PL201818B1 - Sekwencja DNA oraz sposób rekombinacyjnego otrzymywania alergenów graminae - Google Patents
Sekwencja DNA oraz sposób rekombinacyjnego otrzymywania alergenów graminaeInfo
- Publication number
- PL201818B1 PL201818B1 PL356055A PL35605500A PL201818B1 PL 201818 B1 PL201818 B1 PL 201818B1 PL 356055 A PL356055 A PL 356055A PL 35605500 A PL35605500 A PL 35605500A PL 201818 B1 PL201818 B1 PL 201818B1
- Authority
- PL
- Poland
- Prior art keywords
- allergen
- phl
- phleum pratense
- recombinant
- nucleotide sequence
- Prior art date
Links
- 239000013566 allergen Substances 0.000 title claims abstract description 53
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title claims description 3
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 title description 3
- 241000746983 Phleum pratense Species 0.000 claims abstract description 25
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 claims abstract description 14
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims abstract description 13
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims abstract description 12
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims abstract description 12
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims abstract description 12
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims abstract description 9
- 238000010367 cloning Methods 0.000 claims abstract description 5
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims abstract description 3
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 12
- 208000035285 Allergic Seasonal Rhinitis Diseases 0.000 claims description 11
- 206010048908 Seasonal allergy Diseases 0.000 claims description 10
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 10
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 10
- 201000004338 pollen allergy Diseases 0.000 claims description 10
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 8
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 6
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims description 5
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 claims description 4
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims description 4
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 3
- 238000011238 DNA vaccination Methods 0.000 claims description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 claims description 2
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 claims description 2
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 claims description 2
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 claims description 2
- 108700012242 Phleum pratense phl p 13 Proteins 0.000 abstract 3
- 206010020751 Hypersensitivity Diseases 0.000 description 22
- 230000007815 allergy Effects 0.000 description 21
- 208000026935 allergic disease Diseases 0.000 description 20
- 229960004784 allergens Drugs 0.000 description 15
- 235000013351 cheese Nutrition 0.000 description 15
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 8
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 8
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 8
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 8
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 8
- 108091028026 C-DNA Proteins 0.000 description 6
- UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N Inosine Chemical group O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C2=NC=NC(O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 6
- 229930010555 Inosine Natural products 0.000 description 6
- 229960003786 inosine Drugs 0.000 description 6
- 229940046528 grass pollen Drugs 0.000 description 5
- 230000000774 hypoallergenic effect Effects 0.000 description 4
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 4
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 4
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 4
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 3
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 3
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 3
- 238000000586 desensitisation Methods 0.000 description 3
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 3
- NTYJJOPFIAHURM-UHFFFAOYSA-N Histamine Chemical compound NCCC1=CN=CN1 NTYJJOPFIAHURM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 2
- 240000004296 Lolium perenne Species 0.000 description 2
- RIPJMCFGQHGHNP-RHYQMDGZSA-N Lys-Val-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)O RIPJMCFGQHGHNP-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 2
- 241000209504 Poaceae Species 0.000 description 2
- 229940074608 allergen extract Drugs 0.000 description 2
- 230000002009 allergenic effect Effects 0.000 description 2
- 230000000172 allergic effect Effects 0.000 description 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 2
- 208000010668 atopic eczema Diseases 0.000 description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 2
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 2
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 2
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 2
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 2
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 2
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 2
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 2
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 2
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 2
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 2
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 2
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 2
- 241000238876 Acari Species 0.000 description 1
- KRHRBKYBJXMYBB-WHFBIAKZSA-N Ala-Cys-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O KRHRBKYBJXMYBB-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- BLTRAARCJYVJKV-QEJZJMRPSA-N Ala-Lys-Phe Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C(O)=O BLTRAARCJYVJKV-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 1
- MDNAVFBZPROEHO-UHFFFAOYSA-N Ala-Lys-Val Natural products CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(C)N)CCCCN MDNAVFBZPROEHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N Ala-Ser Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- BOKLLPVAQDSLHC-FXQIFTODSA-N Ala-Val-Cys Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N BOKLLPVAQDSLHC-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- 239000010267 Allergoid Substances 0.000 description 1
- 206010002199 Anaphylactic shock Diseases 0.000 description 1
- QLSRIZIDQXDQHK-RCWTZXSCSA-N Arg-Val-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O QLSRIZIDQXDQHK-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- APHUDFFMXFYRKP-CIUDSAMLSA-N Asn-Asn-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N APHUDFFMXFYRKP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- IYVSIZAXNLOKFQ-BYULHYEWSA-N Asn-Asp-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O IYVSIZAXNLOKFQ-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- SQZIAWGBBUSSPJ-ZKWXMUAHSA-N Asn-Cys-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N SQZIAWGBBUSSPJ-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- KYQJHBWHRASMKG-ZLUOBGJFSA-N Asn-Ser-Cys Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O KYQJHBWHRASMKG-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- RTFXPCYMDYBZNQ-SRVKXCTJSA-N Asn-Tyr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RTFXPCYMDYBZNQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LMIWYCWRJVMAIQ-NHCYSSNCSA-N Asn-Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N LMIWYCWRJVMAIQ-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- PBVLJOIPOGUQQP-CIUDSAMLSA-N Asp-Ala-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O PBVLJOIPOGUQQP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- AKPLMZMNJGNUKT-ZLUOBGJFSA-N Asp-Asp-Cys Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O AKPLMZMNJGNUKT-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- OAMLVOVXNKILLQ-BQBZGAKWSA-N Asp-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O OAMLVOVXNKILLQ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- 206010010744 Conjunctivitis allergic Diseases 0.000 description 1
- 244000052363 Cynodon dactylon Species 0.000 description 1
- OIMUAKUQOUEPCZ-WHFBIAKZSA-N Cys-Asn-Gly Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O OIMUAKUQOUEPCZ-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- WYVKPHCYMTWUCW-YUPRTTJUSA-N Cys-Thr Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N)O WYVKPHCYMTWUCW-YUPRTTJUSA-N 0.000 description 1
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 1
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 1
- 108020001019 DNA Primers Proteins 0.000 description 1
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 1
- 240000004585 Dactylis glomerata Species 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- SZXSSXUNOALWCH-ACZMJKKPSA-N Glu-Ala-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O SZXSSXUNOALWCH-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- WATXSTJXNBOHKD-LAEOZQHASA-N Glu-Asp-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O WATXSTJXNBOHKD-LAEOZQHASA-N 0.000 description 1
- LGYZYFFDELZWRS-DCAQKATOSA-N Glu-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O LGYZYFFDELZWRS-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- LSPKYLAFTPBWIL-BYPYZUCNSA-N Glu-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LSPKYLAFTPBWIL-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- CUPSDFQZTVVTSK-GUBZILKMSA-N Glu-Lys-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O CUPSDFQZTVVTSK-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YSWHPLCDIMUKFE-QWRGUYRKSA-N Glu-Tyr Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 YSWHPLCDIMUKFE-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N Gly-Asp Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- VEPBEGNDJYANCF-QWRGUYRKSA-N Gly-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCCN VEPBEGNDJYANCF-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- NSVOVKWEKGEOQB-LURJTMIESA-N Gly-Pro-Gly Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O NSVOVKWEKGEOQB-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 1
- JQFILXICXLDTRR-FBCQKBJTSA-N Gly-Thr-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)NCC(O)=O JQFILXICXLDTRR-FBCQKBJTSA-N 0.000 description 1
- LYZYGGWCBLBDMC-QWHCGFSZSA-N Gly-Tyr-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)NC(=O)CN)C(=O)O LYZYGGWCBLBDMC-QWHCGFSZSA-N 0.000 description 1
- SBVMXEZQJVUARN-XPUUQOCRSA-N Gly-Val-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SBVMXEZQJVUARN-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 240000003857 Holcus lanatus Species 0.000 description 1
- BABSVXFGKFLIGW-UWVGGRQHSA-N Leu-Gly-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N BABSVXFGKFLIGW-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- IAJFFZORSWOZPQ-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O IAJFFZORSWOZPQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- IFMPDNRWZZEZSL-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Cys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O IFMPDNRWZZEZSL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- KPYAOIVPJKPIOU-KKUMJFAQSA-N Leu-Lys-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O KPYAOIVPJKPIOU-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- RRVCZCNFXIFGRA-DCAQKATOSA-N Leu-Pro-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RRVCZCNFXIFGRA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- OVIVOCSURJYCTM-GUBZILKMSA-N Lys-Asp-Glu Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O OVIVOCSURJYCTM-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- GPJGFSFYBJGYRX-YUMQZZPRSA-N Lys-Gly-Asp Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O GPJGFSFYBJGYRX-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- UQRZFMQQXXJTTF-AVGNSLFASA-N Lys-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O UQRZFMQQXXJTTF-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- HONVOXINDBETTI-KKUMJFAQSA-N Lys-Tyr-Cys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 HONVOXINDBETTI-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-proline Natural products NCC(=O)N1CCCC1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 description 1
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 101800000135 N-terminal protein Proteins 0.000 description 1
- 101800001452 P1 proteinase Proteins 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- ZBYHVSHBZYHQBW-SRVKXCTJSA-N Phe-Cys-Asp Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N ZBYHVSHBZYHQBW-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 241000209049 Poa pratensis Species 0.000 description 1
- JQOHKCDMINQZRV-WDSKDSINSA-N Pro-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 JQOHKCDMINQZRV-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- MTHRMUXESFIAMS-DCAQKATOSA-N Pro-Asn-Lys Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O MTHRMUXESFIAMS-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- WSRWHZRUOCACLJ-UWVGGRQHSA-N Pro-Gly-His Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CN=CN1 WSRWHZRUOCACLJ-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- VTFXTWDFPTWNJY-RHYQMDGZSA-N Pro-Leu-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VTFXTWDFPTWNJY-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- 206010039085 Rhinitis allergic Diseases 0.000 description 1
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 1
- 206010070834 Sensitisation Diseases 0.000 description 1
- MUARUIBTKQJKFY-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O MUARUIBTKQJKFY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- 239000012505 Superdex™ Substances 0.000 description 1
- LVHHEVGYAZGXDE-KDXUFGMBSA-N Thr-Ala-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O LVHHEVGYAZGXDE-KDXUFGMBSA-N 0.000 description 1
- SWIKDOUVROTZCW-GCJQMDKQSA-N Thr-Asn-Ala Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)N)O SWIKDOUVROTZCW-GCJQMDKQSA-N 0.000 description 1
- TZKPNGDGUVREEB-FOHZUACHSA-N Thr-Asn-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(O)=O TZKPNGDGUVREEB-FOHZUACHSA-N 0.000 description 1
- IOWJRKAVLALBQB-IWGUZYHVSA-N Thr-Asp Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O IOWJRKAVLALBQB-IWGUZYHVSA-N 0.000 description 1
- JEDIEMIJYSRUBB-FOHZUACHSA-N Thr-Asp-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O JEDIEMIJYSRUBB-FOHZUACHSA-N 0.000 description 1
- QWMPARMKIDVBLV-VZFHVOOUSA-N Thr-Cys-Ala Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O QWMPARMKIDVBLV-VZFHVOOUSA-N 0.000 description 1
- XPNSAQMEAVSQRD-FBCQKBJTSA-N Thr-Gly-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O XPNSAQMEAVSQRD-FBCQKBJTSA-N 0.000 description 1
- QQWNRERCGGZOKG-WEDXCCLWSA-N Thr-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O QQWNRERCGGZOKG-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- KBBRNEDOYWMIJP-KYNKHSRBSA-N Thr-Gly-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N)O KBBRNEDOYWMIJP-KYNKHSRBSA-N 0.000 description 1
- XKWABWFMQXMUMT-HJGDQZAQSA-N Thr-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O XKWABWFMQXMUMT-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N 0.000 description 1
- REJRKTOJTCPDPO-IRIUXVKKSA-N Thr-Tyr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O REJRKTOJTCPDPO-IRIUXVKKSA-N 0.000 description 1
- PWONLXBUSVIZPH-RHYQMDGZSA-N Thr-Val-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O PWONLXBUSVIZPH-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- HKYTWJOWZTWBQB-AVGNSLFASA-N Tyr-Glu-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 HKYTWJOWZTWBQB-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- IWRMTNJCCMEBEX-AVGNSLFASA-N Tyr-Glu-Cys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)O IWRMTNJCCMEBEX-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- HSBZWINKRYZCSQ-KKUMJFAQSA-N Tyr-Lys-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O HSBZWINKRYZCSQ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- AGXGCFSECFQMKB-NHCYSSNCSA-N Val-Leu-Asp Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N AGXGCFSECFQMKB-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- KTEZUXISLQTDDQ-NHCYSSNCSA-N Val-Lys-Asp Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N KTEZUXISLQTDDQ-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- GVRKWABULJAONN-VQVTYTSYSA-N Val-Thr Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GVRKWABULJAONN-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- DLRZGNXCXUGIDG-KKHAAJSZSA-N Val-Thr-Asp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O DLRZGNXCXUGIDG-KKHAAJSZSA-N 0.000 description 1
- PDDJTOSAVNRJRH-UNQGMJICSA-N Val-Thr-Phe Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O PDDJTOSAVNRJRH-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- HTONZBWRYUKUKC-RCWTZXSCSA-N Val-Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O HTONZBWRYUKUKC-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- IOUPEELXVYPCPG-UHFFFAOYSA-N Valylglycine Chemical compound CC(C)C(N)C(=O)NCC(O)=O IOUPEELXVYPCPG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000013572 airborne allergen Substances 0.000 description 1
- 108010069020 alanyl-prolyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 208000002205 allergic conjunctivitis Diseases 0.000 description 1
- 201000010105 allergic rhinitis Diseases 0.000 description 1
- 208000003455 anaphylaxis Diseases 0.000 description 1
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010069205 aspartyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 1
- 108010092854 aspartyllysine Proteins 0.000 description 1
- 208000006673 asthma Diseases 0.000 description 1
- 208000024998 atopic conjunctivitis Diseases 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 238000005352 clarification Methods 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010060199 cysteinylproline Proteins 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 239000000428 dust Substances 0.000 description 1
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 1
- 108010080575 glutamyl-aspartyl-alanine Proteins 0.000 description 1
- 108010037389 glutamyl-cysteinyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 1
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 1
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 1
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 description 1
- 239000013574 grass pollen allergen Substances 0.000 description 1
- 229960001340 histamine Drugs 0.000 description 1
- 210000003630 histaminocyte Anatomy 0.000 description 1
- 108010036413 histidylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010092114 histidylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 238000004191 hydrophobic interaction chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 208000030603 inherited susceptibility to asthma Diseases 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 239000002655 kraft paper Substances 0.000 description 1
- 108010009298 lysylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 1
- 210000004379 membrane Anatomy 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 210000004400 mucous membrane Anatomy 0.000 description 1
- 231100000957 no side effect Toxicity 0.000 description 1
- 238000005457 optimization Methods 0.000 description 1
- 229940094443 oxytocics prostaglandins Drugs 0.000 description 1
- 238000012856 packing Methods 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 150000003180 prostaglandins Chemical class 0.000 description 1
- 238000000734 protein sequencing Methods 0.000 description 1
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 1
- 230000008313 sensitization Effects 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 239000007929 subcutaneous injection Substances 0.000 description 1
- 238000010254 subcutaneous injection Methods 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 229920002554 vinyl polymer Polymers 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/415—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/08—Antiallergic agents
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/51—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
- A61K2039/53—DNA (RNA) vaccination
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Botany (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Pulmonology (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Public Health (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
1. Rekombinowana moleku la DNA, znamienna tym, ze zawiera sekwencj e nukleotydow a aler- genu Phl p 13 z Phleum pratense jak przedstawiono na rysunku fig. 1 (SEQ ID No. 1) i koduje alergen Phl p 13 z Phleum pratense. 2. Moleku la DNA, znamienna tym, ze ma sekwencj e nukleotydowa, która jest komplementarna do sekwencji nukleotydowej alergenu Phl p 13 z Phleum pratense zdefiniowanej w zastrz. 1. 3. Rekombinowany wektor ekspresyjny DNA lub system klonowania zawieraj acy rekombinowa- n a molekule DNA, znamienny tym, ze zawiera sekwencj e nukleotydow a alergenu Phl p 13 z Phleum pratense przedstawion a na rysunku fig. 1 (SEQ ID No. 1) i zdefiniowana w zastrz. 1, funkcjonalnie po laczon a z kontroln a sekwencj a ekspresyjn a. PL PL PL PL
Description
Opis wynalazku
Przedmiotem wynalazku jest identyfikacja oraz charakterystyka alergenów pyłków traw jak również kodujących ich rekombinantów DNA. Jako naturalnego surowca używa się pyłków Phleum pratense. Wynalazek obejmuje także fragmenty i części sekwencji oraz mutacje. Rekombinanty DNA oraz wywodzące się z nich polipeptydy, ich fragmenty oraz warianty mogą być stosowane w terapii chorób, których przyczyną jest uczulenie na pyłki kwiatowe. Rekombinacyjnie otrzymywane białka oraz ich fragmenty mogą być ponadto stosowane w diagnostyce alergii na pyłki kwiatowe.
Alergie typu 1 stanowią istotny problem o skali światowej. Do 20% ludności krajów uprzemysłowionych cierpi na dolegliwości związane z alergicznym katarem, zapaleniem spojówek lub astmą oskrzelową. Alergie te wywoływane są przez alergeny znajdujące się w powietrzu (aeoroalergeny), które uwalniane są z różnych źródeł takich jak pyłki roślinne, roztocza, koty lub psy. W przypadku pyłków traw do 40% alergików typu 1 wykazuje specyficzną reaktywność względem immunoglobuliny lgE (Freidhoff et al., 1986, J Allergy Clin Immunol 78, 1190-201).
W przypadku substancji wyzwalających alergie typu 1 chodzi o białka, glikoproteiny lub polipeptydy. Alergeny te po wniknięciu do organizmu przez błony śluzowe u osób uczulonych reagują na powierzchni komórek tucznych ze związanymi molekułami immunoglobuliny IgE.
W wypadku kiedy alergen doprowadzi do utworzenia połączenia między dwoma molekułami IgE, komórki efektorowe uwalniają mediatory (np. histaminę lub prostaglandyny) oraz cytokiny, doprowadzając do powstawania symptomów klinicznych.
W zależności od względnej częstości występowania poszczególnych grup alergików, czego dowodzą przeciwciała IgE względem określonych alergenów, zalicza się je do alergenów głównych (majorallergen) lub alergenów rzadkich (minorallergen). W wypadku traw tymotki (Phleum pratense) jako główne alergeny scharakteryzowano dotychczas Phl p 1 (Peterson et al., 1993, J. Allergy Clin. Immunol. 92, 789-796), Phl p 5 (Matthiesen und Lowenstein, 1991, Clin. Exp. Allergy 21,297-307, Petersen et al., 1992), Phl p 6 (Petersen et al., 1995, Int. Arch. Allergy Immunol. 108, 49-54) oraz Phl p 2/3 (Dolecek et al., 1993, FEBS 335 (3), 299-304), a jako alergeny rzadkie-Phl p 4 (Lowenstein, 1978, Prog. Allergy 25, 1-62) jak również grupa 10 i 11 z Lolium perenne (Ansari et al., 1987, J. Allergy Clin Immunol. 80, 229-235).
W związku z omawianym wynalazkiem szczególne znaczenie ma alergen Phl p 4, ponieważ posiada on podobną masę cząsteczkową ok. 55 kDa (Fischer et al., 1996, J. Allergy Clin Immunol. 98(1), 189-98) jak nowy alergen i ze względu na to jest najbardziej zbliżony do nowego alergenu otrzymanego według wynalazku, przy czym jednak biochemicznie i immunologicznie wyraźnie różnią się one od siebie. W przeciwieństwie do innych alergenów w/w Phi p 4 jest jedynym, którego genomiczna i traskrypcyjna sekwencja (c-DNA) nie została dotąd zidentyfikowana. Dane dotyczące sekwencji przedstawione zostały między innymi dla Phl p 1 (Laffer et al., 1994, J. Allergy Clin Immunol. 94, 1190-98; Petersen et al., 1995, J. Allergy Clin Immunol. 95(5), 987-994), Phl p 5 (Vrtala et al., 1993, J. Immunol. 151(9), 4773-4781), Phl p 6 (Petersen et al., 1995, Int. Arch. Allergy Immunol. 108(1), 55-59) oraz Phl p 2 (Dolecek et al., 1993, FEBS 335(3), 299-304). Za pomocą sekwencji c-DNA możliwe jest otrzymanie rekombinowanych alergenów, które mogą znaleźć zastosowanie w diagnostyce i terapii (Scheiner i Kraft, 1995, Allergy 50, 384-391).
Klasycznym punktem wyjściowym aktywnego leczenia alergii jest specyficzna immunoterapia lub odczulanie (Fiebig, 1995, Allergo J. 4(6), 336-339, Bousquet et al., 1998, J. Allergy Clin Immunol. 102(4), 558-562). W takim wypadku pacjentom podaje się rosnące dawki podskórnych iniekcji naturalnych ekstraktów alergenów. Jednakże w metodzie takiej występuje zagrożenie reakcji alergicznych lub nawet szoku anafilaktycznego. W celu zminimalizowania tego ryzyka stosuje się nowe preparaty alergoidów. Chodzi w tym wypadku o chemicznie modyfikowane ekstrakty alergenów, które w porównaniu do niemodyfikowanych ekstraktów wykazują oczywiście obniżoną reaktywność względem IgE, przy czym posiadają identyczną reaktywność względem komórek T (Fiebig, 1995, Allergo J. 4(7), 377-382).
Dalsza optymalizacja terapii możliwa jest z zastosowaniem alergenów otrzymywanych technikami rekombinacyjnymi. Określone koktajle z wysoko oczyszczonych rekombinowanych alergenów ustalone dla indywidualnych pacjentów zastąpić mogą ekstrakty z naturalnych źródeł alergenów, ponieważ zawierają one poza różnymi alergenami dużą liczbę towarzyszących immunogenicznych lecz nie alergenicznych białek. Realne perspektywy niezawodnego odczulania produktami ekspresji dają poddane mutacji rekombinowane alergeny o ściśle określonym celu działania, w których epitopy IgE
PL 201 818 B1 poddaje się specyficznej delecji bez naruszania, posiadającego podstawowe znaczenie dla terapii, epitopu komórki T (Schramm et al., 1999, J. Immunol. 162, 2406-2414).
Inną możliwością terapeutycznego oddziaływania na zakłóconą równowagę komórki Th u alergików jest leczenie DNA, które wykazuje zdolność ekspresji, kodując przy tym odpowiednie alergeny. Pierwsze eksperymentalne dowody alergospecyficznego wpływu na odpowiedź immunologiczną otrzymano u gryzoni przez podanie iniekcji DNA kodującego alergen (Hsu et al., 1996, Nature Medicine 2(5), 540-544).
Wynalazek może być korzystnie stosowany w diagnostyce chorób alergicznych in vitro oraz in vivo, a w szczególności kataru siennego. W tym celu klonowane kwasy nukleinowe umieszcza się w wektorze ekspresji (ligacja), a konstrukt taki poddaje się ekspresji w odpowiednim typie komórki. Po oczyszczeniu biochemicznym rekombinowany alergen używany może być do wykrywania przeciwciał IgE. Z drugiej strony podstawowe zastosowania według wynalazku w postaci rekombinowanych preparatów zawierających alergeny lub kwasy nukleinowe mogą być stosowane w specyficznej immunoterapii. W omawianym aspekcie występuje wiele różnych możliwości. Z jednej strony część białka stanowić może niezmieniona pierwszorzędowa struktura białka. Z drugiej zaś strony w celu uniknięcia działań ubocznych w terapii stosowane mogą być hipoalergiczne (alergoidalne) formy według wynalazku, otrzymane przez specyficzną delecję w epitopach IgE całej cząsteczki lub konstrukcję pojedynczych fragmentów, które kodują epitopy komórki T. W końcu stosując kwasy nukleinowe jako takie, w wypadku kiedy umieszczane są one poprzez ligację w eukariotycznym wektorze ekspresji, otrzymuje się preparaty, których bezpośrednie zastosowanie zmienia w sensie terapeutycznym alergiczny stan immunologiczny.
Przedmiotem wynalazku jest rekombinowana molekuła DNA, która składa się z sekwencji kwasu nukleinowego przedstawionej na rysunku fig. 1 i koduje alergen. Jako naturalny surowiec służą ziarna pyłków graminae, jak np. Phleum pratense, Lolium perenne, Dactylis glomerata, Poa pratensis, Cynodon dactylon, Holcus lanatus i inne. Po oczyszczeniu i wyizolowaniu naturalnych alergenów przeprowadza się N-terminalne sekwencjonowanie białka. W oparciu o wydedukowaną na tej podstawie sekwencję kwasu nukleinowego konstruuje się primer. Za pomocą tego primeru z populacji c-DNA techniką PCR otrzymuje się odpowiednie c-DNA, klonuje się je oraz charakteryzuje. Według wynalazku fragmenty i częściowe sekwencje otrzymuje się z molekuły DNA kodującej ten alergen. Po ekspresji rekombinowanej molekuły DNA względnie fragmentu i częściowej sekwencji za pomocą odpowiedniego wektora ekspresji w systemie komórkowym oczyszcza się alergen względnie warianty hipoalergiczne względnie fragmenty.
Oczyszczanie naturalnych alergenów z pyłków traw tymotki przeprowadza się w procesie dwuetapowym. Ekstrakt otrzymany po wodnej ekstrakcji pyłku rozdziela się za pomocą chromatografii z oddział ywaniami hydrofobowymi na dwie frakcje; frakcj ę przesą czu oraz eluat. Przesą cz zawiera trzy alergeny, Phl p1 (30-35 kDa), Phl p 2/3 (11-14 kDa) oraz nieznany alergen (55-60 kDa). Białka te rozdziela się od siebie techniką chromatograficzną przez filtrację żelową, stosując wypełnienie Superdex 75.
Wymieniony nowy alergen Phl p 13 (roboczo oznaczony p55) wydziela się za pomocą SDSPAGE, nanosi się na błonę z difluorku poliwinylu (PVDF) oraz izoluje się w postaci ściśle zdefiniowanej frakcji. Następnie molekułę poddaje się N-terminalnemu sekwencjonowaniu aminokwasów metodą degradacji Edmana (rysunek fig. 2).
W celu otrzymania i klonowania c-DNA odpowiadają cego p55 wedł ug wynalazku w oparciu o sekwencję N-terminalną (rysunek fig. 3) konstruuje się specyficzny primer DNA (21 członowy mer). Jako drugi primer używa się sekwencji kotwiczącej, która zlokalizowana jest w primerze oligo-dT używanym do odwrotnej transkrypcji.
Stosując c-DNA, które otrzymuje się z reprezentatywnej populacji m-RNA z pyłków Phleum pratense oraz primerów według wynalazku oraz primerów kotwiczących przeprowadza się reakcję PCR w ściśle kontrolowanych warunkach. Amplifikat otrzymany w reakcji PCR poddany analizie w analitycznym urządzeniu do elektroforezy żelowej wykazuje rozmiar 1,65 kb. Amplifikat ten umieszcza się (przez ligację) w wektorze pCR2.1 oraz poddaje się transformacji. Sekwencjonowanie insercji przez dwa różne klony dają identyczne wyniki sekwencji. W wymienionym pierwszorzędowym amplifikacie zidentyfikowano ramkę odczytu (ORF) o rozmiarze 1492 bp (por. rysunek fig. 1).
W celu otrzymania z wymienionego kwasu nukleinowego odpowiedniego rekombinowanego białka (rysunek fig. 4) przeprowadza się następnie klonowanie wektora pCR2.1 za pomocą enzymów restrykcyjnych do wektora ekspresji pProEx Htb. Po ekspresji oraz oczyszczaniu biochemicznym produktów ekspresji przeprowadza się wiele analiz otrzymanych białek pod kątem ich właściwości alergo4
PL 201 818 B1 logicznych. Przeprowadzone analizy np. Western Blot i Dot blot wykazały, że rekombinowane białka reagują specyficznie z IgE pacjentów, u których stwierdzono kliniczne symptomy alergii na pyłki traw. Jako kontrolę stosuje się naturalne p55. Tak więc bez wątpienia w przypadku rekombinowanego białka chodzi o alergen. Ten produkt ekspresji stosowany może być w ulepszonej wysoce specyficznej diagnostyce alergii pyłków traw.
Ściśle zdefiniowane fragmenty oraz kombinacje częściowych sekwencji opracowano według wynalazku wychodząc z kwasów nukleinowych klonowanych w wektorach ekspresji. Celem było otrzymanie hipoalergicznych wariantów do ulepszonych zastosowań terapeutycznych. Ponadto wprowadzano selektywne względem miejsca punktowe mutacje, przeważnie w tryplecie kodującym cysteinę. Preparaty według tej części wynalazku wyróżniają się więc względem części wynalazku, która dotyczy celów diagnostycznych, obniżoną reaktywnością względem IgE lub też całkowitym brakiem takiej reaktywności. Tak więc opracowano preparaty do odczulania, w których w oczywisty sposób obserwuje się niższe efekty uboczne, lub też efektów takich w ogóle nie obserwuje się. W wypadku kiedy hipoalergiczne warianty białek kodujących kwasy nukleinowe lub niemodyfikowane kwasy nukleinowe, które kodują p55, podda się ligacji z ludzkim wektorem ekspresji, otrzymane konstrukty mogą również być stosowane jako preparaty do specyficznej immunoterapii.
Istotą wynalazku jest:
a) Rekombinowana molekuła DNA, charakteryzująca się tym, że zawiera sekwencję nukleotydową alergenu Phl p 13 z Phleum pratense jak przedstawiono na rysunku fig. 1 (SEQ ID No. 1) i koduje alergen Phl p 13 z Phleum pratense;
b) Molekuła DNA, charakteryzująca się tym, że ma sekwencję nukleotydową, która jest komplementarna do sekwencji nukleotydowej alergenu Phl p 13 z Phleum pratense zdefiniowaną powyżej;
c) Rekombinowany wektor ekspresyjny DNA lub system klonowania zawierający rekombinowaną molekułę DNA, charakteryzujący się tym, że zawiera sekwencję nukleotydową alergenu Phl p 13 z Phleum pratense przedstawioną na rysunku fig. 1 (SEQ ID No. 1), funkcjonalnie połączoną z kontrolną sekwencją ekspresyjną;
d) Naturalny alergen Phl p 13 z Phleum pratense, charakteryzujący się tym, że jest kodowany przez kwas nukleinowy zdefiniowany w punkcie a);
e) Rekombinowany alergen Phl p 13 z Phleum pratense, charakteryzujący się tym, że jest kodowany przez kwas nukleinowy zdefiniowany w punkcie a);
f) Sposób otrzymywania rekombinowanego alergenu Phl p 13 z Phleum pratense, charakteryzujący się tym, że hoduje się komórki prokariotyczne lub eukariotyczne, które poddano transformacji z wykorzystaniem wektora ekspresyjnego zdefiniowanego w punkcie c), a rekombinowany alergen Phl p 13 wyodrę bnia się z kultury komórek;
g) Sposób diagnozy alergii na pyłki kwiatowe in vitro, charakteryzujący się tym, że obejmuje zastosowanie naturalnego bądź rekombinowanego alergenu Phl p 13 z Phleum pratense zdefiniowanego w punkcie d) lub e);
h) Preparat farmaceutyczny, charakteryzujący się tym, że zawiera naturalny bądź rekombinowany alergen Phl p 13 z Phleum pratense, do terapii alergii na pyłek u ludzi lub zwierząt zdefiniowanego w punkcie d) lub e);
i) Zastosowanie rekombinowanego wektora ekspresyjnego DNA lub systemu klonowania zdefiniowanego w punkcie c) do wytwarzania leku do przeprowadzania szczepienia DNA w terapii alergii na pyłek u ludzi lub zwierząt.
Wynalazek odnosi się więc do ulepszenia diagnostyki in vitro w ramach identyfikacji (wraz z wyjaśnieniem komponentów alergenowych) widma uczuleniowego specyficznego dla pacjenta. Ponadto wynalazek odnosi się do otrzymywania zdecydowanie ulepszonych preparatów do specyficznej immunoterapii alergii na pyłki traw.
PL 201 818 B1
SEGUENZPROTOKOLL
[0020] <110> Merck Patent GmbH <120> DNA-Sequenz und rekombinante Herstellung eines Graminaen-Allergens <130> DNA-Sequenz <140>
<141 >
<160>4 <170> Patentln Ver. 2.1 <210> 1 <211>1187 <212> DNA <213> Gramineae <400> 1
PL 201 818 B1 gggaagaagg aggagaagaa ggaggagaag aaggagagtg gagatgctgc gtccggggcc 60 gacggaacct acgacatcac caagctcggc gccaaacccg acggcaagac ggactgeacc 120 aaggaggtgg aggaggcatg ggcttcggct tgcggtggta ccgggaagaa tacgatcgtc 180 atccccaagg gtgatttcct gaccgggcct ctgaatttca ccgggccatg caagggcgac 240 agcgtcacca tcaagctgga cggcaacctg ctgagctcca acgacctggc caagtacaag 300 gctaactgga tcgagatcaŁ gcggatcaag aaactcacta tcaccggcaa aggcacgctc 360 gacggccaag gcaaggccgt gtggggcaag aacagctgcg ccaagaacta caactgcaag 420 atcttgccaa acacattggt gctggacttc tgtgacgacg ctctcatcga aggcatcacc 480 ctcctaaacg ccaagttctt ccatatgaac atctacgagt gcaagggcgt gaccgtcaag 540 gacgtgacca tcaccgcgcc cggggacagc cocaacaccg acggcatcca catcggcgac 600 tcgtccaagg tcaccatcac cgacaccacc atcggcaccg gcgacgactg catctccatc 660 ggccccggaa gcaccggcct caacatcacc ggcgtgacct gcggtccagg ccacggcatc 720 agcgttggca gcctgggacg gtacaaggac gagaaggacg tgaccgacat oaccgtaaag 780 aactgcgtgc tcaagaagto caccaacggc ctccggatca agtcgtacga ggacgccaag 840 tcgccgctga cggcgtcgaa gctgacctac gagaacgtga agatggagga cgtgggctac 900 cccatcatca tcgaccagaa gtactgcccc aacaagatct gcacctccaa gggagactcc 960 gccagggtca ccgtcaagga cgtcaccttc cgcaacatca ccggcacctc ctccaccccc 1020 gaggccgtca gcctgctctg ctccgacaag cagccctgca atggtgtcac catgaacgac 1080 gtcaagatcg agtacagcgg caccaacaac aagaccatgg ctgtctgcac caacgccaag 1140 gtcaccgcca agggtgtcag cgaggctaac acctgcgccg cctgatg 1187 <210> 2 <211> 20 <212> PRT <213> Kijnstliche Sequenz <220>
<223> Beschreibung der kiinstlichen Seguenz; p55 spezifischer primer <400> 2
Gly Lys Lys Glu Glu Lys Lys Asp Glu Lys Lys Glu Ser Gly Asp Ala 15 10 15
Ala Ser Xaa Ala 20 <210> 3 <211> 26 <212>DNA <213> Kijnstliche Sequenz <220>
<223> Beschreibung der kiinstlichen Sequenz:p55 spezifischer primer <220>
<221 > variation <222> (3) <223> rt = Inosine
PL 201 818 B1 <220>
<221 > variation <222> (6) <223> π = Inosine <220 <221 > variation <222>(9) <223> η = Inosine <220 <221 > variation <222> (12) <223> η - Inosin <220>
<221 > variation <222> (15) <223> η - Inosin <220 <221 > variation <222> (18) <223> η = Inosine <220 <221 > variation <222> (21) <223> η = Inosine <220 <221 > variation <222> (24) <223> η = Inosine <400> 3 ggnaanaang anganaanaa nganga 26 <2104 <211> 394 <212> PRT <213> Gramineae <400 4
PL 201 818 B1
PL 201 818 B1
Gly Lys ' 130 | Asn Ser | Cys | Ala | Lys 135 | Asn Tyr Asn | Cys | Lys 140 | Ile | Leu | Pro | Asn | ||||
Thr | Len | Val | Leu | Asp | Phe | cys | Asp | Asp | Ala | Leu | Ile | Glu | Gly | Ile | Thr |
14 5 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Leu | Leu | Asn | Ala | Lys | Phe | Phe | His | Met | Asn | Ile | Tyr | Glu | Cys | Lys | Gly |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Val | Thr | Val | Lys | Asp | Val | Thr | Ile | Thr | Ala | Pro | Gly | Asp | Ser | Pro | Asn |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Thr | Asp | Gly | Ile | His | Ile | Gly | Asp | Ser | Ser | Lys | Val | Thr | Ile | Thr | Asp |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Thr | Thr | Ile | Gly | Thr | Gly | Asp | Asp | Cys | Ile | Ser | Ile | Gly | Pro | Gly | Ser |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Thr | Gly | Leu | Asn | Ile | Thr | Gly | Gly | Ala | Cys | Gly | Pro | Gly | His | Gly | Ile |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Ser | Val | Gly | Ser | Leu | Gly | Arg | Tyr | Lys | Asp | Glu | Lys | Asp | Val | Thr | Asp |
24 5 | 250 | 255 | |||||||||||||
Ile | Thr | Val | Lys | Asn | Cys | Val | Leu | Lys | Lys | Ser | Thr | Asn | Gly | Leu | Arg |
2 60 | 265 | 270 | |||||||||||||
Ile | Lys | Ser | Tyr | Glu | Asp | Ala | Lys | Ser | Pro | Leu | Thr | Ala | Ser | Lys | Leu |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Thr | Tyr | Glu | Asn | Val | Lys | Met | Glu | Asp | Val | Gly | Tyr | Pro | Ile | Ile | Ile |
2 30 | 235 | 300 | |||||||||||||
Asp | Gin | Lys | Tyr | Cys | Pro | Asn | Lys | Ile | Cys | Thr | Ser | Lys | Gly | Asp | Ser |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Ala | Arg | Val | Thr | Val | Lys | Asp | Val | Thr | Phe | Arg | Asn | Ile | Thr | Gly | Thr |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Ser | Ser | Thr | Pro | Glu | Ala | Val | Ser | Leu | Leu | Cys | Ser | Asp | Lys | Gin | Pro |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Cys | Asn | Gly | Val | Thr | Met | Asn | Asp | Val | Lys | Ile | Glu | Tyr | Ser | Gly | Thr |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Asn | Asn | Lys | Thr | Met | Ala | Val | Cys | Thr | Asn | Ala | Lys | Val | Thr | Ala | Lys |
370 375 380
Gly Val Ser Glu Ala Asn Thr Cys Ala Ala 385 390 .
Claims (9)
1. Rekombinowana molekuła DNA, znamienna tym, że zawiera sekwencję nukleotydową alergenu Phl p 13 z Phleum pratense jak przedstawiono na rysunku fig. 1 (SEQ ID No. 1) i koduje alergen Phl p 13 z Phleum pratense.
2. Molekuła DNA, znamienna tym, że ma sekwencję nukleotydową, która jest komplementarna do sekwencji nukleotydowej alergenu Phl p 13 z Phleum pratense zdefiniowanej w zastrz. 1.
3. Rekombinowany wektor ekspresyjny DNA lub system klonowania zawierający rekombinowaną molekułę DNA, znamienny tym, że zawiera sekwencję nukleotydową alergenu Phl p 13 z Phleum pratense przedstawioną na rysunku fig. 1 (SEQ ID No. 1) i zdefiniowaną w zastrz. 1, funkcjonalnie połączoną z kontrolną sekwencją ekspresyjną.
4. Naturalny alergen Phl p 13 z Phleum pratense, znamienny tym, że jest kodowany przez kwas nukleinowy zdefiniowany w zastrz. 1.
5. Rekombinowany alergen Phl p 13 z Phleum pratense, znamienny tym, że jest kodowany przez kwas nukleinowy zdefiniowany w zastrz. 1.
6. Sposób otrzymywania rekombinowanego alergenu Phl p 13 z Phleum pratense, zdefiniowanego w zastrzeżeniu 5, znamienny tym, że hoduje się komórki prokariotyczne lub eukariotyczne, które poddano transformacji z wykorzystaniem wektora ekspresyjnego zdefiniowanego w zastrz. 3, a rekombinowany alergen Phl p 13 wyodrębnia się z kultury komórek.
7. Sposób diagnozy alergii na pyłki kwiatowe in vitro, znamienny tym, że obejmuje zastosowanie naturalnego bądź rekombinowanego alergenu Phl p 13 z Phleum pratense zdefiniowanego w zastrz. 4 lub 5.
8. Preparat farmaceutyczny, znamienny tym, że zawiera naturalny bądź rekombinowany alergen Phl p 13 z Phleum pratense zdefiniowany w zastrz. 4 lub 5, do terapii alergii na pyłek u ludzi lub zwierząt.
9. Zastosowanie rekombinowanego wektora ekspresyjnego DNA lub systemu klonowania zdefiniowanego w zastrz. 3 do wytwarzania leku do przeprowadzania szczepienia DNA w terapii alergii na pyłek u ludzi lub zwierząt.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE19918682A DE19918682A1 (de) | 1999-04-23 | 1999-04-23 | DNA-Sequenz und rekombinante Herstellung eines Graminaen-Allergens |
PCT/EP2000/003259 WO2000065060A2 (de) | 1999-04-23 | 2000-04-12 | Dna-sequenz und rekombinante herstellung eines graminaen-allergens |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
PL356055A1 PL356055A1 (pl) | 2004-06-14 |
PL201818B1 true PL201818B1 (pl) | 2009-05-29 |
Family
ID=7905749
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
PL356055A PL201818B1 (pl) | 1999-04-23 | 2000-04-12 | Sekwencja DNA oraz sposób rekombinacyjnego otrzymywania alergenów graminae |
Country Status (15)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US7241450B1 (pl) |
EP (1) | EP1171604B1 (pl) |
JP (1) | JP4588888B2 (pl) |
CN (1) | CN1203179C (pl) |
AT (1) | ATE338126T1 (pl) |
AU (1) | AU781275B2 (pl) |
CA (1) | CA2370393C (pl) |
CZ (1) | CZ20013796A3 (pl) |
DE (2) | DE19918682A1 (pl) |
ES (1) | ES2270828T3 (pl) |
HU (1) | HUP0200883A2 (pl) |
PL (1) | PL201818B1 (pl) |
PT (1) | PT1171604E (pl) |
RU (1) | RU2238321C2 (pl) |
WO (1) | WO2000065060A2 (pl) |
Families Citing this family (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DE19939982A1 (de) | 1999-08-24 | 2001-03-01 | Merck Patent Gmbh | Verfahren zur Isolierung und Aufreinigung von Gräserpollenallergenen |
AUPR779201A0 (en) * | 2001-09-20 | 2001-10-11 | University Of Melbourne, The | Immunotherapeutic and immunoprophylactic reagents |
SE0200946D0 (sv) * | 2002-03-27 | 2002-03-27 | Pharmacia Diagnostics Ab | Novel Allergen |
EP2272863B1 (de) | 2003-06-04 | 2012-10-31 | Merck Patent GmbH | Poa p 5-Derivate mit reduzierter Allergenität und erhaltener T-Zellrealktivität |
JP5871818B2 (ja) * | 2010-01-14 | 2016-03-01 | メルク パテント ゲゼルシャフト ミット ベシュレンクテル ハフツングMerck Patent Gesellschaft mit beschraenkter Haftung | プロリン残基の突然変異誘発により低減したアレルゲン性を有するイネ科のグループ6アレルゲンの変異体 |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5736362A (en) * | 1990-10-26 | 1998-04-07 | The University Of Melbourne | Ryegrass pollen allergen |
-
1999
- 1999-04-23 DE DE19918682A patent/DE19918682A1/de not_active Withdrawn
-
2000
- 2000-04-12 CZ CZ20013796A patent/CZ20013796A3/cs unknown
- 2000-04-12 ES ES00926876T patent/ES2270828T3/es not_active Expired - Lifetime
- 2000-04-12 PT PT00926876T patent/PT1171604E/pt unknown
- 2000-04-12 DE DE50013400T patent/DE50013400D1/de not_active Expired - Lifetime
- 2000-04-12 JP JP2000614395A patent/JP4588888B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2000-04-12 WO PCT/EP2000/003259 patent/WO2000065060A2/de active IP Right Grant
- 2000-04-12 AT AT00926876T patent/ATE338126T1/de active
- 2000-04-12 PL PL356055A patent/PL201818B1/pl unknown
- 2000-04-12 RU RU2001130165A patent/RU2238321C2/ru not_active IP Right Cessation
- 2000-04-12 CA CA2370393A patent/CA2370393C/en not_active Expired - Fee Related
- 2000-04-12 US US09/959,340 patent/US7241450B1/en not_active Expired - Fee Related
- 2000-04-12 EP EP00926876A patent/EP1171604B1/de not_active Expired - Lifetime
- 2000-04-12 AU AU45477/00A patent/AU781275B2/en not_active Ceased
- 2000-04-12 HU HU0200883A patent/HUP0200883A2/hu unknown
- 2000-04-12 CN CNB008066566A patent/CN1203179C/zh not_active Expired - Fee Related
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
RU2238321C2 (ru) | 2004-10-20 |
WO2000065060A3 (de) | 2001-03-01 |
US7241450B1 (en) | 2007-07-10 |
CN1351664A (zh) | 2002-05-29 |
HUP0200883A2 (hu) | 2003-07-28 |
CN1203179C (zh) | 2005-05-25 |
JP2002542783A (ja) | 2002-12-17 |
WO2000065060A2 (de) | 2000-11-02 |
AU781275B2 (en) | 2005-05-12 |
AU4547700A (en) | 2000-11-10 |
ATE338126T1 (de) | 2006-09-15 |
PT1171604E (pt) | 2007-01-31 |
PL356055A1 (pl) | 2004-06-14 |
EP1171604A2 (de) | 2002-01-16 |
EP1171604B1 (de) | 2006-08-30 |
CZ20013796A3 (cs) | 2002-01-16 |
CA2370393A1 (en) | 2000-11-02 |
ES2270828T3 (es) | 2007-04-16 |
JP4588888B2 (ja) | 2010-12-01 |
DE50013400D1 (de) | 2006-10-12 |
DE19918682A1 (de) | 2000-10-26 |
CA2370393C (en) | 2010-09-14 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Ferreira et al. | Modulation of IgE reactivity of allergens by site‐directed mutagenesis: potential use of hypoallergenic variants for immunotherapy | |
US9789178B2 (en) | DNA sequence, and recombinant preparation of the grass pollen allergen Lol p 4 | |
JP5363441B2 (ja) | 低減したアレルギー誘発性および保持されたT細胞反応性を有するPhlp5a誘導体 | |
US20170246317A1 (en) | Dna sequence, and recombinant preparation of group 4 major allergens from cereals | |
PL201818B1 (pl) | Sekwencja DNA oraz sposób rekombinacyjnego otrzymywania alergenów graminae | |
RU2409589C2 (ru) | ВАРИАНТ АЛЛЕРГЕНА ГРУППЫ I ИЗ Роасеае, ХАРАКТЕРИЗУЮЩИЙСЯ СНИЖЕННОЙ АЛЛЕРГЕННОСТЬЮ И СОХРАНЕННОЙ Т-КЛЕТОЧНОЙ РЕАКТИВНОСТЬЮ (ВАРИАНТЫ), КОДИРУЮЩАЯ ЕГО МОЛЕКУЛА ДНК И ЕГО ПРИМЕНЕНИЕ | |
RU2327739C2 (ru) | ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ ДНК И ПОЛУЧЕНИЕ АЛЛЕРГЕНА ПЫЛЬЦЫ ТРАВ Phl p 4 С ПОМОЩЬЮ РЕКОМБИНАНТНЫХ СПОСОБОВ | |
AU2012205288B2 (en) | DNA-sequence and recombinant production of group 4 major allergens from cereals | |
JP2008504004A5 (pl) | ||
AU2013204574B2 (en) | DNA-sequence and recombinant production of group 4 major allergens from cereals |