Claims (38)
1. Изолированная молекула нуклеиновой кислоты Corynebacterium glutamicum, содержащая ген стресса, резистентности или толерантности, или его часть, при условии, что данная молекула нуклеиновой кислоты не состоит из каких-либо F-обозначенных генов, представленных в таблице 1.1. An isolated Corynebacterium glutamicum nucleic acid molecule containing a stress, resistance or tolerance gene, or part thereof, provided that the nucleic acid molecule does not consist of any F-designated genes shown in Table 1.
2. Изолированная молекула нуклеиновой кислоты по п.1, где указанный ген стресса, резистентности или толерантности выбирается из группы, состоящей из молекул нуклеиновой кислоты, участвующих в ответной реакции на стресс, толерантности или резистентности к температурным стрессам, рН-стрессам, кислородным стрессам, осмотическим стрессам, токсичным химическим веществам, кислородным радикалам, антибиотикам или к линкомицину.2. The isolated nucleic acid molecule according to claim 1, wherein said stress, resistance or tolerance gene is selected from the group consisting of nucleic acid molecules involved in the response to stress, tolerance or resistance to temperature stresses, pH stresses, oxygen stresses, osmotic stresses, toxic chemicals, oxygen radicals, antibiotics, or lincomycin.
3. Изолированная молекула нуклеиновой кислоты Corynebackerium glutamicum, выбранная из группы, состоящей из последовательностей, представленных нечетно пронумерованными SEQ ID Nos Списка последовательностей, или ее части, при условии, что данная молекула нуклеиновой кислоты не состоит из каких-либо F-обозначенных генов, представленных в таблице 1.3. An isolated Corynebackerium glutamicum nucleic acid molecule selected from the group consisting of sequences represented by the oddly numbered SEQ ID Nos of the Sequence List, or part thereof, provided that the nucleic acid molecule does not consist of any F-designated genes represented in table 1.
4. Изолированная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептидную последовательность, выбранную из группы, состоящей из последовательностей, представленных четно пронумерованными SEQ ID Nos в Списке последовательностей, при условии, что данная молекула нуклеиновой кислоты не состоит из каких-либо F-обозначенных генов, представленных в таблице 1.4. An isolated nucleic acid molecule encoding a polypeptide sequence selected from the group consisting of sequences represented by evenly numbered SEQ ID Nos in the Sequence List, provided that the nucleic acid molecule does not consist of any F-designated genes represented in table 1.
5. Изолированная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая природный аллельный вариант полипептида, выбранного из группы аминокислотных последовательностей, состоящей из последовательностей, представленных четно пронумерованными SEQ ID Nos Списка последовательностей, при условии, что данная молекула нуклеиновой кислоты не состоит из каких-либо F-обозначенных генов, представленных в таблице 1.5. An isolated nucleic acid molecule encoding a natural allelic variant of a polypeptide selected from the group of amino acid sequences consisting of sequences represented by evenly numbered SEQ ID Nos Sequence List, provided that the nucleic acid molecule does not consist of any F-designated genes presented in table 1.
6. Изолированная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая нуклеотидную последовательность, которая, по крайней мере, на 50% гомологична нуклеотидной последовательности, выбранной из группы, состоящей из последовательностей, представленных нечетно пронумерованными SEQ ID NO Списка последовательностей, или ее части, при условии, что данная молекула нуклеиновой кислоты не состоит из каких-либо F-обозначенных генов, представленных в таблице 1.6. An isolated nucleic acid molecule containing a nucleotide sequence that is at least 50% homologous to a nucleotide sequence selected from the group consisting of sequences represented by the oddly numbered SEQ ID NO of the Sequence List, or part thereof, provided that this the nucleic acid molecule does not consist of any F-designated genes shown in table 1.
7. Изолированная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая фрагмент, по крайней мере, из 15 нуклеотидов нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, выбранную из группы, состоящей из последовательностей, представленных нечетно пронумерованными SEQ ID Nos Списка последовательностей, при условии, что данная молекула нуклеиновой кислоты не состоит из каких-либо F-обозначенных генов, представленных в таблице 1.7. An isolated nucleic acid molecule containing a fragment of at least 15 nucleotides of a nucleic acid containing a nucleotide sequence selected from the group consisting of sequences represented by the oddly numbered SEQ ID Nos of the Sequence List, provided that the nucleic acid molecule is not consists of any F-designated genes shown in table 1.
8. Изолированная молекула нуклеиновой кислоты, которая гибридизуется с указанной молекулой нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-7 в жестких условиях.8. An isolated nucleic acid molecule that hybridizes with the specified nucleic acid molecule according to any one of claims 1 to 7 under stringent conditions.
9. Изолированная молекула нуклеиновой кислоты, содержащая указанную молекулу нуклеиновой кислоты по пп.1-8 или ее часть и нуклеотидную последовательность, кодирующую гетерологичный полипептид.9. An isolated nucleic acid molecule containing the specified nucleic acid molecule according to claims 1 to 8 or a part thereof and a nucleotide sequence encoding a heterologous polypeptide.
10. Вектор, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-9.10. A vector containing a nucleic acid molecule according to any one of claims 1 to 9.
11. Вектор по п.10, который является экспрессирующим вектором.11. The vector of claim 10, which is an expression vector.
12. Клетка-хозяин, трансфецированная экспрессирующим вектором по п.11.12. A host cell transfected with an expression vector according to claim 11.
13. Клетка-хозяин по п.12, где указанной клеткой является микроорганизм.13. The host cell of claim 12, wherein said cell is a microorganism.
14. Клетка-хозяин по п.13, где указанная клетка принадлежит к роду Corynebacterium и Brevibacterium.14. The host cell according to item 13, where the specified cell belongs to the genus Corynebacterium and Brevibacterium.
15. Клетка-хозяин по п.12, где экспрессия указанной молекулы нуклеиновой кислоты приводит к модуляции продуцирования химических продуктов тонкого органического синтеза из указанной клетки.15. The host cell of claim 12, wherein the expression of said nucleic acid molecule modulates the production of fine chemicals from said cell.
16. Клетка-хозяин по п.15, где указанный химический продукт тонкого органического синтеза выбирается из группы, состоящей из органических кислот, протеиногенных и непротеиногенных аминокислот, пуриновых и пиримидиновых оснований, нуклеозидов, нуклеотидов, липидов, насыщенных и ненасыщенных жирных кислот, диолов, углеводов, ароматических соединений, витаминов, кофакторов, поликетидов и ферментов.16. The host cell according to clause 15, where the specified chemical product of fine organic synthesis is selected from the group consisting of organic acids, proteinogenic and non-proteinogenic amino acids, purine and pyrimidine bases, nucleosides, nucleotides, lipids, saturated and unsaturated fatty acids, diols, carbohydrates, aromatic compounds, vitamins, cofactors, polyketides and enzymes.
17. Способ продуцирования полипептида, предусматривающий культивирование клетки-хозяина по п.12 в соответствующей культуральной среде с продуцированном полипептида.17. A method for producing a polypeptide, comprising culturing a host cell of claim 12 in an appropriate culture medium with the produced polypeptide.
18. Изолированный полипептид стрессов, резистентности или толерантности, происходящий от Corynebacterium glutamicum, или его часть.18. An isolated polypeptide of stress, resistance, or tolerance derived from Corynebacterium glutamicum, or part thereof.
19. Белок по п.18, где указанный полипептид стрессов, резистентности или толерантности выбирается из группы, состоящей из белков, участвующих в ответной реакции на стресс, белков толерантности или резистентности к температурным стрессам, рН-стрессам, кислородным стрессам, осмотическим стрессам, токсичным химическим веществам, кислородным радикалам, антибиотикам или к линкомицину.19. The protein of claim 18, wherein said stress, resistance or tolerance polypeptide is selected from the group consisting of proteins involved in the response to stress, tolerance or resistance to temperature stress, pH stress, oxygen stress, osmotic stress, toxic chemicals, oxygen radicals, antibiotics, or lincomycin.
20. Изолированный полипептид, включающий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из последовательностей, представленных четно пронумерованными SEQ ID Nos Списка последовательностей, при условии, что указанная аминокислотная последовательность не кодируется любым из F-обозначенных генов, представленных в таблице 1.20. An isolated polypeptide comprising an amino acid sequence selected from the group consisting of sequences represented by the evenly numbered SEQ ID Nos of the Sequence List, provided that the amino acid sequence is not encoded by any of the F-designated genes shown in Table 1.
21. Изолированный полипептид, включающий природный аллельный вариант полипептида, содержащего аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из последовательностей, представленных четно пронумерованными SEQ ID NOs Списка последовательностей, или его части, при условии, что указанная аминокислотная последовательность не кодируется любым из F-обозначенных генов, представленных в таблице 1.21. An isolated polypeptide comprising a natural allelic variant of a polypeptide containing an amino acid sequence selected from the group consisting of sequences represented by evenly numbered SEQ ID NOs of the Sequence List, or part thereof, provided that the amino acid sequence is not encoded by any of the F-labeled genes are presented in table 1.
22. Изолированный полипептид по любому из пп.18-21, который, кроме того, содержит гетерологичные аминокислотные последовательности.22. An isolated polypeptide according to any one of paragraphs 18-21, which, in addition, contains heterologous amino acid sequences.
23. Изолированный полипептид, кодируемый молекулой нуклеиновой кислоты, содержащей нуклеотидную последовательность, которая, по крайней мере, на 50% гомологична нуклеиновой кислоте, выбранной из группы, состоящей из последовательностей, представленных нечетно пронумерованными SEQ ID NOs Списка последовательностей, при условии, что указанная молекула нуклеиновой кислоты не состоит из каких-либо F-обозначенных молекул нуклеиновой кислоты, представленных в таблице 1.23. An isolated polypeptide encoded by a nucleic acid molecule containing a nucleotide sequence that is at least 50% homologous to a nucleic acid selected from the group consisting of sequences represented by the oddly numbered SEQ ID NOs of the Sequence List, provided that the molecule the nucleic acid does not consist of any F-designated nucleic acid molecules shown in table 1.
24. Изолированный полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, которая, по крайней мере, на 50% гомологична аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из последовательностей, представленных четно пронумерованными SEQ ID NOs Списка последовательностей, при условии, что указанная аминокислотная последовательность не кодируется каким-либо из F-обозначенных генов, представленных в таблице 1.24. An isolated polypeptide containing an amino acid sequence that is at least 50% homologous to an amino acid sequence selected from the group consisting of sequences represented by evenly numbered SEQ ID NOs of the Sequence List, provided that the specified amino acid sequence is not encoded by any or from the F-designated genes shown in table 1.
25. Способ продуцирования химического продукта тонкого органического синтеза, предусматривающий культивирование клетки, содержащей вектор по п.12, так, чтобы продуцировался химический продукт тонкого органического синтеза.25. A method of producing a chemical product of fine organic synthesis, comprising cultivating a cell containing the vector of claim 12, so that a chemical product of fine organic synthesis is produced.
26. Способ по п.25, где указанный способ, кроме того, предусматривает проведение стадии выделения химического продукта тонкого органического синтеза из указанной культуры.26. The method according A.25, where the specified method, in addition, provides for the stage of separation of the chemical product of fine organic synthesis from the specified culture.
27. Способ по п.25, который, кроме того, предусматривает проведение стадии трансфекции указанной клетки вектором по п.11 с получением клетки, содержащей данный вектор.27. The method according A.25, which, furthermore, provides for the stage of transfection of a specified cell with the vector according to claim 11 to obtain a cell containing this vector.
28. Способ по п.25, где указанная клетка принадлежит к роду Corynebacterium или Brevibacterium.28. The method according A.25, where the specified cell belongs to the genus Corynebacterium or Brevibacterium.
29. Способ по п.25, где указанная клетка выбрана из Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium herculis, Corynebacterium lilium, Corynebacterium acetoacidophilum, Corynebacterium acetoglutamicum, Corynebacterium acetophilum, Corynebacterium ammoniagenes, Corynebacterium fujiokense, Corynebacterium nitrilophilus, Brevibacterium ammoniaqenes, Brevibacterium butanicum, Brevibacterium divaricatum, Brevibacterium flavum, Brevibacterium bealii, Brevibacterium ketoglutamicum, Brevibacterium ketosoreductum, Brevibacterium lactofermentum, Brevibacterium linens, Brevibacterium paraffinolyticum и штаммов, представленных в таблице 3.29. The method of claim 25, wherein said cell is selected from Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium herculis, Corynebacterium lilium, Corynebacterium acetoacidophilum, Corynebacterium acetoglutamicum, Corynebacterium acetophilum, Corynebacterium ammoniagenes, Corynebacterium fujiokense, Corynebacterium nitrilophilus, Brevibacterium ammoniaqenes, Brevibacterium butanicum, Brevibacterium divaricatum, Brevibacterium flavum, Brevibacterium bealii, Brevibacterium ketoglutamicum, Brevibacterium ketosoreductum, Brevibacterium lactofermentum, Brevibacterium linens, Brevibacterium paraffinolyticum and the strains shown in table 3.
30. Способ по п.25, где экспрессия указанной молекулы нуклеиновой кислоты из указанного вектора приводит к модуляции продуцирования указанного химического продукта тонкого органического синтеза.30. The method according A.25, where the expression of the specified nucleic acid molecule from the specified vector leads to modulation of the production of the specified chemical product of fine organic synthesis.
31. Способ по п.25, где указанный химический продукт тонкого органического синтеза выбирается из группы, состоящей из органических кислот, протеиногенных и непротеиногенных аминокислот, пуриновых и пиримидиновых оснований, нуклеозидов, нуклеотидов, липидов, насыщенных и ненасыщенных жирных кислот, диолов, углеводов, ароматических соединений, витаминов, кофакторов, поликетидов и ферментов.31. The method according A.25, where the specified chemical product of fine organic synthesis is selected from the group consisting of organic acids, proteinogenic and non-proteinogenic amino acids, purine and pyrimidine bases, nucleosides, nucleotides, lipids, saturated and unsaturated fatty acids, diols, carbohydrates, aromatic compounds, vitamins, cofactors, polyketides and enzymes.
32. Способ по п.25, где указанным химическим продуктом тонкого органического синтеза является аминокислота.32. The method according A.25, where the specified chemical product of fine organic synthesis is an amino acid.
33. Способ по п.32, где указанная аминокислота выбирается из группы, состоящей из лизина, глутамата, глутамина, аланина, аспартата, глицина, серина, треонина, метионина, цистеина, валина, лейцина, изолейцина, аргинина, пролина, гистидина, тирозина, фенилаланина и триптофана.33. The method of claim 32, wherein said amino acid is selected from the group consisting of lysine, glutamate, glutamine, alanine, aspartate, glycine, serine, threonine, methionine, cysteine, valine, leucine, isoleucine, arginine, proline, histidine, tyrosine , phenylalanine and tryptophan.
34. Способ продуцирования химического продукта тонкого органического синтеза, предусматривающий культивирование клетки, геномная ДНК которой была модифицирована путем включения молекулы нуклеиновой кислоты по любому из пп.1-9.34. A method of producing a fine organic chemical product, comprising culturing a cell whose genomic DNA has been modified by incorporating a nucleic acid molecule according to any one of claims 1 to 9.
35. Способ обнаружения присутствия или активности Corynebacterium diphtheriae у индивидуума, предусматривающий обнаружение присутствия одной или нескольких SEQ ID NO 1-304 Списка последовательностей у этого индивидуума, при условии, что эти последовательности не являются или не кодируются какой-либо из F-обозначенных последовательностей, представленных в таблице 1, что позволяет диагностировать присутствие или активность Corynebacterium diphtheriae у данного индивидуума.35. A method for detecting the presence or activity of Corynebacterium diphtheriae in an individual, comprising detecting the presence of one or more SEQ ID NOS 1-304 of the List of sequences in this individual, provided that these sequences are not or are not encoded by any of the F-labeled sequences, presented in table 1, which allows to diagnose the presence or activity of Corynebacterium diphtheriae in this individual.
36. Клетка-хозяин, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из молекул нуклеиновой кислоты, представленных нечетно пронумерованными SEQ ID NOs Списка последовательностей, где указанная молекула нуклеиновой кислоты является разрушенной.36. A host cell containing a nucleic acid molecule selected from the group consisting of nucleic acid molecules represented by the oddly numbered SEQ ID NOs of the Sequence Listing, where the specified nucleic acid molecule is disrupted.
37. Клетка-хозяин, содержащая молекулу нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из молекул нуклеиновой кислоты, представленных нечетно пронумерованными SEQ ID NOs Списка последовательностей, где указанная молекула нуклеиновой кислоты содержит одну или несколько нуклеотидных модификаций, выбранных из последовательностей, представленных нечетно пронумерованными SEQ ID NOs Списка последовательностей.37. A host cell containing a nucleic acid molecule selected from the group consisting of nucleic acid molecules represented by odd numbered SEQ ID NOs A sequence listing where the specified nucleic acid molecule contains one or more nucleotide modifications selected from sequences represented by odd numbered SEQ ID NOs of the Sequence List.
38. Клетка-хозяин, включающая молекулу нуклеиновой кислоты, выбранную из группы, состоящей из молекул нуклеиновой кислоты, представленных нечетно пронумерованными SEQ ID NOs Списка последовательностей, где указанная регуляторная область данной молекулы нуклеиновой кислоты модифицирована по сравнению с регуляторной областью дикого типа данной молекулы.38. A host cell comprising a nucleic acid molecule selected from the group consisting of nucleic acid molecules represented by the oddly numbered SEQ ID NOs of the Sequence List, where the specified regulatory region of this nucleic acid molecule is modified compared to the wild-type regulatory region of this molecule.
