RU2014142009A - Средства и способы предсказания ответа на лечение гепатита b - Google Patents
Средства и способы предсказания ответа на лечение гепатита b Download PDFInfo
- Publication number
- RU2014142009A RU2014142009A RU2014142009A RU2014142009A RU2014142009A RU 2014142009 A RU2014142009 A RU 2014142009A RU 2014142009 A RU2014142009 A RU 2014142009A RU 2014142009 A RU2014142009 A RU 2014142009A RU 2014142009 A RU2014142009 A RU 2014142009A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- hepatitis
- snp
- patient
- sample
- carnitine
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract 34
- 208000006454 hepatitis Diseases 0.000 title claims 2
- 231100000283 hepatitis Toxicity 0.000 title claims 2
- 208000002672 hepatitis B Diseases 0.000 claims abstract 35
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 claims abstract 22
- 102000014150 Interferons Human genes 0.000 claims abstract 10
- 108010050904 Interferons Proteins 0.000 claims abstract 10
- 229960004203 carnitine Drugs 0.000 claims abstract 10
- 229940079322 interferon Drugs 0.000 claims abstract 10
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims abstract 10
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims abstract 10
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims abstract 10
- 239000002955 immunomodulating agent Substances 0.000 claims abstract 9
- 230000002584 immunomodulator Effects 0.000 claims abstract 9
- 229940121354 immunomodulator Drugs 0.000 claims abstract 9
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims abstract 7
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims abstract 4
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims abstract 4
- 230000008034 disappearance Effects 0.000 claims abstract 4
- 229940123014 DNA polymerase inhibitor Drugs 0.000 claims abstract 3
- 108020005202 Viral DNA Proteins 0.000 claims abstract 3
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 claims abstract 3
- 150000003833 nucleoside derivatives Chemical class 0.000 claims abstract 3
- 208000000419 Chronic Hepatitis B Diseases 0.000 claims abstract 2
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims abstract 2
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 claims abstract 2
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 claims abstract 2
- 230000009265 virologic response Effects 0.000 claims abstract 2
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims 23
- PHIQHXFUZVPYII-ZCFIWIBFSA-N (R)-carnitine Chemical compound C[N+](C)(C)C[C@H](O)CC([O-])=O PHIQHXFUZVPYII-ZCFIWIBFSA-N 0.000 claims 15
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims 12
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims 12
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims 12
- RDHQFKQIGNGIED-MRVPVSSYSA-N O-acetyl-L-carnitine Chemical compound CC(=O)O[C@H](CC([O-])=O)C[N+](C)(C)C RDHQFKQIGNGIED-MRVPVSSYSA-N 0.000 claims 4
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims 4
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 4
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims 3
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 claims 2
- 101150076489 B gene Proteins 0.000 claims 1
- 208000034826 Genetic Predisposition to Disease Diseases 0.000 claims 1
- UFAHZIUFPNSHSL-MRVPVSSYSA-N O-propanoyl-L-carnitine Chemical compound CCC(=O)O[C@H](CC([O-])=O)C[N+](C)(C)C UFAHZIUFPNSHSL-MRVPVSSYSA-N 0.000 claims 1
- ATJFFYVFTNAWJD-UHFFFAOYSA-N Tin Chemical compound [Sn] ATJFFYVFTNAWJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- PHIQHXFUZVPYII-ZCFIWIBFSA-O (R)-carnitinium Chemical compound C[N+](C)(C)C[C@H](O)CC(O)=O PHIQHXFUZVPYII-ZCFIWIBFSA-O 0.000 abstract 4
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/20—Antivirals for DNA viruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
- C12Q1/701—Specific hybridization probes
- C12Q1/706—Specific hybridization probes for hepatitis
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/576—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for hepatitis
- G01N33/5761—Hepatitis B
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2535/00—Reactions characterised by the assay type for determining the identity of a nucleotide base or a sequence of oligonucleotides
- C12Q2535/131—Allele specific probes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/136—Screening for pharmacological compounds
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Hematology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Pathology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Virology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Oncology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
Abstract
1. Способ типирования образца пациента с гепатитом В, включающий установление SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2, в нуклеиновой кислоте указанного образца, и/или определение уровня экспрессии карнитина или производного карнитина в указанном образце.2. Способ по п. 1, в котором указанный пациент с гепатитом В страдает от хронического гепатита В.3. Способ по п. 1, в котором содержащий нуклеиновую кислоту указанный образец является ДНК-содержащим образцом, предпочтительно мазком слюны или образцом крови или образцом сыворотки.4. Способ по п. 1, в котором указанный положительный результат выбирают из группы, состоящей из исчезновения HBsAg, исчезновения HBsAg в сочетании с сероконверсией анти-НВ, устойчивого вирусологического ответа и уменьшения HBsAg более, чем на 1,5 log, в крови указанного пациента на или до 24 недели лечения.5. Способ по п. 1, в котором указанное лечение гепатита В включает введение интерферона или другого иммуномодулятора, необязательно в комбинации с ингибитором вирусной ДНК-полимеразы, предпочтительно аналога нуклеозида или аналога нуклеотида.6. Способ по п. 1, в котором указанный ассоциированный с положительным результатом SNP аллель содержит G аллель SNP rs12356193.7. Способ по п. 1, в котором указанный ассоциированный с положительным результатом SNP аллель содержит HBV T784G аллель.8. Способ по п. 1, включающий выявление SNP rs12356193 и/или HBV SNP в положении 784.9. Способ по п. 1, включающий выявление SNP rs12356193 и/или HBV SNP в положении 784, в комбинации, по меньшей мере, с одним другим SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2.10. Способ по п. 1, включающий сравнение количества карнитина или производного карнитина в указанном образце, по меньшей мере, с одним эталоном.11. Способ по п. 1, включающий определение, что уровень экспрессии карнити
Claims (35)
1. Способ типирования образца пациента с гепатитом В, включающий установление SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2, в нуклеиновой кислоте указанного образца, и/или определение уровня экспрессии карнитина или производного карнитина в указанном образце.
2. Способ по п. 1, в котором указанный пациент с гепатитом В страдает от хронического гепатита В.
3. Способ по п. 1, в котором содержащий нуклеиновую кислоту указанный образец является ДНК-содержащим образцом, предпочтительно мазком слюны или образцом крови или образцом сыворотки.
4. Способ по п. 1, в котором указанный положительный результат выбирают из группы, состоящей из исчезновения HBsAg, исчезновения HBsAg в сочетании с сероконверсией анти-НВ, устойчивого вирусологического ответа и уменьшения HBsAg более, чем на 1,5 log, в крови указанного пациента на или до 24 недели лечения.
5. Способ по п. 1, в котором указанное лечение гепатита В включает введение интерферона или другого иммуномодулятора, необязательно в комбинации с ингибитором вирусной ДНК-полимеразы, предпочтительно аналога нуклеозида или аналога нуклеотида.
6. Способ по п. 1, в котором указанный ассоциированный с положительным результатом SNP аллель содержит G аллель SNP rs12356193.
7. Способ по п. 1, в котором указанный ассоциированный с положительным результатом SNP аллель содержит HBV T784G аллель.
8. Способ по п. 1, включающий выявление SNP rs12356193 и/или HBV SNP в положении 784.
9. Способ по п. 1, включающий выявление SNP rs12356193 и/или HBV SNP в положении 784, в комбинации, по меньшей мере, с одним другим SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2.
10. Способ по п. 1, включающий сравнение количества карнитина или производного карнитина в указанном образце, по меньшей мере, с одним эталоном.
11. Способ по п. 1, включающий определение, что уровень экспрессии карнитина в образце плазмы указанного пациента с гепатитом В равен или меньше, чем 33,3 микромоль/литр, предпочтительно равен или меньше, чем 29 микромоль/литр, что указывает на пациента, отвечающего на лечение, или больше, чем 33,3 микромоль/литр, что указывает на пациента, не отвечающего на лечение.
12. Способ по п. 1, включающий определение, что уровень экспрессии ацетил-L-карнитина в плазме образца указанного пациента с гепатитом В равен или меньше, чем 3,89 микромоль/литр, что указывает на пациента, отвечающего на лечение, или больше, чем 3,89 микромоль/литр, что указывает на пациента, не отвечающего на лечение.
13. Способ по п. 1, включающий определение, что уровень экспрессии проприонил-L-карнитина в плазме образца указанного пациента с гепатитом В равен или меньше, чем 0,43 микромоль/литр, что служит признаком пациента, отвечающего на лечение, или больше, чем 0,43 микромоль/литр, что указывает на пациента, не отвечающего на лечение.
14. Способ по п. 1 в котором указанное производное карнитина содержит ацетил-L-карнитин и/или проприонил-L-карнитин.
15. Способ определения, имеется ли у пациента с гепатитом В повышенная вероятность положительного результата лечения гепатита В по сравнению со средней вероятностью в популяции пациентов с гепатитом В, включающий установление, содержит ли содержащий нуклеиновую кислоту образец указанного пациента с гепатитом В ассоциированный с положительным результатом аллель SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2, и/или определение, содержит ли образец указанного пациента с гепатитом В уровень экспрессии карнитина или производного карнитина, ассоциированный с положительным результатом лечения гепатита В.
16. Способ по п. 15, дополнительно включающий определение, наблюдается ли у указанного индивидуума исходное содержание HBsAg менее, чем 387 IU/мл, до начала лечения гепатита В.
17. Интерферон или другой иммуномодулятор необязательно в комбинации с ингибитором вирусной ДНК-полимеразы, предназначенный для использования при лечении гепатита В, отличающийся тем, что лечению подвергается пациент с гепатитом В, который при тестировании был определен, как позитивный в отношении, по меньшей мере, одного ассоциированного с положительным результатом SNP аллеля, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2, и/или который при тестировании был определен, как позитивный в отношении ассоциированного с положительным результатом уровня карнитина или производного карнитина.
18. Интерферон или другой иммуномодулятор для применения по п. 17, согласно которому лечению подвергается пациент с гепатитом В, который при тестировании был определен, как позитивный в отношении G аллеля SNP rs12356193 и/или T784G аллеля HBV генома.
19. Интерферон или другой иммуномодулятор для применения по п. 17 или 18, согласно которому лечению подвергается пациент с гепатитом В, который при тестировании был определен, как позитивный в отношении G аллеля SNP rs12356193 и/или T784G аллеля HBV, в сочетании, по меньшей мере, с одним другим ассоциированным с положительным результатом SNP аллелем, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2.
20. Интерферон или другой иммуномодулятор для применения по п. 17, согласно которому HBV-терапии подвергается пациент с гепатитом В, у которого был исследован уровень экспрессии карнитина в плазме, и у которого проверенный уровень экспрессии карнитина в плазме был равен или меньше, чем 33,3 микромоль/литр, предпочтительно равен или меньше, чем 29 микромоль/литр.
21. Интерферон или другой иммуномодулятор для применения по п. 17, согласно которому HBV-терапии подвергается пациент с гепатитом В, у которого был исследован уровень экспрессии ацетил-L-карнитина в плазме, и у которого проверенный уровень экспрессии ацетил-L-карнитина в плазме был равен или меньше, чем 3,89 микромоль/литр.
22. Интерферон или другой иммуномодулятор для применения по п. 17, согласно которому HBV-терапии подвергается пациент с гепатитом, у которого был исследован уровень экспрессии проприонил-L-карнитина в плазме, и у которого проверенный уровень экспрессии проприонил-L-карнитина в плазме был равен или меньше, чем 0,43 микромоль/литр.
23. Интерферон или другой иммуномодулятор для применения по п. 17, согласно которому указанное лечение гепатита В включает введение интерферона в комбинации с аналогом нуклеозида или аналогом нуклеотида.
24. Состоящий из частей набор или панель или микропанель, включающий, по меньшей мере, два полинуклеотида, содержащих SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2, и необязательно один или более эталонных полинуклеотидов, при этом, по меньшей мере, 70% полинуклеотидов указанного набора, состоящего из частей, или панели содержат SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2.
25. Состоящий из частей набор или панель или микропанель по п. 24, содержащий набор праймеров или зондов, причем каждый из указанных праймеров или зондов имеет в длину, независимо друг от друга, от 8 до 50 нуклеотидов, отличающийся тем, что указанные праймеры или зонды являются комплементарными SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2.
26. Состоящий из частей набор или панель или микропанель по п. 24 или 25, согласно которому указанный, по меньшей мере, один полинуклеотид является способным амплифицировать последовательность длиной в пределах от 50 до 600 нуклеотидов, от 100 до 400 нуклеотидов, более предпочтительно 150-250 нуклеотидов, при этом указанная последовательность содержит SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигура 2.
27. Применение, по меньшей мере, одного изолированного полинуклеотида, содержащего SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2, для типирования содержащего нуклеиновую кислоту образца пациента с гепатитом В.
28. Применение состоящего из частей набора или панели или микропанели по п. 27 для типирования содержащего нуклеиновую кислоту образца пациента с гепатитом В.
29. Способ оценки наличия нуклеиновой кислоты, содержащей ассоциированный с положительным результатом SNP аллель, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2, в образце, включающий контактирование указанного образца, по меньшей мере, с одним полинуклеотидом, содержащим SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2, и установление, гибридизируется ли указанный полинуклеотид с образцом нуклеиновой кислоты в строгих условиях.
30. Способ по п. 29, согласно которому используется полинуклеотид, комплементарный G аллелю SNP rs12356193 и/или T784G аллелю HBV.
31. Способ по п. 29 или 30, согласно которому указанный, по меньшей мере, один полинуклеотид является, по меньшей мере, на 80% комплементарным любой одной из последовательностей, изображенных на фигуре 1 и/или 2.
32. Применение способов определения уровня экспрессии карнитина и/или производного карнитина для типирования образца, полученного от пациента с гепатитом В.
33. Способ определения, имеет ли индивидуум генетическую предрасположенность к повышенной вероятности положительного результата лечения гепатита В по сравнению со средним значением в популяции пациентов с гепатитом В, включающий установление содержит ли геномная нуклеиновая кислота указанного индивидуума, по меньшей мере, один связанный с положительным результатом SNP аллель, как показано на фигуре 1, предпочтительно по меньшей мере, G аллель SNP rs12356193, и/или установление, содержит ли образец указанного индивидуума уровень экспрессии карнитина и/или производного карнитина, ассоциированный с положительным результатом лечения гепатита В.
34. Способ идентификации у пациента с гепатитом В гена, ассоциированного с повышенной вероятностью положительного результата лечения гепатита В по сравнению со средним значением в популяции пациентов с гепатитом В, включающий:
- идентификацию гена, содержащего SNP, как показано на фигуре 1, и
- сравнение экспрессии данного гена у индивидуума, имеющего ассоциированный с положительным результатом аллель SNP, как показано на фигуре 1, с экспрессией данного гена у индивидуума, не имеющего указанный ассоциированный с положительным результатом аллель SNP, с целью обнаружения различий, указывающих, что данный ген ассоциируется с повышенной вероятностью положительного результата лечения гепатита В.
35. Вектор, включающий, по меньшей мере, два полинуклеотида, содержащих SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2, и при необходимости, один или более эталонных полинуклеотидов, при этом, по меньшей мере, 70% полинуклеотидов указанного вектора содержат SNP, как показано на фигуре 1 и/или фигуре 2.
Applications Claiming Priority (5)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EP12160199.1 | 2012-03-19 | ||
| EP12160199 | 2012-03-19 | ||
| EP12186188 | 2012-09-26 | ||
| EP12186188.4 | 2012-09-26 | ||
| PCT/NL2013/050204 WO2013141705A2 (en) | 2012-03-19 | 2013-03-19 | Means and methods for response prediction of hepatitis b treatment |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2014142009A true RU2014142009A (ru) | 2016-05-10 |
| RU2640256C2 RU2640256C2 (ru) | 2017-12-27 |
Family
ID=47997743
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2014142009A RU2640256C2 (ru) | 2012-03-19 | 2013-03-19 | Средства и способы предсказания ответа на лечение гепатита b |
Country Status (9)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US20150044167A1 (ru) |
| EP (1) | EP2828401B1 (ru) |
| BR (1) | BR112014023296A2 (ru) |
| ES (1) | ES2657266T3 (ru) |
| HK (1) | HK1206791A1 (ru) |
| IN (1) | IN2014MN01989A (ru) |
| MX (1) | MX2014011256A (ru) |
| RU (1) | RU2640256C2 (ru) |
| WO (1) | WO2013141705A2 (ru) |
Families Citing this family (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN105829548A (zh) * | 2013-12-17 | 2016-08-03 | 豪夫迈·罗氏有限公司 | 用于hbv治疗反应的生物标记物 |
| JP2018519839A (ja) * | 2015-07-15 | 2018-07-26 | エフ．ホフマン−ラ ロシュ アーゲーＦ． Ｈｏｆｆｍａｎｎ−Ｌａ Ｒｏｃｈｅ Ａｋｔｉｅｎｇｅｓｅｌｌｓｃｈａｆｔ | Ｈｂｖ処置応答に関するバイオマーカー |
| CN109504763B (zh) * | 2018-12-17 | 2020-09-04 | 北京三元基因药业股份有限公司 | 用于预测α干扰素治疗乙肝患者疗效的分子标记 |
| MX2021006421A (es) | 2018-12-19 | 2021-08-16 | Leo Pharma As | Anilidas de aminoácidos como moduladores de moléculas pequeñas de interleucinas-17 (il-17). |
| CN115267193B (zh) * | 2022-09-20 | 2022-12-27 | 北京大学 | 用于判断生物样本中HBsAg来源的方法及系统和用途 |
-
2013
- 2013-03-19 BR BR112014023296A patent/BR112014023296A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2013-03-19 IN IN1989MUN2014 patent/IN2014MN01989A/en unknown
- 2013-03-19 EP EP13712387.3A patent/EP2828401B1/en not_active Not-in-force
- 2013-03-19 MX MX2014011256A patent/MX2014011256A/es unknown
- 2013-03-19 ES ES13712387.3T patent/ES2657266T3/es active Active
- 2013-03-19 WO PCT/NL2013/050204 patent/WO2013141705A2/en active Application Filing
- 2013-03-19 US US14/386,176 patent/US20150044167A1/en not_active Abandoned
- 2013-03-19 RU RU2014142009A patent/RU2640256C2/ru not_active IP Right Cessation
-
2015
- 2015-07-27 HK HK15107184.4A patent/HK1206791A1/xx unknown
-
2017
- 2017-08-29 US US15/689,582 patent/US20180044735A1/en not_active Abandoned
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| RU2640256C2 (ru) | 2017-12-27 |
| BR112014023296A2 (pt) | 2019-09-24 |
| EP2828401B1 (en) | 2017-10-25 |
| HK1206791A1 (en) | 2016-01-15 |
| WO2013141705A3 (en) | 2013-12-05 |
| US20150044167A1 (en) | 2015-02-12 |
| EP2828401A2 (en) | 2015-01-28 |
| IN2014MN01989A (ru) | 2015-07-10 |
| MX2014011256A (es) | 2015-07-14 |
| US20180044735A1 (en) | 2018-02-15 |
| ES2657266T3 (es) | 2018-03-02 |
| WO2013141705A2 (en) | 2013-09-26 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2014142009A (ru) | Средства и способы предсказания ответа на лечение гепатита b | |
| Kim et al. | Allelic imbalance sequencing reveals that single-nucleotide polymorphisms frequently alter microRNA-directed repression | |
| Besse et al. | Genotyping and resistance profile of hepatitis C (HCV) genotypes 1–6 by sequencing the NS3 protease region using a single optimized sensitive method | |
| JP2010528590A5 (ru) | ||
| Walker et al. | Multiplex Paralogue Ratio Tests for accurate measurement of multiallelic CNVs | |
| Goergen et al. | Mutation specific PCR and direct solid phase sequencing assay for the detection of hepatitis B virus Pre‐C/C mutants in anti‐HBe‐positive, chronic hepatitis B | |
| Rybicka et al. | High-Throughput Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization–Time of Flight Mass Spectrometry as an Alternative Approach to Monitoring Drug Resistance of Hepatitis B Virus | |
| Sertoz et al. | Comparison of sequence analysis and INNO-LiPA HBV DR line probe assay in patients with chronic hepatitis B | |
| CN115066505A (zh) | 生物标记物及其在治疗慢性乙型肝炎感染中的用途 | |
| Shah et al. | Monoamine Oxidase A gene polymorphisms and self reported aggressive behaviour in a Pakistani ethnic group | |
| CN110029162B (zh) | 一种用于检测系统性红斑狼疮易感性位于非编码基因区的snp标志物及其应用 | |
| Song et al. | Three-dimensional polyacrylamide gel-based DNA microarray method effectively identifies UDP-glucuronosyltransferase 1A1 gene polymorphisms for the correct diagnosis of Gilbert's syndrome | |
| Lettow et al. | A Duffy antigen receptor for chemokines (DARC) polymorphism that determines pro-fibrotic chemokine serum concentrations is not directly associated with severity of hepatitis C infection | |
| Chantratita et al. | HBV/4DR 9G test and its comparison with INNO-LiPA HBV multi-DR test for the detection of drug-resistant Hepatitis B virus | |
| CN101812534B (zh) | 焦磷酸测序检测hbv拉米夫定耐药突变位点的pcr与测序引物 | |
| Vergori et al. | Analysis of genetic and viral determinants of HBsAg levels in patients with chronic HBV infection | |
| JP6286904B2 (ja) | ＳＮＰ（ｒｓ８１０３１４２）を検出するためのプローブ | |
| Liu et al. | Whole Blood PCR Amplification with Pfu DNA Polymerase and Its Application in Single-Nucleotide Polymorphism Analysis | |
| Katrinli et al. | HLA DPB1 15: 01 allele predicts spontaneus hepatitis B surface antigen seroconversion | |
| Ninomiya et al. | Sequential analysis of amino acid substitutions with hepatitis B virus in association with nucleoside/nucleotide analog treatment detected by deep sequencing | |
| WO2011138370A1 (en) | Antiviral treatment susceptibility gene and uses thereof | |
| CN114921542A (zh) | 一种与病毒性肝炎抗病毒治疗应答预测相关的snp分子标记及其应用 | |
| WU et al. | Effect of rs6858698 on susceptibility to chronic lymphocytic leukemia | |
| WO2024026336A3 (en) | Methods and reagents for detection, quantitation, and genotyping of epstein-barr virus | |
| Xu et al. | The central nervous system is a potential reservoir and possible origin of drug resistance in HBV |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20190320 |