RU2018135302A - Агонисты rara для лечения омл и мдс - Google Patents
Агонисты rara для лечения омл и мдс Download PDFInfo
- Publication number
- RU2018135302A RU2018135302A RU2018135302A RU2018135302A RU2018135302A RU 2018135302 A RU2018135302 A RU 2018135302A RU 2018135302 A RU2018135302 A RU 2018135302A RU 2018135302 A RU2018135302 A RU 2018135302A RU 2018135302 A RU2018135302 A RU 2018135302A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- rara
- sample
- irf8
- subject
- mcpc
- Prior art date
Links
- 239000000556 agonist Substances 0.000 title claims 17
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 claims 45
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 claims 43
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 42
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims 42
- 101001112293 Homo sapiens Retinoic acid receptor alpha Proteins 0.000 claims 36
- 102100023606 Retinoic acid receptor alpha Human genes 0.000 claims 36
- PKAHQJNJPDVTDP-UHFFFAOYSA-N methyl cyclopropanecarboxylate Chemical compound COC(=O)C1CC1 PKAHQJNJPDVTDP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 34
- 208000031261 Acute myeloid leukaemia Diseases 0.000 claims 28
- 208000033776 Myeloid Acute Leukemia Diseases 0.000 claims 28
- 101001032345 Homo sapiens Interferon regulatory factor 8 Proteins 0.000 claims 27
- 102100038069 Interferon regulatory factor 8 Human genes 0.000 claims 27
- 201000003793 Myelodysplastic syndrome Diseases 0.000 claims 23
- 101150037497 Irf8 gene Proteins 0.000 claims 22
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 claims 16
- 101150066717 Rara gene Proteins 0.000 claims 14
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims 10
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 claims 10
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims 10
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 claims 9
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims 7
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 claims 7
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 claims 7
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 claims 6
- 229950010130 tamibarotene Drugs 0.000 claims 5
- MUTNCGKQJGXKEM-UHFFFAOYSA-N tamibarotene Chemical compound C=1C=C2C(C)(C)CCC(C)(C)C2=CC=1NC(=O)C1=CC=C(C(O)=O)C=C1 MUTNCGKQJGXKEM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 5
- 238000002487 chromatin immunoprecipitation Methods 0.000 claims 4
- 102000003676 Glucocorticoid Receptors Human genes 0.000 claims 3
- 101000932478 Homo sapiens Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3 Proteins 0.000 claims 3
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 claims 3
- 102100020718 Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3 Human genes 0.000 claims 3
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims 3
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 claims 3
- MLDQJTXFUGDVEO-UHFFFAOYSA-N BAY-43-9006 Chemical compound C1=NC(C(=O)NC)=CC(OC=2C=CC(NC(=O)NC=3C=C(C(Cl)=CC=3)C(F)(F)F)=CC=2)=C1 MLDQJTXFUGDVEO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 108091005625 BRD4 Proteins 0.000 claims 2
- 102100029895 Bromodomain-containing protein 4 Human genes 0.000 claims 2
- 229940125888 CDK7 inhibitor Drugs 0.000 claims 2
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims 2
- 229940126190 DNA methyltransferase inhibitor Drugs 0.000 claims 2
- 101001088883 Homo sapiens Lysine-specific demethylase 5B Proteins 0.000 claims 2
- 101001025971 Homo sapiens Lysine-specific demethylase 6B Proteins 0.000 claims 2
- 239000005511 L01XE05 - Sorafenib Substances 0.000 claims 2
- 102100033247 Lysine-specific demethylase 5B Human genes 0.000 claims 2
- 102100037461 Lysine-specific demethylase 6B Human genes 0.000 claims 2
- 229940122954 Transcription factor inhibitor Drugs 0.000 claims 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims 2
- 239000003968 dna methyltransferase inhibitor Substances 0.000 claims 2
- 239000003534 dna topoisomerase inhibitor Substances 0.000 claims 2
- 229940121372 histone deacetylase inhibitor Drugs 0.000 claims 2
- 239000003276 histone deacetylase inhibitor Substances 0.000 claims 2
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims 2
- BMGQWWVMWDBQGC-IIFHNQTCSA-N midostaurin Chemical compound CN([C@H]1[C@H]([C@]2(C)O[C@@H](N3C4=CC=CC=C4C4=C5C(=O)NCC5=C5C6=CC=CC=C6N2C5=C43)C1)OC)C(=O)C1=CC=CC=C1 BMGQWWVMWDBQGC-IIFHNQTCSA-N 0.000 claims 2
- 229950010895 midostaurin Drugs 0.000 claims 2
- OBJNFLYHUXWUPF-IZZDOVSWSA-N n-[3-[[5-chloro-4-(1h-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]phenyl]-4-[[(e)-4-(dimethylamino)but-2-enoyl]amino]benzamide Chemical compound C1=CC(NC(=O)/C=C/CN(C)C)=CC=C1C(=O)NC1=CC=CC(NC=2N=C(C(Cl)=CN=2)C=2C3=CC=CC=C3NC=2)=C1 OBJNFLYHUXWUPF-IZZDOVSWSA-N 0.000 claims 2
- XOFYZVNMUHMLCC-ZPOLXVRWSA-N prednisone Chemical compound O=C1C=C[C@]2(C)[C@H]3C(=O)C[C@](C)([C@@](CC4)(O)C(=O)CO)[C@@H]4[C@@H]3CCC2=C1 XOFYZVNMUHMLCC-ZPOLXVRWSA-N 0.000 claims 2
- 229960004618 prednisone Drugs 0.000 claims 2
- 229960003787 sorafenib Drugs 0.000 claims 2
- 229940044693 topoisomerase inhibitor Drugs 0.000 claims 2
- ILLYYNHLCANIBL-YCNIQYBTSA-N (2e,4e,6e,8e)-3,7-dimethyl-9-(2,6,6-trimethylcyclohex-2-en-1-yl)nona-2,4,6,8-tetraenoic acid Chemical compound OC(=O)\C=C(/C)\C=C\C=C(/C)\C=C\C1C(C)=CCCC1(C)C ILLYYNHLCANIBL-YCNIQYBTSA-N 0.000 claims 1
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 claims 1
- HJTAZXHBEBIQQX-UHFFFAOYSA-N 1,5-bis(chloromethyl)naphthalene Chemical compound C1=CC=C2C(CCl)=CC=CC2=C1CCl HJTAZXHBEBIQQX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- WBKCKEHGXNWYMO-UHFFFAOYSA-N 3-[[2-(2-pyridinyl)-6-(1,2,4,5-tetrahydro-3-benzazepin-3-yl)-4-pyrimidinyl]amino]propanoic acid ethyl ester Chemical group N=1C(NCCC(=O)OCC)=CC(N2CCC3=CC=CC=C3CC2)=NC=1C1=CC=CC=N1 WBKCKEHGXNWYMO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- XAUDJQYHKZQPEU-KVQBGUIXSA-N 5-aza-2'-deoxycytidine Chemical compound O=C1N=C(N)N=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 XAUDJQYHKZQPEU-KVQBGUIXSA-N 0.000 claims 1
- NMUSYJAQQFHJEW-KVTDHHQDSA-N 5-azacytidine Chemical group O=C1N=C(N)N=CN1[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 NMUSYJAQQFHJEW-KVTDHHQDSA-N 0.000 claims 1
- STQGQHZAVUOBTE-UHFFFAOYSA-N 7-Cyan-hept-2t-en-4,6-diinsaeure Natural products C1=2C(O)=C3C(=O)C=4C(OC)=CC=CC=4C(=O)C3=C(O)C=2CC(O)(C(C)=O)CC1OC1CC(N)C(O)C(C)O1 STQGQHZAVUOBTE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 208000036762 Acute promyelocytic leukaemia Diseases 0.000 claims 1
- 229940123877 Aurora kinase inhibitor Drugs 0.000 claims 1
- 238000001353 Chip-sequencing Methods 0.000 claims 1
- UHDGCWIWMRVCDJ-CCXZUQQUSA-N Cytarabine Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 UHDGCWIWMRVCDJ-CCXZUQQUSA-N 0.000 claims 1
- 230000005971 DNA damage repair Effects 0.000 claims 1
- 102100038970 Histone-lysine N-methyltransferase EZH2 Human genes 0.000 claims 1
- 102100039489 Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-79 specific Human genes 0.000 claims 1
- 101000882127 Homo sapiens Histone-lysine N-methyltransferase EZH2 Proteins 0.000 claims 1
- 101000963360 Homo sapiens Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-79 specific Proteins 0.000 claims 1
- XDXDZDZNSLXDNA-TZNDIEGXSA-N Idarubicin Chemical compound C1[C@H](N)[C@H](O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1C2=C(O)C(C(=O)C3=CC=CC=C3C3=O)=C3C(O)=C2C[C@@](O)(C(C)=O)C1 XDXDZDZNSLXDNA-TZNDIEGXSA-N 0.000 claims 1
- XDXDZDZNSLXDNA-UHFFFAOYSA-N Idarubicin Natural products C1C(N)C(O)C(C)OC1OC1C2=C(O)C(C(=O)C3=CC=CC=C3C3=O)=C3C(O)=C2CC(O)(C(C)=O)C1 XDXDZDZNSLXDNA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N L-methotrexate Chemical compound C=1N=C2N=C(N)N=C(N)C2=NC=1CN(C)C1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N 0.000 claims 1
- 229940123628 Lysine (K)-specific demethylase 1A inhibitor Drugs 0.000 claims 1
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 claims 1
- 239000012661 PARP inhibitor Substances 0.000 claims 1
- 229940121906 Poly ADP ribose polymerase inhibitor Drugs 0.000 claims 1
- 208000033826 Promyelocytic Acute Leukemia Diseases 0.000 claims 1
- 229940079156 Proteasome inhibitor Drugs 0.000 claims 1
- 238000003559 RNA-seq method Methods 0.000 claims 1
- 229940122429 Tubulin inhibitor Drugs 0.000 claims 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims 1
- GOLCXWYRSKYTSP-UHFFFAOYSA-N arsenic trioxide Inorganic materials O1[As]2O[As]1O2 GOLCXWYRSKYTSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 229960002594 arsenic trioxide Drugs 0.000 claims 1
- 239000003719 aurora kinase inhibitor Substances 0.000 claims 1
- 229960002756 azacitidine Drugs 0.000 claims 1
- 229960000684 cytarabine Drugs 0.000 claims 1
- 229960000975 daunorubicin Drugs 0.000 claims 1
- STQGQHZAVUOBTE-VGBVRHCVSA-N daunorubicin Chemical compound O([C@H]1C[C@@](O)(CC=2C(O)=C3C(=O)C=4C=CC=C(C=4C(=O)C3=C(O)C=21)OC)C(C)=O)[C@H]1C[C@H](N)[C@H](O)[C@H](C)O1 STQGQHZAVUOBTE-VGBVRHCVSA-N 0.000 claims 1
- 229960003603 decitabine Drugs 0.000 claims 1
- 229940014144 folate Drugs 0.000 claims 1
- OVBPIULPVIDEAO-LBPRGKRZSA-N folic acid Chemical compound C=1N=C2NC(N)=NC(=O)C2=NC=1CNC1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 OVBPIULPVIDEAO-LBPRGKRZSA-N 0.000 claims 1
- 235000019152 folic acid Nutrition 0.000 claims 1
- 239000011724 folic acid Substances 0.000 claims 1
- 229960000908 idarubicin Drugs 0.000 claims 1
- 229940124302 mTOR inhibitor Drugs 0.000 claims 1
- 239000003628 mammalian target of rapamycin inhibitor Substances 0.000 claims 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 claims 1
- 229960000485 methotrexate Drugs 0.000 claims 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims 1
- 239000003207 proteasome inhibitor Substances 0.000 claims 1
- 229950001626 quizartinib Drugs 0.000 claims 1
- CVWXJKQAOSCOAB-UHFFFAOYSA-N quizartinib Chemical compound O1C(C(C)(C)C)=CC(NC(=O)NC=2C=CC(=CC=2)C=2N=C3N(C4=CC=C(OCCN5CCOCC5)C=C4S3)C=2)=N1 CVWXJKQAOSCOAB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 102000003702 retinoic acid receptors Human genes 0.000 claims 1
- 108090000064 retinoic acid receptors Proteins 0.000 claims 1
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K33/00—Medicinal preparations containing inorganic active ingredients
- A61K33/24—Heavy metals; Compounds thereof
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/185—Acids; Anhydrides, halides or salts thereof, e.g. sulfur acids, imidic, hydrazonic or hydroximic acids
- A61K31/19—Carboxylic acids, e.g. valproic acid
- A61K31/192—Carboxylic acids, e.g. valproic acid having aromatic groups, e.g. sulindac, 2-aryl-propionic acids, ethacrynic acid
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/185—Acids; Anhydrides, halides or salts thereof, e.g. sulfur acids, imidic, hydrazonic or hydroximic acids
- A61K31/19—Carboxylic acids, e.g. valproic acid
- A61K31/195—Carboxylic acids, e.g. valproic acid having an amino group
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/16—Amides, e.g. hydroxamic acids
- A61K31/165—Amides, e.g. hydroxamic acids having aromatic rings, e.g. colchicine, atenolol, progabide
- A61K31/167—Amides, e.g. hydroxamic acids having aromatic rings, e.g. colchicine, atenolol, progabide having the nitrogen of a carboxamide group directly attached to the aromatic ring, e.g. lidocaine, paracetamol
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/21—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates
- A61K31/215—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates of carboxylic acids
- A61K31/22—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates of carboxylic acids of acyclic acids, e.g. pravastatin
- A61K31/23—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates of carboxylic acids of acyclic acids, e.g. pravastatin of acids having a carboxyl group bound to a chain of seven or more carbon atoms
- A61K31/232—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates of carboxylic acids of acyclic acids, e.g. pravastatin of acids having a carboxyl group bound to a chain of seven or more carbon atoms having three or more double bonds, e.g. etretinate
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/21—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates
- A61K31/215—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates of carboxylic acids
- A61K31/235—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates of carboxylic acids having an aromatic ring attached to a carboxyl group
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/21—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates
- A61K31/215—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates of carboxylic acids
- A61K31/25—Esters, e.g. nitroglycerine, selenocyanates of carboxylic acids with polyoxyalkylated alcohols, e.g. esters of polyethylene glycol
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/335—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin
- A61K31/35—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin having six-membered rings with one oxygen as the only ring hetero atom
- A61K31/352—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin having six-membered rings with one oxygen as the only ring hetero atom condensed with carbocyclic rings, e.g. methantheline
- A61K31/353—3,4-Dihydrobenzopyrans, e.g. chroman, catechin
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/40—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having five-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom, e.g. sulpiride, succinimide, tolmetin, buflomedil
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/40—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having five-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom, e.g. sulpiride, succinimide, tolmetin, buflomedil
- A61K31/4025—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having five-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom, e.g. sulpiride, succinimide, tolmetin, buflomedil not condensed and containing further heterocyclic rings, e.g. cromakalim
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/41—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having five-membered rings with two or more ring hetero atoms, at least one of which being nitrogen, e.g. tetrazole
- A61K31/415—1,2-Diazoles
- A61K31/4155—1,2-Diazoles non condensed and containing further heterocyclic rings
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/41—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having five-membered rings with two or more ring hetero atoms, at least one of which being nitrogen, e.g. tetrazole
- A61K31/425—Thiazoles
- A61K31/426—1,3-Thiazoles
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/435—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom
- A61K31/44—Non condensed pyridines; Hydrogenated derivatives thereof
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/435—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom
- A61K31/44—Non condensed pyridines; Hydrogenated derivatives thereof
- A61K31/4427—Non condensed pyridines; Hydrogenated derivatives thereof containing further heterocyclic ring systems
- A61K31/4436—Non condensed pyridines; Hydrogenated derivatives thereof containing further heterocyclic ring systems containing a heterocyclic ring having sulfur as a ring hetero atom
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/495—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
- A61K31/498—Pyrazines or piperazines ortho- and peri-condensed with carbocyclic ring systems, e.g. quinoxaline, phenazine
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/495—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
- A61K31/505—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
- A61K31/519—Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim ortho- or peri-condensed with heterocyclic rings
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/535—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with at least one nitrogen and one oxygen as the ring hetero atoms, e.g. 1,2-oxazines
- A61K31/5375—1,4-Oxazines, e.g. morpholine
- A61K31/5377—1,4-Oxazines, e.g. morpholine not condensed and containing further heterocyclic rings, e.g. timolol
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/55—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having seven-membered rings, e.g. azelastine, pentylenetetrazole
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/55—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having seven-membered rings, e.g. azelastine, pentylenetetrazole
- A61K31/551—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having seven-membered rings, e.g. azelastine, pentylenetetrazole having two nitrogen atoms, e.g. dilazep
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/55—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having seven-membered rings, e.g. azelastine, pentylenetetrazole
- A61K31/553—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having seven-membered rings, e.g. azelastine, pentylenetetrazole having at least one nitrogen and one oxygen as ring hetero atoms, e.g. loxapine, staurosporine
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/56—Compounds containing cyclopenta[a]hydrophenanthrene ring systems; Derivatives thereof, e.g. steroids
- A61K31/57—Compounds containing cyclopenta[a]hydrophenanthrene ring systems; Derivatives thereof, e.g. steroids substituted in position 17 beta by a chain of two carbon atoms, e.g. pregnane or progesterone
- A61K31/573—Compounds containing cyclopenta[a]hydrophenanthrene ring systems; Derivatives thereof, e.g. steroids substituted in position 17 beta by a chain of two carbon atoms, e.g. pregnane or progesterone substituted in position 21, e.g. cortisone, dexamethasone, prednisone or aldosterone
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/69—Boron compounds
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/695—Silicon compounds
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
- A61K31/7028—Compounds having saccharide radicals attached to non-saccharide compounds by glycosidic linkages
- A61K31/7034—Compounds having saccharide radicals attached to non-saccharide compounds by glycosidic linkages attached to a carbocyclic compound, e.g. phloridzin
- A61K31/704—Compounds having saccharide radicals attached to non-saccharide compounds by glycosidic linkages attached to a carbocyclic compound, e.g. phloridzin attached to a condensed carbocyclic ring system, e.g. sennosides, thiocolchicosides, escin, daunorubicin
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
- A61K31/7042—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings
- A61K31/7052—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides
- A61K31/706—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
- A61K31/7042—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings
- A61K31/7052—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides
- A61K31/706—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom
- A61K31/7064—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines
- A61K31/7068—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines having oxo groups directly attached to the pyrimidine ring, e.g. cytidine, cytidylic acid
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K33/00—Medicinal preparations containing inorganic active ingredients
- A61K33/24—Heavy metals; Compounds thereof
- A61K33/36—Arsenic; Compounds thereof
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K45/00—Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
- A61K45/06—Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
- A61P35/02—Antineoplastic agents specific for leukemia
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
- A61P35/04—Antineoplastic agents specific for metastasis
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
Claims (87)
1. Способ лечения рака, включающий этап:
введения тамибаротена субъекту, имеющему не-ОПЛ (острый промиелоцитарный лейкоз) острый миелоцитарный лейкоз (ОМЛ) или миелодиспластический синдром (МДС),
при этом в образце МКПК или в образце обогащенных МКПК от пациента был выявлен биомаркер IFR8, причем биомаркер IFR8 выбран из группы, состоящей из эффективности энхансера IFR8, равной предварительно определенному порогу или превышающей его, уровня мРНК IFR8, равного предварительно определенному порогу или превышающего его, и их комбинаций.
2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что в образце МКПК или в образце обогащенных МКПК от пациента был выявлен биомаркер RARA (рецептор альфа ретиноевой кислоты), причем биомаркер RARA выбран из группы, состоящей из эффективности энхансера RARA, равной предварительно определенному порогу или превышающей его, уровня мРНК RARA, равного предварительно определенному порогу или превышающего его, и их комбинаций.
3. Способ по п. 2, отличающийся тем, что субъект имеет не-ОПЛ ОМЛ.
4. Способ лечения рака, выбранного из не-ОПЛ ОМЛ и МДС, включающий этап:
введения имеющему рак субъекту агониста RARA, при этом определено, что образец МКПК или образец обогащенных МКПК от субъекта содержит биомаркер IRF8,
причем биомаркер IRF8 представляет собой или включает экспрессию одного или более из повышенных уровней мРНК IRF8 или суперэнхансера, связанного с геном IRF8.
5. Способ по п. 4, отличающийся тем, что образец МКПК или образец обогащенных МКПК от субъекта определяют как экспрессирущий повышенные уровни мРНК IRF8 посредством выявления уровня, равного предварительно определенному пороговому уровню или превышающего его.
6. Способ по п. 4, отличающийся тем, что образец МКПК или образец обогащенных МКПК от субъекта определяют как экспрессирущий суперэнхансер, связанный с геном IRF8, когда суперэнхансер имеет эффективность, порядковый ранг или показатель распространенности, равные предварительно определенному пороговому уровню или превышающие его.
7. Способ по п. 5, отличающийся тем, что предварительно определенный пороговый уровень представляет собой предварительно определенный предельный уровень распространенности.
8. Способ по п. 7, отличающийся тем, что предварительно определенный предельный уровень распространенности для не-ОПЛ ОМЛ или МДС составляет от около 15 до около 40%.
9. Способ по любому из пп. 1-8, отличающийся тем, что дополнительно было продемонстрировано, что субъект имеет повышенные уровни мРНК RARA или суперэнхансер, связанный с геном RARA.
10. Способ по пп. 1-8, отличающийся тем, что дополнительно было продемонстрировано, что субъект не имеет повышенные уровни мРНК RARA или суперэнхансер, связанный с геном RARA.
11. Способ по п. 10, отличающийся тем, что было продемонстрировано, что субъект не имеет повышенные уровни мРНК RARA или суперэнхансер, связанный с геном RARA, прежде чем было продемонстрировано, что субъект имеет повышенные уровни мРНК IRF8 или суперэнхансер, связанный с геном IRF8.
12. Способ по п. 10, отличающийся тем, что было продемонстрировано, что субъект не имеет повышенные уровни мРНК RARA или суперэнхансер, связанный с геном RARA, одновременно с тем, как было продемонстрировано, что субъект имеет повышенные уровни мРНК IRF8 или суперэнхансер, связанный с геном IRF8.
13. Способ по любому из пп. 4-12, отличающийся тем, что рак представляет собой не-ОПЛ острый миелоцитарный лейкоз (ОМЛ).
14. Способ применения терапии к субъекту, имеющему не-ОПЛ ОМЛ или МДС, отличающийся тем, что определено, что образец МКПК или образец обогащенных МКПК от субъекта
а. не экспрессирует одно или более из повышенных уровней мРНК RARA или суперэнхансера, связанного с геном RARA; и
b. не экспрессирует одно или более из повышенных уровней мРНК IRF8 или суперэнхансера, связанного с геном IRF8, при этом терапия не включает введение тамибаротена.
15. Способ по п. 14, отличающийся тем, что терапия не включает введение агониста RARA.
16. Способ лечения не-ОПЛ ОМЛ или МДС, включающий этап применения терапии к субъекту, при этом определено, что образец МКПК или образец обогащенных МКПК от субъекта:
a. экспрессирует одно или более из повышенных уровней мРНК RARA или суперэнхансера, связанного с геном RARA; и
b. экспрессирует одно или более из повышенных уровней мРНК IRF8 или суперэнхансера, связанного с геном IRF8,
при этом терапия состоит в применении агониста RARA.
17. Способ лечения не-ОПЛ ОМЛ или МДС, включающий этап применения терапии к субъекту, при этом определено, что образец МКПК или образец обогащенных МКПК от субъекта:
a. не экспрессирует одно или более из повышенных уровней мРНК RARA или суперэнхансера, связанного с геном RARA; и
b. экспрессирует одно или более из повышенных уровней мРНК IRF8 или суперэнхансера, связанного с геном IRF8,
при этом терапия состоит в применении агониста RARA.
18. Способ лечения не-ОПЛ ОМЛ или МДС, включающий этапы:
a. получения информации, относящейся к уровню мРНК IRF8 в образце МКПК или образце обогащенных МКПК от субъекта, страдающего от не-ОПЛ ОМЛ или МДС; и
b. введения субъекту агониста RARA, если информация указывает на то, что уровень мРНК IRF8 или уровень суперэнхансера равен эталонному уровню или превышает его.
19. Способ лечения не-ОПЛ ОМЛ или МДС, включающий этапы:
a. получения информации, относящейся к суперэнхансеру, связанному с геном IRF8, при этом суперэнхансер имеет эффективность, порядковый ранг или показатель распространенности, равные предварительно определенному пороговому уровню или превышающие его, в образце МКПК или образце обогащенных МКПК от субъекта, страдающего от не-ОПЛ ОМЛ или МДС; и
b. введения субъекту агониста RARA, если информация указывает на то, что суперэнхансер, связанный с геном IRF8, имеет эффективность, порядковый ранг или показатель распространенности, равные предварительно определенному пороговому уровню или превышающие его.
20. Способ по любому из пп. 16-19, отличающийся тем, что агонист RARA представляет собой тамибаротен.
21. Способ прогнозирования эффективности агониста RARA при лечении не-ОПЛ ОМЛ или МДС, включающий этап:
определения, имеет ли образец МКПК или образец обогащенных МКПК от субъекта, страдающего от не-ОПЛ ОМЛ или МДС, уровень мРНК IRF8, равный эталонному или превышающий его,
при этом уровень мРНК IRF8, равный эталонному или превышающий его, является прогностическим в отношении эффективности агониста RARA при лечении.
22. Способ прогнозирования эффективности агониста RARA при лечении рака, включающий этапы:
a. определения, имеет ли образец МКПК или образец обогащенных МКПК от субъекта, страдающего от не-ОПЛ ОМЛ или МДС, суперэнхансер, связанный с геном IRF8,
b. при этом суперэнхансер имеет эффективность, порядковый ранг или показатель распространенности, равные предварительно определенному пороговому уровню или превышающие его, у субъекта, страдающего от рака.
23. Способ, включающий этапы:
a. получения образца МКПК или образца обогащенных МКПК от субъекта, страдающего от не-ОПЛ ОМЛ или МДС;
b. выявления в биологическом образце одного или более из:
i) уровня мРНК IRF8, равного эталонному или превышающего его; или
ii) наличия суперэнхансера, связанного с геном IRF8, при этом суперэнхансер имеет эффективность, порядковый ранг или показатель распространенности, равные предварительно определенному порогу или превышающие его.
24. Способ диагностирования, прогнозирования или лечения субъекта, страдающего от не-ОПЛ ОМЛ или МДС, включающий этапы:
a. получения образца МКПК или образца обогащенных МКПК от субъекта;
b. определения в образце одного или более из повышенного уровня мРНК IRF8 или суперэнхансера, связанного с геном IRF8, у субъекта.
25. Способ по п. 24, отличающийся тем, что субъекту вводят терапевтическую композицию, содержащую агонист RARA, если уровень мРНК IRF8 равен эталонному или превышает его.
26. Способ по п. 24, отличающийся тем, что субъекту вводят терапевтическую композицию, содержащую агонист RARA, если суперэнхансер, связанный с геном IRF8, имеет эффективность, порядковый ранг или показатель распространенности, равные предварительно определенному порогу или превышающие его.
27. Способ диагностирования, прогнозирования или лечения субъекта, страдающего от не-ОПЛ ОМЛ или МДС, включающий этапы:
a. получения образца МКПК или образца обогащенных МКПК от субъекта;
b. определения в образце уровня мРНК IRF8 или суперэнхансера, связанного с геном IRF8, у субъекта; и
c. введения терапевтической композиции, содержащей агонист RARA, в случае одного или более из:
i) уровня мРНК IRF8, равного эталонному или превышающего его; или
ii) наличия суперэнхансера, связанного с геном IRF8, при этом суперэнхансер имеет эффективность, порядковый ранг или показатель распространенности, равные предварительно определенному порогу или превышающие его.
28. Способ по любому из пп. 24, 25 или 27, отличающийся тем, что агонист RARA представляет собой
29. Способ, включающий:
a. выявление одного или более из уровня мРНК RARA или суперэнхансера, связанного с геном RARA, в образце МКПК или образце обогащенных МКПК, полученном от субъекта с не-ОПЛ ОМЛ или МДС;
b. выявление одного или более из уровня мРНК IRF8 или суперэнхансера, связанного с геном IRF8, в биологическом образце, если биологический образец не экспрессирует одно или более из повышенного уровня мРНК RARA, равного эталонному или превышающего его, или суперэнхансера, связанного с геном RARA, который имеет эффективность, порядковый ранг или показатель распространенности, равные предварительно определенному порогу или превышающие его.
30. Способ, включающий:
a. выявление одного или более из уровня мРНК RARA или суперэнхансера, связанного с геном RARA, в образце МКПК или образце обогащенных МКПК, полученном от субъекта с не-ОПЛ ОМЛ или МДС;
b. выявление одного или более из уровня мРНК IRF8 или суперэнхансера, связанного с геном IRF8, в биологическом образце, если биологический образец экспрессирует одно или более из повышенного уровня мРНК RARA, равного эталонному или превышающего его, или суперэнхансера, связанного с геном RARA, который имеет эффективность, порядковый ранг или показатель распространенности, равные предварительно определенному порогу или превышающие его.
31. Способ, включающий:
a. выявление одного или более из уровня мРНК IRF8 или суперэнхансера, связанного с геном IRF8, в образце МКПК или образце обогащенных МКПК, полученном от субъекта с не-ОПЛ ОМЛ или МДС;
b. выявление одного или более из уровня мРНК RARA или суперэнхансера, связанного с геном RARA, в биологическом образце, если биологический образец не экспрессирует одно или более из повышенного уровня мРНК IRF8, равного эталонному или превышающего его, или суперэнхансера, связанного с геном IRF8, который имеет эффективность, порядковый ранг или показатель распространенности, равные предварительно определенному порогу или превышающие его.
32. Способ, включающий:
a. выявление одного или более из уровня мРНК IRF8 или суперэнхансера, связанного с геном IRF8, в образце МКПК или образце обогащенных МКПК, полученном от субъекта с не-ОПЛ ОМЛ или МДС;
b. выявление одного или более из уровня мРНК RARA или суперэнхансера, связанного с геном RARA, в биологическом образце, если биологический образец экспрессирует одно или более из повышенного уровня мРНК IRF8, равного эталонному или превышающего его, или суперэнхансера, связанного с геном IRF8, который имеет эффективность, порядковый ранг или показатель распространенности, равные предварительно определенному порогу или превышающие его.
33. Способ по любому из пп. 29-32, отличающийся тем, что этапы выявления можно проводить одновременно.
34. Способ по любому из пп. 29-32, дополнительно включающий введение пациенту агониста RARA.
35. Способ по п. 34, отличающийся тем, что агонист RARA представляет собой тамибаротен.
36. Способ по любому из пп. 29-35, отличающийся тем, что этап выявления уровня мРНК проводят, используя флуоресцентную гибридизацию, ПЦР, кПЦР, кОТ-ПЦР, РНК-секвенирование, РНК-гибридизацию и амплификацию сигнала или нозерн-блот.
37. Способ по любому из пп. 29-35, отличающийся тем, что этап выявления суперэнхансера проводят, используя H3K27Ас ChIP-секвенирование, иммунопреципитацию хроматина и матричный чип (ChIP-чип) или иммунопреципитацию хроматина с последующей кПЦР (ChIP-кПЦР).
38. Способ лечения не-ОПЛ ОМЛ или МДС, включающий этап:
введения комбинации тамибаротена и второго терапевтического агента субъекту, имеющему не-ОПЛ ОМЛ или МДС, при этом определено, что образец МКПК или образец обогащенных МКПК, полученный от субъекта, содержит биомаркер IRF8 и/или биомаркер RARA, причем:
биомаркер IRF8 представляет собой или включает экспрессию одного или более из повышенных уровней мРНК IRF8 или суперэнхансера, связанного с геном IRF8;
биомаркер RARA представляет собой или включает экспрессию одного или более из повышенных уровней мРНК RARA или суперэнхансера, связанного с геном RARA; и
второй терапевтический агент выбран из ингибитора ДНК-метилтрансферазы, ингибитора ДНК-синтазы, ингибитора топоизомеразы, ингибитора FLT3, ингибитора фолата, ингибитора BRD4, ингибитора Zn-пальцевого фактора транскрипции, ингибитора GCR, ингибитора CDK7, ингибитора HDAC, ингибитора JMJD3/JARID1B, ингибитора EZH2, ингибитора LSD1, ингибитора протеасом, ингибитора репарации повреждения ДНК, ингибитора PARP, ингибитора mTOR, ингибитора DOT1L, ингибитора тубулина, ингибитора PLK или ингибитора аврора-киназы.
39. Способ по п. 38, отличающийся тем, что рак представляет собой не-ОПЛ ОМЛ.
40. Способ по п. 38 или 39, отличающийся тем, что второй терапевтический агент выбран из ингибитора ДНК-метилтрансферазы, ингибитора ДНК-синтазы, ингибитора топоизомеразы, ингибитора FLT3, ингибитора фолата, ингибитора BRD4, ингибитора Zn-пальцевого фактора транскрипции, ингибитора GCR, ингибитора CDK7, ингибитора HDAC, ингибитора JMJD3/JARID1B и ингибитора EZH2.
41. Способ по п. 40, отличающийся тем, что второй терапевтический агент выбран из азацитидина, триоксида мышьяка, мидостаурина, цитарабина, даунорубицина, метотрексата, идарубицина, сорафениба, децитабина, квизартиниба, JQ1, АТО, преднизона, SAHA и GSKJ4, причем:
если второй терапевтический агент представляет собой мидостаурин, сорафениб или квизартиниб, агент вводят только в случае, если дополнительно определено, что рак имеет повышенный уровень мРНК FLT3;
если второй терапевтический агент представляет собой преднизон, агент вводят только в случае, если дополнительно определено, что рак имеет повышенный уровень мРНК GCR; и
если второй терапевтический агент представляет собой GSKJ4, агент вводят только в случае, если дополнительно определено, что рак имеет повышенный уровень мРНК JMJD3 и/или JARID1B.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201662320352P | 2016-04-08 | 2016-04-08 | |
| US62/320,352 | 2016-04-08 | ||
| PCT/US2017/026657 WO2017177167A1 (en) | 2016-04-08 | 2017-04-07 | Rara agonists for the treatment of aml and mds |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2018135302A true RU2018135302A (ru) | 2020-05-12 |
| RU2018135302A3 RU2018135302A3 (ru) | 2020-11-06 |
| RU2799789C2 RU2799789C2 (ru) | 2023-07-11 |
Family
ID=
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2017177167A1 (en) | 2017-10-12 |
| CN115737821A (zh) | 2023-03-07 |
| KR20180132841A (ko) | 2018-12-12 |
| AU2017248187B2 (en) | 2023-03-16 |
| JP2019513758A (ja) | 2019-05-30 |
| KR20220148926A (ko) | 2022-11-07 |
| RU2018135302A3 (ru) | 2020-11-06 |
| JP7034085B2 (ja) | 2022-03-11 |
| CA3020173A1 (en) | 2017-10-12 |
| US20240102106A1 (en) | 2024-03-28 |
| CN109310657A (zh) | 2019-02-05 |
| IL262156A (en) | 2018-11-29 |
| EP3452032A1 (en) | 2019-03-13 |
| AU2017248187A1 (en) | 2018-11-01 |
| BR112018070547A2 (pt) | 2019-02-12 |
| AU2023203040A1 (en) | 2023-06-08 |
| IL307615A (en) | 2023-12-01 |
| WO2017177167A4 (en) | 2017-12-21 |
| IL262156B1 (en) | 2023-11-01 |
| KR102457851B1 (ko) | 2022-10-25 |
| JP2021185171A (ja) | 2021-12-09 |
| JP2023057151A (ja) | 2023-04-20 |
| JP7284224B2 (ja) | 2023-05-30 |
| CN115737821B (zh) | 2024-04-12 |
| MX2018012250A (es) | 2019-06-24 |
| IL262156B2 (en) | 2024-03-01 |
| CN109310657B (zh) | 2022-12-13 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Long et al. | The critical role of epigenetics in systemic lupus erythematosus and autoimmunity | |
| Cheng et al. | Exosomes provide a protective and enriched source of miRNA for biomarker profiling compared to intracellular and cell-free blood | |
| Mposhi et al. | Regulation of mitochondrial gene expression, the epigenetic enigma | |
| Petrelli et al. | MicroRNA/gene profiling unveils early molecular changes and nuclear factor erythroid related factor 2 (NRF2) activation in a rat model recapitulating human hepatocellular carcinoma (HCC) | |
| Silakit et al. | Circulating mi R‐192 in liver fluke‐associated cholangiocarcinoma patients: a prospective prognostic indicator | |
| Chiba et al. | Cell growth inhibition and gene expression induced by the histone deacetylase inhibitor, trichostatin A, on human hepatoma cells | |
| Cao et al. | Role of MiRNAs in inflammatory bowel disease | |
| Li et al. | miRNA-155 upregulation and complement factor H deficits in Down’s syndrome | |
| Shiiyama et al. | Sensitive detection of melanoma metastasis using circulating microRNA expression profiles | |
| Guo et al. | Altered micro RNA expression in inflamed and non‐inflamed terminal ileal mucosa of adult patients with active C rohn's disease | |
| Stetka et al. | Addiction to DUSP1 protects JAK2V617F-driven polycythemia vera progenitors against inflammatory stress and DNA damage, allowing chronic proliferation | |
| Rossetti et al. | RNA editing signature during myeloid leukemia cell differentiation | |
| Zeng et al. | Dysregulated epigenetic modifications in psoriasis | |
| WO2014113804A1 (en) | Anti-tnf and anti-il17 combination therapy biomarkers for inflammatory disease | |
| Shen et al. | A three-gene signature as potential predictive biomarker for irinotecan sensitivity in gastric cancer | |
| Suzuki et al. | Peripheral blood cell‐free DNA is an alternative tumor DNA source reflecting disease status in myelodysplastic syndromes | |
| US11041212B2 (en) | ABCA1 downregulation in prostate cancer | |
| Iriyama et al. | Using peripheral blood circulating DNAs to detect CpG global methylation status and genetic mutations in patients with myelodysplastic syndrome | |
| Yang et al. | Epigenetic silencing of GDF1 disrupts SMAD signaling to reinforce gastric cancer development | |
| US20170175190A1 (en) | Circulating microRNA as Biomarkers for Endometriosis | |
| Ioannidis et al. | Association of plasma microRNA expression with age, genetic background and functional traits in dairy cattle | |
| Zhao et al. | Development of a highly sensitive method for detection of JAK2V617F | |
| Zhuang et al. | Hypermethylation of miR-145 promoter-mediated SOX9-CLDN8 pathway regulates intestinal mucosal barrier in Crohn's disease | |
| RU2018135302A (ru) | Агонисты rara для лечения омл и мдс | |
| Floch et al. | Characterisation of inflammatory processes in Helicobacter pylori-induced gastric lymphomagenesis in a mouse model |