RU2017118481A - Растения салат-латук, имеющие резистентность против nasonovia ribisnigri биотипа 1 - Google Patents

Растения салат-латук, имеющие резистентность против nasonovia ribisnigri биотипа 1 Download PDF

Info

Publication number
RU2017118481A
RU2017118481A RU2017118481A RU2017118481A RU2017118481A RU 2017118481 A RU2017118481 A RU 2017118481A RU 2017118481 A RU2017118481 A RU 2017118481A RU 2017118481 A RU2017118481 A RU 2017118481A RU 2017118481 A RU2017118481 A RU 2017118481A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
snp
seq
plant
marker
chromosome
Prior art date
Application number
RU2017118481A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2731639C2 (ru
RU2017118481A3 (ru
Inventor
Роберт Теодорус Герардус ШААРЕМАН
Винсан Пьер Андрэ ТОМАС
ДЕР АРЕНД Адрианус Дж. М. ВАН
Роберт Йоханнес Мартинус РЕДТС
Ольга Джулиан РОДРИГЕЗ
Original Assignee
Нунхемс Б.В.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Нунхемс Б.В. filed Critical Нунхемс Б.В.
Publication of RU2017118481A publication Critical patent/RU2017118481A/ru
Publication of RU2017118481A3 publication Critical patent/RU2017118481A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2731639C2 publication Critical patent/RU2731639C2/ru

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01HNEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H6/00Angiosperms, i.e. flowering plants, characterised by their botanic taxonomy
    • A01H6/14Asteraceae or Compositae, e.g. safflower, sunflower, artichoke or lettuce
    • A01H6/1472Lactuca sativa [lettuce]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01HNEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H1/00Processes for modifying genotypes ; Plants characterised by associated natural traits
    • A01H1/04Processes of selection involving genotypic or phenotypic markers; Methods of using phenotypic markers for selection
    • A01H1/045Processes of selection involving genotypic or phenotypic markers; Methods of using phenotypic markers for selection using molecular markers
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A01AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01HNEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
    • A01H5/00Angiosperms, i.e. flowering plants, characterised by their plant parts; Angiosperms characterised otherwise than by their botanic taxonomy
    • A01H5/12Leaves
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/415Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • C12N15/8279Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813Hybridisation assays
    • C12Q1/6827Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Environmental Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Physiology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Natural Medicines & Medicinal Plants (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Claims (32)

1. Растение Lactuca sativa, содержащее фрагмент интрогрессии из Lactuca virosa на хромосоме 6 и/или на хромосоме 7, который содержит локус количественных признаков, который придает резистентность против Nasonovia ribisnigri биотипа 1 (Nr:1), и где указанный фрагмент интрогрессии на хромосоме 6 содержит всю или часть области, начинающейся в месте 77 Мб и заканчивающейся в месте 161 Мб хромосомы 6, и где указанный фрагмент интрогрессии на хромосоме 7 одержит всю или часть области, начинающейся в месте 203 Мб и заканчивающейся в месте 219 Мб хромосомы 7.
2. Растение по п. 1, содержащее как фрагмент интрогрессии на хромосоме 6, так и на хромосоме 7.
3. Растение по п. 1, где указанный фрагмент интрогрессии на хромосоме 6 является обнаруживаемым посредством анализа молекулярного маркера, который обнаруживает по меньшей мере один, предпочтительно по меньшей мере 2 или 3 или 4 или 5 или более, маркеров, выбранных из группы, состоящей из:
a) генотип СС или СТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP1.23 в SEQ ID NO: 23 или в последовательности, имеющей существенную идентичность последовательности с SEQ ID NO: 23;
b) генотип СС или СТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_02 в SEQ ID NO: 2 или в последовательности, имеющей существенную идентичность последовательности с SEQ ID NO: 2;
c) генотип ТТ или СТ для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP2.24 в SEQ ID NO: 24 или в последовательности, имеющей существенную идентичность последовательности с SEQ ID NO: 24;
генотип АА или АС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_03 в SEQ ID NO: 3 или в последовательности, имеющей существенную идентичность последовательности с SEQ ID NO: 3;
d) любой маркер, специфичный для генома растения салат-латук дикого типа, особенно маркер, специфичный для генома L. Virosa, расположенный физически между SNP1.23 и SNP_03, или между SNP_02 и SNP_03, или между SNP2.24 и SNP_03;
e) любой маркер, специфичный для генома растения салат-латук дикого типа, особенно маркер, специфичный для генома L. Virosa, расположенный в пределах расстояния, равного 10 Мб, предпочтительно в пределах 5 Мб, любого маркера, выбранного из SNP1.23, SNP_02, SNP2.24, или SNP_03.
4. Растение по п. 1, где указанный фрагмент интрогрессии на хромосоме 6 является обнаруживаемым посредством анализа молекулярного маркера, который обнаруживает:
a) генотип GG или GT для маркера однонуклеотидного полиморфизма VSP1 в SEQ ID NO: 26 (или в последовательности, имеющей существенную идентичность последовательности с SEQ ID NO: 26), или
b) генотип АА или АС для маркера однонуклеотидного полиморфизма VSP3 в SEQ ID NO: 27 (или в последовательности, имеющей существенную идентичность последовательности с SEQ ID NO: 27).
5. Растение по п. 1, где фрагмент интрогрессии на хромосоме 7 является обнаруживаемым посредством анализа молекулярного маркера, который обнаруживает по меньшей мере один, предпочтительно по меньшей мере 2 или 3 или 4 или 5 или более маркеров, выбранных из группы, состоящей из:
a) генотип ТТ или ТС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_17 в SEQ ID NO: 17 (или в последовательности, имеющей существенную идентичность последовательности с SEQ ID NO: 17);
b) генотип ТТ или ТС для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP17.25 в SEQ ID NO: 25 (или в последовательности, имеющей существенную идентичность последовательности с SEQ ID NO: 25);
c) генотип GG или GC для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_18 в SEQ ID NO: 18 (или в последовательности, имеющей существенную идентичность последовательности с SEQ ID NO: 18);
d) генотип GG или GA для маркера однонуклеотидного полиморфизма SNP_19 в SEQ ID NO: 19 (или в последовательности, имеющей существенную идентичность последовательности с SEQ ID NO: 19);
e) любой маркер, специфичный для генома растения салат-латук дикого типа, особенно маркер, специфичный для генома L. Virosa, расположенный физически между SNP_17 и SNP_19, или между SNP_17 и SNP_18, или между SNP_17 и SNP 17.25, или между SNP 17.25 и SNP_19, или между SNP 17.25 и SNP_18, или между SNP_18 и SNP_19;
f) любой маркер, специфичный для генома растения салат-латук дикого типа, особенно маркер, специфичный для генома L. virosa, расположенный в пределах расстояния, равного 12 Мб, 10 Мб, предпочтительно в пределах 5 Мб, любого маркера, выбранного из SNP_17, SNP_17.25, SNP_18 и SNP_19.
6. Растение по п. 1, где указанный фрагмент интрогрессии на хромосоме 7 является обнаруживаемым посредством анализа молекулярного маркера, который обнаруживает:
a) генотип СС или СА для маркера однонуклеотидного полиморфизма VSP2 в SEQ ID NO: 28 или в последовательности, имеющей существенную идентичность последовательности с SEQ ID NO: 28, или
b) генотип GG или GA для маркера однонуклеотидного полиморфизма VSP4 в SEQ ID NO: 29 или в последовательности, имеющей существенную идентичность последовательности с SEQ ID NO: 29.
7. Растение по п. 1, где указанное растение имеет резистентность против Nasonovia ribisnigri биотипа 1 в условиях как испытания со свободным выбором, так и испытания без выбора.
8. Растение по п. 1, где среднее число тлей биотипа 1 на указанном растении составляет не более 50% от среднего числа тлей биотипа 1, обнаруженного на Nr: 1 восприимчивом контрольном растении, таком как сорт Mafalda, при выращивании при одних и тех же условиях.
9. Растение по п. 1, где среднее число тлей биотипа 1 на указанном растении составляет менее 10 тлей, тогда как среднее число тлей биотипа 1 на Nr: 1 восприимчивом контрольном растении, таком как Mafalda, составляет по меньшей мере 100 тлей, при выращивании при одних и тех же условиях.
10. Растение по п. 1, где растение Lactuca sativa выбирается из группы, состоящей из: листовой салат, салат-ромен, салат Crisphead, салат кочанный, Салат Батавия и спаржевый салат.
11. Растение по любому из пп. 1-10, где указанным фрагментом интрогрессии является фрагмент хромосомы 6 и/или 7, как обнаружено в L. virosa под номером доступа NCIMB42086.
12. Семя, из которого растение по любому из пп. 1-11 может быть выращено.
13. Листья или головки растения по любому из пп. 1-11.
14. Потомственное растение растения салат-латук по любому из пп. 1-11, где указанное потомственное растение сохраняет фрагмент интрогрессии на хромосоме 6, содержащий QTL6.1, и/или на хромосоме 7, содержащий QTL7.1.
15. Потомственное растение по п. 14, где потомственное растение получают одним или более способами, выбранными из группы, состоящей из: самоопыления, скрещивания, мутации, получения двойного гаплоида или трансформации.
16. Часть растения салат-латук по любому из пп. 1-11 или потомственного растения по п. 14 или 15, где часть выбирается из группы, состоящей из: стеблей, черенков, черешков, семядолей, цветов, пыльников, пыльцы, завязей, корней, корневых кончиков, протопластов, каллюса, микроспор, цветоножек, семяпочек, побегов, семян, зародышей, зародышевых мешков, клеток, почек, листьев, меристемы, причем указанная часть содержит указанный фрагмент интрогрессии на хромосоме 6 и/или 7.
RU2017118481A 2014-10-30 2015-10-29 Растения салат-латук, имеющие резистентность против nasonovia ribisnigri биотипа 1 RU2731639C2 (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP14191135.4 2014-10-30
EP14191135 2014-10-30
PCT/EP2015/075127 WO2016066748A1 (en) 2014-10-30 2015-10-29 Lettuce plants comprising resistance against nasonovia ribisnigri biotype 1

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2017118481A true RU2017118481A (ru) 2018-11-30
RU2017118481A3 RU2017118481A3 (ru) 2019-05-31
RU2731639C2 RU2731639C2 (ru) 2020-09-07

Family

ID=51844568

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2017118481A RU2731639C2 (ru) 2014-10-30 2015-10-29 Растения салат-латук, имеющие резистентность против nasonovia ribisnigri биотипа 1

Country Status (13)

Country Link
US (2) US10638689B2 (ru)
EP (2) EP3211991B1 (ru)
JP (1) JP6797794B2 (ru)
KR (1) KR102534706B1 (ru)
AU (1) AU2015340590B2 (ru)
CA (1) CA2966065A1 (ru)
ES (1) ES2896887T3 (ru)
MX (1) MX2017005247A (ru)
NZ (1) NZ730937A (ru)
PT (1) PT3211991T (ru)
RU (1) RU2731639C2 (ru)
WO (1) WO2016066748A1 (ru)
ZA (1) ZA201703678B (ru)

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2731639C2 (ru) * 2014-10-30 2020-09-07 Нунхемс Б.В. Растения салат-латук, имеющие резистентность против nasonovia ribisnigri биотипа 1
CN109280720A (zh) * 2018-11-01 2019-01-29 宁波检验检疫科学技术研究院 一种毒莴苣的pcr检测引物、试剂盒以及pcr检测方法
SG10202008262UA (en) 2019-09-26 2021-04-29 Seminis Vegetable Seeds Inc Lettuce plants having resistance to nasonovia ribisnigri biotype nr:1
US10999989B1 (en) * 2019-11-08 2021-05-11 Syngenta Crop Protection Ag Lettuce variety solan

Family Cites Families (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE69233719T2 (de) 1991-09-24 2009-01-02 Keygene N.V. Primer, Sätze und Restriktionsfragmente und deren Benutzung in selektiver Restriktionsfragmentenamplifikation
PT921720E (pt) 1996-06-04 2004-05-31 Rijk Zwaan Zaadteelt En Zaadha Resistencia ao pulgao em asteraceas
EP1782685A1 (en) * 2005-11-04 2007-05-09 De Ruiter Seeds R&D B.V. Disease resistant cucumber plants
CA2780233C (en) * 2009-11-16 2019-04-23 Rijk Zwaan Zaadteelt En Zaadhandel B.V. Lettuce that is resistant to the lettuce aphid nasonovia ribisnigri biotype 1
WO2012065629A1 (en) 2010-11-16 2012-05-24 Rijk Zwaan Zaadteelt En Zaadhandel B.V. Resistance to nasonovia ribisnigri biotype 1 (nr:1) from lactuca serriola
US8735662B2 (en) * 2011-05-16 2014-05-27 Nunhems B.V. Lettuce variety salmon
US9380756B2 (en) * 2012-01-04 2016-07-05 Nunhems B.V. Lettuce variety multigreen 50
RU2731639C2 (ru) * 2014-10-30 2020-09-07 Нунхемс Б.В. Растения салат-латук, имеющие резистентность против nasonovia ribisnigri биотипа 1

Also Published As

Publication number Publication date
CA2966065A1 (en) 2016-05-06
EP3211991A1 (en) 2017-09-06
KR20170077137A (ko) 2017-07-05
US20170318770A1 (en) 2017-11-09
EP3777526A1 (en) 2021-02-17
US20200359589A1 (en) 2020-11-19
AU2015340590B2 (en) 2021-10-21
KR102534706B1 (ko) 2023-05-23
WO2016066748A1 (en) 2016-05-06
JP2017532056A (ja) 2017-11-02
AU2015340590A1 (en) 2017-05-04
ZA201703678B (en) 2019-11-27
RU2731639C2 (ru) 2020-09-07
RU2017118481A3 (ru) 2019-05-31
US11185028B2 (en) 2021-11-30
EP3211991B1 (en) 2021-08-18
JP6797794B2 (ja) 2020-12-09
US10638689B2 (en) 2020-05-05
MX2017005247A (es) 2017-12-18
PT3211991T (pt) 2021-11-11
NZ730937A (en) 2023-02-24
ES2896887T3 (es) 2022-02-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US10499578B2 (en) Seedless pepper plants
RU2017118481A (ru) Растения салат-латук, имеющие резистентность против nasonovia ribisnigri биотипа 1
US10306851B2 (en) Yield QTLs in cucumber plants
US10306850B2 (en) Yield QTLs in cucumber plants
ES2928778T3 (es) Lactuca Sativa (lechuga) con resistencia a Bremia Lactucae (Mildiu de la vid)
Hashida et al. Construction of a chromosome-assigned, sequence-tagged linkage map for the radish, Raphanus sativus L. and QTL analysis of morphological traits
AU2023204651A1 (en) Introgression of two yield QTLs in cucumis sativus plants
Mo et al. Changes in the panicle-related traits of different rice varieties under high temperature condition
JP2017532056A5 (ru)
Behrend et al. AFLP-based genetic mapping of the “bud-flowering” trait in heather (Calluna vulgaris)
CN107969104B (zh) 黄瓜中镰孢属抗性的qtl
US10645890B2 (en) Introgression of a yield QTL in Cucumis sativus plants
RU2017116545A (ru) Растения томата с улучшенной устойчивостью к болезням
Bizzarri et al. The genetics of wheat powdery mildew resistance expressed after the introgression of chromosome 6V in T. aestivum
Mo YoungJun et al. Changes in the panicle-related traits of different rice varieties under high temperature condition.