RU2014150777A - Способ индикации наличия или отсутствия рака предстательной железы - Google Patents

Способ индикации наличия или отсутствия рака предстательной железы Download PDF

Info

Publication number
RU2014150777A
RU2014150777A RU2014150777A RU2014150777A RU2014150777A RU 2014150777 A RU2014150777 A RU 2014150777A RU 2014150777 A RU2014150777 A RU 2014150777A RU 2014150777 A RU2014150777 A RU 2014150777A RU 2014150777 A RU2014150777 A RU 2014150777A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
rsa
concentration
biomarker
ligand
subject
Prior art date
Application number
RU2014150777A
Other languages
English (en)
Inventor
Хенрик ГРЁНБЕРГ
Мартин Эклунд
Original Assignee
Пхадиа Аб
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Пхадиа Аб filed Critical Пхадиа Аб
Publication of RU2014150777A publication Critical patent/RU2014150777A/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57407—Specifically defined cancers
    • G01N33/57434—Specifically defined cancers of prostate
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/90—Enzymes; Proenzymes
    • G01N2333/914—Hydrolases (3)
    • G01N2333/948—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • G01N2333/95—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99)
    • G01N2333/964—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99) derived from animal tissue
    • G01N2333/96425—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99) derived from animal tissue from mammals
    • G01N2333/96427—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99) derived from animal tissue from mammals in general
    • G01N2333/9643—Proteinases, i.e. endopeptidases (3.4.21-3.4.99) derived from animal tissue from mammals in general with EC number
    • G01N2333/96433—Serine endopeptidases (3.4.21)
    • G01N2333/96441—Serine endopeptidases (3.4.21) with definite EC number

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)

Abstract

1. Способ индикации наличия или отсутствия у субъекта рака предстательной железы (РСа), который включает следующие стадии:1) получение у указанного субъекта по меньшей мере одного биологического образца;2) определение в указанном биологическом образце:a) наличия или концентрации по меньшей мере одного биомаркера, относящегося к РСа;b) генетического статуса указанного субъекта, обусловленного раком предстательной железы, путем определения наличия по меньшей мере одного SNP, относящегося к РСа; иc) генетического статуса указанного субъекта, обусловленного концентрацией биомаркера РСа, путем определения наличия по меньшей мере одного SNP, относящегося к концентрации биомаркера РСа;3) объединение данных указанного субъекта, относящихся к наличию или концентрации по меньшей мере одного биомаркера, относящегося к РСа, данных субъекта, относящихся к РСа-обусловленному генетическому статусу, и данных субъекта, относящихся к генетическому статусу, обусловленному концентрацией биомаркера РСа, с определением общего составного значения;4) корреляцию общего составного значения с наличием РСа у указанного субъекта путем сравнения общего составного значения с ранее определенным предельным значением, установленным с помощью контрольных образцов известных случаев диагностики РСа и доброкачественного заболевания;при этом определяют наличие или концентрацию по меньшей мере одного из биомаркеров (i) PSA, (ii) общего PSA (tPSA), (iii) интактного PSA (iPSA), (iv) свободного PSA (fPSA) и (v) HK2 и включают полученное значение в общее составное значение.2. Способ индикации наличия или отсутствия у субъекта рака предстательной железы (РСа), который включает следующие стадии:1) получение у указанного с

Claims (30)

1. Способ индикации наличия или отсутствия у субъекта рака предстательной железы (РСа), который включает следующие стадии:
1) получение у указанного субъекта по меньшей мере одного биологического образца;
2) определение в указанном биологическом образце:
a) наличия или концентрации по меньшей мере одного биомаркера, относящегося к РСа;
b) генетического статуса указанного субъекта, обусловленного раком предстательной железы, путем определения наличия по меньшей мере одного SNP, относящегося к РСа; и
c) генетического статуса указанного субъекта, обусловленного концентрацией биомаркера РСа, путем определения наличия по меньшей мере одного SNP, относящегося к концентрации биомаркера РСа;
3) объединение данных указанного субъекта, относящихся к наличию или концентрации по меньшей мере одного биомаркера, относящегося к РСа, данных субъекта, относящихся к РСа-обусловленному генетическому статусу, и данных субъекта, относящихся к генетическому статусу, обусловленному концентрацией биомаркера РСа, с определением общего составного значения;
4) корреляцию общего составного значения с наличием РСа у указанного субъекта путем сравнения общего составного значения с ранее определенным предельным значением, установленным с помощью контрольных образцов известных случаев диагностики РСа и доброкачественного заболевания;
при этом определяют наличие или концентрацию по меньшей мере одного из биомаркеров (i) PSA, (ii) общего PSA (tPSA), (iii) интактного PSA (iPSA), (iv) свободного PSA (fPSA) и (v) HK2 и включают полученное значение в общее составное значение.
2. Способ индикации наличия или отсутствия у субъекта рака предстательной железы (РСа), который включает следующие стадии:
1) получение у указанного субъекта по меньшей мере одного биологического образца;
2) определение в указанном биологическом образце:
a) наличия или концентрации по меньшей мере двух биомаркеров, относящихся к РСа;
b) генетического статуса указанного субъекта, обусловленного раком предстательной железы, путем определения наличия по меньшей мере одного SNP, относящегося к РСа;
3) объединение данных указанного субъекта, относящихся к наличию или концентрации по меньшей мере двух биомаркеров, относящихся к РСа, с получением составного значения биомаркеров, определяющего обусловленный биомаркерами РСа риск развития РСа;
4) объединение данных указанного субъекта, относящихся к генетическому статусу, обусловленному раком предстательной железы, с получением составного значения генетики, определяющего обусловленный генетикой риск развития РСа;
5) объединение составного значения биомаркеров и составного значения генетики с получением общего составного значения, позволяющего прогнозировать наличие РСа у указанного субъекта путем сравнения указанного общего составного значения с ранее определенным предельным значением, установленным с помощью контрольных образцов известных случаев диагностики РСа и доброкачественного заболевания;
при этом определяют наличие или концентрацию по меньшей мере одного и максимум четырех биомаркеров (i) PSA, (ii) общего PSA (tPSA), (iii) интактного PSA (iPSA), (iv) свободного PSA (fPSA) и (v) HK2 и включают полученное значение в составное значение биомаркеров.
3. Способ по п. 2, который дополнительно включает стадию 2с), при выполнении которой в биологическом образце определяют генетический статус указанного субъекта, обусловленный концентрацией биомаркера РСа, определяя наличие по меньшей мере одного SNP, относящегося к концентрации биомаркера РСа; и стадию 4, при выполнении которой объединяют данные указанного субъекта, относящиеся к генетическому статусу, обусловленному раком предстательной железы, и генетическому статусу, обусловленному концентрацией биомаркера РСа, получая при этом составное значение генетики, устанавливающее определяемый генетикой риск развития РСа.
4. Способ по любому из пп. 1-3, в котором SNP, относящийся к РСа, включает по меньшей мере один из rs11672691, rs11704416, rs3863641, rs12130132, rs4245739, rs3771570, rs7611694, rs1894292, rs6869841, rs2018334, rs16896742, rs2273669, rs1933488, rs11135910, rs3850699, rs11568818, rs1270884, rs8008270, rs4643253, rs684232, rs11650494, rs7241993, rs6062509, rs1041449, rs2405942, rs12621278, rs9364554, rs10486567, rs6465657, rs2928679, rs6983561, rs16901979, rs16902094, rs12418451, rs4430796, rs11649743, rs2735839, rs9623117 и rs138213197.
5. Способ по п. 1 или 3, в котором SNP, относящийся к концентрации биомаркера РСа, включает по меньшей мере один из rs3213764, rs1354774 и rs1227732.
6. Способ по п. 1 или 2, который далее включает определение генетического статуса, обусловленного индексом массы тела (BMI) указанного субъекта, путем определения наличия по меньшей мере одного SNP, относящегося к BMI, после чего данные субъекта для SNP, относящегося к BMI, включают в объединенные данные, образующие указанное составное значение.
7. Способ по п. 6, в котором SNP, относящийся к BMI указанного субъекта, включает по меньшей мере один из rs3817334, rs10767664, rs2241423, rs7359397, rs7190603, rs571312, rs29941, rs2287019, rs2815752, rs713586, rs2867125, rs9816226, rs10938397 и rs1558902.
8. Способ по п. 1 или 2, который далее включает получение семейного анамнеза, относящегося к РСа, и физических данных субъекта, после чего семейный анамнез и/или физические данные включают в объединенные данные, образующие указанное общее составное значение.
9. Способ по п. 1 или 2, в котором далее определяют наличие или концентрацию MIC-1 и/или MSMB и полученные данные включают в составное значение биомаркеров или непосредственно в общее составное значение.
10. Способ по п. 1 или 2, в котором указанный биологический образец является пробой крови.
11. Способ по п. 1 или 2, в котором общее составное значение, составное значение биомаркеров и/или составное значение генетики вычисляют с помощью метода, позволяющего определить неаддитивный эффект SNP, относящегося к концентрации биомаркеров РСа, и соответствующей концентрации биомаркеров РСа.
12. Способ по п. 1 или 2, в котором генетический статус определяют при помощи масс-спектрометрии MALDI.
13. Способ по п. 1 или 2, в котором наличие или концентрацию биомаркеров РСа определяют микроматричным методом.
14. Аналитическое устройство, предназначенное для выполнения стадий 2а, 2b и 2с по п. 1, которое включает твердую фазу, на поверхности которой иммобилизованы лиганды по меньшей мере трех разных типов, из которых:
указанные лиганды первого типа включают по меньшей мере один лиганд, специфически связывающийся с биомаркером, относящимся к РСа, таким как по меньшей мере один из PSA, iPSA, tPSA, fPSA и hK2, а также необязательно MIC-1 и/или MSMB;
указанные лиганды второго типа включают по меньшей мере один лиганд, специфически связывающийся с SNP, относящимся к РСа, таким как по меньшей мере один из rs11672691, rs11704416, rs3863641, rs12130132, rs4245739, rs3771570, rs7611694, rs1894292, rs6869841, rs2018334, rs16896742, rs2273669, rs1933488, rs11135910, rs3850699, rs11568818, rs1270884, rs8008270, rs4643253, rs684232, rs11650494, rs7241993, rs6062509, rs1041449, rs2405942, rs12621278, rs9364554, rs10486567, rs6465657, rs2928679, rs6983561, rs16901979, rs16902094, rs12418451, rs4430796, rs11649743, rs2735839, rs9623117 и rs138213197; и
указанные лиганды третьего типа включают по меньшей мере один лиганд, специфически связывающийся с SNP, относящимся к концентрации биомаркера РСа, таким как по меньшей мере один из rs3213764, rs1354774 и rs1227732.
15. Аналитическое устройство, предназначенное для выполнения стадий 2а и 2b по п. 2, которое включает твердую фазу, на поверхности которой иммобилизованы лиганды по меньшей мере двух разных типов, из которых:
указанные лиганды первого типа включают по меньшей мере два разных лиганда, каждый из которых специфически связывается с биомаркером, относящимся к РСа, таким как по меньшей мере один из PSA, iPSA, tPSA, fPSA и hK2, а также необязательно MIC-1 и/или MSMB; и
указанные лиганды второго типа включают по меньшей мере один лиганд, специфически связывающийся с SNP, относящимся к РСа, таким как по меньшей мере один из rs11672691, rs11704416, rs3863641, rs12130132, rs4245739, rs3771570, rs7611694, rs1894292, rs6869841, rs2018334, rs16896742, rs2273669, rs1933488, rs11135910, rs3850699, rs11568818, rs1270884, rs8008270, rs4643253, rs684232, rs11650494, rs7241993, rs6062509, rs1041449, rs2405942, rs12621278, rs9364554, rs10486567, rs6465657, rs2928679, rs6983561, rs16901979, rs16902094, rs12418451, rs4430796, rs11649743, rs2735839, rs9623117 и rs138213197.
16. Аналитическое устройство по п. 15, дополнительно предназначенное для выполнения стадии 2с по п. 3, в котором на твердой фазе иммобилизован лиганд третьего типа, включающий по меньшей мере один лиганд, специфически связывающийся с SNP, относящимся к концентрации биомаркера РСа, таким как по меньшей мере один из rs3213764, rs1354774 и rs1227732.
17. Аналитическое устройство по любому из пп. 14-16, дополнительно предназначенное для выполнения способа по п. 6, в котором на твердой фазе иммобилизован лиганд четвертого типа, включающий по меньшей мере один лиганд, специфически связывающийся с SNP, относящимся к BMI, таким как по меньшей мере один из rs3817334, rs10767664, rs2241423, rs7359397, rs7190603, rs571312, rs29941, rs2287019, rs2815752, rs713586, rs2867125, rs9816226, rs10938397 и rs1558902.
18. Диагностический набор, предназначенный для выполнения стадий 2а, 2b и 2с по п. 1, который включает аналитическое устройство по п. 14 и детектирующие молекулы по меньшей мере трех разных типов, из которых:
детектирующие молекулы первого типа включают по меньшей мере один лиганд, способный обнаруживать биомаркер, относящийся к РСа, такой как по меньшей мере один из PSA, iPSA, tPSA, fPSA и hK2, а также необязательно MIC-1 и/или MSMB;
детектирующие молекулы второго типа включают по меньшей мере один лиганд, способный обнаруживать SNP, относящийся к РСа, такой как по меньшей мере один из rs11672691, rs11704416, rs3863641, rs12130132, rs4245739, rs3771570, rs7611694, rs1894292, rs6869841, rs2018334, rs16896742, rs2273669, rs1933488, rs11135910, rs3850699, rs11568818, rs1270884, rs8008270, rs4643253, rs684232, rs11650494, rs7241993, rs6062509, rs1041449, rs2405942, rs12621278, rs9364554, rs10486567, rs6465657, rs2928679, rs6983561, rs16901979, rs16902094, rs12418451, rs4430796, rs11649743, rs2735839, rs9623117 и rs138213197; и
детектирующие молекулы третьего типа включают по меньшей мере один лиганд, способный обнаруживать SNP, относящийся к концентрации биомаркера РСа, такой как по меньшей мере один из rs3213764, rs1354774 и rs1227732.
19. Диагностический набор, предназначенный для выполнения стадий 2а и 2b по п. 2, который включает аналитическое устройство по п. 15 и детектирующие молекулы по меньшей мере двух разных типов, из которых:
детектирующие молекулы первого типа включают по меньшей мере две разные детектирующие молекулы, каждая из которых способна обнаруживать биомаркер, относящийся к РСа, такой как по меньшей мере один из PSA, iPSA, tPSA, fPSA и hK2, а также необязательно MIC-1 и/или MSMB, при условии, что по меньшей мере две разные детектирующие молекулы способны обнаруживать разные биомаркеры, относящиеся к РСа; и
детектирующие молекулы второго типа включают по меньшей мере один лиганд, способный обнаруживать SNP, относящийся к РСа, такой как по меньшей мере один из rs11672691, rs11704416, rs3863641, rs12130132, rs4245739, rs3771570, rs7611694, rs1894292, rs6869841, rs2018334, rs16896742, rs2273669, rs1933488, rs11135910, rs3850699, rs11568818, rs1270884, rs8008270, rs4643253, rs684232, rs11650494, rs7241993, rs6062509, rs1041449, rs2405942, rs12621278, rs9364554, rs10486567, rs6465657, rs2928679, rs6983561, rs16901979, rs16902094, rs12418451, rs4430796, rs11649743, rs2735839, rs9623117 и rs138213197.
20. Диагностический набор, предназначенный для выполнения стадий 2а, 2b и 2с по п. 3, который включает аналитическое устройство по п. 16 и детектирующие молекулы по меньшей мере трех разных типов, из которых:
детектирующие молекулы первого типа включают по меньшей мере две разные детектирующие молекулы, каждая из которых способна обнаруживать биомаркер, относящийся к РСа, такой как по меньшей мере один из PSA, iPSA, tPSA, fPSA и hK2, а также необязательно MIC-1 и/или MSMB, при условии, что по меньшей мере две разные детектирующие молекулы способны обнаруживать разные биомаркеры, относящиеся к РСа;
детектирующие молекулы второго типа включают по меньшей мере один лиганд, способный обнаруживать SNP, относящийся к РСа, такой как по меньшей мере один из rs11672691, rs11704416, rs3863641, rs12130132, rs4245739, rs3771570, rs7611694, rs1894292, rs6869841, rs2018334, rs16896742, rs2273669, rs1933488, rs11135910, rs3850699, rs11568818, rs1270884, rs8008270, rs4643253, rs684232, rs11650494, rs7241993, rs6062509, rs1041449, rs2405942, rs12621278, rs9364554, rs10486567, rs6465657, rs2928679, rs6983561, rs16901979, rs16902094, rs12418451, rs4430796, rs11649743, rs2735839, rs9623117 и rs138213197; и
детектирующие молекулы третьего типа включают по меньшей мере один лиганд, способный обнаруживать SNP, относящийся к концентрации биомаркера РСа, такой как по меньшей мере один из rs3213764, rs1354774 и rs1227732.
21. Диагностический набор по любому из пп. 18-20, предназначенный для выполнения способа по п. 6, который включает аналитическое устройство по п. 17 и детектирующую молекулу четвертого типа, включающую по меньшей мере один лиганд, способный обнаруживать SNP, относящийся к BMI, такой как по меньшей мере один из rs3817334, rs10767664, rs2241423, rs7359397, rs7190603, rs571312, rs29941, rs2287019, rs2815752, rs713586, rs2867125, rs9816226, rs10938397 и rs1558902.
22. Аналитическое устройство, включающее твердую фазу, на поверхности которой иммобилизованы лиганды по меньшей мере трех типов, из которых
указанные лиганды первого типа включают по меньшей мере один лиганд, специфически связывающийся с биомаркером, относящимся к РСа, который выбирают по меньшей мере из одного PSA, iPSA, tPSA, fPSA и hK2, а также необязательно MIC-1 и/или MSMB;
указанные лиганды второго типа включают по меньшей мере один лиганд, специфически связывающийся с SNP, относящимся к РСа, который выбирают по меньшей мере из одного rs11672691, rs11704416, rs3863641, rs12130132, rs4245739, rs3771570, rs7611694, rs1894292, rs6869841, rs2018334, rs16896742, rs2273669, rs1933488, rs11135910, rs3850699, rs11568818, rs1270884, rs8008270, rs4643253, rs684232, rs11650494, rs7241993, rs6062509, rs1041449, rs2405942, rs12621278, rs9364554, rs10486567, rs6465657, rs2928679, rs6983561, rs16901979, rs16902094, rs12418451, rs4430796, rs11649743, rs2735839, rs9623117 и rs138213197; и
указанные лиганды третьего типа включают по меньшей мере один лиганд, специфически связывающийся с SNP, относящимся к концентрации биомаркера РСа, который выбирают по меньшей мере из одного rs3213764, rs1354774 и rs1227732.
23. Аналитическое устройство, включающее твердую фазу, на поверхности которой иммобилизованы лиганды по меньшей мере двух разных типов, из которых:
указанные лиганды первого типа включают по меньшей мере два лиганда, специфически связывающихся с биомаркером, относящимся к РСа, который выбирают по меньшей мере из одного PSA, iPSA, tPSA, fPSA и hK2, а также необязательно MIC-1 и/или MSMB, при условии, что по меньшей мере две разные детектирующие молекулы способны обнаруживать разные биомаркеры, относящиеся к РСа; и
указанные лиганды второго типа включают по меньшей мере один лиганд, специфически связывающийся с SNP, относящимся к РСа, который выбирают по меньшей мере из одного rs11672691, rs11704416, rs3863641, rs12130132, rs4245739, rs3771570, rs7611694, rs1894292, rs6869841, rs2018334, rs16896742, rs2273669, rs1933488, rs11135910, rs3850699, rs11568818, rs1270884, rs8008270, rs4643253, rs684232, rs11650494, rs7241993, rs6062509, rs1041449, rs2405942, rs12621278, rs9364554, rs10486567, rs6465657, rs2928679, rs6983561, rs16901979, rs16902094, rs12418451, rs4430796, rs11649743, rs2735839, rs9623117 и rs138213197.
24. Аналитическое устройство по п. 23, в котором на поверхности твердой фазы далее иммобилизован лиганд третьего типа, включающий по меньшей мере один лиганд, специфически связывающийся с SNP, относящимся к концентрации биомаркера РСа, который выбирают по меньшей мере из одного rs3213764, rs1354774 и rs1227732.
25. Аналитическое устройство по любому из пп. 22-24, в котором на поверхности твердой фазы далее иммобилизован лиганд четвертого типа, включающий по меньшей мере один лиганд, специфически связывающийся с SNP, относящимся к BMI, который выбирают по меньшей мере из одного rs3817334, rs10767664, rs2241423, rs7359397, rs7190603, rs571312, rs29941, rs2287019, rs2815752, rs713586, rs2867125, rs9816226, rs10938397 и rs1558902.
26. Постоянный считываемый компьютером носитель, включающий инструкции по выполнению компьютером по меньшей мере стадий 3 и 4 способа по п. 1, в частности, стадий 1, 2а, 2b, 2с, 3 и 4 способа по п. 1.
27. Постоянный считываемый компьютером носитель, включающий инструкции по выполнению компьютером по меньшей мере стадий 3 и 4 способа по п. 2, в частности, стадий 1, 2а, 2b, 3 и 4 способа по п. 2, и необязательно дополнительно включающий инструкции по выполнению компьютером стадии 5 способа по п. 2.
28. Считываемый компьютером носитель по п. 27, который дополнительно включает инструкции по выполнению компьютером стадии 2с способа по п. 3.
29. Считываемый компьютером носитель по любому из пп. 26-28, который дополнительно включает инструкции по выполнению компьютером способа по п. 6.
30. Аппарат, включающий аналитическое устройство по п. 22 и считываемый компьютером носитель по п. 26; аналитическое устройство по п. 23 и считываемый компьютером носитель по п. 27; аналитическое устройство по п. 24 и считываемый компьютером носитель по п. 28 или аналитическое устройство по п. 25 и считываемый компьютером носитель по п. 29.
RU2014150777A 2012-05-16 2013-05-16 Способ индикации наличия или отсутствия рака предстательной железы RU2014150777A (ru)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
SE1250508 2012-05-16
SE1250508-7 2012-05-16
SE1251309-9 2012-11-20
SE1251309 2012-11-20
PCT/SE2013/050554 WO2013172779A2 (en) 2012-05-16 2013-05-16 Method for indicating the presence or non-presence of prostate cancer

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2014150777A true RU2014150777A (ru) 2016-07-10

Family

ID=48577212

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2014150777A RU2014150777A (ru) 2012-05-16 2013-05-16 Способ индикации наличия или отсутствия рака предстательной железы

Country Status (7)

Country Link
US (1) US20150094221A1 (ru)
EP (1) EP2850432A2 (ru)
JP (1) JP2015524052A (ru)
AU (1) AU2013263473A1 (ru)
CA (1) CA2871877A1 (ru)
RU (1) RU2014150777A (ru)
WO (1) WO2013172779A2 (ru)

Families Citing this family (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101754812B (zh) 2007-05-04 2013-06-26 克拉洛诊断仪器公司 流体连接器和微流体系统
DE202010018623U1 (de) 2009-02-02 2018-12-07 Opko Diagnostics, Llc Strukturen zur Steuerung der Lichtwechselwirkung mit mikrofluidischen Vorrichtungen
EA036387B1 (ru) 2012-03-05 2020-11-03 Ой Арктик Партнерс Аб Способы и аппараты для прогнозирования риска рака предстательной железы и объема предстательной железы
AU2013349721B2 (en) 2012-11-20 2019-03-28 Phadia Ab Prognostic method for individuals with prostate cancer
CA3092807C (en) 2012-11-20 2024-02-27 Phadia Ab Method for indicating a presence or non-presence of aggressive prostate cancer
EP2759605B1 (en) * 2013-01-25 2018-11-14 Signature Diagnostics AG A method for predicting a manifestation of an outcome measure of a cancer patient
AU2015230017B2 (en) 2014-03-11 2021-06-17 Phadia Ab Method for detecting a solid tumor cancer
JP6474198B2 (ja) * 2014-03-24 2019-02-27 花王株式会社 内臓脂肪蓄積感受性の判定方法
US11761962B2 (en) * 2014-03-28 2023-09-19 Opko Diagnostics, Llc Compositions and methods related to diagnosis of prostate cancer
MX2017012320A (es) 2015-03-27 2018-01-18 Opko Diagnostics Llc Estandares de antigeno prostatico y sus usos.
PE20180930A1 (es) * 2015-04-29 2018-06-08 Opko Diagnostics Llc Composiciones y metodos para la vigilancia activa del cancer de prostata
JP7138112B2 (ja) * 2017-02-01 2022-09-15 ファディア・アクチボラゲット 特定の特徴を有する個体において前立腺癌の存在または不存在を示すための方法

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20030219840A1 (en) 2002-05-24 2003-11-27 Mikolajczyk Stephen D. Method of analyzing proenzyme forms of prostate specific antigen in serum to improve prostate cancer detection
CA2750062A1 (en) 2009-01-19 2010-07-22 Katrin Stedronsky Diagnostic assays for prostate cancer using psp94 and psa biomarkers
EP2611943B1 (en) * 2010-09-03 2017-01-04 Wake Forest University Health Sciences Methods and compositions for correlating genetic markers with prostate cancer risk
US20120150032A1 (en) * 2010-12-13 2012-06-14 Julius Gudmundsson Sequence Variants Associated with Prostate Specific Antigen Levels

Also Published As

Publication number Publication date
AU2013263473A1 (en) 2014-11-20
US20150094221A1 (en) 2015-04-02
CA2871877A1 (en) 2013-11-21
WO2013172779A2 (en) 2013-11-21
EP2850432A2 (en) 2015-03-25
WO2013172779A3 (en) 2014-02-27
JP2015524052A (ja) 2015-08-20

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2014150777A (ru) Способ индикации наличия или отсутствия рака предстательной железы
Asplund et al. Antibodies for profiling the human proteome—The H uman P rotein A tlas as a resource for cancer research
Simpson et al. Proteomics-driven cancer biomarker discovery: looking to the future
Xiao et al. Proteomic patterns: their potential for disease diagnosis
Jerevall et al. Prognostic utility of HOXB13: IL17BR and molecular grade index in early-stage breast cancer patients from the Stockholm trial
Hüttenhain et al. A targeted mass spectrometry strategy for developing proteomic biomarkers: A case study of epithelial ovarian cancer*[S]
Lou et al. Quantification of rare circulating tumor cells in non-small cell lung cancer by ligand-targeted PCR
Jimenez et al. Mass spectrometry-based proteomics: from cancer biology to protein biomarkers, drug targets, and clinical applications
Steiner et al. Applications of mass spectrometry for quantitative protein analysis in formalin‐fixed paraffin‐embedded tissues
Maes et al. Proteomics in cancer research: Are we ready for clinical practice?
JP2016503301A5 (ru)
Prieto et al. Mass spectrometry in cancer biomarker research: a case for immunodepletion of abundant blood-derived proteins from clinical tissue specimens
Taguchi et al. Unleashing the power of proteomics to develop blood-based cancer markers
Hou et al. Biomarker discovery and verification of esophageal squamous cell carcinoma using integration of SWATH/MRM
Ren et al. Tumor markers for early detection of ovarian cancer
Pan et al. Three-dimensionally functionalized reverse phase glycoprotein array for cancer biomarker discovery and validation
RU2015124008A (ru) Способ прогноза для индивидуумов с раком предстательной железы
Chung et al. Breast cancer biomarkers: proteomic discovery and translation to clinically relevant assays
Mischak et al. Epidemiologic design and analysis for proteomic studies: a primer on-omic technologies
Simpkins et al. SELDI-TOF mass spectrometry for cancer biomarker discovery and serum proteomic diagnostics
Nie et al. Quantitative analysis of single amino acid variant peptides associated with pancreatic cancer in serum by an isobaric labeling quantitative method
Umelo et al. Innovative methods for biomarker discovery in the evaluation and development of cancer precision therapies
Chen et al. Development of biomarkers of genitourinary cancer using mass spectrometry-based clinical proteomics
John et al. Patient-specific multi-omics models and the application in personalized combination therapy
Krochmal et al. Urinary peptide panel for prognostic assessment of bladder cancer relapse