКСА КАРБОГИДРАЗ В КЛЕТКАХ МИЦЕЛИАЛЬНОГО ГРИБА Penicillium verruculosum, ИСПОЛЬЗУЕМОГО В КАЧЕСТВЕ ХОЗЯИНА, СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ РЕКОМБИНАНТНОГО ШТАММА ГРИБА Penicillium verruculosum И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ФЕРМЕНТНОГО ПРЕПАРАТА НА ЕГО ОСНОВЕ - Google Patents

ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ФЬЮЖН-КОНСТРУКЦИЯ ДЛЯ ОБЕСПЕЧЕНИЯ ЭКСПРЕССИИ МУЛЬТИФЕРМЕНТНОГО КОМПЛЕКСА КАРБОГИДРАЗ В КЛЕТКАХ МИЦЕЛИАЛЬНОГО ГРИБА Penicillium verruculosum, ИСПОЛЬЗУЕМОГО В КАЧЕСТВЕ ХОЗЯИНА, СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ РЕКОМБИНАНТНОГО ШТАММА ГРИБА Penicillium verruculosum И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ФЕРМЕНТНОГО ПРЕПАРАТА НА ЕГО ОСНОВЕ Download PDF

Info

Publication number
RU2550044C2
RU2550044C2 RU2013141271/10A RU2013141271A RU2550044C2 RU 2550044 C2 RU2550044 C2 RU 2550044C2 RU 2013141271/10 A RU2013141271/10 A RU 2013141271/10A RU 2013141271 A RU2013141271 A RU 2013141271A RU 2550044 C2 RU2550044 C2 RU 2550044C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
verruculosum
cellobiohydrolase
gene
penicillium verruculosum
glucosidase
Prior art date
Application number
RU2013141271/10A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2013141271A (ru
Inventor
Аркадий Пантелеймонович Синицын
Александра Михайловна Рожкова
Иван Никитич Зоров
Ольга Аркадьевна Синицына
Ольга Владимировна Проскурина
Ольга Генриховна Короткова
Екатерина Вячеславовна Бушина
Олег Николаевич Окунев
Вероника Юрьевна Матыс
Анатолий Владимирович Кошелев
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биохимии им. А.Н. Баха Российской академии наук (ИНБИ РАН)
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биохимии им. А.Н. Баха Российской академии наук (ИНБИ РАН) filed Critical Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биохимии им. А.Н. Баха Российской академии наук (ИНБИ РАН)
Priority to RU2013141271/10A priority Critical patent/RU2550044C2/ru
Publication of RU2013141271A publication Critical patent/RU2013141271A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2550044C2 publication Critical patent/RU2550044C2/ru

Links

Images

Landscapes

  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Изобретение относится к биотехнологии, в частности к микробиологической промышленности, и представляет собой способ получения комплексных мультиферментных препаратов с целлобиогидролазной, эндоглюканазной, β-глюкозидазной (целлобиазной) активностями путем культивирования рекомбинантных штаммов мицелиальных грибов рода Penicillium verruculosum, трансформированных линейной фьюжн-конструкцией, представляющей собой последовательно соединенные через линкер гомологичные и гетерологичный гены карбогидраз, таких как целлобиогидролаза I, эндоглюканаза и бета-глюкозидаза. Изобретение позволяет получить эффективный мультиферментный препарат заданного состава. 3 н.п. ф-лы, 2 табл., 3 ил.

Description

Изобретение в области биотехнологии относится к микробиологической промышленности и представляет собой способ получения комплексных мультиферментных препаратов с целлобиогидролазной, эндоглюканазной, β-глюкозидазной (целлобиазной) активностями путем культивирования рекомбинантных штаммов мицелиальных грибов рода Penicillium verruculosum, трансформированных линейной фьюжн-конструкцией, представляющей собой последовательно состыкованные гомологичные и гетерологичный гены карбогидраз.
В последние годы процессы получения биоспиртов из возобновляемого целлюлозосодержащего сырья (ЦСС) предполагают использование гидролизатов исходных субстратов, содержащих сахара, с их последующей конверсией в целевой продукт.
Ферментативный гидролиз растительной биомассы во многом решает проблемы, существующие при использовании альтернативных методов получения простых сахаров (глюкозы, ксилозы), позволяя получать их в доступном для роста и утилизации микроорганизмов виде.
Ферментативный гидролиз ЦСС происходит под действием карбогидразного комплекса - совокупности ферментов различной специфичности, гидролизующих полисахаридные молекулы с получением олиго- и моносахаридов. Лучшими продуцентами целлюлозоразрушающих ферментов, на сегодняшний день, являются микроскопические грибы, преимущественно относящиеся к родам Trichoderma, Penicillium, а также Aspergillus. Это связано с их высокой способностью секретировать внеклеточные ферменты-карбогидразы. Глубокое осахаривание ЦСС с образованием простых сахаров, которые могут быть далее конвертированы в различные продукты микробиологического синтеза, эффективно осуществляется только при наличии сбалансированного состава различных ферментов в целлюлазном комплексе. Грибы рода Penicillium по сравнению с другими продуцентами секретируют целлюлазный ферментный комплекс достаточно сбалансированного состава, в который входят целлобиогидролазы, эндоглюканазы и β-глюкозидазы (целлобиазы). Гемицеллюлазы Penicillium представлены ксиланазами, маннаназами и другими. Данный состав ферментов карбогидразного комплекса Penicillium позволяет эффективно осуществлять гидролиз растительных полисахаридов, причем продуктами реакции оказываются, преимущественно, простые сахара.
Ранее было показано, что входящая в состав целлюлазного комплекса гриба Penicillium verruculosum целлобиогидролаза I обладает высокой удельной активностью, превосходящей аналогичную целлобиогидролазу Trichoderma более чем в полтора раза [Чекушина А.В., Доценко Г.С., Синицын А.П. Катализ в промышленности, №6, 2012, 68-75]. Также было показано, что в состав ферментов для эффективного гидролиза ЦСС должно входить 50-60% целлобиогидролазы I, около 30% эндоглюканаз и 10-15% β-глюкозидазы (целлобиазы) [А.В. Чекушина, Г.С. Доценко, Е.Г. Кондратьева, А.П. Синицын. Биотехнология, 2013, №3, стр.69-80]. Разработка новых рекомбинантных штаммов-продуцентов, секретирующих эти ферменты в заданных соотношениях в пределах одного рекомбинантного штамма, является актуальной научной и прикладной задачей, решение которой позволит элиминировать необходимость смешивания индивидуальных ферментных препаратов, что, в конечном счете, приведет к значимому экономическому эффекту при промышленном использовании ферментных препаратов для биоконверсиии ЦСС.
В последнее десятилетие получили широкое распространение мультикопийные грибные суперпродуценты ферментов, у которых амплификация генов, кодирующих секретируемые ферменты, позволила резко увеличить продуктивность штаммов микроорганизмов для получения дешевых промышленных ферментов. К известным мультикопийным продуцентам эндо-β1,4-глюканаз относятся штаммы на основе Trichoderma longibrachiatum [Clarkson et al, 1995, US Patent 5419778], T.reesei [Saloheimo et al., 1994, WO Patent 94/28117] и Humicola insolens [Rasmussen et al., 1991, Patent WO 91/17243]. Известны различные грибные мультикопийные продуценты ксиланаз - Aspergillus niger [van den Broek et al, 1994, US Patent 5358864], T.reesei [Nevalainen et al., 1994, US Patent 5298405], Thermoascus auranticus [Yu et al., 1990, US Patent 4966850], H.insolens [Schulein et al, 1997, US Patent 5610048].
Из грибов рода Penicillium большой интерес представляют Р.verruculosum.
Прототипом разработанного технического решения может служить патент РФ №2378372 «Генетическая конструкция для обеспечения экспрессии целевых гомологичных и гетерологичных генов в клетках мицелиального гриба Penicillium verruculosum, используемого в качестве хозяина, способ получения штамма гриба Penicillium verruculosum и способ получения ферментного препарата». Изобретение относится к биотехнологии и представляет собой способ получения фермента, предпочтительно целлюлазы или ксиланазы, расщепляющих целлюлозу или ксиланы соответственно, путем культивирования штамма гриба Р.verruculosum. При этом указанный штамм получают трансформацией клетки гриба Р.verruculosum генетической конструкцией, содержащей одну целевую кодирующую последовательность фермента, функционально связанную с регуляторными элементами гена целлобиогидролазы I P.verruculosum, которые представляют собой промотор и терминатор гена целлобиогидролазы I, а сигнальный пептид при этом зависит от того, каков целевой фермент.
Техническая задача, решаемая группой разработанных технических решений, состоит в создании способа получения ферментных препаратов с заданным соотношением ферментов карбогидразного комплекса при ферментации рекомбинантных штаммов, полученных при трансформации реципиентного высокопродуктивного штамма P.verruculosum фьюжн-конструкцией, содержащей три различных гена (два гомологичных и один гетерологичный ген, кодирующие целлобиогидролазу I, эндо-1,4-β-глюканазу (эндоглюканазу) и β-глюкозидазу (целлобиазу), соответственно) в пределах одной кодирующей последовательности.
Технический результат, получаемый при реализации разработанных технических решений, состоит в получении промышленных ферментных препаратов (ФП) сбалансированного состава с высокой целлюлолитической активностью при культивировании новых мультикопийных штаммов грибов рода P.verruculosum, полученных с привлечением методов рекомбинантных ДНК и микробиологии.
Для получения указанного технического результата предложено использовать генетическую линейную фьюжн-конструкцию для обеспечения экспрессии целевых гомологичных и гетерологичного генов в клетках мицелиального гриба P.verruculosum, используемого в качестве хозяина, содержащую целевую кодирующую последовательность гена целлобиогидролазы I P.verruculosum, гена эндоглюканазы P.verruculosum и гена β-глюкозидазы (целлобиазы) A.niger, функционально связанную с регуляторными элементами гена целлобиогидролазы I P.verruculosum, которые представляют собой промотор и терминатор гена целлобиогидролазы I.
Для получения указанного технического результата предложено также использовать способ получения штамма гриба P.verruculosum - продуцента карбогидразного комплекса ферментов, кодирующихся нуклеотидной последовательностью фьюжн-конструкции, предусматривающей трансформацию клетки гриба P.verruculosum генетической фьюжн-констркуцией, содержащей целевую кодирующую последовательность, функционально связанную с регуляторными элементами гена целлобиогидролазы I P.verruculosum, которые представляют собой промотор и терминатор гена целлобиогидролазы I.
Кроме того, для получения указанного технического результата предложено использовать способ получения ферментных препаратов, включающих ферменты карбогидразного комплекса, расщепляющие растительные полисахариды, путем культивирования микроорганизмов, причем ранее указанным способом получают штамм гриба P.verruculosum, осуществляют культивирование полученного штамма и выделяют целевой продукт из культуральной жидкости гриба. При реализации указанного способа для получения комплексного ферментного препарата получают штамм P.verruculosum FUS3 (ВКМ F-4512 D), мультикопийный по гену cbhI - целлобиогидролазы I, гену eglII - эндоглюканазы II P.verruculosum и гену bglI-β - глюкозидазы (целлобиазы) A.niger.
Указанные варианты не исчерпывают возможности разработанного способа.
Схема разработки способа получения каждого из ферментных препаратов, обладающего комплексом карбогидразных активностей, складывается из трех типовых этапов.
Этап 1. Амплифицируют целевые гены ферментов карбогидразного комплекса - cbhI, кодирующий целлобиогидролазу I P.verruculosum, eglII, кодирующий эндо-1,4-β-глюканазу Р. Verruculosum, и bglI, кодирующий β-глюкозидазу (целлобиазу) A.niger, а также промоторную и терминаторную область гена cbhI P.verruculosum. Конструируют линейную фьюжн-конструкцию, представляющую собой полинуклеотидную последовательность, состоящую из промоторной области гена cbhI, гена bglI, гена eglII, гена cbhI и терминаторной области гена cbhI.
Этап 2. Проводят трансформацию реципиентного высокопродуктивного штамма P.verruculosum 537(niaD-) фьюжн-конструкцией, полученной на Этапе 1, в условиях котрансформации вместе с линеаризованной плазмидой (или фрагментом ДНК в линейной форме), несущей последовательность niaD гена, как маркера селекции, и осуществляют отбор трансформантов, секретирующих в культуральную жидкость искомые ферменты карбогидразного комплекса. Проводят ферментацию отобранных трансформантов в качалочных колбах и среди них выбирают наиболее продуктивный вариант(ы) штамма(ов)-продуцента(ов) комплекса карбогидраз с искомым соотношением карбогидраз.
Этап 3. Проводят процесс ферментации отобранного наиболее активного варианта(ов) штамма-продуцента(ов) в ферментерах, получают и характеризуют ФП с высокой активностью искомых ферментов карбогидразного комплекса.
Изобретение иллюстрируется следующими примерами.
Пример 1. Конструирование фьюжн-конструкции состояло из амплификации генов bglI A.niger (GenBank AN:DQ220304), eglII P.verruculosum [РФ №2378372], промоторной области гена cbhI Pen.verruculosum [РФ №2378372], гена cbhI P.verruculosum, совместно с его терминаторной областью [РФ №2378372] и финальной амплификации линейного продукта, состоящего из состыкованных генов, соответствующих промоторной области гена cbhI, гена bglI, гена eglII и cbhI P.verruculosum, совместно с его терминаторной областью.
Для индивидуальной амплификации каждой из частей фьюжн-конструкции использовались следующие олигонуклеотиды:
Figure 00000001
Далее с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) и праймеров (7 и 2) синтезируют отдельно промоторную область гена cbhI размером 1303 п.н. В качестве матрицы для ПЦР используют геномную ДНК штамма P.verruculosum, выделенную из мицелия. Нуклеотидную последовательность полученного фрагмента определяют методом Сэнгера по обеим цепям.
Далее с помощью ПЦР и праймеров (1 и 3) синтезируют отдельно ген bglI размером 2959 п.н., из которых 2935 п.н. составляет ген bglI и 24 п.н. относится к синтетическому линкерному участку, соединяющему ген bglI и ген eglII с 3`-конца гена bglI. В качестве матрицы для ПЦР используют геномную ДНК штамма A.niger, выделенную из мицелия. Нуклеотидную последовательность полученного фрагмента определяют методом Сэнгера по обеим цепям.
Далее с помощью ПЦР и праймеров (4 и 5) синтезируют отдельно ген eglII размером 1367 п.н., из которых 1319 п.н. составляет ген eglII, 24 п.н. относится к синтетическому линкерному участку, соединяющему ген bglI и ген eglII с 5`-конца гена eglII, и 24 п.н. относится к синтетическому линкерному участку, соединяющему ген eglII и ген cbhI с 3` -конца гена eglII. В качестве матрицы для ПЦР используют геномную ДНК штамма P.verruculosum, выделенную из мицелия. Нуклеотидную последовательность полученного фрагмента определяют методом Сэнгера по обеим цепям.
Далее с помощью ПЦР и праймеров (6 и 8) синтезируют ген cbhI и его терминаторную область размером 2172 п.н., из которых 1578 п.н. составляет ген cbhI, 570 п.н. относится к терминаторной области гена cbhI и 24 п.н. относится к синтетическому линкерному участку, соединяющему ген eglII и ген cbhI с 5`-конца гена cbhI. В качестве матрицы для ПЦР используют геномную ДНК штамма P.verruculosum, выделенную из мицелия. Нуклеотидную последовательность полученного фрагмента определяют методом Сэнгера по обеим цепям.
Полученные ПЦР-фрагменты смешивают в эквимолярном соотношении и используют в качестве матрицы для финальной ПЦР-реакции при помощи праймеров (7) и (8). Синтезированная линейная фьюжн-конструкция имеет размер 7753 п.н. Нуклеотидную последовательность полученного фрагмента определяют методом секвенирования по Сэнгеру по обеим цепям. Общая структура фьюжн-конструкции PVER-FUS представлена на фиг.1. Полинуклеотидная последовательность PVER-FUS представлена на фиг.2
Транслируемая аминокислотная последовательность состоит из трех ферментов карбогидразного комплекса - целлобиогидролазы I, эндоглюканазы II и β-глюкозидазы (целлобиазы). Первичные аминокислотные последовательности ферментов представлены на фиг.3.
Пример 2. Трансформация высокопродуктивного штамма-реципиента Pen.verruculosum 537(niaD-) фьюжн-конструкцией, полученной в Примере 1, для получения набора рекомбинантных штаммов, обладающих карбогидразными активностями.
К смеси двух ДНК (1 мкг котрансформационной плазмиды PSTA10 (несущей ген niaD+ A.niger)), линеаризованной с помощью HindIII эндонуклеазы рестрикции и 3 мкг фьюжн-конструкции FUS объемом 20 мкл, добавляют 200 мкл раствора протопластов штамма P.verruculosum 537(niaD-), полученных по методике, описанной в статье [A.Y. Aleksenko, N.А. Makarova, I.V. Nikolaev, A.J. Clutter buck Integrative and replicative transformation of Penicillium canescens with a heterologous nitrate-reductase gene, Curr. Genet. - 1995. - V.28. - P.474-477], и 50 мкл буфера РСТ1, содержащего 50%-ный ПЭГ 4000 (по объему) + 0.01М трис-HCl pH 7.5+0.02М CaCl2. Смесь аккуратно перемешивают и оставляют на 20 мин во льду. Затем добавляют 500 мкл буфера РСТ1 и оставляют на 5 мин при комнатной температуре. Параллельно проводят эксперимент с контрольными протопластами без добавления ДНК. Далее пробирки со смесью протопластов и ДНК центрифугируют при 5000 об/мин в течение 20 мин. Супернатант сливают, а осадок ресуспендируют в 200 мкл стерильного раствора сорбитола (182,2 г/л). Трансформационную смесь стерильно переносят над пламенем горелки в 5 мл верхнего агара (для приготовления 100 мл верхнего агара берут 21,86 г 1,2 М сорбитола, 0,7 г агара, 0,8 г глюкозы, 1 мл 1М источника азота), перемешивают и распределяют агар по поверхности предварительно подготовленных чашек с нижним агаром (для приготовления 100 мл нижнего агара берут 21,86 г 1,2 М сорбитола, 2 г агара, 0,8 г глюкозы, 1 мл 1М источника азота). Так же переносят и контрольные смеси.
Готовят три чашки Петри с нижним агаром, две с селективной средой (источник азота: NaNO3 10 mM) и одна - с неселективной (источник азота: NH4Cl 10 mM). Чашки Петри помещают в инкубатор на 30°C и оставляют там на 6 дней. На шестой день роста трансформанты переносят на селективную минимальную среду (источник азота: NaNO3 10 mM). В результате трансформации реципиентного штамма P.verruculosum 537 фьюжн-конструкцией получают 90 трансформантов на 3 мкг введенной целевой ДНК, что соответствует стандартной частоте трансформации грибных штаммов.
Для определения наличия встроенного экзогенного генетического материала в хромосому рекомбинантных штаммов проводят первичный скрининг трансформантов с использованием ПНР-реакции. Поскольку фьюжн-конструкция содержит гетерологичный ген β-глюкозидазы (целлобиазы), то скрининг гена bglI осуществляют с использованием пары праймеров (1) и (3). Полученный ПЦР-продукт, анализируемый методом электрофореза в агарозном геле, должен иметь размер ~3000 п.н., что соответствует размеру полинуклеотидной последовательности гена bglI из A.niger.
Пример 3. Получение ферментного препарата рекомбинантного штамма серии FUS P.verruculosum, мультикопийного по cbhI, eglII генам P.verruculosum (ген целлобиогидролазы I, 7-е семейство гликозидгидролаз, молекулярная масса 66 кДа и ген эндо-1,4-β-глюканазы II, 5-е семейство гликозидгидролаз, молекулярная масса 40 кДа, соответственно) и bglI гену β-глюкозидазы A.niger (3-е семейство гликозидгидролаз, молекулярная масса 120 кДа).
Полученные в Примере 2 позитивные по гену bglI трансформанты пересевают на чашки с минимальной средой и источником азота NaNO3 и инкубируют при 30°C в течение 140 часов до образования конидий. Затем трансформанты ферментируют в качалочных колбах, используя водную ферментационную среду следующего состава, г/л: МКЦ - 40, пшеничные отруби - 10, дрожжевой экстракт - 10, (NH4)2SO4 - 5, KH2PO4 - 5, MgSO4×7H2O - 0,3, CaCl2×2H2O - 0,3, pH 4,5. Колбы инкубируют на качалке при 32°C и 200 об/мин, в течение 144 ч. Далее отбирают трансформанты с увеличенной по сравнению с реципиентным штаммом P.verruculosum 537 целлобиогидролазной, эндоглюканазной и β-глюкозидазной (целлобиазной) активностью.
Для отобранных штаммов определяют в культуральной жидкости активности по следующим субстратам: МКЦ (микрокристаллическая целлюлоза, нерастворимый субстрат), КМЦ (Na-соль карбоксиметилцеллюлозы, растворимый субстрат), глюкуроноксилану березы, ПНФГ (п-нитрофенил-β-D-глюкопиранозид). Активность по отношению к МКЦ (авицелазная активность характеризует активность целлобиогидролаз) определяют при 40°C и рН=5,0 по начальной скорости образования восстанавливающих сахаров (ВС). Активность по отношению к КМЦ (характеризует активность эндоглюканаз) и к глюкуроноксилану березы (характеризует активность ксиланаз) определяют при 50°C и pH=5,0 по начальной скорости образования ВС. Концентрация полисахаридных субстратов в реакционной смеси составляла 5 г/л. Концентрацию ВС определяли методом Шомоди-Нельсона. [М. Somogui, 1945, JBC, №61, p. 160].
Активность по ПНФГ (характеризует активность β-глюкозидаз (целлобиаз)) определяют по начальной скорости образования п-нитрофенола (ПНФ). Раствор 0,05 М субстрата в 0,1 М, Na-ацетатном буфере, pH 5,0, инкубируют с ферментом при 40°C в течение 10 мин. Реакцию останавливают добавлением раствора 1М Na2CO3. Образовавшийся в растворе ПНФ определяли спектрофотометрически при длине волны 400 нм, используя коэффициент молярного поглощения (ε=18300 моль*см-1).
Активность ферментов выражают в международных единицах: 1 единица соответствует образованию 1 мкмоль продукта за 1 мин при действии ферментов на соответствующий субстрат
Для культуральных жидкостей проводят ДДС-электрофорез в денатурирующих условиях для идентификации полос, соответствующих зонам, занимаемым целлобиогидролазой I (66 кДа), эндоглюканазой II (40 кДа) и β-глюкозидазой (140 кДа).
Проводят ферментацию наиболее продуктивного трансформанта P.verruculosum FUS3 (ВКМ F-4512D) в 10-литровом ферментере, используя питательную среду того же состава, что в качалочных колбах, и проводя подпитку глюкозой при pH 4,5 и 32°C в течение 144 час. После окончания ферментации с помощью ультрафильтрации культуральной жидкости на полых волокнах (с пределом отсечения 10 KDa) и последующего лиофильного высушивания получают сухой ФП и характеризуют их по уровню карбогидразных активностей (см. таблицу 1).
Карбогидразные активности отобранного наиболее активного трансформанта P.verruculosum FUS3 (ВКМ F-4512D) в культуральной жидкости составляют: 18 ед./мл целлобиогидролазной активности, 60 ед./мл ксиланазной активности, 850 ед./мл КМЦ-азной активности, 210 ед./мл β-глюкозидазной активности.
Пример 4. Определение количественного состава ферментного препарата FUS3.
Качественный и количественный состав ФП определяют хроматографическим методом. Навеску ФП растворяют в 0,1 М Na-ацетатном буфере (pH 5,0), центрифугируют и обессоливают с заменой буфера при помощи гель-проникающей хроматографии на носителе Bio-Gel Р-6 фирмы Bio-Rad (США) в 20 мМ буфере bis-Tris-HCl, pH 6,9. Подготовленный таким образом ФП фракционируют с помощью FPLC-системы фирмы «Pharmacia» (Швеция) на анионообменном носителе Source 15Q («Amersham Biosciences», Швеция), объем колонки составляет 1 мл. Образец наносят в стартовом буфере Bis-Tris/HCl при pH 6,9; связавшиеся белки элюируют в градиентой концентрации Nad от 0 до 0,4М. В полученных в ходе элюирования фракциях, а также в несвязавшейся фракции определяют авицелазную, КМЦ-азную, ксиланазную и β-глюкозидазную (целлобиазную) активности, а также содержание белка.
Содержание целевых ферментов в ФП FUS3, полученном с помощью трансформанта P.verruculosum FUS3, и контрольном ФП 537, полученном с помощью исходного штамма P.verruculosum 537, приведено в таблице 2.
В ФП FUS3 представлены три мажорных компонента: это рекомбинантные белки - ЦБГI (45%), ЭГ II (32%) и β-глюкозидаза (целлобиаза) A.niger 116 кДа (12%), обнаружено также наличие в незначительных количествах других ферментов.
Контрольный ФП 537 имел в своем составе 68% различных целлобиогидролаз (ЦБГI 38%, ЦБГII - 30%,), 16% различных эндоглюканаз, 4% собственной (гомологичной) β-глюкозидазы (целлобиазы).
Таким образом, путем трансформации реципиентного высокопродуктивного штамма P.verruculosum фьюжн-конструкцией с гомологичными и гетерологичным генами, кодирующими целлобиогидролазу I, эндо-1,4-β-глюканазу (эндоглюканазу) и β-глюкозидазу (целлобиазу), удалось создать штамм P.verruculosum FUS3 (ВКМ F-4512D) - продуцент целлюлазного комплекса с заданым и близким к оптимальному соотношением ферментов целлюлазного комплекса для получения простых сахаров из ЦСС.
Табл.1
Карбогидразные активности по отношению к специфическим субстратам в сухом ФП наиболее активного рекомбинантного штамма P.verruculosum FUS3, а также в ФП, полученном с помощью исходного штамма Pen.verruculosum 537.
Ферм. препарат Активность по базовым субстратам, ед./г
КМЦ Авицел Ксилан пНФГ
FUS3 10258 230 1138 2932
537 6943 320 14498 397
Табл. 2
Содержание ферментов в сухих ФП (по данным FPLC-фракционирования), % от общего содержания белка.
Фермент ФП 537 ФП FUS3
ЦБГI 38 45
ЦБГII 30 2
Различные эндоглюканазы 16 -
ЭГII 3 32
β-Глюкозидаза (гетерологичная), 116 кДа - 12
β-Глюкозидаза (гомологичная), 118 кДа 4 2
Другие белки 9 7

Claims (3)

1. Генетическая конструкция для обеспечения экспрессии целевых гомологичных и гетерологичного генов в клетках мицелиального гриба Penicillium verruculosum, используемого в качестве хозяина, содержащая целевую кодирующую последовательность, включающую последовательно соединенные гены карбогидраз - целлобиогидролазы I, эндо-1,4-β-глюканазы II и β-глюкозидазы (целлобиазы) посредством синтетического линкeра и функционально связанную с регуляторными элементами гена целлобиогидролазы I Penicillium verruculosum, которые представляют собой промотор, сигнальный пептид и терминатор гена целлобиогидролазы I.
2. Способ получения штамма гриба Penicillium verruculosum FUS3 ВКМ F-4512D - продуцента мультиферментного комплекса карбогидраз, кодируемого гомологичными последовательностями целлобиогидролазы I, эндо-1,4-β-глюканазы II и гетерологичной нуклеотидной последовательностью β-глюкозидазы (целлобиазы) Aspergillus niger, предусматривающей трансформацию клетки гриба Penicillium verruculosum 537(niaD-) линейной генетической конструкцией по п.1.
3. Способ получения мультиферментного препарата заданного состава Penicillium verruculosum FUS3, включающего активные карбогидразы в составе: гомологичная целлобиогидролаза I - 45%, гомологичная эндоглюканаза - 32% и гетерологичная бета-глюкозидаза - 12%, расщепляющие растительные полисахариды, путем культивирования микроорганизмов, отличающийся тем, что способом по п.2 получают штамм гриба Penicillium verruculosum FUS3 ВКМ F-4512D, осуществляют культивирование полученного штамма и выделяют целевой продукт из культуральной жидкости гриба.
RU2013141271/10A 2013-09-10 2013-09-10 ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ФЬЮЖН-КОНСТРУКЦИЯ ДЛЯ ОБЕСПЕЧЕНИЯ ЭКСПРЕССИИ МУЛЬТИФЕРМЕНТНОГО КОМПЛЕКСА КАРБОГИДРАЗ В КЛЕТКАХ МИЦЕЛИАЛЬНОГО ГРИБА Penicillium verruculosum, ИСПОЛЬЗУЕМОГО В КАЧЕСТВЕ ХОЗЯИНА, СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ РЕКОМБИНАНТНОГО ШТАММА ГРИБА Penicillium verruculosum И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ФЕРМЕНТНОГО ПРЕПАРАТА НА ЕГО ОСНОВЕ RU2550044C2 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2013141271/10A RU2550044C2 (ru) 2013-09-10 2013-09-10 ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ФЬЮЖН-КОНСТРУКЦИЯ ДЛЯ ОБЕСПЕЧЕНИЯ ЭКСПРЕССИИ МУЛЬТИФЕРМЕНТНОГО КОМПЛЕКСА КАРБОГИДРАЗ В КЛЕТКАХ МИЦЕЛИАЛЬНОГО ГРИБА Penicillium verruculosum, ИСПОЛЬЗУЕМОГО В КАЧЕСТВЕ ХОЗЯИНА, СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ РЕКОМБИНАНТНОГО ШТАММА ГРИБА Penicillium verruculosum И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ФЕРМЕНТНОГО ПРЕПАРАТА НА ЕГО ОСНОВЕ

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2013141271/10A RU2550044C2 (ru) 2013-09-10 2013-09-10 ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ФЬЮЖН-КОНСТРУКЦИЯ ДЛЯ ОБЕСПЕЧЕНИЯ ЭКСПРЕССИИ МУЛЬТИФЕРМЕНТНОГО КОМПЛЕКСА КАРБОГИДРАЗ В КЛЕТКАХ МИЦЕЛИАЛЬНОГО ГРИБА Penicillium verruculosum, ИСПОЛЬЗУЕМОГО В КАЧЕСТВЕ ХОЗЯИНА, СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ РЕКОМБИНАНТНОГО ШТАММА ГРИБА Penicillium verruculosum И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ФЕРМЕНТНОГО ПРЕПАРАТА НА ЕГО ОСНОВЕ

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2013141271A RU2013141271A (ru) 2015-03-20
RU2550044C2 true RU2550044C2 (ru) 2015-05-10

Family

ID=53285374

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2013141271/10A RU2550044C2 (ru) 2013-09-10 2013-09-10 ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ФЬЮЖН-КОНСТРУКЦИЯ ДЛЯ ОБЕСПЕЧЕНИЯ ЭКСПРЕССИИ МУЛЬТИФЕРМЕНТНОГО КОМПЛЕКСА КАРБОГИДРАЗ В КЛЕТКАХ МИЦЕЛИАЛЬНОГО ГРИБА Penicillium verruculosum, ИСПОЛЬЗУЕМОГО В КАЧЕСТВЕ ХОЗЯИНА, СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ РЕКОМБИНАНТНОГО ШТАММА ГРИБА Penicillium verruculosum И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ФЕРМЕНТНОГО ПРЕПАРАТА НА ЕГО ОСНОВЕ

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2550044C2 (ru)

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2646136C2 (ru) * 2015-12-02 2018-03-01 Федеральное государственное учреждение "Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" Российской академии наук" (ФИЦ Биотехнологии РАН) Рекомбинантный штамм мицелиального гриба penicillium verruculosum ( варианты) и способ получения ферментного препарата с его использованием (варианты)
RU2653429C1 (ru) * 2017-05-10 2018-05-08 Федеральное государственное учреждение "Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" Российской академии наук (ФИЦ Биотехнологии РАН) Генетическая конструкция для обеспечения экспрессии комплекса ферментов эндоглюканаз и ксиланаз в клетках гриба penicillium verruculosum и способ получения комплексных ферментных препаратов на его основе, предназначенных для кормопроизводства

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2261910C2 (ru) * 1998-05-06 2005-10-10 Адиссео Франс С.А.С. ШТАММ Penicillium funiculosum, ПРОДУЦИРУЮЩИИЙ КОМПЛЕКС ФЕРМЕНТОВ - ЦЕЛЛЮЛАЗУ, ЭНДО-1,4-β-КСИЛАНАЗУ, ЦЕЛЛОБИОГИДРОЛАЗУ, β-ГЛЮКОЗИДАЗУ, ЭНДО-1,3(4)- β-ГЛЮКАНАЗУ, ФЕРУЛОИЛ-ЭСТЕРАЗУ, ЖИДКАЯ КОРМОВАЯ ДОБАВКА И СУХОЙ КОРМ ДЛЯ СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННЫХ ЖИВОТНЫХ
RU2361918C1 (ru) * 2008-02-26 2009-07-20 Общество с ограниченной ответственностью Научно-производственная компания "Фермтек" Штамм мицелиального гриба penicillium verruculosum - продуцент комплекса целлюлаз, ксиланазы и ксилоглюканазы и способ получения ферментного препарата комплекса целлюлаз, ксиланазы и ксилоглюканазы для гидролиза целлюлозы и гемицеллюлозы
RU2378372C2 (ru) * 2008-03-03 2010-01-10 ООО НПК "Фермтек" Генетическая конструкция для обеспечения экспрессии целевых гомологичных и гетерологичных генов в клетках мицелиального гриба penicillium verruculosum, используемого в качестве хозяина, способ получения штамма гриба penicillium verruculosum и способ получения ферментного препарата

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2261910C2 (ru) * 1998-05-06 2005-10-10 Адиссео Франс С.А.С. ШТАММ Penicillium funiculosum, ПРОДУЦИРУЮЩИИЙ КОМПЛЕКС ФЕРМЕНТОВ - ЦЕЛЛЮЛАЗУ, ЭНДО-1,4-β-КСИЛАНАЗУ, ЦЕЛЛОБИОГИДРОЛАЗУ, β-ГЛЮКОЗИДАЗУ, ЭНДО-1,3(4)- β-ГЛЮКАНАЗУ, ФЕРУЛОИЛ-ЭСТЕРАЗУ, ЖИДКАЯ КОРМОВАЯ ДОБАВКА И СУХОЙ КОРМ ДЛЯ СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННЫХ ЖИВОТНЫХ
RU2361918C1 (ru) * 2008-02-26 2009-07-20 Общество с ограниченной ответственностью Научно-производственная компания "Фермтек" Штамм мицелиального гриба penicillium verruculosum - продуцент комплекса целлюлаз, ксиланазы и ксилоглюканазы и способ получения ферментного препарата комплекса целлюлаз, ксиланазы и ксилоглюканазы для гидролиза целлюлозы и гемицеллюлозы
RU2378372C2 (ru) * 2008-03-03 2010-01-10 ООО НПК "Фермтек" Генетическая конструкция для обеспечения экспрессии целевых гомологичных и гетерологичных генов в клетках мицелиального гриба penicillium verruculosum, используемого в качестве хозяина, способ получения штамма гриба penicillium verruculosum и способ получения ферментного препарата

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2646136C2 (ru) * 2015-12-02 2018-03-01 Федеральное государственное учреждение "Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" Российской академии наук" (ФИЦ Биотехнологии РАН) Рекомбинантный штамм мицелиального гриба penicillium verruculosum ( варианты) и способ получения ферментного препарата с его использованием (варианты)
RU2653429C1 (ru) * 2017-05-10 2018-05-08 Федеральное государственное учреждение "Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" Российской академии наук (ФИЦ Биотехнологии РАН) Генетическая конструкция для обеспечения экспрессии комплекса ферментов эндоглюканаз и ксиланаз в клетках гриба penicillium verruculosum и способ получения комплексных ферментных препаратов на его основе, предназначенных для кормопроизводства

Also Published As

Publication number Publication date
RU2013141271A (ru) 2015-03-20

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Amer et al. Microbial β-glucosidase: sources, production and applications
Singhania et al. Role and significance of beta-glucosidases in the hydrolysis of cellulose for bioethanol production
US9080163B2 (en) Cellobiohydrolase variants
KR20110020243A (ko) 비-셀룰로오스 물질에 대해 감소된 친화성을 갖는 셀룰라아제 변이체를 포함하는 조성물 및 방법
Meng et al. Engineering Trichoderma reesei Rut-C30 with the overexpression of egl1 at the ace1 locus to relieve repression on cellulase production and to adjust the ratio of cellulolytic enzymes for more efficient hydrolysis of lignocellulosic biomass
RU2378372C2 (ru) Генетическая конструкция для обеспечения экспрессии целевых гомологичных и гетерологичных генов в клетках мицелиального гриба penicillium verruculosum, используемого в качестве хозяина, способ получения штамма гриба penicillium verruculosum и способ получения ферментного препарата
US10457925B2 (en) Process for the production of cellulolytic and/or hemicellulolytic enzymes
CN102428170A (zh) 改良的内切葡聚糖酶
MX2014000665A (es) Proceso de produccion de celulasas para hongo filamentoso adaptado a fermentador que tiene un coeficiente reducido de transferencia volumetrica del oxigeno.
Huang et al. Cellulose and hemicellulose-degrading enzymes in Fusarium commune transcriptome and functional characterization of three identified xylanases
Thompson et al. Structure of the catalytic core module of the Chaetomium thermophilum family GH6 cellobiohydrolase Cel6A
Jain et al. Functional expression of a thermostable endoglucanase from Thermoascus aurantiacus RCKK in Pichia pastoris X-33 and its characterization
RU2550044C2 (ru) ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ФЬЮЖН-КОНСТРУКЦИЯ ДЛЯ ОБЕСПЕЧЕНИЯ ЭКСПРЕССИИ МУЛЬТИФЕРМЕНТНОГО КОМПЛЕКСА КАРБОГИДРАЗ В КЛЕТКАХ МИЦЕЛИАЛЬНОГО ГРИБА Penicillium verruculosum, ИСПОЛЬЗУЕМОГО В КАЧЕСТВЕ ХОЗЯИНА, СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ РЕКОМБИНАНТНОГО ШТАММА ГРИБА Penicillium verruculosum И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ФЕРМЕНТНОГО ПРЕПАРАТА НА ЕГО ОСНОВЕ
Giwa et al. Cellulose Degradation Enzymes in Filamentous Fungi, A Bioprocessing Approach Towards Biorefinery
Li et al. Properties of a recombinant β-glucosidase from polycentric anaerobic fungus Orpinomyces PC-2 and its application for cellulose hydrolysis
Wei et al. Molecular cloning and characterization of two major endoglucanases from Penicillium decumbens
CN102559530B (zh) 一株分泌表达瑞氏木霉外切葡聚糖酶i的重组酿酒酵母菌株及应用
RU2646132C1 (ru) Рекомбинантный штамм мицелиального гриба penicillium canescens cl14, продуцирующий компонент целллюлосомы clostridium thermocellum, и способ его культивирования
RU2532840C2 (ru) ШТАММ ГРИБА Penicillium verruculosum B10 EGII ПРОДУЦЕНТ ЭНДО-1.3/1.4-β-ГЛЮКАНАЗЫ, ЦЕЛЛЮЛАЗЫ, β-ГЛЮКОЗИДАЗЫ И КСИЛАНАЗЫ И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ КОРМОВОГО КОМПЛЕКСНОГО ФЕРМЕНТНОГО ПРЕПАРАТА
EP2660319B1 (en) Endoglucanases with improved properties
CN105492612B (zh) 重组纤维素糖化酶混合物和重组酵母复合菌株及其用途
JP5434689B2 (ja) セルラーゼ複合体及びその利用
RU2646136C2 (ru) Рекомбинантный штамм мицелиального гриба penicillium verruculosum ( варианты) и способ получения ферментного препарата с его использованием (варианты)
CN111757939A (zh) 突变β-葡萄糖苷酶
RU2741078C1 (ru) ШТАММ ГРИБА PENICILLIUM CANESCENS mtCBHI ПРОДУЦЕНТ ТЕРМОСТАБИЛЬНОЙ ЦЕЛЛОБИОГИДРОЛАЗЫ I И ФЕРМЕНТНЫЙ ПРЕПАРАТ НА ЕГО ОСНОВЕ ДЛЯ БИОКОНВЕРСИИ ВОЗОБНОВЛЯЕМОГО РАСТИТЕЛЬНОГО СЫРЬЯ В САХАРА

Legal Events

Date Code Title Description
PD4A Correction of name of patent owner