RU2022131159A - Способы и композиции для прогнозирования терапевтической эффективности лечения онкологических заболеваний и прогноза онкологических заболеваний - Google Patents
Способы и композиции для прогнозирования терапевтической эффективности лечения онкологических заболеваний и прогноза онкологических заболеваний Download PDFInfo
- Publication number
- RU2022131159A RU2022131159A RU2022131159A RU2022131159A RU2022131159A RU 2022131159 A RU2022131159 A RU 2022131159A RU 2022131159 A RU2022131159 A RU 2022131159A RU 2022131159 A RU2022131159 A RU 2022131159A RU 2022131159 A RU2022131159 A RU 2022131159A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- cancer patient
- reduced risk
- antibody
- patient
- free survival
- Prior art date
Links
- 201000010099 disease Diseases 0.000 title claims 18
- 230000000771 oncological Effects 0.000 title claims 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title 1
- 230000001225 therapeutic Effects 0.000 title 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims 58
- 108090001123 antibodies Proteins 0.000 claims 41
- 102000004965 antibodies Human genes 0.000 claims 41
- 230000004083 survival Effects 0.000 claims 36
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims 16
- 230000002411 adverse Effects 0.000 claims 10
- 239000000427 antigen Substances 0.000 claims 8
- 102000038129 antigens Human genes 0.000 claims 8
- 108091007172 antigens Proteins 0.000 claims 8
- 102100004728 CDH1 Human genes 0.000 claims 6
- 101700016900 CDH1 Proteins 0.000 claims 6
- 101700011568 DIB1 Proteins 0.000 claims 6
- 102100006402 DNMT3A Human genes 0.000 claims 6
- 101710038368 DNMT3A Proteins 0.000 claims 6
- 210000000987 Immune System Anatomy 0.000 claims 3
- 239000000611 antibody drug conjugate Substances 0.000 claims 3
- 108091008116 antibody drug conjugates Proteins 0.000 claims 3
- 230000003111 delayed Effects 0.000 claims 3
- 229920003013 deoxyribonucleic acid Polymers 0.000 claims 3
- 208000009956 Adenocarcinoma Diseases 0.000 claims 2
- 210000003238 Esophagus Anatomy 0.000 claims 2
- 210000002784 Stomach Anatomy 0.000 claims 2
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 2
- 230000001419 dependent Effects 0.000 claims 2
- 230000000750 progressive Effects 0.000 claims 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 2
- 210000004881 tumor cells Anatomy 0.000 claims 2
- 210000004369 Blood Anatomy 0.000 claims 1
- 231100000023 Cell-mediated cytotoxicity Toxicity 0.000 claims 1
- 206010057250 Cell-mediated cytotoxicity Diseases 0.000 claims 1
- 206010062878 Gastrooesophageal cancer Diseases 0.000 claims 1
- 231100000765 Toxin Toxicity 0.000 claims 1
- 230000000259 anti-tumor Effects 0.000 claims 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims 1
- 230000000973 chemotherapeutic Effects 0.000 claims 1
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 claims 1
- 230000000295 complement Effects 0.000 claims 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims 1
- 230000001085 cytostatic Effects 0.000 claims 1
- 239000000824 cytostatic agent Substances 0.000 claims 1
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 claims 1
- 230000001472 cytotoxic Effects 0.000 claims 1
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 claims 1
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 claims 1
- 201000006974 gastroesophageal cancer Diseases 0.000 claims 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 claims 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 claims 1
- 108010045030 monoclonal antibodies Proteins 0.000 claims 1
- 102000005614 monoclonal antibodies Human genes 0.000 claims 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims 1
- 230000002285 radioactive Effects 0.000 claims 1
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 claims 1
- 239000003053 toxin Substances 0.000 claims 1
Claims (68)
1. Способ определения
(i) отвечает ли пациент с онкологическим заболеванием, имеющий опухоль, положительную по опухолевому антигену, на лечение с применением антитела против опухолевого антигена и/или
(ii) будет ли у пациента с онкологическим заболеванием период выживаемости без прогрессирования, предпочтительно у пациента с онкологическим заболеванием, имеющего опухоль, положительную по опухолевому антигену,
причем указанный способ включает определение генотипа для одного или нескольких однонуклеотидных полиморфизмов, выбранных из группы, состоящей из FCGR2A rs1801274, MUC1 rs4072037, IL-10 rs1800896, DNMT3A rs1550117, SMAD4 rs12456284, EGF rs4444903, CDH1 rs16260, ERCC1 rs11615 и FCGR3A rs396991 в образце, полученном из пациента.
2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что присутствие гетерозиготного генотипа FCGR2A rs1801274 [CT] указывает на снижение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером на лечение антителом и/или снижение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
3. Способ по п. 1, отличающийся тем, что наличие гомозиготного генотипа FCGR2A rs1801274 [TT] и/или гомозиготного генотипа FCGR2A rs1801274 [CC] указывает на повышение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером лечения антителом и/или повышение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
4. Способ по п. 1, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа MUC1 rs4072037 [AA] указывает на снижение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером лечения антителом и/или на снижение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
5. Способ по п. 1, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа MUC1 rs4072037 [GG] указывает на повышение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером на лечение антителом и/или повышение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
6. Способ по п. 1, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа IL-10 rs1800896 [GG] указывает на снижение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером на лечение антителом и/или на снижение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
7. Способ по п. 1, отличающийся тем, что присутствие гетерозиготного генотипа DNMT3A rs1550117 [GA] указывает на снижение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером на лечение антителом и/или на снижение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
8. Способ по п. 1, отличающийся тем, что присутствие гетерозиготного генотипа SMAD4 rs12456284 [GA] указывает на снижение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером на лечение антителом и/или на снижение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
9. Способ по п. 1, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа EGF rs4444903 [AA] указывает на снижение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером на лечение антителом и/или на снижение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
10. Способ по п. 1, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа CDH1 rs16260 [AA] указывает на снижение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером на лечение антителом и/или на снижение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
11. Способ по п. 1, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа ERCC1 rs11615 [TT] указывает на снижение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером на лечение антителом и/или на снижение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
12. Способ по п. 1, отличающийся тем, что присутствие гетерозиготного генотипа FCGR3A rs396991 [TG] и/или гомозиготного генотипа FCGR3A rs396991 [TT] указывает на снижение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером на лечение антителом и/или на снижение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
13. Способ по любому из пп. 1-12, отличающийся тем, что опухолевым антигеном является белок CLDN18.2.
14. Способ определения
(i) является ли пациент с онкологическим заболеванием, имеющий CLDN18.2-положительную опухоль, респондером на лечение антителом против белка CLDN18.2 и/или
(ii) будет ли у пациента с онкологическим заболеванием, предпочтительно пациента с онкологическим заболеванием, имеющего CLDN18.2-положительную опухоль, период выживаемости без прогрессирования,
причем указанный способ включает определение генотипа для одного или нескольких однонуклеотидных полиморфизмов, выбранных из группы, состоящей из FCGR2A rs1801274, MUC1 rs4072037, IL-10 rs1800896, DNMT3A rs1550117, SMAD4 rs12456284, EGF rs4444903, CDH1 rs16260, ERCC1 rs11615 и FCGR3A rs396991 в образце, полученном от пациента.
15. Способ по п. 14, отличающийся тем, что присутствие гетерозиготного генотипа FCGR2A rs1801274 [CT] указывает на снижение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером на лечение антителом и/или на снижение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
16. Способ по п. 14, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа FCGR2A rs1801274 [TT] и/или гомозиготного генотипа FCGR2A rs1801274 [CC] указывает на повышение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не будет респондером на лечение антителом и/или повышение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
17. Способ по п. 14, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа MUC1 rs4072037 [AA] указывает на снижение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером на лечение антителом и/или на снижение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
18. Способ по п. 14, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа MUC1 rs4072037 [GG] указывает на повышение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не будет респондером на лечение антителом и/или повышение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
19. Способ по п. 14, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа IL-10 rs1800896 [GG] указывает на снижение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером на лечение антителом и/или на снижение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
20. Способ по п. 14, отличающийся тем, что присутствие гетерозиготного генотипа DNMT3A rs1550117 [GA] указывает на снижение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером на лечение антителом и/или на снижение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
21. Способ по п. 14, отличающийся тем, что присутствие гетерозиготного генотипа SMAD4 rs12456284 [GA] указывает на снижение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером на лечение антителом и/или на снижение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
22. Способ по п. 14, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа EGF rs4444903 [AA] указывает на снижение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером на лечение антителом и/или на снижение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
23. Способ по п. 14, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа CDH1 rs16260 [AA] указывает на снижение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером на лечение антителом и/или на снижение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
24. Способ по п. 14, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа ERCC1 rs11615 [TT] указывает на снижение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером на лечение антителом и/или на снижение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
25. Способ по п. 14, отличающийся тем, что присутствие гетерозиготного генотипа FCGR3A rs396991 [TG] и/или гомозиготного генотипа FCGR3A rs396991 [TT] указывает на снижение риска того, что пациент с онкологическим заболеванием не является респондером на лечение антителом и/или на снижение риска того, что у пациента с онкологическим заболеванием не будет периода выживаемости без прогрессирования.
26. Способ по любому из пп. 1-25, отличающийся тем, что антитело действует путем рекрутирования иммунной системы пациента для уничтожения опухолевых клеток.
27. Способ по любому из пп. 1-26, отличающийся тем, что антитело действует через антителозависимую клеточно-опосредованную цитотоксичность (ADCC) и/или комплементарно-зависимую цитотоксичность (CDC).
28. Способ по любому из пп. 1-27, отличающийся тем, что антитело представляет собой моноклональное антитело.
29. Способ по любому из пп. 1-28, отличающийся тем, что антитело содержит тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность, представленную с помощью SEQ ID NO: 17 или 51, или ее фрагмент, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность, представленную с помощью SEQ ID NO: 24, или ее фрагмент.
30. Способ по любому из пп. 1-29, отличающийся тем, что невосприимчивость к лечению антителом включает относительное снижение одного или нескольких из числа выживаемости, выживаемости без прогрессирования, безрецидивной выживаемости, отсроченной безрецидивной выживаемости и стабильного заболевания.
31. Способ лечения пациент с онкологическим заболеванием, причем указанный способ включает
а. оценку того, является ли пациент с онкологическим заболеванием респондером на лечение антителом с помощью способа по любому из пп. 1-30 и
b. (i) лечение пациента с онкологическим заболеванием антителом, если пациент имеет сниженный риск отсутствия ответа на лечение антителом или (ii) отсутствие лечения пациента с онкологическим заболеванием антителом и/или лечение пациента с онкологическим заболеванием с использованием схемы лечения, которая включает лечение, которое отличается от лечения антителом, если пациент имеет повышенный риск того, что он не будет отвечать на лечение антителом.
32. Способ по п. 31, отличающийся тем, что схема лечения включает лечение, не зависящее от иммунной системы пациента.
33. Способ по п. 31 или 32, отличающийся тем, что схема лечения не включает лечение антителом, действующим посредством рекрутирования иммунной системы пациента для уничтожения опухолевых клеток.
34. Способ по любому из пп. 31-33, отличающийся тем, что схема лечения включает хирургическую операцию, химиотерапию и/или радиацию.
35. Способ по любому из пп. 31-34, отличающийся тем, что схема лечения включает лечение низкомолекулярным ингибитором опухолевого антигена и/или конъюгатом антитело-лекарственное средство, где антитело направлено против опухолевого антигена.
36. Способ по п. 35, отличающийся тем, что конъюгат антитело-лекарственное средство представляет собой антитело, связанное с радиоактивным, химиотерапевтическим или токсиновым компонентом.
37. Способ по п. 35 или 36, отличающийся тем, что конъюгат антитело-лекарственное средство представляет собой антитело, связанное с цитостатическим или цитотоксическим соединением.
38. Способ оценки клинического исхода для пациент с онкологическим заболеванием, причем указанный способ включает определение генотипа для одного или нескольких однонуклеотидных полиморфизмов, выбранных из группы, состоящей из FCGR2A rs1801274, MUC1 rs4072037, IL-10 rs1800896, DNMT3A rs1550117, SMAD4 rs12456284, EGF Rs4444903, CDH1 rs16260, ERCC1 rs11615 и FCGR3A rs396991 в образце, полученном от пациента.
39. Способ по п. 38, отличающийся тем, что присутствие гетерозиготного генотипа FCGR2A rs1801274 [CT] указывает на снижение риска неблагоприятного клинического исхода.
40. Способ по п. 38, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа FCGR2A rs1801274 [TT] и/или гомозиготного генотипа FCGR2A rs1801274 [CC] указывает на повышение риска неблагоприятного клинического исхода.
41. Способ по п. 38, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа MUC1 rs4072037 [AA] указывает на снижение риска неблагоприятного клинического исхода.
42. Способ по п. 38, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа MUC1 rs4072037 [GG] указывает на повышение риска неблагоприятного клинического исхода.
43. Способ по п. 38, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа IL-10 rs1800896 [GG] указывает на снижение риска неблагоприятного клинического исхода.
44. Способ по п. 38, отличающийся тем, что присутствие гетерозиготного генотипа DNMT3A rs1550117 [GA] указывает на снижение риска неблагоприятного клинического исхода.
45. Способ по п. 38, отличающийся тем, что присутствие гетерозиготного генотипа SMAD4 rs12456284 [GA] указывает на снижение риска неблагоприятного клинического исхода.
46. Способ по п. 38, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа EGF rs4444903 [AA] указывает на снижение риска неблагоприятного клинического исхода.
47. Способ по п. 38, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа CDH1 rs16260 [AA] указывает на снижение риска неблагоприятного клинического исхода.
48. Способ по п. 38, отличающийся тем, что присутствие гомозиготного генотипа ERCC1 rs11615 [TT] указывает на снижение риска неблагоприятного клинического исхода.
49. Способ по п. 38, отличающийся тем, что присутствие гетерозиготного генотипа FCGR3A rs396991 [TG] и/или гомозиготного генотипа FCGR3A rs396991 [TT] указывает на снижение риска неблагоприятного клинического исхода.
50. Способ по любому из пп. 38-49, отличающийся тем, что оценка клинического исхода для пациент с онкологическим заболеванием включает прогнозирование вероятности одного или нескольких из числа выживаемости, выживаемости без прогрессирования, выживаемости без рецидива, отсроченной безрецидивной выживаемости и стабильного заболевания.
51. Способ по любому из пп. 39-49, отличающийся тем, что неблагоприятный клинический исход включает относительное снижение одного или нескольких из выживаемости, выживаемости без прогрессирования, выживаемости без рецидива, отсроченной выживаемости без рецидива и стабильного заболевания.
52. Способ по любому из пп. 38-51, отличающийся тем, что пациент имеет антигенположительную опухоль и получает лечение антителом против опухолевого антигена.
53. Способ по любому из пп. 1-52, отличающийся тем, что образец представляет собой образец, содержащий ДНК.
54. Способ по п. 53, отличающийся тем, что ДНК экстрагирована из образца организма пациента.
55. Способ по п. 53 или 54, отличающийся тем, что ДНК была экстрагирована из крови.
56. Способ по любому из пп. 1-55, отличающийся тем, что опухоль представляет собой солидную опухоль.
57. Способ по любому из пп. 1-56, отличающийся тем, что опухоль представляет собой гастроэзофагеальную опухоль.
58. Способ по любому из пп. 1-57, отличающийся тем, что опухоль представляет собой прогрессирующую аденокарциному желудка или нижнего пищевода.
59. Способ по любому из пп. 1-58, отличающийся тем, что злокачественное новообразование представляет собой гастроэзофагеальный рак.
60. Способ по любому из пп. 1-59, отличающийся тем, что злокачественное новообразование представляет собой прогрессирующую аденокарциному желудка или нижнего пищевода.
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EPPCT/EP2015/058212 | 2015-04-15 |
Related Parent Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2017139489A Division RU2785291C2 (ru) | 2015-04-15 | 2016-04-13 | Способы и композиции для прогнозирования терапевтической эффективности лечения онкологических заболеваний и прогноза онкологических заболеваний |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2022131159A true RU2022131159A (ru) | 2022-12-08 |
Family
ID=
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP7325463B2 (ja) | がんの予後診断及び治療のための方法及び組成物 | |
| US20240011098A1 (en) | Diagnostic and therapeutic methods for cancer | |
| US20220340653A1 (en) | Methods for treatment of cancer comprising tigit-binding agents | |
| JP2022023226A5 (ru) | ||
| US11873486B2 (en) | Modulating dsRNA editing, sensing, and metabolism to increase tumor immunity and improve the efficacy of cancer immunotherapy and/or modulators of intratumoral interferon | |
| JP2021524744A (ja) | 分子遺伝子シグネチャーとその使用方法 | |
| US20230279112A1 (en) | Methods of treating cancer using antibodies and molecules that bind to btn1a1 or btn1a1-ligands | |
| WO2019178217A1 (en) | Methods and compositions for treating, diagnosing, and prognosing cancer | |
| US11278629B2 (en) | Methods for improving anti-CD37 immunoconjugate therapy | |
| WO2018222685A1 (en) | Methods of treating cancer using antibodies and molecules that immunospecifically bind to btn1a1 | |
| US20160274115A1 (en) | Novel method to detect resistance to chemotherapy in patients with lung cancer | |
| EP2558114A2 (en) | Cancer methods | |
| RU2677656C2 (ru) | Способ прогнозирования терапевтического эффекта для пациента с колоректальным раком, у которого повышена экспрессия белка tk1 | |
| EP2334826A2 (en) | Method of detection and diagnosis of oral and nasopharyngeal cancers | |
| RU2022131159A (ru) | Способы и композиции для прогнозирования терапевтической эффективности лечения онкологических заболеваний и прогноза онкологических заболеваний | |
| RU2017139489A (ru) | Способы и композиции для прогнозирования терапевтической эффективности лечения онкологических заболеваний и прогноза онкологических заболеваний | |
| WO2023091990A1 (en) | Compositions and methods targeting gaba signaling pathway for solid tumor cancer treatment | |
| US20220003770A1 (en) | Classification and Treatment of Gastric Cancer | |
| US20210340628A1 (en) | Sensitivity marker for antibody-drug conjugate | |
| WO2023033178A1 (ja) | 癌についての情報を提供する方法、癌についての情報を提供するシステム及び癌を治療する方法 | |
| WO2024124108A1 (en) | Methods of treating aml by identifying and targeting a myeloid/lymphoid leukemia stem cell |