RU2020133433A - Химическое соединение с триазиновой группой и способ его получения - Google Patents

Химическое соединение с триазиновой группой и способ его получения Download PDF

Info

Publication number
RU2020133433A
RU2020133433A RU2020133433A RU2020133433A RU2020133433A RU 2020133433 A RU2020133433 A RU 2020133433A RU 2020133433 A RU2020133433 A RU 2020133433A RU 2020133433 A RU2020133433 A RU 2020133433A RU 2020133433 A RU2020133433 A RU 2020133433A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
nhc
oligonucleotide
groups
substituents
group
Prior art date
Application number
RU2020133433A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2799452C2 (ru
RU2020133433A3 (ru
Inventor
Максим Сергеевич Купрюшкин
Тимофей Дмитриевич Жарков
Илья Сергеевич Довыденко
Олег Владимирович Марков
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской академии наук (ИХБФМ СО РАН)
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской академии наук (ИХБФМ СО РАН) filed Critical Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской академии наук (ИХБФМ СО РАН)
Priority to RU2020133433A priority Critical patent/RU2799452C2/ru
Priority claimed from RU2020133433A external-priority patent/RU2799452C2/ru
Priority to PCT/RU2021/050339 priority patent/WO2022081046A1/ru
Publication of RU2020133433A publication Critical patent/RU2020133433A/ru
Publication of RU2020133433A3 publication Critical patent/RU2020133433A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2799452C2 publication Critical patent/RU2799452C2/ru

Links

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/712—Nucleic acids or oligonucleotides having modified sugars, i.e. other than ribose or 2'-deoxyribose
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
    • Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
    • Y02P20/55—Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Claims (71)

1. Соединение, отвечающее формуле F0
Figure 00000001
,
в котором заместитель Z выбран из группы: -ОН, -SH, -SeH, -NHRN, -O-PG, -S-PG, -Se-PG или -N(PG)RN;
заместители X и Y выбраны из группы, состоящей из 5'-O-конца нуклеозида или олигонуклеотида, 3'-О-конца нуклеозида или олигонуклеотида, -Н, -ОН, -SH, -NHRN, -O-PG или S-PG, линкера, монофосфата или дифосфата;
заместители R1, R2, R3, R4 выбраны из ряда -Н, -С1-18алкил, -С2-18алкенил, -С2-18алкинил и -С6-18арил, которые могут включать группы -NH-, -N<, -О-, -NHC(O)-, -NHS(O)2-
N(CH2CH2)2N- и/или
Figure 00000002
,
а также оканчиваться группами -NR2, -OR, -SR, -OC(O)R, -NHC(O)R, -C(O)OR, -C(O)NHR, -N=C(N(R2)2, -S(O)R, -S(O)2R, -S(O)2NR2, -CN, -Cl, -Br, -I, -F, -N3-
Figure 00000003
при этом заместители R5, R6, R7, R8 выбраны из ряда, содержащего -Н, -С1-18алкил, -С2-18алкенил, -С2-18алкинил и -С6-18арил, которые могут включать группы -NH-, -N<, -О-, -NHC(O)-, -NHS(O)2-, -N(CH2CH2)2N-, а также оканчиваться группами -NR2, -OR, -SR, -OC(O)R, -NHC(O)R, -C(O)OR, -C(O)NHR, -N=C(N(R2))2, -S(O)R, -S(O)2R, -S(O)2NR2, -CN, -Cl, -Br, -I, -F, -N3;
при этом R представляет собой заместитель, выбранный из ряда -Н, -С1-18алкил, -С2-18алкенил, -С2-18алкинил и -С6-18арил, которые могут включать группы -NH-, -N<, -О-, -NHC(O)-, -NHS(O)2-, -N(CH2CH2)2N- и могут оканчиваться группами -NRN2, -ORN, -SRN, -OC(O)RN, -NHC(O)RN, -C(O)ORN, -C(O)NHRN, -N=C(N(R2))2, -S(O)R, -S(O)2R, -S(O)2NR2, -CN, -Cl, -Br, -I, -F, -N3;
при этом PG - это защитная группа;
при этом RN представляет собой -Н или -С1-4алкил.
2. Соединение по п. 1, в котором X выбран из группы, состоящей из 5'-О конца нуклеозида или олигонуклеотида, a Y выбран из группы, состоящей из 3'-О-конца нуклеозида или олигонуклеотида, Н, ОН, SH, NHRN, O-PG или S-PG, линкера, монофосфата или дифосфата.
3. Соединение по п. I, в котором Y выбран из группы, состоящей из 5'-O-конца нуклеозида или олигонуклеотида, а X выбран из группы, состоящей из 3'-О конца нуклеозида или олигонуклеотида, Н, ОН, SH, NHRN, O-PG или S-PG, линкера, монофосфата или дифосфата.
4. Соединение по п. 1, в котором заместители R1, R2, R3; R4 выбраны из ряда -Н, -C1-18алкил, -С2-18алкенил, -С2-18алкинил и -С6-18арил, которые включают группы -NH-, -N<
-О- -NHC(O)-, -NHS(O)2-, -N(CH2CH2)2N- и/или
Figure 00000004
5. Соединение по п. 1, в котором заместители R1, R2, R3, R4 выбраны из ряда -Н, -C1-18алкил, -С2-18алкенил, -С2-18алкинил и -С6-18арил, которые оканчиваются группами -NR2, OR, SR, OC(O)R, NHC(O)R, C(O)OR, -C(O)NHR, N=C(N(R2)2, S(O)R, S(O)2R, S(O)2NR2, -CN, -Cl, -Br, -I, -F, -N3,
Figure 00000005
6. Химическое соединение по п. 5, в котором заместители R5, R6, R7, R8 выбраны из ряда, содержащего -Н, -С1-18алкил, -С2-18алкенил, -С2-18алкинил и -С6-18арил, которые включают группы -NH-, -N<, -О-, -NHC(O)-, -NHS(O)2-, -N(CH2CH2)2N-.
7. Химическое соединение по п. 5, в котором заместители R5, R6, R7, R8 выбраны из ряда, содержащего -Н, -С1-18алкил, -С2-18алкенил, -С2-18алкинил и -С6-18арил, которые оканчиваются группами -NR2, -OR, -SR, -OC(O)R, -NHC(O)R, -C(O)OR, -C(O)NHR, -N=C(N(R2))2, -S(O)R, -S(O)2R, -S(O)2NR2, -CN, -Cl, -Br, -I, -F, -N3.
8. Соединение по п. 1, в котором R1 = R3, R2 = R4.
9. Соединение по п. 8, в котором R1 = R3 = -H или -CH3.
10. Соединение по п. 9, в котором R2 = R4 = -С1-18алкил или -С1-18алкенил.
11. Соединение по п. 1, в котором R1 и R2 и/или R3 и R4, вместе формируют =C(NR2)2 группу.
12. Соединение, по п. 1, в котором R1 и R2; R3 и R4; R5 и R6; R7 и R8 совместно со связанным с ними атомом формируют 5-8 членный гетероцикличный заместитель, выбранный из группы, состоящей N-пирролидинила, N-пиперидинила, N-азепанила, N-азоканила или N-пиперазинила.
13. Способ получения соединения, отвечающего формуле (F0)
Figure 00000001
,
заключающийся во взаимодействии производного трехвалентного фосфора формулы (F1) с азидотриазином формулы (F2) с получением соединения формулы (F3)
Figure 00000006
,
при этом заместитель Z выбран из группы: -ОН, -SH, -SeH, -NHRN, -O-PG, -S-PG, -Se-PG или -N(PG)RN;
заместители X, Y выбраны из группы, состоящей из 5'-O-конца нуклеозида или олигонуклеотида, а 3'-О-конца нуклеозида или олигонуклеотида, -Н, -ОН, -SH, -NHRN, -O-PG или S-PG, линкера, монофосфата или дифосфата;
группы А и В могут быть независимо выбраны из ряда -NR1R2, -NR3R4, -NRXRY, -Q; при этом заместители RX и RY будут преобразованы в заместители R1, R2, R3, R4 с использованием известных в области техники реакций превращения соответствующих реакционных групп, входящих в состав RX и RY;
Q - это группа, которую замещают на -NR1R2, -NR3R4, -NRXRY в реакции с соответствующим амином HNR1R2, HNR3R4, HNRXRY;
при этом Q выбирается из ряда: -OR, -OC(O)R, -OS(O)2R, -CN, -Cl, -Br, -I, -F, -N3; заместители RX, RY выбраны из ряда, содержащего -Н, -С1-18алкил, -С2-18алкенил, -С2-18алкинил и -С6-18арил, которые могут включать группы -NH-, -N<, -О-, -NHC(O)-, -NHS(O)2- и/или -N(CH2CH2)2N-, а также оканчиваться группами -NR2, -OR, -SR, -OC(O)R, -NHC(O)R, -C(O)OR, -C(O)NHR, -N=C(N(R2))2, -S(O)R, -S(O)2R, -S(O)2NR2, -CN, -Cl, -Br, -I, -F, -N3;
заместители R1, R2, R3, R4 выбраны из ряда -H, -С1-8алкил, -С2-18алкенил, -С2-18алкинил и -С6-18арил, которые могут включать группы -NH-, -N<, -О-, -NHC(O)-, -NHS(O)2-, -N(CH2CH2)2N- и/или
Figure 00000007
а также оканчиваться группами -NR2, -OR, -SR, -OC(O)R, -NHC(O)R, -C(O)OR, -C(O)NHR, -N=C(N(R2)2, -S(O)R, -S(O)2R, -S(O)2NR2, -CN, -Cl, -Br, -I, -F, -N3,
Figure 00000008
или
Figure 00000009
при этом заместители R5, R6, R7, R8 выбраны из ряда, содержащего -Н, -С1-18алкил, -С2-18алкенил, -С2-18алкинил и -С6-18арил, которые могут включать группы -NH-, -N<, -О-, -NHC(O)-, -NHS(O)2-, -N(CH2CH2)2N-, а также оканчиваться группами -NR2, -OR, -SR, -OC(O)R, -NHC(O)R, -C(O)OR, -C(O)NHR, -N=C(N(R2))2, -S(O)R, -S(O)2R, -S(O)2NR2, -CN, -Cl, -Br, -I, -F, -N3;
при этом R представляет собой заместитель, выбранный из ряда -Н, -С1-18алкил, -С2-18алкенил, -С2-18алкинил и -С6-18арил, которые могут включать группы -NH-, -N<, -О-, -NHC(O)-, -NHS(O)2-, -N(CH2CH2)2N- и могут оканчиваться группами -NRN2, -ORN, -SRN, -OC(O)RN, -NHC(O)RN, -C(O)ORN, -C(O)NHRN, -N=C(N(R2))2, -S(O)R, -S(O)2R, -S(O)2NR2, -CN, -Cl, -Br, -I, -F, -N3;
при этом PG - это защитная группа;
при этом RN представляет собой -Н или -С1-4алкил.
14. Способ получения соединения по п. 13, где производное трехвалентного фосфора это Н-фосфонатное звено, полученное согласно Н-фосфонатному методу олигонуклеотидного синтеза, или фосфитное звено, полученного согласно амидофосфитному методу олигонуклеотидного синтеза.
15. Способ по п. 14, где А = В -Q.
16. Способ по п. 15, где Q = Cl.
17. Способ по п. 14, где А = -NR1 R2, В = -Q.
18. Способ по п. 17, где Q = Cl.
19. Способ по п. 14, где А = -NR1 R2, В = -NR3R4.
20. Олигонуклеотид, в котором хотя бы одна модифицированная фосфатная группа, соответствует формуле Fx
Figure 00000010
где - показывает место присоединения соответствующих олигонуклеотиду заместителей;
R1, R2, R3 и R4 выбраны из ряда -Н, -С1-18алкил, -С2-18алкенил, -С2-18алкинил и -С6-18арил, которые могут включать группы -NH-, -N<, -О-, -NHC(O)-, -NHS(O)2-, -N(CH2CH2)2N-и/или
Figure 00000011
а также оканчиваться группами -NR2, -OR, -SR, -OC(O)R, -NHC(O)R, -C(O)OR, -C(O)NHR, -N=C(N(R2)2, -S(O)R, -S(O)2R, -S(O)2NR2, -CN, -Cl, -Br, -I, -F, -N3,
Figure 00000012
или
Figure 00000013
при этом заместители R5, R6, R7, R8 выбраны из ряда, содержащего -Н, -С1-18алкил, С2-18алкенил, -С2-18алкинил и -С6-18арил, которые могут включать группы -NH-, -N<, -О-, -NHC(O)-, -NHS(O)2-, -N(CH2CH2)2N-, а также оканчиваться группами -NR2, -OR, -SR, -OC(O)R, -NHC(O)R, -C(O)OR, -C(O)NHR, -N=C(N(R2))2, -S(O)R, -S(O)2R, -S(O)2NR2, -CN, -Cl, -Br, -I, -F, -N3;
при этом R представляет собой заместитель, выбранный из ряда -Н, -С1-18алкил, -С2-18алкенил, -С2-18алкинил и -С6-18арил, которые могут включать группы -NH-, -N<, -О-, -NHC(O)-, -NHS(O)2-, -N(CH2CH2)2N- и могут оканчиваться группами -NRN2, -ORN, -SRN, -OC(O)RN, -NHC(O)RN, -C(O)ORN, -C(O)NHRN, -N=C(N(R2))2, -S(O)R, -S(O)2R, -S(O)2NR2, -CN, -Cl, -Br, -I, -F, -N3;
при этом RN представляет собой -H или -С1-4алкил.
21. Олигонуклеотид по п. 20, в котором R1=R3, R2=R4.
22. Олигонуклеотид по п. 21, в котором R1=R3=Н или СН3.
23. Олигонуклеотид по п. 22, в котором R2=R4=-С1-18алкил или -С1-18алкенил.
24. Олигонуклеотид по п. 20, в котором R1 и R2 и/или R3 и R4, вместе формируют =C(NR2)2 группу.
Олигонуклеотид по п. 20, в котором R1 и R2; R3 и R4; R5 и R6; R7 и R8 совместно со связанным с ними атомом формируют 5-8 членный гетероцикличный заместитель, выбранный из группы, состоящей N-пирролидинила, N-пиперидинила, N-азепанила, N-азоканила или N-пиперазинила.
25. Использование соединения по п.1 в качестве исследовательского средства in vitro и in vivo.
26. Использование соединения по п.1 в качестве диагностического средства.
27. Использование соединения по п.1 в качестве терапевтического средства.
28. Использование олигонуклеотида по п. 20 в качестве противовирусного средства.
29. Использование олигонуклеотида по п. 20 в качестве противомикробного средства.
30. Использование олигонуклеотида по п. 20 в качестве противоракового средства.
31. Использование олигонуклеотида по п. 20 в качестве противоракового средства, модулирующего экспрессию микро-РНК.
RU2020133433A 2020-10-12 2020-10-12 Химическое соединение с триазиновой группой и способ его получения RU2799452C2 (ru)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2020133433A RU2799452C2 (ru) 2020-10-12 Химическое соединение с триазиновой группой и способ его получения
PCT/RU2021/050339 WO2022081046A1 (ru) 2020-10-12 2021-10-13 Химическое соединение с триазиновой группой и способ его получения

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2020133433A RU2799452C2 (ru) 2020-10-12 Химическое соединение с триазиновой группой и способ его получения

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2020133433A true RU2020133433A (ru) 2022-04-12
RU2020133433A3 RU2020133433A3 (ru) 2022-04-12
RU2799452C2 RU2799452C2 (ru) 2023-07-05

Family

ID=

Also Published As

Publication number Publication date
WO2022081046A1 (ru) 2022-04-21
RU2020133433A3 (ru) 2022-04-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR102531388B1 (ko) 알콕시 페닐 유도체, 뉴클레오시드 보호체 및 뉴클레오티드 보호체, 올리고뉴클레오티드 제조 방법, 및 치환기 제거 방법
RU2014134380A (ru) Модифицированные олигонуклеотиды и способ их получения
Garegg et al. Nucleoside H-phosphonates. V. The mechanism of hydrogenphosphonate diester formation using acyl chlorides as coupling agents in oligonucleotide synthesis by the hydrogenphosphonate approach
WO2011017521A4 (en) Bicyclic cyclohexose nucleic acid analogs
CA2879023A1 (en) Asymmetric auxiliary group
JP2012530713A5 (ru)
JP2017528416A5 (ru)
RU2020133433A (ru) Химическое соединение с триазиновой группой и способ его получения
US20090075945A1 (en) Phosphate-bearing prodrugs of sulfonyl hydrazines as hypoxia-selective antineoplastic agents
Arafa et al. A sustainable strategy for the synthesis of bis-2-iminothiazolidin-4-ones utilizing novel series of asymmetrically substituted bis-thioureas as viable precursors
RU2017105743A (ru) Модифицированные олигонуклеотиды, активирующие рнказу н
WO2008024169A1 (en) Reactive pyrophosphoric and bisphosphonic acid derivatives and methods of their use
WO2013016321A1 (en) Minor groove binder phosphoramidites and methods of use
CA2684638A1 (en) 2, 6-dinitrogen-containing substituted purine derivatives, the preparation and uses thereof
EP2170912A1 (en) New phosphorus containing heterocyclic compounds, sugar analogues, and compositions having anti-cancer activity containing the same
PL111784B1 (en) Method of manufacture of novel derivatives of nitrosourea
GB2403949A (en) Combretastatin derivatives
AU2006271923A1 (en) Thiocolchicoside analogues with myorelaxant and anti-inflammatory activity
EP2900273B1 (en) Colloid bonded medicinal compounds
JP7423533B2 (ja) 配糖体化合物の製造方法
KR20020094000A (ko) 항종양제로서비스-(ｎ,ｎ&#39;-비스-(2-할로에틸)아미노)포스포라미데이트
JP7205914B2 (ja) グアノシン－３’，５’－ビスジホスフェートの製造方法及びその製造中間体
WO2023179773A1 (en) Bicyclic heterocycles and their ligands for targeted delivery of therapeutic agents
RU2415861C1 (ru) Способ получения n-замещенных бис[диалкоксифосфорил]ацетамидинов
HU220593B1 (hu) Foszfolipidszármazékok, foszfónium, arzónium és stibónium belső sói, ezeket tartalmazó gyógyszerkészítmények és eljárás az előállításukra