RU2017131505A - Система лиганд-индуцируемого сопряжения полипептидов - Google Patents
Система лиганд-индуцируемого сопряжения полипептидов Download PDFInfo
- Publication number
- RU2017131505A RU2017131505A RU2017131505A RU2017131505A RU2017131505A RU 2017131505 A RU2017131505 A RU 2017131505A RU 2017131505 A RU2017131505 A RU 2017131505A RU 2017131505 A RU2017131505 A RU 2017131505A RU 2017131505 A RU2017131505 A RU 2017131505A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- alkyl
- polypeptide
- sequence seq
- polypeptides
- paragraphs
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6803—General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
- G01N33/6845—Methods of identifying protein-protein interactions in protein mixtures
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
- C07K14/01—DNA viruses
- C07K14/03—Herpetoviridae, e.g. pseudorabies virus
- C07K14/035—Herpes simplex virus I or II
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/43504—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from invertebrates
- C07K14/43563—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from invertebrates from insects
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/70567—Nuclear receptors, e.g. retinoic acid receptor [RAR], RXR, nuclear orphan receptors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/01—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
- C07K2319/03—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a transmembrane segment
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/70—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction
- C07K2319/71—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing domain for transcriptional activaation, e.g. VP16
- C07K2319/715—Fusion polypeptide containing domain for protein-protein interaction containing domain for transcriptional activaation, e.g. VP16 containing a domain for ligand dependent transcriptional activation, e.g. containing a steroid receptor domain
Claims (78)
1. Два полипептида, содержащих первый не встречающийся в природе полипептид, содержащий фрагмент или домен ядерного рецепторного белка, и второй не встречающийся в природе полипептид, содержащий другой фрагмент или домен ядерного рецепторного белка, причем указанный первый полипептид способен к связыванию активирующего лиганда, причем указанный второй полипептид способен вступать в связь с указанным первым полипептидом в присутствии указанного активирующего лиганда, при этом каждый из указанных первого и второго полипептидов дополнительно содержит гетерологичные аминокислоты или последовательности полипептидов, такие, что индуцированное активирующим лигандом образование связи между указанными первым и вторым полипептидами приводит к активированному функциональному состоянию, биологическому состоянию или состоянию передачи клеточных сигналов.
2. Первый и второй полипептиды по п. 1, отличающиеся тем, что один или оба фрагмента или домена ядерного рецепторного белка содержат последовательность аминокислот ядерного рецептора членистоногих.
3. Первый и второй полипептиды по п. 1 или 2, отличающиеся тем, что один или оба фрагмента или домена ядерного рецепторного белка содержат последовательность аминокислот ядерного рецептора группы Н.
4. Первый и второй полипептиды по любому из пп. 1-3, отличающиеся тем, что указанная последовательность аминокислот ядерного рецептора в первом полипептиде содержит лиганд-связывающий домен экдизонового рецептора (EcR), его полипептидный фрагмент или полученный путем замен мутант.
5. Первый и второй полипептиды по любому из пп. 1-4, отличающиеся тем, что указанный второй полипептидный фрагмент или домен ядерного рецепторного белка содержит последовательность аминокислот ядерного рецептора млекопитающих.
6. Первый и второй полипептиды по п. 5, отличающиеся тем, что указанный фрагмент или домен ядерного рецепторного белка млекопитающих содержит полипептидный фрагмент ядерного рецептора RXR или его полученный путем замен мутант.
7. Первый и второй полипептиды по любому из пп. 1-6, отличающиеся тем, что указанный второй полипептидный фрагмент или домен ядерного рецепторного белка содержит химеру из последовательностей аминокислот ядерных рецепторов беспозвоночных и млекопитающих, или их полученных путем замен мутантов.
8. Первый и второй полипептиды по п. 7, отличающиеся тем, что указанный второй полипептидный фрагмент или домен ядерного рецепторного белка содержит химеру из последовательностей аминокислот ядерных рецепторов USP (гомолог RXR) беспозвоночных и RXR млекопитающих, или их полученных путем замен мутантов.
9. Система лиганд-индуцируемого сопряжения полипептидов (LIPC), содержащая:
a) Первый не встречающийся в природе полипептид, содержащий фрагмент или домен ядерного рецепторного белка членистоногих, и
b) Второй не встречающийся в природе полипептид, содержащий фрагмент или домен ядерного рецепторного белка членистоногих и/или млекопитающих,
при этом указанные первый и второй полипептиды содержат дополнительные гетерологичные последовательности, способные обеспечивать активированное функциональное состояние, биологическое состояние или состояние передачи клеточных сигналов после контакта с активирующим лигандом.
10. Система LIPC по п. 9, отличающаяся тем, что один или оба фрагмента или домена ядерного рецепторного белка содержат последовательность аминокислот ядерного рецептора группы Н.
11. Система LIPC по п. 9 или 10, отличающаяся тем, что указанный первый полипептид содержит лиганд-связывающий домен экдизонового рецептора (EcR), его полипептидный фрагмент или полученный путем замен мутант.
12. Система LIPC по любому из пп. 9-11, отличающаяся тем, что указанный второй полипептид содержит последовательность аминокислот ядерного рецептора млекопитающих.
13. Система LIPC по п. 12, отличающаяся тем, что указанный второй полипептид содержит полипептидный фрагмент ядерного рецептора RXR или его полученный путем замен мутант.
14. Система LIPC по любому из пп. 9-13, отличающаяся тем, что указанный второй полипептид содержит химеру из последовательностей аминокислот ядерных рецепторов беспозвоночных и млекопитающих, или их полученных путем замен мутантов.
15. Система LIPC по п. 14, отличающаяся тем, что указанный второй полипептид содержит химеру из последовательностей аминокислот ядерных рецепторов USP (гомолог RXR) беспозвоночных и RXR млекопитающих, или их полученных путем замен мутантов.
16. Первый и второй полипептиды по любому из пп. 1-8 или система LIPC по любому из пп. 9-15, отличающиеся тем, что по меньшей мере один из фрагментов ядерных рецепторных белков происходит из полипептида экдизонового рецептора, выбранного из группы, состоящей из LBD EcR еловой листовертки-почкоеда Choristoneura fumiferana («CfEcR»), LBD EcR жука Tenebrio molitor («TmEcR»), LBD EcR Manduca sexta («MsEcR»), EcR LBD Heliothies virescens («HvEcR»), LBD EcR звонца Chironomus tentans («CfEcR»), LBD EcR тутового шелкопряда Bombyx mori («BmEcR»), LBD EcR плодовой мушки Drosophila melanogaster («DmEcR»), LBD EcR комара Aedes aegypti («AaEcR»), LBD EcR мясной мухи Lucilia capitata («LcEcR»), LBD EcR мясной мухи Lucilia cuprina («LucEcR»), LBD EcR средиземноморской плодовой мушки Ceratitis capitata («CcEcR»), LBD EcR саранчи Locusta migratoria («LmEcR»), LBD EcR тли Myzus persicae («MpEcR»), LBD EcR краба-скрипача Celuca pugilator («CpEcR»), LBD EcR белокрылки Bamecia argentifoli (BaEcR), LBD EcR цикадки Nephotetix cincticeps (NcEcR) и LBD EcR иксодового клеща Amblyomma americanum («AmaEcR»).
17. Первый и второй полипептиды по любому из пп. 1-8 или система LIPC по любому из пп. 9-15, отличающиеся тем, что по меньшей мере один из фрагментов ядерных рецепторных белков происходит из полипептида экдизонового рецептора, кодируемого полинуклеотидом, содержащим последовательность нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 1 (CfEcR-DEF), SEQ ID NO: 2 (CfEcR-CDEF), SEQ ID NO: 3 (DmEcR-DEF), SEQ ID NO: 4 (TmEcR-DEF) SEQ ID NO: 5 (AmaEcR-DEF), или полинуклеотидом, кодирующим функциональный вариант, по существу идентичный указанному полипептиду.
18. Первый и второй полипептиды или система LIPC по пп. 16-17, отличающиеся тем, что по меньшей мере один из полипептидов экдизонового рецептора содержит последовательность полипептида SEQ ID NO: 6 (CfEcR-DEF), SEQ ID NO: 7 (DmEcR-DEF), SEQ ID NO: 8 (CfEcR-CDEF), SEQ ID NO: 9 (TmEcR-DEF), SEQ ID NO: 10 (AmaEcR-DEF), или последовательность полипептида, по существу идентичную указанной.
19. Первый и второй полипептиды или система LIPC по любому из пп. 16-18, отличающиеся тем, что указанная последовательность полипептида экдизонового рецептора содержит приблизительно или по меньшей мере 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 или более мутаций по типу замены относительно соответствующего полипептида экдизонового рецептора дикого типа.
20. Первый и второй полипептиды или система LIPC по любому из пп. 16-19, отличающиеся тем, что указанный полипептид экдизонового рецептора кодируется полинуклеотидом, содержащим мутацию кодона, которая приводит к замене остатка аминокислоты, причем указанный остаток аминокислоты находится в положении, эквивалентном или аналогичном а) остатку аминокислоты 20, 21, 48, 51, 52, 55, 58, 59, 61, 62, 92, 93, 95, 96, 107, 109, 110, 120, 123, 125, 175, 218, 219, 223, 230, 234 или 238 последовательности SEQ ID NO: 17, b) остаткам аминокислот 95 и 110 последовательности SEQ ID NO: 17, с) остаткам аминокислот 218 и 219 последовательности SEQ ID NO: 17, d) остаткам аминокислот 107 и 175 последовательности SEQ ID NO: 17, е) остаткам аминокислот 127 и 175 последовательности SEQ ID NO: 17, f) остаткам аминокислот 107 и 127 последовательности SEQ ID NO: 17, g) остаткам аминокислот 107, 127 и 175 последовательности SEQ ID NO: 17, h) остаткам аминокислот 52, 107 и 175 последовательности SEQ ID NO: 17, i) остаткам аминокислот 96, 107 и 175 последовательности SEQ ID NO: 17, j) остаткам аминокислот 107, 110 и 175 последовательности SEQ ID NO: 17, k) остатку аминокислоты 107, 121, 213 или 217 последовательности SEQ ID NO: 18, или l) остатку аминокислоты 91 или 105 последовательности SEQ ID NO: 19.
21. Первый и второй полипептиды или система LIPC по любому из пп. 16-20, отличающиеся тем, что указанная мутация по типу замены выбрана из группы, состоящей из а) мутации по типу замены Е20А, Q21A, F48A, 151А, Т52А, T52V, T52I, T52L, Т55А, Т58А, V59A, L61A, I62A, М92А, М93А, R95A, V96A, V96T, V96D, V96M, VI071, F109A, А110Р, A110S, А110М, A110L, Y120A, A123F, М125А, R175E, М218А, С219А, L223A, L230A, L234A, W238A, R95A/A110P, М218А/С219А, V107I/R175E, Y127E/R175E, V107I/Y127E, V107I/Y127E/R175E, T52V/V107I/R175E, V96A/V107I/R175E, T52A/V107I/R175E, V96T/V107I/R175E или V107I/A110P/R175E последовательности SEQ ID NO: 17, b) мутации по типу замены А107Р, G121R, G121L, N213A, С217А или C217S последовательности SEQ ID NO: 18, и с) мутации по типу замены G91A или А105Р последовательности SEQ ID NO: 19.
22. Первый и второй полипептиды или система LIPC по любому из пп. 16-21, отличающиеся тем, что указанный полипептид ретиноидного Х-рецептора содержит полипептид, выбранный из группы, состоящей из полипептида ретиноидного Х-рецептора позвоночных, полипептида ретиноидного Х-рецептора беспозвоночных (USP) и химерного ретиноидного Х-полипептида, содержащего полипептидные фрагменты из RXR позвоночных и беспозвоночных.
23. Первый и второй полипептиды или система LIPC по п. 22, отличающиеся тем, что указанный химерный полипептид ретиноидного Х-рецептора содержит по меньшей мере два разных полипептидных фрагмента ретиноидного Х-рецептора, выбранных из группы, состоящей из полипептидного фрагмента ретиноидного Х-рецептора вида позвоночных, полипептидного фрагмента ретиноидного Х-рецептора вида беспозвоночных и полипептидного фрагмента ретиноидного Х-рецептора не относящегося к двукрылым/чешуекрылым вида беспозвоночных.
24. Первый и второй полипептиды или система LIPC по п. 23, отличающиеся тем, что указанный химерный полипептид ретиноидного Х-рецептора содержит полипептид ретиноидного Х-рецептора, содержащий по меньшей мере один полипептидный фрагмент ретиноидного Х-рецептора, выбранный из группы, состоящей из спирали EF-домена 1, спирали EF-домена 2, спирали EF-домена 3, спирали EF-домена 4, спирали EF-домена 5, спирали EF-домена 6, спирали EF-домена 7, спирали EF-домена 8, спирали EF-домена 9, спирали EF-домена 10, спирали EF-домена 11, спирали EF-домена 12, F-домена и β-складчатого листа EF-домена, причем указанный полипептидный фрагмент ретиноидного Х-рецептора происходит из полипептида ретиноидного Х-рецептора другого вида или полипептида ретиноидного Х-рецептора другой изоформы относительно второго полипептидного фрагмента ретиноидного Х-рецептора.
25. Первый и второй полипептиды или система LIPC по п. 22, отличающиеся тем, что указанный химерный полипептид ретиноидного Х-рецептора кодируется полинуклеотидом, содержащим последовательность нуклеиновой кислоты соответствующую а) последовательности SEQ ID NO: 11, b) нуклеотидам 1-348 последовательности SEQ ID NO: 12 и нуклеотидам 268-630 последовательности SEQ ID NO: 13, с) нуклеотидам 1-408 последовательности SEQ ID NO: 12 и нуклеотидам 337-630 последовательности SEQ ID NO: 13, d) нуклеотидам 1465 последовательности SEQ ID NO: 12 и нуклеотидам 403-630 последовательности SEQ ID NO: 13, e) нуклеотидам 1-555 последовательности SEQ ID NO: 12 и нуклеотидам 490-630 последовательности SEQ ID NO: 13, f) нуклеотидам 1-624 последовательности SEQ ID NO: 12 и нуклеотидам 547-630 последовательности SEQ ID NO: 13, g) нуклеотидам 1-645 последовательности SEQ ID NO: 12 и нуклеотидам 601-630 последовательности SEQ ID NO: 13, и h) нуклеотидам 1-717 последовательности SEQ ID NO: 12, нуклеотидам 613-630 последовательности SEQ ID NO: 13; или полинуклеотидом, кодирующим функциональный вариант, по существу идентичный указанному полипептиду.
26. Первый и второй полипептиды или система LIPC по п. 22, отличающиеся тем, что указанный химерный ретиноидный Х-полипептид содержит последовательность полипептида, соответствующую а) последовательности SEQ ID NO: 14, b) аминокислотам 1-116 последовательности SEQ ID NO: 15 и аминокислотам 90-210 последовательности SEQ ID NO: 16, с) аминокислотам 1-136 последовательности SEQ ID NO: 15 и аминокислотам 113-210 последовательности SEQ ID NO: 16, d) аминокислотам 1-155 последовательности SEQ ID NO: 15 и аминокислотам 135-210 последовательности SEQ ID NO: 16, e) аминокислотам 1-185 последовательности SEQ ID NO: 15 и аминокислотам 164- 210 последовательности SEQ ID NO: 16, f) аминокислотам 1-208 последовательности SEQ ID NO: 15 и аминокислотам 183-210 последовательности SEQ ID NO: 16, g) аминокислотам 1-215 последовательности SEQ ID NO: 15 и аминокислотам 201-210 последовательности SEQ ID NO: 16, и h) аминокислотам 1-239 последовательности SEQ ID NO: 15, аминокислотам 205-210 последовательности SEQ ID NO: 16; или последовательность полипептида, по существу идентичную указанной.
27. Первый и второй полипептиды или система LIPC по любому из пп. 1-26, отличающиеся тем, что одна или обе дополнительных гетерологичных последовательности содержат трансмембранный домен.
28. Первый и второй полипептиды или система LIPC по п. 27, отличающиеся тем, что по меньшей мере один из трансмембранных доменов представляет собой однократно проходящий через мембрану трансмембранный домен I типа.
29. Выделенный полинуклеотид, содержащий последовательность полинуклеотида, которая кодирует первый или второй полипептиды по любому из пп. 1-28.
30. Первый полинуклеотид, содержащий последовательность нуклеотидов, кодирующую первый полипептид, и второй полинуклеотид, содержащий последовательность нуклеотидов, кодирующую второй полипептид по любому из пп. 1-28.
31. Вектор, содержащий один из полинуклеотидов по п. 29 или 30.
32. Вектор, содержащий оба полинуклеотида по п. 29 или 30.
33. Вектор по п. 31 или 32, отличающийся тем, что указанный вектор представляет собой экспрессионный вектор.
34. Клетка-хозяин, содержащая вектор по любому из пп. 31-33.
35. Клетка-хозяин по п. 34, отличающаяся тем, что указанная клетка-хозяин представляет собой Т-клетку млекопитающего.
36. Клетка-хозяин по п. 34, отличающаяся тем, что указанная клетка-хозяин представляет собой Т-клетку человека.
37. Способ индуцирования передачи клеточных сигналов, включающий введение первого и второго полипептидов, или системы LIPC по любому из пп. 1-28, полинуклеотидов по п. 29 или 30, или вектора по любому из пп. 31-33, в клетку-хозяина, и приведение в контакт указанной клетки-хозяина с активирующим лигандом.
38. Первый и второй полипептиды, или система LIPC по любому из пп. 1-28, полинуклеотиды по п. 29 или 30, вектор по любому из пп. 31-33, или способ по любому из пп. 34-36, отличающиеся тем, что указанный активирующий лиганд представляет собой
с) соединение формулы:
где Е представляет собой (С4-С6)алкил, в состав которого входит третичный атом углерода, или циано(С3-С5)алкил, в состав которого входит третичный атом углерода; R1 представляет собой Н, Me, Et, i-Pr, F, формил, CF3, CHF2, CHCl2, CH2F, CH2Cl, CH2OH, СН2ОМе, CH2CN, CN, C≡CH, 1-пропинил, 2-пропинил, винил, ОН, ОМе, OEt, циклопропил, CF2CF3, CH=CHCN, аллил, азидо, SCN или SCHF2;
R2 представляет собой Н, Me, Et, н-Pr, i-Pr, формил, CF3, CHF2, CHCl2, CH2F, CH2Cl, CH2OH, CH2OMe, CH2CN, CN, C≡CH, 1-пропинил, 2-пропинил, винил, Ac, F, Cl, OH, OMe, OEt, O-n-Pr, OAc, NMe2, NEt2, SMe, SEt, SOCF3, OCF2CF2H, COEt, циклопропил, CF2CF3, CH=CHCN, аллил, азидо, OCF3, OCHF2, O-i-Pr, SCN, SCHF2, SOMe, NH-CN, или соединен с R3 и фенильными атомами углерода, к которым присоединены R2 и R3, с образованием этилендиокси, дигидрофурильного кольца, содержащего атом кислорода, смежный с фенильным атомом углерода, или дигидропирильного кольца, содержащего атом кислорода, смежный с фенильным атомом углерода;
R3 представляет собой Н, Et, или соединен с R2 и фенильными атомами углерода, к которым присоединены R2 и R3, с образованием этилендиокси, дигидрофурильного кольца, содержащего атом кислорода, смежный с фенильным атомом углерода, или дигидропирильного кольца, содержащего атом кислорода, смежный с фенильным атомом углерода;
R4, R5 и R6 представляют собой независимым образом Н, Me, Et, F, Cl, Br, формил, CF3, CHF2, CHCl2, CH2F, CH2Cl, CH2OH, CN, C≡CH, 1-пропинил, 2-пропинил, винил, OMe, OEt, SMe, или Set; или
d) экдизон, 20-гидроксиэкдизон, понастерон А, муристерон А, оксистерол, 22(R) гидроксихолестерин, 24(S) гидроксихолестерин, 25-эпоксихолестерин, Т0901317, 5-альфа-6-альфа-эпоксихолестерин-3-сульфат, 7-кетохолестерин-3-сульфат, фарнезол, желчную кислоту, 1,1-бифосфонат сложного эфира, или ювенильный гормон III.
39. Первый и второй полипептиды, или система LIPC по любому из пп. 1-28, полинуклеотиды по п. 29 или 30, вектор по любому из пп. 31-33, или способ по любому из пп. 34-36, отличающиеся тем, что указанный активирующий лиганд представляет собой соединение формулы:
или
где R1, R2, R3 и R4 представляют собой: a) H, (С1-С6)алкил; (С1-С6)галогеналкил; (С1-С6)цианоалкил; (С1-С6)гидроксиалкил; (С1-С4)алкокси(С1-С6)алкил; (С2-С6)алкенил, необязательно замещенный галогеном, циано, гидроксилом или (С1-С4)алкилом; (С2-С6)алкинил, необязательно замещенный галогеном, циано, гидроксилом или (С1-С4)алкилом; (С3-С5)циклоалкил, необязательно замещенный галогеном, циано, гидроксилом или (С1-С4)алкилом; или b) незамещенный или замещенный бензил, где заместители представляют собой независимым образом 1-5 Н, галоген, нитро, циано, гидроксил, (С1-С6)алкил или (Ci-С6)алкокси; и
R5 представляет собой Н; ОН; F; Cl; или (С1-С6)алкокси;
при условии, что: в тех случаях, когда R1, R2, R3 и R4 представляют собой изопропил, R5 не является гидроксилом;
когда R5 представляет собой Н, гидроксил, метокси или фтор, по меньшей мере один из R1, R2, R3 и R4 не является Н;
когда только один из R1, R2, R3 и R4 представляет собой метил, и R5 представляет собой Н или гидроксил, остальные из R1, R2, R3 и R4 не являются Н;
когда оба R4 и один из R1, R2 и R3 представляют собой метил, R5 не является ни Н, ни гидроксилом;
когда все из R1, R2, R3 и R4 представляют собой метил, R5 не является гидроксилом;
когда все из R1, R2 и R3 представляют собой Н, и R5 представляет собой гидроксил, R4 не является этилом, н-пропилом, н-бутилом, аллилом или бензилом.
40. Первый и второй полипептиды, или система LIPC по любому из пп. 1-28, полинуклеотиды по п. 29 или 30, вектор по любому из пп. 31-33, или способ по любому из пп. 34-36, отличающиеся тем, что указанный активирующий лиганд представляет собой соединение формулы:
где X и X' представляют собой независимым образом О или S;
Y представляет собой:
(a) замещенный или незамещенный фенил, где заместители представляют собой независимым образом 1-5Н, (С1-С4)алкил, (С1-С4)алкокси, (С2-С4)алкенил, галоген (F, Cl, Br, I), (С1-С4)галогеналкил, гидрокси, амино, циано или нитро; или
(b) замещенный или незамещенный 2-пиридил, 3-пиридил или 4-пиридил, где заместители представляют собой независимым образом 1-4Н, (С1-С4)алкил, (C1-С4)алкокси, (С2-С4)алкенил, галоген (F, Cl, Br, I), (С1-С4)галогеналкил, гидрокси, амино, циано или нитро;
R1 и R2 независимым образом представляют собой: Н; циано; циано-замещенный или незамещенный (С1-С7) разветвленный или прямоцепочечный алкил; циано-замещенный или незамещенный (С2-С7) разветвленный или прямоцепочечный алкенил; циано-замещенный или незамещенный (С3-С7) разветвленный или прямоцепочечный алкенилалкил; или валентности R1 и R2 совместно обеспечивают образование циано-замещенной или незамещенной (С1-С7) алкилиденовой группы (R a RbC=), причем сумма не принадлежащих заместителям атомов углерода в R a и Rb равна 0-6;
R3 представляет собой Н, метил, этил, н-пропил, изопропил или циано;
R4, R7 и R8 независимым образом представляют собой: Н, (С1-С4)алкил, (С1-С4)алкокси, (С2-С4)алкенил, галоген (F, Cl, Br, I), (С1-С4)галогеналкил, гидрокси, амино, циано или нитро; и R5 и R6 независимым образом представляют собой: Н, (С1-С4)алкил, (С2-С4)алкенил, (С3-С4)алкенилалкил, галоген (F, Cl, Br, I), С1-С4 галогеналкил, (С1-С4)алкокси, гидрокси, амино, циано, нитро, или совместно посредством связи типа (-OCHR9CHR10O-) образуют кольцо с фенильными атомами углерода, к которым они присоединены; где R9 и R10 независимым образом представляют собой: Н, галоген, (С1-С3)алкил, (С2-С3)алкенил, (С1-С3)алкокси(С1-С3)алкил, бензоилокси(С1-С3)алкил, гидрокси(С1-С3)алкил, галоген(С1-С3)алкил, формил, формил(С1-С3)алкил, циано, циано(С1-С3)алкил, карбокси, карбокси(С1-С3)алкил, (С1-С3)алкоксикарбонил(С1-С3)алкил, (С1-С3)алкилкарбонил(С1-С3)алкил, (C1-С3)алканоилокси(С1-С3)алкил, амино(С1-С3)алкил, (С1-С3)алкиламино(С1-С3)алкил (-(CH2)nRcRe), оксимо(-CH=NOH), оксимо(С1-С3)алкил, (С1-С3)алкоксимо(-C=NORd), алкоксимо(С1-С3)алкил, (С1-С3)карбоксамидо (-C(O)NReRf), (С1-С3)карбоксамидо(С1-С3)алкил, (С1-С3)семикарбазидо(-C=NNHC(O)NReRf), семикарбазидо(С1-С3)алкил, аминокарбонилокси(-OC(O)NHRg), аминокарбонилокси(С1-С3)алкил, пентафторфенилоксикарбонил, пентафторфенилоксикарбонил(С1-С3)алкил, п-толуолсульфонилокси(С1-С3)алкил, арилсульфонилокси(С1-С3)алкил, (С1-С3)тио(С1-С3)алкил, (С1-С3)алкилсульфоксидо(С1-С3)алкил, (С1-С3)алкилсульфонил(С1-С3)алкил или (С1-С5)тризамещенный-силокси(С1-С3)алкил (-(CH2)nSiORdReRg); где n=1-3, Rc и Rd представлены прямыми или разветвленными углеводородными цепями указанной длины, Re, Rf представлены Н, или прямыми или разветвленными углеводородными цепями указанной длины, Rg представлен (С1-С3)алкилом или арилом, необязательно замещенным галогеном или (С1-С3)алкилом, и Rc, Rd, Re, Rf и Rg являются независимыми друг от друга;
при условии, что
i) в тех случаях, когда и R9, и R10 представляют собой Н, или
ii) когда либо R9, либо R10 представляют собой галоген, (С1-С3)алкил, (C1-С3)алкокси(С1-С3)алкил или бензоилокси(C1-С3)алкил, или
iii) когда R5 и R6 совместно не образуют связь типа (-OCHR9CHR10O-),
число атомов углерода, за исключением входящих в циано-заместитель, для какой-либо одной или обеих групп R1 или R2 превышает 4, а число атомов углерода, за исключением входящих в циано-заместитель, для совокупности групп R1, R2 и R3 составляет 10, 11 или 12.
41. Способ измерения лиганд-индуцированной передачи клеточных сигналов, включающий:
a) введение первого и второго полипептидов, или системы LIPC по любому из пп. 1-28, полинуклеотидов по п. 29 или 30, или вектора по любому из пп. 31-33, в клетку-хозяина;
b) приведение указанной клетки-хозяина в контакт с активирующим лигандом; и
c) количественное определение абсолютной или относительной величины лиганд-индуцированной биологической активности или олигомеризации полипептидов.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201562140380P | 2015-03-30 | 2015-03-30 | |
US62/140,380 | 2015-03-30 | ||
PCT/US2016/024690 WO2016160791A1 (en) | 2015-03-30 | 2016-03-29 | Ligand inducible polypeptide coupler system |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2017131505A true RU2017131505A (ru) | 2019-05-06 |
RU2017131505A3 RU2017131505A3 (ru) | 2019-09-19 |
Family
ID=57005332
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2017131505A RU2017131505A (ru) | 2015-03-30 | 2016-03-29 | Система лиганд-индуцируемого сопряжения полипептидов |
Country Status (14)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20180348231A1 (ru) |
EP (1) | EP3278110A4 (ru) |
JP (1) | JP2018511602A (ru) |
KR (1) | KR20180012247A (ru) |
CN (1) | CN107430128A (ru) |
AU (1) | AU2016243464A1 (ru) |
CA (1) | CA2979724A1 (ru) |
HK (1) | HK1248811A1 (ru) |
IL (1) | IL254340A0 (ru) |
MX (1) | MX2017012455A (ru) |
PH (1) | PH12017501763A1 (ru) |
RU (1) | RU2017131505A (ru) |
SG (1) | SG11201707652WA (ru) |
WO (1) | WO2016160791A1 (ru) |
Families Citing this family (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JOP20180027A1 (ar) * | 2017-03-28 | 2019-01-30 | Cell Design Labs Inc | بوليبيبتيدات مخلطة و طرق لتغيير موضع الغشاء فيها |
JP6990369B2 (ja) * | 2017-05-19 | 2022-02-03 | 国立大学法人 熊本大学 | 遺伝性腎疾患アルポート症候群治療薬に係る評価系 |
Family Cites Families (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH10234372A (ja) * | 1997-02-27 | 1998-09-08 | Boehringer Mannheim Corp | キメラ受容体を有する細胞とその作成方法、並びに その利用 |
AU5143099A (en) * | 1998-07-30 | 2000-02-21 | Universite De Montreal | Protein fragment complementation assays for the detection of biological or drug interactions |
AU2001249315A1 (en) * | 2000-03-22 | 2001-10-03 | Rheogene, Inc. | Ecdysone receptor-based inducible gene expression system |
DK1572862T3 (da) * | 2001-02-20 | 2012-11-26 | Intrexon Corp | Kimære, retinoide x-receptorer og deres anvendelse i et hidtil ukendt ecdysonrecepttorbaseret inducerbart genekspressionssystem |
US20040102367A1 (en) * | 2001-02-23 | 2004-05-27 | Gage Fred H | Gene expression system based on chimeric receptors |
EP1520010B1 (en) * | 2002-03-25 | 2007-11-07 | Applera Corporation | Systems and methods for detection of nuclear receptor function using reporter enzyme mutant complementation |
-
2016
- 2016-03-29 RU RU2017131505A patent/RU2017131505A/ru not_active Application Discontinuation
- 2016-03-29 CN CN201680020980.9A patent/CN107430128A/zh active Pending
- 2016-03-29 AU AU2016243464A patent/AU2016243464A1/en not_active Abandoned
- 2016-03-29 KR KR1020177030658A patent/KR20180012247A/ko unknown
- 2016-03-29 EP EP16773986.1A patent/EP3278110A4/en not_active Withdrawn
- 2016-03-29 WO PCT/US2016/024690 patent/WO2016160791A1/en active Application Filing
- 2016-03-29 SG SG11201707652WA patent/SG11201707652WA/en unknown
- 2016-03-29 US US15/562,290 patent/US20180348231A1/en not_active Abandoned
- 2016-03-29 CA CA2979724A patent/CA2979724A1/en not_active Abandoned
- 2016-03-29 MX MX2017012455A patent/MX2017012455A/es unknown
- 2016-03-29 JP JP2017550901A patent/JP2018511602A/ja active Pending
-
2017
- 2017-09-05 IL IL254340A patent/IL254340A0/en unknown
- 2017-09-26 PH PH12017501763A patent/PH12017501763A1/en unknown
-
2018
- 2018-06-28 HK HK18108357.0A patent/HK1248811A1/zh unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO2016160791A1 (en) | 2016-10-06 |
KR20180012247A (ko) | 2018-02-05 |
RU2017131505A3 (ru) | 2019-09-19 |
MX2017012455A (es) | 2018-06-27 |
HK1248811A1 (zh) | 2018-10-19 |
JP2018511602A (ja) | 2018-04-26 |
CA2979724A1 (en) | 2016-10-06 |
CN107430128A (zh) | 2017-12-01 |
SG11201707652WA (en) | 2017-10-30 |
IL254340A0 (en) | 2017-11-30 |
AU2016243464A1 (en) | 2017-09-28 |
US20180348231A1 (en) | 2018-12-06 |
EP3278110A4 (en) | 2018-08-29 |
EP3278110A1 (en) | 2018-02-07 |
PH12017501763A1 (en) | 2018-04-23 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Lu et al. | Molecular characterization and RNA interference analysis of vitellogenin receptor from Nilaparvata lugens (Stål) | |
Anderson et al. | Phylogeny of ion channels: clues to structure and function | |
Nguyen et al. | Transcriptomic characterization and curation of candidate neuropeptides regulating reproduction in the eyestalk ganglia of the Australian crayfish, Cherax quadricarinatus | |
Li et al. | Adipokinetic hormones and their G protein-coupled receptors emerged in Lophotrochozoa | |
Jegla et al. | Evolution of the human ion channel set | |
Mareddy et al. | Isolation and characterization of the complete cDNA sequence encoding a putative insulin-like peptide from the androgenic gland of Penaeus monodon | |
Maestro et al. | Differential expression of two RXR/ultraspiracle isoforms during the life cycle of the hemimetabolous insect Blattella germanica (Dictyoptera, Blattellidae) | |
Hayward et al. | The sequence of Locusta RXR, homologous to Drosophila Ultraspiracle, and its evolutionary implications | |
Mykles | Signaling pathways that regulate the crustacean molting gland | |
Horigane et al. | Characterization of a vitellogenin gene reveals two phase regulation of vitellogenesis by engorgement and mating in the soft tick Ornithodoros moubata (Acari: Argasidae) | |
JP2004533215A5 (ru) | ||
RU2017131505A (ru) | Система лиганд-индуцируемого сопряжения полипептидов | |
Vogel et al. | Phylogenetic investigation of peptide hormone and growth factor receptors in five dipteran genomes | |
Tang et al. | RNA interference‐mediated knockdown of the transcription factor Krüppel homologue 1 suppresses vitellogenesis in Chilo suppressalis | |
Bloom et al. | Identification, functional characterization, and pharmacological analysis of two sulfakinin receptors in the medically-important insect Rhodnius prolixus | |
Li et al. | Functional characterization of GH-like homolog in amphioxus reveals an ancient origin of GH/GH receptor system | |
Baker et al. | Functional characterization of cnidarian HCN channels points to an early evolution of Ih | |
Liu et al. | Characterization of vitellogenin receptor (VgR) from the Chinese oak silkworm, Antheraea pernyi | |
Riddiford | Hormonal regulation of gene expression during lepidopteran development | |
JP2018511602A5 (ru) | ||
Li et al. | Evolution and potential function in molluscs of neuropeptide and receptor homologues of the insect allatostatins | |
Matsumoto et al. | Sequence analysis and expression patterns of opsin genes in the longtooth grouper Epinephelus bruneus | |
Lee et al. | Four cDNAs encoding lipoprotein receptors from shrimp (Pandalopsis japonica): Structural characterization and expression analysis during maturation | |
Maekawa et al. | Constitutive overexpressed type I interferon induced downregulation of antiviral activity in medaka fish (Oryzias latipes) | |
Wu et al. | Identification of novel antigens within the Schistosoma japonicum tetraspanin family based on molecular characterization |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20200730 |