RU2438298C2 - Растения brassica oleracea с устойчивостью к mycosphaerella brassicicola - Google Patents

Растения brassica oleracea с устойчивостью к mycosphaerella brassicicola Download PDF

Info

Publication number
RU2438298C2
RU2438298C2 RU2008144575/10A RU2008144575A RU2438298C2 RU 2438298 C2 RU2438298 C2 RU 2438298C2 RU 2008144575/10 A RU2008144575/10 A RU 2008144575/10A RU 2008144575 A RU2008144575 A RU 2008144575A RU 2438298 C2 RU2438298 C2 RU 2438298C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
oleracea
plant
var
brassicicola
resistance gene
Prior art date
Application number
RU2008144575/10A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2008144575A (ru
Inventor
Пит БАРТЕН (NL)
Пит БАРТЕН
Original Assignee
Бейо Заден Б.В.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Бейо Заден Б.В. filed Critical Бейо Заден Б.В.
Publication of RU2008144575A publication Critical patent/RU2008144575A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2438298C2 publication Critical patent/RU2438298C2/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8242Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
    • C12N15/8257Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits for the production of primary gene products, e.g. pharmaceutical products, interferon
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01HNEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H1/00Processes for modifying genotypes ; Plants characterised by associated natural traits
    • A01H1/04Processes of selection involving genotypic or phenotypic markers; Methods of using phenotypic markers for selection
    • A01H1/045Processes of selection involving genotypic or phenotypic markers; Methods of using phenotypic markers for selection using molecular markers

Landscapes

  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Environmental Sciences (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

Настоящее изобретение относится к получению растений Brassica oleracea, устойчивых к возбудителю кольцевой пятнистости (Mycosphaerella brassicicola). Описано растение Brassica oleracea, содержащее ген резистентности к М. brassicicola, выделенный из устойчивого к заболеванию растения, семена которого депонированы в АТСС под номером РТА-7413, и располагающийся в геноме растения в окружении, по меньшей мере, двух ДНК-маркеров, выявляемых с помощью раскрытых в изобретении специфических праймеров. Предложен способ получения устойчивого к М. brassicicola растения Brassica oleracea, включающий (а) получение первого растения В. oleracea, принадлежащего к М. brassicicola-устойчивой родительской линии, депонированной в АТСС под номером РТА 7413; (b) скрещивание полученного на стадии (а) резистентного растения с восприимчивым вторым растением В. oleracea; (с) выделение из полученного на стадии (b) потомства геномной ДНК и детекцию интрогрессии гена устойчивости по наличию двух или более специфичных ДНК-маркеров, присутствие которых устанавливается с помощью раскрытых в изобретении комбинаций праймеров, и (d) селекцию потомства растения В. oleracea, для которого на этапе (с) было показано присутствие интрогрессии гена устойчивости. 5 н. и 6 з.п. ф-лы, 2 табл.

Description

Настоящее изобретение относится к растениям Brassica oleracea, которые устойчивы к Mycosphaerella brassicicola, возбудителю кольцевой пятнистости. Изобретение также относится к семенам, плодам и/или другим частям растения этих устойчивых растений. Настоящее изобретение дополнительно относится к способу получения растения B. oleracea, которое устойчиво к M. brassicicola. Изобретение также относится к применению определенных ДНК-маркеров, которые специфично связаны с геном устойчивости к M. Brassicicola, с целью идентификации устойчивого растения B. oleracea.
Mycosphaerella brassicicola (иногда также встречающаяся под названиями Sphaeria brassicicola, Sphaerella brassicicola, Dothidea brassicae, Asteroma brassicae и Phyllosticta brassicicola (Punithalingham и Holliday, Descriptions of Pathogenic Fungi and Bacteria, CMI (Commonwealth Mycological Institute) England, No. 468, 1975)) является возбудителем так называемой кольцевой пятнистости у растений Brassica. Гриб, который встречается во многих регионах с начала восьмидесятых и в некоторых случаях даже достиг масштабов эпидемии, принадлежит к дрожжевым грибам и образует серо-коричневые поражения на листьях растений, на которых, в конечном счете, формируются аскоспоры. Эти споры являются средством распространения гриба и распространяются, главным образом, ветром и каплями дождя. Гриб лучше всего растет в сырых и умеренных условиях. В силу сочетания факторов M. brassicicola может быстро распространяться на большой территории. Серьезная инфекция M. brassicicola может привести к быстрому старению листа, дефолиации и последовательному снижению урожайности. Кроме того, это может привести к косметическому ущербу продукту (растению и/или части растения), также потому что инфекция M. brassicicola может даже распространяться во время хранения продукта и потому что поражения образуют сайт инвазии для вторичных инфекций (например, Botrvtis spp).
Растения-хозяева M. brassicicola включают почти все виды Brassica, включая B. campestris, B. carinata, B. napus, B. nigra, B. oleracea, и дополнительно Raphanus sativus, и также некоторые крестоцветные сорняки, включая Hirschfeldia incana, Matthiola incana, Sisymbrium officinale и Thlaspi arvense.
Brassica является родом растений семейства Brassicaceae (ранее Cruciferae). Члены этого рода все вместе упоминаются как капуста или горчица. Род Brassica включает многие важные сельскохозяйственные и садоводческие зерновые культуры, включая капусту, цветную капусту, красную капусту, савойскую капусту, капусту белокочанную, капусту бычье сердце, курчавую капусту кале, брокколи, брюссельскую капусту, китайскую капусту, брюкву и капусту португальскую (тронхуда). Почти все части растений используются в качестве пищи, такие как корни (репа), стебли (брюква), листья (капуста белокочанная), пазушные почки (ростки), цветы (цветная капуста, брокколи) и семена (рапс). Некоторые разновидности с белыми или фиолетовыми цветами или отличного цвета или формой листьев выращивают в декоративных целях.
Хотя M. brassicicola возможно контролировать с помощью фунгицидов, число разрешенных средств и применение этих средств становятся все более и более ограниченными по экологическим и связанным со здоровьем причинам. Использование фунгицидов для контроля M. brassicicola, кроме того, нелегко, потому что трудно определить правильный момент для лечения. Поэтому желательно вывести растения Brassica, в частности растения Brassica oleracea, которые устойчивы к вышеуказанному описанному грибу. Не существует никаких доступных сортов Brassica с устойчивостью к M. brassicicola.
Целью настоящего изобретения является предоставление растения Brassica oleracea с устойчивостью к M. brassicicola, возбудителю кольцевой пятнистости.
С этой целью настоящее изобретение предоставляет растение Brassica oleracea, содержащее ген устойчивости к M. brassicicola, в котором указанный ген устойчивости обеспечивает моногенную и доминантную устойчивость к M. brassicicola и в котором ген устойчивости получен из растения B. oleracea, семена которого содержат депонированный в американской коллекции типовых культур (ATCC, Патентный Депозитарий, 10801 University Boulevard, Manassas, VA 20110, United States of America) 1 марта 2006 под номером РТА-7413. Неожиданно было установлено, что геном устойчивости согласно настоящему изобретению обеспечивает доминантная устойчивость к двум физиологическим видам (physio's) M. brassicicola. Эти физиологические виды часто встречаются в Нидерландах и являются более вирулентными физиологическими видами, с которыми часто сталкиваются в регионах выращивания цветной капусты в Западной Франции (особенно Нормандия и Бретань) и в регионах выращивания капусты в Центральной Америке (особенно Гватемала).
В дополнительном предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения ген устойчивости в растении B. oleracea связан с одним или более специфическими ДНК-маркерами. Эти маркеры можно использовать для определения наличия гена устойчивости по настоящему изобретению.
В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения ген устойчивости к M. brassicicola связан, по меньшей мере, с двумя, предпочтительно, по меньшей мере, с тремя, более предпочтительно, по меньшей мере, с четырьмя, более предпочтительно, по меньшей мере, с пятью, наиболее предпочтительно с шестью ДНК-маркерами, причем ДНК-маркеры окружают ген устойчивости. Под "окружают" в настоящей заявке понимают, что ДНК-маркеры расположены в геноме с обеих сторон от гена устойчивости, то есть "выше" так же, как и "ниже" гена устойчивости. Определение наличия множества ДНК-маркеров, которые связаны с геном устойчивости и окружают ген устойчивости, гарантирует, что интрогрессия гена устойчивости в действительности присутствует.
ДНК-маркеры согласно настоящему изобретению предпочтительно выбраны из таблицы 1, причем наличие ДНК-маркеров в геноме растения определяют, используя праймерные последовательности, выбранные из группы, состоящей из SEQ ID NO: с 1 по включая SEQ ID NO: 6 включительно.
В исследовании, которое привело к настоящему изобретению, было показано, что соответствующие ДНК-маркеры являются признаками интрогрессии устойчивости к M. brassicicola. ДНК-маркеры согласно настоящему изобретению являются фрагментами ДНК, которые связаны с соответствующим геном устойчивости, имеют определенный размер (п.о.), как указано в таблице 1, и их можно определить, используя определенные комбинации праймеров.
Растение согласно настоящему изобретению предпочтительно выбрано из группы, состоящей из B. oleracea convar. botrytis var. botrytis (цветная капуста, романеско), B. oleracea convar. botrytis var. cymosa (брокколи), B. oleracea convar. botrytis var. asparagoides (спаржевая капуста), B. oleracea convar. oleracea var. gemnifera (брюссельская капуста), B. oleracea convar. capitata var. alba (капуста белокочанная, капуста с кочанами округло-конической формы), B. oleracea convar. capitata var. rubra (красная капуста), B. oleracea convar. capitata var. sabauda (капуста савойская), B. oleracea convar. acephela var. sabellica (курчавая капуста кале), B. oleracea convar. acephela var. gongyloides (брюква) и B. oleracea var. tronchuda syn. costata (капуста португальская).
Изобретение также относится к семенам, плодам и/или другим частям растения от вышеуказанных описанных растений. Части растения в рамках настоящего описания означают, среди прочего, съедобные части растения, такие как, например, пазушные почки (ростки).
Изобретение также относится к способу получения растения B. oleracea с устойчивостью к M. brassicicola, который включает, по меньшей мере, следующие этапы:
(a) предоставление первого растения B. oleracea, которое содержит ген устойчивости к M. brassicicola;
(b) скрещивание устойчивого растения со вторым восприимчивым растением B. oleracea;
(c) выделение от потомства геномной ДНК для определения наличия интрогрессии гена устойчивости, используя один или более специфичных ДНК-маркеров, связанных с геном устойчивости; и
(d) отбор потомства растения B. oleracea, в котором наличие интрогрессии гена устойчивости было определено на этапе (c).
Способом согласно настоящему изобретению быстро и несложно можно получить устойчивые растения B. Oleracea, используя ДНК-маркеры, которые являются специфичными к интрогрессии гена устойчивости согласно настоящему изобретению.
Степень тяжести заболевания M. brassicicola может быть очень вариабельной в силу различных природных факторов, таких как ветер, температура, влажность воздуха и окружающая среда (среди прочего, другие растения-хозяева). Поэтому можно наблюдать большие различия в степени инфекции. Кроме того, симптомы можно легко перепутать с болезнями, вызванными Alternaria brassicae и A. brassicicola. Применение способа согласно настоящему изобретению и использование специфичных ДНК-маркеров, связанных с геном устойчивости, простым способом можно определить, содержит ли растение ген устойчивости. Таким образом, устойчивые растения B. oleracea можно, кроме того, получить быстрее, чем с помощью стандартных программ выведения. Многие сорта Brassica имеют двухлетний цикл, в течение которого растение является вегетативным на первом году и цветет и производит семена на втором году. Используя специфичные ДНК-маркеры, связанные с геном устойчивости, способ можно ускорить до одногодичного цикла, поскольку не требуется проводить тест на устойчивость, а также не требуется выращивать растения до взрослой стадии для того, чтобы сделать возможным отбор. Таким образом, такая программа выведения может сохранить много лет.
Растения, отобранные на этапе (d) способа согласно настоящему изобретению, можно необязательно подвергнуть дополнительным этапам, таким как обратное скрещивание или самоопыление растения, полученного на этапе (d), один или более раз с восприимчивым растением B. oleracea и впоследствии выбрать еще раз из потомства устойчивое растение B. oleracea, используя специфичные ДНК-маркеры. Растения, полученные на этапе (d), можно, например, также сделать гомозиготными с помощью методов, известных квалифицированному специалисту, таких как культура пыльника и/или микроспоры.
Первое растение B. oleracea предпочтительно содержит ген устойчивости, который наделяет моногенной и доминирующей устойчивостью к M. brassicicola.
В предпочтительном варианте осуществления первое растение B. oleracea содержит ген устойчивости, полученный из растения B. oleracea, семена которого были депонированы в Американской коллекции типовых культур (ATCC, Патентный Депозитарий, 10801 University Boulevard, Manassas, VA 20110, United States of America) 1 марта 2006 под номером РТА-7413.
В дополнительном предпочтительном варианте осуществления способа согласно настоящему изобретению селекция устойчивого растения B. oleracea на этапе (d) включает отбор растения B. oleracea, которое содержит, по меньшей мере, два, предпочтительно, по меньшей мере, три, более предпочтительно, по меньшей мере, четыре, более предпочтительно, по меньшей мере, пять и наиболее предпочтительно шесть ДНК-маркеров, связанных с геном устойчивости, причем ДНК-маркеры окружают ген устойчивости. Тем самым, можно с уверенностью определить, имеет ли растение интрогрессию гена устойчивости.
ДНК-маркеры согласно настоящему изобретению предпочтительно выбраны из таблицы 1, причем наличие ДНК-маркеров в геноме растения определяют, используя последовательности праймеров, выбранные из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1 до SEQ ID NO: 6 включительно (таблица 2).
В частном варианте осуществления согласно настоящему изобретению первое растение B. oleracea содержит ген устойчивости к M. brassicicola, происходящий из растения B. oleracea, семена которого задепонированы в Американской коллекции типовых культур (ATCC, Патентный Депозитарий, 10801 University Boulevard, Manassas, VA 20110, United States of America) 1 марта 2006 под PTA-номером 7413.
Восприимчивое растение B. oleracea, в которое вставлен ген устойчивости, предпочтительно выбрано из группы, состоящей из B. oleracea convar. botrytis var. botrytis (цветная капуста, романеско), B. oleracea convar. botrytis var. cymosa (брокколи), B. oleracea convar. botrytis var. asparagoides (спаржевая капуста), B. oleracea convar. oleracea var. gemnifera (брюссельская капуста), B. oleracea convar. capitata var. alba (капуста белокочанная, капуста бычье сердце), B. oleracea convar. capitata var. rubra (красная капуста), B. oleracea convar. capitata var. sabauda (капуста савойская) B. oleracea convar. acephela var. sabellica (курчавая капуста кале), B. oleracea convar. acephela var. gongyloides (брюква) и B. oleracea var. tronchuda syn. costata (капуста португальская).
Изобретение дополнительно относится к растениям B. oleracea, доступным посредством вышеуказанного описанного способа, и к семенам и/или частям этих растений.
Изобретение также относится к применению, по меньшей мере, одного ДНК-маркера, связанного с геном устойчивости к M. brassicicola, для идентификации растения B. oleracea, которое устойчиво к M. brassicicola, где ДНК-маркер выбран из ДНК-маркеров в таблице 1 и где ДНК-маркер приведен с праймерными последовательностями, выбранными из группы, состоящей из SEQ ID No.: 1-6 (таблица 2).
Ген устойчивости предпочтительно происходит из растения B. oleracea, семена которого были депонированы в Американской коллекции типовых культур (ATCC) под номером РТА - 7413.
Изобретение дополнительно объяснено на основе следующего примера.
ПРИМЕР
M. Brassicicola-устойчивую родительскую линию M. B. oleracea (9009899, тип цветной капусты; депонированный в ATCC под номером РТА-7413) скрещивали с различными сортами B. oleracea (брюква, брокколи, капуста бычье сердце, капуста белокочанная, красная капуста, курчавая капуста кале, капуста савойская, тронхуда, капуста брюссельская и цветная капуста). Популяцию BC1 получали возвратным скрещиванием с восприимчивыми родительскими линиями.
Полевые испытания проводили в различные годы. Растительный материал собирали в год, когда степень инфекции M. brassicicola была высока и единообразна у различных видов Brassica. Поиск ДНК-маркеров устойчивости к M. brassicicola начинали с этих популяций. Почти все популяции имели расщепление 1:1 по устойчивости к M. brassicicola, что свидетельствует об ожидаемой моногенной доминантной устойчивости.
Использовали три популяции (капуста бычье сердце, брокколи и брюква), каждая приблизительно из 150 особей. ДНК всех особей выделяли из образцов листа (~0,3 см2/образец листа). Для поиска близко связанных ДНК-маркеров впоследствии использовали метод BSA (анализ смешанного образца сегреганта), в котором применяли методику RAMP (Matsumoto и др., Mammalian Genome, 9: 531-535, 1998; Reiter, PCR-based marker systems, in: DNA-based markers in plants, Kluwer Academic Publishers, vol. 6: 9-29, 2001; Weising и др., Detecting DNA variation by molecular markers, in: DNA fingerprinting in plants, principles, methods and applications, CRC Press, 2nd ed.: 21-73, 2005).
Методика RAMP, в которой комбинируют iSSR и RAPD-праймер, приводит к паттерну полос, которые представлены фрагментами ДНК, которые специфично косегрегируют с устойчивостью, причем можно провести различие между особями, которые действительно имеют интрогрессию гена устойчивости, и особями, которые не имеют интрогрессию.
Путем картирования RAMP-фрагментов были идентифицированы тесно связанные RAMP-маркеры, которые находятся в пределах интрогрессии и окружают ген устойчивости, см. таблицу 1. Генетическое расстояние между ДНК-маркером и геном устойчивости представлено в сантиморганидах (сМ).
Анализ маркеров и условия ПЦР
Общие условия ПЦР, при которых получали ДНК-маркеры, представлены вкратце далее.
ПЦР-смесь для реакции RAMP:
На реакцию
Приблизительно 1 нг геномной ДНК растения
75 мМ Tris-HCl (pH 8,8)
20 мМ NH4SO4
0,01 (об./об.) Tween 20
2,8 мМ MgCl2
0,15 мкМ прямого праймера
0,20 мкМ обратного праймера
0,25 мМ dNTP
0,04 единиц/мкл Red Hot® ДНК-полимеразы (Abgene, Epsom, UK)
Программа ПЦР:
RAPD35 Количество циклов
1 2 минуты 93°С 1
2 30 секунд 93°С
3 30 секунд 35°С
4 нагревание до 72°С со скоростью 0,3°/сек
5 1 минута 30 секунд 72°С
2-5 40
6 5 минут 72°С 1
PAGE/Licor
Для анализа паттернов RAMP использовали “Gene ReadIR 4200 DNA analyzer” (Licor Inc.). При оптимальной концентрации акриламида 6,5% фрагменты разделяли с разрешением до одного основания. Для того чтобы сделать фрагменты детектируемыми в этой системе, важно использовать меченные праймеры (IRDye метки). С этой целью треть исходного количества прямого праймера замещали меченным праймером с такой же последовательностью.
Обзор маркеров
В исследовании, которое привело к настоящему изобретению, для получения ДНК-маркеров, представленных в таблице 1, использовали праймеры, приведенные в таблице 2.
Таблица 1
Обзор RAMP маркеров
RAMP SEQ ID
Комбинация
Размер фрагмента (п.о.) Положение в сМ относительно гена резистентности
1+6 198 2,4
2+6 360 0,7
3+6 370 0,3
4+6 230 1,2
5+6 173 2,1
5+6 473 3,2
Таблица 2
Обзор SEQ ID номеров
SEQ ID № Sequence
1 iSSR CAGGAAACAGCTATGACAATGTCTCTCTCTCTC
2 iSSR CAGGAAACAGCTATGACTTGCTCTCTCTCTCTC
3 iSSR CAGGAAACAGCTATGACCACTTCTCTCTCTCTC
4 iSSR CAGGAAACAGCTATGACCTTTTCTCTCTCTCTC
5 iSSR CCAGGTGTGTGTGTGT
6 Operon RAPD® 10-mer наборы с A-01 по Z-20
(Operon Biotechnologies, Inc. Huntsville, USA)
Комбинации праймеров образуют фрагменты с определенным размером при интрогрессии гена устойчивости (таблица 1). Эти ДНК-маркеры, таким образом, являются характеристическими для интрогрессии гена устойчивости. Комбинация этих ДНК-маркеров, окружающих ген устойчивости, представляет достоверный признак того, что интрогрессия гена устойчивости к M. brassicicola произошла.
Определения
BSA - анализ смешанного образца сегрегантов - это стратегия селекции, при которой в больших популяциях сегрегантов особи с одинаковым свойством (фенотипом) или ДНК этих особей объединяют в "пулы". После скрининга этих пулов ДНК методиками определяют маркеры, которые связаны с соответствующим фенотипом.
сМ - сантиморганида - это единица генетического расстояния между маркерами, основанная на количестве кроссинговеров на сто особей.
ДНК-маркер - это фрагмент ДНК, который связан с геном или другой частью ДНК с известным местоположением в геноме, который используется для определения наследования этого гена или этого участка.
Гель-электрофорез - это способ разделения молекул (ДНК, РНК, белков, среди прочих) на основе их размера, структуры или заряда в матриксе (агароза или полиакриламид) под действием электрического поля.
Интрогрессия - это фрагмент хромосомы линии, который, например, может быть вставлен в другую линию посредством скрещивания.
IRDye метки - это инфракрасные метки, которые используют для систем отображения Licor, детекция которых происходит при 700 нм или 800 нм.
Моногенный - определяемый одним геном.
ПЦР - полимеразная цепная реакция - это метод амплификации in vitro для увеличения копий определенного фрагмента ДНК. В этой реакции синтеза используется, по меньшей мере, один олигонуклеотид, который гибридизируется с участком ДНК, после чего полимераза амплифицирует фланкирующую область в течение последовательных температурных циклов.
Праймер - это короткий олигонуклеотид (~20-50 п.о.), комплементарный последовательности одноцепочечной молекулы ДНК, который служит отправной точкой для полимеразы.
RAMPs - случайно амплифицируемые микросателлитные полиморфизмы - это метод «ДНК-отпечатка», основанный на RAPD- и iSSR-праймерах, с помощью которых детектируют полиморфизмы ДНК у различных мутантов.
RAPD - случайно амплифицируемая полиморфная ДНК - это случайно амплифицируемый полиморфный ДНК-праймер: 10-членник со "случайной" последовательностью, в котором содержание GC составляет от 60% до 70% и в котором концы праймера не является самокомплементарным.
iSSR - межмикросателлитная последовательность - это праймер к межмикросателлитной последовательности: праймер, выбранный на 5'-конце SSR (микросателлитного повтора); фрагмент ДНК, состоящий из повторения 2 или 3 нуклеотидов.
BC - обратное скрещивание - скрещивание особи с одним из исходных родителей.

Claims (11)

1. Растение Brassica oleracea, содержащее ген устойчивости к Mycosphaerella brassicicola, в котором указанный ген устойчивости обеспечивает моногенную и доминантную устойчивость к М. brassicicola, происходит из растения В. oleracea, семена которого депонированы в Американской коллекции типовых культур (АТСС) под номером РТА-7413, и связан в геноме, по меньшей мере, с двумя расположенными по обе стороны от него ДНК-маркерами, присутствие которых устанавливается путем использования указанных в таблице 1 комбинаций праймерных последовательностей, выбранных из группы, состоящей из с SEQ ID NO: 1-6.
2. Растение по п.1, в котором ген устойчивости к М. brassicicola связан, по меньшей мере, с тремя ДНК-маркерами, где ДНК-маркеры окружают ген устойчивости.
3. Растение по п.2, в котором ген устойчивости к М. brassicicola связан, по меньшей мере, с четырьмя ДНК-маркерами, где ДНК-маркеры окружают ген устойчивости.
4. Растение по п.3, в котором ген устойчивости к М. brassicicola связан, по меньшей мере, с пятью ДНК-маркерами, где ДНК-маркеры окружают ген устойчивости.
5. Растение по п.4, в котором ген устойчивости к М. brassicicola связан, по меньшей мере, с шестью ДНК-маркерами, где ДНК-маркеры окружают ген устойчивости.
6. Растение по любому из пп.1-5, где растение выбрано из группы, состоящей из Brassica oleracea convar. botrytis var. botrytis (цветная капуста, романеско), Brassica oleracea convar. botrytis var. cymosa (брокколи), Brassica oleracea convar. botrytis var. asparagoides (спаржевая капуста), Brassica oleracea convar. oleracea var. gemnifera (брюссельская капуста), Brassica oleracea convar. capitata var. alba (капуста белокочанная, капуста бычье сердце), Brassica oleracea convar. capitata var. rubra (красная капуста), Brassica oleracea convar. capitata var. sabauda (капуста савойская), Brassica oleracea convar. acephela var. sabellica (курчавая капуста кале), Brassica oleracea convar. acephela var. gongyloides (брюква) и Brassica oleracea var. tronchuda syn. costata (капуста португальская).
7. Семена, плоды и/или другие части растения, происходящие от растения по любому из пп.1-6 и содержащие ген устойчивости к Mycosphaerella brassicicola, где указанный ген устойчивости определяют в геноме по наличию, по меньшей мере, двух ДНК-маркеров, выявляемых при помощи указанных в таблице 1 комбинаций праймеров с последовательностями, выбранными из группы, состоящей из SEQ ID NO:1-6.
8. Способ получения растения Brassica oleracea с устойчивостью к Mycosphaerella brassicicola по любому из пп.1-6, включающий:
(a) получение первого растения В. oleracea, принадлежащего к М. brassicicola-устойчивой родительской линии, депонированной в АТСС под номером РТА-7413,
(b) скрещивание полученного на стадии (а) резистентного растения с восприимчивым вторым растением В. oleracea;
(c) выделение из полученного на стадии (b) потомства геномной ДНК и детекцию присутствия интрогрессии гена устойчивости по наличию двух или более специфичных ДНК-маркеров, присутствие которых устанавливается путем использования указанных в таблице 1 комбинаций праймеров с последовательностями, выбранными из группы, состоящей из с SEQ ID NO:1-6, и
(d) селекцию потомства растения В. oleracea, в котором на этапе (с) было установлено присутствие интрогрессии гена устойчивости.
9. Способ по п.8, в котором восприимчивое растение В. oleracea выбрано из группы, состоящей из В. oleracea convar. botrytis var. botrytis (цветная капуста, романеско), В. oleracea convar. botrytis var. cymosa (брокколи), В. oleracea convar. botrytis var. asparagoides (спаржевая капуста), В. oleracea convar. oleracea var. gemnifera (брюссельская капуста), В. oleracea convar. capitata var. alba (капуста белокочанная, капуста бычье сердце), В. oleracea convar. capitata var. rubra (красная капуста), В. oleracea convar. capitata var. sabauda (капуста савойская) В.oleracea convar. acephela var. sabellica (курчавая капуста кале), В. oleracea convar. acephela var. gongyloides (брюква) и В. oleracea var. tronchuda syn. costata (капуста португальская).
10. Растение В. oleracea, устойчивое к М. brassicicola, которое получено способом по п.8 или 9.
11. Применение анализа геномной ДНК растения В. oleracea на наличие, по меньшей мере, двух ДНК-маркеров, выявляемых при помощи указанных в таблице 1 комбинаций праймеров с последовательностями, выбранными из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1-6.
RU2008144575/10A 2006-04-12 2007-04-12 Растения brassica oleracea с устойчивостью к mycosphaerella brassicicola RU2438298C2 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
NL1031584 2006-04-12
NL1031584A NL1031584C2 (nl) 2006-04-12 2006-04-12 Brassica Oleracea planten met een resistentie tegen Mycosphaerella Brassicicola.

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2008144575A RU2008144575A (ru) 2010-05-20
RU2438298C2 true RU2438298C2 (ru) 2012-01-10

Family

ID=37495891

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2008144575/10A RU2438298C2 (ru) 2006-04-12 2007-04-12 Растения brassica oleracea с устойчивостью к mycosphaerella brassicicola

Country Status (9)

Country Link
US (1) US8492615B2 (ru)
EP (1) EP1998608A1 (ru)
JP (1) JP2009533037A (ru)
AR (1) AR060803A1 (ru)
AU (1) AU2007235880B2 (ru)
NL (1) NL1031584C2 (ru)
NZ (1) NZ571894A (ru)
RU (1) RU2438298C2 (ru)
WO (1) WO2007116096A1 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2810093C1 (ru) * 2019-10-17 2023-12-21 Бейо Заден Б.В. Растения brassica oleracea, устойчивые к mycosphaerella brassicicola

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU2019470010A1 (en) * 2019-10-17 2022-04-14 Bejo Zaden B.V. Mycosphaerella brassicicola resistant Brassica oleracea plants

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
NL1017616C2 (nl) * 2001-03-15 2002-09-17 Rijk Zwaan Zaadteelt En Zaadha Mycosphaerella Resistentie.
EP2322650A1 (en) * 2004-05-14 2011-05-18 Rosetta Genomics Ltd MicroRNAs and uses thereof

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2810093C1 (ru) * 2019-10-17 2023-12-21 Бейо Заден Б.В. Растения brassica oleracea, устойчивые к mycosphaerella brassicicola

Also Published As

Publication number Publication date
NL1031584C2 (nl) 2007-10-15
AU2007235880A1 (en) 2007-10-18
AU2007235880B2 (en) 2012-12-06
AR060803A1 (es) 2008-07-16
WO2007116096A1 (en) 2007-10-18
RU2008144575A (ru) 2010-05-20
US20090126036A1 (en) 2009-05-14
EP1998608A1 (en) 2008-12-10
JP2009533037A (ja) 2009-09-17
NZ571894A (en) 2011-12-22
US8492615B2 (en) 2013-07-23

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Jensen et al. Occurrence and diversity of Xanthomonas campestris pv. campestris in vegetable Brassica fields in Nepal
CA2682023C (en) Brassica oleracea plants with a resistance to albugo candida
EP2934096B1 (en) Brassica plants resistant to clubroot
Wang et al. Genetic mapping of PcDw determining pear dwarf trait
Kolmer Physiologic specialization of Puccinia triticina in Canada in 1997
JP4203595B2 (ja) 穂の形態および赤かび病抵抗性の識別方法とその利用による麦類植物の改良方法
CN114144058B (zh) 对霜霉病有抗性的芸苔属植物
RU2438298C2 (ru) Растения brassica oleracea с устойчивостью к mycosphaerella brassicicola
Li et al. A new source of resistance to Tapesia yallundae associated with a homoeologous group 4 chromosome in Thinopyrum ponticum
CA3207051A1 (en) Albugo-candida-resistant brassica oleracea plants
O'Boyle Genetic characterization and linkage mapping of barley net blotch resistance genes
AU2022399921A1 (en) Novel squash plants with downy mildew resistance
Joshi Molecular Tagging of Resistance Genes to Septoria Leaf Spot and Late Blight in Tomato (Solanum lycopersicum L.).
WO2023156569A1 (en) Novel tomato plants with tobrfv resistance
KIPCHIRCHIR SCREENING FRENCH BEAN GENOTYPES (Phaseolus vulgaris L.) USING PHENOTYPIC AND SEQUENCE TAGGED SITE (STS) MOLECULAR MARKER FOR ANGULAR LEAF SPOT (Pseudocercospora griseola) RESISTANCE
Samuel-Foo Genetic analyses of Hessian fly resistance in KS 94U275
MALLICK xsg w¡ dh fdLe, p Mh 2932 esa cgqx qf. kr jrqv k izfrjksf/krk gsr q thuksa dk fpgu d dh lgk; rk ls var osZ'ku