RU2020135985A - Принадлежность к сообществу на основе совокупности идентичности аллелей и происхождения аллеля - Google Patents
Принадлежность к сообществу на основе совокупности идентичности аллелей и происхождения аллеля Download PDFInfo
- Publication number
- RU2020135985A RU2020135985A RU2020135985A RU2020135985A RU2020135985A RU 2020135985 A RU2020135985 A RU 2020135985A RU 2020135985 A RU2020135985 A RU 2020135985A RU 2020135985 A RU2020135985 A RU 2020135985A RU 2020135985 A RU2020135985 A RU 2020135985A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- carriers
- variant
- individuals
- community
- haplotypes
- Prior art date
Links
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B10/00—ICT specially adapted for evolutionary bioinformatics, e.g. phylogenetic tree construction or analysis
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06N—COMPUTING ARRANGEMENTS BASED ON SPECIFIC COMPUTATIONAL MODELS
- G06N20/00—Machine learning
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
- G16B20/20—Allele or variant detection, e.g. single nucleotide polymorphism [SNP] detection
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
- G16B20/40—Population genetics; Linkage disequilibrium
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B30/00—ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
- G16B30/10—Sequence alignment; Homology search
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B40/00—ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B40/00—ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
- G16B40/20—Supervised data analysis
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B40/00—ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
- G16B40/30—Unsupervised data analysis
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A90/00—Technologies having an indirect contribution to adaptation to climate change
- Y02A90/10—Information and communication technologies [ICT] supporting adaptation to climate change, e.g. for weather forecasting or climate simulation
Landscapes
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Evolutionary Biology (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Data Mining & Analysis (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Software Systems (AREA)
- Evolutionary Computation (AREA)
- Artificial Intelligence (AREA)
- Computer Vision & Pattern Recognition (AREA)
- Physiology (AREA)
- Bioethics (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Databases & Information Systems (AREA)
- Public Health (AREA)
- Ecology (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Computing Systems (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Mathematical Physics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Information Retrieval, Db Structures And Fs Structures Therefor (AREA)
- Management, Administration, Business Operations System, And Electronic Commerce (AREA)
- Machine Translation (AREA)
Claims (70)
1. Компьютеризированный способ, включающий:
получение запроса на создание отчета о целевом наборе одного или более вариантов пользователя, пользующегося компьютерной системой;
идентификацию группы из одного или более носителей, которые являются несущими один или более вариантов, указанных в целевом наборе;
доступ к набору данных ДНК-носителей;
доступ к набору данных ДНК дополнительных индивидуумов, которые имеют общую идентичность по происхождению (IBD), по меньшей мере, с одним из носителей в генетическом локусе, который включает один или более вариантов, указанных в целевом наборе;
доступ к генеалогическим данным носителей и дополнительных индивидуумов; и
получение результата, обобщающего характеристику одного или более вариантов на основе связи между одним или более вариантами и генеалогическими данными носителей и дополнительных индивидуумов.
2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что получение результата включает:
осуществление накопительного анализа генеалогических данных носителей и дополнительных индивидуумов для определения набора расширенных мест рождения;
определение одного или более местоположений в наборе дополненных мест рождения, которые связаны с происхождением одного или более вариантов; и
определение распределения одного или более вариантов по результатам накопительного анализа.
3. Способ по п. 1, отличающийся тем, что получение результата включает:
построение карты, показывающей характеристику одного или более вариантов в различных географических местоположениях, характеристику одного или более вариантов, включая одну или более из историй вариантов, происхождения варианта, схемы миграции варианта или текущего распределения варианта.
4. Способ по п. 1, отличающийся тем, что характеристика одного или более вариантов отображается на карте вариантов географических местоположений с указанием характеристики одного или более вариантов в различных географических местоположениях.
5. Способ по п. 1, отличающийся тем, что карта различных географических местоположений связана с разными промежутками времени, указывающими один или более из: промежуток времени, связанный с историей варианта, промежуток времени, связанный с происхождением варианта, промежуток времени, связанный со схемой миграции варианта или промежуток времени, связанный с текущим распределением варианта.
6. Способ по п. 1, отличающийся тем, что характеристика одного или более вариантов дополнительно включает:
осуществление накопительного анализа на генеалогических данных кластера для определения одной или более дополненных местоположений, связанных с одним или более вариантами.
7. Способ по п. 1, отличающийся тем, что получение результата, обобщающего характеристику одного или более вариантов, дополнительно содержит:
осуществление накопительного анализа генеалогических данных в разные промежутки времени для определения набора дополненных местоположений в течение определенного промежутка времени.
8. Способ по п. 1, дополнительно включающий:
получение второго запроса на характеристику другого варианта;
в ответ на получение второго запроса:
определение второй группы одного или более носителей, которые считаются носителями другого варианта;
доступ к наборам данных ДНК второй группы одного или более носителей;
доступ к наборам данных ДНК индивидуумов, которые имеют общую идентификацию по происхождению (IBD), по меньшей мере, с одним из носителей второй группы одного или более носителей в генетическом локусе, который включает другой вариант;
доступ к генеалогическим данным второй группы одного или более носителей и индивидуумов; и
обеспечение изображения отчета, обобщающего характеристики другого варианта, характеристики на основе генеалогических данных одного или более носителей и индивидуумов второй группы.
9. Способ по п. 1, дополнительно включающий:
определение аналитической достоверности анализа для варианта в целевом наборе одного или более вариантов с помощью:
определения того, что наборы данных ДНК-носителей и дополнительных индивидуумов имеют общую IBD друг с другом в генетических локусах варианта; и
определения того, что наборы данных ДНК-носителей и дополнительных индивидуумов не имеют общую IBD с индивидуумами, которые не являются носителями варианта в генетическом локусе варианта.
10. Компьютеризированный способ, включающий:
получения запроса на характеристику целевого варианта лица, пользующегося компьютерной системой;
доступ к наборам данных ДНК группы из одного или более носителей, которые являются носителями целевого варианта;
создание кластера, содержащего группу из одного или более носителей и дополнительных индивидуумов, которые имеют общую идентичность аллелей (IBD), по меньшей мере, одного носителя в группе из одного или более носителей, кластер, созданный на основе IBD сродства между носителями и дополнительными индивидуумами;
доступ к генеалогическим данным кластера;
выполнение накопительного анализа на генеалогических данных; и
обеспечение отображения характеристики целевого варианта, характеристика основана на результате накопительного анализа.
11. Способ по п. 10, отличающийся тем, что целевой вариант подлежит критерию отбора, критерий отбора включает по меньшей мере один из: частота аллелей в различных популяциях, соответствующая литература; известная функция, давление отбора или аутосомное или сцепленное с полом наследование.
12. Способ по п. 10, отличающийся тем, что дополнительные индивидуумы имеют общую IBD, по меньшей мере, с одним носителем в группе из одного или более носителей в генетическом локусе целевого варианта.
13. Способ по п. 10, отличающийся тем, что обеспечение отображения характеристики целевого варианта дополнительно включает:
создание карты различных географических местоположений, обобщающей характеристики целевого варианта в различных географических местоположениях.
14. Способ по п. 13, где карта различных географических местоположений связана с различными промежутками времени, указывающая один или более из: промежуток времени, связанный с историей целевого варианта, промежуток времени, связанный с происхождением целевого варианта, промежуток времени, связанный со схемой миграции целевого варианта или промежуток времени, связанный с текущим распределением целевого варианта.
15. Способ, включающий:
получение набора данных ДНК индивидуума;
определение генотипов индивидуума на основе набора данных ДНК;
поэтапное распределение генотипов для создания гаплотипов индивидуума;
выбор подмножества гаплотипов индивидуума;
ввод подмножества гаплотипов индивидуума в модель, модель подготовлена на основе обучающих образцов, каждый обучающий образец содержит группу гаплотипов референсных индивидуумов и метку, определяющую принадлежит ли референсный индивидуум к сообществу, референсные индивидуумы, принадлежащие к сообществу, имеют группу гаплотипов, характерных сообществу; и
определение того, является ли индивидуум членом сообщества на основе выходных данных модели.
16. Способ по п. 15, отличающийся тем, что модель подготовлена с помощью:
поэтапного распределения генотипов референсных индивидуумов;
определение общих гаплотипов в каждом окне генотипов;
выполнение накопительного анализа на общих гаплотипах для определения набора дополненных гаплотипов;
создание вектора признаков для каждого референсного индивидуума, вектор признаков имеет набор двоичных элементов, каждый связан с дополненным гаплотипом, значение каждого двоичного элемента указывает имеет ли референсный индивидуум дополненный гаплотип;
создание кадра данных, которые включают референсные индивидуумы с их вектором признаков и меткой, указывающей принадлежит ли референсный индивидуум к сообществу;
применение модели к кадру данных, дополненные гаплотипы являются признаками модели; и
коррекция параметров модели в зависимости от производительности модели.
17. Способ по п. 15, отличающийся тем, что по меньшей мере позитивный обучающий образец из обучающих образцов создается с помощью:
поэтапное распределение наборов данных ДНК одного из референсных индивидуумов, принадлежащих к сообществу для создания гаплотипов референсных индивидуумов;
выполнение накопительного анализа на гаплотипах по отношению к сообществу; и
определение одной или более групп гаплотипов из референсного индивидуума, который представляет сообщество;
извлечение одной или более групп гаплотипов в качестве позитивного обучающего образца;
связывание позитивного обучающего образца с позитивной меткой, так чтобы референсный индивидуум относится к сообществу.
18. Способ по п. 17, отличающийся тем, что по меньшей мере негативный обучающий образец из обучающих образцов создается с помощью:
выбор набора данных ДНК второго референсного индивидуума, который, как известно, не принадлежит сообществу;
извлечение одной или более групп гаплотипов в качестве негативного обучающего образца, причем извлеченные одна или более групп гаплотипов находятся в одних и тех же генетических локусах одной или более групп гаплотипов одного из референсных индивидуумов, принадлежащих сообществу; и
связывание негативного обучающего образца с негативной меткой, так чтобы второй референсный индивидуум не принадлежит к сообществу.
19. Способ по п. 15, отличающийся тем, что референсные гаплотипы идентифицируют с применением накопительного анализа для определения того, какие гаплотипы с большей вероятностью будут наблюдаться в сообществе.
20. Способ по п. 15, отличающийся тем, что модель представляет собой нелинейный классификатор, выбранный из группы, состоящей из оператора опорных векторов, одной или более деревьев решений или нейросети.
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201862653420P | 2018-04-05 | 2018-04-05 | |
US201862653416P | 2018-04-05 | 2018-04-05 | |
US62/653,416 | 2018-04-05 | ||
US62/653,420 | 2018-04-05 | ||
PCT/IB2019/052788 WO2019193551A1 (en) | 2018-04-05 | 2019-04-04 | Community assignments in identity by descent networks and genetic variant origination |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2020135985A true RU2020135985A (ru) | 2022-05-05 |
Family
ID=68101335
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2020135985A RU2020135985A (ru) | 2018-04-05 | 2019-04-04 | Принадлежность к сообществу на основе совокупности идентичности аллелей и происхождения аллеля |
Country Status (12)
Country | Link |
---|---|
US (3) | US11238957B2 (ru) |
EP (1) | EP3776556A4 (ru) |
JP (1) | JP2021521511A (ru) |
CN (1) | CN112154508A (ru) |
AU (1) | AU2019248875A1 (ru) |
BR (1) | BR112020020430A2 (ru) |
CA (1) | CA3095996A1 (ru) |
IL (1) | IL277776A (ru) |
MX (1) | MX2020010414A (ru) |
NZ (1) | NZ769586A (ru) |
RU (1) | RU2020135985A (ru) |
WO (1) | WO2019193551A1 (ru) |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US12086914B2 (en) * | 2021-11-24 | 2024-09-10 | Ancestry.Com Dna, Llc | Graphical user interface for presenting geographic boundary estimation |
Family Cites Families (58)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4201386A (en) | 1978-02-13 | 1980-05-06 | Triad Associates | Genealogy apparatus |
IS1355B6 (is) | 1984-11-12 | 1989-04-19 | Lister Institute Of Preventive Medicine | Fjölkjarna kannar |
US5115504A (en) | 1988-11-01 | 1992-05-19 | Lotus Development Corporation | Information management system |
US5246374A (en) | 1992-05-19 | 1993-09-21 | Alma Boodram | Expandable family tree and modular kit for building the same |
US5978811A (en) | 1992-07-29 | 1999-11-02 | Texas Instruments Incorporated | Information repository system and method for modeling data |
US5467471A (en) | 1993-03-10 | 1995-11-14 | Bader; David A. | Maintaining databases by means of hierarchical genealogical table |
US6277567B1 (en) | 1997-02-18 | 2001-08-21 | Fitolink Corporation | Methods for the construction of genealogical trees using Y chromosome polymorphisms |
US6105147A (en) | 1997-04-16 | 2000-08-15 | Compaq Computer Corporation | Using process pairs as transaction-coordinated resource managers |
US6049803A (en) | 1997-08-29 | 2000-04-11 | Advanced Micro Devices, Inc. | Documenting system for entities, attributes and schema of a relational database |
US6528260B1 (en) | 1999-03-25 | 2003-03-04 | Genset, S.A. | Biallelic markers related to genes involved in drug metabolism |
US6633819B2 (en) | 1999-04-15 | 2003-10-14 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Gene discovery through comparisons of networks of structural and functional relationships among known genes and proteins |
US20030195707A1 (en) | 2000-05-25 | 2003-10-16 | Schork Nicholas J | Methods of dna marker-based genetic analysis using estimated haplotype frequencies and uses thereof |
US6570567B1 (en) | 2000-05-31 | 2003-05-27 | Alan Eaton | System and method for using a graphical interface for the presentation of genealogical information |
US6961731B2 (en) | 2000-11-15 | 2005-11-01 | Kooltorch, L.L.C. | Apparatus and method for organizing and/or presenting data |
US20030113727A1 (en) | 2000-12-06 | 2003-06-19 | Girn Kanwaljit Singh | Family history based genetic screening method and apparatus |
US7957907B2 (en) | 2001-03-30 | 2011-06-07 | Sorenson Molecular Genealogy Foundation | Method for molecular genealogical research |
US20020143578A1 (en) | 2001-04-02 | 2002-10-03 | Cole Louis Scott | Interactives system and method for recording and assessing a person's inherited risk for a range of diseases |
US6909971B2 (en) | 2001-06-08 | 2005-06-21 | Licentia Oy | Method for gene mapping from chromosome and phenotype data |
US6886015B2 (en) | 2001-07-03 | 2005-04-26 | Eastman Kodak Company | Method and system for building a family tree |
US20030113756A1 (en) | 2001-07-18 | 2003-06-19 | Lawrence Mertz | Methods of providing customized gene annotation reports |
US8438042B2 (en) | 2002-04-25 | 2013-05-07 | National Biomedical Research Foundation | Instruments and methods for obtaining informed consent to genetic tests |
US20080154566A1 (en) | 2006-10-02 | 2008-06-26 | Sorenson Molecular Genealogy Foundation | Method and system for displaying genetic and genealogical data |
US8855935B2 (en) | 2006-10-02 | 2014-10-07 | Ancestry.Com Dna, Llc | Method and system for displaying genetic and genealogical data |
US20040229231A1 (en) | 2002-05-28 | 2004-11-18 | Frudakis Tony N. | Compositions and methods for inferring ancestry |
US20070037182A1 (en) | 2002-05-28 | 2007-02-15 | Gaskin James Z | Multiplex assays for inferring ancestry |
AU2003293132A1 (en) | 2002-11-27 | 2004-06-23 | Sra International, Inc. | Integration of gene expression data and non-gene data |
US20040122705A1 (en) | 2002-12-18 | 2004-06-24 | Sabol John M. | Multilevel integrated medical knowledge base system and method |
US20040243531A1 (en) | 2003-04-28 | 2004-12-02 | Dean Michael Anthony | Methods and systems for representing, using and displaying time-varying information on the Semantic Web |
US7249129B2 (en) | 2003-12-29 | 2007-07-24 | The Generations Network, Inc. | Correlating genealogy records systems and methods |
US20050147947A1 (en) | 2003-12-29 | 2005-07-07 | Myfamily.Com, Inc. | Genealogical investigation and documentation systems and methods |
US20060136143A1 (en) | 2004-12-17 | 2006-06-22 | General Electric Company | Personalized genetic-based analysis of medical conditions |
US8285486B2 (en) | 2006-01-18 | 2012-10-09 | Dna Tribes Llc | Methods of determining relative genetic likelihoods of an individual matching a population |
US8700334B2 (en) | 2006-07-31 | 2014-04-15 | International Business Machines Corporation | Methods and systems for reconstructing genomic common ancestors |
US8661048B2 (en) | 2007-03-05 | 2014-02-25 | DNA: SI Labs, Inc. | Crime investigation tool and method utilizing DNA evidence |
US7844609B2 (en) | 2007-03-16 | 2010-11-30 | Expanse Networks, Inc. | Attribute combination discovery |
US8510057B1 (en) | 2007-10-15 | 2013-08-13 | 23Andme, Inc. | Summarizing an aggregate contribution to a characteristic for an individual |
EP2227780A4 (en) | 2008-03-19 | 2011-08-03 | Existence Genetics Llc | GENETIC ANALYSIS |
CN102067140B (zh) | 2008-06-20 | 2014-12-24 | 皇家飞利浦电子股份有限公司 | 用于系谱分析的系统、方法和计算机程序产品 |
EP2370929A4 (en) * | 2008-12-31 | 2016-11-23 | 23Andme Inc | LOOKING FOR PARENTS IN A DATABASE |
US8413188B2 (en) | 2009-02-20 | 2013-04-02 | At&T Intellectual Property I, Lp | System and method for processing image objects in video data |
US8224821B2 (en) | 2009-07-28 | 2012-07-17 | Ancestry.Com Operations Inc. | Systems and methods for the organized distribution of related data |
WO2011025400A1 (en) | 2009-08-30 | 2011-03-03 | Cezary Dubnicki | Structured analysis and organization of documents online and related methods |
US8185557B2 (en) | 2010-01-27 | 2012-05-22 | Ancestry.Com Operations Inc. | Positioning of non-constrained amount of data in semblance of a tree |
US8786603B2 (en) | 2011-02-25 | 2014-07-22 | Ancestry.Com Operations Inc. | Ancestor-to-ancestor relationship linking methods and systems |
US20130297221A1 (en) | 2011-06-01 | 2013-11-07 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Method and System for Accurate Construction Of Long Range Haplotype |
US10025877B2 (en) | 2012-06-06 | 2018-07-17 | 23Andme, Inc. | Determining family connections of individuals in a database |
US9116882B1 (en) | 2012-08-02 | 2015-08-25 | 23Andme, Inc. | Identification of matrilineal or patrilineal relatives |
US20140067355A1 (en) | 2012-09-06 | 2014-03-06 | Ancestry.Com Dna, Llc | Using Haplotypes to Infer Ancestral Origins for Recently Admixed Individuals |
US20140108527A1 (en) | 2012-10-17 | 2014-04-17 | Fabric Media, Inc. | Social genetics network for providing personal and business services |
US9836576B1 (en) | 2012-11-08 | 2017-12-05 | 23Andme, Inc. | Phasing of unphased genotype data |
US9213947B1 (en) | 2012-11-08 | 2015-12-15 | 23Andme, Inc. | Scalable pipeline for local ancestry inference |
NZ629509A (en) | 2013-03-15 | 2017-04-28 | Ancestry Com Dna Llc | Family networks |
CN104862380B (zh) * | 2014-02-25 | 2018-04-13 | 绍兴市柯桥区基石生物科技有限公司 | 家族特异性遗传病关联等位基因单体型变异标签确认方法 |
MX2017004978A (es) * | 2014-10-17 | 2017-09-13 | Ancestry Com Dna Llc | Modelos de formacion de fases de haplotipo. |
US10867705B2 (en) | 2014-11-06 | 2020-12-15 | Ancestryhealth.Com, Llc | Predicting health outcomes |
US11232854B2 (en) | 2015-05-30 | 2022-01-25 | Ancestry.Com Dna, Llc | Characterizing heterogeneity with fine-scale population structure |
NZ737553A (ru) * | 2015-05-30 | 2017-11-24 | ||
US10957422B2 (en) * | 2015-07-07 | 2021-03-23 | Ancestry.Com Dna, Llc | Genetic and genealogical analysis for identification of birth location and surname information |
-
2019
- 2019-04-04 US US17/044,223 patent/US11238957B2/en active Active
- 2019-04-04 BR BR112020020430-7A patent/BR112020020430A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2019-04-04 EP EP19782160.6A patent/EP3776556A4/en active Pending
- 2019-04-04 CA CA3095996A patent/CA3095996A1/en active Pending
- 2019-04-04 CN CN201980033508.2A patent/CN112154508A/zh active Pending
- 2019-04-04 JP JP2020554497A patent/JP2021521511A/ja active Pending
- 2019-04-04 MX MX2020010414A patent/MX2020010414A/es unknown
- 2019-04-04 AU AU2019248875A patent/AU2019248875A1/en active Pending
- 2019-04-04 NZ NZ76958619A patent/NZ769586A/xx unknown
- 2019-04-04 WO PCT/IB2019/052788 patent/WO2019193551A1/en active Application Filing
- 2019-04-04 RU RU2020135985A patent/RU2020135985A/ru unknown
-
2020
- 2020-10-04 IL IL277776A patent/IL277776A/en unknown
-
2021
- 2021-11-19 US US17/531,438 patent/US11984196B2/en active Active
-
2024
- 2024-04-22 US US18/642,769 patent/US20240274229A1/en active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20240274229A1 (en) | 2024-08-15 |
WO2019193551A1 (en) | 2019-10-10 |
BR112020020430A2 (pt) | 2021-03-30 |
US20210057041A1 (en) | 2021-02-25 |
NZ769586A (en) | 2020-11-27 |
CN112154508A (zh) | 2020-12-29 |
EP3776556A4 (en) | 2021-12-15 |
MX2020010414A (es) | 2020-10-28 |
US20220076782A1 (en) | 2022-03-10 |
AU2019248875A1 (en) | 2020-11-26 |
IL277776A (en) | 2020-11-30 |
US11984196B2 (en) | 2024-05-14 |
US11238957B2 (en) | 2022-02-01 |
JP2021521511A (ja) | 2021-08-26 |
EP3776556A1 (en) | 2021-02-17 |
CA3095996A1 (en) | 2019-10-10 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US20230102326A1 (en) | Discovering population structure from patterns of identity-by-descent | |
Martin et al. | Natural selection and genetic diversity in the butterfly Heliconius melpomene | |
Donnelly et al. | Evidence for recent population expansion in the evolutionary history of the malaria vectors Anopheles arabiensis and Anopheles gambiae | |
Wall | Detecting ancient admixture in humans using sequence polymorphism data | |
Lirón et al. | Genetic characterization of Argentine and Bolivian Creole cattle breeds assessed through microsatellites | |
CN111524545B (zh) | 全基因组选择育种的方法和装置 | |
OROZCO‐terWENGEL et al. | Genealogical lineage sorting leads to significant, but incorrect Bayesian multilocus inference of population structure | |
Endler et al. | Reconciling differences in pool-GWAS between populations: a case study of female abdominal pigmentation in Drosophila melanogaster | |
US20240274229A1 (en) | Community Assignments in Identity by Descent Networks and Genetic Variant Origination | |
Derbyshire et al. | A whole genome scan of SNP data suggests a lack of abundant hard selective sweeps in the genome of the broad host range plant pathogenic fungus Sclerotinia sclerotiorum | |
KR20190019395A (ko) | 유전자 정보에 기초하여 서비스를 제공하기 위한 방법, 시스템 및 비일시성의 컴퓨터 판독 가능 기록 매체 | |
Moran et al. | Opposing patterns of intraspecific and interspecific differentiation in sex chromosomes and autosomes | |
Brunelli et al. | Y chromosomal evidence on the origin of northern Thai people | |
Bonavita et al. | The first SSR-based assessment of genetic variation and structure among Pinus laricio Poiret populations within their native area | |
Vázquez et al. | BDBM 1.0: a desktop application for efficient retrieval and processing of high-quality sequence data and application to the identification of the putative coffea s-locus | |
EP3929928A1 (en) | Associating pedigree scores and similarity scores for plant feature prediction | |
Aylward et al. | How methodological changes have influenced our understanding of population structure in threatened species: insights from tiger populations across India | |
Lepais et al. | Joint analysis of microsatellites and flanking sequences enlightens complex demographic history of interspecific gene flow and vicariance in rear-edge oak populations | |
Ortego et al. | Broadly distributed but genetically fragmented: demographic consequences of Pleistocene climatic oscillations in a common Iberian grasshopper | |
Zeinalabedini et al. | Integration of molecular and geographical data analysis of Iranian Prunus scoparia populations in order to assess genetic diversity and conservation planning | |
Santos et al. | Neither barriers nor refugia explain genetic structure in a major biogeographic break: phylogeography of praying mantises in the Brazilian Atlantic Forest | |
LU502479B1 (en) | Group of snp loci and method for identifying biogeographic origins of east asian populations | |
Ortego et al. | Demographic and spatially explicit landscape genomic analyses in a tropical oak reveal the impacts of late Quaternary climate change on Andean montane forests | |
Assoumane et al. | Wild crop relative populations hot-spots of diversity are hot-spots of introgression in the case of pearl millet | |
Yu | Using landscape genomics to delineate seed and breeding zones and project genetic offset for lodgepole pine |