PL229055B1 - DNA sequence, oligonucleotide primers, DNA sequence with the recognition sites for restriction enzymes NdeI and XhoI, expression vector and method for the preparation thereof, recombinant strain of Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS and method for the preparation thereof and method for obtaining recombinant protein with oligo-histidine tag of Deinococcus radiodurans DSMZ 20 539 trehalose synthase (TS) - Google Patents

DNA sequence, oligonucleotide primers, DNA sequence with the recognition sites for restriction enzymes NdeI and XhoI, expression vector and method for the preparation thereof, recombinant strain of Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS and method for the preparation thereof and method for obtaining recombinant protein with oligo-histidine tag of Deinococcus radiodurans DSMZ 20 539 trehalose synthase (TS)

Info

Publication number
PL229055B1
PL229055B1 PL392388A PL39238810A PL229055B1 PL 229055 B1 PL229055 B1 PL 229055B1 PL 392388 A PL392388 A PL 392388A PL 39238810 A PL39238810 A PL 39238810A PL 229055 B1 PL229055 B1 PL 229055B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
dsmz
preparation
plyss
escherichia coli
deinococcus radiodurans
Prior art date
Application number
PL392388A
Other languages
Polish (pl)
Other versions
PL392388A1 (en
Inventor
Paweł Filipkowski
Józef Synowiecki
Katarzyna Licznerska
Olga Pietrow
Anna Panek
Original Assignee
Politechnika Gdanska
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Politechnika Gdanska filed Critical Politechnika Gdanska
Priority to PL392388A priority Critical patent/PL229055B1/en
Publication of PL392388A1 publication Critical patent/PL392388A1/en
Publication of PL229055B1 publication Critical patent/PL229055B1/en

Links

Description

Przedmiotem wynalazku jest sposób otrzymywania rekombinantowego szczepu Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS zawierającego wklonowane DNA z fragmentem kodującym białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 oraz sposób wytwarzania białka syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539.The present invention relates to a method for the preparation of a recombinant Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS strain containing cloned DNA with a fragment encoding the Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539 and a method for the production of Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539.

Trehaloza (a-D-glukopiranozylo-1,1a-D-glukopiranozyd) jest cukrem nieredukującym, zbudowanym z dwóch cząsteczek glukozy połączonych wiązaniem a-1,1-glikozydowym. Trehaloza łatwo ulega hydrolizie do glukozy i może pełnić w komórce rezerwę tego cukru. Występowanie trehalozy stwierdzono w komórkach grzybów i drożdży, bakterii, nicieni, owadów, jaj, poczwarek oraz niektórych roślin. Właściwości trehalozy czynią z niej potencjalne źródło wielu zastosowań w medycynie, weterynarii, przemyśle farmaceutycznym i spożywczym.Trehalose (α-D-glucopyranosyl-1,1a-D-glucopyranoside) is a non-reducing sugar composed of two glucose molecules linked by an α-1,1-glycosidic bond. Trehalose is easily hydrolyzed to glucose and can fill the cell's reserve of this sugar. The occurrence of trehalose was found in the cells of fungi and yeasts, bacteria, nematodes, insects, eggs, pupae and some plants. The properties of trehalose make it a potential source of many applications in human, veterinary, pharmaceutical and food industries.

Biosynteza trehalozy w żywych komórkach prowadzona jest różnymi znanymi szlakami metabolicznymi, między innymi z wykorzystaniem syntazy trehalozy.Trehalose biosynthesis in living cells is carried out by various known metabolic pathways, including the use of trehalose synthase.

Bakterie z rodzaju Deinococcus należą do mikroorganizmów wytwarzających syntazę trehalozy.Bacteria of the genus Deinococcus belong to the microorganisms that produce trehalose synthase.

Geny kodujące białka syntazy trehalozy mikroorganizmów rodzaju Deinococcus klonowano w komórkach E. coli. Prowadzono również biosyntezę termostabilnych enzymów w komórkach mezofilnego gospodarza w układzie Tabora-Studiera. Niestety zastosowane układy ekspresyjne E. coli oraz z zastosowaniem kosztownego induktora jakim jest IPTG (isopropyl-beta-D-thiogalaktopyranozyd) nie należą do optymalnych i najbardziej wydajnych. Ponadto otrzymywane białka nie posiadały ułatwiające w znaczący sposób proces otrzymywania metki oligohistydynowej, a w trakcie samej procedury oczyszczania nie stosowano etapu wstępnej denaturacji termicznej białek gospodarza.The genes encoding the trehalose synthase proteins of microorganisms of the genus Deinococcus were cloned in E. coli cells. The biosynthesis of thermostable enzymes in mesophilic host cells was also carried out in the Tabor-Studier system. Unfortunately, the E. coli expression systems used and with the use of the expensive inducer IPTG (isopropyl-beta-D-thiogalactopyranoside) are not optimal and the most efficient. Moreover, the obtained proteins did not have the oligohistidine tag which would significantly facilitate the process of obtaining the oligohistidine tag, and the preliminary thermal denaturation of the host proteins was not used during the purification procedure itself.

W trakcie prowadzonych prac wykonano izolację i klonowanie genu kodującego syntazę trehalozy pochodzącej z Deinococcus radiodurans do wektorów ekspresyjnych w układzie Tabora-Studiera oraz arabinozowym oraz jego sprawdzono ekspresję w różnych gospodarzach. Ustalono także optymalny sposób oczyszczania i określono właściwości białek rekombinantowych typu dzikiego DraST w układzie arabinozowym i z domeną oligohistydynową DraSTHis.In the course of the work, the isolation and cloning of the gene encoding the Deinococcus radiodurans trehalose synthase into expression vectors in the Tabora-Studier and arabinose systems were performed, and its expression in various hosts was checked. The optimal purification process was also established and the properties of DraST wild-type recombinant proteins in the arabinose system and with the DraSTHis oligohistidine domain were determined.

Oczyszczanie białka polega na nowatorskim zastosowaniu wstępnej denaturacji białek gospodarza oraz chromatografii metalopowinowactwa.Protein purification is based on the innovative application of pre-denaturation of host proteins and metal affinity chromatography.

Dla białka DraSTHis uzyskano preparat o wysokiej czystości. Ustalono optymalne warunki działania zarówno dla białka DraST jak i DraSTHis. Za optymalne warunki działania enzymu wyznaczono zakres temperatur od 5 do 20°C oraz pH 6,5.A high purity preparation was obtained for the DraSTHis protein. The optimal operating conditions for both DraST and DraSTHis proteins have been established. The temperature range from 5 to 20 ° C and pH 6.5 were determined as the optimal conditions for the enzyme operation.

Sączenie molekularne pozwoliło wyznaczyć masę cząsteczkową białka DraSTHis, która wynosi 126,9 kDa, która odpowiada masie homodimeru.Molecular filtration allowed the determination of the molecular weight of the DraSTHis protein, which is 126.9 kDa, which corresponds to the mass of the homodimer.

Sposób otrzymywania rekombinantowego szczepu Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS o symbolu Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek/LICDraSTH, charakteryzuje się według wynalazku tym, że uzyskuje się fragment DNA kodujący białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 o wzorze 3 poprzez amplifikację DNA z zastosowaniem starterów oligonukleotydowych o wzorze 2 i o symbolach DraSTNdeF i DraSTXhoR. Uzyskany fragment DNA klonuje się do wektora plazmidowego pET30Ek/LIC, w wyniku czego uzyskuje się wektor plazmidowy o wzorze 4 i o symbolu pET30Ek//LICDraSTH, zawierający wklonowane DNA z fragmentem kodującym białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539, z fragmentami rozpoznawanymi przez enzymy restrykcyjne Ndel i XhoI, z miejscem wiązania rybosomów rbs, z genem oporności na kanamycynę, z origin plazmidu pBR322, z origin f1, regionem polihistydynowym, promotorem T7, sekwencją kodującą S-Tag, z miejscem terminacji transkrypcji T7, z miejscem operatorowym lacI. Następnie otrzymanym wektorem transformuje się komórki Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS.The method of obtaining the recombinant Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS strain, symbol Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek / LICDraSTH, is characterized according to the invention in that a DNA fragment encoding the Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 of the formula 3 is obtained. using oligonucleotide primers of formula 2 and symbols DraSTNdeF and DraSTXhoR. The obtained DNA fragment is cloned into the pET30Ek / LIC plasmid vector, as a result of which the plasmid vector of formula 4 and the symbol pET30Ek // LICDraSTH is obtained, containing the cloned DNA with the fragment encoding the Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539, with fragments recognized by restriction enzymes and XhoI, with the rbs ribosome binding site, with the kanamycin resistance gene, with the origin of the pBR322 plasmid, with the origin f1, the polyhistidine region, the T7 promoter, the S-Tag coding sequence, with the T7 transcription termination site, with the lacI operator site. Then Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS cells were transformed with the obtained vector.

Sposób wytwarzania białka syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 polegający na produkcji białka przez komórki rekombinantowego szczepu bakterii w pożywkach płynnych, charakteryzuje się według wynalazku tym, że prowadzi się hodowlę komórek szczepu bakterii o symbolu Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek/LICDraSTH w temperaturze początkowej od 35°C do 38°C. Następnie po uzyskaniu gęstości zawiesiny komórkowej od 0,3 do 0,9 prowadzi się nadekspresję genu kodującego białko przez od 2 do 24 godzin, poprzez dodanie do pożywki induktora jakim jest IPTG o stężeniu od 0,05 mM do 10 mM, a po oddzieleniu zawiesiny komórkowej od płynu pohodowlanego, dezintegracji komórek i wstępnej termicznej denaturacji, na drodze wirowania izoluje się białka rozpuszczalne. Następnie oczyszcza się je stosując jeden etap oczyszczania na złożach wiążących koordynacyjnie, odwracalnie jony metali IDA-Co, po czym zagęszcza i zawiesza w buforze do przechowywania.The method for producing the Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 trehalose synthase protein consisting in the production of the protein by cells of a recombinant bacterial strain in liquid media, is characterized according to the invention in that cells of the Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek / LICDraSTH bacterial strain are cultivated at a temperature of starting from 35 ° C to 38 ° C. Then, after obtaining a density of the cell suspension from 0.3 to 0.9, overexpression of the gene encoding the protein is carried out for 2 to 24 hours by adding an inducer, which is IPTG, with a concentration of 0.05 mM to 10 mM to the medium, and after separating the suspension from the culture fluid, cell disintegration and initial thermal denaturation, the soluble proteins are isolated by centrifugation. They are then purified using one purification step on IDA-Co coordinated reversible metal ion-binding beds, then concentrated and suspended in storage buffer.

PL 229 055 B1PL 229 055 B1

Bufor do przechowywania ma korzystnie następujący skład: 0,85% NaCI, 20% glicerol (v/v), 5 mM EDTA, 1 mM DTT, 1 mM PMSF, 0,05% IGEPAL.The storage buffer preferably has the following composition: 0.85% NaCl, 20% glycerol (v / v), 5mM EDTA, 1mM DTT, 1mM PMSF, 0.05% IGEPAL.

Uzyskane według wynalazku rekombinantowe białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 cechuje się dużą aktywności w temperaturach pokojowych i poniżej pokojowych co umożliwia zastosowanie go w ciągłej konwersji maltozy do trehalozy bez konieczności ponoszenia nakładów na ogrzewanie bioreaktora kolumnowego.The recombinant Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 trehalose synthase protein obtained according to the invention is characterized by high activity at room and sub-room temperatures, which allows it to be used in the continuous conversion of maltose into trehalose without the need to incur expenditure on heating the column bioreactor.

Sposób według wynalazku umożliwia uzyskanie rekombinantowego białka syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 szybką metodą charakteryzującą się ograniczoną liczbą etapów potrzebnych do uzyskania preparatu białkowego.The method according to the invention makes it possible to obtain the recombinant Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 trehalose synthase protein by a fast method characterized by a limited number of steps needed to obtain a protein preparation.

Wynalazek objaśniony jest bliżej w przykładach wykonania i na rysunkach, na którym na fig. 1 przedstawiono fragment DNA o wzorze 3 z zaznaczeniem sekwencji genu syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 i fragmentów DNA rozpoznawanych przez enzymy restrykcyjne Ndel i XhoI;The invention is explained in more detail in the working examples and in the drawings, in which Fig. 1 shows the DNA fragment of the formula 3 with the sequence of the Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 trehalose synthase gene and DNA fragments recognized by the restriction enzymes NdeI and XhoI;

na fig. 2 przedstawiono sekwencję nukleotydową wektora plazmidowego pET30Ek/LICDraSTH w rejonie klonowania fragmentu DNA o wzorze 3 oraz sekwencję aminokwasową białka powstającego w komórkach Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS transformowanych DNA wektora ekspresyjnego pET30Ek/LICDraSTH;Figure 2 shows the nucleotide sequence of the pET30Ek / LICDraSTH plasmid vector in the cloning region of the DNA fragment of formula 3 and the amino acid sequence of the protein produced in Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS cells transformed with pET30Ek / LICDraSTH expression vector DNA;

na fig. 3 przedstawiono wynik rozdziału elektroforetycznego w 12% żelu poliakrylamidowym z 6% warstwą zagęszczającą frakcji pochodzących z kolejnych etapów izolacji i oczyszczania białka syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 produkowanego przez rekombinantowy szczep Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek/LICDraSTH;Figure 3 shows the result of the electrophoretic separation on a 12% polyacrylamide gel with a 6% thickening layer of fractions from the subsequent isolation and purification steps of the Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539 produced by the recombinant Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek / LICDraSTH strain;

na fig. 4 przedstawiono schemat uzyskania fragmentu DNA o wzorze 3 z zaznaczeniem sekwencji genu syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 i fragmentów DNA rozpoznawanych przez enzymy restrykcyjne Ndel i XhoI oraz wektora ekspresyjnego o wzorze 4 i o symbolu pET30Ek/LICDraSTH.Figure 4 shows a scheme for obtaining a DNA fragment of formula 3 with the sequence of the Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 trehalose synthase gene and DNA fragments recognized by the restriction enzymes NdeI and XhoI and the expression vector of formula 4 and the symbol pET30Ek / LICDraSTH.

P r z y k ł a d 1P r z k ł a d 1

Otrzymywanie sekwencji DNA kodującej białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539.Preparation of DNA sequence encoding Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539.

W celu amplifikacji DNA kodującego białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 syntetyzuje się w znany sposób startery oligonukleotydowe o wzorze 2 i o symbolach DraSTNdeF i DraSTXhoR. Reakcję amplifikacji DNA kodującego białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 wykonuje się z użyciem starterów DraSTNdeF (0,2 μM) i DraSTXhoR (0,2 μM) na matrycy wyizolowanego DNA genomowego w buforze zawierającym: 20 mM Tris-HCl pH 8,8, 10 mM KCl, 10 mM (NH4)2SO4, 2 mM MgSO4, 0,1% Triton X-100, 200 μM każdego z trifosforanów deoksyrybonukleozydów (dNTP) i 0,2 U polimerazy DNA Pwo produkowanej przez DNA-Gdańsk II s.c., Gdańsk, Polska. Reakcję przeprowadza się w termocyklerze w następujących warunkach temperaturowo-czasowych: 95°C - 1 minuta, 63,5°C - 1,5 minut, 72°C - 2 minuty; 35 cykli. W wyniku reakcji amplifikacji uzyskuje się fragment DNA o wzorze 3. Fragment DNA o wzorze 3 z dokładnym zaznaczeniem sekwencji genu kodującego białko syntazy treahlozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 i fragmentów DNA rozpoznawanych przez enzymy restrykcyjne Ndel i XhoI przedstawiono na fig. 1.For the amplification of DNA encoding the Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 trehalose synthase protein, oligonucleotide primers of the formula 2 and the symbols DraSTNdeF and DraSTXhoR are synthesized in a known manner. The amplification reaction of the DNA encoding the Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 trehalose synthase protein is performed using the primers DraSTNdeF (0.2 μM) and DraSTXhoR (0.2 μM) on the template of the isolated genomic DNA in a buffer containing: 20 mM Tris-HCl pH 8.8, 10 mM KCl, 10 mM (NH4) 2SO4, 2 mM MgSO4, 0.1% Triton X-100, 200 μM of each deoxyribonucleoside triphosphate (dNTP) and 0.2 U of Pwo DNA polymerase produced by DNA-Gdańsk II sc, Gdańsk , Poland. The reaction is carried out in a thermal cycler under the following temperature-time conditions: 95 ° C - 1 minute, 63.5 ° C - 1.5 minutes, 72 ° C - 2 minutes; 35 cycles. The amplification reaction yields a DNA fragment of formula 3. A DNA fragment of formula 3 with the exact sequence of the gene encoding the Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 treahlose synthase protein and DNA fragments recognized by the restriction enzymes NdeI and XhoI are shown in Fig. 1.

P r z y k ł a d 2P r z k ł a d 2

Otrzymywanie wektora ekspresyjnego o wzorze 4 i o symbolu pET30Ek/LICDraSTH oraz rekombinantowego szczepu Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek/LICDraSTH.Preparation of the expression vector of formula 4 and symbol pET30Ek / LICDraSTH and recombinant Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek / LICDraSTH strain.

Schemat uzyskania wektora ekspresyjnego o wzorze 4 i o symbolu pET30Ek/LICDraSTH ilustruje fig. 4. W celu uzyskania wektora plazmidowego pET30Ek/LICDraSTH przeprowadza się klonowanie fragmentu DNA o wzorze 3 otrzymanego według przykładu 1 do wektora ekspresyjnego pET30Ek/LIC firmy Merck. W tym celu przeprowadza się reakcję ligacji fragmentu DNA o wielkości 5234 par zasad powstałego w wyniku trawienia plazmidu pET30Ek/LIC firmy Merck enzymami restrykcyjnymi Ndel i XhoI (wektora) z fragmentem DNA o wielkości 1658 par zasad powstałym po trawieniu produktu PCR o wzorze 3 enzymami restrykcyjnymi Ndel i XhoI (insertu), w temperaturze 17°C przez 3 godziny z użyciem 2 U DNA ligazy faga T4, stosując bufor reakcyjny: 33 mM Tris-CH3COOH pH=7,8; 10 mM (CH3COO)2Mg; 66 mM CH3COOK; 0,5 mM DTT; 1 mM ATP.The scheme of obtaining the expression vector of formula 4 and the symbol pET30Ek / LICDraSTH is shown in Fig. 4. In order to obtain the plasmid vector pET30Ek / LICDraSTH, the DNA fragment of formula III obtained according to example 1 is cloned into the pET30Ek / LIC expression vector from Merck. For this purpose, a DNA fragment of 5,234 bp resulting from digestion of the Merck plasmid pET30Ek / LIC with restriction enzymes NdeI and XhoI (vector) is carried out with a DNA fragment of 1658 bp resulting from digestion of the PCR product of formula 3 with restriction enzymes NdeI and XhoI (insert) at 17 ° C for 3 hours with 2 U of T4 DNA ligase using reaction buffer: 33 mM Tris-CH3COOH pH = 7.8; 10mM (CH3COO) 2Mg; 66 mM CH3COOK; 0.5 mM DTT; 1 mM ATP.

Następnie mieszaniną reakcyjną transformuje się komórki kompetentne Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS i po wytrząsaniu przez okres 1 h, w temperaturze 37°C, przy około 230 rpm, w 250 μl pożywki LB wysiewa na pożywkę LA (pożywka LB z dodatkiem 1,5% agaru wg Sambrook i in., 1989), zawierającą tetracyklinę i kanamycynę.Then the reaction mixture is transformed into Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS competent cells and, after shaking for 1 h at 37 ° C, about 230 rpm, in 250 μl of LB medium, it is plated on LA medium (LB medium supplemented with 1.5 % agar according to Sambrook et al., 1989), containing tetracycline and kanamycin.

PL 229 055 B1PL 229 055 B1

Uzyskane kolonie bakteryjne Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek/LICDraSTH zawierające ekspresyjne wektory plazmidowe przesiewa się na pożywkę LB z dodatkiem tetracykliny i kanamycyny i hoduje się w celu izolacji DNA plazmidowego.The resulting Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek / LICDraSTH bacterial colonies containing plasmid expression vectors are screened on LB medium supplemented with tetracycline and kanamycin and grown to isolate plasmid DNA.

W wyniku izolacji uzyskuje się DNA wektora plazmidowego o wzorze 4 i o symbolu pET30Ek/LICDraSTH, który zawiera wklonowany gen kodujący białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 pod kontrolą silnego promotora faga T7 (fig. 2), co potwierdza się poprzez analizę restrykcyjną i sekwencjonowanie DNA, np. metodą Sangera.As a result of the isolation, DNA of the plasmid vector of formula 4 and symbol pET30Ek / LICDraSTH was obtained, which contains the cloned gene encoding the Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539 under the control of the strong T7 phage promoter (Fig. 2), which was confirmed by restriction analysis and DNA sequencing , e.g. by the Sanger method.

Dokładną sekwencję nukleotydową wektora plazmidowego o wzorze 4 i symbolu pET30Ek/LICDraSTH w rejonie klonowania fragmentu DNA o wzorze 3 ilustruje fig. 2.The exact nucleotide sequence of the plasmid vector of formula 4 and the symbol pET30Ek / LICDraSTH in the cloning region of the DNA fragment of formula 3 is illustrated in Figure 2.

P r z y k ł a d 3P r z k ł a d 3

Otrzymywanie białka syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539.Preparation of Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539.

Uzyskuje się sekwencję DNA kodującą białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 wraz z miejscami rozpoznania dla enzymów restrykcyjnych Ndel i XhoI o wzorze 3 według przykładu 1.The DNA sequence encoding the Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539 is obtained along with the recognition sites for the restriction enzymes NdeI and XhoI of Formula 3 according to Example 1.

Następnie otrzymuje się ekspresyjny wektor plazmidowy o wzorze 4 i o symbolu pET30Ek//LICDraSTH zgodnie z przykładem 2.The expression vector plasmid of formula 4 and the symbol pET30Ek // LICDraSTH is then obtained according to example 2.

W kolejnym etapie poprzez transformację komórek kompetentnych Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS i presję selekcyjną na podłoży z chloramfenikolem i kanamycyną otrzymuje się rekombinantowy szczep Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek/LICDraSTH.In the next step, the recombinant Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek / LICDraSTH strain is obtained by transforming Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS competent cells and selective pressure on chloramphenicol and kanamycin media.

Szczep hoduje się w pożywce LB z dodatkiem ampicyliny przez 18 godzin w temperaturze 37°C. Hodowlą nocną rekombinantowego szczepu E. coli szczepi się 500 ml pożywki LB z antybiotykiem i po uzyskaniu w hodowli gęstości zawiesiny komórkowej na poziomie OD600nm>0,5 indukuje się ekspresję białka syntazy trehalozy IPTG. Hodowle po 3,5 godzinach od indukcji przeprowadzoną w temperaturze pokojowej (objętość pożywki 500 ml) wiruje się przez 10 minut przy 5000 rpm. Osad bakteryjny zawiesza w 30 ml buforu lizującego, homogenizuje i poddaje działaniu ultradźwięków przez 10 s - przy amplitudze A=30%, powtarzając procedurę trzykrotnie w krótkich odstępach czasowych. Otrzymany totalny lizat wiruje się przez 40 minut przy 9 000 rpm. Białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 oczyszcza się na drodze strącania termicznego innych obecnych w preparacie białek (białka mezofilnej bakterii E. coli) w temperaturze 56°C, przez 10 minut. Lizat wiruje się przez 30 minut przy 12000 rpm. Supernatant zawierający niezdenaturowane białka rozpuszczalne poddaje się dalszemu oczyszczaniu stosując chromatografię metalopowinowactwa. W innym wariancie oczyszczania można poddawać otrzymane białka strącaniu siarczanem amonu lub wytrącaniu etanolem, acetonem, izopropanolem lub innym alkoholem niskorzędowym.The strain is cultivated in LB medium supplemented with ampicillin for 18 hours at 37 ° C. An overnight culture of the recombinant E. coli strain is inoculated with 500 ml of LB medium with antibiotic, and after the culture has reached a cell suspension density of OD 600nm> 0.5, expression of IPTG trehalose synthase protein is induced. Cultures 3.5 hours after induction performed at room temperature (500 ml medium volume) are centrifuged for 10 minutes at 5000 rpm. The bacterial pellet is suspended in 30 ml of lysis buffer, homogenized and sonicated for 10 s - at amplitude A = 30%, repeating the procedure three times at short intervals. The resulting total lysate is centrifuged for 40 minutes at 9,000 rpm. Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 trehalose synthase protein is purified by thermal precipitation of other proteins present in the preparation (mesophilic E. coli protein) at 56 ° C for 10 minutes. The lysate is centrifuged for 30 minutes at 12,000 rpm. The supernatant containing undenatured soluble proteins is further purified using metal affinity chromatography. In another variant of the purification, the proteins obtained can be subjected to precipitation with ammonium sulphate or precipitation with ethanol, acetone, isopropanol or other low-alcohol alcohol.

Kolumnę ze złożem IDA-Co kalibruje się 5 objętościami złoża buforu A: 5 mM imidazolu, 50 mM bufor fosforanowy, 50 mM NaCl o pH=7,6. Następnie na złoże nanosi się ilość całkowitego ekstraktu bezkomórkowego równą objętościowo objętości złoża. Kolumnę płucze się buforem niskosolnym A: 5 mM, 50 mM bufor fosforanowego, 50 mM NaCl i A' o stężeniu 25 mM imidazolu, 50 mM bufor fosforanowy, 50 mM NaCl o pH=7,6 celem usunięcia niezwiązanych ze złożem białek. Elucję DraST prowadzi się dwoma porcjami po 10 ml wysokosolnego buforu fosforanowego o pH=7,6 i stężeniu imidazolu 500 mM, 50 mM bufor fosforanowy, 50 mM NaCl.The IDA-Co matrix column is calibrated with 5 bed volumes of buffer A: 5 mM imidazole, 50 mM phosphate buffer, 50 mM NaCl, pH 7.6. Then, an amount of total cell-free extract equal to the volume of the bed is applied to the bed. The column is washed with low salt A buffer: 5 mM, 50 mM phosphate buffer, 50 mM NaCl and A 'at 25 mM imidazole, 50 mM phosphate buffer, 50 mM NaCl at pH = 7.6 to remove unbound proteins. DraST is eluted with two 10 ml aliquots of high-salt phosphate buffer with pH = 7.6 and an imidazole concentration of 500 mM, 50 mM phosphate buffer, 50 mM NaCl.

Preparat po oczyszczaniu na kolumnie IDA-Co należy trzykrotne zwirować na filtrach wirówkowych o wielkości odcięcia równej 30 kDa (Amicon, Millipore), przy 5000 rpm, przez 30 minut, dodając kolejno uzyskane powyżej frakcje elucyjne celem zagęszczenia białka. W trakcie zagęszczania należy wymienić bufor wysokosolny na bufor do przechowywania preparatu białkowego (np. zawierającego inhibitory proteaz lub glicerol, i/lub sól fizjologiczną. Korzystnie o składzie: 0,85% NaCl, 20% glicerol (v/v), 5 mM EDTA, 1 mM DTT, 1 mM PMSF, 0,05% IGEPAL. W innym wariancie uzyskany preparat białkowy można dializować do żądanego buforu. Możliwe jest także zastosowanie do konwersji maltozy do trehalozy całkowitego ekstraktu bezkomórkowego już po etapie lizy lub tylko po wstępnej termicznej denaturacji białek gospodarza.The preparation after purification on the IDA-Co column should be centrifuged three times on centrifuge filters with a cut-off of 30 kDa (Amicon, Millipore), at 5000 rpm, for 30 minutes, successively adding the elution fractions obtained above to concentrate the protein. During concentration, the high-salt buffer should be replaced with a buffer for storing the protein preparation (e.g. containing protease inhibitors or glycerol and / or saline. Preferably, the composition consists of: 0.85% NaCl, 20% glycerol (v / v), 5 mM EDTA , 1 mM DTT, 1 mM PMSF, 0.05% IGEPAL. In another variant, the obtained protein preparation can be dialyzed into the desired buffer. It is also possible to use the total cell-free extract for the conversion of maltose to trehalose after the lysis step or only after the initial thermal denaturation of the proteins the host.

Wyniki biosyntezy i oczyszczania białka syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20339 analizuje się metodą elektroforezy w 12% zolu poliakrylamidowym w warunkach denaturujących w obecności odpowiedniego białkowego markera wielkości, co przedstawiono na fig. 3 i 3a.The results of the biosynthesis and purification of Deinococcus radiodurans DSMZ 20339 trehalose synthase protein are analyzed by electrophoresis on a 12% polyacrylamide sol under denaturing conditions in the presence of an appropriate size marker protein as shown in Figures 3 and 3a.

PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1

Wzór 1. Sekwencje genu kodującego białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539Formula 1. Sequences of the gene encoding the Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539

ATGACCCAGGCACACCCGGAGTGGTACAAGAGCGCTGTCTTCTACGAACTGTCCGTGCATGACCCAGGCACACCCGGAGTGGTACAAGAGCGCTGTCTTCTACGAACTGTCCGTGC

GGACCTTTCAGGACGGCAACGGCGACGGCAAGGGCGATTTTCCCGGCCTGACCTCGCGGACCTTTCAGGACGGCAACGGCGACGGCAAGGGCGATTTTCCCGGCCTGACCTCGC

GGCTGGACTACCTGAAAAACCTCGGCGTGGACTGCCTGTGGTTGCTGCCCTGGTTTCCGGCTGGACTACCTGAAAAACCTCGGCGTGGACTGCCTGTGGTTGCTGCCCTGGTTTCC

CAGCCCACTGCGCGACGACGGGTACGACGTGGCCGACTACCGGGGGATTCACCCTGACAGCCCACTGCGCGACGACGGGTACGACGTGGCCGACTACCGGGGGATTCACCCTGA

CCTCGGCACGCTCGACGACTTCAAGGTCTTTCTGCGCGAAGCCCACGCCCGGGGCCTGCCTCGGCACGCTCGACGACTTCAAGGTCTTTCTGCGCGAAGCCCACGCCCGGGGCCTG

CGGGTCATCGGCGACCTGGTGACCAACCACACGTCCAGCGACCACCCCTGGTTTCAGGCGGGTCATCGGCGACCTGGTGACCAACCACACGTCCAGCGACCACCCCTGGTTTCAGG

CGGCGCGGCGCGGCCCGACCCTGCCCGACGGCTCGCCCAACGAGTACCACGACTACTCGGCGCGGCGCGGCCCGACCCTGCCCGACGGCTCGCCCAACGAGTACCACGACTACT

ACGTCTGGAGCGACGAGGGCAAGGAATACGCCGACACCCGCATCATCTTCACCGACAACGTCTGGAGCGACGAGGGCAAGGAATACGCCGACACCCGCATCATCTTCACCGACA

CCGAGGTCAGCAACTGGACGCTCGACGAGCAGGCAGGCAAGTATTACTGGCACCGCTCCGAGGTCAGCAACTGGACGCTCGACGAGCAGGCAGGCAAGTATTACTGGCACCGCT

TTTTCGCCAGCCAGCCGGACCTGAACTACGACAACCCGAAAGTGGTGGAAGAACTTCTTTTCGCCAGCCAGCCGGACCTGAACTACGACAACCCGAAAGTGGTGGAAGAACTTC

ACGGCGCCGCCCGCTTCTGGCTCGACCTCGGCCTCGACGGGTTCCGGGTGGACGCCGTACGGCGCCGCCCGCTTCTGGCTCGACCTCGGCCTCGACGGGTTCCGGGTGGACGCCGT

GCCCTACCTCATCGAGCGCGAGGGCACGAGCTGCGAGAATCTGCCCGAAACACACGAGCCCTACCTCATCGAGCGCGAGGGCACGAGCTGCGAGAATCTGCCCGAAACACACGA

GATTCTCAAGGGCTTCCGGGCGATGGTGGACCGCGAGTATCCGGGGCGGCTGCTGCTTGATTCTCAAGGGCTTCCGGGCGATGGTGGACCGCGAGTATCCGGGGCGGCTGCTGCTT

GCCGAGGCGAACCAGTGGCCCGAGGAAGTCGTCGAGTACTTCGGCACCGAAGCCGAGGCCGAGGCGAACCAGTGGCCCGAGGAAGTCGTCGAGTACTTCGGCACCGAAGCCGAG

CCCGAGTTCCACATGTGCTTCAACTTCCCGGTGATGCCCCGGCTGTACATGAGCCTGACCCGAGTTCCACATGTGCTTCAACTTCCCGGTGATGCCCCGGCTGTACATGAGCCTGA

AAAGGGAGGACACCTCCAGCATCCGCGAGATCATGGGCCGCCTGCCGAAAATCCCGAAAAGGGAGGACACCTCCAGCATCCGCGAGATCATGGGCCGCCTGCCGAAAATCCCGA

GTTTCGGCCAGTGGTGCACCTTCCTGCGCAACCACGACGAACTGACGCTGGAAATGGTGTTTCGGCCAGTGGTGCACCTTCCTGCGCAACCACGACGAACTGACGCTGGAAATGGT

CACCGACGACGAGCGCGCCTTCATGTATGCCGCCTACGCGCCCGACGCCCGCATGAACACCGACGACGAGCGCGCCTTCATGTATGCCGCCTACGCGCCCGACGCCCGCATGAA

AATCAACGTGGGCATCCGCCGTCGCCTCGCGCCGCTGCTCGACAACGACCGGCGCCGAATCAACGTGGGCATCCGCCGTCGCCTCGCGCCGCTGCTCGACAACGACCGGCGCCG

CATCGAGCTGCTGAACACTGTGCTCCTCGCCCTGCCCGGCAGCCCCATCCTGTACTACCATCGAGCTGCTGAACACTGTGCTCCTCGCCCTGCCCGGCAGCCCCATCCTGTACTAC

GGCGACGAAATCGGCATGGGCGACGACCTCGGCCTGCCCGACCGCAACGGCGTGCGCGGCGACGAAATCGGCATGGGCGACGACCTCGGCCTGCCCGACCGCAACGGCGTGCGC

ACCCCGATGCAGTGGAACGCGGGCACCAGCGGCGGTTTTTCCACTGCGCAGCCCTCCGACCCCGATGCAGTGGAACGCGGGCACCAGCGGCGGTTTTTCCACTGCGCAGCCCTCCG

ACTGCTTTTTCCCGCCGATTCAGGACCCGGTGTACGGCTTCGGGCGCGTCAACGTGCAACTGCTTTTTCCCGCCGATTCAGGACCCGGTGTACGGCTTCGGGCGCGTCAACGTGCA

GAGCCAGCTCCAAGACCCCAGCAGCCTGCTGAAGTGGACCGCCCGGCAACTCGAACTGAGCCAGCTCCAAGACCCCAGCAGCCTGCTGAAGTGGACCGCCCGGCAACTCGAACT

GCGCCGCGCCCACCCCGCCTTTGCGCACGGCGACCTCACCTTCATCGAAACCGGCAACGCGCCGCGCCCACCCCGCCTTTGCGCACGGCGACCTCACCTTCATCGAAACCGGCAAC

CCCGCCATCCTCGCCTTTACCCGCCAGTACGACGGCGAAACGCTGCTCATCGTCAGCACCCGCCATCCTCGCCTTTACCCGCCAGTACGACGGCGAAACGCTGCTCATCGTCAGCA

ACTTCGCGGGCAACGCCCAGGCCGGGCTGCTCGATCTCGCGCCCTTCGTGGGCCGCGCACTTCGCGGGCAACGCCCAGGCCGGGCTGCTCGATCTCGCGCCCTTCGTGGGCCGCGC

CCCGGTCACACTTTCCGGGGCCAGCCCGCTGCCGGTGGTCACTGGAAACGGCCAGTACCCCGGTCACACTTTCCGGGGCCAGCCCGCTGCCGGTGGTCACTGGAAACGGCCAGTAC

CCGGTGGTGATGGGCAAGTACGACTATTACTGGCTGCGGTTGAATTGACCGGTGGTGATGGGCAAGTACGACTATTACTGGCTGCGGTTGAATTGA

Informacja o sekwencji:Sequence information:

DŁUGOŚĆ: 1659 nukleotydyLENGTH: 1659 nucleotides

TYP: kwas nukleinowyTYPE: nucleic acid

TOPOLOGIA: liniowaTOPOLOGY: linear

ILOŚĆ NICI: jednaTHREAD COUNT: one

RODZAJ CZĄSTECZKI: DNATYPE OF PARTICLE: DNA

PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1

Wzór 2. Sekwencje starterówFormula 2. Primer sequences

DraSTNdeFDraSTNdeF

5’ aa cat ATG ACC CAG GCA CAC CCG GA 3’5 'aa cat ATG ACC CAG GCA CAC CCG GA 3'

Informacja o sekwencji:Sequence information:

DŁUGOŚĆ: 25 nukleotydyLENGTH: 25 nucleotides

TYP: kwas nukleinowyTYPE: nucleic acid

TOPOLOGIA: liniowaTOPOLOGY: linear

RODZAJ CZĄSTECZKI: DNATYPE OF PARTICLE: DNA

DraSTXhoRDraSTXhoR

5’ aa ctc gag ATT CAA CCG CAG CC A GTA AT A GTC 3’5 'aa ctc gag ATT CAA CCG CAG CC A GTA AT A GTC 3'

Informacja o sekwencji:Sequence information:

DŁUGOŚĆ: 32 nukleotydyLENGTH: 32 nucleotides

TYP: kwas nukleinowyTYPE: nucleic acid

TOPOLOGIA: liniowaTOPOLOGY: linear

RODZAJ CZĄSTECZKI: DNATYPE OF PARTICLE: DNA

Wzór 3. Sekwencja zamplifikowanego genu kodującego białko Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 wraz z dodatkowymi miejscami rozpoznania dla enzymów restrykcyjnych Ndel i Xhol.Formula 3. Sequence of the amplified gene encoding the protein Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 along with additional recognition sites for the restriction enzymes NdeI and XhoI.

AACATATGACCCAGGCACACCCGGAGTGGTACAAGAGCGCTGTCTTCTACGAACTGTAACATATGACCCAGGCACACCCGGAGTGGTACAAGAGCGCTGTCTTCTACGAACTGT

CCGTGCGGACCTTTCAGGACGGCAACGGCGACGGCAAGGGCGATTTTCCCGGCCTGACCGTGCGGACCTTTCAGGACGGCAACGGCGACGGCAAGGGCGATTTTCCCGGCCTGA

CCTCGCGGCTGGACTACCTGAAAAACCTCGGCGTGGACTGCCTGTGGTTGCTGCCCTGCCTCGCGGCTGGACTACCTGAAAAACCTCGGCGTGGACTGCCTGTGGTTGCTGCCCTG

GTTTCCCAGCCCACTGCGCGACGACGGGTACGACGTGGCCGACTACCGGGGGATTCAGTTTCCCAGCCCACTGCGCGACGACGGGTACGACGTGGCCGACTACCGGGGGATTCA

CCCTGACCTCGGCACGCTCGACGACTTCAAGGTCTTTCTGCGCGAAGCCCACGCCCGGCCCTGACCTCGGCACGCTCGACGACTTCAAGGTCTTTCTGCGCGAAGCCCACGCCCGG

GGCCTGCGGGTCATCGGCGACCTGGTGACCAACCACACGTCCAGCGACCACCCCTGGGGCCTGCGGGTCATCGGCGACCTGGTGACCAACCACACGTCCAGCGACCACCCCTGG

TTTCAGGCGGCGCGGCGCGGCCCGACCCTGCCCGACGGCTCGCCCAACGAGTACCACTTTCAGGCGGCGCGGCGCGGCCCGACCCTGCCCGACGGCTCGCCCAACGAGTACCAC

GACTACTACGTCTGGAGCGACGAGGGCAAGGAATACGCCGACACCCGCATCATCTTCGACTACTACGTCTGGAGCGACGAGGGCAAGGAATACGCCGACACCCGCATCATCTTC

ACCGACACCGAGGTCAGCAACTGGACGCTCGACGAGCAGGCAGGCAAGTATTACTGGACCGACACCGAGGTCAGCAACTGGACGCTCGACGAGCAGGCAGGCAAGTATTACTGG

CACCGCTTTTTCGCCAGCCAGCCGGACCTGAACTACGACAACCCGAAAGTGGTGGAACACCGCTTTTTCGCCAGCCAGCCGGACCTGAACTACGACAACCCGAAAGTGGTGGAA

G AACTTC A CGGCGCCG C CCGCTTCTGGCTCGA CCTCGG CCTCGACGGGTTCCGGGTGGG AACTTC A CGGCGCCG C CCGCTTCTGGCTCGA CCTCGG CCTCGACGGGTTCCGGGTGG

ACGCCGTGCCCTACCTCATCGAGCGCGAGGGCACGAGCTGCGAGAATCTGCCCGAAAACGCCGTGCCCTACCTCATCGAGCGCGAGGGCACGAGCTGCGAGAATCTGCCCGAAA

CACACGAGATTCTCAAGGGCTTCCGGGCGATGGTGGACCGCGAGTATCCGGGGCGGCCACACGAGATTCTCAAGGGCTTCCGGGCGATGGTGGACCGCGAGTATCCGGGGCGGC

TGCTGCTTGCCGAGGCGAACCAGTGGCCCGAGGAAGTCGTCGAGTACTTCGGCACCGTGCTGCTTGCCGAGGCGAACCAGTGGCCCGAGGAAGTCGTCGAGTACTTCGGCACCG

AAGCCGAGCCCGAGTTCCACATGTGCTTCAACTTCCCGGTGATGCCCCGGCTGTACATAAGCCGAGCCCGAGTTCCACATGTGCTTCAACTTCCCGGTGATGCCCCGGCTGTACAT

GAGCCTGAAAAGGGAGGACACCTCCAGCATCCGCGAGATCATGGGCCGCCTGCCGAAGAGCCTGAAAAGGGAGGACACCTCCAGCATCCGCGAGATCATGGGCCGCCTGCCGAA

AATCCCGAGTTTCGGCCAGTGGTGCACCTTCCTGCGCAACCACGACGAACTGACGCTGAATCCCGAGTTTCGGCCAGTGGTGCACCTTCCTGCGCAACCACGACGAACTGACGCTG

GAAATGGTCACCGACGACGAGCGCGCCTTCATGTATGCCGCCTACGCGCCCGACGCCGAAATGGTCACCGACGACGAGCGCGCCTTCATGTATGCCGCCTACGCGCCCGACGCC

CGCATGAAAATCAACGTGGGCATCCGCCGTCGCCTCGCGCCGCTGCTCGACAACGACCGCATGAAAATCAACGTGGGCATCCGCCGTCGCCTCGCGCCGCTGCTCGACAACGAC

CGGCGCCGCATCGAGCTGCTGAACACTGTGCTCCTCGCCCTGCCCGGCAGCCCCATCCCGGCGCCGCATCGAGCTGCTGAACACTGTGCTCCTCGCCCTGCCCGGCAGCCCCATCC

TGTACTACGGCGACGAAATCGGCATGGGCGACGACCTCGGCCTGCCCGACCGCAACGTGTACTACGGCGACGAAATCGGCATGGGCGACGACCTCGGCCTGCCCGACCGCAACG

GCGTGCGCACCCCGATGCAGTGGAACGCGGGCACCAGCGGCGGTTTTTCCACTGCGCGCGTGCGCACCCCGATGCAGTGGAACGCGGGCACCAGCGGCGGTTTTTCCACTGCGC

AGCCCTCCG A CTGCTTTTTCCCGCCG ATTC AGG ACCCGG TG TACGGCTTCGGGCGCGTAGCCCTCCG A CTGCTTTTTCCCGCCG ATTC AGG ACCCGG TG TACGGCTTCGGGCGCGT

CAACGTGCAGAGCCAGCTCCAAGACCCCAGCAGCCTGCTGAAGTGGACCGCCCGGCACAACGTGCAGAGCCAGCTCCAAGACCCCAGCAGCCTGCTGAAGTGGACCGCCCGGCA

ACTCGAACTGCGCCGCGCCCACCCCGCCTTTGCGCACGGCGACCTCACCTTCATCGAAACTCGAACTGCGCCGCGCCCACCCCGCCTTTGCGCACGGCGACCTCACCTTCATCGAA

ACCGGCAACCCCGCCATCCTCGCCTTTACCCGCCAGTACGACGGCGAAACGCTGCTCAACCGGCAACCCCGCCATCCTCGCCTTTACCCGCCAGTACGACGGCGAAACGCTGCTCA

TCGTCAGCAACTTCGCGGGCAACGCCCAGGCCGGGCTGCTCGATCTCGCGCCCTTCGTTCGTCAGCAACTTCGCGGGCAACGCCCAGGCCGGGCTGCTCGATCTCGCGCCCTTCGT

GGGCCGCGCCCCGGTCACACTTTCCGGGGCCAGCCCGCTGCCGGTGGTCACTGGAAAGGGCCGCGCCCCGGTCACACTTTCCGGGGCCAGCCCGCTGCCGGTGGTCACTGGAAA

CGGCCAGTACCCGGTGGTGATGGGCAAGTACGACTATTACTGGCTGCGGTTGAATCTCCGGCCAGTACCCGGTGGTGATGGGCAAGTACGACTATTACTGGCTGCGGTTGAATCTC

GAGTTGAGTT

PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1

Informacja o sekwencji:Sequence information:

DŁUGOŚĆ: 1669 nukleotydyLENGTH: 1669 nucleotides

TYP: kwas nukleinowyTYPE: nucleic acid

TOPOLOGIA: liniowaTOPOLOGY: linear

ILOŚĆ NICI: jednaTHREAD COUNT: one

RODZAJ CZĄSTECZKI: DNATYPE OF PARTICLE: DNA

Wzór 4. Sekwencja plazmidu rekombinantowego pETSOEk/LICDraSTH.Formula 4. Sequence of the recombinant pETSOEk / LICDraSTH plasmid.

ATCCGGATAT AGTTCCTCCT TTCAGCAAAA AACCCCTCAA GACCCGTTTAATCCGGATAT AGTTCCTCCT TTCAGCAAAA AACCCCTCAA GACCCGTTTA

GAGGCCCCAAGAGGCCCCAA

GGGGTTATGC TAGTTATTGC TCAGCGGTGG CAGCAGCCAA CTCAGCTTCCGGGGTTATGC TAGTTATTGC TCAGCGGTGG CAGCAGCCAA CTCAGCTTCC

TTTCGGGCTT TTTCGGGCTT 121 TGTTAGCAGC CGGATCTCAG TGGTGGTGGT GGTGGTGCTC GAGATTCAAC 121 TGTTAGCAGC CGGATCTCAG TGGTGGTGGT GGTGGTGCTC GAGATTCAAC CGCAGCCAGT CGCAGCCAGT 181 AATAGTCGTA CTTGCCCATC ACCACCGGGT ACTGGCCGTT TCCAGTGACC 181 AATAGTCGTA CTTGCCCATC ACCACCGGGT ACTGGCCGTT TCCAGTGACC ACCGGCAGCG ACCGGCAGCG 241 GGCTGGCCCC GGAAAGTGTG ACCGGGGCGC GGCCCACGAA GGGCGCGAGA 241 GGCTGGCCCC GGAAAGTGTG ACCGGGGCGC GGCCCACGAA GGGCGCGAGA TCGAGCAGCC TCGAGCAGCC 301 CGGCCTGGGC GTTGCCCGCG AAGTTGCTGA CGATGAGCAG CGTTTCGCCG 301 CGGCCTGGGC GTTGCCCGCG AAGTTGCTGA CGATGAGCAG CGTTTCGCCG TCGTACTGGC TCGTACTGGC 361 GGGTAAAGGC GAGGATGGCG GGGTTGCCGG TTTCGATGAA GGTGAGGTCG 361 GGGTAAAGGC GAGGATGGCG GGGTTGCCGG TTTCGATGAA GGTGAGGTCG CCGTGCGCAA CCGTGCGCAA 421 AGGCGGGGTG GGCGCGGCGC AGTTCGAGTT GCCGGGCGGT CCACTTCAGC 421 AGGCGGGGTG GGCGCGGCGC AGTTCGAGTT GCCGGGCGGT CCACTTCAGC AGGCTGCTGG AGGCTGCTGG 481 GGTCTTGGAG CTGGCTCTGC ACGTTGACGC GCCCGAAGCC GTACACCGGG 481 GGTCTTGGAG CTGGCTCTGC ACGTTGACGC GCCCGAAGCC GTACACCGGG TCCTGAATCG TCCTGAATCG 541 GCGGGAAAAA GCAGTCGGAG GGCTGCGCAG TGGAAAAACC GCCGCTGGTG 541 GCGGGAAAAA GCAGTCGGAG GGCTGCGCAG TGGAAAAACC GCCGCTGGTG CCCGCGTTCC CCCGCGTTCC 601 ACTGCATCGG GGTGCGCACG CCGTTGCGGT CGGGCAGGCC GAGGTCGTCG 601 ACTGCATCGG GGTGCGCACG CCGTTGCGGT CGGGCAGGCC GAGGTCGTCG CCCATGCCGA CCCATGCCGA 661 TTTCGTCGCC GTAGTACAGG ATGGGGCTGC CGGGCAGGGC GAGGAGCACA 661 TTTCGTCGCC GTAGTACAGG ATGGGGCTGC CGGGCAGGGC GAGGAGCACA GTGTTCAGCA GTGTTCAGCA 721 GCTCGATGCG GCGCCGGTCG TTGTCGAGCA GCGGCGCGAG GCGACGGCGG 721 GCTCGATGCG GCGCCGGTCG TTGTCGAGCA GCGGCGCGAG GCGACGGCGG ATGCCCACGT ATGCCCACGT 781 TGATTTTCAT GCGGGCGTCG GGCGCGTAGG CGGCATACAT GAAGGCGCGC 781 TGATTTTCAT GCGGGCGTCG GGCGCGTAGG CGGCATACAT GAAGGCGCGC TCGTCGTCGG TCGTCGTCGG 841 TGACCATTTC CAGCGTCAGT TCGTCGTGGT TGCGCAGGAA GGTGCACCAC 841 TGACCATTTC CAGCGTCAGT TCGTCGTGGT TGCGCAGGAA GGTGCACCAC TGGCCGAAAC TGGCCGAAAC 901 TCGGGATTTT CGGCAGGCGG CCCATGATCT CGCGGATGCT GGAGGTGTCC 901 TCGGGATTTT CGGCAGGCGG CCCATGATCT CGCGGATGCT GGAGGTGTCC TCCCTTTTCA TCCCTTTTCA 961 GGCTCATGTA CAGCCGGGGC ATCACCGGGA AGTTGAAGCA CATGTGGAAC 961 GGCTCATGTA CAGCCGGGGC ATCACCGGGA AGTTGAAGCA CATGTGGAAC

TGGGGCTCGGTGGGGCTCGG

PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1

1021 CTTCGGTGCC 1021 CTTCGGTGCC GAAGTACTCG GAAGTACTCG ACGACTTCCT ACGACTTCCT CGGGCCACTG CGGGCCACTG GTTCGCCTCG GTTCGCCTCG GCAAGCAGCA 1081 GCCGCCCCGG GCAAGCAGCA 1081 GCCGCCCCGG ATACTCGCGG ATACTCGCGG TCCACCATCG TCCACCATCG CCCGGAAGCC CCCGGAAGCC CTTGAGAATC CTTGAGAATC TCGTGTGTTT 1141 CGGGCAGATT TCGTGTGTTT 1141 CGGGCAGATT CTCGCAGCTC CTCGCAGCTC GTGCCCTCGC GTGCCCTCGC GCTCGATGAG GCTCGATGAG GTAGGGCACG GTAGGGCACG GCGTCCACCC 1201 GGAACCCGTC GCGTCCACCC 1201 GGAACCCGTC GAGGCCGAGG GAGGCCGAGG TCGAGCCAGA TCGAGCCAGA AGCGGGCGGC AGCGGGCGGC GCCGTGAAGT GCCGTGAAGT TCTTCCACCA 1261 CTTTCGGGTT TCTTCCACCA 1261 CTTTCGGGTT GTCGTAGTTC GTCGTAGTTC AGGTCCGGCT AGGTCCGGCT GGCTGGCGAA GGCTGGCGAA AAAGCGGTGC AAAGCGGTGC CAGTAATACT 1321 TGCCTGCCTG CAGTAATACT 1321 TGCCTGCCTG CTCGTCGAGC CTCGTCGAGC GTCCAGTTGC GTCCAGTTGC TGACCTCGGT TGACCTCGGT GTCGGTGAAG GTCGGTGAAG ATGATGCGGG 1381 TGTCGGCGTA ATGATGCGGG 1381 TGTCGGCGTA TTCCTTGCCC TTCCTTGCCC TCGTCGCTCC TCGTCGCTCC AGACGTAGTA AGACGTAGTA GTCGTGGTAC GTCGTGGTAC ICGTTGGGCG 1441 AGCCGTCGGG ICGTTGGGCG 1441 AGCCGTCGGG CAGGGTCGGG CAGGGTCGGG CCGCGCCGCG CCGCGCCGCG CCGCCTGAAA CCGCCTGAAA CCAGGGGTGG CCAGGGGTGG TCGCTGGACG 1501 TGTGGTTGGT TCGCTGGACG 1501 TGTGGTTGGT CACCAGGTCG CACCAGGTCG CCGATGACCC CCGATGACCC GCAGGCCCCG GCAGGCCCCG GGCGTGGGCT GGCGTGGGCT TCGCGCAGAA 1561 AGACCTTGAA TCGCGCAGAA 1561 AGACCTTGAA GTCGTCGAGC GTCGTCGAGC GTGCCGAGGT GTGCCGAGGT CAGGGTGAAT CAGGGTGAAT CCCCCGGTAG CCCCCGGTAG TCGGCCACGT 1621 CGTACCCGTC TCGGCCACGT 1621 CGTACCCGTC GTCGCGCAGT GTCGCGCAGT GGGCTGGGAA GGGCTGGGAA ACCAGGGCAG ACCAGGGCAG CAACCACAGG CAACCACAGG CAGTCCACGC 1681 CGAGGTTTTT CAGTCCACGC 1681 CGAGGTTTTT CAGGTAGTCC CAGGTAGTCC AGCCGCGAGG AGCCGCGAGG TCAGGCCGGG TCAGGCCGGG AAAATCGCCC AAAATCGCCC TTGCCGTCGC 1741 CGTTGCCGTC TTGCCGTCGC 1741 CGTTGCCGTC CTGAAAGGTC CTGAAAGGTC CGCACGGACA CGCACGGACA GTTCGTAGAA GTTCGTAGAA GACAGCGCTC GACAGCGCTC TTGTACCACT 1801 CCGGGTGTGC TTGTACCACT 1801 CCGGGTGTGC CTGGGTCATA CTGGGTCATA TGTATATCTC TGTATATCTC CTTCTTAAAG CTTCTTAAAG TTAAACAAAA TTAAACAAAA TTATTTCTAG 1861 AGGGGAATTG TTATTTCTAG 1861 AGGGGAATTG TTATCCGCTC TTATCCGCTC ACAATTCCCC ACAATTCCCC TATAGTGAGT TATAGTGAGT CGTATTAATT CGTATTAATT TCGCGGGATC 1921 GAGATCGATC TCGCGGGATC 1921 GAGATCGATC TCGATCCTCT TCGATCCTCT ACGCCGGACG ACGCCGGACG CATCGTGGCC CATCGTGGCC GGCATCACCG GGCATCACCG GCGCCACAGG 1981 TGCGGTTGCT GCGCCACAGG 1981 TGCGGTTGCT GGCGCCTATA GGCGCCTATA TCGCCGACAT TCGCCGACAT CACCGATGGG CACCGATGGG GAAGATCGGG GAAGATCGGG CTCGCCACTT 2041 CGGGCTCATG CTCGCCACTT 2041 CGGGCTCATG AGCGCTTGTT AGCGCTTGTT TCGGCGTGGG TCGGCGTGGG TATGGTGGCA TATGGTGGCA GGCCCCGTGG GGCCCCGTGG

CCGGGGGACTCCGGGGGACT

PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1

2101 GTTGGGCGCC 2101 GTTGGGCGCC ATCTCCTTGC ATCTCCTTGC ATGCACCATT ATGCACCATT CCTTGCGGCG CCTTGCGGCG GCGGTGCTCA GCGGTGCTCA ACGGCCTCAA 2161 CCTACTACTG ACGGCCTCAA 2161 CCTACTACTG GGCTGCTTCC GGCTGCTTCC TAATGCAGGA TAATGCAGGA GTCGCATAAG GTCGCATAAG GGAGAGCGTC GGAGAGCGTC GAGATCCCGG 2221 ACACCATCGA GAGATCCCGG 2221 ACACCATCGA ATGGCGCAAA ATGGCGCAAA ACCTTTCGCG ACCTTTCGCG GTATGGCATG GTATGGCATG ATAGCGCCCG ATAGCGCCCG GAAGAGAGTC 2281 AATTCAGGGT GAAGAGAGTC 2281 AATTCAGGGT GGTGAATGTG GGTGAATGTG AAACCAGTAA AAACCAGTAA CGTTATACGA CGTTATACGA TGTCGCAGAG TGTCGCAGAG TATGCCGGTG 2341 TCTCTTATCA TATGCCGGTG 2341 TCTCTTATCA GACCGTTTCC GACCGTTTCC CGCGTGGTGA CGCGTGGTGA ACCAGGCCAG ACCAGGCCAG CCACGTTTCT CCACGTTTCT GCGAAAACGC 2401 GGGAAAAAGT GCGAAAACGC 2401 GGGAAAAAGT GGAAGCGGCG GGAAGCGGCG ATGGCGGAGC ATGGCGGAGC TGAATTACAT TGAATTACAT TCCCAACCGC TCCCAACCGC GTGGCACAAC 2461 AACTGGCGGG GTGGCACAAC 2461 AACTGGCGGG CAAACAGTCG CAAACAGTCG TTGCTGATTG TTGCTGATTG GCGTTGCCAC GCGTTGCCAC CTCCAGTCTG CTCCAGTCTG GCCCTGCACG 2521 CGCCGTCGCA GCCCTGCACG 2521 CGCCGTCGCA AATTGTCGCG AATTGTCGCG GCGATTAAAT GCGATTAAAT CTCGCGCCGA CTCGCGCCGA TCAACTGGGT TCAACTGGGT GCCAGCGTGG 2581 TGGTGTCGAT GCCAGCGTGG 2581 TGGTGTCGAT GGTAGAACGA GGTAGAACGA AGCGGCGTCG AGCGGCGTCG AAGCCTGTAA AAGCCTGTAA AGCGGCGGTG AGCGGCGGTG CACAATCTTC 2641 TCGCGCAACG CACAATCTTC 2641 TCGCGCAACG CGTCAGTGGG CGTCAGTGGG CTGATCATTA CTGATCATTA ACTATCCGCT ACTATCCGCT GGATGACCAG GGATGACCAG GATGCCATTG 2701 CTGTGGAAGC GATGCCATTG 2701 CTGTGGAAGC TGCCTGCACT TGCCTGCACT AATGTTCCGG AATGTTCCGG CGTTATTTCT CGTTATTTCT TGATGTCTCT TGATGTCTCT GACCAGACAC 2761 CCATCAACAG GACCAGACAC 2761 CCATCAACAG TATTATTTTC TATTATTTTC TCCCATGAAG TCCCATGAAG ACGGTAGGCG ACGGTAGGCG ACTGGGCGTG ACTGGGCGTG GAGCATGTGG 2821 TCGCATTGGG GAGCATGTGG 2821 TCGCATTGGG TCACCAGCAA TCACCAGCAA ATCGCGCTGT ATCGCGCTGT TAGCGGGCCC TAGCGGGCCC ATTAAGTTCT ATTAAGTTCT GTCTCGGCGC 2881 GTCTGCGTCT GTCTCGGCGC 2881 GTCTGCGTCT GGCTGGCTGG GGCTGGCTGG CATAAATATC CATAAATATC TCACTCGCAA TCACTCGCAA TCAAATTCAG TCAAATTCAG CCGATAGCGG 2941 AACGGGAAGG CCGATAGCGG 2941 AACGGGAAGG CGACTGGAGT CGACTGGAGT GCCATGTCCG GCCATGTCCG GTTTTCAACA GTTTTCAACA AACCATGCAA AACCATGCAA ATGCTGAATG 3001 A3GGCATCGT ATGCTGAATG 3001 A3GGCATCGT TCCCACTGCG TCCCACTGCG ATGCTGGTTG ATGCTGGTTG CCAACGATCA CCAACGATCA GATGGCGCTG GATGGCGCTG GGCGCAATGC 3061 GCGCCATTAC GGCGCAATGC 3061 GCGCCATTAC CGAGTCCGGG CGAGTCCGGG CTGCGCGTTG CTGCGCGTTG GTGCGGACAT GTGCGGACAT CTCGGTAGTG CTCGGTAGTG GGATACGACG 3121 ATACCGAAGA GGATACGACG 3121 ATACCGAAGA CAGCTCATGT CAGCTCATGT TATATCCCGC TATATCCCGC CGTTAACCAC CGTTAACCAC CATCAAACAG CATCAAACAG

GATTTTCGCCGATTTTCGCC

PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1

3181 TGCTGGGGCA 3181 TGCTGGGGCA AACCAGCGTG AACCAGCGTG GACCGCTTGC GACCGCTTGC TGCAACTCTC TGCAACTCTC TCAGGGCCAG TCAGGGCCAG GCGGTGAAGG 3241 GCAATCAGCT GCGGTGAAGG 3241 GCAATCAGCT GTTGCCCGTC GTTGCCCGTC TCACTGGTGA TCACTGGTGA AAAGAAAAAC AAAGAAAAAC CACCCTGGCG CACCCTGGCG CCCAATACGC 3301 AAACCGCCTC CCCAATACGC 3301 AAACCGCCTC TCCCCGCGCG TCCCCGCGCG TTGGCCGATT TTGGCCGATT CATTAATGCA CATTAATGCA GCTGGCACGA GCTGGCACGA CAGGTTTCCC 3361 GACTGGAAAG CAGGTTTCCC 3361 GACTGGAAAG CGGGCAGTGA CGGGCAGTGA GCGCAACGCA GCGCAACGCA ATTAATGTAA ATTAATGTAA GTTAGCTCAC GTTAGCTCAC TCATTAGGCA 3421 CCGGGATCTC TCATTAGGCA 3421 CCGGGATCTC GACCGATGCC GACCGATGCC CTTGAGAGCC CTTGAGAGCC TTCAACCCAG TTCAACCCAG TCAGCTCCTT TCAGCTCCTT CCGGTGGGCG 3481 CGGGGCATGA CCGGTGGGCG 3481 CGGGGCATGA CTATCGTCGC CTATCGTCGC CGCACTTATG CGCACTTATG ACTGTCTTCT ACTGTCTTCT TTATCATGCA TTATCATGCA ACTCGTAGGA 3541 CAGGTGCCGG ACTCGTAGGA 3541 CAGGTGCCGG CAGCGCTCTG CAGCGCTCTG GGTCATTTTC GGTCATTTTC GGCGAGGACC GGCGAGGACC GCTTTCGCTG GCTTTCGCTG GAGCGCGACG 3501 ATGATCGGCC GAGCGCGACG 3501 ATGATCGGCC TGTCGCTTGC TGTCGCTTGC GGTATTCGGA GGTATTCGGA ATCTTGCACG ATCTTGCACG CCCTCGCTCA CCCTCGCTCA AGCCTTCGTC 3661 ACTGGTCCCG AGCCTTCGTC 3661 ACTGGTCCCG CCACCAAACG CCACCAAACG TTTCGGCGAG TTTCGGCGAG AAGCAGGCCA AAGCAGGCCA TTATCGCCGG TTATCGCCGG CATGGCGGCC 3721 CCACGGGTGC CATGGCGGCC 3721 CCACGGGTGC GCATGATCGT GCATGATCGT GCTCCTGTCG GCTCCTGTCG TTGAGGACCC TTGAGGACCC GGCTAGGCTG GGCTAGGCTG GCGGGGTTGC 3781 CTTACTGGTT GCGGGGTTGC 3781 CTTACTGGTT AGCAGAATGA AGCAGAATGA ATCACCGATA ATCACCGATA CGCGAGCGAA CGCGAGCGAA CGTGAAGCGA CGTGAAGCGA CTGCTGCTGC 3841 AAAACGTCTG CTGCTGCTGC 3841 AAAACGTCTG CGACCTGAGC CGACCTGAGC AACAACATGA AACAACATGA ATGGTCTTCG ATGGTCTTCG GTTTCCGTGT GTTTCCGTGT TTCGTAAAGT 3901 CTGGAAACGC TTCGTAAAGT 3901 CTGGAAACGC GGAAGTCAGC GGAAGTCAGC GCCCTGCACC GCCCTGCACC ATTATGTTCC ATTATGTTCC GGATCTGCAT GGATCTGCAT CGCAGGATGC 3961 TGCTGGCTAC CGCAGGATGC 3961 TGCTGGCTAC CCTGTGGAAC CCTGTGGAAC ACCTACATCT ACCTACATCT GTATTAACGA GTATTAACGA AGCGCTGGCA AGCGCTGGCA TTGACCCTGA 4021 GTGATTTTTC TTGACCCTGA 4021 GTGATTTTTC TCTGGTCCCG TCTGGTCCCG CCGCATCCAT CCGCATCCAT ACCGCCAGTT ACCGCCAGTT GTTTACCCTC GTTTACCCTC ACAACGTTCC 4081 AGTAACCGGG ACAACGTTCC 4081 AGTAACCGGG CATGTTCATC CATGTTCATC ATCAGTAACC ATCAGTAACC CGTATCGTGA CGTATCGTGA GCATCCTCTC GCATCCTCTC TCGTTTCATC 4141 GGTATCATTA TCGTTTCATC 4141 GGTATCATTA CCCCCATGAA CCCCCATGAA CAGAAATCCC CAGAAATCCC CCTTACACGG CCTTACACGG AGGCATCAGT AGGCATCAGT GACCAAACAG 4201 GAAAAAACCG GACCAAACAG 4201 GAAAAAACCG CCCTTAACAT CCCTTAACAT GGCCCGCTTT GGCCCGCTTT ATCAGAAGCC ATCAGAAGCC AGACATTAAC AGACATTAAC

GCTTCTGGAGGCTTCTGGAG

PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1

4261 AAACTCAACG 4261 AAACTCAACG AGCTGGACGC AGCTGGACGC GGATGAACAG GGATGAACAG GCAGACATCT GCAGACATCT GTGAATCGCT GTGAATCGCT TCACGACCAC 4321 GCTGATGAGC TCACGACCAC 4321 GCTGATGAGC TTTACCGCAG TTTACCGCAG CTGCCTCGCG CTGCCTCGCG CGTTTCGGTG CGTTTCGGTG ATGACGGTGA ATGACGGTGA AAACCTCTGA 4381 CACATGCAGC AAACCTCTGA 4381 CACATGCAGC TCCCGGAGAC TCCCGGAGAC GGTCACAGCT GGTCACAGCT TGICTG^AAG TGICTG ^ AAG CGGATGCCGG CGGATGCCGG GAGCAGACAA 4441 GCCCGTCAGG GAGCAGACAA 4441 GCCCGTCAGG GCGCGTCAGC GCGCGTCAGC GGGTGTTGGC GGGTGTTGGC GGGTGTCGGG GGGTGTCGGG GCGCAGCCAT GCGCAGCCAT GACCCAGTCA 4501 CGTAGCGATA GACCCAGTCA 4501 CGTAGCGATA GCGGAGTGTA GCGGAGTGTA TACTGGCTTA TACTGGCTTA ACTATGCGGC ACTATGCGGC ATCAGAGCAG ATCAGAGCAG ATTGTACTGA 4561 GAGTGCACCA ATTGTACTGA 4561 GAGTGCACCA TATATGCGGT TATATGCGGT GTGAAATACC GTGAAATACC GCACAGATGC GCACAGATGC GTAAGGAGAA GTAAGGAGAA AATACCGCAT 4621 CAGGCGCTCT AATACCGCAT 4621 CAGGCGCTCT TCCGCTTCCT TCCGCTTCCT CGCTCACTGA CGCTCACTGA CTCGCTGCGC CTCGCTGCGC TCGGTCGTTC TCGGTCGTTC GGCTGCGGCG 4681 AGCGGTATCA GGCTGCGGCG 4681 AGCGGTATCA GCTCACTCAA GCTCACTCAA AGGCGGTAAT AGGCGGTAAT ACGGTTATCC ACGGTTATCC ACAGAATCAG ACAGAATCAG GGGATAACGC 4741 AGGAAAGAAC GGGATAACGC 4741 AGGAAAGAAC ATGTGAGCAA ATGTGAGCAA AAGGCCAGCA AAGGCCAGCA AAAGGCCAGG AAAGGCCAGG AACCGTAAAA AACCGTAAAA AGGCCGCGTT 4801 GCTGGCGTTT AGGCCGCGTT 4801 GCTGGCGTTT TTCCATAGGC TTCCATAGGC TCCGCCCCCC TCCGCCCCCC TGACGAGCAT TGACGAGCAT CACAAAAATC CACAAAAATC GACGCTCAAG 4861 TCAGAGGTGG GACGCTCAAG 4861 TCAGAGGTGG CGAAACCCGA CGAAACCCGA CAGGACTATA CAGGACTATA AAGATACCAG AAGATACCAG GCGTTTCCCC GCGTTTCCCC CTGGAAGCTC 4921 CCTCGTGCGC CTGGAAGCTC 4921 CCTCGTGCGC TCTCCTGTTC TCTCCTGTTC CGACCCTGCC CGACCCTGCC GCTTACCGGA GCTTACCGGA TACCTGTCCG TACCTGTCCG CCTTTCTCCC 4981 TTCGGGAAGC CCTTTCTCCC 4981 TTCGGGAAGC GTGGCGCTTT GTGGCGCTTT CTCATAGCTC CTCATAGCTC ACGCTGTAGG ACGCTGTAGG TATCTCAGTT TATCTCAGTT CGGTGTAGGT 5041 CGTTCGCTCC CGGTGTAGGT 5041 CGTTCGCTCC AAGCTGGGCT AAGCTGGGCT GTGTGCACGA GTGTGCACGA ACCCCCCGTT ACCCCCCGTT CAGCCCGACC CAGCCCGACC GCTGCGCCTT 5101 ATCCGGTAAC GCTGCGCCTT 5101 ATCCGGTAAC TATCGTCTTG TATCGTCTTG AGTCCAACCC AGTCCAACCC GGTAAGACAC GGTAAGACAC GACTTATCGC GACTTATCGC CACTGGCAGC 5161 AGCCACTGGT CACTGGCAGC 5161 AGCCACT GGT AACAGGATTA AACAGGATTA GCAGAGCGAG GCAGAGCGAG GTATGTAGGC GTATGTAGGC GGTGCTACAG GGTGCTACAG AGTTCTTGAA 5221 GTGGTGGCCT AGTTCTTGAA 5221 GTGGTGGCCT AACTACGGCT AACTACGGCT ACACTAGAAG ACACTAGAAG GACAGTATTT GACAGTATTT GGTATCTGCG GGTATCTGCG CTCTGCTGAA 5281 GCCAGTTACC CTCTGCTGAA 5281 GCCAGTTACC TTCGGAAAAA TTCGGAAAAA GAGTTGGTAG GAGTTGGTAG CTCTTGATCC CTCTTGATCC GGCAAACAAA GGCAAACAAA

CCACCGCTGGCCACCGCTGG

PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1

5341 TAGCGGTGGT 5341 TAGCGGTGGT TTTTTTGTTT TTTTTTGTTT GCAAGCAGCA GCAAGCAGCA GATTACGCGC GATTACGCGC AGAAAAAAAG AGAAAAAAAG GATCTCAAGA 5401 AGATCCTTTG GATCTCAAGA 5401 AGATCCTTTG ATCTTTTCTA ATCTTTTCTA CGGGGTCTGA CGGGGTCTGA CGCTCAGTGG CGCTCAGTGG AACGAAAACT AACGAAAACT CACGTTAAGG 5461 GATTTTGGTC CACGTTAAGG 5461 GATTTTGGTC ATGAACAATA ATGAACAATA AAACTGTCTG AAACTGTCTG CTTACATAAA CTTACATAAA CAGTAATACA CAGTAATACA AGGGGTGTTA 5521 TGAGCCATAT AGGGGTGTTA 5521 TGAGCCATAT TCAACGGGAA TCAACGGGAA ACGTCTTGCT ACGTCTTGCT CTAGGCCGCG CTAGGCCGCG attaaattcc attaaattcc AACATGGATG 5581 CTGATTTATA AACATGGATG 5581 CTGATTTATA TGGGTATAAA TGGGTATAAA TGGGCTCGCG TGGGCTCGCG ATAATGTCGG ATAATGTCGG GCAATCAGGT GCAATCAGGT GCGACAATCT 5641 ATCGATTGTA GCGACAATCT 5641 ATCGATTGTA TGGGAAGCCC TGGGAAGCCC GATGCGCCAG GATGCGCCAG AGTTGTTTCT AGTTGTTTCT GAAACATGGC GAAACATGGC AAAGGTAGCG 5701 TTGCCAATGA AAAGGTAGCG 5701 TTGCCAATGA TGTTACAGAT TGTTACAGAT GAGATGGTCA GAGATGGTCA GACTAAACTG GACTAAACTG GCTGACGGAA GCTGACGGAA TTTATGCCTC 5761 TTCCGACCAT TTTATGCCTC 5761 TTCCGACCAT CAAGCATTTT CAAGCATTTT ATCCGTACTC ATCCGTACTC CTGATGATGC CTGATGATGC ATGGTTACTC ATGGTTACTC ACCACTGCGA 5821 TCCCCGGGAA ACCACTGCGA 5821 TCCCCGGGAA AACAGCATTC AACAGCATTC CAGGTATTAG CAGGTATTAG AAGAATATCC AAGAATATCC TGATTCAGGT TGATTCAGGT GAAAATATTG 5381 TTGATGCGCT GAAAATATTG 5381 TTGATGCGCT GGCAGTGTTC GGCAGTGTTC CTGCGCCGGT CTGCGCCGGT TGCATTCGAT TGCATTCGAT TCCTGTTTGT TCCTGTTTGT AATTGTCCTT 5941 TTAACAGCGA AATTGTCCTT 5941 TTAACAGCGA TCGCGTATTT TCGCGTATTT CGTCTCGCTC CGTCTCGCTC AGGCGCAATC AGGCGCAATC ACGAATGAAT ACGAATGAAT AACGGTTTGG 6001 TTGATGCGAG AACGGTTTGG 6001 TTGATGCGAG TGATTTTGAT TGATTTTGAT GACGAGCGTA GACGAGCGTA ATGGCTGGCC ATGGCTGGCC TGTTGAACAA TGTTGAACAA GTCTGGAAAG 6061 AAATGCATAA GTCTGGAAAG 6061 AAATGCATAA ACTTTTGCCA ACTTTTGCCA TTCTCACCGG TTCTCACCGG ATTCAGTCGT ATTCAGTCGT CACTCATGGT CACTCATGGT GATTTCTCAC 6121 TTGATAACCT GATTTCTCAC 6121 TTGATAACCT TATTTTTGAC TATTTTTGAC GAGGGGAAAT GAGGGGAAAT TAATAGGTTG TAATAGGTTG TATTGATGTT TATTGATGTT GGACGAGTCG 6181 GAATCGCAGA GGACGAGTCG 6181 GAATCGCAGA CCGATACCAG CCGATACCAG GATCTTGCCA GATCTTGCCA TCCTATGGAA TCCTATGGAA CTGCCTCGGT CTGCCTCGGT GAGTTTTCTC 6241 CTTCATTACA GAGTTTTCTC 6241 CTTCATTACA GAAACGGCTT GAAACGGCTT TTTCAAAAAT TTTCAAAAAT ATGGTATTGA ATGGTATTGA TAATCCTGAT TAATCCTGAT ATGAATAAAT 6301 TGCAGTTTCA ATGAATAAAT 6301 TGCAGTTTCA TTTGATGCTC TTTGATGCTC GATGAGTTTT GATGAGTTTT TCTAAGAATT TCTAAGAATT AATTCATGAG AATTCATGAG CGGATACATA 6361 TTTGAATGTA CGGATACATA 6361 TTTGAATGTA TTTAGAAAAA TTTAGAAAAA TAAACAAATA TAAACAAATA GGGGTTCCGC GGGGTTCCGC GCACATTTCC GCACATTTCC

CCGAAAAGTGCCGAAAAGTG

PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1

6421 CCACCTGAAA TTGTAAACGT TAATATTTTG TTAAAATTCG CGTTAAATTT6421 CCACCTGAAA TTGTAAACGT TAATATTTTG TTAAAATTCG CGTTAAATTT

TTGTTAAATCTTGTTAAATC

6481 AGCTCATTTT TTAACCAATA GGCCGAAATC GGCAAAATCC CTTATAAATC6481 AGCTCATTTT TTAACCAATA GGCCGAAATC GGCAAAATCC CTTATAAATC

AAAAGAATAGAAAAGAATAG

6541 ACCGAGATAG GGTTGAGTGT TGTTCCAGTT TGGAACAAGA GTCCACTATT6541 ACCGAGATAG GGTTGAGTGT TGTTCCAGTT TGGAACAAGA GTCCACTATT

AAAGAACGTGAAAGAACGTG

6601 GACTCCAACG TCAAAGGGCG AAAAACCGTC TATCAGGGCG ATGGCCCACT6601 GACTCCAACG TCAAAGGGCG AAAAACCGTC TATCAGGGCG ATGGCCCACT

ACGTGAACCAACGTGAACCA

6661 TCACCCTAAT CAAGTTTTTT GGGGTCGAGG TGCCGTAAAG CACTAAATCG GAACCCTAAA6661 TCACCCTAAT CAAGTTTTTT GGGGTCGAGG TGCCGTAAAG CACTAAATCG GAACCCTAAA

6721 GGGAGCCCCC GATTTAGAGC TTGACGGGGA AAGCCGGCGA ACGTGGCGAG6721 GGGAGCCCCC GATTTAGAGC TTGACGGGGA AAGCCGGCGA ACGTGGCGAG

AAAGGAAGGGAAAGGAAGGG

6781 AAGAAAGCGA AAGGAGCGGG CGCTAGGGCG CTGGCAAGTG TAGCGGTCAC6781 AAGAAAGCGA AAGGAGCGGG CGCTAGGGCG CTGGCAAGTG TAGCGGTCAC

GCTGCGCGTAGCTGCGCGTA

6841 ACCACCACAC CCGCCGCGCT TAATGCGCCG CTACAGGGCG CGTCCCATTC GCCA6841 ACCACCACAC CCGCCGCGCT TAATGCGCCG CTACAGGGCG CGTCCCATTC GCCA

Informacja o sekwencji:Sequence information:

DŁUGOŚĆ: 6894 nukleotydówLENGTH: 6,894 nucleotides

TYP: kwas nukleinowyTYPE: nucleic acid

TOPOLOGIA: plazmidTOPOLOGY: plasmid

ILOŚĆ NICI: jednaTHREAD COUNT: one

RODZAJ CZĄSTECZKI: DNATYPE OF PARTICLE: DNA

Claims (2)

1. Sposób otrzymywania rekombinantowego szczepu Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS o symbolu Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek/LICDraSTH, znamienny tym, że uzyskuje się fragment DNA kodujący białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 o wzorze 3 poprzez amplifikację DNA z zastosowaniem starterów oligonukleotydowych o wzorze 2 i o symbolach DraSTNdeF i DraSTXhoR, a uzyskany fragment DNA klonuje się do wektora plazmidowego pET30Ek/LIC, w wyniku czego uzyskuje się wektor plazmidowy o wzorze 4 i o symbolu pET30Ek/LICDraSTH, zawierający wklonowane DNA z fragmentem kodującym białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539, z fragmentami rozpoznawanymi przez enzymy restrykcyjne Ndel i XhoI, z miejscem wiązania rybosomów rbs, z genem oporności na kanamycynę, z origin plazmidu pBR322, z origin f1, regionem polihistydynowym, promotorem T7, sekwencją kodującą S-Tag, z miejscem terminacji transkrypcji T7, z miejscem operatorowym lacl, a następnie otrzymanym wektorem transformuje się komórki Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS.1. The method of obtaining the recombinant Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS strain with the symbol Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek / LICDraSTH, characterized by obtaining a DNA fragment encoding the Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539 of the formula 3 by amplification using oligonucleotide primers of formula 2 and symbols DraSTNdeF and DraSTXhoR, and the obtained DNA fragment is cloned into the pET30Ek / LIC plasmid vector, resulting in the plasmid vector of formula 4 and the symbol pET30Ek / LICDraSTH, containing the cloned DNA with the fragment encoding the trehalose protein synthase Deinococcus radiodurans DSMZ 20539, with fragments recognized by the restriction enzymes NdeI and XhoI, with the rbs ribosome binding site, with the kanamycin resistance gene, with the pBR322 plasmid origin, with origin f1, polyhistidine region, T7 promoter, S-Tag coding sequence, T7 transcription termination, with the lacI operator site then obtained the vector transforms into Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS cells. 2. Sposób wytwarzania białka syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 polegający na produkcji białka przez komórki rekombinantowego szczepu bakterii w pożywkach płynnych, znamienny tym, że prowadzi się hodowlę komórek szczepu bakterii o symbolu Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek/LICDraSTH w temperaturze początkowej od 35°C do 38°C, a następnie po uzyskaniu gęstości zawiesiny komórkowej od 0,3 do 0,9 prowadzi się nadekspresję genu kodującego białko przez czas z zakresu od 2 do 24 godzin, poprzez dodanie do pożywki induktora jakim jest IPTG o stężeniu od 0,05 mM do 10 mM, a po oddzieleniu zawiesiny komórkowej od płynu pohodowlanego, dezintegracji komórek i wstępnej termicznej denaturacji, na drodze wirowania izoluje się białka rozpuszczalne, po czym oczyszcza się je stosując jeden etap oczyszczania na złożach wiążących koordynacyjnie, odwracalnie jony metali IDA-Co, po czym zagęszcza i zawiesza w buforze do przechowywania, korzystnie o składzie: 0,85% NaCl, 20% glicerol (v/v), 5 mM EDTA, 1 mM DTT, 1 mM PMSF, 0,05% IGEPAL.2. Method for the production of Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 trehalose synthase protein consisting in the production of the protein by cells of a recombinant bacterial strain in liquid media, characterized by the cultivation of cells of the Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS-pET30Ek / LICDraSTH bacterial strain at the initial temperature from 35 ° C to 38 ° C, and then, after obtaining the density of the cell suspension from 0.3 to 0.9, overexpression of the gene encoding the protein is carried out for a time ranging from 2 to 24 hours by adding an inducer, which is IPTG with a concentration of from 0.05 mM to 10 mM, and after separation of the cell suspension from the culture fluid, cell disintegration and initial thermal denaturation, the soluble proteins are isolated by centrifugation, and then they are purified using one purification step on coordinate-binding, reversible metal ions IDA-Co, then concentrated and suspended in a storage buffer, preferably with the following composition: 0.85% NaCl, 20% glycine erol (v / v), 5mM EDTA, 1mM DTT, 1mM PMSF, 0.05% IGEPAL. PL 229 055 Β1PL 229 055 Β1 RysunkiDrawings Fig 1. Zamplifikowany gen kodujący białko syntazy trehalozy Deinococcus radiodurans DSMZ 20539 wraz z dodatkowymi miejscami rozpoznania dla enzymów restrykcyjnych Ndel i Xhol, zachowaniem ramki odczytu, usuniętym kodonem stop - opis.Fig. 1. Amplified gene encoding Deinococcus radiodurans trehalose synthase protein DSMZ 20539 with additional recognition sites for NdeI and XhoI restriction enzymes, frame preservation, deleted stop codon - description.
PL392388A 2010-09-14 2010-09-14 DNA sequence, oligonucleotide primers, DNA sequence with the recognition sites for restriction enzymes NdeI and XhoI, expression vector and method for the preparation thereof, recombinant strain of Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS and method for the preparation thereof and method for obtaining recombinant protein with oligo-histidine tag of Deinococcus radiodurans DSMZ 20 539 trehalose synthase (TS) PL229055B1 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL392388A PL229055B1 (en) 2010-09-14 2010-09-14 DNA sequence, oligonucleotide primers, DNA sequence with the recognition sites for restriction enzymes NdeI and XhoI, expression vector and method for the preparation thereof, recombinant strain of Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS and method for the preparation thereof and method for obtaining recombinant protein with oligo-histidine tag of Deinococcus radiodurans DSMZ 20 539 trehalose synthase (TS)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL392388A PL229055B1 (en) 2010-09-14 2010-09-14 DNA sequence, oligonucleotide primers, DNA sequence with the recognition sites for restriction enzymes NdeI and XhoI, expression vector and method for the preparation thereof, recombinant strain of Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS and method for the preparation thereof and method for obtaining recombinant protein with oligo-histidine tag of Deinococcus radiodurans DSMZ 20 539 trehalose synthase (TS)

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL392388A1 PL392388A1 (en) 2012-03-26
PL229055B1 true PL229055B1 (en) 2018-06-29

Family

ID=45891410

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL392388A PL229055B1 (en) 2010-09-14 2010-09-14 DNA sequence, oligonucleotide primers, DNA sequence with the recognition sites for restriction enzymes NdeI and XhoI, expression vector and method for the preparation thereof, recombinant strain of Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS and method for the preparation thereof and method for obtaining recombinant protein with oligo-histidine tag of Deinococcus radiodurans DSMZ 20 539 trehalose synthase (TS)

Country Status (1)

Country Link
PL (1) PL229055B1 (en)

Also Published As

Publication number Publication date
PL392388A1 (en) 2012-03-26

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN112111469B (en) Gamma-glutamyl kinase mutant and application thereof
CN111500570A (en) Method for modifying genome sequence of nucleic acid base for specifically converting target DNA sequence, and molecular complex used therefor
CN108676809A (en) A kind of Corynebacterium glutamicum gene group edit methods
KR101692103B1 (en) Synthetic phytase variants
CN111004755A (en) Citrobacter T26 for specifically degrading hyaluronic acid, hyaluronidase HylC produced by Citrobacter T26 and application of hyaluronidase HylC
CN114230677B (en) Recombinant protein containing Cap of hog cholera E2 and circovirus, preparation method and application thereof
CN102021197A (en) Plant bivalent expression vector and construction method thereof
CN110669775B (en) Application of differential proxy technology in enrichment of A.G base substitution cells
PL229055B1 (en) DNA sequence, oligonucleotide primers, DNA sequence with the recognition sites for restriction enzymes NdeI and XhoI, expression vector and method for the preparation thereof, recombinant strain of Escherichia coli Rosetta (DE3) pLysS and method for the preparation thereof and method for obtaining recombinant protein with oligo-histidine tag of Deinococcus radiodurans DSMZ 20 539 trehalose synthase (TS)
CN109097361B (en) Promoter, vector thereof and application thereof
CN109097362B (en) Operon, vector thereof and application thereof
CN113717962A (en) Cas phi-2 protein for rice gene editing and expression cassette and expression vector thereof
CN113201514B (en) Polypeptides having aspartokinase activity and their use for producing amino acids
CN108728390B (en) Genetically engineered bacterium for producing A82846B as well as preparation method and application thereof
CN113943748B (en) Recombination system in pseudomonas syringae and application
CN114438115A (en) CRISPR/Cas9 gene editing vector, construction method and application thereof
CN110691510A (en) Immunomodulatory transgenic plants and related methods
CN112831519B (en) Method for preparing santalol by utilizing sweet wormwood herbs
CN111304239B (en) Rolling circle replication recombinant vector, construction method and application
CN114621974B (en) Vector of plant single-gene or multi-gene CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic surface plasmon) activation technology, and construction method and application thereof
CN107227312B (en) Method for increasing content of salvianolic acid B in hairy roots of salvia miltiorrhiza and laccase gene
CN112266925A (en) Subcellular localization expression vector and construction method
CA2621608A1 (en) Methods of optimizing the secretion of protein in prokaryotes
RU2817891C1 (en) ESCHERICHIA COLI L-ASPARAGINASE PRODUCER AND EXPRESSION PLASMID pET28a-AsnSYN CODING L-ASPARAGINASE
CN117050994A (en) Optimized viral vector subgenomic promoters and uses thereof