PL229055B1 - DNA sequence, oligonucleotide primers, DNA sequence with the recognition sites for restriction enzymes NdeI and XhoI, expression vector and method for the preparation thereof, recombinant strain of Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS and method for the preparation thereof and method for obtaining recombinant protein with oligo-histidine tag of Deinococcus radiodurans DSMZ 20 539 trehalose synthase (TS) - Google Patents
DNA sequence, oligonucleotide primers, DNA sequence with the recognition sites for restriction enzymes NdeI and XhoI, expression vector and method for the preparation thereof, recombinant strain of Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS and method for the preparation thereof and method for obtaining recombinant protein with oligo-histidine tag of Deinococcus radiodurans DSMZ 20 539 trehalose synthase (TS)Info
- Publication number
- PL229055B1 PL229055B1 PL392388A PL39238810A PL229055B1 PL 229055 B1 PL229055 B1 PL 229055B1 PL 392388 A PL392388 A PL 392388A PL 39238810 A PL39238810 A PL 39238810A PL 229055 B1 PL229055 B1 PL 229055B1
- Authority
- PL
- Poland
- Prior art keywords
- dsmz
- preparation
- plyss
- escherichia coli
- deinococcus radiodurans
- Prior art date
Links
Description
Przedmiotem wynalazku jest sposób otrzymywania rekombinantowego szczepu Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS zawierającego wklonowane DNA z fragmentem kodującym białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 oraz sposób wytwarzania białka syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539.The present invention relates to a method for the preparation of a recombinant Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS strain containing cloned DNA with a fragment encoding the Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539 and a method for the production of Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539.
Trehaloza (a-D-glukopiranozylo-1,1a-D-glukopiranozyd) jest cukrem nieredukującym, zbudowanym z dwóch cząsteczek glukozy połączonych wiązaniem a-1,1-glikozydowym. Trehaloza łatwo ulega hydrolizie do glukozy i może pełnić w komórce rezerwę tego cukru. Występowanie trehalozy stwierdzono w komórkach grzybów i drożdży, bakterii, nicieni, owadów, jaj, poczwarek oraz niektórych roślin. Właściwości trehalozy czynią z niej potencjalne źródło wielu zastosowań w medycynie, weterynarii, przemyśle farmaceutycznym i spożywczym.Trehalose (α-D-glucopyranosyl-1,1a-D-glucopyranoside) is a non-reducing sugar composed of two glucose molecules linked by an α-1,1-glycosidic bond. Trehalose is easily hydrolyzed to glucose and can fill the cell's reserve of this sugar. The occurrence of trehalose was found in the cells of fungi and yeasts, bacteria, nematodes, insects, eggs, pupae and some plants. The properties of trehalose make it a potential source of many applications in human, veterinary, pharmaceutical and food industries.
Biosynteza trehalozy w żywych komórkach prowadzona jest różnymi znanymi szlakami metabolicznymi, między innymi z wykorzystaniem syntazy trehalozy.Trehalose biosynthesis in living cells is carried out by various known metabolic pathways, including the use of trehalose synthase.
Bakterie z rodzaju Deinococcus należą do mikroorganizmów wytwarzających syntazę trehalozy.Bacteria of the genus Deinococcus belong to the microorganisms that produce trehalose synthase.
Geny kodujące białka syntazy trehalozy mikroorganizmów rodzaju Deinococcus klonowano w komórkach E. coli. Prowadzono również biosyntezę termostabilnych enzymów w komórkach mezofilnego gospodarza w układzie Tabora-Studiera. Niestety zastosowane układy ekspresyjne E. coli oraz z zastosowaniem kosztownego induktora jakim jest IPTG (isopropyl-beta-D-thiogalaktopyranozyd) nie należą do optymalnych i najbardziej wydajnych. Ponadto otrzymywane białka nie posiadały ułatwiające w znaczący sposób proces otrzymywania metki oligohistydynowej, a w trakcie samej procedury oczyszczania nie stosowano etapu wstępnej denaturacji termicznej białek gospodarza.The genes encoding the trehalose synthase proteins of microorganisms of the genus Deinococcus were cloned in E. coli cells. The biosynthesis of thermostable enzymes in mesophilic host cells was also carried out in the Tabor-Studier system. Unfortunately, the E. coli expression systems used and with the use of the expensive inducer IPTG (isopropyl-beta-D-thiogalactopyranoside) are not optimal and the most efficient. Moreover, the obtained proteins did not have the oligohistidine tag which would significantly facilitate the process of obtaining the oligohistidine tag, and the preliminary thermal denaturation of the host proteins was not used during the purification procedure itself.
W trakcie prowadzonych prac wykonano izolację i klonowanie genu kodującego syntazę trehalozy pochodzącej z Deinococcus radiodurans do wektorów ekspresyjnych w układzie Tabora-Studiera oraz arabinozowym oraz jego sprawdzono ekspresję w różnych gospodarzach. Ustalono także optymalny sposób oczyszczania i określono właściwości białek rekombinantowych typu dzikiego DraST w układzie arabinozowym i z domeną oligohistydynową DraSTHis.In the course of the work, the isolation and cloning of the gene encoding the Deinococcus radiodurans trehalose synthase into expression vectors in the Tabora-Studier and arabinose systems were performed, and its expression in various hosts was checked. The optimal purification process was also established and the properties of DraST wild-type recombinant proteins in the arabinose system and with the DraSTHis oligohistidine domain were determined.
Oczyszczanie białka polega na nowatorskim zastosowaniu wstępnej denaturacji białek gospodarza oraz chromatografii metalopowinowactwa.Protein purification is based on the innovative application of pre-denaturation of host proteins and metal affinity chromatography.
Dla białka DraSTHis uzyskano preparat o wysokiej czystości. Ustalono optymalne warunki działania zarówno dla białka DraST jak i DraSTHis. Za optymalne warunki działania enzymu wyznaczono zakres temperatur od 5 do 20°C oraz pH 6,5.A high purity preparation was obtained for the DraSTHis protein. The optimal operating conditions for both DraST and DraSTHis proteins have been established. The temperature range from 5 to 20 ° C and pH 6.5 were determined as the optimal conditions for the enzyme operation.
Sączenie molekularne pozwoliło wyznaczyć masę cząsteczkową białka DraSTHis, która wynosi 126,9 kDa, która odpowiada masie homodimeru.Molecular filtration allowed the determination of the molecular weight of the DraSTHis protein, which is 126.9 kDa, which corresponds to the mass of the homodimer.
Sposób otrzymywania rekombinantowego szczepu Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS o symbolu Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek/LICDraSTH, charakteryzuje się według wynalazku tym, że uzyskuje się fragment DNA kodujący białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 o wzorze 3 poprzez amplifikację DNA z zastosowaniem starterów oligonukleotydowych o wzorze 2 i o symbolach DraSTNdeF i DraSTXhoR. Uzyskany fragment DNA klonuje się do wektora plazmidowego pET30Ek/LIC, w wyniku czego uzyskuje się wektor plazmidowy o wzorze 4 i o symbolu pET30Ek//LICDraSTH, zawierający wklonowane DNA z fragmentem kodującym białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539, z fragmentami rozpoznawanymi przez enzymy restrykcyjne Ndel i XhoI, z miejscem wiązania rybosomów rbs, z genem oporności na kanamycynę, z origin plazmidu pBR322, z origin f1, regionem polihistydynowym, promotorem T7, sekwencją kodującą S-Tag, z miejscem terminacji transkrypcji T7, z miejscem operatorowym lacI. Następnie otrzymanym wektorem transformuje się komórki Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS.The method of obtaining the recombinant Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS strain, symbol Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek / LICDraSTH, is characterized according to the invention in that a DNA fragment encoding the Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 of the formula 3 is obtained. using oligonucleotide primers of formula 2 and symbols DraSTNdeF and DraSTXhoR. The obtained DNA fragment is cloned into the pET30Ek / LIC plasmid vector, as a result of which the plasmid vector of formula 4 and the symbol pET30Ek // LICDraSTH is obtained, containing the cloned DNA with the fragment encoding the Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539, with fragments recognized by restriction enzymes and XhoI, with the rbs ribosome binding site, with the kanamycin resistance gene, with the origin of the pBR322 plasmid, with the origin f1, the polyhistidine region, the T7 promoter, the S-Tag coding sequence, with the T7 transcription termination site, with the lacI operator site. Then Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS cells were transformed with the obtained vector.
Sposób wytwarzania białka syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 polegający na produkcji białka przez komórki rekombinantowego szczepu bakterii w pożywkach płynnych, charakteryzuje się według wynalazku tym, że prowadzi się hodowlę komórek szczepu bakterii o symbolu Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek/LICDraSTH w temperaturze początkowej od 35°C do 38°C. Następnie po uzyskaniu gęstości zawiesiny komórkowej od 0,3 do 0,9 prowadzi się nadekspresję genu kodującego białko przez od 2 do 24 godzin, poprzez dodanie do pożywki induktora jakim jest IPTG o stężeniu od 0,05 mM do 10 mM, a po oddzieleniu zawiesiny komórkowej od płynu pohodowlanego, dezintegracji komórek i wstępnej termicznej denaturacji, na drodze wirowania izoluje się białka rozpuszczalne. Następnie oczyszcza się je stosując jeden etap oczyszczania na złożach wiążących koordynacyjnie, odwracalnie jony metali IDA-Co, po czym zagęszcza i zawiesza w buforze do przechowywania.The method for producing the Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 trehalose synthase protein consisting in the production of the protein by cells of a recombinant bacterial strain in liquid media, is characterized according to the invention in that cells of the Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek / LICDraSTH bacterial strain are cultivated at a temperature of starting from 35 ° C to 38 ° C. Then, after obtaining a density of the cell suspension from 0.3 to 0.9, overexpression of the gene encoding the protein is carried out for 2 to 24 hours by adding an inducer, which is IPTG, with a concentration of 0.05 mM to 10 mM to the medium, and after separating the suspension from the culture fluid, cell disintegration and initial thermal denaturation, the soluble proteins are isolated by centrifugation. They are then purified using one purification step on IDA-Co coordinated reversible metal ion-binding beds, then concentrated and suspended in storage buffer.
PL 229 055 B1PL 229 055 B1
Bufor do przechowywania ma korzystnie następujący skład: 0,85% NaCI, 20% glicerol (v/v), 5 mM EDTA, 1 mM DTT, 1 mM PMSF, 0,05% IGEPAL.The storage buffer preferably has the following composition: 0.85% NaCl, 20% glycerol (v / v), 5mM EDTA, 1mM DTT, 1mM PMSF, 0.05% IGEPAL.
Uzyskane według wynalazku rekombinantowe białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 cechuje się dużą aktywności w temperaturach pokojowych i poniżej pokojowych co umożliwia zastosowanie go w ciągłej konwersji maltozy do trehalozy bez konieczności ponoszenia nakładów na ogrzewanie bioreaktora kolumnowego.The recombinant Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 trehalose synthase protein obtained according to the invention is characterized by high activity at room and sub-room temperatures, which allows it to be used in the continuous conversion of maltose into trehalose without the need to incur expenditure on heating the column bioreactor.
Sposób według wynalazku umożliwia uzyskanie rekombinantowego białka syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 szybką metodą charakteryzującą się ograniczoną liczbą etapów potrzebnych do uzyskania preparatu białkowego.The method according to the invention makes it possible to obtain the recombinant Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 trehalose synthase protein by a fast method characterized by a limited number of steps needed to obtain a protein preparation.
Wynalazek objaśniony jest bliżej w przykładach wykonania i na rysunkach, na którym na fig. 1 przedstawiono fragment DNA o wzorze 3 z zaznaczeniem sekwencji genu syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 i fragmentów DNA rozpoznawanych przez enzymy restrykcyjne Ndel i XhoI;The invention is explained in more detail in the working examples and in the drawings, in which Fig. 1 shows the DNA fragment of the formula 3 with the sequence of the Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 trehalose synthase gene and DNA fragments recognized by the restriction enzymes NdeI and XhoI;
na fig. 2 przedstawiono sekwencję nukleotydową wektora plazmidowego pET30Ek/LICDraSTH w rejonie klonowania fragmentu DNA o wzorze 3 oraz sekwencję aminokwasową białka powstającego w komórkach Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS transformowanych DNA wektora ekspresyjnego pET30Ek/LICDraSTH;Figure 2 shows the nucleotide sequence of the pET30Ek / LICDraSTH plasmid vector in the cloning region of the DNA fragment of formula 3 and the amino acid sequence of the protein produced in Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS cells transformed with pET30Ek / LICDraSTH expression vector DNA;
na fig. 3 przedstawiono wynik rozdziału elektroforetycznego w 12% żelu poliakrylamidowym z 6% warstwą zagęszczającą frakcji pochodzących z kolejnych etapów izolacji i oczyszczania białka syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 produkowanego przez rekombinantowy szczep Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek/LICDraSTH;Figure 3 shows the result of the electrophoretic separation on a 12% polyacrylamide gel with a 6% thickening layer of fractions from the subsequent isolation and purification steps of the Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539 produced by the recombinant Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek / LICDraSTH strain;
na fig. 4 przedstawiono schemat uzyskania fragmentu DNA o wzorze 3 z zaznaczeniem sekwencji genu syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 i fragmentów DNA rozpoznawanych przez enzymy restrykcyjne Ndel i XhoI oraz wektora ekspresyjnego o wzorze 4 i o symbolu pET30Ek/LICDraSTH.Figure 4 shows a scheme for obtaining a DNA fragment of formula 3 with the sequence of the Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 trehalose synthase gene and DNA fragments recognized by the restriction enzymes NdeI and XhoI and the expression vector of formula 4 and the symbol pET30Ek / LICDraSTH.
P r z y k ł a d 1P r z k ł a d 1
Otrzymywanie sekwencji DNA kodującej białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539.Preparation of DNA sequence encoding Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539.
W celu amplifikacji DNA kodującego białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 syntetyzuje się w znany sposób startery oligonukleotydowe o wzorze 2 i o symbolach DraSTNdeF i DraSTXhoR. Reakcję amplifikacji DNA kodującego białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 wykonuje się z użyciem starterów DraSTNdeF (0,2 μM) i DraSTXhoR (0,2 μM) na matrycy wyizolowanego DNA genomowego w buforze zawierającym: 20 mM Tris-HCl pH 8,8, 10 mM KCl, 10 mM (NH4)2SO4, 2 mM MgSO4, 0,1% Triton X-100, 200 μM każdego z trifosforanów deoksyrybonukleozydów (dNTP) i 0,2 U polimerazy DNA Pwo produkowanej przez DNA-Gdańsk II s.c., Gdańsk, Polska. Reakcję przeprowadza się w termocyklerze w następujących warunkach temperaturowo-czasowych: 95°C - 1 minuta, 63,5°C - 1,5 minut, 72°C - 2 minuty; 35 cykli. W wyniku reakcji amplifikacji uzyskuje się fragment DNA o wzorze 3. Fragment DNA o wzorze 3 z dokładnym zaznaczeniem sekwencji genu kodującego białko syntazy treahlozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 i fragmentów DNA rozpoznawanych przez enzymy restrykcyjne Ndel i XhoI przedstawiono na fig. 1.For the amplification of DNA encoding the Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 trehalose synthase protein, oligonucleotide primers of the formula 2 and the symbols DraSTNdeF and DraSTXhoR are synthesized in a known manner. The amplification reaction of the DNA encoding the Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 trehalose synthase protein is performed using the primers DraSTNdeF (0.2 μM) and DraSTXhoR (0.2 μM) on the template of the isolated genomic DNA in a buffer containing: 20 mM Tris-HCl pH 8.8, 10 mM KCl, 10 mM (NH4) 2SO4, 2 mM MgSO4, 0.1% Triton X-100, 200 μM of each deoxyribonucleoside triphosphate (dNTP) and 0.2 U of Pwo DNA polymerase produced by DNA-Gdańsk II sc, Gdańsk , Poland. The reaction is carried out in a thermal cycler under the following temperature-time conditions: 95 ° C - 1 minute, 63.5 ° C - 1.5 minutes, 72 ° C - 2 minutes; 35 cycles. The amplification reaction yields a DNA fragment of formula 3. A DNA fragment of formula 3 with the exact sequence of the gene encoding the Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 treahlose synthase protein and DNA fragments recognized by the restriction enzymes NdeI and XhoI are shown in Fig. 1.
P r z y k ł a d 2P r z k ł a d 2
Otrzymywanie wektora ekspresyjnego o wzorze 4 i o symbolu pET30Ek/LICDraSTH oraz rekombinantowego szczepu Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek/LICDraSTH.Preparation of the expression vector of formula 4 and symbol pET30Ek / LICDraSTH and recombinant Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek / LICDraSTH strain.
Schemat uzyskania wektora ekspresyjnego o wzorze 4 i o symbolu pET30Ek/LICDraSTH ilustruje fig. 4. W celu uzyskania wektora plazmidowego pET30Ek/LICDraSTH przeprowadza się klonowanie fragmentu DNA o wzorze 3 otrzymanego według przykładu 1 do wektora ekspresyjnego pET30Ek/LIC firmy Merck. W tym celu przeprowadza się reakcję ligacji fragmentu DNA o wielkości 5234 par zasad powstałego w wyniku trawienia plazmidu pET30Ek/LIC firmy Merck enzymami restrykcyjnymi Ndel i XhoI (wektora) z fragmentem DNA o wielkości 1658 par zasad powstałym po trawieniu produktu PCR o wzorze 3 enzymami restrykcyjnymi Ndel i XhoI (insertu), w temperaturze 17°C przez 3 godziny z użyciem 2 U DNA ligazy faga T4, stosując bufor reakcyjny: 33 mM Tris-CH3COOH pH=7,8; 10 mM (CH3COO)2Mg; 66 mM CH3COOK; 0,5 mM DTT; 1 mM ATP.The scheme of obtaining the expression vector of formula 4 and the symbol pET30Ek / LICDraSTH is shown in Fig. 4. In order to obtain the plasmid vector pET30Ek / LICDraSTH, the DNA fragment of formula III obtained according to example 1 is cloned into the pET30Ek / LIC expression vector from Merck. For this purpose, a DNA fragment of 5,234 bp resulting from digestion of the Merck plasmid pET30Ek / LIC with restriction enzymes NdeI and XhoI (vector) is carried out with a DNA fragment of 1658 bp resulting from digestion of the PCR product of formula 3 with restriction enzymes NdeI and XhoI (insert) at 17 ° C for 3 hours with 2 U of T4 DNA ligase using reaction buffer: 33 mM Tris-CH3COOH pH = 7.8; 10mM (CH3COO) 2Mg; 66 mM CH3COOK; 0.5 mM DTT; 1 mM ATP.
Następnie mieszaniną reakcyjną transformuje się komórki kompetentne Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS i po wytrząsaniu przez okres 1 h, w temperaturze 37°C, przy około 230 rpm, w 250 μl pożywki LB wysiewa na pożywkę LA (pożywka LB z dodatkiem 1,5% agaru wg Sambrook i in., 1989), zawierającą tetracyklinę i kanamycynę.Then the reaction mixture is transformed into Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS competent cells and, after shaking for 1 h at 37 ° C, about 230 rpm, in 250 μl of LB medium, it is plated on LA medium (LB medium supplemented with 1.5 % agar according to Sambrook et al., 1989), containing tetracycline and kanamycin.
PL 229 055 B1PL 229 055 B1
Uzyskane kolonie bakteryjne Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek/LICDraSTH zawierające ekspresyjne wektory plazmidowe przesiewa się na pożywkę LB z dodatkiem tetracykliny i kanamycyny i hoduje się w celu izolacji DNA plazmidowego.The resulting Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek / LICDraSTH bacterial colonies containing plasmid expression vectors are screened on LB medium supplemented with tetracycline and kanamycin and grown to isolate plasmid DNA.
W wyniku izolacji uzyskuje się DNA wektora plazmidowego o wzorze 4 i o symbolu pET30Ek/LICDraSTH, który zawiera wklonowany gen kodujący białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 pod kontrolą silnego promotora faga T7 (fig. 2), co potwierdza się poprzez analizę restrykcyjną i sekwencjonowanie DNA, np. metodą Sangera.As a result of the isolation, DNA of the plasmid vector of formula 4 and symbol pET30Ek / LICDraSTH was obtained, which contains the cloned gene encoding the Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539 under the control of the strong T7 phage promoter (Fig. 2), which was confirmed by restriction analysis and DNA sequencing , e.g. by the Sanger method.
Dokładną sekwencję nukleotydową wektora plazmidowego o wzorze 4 i symbolu pET30Ek/LICDraSTH w rejonie klonowania fragmentu DNA o wzorze 3 ilustruje fig. 2.The exact nucleotide sequence of the plasmid vector of formula 4 and the symbol pET30Ek / LICDraSTH in the cloning region of the DNA fragment of formula 3 is illustrated in Figure 2.
P r z y k ł a d 3P r z k ł a d 3
Otrzymywanie białka syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539.Preparation of Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539.
Uzyskuje się sekwencję DNA kodującą białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 wraz z miejscami rozpoznania dla enzymów restrykcyjnych Ndel i XhoI o wzorze 3 według przykładu 1.The DNA sequence encoding the Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539 is obtained along with the recognition sites for the restriction enzymes NdeI and XhoI of Formula 3 according to Example 1.
Następnie otrzymuje się ekspresyjny wektor plazmidowy o wzorze 4 i o symbolu pET30Ek//LICDraSTH zgodnie z przykładem 2.The expression vector plasmid of formula 4 and the symbol pET30Ek // LICDraSTH is then obtained according to example 2.
W kolejnym etapie poprzez transformację komórek kompetentnych Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS i presję selekcyjną na podłoży z chloramfenikolem i kanamycyną otrzymuje się rekombinantowy szczep Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek/LICDraSTH.In the next step, the recombinant Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek / LICDraSTH strain is obtained by transforming Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS competent cells and selective pressure on chloramphenicol and kanamycin media.
Szczep hoduje się w pożywce LB z dodatkiem ampicyliny przez 18 godzin w temperaturze 37°C. Hodowlą nocną rekombinantowego szczepu E. coli szczepi się 500 ml pożywki LB z antybiotykiem i po uzyskaniu w hodowli gęstości zawiesiny komórkowej na poziomie OD600nm>0,5 indukuje się ekspresję białka syntazy trehalozy IPTG. Hodowle po 3,5 godzinach od indukcji przeprowadzoną w temperaturze pokojowej (objętość pożywki 500 ml) wiruje się przez 10 minut przy 5000 rpm. Osad bakteryjny zawiesza w 30 ml buforu lizującego, homogenizuje i poddaje działaniu ultradźwięków przez 10 s - przy amplitudze A=30%, powtarzając procedurę trzykrotnie w krótkich odstępach czasowych. Otrzymany totalny lizat wiruje się przez 40 minut przy 9 000 rpm. Białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 oczyszcza się na drodze strącania termicznego innych obecnych w preparacie białek (białka mezofilnej bakterii E. coli) w temperaturze 56°C, przez 10 minut. Lizat wiruje się przez 30 minut przy 12000 rpm. Supernatant zawierający niezdenaturowane białka rozpuszczalne poddaje się dalszemu oczyszczaniu stosując chromatografię metalopowinowactwa. W innym wariancie oczyszczania można poddawać otrzymane białka strącaniu siarczanem amonu lub wytrącaniu etanolem, acetonem, izopropanolem lub innym alkoholem niskorzędowym.The strain is cultivated in LB medium supplemented with ampicillin for 18 hours at 37 ° C. An overnight culture of the recombinant E. coli strain is inoculated with 500 ml of LB medium with antibiotic, and after the culture has reached a cell suspension density of OD 600nm> 0.5, expression of IPTG trehalose synthase protein is induced. Cultures 3.5 hours after induction performed at room temperature (500 ml medium volume) are centrifuged for 10 minutes at 5000 rpm. The bacterial pellet is suspended in 30 ml of lysis buffer, homogenized and sonicated for 10 s - at amplitude A = 30%, repeating the procedure three times at short intervals. The resulting total lysate is centrifuged for 40 minutes at 9,000 rpm. Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 trehalose synthase protein is purified by thermal precipitation of other proteins present in the preparation (mesophilic E. coli protein) at 56 ° C for 10 minutes. The lysate is centrifuged for 30 minutes at 12,000 rpm. The supernatant containing undenatured soluble proteins is further purified using metal affinity chromatography. In another variant of the purification, the proteins obtained can be subjected to precipitation with ammonium sulphate or precipitation with ethanol, acetone, isopropanol or other low-alcohol alcohol.
Kolumnę ze złożem IDA-Co kalibruje się 5 objętościami złoża buforu A: 5 mM imidazolu, 50 mM bufor fosforanowy, 50 mM NaCl o pH=7,6. Następnie na złoże nanosi się ilość całkowitego ekstraktu bezkomórkowego równą objętościowo objętości złoża. Kolumnę płucze się buforem niskosolnym A: 5 mM, 50 mM bufor fosforanowego, 50 mM NaCl i A' o stężeniu 25 mM imidazolu, 50 mM bufor fosforanowy, 50 mM NaCl o pH=7,6 celem usunięcia niezwiązanych ze złożem białek. Elucję DraST prowadzi się dwoma porcjami po 10 ml wysokosolnego buforu fosforanowego o pH=7,6 i stężeniu imidazolu 500 mM, 50 mM bufor fosforanowy, 50 mM NaCl.The IDA-Co matrix column is calibrated with 5 bed volumes of buffer A: 5 mM imidazole, 50 mM phosphate buffer, 50 mM NaCl, pH 7.6. Then, an amount of total cell-free extract equal to the volume of the bed is applied to the bed. The column is washed with low salt A buffer: 5 mM, 50 mM phosphate buffer, 50 mM NaCl and A 'at 25 mM imidazole, 50 mM phosphate buffer, 50 mM NaCl at pH = 7.6 to remove unbound proteins. DraST is eluted with two 10 ml aliquots of high-salt phosphate buffer with pH = 7.6 and an imidazole concentration of 500 mM, 50 mM phosphate buffer, 50 mM NaCl.
Preparat po oczyszczaniu na kolumnie IDA-Co należy trzykrotne zwirować na filtrach wirówkowych o wielkości odcięcia równej 30 kDa (Amicon, Millipore), przy 5000 rpm, przez 30 minut, dodając kolejno uzyskane powyżej frakcje elucyjne celem zagęszczenia białka. W trakcie zagęszczania należy wymienić bufor wysokosolny na bufor do przechowywania preparatu białkowego (np. zawierającego inhibitory proteaz lub glicerol, i/lub sól fizjologiczną. Korzystnie o składzie: 0,85% NaCl, 20% glicerol (v/v), 5 mM EDTA, 1 mM DTT, 1 mM PMSF, 0,05% IGEPAL. W innym wariancie uzyskany preparat białkowy można dializować do żądanego buforu. Możliwe jest także zastosowanie do konwersji maltozy do trehalozy całkowitego ekstraktu bezkomórkowego już po etapie lizy lub tylko po wstępnej termicznej denaturacji białek gospodarza.The preparation after purification on the IDA-Co column should be centrifuged three times on centrifuge filters with a cut-off of 30 kDa (Amicon, Millipore), at 5000 rpm, for 30 minutes, successively adding the elution fractions obtained above to concentrate the protein. During concentration, the high-salt buffer should be replaced with a buffer for storing the protein preparation (e.g. containing protease inhibitors or glycerol and / or saline. Preferably, the composition consists of: 0.85% NaCl, 20% glycerol (v / v), 5 mM EDTA , 1 mM DTT, 1 mM PMSF, 0.05% IGEPAL. In another variant, the obtained protein preparation can be dialyzed into the desired buffer. It is also possible to use the total cell-free extract for the conversion of maltose to trehalose after the lysis step or only after the initial thermal denaturation of the proteins the host.
Wyniki biosyntezy i oczyszczania białka syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20339 analizuje się metodą elektroforezy w 12% zolu poliakrylamidowym w warunkach denaturujących w obecności odpowiedniego białkowego markera wielkości, co przedstawiono na fig. 3 i 3a.The results of the biosynthesis and purification of Deinococcus radiodurans DSMZ 20339 trehalose synthase protein are analyzed by electrophoresis on a 12% polyacrylamide sol under denaturing conditions in the presence of an appropriate size marker protein as shown in Figures 3 and 3a.
PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1
Wzór 1. Sekwencje genu kodującego białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539Formula 1. Sequences of the gene encoding the Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539
ATGACCCAGGCACACCCGGAGTGGTACAAGAGCGCTGTCTTCTACGAACTGTCCGTGCATGACCCAGGCACACCCGGAGTGGTACAAGAGCGCTGTCTTCTACGAACTGTCCGTGC
GGACCTTTCAGGACGGCAACGGCGACGGCAAGGGCGATTTTCCCGGCCTGACCTCGCGGACCTTTCAGGACGGCAACGGCGACGGCAAGGGCGATTTTCCCGGCCTGACCTCGC
GGCTGGACTACCTGAAAAACCTCGGCGTGGACTGCCTGTGGTTGCTGCCCTGGTTTCCGGCTGGACTACCTGAAAAACCTCGGCGTGGACTGCCTGTGGTTGCTGCCCTGGTTTCC
CAGCCCACTGCGCGACGACGGGTACGACGTGGCCGACTACCGGGGGATTCACCCTGACAGCCCACTGCGCGACGACGGGTACGACGTGGCCGACTACCGGGGGATTCACCCTGA
CCTCGGCACGCTCGACGACTTCAAGGTCTTTCTGCGCGAAGCCCACGCCCGGGGCCTGCCTCGGCACGCTCGACGACTTCAAGGTCTTTCTGCGCGAAGCCCACGCCCGGGGCCTG
CGGGTCATCGGCGACCTGGTGACCAACCACACGTCCAGCGACCACCCCTGGTTTCAGGCGGGTCATCGGCGACCTGGTGACCAACCACACGTCCAGCGACCACCCCTGGTTTCAGG
CGGCGCGGCGCGGCCCGACCCTGCCCGACGGCTCGCCCAACGAGTACCACGACTACTCGGCGCGGCGCGGCCCGACCCTGCCCGACGGCTCGCCCAACGAGTACCACGACTACT
ACGTCTGGAGCGACGAGGGCAAGGAATACGCCGACACCCGCATCATCTTCACCGACAACGTCTGGAGCGACGAGGGCAAGGAATACGCCGACACCCGCATCATCTTCACCGACA
CCGAGGTCAGCAACTGGACGCTCGACGAGCAGGCAGGCAAGTATTACTGGCACCGCTCCGAGGTCAGCAACTGGACGCTCGACGAGCAGGCAGGCAAGTATTACTGGCACCGCT
TTTTCGCCAGCCAGCCGGACCTGAACTACGACAACCCGAAAGTGGTGGAAGAACTTCTTTTCGCCAGCCAGCCGGACCTGAACTACGACAACCCGAAAGTGGTGGAAGAACTTC
ACGGCGCCGCCCGCTTCTGGCTCGACCTCGGCCTCGACGGGTTCCGGGTGGACGCCGTACGGCGCCGCCCGCTTCTGGCTCGACCTCGGCCTCGACGGGTTCCGGGTGGACGCCGT
GCCCTACCTCATCGAGCGCGAGGGCACGAGCTGCGAGAATCTGCCCGAAACACACGAGCCCTACCTCATCGAGCGCGAGGGCACGAGCTGCGAGAATCTGCCCGAAACACACGA
GATTCTCAAGGGCTTCCGGGCGATGGTGGACCGCGAGTATCCGGGGCGGCTGCTGCTTGATTCTCAAGGGCTTCCGGGCGATGGTGGACCGCGAGTATCCGGGGCGGCTGCTGCTT
GCCGAGGCGAACCAGTGGCCCGAGGAAGTCGTCGAGTACTTCGGCACCGAAGCCGAGGCCGAGGCGAACCAGTGGCCCGAGGAAGTCGTCGAGTACTTCGGCACCGAAGCCGAG
CCCGAGTTCCACATGTGCTTCAACTTCCCGGTGATGCCCCGGCTGTACATGAGCCTGACCCGAGTTCCACATGTGCTTCAACTTCCCGGTGATGCCCCGGCTGTACATGAGCCTGA
AAAGGGAGGACACCTCCAGCATCCGCGAGATCATGGGCCGCCTGCCGAAAATCCCGAAAAGGGAGGACACCTCCAGCATCCGCGAGATCATGGGCCGCCTGCCGAAAATCCCGA
GTTTCGGCCAGTGGTGCACCTTCCTGCGCAACCACGACGAACTGACGCTGGAAATGGTGTTTCGGCCAGTGGTGCACCTTCCTGCGCAACCACGACGAACTGACGCTGGAAATGGT
CACCGACGACGAGCGCGCCTTCATGTATGCCGCCTACGCGCCCGACGCCCGCATGAACACCGACGACGAGCGCGCCTTCATGTATGCCGCCTACGCGCCCGACGCCCGCATGAA
AATCAACGTGGGCATCCGCCGTCGCCTCGCGCCGCTGCTCGACAACGACCGGCGCCGAATCAACGTGGGCATCCGCCGTCGCCTCGCGCCGCTGCTCGACAACGACCGGCGCCG
CATCGAGCTGCTGAACACTGTGCTCCTCGCCCTGCCCGGCAGCCCCATCCTGTACTACCATCGAGCTGCTGAACACTGTGCTCCTCGCCCTGCCCGGCAGCCCCATCCTGTACTAC
GGCGACGAAATCGGCATGGGCGACGACCTCGGCCTGCCCGACCGCAACGGCGTGCGCGGCGACGAAATCGGCATGGGCGACGACCTCGGCCTGCCCGACCGCAACGGCGTGCGC
ACCCCGATGCAGTGGAACGCGGGCACCAGCGGCGGTTTTTCCACTGCGCAGCCCTCCGACCCCGATGCAGTGGAACGCGGGCACCAGCGGCGGTTTTTCCACTGCGCAGCCCTCCG
ACTGCTTTTTCCCGCCGATTCAGGACCCGGTGTACGGCTTCGGGCGCGTCAACGTGCAACTGCTTTTTCCCGCCGATTCAGGACCCGGTGTACGGCTTCGGGCGCGTCAACGTGCA
GAGCCAGCTCCAAGACCCCAGCAGCCTGCTGAAGTGGACCGCCCGGCAACTCGAACTGAGCCAGCTCCAAGACCCCAGCAGCCTGCTGAAGTGGACCGCCCGGCAACTCGAACT
GCGCCGCGCCCACCCCGCCTTTGCGCACGGCGACCTCACCTTCATCGAAACCGGCAACGCGCCGCGCCCACCCCGCCTTTGCGCACGGCGACCTCACCTTCATCGAAACCGGCAAC
CCCGCCATCCTCGCCTTTACCCGCCAGTACGACGGCGAAACGCTGCTCATCGTCAGCACCCGCCATCCTCGCCTTTACCCGCCAGTACGACGGCGAAACGCTGCTCATCGTCAGCA
ACTTCGCGGGCAACGCCCAGGCCGGGCTGCTCGATCTCGCGCCCTTCGTGGGCCGCGCACTTCGCGGGCAACGCCCAGGCCGGGCTGCTCGATCTCGCGCCCTTCGTGGGCCGCGC
CCCGGTCACACTTTCCGGGGCCAGCCCGCTGCCGGTGGTCACTGGAAACGGCCAGTACCCCGGTCACACTTTCCGGGGCCAGCCCGCTGCCGGTGGTCACTGGAAACGGCCAGTAC
CCGGTGGTGATGGGCAAGTACGACTATTACTGGCTGCGGTTGAATTGACCGGTGGTGATGGGCAAGTACGACTATTACTGGCTGCGGTTGAATTGA
Informacja o sekwencji:Sequence information:
DŁUGOŚĆ: 1659 nukleotydyLENGTH: 1659 nucleotides
TYP: kwas nukleinowyTYPE: nucleic acid
TOPOLOGIA: liniowaTOPOLOGY: linear
ILOŚĆ NICI: jednaTHREAD COUNT: one
RODZAJ CZĄSTECZKI: DNATYPE OF PARTICLE: DNA
PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1
Wzór 2. Sekwencje starterówFormula 2. Primer sequences
DraSTNdeFDraSTNdeF
5’ aa cat ATG ACC CAG GCA CAC CCG GA 3’5 'aa cat ATG ACC CAG GCA CAC CCG GA 3'
Informacja o sekwencji:Sequence information:
DŁUGOŚĆ: 25 nukleotydyLENGTH: 25 nucleotides
TYP: kwas nukleinowyTYPE: nucleic acid
TOPOLOGIA: liniowaTOPOLOGY: linear
RODZAJ CZĄSTECZKI: DNATYPE OF PARTICLE: DNA
DraSTXhoRDraSTXhoR
5’ aa ctc gag ATT CAA CCG CAG CC A GTA AT A GTC 3’5 'aa ctc gag ATT CAA CCG CAG CC A GTA AT A GTC 3'
Informacja o sekwencji:Sequence information:
DŁUGOŚĆ: 32 nukleotydyLENGTH: 32 nucleotides
TYP: kwas nukleinowyTYPE: nucleic acid
TOPOLOGIA: liniowaTOPOLOGY: linear
RODZAJ CZĄSTECZKI: DNATYPE OF PARTICLE: DNA
Wzór 3. Sekwencja zamplifikowanego genu kodującego białko Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 wraz z dodatkowymi miejscami rozpoznania dla enzymów restrykcyjnych Ndel i Xhol.Formula 3. Sequence of the amplified gene encoding the protein Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 along with additional recognition sites for the restriction enzymes NdeI and XhoI.
AACATATGACCCAGGCACACCCGGAGTGGTACAAGAGCGCTGTCTTCTACGAACTGTAACATATGACCCAGGCACACCCGGAGTGGTACAAGAGCGCTGTCTTCTACGAACTGT
CCGTGCGGACCTTTCAGGACGGCAACGGCGACGGCAAGGGCGATTTTCCCGGCCTGACCGTGCGGACCTTTCAGGACGGCAACGGCGACGGCAAGGGCGATTTTCCCGGCCTGA
CCTCGCGGCTGGACTACCTGAAAAACCTCGGCGTGGACTGCCTGTGGTTGCTGCCCTGCCTCGCGGCTGGACTACCTGAAAAACCTCGGCGTGGACTGCCTGTGGTTGCTGCCCTG
GTTTCCCAGCCCACTGCGCGACGACGGGTACGACGTGGCCGACTACCGGGGGATTCAGTTTCCCAGCCCACTGCGCGACGACGGGTACGACGTGGCCGACTACCGGGGGATTCA
CCCTGACCTCGGCACGCTCGACGACTTCAAGGTCTTTCTGCGCGAAGCCCACGCCCGGCCCTGACCTCGGCACGCTCGACGACTTCAAGGTCTTTCTGCGCGAAGCCCACGCCCGG
GGCCTGCGGGTCATCGGCGACCTGGTGACCAACCACACGTCCAGCGACCACCCCTGGGGCCTGCGGGTCATCGGCGACCTGGTGACCAACCACACGTCCAGCGACCACCCCTGG
TTTCAGGCGGCGCGGCGCGGCCCGACCCTGCCCGACGGCTCGCCCAACGAGTACCACTTTCAGGCGGCGCGGCGCGGCCCGACCCTGCCCGACGGCTCGCCCAACGAGTACCAC
GACTACTACGTCTGGAGCGACGAGGGCAAGGAATACGCCGACACCCGCATCATCTTCGACTACTACGTCTGGAGCGACGAGGGCAAGGAATACGCCGACACCCGCATCATCTTC
ACCGACACCGAGGTCAGCAACTGGACGCTCGACGAGCAGGCAGGCAAGTATTACTGGACCGACACCGAGGTCAGCAACTGGACGCTCGACGAGCAGGCAGGCAAGTATTACTGG
CACCGCTTTTTCGCCAGCCAGCCGGACCTGAACTACGACAACCCGAAAGTGGTGGAACACCGCTTTTTCGCCAGCCAGCCGGACCTGAACTACGACAACCCGAAAGTGGTGGAA
G AACTTC A CGGCGCCG C CCGCTTCTGGCTCGA CCTCGG CCTCGACGGGTTCCGGGTGGG AACTTC A CGGCGCCG C CCGCTTCTGGCTCGA CCTCGG CCTCGACGGGTTCCGGGTGG
ACGCCGTGCCCTACCTCATCGAGCGCGAGGGCACGAGCTGCGAGAATCTGCCCGAAAACGCCGTGCCCTACCTCATCGAGCGCGAGGGCACGAGCTGCGAGAATCTGCCCGAAA
CACACGAGATTCTCAAGGGCTTCCGGGCGATGGTGGACCGCGAGTATCCGGGGCGGCCACACGAGATTCTCAAGGGCTTCCGGGCGATGGTGGACCGCGAGTATCCGGGGCGGC
TGCTGCTTGCCGAGGCGAACCAGTGGCCCGAGGAAGTCGTCGAGTACTTCGGCACCGTGCTGCTTGCCGAGGCGAACCAGTGGCCCGAGGAAGTCGTCGAGTACTTCGGCACCG
AAGCCGAGCCCGAGTTCCACATGTGCTTCAACTTCCCGGTGATGCCCCGGCTGTACATAAGCCGAGCCCGAGTTCCACATGTGCTTCAACTTCCCGGTGATGCCCCGGCTGTACAT
GAGCCTGAAAAGGGAGGACACCTCCAGCATCCGCGAGATCATGGGCCGCCTGCCGAAGAGCCTGAAAAGGGAGGACACCTCCAGCATCCGCGAGATCATGGGCCGCCTGCCGAA
AATCCCGAGTTTCGGCCAGTGGTGCACCTTCCTGCGCAACCACGACGAACTGACGCTGAATCCCGAGTTTCGGCCAGTGGTGCACCTTCCTGCGCAACCACGACGAACTGACGCTG
GAAATGGTCACCGACGACGAGCGCGCCTTCATGTATGCCGCCTACGCGCCCGACGCCGAAATGGTCACCGACGACGAGCGCGCCTTCATGTATGCCGCCTACGCGCCCGACGCC
CGCATGAAAATCAACGTGGGCATCCGCCGTCGCCTCGCGCCGCTGCTCGACAACGACCGCATGAAAATCAACGTGGGCATCCGCCGTCGCCTCGCGCCGCTGCTCGACAACGAC
CGGCGCCGCATCGAGCTGCTGAACACTGTGCTCCTCGCCCTGCCCGGCAGCCCCATCCCGGCGCCGCATCGAGCTGCTGAACACTGTGCTCCTCGCCCTGCCCGGCAGCCCCATCC
TGTACTACGGCGACGAAATCGGCATGGGCGACGACCTCGGCCTGCCCGACCGCAACGTGTACTACGGCGACGAAATCGGCATGGGCGACGACCTCGGCCTGCCCGACCGCAACG
GCGTGCGCACCCCGATGCAGTGGAACGCGGGCACCAGCGGCGGTTTTTCCACTGCGCGCGTGCGCACCCCGATGCAGTGGAACGCGGGCACCAGCGGCGGTTTTTCCACTGCGC
AGCCCTCCG A CTGCTTTTTCCCGCCG ATTC AGG ACCCGG TG TACGGCTTCGGGCGCGTAGCCCTCCG A CTGCTTTTTCCCGCCG ATTC AGG ACCCGG TG TACGGCTTCGGGCGCGT
CAACGTGCAGAGCCAGCTCCAAGACCCCAGCAGCCTGCTGAAGTGGACCGCCCGGCACAACGTGCAGAGCCAGCTCCAAGACCCCAGCAGCCTGCTGAAGTGGACCGCCCGGCA
ACTCGAACTGCGCCGCGCCCACCCCGCCTTTGCGCACGGCGACCTCACCTTCATCGAAACTCGAACTGCGCCGCGCCCACCCCGCCTTTGCGCACGGCGACCTCACCTTCATCGAA
ACCGGCAACCCCGCCATCCTCGCCTTTACCCGCCAGTACGACGGCGAAACGCTGCTCAACCGGCAACCCCGCCATCCTCGCCTTTACCCGCCAGTACGACGGCGAAACGCTGCTCA
TCGTCAGCAACTTCGCGGGCAACGCCCAGGCCGGGCTGCTCGATCTCGCGCCCTTCGTTCGTCAGCAACTTCGCGGGCAACGCCCAGGCCGGGCTGCTCGATCTCGCGCCCTTCGT
GGGCCGCGCCCCGGTCACACTTTCCGGGGCCAGCCCGCTGCCGGTGGTCACTGGAAAGGGCCGCGCCCCGGTCACACTTTCCGGGGCCAGCCCGCTGCCGGTGGTCACTGGAAA
CGGCCAGTACCCGGTGGTGATGGGCAAGTACGACTATTACTGGCTGCGGTTGAATCTCCGGCCAGTACCCGGTGGTGATGGGCAAGTACGACTATTACTGGCTGCGGTTGAATCTC
GAGTTGAGTT
PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1
Informacja o sekwencji:Sequence information:
DŁUGOŚĆ: 1669 nukleotydyLENGTH: 1669 nucleotides
TYP: kwas nukleinowyTYPE: nucleic acid
TOPOLOGIA: liniowaTOPOLOGY: linear
ILOŚĆ NICI: jednaTHREAD COUNT: one
RODZAJ CZĄSTECZKI: DNATYPE OF PARTICLE: DNA
Wzór 4. Sekwencja plazmidu rekombinantowego pETSOEk/LICDraSTH.Formula 4. Sequence of the recombinant pETSOEk / LICDraSTH plasmid.
ATCCGGATAT AGTTCCTCCT TTCAGCAAAA AACCCCTCAA GACCCGTTTAATCCGGATAT AGTTCCTCCT TTCAGCAAAA AACCCCTCAA GACCCGTTTA
GAGGCCCCAAGAGGCCCCAA
GGGGTTATGC TAGTTATTGC TCAGCGGTGG CAGCAGCCAA CTCAGCTTCCGGGGTTATGC TAGTTATTGC TCAGCGGTGG CAGCAGCCAA CTCAGCTTCC
TGGGGCTCGGTGGGGCTCGG
PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1
CCGGGGGACTCCGGGGGACT
PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1
GATTTTCGCCGATTTTCGCC
PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1
GCTTCTGGAGGCTTCTGGAG
PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1
CCACCGCTGGCCACCGCTGG
PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1
CCGAAAAGTGCCGAAAAGTG
PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1
6421 CCACCTGAAA TTGTAAACGT TAATATTTTG TTAAAATTCG CGTTAAATTT6421 CCACCTGAAA TTGTAAACGT TAATATTTTG TTAAAATTCG CGTTAAATTT
TTGTTAAATCTTGTTAAATC
6481 AGCTCATTTT TTAACCAATA GGCCGAAATC GGCAAAATCC CTTATAAATC6481 AGCTCATTTT TTAACCAATA GGCCGAAATC GGCAAAATCC CTTATAAATC
AAAAGAATAGAAAAGAATAG
6541 ACCGAGATAG GGTTGAGTGT TGTTCCAGTT TGGAACAAGA GTCCACTATT6541 ACCGAGATAG GGTTGAGTGT TGTTCCAGTT TGGAACAAGA GTCCACTATT
AAAGAACGTGAAAGAACGTG
6601 GACTCCAACG TCAAAGGGCG AAAAACCGTC TATCAGGGCG ATGGCCCACT6601 GACTCCAACG TCAAAGGGCG AAAAACCGTC TATCAGGGCG ATGGCCCACT
ACGTGAACCAACGTGAACCA
6661 TCACCCTAAT CAAGTTTTTT GGGGTCGAGG TGCCGTAAAG CACTAAATCG GAACCCTAAA6661 TCACCCTAAT CAAGTTTTTT GGGGTCGAGG TGCCGTAAAG CACTAAATCG GAACCCTAAA
6721 GGGAGCCCCC GATTTAGAGC TTGACGGGGA AAGCCGGCGA ACGTGGCGAG6721 GGGAGCCCCC GATTTAGAGC TTGACGGGGA AAGCCGGCGA ACGTGGCGAG
AAAGGAAGGGAAAGGAAGGG
6781 AAGAAAGCGA AAGGAGCGGG CGCTAGGGCG CTGGCAAGTG TAGCGGTCAC6781 AAGAAAGCGA AAGGAGCGGG CGCTAGGGCG CTGGCAAGTG TAGCGGTCAC
GCTGCGCGTAGCTGCGCGTA
6841 ACCACCACAC CCGCCGCGCT TAATGCGCCG CTACAGGGCG CGTCCCATTC GCCA6841 ACCACCACAC CCGCCGCGCT TAATGCGCCG CTACAGGGCG CGTCCCATTC GCCA
Informacja o sekwencji:Sequence information:
DŁUGOŚĆ: 6894 nukleotydówLENGTH: 6,894 nucleotides
TYP: kwas nukleinowyTYPE: nucleic acid
TOPOLOGIA: plazmidTOPOLOGY: plasmid
ILOŚĆ NICI: jednaTHREAD COUNT: one
RODZAJ CZĄSTECZKI: DNATYPE OF PARTICLE: DNA
Claims (2)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
PL392388A PL229055B1 (en) | 2010-09-14 | 2010-09-14 | DNA sequence, oligonucleotide primers, DNA sequence with the recognition sites for restriction enzymes NdeI and XhoI, expression vector and method for the preparation thereof, recombinant strain of Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS and method for the preparation thereof and method for obtaining recombinant protein with oligo-histidine tag of Deinococcus radiodurans DSMZ 20 539 trehalose synthase (TS) |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
PL392388A PL229055B1 (en) | 2010-09-14 | 2010-09-14 | DNA sequence, oligonucleotide primers, DNA sequence with the recognition sites for restriction enzymes NdeI and XhoI, expression vector and method for the preparation thereof, recombinant strain of Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS and method for the preparation thereof and method for obtaining recombinant protein with oligo-histidine tag of Deinococcus radiodurans DSMZ 20 539 trehalose synthase (TS) |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
PL392388A1 PL392388A1 (en) | 2012-03-26 |
PL229055B1 true PL229055B1 (en) | 2018-06-29 |
Family
ID=45891410
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
PL392388A PL229055B1 (en) | 2010-09-14 | 2010-09-14 | DNA sequence, oligonucleotide primers, DNA sequence with the recognition sites for restriction enzymes NdeI and XhoI, expression vector and method for the preparation thereof, recombinant strain of Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS and method for the preparation thereof and method for obtaining recombinant protein with oligo-histidine tag of Deinococcus radiodurans DSMZ 20 539 trehalose synthase (TS) |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
PL (1) | PL229055B1 (en) |
-
2010
- 2010-09-14 PL PL392388A patent/PL229055B1/en unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
PL392388A1 (en) | 2012-03-26 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN112111469B (en) | Gamma-glutamyl kinase mutant and application thereof | |
CN111500570A (en) | Method for modifying genome sequence of nucleic acid base for specifically converting target DNA sequence, and molecular complex used therefor | |
CN108676809A (en) | A kind of Corynebacterium glutamicum gene group edit methods | |
KR101692103B1 (en) | Synthetic phytase variants | |
CN111004755A (en) | Citrobacter T26 for specifically degrading hyaluronic acid, hyaluronidase HylC produced by Citrobacter T26 and application of hyaluronidase HylC | |
CN114230677B (en) | Recombinant protein containing Cap of hog cholera E2 and circovirus, preparation method and application thereof | |
CN102021197A (en) | Plant bivalent expression vector and construction method thereof | |
CN110669775B (en) | Application of differential proxy technology in enrichment of A.G base substitution cells | |
PL229055B1 (en) | DNA sequence, oligonucleotide primers, DNA sequence with the recognition sites for restriction enzymes NdeI and XhoI, expression vector and method for the preparation thereof, recombinant strain of Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS and method for the preparation thereof and method for obtaining recombinant protein with oligo-histidine tag of Deinococcus radiodurans DSMZ 20 539 trehalose synthase (TS) | |
CN109097361B (en) | Promoter, vector thereof and application thereof | |
CN109097362B (en) | Operon, vector thereof and application thereof | |
CN113717962A (en) | Cas phi-2 protein for rice gene editing and expression cassette and expression vector thereof | |
CN113201514B (en) | Polypeptides having aspartokinase activity and their use for producing amino acids | |
CN108728390B (en) | Genetically engineered bacterium for producing A82846B as well as preparation method and application thereof | |
CN113943748B (en) | Recombination system in pseudomonas syringae and application | |
CN114438115A (en) | CRISPR/Cas9 gene editing vector, construction method and application thereof | |
CN110691510A (en) | Immunomodulatory transgenic plants and related methods | |
CN112831519B (en) | Method for preparing santalol by utilizing sweet wormwood herbs | |
CN111304239B (en) | Rolling circle replication recombinant vector, construction method and application | |
CN114621974B (en) | Vector of plant single-gene or multi-gene CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic surface plasmon) activation technology, and construction method and application thereof | |
CN107227312B (en) | Method for increasing content of salvianolic acid B in hairy roots of salvia miltiorrhiza and laccase gene | |
CN112266925A (en) | Subcellular localization expression vector and construction method | |
CA2621608A1 (en) | Methods of optimizing the secretion of protein in prokaryotes | |
RU2817891C1 (en) | ESCHERICHIA COLI L-ASPARAGINASE PRODUCER AND EXPRESSION PLASMID pET28a-AsnSYN CODING L-ASPARAGINASE | |
CN117050994A (en) | Optimized viral vector subgenomic promoters and uses thereof |