RU2010146701A - Противовирусная терапия - Google Patents

Противовирусная терапия Download PDF

Info

Publication number
RU2010146701A
RU2010146701A RU2010146701/15A RU2010146701A RU2010146701A RU 2010146701 A RU2010146701 A RU 2010146701A RU 2010146701/15 A RU2010146701/15 A RU 2010146701/15A RU 2010146701 A RU2010146701 A RU 2010146701A RU 2010146701 A RU2010146701 A RU 2010146701A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
expression
sample
genes
gene
patient
Prior art date
Application number
RU2010146701/15A
Other languages
English (en)
Inventor
Витоль Д. ФИЛИПОВИЧ (CH)
Витоль Д. ФИЛИПОВИЧ
Маркус ХАЙМ (CH)
Маркус ХАЙМ
Магдалена САРАСИН-ФИЛИПОВИЧ (CH)
Магдалена САРАСИН-ФИЛИПОВИЧ
Франсуа Х. Т. ДЮНЬ (FR)
Франсуа Х. Т. ДЮНЬ
Эдуард ОУКЛИ (CH)
Эдуард ОУКЛИ
Original Assignee
Новартис Форшунгсстифтунг Цвайгнидерлассунг Фридрих Мишер Инститьют Фор Байомедикал Рисерч (Ch)
Новартис Форшунгсстифтунг Цвайгнидерлассунг Фридрих Мишер Инститьют Фор Байомедикал Рисерч
Юниверсити Хоспитл Базель (Ch)
Юниверсити Хоспитл Базель
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Новартис Форшунгсстифтунг Цвайгнидерлассунг Фридрих Мишер Инститьют Фор Байомедикал Рисерч (Ch), Новартис Форшунгсстифтунг Цвайгнидерлассунг Фридрих Мишер Инститьют Фор Байомедикал Рисерч, Юниверсити Хоспитл Базель (Ch), Юниверсити Хоспитл Базель filed Critical Новартис Форшунгсстифтунг Цвайгнидерлассунг Фридрих Мишер Инститьют Фор Байомедикал Рисерч (Ch)
Publication of RU2010146701A publication Critical patent/RU2010146701A/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/15Medicinal preparations ; Physical properties thereof, e.g. dissolubility
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/576Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for hepatitis
    • G01N33/5767Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for hepatitis non-A, non-B hepatitis
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158Expression markers

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

1. Способ определения вероятности того, что пациент, страдающий вирусной инфекцией печени, будет чувствителен к противовирусной терапии, включающей стимуляцию активности интерферона (ИФН), где способ включает: ! (а) анализ образца пациента на экспрессию хотя бы одного гена каждой из нижеследующих групп генов: ! (1) LOC129607, RPLP0 и HERC5, ! (2) HTATIP2 и IFI44L, ! (3) IFI27, IFIT1, G1P2, IRF7, RSAD2, IFI44, OAS3 и IFIT2, ! (4) LAMP3, HERC6, LOC286208, IFIT3, RALGPS1, PARP9, CCDC75 и CNP, ! (5) HIST1H2BG, HIST1H2BD, FLJ20035, PARP12, PNPT1, LGALS3BP, SAMD9 и LOC402560, а также ! (б) сопоставление экспрессии генов в образце с экспрессией тех же генов в контрольном образце. ! 2. Способ по п.1, в котором отклонения в экспрессии генов образце по сравнению с теми же генами в контрольном образце указывает на то, что пациент вероятно не будет чувствителен к упомянутой противовирусной терапии. ! 3. Способ по п.1, в котором отсутствие отклонений в экспрессии генов образце по сравнению с теми же генами в контрольном образце указывает на то, что пациент вероятно будет чувствителен к упомянутой противовирусной терапии. ! 4. Способ по п.1, в котором противовирусная терапия включает пегилированный ИФНα. ! 5. Способ по п.4, в котором противовирусная терапия включает пегИФНα и рибавирин. ! 6. Способ по п.1, в котором вирусная инфекция представляет собой инфекцию вируса гепатита В или вируса гепатита С. ! 7. Способ по п.4, в котором вирус представляет собой вирус гепатита С. ! 8. Способ по п.1, в котором образец включает ткань печени. ! 9. Способ по п.1, в котором анализируют экспрессию пяти, шести, семи, восьми, девяти, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 20, 25, 26, 27, 28 или 29 генов по п.1. ! 10. Способ по п.1, в котором экспрессию генов определяют посредством измерения количества генного транс�

Claims (15)

1. Способ определения вероятности того, что пациент, страдающий вирусной инфекцией печени, будет чувствителен к противовирусной терапии, включающей стимуляцию активности интерферона (ИФН), где способ включает:
(а) анализ образца пациента на экспрессию хотя бы одного гена каждой из нижеследующих групп генов:
(1) LOC129607, RPLP0 и HERC5,
(2) HTATIP2 и IFI44L,
(3) IFI27, IFIT1, G1P2, IRF7, RSAD2, IFI44, OAS3 и IFIT2,
(4) LAMP3, HERC6, LOC286208, IFIT3, RALGPS1, PARP9, CCDC75 и CNP,
(5) HIST1H2BG, HIST1H2BD, FLJ20035, PARP12, PNPT1, LGALS3BP, SAMD9 и LOC402560, а также
(б) сопоставление экспрессии генов в образце с экспрессией тех же генов в контрольном образце.
2. Способ по п.1, в котором отклонения в экспрессии генов образце по сравнению с теми же генами в контрольном образце указывает на то, что пациент вероятно не будет чувствителен к упомянутой противовирусной терапии.
3. Способ по п.1, в котором отсутствие отклонений в экспрессии генов образце по сравнению с теми же генами в контрольном образце указывает на то, что пациент вероятно будет чувствителен к упомянутой противовирусной терапии.
4. Способ по п.1, в котором противовирусная терапия включает пегилированный ИФНα.
5. Способ по п.4, в котором противовирусная терапия включает пегИФНα и рибавирин.
6. Способ по п.1, в котором вирусная инфекция представляет собой инфекцию вируса гепатита В или вируса гепатита С.
7. Способ по п.4, в котором вирус представляет собой вирус гепатита С.
8. Способ по п.1, в котором образец включает ткань печени.
9. Способ по п.1, в котором анализируют экспрессию пяти, шести, семи, восьми, девяти, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 20, 25, 26, 27, 28 или 29 генов по п.1.
10. Способ по п.1, в котором экспрессию генов определяют посредством измерения количества генного транскрипта мРНК в образце или количества кДНК, производной от упомянутой мРНК.
11. Способ по п.1, в котором экспрессию генов определяют посредством измерения количества кодируемого геном пептида или полипептида в образце.
12. Способ по п.11, в котором количество пептида или полипептида определяют с помощью специфично связывающейся молекулы.
13. Способ по п.1, в котором пациент является человеком.
14. Набор для осуществления способа по любому из пп.1-13, включающий:
(1) средства для анализа образца от пациента на экспрессию хотя бы одного гена из каждой из групп генов, перечисленных в п.1, а также необязательно
(2) средства для сопоставления экспрессии генов в образце с экспрессией тех же генов в контрольном образце.
15. Набор по п.14, включающий одну или несколько специфично связывающихся молекул, которые могут связываться с молекулами, репрезентативными в отношении экспрессии в образце упомянутого гена, где таковая специфично связывающаяся молекула является олигонуклеотидным зондом, антителом или аптамером.
RU2010146701/15A 2008-04-21 2009-04-20 Противовирусная терапия RU2010146701A (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP08154878 2008-04-21
EP08154878.6 2008-04-21

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2010146701A true RU2010146701A (ru) 2012-05-27

Family

ID=39830378

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2010146701/15A RU2010146701A (ru) 2008-04-21 2009-04-20 Противовирусная терапия

Country Status (16)

Country Link
US (1) US20110117563A1 (ru)
EP (1) EP2271776A1 (ru)
JP (1) JP2011519551A (ru)
KR (1) KR20110014979A (ru)
CN (1) CN102016072A (ru)
AU (1) AU2009240021B2 (ru)
BR (1) BRPI0910534A2 (ru)
CA (1) CA2719078A1 (ru)
IL (1) IL208351A0 (ru)
MA (1) MA32274B1 (ru)
MX (1) MX2010011587A (ru)
NZ (1) NZ588144A (ru)
RU (1) RU2010146701A (ru)
SG (1) SG190570A1 (ru)
WO (1) WO2009130176A1 (ru)
ZA (1) ZA201006647B (ru)

Families Citing this family (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA2772921A1 (en) * 2009-09-03 2011-03-10 Medimmune, Llc Type 1 interferon diagnostic
BR112012011221A2 (pt) * 2009-11-14 2016-04-05 Hoffmann La Roche biomarcadores para prever resposta rápida ao tratamento de hcv
US9709565B2 (en) 2010-04-21 2017-07-18 Memed Diagnostics Ltd. Signatures and determinants for distinguishing between a bacterial and viral infection and methods of use thereof
ES2679107T3 (es) 2012-02-09 2018-08-22 Memed Diagnostics Ltd. Distintivos y determinantes para diagnosticar infecciones y métodos para usarlos
CN103740755A (zh) * 2013-12-23 2014-04-23 中国农业大学 猪ifit1基因在抗prrs病毒中的应用
BR112017002884A2 (pt) 2014-08-14 2018-01-30 Memed Diagnostics Ltd ?análise computacional de dados biológicos por meio do uso de variedade e hiperplano?
US20170234873A1 (en) 2014-10-14 2017-08-17 Memed Diagnostics Ltd. Signatures and determinants for diagnosing infections in non-human subjects and methods of use thereof
CN108699583B (zh) 2016-03-03 2022-11-01 米密德诊断学有限公司 用于区分细菌和病毒感染的rna决定子
US11340223B2 (en) 2016-07-10 2022-05-24 Memed Diagnostics Ltd. Early diagnosis of infections
CA3027341A1 (en) 2016-07-10 2018-01-18 Memed Diagnostics Ltd. Protein signatures for distinguishing between bacterial and viral infections
WO2018060998A1 (en) 2016-09-29 2018-04-05 Memed Diagnostics Ltd. Methods of prognosis and treatment
US11353456B2 (en) 2016-09-29 2022-06-07 Memed Diagnostics Ltd. Methods of risk assessment and disease classification for appendicitis
US10209260B2 (en) 2017-07-05 2019-02-19 Memed Diagnostics Ltd. Signatures and determinants for diagnosing infections and methods of use thereof

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20050123938A1 (en) * 1999-01-06 2005-06-09 Chondrogene Limited Method for the detection of osteoarthritis related gene transcripts in blood
US20080161203A1 (en) * 2006-12-27 2008-07-03 Su Chun-Lin Markers identified for liver fibrosis and cirrhosis and the microarray panel thereof

Also Published As

Publication number Publication date
EP2271776A1 (en) 2011-01-12
MX2010011587A (es) 2011-05-03
MA32274B1 (fr) 2011-05-02
SG190570A1 (en) 2013-06-28
AU2009240021A1 (en) 2009-10-29
IL208351A0 (en) 2010-12-30
BRPI0910534A2 (pt) 2015-09-29
CN102016072A (zh) 2011-04-13
US20110117563A1 (en) 2011-05-19
JP2011519551A (ja) 2011-07-14
NZ588144A (en) 2012-04-27
ZA201006647B (en) 2011-05-25
KR20110014979A (ko) 2011-02-14
WO2009130176A1 (en) 2009-10-29
CA2719078A1 (en) 2009-10-29
WO2009130176A9 (en) 2010-01-07
AU2009240021B2 (en) 2013-01-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2010146701A (ru) Противовирусная терапия
Suppiah et al. IL28B, HLA-C, and KIR variants additively predict response to therapy in chronic hepatitis C virus infection in a European Cohort: a cross-sectional study
Danesh et al. Early gene expression events in ferrets in response to SARS coronavirus infection versus direct interferon-alpha2b stimulation
Jiang et al. Genetic variation in STAT4 predicts response to interferon‐α therapy for hepatitis B e antigen‐positive chronic hepatitis B
RU2011102818A (ru) Прогнозирование ответа на противовирусную терапию
Alborzi et al. Role of serum level and genetic variation of IL-28B in interferon responsiveness and advanced liver disease in chronic hepatitis C patients
Younossi et al. Early gene expression profiles of patients with chronic hepatitis C treated with pegylated interferon‐alfa and ribavirin
Morgan et al. DNA polymorphisms and response to treatment in patients with chronic hepatitis C: results from the HALT-C trial
Zhang et al. The gene expression profile of peripheral blood mononuclear cells from EV71-infected rhesus infants and the significance in viral pathogenesis
Huang et al. Profound week 4 interferon responsiveness is mandatory for hepatitis C genotype 1 patients with unfavorable IL-28B genotype
Akkarathamrongsin et al. High sensitivity assay using serum sample for IL28B genotyping to predict treatment response in chronic hepatitis C patients
Biswas et al. Association of TNF-alpha (− 308 A/G) and IFN-gamma (+ 874 A/T) gene polymorphisms in response to spontaneous and treatment induced viral clearance in HCV infected multitransfused thalassemic patients
Sultana et al. Impact of hepatitis C virus core mutations on the response to interferon-based treatment in chronic hepatitis C
Khafaei et al. Impact of IL-6 rs1800795 and IL-17A rs2275913 gene polymorphisms on the COVID-19 prognosis and susceptibility in a sample of Iranian patients
JP2013521497A5 (ru)
Schaefer et al. Increased expression of interferon-inducible genes in macaque lung tissues during simian immunodeficiency virus infection
Sivaprasad et al. The distribution of genotype and allelic frequency of IL28B gene polymorphism in Andhra Pradesh, India
Younossi et al. Gene expression profile associated with superimposed non‐alcoholic fatty liver disease and hepatic fibrosis in patients with chronic hepatitis C
Selzner et al. Hepatic gene expression and prediction of therapy response in chronic hepatitis C patients
Machicote et al. IL28B SNPs rs12979860 and rs8099917 are associated with inflammatory response in Argentine chronic HCV patients
Xiang et al. Association of the IFNAR1-17470 and IL-10-592 cytokine variants with susceptibility to chronic hepatitis B viral infections in a Chinese population
Amir et al. Interleukin 28B gene polymorphisms and chronic Hepatitis C Virus infection
Pedergnana et al. Refined association of melanoma differentiation‐associated gene 5 variants with spontaneous hepatitis C virus clearance in Egypt
Abdallah et al. Impact of HCV Genome Structure on Responder to Pegylated Interferon Therapy in Egyptian Patients
Zhang et al. A lower PBMC estrogen receptor α gene expression in chronic hepatitis B Is Associated with a sustained virological response to pegylated interferon

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20130904