RU2009124649A - Интернализация - Google Patents
Интернализация Download PDFInfo
- Publication number
- RU2009124649A RU2009124649A RU2009124649/10A RU2009124649A RU2009124649A RU 2009124649 A RU2009124649 A RU 2009124649A RU 2009124649/10 A RU2009124649/10 A RU 2009124649/10A RU 2009124649 A RU2009124649 A RU 2009124649A RU 2009124649 A RU2009124649 A RU 2009124649A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- binding partner
- cell
- nucleic acid
- internalized
- target
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
- C12N15/1037—Screening libraries presented on the surface of microorganisms, e.g. phage display, E. coli display
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Virology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Furan Compounds (AREA)
- Polysaccharides And Polysaccharide Derivatives (AREA)
Abstract
1. Способ выделения молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей партнера по связыванию комплекса, интернализованного в клетку, включающий следующие стадии: ! (а) приведение клетки в контакт со смешанной группой бактериофаговых частиц, где каждая или по существу все из указанных бактериофаговых частиц экспонируют партнера по связыванию на своей поверхности, где указанный партнер по связыванию экспонирован в виде неслитого (поли)пептида с фаговым оболочечным белком указанной бактериофаговой частицы, и где каждая или по существу все из указанных бактериофаговых частиц содержат молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую данный экспонированный партнер по связыванию, ! (б) обеспечение связывания партнера по связыванию, экспонированного на бактериофаговой частице, с его мишенью, с обеспечением посредством этого образования по меньшей мере одного комплекса, причем каждый из указанных комплексов содержит бактериофаговую частицу с экспонированным на ней партнером по связыванию и его мишенью, ! (в) культивирование данной клетки в условиях, которые обеспечивают интернализацию по меньшей мере одного из указанных комплексов в клетку, !(г) элюирование молекул нуклеиновой кислоты, кодирующих партнера по связыванию, которые не интернализуются, в условиях, при которых не происходит по существу никакого лизиса клетки, ! (д) лизирование клетки, содержащей интернализованные комплексы, и ! (е) выделение из лизированной клетки молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей партнера по связыванию, происходящего из по меньшей мере одного из интернализованных комплексов. ! 2. Способ по п.1, дополнительно включающий стадию определения п�
Claims (10)
1. Способ выделения молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей партнера по связыванию комплекса, интернализованного в клетку, включающий следующие стадии:
(а) приведение клетки в контакт со смешанной группой бактериофаговых частиц, где каждая или по существу все из указанных бактериофаговых частиц экспонируют партнера по связыванию на своей поверхности, где указанный партнер по связыванию экспонирован в виде неслитого (поли)пептида с фаговым оболочечным белком указанной бактериофаговой частицы, и где каждая или по существу все из указанных бактериофаговых частиц содержат молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую данный экспонированный партнер по связыванию,
(б) обеспечение связывания партнера по связыванию, экспонированного на бактериофаговой частице, с его мишенью, с обеспечением посредством этого образования по меньшей мере одного комплекса, причем каждый из указанных комплексов содержит бактериофаговую частицу с экспонированным на ней партнером по связыванию и его мишенью,
(в) культивирование данной клетки в условиях, которые обеспечивают интернализацию по меньшей мере одного из указанных комплексов в клетку,
(г) элюирование молекул нуклеиновой кислоты, кодирующих партнера по связыванию, которые не интернализуются, в условиях, при которых не происходит по существу никакого лизиса клетки,
(д) лизирование клетки, содержащей интернализованные комплексы, и
(е) выделение из лизированной клетки молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей партнера по связыванию, происходящего из по меньшей мере одного из интернализованных комплексов.
2. Способ по п.1, дополнительно включающий стадию определения последовательности мишени интернализованного комплекса.
3. Способ по п.1, где указанный экспонированный партнер в виде неслитого (поли)пептида характеризуется непептидной связью между фаговым оболочечным белком и партнером по связыванию.
4. Способ по п.3, где указанная непептидная связь представляет собой дисульфидную связь.
5. Способ по п.4, где указанная дисульфидная связь образуется между первым остатком цистеина, содержащимся в указанном фаговом оболочечном белке, и вторым остатком цистеина, содержащимся в указанном партнере по связыванию.
6. Способ по п.4 или 5, где указанную стадию элюирования указанных молекул нуклеиновой кислоты, кодирующих партнера по связыванию, которые не интернализуются, проводят в восстановительных условиях, так что указанная дисульфидная связь расщепляется.
7. Способ по любому из пп.1-5, где указанное выделение из лизированной клетки указанной молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей партнера по связыванию, осуществляют посредством полимеразной цепной реакции (ПЦР).
8. Способ по п.2, где указанную стадию определения последовательности мишени в интернализованном комплексе осуществляют посредством масс-спектрометрии.
9. Мишень и/или партнер по связыванию, получаемые способом по любому из пп.1-8.
10. Способ доставки токсичного вещества в клетку, включающий стадии:
(а) получения (поли)пептида, кодируемого выделенной молекулой нуклеиновой кислоты, охарактеризованной в п.1,
(б) объединения указанного токсичного вещества с указанным (поли)пептидом, кодируемым выделенной нуклеиновой кислотой, охарактеризованной в п.1, и
(в) введения в клетку токсичного вещества, полученного на стадии (б), запуская посредством этого интернализацию указанного токсичного вещества в данную клетку.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US86965206P | 2006-12-12 | 2006-12-12 | |
| US60/869,652 | 2006-12-12 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2009124649A true RU2009124649A (ru) | 2011-01-20 |
Family
ID=39462145
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2009124649/10A RU2009124649A (ru) | 2006-12-12 | 2007-12-12 | Интернализация |
Country Status (12)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US8759087B2 (ru) |
| EP (1) | EP2102338B1 (ru) |
| JP (1) | JP5307023B2 (ru) |
| CN (1) | CN101558156B (ru) |
| AT (1) | ATE474920T1 (ru) |
| AU (1) | AU2007331484B2 (ru) |
| CA (1) | CA2672393C (ru) |
| DE (1) | DE602007007989D1 (ru) |
| DK (1) | DK2102338T3 (ru) |
| ES (1) | ES2348343T3 (ru) |
| RU (1) | RU2009124649A (ru) |
| WO (1) | WO2008071749A2 (ru) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US10567236B2 (en) | 2017-12-18 | 2020-02-18 | United States Of America As Represented By Secretary Of The Navy | Communication assets survey and mapping, next generation |
Family Cites Families (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO1999010485A1 (en) | 1997-08-29 | 1999-03-04 | Selective Genetics, Inc. | Methods using phage display for selecting internalizing ligands for gene delivery |
| US6723512B2 (en) | 1997-08-29 | 2004-04-20 | Selective Genetics Inc. | Methods using genetic package display for detecting and identifying protein-protein interactions that facilitate internalization and transgene expression and cells or tissues competent for the same and methods for evolving gene delivery vectors |
| US6451527B1 (en) | 1997-08-29 | 2002-09-17 | Selective Genetics, Inc. | Methods using genetic package display for selecting internalizing ligands for gene delivery |
| US7244826B1 (en) * | 1998-04-24 | 2007-07-17 | The Regents Of The University Of California | Internalizing ERB2 antibodies |
| GB9908195D0 (en) * | 1999-04-09 | 1999-06-02 | Microbiological Res Authority | Treatment of intracellular infection |
| DE60041119D1 (de) | 1999-07-20 | 2009-01-29 | Morphosys Ag | Verfahren zur präsentation von (poly)peptiden/proteinen auf bakteriophagenpartikeln via disulfidbindungen |
| CN1235910C (zh) * | 1999-10-13 | 2006-01-11 | 中国人民解放军军事医学科学院军事兽医研究所 | 与短肽激素嵌合的靶特异性细胞毒性剂 |
-
2007
- 2007-12-12 WO PCT/EP2007/063843 patent/WO2008071749A2/en active Application Filing
- 2007-12-12 CN CN200780045995.1A patent/CN101558156B/zh not_active Expired - Fee Related
- 2007-12-12 AT AT07857500T patent/ATE474920T1/de active
- 2007-12-12 ES ES07857500T patent/ES2348343T3/es active Active
- 2007-12-12 AU AU2007331484A patent/AU2007331484B2/en not_active Ceased
- 2007-12-12 CA CA2672393A patent/CA2672393C/en not_active Expired - Fee Related
- 2007-12-12 JP JP2009540769A patent/JP5307023B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2007-12-12 DK DK07857500.8T patent/DK2102338T3/da active
- 2007-12-12 DE DE602007007989T patent/DE602007007989D1/de active Active
- 2007-12-12 EP EP07857500A patent/EP2102338B1/en active Active
- 2007-12-12 US US12/518,439 patent/US8759087B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2007-12-12 RU RU2009124649/10A patent/RU2009124649A/ru not_active Application Discontinuation
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP2102338A2 (en) | 2009-09-23 |
| WO2008071749A3 (en) | 2008-07-31 |
| CN101558156A (zh) | 2009-10-14 |
| ATE474920T1 (de) | 2010-08-15 |
| AU2007331484A1 (en) | 2008-06-19 |
| JP2010522538A (ja) | 2010-07-08 |
| JP5307023B2 (ja) | 2013-10-02 |
| ES2348343T3 (es) | 2010-12-03 |
| DK2102338T3 (da) | 2010-11-01 |
| CA2672393C (en) | 2014-11-18 |
| EP2102338B1 (en) | 2010-07-21 |
| CA2672393A1 (en) | 2008-06-19 |
| AU2007331484B2 (en) | 2012-11-15 |
| US20100016553A1 (en) | 2010-01-21 |
| US8759087B2 (en) | 2014-06-24 |
| WO2008071749A2 (en) | 2008-06-19 |
| DE602007007989D1 (de) | 2010-09-02 |
| CN101558156B (zh) | 2011-11-23 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US20180284125A1 (en) | Proteomic analysis with nucleic acid identifiers | |
| Tegel et al. | Enhancing the protein production levels in Escherichia coli with a strong promoter | |
| Souza-Moreira et al. | Screening of 2A peptides for polycistronic gene expression in yeast | |
| CN1617938A (zh) | 从单个样品中分离核酸和蛋白质的方法 | |
| Passioura et al. | Flexizyme‐Mediated Genetic Reprogramming As a Tool for Noncanonical Peptide Synthesis and Drug Discovery | |
| EP1379693A4 (en) | BIO STICK CODES BASED ON OLIGONUCLEOTIDE-MODIFIED PARTICLES | |
| Edfors et al. | Immunoproteomics using polyclonal antibodies and stable isotope–labeled affinity-purified recombinant proteins | |
| Nord et al. | Microbead display of proteins by cell-free expression of anchored DNA | |
| Falgenhauer et al. | Evaluation of an E. coli cell extract prepared by lysozyme‐assisted sonication via gene expression, phage assembly and proteomics | |
| US20200063122A1 (en) | Methods for In Vitro Ribosome Synthesis and Evolution | |
| Scholle et al. | Mapping protease substrates by using a biotinylated phage substrate library | |
| Tan et al. | Preparation and purification of mono-ubiquitinated proteins using Avi-tagged ubiquitin | |
| Whiteaker et al. | Targeted mass spectrometry enables multiplexed quantification of immunomodulatory proteins in clinical biospecimens | |
| Giagnoni et al. | Soil solid phases effects on the proteomic analysis of Cupriavidus metallidurans CH34 | |
| WO2012035508A4 (en) | Method for separating target molecules or particles from fibrinogen-containing samples including blood components | |
| US20230332215A1 (en) | Methods for barcoding macromolecules in individual cells | |
| JP5999699B2 (ja) | タンパク質定量方法 | |
| RU2009124649A (ru) | Интернализация | |
| Zhao et al. | A practical approach to enrich intact tryptic N-glycopeptides through size exclusion chromatography and hydrophilicity (SELIC) using an acrylamide-agarose composite gel system | |
| Tammen et al. | Mass spectrometric phenotyping of Val34Leu polymorphism of blood coagulation factor XIII by differential peptide display | |
| Lim Kam Sian et al. | SAPrIm, a semi-automated protocol for mid-throughput immunopeptidomics | |
| WO2006028565A3 (en) | Novel methods for high-throughput genome-wide location analysis | |
| WO2013024821A1 (ja) | 並列反応用懸濁液、並列反応方法およびスクリーニング方法 | |
| Fischer et al. | SUPT3H-less SAGA coactivator can assemble and function without significantly perturbing RNA polymerase II transcription in mammalian cells | |
| Kuyama et al. | Enriching C-terminal peptide from endopeptidase ArgC digest for protein C-terminal analysis |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FA92 | Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted) |
Effective date: 20120312 |