RU2020142080A - Присоединение полимеразы к проводящему каналу - Google Patents
Присоединение полимеразы к проводящему каналу Download PDFInfo
- Publication number
- RU2020142080A RU2020142080A RU2020142080A RU2020142080A RU2020142080A RU 2020142080 A RU2020142080 A RU 2020142080A RU 2020142080 A RU2020142080 A RU 2020142080A RU 2020142080 A RU2020142080 A RU 2020142080A RU 2020142080 A RU2020142080 A RU 2020142080A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- nickel
- nitrilotriacetic acid
- channel
- paragraphs
- polymerase
- Prior art date
Links
- ZTDCFXVUXBPHCE-UHFFFAOYSA-L 2-[bis(carboxylatomethyl)amino]acetate;hydron;nickel(3+) Chemical compound [H+].[Ni+3].[O-]C(=O)CN(CC([O-])=O)CC([O-])=O ZTDCFXVUXBPHCE-UHFFFAOYSA-L 0.000 claims 10
- FMYBFLOWKQRBST-UHFFFAOYSA-N 2-[bis(carboxymethyl)amino]acetic acid;nickel Chemical group [Ni].OC(=O)CN(CC(O)=O)CC(O)=O FMYBFLOWKQRBST-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 9
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims 9
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims 9
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims 4
- PXHVJJICTQNCMI-UHFFFAOYSA-N nickel Chemical compound [Ni] PXHVJJICTQNCMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- MGFYIUFZLHCRTH-UHFFFAOYSA-N nitrilotriacetic acid Chemical group OC(=O)CN(CC(O)=O)CC(O)=O MGFYIUFZLHCRTH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 4
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims 4
- 229920000023 polynucleotide Polymers 0.000 claims 4
- 239000007787 solid Substances 0.000 claims 4
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 claims 3
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 claims 3
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 claims 3
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N Imidazole Chemical compound C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 238000003780 insertion Methods 0.000 claims 2
- 229910052759 nickel Inorganic materials 0.000 claims 2
- 230000037361 pathway Effects 0.000 claims 2
- 230000000295 complement Effects 0.000 claims 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N edta Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 238000010828 elution Methods 0.000 claims 1
Claims (37)
1. Устройство для обнаружения в реальном времени нуклеотидов, содержащее:
проводящий канал и число молекул полимеразы, присоединенных к упомянутому проводящему каналу, причем это число составляет от одной до пяти, а проводящий канал предназначен обнаруживать встраивание содержащего зарядовую метку нуклеотида в образующийся полинуклеотид посредством полимеразы, и
каждая из упомянутых одной или более молекул полимеразы содержит гистидиновую метку, проводящий канал содержит комплекс никеля-нитрилотриуксусной кислоты, и гистидиновая метка связана с комплексом никеля-нитрилотриуксусной кислоты.
2. Устройство по п. 1, при этом число молекул полимеразы, присоединенных к упомянутому проводящему каналу, составляет менее пяти.
3. Устройство по п. 1, при этом число молекул полимеразы, присоединенных к упомянутому проводящему каналу, составляет менее четырех.
4. Устройство по п. 1, при этом число молекул полимеразы, присоединенных к упомянутому проводящему каналу, составляет менее трех.
5. Устройство по п. 1, при этом число молекул полимеразы, присоединенных к упомянутому проводящему каналу, равно одной.
6. Устройство по любому из пп. 1-5, при этом комплекс никеля-нитрилотриуксусной кислоты содержит девять групп никеля-нитрилотриуксусной кислоты.
7. Устройство по любому из пп. 1-6, при этом проводящий канал содержит нанонить, имеющую диаметр между примерно 10 нм и примерно 100 нм и длину между примерно 50 нм и примерно 300 нм.
8. Устройство по п. 7, при этом нанонить имеет диаметр примерно 30 нм и длину между примерно 100 нм и примерно 150 нм.
9. Устройство по любому из пп. 1-8, при этом поверхность проводящего канала дополнительно содержит множество фрагментов полиэтиленгликоля, непосредственно не связанных с комплексом групп нитрилотриуксусной кислоты.
10. Способ обнаружения встраивания нуклеотида в образующуюся нуклеотидную цепь, содержащий:
присоединение от одного до пяти комплексов никеля-нитрилотриуксусной кислоты к проводящему каналу и присоединение содержащей гистидиновую метку полимеразы к одному или более из комплексов никеля-нитрилотриуксусной кислоты, при этом
проводящий канал предназначен обнаруживать встраивание содержащего зарядовую метку нуклеотида в образующийся полинуклеотид посредством полимеразы.
11. Способ по п. 10, содержащий присоединение менее пяти комплексов никеля-нитрилотриуксусной кислоты к проводящему каналу.
12. Способ по п. 10, содержащий присоединение менее четырех комплексов никеля-нитрилотриуксусной кислоты к проводящему каналу.
13. Способ по п. 10, содержащий присоединение менее трех комплексов никеля-нитрилотриуксусной кислоты к проводящему каналу.
14. Способ по п. 10, содержащий присоединение одного комплекса никеля-нитрилотриуксусной кислоты к проводящему каналу.
15. Способ по любому из пп. 10-14, при этом комплекс никеля-нитрилотриуксусной кислоты содержит девять групп никеля-нитрилотриуксусной кислоты.
16. Способ по любому из пп. 10-15, при этом проводящий канал содержит нанонить, имеющую диаметр между примерно 10 нм и примерно 100 нм и длину между примерно 50 нм и примерно 300 нм.
17. Способ по п. 16, при этом нанонить имеет диаметр примерно 30 нм и длину между примерно 100 нм и примерно 150 нм.
18. Способ по любому из пп. 10-17, при этом поверхность проводящего канала дополнительно содержит множество фрагментов полиэтиленгликоля, непосредственно не связанных с комплексом групп нитрилотриуксусной кислоты.
19. Способ по любому из пп. 10-18, дополнительно содержащий элюирование полимеразы из упомянутых от одного до пяти комплексов никеля-нитрилотриуксусной кислоты, при этом элюирование содержит хелатирование никеля этилендиаминтетрауксусной кислотой или имидазолом.
20. Способ по любому из пп. 10-19, дополнительно содержащий повторную загрузку фрагментов нитрилотриуксусной кислоты никелем с повторным образованием комплексов никеля-нитрилотриуксусной кислоты и связывание полимеразы с повторно образовавшимися комплексами никеля-нитрилотриуксусной кислоты.
21. Способ обнаружения встраивания нуклеотида в образующуюся нуклеотидную цепь, содержащий:
обнаружение встраивания, с использованием некоторого числа полимераз, одного или более нуклеотидов в одну или более образующихся полинуклеотидных цепей, комплементарных одной или более матричным полинуклеотидным цепям, при этом
от одной до пяти полимераз присоединены к проводящему каналу,
один или более из упомянутых одного или более нуклеотидов содержит зарядовую метку, и проводящий канал предназначен обнаруживать зарядовую метку во время встраивания, при этом
каждая из упомянутых полимераз содержит гистидиновую метку, проводящий канал содержит комплекс никеля-нитрилотриуксусной кислоты, и гистидиновая метка связана с комплексом никеля-нитрилотриуксусной кислоты.
22. Способ по п. 21, при этом число молекул полимеразы, присоединенных к упомянутому твердому поддерживающему проводящему каналу, составляет менее пяти.
23. Способ по п. 21, при этом число молекул полимеразы, присоединенных к упомянутому твердому поддерживающему проводящему каналу, составляет менее четырех.
24. Способ по п. 21, при этом число молекул полимеразы, присоединенных к упомянутому твердому поддерживающему проводящему каналу, составляет менее трех.
25. Способ по п. 21, при этом число молекул полимеразы, присоединенных к упомянутому твердому поддерживающему проводящему каналу, равно одной.
26. Способ по любому из пп. 21-25, при этом комплекс никеля-нитрилотриуксусной кислоты содержит девять групп никеля-нитрилотриуксусной кислоты.
27. Способ по любому из пп. 21-26, при этом проводящий канал содержит нанонить, имеющую диаметр между примерно 10 нм и примерно 100 нм и длину между примерно 50 нм и примерно 300 нм.
28. Способ по п. 27, при этом нанонить имеет диаметр примерно 30 нм и длину между примерно 100 нм и примерно 150 нм.
29. Способ по любому из пп. 21-28, при этом поверхность проводящего канала дополнительно содержит множество фрагментов полиэтиленгликоля, непосредственно не связанных с комплексом групп нитрилотриуксусной кислоты.
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US62/862,767 | 2019-06-18 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2020142080A true RU2020142080A (ru) | 2022-06-22 |
| RU2781299C2 RU2781299C2 (ru) | 2022-10-11 |
Family
ID=
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN103937896A (zh) | 一种snp分型方法及试剂盒 | |
| WO2016205233A3 (en) | Integrated purification and measurement of dna methylation and co-measurement of mutations and/or mrna expression levels in an automated reaction cartridge | |
| RU2017101174A (ru) | Набор или устройство для обнаружения рака печени и способ обнаружения | |
| JP2017520251A5 (ru) | ||
| RU2019138705A (ru) | Транспозиция с сохранением сцепления генов | |
| WO2014152397A3 (en) | Selective purification of rna and rna-bound molecular complexes | |
| CN108034659B (zh) | 一种ssDNA核酸适配体及其的溶藻弧菌快速检测中的应用 | |
| RU2017101353A (ru) | Набор или устройство для обнаружения рака пищевода и способ обнаружения | |
| JP2012198225A5 (ru) | ||
| DK1649051T3 (da) | Bestemmelse af sekvensen for et polynukleotid | |
| RU2020142080A (ru) | Присоединение полимеразы к проводящему каналу | |
| Zhang et al. | Archaeal chromatin proteins Cren7 and Sul7d compact DNA by bending and bridging | |
| CN106434630B (zh) | 牛副流感病毒3型hn蛋白核酸适配体及其筛选方法 | |
| Kim et al. | Mechanisms of Theta plasmid replication in Enterobacteria and implications for adaptation to its host | |
| JP2014507155A5 (ru) | ||
| EA201491064A1 (ru) | Зонд на основе нуклеиновой кислоты, способ конструирования зонда на основе нуклеиновой кислоты и способ обнаружения последовательности-мишени | |
| CA2955087C (en) | Method for identifying high-affinity complexes of two ligands and a receptor using a self-assemblying chemical library of ligands | |
| Chu et al. | Cyclic Multiple Primer Generation Rolling Circle Amplification Assisted Capillary Electrophoresis for Simultaneous and Ultrasensitive Detection of Multiple Pathogenic Bacteria | |
| DE502004008376D1 (de) | Verfahren zum Nachweis von Nukleinsäuren | |
| Lee et al. | Origin of DNA replication at the human lamin B2 locus: OBR or ABR? | |
| CN103305503B (zh) | 一种用于高通量测序的索引序列组 | |
| JP2015500017A5 (ru) | ||
| CN204977185U (zh) | 一种光纤阵列uv固化的定位装置 | |
| Stern | Chromatography of synthetic polyribonucleotides on columns of benzoylated diethylaminoethylcellulose | |
| WO2013003849A4 (en) | Process and apparatus for quantifying nucleic acid in a sample |