RU2020103804A - Выявление продуцирующих карбапенемазу видов enterobacteriales, pseudomonas и acinetobacter с применением хромогена - Google Patents

Выявление продуцирующих карбапенемазу видов enterobacteriales, pseudomonas и acinetobacter с применением хромогена Download PDF

Info

Publication number
RU2020103804A
RU2020103804A RU2020103804A RU2020103804A RU2020103804A RU 2020103804 A RU2020103804 A RU 2020103804A RU 2020103804 A RU2020103804 A RU 2020103804A RU 2020103804 A RU2020103804 A RU 2020103804A RU 2020103804 A RU2020103804 A RU 2020103804A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
dinitrostyryl
aminothiazol
cephem
methoxyimino
acetamide
Prior art date
Application number
RU2020103804A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2776822C2 (ru
RU2020103804A3 (ru
Inventor
Джонатан Энтони ХОБСОН
Матильда Мэй КОУЛБОРН
Майя ДЭВИС
Эндрю Чука АНЯКУО
Original Assignee
Маст Груп Лимитед
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Маст Груп Лимитед filed Critical Маст Груп Лимитед
Publication of RU2020103804A publication Critical patent/RU2020103804A/ru
Publication of RU2020103804A3 publication Critical patent/RU2020103804A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2776822C2 publication Critical patent/RU2776822C2/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/02Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
    • C12Q1/04Determining presence or kind of microorganism; Use of selective media for testing antibiotics or bacteriocides; Compositions containing a chemical indicator therefor
    • C12Q1/10Enterobacteria
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/02Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
    • C12Q1/04Determining presence or kind of microorganism; Use of selective media for testing antibiotics or bacteriocides; Compositions containing a chemical indicator therefor
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/25Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving enzymes not classifiable in groups C12Q1/26 - C12Q1/66
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/34Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y305/00Hydrolases acting on carbon-nitrogen bonds, other than peptide bonds (3.5)
    • C12Y305/02Hydrolases acting on carbon-nitrogen bonds, other than peptide bonds (3.5) in cyclic amides (3.5.2)
    • C12Y305/02006Beta-lactamase (3.5.2.6)
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/90Enzymes; Proenzymes
    • G01N2333/914Hydrolases (3)
    • G01N2333/978Hydrolases (3) acting on carbon to nitrogen bonds other than peptide bonds (3.5)
    • G01N2333/986Hydrolases (3) acting on carbon to nitrogen bonds other than peptide bonds (3.5) acting on amide bonds in cyclic amides (3.5.2), e.g. beta-lactamase (penicillinase, 3.5.2.6), creatinine amidohydrolase (creatininase, EC 3.5.2.10), N-methylhydantoinase (3.5.2.6)
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Cephalosporin Compounds (AREA)

Claims (20)

1. Способ выявления присутствия продуцирующих карбапенемазу Enterobacteriales, Pseudomonas и Acinetobacter в образце, включающий:
обеспечение образца, в котором предполагается присутствие продуцирующих карбапенемазу Enterobacteriales, Pseudomonas или Acinetobacter,
реагирование указанного образца с раствором (7R)-7-[(z)-2-(2-аминотиазол-4-ил)-(Z)-2(метоксиимино)ацетамид]-3-(2,4-динитростирил)-3-цефем-4-карбоновой кислоты) или ее соли и
выявление изменения цвета в реакционной среде, когда продуцирующие карбапенемазу Enterobacteriales, Pseudomonas или Acinetobacter присутствуют в исследуемом образце.
2. Способ по п. 1, причем образец представляет собой биологический образец.
3. Способ по п. 2, причем биологический образец является выбранным из группы, состоящей из такого биологического образца, как моча, или, как правило, из выделенной клеточной культуры.
4. Способ по любому предыдущему пункту, причем способ дополнительно включает стадию лизиса образца до или одновременно с реакцией с (7R)-7-[(z)-2-(2-аминотиазол-4-ил)-(Z)-2(метоксиимино)ацетамид]-3-(2,4-динитростирил)-3-цефем-4-карбоновой кислотой) или ее солью.
5. Способ по пп. 1-3, причем лизис образца происходит в присутствии (7R)-7-[(z)-2-(2-аминотиазол-4-ил)-(Z)-2(метоксиимино)ацетамид]-3-(2,4-динитростирил)-3-цефем-4-карбоновой кислоты) или ее соли.
6. Способ по п. 5, причем лизис образца облегчают с помощью комбинации полимиксинового, гликопептидного и полипептидного антибиотика.
7. Способ по любому предыдущему пункту, причем реакцию образца с ([(7R)-7-[(z)-2-(2-аминотиазол-4-ил)-(Z)-2(метоксиимино)ацетамид]-3-(2,4-динитростирил)-3-цефем-4-карбоновой кислотой) или ее солью осуществляют в течение периода времени, достаточного для наблюдения изменения цвета, предпочтительно, менее 1 часа, более предпочтительно, менее 30 минут и, наиболее предпочтительно, от около 5 до около 20 минут.
8. Способ по любому предыдущему пункту, причем реакцию образца с ([(7R)-7-[(z)-2-(2-аминотиазол-4-ил)-(Z)-2(метоксиимино)ацетамид]-3-(2,4-динитростирил)-3-цефем-4-карбоновой кислотой) или ее солью осуществляют при температуре от около 5°С до около 40°С, более предпочтительно от около 20°С до около 37°С и наиболее предпочтительно при 35°С.
9. Способ по любому предыдущему пункту, причем способ дополнительно включает ингибитор β-лактамаз расширенного спектра (ESBL), ингибитор AmpC или их смесь.
10. Способ по любому предыдущему пункту, причем ([(7R)-7-[(z)-2-(2-аминотиазол-4-ил)-(Z)-2(метоксиимино)ацетамид]-3-(2,4-динитростирил)-3-цефем-4-карбоновую кислоту) или ее соль применяют в комбинации с карбапенемом или пенемом отдельно или в комбинации с ингибитором β-лактамаз расширенного спектра (ESBL), ингибитором AmpC или их смесью.
11. Способ по п. 9 или п. 10, причем ингибитор расширенного спектра представляет собой клавулановую кислоту, и ингибитор AmpC представляет собой клоксациллин или смесь с ним.
12. Способ по любому предыдущему пункту, причем ингибитор содержит по меньшей мере одно из клавулановой кислоты в концентрации от около 30 мкг/мл до около 50 мкг/мл и клоксациллин в концентрации от около 300 мкг/мл до около 500 мкг/мл.
13. Способ по любому предыдущему пункту, причем ([(7R)-7-[(z)-2-(2-аминотиазол-4-ил)-(Z)-2(метоксиимино)ацетамид]-3-(2,4-динитростирил)-3-цефем-4-карбоновую кислоту) или ее соль растворяют в растворе, содержащем по меньшей мере одно из органического растворителя, органической кислоты и сульфата цинка.
14. Способ по п. 10, причем органический растворитель представляет собой полярный апротонный растворитель, предпочтительно DMSO, и при этом органическая кислота представляет собой линейную насыщенную дикарбоновую кислоту.
15. Применение ([(7R)-7-[(z)-2-(2-аминотиазол-4-ил)-(Z)-2(метоксиимино)ацетамид]-3-(2,4-динитростирил)-3-цефем-4-карбоновой кислоты) или ее соли для выявления присутствия продуцирующих карбапенемазу Enterobacteriales, Pseudomonas и Acinetobacter в образце.
16. Применение ([(7R)-7-[(z)-2-(2-аминотиазол-4-ил)-(Z)-2(метоксиимино)ацетамид]-3-(2,4-динитростирил)-3-цефем-4-карбоновой кислоты) или ее соли по п. 15, причем ([(7R)-7-[(z)-2-(2-аминотиазол-4-ил)-(Z)-2(метоксиимино)ацетамид]-3-(2,4-динитростирил)-3-цефем-4-карбоновая кислота) или ее соль применяются в сочетании с карбапенемом или пенемом отдельно или в комбинации с ингибитором β-лактамаз расширенного спектра (ESBL), AmpC или их смесью.
17. Набор для определения того, продуцирует ли микроорганизм гидролизующую карбапенем β-лактамазу, содержащий флакон, который содержит ([(7R)-7-[(z)-2-(2-аминотиазол-4-ил)-(Z)-2(метоксиимино)ацетамид]-3-(2,4-динитростирил)-3-цефем-4-карбоновую кислоту) или ее соль, микротитровальный планшет, имеющий лунки, которые покрыты ([(7R)-7-[(z)-2-(2-аминотиазол-4-ил)-(Z)-2(метоксиимино)ацетамид]-3-(2,4-динитростирил)-3-цефем-4-карбоновой кислотой) или ее солью, или диск для анализа, пропитанный HMRZ-98 ([(7R)-7-[(z)-2-(2-аминотиазол-4-ил)-(Z)-2(метоксиимино)ацетамид]-3-(2,4-динитростирил)-3-цефем-4-карбоновой кислотой) или ее солью и ингибитором β-лактамаз расширенного спектра (ESBL), ингибитором AmpC или их смесью.
RU2020103804A 2017-08-07 2018-08-07 Выявление продуцирующих карбапенемазу видов enterobacteriales, pseudomonas и acinetobacter с применением хромогена RU2776822C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
GB1712671.5 2017-08-07
GBGB1712671.5A GB201712671D0 (en) 2017-08-07 2017-08-07 Chromogenic Carbapenemase detection method
PCT/GB2018/052255 WO2019030519A1 (en) 2017-08-07 2018-08-07 DETECTION OF PSEUDOMONAS AND ACINETOBACTER SPECIES PRODUCING CARBAPENEMASES USING CHROMOGENES

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2020103804A true RU2020103804A (ru) 2021-09-10
RU2020103804A3 RU2020103804A3 (ru) 2021-11-29
RU2776822C2 RU2776822C2 (ru) 2022-07-27

Family

ID=

Also Published As

Publication number Publication date
ES2900172T3 (es) 2022-03-16
EP3665299B1 (en) 2021-07-21
GB2566810B (en) 2021-09-22
WO2019030519A1 (en) 2019-02-14
JP2020529850A (ja) 2020-10-15
AU2018315240A1 (en) 2020-02-20
CA3072023A1 (en) 2019-02-14
GB2566810A (en) 2019-03-27
RU2020103804A3 (ru) 2021-11-29
CN111133114B (zh) 2023-10-27
ZA202000674B (en) 2023-10-25
CN111133114A (zh) 2020-05-08
GB201812831D0 (en) 2018-09-19
EP3665299A1 (en) 2020-06-17
GB201712671D0 (en) 2017-09-20
SA520411245B1 (ar) 2023-01-22
JP7411541B2 (ja) 2024-01-11

Similar Documents

Publication Publication Date Title
DK2723884T3 (en) METHOD FOR DETECTION OF EXISTENCE OF carbapenemase-PRODUCING BACTERIA IN A SAMPLE
US20200407770A1 (en) Method for detecting the presence of expanded spectrum b-lactamase-producing bacteria in a sample
AU2010359382B2 (en) Methods and means for characterizing antibiotic resistance in microorganisms
EP3380631B1 (en) Carbapenemase detection method
WO2006031936B1 (en) Device and method for detecting antibiotic-inactivating enzymes
JP2008513016A5 (ru)
Lee et al. Carbapenemase-producing Enterobacterales infections: Recent advances in diagnosis and treatment
JP6748701B2 (ja) βラクタマーゼ産生細菌の存在を検出するための新規な方法
DK1557473T3 (da) Reagenssammensætning til at skelne beta-lactamaser, kit og fremgangsmåde dermed
RU2020103804A (ru) Выявление продуцирующих карбапенемазу видов enterobacteriales, pseudomonas и acinetobacter с применением хромогена
US9803229B2 (en) Method of detection of gram-negative bacteria periplasmic space and cell wall outer membrane proteins by mass spectrometry
Spicer et al. ML302, a novel beta-lactamase (BLA) inhibitor
JP7479433B2 (ja) クラスa型カルバペネマーゼ産生菌の検出方法および検出用多ウェルプレート
US20170138944A1 (en) Method for detecting enzyme activity hydrolyzing beta-lactam ring antimicrobial agents
RU2776822C2 (ru) Выявление продуцирующих карбапенемазу видов enterobacteriales, pseudomonas и acinetobacter с применением хромогена
WO2015013177A2 (en) Rapid detection of carbapenemase and beta-lactamase producing bacteria
RU2518249C1 (ru) Способ определения неспецифической устойчивости патогенных микроогранизмов к антибиотикам на основании измерения каталитической активности фосфодиэстераз, расщепляющих циклический дигуанозинмонофосфат
KR100592693B1 (ko) 항생제 민감성 시험방법 및 시험 키트
US9376705B2 (en) Method for detecting susceptibility of microorganisms to chemical agents
KR20090016942A (ko) 3-아미노페닐 보로닉산을 이용한 기질확장성 β-락타마제생산 균주의 스크리닝 방법