RU2015144019A - Биомаркеры фармакодинамического ответа опухоли - Google Patents
Биомаркеры фармакодинамического ответа опухоли Download PDFInfo
- Publication number
- RU2015144019A RU2015144019A RU2015144019A RU2015144019A RU2015144019A RU 2015144019 A RU2015144019 A RU 2015144019A RU 2015144019 A RU2015144019 A RU 2015144019A RU 2015144019 A RU2015144019 A RU 2015144019A RU 2015144019 A RU2015144019 A RU 2015144019A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- patient
- cancer
- ylmethylphenyl
- auy922
- ethylamide
- Prior art date
Links
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 title claims 18
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 title 1
- 230000003285 pharmacodynamic effect Effects 0.000 title 1
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 20
- JLLYLQLDYORLBB-UHFFFAOYSA-N 5-bromo-n-methylthiophene-2-sulfonamide Chemical compound CNS(=O)(=O)C1=CC=C(Br)S1 JLLYLQLDYORLBB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 18
- 102100022103 Histone-lysine N-methyltransferase 2A Human genes 0.000 claims 17
- 101001045846 Homo sapiens Histone-lysine N-methyltransferase 2A Proteins 0.000 claims 17
- VJZBSHKIQOPPRU-UHFFFAOYSA-N 5-(2,4-dihydroxy-5-propan-2-ylphenyl)-4-[4-(morpholin-4-ylmethyl)phenyl]-1,2-oxazole-3-carboxylic acid Chemical compound C1=C(O)C(C(C)C)=CC(C2=C(C(C(O)=O)=NO2)C=2C=CC(CN3CCOCC3)=CC=2)=C1O VJZBSHKIQOPPRU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 15
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims 15
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims 13
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims 11
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims 11
- 239000003481 heat shock protein 90 inhibitor Substances 0.000 claims 9
- 101000828537 Homo sapiens Synaptic functional regulator FMR1 Proteins 0.000 claims 8
- 102100023532 Synaptic functional regulator FMR1 Human genes 0.000 claims 8
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 claims 8
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 claims 8
- -1 2,4-dihydroxy-5-isopropylphenyl Chemical group 0.000 claims 5
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims 5
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims 5
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 claims 4
- 238000010240 RT-PCR analysis Methods 0.000 claims 4
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 claims 4
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims 4
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims 4
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims 4
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 claims 4
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 claims 4
- 238000000123 temperature gradient gel electrophoresis Methods 0.000 claims 4
- 108091007960 PI3Ks Proteins 0.000 claims 3
- 238000003556 assay Methods 0.000 claims 3
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 claims 3
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 claims 2
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims 2
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 claims 2
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 claims 2
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 claims 2
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 claims 2
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims 2
- 238000005251 capillar electrophoresis Methods 0.000 claims 2
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 claims 2
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 claims 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims 2
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 claims 2
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims 2
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 claims 2
- 208000002154 non-small cell lung carcinoma Diseases 0.000 claims 2
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 claims 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 2
- 208000029729 tumor suppressor gene on chromosome 11 Diseases 0.000 claims 2
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims 1
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 claims 1
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 claims 1
- 206010009944 Colon cancer Diseases 0.000 claims 1
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 claims 1
- 206010014733 Endometrial cancer Diseases 0.000 claims 1
- 206010014759 Endometrial neoplasm Diseases 0.000 claims 1
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 claims 1
- 206010033128 Ovarian cancer Diseases 0.000 claims 1
- 206010061535 Ovarian neoplasm Diseases 0.000 claims 1
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 claims 1
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 claims 1
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 claims 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 claims 1
- 208000029742 colonic neoplasm Diseases 0.000 claims 1
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 claims 1
- 239000012520 frozen sample Substances 0.000 claims 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 claims 1
- 208000005017 glioblastoma Diseases 0.000 claims 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 claims 1
- 238000003364 immunohistochemistry Methods 0.000 claims 1
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 claims 1
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 claims 1
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 claims 1
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 claims 1
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 claims 1
- 239000012188 paraffin wax Substances 0.000 claims 1
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 claims 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 claims 1
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
- A61K31/535—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with at least one nitrogen and one oxygen as the ring hetero atoms, e.g. 1,2-oxazines
- A61K31/5375—1,4-Oxazines, e.g. morpholine
- A61K31/5377—1,4-Oxazines, e.g. morpholine not condensed and containing further heterocyclic rings, e.g. timolol
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D261/00—Heterocyclic compounds containing 1,2-oxazole or hydrogenated 1,2-oxazole rings
- C07D261/02—Heterocyclic compounds containing 1,2-oxazole or hydrogenated 1,2-oxazole rings not condensed with other rings
- C07D261/06—Heterocyclic compounds containing 1,2-oxazole or hydrogenated 1,2-oxazole rings not condensed with other rings having two or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members
- C07D261/10—Heterocyclic compounds containing 1,2-oxazole or hydrogenated 1,2-oxazole rings not condensed with other rings having two or more double bonds between ring members or between ring members and non-ring members with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to ring carbon atoms
- C07D261/18—Carbon atoms having three bonds to hetero atoms, with at the most one bond to halogen
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Pathology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Oncology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Heterocyclic Carbon Compounds Containing A Hetero Ring Having Nitrogen And Oxygen As The Only Ring Hetero Atoms (AREA)
- Cell Biology (AREA)
Claims (43)
1. Способ селективного лечения пациента, страдающего от рака, включающий селективное введение терапевтически эффективного количества этиламида (5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-4-(4-морфолин-4-илметилфенил)-изоксазол-3-карбоновой кислоты (AUY922) или его фармацевтически приемлемой соли, пациенту на основании того, что пациент имеет сниженный уровень MLL1.
2. Способ селективного лечения пациента, страдающего от рака, включающий:
a) оценку биологического образца от пациента в отношении уровня MLL1; и
b) селективное введение терапевтически эффективного количества этиламида (5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-4-(4-морфолин-4-илметилфенил)-изоксазол-3-карбоновой кислоты (AUY922) или его фармацевтически приемлемой соли пациенту на основании того, что образец имеет сниженный уровень MLL1.
3. Способ селективного лечения пациента, страдающего от рака, включающий:
a) селективное введение терапевтически эффективного количества этиламида (5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-4-(4-морфолин-4-илметилфенил)-изоксазол-3-карбоновой кислоты (AUY922) или его фармацевтически приемлемой соли пациенту на основании того, что образец имеет сниженный уровень MLL1.
4. Способ селективного лечения пациента, страдающего от рака, включающий:
a) оценку биологического образца от пациента в отношении уровня MLL1;
b) после этого выбор пациента для лечения этиламидом (5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-4-(4-морфолин-4-илметилфенил)изоксазол-3-карбоновой кислоты (AUY922) или его фармацевтически приемлемой солью на основании того, что пациент имеет сниженный уровень MLL1; и
c) после этого введение этиламида (5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-4-(4-морфолин-4-илметилфенил)изоксазол-3-карбоновой кислоты (AUY922) или его фармацевтически приемлемой соли пациенту на основании того, что пациент имеет сниженный уровень MLL1.
5. Способ селективного лечения пациента, страдающего от рака, включающий:
a) определение уровней MLL1 в биологическом образце от пациента, где наличие сниженного уровня MLL1 показывает, что существует повышенная вероятность того, что пациент ответит на лечение соединением ингибитором HSP90 этиламидом (5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-4-(4-морфолин-4-илметилфенил)изоксазол-3-карбоновой кислоты (AUY922) или его фармацевтически приемлемой солью; и
d) после этого выбор пациента для лечения соединением ингибитором HSP90 этиламидом (5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-4-(4-морфолин-4-илметилфенил)изоксазол-3-карбоновой кислоты (AUY922) на основании того, что образец от пациента имеет сниженный уровень MLL1.
6. Способ выбора для лечения пациента, страдающего от рака, включающий определение уровней MLL1 в биологическом образце от пациента, где присутствие сниженного уровня MLL1 показывает, что существует повышенная вероятность того, что пациент ответит на лечение соединением ингибитором HSP90 этиламидом (5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-4-(4-морфолин-4-илметилфенил)изоксазол-3-карбоновой кислоты (AUY922) или его фармацевтически приемлемой солью.
7. Способ выбора для лечения пациента, страдающего от рака, включающий оценку образца нуклеиновой кислоты, полученного от пациента, страдающего от рака, в отношении уровня MLL1, где наличие сниженного уровня MLL1 показывает, что существует повышенная вероятность того, что пациент ответит на лечение соединением ингибитором HSP90 этиламидом (5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-4-(4-морфолин-4-илметилфенил)-изоксазол-3-карбоновой кислоты (AUY922) или его фармацевтически приемлемой солью.
8. Способ генотипирования пациента, включающий определение генетического варианта, который приводит к варианту аминокислоты в положении 859 кодируемой каталитической субъединицы р110α, где отсутствие варианта в положении 859 показывает, что пациенту должен вводиться этиламид (5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-4-(4-морфолин-4-илметилфенил)изоксазол-3-карбоновой кислоты (AUY922).
9. Способ генотипирования пациента, включающий определение отсутствия или присутствия CAA в положении 2575-2577 в каталитической субъединице p110α гена PI3K, полученной от указанного пациента, где присутствие CAA показывает, что пациент имеет повышенную вероятность ответа на этиламид (5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-4-(4-морфолин-4-илметилфенил)изоксазол-3-карбоновой кислоты (AUY922).
10. Соединение ингибитор HSP90 этиламид (5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-4-(4-морфолин-4-илметилфенил)изоксазол-3-карбоновой кислоты (AUY922), или его фармацевтически приемлемая соль, для применения в лечении рака, характеризующееся тем, что терапевтически эффективное количество указанного соединения или его фармацевтически приемлемой соли вводят пациенту на основании того, что пациент имеет сниженный уровень MLL1 по сравнению с контролем в одном или более из следующих положений:
(a) 146982000-146984500 на хромосоме X локуса генома FMR1;
(b) 146991500-146993600 на хромосоме X локуса генома FMR1;
(c) 146994300-147005500 на хромосоме X локуса генома FMR1; или
(d) 147023800-147027400 на хромосоме X локуса генома FMR1.
11. Соединение ингибитор HSP90 этиламид (5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-4-(4-морфолин-4-илметилфенил)изоксазол-3-карбоновой кислоты (AUY922), или его фармацевтически приемлемая соль, для применения в лечении рака, характеризующееся тем, что терапевтически эффективное количество указанного соединения или его фармацевтически приемлемой соли вводят пациенту на основании того, что в образце от пациента определили сниженный уровень MLL1 по сравнению с контролем в одном или более из следующих положений:
(a) 146982000-146984500 на хромосоме X локуса генома FMR1;
(b) 146991500-146993600 на хромосоме X локуса генома FMR1;
(c) 146994300-147005500 на хромосоме X локуса генома FMR1; или
(d) 147023800-147027400 на хромосоме X локуса генома FMR1.
12. Способ по любому из предшествующих пунктов, где рак выбирают из группы, состоящей из глиобластомы; меланомы; рака яичника: рака молочной железы: рак легкого: немелкоклеточного рака легкого (NSCLC); рака эндометрия, рака предстательной железы: рака толстой кишки; и миеломы.
13. Способ по любому из пунктов 1-11, где образцом является образец опухоли.
14. Способ по п. 13, где образец опухоли представляет собой свежезамороженный образец или образец ткани, погруженной в парафин.
15. Способ по любому из пп. 1-6 и 14, где определение может быть проведено посредством иммуноанализов, иммуногистохимии, ELISA, проточной цитометрии, Вестерн блоттинга, ВЭЖХ и масс спектрометрии.
16. Способ по любому из пп. 7-11, где присутствие или отсутствие мутации в молекуле нуклеиновой кислоты, кодирующей каталитическую субъединицу p110α PI3K может быть определено методикой, выбираемой из группы, состоящей из Нозерн блоттинга, полимеразной цепной реакции (ПЦР), обратно-транскриптазной полимеразной цепной реакции (ОТ-ПЦР), анализов на основе TaqMan, прямого секвенирования, динамической аллель-специфической гибридизации олигонуклеотидов матриц SNP высокой плотности, анализов длин полиморфизмов фрагментов рестрикции (RFLP), анализов удлинения праймеров, исследований лигазы олигонуклеотидов, анализ конформационного полиморфизма одиночной цепи, гель-электрофореза по градиенту температуры (TGGE), денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии, анализа расплава с высоким разрешением, анализов связывания белка ошибок ДНК, SNPLex®, капиллярного электрофореза, Саузернблоттинга.
17. Способ по п. 15, где присутствие или отсутствие мутации в молекуле нуклеиновой кислоты, кодирующей каталитическую субъединицу p110α PI3K может быть определено методикой, выбираемой из группы, состоящей из Нозерн блоттинга, полимеразной цепной реакции (ПЦР), обратно-транскриптазной полимеразной цепной реакции (ОТ-ПЦР), анализов на основе TaqMan, прямого секвенирования, динамической аллель-специфической гибридизации олигонуклеотидов матриц SNP высокой плотности, анализов длин полиморфизмов фрагментов рестрикции (RFLP), анализов удлинения праймеров, исследований лигазы олигонуклеотидов, анализ конформационного полиморфизма одиночной цепи, гель-электрофореза по градиенту температуры (TGGE), денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии, анализа расплава с высоким разрешением, анализов связывания белка ошибок ДНК, SNPLex®, капиллярного электрофореза, Саузернблоттинга.
18. Способ по любому из пп. 7-11, где указанная стадия определения включает секвенирование гена каталитической субъединицы p110α PI3K или его части.
19. Способ по п. 15, где указанная стадия определения включает секвенирование гена каталитической субъединицы p110α PI3K или его части.
20. Способ получения передаваемой формы информации для предсказания ответа пациента, страдающего от рака, на лечение этиламидом (5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-4-(4-морфолин-4-илметилфенил)изоксазол-3-карбоновой кислоты (AUY922), включающий:
a) определение, имеет ли пациент повышенную вероятность того, что пациент ответит на лечение этиламидом (5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-4-(4-морфолин-4-илметилфенил)изоксазол-3-карбоновой кислоты (AUY922), где пациент имеет повышенную вероятность на основании сниженного уровня MLL1, и
b) запись результатов стадии определения на материальном или нематериальном носителе для применения в передаче.
21. Набор для определения, ответит ли опухоль на лечение соединением ингибитором HSP90 этиламидом (5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-4-(4-морфолин-4-илметилфенил)изоксазол-3-карбоновой кислоты (AUY922) или его фармацевтически приемлемой солью, включающий обеспечение одного или более зондов или праймеров для определения наличия мутации в локусе гена PI3K (нуклеиновая кислота 2575-2577 SEQ ID NO:2) и инструкции для применения.
22. Набор для определения, получит ли пациент, страдающий раком, преимущество от лечения соединением ингибитором HSP90 этиламидом (5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-4-(4-морфолин-4-илметилфенил)изоксазол-3-карбоновой кислоты (AUY922) или его фармацевтически приемлемой солью, набор включает:
e) множество средств для определения наличия мутации, которая кодирует вариант в положении 859 каталитической субъединицы p110α PI3K; и
f) инструкции по применению.
23. Набор для определения, будет ли опухоль отвечать на лечение соединением ингибитором HSP90 этиламидом (5-(2,4-дигидрокси-5-изопропилфенил)-4-(4-морфолин-4-илметилфенил)изоксазол-3-карбоновой кислоты (AUY922) или его фармацевтически приемлемой солью, включающий обеспечение одного или более зондов или праймеров для определения присутствия или отсутствия мутации, которая кодирует вариант в каталитической субъединице p110α гена PI3K в положении 859.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201361802327P | 2013-03-15 | 2013-03-15 | |
| US61/802,327 | 2013-03-15 | ||
| PCT/IB2014/059826 WO2014141194A2 (en) | 2013-03-15 | 2014-03-14 | Biomarker |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2015144019A true RU2015144019A (ru) | 2017-04-24 |
| RU2015144019A3 RU2015144019A3 (ru) | 2018-04-03 |
Family
ID=50391246
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2015144019A RU2015144019A (ru) | 2013-03-15 | 2014-03-14 | Биомаркеры фармакодинамического ответа опухоли |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20160031836A1 (ru) |
| EP (1) | EP2968349A2 (ru) |
| JP (1) | JP2016512812A (ru) |
| KR (1) | KR20150131155A (ru) |
| CN (1) | CN105050603A (ru) |
| AU (2) | AU2014229240B2 (ru) |
| BR (1) | BR112015021846A2 (ru) |
| CA (1) | CA2902699A1 (ru) |
| MX (1) | MX2015013197A (ru) |
| RU (1) | RU2015144019A (ru) |
| WO (1) | WO2014141194A2 (ru) |
Families Citing this family (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20160371957A1 (en) * | 2015-06-22 | 2016-12-22 | Mc10, Inc. | Method and system for structural health monitoring |
| RU2689400C1 (ru) * | 2018-04-17 | 2019-05-28 | Федеральное Государственное Бюджетное Учреждение Науки Институт Молекулярной Биологии Им. В.А. Энгельгардта Российской Академии Наук (Имб Ран) | Способ анализа полиморфных маркеров в генах VKORC1, CYP4F2, CYP2C9, CYP2C19, ABCB1, ITGB3 для определения индивидуальной чувствительности к противосвертывающим препаратам |
| CN108570501B (zh) * | 2018-04-28 | 2020-06-12 | 北京师范大学 | 多发性骨髓瘤分子分型及应用 |
| WO2020206608A1 (en) | 2019-04-09 | 2020-10-15 | Ranok Therapeutics (Hangzhou) Co., Ltd. | Methods and compositions for targeted protein degradation |
Family Cites Families (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| DK1611112T3 (da) * | 2003-02-11 | 2012-11-19 | Cancer Res Inst | Isoxazolforbindelser som hæmmere af varmechokproteiner |
| TW200922595A (en) * | 2007-10-12 | 2009-06-01 | Novartis Ag | Organic compounds |
| US20110319415A1 (en) * | 2008-08-18 | 2011-12-29 | Universit+e,uml a+ee t zu K+e,uml o+ee ln | Susceptibility to HSP90-Inhibitors |
| CN101445832B (zh) * | 2008-12-23 | 2011-09-14 | 广州益善生物技术有限公司 | Pik3ca基因突变的检测探针、液相芯片及其检测方法 |
| PL2488873T3 (pl) * | 2009-10-16 | 2016-01-29 | Novartis Ag | Biomarkery odpowiedzi farmakodynamicznej wobec guza |
| CA2779843A1 (en) * | 2009-11-13 | 2011-05-19 | Infinity Pharmaceuticals, Inc. | Compositions, kits, and methods for identification, assessment, prevention, and therapy of cancer |
| EA028984B1 (ru) * | 2012-03-29 | 2018-01-31 | Новартис Аг | Применение (s)-пирролидин-1,2-дикарбоновой кислоты 2-амид 1-({4-метил-5-[2-(2,2,2-трифтор-1,1-диметилэтил)пиридин-4-ил]тиазол-2-ил}амида) для лечения рака |
-
2014
- 2014-03-14 CA CA2902699A patent/CA2902699A1/en not_active Abandoned
- 2014-03-14 JP JP2015562532A patent/JP2016512812A/ja active Pending
- 2014-03-14 WO PCT/IB2014/059826 patent/WO2014141194A2/en active Application Filing
- 2014-03-14 BR BR112015021846A patent/BR112015021846A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2014-03-14 US US14/774,511 patent/US20160031836A1/en not_active Abandoned
- 2014-03-14 EP EP14713928.1A patent/EP2968349A2/en not_active Withdrawn
- 2014-03-14 AU AU2014229240A patent/AU2014229240B2/en not_active Ceased
- 2014-03-14 KR KR1020157028396A patent/KR20150131155A/ko not_active Application Discontinuation
- 2014-03-14 RU RU2015144019A patent/RU2015144019A/ru not_active Application Discontinuation
- 2014-03-14 MX MX2015013197A patent/MX2015013197A/es unknown
- 2014-03-14 CN CN201480016035.2A patent/CN105050603A/zh active Pending
-
2017
- 2017-05-19 AU AU2017203395A patent/AU2017203395A1/en not_active Abandoned
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2014141194A2 (en) | 2014-09-18 |
| EP2968349A2 (en) | 2016-01-20 |
| JP2016512812A (ja) | 2016-05-09 |
| AU2014229240B2 (en) | 2017-06-15 |
| MX2015013197A (es) | 2016-07-07 |
| AU2017203395A1 (en) | 2017-06-08 |
| WO2014141194A3 (en) | 2015-01-08 |
| KR20150131155A (ko) | 2015-11-24 |
| CN105050603A (zh) | 2015-11-11 |
| AU2014229240A1 (en) | 2015-09-17 |
| RU2015144019A3 (ru) | 2018-04-03 |
| US20160031836A1 (en) | 2016-02-04 |
| BR112015021846A2 (pt) | 2017-07-18 |
| CA2902699A1 (en) | 2014-09-18 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| EP3140427B1 (en) | Biomarkers for response to pi3k inhibitors | |
| US20120100134A1 (en) | Genetic variants in angiogenesis pathway associated with clinical outcome | |
| US20120100997A1 (en) | Cd133 polymorphisms and expression predict clinical outcome in patients with cancer | |
| WO2013172933A1 (en) | Ethnic gene profile of genes involved in angiogenesis may predict regional bevacizumab efficacy difference in gastric cancer | |
| JP2022173308A (ja) | エンザスタウリンの活性を予測するための方法および組成物 | |
| JP2017519498A5 (ru) | ||
| US20180100198A1 (en) | Gene fusion | |
| RU2015144019A (ru) | Биомаркеры фармакодинамического ответа опухоли | |
| WO2010118210A1 (en) | Methods of predicting complication and surgery in crohn's disease | |
| US20110178110A1 (en) | Genotype and Expression Analysis for Use in Predicting Outcome and Therapy Selection | |
| EP3322823A1 (en) | Methods for diagnosis, prognosis and monitoring of breast cancer and reagents therefor | |
| CA2760814A1 (en) | Hepatocellular carcinoma | |
| WO2011017120A1 (en) | Use of ccr9, ccl25, batf and il17/il23 pathway variants to diagnose and treat inflammatory bowel disease | |
| Zhang et al. | Ultrasensitive biosensing of low abundance BRAF V600E mutation in real samples by coupling dual padlock-gap-ligase chain reaction with hyperbranched rolling circle amplification | |
| US20120108445A1 (en) | Vegf and vegfr1 gene expression useful for cancer prognosis | |
| US20120100135A1 (en) | Genetic polymorphisms associated with clinical outcomes of topoisomerase inhibitor therapy for cancer | |
| WO2013172932A1 (en) | Colon cancer tumor suppressor gene, b-defensin 1, predicts recurrence in patients with stage ii and iii colon cancer | |
| CN103789436B (zh) | 一种基于人工修饰引物的定量突变检测系统 | |
| WO2021066038A1 (ja) | 膀胱癌治療におけるｂｃｇ膀胱内注入療法の治療効果を予測するためのバイオマーカー、方法、キット及びアレイ | |
| US20080160533A1 (en) | Assay for prediction of response to Met antagonists | |
| KR101622454B1 (ko) | Egfr 티로신 키나아제 억제제에 대한 항암 치료 반응 예측 마커 | |
| Jenner et al. | Development of a gLCR-based KRAS mutation detection approach and its comparison with other screening methods | |
| KR101213173B1 (ko) | 유방암과 연관된 단일염기다형성 및 그의 용도 | |
| WO2011155531A1 (ja) | 薬剤性肺障害の発症のリスク予測、該リスク予測のための遺伝子の検出方法及び検出用キット | |
| KR20220152853A (ko) | 대장암의 예후 예측용 바이오마커 및 이의 용도 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20181206 |