RU2018110079A - Способ и устройство для распознавания тканей - Google Patents

Способ и устройство для распознавания тканей Download PDF

Info

Publication number
RU2018110079A
RU2018110079A RU2018110079A RU2018110079A RU2018110079A RU 2018110079 A RU2018110079 A RU 2018110079A RU 2018110079 A RU2018110079 A RU 2018110079A RU 2018110079 A RU2018110079 A RU 2018110079A RU 2018110079 A RU2018110079 A RU 2018110079A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
image
data
roi
discrete
comparator
Prior art date
Application number
RU2018110079A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2018110079A3 (ru
Inventor
Питер ХЭМИЛТОН
Original Assignee
Конинклейке Филипс Н.В.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Конинклейке Филипс Н.В. filed Critical Конинклейке Филипс Н.В.
Publication of RU2018110079A publication Critical patent/RU2018110079A/ru
Publication of RU2018110079A3 publication Critical patent/RU2018110079A3/ru

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T7/00Image analysis
    • G06T7/0002Inspection of images, e.g. flaw detection
    • G06T7/0012Biomedical image inspection
    • GPHYSICS
    • G02OPTICS
    • G02BOPTICAL ELEMENTS, SYSTEMS OR APPARATUS
    • G02B21/00Microscopes
    • G02B21/36Microscopes arranged for photographic purposes or projection purposes or digital imaging or video purposes including associated control and data processing arrangements
    • G02B21/365Control or image processing arrangements for digital or video microscopes
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06VIMAGE OR VIDEO RECOGNITION OR UNDERSTANDING
    • G06V20/00Scenes; Scene-specific elements
    • G06V20/60Type of objects
    • G06V20/69Microscopic objects, e.g. biological cells or cellular parts
    • G06V20/695Preprocessing, e.g. image segmentation
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06VIMAGE OR VIDEO RECOGNITION OR UNDERSTANDING
    • G06V20/00Scenes; Scene-specific elements
    • G06V20/60Type of objects
    • G06V20/69Microscopic objects, e.g. biological cells or cellular parts
    • G06V20/698Matching; Classification
    • HELECTRICITY
    • H04ELECTRIC COMMUNICATION TECHNIQUE
    • H04NPICTORIAL COMMUNICATION, e.g. TELEVISION
    • H04N7/00Television systems
    • H04N7/18Closed-circuit television [CCTV] systems, i.e. systems in which the video signal is not broadcast
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T2207/00Indexing scheme for image analysis or image enhancement
    • G06T2207/10Image acquisition modality
    • G06T2207/10056Microscopic image
    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T2207/00Indexing scheme for image analysis or image enhancement
    • G06T2207/20Special algorithmic details
    • G06T2207/20112Image segmentation details
    • G06T2207/20161Level set

Landscapes

  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Multimedia (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Computer Vision & Pattern Recognition (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Radiology & Medical Imaging (AREA)
  • Quality & Reliability (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Optics & Photonics (AREA)
  • Signal Processing (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Image Processing (AREA)
  • Image Analysis (AREA)
  • Investigating Or Analysing Materials By Optical Means (AREA)

Claims (38)

1. Компьютерно-реализуемый способ обработки изображений, включающий в себя
получение данных изображения с микроскопа, определяющих изображение предметного стекла микроскопа для окрашенного гематоксилином и эозином образца ткани, при этом данные изображения предметного стекла микроскопа содержат множество пикселей изображения;
получение данных дескриптора, указывающих тип ткани, из которого происходит образец ткани;
выбор, на основании данных дескриптора, операции с изображением, сконфигурированной для преобразования данных изображения;
применение выбранной операции с изображением к данным изображения для идентификации ряда дискретных областей пространства на изображении;
выбор из хранилища данных множества количественных метрик изображения, при этом количественные метрики изображения выбирают на основании данных дескриптора,
определение, для каждой дискретной области пространства, значения данных области изображения для каждой из множества количественных метрик изображения на основании подмножества данных изображения, ассоциированных с конкретной или каждой дискретной областью пространства,
использование данных дескриптора для выбора из хранилища данных по меньшей мере одного компараторного набора значений данных модели ткани, при этом каждый компараторный набор ассоциирован с отдельной соответствующей компараторной структурой ткани, и каждый компараторный набор содержит значения данных для множества количественных метрик изображения для соответствующей компараторной структуры ткани;
сравнение значений данных области изображения для каждой дискретной области по меньшей мере с одним компараторным набором;
в случае, когда значение данных области изображения для конкретной или каждой дискретной области пространства соответствует компараторному набору, предоставление карты данных изображения, показывающей, что конкретная дискретная область пространства содержит соответствующую компараторную структуру ткани;
в случае, когда дискретная область пространства (ROI) не соответствует данным компаратора, ее классифицируют как неразрешенную ROI, и дополнительную операцию с изображением применяют к неразрешенной ROI с получением модифицированной ROI; и
вычисление для модифицированной ROI по меньшей мере одной количественной метрики изображения для сравнения с данными компаратора с целью классификации модифицированной ROI.
2. Способ по п. 1, в котором операция с изображением включает операцию сравнения с порогом, сконфигурированную для предоставления карты изображения с двумя состояниями, например,
в котором дискретные области пространства содержат смежные группы пикселей, принадлежащие к первому из двух состояний карты с двумя состояниями, например, в котором смежные группы пикселей содержат превышающие порог пиксели.
3. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором количественные метрики изображения включают в себя по меньшей мере одну из: размера дискретной области пространства (ROI), формы дискретной области пространства (ROI), оптической плотности дискретной области пространства (ROI), границы дискретной области пространства (ROI), и содержит ли дискретная область пространства (ROI) идентифицируемые подкомпоненты ROI.
4. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором дополнительная операция с изображением включает по меньшей мере одно из размывания, расширения и открытия.
5. Способ по любому из предшествующих пунктов, включающий в себя сравнение значения по меньшей мере одной количественной метрики изображения для модифицированной ROI с данными компаратора с целью идентификации модифицированной ROI.
6. Способ по п. 5, в котором, в случае, когда одно или более значений по меньшей мере одной количественной метрики изображения для модифицированной ROI не соответствуют данным компаратора для идентификации модифицированной ROI, способ включает в себя получение второй модифицированной ROI путем применения второй дополнительной операции с изображением по меньшей мере к одной из: (a) неразрешенной ROI и (b) модифицированной ROI.
7. Способ по п. 6, включающий в себя вычисление для второй модифицированной ROI по меньшей мере одной количественной метрики изображения, выбранной из списка, включающего в себя: размер ROI, форму ROI, оптическую плотность ROI, границу ROI, и содержит ли ROI идентифицируемые подкомпоненты ROI, и
сравнение значений по меньшей мере одной количественной метрики изображения для второй модифицированной ROI с данными компаратора для идентификации второй модифицированной ROI, например,
в случае, когда вторая модифицированная ROI не соответствует данным компаратора для идентификации второй модифицированной ROI, способ включает в себя циклическое повторение:
(i) применение еще одного оператора изображения с получением дополнительно модифицированной ROI;
(ii) вычисление по меньшей мере одной количественной метрики изображения; и
(iii) сравнение значений по меньшей мере одной количественной метрики изображения для этой дополнительно модифицированной ROI с данными компаратора для идентификации этой дополнительно модифицированной ROI.
8. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором операция с изображением включает пространственный фильтр, сконфигурированный для идентификации структурированных данных изображения, которые описывают структуры, имеющие шкалу пространственной длины в выбранном диапазоне, например,
в котором пространственный фильтр включает морфологический фильтр, имеющий структурирующий элемент, выбранный на основании данных дескриптора, при этом
по меньшей мере одно из размера и формы структурирующего элемента выбирают на основании данных дескриптора.
9. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором множество количественных метрик изображения включает в себя метрику, основанную на оптической плотности в конкретной или каждой дискретной области.
10. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором множество количественных метрик изображения включает в себя:
(a) метрику, основанную на пространственных частотных данных в выбранном диапазоне пространственных частот в конкретной или каждой дискретной области;
(b) метрику, основанную на данных текстуры в конкретной или каждой дискретной области; и
(c) по меньшей мере одну метрику морфологии ткани по шкале длины, выбранной на основании данных дескриптора.
11. Способ по любому из предшествующих пунктов, включающий в себя определение на основании идентичности соответствующей компараторной структуры ткани, следует ли дополнительно анализировать конкретную или каждую дискретную область, при этом в случае, когда конкретную или каждую дискретную область не будут дополнительно анализировать, конкретную или каждую дискретную область исключают из последующего анализа данных изображения.
12. Способ по любому из предшествующих пунктов, включающий в себя применение первого морфологического фильтра к данным изображения в конкретной или каждой дискретной области в случае, когда конкретную или каждую дискретную область следует проанализировать дополнительно, при этом морфологический фильтр имеет структурирующий элемент, выбранный для предоставления данных по клеточным ядрам, идентифицирующих клеточные ядра.
13. Способ по любому из предшествующих пунктов, включающий в себя получение значений данных для указанного множества количественных метрик изображения из множества изображений предметного стекла микроскопа, выбор последовательности из множества изображений предметного стекла микроскопа на основании значений данных для по меньшей мере одной из указанного множества количественных метрик изображения, например, дополнительно включающий в себя представление множества изображений предметного стекла микроскопа человеку-оператору в выбранной последовательности.
14. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором данные изображения включают в себя данные оптической плотности.
15. Диагностическое устройство, сконфигурированное для выполнения способа по любому из предшествующих пунктов, например, при этом устройство сконфигурировано для предоставления по меньшей мере одного из (a) дополненного изображения, содержащего указание результата по меньшей мере одного из указанных этапов сравнения, и (b) диагностического указания наличия раковых клеток в ткани на основании результата по меньшей мере одного из указанных этапов сравнения.
16. Компьютерный программный продукт, включающий в себя инструкции программ, сконфигурированные для программирования процессора для выполнения способа по любому из пп. 1-13.
RU2018110079A 2015-09-23 2016-09-23 Способ и устройство для распознавания тканей RU2018110079A (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
GB1516869.3A GB2542765A (en) 2015-09-23 2015-09-23 Method and apparatus for tissue recognition
GB1516869.3 2015-09-23
PCT/GB2016/052974 WO2017051191A2 (en) 2015-09-23 2016-09-23 Method and apparatus for tissue recognition

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2018110079A true RU2018110079A (ru) 2019-10-23
RU2018110079A3 RU2018110079A3 (ru) 2020-03-13

Family

ID=54544702

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2018110079A RU2018110079A (ru) 2015-09-23 2016-09-23 Способ и устройство для распознавания тканей

Country Status (7)

Country Link
US (1) US10671832B2 (ru)
EP (1) EP3353743A2 (ru)
JP (1) JP2018529103A (ru)
CN (1) CN108140239A (ru)
GB (1) GB2542765A (ru)
RU (1) RU2018110079A (ru)
WO (1) WO2017051191A2 (ru)

Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA3081643A1 (en) 2017-11-06 2019-05-09 University Health Network Platform, device and process for annotation and classification of tissue specimens using convolutional neural network
US11080324B2 (en) * 2018-12-03 2021-08-03 Accenture Global Solutions Limited Text domain image retrieval
WO2020182710A1 (en) 2019-03-12 2020-09-17 F. Hoffmann-La Roche Ag Multiple instance learner for prognostic tissue pattern identification
CN111144244B (zh) * 2019-12-13 2023-07-11 唐美(北京)文化科技发展有限公司 家具木材类别识别方法及装置
CN113066080A (zh) * 2021-04-19 2021-07-02 广州信瑞医疗技术有限公司 切片组织识别方法、装置,细胞识别模型及组织分割模型
WO2024011111A1 (en) * 2022-07-06 2024-01-11 Memorial Sloan-Kettering Cancer Center Determining predicted outcomes of subjects with cancer based on segmentations of biomedical images
CN117853932B (zh) * 2024-03-05 2024-05-14 华中科技大学 一种基于光电吊舱的海面目标检测方法、检测平台及系统

Family Cites Families (28)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6466687B1 (en) * 1997-02-12 2002-10-15 The University Of Iowa Research Foundation Method and apparatus for analyzing CT images to determine the presence of pulmonary tissue pathology
US8406498B2 (en) * 1999-01-25 2013-03-26 Amnis Corporation Blood and cell analysis using an imaging flow cytometer
US6993169B2 (en) * 2001-01-11 2006-01-31 Trestle Corporation System and method for finding regions of interest for microscopic digital montage imaging
US7864380B2 (en) * 2001-03-19 2011-01-04 Dmetrix, Inc. Slide-borne imaging instructions
CA2492071A1 (en) * 2002-06-18 2003-12-24 Lifespan Biosciences, Inc. Computerized image capture of structures of interest within a tissue sample
GB2398379A (en) * 2003-02-11 2004-08-18 Qinetiq Ltd Automated digital image analysis
JP2006526783A (ja) * 2003-05-30 2006-11-24 アンドリュー エム. ラビノビッチ、 色分解および組織試料内の対象となる領域の検出
RU2295297C2 (ru) 2003-12-02 2007-03-20 Александр Васильевич Жукоцкий Способ исследования и диагностики состояния биологического объекта или его части
CN1296699C (zh) * 2003-12-19 2007-01-24 武汉大学 显微多光谱骨髓及外周血细胞自动分析仪和分析骨髓及外周血细胞的方法
US20060127880A1 (en) * 2004-12-15 2006-06-15 Walter Harris Computerized image capture of structures of interest within a tissue sample
US20070135999A1 (en) * 2005-12-13 2007-06-14 Applied Spectral Imaging Ltd. Method, apparatus and system for characterizing pathological specimen
US8077958B2 (en) * 2006-06-30 2011-12-13 University Of South Florida Computer-aided pathological diagnosis system
AU2008247379A1 (en) 2007-05-07 2008-11-13 Ge Healthcare Bio-Sciences Corp. System and method for the automated analysis of cellular assays and tissues
RU2353295C2 (ru) 2007-05-08 2009-04-27 Государственное учреждение Научный центр клинической и экспериментальной медицины Сибирского отделения Российской академии медицинских наук (ГУ НЦКЭМ СО РАМН) Способ дифференциальной диагностики фолликулярной аденомы и фолликулярного рака щитовидной железы
WO2009003198A1 (en) 2007-06-28 2008-12-31 Mayo Foundation For Medical Education And Research System and method for automatically detecting change in a series of medical images of a subject over time
US8600135B2 (en) 2007-06-28 2013-12-03 Mayo Foundation For Medical Education And Research System and method for automatically generating sample points from a series of medical images and identifying a significant region
US8116551B2 (en) * 2007-12-04 2012-02-14 University College, Dublin, National University of Ireland Method and system for image analysis
JP2011022131A (ja) 2009-06-18 2011-02-03 Olympus Corp 医療診断支援装置、画像処理方法、画像処理プログラム、およびバーチャル顕微鏡システム
US20100329535A1 (en) * 2009-06-26 2010-12-30 Marc Macenko Methods, Systems and Computer Program Products for Analyzing Histology Slide Images
RU2014102672A (ru) 2011-07-28 2015-09-10 Медетект Аб Способ получения изображений среза ткани
WO2013022688A1 (en) * 2011-08-05 2013-02-14 Siemens Healthcare Diagnostics Inc. Automated detection of diagnostically relevant regions in pathology images
US20140233826A1 (en) * 2011-09-27 2014-08-21 Board Of Regents Of The University Of Texas System Systems and methods for automated screening and prognosis of cancer from whole-slide biopsy images
JP6530314B2 (ja) * 2012-10-03 2019-06-12 コーニンクレッカ フィリップス エヌ ヴェKoninklijke Philips N.V. 組み合わされた試料検査
US9946953B2 (en) * 2013-05-10 2018-04-17 Koninklijke Philips N.V. Apparatus and method for processing images of tissue samples
US10776606B2 (en) * 2013-09-22 2020-09-15 The Regents Of The University Of California Methods for delineating cellular regions and classifying regions of histopathology and microanatomy
AU2015212984A1 (en) * 2014-01-28 2016-06-23 Ventana Medical Systems, Inc. Adaptive classification for whole slide tissue segmentation
US9092691B1 (en) * 2014-07-18 2015-07-28 Median Technologies System for computing quantitative biomarkers of texture features in tomographic images
CN104745670A (zh) * 2015-04-16 2015-07-01 黄小军 一种细胞芯片的制备方法及其在肿瘤筛查领域的应用

Also Published As

Publication number Publication date
CN108140239A (zh) 2018-06-08
US20190073511A1 (en) 2019-03-07
EP3353743A2 (en) 2018-08-01
GB2542765A (en) 2017-04-05
RU2018110079A3 (ru) 2020-03-13
US10671832B2 (en) 2020-06-02
GB201516869D0 (en) 2015-11-04
WO2017051191A2 (en) 2017-03-30
JP2018529103A (ja) 2018-10-04
WO2017051191A3 (en) 2017-04-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2018110079A (ru) Способ и устройство для распознавания тканей
US9842391B2 (en) Method and apparatus for processing an image of a tissue sample
Zhang et al. Cell detection and segmentation using correlation clustering
JP6547386B2 (ja) 画像処理装置及び方法
JP2022164718A (ja) 顕微鏡スライド画像のための焦点重み付き機械学習分類器誤り予測
WO2016201186A1 (en) Systems and methods for finding regions of interest in hematoxylin and eosin (h&e) stained tissue images and quantifying intratumor cellular spatial heterogeneity in multiplexed/hyperplexed fluorescence tissue images
US9916658B2 (en) Disease analysis apparatus, control method, and program
RU2015111423A (ru) Способ и устройство для идентификации целевого объекта на изображении
US20150186755A1 (en) Systems and Methods for Object Identification
Rabinovich et al. Model order selection and cue combination for image segmentation
CN107315989B (zh) 针对医学资料图片的文本识别方法和装置
JP2018535470A5 (ru)
US10565706B2 (en) Method and apparatus for tissue recognition
CN106408578A (zh) 一种单木分割方法及装置
Son et al. Morphological change tracking of dendritic spines based on structural features
US9070203B2 (en) Identification and quantification of microtextured regions in materials with ordered crystal structure
Schimke et al. Quickshear Defacing for Neuroimages.
US20180047158A1 (en) Chest radiograph (cxr) image analysis
Yanulevskaya et al. Salient object detection: from pixels to segments
JP6070420B2 (ja) 画像処理装置及びプログラム
WO2017051195A1 (en) Pattern driven image processing method & apparatus for tissue recognition
Fabjawska Normalized cuts and watersheds for image segmentation
JP5755810B2 (ja) 特徴抽出のための技法
Kerekes et al. Colon cancer diagnosis on digital tissue images
Su et al. Learning based automatic detection of myonuclei in isolated single skeletal muscle fibers using multi-focus image fusion

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20210416