RS67265B1 - Lečenje kancera koji ima gnaq ili gna11 genetske mutacije sa inhibitorima protein kinaze c - Google Patents

Description

Opis

UNAKRSNA REFERENCA NA SRODNU PRIJAVU

[0001] Ova prijava ima prioritet U.S. privremene patentne prijave br. 62/789,177, koja je podneta 07.01.2019.

STANJE TEHNIKE

[0002] Heterotrimerni proteini koji vezuju guanin nukleotide (G proteini) se spajaju sa G protein-sparenim receptorima (GPCR) i služe kao molekularni prekidači koji prenose signale sa aktiviranih GPCR na širok spektar intracelularnih efektora. G proteini predstavljaju veliku porodicu heterotrimernih proteina koji se nalaze kod sisara, sastavljenih od alfa (Gα), beta (Gβ) i gama (Gγ) podjedinica. U svom neaktivnom stanju, G proteini su heterotrimerni, sastoje se od jedne Gα, jedne Gβ i jedne Gγ podjedinice i vezanog dezoksiguanozin difosfata (GDP). Razmena guanin nukleotida katalizovana receptorom rezultira vezivanjem dezoksiguanozin trifosfata (GTP) za Gα podjedinicu i aktivacijom G proteina. Gα-GTP se disocira od Gβ i Gγ podjedinica, omogućavajući Gβγ dimeru i Gα-GTP podjedinici da aktiviraju nishodne efektore. Hidroliza GTP u GDP deaktivira kompleks i isključuje ćelijski odgovor.

[0003] Protein alfa-Q koji vezuje guanin nukleotide (GNAQ) i protein alfa 11 koji vezuje guanin nukleotide (GNA11) su geni koji kodiraju Gαqi Gα11podjedinice respektivno. Većina somatskih aktivirajućih mutacija pronađenih u GNAQ i GNA11 rezultira u konstitutivno aktivnim Gαqili Gα11proteinima, respektivno. Pokazano je da uvealni melanom, koji nastaje iz melanocita i biološki se razlikuje od melanoma kože, ima ove aktivirajuće mutacije u GNAQ i/ili GNA11 genima. GNAQ i GNA11 promene na Q209 su okarakterisane kao mutacije dobitka funkcije koje donose zavisnost od nishodne signalizacije protein kinaze C (PKC). PKC je porodica multifunkcionalnih izoenzima koja igra vitalnu ulogu u regulaciji prenosa signala, ćelijske proliferacije i diferencijacije kroz pozitivnu i negativnu regulaciju ćelijskog ciklusa. PKC je jedan od glavnih nishodnih efektora u Gαq(Gα11ili Gαq/11) signalnom putu. Međunarodne patentne prijave WO 2011/130691 i WO 2016/020864 otkrivaju upotrebu inhibitora PKC za lečenje uvealnog melanoma koji nosi GNAQ ili GNA11 mutacije.

[0004] Postoji nezadovoljena potreba za efikasnim i bezbednim terapeutskim sredstvima koji mogu lečiti druge vrste kancera osim uvealnog melanoma. Klinički značaj i učestalost mutacija GNAQ i GNA11 kod neuvealnog melanoma i drugih vrsta kancera generalno je nepoznat i nerazumljiv.

KRATAK OPIS

[0005] Predmetni pronalazak je definisan patentnim zahtevima. Svaki predmet koji je van obima patentnih zahteva dat je samo u informativne svrhe. Postupci lečenja ljudskog tela terapijom, na koje se pozivamo u ovom opisu, nisu deo ovog pronalaska kao takvih, ali su ovde opisani u vezi sa jedinjenjima i farmaceutskim kompozicijama za upotrebu u navedenim postupcima lečenja ljudskog tela terapijom, prema ovom pronalasku. Predmetni pronalazak je delimično zasnovan na otkriću da su određeni kanceri povezani sa GNAQ i/ili GNA11 genetskim mutacijama, i na primer, kada se identifikuju, takvi kanceri mogu se lečiti primenom farmaceutski efikasne količine inhibitora protein kinaze C. Na primer, ovde je dat inhibitor PKC za upotrebu u postupku lečenja pacijenta koji ima ne-uvealni melanomski tumor ili kancer, ili nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema (npr., kancer pankreasa, kolorektalni kancer, adenokarcinom pluća, melanom kože, kancer želuca, kancer grlića materice, kancer materice, kancer bešike, hepatocelularni karcinom, kancer prostate, kancer dojke, kancer glave i vrata i glioblastom), pri čemu postupak sadrži : određivanje da li ne-uvealni melanom ili nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju koja aktivira PKC put; i oralno primenjivanje na pacijenta koji boluje od ne-uvealnog melanoma sa GNAQ ili GNA11 genetskom mutacijom farmaceutski efikasne količine inhibitora protein kinaze C. Takvo određivanje može uključivati određivanje da li ne-uvealni melanom ili nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema ima GNAQ Q209, GNA11 Q209, GNAQ R183 ili GNA11 R183 genetsku mutaciju, pri čemu na primer, ne-uvealni melanomski kancer ili ne-uvealni melanomski tumor ili ne-melanocitni tumor centralnog nervnog sistema može biti izabran iz grupe koja se sastoji od kancera pankreasa, kolorektalnog kancera, adenokarcinoma pluća i kožnog melanoma. Alternativno, takvo određivanje može uključivati određivanje da li neuvealni melanom ili ne-melanocitni tumor centralnog nervnog sistema ima mutaciju koja nije bilo koja od GNAQ Q209, GNA11 Q209, GNAQ R183 ili GNA11 R183 genetska mutacija, i na primer, tumor ili kancer mogu biti odabrani iz grupe koja se sastoji od karcinoma materice, želuca, bešike, grlića materice, dojke, glave i vrata, hepatocelularnog karcinoma i glioblastoma.

[0006] Na primer, ovo otkriće se delimično odnosi na inhibitor PKC za upotrebu u postupku lečenja karcinoma, npr., solidni tumor melanoma koji nije uvealnog porekla, koji ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju (npr., GNAQ Q209, GNAQ R183, ili GNA11 Q209 genetsku mutaciju), ili mutaciju koja nije Q209 ili nije R183, kod pacijenta kome je to potrebno, pri čemu je karcinom, na primer, izabran iz grupe koja se sastoji od adenokarcinoma pankreasa, adenokarcinoma želuca, karcinoma grlića materice, adenokarcinoma pluća i melanoma kože. U primerima izvođenja ovog otkrića, takav predviđeni postupak može uključivati određivanje da li pacijentov karcinom ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju; i oralno primenjivanje na pacijenta koji ima karcinom sa GNAQ ili GNA11 genetskom mutacijom terapeutski efikasne količine inhibitora protein kinaze C, na primer, inhibitora protein kinaze C male molekulske mase.

[0007] Ovde je, na primer, obezbeđen inhibitor PKC za upotrebu u postupku lečenja kancera solidnog tumora kod pacijenta kome je to potrebno, pri čemu postupak sadrži: oralno primenjivanje efikasne količine inhibitora protein kinaze C na pacijenta, pri čemu je određeno da pacijent ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju tumora, pri čemu je kancer solidnog tumora izabran od adenokarcinoma pankreasa, adenokarcinoma želuca, karcinoma grlića materice i adenokarcinoma pluća.

[0008] Na primer, ovde je opisan inhibitor PKC za upotrebu u postupku lečenja solidnog tumora kancera koji ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju kod pacijenta, na primer, pacijenta kome je to potrebno, pri čemu postupak uključuje određivanje da li kancer solidnog tumora ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju; određivanje da li pacijent nema aktivirajuće BRAF ili NRAS mutacije (npr., pacijent možda nema BRAF V600 mutaciju); i oralno primenjivanje na pacijenta bez aktiviranja BRAF ili NRAS mutacije farmaceutski efikasne količine inhibitora protein kinaze C.

[0009] U nekim primerima izvođenja, predviđeni postupci uključuju lečenje kancera solidnog tumora kod pacijenta kome je to potrebno, pri čemu pacijent u suštini nije responsivan na lečenje inhibitorom imunološke kontrolne tačke, npr., nije responsivan na 3-mesečni kurs lečenja inhibitorom imunološke kontrolne tačke kao što je jedan ili više od pembrolizumaba, ipilimumaba, nivolumaba i atezolizumaba, što sadrži oralno primenjivanje na pacijenta farmaceutski prihvatljive količine inhibitora protein kinaze, pri čemu je utvrđeno da pacijentov solidni tumor ima npr., GNAQ ili GNA11 mutaciju, npr., Q209L ili GNA11 Q209L genetsku mutaciju.

[0010] Ovde razmatrani postupci lečenja mogu biti usmereni na pacijente koji imaju nisko opterećenje tumorskim mutacijama. Na primer, u nekim primerima izvođenja, pacijent može imati nisko opterećenje tumorskim mutacijama u jednom ili više BAP1, SF3B1, EIF1AX, TERT, BRAF, CDKN2A, NRAS, ili KRAS.

KRATAK OPIS SLIKA

[0011]

SLIKA 1 prikazuje Galpha-q sa mutacijama mapiranim na mestu vezivanja CPK i GTP na pozadinskoj površini.

SLIKA 2 prikazuje model homologije GNA11 sa mutacijama mapiranim u CPK i pretpostavljenim mestom vezivanja GTP na pozadinskoj površini.

SLIKA 3 je šematski dijagram studije opisane u Primeru 3. Skraćenice korišćene na slici: BID: bis in diem/dva puta dnevno; MUM: metastatski uvealni melanom; CRC: kolorektalni kancer; RP2D: preporučena doza faze 2.

DETALJAN OPIS

[0012] Ovo otkriće se delimično odnosi na inhibitore PKC za upotrebu u postupcima lečenja kancera kod pacijenata koji imaju mutacije, na primer, aktivirajuće mutacije koje, na primer, aktiviraju PKC put, u GNAQ ili GNA11, pri čemu postupak uključuje oralno primenjivanje inhibitora PKC kao što je ovde opisano. Ovde opisano otkriće je korisno za lečenje ne-uvealnih melanomskih karcinoma kako je definisano u patentnim zahtevima, koji imaju ili aktivirajuću mutaciju GNAQ ili GNA11 npr., heterozigotne somatske supstitucije Q209 ili R183 od GNAQ ili GNA11, ili imaju aktivirajuću mutaciju koja nije mutacija Q209 ili R183, oralnim primenjivanjem inhibitora protein kinaze C na pacijenta kome je to potrebno.

Definicije

[0013] Pod „lečenjem“ se podrazumeva smanjenje najmanje jednog simptoma povezanog sa bolešću ili stanjem koje se leči.

[0014] „Subjekat“ ili „pacijent“, kako su ovde opisani, odnosi se na bilo koju životinju koja je u riziku od kancera, pati od njega ili joj je dijagnostikovan kancer (na primer, karcinom, kancer solidnog tumora ili ne-uvealni melanomski tumor ili nemelanocitični tumor centralnog nervnog sistema), uključujući, ali ne ograničavajući se na, sisare, primate i ljude. U određenim primerima izvođenja, subjekat može biti sisar koji nije čovek, kao što je, na primer, mačka, pas ili konj. U sledećem primeru izvođenja, subjekat je ljudski subjekat. Subjekat može biti osoba kojoj je dijagnostikovan visok rizik od razvoja kancera, neko kome je dijagnostikovan kancer, neko ko je prethodno bolovao od kancera i/ili individua koja je procenjena na simptome ili indikacije kancera.

[0015] Termini „polipeptid“, „peptid“ i „protein“ se ovde koriste naizmenično da bi se odnosili na polimer aminokiselinskih ostataka. Termini se primenjuju na polimere aminokiselina u kojima je jedan ili više aminokiselinskih ostataka neprirodni hemijski mimetik odgovarajuće prirodne aminokiseline, kao i na prirodne polimere aminokiselina, one koji sadrže modifikovane ostatke aminokiselina i polimere aminokiselina koje se ne javljaju u prirodi.

[0016] Kako se ovde koristi, termin „farmaceutski prihvatljive soli“ odnosi se na netoksične kisele ili zemnoalkalne metalne soli jedinjenja opisanih ovde, na primer, jedinjenja formule (II). Ove soli se mogu pripremiti in situ tokom konačne izolacije i prečišćavanja jedinjenja, na primer, jedinjenja formule (II), ili odvojenim reagovanjem bazne ili kisele funkcionalne grupe jedinjenja opisanih ovde, na primer, jedinjenja formule (II), sa odgovarajućom organskom ili neorganskom kiselinom ili bazom, respektivno. Reprezentativne soli uključuju, ali nisu ograničene na sledeće: acetat, adipat, alginat, citrat, aspartat, benzoat, benzensulfonat, bisulfat, butirat, kamforat, kamforsulfonat, diglukonat, ciklopentanpropionat, dodecilsulfat, etansulfonat, glukoheptanoat, glicerofosfat, hemisulfat, heptanoat, heksanoat, fumarat, hidrohlorid, hidrobromid, hidrojodid, 2-hidroksietansulfonat, laktat, maleat, metansulfonat, nikotinat, 2-naftalensulfonat, oksalat, pamoat, pektinat, persulfat, 3-fenilprojonat, pikrat, pivalat, propionat, sukcinat, sulfat, tartarat, tiocijanat, p-toluensulfonat i undekanoat. Takođe, osnovne grupe koje sadrže azot mogu se kvaternizovati pomoću agenasa kao što su niži alkil halidi, kao što su metil, etil, propil i butil hlorid, bromidi i jodidi; dialkil sulfati poput dimetil, dietil, dibutil i diamil sulfata, dugolančani halidi kao što su decil, lauril, miristil i stearil hloridi, bromidi i jodidi, aralkil halidi poput benzil i fenetil bromida i drugi. Na taj način se dobijaju proizvodi rastvorljivi u vodi ili ulju ili disperzibilni proizvodi.

[0017] Kako se ovde koristi, termin „GNAQ“ odnosi se na gen alfa-Q proteina koji vezuje guanin nukleotide i kodira alfa podjedinicu Gq (Gαq) i termin „GNA11“ odnosi se na gene proteina alfa 11 koji vezuje guanin nukleotide i kodira podjedinicu G11alfa (Gα11). Termin obuhvata nukleinsku kiselinu i polimorfne varijante, alele, mutante i fragmente GNAQ i GNA11. GNAQ i GNA11 sekvence su dobro poznate u struci. Primeri humanih GNAQ sekvenci dostupni su pod referentnim sekvencama NM_002072 u NCBI bazi podataka nukleotida (nukleotidna sekvenca) i pristupnim brojem NP_002063.2 (polipeptidna sekvenca). Humani GNAQ je lokalizovan na hromozomu 9q21. Primeri humanih GNA11 sekvenci dostupni su pod referentnim sekvencama NM_002067 u NCBI bazi podataka nukleotida (nukleotidna sekvenca) i pristupnim brojem NP_002058.2 (polipeptidna sekvenca). Humani GNA11 je lokalizovan u regionu hromozoma 19p13.3.

[0018] Kako se ovde koriste, „mutacije“ mogu se odnositi na promene u polinukleotidnoj sekvenci koje dovode do promena u aktivnosti proteina. Mutacije mogu biti nukleotidne supstitucije, kao što su supstitucije, insercije ili delecije jednog nukleotida. GNAQ i GNA11 mutacije su tipično aktivirajuće mutacije koje dovode do konstitutivne aktivacije α podjedinice. Bez vezivanja za teoriju, smatra se da konstitutivna aktivnost proizilazi iz nedostatka aktivnosti GTP-hidrolaze u mutantnom GNAQ ili GNA11 proteinu. Aktivirajuće mutacije mogu se odnositi i na mutacije koje dovode do gubitka ili smanjenja aktivnosti hidrolize GTP-a Gα podjedinice. Mutacije u GNAQ i GNA11 uključuju supstituciju arginina u kodonu R183 ili supstituciju glutamina u kodonu Q209, ili mogu biti druge mutacije. U primerima izvođenja, mutacije u GNAQ i/ili GNA11 mogu biti izabrane iz grupe koja sadrži: Q209P, Q209L, Q209H, Q209K, Q209Y, Q209R, Q209H, R183Q, R183, na primer, GNAQ Q209 može biti mutiran u P ili L, kao i u R ili H; GNAQ R183 može biti mutiran u Q; GNA11 Q209 može biti mutiran u L, kao i u P ili K; GNAQ R183 može mutirati u C ili H.

[0019] GNA11 Q209 može mutirati u L, kao i retko u P ili K; takođe, GNAQ R183 najčešće mutira u C, a ređe u H.

[0020] Kako se ovde koristi, termin „PKC“ odnosi se na protein kinazu C. PKC porodica serin/treonin kinaza je sastavljena od najmanje deset izoformi, ključnih u različitim procesima ćelijske diferencijacije sa različitim načinima regulacije i distribucije u tkivima. Poznato je da je pet izozima prisutno u humanim neutrofilima (videti Karlsson A. et al (2002) antioxid. Redox Signal. 4:49-60).

[0021] Kako se ovde koristi, termin „inhibitor PKC“ odnosi se na inhibitor protein kinaze C koji može biti „pan“ (višestruko podtipski) ili selektivan za jedan ili više PKC izozima. Termin PKC se generalno odnosi na celu porodicu izoformi: konvencionalne izoforme; alfa, beta i gama, nove izoforme; delta, epsilon, eta i teta, i atipične izoforme; zeta i jota. Termin „inhibitor“ se odnosi na modulatorne molekule ili jedinjenja koja, npr., vezuju se za, delimično ili potpuno blokiraju aktivnost, smanjuju, sprečavaju, odlažu aktivaciju, inaktiviraju, desenzibilizuju ili snižavaju aktivnost ili ekspresiju npr., proteina, npr., PKC.

[0022] Izraz „alkil“ se odnosi na alkil grupe koje ne sadrže heteroatome. Dakle, izraz uključuje alkil grupe pravog lanca, kao što su metil, etil, propil, butil, pentil, heksil, heptil, oktil, nonil, decil, undecil, dodecil i slično. Fraza takođe uključuje izomere razgranatog lanca alkil grupa pravog lanca, uključujući, ali ne ograničavajući se na, sledeće koje su date kao primer: --CH(CH3)2, -CH(CH3)(CH2CH3), -CH(CH2CH3)2, -C(CH3)3, -C(CH2CH3)3, -CH2CH(CH3)2, -CH2CH(CH3)(CH2CH3), -CH2CH(CH2CH3)2, -CH2C(CH3)3, -CH2C(CH2CH3)3, -CH(CH3)-CH(CH3)(CH2CH3), -CH2CH2-CH(CH3)2, -CH2CH2CH(CH3)(CH2CH3), -CH2CH2CH(CH2CH3)2, -CH2CH2C(CH3)3, -CH2CH2C(CH2CH3)3, -CH(CH3)CH2-CH(CH3)2, -CH(CH3)CH(CH3)CH(CH3)2, -CH(CH2CH3)CH(CH3) CH(CH3)(CH2CH3) i drugi. Izraz takođe uključuje ciklične alkil grupe kao što su ciklopropil, ciklobutil, ciklopentil, cikloheksil, cikloheptil i ciklooktil, i takve prstenove supstituisane alkil grupama pravog i razgranatog lanca kao što su gore definisani. Dakle, termin alkil grupa“ obuhvata primarne alkil grupe, sekundarne alkil grupe i tercijarne alkil grupe. Alkil grupe obuhvataju alkil grupe pravog i razgranatog lanca i ciklične alkil grupe koje imaju od 1 do 12 atoma ugljenika.

[0023] Kako se ovde koristi, alkil“ obuhvata i supstituisane i nesupstituisane alkil grupe pravog ili razgranatog lanca koje imaju od 1 do 6 atoma ugljenika. Reprezentativne C1-6alkil grupe uključuju, na primer, metil, etil, propil, izopropil, n-butil, terc-butil, neopentil, trifluorometil, pentafluoroetil i slično. Osim ako nije drugačije naznačeno, C1-6alkil grupe mogu biti supstituisane, kao što je sa halo, hidroksi, amino, nitro i/ili cijano grupama i slično. Reprezentativni primer C1-3haloalkil i C1-3hidroksialkil uključuje hlorometil, trihlorometil, trifluorometil, fluorometil, fluoroetil, hloroetil, hidroksimetil, hidroksietil i slično. Druge pogodne supstituisane C1-3alkil grupe uključuju, na primer, aralkil, aminoalkil, aminoaralkil, karbonilaminoalkil, alkilkarbonilaminoalkil, arilkarbonilaminoalkil, aralkilkarbonilaminoalkil, aminoalkoksialkil i arilaminoalkil, osim ako nije drugačije naznačeno.

[0024] Kako se ovde koristi, alkoksi“, kako se ovde koristi, odnosi se na radikal RO-, gde je R jednako C1-6alkil. Reprezentativni primeri C1-6alkoksi grupe uključuju metoksi, etoksi, tbutoksi, trifluorometoksi i slično.

[0025] Kako se ovde koristi, termin „halogen“ ili „halo“ odnosi se na hloro, bromo, fluoro i jodo grupe.

[0026] „Haloalkil“ se odnosi na C1-3alkil radikal supstituisan jednim ili više atoma halogena.

[0027] Termin „haloalkoksi“ se odnosi na C1-3alkoksi radikal supstituisan jednim ili više atoma halogena.

[0028] Hidroksi se odnosi na grupu -OH.

[0029] „Amino“ se ovde odnosi na grupu -NH2.

[0030] Termin alkilamino“ se ovde odnosi na grupu -NRR' gde su R i R' svaki nezavisno izabrani od vodonika ili C1-3alkil pod uslovom da je najmanje jedan od R i R' jednak C1-3alkil.

[0031] Termin „arilamino“ se ovde odnosi na grupu -NRR' pri čemu, R je C6-10aril, uključujući fenil, i R' je vodonik, C1-3alkil, ili C6-10aril, uključujući fenil.

[0032] Termin cikloalkil“ se odnosi na mono- ili policiklični, heterociklični ili karbociklični C3-8alkil supstituent. Tipični cikloalkil supstituenti imaju od 3 do 8 atoma osnovnog lanca (tj., prstena) u kojima je svaki atom u osnovnoj grupi ili ugljenik ili heteroatom. Termin „heterocikloalkil“ se ovde odnosi na cikloalkil supstituente koji imaju od 1 do 5, a tipičnije od 1 do 4 heteroatoma u prstenastoj strukturi. Pogodni heteroatomi koji se koriste u jedinjenjima ovog otkrića su azot, kiseonik i sumpor. Reprezentativni heterocikloalkil ostaci uključuju, na primer, morfolino, piperazinil, piperidinil i slično. Karbocikloalkil grupe su cikloalkil grupe u kojima su svi atomi prstena ugljenik. Kada se koristi u vezi sa cikloalkil supstituentima, termin „policiklični“ se ovde odnosi na kondenzovane i nekondenzovane ciklične alkil strukture. Termin „karbobiciklični ili karbobiciklil“ se odnosi na zasićeni ili delimično nezasićeni karbociklični prsten kondenzovan sa drugim karbocikličnim prstenom, aril prstenom, heterocikličnim prstenom ili heteroaril prstenom. Cikloalkil grupa je nesupstituisana ili supstituisana.

[0033] Termin „heterociklus“ ili „heterociklil“ obuhvata prstenove u kojima azot je heteroatom, kao i delimično i potpuno zasićene prstenove. Primeri heterociklusa uključuju, ali nisu ograničeni na, na primer: piperidinil, piperazinil, 1,2-oksazinan, 2-oksopiperazinil, 2-oksopiperidinil, N-metil piperazinil i morfolinil, svaki opciono supstituisan.

[0034] Heterociklični ostaci mogu biti nesupstituisani ili monosupstituisani ili disupstituisani različitim supstituentima nezavisno odabranim od hidroksi, halo, okso (C=O), alkilimino (RN=, pri čemu R je C1-3alkil ili C1-3alkoksi grupa), amino, C1-3alkilamino, C1-3dialkilamino, acilaminoalkil, C1-3alkoksi, C1-3alkil, cikloalkil ili C1-3haloalkil. Heterociklične grupe (heterociklil) mogu biti vezane na različitim položajima, što će biti očigledno onima koji su stručnjaci u oblasti organske i medicinske hemije u vezi sa ovim.

[0035] Termin „heteroaril“ se odnosi na 5-10-člani karbociklični sistem prstena, uključujući kondenzovane sisteme prstena, koji imaju 1 do 4 heteroatoma, svaki nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od: O, N i S. Navedeni heteroaril može biti opciono supstituisan sa jednim ili dva supstituenta. Termin „heteroaril“ se ovde takođe odnosi na C6-10aril grupe koje imaju od 1 do 4 heteroatoma kao atome prstena u aromatičnom prstenu, pri čemu su ostatak atoma prstena atomi ugljenika. Primeri supstituenata uključuju, ali nisu ograničeni na: halo, CN, C1-3alkil, C

1-3alkoksi, C1-3haloalkil, C1-3haloalkoksi, C3-7cikloalkil, i 4-7 člani heterociklil koji ima 1 ili 2 heteroatoma izabrana od N, O i S, pri čemu je pomenuti heterociklil opciono supstituisan sa 1 do 3 supstituenta, svaki nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od: halo, CN, C1-3alkil, C1-3alkoksi, C1-3haloalkil i C1-3haloalkoksi. Reprezentativne heteroaril grupe uključuju, na primer, one prikazane ispod. Reprezentativni heteroarili uključuju, na primer, imidazolil, piridinil (takođe se naziva spiridil), pirazinil, azetidinil, tiazolil, triazolil, benzimidazolil, benzotiazolil, tiazolil, tiazolidinil, izotiazolil, izotiazolil, indolil, hinolinil, izohinolinil, azetidinil, N-metilazetidinil, pirimidinil, piridazinil, oksazolil, oksazolidinil, izoksazolil, izoazolidinil, benzimidazolil, benzotiazolil, benzoksazolil, furil, tienil, triazolil, benzotienil diazapinil, piril, pirolinil, pirolidinil, pirazolil, pirazolinil, pirazolidinil, imidazoil, imidazolinil, imidazolidinil i benzoksazolil. Heteroaril je nesupstituisan ili supstituisan sa 1 do 3 supstituenta, svaki nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od: H,<2>H, halo, C2-3alkinil, C2-3alkenil, CN, C1-3alkil, C1-3alkoksi, C1-3haloalkil, C1-3haloalkoksi, C3-7cikloalkil, CONH2, CONHC1-3alkil, CONHC6-10aril, SO2NH2, SO2NHC1-3alkil, SO2NHC6-10aril i 4-7 člani heterociklil koji ima 1 do 3 heteroatoma izabrana od N, O i S, pri čemu je pomenuti heterociklil opciono supstituisan sa jednim ili dva supstituenta, svaki nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od: H,<2>H, halo, CN, C1-3alkila, C1-3alkoksi, C1-3haloalkila i C1-3haloalkoksi.

[0036] Termin „<2>H“ se odnosi na teški izotop vodonika koji se takođe naziva deuterijum (D). Podrazumeva se da gore navedene definicije nisu namenjene da uključe nedozvoljene obrasce supstitucije (npr., metil supstituisan sa pet fluoro grupa ili atom halogena supstituisan drugim atomom halogena).

[0037] Kako se ovde koristi, termin „inhibitor MEK“ odnosi se na inhibitor protein kinaze aktivirane mitogenom (MEK). Termin „inhibitor“ se odnosi na modulatorne molekule ili jedinjenja koja, npr., vezuju se za, delimično ili potpuno blokiraju aktivnost, smanjuju, sprečavaju, odlažu aktivaciju, inaktiviraju, desenzibilizuju ili snižavaju aktivnost ili ekspresiju MEK, mTOR ili CDKi. Reprezentativni inhibitori MEK uključuju trametinib, kobimetinib, binimetinib i selumetinib, kao i TAK733, PD-325901, CI-1040, PD 184352 i PD035901. Reprezentativni inhibitor mTor uključuje rapamicin. CDKi(inhibitori ciklin zavisne kinaze) uključuju ribociklib, palbociklib, abemaciklib, abernaciklib, ribociklib i trilaciklib.

[0038] Kako se ovde koristi, termin „inhibitor HDM2-p53“ odnosi se na inhibitore, regulatore ili modulatore humanog „double minute 2“ proteina, farmaceutske kompozicije koje sadrže jedinjenja i potencijalne postupke lečenja korišćenjem jedinjenja i kompozicija za potencijalno lečenje bolesti kao što su, na primer, kancer, bolesti koje uključuju abnormalnu ćelijsku proliferaciju i uključuju male molekule inhibitore HDM201 (siremaldin) i JNJ-26854165.

[0039] Kako se ovde koristi, termin „mutaciono opterećenje“ odnosi se na nivo, npr., broj, promene (npr., jedna ili više promena, npr., jedna ili više somatskih promena) po unapred odabranoj jedinici (npr., po megabazi) u unapred određenom skupu gena ili svim analiziranim genima (npr., u kodirajućim regionima unapred određenog skupa gena). Može se izmeriti mutaciono opterećenje, npr., na osnovu celog genoma ili egzoma, ili na osnovu podskupa genoma ili egzoma. U određenim primerima izvođenja, mutaciono opterećenje mereno na osnovu podskupa genoma ili egzoma može se ekstrapolirati da bi se odredilo mutaciono opterećenje celog genoma ili egzoma. Termini „opterećenje mutacijama“ i „mutaciono opterećenje“ se ovde koriste naizmenično. U kontekstu tumora, mutaciono opterećenje se ovde takođe naziva „mutaciono opterećenje tumora“, „opterećenje mutacijama tumora“ ili „TMB“.

[0040] Kako se ovde koristi, termin „BAP1“ odnosi se na gen proteina-1 povezanog sa BRCA1 (ubikvitin karboksi-terminalna hidrolaza; BAP1). Sekvence nukleinske kiseline i aminokiselinske sekvence BAP1 su poznate i javno dostupne (Genbank NM_004656.2, Genbank NP_004647.1). BAP1 je funkcionalno uključen u odgovor na oštećenje DNK, kao i u regulaciju apoptoze, starenja i ćelijskog ciklusa. Delecije i inaktivirajuće mutacije u BAP1 su ranije bile povezane sa tumorima dojke i pluća i, u skladu sa ulogom BAP1 kao supresora tumora, pokazano je da obnavljanje funkcije BAP1 suzbija rast ćelija i tumorigenost u ćelijskoj liniji kancera pluća mutantnog BAP1.

[0041] Kako se ovde koristi, „SF3B1“ se odnosi na gen koji kodira podjedinicu 1 faktora splajsinga 3b. Sekvence nukleinske kiseline i aminokiselinske sekvence SF3B1 su poznate i javno dostupne (NM_012433.3, Genbank NP_036565.2). Podjedinica 1 proteinskog kompleksa faktora splajsinga 3b igra brojne kritične uloge u mehanizmu splajsinga ćelije. Mutacije u SF3B1 utiču na sposobnost ćelije da konvertuje pre-iRNK, koja sadrži intronsku sekvencu, u zrelu iRNK.

[0042] Kako se ovde koristi, „E1F1AX“ odnosi se na gen koji kodira eukariotski faktor 1A inicijacije translacije vezan za X protein, koji igra ulogu u sintezi proteina. Sekvence nukleinske kiseline i aminokiselinske sekvence E1F1AX su poznate i javno dostupne (NM_001412.4, Genbank NP_001403.1). E1F1AX često mutira kod uvealnog melanoma.

[0043] Kako se ovde koristi, „TERT“ može se odnositi ili na gen koji kodira enzim telomeraznu reverznu transkriptazu (TERT) ili na sam enzim (tj. protein). TERT se odnosi na nukleoproteinski, ili enzimski, deo telomeraze. TERT geni su takođe nazvani geni „sve kraćih telomera“ ili „EST“. Mutacije u promotorskom regionu TERT su povezane sa kancerima, uključujući, ali ne ograničavajući se na, kancer štitne žlezde, kancer bešike i glioblastom. Nukleinske i aminokiselinske sekvence TERT su poznate i javno dostupne (NM_198253.2, Genbank NP_937983.2).

[0044] Kako se ovde koristi, „NRAS“ ili „homolog virusnog onkogena neuroblastoma RAS“ odnosi se na mali protein porodice GTPase Ras kodiran na hromozomu 1. Sekvence nukleinske kiseline i aminokiselinske sekvence NRAS su poznate i javno dostupne (NM_002524, Genbank NP_002515).

[0045] Kako se ovde koristi, „BRAF“ ili „homolog B virusnog onkogena v-Raf mišjeg sarkoma“ odnosi se na serin/treonin-specifičnu protein kinazu iz porodice Raf kinaza koja interaguje sa AKT1; CRaf, HRAS i YWHAB. Sekvence BRAF su dobro poznate u struci za brojne vrste, npr., humani BRAF (NM_004333, Genbank NP_004324). Varijacija(e) NRAS i/ili BRAF sekvence mogu biti tačkaste mutacije. U nekim primerima izvođenja, NRAS tačkasta mutacija može biti tačkasta mutacija koja rezultira jednom od sledećih promena aminokiselinskih ostataka: G12D; G12S; G13A; G13C; G13D; G12R; G13V; Q61H1; Q61K; Q61L; Q61R1; i Q61R2. U nekim primerima izvođenja, BRAF tačkasta mutacija može biti tačkasta mutacija koja rezultira jednom od sledećih promena aminokiselinskih ostataka: V600D TG/AT; V600E T/A; V600E TG/AA; i V600K GT/AA.

[0046] Kako se ovde koriste, termini „solidni tumori“ i „kanceri solidnih tumora“ mogu se koristiti naizmenično. Ovde je, na primer, dat postupak lečenja pacijenta koji ima neuvealni melanomski tumor ili nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema, koji sadrži: određivanje da li neuvealni melanom ili nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju koja aktivira PKC put; i oralno primenjivanje na pacijenta koji boluje od ne-uvealnog melanoma sa GNAQ ili GNA11 genetskom mutacijom farmaceutski efikasne količine inhibitora protein kinaze C, kao što je ovde opisan. Određivanje može da uključuje određivanje da li ne-uvealni melanom ili nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema ima GNAQ Q209, GNA11 Q209, GNAQ R183 ili GNA11 R183 genetsku mutaciju. Takve mutacije mogu biti prisutne, na primer, u predviđenom postupku lečenja ne-uvealnog melanomskog karcinoma ili ne-uvealnog melanomskog tumora ili nemelanocitnog tumora centralnog nervnog sistema izabranog iz grupe koja se sastoji od tumora pankreasa, tumora kolorektalnog karcinoma, adenokarcinoma pluća i kožnog melanoma, kod pacijenta kome je to potrebno.

[0047] Alternativno, određivanje može uključivati određivanje da li ne-uvealni melanom ili nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema ima mutaciju koja nije bilo koja od GNAQ Q209, GNA11 Q209, GNAQ R183 ili GNA11 R183 genetska mutacija, kao što je druga mutacija data ovde. Takve mutacije mogu biti prisutne kod ne-uvealnog melanomskog kancera ili neuvealnog melanomskog tumora ili ne-melanocitnog tumora centralnog nervnog sistema izabranog iz grupe koja se sastoji od kancera/tumora materice, želuca, grlića materice, bešike, hepatocelularnog karcinoma, kancera prostate, dojke, glave i vrata ili glioblastoma. Na primer, razmatrani postupci mogu se koristiti za lečenje pacijenata sa ne-uvealnim tumorom koji može imati drugačiju mutaciju u GNAQ ili GNA11 drugu Q209 ili R183 mutaciju koja npr. aktivira PKC put kod specifičnog kancera kao što je npr., kancer materice, želuca, grlića materice, bešike, hepatocelularni karcinom, kancer prostate, dojke, glave i vrata ili glioblastom.

[0048] Ovde je, u jednom primeru izvođenja, obezbeđen inhibitor PKC za upotrebu u postupku lečenja pacijenta koji ima ne-uvealni melanomski tumor ili ne-melanocitni tumor centralnog nervnog sistema, pri čemu postupak sadrži određivanje da li ne-uvealni melanom ili nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema ima GNAQ ili GNA11 mutaciju, npr., GNAQ Q209L ili GNA11 Q209L genetsku mutaciju; i oralno primenjivanje na pacijenta koji boluje od ne-uvealnog melanoma sa GNAQ ili GNA11 genetskom mutacijom farmaceutski efikasne količine inhibitora protein kinaze C. Takav ne-uvealni melanomski tumor ili ne-uvealni melanomski tumor ili nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema može uključivati tumor kancera pankreasa, tumor kancera želuca, tumor kolorektalnog kancera, tumor kancera grlića materice, adenokarcinom pluća i melanom kože, kancer materice, želuca, grlića materice, bešike, hepatocelularni karcinom, kancer prostate, dojke, glave i vrata ili glioblastom.

[0049] Na primer, inhibitor PKC za upotrebu u postupku lečenja karcinoma koji ima GNAQ ili GNA11 obezbeđena je genetska mutacija kod pacijenta kome je to potrebno, pri čemu je karcinom izabran iz grupe koja se sastoji od adenokarcinoma pankreasa, adenokarcinoma želuca, karcinoma grlića materice i adenokarcinoma pluća, pri čemu postupak sadrži određivanje da li karcinom ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju; i oralno primenjivanje na pacijenta koji ima karcinom sa GNAQ ili GNA11 genetskom mutacijom terapeutski efikasne količine inhibitora protein kinaze C.

[0050] U sledećem primeru izvođenja, obezbeđen je inhibitor PKC za upotrebu u postupku lečenja kancera solidnog tumora kod pacijenta kome je to potrebno, koji sadrži oralno primenjivanje efikasne količine inhibitora protein kinaze C na pacijenta, pri čemu je utvrđeno da pacijent ima GNAQ ili GNA11 genetsku tumorsku mutaciju, pri čemu kancer solidnog tumora je izabran od adenokarcinoma pankreasa, adenokarcinoma želuca, karcinoma grlića materice i adenokarcinoma pluća.

[0051] U nekim primerima izvođenja ovde opisanih postupaka, GNAQ ili GNA11 mutacija može biti bilo koja od brojnih mutacija, uključujući supstitucionu mutaciju, insercionu mutaciju i/ili delecionu mutaciju. U nekim primerima izvođenja, GNAQ ili GNA11 mutacija je mutacija dobitka funkcije. U nekim primerima izvođenja, GNAQ ili GNA11 mutacija je supstitucija glutamina u kodonu 209 (Q209) i/ili supstitucija arginina u kodonu R183. U nekim primerima izvođenja, GNAQ mutacija je jedna od Q209P, Q209L, Q209H, Q209K ili Q209Y. Takođe, kao što je gore navedeno, u nekim primerima izvođenja karcinom, kancer, solidni tumor ili neuvealni melanomski tumor ili nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema ima GNA11 mutaciju. Na primer, u ovde opisanim primerima izvođenja, GNA11 mutacija je jedna od Q209P, Q209L, Q209K ili Q209H. Na primer, u određenim primerima izvođenja, GNAQ ili GNA11 mutacija je Q209L. U nekim primerima izvođenja, GNAQ ili GNA11 mutacija je supstitucija arginina u kodonu R183. Na primer, u određenim primerima izvođenja, GNAQ mutacija je R183Q, ili GNA11 mutacija je R183C ili R183H. Alternativno, GNAQ ili GNA11 mutacija je na R256, L279, R166, A168, R210, R213, R166, A231, A342, D333, G171, R147, R73, T47, E191, E221, R149, T175, T379, T85, A86, E163, D195, E319, E191, E280, E49, P293, R300, R338, R60, D155, D205, D321, I226, R37, ili V240.

[0052] Određivanje da li pacijent (npr., karcinom ili tumor) ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju može uključivati identifikaciju GNAQ ili GNA11 mutacije u DNK ekstrahovanoj iz uzorka tumora i/ili u cirkulišućoj DNK tumora ili tumorskih ćelija.

[0053] Na primer, ovde je dat inhibitor PKC za upotrebu u postupku lečenja neuvealnog kancera solidnog tumora koji ima genetsku mutaciju GNAQ ili GNA11 kod pacijenta kome je to potrebno, pri čemu postupak sadrži: određivanje da li kancer solidnog tumora ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju; određivanje da li pacijent nema aktivirajuće BRAF ili NRAS mutacije (npr. nema BRAF V600 mutaciju); i oralno primenjivanje na pacijenta farmaceutski efikasne količine inhibitora protein kinaze C, bez aktiviranja BRAF ili NRAS mutacija. Takvi kanceri solidnog tumora mogu biti izabrani iz grupe koja se sastoji od kancera pankreasa, kancera želuca, kolorektalnog kancera, kancera grlića materice, adenokarcinoma pluća, kožnog melanoma, karcinoma materice, bešike, hepatocelularnog karcinoma, prostate, dojke, glave i vrata i glioblastoma.

[0054] U sledećem primeru izvođenja, obezbeđen je inhibitor PKC za upotrebu u postupku lečenja neuvealnog kancera solidnog tumora kod pacijenta kome je to potrebno, pri čemu pacijent u suštini ne reaguje na lečenje inhibitorom imunološke kontrolne tačke, što sadrži oralnu primenu na pacijenta farmaceutski efikasne količine inhibitora protein kinaze C, pri čemu je utvrđeno da pacijentov solidni tumor ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju.

[0055] Na primer, GNAQ ili GNA11 mutacija može biti supstitucija glutamina u kodonu 209 (Q209) ili pri čemu GNAQ ili GNA11 mutacija je supstitucija arginina u kodonu R183, i na primer, solidni tumor je jedan od melanoma kože, kolorektalnog karcinoma, adenokarcinoma pluća ili pankreasa. Alternativno, GNAQ ili GNA11 mutacija je drugačija od supstitucije glutamina u kodonu 209 (Q209) i drugačija od supstitucije arginina u kodonu R183, a solidni tumor može biti, npr., jedan od karcinoma materice, želuca, grlića materice, hepatocelularnog karcinoma, karcinoma prostate, dojke, glave i vrata ili glioblastoma.

[0056] Opisani postupci mogu da uključuju lečenje pacijenata sa niskim opterećenjem tumorskim mutacijama manjim od 10 mut/Mb, 11 mut/Mb, 12 mut/Mb, 13 mut/Mb, 14 mut/Mb, 15 mut/Mb, 16 mut/Mb, 17 mut/Mb, 18 mut/Mb, 19 mut/Mb ili 20 mut/Mb, na primer, nisko opterećenje tumorskim mutacijama u jednom ili više od BAP1, SF3B1, EIF1AX, TERT, BRAF, KRAS, i/ili NRAS. Na primer, pacijent može imati nisko opterećenje tumorskim mutacijama manje od 17 mut/Mb ili manje od 10 mut/Mb, na primer, pacijent može imati nisko opterećenje tumorskim mutacijama u genomu, npr., jedan ili više BAP1, SF3B1, EIF1AX i TERT. U određenim primerima izvođenja, predviđeni pacijenti možda nemaju aktivirajuće BRAF ili NRAS mutacije. U određenim primerima izvođenja, opisani postupci su usmereni na pacijente koji nemaju BRAF V600 mutaciju.

[0057] U drugim aspektima, ovo otkriće pruža inhibitor PKC za upotrebu u postupku za lečenje kancera sa mutacijama u GNAQ i/ili GNA11, na primer, aktiviranje GNAQ ili GNA11 mutacije, kod humanog ili životinjskog subjekta kod koga je prepoznata potreba za takvim lečenjem, koje sadrži primenu na pomenutog subjekta količine jedinjenja, na primer, jedinjenja formule (II), ili npr., jedinjenja predstavljenog formulom III koja je efikasna u inhibiranju aktivnosti PKC kod subjekta.

[0058] Ovde je, u jednom primeru izvođenja, obezbeđen inhibitor PKC za upotrebu u postupku lečenja pacijenta koji ima ne-uvealni melanomski tumor ili nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema, pri čemu postupak sadrži: određivanje da li ne-uvealni melanom ili nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema ima Q209L genetsku mutaciju ili ne-Q209 mutaciju, i oralno primenjivanje na pacijenta koji pati od ne-uvealnog melanomskog kancera sa GNAQ Q209L ili GNA11 Q209L genetskom mutacijom, ili ne-Q209 mutacijom, farmaceutski efikasne količine inhibitora protein kinaze C.

[0059] U drugim aspektima, ovo otkriće pruža inhibitor PKC za upotrebu u postupku za lečenje ne-uvealnog melanomskog tumora ili nemelanocitnog tumora centralnog nervnog sistema koji sadrži GNAQ ili GNA11 mutacije kod čoveka ili životinje kod koje je prepoznata potreba za takvim lečenjem. Postupak može da uključi oralno primenjivanje na subjekta terapeutski efikasne količine jedinjenja inhibitora PKC, na primer, jedinjenja formule (II) ili npr., jedinjenja predstavljenog formulom III.

[0060] U sledećem aspektu, ovo otkriće pruža inhibitor PKC za upotrebu u postupku lečenja pacijenta koji jeste ili je bio u suštini neodgovarajući na lečenje inhibitorom imunološke kontrolne tačke. Postupak može da uključuje oralno primenjivanje na takvog pacijenta terapeutski efikasne količine jedinjenja inhibitora PKC, na primer, jedinjenja formule (II). Inhibitori imunološke kontrolne tačke na koje pacijent jeste ili je bio neresponsivan mogu uključivati pembrolizumab, ipilimumab, nivolumab, cemiplimab, avelumab, durvalumab i atezolizumab. Gore pomenuti pacijent može biti pacijent koji jeste ili je bio neresponsivan na kurs lečenja inhibitorom imunološke kontrolne tačke od 1 meseca, 2 meseca, 3 meseca, 4 meseca, 5 meseci, 6 meseci, 1 godine ili duže od 1 godine. Na primer, takav pacijent nije i/ili nije bio responsivan na tromesečni kurs lečenja inhibitorom imunološke kontrolne tačke kao što su pembrolizumab, ipilimumab, nivolumab i/ili atezolizumab.

[0061] Na primer, ovde je opisan inhibitor PKC za upotrebu u postupku lečenja kancera kod pacijenta kome je to potrebno, pri čemu postupak uključuje: identifikaciju pacijenta kao pacijenta sa tumorom sa mutacijom koja uključuje supstituciju arginina u kodonu R183 u GNAQ ili GNA11; i oralnu primenu kompozicije koja sadrži jedinjenje predstavljeno formulom III, ili njegovu farmaceutski prihvatljivu so, na pacijenta; pri čemu je kancer izabran iz grupe koja se sastoji od tumora kancera pankreasa, tumora kancera želuca, tumora kolorektalnog karcinoma, tumora grlića materice, adenokarcinoma pluća i kožnog melanoma.

[0062] Opisani postupci mogu uključivati primenu inhibitora protein kinaze C kao monoterapije ili mogu dalje uključivati primenu terapeutski efikasne količine jednog ili više dodatnih terapeutskih sredstava kao što su inhibitor protein kinaze aktivirane mitogenom (MEK), inhibitor mTOR, inhibitor CDKi, inhibitor imunološke kontrolne tačke ili inhibitor HDM2-p53. Inhibitori MEK uključuju trametinib, kobimetinib, binimetinib i selumetinib. U nekim primerima izvođenja, postupci opisani ovde dalje uključuju primenu terapeutski efikasne količine inhibitora HDM2-p53.

[0063] Takođe je ovde dat inhibitor PKC za upotrebu u postupku lečenja kancera kod pacijenta kome je to potrebno, pri čemu navedeni postupak sadrži: identifikaciju pacijenta kao pacijenta sa tumorom sa mutacijom GNAQ ili GNA11; oralno primenjivanje na pacijenta kompozicije koja sadrži mali molekul inhibitor PKC, kao što je predstavljen u formuli III; pri čemu je kancer izabran iz grupe koja se sastoji od tumora kancera pankreasa, tumora kancera želuca, tumora kolorektalnog karcinoma, tumora grlića materice, adenokarcinoma pluća, kožnog melanoma, kolorektalnog kancera, kancera želuca, kancera bešike, hepatocelularnog karcinoma, kancera prostate, kancera dojke, kancera glave i vrata i glioblastoma.

Inhibitori PKC

[0064] Inhibitori PKC korisni u izvođenju ovog otkrića mogu inhibirati nekoliko izoformi PKC, npr., mogu inhibirati jednu ili više izoformi α, β-1, β2, γ, δ, ε, η, θ, ζ, ι. U posebnim primerima izvođenja opisanim ovde, predviđeni inhibitori PKC mogu inhibirati α i θ izoforme PKC, i/ili δ i/ili ε izoforme. Pogodni inhibitori PKC uključuju one koji su ovde opisani, ili mogu uključivati derivate maleimida kao što su bisindoilmaleimid, enzastaurin, stavrospoin, roboksistaurin, sotrastaurin, rotlerin i/ili midostaurin. U nekim primerima izvođenja, predviđeni inhibitor PKC je inhibitor protein kinaze C male molekulske veličine, koji se, na primer, može oralno primenjivati.

[0065] Na primer, inhibitori protein kinaze C (PKC) koji se ovde razmatraju mogu imati potenciju protiv jedne ili više PKC izoformi, uključujući, ali ne ograničavajući se na, jednu ili više od δ, ε, η, θ i/ili α PKC izoformi. Na primer, razmatrani inhibitor protein kinaze C za upotrebu u opisanim postupcima može biti inhibitor protein kinaze C male molekulske mase koji ima potenciju protiv višestrukih izoformi protein kinaze C. Na primer, razmatrani inhibitor protein kinaze C ovog otkrića ima potenciju protiv jedne ili više (npr.; jedne, dve, tri, četiri, pet, šest, sedam ili više) δ, ε, η, θ, β, γ, α izoformi protein kinaze C. Na primer, inhibitor protein kinaze C ovog otkrića može imati potenciju protiv dve ili više δ, ε, η, θ, β, γ ili α izoformi protein kinaze C. Inhibitor protein kinaze C, ovog otkrića, može, u jednom primeru izvođenja, imati potenciju protiv svake od δ, ε, η, θ, β, γ ili α izoformi protein kinaze C. U još jednom primeru izvođenja, inhibitor protein kinaze C ima IC50u odnosu na PKC θ/α i/ili PKC δ i/ili PKC ε izoforme manje od 50 nM. Na primer, u nekim primerima izvođenja, inhibitor PKC ima IC50u odnosu na svaku od PKC θ/α, PKC δ i/ili PKC ε izoformi nezavisno odabranih, manje od 100 nM, manje od 90 nM, manje od 80 nM, manje od 70 nM, manje od 60 nM, manje od 50 nM, manje od 40 nM, manje od 30 nM, manje od 20 nM, manje od 10 nM, manje od 5 nM ili u nekim primerima izvođenja, manje od 1 nM.

[0066] Primeri inhibitora PKC pogodnih za upotrebu sa ovim otkrićem uključuju one koji su ovde razmatrani, a mogu takođe uključivati stavrosporin, analog stavrosporina CPG41251, briostatin-1, KAI-9803, 7-hidroksistavrosporin, L-treo-dihidrosfingozin (safingol), AHT956 i AEB071, neselektivni inhibitor PKC (PKC412), ilmofozin (BM 41440), indolkarbazol Gö6796 koji je specifičniji inhibitor klasičnih izoformi PKC, uključujući PKCµ, antisens inhibitor PKC-alfa LY900003 i inhibitore PKC-beta LY333531, LY317615 (Enzastaurin). Primer antisens molekula pogodnog za upotrebu u depleciji PKC-alfa iRNK je 5'-GTTCTCGCTGGTGAGTTTCA-3'.

[0067] U skladu sa nekim aspektima ovog otkrića, razmatrani inhibitor PKC može biti predstavljen formulom (II):

pri čemu:

X je N ili CR;

R, R<2>, R<3>i R<4>su svaki nezavisno izabrani iz grupe koja se sastoji od H,<2>H, halogena, hidroksil (-OH), C1-3alkoksi i C1-3alkil; pri čemu C1-3alkoksi može opciono biti supstituisan sa jednim, dva, tri ili više halogena; i pri čemu C1-3alkil može opciono biti supstituisan sa jednim, dva, tri ili više supstituenata, svaki nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od hidroksila, halogena i C1-3alkoksi (opciono supstituisan jednim ili više halogena);

R<5>je izabran iz grupe koja se sastoji od -H,<2>H, CH3, CH2F, CHF2, CF3, CH2OH i C2-3alkila; pri čemu C2-3alkil može opciono biti supstituisan sa jednim, dva, tri ili više supstituenata, svaki nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od fluora, hidroksila i C1-3alkoksi (opciono supstituisan jednim ili više halogena);

R<5a>i R<5b>su svaki nezavisno izabrani iz grupe koja se sastoji od H,<2>H i C1-3alkila; pri čemu C1-

3alkil može opciono biti supstituisan sa jednim, dva, tri ili više supstituenata, svaki nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od fluora, hidroksila i C1-3alkoksi; ili R<5a>i R<5b>zajedno formiraju metilensku ili etilensku premošćujuću grupu;

R<5c>i R<5d>su svaki nezavisno izabrani iz grupe koja se sastoji od H,<2>H, F, - OH, C1-3alkoksi i C1-

3alkil; pri čemu C1-3alkil može opciono biti supstituisan sa jednim, dva, tri ili više supstituenata, svaki nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od fluora, hidroksila i C1-3alkoksi; ili R<5c>i R<5d>zajedno formiraju metilen, etilen ili -CH2-O- premošćujuću grupu;

R<6>, R<7>i R<8>su svaki nezavisno izabrani iz grupe koja se sastoji od H,<2>H, halogena, C1-3alkila, C1-3alkoksi, C3-7cikloalkila i 4-7 članog heterociklila sa jednim, dva ili tri heteroatoma, svaki nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od N, O i S; pri čemu C1-3alkoksi može opciono biti supstituisan sa jednim, dva, tri ili više halogena; i pri čemu C1-3alkil može opciono biti supstituisan sa jednim, dva, tri ili više supstituenata, svaki nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od hidroksila, halogena i C1-3alkoksi (opciono supstituisan jednim ili više halogena); ili pri čemu R<6>i R<8>opciono formiraju delimično nezasićeni karbobiciklični ili heterobiciklični prsten sa heteroaril prstenom za koji su vezani, pri čemu karbobiciklični ili heterobiciklični prsten može opciono biti supstituisan sa jednom, dve ili tri grupe, svaka nezavisno izabrana iz grupe koja se sastoji od<2>H, halogena, C1-3alkila, C1-3alkoksi, C3-7cikloalkila i heterociklila sa 4-7 članova koji ima jedan, dva ili tri heteroatoma, svaki nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od N, O i S; pri čemu C1-3alkil i C1-3alkoksi mogu opciono biti supstituisani sa jednim, dva, tri ili više halogena; ili

njegovim tautomerima, stereoizomerima ili farmaceutski prihvatljivim solima ili estrima.

[0068] Na primer, razmatrani inhibitori PKC mogu biti predstavljeni Formulom II pri čemu X je CR; R<2>, R<3>i R<4>su svaki H; R<5>je nezavisno H, CH3, CH2F, CHF2, CF3, CH2OH i CH2-O-C1-

3alkil; R<5a>i R<5b>su svaki H; R<5c>i R<5d>su svaki nezavisno H, F, C1-3alkil, ili C1-3alkoksi ili R<5c>i R<5d>su spojeni zajedno formirajući metilen, etilen ili -CH2-O- premošćujuću grupu; i R<6>i R<7>su svaki nezavisno izabrani od H, halo, C1-3haloalkila, C1-3haloalkoksi, C3-7cikloalkila, morfolino, piperinila i piperazinila.

[0069] Na primer, razmatrani inhibitor PKC može biti predstavljen formulom III:

ili njegovom farmaceutski prihvatljivom soli.

[0070] Može se razumeti da otkriveni postupci mogu uključivati primenu inhibitora PKC kao dela farmaceutskih kompozicija, na primer, mogu uključivati primenu jedinjenja inhibitora PKC, kao što su ona ovde otkrivena, u obliku jedinične doze. Farmaceutska kompozicija treba da bude formulisana tako da bude kompatibilna sa predviđenim putem primene, tj. oralnim putem.

Detekcija mutacija

[0071] Određivanje da li pacijent ima specifičnu mutaciju, na primer, GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju može uključivati prikupljanje i/ili analizu uzorka pacijenta. Uzorci pacijenata od interesa uključuju, na primer, tkivo karcinoma, tkivo kancera, tkivo solidnog tumora, tkivo tumora, telesno tkivo, krv, serum, plazmu ili telesnu tečnost, na primer, cirkulišuću krv koja sadrži tumorsku DNK, dobijenu od pacijenta. Uzorci pacijenata koji se koriste u ovde opisanom postupku mogu takođe uključivati uzorke tkiva kao što su, ali ne ograničavajući se na, gastrointestinalne, mukozne, submukozne, crevne, ezofagealne, ilealne, rektalne, cervikalne, kolonične, epidermalne, plućne, timusne, pankreasne, želudačne, rektalne, kožne, potkožne ili limfne uzorke. Uzorci takođe mogu uključivati ćelijske uzorke, na primer, uzorke ćelija kože. Prisustvo genetske mutacije od interesa u uzorku pacijenta može se utvrditi korišćenjem različitih testova. Na primer, u postupcima ovog otkrića, genetska mutacija u GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, NRAS, i/ili drugom genu ili DNK sekvenci mogu se odrediti analizom nukleotida, na primer, genetskim sekvenciranjem, pomoću Southern blotting, FISH, sekvenciranjem visokog protoka, fagnim prikazom, sekvenciranjem „shotgun“ metodom ili pomoću PCR, na primer, RT-PCR. Postupci sekvenciranja opisani ovde mogu koristiti DNK prajmer sekvence usmerene na specifične genske sekvence, na primer, gensku sekvencu GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, ili NRAS.

[0072] Prisustvo genetske mutacije kod pacijenta, na primer genetske mutaciju u GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF ili NRAS može se analizirati analizom genskih proizvoda gena od interesa, uključujući nivoe iRNK i proteina GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, ili NRAS gena. Na primer, u nekim primerima izvođenja, prisustvo jedne ili više genetskih mutacija se analizira analizom GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, ili NRAS proteina ili iRNK. Prisustvo jedne ili više genetskih mutacija u GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, ili NRAS identifikovanih na nivou proteina ili iRNK mogu se utvrditi korišćenjem različitih postupaka detekcije. Na primer, u nekim primerima izvođenja, prisustvo jedne ili više genetskih mutacija u GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, ili NRAS identifikovane na nivou proteina ili iRNK određuje se imunohistohemijom ili analizom nukleotida.

[0073] Pored toga, postupci ovog otkrića mogu takođe uključivati određivanje da li je genetska mutacija povezana sa genom koji nije GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, ili NRAS.

[0074] Postupci za određivanje prisustva jedne ili više genetskih mutacija u GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, ili NRAS uključuju, ali nisu ograničeni na, postupke analize transkripata iRNK analita kao što su metode lančane reakcije polimeraze, na primer, kvantitativne metode lančane reakcije polimeraze. Analiza nukleotida može se izvršiti korišćenjem oligonukleotidne sonde koja se vezuje za nukleotidnu sekvencu analita (npr., nukleotidna sekvenca GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, ili NRAS) ili par oligonukleotidnih prajmera sposobnih da amplifikuju nukleotidnu sekvencu analita putem lančane reakcije polimeraze, na primer, kvantitativnom lančanom reakcijom polimeraze. Oligonukleotidne sonde i oligonukleotidni prajmeri mogu biti povezani sa detektabilnim obeleživačem, kao što je, na primer, fluorescentni obeleživač. Prilikom određivanja prisustva jedne ili više genetskih mutacija u GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, ili NRAS analizom nukleotida, lekar može da proceni sastav ili koncentraciju iRNK transkripta određenog gena u uzorku.

[0075] Prisustvo jedne ili više genetskih mutacija u GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, ili NRAS kod pacijenta može se utvrditi dobijanjem uzorka od pacijenta. Na primer, u nekim primerima izvođenja, prisustvo jedne ili više genetskih mutacija u GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, i/ili NRAS kod pacijenta se određuje u uzorku dobijenom od pacijenta. U nekim primerima izvođenja, uzorak je uzorak krvi, seruma, plazme, tumora ili tkiva. Prema ovde opisanim postupcima, uzorak može biti uzorak tkiva (npr., uzorak crevnog tkiva, uzorak tkiva dvanaestopalačnog creva, uzorak tkiva jejunuma, uzorak želuca, uzorak tkiva pankreasa, uzorak tkiva pluća, uzorak gastrointestinalnog tkiva, uzorak tkiva rektuma, uzorak tkiva debelog creva ili uzorak tkiva grlića materice), uzorak tumora (na primer, uzorak karcinoma, uzorak solidnog tumora ili uzorak telesne tečnosti koji sadrži DNK tumora) ili uzorak telesne tečnosti (npr., uzorak pljuvačke, stolice ili uzorak urina). Uzorak može biti uzorak dobijen iz biopsije tkiva pacijenta, na primer, biopsije tkiva sluzokože, na primer, biopsije tkiva crevne sluzokože, na primer biopsije tkiva sluzokože tankog creva. Pored toga, uzorak može biti uzorak krvi, seruma ili plazme. Uzorak krvi od subjekta može se dobiti korišćenjem tehnika dobro poznatih u struci. Uzorci krvi mogu uključivati mononuklearne ćelije periferne krvi (PBMC), punu krv sa smanjenim brojem eritrocita ili krvni serum. PBMC se mogu odvojiti od uzoraka pune krvi korišćenjem različitih postupaka centrifugiranja sa gradijentom gustine (npr., Ficoll gradijent gustine). Na primer, puna krv (npr., antikoagulisana puna krv) se nanosi preko medijuma za razdvajanje i centrifugira. Na kraju koraka centrifugiranja, sledeći slojevi se vizuelno posmatraju odozgo nadole: plazma/trombociti, PBMC, medijum za razdvajanje i eritrociti/granulociti.

[0076] Postupci prema otkriću za koji se traži zaštita uključuju korake koji se mogu izvršiti in vitro. Na primer, smatra se da koraci prisustva jedne ili više genetskih mutacija u GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, i/ili NRAS kod subjekta mogu uključivati određivanje prisustva jedne ili više genetskih mutacija u GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, i/ili NRAS u uzorku. Na primer, prisustvo jedne ili više genetskih mutacija u GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, i/ili NRAS u uzorku može se odrediti izvođenjem analize nukleotida na uzorku in vitro. Alternativno, u nekim primerima izvođenja ovog otkrića, koraci određivanja i analize prisustva jedne ili više genetskih mutacija u GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, i/ili NRAS kod pacijenta se mogu izvršiti in vivo.

[0077] Postupci opisani ovde predviđaju identifikaciju prisustva jedne ili više genetskih mutacija u npr., GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, i/ili NRAS analizom pacijenta ili uzorka od pacijenta, na primer, uzorka tumora, krvi ili tkiva od pacijenta. Analiziranje pacijenta ili uzorka od pacijenta, na primer, uzorka tumora, krvi ili tkiva od pacijenta, može uključivati sakupljanje, prečišćavanje i/ili ekstrakciju DNK od pacijenta ili uzorka. Tehnike sakupljanja, prečišćavanja i ekstrakcije DNK su dobro poznate stručnjacima u ovoj oblasti. Generalno, ekstrakcija DNK zahteva sakupljanje ćelija koje sadrže DNK za analizu i razbijanje ćelijskih membrana da bi se otkrila DNK. Ekstrakcija DNK može da podrazumeva korake tretmana koncentrovanim rastvorom soli, centrifugiranja da bi se DNK odvojila od drugih ćelijskih komponenti i prečišćavanja DNK korišćenjem, na primer, etanolskog taloženja, ekstrakcije fenol-hloroformom i/ili prečišćavanja mini-kolonom. Uobičajeni postupci ekstrakcije DNK uključuju organsku ekstrakciju, Chelex ekstrakciju i ekstrakciju čvrste faze. Prečišćavanje DNK može uključivati sakupljanje uzorka krvi za analizu prisustva cirkulišućih tumorskih ćelija ili slobodne DNK iz tumorskih ćelija. Kompleti dostupni za sakupljanje tumorske DNK bez ćelija uključuju MagNA Pure Compact (MPC) Nucleic Acid Isolation Kit I, Maxwell<®>RSC (MR) ccfDNA plazma komplet i QIAamp komplet za cirkulišuće nukleinske kiseline (QCNA).

[0078] Prisustvo jedne ili više genetskih mutacija u GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, i/ili NRAS može se postići, na primer, korišćenjem bilo kog postupka poznatog u struci. Generalno, prisustvo se detektuje u uzorku uzetom od pacijenta.

Identifikacija prisustva genetske mutacije kod pacijenta može se postići korišćenjem standardnih tehnika, uključujući tehnike zasnovane na hibridizaciji, tehnike sekvenciranja i tehnike zasnovane na nizovima.

[0079] Određivanje prisustva jedne ili više genetskih mutacija u GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, i/ili NRAS može se detektovati u bilo kom biološkom uzorku i može biti bilo koji uzorak dobijen od pacijenta ili ispitanika koji sadrži nukleinsku kiselinu (npr., genomska DNK ili RNK) koja kodira GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, i/ili NRAS. Primeri uzoraka uključuju biopsiju tkiva, ćelije, telesne tečnosti (npr., krv, serum, plazma, sperma, urin, pljuvačka, amnionska tečnost ili cerebrospinalna tečnost).

[0080] Jednom dobijeno, prisustvo jedne ili više genetskih mutacija u GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, i/ili NRAS može se detektovati korišćenjem bilo kog odgovarajućeg postupka. U nekim primerima izvođenja koristi se hibridizacioni pristup. Hibridizacioni pristupi uključuju dinamičku alel-specifičnu hibridizaciju (Howell et al., Nat. Biotechnol. 17:87, 1999). Ovaj pristup se oslanja na različite temperature topljenja između sekvence koja sadrži polimorfizam u poređenju sa sekvencom bez polimorfizma. Ukratko, DNK region od interesa se amplifikuje pomoću PCR korišćenjem biotinilovanog prajmera. Dobijeni PCR proizvod se vezuje za streptavidinski nosač i hibridizuje se sa alel-specifičnom sondom u prisustvu fluorescentnog molekula koji vezuje DNK dupleks. Dupleks se zagreva, a temperatura na kojoj dupleks denaturiše se određuje na osnovu gubitka fluorescencije. Temperatura denaturacije je odlučujuća za prisustvo ili odsustvo polimorfizma ili mutacije.

[0081] Još jedan hibridizacioni pristup za identifikaciju prisustva SNP je upotreba nizova nukleinskih kiselina dizajniranih za ovu svrhu. Na primer, nizovi dizajnirani za detekciju jedne ili više genetskih mutacija u GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, i/ili NRAS mogu se koristiti za otkrivanje prisustva genetskih mutacija u uzorcima uzetim od pacijenta.

[0082] U nekim primerima izvođenja, prisustvo jedne ili više genetskih mutacija u GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, ili NRAS može se odrediti izvođenjem „nukleotidne analize“. Nukleotidna analiza može da uključi analizu nivoa transkripata nukleotida analita (npr., nivoi transkripta GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, ili NRAS iRNK) u uzorku, na primer, uzorku krvi. Nivoi transkripta analita mogu se odrediti Nortern blotom, na primer, kvantitativnim Nortern blotom; ili lančanom reakcijom polimeraze, na primer, kvantitativnom lančanom reakcijom polimeraze. Reagensi neophodni za izvođenje Nortern blota uključuju oligonukleotidne sonde, na primer, oligonukleotidne sonde povezane sa detektabilnim obeleživačem. Nukleotidna analiza može uključivati analizu za određivanje gena i/ili iRNK sekvence gena od interesa (npr., GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, ili NRAS). Postupci određivanja genetske sekvence uključuju PCR, sekvenciranje RNK, RNK-sekvenciranje, ChIP-sekvenciranje, sekvenciranje masivnih paralelnih potpisa (MPSS), nanoporno sekvenciranje DNK, Polony sekvenciranje, pirosekvenciranje 454 (454 Life Sciences), Illumina (Solexa) sekvenciranje, sekvenciranje pojedinačnih molekula u realnom vremenu (SMRT) (Pacific Biosciences), kombinatornu sintezu sidra sonde (cPAS), SOLiD sekvenciranje (Applied Biosystems), sekvenciranje poluprovodnika Ion Torrent (Ion Torrent Sequencing; Life Technologies), sekvenciranje DNK nanolopti, sekvenciranje pojedinačnih molekula Heliscope, fagni prikaz, de novo sekvenciranje, most PCR, Sautern bloting, sekvenciranje DNK metodom „shotgun“ i sekvenciranje DNK visokog protoka. Detektabilni obeleživači mogu uključivati fluorescentne obeleživače ili enzime sposobne da reaguju sa specifičnim supstratom. Reagensi neophodni za izvođenje lančane reakcije polimeraze uključuju oligonukleotidne prajmere sposobne da se specifično vežu za određeni transkript iRNK analita i da amplifikuju broj transkripata iRNK analita pomoću lančane reakcije polimeraze. Oligonukleotidni prajmeri mogu biti povezani sa detektabilnim obeleživačem kako bi se omogućila, na primer, kvantitativna lančana reakcija polimeraze. Drugi reagensi neophodni za izvođenje kvantitativne lančane reakcije polimeraze uključuju, ali nisu ograničeni na, prajmere sposobne da amplifikuju signal kontrolnog transkripta, na primer, signal transkripta beta tubulina. Puferi, reagensi (uključujući oligonukleotidne prajmere i sonde), tehnike i oprema neophodna za izvođenje postupaka sekvenciranja nukleotida opisanih ovde su lako dostupni i dobro poznati u struci.

[0083] Postupci opisani ovde uključuju, u nekim primerima izvođenja, određivanje da li kancer, tumor ili karcinom ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju i/ili GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, ili NRAS genetsku mutaciju, postupke kod kojih je utvrđeno da pacijent ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju tumora i/ili GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, ili NRAS genetsku mutaciju, postupke lečenja kancera, na primer, kancera solidnog tumora koji ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju i/ili GNAQ, GNA11, BAP1, SF3B1, EIF1AX, CDKN2A, TERT, BRAF, ili NRAS genetsku mutaciju kod pacijenta i identifikovanje pacijenta kao pacijenta sa tumorom sa mutacijom koja uključuje specifičnu genetsku mutaciju, na primer, supstituciju arginina u kodonu R183 u GNAQ ili GNA11. Genetske mutacije mogu obuhvatati bilo šta od sledećeg: insercione mutacije, supstitucione mutacije, delecione mutacije, mutacije sa dobitkom funkcije, mutacije sa gubitkom funkcije i nesinonimne mutacije. Inserciona mutacija je dodavanje jednog ili više parova baza nukleotida u DNK sekvencu. Supstituciona mutacija može biti uzrokovana hemikalijama ili neispravnošću replikacije DNK i uključuje zamenu jednog nukleotida za drugi. Deleciona mutacija uklanja jedan ili više nukleotida iz DNK i može promeniti okvir čitanja gena. Mutacija sa dobitkom funkcije rezultira izmenjenim genskim proizvodom koji poseduje novu molekularnu funkciju ili novi obrazac ekspresije gena. Mutacija sa gubitkom funkcije proizvodi izmenjeni genski proizvod kojem nedostaje molekularna funkcija ekvivalentnog gena divljeg tipa. Nesinonimna je genetska mutacija koja menja rezultujuću aminokiselinu koju kodira gen.

[0084] Nakon što je sada opšte opisano, biće lakše razumeti pozivanjem na sledeće primere koji su uključeni samo u svrhu ilustracije određenih aspekata i primera izvođenja ovog otkrića i nisu namenjeni da na bilo koji način ograniče otkriće.

PRIMERI

[0085] Sledeći primeri su samo ilustrativni i nisu namenjeni da na bilo koji način ograniče obim ili sadržaj ovog otkrića.

Primer 1 - Identifikacija mutacija u bilo kom od GNAQ ili GNA11

[0086] Učestalost svih promena na GNAQ i GNA11 u različitim tipovima tumora određena je korišćenjem tri skupa podataka zasnovana na kanceru/tumoru: The Cancer Genome Atlas (TCGA), Genomics Evidence Neoplasia Information Exchange (Genie) i Memorial Sloan Kettering-Integrated Mutation Profiling of Actionable Cancer Targets (MSK-Impact). Broj uzoraka tumora procenjenih u svakom skupu podataka uključivao je 9136 uzoraka tumora iz TCGA, 48451 uzorak tumora iz Genie i 10949 uzoraka tumora iz MSK-Impact. Mnoge GNAQ i GNA11 promene su identifikovane, uključujući aktivirajuće mutacije na Q209 i R183 -mutacije dobitka funkcije koje daju zavisnost od nishodne PKC signalizacije. Da bi se ove mutacije rangirale za nishodnu validaciju i da bi se procenila prevalencija ponovnog pojavljivanja aminokiselina koje su nastale usled misens mutacija u svim uzorcima, izvršena je analiza odnosa tipova mutacija. Analiza odnosa sinonimnih i nesinonimnih je izvršena korišćenjem TCGA i Genie skupova podataka.

[0087] Ova analiza rangiranja dovela je do identifikacije 294 mutacije koje nisu mutacije na Q209 ili R183, u bilo kom od GNAQ ili GNA11 i sa kombinovanom prevalencijom u uzorcima tumora u sva tri skupa podataka u rasponu od 1 do 8 ukupnih uzoraka po mutaciji. Dok je identifikovano 139 mutacija (osim mutacija Q209 ili R183) za GNAQ, ukupno je identifikovano 155 mutacija za GNA11 koje nisu Q209/R183, barem neke od njih mogu biti aktivirajuće mutacije koje daju zavisnost od nishodne PKC signalizacije.

[0088] Nakon dodatne analize, identifikovano je 38 drugih mutacija koje nisu Q209/R183 u GNAQ ili GNA11 sa prevalencijom od 3 ili više uzoraka u sva tri skupa podataka. Ove druge mutacije pokazuju obogaćivanje kod kolorektalnog, plućnog, endometrijalnog i kancera bešike, zajedno sa melanomom i gliomom. Ove mutacije su navedene u Tabeli 1. Ovi rezultati pokazuju obogaćivanje drugih mutacija u GNAQ ili GNA11 kod određenih neuvealnih oblika kancera, npr., kolorektalnog, nesitnoćelijskog kancera pluća, kancera pankreasa.

a)]inisel okin m (A A

a);A m

geno gano

hum a cijiza anrg (O O G

U

- H i1 bel Tau e ćenriškoice enraćSk .[ija utacmiza nal 1.A ael Tab

[0089] Analiza je sprovedena korišćenjem cBioPortal (kombinovane studije koje obuhvataju ukupno 72175 uzoraka). Tabela 2 prikazuje broj pacijenata sa vrstom kancera i vrstom mutacije (npr., GNAQ Q209 mutacija ili mutacija koja nije Q209).

Tabela 2: Rezime analize cBioPortal. [Skraćenice korišćene u Tabeli 2: n = broj uzoraka povezanih sa vrstom kancera; HCC = hepatocelularni karcinom; GBM = glioblastom]

Primer 2 - Strukturna analiza mutacija u bilo kom od GNAQ ili GNA11

[0090] Trodimenzionalne koordinate su preuzete za mišji Galpha-q (R183C) protein u kompleksu sa G proteinskom signalizacijom 2 (RGS2) iz RCSB banke podataka proteina. Protein je pripremljen dodavanjem vodonika i podešavanjem stanja protonacije jonizabilnih grupa korišćenjem alata za pripremu proteina i epik u okviru Maestro 2018-3. Nakon toga je usledila ograničena minimizacija kako bi se teški atomi konvergirali do RMSD od 0,3 Å. Aktivirajuće mutacije koje daju zavisnost od nishodne PKC signalizacije su mapirane na protein, a vizuelni pregled je otkrio ostatke u kontaktu sa mestom vezivanja GDP, kao i sekundarne ostatke koji direktno interaguju sa strukturnim motivima uključenim u vezivanje za GTP. Model homologije humanog GNA11 (GenBank: CAG33285.1) je izgrađen korišćenjem kristalne strukture humanog regulatora G proteinske signalizacije 2 (RGS2) u kompleksu sa mišjim Galpha-q(R183C) (4EKC) kao proteinom-matricom. Prime 5.3 je korišćen za izgradnju modela jednog šablona, jednog lanca sa ligandom GDP iz 4EKD. Pozicije bočnih lanaca su predviđene za nekonzervirane ostatke mutacijom ostatka proteinskog šablona do željenog identiteta. Nakon toga, zadržan je prvi rotomer niske energije koji nije proizveo sudar. Nakon toga je usledila optimizacija svih atoma koji nisu šablon korišćenjem uzorkovanja ugla veze Ca-Cb i minimizacije korišćenjem silovog polja OPLS3e u VSGB modelu solvatacije za sve ostatke. Ograničena minimizacija korišćenjem Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shanno metode za konvergenciju teških atoma do RMSD (srednje kvadratno odstupanje i mera za procenu strukturne sličnosti između dva makromolekula) od 0,3 Å. Aktivirajuće mutacije koje daju zavisnost od nishodne PKC signalizacije su mapirane na protein kao što je prikazano na SLICI 1 i SLICI 2 i vizuelnim pregledom otkriveni su ostaci u kontaktu sa mestom vezivanja GDP-a, kao i sekundarni ostaci koji direktno interaguju sa strukturnim motivima uključenim u vezivanje za GTP. Ovi podaci ukazuju na to da mutacije (uključujući mutacije koje nisu Q209 ili R183), povezane sa GNAQ i GNA11 kod neuvealnih oblika kancera utiču na funkciju G proteina.

Primer 3 - Studija inhibitora protein kinaze C (IDE196) za lečenje pacijenata sa solidnim tumorima koji sadrže GNAQ/11 mutacije

[0091] Ovaj primer opisuje studiju faze 1/2 jedinjenja formule (III) iznad, („IDE196“), kod pacijenata sa solidnim tumorima koji sadrže GNAQ/11 mutacije. Studija se sastoji od dve faze: faze eskalacije doze, nakon čega sledi faza ekspanzije doze.

1. Ciljevi studije

[0092]

I. Primarni ciljevi: Slede glavni ciljevi ove studije:

- Evaluacija bezbednosnog profila IDE196 kod uključenih pacijenata (eskalacija doze u fazi 1);

- Identifikacija maksimalne tolerisane doze (MTD) i/ili preporučene doze faze 2 (RP2D) (eskalacija doze faze 1);

- Karakterizacija farmakokinetskog (PK) profila IDE196 primenjenog kao prah u kapsulama (PIC) ili tableta (eskalacija doze u fazi 1)

II. Sekundarni ciljevi: Slede sekundarni ciljevi ove studije:

- Evaluacija antitumorske aktivnosti IDE196 kod svih pacijenata;

- Evaluacija antitumorske aktivnosti IDE196 kod pacijenata sa nemetastatskim uvealnim melanomom (ne-MUM) kako je utvrdio istraživač (INV);

- Evaluacija sveobuhvatne bezbednosti i podnošljivosti IDE196 za sve pacijente;

- Procena farmakodinamskog (PD) efekta IDE196 kod svih pacijenata.

III. Istraživački ciljevi: Slede istraživački ciljevi ove studije:

- Karakterizacija preliminarne antitumorske aktivnosti IDE196 kod svih pacijenata; - Istraživanje bilo kakve korelacije genetskih i molekularnih profila tumora i odgovora na IDE196 kod svih pacijenata;

- Istraživanje bilo kakve povezanosti PD efekta u DNK dobijenoj iz krvi ili tumora sa kliničkim odgovorom.

2. Krajnje tačke studije

[0093]

I. Primarni krajnji ciljevi: Slede primarni krajnji ciljevi ove studije:

- Učestalost neželjenih događaja (AE) 3. ili 4. stadijuma i klinički značajnih laboratorijskih abnormalnosti definisanih kao toksičnosti koje ograničavaju dozu (DLT) (takođe razmotreno kasnije u Odeljku 4);

- PK parametri:

∘ Površina ispod krive (AUC) od vremena nula do vremena t (AUC0-t), definisana kao AUC izračunata od 0 do određenih vremenskih tačaka (količina x vreme x zapremina<-1>), na primer, 8, 24, 48, 168 sati ili beskonačno.

∘ AUC od vremena nula do beskonačnosti (AUC0-∞ili AUCinf), definisana kao površina ispod krive koncentracija-vreme od 0 do beskonačnosti [masa x vreme x zapremina<-1>].

∘ AUC tokom intervala doziranja (AUCtau), definisana kao površina ispod krive koncentracija-vreme od vremena 0 do kraja intervala doziranja tau.

∘ Maksimalna koncentracija (Cmax), definisana kao maksimalna zabeležena koncentracija u plazmi nakon primene leka [masa x zapremina<-1>].

∘ Vreme do maksimalne koncentracije (Tmax), definisano kao vreme potrebno za dostizanje Cmax[vreme].

∘ Poluživot eliminacije (T1⁄2), definisan kao poluživot eliminacije povezan sa terminalnim nagibom (lambda z) polulogaritamske krive koncentracija-vreme [vreme].

∘ Prividni volumen distribucije u stabilnom stanju nakon primene (Vss/F). ∘ Prividni ukupni plazma klirens (CL/F).

- Slepi nezavisni centralni prikaz (BICR) - određena objektivna stopa odgovora (ORR) prema kriterijumima za procenu odgovora kod solidnih tumora (RECIST) verzija 1.1 (v1.1).

II. Sekundarni krajnji ciljevi: Slede sekundarni krajnji ciljevi ove studije:

- objektivna stopa odgovora (ORR) određena pomoću BICR i INV prema RECIST v1.1; - Trajanje odgovora (DOR) utvrđeno pomoću BICR prema RECIST verziji 1.1;

- ORR, DOR određeni pomoću INV prema RECIST v1.1;

- Stopa kontrole bolesti određena pomoću BICR i INV koja traje ≥ 6 meseci (DCR6) prema RECIST v1.1;

- Učestalost neželjenih događaja i klinički značajnih laboratorijskih abnormalnosti; - Modulacija signalnih proteina u PKC putu, npr. PKC-delta.

III. Istraživačke krajnje tačke: Slede istraživačke krajnje tačke ove studije:

- Preživljavanje bez progresije (PFS) prema RECIST v1.1 i ukupno preživljavanje (OS); - Eksplorativna procena genskih potpisa i/ili molekularnog profilisanja i ORR prema RECIST v1.1;

- Eksplorativna procena promena povezanih sa lečenjem u tumorskom tkivu ili slobodnoj DNK iz krvi i ORR prema RECIST v1.1.

3. Dizajn studije

[0094] Ovo je studija faze 1/2, multicentrična, otvorena, sa eskalacijom i ekspanzijom doze IDE196 kod pacijenata sa solidnim tumorima koji sadrže GNAQ/11 mutacije. Šematski dijagram studije je opisan na SLICI 3.

[0095] I. Faza I Eskalacija doze: Standardna 3+3 metodologija se koristi za početak dela studije sa povećanjem doze IDE196. Za povećanje doze, procenjuje se da postoje tri do pet kohorti, sa najmanje tri pacijenta sa metastatskim uvealnim melanomom (MUM), a do 6, uključenih u svaku kohortu. Kada nivo doze zadovolji kriterijume posmatranja DLT (o kojima se govori u Odeljku 4), pacijenti sa tumorima koji nisu MUM i koji nose GNAQ/11 žarišne mutacije se uključuju na tom nivou doze, doprinoseći procenama bezbednosti i efikasnosti, ali ne i proceni DLT. Svaki ciklus lečenja obuhvata kontinuirano doziranje tokom 28 dana. Sva povećanja doze zasnivaju se na proceni DLT, ukupne bezbednosti i podnošljivosti i PK koje se javljaju sa svakom kohortom, i dogovoreni su između istraživača i sponzora. Povećanje doze može se nastaviti ako 0 od 3 ili najviše 1 od 6 pacijenata doživi DLT tokom perioda procene DLT u ciklusu 1, dani 1 - 28.

[0096] Preporučena doza faze 2 (RP2D) može se odabrati na osnovu jednog ili više sledećih faktora: (1) maksimalno tolerisana doza (MTD), definisana kao maksimalna dnevna oralna doza pri kojoj ne više od 1 od 6 pacijenata (<33%) doživi DLT tokom 1. ciklusa (period procene bezbednosti i PK). Ako se DLT primeti kod jednog od tri pacijenta, tada se upisuju još tri pacijenta na istom nivou doze. Eskalacija doze se nastavlja dok dva ili više od tri do šest pacijenata lečenih na istom nivou doze ne dožive DLT. Sledeća niža doza se tada smatra MTD; (2) maksimalno primenjena doza (MAD), ako se ne identifikuje MTD; (3) anti-tumorski, PK i/ili PD rezultati; i/ili (4) pojava, priroda i težina toksičnosti koje se javljaju nakon 1. ciklusa.

II. Faza 2. Ekspanzija doze: Kada se uspostavi RP2D,

[0097]

A. GNAQ/11- kohorte tumora sa mutacijama žarišta: Lečenje IDE196 je pokazalo preliminarnu antitumorsku aktivnost kod pacijenata sa MUM. Uključeno je do 24 pacijenta sa a) melanomom kože ili b) kolorektalnim kancerom (CRC) koji sadrži GNAQ/11 mutacije žarišta. Mutacije se definišu kao „žarišta“ na osnovu njihove značajno veće učestalosti pojavljivanja u poređenju sa pozadinom i ne ukazuju na to da li se genski proizvod aktivira. Uključeni su pacijenti sa melanomom kože ili CRC tumorima koji sadrže mutacije u kodonima Q209 ili R183 gena GNAQ ili GNA11, što je utvrđeno lokalnim testiranjem u laboratoriji koju je sertifikovao Koledž američkih patologa (CAP)/sertifikovan putem Amandmana za poboljšanje kliničke laboratorije (CLIA). Nezavisno centralno testiranje se sprovodi retrospektivno radi potvrde GNAQ/11 mutacije na tumoru i uzorcima krvi.

B. Drugi tumori sa GNAQ/11-mutacijama žarišta: Uključeni su pacijenti sa drugim solidnim tumorima (isključujući MUM, melanom kože i CRC) koji sadrže GNAQ/11 mutacije žarišta u kodonima Q209 ili R183 GNAQ ili GNA11, utvrđene lokalnim testiranjem u CAP/CLIA sertifikovanoj laboratoriji. Nezavisno centralno testiranje se sprovodi retrospektivno radi potvrde. GNAQ/11 mutacija na tumoru i uzorcima krvi. Ukupno je u ovu kohortu uključeno do 10 podobnih pacijenata.

4. Toksičnosti koje ograničavaju dozu (DLT)

[0098] Toksičnost koja ograničava dozu (DLT) definiše se kao neželjeni događaj stepena 3 ili više povezan sa lekom (ili barem moguće povezan) ili abnormalna laboratorijska vrednost procenjena kao nepovezana sa bolešću, progresijom bolesti, interkurentnom bolešću ili istovremenim lekovima, koja se javlja u prvom ciklusu ispitivanog leka sa IDE196 i ispunjava bilo koji od kriterijuma navedenih u nastavku:

Hematologija:

[0099]

- Neutropenija ≥ stadijuma 4 tokom > 7 uzastopnih dana;

- febrilna neutropenija ≥ stadijuma 3 (definisana kao apsolutni broj neutrofila [ANC] < 1000 mm<3>, sa jednom temperaturom od 38,3 °C (101 °F) ili kontinuiranom temperaturom od 38,0 °C (100,4 °F) tokom > 1 sata;

- trombocitopenija stadijuma 4;

- trombocitopenija stadijuma 3 povezana sa krvarenjem stadijuma ≥ 2.

Hepatični:

[0100] Za pacijente sa normalnim početnim vrednostima aspartat aminotransferaze (AST) i alanin aminotransferaze (ALT) i ukupnog bilirubina:

∘ AST ili ALT > 3 x gornja granica normale (ULN), u kombinaciji sa ukupnim bilirubinom > 2 x ULN i bez dokaza o holestazi (po ALP < 2 x ULN), i bez utvrđenog drugog uzroka.

- Za pacijente sa abnormalnim početnim vrednostima AST i ALT i ukupnog bilirubina:

∘ [AST ili ALT > 2 x početna vrednost I > 3 x ULN] ILI [AST ili ALT > 8 x ULN], šta god je niže, u kombinaciji sa [ukupni bilirubin > 2 x početna vrednost I > 2 x ULN].

- direktan bilirubin ≥ stadijuma 3 (> 3 x ULN);

- direktni bilirubin ≥ stadijuma 2 i ≥ stadijum 2 ALT prema Zajedničkim kriterijumima terminologije za neželjene događaje (CTCAE).

Druge nehematološke toksičnosti:

[0101]

- bilo koja nehematološka toksičnost ≥ stadijuma 4;

- bilo koja nehematološka toksičnost ≥ stadijuma 3 koja traje > 3 dana uprkos optimalnoj suportivnoj nezi, osim izuzetaka navedenih pod Izuzeci od kriterijuma DLT;

- bilo koja nehematološka laboratorijska vrednost ≥ stadijuma 3 koja je simptomatska i perzistira tokom > 3 dana, osim izuzetaka navedenih pod Izuzeci od DLT kriterijuma.

[0102] Izuzeci od DLT kriterijuma:

- Umor stadijuma 3 po CTCAE koji traje ≤ 7 dana;

- Laboratorijske abnormalnosti stadijuma 3 po CTCAE koje su responsivne na oralnu suplementaciju u roku od 7 dana ili koje istraživač smatra klinički beznačajnim;

- Limfopenija stadijuma 3 ili 4 prema CTCAE, osim ako se ne proceni kao klinički značajna;

- Leukopenija u odsustvu neutropenije ili limfopenije koja ograničava dozu.

5. Studijska populacija:

[0103]

I. Kriterijumi za uključivanje- Pacijent mora da ispunjava sve sledeće kriterijume za uključivanje:

1. Pacijent mora imati najmanje 18 godina.

2. Pacijent je u stanju da obezbedi pisani, informisani pristanak pre početka bilo koje procedure vezane za studiju i, po mišljenju istraživača, u stanju je da se pridržava svih zahteva studije.

3. Populacija pacijenata: Studija je sprovedena kod pacijenata sa solidnim tumorima koji sadrže GNAQ/11 mutacije, uključujući, ali ne ograničavajući se na, melanom kože i kolorektalni kancer. Pacijenti sa drugim solidnim tumorima koji sadrže mutacije od interesa morali su prethodno primati standardne terapije pre nego što budu razmatrani za ovu studiju.

4. Dijagnoza:

- Ne-MUM: Uznapredovali melanom kože, CRC ili drugi solidni tumor koji je ili napredovao nakon prethodnih standardnih terapija ili za koji ne postoje zadovoljavajuće alternativne terapije i ima dokaze o GNAQ/11 mutaciji žarišta (kodoni Q209 ili R183) lokalnim testiranjem u laboratoriji sertifikovanoj od strane CAP/CLIA.

Obavezni su reprezentativni arhivski uzorci metastatskih tumora u parafinskim blokovima sa pratećim patološkim izveštajem ili najmanje 15 FFPE preparata fiksiranih formalinom, ukalupljenih u parafin.

Prihvata se samo uzorak tkiva iz hirurške resekcije ili uzorka dobijenog iglom, „punch“ ili ekscizionom/incizionom biopsijom. Uzorci dobijeni tankom iglom za aspiraciju (TAB) nisu prihvatljivi.

5. Pacijenti sa prethodnom istorijom ili klinički stabilnim istovremenim malignitetom ispunjavaju uslove za uključenje pod uslovom da je malignitet klinički beznačajan, da nije potrebno lečenje i da je pacijent klinički stabilan.

- Mogu biti uključeni pacijenti sa istorijom skvamoznog ili bazalnog ćelijskog karcinoma kože ili karcinoma in situ cerviksa.

- Pacijenti sa kancerom prostate sa povišenim PSA koji ne zahteva lečenje mogu biti uključeni u studiju.

6. Merljiva bolest prema RECIST v1.1, definisana kao najmanje jedna lezija koja se može precizno izmeriti u najmanje jednoj dimenziji (najduži prečnik koji se beleži) kao ≥ 10 mm pomoću CT ili MRI skeniranja, ili digitalnom fotografijom pomoću kalipera i lenjira za kožne lezije. Uvećani limfni čvor mora biti ≥ 15 mm u kratkoj osi da bi se smatrao merljivom lezijom.

- Lezije u prethodno ozračenim područjima ne treba smatrati ciljnim lezijama, osim ako nisu jasno napredovale od radioterapije.

- Lezije jetre koje su primale terapije usmerene ka jetri ne treba smatrati ciljnim lezijama, osim ako nisu jasno napredovale od terapije.

- Za pacijente sa metastazama u jetri, stručnjaci u ustanovi koja ih leči treba da odrede preferencijalni način snimanja jetre sa kontrastom.

7. Pacijent ima status performanse 0 - 1 po Istočnoj kooperativnoj onkološkoj grupi (ECOG).

8. Pacijent ima adekvatnu funkciju organa prilikom skrininga:

- Apsolutni broj neutrofila ≥ 1500/mm<3>bez upotrebe hematopoetskih faktora rasta; - Broj trombocita ≥ 75 000/mm<3>(mora biti najmanje 2 nedelje nakon transfuzije trombocita i da ne primaju sredstva koja stimulišu trombocite);

- Hemoglobin ≥ 8,0 g/dl (mora biti najmanje 2 nedelje nakon transfuzije crvenih krvnih zrnaca i da ne primaju sredstva za stimulaciju eritropoeze);

- Ukupni bilirubin ≤ 1,5 x gornja granica normale (ULN). Za pacijente sa dokumentovanom Gilbert-ovom bolešću, dozvoljen je ukupni bilirubin ≤ 3,0 mg/dl; - ALT i AST ≤ 3 x ULN u odsustvu dokumentovanih metastaza na jetri; ≤ 5 x ULN u prisustvu metastaza na jetri;

- Serumski albumin ≥ 2,0 g/dl;

- Klirens kreatinina ≥ 60 ml/min/1,73 m<2>po Cockroft-Gault jednačini [klirens kreatina = [(140 - starost) x težina u kg)] / (serumski kreatinin x 72)];

- Rezultati testa protrombinskog vremena/internacionalnog normalizovanog odnosa (INR) ili parcijalnog tromboplastinskog vremena pri skriningu ≤ 1,5 x ULN (ovo se odnosi samo na pacijente koji ne primaju terapeutsku antikoagulaciju; pacijenti koji primaju terapeutsku antikoagulaciju treba da budu na stabilnoj dozi najmanje 4 nedelje pre prve doze leka koji se ispituje).

9. Pacijenti koji su prethodno primali imunostimulatorne antitumorske lekove, kao što su anti-PD-1, anti-PD-L1, anti-CTLA-4, OX-40, CD137 itd., ili inhibitori MAPK puta mogu biti podobni. Pre 1. dana studije (prva doza), pacijent mora biti:

- najmanje 4 nedelje ili 5 poluživota (T1⁄2) nakon najnovije biološke (na bazi antitela) ili imunoterapije, šta god je kraće;

- najmanje 2 nedelje ili 5 T1⁄2 nakon bilo koje prethodne sistemske hemoterapije (> 6 nedelja od nitrozoureje i mitomicina C) ili ciljane terapije malim molekulima, šta god je kraće.

10. Pacijentkinje u reproduktivnom periodu ne smeju biti trudne, niti da doje i treba da imaju negativan rezultat testa na trudnoću sa humanim horionskim gonadotropinom u serumu u roku od 28 dana pre prve primene leka koji se ispituje.

11. Žene u reproduktivnom dobu koje su seksualno aktivne sa nesterilisanim muškim partnerom slažu se da koriste efikasne metode kontracepcije od skrininga, tokom celog lečenja i slažu se da nastave da koriste takve mere predostrožnosti 30 dana nakon poslednje doze leka.

12. Nesterilisani muškarci koji su seksualno aktivni sa ženom u reproduktivnom dobu moraju se složiti da koriste efikasne metode kontracepcije od prvog dana tokom primene leka i 30 dana nakon poslednje doze leka.

13. Pacijenti mora da su iscrpli sve standardne tretmane ili da imaju dokumentovanu netoleranciju, prema rečima istraživača.

14. Obavezni su arhivski uzorci metastatskih tumora u parafinskim blokovima sa pratećim patološkim izveštajem ili najmanje 15 FFPE pločica. Prihvata se samo tkivo iz hirurške resekcije ili uzorci dobijeni iglom, „punch“ ili ekscizionom/incizionom biopsijom. Uzorci dobijeni tankom iglom (FNA) nisu prihvatljivi.

15. Melanom kože:

- Histološki potvrđen lokalno uznapredovali i neoperabilni ili metastatski melanom sa fotografijama u boji medicinskog kvaliteta sa lenjirom ako su prisutne kožne lezije.

- Dokumentovani status RAF/RAS divljeg tipa.

16. Kolorektalni kancer:

- Histološki potvrđen lokalno uznapredovali i neoperabilni ili metastatski adenokarcinom poreklom iz debelog creva ili rektuma.

- Dokumentovani status RAF/RAS divljeg tipa i status stabilnog mikrosatelita (MSS)

17. Faza 2: Mutacije žarišta u drugim tumorima:

- Pacijenti mora da su iscrpili sve standardne tretmane ili imaju dokumentovanu netoleranciju, prema uputstvu istraživača.

- Pacijenti moraju imati odgovarajuću karakterizaciju biomarkera za svoj tip tumora npr., CA125, PSA, CEA

Dodatni kriterijumi za uključivanje za pacijente bez MUM i ispunjavaju uslove za biopsiju

[0104]

1. Pristupačne lezije koje omogućavaju ukupno najmanje dve biopsije (pre tretmana i tokom tretmana) bez neprihvatljivog rizika od značajne proceduralne komplikacije. Prihvatljivi uzorci uključuju biopsije iglom za duboko tumorsko tkivo ili limfne čvorove ili ekscizione, incizione, „punch“ ili biopsije forcepsom za kožne, potkožne ili mukozne lezije. Aspirati tankom iglom, ćelijski peleti iz izliva ili ascitesa, uzorci lavaža i biopsije kostiju nisu dozvoljeni.

- Ciljane lezije koje se razmatraju za biopsiju jezgra iglom trebalo bi smatrati pogodnim za uzimanje najmanje tri, a idealno pet, jezgra u datom trenutku (minimalni prečnik 18-gauge).

- Alternativno, prihvatljivo je najmanje dva jezgra u datom trenutku sa iglom kalibra 14. - Ako je dostupno više lezija, poželjno je da se biopsija tokom lečenja uzme iz iste lezije (ili organa) kao i biopsija pre lečenja, ako je to izvodljivo.

- Biopsija iz iste lezije (ili organa) kao i biopsija pre tretmana, ako je izvodljivo.

[0105] II. Opšti kriterijumi za isključenje za Fazu I i Fazu 2: Prisustvo bilo kog od sledećeg bi isključilo pacijenta iz podobnosti za studiju:

1. Prethodni tretman inhibitorom PKC.

2. Poznati tumori sa visokom mikrosatelitskom nestabilnošću (MSI-H) su isključeni.

3. Imaju neželjene događaje iz prethodne terapije protiv kancera koji se nisu povukli na stadijumu ≤1, osim alopecije, prethodne periferne neuropatije ili anemije. Endokrinopatije nastale usled prethodne imunoterapije smatraju se delom medicinske istorije, a ne neželjenim događajem.

4. Nelečene ili simptomatske maligne lezije u centralnom nervnom sistemu (CNS). Pacijenti sa asimptomatskim lezijama CNS-a ispunjavaju uslove pod uslovom da su klinički stabilni i da im nisu potrebni steroidi najmanje 4 nedelje.

5. Poznata bolest povezana sa virusom humane imunodeficijencije (HIV) ili sindromom stečene imunodeficijencije (SIDA).

6. Aktivna infekcija koja zahteva terapiju (osim gljivica na noktima), pozitivni testovi na površinski antigen hepatitisa B (HBsAg) sa detektovanom DNK virusa hepatitisa B (HBV) ili pozitivni testovi na antitela na hepatitis C sa detektovanom RNK virusa hepatitisa C (HCV).

7. Hirurške procedure koje zahtevaju opštu anesteziju ≤ 5 dana pre prve planirane doze IDE196; u svim slučajevima, pacijent mora biti dovoljno oporavljen i stabilan pre primene leka koji se ispituje.

8. Prethodna gastrektomija ili uklanjanje gornjeg dela creva ili bilo koji drugi gastrointestinalni poremećaj ili defekt npr., poremećaj malapsorpcije kao što je Crohn-ova bolest ili ulcerozni kolitis, koji bi mogao da ometa apsorpciju IDE196.

9. Pacijenti koji su primili radioterapiju u roku od 2 nedelje od prve doze leka koji se ispituje.

10. Pacijenti koji primaju terapiju lekovima koja se ne može prekinuti pre uključivanja u studiju i koji se smatraju bilo kojim od sledećih:

- poznati i mogući rizik od produženje QT intervala

11. Žene koje su trudne ili doje.

12. Žene u reproduktivnom periodu ne smeju razmatrati trudnoću tokom studije.

13. Pacijenti reproduktivnog potencijala (muškarci i žene) moraju koristiti efikasnu metodu kontracepcije tokom lečenja i 30 dana nakon poslednje doze IDE196. Pacijenti koji to ne žele su isključeni.

14. Oštećena srčana funkcija ili klinički značajne srčane bolesti, uključujući bilo šta od sledećeg:

- Istorija ili prisustvo ventrikularne tahiaritmije.

- Prisustvo nestabilne atrijalne fibrilacije (ventrikularni odgovor > 100 otkucaja u minuti); pacijenti sa stabilnom atrijalnom fibrilacijom ispunjavaju uslove, pod uslovom da ne ispunjavaju nijedan od drugih kriterijuma za isključenje iz kardiološke studije. - Angina pektoris ili akutni infarkt miokarda ≤ 3 meseca pre početka uzimanja leka koji se ispituje.

- Druge klinički značajne srčane bolesti (npr., simptomatska kongestivna srčana insuficijencija; nekontrolisana aritmija ili hipertenzija; istorija labilne hipertenzije ili loše pridržavanje antihipertenzivnog režima).

- Pacijenti sa stentom koji eluira lek u kardiovaskularne svrhe postavljeni ≤ 2 meseca pre početka primene leka koji se ispituje.

- Korigovani QT interval korišćenjem Fridericia-eve metode (QTcF) > 480 ms na početnom EKG (srednja vrednost početnih vrednosti). Ako su elektroliti abnormalni, mogu se korigovati i početni EKG treba da se ponovi.

- Formula za QT korekciju prema Fridericia (videti Luo S, Michler K, Johnston P, et al. (2004) A comparison of commonly used QT correction formulae: the effect of heart rate on the QTc of normal ECGs. Journal of Electrocardiology.37:81-90)

15. Alergija na proizvode od mesa sisara ili želatin (samo za pacijente koji primaju IDE196 PIC).

16. Prisustvo bilo kog drugog stanja koje može povećati rizik povezan sa učešćem u studiji ili može ometati tumačenje rezultata studije i, po mišljenju istraživača, učinilo bi pacijenta neprikladnim za učešće u studiji.

[0106] Istraživač i sponzor ili njegov ovlašćeni predstavnik ne odobravaju nikakva izuzeća od kriterijuma za uključivanje ili isključivanje za bilo kog pacijenta uključenog u studiju.

6. Tretman studije

Doziranje: Svaka doza IDE196 se uzima dva puta dnevno.

[0107] Početna doza kod eskalacije doze je 300 mg dva puta dnevno (BID), koja je ocenjena kao bezbedna i podnošljiva u tekućoj studiji faze I CLXS196X2010 (EudraCT 2015-00215811, NCT02601378). U određenim ilustrativnim primerima izvođenja, naknadni planirani nivoi doza su 400 mg BID. U određenim ilustrativnim primerima izvođenja, naknadni planirani nivoi doza su 500 mg BID. Nema eskalacije doze među pacijentima u kohortama sa eskalacijom doze.

7. Istovremeni lekovi

[0108] Istovremene antineoplastične terapije ili istraživačke terapije osim IDE196 su zabranjene. Pored toga, sledeće klase lekova su zabranjene:

- Lekovi sa poznatim i mogućim rizikom od produženja QT intervala;

- Jaki inhibitori i induktori CYP3A4/5;

- Inhibitori i induktori ABCB1 (P-gp);

- Supstrati CYP3A4/5 i/ili ABCB1 sa uskim terapeutskim indeksom (NTI);

- Supstrati OAT3, OATPIB1 i MATE1/2-K sa NTI.

[0109] Upotreba bilo kog istovremenog leka/terapije koji nije lek za kancer, uključujući lekove koji se izdaju bez recepta, a koji se smatraju neophodnim za negu pacijenta ili za lečenje neželjenih događaja, dozvoljena je, osim onih koji su navedeni kao zabranjeni.

8. Kriterijumi za povlačenje

[0110] Lek koji se ispituje može biti prekinut zbog bilo kog od sledećih razloga: neželjeni događaj, gubitak praćenja, odluka lekara, progresivna bolest, prekid studije od strane sponzora, odluka pacijenta/staratelja, odstupanje od protokola ili nepoštovanje protokola. Lek koji se ispituje se prekida ukoliko dođe do smrti ili trudnoće.

9. Procene

[0111] I. Farmakokinetičke procene: Farmakokinetički uzorci se uzimaju u različitim vremenskim tačkama nakon kontinuiranog doziranja dva puta dnevno. Za pacijente faze I, 1. dana ciklusa 1 i 15. dana ciklusa 1, nakon doze slede česta farmakokinetička uzorkovanja tokom 12 sati kako bi se odredila farmakokinetička svojstva IDE196 prema rasporedu događaja. Za cikluse 2 i dalje, tokom svakog ciklusa lečenja prikupljaju se samo pojedinačni farmakokinetički uzorci na najnižem nivou.

[0112] Farmakokinetička procena se zasniva na određivanju sledećih parametara za IDE196, uključujući, ali ne ograničavajući se na: AUC0-t, AUCO-∞, AUCtau, Cmax, Tmax, T1⁄2, Vss/F, CL/F. Farmakokinetički test se sprovodi u centralnoj laboratoriji.

II. Farmakodinamičke procene: Testovi se sprovode u centralnoj laboratoriji.

[0113] III. Procene efikasnosti: Mere efikasnosti uključuju procene tumora, koje se sastoje od kliničkog ispitivanja i digitalne fotografije pomoću kalipera i lenjira za kožne lezije, i odgovarajuće tehnike snimanja (poželjno kompjuterizovana tomografija (CT) grudnog koša, abdomena i karlice sa odgovarajućom debljinom preseka prema RECIST v1.1); po potrebi se mogu izvršiti i druge studije (magnetna rezonanca [MRI], rendgen, pozitronska emisiona tomografija [PET] i ultrazvuk).

[0114] Pacijenti se procenjuju na odgovor na bolest prema RECIST v1.1, pri čemu se prva procena vrši prilikom skrininga, a zatim svakih 8 nedelja (± 7 dana) počevši od prve doze tokom prvih 12 ciklusa i nakon toga svakih 12 nedelja (± 7 dana).

[0115] IV. Procene bezbednosti: Bezbednost se procenjuje kroz neželjene događaje, promene u laboratorijskim testovima i promene vitalnih znakova. Beleže se učestalost i trajanje toksičnosti prema NCI-CTCAE v5.0. Neželjeni događaji se kodiraju pomoću Medicinskog rečnika za regulatorne aktivnosti (MedDRA).

[0116] Svi neželjeni događaji (AE) koji se javljaju tokom lečenja su sumirani na sledeći način:

- Toksičnost koja ograničava dozu;

- Svi AE;

- Sve specifične kategorije bezbednosnih događaja (SEC) - AE;

- Svi AE 3/4/5 stadijuma;

- Svi AE povezani sa lečenjem;

- Svi AE koji dovode do modifikacija leka koji se proučava ili prekida studije; i

- Svi SAE, uključujući smrtne slučajeve.

[0117] Navedeni su svi podaci o neželjenim efektima (AE), SAE i DLT. Promena u odnosu na početne vrednosti za odabrane laboratorijske parametre je sumirana po grupi lečenja i zakazanim posetama. Svi podaci laboratorijskih testova su navedeni sa označenim abnormalnim vrednostima.

[0118] Promena u odnosu na početne vrednosti za parametre vitalnih znakova je sumirana po grupi i zakazanim posetama; navedeni su svi podaci o vitalnim znacima.

[0119] MTD i RP2D za IDE196 se određuju kao funkcija zabeležene toksičnosti. PK i PD analize i drugi parametri mogu se uzeti u obzir pri određivanju RP2D.

Uzorci tumorskog tkiva

[0120] Arhiviranje uzoraka tkiva metastatskog tumora je obavezno.

[0121] Kohorte za ekspanziju: Potrebno je najmanje 15 uparenih svežih biopsija tumora kod pacijenata koji nisu sa MUM i uključeni su u kohorte ekspanzije, kako pri skriningu, tako i između 15. dana 1. ciklusa i 1. dana 2. ciklusa. Biopsije tumorskog tkiva u vreme progresije bolesti/prekida lečenja su opcione za sve pacijente.

Statistički postupci

[0122] Za kohorte ekspanzije bez MUM, Simon dvostepeni dizajn se koristi za istraživanje preliminarne efikasnosti i za dalju karakterizaciju bezbednosnog profila terapije IDE196 u preporučenoj dozi faze 2 (R2PD).

[0123] Za svaku od kohorti ekspanzije GNAQ/11 kohorte žarišta bez MUM, ORR od 5% nije klinički značajan (nula), dok je ORR od 20% interesantan. Sa greškom tipa I od 10% i snagom od 80%, u prvoj fazi za svaku kohortu se dodaje 9 pacijenata. Ako se kod 9 pacijenata za kohortu ne primeti nikakav odgovor, u tu kohortu se ne uključuju dodatni pacijenti. U suprotnom, dodaje se dodatnih 15 pacijenata, za ukupno 24 u toj kohorti. Potrebno je tri ili više rensposivnih osoba od 24 pacijenta u kohorti da bi se opravdalo dalje ispitivanje.

[0124] Eksploratorne kohorte pokrivaju druge GNAQ/11-tumore sa mutacijom žarišta. Približno 10 pacijenata sa drugim GNAQ/11-mutiranim tumorima sa mutacijom žarišta je uključeno u istraživanje kako bi se procenila lakoća identifikacije ovih tumora i istražila preliminarna aktivnost IDE196 u ovom okruženju.

[0125] Sprovedene su analize bezbednosti, efikasnosti, PK i PD. Analizirane populacije uključuju:

- Celu registrovanu populaciju;

- Bezbednosnu populaciju;

- Populaciju koja se može proceniti pomoću DLT;

- Populaciju koja se može proceniti efikasnošću; i

- Farmakokinetičku analizu populacije

[0126] Pripremljeni su i navedeni rezimei demografskih podataka pacijenata, istovremenih terapija i komplajansa. Analize bezbednosti uključuju, ali nisu ograničene na, primenu leka koji se ispituje, neželjene efekte, laboratorijske abnormalnosti, procene EKG i vitalne znake. Analize efikasnosti uključuju preliminarnu antitumorsku aktivnost procenjenu pomoću INV i BICR, kao što su ORR, DOR, PFS, DCR i OS. PK će biti okarakterisana kod pacijenata sa eskalacijom doze pri različitim dozama IDE196. Procena PD efekata će se zasnivati na PD markerima kao što su PKC-delta i drugi eksploratorni farmakodinamički biomarkeri.

Claims (16)

1. Patentni zahtevi 1. Inhibitor protein kinaze C za upotrebu u postupku lečenja karcinoma koji ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju kod pacijenta kome je to potrebno, pri čemu je karcinom izabran iz grupe koja se sastoji od adenokarcinoma pankreasa, adenokarcinoma želuca, karcinoma grlića materice i adenokarcinoma pluća, pri čemu postupak sadrži: određivanje da li karcinom ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju; i oralno primenjivanje na pacijenta koji ima karcinom sa GNAQ ili GNA11 genetskom mutacijom terapeutski efikasne količine inhibitora protein kinaze C.
2. 2. Inhibitor protein kinaze C za upotrebu prema patentnom zahtevu 1, pri čemu GNAQ ili GNA11 mutacija je mutacija supstitucije, insercije i/ili delecije i/ili mutacija dobitka funkcije.
3. 3. Inhibitor protein kinaze C za upotrebu prema patentnom zahtevu 1 ili 2, pri čemu: a. GNAQ ili GNA11 genetska mutacija je supstitucija glutamina u kodonu 209 (Q209); i/ili b. karcinom ima GNAQ genetsku mutaciju odabranu od Q209P, Q209L, Q209H, Q209K i Q209Y, ili GNA11 genetsku mutaciju odabranu od Q209P, Q209L, Q209K i Q209H; i/ili c. GNAQ ili GNA11 genetska mutacija je Q209L.
4. 4. Inhibitor protein kinaze C za upotrebu prema patentnom zahtevu 1 ili 2, pri čemu: a. GNAQ ili GNA11 genetska mutacija je supstitucija arginina u kodonu 183 (R183), opciono pri čemu GNAQ genetska mutacija je R183Q; ili b. GNAQ ili GNA11 genetska mutacija nije supstitucija glutamina u kodonu 209 (Q209) niti supstitucija arginina u kodonu 183 (R183), opciono pri čemu GNAQ ili GNA11 genetska mutacija aktivira PKC put.
5. 5. Inhibitor protein kinaze C za upotrebu prema bilo kom od patentnih zahteva 1-4, pri čemu: a. određivanje da li karcinom ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju sadrži identifikaciju GNAQ ili GNA11 genetske mutacije u DNK ekstrahovanoj iz uzorka tumora ili u cirkulišućoj tumorskoj DNK; i/ili b. određivanje sadrži identifikaciju prisustva fuzionog gena u DNK ekstrahovanoj iz cirkulišuće tumorske ćelije; i/ili c. pacijent ima nisko tumorsko mutaciono opterećenje manje od 17 mut/Mb, opciono pri čemu pacijent ima nisko tumorsko mutaciono opterećenje manje od 10 mut/Mb; i/ili d. pacijent ima nisko tumorsko mutaciono opterećenje mutacijama u ostatku genoma; i/ili e. pacijent nema aktivirajuće BRAF ili NRAS mutacije; i/ili f. pacijent nije reagovao na lečenje inhibitorima imunoloških kontrolnih tačaka.
6. 6. Inhibitor protein kinaze C za upotrebu prema bilo kom od patentnih zahteva 1-5, pri čemu: a. primena sadrži primenu inhibitora protein kinaze C kao monoterapije; ili b. primena dodatno sadrži primenu najmanje jednog dodatnog terapeutskog sredstva; ili c. postupak dodatno sadrži primenu terapeutski efikasne količine terapeutskog sredstva izabranog iz grupe koja se sastoji od inhibitora MEK, inhibitora mTOR, inhibitora CDKi, inhibitora HDM2-p53, inhibitora imunološke kontrolne tačke i kombinacija dva ili više njih, opciono pri čemu je inhibitor MEK izabran iz grupe koja se sastoji od trametiniba, kobimetiniba, binimetiniba i selumetiniba.
7. 7. Inhibitor protein kinaze C za upotrebu prema bilo kom od patentnih zahteva 1-6, pri čemu: a. inhibitor protein kinaze C ima potenciju protiv jedne ili više izoformi δ, ε, η, θ, α protein kinaze C; i/ili b. inhibitor protein kinaze C ima potenciju protiv višestrukih izoformi protein kinaze C; i/ili c. inhibitor protein kinaze C je mali molekul inhibitor protein kinaze C; i/ili d. inhibitor protein kinaze C ima IC50u odnosu na izoforme PKC θ/α i/ili PKC δ i/ili PKC ε manju od 50 nM.
8. 8. Inhibitor protein kinaze C za upotrebu u postupku lečenja kancera solidnog tumora kod pacijenta kome je to potrebno, pri čemu postupak sadrži: oralno primenjivanje efikasne količine inhibitora protein kinaze C na pacijenta, pri čemu je utvrđeno da pacijent ima GNAQ ili GNA11 genetsku tumorsku mutaciju, pri čemu je kancer solidnog tumora izabran od adenokarcinoma pankreasa, adenokarcinoma želuca, karcinoma grlića materice i adenokarcinoma pluća.
9. 9. Inhibitor protein kinaze C za upotrebu u postupku lečenja ne-uvealnog kancera solidnog tumora koji ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju kod pacijenta kome je to potrebno, pri čemu je ne-uvealni kancer solidnog tumora izabran iz grupe koja se sastoji od kancera pankreasa, kancera želuca, kolorektalnog kancera, kancera grlića materice, adenokarcinoma pluća, kancera materice, kancera bešike, hepatocelularnog karcinoma, kancera prostate, kancera dojke, kancera glave i vrata i glioblastoma, pri čemu postupak sadrži: određivanje da li neuvealni kancer solidnog tumora ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju; određivanje da li pacijent nema aktivirajuće BRAF ili NRAS mutacije; i oralno primenjivanje na pacijenta bez aktiviranja BRAF ili NRAS mutacija, opciono pri čemu pacijent nema BRAF V600 mutaciju, farmaceutski efikasne količine inhibitora protein kinaze C, opciono pri čemu GNAQ ili GNA11 mutacija je: a. supstitucija glutamina u kodonu 209 (Q209) ili supstitucija arginina u kodonu 183 (R183), opciono pri čemu je ne-uvealni kancer solidnog tumora kolorektalni kancer, adenokarcinom pluća ili kancer pankreasa; ili b. osim supstitucije glutamina u kodonu 209 (Q209) i osim supstitucije arginina u kodonu 183 (R183), opciono pri čemu, ne-uvealni kancer solidnog tumora je kancer materice, kancer želuca, kancer grlića materice, hepatocelularni karcinom, kancer prostate, kancer dojke, kancer glave i vrata ili glioblastom.
10. 10. Inhibitor protein kinaze C za upotrebu u postupku lečenja pacijenta koji ima ne-uvealni melanomski tumor ili ne-melanocitni tumor centralnog nervnog sistema, pri čemu, ne-uvealni melanomski tumor ili ne-melanocitni tumor centralnog nervnog sistema je kancer pankreasa, kolorektalni kancer, adenokarcinom pluća, kancer želuca, kancer grlića materice, kancer materice, kancer bešike, hepatocelularni karcinom, kancer prostate, kancer dojke, kancer glave i vrata ili glioblastom, pri čemu postupak sadrži: određivanje da li neuvealni melanomski tumor ili nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju koja aktivira PKC put; i oralno primenjivanje na pacijenta koji pati od ne-uvealnog melanomskog tumora ili nemelanocitnog tumora centralnog nervnog sistema sa GNAQ ili GNA11 genetskom mutacijom farmaceutski efikasne količine inhibitora protein kinaze C, opciono pri čemu određivanje sadrži: a. određivanje da li neuvealni melanomski tumor ili nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema ima GNAQ Q209, GNA11 Q209, GNAQ R183 ili GNA11 R183 genetsku mutaciju, opciono pri čemu je ne-uvealni melanomski tumor ili nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema izabran iz grupe koja se sastoji od tumora kancera pankreasa, tumora kolorektalnog kancera i adenokarcinoma pluća; ili b. određivanje da li neuvealni melanomski tumor ili nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema ima mutaciju koja nije GNAQ Q209, GNA11 Q209, GNAQ R183 ili GNA11 R183 genetska mutacija, opciono pri čemu, ne-uvealni melanomski tumor ili nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema je kancer materice, kancer želuca, kancer grlića materice, kancer bešike, hepatocelularni karcinom, kancer prostate, kancer dojke, kancer glave i vrata ili glioblastom.
11. 11. Inhibitor protein kinaze C za upotrebu u postupku lečenja pacijenta koji ima nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema, pri čemu postupak sadrži: određivanje da li nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju koja aktivira PKC put; i oralno primenjivanje na pacijenta koji pati od nemelanocitnog tumora centralnog nervnog sistema sa GNAQ ili GNA11 genetskom mutacijom farmaceutski efikasne količine inhibitora protein kinaze C, opciono pri čemu određivanje sadrži: a. određivanje da li nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema ima GNAQ Q209, GNA11 Q209, GNAQ R183, ili GNA11 R183 genetsku mutaciju; ili b. određivanje da li nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema ima mutaciju koja nije GNAQ Q209, GNA11 Q209, GNAQ R183 ili GNA11 R183 genetska mutacija, opciono pri čemu, nemelanocitni tumor centralnog nervnog sistema je glioblastom.
12. 12. Inhibitor protein kinaze C za upotrebu u postupku lečenja ne-uvealnog kancera solidnog tumora kod pacijenta kome je to potrebno, pri čemu je pacijent u suštini neresponsivan na lečenje inhibitorom imunološke kontrolne tačke, pri čemu postupak sadrži oralno primenjivanje na pacijenta farmaceutski efikasne količine inhibitora protein kinaze C, pri čemu je utvrđeno da ne-uvealni kancer solidnog tumora pacijenta ima GNAQ ili GNA11 genetsku mutaciju, opciono pri čemu: a. ne-uvealni kancer solidnog tumora je izabran iz grupe koja se sastoji od kancera pankreasa, kancera želuca, kolorektalnog kancera, kancera materice, kancera grlića materice, kancera bešike, hepatocelularnog karcinoma, kancera glave i vrata, kancera prostate, kancera dojke, adenokarcinoma pluća i kožnog melanoma, opciono pri čemu je utvrđeno da ne-uvealni kancer solidnog tumora pacijenta ima GNAQ Q209L ili GNA11 Q209L mutaciju; ili b. utvrđeno je da pacijentov neuvealni solidni tumor ima GNAQ Q209 ili a GNA11 Q209 mutacija, opciono gde je ne-uvealni solidni tumorski karcinom izabran iz grupe koja se sastoji od kancera pankreasa, kolorektalnog karcinoma, adenokarcinoma pluća i melanoma kože; ili c. utvrđeno je da pacijentov neuvealni kancer solidnog tumora ima mutaciju koja nije GNAQ Q209, GNA11 Q209, GNAQ R183 ili GNA11 R183, opciono pri čemu, neuvealni kancer solidnog tumora je izabran iz grupe koja se sastoji od kancera materice, kancera želuca, kancera bešike, kancera grlića materice, kancera dojke, kancera glave i vrata, hepatocelularnog karcinoma i glioblastoma.
13. 13. Inhibitor protein kinaze C za upotrebu prema patentnom zahtevu 12, pri čemu: a. pacijent ne reaguje na 3-mesečni kurs lečenja inhibitorom imunološke kontrolne tačke; i/ili b. inhibitor imunološke kontrolne tačke je izabran iz grupe koja se sastoji od pembrolizumaba, ipilimumaba, nivolumaba i atezolizumaba; i/ili c. pacijent ima nisko tumorsko mutaciono opterećenje; i/ili d. pacijent ima nisko tumorsko opterećenje mutacija u jednom ili više BAP1, SF3B1, EIF1AX, TERT, BRAF, CDKN2A, NRAS i KRAS.
14. 14. Inhibitor protein kinaze C za upotrebu prema bilo kom od patentnih zahteva 1-13, pri čemu inhibitor protein kinaze C je predstavljen formulom II:

    ili njegovom farmaceutski prihvatljivom soli, pri čemu: X je N ili CR; R, R<2>, R<3>i R<4>su svaki nezavisno izabrani iz grupe koja se sastoji od H,<2>H, halogena, hidroksila, C1-3alkoksi i C1-3alkila; pri čemu, C1-3alkoksi može opciono biti supstituisan sa jednim, dva, tri ili više halogena; i pri čemu C1-3alkil može opciono biti supstituisan sa jednim, dva, tri ili više supstituenata, svaki nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od hidroksila, halogena i C1-3alkoksi (opciono supstituisan jednim ili više halogena); R<5>je izabran iz grupe koja se sastoji od H,<2>H, -CH3, -CH2F, -CHF2, -CF3, - CH2OH i C2-3alkila; pri čemu C2-3alkil može opciono biti supstituisan sa jednim, dva, tri ili više supstituenata, svaki nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od fluora, hidroksila i C1- 3alkoksi (opciono supstituisan sa jednim ili više halogena); R<5a>i R<5b>su svaki nezavisno izabrani iz grupe koja se sastoji od H,<2>H i C1-3alkila; pri čemu C1-3alkil može opciono biti supstituisan sa jednim, dva, tri ili više supstituenata, svaki nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od fluora, hidroksila i C1-3alkoksi; ili R<5a>i R<5b>zajedno formiraju metilen ili etilen premošćujuću grupu; R<5c>i R<5d>su svaki nezavisno izabrani iz grupe koja se sastoji od H,<2>H, fluora, hidroksila, C1-3alkoksi i C1-3alkila; pri čemu C1-3alkil može opciono biti supstituisan sa jednim, dva, tri ili više supstituenata, svaki nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od fluora, hidroksila i C1-3alkoksi; ili R<5c>i R<5d>zajedno formiraju metilen, etilen ili -CH2-O-premošćujuću grupu; R<6>, R<7>i R<8>su svaki nezavisno izabrani iz grupe koja se sastoji od H,<2>H, halogena, C1- 3alkila, C1-3alkoksi, C3-7cikloalkila i heterociklila sa 4-7 članova koji ima jedan, dva ili tri heteroatoma, svaki nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od N, O i S; pri čemu C1-3alkoksi može opciono biti supstituisan sa jednim, dva, tri ili više halogena; i pri čemu C1-3alkil može opciono biti supstituisan sa jednim, dva, tri ili više supstituenata, svaki nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od hidroksila, halogena i C1-3alkoksi (opciono supstituisan jednim ili više halogena); ili R<6>i R<8>formiraju delimično nezasićeni karbobiciklični ili heterobiciklični prsten sa heteroarilnim prstenom za koji su vezani, pri čemu karbobiciklični ili heterobiciklični prsten može opciono biti supstituisan sa jednom, dve ili tri grupe, svaka nezavisno izabrana iz grupe koja se sastoji od<2>H, halogena, C1-3alkila, C1-3alkoksi, C3-7cikloalkila i heterociklila sa 4-7 članova koji ima jedan, dva ili tri heteroatoma, svaki nezavisno izabran iz grupe koja se sastoji od N, O i S; i pri čemu C1-3alkil i C1-3alkoksi mogu opciono biti supstituisani sa jednim, dva, tri ili više halogena, opciono pri čemu, inhibitor protein kinaze C je:

    ili njegova farmaceutski prihvatljiva so.
15. 15. Jedinjenje predstavljeno sa:

    ili njegovom farmaceutski prihvatljivom soli, za upotrebu u postupku lečenja kancera kod pacijenta kome je to potrebno, pri čemu postupak sadrži: identifikovanje pacijenta kao da ima tumor sa GNAQ ili GNA11 mutacijom; oralno primenjivanje na pacijenta kompozicije koja sadrži jedinjenje; pri čemu je kancer izabran iz grupe koja se sastoji od tumora kancera pankreasa, tumora kancera želuca, tumora kolorektalnog kancera, tumora kancera grlića materice, adenokarcinoma pluća, melanoma kože, kolorektalnog kancera, kancera želuca, kancera bešike, hepatocelularnog karcinoma, kancera prostate, kancera dojke, kancera glave i vrata i glioblastoma.
16. 16. Jedinjenje za upotrebu prema patentnom zahtevu 15, pri čemu, kancer je melanom kože.