RU2018105883A - Растения пшеницы, устойчивые к мучнистой росе - Google Patents

Растения пшеницы, устойчивые к мучнистой росе Download PDF

Info

Publication number
RU2018105883A
RU2018105883A RU2018105883A RU2018105883A RU2018105883A RU 2018105883 A RU2018105883 A RU 2018105883A RU 2018105883 A RU2018105883 A RU 2018105883A RU 2018105883 A RU2018105883 A RU 2018105883A RU 2018105883 A RU2018105883 A RU 2018105883A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
plant
tamlo
wheat
mutation
cell
Prior art date
Application number
RU2018105883A
Other languages
English (en)
Inventor
Цайся ГАО
Цзинь-Лун ЦЮ
Яньпэн ВАН
Original Assignee
Инститьют Оф Джинетикс Энд Дивелопментал Байолоджи Чайниз Академи Оф Сайенсиз
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Инститьют Оф Джинетикс Энд Дивелопментал Байолоджи Чайниз Академи Оф Сайенсиз filed Critical Инститьют Оф Джинетикс Энд Дивелопментал Байолоджи Чайниз Академи Оф Сайенсиз
Publication of RU2018105883A publication Critical patent/RU2018105883A/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • C12N15/8279Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance
    • C12N15/8282Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance for fungal resistance
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01HNEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H1/00Processes for modifying genotypes ; Plants characterised by associated natural traits
    • A01H1/12Processes for modifying agronomic input traits, e.g. crop yield
    • A01H1/122Processes for modifying agronomic input traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • A01H1/1245Processes for modifying agronomic input traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, e.g. pathogen, pest or disease resistance
    • A01H1/1255Processes for modifying agronomic input traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, e.g. pathogen, pest or disease resistance for fungal resistance
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01HNEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H5/00Angiosperms, i.e. flowering plants, characterised by their plant parts; Angiosperms characterised otherwise than by their botanic taxonomy
    • A01H5/10Seeds
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01HNEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H6/00Angiosperms, i.e. flowering plants, characterised by their botanic taxonomy
    • A01H6/46Gramineae or Poaceae, e.g. ryegrass, rice, wheat or maize
    • A01H6/4678Triticum sp. [wheat]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/20Type of nucleic acid involving clustered regularly interspaced short palindromic repeats [CRISPRs]

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Environmental Sciences (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Physiology (AREA)
  • Natural Medicines & Medicinal Plants (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Agricultural Chemicals And Associated Chemicals (AREA)

Claims (29)

1. Растение, часть растения или клетка растения, пшеницы, имеющее повышенную устойчивость к настоящей мучнистой росе в сравнении с растением пшеницы дикого типа и сопоставимую урожайность в условиях, когда заболевание отсутствует, в сравнении с растением пшеницы дикого типа, при этом указанное растение имеет мутацию потери функции в кодирующих областях двух аллелей, выбранных из TaMLO-A1, TaMLO-B1 и TaMLO-D1, и сниженную экспрессию третьего аллеля TaMLO.
2. Растение, часть растения или клетка растения, пшеницы по п. 1, при этом указанный третий аллель TaMLO не имеет мутацию в кодирующей области в сравнении с аллелем дикого типа.
3. Растение, часть растения или клетка растения, пшеницы по п. 1, при этом указанное растение имеет мутацию потери функции в кодирующих областях TaMLO-A1 и TaMLO-D1 и сниженную экспрессию TaMLO-B1.
4. Растение, часть растения или клетка растения, пшеницы по п. 3, при этом указанная сниженная экспрессия TaMLO-B1 вызвана мутацией в регуляторной области TaMLO-B1, мутацией в гене, находящемся далее в пути ответа MLO на патоген, или является следствием эпигенетического фактора.
5. Растение, часть растения или клетка растения, пшеницы по п. 1, при этом указанную мутацию вносят методом направленной модификации генома.
6. Растение, часть растения или клетка растения, пшеницы по п. 5, при этом указанную мутацию вносят с использованием редкощепящей эндонуклеазы, например, TALEN, ZFN или CRISPR/Cas9.
7. Растение, часть растения или клетка растения, пшеницы по п. 6, при этом указанную мутацию вносят с использованием TALEN и при этом указанный TAL-эффектор связывается с TCGCTGCTGCTCGCCGTgacgcaggaccccatctcCGGGATATGCATCTCCGA (SEQ ID NO: 13).
8. Растение, часть растения или клетка растения, пшеницы по п. 1, при этом указанная мутация представляет собой вставку, делецию или замену.
9. Растение, часть растения или клетка растения, пшеницы по п. 1, при этом указанное растение пшеницы выбирают из списка, который включает, но без ограничения, Triticum aestivum, T. aethiopicum, T. araraticum, T. boeoticum, T. carthlicum, T. compactum, T. dicoccoides, T. dicoccum, T. durum, T. ispahanicum, T. karamyschevii, T. macha, T. militinae, T. monococcum, T. polonicum, T. repens, T. spelta, T. sphaerococcum, T. timopheevii, T. turanicum, T. turgidum, T. urartu, T. vavilovii и T. zhukovskyi.
10. Растение, часть растения или клетка растения, пшеницы по п. 1, при этом указанная мутация находится в аллеле TaMLO-A1, содержащем последовательность дикого типа SEQ ID NO: 1 или ее функциональный вариант с по меньшей мере 75% идентичности последовательности с указанной последовательностью дикого типа.
11. Растение, часть растения или клетка растения, пшеницы по п. 1, при этом мутация находится в аллеле TaMLO-B1, содержащем последовательность дикого типа SEQ ID NO: 2 или ее функциональный вариант с по меньшей мере 75% идентичности последовательности с указанной последовательностью дикого типа.
12. Растение, часть растения или клетка растения, пшеницы по п. 1, при этом мутация находится в аллеле TaMLO-D1, содержащем последовательность дикого типа SEQ ID NO: 3 или ее функциональный вариант с по меньшей мере 75% идентичности последовательности с указанной последовательностью дикого типа.
13. Растение, часть растения или клетка растения, пшеницы по п. 1, при этом указанное растение не содержит трансген.
14. Растение, часть растения или клетка растения, пшеницы по п. 1, содержащее последовательность Tamlo-a, приведенную в SEQ ID NO: 38, последовательность Tamlo-d, приведенную в SEQ ID NO: 39, и последовательность TaMLO-B1, имеющую последовательность дикого типа SEQ ID NO: 2.
15. Растение, часть растения или клетка растения, пшеницы, при этом генотип указанной пшеницы депонирован под регистрационным номером CGMCC 10951.
16. Часть растения или семя растения по любому из предшествующих пунктов.
17. Способ получения растения, части растения или клетки растения, пшеницы с повышенной устойчивостью к настоящей мучнистой росе в сравнении с растением дикого типа и сопоставимой урожайностью в условиях, когда заболевание отсутствует, в сравнении с растением пшеницы дикого типа, методом направленной модификации генома, включающим внесение мутации потери функции в кодирующие области двух аллелей MLO, выбранных из TaMLO-A1, TaMLO-B1 и TaMLO-D1, и снижение экспрессии третьего аллеля TaMLO.
18. Способ по п. 17, отличающийся тем, что указанный третий аллель TaMLO не имеет мутацию в кодирующей области в сравнении с аллелем дикого типа.
19. Способ по п. 17, включающий внесение мутации потери функции в кодирующие области TaMLO-A1, TaMLO-D1 и снижение экспрессии TaMLO-B1.
20. Способ по п. 19, отличающийся тем, что TaMLO-B1 имеет мутацию в регуляторной области.
21. Способ по пп. 17 и 20, отличающийся тем, что указанную мутацию вносят с использованием редкощепящей эндонуклеазы, например, TALEN, ZFN или CRISPR/Cas9.
22. Способ по п. 21, отличающийся тем, что скрининг на индуцированные направленные мутации в аллеле TaMLO-A1, TaMLO-B1 и/или TaMLO-D1 включает получение образца нуклеиновой кислоты из указанного растения, проведение амплификации нуклеиновой кислоты и, необязательно, расщепление ферментом рестрикции для обнаружения мутации в аллеле TaMLO-A1, TaMLO-B1 и/или TaMLO-D1.
23. Способ по п. 22, включающий подтверждение наличия мутации путем секвенирования нуклеиновой кислоты TaMLO-A1, TaMLO-B1 и/или TaMLO-D1.
24. Способ по п. 21, включающий дополнительный этап регенерации растения и скрининга на растение, устойчивое к настоящей мучнистой росе.
25. Способ придания растению пшеницы устойчивости к настоящей мучнистой росе, включающий получение растения по п. 17.
26. Способ по п. 17, отличающийся тем, что указанное растение не содержит трансген.
27. Растение, часть растения или клетка растения, полученные или получаемые способом по п. 17.
28. Часть растения по п. 27, представляющая собой семя.
29. Выделенная нуклеотидная последовательность Tamlo, приведенная в SEQ ID NO: 38 или 39.
RU2018105883A 2015-07-17 2016-07-15 Растения пшеницы, устойчивые к мучнистой росе RU2018105883A (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN2015084370 2015-07-17
CNPCT/CN2015/084370 2015-07-17
PCT/GB2016/052149 WO2017013409A2 (en) 2015-07-17 2016-07-15 Modified plants

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2018105883A true RU2018105883A (ru) 2019-08-19

Family

ID=56802625

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2018105883A RU2018105883A (ru) 2015-07-17 2016-07-15 Растения пшеницы, устойчивые к мучнистой росе

Country Status (7)

Country Link
US (1) US10988775B2 (ru)
EP (1) EP3325629A2 (ru)
CN (1) CN108026540A (ru)
AU (1) AU2016295291A1 (ru)
CA (1) CA2992799A1 (ru)
RU (1) RU2018105883A (ru)
WO (1) WO2017013409A2 (ru)

Families Citing this family (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP6614622B2 (ja) * 2018-04-17 2019-12-04 国立大学法人名古屋大学 植物ゲノム編集方法
CN109430045A (zh) * 2018-11-12 2019-03-08 江苏里下河地区农业科学研究所 一种嵌合型小麦抗白粉病基因突变体的创制方法
EP3927145A4 (en) * 2019-02-23 2022-08-10 Betterseeds Ltd. MILDEW RESISTANT CANNABIS PLANTS
WO2021218961A1 (zh) * 2020-04-27 2021-11-04 中国科学院微生物研究所 获得具有增加的白粉病抗性的小麦的方法
CN111961684B (zh) * 2020-08-31 2022-01-04 中国农业科学院作物科学研究所 通过抑制小麦中TaVQ5基因的表达提高小麦抗病性的方法
WO2023081819A2 (en) * 2021-11-05 2023-05-11 Colorado State University Research Foundation Wheat plants with reduced free asparagine concentration in grain
CN114231661B (zh) * 2022-01-20 2024-04-19 河南大学 与抗白粉病基因Pm58共分离的KASP分子标记及其应用
CN116479015B (zh) * 2023-03-30 2024-04-26 西北农林科技大学 葡萄白粉菌效应因子、其互作蛋白及其应用

Family Cites Families (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8440A (en) 1851-10-21 Improvement in the tops of cans or canisters
US432A (en) 1837-10-20 Improvement in gun-carriages
JP4324656B2 (ja) 1996-07-29 2009-09-02 ケイヘン ナームロゼ フェンノートシャップ 植物の防御応答を調節するポリヌクレオチドおよびそれの使用
EP2510096B2 (en) 2009-12-10 2018-02-07 Regents of the University of Minnesota Tal effector-mediated dna modification
CN102703462A (zh) * 2012-03-31 2012-10-03 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 二穗短柄草抗白粉病基因快速鉴定
US10077451B2 (en) * 2012-10-18 2018-09-18 Monsanto Technology Llc Methods and compositions for plant pest control
US8697359B1 (en) 2012-12-12 2014-04-15 The Broad Institute, Inc. CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products
CN104561033A (zh) * 2013-10-28 2015-04-29 常熟市杜桥稻米专业合作社 小麦mlo型白粉病基因的快速鉴定
AU2014378946B2 (en) * 2014-01-21 2018-04-19 Suzhou Qi Biodesign Biotechnology Company Limited Modified plants
JP2016153406A (ja) * 2016-03-02 2016-08-25 住友化学株式会社 有害生物の防除方法

Also Published As

Publication number Publication date
EP3325629A2 (en) 2018-05-30
CA2992799A1 (en) 2017-01-26
CN108026540A (zh) 2018-05-11
WO2017013409A2 (en) 2017-01-26
WO2017013409A3 (en) 2017-03-02
US20180208939A1 (en) 2018-07-26
AU2016295291A1 (en) 2018-02-08
US10988775B2 (en) 2021-04-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2018105883A (ru) Растения пшеницы, устойчивые к мучнистой росе
Barragan et al. RPW8/HR repeats control NLR activation in Arabidopsis thaliana
Acevedo‐Garcia et al. mlo‐based powdery mildew resistance in hexaploid bread wheat generated by a non‐transgenic TILLING approach
Bertazzoni et al. Accessories make the outfit: accessory chromosomes and other dispensable DNA regions in plant-pathogenic fungi
Downie et al. Assessing European wheat sensitivities to Parastagonospora nodorum necrotrophic effectors and fine-mapping the Snn3-B1 locus conferring sensitivity to the effector SnTox3
Cho et al. Complete chloroplast genome sequences of Solanum commersonii and its application to chloroplast genotype in somatic hybrids with Solanum tuberosum
Marone et al. Characterization of wheat DArT markers: genetic and functional features
Nellist et al. Multiple copies of eukaryotic translation initiation factors in Brassica rapa facilitate redundancy, enabling diversification through variation in splicing and broad‐spectrum virus resistance
Bronner et al. Quantitative insertion-site sequencing (QIseq) for high throughput phenotyping of transposon mutants
Ouyang et al. Fine physical and genetic mapping of powdery mildew resistance gene MlIW172 originating from wild emmer (Triticum dicoccoides)
Arafa et al. Rapid identification of candidate genes for resistance to tomato late blight disease using next-generation sequencing technologies
Gawroński et al. DArT markers effectively target gene space in the rye genome
Chen et al. Genetic analyses of the internal transcribed spacer sequences suggest introgression and duplication in the medicinal mushroom Agaricus subrufescens
Hébrard et al. Identification of a hypervirulent pathotype of Rice yellow mottle virus: A threat to genetic resistance deployment in West-Central Africa
Terracciano et al. Development of COS-SNP and HRM markers for high-throughput and reliable haplotype-based detection of Lr14a in durum wheat (Triticum durum Desf.)
Vossen et al. Mining the genus Solanum for increasing disease resistance
Poulicard et al. Human management of a wild plant modulates the evolutionary dynamics of a gene determining recessive resistance to virus infection
US20210189419A1 (en) Loss-of-function gene of dominant gene eifiso4e-s resistant to tvbmv and uses thereof
Gilbert et al. Components of Brachypodium distachyon resistance to nonadapted wheat stripe rust pathogens are simply inherited
Vasudevan et al. Geographically distinct and domain-specific sequence variations in the alleles of rice blast resistance gene Pib
Vaghefi et al. Identification of the MAT1 locus in Stagonosporopsis tanaceti, and exploring its potential for sexual reproduction in Australian pyrethrum fields
Muñoz-Baena et al. Genome sequencing of two Bell pepper endornavirus (BPEV) variants infecting Capsicum annuum in Colombia
CA2874535C (en) High throughput method of screening a population for members comprising mutation(s) in a target sequence
Becker et al. Improved detection and quantification of cauliflower mosaic virus in food crops: assessing false positives in GMO screening based on the 35S promoter
Zhou et al. Identification of novel alleles of the rice blast-resistance gene Pi9 through sequence-based allele mining

Legal Events

Date Code Title Description
FA93 Acknowledgement of application withdrawn (no request for examination)

Effective date: 20190716