RU2012145028A - Клонирование и применение функционального r-гена solanum x edinense - Google Patents

Клонирование и применение функционального r-гена solanum x edinense Download PDF

Info

Publication number
RU2012145028A
RU2012145028A RU2012145028/10A RU2012145028A RU2012145028A RU 2012145028 A RU2012145028 A RU 2012145028A RU 2012145028/10 A RU2012145028/10 A RU 2012145028/10A RU 2012145028 A RU2012145028 A RU 2012145028A RU 2012145028 A RU2012145028 A RU 2012145028A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
nucleic acid
acid sequence
plant
rpi
cell
Prior art date
Application number
RU2012145028/10A
Other languages
English (en)
Inventor
ВЕТТЕН Николас Клеменс Мария Хенрикус ДЕ
Эстель Селин ВЕРЗАУКС
Якобус Хубертус ВОССЕН
Хендрик РИТМАН
Вивианн Гертруда Антониа Анна ВЛЕСХАУЭРС
Эверт ЯКОБСЕН
Рихард Герардус Франсискус ВИССЕР
Original Assignee
Кооперати Авебе Ю.А.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Кооперати Авебе Ю.А. filed Critical Кооперати Авебе Ю.А.
Publication of RU2012145028A publication Critical patent/RU2012145028A/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • C12N15/8279—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance
    • C12N15/8286—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance for insect resistance
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/415—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • C12N15/8279—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • C12N15/8279—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance
    • C12N15/8282—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for biotic stress resistance, pathogen resistance, disease resistance for fungal resistance
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/6895—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/13—Plant traits

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Insects & Arthropods (AREA)
  • Pest Control & Pesticides (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Environmental Sciences (AREA)

Abstract

1. Выделенная или рекомбинантная последовательность нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность, кодирующую аминокислотную последовательность Rpi-edn2 согласно Фигуре 4, причем указанная аминокислотная последовательность обеспечивает по меньшей мере частичную устойчивость к оомицетной инфекции, или функциональный фрагмент или функциональный гомолог указанной последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующий аминокислотную последовательность, более чем на 80% идентичную аминокислотной последовательности Rpi-edn2 согласно Фигуре 4.2. Выделенная или рекомбинантная последовательность нуклеиновой кислоты по п.1, отличающаяся тем, что содержит последовательность нуклеиновой кислоты, показанную на Фигуре 4.3. Вектор, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты по любому из пп.1 и 2.4. Клетка-хозяин, которая содержит последовательность нуклеиновой кислоты по любому из пп.1 и 2 или вектор по п.3, предпочтительно клетка Agrobacterium или клетка растения.5. Клетка растения, которая содержит последовательность нуклеиновой кислоты по любому из пп.1 и 2 или вектор по п.3, при этом указанная клетка растения предпочтительно представляет собой клетку Solanaceae, более предпочтительно Solanum tuberosum, более предпочтительно тетраплоидного Solanum tuberosum.6. Трансгенное растение, включающее клетку по п.5.7. Часть, полученная из растения по п.6, причем в более предпочтительном случае указанная часть представляет собой клубень.8. Белок, кодируемый выделенной или рекомбинантной нуклеиновой кислотой по любому из пп.1 и 2 или функциональный фрагмент, или функциональный гомолог указанного белка, который предпочтительно имеет ами

Claims (16)

1. Выделенная или рекомбинантная последовательность нуклеиновой кислоты, включающая нуклеотидную последовательность, кодирующую аминокислотную последовательность Rpi-edn2 согласно Фигуре 4, причем указанная аминокислотная последовательность обеспечивает по меньшей мере частичную устойчивость к оомицетной инфекции, или функциональный фрагмент или функциональный гомолог указанной последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующий аминокислотную последовательность, более чем на 80% идентичную аминокислотной последовательности Rpi-edn2 согласно Фигуре 4.
2. Выделенная или рекомбинантная последовательность нуклеиновой кислоты по п.1, отличающаяся тем, что содержит последовательность нуклеиновой кислоты, показанную на Фигуре 4.
3. Вектор, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты по любому из пп.1 и 2.
4. Клетка-хозяин, которая содержит последовательность нуклеиновой кислоты по любому из пп.1 и 2 или вектор по п.3, предпочтительно клетка Agrobacterium или клетка растения.
5. Клетка растения, которая содержит последовательность нуклеиновой кислоты по любому из пп.1 и 2 или вектор по п.3, при этом указанная клетка растения предпочтительно представляет собой клетку Solanaceae, более предпочтительно Solanum tuberosum, более предпочтительно тетраплоидного Solanum tuberosum.
6. Трансгенное растение, включающее клетку по п.5.
7. Часть, полученная из растения по п.6, причем в более предпочтительном случае указанная часть представляет собой клубень.
8. Белок, кодируемый выделенной или рекомбинантной нуклеиновой кислотой по любому из пп.1 и 2 или функциональный фрагмент, или функциональный гомолог указанного белка, который предпочтительно имеет аминокислотную последовательность Rpi-edn2 согласно Фигуре 4.
9. Антитело, которое (специфично) связывается с белком по п.8.
10. Способ обеспечения по меньшей мере частичной устойчивости или повышения устойчивости растения к оомицетной инфекции, включающий обеспечение указанного растения или его части путем трансформации нуклеиновой кислотой по любому из пп.1 и 2 или вектором по п.3, или клеткой-хозяина по п.4 или обеспечение указанного растения белком по п.8, причем указанное растение предпочтительно представляет собой растение из семейства Solanaceae, более предпочтительно Solanum tuberosum.
11. Способ по п.10, отличающийся тем, что указанный оомицет включает Phytophthora, предпочтительно Phytophthora infestans.
12. Способ по п.10 или 11, отличающийся тем, что указанное растение дополнительно обеспечивают нуклеиновой кислотой, кодирующей белок устойчивости, выбранный из группы Rpi-blb1, Rpi-blb2, Rpi-blb3, Rpi-chq1-1, Rpi-chq1-2, Rpi-vnt1, Rpi-CHC1, Rpi-edn1, Rpi-edn3, Rpi-mcq1 и их комбинаций.
13. Связывающая молекула, способная специфически связываться с нуклеиновой кислотой по любому из пп.1 и 2 или комплементарной ей нуклеиновой кислотой, причем указанная связывающая молекула предпочтительно представляет собой праймер или зонд, предпочтительно праймер, выбранный из группы праймеров для Tm2-профилирования, представленных в Таблице 7, или группы праймеров для хромосомы 9, представленных в Таблице 5, или специфически связывающаяся с последовательностью нуклеиновой кислоты, показанной на Фигуре 4, или ее частью.
14. Способ отбора растения или растительного материала или их потомства в отношении их чувствительности или устойчивости к оомицетной инфекции, причем указанный способ включает этапы тестирования по меньшей мере части указанного растения, или растительного материала, или их потомства на наличие или отсутствие нуклеиновой кислоты, описанной в любом из пп.1 и 2, причем указанное тестирование предпочтительно выполняют с помощью праймера или зонда по п.13, или указанное тестирование включает обнаружение наличия одного или более маркеров, выбранных из группы праймеров для Tm2-профилирования, приведенных в Таблице 7, или группы праймеров хромосомы 9, приведенных в Таблице 5, или указанный маркер включает часть последовательности нуклеиновой кислоты, показанной на Фигуре 4.
15. Способ селекции устойчивых тетраплоидных растений, включающий
a. применение гамет пентаплоидного растения, которые уже содержат последовательность нуклеиновой кислоты по любому из пп.1 и 2; в процессе скрещивания с гаметами тетраплоидного растения; и
c. селекцию потомства указанного скрещивания по присутствию указанной последовательности нуклеиновой кислоты.
16. Маркер для селекции с помощью маркера, используемый при селекции растений для получения устойчивости к оомицетам, причем указанный маркер выбирают из маркеров, выбранных из группы праймеров для Tm2-профилирования, представленных в Таблице 7, или группы праймеров для хромосомы 9, представленных в Таблице 5, причем указанный маркер включает фрагмент последовательности нуклеиновой кислоты, показанной на Фигуре 4.
RU2012145028/10A 2010-05-31 2011-05-31 Клонирование и применение функционального r-гена solanum x edinense RU2012145028A (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP10164531.5 2010-05-31
EP10164531A EP2390332A1 (en) 2010-05-31 2010-05-31 Cloning and exploitation of a functional R-gene from Solanum x edinense
PCT/NL2011/050386 WO2011152722A2 (en) 2010-05-31 2011-05-31 Cloning and exploitation of a functional r-gene from solanum x edinense

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2012145028A true RU2012145028A (ru) 2014-07-20

Family

ID=42830069

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2012145028/10A RU2012145028A (ru) 2010-05-31 2011-05-31 Клонирование и применение функционального r-гена solanum x edinense

Country Status (7)

Country Link
US (1) US9856494B2 (ru)
EP (2) EP2390332A1 (ru)
CN (1) CN103038350A (ru)
CA (1) CA2797875C (ru)
RU (1) RU2012145028A (ru)
WO (1) WO2011152722A2 (ru)
ZA (1) ZA201208338B (ru)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2022091104A1 (en) * 2020-11-02 2022-05-05 The State Of Israel, Ministry Of Agriculture & Rural Development, Agricultural Research Organization (Aro) (Volcani Institute) Tobamovirus-resistant tomato plants

Family Cites Families (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1984002913A1 (en) 1983-01-17 1984-08-02 Monsanto Co Chimeric genes suitable for expression in plant cells
CA1340766C (en) 1984-12-24 1999-09-28 Clive Waldron Selectable marker for development of vectors and transformation systems in plants
ATE85360T1 (de) 1985-08-07 1993-02-15 Monsanto Co Glyphosat resistente pflanzen.
CN87100603A (zh) 1987-01-21 1988-08-10 昂科公司 抗黑素瘤疫苗
US5302523A (en) 1989-06-21 1994-04-12 Zeneca Limited Transformation of plant cells
US5550318A (en) 1990-04-17 1996-08-27 Dekalb Genetics Corporation Methods and compositions for the production of stably transformed, fertile monocot plants and cells thereof
US5484956A (en) 1990-01-22 1996-01-16 Dekalb Genetics Corporation Fertile transgenic Zea mays plant comprising heterologous DNA encoding Bacillus thuringiensis endotoxin
US5384253A (en) 1990-12-28 1995-01-24 Dekalb Genetics Corporation Genetic transformation of maize cells by electroporation of cells pretreated with pectin degrading enzymes
EP1279737A1 (en) 2001-07-27 2003-01-29 Coöperatieve Verkoop- en Productievereniging, van Aardappelmeel en Derivaten AVEBE B.A. Transformation method for obtaining marker-free plants
EP1382682A3 (en) 2002-07-17 2004-06-30 Expressive Research B.V. Modulating developmental pathways in plants
WO2008091153A1 (en) 2007-01-26 2008-07-31 Wageningen Universiteit A functional r-gene from solanum bulbocastanum
GB0714241D0 (en) 2007-07-20 2007-08-29 Univ Wageningen Light blight resistances genes and methods
EP2250271A2 (en) * 2008-02-18 2010-11-17 Norfolk Plant Sciences Limited Methods and compositions for modifying plant flavonoid composition and disease resistance

Also Published As

Publication number Publication date
WO2011152722A3 (en) 2012-01-19
CN103038350A (zh) 2013-04-10
EP2576788A2 (en) 2013-04-10
CA2797875C (en) 2019-04-09
WO2011152722A2 (en) 2011-12-08
US9856494B2 (en) 2018-01-02
CA2797875A1 (en) 2011-12-08
US20140041072A1 (en) 2014-02-06
ZA201208338B (en) 2013-07-31
EP2390332A1 (en) 2011-11-30

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Okuyama et al. A multifaceted genomics approach allows the isolation of the rice Pia‐blast resistance gene consisting of two adjacent NBS‐LRR protein genes
Das et al. A novel blast resistance gene, Pi54rh cloned from wild species of rice, Oryza rhizomatis confers broad spectrum resistance to Magnaporthe oryzae
Meagher Divergence and differential expression of actin gene families in higher plants
Song et al. Broad taxonomic characterization of Verticillium wilt resistance genes reveals an ancient origin of the tomato Ve1 immune receptor
Kim et al. A genome-wide comparison of NB-LRR type of resistance gene analogs (RGA) in the plant kingdom
US20180155737A1 (en) Method for modulating plant root architecture
Meng et al. Arabidopsis AINTEGUMENTA mediates salt tolerance by trans-repressing SCABP8
US20130254945A1 (en) Soybean aphid resistance gene rag2
He et al. Comparative mapping of powdery mildew resistance gene Pm21 and functional characterization of resistance-related genes in wheat
UA127447C2 (uk) Спосіб трансфекції рослин і скорочення подій випадкової інтеграції
Sauerborn Klobučar et al. Presence of ecotoxicologically relevant Pgp and MRP transcripts and proteins in Cyprinid fish
HRP20200471T1 (hr) Tonoplastni protonsko/šećerni antiporterski proteini i njihova upotreba u povećavanju koncentracije saharoze u biljnom organu za skladištenje saharoze
ES2524065T3 (es) Gen de resistencia y usos del mismo
Zamani Babgohari et al. In silico analysis of high affinity potassium transporter (HKT) isoforms in different plants
Furumizu et al. The RGF/GLV/CLEL family of short peptides evolved through lineage-specific losses and diversification and yet conserves its signaling role between vascular plants and bryophytes
RU2012145028A (ru) Клонирование и применение функционального r-гена solanum x edinense
Kaleshkumar et al. DNA barcoding of selected species of pufferfishes (Order: Tetraodontiformes) of Puducherry coastal waters along south-east coast of India
Fadina et al. Revisiting late blight resistance genes in complex interspecific potato hybrids [Conference poster].
Kosovac et al. Microsatellite and mtDNA evidence of genetic differentiation in Hyalesthes obsoletus populations associated with a new major host, stinking hawk’s-beard (Crepis foetida), in southeast Europe
US11028404B2 (en) Methods of improving mycorrhization in plants and genetically modifed plants with improved mycorrhization
CN106148298B (zh) 水稻抗病相关基因OsDR11及其在水稻抗病中的应用
ZHANG et al. Characterization of NPR1 genes from Norton and Cabernet sauvignon grapevine
US9873890B2 (en) Nucleic acid molecules encoding enzymes that confer disease resistance in jute
CN102465132B (zh) 一种WRKY多肽Glyma02g39870在促进水杨酸生物合成以及增强植物抗病中的应用
Zhu et al. Expression and function analysis of wheat expasin genes EXPA2 and EXPB1

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20150302