PL238767B1 - Zasobnik do pozyskiwania biofilmu do analizy mikroskopii elektronowej SEM - Google Patents

Zasobnik do pozyskiwania biofilmu do analizy mikroskopii elektronowej SEM Download PDF

Info

Publication number
PL238767B1
PL238767B1 PL421673A PL42167317A PL238767B1 PL 238767 B1 PL238767 B1 PL 238767B1 PL 421673 A PL421673 A PL 421673A PL 42167317 A PL42167317 A PL 42167317A PL 238767 B1 PL238767 B1 PL 238767B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
biofilm
cartridge according
cartridge
diameter
stabilizing ring
Prior art date
Application number
PL421673A
Other languages
English (en)
Other versions
PL421673A1 (pl
Inventor
Arkadiusz Dziedzic
Robert Dariusz Wojtyczka
Robert Kubina
Marta Tanasiewicz
Wojciech Kujawski
Original Assignee
Slaski Univ Medyczny W Katowicach
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Slaski Univ Medyczny W Katowicach filed Critical Slaski Univ Medyczny W Katowicach
Priority to PL421673A priority Critical patent/PL238767B1/pl
Priority to EP17461633.4A priority patent/EP3406703B1/en
Publication of PL421673A1 publication Critical patent/PL421673A1/pl
Publication of PL238767B1 publication Critical patent/PL238767B1/pl

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12MAPPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
    • C12M25/00Means for supporting, enclosing or fixing the microorganisms, e.g. immunocoatings
    • C12M25/02Membranes; Filters
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12MAPPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
    • C12M25/00Means for supporting, enclosing or fixing the microorganisms, e.g. immunocoatings
    • C12M25/02Membranes; Filters
    • C12M25/04Membranes; Filters in combination with well or multiwell plates, i.e. culture inserts
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12MAPPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
    • C12M25/00Means for supporting, enclosing or fixing the microorganisms, e.g. immunocoatings
    • C12M25/06Plates; Walls; Drawers; Multilayer plates
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12MAPPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
    • C12M35/00Means for application of stress for stimulating the growth of microorganisms or the generation of fermentation or metabolic products; Means for electroporation or cell fusion
    • C12M35/02Electrical or electromagnetic means, e.g. for electroporation or for cell fusion
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12MAPPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
    • C12M41/00Means for regulation, monitoring, measurement or control, e.g. flow regulation
    • C12M41/30Means for regulation, monitoring, measurement or control, e.g. flow regulation of concentration
    • C12M41/36Means for regulation, monitoring, measurement or control, e.g. flow regulation of concentration of biomass, e.g. colony counters or by turbidity measurements

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Sustainable Development (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Electromagnetism (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
  • Immobilizing And Processing Of Enzymes And Microorganisms (AREA)
  • Sampling And Sample Adjustment (AREA)

Description

Opis wynalazku
Przedmiotem wynalazku jest zasobnik do pozyskiwania biofilmu w warunkach in vitro, przeznaczony do hodowli mikrobiologicznej w przypadku konieczności zapewnienia odpowiedniego środowiska wzrostu drobnoustrojów tworzących biofilm, z zastosowaniem do badań mikroskopii elektronowej (SEM, Scannin Electron Microscopy). Dzielony zasobnik dwukompartmentowy z separowanym nośnikiem umożliwia bezurazowe pozyskanie biofilmu biologicznego m.in. na konduktywnej matrycy krążka węglowego do zastosowania podczas analizy mikroskopowej SEM. Matryca węglowa przewodząca elektrony zapobiega uszkodzeniu próbki biofilmu przez strumień elektronów emitera SEM.
Kompozycja i struktura uzyskanego biofilmu zależy m.in. od podłoża wzrostu. W pomiarze mikroskopowym SEM, w odróżnieniu od klasycznej mikroskopii optycznej, stosowane jest wysokoenergetyczne działo elektronowe, które w przypadku próbek organicznych (biofilm) może wywoływać istotny efekt urazowy. W związku z tym istotne jest zapewnienie nośnika organicznego materiału do badań mikrobiologicznych podczas pomiaru SEM, który stanowi dobry przewodnik elektronów, zapobiegając kumulacji energii na powierzchni próbki wpływającej negatywnie na strukturę biofilmu.
Z amerykańskiego opisu patentowego nr US 7871791 B2 znany jest sposób uzyskiwania biofilmu do celów jego wizualizacji za pomocą technik mikroskopowych. Z publikacji międzynarodowych zgłoszeń patentowych nr U.S. Patent 6,051,423; U.S. Patent 6,326,190; U.S. Patent 6,410,256; U.S. Patent 6,596,505; U.S. Patent 6,599,696; U.S. Patent 6,599,714 nr US 4,974,243 znany jest system o nazwie The MBEC High-throughput (HTP) Assay (lnnovotech) hodowli mikrobiologicznej wykorzystujący podłoża bulionowe do oceny wrażliwości bakterii z oznaczeniem wartości MIC.
Z amerykańskiego opisu patentowego nr US 5,943,387 znany jest system sekwencyjny do detekcji tworzenia biofilmu w warunkach laboratoryjnych, przeznaczony do oceny stopnia swobody przemieszczania cząstek w hodowli bakteryjnej in vitro, który w konstrukcji wyposażone jest w zasobniki z medium oraz źródło wywołujące efekt elektryczny, magnetyczny lub magnetyczny w zawiesinie drobnoustrojów.
Inne rozwiązanie w konstrukcji urządzenia do hodowli biofilmu posiada możliwość detekcji drobnoustrojów w warunkach in situ do celów analizy za pomocą mikroskopii sił atomowych (AFM).
Celem wynalazku jest opracowanie takiej konstrukcji urządzenia do pozyskiwania biofilmu na nośniku węglowym w środowisku podłoża mikrobiologicznego do hodowli, która umożliwi i zapewni niezakłócony pomiar w trakcie analizy próbki biofilmu poddanej badaniu mikroskopowemu SEM, z możliwością wykorzystania zasobnika jako rezerwuaru dla pożywki płynnej lub półpłynnej oraz możliwością jej wymiany. Innym celem jest zaprojektowanie zintegrowanego systemu wspomagającego hodowlę biofilmu do jego analizy jakościowo-ilościowej w zakresie badania drobnoustrojów tworzących biofilm o różnych wymaganiach wzrostu, który zapewnia uniwersalne zastosowanie w różnych dziedzinach mikrobiologii klinicznej i eksperymentalnej.
Zasobnik do pozyskiwania biofilmu do analizy mikroskopii elektronowej SEM według wynalazku charakteryzuje się tym, że posiada konstrukcję pionową w kształcie walca z szerszą podstawą oraz standardowe zamknięcie korkowe. Walec zawiera dwa kompartmenty dolny oraz górny połączone rozłącznie tuleją z przewodzącym pierścieniem stabilizującym na krążek węglowy umieszczonym na wysokości górnej krawędzi kompartmentu dolnego i posiadającym co najmniej cztery wsporniki na powierzchni bocznej, przy czym w dolny kompartment wbudowany jest zawór.
Korzystnie wsporniki na powierzchni bocznej pierścienia stabilizującego rozlokowane są symetrycznie naprzeciwległe co 90 stopni.
Korzystnie pierścień stabilizujący posiada średnicę mniejszą niż średnica zasobnika o co najmniej 1 mm i zintegrowany jest z wewnętrzną ścianą kompartmentu dolnego rozłącznie.
Korzystnie proporcja średnicy pierścienia stabilizującego do średnicy zasobnika wynosi co najmniej 1:1,2.
Korzystnie średnica zasobnika wynosi 10 do 15 mm, a maksymalna średnica pierścienia stabilizującego 8 do 13 mm.
Korzystnie proporcja wysokości kompartmentów dolnego i górnego wynosi co najmniej 0,5 do 1,0
Korzystnie wysokość kompartmentu dolnego nie jest mniejsza niż 20 mm, a górnego 40 mm.
Korzystnie materiał tworzący tuleję łączącą stanowi tworzywo sztuczne.
Korzystnie materiał tworzący tuleję łączącą stanowi tworzywo silikonowe lub kauczukowe.
Korzystnie materiał tworzący kompartmenty stanowi tworzywo sztuczne lub szkło.
PL 238 767 B1
Przedmiot wynalazku uwidoczniony został w przykładzie wykonania na rysunku, na którym fig. 1 przedstawia schematycznie składowe części zasobnika w widoku z boku i z góry.
W przykładzie wykonania kompartmentowy zasobnik do hodowli drobnoustrojów i pozyskania biofilmu dla analizy SEM posiada konstrukcję pionową w kształcie walca, z szerszą podstawą 1 zapewniającą jego stabilne pozycjonowanie w pionie, zamykany od góry korkiem 9. Zasobnik złożony jest z dwóch kompartmentów, dolnego 3 oraz górnego 8, połączonych rozłącznie tuleją 7 z pierściniem stabilizującym 4 na krążek węglowy 6 do hodowli biofilmu. Pierścień stabilizujący 4, z uwagi na fakt konieczności transferu elektronów z emitera SEM, jest pierścieniem przewodzącym. Na powierzchni bocznej pierścienia stabilizującego 4 znajdują się wsporniki 5, umożliwiające jego zaklinowanie w świetle dolnego kompartmentu 3 zasobnika. Kompartment górny 8 i dolny 3 zasobnika stanowią zasadniczo środowisko dla substancji płynnej (podłoże mikrobiologiczne). W dolny kompartment 3 wbudowany jest zawór 2 z przeznaczeniem do usuwania podłoża płynnego. Zawór 2 umieszczony jest maksymalnie 2 mm powyżej podstawy kompartmentu dolnego 3 zasobnika. Średnica zasobnika wynosi od 10 do 15 mm, a maksymalna średnica pierścienia stabilizującego od 8 do 13 mm. Krążek węglowy 6 posiada średnicę nie większą niż 10 mm. Proporcja wysokości kompartmentów 3 i 8 wynosi co najmniej 0,5:1, z zaznaczeniem, że wysokość kompartmentu dolnego 3 nie powinna być mniejsza niż 20 mm, a górnego 40 mm.
Materiał tworzący zasobnik stanowi tworzywo sztuczne lub szkło. Materiał tworzący tuleję łączącą stanowi tworzywo sztuczne, polimerowe, np. silikonowe lub kauczukowe.
Taki układ zapewnia stabilną kultywację formy biofilmowej w warunkach in vitro.
Rozwiązanie według wynalazku zapewnia użycie dowolnego podłoża płynnego jako środowiska wzrostu drobnoustrojów, zapewniając jednocześnie ułatwioną separację kompartmentu dolnego oraz biofilmu na nośniku węglowym, bez względu na skład jakościowo-ilościowy biofilmu. Jako uniwersalne rozwiązanie może zostać wykorzystane dla badania biofilmu bakteryjnego oraz wytwarzanego przez grzyby. Zastosowanie nośnika węglowego w zasobniku umożliwia wzrost zróżnicowanego typu biofilmu w przypadku użycia specyficznego podłoża do hodowli.
Zaletą rozwiązania jest zredukowanie całkowitego czasu przeznaczonego na procedurę przygotowania próbki biofilmu badanej w SEM, ograniczenie czynności przygotowawczych wykonywanych przez personel, atraumatyczne przygotowanie próbki oraz eliminacja niebezpieczeństwa uszkodzenia próbki biofilmu wynikająca ze wzrostu drobnoustrojów na podłożu wysokoprzewodzącym.
Z uwagi na fakt, że wymiar średnicy zasobnika o przekroju okrągłym wynosi optymalnie od 10 mm do 20 mm oraz biorąc pod uwagę wymaganą objętość substancji płynnej do hodowli gromadzonej w zasobniku, minimalna wysokość całego zasobnika według wynalazku powinna wynosić w zakresie od 70 mm do 80 mm w zależności od rodzaju hodowli mikrobiologicznej i przeznaczenia zasobnika. Korzystnym jest, gdy średnica zasobnika wynosi od 10 mm do 15 mm, a maksymalna średnica pierścienia od 8 do 13 mm.

Claims (10)

  1. Zastrzeżenia patentowe
    1. Zasobnik do pozyskiwania biofilmu do analizy mikroskopii elektronowej SEM o pionowej konstrukcji w kształcie walca, znamienny tym, że podstawa walca jest szersza, walec zawiera dwa kompartmenty dolny (3) oraz górny (8) połączone rozłącznie tuleją (7) z przewodzącym pierścieniem stabilizującym (4) na krążek węglowy (6) umieszczonym na wysokości górnej krawędzi kompartmentu dolnego (3) i posiadającym co najmniej cztery wsporniki (5) na powierzchni bocznej, przy czym w dolny kompartment (3) wbudowany jest zawór (2).
  2. 2. Zasobnik według zastrz. 1, znamienny tym, że wsporniki (5) na powierzchni bocznej pierścienia stabilizującego (4) rozlokowane są symetrycznie naprzeciwległe co 90 stopni.
  3. 3. Zasobnik według zastrz. 1, znamienny tym, że pierścień stabilizujący (4) posiada średnicę mniejszą niż średnica zasobnika o co najmniej 1 mm i zintegrowany jest z wewnętrzną ścianą kompartmentu dolnego (3) rozłącznie.
  4. 4. Zasobnik według zastrz. 1, znamienny tym, że proporcja średnicy pierścienia stabilizującego (4) do średnicy zasobnika wynosi co najmniej 1:1,2.
  5. 5. Zasobnik według zastrz. 1, znamienny tym, że średnica zasobnika wynosi 10 do 15 mm, a maksymalna średnica pierścienia stabilizującego 8 do 13 mm.
    PL 238 767 Β1
  6. 6. Zasobnik według zastrz. 1, znamienny tym, że proporcja wysokości kompartmentów dolnego (3) i górnego (8) wynosi co najmniej 0,5 do 1,0.
  7. 7. Zasobnik według zastrz. 1, znamienny tym, że wysokość kompartmentu dolnego (3) nie jest mniejsza niż 20 mm, a górnego (8) 40 mm.
  8. 8. Zasobnik według zastrz. 1, znamienny tym, że materiał tworzący tuleję łączącą (7) stanowi tworzywo sztuczne.
  9. 9. Zasobnik według zastrz. 1, znamienny tym, że materiał tworzący tuleję łączącą (7) stanowi tworzywo silikonowe lub kauczukowe.
  10. 10. Zasobnik według zastrz. 1, znamienny tym, że materiał tworzący kompartmenty stanowi tworzywo sztuczne lub szkło.
PL421673A 2017-05-22 2017-05-22 Zasobnik do pozyskiwania biofilmu do analizy mikroskopii elektronowej SEM PL238767B1 (pl)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL421673A PL238767B1 (pl) 2017-05-22 2017-05-22 Zasobnik do pozyskiwania biofilmu do analizy mikroskopii elektronowej SEM
EP17461633.4A EP3406703B1 (en) 2017-05-22 2017-11-22 Compartment container to prepare biofilm for analysis with scanning electron microscopy (sem)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL421673A PL238767B1 (pl) 2017-05-22 2017-05-22 Zasobnik do pozyskiwania biofilmu do analizy mikroskopii elektronowej SEM

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL421673A1 PL421673A1 (pl) 2018-12-03
PL238767B1 true PL238767B1 (pl) 2021-10-04

Family

ID=61156960

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL421673A PL238767B1 (pl) 2017-05-22 2017-05-22 Zasobnik do pozyskiwania biofilmu do analizy mikroskopii elektronowej SEM

Country Status (2)

Country Link
EP (1) EP3406703B1 (pl)
PL (1) PL238767B1 (pl)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
PL244125B1 (pl) * 2020-05-15 2023-12-04 Politechnika Slaska Im Wincent Kompartmentowy zasobnik do hodowli i namnażania powierzchniowego ludzkich autologicznych fibroblastów na nośniku membranowym

Family Cites Families (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4974243A (en) 1989-12-04 1990-11-27 Axialtome Corporation Positioning system for a X-ray tomography
FR2740561B1 (fr) 1995-10-27 1997-12-19 Inst Francais Du Petrole Methode pour evaluer la variation d'intensite d'un rayonnement polychromatique ayant un spectre de frequence connu, apres traversee d'un corps absorbant
US6599714B1 (en) 1996-03-13 2003-07-29 University Technologies International Inc. Method of growing and analyzing a biofilm
US6596505B2 (en) 2000-04-17 2003-07-22 University Technologies International, Inc. Apparatus and methods for testing effects of materials and surface coatings on the formation of biofilms
US6599696B2 (en) 2000-04-17 2003-07-29 University Technologies International, Inc. Effects of materials and surface coatings on encrustation and biofilm formation
CA2451789C (en) * 2001-06-29 2012-03-27 Meso Scale Technologies, Llc. Assay plates, reader systems and methods for luminescence test measurements
US7871791B2 (en) 2007-01-18 2011-01-18 Allegheny-Singer Research Institute Biofilm preparation using potassium permanganate
US20110236769A1 (en) * 2010-03-23 2011-09-29 Xing Xie Three dimensional electrodes useful for microbial fuel cells
EP2609189A4 (en) * 2010-08-24 2015-08-05 Hawley & Hazel Chemical Co Zhongshan Ltd METHODS, DEVICES AND USES RELATED TO BIOFILMS

Also Published As

Publication number Publication date
PL421673A1 (pl) 2018-12-03
EP3406703B1 (en) 2021-12-22
EP3406703A1 (en) 2018-11-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Guillard et al. Counting cells in cultures with the light microscope
McDonald et al. “Tips and tricks” for high-pressure freezing of model systems
US8633017B2 (en) Device, a system and a method for monitoring and/or cultivation of microscopic objects
KR101446526B1 (ko) 마이크로플루이딕 멀티-웰 기반의 세포배양검사 장치
CN105828948A (zh) 使用分离液进行样品浓缩和检测的系统和方法
CN105378051A (zh) 用于培养细胞的结构件
JP7450269B2 (ja) 灌流可能なバイオリアクタ
CN202322856U (zh) 用于高通量、高分辨免疫荧光染色的细胞培养装置
PL238767B1 (pl) Zasobnik do pozyskiwania biofilmu do analizy mikroskopii elektronowej SEM
FI57128C (fi) Saett att identifiera mikroorganismer
US9249382B2 (en) Devices and methods for the selective isolation of microorganisms
CN109475873A (zh) 用于微生物菌落取样的端部配件和装置及使用它们的取样方法
CN202322857U (zh) 用于高通量、高分辨成像的细胞培养印玻片
IL194085A (en) Devices and methods for isolating and cultivating microorganisms
CN204417516U (zh) 激光扫描共聚焦显微镜专用微量细胞培养皿
RU182023U1 (ru) Ростовая камера для культивирования микроорганизмов
DE102018132120B4 (de) Probenaufnahmeeinrichtung für biologische Proben mit einer Probenaufnahme aus Kohlenstoff-basiertem Werkstoff
CN207385521U (zh) 一种医用检验标本架
DE102023109953B3 (de) Scaffold-Halter
CN202519250U (zh) 一种多用微生物检验玻片
Putriningsih et al. Macroconidia of dermatophytes fungi on direct microscopic examinations
WO2014057233A2 (en) Screening method and apparatus
CN106399494B (zh) 活体内原位检测分析微生物相互作用的方法
CN202427457U (zh) 用于加热生物样品的透气容器
WO2014207857A1 (ja) 細胞毒性試験装置、及び細胞毒性試験方法