Claims (33)
1. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты Corynebacterium glutamicum, содержащая последовательность, выбранную из группы, состоящей из последовательностей с нечетными номерами SEQ ID No:3-1155, при условии, что молекула нуклеиновой кислоты не состоит ни из одного из F-обозначенных генов, представленных в таблице 1, или комплементарную ей последовательность.1. An isolated Corynebacterium glutamicum nucleic acid molecule containing a sequence selected from the group consisting of sequences with odd numbers SEQ ID No: 3-1155, provided that the nucleic acid molecule does not consist of any of the F-designated genes represented in table 1, or its complementary sequence.
2. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из последовательностей с четными номерами SEQ ID No:4-1156, при условии, что молекула нуклеиновой кислоты не состоит ни из одного F-обозначенных генов, представленных в таблице 1, или комплементарную ей последовательность.2. The selected nucleic acid molecule that encodes a polypeptide containing an amino acid sequence selected from the group consisting of sequences with even numbers SEQ ID No: 4-1156, provided that the nucleic acid molecule does not consist of any F-designated genes, presented in table 1, or a complementary sequence to it.
3. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, которая кодирует природный аллельный вариант полипептида, включающего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей последовательностей с четными номерами SEQ ID NO:4-1156, при условии, что молекула нуклеиновой кислоты не состоит ни из одного из F-обозначенных генов, представленных в таблице 1, или комплементарную ей последовательность.3. An isolated nucleic acid molecule that encodes a natural allelic variant of a polypeptide comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of sequences with even numbers SEQ ID NO: 4-1156, provided that the nucleic acid molecule does not consist of any of F- designated genes shown in table 1, or a complementary sequence to it.
4. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере на 50% идентична всей нуклеотидной последовательности любой последовательности с нечетным номером SEQ ID NO:3-1155, при условии, что молекула нуклеиновой кислоты не состоит ни из одного из F-обозначенных генов, представленных в таблице 1, или комплементарную ей последовательность.4. The selected nucleic acid molecule containing a nucleotide sequence that is at least 50% identical to the entire nucleotide sequence of any sequence with an odd number SEQ ID NO: 3-1155, provided that the nucleic acid molecule does not consist of any of F- designated genes shown in table 1, or a complementary sequence to it.
5. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая фрагмент, состоящий по меньшей мере из 15 последовательных нуклеотидов нуклеотидной последовательности любой последовательности с нечетным номером SEQ ID NO:3-1155, при условии, что молекула нуклеиновой кислоты не состоит ни из одного из F-обозначенных генов, представленных в таблице 1, или комплементарную ей последовательность.5. The selected nucleic acid molecule containing a fragment consisting of at least 15 consecutive nucleotides of the nucleotide sequence of any sequence with an odd number SEQ ID NO: 3-1155, provided that the nucleic acid molecule does not consist of any of the F-designated genes presented in table 1, or a complementary sequence to it.
6. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-5, и нуклеотидная последовательность, кодирующая гетерологичный полипептид.6. The selected nucleic acid molecule containing the nucleic acid molecule according to any one of claims 1 to 5, and the nucleotide sequence encoding a heterologous polypeptide.
7. Вектор, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-6.7. A vector containing a nucleic acid molecule according to any one of claims 1 to 6.
8. Вектор по п.7, который является экспрессирующим вектором.8. The vector according to claim 7, which is an expression vector.
9. Клетка-хозяин, трансфецированная экспрессирующим вектором по п.8.9. A host cell transfected with an expression vector of claim 8.
10. Клетка-хозяин по п.9, где указанная клетка является микроорганизмом.10. The host cell according to claim 9, where the specified cell is a microorganism.
11. Клетка-хозяин по п.10, где указанная клетка принадлежит роду Corynebacterium или Brevibacterium.11. The host cell of claim 10, where the specified cell belongs to the genus Corynebacterium or Brevibacterium.
12. Клетка-хозяин по п.9, где экспрессия указанной молекулы нуклеиновой кислоты приводит к модуляции продуцирования химического продукта тонкого органического синтеза из указанной клетки.12. The host cell according to claim 9, where the expression of the specified nucleic acid molecule leads to modulation of the production of a chemical product of fine organic synthesis from the specified cell.
13. Клетка-хозяин по п.12, где указанный химический продукт тонкого органического синтеза выбран из группы, включающей органические кислоты, протеиногенные и непротеиногенные аминокислоты, пуриновые и пиримидиновые основания, нуклеозиды, нуклеотиды, липиды, насыщенные и ненасыщенные жирные кислоты, диолы, углеводы, ароматические соединения, витамины, кофакторы, поликетиды и ферменты.13. The host cell according to item 12, where the specified chemical product of fine organic synthesis is selected from the group comprising organic acids, proteinogenic and non-proteinogenic amino acids, purine and pyrimidine bases, nucleosides, nucleotides, lipids, saturated and unsaturated fatty acids, diols, carbohydrates , aromatic compounds, vitamins, cofactors, polyketides and enzymes.
14. Способ получения полипептида, включающий культивирование клетки-хозяина по п.9 в подходящей культуральной среде для получения посредством этого данного полипептида.14. A method for producing a polypeptide, comprising culturing a host cell according to claim 9 in a suitable culture medium to thereby produce a given polypeptide.
15. Выделенный полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из последовательностей с четными номерами SEQ ID No:4-1156, при условии, что аминокислотная последовательность не кодируется никаким из F-обозначенных генов, представленных в таблице 1.15. The selected polypeptide containing the amino acid sequence selected from the group consisting of sequences with even numbers SEQ ID No: 4-1156, provided that the amino acid sequence is not encoded by any of the F-designated genes shown in table 1.
16. Выделенный полипептид, содержащий природный аллельный вариант полипептида, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из последовательностей с четными номерами SEQ ID NO:4-1156, при условии, что аминокислотная последовательность не кодируется никаким из F-обозначенных генов, представленных в таблице 1.16. The selected polypeptide containing a natural allelic variant of the polypeptide containing an amino acid sequence selected from the group consisting of sequences with even numbers SEQ ID NO: 4-1156, provided that the amino acid sequence is not encoded by any of the F-designated genes represented in table 1.
17. Выделенный полипептид, который кодируется молекулой нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, которая является по меньшей мере на 50% идентична всей последовательности нуклеиновой кислоты любой последовательности с нечетным номером SEQ ID NO:3-1155, при условии, что молекула нуклеиновой кислоты не содержит никакой из F-обозначенных молекул нуклеиновых кислот, представленных в таблице 1.17. The selected polypeptide, which is encoded by a nucleic acid molecule containing a nucleotide sequence that is at least 50% identical to the entire nucleic acid sequence of any sequence with an odd number SEQ ID NO: 3-1155, provided that the nucleic acid molecule does not contain none of the F-designated nucleic acid molecules shown in table 1.
18. Выделенный полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, которая является по меньшей мере на 50% идентична аминокислотной последовательности любой последовательности с четным номером SEQ ID NO:4-1156, при условии, что эта аминокислотная последовательность не кодируется никаким из F-обозначенных генов, представленных в таблице 1.18. The selected polypeptide containing an amino acid sequence that is at least 50% identical to the amino acid sequence of any sequence with even number SEQ ID NO: 4-1156, provided that this amino acid sequence is not encoded by any of the F-designated genes represented in table 1.
19. Выделенный полипептид, содержащий фрагмент полипептида, содержащего аминокислотную последовательность любой последовательности с четным номером SEQ ID No:4-1156, при условии, что эта аминокислотная последовательность не кодируется никаким из F-обозначенных генов, представленных в таблице 1, где указанный полипептидный фрагмент сохраняет биологическую активность полипептида, содержащего аминокислотную последовательность.19. The selected polypeptide containing a fragment of a polypeptide containing the amino acid sequence of any sequence with an even number SEQ ID No: 4-1156, provided that this amino acid sequence is not encoded by any of the F-designated genes shown in table 1, where the specified polypeptide fragment preserves the biological activity of the polypeptide containing the amino acid sequence.
20. Выделенный полипептид по любому из пп.15-19, дополнительно содержащий гетерологичные аминокислотные последовательности.20. The selected polypeptide according to any one of claims 15-19, further comprising heterologous amino acid sequences.
21. Способ получения химического продукта тонкого органического синтеза, включающий культивирование клетки по п.9, так что продуцируется химический продукт тонкого органического синтеза.21. A method of obtaining a chemical product of fine organic synthesis, comprising cultivating the cell according to claim 9, so that a chemical product of fine organic synthesis is produced.
22. Способ по п.21, где указанный способ дополнительно включает стадию извлечения химического продукта тонкого органического синтеза из указанной культуры.22. The method according to item 21, where the specified method further includes the stage of extraction of the chemical product of fine organic synthesis from the specified culture.
23. Способ по п.21, где указанная клетка принадлежит роду Corynebacterium или Brevibacterium.23. The method according to item 21, where the specified cell belongs to the genus Corynebacterium or Brevibacterium.
24. Способ по п.21, где указанная клетка выбрана из группы, состоящей из Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium herculis, Corynebacterium lilium, Corynebacterium acetoacidophilum, Corynebacterium acetoglutamicum, Corynebacterium acetophilum, Corynebacterium ammoniagenes, Corynebacterium fujiokense, Corynebacterium nitrilophilus, Brevibacterium ammoniagenes, Brevibacterium butanicum, Brevibacterium divaricatum, Brevibacterium flavum, Brevibacterium healii, Brevibacterium ketoglutamicum, Brevibacterium ketosoreductum, Brevibacterium lactofermentum, Brevibacterium linens, Brevibacterium paraffinolyticum и эти штаммы, представленных в таблице 3.24. The method of claim 21, wherein said cell is selected from the group consisting of Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium herculis, Corynebacterium lilium, Corynebacterium acetoacidophilum, Corynebacterium acetoglutamicum, Corynebacterium acetophilum, Corynebacterium ammoniagenes, Corynebacterium fujiokense, Corynebacterium nitrilophilus, Brevibacterium ammoniagenes, Brevibacterium butanicum, Brevibacterium divaricatum, Brevibacterium flavum, Brevibacterium healii, Brevibacterium ketoglutamicum, Brevibacterium ketosoreductum, Brevibacterium lactofermentum, Brevibacterium linens, Brevibacterium paraffinolyticum and these strains are shown in Table 3,
25. Способ по п.21, где экспрессия молекулы нуклеиновой кислоты из указанного вектора приводит к модуляции продуцирования указанного химического продукта тонкого органического синтеза.25. The method according to item 21, where the expression of a nucleic acid molecule from the specified vector leads to modulation of the production of the specified chemical product of fine organic synthesis.
26. Способ по п.21, где указанный химический продукт тонкого органического синтеза выбран из группы, состоящей из органических кислот, протеиногенных и непротеиногенных аминокислот, пуриновых и пиримидиновых оснований, нуклеозидов, нуклеотидов, липидов, насыщенных и ненасыщенных жирных кислот, диолов, углеводов, ароматических соединений, витаминов, кофакторов, поликетидов и ферментов.26. The method according to item 21, where the specified fine organic synthesis product is selected from the group consisting of organic acids, proteinogenic and non-proteinogenic amino acids, purine and pyrimidine bases, nucleosides, nucleotides, lipids, saturated and unsaturated fatty acids, diols, carbohydrates, aromatic compounds, vitamins, cofactors, polyketides and enzymes.
27. Способ по п.21, где указанный химический продукт является аминокислотой.27. The method according to item 21, where the specified chemical product is an amino acid.
28. Способ по п.27, отличающийся тем, что указанная аминокислота выбрана из группы, состоящей из лизина, глутамата, глутамина, аланина, аспартата, глицина, серина, треонина, метионина, цистеина, валина, лейцина, изолейцина, аргинина, пролина, гистидина, тирозина, фенилаланина и триптофана.28. The method of claim 27, wherein said amino acid is selected from the group consisting of lysine, glutamate, glutamine, alanine, aspartate, glycine, serine, threonine, methionine, cysteine, valine, leucine, isoleucine, arginine, proline, histidine, tyrosine, phenylalanine and tryptophan.
29. Способ получения химического продукта тонкого органического синтеза, включающий культивирование клетки, геномная ДНК которой была изменена включением молекулы нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-6.29. A method of obtaining a chemical product of fine organic synthesis, comprising cultivating a cell whose genomic DNA has been altered by incorporating a nucleic acid molecule according to any one of claims 1 to 6.
30. Способ диагностики присутствия или активности Corynebacterium diphtheriae в субъекте, включающий детектирование присутствия одной молекулы нуклеиновой кислоты по пп.1-5 или полипептидных молекул по пп.15-19, и таким образом диагностики присутствия или активности Corynebacterium diphtheriae в субъекте.30. A method for diagnosing the presence or activity of Corynebacterium diphtheriae in a subject, comprising detecting the presence of one nucleic acid molecule according to claims 1-5 or polypeptide molecules according to claims 15-19, and thus diagnosing the presence or activity of Corynebacterium diphtheriae in the subject.
31. Клетка-хозяин, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из последовательностей с нечетными номерами SEQ ID NO:3-1155, где эта молекула нуклеиновой кислоты является разрушенной.31. A host cell containing a nucleic acid molecule selected from the group consisting of the sequences with odd numbers SEQ ID NO: 3-1155, where this nucleic acid molecule is disrupted.
32. Клетка-хозяин, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из последовательностей с нечетными номерами SEQ ID NO:3-1155, где молекула нуклеиновой кислоты содержит одну или несколько модификаций нуклеиновых кислот по сравнению с последовательностями с нечетными номерами SEQ ID NO:3-115532. A host cell containing a nucleic acid molecule selected from the group consisting of sequences with odd numbers SEQ ID NO: 3-1155, where the nucleic acid molecule contains one or more modifications of nucleic acids compared to sequences with odd numbers SEQ ID NO : 3-1155
33. Клетка-хозяин, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из последовательностей с нечетными номерами SEQ ID NO:3-1155, где регуляторный участок этой молекулы нуклеиновой кислоты модифицирован относительно регуляторного участка этой молекулы дикого типа.33. A host cell containing a nucleic acid molecule selected from the group consisting of the sequences with odd numbers SEQ ID NO: 3-1155, where the regulatory portion of this nucleic acid molecule is modified relative to the regulatory portion of this wild-type molecule.