RU2020124074A - Кофеилпируват-гидролазы и их применение - Google Patents
Кофеилпируват-гидролазы и их применение Download PDFInfo
- Publication number
- RU2020124074A RU2020124074A RU2020124074A RU2020124074A RU2020124074A RU 2020124074 A RU2020124074 A RU 2020124074A RU 2020124074 A RU2020124074 A RU 2020124074A RU 2020124074 A RU2020124074 A RU 2020124074A RU 2020124074 A RU2020124074 A RU 2020124074A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- seq
- amino acid
- identity
- nos
- acid
- Prior art date
Links
Landscapes
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
Claims (46)
1. Белок биосинтеза люциферина грибов, представляющий собой кофеилпируват-гидролазу, состоящий из:
а) аминокислотной последовательности, выбранной из группы SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75; или
б) аминокислотной последовательности, которая имеет не менее 60% идентичности с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75, где указанная кофеилпируват-гидролаза катализирует превращение 6-арил-2-гидрокси-4-оксогекса-2,5-диеновые кислоты, имеющей структурную формулу
где R - арил или гетероарил, в 3-арилакриловую кислоту со структурной формулой
2. Белок по п. 1, где аминокислотная последовательность кофеилпируват-гидролазы имеет не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, или не менее 80% идентичности, или не менее 85% идентичности, или не менее 90% идентичности, или не менее 95% идентичности с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75.
3. Белок по 2, где аминокислотная последовательность кофеилпируват-гидролазы имеет не менее 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75.
4. Белок по п. 1, где 3-арилакриловая кислота выбрана из группы: кофейная кислота, коричная кислота, паракумаровая кислота, кумаровая кислота, умбеллиновая кислота, синаповая кислота, феруловая кислота.
5. Применение белка биосинтеза люциферина грибов, состоящего из:
а) аминокислотной последовательности, выбранной из группы SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75; или
б) аминокислотной последовательности, которая имеет не менее 60% идентичности с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75,
в системах in vitro или in vivo как кофеилпируват-гидролазы, катализирующей реакцию превращения 6-арил-2-гидрокси-4-оксогекса-2,5-диеновые кислоты, имеющей структурную формулу
где R - арил или гетероарил, в 3-арилакриловую кислоту со структурной формулой
6. Применение по п. 5, где аминокислотная последовательность кофеилпируват-гидролазы имеет не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, или не менее 80% идентичности, или не менее 85% идентичности, или не менее 90% идентичности, или не менее 95% идентичности с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75.
7. Применение по п. 5, где 3-арилакриловая кислота выбрана из группы: кофейная кислота, коричная кислота, паракумаровая кислота, кумаровая кислота, умбеллиновая кислота, синаповая кислота, феруловая кислота.
8. Нуклеиновая кислота, кодирующая белок биосинтеза люциферина грибов по п. 1.
9. Кассета экспрессии, содержащая (а) регион инициации транскрипции функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновую кислоту по п. 8 и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека.
10. Клетка-хозяин, содержащая по крайней мере одну кассету экспрессии по п. 9 как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки как результат внедрения указанной кассеты в указанную клетку, где указанная клетка экспрессирует по крайней мере один из функциональных белков биосинтеза люциферина грибов, представляющего собой кофеилпируват-гидролазу, а также указанная клетка не является эмбриональной клеткой человека.
11. Применение нуклеиновой кислоты, кодирующей белок биосинтеза люциферина грибов, представляющего собой кофеилпируват-гидролазу, по п. 8 для получения в системах in vitro или in vivo кофеилпируват-гидролазы по п. 1.
12. Применение по п. 11, где нуклеиновая кислота применяется для экспрессии белка биосинтеза люциферина грибов в составе кассеты экспрессии, которая также включает регион инициации транскрипции функциональный в клетке-хозяине и регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека.
13. Применение по п. 12, где кассета экспрессии применяется в клетке-хозяине, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека.
14. Трансгенный организм, способный к автономной биолюминесценции, где указанный организм содержит по крайней мере одну нуклеиновую кислоту по п. 8 как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки как результат внедрения в указанную клетку кассеты экспрессии по п. 9, а также нуклеиновую кислоту, кодирующию:
(а) гиспидин-гидроксилазу, способную катализировать превращение 6-(2-арилвинил)-4- гидрокси-2H-пиран-2-она, имеющего структурную формулу
в 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он, имеющий структурную формулу,
где R - арил или гетероарил; и нуклеиновую кислоту, кодирующую:
(б) люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света,
причем трансгенный организм не является человеком или человеческим эмбрионом.
15. Трансгенный организм по п. 14, также содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-синтазу, способную катализировать превращение 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой,
где R - арил или гетероарил в 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он, имеющий структурную формулу
где R - арил или гетероарил.
16. Трансгенный организм по п. 15, также содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую поликетидсинтазу III типа, способную катализировать синтез гиспидин из кофеил-КоА.
17. Трансгенный организм по п. 15, также содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую 4'-фосфопантотеинил трансферазу и/или нуклеиновые кислоты, кодирующие ферменты биосинтеза 3-арилакриловой кислоты.
18. Трансгенный организм по 17, где ферменты биосинтеза 3-арилакриловой кислоты выбраны из группы:
(а) тирозин-аммоний-лиаза, аминокислотная последовательность которой представляет собой SEQ ID No: 107 или по крайней мере на 40% идентична последовательности, показанной в SEQ ID No: 107; компоненты HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы, аминокислотные последовательности которых представляет собой SEQ ID Nos: 109 и 111 или по крайней мере на 40% идентичны последовательностями компонентов HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы E. coli, показанными в SEQ ID Nos: 109 и 111;
(б) фенилаланин-аммоний-лиаза, аминокислотная последовательность которой представляет собой SEQ ID Nos: 117 или по крайней мере на 40% идентична аминокислотной последовательности, показанной в SEQ ID Nos: 117.
19. Трансгенный организм по п. 16, также содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую кумарат-КоА-лигазу и/или нуклеиновые кислоты, кодирующие ферменты биосинтеза 3-арилакриловой кислоты.
20. Трансгенный организм по 19, где ферменты биосинтеза 3-арилакриловой кислоты выбраны из группы:
(а) тирозин-аммоний-лиаза, аминокислотная последовательность которой представляет собой SEQ ID No: 107 или по крайней мере на 40% идентична последовательности, показанной в SEQ ID No: 107; компоненты HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы, аминокислотные последовательности которых по крайней мере на 40% идентичны последовательностями компонентов HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы E. coli, показанными в SEQ ID Nos: 109 и 111;
(б) фенилаланин-аммоний-лиаза, аминокислотная последовательность которой представляет собой SEQ ID Nos: 117 или по крайней мере на 40% идентична аминокислотной последовательности, показанной в SEQ ID Nos: 117.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2020124074A RU2812474C2 (ru) | 2020-07-20 | Кофеилпируват-гидролазы и их применение |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2020124074A RU2812474C2 (ru) | 2020-07-20 | Кофеилпируват-гидролазы и их применение |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2018123601A Division RU2730038C2 (ru) | 2018-06-28 | 2018-06-28 | Ферменты биосинтеза люциферина и их применение |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2020124074A true RU2020124074A (ru) | 2022-01-20 |
RU2812474C2 RU2812474C2 (ru) | 2024-01-30 |
Family
ID=
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US20190270999A1 (en) | Method for modulating gene expression by modifying the cpg content | |
RU2019127316A (ru) | Рнк-направляемая инженерия генома человека | |
RU2018123601A (ru) | Ферменты биосинтеза люциферина и их применение | |
TWI708780B (zh) | 具有高分泌效能之蛋白質分泌因子及包含該因子之表現載體 | |
IL126100A (en) | Recombinant thermostable dna polymerase having reduced level of discrimination, nucleic acid sequence encoding it and method for its preparation | |
CN110408635B (zh) | 一种含有链霉亲和素元件的核酸构建物在蛋白质表达、纯化中的应用 | |
CN110408636B (zh) | 多重标签串联的dna序列及其在蛋白质表达纯化系统的应用 | |
CN110093284B (zh) | 一种在细胞中提高蛋白合成效率的方法 | |
WO2010131748A1 (ja) | ペプチドを認識するアプタマー | |
JP2019525774A (ja) | Rna結合ポリペプチドの標的を同定するための組成物および方法 | |
RU2020124074A (ru) | Кофеилпируват-гидролазы и их применение | |
Kalidasan et al. | Fluorescence-activated cell sorting and directed evolution of α-N-acetylgalactosaminidases using a quenched activity-based probe (q ABP) | |
CN111378708A (zh) | 一种优化的体外无细胞蛋白合成体系及其应用 | |
CN110551745A (zh) | 一种多重组氨酸序列标签及其在蛋白质表达、纯化中的应用 | |
CA3049826C (en) | Promoter construct for cell-free protein synthesis | |
KR20160134669A (ko) | 시클로프로펜 아미노산 및 방법 | |
CN110699487B (zh) | 用于诊断禽白血病病毒肿瘤发生的反义rna及制备方法、应用和构建过表达载体的引物 | |
US20220396833A1 (en) | In situ readout of dna barcodes | |
RU2020123860A (ru) | Гиспидин-синтазы и их применение | |
CN101641437B (zh) | 猪肝酯酶的同工型 | |
CA2428059A1 (en) | Process for the enzymatic preparation of enantiomerically enriched beta-amino acids | |
CN102504021B (zh) | Fbxl15蛋白及其抑制剂以及它们的应用 | |
CN111315875A (zh) | 改进修饰的/突变的细菌萤光素酶 | |
JP2022528252A (ja) | 環状rnaを使用したタンパク質翻訳およびその応用 | |
RU2020124171A (ru) | Поликетидсинтазы III типа и их применение |