RU2174845C2 - Compositions and methods of genetic material delivery - Google Patents

Compositions and methods of genetic material delivery Download PDF

Info

Publication number
RU2174845C2
RU2174845C2 RU95117922/14A RU95117922A RU2174845C2 RU 2174845 C2 RU2174845 C2 RU 2174845C2 RU 95117922/14 A RU95117922/14 A RU 95117922/14A RU 95117922 A RU95117922 A RU 95117922A RU 2174845 C2 RU2174845 C2 RU 2174845C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
hiv
nucleic acid
protein
dna
virus
Prior art date
Application number
RU95117922/14A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU95117922A (en
Inventor
Б. ВЕЙНЕР Дэвид
В. ВИЛЛЬЯМС Вилльям
ВАНГ Бин
Р. КОНИ Лесли
Дж. МЕРВА Майкл
Р. ЗУРАВСКИ мл. Винсент
Original Assignee
Америкэн Хоум Продактс Корпорэйшн
Дзе Вистар Институт
Дзе Трастис оф дзе Юниверсити оф Пенсильвания
Винсент Р. Зуравски Джр.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Америкэн Хоум Продактс Корпорэйшн, Дзе Вистар Институт, Дзе Трастис оф дзе Юниверсити оф Пенсильвания, Винсент Р. Зуравски Джр. filed Critical Америкэн Хоум Продактс Корпорэйшн
Publication of RU95117922A publication Critical patent/RU95117922A/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2174845C2 publication Critical patent/RU2174845C2/en

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/005Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/12Viral antigens
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/12Viral antigens
    • A61K39/21Retroviridae, e.g. equine infectious anemia virus
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/51Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
    • A61K2039/53DNA (RNA) vaccination
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2740/00Reverse transcribing RNA viruses
    • C12N2740/00011Details
    • C12N2740/10011Retroviridae
    • C12N2740/16011Human Immunodeficiency Virus, HIV
    • C12N2740/16034Use of virus or viral component as vaccine, e.g. live-attenuated or inactivated virus, VLP, viral protein
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2740/00Reverse transcribing RNA viruses
    • C12N2740/00011Details
    • C12N2740/10011Retroviridae
    • C12N2740/16011Human Immunodeficiency Virus, HIV
    • C12N2740/16111Human Immunodeficiency Virus, HIV concerning HIV env
    • C12N2740/16122New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2740/00Reverse transcribing RNA viruses
    • C12N2740/00011Details
    • C12N2740/10011Retroviridae
    • C12N2740/16011Human Immunodeficiency Virus, HIV
    • C12N2740/16111Human Immunodeficiency Virus, HIV concerning HIV env
    • C12N2740/16134Use of virus or viral component as vaccine, e.g. live-attenuated or inactivated virus, VLP, viral protein
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2740/00Reverse transcribing RNA viruses
    • C12N2740/00011Details
    • C12N2740/10011Retroviridae
    • C12N2740/16011Human Immunodeficiency Virus, HIV
    • C12N2740/16211Human Immunodeficiency Virus, HIV concerning HIV gagpol
    • C12N2740/16222New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2740/00Reverse transcribing RNA viruses
    • C12N2740/00011Details
    • C12N2740/10011Retroviridae
    • C12N2740/16011Human Immunodeficiency Virus, HIV
    • C12N2740/16211Human Immunodeficiency Virus, HIV concerning HIV gagpol
    • C12N2740/16234Use of virus or viral component as vaccine, e.g. live-attenuated or inactivated virus, VLP, viral protein
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2740/00Reverse transcribing RNA viruses
    • C12N2740/00011Details
    • C12N2740/10011Retroviridae
    • C12N2740/16011Human Immunodeficiency Virus, HIV
    • C12N2740/16311Human Immunodeficiency Virus, HIV concerning HIV regulatory proteins
    • C12N2740/16322New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2740/00Reverse transcribing RNA viruses
    • C12N2740/00011Details
    • C12N2740/10011Retroviridae
    • C12N2740/16011Human Immunodeficiency Virus, HIV
    • C12N2740/16311Human Immunodeficiency Virus, HIV concerning HIV regulatory proteins
    • C12N2740/16334Use of virus or viral component as vaccine, e.g. live-attenuated or inactivated virus, VLP, viral protein
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A90/00Technologies having an indirect contribution to adaptation to climate change
    • Y02A90/10Information and communication technologies [ICT] supporting adaptation to climate change, e.g. for weather forecasting or climate simulation
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y10TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
    • Y10STECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y10S435/00Chemistry: molecular biology and microbiology
    • Y10S435/975Kit

Abstract

FIELD: medicine, medicinal genetics. SUBSTANCE: method involves introduction of genetic material with enhancer of polynucleotide function (for example, bupivacaine) in cells of individual person. Molecules of nucleic acid no containing retrovirus particles are incorporated also. Nucleic acid molecule has the sequence that encodes protein which involves at least one epitope identical or similar with antigen epitope being the latter is a target for immune response. This nucleotide sequence is bound operatively with regulatory sequences. Invention describes also a pharmaceutical composition and set for method realization. EFFECT: broadened arsenal of agents against HIV infection. 48 cl, 1 tbl, 19 dwg, 59 ex

Description

Изобретение относится к препаратам и способам для введения генетического материала в клетки индивидуума. Препараты и способы изобретения могут применяться для доставки защитных и/или лечебных агентов, в том числе и генетического материала, кодирующего белковые мишени для вакцинации и лечебных белков. The invention relates to preparations and methods for introducing genetic material into cells of an individual. The preparations and methods of the invention can be used to deliver protective and / or therapeutic agents, including genetic material encoding protein targets for vaccination and therapeutic proteins.

В качестве средства замены дефектной генетической информации рассматривалось непосредственное введение в живой организм нормально функционирующего гена. В отдельных исследованиях ДНК вводят непосредственно в клетки живого организма без применения вирусной частицы или иного инфекционного вектора. В работе Nabel E.G. и др. (1990) Science 249, 1285-1288 раскрыта cайт-специфичная генная экспрессия in vivo гена бета-галактозидазы, перенесенного непосредственно в стенку артерии мыши. В работе Wolfe J.A. и др. (1990) Science 247, 1465-1468 раскрыта экспрессия разнообразных генов-репортеров, перенесенных непосредственно в мышцы мыши in vivo. В работе Acsadi G. и др. (1991) Nature 352, 815-818, раскрыта экспрессия гена дистрофина человека у мыши после внутримышечной инъекции ДНК конструкции. Работа Wolfe J. A. и др. (1991) Biotechniques 11(4), 474-485 которая вводится здесь в качестве ссылки, относится к условиям, влияющим на прямой перенос гена в мышцы грызуна in vivo. В работе Felgner P.L. и G. Rhodes (1991) Nature 349, 351-352 раскрыта непосредственная доставка в качестве лекарственных средств выделенных генов без применения ретровирусов. As a means of replacing defective genetic information, the direct introduction of a normally functioning gene into a living organism was considered. In separate studies, DNA is injected directly into the cells of a living organism without the use of a viral particle or other infectious vector. In the work of Nabel E.G. et al. (1990) Science 249, 1285-1288 disclosed a site-specific gene expression in vivo of a beta-galactosidase gene transferred directly to the wall of a mouse artery. In the work of Wolfe J.A. et al. (1990) Science 247, 1465-1468, the expression of a variety of reporter genes transferred directly to mouse muscles in vivo is disclosed. Acsadi G. et al. (1991) Nature 352, 815-818, disclosed expression of a human dystrophin gene in a mouse after intramuscular injection of a DNA construct. Wolfe J. A. et al. (1991) Biotechniques 11 (4), 474-485, which is incorporated herein by reference, refers to conditions affecting direct gene transfer to rodent muscles in vivo. In the work of Felgner P.L. and G. Rhodes (1991) Nature 349, 351-352, disclosed are direct drug delivery of isolated genes without the use of retroviruses.

В качестве альтернативы способу противопатогенной вакцинации предложено применение прямого переноса гена. В качестве возможной стратегии вакцинации против ВИЧ предложено применение прямого переноса гена путем единственной инъекции. Имеются сообщения о наблюдаемой клеточной иммунной реакции на ВИЧ-gp120, возникающей при введении в клетку плазмидной ДНК, кодирующей указанный гликопротеин. РСТ Международная заявка под номером PCT/US 90/01515, опубликованная 4 октября 1990, раскрывает способы вакцинации индивидуума против патогенной инфекции прямой инъекцией одних только полинуклеотидов в клетки индивидуума применением одностадийной методики. Применение трансфецирующих агентов, отличных от липофектинов, специально исключено из раскрываемых способов. Стимулирование инокулированных клеток не раскрывается и не предполагается. Раскрыта ВИЧ вакцина, состоящая из введенных полинуклеотидов, кодирующих вирусный белок gp120. Свидетельств о действенности вакцины не приводится. The use of direct gene transfer has been proposed as an alternative to the anti-pathogenic vaccination method. As a possible HIV vaccination strategy, the use of direct gene transfer through a single injection is proposed. There are reports of an observed cellular immune response to HIV-gp120 that occurs when plasmid DNA encoding said glycoprotein is introduced into the cell. PCT International Application No. PCT / US 90/01515, published October 4, 1990, discloses methods for vaccinating an individual against a pathogenic infection by directly injecting polynucleotides into individual cells using a one-step technique. The use of transfection agents other than lipofectins is specifically excluded from the disclosed methods. Stimulation of inoculated cells is not disclosed and is not expected. Disclosed is an HIV vaccine consisting of introduced polynucleotides encoding the gp120 viral protein. Evidence of the effectiveness of the vaccine is not given.

В работе Thomason D. B. и др. (1990) Cell Physiol, 27, 578-581 и РСТ заявке на патент N WO 91/12329 раскрыто введение в мышечные клетки бупивакаина (bupivacaina) с целью вызвать пролиферацию сателитных клеток в виде части методики поставки гена при участии ретровируса. Thomason DB et al. (1990) Cell Physiol, 27, 578-581 and PCT patent application N WO 91/12329 disclose the introduction of bupivacaine (bupivacaina) into muscle cells in order to induce the proliferation of satellite cells as part of the gene delivery technique when participation of a retrovirus.

Настоящее изобретение относится к способам введения в клетки индивидуума генетического материала. Способы включают стадии контактирования клеток индивидуума с усиливающим функцию полинуклеотида агентом, в качестве которого рекомендуется агент, облегчающий поглощение ДНК клеткой или усиливающий воспалительную реакцию, и введения в клетки молекул нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, которая либо кодирует целевой пептид или белок, либо служит матрицей для молекул функциональной нуклеиновой кислоты. Вводимые молекулы нуклеиновой кислоты не содержат ретровирусных частиц. Целевой белок может быть представлен либо белком, функционирующим в организме индивидуума, либо белком, служащим мишенью для иммунной реакции. The present invention relates to methods for introducing genetic material into cells of an individual. The methods include the steps of contacting the cells of an individual with an agent enhancing the function of the polynucleotide, which is recommended as an agent that facilitates the uptake of DNA by the cell or enhances the inflammatory response, and introducing into the cells nucleic acid molecules containing a nucleotide sequence that either encodes the target peptide or protein, or serves as a matrix for functional nucleic acid molecules. The introduced nucleic acid molecules do not contain retroviral particles. The target protein can be either a protein that functions in the body of an individual, or a protein that serves as a target for an immune response.

Настоящее изобретение относится к способу вакцинации индивидуума против патогена. Способ включает стадии контактирования клеток индивидуума с усиливающим функцию полинуклеотида агентом, в качестве которого рекомендуется агент, облегчающий поглощение ДНК клеткой или усиливающий иммунный ответ, и введения в клетки молекул нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, кодирующую пептид, имеющий по меньшей мере один эпитоп, который идентичен или по существу аналогичен эпитопу, имеющемуся на антигене патогена и операбельно связанному с регуляторными последовательностями. Молекула нуклеиновой кислоты способна экспрессироваться в клетках индивидуума. The present invention relates to a method for vaccinating an individual against a pathogen. The method includes the steps of contacting the cells of an individual with an agent enhancing the function of the polynucleotide, which is recommended as an agent that facilitates the absorption of DNA by the cell or enhances the immune response, and introducing into the cells a nucleic acid molecule containing a nucleotide sequence encoding a peptide having at least one epitope that identical or substantially similar to an epitope present on a pathogen antigen and operably linked to regulatory sequences. A nucleic acid molecule is able to be expressed in an individual's cells.

Настоящее изобретение относится к способу вакцинации человека против ВИЧ. Способ состоит во введении человеку молекулы нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере один пептид, в состав которого входит по меньшей мере один эпитоп, идентичный или по существу аналогичный эпитопу, имеющемуся на ВИЧ белке, операбельно связанном с регуляторными последовательностями. The present invention relates to a method for vaccinating a person against HIV. The method consists in introducing to a person a nucleic acid molecule containing a nucleotide sequence encoding at least one peptide, which includes at least one epitope that is identical or essentially similar to the epitope present on an HIV protein operably linked to regulatory sequences.

Настоящее изобретение относится к способу вакцинации человека против ВИЧ. Способ состоит во введении молекул двух различных нуклеиновых кислот в различные клетки человека. Молекула каждой нуклеиновой кислоты содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере один пептид, в состав которого входит по меньшей мере один эпитоп, идентичный или по существу аналогичный эпитопу, имеющемуся на ВИЧ белке, операбельно связанном с регуляторными последовательностями. Каждая из молекул различных нуклеиновых кислот содержит различные нуклеотидные последовательности, кодирующие по меньшей мере один отличный от другого пептид, и каждая нуклеиновая кислота способна экспрессироваться в клетках человека. The present invention relates to a method for vaccinating a person against HIV. The method consists in introducing molecules of two different nucleic acids into different human cells. The molecule of each nucleic acid contains a nucleotide sequence encoding at least one peptide, which includes at least one epitope that is identical or substantially similar to the epitope present on an HIV protein operably linked to regulatory sequences. Each of the molecules of different nucleic acids contains a different nucleotide sequence encoding at least one peptide different from the other, and each nucleic acid is able to be expressed in human cells.

Настоящее изобретение относится к способу вакцинации индивидуума против гиперпролиферативного заболевания или аутоиммунных заболеваний. Способ состоит во введении в клетки индивидуума молекул нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, кодирующую пептид, в состав которого входит по меньшей мере один эпитоп, идентичный или по существу аналогичный эпитопу, находящемуся в белке, связанном с гиперпролиферативным заболеванием, или белке, связанном с аутоиммунным заболеванием соответственно и операбельно связанном с регуляторными последовательностями, причем молекула нуклеиновой кислоты способна экспрессироваться в клетках. The present invention relates to a method for vaccinating an individual against hyperproliferative disease or autoimmune diseases. The method consists in introducing into the cells of an individual nucleic acid molecules containing a nucleotide sequence encoding a peptide comprising at least one epitope that is identical or substantially similar to an epitope located in a protein associated with a hyperproliferative disease or a protein associated with an autoimmune a disease, respectively, and operably linked to regulatory sequences, the nucleic acid molecule being able to be expressed in cells.

Настоящее изобретение относится к способам лечения страдающего заболеванием индивидуума, включающим стадии контактирования клеток индивидуума с усиливающим функцию полинуклеотида агентом, в качестве которого рекомендуется агент, облегчающий поглощение ДНК клетками или усиливающий воспалительную реакцию, и введения в клетки индивидуума молекул нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, функционирующую вместо дефектного гена или кодирующую молекулу, создающую лечебный эффект в организме индивидуума и операбельно связанную с регуляторными последовательностями, причем молекулы нуклеиновой кислоты способны экспрессироваться в клетках. The present invention relates to methods for treating an individual suffering from a disease, comprising the steps of contacting the individual's cells with an agent enhancing the function of the polynucleotide, which is recommended as an agent that facilitates the uptake of DNA by cells or enhances the inflammatory response, and introducing into the individual's cells nucleic acid molecules containing a nucleotide sequence that functions instead of a defective gene or a coding molecule that creates a therapeutic effect in the body of an individual and opera closely associated with regulatory sequences, moreover, nucleic acid molecules are able to be expressed in cells.

Настоящее изобретение относится к фармацевтическим препаратам, содержащим нуклеиновую кислоту и усилитель функции полинуклеотида. Настоящее изобретение относится к фармацевтическому набору, включающему контейнер с нуклеиновой кислотой и контейнер с усилителем функции полинуклеотида. The present invention relates to pharmaceutical preparations comprising a nucleic acid and a polynucleotide function enhancer. The present invention relates to a pharmaceutical kit comprising a container with a nucleic acid and a container with a polynucleotide function enhancer.

Настоящее изобретение относится к профилактическим и лечебным ВИЧ вакцинам, содержащим фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель и нуклеиновую кислоту, кодирующую один или несклько пептидов, каждый из которых имеет по меньшей мере один эпитоп, идентичный или по существу аналогичный эпитопу, находящемуся в по меньшей мере одном ВИЧ белке, операбельно связанном с регуляторными последовательностями, причем нуклеиновая кислота способна экспрессироваться в клетках человека. The present invention relates to HIV prophylactic and therapeutic vaccines comprising a pharmaceutically acceptable carrier or diluent and a nucleic acid encoding one or more peptides, each of which has at least one epitope that is identical or essentially similar to the epitope found in at least one HIV a protein operably linked to regulatory sequences, the nucleic acid being able to be expressed in human cells.

Настоящее изобретение относится к профилактическим и лечебным ВИЧ вакцинам, содержащим два инокулята. Первый инокулят состоит из фармацевтически приемлемого носителя или разбавителя и первой нуклеиновой кислоты. Молекула первой нуклеиновой кислоты включает нуклеотидную последовательность, кодирующую один или несколько пептидов, каждый из которых содержит по меньшей мере один эпитоп, идентичный или по существу аналогичный эпитопу, имеющемуся в по меньшей мере одном ВИЧ белке, операбельно связанном с регуляторными последовательностями, причем молекула нуклеиновой кислоты способна экспрессироваться в клетках человека. Второй инокулят состоит из фармацевтически приемлемого носителя или разбавителя и второй нуклеиновой кислоты. Молекула второй нуклеиновой кислоты включает нуклеотидную последовательность, кодирующую один или несколько пептидов, каждый из которых содержит по меньшей мере один эпитоп, идентичный или по существу аналогичный эпитопу, имеющемуся в по меньшей мере одном ВИЧ белке, операбельно связанном с регуляторными последовательностями, причем молекула нуклеиновой кислоты способна экспрессироваться в клетках человека. Молекулы первой и второй нуклеиновых кислот различны и кодируют различные пептиды. The present invention relates to prophylactic and therapeutic HIV vaccines containing two inoculum. The first inoculum consists of a pharmaceutically acceptable carrier or diluent and a first nucleic acid. The first nucleic acid molecule includes a nucleotide sequence encoding one or more peptides, each of which contains at least one epitope identical or substantially similar to the epitope present in at least one HIV protein operably linked to regulatory sequences, the nucleic acid molecule capable of being expressed in human cells. The second inoculum consists of a pharmaceutically acceptable carrier or diluent and a second nucleic acid. The second nucleic acid molecule comprises a nucleotide sequence encoding one or more peptides, each of which contains at least one epitope that is identical or substantially similar to the epitope present in at least one HIV protein operably linked to regulatory sequences, the nucleic acid molecule capable of being expressed in human cells. The molecules of the first and second nucleic acids are different and encode different peptides.

На фиг. 1A приведена диаграмма, иллюстрирующая конструирование плазмиды pM160, созданной путем вставки образованного в ПЦР (полимеразной цепной реакции) фрагмента, кодирующего гликопротеин gp160 ВИЧ-НХВ2 в плазмиду pMAMneoBlue (Клонтех). In FIG. 1A is a diagram illustrating the construction of the plasmid pM160 created by inserting a fragment encoded in PCR (polymerase chain reaction) encoding HIV-HXB2 glycoprotein gp160 into plasmid pMAMneoBlue (Clontech).

На фиг. 1B приведена фотография авторадиограммы вестерн блотинга полного клеточного лизата клеток, трансфецированных плазмидой pM160 (3G7 клетки), в сравнении с трансфецированными только вектором клетками (ТЕ671 клетки). Видно продуцирование gp120 и gp41 в 3G7 клетках, но не в ТЕ 671 клетках. In FIG. Figure 1B shows a photograph of an autoradiogram of Western blotting of the complete cell lysate of cells transfected with plasmid pM160 (3G7 cells), compared with cells transfected with vector only (TE671 cells). One can see the production of gp120 and gp41 in 3G7 cells, but not in TE 671 cells.

На фиг. 2 показана фотография авторадиограммы результатов иммуноосаждения при связывании антител сыворотки с 125J-gp160.In FIG. 2 shows a photograph of an autoradiogram of immunoprecipitation results when serum antibodies bind to 125 J-gp160.

На фиг. 3A-3E приведены графики, показывающие результаты ELISA (ФИСА) при связывании различных сывороток с различными белками, иммобилизованными на титрационных михропланшетах. In FIG. 3A-3E are graphs showing ELISA (FISA) results on binding of various sera to various proteins immobilized on microtiter plates.

На фиг. 4A и 4B показаны фотографии МТ-2 клеток, инфицированных ТСID50ВИЧ-1/III8 бесклеточным вирусом, предварительно инкубированным в последовательных разбавлениях антисыворотки.In FIG. 4A and 4B are photographs of MT-2 cells infected with TCID 50 HIV-1 / III 8 cell-free virus previously incubated in successive dilutions of antiserum.

На фиг. 4C приведены графики, показывающие изменение величин нейтрализации (Vn/Vo) в зависимости от факторов разбавления и построенные на основании результатов с применением контрольной сыворотки (x = мыши, иммунизируемые pMAMneoBlue вектором) и испытуемой сыворотки (о = мыши, иммунизируемые pM160).In FIG. Figure 4C shows graphs showing the change in neutralization values (V n / V o ) depending on dilution factors and based on the results using control serum (x = mice immunized with pMAMneoBlue vector) and test serum (o = mice immunized with pM160).

На фиг. 4D-4G показаны фотографии H9/III8 клеток, применяемых в опытах с целью изучения синцитиального ингибирова- ния применением сыворотки от иммунизированных и контрольных животных.In FIG. 4D-4G shows photographs of H9 / III of 8 cells used in experiments to study syncytial inhibition using serum from immunized and control animals.

На фиг. 5 приведена диаграмма, отражающая выживание иммунизированных и неиммунизированных мышей, контрольно зараженных gp160-мечеными и немечеными клетками опухоли. Мышей иммунизируют рекомбинантным gp160 белком только векторной ДНК или рекомбинантным вектором, включающим ДНК, кодирующую gp160. Мышам вводят SP2/0 клетки опухоли или SP2/0-gp160 клетки опухоли (SP2/0 клетки, трансфектированные ДНК, кодирующей gp160, и экспрессирующие gp160). In FIG. Figure 5 is a graph depicting the survival of immunized and non-immunized mice that were challenged with gp160-labeled and unlabeled tumor cells. Mice are immunized with the recombinant gp160 protein of only vector DNA or a recombinant vector comprising DNA encoding gp160. Mice are injected with SP2 / 0 tumor cells or SP2 / 0-gp160 tumor cells (SP2 / 0 cells transfected with DNA encoding gp160 and expressing gp160).

На фиг. 6 приведена карта плазмиды pGAGPOL.rev. In FIG. 6 shows a map of plasmid pGAGPOL.rev.

На фиг. 7 приведена карта плазмиды pENV. In FIG. 7 shows a map of plasmid pENV.

На фиг. 8 показаны четыре макромолекулярных скелета (А, В, С и D), применяемых для построения генетического конструкта. In FIG. Figure 8 shows four macromolecular skeletons (A, B, C, and D) used to construct the genetic construct.

На фиг. 9 показаны четыре вставки (1, 2, 3 и 4), вставляемые в скелеты с получением генетических конструктов. In FIG. 9 shows four inserts (1, 2, 3, and 4) inserted into skeletons to produce genetic constructs.

Настоящее изобретение относится к способу введения в клетки животного молекул нуклеиновой кислоты, чем обеспечивается высокий уровень поглощения и функционирования молекул нуклеиновой кислоты. Способ настоящего изобретения включает стадии введения в клетки индивидуума молекул нуклеиновой кислоты, не содержащих вирусных частиц, в частности ретровирусных частиц, в сочетании с введением ко-агента, усиливающего воспалительную реакцию и/или усиливающего экспрессию молекул нуклеиновой кислоты в тканях, и/или облегчающих поглощения клетками молекул нуклеиновой кислоты. Рекомендуемыми вариантами настоящего изобретения даются способы поставки в клетки индивидуума молекул нуклеиновой кислоты без применения инфекционных агентов. The present invention relates to a method for introducing nucleic acid molecules into animal cells, thereby providing a high level of absorption and functioning of nucleic acid molecules. The method of the present invention includes the steps of introducing into the cells of an individual nucleic acid molecules that do not contain viral particles, in particular retroviral particles, in combination with the introduction of a co-agent that enhances the inflammatory response and / or enhances the expression of nucleic acid molecules in the tissues and / or facilitates absorption nucleic acid molecule cells. Recommended embodiments of the present invention provide methods for delivering nucleic acid molecules to individual cells without the use of infectious agents.

Молекулы нуклеиновых кислот, поставляемые по изобретению в клетки, могут служить: 1) генетическими матрицами для белков, действующих в качестве профилактических и/или лечебных иммунизирующих средств; 2) копиями, заменяющими дефектные, отсутствующие или нефункционирующие гены; 3) генетическими матрицами для лечебных белков; 4) генетическими матрицами для антисмысловых молекул или 5) генетическими матрицами для рибозимов. В том случае, если молекула нуклеиновой кислоты кодирует белок, рекомендуется, чтобы молекула нуклеиновой кислоты включала последовательности, необходимые для транскрипции и трансляции в клетках животного. В случае молекул нуклеиновой кислоты, служащей матрицей для антисмысловых молекул и рибозимов, рекомендуется, чтобы такие нуклеиновые кислоты были связаны с регуляторными элементами, необходимыми для продукции достаточного числа копий кодируемых ими антисмысловых молекул и рибозимов соответственно. Молекулы нуклеиновой кислоты не содержат ретровирусных частиц и предпочтительно даются как ДНК, имеющей вид плазмиды. The nucleic acid molecules delivered according to the invention into cells can serve as: 1) genetic matrices for proteins that act as prophylactic and / or therapeutic immunizing agents; 2) copies that replace defective, missing or non-functioning genes; 3) genetic matrices for therapeutic proteins; 4) genetic matrices for antisense molecules; or 5) genetic matrices for ribozymes. In the event that the nucleic acid molecule encodes a protein, it is recommended that the nucleic acid molecule include the sequences necessary for transcription and translation in animal cells. In the case of nucleic acid molecules serving as a matrix for antisense molecules and ribozymes, it is recommended that such nucleic acids be linked to the regulatory elements necessary for the production of a sufficient number of copies of the antisense molecules and ribozymes encoded by them, respectively. The nucleic acid molecules do not contain retroviral particles and are preferably given as plasmid-shaped DNA.

Ко-агент также называется "усилителем функции полинуклеотида" или "УФП". УФП является соединением или смесью соединений, усиливающих воспалительную реакцию и/или усиливающих экспрессию молекул нуклеиновой кислоты в тканях, и/или облегчающих поглощение клетками молекул нуклеиновой кислоты, предпочтительно обладающих несколькими из указанных свойств. Усилители функции полинуклеотида, облегчающие поглощение клетками ДНК и РНК и стимулирующие деление и репликацию клеток, называются также стимулирующими клетку агентами. Рекомендуемые для настоящего изобретения ко-агенты выбирают из группы, включающей эфиры и анилиды бензойной кислоты. В рекомендуемых вариантах УФП представлен бупивакаином. The co-agent is also called a “polynucleotide function enhancer” or “UVP”. UVP is a compound or mixture of compounds that enhance the inflammatory response and / or enhance the expression of nucleic acid molecules in tissues and / or facilitate the uptake of nucleic acid molecules by cells, preferably having several of these properties. Polynucleotide function enhancers that facilitate the uptake of DNA and RNA by cells and stimulate cell division and replication are also called cell-stimulating agents. The coagents recommended for the present invention are selected from the group consisting of benzoic acid esters and anilides. In recommended embodiments, the UVP is represented by bupivacaine.

В соответствии с некоторыми аспектами настоящего изобретения даются препараты и способы, которыми индивидуум профилактически и/или терапевтически вакцинируют против патогена или ненормальной, связанной с заболеванием клеткой. Генетический материал кодирует пептид или белок, разделяющий по меньшей мере один эпитоп с иммуногенным белком, обнаруживаемым в являющихся мишенями патогене или клетках. Генетический материал экспрессируется клетками индивидуума, и служит иммуногенной мишенью, против которой возникает иммунная реакция. Возникшая иммунная реакция имеет широкую основу: помимо гуморальной иммунной реакции вызываются также оба вида клеточной иммунной реакции. Способы настоящего изобретения применимы для придания профилактического или терапевтического иммунитета. Таким образом, способ включает как методы защиты индивидуума от заражения патогеном или возникновения, или пролиферации специфичных клеток, так и методы лечения индивидуума, страдающего от инфицирования патогеном, гиперпролиферативного заболевания или аутоиммунного заболевания. In accordance with some aspects of the present invention, there are provided preparations and methods by which an individual is prophylactically and / or therapeutically vaccinated against a pathogen or abnormal disease-related cell. The genetic material encodes a peptide or protein that shares at least one epitope with an immunogenic protein found in the target pathogen or cells. Genetic material is expressed by the cells of the individual, and serves as an immunogenic target against which an immune response occurs. The resulting immune response has a broad basis: in addition to the humoral immune response, both types of cellular immune responses are also triggered. The methods of the present invention are useful for imparting prophylactic or therapeutic immunity. Thus, the method includes both methods of protecting an individual from infection by a pathogen or the emergence or proliferation of specific cells, and methods of treating an individual suffering from infection by a pathogen, hyperproliferative disease or autoimmune disease.

Настоящее изобретение позволяет вызвать широкий спектр иммунных реакций против целевых белков, т.е. белков, специфично ассоциированных с патогенами или собственными "ненормальными" клетками индивидуума. Настоящее изобретение применимо для вакцинации индивидуумов против патогенных агентов или микроорганизмов таким образом, что иммунная реакция против патогена обеспечивает защитный иммунитет против патогена. Настоящее изобретение применимо для борьбы с гиперпролиферативными заболеваниями и нарушениями, например раком, путем создания иммунной реакции против целевого белка, специфично ассоциируемого с гиперпролиферативными клетками. Настоящее изобретение позволяет бороться с аутоиммунными заболеваниями и нарушениями путем создания иммунной реакции против целевого белка, специфично ассоциируемого с клетками, ответственными за аутоиммунное состояние. The present invention allows to induce a wide range of immune responses against target proteins, i.e. proteins specifically associated with pathogens or the individual's own "abnormal" cells. The present invention is applicable for vaccinating individuals against pathogenic agents or microorganisms in such a way that the immune response against the pathogen provides protective immunity against the pathogen. The present invention is useful for controlling hyperproliferative diseases and disorders, for example, cancer, by creating an immune response against a target protein specifically associated with hyperproliferative cells. The present invention allows the fight against autoimmune diseases and disorders by creating an immune response against the target protein specifically associated with cells responsible for the autoimmune condition.

Некоторые аспекты настоящего изобретения относятся к генной терапии, т. е. к препаратам нуклеиновой кислоты и способам их введения в клетки индивидуума в виде экзогенных ионий гена, который либо соответствует дефектному, отсутствующему, нефункционирующему или частично функционирующему гену индивидуума, либо кодирует лечебные белки, т.е. белки, присутствие которых в организме индивидуума компенсирует их дефицит в организме и/или присутствие которых создает лечебное действие на организм индивидуума. Таким образом, настоящим изобретением предусмотрены средства доставки белка альтернативным путем, отличным от простого введения белка. Some aspects of the present invention relate to gene therapy, i.e., nucleic acid preparations and methods for their introduction into the cells of an individual in the form of exogenous ion ions of a gene that either corresponds to a defective, missing, non-functioning or partially functioning gene of the individual, or encodes therapeutic proteins, t .e. proteins whose presence in the body of the individual compensates for their deficiency in the body and / or the presence of which creates a therapeutic effect on the body of the individual. Thus, the present invention provides protein delivery vehicles in an alternative way than simple administration of the protein.

Подразумевается, что в применяемом здесь значении термин "целевой белок" относится к пептидам и белкам, кодируемым генными конструкциями настоящего изобретения, которые либо служат белковыми мишенями для иммунной реакции, либо действуют в качестве терапевтических или компенсирующих белков в режимах генной терапии. It is understood that, as used herein, the term “target protein” refers to peptides and proteins encoded by the gene constructs of the present invention, which either serve as protein targets for the immune response, or act as therapeutic or compensating proteins in gene therapy regimens.

Согласно настоящему изобретению ДНК и РНК, кодирующую целевой белок, вводят в клетки индивидуума, где происходит ее экспрессия с продуцированием в результате целевого белка. ДНК или РНК, кодирующая целевой белок, связана с регуляторными элементами, необходимыми для экспрессии в клетках индивидуума. Регуляторные элементы для экспрессии ДНК включают промотор и сигнал полиаденилирования. В генетический конструкт могут быть также включены и другие элементы, например область Козака. According to the present invention, DNA and RNA encoding a target protein are introduced into the cells of an individual, where it is expressed and produced as a result of the target protein. DNA or RNA encoding a target protein is bound to regulatory elements necessary for expression in an individual's cells. Regulatory elements for DNA expression include a promoter and a polyadenylation signal. Other elements, such as the Kozak region, may also be included in the genetic construct.

В применяемом здесь значении термин "генетический конструкт" относится к молекуле ДНК или РНК, содержащей нуклеотидную последовательность, кодирующую целевой белок, и которая включает сигналы инициирования и терминирования, операбельно связанные с регуляторными элементами, в том числе промотором и сигналом полиаденилирования, способными направлять экспрессию в клетках вакцинированного индивидуума. As used herein, the term "genetic construct" refers to a DNA or RNA molecule containing a nucleotide sequence encoding a target protein, and which includes initiation and termination signals operably linked to regulatory elements, including a promoter and polyadenylation signal, capable of directing expression into cells of the vaccinated individual.

В применяемом здесь значении термин "экспрессируемая форма" относится к генному конструкту, содержащему необходимые регуляторные элементы, операбельно связанные с кодирующей последовательностью таким образом, что при их наличии в клетках индивидуума происходит экспрессия кодирующей последовательности. Кодирующая последовательность кодирует целевой белок. As used herein, the term “expressed form” refers to a gene construct containing the necessary regulatory elements operably linked to a coding sequence such that when they are present in an individual’s cells, the coding sequence is expressed. The coding sequence encodes the target protein.

В применяемом здесь значении термин "генетическая вакцина" относится к фармацевтическому препарату, содержащему генетический конструкт. Такой конструкт включает нуклеотидную последовательность, кодирующую целевой белок. В число таких препаратов входят и фармацевтические препараты, применимые для создания терапевтической иммунной реакции. As used herein, the term “genetic vaccine” refers to a pharmaceutical preparation containing a genetic construct. Such a construct includes a nucleotide sequence encoding a target protein. These drugs include pharmaceuticals that are useful for creating a therapeutic immune response.

В применяемом здесь значении термин "генетический терапевтический (лечебный) препарат" относится к фармацевтическому препарату, содержащему генетический конструкт. Конструкт включает нуклеотидную последовательность, кодирующую терапевтический или компенсирующий белок. As used herein, the term “genetic therapeutic (therapeutic) drug” refers to a pharmaceutical preparation containing a genetic construct. The construct includes a nucleotide sequence encoding a therapeutic or compensating protein.

В применяемом здесь значении термин "целевой белок" относится к белку, относительно которого может быть вызвана иммунная реакция. Целевой белок является иммуногенным белком, разделяющим по меньшей мере один эпитоп с белком из патогена или клетки нежелательного типа, например раковой клетки или клетки, участвующей в аутоиммунном заболевании, относительно которого требуется вакцинация. Иммунная реакция, направленная против целевого белка, способна защитить индивидуума от специфичных инфекции или заболевания, с которыми ассоциируется целевой белок, или вылечить от них. As used herein, the term “target protein” refers to a protein against which an immune response can be caused. The target protein is an immunogenic protein sharing at least one epitope with a protein from a pathogen or cell of an undesired type, for example a cancer cell or a cell participating in an autoimmune disease against which vaccination is required. An immune response directed against the target protein can protect the individual from the specific infections or diseases with which the target protein is associated, or can cure them.

В применяемом здесь значении выражение "разделять эпитоп" относится к белкам, содержащим по меньшей мере один эпитоп, который идентичен или по существу аналогичен эпитопу другого белка. As used herein, the term “separate epitope” refers to proteins containing at least one epitope that is identical or substantially similar to an epitope of another protein.

Имеется в виду, что в применяемом здесь значении выражение "по существу аналогичный эпитоп" относится к эпитопу, строение которого не идентично строению эпитопа белка, но тем не менее способному вызвать перекрестную клеточную или гуморальную иммунную реакцию. It is understood that, as used herein, the expression "substantially similar to an epitope" refers to an epitope whose structure is not identical to that of a protein epitope, but nonetheless capable of inducing a cross-cell or humoral immune response.

В применяемом здесь значении термин "терапевтический (лечебный) белок" относится к белкам, присутствие которых оказывает лечебное действие на индивидуума. As used herein, the term “therapeutic (therapeutic) protein” refers to proteins whose presence has a therapeutic effect on an individual.

Считается, что в применяемом здесь значении термин "компенсирующий белок" будет относится к белкам, присутствие которых компенсирует отсутствие в полной мере функционального, эндогенно продуцируемого белка, связанное с отсутствием, дефектом, нефункциональностью или частичной функциональностью эндогенного гена. It is believed that, as used herein, the term “compensating protein” will refer to proteins whose presence compensates for the absence of a fully functional, endogenously produced protein associated with the absence, defect, nonfunctionality or partial functionality of the endogenous gene.

Генетические конструкты включают нуклеотидную последовательность, кодирующую целевой белок, операбельно связанный с необходимыми для генной экспрессии регуляторными элементами. Соответственно, введение в живую клетку молекулы ДНК или РНК приводит к экспрессии ДНК или РНК, кодирующей целевой белок, с продуцированием тем самым целевого белка. Genetic constructs include a nucleotide sequence encoding a target protein operably linked to regulatory elements necessary for gene expression. Accordingly, the introduction of a DNA or RNA molecule into a living cell results in the expression of DNA or RNA encoding the target protein, thereby producing the target protein.

При усвоении клеткой генетический констуркт, включающий нуклеотидную последовательность, кодирующую целевой белок, операбельно связанный с регуляторынми элементами, может остаться в клетке в виде функционирующей внехромосомной молекулы или может быть интегрирован в хромосомную ДНК клетки. ДНК может быть введена в клетку, где и будет оставаться в виде отдельного генетического материала в форме плазмиды. Или же в клетку может быть введена линейная ДНК, способная интегрироваться с хромосомой. При введении ДНК в клетку могут быть добавлены реагенты, способствующие интеграции ДНК с хромосомами. В молекулу ДНК могут быть также включены ДНК последовательности, способные промотировать интеграцию. Или же в клетку может быть введена РНК. Не исключено также создание генетического конструкта в виде линейной минихромосомы, включающей центромер, теломеры и ориджин репликации. When a cell assimilates a genetic construct, including a nucleotide sequence encoding a target protein operably linked to regulatory elements, it can remain in the cell as a functioning extrachromosomal molecule or can be integrated into the chromosomal DNA of the cell. DNA can be introduced into the cell, where it will remain as a separate genetic material in the form of a plasmid. Or linear DNA that can integrate with the chromosome can be introduced into the cell. When DNA is introduced into the cell, reagents can be added to facilitate the integration of DNA with the chromosomes. DNA sequences that can promote integration can also be included in the DNA molecule. Alternatively, RNA can be introduced into the cell. It is also possible the creation of a genetic construct in the form of a linear minichromosome, including centromeres, telomeres, and the origin of replication.

Молекула, кодирующая целевой белок, может представлять собой ДНК или РНК, содержащую нуклеотидную последовательность, кодирующую целевой белок. Такие молекулы могут быть представлены кДНК, геномной ДНК, синтетической ДНК или их гибридом, или молекулой РНК, например мРНК. Соответственно, считается, что в применяемом здесь значении термины "ДНК конструкт", "генетический конструкт" и "нуклеотидная последовательность" относятся к молекулам как ДНК, так и РНК. The molecule encoding the target protein may be DNA or RNA containing the nucleotide sequence encoding the target protein. Such molecules can be represented by cDNA, genomic DNA, synthetic DNA or a hybrid thereof, or an RNA molecule, for example mRNA. Accordingly, it is believed that, as used herein, the terms “DNA construct”, “genetic construct” and “nucleotide sequence” refer to both DNA and RNA molecules.

Регуляторные элементы необходимые для генной экспрессии молекулы ДНК, включают: промотор, инициирующий кодон, терминирующий кодон и сигнал полиаденилирования. Кроме того, для генной экспрессии часто требуются усилители. Необходимо, чтобы такие элементы были операбельно связаны с кодирующей целевые белки последовательностью и чтобы регуляторные элементы были операбельны в организме индивидуума, которому они вводятся
Обычно считают, что инициирующий кодон и терминирующий кодон являются частью нуклеотидной последовательности, кодирующей целевой белок. Однако необходимо, чтобы указанные элементы были функциональны в организме индивидуума, которому вводят генный конструкт. Инициирующий и терминирующий кодоны должны находиться в одной рамке с кодирующей последовательностью.
Regulatory elements necessary for gene expression of a DNA molecule include: a promoter, an initiation codon, a termination codon, and a polyadenylation signal. In addition, amplifiers are often required for gene expression. It is necessary that such elements are operably linked to the sequence encoding the target proteins and that regulatory elements are operable in the body of the individual to whom they are introduced
It is generally believed that the initiation codon and the termination codon are part of the nucleotide sequence encoding the target protein. However, it is necessary that these elements are functional in the body of the individual to whom the gene construct is introduced. The initiating and terminating codons must be in the same frame with the coding sequence.

Промоторы и сигналы полиаденилирования, которые применяют, должны быть функциональны в пределах клетки индивидуума. The promoters and polyadenylation signals that are used must be functional within the cell of an individual.

Примеры промоторов, применимых в практике настоящего изобретения, особенно при получении генетической вакцины для человека, включают (но без ограничения только ими) промоторы из обезьяньего вируса 40 (ОВ40), вируса опухоли молочной железы мыши (ВОМЖМ) промотор, вируса иммунодефицита человека (ВИЧ), например ВИЧ длинного концевого повтора (ДКП) промотор, вирус Молони, ALV, цитомегаловируса (ЦМВ), например ЦМВ непосредственно ранний промотор, вируса Эпштейна-Барра (ВЭБ), вируса саркомы Рауса (ВСР), а также промоторы из генов человека, например актина человека, миозина человека, гемоглобина человека, мышечного креатина человека и металлотионеина. Examples of promoters useful in the practice of the present invention, especially in the preparation of a human genetic vaccine, include, but are not limited to, promoters from monkey virus 40 (OB40), mouse breast tumor virus (VOMG) promoter, human immunodeficiency virus (HIV) for example, HIV long terminal repeat (DCT) promoter, Moloni virus, ALV, cytomegalovirus (CMV), e.g. CMV directly early promoter, Epstein-Barr virus (EBV), Routh sarcoma virus (HRV), as well as promoters from human genes, for example actin and human, human myosin, human hemoglobin, human muscle creatine, and metallothionein.

Примеры сигналов полиаденилирования, применимых в практике настоящего изобретения, особенно при получении генной вакцины для человека, включают (во без ограничения только ими) ОВ40 сигналы полиаденилировавия и ДКП сигналы полиаденилирования. В частности, применяют ОВ40 сигнал полиаденилирования, являющийся рСЕР4 плазмидой (Инвитроген, Сан Диего, КА), называемый ОВ40 сигналом полиаденилирования. Examples of polyadenylation signals useful in the practice of the present invention, especially when producing a human vaccine, include (but are not limited to) OB40 polyadenylation signals and DCT polyadenylation signals. In particular, an OB40 polyadenylation signal is used, which is a pCEP4 plasmid (Invitrogen, San Diego, CA), called an OB40 polyadenylation signal.

Помимо регуляторных элементов, необходимых для экспрессии ДНК, в молекулу ДНК могут быть также включены и другие элементы. Также дополнительные элементы включают усилители. Усилитель может быть выбран из группы, включающей (но без ограничения только ими) актин человека, миозин человека, гемоглобин человека, мышечный креатин человека и вирусные усилители, например усилители из ЦМВ, ВСР и ВЭБ. In addition to the regulatory elements necessary for the expression of DNA, other elements may also be included in the DNA molecule. Also additional elements include amplifiers. The amplifier may be selected from the group including (but not limited to) human actin, human myosin, human hemoglobin, human muscle creatine and viral enhancers, for example, amplifiers from CMV, HRV and EBV.

Генетические конструкты могут быть обеспечены ориджином репликации млекопитающего, цель которого удержание конструкта вне хромосомы и получение множества копий конструкта в клетке. Плазмиды рСЕР4 и pREP4 фирмы Инвитроген (Сан Диего, КА) содержат ориджин репликации вируса Эпштейна-Барра и область кодирования ядерного антигена EBNA-1, что обеспечивает высокопийную эписомальную репликацию без интеграции. Genetic constructs can be provided by the origin of mammalian replication, the purpose of which is to keep the construct outside the chromosome and obtain multiple copies of the construct in the cell. Invitrogen (San Diego, CA) plasmids pCEP4 and pREP4 contain the Epstein-Barr virus origin of replication and the coding region of the nuclear antigen EBNA-1, which provides high-copy episomal replication without integration.

В некоторых рекомендуемых воплощениях изобретения применяемый вектор выбирают из векторов, описанных в Примере 46. В тех аспектах изобретения, которые относятся к генной терапии, рекомендуются конструкты с ориджином репликации, включающим необходимый для активации антиген. In some recommended embodiments of the invention, the vector used is selected from the vectors described in Example 46. In those aspects of the invention that relate to gene therapy, constructs with an origin of replication including the antigen necessary for activation are recommended.

В некоторых рекомендуемых воплощениях изобретения, относящихся к вакцинации, генетический конструкт содержит нуклеотидные последовательности, кодирующие целевой белок, и, кроме того, включает гены для белков, усиливающих иммунную реакцию против таких целевых белков. Примеры подобных генов включают гены, кодирующие цитокины и лимфокины, например альфа-интерферон, гамма-интерферон, происходящий из тромбоцитов фактор роста (ПТФР), GC-SF, GM-CSF, ФНО, эпидермальный фактор роста (ЭФР), ИЛ-1, ИЛ-2, ИЛ-4, ИЛ-6, ИЛ-8, ИЛ-10 и ИЛ-12. В некоторых вариантах рекомендуется, чтобы в применяемых в вакцинирующих препаратах генетических конструктах был включен ген для GM-CSF. In some recommended vaccination-related embodiments of the invention, the genetic construct contains nucleotide sequences encoding a target protein, and furthermore includes genes for proteins that enhance the immune response against such target proteins. Examples of such genes include genes encoding cytokines and lymphokines, for example alpha interferon, gamma interferon, platelet derived growth factor (PTFR), GC-SF, GM-CSF, TNF, epidermal growth factor (EGF), IL-1, IL-2, IL-4, IL-6, IL-8, IL-10 and IL-12. In some embodiments, it is recommended that the gene for GM-CSF be included in the genetic constructs used in vaccine preparations.

Может быть добавлен дополнительный элемент, служащий мишенью для разрушения клетки, если по какой-либо причине желательно исключить попадания в клетку генетического конструкта. В генетический конструкт может быть включен ген тимидин-киназы герпеса (tk). Индивидууму может быть введено лекарственное средство гангцикловир, ведущее к селективному уничтожению любых продуцирующих tk клеток, с обеспечением тем самым средств для селективного разрушения клеток генетическим конструктом. An additional element can be added that serves as a target for cell destruction, if for any reason it is desirable to exclude the entry of a genetic construct into the cell. A herpes thymidine kinase (tk) gene may be included in the genetic construct. The drug gangciclovir may be administered to an individual, leading to the selective destruction of any tk-producing cells, thereby providing means for the selective destruction of cells with a genetic construct.

Для максимального увеличения продуцирования белка могут быть подобраны регуляторные последовательности, хорошо соответствующие генной экспрессии в клетках, в которые был введен конструктор. Кроме того, могут быть подобраны кодоны, наиболее эффективно транскрибируемые в клетках. Любой специалист способен создать функционирующие в клетках ДНК конструкты. To maximize protein production, regulatory sequences that are well matched to gene expression in cells into which the designer was introduced can be selected. In addition, codons that are most efficiently transcribed in cells can be selected. Any specialist is able to create constructs that function in DNA cells.

Для выявления экспрессии генетические конструкты могут быть проанализированы in vltro на уровень экспрессии с применением тканевых культур клеток того же типа, что и клетки, в которые будет вводиться конструкт. К примеру, если генетическая вакцина должна быть введена в мышечные клетки человека, для определения уровня экспрессии в качестве модели in vitro могут быть использованы мышечные клетки, выращенные в культуре, например, клетки твердой мышечной опухоли рабдомиосаркомы. To detect expression, genetic constructs can be analyzed in vltro for the expression level using tissue cultures of cells of the same type as the cells into which the construct will be introduced. For example, if a genetic vaccine is to be introduced into human muscle cells, muscle cells grown in culture, for example, solid muscle tumor cells of rhabdomyosarcoma, can be used to determine the expression level as an in vitro model.

Применяемые в настоящем изобретении генетические конструкты не вводятся в ретровирусные частицы. Генетические конструкты усвиваются клеткой без участия передаваемой ретровирусной частицей вставки, например такой, которая возникает, когда ретровирусными частицами с введенными в них РНК инфицируют клетку. В применяемом здесь значении термин "без ретровирусных частиц" относится к генетическим конструктам, которые не вводятся в ретровирусные частицы. В применяемом здесь значении выражение "отделенный от инфекционного агента" относится к генетическому материалу, не являющемуся частью вирусного, бактериального или эукариотного вектора (активного, инактивированного, живого или мертвого), способного инфицировать клетку. The genetic constructs used in the present invention are not introduced into retroviral particles. Genetic constructs are absorbed by the cell without the participation of a retroviral particle insert, such as that which occurs when retroviral particles with RNA introduced into them infect the cell. As used herein, the term “non-retroviral particles” refers to genetic constructs that are not inserted into retroviral particles. As used herein, the expression "separated from an infectious agent" refers to genetic material that is not part of a viral, bacterial or eukaryotic vector (active, inactivated, alive or dead) capable of infecting a cell.

В некоторых воплощениях изобретения генетические конструкты представляют собой недостаточно полные способные реплицироваться вирусные геномы, в результате чего при введении в клетку генетический конструкт обладает генетической информацией, недостаточной для обеспечения продукции инфекционных вирусных частиц. В применяемом здесь значении термин "неполный вирусный геном" относится к генетическому конструкту, содержащему недостаточно полный геном, в силу чего при введении такого генетического конструкта в клетку не происходит ввода генетической информации, достаточной для продуцирования инфекционного вируса. In some embodiments of the invention, the genetic constructs are not sufficiently complete replicable viral genomes, as a result of which, when introduced into the cell, the genetic construct has enough genetic information to ensure the production of infectious viral particles. As used herein, the term "incomplete viral genome" refers to a genetic construct containing an insufficiently complete genome, and therefore, when such a genetic construct is introduced into the cell, no genetic information is sufficient to produce an infectious virus.

В некоторых вариантах ослабленная вирусная вакцина может быть поставлена в виде генетического конструкта, содержащего достаточно генетического материала, чтобы позволить продуцирование вирусных частиц. Поставка ослабленной вакцины в виде генетического конструкта представляется более легким путем для продуцирования больших количеств безопасного, чистого активного вакцинирующего продукта. In some embodiments, the attenuated viral vaccine may be delivered as a genetic construct containing enough genetic material to allow the production of viral particles. The delivery of an attenuated vaccine in the form of a genetic construct appears to be an easier way to produce large quantities of a safe, pure active vaccinating product.

Генетический конструкт может быть введен с применением или без применения "микроснарядов". Преимуществом является то, что генетический конструкт настоящего изобретения может быть доставлен в клетки индивидуума без твердых частиц. Имеется в виду, что выражение "без твердых частиц" в применяемом здесь значении относится к жидкости, которая не содержит каких-либо твердых "микроснарядов", применяемых в качестве средства для перфорации, прокалывания или каким-то иным путем протыкания клеточной мембраны с целью создания входного отверстия для поступления в клетку генетического материала. The genetic construct can be introduced with or without the use of "microprojectiles". An advantage is that the genetic construct of the present invention can be delivered to individual cells without particulate matter. It is understood that the expression “without particulate matter” as used herein refers to a fluid that does not contain any solid “microprojectiles” used as a means for perforating, puncturing, or otherwise piercing the cell membrane to create an inlet for the entry of genetic material into the cell.

Настоящее изобретение может быть применено для вакцинации индивидуума против всех патогенов, например вирусов, прокариотных и патогенных эукариотных микроорганизмов, таких как одноклеточные патогенные микроорганизмы и многоклеточные паразиты. Настоящее изобретение особенно пригодно для вакцинации индивидуума против тех патогенов, которые инфицируют клетку и которые не капсулируются, например вирусов и прокариотов, таких как гоноррея, листерез и шигеллез. Кроме того, настоящее изобретение применимо также для вакцинации индивидуума против патогенов из класса простейших, в жизненном цикле которых имеется стадия, когда они являются внутриклеточными патогенами. Имеется в виду, что в применяемом здесь значении термин "внутриклеточный патоген" к вирусу и патогенному микроорганизму, которые по меньшей мере часть своего репродуктивного или жизненного цикла проводят в клетке-хозяине, в которой продуцируют или принуждаются к продуцированию патогенных белков. В Таблице 1 приведен перечень некоторых вирусных семейств и родов, для которых могут быть изготовлены вакцины по настоящему изобретению. В вакцинах могут быть использованы ДНК конструкты, включающие ДНК последовательности, кодирующие пептиды, в состав которых входит по меньшей один эпитоп, идентичный или по существу аналогичный эпитопу, имеющемуся на антигене патогена, например тех антигенов, перечень которых приведен в таблицах. Более того, настоящее изобретение применимо также для вакцинации индивидуума против других патогенов, в том числе прокариотных и эукариотных патогенов из класса простейших, а также многоклеточных паразитов, например тех, перечень которых приведен в Таблице 2. The present invention can be used to vaccinate an individual against all pathogens, for example viruses, prokaryotic and pathogenic eukaryotic microorganisms, such as unicellular pathogenic microorganisms and multicellular parasites. The present invention is particularly suitable for vaccinating an individual against pathogens that infect a cell and that are not encapsulated, such as viruses and prokaryotes, such as gonorrhea, listeriosis and shigellosis. In addition, the present invention is also applicable for vaccinating an individual against pathogens from the class of protozoa, in the life cycle of which there is a stage when they are intracellular pathogens. It is understood that, as used herein, the term "intracellular pathogen" refers to a virus and a pathogenic microorganism that spend at least part of its reproductive or life cycle in a host cell in which pathogenic proteins are produced or forced to produce. Table 1 lists some of the viral families and genera for which the vaccines of the present invention can be made. In DNA vaccines, DNA constructs can be used that include DNA sequences encoding peptides that contain at least one epitope that is identical or substantially similar to the epitope present on a pathogen antigen, for example, those antigens listed in the tables. Moreover, the present invention is also applicable for vaccinating an individual against other pathogens, including prokaryotic and eukaryotic pathogens from the class of protozoa, as well as multicellular parasites, for example those listed in Table 2.

Для создания генетической вакцины, предназначенной для защиты от патогенной инфекции, в генетический конструкт должен быть включен генетический материал, кодирующий иммуногенные белки, против которых может быть создана защитная иммунная реакция. Будет ли инфекция патогеном внутриклеточной, что особенно приемлемо для настоящего изобретения, или внеклеточной, маловероятно, чтобы все антигены патогена создавали защитную реакцию. Поскольку и ДНК, и РНК сравнительно малы и могут быть получены сравнительно легко, настоящее изобретение обладает дополнительным преимуществом, заключающимся в том, что допускает вакцинацию рядом антигенов патогена. Применяемый в генетической вакцине генетический конструкт может включать генетический материал, кодирующий целый ряд патогенов антигена. К примеру, в один конструкт может быть включено несколько вирусных генов с обеспечением тем самым множества мишений. Кроме того, может быть приготовлен целый ряд инокулятов, которые могут быть поставлены в различные клетки, и совместно включающих в некоторых случаях полный или, что более предпочтительно, неполный, например почти полный, набор генов в вакцине. К примеру, полный набор вирусных генов может быть введен применением двух конструктов, каждый из которых содержит разные половины генома, вводимые в разных участках. Таким образом, может быть создана иммунная реакция против каждого антигена без риска вовлечения инфекционного вируса. Это позволяет вводить более одной мишени антигена, а также позволяет исключить требование идентифицировать защитные антигены. To create a genetic vaccine designed to protect against pathogenic infection, genetic material encoding immunogenic proteins against which a protective immune response can be created must be included in the genetic construct. Whether the infection is an intracellular pathogen, which is particularly suitable for the present invention, or extracellular, it is unlikely that all pathogen antigens would produce a protective response. Since both DNA and RNA are relatively small and can be obtained relatively easily, the present invention has the additional advantage that it allows vaccination with a number of pathogen antigens. The genetic construct used in a genetic vaccine may include genetic material encoding a variety of antigen pathogens. For example, several viral genes can be included in a single construct, thereby providing multiple targets. In addition, a number of inoculums can be prepared that can be delivered to various cells, and together including in some cases a complete or, more preferably, incomplete, for example almost complete, set of genes in the vaccine. For example, a complete set of viral genes can be introduced using two constructs, each of which contains different half of the genome, introduced in different areas. Thus, an immune response can be created against each antigen without the risk of infectious virus involvement. This allows you to enter more than one antigen target, and also eliminates the requirement to identify protective antigens.

Простота в обращении и недорогая природа ДНК и РНК позволяют, кроме того, более эффективно отбирать защитные антигены. Гены могут быть отсортированы и подвергнуты системному анализу более легко, чем белки. Отбирают патогенные агенты микроорганизмы, для защиты от которых создается вакцина, и затем идентифицируют иммуногенный белок. Таблицы 1 и 2 включают перечни некоторых патогенных агентов и микроорганизмов, для защиты от инфицирования которыми могут быть созданы генетические вакцины. В некоторых рекомендуемых вариантах способы вакцинации индивидуума от патогена направлены против ВИЧ, HTLV или ВЭБ. The ease of handling and the inexpensive nature of DNA and RNA make it possible, moreover, to select protective antigens more effectively. Genes can be sorted and systematically analyzed more easily than proteins. Microorganisms are selected as pathogenic agents to protect against which a vaccine is created, and then an immunogenic protein is identified. Tables 1 and 2 include lists of some pathogenic agents and microorganisms for which genetic vaccines can be created to protect against infection. In some recommended embodiments, methods for vaccinating an individual against a pathogen are directed against HIV, HTLV, or EBV.

Другим аспектом настоящего изобретения являются способ придания на широкой основе защитной иммунной реакции против гиперпролиферирующих клеток, характерных для гиперпролиферирующих заболеваний, и способ лечения страдающего гиперпролиферативным заболеванием индивидуума. Подразумевается, что в применяемом здесь значении термин "гиперпролиферативное заболевание" относится к тем заболеваниям и нарушениям, которые характеризуются гиперпролиферацией клеток. Примеры гиперпролиферативных заболеваний включают рак всех видов и псориаз. Another aspect of the present invention is a method for imparting a broad-based protective immune response against hyperproliferative cells characteristic of hyperproliferative diseases, and a method for treating an individual suffering from a hyperproliferative disease. It is understood that, as used herein, the term "hyperproliferative disease" refers to those diseases and disorders that are characterized by hyperproliferation of cells. Examples of hyperproliferative diseases include all types of cancer and psoriasis.

Обнаружено, что введение генетического конструкта, включающего нуклеотидную последовательность, кодирующую иммуногенный, ассоциированный с "гиперпролиферирующей клеткой" белок, в клетку индивидуума приводит к продуцированию указанных белков в вакцинированных клетках индивидуума. Имеется в виду, что в применяемом здесь значении термин "гиперпролиферативно ассоциируемый белок" относится к белкам, ассоциируемым с гиперпролиферативным заболеванием. Для вакцинации от гиперпролиферативных заболеваний индивидууму вводят генетический конструкт, включающий нуклеотидную последовательность, кодирующую ассоциируемый с гиперпролиферирующим заболеванием белок. It has been found that the introduction of a genetic construct comprising a nucleotide sequence encoding an immunogenic protein associated with a “hyperproliferating cell” into an individual cell leads to the production of these proteins in the vaccinated cells of the individual. It is understood that, as used herein, the term “hyperproliferatively associated protein” refers to proteins associated with a hyperproliferative disease. For vaccination against hyperproliferative diseases, a genetic construct is introduced to an individual, including a nucleotide sequence encoding a protein associated with a hyperproliferative disease.

Для того чтобы гиперпролиферативно ассоциируемый белок был эффективной иммуногенной мишенью, это должен быть белок, продуцируемый исключительно или на более высоком, чем в нормальных клетках, уровне в гиперпролиферативных клетках. Целевые антигены включают те белки, их фрагменты и пептиды, которые содержат по меньшей мере один эпитоп, обнаруживаемый в указанных белках. В отдельных случаях гиперпролиферативно ассоциируемый белок является продуктом мутации кодирующего белок гена. Мутировавший ген кодирует белок, почти идентичный нормальному белку за исключением некоторых отличий в аминокислотной последовательности, что приводит к отличному, не обнаруживаемому в нормальном белке эпитопу. Подобные целевые белки включают те белки, которые кодируются онкогенами, например: myb, myc, fyn, а также транслокационным геном bcr/ab1, ras, src, Р53, neu, trk и ECRF. Помимо онкогенных продуктов в качестве целевых антигенов целевые белки для противоракового лечения и защитных режимов включают переменные области антител, создаваемых лимфомами В-клеток, и переменные области рецепторов Т-клеток из Т-клеточных лимфом, а в некоторых вариантах применяют также целевые антигены для аутоиммунных заболеваний. В качестве целевых белков могут быть использованы и другие ассоциируемые с опухолью белки, например белки, обнаруживаемые на самом высоком уровне в клетках опухоли, в том числе белки, распознаваемые моноклональным антителом 17-1А, и связывающие фолат белки. In order for a hyperproliferatively associated protein to be an effective immunogenic target, it must be a protein produced exclusively or at a higher level than in normal cells in hyperproliferative cells. Target antigens include those proteins, fragments thereof, and peptides that contain at least one epitope found in said proteins. In some cases, a hyperproliferatively associated protein is a product of a mutation of a protein-coding gene. A mutated gene encodes a protein that is almost identical to a normal protein, with the exception of some differences in the amino acid sequence, which leads to an excellent epitope not found in a normal protein. Such target proteins include those encoded by oncogenes, for example: myb, myc, fyn, as well as the translational gene bcr / ab1, ras, src, P53, neu, trk and ECRF. In addition to oncogenic products, target proteins for anticancer treatment and protective regimes include variable regions of antibodies produced by B-cell lymphomas and variable regions of T-cell receptors from T-cell lymphomas, and in some embodiments, targeted antigens for autoimmune diseases are also used . Other proteins associated with the tumor can be used as target proteins, for example, proteins found at the highest level in tumor cells, including proteins recognized by monoclonal antibody 17-1A and folate binding proteins.

Хотя настоящее изобретение может быть использовано для вакцинации индивидуума от одной или нескольких форм рака, тем не менее настоящее изобретение особенно пригодно для профилактической вакцинации индивидуума, предрасположенного к развитию определенного вида рака или болевшего раком, вследствие чего склонного к рецидиву. Достижения генетики и технологии, а также эпидемиологии позволяют определять вероятность и риск развития рака у индивидуума. Применением генетического отбора и/или историй болезни семьи можно предсказать вероятность развития у конкретного индивидуума одного из нескольких типов рака. Although the present invention can be used to vaccinate an individual against one or more forms of cancer, nevertheless, the present invention is particularly suitable for the prophylactic vaccination of an individual predisposed to the development of a particular type of cancer or having cancer, thereby being prone to relapse. Advances in genetics and technology, as well as epidemiology, help determine the likelihood and risk of developing cancer in an individual. By using genetic selection and / or family histories, one can predict the likelihood of a particular individual developing one of several types of cancer.

Аналогично, те индивидуумы, которые уже перенесли рак и которые подвергались лечению с удалением опухоли или по каким-то иным причинам находящиеся в состоянии ремиссии, особенно склонны к рецидиву и повторным проявлениям рака. В виде части лечебного процесса такие индивидуумы могут быть вакцинированы от рака, который был у них диагностирован, с целью борьбы с повторными его проявлениями. Таким образом, после того как стало известно, что индивидуум был болен раком какого-то типа и имеется риск рецидива, этот индивидуум может быть вакцинирован с целью подготовки его иммунной системы для борьбы с любыми будущими проявлениями рака. Similarly, those individuals who have already had cancer and who have been treated with the removal of the tumor, or for some other reason in remission, are especially prone to relapse and re-manifestations of the cancer. As part of the treatment process, such individuals can be vaccinated against the cancer that was diagnosed with them, in order to combat its repeated manifestations. Thus, after it has become known that an individual has a cancer of some type and there is a risk of relapse, this individual can be vaccinated in order to prepare his immune system to fight any future manifestations of cancer.

Настоящим изобретением дается способ лечения индивидуума, страдающего гиперпролиферативным заболеванием. В таких способах введение генетических конструктов служит иммунотерапевтическим, направляющим и промотирующим иммунную систему целям с целью борьбы с продуцирующими гиперпролиферативными клетками. The present invention provides a method of treating an individual suffering from a hyperproliferative disease. In such methods, the introduction of genetic constructs serves immunotherapeutic, directing and immune system promoting purposes in order to combat producing hyperproliferative cells.

Настоящим изобретением дается способ лечения индивидуумов, страдающих аутоиммунными заболеваниями и нарушениями приданием на широкой основе иммунной реакции против целей, ассоциируемых с аутоиммунитетом, в том числе клеточных рецепторов и клеток, продуцирующих "само"-направленные антитела. The present invention provides a method of treating individuals suffering from autoimmune diseases and disorders by imparting a broad-based immune response against targets associated with autoimmunity, including cell receptors and self-directed antibodies producing cells.

Передаваемые через Т-клетки аутоиммунные заболевания включают: ревматоидный артрит (РА), множественный склероз (МС), синдром Сьегрена, саркоидоз, инсулинозависимый сахарный диабет (ИЗСД), аутоиммунный тиреоидит, реактивный артрит, анкилозирующий спондилоартрит, склеродермия, полимиозит, дерматомиозит, болезнь Крона и язвенный колит. Каждое из указанных заболеваний характеризуется участием Т-клеточных рецепторов, связывающихся с эндогенными антигенами и инициирующих воспалительный каскад, ассоциируемый с аутоиммунными заболеваниями. Вакцинация от переменной области Т-клеток способна вызвать иммунную реакцию, в том числе ЦТЛ с удалением этих Т-клеток. Autoimmune diseases transmitted through T cells include: rheumatoid arthritis (RA), multiple sclerosis (MS), Sjögren's syndrome, sarcoidosis, insulin-dependent diabetes mellitus (IDDM), autoimmune thyroiditis, reactive arthritis, ankylosing spondylitis, polio dermatitis, scleroderma, dermatitis and ulcerative colitis. Each of these diseases is characterized by the participation of T-cell receptors that bind to endogenous antigens and initiate the inflammatory cascade associated with autoimmune diseases. Vaccination against a variable region of T cells can cause an immune response, including CTL, to remove these T cells.

В случае РА охарактеризовано несколько специфичных переменных областей Т-клеточных рецепторов (ТКР), участвующих в заболевании. Подобные ТКР включают: Vβ-3,Vβ-14,Vβ-17 и Vα-17. Таким образом, вакцинация ДНК конструктом, кодирующим по меньшей мере один из указанных белков, вызовет иммунную реакцию, направленную на участвующие в RA Т-клетки. См.: Howell M.D. и др. , 1991, Proc. Natl. Acad. Sci. США 88, 10821-10925; Palliard X. и др., 1991, Science 253, 325-329; Williams W.V. и др., 1992, J.CIin.Invest. 90, 326-333; каждая из этих работ вводится здесь в качестве ссылки.In the case of RA, several specific variable regions of T-cell receptors (TCRs) involved in the disease have been characterized. Similar TCRs include: V β -3, V β -14, V β -17 and V α -17. Thus, vaccination of DNA with a construct encoding at least one of these proteins will elicit an immune response directed at the T cells involved in RA. See: Howell MD et al., 1991, Proc. Natl. Acad Sci. US 88, 10,821-10925; Palliard X. et al., 1991, Science 253, 325-329; Williams WV et al., 1992, J.Cin.Invest. 90, 326-333; each of these works is introduced here as a reference.

В случае МС охарактеризовано несколько специфичных переменных областей ТКР, участвующих в заболевании. Такие ТКР включают: Vβ-7 и Vα-10. Таким образом, вакцинация ДНК конструктом, кодирующим по меньшей мере один из указанных белков, создает иммунную реакцию, направленную на участвующие в МС Т-клетки. См.: Wucherphennig K.W. и др., 1990, Science 248, 1016-1019; Oksenberg J.R. и др., 1990, Nature 345, 344-346; каждая из этих работ вводится в качестве ссылки.In the case of MS, several specific variable regions of TCR involved in the disease have been characterized. Such TCRs include: V β -7 and V α -10. Thus, DNA vaccination with a construct encoding at least one of these proteins creates an immune response directed at T cells participating in MS. See: Wucherphennig KW et al., 1990, Science 248, 1016-1019; Oksenberg JR et al., 1990, Nature 345, 344-346; each of these works is introduced as a reference.

В случае склеродермии охарактеризовано несколько специфичных переменных областей ТКР, участвующих в заболевании. Эти ТКР включают:

Figure 00000002

Таким образом, вакцинации ДНК конструктом, кодирующим по меньшей мере один из указанных белков, создаст иммунную реакцию, направленную на участвующие в склеродермии Т-клетки.In the case of scleroderma, several specific variable regions of TCR involved in the disease have been characterized. These TCRs include:
Figure 00000002

Thus, vaccination of DNA with a construct encoding at least one of these proteins will create an immune response directed at T cells involved in scleroderma.

При лечении больных, страдающих передаваемым через Т-клетки аутоиммунным заболеванием, в частности больных, для которых переменные области ТКР еще не охарактеризованы, может быть проведена синовиальная биопсия. Могут быть отобраны образцы присутствующих Т-клеток, в которых с помощью стандартных методик идентифицируют переменные области этих ТКР. На основе полученной информации могут быть приготовлены генетические вакцины. In the treatment of patients suffering from an autoimmune disease transmitted through T cells, in particular patients for whom variable regions of TCR have not yet been characterized, a synovial biopsy can be performed. Samples of T cells present can be taken in which, using standard techniques, the variable regions of these TCRs are identified. Based on the information received, genetic vaccines can be prepared.

Передаваемые через В-клетки аутоиммунные заболевания включают: волчанку (СКВ), тяжкую миастению, аутоиммунную гемолитическую анемию, аутоиммунную тромбоцитопению, астму, криоглобулинемию, первичный билиарный склероз и пернициозную анемию. Каждое из указанных заболеваний характеризуется антителами, связывающимися с эндогенными антигенами и инициирующими воспалительный каскад, ассоциируемый с аутоиммунными заболеваниями. Вакцинация от переменных областей антител способна вызвать иммунную реакцию, в том числе ЦТЛ с удалением продуцирующих антитело В-клеток. Autoimmune diseases transmitted through B cells include lupus (SLE), severe myasthenia gravis, autoimmune hemolytic anemia, autoimmune thrombocytopenia, asthma, cryoglobulinemia, primary biliary sclerosis, and pernicious anemia. Each of these diseases is characterized by antibodies that bind to endogenous antigens and initiate an inflammatory cascade associated with autoimmune diseases. Vaccination against variable regions of antibodies can induce an immune response, including CTL, with the removal of antibody-producing B cells.

Для лечения больного, страдающего передаваемым через В-клетки аутоиммунным заболеванием, необходимо идентифицировать переменную область антител, проявляющих аутоиммунную активность. Может быть проведена биопсия с отбором образцов антител, присутствующих в месте воспаления. Переменная область этих антител может быть идентифицирована с помощью стандартных методик. На основании полученной информации могут быть приготовлены генетические вакцины. To treat a patient suffering from B-cell transmitted autoimmune disease, it is necessary to identify a variable region of antibodies exhibiting autoimmune activity. A biopsy can be performed with sampling of antibodies present at the site of inflammation. The variable region of these antibodies can be identified using standard techniques. Based on the information received, genetic vaccines can be prepared.

В случае СКВ один из антигенов, как полагают, представлен ДНК. Таким образом, у больных, подлежащих вакцинации от СКВ, их сыворотка может быть проанализирована на анти-ДНК антитела и может быть приготовлена вакцина, включающая ДНК конструкты, кодирующие переменную область таких, обнаруженных в сыворотке анти-ДНК антител. In the case of SLE, one of the antigens is believed to be DNA. Thus, in patients subject to vaccination against SLE, their serum can be analyzed for anti-DNA antibodies and a vaccine can be prepared that includes DNA constructs encoding a variable region of those found in the serum of anti-DNA antibodies.

Общие структурные признаки для переменных областей как ТКР, так и антител хорошо известны. ДНК последовательность, кодирующая конкретные ТКР и антитело, как правило, может быть выявлена с помощью хорошо известных методов, описанных, например, в издании: Kabat и др., 1987, "Последовательности представляющих иммунологический интерес белков", США, Департамент здоровья и службы человека, Бетесда, МД, которое вводится здесь в качестве ссылки. Кроме того, общий способ клонирования функциональных переменных областей из антител можно найти в работе: Chaudhery V.К. и др., 1990, Proc. Natl.Acad. Sci. США 87, 1066, которая вводится здесь в качестве ссылки. Common structural features for variable regions of both TCR and antibodies are well known. A DNA sequence encoding specific TKRs and an antibody can typically be detected using well-known methods described, for example, in Kabat et al., 1987, "Sequences of Immunological Interest of Proteins", USA, Department of Human Health and Human Services , Bethesda, MD, which is incorporated herein by reference. In addition, a general method for cloning functional variable regions from antibodies can be found in: Chaudhery V.K. et al., 1990, Proc. Natl.Acad. Sci. US 87, 1066, which is incorporated herein by reference.

В некоторых воплощениях изобретения, относящихся к генной терапии, генные конструкты содержат либо компенсирующие гены, либо гены, кодирующие лечебные белки. Примеры компенсирующих генов включают ген, кодирующий дистрофин или его функциональный фрагмент, ген, предназначенный компенсировать дефектный ген у больных, страдающих муковисцидозом, инсулин, ген, предназначенный компенсировать дефектный ген у больных, страдающих ADA, и ген, кодирующий фактор VIII. Примеры генов, кодирующих лечебные белки, включают гены, кодирующие эритропоиэтин, интерферон, LDL рецептор, GM-CSF, ИЛ-2, ИЛ-4 и ФНО. Кроме того, могут быть введены генетические конструкты, кодирующие одноцепочечные компоненты антитела, специфично связывающиеся с токсичными веществами. In some embodiments of the invention related to gene therapy, gene constructs contain either compensating genes or genes encoding therapeutic proteins. Examples of compensating genes include a gene encoding dystrophin or a functional fragment thereof, a gene intended to compensate for a defective gene in patients with cystic fibrosis, insulin, a gene for compensating for a defective gene in patients suffering from ADA, and a gene encoding factor VIII. Examples of genes encoding therapeutic proteins include genes encoding erythropoietin, interferon, LDL receptor, GM-CSF, IL-2, IL-4 and TNF. In addition, genetic constructs encoding single chain antibody components that specifically bind to toxic substances can be introduced.

В некоторых рекомендуемых вариантах ген дистрофина дается в виде минигена, который применяют для лечения индивидуумов, страдающих мышечной дистрофией. В отдельных рекомендуемых вариантах дается миниген, содержащий последовательность, кодирующую часть белка дистрофина. Нарушения в гене дистрофина ведут как к более мягкой мышечной дистрофии Бекера
(МДБ), так и к более тяжкой мышечной дистрофии Дученне (МДД) В случае МДБ дистрофин образуется, но имеет отклонения от нормы по размеру и/или по количеству. Больной находится в состоянии от слабого до умеренно слабого. При МДД белок не образуется, и больной прикован к креслу в возрасте 13 лет и обычно умирает в возрасте 20. У некоторых больных, в частности больных МДБ, частичный белок дистрофин, полученный экспрессией минигена, поставляемого способом изобретения, может привести к улучшению мышечной функции.
In some recommended embodiments, the dystrophin gene is given as a minigene, which is used to treat individuals suffering from muscular dystrophy. In certain recommended embodiments, a minigen is provided containing a sequence encoding a portion of a dystrophin protein. Disturbances in the dystrophin gene lead to Becker softer muscular dystrophy
(MDB), and to more severe muscular dystrophy Duchenne (DMD) In the case of MDB, dystrophin is formed, but has deviations from the norm in size and / or in quantity. The patient is in a state of mild to moderate. With DMD, protein is not formed, and the patient is confined to a chair at the age of 13 and usually dies at the age of 20. In some patients, in particular MDB patients, a partial dystrophin protein obtained by expression of the minigen provided by the method of the invention can lead to an improvement in muscle function.

В некоторых рекомендуемых вариантах гены, кодирующие ИЛ-2, ИЛ-4, интерферон или ФНО, поставляются в клетки опухоли, которые либо присутствуют, либо удалены и затем возвращены в организм индивидуума. В отдельных вариантах индивидууму, страдающему множественным склерозом, вводят ген, кодирующий гамма-интерферон. In some recommended embodiments, genes encoding IL-2, IL-4, interferon, or TNF are delivered to tumor cells that are either present or removed and then returned to the individual. In certain embodiments, a gene coding for gamma interferon is administered to an individual suffering from multiple sclerosis.

Антисмысловые молекулы и рибозимы также могут быть поставлены в клетки индивидуума путем введения генетического материала, действующего в качестве матрицы для копий таких активных агентов. Такие агенты дезактивируют или каким-то иным путем влияют на экспрессию генов, кодирующих белки, присутствие которых нежелательно. Конструкты, содержащие последовательности, кодирующие антисмысловые молекулы, могут применяться для подавления или предотвращения продуцирования белков в клетке. Так, продуцирование таких белков, как онкогеновые продукты, может быть исключено или снижено. Аналогично, рибозимы способны прервать генную экспрессию селективным разрушением матричной РНК до ее трансляции в белок. В некоторых вариантах клетки обрабатывают способом изобретения с применением конструктов, кодирующих антисмысловые молекулы или рибозимы в виде части лечебного процесса, включающего введение других лекарственных средств и другие процедуры. В генных конструктах, кодирующих антисмысловые молекулы и рибозимы, применяют вектора, аналогичные тем, которые применяют, когда желательно продуцирование белка, за исключением того, что кодирующая последовательность не имеет инициирующего кодона, инициирующего трансляцию РНК в белок. В некоторых вариантах рекомендуется, чтобы вектора, описанные, в частности, в Примере 46, содержали ориджин репликации и экспрессируемую форму соответствующего ядерного антигена. Antisense molecules and ribozymes can also be delivered to individual cells by introducing genetic material that acts as a template for copies of such active agents. Such agents deactivate or otherwise affect the expression of genes encoding proteins whose presence is undesirable. Constructs containing sequences encoding antisense molecules can be used to inhibit or prevent the production of proteins in a cell. Thus, the production of proteins such as oncogen products can be eliminated or reduced. Similarly, ribozymes can interrupt gene expression by selective destruction of messenger RNA before it is translated into protein. In some embodiments, cells are treated by the method of the invention using constructs encoding antisense molecules or ribozymes as part of a treatment process, including administration of other drugs and other procedures. In gene constructs encoding antisense molecules and ribozymes, vectors similar to those used when protein production is desired are used, except that the coding sequence does not have an initiation codon that initiates RNA translation into protein. In some embodiments, it is recommended that the vectors described, in particular in Example 46, contain the origin of replication and the expressed form of the corresponding nuclear antigen.

Рибозимы являются каталитическими РНК, способными саморасщепляться или расщеплять молекулы других РНК. Специалистам известны рибозимы нескольких различных типов, например типа молота, шпильки, интрон группы I Tetrahymena, топора и РНКазы Р (S. Edgington, Biotechnology, 1992, 10, 256-262). Рибозимы типа молота обладают каталитическим участком, который был картирован до ядра в менее чем 40 нуклеотидов. Некоторые рибозимы в растительных вироидах и сателитных РНК делят общую вторичную структуру и определенные консервативные нуклеотиды. Хотя указанные рибозимы в природе выступают в роли собственного субстрата, домен субстрата может быть направлен на другой РНК субстрат путем спаривания оснований в последовательностях, фланкирующих консервированный участок расщепления. Такая способность рибозимов обычного строения позволяет применять их для последовательность-специфичного расщепления РНК (G. Peolella и др., ЕМВО 1992, 1913-1919). Таким образом, в компетенции специалиста применение различных каталитических последовательностей из рибозимов разных типов, например каталитической последовательности типа молота, и конструирование их вышеприведенным путем. Могут быть созданы рибозимы, направленные на разнообразные цели, в том числе патогенные нуклеотидные последовательности и онкогенные последовательности. Определенные рекомендуемые варианты изобретения включают достаточную комплементарность к специфично нацеленному abl-bcr слитому транскрипту при сохранении эффективности реакции расщепления. Ribozymes are catalytic RNAs capable of self-cleaving or cleaving molecules of other RNAs. Ribozymes of several different types are known to those skilled in the art, for example, the hammer type, hairpin, group I intron Tetrahymena, ax and RNase P (S. Edgington, Biotechnology, 1992, 10, 256-262). Hammer-type ribozymes possess a catalytic site that was mapped to the nucleus in less than 40 nucleotides. Some ribozymes in plant viroids and satellite RNAs share a common secondary structure and certain conserved nucleotides. Although these ribozymes in nature act as their own substrate, the substrate domain can be directed to another RNA substrate by base pairing in sequences flanking the preserved cleavage site. This ability of ribozymes of the usual structure allows their use for sequence-specific cleavage of RNA (G. Peolella et al., EMBO 1992, 1913-1919). Thus, it is within the competence of a specialist to use various catalytic sequences from different types of ribozymes, for example, a catalytic sequence such as a hammer, and construct them in the above manner. Ribozymes can be created that target a variety of purposes, including pathogenic nucleotide sequences and oncogenic sequences. Certain recommended embodiments of the invention include sufficient complementarity to the specifically targeted abl-bcr fusion transcript while maintaining the efficiency of the cleavage reaction.

В соответствии с некоторыми воплощениями настоящего изобретения клетки обрабатывают соединениями, облегчающими поглощение клеткой генетического конструкта. Согласно определенным воплощениям изобретения клетки обрабатывают соединениями, облегчающими клеточное деление и способствующими поглощению генетического конструкта. Введение соединений, облегчающих поглощение клеткой генетического конструкта, в том числе стимулирующих клетку соединений, приводит к более эффективной иммунной реакции против кодируемого генетическим конструктом целевого белка. In accordance with some embodiments of the present invention, the cells are treated with compounds that facilitate the absorption of the genetic construct by the cell. According to certain embodiments of the invention, the cells are treated with compounds that facilitate cell division and promote uptake of the genetic construct. The introduction of compounds that facilitate the uptake of the genetic construct by the cell, including those stimulating the cell, leads to a more effective immune response against the target protein encoded by the genetic construct.

Согласно некоторым воплощениям настоящего изобретения генетический конструкт вводят в организм индивидуума с помощью безыгольного устройства для инъекций. В соответствии с некоторыми воплощениями настоящего изобретения генетический конструкт вводят одновременно в организм индивидуума внутрикожно, подкожно и внутримышечно с помощью безыгольного устройства для инъекций. Безыгольные устройства для инъекций хорошо известны и широко доступны. Обычный специалист, руководствуясь данным описанием, для поставки генетического материала в клетки индивидуума применяет безыгольное устройство для инъекций. Безыгольные устройства для инъекций хорошо подходят для поставки генетического материала во все ткани. Устройства особенно пригодны для поставки генетического материала в клетки кожи и мышц. В некоторых вариантах безыгольное устройство для инъекций может быть использовано для продвижения содержащей молекулы ДНК жидкости к поверхности кожи индивидуума. Жидкость продвигается с достаточной скоростью так, что при соударении с кожей жидкость проникает через поверхность кожи и проходит в нижерасположенные ткани кожи и мышц. Таким образом, генетический материал вводится одновременно чрескожно, подкожно и внутримышечно. В некоторых вариантах безыгольное устройство для инъекций может быть использовано для поставки генетического материала в ткани другого органа с целью введения молекулы нуклеиновой кислоты в клетки этого органа. According to some embodiments of the present invention, the genetic construct is introduced into the body of an individual using a needleless injection device. In accordance with some embodiments of the present invention, the genetic construct is introduced simultaneously into the body of an individual intradermally, subcutaneously and intramuscularly using a needleless injection device. Needleless injection devices are well known and widely available. An ordinary specialist, guided by this description, uses a needleless device for injection to supply genetic material to the cells of an individual. Needle-free injection devices are well-suited for delivering genetic material to all tissues. The devices are particularly suitable for delivering genetic material to skin and muscle cells. In some embodiments, a needleless injection device may be used to advance a liquid containing a DNA molecule to the surface of an individual's skin. The liquid advances at a sufficient speed so that when it hits the skin, the liquid penetrates the surface of the skin and passes into the underlying tissues of the skin and muscles. Thus, genetic material is introduced simultaneously percutaneously, subcutaneously and intramuscularly. In some embodiments, a needleless injection device may be used to deliver genetic material to the tissues of another organ in order to introduce a nucleic acid molecule into the cells of that organ.

Согласно изобретению генетическая вакцина может быть введена непосредственно в организм подлежащего вакцинации индивидуума или может быть введена ex vivo в удаленные клетки индивидуума с последующей их реимплантацией после введения. При любом пути введения генетический материал вводится в клетки, присутствующие в организме индивидуума. Пути введения включают (но без ограничения только ими): внутримышечный, внутрибрюшинный, внутрикожный, подкожный, внутривенный, внутриартериальный, внутриглазной и пероральный, а также чрезкожный, в виде ингаляции или супозитория. Рекомендуемые пути введения включают внутримышечные, внутрибрюшинные, внутрикожные и подкожные инъекции. Поставка кодирующих целевые белки генных конструктов может придать защитные свойства слизистым оболочкам индивидуума, если введение осуществляют путем, в котором материал присутствует в тканях, ассоциируемых с защитными свойствами слизистых оболочек. Так, в некоторых примерах генный конструкт поставляется путем введения в щечный карман, находящийся во рту индивидуума. According to the invention, the genetic vaccine can be introduced directly into the body of the individual to be vaccinated, or it can be introduced ex vivo into the remote cells of the individual, followed by reimplantation after administration. With any route of administration, genetic material is introduced into cells present in the individual’s body. Routes of administration include, but are not limited to: intramuscular, intraperitoneal, intradermal, subcutaneous, intravenous, intraarterial, intraocular and oral, as well as percutaneous, as an inhalation or suppository. Recommended routes of administration include intramuscular, intraperitoneal, intradermal, and subcutaneous injections. The supply of gene constructs encoding target proteins can confer protective properties to the mucous membranes of an individual if the administration is carried out in a manner in which the material is present in the tissues associated with the protective properties of the mucous membranes. So, in some examples, the gene construct is supplied by insertion into the buccal pocket located in the mouth of the individual.

Генетические конструкты могут быть введены применением (но не только их) традиционных шприцев, безыгольных устройств для инъецирования или "генных пистолетов для микробомбардировки". Или же генетическая вакцина может быть введена разнообразными способами в клетки, удаленные из организма индивидуума. Такие способы включают, например, ex vivo трансфекцию, электропорацию, микроинъецирование и микробомбардировку. После поглощения клетками генного конструкта их вновь имплантируют в организм индивидуума. Считается, что обычно неиммуногенные клетки после введения в них генных конструктов могут быть имплантированы в организм индивидуума, даже если вакцинированные клетки изначально были отобраны у другого индивидуума. Genetic constructs can be introduced using (but not limited to) traditional syringes, needleless injection devices, or "microbombing gene guns." Or, a genetic vaccine can be introduced in a variety of ways into cells removed from the body of an individual. Such methods include, for example, ex vivo transfection, electroporation, microinjection and microbombing. After the cells are absorbed by the gene construct, they are again implanted into the body of the individual. It is believed that usually non-immunogenic cells, after the introduction of gene constructs into them, can be implanted into the individual’s body, even if the vaccinated cells were initially taken from another individual.

Генетические вакцины изобретения содержат ДНК в интервале от 1 нг до 1000 мкг. В некоторых рекомендуемых вариантах вакцина содержит ДНК в пределах от 10 нг до 800 мкг. В отдельных рекомендуемых вариантах вакцина содержит 0.1-500 мкг ДНК. В других рекомендуемых вариантах вакцины содержат 1-350 мгк ДНК. И в еще одних рекомендуемых вариантах вакцины содержат 25-250 мкг ДНК. В других рекомендуемых вариантах вакцины содержат около 100 мкг ДНК. Genetic vaccines of the invention contain DNA in the range from 1 ng to 1000 μg. In some recommended embodiments, the vaccine contains DNA ranging from 10 ng to 800 mcg. In certain recommended embodiments, the vaccine contains 0.1-500 μg of DNA. In other recommended embodiments, the vaccines contain 1-350 μg of DNA. And in yet another recommended embodiment, vaccines contain 25-250 μg of DNA. In other recommended embodiments, the vaccines contain about 100 μg of DNA.

Генетические вакцины настоящего изобретения готовят в зависимости от намеченного к применению пути введения. Обычный специалист без труда приготовит генетическую вакцину, содержащую генетический конструкт. В случае, если в качестве пути введения выбраны внутримышечные инъекции, рекомендуют применять изотонические препараты. Применяемые для придания изотоничности добавки, как правило, включают: хлорид натрия, декстрозу, маннит, сорбит и лактозу. В некоторых случаях рекомендуются такие изотонические растворы, как фосфатные буферные солевые растворы. В некоторых вариантах к препарату добавляют суживающее сосуды средство. Стабилизаторы включают желатин и альбумин. Фармацевтические препараты настоящего изобретения даются стерильными и не содержащими пирогенов. Genetic vaccines of the present invention are prepared depending on the intended route of administration. An ordinary specialist can easily prepare a genetic vaccine containing a genetic construct. If intramuscular injections are chosen as the route of administration, isotonic preparations are recommended. Used to impart isotonicity additives, as a rule, include: sodium chloride, dextrose, mannitol, sorbitol and lactose. In some cases, isotonic solutions such as phosphate buffered saline are recommended. In some embodiments, a vasoconstrictor agent is added to the preparation. Stabilizers include gelatin and albumin. The pharmaceutical preparations of the present invention are sterile and pyrogen free.

Генетические конструкты изобретения готовят в виде препарата или вводят в сочетании с усилителем функции полинуклеотида. Рекомендуемые соагенты настоящего изобретения выбирают из группы, включающей: эфиры, анилиды, амидины, уретаны бензойной кислоты и их гидрохлориды, принадлежащие, например, к семейству местных анестетиков. Genetic constructs of the invention are prepared in the form of a preparation or administered in combination with a polynucleotide function enhancer. Recommended coagents of the present invention are selected from the group consisting of: esters, anilides, amidines, urethanes of benzoic acid and their hydrochlorides, which belong, for example, to the family of local anesthetics.

УФП может быть соединением, представленным одной из следующих формул:
Ar-R1-O-R2-R3,
или
Ar-N-R1-R2-R3,
или
R4-N-R5-R6,
или
R4-O-R1-N-R7,
где Ar представляет бензол, п-аминобензол, м-аминобензол, о- аминобензол, замещенный бензол, замещенный п-аминобензол, замещенный м-аминобензол, замещенный о-аминобензол, где аминогруппа в аминобензольных производных может быть представлена амино-, С15-алкиламино-, ди(С1-C5-алкил) аминогруппой, и заместители в замещенных производных представлены галогеном, С1-C5-алкилом и C1-C5-алкоксигруппой;
R1 представляет C=O;
R2 представляет C1-C10-алкил, в том числе разветвленные алкилы;
R3 представляет водород, амин, C1-C5-алкиламин, ди(C1-C5-алкил) амин,
R2 + R3 могут образовывать циклический алкил, C1-C5- алкилзамещенный циклический алкил, циклический алифатический амин, C1-C10-алкилзамещенный циклический алифатический амин, гетероцикл, C1-C10-алкилзамещенный гетероцикл, в том числе C1-C10)-алкил-N-замещенный гетероцикл;
R4 представляет Ar, R2 или C1-C5-алкоксигруппу, циклический алкил, C1-C10-алкилзамещенный циклический алкил, циклический алифатический амин, C1-C10-алкилзамещенный циклический алифатический амин, гетероцикл, C5-C10-алкилзамещенный гетероцикл и C1-C10-алкоксизамещенный гетероцикл, в том числе C1-C10-алкил-N-замещенный гетероцикл;
R5 представляет C=NH;
R6 представляет Ar, R2 или C1-C10-алкоксигруппу, циклический алкил, C1-C10-алкилзамещенный циклический алкил, циклический алифатический амин, C1-C10-алкилзамещенный циклический алифатический амин, гетероцикл, C1-C10-алкилзамещенный гетероцикл и C1-C10-алкоксизамещенный гетероцикл, в том числе C1-C10-aлкил-N-зaмeщeнный гетероцикл и
R7 представляет Ar, R2 или C1-C5-алкоксигруппу, циклический алкил, C1-C10-алкилзамещенный циклический алкил, циклический алифатический амин, C1-C10-алкилзамещенный циклический алифатический амин, гетероцикл, C1-C10-алкилзамещенный гетероцикл и C1-C10-алкоксизамещенный гетероцикл, в том числе C1-C10-алкил-N-замещенный гетероцикл.
UVP may be a compound represented by one of the following formulas:
Ar-R 1 -OR 2 -R 3 ,
or
Ar-NR 1 -R 2 -R 3 ,
or
R 4 -NR 5 -R 6 ,
or
R 4 -OR 1 -NR 7 ,
where Ar represents benzene, p-aminobenzene, m-aminobenzene, o-aminobenzene, substituted benzene, substituted p-aminobenzene, substituted m-aminobenzene, substituted o-aminobenzene, where the amino group in the aminobenzene derivatives may be represented by amino, C 1 -C 5- alkylamino, di (C 1 -C 5 -alkyl) amino, and substituents in the substituted derivatives are represented by halogen, C 1 -C 5 -alkyl and C 1 -C 5 -alkoxy;
R 1 represents C = O;
R 2 is C 1 -C 10 alkyl, including branched alkyls;
R 3 represents hydrogen, amine, C 1 -C 5 -alkylamine, di (C 1 -C 5 -alkyl) amine,
R 2 + R 3 can form cyclic alkyl, C 1 -C 5 - alkyl substituted cyclic alkyl, cyclic aliphatic amine, C 1 -C 10 -alkyl substituted cyclic aliphatic amine, heterocycle, C 1 -C 10 -alkyl-substituted heterocycle, including C 1 -C 10 ) -alkyl-N-substituted heterocycle;
R 4 represents Ar, R 2 or a C 1 -C 5 alkoxy group, cyclic alkyl, C 1 -C 10 -alkyl-substituted cyclic alkyl, cyclic aliphatic amine, C 1 -C 10 -alkyl-substituted cyclic aliphatic amine, heterocycle, C 5 -C A 10- alkyl substituted heterocycle and a C 1 -C 10 alkoxy substituted heterocycle, including a C 1 -C 10 alkyl-N-substituted heterocycle;
R 5 represents C = NH;
R 6 is Ar, R 2 or a C 1 -C 10 alkoxy group, cyclic alkyl, C 1 -C 10 alkyl substituted cyclic alkyl, cyclic aliphatic amine, C 1 -C 10 alkyl substituted cyclic aliphatic amine, heterocycle, C 1 -C A 10- alkyl substituted heterocycle and a C 1 -C 10 alkoxy-substituted heterocycle, including a C 1 -C 10 -alkyl-N-substituted heterocycle and
R 7 represents Ar, R 2 or a C 1 -C 5 alkoxy group, cyclic alkyl, C 1 -C 10 alkyl substituted cyclic alkyl, cyclic aliphatic amine, C 1 -C 10 alkyl substituted cyclic aliphatic amine, heterocycle, C 1 -C A 10- alkyl substituted heterocycle; and a C 1 -C 10 alkoxy substituted heterocycle, including a C 1 -C 10 alkyl-N-substituted heterocycle.

Примеры эфиров включают эфиры бензойной кислоты, например пиперокаин, меприлкаин и изобукаин, эфиры пара-аминобензойной кислоты, например прокаин, тетракаин, бутетамин, пропоксикаин и хлорпрокаин; эфиры мета-аминобензойной кислоты, в их числе метабутамин и примакаин; эфиры пара-этоксибензойной кислоты, например парэтоксикаин. Примеры анилидов включают: лидокаин, этидокаин, мепивакаин, бупивакаин, пиррокаин и прилокаин. Другие примеры подобных соединений включают: дибукаин, бензокаин, диклонин, прамоксин, пропаракаин, бутакаин, беноксинат, карбокаин, метилбупивакаин, пикрат бутазина, фенакаин, диотан, луккаин, интракаин, нуперкаин, метабутоксикаин, пиридокаин, бифенамин, а также бициклические соединения растительного происхождения, например кокаин, цинамоилкокаин, труксиллин и кокаэтилен и все перечисленные соединения в виде гидрохлоридов. Examples of esters include benzoic acid esters, for example piperocaine, meprilcaine and isobucaine, para-aminobenzoic acid esters, for example procaine, tetracaine, butetamine, propoxicaine and chlorprocaine; esters of meta-aminobenzoic acid, including metabutamine and primacaine; esters of p-ethoxybenzoic acid, for example parethoxicaine. Examples of anilides include: lidocaine, ethidocaine, mepivacaine, bupivacaine, pyrrocaine and prilocaine. Other examples of such compounds include: dibucaine, benzocaine, diclonin, pramoxin, proparacaine, butacaine, benoxinate, carbocaine, methylbupivacaine, butazine picrate, phenacaine, diotan, luccaine, intracaine, nupercaine, metabutoxicaine, pyridocaine, biphenamine, and biphenamine for example cocaine, cinamoylcocaine, truxillin and cocaethylene and all of these compounds in the form of hydrochlorides.

В рекомендуемых вариантах УФП представлен бупивакаином. Разница между бипивакаином и мепивакаином заключается в том, что бупивакаин имеет N-бутильную группу вместо N-метильной группы мепивакаина. В этом случае речь идет о N-С110- алкилпроизводных. Соединения могут быть замещены галогеном, как в случае с прокаином и хлорпрокаином. Анилиды более предпочтительны.In recommended embodiments, the UVP is represented by bupivacaine. The difference between bipivacaine and mepivacaine is that bupivacaine has an N-butyl group instead of the N-methyl group of mepivacaine. In this case, we are talking about N-C 1 -C 10 - alkyl derivatives. The compounds may be substituted with halogen, as is the case with procaine and chlorprocaine. Anilides are more preferred.

Бупивакаин вводят до, одновременно или после генетического конструкта. Бупивакаин и генетический конструкт могут быть приготовлены в виде совместного препарата. Бупивакаин особенно полезен в качестве стимулирующего клетку агента, что объясняется проявлением его активности и его многообразными свойствами при введении в ткани. Бупивакаин способствует и облегчает поглощение клеткой генетического материала. Сам по себе бупивакаин является трансфектирующим средством. Введение генетических конструктов совместно с бупивакаином облегчает вхождение генетического конструкта в клетку. Полагают, что бупивакаин разрывает клетку или каким-то иным образом делает клетку более проницаемой. Бупивакаин стимулирует деление и репликацию клеток. Следовательно, бупивакаин действует, как реплицирующее средство. Введение бупивакаина, кроме того, раздражает и повреждает ткани. Как таковой бупивакаин действует как воспалительное средство, вызывающее миграцию и хемотаксис иммунных клеток в месте введения. Помимо клеток, обычно присутствующих в месте введения, клетки иммунной системы, мигрировавшие в виде иммунного ответа на воспалительное средство, могут вступить в контакт с введенными генетическим материалом и бупивакаином. Бупивакаин, действующий в качестве трансфецирующего средства способен также промотировать поглощение генетического материала и такими клетками иммунной системы. Bupivacaine is administered before, simultaneously with, or after a genetic construct. Bupivacaine and the genetic construct can be prepared as a joint preparation. Bupivacaine is especially useful as a cell-stimulating agent, due to the manifestation of its activity and its diverse properties when introduced into the tissue. Bupivacaine promotes and facilitates the absorption of genetic material by the cell. Bupivacaine per se is a transfection agent. The introduction of genetic constructs together with bupivacaine facilitates the entry of the genetic construct into the cell. It is believed that bupivacaine breaks the cell, or in some other way makes the cell more permeable. Bupivacaine stimulates cell division and replication. Therefore, bupivacaine acts as a replicating agent. The administration of bupivacaine also irritates and damages tissues. As such, bupivacaine acts as an inflammatory agent that causes migration and chemotaxis of immune cells at the injection site. In addition to the cells that are usually present at the injection site, cells of the immune system that migrate as an immune response to the inflammatory agent can come into contact with the introduced genetic material and bupivacaine. Bupivacaine, acting as a transfection agent, is also able to promote the absorption of genetic material by such cells of the immune system.

Химически и фармакологически бупивакаин относится к аминоацильным местным анестетикам. Бупивакаин является гомологом мепивакаина и родственен лидокаину. Бупивакаин придает мышечной ткани чувствительность к электрическому напряжению при введении натрия и влияет на концентрацию ионов в клетке. Полное описание фармакологической активности бупивакаина можно найти в издании: Ritchie J. M. и N.M. Greene, "Фармакологические основы терапии", ред. Gilman A.G. и др., 8-ое издание, глава 15, стр. 3111, которое вводится здесь в качестве ссылки. В способе настоящего изобретения рекомендуется применение бупивакаина и функционально аналогичных бупивакаину соединений. Chemically and pharmacologically, bupivacaine is an aminoacyl local anesthetic. Bupivacaine is a homologue of mepivacaine and is related to lidocaine. Bupivacaine gives muscle tissue sensitivity to voltage when sodium is introduced and affects the concentration of ions in the cell. A full description of the pharmacological activity of bupivacaine can be found in the publication: Ritchie J. M. and N.M. Greene, Pharmacological Basics of Therapy, ed. Gilman A.G. et al., 8th edition, chapter 15, p. 3111, which is incorporated herein by reference. In the method of the present invention, the use of bupivacaine and functionally similar compounds of bupivacaine is recommended.

Бупивакаин-HCl имеет следующее химическое название: 2-пиперидинкарбоксамид, 1-бутил-N-(2,6-диметилфенил)- моногидрохлорид, моногидрат, и широко выпускается для применения в фармацевтике многими фирмами, в том числе Астра Фармасьютикл Продуктс Инк. (Уэстборо, МА), Санофи Уинтроп Фармасьютиклз (Нью-Йорк, Н-Й), Истман Кодак (Рочестер, Н-Й). В продажу бупивакаин поступает с добавкой или без метилпарабена, а также с добавкой или без эпинефрина. Могут быть использованы любые такие препараты. Для применения в фармацевтике бупивакаин поступает в продажу в концентрации 0.25%, 0.5% и 0.75% и в таком виде может быть использован в изобретении. Или же при желании могут быть использованы альтернативные, создающие необходимый эффект концентрации, в частности 0.05-1%. Согласно настоящему изобретению бупивакаин вводится в количестве от 250 мкг до 10 мг. В некоторых вариантах вводят от 250 мкг до 7.5 мг бупивакаина. В отдельных вариантах вводят 0.05-5 мг бупивакаина. В других вариантах бупивакаин вводят в количестве 0.5-3 мг. И еще в одних вариантах вводят 5-50 мкг бупивакаина. К примеру, в некоторых вариантах в том же участке, что и вакцина вводят от 50 мкл до 2 мл, предпочтительно 50-1500 мкл, более предпочтительно около 1 мл 0.5% бупивакаин-HCl и 0.1% метилпарабена в изотоническом фармацевтическом носителе до, одновременно или после введения вакцины. Аналогично, в отдельных вариантах в том же участке, что и вакцина, вводят от 50 мкл до 2 мл, предпочтительно 50-1500 мкл и более предпочтительно около 1 мл 0.5% бупивакаин-HCl в изотоническом фармацевтическом носителе до, одновременно или после введения вакцины. Бупивакаин и любые другие, аналогично действующие соединения, в частности соединения, относящиеся к семейству местных анестетиков, могут быть введены в концентрациях, обеспечивающих необходимое облегчение поглощения клеткой генетических конструктов. Bupivacaine-HCl has the following chemical name: 2-piperidinecarboxamide, 1-butyl-N- (2,6-dimethylphenyl) monohydrochloride, monohydrate, and is widely available for pharmaceutical applications by many companies, including Astra Pharmaceutical Products Inc. (Westborough, MA), Sanofi Winthrop Pharmaceuticals (New York, NY), Eastman Kodak (Rochester, NY). Bupivacaine comes on sale with or without methyl paraben, and with or without epinephrine. Any such preparations may be used. For pharmaceutical applications, bupivacaine is marketed at a concentration of 0.25%, 0.5%, and 0.75%, and as such can be used in the invention. Or, if desired, alternative ones that create the necessary concentration effect, in particular 0.05-1%, can be used. According to the present invention, bupivacaine is administered in an amount of 250 μg to 10 mg. In some embodiments, 250 μg to 7.5 mg of bupivacaine is administered. In certain embodiments, 0.05-5 mg of bupivacaine is administered. In other embodiments, bupivacaine is administered in an amount of 0.5-3 mg. And in some embodiments, 5-50 μg of bupivacaine is administered. For example, in some embodiments, 50 μl to 2 ml, preferably 50-1500 μl, more preferably about 1 ml of 0.5% bupivacaine-HCl and 0.1% methylparaben in an isotonic pharmaceutical carrier, are administered simultaneously, or after the introduction of the vaccine. Similarly, in certain embodiments, 50 μl to 2 ml, preferably 50-1500 μl, and more preferably about 1 ml of 0.5% bupivacaine-HCl in an isotonic pharmaceutical carrier, is administered before, simultaneously with or after administration of the vaccine in the same area as the vaccine. Bupivacaine and any other similarly acting compounds, in particular compounds belonging to the family of local anesthetics, can be introduced in concentrations that provide the necessary facilitation of the absorption of genetic constructs by the cell.

В некоторых воплощениях изобретения индивидууму вначале вводят инъекцию бупивакаина перед генетической вакцинацией внутримышечной инъекцией, т.е. в пределах от недели до десяти дней, например, индивидууму вначале вводят инъекцию бупивакаина. В некоторых вариантах перед вакцинацией индивидууму за 1-5 дней перед введением генетического конструкта вводят инъекцию бупивакаина. В отдельных вариантах перед вакцинацией, примерно за 24 часа до введения генетического конструкта индивидууму вводят инъекцию бупивакаина. Или же бупивакаин может быть инъецирован одновременно, за несколько минут до или после вакцинации. Соответственно бупивакаин и генетический конструкт могут быть объединены и инъецированы одновременно в виде смеси. В некоторых вариантах бупивакаин вводят после введения генетического конструкта. К примеру, индивидууму вводят инъекцию бупивакаина в пределах от недели до десяти дней после введения генетического конструкта. В некоторых вариантах индивидууму вводят инъекцию бупивакаина примерно через 24 часа после вакцинации. В отдельных вариантах индивидууму вводят инъекцию бупивакаина через 1-5 дней после вакцинации. В других вариантах индивидууму вводят бупивакаин в пределах от недели до десяти дней после вакцинации. In some embodiments of the invention, the individual is first given an injection of bupivacaine prior to the genetic vaccination by intramuscular injection, i.e. ranging from a week to ten days, for example, an individual is first given an injection of bupivacaine. In some embodiments, an injection of bupivacaine is administered to an individual 1-5 days before the introduction of the genetic construct before vaccination. In certain embodiments, prior to vaccination, approximately 24 hours before the introduction of the genetic construct, the individual is given an injection of bupivacaine. Or bupivacaine can be injected at the same time, several minutes before or after vaccination. Accordingly, bupivacaine and the genetic construct can be combined and injected simultaneously as a mixture. In some embodiments, bupivacaine is administered after the introduction of the genetic construct. For example, an individual is given an injection of bupivacaine from a week to ten days after the introduction of the genetic construct. In some embodiments, the individual is given an injection of bupivacaine approximately 24 hours after vaccination. In certain embodiments, a bupivacaine injection is administered to an individual 1-5 days after vaccination. In other embodiments, bupivacaine is administered to the individual from a week to ten days after vaccination.

Другие агенты, способные выполнять роль трансфектирующих средств и/или реплицирующих средств, и/или воспалительных средств, и которые могут быть введены совместно с бупивакаином и аналогично действующими соединениями, включают: пектины, факторы роста, цитокины и лимфокины, например: α-интерферон, гамма-интерферон, происходящий из тромбоцитов фактор роста (ПТФР), GC-SF, GM-CSF, ФНО, эпидермальный фактор роста (ЭФР), ИЛ-1, ИЛ-2, ИЛ-4, ИЛ-6, ИЛ-8, ИЛ-10 и ИЛ-12, а также коллагеназу, фактор роста фибробласта, эстроген, дексаметазон, сапонины, поверхностно-активные вещества, например иммуностимулирующие комплексы (ИСКОМ), неполный адъювант Фрейнда, LPS аналог, включая монофосфорильный липид А (МФЛ), мурамиловые пептиды, аналоги хинона и пузырьки, например, сквалана и свалена, гиалуроновую кислоту и гиалуронидазу. Все эти вещества могут быть введены в сочетании с бупивакаином и генетическим конструктом. К примеру, совместно с генетическим конструктом вводят бупивакаин и либо гиалуроновую кислоту, либо гиалуронидазу. Other agents capable of performing the role of transfecting agents and / or replicating agents and / or inflammatory agents, and which may be administered together with bupivacaine and similarly active compounds, include: pectins, growth factors, cytokines and lymphokines, for example: α-interferon, gamma interferon, platelet derived growth factor (PTFR), GC-SF, GM-CSF, TNF, epidermal growth factor (EGF), IL-1, IL-2, IL-4, IL-6, IL-8, IL-10 and IL-12, as well as collagenase, fibroblast growth factor, estrogen, dexamethasone, saponins, surface-active substances such as immunostimulatory complexes (ISCOM), Freund's incomplete adjuvant, LPS analogue, including monophosphoryl lipid A (MPL), muramyl peptides, quinone analogs and vesicles, for example, squalane and svalen, hyaluronic acid and hyaluronidase. All of these substances can be administered in combination with bupivacaine and the genetic construct. For example, bupivacaine and either hyaluronic acid or hyaluronidase are administered together with the genetic construct.

Генетический конструкт может быть смешан с коллагеном в виде эмульсии и введен парентерально. Эмульсия коллагена дает средство для постепенного выделения ДНК. Коллаген применяют в количестве от 50 мкл до 2 мл. В рекомендуемом варианте с применением указанного состава смешивают около 100 мкг ДНК с 2 мл коллагена. Могут применяться и другие препараты продленного действия, описанные, например, в справочнике Ремингтона для фармацевтов (A. Osol), являющимся стандартным пособием в данной области, который вводится здесь в качестве ссылки. Такие препараты включают: водные суспензии, растворы и суспензии в масле, эмульсии и имплантанты, а также контейнеры и чрезкожные устройства. В некоторых вариантах рекомендуются выделяемые во времени препараты генетического конструкта. В некоторых вариантах рекомендуется, чтобы генетический конструкт выделялся во времени в пределах 6-144 часов, предпочтительно 12-96 часов, более предпочтительно 18-72 часов. The genetic construct can be mixed with collagen in the form of an emulsion and introduced parenterally. A collagen emulsion provides a means for the gradual isolation of DNA. Collagen is used in an amount of 50 μl to 2 ml. In a recommended embodiment, using this composition, about 100 μg of DNA is mixed with 2 ml of collagen. Other extended-release drugs may also be used, as described, for example, in the Remington Pharmacist Guide (A. Osol), a standard reference in the art, which is incorporated herein by reference. Such preparations include: aqueous suspensions, solutions and suspensions in oil, emulsions and implants, as well as containers and transdermal devices. In some embodiments, time-consuming genetic construct preparations are recommended. In some embodiments, it is recommended that the genetic construct is allocated in time within 6-144 hours, preferably 12-96 hours, more preferably 18-72 hours.

В некоторых воплощениях настоящего изобретения генетический конструкт инъецируют с помощью безыгольного устройства для инъекций. Безыгольные устройства для инъекций особенно предпочтительны для одновременного введения вещества внутримышечно, внутрикожно и подкожно. In some embodiments of the present invention, the genetic construct is injected using a needleless injection device. Needleless injection devices are particularly preferred for the simultaneous administration of a substance intramuscularly, intradermally and subcutaneously.

В некоторых воплощениях настоящего изобретения генетический конструкт вводят вместе с (УФП) применением методики микрозарядной бомбардировки частицами, раскрытой Sanford и др. в патенте США 4945050, выдан 31 июля 1990 г., который вводится здесь в качестве ссылки. In some embodiments of the present invention, the genetic construct is introduced together with (UVP) using the microparticle particle bombardment technique disclosed by Sanford et al. In US Pat. No. 4,945,050, issued July 31, 1990, which is incorporated herein by reference.

В некоторых воплощениях настоящего изобретения генетический конструкт вводят в виде части липосомного комплекса с усиливающим функцию полинуклеотида агентом. In some embodiments of the present invention, the genetic construct is introduced as part of a liposome complex with a polynucleotide function enhancing agent.

В некоторых воплощениях изобретения индивидуум подвергают единственной вакцинации с созданием полной, широкой иммунной реакции. В отдельных воплощениях изобретения индивидуума подвергают ряду вакцинаций и создают полную, широкую иммунную реакцию. Согласно некоторым воплощениям изобретения в течение какого-то времени проводят по меньшей мере две, предпочтительно четыре-пять инъекций. Промежуток времени между инъекциями может составлять от 24 часов до двух недель и более, предпочтительно одна неделя. Или же по меньшей мере две и вплоть до четырех инъекций проводят одновременно в различных участках. In some embodiments of the invention, the individual is subjected to a single vaccination with the creation of a complete, broad immune response. In certain embodiments of the invention, the individual is subjected to a series of vaccinations and a complete, broad immune response is created. According to some embodiments of the invention, at least two, preferably four to five, injections are given over time. The time interval between injections can be from 24 hours to two weeks or more, preferably one week. Or at least two and up to four injections are carried out simultaneously in different areas.

В некоторых воплощениях изобретения полная вакцинация включает инъецирование единственного инокулята, содержащего генетический конструкт, включающий последовательности, кодирующие один или несколько целевых эпитопов. In some embodiments of the invention, complete vaccination involves injecting a single inoculum containing a genetic construct comprising sequences encoding one or more target epitopes.

В некоторых воплощениях изобретения исчерпывающая вакцинация включает инъецирование двух или более разных инокулятов в разных участках. К примеру, ВИЧ вакцина по изобретению содержит два инокулята, каждый из которых включает генетический материал, кодирующий разные вирусные белки. Такой способ вакцинации позволяет вводить возможно более полный набор вирусных генов без риска введения инфекционной вирусной частицы. Так, у вакцинированного индивидуума может быть создана иммунная реакция к большинству или всем вирусам. Инъецирование каждого инокулянта осуществляют в разных участках, предпочтительно на некотором расстоянии, чтобы избежать получение клетками обоих генетических конструктов. Для большей безопасности некоторые гены могут быть изъяты или изменены с дополнительной гарантией предотвращения возможности появления инфекционного вирусного ансамбля. В применяемом здесь значении термин "фармацевтический набор" относится собирательно к множественному инокуляту, применяемому в настоящем изобретении. Такие наборы включают отдельные контейнеры с разными инокулятами и/или стимулирующими клетку агентами. Предполагается, что эти наборы включают ряд инокулятов, применяемых в способе вакцинации. In some embodiments of the invention, comprehensive vaccination involves the injection of two or more different inoculums at different sites. For example, the HIV vaccine of the invention contains two inoculums, each of which includes genetic material encoding different viral proteins. This method of vaccination allows you to enter the most complete set of viral genes without the risk of introducing an infectious viral particle. So, in a vaccinated individual, an immune response can be created to most or all viruses. Inoculation of each inoculant is carried out in different areas, preferably at a certain distance, in order to avoid cells receiving both genetic constructs. For greater security, some genes can be removed or altered with the additional guarantee of preventing the possibility of an infectious viral ensemble. As used herein, the term "pharmaceutical kit" refers collectively to the multiple inoculum used in the present invention. Such kits include separate containers with different inoculum and / or cell stimulating agents. These kits are intended to include a number of inoculums used in the vaccination method.

Способы настоящего изобретения применимы в области медицины человека и ветеринарии. Соответственно настоящее изобретение относится к генетической вакцинации млекопитающих, птиц и рыб. Способы настоящего изобретения могут быть особенно полезными в применении к млекопитающим, в том числе человеку, коровам, овцам, свиньям, козам, собакам и кошкам. The methods of the present invention are applicable in the field of human medicine and veterinary medicine. Accordingly, the present invention relates to genetic vaccination of mammals, birds and fish. The methods of the present invention can be particularly useful when applied to mammals, including humans, cows, sheep, pigs, goats, dogs and cats.

Нижеприведенные Примеры включают характерные примеры аспектов настоящего изобретения. Примеры не предназначены для ограничения объема изобретения, но скорее служат целям иллюстрации. Кроме того, разнообразные аспекты изобретения суммированы в следующем описании. Однако данное описание не предназначено для ограничения объема изобретения, но скорее дается для освещения разнообразных аспектов изобретения. Обычный специалист способен легко выявить дополнительные аспекты изобретения и его варианты. The following Examples include representative examples of aspects of the present invention. The examples are not intended to limit the scope of the invention, but rather serve the purpose of illustration. In addition, various aspects of the invention are summarized in the following description. However, this description is not intended to limit the scope of the invention, but rather is given to illuminate various aspects of the invention. An ordinary specialist is able to easily identify additional aspects of the invention and its variants.

Пример 1
Настоящим изобретением дается ВИЧ вакцина, применимая для прямой генетической вакцинации. Даются генетические конструкты, которые при поступлении в клетки индивидуума экспрессируются с продуцированием ВИЧ белков. Согласно некоторым вариантам продуцирование всех вирусных структурных белков в клетках индивидуума создает защитную иммунную реакцию, защищающую от ВИЧ инфекции. ВИЧ вакцина настоящего изобретения может быть использована для вакцинации неинфицированвых индивидуумов от ВИЧ инфекции или может служить в качестве иммунотерапевтического средства для уже инфицированных индивидуумов. ВИЧ вакцина настоящего изобретения создает иммунную реакцию, в том числе ЦТЛ, позволяющую распознавать и атаковать ВИЧ инфицированные клетки и распознавать широкий спектр ВИЧ белков. Таким образом, неинфицированные индивидуумы оказываются защищенными от ВИЧ инфекции.
Example 1
The present invention provides an HIV vaccine useful for direct genetic vaccination. Genetic constructs are given that, when introduced into an individual's cells, are expressed with the production of HIV proteins. In some embodiments, the production of all viral structural proteins in an individual's cells creates a protective immune response that protects against HIV infection. The HIV vaccine of the present invention can be used to vaccinate uninfected individuals against HIV infection or can serve as an immunotherapeutic agent for already infected individuals. The HIV vaccine of the present invention generates an immune response, including CTL, which recognizes and attacks HIV-infected cells and recognizes a wide range of HIV proteins. Thus, uninfected individuals are protected against HIV infection.

В некоторых своих воплощениях настоящее изобретение относится к способу вакцинации индивидуума от ВИЧ путем введения двух инокулятов. Такие два инокулята включают по меньшей мере два и предпочтительно более двух наборов генов или все гены ВИЧ вируса. Однако инокуляты не поставляются совместно. Соответственно в инокулированную клетку не поступает полный набор генов. Вакцинированный индивидуум получит по меньшей мере два разных и предпочтительно более двух, более предпочтительно целый ряд или все вирусные гены. In some of its embodiments, the present invention relates to a method for vaccinating an individual against HIV by administering two inoculums. Such two inoculums include at least two and preferably more than two sets of genes or all genes of the HIV virus. However, inoculums are not supplied together. Accordingly, a complete set of genes does not enter the inoculated cell. The vaccinated individual will receive at least two different and preferably more than two, more preferably a whole series or all of the viral genes.

Такая стратегия повышает вероятность того, что генетический материал, кодирующий наиболее эффективные целевые белки, будет включен в вакцину, и снижает вероятность того, что вирусной частице удастся избежать обнаружения при иммунной реакции, несмотря на структурные изменения в одном или нескольких вирусных белках, возникающих при мутации вируса. Соответственно желательна вакцинация индивидуума целым рядом и предпочтительно почти полным или полным набором генов, кодирующих вирусные белки. Such a strategy increases the likelihood that the genetic material encoding the most effective target proteins will be included in the vaccine, and reduces the likelihood that the virus particle will be able to avoid detection during the immune response, despite structural changes in one or more viral proteins resulting from the mutation the virus. Accordingly, vaccination of an individual with a variety of and, preferably, an almost complete or complete set of genes encoding viral proteins is desirable.

Если единичная клетка обеспечивается полным набором вирусных генов, возникает вероятность того, что в пределах клетки появится полный инфекционный вирус. Соответственно, генетический конструкт изобретения не содержит полного набора таких генов. Более того, два или более инокулята, каждый из которых имеет неполный набор генов, а все вместе имеют вплоть до полного набора вирусных генов, вводят в разные клетки, предпочтительно расположенные на некотором расстоянии друг от друга с целью избежать возможности действия на вакцинированную клетку полного набора генов. К примеру, часть ВИЧ генома может быть вставлена в первый конструкт, а оставшаяся ВИЧ генома вставлена во второй конструкт. Первый конструкт вводят индивидууму в виде генетической вакцины в мышечную ткань одной руки, а второй конструкт вводят индивидууму в виде генетической вакцины в другую руку. Индивидуум подвергается воздействию полного набора вирусных генов с вакцинацией тем самым по существу от полного вируса, но без риска возникновения инфекционной вирусной частицы. If a single cell is provided with a complete set of viral genes, it is likely that a complete infectious virus will appear within the cell. Accordingly, the genetic construct of the invention does not contain a complete set of such genes. Moreover, two or more inoculums, each of which has an incomplete set of genes, and all together have up to a complete set of viral genes, are introduced into different cells, preferably located at a certain distance from each other in order to avoid the possibility of a complete set of actions on the vaccinated cell genes. For example, part of the HIV genome can be inserted into the first construct, and the remaining HIV genome can be inserted into the second construct. The first construct is administered to the individual in the form of a genetic vaccine in the muscle tissue of one arm, and the second construct is administered to the individual in the form of a genetic vaccine in the other arm. The individual is exposed to a complete set of viral genes with vaccination thereby essentially from the complete virus, but without the risk of an infectious viral particle.

В целях дополнительной безопасности, даже если генетический материал поставляется двумя или несколькими инокулятами в расположенные на расстоянии части тела индивидуума, один или несколько существенных генов может быть изъято или преднамеренно изменено с еще большей гарантией невозможности образования инфекционной вирусной частицы. В подобных вариантах индивидууму вводят неполный функциональный набор вирусных генов. For added safety, even if genetic material is delivered by two or more inoculums to spaced parts of an individual’s body, one or more essential genes can be removed or intentionally altered with an even greater guarantee that an infectious viral particle cannot be formed. In such embodiments, an incomplete functional set of viral genes is administered to an individual.

Дополнительными мерами безопасности даются неперекрывающиеся части вирусного генома в отдельных генетических конструктах, образующих соответственно отдельные инокуляты. Тем самым предотвращается рекомбинация между двумя генетическими конструктами. Additional safety measures are given to the non-overlapping parts of the viral genome in individual genetic constructs, forming correspondingly separate inoculums. This prevents recombination between the two genetic constructs.

В некоторых воплощениях настоящего изобретения дается полный набор структурных генов. Структурные гены ВИЧ включают gag, pol и env. Эти три гена даются в двух разных ДНК или РНК конструктах. Соответственно в одном рекомендуемом варианте gag и pol находятся в одном ДНК или РНК конструкте, а env - в другом. В другом рекомендуемом варианте gag находится в одном ДНК или РНК конструкте, а pol и env - в другом. В еще одном рекомендуемом варианте gag и env находятся в одном ДНК или РНК конструкте, а pol - в другом. В некоторых рекомендуемых вариантах конструкты, содержащие rev, имеют сплайс-акцептор в восходящем направлении от инициирующего кодона для rev. В отдельных рекомендуемых вариантах конструкты, содержащие gag, имеют сплайс-донор в восходящем направлении от gag трансляционного инициирующего кодона. Возможно, что в любой из приведенных комбинаций могут также присутствовать ВИЧ регуляторные гены. К ВИЧ регуляторным генам относятся: vpr, vif, vpu, tat и rev. In some embodiments of the present invention, a complete set of structural genes is provided. HIV structural genes include gag, pol and env. These three genes are given in two different DNA or RNA constructs. Accordingly, in one recommended embodiment, gag and pol are in the same DNA or RNA construct, and env in the other. In another recommended embodiment, gag is in one DNA or RNA construct, and pol and env are in another. In another recommended embodiment, gag and env are in the same DNA or RNA construct, and pol is in the other. In some recommended embodiments, constructs containing rev have a splice acceptor upstream of the initiation codon for rev. In certain recommended embodiments, constructs containing gag have a splice donor upstream of the gag translational initiation codon. It is possible that HIV regulatory genes may also be present in any of these combinations. HIV regulatory genes include: vpr, vif, vpu, tat and rev.

ДНК конструкты в рекомендуемом варианте включают промотор, усилитель и сигнал полиаденилирования. Промотор может быть выбран из группы, включающей ВИЧ ДКП, актин человека, миозин человека, ЦМВ, ВСР, Молони, ВОМЖМ, гемоглобин человека, мышечный креатин человека и ВЭБ. Усилитель может быть выбран из группы, включающей актин человека, миозин человека, ЦМВ, ВСР, гемоглобин человека, мышечный креатин человека и ВЭБ. Сигнал полиаденилирования может быть выбран из группы, включающей ДКП сигнал полиаденилирования и ОВ40 сигнал полиаденилирования, в частности среди прочих меньший ОВ40 сигнал полиаденилирования. DNA constructs in the recommended embodiment include a promoter, an amplifier, and a polyadenylation signal. The promoter may be selected from the group including HIV DCT, human actin, human myosin, CMV, HRV, Moloni, VOMZHM, human hemoglobin, human muscle creatine and EBV. The enhancer may be selected from the group consisting of human actin, human myosin, CMV, HRV, human hemoglobin, human muscle creatine and EBV. The polyadenylation signal may be selected from the group comprising an DCT polyadenylation signal and an OB40 polyadenylation signal, in particular, among others, a smaller OB40 polyadenylation signal.

В некоторых вариантах две инокулятные вакцины вводят внутримышечно в пространственно разделенные ткани индивидуума, предпочтительно в разные части тела индивидуума, такие как, например, его правая и левая руки. Каждый инокулят настоящего изобретения может содержать 0.1-10000 мкг ДНК. Каждый инокулят предпочтительно содержит 1-500 мкг ДНК. Более предпочтительно, если каждый инокулят содержит 25-250 мкг ДНК. Наиболее предпочтительно, если каждый инокулят содержит около 100 мкг ДНК. In some embodiments, two inoculum vaccines are administered intramuscularly in spatially separated tissues of an individual, preferably in different parts of the body of the individual, such as, for example, his right and left hands. Each inoculum of the present invention may contain 0.1-10000 μg of DNA. Each inoculum preferably contains 1-500 μg of DNA. More preferably, each inoculum contains 25-250 μg of DNA. Most preferably, each inoculum contains about 100 μg of DNA.

Инокулят в некоторых вариантах представляет собой стерильный изотонический носитель, предпочтительно фосфатный буферный солевой раствор или простой солевой раствор. The inoculum in some embodiments is a sterile isotonic carrier, preferably a phosphate buffered saline or simple saline.

В некоторых вариантах перед введением вакцины в подлежащие вакцинации ткани инъецируют способствующее клеточной пролиферации средство, предпочтительно бупивакаин. Инъекции бупивакаином могут быть проведены вплоть до примерно 24 часов перед вакцинацией. Инъекцию бупивакаина целесообразно проводить непосредственно перед вакцинацией. В место введения вакцины вводят от 50 мкл до 2 мл 0.5% бупивакаин-HCl и 0.1% метилпарабена в изотоническом растворе NaCl, предпочтительно 50-1500 мкл, более предпочтительно около 1 мл. In some embodiments, a cell proliferative promoting agent, preferably bupivacaine, is injected into the tissues to be vaccinated before the vaccine is administered. Bupivacaine injections can be given up to about 24 hours before vaccination. It is advisable to administer bupivacaine immediately before vaccination. At the injection site, 50 μl to 2 ml of 0.5% bupivacaine-HCl and 0.1% methyl paraben in isotonic NaCl solution are added, preferably 50-1500 μl, more preferably about 1 ml.

В других вариантах способствующее пролиферации клеток средство, предпочтительно бупивакаин, включают в препарат совместно с генетическим конструктом. В место, куда должна быть введена вакцина, вводят от 50 мкл до 2 мл 0.5% бупивакаин-HCl и 0.1% метилпарабена в изотоническом растворе NaCl, предпочтительно 50-1500 мкл, более предпочтительно около 1 мл. In other embodiments, a cell proliferation promoting agent, preferably bupivacaine, is included in the preparation in conjunction with a genetic construct. Between 50 μl and 2 ml of 0.5% bupivacaine-HCl and 0.1% methylparaben in isotonic NaCl solution, preferably 50-1500 μl, more preferably about 1 ml, are introduced into the place where the vaccine is to be administered.

Соответственно, некоторыми вариантами предлагаются две инокулятные вакцины: один инокулят включает ДНК или РНК конструкт, содержащий два ВИЧ структурных гена, второй инокулят включает ДНК или РНК конструкт, содержащий третий, оставшийся структурный ген, так что вместе инокуляты содержат полный набор ВИЧ структурных генов. Структурные гены в каждом ДНК конструкте операбельно связаны с промотором, усилителем и сигналом полиаденилирования. Экспрессию вирусных генов могут регулировать одинаковые или разные регуляторные элементы. При вакцинации индивидуума два инокулята вводят внутримышечно в различных местах, предпочтительно в разные руки индивидуума. В некоторых воплощениях изобретения в место введения вакцины вначале вводят бупивакаин. В отдельных воплощениях изобретения бупивакаин включен в общий с генетическим конструктом препарат. Accordingly, two inoculum vaccines are offered in some variants: one inoculum contains a DNA or RNA construct containing two HIV structural genes, the second inoculum includes a DNA or RNA construct containing the third remaining structural gene, so that together the inoculum contains a complete set of HIV structural genes. The structural genes in each DNA construct are operably linked to a promoter, amplifier, and polyadenylation signal. The expression of viral genes can be regulated by the same or different regulatory elements. When vaccinating an individual, two inoculum is administered intramuscularly in different places, preferably in different hands of the individual. In some embodiments of the invention, bupivacaine is first administered at the injection site. In certain embodiments of the invention, bupivacaine is included in a preparation with a genetic construct.

В некоторых вариантах процедуру вакцинации повторяют по меньшей мере еще раз, предпочтительно два или три раза. Каждую вакцинацию разделяет промежуток времени от 24 часов до двух месяцев. In some embodiments, the vaccination procedure is repeated at least once, preferably two or three times. Each vaccination is separated by a period of time from 24 hours to two months.

В некоторых вариантах вакцину вводят с помощью безыгольного устройства для инъекций. В отдельных вариантах вакцину вводят гиподермально с помощью безыгольного устройства для инъекций с обеспечением тем самым внутримышечного, внутрикожного и подкожного введения одновременно и осуществлением также промежуточного введения вещества. In some embodiments, the vaccine is administered using a needleless injection device. In certain embodiments, the vaccine is administered hypodermically using a needleless injection device, thereby providing for intramuscular, intradermal and subcutaneous administration at the same time as intermediate administration of the substance.

Рекомендуемые генетические конструкты включают следующее: плазмиды и конструкты, полученные клонированием. Recommended genetic constructs include the following: plasmids and constructs obtained by cloning.

Сконструированы две плазмиды: одна содержит ВИЧ gag/pol, а другая содержит ВИЧ env. Two plasmids were constructed: one containing HIV gag / pol, and the other containing HIV env.

ВИЧ-1 геномный клон pNL43 получен от Др. Malcolm Martin, Программа НИЗ СПИД, исследования и ссылочные реагенты (ARRRR), отдел СПИД, NIAID, NIH. Клон может быть использован в качестве исходного продукта для ВИЧ-1 вирусных генов, предназначенных для генетических конструктов. Или же любой ВИЧ молекулярный клон инфицированной клетки может быть с помощью полимеразной цепной технологии модифицирован в достаточной для конструирования степени, например: НХВ2 клон, MN клон, а также SP или BAL-1 клон. Клон pNL43 является конструктом, состоящим из ВИЧ-1 провирусной ДНК плюс 3 к.о. хозяйской последовательности из участка интеграции клонированием в плазмиду pUC18. HIV-1 genomic clone pNL43 obtained from Dr. Malcolm Martin, AIDS NCD Program, Research and Reference Reagents (ARRRR), AIDS Division, NIAID, NIH. The clone can be used as a starting product for HIV-1 viral genes intended for genetic constructs. Alternatively, any HIV molecular clone of an infected cell can be modified to a sufficient degree by means of polymerase chain technology, for example: HXB2 clone, MN clone, as well as SP or BAL-1 clone. Clone pNL43 is a construct consisting of HIV-1 proviral DNA plus 3 k.o. the host sequence from the integration site by cloning into plasmid pUC18.

Конструирование pNL-puro-env- плазмиды
Данная плазмида сконструирована для экспрессии gag/pol. StuI сайт в пределах не- ВИЧ 5'-фланкирующей человеческой ДНК из pNL43 разрушают частичным гидролизом в присутствии StuI с последующим гидролизом свободных концов в присутствии Е. coli полимеразы 1. Линейную плазмиду наполняют и затем самолигируют, оставляя в пределах ВИЧ генома единственный StuI сайт. Данную плазмиду (pNLDstu) затем гидролизуют в присутствии затупляющих ферментов StuI и BsaBI, удаляющих фрагмент кодирующей gp120 последовательности. В присутствии EcoRI и ClaI из pBABE-puro (Morgenstern, Land, 1990, Nucl.Acids Res. 18(12), 3587-3596, вводится здесь в качестве ссылки, плазмида предоставлена Др. Hartmut Land, Имперский раковый исследовательский центр) выделяют ОВ40 промотор и область кодирования устойчивости к пуромицину (пуромицин-ацетилтрансфераза (ПАТ)). Данный фрагмент затупляют и затем клонируют в StuI/BsaBI-гидролизованную pNLDstu. Отбирают клон с OB40-puro-фрагментом в необходимой ориентации с тем, чтобы 3'-ДКП из ВИЧ мог обеспечить поли-А функции для трансляции ПАТ. Полученная плазмида обозначена pNLpuro.
Construction of pNL-puro-env - plasmids
This plasmid is designed to express gag / pol. The StuI site within the non-HIV 5'-flanking human DNA from pNL43 is destroyed by partial hydrolysis in the presence of StuI followed by hydrolysis of the free ends in the presence of E. coli polymerase 1. The linear plasmid is filled and then self-ligated, leaving only the StuI site within the HIV genome. This plasmid (pNLDstu) is then hydrolyzed in the presence of blunting enzymes StuI and BsaBI, which remove a fragment of the gp120 coding sequence. In the presence of EcoRI and ClaI from pBABE-puro (Morgenstern, Land, 1990, Nucl. Acids Res. 18 (12), 3587-3596, incorporated herein by reference, a plasmid provided by Dr. Hartmut Land, Imperial Cancer Research Center) isolated OB40 promoter and region of coding for resistance to puromycin (puromycin-acetyltransferase (PAT)). This fragment is blunted and then cloned into StuI / BsaBI-hydrolyzed pNLDstu. A clone with the OB40-puro fragment in the required orientation is selected so that 3'-DCT from HIV can provide poly-A functions for the translation of PAT. The resulting plasmid is designated pNLpuro.

Стратегия клонирования для делеции vpr регуляторного гена из ВИЧ gag pol вектора
Область, находящуюся сразу же в восходящем направлении от единственного PflMI сайта до сразу же после vif терминирующего кодона, амплифицируют методом ПЦР с применением праймеров, которыми вводятся неконсервативная замена аминокислоты (glu ---> val) у аминокислоты 22 в vpr, терминирующий кодон в vpr рамке считывания после аминокислоты 22 и EcoRI сайт, расположенный сразу же после нового терминирующего кодона. Данный ПЦР фрагмент замещают PflMI-EcoRI фрагментом из pNLpuro или pNL43. Такое замещение приводит к делеции 122 нуклеотидов в открытой рамке считывания vpr с исключением тем самым возможности обращения, характерного для стратегии точетной мутации. Полученная плазмида (pNLpuro vpr) кодирует первые 21 природные аминокислоты из vpr плюс валин плюс все остальные оставшиеся ВИЧ-1 гены и сплайс-сочленения в их нативной форме. Подобная стратегия делеции применима также к nef, vif и vpu и допускает экспрессию структурного гена с одновременной защитой от образования живого рекомбинантного вируса.
Cloning strategy for deletion of vpr regulatory gene from HIV gag pol vector
The region immediately upstream from the only PflMI site to immediately after the vif termination codon is amplified by PCR using primers that introduce the non-conservative substitution of amino acid (glu ---> val) at amino acid 22 in vpr, the termination codon in vpr a reading frame after amino acid 22 and an EcoRI site located immediately after the new termination codon. This PCR fragment is replaced by a PflMI-EcoRI fragment from pNLpuro or pNL43. Such a substitution leads to a deletion of 122 nucleotides in the open vpr reading frame, thereby eliminating the possibility of reversal characteristic of the even mutation strategy. The resulting plasmid (pNLpuro vpr) encodes the first 21 natural amino acids from vpr plus valine plus all other remaining HIV-1 genes and splice junctions in their native form. A similar deletion strategy also applies to nef, vif and vpu and allows expression of the structural gene while protecting against the formation of a living recombinant virus.

Конструирование плазмиды, предназначенной для экспрессии оболочки
ДНК сегмент, кодирующий ген оболочки ВИЧ-1 НХВ2, клонируют амплификацией методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с применением лямда-клонированной ДНК, полученной от Программы СПИД, исследования и ссылочные реагенты. Последовательности 5'- и 3'-праймеров имеют следующий вид: 5'-AGGCGTCTCGAGACAGAGGAGAGCAAGAAATG-3' (ПОСЛЕД. N 1) с введением XhoI сайта и 5'-TTTCCCTCTAGATAAGCCATCCAATCACAC-3' (ПОСЛЕД. N 2) с введением XbaI сайта, направленных на gp160, tat и rev кодирующую область. Ген-специфичную амплификацию осуществляют применением Tag ДНК полимеразы согласно инструкциям изготовителя (Перкин-Эльмер Цетус Корп.). Продукт ПЦР обрабатывают тридцать минут при 37oC 0.5 мкг/мл протеиназы К с последующим экстрагированием смесью фенол-хлороформ и осаждением этанолом. Выделенную ДНК затем гидролизуют два часа при 37oC в присутствии XhoI и XbaI и подвергают электрофорезу на агарозном геле. Выделенный и очищенный XhoI-XbaI фрагмент клонируют в Bluescript плазмиду (Стратеген Инк., Ля Джолла, Ка) и затем субклонируют в эукариотный экспрессионный вектор pMAMneoVlue (Клонтех Лаборэториз, Инк., Рало Альто, КА). Полученный конструкт обозначен как рМ160 (фиг. 1А). Плазмидную ДНК очищают ультрацентрифугированием с градиентом CsCl. ДНК конструкт рМ160 кодирует ВИЧ-1/НХВ2 (Fisher A.G. и др., (1985) Nature 316, 262-265) связанный с мембраной гликопротеин gp160 под контролем ВСР усиливающего элемента и ВОМЖМ ЦДК в качестве промотора.
Construction of plasmids designed for expression of the membrane
The DNA segment encoding the HIV-1 HXB2 envelope gene is cloned by polymerase chain reaction (PCR) amplification using lamda-cloned DNA obtained from the AIDS program, studies and reference reagents. The sequences of the 5'- and 3'-primers are as follows: 5'-AGGCGTCTCGAGACAGAGGAGAGCAAGAAATG-3 '(SEQ. N 1) with the introduction of the XhoI site and 5'-TTTCCCTCTAGATAAGCCATCCAATCACAC-3' (SEE. N 2) with the introduction of XbaI Xba on gp160, tat and rev coding region. Gene-specific amplification is carried out using Tag DNA polymerase according to the manufacturer's instructions (Perkin-Elmer Cetus Corp.). The PCR product is treated for thirty minutes at 37 ° C. with 0.5 μg / ml proteinase K, followed by extraction with a phenol-chloroform mixture and ethanol precipitation. The isolated DNA is then hydrolysed for two hours at 37 ° C. in the presence of XhoI and XbaI and subjected to agarose gel electrophoresis. The isolated and purified XhoI-XbaI fragment is cloned into a Bluescript plasmid (Strategen Inc., La Jolla, Ka) and then subcloned into the pMAMneoVlue eukaryotic expression vector (Clontech Laboratory, Inc., Ralo Alto, CA). The resulting construct is designated as pM160 (Fig. 1A). Plasmid DNA is purified by CsCl gradient centrifugation. The pM160 DNA construct encodes HIV-1 / HXB2 (Fisher AG et al., (1985) Nature 316, 262-265) membrane bound glycoprotein gp160 under the control of the HRV reinforcing element and VOMGM CDK as a promoter.

Конструирование альтернативной плазмиды экспрессии оболочки, названной ВИЧ-1 env-rev плазмидой
Область, кодирующую два экзона из rev и vpu, и оболочечные открытые рамки считывания из ВИЧ-1 НХВ2 амплифицируют методом ПЦР и клонируют в экспрессионный вектор pCNDA/neo (Инвитроген). Данная плазмида направляет продуцирование оболочки при участии ЦМВ промотора.
Construction of an alternative plasmid for expression of the membrane, called HIV-1 env-rev plasmid
The region encoding the two exons from rev and vpu and the enveloped open reading frames from HIV-1 HXB2 are amplified by PCR and cloned into the pCNDA / neo expression vector (Invitrogen). This plasmid directs the production of the membrane with the participation of the CMV promoter.

Получение и очистка
Плазмиду в E.coli (DH5 альфа) выращивают следующим образом. LB плюс ампициллин агаровые пластинки засевают штрихованием культурой целевой плазмиды из замороженной общей партии. Пластинки выдерживают при 37oC в течение ночи (14-15 часов). С пластинки отбирают единственную колонию, которой инокулируют 15 мл LB среды с препаратом пептона и 50 мкг/мл ампициллина. Полученную культуру выращивают при 37oC со встряхиванием (прим. 175 об/мин) в течение 8-10 часов. Показания ОП600 должны быть равны по меньшей мере 1. LB среду с пептоном и 50 мкг/мл ампициллина (1 л) инокулируют культурой со значением ОП = 1. Приготовленную культуру (1-2 литра) выращивают в течение ночи при 37oC со встряхиванием (175 об/мин).
Receiving and cleaning
The plasmid in E. coli (DH5 alpha) is grown as follows. LB plus ampicillin agar plates are seeded by hatching the culture of the target plasmid from the frozen total lot. The plates are kept at 37 ° C. overnight (14-15 hours). A single colony was selected from the plate, which was inoculated with 15 ml of LB medium with peptone and 50 μg / ml ampicillin. The resulting culture was grown at 37 o C with shaking (approx. 175 rpm) for 8-10 hours. Indications of OD 600 should be at least 1. LB medium with peptone and 50 μg / ml ampicillin (1 L) are inoculated with a culture with an OD value of 1. The prepared culture (1-2 liters) is grown overnight at 37 ° C. shaking (175 rpm).

Плазмиды, выращенные в Е. coli (штамм DH5 альфа) собирают и очищают по следующей методике. Общие методики лизиса клеток и очистки плазмид можно найти в издании: "Молекулярное клонирование. Лабораторное руководство", 2-ое издание, J. Sambrook, E.F. Fritsch, Т. Maniatis, Коулд Спринг Харбор Пресс, 1989. Клетки концентрируют и промывают глюкоза-трис-ЭДТК буфером (pH 8). Концентрированные клетки лизируют действием лизозима и кратковременно обрабатывают 0.2 н. КОН, последующим добавлением калийацетат-уксусной кислоты буфера устанавливают pH 5.5. Нерастворимые вещества удаляют центрифугированием. Для осаждения плазмиды к надосадочной жидкости добавляют 2-пропанол. Плазмиду вновь растворяют в трис-ЭДТК буфере и дополнительно очищают экстрагированием фенол-хлороформенной смесью и повторным осаждением 2-пропанолом. Plasmids grown in E. coli (strain DH5 alpha) are harvested and purified according to the following procedure. General techniques for cell lysis and plasmid purification can be found in: Molecular Cloning. Laboratory Manual, 2nd Edition, J. Sambrook, E.F. Fritsch, T. Maniatis, Could Spring Harbor Press, 1989. The cells are concentrated and washed with glucose-Tris-EDTA buffer (pH 8). Concentrated cells are lysed by the action of lysozyme and briefly treated with 0.2 n. KOH, the subsequent addition of potassium acetate-acetic acid buffer set the pH to 5.5. Insoluble substances are removed by centrifugation. To precipitate the plasmid, 2-propanol is added to the supernatant. The plasmid was redissolved in Tris-EDTA buffer and further purified by extraction with a phenol-chloroform mixture and reprecipitation with 2-propanol.

Возможно удаление эндотоксина применением самых разнообразных способов, в том числе следующих: специфичная адсорбция иммобилизованными веществами, например полимиксином (Tani и др., Biomater. Aptif. Cells Inimobilization Biotechnol. 20(2-4), 457-62 (1992); Issekutz, J. Immunol. Methods 61(3), 275-81 (1983); применение антиэндотоксиновых моноклональных антител, например: 8А1 и НА-1АТМ (Центокор, Мальверн, ПА, Bogard и др., J. Immunol. 150(10), 4438-4449 (1993); Rietschel и др. Infect. Immunity, стр. 3863 (1993)); применение положительно заряженных глубинных фильтров (Hou и др., J. Parenter. Sci. Technol. 44(4), 204-9 (июль-август 1990)); применение поли(гамма-метил-L-глютамата), Hirayama и др., Chem. Pharm. Vull. (Токио) 40(8), 2106-9 (1992)); применение гистидина (Matsumae и др., Biotechnol. Appl. Biochem. 12(2), 129-40 (1990)); применение колонок и мембран гидрофобного взаимодействия (Aida и др., J. Immunol. Methods 132(2), 191-5 (1990); Umeda и др., Biomater. Artif. Cells Artif. Organs 18(4), 491-7 (1990); Hou и др. , Biochem. Biophys. Acta 1073 (1), 149-54 (1991); Sawada и др., J. Hyg. Лондон) 91(1), 103-14 (1986)); применение специфичных смол, пригодных для удаления эндотоксина, в том числе полистирол-дивинилбензольных или дивинилбензольных смол, например Браунли Полипор смолы (Эпплайд Биосистемс, Пало Альто, КА); XUS 40323 (Дау Кемикл, Мидлэнд, МИ); НР20, УНР20Р (Мицубиси Касей, США); Гамильтон PRP-1, PRP-сродство (Гамильтон, Рено, НВ); Джорди с обращенными фазами ДВБ, Джорди гель ДВБ, Полимер Лабс ПЛ-гельТМ (Олтех, Дирфилд, ИЛ); Видак PLxТМ (Сепарейшн Групп, Гесперия, КА); другие удаляющие эндотоксин материалы и методы включают; Детокси-ГельТМ, удаляющий эндотоксин гель (Пирс Кемикл, Рокфорд, ИЛ); Примечание 206 к применению (Фармация Биотех, Инк., Пискэтэвей, Н-Й). См. также в целом: Sharma, Biotech. Арр. Biochem. 8, 5-22 (1986). Рекомендуемые антиэндотоксиновые моноклональные антитела связываются с консервативными доменами эндотоксина и предпочтительно являются антителами к липиду А - наиболее структурно сохраняемой части молекулы эндотоксина. Такие антилипид А моноклональные антитела включают: моноклональные антитела 8А1 с высоким сродством к мышиному IgG и человечьи антилипид A IgM(k) моноклональные антитела НА-1АТМ. Источником НА-1АТМ служит человечья В Е. coli 15 вакцина. Как сообщается НА-1АТМ широко перекрестно реакционноспособно с самыми различными бактериальными эндотоксинами (липополисахаридами).Endotoxin can be removed using a wide variety of methods, including the following: specific adsorption by immobilized substances, for example polymyxin (Tani et al., Biomater. Aptif. Cells Inimobilization Biotechnol. 20 (2-4), 457-62 (1992); Issekutz, J. Immunol. Methods 61 (3), 275-81 (1983); use of anti-endotoxin monoclonal antibodies, e.g. 8A1 and HA-1A TM (Centocor, Malvern, PA, Bogard et al., J. Immunol. 150 (10) 4438-4449 (1993); Rietschel et al. Infect. Immunity, p. 3863 (1993)); use of positively charged depth filters (Hou et al., J. Parenter. Sci. Technol. 44 (4), 204- 9 (July-August 1990)); use of poly (gamma-methi l-L-Glutamate), Hirayama et al., Chem. Pharm. Vull. (Tokyo) 40 (8), 2106-9 (1992)); the use of histidine (Matsumae et al., Biotechnol. Appl. Biochem. 12 (2), 129-40 (1990)); the use of columns and membranes of hydrophobic interaction (Aida et al., J. Immunol. Methods 132 (2), 191-5 (1990); Umeda et al., Biomater. Artif. Cells Artif. Organs 18 (4), 491-7 (1990); Hou et al., Biochem. Biophys. Acta 1073 (1), 149-54 (1991); Sawada et al., J. Hyg. London) 91 (1), 103-14 (1986)); the use of specific resins suitable for the removal of endotoxin, including polystyrene-divinylbenzene or divinylbenzene resins, for example Brownley Polypore resins (Apple Biosystems, Palo Alto, CA); XUS 40323 (Dow Chemical, Midland, MI); HP20, UNR20R (Mitsubishi Kasei, USA); Hamilton PRP-1, PRP-affinity (Hamilton, Renault, HB); Georgy with reversed phases of DVB, Geordi gel of DVB, Polymer Labs PL-gel TM (Oltech, Deerfield, IL); Vidak PLx TM (Separation Group, Hesperia, KA); other endotoxin-removing materials and methods include; Detoxi-Gel TM , removing endotoxin gel (Pierce Chemical, Rockford, IL); Note 206 to use (Pharmacy Biotech, Inc., Pisketaway, NY). See also generally: Sharma, Biotech. Arr. Biochem. 8, 5-22 (1986). Recommended anti-endotoxin monoclonal antibodies bind to the conserved domains of endotoxin and are preferably antibodies to lipid A, the most structurally preserved part of the endotoxin molecule. Such anti-lipid A monoclonal antibodies include: monoclonal antibodies 8A1 with high affinity for mouse IgG and human anti-lipid A IgM (k) monoclonal antibodies HA-1A TM . The source of HA-1A TM is human E. coli 15 vaccine. As reported, HA-1A TM is widely cross-reactive with a wide variety of bacterial endotoxins (lipopolysaccharides).

Пример 2
В опытах, предназначенных для сравнения иммуногенного ответа, возникающего после генетической вакцинации и вакцинации белками, созданы модели на животных с применением клеток опухоли, специфично экспрессирующих чужеродный долевой белок. Созданы три модели на иммунокомпетентных мышах, экспрессирующих чужеродные антигены. Применяют три линии клональных клеток опухоли, источником которых служат мыши линии Balb/c. Клеточные линии представлены: 1) лимфоидной клеточной линией, не дающей существенных метастазов в другие ткани, но образующей пальпируемую опухоль, которая, видимо, и убивает животное в пределах 8-12 недель; 2) клеточной линией мышиной меланомы с той же способностью образовывать метастазы, по большей части в легкое, и которая после инокуляции 1 миллионом клеток приводит к развитию у мыши больших пальпируемых опухолей, аналогичным образом убивающих животное в пределах 10-12 недель; и 3) клеточной линией мышиной легочной аденокарциномы, которая дает метастазы в множество тканей и убивает животное в течение 12 или более недель. Отбирают субклоны, в которых обнаруживаются чужеродные антигены в нераспознаваемом виде. После имплантации трансфектированной опухоли мыши родоначальной линии, в отличие от большинства
аналогичных линий мышиных опухолей, у животных не возникает защитной реакции на имеющиеся чужеродные антигены, и опухоль приживается. Эта опухоль впоследствии убивает животное с тем же фенотипом и в те же отрезки времени, что и первоначальная нетрансфецированная опухоль. Применением таких моделей можно определить иммунную реакцию, создаваемую генетической вакцинацией против антигена.
Example 2
In experiments designed to compare the immunogenic response that occurs after genetic vaccination and vaccination with proteins, animal models were created using tumor cells specifically expressing a foreign fractional protein. Three models were created on immunocompetent mice expressing foreign antigens. Three lines of tumor clonal cells are used, the source of which is the Balb / c mouse line. The cell lines are represented by: 1) a lymphoid cell line that does not give significant metastases to other tissues, but forms a palpable tumor, which, apparently, kills the animal within 8-12 weeks; 2) a cell line of murine melanoma with the same ability to form metastases, mostly to the lung, and which, after inoculation with 1 million cells, leads to the development of large palpable tumors in the mouse, which similarly kill the animal within 10-12 weeks; and 3) a murine pulmonary adenocarcinoma cell line that metastases to many tissues and kills the animal for 12 or more weeks. Subclones are selected in which foreign antigens are detected in an unrecognized form. After implantation of a transfected tumor of the mouse of the parent line, unlike most
similar lines of mouse tumors, the animals do not have a protective reaction to existing foreign antigens, and the tumor survives. This tumor subsequently kills the animal with the same phenotype and at the same time intervals as the original non-transfected tumor. The use of such models can determine the immune response generated by genetic vaccination against antigen.

Сделано наблюдение, что мыши, вакцинированные генетическими вакцинами, включающими генетический конструкт, в результате продуцируют в своих клетках целевой белок, создающий иммунную реакцию, в том числе и сильную цитотоксичную реакцию, полностью уничтожающую опухоли, в которых обнаруживается целевой белок, но безо всякого влияния на опухоли без целевого белка. У мышей, инокулированных самим целевым белком, создаваемая в результате иммунная реакция была гораздо менее эффективной. Опухоль уменьшалась в размерах, но из-за отсутствия цитотоксичной реакции ее уничтожения не происходило. В качестве контроля в опытах по сравнению иммунной реакции животных, вакцинированных генетической вакциной, субъединичной вакциной, и невакцинированных животных применялись нетрансфецированные опухоли. В этих опытах четко показано, что генетическая вакцина создает более эффективную иммунную реакцию с более широким спектром действия, способную при участии ЦТЛ полностью уничтожить опухоль. И напротив, иммунизация применением интактного целевого белка создает более ограниченную, менее эффективную иммунную реакцию. It was observed that mice vaccinated with genetic vaccines, including a genetic construct, as a result produce in their cells a target protein that creates an immune response, including a strong cytotoxic reaction that completely destroys tumors in which the target protein is found, but without any effect on tumors without the target protein. In mice inoculated with the target protein itself, the resulting immune response was much less effective. The tumor was reduced in size, but due to the absence of a cytotoxic reaction, its destruction did not occur. Nontransfected tumors were used as a control in experiments when comparing the immune response of animals vaccinated with a genetic vaccine, subunit vaccine, and unvaccinated animals. In these experiments, it was clearly shown that a genetic vaccine creates a more effective immune response with a wider spectrum of activity, capable of completely destroying the tumor with the participation of CTLs. Conversely, immunization with an intact target protein creates a more limited, less effective immune response.

Пример 3
В другом воплощении изобретения создана генетическая вакцина против ВИЧ. Вирусный белок gp160, превращенный в gp120 и gp41, является целевым белком, против которого получена генетическая вакцина. Генетическая вакцина содержит ДНК конструкт, включающий ДНК последовательность, кодирующую gp160 операбельно связанные регуляторные элементы. При введении индивидууму ДНК конструкт генетической вакцины внедряется в клетки индивидуума, после чего продуцируется gp160. Иммунная реакция, создаваемая белком, имеет широкую основу и включает гуморальную и оба вида клеточной иммунной реакции. Широкая биологическая реакция обеспечивает более высокую степень защиты по сравнению с той, которая достигается при введении самого белка.
Example 3
In another embodiment of the invention, a genetic HIV vaccine is provided. The gp160 viral protein, converted to gp120 and gp41, is the target protein against which the genetic vaccine is obtained. A genetic vaccine contains a DNA construct comprising a DNA sequence encoding gp160 operably linked regulatory elements. When DNA is administered to an individual, the construct of the genetic vaccine is introduced into the cells of the individual, after which gp160 is produced. The immune response generated by the protein has a broad basis and includes the humoral and both types of cellular immune responses. A wide biological reaction provides a higher degree of protection compared to that achieved with the introduction of the protein itself.

Мышам внутримышечно инъецируют рМ160 (см. Пример 1), после чего проводят анализ на анти-ВИЧ иммунную реакцию. В антисыворотке иммунизированных таким путем животных создается иммунная реакция на ВИЧ оболочечный белок, определяемая ферментативным иммуносорбентным анализом (ФИСА) и анализом иммуноосаждением. Антисыворотка нейтрализует ВИЧ-1 инфекцию и подавляет индуцируемое ВИЧ-1 образование синцитий. Mice were injected intramuscularly with pM160 (see Example 1), after which an anti-HIV immune response was tested. In the antiserum of animals immunized in this way, an immune response to HIV envelope protein is created, determined by enzymatic immunosorbent analysis (FISA) and immunoprecipitation analysis. The antiserum neutralizes HIV-1 infection and suppresses HIV-1-induced syncytium formation.

Наблюдаемая нейтрализация и противосинцитиальная активность могут быть результатом реакционноспособности созданных антител к белку оболочки ВИЧ-1, например: V3 петле gp120, CD4 участку связывания и N-концевой "иммунодоминантной" области gp41 среди прочих. The observed neutralization and anti-syncytial activity may result from the reactivity of the created antibodies to the HIV-1 envelope protein, for example: the V3 loop of gp120, the CD4 binding site and the N-terminal “immunodominant” region of gp41 among others.

В приведенной здесь методике генетической иммунизации в квадрицепсные мышцы мышей линии BALB/c инъецируют 100 мкл 0.5% бупивакаина-HCl и 0.1% метилпарабена в изотоническом растворе NaCl с применением иглы 27-го размера. Цель инъекции - стимулировать регенерацию мышечных клеток и облегчить поглощение генетического конструкта. Спустя двадцать четыре часа в те же места инъекции инъецируют либо 100 мкг рМ160, либо 100 мкг pMAMneoBlue в качестве контрольной плазмиды (фиг. 1А). Мышей ревакцинируют инъецированием того же количества ДНК конструкта трижды с интервалом в две недели указанным путем, но без предварительной обработки бупивакаин-HCl. In the genetic immunization method described here, 100 μl of 0.5% bupivacaine-HCl and 0.1% methylparaben in isotonic NaCl solution are injected into the quadriceps muscles of BALB / c mice using a 27-gauge needle. The purpose of the injection is to stimulate the regeneration of muscle cells and facilitate the absorption of the genetic construct. Twenty-four hours later, either 100 μg pM160 or 100 μg pMAMneoBlue was injected into the same injection sites as a control plasmid (Fig. 1A). Mice are revaccinated by injection of the same amount of construct DNA three times with an interval of two weeks in the specified way, but without prior treatment with bupivacaine-HCl.

При иммунизации рекомбинантным gp160 мышей линии BALB/c первоначально иммунизируют 1 мкг гликозилированного рекомбинантного (ВИЧ-1/III8) gp160 (МикроГенСис Инк.) в полном адъюванте Фрейнда с последующим трехкратным ревакцинированием 1 мкг gp160 каждый раз в неполном адъюванте Фрейнда с интервалом в две недели. Продуцирование антител против ВИЧ-1 gp160 определяют анализом сыворотки мышей на способность иммуноосаждать gp160. Иммуноосаждение проводят использованием 1 • 106 cpm 125J-меченого rgp160 сыворотки мышей и агарозных шариков протеина-G (ГИБКО, Инк.) по ранее описанной методике Osther К. и др., Hybridoma 10, 673-683 (1991), которая вводится здесь в качестве ссылки. Результаты специфичного осаждения анализируют на 10% НДС-ПАГЭ. Полоса 1 соответствует 1 мкл сыворотки предсенсибилизированной мыши в реакции с 125J-gpl60. Полоса 2 соответствует 1 мкл сыворотки мыши, иммунизированной рМ160. Полоса 3 соответствует 1 мкл 1:100 разбавления моноклональных анти-gp120 антител ID6 (Ugen К.E. и др. (1992) "Создание моноклональных антител против аминообласти gp120, вызывающей зависимую от антител клеточную цитотоксичность", Коулд Спринг Харбор Лаборэтори) в качестве положительного контроля. Стрелкой указан специфично иммуноосажденный гликопротеин оболочки 125J-gpl60.When immunizing with recombinant gp160, BALB / c mice were initially immunized with 1 μg of glycosylated recombinant (HIV-1 / III 8 ) gp160 (MicroGenSys Inc.) in complete Freund's adjuvant followed by three re-vaccinations with 1 μg gp160 twice every time weeks. The production of anti-HIV-1 gp160 antibodies is determined by assaying mouse sera for the ability to immunoprecipitate gp160. Immunoprecipitation is carried out using 1 • 10 6 cpm 125 J-labeled rgp160 serum of mice and protein-G agarose beads (GIBCO, Inc.) according to the previously described method of Osther K. et al., Hybridoma 10, 673-683 (1991), which is introduced here as a reference. Specific precipitation results are analyzed for 10% VAT-PAGE. Lane 1 corresponds to 1 μl of serum of a pre-sensitized mouse in reaction with 125 J-gpl60. Lane 2 corresponds to 1 μl of mouse serum immunized with pM160. Lane 3 corresponds to 1 μl of a 1: 100 dilution of ID6 monoclonal anti-gp120 antibodies (Ugen K.E. et al. (1992) "Creating monoclonal antibodies against the gp120 amino region causing antibody-dependent cell cytotoxicity", Could Spring Harbor Labor) as positive control. The arrow indicates the specifically immunoprecipitated glycoprotein of the 125 J-gpl60 membrane.

125J-меченый gpl60 специфично иммуноосаждается антисывороткой от рМ160-иммунизированных животных (фиг. 2, полоса 2), а также применяемыми в качестве положительного контроля анти-gp160 моноклональными антителами ID6 (фиг. 2, полоса 3). Напротив, сыворотка предсенсибизированных мышей (фиг. 2, полоса 1) показывает минимальную активность в том же анализе. 125 J-labeled gpl60 is specifically immunoprecipitated with antiserum from pM160-immunized animals (Fig. 2, lane 2), as well as ID6 monoclonal antibodies used as a positive control (Fig. 2, lane 3). In contrast, the serum of the pre-sensitized mice (FIG. 2, lane 1) showed minimal activity in the same assay.

Восемь из десяти мышей, иммунизированных рМ160 конструктом, оказались положительными с точки зрения реакционности к gpl60 при определении методом ФИСА, и иммунная реакция животных с наиболее высоким анти-gp160 титром подвергнута подробному анализу. Все четыре мыши, иммунизированные контрольным вектором, показали одинаковую отрицательную реакционность к gp160 при определении методом ФИСА, и сыворотка одной из этих мышей использована в качестве контрольной в последующих опытах. Eight out of ten mice immunized with the pM160 construct were positive in terms of reactivity to gpl60 as determined by FISA and the immune response of animals with the highest anti-gp160 titer was subjected to detailed analysis. All four mice immunized with a control vector showed the same negative reactivity to gp160 as determined by FISA, and the serum of one of these mice was used as a control in subsequent experiments.

Показано, что нейтрализующие ВИЧ антитела специфично направлены на некоторые эпитопы gp120 и gp41, в том числе V3 петлю в gp120 (Goudsmit J. и др., (1988) AIDS 2, 157-164; Putney S.D. и др., (1989) "Создание ВИЧ субъединичной вакцины", Монреаль), CD4 участок связывания вблизи карбоксиокончания gp120 (Lasky L.A. и др. (1987) Cell 50, 975-985), a также иммунодоминантную петлю gp41 непосредственно в нисходящем направлении от N-концевой области слияния (Schrier R.D. и др. (1988) J. Virol. 62, 2531-2536). HIV neutralizing antibodies have been shown to specifically target certain epitopes of gp120 and gp41, including the V3 loop in gp120 (Goudsmit J. et al., (1988) AIDS 2, 157-164; Putney SD et al., (1989) " Creation of HIV subunit vaccine, Montreal, CD4 binding site near the carboxy terminus of gp120 (Lasky LA et al. (1987) Cell 50, 975-985), as well as the immunodominant gp41 loop directly in the downstream direction from the N-terminal fusion region (Schrier RD et al. (1988) J. Virol. 62, 2531-2536).

Для определения того, будут ли анти-gp160 антитела, созданные у этих мышей, вступать в реакцию с указанными важными участками гликопротеинами оболочки, пептиды для BRU/V3 петли, пептиды для MN/V3 петли, пептиды для БХВ2/gp41 N-окончания или пептиды для HXB2/CD4 участка связывания адсорбируют на титрационных микропланшетах, после чего методом ФИСА определяют удельную реакционность мышиной антисыворотки. Один мкг/мл gp160 или 10 мкг/мл каждого пептида наносят в виде покрытия на титрационные микропланшеты в 0.1 М бикарбонатного буфера (pH 9.5), выдерживают в течение ночи при 4oC, блокируют 2% альбумина бычьей сыворотки в ФБС, проводят в течение одного часа при 37oC реакцию с козьим антимышиным IgG, конъюгированным с ПОХ (Фишер) и проявляют 10-30 минут при комнатной температуре в темноте ТМВ субстратом (Сигма). Полученные результаты приведены на фиг. 3. Показаны следующие антисыворотки: (-+-) соответствует сыворотке предсенсибилизированной мыши, (-х-) соответствует сыворотке мыши, иммунизированной pMAMneoBlue вектором, (-o-) соответствует сыворотке мыши, иммунизированной рМ160, (-Δ-) соответствует сыворотке мыши, иммунизированной белком rgp160. На фиг. 3А приведены результаты, полученные применением планшетов, покрытых rgp160 белком. На фиг. 3В показаны результаты, полученные применением планшетов, покрытых BRU/V3 петли пептидов (CNTRKR- IRIQRGPGRAFVTIGK (ПОСЛЕД. N 11)). На фиг. 3С показаны результаты, полученные применением планшетов, покрытых MN/V пептидами (YNKRKRIHIQRGPGRAFYTTKNIIC (ПОСЛЕД. N 12)) с QR последовательностью из ВИЧ-1/III8 подчеркнутого типа. На фиг. 3D приведены результаты, полученные применением планшетов, покрытых HXB2/CD4 пептидов участка связывания (CRIKQFINMWQEVGKAMYAPPISGIRC (ПОСЛЕД. N 13)). На фиг. 3Е приведены результаты, полученные применением планшетов, покрытых пептидами BRU/gp41 иммунодоминантной области (RILAVERYTKDQQLLGIWGCSGKLIC (ПОСЛЕД. N 14)).To determine whether the anti-gp160 antibodies created in these mice will react with the indicated important regions of envelope glycoproteins, peptides for the BRU / V3 loop, peptides for the MN / V3 loop, peptides for BXB2 / gp41 N-terminus or peptides for HXB2 / CD4, the binding sites are adsorbed onto microtiter plates, after which the specific reactivity of the mouse antiserum is determined by FISA. One μg / ml gp160 or 10 μg / ml of each peptide is coated onto microtiter plates in 0.1 M bicarbonate buffer (pH 9.5), kept overnight at 4 ° C, blocked with 2% bovine serum albumin in PBS, carried out over one hour at 37 o C the reaction with goat anti-mouse IgG conjugated with POH (Fisher) and show 10-30 minutes at room temperature in the dark TMB substrate (Sigma). The results are shown in FIG. 3. The following antisera are shown: (- + -) corresponds to serum of a pre-sensitized mouse, (-x-) corresponds to serum of a mouse immunized with pMAMneoBlue vector, (-o-) corresponds to mouse serum immunized with pM160, (-Δ-) corresponds to mouse serum, immunized with rgp160 protein. In FIG. 3A shows the results obtained using tablets coated with rgp160 protein. In FIG. 3B shows the results obtained using tablets coated with BRU / V3 peptide loops (CNTRKR-IRIQRGPGRAFVTIGK (FOLLOW N 11)). In FIG. 3C shows the results obtained using tablets coated with MN / V peptides (YNKRKRIHIQRGPGRAFYTTKNIIC (SEQ ID NO: 12)) with a QR sequence of HIV-1 / III 8 underlined type. In FIG. 3D shows the results obtained using tablets coated with HXB2 / CD4 peptides of the binding site (CRIKQFINMWQEVGKAMYAPPISGIRC (FOLLOW N 13)). In FIG. 3E shows the results obtained using tablets coated with the BRU / gp41 peptides of the immunodominant region (RILAVERYTKDQQLLGIWGCSGKLIC (FOLLOW N 14)).

Из фиг. 3 видно, что антисыворотка от мыши, иммунизированной рМ160 конструктом, показывает значительно более высокую реакционоспособность к пептидам BRU и MN/V3 петли, пептиду CD4 участка связывания и иммунодоминантному пептиду gp41, чем сыворотка при иммунизации рекомбинантным gp160 белком (rgp160). Антисыворотка от иммунизированной rgp160 мыши имела гораздо более высокий титр относительно rgp160 по сравнению с антисывороткой при иммунизации рМ160, но более низкую активность относительно трех специфичных нейтрализующих эпитопов gp160, подвергнутых анализу. From FIG. Figure 3 shows that the antiserum from a mouse immunized with the pM160 construct shows a significantly higher reactivity to the BRU and MN / V3 peptides, the CD4 binding site peptide and the immunodominant gp41 peptide than the serum when immunized with the recombinant gp160 protein (rgp160). The antiserum from the rgp160 immunized mouse had a much higher titer relative to rgp160 compared to the antiserum from the pM160 immunization, but lower activity relative to the three specific neutralizing gp160 epitopes analyzed.

Для определения того, будет антисыворотка, созданная при иммунизации ДНК, обладать антивирусной активностью, исследована способность антисыворотки нейтрализовать инфекцию ВИЧ-1. Бесконечный ВИЧ-1/III8 вирус при 100 TCID50 инкубируют с последовательными разбавлениями антисыворотки перед использованием для инфицирования МТ-2 целевых клеток (Montefiori D.C. (1988) J. Clin. Microbiol. 26, 231-235).To determine whether the antiserum created by immunization with DNA will have antiviral activity, the ability of the antiserum to neutralize HIV-1 infection has been investigated. Infinite HIV-1 / III 8 virus at 100 TCID 50 was incubated with successive dilutions of antiserum before using target cells to infect MT-2 (Montefiori DC (1988) J. Clin. Microbiol. 26, 231-235).

Сто (100) TCID50 ВИЧ/III8 бесклеточного вируса выдерживают один час при 37oC с последовательными разбавлениями антисыворотки. После выдерживания подвергнутые предварительной обработке вирусы наносят на пластинки с целевой МТ-2 клеточной линией (4 • 106), выдерживают один час при 37oC, после инфицирования МТ-2 клетки промывают трижды и затем инкубируют при 37oC и 5% СО2. Спустя три дня определяют количественно слияние путем визуального подсчета числа синцитий на лунку в опытах с тремя повторами под фазовоконтрастным микроскопом.One hundred (100) TCID 50 HIV / III 8 cell-free viruses were incubated for one hour at 37 ° C. with successive dilutions of antiserum. After incubation, the pre-treated viruses are applied to plates with the target MT-2 cell line (4 x 10 6 ), incubated for one hour at 37 ° C, after infection with MT-2, the cells are washed three times and then incubated at 37 ° C and 5% CO 2 . Three days later, fusion was quantified by visual counting of the number of syncytium per well in experiments with three repetitions under a phase contrast microscope.

Полученные результаты показаны на фиг. 4. На фиг. 4А показаны результаты, полученные использованием сыворотки от иммунизированной вектором мыши в сравнении с сывороткой при иммунизации рМ160. Графики зависимости величин нейтрализации (Vn/Vo) от фактора разбавления (Nara P. (1989) "Методы исследования ВИЧ", ред. Aldovini A., Walkter B.D., 77-86, M. Стоктон Пресс) показаны на фиг. 4С. Контрольная сыворотка (-х-) получена от иммунизированной pMAMneoBlue вектором мыши. Испытуемая сыворотка (-о-) получена от иммунизированных рМ160 мышей.The results obtained are shown in FIG. 4. In FIG. 4A shows the results obtained using serum from a mouse immunized with a vector in comparison with serum when immunized with pM160. Plots of neutralization (V n / V o ) versus dilution factor (Nara P. (1989) HIV Research Methods, ed. Aldovini A., Walkter BD, 77-86, M. Stockton Press) are shown in FIG. 4C. Control serum (-x-) was obtained from immunized with pMAMneoBlue mouse vector. Test serum (-o) was obtained from immunized pM160 mice.

Подавление синцитий осуществляют по методике Osther К. и др. (1991) Hybridoma 10, 673-683. Клеточную линию Н9/III8 предварительно инкубируют тридцать минут при 37oC и 5% СО2 с последовательными разбавлениями (1:100, 1:200 и 1:400) антисыворотки, приготовленными в планшетах на 96 лунок в общем объеме 50 мкл. Спустя три дня определяют количественно слияние путем визуального подсчета числа синцитий на лунку под фазовоконтрастным микроскопом. Фиг. 4D иллюстрирует совместное культивирование целевых клеток с ВИЧ-1/III8 клеточной линией, обработанной сывороткой от предиммунизации. Фиг. 4Е иллюстрирует то же самое, что и фиг. 4D, но обработка ведется сывороткой от контрольной иммунизации вектором. Фиг. 4F иллюстрирует то же самое, что и фиг. 4D, но обработка ведется сывороткой от иммунизации rgp160. Фиг. 4G иллюстрирует то же самое, что и фиг. 4D, но обработка ведется сывороткой от иммунизации рМ160. Фиг. 4D-4G показывают, что в данном анализе подавление синцитий становится очевидным при разбавлении 1:200. МТ-2 клетки инфицируют бесклеточным ВИЧ-1/III8 вирусом, предварительно инкубированным синцитиями, легко образующимися в антисыворотке от иммунизации вектором (фиг. 4А).The suppression of syncytium is carried out according to the method of Osther K. et al. (1991) Hybridoma 10, 673-683. The H9 / III 8 cell line was preincubated for thirty minutes at 37 ° C and 5% CO 2 with successive dilutions (1: 100, 1: 200 and 1: 400) of antiserum prepared in 96 well plates in a total volume of 50 μl. Three days later, fusion is quantified by visually counting the number of syncytium per well under a phase contrast microscope. FIG. 4D illustrates co-cultivation of target cells with HIV-1 / III 8 pre-immunized serum cell line. FIG. 4E illustrates the same as FIG. 4D, but the treatment is carried out with serum from the control immunization with the vector. FIG. 4F illustrates the same thing as FIG. 4D, but treatment is carried out with rgp160 immunization serum. FIG. 4G illustrates the same as FIG. 4D, but treatment is carried out with pM160 immunization serum. FIG. 4D-4G show that in this assay, suppression of syncytium becomes apparent at a 1: 200 dilution. MT-2 cells are infected with the acellular HIV-1 / III 8 virus previously incubated with syncytia, which easily forms in the antiserum from immunization with the vector (Fig. 4A).

Для сравнения: предварительное инкубирование с сывороткой от иммунизированной рМ160 мыши предотвращает образование синцитий (фиг. 4В). Кинетику нейтрализации определяют построением графика зависимости Vn/Vo от последовательных разбавлений (Nara P. (1989) "Методы исследования ВИЧ", ред. Aldovini А., Walker B.D., 77-86, М. Стоктон Пресс) (фиг. 4С). Сыворотка от рМ160 иммунизированной мыши проявляет биологическую нейтрализующую активность при разбавлениях вплоть до 1:320, в то время как контрольная антисыворотка не показывает аналогичной активности.In comparison: pre-incubation with serum from an immunized mouse pM160 prevents the formation of syncytium (Fig. 4B). The neutralization kinetics is determined by plotting V n / V o versus sequential dilutions (Nara P. (1989) HIV Research Methods, ed. A. Aldovini, Walker BD, 77-86, M. Stockton Press) (Fig. 4C) . The serum from the pM160 immunized mouse exhibits biological neutralizing activity when diluted up to 1: 320, while the control antiserum does not show similar activity.

Для определения того, будет ли антисыворотка от рМ160 иммунизированной мыши способна подавлять передаваемое через оболочку распространение вируса путем слияния непосредственно клетка с клеткой, проведены опыты с подавлением синцитий. Антисыворотка от рМ160 иммунизированной мыши подавляют ВИЧ-1 индуцируемое образование синцитий при разбавлении 1:200 (фиг. 4G). И напротив, предиммунная сыворотка, антисыворотка от rgp160 иммунизированной мыши (фиг. 4F) и антисыворотка от иммунизированных контрольных вектором животных (фиг. 4Е) оказались не способны подавлять образование синцитий при том же разбавлении. In order to determine whether the antiserum from pM160 of an immunized mouse is able to suppress the transmission of the virus transmitted through the membrane by directly fusing the cell with the cell, experiments were carried out to suppress syncytium. The antiserum from the pM160 immunized mouse suppresses HIV-1-induced syncytium formation at a dilution of 1: 200 (FIG. 4G). In contrast, the pre-immune serum, the antiserum from rgp160 of the immunized mouse (Fig. 4F) and the antiserum from the immunized control animals of the vector (Fig. 4E) were not able to suppress the formation of syncytia with the same dilution.

Наблюдения, сделанные в опытах по нейтрализации (фиг. 4А-С) и подавлению образования синцитий (фиг. 4D-G) для указанных сывороток, коррелируются с наблюдениями реакционности, сделанные в ФИСА (фиг. 3). Антисыворотка от рМ160 иммунизированной мыши, показавшая высокий уровень связывания с нейтрализующими эпитопами, проявила также и высокий уровень антивирусной активности. И напротив, с низким уровнем связывания с теми же эпитопами, в том числе антисыворотка от rgp160 иммунизированной мыши, обладает низкой антивирусной активностью. The observations made in the neutralization experiments (Fig. 4A-C) and inhibition of syncytium formation (Fig. 4D-G) for these sera correlate with the reactivity observations made in FISA (Fig. 3). The antiserum from the pM160 immunized mouse, which showed a high level of binding to neutralizing epitopes, also showed a high level of antiviral activity. Conversely, with a low level of binding to the same epitopes, including the antiserum from rgp160 of an immunized mouse, it has low antiviral activity.

Для выявления того, будет ли антисыворотка от рМ160 иммунизированной мыши способна подавлять связывание gp120 с СD4- содержащими Т-клетками, проведен анализ прямого подавления с применением флюроцитометрии (Chen Y.H. и др. (1992) AIDS 6, 533-539). Сделано наблюдение о том, что сыворотка от иммунизированный рМ160 конструктом мыши способна блокировать связывание gp120 с СD4-содержащими Т-клетки. Иммунная сыворотка в разбавлении 1:15 подавляет связывание FITC-gp120 с CD4+ SupT1 клетками на 22±2% при определении проточной цитометрией в дублированных опытах. Это указывает на то, что указанная область проникновения ВИЧ в целевые клетки может быть также функционально подавлена данной антисывороткой. Полученные данные коррелируются с наблюдаемой в ФИСА реакционностью антисыворотки к пептидам CD4 участка связывания (фиг. 3C).To determine whether the antiserum from pM160 of an immunized mouse is able to inhibit the binding of gp120 to CD4-containing T cells, a direct inhibition assay was performed using fluorocytometry (Chen YH et al. (1992) AIDS 6, 533-539). It was observed that serum from an immunized mouse pM160 construct was able to block the binding of gp120 to CD4-containing T cells. Immune serum at a 1:15 dilution inhibits the binding of FITC-gp120 to CD4 + SupT1 cells by 22 ± 2% when determined by flow cytometry in duplicate experiments. This indicates that this region of HIV penetration into target cells can also be functionally suppressed by this antiserum. The data obtained correlate with the observed in FISA reactivity of the antiserum to peptides CD4 binding site (Fig. 3C).

Применением продажного набора мышиных моноклональных антител для определения изотипов (Сигма) проведены исследования изотипа иммуноглобулина. Из анти-gp160 специфичных антител, создаваемых рМ160 иммунизацией, 19% относятся к IgG1, 51% - в IgG2, 16% - к IgG3, 10% - к IgM и 5% относятся к IgA. Using a commercially available mouse monoclonal antibody kit for isotype determination (Sigma), immunoglobulin isotype studies were performed. Of the anti-gp160 specific antibodies produced by pM160 immunization, 19% are IgG1, 51% are IgG2, 16% are IgG3, 10% are IgM and 5% are IgA.

Преобладание IgC изотипов указывает на протекание вторичной иммунной реакции, что еще больше усиливает предположение о возможности возникновения при генетической вакцинации хелперных Т-клеток. The predominance of IgC isotypes indicates the occurrence of a secondary immune response, which further strengthens the assumption that helper T cells can arise during genetic vaccination.

Титрационные микропланшеты покрывают рМ160 и PMAMneoBlue ДНК и методом ФИСА с применением сыворотки всех иммунизированных животных определяют специфичное связывание. Никакого значительного связывания с плазмидной ДНК не отмечено. Таким образом, маловероятно, что применением генетического материала для инокуляции мышечной ткани можно создать реакцию против плазмидной ДНК. The microtiter plates are coated with pM160 and PMAMneoBlue DNA and specific binding is determined by the FISA method using serum from all immunized animals. No significant binding to plasmid DNA was noted. Thus, it is unlikely that using genetic material to inoculate muscle tissue can create a reaction against plasmid DNA.

Введение ДНК конструкта в мышцы мыши инъекций с помощью иглы может привести к непредсказуемым результатам, поскольку такая методика не обеспечивает средств регулирования поглощения ДНК клетками мышц. Проведено сравнение инициирования одного только ДНК конструкта (n ≈ 4) с животными (n ≈ 4), предварительно обработанных бупивакаином. Наблюдаемые в двух группах иммунные реакции не совпадают, и методом ФИСА для этих групп получены величины соответственно в 25% и 75% для респондирующих животных. Повышенная эффективность может быть достигнута применением системы прямой доставки ДНК, например, бомбардировкой частицами (Klein Т.М. и др. (1992) Biotechnology 10, 286-291). The introduction of DNA construct into the muscle of the mouse by injection using a needle can lead to unpredictable results, since this technique does not provide a means of regulating the absorption of DNA by muscle cells. The initiation of DNA construct alone (n ≈ 4) with animals (n ≈ 4) pretreated with bupivacaine was compared. The immune reactions observed in the two groups do not coincide, and the FISA method for these groups yields values of 25% and 75%, respectively, for the responding animals. Increased efficiency can be achieved by using a direct DNA delivery system, for example, particle bombardment (Klein, T.M. et al. (1992) Biotechnology 10, 286-291).

Факты нейтрализации, подавления синцитий, подавления CD4-gp120 связывания и специфичного связывания с некоторыми важными областями в gp160 показывают, что введение ДНК конструкта, кодирующего ВИЧ gp160 связанный с мембраной гликопротеин, непосредственно в мышцы животного вызывает специфичные гуморальные реакции и ведет к образованию биологически уместных антивирусных антител. The facts of neutralization, suppression of syncytium, suppression of CD4-gp120 binding and specific binding to some important areas in gp160 show that the introduction of the DNA construct encoding HIV gp160 membrane-bound glycoprotein directly into the muscles of the animal causes specific humoral reactions and leads to the formation of biologically relevant antiviral antibodies.

Для выявления того, будет ли вакцина способна создавать защитную иммунную реакцию, использована вышеописанная модель на животных. Клетки опухоли трансфецируют ДНК, кодирующей gp160, затем подтверждают экспрессию белка и имплантируют животному. Контроль включает нетрансфецированные клеточные линии. To determine whether the vaccine will be able to create a protective immune response, the above animal model was used. Tumor cells transfect DNA encoding gp160, then confirm the expression of the protein and implant the animal. Control includes nontransfected cell lines.

Генетически иммунизированных животных вакцинируют плазмидой рМ160. Контроль включает невакцинированных животных, животных, вакцинированных только векторной ДНК, и животных, которым введен gp160 белок. Genetically immunized animals are vaccinated with plasmid pM160. The control includes unvaccinated animals, animals vaccinated with vector DNA only, and animals that have been introduced gp160 protein.

Полученные результаты показывают, что иммунная реакция вакцинированной мыши достаточна для полного удаления трансфецированных опухолей без оказания какого-либо воздействия на нетрансфецированные опухоли. Вакцинация gp160 белком приводит к некоторому уменьшению размера трансфецированных опухолей по сравнению с нетрансфецированными опухолями, но не оказывает никакого влияния на смертность. Невакцинированные животные показали одинаковую смертность как для трансфецированных, так и нетрансфецированных опухолей. The results show that the immune response of the vaccinated mouse is sufficient to completely remove the transfected tumors without exerting any effect on the non-transfected tumors. Vaccination with gp160 protein leads to a slight decrease in the size of transfected tumors compared to non-transfected tumors, but has no effect on mortality. Unvaccinated animals showed the same mortality for both transfected and non-transfected tumors.

Пример 4
Ниже приводится перечень конструктов, которые могут быть использованы в способах настоящего изобретения. Впервые сообщение о создании вектора pBabe. puro, применяемого в качестве исходного вещества при создании многих из нижеперечисленных конструктов, появилось в работе Morgenstenn J.P., Land H. (1990) Nucl. Acids Res. 18(12), 3587-3596, которая вводится здесь в качестве ссылки. Плазмида pBabe. puro особенно приемлема для экспрессии экзогенных генов в клетках млекопитающих. Подлежащие экспрессии ДНК последовательности вставляют в участки клонирования под контролем повтора длинного конца (ПДК) вируса Молони мышиного лейкоза (Мо MuLV) промотора. Плазмида содержит отбираемый маркер для устойчивости к пуромицину.
Example 4
The following is a list of constructs that can be used in the methods of the present invention. First post on pBabe vector creation. puro, used as a starting material in the construction of many of the following constructs, appeared in Morgenstenn JP, Land H. (1990) Nucl. Acids Res. 18 (12), 3587-3596, which is incorporated herein by reference. Plasmid pBabe. puro is particularly suitable for the expression of exogenous genes in mammalian cells. The sequences to be expressed are inserted into the cloning sites under the control of the long-term repeat (MAC) of the murine mouse leukemia virus (Mo MuLV) promoter. The plasmid contains a selectable marker for puromycin resistance.

Пример 5
Плазмида pBa.Vα3 является плазмидой в 7.8 к.о., содержащей 2.7 к. о. EcoRI геномного фрагмента, кодирующего Vα3 область Т-клеточного рецептора, содержащую L, V и J сегменты, клонированные в EcoRI сайте плазмиды pBabe.puro. Происходящий из Т-клеточного рецептора целевой белок применим для вакцинации против и лечении передаваемого через Т-клетки аутоиммунного заболевания, а также клонотипичной Т-клеточной лимфомы и лейкоза.
Example 5
Plasmid pBa.Vα3 is a plasmid at 7.8 kb containing 2.7 kb. EcoRI of the genomic fragment encoding the Vα3 region of the T cell receptor containing the L, V and J segments cloned at the EcoRI site of the plasmid pBabe.puro. The target protein originating from the T cell receptor is useful for vaccinating against and treating autoimmune disease transmitted through T cells, as well as clonotypic T cell lymphoma and leukemia.

Пример 6
Плазмида pBa. gagpol-vpr является плазмидой в 9.88 к.о., содержащей gag/pol и vlf гены из ВИЧ/MN, клонированные в pBabe.puro. Ген vpr изъят. Плазмида, содержащая указанные вирусные гены, кодирующие ВИЧ целевые белки, применима для иммунизации от ВИЧ инфекции и СПИД и для их лечения. ВИЧ ДНК последовательность опубликована в работе: Reiz M.S. (1992) AIDS Res. Human Retro. B, 1549, которая вводится здесь в качестве ссылки. Последовательность может быть получена в Генбанке под N М17449, который указан здесь в виде ссылки.
Example 6
Plasmid pBa. gagpol-vpr is a 9.88 kb plasmid containing gag / pol and vlf genes from HIV / MN cloned into pBabe.puro. The vpr gene has been removed. A plasmid containing the indicated viral genes encoding HIV target proteins is useful for immunization against HIV infection and AIDS and for their treatment. HIV DNA sequence published by: Reiz MS (1992) AIDS Res. Human Retro. B, 1549, which is incorporated herein by reference. The sequence can be obtained in the Genebank under N M17449, which is indicated here by reference.

Пример 7
Плазмида рМ160 является плазмидой в 11 к.о., содержащей 2.3 к. о. ПЦР фрагмента, кодирующего ВИЧ-1/3В оболочечный белок и rev/tat гены, клонированные в pMAMneoBlue. Область nef изъята. Плазмида, содержащая указанные вирусные гены, кодирующие целевые белки, применима для вакцинации от ВИЧ инфекции и СПИД и для их лечения. ДНК последовательность ВИЧ-1/3В опубликована в работе; Fisher А. (1995) Nature 316, 262, которая вводится здесь в качестве ссылки. Последовательность может быть получена в Генбанке под N К03455, который указан здесь в виде ссылки.
Example 7
Plasmid pM160 is an 11 kb plasmid containing 2.3 kb. PCR fragment encoding HIV-1 / 3B envelope protein and rev / tat genes cloned into pMAMneoBlue. The nef area has been removed. A plasmid containing the indicated viral genes encoding the target proteins is applicable for vaccination against HIV infection and AIDS and for their treatment. DNA sequence HIV-1 / 3B published in the work; Fisher A. (1995) Nature 316, 262, which is incorporated herein by reference. The sequence can be obtained in the Genebank under N K03455, which is indicated here by reference.

Пример 8
Плазмида pBa.VL является плазмидой в 5.4 к.о., содержащей ПЦР фрагмент, кодирующий VL область анти-ДНК антитела, клонированную в pBabe.puro в XbaI и EcoRI сайтах. Происходящий из антитела целевой белок служит примером целевого белка, применимого для вакцинации от передаваемого через В-клетки аутоиммунного заболевания и клонотипичной В-клеточной лимфомы и лейкоза. Общую методику клонирования функциональных переменных областей из антител можно найти в работе: Chaudhary V.К. и др. (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. США 87, 1066, которая вводится здесь в качестве ссылки.
Example 8
Plasmid pBa.VL is a 5.4 kb plasmid containing a PCR fragment encoding the VL region of an anti-antibody antibody cloned at pBabe.puro at XbaI and EcoRI sites. The target protein derived from an antibody is an example of a target protein useful for vaccination against B-cell-transmitted autoimmune disease and clonotypic B-cell lymphoma and leukemia. A general technique for cloning functional variable regions from antibodies can be found in: Chaudhary V.K. et al. (1990) Proc. Natl. Acad Sci. US 87, 1066, which is incorporated herein by reference.

Пример 9
Плазмида pOspa.B является плазмидой в 6.84 к.о., содержащей области кодирования, кодирующие OspA и OspB антигены Borrelia burgdorferi - спирохеты, ответственной за болезнь Лима. Антигены клонированы BamHI и SalI сайтах плазмиды pBabe. puro. ПЦР праймеры, применяемые для создания OspA и OspB фрагментов, имеют следующие последовательности: 5'-GAAGGATCCATGAAAAAATATTTATTGGG-3' (ПОСЛЕД. N 3) и 5'-ACTGTCGACTTATTTTAAAGCGTTTTTAAG-3' (ПОСЛЕД. N 4). Cм.: Williams W.V. и др. (1992) DNA and Cell. Viol. 11(3), 207, которая вводится здесь в качестве ссылки. Плазмида, содержащая указанные патогенные гены, кодирующие целевые белки, применима для вакцинации от болезни Лима.
Example 9
Plasmid pOspa.B is a 6.84 kb plasmid containing the coding region encoding the OspA and OspB antigens of Borrelia burgdorferi, the spirochete responsible for Lim disease. Antigens are cloned by BamHI and SalI sites of plasmid pBabe. puro. PCR primers used to create OspA and OspB fragments have the following sequences: 5'-GAAGGATCCATGAAAAAATATTTATTGGG-3 '(SEQ. N 3) and 5'-ACTGTCGACTTATTTTAAAGCGTTTTTAAG-3' (SEQ. N 4). See: Williams WV et al. (1992) DNA and Cell. Viol. 11 (3), 207, which is incorporated herein by reference. A plasmid containing the indicated pathogenic genes encoding target proteins is useful for vaccination against Lim disease.

Пример 10
Плазмида pBa. RB-G является плазмидой в 7.1 к.о., содержащей созданный методом ПЦР фрагмент, кодирующей белок С бешенства, клонированный в BamHI сайт плазмиды pBabe.puro. Содержащая этот патогенный ген плазмида, кодирующая белок С бешенства, применима для вакцинации от бешенства. ДНК последовательность находится в Генбанке под N М32751, который указан здесь в виде ссылки. См. также: Aniliopis А. и др. (1981) Nature 294, 275, которая вводится здесь в качестве ссылки.
Example 10
Plasmid pBa. RB-G is a 7.1 kb plasmid containing the PCR generated fragment encoding rabies protein C cloned into the BamHI site of pBabe.puro plasmid. The plasmid containing this pathogen gene encoding rabies protein C is useful for rabies vaccination. The DNA sequence is in Genbank under N M32751, which is indicated here by reference. See also: Aniliopis A. et al. (1981) Nature 294, 275, which is incorporated herein by reference.

Пример 11
Плазмида pBa.HPV-L1 является плазмидой в 6.8 к.о., содержащей созданный методом ПЦР фрагмент, кодирующий L1 капсидный белок вируса папилломы человека (ВПЧ), в том числе его штаммов 16, 18, 31 и 33. Фрагмент клонирован в BamHI и EcoRI сайтах плазмиды pBabe.puro. ДНК последовательность помещена в Генбанк под N М15781, который указан здесь в виде ссылки. См. также: Howley P. (1990) "Разделы вирусологии", том 2, ред. Channock R.M. и др., глава 58, 1625 и Shah К., Howley P., "Разделы вирусологии" (1990), том 2, ред. Channock R.M. и др., глава 59, каждое из которых вводится здесь в качестве ссылки. Плазмида применима для вакцинации от ВПЧ инфекции и в терапии раковых заболеваний.
Example 11
Plasmid pBa.HPV-L1 is a 6.8 kb plasmid containing a fragment created by PCR that encodes the L1 capsid protein of human papillomavirus (HPV), including its strains 16, 18, 31 and 33. The fragment was cloned into BamHI and EcoRI plasmid sites of pBabe.puro. The DNA sequence is placed in the Genebank under N M15781, which is indicated here by reference. See also: Howley P. (1990) "Sections of Virology", Volume 2, ed. Channock RM et al., Chapter 58, 1625, and Shah K., Howley P., "Sections of Virology" (1990), Volume 2, ed. Channock RM et al., Chapter 59, each of which is incorporated herein by reference. The plasmid is applicable for vaccination against HPV infection and in the treatment of cancer.

Пример 12
Плазмида pBa.HRV-L2 является плазмидой в 6.8 к. о., содержащей созданный методом ПЦР фрагмент, кодирующий L2 капсидный белок вируса папилломы человека (ВПЧ), в том числе штаммов 16, 18, 31 и 33 ВПЧ. Фрагмент клонирован в BamHI и EcoRI сайтах плазмиды pBabe.puro. Плазмида применима для вакцинации от ВПЧ инфекции и в терапии раковых заболеваний. ДНК последовательность помещена в Генбанк под N М15781, который указан здесь в виде ссылки. См. также издания: Howley P. (1990) "Разделы вирусологии", том. 2, ред. Channock и др., глава 58, 1625; Shah К., P. Howley (1990) "Разделы вирусологии", том 2, ред. Channock и др., глава 59, каждое из которых вводится здесь в качестве ссылки.
Example 12
Plasmid pBa.HRV-L2 is a 6.8 kb plasmid containing the fragment created by PCR that encodes the L2 capsid protein of human papilloma virus (HPV), including HPV strains 16, 18, 31 and 33. The fragment was cloned at BamHI and EcoRI sites of plasmid pBabe.puro. The plasmid is applicable for vaccination against HPV infection and in the treatment of cancer. The DNA sequence is placed in the Genebank under N M15781, which is indicated here by reference. See also: Howley P. (1990), "Sections of Virology," vol. 2, ed. Channock et al., Chap. 58, 1625; Shah K., P. Howley (1990) "Sections of Virology", Volume 2, ed. Channock et al., Chapter 59, each of which is incorporated herein by reference.

Пример 13
Плазмида pBa. MNp7 является плазмидой в 5.24 к.о., содержащей созданный методом ПЦР фрагмент, кодирующий область кодирования р7, включающую ВИЧ MN gag (белок ядра) последовательность, клонированную в BamHI сайте плазмиды pBabe. puro. Содержащая указанные ВИЧ вирусные гены, кодирующие ВИЧ целевые белки, плазмида применима для вакцинации от ВИЧ инфекции и СПИД и для их лечения. См. работу: Reiz M.S. (1992) AIDS Res. Human Retro. 8, 1549, которая вводится здесь в качестве ссылки. Последовательность может быть получена в Генбанке под N М17449, который указан здесь в виде ссылки.
Example 13
Plasmid pBa. MNp7 is a 5.24 kb plasmid containing the PCR generated fragment encoding the p7 coding region, including the HIV MN gag (core protein) sequence cloned at the BamHI site of pBabe plasmid. puro. Containing these HIV viral genes encoding HIV target proteins, the plasmid is applicable for vaccination against HIV infection and AIDS and for their treatment. See work: Reiz MS (1992) AIDS Res. Human Retro. 8, 1549, which is incorporated herein by reference. The sequence can be obtained in the Genebank under N M17449, which is indicated here by reference.

Пример 14
Плазмида pGA733-2 является плазмидой в 6.3 к.о., содержащей поверхностный антиген GA-733-2 опухоли, клонированный из клеточной линии SW948 колоректальной карциномы в pCUM8 вектор (Seed В., A. Aruffo (1987) Proc. Natl. Acad. Sci. США 84, 3365, вводится здесь в качестве ссылки) в BstXI сайте. Ассоциируемый с опухолью целевой белок является примером целевого белка, пригодного для вакцинации от и лечения гиперпролиферативного заболевания, например рака. GA733-2 антиген является целевым антигеном против рака ободочной кишки. Сообщения об GA733 антигене приводятся в работе: Szala S. и др. (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. США 87, 3542- 3546, которая вводится здесь в качестве ссылки.
Example 14
Plasmid pGA733-2 is a 6.3 kb plasmid containing tumor surface antigen GA-733-2, cloned from colorectal carcinoma cell line SW948 into pCUM8 vector (Seed B., A. Aruffo (1987) Proc. Natl. Acad. Sci. US 84, 3365, hereby incorporated by reference) in the BstXI site. A tumor-associated target protein is an example of a target protein suitable for vaccinating against and treating a hyperproliferative disease, for example, cancer. The GA733-2 antigen is a targeted antigen against colon cancer. Reported GA733 antigen cited in: Szala S. et al. (1990) Proc. Natl. Acad Sci. US 87, 3542-3546, which is incorporated herein by reference.

Пример 15
Плазмида pT4-pMV7 является плазмидой в 11.15 к.о., содержащей кДНК, кодирующую CD4 рецептор человека, клонированный в pMV7 вектор по EcoRI сайту. CD4 целевой белок применим для вакцинации от Т-клеточной лимфомы и ее лечения. Плазмида pT4-pMV7 может быть получена в СПИД Хранилище, каталожный номер 158.
Example 15
Plasmid pT4-pMV7 is a 11.15 kb plasmid containing cDNA encoding a human CD4 receptor cloned into a pMV7 vector at the EcoRI site. CD4 target protein is useful for vaccination against T-cell lymphoma and its treatment. Plasmid pT4-pMV7 can be obtained from the AIDS Repository, catalog number 158.

Пример 16
Плазмида pDJCA733 является плазмидой в 5.1 к.о., содержащей GA733 поверхностный антиген опухоли, клонированный в pBabe.puro по BamHI сайту. Ассоциируемый с опухолью целевой белок является примером целевого белка, применимого для вакцинации от и для лечения гиперпролиферативного заболевания, например рака. GA733 антиген является целевым антигеном против рака ободочной кишки.
Example 16
Plasmid pDJCA733 is a 5.1 kb plasmid containing the GA733 surface tumor antigen cloned into pBabe.puro at the BamHI site. A tumor-associated target protein is an example of a target protein useful for vaccinating against and for treating a hyperproliferative disease, for example, cancer. GA733 antigen is a targeted antigen against colon cancer.

Пример 17
Плазмида pBa.RAS является плазмидой в 6.8 к. о., содержащей ras область кодирования, которую вначале субклонируют из pZIPneoRAS и клонируют в pBabe. puro по BamHI сайту. Целевой белок ras служит примером цитоплазмический сигнальной молекулы. Способ клонирования ras приводится в работе: Weinberg (1984) Mol. Cell. Biol. 4, 1577, которая вводится здесь в качестве ссылки. Кодирующая ras плазмида применима для вакцинации от и для лечения гиперпролиферативного заболевания, например рака, в частности, рака мочевого пузыря, мышц, легких, мозга и костей.
Example 17
Plasmid pBa.RAS is a 6.8 kb plasmid containing the ras coding region, which is first subcloned from pZIPneoRAS and cloned into pBabe. puro on the BamHI site. The ras target protein is an example of a cytoplasmic signaling molecule. A method for cloning ras is provided by Weinberg (1984) Mol. Cell. Biol. 4, 1577, which is incorporated herein by reference. The ras coding plasmid is useful for vaccination against and for the treatment of hyperproliferative disease, for example, cancer, in particular cancer of the bladder, muscles, lungs, brain and bones.

Пример 18
Плазмида pBa.MNp55 является плазмидой в 6.38 к.о., содержащей созданный методом ПЦР фрагмент, кодирующий область кодирования р55, включающую последовательность ВИЧ MN gag предшественника (белок ядра), клонированную в pBabe. puro по BamHI сайту. Плазмида, содержащая указанные вирусные гены ВИЧ, кодирующие ВИЧ целевые белки, применима для вакцинации от ВИЧ инфекции и СПИД и для их лечения. См. работу: Reiz M.S. (1992) AIDS Res. Human Retro. 8, которая вводится здесь в качестве ссылки. Последовательность может быть получена в Генбанке под N М17449, который указан здесь в виде ссылки.
Example 18
Plasmid pBa.MNp55 is a 6.38 kb plasmid containing the PCR generated fragment encoding the p55 coding region including the HIV MN gag precursor sequence (core protein) cloned into pBabe. puro on the BamHI site. A plasmid containing the indicated HIV viral genes encoding HIV target proteins is useful for vaccination against HIV infection and AIDS and for their treatment. See work: Reiz MS (1992) AIDS Res. Human Retro. 8, which is incorporated herein by reference. The sequence can be obtained in the Genebank under N M17449, which is indicated here by reference.

Пример 19
Плазмида pBa.MNp24 является плазмидой в 5.78 к.о., содержащей созданный методом ПЦР фрагмент из pMN-SFl матрицы, кодирующей область кодирования р24, включающей полную ВИЧ MN gag область кодирования, клонированную в pBabe.puro по BamHI и EcoRI сайтам. Плазмида, содержащая указанные ВИЧ вирусные гены, кодирующие ВИЧ целевые белки, применима для вакцинации от ВИЧ инфекции и СПИД и для их лечения. См. работу: Reiz M.S. (1992) AIDS Res. Human Retro. 8, 1549, которая вводится здесь в качестве ссылки. Последовательность может быть получена в Генбанке под N М17449, который указан здесь в виде ссылки.
Example 19
Plasmid pBa.MNp24 is a 5.78 kb plasmid containing a PCR generated fragment from a pMN-SFl matrix encoding a p24 coding region including a complete HIV MN gag coding region cloned into pBabe.puro by BamHI and EcoRI sites. A plasmid containing said HIV viral genes encoding HIV target proteins is useful for vaccination against HIV infection and AIDS and for their treatment. See work: Reiz MS (1992) AIDS Res. Human Retro. 8, 1549, which is incorporated herein by reference. The sequence can be obtained in the Genebank under N M17449, which is indicated here by reference.

Пример 20
Плазмида pBa.MNpl7 является плазмидой в 5.5 к. о., содержащей созданный методом ПЦР фрагмент, кодирующий область кодирования р17, включающую ВИЧ MN gag (белок ядра) последовательность, клонированную в pBabe.puro по BamHI и EcoRI сайтам. Плазмида, содержащая указанные ВИЧ вирусные гены, кодирующие ВИЧ целевые белки, применима для вакцинации от ВИЧ инфекции и СПИД и для их лечения. См. работу: Reiz M.S. (1992) AIDS Res. Human Retro. 8, 1549, которая вводится здесь в качестве ссылки. Последовательность может быть получена в Генбанке под N М17449, который указан здесь в виде ссылки.
Example 20
Plasmid pBa.MNpl7 is a 5.5 kb plasmid containing the PCR generated fragment encoding the p17 coding region, including the HIV MN gag (core protein) sequence cloned into pBabe.puro at BamHI and EcoRI sites. A plasmid containing said HIV viral genes encoding HIV target proteins is useful for vaccination against HIV infection and AIDS and for their treatment. See work: Reiz MS (1992) AIDS Res. Human Retro. 8, 1549, which is incorporated herein by reference. The sequence can be obtained in the Genebank under N M17449, which is indicated here by reference.

Пример 21
Плазмида pBa.SIVenv является плазмидой в 7.8 к. о., содержащей созданный методом ПЦР фрагмент в 2.71 к.о., амплифицированный из конструкта, содержащего SIV 239 в рВР322 и клонированный в pBabe.puro по BamHI и EcoRI сайтам. Применяют следующие праймеры: 5'-GCCAGTTTTGGATCCTTAAAAAAGGCTTGG-3' (ПОСЛЕД. N 5) и 5'-TTGTGAGGGACAGAATTCCAATCAGGG-3' (ПОСЛЕД. N 6). Последовательность может быть получена от Программы исследования СПИД и ссылочных реагентов, каталожный N 210.
Example 21
Plasmid pBa.SIVenv is a 7.8 kb plasmid containing the 2.71 kb PCR generated fragment amplified from a construct containing SIV 239 in pBP322 and cloned into pBabe.puro at BamHI and EcoRI sites. The following primers are used: 5'-GCCAGTTTTGGATCCTTAAAAAAGGCTTGG-3 '(SEQ. N 5) and 5'-TTGTGAGGGACAGAATTCCAATCAGGG-3' (SEQ. N 6). The sequence can be obtained from the AIDS Research Program and reference reagents, catalog N 210.

Пример 22
Плазмида pcTSP/ATK.env является плазмидой в 8.92 к.о., содержащей созданный методом ПЦР фрагмент, кодирующий полную область кодирования HTLV оболочки из HTLV-1/TSP и /АТК изолятов, субклонированных pcDNA1/neo вектор. Применяют следующие праймеры: 5'-CAGTGATATCCCGGGAGACTCCTC-3' (ПОСЛЕД. N 7) и 5'- GAATAGAAGAACTCCTCTAGAATTC-3' (ПОСЛЕД. N 8). Сообщения о плазмиде pcTSP/ATK. env даются в работе: Proc. Natl. Acad. Sci. США 85, 3599 (1988), которая вводится здесь в качестве ссылки, HTLV env целевой белок применим для вакцинации от HTLV и Т-клеточной лимфомы и для их лечения.
Example 22
Plasmid pcTSP / ATK.env is an 8.92 kb plasmid containing the PCR generated fragment encoding the entire HTLV encoding region of the HTLV-1 / TSP and / ATK isolates subcloned by the pcDNA1 / neo vector. The following primers are used: 5'-CAGTGATATCCCGGGAGAGACTCCTC-3 '(LAST N 7) and 5'-GAATAGAAGAACTCCTCTAGAATTC-3' (LAST N 8). Messages about the plasmid pcTSP / ATK. env are given in the work: Proc. Natl. Acad Sci. US 85, 3599 (1988), which is incorporated herein by reference, HTLV env target protein is applicable for vaccination against HTLV and T cell lymphoma and for their treatment.

Пример 23
Плазмида pBa.MNgpl60 является плазмидой в 7.9 к.о., содержащей созданный методом ПЦР фрагмент в 2.8 к. о., амплифицированный из содержащего MNenv в pSR72 конструкта и клонированного в pBabe.puro по BamHI и EcoRI сайтам. Применяют следующие праймеры: 5'-GCCTTAGGCGGATCCTATGGCAGGAAG-3' (ПОСЛЕД. N 9) и 5'-TAAGATGGGTGGCCATGGTGAAT-3' (ПОСЛЕД. N 10). См. работу: Reiz M.S. (1992) AIDS Res. Himan Retro. 8, 1459, которая вводится здесь в качестве ссылки. Последовательность может быть получена в Генбанке под N М17449, который указан здесь в виде ссылки. Плазмида, содержащая указанные ВИЧ вирусные гены, кодирующие ВИЧ целевые белки, применима для вакцинации от инфекции ВИЧ и СПИД и для их лечения.
Example 23
Plasmid pBa.MNgpl60 is a 7.9 kb plasmid containing the 2.8 kb PCR generated fragment, amplified from the MNenv containing construct in pSR72 and cloned into pBabe.puro at BamHI and EcoRI sites. The following primers are used: 5'-GCCTTAGGCGGATCCTATGGCAGGAAG-3 '(FOLLOW N 9) and 5'-TAAGATGGGTGGCCATGGTGAAT-3' (FOLLOW N 10). See work: Reiz MS (1992) AIDS Res. Himan Retro. 8, 1459, which is incorporated herein by reference. The sequence can be obtained in the Genebank under N M17449, which is indicated here by reference. A plasmid containing said HIV viral genes encoding HIV target proteins is useful for vaccination against HIV and AIDS infection and for their treatment.

Пример 24
Плазмида pC. MNp55 является плазмидой в 11.8 к.о., содержащей созданный методом ПЦР фрагмент в 1.4 к.о., амплифицированный из gag области MN изолята и клонированный в рСЕР4 вектор. Плазмида, содержащая указанные ВИЧ вирусные гены, кодирующие ВИЧ целевые белки, применимы для вакцинации от ВИЧ инфекции и СПИД и для их лечения. См. работу: Reiz M.S. (1992) AIDS Res. Human Retro. 8, 1549, которая вводится здесь в качестве ссылки. Последовательность может быть получена в Генбанке под N М17449, который указан здесь в виде ссылки.
Example 24
Plasmid pC. MNp55 is a 11.8 kb plasmid containing a 1.4 kb PCR-generated fragment amplified from the gag region of the MN isolate and cloned into pCEP4 vector. A plasmid containing said HIV viral genes encoding HIV target proteins is useful for vaccination against HIV infection and AIDS and for their treatment. See work: Reiz MS (1992) AIDS Res. Human Retro. 8, 1549, which is incorporated herein by reference. The sequence can be obtained in the Genebank under N M17449, which is indicated here by reference.

Пример 25
Плазмида pC.Neu является плазмидой в 14.2 к.о., содержащей ДНК фрагмент в 3.8 к. о., в состав которого входит область кодирования neu онкогена человека, вырезанного из LTR-2/erbB-2 конструкта и субклонированного в рСЕР4 вектор. Сообщение о pC.Neu плазмиде приводится в работе: DiFiore (1987) Science 237, 178, которая вводится здесь в качестве ссылки. Целевой белок - peu онкоген служит примером рецептора фактора роста, применимого в качестве целевого белка для вакцинации от и для лечения гиперпролиферативного заболевания, например рака, в частности рака ободочной кишки, молочной железы, легкого и мозга.
Example 25
Plasmid pC.Neu is a 14.2 kb plasmid containing a 3.8 kb DNA fragment, which includes the neu coding region of a human oncogen cut from the LTR-2 / erbB-2 construct and subcloned into the pCEP4 vector. A report on the pC.Neu plasmid is provided in: DiFiore (1987) Science 237, 178, which is incorporated herein by reference. The target protein, peu oncogene, is an example of a growth factor receptor useful as a target protein for vaccination against and for the treatment of a hyperproliferative disease, for example cancer, in particular cancer of the colon, breast, lung and brain.

Пример 26
Плазмида pC.RAS является плазмидой в 11.7 к.о., содержащей ДНК фрагмент в 1.4 к. о. , включающей область кодирования gas онкогена, которую сначала субклонируют из pZIPneoRAS и субклонируют в рСЕР4 по BamHI сайту. Сообщение о pC. RAS плазмиде приводится в работе: Weinberg (1984) Mol. Cell. Biol. 4, 1577, которая вводится здесь в качестве ссылки. Целевой белок ras служит примером цитоплазмической сигнальной молекулы. Кодирующая ras плазмида применима для вакцинации от и для лечения гиперпролиферативного заболевания, например рака, в частности рака мочевого пузыря, мышц, легкого, мозга и костей.
Example 26
Plasmid pC.RAS is a 11.7 kb plasmid containing a 1.4 kb DNA fragment. including the gas coding region of the oncogen, which is first subcloned from pZIPneoRAS and subcloned into pCEP4 at the BamHI site. Report pC. RAS plasmid is provided by: Weinberg (1984) Mol. Cell. Biol. 4, 1577, which is incorporated herein by reference. The ras target protein is an example of a cytoplasmic signaling molecule. The ras coding plasmid is useful for vaccination against and for the treatment of a hyperproliferative disease, for example, cancer, in particular cancer of the bladder, muscle, lung, brain and bone.

Пример 27
Плазмида pNLpuro является плазмидой в 15 к.о., содержащей gag/pol и SV40-puro вставки. Плазмида, содержащая указанные ВИЧ вирусные гены, кодирующие ВИЧ целевые белки, применима для вакцинации от ВИЧ инфекции и СПИД и для их лечения.
Example 27
Plasmid pNLpuro is a 15 kb plasmid containing gag / pol and the SV40-puro insert. A plasmid containing said HIV viral genes encoding HIV target proteins is useful for vaccination against HIV infection and AIDS and for their treatment.

Пример 28
Для проверки эффективности генетической вакцины против человеческого CD4 на мыши создан ДНК конструкт. Данные опыты были созданы для выявления способности вакцины защищать от антигена Т-клеточной лимфомы. При Т-клеточной лимфоме CD4 является специфичным для опухоли антигеном. Соответственно, данная модель показывает способность генетической вакцины защищать от Т-клеточной лимфомы. Кроме того, в данных опытах выявлялась эффективность против одного из членов сверхсемейства иммуноглобулиновых молекул. CD4 характеризуется высокой консервацией между человеческим и мышиным видами.
Example 28
To construct the effectiveness of a genetic vaccine against human CD4, a DNA construct was created in mice. These experiments were created to identify the ability of the vaccine to protect against the antigen of T-cell lymphoma. In T-cell lymphoma, CD4 is a tumor specific antigen. Accordingly, this model shows the ability of a genetic vaccine to protect against T-cell lymphoma. In addition, in these experiments, efficacy against one of the members of the superfamily of immunoglobulin molecules was revealed. CD4 is characterized by high conservation between human and mouse species.

Применяемая модель на животных приведена выше. Клетки опухоли трансфецируют ДНК, кодирующей CD4, подтверждают экспрессию клетками белка, после чего их имплантируют животному. Контроль включает нетрансфецированные клеточные линии. Хотя животные и стали иммунокомпетентными, иммунная реакция не была направлена против имплантированной, CD4-меченой опухоли у невакцинированных животных. The applicable animal model is given above. Tumor cells transfect DNA encoding CD4, confirm the expression of protein cells, after which they are implanted into the animal. Control includes nontransfected cell lines. Although animals became immunocompetent, the immune response was not directed against an implanted, CD4-labeled tumor in unvaccinated animals.

Генетически иммунизированных животных вакцинируют плазмидой pT4-pMV7, описанной в Примере 15. Контроль включает невакцинированных животных и животных, которым вводился CD4 белок. Genetically immunized animals are vaccinated with the plasmid pT4-pMV7 described in Example 15. The control includes unvaccinated animals and animals that were introduced CD4 protein.

В описываемой здесь процедуре генетической иммунизации в квадрицепсные мышцы мышей линии BALB/c инъецируют 100 мкл 0.5% бупивакаина-HCl и 0.1% метилпарабена в изотоническом растворе NaCl применением иглы номер 27 с целью стимулирования регенерации мышечных клеток и облегчения поглощения генетического конструкта. Спустя двадцать четыре часа в тот же участок инъецирования инъецируют либо 100 мкг pT4-pMV7, либо 100 мкг pMV7 в качестве контрольной плазмиды. Мышей ревакцинируют инъецированием того количества ДНК трижды с интервалом в две недели и тем же способом, но без предварительного введения бупивакаина-HCl. In the genetic immunization procedure described here, 100 μl of 0.5% bupivacaine-HCl and 0.1% methylparaben in isotonic NaCl solution are injected into the quadriceps muscles of BALB / c mice using a No. 27 needle to stimulate muscle cell regeneration and facilitate absorption of the genetic construct. Twenty-four hours later, either 100 μg pT4-pMV7 or 100 μg pMV7 as a control plasmid is injected into the same injection site. Mice are revaccinated by injection of that amount of DNA three times at two-week intervals in the same manner, but without prior administration of bupivacaine-HCl.

Животным вводят 1000000 СD4-меченых клеток опухоли. У невакцинированных животных образуются большие опухоли и смерть наступает в пределах 7-10 недель. У вакцинированных животных аналогичные смертельные опухоли не развивались. The animals are injected with 1,000,000 CD4-labeled tumor cells. In unvaccinated animals, large tumors form and death occurs within 7-10 weeks. In vaccinated animals, similar deadly tumors did not develop.

Полученные результаты показывают, что иммунная реакция у генетически вакцинированных мышей достаточна для полного удаления трансфецированных опухолей, и в то же время не влияет на нетрансфецированные опухоли. Вакцинация CD4 белком приводит к некоторому уменьшению размера опухоли в случае трансфецированных опухолей по сравнению с нетрансфецированными опухолями, но на смертность не влияет. Невакцинированные животные показали одинаковую смертность как в случае трансфецированных, так и нетрансфецированных опухолей. The results show that the immune response in genetically vaccinated mice is sufficient to completely remove transfected tumors, and at the same time does not affect nontransfected tumors. Vaccination with CD4 protein leads to a slight decrease in tumor size in the case of transfected tumors compared to non-transfected tumors, but does not affect mortality. Unvaccinated animals showed the same mortality in both transfected and non-transfected tumors.

Пример 29
Для выявления эффективности генетической вакцины против GA733 человека на мышах создан ДНК конструкт. Данные опыты были проведены для определения способности вакцины защищать от ассоциируемого с GA733 раком, например раком ободочной кишки. Применяемая модель на животных приведена выше. Клетки опухоли трансфецируют ДНК, кодирующей GA733, подтверждают способность клеток экспрессировать белок, после чего их имплантируют животному. Контроль включает нетрансфецированные клеточные линии.
Example 29
To construct the effectiveness of the genetic vaccine against human GA733, a DNA construct was created in mice. These experiments were conducted to determine the ability of the vaccine to protect against cancer associated with GA733, such as colon cancer. The applicable animal model is given above. Tumor cells transfect DNA encoding GA733, confirm the ability of the cells to express protein, and then they are implanted into the animal. Control includes nontransfected cell lines.

Вышеприведенным способом иммунизированных животных вакцинируют плазмидой pGA733-2, описанной в Примере 14. Контроль включает невакцинированных животных и животных, которым вводился GA733 белок. In the above method, the immunized animals are vaccinated with the plasmid pGA733-2 described in Example 14. The control includes unvaccinated animals and animals that were injected with GA733 protein.

Полученные результаты показывают, что иммунная реакция генетически вакцинированных мышей достаточна для полного удаления трансфецированных, и в то же время никак не влияет на нетрансфецировавные опухоли. Вакцинация GA733 белок приводит к некоторому уменьшению размера трансфецированной опухоли по сравнению с нетрансфецированной опухолью, но не влияет на смертность. Невакцинированные животные показали одинаковую смертность как в случае трансфецированных, так и нетрансфецированных опухолей. The results show that the immune response of genetically vaccinated mice is sufficient to completely remove the transfected, and at the same time does not affect the nontransfected tumors. Vaccination of GA733 protein leads to a slight decrease in the size of the transfected tumor compared to a non-transfected tumor, but does not affect mortality. Unvaccinated animals showed the same mortality in both transfected and non-transfected tumors.

Пример 30
Для выявления эффективности генетической вакцины против человечьего p185neu создан ДНК конструкт. Данные опыты были проведены для определения способности вакцины защищать от ассоциируемого с р185 neu рака, например рака молочной железы, легких и мозга. Применяемая модель на животных приведена выше. Клетки опухоли трансфецируют ДНК, кодирующей neu, подтверждают экспрессию белка клетками, после чего имплантируют животному. Контроль включает линии нетрансфецированных опухолей.
Example 30
To construct the effectiveness of a genetic vaccine against human p185neu, a DNA construct was created. These experiments were conducted to determine the ability of the vaccine to protect against cancer associated with p185 neu, such as breast, lung and brain cancer. The applicable animal model is given above. Tumor cells transfect DNA encoding neu, confirm the expression of the protein by the cells, and then implant the animal. Control includes lines of non-transfected tumors.

Генетически иммунизированных животных вакцинируют плазмидой pLTR-2/egbB-2, т. е. плазмидой в 14.3 к.о., содержащей область кодирования человечьего neu онкогена, клонированную по вышеприведенной методике в LTP-2 вектор по XhoI сайту. 5'-ДКП и 3'-ДКП являются ДКП из Молони-MuLV. Контроль включает невакцинированных животных и животных, которым вводился pl85neu белок. Genetically immunized animals are vaccinated with plasmid pLTR-2 / egbB-2, i.e., a 14.3 kb plasmid containing the coding region of the human neu oncogen, cloned by the above procedure into the LTP-2 vector at the XhoI site. 5'-DCT and 3'-DCT are DCT from Moloni-MuLV. Control includes unvaccinated animals and animals to which pl85neu protein was administered.

Полученные результаты показывают, что иммунная реакция генетически вакцинированных мышей достаточна для полного удаления трансфецированных опухолей, и в то же время никак не влияет на нетрансфецированные опухоли. Вакцинация р185 белком приводит к некоторому уменьшению размера опухоли в случае трансфецированной опухоли по сравнению с нетрансфецированной опухолью, но не влияет на смертность. Невакцинированные животные показали одинаковую смертность как в случае трансфецированыых, так и нетрансфецированных опухолей. The results obtained show that the immune response of genetically vaccinated mice is sufficient to completely remove transfected tumors, and at the same time does not affect non-transfected tumors. Vaccination with p185 protein leads to a slight decrease in tumor size in the case of a transfected tumor compared to a non-transfected tumor, but does not affect mortality. Unvaccinated animals showed the same mortality in both transfected and non-transfected tumors.

Пример 31
Для выявления эффективности генетической вакцины против человечьего Ras на мышах создан ДНК конструкт. Данные опыты предназначались для определения способности вакцины защищать от ассоциируемого в Ras рака, например рака мочевого пузыря, мышц, легких, мозга и костей. Применяемая модель на животных приведена выше. Клетки опухоли трансфецируют ДНК, кодирующей Ras, подтверждают экспрессию клетками белка, после чего их имплантируют животному. Контроль включает нетрансфецированные линии опухоли.
Example 31
To construct the effectiveness of a genetic vaccine against human Ras, a DNA construct was created in mice. These experiments were designed to determine the ability of a vaccine to protect against cancer associated with Ras, such as cancer of the bladder, muscles, lungs, brain and bones. The applicable animal model is given above. Tumor cells transfect DNA encoding Ras, confirm the expression of protein cells, and then they are implanted into the animal. Control includes untransfected tumor lines.

Вышеприведенным способом вакцинации генетически вакцинированных животных вакцинируют плазмидой pBa. RAS, описанной в примере 17. Целевой белок ras является примером цитоплазмической сигнальной молекулы. Способ клонирования ras приводится в работе: Weinberg (1984) Mol. Cell. Biol. 4, 1577, которая вводится здесь в качестве ссылки. Контроль включает невакцивированных животных и животных, которым вводился Ras белок. The above vaccination method for genetically vaccinated animals is vaccinated with the plasmid pBa. RAS described in example 17. The target ras protein is an example of a cytoplasmic signaling molecule. A method for cloning ras is provided by Weinberg (1984) Mol. Cell. Biol. 4, 1577, which is incorporated herein by reference. Control includes unvaccinated animals and animals that have been injected with Ras protein.

Пример 32
Для выявления эффективности генетической вакцины на мышах против антигена G-белка вируса бешенства человека создан ДНК конструкт. Применяемая модель на животных приведена выше. Клетки опухоля трансфецируют ДНК, кодирующий белок G вируса бешенства, подтверждают экспрессию белка клетками, после чего их имплантируют животному.
Example 32
To construct the effectiveness of a genetic vaccine in mice against the human rabies virus G protein antigen, a DNA construct was created. The applicable animal model is given above. Tumor cells transfect DNA encoding rabies virus G protein, confirm the expression of the protein by the cells, after which they are implanted into the animal.

Генетически иммунизированных животных вакцинируют плазмидой рВа.РЬ-G, описанной в Примере 10, применением вышеприведенного способа вакцинации. Целевой G-белок вируса бешенства служит примером патогенного антигена. ДНК последовательность находится в Генбанке под N 32751. Контроль включает невакцинированных животных и животных, которым вводился G-белок вируса бешенства. Genetically immunized animals are vaccinated with the plasmid pBa.PB-G described in Example 10 using the above vaccination method. The rabies virus target G protein is an example of a pathogenic antigen. The DNA sequence is located in Genebank under N 32751. Control includes unvaccinated animals and animals that were introduced rabies virus G-protein.

Пример 33
Для выявления эффективности генетической вакцины на мышах против антигена болезни Лима создан ДНК конструкт. Применяемая модель на животных приведена выше. Клетки опухоли трансфецируют ДНК, кодирующей OspA и OspB, подтверждают экспрессию белка клетками, после чего их имплантируют животному.
Example 33
To construct the effectiveness of a genetic vaccine in mice against the antigen of Lim disease, a DNA construct was created. The applicable animal model is given above. Tumor cells transfect DNA encoding OspA and OspB, confirm the expression of the protein by the cells, after which they are implanted into the animal.

Генетически иммунизированных животных вакцинируют плазмидой pOspA.B, описанной в Примере 9. Контроль включает невакцинированных животных и животных, которым вводились белки OspA и OspB. Genetically immunized animals are vaccinated with the plasmid pOspA.B described in Example 9. Control includes unvaccinated animals and animals to which the OspA and OspB proteins were administered.

Пример 34
Для выявления на мышах эффективности генетической вакцины против переменной области Т-клеточного рецептора человека создан ДНК конструкт. Данные опыты предназначались для определения способности вакцины защищать от происходящего из Т-клеточного рецептора белка, ассоциируемого с раком, например: Т-клеточной лимфомой и передаваемой через Т-клетки аутоиммунной болезнью. Применяемая модель на животных приведена выше. Клетки опухоли трансфецируют ДНК, кодирующей Ras, подтверждают экспрессию белка клетками, после чего их имплантируют животному.
Example 34
To identify the effectiveness of a genetic vaccine in mice against a variable region of a human T-cell receptor, a DNA construct was created. These experiments were designed to determine the ability of a vaccine to protect against a protein associated with a cancer associated with a T-cell receptor, for example: T-cell lymphoma and an autoimmune disease transmitted through T-cells. The applicable animal model is given above. Tumor cells transfect DNA encoding Ras, confirm the expression of the protein by the cells, after which they are implanted into the animal.

Генетически иммунизированных животных вакцинируют плазмидой рВа.Vα3, описанной в Примере 5, применением вышеприведенного способа вакцинации. Genetically immunized animals are vaccinated with the plasmid pVA.Vα3 described in Example 5 using the above vaccination method.

Пример 35
Плазмида рМ160 может быть использована в качестве исходного продукта для получения ряда плазмид, применимых для экспрессии одного или нескольких генов из env части ВИЧ. Описание
конструирования рМ160 приведено выше. Плазмида направлена на gp160, tat и rev область кодирования. Ген nef отсутствует.
Example 35
Plasmid pM160 can be used as a starting product for the production of a number of plasmids suitable for the expression of one or more genes from the env part of HIV. Description
design pM160 above. The plasmid is directed to the gp160, tat and rev coding region. The nef gene is missing.

Промотором, контролирующим экспрессию gp160/rev/tat гена, является ВОМЖМ ДКП. Промотор может быть изъят и заменен актиновым промотором, миозиновым промотором, ВИЧ ДКП промотором и ЦМВ промотором. The promoter that controls the expression of the gp160 / rev / tat gene is VOMZH DKP. The promoter can be removed and replaced by the actin promoter, the myosin promoter, the HIV DCT promoter, and the CMV promoter.

Ген, придающий устойчивость к ампициллину, может быть изъят или каким-то иным путем дезактивирован. Ген, придающий устойчивость к неомицину, может быть помещен под контроль бактериального промотора. The gene conferring resistance to ampicillin may be removed or deactivated in some other way. A gene that confers resistance to neomycin can be placed under the control of a bacterial promoter.

Из плазмиды может быть удален усилитель вируса саркомы Рауса. ВСР усилитель может быть заменен усилителем мышечного креатина. Raus sarcoma virus enhancer can be removed from the plasmid. The HRV booster can be replaced with a muscle creatine booster.

Гены gp160/rev/tat перекрываются и разделяют одинаковые нуклеотидные последовательности в разных рамках считывания. Ген rev может быть изъят путем замены его инициирующего кодона другим кодоном. Аналогичным путем может быть удален и tat ген. В каждой плазмиде за исключением тех, в которых для контроля gp160/rev/tat применяется ВИЧ ДКП, может быть удален один из rev или tat, или оба rev и tat. В плазмидах, использующих ВИЧ ДКП промотор, присутствие tat обязательно. The gp160 / rev / tat genes overlap and share the same nucleotide sequences in different reading frames. The rev gene can be removed by replacing its initiating codon with another codon. The tat gene can be deleted in a similar way. In each plasmid, with the exception of those that use HIV DCT to control gp160 / rev / tat, one of rev or tat, or both rev and tat, can be deleted. In plasmids using the HIV DCT promoter, the presence of tat is mandatory.

В Таблице 3 дается перечень рМ160-модифицированных плазмид. В каждой удален ВСР усилитель. В некоторых из них усилитель отсутствует (нет), в других присутствует усилитель мышечного креатина (УМК). В некоторых из них присутствует ВИЧ rev ген (да), а в других этот ген отсутствует (нет). Некоторые из них имеют ВИЧ tat ген (да), в то время как в других этот ген отсутствует (нет). Table 3 lists the pM160-modified plasmids. Each removed HRV amplifier. In some of them, an amplifier is absent (no), in others there is an amplifier of muscle creatine (UMC). In some of them, the HIV rev gene is present (yes), while in others this gene is absent (no). Some of them have the HIV tat gene (yes), while in others this gene is absent (no).

Конструкты RA-29 - RA-56 идентичны соответственно конструктам RA-1 - RА-32 за исключением того, что в каждом случае промотор, контролирующий ген неомицина, является бактериальным промотором. Constructs RA-29 - RA-56 are identical to constructs RA-1 - RA-32, respectively, except that in each case the promoter that controls the neomycin gene is a bacterial promoter.

Пример 36
Плазмида pNLpuro может быть использована в качестве исходного продукта в создании нескольких различных плазмид, экспрессирующих ВИЧ gag/pol гены. Как указано выше pNLpuro создана для экспрессии gag/pol. Описанная выше плазмида pNL- puroΔvpr сконструирована с изъятием vpr регуляторного гена из ВИЧ gag pol вектора с целью исключить присутствие необходимого регуляторного белка из ряда генов, вводимых при вакцинации. Помимо изъятия vpr обычным специалистам в данной области в плазмиду pNLpuro могут быть внесены и другие изменения применением стандартных методик молекулярной биологии и широкодоступных исходных продуктов.
Example 36
Plasmid pNLpuro can be used as a starting product in the creation of several different plasmids expressing HIV gag / pol genes. As indicated above, pNLpuro is designed to express gag / pol. The plasmid pNL-puroΔvpr described above was designed to remove the vpr regulatory gene from the HIV gag pol vector in order to exclude the presence of the necessary regulatory protein from a number of genes introduced during vaccination. In addition to the removal of vpr by ordinary specialists in this field, other changes to the pNLpuro plasmid can be made using standard molecular biology techniques and widely available starting materials.

Человечьи фланкирующие 5' и 3' последовательности из ВИЧ последовательностей могут быть удалены несколькими способами. К примеру, методом ПЦР могут быть амплифицированы и реконструированы только ВИЧ, OB40-puro и pUC18 последовательности. Human flanking 5 ′ and 3 ′ sequences from HIV sequences can be removed in several ways. For example, only HIV, OB40-puro and pUC18 sequences can be amplified and reconstructed by PCR.

Из основанных на pNLpuro плазмид может быть изъята psi область, имеющая важное значение для упаковки вируса. Для удаления psi области pNLpuro плазмиду обрезают в присутствии SacI и SpeI. В результате гидролиза удаляется psi область, а также 5'-ДКП, находящийся в нисходящем направлении, и часть gag/pol области в нисходящем направлении от psi. Для повторной вставки не относящихся к psi последовательностей методом ДКП осуществляют амплификацию с регенерацией этих последовательностей. Созданы праймеры, позволяющие регенерировать часть ВИЧ последовательности 5' и 3' до psi без регенерации psi. Праймеры реформируют SacI сайт в 5'-части из 5'-ДКП плазмиды. Праймеры идут в восходящем направлении от SacI сайта до участка, находящегося непосредственно у 3'-части 5'-конца psi области с образованием у 3'-конца AatI сайта. Праймеры, начинающиеся непосредственно в 5'-части psi области, кроме того, создают AatI сайт, а начинающиеся в 3'-части SpeI сайта, регенерируют этот сайт. Созданные методом ПЦР фрагменты гидролизуют в присутствии SacI, AatI и SpeI и лигируют совместно с гидролизованным в присутствии SacI/SpeI pNLpuro-psi фрагмента. ВИЧ 5'-ДКП промотор может быть удален в заменен промотором вируса Молони, ВОМЖМ ДКП, актиновым промотором, миозиновым промотором и ЦМВ промотором. From the pNLpuro-based plasmids, a psi region important for virus packaging can be deleted. To remove the psi region of the pNLpuro, the plasmid was cut in the presence of SacI and SpeI. As a result of hydrolysis, the psi region is removed, as well as the 5'-DCT, located in the downstream direction, and part of the gag / pol region in the downstream direction from the psi. To re-insert non-psi sequences by DCT, amplification is carried out with the regeneration of these sequences. Primers have been developed that allow the regeneration of part of the HIV sequence 5 'and 3' to psi without psi regeneration. The primers reformate the SacI site in the 5 ′ portion of the 5′-DCP plasmid. Primers go upstream from the SacI site to the site located directly at the 3'-part of the 5'-end of the psi region with the formation at the 3'-end of the AatI site. Primers starting directly in the 5'-part of the psi region, in addition, create an AatI site, and starting in the 3'-part of the SpeI site, regenerate this site. The fragments created by PCR are hydrolyzed in the presence of SacI, AatI and SpeI and ligated together with the pNLpuro-psi fragment hydrolyzed in the presence of SacI / SpeI. The HIV 5'-DKP promoter can be deleted in the replacement of the Moloni virus promoter, VOMZHM DKP, actin promoter, myosin promoter and CMV promoter.

ВИЧ 3'-ДКП участок полиаденилирования может быть удален и заменен ОВ40 участком полиаденилирования. The HIV 3'-DCT polyadenylation site can be removed and replaced with OB40 polyadenylation site.

Ген, придающий устойчивость к ампициллину, может быть удален или дезактивирован каким-то иным путем. The gene conferring resistance to ampicillin may be removed or deactivated in some other way.

В Таблице 4 приводится перечень основанных на pNLpuro конструктов, в которых изъяты ВИЧ psi и vpr области и, кроме того, удалены фланкирующие 5'- и 3'-области ВИЧ последовательности человека. Table 4 lists pNLpuro-based constructs in which HIV psi and vpr regions were removed and, in addition, the flanking 5 ′ and 3 ′ regions of the human HIV sequence were removed.

Конструкты от LA-17 до LA-32 идентичны соответственно конструктам от LA-1 до LA-16, за исключением того, что в каждом случае остается по меньшей мере одна из человечьих фланкирующих последовательностей. Constructs LA-17 to LA-32 are identical to constructs LA-1 to LA-16, respectively, except that in each case at least one of the human flanking sequences remains.

Пример 37
При создании других конструктов для экспрессии env гена эта область ВИЧ может быть вставлена в коммерчески доступную плазмиду рСЕР4 (Инвитроген). рСЕР4 плазмида особенно приемлема, поскольку содержит ориджин репликации вируса Эпштейна-Барра и область кодирования ядерного антигена EBNA-1, создающих высококопийную репликацию без интеграции. рСEР4 содержит также гигромициновый маркер под регуляторным контролем тимидинкиназного промотора и участок полиаденилирования. Область кодирования ВИЧ env помещают под регуляторный контроль промотора ЦМВ и участка полиаденилирования ОВ40. Область кодирования ВИЧ env в виде ПЦР фрагмента в 2.3 к.о. из ВИЧ/3В, последовательность в Генбанке под N К03455. Полученную на основе рСЕР4 плазмиду (pRA-100) внедряют вне хромосомы, и плазмида продуцирует gp160 белок.
Example 37
When creating other constructs for expression of the env gene, this HIV region can be inserted into the commercially available plasmid pCEP4 (Invitrogen). The pCEP4 plasmid is particularly suitable because it contains the origin of the Epstein-Barr virus replication and the coding region of the nuclear antigen EBNA-1, creating high-copy replication without integration. pCEP4 also contains a hygromycin marker under the regulatory control of the thymidine kinase promoter and a polyadenylation site. The HIV env coding region is placed under regulatory control of the CMV promoter and the OB40 polyadenylation site. The coding region of HIV env as a 2.3 kb PCR fragment from HIV / 3B, sequence in the Genebank under N K03455. The pCEP4-derived plasmid (pRA-100) is introduced outside the chromosome, and the plasmid produces the gp160 protein.

Пример 38
Для получения других конструктов для экспрессии env гена эта область ВИЧ может быть вставлена в коммерчески доступную плазмиду pREP4 (Инвитроген). pREP4 плазмида особенно приемлема, поскольку содержит ориджин репликации вируса Эпштейна-Барра и область кодирования ядерного антигена EBNA-1, обеспечивающих высококопийную репликацию без интеграции. pREP4 содержит также гигромициновый маркер под регуляторным контролем тимидинкиназного промотора и участка полиаденилирования. Область кодирования ВИЧ env помещают под регуляторный контроль ВСР промотора и ОВ40 участка полиаденилирования. Область кодирования ВИЧ env получена в виде ПЦР фрагмента в 2.3 к.о. ВИЧ/3В формы, последовательность в Генбанке N К03455. Полученную на основе рRЕР4 плазмиду (pRA-101) внедряют внехромосомно, и плазмида продуцирует gp160 белок.
Example 38
To obtain other constructs for expression of the env gene, this HIV region can be inserted into the commercially available plasmid pREP4 (Invitrogen). The pREP4 plasmid is particularly suitable because it contains the Epstein-Barr virus origin of replication and the coding region of the EBNA-1 nuclear antigen, which provides high-copy replication without integration. pREP4 also contains a hygromycin marker under the regulatory control of the thymidine kinase promoter and polyadenylation site. The HIV env coding region is placed under regulatory control of the HRV promoter and OB40 of the polyadenylation site. The HIV env coding region was obtained as a 2.3 kb PCR fragment. HIV / 3B form, sequence in Genebank N K03455. The plasmid (pRA-101) obtained on the basis of pREP4 was introduced extrachromosomally, and the plasmid produced the gp160 protein.

Пример 39
Для создания других конструктов, предназначенных для экспрессии gag/pol генов, эта область ВИЧ может быть вставлена в продажную плазмиду pСЕР4 (Инвитроген). рСЕР4 плазмида особенно приемлема, поскольку содержит ориджин репликации вируса Эпштейна-Барра и область кодирования ядерного антигена EBNA-1, обеспечивающий высококопийную эписомальную репликацию без интеграции. рСЕР4 содержит также гигромициновый маркер под регуляторным контролем тимидинкиназного промотора и участка полиаденилирования. Область кодирования ВИЧ gag/pol помещают под регуляторный контроль ЦМВ промотора и ОВ40 участка полиаденилирования Область кодирования ВИЧ gag/pol получена из ВИЧ MN (последовательность в Генбанке N М17449), и включает vif ген. Ген vpr не включен. Полученная на основе рСЕР4 плазмида (pLA-100), внедренная внехромосомно, продуцирует белки GAG55, обратной транскриптазы, протеазы и интегразы.
Example 39
To create other constructs designed to express gag / pol genes, this HIV region can be inserted into the commercial plasmid pCEP4 (Invitrogen). The pCEP4 plasmid is particularly suitable because it contains the Epstein-Barr virus origin of replication and the coding region of the nuclear antigen EBNA-1, which provides high-copy episomal replication without integration. pCEP4 also contains a hygromycin marker under the regulatory control of the thymidine kinase promoter and the polyadenylation site. The HIV gag / pol coding region is placed under the regulatory control of the CMV promoter and the OB40 polyadenylation site. The HIV gag / pol coding region is derived from HIV MN (sequence in Genebank N M17449), and includes the vif gene. The vpr gene is not included. The plasmid (pLA-100) obtained on the basis of pCEP4, introduced extrachromosomally, produces GAG55, reverse transcriptase, protease and integrase proteins.

Пример 40
Для создания других конструктов, предназначенных для экспрессии gag/pol, эта область ВИЧ может быть вставлена в коммерческую плазмиду pREP4 (Инвитроген). pREP4 плазмида особенно приемлема, поскольку содержит ориджин репликации вируса Эпштейна-Барра и область кодирования ядерного антигена EBNA-1, обеспечивающих высококопийную эписомальную репликацию без интеграции. pREP4 содержит также гигромициновый маркер под регуляторным контролем тимидинкиназного маркера и участка полиаденилирования. Область кодирования ВИЧ gag/pol помещают под регуляторный контроль ЦMB промотора и ОВ40 участка полиаденилирования. Область кодирования ВИЧ gag/pol получена из ВИЧ MN (последовательность в Генбанке N М17449), и включает vif ген. Ген vpr не включен. Полученную на основе pREP4 плазмиду (pLA-101) внедряют внехромосомно, и плазмида продуцирует белки GAG55, обратной транскриптазы, протеазы и интегразы.
Example 40
To create other constructs designed for gag / pol expression, this HIV region can be inserted into the commercial plasmid pREP4 (Invitrogen). The pREP4 plasmid is particularly suitable because it contains the Epstein-Barr virus origin of replication and the coding region of the nuclear antigen EBNA-1, providing high-copy episomal replication without integration. pREP4 also contains a hygromycin marker under regulatory control of the thymidine kinase marker and the polyadenylation site. The HIV gag / pol coding region is placed under regulatory control of the CMB promoter and the OB40 polyadenylation site. The HIV gag / pol coding region is derived from HIV MN (sequence in Genebank N M17449), and includes the vif gene. The vpr gene is not included. The pREP4-derived plasmid (pLA-101) is introduced extrachromosomally, and the plasmid produces GAG55, reverse transcriptase, protease and integrase proteins.

Пример 41
Следующий конструкт, называемый здесь pGACPOL.rev, применим для экспрессии ВИЧ gag/pol генов.
Example 41
The following construct, called pGACPOL.rev here, is applicable for the expression of HIV gag / pol genes.

Плазмида включает ген устойчивости к канамицину и pBR322 ориджин ДНК репликации. Необходимые для регуляции транскрипции последовательности включают: цитомегаловирусный промотор, усилитель вируса саркомы Рауса и ОВ40 сигнал полиаденилирования. Содержащиеся в pGAGPOL.gev ВИЧ-1 последовательности включают: последовательность, кодирующую р17, р24 и р15 из gag открытой рамки считывания, последовательность, кодирующую протеазу, последовательность, кодирующую обратную транскриптазу и содержащую небольшую делецию, и последовательность, кодирующую неактивное аминоокончание интегразы из роl открытой рамки считывания, а также кодирующую rev последовательность. Каждая ВИЧ последовательность происходит из штамма НХВ2 ВИЧ-1. The plasmid includes the kanamycin resistance gene and pBR322 origin of DNA replication. Sequences necessary for transcriptional regulation include the cytomegalovirus promoter, Routh sarcoma virus enhancer, and OB40 polyadenylation signal. The sequences contained in pGAGPOL.gev HIV-1 include: a sequence encoding p17, p24 and p15 from gag open reading frame, a sequence encoding a protease, a sequence encoding a reverse transcriptase containing a small deletion, and a sequence encoding an inactive amino termination of integrase from open open reading frames, as well as a coding rev sequence. Each HIV sequence originates from the HIV-1 strain HXB2.

В pGAGPOL.rev предусмотрено несколько уровней безопасности. Они включают применение ЦМВ промотора и неретровирусный поли (А) участок. Более того, делеция ψ последовательности ограничивает возможности упаковки вирусной РНК. Кроме того, многочисленные мутации в обратной транскриптазе приводят к форментативно неактивному продукту. Более того, большая делеция в интегразе приводит к неактивному продукту, а для стабилизации бактериальных трансформантов применяют маркер устойчивости к канамицину. PGAGPOL.rev provides several levels of security. These include the use of the CMV promoter and the non-retroviral poly (A) region. Moreover, deletion of the ψ sequence limits the packaging of viral RNA. In addition, numerous mutations in reverse transcriptase result in a productively inactive product. Moreover, a large deletion in integrase leads to an inactive product, and a kanamycin resistance marker is used to stabilize bacterial transformants.

Плазмиду pGAGROL.rev конструируют следующим образом. Plasmid pGAGROL.rev is constructed as follows.

Стадия 1. Применяют субклон части ВИЧ-1 (НХВ2) генома, клонированный в Bluescript (Стратаген). Субклон ВИЧ-1 содержит полный 5'-ДКП и остальную часть ВИЧ-1 генома до нуклеотида 5795 (нумерация Генбанка). ВИЧ-1 последовательности получены из HXB2D (СПИД хранилище). Stage 1. Apply a subclone of part of the HIV-1 (HXB2) genome, cloned in Bluescript (Stratagen). The HIV-1 subclone contains the complete 5'-DCT and the rest of the HIV-1 genome up to nucleotide 5795 (Genbank numbering). HIV-1 sequences are derived from HXB2D (AIDS repository).

Стадия 2. Подвергают ПЦР часть gag из открытой рамки считывания HXB2D плазмиды (СПИД хранилище). ПЦР фрагмент обрезают в присутствии NotI и SpeI и лигируют с вышеописанным ВИЧ-1 субклоном, рестриктированным в присутствии NotI и SpeI. Stage 2. Subject the PCR portion of the gag from the open reading frame of the HXB2D plasmid (AIDS storage). The PCR fragment is cut off in the presence of NotI and SpeI and ligated to the above-described HIV-1 subclone, restricted in the presence of NotI and SpeI.

Стадия 3. Подвергают ПЦР комплекс gag/pol и часть pol-кодирующих последовательностей из HXB2D плазмиды (СПИД хранилище) с праймерами ПОСЛЕД. N 15 и ПОСЛЕД. N 16. Обрезают ПЦР продукт в присутствии ClaI и лигируют друг с другом. Обрезают лигированные фрагменты в присутствии BclI и SalI и лигируют с плазмидой со стадии 2, гидролизованной в присутствии BclI и SalI. Stage 3. Subjected to the PCR complex gag / pol and part of the pol-coding sequences from the HXB2D plasmid (AIDS storage) with primers AFTER. N 15 and AFTER. N 16. Cut off the PCR product in the presence of ClaI and ligate with each other. Ligated fragments were cut in the presence of BclI and SalI and ligated with the plasmid from step 2 hydrolyzed in the presence of BclI and SalI.

Стадия 4. Обрезают плазмиду со стадии 3 в присутствии BspMI и EcoRI и вновь лигируют с адаптерами, образованными отжигом линкеров (ПОСЛЕД. N 17 и ПОСЛЕД. N 18). Stage 4. Cut the plasmid from stage 3 in the presence of BspMI and EcoRI and again ligated with adapters formed by annealing the linkers (FOLLOW. N 17 and FOLLOW. N 18).

Стадия 5. Плазмиду со стадии 4 обрезают в присутствии NotI и SalI и лигируют либо с плазмидой 4a или 4b из описания, приведенного для pENV (см. ниже). Обрезают также в присутствии NotI и SatI. Stage 5. The plasmid from stage 4 is cut in the presence of NotI and SalI and ligated with either plasmid 4a or 4b from the description given for pENV (see below). Also cut in the presence of NotI and SatI.

Стадия 6. Плазмиду со стадии 5 рестриктируют в присутствии SalI и MluI и лигируют с ПЦР продуктом, полученным ПЦР rev с праймерами ПОСЛЕД. N 19 и ПОСЛЕД. N 20. Stage 6. The plasmid from stage 5 is restricted in the presence of SalI and MluI and ligated with the PCR product obtained by PCR rev with primers AFTER. N 19 and AFTER. N 20.

Стадия 7. Плазмиду со стадии 6 обрезают в присутствии NotI и лигируют с продуктом, полученным методом ПЦР rev-ответственного элемента в HXB2D плазмиде (СПИД хранилище) с праймерами ПОСЛЕД. N 21 и ПОСЛЕД. N 22. Stage 7. The plasmid from stage 6 is cut in the presence of NotI and ligated with the product obtained by PCR of the rev-responsible element in the HXB2D plasmid (AIDS storage) with primers AFTER. N 21 and AFTER. N 22.

Стадии 6 и 7 необязательны. Steps 6 and 7 are optional.

Пример 42
Следующий конструкт, называемый здесь pENV, применим для экспрессии ВИЧ env генов.
Example 42
The following construct, called pENV here, is applicable for the expression of HIV env genes.

Плазмида включает ген устойчивости к канамицину и pBR322 ориджин ДНК репликации. Необходимые для регуляции транскрипции последовательности включают: цитомегаловирусный промотор, усилитель вируса саркомы Рауса и ОВ40 сигнал полиаденилирования. Содержащиеся в pENV ВИЧ-1 последовательности включают последовательность, кодирующую vpu, последовательность, кодирующую rev, последовательность, кодирующую gp160, последовательность, кодирующую 50% nef, последовательность, кодирующую vif, и последовательность, кодирующую vpr с делецией 13 аминокислот карбокси-конца. Последовательности vpu, rev, gp160 и nef происходят ив ВИЧ-1 штамма MN. Источником vif и vpr последовательностей является ВИЧ-1 штамм НХВ2. The plasmid includes the kanamycin resistance gene and pBR322 origin of DNA replication. Sequences necessary for transcriptional regulation include the cytomegalovirus promoter, Routh sarcoma virus enhancer, and OB40 polyadenylation signal. The HIV-1 sequences contained in pENV include a vpu coding sequence, a rev coding sequence, a gp160 coding sequence, a 50% nef coding sequence, a vif coding sequence, and a 13pr carboxy terminating vpr coding sequence. The vpu, rev, gp160, and nef sequences occur in the HIV-1 strain MN. The source of vif and vpr sequences is the HIV-1 strain HXB2.

В pGAGROL.rev предусмотрено несколько уровней безопасности. Они включают применение ЦМВ промотора и неретровирусно поли (А) участка. Более того, удален tat, а 50-ая делеция nef приводит к "неактивному" nef продукта. Кроме того, vif и vpr выведены из нормальной последовательности, а частичная делеция vpr дополнительно гарантирует неактивный vpr продукт. PGAGROL.rev provides several levels of security. These include the use of the CMV promoter and the non-retroviral poly (A) region. Moreover, the tat was deleted, and the 50th deletion of nef leads to the “inactive" nef of the product. In addition, vif and vpr are deduced from the normal sequence, and a partial deletion of vpr additionally guarantees an inactive vpr product.

Плазмида pENV создана следующим образом. Plasmid pENV was created as follows.

Стадия 1. Исходную плазмиду pUC18 гидролизуют в присутствии HindIII и EcoRI. Полученный фрагмент, содержащий ColEl ориджин репликации и laci ген, необходимо лигировать с EcoRI/HindIII фрагментом из pMAMneoBlue, содержащий наш усилитель вируса саркомы. Полученная плазмида или pMAMneoBlue от фирмы Клонтех (Пало Альто, КА) может быть затем гидролизована в присутствии HindIII и BglI. С помощью стандартных методик лигируют с фрагментом, содержащим kan ген, полученным методом ПЦР из генблочной плазмиды (Фармация). Stage 1. The original plasmid pUC18 hydrolyzed in the presence of HindIII and EcoRI. The resulting fragment containing the ColEl origin of replication and the laci gene must be ligated with the EcoRI / HindIII fragment from pMAMneoBlue containing our sarcoma virus enhancer. The resulting plasmid or pMAMneoBlue from Clontech (Palo Alto, CA) can then be hydrolyzed in the presence of HindIII and BglI. Using standard techniques, they are ligated with a fragment containing the kan gene obtained by PCR from a gene block plasmid (Pharmacy).

Стадия 2. Если в качестве исходной плазмиды применяют pMAMneoBlue, ее гидролизуют в присутствии MluI и EcoRI, наполняют концы фрагментом Кленова из полимеразы I и повторно лигируют. Stage 2. If pMAMneoBlue is used as the initial plasmid, it is hydrolyzed in the presence of MluI and EcoRI, the ends are filled with a Klenov fragment from polymerase I and re-ligated.

Стадия 3. Затем плазмиду, полученную из pMAMneoBlue либо из pUC18, гидролизуют в присутствии HindIII и лигируют с OB40 поли (А) участком и областью раннего сплайсинга, полученную методом ПЦР из рCEP4 (Инвитроген, Сан-Диего, КА) с праймерами ПОСЛЕД N 23 и ПОСЛЕД. N 24. Stage 3. Then, the plasmid obtained from pMAMneoBlue or pUC18 is hydrolyzed in the presence of HindIII and ligated to the OB40 poly (A) region and the early splicing region obtained by PCR from pCEP4 (Invitrogen, San Diego, KA) with primers SEQUENCE N 23 and AFTER. N 24.

Стадия 4a. Гидролизуют в присутствии BamHI и лигируют с ЦМВ промотором, полученным методом ПЦР из рСЕР4 (Инвитроген, Сан-Диего, КА) с праймерами ПОСЛЕД. N 25 и ПОСЛЕД. N 26. Stage 4a. Hydrolyzed in the presence of BamHI and ligated with the CMV promoter obtained by PCR from pCEP4 (Invitrogen, San Diego, CA) with primers AFTER. N 25 and AFTER. N 26.

Стадия 4b. Гидролизуют в присутствии BamHI и лигируют с MoMLV ДКП, полученным методом ПЦР с праймерами ПОСЛЕД. N 27 и ПОСЛЕД. N 28. Stage 4b. Hydrolyzed in the presence of BamHI and ligated with MoMLV DCT obtained by PCR with primers AFTER. N 27 and AFTER. N 28.

Стадия 5. Гидролизуют в присутствии NotI и MluI и лигируют с областью кодирования gp160, полученной из pMN-ST1 методом ПЦР с праймерами ПОСЛЕД. N 29 и ПОСЛЕД. N 30. Stage 5. Hydrolyzed in the presence of NotI and MluI and ligated to the gp160 coding region obtained from pMN-ST1 by PCR with primers AFTER. N 29 and AFTER. N 30.

Стадия 6. Гидролизуют в присутствии MluI и лигируют с последовательностями, кодирующими vif во всей его полноте и vpr с делецией 13 а. к. у карбокси-конца, получены из HX2BD плазмиды (СПИД хранилище) методом ПЦР с праймерами ПОСЛЕД. N 31 и ПОСЛЕД. N 32. Stage 6. Hydrolyzed in the presence of MluI and ligated with sequences encoding vif in its entirety and vpr with a deletion of 13 a. K. at the carboxy terminus, obtained from the HX2BD plasmid (AIDS storage) by PCR with primers AFTER. N 31 and AFTER. N 32.

Пример 43
Дается система вакцинации, включающая:
фармацевтический препарат, содержащий около 100 мкг pGAGPOL.rev в изотоническом фармацевтически приемлемом растворе и фармацевтический препарат, содержащий 100 мкг pENV в изотоническом фармацевтически приемлемом растворе. Кроме того, система вакцинации предпочтительно включает фармацевтический препарат, содержащий 1 мл 0.5% бупивакаин-HCl и 0.1% метилпарабена в изотоническом фармацевтическом носителе.
Example 43
A vaccination system is provided, including:
a pharmaceutical preparation containing about 100 μg pGAGPOL.rev in an isotonic pharmaceutically acceptable solution; and a pharmaceutical preparation containing 100 μg pGAGPOL.rev in an isotonic pharmaceutically acceptable solution. In addition, the vaccination system preferably includes a pharmaceutical preparation containing 1 ml of 0.5% bupivacaine-HCl and 0.1% methyl paraben in an isotonic pharmaceutical carrier.

В случае применения такой рекомендуемой системы вакцинации вначале проводят первую серию введений, в которой бупивакаин и один из двух фармацевтических препаратов вводят индивидууму внутримышечно, предпочтительно в мышцы руки и ягодицы. Бупивакаин и второй из двух фармацевтических препаратов вводят индивидууму внутримышечно в другом месте, предпочтительно удаленном от места введения первого фармацевтического препарата, предпочтительно в другую руку или ягодицу. Последовательность серии введений может быть разделена во времени, предпочтительно от 48 часов до двух или более недель между двумя введениями. In the case of using such a recommended vaccination system, a first series of administrations is first carried out, in which bupivacaine and one of the two pharmaceutical preparations are administered intramuscularly to the individual, preferably into the muscles of the arm and buttocks. Bupivacaine and the second of the two pharmaceutical preparations are administered intramuscularly to the individual in another place, preferably remote from the injection site of the first pharmaceutical preparation, preferably in the other hand or buttock. The sequence of a series of administrations can be divided in time, preferably from 48 hours to two or more weeks between two administrations.

Система вакцинации может быть использована для вакцинации индивидуума с целью его защиты от ВИЧ инфекции или для лечения ВИЧ-инфицированного индивидуума иммунотерапевтическим средством. The vaccination system can be used to vaccinate an individual to protect him from HIV infection or to treat an HIV-infected individual with an immunotherapeutic agent.

Пример 44
В некоторых своих воплощениях изобретение относится к способу вакцинации индивидуума от ВИЧ введением единственного инокулята. Такой инокулят включает генетический конструкт, содержащий по меньшей мере один, предпочтительно два, более предпочтительно более двух или ряд генов ВИЧ вируса или все структурные гены. Однако инокулят не содержит полный набор всех ВИЧ генов. При попадании в единичную клетку полного набора вирусных генов возникает вероятность сборки в пределах клетки целого инфекционного вируса. Соответственно, в генетическом конструкте настоящего изобретения отсутствует такой полный набор генов. В целях безопасности один или несколько существенных генов может быть удалено или преднамеренно изменено с дополнительной гарантией исключения образования инфекционной вирусной частицы.
Example 44
In some embodiments, the invention relates to a method for vaccinating an individual against HIV by administering a single inoculum. Such an inoculum includes a genetic construct containing at least one, preferably two, more preferably more than two, or a series of HIV virus genes or all structural genes. However, the inoculum does not contain a complete set of all HIV genes. When a complete set of viral genes enters a single cell, it is likely that an entire infectious virus will be assembled within the cell. Accordingly, such a complete set of genes is missing from the genetic construct of the present invention. For safety reasons, one or more essential genes can be deleted or intentionally altered with the additional guarantee of eliminating the formation of an infectious viral particle.

В некоторых воплощениях настоящего изобретения дается по меньшей мере части одного, двух или всех ВИЧ структурных генов. Структурные гены ВИЧ включают; gag, pol и env. В генетическом конструкте даются части по меньшей мере одного из этих генов. Соответственно, в некоторых вариантах в генетическом конструкте даются по меньшей мере части каждого из gag и pol; в отдельных вариантах в генетическом конструкте дается по меньшей мере часть env; в других вариантах в генетическом конструкте дается по меньшей мере часть gag; в отдельных вариантах в генетическом конструкте дается по меньшей мере часть каждого из pol и env; в отдельных вариантах в генетическом конструкте дается по меньшей мере часть каждого из gag и env; в других вариантах в генетическом конструкте дается по меньшей мере часть pol. Возможно присутствие гена целиком. В любом из указанных конструктов возможно также присутствие ВИЧ регуляторных генов. ВИЧ регуляторные гены включают: vpr, vif, nef, vpu, tat и rev. In some embodiments of the present invention, at least a portion of one, two, or all of the HIV structural genes is provided. HIV structural genes include; gag, pol and env. In the genetic construct, parts of at least one of these genes are given. Accordingly, in some embodiments, at least portions of each of the gag and pol are given in the genetic construct; in certain embodiments, at least a portion of env is given in the genetic construct; in other embodiments, at least a portion of the gag is given in the genetic construct; in certain embodiments, at least a portion of each of pol and env is given in the genetic construct; in certain embodiments, at least a portion of each of the gag and env is given in the genetic construct; in other embodiments, at least a portion of pol is given in the genetic construct. Perhaps the presence of the whole gene. In any of these constructs, the presence of HIV regulatory genes is also possible. HIV regulatory genes include: vpr, vif, nef, vpu, tat and rev.

Пример 45
В применяемом здесь значении термин "экспрессионная единица" относится к последовательности нуклеиновой кислоты, содержащей промотор, операбельно связанный с кодирующей последовательностью, в свою очередь операбельно связанной с сигналом полиаденилирования. Кодирующая последовательность может кодировать один или несколько белков или их фрагментов. В рекомендуемых вариантах экспрессионная единица находится в пределах плазмиды.
Example 45
As used herein, the term “expression unit” refers to a nucleic acid sequence containing a promoter operably linked to a coding sequence operably linked to a polyadenylation signal. The coding sequence may encode one or more proteins or fragments thereof. In recommended embodiments, the expression unit is within the plasmid.

В применяемом здесь значении термин "ВИЧ экспрессионная единица" относится к последовательности нуклеиновой кислоты, содержащей промотор, операбельно связанный с кодирующей последовательностью, в свою очередь операбельно связанной с сигналом полиаденилирования, причем кодирующая последовательность кодирует пептид, имеющий эпитоп, который идентичен или по существу аналогичен эпитопу, обнаруживаемому в ВИЧ белке. Выражение "по существу аналогичный эпитоп" относится к эпитопу, строение которого не идентично строению эпитопа ВИЧ белка, но который, тем не менее, создает клеточную или гуморальную иммунную реакцию, перекрестно реакционную к ВИЧ белку. В рекомендуемых вариантах ВИЧ экспрессионная единица содержит последовательность, кодирующую один или несколько ВИЧ белков или их фрагменты. В рекомендуемых вариантах ВИЧ экспрессионная единица находится в пределах плазмиды. As used herein, the term “HIV expression unit” refers to a nucleic acid sequence containing a promoter operably linked to a coding sequence operably linked to a polyadenylation signal, the coding sequence encoding a peptide having an epitope that is identical or substantially similar to an epitope found in HIV protein. The term “substantially similar epitope” refers to an epitope whose structure is not identical to that of the HIV protein epitope, but which nonetheless produces a cellular or humoral immune response that cross-reacts with the HIV protein. In preferred embodiments, the HIV expression unit comprises a sequence encoding one or more HIV proteins or fragments thereof. In recommended embodiments, the HIV expression unit is within the plasmid.

В некоторых воплощениях настоящего изобретения дается единичный генетический конструкт, содержащий единственную ВИЧ экспрессионную единицу, включающую ДНК последовательности, кодирующие один или несколько ВИЧ белков или их фрагменты. В применяемом здесь значении термин "конструкт с единственной ВИЧ экспрессионной единицей" относится к единичному генетическому конструкту, содержащему единственную ВИЧ экспрессионную единицу. В рекомендуемых вариантах конструкт с единственной ВИЧ экспрессионной единицей имеет вид плазмиды. In some embodiments of the present invention, a single genetic construct is provided comprising a single HIV expression unit comprising DNA sequences encoding one or more HIV proteins or fragments thereof. As used herein, the term “construct with a single HIV expression unit” refers to a single genetic construct containing a single HIV expression unit. In recommended embodiments, a construct with a single HIV expression unit has the appearance of a plasmid.

В некоторых воплощениях настоящего изобретения дается единичный генетический конструкт, включающий более одной ВИЧ экспрессионной единицы, каждая из которых содержит ДНК последовательности, кодирующие один или несколько ВИЧ белков или их фрагменты. В применяемом здесь значении термин "генетический конструкт с рядом ВИЧ экспрессионных единиц" относится к единичной плазмиде, содержащей более одной ВИЧ экспрессионной единицы. В рекомендуемых вариантах конструкт с рядом ВИЧ экспрессионных единиц имеет вид плазмиды. In some embodiments of the present invention, a single genetic construct is provided comprising more than one HIV expression unit, each of which contains DNA sequences encoding one or more HIV proteins or fragments thereof. As used herein, the term “genetic construct with a number of HIV expression units” refers to a single plasmid containing more than one HIV expression unit. In recommended embodiments, the construct with a number of HIV expression units has the appearance of a plasmid.

В некоторых воплощениях настоящего изобретения дается единичный генетический конструкт, включающий две ВИЧ экспрессионных единицы, каждая из которых содержит ДНК последовательности, кодирующие один или более ВИЧ белков или их фрагменты. В применяемом здесь значении термин "генетический конструкт с двумя ВИЧ экспрессионными единицами" относится к единичной плазмиде, содержащей две ВИЧ экспрессионные единицы, т.е. к генетическому конструкту с рядом ВИЧ экспрессионных единиц, содержащему две ВИЧ экспрессионных единицы. В случае генетического конструкта с двумя ВИЧ экспрессионными единицами рекомендуется, чтобы одна из ВИЧ экспрессионных единиц функционировала в направлении, противоположном функционированию другой ВИЧ экспрессионной единицы. В рекомендуемых вариантах генетический конструкт с двумя ВИЧ экспрессионными единицами имеет вид плазмиды. In some embodiments of the present invention, a single genetic construct is provided comprising two HIV expression units, each of which contains DNA sequences encoding one or more HIV proteins or fragments thereof. As used herein, the term "genetic construct with two HIV expression units" refers to a single plasmid containing two HIV expression units, i.e. to a genetic construct with a series of HIV expression units containing two HIV expression units. In the case of a genetic construct with two HIV expression units, it is recommended that one of the HIV expression units function in a direction opposite to that of the other HIV expression units. In recommended embodiments, the genetic construct with two HIV expression units is a plasmid.

В некоторых воплощениях настоящего изобретения дается ВИЧ генетическая вакцина, содержащая единственный генетический конструкт. Единственный генетический конструкт может представлять собой генетический конструкт с единственной ВИЧ экспрессионной единицей, двумя ВИЧ экспрессионными единицами или генетический конструкт с рядом ВИЧ экспрессионных единиц, в котором содержится более двух ВИЧ экспрессионных единиц. In some embodiments of the present invention, an HIV genetic vaccine is provided containing a single genetic construct. A single genetic construct may be a genetic construct with a single HIV expression unit, two HIV expression units, or a genetic construct with a series of HIV expression units that contains more than two HIV expression units.

В некоторых воплощениях настоящего изобретения дается ВИЧ генетическая вакцина, содержащая более одного генетического конструкта в единственном инокуляте. In some embodiments of the present invention, an HIV genetic vaccine is provided containing more than one genetic construct in a single inoculum.

В некоторых воплощениях настоящего изобретения дается ВИЧ генетическая вакцина, содержащая более одного генетического конструкта в более чем одном инокуляте. В применяемом здесь значении термин "множественный инокулят" относится к генетической вакцине, включающей более одного генетического конструкта, каждый из которых вводят отдельно. В некоторых воплощениях настоящего изобретения дается ВИЧ генетическая вакцина, содержащая два генетических конструкта. Каждый генетический конструкт может представлять собой независимо от другого генетический конструкт с единственной ВИЧ экспрессиониой единицей, генетический конструкт с двумя ВИЧ экспрессионными единицами или генетический конструкт с рядом ВИЧ экспрессионных единиц, в котором содержится более двух ВИЧ экспрессионных единиц. В некоторых вариантах оба генетических конструкта представляют собой генетический конструкт с единственной ВИЧ экспрессионной единицей. В отдельных вариантах оба генетических конструкта представлены генетическими конструктами с двумя ВИЧ экспрессионными единицами. В других вариантах оба генетических конструкта представлены генетическими конструктами с рядом ВИЧ экспрессионных единиц. В некоторых вариантах один генетический конструкт является генетическим конструктом с единственной ВИЧ экспрессионной единицей, а другой - генетическим конструктом с двумя ВИЧ экспрессионными единицами. Для обычного специалиста совершенно очевидны многие вариации, зависящие от числа генетических конструктов, применяемых в генетической вакцине, и числа ВИЧ экспрессионных единиц, которые могут присутствовать в каждом генетическом конструкте. In some embodiments of the present invention, an HIV genetic vaccine is provided containing more than one genetic construct in more than one inoculum. As used herein, the term "multiple inoculum" refers to a genetic vaccine comprising more than one genetic construct, each of which is administered separately. In some embodiments of the present invention, an HIV genetic vaccine is provided containing two genetic constructs. Each genetic construct may be, independently of the other, a genetic construct with a single HIV expression unit, a genetic construct with two HIV expression units, or a genetic construct with a series of HIV expression units containing more than two HIV expression units. In some embodiments, both genetic constructs are a genetic construct with a single HIV expression unit. In separate embodiments, both genetic constructs are represented by genetic constructs with two HIV expression units. In other embodiments, both genetic constructs are represented by genetic constructs with a number of HIV expression units. In some embodiments, one genetic construct is a genetic construct with a single HIV expression unit, and the other is a genetic construct with two HIV expression units. Many variations are quite obvious to the average person, depending on the number of genetic constructs used in the genetic vaccine and the number of HIV expression units that may be present in each genetic construct.

Рекомендуется, чтобы генетические конструкты настоящего изобретения не содержали определенных ВИЧ последовательностей, в частности, тех, которые принимают участие в интеграции ВИЧ генома в хромосомное вещество клетки, в которую вводится конструкт. Рекомендуется, чтобы генетические конструкты настоящего изобретения не содержали ПДК из ВИЧ. Рекомендуется также, чтобы генетические конструкты настоящего изобретения не содержали psi сайта ВИЧ. Кроме того, рекомендуется, чтобы были подвергнуты делеции ген обратной транскриптазы и ген интегразы. Делеции включают делецию только некоторых кодонов или замену отдельных кодонов с целью существенного изменения гена. К примеру, инициирующий кодон может быть делетирован, изменен или смещен за рамку с образованием нуклеотидной последовательности, кодирующей неполный или нефункциональный продукт. It is recommended that the genetic constructs of the present invention do not contain specific HIV sequences, in particular those involved in the integration of the HIV genome into the chromosome substance of the cell into which the construct is introduced. It is recommended that the genetic constructs of the present invention do not contain MPCs from HIV. It is also recommended that the genetic constructs of the present invention do not contain the HIV psi site. In addition, it is recommended that the reverse transcriptase gene and integrase gene be deleted. Deletions include the deletion of only certain codons or the replacement of individual codons in order to significantly alter the gene. For example, the initiating codon can be deleted, altered, or shifted outside the frame to form a nucleotide sequence encoding an incomplete or non-functional product.

Рекомендуется также, чтобы генетические конструкты настоящего изобретения не содержали транскрибируемый tat из ВИЧ. Ген tat, перекрывающий rev ген, может быть полностью изъят путем замены кодонов, кодирующих rev, другими кодонами, кодирующими ту же аминокислоту для rev, но не кодирующими необходимую tat аминокислоту в рамке считывания, в которой кодируется tat. Или же отключаются только некоторые кодоны путем замены, а по существу делеции инициирующего кодона для tat и/или путем замены, а по существу делеции достаточных кодонов с образованием в результате нуклеотидной последовательности, кодирующей неполный или нефункциональный tat. It is also recommended that the genetic constructs of the present invention do not contain transcribed tat from HIV. The tat gene overlapping the rev gene can be completely removed by replacing the codons encoding rev with other codons encoding the same amino acid for rev, but not encoding the necessary tat amino acid in the reading frame in which tat is encoded. Or, only certain codons are disabled by substituting, but essentially deleting, the initiating codon for tat and / or by replacing, and essentially, deleting, sufficient codons to form a nucleotide sequence encoding an incomplete or non-functional tat.

Рекомендуется, чтобы генетический конструкт включал кодирующие последовательности, кодирующие пептиды, имеющие по меньшей мере один эпитоп, идентичный или по существу аналогичный эпитопу из ВИЧ gag, pol, env или rev белков. Еще более предпочтительно, если генетический конструкт включает кодирующие последовательности, которые кодируют по меньшей мере один из ВИЧ gag, pol, env или rev белков или их фрагменты. Рекомендуется, чтобы генетический конструкт включал кодирующие последовательности, кодирующие пептиды, содержащие более одного эпитопа, идентичного или по существу аналогичного эпитопу из ВИЧ gag, pol, env или rev белков. Более предпочтительно, если генетический конструкт включает последовательности, кодирующие более одного ВИЧ gag, pol, env или rev белков или их фрагменты. It is recommended that the genetic construct include coding sequences encoding peptides having at least one epitope identical or substantially similar to the epitope of HIV gag, pol, env or rev proteins. Even more preferably, the genetic construct includes coding sequences that encode at least one of the HIV gag, pol, env or rev proteins or fragments thereof. It is recommended that the genetic construct includes coding sequences encoding peptides containing more than one epitope identical or substantially similar to the epitope of HIV gag, pol, env or rev proteins. More preferably, the genetic construct includes sequences encoding more than one HIV gag, pol, env or rev protein, or fragments thereof.

В некоторых вариантах генетический конструкт включает последовательности, кодирующие пептиды, имеющие по меньшей мере один эпитоп, идентичный или по существу аналогичный эпитопу из ВИЧ vif, vpr, vpu или nef белков. В отдельных вариантах генетический конструкт включает последовательности, кодирующие по меньшей мере один из ВИЧ vif, vpr, vpu или nef белков. In some embodiments, the genetic construct includes sequences encoding peptides having at least one epitope that is identical or substantially similar to the epitope of HIV vif, vpr, vpu or nef proteins. In certain embodiments, the genetic construct includes sequences encoding at least one of the HIV vif, vpr, vpu, or nef proteins.

Генетический конструкт с единственной ВИЧ экспрессионной единицей может включать области кодирования одного или нескольких пептидов, разделяющих по меньшей мере один эпитоп с ВИЧ белком или его фрагментом в единственной экспрессионной единице под регуляторным контролем единственного промотора и сигнала полиаденилирования. Рекомендуется, чтобы генетические конструкты кодировали более одного ВИЧ белка или его фрагменты. Промотором может быть любой, функциональный в клетке человека промотор. В качестве промотора рекомендуется ОВ40 промотор или ЦМВ промотор, предпочтительно ЦМВ непосредственно ранний промотор. Сигналом полиаденилирования может служить любой функциональный в клетке человека сигнал полиаденилирования. В качестве сигнала полиаденилирования рекомендуется ОВ40 сигнал полиаденилирования, предпочтительно ОВ40 малый сигнал полиаденилирования. Если в единственной экспрессионной единице имеются более одной области кодирования, эти области могут непосредственно примыкать друг к другу или могут быть разделены некодирующими областями. Для правильной экспрессии область кодирования должна иметь инициирующий кодон и терминирующий кодон. A genetic construct with a single HIV expression unit may include coding regions of one or more peptides sharing at least one epitope with an HIV protein or fragment thereof in a single expression unit under the regulatory control of a single promoter and polyadenylation signal. It is recommended that genetic constructs encode more than one HIV protein or fragments thereof. A promoter can be any functional promoter in a human cell. As a promoter, the OB40 promoter or the CMV promoter is recommended, preferably the CMV directly early promoter. The polyadenylation signal can be any polyadenylation signal that is functional in a human cell. As the polyadenylation signal, an OB40 polyadenylation signal is recommended, preferably OB40 is a small polyadenylation signal. If there are more than one coding region in a single expression unit, these regions can be directly adjacent to each other or can be separated by non-coding regions. For proper expression, the coding region must have an initiation codon and a termination codon.

Генетический конструкт с двумя ВИЧ экспрессионными единицами может включать области кодирования одного или нескольких пептидов, разделяющих по меньшей мере один эпитоп с ВИЧ белком или его фрагментом в каждой из двух экспрессионных единиц. Каждая экспрессионная единица находится под регуляторным контролем единственного промотора и сигнала полиаденилирования. В некоторых вариантах рекомендуется, чтобы генетические конструкты кодировали более одного ВИЧ белка или его фрагмента. В некоторых вариантах рекомендуется, чтобы в одной экспрессионной единице присутствовали нуклеотидные последовательности, кодирующие gag и pol, а в другой присутствовали нуклеотидные последовательности, кодирующие env и rev. Промотор может быть представлен любым функциональным в клетке человека промотором. В качестве промотора рекомендуется ОВ40 промотор или ЦМВ промотор, предпочтительно непосредственно ранний ЦМВ промотор. Сигнал полиаденилирования может быть представлен любым функциональным в клетке человека сигналом полиаденилирования. В качестве сигнала полиаденилирования рекомендуется ОВ40 сигнал полиаденилирования, предпочтительно ОВ40 малый сигнал полиаденилирования. Если в экспрессионной единице имеется более одной области кодирования, эти области могут непосредственно примыкать друг к другу или могут быть разделены некодирующими областями. Для правильной экспрессии области кодирования должны иметь инициирующий кодон и терминирующий кодон. A genetic construct with two HIV expression units may include coding regions of one or more peptides sharing at least one epitope with an HIV protein or fragment thereof in each of two expression units. Each expression unit is under the regulatory control of a single promoter and polyadenylation signal. In some embodiments, it is recommended that genetic constructs encode more than one HIV protein or fragment thereof. In some embodiments, it is recommended that nucleotide sequences encoding gag and pol are present in one expression unit, and nucleotide sequences encoding env and rev are present in another. A promoter may be any functional promoter in a human cell. As the promoter, the OB40 promoter or the CMV promoter is recommended, preferably directly the early CMV promoter. The polyadenylation signal can be represented by any polyadenylation signal functional in a human cell. As the polyadenylation signal, an OB40 polyadenylation signal is recommended, preferably OB40 is a small polyadenylation signal. If there is more than one coding region in the expression unit, these regions can be directly adjacent to each other or can be separated by non-coding regions. For proper expression, coding regions must have an initiation codon and a termination codon.

Согласно некоторым воплощениям настоящего изобретения МНС Класса II перекрестно реакционный эпитоп в env изъят и заменен аналогичной областью из ВИЧ II. According to some embodiments of the present invention, MHC Class II cross-reaction epitope in env is removed and replaced by a similar region from HIV II.

Если генетический конструкт содержит gag и/или pol, как правило, важно, чтобы в этом случае присутствовал и rev. Для повышенной экспрессии gag и pol вместе с этими генами помимо rev может быть предусмотрен и rev-респондирующий элемент. If the genetic construct contains gag and / or pol, it is usually important that rev. For increased expression of gag and pol together with these genes, in addition to rev, a rev-responsive element may also be provided.

При получении генетических конструктов рекомендуется, чтобы применяемый в плазмиде 1 env ген происходил из MN или MN-подобных изолятов, включая клинические MN-подобные изоляты, предпочтительно несинцитиально индуцируемые клинические изоляты, предпочтительно те клинические изоляты, которые являются макрофаговыми тропиками из клинических изолятов ранней стадии. When generating genetic constructs, it is recommended that the gene used in plasmid 1 env be derived from MN or MN-like isolates, including clinical MN-like isolates, preferably non-syncytially induced clinical isolates, preferably those clinical isolates that are macrophage tropics from early clinical isolates.

Альтернативным сплайсингом из единственной экспрессионной единицы может быть получен целый ряд белков. Обеспечением сигналов сплайсинга можно достигнуть альтернативного сплайсинга, в котором создаются различные матрицы, кодирующие разные белки. Alternative splicing from a single expression unit can produce a variety of proteins. By providing splicing signals, alternative splicing can be achieved in which different matrices are created that encode different proteins.

Пример 46
На фиг. 8 показаны четыре скелета: A, B, C и D. На фиг. 9 показаны вставки: 1, 2, 3 и 4. Вставка 1 поддерживает экспрессию gag и pol; rev-респондирующий элемент клонирован путем, при котором сохраняется ВИЧ сплайс-акцептор. Вставка 2 аналогична вставке 1 в том, что также поддерживает экспрессию gag и pol, но при этом rev-респондирующий элемент клонируют без сохранения ВИЧ сплайс-акцептора. Вставка 3 поддерживает экспрессию gag и pol, включает делецию гена интегразы и не включает цис-действующего rev-респондирующего элемента. Вставка 4 поддерживает экспрессию rev, vpu и env. Ген env может иметь МНС Класса II перекрестно реакционный эпитоп, измененный с удалением перекрестной реакционности; петля V3 может быть изменена с целью исключения возможности образования синцитий.
Example 46
In FIG. 8 shows four skeletons: A, B, C, and D. FIG. 9 shows the inserts: 1, 2, 3, and 4. Box 1 supports the expression of gag and pol; The rev-responsive element is cloned in a way that retains the HIV splice acceptor. Box 2 is similar to box 1 in that it also supports the expression of gag and pol, but the rev-responsive element is cloned without preserving the HIV splice acceptor. Box 3 supports the expression of gag and pol, includes a deletion of the integrase gene, and does not include a cis-acting rev-responsive element. Box 4 supports expression of rev, vpu, and env. The env gene may have a MHC Class II cross-reaction epitope altered to remove cross-reactivity; the V3 loop can be modified to exclude the possibility of syncytium formation.

В некоторых вариантах скелет А используют со вставкой 1. Подобные конструкты возможно содержат ОВ40 ориджин репликации. Плазмида pAlori+ представляет собой скелет А со вставкой 1 и ОВ40 ориджином репликации. Плазмида pAlori- представляет собой скелет А со вставкой 1 и без ОВ40 ориджина-репликации. Кроме того, как pAlori+, так и pAlori- могут включать интегразу, что приводит к плазмидам pAlori+int+ и pAlori-int+ соответственно. Плазмиды pAlori+, pAlori-, pAlori+int+ и pAlori-int+ могут быть дополнительно модифицированы функциональной делецией гена обратной транскриптазы (RT) с образованием соответственно pAlori+RT-, pAlori-RT-, pAlori+int+RT-и pAlori-int+RT-. In some embodiments, skeleton A is used with insert 1. Similar constructs possibly contain OB40 origin of replication. Plasmid pAlori + is a skeleton A with insert 1 and OB40 origin of replication. Plasmid pAlori- is a skeleton A with insert 1 and without OB40 of origin replication. In addition, both pAlori + and pAlori- can include integrase, which leads to plasmids pAlori + int + and pAlori-int +, respectively. The plasmids pAlori +, pAlori-, pAlori + int +, and pAlori-int + can be further modified by functional deletion of the reverse transcriptase (RT) gene to form pAlori + RT-, pAlori-RT-, pAlori + int + RT, and pAlori-int + RT, respectively -.

В некоторых вариантах скелет А применяют со вставкой 2. Подобные конструкты возможно содержат ОВ40 ориджин репликации. Плазмида pA2ori+ состоит из скелета А со вставкой 2 и ОВ40 ориджина репликации. Плазмида pA2ori- состоит из скелета А со вставкой 2, но без ОВ40 ориджина репликации. Кроме того, как pA2ori+, так и pA2ori- могут включать интегразу, что приводит к плазмидам pA2ori+int+ и pA2ori-int+ соответственно. Плазмиды pA2ori+, pA2ori-, pA2ori+int+ и pA2ori-int+ могут быть дополнительно модифицированы функциональной делецией гена обратной транскриптазы (RT) с образованием соответственно pA2ori+RT-, pA2ori-RT-, pA2ori+int+RT- и pA2ori-int+RT-. In some embodiments, skeleton A is used with insert 2. Similar constructs may contain OB40 origin of replication. Plasmid pA2ori + consists of skeleton A with insert 2 and OB40 of the origin of replication. Plasmid pA2ori- consists of skeleton A with insert 2, but without the OB40 origin of replication. In addition, both pA2ori + and pA2ori- can include integrase, which leads to plasmids pA2ori + int + and pA2ori-int +, respectively. The plasmids pA2ori +, pA2ori-, pA2ori + int + and pA2ori-int + can be further modified by functional deletion of the reverse transcriptase (RT) gene to form pA2ori + RT-, pA2ori-RT-, pA2ori + int + RT- and pA2ori-int + RT, respectively -.

В некоторых вариантах скелет В применяют со вставкой 1. Подобные конструкты возможно содержат ОВ40 ориджин репликации. Плазмида pBlori+ состоит из скелета В со вставкой 1 и ОВ40 ориджином репликации. Плазмида pBlori- состоит из скелета В со вставкой 1, но без ОВ40 ориджина репликации. Кроме того, как плазмида pBlori+, так и pBlori- могут включать интегразу, что приводит к плазмидам pBlori+int+ и pBlori-int+ соответственно. Плазмиды pBlori+, pBlori-, pBlori+int+ и pBlori-int+ могут быть дополнительно модифицированы функциональной делецией гена обратной транскриптазы (RT) с образованием соответственно pBlori+RT-, pBlori-RT-, pBlori+int+RT- и pBlori-int+RT-. In some embodiments, the skeleton B is used with insert 1. Similar constructs possibly contain OB40 origin of replication. Plasmid pBlori + consists of skeleton B with insert 1 and OB40 origin of replication. Plasmid pBlori- consists of skeleton B with insert 1 but without OB40 origin of replication. In addition, both plasmid pBlori + and pBlori- can include integrase, which leads to plasmids pBlori + int + and pBlori-int +, respectively. Plasmids pBlori +, pBlori-, pBlori + int + and pBlori-int + can be further modified by functional deletion of the reverse transcriptase (RT) gene to form pBlori + RT-, pBlori-RT-, pBlori + int + RT- and pBlori-int + RT, respectively -.

В некоторых вариантах скелет В применяют со вставкой 2. Такие конструкты возможно содержат ОВ40 ориджин репликации Плазмида pB2ori+ состоит из скелета В со вставкой 2 и ОВ40 ориджина репликации. Плазмида pB2ori- состоит из скелета В со вставкой 2, но без ОВ40 ориджина репликации. Кроме того, как pB2ori+, так и pB2ori- могут включать интегразу, что приводит к плазмидам pB2ori+int+ и pB2ori-int+ соответственно. Плазмиды pB2ori+, pB2ori-, pB2ori+int+ и pB2ori-int+ могут быть дополнительно модифицированы с функциональной делецией гена обратной транскриптазы (RT) с образованием соответственно pB2ori+RT-, pB2ori-RT-, pB2ori+int+RT- и pB2ori-int+RT-. In some embodiments, skeleton B is used with insert 2. Such constructs possibly contain OB40 origin of replication. Plasmid pB2ori + consists of skeleton B with insert 2 and OB40 of the origin of replication. Plasmid pB2ori- consists of skeleton B with insert 2, but without the OB40 origin of replication. In addition, both pB2ori + and pB2ori- can include integrase, which leads to plasmids pB2ori + int + and pB2ori-int +, respectively. Plasmids pB2ori +, pB2ori-, pB2ori + int + and pB2ori-int + can be further modified with functional deletion of the reverse transcriptase (RT) gene to form pB2ori + RT-, pB2ori-RT-, pB2ori + int + RT- and pB2ori-int +, respectively RT-.

В некоторых вариантах скелет А минус rev применяют со вставкой 3. Такие конструкты возможно содержат ОВ40 ориджин репликации. Плазмида pA/r-3ori+ имеет скелет А со вставкой 3 и ОВ40 ориджином репликации. Плазмида pA/r-3ori- имеет скелет А минус rev со вставкой 3 и без ОВ40 ориджина репликации. Кроме того, как pA/r-3ori+, так и pA/r-3ori- могут включать интегразу, что приводит к плазмидам pA/r-3ori+int+ и pA/r-3ori-int+ соответственно. Плазмиды pA/r-3ori+, pA/r-3ori-, pA/r-3ori+int+ и pA/r-3ori-int+ могут быть дополнительно модифицированы функциональной делецией гена обратной транскрип-тазы (RT) с образованием соответственно pA/r-3ori+RT-, pA/r-3ori-RT-, pA/r-3ori+int+RT- и pA/r-3ori-int+RT-. In some embodiments, skeleton A minus rev is used with insert 3. Such constructs may possibly contain OB40 origin of replication. Plasmid pA / r-3ori + has skeleton A with insert 3 and OB40 origin of replication. Plasmid pA / r-3ori- has a skeleton A minus rev with insert 3 and without OB40 origin of replication. In addition, both pA / r-3ori + and pA / r-3ori- can include integrase, which leads to plasmids pA / r-3ori + int + and pA / r-3ori-int +, respectively. Plasmids pA / r-3ori +, pA / r-3ori-, pA / r-3ori + int + and pA / r-3ori-int + can be further modified by functional deletion of the gene for reverse transcriptase (RT) with the formation respectively pA / r- 3ori + RT-, pA / r-3ori-RT-, pA / r-3ori + int + RT- and pA / r-3ori-int + RT-.

В некоторых вариантах скелет С применяют со вставкой 1. Такие конструкты возможно содержат ОВ40 ориджин репликации. Плазмида pClori+ имеет скелет С со вставкой 1 и ОВ40 ориджином репликации. Плазмида pClori- имеет скелет С со вставкой 1, но без ОВ40 ориджина репликации. Кроме того, как pClori+ так и pClori- могут включать интегразу, что приводит к плазмидам pClori+int+ и pClori-int+ соответственно. Плазмиды pClori+, pClori-, pClori+int+ и pClori-int+ могут быть дополнительно модифицированы функциональной делецией гена обратной транскриптазы (RT) с образованием соответственно pClori+RT-, pClori-RT-, pClori+int+RT- и pClori-int+RT-. In some embodiments, skeleton C is used with insert 1. Such constructs possibly contain OB40 origin of replication. Plasmid pClori + has skeleton C with insert 1 and OB40 origin of replication. Plasmid pClori- has skeleton C with insert 1 but without OB40 origin of replication. In addition, both pClori + and pClori- can include integrase, resulting in plasmids pClori + int + and pClori-int +, respectively. The plasmids pClori +, pClori-, pClori + int + and pClori-int + can be further modified by functional deletion of the reverse transcriptase (RT) gene to form pClori + RT-, pClori-RT-, pClori + int + RT- and pClori-int + RT, respectively -.

В некоторых вариантах скелет С применяют со вставкой 2. Такие конструкты возможно содержат ОВ40 ориджин репликации. Плазмида pC2ori+ имеет скелет С со вставкой 2 и ОВ40 ориджином репликации. Плазмида pC2ori- имеет скелет С со вставкой 2, но без ОВ40 ориджнна репликации. Кроме того, как pC2ori+, так и pC2ori- могут включать интегразу, что приводит к плазмидам pC2ori+int+ и pC2ori-int+ соответственно. Плазмиды pC2ori+, pC2ori-, pC2ori+int+ и pC2ori-int+ могут быть дополнительно модифицированы функциональной делецией гена обратной транскриптазы (RT) с образованием соответственно pC2ori+RT-, pC2ori-RT-, pC2ori+int+RT- и pC2ori-int+RT-. In some embodiments, skeleton C is used with insert 2. Such constructs possibly contain OB40 origin of replication. Plasmid pC2ori + has skeleton C with insert 2 and OB40 origin of replication. Plasmid pC2ori- has skeleton C with insert 2, but without OB40, origin of replication. In addition, both pC2ori + and pC2ori- can include integrase, which leads to plasmids pC2ori + int + and pC2ori-int +, respectively. The plasmids pC2ori +, pC2ori-, pC2ori + int + and pC2ori-int + can be further modified by functional deletion of the reverse transcriptase (RT) gene to form pC2ori + RT-, pC2ori-RT-, pC2ori + int + RT- and pC2ori-int + RT, respectively -.

В некоторых вариантах скелет С применяют со вставкой 3. Такие конструкты возможно содержат ОВ40 ориджин репликации. Плазмида pC3ori+ имеет скелет С со вставкой 3 и ОВ40 ориджином репликации. Плазмида pC3ori- имеет скелет С со вставкой 3, но без ОВ40 ориджина репликации. Кроме того, как pC3ori+, так и pC3ori- могут включать интегразу, что приводит к плазмидам pC3ori+int+ и pC3ori-int+ соответственно. Плазмиды pC3ori+, pC3ori-, pC3ori+int+ и pC3ori-int+ могут быть дополнительно модифицированы функциональной делецией гена обратной транскриптазы (RT) с образованием соответственно pC3ori+RT-, pC3ori-RT-, pC3ori+int+RT- и pC3ori-int+RT-. In some embodiments, skeleton C is used with insert 3. Such constructs possibly contain OB40 origin of replication. Plasmid pC3ori + has skeleton C with insert 3 and OB40 origin of replication. Plasmid pC3ori- has skeleton C with insert 3, but without the OB40 origin of replication. In addition, both pC3ori + and pC3ori- can include integrase, which leads to plasmids pC3ori + int + and pC3ori-int +, respectively. Plasmids pC3ori +, pC3ori-, pC3ori + int + and pC3ori-int + can be further modified by functional deletion of the reverse transcriptase (RT) gene to form pC3ori + RT-, pC3ori-RT-, pC3ori + int + RT- and pC3ori-int + RT, respectively -.

В некоторых вариантах скелет D применяют со вставкой 4. Такие конструкты возможно содержат ОВ40 ориджин репликации. Плазмида pD4ori+ имеет скелет D со вставкой 4 и ОВ40 ориджином репликации. Плазмида pD4ori- имеет скелет D со вставкой 4, но без ОВ40 ориджина репликации. In some embodiments, skeleton D is used with insert 4. Such constructs possibly contain OB40 origin of replication. Plasmid pD4ori + has a skeleton D with insert 4 and OB40 origin of replication. Plasmid pD4ori- has a skeleton D with insert 4, but without OB40 origin of replication.

Пример 47
В некоторых вариантах в качестве генетической вакцины дается единственная экспрессионная единица/единственный инокулят. Вакцина представляет собой генетический конструкт, включающий последовательность, кодирующую пептид, в состав которого входит по меньшей мере один эпитоп, идентичный или по существу аналогичный эпитопам ВИЧ белков. Кодирующая последовательность находится под регуляторным контролем непосредственно раннего промотора ЦМВ и малого сигнала полиаденилирования ОВ40.
Example 47
In some embodiments, a single expression unit / single inoculum is given as a genetic vaccine. A vaccine is a genetic construct that includes a sequence encoding a peptide that comprises at least one epitope that is identical or substantially similar to the epitopes of HIV proteins. The coding sequence is under regulatory control of the directly early promoter of CMV and the small signal polyadenylation OB40.

В некоторых вариантах в качестве генетической вакцины дается единственная экспрессионная единица/единственный инокулят. Вакцина представляет собой генетический конструкт, включающий последовательность, кодирующую по меньшей мере один ВИЧ белок или его фрагмент. Кодирующая последовательность находится под регуляторным контролем непосредственно раннего промотора ЦМВ и малого сигнала полиаденилирования ОВ40. ВИЧ белок выбирают из группы, включающей: gag, pol, env и rev. В некоторых рекомендуемых вариантах генетическая вакцина представляет собой генетический конструкт, включающий последовательность, кодирующую по меньшей мере два ВИЧ белка или их фрагменты, выбранных из группы, включающей: gag, pol, env и rev или их фрагменты. В отдельных рекомендуемых вариантах генетическая вакцина представляет собой генетический конструкт, включающий последовательность, кодирующую по меньшей мере три ВИЧ белка или их фрагменты, выбранных на группы, включающей: gag, pol, env и rev или их фрагменты. В некоторых рекомендуемых вариантах дается генетическая вакцина, представляющая собой генетический конструкт, включающий последовательность, кодирующая gag, pol, env и rev или их фрагменты. In some embodiments, a single expression unit / single inoculum is given as a genetic vaccine. A vaccine is a genetic construct comprising a sequence encoding at least one HIV protein or fragment thereof. The coding sequence is under regulatory control of the directly early promoter of CMV and a small signal polyadenylation OB40. The HIV protein is selected from the group consisting of: gag, pol, env and rev. In some recommended embodiments, the genetic vaccine is a genetic construct comprising a sequence encoding at least two HIV proteins or fragments thereof selected from the group consisting of: gag, pol, env and rev, or fragments thereof. In certain recommended embodiments, a genetic vaccine is a genetic construct comprising a sequence encoding at least three HIV proteins or fragments thereof selected into groups comprising: gag, pol, env and rev, or fragments thereof. In some recommended embodiments, a genetic vaccine is provided that is a genetic construct comprising a sequence encoding gag, pol, env and rev, or fragments thereof.

В некоторых вариантах дается двойная экспрессионная единица/единственный инокулят в качестве генетической вакцины. Вакцина представляет собой генетический конструкт, включающий две экспрессионные единицы, каждая из которых содержит последовательности, кодирующие пептид, имеющий по меньшей мере один эпитоп, идентичный или по существу аналогичный эпитопам ВИЧ белков. Кодирующая последовательность находится под контролем ЦМВ непосредственно раннего промотора ЦМВ и ОВ40 малого сигнала полиаденилирования. In some embodiments, a double expression unit / single inoculum is given as a genetic vaccine. A vaccine is a genetic construct comprising two expression units, each of which contains sequences encoding a peptide having at least one epitope that is identical or substantially similar to the epitopes of HIV proteins. The coding sequence is under the control of CMV directly from the early promoter of CMV and OB40 of a small polyadenylation signal.

В некоторых вариантах в качестве генетической вакцины дается двойная экспрессионная единица/единственный инокулят. Вакцина представляет собой генетический конструкт, включающий две экспрессионные единицы, каждая из которых содержит последовательность, кодирующую по меньшей мере один ВИЧ белок или его фрагмент. Каждая экспрессионная единица содержит кодирующую последовательность, находящуюся под регуляторным контролем ЦМВ непосредственно раннего промотора и ОВ40 малого сигнала полиаденилирования. ВИЧ белки выбирают из группы, включающей: gag, pol, env и rev. В некоторых рекомендуемых вариантах дается генетическая вакцина представляющая собой генетический конструкт, включающий две экспрессионные единицы, по меньшей мере одна из которых содержит последовательность, кодирующую по меньшей мере два ВИЧ белка или их фрагменты, выбранные из группы, включающей: gag, rol, env и rev или их фрагменты, а другая содержит по меньшей мере один ВИЧ белок или его фрагменты, выбранные из группы, включающей gag, pol, env и rev или их фрагменты. В отдельных рекомендуемых вариантах дается генетическая вакцина, представляющая собой генетический конструкт, включающий две экспрессионные единицы, по меньшей мере одна из которых содержит последовательность, кодирующую по меньшей мере три ВИЧ белка или их фрагменты, выбранные из группы, включающей: gag, pol, env и rev или их фрагменты, а другая содержит по меньшей мере один ВИЧ белок или его фрагменты, выбранный из группы, включающей: gag, pol, env и rev или их фрагменты. В других рекомендуемых вариантах дается генетическая вакцина, представляющая собой генетический конструкт, состоящий из двух экспрессионных единиц и включающий последовательность, кодирующую gag, pol, env и rev или их фрагменты. In some embodiments, a double expression unit / single inoculum is given as a genetic vaccine. A vaccine is a genetic construct comprising two expression units, each of which contains a sequence encoding at least one HIV protein or fragment thereof. Each expression unit contains a coding sequence under the regulatory control of the CMV of the immediate early promoter and OB40 of the small polyadenylation signal. HIV proteins are selected from the group consisting of: gag, pol, env and rev. In some recommended embodiments, a genetic vaccine is provided, which is a genetic construct comprising two expression units, at least one of which contains a sequence encoding at least two HIV proteins or fragments thereof selected from the group consisting of: gag, rol, env and rev or fragments thereof, and the other contains at least one HIV protein or fragments thereof selected from the group consisting of gag, pol, env and rev or fragments thereof. In certain recommended embodiments, a genetic vaccine is provided, which is a genetic construct comprising two expression units, at least one of which contains a sequence encoding at least three HIV proteins or fragments thereof selected from the group consisting of: gag, pol, env and rev or fragments thereof, and the other contains at least one HIV protein or fragments thereof, selected from the group consisting of: gag, pol, env and rev or fragments thereof. In other recommended embodiments, a genetic vaccine is provided, which is a genetic construct consisting of two expression units and comprising a sequence encoding gag, pol, env and rev, or fragments thereof.

Пример 48
Для применения в анти-ВИЧ фармацевтическом наборе или фармацевтическом препарате создан генетический конструкт (плазмида pCMN160Δ16). pCMN160Δ16 конструируют следующим образом.
Example 48
A genetic construct (plasmid pCMN160Δ16) has been created for use in an anti-HIV pharmaceutical kit or pharmaceutical preparation. pCMN160Δ16 is constructed as follows.

Стадия 1. Для получения из ВИЧ/MN геномной ДНК ПЦР фрагмента применяют праймеры ПОСЛЕД. N 35 и ПОСЛЕД. N 34. Stage 1. To obtain the genomic DNA of the PCR fragment from HIV / MN, primers are used AFTER. N 35 and AFTER. N 34.

Стадия 2. Для получения ПЦР фрагмента из ВИЧ/MN геномной ДНК применяют праймеры ПОСЛЕД. N 33 и ПОСЛЕД. N 36. Stage 2. To obtain a PCR fragment from HIV / MN genomic DNA, primers are used AFTER. N 33 and AFTER. N 36.

Стадия 3. Праймеры ПОСЛЕД. N 35 и ПОСЛЕД. N 36 смешивают с 2 мкл продукта реакции стадий 1 и 2. Stage 3. Primers LAST. N 35 and AFTER. N 36 is mixed with 2 μl of the reaction product of steps 1 and 2.

Стадия 4. Продукт реакции стадии 3 разрезают с помощью NotI и MluI и вставляют в скелет А, описанный в Примере 46 и разрезанный NotI и Mlul. Step 4. The reaction product of step 3 is cut with NotI and MluI and inserted into the skeleton A described in Example 46 and cut with NotI and Mlul.

В результате создают плазмиду pCMN160Δ16, содержащую в качестве вставки в скелет А область кодирования, кодирующую ENV белок MN штамма с rev областью и половиной nef, имеющий изменения в HLA-DB области ВИЧ-2. As a result, plasmid pCMN160Δ16 is created containing, as an insert into skeleton A, a coding region encoding an ENV protein of the MN strain with a rev region and half nef having changes in the HLA-DB region of HIV-2.

Пример 49
Плазмиду pGAGPOL. rev2 получают следующим образом. Сначала готовят скелет. Затем образуют вставку с ВИЧ gag и pol генами, которую вставляют в скелет.
Example 49
Plasmid pGAGPOL. rev2 is prepared as follows. First, the skeleton is prepared. Then form an insert with HIV gag and pol genes, which is inserted into the skeleton.

Скелет получают следующим образом. The skeleton is obtained as follows.

Стадия 1. Плазмиду pMAMneo (Клонтех) гидролизуют в присутствии BglI. Наполняют фрагментом Кленова полимеразы I. Разрезают HindIII. Выделяют на геле фрагмент в 1763 п.о. Stage 1. The plasmid pMAMneo (Clontech) is hydrolyzed in the presence of BglI. Fill with a maple fragment of polymerase I. HindIII is cut. A fragment of 1763 bp was isolated on a gel.

Стадия 2. Из плазмиды pJ4Ωkan+ амплифицируют KanR ген (ген устойчивости к канамицину, получен от фирмы Фармация Инк., клонирован в pJ4Ω, полученную в виде дара от Имперского Фонда раковых исследований, Великобритания; впервые сообщения о конструировании pJ4Ω появились в работе: Morgenstern J. P., Н. Land, Nucl. Acids Res. 18(4), 1068, которая вводится здесь в качестве ссылки, с олигонуклеотидами ПОСЛЕД. N 37 и ПОСЛЕД. N 38. Затупляют ПЦР продукт. Разрезают HindIII. ПЦР фрагмент очищают на геле.Stage 2. The Kan R gene is amplified from plasmid pJ4Ωkan + (the kanamycin resistance gene, obtained from Pharmacy Inc., cloned into pJ4Ω, received as a gift from the Imperial Cancer Research Foundation, UK; reports on the construction of pJ4Ω first appeared in: Morgenstern JP, N. Land, Nucl. Acids Res. 18 (4), 1068, which is incorporated herein by reference, with the oligonucleotides SEQ ID NO: 37 and SEQ ID NO: 38. The PCR product is blunted, HindIII is cut, the PCR fragment is gel purified.

Стадия 3. Лигируют векторный скелет, образованный из pMAMneo и описанный для стадии 1, с ПЦР продуктом, кодирующим KanR ген и описанным для стадии 2. Выделяют плазмиду, содержащую KanR ген и бактериальный ориджии репликации.Stage 3. The vector skeleton formed from pMAMneo and described for stage 1 is ligated with a PCR product encoding the Kan R gene and described for stage 2. A plasmid containing the Kan R gene and bacterial origin of replication is isolated.

Стадия 4. Полученную плазмиду гидролизуют в присутствии MluI, наполняют фрагментом Кленова из ДНК полимеразы I. Лигируют с SacII линкером (Нью Ингланд Биолабз). Stage 4. The resulting plasmid is hydrolyzed in the presence of MluI, filled with a Klenov fragment from DNA polymerase I. Ligated with a SacII linker (New England Biolabs).

Стадия 5. Полученную на стадии 4 плазмиду гидролизуют в присутствии AseI и SspI. Step 5. The plasmid obtained in Step 4 is hydrolyzed in the presence of AseI and SspI.

Стадия 6. Подвергают ПЦР часть KanR гена из плазмиды, описанной для стадии 3, с применением праймеров ПОСЛЕД. N 39 и ПОСЛЕД. 40. Разрезают ПНР продукт SspI и AseI.Stage 6. Subjected to PCR part of the Kan R gene from the plasmid described for stage 3, using primers AFTER. N 39 and AFTER. 40. Cut the NDP product SspI and AseI.

Стадия 7. Лигируют самый крупный фрагмент, полученный на стадии 5, с ПЦР продуктом, полученным на стадии 6. Step 7. The largest fragment obtained in step 5 is ligated with the PCR product obtained in step 6.

Стадия 8. Разрезают продукт лигирования/плазмиду,
полученный на стадии 7, в присутствии HindIII. Наполняют фрагментом Кленова ДНК полимеразы I.
Stage 8. Cut the ligation product / plasmid,
obtained in stage 7, in the presence of HindIII. Fill with a maple fragment of DNA polymerase I.

Стадия 9. В присутствии SelI разрезают рСЕР4 (Инвитроген) с выделением ДНК фрагмента, содержащего промотор ЦМВ, полилинкер и поли(А) участок ОВ40. Полученный фрагмент очищают и затупляют фрагментом Кленова ДНК полимеразы I. Stage 9. In the presence of SelI, pCEP4 (Invitrogen) was cut to isolate the DNA fragment containing the CMV promoter, polylinker and poly (A) OB40 region. The resulting fragment is purified and blunted by the Klenov fragment of DNA polymerase I.

Стадия 10. Лигируют полученную на стадии 8 плазмиду с полученным на стадии 9 фрагментом. Выделяют плазмиду, содержащую бактериальный ориджин репликации, KanR ген, ВСР усилитель, ЦМВ промотор, полилинкер и ОВ40 поли(А) участок.Step 10. The plasmid obtained in step 8 is ligated with the fragment obtained in step 9. A plasmid containing bacterial origin of replication, Kan R gene, HRV amplifier, CMV promoter, polylinker and OB40 poly (A) region is isolated.

Стадия 11. Полученную на стадии 10 плазмиду разрезают BamHI и NbeI. Step 11. The plasmid obtained in step 10 is cut with BamHI and NbeI.

Стадия 12. Отжигают олигонуклеотиды ПОСЛЕД. N 41 и ПОСЛЕД. N 42. Stage 12. Annealed oligonucleotides AFTER. N 41 and AFTER. N 42.

Стадия 13. Лигируют полученную на стадии 10 плазмиду с полученными на стадии 12 олигонуклеотидами. Выделяют плазмиду, содержащую адаптор со стадии 12. Step 13. The plasmid obtained in step 10 is ligated with the oligonucleotides obtained in step 12. A plasmid containing the adapter from step 12 is isolated.

Стадия 14. Полученную на стадии 13 плазмиду гидролизуют в присутствии SalI и MluI. Step 14. The plasmid obtained in step 13 is hydrolyzed in the presence of SalI and MluI.

Стадия 15. Методом ПЦР амплифицируют rev открытую рамку считывания с применением BBG35 (РД Системс Инк. Миннеаполис, МН, содержит область кодирования rev из ВИЧ штамма НХ3В в pUC19) в качестве матрицы и праймеров ПОСЛЕД. N 43 и ПОСЛЕД. N 44. ПЦР продукт гидролизуют в присутствии SalI и MluI. Step 15. By PCR, the rev open reading frame is amplified using BBG35 (RD Systems Inc. Minneapolis, MN, contains the rev coding region of the HIV strain HX3B in pUC19) as the template and primers AFTER. N 43 and AFTER. N 44. The PCR product is hydrolyzed in the presence of SalI and MluI.

Стадия 16. Полученную на стадии 14 плазмиду лигируют с полученным на стадии 15 ПЦР продуктом. Выделяют плазмиду, содержащую область кодирования rev. Step 16. The plasmid obtained in step 14 is ligated with the PCR product obtained in step 15. A plasmid containing the coding region rev. Is isolated.

Получение gag/pol вставки. Getting the gag / pol insert.

Стадия 1. Субклонируют часть ВИЧ-1 (НХВ2) генома, клонированного в Bluescript (Стратаген). Субклон ВИЧ-1 содержит полный 5'-ДКП и остаток ВИЧ-1 генома до нуклеотида 5795 (Нумерация Генбанка), клонированные в XbaI и SalI сайтах Blue-script. Из HXB2D плазмиды (СПИД хранилище) получают ВИЧ-1 последовательности. Stage 1. Subclone part of the HIV-1 (HXB2) genome cloned in Bluescript (Stratagen). The HIV-1 subclone contains the complete 5'-DCP and the remainder of the HIV-1 genome to nucleotide 5795 (Genebank Numbering), cloned into the XbaI and SalI Blue-script sites. From the HXB2D plasmid (AIDS storage), HIV-1 sequences are obtained.

Стадия 2. Подвергают ПЦР часть области кодирования gag из открытой рамки считывания плазмиды, описанной на стадии 1 (субклон части ВИЧ-1 НХВ2 генома, клонированного в Blue-script), с применением праймеров ПОСЛЕД. N 45 и ПОСЛЕД. N 46. Stage 2. PCR is subjected to part of the gag coding region from the open reading frame of the plasmid described in stage 1 (subclone of the HIV-1 HXB2 part of the genome cloned in Blue-script) using primers AFTER. N 45 and AFTER. N 46.

Стадия 3. Описанную на стадии 1 плазмиду (субклон части ВИЧ-1 НХВ2 генома, клонированного в Bluescript) гидролизуют в присутствии EcoRI. Очищают плазмиду, содержащую скелет pBluescript, 5' ВИЧ-1 ДКП, область кодирования gag и часть области кодирования pol, и религируют. Step 3. The plasmid described in Step 1 (a subclone of the HIV-1 HXB2 part of the Bluescript cloned genome) is hydrolyzed in the presence of EcoRI. The plasmid containing the pBluescript skeleton, 5 'HIV-1 DCT, the gag coding region and part of the pol coding region are purified and religion is purified.

Стадия 4. Обрезают полученную на стадии 3 плазмиду в присутствии NotI и SpeI и лигируют с описанным для стадии 2 ПЦР фрагментом после его гидролиза в присутствии NotI и SpeI. Выделяют плазмиду, содержащую ПЦР фрагмент вместо NotI/SpeI фрагмента, включающего 5' ВИЧ-1 ДКП. Step 4. The plasmid obtained in Step 3 is cut off in the presence of NotI and SpeI and ligated to the fragment described for Step 2 by PCR after hydrolysis in the presence of NotI and SpeI. A plasmid was isolated containing the PCR fragment instead of the NotI / SpeI fragment, including 5 'HIV-1 DCT.

Стадия 5. Полученную на стадии 4 плазмиду гидролизуют в присутствии EcoRI и SalI. Step 5. The plasmid obtained in Step 4 is hydrolyzed in the presence of EcoRI and SalI.

Стадия 6. Отжигают олигонуклеотиды ПОСЛЕД. N 47 и ПОСЛЕД. N 48. Stage 6. Annealed oligonucleotides AFTER. N 47 and AFTER. N 48.

Стадия 7. Лигируют полученную на стадии 5 плазмиду с полученным на стадии 6 адаптором. Выделяют плазмиду, содержащую адаптор, клонированный в EcoRI/SalI сайтах. Step 7. The plasmid obtained in step 5 is ligated with the adapter obtained in step 6. A plasmid containing an adapter cloned at EcoRI / SalI sites is isolated.

Стадия 8. Полученную на стадии 7 плазмиду гидролизуют в присутствии NdeI и EcoRI. Step 8. The plasmid obtained in Step 7 is hydrolyzed in the presence of NdeI and EcoRI.

Стадия 9. Методом ПЦР амплифицируют Rev-респондирующий элемент (RRE) из плазмиды, содержащей RRE последовательности из ВИЧ-1 штамма НХВ2, с применением праймеров ПОСЛЕД. N 49 и ПОСЛЕД. N 50. ПЦР продукт гидролизуют в присутствии NdeI и EcoRI. Stage 9. The PCR method amplifies the Rev-responding element (RRE) from a plasmid containing the RRE sequences from the HIV-1 strain HXB2, using primers AFTER. N 49 and AFTER. N 50. The PCR product is hydrolyzed in the presence of NdeI and EcoRI.

Стадия 10. Лигируют полученную на стадии 8 плазмиду с полученным на стадии 9 ПЦР продуктом. Выделяют плазмиду, содержащую вставку с RRE последовательностью. Step 10. The plasmid obtained in step 8 is ligated with the PCR product obtained in step 9. A plasmid containing an insert with an RRE sequence is isolated.

Стадия 11. Полученную на стадии 10 плазмиду гидролизуют в присутствии NotI и SalI и выделяют фрагмент, содержащий область кодирования gag, область кодирования модифицированного pol и RRE последовательность. Step 11. The plasmid obtained in step 10 is hydrolyzed in the presence of NotI and SalI and a fragment containing the gag coding region, the modified pol coding region and the RRE sequence is isolated.

Стадия 12. По вышеприведенной методике получения скелета в присутствии NotI и SalI гидролизуют полученную на стадии 16 плазмиду. Stage 12. According to the above procedure for obtaining the skeleton in the presence of NotI and SalI, the plasmid obtained in stage 16 is hydrolyzed.

Стадия 13. Полученную на стадии 12 плазмиду лигируют со вставкой, полученной на стадии 11. Выделяют плазмиды, содержащие вставку, включающую область кодирования gag, область кодирования модифицированного pol и RRE последовательность. Step 13. The plasmid obtained in step 12 is ligated with the insert obtained in step 11. Plasmids containing the insert including the gag coding region, the modified pol coding region, and the RRE sequence are isolated.

Стадия 14. Полученную на стадии 13 плазмиду гидролизуют в присутствии XbaI и NheI, концы затупляют и повторно лигируют. Step 14. The plasmid obtained in step 13 is hydrolyzed in the presence of XbaI and NheI, the ends are blunt and re-ligated.

Стадия 15. Получение на стадии 14 плазмиду гидролизуют в присутствии KpnI и выделяют самый крупный фрагмент. Stage 15. Obtaining at stage 14, the plasmid is hydrolyzed in the presence of KpnI and the largest fragment is isolated.

Стадия 16. Отжигают олигонуклеотиды ПОСЛЕД. N 51 и ПОСЛЕД. N 52. Stage 16. Annealed oligonucleotides AFTER. N 51 and AFTER. N 52.

Стадия 17. Очищенный плазмидный фрагмент, полученный на стадии 15, лигируют с полученным на стадии 16 адаптором. Выделяют плазмиду, содержащую адаптор, вставленный в KpnI сайт полученной на стадии 15 плазмиды. Step 17. The purified plasmid fragment obtained in step 15 is ligated to the adapter obtained in step 16. A plasmid containing an adapter inserted into the KpnI site of the plasmid obtained in step 15 is isolated.

Пример 50. Генетическая вакцинация генами регуляторных белков
Затруднения, возникающие при борьбе с ВИЧ, частично связаны с чрезвычайной изменчивостью вируса и его способностью быстро мутировать в новые формы. Существуют существенные изменения белковой последовательности не только в ВИЧ изолятов, обнаруженные среди населения земли в целом, но вирус мутирует настолько быстро, что каждый ВИЧ-инфицированный индивидуум на деле является носителем целого ряда микровариантов ВИЧ. Такие ВИЧ изоляты характеризуются отличиями в эффективности репликации, тропизме, склонности к нейтрализации и устойчивости к лекарственному средству. С появлением устойчивых к лекарству мутантов преимущества лекарственной терапии исчезают. В случае АЗТ устойчивость к лекарственному средству обычно возникает в течение первого года лечения. Такое постоянное возникновение "ускользнувших" мутантов может частично влиять на способность ВИЧ в конце концов подавлять защиту хозяина после длительного периода, в течение которого вирус, видимо, находится под контролем.
Example 50. Genetic vaccination with regulatory protein genes
Difficulties in the fight against HIV are partly due to the extreme variability of the virus and its ability to rapidly mutate into new forms. There are significant changes in the protein sequence not only in HIV isolates found among the global population, but the virus mutates so quickly that every HIV-infected individual actually carries a number of HIV microvariants. Such HIV isolates are characterized by differences in replication efficiency, tropism, neutralization tendency, and drug resistance. With the advent of drug-resistant mutants, the benefits of drug therapy disappear. In the case of AZT, drug resistance usually occurs during the first year of treatment. Such a constant occurrence of “escaping” mutants may partially affect the ability of HIV to ultimately suppress host defense after a long period during which the virus is apparently under control.

Имеются сообщения о таком мутационном дрейфе в различных участках gp120 оболочечного гликопротеина, включая принципиальные нейтрализующие домены V3 петли, а также в белках ядра ВИЧ. ВИЧ регуляторные белки гораздо более консервативны, чем структурные белки, и, кроме того, характеризуются меньшим мутационным дрейфом во времени. Таким образом, регуляторные белки представляются привлекательной целью для противовирусной атаки. There are reports of such mutational drift in various parts of the gp120 envelope glycoprotein, including the principal neutralizing domains of the V3 loop, as well as in the proteins of the HIV core. HIV regulatory proteins are much more conservative than structural proteins, and, in addition, are characterized by less mutational drift in time. Thus, regulatory proteins appear to be an attractive target for antiviral attacks.

ВИЧ отличается заметной временной регуляцией экспрессии регуляторных белков по сравнению со структурными. На ранних этапах вирусной репликации преобладает мРНК, кодирующая регуляторные белки Tat, Rev и Nef в то время, как на поздних этапах наблюдается повышенная экспрессия мРНК, кодирующей структурные белки, в том числе Gag, Pol и Env предшественники и многие вспомогательные белки. Такое смещение от ранних к поздним этапам прекращается при достижении определенного уровня Rev белка. Преобладание Tat, Rev и Nef на ранних этапах вирусного цикла также делает эти белки благоприятными целями для противовирусной атаки. Это особенно справедливо для tat и rev, играющих абсолютно важную роль в транскрипционной и посттранскрипционной регуляции ВИЧ генной экспрессии, и которые преобладают на ранних этапах цикла вирусной репликации перед транскрипцией вирусных структурных белков и продуцированием инфекционных вирусных частиц. HIV is characterized by a noticeable temporal regulation of the expression of regulatory proteins compared to structural ones. In the early stages of viral replication, mRNA encoding Tat, Rev, and Nef regulatory proteins predominates, while in the later stages there is an increased expression of mRNA encoding structural proteins, including Gag, Pol, and Env precursors and many auxiliary proteins. This shift from early to late stages stops when a certain level of Rev protein is reached. The prevalence of Tat, Rev, and Nef in the early stages of the viral cycle also makes these proteins favorable targets for antiviral attack. This is especially true for tat and rev, which play an absolutely important role in the transcriptional and post-transcriptional regulation of HIV gene expression, and which prevail in the early stages of the viral replication cycle before transcription of viral structural proteins and the production of infectious viral particles.

В отличие от tat и rev, однозначно играющих существенную роль в ВИЧ репликации, другие белки, например: nef, vpr, vif и vpu иногда называют "вспомогательными" белками. Их функции менее хорошо изучены, и степень, в которой может быть ослаблена вирусная репликация при потере определенной функции, колеблется в широких пределах и может зависеть от инфицированной клетки-хозяина. Тем не менее, сильная степень консервативности таких функций в самых различных ВИЧ изолятах, а также в других приматных вирусах иммунодефицита предполагает важность таких "вспомогательных" функций в процессе естественного инфицирования (см. в целом: Terwilliger E.F. (1992) AIDS Research Peviews 2, 3-27, ред. W.C. Koff, F. Wong-Staal, R.C. Kennedy, Нью-Йорк, Марсель Деккер, Инк.). В самом деле, приматные рекомбинантные вирусы с делецией vpr, nef или vif непатогены in vivo, что еще больше подчеркивает важность этих вспомогательных генов в жизненном цикле вируса. Unlike tat and rev, which uniquely play a significant role in HIV replication, other proteins, for example: nef, vpr, vif and vpu, are sometimes called “auxiliary” proteins. Their functions are less well understood, and the extent to which viral replication can be impaired by the loss of a particular function varies widely and may depend on the infected host cell. Nevertheless, the strong degree of conservatism of such functions in a wide variety of HIV isolates, as well as in other primitive immunodeficiency viruses, suggests the importance of such “auxiliary” functions in the process of natural infection (see generally: Terwilliger EF (1992) AIDS Research Peviews 2, 3 -27, ed. WC Koff, F. Wong-Staal, RC Kennedy, New York, Marcel Dekker, Inc.). In fact, primitive recombinant viruses with a deletion of vpr, nef or vif are non-pathogenic in vivo, further emphasizing the importance of these auxiliary genes in the life cycle of the virus.

Существуют некоторые свидетельства того, что защитной иммунной реакции против ВИЧ на более высоком уровне можно достигнуть проведением отбора нескольких регуляторных и/или ферментативных белков, но не всего набора ВИЧ генов. Соответственно, стратегия сфокусированной вакцинации желательно включает генетическую вакцинацию с применением последовательностей, кодирующих один или несколько регуляторных, неструктурных ВИЧ белков, в том числе tat, rev, vpr, nef, vpu или vif. Только vpr, как найдено, ассоциируется с вирусными частицами, в то время как другие регуляторные белки, включая tat, rev, nef, vif и vpu не связаны с вирионом. There is some evidence that a protective immune response against HIV at a higher level can be achieved by selecting several regulatory and / or enzymatic proteins, but not the entire set of HIV genes. Accordingly, a focused vaccination strategy desirably includes genetic vaccination using sequences encoding one or more regulatory, non-structural HIV proteins, including tat, rev, vpr, nef, vpu or vif. Only vpr has been found to be associated with viral particles, while other regulatory proteins, including tat, rev, nef, vif and vpu, are not associated with the virion.

В некоторых вариантах генетической вакцинации от ВИЧ с применением регуляторных генов один из tat, rev, nef, vif или vpu генов или несколько таких генов вставляют в описанный в Примере 46 скелет А. Рекомендуется применение tat и/или rev. Е некоторых вариантах в скелет А, описанный в Примере 46, вставляют tat или rev. В некоторых вариантах применяют (далее следует перечень в порядке снижения приемлемости в качестве целей) nef, vpr, vif и vpu. Рекомендуется применение более одного регуляторного гена, в том числе: tat и rev; tat, rev и nef; tat, rev, nef и vpr; tat, rev, nef, vpr и vif; tat, rev, nef, vpr, vif и vpu, а также их комбинаций и возможно таких дополнительных регуляторных генов, как tev. In some variants of genetic vaccination against HIV using regulatory genes, one of the tat, rev, nef, vif or vpu genes or several such genes are inserted into the skeleton described in Example 46. The use of tat and / or rev is recommended. In some embodiments, tat or rev. Is inserted into the skeleton A described in Example 46. In some embodiments, nef, vpr, vif and vpu are used (the list follows in order of decreasing acceptability as goals). The use of more than one regulatory gene is recommended, including: tat and rev; tat, rev and nef; tat, rev, nef and vpr; tat, rev, nef, vpr and vif; tat, rev, nef, vpr, vif and vpu, as well as combinations thereof and possibly additional regulatory genes such as tev.

Tat белок является трансактиватором ДКП-направленной генной экспрессии. Белок абсолютно необходим для ВИЧ репликации. Tat. продуцируется на ранних этапах цикла вирусной репликации, и функциональный Tat необходим для экспрессии Gag, Pol, Env и Vpr. Преобладающей формой Tat является белок из 86 аминокислот, происходящий из двухэкзонной мРНК. Амино-концевых 58 аминокислот достаточно для трансактивации, хотя и с пониженной активностью. Tat влияет на цис-действующую последовательность, называемую tar, с обеспечением значительного повышения ДКП-ведомой генной экспрессии. Влияние Tat может осуществляться частично путем повышения синтеза РНК и частично путем увеличения количества белка, синтезируемого через РНК транскрипт. До недавнего времени считалось, что Tat влияет только на ВИЧ-1 ДКП. Однако появились также сообщения о Tat-активируемой экспрессии из позднего промотора JC вируса. В качестве экзогенного фактора Tat может также стимулировать клеточную пролиферацию и может вносить свой вклад в промотирование роста саркомы Капоши у ВИЧ-инфицированных индивидуумов. Вследствие такого потенциально опасного действия на ВИЧ-инфицированных и неинфицированных индивидуумов рекомендуемые tat конструкты, применяемые для генетической вакцинации, модифицированы с экспрессией только нефункционального Tat. Мутации, способные дезактивировать Tat или Rev, могут, кроме того, действовать, как трансдоминантные мутации с потенциальной дезактивацией в результате любого функционального Tat, продуцируемого в организме ВИЧ-инфицированных индивидуумов. Tat protein is a transactivator of DCP-directed gene expression. Protein is absolutely essential for HIV replication. Tat. produced in the early stages of the viral replication cycle, and functional Tat is required for expression of Gag, Pol, Env and Vpr. The predominant form of Tat is a 86 amino acid protein derived from two-exon mRNA. Amino-terminal 58 amino acids are sufficient for transactivation, albeit with reduced activity. Tat influences a cis-acting sequence called tar, providing a significant increase in DCT-driven gene expression. The effect of Tat can be carried out partly by increasing the synthesis of RNA and partly by increasing the amount of protein synthesized through the RNA transcript. Until recently, it was believed that Tat only affects HIV-1 DCT. However, there have also been reports of Tat-activated expression from the late promoter of the JC virus. As an exogenous factor, Tat can also stimulate cell proliferation and can contribute to promoting the growth of Kaposi’s sarcoma in HIV-infected individuals. Due to this potentially dangerous effect on HIV-infected and uninfected individuals, the recommended tat constructs used for genetic vaccination are modified with expression of only non-functional Tat. Mutations capable of deactivating Tat or Rev can also act as transdominant mutations with potential deactivation as a result of any functional Tat produced in the body of HIV-infected individuals.

Rev является вторым регуляторным белком ВИЧ, необходимым для вирусной репликации. Rev является белком в 19 кД (116 аминокислот), экспрессируемым из двух кодирующих экзонов, в широком спектре сплайсированных мРНК. Идентифицированы два отличных друг от друга домена: основная область, участвующая в связывании с RRE (Rev-респондирующий элемент) содержащими транскриптами, и домен "активации", индуцирующий в результате связывания ядерный экспорт таких транскриптов. В ходе естественной вирусной инфекции Rev необходим для экспрессии ВИЧ структурных белков Gag, Pol и Env, а также Vpr. Rev is the second HIV regulatory protein necessary for viral replication. Rev is a 19 kD protein (116 amino acids) expressed from two coding exons in a wide range of spliced mRNAs. Two distinct domains were identified: the main region involved in binding to RRE (Rev-responsive element) containing transcripts, and the “activation” domain, which induces nuclear export of such transcripts as a result of binding. During natural viral infection, Rev is required for the expression of HIV structural proteins Gag, Pol and Env, as well as Vpr.

Vpr, являющийся белком в 15 кД (96 аминокислот), находится в большинстве ВИЧ-1 штаммов, хотя Vpr открытая рамка считывания интенсивно усекается во многих вирусных штаммах при интенсивном прохождении в клеточной культуре. Vpr открытая рамка считывания присутствует также в ВИЧ-2 и большинстве изолятах. Vpr является первым ретровирусным регуляторным белком, для которого обнаружена связь с ВИЧ вирусными частицами. Его присутствие в ВИЧ вирионах предполагает возможность участия белка в некоторых ранних этапах цикла вирусной репликации. Vpr ускоряет репликацию ВИЧ, особенно на ранних этапах инфекции. Vpr примерно в три раза повышает уровень экспрессии генов-репортеров, связанных в ВИЧ ДКП. Более того, Vpr и Tat, видимо, действуют синергически на ДКП-связанные гены. Vpr может быть выделен из сыворотки ВИЧ-инфицированных индивидуумов, и, видимо, повышает способность вируса инфицировать новые клетки. Найдено также, что Vpr подавляет клеточную пролиферацию и индуцирует дифференцировку клеток (Levy D.M. и др. Cell (1993) 72, 1-20), открытие, которое может оказаться важным ввиду сообщений о том, что первичные моноциты/макрофаги оказываются инфекционными in vitro только претерпевая дифференцировку (Schuitemaker Н. и др. , J. Clin. Invest. 89, 1154-1160 (1992)). Одинаковые клетки, неспособные поддерживать репликацию ВИЧ, под влиянием Vpr могут быть разрегулированы. К примеру, Vpr может нести ответственность за потерю) мышечной ткани, часто наблюдаемую у больных СПИДом. Вследствие потенциально опасной активности Vpr генетическую вакцинацию следует предпочтительно проводить с модифицированным vpr конструктом, экспрессирующим нефункциональный Vpr белок. Vpr, a protein of 15 kDa (96 amino acids), is found in most HIV-1 strains, although the Vpr open reading frame is intensively truncated in many viral strains during intensive passage in cell culture. A Vpr open reading frame is also present in HIV-2 and most isolates. Vpr is the first retroviral regulatory protein to be found to be associated with HIV viral particles. Its presence in HIV virions suggests the possibility of protein participation in some early stages of the viral replication cycle. Vpr accelerates HIV replication, especially in the early stages of infection. Vpr increases approximately three times the level of expression of reporter genes associated with HIV DC. Moreover, Vpr and Tat apparently act synergistically on DCT-linked genes. Vpr can be isolated from the serum of HIV-infected individuals, and, apparently, increases the ability of the virus to infect new cells. Vpr has also been found to inhibit cell proliferation and induce cell differentiation (Levy DM et al. Cell (1993) 72, 1-20), a discovery that may be important in view of reports that primary monocytes / macrophages are infectious in vitro only undergoing differentiation (Schuitemaker N. et al., J. Clin. Invest. 89, 1154-1160 (1992)). Identical cells that are unable to support HIV replication can be deregulated by Vpr. For example, Vpr may be responsible for the loss of) muscle tissue often seen in AIDS patients. Due to the potentially dangerous activity of Vpr, genetic vaccination should preferably be carried out with a modified vpr construct expressing a non-functional Vpr protein.

Nef (называемый также в более старых источниках 3'orf) является белком в 25-27 кД. Предполагалось, что Nef может участвовать в разрегулировании CD4+ Т-лимфоцитов. Кроме того, Nef может участвовать в клеточных сигналах. Nef, видимо, имеет важное значение для установления ВИЧ инфекции in vivo. Полагают, что Nef-специфичные ЦТЛ имеют важное значение для регулирования ВИЧ инфекции in vivo. Nef (also called 3'orf in older sources) is a 25-27 kD protein. It has been suggested that Nef may be involved in the upregulation of CD4 + T lymphocytes. In addition, Nef can participate in cellular signals. Nef appears to be important for establishing HIV infection in vivo. Nef-specific CTLs are believed to be important for regulating HIV infection in vivo.

Vif является цитоплазмическим белком в 23 кД, называемым "фактором инфекционности вируса". Хотя Vif-дефектные мутанты и не являются компромиссными в отношении трансмиссии типа клетка-к-клетке, такие мутанты характеризуются заметным снижением способности инфицировать многие CD4+ клеточные линии. В отсутствие Vif наблюдается снижение отмочковывания и снижение инфекционности. В опытах на приматах мутанты Vif с делецией проявляют жестко сниженную способность создавать инфекцию in vivo. Эти исследования подтверждают клиническую роль Vif в репликации вируса в хозяине. Vif is a 23 kD cytoplasmic protein called the "virus infectivity factor". Although Vif-defective mutants are not compromised with cell-to-cell transmission, such mutants are characterized by a marked decrease in the ability to infect many CD4 + cell lines. In the absence of Vif, a decrease in wetting and a decrease in infectivity are observed. In primitive experiments, Vif mutants with deletion show a severely reduced ability to create an infection in vivo. These studies confirm the clinical role of Vif in virus replication in the host.

Vpu является белком в 15-20 кД (81 аминокислота). Хотя Vpu(+) и Vpu(-) вирусы продуцируют одинаковое количество белка, последние отличаются повышенным внутриклеточным аккумулированием вирусных белков одновременно с уменьшением внеклеточного вируса. Это предполагает участие Vpu в сборке и/или выделении вирусных частиц. Vpu is a 15-20 kD protein (81 amino acids). Although Vpu (+) and Vpu (-) viruses produce the same amount of protein, the latter are characterized by increased intracellular accumulation of viral proteins while reducing extracellular virus. This implies the participation of Vpu in the assembly and / or isolation of viral particles.

Простые ретровирусы, например: мышиные к птичьи вирусы не имеют белков, аналогичных ВИЧ-1, ВИЧ-2 и SIV регуляторным белкам. У таких животных ретровирусная инфекция имеет тенденцию к самоограничению с клиренсом вируса и сниженной патогенностью. Аналогично, HTLV-1, включающий только Tax (действующий почти как Tat и, кроме того, проявляющий vpr-подобную активность) и Rex (действующий почти, как Rev), подвергается клиренсу в организме многих индивидуумов. Генетическая вакцинация регуляторными генами, как считают, уместна не только от ВИЧ, но также в случае ВЭБ (X генный продукт), HCV и HTLV-I (Tax) и (Rex). У всех указанных вирусов регуляторные гены, как полагают, играют решающую роль в жизненном цикле вируса и создании инфекции. Simple retroviruses, for example: mouse-to-bird viruses do not have proteins similar to HIV-1, HIV-2 and SIV regulatory proteins. In such animals, a retroviral infection tends to self-limit with virus clearance and reduced pathogenicity. Similarly, HTLV-1, which includes only Tax (acting almost like Tat and, moreover, showing vpr-like activity) and Rex (acting almost like Rev), undergoes clearance in many individuals. Genetic vaccination with regulatory genes is thought to be appropriate not only for HIV, but also for EBV (X gene product), HCV and HTLV-I (Tax) and (Rex). In all of these viruses, regulatory genes are believed to play a crucial role in the life cycle of the virus and the creation of infection.

Пример 51. Конструирование ВИЧ-1 регуляторной плазмиды (рРЕС)
Плазмиду рРЕС конструируют постадийно, и каждое промежуточное вещество перед продолжением конструирования может быть проверено на экспрессию белка. Экспрессионный вектор, поддерживающий экспрессию tat и rev, конструируют в две стадии. Вначале продукт амплификации, содержащий 5' NheI сайт, ВИЧ-1 основной сплайс-донорный участок, основную часть области кодирования tat, область кодирования, кодирующей аминоконцевую область rev белка, и AvaII сайт, амплифицируют из синтетической матрицы. Такая синтетическая матрица создана применением опубликованных последовательностей НХВ2 штамма ВИЧ-1, полученных из базы данных GenBank, и последовательности изменены мутацией в белке tat цистеиновых остатков в положениях 22 и 30. Такие мутации, как показано, придают tat нефункциональность (Kuppuswany и др. (1989) Hucleic Acids Research 17(9), 3551-3561).
Example 51. Construction of HIV-1 regulatory plasmids (pREC)
The pREC plasmid was constructed in stages, and each intermediate could be tested for protein expression before proceeding. An expression vector supporting expression of tat and rev is constructed in two stages. First, the amplification product containing the 5 'NheI site, the HIV-1 main splice donor region, the main part of the tat coding region, the coding region encoding the amino terminal region of the rev protein, and the AvaII site are amplified from a synthetic matrix. Such a synthetic matrix was created using published HXB2 sequences of the HIV-1 strain obtained from the GenBank database, and the sequences were changed by mutations in the tat protein of cysteine residues at positions 22 and 30. Such mutations have been shown to render tat non-functional (Kuppuswany et al. (1989 ) Hucleic Acids Research 17 (9), 3551-3561).

ПЦР продукт лигируют в вектор, гидролизованный в присутствии NheI и AvaII и содержащий ген устойчивости к канамицину и рВР322 ориджин репликации. Кроме того, эта плазмида содержит цитомегаловирусный промотор, усилитель вируса саркомы Рауса, область кодирования rev и ОВ40 сигнал полиаденилирования. Присутствующая в указанной плазмиде rev последовательность происходит из провирусного клона ВИЧ-1 III8. В результате создают экспрессионный вектор, содержащий полную, но мутированную область кодирования tat и полную область кодирования rev.The PCR product is ligated into a vector hydrolyzed in the presence of NheI and AvaII and containing the kanamycin resistance gene and the pBP322 origin of replication. In addition, this plasmid contains a cytomegalovirus promoter, Routh sarcoma virus enhancer, rev coding region, and OB40 polyadenylation signal. The rev sequence present in the plasmid is derived from the proviral clone HIV-1 III 8 . As a result, an expression vector is created containing the complete but mutated tat coding region and the full rev coding region.

Проведением последующей стадии создают ПЦР продукт, содержащий AvaII сайт у своего 5'-конца, мутацию у аминокислоты в положении 81 rev, примерно 30% области кодирования rev, примерно 30% области кодирования nef и MluI сайт и 3'-конца. Замена аминокислоты в положении 81, как показано, приводит к удалению rev функции, вследствие чего полученная плазмида будет продуцировать нефункциональный rev белок (Bogard Н., Greene W.C. (1993) J. Virol. 67(5), 2496-2502). Считается, что основная делеция в nef области кодирования приведет к продуцированию нефункционального nef белка. 5' AvaII сайт и мутацию у аминокислоты в положении 81 rev белка вводят в 5' ПЦР праймер, комплементарный области кодирования rev, содержащей как AvaII сайт, так и нуклеотид, кодирующий аминокислоту 81. Применением 3' ПЦР праймера вводятся терминирующая кодон, вызывающий обрыв Nef у аминокислоты в положении 63, и 3' кодирующий клонирование MluI сайт. Матрицей для такой ПЦР амплификации служит плазмида или синтетическая матрица, содержащие области кодирования rev и nef из MN штамма ВИЧ-1. Полученный ПЦР продукт гидролизуют в присутствии AvaII и MluI и применяют для замены меньшего AvaII-MluI фрагмента, образующегося после гидролиза в присутствии AvaII и MluI описанной в предыдущем параграфе tat-rev плазмиды. The next step is to create a PCR product containing the AvaII site at its 5'-end, a mutation at the amino acid position 81 rev, about 30% of the coding region rev, about 30% of the coding region nef and MluI site and 3'-end. Replacing the amino acid at position 81, as shown, leads to the removal of rev functions, as a result of which the resulting plasmid will produce a non-functional rev protein (Bogard N., Greene W.C. (1993) J. Virol. 67 (5), 2496-2502). It is believed that a major deletion in the nef coding region will lead to the production of a non-functional nef protein. The 5 ′ AvaII site and the mutation at the amino acid at position 81 rev of the protein are introduced into the 5 ′ PCR primer complementary to the rev coding region containing both the AvaII site and the nucleotide encoding amino acid 81. Using the 3 ′ PCR primer, a termination codon is introduced that causes the termination of Nef at the amino acid at position 63, and the 3 'MluI cloning coding site. The matrix for such PCR amplification is a plasmid or synthetic matrix containing the coding region rev and nef from the MN strain of HIV-1. The resulting PCR product is hydrolyzed in the presence of AvaII and MluI and used to replace a smaller AvaII-MluI fragment formed after hydrolysis in the presence of AvaII and MluI described in the previous paragraph of the tat-rev plasmid.

Возможно введение в один из двух сайтов этой плазмиды vpr. В одном из подходов vpr может быть амплифицирован применением 5' ПЦР праймера, содержащего MluI сайт в восходящем направлении в последовательности, охватывающей vpr трансляционный инициирующий кодон, и 3' ПЦР праймера, комплементарного vpr терминирующему кодон и последовательностям, фланкирующих кодон и содержащих также MluI сайт клонирования. Последовательности в восходящем направлении от инициирующего кодона содержат сплайс-акцептор. ПЦР продукт может быть гидролизован в присутствии Mlul и вставлен в tat rev net плазмиду, описанную выше, после ее гидролиза в присутствии Mlul. An introduction to one of the two sites of this plasmid vpr is possible. In one approach, vpr can be amplified by applying a 5 ′ PCR primer containing the upstream MluI site in a sequence spanning the vpr translation initiation codon, and 3 ′ PCR primer complementary to the vpr terminating codon and sequences flanking the codon and also containing the MluI cloning site . Sequences in the upstream direction from the initiating codon comprise a splice acceptor. The PCR product can be hydrolyzed in the presence of Mlul and inserted into the tat rev net plasmid described above after hydrolysis in the presence of Mlul.

Или же vpr амплификация может быть осуществлена аналогичным путем, однако ПЦР праймеры должны содержать рестрикционные сайты, совместимые с клонированием в другой вектор так, что тот экспрессируется под контролем второго эукариотного промотора. Происходящая из такой плазмиды кассета, содержащая второй промотор, за которым следует область кодирования vpr, затем поли(А), может быть получена гидролизом ферментами рестрикции, фланкирующими кассету, но не вклинивающимися в ее пределы. Полученный ДНК фрагмент необходимо клонировать в единственный сайт tat, rev, vpr плазмиды выпадающей из области, необходимой для экспрессии tat rev vpr. Таким путем образуют плазмиду с двумя экспрессионными единицами. Alternatively, vpr amplification can be carried out in a similar way, however, PCR primers must contain restriction sites compatible with cloning into another vector so that it is expressed under the control of the second eukaryotic promoter. A cassette originating from such a plasmid, containing a second promoter, followed by a vpr coding region, then poly (A), can be obtained by hydrolysis of restriction enzymes flanking the cassette, but not wedging within it. The DNA fragment obtained must be cloned into a single site of the tat, rev, vpr plasmid dropping out of the region necessary for expression of tat rev vpr. A plasmid with two expression units is formed in this way.

Пример 52. Конструирование HCV и HTLV-I плазмид
Аналогичный подход может быть использован для создания плазмиды, экспрессирующей HTLV-1 или HCV кодируемые белки, обладающей ферментативными свойствами, необходимыми для жизненного цикла вируса и/или для регуляторных белков указанных вирусов. В случае HTLV-1 применением плазмидного скелета и стратегии клонирования, аналогичных вышеприведенным, создают плазмиду, кодирующую регуляторный белок Tax. Подобные HCV гены, кодирующие ферментативные белки, включают РНК-зависимую РНК-полимеразу, белок с функциями геликазы/протеазы. Сведения о необходимых последовательностях опубликованы и они могут быть получены в Генбанке. Данные о строении HTLV-1 и HCV приводятся в издании: Cann A.J., Chen I.S.Y. "Вирусология", 2-ое издание, под редакцией B.N. Fiddr, Равен Пресс, Лтд., Нью-Йорк, 1990 и работе: Bradley V.W. Transfusion Medicine Peviews 1(2), 93-102, 1992, соответственно.
Example 52. Construction of HCV and HTLV-I plasmids
A similar approach can be used to create a plasmid expressing HTLV-1 or HCV encoded proteins, with enzymatic properties necessary for the life cycle of the virus and / or for regulatory proteins of these viruses. In the case of HTLV-1, using a plasmid skeleton and a cloning strategy similar to the above, create a plasmid encoding a regulatory regulatory protein Tax. Enzymatic protein encoding HCV genes include RNA-dependent RNA polymerase, a protein with helicase / protease functions. Information about the required sequences is published and they can be obtained at the Genebank. Structural data for HTLV-1 and HCV are provided by Cann AJ, Chen ISY Virology, 2nd Edition, edited by BN Fiddr, Raven Press, Ltd., New York, 1990, and Bradley VW Transfusion Medicine Peviews 1 (2), 93-102, 1992, respectively.

Пример 53. Генетическая вакцинация ферментативными генами
Генетическая вакцинация генами, кодирующими белки с функцией ферментов, например ВИЧ pol геном, может также являться важной стратегией борьбы с вирусом, поскольку такие ферменты, как Pol необходимы для продуцирования живого вируса. Без полимеразы или ее любого функционального компонента ВИЧ непатогенен и неинфекционен. Аналогично, ферментативные гены других вирусов, например HBV полимеразы, представляются привлекательными целями для генетической вакцинации. См., напр., Radziwill и др. "Мутационный анализ генного продукта вируса Р гепатита В. Строение домена и активность РНазы Н", J. Virol. 64(2), 613-620 (1990).
Example 53. Genetic vaccination with enzymatic genes
Genetic vaccination with genes encoding proteins with enzyme function, such as the HIV pol gene, can also be an important strategy for controlling the virus, since enzymes such as Pol are necessary for the production of live virus. Without polymerase or any of its functional components, HIV is non-pathogenic and non-infectious. Similarly, enzymatic genes of other viruses, such as HBV polymerase, appear to be attractive targets for genetic vaccination. See, for example, Radziwill et al. "Mutation analysis of the hepatitis B virus P gene product. Domain structure and RNase H activity", J. Virol. 64 (2), 613-620 (1990).

Одна из причин привлекательности вирусных ферментов в качестве иммунологических мишений состоит в ограниченной способности аминокислотных последовательностей таких ферментов к мутации с сохранением ими при этом своей ферментативной способности. К примеру, в случае ВИЧ-1 фермент Pol характеризуется ограниченным числом "ускользнувших" мутаций, ассоциируемых с устойчивостью к нуклеотидным аналогам, например АЗТ. Однако подавляющее большинство иммунологических мишеней в белке сохраняются даже в ускользнувших от лекарственного средства мутантах. One of the reasons for the attractiveness of viral enzymes as immunological targets is the limited ability of the amino acid sequences of such enzymes to mutate while retaining their enzymatic ability. For example, in the case of HIV-1, the Pol enzyme is characterized by a limited number of “escaped” mutations associated with resistance to nucleotide analogues, for example, AZT. However, the vast majority of immunological targets in the protein are retained even in the mutants escaped from the drug.

Пример 54. Конструирование HBV полимеразной плазмиды
Освещенные в литературе опыты указывают на то, что экспрессия HBV полимеразы достигается в тканевой культуре клеток в случае присутствия в молекуле мРНК как коровой, так и полимеразной открытых рамок считывания. Также показано, что в такой ситуации мутация в АТС ядра не влияет на экспрессию полимеразы.
Example 54. Construction of HBV polymerase plasmid
The experiments reported in the literature indicate that the expression of HBV polymerase is achieved in tissue culture of cells in the presence of both a core and a polymerase open reading frame in the mRNA molecule. It was also shown that in such a situation, a mutation in the nuclear exchange of the nucleus does not affect the expression of polymerase.

HBV геном амплифицируют из плазмиды, содержащей димер типа голова-к-хвосту ADW HBV штамма. Поскольку желательна экспрессия только полимеразы, но не ядра, созданный 5' ПСР праймер приводит к мутации трансляционных инициирующих кодонов преядра и ядра. Кроме того, такой праймер вводит также мутантную DRI последовательность с целью исключить возможность образования репликационно-компетентной HBV геномной РНК. Этот ПЦР продукт помещают в плазмиду, содержащую ген устойчивости к канамицину и pBR322 ориджин репликации. Кроме того, такая плазмида содержит цитомегаловирусный промотор, усилитель вируса саркомы Payса и ОВ40 сигнал полиаденилирования. Для предотвращения экспрессии HBV и X генных продуктов трансляционные инициирующие кодоны для поверхностного антигена и продукта области кодирования X подвергают мутации. The HBV genome is amplified from a plasmid containing a head-to-tail dimer of the ADW HBV strain. Since it is desirable to express only the polymerase, but not the nucleus, the created 5 'PSR primer leads to a mutation of the translational initiating codons of the nucleus and nucleus. In addition, such a primer also introduces a mutant DRI sequence in order to exclude the possibility of the formation of replication-competent HBV genomic RNA. This PCR product is placed in a plasmid containing the kanamycin resistance gene and pBR322 origin of replication. In addition, such a plasmid contains a cytomegalovirus promoter, Payza sarcoma virus enhancer, and OB40 polyadenylation signal. To prevent the expression of HBV and X gene products, translational initiation codons for the surface antigen and the product of the X coding region are mutated.

Согласно другому подходу к достижению экспрессии HBV полимеразы ПЦР продукт, кодирующий область кодирования полной полимеразы, амплифицируют и клонируют в вектор, содержащий ген устойчивости к канамицину и pBR322 ориджин репликации. Кроме того, такая плазмида содержит цитомегаловирусный промотор, усилитель саркомы Рауса и ОВ40 сигнал полиаденилирования. 5' ПЦР праймер для такой амплификации содержит сайт клонирования и охватывает трансляционный инициирующий кодон гена полимеразы. 3' ПЦР продукт содержит сайт рестрикции для клонирования вставки в экспрессионный вектор и, кроме того, комплементарен традиционному терминирующему кодону гена HBV полимеразы и последовательностям, фланкирующим этот терминирующий кодон. После лигирования указанного ПЦР продукта в плазмиду, содержащую ген устойчивости к канамицину, pBR322 ориджин репликации, цитомегаловирусный промотор, усилитель вируса саркомы Рауса и ОВ40 сигнал полиаденилирования, трансляционные инициирующие кодоны для поверхностного антигена гепатита В и X генов подвергают мутации с целью предотвратить экспрессию этих генных продуктов. Применяемая альтернативная стратегия аналогична вышеприведенной, однако 3' ПЦР праймер в этом случае включает HBVполи(А) сигнал и фланкирующие этот сигнал последовательности. Такой 3' праймер применяют в том случае, если последовательности, включающие и/или окружающие HBVполи(А) сигнал, имеют важное для экспрессии значение. Мутационный анализ показал, что функционирование HBV полимеразного генного продукта можно исключить заменой конкретного нуклеотида (Radziwell G. и др. (1990) J. Virol. 64(2), 613-620). Перед употреблением плазмиды, сконструированной вышеприведенным образом, экспрессируемая полимераза может быть подвергнута мутации созданием одной из таких мутаций или других аналогичных мутаций. According to another approach to achieve expression of the HBV polymerase, PCR product encoding the coding region of the complete polymerase is amplified and cloned into a vector containing the kanamycin resistance gene and pBR322 origin of replication. In addition, such a plasmid contains a cytomegalovirus promoter, an Routh sarcoma enhancer, and an OB40 polyadenylation signal. The 5 'PCR primer for such amplification contains a cloning site and spans the translational initiation codon of the polymerase gene. The 3 'PCR product contains a restriction site for cloning the insert into the expression vector and is also complementary to the traditional termination codon of the HBV polymerase gene and the sequences flanking this termination codon. After ligation of the indicated PCR product into a plasmid containing the kanamycin resistance gene, pBR322 origin of replication, cytomegalovirus promoter, Routh sarcoma virus enhancer and OB40 polyadenylation signal, translational initiation codons for hepatitis B surface antigen and X genes are mutated to prevent the expression of these g . The alternative strategy used is similar to the above, however, the 3 'PCR primer in this case includes the HBV field (A) signal and the sequences flanking this signal. Such a 3 'primer is used if sequences comprising and / or surrounding HBV fields (A) are important for expression. Mutation analysis showed that the functioning of the HBV polymerase gene product can be excluded by replacing a particular nucleotide (Radziwell G. et al. (1990) J. Virol. 64 (2), 613-620). Before consuming a plasmid constructed in the manner described above, the expressed polymerase can be mutated by creating one of these mutations or other similar mutations.

Пример 55
Гранулоцит-макрофаг колониестимулирующий фактор (GM-CSF) оказывает стимулирующее действие на разнообразные клеточные линии, в том числе нейтрофилы, моноциты/макрофаги и эозинофилы. Действие GM-CSF делает его привлекательной терапевтической моделью. GM-CSF одобрен FDA для применения в аутологичной пересадке костного мозга, и начаты клинические испытания эффективности фактора в лечении различных нейтропений. В настоящее время GM-CSF вводят в виде белка, обычно требующего введения многими дозами. Необходимо получить и очистить такие белки.
Example 55
Granulocyte macrophage colony stimulating factor (GM-CSF) has a stimulating effect on a variety of cell lines, including neutrophils, monocytes / macrophages and eosinophils. The action of GM-CSF makes it an attractive therapeutic model. GM-CSF is approved by the FDA for use in autologous bone marrow transplantation, and clinical trials of factor effectiveness in the treatment of various neutropenia have begun. GM-CSF is currently administered as a protein, usually requiring multiple doses. It is necessary to obtain and purify such proteins.

Альтернативный подход к применению GM-CSF белка состоит в прямом введении генного конструкта, содержащего ген, кодирующий GM-CSF, в сочетании с введением бупивакаина. Генетически конструкт создают методом ПЦР из GM-CSF гена, включающего сигнальную последовательность. Генетический конструкт предпочтительно содержит ген устойчивости к канамицину (ген аминогликозид-3'фосфотрансферазы), бактериальный ориджин репликации, последовательности, поддерживающие экспрессию области кодирования GM-CSF в клетках, в которые вводят плазмиду, например, векторов, охарактеризованных в виде скелетов в Примере 46. Плазмида предпочтительно содержит ориджин репликации млекопитающего, индуцируемый клеточной репликацией, связанной с введением бупивакаина. В случае применения ВЭБ ориджина репликации включают также последовательность, кодирующую ядерный антиген EBNA-1, вместе с соответствующими регуляторными последовательностями. Праймеры для ПЦР амплификации вставки сайты рестрикции ферментами, позволяющими проводить клонирование в экспрессионный вектор, и комплементарными 5'- и 3'-концам GM-CSF кодирующей последовательности. ПЦР реакцию осуществляют с кДНК клоном по методике Lee и др., Proc. Natl. Acad. Sci. США 82, 4360- 4364. An alternative approach to the use of GM-CSF protein is the direct introduction of a gene construct containing a gene encoding GM-CSF, in combination with the introduction of bupivacaine. Genetically, the construct is created by PCR from a GM-CSF gene including a signal sequence. The genetic construct preferably contains a kanamycin resistance gene (aminoglycoside-3'phosphotransferase gene), a bacterial origin of replication, sequences supporting the expression of the GM-CSF coding region in cells into which the plasmid is introduced, for example, vectors characterized as skeletons in Example 46. The plasmid preferably contains the origin of mammalian replication induced by cell replication associated with the introduction of bupivacaine. In the case of the use of EBV, the origin of replication also includes the sequence encoding the nuclear antigen EBNA-1, together with the corresponding regulatory sequences. Primers for PCR amplification of the insert are restriction enzyme sites that allow cloning into the expression vector, and are complementary to the 5 ′ and 3 ′ ends of the GM-CSF coding sequence. The PCR reaction is carried out with a cDNA clone according to the method of Lee and others, Proc. Natl. Acad Sci. U.S. 82, 4360-4344.

Пример 56
Хронический миелогенный лейкоз (ХМЛ) является клональным миелопролиферативным нарушением кроветворных стволовых клеток, ассоциируемым с Филадельфийской хромосомой, т.е. хромосомой, возникающей в результате транслокации между хромосомами 9 и 22. Точечный разрыв в хромосоме 22 образует кластер в области в 6 к. о., называемой кластерной областью точечного разрыва (КОКР), в то время как в хромосоме 9 точечные разрывы рассеяны по всей области в 90 к. о. в восходящем направлении от c-abl экзона 2. Различные возникающие 9:22 транслокации могут быть подразделены на два типа: К28 транслокации и L6 транслокации. Транскрипция через bcr-abl приводит к образованию слитых мРНК. Антисмысловая молекула, нацеленная на bcr-abl сочленение мРНК, как показано, снижает способность кроветворных клеток, отобранных у больных ХМЛ, образовывать колонии.
Example 56
Chronic myelogenous leukemia (CML) is a clonal myeloproliferative disorder of hematopoietic stem cells associated with the Philadelphia chromosome, i.e. the chromosome resulting from translocation between chromosomes 9 and 22. Point discontinuity in chromosome 22 forms a cluster in a 6 kb region called the point discontinuity cluster region (COCR), while point discontinuities in chromosome 9 are scattered throughout the region in 90 K. about. upstream from c-abl exon 2. The various occurring 9:22 translocations can be divided into two types: K28 translocations and L6 translocations. Transcription via bcr-abl leads to the formation of fused mRNA. An antisense molecule targeting the bcr-abl fusion of mRNA has been shown to reduce the ability of blood-forming cells from CML patients to form colonies.

Генетический конструкт, кодирующий антисмысловую молекулу, вводят вместе с бупивакаином в клетки индивидуума, страдающего ХМЛ, ex vivo. Обработанные клетки затем вновь вводят индивидууму. A genetic construct encoding an antisense molecule is introduced together with bupivacaine into the cells of an individual suffering from CML ex vivo. The treated cells are then reintroduced to the individual.

Пример 57
Генные конструкты, применимые в фармацевтических наборах и препаратах для вакцинации от HBV и его лечения, конструируют с векторами, охарактеризованными в виде скелетов в Примере 46. Плазмиды содержат HBV структурные гены, в частности генов, кодирующих HBV поверхностный антиген и/или HBV антиген ядра, и/или HBV антиген преядра.
Example 57
Gene constructs useful in pharmaceutical kits and preparations for HBV vaccination and treatment are constructed with vectors characterized as skeletons in Example 46. Plasmids contain HBV structural genes, in particular genes encoding the HBV surface antigen and / or HBV core antigen, and / or HBV antigen antigen.

Пример 58
Генные конструкты, применимые в фармацевтических наборах и препаратах для вакцинации от HCV и его лечения, конструируют с векторами, охарактеризованными в виде скелета в Примере 46. Плазмиды содержат HCV структурные гены, в частности гены, кодирующие HCV белок ядра и/или HCV белок оболочки.
Example 58
Gene constructs useful in pharmaceutical kits and preparations for HCV vaccination and treatment are constructed with the vectors characterized as the skeleton in Example 46. Plasmids contain HCV structural genes, in particular genes encoding the HCV core protein and / or HCV coat protein.

Пример 59
Создают генный конструкт pREV, содержащий нуклеотидную последовательность, кодирующую ВИЧ rev в качестве единственного целевого белка. Кодирующую rev последовательность клонируют в скелете В, описанный в Примере 46, из ВВС35 (RD Системе Инк., Миннеаполис, МН), содержащей область кодирования rev из ВИЧ штамма НХ3В в pUC19.
Example 59
The pREV gene construct is created containing the nucleotide sequence encoding HIV rev as the sole target protein. The rev coding sequence is cloned into the skeleton B described in Example 46 from BBB35 (RD System Inc., Minneapolis, MH) containing the rev coding region from the HIV strain HX3B in pUC19.

ТАБЛИЦА 1
Семейство пикорнавирусов.
TABLE 1
The picornavirus family.

Род
Риновирусы: (медицина) ответственны за ≈50% общих простудных состояний.
Kind
Rhinoviruses: (medicine) are responsible for ≈50% of common colds.

Этеровирусы: (медицина) включают полиовирусы, вирус коксаки, эховирусы и энтеровирусы человека, например вирус гепатита А. Eteroviruses: (medicine) include polioviruses, coxsackie virus, echoviruses and human enteroviruses, such as hepatitis A.

Аптовирусы: (ветеринария) включают вирусы ящура. Aptoviruses: (veterinary medicine) include foot and mouth disease viruses.

Целевые антигены: VP1, VP2, VP3, VP4, VPG. Target antigens: VP1, VP2, VP3, VP4, VPG.

Семейство кальцивирусов. The family of calciviruses.

Род
Вирусы Группы Norwalk: (медицина) вирусы являются важными возбудителями эпидемического гастроэнтерита.
Kind
Norwalk Group viruses: (medicine) viruses are important causative agents of epidemic gastroenteritis.

Семейство тогавирусов. The togavirus family.

Род
Альфавирусы: (медицина и ветеринария) примеры включают вирус преждевременного старения, вирус Росс-Ривер, вирус восточного и западного энцефалита лошадей.
Kind
Alphaviruses: (medicine and veterinary medicine) examples include premature aging virus, Ross River virus, equine and western encephalitis viruses in horses.

Реовирус: (медицина) вирус краснухи. Reovirus: (medicine) rubella virus.

Семейство флавирусов. Family of flaviruses.

Примеры включают: (медицина) вирус денге, желтой лихорадки, японского энцефалита, энцефалита Сент-Луис и клещевого энцефалита. Examples include: (medicine) dengue virus, yellow fever, Japanese encephalitis, St. Louis encephalitis and tick-borne encephalitis.

Вирус гепатита С: (медицина) эти вирусы не объединены в семейство до настоящего времени, но, как полагают, они относятся либо к тогавирусам, либо флавивирусам. Наибольшее сходство с семейством тогавирусов. Hepatitis C virus: (medicine), these viruses have not been grouped to date, but are thought to be either togaviruses or flaviviruses. The greatest resemblance to the togavirus family.

Семейство коронавирусов:
(медицина и ветеринария) вирус инфекционного бронхита (домашняя птица), переносимый вирус гастроэнтерита свиней (свиньи), вирус гемагглютинирующего энцефаломиелита свиней (свиньи), вирус кошачьего инфекционного перитонита (кошки), кошачий брюшной коронавирус (кошки), собачий коронавирус (собаки). Респираторные коронавирусы человека вызывают ≈40% случаев общих простудных состояний, напр., 22КЕ, ОСК3.
Coronavirus Family:
(medicine and veterinary medicine) infectious bronchitis virus (poultry), pigs (pigs) gastroenteritis virus, pigs (pigs) hemagglutinating encephalomyelitis virus, feline infectious peritonitis virus (cats), feline abdominal coronavirus (cats), canine coronavirus (dogs). Human respiratory coronaviruses cause ≈40% of cases of common colds, for example, 22KE, OSK3.

Примечание: коронавирусы могут вызвать гепатит не-А, В или С. Note: Coronaviruses can cause non-A, B, or C hepatitis.

Целевые антигены:
Е1, называемый также М или матриксным белком; Е2, называемый также S или белком шипов; Е3, называемый также НЕ или гемагглютинелтерозным гликопротеином (присутствует не во всех коронавирусах; N или нуклеокапсид.
Target antigens:
E1, also called M or matrix protein; E2, also called S or spike protein; E3, also called HE or hemagglutinelteric glycoprotein (not present in all coronaviruses; N or nucleocapsid.

Семейство рабдовирусов. The rhabdovirus family.

Род: везилиовирус, лиззавирус (медицина и ветеринария): бешенство. Genus: vesiliovirus, lysavirus (medicine and veterinary medicine): rabies.

Целевой антиген: G-протеин, N-протеин. Target antigen: G-protein, N-protein.

Семейство филовирусов. The family of filoviruses.

Род
Парамиксовирус: (медицина и ветеринария) вирус эпидемического паратита, вирус ньюкастлской болезни (важный патоген у цыплят).
Kind
Paramyxovirus: (medicine and veterinary medicine) epidemic paratitis virus, Newcastle disease virus (an important pathogen in chickens).

Морбилливирус: (медицина и ветеринария) корь, собачья чума. Morbillivirus: (medicine and veterinary medicine) measles, canine distemper.

Пневминвирус: (медицина и ветеринария) респираторный синцитиальный вирус. Pneuminvirus: (medicine and veterinary medicine) respiratory syncytial virus.

Семейство ортомиксовирусов (медицина): вирус гриппа. Orthomyxovirus family (medicine): influenza virus.

Семейство буньявирусов (Bungavirus Family). Bunavirus Family

Род
Буньявирус (медицина): калифорнийский энцефалит, ЛЯ Кросс.
Kind
Bunyavirus (medicine): California encephalitis, LA Cross.

Флебовирус (медицина): вирус лихорадки долины Рифт. Phlebovirus (medicine): Rift Valley Fever virus.

Хантавирус: пуремала, являющийся вирусом гемахагиновой (hemahagin) лихорадки. Hantavirus: Puremala, a hemahagin fever virus.

Найрвирус (ветеринария): найробийская болезнь овец. Nairvirus (veterinary medicine): Nairobi sheep disease.

Кроме того, много неклассифицированных буньявирусов. In addition, many unclassified bunyaviruses.

Семейство ареновирусов. The arenovirus family.

(медицина): LCM, вирус лихорадки Ласса. (medicine): LCM, Lassa fever virus.

Семейство Реовирусов. Reovirus family.

Род
Реовирус (возможный патоген человека).
Kind
Reovirus (a possible human pathogen).

Ротавирус: острый гастроэнтерит у детей. Rotavirus: acute gastroenteritis in children.

Орбивирусы (медицина и ветеринария): колорадская клещевая лихорадка, лемомбо (человек), лошадиный энцефалит, болезнь "синего языка". Orbiviruses (medicine and veterinary medicine): Colorado tick-borne fever, lembo (human), equine encephalitis, blue tongue disease.

Семейство ретровирусов. The family of retroviruses.

Подсемейство: онковирусное (ветеринария и медицина): вирус кошачьего лейкоза, HTLV-1, HTLV-2. Subfamily: oncovirus (veterinary medicine): feline leukemia virus, HTLV-1, HTLV-2.

Лентивирусно (медицина и ветеринария): ВИЧ, вирус иммунодефицита кошек, инфекции лошадей, вирус анемии. Lentivirus (medicine and veterinary medicine): HIV, cat immunodeficiency virus, equine infections, anemia virus.

Спумавирусное. Spumavirus.

Семейство паповавирусов. Papovavirus family.

Подсемейства: полиомавирусы (медицина): BKU и JCU вирусы. Subfamilies: poliomaviruses (medicine): BKU and JCU viruses.

Папилломавирус (медицина): многие вирусные типы, ассоциируемые с раком или злокачественным развитием папилломы. Papillomavirus (medicine): many viral types associated with cancer or malignant papilloma.

Аденовирус (медицина): напр. : AD7, ARD, А.В. - вызывают респираторные заболевания, некоторые аденовирусы, например, 275 вызывают энтерит. Adenovirus (medicine): e.g. : AD7, ARD, A.V. - cause respiratory diseases, some adenoviruses, for example, 275 cause enteritis.

Семейство парвовирусов (ветеринария): кошачий парвовирус, вызывает энтерит у кошек; кошачий вирус панлейкопении кошек; собачий парвовирус; парвовирус свиней. Parvovirus family (veterinary medicine): feline parvovirus, causes enteritis in cats; feline panleukopenia virus of cats; canine parvovirus; pig parvovirus.

Семейство герпесвирусов. The family of herpes viruses.

Подсемейство: альфагерпесвиридное. Subfamily: alpha-herpes-free.

Род: симплексвирус (медицина); HSVI, HSVII; варицелловирус (медицина и ветеринария): псевдобешенство - ветряная оспа. Genus: simplex virus (medicine); HSVI, HSVII; varicellovirus (medicine and veterinary medicine): pseudorabies - chicken pox.

Подсемейство: бетагерпесвиридное. Subfamily: beta-herpes-sviridny.

Род: цитомегаловирус; HCMV; мурамегаловирус. Genus: cytomegalovirus; HCMV; muramegalovirus.

Подсемейство: гаммагерпесвиридное. Subfamily: gamma herpes sviridny.

Род: (медицина) лимфокриптовирус; ВЭБ (буркитт лимфо); радиновирус. Genus: (medicine) lymphocryptovirus; EBV (burkitt lymph); radinovirus.

Семейство поксвируса. Poxvirus family.

Подсемейство: хордопоксвиридное (медицина и ветеринария)
Род вариола (натуральная оспа), вакциния (коровья оспа); парапоксвирус (ветеринария); ауипоксвирус (ветеринария); каприпоксвирус; лепорипоксвирус, суипоксвирус.
Subfamily: chordopoxvirid (medicine and veterinary medicine)
Genus variola (smallpox), vaccine (cowpox); parapoxvirus (veterinary medicine); auipoxvirus (veterinary medicine); capricoxvirus; leporipoxvirus, suipoxvirus.

Подсемейство: энтемопоксвиридное. Subfamily: entemopoxvirid.

Семейство гепадневируса: вирус гепатита В. Hepadnevirus family: hepatitis B virus.

Неклассифицирован: вирус гепатита дельта. Unclassified: hepatitis delta virus.

ТАБЛИЦА 2
Бактериальные патогены
Патогенные грамположительные кокки включают: пнемококк, стафилококк, стрептококк. Патогенные грамотрицательные кокки включают: менингококк и гонококк.
TABLE 2
Bacterial pathogens
Pathogenic gram-positive cocci include: pneumococcus, staphylococcus, streptococcus. Pathogenic gram-negative cocci include: meningococcus and gonococcus.

Патогенные энтерические грамотрицательные бациллы включают: энтеробактерии, псевдомонады, ацинетобактерии и эйкенеллы, мелиоидоза, сальмонеллы, шигеллоза, гемофилии, шанкроида, бруцеллоза, тулеремии, йерсинии (пастеурелла), стрептобацилла монилиформис, спирилла, листериозные моноцитогены, эризипелотриксные рузиопаты, дифтерии, холеры, сибирской язвы, донованоза (паховой грануломы) и бартенеллоза. Pathogenic enteric gram-negative bacilli include: enterobacteria, pseudomonads, acinetobacteria and eikenella, melioidosis, salmonella, shigellosis, hemophilia, chancroid, brucellosis, tularemia, yersinia, montrecylocytofibliocytophyllocytobacterium, , donovanosis (inguinal granuloma) and barthenellosis.

Патогенные анаэробные бактерии включают: столбняка, ботулизма, другие клостридии, туберкулеза, проказы и другие микробактерии. Патогенные спирохетные заболевания включают: сифилис, трепонематоз, тропическую гранулему, пинту, эндемический сифилис и лептоспироз. Другие инфекции, возбудителями которых являются высшие патогенные бактерии и патогенные грибки, включают: актиномикоз, нокардиоз, криптококкоз, бластомикоз, гистоплазмоз, мукормикоз, споротрихоз, паракокцидиомукоз, петриеллидиоз, торулопсоз, мицетому, хромомикоз и дерматофитоз. Pathogenic anaerobic bacteria include: tetanus, botulism, other clostridia, tuberculosis, leprosy and other microbacteria. Pathogenic spirochete diseases include: syphilis, treponematosis, tropical granuloma, pint, endemic syphilis and leptospirosis. Other infections caused by higher pathogenic bacteria and pathogenic fungi include actinomycosis, nocardiosis, cryptococcosis, blastomycosis, histoplasmosis, mucormycosis, sporotrichosis, paracoccidiomycosis, petriellidiosis, torulopsosis, mycetoma, and chromomycosis.

Риккетсиозные инфекции включают риккетсиоз. Rickettsial infections include rickettsiosis.

Примеры микоплазмических и хламидиальных инфекций включают: микоплазмической пневмонии, венерической лимфогрануломы, пситакоз и перинатальные хламидиальные инфекции. Examples of mycoplasmic and chlamydial infections include: mycoplasmic pneumonia, venereal lymphogranuloma, psitacosis, and perinatal chlamydial infections.

Патогенные эукариоты
Патогенные простейшие и гельминты и создаваемые ими инфекции включают: амебиоз, малярию, лейшманиоз, трипаносомоз, токсоплазмоз, пневмоцистизный каринез, бебизиоз, гиардиаз, трихиноз, филариоз, шистосомоз, нематоды, трематоды или трематоды и цестодные (ленточные черви) инфекции.
Pathogenic eukaryotes
Pathogenic protozoa and helminths and the infections they create include: amoebiasis, malaria, leishmaniasis, trypanosomiasis, toxoplasmosis, pneumocystis cariniosis, babysiosis, giardiasis, trichinosis, filariosis, schistosomiasis, nematodes, trematodes or trematodes (trematodes and trematodes).

ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 1:
(I) Характеристики последовательности
(А) Длина:; 32 пары оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(IX) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 1:
AGGCGTCTCG AGACAGAGGA GAGCAAGAAA TG
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 2:
(I) Характеристики последовательности
(А) Длина: 30 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 2:
ТТТСССТСТА GATAAGCCAT ССААТСАСАС
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 3:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 29 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 3:
GAAGGATCCA TGAAAAAATA TTTATTGGG
(2) Описание для ПОСЛЕД. N 4:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 30 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 4:
ACTGTCGACT TATTTTAAAG CGTTTTTAAG
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 5:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 30 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 5:
GCCAGTTTTG GATCCTTAAA AAAGGCTTGG
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 6:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 27 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 6:
TTGTGAGGGA CAGAATTCCA ATCAGGG
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 7:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 24 пары оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 7:
CAGTGATATC CCGGGAGACT CCTC
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 8:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 25 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 8:
GAATAGAAGA ACTCCTCTAG ААТТС
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 9:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 27 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 9:
GCCTTAGGCG GATCCTATGG CAGGAAG
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 10:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 24 пары оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 10:
TAAGATGGGT GGCCATGGTG AATT
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 11:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 22 аминокислоты
(В) Тип: аминокислота
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: пептид
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 11:

Figure 00000003

(2) Информация для ПОСЛЕД. N 12:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 25 аминокислот
(В) Тип: аминокислота
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: пептид
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 12:
Figure 00000004

(2) Информация для ПОСЛЕД. N 13:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 27 аминокислот
(В) Тип: аминокислота
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: пептид
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 13:
Figure 00000005

(2) Информация для ПОСЛЕД. N 14:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 25 аминокислот
(В) Тип: аминокислота
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: пептид
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 14:
Figure 00000006

(2) Информация для ПОСЛЕД. N 15:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 27 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 15:
TTGTTTAACT TTTGATCGAT ССАТТСС
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 16:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 21 пара оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 16:
GATTTGTATC GATGATCTGA С
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 17:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 25 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 17:
TGTAGTAGCA AAAGAAATAG TTAAG
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 18:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 25 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 18:
ААТТСТТААС ТАТТТСТТТТ GCTAC
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 19:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 40 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 19:
ATTTGTCGAC TGGTTTCAGC CTGCCATGGC AGGAAGAAGC
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 20:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 29 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 20:
ACGACGCGTA TTCTTTAGCT CCTGACTCC
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 21:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 24 пары оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 21:
GCTGACGGTA GCGGCCGCAC ААТТ
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 22:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 22 пары оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 22:
GTATTAAGCG GCCGCAATTG ТТ
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 23:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 78 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 23:
AAAAAGCTTC GCGGATCCGC GTTGCGGCCG CAACCGGTCA CCGGCGACGC GTCGGTCGAC CGGTCATGGC TGGGCCCC
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 24:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 29 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 24:
CCCAGCTTA GACATGATAA GATACATTG
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 25:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 22 пары оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 25:
CTAGCAGCTG GATCCCAGCT TC
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 26:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 24 пары оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 26:
GGATTTCTGG GGATCCAAGC TAGT
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 27:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 31 пара оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 27:
TATAGGATCC GCGCAATGAA AGACCCCACC Т
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 28:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 31 пара оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 28:
ATATGGATCC GCAATGAAAG ACCCCCGCTG А
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 29:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 30 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 29:
TAAAGCGGCC GCTCCTATGG CAGGAAGACG
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 30:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 34 пары оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 30:
ATTACGCGTC TTATGCTTCT AGCCAGGCAC AATG
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 31:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 40 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 31:
ATTACGCGTT TATTACAGAA TGGAAAACAG ATGGCAGGTG
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 32:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина; 32 пары оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 32:
ATTACGCGTT ATTGCAGAAT TCTTATTATG GC
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 33:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 38 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 33:
GAGGCTTGGA GAGGATTATA GAAGTACTGC AAGAGCTG
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 34:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 39 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 34:
GAATCCTCTC CAAGCCTCAG CTACTGCTAT AGCTGTGGC
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 35:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 39 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 35:
AAAAATAAAG CGGCCGCTCC TATGGCAGGA AGAGAAGCG
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 36:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 39 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 36:
ААААААТТАС GCGTCTTATG CTTCTAGCCA GGCACAATG
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 37:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 31 пара оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 37:
CCCAAGCTTG GGAATGCTCT GCCAGTGTTA С
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 38:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 36 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 38:
GGGGGCCGGA AGGGCACAAT AAAACTGTCT GCTTAC
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 39:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 33 пары оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 39:
CCTGATTCAG GTGAAAATAT TGTTGATGCG CTG
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 40:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 111 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 40:
ААСАТСААТА СААССТАТТА АТТТССССТС GTCAAAAATA AGGTTATCAA GTGAGAAATC ACCATCAGTG ACGACTGAAT CCGGTGAGAA TGGCAAAAGT TTATGCATTT С
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 41:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 55 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 41:
CTAGCTCGGG GATCCGCGTT GCGGCCGCAA AAAGTCGACG GGCGACGCGT AAAAA
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 42:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 55 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 42:
GATCTTTTTA CGCGTCGCCC GTCGACTTTT TGCGGCCGCA ACGCGGATCC CCGCG
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 43:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 48 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 43:
ATGTCGACTG GTTTCAGCCT GCCATGGCAG GAAGAAGC
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 44:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 35 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 44:
CCCCACGACG CGTCTATTCT TTAGCTCCTG АСТСС
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 45:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 35 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 45:
TTTGCGGCCG CGTAAGTGGA GAGAGATGGT GCGAG
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 46:
(1) Характеристики последовательности
(А) Длина: 21 пара оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 46:
CTGGTGGGGC TGTTGGCTCT G
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 47:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 80 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 47:
ААТТТААТАА GTAAGTAAGT GTCATATGTT TGTTTGAATT CTGCAACAAC TGCTGTTTAT CCATTTTCAG AATTGGGTG
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 48:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 80 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 48:
TCGACACCCA ATTCTGAAAA TGGATAAACA GCACTTGTTG CAGAATTCAA АСАААСАТАТ GACACTTACT ТАСТТАТТА
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 49:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 41 пара оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 49:
GGGGTTTTTG GGCATATGTA TGAGGGACAA TTGGAGAAGT G
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 50
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 70 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 50:
AAGCTTGTGG AATTCTTAAT TTCTCTGTCC GGGGTTTTTG GGCATATGTA TGAGGGACAT TGGAGAAGTG
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 51:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 29 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 51:
CAGTATCTGG CATGGGTAC
(2) Информация для ПОСЛЕД. N 52:
(I) Характеристики последовательности:
(А) Длина: 29 пар оснований
(В) Тип: нуклеиновая кислота
(С) Число нитей: одна
(D) Топология: линейная
(II) Тип молекулы: ДНК
(XI) Описание последовательности: ПОСЛЕД. N 52:
CCATGCCAGA TACTGGTACйLIST OF SEQUENCES
(2) Information for the AFTER. N 1:
(I) Characteristics of the sequence
(A) Length :; 32 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(Ix) Description of sequence: LAST. N 1:
AGGCGTCTCG AGACAGAGGA GAGCAAGAAA TG
(2) Information for the AFTER. N 2:
(I) Characteristics of the sequence
(A) Length: 30 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 2:
TTTSSSTSTA GATAAGCCAT CCAATSASAS
(2) Information for the AFTER. N 3:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 29 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 3:
GAAGGATCCA TGAAAAAATA TTTATTGGG
(2) Description for LAST. N 4:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 30 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 4:
ACTGTCGACT TATTTTAAAG CGTTTTTAAG
(2) Information for the AFTER. N 5:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 30 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 5:
GCCAGTTTTG GATCCTTAAA AAAGGCTTGG
(2) Information for the AFTER. N 6:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 27 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 6:
TTGTGAGGGA CAGAATTCCA ATCAGGG
(2) Information for the AFTER. N 7:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 24 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 7:
CAGTGATATC CCGGGAGACT CCTC
(2) Information for the AFTER. N 8:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 25 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 8:
GAATAGAAGA ACTCCTCTAG AATTS
(2) Information for the AFTER. N 9:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 27 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 9:
GCCTTAGGCG GATCCTATGG CAGGAAG
(2) Information for the AFTER. N 10:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 24 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 10:
TAAGATGGGT GGCCATGGTG AATT
(2) Information for the AFTER. N 11:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 22 amino acids
(B) Type: amino acid
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: Peptide
(XI) Description of the sequence: LAST. N 11:
Figure 00000003

(2) Information for the AFTER. N 12:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 25 amino acids
(B) Type: amino acid
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: Peptide
(XI) Description of the sequence: LAST. N 12:
Figure 00000004

(2) Information for the AFTER. N 13:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 27 amino acids
(B) Type: amino acid
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: Peptide
(XI) Description of the sequence: LAST. N 13:
Figure 00000005

(2) Information for the AFTER. N 14:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 25 amino acids
(B) Type: amino acid
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: Peptide
(XI) Description of the sequence: LAST. N 14:
Figure 00000006

(2) Information for the AFTER. N 15:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 27 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 15:
TTGTTTAACT TTTGATCGAT SSATTSS
(2) Information for the AFTER. N 16:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 21 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 16:
GATTTGTATC GATGATCTGA C
(2) Information for the AFTER. N 17:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 25 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 17:
TGTAGTAGCA AAAGAAATAG TTAAG
(2) Information for the AFTER. N 18:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 25 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 18:
AATTSTTAAS TATTTSTTTT GCTAC
(2) Information for the AFTER. N 19:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 40 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 19:
ATTTGTCGAC TGGTTTCAGC CTGCCATGGC AGGAAGAAGC
(2) Information for the AFTER. N 20:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 29 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 20:
ACGACGCGTA TTCTTTAGCT CCTGACTCC
(2) Information for the AFTER. N 21:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 24 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 21:
GCTGACGGTA GCGGCCGCAC AATT
(2) Information for the AFTER. N 22:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 22 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 22:
GTATTAAGCG GCCGCAATTG TT
(2) Information for the AFTER. N 23:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 78 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 23:
AAAAAGCTTC GCGGATCCGC GTTGCGGCCG CAACCGGTCA CCGGCGACGC GTCGGTCGAC CGGTCATGGC TGGGCCCC
(2) Information for the AFTER. N 24:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 29 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 24:
CCCAGCTTA GACATGATAA GATACATTG
(2) Information for the AFTER. N 25:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 22 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 25:
CTAGCAGCTG GATCCCAGCT TC
(2) Information for the AFTER. N 26:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 24 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 26:
GGATTTCTGG GGATCCAAGC TAGT
(2) Information for the AFTER. N 27:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 31 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 27:
TATAGGATCC GCGCAATGAA AGACCCCACC T
(2) Information for the AFTER. N 28:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 31 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 28:
ATATGGATCC GCAATGAAAG ACCCCCGCTG A
(2) Information for the AFTER. N 29:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 30 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 29:
TAAAGCGGCC GCTCCTATGG CAGGAAGACG
(2) Information for the AFTER. N 30:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 34 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 30:
ATTACGCGTC TTATGCTTCT AGCCAGGCAC AATG
(2) Information for the AFTER. N 31:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 40 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 31:
ATTACGCGTT TATTACAGAA TGGAAAACAG ATGGCAGGTG
(2) Information for the AFTER. N 32:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length; 32 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 32:
ATTACGCGTT ATTGCAGAAT TCTTATTATG GC
(2) Information for the AFTER. N 33:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 38 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 33:
GAGGCTTGGA GAGGATTATA GAAGTACTGC AAGAGCTG
(2) Information for the AFTER. N 34:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 39 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 34:
GAATCCTCTC CAAGCCTCAG CTACTGCTAT AGCTGTGGC
(2) Information for the AFTER. N 35:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 39 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 35:
AAAAATAAAG CGGCCGCTCC TATGGCAGGA AGAGAAGCG
(2) Information for the AFTER. N 36:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 39 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 36:
AAAAAATTAS GCGTCTTATG CTTCTAGCCA GGCACAATG
(2) Information for the AFTER. N 37:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 31 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 37:
CCCAAGCTTG GGAATGCTCT GCCAGTGTTA C
(2) Information for the AFTER. N 38:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 36 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 38:
GGGGGCCGGA AGGGCACAAT AAAACTGTCT GCTTAC
(2) Information for the AFTER. N 39:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 33 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 39:
CCTGATTCAG GTGAAAATAT TGTTGATGCG CTG
(2) Information for the AFTER. N 40:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 111 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 40:
AASATSAATA SAASSTATTA ATTTSSSSTS GTCAAAAATA AGGTTATCAA GTGAGAAATC ACCATCAGTG ACGACTGAAT CCGGTGAGAA TGGCAAAAGT TTATGCATTT C
(2) Information for the AFTER. N 41:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 55 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 41:
CTAGCTCGGG GATCCGCGTT GCGGCCGCAA AAAGTCGACG GGCGACGCGT AAAAA
(2) Information for the AFTER. N 42:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 55 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 42:
GATCTTTTTA CGCGTCGCCC GTCGACTTTT TGCGGCCGCA ACGCGGATCC CCGCG
(2) Information for the AFTER. N 43:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 48 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 43:
ATGTCGACTG GTTTCAGCCT GCCATGGCAG GAAGAAGC
(2) Information for the AFTER. N 44:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 35 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 44:
AC CCCC AC AC AC AC AC AC AC AC CCCC CCCC CCCC CCCC CCCC CCCC CCCC CCCC CCCC AC
(2) Information for the AFTER. N 45:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 35 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 45:
TTTGCGGCCG CGTAAGTGGA GAGAGATGGT GCGAG
(2) Information for the AFTER. N 46:
(1) Characteristics of the sequence
(A) Length: 21 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 46:
CTGGTGGGGC TGTTGGCTCT G
(2) Information for the AFTER. N 47:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 80 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 47:
AATTTAATAA GTAAGTAAGT GTCATATGTT TGTTTGAATT CTGCAACAAC TGCTGTTTAT CCATTTTCAG AATTGGGTG
(2) Information for the AFTER. N 48:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 80 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 48:
TCGACACCCA ATTCTGAAAA TGGATAAACA GCACTTGTTG CAGAATTCAA ASAAASATAT GACACTTACT TASTATTA
(2) Information for the AFTER. N 49:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 41 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 49:
GGGGTTTTTTG GGCATATGTA TGAGGGACAA TTGGAGAAGT G
(2) Information for the AFTER. N 50
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 70 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 50:
AAGCTTGTGG AATTCTTAAT TTCTCTGTCC GGGGTTTTTG GGCATATGTA TGAGGGACAT TGGAGAAGTG
(2) Information for the AFTER. N 51:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 29 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 51:
CAGTATCTGG CATGGGTAC
(2) Information for the AFTER. N 52:
(I) Characteristics of the sequence:
(A) Length: 29 base pairs
(B) Type: nucleic acid
(C) Number of threads: one
(D) Topology: linear
(II) Molecule Type: DNA
(XI) Description of the sequence: LAST. N 52:
CCATGCCAGA TACTGGTAC

Claims (48)

1. Способ введения в клетки индивидуума генетического материала, отличающийся тем, что осуществляют контактирование клеток с усилителем функции полинуклеотида и вводят в клетки молекулы нуклеиновой кислоты, не содержащей частиц ретровируса. 1. The method of introducing into an individual's cells genetic material, characterized in that the cells are contacted with an enhancer of polynucleotide function and nucleic acid molecules containing no retrovirus particles are introduced into the cells. 2. Способ по п.1, отличающийся тем, что усилитель функции полинуклеотида представлен бупивакаином. 2. The method according to claim 1, characterized in that the polynucleotide function enhancer is represented by bupivacaine. 3. Способ по п. 1, отличающийся тем, что молекула нуклеиновой кислоты включает нуклеотидную последовательность, кодирующую белок и операбельно связанную с регуляторными последовательностями. 3. The method according to p. 1, characterized in that the nucleic acid molecule comprises a nucleotide sequence encoding a protein and operably linked to regulatory sequences. 4. Способ по п. 1, отличающийся тем, что молекула нуклеиновой кислоты включает нуклеотидную последовательность, кодирующую белок, в состав которого входит по меньшей мере один эпитоп, идентичный или, по существу, аналогичный эпитопу антигена, против которого желателен иммунный ответ, причем нуклеотидная последовательность операбельно связана с регуляторными последовательностями. 4. The method according to p. 1, characterized in that the nucleic acid molecule comprises a nucleotide sequence encoding a protein, which includes at least one epitope that is identical or substantially similar to the epitope of the antigen against which an immune response is desired, the nucleotide the sequence is operably linked to regulatory sequences. 5. Способ по п. 1, отличающийся тем, что молекула нуклеиновой кислоты включает нуклеотидную последовательность, кодирующую белок, в состав которого входит по крайней мере один эпитоп, идентичный или, по существу, подобный эпитопу антигена патогена. 5. The method according to p. 1, characterized in that the nucleic acid molecule includes a nucleotide sequence encoding a protein, which includes at least one epitope that is identical or essentially similar to the epitope of the pathogen antigen. 6. Способ по п.5, отличающийся тем, что усилитель функции полинуклеотида представлен бупивакаином. 6. The method according to claim 5, characterized in that the polynucleotide function enhancer is represented by bupivacaine. 7. Способ по п. 5, отличающийся тем, что молекула нуклеиновой кислоты представлена молекулой ДНК. 7. The method according to p. 5, characterized in that the nucleic acid molecule is a DNA molecule. 8. Способ по п.5, отличающийся тем, что белок представлен антигеном патогена или его фрагментом. 8. The method according to claim 5, characterized in that the protein is represented by a pathogen antigen or fragment thereof. 9. Способ по п. 5, отличающийся тем, что молекулу нуклеиновой кислоты вводят внутримышечно. 9. The method according to p. 5, characterized in that the nucleic acid molecule is administered intramuscularly. 10. Способ по п.5, отличающийся тем, что патоген представлен вирусом, выбранным из группы, включающей вирус иммунодефицита человека (ВИЧ); вирус Т-клеточного лейкоза человека (TRVL), вирус гриппа, вирус гепатита А (HAV), вирус гепатита В (HBV), вирус гепатита С (HCV), вирус папилломы человека (HPV), вирус простого герпеса 1 (HSV1), вирус простого герпеса 2 (HSV2), цитамегаловирус (CMV), вирус Эпштейна-Барра (NBV), риновирус и коронавирус. 10. The method according to claim 5, characterized in that the pathogen is a virus selected from the group comprising the human immunodeficiency virus (HIV); human T-cell leukemia virus (TRVL), influenza virus, hepatitis A virus (HAV), hepatitis B virus (HBV), hepatitis C virus (HCV), human papillomavirus (HPV), herpes simplex virus 1 (HSV1), virus herpes simplex 2 (HSV2), cytomegalovirus (CMV), Epstein-Barr virus (NBV), rhinovirus and coronavirus. 11. Способ по п.5, отличающийся тем, что патоген представлен ВИЧ и молекула нуклеиновой кислоты включает нуклеотидную последовательность, кодирующую белок ВИЧ. 11. The method according to claim 5, characterized in that the pathogen is HIV and the nucleic acid molecule comprises a nucleotide sequence encoding an HIV protein. 12. Способ по п.5, отличающийся тем, что патоген представлен ВИЧ и молекула нуклеиновой кислоты включает нуклеотидные последовательности, кодирующие более одного структурного белка ВИЧ. 12. The method according to claim 5, characterized in that the pathogen is represented by HIV and the nucleic acid molecule comprises nucleotide sequences encoding more than one structural HIV protein. 13. Способ по п.5, отличающийся тем, что патоген представлен ВИЧ и молекула нуклеиновой кислоты включает нуклеотидные последовательности, кодирующие более одного регулярного белка ВИЧ. 13. The method according to claim 5, characterized in that the pathogen is HIV and the nucleic acid molecule comprises nucleotide sequences encoding more than one regular HIV protein. 14. Способ по п.5, отличающийся тем, что по крайней мере молекулы двух или более разных нуклеиновых кислот вводят в разные клетки индивидуума, причем разные нуклеиновые кислоты включают каждая нуклеотидные последовательности, кодирующие один или более антигенов одного и того же патогена. 14. The method according to claim 5, characterized in that at least two or more different nucleic acid molecules are introduced into different cells of the individual, and different nucleic acids include each nucleotide sequence encoding one or more antigens of the same pathogen. 15. Способ по п.5, отличающийся тем, что усилитель функции полинуклеотида и молекулу нуклеиновой кислоты вводят одновременно. 15. The method according to claim 5, characterized in that the polynucleotide function enhancer and the nucleic acid molecule are administered simultaneously. 16. Способ по п.5, отличающийся тем, что индивидуумом является человек; усилитель функции полинукдеотида представлен бупивакаином; патоген представлен вирусом иммунодефицита человека; молекула нуклеиновой кислоты представлена ДНК и включает ДНК-последовательность, кодирующую структурные белки gag и pol ВИЧ с делецией psi, причем кодирующая gag и pol ДНК-последовательность операбельно связана с усилителем вируса саркомы Рауса, непосредственно ранним промотором цитомегаловируса и малым сигналом полиаденилирования SV 40 и необязательно точкой начала репликации SV 40. 16. The method according to claim 5, characterized in that the individual is a person; the polynucdeotide function enhancer is represented by bupivacaine; the pathogen is a human immunodeficiency virus; the nucleic acid molecule is represented by DNA and includes a DNA sequence encoding the gag and pol structural proteins of HIV with a psi deletion, the gag and pol encoding DNA sequence operably linked to an Routh sarcoma virus enhancer, directly an early cytomegalovirus promoter, and a small SV 40 polyadenylation signal and optionally SV 40 replication start point. 17. Способ по п.16, отличающийся тем, что ДНК-последовательность дополнительно включает rev-респондирующий элемент ВИЧ и делецию интегразы ВИЧ. 17. The method according to clause 16, wherein the DNA sequence further includes a rev-responsive element of HIV and a deletion of HIV integrase. 18. Способ по п.17, отличающийся тем, что ДНК-последовательность дополнительно включает сплайс-акцептор ВИЧ. 18. The method according to 17, characterized in that the DNA sequence further includes a splice acceptor of HIV. 19. Способ по п. 16, отличающийся тем, что ДНК-молекула дополнительно включает ДНК-последовательность, кодирующую последовательность, дополнительно содержащую ВИЧ rev, операбельно связанную с промотором SV 40 и малым сигналом полиаденилирования SV 40 и необязательно с точкой начала репликации SV 40. 19. The method of claim 16, wherein the DNA molecule further comprises a DNA sequence encoding a sequence additionally containing HIV rev, operably linked to the SV 40 promoter and the SV 40 small polyadenylation signal and optionally to the SV 40 origin of replication. 20. Способ по п.19, отличающийся тем, что кодирующая rev ДНК-последовательность кодирует кроме того vpu ВИЧ и env ВИЧ. 20. The method according to claim 19, wherein the rev coding DNA sequence encodes furthermore HIV vpu and HIV env. 21. Способ по п.19, отличающийся тем, что ДНК-последовательность, кодирующая gag и pol, дополнительно включает rev-респондирующий элемент ВИЧ и делецию интегразы ВИЧ. 21. The method according to claim 19, wherein the DNA sequence encoding gag and pol further comprises a rev-responsive HIV element and a deletion of HIV integrase. 22. Способ по п.21, отличающийся тем, что ДНК-последовательность, кодирующая gag и pol, дополнительно включает сплайс-акцектор ВИЧ. 22. The method according to item 21, wherein the DNA sequence encoding gag and pol, further includes a splice-promoter of HIV. 23. Способ по п.5, отличающийся тем, что индивидуумом является человек усилитель функции полинуклеотида представлен бупивакаином; патоген представлен вирусом иммунодефицита человека; молекула нуклеиновой кислоты является ДНК и содержит ДНК-последовательность, кодирующую rev-, vpu- и env-белки H1V, операбельно связанную с усилителем вируса саркомы Рауса, непосредственно ранним промотором цитомегаловируса и малым сигналом полиаденилирования SV 40 и необязательно точкой начала репликации SV 40. 23. The method according to claim 5, characterized in that the individual is a human polynucleotide function enhancer represented by bupivacaine; the pathogen is a human immunodeficiency virus; the nucleic acid molecule is DNA and contains a DNA sequence encoding the H1V rev, vpu, and env proteins operably linked to the Routh sarcoma virus enhancer, the immediate early cytomegalovirus promoter, and the small SV 40 polyadenylation signal and optionally the SV 40 origin of replication. 24. Способ по п.5, отличающийся тем, что индивидуумом является человек, усилитель функции полинуклеотида представлен бупивакаином; патоген представлен вирусом иммунодефицита человека, молекулы двух различных ДНК вводят в разные клетки индивидуума, причем молекула одной из нуклеиновых кислот является ДНК и включает ДНК-последовательность, кодирующую структурные белки gag и pol ВИЧ с делецией psi, причем ДНК-последовательность, кодирующая gag и pol, операбельно связана с усилителем вируса саркомы Рауса, непосредственно ранним промотором цитомегаловируса и малым сигналом полиаденилирования SV 40 и необязательно с точкой начала репликации SV 40, молекула другой нуклеиновой кислоты является ДНК и включает ДНК-последовательность, кодирующую ВИЧ-белки rev, vpu и env, операбельно связанную с усилителем вируса саркомы Рауса, непосредственно ранним промотором цитомегаловируса и малым сигналом полиаденилирования SV 40 и необязательно с точкой начала репликации SV 40. 24. The method according to claim 5, characterized in that the individual is a person, the polynucleotide function enhancer is represented by bupivacaine; the pathogen is a human immunodeficiency virus, two different DNA molecules are introduced into different cells of an individual, the molecule of one of the nucleic acids being DNA and includes a DNA sequence encoding the gag and pol structural proteins of HIV with a psi deletion, and the DNA sequence encoding gag and pol , operably linked to an Routh sarcoma virus enhancer, directly an early cytomegalovirus promoter and a small SV 40 polyadenylation signal, and optionally with an SV 40 replication origin, another nucleic acid molecule This is DNA and includes the DNA sequence encoding the HIV proteins rev, vpu and env operably linked to the Routh sarcoma virus enhancer, directly the early cytomegalovirus promoter and the small polyadenylation signal SV 40 and optionally with the SV 40 origin of replication. 25. Способ по п.5, отличающийся тем, что осуществляют введение в клетки человека молекул двух разных нуклеиновых кислот, при этом молекула каждой нуклеиновой кислоты включает нуклеотидную последовательность, кодирующую белок, содержащий по меньшей мере один эпитоп, идентичный или, по существу, аналогичный эпитопу по меньшей мере одного антигена ВИЧ, операбельно связанную с регуляторными последовательностями, причем нуклеотидные последовательности способны экспрессироваться в клетках, нуклеотидные последовательности каждой из двух разных нуклеиновых кислот кодируют различные белки, указанные белки имеют по меньшей мере один эпитоп, идентичный или, по существу, аналогичный эпитопу по меньшей мере одного белка ВИЧ, кодируемого генами ВИЧ, выбранными из группы, включающей gag, pol и env. 25. The method according to claim 5, characterized in that the implementation of the introduction into human cells of molecules of two different nucleic acids, the molecule of each nucleic acid comprising a nucleotide sequence encoding a protein containing at least one epitope that is identical or essentially similar an epitope of at least one HIV antigen operably linked to regulatory sequences, the nucleotide sequences being able to be expressed in cells, the nucleotide sequences of each of two times s nucleic acids encode different proteins, these proteins have at least an epitope identical or substantially similar to an epitope of at least one HIV protein encoded by HIV genes selected from the group consisting of gag, pol and env. 26. Способ по п.1, отличающийся тем, что молекула нуклеиновой кислоты включает нуклеотидную последовательность, кодирующую целевой белок, содержащий эпитоп, идентичный или, по существу, подобный эпитопу белка, ассоциированного с клетками, характеризующими заболевание. 26. The method according to claim 1, characterized in that the nucleic acid molecule comprises a nucleotide sequence encoding a target protein containing an epitope that is identical or essentially similar to the epitope of a protein associated with cells characterizing the disease. 27. Способ по п.26, отличающийся тем, что усилитель функции полинуклеотида представлен бупивакаином. 27. The method according to p, characterized in that the polynucleotide function enhancer is represented by bupivacaine. 28. Способ по п.26, отличающийся тем, что заболевание характеризуется гиперпролиферацией клеток. 28. The method according to p, characterized in that the disease is characterized by hyperproliferation of cells. 29. Способ по п.26, отличающийся тем, что заболевание является аутоиммунным заболеванием. 29. The method according to p, characterized in that the disease is an autoimmune disease. 30. Способ по п.26, отличающийся тем, что молекула нуклеиновой кислоты является молекулой ДНК. 30. The method according to p, characterized in that the nucleic acid molecule is a DNA molecule. 31. Способ по п.26, отличающийся тем, что молекулу нуклеиновой кислоты вводят внутримышечно. 31. The method according to p, characterized in that the nucleic acid molecule is administered intramuscularly. 32. Способ по п.26, отличающийся тем, что молекула нуклеиновой кислоты включает нуклеотидную последовательность, кодирующую целевой белок, выбранный из группы, включающей белковые продукты онкогенов myb, myc, fyn, ras, sarc, neu и trk; белковые продукты транслокационного гена bcl/abl; P53; EGRF; вариабельные области антител, полученных с помощью В-клеточных лимфом, и вариабельные области Т-клеточных рецепторов Т-клеточных лимфом. 32. The method according to p. 26, wherein the nucleic acid molecule comprises a nucleotide sequence encoding a target protein selected from the group consisting of protein products of the oncogenes myb, myc, fyn, ras, sarc, neu and trk; protein products of the bcl / abl translocation gene; P53; EGRF; the variable regions of antibodies obtained using B-cell lymphomas; and the variable regions of T-cell receptors of T-cell lymphomas. 33. Способ по п. 26, отличающийся тем, что белок выбирают из группы, включающей вариабельные области антител, участвующих в опосредуемом В-клетками аутоиммунном заболевании, и вариабельные области Т-клеточных рецепторов, участвующих в опосредуемом Т-клетками аутоиммунном заболевании. 33. The method according to p. 26, wherein the protein is selected from the group comprising variable regions of antibodies involved in B-cell-mediated autoimmune disease and variable regions of T-cell receptors involved in T-cell-mediated autoimmune disease. 34. Способ по п.1, отличающийся тем, что молекула нуклеиновой кислоты включает нуклеотидную последовательность, кодирующую белок, присутствие которого будет компенсировать отсутствующий, нефункциональный или частично функциональный белок или обеспечивать терапевтический эффект у индивидуума. 34. The method according to claim 1, characterized in that the nucleic acid molecule comprises a nucleotide sequence encoding a protein, the presence of which will compensate for an absent, non-functional or partially functional protein or provide a therapeutic effect in an individual. 35. Способ по п.34, отличающийся тем, что усилитель функции полинуклеотида представлен бупивакаином. 35. The method according to clause 34, wherein the polynucleotide function enhancer is represented by bupivacaine. 36. Способ по п.34, отличающийся тем, что молекула нуклеиновой кислоты представлена молекулой ДНК. 36. The method according to clause 34, wherein the nucleic acid molecule is a DNA molecule. 37. Способ по п.34, отличающийся тем, что молекула нуклеиновой кислоты вводится внутримышечно. 37. The method according to clause 34, wherein the nucleic acid molecule is administered intramuscularly. 38. Способ по п.34, отличающийся тем, что молекула нуклеиновой кислоты включает нуклеотидную последовательность, кодирующую белок, выбранный из группы, состоящей из ферментов, структурных белков, цитокинов, лимфокинов и факторов роста. 38. The method according to clause 34, wherein the nucleic acid molecule comprises a nucleotide sequence encoding a protein selected from the group consisting of enzymes, structural proteins, cytokines, lymphokines and growth factors. 39. Фармацевтическая композиция для введения генетического материала, который кодирует ВИЧ-белки, в клети индивидуума, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты, представленную молекулой ДНК, которая включает ДНК-последовательность, кодирующую белок, необязательно связанную с регуляторными элементами, и усилитель функции полинуклеотида. 39. A pharmaceutical composition for introducing genetic material that encodes HIV proteins into an individual's cage, comprising a nucleic acid molecule represented by a DNA molecule that includes a DNA sequence encoding a protein, optionally linked to regulatory elements, and a polynucleotide function enhancer. 40. Фармацевтическая композиция по п.39, отличающаяся тем, что молекула нуклеиновой кислоты включает нуклеотидную последовательность, кодирующую белок, выбранный из группы, состоящей из белков, включающих по крайней мере один эпитоп, идентичный или, по существу, подобный эпитопу антигена патогена; белков, содержащих эпитоп, идентичный или, по существу, подобный эпитопу белка, ассоциированного с гиперпролиферирующими клетками; белков, содержащих эпитоп, идентичный или, по существу, подобный эпитопу белка, ассоциированного с клетками, характеризующими аутоиммунное заболевание; белков, присутствие которых будет компенсировать отсутствующий нефункциональный или частично функционирующий белок у индивидуума; и белков, обеспечивающих терапевтический эффект у индивидуума. 40. The pharmaceutical composition according to § 39, wherein the nucleic acid molecule comprises a nucleotide sequence encoding a protein selected from the group consisting of proteins comprising at least one epitope identical or substantially similar to an epitope of a pathogen antigen; proteins containing an epitope identical to or essentially similar to an epitope of a protein associated with hyperproliferating cells; proteins containing an epitope that is identical or substantially similar to an epitope of a protein associated with cells characterizing an autoimmune disease; proteins whose presence will compensate for an absent non-functional or partially functioning protein in an individual; and proteins that provide a therapeutic effect in an individual. 41. Фармацевтическая композиция по п.39, отличающаяся тем, что патоген представляет собой вирус, выбранный из группы, состоящей из вируса иммунодефицита человека (HIV); вируса Т-клеточного лейкоза человека (HTLV); вируса гриппа; вируса гепатита А (HAV); вируса гепатита В (HBV); вируса гепатита С (HCV); вируса папилломы человека (HPV); вируса простого герпеса 1 (HSV1); вируса простого герпеса 2 (HSV2); цитомегаловируса (CMV); вируса Эпштейна-Барра (EBV); риновируса и коронавируса. 41. The pharmaceutical composition according to § 39, wherein the pathogen is a virus selected from the group consisting of human immunodeficiency virus (HIV); human T-cell leukemia virus (HTLV); influenza virus; hepatitis A virus (HAV); hepatitis B virus (HBV); hepatitis C virus (HCV); human papillomavirus (HPV); herpes simplex virus 1 (HSV1); herpes simplex virus 2 (HSV2); cytomegalovirus (CMV); Epstein-Barr virus (EBV); rhinovirus and coronavirus. 42. Фармацевтическая композиция по п.39, отличающаяся тем, что молекула нуклеиновой кислоты представляет собой ДНК-последовательность, кодирующую структурные белки gag и pol ВИЧ с делецией psi, причем последовательность ДНК, кодирующая gag и pol, операбельно связана с усилителем вируса саркомы Рауса, непосредственно ранним промотором цитомегаловируса, малым сигналом полиаденилирования SV 40 и необязательно с точкой начала репликации SV.40. 42. The pharmaceutical composition according to § 39, wherein the nucleic acid molecule is a DNA sequence encoding the HIV gag and pol structural proteins with a psi deletion, the DNA sequence encoding gag and pol operably linked to an Routh sarcoma virus enhancer, directly by the early cytomegalovirus promoter, small SV 40 polyadenylation signal, and optionally with SV.40 replication origin. 43. Фармацевтическая композиция по п.39, отличающаяся тем, что молекула нуклеиновой кислоты представляет собой молекулу ДНК, включающую последовательность ДНК, кодирующую белки rev, vpu и env ВИЧ, операбельно связанную с усилителем вируса саркомы Рауса, непосредственно ранним промотором цитомегаловируса, малым сигналом полиаденилирования SV 40 и необязательно точкой начала репликации SV 40. 43. The pharmaceutical composition according to claim 39, wherein the nucleic acid molecule is a DNA molecule comprising a DNA sequence encoding HIV rev, vpu and env proteins operably linked to an Routh sarcoma virus enhancer, directly an early cytomegalovirus promoter, a small polyadenylation signal SV 40 and optionally SV 40 replication origin. 44. Фармацевтическая композиция по п.39, отличающаяся тем, что усилитель функции полинуклеотида представлен бупивакаином. 44. The pharmaceutical composition according to § 39, wherein the polynucleotide function enhancer is represented by bupivacaine. 45. Фармацевтический набор для введения генетического материала, который кодирует ВИЧ-белки, в клетки индивидуума, включающий первый инокулят, содержащий фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель и молекулу первой нуклеиновой кислоты, включающую нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере один белок ВИЧ, операбельно связанную с регуляторными последовательностями, причем нуклеиновая последовательность способна экспрессироваться в клетках человека, и второй инокулят, содержащий фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель и молекулу второй нуклеиновой кислоты, включающую нуклеотидную последовательность, кодирующую по меньшей мере один белок ВИЧ, операбельно связанную с регуляторными последовательностями, причем нуклеотидная последовательность способна экспрессироваться в клетках человека, при этом молекула первой нуклеиновой кислоты неидентична молекуле второй нуклеиновой кислоты. 45. A pharmaceutical kit for introducing genetic material that encodes HIV proteins into cells of an individual, comprising a first inoculum containing a pharmaceutically acceptable carrier or diluent and a first nucleic acid molecule comprising a nucleotide sequence encoding at least one HIV protein operably linked to regulatory sequences, the nucleic sequence being able to be expressed in human cells, and a second inoculum containing a pharmaceutically acceptable n a carrier or diluent and a second nucleic acid molecule comprising a nucleotide sequence encoding at least one HIV protein operably linked to regulatory sequences, the nucleotide sequence being able to be expressed in human cells, wherein the first nucleic acid molecule is not identical to the second nucleic acid molecule. 46. Фармацевтический набор по п.45, отличающийся тем, что первый и второй инокуляты включают усилитель функции полинуклеотида или третий инокулят, содержащий усилитель функции полинуклеотида. 46. The pharmaceutical kit according to item 45, wherein the first and second inoculum include a polynucleotide function enhancer or a third inoculum containing a polynucleotide function enhancer. 47. Фармацевтический набор по п.45, отличающийся тем, что молекула первой нуклеиновой кислоты и молекула второй нуклеиновой кислоты вместе кодируют белки gag, pol и env ВИЧ. 47. The pharmaceutical kit according to item 45, wherein the first nucleic acid molecule and the second nucleic acid molecule together encode HIV gag, pol and env proteins. 48. Фармацевтический набор по п.45, отличающийся тем, что включает первый инокулят, содержащий первую фармацевтическую композицию, включающую молекулу ДНК, которая содержит последовательность ДНК, кодирующую структурные белки gag и pol ВИЧ с делецией psi, причем упомянутая последовательность, кодирующая gag и pol, операбельно связана с усилием вируса саркомы Рауса, непосредственно ранним промотором цитомегаловируса, малым сигналом полиаденилирования SV 40 и необязательно с точкой начала репликации SV 40, и второй инокулят, содержащий вторую фармацевтическую композицию, включающую молекулу ДНК, которая содержит последовательность ДНК, кодирующую белки rev, vpu и env ВИЧ, операбельно связанную с усилителем вируса саркомы Рауса, непосредственно ранним промотором цитомегаловируса, малым сигналом полиаденилирования SV 40 и необязательно с точкой начала репликации SV 40. 48. The pharmaceutical kit according to item 45, characterized in that it includes a first inoculum containing a first pharmaceutical composition comprising a DNA molecule that contains a DNA sequence encoding the HIV gag and pol structural proteins with psi deletion, said sequence encoding gag and pol is operably linked to the potency of the Routh sarcoma virus, directly by the early cytomegalovirus promoter, the small SV 40 polyadenylation signal, and optionally the SV 40 origin of replication, and a second inoculum containing a second pharmaceutical a chemical composition comprising a DNA molecule that contains a DNA sequence encoding HIV rev, vpu, and env proteins operably linked to an Routh sarcoma virus enhancer, directly an early cytomegalovirus promoter, a small SV 40 polyadenylation signal, and optionally an SV 40 origin of replication. Приоритеты по пунктам:
26.01.1993 по пп.2, 17, 44, 45 и 48;
11.03.1993 по пп.6, 18 - 25 и 27.
Priorities for items:
01/26/1993 according to claims 2, 17, 44, 45 and 48;
03/11/1993 according to claims 6, 18 - 25 and 27.
RU95117922/14A 1993-01-26 1994-01-26 Compositions and methods of genetic material delivery RU2174845C2 (en)

Applications Claiming Priority (9)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US834293A 1993-01-26 1993-01-26
US08/008.342 1993-01-26
US2933693A 1993-03-11 1993-03-11
US08/029.336 1993-03-11
US08/093.235 1993-07-15
US08/008,342 1993-09-21
US08/125.012 1993-09-21
US08/029,336 1993-09-21
US08/124.962 1993-09-21

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU95117922A RU95117922A (en) 1998-02-10
RU2174845C2 true RU2174845C2 (en) 2001-10-20

Family

ID=26678092

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU95117922/14A RU2174845C2 (en) 1993-01-26 1994-01-26 Compositions and methods of genetic material delivery

Country Status (2)

Country Link
US (4) US5593972A (en)
RU (1) RU2174845C2 (en)

Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2004061110A1 (en) * 2003-01-05 2004-07-22 Obschestvo S Ogranichennoi Otvetstvennostiju 'genno-Inzhenernye Tekhnologii 2000' Complementation method for producing rna-containing virus-like particles of hepatotropic viruses
EA012066B1 (en) * 2003-10-10 2009-08-28 Паудерджект Вэксинс, Инк. Method of eliciting a t cell response
EA013251B1 (en) * 2004-10-28 2010-04-30 Арес Трейдинг С.А. vWFA AND/OR ANT_IG DOMAINS CONTAINING PROTEINS
RU2749717C2 (en) * 2015-11-24 2021-06-16 Глэксосмитклайн Интеллекчуал Проперти Дивелопмент Лимитед Method for temporary transfection for producing retrovirus
RU2752498C2 (en) * 2015-11-24 2021-07-28 Глэксосмитклайн Интеллекчуал Проперти Дивелопмент Лимитед Stable cell lines for retroviruses production

Families Citing this family (479)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6706694B1 (en) 1990-03-21 2004-03-16 Vical Incorporated Expression of exogenous polynucleotide sequences in a vertebrate
US20030186913A1 (en) * 1990-03-21 2003-10-02 Vical Incorporated Expression of exogenous polynucleotide sequences in a vertebrate
US6228844B1 (en) 1991-11-12 2001-05-08 Vical Incorporated Stimulating vascular growth by administration of DNA sequences encoding VEGF
US20030113347A1 (en) * 1991-05-08 2003-06-19 Schweiz. Serum- & Impfinstitut Bern Immunostimulating and immunopotentiating reconstituted influenza virosomes and vaccines containing them
EP0671926B1 (en) * 1992-08-11 2002-11-13 President And Fellows Of Harvard College Immunomodulatory peptides
GB9224584D0 (en) * 1992-11-23 1993-01-13 Connaught Lab Use of outer membrane protein d15 and its peptides as vaccine against haempohilus influenzae diseases
US5593972A (en) 1993-01-26 1997-01-14 The Wistar Institute Genetic immunization
US5981505A (en) * 1993-01-26 1999-11-09 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Compositions and methods for delivery of genetic material
US7001759B1 (en) 1993-01-26 2006-02-21 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Compositions and methods for delivery of genetic material
PT681483E (en) * 1993-01-26 2005-11-30 Wyeth Corp COMPOSITIONS AND METHODS FOR DISTRIBUTION OF GENETIC MATERIAL
JPH09500013A (en) 1993-06-01 1997-01-07 ライフ・テクノロジーズ・インコーポレイテッド Gene immunity with cationic lipids
US6652850B1 (en) 1993-09-13 2003-11-25 Aventis Pharmaceuticals Inc. Adeno-associated viral liposomes and their use in transfecting dendritic cells to stimulate specific immunity
US6348449B1 (en) 1993-09-21 2002-02-19 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Methods of inducing mucosal immunity
FR2711670B1 (en) 1993-10-22 1996-01-12 Pasteur Institut Nucleotide vector, composition containing it and vaccine for immunization against hepatitis.
US6133244A (en) 1993-10-22 2000-10-17 Institut Pasteur Method for immunization against hepatitis B
US5780238A (en) * 1993-12-15 1998-07-14 The Trustees Of The University Of Pennsylvania VPR receptor protein
US5739118A (en) 1994-04-01 1998-04-14 Apollon, Inc. Compositions and methods for delivery of genetic material
US7732423B2 (en) * 1994-04-27 2010-06-08 Institut Pasteur Nucleotide vector, composition containing such vector, and vaccine for immunization against hepatitis
IL113817A (en) * 1994-06-30 2001-03-19 Merck & Co Inc Polynucleotide vaccne for papillomavirus
US20030026782A1 (en) * 1995-02-07 2003-02-06 Arthur M. Krieg Immunomodulatory oligonucleotides
US6207646B1 (en) * 1994-07-15 2001-03-27 University Of Iowa Research Foundation Immunostimulatory nucleic acid molecules
US6235888B1 (en) 1994-10-05 2001-05-22 The General Hospital Corporation Hepatitis C virus vaccine
US5962428A (en) * 1995-03-30 1999-10-05 Apollon, Inc. Compositions and methods for delivery of genetic material
US20030220276A1 (en) * 1995-05-16 2003-11-27 Opendra Narayan HIV vaccine and method of use
US5935568A (en) * 1995-05-18 1999-08-10 National Jewish Medical & Research Center Gene therapy for effector cell regulation
US5922836A (en) * 1995-05-31 1999-07-13 Washington University Mammaglobin antigens
US5668267A (en) 1995-05-31 1997-09-16 Washington University Polynucleotides encoding mammaglobin, a mammary-specific breast cancer protein
US6566072B1 (en) 1995-05-31 2003-05-20 Washington University Mammaglobin, a secreted mammary-specific breast cancer protein
RU2189254C2 (en) * 1995-06-06 2002-09-20 Америкэн Хоум Продактс Корпорэйшн Vaccines against hepatitis viruses
US7176186B1 (en) * 1997-09-16 2007-02-13 The University Of Pittsburgh Of The Commonwealth System Of Higher Education Stimulation of cell-mediated immune responses by targeted particulate genetic immunization
US6121246A (en) * 1995-10-20 2000-09-19 St. Elizabeth's Medical Center Of Boston, Inc. Method for treating ischemic tissue
US6310046B1 (en) * 1995-11-17 2001-10-30 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Army Sequestrin of Plasmodium falciparum
US5888767A (en) * 1996-11-27 1999-03-30 The Johns Hopkins University School Of Medicine Method of using a conditionally replicating viral vector to express a gene
WO1997025860A1 (en) * 1996-01-19 1997-07-24 Allegheny University Of The Health Sciences Cellular immunogens useful as cancer vaccines
US6365151B1 (en) 1996-01-19 2002-04-02 Philadelphia Health And Educational Corporation Cellular immunogens comprising cognate proto-oxogenes
US6096548A (en) 1996-03-25 2000-08-01 Maxygen, Inc. Method for directing evolution of a virus
US5851804A (en) * 1996-05-06 1998-12-22 Apollon, Inc. Chimeric kanamycin resistance gene
AU3210997A (en) * 1996-05-24 1997-12-09 University Of Maryland At Baltimore Dna vaccines for eliciting a mucosal immune response
US6444444B1 (en) * 1996-07-10 2002-09-03 Aventis Pasteur Limited Genes encoding mycobacterial proteins associated with cell binding and cell entry and uses thereof
FR2751222B1 (en) * 1996-07-16 1998-10-09 Capsulis COMPOSITIONS CONTAINING AT LEAST ONE NUCLEIC ACID AND THEIR APPLICATIONS IN THE BIOMEDICAL FIELD, PARTICULARLY IN GENE THERAPY
US6093400A (en) * 1996-08-09 2000-07-25 Cel Sci Corporation Modified HGP-30 peptides, conjugates, compositions and methods of use
AU731367B2 (en) 1996-08-09 2001-03-29 Viral Technologies, Inc. HIV p-17 peptide fragment, compositions containing and methods for producing and using same
US7384923B2 (en) * 1999-05-14 2008-06-10 Lipoxen Technologies Limited Liposomes
KR100507660B1 (en) * 1996-09-13 2005-08-10 리폭센 테크놀로지즈 리미티드 Liposomes
AU733719B2 (en) 1996-10-23 2001-05-24 Trustees Of The University Of Pennsylvania, The Improved vaccines
US20060002959A1 (en) * 1996-11-14 2006-01-05 Government Of The United States Skin-sctive adjuvants for transcutaneous immuization
US5980898A (en) * 1996-11-14 1999-11-09 The United States Of America As Represented By The U.S. Army Medical Research & Material Command Adjuvant for transcutaneous immunization
US6797276B1 (en) 1996-11-14 2004-09-28 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Army Use of penetration enhancers and barrier disruption agents to enhance the transcutaneous immune response
US20060002949A1 (en) * 1996-11-14 2006-01-05 Army Govt. Of The Usa, As Rep. By Secretary Of The Office Of The Command Judge Advocate, Hq Usamrmc. Transcutaneous immunization without heterologous adjuvant
US6884435B1 (en) * 1997-01-30 2005-04-26 Chiron Corporation Microparticles with adsorbent surfaces, methods of making same, and uses thereof
EP0991403B1 (en) * 1997-01-30 2003-04-02 Chiron Corporation Use of microparticles with adsorbed antigen to stimulate immune responses
CA2223029A1 (en) * 1997-02-12 1998-08-12 Akzo Nobel Nv Canine parvovirus dna vaccines
US7098306B2 (en) * 1997-02-13 2006-08-29 The Regents Of The University Of California Method and compositions for treating hepatocellular cancer
DE69836209D1 (en) * 1997-02-13 2006-11-30 Univ California PREVENTION AND TREATMENT OF HEPATOCELLULAR CANCER
DE69828182T2 (en) * 1997-02-14 2005-12-22 Merck & Co., Inc. POLYNUCLEOTIDE VACCINE FORMULATIONS
US20040242522A1 (en) * 1997-02-14 2004-12-02 Volkin David B. Polynucleotide vaccine formulations
US20030118601A1 (en) * 1997-03-11 2003-06-26 Neil James Charles FIV vaccine
GB9708526D0 (en) * 1997-04-25 1997-06-18 Royal Free Hosp School Med Eukaryotic gene expression cassette and uses thereof
US6217900B1 (en) 1997-04-30 2001-04-17 American Home Products Corporation Vesicular complexes and methods of making and using the same
US20070010471A1 (en) * 1997-05-02 2007-01-11 Opendra Narayan HIV DNA vaccine
KR100220645B1 (en) * 1997-07-04 1999-09-15 구광시 Process for producing benzene derivatives
US20030125278A1 (en) * 1997-08-13 2003-07-03 Tang De-Chu C. Immunization of animals by topical applications of a salmonella-based vector
US6348450B1 (en) 1997-08-13 2002-02-19 The Uab Research Foundation Noninvasive genetic immunization, expression products therefrom and uses thereof
US6716823B1 (en) 1997-08-13 2004-04-06 The Uab Research Foundation Noninvasive genetic immunization, expression products therefrom, and uses thereof
US6706693B1 (en) 1997-08-13 2004-03-16 The Uab Research Foundation Vaccination by topical application of genetic vectors
US20030045492A1 (en) * 1997-08-13 2003-03-06 Tang De-Chu C. Vaccination by topical application of recombinant vectors
US6818627B1 (en) 1997-08-14 2004-11-16 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Functional fragments of HIV-1 Vpr protein and methods of using the same
US7151172B1 (en) 1997-09-18 2006-12-19 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Attenuated vif DNA immunization cassettes for genetic vaccines
US6699478B1 (en) * 1997-09-19 2004-03-02 Wyeth Holdings Corporation Enhanced immune response to attachment (G) protein of Respiratory Syncytial Virus
US6013258A (en) * 1997-10-09 2000-01-11 Zycos Inc. Immunogenic peptides from the HPV E7 protein
US6183746B1 (en) 1997-10-09 2001-02-06 Zycos Inc. Immunogenic peptides from the HPV E7 protein
AU745805B2 (en) 1997-10-28 2002-04-11 Wyeth Compositions and methods for delivery of genetic material
US6596539B1 (en) 1997-10-31 2003-07-22 Maxygen, Inc. Modification of virus tropism and host range by viral genome shuffling
US20040258703A1 (en) * 1997-11-14 2004-12-23 The Government Of The Us, As Represented By The Secretary Of The Army Skin-active adjuvants for transcutaneous immunization
EP1032676A2 (en) 1997-11-28 2000-09-06 Genset $i(CHLAMYDIA TRACHOMATIS) GENOMIC SEQUENCE AND POLYPEPTIDES, FRAGMENTS THEREOF AND USES THEREOF, IN PARTICULAR FOR THE DIAGNOSIS, PREVENTION AND TREATMENT OF INFECTION
US7078500B1 (en) * 1998-01-30 2006-07-18 The General Hospital Corporation Genetic immunization with nonstructural proteins of hepatitis C virus
JP2002501737A (en) * 1998-01-30 2002-01-22 ザ・ジェネラル・ホスピタル・コーポレイション Genetic immunization with nonstructural proteins of hepatitis C virus
US7390619B1 (en) * 1998-02-11 2008-06-24 Maxygen, Inc. Optimization of immunomodulatory properties of genetic vaccines
US6541011B2 (en) 1998-02-11 2003-04-01 Maxygen, Inc. Antigen library immunization
WO1999041403A1 (en) * 1998-02-12 1999-08-19 The Regents Of The University Of California Compositions for receptor/liposome mediated transfection and methods of using same
AU2873999A (en) 1998-02-24 1999-09-06 Sisters Of Providence In Oregon Compositions containing an OX-40 receptor binding agent or nucleic acid encoding the same and methods for enhancing antigen-specific immune response
US8119395B1 (en) 1998-02-27 2012-02-21 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Vaccines, immunotherapeutics and methods for using the same
CA2323776C (en) 1998-03-19 2010-04-27 Human Genome Sciences, Inc. Cytokine receptor common gamma chain like
US6844188B1 (en) * 1998-04-08 2005-01-18 University Of North Carolina At Chapel Hill Methods and modified cells for the treatment of cancer
US6528312B1 (en) * 1998-05-06 2003-03-04 Transgene S.A. Use of G-actin for improving transfection of a polynucleotide into a cell
US6803035B2 (en) * 1998-05-08 2004-10-12 Arkion Life Sciences Anti-diarrheal and method for using the same
AU4563099A (en) * 1998-06-11 1999-12-30 Trustees Of The University Of Pennsylvania, The Methods and compositions for delivering proteins to macrophage cells and cells of macrophage derived lineage
US20030022854A1 (en) 1998-06-25 2003-01-30 Dow Steven W. Vaccines using nucleic acid-lipid complexes
US20040247662A1 (en) * 1998-06-25 2004-12-09 Dow Steven W. Systemic immune activation method using nucleic acid-lipid complexes
US6693086B1 (en) * 1998-06-25 2004-02-17 National Jewish Medical And Research Center Systemic immune activation method using nucleic acid-lipid complexes
US6264940B1 (en) * 1998-08-05 2001-07-24 The Research Foundation Of State University Of New York Recombinant poliovirus for the treatment of cancer
EP0998945A1 (en) * 1998-09-30 2000-05-10 Transgene S.A. Use of magnesium (Mg2+) for the enhancement of gene delivery in gene therapy
AU1606100A (en) * 1998-11-04 2000-05-22 Pharmadigm, Inc. Compounds and methods for genetic immunization
US6716810B1 (en) * 1998-12-09 2004-04-06 Eleanor Roosevelt Institute Composition and method for regulation of body weight and associated conditions
JP2002533118A (en) * 1998-12-29 2002-10-08 ユニバーシティ オブ バーモント アンド ステイト アグリカルチャー カレッジ Use of CD40 engagement to modify T cell receptor use
WO2000039303A2 (en) 1998-12-31 2000-07-06 Chiron Corporation Modified hiv env polypeptides
CA2358385C (en) * 1998-12-31 2013-08-06 Chiron Corporation Polynucleotides encoding antigenic hiv type c polypeptides, polypeptides and uses thereof
US7935805B1 (en) * 1998-12-31 2011-05-03 Novartis Vaccines & Diagnostics, Inc Polynucleotides encoding antigenic HIV Type C polypeptides, polypeptides and uses thereof
JP2002533124A (en) 1998-12-31 2002-10-08 カイロン コーポレイション Improved expression of HIV polypeptide and generation of virus-like particles
AU2868200A (en) * 1999-02-08 2000-08-25 Chiron Corporation Electrically-mediated enhancement of dna vaccine immunity and efficacy in vivo
MXPA01008883A (en) 1999-03-03 2003-07-21 Univ Pennsylvania Vaccines and gene therapy compositions and methods of making and using the same.
EP2368575B1 (en) 1999-04-08 2014-10-01 Intercell USA, Inc. Dry formulation for transcutaneous immunization
WO2000063364A2 (en) 1999-04-21 2000-10-26 American Home Products Corporation Methods and compositions for inhibiting the function of polynucleotide sequences
CA2369747A1 (en) 1999-04-30 2000-11-09 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Mutant human cd80 and compositions for and methods of making and using the same
US20040009936A1 (en) * 1999-05-03 2004-01-15 Tang De-Chu C. Vaccine and drug delivery by topical application of vectors and vector extracts
GEP20053446B (en) 1999-05-13 2005-02-25 Wyeth Corp Adjuvant Combination Formulations
US20030232060A1 (en) * 1999-07-28 2003-12-18 Smith Stephen M. Attenuated, doxycycline-inducible human immunodeficiency virus proviral molecular clones
US20050100928A1 (en) * 1999-09-16 2005-05-12 Zycos Inc., A Delaware Corporation Nucleic acids encoding polyepitope polypeptides
EP1257298B1 (en) * 1999-12-22 2008-08-06 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Cosmid dna constructs and methods of making and using the same
EP1244687A4 (en) * 1999-12-22 2005-06-15 Univ Ohio State Res Found METHODS FOR PROTECTING AGAINST LETHAL INFECTION WITH i BACILLUS ANTHRACIS /i
AU2001234980A1 (en) 2000-02-09 2001-08-20 Genvec, Inc. Methods of preparing and using a viral vector library
EP2388015A1 (en) 2000-03-02 2011-11-23 Emory University DNA expression vectors and methods of use
US8623379B2 (en) * 2000-03-02 2014-01-07 Emory University Compositions and methods for generating an immune response
US20040105871A1 (en) * 2000-03-02 2004-06-03 Robinson Harriet L. Compositions and methods for generating an immune response
CA2405912A1 (en) 2000-04-12 2001-10-18 Human Genome Sciences, Inc. Albumin fusion proteins
WO2001092549A2 (en) * 2000-05-31 2001-12-06 Genvec, Inc. Method and composition for targeting an adenoviral vector
US7910716B2 (en) * 2000-07-07 2011-03-22 Medical Research Council Nucleic acids encoding modified South African HIV-1 subtype C gag proteins
KR100815888B1 (en) * 2000-07-14 2008-03-21 더 트러스티스 오브 더 유니버시티 오브 펜실바니아 DNA Vaccines Encoding HIV Accessory Proteins
EP1305435B1 (en) * 2000-07-27 2007-12-19 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Use of herpes simplex virus glycoprotein d to suppress immune responses
US6680059B2 (en) * 2000-08-29 2004-01-20 Tripep Ab Vaccines containing ribavirin and methods of use thereof
RU2286172C2 (en) * 2000-08-17 2006-10-27 Трипеп Аб Ribavirin-containing vaccines and methods for their application
US7022830B2 (en) * 2000-08-17 2006-04-04 Tripep Ab Hepatitis C virus codon optimized non-structural NS3/4A fusion gene
BR0113512A (en) 2000-08-25 2005-05-10 Basf Plant Science Gmbh Plant polynucleotides encoding new prenyl proteases
AU2002211524B2 (en) * 2000-10-04 2007-03-22 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Highly expressible genes
EE200300172A (en) 2000-11-10 2003-06-16 Wyeth Holdings Corporation An antigenic composition and adjuvant mixture
US20040220076A1 (en) * 2000-11-16 2004-11-04 Laure Aurelian Prevention of recurrent viral disease
US20030162733A1 (en) * 2000-11-27 2003-08-28 Haynes Joel R. Nucleic acid adjuvants
US6892140B1 (en) * 2000-11-27 2005-05-10 Enteron, Inc. Immunogenic cancer peptides and uses thereof
PT1372708E (en) * 2001-02-13 2008-09-29 Us Gov Sec Army Vaccine for transcutaneous immunization against travellers` diarrhoea
ATE445411T1 (en) * 2001-03-08 2009-10-15 Us Gov Health & Human Serv MVA-EXPRESSING MODIFIED HIV ENVELOPE, GAG AND POL GENES
US20040028651A1 (en) * 2001-03-29 2004-02-12 Karrupiah Muthumani Composition and methods of using hiv vpr
US20070128229A1 (en) * 2002-04-12 2007-06-07 Wyeth Surface proteins of Streptococcus pyogenes
ATE470676T1 (en) 2001-04-13 2010-06-15 Human Genome Sciences Inc ANTI-VEGF-2 ANTIBODIES
KR100923598B1 (en) * 2001-04-13 2009-10-23 와이어쓰 Surface Proteins of Streptococcus pyogenes
EP2278013A1 (en) 2001-04-16 2011-01-26 Wyeth Holdings Corporation Streptococcus pneumoniae open reading frames encoding polypeptide antigens and uses thereof
US20020193295A1 (en) * 2001-05-04 2002-12-19 Emanuel Calenoff Immunogenic peptides and uses thereof
US8216585B2 (en) 2001-05-25 2012-07-10 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Targeted particles and methods of using the same
CA2452119C (en) * 2001-07-05 2013-10-15 Chiron Corporation Polynucleotides encoding antigenic hiv type b and/or type c polypeptides, polypeptides and uses thereof
WO2003004620A2 (en) 2001-07-05 2003-01-16 Chiron, Corporation Polynucleotides encoding antigenic hiv type c polypeptides, polypeptides and uses thereof
JP2005521380A (en) * 2001-08-31 2005-07-21 カイロン コーポレイション Polynucleotide encoding antigenic type B HIV polypeptide, polypeptide and use thereof
US20030170614A1 (en) * 2001-08-31 2003-09-11 Megede Jan Zur Polynucleotides encoding antigenic HIV type B polypeptides, polypeptides and uses thereof
US20030129161A1 (en) * 2001-09-17 2003-07-10 Hsien-Jue Chu Interleukin-12 as a veterinary vaccine adjuvant
EP1432431B1 (en) 2001-10-04 2017-05-10 Genetics Institute LLC Methods and compositions for modulating interleukin-21 activity
AU2002362753B9 (en) * 2001-10-05 2008-05-15 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Compositions for and methods of treating and preventing sirs/sepsis
UA81613C2 (en) * 2001-10-26 2008-01-25 Род Айленд Хоспитл Thymosin augmentation of genetic immunization
EP1497320B1 (en) 2001-11-14 2011-08-24 THE GOVERNMENT OF THE UNITED STATES OF AMERICA, as represented by THE SECRETARY, DEPARTMENT OF HEALTH AND HUMAN SERVICES New gene expressed in prostate cancer and methods of use
EP1456376A4 (en) * 2001-11-16 2006-09-06 Us Gov Health & Human Serv Novel chimeric rev, tat, and nef antigens
US6768476B2 (en) * 2001-12-05 2004-07-27 Etenna Corporation Capacitively-loaded bent-wire monopole on an artificial magnetic conductor
ES2545090T3 (en) 2001-12-21 2015-09-08 Human Genome Sciences, Inc. Albumin and GCSF fusion proteins
WO2003067399A2 (en) * 2002-02-07 2003-08-14 Byington Carrie L Method for creating and using a treatment protocol
IL163988A0 (en) * 2002-03-15 2005-12-18 Wyeth Corp Mutants of the p4 protein of nontypable haemophilus influenzae with reduced enzymatic activity
US20040180438A1 (en) 2002-04-26 2004-09-16 Pachuk Catherine J. Methods and compositions for silencing genes without inducing toxicity
US20060094006A1 (en) * 2002-05-01 2006-05-04 Genoveffa Franchini Immunotherapy regimens in hiv-infected patients
US20030206916A1 (en) * 2002-05-03 2003-11-06 Rush-Presbyterian-St. Luke's Medical Center Immunogenic peptides
AU2003266014B2 (en) * 2002-05-06 2009-05-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Methods for delivery of nucleic acids
JP3660650B2 (en) * 2002-06-13 2005-06-15 株式会社東芝 Manufacturing method of semiconductor device
AU2003243663A1 (en) 2002-06-20 2004-01-06 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Vaccines for suppressing ige-mediated allergic disease and methods for using the same
EP1540004A4 (en) * 2002-07-31 2007-10-03 Nucleonics Inc Double stranded rna structures and constructs, and methods for generating and using the same
US20040116370A1 (en) * 2002-08-30 2004-06-17 Genteric, Inc. Retroductal salivary gland genetic vaccination
WO2004020592A2 (en) * 2002-08-30 2004-03-11 Genteric, Inc. Retroductal salivary gland genetic vaccination
EP1545575A4 (en) 2002-09-19 2006-04-05 Us Gov Health & Human Serv P. ariasi polypeptides, p. perniciosus polypeptides and methods of use
AU2003284239B2 (en) * 2002-10-21 2008-08-21 Eisai Inc. Compositions and methods for treating human papillomavirus-mediated disease
BR0315872A (en) 2002-10-29 2006-07-18 Us Gov Health & Human Serv Lutzomyia longipalpis polypeptides and processes of use and method of use
ATE544466T1 (en) 2002-10-29 2012-02-15 Coley Pharm Group Inc USE OF CPG OLIGONUCLEOTIDES TO TREAT HEPATITIS C VIRUS INFECTION
JP2006506094A (en) * 2002-11-19 2006-02-23 ザ・トラスティーズ・オブ・ザ・ユニバーシティ・オブ・ペンシルベニア Genetic constructs and compositions comprising RRE and CTE and uses thereof
AU2003298912B2 (en) * 2002-12-03 2011-06-02 Advanced Bioscience Laboratories, Inc. Polyvalent, primary HIV-1 glycoprotein DNA vaccines and vaccination methods
EP1585815A4 (en) * 2003-01-21 2006-02-22 Bristol Myers Squibb Co Polynucleotide encoding a novel acyl coenzyme a, monoacylglycerol acyltransferase-3 (mgat3), and uses thereof
AU2004212953B2 (en) 2003-02-14 2010-03-11 The Curators Of The University Of Missouri Contraceptive methods and compositions related to proteasomal interference
PL1605971T3 (en) * 2003-03-26 2010-10-29 Wyeth Llc Immunogenic composition and methods
MXPA05012475A (en) * 2003-05-23 2006-05-25 Wyeth Corp Gitr ligand and gitr ligand-related molecules and antibodies and uses thereof.
CA3040025C (en) 2003-06-12 2023-01-10 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Conserved hbv and hcv sequences useful for gene silencing
NZ570709A (en) 2003-06-13 2010-04-30 Univ Pennsylvania Nucleic acid sequences encoding and compositions comprising IgE signal peptide and/or IL-15 and methods for using the same
US8008265B2 (en) 2003-06-13 2011-08-30 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Vaccines, immunotherapeutics and methods for using the same
US20050013812A1 (en) * 2003-07-14 2005-01-20 Dow Steven W. Vaccines using pattern recognition receptor-ligand:lipid complexes
US7663017B2 (en) 2003-07-30 2010-02-16 Institut Pasteur Transgenic mice having a human major histocompatability complex (MHC) phenotype, experimental uses and applications
US20050106159A1 (en) * 2003-08-12 2005-05-19 Thompson Stuart A. Campylobacter jejuni outer membrane protein immunogenic composition
WO2005040388A2 (en) * 2003-08-22 2005-05-06 Nucleonics Inc. Eukariotic expression systems for expression of inhibitory rna in multiple intracellular compartments
US8647873B2 (en) * 2004-04-27 2014-02-11 Viacyte, Inc. PDX1 expressing endoderm
US7541185B2 (en) * 2003-12-23 2009-06-02 Cythera, Inc. Methods for identifying factors for differentiating definitive endoderm
CN103898047B (en) 2003-12-23 2020-03-03 维亚希特公司 Definitive endoderm
US7625753B2 (en) * 2003-12-23 2009-12-01 Cythera, Inc. Expansion of definitive endoderm cells
US8586357B2 (en) * 2003-12-23 2013-11-19 Viacyte, Inc. Markers of definitive endoderm
US7985585B2 (en) 2004-07-09 2011-07-26 Viacyte, Inc. Preprimitive streak and mesendoderm cells
US20050266554A1 (en) * 2004-04-27 2005-12-01 D Amour Kevin A PDX1 expressing endoderm
US20050181035A1 (en) * 2004-02-17 2005-08-18 Dow Steven W. Systemic immune activation method using non CpG nucleic acids
EP2377922B1 (en) 2004-04-27 2020-04-08 Viacyte, Inc. PDX1 expressing endoderm
EP1598428A1 (en) 2004-05-18 2005-11-23 Georg Dewald Methods and kits to detect Hereditary angioedema type III
CN1953991A (en) 2004-05-21 2007-04-25 惠氏公司 Altered fibronectin-binding protein of staphylococcus aureus
TW200613554A (en) 2004-06-17 2006-05-01 Wyeth Corp Plasmid having three complete transcriptional units and immunogenic compositions for inducing an immune response to HIV
CA2572921C (en) * 2004-07-09 2017-01-03 The University Of North Carolina At Chapel Hill Replication-competent and propagation-defective venezuelan equine encephalitis (vee) viral adjuvants
CN102925406B (en) 2004-07-09 2019-11-22 维亚希特公司 Method of the identification for the factor of differentiating definitive endoderm
EP1791952A4 (en) * 2004-08-13 2008-06-11 Univ Georgia Res Found Compositions and methods for self-renewal and differentiation in human embryonic stem cells
US20060039949A1 (en) * 2004-08-20 2006-02-23 Nycz Jeffrey H Acetabular cup with controlled release of an osteoinductive formulation
US7985581B2 (en) 2004-08-23 2011-07-26 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Multiple RNA polymerase III promoter expression constructs
US20060045902A1 (en) * 2004-09-01 2006-03-02 Serbousek Jon C Polymeric wrap for in vivo delivery of osteoinductive formulations
US20060057184A1 (en) * 2004-09-16 2006-03-16 Nycz Jeffrey H Process to treat avascular necrosis (AVN) with osteoinductive materials
ES2362670T3 (en) 2004-09-24 2011-07-11 Alnylam Pharmaceuticals, Inc GUIDANCE TO INTERMEDIATES OF REPLICATION OF NON-CODING HEBRA OF MONOCATENARY VIRUSES BY RNAI
CN101175508A (en) 2004-10-21 2008-05-07 惠氏公司 Immunogenic compositions of staphylococcus epidermidis polypeptide antigens
US20080274140A1 (en) * 2004-11-19 2008-11-06 David B Weiner Vaccines and Methods for Using the Same
CA2592099A1 (en) 2004-12-22 2006-06-29 Nucleonics, Inc. Conserved hbv and hcv sequences useful for gene silencing
EP2446897A1 (en) 2005-01-06 2012-05-02 Novo Nordisk A/S Anti-KIR combination treatments and methods
CA2597921A1 (en) * 2005-02-15 2007-04-26 University Of North Carolina At Chapel Hill New live virus vaccines
BRPI0607474A2 (en) * 2005-02-23 2016-11-01 Uab Research Foundation glycoside-alkyl enriched vaccination
RS59399B1 (en) 2005-03-23 2019-11-29 Genmab As Antibodies against cd38 for treatment of multiple myeloma
US7968697B2 (en) * 2005-05-25 2011-06-28 Chrontech Pharma Ab Hepatitis C virus non-structural NS3/4A fusion gene
CN101242869B (en) 2005-09-02 2010-05-26 Iomai公司 Devices for transcutaneous delivery of vaccines and transdermal delivery of drugs and uses thereof
WO2007051038A2 (en) 2005-10-27 2007-05-03 Cythera, Inc. Pdx1-expressing dorsal and ventral foregut endoderm
US20090155850A1 (en) * 2005-10-28 2009-06-18 The Florida International University Board Of Trustees Horse:Human Chimeric Antibodies
KR101421745B1 (en) * 2006-01-13 2014-07-22 더 트러스티스 오브 더 유니버시티 오브 펜실바니아 Vaccines and immunotherapeutics using codon optimized il-15 and methods for using the same
EP1981905B1 (en) 2006-01-16 2016-08-31 THE GOVERNMENT OF THE UNITED STATES OF AMERICA as represented by THE SECRETARY OF THE DEPARTMENT OF HEALTH AND HUMAN SERVICES Chlamydia vaccine
NL2000439C2 (en) 2006-01-20 2009-03-16 Quark Biotech Therapeutic applications of inhibitors of RTP801.
DK1999253T3 (en) 2006-03-02 2019-08-12 Viacyte Inc ENDOCRINE PRECURSOR CELLS, PANCREATIC HORMON-EXPRESSING CELLS AND PROCEDURES FOR MANUFACTURING
US7695965B2 (en) * 2006-03-02 2010-04-13 Cythera, Inc. Methods of producing pancreatic hormones
US11254916B2 (en) 2006-03-02 2022-02-22 Viacyte, Inc. Methods of making and using PDX1-positive pancreatic endoderm cells
EP1994409A2 (en) 2006-03-14 2008-11-26 Oregon Health and Science University Methods for producing an immune response to tuberculosis
WO2007127454A2 (en) * 2006-04-28 2007-11-08 Cythera, Inc. Hepatocyte lineage cells
US7572618B2 (en) 2006-06-30 2009-08-11 Bristol-Myers Squibb Company Polynucleotides encoding novel PCSK9 variants
WO2008008360A1 (en) 2006-07-13 2008-01-17 Wyeth Production of glycoproteins
CA2949851C (en) 2006-07-28 2019-11-12 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Htert sequences and methods for using the same
US20100323442A1 (en) * 2006-10-17 2010-12-23 Emmanuel Edward Baetge Modulation of the phosphatidylinositol-3-kinase pathway in the differentiation of human embryonic stem cells
JP2010507387A (en) 2006-10-25 2010-03-11 クアーク・ファーマスーティカルス、インコーポレイテッド Novel siRNA and method of using the same
AU2008221383B2 (en) 2007-02-28 2012-09-13 The Government Of The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Brachyury polypeptides and methods for use
EP2185195A2 (en) * 2007-08-16 2010-05-19 Tripep Ab Immunogen platform
US7855049B2 (en) 2007-08-31 2010-12-21 Biocrine Ab Inositol pyrophosphates determine exocytotic capacity
US7695963B2 (en) 2007-09-24 2010-04-13 Cythera, Inc. Methods for increasing definitive endoderm production
KR101383476B1 (en) 2007-11-01 2014-04-11 아스테라스 세이야쿠 가부시키가이샤 Immunosuppressive polypeptides and nucleic acids
WO2009073330A2 (en) 2007-11-12 2009-06-11 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Novel vaccines against multiple subtypes of influenza virus
CA2702971C (en) * 2007-11-14 2023-03-14 Vgx Pharmaceuticals, Llc Antibody production elicited by a dna vaccine delivered by electroporation
EP2234624B1 (en) 2008-01-11 2018-06-20 Inovio Pharmaceuticals, Inc. Novel vaccines against multiple subtypes of dengue virus
CN102016023A (en) 2008-04-04 2011-04-13 宾夕法尼亚州立大学托管会 Vaccines and immunotherapeutics using IL-28 and compositions and methods of using the same
CN107083391A (en) * 2008-04-04 2017-08-22 宾夕法尼亚大学托管会 Chikungunya virus albumen consensus sequence, the nucleic acid molecules and composition and its application method for encoding the chikungunya virus albumen consensus sequence
WO2009130588A2 (en) * 2008-04-22 2009-10-29 Tripep Ab Immunogen platform
AU2009303788B2 (en) * 2008-05-28 2015-02-05 Inovio Pharmaceuticals, Inc. Smallpox DNA vaccine and the antigens therein that elicit an immune response
CA2635187A1 (en) 2008-06-05 2009-12-05 The Royal Institution For The Advancement Of Learning/Mcgill University Oligonucleotide duplexes and uses thereof
WO2009147684A2 (en) 2008-06-06 2009-12-10 Quark Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for treatment of ear disorders
EP2650014A2 (en) 2008-06-20 2013-10-16 Wyeth LLC Compositions and methods of use of ORF1358 from beta-hemolytic streptococcal strains
US8829174B2 (en) 2008-10-29 2014-09-09 The Trustees Of The University Of Pennsylvania HCV vaccines and methods for using the same
US8921536B2 (en) 2008-10-29 2014-12-30 The Trustees Of The University Of Pennsylvania HCV vaccines and methods for using the same
BRPI0921286B8 (en) 2008-11-05 2022-10-25 Wyeth Llc MULTIPLE COMPONENT IMMUNOGENIC COMPOSITION FOR THE PREVENTION OF BETA-HEMOLYTIC STREPTOCOCCAL (BHS) DISEASE.
EP2356227B1 (en) 2008-11-14 2018-03-28 Viacyte, Inc. Encapsulation of pancreatic cells derived from human pluripotent stem cells
CN102292345B (en) 2008-11-17 2015-12-02 Vgx药品有限责任公司 Cause the antigen to the immunne response of anti-flavivirus and application method thereof
UA109633C2 (en) 2008-12-09 2015-09-25 HUMAN ANTIBODY AGAINST TISSUE FACTOR
WO2010080452A2 (en) 2008-12-18 2010-07-15 Quark Pharmaceuticals, Inc. siRNA COMPOUNDS AND METHODS OF USE THEREOF
CA2653478A1 (en) * 2009-01-23 2010-07-23 Gregg Martin Automated wash system for industrial vehicles
US9050287B2 (en) 2009-01-23 2015-06-09 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Vaccines for human papilloma virus and methods for using the same
US8664183B2 (en) 2009-02-27 2014-03-04 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services SPANX-B polypeptides and their use
MX2011012347A (en) * 2009-05-22 2012-02-21 Genocea Biosciences Inc Vaccines against herpes simplex virus type 2: compositions and methods for eliciting an immune response.
DK3276004T3 (en) 2009-06-08 2020-04-06 Quark Pharmaceuticals Inc PROCEDURES FOR TREATING CHRONIC NONUS DISEASE
AU2010291900A1 (en) 2009-09-14 2012-03-22 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Vaccines and immunotherapeutics comprising IL-15 receptor alpha and/or nucleic acid molecules encoding the same, and methods for using the same
EP2491116A4 (en) 2009-10-22 2013-12-11 Univ Jefferson Cell-based anti-cancer compositions and methods of making and using the same
CN102712931A (en) 2009-11-02 2012-10-03 宾夕法尼亚大学托管会 Foot and mouth disease virus (FMDV) consensus proteins, coding sequences therefor and vaccines made therefrom
US8961989B2 (en) 2009-11-20 2015-02-24 Oregon Health & Science University Methods for producing an immune response to tuberculosis
CA2781645A1 (en) 2009-11-24 2011-06-03 Inviragen, Inc. Compositions, methods and uses for expression of enterobacterium-associated peptides
TW201124160A (en) 2009-11-26 2011-07-16 Quark Pharmaceuticals Inc SiRNA compounds comprising terminal substitutions
EP2862929B1 (en) 2009-12-09 2017-09-06 Quark Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for treating diseases, disorders or injury of the CNS
WO2011084193A1 (en) 2010-01-07 2011-07-14 Quark Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide compounds comprising non-nucleotide overhangs
US8298820B2 (en) 2010-01-26 2012-10-30 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Influenza nucleic acid molecules and vaccines made therefrom
CN102781952B (en) 2010-02-08 2015-09-02 宾夕法尼亚大学托管会 The nucleic acid molecule of coding RANTES, the composition comprising it and its using method
WO2011112599A2 (en) 2010-03-12 2011-09-15 The United States Of America, As Represented By The Secretary. Department Of Health & Human Services Immunogenic pote peptides and methods of use
CA2793959C (en) 2010-03-25 2019-06-04 Oregon Health & Science University Cmv glycoproteins and recombinant vectors
EP3613774A1 (en) 2010-06-09 2020-02-26 Genmab A/S Antibodies against human cd38
RS56599B1 (en) 2010-06-15 2018-02-28 Genmab As Human antibody drug conjugates against tissue factor
US9045755B2 (en) 2010-06-24 2015-06-02 Quark Pharmaceuticals, Inc. Double stranded RNA compounds to RhoA and use thereof
BR112013011705B1 (en) 2010-11-12 2022-04-05 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Consensus prostate antigens, nucleic acid molecule encoding the same, and vaccine and uses comprising the same
WO2012074881A2 (en) 2010-11-24 2012-06-07 Genocea Biosciences, Inc. Vaccines against herpes simplex virus type 2: compositions and methods for eliciting an immune response
US20130324591A1 (en) 2010-12-06 2013-12-05 Quark Pharmaceuticals, Inc. Double stranded oligonucleotide compounds comprising positional modifications
CA2826199A1 (en) 2011-01-31 2012-08-09 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Nucleic acid molecules encoding novel herpes antigens, vaccine comprising the same, and methods of use thereof
EA037377B1 (en) 2011-02-11 2021-03-22 Дзе Трастиз Оф Дзе Юниверсити Оф Пенсильвания Vaccine for inducing an immune response against hbv
US9238679B2 (en) 2011-02-11 2016-01-19 The Trustees Of The University Of Pennslyvania Nucleic acid molecule encoding hepatitis B virus core protein and surface antigen protein and vaccine comprising the same
EP2492279A1 (en) 2011-02-25 2012-08-29 Laboratorios Del. Dr. Esteve, S.A. Rapid immunogen selection method using lentiviral display
JP6132775B2 (en) 2011-03-03 2017-05-24 クォーク ファーマシューティカルズ インコーポレーティッドQuark Pharmaceuticals,Inc. Oligonucleotide modifiers of the Toll-like receptor pathway
US9796979B2 (en) 2011-03-03 2017-10-24 Quark Pharmaceuticals Inc. Oligonucleotide modulators of the toll-like receptor pathway
AU2012267786B2 (en) 2011-06-10 2017-08-03 Oregon Health & Science University CMV glycoproteins and recombinant vectors
CN103687625B (en) 2011-07-11 2017-06-13 艾诺奥医药品有限公司 Intersecting protective arenavirus vaccine and its application method
ES2855110T3 (en) 2011-07-18 2021-09-23 The Us Secretary Department Of Health And Human Services National Institutes Of Health Methods and compositions for the inhibition of a disease associated with polyomavirus
AU2012216792A1 (en) 2011-09-12 2013-03-28 International Aids Vaccine Initiative Immunoselection of recombinant vesicular stomatitis virus expressing HIV-1 proteins by broadly neutralizing antibodies
WO2013039792A1 (en) 2011-09-12 2013-03-21 The United States Of America As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Immunogens based on an hiv-1 gp120 v1v2 epitope
KR102216962B1 (en) 2011-10-12 2021-02-18 더 트러스티스 오브 더 유니버시티 오브 펜실베니아 Vaccines for human papilloma virus and methods for using the same
EP2771035B1 (en) 2011-10-24 2018-04-11 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Improved hcv vaccines and methods for using the same
US9402894B2 (en) 2011-10-27 2016-08-02 International Aids Vaccine Initiative Viral particles derived from an enveloped virus
US20140323549A1 (en) 2011-11-08 2014-10-30 Quark Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for treating diseases, disorders or injury of the nervous system
WO2013078299A1 (en) 2011-11-23 2013-05-30 Genocea Biosciences, Inc. Nucleic acid vaccines against herpes simplex virus type 2: compositions and methods for eliciting an immune response
JP6333730B2 (en) 2011-12-12 2018-05-30 ザ トラスティーズ オブ ザ ユニバーシティ オブ ペンシルバニア Composition comprising improved IL-12 gene construct and vaccine, immunotherapeutic agent and method using the same
US9750795B2 (en) 2011-12-12 2017-09-05 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Proteins comprising MRSA PBP2a and fragments thereof, nucleic acids encoding the same, and compositions and their use to prevent and treat MRSA infections
CN104080912A (en) 2012-01-12 2014-10-01 夸克制药公司 Combination therapy for treating hearing and balance disorders
US10040828B2 (en) 2012-04-10 2018-08-07 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Human respiratory syncytial virus consensus antigens, nucleic acid constructs and vaccines made therefrom, and methods of using same
JP6389163B2 (en) 2012-04-12 2018-09-12 ザ トラスティーズ オブ ザ ユニバーシティ オブ ペンシルバニア Filovirus consensus antigen, nucleic acid construct, and vaccine produced therefrom, and method of use thereof
EP2841572B1 (en) 2012-04-27 2019-06-19 Duke University Genetic correction of mutated genes
US9738879B2 (en) 2012-04-27 2017-08-22 Duke University Genetic correction of mutated genes
EP2679596B1 (en) 2012-06-27 2017-04-12 International Aids Vaccine Initiative HIV-1 env glycoprotein variant
EP2698377A1 (en) 2012-08-17 2014-02-19 Laboratorios Del. Dr. Esteve, S.A. Enhanced rapid immunogen selection method for HIV gp120 variants
JP6364009B2 (en) 2012-09-12 2018-07-25 クォーク ファーマシューティカルズ インコーポレーティッドQuark Pharmaceuticals,Inc. Double-stranded oligonucleotide molecules against P53 and methods of use thereof
EP2895608B1 (en) 2012-09-12 2018-12-05 Quark Pharmaceuticals, Inc. Double-stranded oligonucleotide molecules to p53 and methods of use thereof
WO2014043518A1 (en) 2012-09-14 2014-03-20 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Brachyury protein, non-poxvirus non-yeast vectors encoding brachyury protein, and their use
ES2883590T3 (en) 2012-12-12 2021-12-09 Broad Inst Inc Supply, modification and optimization of systems, methods and compositions for sequence manipulation and therapeutic applications
WO2014093702A1 (en) 2012-12-12 2014-06-19 The Usa, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Hiv therapeutics and methods of making and using same
JP6523174B2 (en) 2012-12-13 2019-05-29 ザ トラスティーズ オブ ザ ユニバーシティ オブ ペンシルバニア WT1 vaccine
WO2014120975A1 (en) 2013-02-01 2014-08-07 California Institute Of Technology Antibody-mediated immunocontraception
EP2956169B1 (en) 2013-02-12 2018-04-11 THE UNITED STATES OF AMERICA, represented by the S Monoclonal antibodies that neutralize norovirus
CN114181961A (en) 2013-03-12 2022-03-15 宾夕法尼亚大学理事会 Improved vaccines for human papilloma virus and methods of use thereof
US9993545B2 (en) 2013-03-15 2018-06-12 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Foot and mouth disease virus (FMDV) consensus proteins, coding sequences therefor and vaccines made therefrom
EA034110B1 (en) 2013-03-15 2019-12-27 Дзе Трастиз Оф Дзе Юниверсити Оф Пенсильвания Cancer vaccines and methods of treatment using the same
US9828582B2 (en) 2013-03-19 2017-11-28 Duke University Compositions and methods for the induction and tuning of gene expression
EP2994163B1 (en) 2013-05-09 2019-08-28 The United States of America, as represented by The Secretary, Department of Health and Human Services Single-domain vhh antibodies directed to norovirus gi.1 and gii.4 and their use
EP3417880A1 (en) 2013-06-05 2018-12-26 Duke University Rna-guided gene editing and gene regulation
BR112015031608A2 (en) 2013-06-17 2017-08-22 Massachusetts Inst Technology APPLICATION AND USE OF CRISPR-CAS SYSTEMS, VECTORS AND COMPOSITIONS FOR LIVER TARGETING AND THERAPY
EP3011032B1 (en) 2013-06-17 2019-10-16 The Broad Institute, Inc. Delivery, engineering and optimization of systems, methods and compositions for targeting and modeling diseases and disorders of post mitotic cells
EP3011034B1 (en) 2013-06-17 2019-08-07 The Broad Institute, Inc. Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for targeting disorders and diseases using viral components
WO2014210018A1 (en) 2013-06-25 2014-12-31 Aeras Global Tb Vaccine Foundation Tuberculosis compositions and methods of using the same
DK3028048T3 (en) 2013-07-31 2019-01-21 Bioventures Llc COMPOSITIONS FOR TREATMENT AND PREVENTION OF CANCER TARGETING AGAINST TUMOR-ASSOCIATED CARBOHYDRATE ANTIGEN
EP2848937A1 (en) 2013-09-05 2015-03-18 International Aids Vaccine Initiative Methods of identifying novel HIV-1 immunogens
WO2015048785A2 (en) 2013-09-30 2015-04-02 Los Alamos National Security, Llc Mosaic conserved region hiv immunogenic polypeptides
US10058604B2 (en) 2013-10-07 2018-08-28 International Aids Vaccine Initiative Soluble HIV-1 envelope glycoprotein trimers
CA2925393C (en) 2013-10-11 2023-03-07 Dimiter Dimitrov Tem8 antibodies and their use
CN105899658B (en) 2013-12-12 2020-02-18 布罗德研究所有限公司 Delivery, use and therapeutic applications of CRISPR-CAS systems and compositions for HBV and viral diseases and disorders
CA2932472A1 (en) 2013-12-12 2015-06-18 Massachusetts Institute Of Technology Compositions and methods of use of crispr-cas systems in nucleotide repeat disorders
BR112016013213A2 (en) 2013-12-12 2017-12-05 Massachusetts Inst Technology administration, use and therapeutic applications of crisper systems and compositions for targeting disorders and diseases using particle delivery components
EP3080259B1 (en) 2013-12-12 2023-02-01 The Broad Institute, Inc. Engineering of systems, methods and optimized guide compositions with new architectures for sequence manipulation
EP3653229A1 (en) 2013-12-12 2020-05-20 The Broad Institute, Inc. Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for genome editing
SG11201604719WA (en) 2013-12-13 2016-07-28 Univ Pennsylvania Dna antibody constructs and method of using same
DK3079716T3 (en) 2013-12-13 2019-08-19 Us Health MULTIEPITOP-TARP-PEPTID VACCINE AND APPLICATIONS THEREOF.
WO2015095770A1 (en) 2013-12-20 2015-06-25 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Immunogenic jc polyomavirus compositions and methods of use
WO2015103549A1 (en) 2014-01-03 2015-07-09 The United States Of America, As Represented By The Secretary Department Of Health And Human Services Neutralizing antibodies to hiv-1 env and their use
WO2015106003A1 (en) 2014-01-08 2015-07-16 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health & Human Services Ras pathways as markers of protection against hiv and methods to improve vaccine efficacy
WO2016011386A1 (en) 2014-07-18 2016-01-21 University Of Washington Cancer vaccine compositions and methods of use thereof
ES2848857T3 (en) 2014-07-31 2021-08-12 Us Gov Health & Human Services Human monoclonal antibodies against EphA4 and their use
ES2780904T3 (en) 2014-08-17 2020-08-27 Broad Inst Inc Genomic editing using Cas9 nickases
EP3189067B1 (en) 2014-09-04 2021-05-19 The United States of America, as represented by The Secretary, Department of Health and Human Services Recombinant hiv-1 envelope proteins and their use
WO2016049258A2 (en) 2014-09-25 2016-03-31 The Broad Institute Inc. Functional screening with optimized functional crispr-cas systems
EP3218397B8 (en) 2014-11-14 2021-04-07 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Neutralizing antibodies to ebola virus glycoprotein and their use
US11319555B2 (en) 2014-11-20 2022-05-03 Duke University Compositions, systems and methods for cell therapy
BR112017011556A2 (en) 2014-12-01 2018-03-06 Inovio Pharmaceuticals Inc methods for generating a synthetic antibody, preventing or treating a disease, treating a subject of pathogen infection and a subject with cancer, product, nucleic acid molecule, and composition.
US10072070B2 (en) 2014-12-05 2018-09-11 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Potent anti-influenza A neuraminidase subtype N1 antibody
WO2016094880A1 (en) 2014-12-12 2016-06-16 The Broad Institute Inc. Delivery, use and therapeutic applications of crispr systems and compositions for genome editing as to hematopoietic stem cells (hscs)
WO2016094874A1 (en) 2014-12-12 2016-06-16 The Broad Institute Inc. Escorted and functionalized guides for crispr-cas systems
WO2016094867A1 (en) 2014-12-12 2016-06-16 The Broad Institute Inc. Protected guide rnas (pgrnas)
WO2016094872A1 (en) 2014-12-12 2016-06-16 The Broad Institute Inc. Dead guides for crispr transcription factors
WO2016100974A1 (en) 2014-12-19 2016-06-23 The Broad Institute Inc. Unbiased identification of double-strand breaks and genomic rearrangement by genome-wide insert capture sequencing
WO2016106236A1 (en) 2014-12-23 2016-06-30 The Broad Institute Inc. Rna-targeting system
US10420834B2 (en) 2014-12-24 2019-09-24 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Recombinant metapneumovirus F proteins and their use
WO2016106244A1 (en) 2014-12-24 2016-06-30 The Broad Institute Inc. Crispr having or associated with destabilization domains
JP6929791B2 (en) 2015-02-09 2021-09-01 デューク ユニバーシティ Compositions and methods for epigenome editing
KR20170140180A (en) 2015-02-24 2017-12-20 더 유나이티드 스테이츠 오브 어메리카, 애즈 리프리젠티드 바이 더 세크러테리, 디파트먼트 오브 헬쓰 앤드 휴먼 서비씨즈 Middle east respiratory syndrome coronavirus immunogens, antibodies, and their use
PL3271389T3 (en) 2015-03-20 2020-08-10 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Neutralizing antibodies to gp120 and their use
US10174292B2 (en) 2015-03-20 2019-01-08 International Aids Vaccine Initiative Soluble HIV-1 envelope glycoprotein trimers
EP3072901A1 (en) 2015-03-23 2016-09-28 International Aids Vaccine Initiative Soluble hiv-1 envelope glycoprotein trimers
WO2016179034A2 (en) 2015-05-01 2016-11-10 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Methods and compositions for stimulating immune response using potent immunostimulatory rna motifs
WO2016196975A1 (en) 2015-06-03 2016-12-08 The United States Of America, As Represented By The Secretary Department Of Health & Human Services Neutralizing antibodies to hiv-1 env and their use
WO2016205749A1 (en) 2015-06-18 2016-12-22 The Broad Institute Inc. Novel crispr enzymes and systems
IL284808B (en) 2015-06-18 2022-07-01 Broad Inst Inc Crispr enzyme mutations reducing off-target effects
US9790490B2 (en) 2015-06-18 2017-10-17 The Broad Institute Inc. CRISPR enzymes and systems
WO2016205745A2 (en) * 2015-06-18 2016-12-22 The Broad Institute Inc. Cell sorting
EP3666895A1 (en) 2015-06-18 2020-06-17 The Broad Institute, Inc. Novel crispr enzymes and systems
US10676735B2 (en) 2015-07-22 2020-06-09 Duke University High-throughput screening of regulatory element function with epigenome editing technologies
AU2016308339A1 (en) 2015-08-18 2018-04-12 Baylor College Of Medicine Methods and compositions for altering function and structure of chromatin loops and/or domains
US11427817B2 (en) 2015-08-25 2022-08-30 Duke University Compositions and methods of improving specificity in genomic engineering using RNA-guided endonucleases
CA2997809A1 (en) 2015-10-07 2017-04-13 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Il-7r-alpha specific antibodies for treating acute lymphoblastic leukemia
WO2017069958A2 (en) 2015-10-09 2017-04-27 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Modulation of novel immune checkpoint targets
WO2017062855A1 (en) 2015-10-09 2017-04-13 Monsanto Technology Llc Novel rna-guided nucleases and uses thereof
EP4089175A1 (en) 2015-10-13 2022-11-16 Duke University Genome engineering with type i crispr systems in eukaryotic cells
WO2017070605A1 (en) 2015-10-22 2017-04-27 The Broad Institute Inc. Type vi-b crispr enzymes and systems
US11492670B2 (en) 2015-10-27 2022-11-08 The Broad Institute Inc. Compositions and methods for targeting cancer-specific sequence variations
WO2017075451A1 (en) 2015-10-28 2017-05-04 The Broad Institute Inc. Compositions and methods for evaluating and modulating immune responses by detecting and targeting pou2af1
WO2017075478A2 (en) 2015-10-28 2017-05-04 The Broad Institute Inc. Compositions and methods for evaluating and modulating immune responses by use of immune cell gene signatures
WO2017075465A1 (en) 2015-10-28 2017-05-04 The Broad Institute Inc. Compositions and methods for evaluating and modulating immune responses by detecting and targeting gata3
WO2017079479A1 (en) 2015-11-03 2017-05-11 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Neutralizing antibodies to hiv-1 gp41 and their use
US11180538B2 (en) 2015-11-13 2021-11-23 University Of Utah Research Foundation Combinatorial gene construct and non-viral delivery for anti-obesity
BR112018011133A2 (en) 2015-11-30 2018-11-21 Univ Duke Therapeutic Targets for the Correction of the Human Dystrophin Gene by Gene Editing and Methods of Use
US20190233814A1 (en) 2015-12-18 2019-08-01 The Broad Institute, Inc. Novel crispr enzymes and systems
AU2016380351B2 (en) 2015-12-29 2023-04-06 Monsanto Technology Llc Novel CRISPR-associated transposases and uses thereof
WO2017136758A1 (en) 2016-02-05 2017-08-10 Inovio Pharmaceuticals, Inc. Cancer vaccines and methods of treatment using the same
WO2017139392A1 (en) 2016-02-08 2017-08-17 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Recombinant hiv-1 envelope proteins and their use
WO2017156272A1 (en) 2016-03-09 2017-09-14 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Recombinant hiv-1 envelope proteins and their use
WO2017160599A1 (en) 2016-03-14 2017-09-21 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Use of cd300b antagonists to treat sepsis and septic shock
US11020160B2 (en) 2016-03-21 2021-06-01 Warsaw Orthopedic, Inc. Surgical injection system and method
CN109069611B (en) 2016-03-29 2022-11-04 美国政府(由卫生和人类服务部的部长所代表) Substitution-modified pre-fusion RSV F proteins and uses thereof
EP3445856A1 (en) 2016-04-19 2019-02-27 The Broad Institute Inc. Novel crispr enzymes and systems
US11286478B2 (en) 2016-04-19 2022-03-29 The Broad Institute, Inc. Cpf1 complexes with reduced indel activity
SG10202010311SA (en) 2016-04-19 2020-11-27 Broad Inst Inc Novel Crispr Enzymes and Systems
US10709814B2 (en) 2016-04-22 2020-07-14 Warsaw Orthopedic, Inc. Osteoimplant comprising an insoluble fibrous polymer
WO2017192589A1 (en) 2016-05-02 2017-11-09 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Neutralizing antibodies to influenza ha and their use and identification
US20190134221A1 (en) 2016-05-05 2019-05-09 Duke University Crispr/cas-related methods and compositions for treating duchenne muscular dystrophy
AU2017285424B2 (en) 2016-06-16 2022-08-18 International Aids Vaccine Initiative, Inc. Tuberculosis compositions and methods of treating or preventing tuberculosis
KR20230156150A (en) 2016-06-17 2023-11-13 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 Type vi crispr orthologs and systems
US11091775B2 (en) 2016-06-22 2021-08-17 Oregon Health And Science University Recombinant cytomegalovirus vectors as vaccines for tuberculosis
US20210222164A1 (en) 2016-06-29 2021-07-22 The Broad Institute, Inc. Crispr-cas systems having destabilization domain
EP4275747A3 (en) 2016-07-19 2024-01-24 Duke University Therapeutic applications of cpf1-based genome editing
WO2018035387A1 (en) 2016-08-17 2018-02-22 The Broad Institute, Inc. Novel crispr enzymes and systems
US11352647B2 (en) 2016-08-17 2022-06-07 The Broad Institute, Inc. Crispr enzymes and systems
WO2018049025A2 (en) 2016-09-07 2018-03-15 The Broad Institute Inc. Compositions and methods for evaluating and modulating immune responses
AU2017332161A1 (en) 2016-09-21 2019-04-04 The United States Government As Represented By The Department Of Veterans Affairs Chimeric antigen receptor (car) that targets chemokine receptor CCR4 and its use
US10350288B2 (en) 2016-09-28 2019-07-16 Genocea Biosciences, Inc. Methods and compositions for treating herpes
EP3518968B1 (en) 2016-10-03 2022-01-05 The U.S.A. as represented by the Secretary, Department of Health and Human Services Hiv-1 env fusion peptide immunogens and their use
WO2018067991A1 (en) 2016-10-07 2018-04-12 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Modulation of novel immune checkpoint targets
WO2018071576A1 (en) 2016-10-14 2018-04-19 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Treatment of tumors by inhibition of cd300f
US10960070B2 (en) 2016-10-25 2021-03-30 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Prefusion coronavirus spike proteins and their use
EP3532096B1 (en) 2016-10-25 2023-02-22 The U.S.A. as represented by the Secretary, Department of Health and Human Services Prefusion piv f immunogens and their use
EP3532616A1 (en) 2016-10-28 2019-09-04 Editas Medicine, Inc. Crispr/cas-related methods and compositions for treating herpes simplex virus
US11202824B2 (en) 2016-10-31 2021-12-21 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Peptide fragments from filoviruses and their uses
MX2019006349A (en) 2016-12-16 2019-08-22 Inst Res Biomedicine Novel recombinant prefusion rsv f proteins and uses thereof.
WO2018148660A1 (en) 2017-02-10 2018-08-16 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Neutralizing antibodies to plasmodium falciparum circumsporozoite protein and their use
EP3596207B1 (en) 2017-03-15 2023-12-20 The Broad Institute, Inc. Novel cas13b orthologues crispr enzymes and systems
US11235056B2 (en) 2017-03-24 2022-02-01 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Glycan-masked engineered outer domains of HIV-1 gp120 and their use
JP2020516285A (en) 2017-04-12 2020-06-11 ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッド New VI type CRISPR ortholog and system
US20200405639A1 (en) 2017-04-14 2020-12-31 The Broad Institute, Inc. Novel delivery of large payloads
WO2018204777A2 (en) 2017-05-05 2018-11-08 The Broad Institute, Inc. Methods for identification and modification of lncrna associated with target genotypes and phenotypes
KR20200031618A (en) 2017-06-26 2020-03-24 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 CRISPR / CAS-adenine deaminase based compositions, systems and methods for targeted nucleic acid editing
US10392616B2 (en) 2017-06-30 2019-08-27 Arbor Biotechnologies, Inc. CRISPR RNA targeting enzymes and systems and uses thereof
GB201710838D0 (en) 2017-07-05 2017-08-16 Ucl Business Plc Bispecific antibodies
BR102017016440A2 (en) 2017-07-31 2019-03-19 Universidade Federal Do Rio Grande Do Sul COMPOSITION FOR CENTRAL NERVOUS SYSTEM GENE THERAPY, OBTAINING AND USE PROCESS
CN111511388A (en) 2017-09-21 2020-08-07 博德研究所 Systems, methods, and compositions for targeted nucleic acid editing
US20200255828A1 (en) 2017-10-04 2020-08-13 The Broad Institute, Inc. Methods and compositions for altering function and structure of chromatin loops and/or domains
EP3697440A1 (en) 2017-10-16 2020-08-26 The United States of America, as represented by the Secretary, Department of Health and Human Services Recombinant hiv-1 envelope proteins and their use
EP3697806A4 (en) 2017-10-17 2021-10-27 International AIDS Vaccine Initiative, Inc. Tuberculosis antigen cassettes
WO2019089803A1 (en) 2017-10-31 2019-05-09 The Broad Institute, Inc. Methods and compositions for studying cell evolution
US20200291395A1 (en) 2017-11-02 2020-09-17 Arbor Biotechnologies, Inc. Novel crispr-associated transposon systems and components
WO2019108541A1 (en) 2017-11-28 2019-06-06 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Recombinant rsv g proteins and their use
US11235044B2 (en) 2017-12-13 2022-02-01 Inovio Pharmaceuticals, Inc. Cancer vaccines targeting MUC16 and uses thereof
HUE061198T2 (en) 2017-12-13 2023-05-28 Inovio Pharmaceuticals Inc Cancer vaccines targeting prame and uses thereof
EP3723810A4 (en) 2017-12-13 2022-02-23 Inovio Pharmaceuticals, Inc. Cancer vaccines targeting mesothelin and uses thereof
EP3724223A1 (en) 2018-01-02 2020-10-21 The United States of America, as represented by The Secretary, Department of Health and Human Services Neutralizing antibodies to ebola virus glycoprotein and their use
WO2019143934A1 (en) 2018-01-19 2019-07-25 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Anti-cancer activity of scbg3a2 and lps
CN111971299A (en) 2018-02-21 2020-11-20 美国政府(由卫生和人类服务部的部长所代表) Neutralizing antibodies to HIV-1Env and uses thereof
US20230242891A1 (en) 2018-03-14 2023-08-03 Arbor Biotechnologies, Inc. Novel crispr dna and rna targeting enzymes and systems
PT3765615T (en) 2018-03-14 2023-08-28 Arbor Biotechnologies Inc Novel crispr dna targeting enzymes and systems
US10968257B2 (en) 2018-04-03 2021-04-06 The Broad Institute, Inc. Target recognition motifs and uses thereof
WO2019222555A1 (en) 2018-05-16 2019-11-21 Arbor Biotechnologies, Inc. Novel crispr-associated systems and components
US20210301288A1 (en) 2018-07-16 2021-09-30 Arbor Biotechnologies, Inc. Novel crispr dna targeting enzymes and systems
AU2019315602A1 (en) 2018-08-03 2021-02-18 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Nipah virus immunogens and their use
WO2020033601A1 (en) 2018-08-07 2020-02-13 The Broad Institute, Inc. Novel cas12b enzymes and systems
US20210317429A1 (en) 2018-08-20 2021-10-14 The Broad Institute, Inc. Methods and compositions for optochemical control of crispr-cas9
JP7320601B2 (en) 2018-09-11 2023-08-03 上▲海▼市公共▲衛▼生▲臨▼床中心 Broad-spectrum anti-influenza vaccine immunogen and its use
WO2020053808A1 (en) 2018-09-12 2020-03-19 Georg Dewald Method of diagnosing vasoregulatory disorders
US20210340188A1 (en) 2018-10-22 2021-11-04 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Servic Recombinant gp120 protein with v1-loop deletion
EP3891170A4 (en) 2018-12-04 2022-12-07 The Rockefeller University Hiv vaccine immunogens
AU2019406778A1 (en) 2018-12-17 2021-07-22 Massachusetts Institute Of Technology Crispr-associated transposase systems and methods of use thereof
EP3883609A2 (en) 2018-12-20 2021-09-29 The United States of America, as represented by the Secretary, Department of Health and Human Services Ebola virus glycoprotein-specific monoclonal antibodies and uses thereof
WO2020186213A1 (en) 2019-03-14 2020-09-17 The Broad Institute, Inc. Novel nucleic acid modifiers
US20220177863A1 (en) 2019-03-18 2022-06-09 The Broad Institute, Inc. Type vii crispr proteins and systems
US20220227853A1 (en) 2019-05-03 2022-07-21 The United States Of America,As Represented By The Secretary,Department Of Health And Human Services Neutralizing antibodies to plasmodium falciparum circumsporozoite protein and their use
US20230085439A1 (en) 2019-05-21 2023-03-16 University Of Georgia Research Foundation, Inc. Antibodies that bind human metapneumovirus fusion protein and their use
CN114269783B (en) 2019-07-02 2024-03-26 美国政府(由卫生和人类服务部的部长所代表) Monoclonal antibody binding to EGFRVIII and application thereof
CA3159320A1 (en) 2019-12-06 2021-06-10 Scribe Therapeutics Inc. Particle delivery systems
EP4072581A1 (en) 2019-12-11 2022-10-19 The United States of America, as represented by the Secretary, Department of Health and Human Services Mumps and measles virus immunogens and their use
WO2021163365A1 (en) 2020-02-11 2021-08-19 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Sars-cov-2 vaccine
EP4093762A1 (en) 2020-02-20 2022-11-30 The United States of America, as represented by the Secretary, Department of Health and Human Services Epstein-barr virus monoclonal antibodies and uses thereof
US11213482B1 (en) 2020-03-05 2022-01-04 University of Pittsburgh—Of the Commonwealth System of Higher Educat SARS-CoV-2 subunit vaccine and microneedle array delivery system
EP4142785A2 (en) 2020-04-29 2023-03-08 The United States of America, as represented by the Secretary, Department of Health and Human Services Recombinant human metapneumovirus f proteins and their use
WO2021249116A1 (en) 2020-06-10 2021-12-16 Sichuan Clover Biopharmaceuticals, Inc. Coronavirus vaccine compositions, methods, and uses thereof
WO2022035860A2 (en) 2020-08-10 2022-02-17 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Replication-competent adenovirus type 4-hiv env vaccines and their use
WO2022068912A1 (en) 2020-09-30 2022-04-07 Huigene Therapeutics Co., Ltd. Engineered crispr/cas13 system and uses thereof
WO2022188039A1 (en) 2021-03-09 2022-09-15 Huigene Therapeutics Co., Ltd. Engineered crispr/cas13 system and uses thereof
WO2022093745A1 (en) 2020-10-26 2022-05-05 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Single domain antibodies targeting sars coronavirus spike protein and uses thereof
WO2022132904A1 (en) 2020-12-17 2022-06-23 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Human monoclonal antibodies targeting sars-cov-2
US20240041990A1 (en) 2020-12-22 2024-02-08 Helmholtz Zentrum München - Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) Application of crispr/cas13 for therapy of rna virus and/or bacterium induced diseases
CN117412769A (en) 2021-01-15 2024-01-16 美国政府(由卫生和人类服务部的部长所代表) Replication-competent adenovirus 4 SARS-COV-2 vaccine and its use
CN117642178A (en) 2021-02-09 2024-03-01 美国政府(由卫生和人类服务部的部长所代表) Antibodies targeting coronavirus spike protein
CN117396502A (en) 2021-02-09 2024-01-12 佐治亚大学研究基金会有限公司 Human monoclonal antibodies to pneumococcal antigens
AU2022230408A1 (en) 2021-03-03 2023-09-21 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services La protien as a novel regulator of osteoclastogenesis
EP4305157A1 (en) 2021-03-09 2024-01-17 Huidagene Therapeutics (Singapore) Pte. Ltd. Engineered crispr/cas13 system and uses thereof
WO2022232648A1 (en) 2021-04-29 2022-11-03 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Prefusion-stabilized lassa virus glycoprotein complex and its use
WO2022232612A1 (en) 2021-04-29 2022-11-03 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Lassa virus-specific nanobodies and methods of their use
WO2022261017A1 (en) 2021-06-09 2022-12-15 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Cross species single domain antibodies targeting pd-l1 for treating solid tumors
WO2023015186A1 (en) 2021-08-03 2023-02-09 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Hiv-1 vaccination and samt-247 microbicide to prevent hiv-1 infection
WO2023044272A1 (en) 2021-09-17 2023-03-23 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Synthetic humanized llama nanobody library and use thereof to identify sars-cov-2 neutralizing antibodies
WO2023076881A1 (en) 2021-10-26 2023-05-04 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Single domain antibodies targeting the s2 subunit of sars-cov-2 spike protein
CN114015674A (en) 2021-11-02 2022-02-08 辉二(上海)生物科技有限公司 Novel CRISPR-Cas12i system
WO2023086961A1 (en) 2021-11-12 2023-05-19 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Sars-cov-2 spike fused to a hepatitis b surface antigen
WO2023154824A1 (en) 2022-02-10 2023-08-17 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Human monoclonal antibodies that broadly target coronaviruses
WO2023177655A1 (en) 2022-03-14 2023-09-21 Generation Bio Co. Heterologous prime boost vaccine compositions and methods of use
WO2023192827A1 (en) 2022-03-26 2023-10-05 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Bispecific antibodies to hiv-1 env and their use
WO2023192835A1 (en) 2022-03-27 2023-10-05 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Base-covered hiv-1 envelope ectodomains and their use
WO2023192881A1 (en) 2022-03-28 2023-10-05 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Neutralizing antibodies to hiv-1 env and their use
WO2023220645A1 (en) 2022-05-10 2023-11-16 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Vaccine for human t-lymphotropic virus-1
WO2023227669A2 (en) 2022-05-26 2023-11-30 UCB Biopharma SRL Novel nucleic acid-editing proteins
WO2024003046A1 (en) 2022-06-27 2024-01-04 Helmholtz Zentrum München - Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) Viral load-dependent crispr/cas13-system
WO2024030829A1 (en) 2022-08-01 2024-02-08 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Monoclonal antibodies that bind to the underside of influenza viral neuraminidase
WO2024054822A1 (en) 2022-09-07 2024-03-14 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Engineered sars-cov-2 antibodies with increased neutralization breadth
WO2024064826A1 (en) 2022-09-22 2024-03-28 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Neutralizing antibodies to plasmodium falciparum circumsporozoite protein and their use

Family Cites Families (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB1594097A (en) * 1976-12-16 1981-07-30 Int Inst Of Differentiation Production of specific immune nucleic acids cell dialysates and antibodies
US4394448A (en) * 1978-02-24 1983-07-19 Szoka Jr Francis C Method of inserting DNA into living cells
US4945050A (en) * 1984-11-13 1990-07-31 Cornell Research Foundation, Inc. Method for transporting substances into living cells and tissues and apparatus therefor
US5036006A (en) * 1984-11-13 1991-07-30 Cornell Research Foundation, Inc. Method for transporting substances into living cells and tissues and apparatus therefor
GB8508845D0 (en) * 1985-04-04 1985-05-09 Hoffmann La Roche Vaccinia dna
US4806463A (en) * 1986-05-23 1989-02-21 Worcester Foundation For Experimental Biology Inhibition of HTLV-III by exogenous oligonucleotides
US5185254A (en) * 1988-12-29 1993-02-09 The Wistar Institute Gene family of tumor-associated antigens
ATE277193T1 (en) * 1989-03-21 2004-10-15 Vical Inc EXPRESSION OF EXOGENEOUS POLYNUCLEOTIDE SEQUENCES IN VERTEBRATES
AU7312891A (en) * 1990-02-12 1991-09-03 Board Of Regents, The University Of Texas System Satellite cell proliferation in adult skeletal muscle
PT584348E (en) * 1992-03-11 2005-10-31 Powderject Vaccines Inc GENETIC VACCINE FOR IMMUNODEFICIENCY VIRUS
AU4253493A (en) * 1992-05-21 1993-12-13 Government Of The United States Of America, As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services, The Targeting gene expression to living tissue using jet injection
US5593972A (en) * 1993-01-26 1997-01-14 The Wistar Institute Genetic immunization

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Wolfe J.A. et al. "Biotechniges", 11(4), p.474-485. *

Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2004061110A1 (en) * 2003-01-05 2004-07-22 Obschestvo S Ogranichennoi Otvetstvennostiju 'genno-Inzhenernye Tekhnologii 2000' Complementation method for producing rna-containing virus-like particles of hepatotropic viruses
EA012066B1 (en) * 2003-10-10 2009-08-28 Паудерджект Вэксинс, Инк. Method of eliciting a t cell response
EA013251B1 (en) * 2004-10-28 2010-04-30 Арес Трейдинг С.А. vWFA AND/OR ANT_IG DOMAINS CONTAINING PROTEINS
RU2749717C2 (en) * 2015-11-24 2021-06-16 Глэксосмитклайн Интеллекчуал Проперти Дивелопмент Лимитед Method for temporary transfection for producing retrovirus
RU2752498C2 (en) * 2015-11-24 2021-07-28 Глэксосмитклайн Интеллекчуал Проперти Дивелопмент Лимитед Stable cell lines for retroviruses production

Also Published As

Publication number Publication date
US5830876A (en) 1998-11-03
US6468982B1 (en) 2002-10-22
US5593972A (en) 1997-01-14
US5817637A (en) 1998-10-06

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2174845C2 (en) Compositions and methods of genetic material delivery
US8304234B2 (en) Compositions and methods for delivery of genetic material
US5981505A (en) Compositions and methods for delivery of genetic material
EP0772437B9 (en) Compositions for delivery of genetic material
US5962428A (en) Compositions and methods for delivery of genetic material
US8536145B2 (en) Methods of inducing mucosal immunity
US7001759B1 (en) Compositions and methods for delivery of genetic material
EP1473369B1 (en) Compositions and methods for delivery of genetic material
KR100328195B1 (en) Genetic material delivery composition and delivery method

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20130127