RU2010114528A

RU2010114528A - METHOD FOR IDENTIFICATION OF 5'-NTR GENOME OF ENVIRUSES OF EVI GENOGRAPHY AND EVII GENOGROUP USING A POLYMERASE CHAIN REACTION

Info

Publication number: RU2010114528A
Application number: RU2010114528/10A
Authority: RU
Inventors: Надежда Алексеевна Новикова (RU); Надежда Алексеевна Новикова; Людмила Николаевна Голицына (RU); Людмила Николаевна Голицына; Светлана Григорьевна Фомина (RU); Светлана Григорьевна Фомина
Priority date: 2010-04-12
Filing date: 2010-04-12
Publication date: 2011-10-20
Also published as: RU2441917C2

Abstract

Способ идентификации 5'-НТР генома энтеровирусов геногрупп ЭВI и ЭВII, включающий выделение геномной РНК, проведение реакции обратной транскрипции, полимеразной цепной реакции и анализ полученных фрагментов ДНК в агарозном геле, отличающийся тем, что при проведении полимеразной цепной реакции используют олигонуклеотиды, имеющие следующие последовательности: ! FEvI - 5'-AGATCAGGYCGATGAGYCACYG-3', ! в которой Y означает С или Т; ! FEvII - 5'-TTGGAATCTTYGAYGCGTTGC-3', ! в которой Y означает С или Т; ! REv - 5'-CACGGWCACCCARAGTACTCG-3', ! в которой W означает А или Т; R означает А или G, о наличии энтеровирусов геногруппы ЭВI судят по специфическому фрагменту ДНК размером 251 п.н. при использовании пары FEvI-REv, о наличии энтеровирусов геногруппы ЭВII судят по специфическому фрагменту 295 п.н. при использовании пары FEvII-REv. A method for identifying the 5'-NTR of the genome of enteroviruses of the EVI and EVII genogroups, including the isolation of genomic RNA, the reverse transcription reaction, polymerase chain reaction and analysis of the obtained DNA fragments in an agarose gel, characterized in that oligonucleotides having the following sequences are used in the polymerase chain reaction :! FEvI - 5'-AGATCAGGYCGATGAGYCACYG-3 ',! in which Y is C or T; ! FEvII - 5'-TTGGAATCTTYGAYGCGTTGC-3 ',! in which Y is C or T; ! REv - 5'-CACGGWCACCCARAGTACTCG-3 ',! in which W means A or T; R means A or G; the presence of enteroviruses of the EVI genogroup is judged by a specific DNA fragment of 251 bp when using a FEvI-REv pair, the presence of enteroviruses of the EVII gene group is judged by a specific fragment of 295 bp when using a pair of FEvII-REv.

Claims

A method for identifying the 5'-NTR of the genome of enteroviruses of the EVI and EVII genogroups, including the isolation of genomic RNA, the reverse transcription reaction, polymerase chain reaction and analysis of the obtained DNA fragments in an agarose gel, characterized in that oligonucleotides having the following sequences are used in the polymerase chain reaction :

FEvI - 5'-AGATCAGGYCGATGAGYCACYG-3 ',

in which Y is C or T;

FEvII - 5'-TTGGAATCTTYGAYGCGTTGC-3 ',

in which Y is C or T;

REv - 5'-CACGGWCACCCARAGTACTCG-3 ',

in which W means A or T; R means A or G, the presence of enteroviruses of the EVI genogroup is judged by a specific DNA fragment of 251 bp in size. when using a FEvI-REv pair, the presence of enteroviruses of the EVII gene group is judged by a specific fragment of 295 bp when using a pair of FEvII-REv.