RU2001104343A - Варианты глюкоамилазы - Google Patents
Варианты глюкоамилазыInfo
- Publication number
- RU2001104343A RU2001104343A RU2001104343/13A RU2001104343A RU2001104343A RU 2001104343 A RU2001104343 A RU 2001104343A RU 2001104343/13 A RU2001104343/13 A RU 2001104343/13A RU 2001104343 A RU2001104343 A RU 2001104343A RU 2001104343 A RU2001104343 A RU 2001104343A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- plot
- glucoamylase
- variant
- paragraphs
- section
- Prior art date
Links
- 108010073178 Glucan 1,4-alpha-Glucosidase Proteins 0.000 title claims 26
- 102100008175 MGAM Human genes 0.000 title claims 26
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 claims 8
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 8
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 claims 8
- 239000008107 starch Substances 0.000 claims 8
- 229920003013 deoxyribonucleic acid Polymers 0.000 claims 5
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims 5
- 230000000875 corresponding Effects 0.000 claims 4
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims 4
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims 4
- 241000228245 Aspergillus niger Species 0.000 claims 3
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims 3
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 3
- 230000002255 enzymatic Effects 0.000 claims 3
- 102200135168 ATF7 T51D Human genes 0.000 claims 2
- 102200135166 ATF7 T53D Human genes 0.000 claims 2
- 240000006439 Aspergillus oryzae Species 0.000 claims 2
- 235000002247 Aspergillus oryzae Nutrition 0.000 claims 2
- 102200121805 BMPR2 Q82H Human genes 0.000 claims 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims 2
- 102000033147 ERVK-25 Human genes 0.000 claims 2
- 102200011151 FOLR1 W28R Human genes 0.000 claims 2
- 241000233866 Fungi Species 0.000 claims 2
- 102220413384 GNA11 S56A Human genes 0.000 claims 2
- 102200067879 GUCA1A A24S Human genes 0.000 claims 2
- 108010028688 Isoamylase Proteins 0.000 claims 2
- 102200009131 MEGF11 S95N Human genes 0.000 claims 2
- 102200029204 PLPPR4 A32V Human genes 0.000 claims 2
- 102200155462 PTHLH L60K Human genes 0.000 claims 2
- 108091005771 Peptidases Proteins 0.000 claims 2
- 239000004365 Protease Substances 0.000 claims 2
- 102200003959 RINT1 S40C Human genes 0.000 claims 2
- 102200010005 RITA1 S34N Human genes 0.000 claims 2
- 102200074241 SLC18B1 S30P Human genes 0.000 claims 2
- 102200002321 SLC25A4 L98P Human genes 0.000 claims 2
- 102220400844 TIMM9 P94V Human genes 0.000 claims 2
- 102200036375 TMPRSS9 S30T Human genes 0.000 claims 2
- 102200114509 TP53 E11K Human genes 0.000 claims 2
- 102220419175 UQCRB D33R Human genes 0.000 claims 2
- 102220371173 XG N93T Human genes 0.000 claims 2
- 102200051743 ZNF184 A27S Human genes 0.000 claims 2
- 102220351450 c.23G>A Human genes 0.000 claims 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims 2
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 2
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims 2
- 108010048769 pullulanase Proteins 0.000 claims 2
- 102220217183 rs1060504842 Human genes 0.000 claims 2
- 102220257835 rs1236604706 Human genes 0.000 claims 2
- 102220273445 rs1555527015 Human genes 0.000 claims 2
- 102220237891 rs367797765 Human genes 0.000 claims 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 claims 2
- 239000006188 syrup Substances 0.000 claims 2
- 235000020357 syrup Nutrition 0.000 claims 2
- 102200110225 AKR1A1 Y50F Human genes 0.000 claims 1
- 102200142336 ATOH1 D55G Human genes 0.000 claims 1
- 241001134780 Bacillus acidopullulyticus Species 0.000 claims 1
- 241000680658 Bacillus deramificans Species 0.000 claims 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims 1
- 229960002989 Glutamic Acid Drugs 0.000 claims 1
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 claims 1
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims 1
- 229920001850 Nucleic acid sequence Polymers 0.000 claims 1
- 241001453300 Pseudomonas amyloderamosa Species 0.000 claims 1
- 102200152913 RNF168 I18A Human genes 0.000 claims 1
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Vitamin C Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 claims 1
- 229960005070 ascorbic acid Drugs 0.000 claims 1
- 235000010323 ascorbic acid Nutrition 0.000 claims 1
- 239000011668 ascorbic acid Substances 0.000 claims 1
- 229960004106 citric acid Drugs 0.000 claims 1
- 235000015165 citric acid Nutrition 0.000 claims 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 claims 1
- 238000010924 continuous production Methods 0.000 claims 1
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 claims 1
- 239000000446 fuel Substances 0.000 claims 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 claims 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 claims 1
- 229960003646 lysine Drugs 0.000 claims 1
- 235000018977 lysine Nutrition 0.000 claims 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 claims 1
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 claims 1
- 150000002482 oligosaccharides Polymers 0.000 claims 1
- 150000002894 organic compounds Chemical class 0.000 claims 1
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 claims 1
- 102220056421 rs730880036 Human genes 0.000 claims 1
- 102220316473 rs764755691 Human genes 0.000 claims 1
- 102220096728 rs876658680 Human genes 0.000 claims 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 claims 1
Claims (29)
1. Вариант исходной глюкоамилазы, включающий одну или большее число мутаций в следующем(их) положении(ях) или участке(ах) в аминокислотной последовательности, показанной в NO: 2: а) участок: 1-18; участок: 19-35; участок: 40-62; участок: 73-80; участок: 93-127; участок: 170-184; участок: 200-212; участок: 234-246; участок: 287-319; участок: 334-341; участок: 353-374; участок: 388-414; участок: 445-470; и/или в соответствующем положении или участке гомологичной глюкоамилазы, которая проявляет по крайней мере 60%-ный уровень гомологии с аминокислотными последовательностями, показанными на SEQ ID NO: 2, за исключением следующих замен: N20C, А27С, S30P, Y48W, Y50F, W52F, R54K/L, D55G/V, G57A, K108R, D112Y, Y116A/W, S119C/W/E/G/Y/P, W120H/L/F/Y, G121T/A, R122Y, P123G, Q124H, R125K, W170F, N171S, Q172N, T173G, G174C, Y175F, D176N/E, L177H/D, W178R/D, E179Q/D, E180D/Q, V181D/A/T, N182A/D/Q/Y/S, G183K, S184H, W212F, R241K, А246С, D293E/Q, A302V, R305K, Y306F, D309N/E, Y312W, W317F, E389D/Q, H391W, A392D, А393Р, N395Q, G396S, E400Q/C, Q401E, G407D, Е408Р, L410F, S411A/G/C/H/D, S460P; b) участок: 1-18; участок: 19-35; участок: 73-80; участок: 93-127; участок: 170-184; участок: 200-212; участок: 234-246; участок: 287-319; участок: 334-341; участок: 353-374; участок: 388-414; участок: 445-470; и/или в соответствующем положении или участке гомологичной глюкоамилазы, которая проявляет по крайней мере 60%-ный уровень гомологии с аминокислотными последовательностями, показанными на SEQ ID NO: 2, за исключением следующих замен: N20C/ А27С, S30P, А246С, при этом указанный вариант исходной глюкоамилазы обладает улучшенной термостабильностью; с) участок: 1-18; участок: 40-62; участок: 93-127; участок: 170-184; участок: 200-212; участок: 234-246; участок: 287-319; участок: 388-414; и/или в соответствующем положении или участке гомологичной глюкоамилазы, которая проявляет по крайней мере 60%-ный уровень ' гомологии с аминокислотными последовательностями, показанными на SEQ ID NO: 2, за исключением следующих замен: S411G, при этом указанный вариант исходной глюкоамилазы обладает повышенной специфической активностью.
2. Вариант по п. 1, отличающийся тем, что вариант (а) включает одну или большее число следующих мутаций: A1V, T2E/P/Q/R/H/M, L3P/N, N9A, А11Р/Е, I18V, L19N, N20T, G23A, A24S/T, D25S/T/R, G26A, A27S/T, W28R/Y, S30T/N, G31A, A32V, D33R/K/H, S34N, S40C, T43R, T51D/S, T53D, S56A/C, V59T/A, L60A, N93T, P94V, S95N, D97S, L98P/S, S100T/D, A102S/*, N110T, V111P, D112N, Е113М/А, T114S, A115Q/G, Y116F, S119A, G127A, N182E, A201D, F202L, A203L, Т204К, A205R/S, V206L/N, G207N, S208H/T/D, S209T, S211P, W212N/A/T, А246Т, Y312Q, N313T/S/G, A353D/S, S356P/N/D, D357S, A359S, T360V, G361S/P/T/A, T362R, S364A/R/N/D/C/Q/E/G/H/I/L/K/M/F/P/T/W/Y/V, S365A/R/N/D/C/Q/E/G/H/I/L/K/M/F/P/T/W/Y/V, S366T, S368P/T/A, T369A/R/N/D/C/Q/E/G/H/I/L/K/M/F/P/T/W/Y/V, S371Y/H/N/D, S372F/Y/C/L/P/H/R/I/T/N/S/V/A/D/G, T390R, A393R, S394R/P, M398L, S399C/Q/T, Y402F, D403S, S405T, D406N, E408C/R, L410I/R, S411V, А412С, D414A, G447S, S465P.
3. Вариант по п. 1, отличающийся тем, что вариант (с) включает одну или большее число мутаций в следующем(их) участке(ах) в аминокислотной последовательности, показанной в NO: 2: участок: 287-300; участок: 305-319; и/или в соответствующем положении или участках гомологичной глюкоамилазы, которая проявляет по крайней мере 60%-ный уровень гомологии с аминокислотными последовательностями, показанными на SEQ ID NO: 2.
4. Вариант по любому из пп. 1-3, отличающийся тем, что исходной гомологичной глюкоамилазой является глюкоамилаза Gl Aspergillus niger.
5. Вариант по любому из пп. 1-4, отличающийся тем, что глюкоамилаза является укороченной глюкоамилазой, в частности, по ее С-концу.
6. ДНК-конструкция, включающая последовательность ДНК, кодирующую вариант глюкоамилазы по любому из пп. 1-5.
7. ДНК-конструкция по п. 6, встроенная в клетку.
8. ДНК-конструкция по п. 1, отличающаяся тем, что указанная клетка является микроорганизмом, таким как бактерия или грибок.
9. ДНК-конструкция по п. 8, отличающаяся тем, что указанная клетка является Aspergillus oryzae или Aspergillus niger без протеазы.
10. Рекомбинантный экспрессирующий вектор, который включает ДНК-конструкцию по п. 6.
11. Вектор по п. 10, встроенный в клетку.
12. Вектор по п. 11, отличающийся тем, что указанная клетка является микроорганизмом, таким как бактерия или грибок.
13. Вектор по п. 12, отличающийся тем, что указанная клетка является Aspergillus oryzae или Aspergillus niger без протеазы.
14. Способ превращения крахмала или частично гидролизованного крахмала в сироп, содержащий декстрозу, отличающийся тем, что указанный способ включает стадию осахаривания крахмального гидролизата в присутствии варианта глюкоамилазы по любому из пп. 1-5.
15. Способ по п. 14, отличающийся тем, что доза глюкоамилазы находится в диапазоне 0,05-0,5 AGU на 1 г сухих твердых веществ.
16. Способ по любому из пп. 14 и 15, включающий осахаривание крахмального гидролизата по крайней мере на 30% по весу сухих твердых веществ.
17. Способ по любому из пп. 14-16, отличающийся тем, что осахаривание осуществляют в присутствии фермента расщепления разветвленной структуры, выбираемого из группы пуллуланазы и изоамилазы, предпочтительно пуллуланазы, происходящей от Bacillus acidopullulyticus или Bacillus deramificans, или изоамилазы, происходящей от Pseudomonas amyloderamosa.
18. Способ по любому из пп. 14-17, отличающийся тем, что осахаривание проводят при рН 3-5,5 и при температуре 60-80oС, предпочтительно при 63-75oС, в течение 24-72 ч, предпочтительно 36-48 ч при рН 4-4,5.
19. Способ осахаривания раствора разжиженного крахмала, отличающийся тем, что включает: (i) стадию осахаривания, в ходе которой имеют место одна или большее число стадий ферментативного осахаривания, и последующую стадию, (ii) одно или многостадийного высокотемпературного разделения на мембранах, где указанное ферментативное осахаривание проводят с использованием варианта глюкоамилазы по любому из пп. 1-5.
20. Вариант глюкоамилазы по любому из пп. 1-5, используемый в способе превращения крахмала.
21. Вариант глюкоамилазы по любому из пп. 1-5, используемый в непрерывном способе превращения крахмала.
22. Вариант глюкоамилазы по п. 21, в котором непрерывный способ превращения крахмала включает непрерывный способ осахаривания по п. 19.
23. Вариант глюкоамилазы по любому из пп. 1-5, используемый в способе получения олигосахаридов.
24. Вариант глюкоамилазы по любому из пп. 1-5, используемый в способе получения специальных сиропов.
25. Вариант глюкоамилазы по любому из пп. 1-5, используемый в способе получения этанола для топлива.
26. Вариант глюкоамилазы по любому из пп. 1-5, используемый в способе получения напитков.
27. Вариант глюкоамилазы по любому из пп. 1-5, используемый в ферментативном способе получения органических соединений, таких как лимонная кислота, аскорбиновая кислота, лизин, глутаминовая кислота.
28. Способ улучшения термостабильности и/или повышения специфической активности исходной глюкоамилазы путем внесения мутации по одному или большему числу следующих положения(и) или участку(ам) в аминокислотной последовательности, показанной в NO: 2: участок: 1-18; участок: 19-35; участок: 40-62; участок: 73-80; участок: 93-127; участок: 170-184; участок: 200-212; участок: 234-246; участок: 287-319; участок: 334-341; участок: 353-374; участок: 388-414; участок: 445-470; и/или в соответствующем положении или участке гомологичной глюкоамилазы, которая проявляет по крайней мере 60%-ный уровень гомологии с аминокислотными последовательностями, показанными на SEQ ID NO: 2.
29. Способ по п. 28, включающий одну или большее число следующих замен: A1V, T2E/P/Q/R/H/M, L3P/N, N9A, А11Р/Е, I18A, L19N, N20T, G23A, A24S/T, D25S/T/R, G26A, A27S/T, W28R/Y, S30T/N, G31A, A32V, D33R/K/H, S34N, S40C, T43R, T51D/S, T53D, S56A/C, V59T/A/ L60A, N93T, P94V, S95N, D97S, L98P/S, S100T/D, A102S/*, N110T, V111P, D112N, Е113М/А, T114S, A115Q/G, Y116F, S119A, G127A, N182E, A201D, F202L, A203L, Т204К, A205R/S, V206L/N, G207N, S208H/T/D, S209T, S211P, W212N/A/T, А246Т, Y312Q, N313T/S/G, A353D/S, S356P/N/D, D357S, A359S, T360V, G361S/P/T/A, T362R, S364A/R/N/D/C/Q/E/G/H/I/L/K/M/F/P/T/W/Y/V, S365A/R/N/D/C/Q/E/G/H/I/L/K/M/F/P/T/W/Y/V, S366T, S368P/T/A, T369A/R/N/D/C/Q/E/G/H/I/L/K/M/F/P/T/W/Y/V, S371Y/H/N/D, S372F/Y/C/L/P/H/R/I/T/N/S/V/A/D/G, T390R, A393R, S394R/P, M398L, S399C/Q/T, Y402F, D403S, S405T, D406N, E408C/R, L410I/R, S411V, A412C, D414A, G447S, S465P.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| DKPA199800937 | 1998-07-15 | ||
| DKPA199801667 | 1998-12-17 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2001104343A true RU2001104343A (ru) | 2003-04-10 |
Family
ID=
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2517602C2 (ru) * | 2009-06-08 | 2014-05-27 | Йенневайн Биотехнологи Гмбх | Синтез нмо |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2517602C2 (ru) * | 2009-06-08 | 2014-05-27 | Йенневайн Биотехнологи Гмбх | Синтез нмо |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN100402645C (zh) | 葡糖淀粉酶变体 | |
| US8101392B2 (en) | Glucoamylase variants | |
| US4560651A (en) | Debranching enzyme product, preparation and use thereof | |
| US8143050B2 (en) | Recombinant β-glucosidase variants for production of soluble sugars from cellulosic biomass | |
| US20040002142A1 (en) | Glucoamylase variants | |
| US8222006B2 (en) | Glucoamylase variants | |
| MX2010013122A (es) | Composicion de enzima de sacarificacion y metodo de sacarificacion de la misma. | |
| CN102933227A (zh) | 包含增强性多肽和淀粉降解酶的组合物及其用途 | |
| JPH08336388A (ja) | 非還元性糖質からトレハロースを遊離する組換え型耐熱性酵素 | |
| US20130157307A1 (en) | Process of Producing A Fermentation Product | |
| RU2001104343A (ru) | Варианты глюкоамилазы | |
| Takasaki et al. | Acid-stable and thermostable α-amylase from Bacillus licheniformis α | |
| CN110603322A (zh) | 热稳定的葡糖淀粉酶及其使用方法 | |
| EP0860500B1 (en) | Purified acid-stable alpha-amylase from fungal origin | |
| DK200001932A (da) | Glucoamylase variants | |
| EP1914306A2 (en) | Glucoamylase Variants | |
| US9862981B2 (en) | Thermophilic acetylxylan esterase genes and enzymes from alicyclobacillus acidocaldarius and related organisms and methods | |
| US5882906A (en) | Staphylothermus amylase | |
| BR112021000059A2 (pt) | Glucoamilases e métodos para uso das mesmas | |
| CN101275125A (zh) | 葡糖淀粉酶变体 |