PL190709B1 - polipeptyd, sekwencje DNA, wektor, szczep, sposób wytwarzania białka, przeciwciała 54) albo ich aktywne fragmenty albo pochodne, zastosowania polipeptydu, cząsteczki DNA i wektora, sposób izolowania i identyfikacji polipeptydu, kompozycje farmaceutyczne, sposoby poszukiwania ligandu i sekwencji DNA, sposoby identyfikacji i wytwarzania ligandu i cząsteczki - Google Patents

polipeptyd, sekwencje DNA, wektor, szczep, sposób wytwarzania białka, przeciwciała 54) albo ich aktywne fragmenty albo pochodne, zastosowania polipeptydu, cząsteczki DNA i wektora, sposób izolowania i identyfikacji polipeptydu, kompozycje farmaceutyczne, sposoby poszukiwania ligandu i sekwencji DNA, sposoby identyfikacji i wytwarzania ligandu i cząsteczki

Info

Publication number
PL190709B1
PL190709B1 PL97329218A PL32921897A PL190709B1 PL 190709 B1 PL190709 B1 PL 190709B1 PL 97329218 A PL97329218 A PL 97329218A PL 32921897 A PL32921897 A PL 32921897A PL 190709 B1 PL190709 B1 PL 190709B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
traf2
polypeptide
activity
amino acid
sequence
Prior art date
Application number
PL97329218A
Other languages
English (en)
Other versions
PL329218A1 (en
Inventor
David Wallach
Nikolai Malinin
Mark Boldin
Andrei Kovalenko
Igor Mett
Original Assignee
Yeda Res & Dev
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from IL11780096A external-priority patent/IL117800A0/xx
Priority claimed from IL11913396A external-priority patent/IL119133A0/xx
Application filed by Yeda Res & Dev filed Critical Yeda Res & Dev
Priority claimed from PCT/IL1997/000117 external-priority patent/WO1997037016A1/en
Publication of PL329218A1 publication Critical patent/PL329218A1/xx
Publication of PL190709B1 publication Critical patent/PL190709B1/pl

Links

Landscapes

  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

1. Polipeptyd, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB, obejmujący: @ a) sekwencję aminokwasową z ID.SEKW.NR: 7 (NIK); b) sekwencję aminokwasową fragmentu z a), przy czym fragment ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB; c) sekwencję aminokwasową analogu z a) lub b), posiadającą nie więcej niż dziesięć zmian w sekwencji aminokwasowej a) lub b), przy czym każda zmiana jest substytucją, delecją lub insercją aminokwasu, a analog ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB; albo d) pochodne a), b) lub c) wiążące się z TRAF2 i modulujące aktywność NF-KB. 13. Sposób wytwarzania białka wiążącego się z TRAF, jego izoformy, fragmentu, analogu albo pochodnej, znamienny tym, że obejmuje hodowanie szczepu komórek gospodarza w warunkach odpowiednich do ekspresji białka, jego izoformy, fragmentu, analogu albo pochodnej; przeprowadzanie modyfikacji potranslacyjnych, jeżeli to konieczne, w celu otrzymania białka, jego izoformy, fragmentu, analogu albo pochodnej; izolowanie wyrażanego białka, jego izoformy, fragmentu, analogu albo pochodnej, przy czym szczep komórek gospodarza jest szczepem transformowanych eukariotycznych lub... 14. Przeciwciało albo jego aktywny fragment albo pochodna, swoiste wobec polipeptydu, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB, przy czym polipeptyd ten obejmuje: a) sekwencję aminokwasową z ID. SEKW. nR: 7 (NIK); b) sekwencję aminokwasową fragmentu z a), przy czym fragment ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB... 16. Zastosowanie polipeptydu określonego w zastrz. 1 albo sekwencji DNA określonej w zastrz. 5 albo wektora zdolnego do ekspresji w komórkach określonego w zastrz. 9, do wytwarzania kompozycji farmaceutycznej do modulowania aktywności NF-KB albo pośredniczenia w działaniu NF-KB w komórkach albo jakichkolwiek innych wewnątrzkomórkowych aktywności sygnalizacyjnych modulowanych albo zachodzących za pośrednictwem TRAF2, przy czym kompozycja ta jest przeznaczona do wprowadzania do komórek.

Description

Przedmiotem wynalazku jest polipeptyd, sekwencje DNA, wektor, szczep, sposób wytwarzania białka, przeciwciała albo ich aktywne fragmenty albo pochodne, zastosowania polipeptydu, cząsteczki DNA i wektora, sposób izolowania i identyfikacji polipeptydu, kompozycje farmaceutyczne, sposoby poszukiwania ligandu i sekwencji DNA, sposoby identyfikacji i wytwarzania ligandu i cząsteczki.
Rozwiązania według wynalazku dotyczą w ogólności sekwencji DNA kodujących białka o zdolności wiązania się z TRAF2, białek przez nie kodowanych i zastosowanie tych białek i sekwencji DNA do leczenia lub zapobiegania stanowi patologicznemu związanemu z indukcją NF-KB lub z dowolną inną aktywnością, w której pośredniczy TRAF2 lub inne cząsteczki, z którymi wiążą się te białka.
Dziedzina wynalazku.
Nadrodzina receptora czynnika martwicy nowotworu/czynnika wzrostu nerwów (TNF/NGF) jest zdefiniowana w oparciu o homologię strukturalną pomiędzy zewnątrzkomórkowymi domenami jej przedstawicieli (Bazan, 1993; Beutler i van Huffel, i994; Smith i wsp., 1994). Poza dwoma receptorami, receptorem TNF p55 i Fas/APOl, różni przedstawiciele tej rodziny receptorów nie wykazują wyraźnego podobieństwa strukturalnego domen wewnątrzkomórkowych. Pomimo tego, pomiędzy receptorami istnieje duże podobieństwo funkcjonalne wskazujące na wspólne szlaki przekazywania sygnałów. Jednym z przykładów takiego podobieństwa jest zdolność kilku receptorów z rodziny TFN/NGF do aktywowania transkrypcji czynnika NF-KB. Ta wspólna zdolność była przypisywana zdolności białka cytoplazmatycznego, które aktywuje transkrypcję NF-KB, czynnika 2 związanego z receptorem TNF (TRAF2, ang. TNF Receptor Associated Factor 2), do wiązania się do strukturalnie niepodobnych wewnątrzkomórkowych domen kilku receptorów z rodziny TFN/NGF. Poprzez jakie
190 709 mechanizmy działa TRAF2 i w jaki sposób jego odpowiedź wobec różnych receptorów, do których się wiąże, jest koordynowana, nie wiadomo.
TRAF2 jest przedstawicielem opisanej ostatnio rodziny białek zwanej TRAF, która obejmuje kilka białek zidentyfikowanych jako, przykładowo, TRAFI, TRAF2 (Rothe, M., Wong, S.C., Henzel, W. J. i Goeddel, D. (1994) Celi 78: 681-692; opublikowane zgłoszenie PCT WO 95/33051), TRAF3 (Cheng, G i wsp., (1995)) i TRAF6 (patrz Cao i wsp., 1996a). Wszystkie białka należące do rodziny TRAF wykazują wysoki stopień identyczności aminokwasowej w domenach C-końcowych, podczas gdy ich domeny N-końcowe mogą być niespokrewnione. Jak pokazano na schematycznej ilustracji przedstawiającej TRAF2 (fig. 1), cząsteczka zawiera motyw palca serdecznego i dwa motywy palca cynkowego podobnego do TFIIIA w regionie C-końcowym. C-końcowa połówka cząsteczki zawiera region znany jako „domena TRAF” zawierający potencjalny region suwaka leucynowego, rozciągający się pomiędzy aminokwasami 264-358 (zwany N-TRAF) i inną część w stronę końca karboksylowego domeny pomiędzy aminokwasami 359-501 (zwaną C-TRAF), która jest odpowiedzialna za wiązanie się TRAF z receptorami i z innymi cząsteczkami TRAF z utworzeniem homo- lub heterodimerów.
Aktywacja czynnika transkrypcyjnego NF-KB jest jednym z przejawów kaskady sygnałów zapoczątkowanej przez niektóre receptory TNF/NGF, w której pośredniczy TRAF2. NF-KB obejmuje przedstawicieli rodziny białek tworzących dimery, homologicznych do onkogenu Rei, które w postaci dimeru działają jako czynniki transkrypcyjne. Czynniki te są obecne wszędzie i uczestniczą w regulacji ekspresji wielu genów. Jakkolwiek początkowo zidentyfikowane jako czynnik, który jest konstytutywnie obecny w limfocytach B w stadium ekspresji lekkiego łańcucha Igk, NF-KB znany jest przede wszystkim ze swojego działania jako indukowalny aktywator transkrypcyjny. W większości znanych przypadków NF-KB zachowuje się jako czynnik pierwotny, czyli, że indukcja jego aktywności odbywa się poprzez aktywację cząsteczek już wcześniej obecnych w komórce w postaci nieaktywnej, a nie syntezy de novo, która z kolei zależy od indukowalnych czynników transkrypcyjnych, które włączają gen NF-KB. Efekty NF-KB są niezmiernie plejotropowe. Wspólną cechą większości z tych wielorakich efektów jest szybka indukcja w odpowiedzi na zewnątrzkomórkowy bodziec. Większość czynników aktywujących NF-KB stanowią induktory obrony immunologicznej, a wśród nich składniki wirusów i bakterii, cytokiny, które regulują odpowiedź immunologiczną, światło UV i inne. A zatem wiele genów regulowanych przez NF-KB ma swój wkład w obronie immunologicznej (patrz prace przeglądowe Blank i wsp., 1992; Grilli i wsp., 1993; Baeuerle i Henkel, 1994).
Jedną z głównych właściwości regulacji NF-KB jest to, że czynnik ten istnieje w cytoplazmatycznej postaci nie wiążącej się z DNA, która może być indukowana do przemieszczenia się do jądra, związania się z DNA i aktywacji transkrypcji. Ta dwoista postać białek NFKB jest regulowana przez I-kB - rodzinę białek, które zawierają powtórzenia domeny, którą początkowo zauważono w białku erytrocytów - ankirynie (Gilmore i Morin, 1993). W postaci nie pobudzonej, dimer NF-KB występuje w połączeniu z cząsteczką I-kB, która decyduje o jego cytoplazmatycznej lokalizacji i zapobiega jego oddziaływaniu z sekwencją DNA wiążącą się z NF-KB i aktywacji transkrypcji. Oddysocjowanie I-kB od dimeru NF-KB stanowi krytyczny etap jego aktywacji przez wiele indukujących go czynników (DiDonato i wsp., 1995). Wiedza na temat mechanizmów, które są zaangażowane w tą regulację jest nadal ograniczona. Niewiele wiadomo również na temat drogi nabywania przez komórki specyficzności w odniesieniu do różnych czynników indukujących NF-KB.
Jednym z najsilniejszych czynników indukujących NF-KB jest cytokina - czynnik martwicy nowotworu (TNF). Istnieją dwa różne receptory TNF, receptor p55 i p75. Poziom ich ekspresji różni się niezależnie w różnych komórkach (Vandenabeele i wsp., 1995). Receptor p75 odpowiada przede wszystkim na postać TNF związaną z komórką (TNF jest wyrażany zarówno jako białko beta-transbłonowe, jak i białko rozpuszczalne), podczas gdy receptor p55 odpowiada tak samo efektywnie na rozpuszczalne cząsteczki TNF (Greli i wsp., 1995). Domeny wewnątrzkomórkowe dwóch receptorów są strukturalnie niespokrewnione i wiążą się z różnymi białkami cytoplazmatycznymi. Pomimo tego, co najmniej część efektów TNF, włączając w to efekt komórkobójczy i indukcję NF-KB, może być indukowany przez obydwa receptory. Cecha ta jest specyficzna komórkowo. Receptor p55 ma zdolność do indukowania
190 709 efektu komórkobójczego lub aktywacji NF-KB we wszystkich komórkach, które wykazują taki efekt w odpowiedzi na TNF. p75-R może dawać taki efekt jedynie w niektórych komórkach. Inne, jakkolwiek wyrażają p75-R na wysokim poziomie, wykazują indukcję efektu jedynie w odpowiedzi na pobudzenie p55-R (Vandenabeele i wsp., 1995). Poza receptorami TNF, różne inne receptory z rodziny TNF/NGF: CD30 (McDonald i wsp., 1995), CD40 (Berberich i wsp., 1994; Lamanach-Girard i wsp., 1993), receptor limfotoksyny beta i w kilku typach komórek, Fas/APOl (Rensing-Ehl i wsp., 1995), mają również zdolność indukcji aktywacji NF-KB. Receptor IL-1 typu I, również efektywnie włączając aktywację NF-KB, ma właściwości wspólne z receptorami TNF pomimo braku strukturalnego podobieństwa.
Aktywacja NF-KB po włączeniu tych różnych receptorów jest wynikiem indukowanej fosforylacji związanych z nią cząsteczek I-kB. Ta fosforylacja naznacza I-kB do degradacji, która najprawdopodobniej ma miejsce w proteosomie. Natura kinazy, która fosforyluje I-kB i mechanizm aktywacji po włączeniu receptora jest nadal nieznany. Jednakże w ciągu ostatnich dwóch lat zyskano pewną wiedzę na temat tożsamości trzech białek związanych z receptorami, które wydają się brać udział w zapoczątkowaniu fosforylacji (patrz schematyczna ilustracja na fig 2a i 6). Białko zwane TRAF2, wyjściowo sklonowane przez D. Goeddela i jego współpracowników (Rothe i wsp., 1994), wydaje się odgrywać centralną rolę w aktywacji NF-KB przez różnorodne receptory z rodziny TNF/NGF. Białko, które wówczas, gdy ulega ekspresji na wysokim poziomie, samo może włączyć aktywację NF-KB, wiąże się do zaktywowanego TNF-R p75 (Rothe i wsp., 1994), receptora limfotoksyny beta (Mosialos i wsp., 1995), CD40 (Rotbe i wsp., 1995a) i CD30 (dane niepublikowane) i pośredniczy w indukcji przez nie NF-KB. TRAF2 nie wiąże się z receptorem TNF p55 ani z Fas/APOl, jednakże może wiązać się z białkiem związanym z receptorem p55, zwanym TRADD, a TRADD ma zdolność wiązania się z białkiem związanym z Fas/APOl, zwanym MORT1 (lub FADD - patrz Boldin i wsp., 1995b i 1996). Inne białko oddziałujące z receptorem, zwane RIP (patrz Stanger i wsp., 1995) jest również zdolne do oddziaływania z TRAF2, jak również z FAS/APO1, TRADD, receptorem TNF p55 i MORT-1. A zatem, jakkolwiek RIP jest związany z indukcją cytotoksyczności komórki (śmiercią komórki), jego zdolność do oddziaływania z TRAF2 sugeruje jego udział w aktywacji NF-KB i może on również służyć do wzmocnienia interakcji pomiędzy FAS1/APO1, MORT1, receptorem p55 i TRADD a TRAF2 na drodze prowadzącej do aktywacji NF-KB. Te powiązania umożliwiają receptorowi TNF p55 i Fas/APOl zapoczątkowanie aktywacji NF-KB (Hsu i wsp., 1995; Boldin i wsp., 1995; Chinnalyan i wsp., 1995; Varfolomeev i wsp., 1996; Hsu i wsp., 1996). Zapoczątkowanie aktywacji NF-KB przez receptor IL-1 odbywa się niezależnie od TRAF2 i może brać w nim udział ostatnio sklonowana kinaza białkowa związana z receptorem IL-1, zwana IRAK (Croston i wsp., 1995).
Mechanizm działania TRAF2 nie jest jasny. Zidentyfikowano kilka cząsteczek cytoplazmatycznych, które wiążą się z TRAF2 (Rothe i wsp., 1994; Rothe i wsp., 1995b). Jednakże informacje o tych cząsteczkach nie dostarczają wyjaśnienia sposobu za pośrednictwem którego TRAF2, który sam nie ma żadnej aktywności enzymatycznej, zapoczątkowuje fosforylację I-kB. Nie ma również jeszcze danych odnośnie mechanizmu, który decyduje o komórkowo-specyficznym wzorze aktywacji TRAF2 przez różne receptory, takim jak obserwowany dla indukcji NF-KB przez dwa receptory TNF.
Poza tym, o czym wspomniano powyżej odnośnie różnych białek TRAF, należy również wspomnieć, że TRAF2 wiąże się z receptorami TNF p55 (CD120a) i p75 (CD120b), jak również kilkoma innymi receptorami z rodziny TNF/NGD, bezpośrednio lub pośrednio poprzez inne białka adaptorowe, jak wspomniano powyżej na przykład w odniesieniu do receptora FAS/APOl i białek adapterowych MORT1, TRADD i RIP. A zatem, TRAF2 odgrywa decydującą rolę w aktywacji NF-KB (patrz również Wallach, 1996). Za to TRAF3 hamuje aktywację NF-KB przez pewne receptory z rodziny TNF/NGF (patrz Rothe i wsp., 1995a), podczas gdy TRAF6 jest wymagany do indukcji NF-KB przez IL-1 (patrz Cao i wsp., 1996a).
Zgodnie z powyższym, jeśli chodzi o aktywację NF-KB i jej znaczenie w utrzymaniu żywotności komórki, różne wewnątrzkomórkowe szlaki biorące udział w tej aktywacji nie zostały dotychczas całkowicie wyjaśnione, przykładowo, jaki jest udział różnych białek TRAF, pośredni czy bezpośredni.
190 709
Ponadto, jak obecnie wiadomo odnośnie różnych przedstawicieli rodziny receptorów TNF/NGF i związanych z nimi wewnątrzkomórkowych szlaków przenoszenia sygnałów, włączając w to, przykładowo, różne białka adaptorowe, pośredniczące - modulujące (patrz krótkie omówienia i piśmiennictwo w np. izraelskie Zgłoszenie Patentowe nr 114615, 114986, 115319, 116588), TNF i ligand FAS/APOl, na przykład, mogą mieć zarówno korzystny, jak i szkodliwy wpływ na komórkę. TNF, przykładowo, bierze udział w obronie organizmu przed rakiem i czynnikami infekcyjnymi oraz bierze udział w likwidacji uszkodzenia poprzez indukowanie zabijania komórek nowotworowych i komórek zainfekowanych wirusem, zwiększając aktywność antybakteryjną granulocytów, a zatem w tych przypadkach zabijanie komórek indukowanych TNF jest pożądane. Jednakże nadmiar TNF może być szkodliwy i wiadomo, że TNF odgrywa główną rolę patogenną w licznych chorobach, takich jak wstrząs septyczny, anoreksja, choroby reumatyczne, stany zapalne i reakcja przeszczep przeciw gospodarzowi. W takich przypadkach niszczenie komórek indukowanych przez TNF nie jest pożądane. Ligand FAS/APOl na przykład daje również pożądane i szkodliwe skutki. Ligand FAS/APOl indukuje poprzez swój receptor zabijanie autoreaktywnych limfocytów T w czasie dojrzewania limfocytów T, to jest niszczenie limfocytów T, które rozpoznają własne antygeny w czasie swojego rozwoju, zapobiegając w ten sposób chorobom autoimmunoiogijznym. Ponadto różne komórki nowotworowe i komórki zainfekowane HIV niosą na swojej powierzchni receptor FAS/APOl i mogą być zatem zniszczone poprzez aktywację tego receptora przez jego ligandy lub specyficzne wobec niego przeciwciała, a co za tym idzie aktywację wewnątrzkomórkowych szlaków śmierci komórki (apoptozy), w której pośredniczy ten receptor. Jednakże receptor FAS/APOl może pośredniczyć w szkodliwym działaniu, na przykład niekontrolowanym zabijaniu tkanki, które jest obserwowane w niektórych chorobach, takich jak ostre zapalenie wątroby, któremu towarzyszy rozpad komórek wątroby.
W świetle powyższego, biorąc pod uwagę to, że receptory z rodziny TNF/NGF mogą z jednej strony indukować szlaki śmierci komórki, a z drugiej strony mogą indukować szlaki przeżycia komórki(poprzez indukcję NF-KB), istnieje subtelna równowaga wewnątrz komórki pomiędzy tymi dwoma przeciwstawnymi szlakami. Przykładowo, kiedy pożądane jest osiągnięcie maksymalnego zniszczenia komórek nowotworowych lub innych zainfekowanych lub chorych komórek, pożądane będzie posiadanie TNF i/lub ligandu FAS/APOl, indukujących jedynie szlak śmierci komórki bez indukcji NF-KB. Przeciwnie, jeżeli jest pożądana ochrona komórek, tak jak przykładowo, w stanach zapalnych, reakcjach przeszczep przeciw gospodarzowi, ostrym zapaleniu wątroby, pożądane będzie blokowanie indukcji zabijania komórki przez TNF i/lub ligand FAS/APOl i zwiększenie w zamian za to indukcji przez niego NF-KB. Podobnie, w pewnych stanach patologicznych pożądane będzie blokowanie wewnątrzkomórkowych szlaków przekazywania sygnałów za pośrednictwem receptora TNF p75 i receptora IL-1, podczas gdy w innych pożądane będzie wzmocnienie tych wewnątrzkomórkowych szlaków.
Streszczenie wynalazku
W ogólności rozwiązania według wynalazku mają na celu dostarczenie nowych białek, włączając w to wszystkie ich izoformy, analogi, fragmenty lub pochodne, które są zdolne do wiązania się z białkami związanymi z receptorem czynnika martwicy nowotworu (TRAF1). Ponieważ białka TRAF biorą udział w modulacji lub pośredniczą w aktywacji transkrypcji czynnika NF-KB, co jest inicjowane przez niektóre receptory TNF/NGF, jak również inne, jak wspomniano powyżej, nowe białka według niniejszego wynalazku są zdolne, poprzez wiązanie się z TRAF, do wywierania wpływu (modulując lub pośrednicząc) na wewnątrzkomórkowe procesy przekazywania sygnałów, zapoczątkowywane przez wiązanie się rozmaitych ligandów (np. TNF, ligand FAS i inne) ze swoimi receptorami, takiego jak, przykładowo modulacjj/pośrrdniczrnir w aktywacji NF-KB, poprzez pośrednie lub bezpośrednie oddziaływanie z białkami TRAF.
Nowe białka są zatem bezpośrednimi modulatorami/pośrednikami wewnątrzkomórkowej aktywności biologicznej białek TRAF (np. indukcja aktywacji NF-KB poprzez TRAF2 i TRAF6 i hamowanie aktywacji NF-KB przez TRAF3).
Nowe białka są, podobnie, pośrednimi modulatorami/pośrednikami wewnątrzkomórkowej aktywności biologicznej różnych innych białek, które mają zdolność oddziaływania, bezpośrednio lub pośrednio, z białkami TRAF (np. receptora FAS/APOl, receptora TNF p55,
190 709 receptora TNF p75, receptora IL-1 i związanych z nim białek, takich jak, przykładowo, MORT1, TRADD, RIP).
W szczególności przedmiotem wynalazku jest polipeptyd, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB, obejmujący:
a) sekwencję aminokwasową z ID. SEKW.NR: 7 (NIK);
b) sekwencję aminokwasową fragmentu z a) , przy czym fragmentten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB;
c) sekwencję aminokwasową analogu z a) lub b), posiadającą nie więcej niż dziesięć zmian w sekwencji aminokwasowej a) lub b), przy czym każda zmiana jest substytucją, delecją lub insercją aminokwasu, a analog ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB; albo
d) pochodne a), b) lub c) wiążące się z TRAF2 i modulujące aktywność NF-KB. .
Korzystnie polipeptyd według wynalazku jest sekwencją kodowaną przez sekwencję nukleotydową ID. SEKW.NR: 3 (klon 10). Ponadto korzystnie polipeptyd według wynalazku jest NEK (ID. SEKW.NR: 7), korzystniej zawiera co najmniej część sekwencji aminokwasowej z ID. SEKW.NR: 7.
Rozwiązania według wynalazku dostarczają również antagonistów (tj. przeciwciał, peptydów, związków organicznych lub nawet niektórych izoform) dla powyższych nowych białek wiążących się z TRAF, włączając w to ich izoformy, analogi, fragmenty lub pochodne, które mogą być użyte do hamowania procesu przekazywania sygnału, lub bardziej konkretnie, hamowania aktywacji NF-KB i związanego z nią udziału w procesach przeżycia komórek, kiedy jest to pożądane. Podobnie, kiedy polipeptyd wiążący się z TRAF według wynalazku lub białko TRAF, do którego ulega on związaniu (np. TRAF3), są same inhibitorami aktywacji NF-KB, rozwiązania według wynalazku dostarczają antagonistów dla tych białek wiążących się z TRAF, w celu aktywacji procesów przekazywania sygnału lub, bardziej konkretnie, blokowania hamowania aktywacji NF-KB, a zatem uzyskania zwiększenia aktywacji NF-KB kiedy jest to pożądane.
Rozwiązania według wynalazku umożliwiają zastosowanie powyższych nowych białek wiążących się z TRAF, ich izoform, analogów, fragmentów lub pochodnych do izolowania i charakteryzowania dodatkowych białek lub czynników, które mogą być zaangażowane w regulację aktywności białka TRAF i/lub opisanej powyżej aktywności receptora, np. innych białek, które mogą wiązać się z białkami TRAF i wpływać na ich aktywność, oraz/albo izolowania i identyfikowania innych receptorów lub innych białek komórkowych umiejscowionych wcześniej lub później w procesie (procesach) przekazywania sygnałów, do których wiążą się te nowe białka, ich analogi, fragmenty lub pochodne, a zatem w których funkcję są zaangażowane.
Rozwiązania według wynalazku umożliwiają dostarczenie inhibitorów, które można wprowadzić do komórek aby związały się lub oddziaływały z nowymi białkami wiążącymi się z TRAF i ich ewentualnymi izoformami, które to inhibitory mogą działać hamująco na aktywność związaną z białkiem TRAF, na przykład przy aktywacji NF-KB, a zatem, jeżeli to pożądane, hamują aktywację NF-KB lub mogą działać tak, że hamują aktywność hamującą związaną z TRAF (np. TRAF3) w aktywacji NF-KB, a zatem, jeżeli to pożądane, zwiększają aktywację NF-KB.
Możliwe jest również zastosowanie wspomnianych powyżej nowych białek wiążących się z TRAF, ich izoform, analogów, fragmentów lub pochodnych jako antygenów do wytwarzania wobec nich' poliklonalnych i/lub monoklonalnych przeciwciał. Przeciwciała z kolei mogą być zastosowane na przykład do oczyszczania nowych białek z różnych źródeł, takich jak ekstrakty komórkowe lub transformowane linie komórkowe.
Ponadto przeciwciała te mogą być użyte do celów diagnostycznych, np. do identyfikowania chorób związanych z nieprawidłowym działaniem funkcji komórkowych, w których pośredniczą bezpośrednio białka TRAF lub w których pośredniczy receptor TNF p55, receptor FAS/APOl i inne pokrewne receptory i związane z nimi białka komórkowe (np. MORT1, TRADD, RIP), które działają bezpośrednio lub pośrednio, modulując/pośrednicząc w procesach wewnątrzkomórkowych poprzez oddziaływanie z białkami TRAF.
Rozwiązania według wynalazku dostarczają również kompozycji farmaceutycznych zawierających wyżej opisane nowe białka TRAF, ich izoformy, analogi, fragmenty lub pochod12
190 709 ne. Możliwe jest również otrzymanie kompozycji farmaceutycznych zawierających wspomniane powyżej przeciwciała lub inne czynniki o właściwościach antagonistów.
Zgodnie z niniejszym wynalazkiem, wyizolowano szereg nowych białek wiążących się z TRAF, a w szczególności białek wiążących się z TRAF2. Te białka wiążące się z Traf2 mają wysoką specyficzność wiązania się z TRAF2 (patrz przykłady poniżej), są więc modulatorami lub pośrednikami w aktywności wewnątrzkomórkowej TRAF2. TRAF2 jest zaangażowany w modulację lub pośredniczenie w co najmniej jednym wewnątrzkomórkowym szlaku przekazywania sygnałów, będącym szlakiem związanym z przeżywalnością lub żywotnością komórki, w którym TRAF2 jest bezpośrednio zaangażowany w aktywację NF-KB, odgrywającą centralną rolę w przeżyciu komórki. Rzeczywiście, jedno z tych nowych białek, zwane NIK (od „kinazy indukującej NF-KB”, ang. „NF-KB Inducing Kinase”) wiąże się z TRAF2 i stymuluje aktywność NF-KB. NIK jest kinazą wykazującą podobieństwo sekwencji do kilku kinaz MaPKK (patrz poniżej). Ponadto, TRAF2 poprzez zdolność oddziaływania bezpośrednio lub pośrednio z wyżej wspomnianym receptorem INF p55, receptorem TNF p75, receptorami FAS/APOl i związanymi z nimi białkami MORT1, TRADD i RIP, jest również pośrednikiem lub modulatorem aktywności indukującej lub aktywującej NF-KB przypisanej tym receptorom. TRAF2 jest zatem modulatorem/pośrednikiem w szlakach przeżywalności komórek (w przeciwieństwie do szlaków śmierci komórek), w których pośredniczą te receptory i związane z nimi białka i w konsekwencji siła oddziaływania pomiędzy tymi receptorami i/lub białkami z TRAF2 jest ważnym czynnikiem dla wypadkowej aktywności tych receptorów (po zaktywowaniu przez swoje ligandy), a mianowicie decyzji, czy komórka przeżyje czy umrze. A zatem, polipeptyd według wynalazku, przykładowo NIK, odgrywają kluczową rolę w tym oddziaływaniu pomiędzy TRAF2 i innymi białkami/receptorami, z którymi oddziałuje TRAF2, ponieważ białka takie jak NIK, poprzez specyficzne wiązanie się TRAF2, będą modulowały jego aktywność i/lub ich aktywność będzie modulowana poprzez oddziaływanie z TRAF2.
Białka wiążące się z TRAF, takie jak, przykładowo, białka wiążące się z TRAF2, włączając w to NIK, zostały wyizolowane i sklonowane przy zastosowaniu systemu dwuhybrydowego, częściowo lub całkowicie zsekwencjonowane i scharakteryzowane i jak opisano szczegółowo poniżej, wydają się być wysoce specyficznymi białkami wiążącymi się z TRAF2, a zatem specyficznymi modulatorami/pośrednikami TRAF2.
Zastosowany dalej termin aktywność białka TRAF, przykładowo, aktywność TRAF2, ma oznaczać jego aktywność w modulowaniu/pośredniczeniu w szlakach przeżycia komórki, w szczególności w odniesieniu do indukcji/aktywacji NF-KB. Podobnie, zastosowany dalej termin aktywność białka wiążącego się z TRAF, w szczególności białka wiążącego się z TRAF2, ma oznaczać modulowanie/pośredniczenie w aktywności TRAF, a w szczególności TRAF2, poprzez jego specyficzne wiązanie się z TRAF, a w szczególności białkami TRAF2, gdzie to modulowanie/pośredniczenie obejmuje modulowanie/pośredniczenie w szlakach przeżycia komórki, w szczególności tych związanych z indukcją/aktywacją NF-KB, w których białka TRAF, a szczególnie TRAF2, są zaangażowane bezpośrednio lub pośrednio, a zatem TRAF lub białko wiążące się z TRAF2 mogą być uważane jako pośrednie modulatory/pośrednicy dla wszystkich wspomnianych powyżej białek i możliwie, że licznych innych, które są zaangażowane w przeżycie komórek, a w szczególności indukcję/aktywację NF-KB i do których TRAF2 (lub inne białka TRAF) wiążą się lub z którymi TR.AF2 (lub inne białka TRAF) oddziałują w sposób bezpośredni lub pośredni.
A zatem, rozwiązania według wynalazku dostarczają sekwencję DNA kodującą białko zdolne do wiązania się z cząsteczką związaną z receptorem czynnika martwicy nowotworu (TRAF). W szczególności, przedmiotem wynalazku jest sekwencja DNA kodująca polipeptyd, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB, wybrana z grupy składającej się z: 1) sekwencji cDNA obejmującej sekwencję nukleotydową ID. SEKW.NR: 3; 2) fragmentu sekwencji z 1), kodującego polipeptyd, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB; 3) sekwencji DNA zdolnej do hybrydyzacji z sekwencjami l)-2) w umiarkowanie ostrych warunkach, kodującej polipeptyd, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB. Korzystnie sekwencja DnA według wynalazku obejmuje sekwencję nukleotydową z ID. SEKW.NR: 3. Korzystniej sekwencja DNA według wynalazku obejmuje sekwencję nukleotydową kodującą białko NIK o sekwencji aminokwasowej z ID. SEKW.NR: 7. Ponadto przedmiotem wynalaz190 709 ku jest sekwencja DNA zdolna do hybrydyzacji w umiarkowanie ostrych warunkach z sekwencją kodującą polipeptyd według wynalazku.
Jedną z sekwencji DNA według wynalazku jest sekwencja kodująca białko mające zdolność wiązania się z TRAF2. Inną sekwencją DNA według wynalazku jest sekwencja kodująca białko zdolne do wiązania się co najmniej do aminokwasów 222-501 z sekwencji aminokwasowej TRAF2.
Niniejszym opisane zostały następujące sekwencje DNA:
a) sekwencja cDNA klonu oznaczonego tu jako klon 9, o sekwencji nukleotydowej przedstawionej na fig 3 a;
b) sekwencja cDNA klonu oznaczonego tu jako klon 10, o sekwencji nukleotydowej przedstawionej na fig 4;
c) sekwencja cDNA klonu oznaczonego tu jako klon 15, o sekwencji nukleotydowej przedstawionej na fig 5 a;
d) fragment sekwencji a)-c), który koduje aktywne biologicznie białko zdolne do wiązania się co najmniej do aminokwasów 222-501 z sekwencji aminokwasowej TRAF2; oraz
e) sekwencja DNA zdolna do hybrydyzowania do sekwencji a)-d) w umiarkowanie ostrych warunkach i która koduje aktywne biologicznie białko zdolne do wiązania się co najmniej do aminokwasów 222-501 z sekwencji aminokwasowej TRAF2.
f) sekwencja DNA, która jest zdegenerowana ze względu na degenerację kodu genetycznego w stosunku do sekwencji DNA zdefiniowanych w a)-e) i która koduje aktywne biologicznie białko zdolne do wiązania się co najmniej do aminokwasów 222-501 z sekwencji aminokwasowej TRAF2.
W szczególności opisane zostały:
- sekwencja DNA wybrana z sekwencji zawartych w klonach cDNA, oznaczonych tu jako klony 9 i 15;
- sekwencja DNA, która koduje białko, które moduluje również aktywność NF-KB; oraz
- sekwencja DNA wybrana z sekwencji zawartych w klonie cDNA, oznaczonych tu jako 10.
Korzystną odmianą powyższych sekwencji DNA jest sekwencja DNA zawierająca sekwencję DNA kodującą białko NIK (od kinazy indukującej NF-KB, ang. „NF-KB inducing kinase”).
Odmiany powyższej sekwencji DNA kodującej białko NIK obejmują:
(i) sekwencję DNA kodującą białko NIK, jego izoformy, fragmenty lub analogi, gdzie białko NIK, jego izoformy, fragmenty lub analogi mają zdolność wiązania się do TRAF2 i które ma zdolność modulowania aktywności NF-KB;
(ii) sekwencję DNA jak w (i) powyżej, wybraną z grupy składającej się z:
a) sekwencji cDNA pochodzącej z regionu kodującego natywnego białka NIK;
b) sekwencji DNA zdolnych do hybrydyzowania do sekwencji a) w umiarkowanie ostrych warunkach i które kodują aktywne biologicznie białko NIK, oraz
c) sekwencji DNA, które są zdegenerowane w wyniku degeneracji kodu genetycznego w odniesieniu do sekwencji DNA zdefiniowanych w a) i b) i które kodują aktywnie biologiczne białko NIK;
(iii) sekwencję DNA jak w (i) lub (ii) powyżej, zawierającą co najmniej część sekwencji przedstawionej na fig. 6 i kodującą co najmniej jedno aktywne białko NIK, jego izoformę, analog lub fragment;
(iv) sekwencję DNA jak w (iii) powyżej, kodującą białko NK, jego izoformę, analog lub fragment zawierające co najmniej część sekwencji aminokwasowej przedstawionej na fig 6.
Zatem rozwiązania według wynalazku dostarczają białek lub polipeptydów kodowanych przez wspomniane powyżej sekwencje kodujące DNA według wynalazku, izoformy, analogi, fragmenty i pochodne takich białek i polipeptydów, zakładając, że mają one zdolność do wiązania się do TRAF2, korzystnie co najmniej do aminokwasów 222-501 w sekwencji TRAF2. Opisane tu odmiany tych białek/polipeptydów, oraz ich izoformy, analogi, fragmenty i pochodne obejmują:
a) białko będące białkiem zakodowanym w klonie oznaczonym fu jako klon 1(0;
190 709
b) białko, jego izoformy, fragmenty, analogi i pochodne, będące białkiem NIK, jego izoformami, analogami, fragmentami i pochodnymi kodowanymi przez wspomniane wyżej sekwencje DNA kodujące to białko NIK, jego izoformy, analogi, fragmenty i pochodne; oraz
c) białko NIK, jego izoformy, analogi, fragmenty i pochodne będące białkiem NIK, jego izoformami, analogami, fragmentami i pochodnymi kodowanymi przez wspomniane wyżej sekwencje DNA kodujące to białko NIK, jego izoformy, analogi, fragmenty i pochodne, gdzie to białko NIK, jego izoformy, fragmenty i pochodne mają co najmniej część sekwencji aminokwasowej przedstawionej na fig. 6.
Przedmiotem wynalazku jest również wektor zawierający sekwencję DNA według wynalazku. Korzystnie wektor według wynalazku jest zdolny do ulegania ekspresji w prokariotycznej albo eukariotycznej komórce gospodarza.
Przedmiotem wynalazku jest również szczep transformowanych eukariotycznych lub prokarietycznych komórek gospodarza zawierający wektor według wynalazku.
Przedmiotem wynalazku jest również sposób wytwarzania białka wiążącego się z TRAF, jego izoformy, fragmentu, analogu lub pochodnej, który obejmuje hodowanie wspomnianych powyżej stransformowanych komórek gospodarza według wynalazku w warunkach odpowiednich do ekspresji takiego białka, jego izoform, analogów, fragmentów lub pochodnych, przeprowadzenie postranslacyjnych modyfikacji, jeżeli to konieczne, w celu otrzymania takiego białka, jego izoformy, fragmentu, analogów lub pochodnych i izolowanie takiego wyrażonego białka, jego izoformy, analogu, fragmentu lub pochodnej.
W dalszym aspekcie wynalazek dostarcza przeciwciał lub ich aktywnych fragmentów albo pochodnych, swoistych wobec powyższych białek wiążących się z TRAF, ich analogów, izoform, fragmentów lub pochodnych albo swoistych wobec białka NIK, jego izoformy, analogu, fragmentu lub pochodnej, wspomnianych powyżej. W szczególności przedmiotem wynalazku jest przeciwciało albo jego aktywny fragment albo pochodna, swoiste wobec polipeptydu według wynalazku.
Przedmiotem wynalazku są również następujące sposoby poszukiwania:
(i) Sposób poszukiwania ligandu mającego zdolność wiązania się z polipeptydem według wynalazku, jak opisano powyżej, włączając w to jego izoformy, analogi, fragmenty lub pochodne, obejmujący doprowadzenie do kontaktu podłoża do chromatografii powinowactwa, do którego dołączone jest to białko, jego izoforma, analog, fragment lub pochodna, z ekstraktem komórkowym tak, że ligand wiąże się z tym podłożem i wymywanie, izolowanie i analizowanie takiego ligandu.
(ii) Sposób poszukiwania sekwencji DNA kodującej ligand wykazujący zdolność wiązania się z polipeptydem, jego izoforma, analogiem, fragmentem lub pochodną według wynalazku, jak opisano powyżej, obejmujący zastosowanie procedury dwuhybrydowej w drożdżach, w której sekwencja kodująca ten polipeptyd jest przenoszona przez jeden wektor hybrydowy, a sekwencje z biblioteki cDNA lub genomowej są przenoszone przez drugi wektor hybrydowy, transformowanie drożdżowych komórek gospodarza takimi wektorami, izolowanie stransformowanych, pozytywnych komórek i ekstrahowanie takiego drugiego wektora hybrydowego w celu otrzymania sekwencji kodującej taki ligand.
Przedmiotem wynalazku jest również sposób izolowania i identyfikowania polipeptydu według wynalazku, mającego zdolność wiązania się bezpośrednio z TRAF2, obejmujący zastosowanie procedury dwuhybrydowej w drożdżach, w której sekwencja kodująca TRA.F2 jest przenoszona przez jeden wektor hybrydowy, a sekwencja z biblioteki cDNA lub genomowej jest przenoszona przez drugi wektor hybrydowy, wektory następnie używa się do transformowania drożdżowych komórek gospodarza i izoluje się pozytywne stransformowane komórki, a następnie ekstrahuje się taki drugi wektor hybrydowy w celu otrzymania sekwencji kodującej białko, które wiąże się z TRAF2.
Przedmiotem wynalazku jest również zastosowanie polipeptydu, sekwencji DNA albo wektora zdolnego do ekspresji w komórkach według wynalazku, do wytwarzania kompozycji farmaceutycznej do modulowania aktywności NF-kB albo pośredniczenia w działaniu NF-kB w komórkach albo jakichkolwiek innych wewnątrzkomórkowych aktywności sygnalizacyjnych modulowanych albo zachodzących za pośrednictwem TRAF2, przy czym kompozycja ta jest przeznaczona do wprowadzania do komórek. Korzystnie wektor wykorzystywany w za190 709 stosowaniu według wynalazku jest rekombinowanym zwierzęcym wektorem wirusowym, obejmującym dodatkowo sekwencję kodującą powierzchniowe białko wirusowe (ligand), które ma zdolność wiązania się ze specyficznymi receptorami na powierzchni komórek, do których ma być wprowadzana kompozycja farmaceutyczna. Również korzystnie polipeptydem w zastosowaniu według wynalazku jest NIK albo przynajmniej jedna z izoform, analogów, fragmentów albo pochodnych NIK.
Tak więc zastosowanie według wynalazku umożliwia modulowanie lub pośredniczenie w aktywności NF-KB w komórce lub dowolnej innej wewnątrzkomórkowej aktywności przenoszenia sygnałów, którą moduluje lub w której pośredniczy TRAF2 lub inne cząsteczki, do których wiąże się polipeptyd według wynalazku jak opisano powyżej, przy czym działanie takie obejmuje traktowanie takich komórek poprzez wprowadzenie do takich komórek jednego lub większej liczby polipeptydów według wynalazku w postaci odpowiedniego wektora przenoszącego taką sekwencję, a wektor ma zdolność wprowadzania takiej sekwencji do tych komórek w taki sposób, że ta sekwencja podlega ekspresji w takich komórkach.
Wykonania powyższej metody modulowania/pośredniczenia w komórkach w aktywności NF-KB lub dowolnej innej wewnątrzkomórkowej aktywności przenoszenia sygnałów, którą moduluję lub w której pośredniczy TRAF2 lub inne cząsteczki, obejmują:
(i) Sposób, w którym takie traktowanie komórki obejmuje wprowadzenie do takich komórek sekwencji DNA kodującej takie białko, jego izoformę, analog, fragment lub pochodną w postaci odpowiedniego wektora przenoszącego taką sekwencję, przy czym wektor ma zdolność wprowadzania takiej sekwencji do komórek w taki sposób, że ta sekwencja podlega ekspresji w takich komórkach.
(ii) Sposób, w którym takie traktowanie komórek polega na transfekcji takich komórek rekombinowanym wirusem zwierzęcym, obejmujący etapy:
a) konstruowania rekombinowanego zwierzęcego wektora wirusowego przenoszącego sekwencję kodującą powierzchniowe białko wirusowe (ligand), które ma zdolność wiązania się ze specyficznymi receptorami na powierzchni komórek, które mają być traktowane i drugą sekwencję, kodującą białko wybrane spośród takiego białka, jego izoform, analogów, fragmentów lub pochodnych według wynalazku, która, kiedy podlega ekspresji w takich komórkach, ma zdolność modulowania/pośredniczenia w aktywności NF-KB lub dowolnej innej wewnątrzkomórkowej aktywności przenoszenia sygnałów, którą moduluje lub w której pośredniczy TRAF2 lub inne cząsteczki; oraz
b) infekowania takich limfocytów takim wektorem z (a).
Podobnie, niniejszym opisano sposób modulowania działania modulującego/pośredniczącego TRAF2 na komórki, obejmujący traktowanie takich komórek przeciwciałami lub ich aktywnymi fragmentami albo pochodnymi według wynalazku, jak opisano powyżej, przy czym traktowanie to odbywa się poprzez zastosowanie wobec komórek odpowiednich kompozycji zawierających takie przeciwciała, ich aktywne fragmenty albo pochodne, a wówczas, gdy białka wiążące się z TRAF2 lub jego części w komórce są eksponowane na zewnętrznej powierzchni, taka kompozycja jest przeznaczona do zastosowania zewnątrzkomórkowego, a kiedy białka wiążące się z TRAF2 są wewnątrzkomórkowe, taka kompozycja jest przeznaczona do zastosowania wewnątrzkomórkowego.
Opisane zostały również sposoby do modulowania modulującego/pośredniczącego działania TRAF2 na komórki obejmujące:
(i) Sposób obejmujący traktowanie takich komórek sekwencją oligonukleotydowąkodującą sekwencję antysensowną w stosunku do co najmniej części sekwencji DNA, kodującej białko wiążące się z TRAF2, przy czym ta sekwencja jest dowolną z powyżej wspomnianych sekwencji, a sekwencja nukleotydowa ma zdolność blokowania ekspresji białek wiążących się z TRAF2.
(ii) Sposób jak w (i) powyżej, w którym tą sekwencję oligonukleotydową wprowadza się takich komórek za pośrednictwem rekombinowanego wirusa, jak opisano powyżej, przy czym druga sekwencja takiego wirusa koduje taką sekwencję oligonukleotydową.
(iii) Sposób obejmujący zastosowanie procedury z użyciem rybozymu, w którym wektor kodujący sekwencję rybozymu zdolnego do oddziaływania z sekwencją komórkowego mRNA kodującego białko wiążące się z TRAF2, jego izoformę, analog, fragment lub pochodną we16
190 709 dług wynalazku, jak opisano powyżej, wprowadza się takich komórek w postaci, która umożliwia ekspresję takiej sekwencji rybozymu w takich komórkach i gdy taka sekwencja rybozymu podlega ekspresji w takich komórkach, oddziałuje ona z sekwencją mRNA w komórce, prowadząc do zahamowania ekspresji białka wiążącego się z TRAF2 w takich komórkach.
Przedmiotem wynalazku jest zatem zastosowanie wektora kodującego sekwencję rybozymu zdolnego do oddziaływania z sekwencją komórkowego mRNA kodującego polipeptyd według wynalazku do wytwarzania kompozycji farmaceutycznej do modulowania działania modulowanego przez/za pośrednictwem TRAF2 na komórki, przy czym kompozycja farmaceutyczna umożliwia wprowadzenie wektora do komórek w postaci powodującej ekspresję takiej sekwencji rybozymu w tych komórkach, następnie jej oddziaływanie z sekwencją mRNA w komórce, co prowadzi do zahamowania ekspresji białka wiążącego się z TRAF2 w tych komórkach.
Należy zauważyć, że we wszystkich powyższych sposobach polipeptydem według wynalazku, jak zaznaczono, może być konkretnie NIK albo co najmniej jedna z izoform, analogów, fragmentów NIK lub jej pochodnych.
Powyższe sposoby i ich wykonania obejmują również sposób zapobiegania lub leczenia stanów patologicznych związanych z indukcją NF-KB lub innymi aktywnościami, w których pośredniczy TRAF2 albo inne cząsteczki do których wiąże się białko, jego izoforma, analog, fragment lub pochodna według wynalazku, przy czym sposób obejmuje podawanie potrzebującym pacjentom skutecznej ilości białka, jego izoformy, analogu, fragmentu lub pochodnej według wynalazku lub kodującej je cząsteczki DNA albo cząsteczki mającej zdolność zaburzania oddziaływania takiego białka, izoformy, analogu, fragmentu lub pochodnej według wynalazku z TRAF2 lub z dowolną inną cząsteczką, do której wiąże się to białko, jego izoforma, analog, fragment lub pochodna. W tym sposobie, takim białkiem według wynalazku podawanym potrzebującym pacjentom może być konkretnie białko kodowane przez klon 10, NIK, izoforma, analog, fragment lub pochodna NIK lub kodująca je cząsteczka DNA. Białko kodowane przez klon 10 działa tak, że hamuje indukcję NF-KB, analogicznie jak inne fragmenty NIK, podczas gdy NIK indukuje aktywację NF-KB.
Tak więc przedmiotem wynalazku jest zastosowanie polipeptydu według wynalazku do zapobiegania albo leczenia stanu patologicznego związanego z indukcją NK-kB albo jakiejkolwiek innej aktywności zachodzącej przez TRAF2 albo inne cząsteczki, z którymi wiąże się polipeptyd według wynalazku. Przedmiotem wynalazku jest również zastosowanie cząsteczki DNA kodującej polipeptyd według wynalazku do zapobiegania albo leczenia stanu patologicznego związanego z indukcją NK-kB albo jakiejkolwiek innej aktywności zachodzącej przez TRAF2 albo inne cząsteczki, z którymi wiąże się polipeptyd według wynalazku. Korzystnie polipeptyd kodowany jest przez klon 10. Również korzystnie polipeptyd jest polipeptydem jest NIK.
Przedmiotem wynalazku jest również kompozycja farmaceutyczna do modulowania działania modulowanego przez/za pośrednictwem TRAF2 na komórki, obejmująca, jako składnik czynny, przynajmniej jeden polipeptyd według wynalazku.
Ponadto przedmiotem wynalazku jest kompozycja farmaceutyczna do modulowania działania modulowanego przez/za pośrednictwem TRAF2 na komórki, obejmująca jako składnik czynny, rekombinowany zwierzęcy wektor wirusowy kodujący białko zdolne do wiązania się z receptorem powierzchniowym komórki i kodujący przynajmniej jeden polipeptyd według wynalazku..
Niniejszym opisana została również kompozycja farmaceutyczna do modulowania działania modulującego/pośredniczącego TRAF2 na komórki, zawierającą jako aktywny składnik sekwencję oligonukleotydową kodującą sekwencję antysensowną w stosunku sekwencji mRNA dla polipeptydu wiążącego się z TRAF2 według wynalazku.
Przedmiotem wynalazku jest również kompozycja farmaceutyczna do zapobiegania albo leczenia stanu patologicznego związanego z indukcją NK-kB albo jakiejkolwiek innej aktywności zachodzącej przez TRAF2 albo inne cząsteczki, z którymi wiąże się polipeptyd według wynalazku, obejmująca skuteczną ilość białka kodowanego przez klon 10 (ID. SEKW.NR: 3). Przedmiotem wynalazku jest również analogiczna kompozycja obejmująca skuteczną ilość cząsteczki DNA kodującej białko kodowane przez klon 10 (ID. SEKW.NR: 3).
190 709
Przedmiotem wynalazku jest również kompozycja farmaceutyczna do zapobiegania albo leczenia stanu patologicznego związanego z indukcją NK-kB albo jakiejkolwiek innej aktywności zachodzącej przez TRAF2 albo inne cząsteczki, z którymi wiąże się polipeptyd według wynalazku, obejmująca skuteczną ilość białka NIK, jego izoformę, fragment, analog lub pochodną. Przedmiotem wynalazku jest również analogiczna kompozycja zawierająca skuteczną ilość cząsteczki DNA kodującej białko NIK, jego izoformę, fragment, analog lub pochodną.
Ponadto przedmiotem wynalazku jest kompozycja farmaceutyczna do zapobiegania albo leczenia stanu patologicznego związanego z indukcją NK-kB albo jakiejkolwiek innej aktywności zachodzącej przez TRAF2 albo inne cząsteczki, z którymi wiąże się białko NIK, jego izoforma, fragment, analog lub pochodna, obejmująca skuteczną ilość białka NIK, jego izoformy, fragmentu, analogu albo pochodnej. Przedmiotem wynalazku jest również analogiczna kompozycja farmaceutyczna obejmująca skuteczną ilość cząsteczki DNA kodującej białko NIK, jego izoformę, fragment, analog albo pochodną. Opisane zostały również kompozycje farmaceutyczne do zapobiegania lub leczenia stanów patologicznych związanych z indukcją NF-KB lub innymi aktywnościami, w których pośredniczy TRAF2 albo inne cząsteczki, do których wiąże się białko NIK, zawierające cząsteczkę zdolną do przeszkadzania w aktywności kinazy białkowej NIK. W tej kompozycji przeszkadzającą cząsteczką może być skuteczna ilość NIK o zmutowanych resztach w miejscu aktywnym, przy czym ta zmutowana NIK służy do przeszkadzania natywnej NIK, a w szczególności aktywności kinazy NIK.
Jednym ze znanych stanów związanych z indukcją NF-KB (nieprawidłową) jest AIDS, innymi są np. choroby autoimmunologiczne, jak również nowotwoty.
Przedmiotem wynalazku jest również sposób identyfikacji i wytwarzania ligandu zdolnego do modulowania aktywności komórkowej, którą moduluje/w której pośredniczy TRAF2, obejmujący: a) poszukiwanie ligandu wykazującego zdolność wiązania się z polipeptydem zawierającym co najmniej część sekwencji TRAF2 o resztach aminokwasowych 222-501 TRAF2; b) identyfikowanie i charakteryzowanie ligandu innego niż TRAF2 albo części receptora z rodziny receptora TNF/NGF, znalezionego w takim etapie poszukiwania jako zdolnego do takiego wiązania; oraz c) wytwarzanie takiego ligandu w postaci zasadniczo wyizolowanej i oczyszczonej.
Przedmiotem wynalazku jest ponadto sposób identyfikacji i wytwarzania ligandu zdolnego do modulowania aktywności komórkowej modulowanej albo w której pośredniczy polipeptyd według wynalazku, przy czym sposób ten obejmuje: a) poszukiwanie ligandu wykazującego zdolność wiązania się z polipeptydem zawierającym co najmniej część sekwencji NIK ID. SEKW. NR: 7; b) identyfikowanie i charakteryzowanie ligandu innego niż TRAF2 albo części receptora z rodziny receptora TNF/NGF, znalezionego w takim etapie poszukiwania jako zdolnego do takiego wiązania; oraz c) wytwarzanie takiego ligandu w postaci zasadniczo wyizolowanej i oczyszczonej.
Przedmiotem wynalazku jest również sposób identyfikacji i wytwarzania ligandu zdolnego do modulowania aktywności komórkowej, którą moduluje/w której pośredniczy NIK, który obejmuje: a) poszukiwanie ligandu wykazującego zdolność wiązania się z polipeptydem zawierającym co najmniej część sekwencji NIK z Id. SEKW.NR: 7; b) identyfikowanie i charakteryzowanie ligandu innego niż TRAF2 albo części receptora z rodziny receptora TNF/NGF, znalezionego w takim etapie poszukiwania jako zdolnego do takiego wiązania; oraz c) wytwarzanie takiego ligandu w postaci zasadniczo wyizolowanej i oczyszczonej.
Przedmiotem wynalazku jest sposób identyfikacji i wytwarzania cząsteczki zdolnej do pośredniego albo bezpośredniego modulowania aktywności komórkowej, którą moduluje/w której pośredniczy NIK, przy czym sposób ten obejmuje: a) poszukiwanie cząsteczki wykazującej zdolność modulowania aktywności komórkowej, którą moduluje/w której pośredniczy NIK; b) identyfikowanie i charakteryzowanie tej cząsteczki; oraz c) wytwarzanie takiej cząsteczki w postaci zasadniczo wyizolowanej i oczyszczonej.
Przedmiotem wynalazku jest też sposób identyfikacji i wytwarzania cząsteczki zdolnej do pośredniego albo bezpośredniego modulowania aktywności komórkowej, którą moduluje/w której pośredniczy polipeptyd według wynalazku, przy czym sposób ten obejmuje: a) poszukiwanie cząsteczki wykazującej zdolność modulowania aktywności komórkowej, którą moduluje/w której pośredniczy polipeptyd określony w zastrz. 1; b) identyfikowanie i charak18
190 709 teryzowanie tej cząsteczki; oraz (c) wytwarzanie takiej cząsteczki w postaci zasadniczo wyizolowanej i oczyszczonej.
Obecny opis zawiera również inne aspekty i wykonania rozwiązań według niniejszego wynalazku, wynikające z następującego szczegółowego opisu wynalazku.
Należy zaznaczyć, że zastosowane tu następujące terminy: medulajjj/pośredmczrnee w działaniu TRAF (lub TRAF2 ) na komórki i dowolna inna taka modulajjα/pośrrdneczemr wspomniane w opisie mają być rozumiane jako obejmujące zarówno działanie in vitro, jak i in vivo, a ponadto obejmują hamowanie lub wzmojneeneo/zweększeneo.
Krótki opis rysunków:
- figura 1 pokazuje diagram ilustrujący strukturę cząsteczki TRAF2
- figura 2 a-b pokazuje schematy ilustrujące pewne białka zaangażowane w aktywację NF-KB, włączając w to nowe białka wiążące się z TRAF według niniejszego wynalazku (np. NIK), w którym:
a) jest schematem azę^o^/ym, a b)j ast s chemctem bardziaj kompletnym;
- figura 3 a-b pokazuje sekwencję nukleotydową na końcu 5' klonu 9 a) i wydedukowaną zakodowaną w niej sekwencję aminokwasową b);
- figura 4 pokazuje sekwencję nukleotydową klonu 10;
- figura 5 a-b pokazuje sekwencję nukleotydową klonu 15 a) i wydedukowaną zakodowaną w niej sekwencję aminokwasową. b);
- figura 6 pokazuje sekwencję nukleotydową i wydedukowaną sekwencję aminokwasową NIK; oraz
- figura 7 pokazuje dopasowanie sekwencji białka NIK do sekwencji mysiej kinazy białkowej mMEKK (mysia MAPK lub Kinaza kinazy ERK) i licznych innych kinaz. Zaznaczone są regiony odpowiadające zakonserwowanym motywom od I do XI w kinazach białkowych.
Szczegółowy opis wynalazku:
Niniejszy wynalazek dotyczy sekwencji DNA kodujących białka zdolne do wiązania się z cząsteczką czynnika związanego z receptorem czynnika martwicy nowotworu (TRAF) i kodowanych przez nie białek.
.'korzystnym wykonaniu niniejszy wynalazek dotyczy sekwencji cDNA, oznaczonych tu jako klon 9, klon 10 i klon 15 (przedstawione, odpowiednio, na fig. 3a, 4 i 5a), które kodują białka zdolne do wiązania się z TRAF2 i białek kodowanych przez te sekwencje DNA.
W dalszym korzystnym wykonaniu wynalazek dotyczy sekwencji DNA kodujących białko NIK oraz samego białka NIK.
DNA i wydedukowane sekwencje aminokwasów opisane powyżej reprezentują nowe sekwencje; nie ma ich w „GENEBANK” lub „PROTREIN BANK”, bazach danych sekwencji DNA lub aminekwasewych.
W zakresie niniejszego wynalazku pozostają również fragmenty wspomnianych powyżej sekwencji DNA i sekwencji DNA zdolnych do hybrydyzacji z tymi sekwencjami dNa lub ich częściami w umiarkowanie ostrych warunkach hybrydyzacji, zakładając, że kodują one aktywne biologicznie białko lub polipeptyd zdolny do wiązania się co najmniej do aminokwasów 222-501 z sekwencji aminokwasowej TRAF2.
Niniejszy wynalazek dotyczy również sekwencji DNA, która jest zdegmerowana w wyniku degeneracji kodu genetycznego w stosunku do sekwencji DNA, która koduje aktywnie biologiczne białko lub pelipeptyd zdolny do wiązania się co najmniej do aminokwasów 222-501 z sekwencji aminokwasowej TRAF2.
Jeśli chodzi o TRAF2, należy zauważyć, że kilku przedstawicieli rodziny receptora TNF/NGF aktywuje transkrypcję czynnika NF-KB poprzez bezpośrednie lub pośrednie połączenie z TRAF2, który jest zatem białkiem adaptorowym dla tych receptorów, a więc może być uważany za modulatora/pośrednika w indukcji aktywacji aktywności NF-KB tych receptorów TNF/NGF (patrz schemat na fig. 2b). Inny receptor, receptor IL-1, aktywuje NF-KB niezależnie od TRAF2. Jednym z korzystnych przykładów białka wiążącego się z TRAF według ninirjszoge wynalazku jest białko NIK, które wiąże się z NIK w bardzo specyficzny sposób i stymuluje aktywność NF-KB. NIK jest kinazą serynewe/treeninową, wykazującą podobieństwo sekwencji z kilkoma kinazami MAPKK (patrz przykłady poniżej). Analogi lub muteiny NIK wytworzone według niniejszego wynalazku (patrz przykłady), którym brak aktyw190 709 ności kinazy, nie stymulują aktywacji NF-KB, jeżeli takie analogi/muteiny są wyrażane w komórkach. Ponadto, takie analogi/muteiny, jeżeli są wyrażone w komórkach, blokują również indukcję NF-KB przez TNF, jak również wiele innych czynników indukujących, takich jak bakteryjna endotoksyna LPS, octan mirystynianu forbolu (aktywator kinazy białkowej C) oraz białko TAK HTLV-1. Indukcja aktywności NF-KB przez TNF odbywa się poprzez jeden z dwóch receptorów TNF (receptor TNF p55 lub p75), a zatem wydaje się, że muteiny/analogi blokują indukcję aktywacji NF-KB poprzez te receptory. Podobnie, ligandy receptorów TNF i FAS/APOl mogą również indukować aktywność NF-KB za pośrednictwem spokrewnionego receptora, receptora FAS/APO1, którego indukcja jest również blokowana przez muteiny/analogi NIK. Co więcej, powyższe receptory mają białka adaptorowe TRADD, RIP i MORT1, które mogą również indukować aktywność NF-KB, ale których indukcja jest również blokowana przez muteiny/analogi NIK. Ponadto, takie muteiny/analogi NIK blokują również indukcję NF-KB przez. IL-1 (działającej za pośrednictwem receptora IL-1). A zatem wygląda na to, że NIK uczestniczy w kaskadzie indukcji NF-KB, która jest wspólna dla receptorów z rodziny TNF/NDG i dla receptora IL-1. NIK wydaje się również działać w sposób bezpośredni przy indukcji aktywacji NF-KB, być może poprzez bezpośrednie zwiększenie fosforylacji I-kB. Z niniejszych obserwacji wynika, że powyższe analogi/muteiny NIK, którym brak aktywności kinazy (zwane również mutantami dominującymi negatywnymi), kiedy są wyrażane w komórkach, nie wpływają w żaden sposób na indukowaną TNF aktywację kinazy Jun, wskazując, że NIK działa specyficznie zwiększając fosforylację I-kB bez wywierania wpływu na kinazę MAP zaangażowaną w fosforylację Jun.
A zatem niniejszy wynalazek dotyczy sekwencji DNA kodujących aktywne biologicznie białka wiążące się z TRAF, np. białka wiążące się z TRAF2, takie jak na przykład NIK, jak również ich analogi, fragmenty lub pochodne oraz kodowane przez nie analogi, fragmenty lub pochodne białek. Wytworzenie takich analogów, fragmentów lub pochodnych odbywa się poprzez standardowe procedury ( patrz, przykładowo, Sambrook i wsp., 1989) dzięki którym z sekwencji kodujących w DNA można usunąć, dodać lub zamienić na inny jeden lub więcej kodonów, z wytworzeniem zakodowanych analogów mających zmienioną co najmniej jedną resztę aminokwasową w stosunku do natywnego białka. Akceptowalnymi analogami są takie, które zachowały co najmniej zdolność do wiązania się z białkami TRAF2, z lub bez wpływu na inne aktywności wiązania lub enzymatyczne, np. analogi, które wiążą się z TRAF2, ale nie przekazują sygnału, tj. nie wiążą się z kolejnym białkiem w kaskadzie lub innym czynnikiem albo nie katalizują reakcji zależnej od sygnału. W ten sposób można wytworzyć analogi, które mają tak zwany efekt dominujący negatywny, a mianowicie, analog, który ma defekt dotyczący bądź wiązania się z TRAF2, bądź następującego po nim przekazania sygnału po zajściu takiego wiązania, jak opisano powyżej. Takie analogi mogą być zastosowane, przykładowo, do hamowania efektów CD40, receptorów TNF p55 i p75, FAS/APOl i innych pokrewnych receptorów, jak również efektów, w których pośredniczą różne białka związane z receptorem (adaptory), jak opisano powyżej, poprzez współzawodniczenie z naturalnymi białkami wiążącymi się z TRAT2. Podobnie, można wytworzyć tak zwane dominujące pozytywne analogi, które służyłyby do wzmacniania efektu TRAF2. Miałyby one takie same lub lepsze właściwości wiązania TRAF2 i takie same albo lepsze własności przekazywania sygnałów od naturalnych białek wiążących się z TRAF2. W analogiczny sposób jak wspomniano powyżej w odniesieniu do otrzymywania analogów, można wytworzyć biologicznie aktywne fragmenty klonów według wynalazku. Odpowiednimi fragmentami sekwencji DNA według wynalazku są takie, które kodują białko lub polipeptyd zachowujący własności wiązania się z TRAF2 lub który może pośredniczyć w dowolnym innym wiązaniu lub aktywności enzymatycznej, jak opisano powyżej. A zatem, można wytworzyć fragmenty zakodowanych białek według wynalazku, które mają efekt dominujący negatywny lub dominujący pozytywny, jak opisano powyżej w odniesieniu do otrzymywania analogów. Podobnie, można wytworzyć pochodne poprzez standardowe modyfikacje grup bocznych jednego lub większej liczby reszt aminokwasowych w białkach, ich analogach lub fragmentach, albo poprzez połączenie białek, ich analogów lub fragmentów z inną cząsteczką np. przeciwciałem, enzymem, receptorem itd., co jest dobrze znane w tej dziedzinie.
190 709
Poza powyższymi sekwencjami DNA według wynalazku, które kodują białko wiążące się z TRAF (np. białko wiążące się z TRAF2, takie jak na przykład NIK), izoformę, analog, fragment lub pochodną, jako wykonanie wynalazku włączone są również sekwencje DNA zdolne do hybrydyzowania z sekwencją cDNA, pochodzącą z regionu kodującego natywnego białka wiążącego się z TRAF, przy czym taką hybrydyzację przeprowadza się w umiarkowanie ostrych warunkach, a zdolne do hybrydyzacji sekwencje DNA kodują aktywne biologicznie białko wiążące się z TRAF. Te zdolne do hybrydyzacji sekwencje DNA obejmują zatem sekwencje DNA, które mają stosunkowo wysoką homologię do sekwencji cDNA natywnych białek wiążących się z TRAF (np. sekwencji cDNA białka wiążącego się z TRAF2, takiego jak na przykład sekwencja cDNA NIK) i jako takie reprezentują sekwencje białek wiążących się z TRAF, którymi mogą być przykładowo, naturalnie występujące sekwencje kodujące różne izoformy białka wiążącego się z TRAF lub naturalnie występujące sekwencje kodujące białka należące do grupy sekwencji kodujących białka podobnego do białek wiążących się z TRAF2, kodujące białko o aktywności białek wiążących się z TRAF (np. białek wiążących się z TRAF2, takich jak, przykładowo, NIK). Ponadto, sekwencje te mogą również, przykładowo, obejmować nie występujące naturalnie, wytworzone syntetycznie sekwencje, które są podobne do sekwencji cDNA natywnych białek wiążących się z TRAF, ale zawierają szereg pożądanych modyfikacji. Takie syntetyczne sekwencje obejmują zatem wszystkie możliwe sekwencje, włączając w to analogi, fragmenty i pochodne białek wiążących się z TRAF (np. białek wiążących się z TRA.F2, takich jak, przykładowo, NIK), przy czym wszystkie mają aktywność białek wiążących się z TRAF1.
W celu otrzymania różnych wspomnianych powyżej, naturalnie występujących sekwencji białka podobnego do białka wiążącego się z TRAF, można zastosować standardowe procedury poszukiwania i izolowania naturalnie występujących DNA lub RNA z próbek różnych tkanek przy zastosowaniu jako sondy naturalnego cDNA białka wiążącego się z TRAF lub jego części (patrz przykładowo, standardowe procedury przedstawione w Sambrook i wsp. 1989).
Podobnie, w celu otrzymania powyżej wspomnianych różnych syntetycznych sekwencji białka podobnego do białka wiążącego się z TRAF (np. do białek wiążących się z TRAF2, takich jak, przykładowo, NIK), można zastosować standardowe procedury, jak przedstawiono szczegółowo poniżej w odniesieniu do wytwarzania takich analogów, fragmentów i pochodnych.
Polipeptyd lub białko „zasadniczo podobne” do białka wiążącego się z TRAF obejmuje nie tylko białko wiążące się z TRAF, ale również polipeptydy lub białka, które są analogami białka wiążącego się z TRAF.
Analogami, które zasadniczo odpowiadają białku wiążącemu się z TRAF są takie polipeptydy, w których jeden lub wiecej aminokwas w sekwencji aminokwasowej białka wiążącego się z TRAF został wymieniony na inny aminokwas, usunięty i/lub wstawiony, przy założeniu, że otrzymane w rezultacie białko wykazuje zasadniczo taką samą lub wyższą aktywność niż białko wiążące się z TRAF, któremu ono odpowiada.
Aby zasadniczo odpowiadać białku wiążącemu się z TRAF, zmiany w sekwencji białek wiążących się z TRAF, takich jak izoformy, są generalnie stosunkowo małe. Jakkolwiek liczba zmian może być większa niż dziesięć, korzystnie jest nie więcej niż dziesięć zmian, korzystniej nie więcej niż pięć, a najkorzystniej nie więcej niż trzy takie zmiany. Jakkolwiek można zastosować dowolną technikę do znalezienia potencjalnych biologicznie aktywnych białek, które zasadniczo odpowiadają białkom wiążącym się z TRAF, jedną z takich technik jest zastosowanie wobec DNA kodującego białko konwencjonalnych technik mutagenezy, uzyskując w rezultacie kilka modyfikacji. Białko wyrażane przez takie klony może być następnie testowane pod kątem zdolności do wiązania się z białkami TRAF (np. TRAF2) i modulowania aktywności białka TRAF (np. TRAF2) dotyczącej modulowania/pośredniczenia w szlakach wewnątrzkomórkowych wspomnianych powyżej.
Zmiany „konserwatywne” są takimi zmianami, które nie powinny zmieniać aktywności białka i są one zwykle testowane w pierwszej kolejności, ponieważ nie powinny zasadniczo zmieniać wielkości, ładunku lub konfiguracji białka, zatem można oczekiwać, że nie będą zmieniać jego właściwości biologicznych.
Konserwatywne podstawienia białek wiążących się z TRAF obejmują analogi, w których co najmniej jedna reszta aminokwasowa w polipeptydzie została konserwatywnie zamie190 709 niona na inny aminokwas. Korzystne jest, jeżeli takie podstawienia są dokonane zgodnie z następującą listą przedstawioną w tabeli IA, które to podstawienia można testować w standardowych doświadczeniach pod kątem uzyskania zmodyfikowanych strukturalnych i funkcjonalnych właściwości syntetyzowanej cząsteczki polipeptydu przy zachowaniu aktywności biologicznej, charakterystycznej dla białka wiążącego się z TRAF
Tabela IA
Wyjściowa reszta
Ala
Arg
Asn
Asp
Cys
Gin
Glu
Gly
His
Ile
Leu
Lys
Met
Phe
Ser
Thr
Trp
Tyr
Val
Przykładowe podstawienie
Gly; Ser Lys
Gin; His
Glu
Ser
Asn
Asp
Ala; Pro
Asn; Gin
Leu; Val
Ile; Val
Arg; Gin; Glu
Leu; Tyr; Ile
Met; Leu; Tyr
Thr
Ser
Tyr
Trp; Phe Ile; Leu
Alternatywnie, inną grupą podstawień w białku wiążącym się z TRAF są takie, w których co najmniej jedna reszta aminokwasowa w polipeptydzie została usunięta i inna reszta wstawiona w jej miejsce zgodnie z tabelą LB. Typy podstawień, których można dokonać w polipeptydzie, mogą opierać się o analizę częstości zmian aminokwasowych między homologicznymi białkami z różnych gatunków, tak jak przedstawiono w tabeli 1-2 w Schulz i wsp., GE., Principies of Protein Structure Springer Verlag, New York, NY, 1798 i figurach 3-9 z Creighton, T.E., Proteins: Structure and Molecular Properties, W.H. Freeman & Co., San Francisco, CA 1983. W oparciu o taką analizę zdefiniowano tu alternatywne konserwatywne podstawienia jako wymiany w obrębie jednej z następujących pięciu grup:
Tabela IB
1. Małe alifatyczne, niepolame lub słabo polarne reszty: A-la, Ser, Thr (Pro, Gly);
2. Polarne ujemnie naładowane reszty i ich amidy: Asp, Asn,Glu, Gin;
3. Polarne dodatnio naładowane reszty: His, Arg, Lys;
4. Duże alifatyczne niepolame reszty: Met, Leu, Ile, Val (Cys); oraz
5. Duże aromatyczne reszty: Phe, Tyr, Trp.
Te trzy reszty aminokwasowe w nawiasach powyżej odgrywają specjalną rolę w architekturze białka. Gly jest jedyną resztą, w której brak łańcucha bocznego, z zatem nadaje łańcuchowi elastyczność. Promuje to jednakże tworzenie struktur drugomędowych innych niż a-helikalne. Pro, z powodu niezwykłej geometrii, mocno więzi łańcuch i generalnie promuje struktury typu zagięcie b, jakkolwiek w niektórych przypadkach Cys ma zdolność uczestniczenia w tworzeniu wiązań dwusiarczkowych, co jest ważne przy fałdowaniu białek. Należy zauważyć, że Schultz i wsp., jak wyżej, łączy pokazane powyżej Grupy 1 i 2. Należy również zauważyć, że Tyr, z powodu potencjału wiążącego jej wodoru, wykazuje znaczące pokrewieństwo z Ser i Thr, itd.
Konserwatywne podstawienia aminokwasowe według wynalazku, np. jak przedstawiono powyżej, są znane w tej dziedzinie i należałoby oczekiwać, że będą zachowywały aktywność biologiczną i właściwości strukturalne polipeptydu po podstawieniu aminokwasowym.
190 709
Większość delecji i podstawień według wynalazku to takie, które nie prowadzą do radykalnych zmian we właściwościach cząsteczki białka lub polipeptydu. Termin „właściwości”, zdefiniowany w sposób nie ograniczający, ma dotyczyć zarówno zmian w strukturze drugorzędowej, np. helisa lub b-kartka, jak i zmian w aktywności biologicznej, np. wiązaniu z białkami TRAF i/lub pośredniczeniu w efektach białek TRAF dotyczących śmierci komórki.
Przykłady wytwarzania podstawień aminokwasowych w białkach, które można wykorzystać do otrzymywania analogów białek wiążących się z TRAF do zastosowania w niniejszym wynalazku, obejmują dowolne znane kroki metodyczne, takie jak przedstawione w patentach USA 33653, 4959314, 4588585 i 4737462 dla Mark i wsp.; 5116943 dla Koths i wsp., 4965195 dla Namen i wsp.; 4879111 dla Chong i wsp.; i 5017691 dla Lee i wsp.; oraz białko z podstawieniem lizynowym przedstawione w patencie USA nr 4904584 (Shaw i wsp.).
Poza konserwatywnymi podstawieniami dyskutowanymi powyżej, które nie zmieniłyby znacząco aktywności białka wiążącego się z TRAF, w zakres wynalazku mają wchodzić bądź konserwatywne podstawienia, bądź mniej konserwatywne i bardziej losowe zmiany, które prowadzą do zwiększenia aktywności biologicznej analogów białek wiążących się z TRAF.
Wówczas, kiedy zajdzie potrzeba potwierdzenia dokładnego efektu podstawienia lub delecji, biegły w tej dziedzinie będzie wiedział, że efekt podstawienia (podstawień), delecji (jednej lub więcej) można oszacować poprzez rutynowe testy wiązania i śmierci komórki. Analiza przy zastosowaniu takich standardowych testów nie wymaga nadmiernego eksperymentowania.
Na poziomie genetycznym, analogi te są generalnie otrzymywane poprzez ukierunkowaną mutagenezę nukleotydów w DNA kodującym białko wiążące się z TRAF, z wytworzeniem tym sposobem DNA kodującego analog, a następnie syntetyzowanie DNA i wyrażenie polipeptydu w hodowli rekombinowanych komórek. Analogi typowo wykazują tą samą lub zwiększoną jakościowo aktywność biologiczną, co białko naturalnie występujące, Ausubel i wsp., Current Protocols in Molecular Biology, Greene Publications and Wiley Interscience, New York, NY, 1987-1995; Sambrook i wsp., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY, 1989.
Wytwarzanie białek wiążących się z TRAF według powyższego lub alternatywnej sekwencji nukleotydowej kodującej ten sam polipeptyd, ale różniącej się od naturalnej sekwencji na skutek zmian dozwolonych ze względu na znany fakt degeneracji kodu genetycznego, można uzyskać poprzez ukierunkowaną mutagenezę DNA, który koduje wcześniej przygotowany analog lub natywną wersję białka wiążącego się z TRAF. Ukierunkowana mutageneza umożliwia wytwarzanie analogów poprzez zastosowanie specyficznych sekwencji oligonukleotydowych, które kodują sekwencję DNA z pożądaną mutacją, 'jak również wystarczającą liczbą sąsiednich nukleotydów, w celu uzyskania sekwencji startera o wystarczających rozmiarach i złożoności sekwencji dla utworzenia stabilnego dupleksu po obu stronach krańców delecji, która jest przekraczana. Typowo, korzystny jest starter o długości około 20 do 25 nukleotydów, z 5 do 10 komplementarnych nukleotydów po obu stronach sekwencji, która jest zmieniana. W ogólności, technika ukierunkowanej mutagenezy jest dobrze znana w tej dziedzinie, czego przykładem jest publikacja taka, jak Adelman i wsp., DNA 2: 183 (1983), włączona tu jako odnośnik literaturowy.
Jak będzie można się zorientować, techniki ukierunkowanej mutagenezy zwykle wykorzystują wektory fagowe, które występują zarówno w formie jednoniciowej, jak i dwuniciowej. Typowe wektory przydatne w ukierunkowanej mutagenezie obejmują wektory takie, jak fag M13, na przykład jak ujawniono w Messing i wsp., Third Cleveland Symposium on Macromolecules and Recombinant DNA, wyd. A. Walton, Elsevier, Amsterdam (1981), włączone tu jako odnośnik literaturowy. Fagi te są łatwo dostępne handlowo, a ich zastosowanie jest ogólnie dobrze znane biegłym w tej dziedzinie. Alternatywnie, w celu otrzymania jednoniciowego DNA można zastosować wektory plazmidowe, które zawierają początek replikacji fagów jednoniciowych (Veira i wsp., Meth. Enzymol. 153: 3, 1987).
W ogólności ukierunkowaną metagenezę zgodnie z powyższym wykonuje się poprzez otrzymanie wyjściowo jednoniciowego wektora, który zawiera w obrębie swojej sekwencji sekwencję dNa kodującą odpowiedni polipeptyd. Starter oligonukleotydowy o pożądanej zmutowanej sekwencji jest wytwarzany syntetycznie poprzez syntezę DNA/oligonukleotydu.
190 709
Starter ten przyłącza się następnie do jednoniciowego wektora zawierającego sekwencję kodującą białko i poddaje działaniu enzymu polimeryzującego, takiego jak fragment Klenowa polimerazy I E. coli w celu dokończenia syntezy nici przenoszącej mutację. W ten sposób zmutowana sekwencja i druga nić przenoszą pożądaną mutację. Taki wektor - heterodupleks używa się następnie do transformacji odpowiednich komórek, takich jak komórki E. coli JM101 i selekcjonuje się klony, które zawierają rekombionowane wektory zawierające zmutowaną sekwencję.
Po wyselekcjonowaniu takiego klonu, zmutowaną sekwencję białka wiążącego się z TRAF można wyciąć i umieścić w odpowiednim wektorze, generalnie w wektorze przenoszącym lub ekspresyjnym takiego typu, który może być zastosowany do transfekcji odpowiedniego gospodarza.
A zatem gen lub kwas nukleinowy kodujący białko wiążące się z TRAF może być również wykrywany, otrzymany i/lub zmodyfikowany in vitro, in situ i/lub in vivo przy zastosowaniu znanych technik powielania DNA, takich jak PCR i chemiczna synteza oligonukleotydów. PCR umożliwia powielanie (zwiększenie liczby) specyficznych sekwencji DNA poprzez powtarzające się reakcje polimerazy DNA. Zastosowanie tej reakcji może zastąpić klonowanie; wszystko co jest potrzebne, to znajomość sekwencji kwasu nukleinowego. W celu przeprowadzenia reakcji PCR projektuje się startery, które są komplementarne do sekwencji będącej przedmiotem zainteresowania. Startery wytwarza się następnie poprzez zautomatyzowaną syntezę DNA. Ponieważ można zaprojektować startery hybrydyzujące z dowolną częścią genu, można stworzyć takie warunki, że niesparowane zasady przy komplementarnym parowaniu mogą być tolerowane. Powielanie takich nie w pełni sparowanych regionów może prowadzić do syntezy zmutowanego produktu, prowadząc w rezultacie do wytworzenia polipeptydu 0 nowych właściwościach (tj. ukierunkowana mutageneza). Patrz również np. Ausubel, jak wyżej, Rozdz. 16. Poprzez powiązanie syntezy komplementarnego DNA (cDNA) przy użyciu odwrotnej transkryptazy z PCR, można zastosować RNA jako materiał wyjściowy do syntezy zewnątrzkomórkowej domeny receptora prolaktyny bez klonowania.
Ponadto można zaprojektować startery PCR w celu dodania nowych miejsc restrykcyjnych lub innych elementów, takich jak kodony terminacyjne na końcach odcinka genu, który ma być powielony. To umieszczenie miejsc restrykcyjnych na końcach 5' i 3' powielanej sekwencji genu umożliwia handlowe przeznaczenie odcinka DNA kodującego białko wiążące się z TRAF lub jego fragment, do ligacji z innymi sekwencjami lub miejscami klonowania w wektorach. .
PCR lub inne metody powielania RNA i/lub DNA są dobrze znane w tej dziedzinie i mogą być zastosowane zgodnie z niniejszym wynalazkiem bez nadmiernego eksperymentowania w oparciu o naukę i wskazówki przedstawione tutaj. Znane metody powielania RNA lub DNA obejmują między innymi reakcję łańcuchową polimerazy (PCR) i pokrewne procesy powielania (patrz np. patent USA Nr 4683195, 4683202, 4800159, 4965188, dla Mullis i wsp.; 4795699 i 4921794 dla Tabor i wsp.; 5142033 dla Innis; 5122464 dla Wilson i wsp. 5091310 dla Innis; 5066584 dla Gyllensten i wsp.; 4889818 dla Gelfii wsp.; 4994370 dla Silver i wsp.; 4766067 dla Biswas; 4656134 dla Ringold; oraz Innis i wsp., wyd., PCR Protocols: A Guide to Method and Applications) oraz powielanie za pośrednictwem RNA, w którym stosuje się antysensowny RNA w stosunku do sekwencji docelowej jako matrycę do syntezy dwuniciowego DNA (patent USA Nr 5130238 dla Małek i wsp., z nazwą handlową NASBA) oraz immuno-PCR, który łączy powielanie DNA ze znakowaniem przeciwciałem (Ruzicka i wsp., Science 260:487 (1993); Sano i wsp., Science 58:120 (1992); Sano i wsp., Biotechniques 9:1378 (1991)), przy czym cała zawartość patentów i odnośników literaturowych jest tu w całości włączona jako odniesienie.
W analogiczny sposób można otrzymać biologicznie aktywne fragmenty białek wiążących się z TRAF (np. dowolnego z białek wiążącego się z TRAF2, takiego jak np. NIK) lub ich izoform), jak opisano powyżej w odniesieniu do analogów białek wiążących się z TRAF. Odpowiednimi fragmentami białek wiążących się z TRAF są takie, które zachowują właściwości białek wiążących się z TRAF i które pośredniczą w aktywności biologicznej białek TRAF lub innych białek związanych z białkami TRAF bezpośrednio lub pośrednio. A zatem można wytworzyć fragmenty białek wiążących się z TRAF, które mają efekt dominujący ne24
190 709 gatywny lub dominujący pozytywny, jak opisano powyżej w odniesieniu do analogów. Należy zauważyć, że te fragmenty reprezentują specjalną klasę analogów według wynalazku, a mianowicie są określonymi częściami białek wiążących się z TRAF, pochodzącymi z pełnej sekwencji białka wiążącego się z TRAF (np. z dowolnego z białek wiążących się z TRAF2, takiego jak np. NIK lub jego izoformy), przy czym każda część lub fragment ma określone powyżej pożądane właściwości. Takim fragmentem może być np. peptyd.
Podobnie, można wytworzyć pochodne poprzez standardowe modyfikacje grup bocznych jednej lub większej liczby reszt aminokwasowych białka wiążącego się z TRAF, jego analogów lub fragmentów, albo poprzez połączenie białka wiążącego się z TR.AF, jego analogu lub fragmentu z inną cząsteczką np. przeciwciałem, enzymem, receptorem itd., co jest dobrze znane w tej dziedzinie. A zatem, stosowany tu termin „pochodne” obejmuje pochodne, które mogą być wytwarzane z grup funkcyjnych, które występują jako łańcuchy boczne reszt aminokwasowych lub grup funkcyjnych N- lub C-końcowych, sposobami znanymi w tej dziedzinie i są one objęte wynalazkiem. Pochodne mogą mieć ugrupowania chemiczne, takie jak reszty węglowodanowe lub fosforanowe, przy założeniu, że mają one tą samą lub wyższą aktywność biologiczną co białka wiążące się z TRA.F.
Przykładowo, pochodne mogą obejmować estry alifatyczne grup karboksylowych, amidy grup karboksylowych poprzez reakcję z amoniakiem lub pierwszorzędowymi albo drugorzędowymi aminami, pochodne N-acylowe lub wolne grupy aminowe reszt aminokwasowych utworzone z grupą acylową (np. grupami alkonoilowymi lub karbocykloaroilowymi) lub pochodne O-acylowe wolnych grup hydroksylowych (przykładowo dla reszt serylowych lub treonylowych) utworzone z resztami acylowymi.
Termin „pochodne” ma obejmować jedynie te pochodne, które nie zmieniają jednego aminokwasu w inny spośród dwudziestu występujących powszechnie naturalnych aminokwasów.
Białko wiążące się z TRAF jest białkiem lub polipeptydem, tj. sekwencją reszt aminokwasowych. Polipeptyd składający się z dłuższej sekwencji, która zawiera całą sekwencję białka wiążącego się z TRAF, według przedstawionej definicji ma być zaliczana jako taki polipeptyd, o ile dodatki nie wpływają na podstawowe i nowe właściwości według wynalazku, tj. jeżeli bądź zachowują, bądź zwiększają aktywność biologiczną białka wiążącego się z TRAF lub mogą być odcinane z uwolnieniem białka lub polipeptydu, mającego aktywność biologiczną białka wiążącego się z TRAF. A zatem, przykładowo, niniejszy wynalazek ma obejmować fuzje białka wiążącego się z TRAF z innymi aminokwasami lub polipeptydami.
Jak wspomniano powyżej, należy rozumieć, że powyższymi białkami „wiążącymi się z TRAF” są dowolne białka, które mogą wiązać się i pośredniczyć/modulować aktywność dowolnego białka TRAF wewnątrzkomórkowo. Konkretnymi przykładami są białka wiążące się z TRAF2, które mogą modulować lub pośredniczyć w związanej z TRAF2 aktywności wewnątrzkomórkowego przekazywania sygnałów, jak wspomniano powyżej, w szczególności w odniesieniu do udziału TRAF2 w indukowaniu aktywności NF-KB, w szczególności po interakcji pomiędzy TRAF2 i różnymi przedstawicielami rodziny receptora TNF/NGF i/lub związanych z nimi białkami adapterowymi, jak opisano szczegółowo powyżej i poniżej. Konkretnym przykładem takiego białka wiążącego się z TRAF2 jest białko NIK i jego różne analogi, fragmenty itp. (patrz przykłady), które wydają się wiązać z TRAF2 bardzo specyficznie i mieć bezpośredni udział w indukowaniu aktywności NF-KB, z różnymi dominującymi negatywnymi analogami/muteinami blokującymi tą aktywność.
Wspomniane powyżej modyfikacje pozostają w zakresie wynalazku o ile zachowują zdolność zakodowanych białek lub polipeptydów albo ich analogów i pochodnych do wiązania się co najmniej do aminokwasów 222-501 w sekwencji aminokwasowej TRAF2.
Wszystkie białka i polipeptydy według wynalazku dzięki swojej zdolności do wiązania się z TRAF2 są uważane za pośredniki lub modulatory w przekazywaniu sygnałów przez TRAF2. Jako takie, te cząsteczki DNA według wynalazku odgrywają rolę na przykład w procesach przekazywania sygnałów, w których wiązanie się ligandu TRAF2 do CD30, CD40, receptora limfokiny beta (LT-β), receptorów p55 lub p75, jak również innych receptorów lub białek adapterowych wspomnianych powyżej, prowadzi do aktywacji czynnika transkrypcyjnego NF-KB. Szczególnie interesujące jest białko NIK i niepełne białko NIK kodowane przez klon 10 według wynalazku; szczegółowa analiza sekwencji NIK i białka kodowanego przez
190 709 klon 10 (wyjściowo nazwanego NMPI) ujawniła zakodowaną sekwencję aminokwasową odpowiadającą konserwowanym motywom I - XI charakterystycznym dla kinaz białkowych Ser/Thr, przypisując w ten sposób funkcję temu białku.
Nowe klony, białka, ich analogi, fragmenty i pochodne mają pewną ilość potencjalnych zastosowań, na przykład:
(i) Mogą być użyte do imitowania lub wzmagania aktywności NF-KB, funkcji TRAF2 i receptorów do których się wiążą, w sytuacjach, w których pożądane jest wzmożone działanie, takich jak zastosowania przeciwnowotworowe lub immunostymulujące, gdzie są pożądane efekty indukowane przez TRAF2. W tym przypadku białka według wynalazku, ich analogi, fragmenty lub pochodne, które wzmagają efekty TRAF2 lub receptorów mogą być wprowadzone do komórek za pomocą standardowych znanych procedur. Przykładowo, ponieważ białka kodowane przez klony DNA według wynalazku są wewnątrzkomórkowe i powinny być wprowadzane tylko do komórek, w których efekt TRAF2 jest pożądany, niezbędny jest system dla specyficznego wprowadzania tych białek do komórki. Jednym ze sposobów dokonania tego jest stworzenie rekombinowanego wirusa zwierzęcego np. pochodzącego od wirusa krowianki, do DNA którego będą wprowadzone dwa z następujących genów: gen, który koduje ligand wiążący się z powierzchniowymi białkami komórki, specyficznie wyrażanymi przez komórki np. taki, jak białko gpl20 wirusa AIDS (HIV), które wiąże się specyficznie do pewnych komórek (limfocyty CD4 i pokrewne białaczki) lub dowolny inny ligand wiążący się specyficznie z pewnymi komórkami niosącymi receptor, który wiąże się z TRAF2, tak by rekombinowany wektor wirusowy był zdolny do wiązania się do takich komórek; i gen kodujący białka według wynalazku. Tak więc ekspresja białka wiążącego się z powierzchnią komórki na powierzchni wirusa naprowadzi wirus specyficznie na komórkę nowotworu lub inną komórkę niosącą receptor, po czym sekwencje kodujące białka będą wprowadzone do komórek za pomocą wirusa i po ekspresji w komórkach spowodują wzmocnienie efektu receptora lub TRAF2, prowadząc do pożądanego efektu immunostymulującego w tych komórkach. Konstrukcji takiego rekombinowanego wirusa zwierzęcego dokonuje się za pomocą standardowych procedur (Sambrook i wsp., 1989). Inną możliwością jest wprowadzenie sekwencji kodowanych białek w postaci oligonukleotydów, które mogą być absorbowane przez te komórki i w nich wyrażane.
(ii) Mogą być one stosowane do hamowania aktywności NF-KB, efektów TRAF2 lub receptora, który go wiąże np. w takich przypadkach, jak niszczenie tkanek w AIDS, szoku septycznym lub odrzucaniu przeszczep-przeciw gospodarzowi, w którym pożądane jest blokowanie indukowanego wewnątrzkomórkowego przekazywania sygnałów. W tej sytuacji jest możliwe, przykładowo, wprowadzenie do komórek za pomocą standardowych procedur oligonukleotydów mających antysensowną sekwencję kodującą dla białek według wynalazku, które by skutecznie blokowały translację mRNA kodujących białka i w ten sposób blokowały ich ekspresję i powodowały hamowanie niepożądanego efektu. Alternatywnie, można stosować inne oligonukleotydy - oligonukleotydy, które zachowują swoją zdolność do wiązania się z TRAF2 w taki sposób, że przeszkadzają w wiązaniu się innych cząsteczek do tego białka, a jednocześnie nie pośredniczą w żadnej aktywacji lub modulacji tej cząsteczki. Mając te cechy, cząsteczki te mogą rozbijać interakcję TRAF2 z jego naturalnym ligandem, działają zatem jako inhibitory zdolne do zaburzania efektów, w których pośredniczy TRAF2, takich jak na przykład aktywacja NF-KB. Takie oligonukleotydy mogą być wprowadzane do komórek przy zastosowaniu powyższego podejścia ze rekombinowanym wirusem, przy czym drugą sekwencją niesioną przez wirus jest sekwencja oligonukleotydu.
Inną możliwością jest stosowanie przeciwciał swoistych wobec białek według wynalazku do hamowania ich wewnątrzkomórkowej aktywności przekazywania sygnałów.
Jeszcze innym sposobem hamowania niepożądanego efektu jest niedawno opracowane podejście z rybozymami. Rybozymy są katalitycznymi cząsteczkami RNA, które specyficznie tną RNA. Rybozymy mogą być poddane manipulacjom tak, aby przecinały docelowe cząsteczki wybranego RNA, np. mRNA kodujące białka według wynalazku. Takie rybozymy miałyby sekwencję specyficzną dla mRNA białek i byłyby zdolne do oddziaływania z nim (wiązanie komplementarne) po czym nastąpiłoby cięcie mRNA, co powodowałoby obniżenie (lub całkowitą utratę) ekspresji tego białka, przy czym poziom obniżonej ekspresji zależałby
190 709 od poziomu ekspresji rybozymu w komórce docelowej. Aby wprowadzić rybozymy do wybranych komórek (np. niosących białka wiążące się z TRAF2) można stosować jakikolwiek odpowiedni wektor, np. plazmid, wirusowe wektory zwierzęce (retrowirus), które są normalnie stosowane w tym celu (patrz też (i), powyżej gdzie wirus ma, jako drugą sekwencję, cDNA kodujący wybraną sekwencję rybozymu). (Dla przeglądu, metod itp. dotyczących rybozymów patrz Chen i wsp., 1992; Zhao i Pick, 1993).
(iii) Mogą być one stosowane do izolacji, identyfikowania i klonowania innych białek, które są zdolne do wiązania się z nimi, np. innych białek związanych z procesem wewnątrzkomórkowego przekazywania sygnału, które działają poniżej TRAF2. Na przykład sekwencje DNA kodujące białka według wynalazku mogą być zastosowane w systemie dwuhybrydowym, w którym zakodowane białka będą stosowane jako przynęta do izolacji, klonowania i identyfikowania w bibliotekach cDNA lub genomowych innych sekwencji („ofiar”) kodujących białka, które mogą wiązać się z białkami klonów. W ten sam sposób też określić, czy białka według niniejszego wynalazku mogą wiązać się z innymi białkami komórkowymi, np. innymi receptorami nadrodziny receptorów TNF/TGF.
(iv) Kodowane białka, ich analogi, fragmenty lub pochodne mogą być też stosowane do izolacji, identyfikacji i klonowania innych białek z tej samej klasy tzn. wiążących się z TRAF2 lub funkcjonalnie pokrewnymi białkami i związanych z wewnątrzkomórkowym procesem przekazywania sygnałów. W tym zastosowaniu może być stosowany wymieniony powyżej system dwuhybrydowy drożdży, albo może być stosowany niedawno opracowany system z zastosowaniem hybrydyzacji Southema w warunkach łagodnych, a następnie klonowanie za pomocą PCR (Wilksiwsp., 1989).
(v) Jeszcze innym podejściem do użycia zakodowanych białek według wynalazku, ich analogów, fragmentów lub pochodnych jest ich stosowanie w metodach chromatografii powinowactwa w celu izolowania i identyfikowania innych białek lub czynników, do których wiązania są one zdolne, np. białek pokrewnych względem TRAF2 lub innych białek lub czynników biorących udział w wewnątrzkomórkowym procesie przekazywania sygnałów. W tym zastosowaniu, białka, ich analogi, fragmenty i pochodne według niniejszego wynalazku można indywidualnie przyłączać do podłoża do chromatografii powinowactwa i następnie doprowadzać do kontaktu z ekstraktami komórkowymi lub izolowanymi białkami lub czynnikami, które podejrzewa się o udział w wewnątrzkomórkowym procesie przekazywania sygnałów. Po zastosowaniu procedury chromatografii powinowactwa, inne białka lub czynniki, które wiążą się z białkami, ich analogami, fragmentami lub pochodnymi według wynalazku mogą być wymywane, izolowane i charakteryzowane.
(vi) Jak odnotowano powyżej, białka, ich analogi, fragmenty lub pochodne według wynalazku mogą być stosowane jako immunogeny (antygeny) do wytwarzania swoistych wobec nich przeciwciał. Te przeciwciała mogą być także stosowane w celu oczyszczania białek według wynalazku bądź z ekstraktów komórkowych, bądź z wytwarzających je, ich analogi lub fragmenty linii komórkowych. Co więcej, przeciwciała te mogą być stosowane w celach diagnostycznych do identyfikacji chorób związanych z nienormalnym działaniem systemu receptorowego, w którym działają, na przykład nadmiernie czynnymi lub niedostatecznie czynnymi efektami komórkowymi indukowanymi przez TRAF2. Tak więc o ile te zaburzenia będą związane ze źle działającym wewnątrzkomórkowym systemem przekazywania sygnałów, w którym uczestniczą białka według wynalazku, takie przeciwciała byłyby ważnym narzędziem diagnostycznym.
Określenie „przeciwciało” ma obejmować poliklonalne przeciwciała, monoklonalne przeciwciała (mAbs), hybrydowe przeciwciała, przeciwciała anty-idiotypowe (anty-Id) wobec przeciwciał, które mogą być wyznakowane w postaci rozpuszczalnej lub związanej, jak również ich fragmenty, takie jak na przykład fragmenty Fab i F(ab')2 pozbawione fragmentu Fc nienaruszonego przeciwciała, które są zdolne do wiązania antygenu.
(vii) Przeciwciała, włączając w to fragmenty przeciwciał, użyteczne w niniejszym wynalazku mogą być stosowane do ilościowego lub jakościowego wykrywania klonów według wynalazku w próbce, lub do wykrywania obecności komórek, które wyrażają klony według niniejszego wynalazku. Może to być osiągnięte przez techniki immunofluorescencji przy za190 709 stosowaniu fluorescencyjnie wyznakowanego przeciwciała w połączeniu z detekcją za pomocą mikroskopu świetlnego, cytometrii przepływowej lub fluorometrii.
Przeciwciała (lub ich fragmenty) przydatne w niniejszym wynalazku mogą być użyte histologicznie, jak w mikroskopii immunofluorescencyjnej lub immunoelektronowej, do wykrywania in situ klonów według niniejszego wynalazku. Detekcję in situ można przeprowadzić poprzez pobranie próbki histologicznej od pacjenta i dostarczenie wyznakowanego przeciwciała według niniejszego wynalazku do takiej próbki. Korzystne jest dostarczenie przeciwciała (lub fragmentu) poprzez zastosowanie lub nałożenie znakowanego przeciwciała (lub fragmentu) na próbkę biologiczną. Poprzez użycie takiej procedury jest możliwe stwierdzenie nie tylko obecności klonów, ale także jego dystrybucji w badanej tkance. Stosując niniejszy wynalazek osoby o przeciętnych umiejętnościach łatwo zauważą, że każda z szerokiego zakresu metod histologicznych (takich jak procedury barwienia) może być zmodyfikowana tak, aby uzyskać taką detekcję in situ.
Takie testy dla klonów według niniejszego wynalazku typowo obejmują inkubację próbki biologicznej, takiej jak płyn biologiczny, ekstrakt z tkanki, świeżo zebrane komórki, takie jak limfocyty lub leukocyty, lub komórki, które były inkubowane w hodowli tkankowej, w obecności wyznakowanego w sposób wykrywalny przeciwciała, zdolnego do identyfikowania zakodowanych białek i wykrywanie przeciwciała za pomocą dowolnej z wielu technik dobrze znanych w tej dziedzinie.
(viii) Zakodzwane białka aaedług wyna lazku mogą być labżć /aistosoaatme jaa« po.średnie modulatory dla licznych innych białek ze względu na swą zdolność wiązania się do innych wewnątrzkomórkowych białek lub wewnątrzkomórkowej domeny białka transmembranowego.
Dla celu modulacji tych innych białek wewnątrzkomórkowych lub wewnątrzkomórkowych domen białek transmembranowych, białka według wynalazku mogą być wprowadzane do komórek przy zastosowaniu szeregu sposobów wspomnianych powyżej w (ii).
Należy także zauważyć, że izolacja, identyfikacja i charakteryzacja białek według wynalazku może być przeprowadzona przy zastosowaniu dowolnej z dobrze znanych procedur poszukiwań. Na przykład, jedna z tych procedur poszukiwań, drożdżowa procedura dwnhżbrydowa, była stosowana do identyfikacji białek według wynalazku. Podobnie, można zastosować inne procedury, na przykład chromatografię powinowactwa, procedury hybrydyzacji DNA itp. dobrze znane w tej dziedzinie, aby wyizolować, zidentyfikować i scharakteryzować dodatkowe białka, czynniki, receptory itp., które są zdolne do wiązania się z białkami według wynalazku.
Co więcej, białka, dla których stwierdzono, że wiążą się z białkami według wynalazku, mogą być same wykorzystane w sposób analogiczny do sposobu, w którym białka według wynalazku były użyte, jak opisano powyżej i poniżej do izolowania, identyfikacji i charakteryzowania innych białek, czynników itp., które są zdolne do wiązania się z białkami wiążącymi się do białek według wynalazku i które mogą reprezentować czynniki biorące udział poniżej w związanym z nimi procesie przekazywania sygnałów lub które mogą mieć aktywności przekazywania sygnałów i reprezentują zatem białka zaangażowane w odrębny proces przekazywania sygnałów.
Sekwencje DNA i kodowane białka według wynalazku mogą być wytwarzane za pomocą dowolnej standardowej procedury rekombinowania DNA (patrz na przykład Sambrook i wsp., 1989), w której odpowiednie eukariotyczne lub prokariotyczne komórki gospodarza są transformowane przez odpowiednie eukariotyczne lub prokariotyczne wektory zawierające sekwencje kodujące białka. Tak więc niniejszy wynalazek dotyczy także takich wektorów ekspresyjnych i stransformowanych gospodarzy do wytwarzania białek według wynalazku. Jak wspomniano powyżej, te białka obejmują także ich biologiczne czynne analogi, fragmenty i pochodne, a zatem kodujące je wektory obejmują także wektory kodujące analogi i fragmenty. Pochodne tych białek są pochodnymi otrzymywanymi za pomocą standardowych modyfikacji białek lub ich analogów lub fragmentów, wytwarzanymi przez stransformowanych gospodarzy.
Niniejszy wynalazek także dotyczy kompozycji farmaceutycznych do modulowania efektów, w których pośredniczy TRAF2. Kompozycje farmaceutyczne obejmująjako składnik czynny, dowolny jeden lub więcej z następujących: (i) jedną lub więcej z sekwencji DNA według wynalazku, lub ich części, subklonowane do odpowiedniego wektora ekspresyjnego; (ii)
190 709 białko według wynalazku, jego fragment biologicznie czynny, analog lub pochodną lub ich mieszanina; (iii) rekombinowany wirus zwierzęcy, kodujący białko według wynalazku, jego biologicznie czynne fragmenty, analogi lub pochodne.
Kompozycje farmaceutyczne stosuje się w zależności od choroby, która ma być leczona i w ilościach korzystnych dla pacjenta, w zależności od masy ciała i innych względów, ustalonych przez lekarza.
Jak zauważono powyżej, jedną ze specyficznych postaci białek wiążących się z TRAF2 według niniejszego wynalazku jest wiążące się z TRAF2 białko NIK. Biorąc pod uwagę odkrycie, zgodnie z niniejszym wynalazkiem, że NIK wiąże się specyficznie z TRAF2 i jako taki jest mediatorem/modulatorem TRAF2 i może więc pośredniczyć/modulować aktywność TRAF2 w aktywacji NF-KB i stąd jego możliwa rola w szlakach przeżywania limfocytów takich, w których TRAF2 działa niezależnie lub wraz z innymi białkami (np. receptory p55 TNF i p75 TNF, receptor FAS/APO1, MORT1, RIP i TRADD), ważne jest projektowanie leków; które mogą wzmagać lub hamować interakcję TRAF2-MK, zależnie od potrzeby. Przykładowo, gdy jest pożądane zwiększenie cytotoksyczności komórek indukowanej przez TNF, byłoby pożądane hamowanie indukcji NF-KB przez hamowanie interakcji TRAF2-NIK lub przez hamowanie samego TRAF2 i/lub NIK. Podobnie, na przykład, gdy jest pożądane hamowanie cytotoksyczności komórek indukowanej przez TNF, byłoby pożądane zwiększenie indukcji NF-KB przez zwiększenie interakcji TRAF2-NIK lub przez zwiększenie specyficznej dla TRAF2 i/lub NIK indukcji NF-KB. Istnieje wiele chorób, w których takie leki mogą być bardzo pomocne. Między innymi (patrz również powyższa dyskusja) ostre zapalenie wątroby, w którym poważne uszkodzenie wątroby wydaje się być odbiciem śmierci komórek, w której pośredniczy receptor FAS/APOl komórek wątroby po indukowaniu przez ligand Fas; śmierć komórek indukowana autoimmunologicznie, taka jak śmierć limfocytów B Langerhansa trzustki, która powoduje cukrzycę; śmierć komórek przy odrzucaniu przeszczepów (np. nerki, serca i wątroby); śmierć oligodendrocytów w mózgu w stwardnieniu rozsianym i hamowane przez AIDS samobójstwa limfocytów T, które powoduje proliferację wirusa AIDS i w efekcie chorobę AIDS.
W takich przypadkach byłoby pożądane zahamowanie szlaku cytotoksyczności (apoptozy), w której bierze udział receptor FAS/APOl i zwiększenie indukcji NF-KB, w której pośredniczy receptor FAS/APO1, z udziałem TRAF2 i interakcji TRAF2-NIK. Jednym ze sposobów dokonania tego byłoby zwiększenie ilości TRAF2 i NIK tak, aby indukcja aktywacji NF-KB, w której biorą udział NIK lub TRAF2-NIK zwiększyła się, dając większy poziom aktywacji NF-KB, a więc i przeżywalności komórek, lub tak, że bezpośrednie lub pośrednie oddziaływanie między receptorem FAS/APOl i TRAF2 (lub TRAF2-NIK) będzie zwiększone powodując zmniejszenie interakcji receptora FAS/APOl z mediatorami cytotoksyczności komórkowej (np. MACH, patrz schemat na fig. 2b) aby uzyskać zwiększenie indukcji aktywacji NF-KB i przeżywania komórek.
Przeciwnie, w przypadku na przykład guzów i komórek zakażonych (patrz także dyskusja powyżej) byłoby pożądane zwiększenie cytotoksyczności, w której pośredniczy receptor FAS/APO1, aby spowodować wzmożoną śmierć komórek. W tym przypadku byłoby pożądane hamowanie interakcji receptor FAS/APOl-TRAF2 (lub TRAF2-NIK) i/lub bezpośrednie hamowanie NIK i ten zmniejszając w ten sposób indukcję aktywności NF-KB.
Jest możliwe, że NIK łub jedna albo więcej z jej możliwych izoform, analogów lub fragmentów mogą posłużyć, jako „naturalne” inhibitory samego NIK lub interakcji NIK-TRAF2 i jako takie działać jako inhibitory indukcji aktywacji NF-KB. Takie inhibitory mogą być więc stosowane jako specyficzne inhibitory opisane powyżej, na przykład te inhibitory mogą być stosowane, gdy jest pożądane zwiększenie cytotoksycznych efektów TNF lub ligandu receptora FAS/APO1, aby zwiększyć śmierć komórek. Faktycznie, jak przedstawiono w przykładach poniżej, wyizolowano różne analogi i muteiny NIK zgodnie z niniejszym wynalazkiem, które są analogami/muteinami pozbawionymi aktywności kinazy i które są zdolne do blokowania indukcji aktywacji NF-KB, w której pośredniczą receptory TNF, receptor FAS/APOl, związane z nimi białka TRADD, RIP i MORT1; jak i tej, w której pośredniczy receptor IL-1 (którego aktywacja zachodzi poprzez NIK, ale jest niezależna od TRAF2) i w której pośredniczą także endotoksyna LPS, octan mirystylanu forbolu i białko H.TI.Y-1 TAX. Podobnie, inne substan190 709 cje, takie jak peptydy, związki organiczne, przeciwciała itp. mogą też być testowane w celu uzyskania specyficznych leków, które są zdolne do hamowania interakcji TRAF2-NIK lub aktywności NIK.
W podobny sposób, gdy jest pożądane zwiększenie aktywacji NF-KB w różnych sytuacjach, jak opisano powyżej, jest na przykład możliwe zwiększenie ilości NIK i/lub TRAF2 w komórkach za pomocą różnych standardowych metod, opisanych tu powyżej (np. wprowadzania DNA kodującego NIK i/lub TRAF2 do komórek w celu indukowania wzmożonej ekspresji lub przygotowania odpowiednich kompozycji zawierających NIK i/lub TRAF2 do bezpośredniego wprowadzania do komórek, lub dowolnego innego sposobu znanego osobom biegłym w dziedzinie). Podobnie, inne substancje, takie jak peptydy, związki organiczne itp. mogą być testowane w celu uzyskania specyficznych leków, które są zdolne do hamowania aktywności NIK lub wzmagania oddziaływania TRAF2-NIK.
Nie ograniczający przykład na to, jak inhibitory peptydowe odziaływania NDC-TRAF2 byłyby projektowane i testowane, jest oparty na uprzednich badaniach nad peptydowymi inhibitorami ICE lub proteaz ICE-podobnych, specyficznością substratową ICE i strategiami analizy epitopów przy zastosowaniu syntezy peptydów. Minimalnym wymaganiem dla skutecznego cięcia peptydu przez ICE okazały się być cztery aminokwasy na lewo od miejsca cięcia, z silną preferencją w stosunku do kwasu asparaginowego w pozycji Pi i z metyloaminą wystarczającą na prawo od pozycji Pi (Sleath i wsp., 1990; Howard i wsp., 1991; Thomberry i wsp., 1992). Co więcej, substrat fluorogenny (tetrapeptyd) acetylo-Asp-Glu-Val-Asp-a-(4-metylokumarylo-7-amid), oznaczony w skrócie Ac-DEVD-AMC, odpowiada sekwencji w polimerazie poli (ADP-rybozy)(PARP), która, jak stwierdzono, jest przecinana w komórkach wkrótce po stymulacji FAS-R, jak również w innych procesach apoptotycznych (Kaufmann, 1989; Kaufmann i wsp., 1993; Lazebnik i wsp., 1994) i jest wydajnie przecinana przez CPP32 (przedstawiciel rodziny proteaz CED3/ICE) i proteazy MACH.
Ponieważ Asp w pozycji Pi substratu wydaje się być ważny, tetrapeptydy mające Asp jako czwartą resztę aminokwasową i różne kombinacje aminokwasów w pozycjach pierwszych trzech reszt mogą być szybko testowane pod kątem wiązania do aktywnego miejsca dla proteaz, stosując na przykład metodę opracowaną przez Geysena (Geysen, 1985; Geysen i wsp., 1987), gdzie duża ilość peptydów na stałych nośnikach była testowana pod kątem specyficznych interakcji z przeciwciałami. Wiązanie proteaz MACH do specyficznych peptydów może być wykryte za pomocą różnych dobrze znanych metod detekcji, leżących w zakresie umiejętności specjalistów, w tym znakowania radioaktywnego itp. Wykazano, że tą metodą Geysena można testować co najmniej 4000 peptydów w każdy dzień roboczy.
W podobny sposób można oznaczyć dokładne miejsce wiązania lub obszar homologii, która określa interakcję między TRAF2 i NIK (lub dowolnym innym białkiem TRAF i białkiem wiążącym się z TRAF) i wówczas można testować peptydy, które mogą posłużyć do blokowania tej interakcji, np. zsyntetyzowane peptydy mające sekwencję podobną do regionu wiązania lub komplementarną do niego, która może współzawodniczyć z naturalną NIK (lub białkiem wiążącym się z TRAF) o wiązanie się z TRAF2 (lub TRAF).
Ponieważ może być korzystne projektowanie inhibitorów peptydowych, które wybiórczo hamują oddziaływania TRAF2-NIK (lub TRAF-białko wiążące się z TRAF), bez negatywnego wpływu na procesy fizjologicznej śmierci komórki, w których biorą udział inni przedstawiciele wewnątrzkomórkowego szlaku przekazywania sygnału, np. proteazy MACH szlaku śmierci komórki, które są przedstawicielami rodziny proteaz CED3/ICE, pula peptydów wiążących się z TRAF2 (lub TRAF) lub NIK (lub białka wiążącego się z TRAF) w teście takim, jak opisane powyżej, może być dalej zsyntetyzowana jako fluorogenny substrat peptyd do testowania pod kątem selektywnego wiązania do takich innych białek w celu wybrania tylko specyficznych dla TRAF2/NIK (lub TRAF/białko wiążące się z TRAF). Peptydy, co do których stwierdzono, że są specyficzne w stosunku do, na przykład, TRAF2-NIK, mogą następnie być modyfikowane, aby wzmagać przepuszczalność komórek i hamować aktywność TRAF i/lub NIK bądź odwracalnie, bądź nieodwracalnie. Thornberry i wsp. (1994) donieśli, że tetrapeptyd (acyloksy)metyloketon Ac-Tyr-Val-Ala-Asp-CI ĘOC (O)-[2,6-(CFa)2]Ph był silnym inaktywatorem ICE. Podobnie, Milligan i wsp. (1995) donieśli, że inhibitory tetrapeptydowe mające grupy chlorometyloketonowe (nieodwracalnie) lub aldehydowe (odwracalnie)
190 709 hamowały ICE. Dodatkowo, wykazano, że benzyloksykarboksylo-Asp-CF^OC (O)-2,6-dichlorobenzen (DCB) hamuje ICE (Mashima i wsp. 1995). Tak więc, w analogiczny sposób tetrapeptydy, które mogą się selektywnie wiązać na przykład do TRAF2 lub NIK, mogą być modyfikowane na przykład przy użyciu grupy aldehydowej, chlorometyloketonu, acyloksymetyloketonu lub grupy CH2OC (O)-DCB aby stworzyć inhibitor peptydowy aktywności TRAF2-NIK. Co więcej, aby polepszyć przepuszczalność, peptydy mogą na przykład być modyfikowane chemicznie lub podstawione tak, aby zwiększyć ich przepuszczalność przez błonę komórkową i ułatwić transport takich peptydów przez błonę i do cytoplazmy. Muranichi i wsp. (1991) opisali podstwianie hormonu uwalniającego tyrotropinę kwasem laurowym z utworzeniem lipofilowej laurylowej pochodnej z dobrą zdolnością penetracji przez błony komórkowe. Zacharia i wsp. (1991) donieśli także o utlenianiu metioniny do sulfotlenku i zastąpieniu wiązania peptydowego jego izoestrem ketometylenowym (COCH2) aby ułatwić transport peptydów przez błonę komórkową. To tylko niektóre ze znanych modyfikacji i pochodnych, które są w zakresie wiedzy osoby biegłej w tej dziedzinie.
Co więcej, leki lub inhibitory peptydowe, które są zdolne do hamowania aktywności na przykład NIK poprzez hamowanie interakcji NIK-TRAF2 i podobnie, interakcji między TRAF i białkami wiążącymi się z TRAF, mogą być sprzęgane lub kompleksowane z cząsteczkami, które ułatwiają wchodzenie do komórki.
Patent USA 5149782 ujawnia sprzęganie cząsteczki, która ma być przeniesiona przez błonę komórkową, z czynnikiem łączącym się z błonami, na przykład fuzogennymi polipeptydami, polipeptydami tworzącymi kanały jonowe, innymi polipeptydami błonowymi oraz długołańcuchowymi kwasami tłuszczowymi np. kwasem mirystylowym, kwasem palmitynowym. Te związki łączące z błonami wstawiają molekularne koniugaty do podwójnej warstwy lipidów błon komórkowych i ułatwiają ich wejście do cytoplazmy.
Low i wsp., Patent USA 5108921, omawia dostępne metody dostarczania przez błonę cząsteczek takich jak, między innymi, białka i kwasy nukleinowe, poprzez mechanizm aktywności endocytozy, w której pośredniczy receptor. Te systemy receptorów obejmują te, które rozpoznają galaktozę, mannozę, mannozo-6-fosforan, transferrynę, asialoglikoproteinę, transkobalaminę (B12), a-2 makroglobuliny, insulinę i inne peptydowe czynniki wzrostowe, takie jak nabłonkowy czynnik wzrostowy (EGF). Low i wsp. naucza, że receptory składników odżywczych, takie jak receptory dla biotyny i folianu, mogą być korzystnie użyte dla wzmagania transportu przez błonę komórkową ze względu na lokalizację i znaczną ilość receptorów biotyny i folianu na powierzchni błony większości komórek i związane z nimi procesy transportu transmembranowego, w których pośredniczą związane receptory. Tak więc doprowadza się do kontaktu kompleksu wytworzonego między związkiem, który ma być wprowadzony do cytoplazmy i ligandem, takim jak biotyna lub folian, z błoną komórkową niosącą receptory biotyny lub folianu aby zainicjować transport transbłonowy, w którym pośredniczy receptor i w ten sposób umożliwić wejście pożądanego związku do komórki.
Wiadomo, że ICE ma zdolność do tolerowania wielu podstawień w pozycji P2 i ta tolerancja na liczne substytucje została wykorzystana, aby opracować silny i wysoce specyficzny znacznik powinowactwa zawierający biotynę (Thomberry i wsp., 1994). W konsekwencji pozycja P2 jak również może N-koniec inhibitora tetrapeptydowego może być modyfikowany lub podstawiany, tak jak przez dodatkek cząsteczki biotyny, aby wzmóc przenikanie tych peptydowych inhibitorów przez błonę komórkowa.
Dodatkowo, wiadomo w tej dziedzinie, że połączenie pożądanej sekwencji peptydowej z sekwencją lidera/sygnałową aby stworzyć „peptyd hybrydowy” pozwoli takiemu „peptydowi hybrydowemu” na transport przez błonę do cytoplazmy.
Będzie docenione przez osoby biegłe w dziedzinie peptydów, że inhibitory peptydowe interakcji TRAF-białko wiążące się z TRAF, na przykład interakcji TRAF2-NIK według niniejszego wynalazku, ma obejmować leki lub inhibitory peptydomimetyczne, które mogą też być szybko badane pod kątem na przykład wiązania się do TRAF2-NIK, aby ewentualnie zaplanować bardziej stabilne inhibitory.
Będzie też docenione, że te same sposoby ułatwiania lub wzmagania transportu peptydowych inhibitorów przez błonę komórkową, jak przedyskutowano powyżej, mogą też być stosowane do samych białek wiążących się z TRAF, na przykład NIK, ich analogów, fragmen190 709 tów, lub jej izoform, jak i innych peptydów, które mogą wywierać swoje efekty wewnątrzkomórkowo.
O ile chodzc o dz wspomniane przeeiwciała. okres lekie „pnzeciwciajo” mai obejmować przeciwciała peliklenelne, przeciwciała monoklenalne (mAbs), pi'zeci\γciała-hybrydy, przeciwciała anty-idietypewe (anty-Id) wobec przeciwciał, które mogą być oznakowane w formie rozpuszczalnej lub związanej, jak i ich fragmenty dostarczone za pomocą znanych technik, takich jak, między innymi, cięcie enzymatyczne, synteza peptydu lub techniki rekombinacji.
Poliklonalne przeciwciała są heterogenną populacją cząsteczek przeciwciał pochodzących z surowic zwierząt immunizowanych antygenem. Monoklonalne przeciwciało zawiera zasadniczo homogi^nną populację przeciwciał swoistych w stosunku do antygenów, która to populacja ma zasadniczo podobne miejsca wiązania epitopów. Mabs mogą być uzyskane za pomocą metod znanych specjalistom. Patrz na przykład Kohler i Milstein, Nature, 256: 495-497 (1975); Patent USA Nr 4376110; Ausubel i wsp., wyd., Harlow i Lane Antibodies : A Laboratory Manual, Cold Spmg Harbor Laboratory (1988); oraz Colligan i wsp., wyd., Current Protocols in Immunology, Greene Publishing As-soc. and Wiley Interscience N.Y., (1992-1996), których treść jest tu włączona w całości w postaci odniesienia. Takie przeciwciała mogą być z dowolnej klasy immunoglobulin w tym IgG, IgM, IgE, IgA, GILD i dowolnej ich podklasy. Hybrydoma produkującą mAb według niniejszego wynalazku może być hodowana in vitro, in situ lub in vivo. Produkcja wysokiego miana przeciwciał mAb in vitro lub in situ sprawia, że jest to obecnie preferowana metoda produkcji.
Hybrydowe przeciwciała są cząsteczkami, których różne części pochodzą z różnych gatunków zwierząt, jak takie, które mają region zmienny pochodzący z mysiego mAb i region stały ludzkiej ^mu^g^^my. Hybrydowe przeciwciała są przede wszystkim stosowane, aby zmniejszyć immunogenność w stosowaniu i zwiększyć wydajności produkcji, na przykład gdy mysie mAbs dają wyższą wydajność z hybrydom, ale wyższą immunogenność u ludzi, tak że stosuje się hybrydowe mAbs ludzkie/mysie. Hybrydowe przeciwciała i metody ich wytwarzania są znane w dziedzinie (Cabilly i wsp., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81: 3273-3277 (1984); Morrison i wsp., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81: 6851-6855 (1984); Boulianne i wsp., Nature 312: 643-646 (1984); Cabilly i wsp., europejskie zgłoszenie patentowe 125023 (opublikowane 14 listopada, 1984); Neuberger i wsp., Nature 314: 268-270 (1985); Taniguchi i wsp., europejskie zgłoszenie patentowe 171496 (opublikowane 19 lutego, 1985); Morrison i wsp., europejskie zgłoszenie patentowe 173494 (opublikowane 5 marca, 1986); Neuberger i wsp., zgłoszenie PCT WO 8601533, (opublikowane 13 marca, 1986); Kudo i wsp., europejskie zgłoszenie patentowe 184187 (opublikowane 11 czerwca, 1986); Sahagan i wsp., J. Immunol. 137: 1066-1074 (1986); Robinson i wsp., międzynarodowe zgłoszenie patentowe nr WO 8702671 (opublikowane 7 maja,1987); Liu i wsp., Proc. Natl. Acad. Sci USA 84: 3439-3443 (1987); Sun i wsp., Proc. Natl. Acad. Sci USA 84: 214-218 (1987); Better i wsp., Science 240:1041-1043 (1988); oraz Harlow i Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, jak wyżej. Te odnośniki są tu włączone w całości w formie odniesienia.
Anty-idiotypowe' (anty-Id) przeciwciało jest przeciwciałem, które rozpoznaje unikalne determinanty na ogół związane z miejscem wiązania antygenu przeciwciała. Przeciwciało Id może być przygotowane przez immunizację zwierzęcia tego samego gatunku i genetycznego typu (np. szczep myszy) co źródło mAb, na który jest przygotowywany anty-Id. Immunizowane zwierzę rozpozna i zareaguje na idiotypowe determinanty immunizującego przeciwciała przez wytworzenie przeciwciała na te idiotypowe determinanty (przeciwciało anty-Id). Patrz na przykład Patent USA Nr 4699880, który jest tu w całości włączony w formie odniesienia.
Przeciwciało anty-Id może też być użyte jako „immunogen” w celu indukowania odpowiedzi immunologicznej w jeszcze innym zwierzęciu, dając tak zwane przeciwciało antyanty-Id. Anty-anty-Id może być epitopowo identyczne z oryginalnym mAb, które indukowało anty-Id. Tak więc przez stosowanie przeciwciał na idiotypowe determinanty mAb jest możliwa identyfikacja innych klonów wyrażających przeciwciała o identycznej specyficzności.
Tak więc mAb wytwarzane przeciw białkom wiążącym się z TRAF, analogom, fragmentom lub pochodnym (np. NIK, jego izoformy, analogi, fragmenty lub pochodne) według niniejszego wynalazku mogą być wykorzystane do indukowania przeciwciał anty-Id u stosowanych zwierząt, takich jak myszy BALB/c. Komórki śledziony z takich immunizowanych my32
190 709 szy są stosowane do produkowania hybrydom anty-Id wydzielających mAbs anty-Id. Co więcej, mAbs anty-Id mogą być sprzęgane z nośnikiem, takim jak hemocyjanina skałoczepu (KLH) i użyte do immunlzajji dodatkowych myszy BALB/c. Surowice z tych myszy będą zawierać przeciwciała anty-anty Id, które mają zdolności wiążące oryginalnego mAb specyficznoge dla epitopu powyższego białka wiążącego się z TRAF lub jego analogów, fragmentów i pochodnych.
Tak więc mAbs anty-Id mają swoje własne rpitepy anty-idiotypowe, lub „idiotopy” strukturalnie podobne do oznaczanego epitopu, takie jak GRB białko a.
Określenie „przeciwciało” ma także obejmować obie nienaruszone cząsteczki, jak i ich fragmenty, takie jak na przykład Fab i F(ab')z, które są zdolne do wiązania antygenu. Fragmenty Fab i F(ab')2 pozbawione fragmentu Fc nienaruszonego przeciwciała są łatwiej usuwane z krwiobiegu i mogą wykazywać mniej niespecyficznego wiązania do tkanek niż nienaruszone przeciwciało (Wahl i wsp., J. Nuci. Med. 24:316-325(1983)).
Będzie docenione, że fragmenty Fab i F(ab')2 i inne fragmenty przeciwciał pożyteczne w niniejszym wynalazku mogą być użyte do detekcji i określenia ilości białka wiążącego się TRAF według metod tu ujawnionych dla nienaruszonych cząsteczek przeciwciała. Takie fragmenty są typowo wytwarzane przez cięcie proteolityczne, przy zastosowaniu enzymów takich jak papaina (aby wyprodukować fragmenty Fab) lub trypsyna (aby wyprodukować fragmenty F(ab')2).
Mówi się, że przeciwciało jest „zdolne do wiązania” cząsteczki, jeśli jest zdolne do specyficznej reakcji z cząsteczką, wiążąc ten sposób cząsteczkę z przeciwciałem. Określenie „opitop” oznacza tę część cząsteczki zdolną do wiązania z przeciwciałem, która może być też rozpoznawana przez to przeciwciało. Epitopy, lub „antygenowe determinanty” na ogół składają się z chemicznie czynnych ugrupowań powierzchniowych cząsteczek, takich jak aminokwasy lub boczne łańcuchy cukrowe i mają specyficzne trójwymiarowe strukturalne cechy, takie jak specyficzne własności ładunku.
„Antygen” jest cząsteczką lub częścią cząsteczki zdolną do bycia wiązaną przez przeciwciało, która dodatkowo jest zdolna do indukowania zwierzęcia do wytwarzania przeciwciała zdolnego do wiązania się do opltepu tego antygenu. Antygen może mieć jeden lub więcej niż jeden epitop. Specyficzna reakcja, do której jest odniesienie powyżej ma oznaczać, że antygen będzie reagował w sposób wysoce wybiórczy z odpowiednim przeciwciałem, a nie z licznymi innymi przeciwciałami, które mogą być wywoływane przez inne antygeny.
Przeciwciała, w tym fragmenty przeciwciał przydatne w niniejszym wynalazku mogą być użyte w celu ilościowego lub jakościowego wykrywania białka wiążącego się z TRAF (np. NIK) w próbce lub aby wykryć obecność komórek, które wyrażają białko wiążące się z TRAF według niniejszego wynalazku. Może to być uzyskane za pomocą technik immunofluorescencyjnych stosujących przeciwciało znakowane fluereojonayJmr (patrz poniżej) w połączeniu z detekcją w mikroskopie świetlnym, za pomocą aytomotrii przepływowej lub fluoromrtrei.
Przeciwciała (lub ich fragmenty) przydatne w niniejszym wynalazku mogą być stosowane histologicznie, jak w mikroskopii immunofluorrsaencyjnej lub immunoelektronewej, do detekcji in situ białka wiążącego się z TRAF według niniejszego wynalazku. Detekcja in situ może być uzyskana przez pobranie próbki histologicznej od pacjenta i dostarczenie znakowanego przeciwciała według nlneejszege wynalazku do takiej próbki. Przeciwciało (lub fragment) jest korzystnie dostarczane przez zastosowanie lub nałożenie znakowanego przeciwciała (lub fragmentu) na próbkę biologiczną. Przez użycie takiej procedury jest możliwe określenie nie tylko obecności białka wiążącego TRAF, ale jego rozkładu w badanej tkance. Stosując niniejszy wynalazek osoby o przeciętnych umiejętnościach łatwo zauważą, że każda z szerokiego zakresu metod histologicznych (takich jak metody barwienia) może być tak zmodyfikowana, aby uzyskać taką detekcję in situ.
Takie oznaczenia białka wiążącego się z TRAF według niniejszego wynalazku typowo obejmuje inkubację próbki biologicznej, takiej jak płyn biologiczny, ekstrakt tkankowy, świeżo zebrane komórki, takie jak limfocyty lub leukocyty lub komórki, które były inkubowane w hodowli tkankowej, w obecności wykrywalnie znakowanego przeciwciała zdolnego do
190 709 identyfikacji białka wiążącego się z TRAF i wykrywanie przeciwciała przez dowolną z szeregu technik dobrze znanych w tej dziedzinie.
Próbka biologiczna może być traktowana podłożem w fazie stałej lub nośnikiem, takimi jak nitroceluloza lub inne stałe podłoże lub nośnik, które są zdolne do immobilizacji komórek, części komórek lub białek rozpuszczalnych. Podłoże lub nośnik mogą być potem odmyte odpowiednimi buforami, a następnie zachodzi traktowanie wykrywalnie znakowanym przeciwciałem zgodnie z niniejszym wynalazkiem, jak opisano powyżej. Podłoże lub nośnik fazy stałej mogą być wówczas przepłukane buforem drugi raz, aby usunąć niezwiązane przeciwciało. Ilość związanego znacznika na tym stałym podłożu lub nośniku może być wtedy wykryta za pomocą konwencjonalnych sposobów.
Przez „podłoże w fazie stałej”, „nośnik w fazie stałej”, „stałe podłoże”, „stały nośnik”, „podłoże” lub „nośnik” rozumie się każde podłoże lub nośnik zdolne do wiązania antygenu lub przeciwciał. Dobrze znane podłoża lub nośniki obejmują szkło, polistyren, polipropylen, polietylen, dekstran, amylazy nylonowe, naturalne i modyfikowane celulozy, poliakiyloamidy, gabros i magnetyty. Natura nośnika może być albo rozpuszczalna w pewnym stopniu albo nierozpuszczalna dla celów niniejszego wynalazku. Materiał podłoża może mieć wirtualnie każdą możliwą strukturalną konfigurację, o ile połączona cząsteczka jest zdolna do wiązania do antygenu lub przeciwciała. Tak więc konfiguracja podłoża lub nośnika może być sferyczna, jak w paciorku, cylindryczna, jak w wewnętrznej powierzchni probówki, lub zewnętrznej powierzchni bagietki. Odmiennie, powierzchnia może być płaska, taka jak arkusz, testowy pasek itp. Korzystne podłoża lub nośniki obejmują paciorki polistyrenowe. Osoby biegłe w dziedzinie będą znały wiele innych odpowiednich nośników do wiązania przeciwciała lub antygenu albo będą w stanie ustalić to za pomocą rutynowych doświadczeń.
Aktywność wiążąca danej partii przeciwciał według wynalazku, jak zanotowano powyżej, może być określona za pomocą dobrze znanych metod. Osoby biegłe w dziedzinie będą zdolne do określenia operacyjnych i optymalnych warunków oznaczenia dla każdego oznaczenia przez stosowanie rutynowych eksperymentów.
Inne etapy takie jak płukanie, mieszanie, wytrząsanie, sączenie i tym podobne mogą być dodane do oznaczeń, jak jest w zwyczaju lub z konieczności w danej sytuacji.
Inny ze sposobów, za pomocą którego przeciwciało według niniejszego wynalazku może być wykrywalnie wyznakowane, jest przez połączenie go z enzymem i zastosowanie w enzymatycznym oznaczeniu immunologicznym (EIA). Enzym z kolei, gdy jest później eksponowany wobec odpowiedniego substratu, będzie reagował z substratem w taki sposób, aby wytworzyć resztę chemiczną, która może być wykryta na przykład za pomocą sposobów spektrometrycznych, fluorometrycznych lub wzrokowych. Enzymy, które mogą być stosowane do znakowania przeciwciała w sposób wykrywalny obejmują, miedzy innymi, dehydrogenazę jabłczanową, nukleazę gronkowców, izomerazę delta-5-steroidu, dehydrogenazę alkoholową drożdży, dehydrogenazę alfa glicerolofosforanu, izmomerazę triozofosforanu. peroksydazę z chrzanu, fosfatazę alkaliczną, asparaginazę, oksydazę glukozy, betagalaktozydazę, rybonukleazę, ureazę, katalazę, dehydrogenazę glikozo-6-fosforanu, glukoamylazę i esterazę actylocholiny. Detekcja może być uzyskana przez wzrokowe porównanie stopnia reakcji enzymatycznej substratu w porównaniu z podobnie przygotowywanymi standardami.
Detekcje można uzyskać stosując dowolne z różnych innych oznaczeń immunologicznych. Na przykład za pomocą radioaktywnego znakowania przeciwciał lub fragmentów przeciwciał możliwe jest wykrycie R-PTPazy przy zastosowaniu oznaczenia radioimmuno logicznego (RIA). Dobry opis RIA można znaleźć w Laboratory Techniques and Biochemistry in Molecular Biology, T.S. Work i wsp., North Holland Publishing Company, NY (1978) ze szczególnym odniesieniem do rozdziału pod tytułem „An Introduction to Radioimmune Assay and Related Techniques” autor T. Chard, włączonego tu w postaci odniesienia. Izotop radioaktywny może być wykryty za pomocą takich sposobów, jak licznik g, licznik scyntylacyjny lub autoradiografia.
Jest też możliwe wyznakowanie przeciwciała w zgodzie z niniejszym wynalazkiem związkiem fluorescencyjnym. Gdy fluorescencyjnie znakowane przeciwciało jest wystawione na światło o odpowiedniej długości fali, jego obecność może być wykryta za pomocą fluorescencji. Wśród najczęściej stosowanych związków fluorescencyjnych do znakowania są izo34
190 709 tiocyjanian fluoresceiny, rodamina, fikoorytryna. pikocyjanian, allofikocyjanian, aldehyd oΑηΟο™ζ i fluorescamina.
Przeciwciało może też być wyznakowane w sposób wykrywalny przy zastosowaniu metali emitujących fluorescencję, takich jak 153E lub innych z serii lantanowców. Te metale mogą być dołączone do przeciwciała, przy zastosowaniu takich grup chelatujących metal, jak kwas dicaylenotrianuriopentaoctowy (ETPA).
Przeciwciało może też być wykrywalnie wyznakowane poprzez połączenie go ze związkiem chomiluminosconcyjnym. Obecność przeciwciała wyznakowanego chemilnmmesconcyjnie jest potem oznaczana poprzez wykrywanie obecności luminescencji, która pojawia się w trakcie reakcji chemicznej. Przykłady szczególnie użytecznych związków chemilnminoscencyjnych do znakowania to: luminol, izoluminol, teromatyczny ester akrydyny, imidazol, sól akrydynowa i ester szczawiowy.
Podobnie, związek bioluminosconcyjny może być użyty do wyznakowania przeciwciała według niniejszego wynalazku. Biolnminosconcja jest typem chemiluminescencji spotykanym w systemach biologicznych, w których białko katalityczne zwiększa skuteczność reakcji chemilnminoscencyjnoj. Obecność białka bioluminesconcyjnego jest oznaczana przez wykrywanie obecności luminescencji. Ważne związki biolnminosconcyjno do znakowania to lucyferyna, lncyforaza i aekworyna.
Cząsteczka przeciwciała według niniejszego wynalazku może być przystosowana do użycia w oznaczeniu immunometrycznym, znanym także jako oznaczenie „dwnmiojscowo” lub typu „kanapka”. W typowym oznaczeniu immunometrycznym, pewna ilość nieznakowanego przeciwciała (lub fragmentu przeciwciała) jest wiązana ze stałym podłożem lub nośnikiem i pewna ilość wykrywalnie znakowanego rozpuszczalnego przeciwciała jest dodawana w celu umożliwienia detekcji i/lub jakościowego oznaczenia kompleksu trójskładnikowego wytworzonego przez przeciwciało w fazie stałej, antygen i wyznakowane przeciwciało.
Typowe i korzystne oznaczenia immunometryczne obejmują oznaczenia „w przód”, w których przeciwciało związane z fazą stałą jest najpierw kontaktowane z badaną próbą, aby wyekstrahować antygen z próbki przez stworzenie dwuskładnikowego kompleksu przeciwciało w fazie stałej-antygen. Po odpowiednim okresie inkubacji stałe podłoże lub nośnik odmywa się, aby usunąć resztkę płynnej próby, w tym nroprzoroagowanego antygenu, o ile takowy jest obecny, a następnie kontaktowanie z roztworem zawierającym nieznaną ilość znakowanego przeciwciała, (które działa jako cząsteczka „wskaźnikowa”). Po drugim okresie inkubacji, aby pozwolić wyznakowanemu przeciwciału na skompleksowanie z przeciwciałem związanym ze stałym podłożem lub nośnikiem poprzez nieoznakowane przeciwciało, stałe podłoże lub nośnik są przepłukiwane drugi raz, aby usunąć nieprzeroogowane oznakowane przeciwciało.
W innym typie oznaczenia typu „kanapka”, które może także być użyteczne z antygenami według niniejszego wynalazku stosowane są tak zwane oznaczenia „równoczesne” i „odwróconym”. Oznaczenie równoczesne obejmuje pojedynczy etap inkubacji, jako że przeciwciało związane ze stałym podłożem lub nośnikiem i oznakowane przeciwciało są razem dodawane do badanej próbki w tym samym momencie. Po zakończeniu inkubacji stałe podłoże lub nośnik płucze się, aby usunąć resztę płynnej próby i nie simpleksowa^ wyznakowane przeciwciało. Obecność wyznakowanego przeciwciała związanego z podłożem stałym lub nośnikiem można następnie oznaczyć, jak w konwencjonalnym teście kanapkowym „w przód”.
W teście „odwróconym” stosuje się stopniowe dodawanie do płynnej próbki roztworu pierwszego przeciwciała, po czym, po odpowiednim okresie czasu dodaje się niewyznakowane przeciwciała związane ze stałym podłożem lub nośnikiem. Po drugiej inkubacji fazę stałą odpukuje się w konwencjonalny sposób w celu pozbycia się resztek testowanej próbki i roztworu nroprzereagowαnych wyznakowanych przeciwciał. Następnie przeprowadza się oznaczenie wyznakowanego przeciwciała związanego ze stałym podłożem lub nośnikiem jak w testach „równoczesnych” i „w przód”.
Jak wspomniano powyżej, niniejszy wynalazek dotyczy również kompozycji farmaceutycznych zawierających zwierzęcy wektor wirusowy kodujący białko wiążące się z TRAF, przy czym wektor koduje również powierzchniowe białko wirusowe zdolne do wiązania się z białkami powierzchniowymi komórki docelowej (np. komórek nowotworowych) w celu kierowania wprowadzeniem sekwencji białka wiążącego się z TRAF do komórek. Dalsze
190 709 kompozycje farmaceutyczne według wynalazku zawierają jako składnik aktywny a) sekwencję oligonukleotydową kodującą sekwencję antysensowną w stosunku do sekwencji białka wiążącego się z TRAF lub b) leki, które blokują oddziaływania TRAF z białkiem wiążącym się z TRAF.
Kompozycje farmaceutyczne według wynalazku zawierają wystarczającą ilość aktywnego składnika, aby osiągnąć zamierzony skutek. Dodatkowo, kompozycje farmaceutyczne mogą zawierać odpowiednie farmaceutycznie akceptowalne nośniki, zawierające zaróbkę i substancje wspomagające, które ułatwiają przekształcenie aktywnych związków w preparaty, które mogą być stosowane farmaceutycznie i które mogą stabilizować takie preparaty do podawanie osobom potrzebującym, co jest dobrze znane biegłym w tej dziedzinie.
Istnieje podejrzenie, że białko wiążące się z TRAF oraz jego izoformy łub izotypy są wyrażane w różnych tkankach na znacząco różniących się poziomach, a również z różniącym się wzorem izotypów, w analogiczny sposób jak ekspresja różnych innych białek zaangażowanych w wewnątrzkomórkowe przekazywanie sygnałów, jak wskazano w wymienionych powyżej stanowiących współwłasność i równocześnie biegnących zgłoszeniach patentowych. Różnice te być mogą mieć udział w tkankowo-specyficznym charakterze odpowiedzi na ligand Fas/APOl i TNF. Jak w przypadku innych homologów CED3/ICE (Wang i wsp., 1994; Alnemri i wsp., 1995), obecni wynalazcy pokazali uprzednio (we wspomnianych powyżej zgłoszeniach patentowych), że izoformy MASH, które zawierają niekompletne regiony CED3/ICE (np. MASHa3) wykazują działanie hamujące na aktywność równolegle wyrażanych cząsteczek MASHal lub MASHa2; stwierdzono również że blokują one indukcję śmierci przez Fas/APOl i p55-R. Ekspresja takich hamujących izoform w komórce może stanowić mechanizm komórkowej samoobrony przed cytotoksycznością, w której uczestniczy Fas/APOl i TNF. Duża heterogenność izoform MASH, która znacznie przekracza obserwowaną dla innych proteaz z rodziny CED3/ICE, powinna umożliwiać szczególnie subtelne modulowanie ihnkcji aktywnych izoform MASH.
Zgodnie z niniejszym wynalazkiem wyizolowano również analogi/muteiny jednego z białek wiążących się z TRAF, a mianowicie białka wiążącego się z TRAF2, NIK. Te analogi/muteiny NIK (patrz powyżej i patrz przykłady poniżej) są inhibitorami dla indukcji aktywacji NF-KB, w której pośredniczy NIK, jak również inhibitorami tej indukcji, w której pośredniczy receptor TNF, receptor Fas/APOl, spokrewnione z nimi białka, receptor IL-1 i inne czynniki. A zatem, jak zaznaczono powyżej, białka wiążące się z TRAF lub ich możliwe izoformy mogą mieć zmienne działanie w różnych tkankach w odniesieniu do ich oddziaływania z białkami TRAF i ich wpływu wywieranego w związku z tym na aktywność białek TRAF lub wewnątrzkomórkowe przekazywanie sygnałów, w którym pośredniczą białka TRAF.
Jest również możliwe, że niektóre z możliwych izoform białka wiążącego się z TRAF spełniają inne funkcje. Przykładowo, NIK i pewne analogi lub izoformy NIK mogą również działać jako miejsca zakotwiczenia dla cząsteczek, które mają udział w innych niecytotoksycznych działaniach, przykładowo, receptorów Fas/APOl i TNF poprzez oddziaływanie z TRAF2 lub nawet niezależnie od TRAF2.
Na skutek wyjątkowej zdolności receptorów Fas/APOl i TNF do powodowania śmierci komórki, jak również zdolności receptorów TNF do włączania innych aktywności uszkadzających tkankę, nieprawidłowości w funkcjonowaniu tych receptorów będą szczególnie szkodliwe dla organizmu. Rzeczywiście, wykazano, że zarówno nadmiar, jak i wadliwe funkcjonowanie tych receptorów ma swój udział w patologicznych objawach różnych chorób (Va^^alli, 1992; Nagata i Golstein, 1995). Zidentyfikowanie cząsteczek, które uczestniczą w aktywności przekazywania sygnałów tych receptorów i znalezienie sposobów modulowania aktywności tych cząsteczek mogłoby prowadzić bezpośrednio do nowych podejść terapeutycznych. W świetle podejrzewanej ważnej roli białek TRAF, np. TRAF2, a zatem TRAF-białko wiążące się z TRAF, np. oddziaływań TRAF2-NIK przy aktywacji NF-KB, w której pośredniczy Fas/APOl i TNF, wydaje się szczególnie ważne zaprojektowanie lekarstw, które blokują oddziaływanie TRAF-białko wiążące się z TRAF, np. oddziaływań TRAF2-NIK, kiedy pożądane jest zabijanie komórek (poprzez hamowanie aktywacji NF-KB) i przeciwnie, kiedy pożądane jest zachowanie komórek, to oddziaływanie powinno być wzmocnione (dla zwiększenia aktywacji NF-KB).
190 709
Niniejszy wynalazek dotyczy również białek lub innych ligandów, które mogą wiązać się z białkami wiążącymi się z TRAF według wynalazku i w ten sposób modelować/pośredniczyć w aktywności białek wiążących się z TRAF. Takich białek lub ligandów można poszukiwać, izolować i wytwarzać dowolną z powyżej wspomnianych metod. Przykładowo, można izolować szereg nowych ligandów, włączając w to białka zdolne do wiązania się z białkami NIK według wynalazku (z wyłączeniem spośród takich nowych białek/ligandów znanego TRAF2 i prawdopodobnie I-kB, jeżeli NIK rzeczywiście wiąże się z I-kB).
Jak przedstawiono szczegółowo poniżej, takie nowe białka/ligandy, wiążące się z białkami wiążącymi się z TRAF, np. białka wiążące się z NIK, mogą służyć jako, przykładowo, inhibitory lub wzmacniacze aktywności, w której pośredniczy NIK lub aktywności, w której pośredniczy, przykładowo, oddziaływanie TRAF2-NIK i jako takie będą miały ważną rolę w różnych stanach patologicznych i innych sytuacjach, jak opisano szczegółowo poniżej. Inną funkcją takich nowych białek/ligandów, wiążących się z białkami wiążącymi się z TRAF, byłoby pełnienie funkcji specyficznych czynników do oczyszczania białek wiążących się z TRAF poprzez, przykładowo, chromatografię powinowactwa, gdzie te nowe białka/ligandy są przytwierdzone do odpowiednich podłóż chromatograficznych z utworzeniem podłoża/matrycy stałego lub powinowactwa, przez który będzie przechodzić roztwór, ekstrakt lub temu podobne, zawierający białka wiążące się z TRAF, np. NIK, ułatwiając w ten sposób ich oczyszczenie. Takie metody chromatografii powinowactwa są dobrze znanymi i generalnie standardowymi procedurami w tej dziedzinie.
Podobnie, wszystkie wspomniane powyżej białka wiążące się z TRAF, analogi, fragmenty, izoformy lub pochodne według niniejszego wynalazku można zastosować do oczyszczenia poprzez chromatografię powinowactwa różnych białek TRAF, do których się wiążą. Przykładowo, białka wiążące się z TRAF2, jak NIK, jej analogi, fragmenty i muteiny NIK (patrz przykłady poniżej) można stosować do oczyszczania TRAF2 poprzez chromatografię powinowactwa. A zatem w ten sam sposób jak białko NIK, można izolować i wytwarzać analogi/muteiny według niniejszego wynalazku (patrz przykłady poniżej) przy zastosowaniu metod i dowolnych innych ekwiwalentnych metod oczywistych dla biegłych w tej dziedzinie (jak przedstawiono szczegółowo powyżej), jak również można identyfikować i wytwarzać dowolne inne białka wiążące się z TRAF2. Takie metody identyfikacji i wytwarzania tych białek wiążących się z TRAF, np. białek wiążących się z TRAF2, będą obejmować etap przeszukiwania, w którym białko TRAF (np. TFLAF2) lub co najmniej jego specyficzna część (np. część TRAF2 pomiędzy aminokwasami 222-501) stosuje się jako substrat lub „przynętę” do otrzymania białek lub innych ligandów zdolnych do wiązanie się z nim; po czym następują etapy identyfikacji i charakteryzowania takich białek/ligandów otrzymanych w ten sposób; i wreszcie wytworzenie takich białek /ligandów w zasadniczo wyizolowanej i oczyszczonej postaci. Wszystkie te etapy są dobrze znane biegłym w tej dziedzinie i przedstawione tu szczegółowo powyżej i poniżej.
Wynalazek będzie teraz opisany bardziej szczegółowo w następujących nie-ograniczających przykładach i towarzyszących im rysunkach:
Należy również zaznaczyć, że procedury:
i) przeszukiwania dwuhybrydowago i dwuhybrydowy test na ekspresję b-galaktozydazy; (ii) indukowanej ekspresji, metabolicznego znakowania i immunoprecypitacji białek; (iii) wiązania in vitro; (iv) pomiaru cytotoksyczności oraz (v) analizy Northern i sekwencji, jak również inne procedury zastosowane w następujących dalej przykładach zostały szczegółowo opisane w poprzednich publikacjach przez obecnych wynalazców w odniesieniu do innych białek i szlaków przenoszących sygnały wewnątrzkomórkowe (patrz przykładowo, Boldin i wsp., 1995a, 1995b, oraz Boldin i wsp. 1996). Procedury te pojawiają się również szczegółowo w będących współwłasnością równocześnie biegnących zgłoszeniach izraelskich nr 114615, 114986, 115319, 116588, 117932 i 120367, jak również odpowiadającym im zgłoszeniu PCTNr PCT/Us96/10521. A zatem pełne ujawnienia wszystkich tych publikacji i zgłoszeń patentowych są tu włączone w całości i w co najmniej takim zakresie, który wyznaczają szczegółowe procedury eksperymentalne.
Przykłady
Materiał i Metody i) biblioteki cDNA
190 709
a) biblioteka cDNA z limfocytów B
Użyto bibliotekę skonstruowaną z zastosowaniem oligo dT z ludzkich limfocytów B (Durfee i wsp., 1993). cDNA z biblioteki wstawiono w miejsce X0oI wektora pSE1107, na bazie pACT, jako fuzja z domeną aktywacyjną GAL4.
b) biblioteka cDNA z jąder w Xgt10
Użyto bibliotekę cDNA z ludzkich jader. Biblioteka zawierająca wstawki o średniej wielkości od 200 do 400 bp została utworzona z zastosowaniem losowych heksanukleotydów ii) Szczepy drożdży
Dwa szczepy drożdży zastosowano jako szczepy gospodarzy do transformacji i poszukiwań: szczep HF7c, który użyto w teście dwuhybrydowym i szczep SFYS26, który użyto w testach na b-galaktozydazę. Obydwa szczepy niosą auksetroficzne markery trpl i leu2, a mianowicie szczepy drożdży nie mogą rosnąć na syntetycznym podłożu bez tryptofanu i leucyny o ile nie są transformowane plazmidem przenoszącym dziką wersję tych genów (TRP1, LEU2). Dwa szczepy drożdży niosą mutacje delecyjne w genach GAL4 i GAL80 (mutacje gal4-542 i gal 80-538, odpowiednio).
Szczepy SFY526 i HF7c zawierają wskaźnik lacZ w swoich genotypach: w szczepie SFY526 przyłączony do odcinka UAS i TATA promotora GALI, w HF7c do lacZ są dołączone trzy kopie n-merowej sekwencji największej zgodności GAL4 i odcinek TATA promotora CYC1. Zarówno UAS GAL1, jak i 17-mery GAL4 odpowiadają na aktywator transkrypcyjny GAL4. Dodatkowo, szczep HF7c niesie wskaźnik HIS3 dołączony do UAS i odcinka TATA promotora GAL 1.
iii) Klonowanie ludzkiego TRAF2
Ludzki TRAF2 sklonowano poprzez PGR z biblioteki cDNA z HL60 (sekwencja TRAF2 i inne szczegóły patrz Rothe i wsp., 1994; Rothe i wsp., 1995a; Cheng i wsp., 1996; Hsu i wsp., 1996; i Waliach, 1996). Zastosowanymi starterami były: a) starter lewy - 30-mer CAGGATCCt ATGGCTGCAGCTAGCGTGAC odpowiadający sekwencji kodującej OTRAF2 rozpoczynającej się od kodonu dla pierwszej metioniny (podkreślona) i obejmującej łącznik z miejscem BamHI; b) starter lewy - 32-mer GGTCGACTTAGAGCCCTGTCAGGTCCACAATG który obejmuje kodon stop hTRAF2 (podkreślony) i miejsce restrykcyjne Sali w łączniku. Program PCR obejmował początkowy etap denaturacji 2 min. w 94°C, a następnie 30 cykli: 1 min. w 94°C, 1 min. W 64°C, 1 min. i 40 sek. w 72°C. Powielony ludzki TRAF2 wstawiono następnie w miejsca BamHI Sali wektora pGBT9, łącząc go z domeną wiążą się z DNA GAL4.
iv) Przeszukiwanie biblioteki z limfocytów B testem dwuliybrydowym
Test dwuhybrydowy jest techniką (patrz szczegóły w powyżej wspomnianych publikacjach i zgłoszeniach patentowych) zastosowaną w celu zidentyfikowania czynników, które są związane z konkretnymi cząsteczkami, które służą jako przynęta. W niniejszym wynalazku TRAF2, który był sklonowany w wektorze pGBT9, służył jako przynęta. TRAF2 wyrażano równocześnie z przeszukiwaną biblioteką cDNA z limfocytów B w szczepie drożdży HF7c. TRAF2, sklonowany poprzez PCR, stanowił rekembinewaną fuzję z domeną wiążącą się z DNA GAL4, a przeszukiwana biblioteka cDNA była dołączona do domeny aktywacyjnej GAL4 w wektorze pSE1107. Genem wskaźnikowym w HF7c był HIS3, dołączony do sekwencji aktywacyjnej 5' (UAS) w promotorze GAL1, który daje podpowiedz, na aktywator transkrypcyjny GAL4. Transformanty, które zawierały zarówno plazmid pGBT9, jak i pSE1, były selekcjonowane pod kątem wzrostu na podłożu bez tryptofanu i leucyny. W drugim etapie klony pozytywne, które wyrażały białka dwuhybrydowe, które wzajemnie ze sobą oddziaływały, a zatem aktywowałY GAL1-HIS3, pobierano z płytek bez tryptofanu, leucyny i histydyny, a zawierających 50 mM 3-aminotriazel (3AT).
v) Test na b-galaktozydazę
Klony pozytywne pobrane w teście dwubybrydewym poddano testowi barwnemu na lacZ w komórkach drożdży SFYS26, zgodnie z instrukcją Clontech Laboratories (dla szczegółów, patrz powyżej wspomniane publikacje i zgłoszenia patentowe). Pokrótce, trensfermantom umożliwiono wzrost w 30°C przez 2-4 dni do osiągnięcia średnicy około 2 mm, a następnie przenoszono na filtry Whatman. Filtry poddano zamrażaniu i rozmrażaniu w celu permabilizacji, a następnie moczono w buforze (16,1 mg/ml Na2HP0^47HzO; 5,5 mg/ml Na2HP0>4H20; 0,75 mg/ml KCl; 0,75 mg/ml MgSO4 i 7H2O, pH=7), zawierającym 0,33 mg/ml X-gal i 0,35 mM β-merkaptoeta38
190 709 nol. Kolonie obserwowano pod kątem pojawienia się niebieskiego koloru, który jest wskaźnikiem indukcji β-galaktozydazy.
vi) Ekspresja sklonowanego cDNAs
Skonstruowano dwa rodzaje wektorów ekspresyjnych:
a) wektory oparte o pUHD10-3 zawierające otwartą ramkę odczytu (ORF) klonu 9, 10 lub 15 połączoną z epitopem hemaglutyniny.
b) wektory oparte o pUHD10-3, do których została wstawiona sekwencja oktapeptydu FLAG tuż przed sklonowanym TRAF2, nazwane zatem FLAGB6/TRAF2.
Konstrukty zawierające ORF klonów 9, 10 lub 15 transfekowano do komórek HeLa-Bujard (dla tych komórek patrz Gossen, M. i Bujard, M. (1992)) same lub kotransfekowane z fLAGB6/TRAF2 przy zastosowaniu standardowej metody wapniowo-fosloranowej (metoda, przykładowo, w Current Protocols in Molecular Biology, wyd. Ausubel, F.M i wsp.).
vii) Test na lucyferazę
Typowo, 5x10 ’ transfekowanych komórek zbierano poprzez trzykrotne przemywanie zimnym PBS i zawieszano ponownie w 400 pl buforu do ekstrakcji (0,1 M K2HPO4/KH2PO4 pH=7,8; 1 mM DTT). Lizę komórek uzyskiwano poprzez trzykrotne zamrażanie w ciekłym azocie i rozmrażanie. Resztki komórek usuwano poprzez wirowanie (5 min. przy 10000 x g). W celu wykonania testu na lucyferazę, dodawano 200 pl buforu do lucyferazy (25 mM glicyloglicyna, 15 mM K2HPO4/KH2PO4, pH=7,8, 15 mM MgSO4, 4 mM EGTA, 2 mM ATP, 1 mM DTT) do 50 pl lizatu. Następnie do reakcji dodawano 100 pl 0,2 mM D-lucyferyny, 25 mM glicyloglicyny, 1 mM DTT. Aktywność lucyferazy oznaczano poprzez odczyt emisji światła przy zastosowaniu zestawu lumenometrycznego.
Lumitron przy integracji 10 sekund (patrz powyższe publikacje i zgłoszenia patentowe dla dodatkowych szczegółów).
Przykład 1
Klonowanie nowych klonów 9, 10 i 15
Bibliotekę cDNA przygotowaną z komórek-B przeszukiwano pod kątem białek, które łączą się z TRAF2 przy zastosowaniu techniki dwuhybrydowej, jak opisano w Materiałach i Metodach (iv). Jedynie u transformantów, w których następowała ekspresja zarówno TRAF2, jak i białka zdolnego do oddziaływania z nim, domena wiążąca DNA GAL4 i domena transaktywacji transkrypcji stykały się ze sobą. Skutkiem tego była aktywacja i ekspresja genu wskaźnikowego, w tym przypadku HIS3, dołączonego do UAS i odcinka TATA promotora GAL1.
W wyniku przeszukiwania uzyskano około 2000 klonów, które miały zdolność do wzrostu na płytkach Trp-, Leu-, His-, 3AT. DNA otrzymane ze 165 losowo wybranych klonów pozytywnych służyły do przejściowej kotransfekcji szczepu drożdży SFYS26 razem z TRAF2 sklonowanym w wektorze pGBT9. Test na aktywność b-galaktozydazy przeprowadzono na stransformowanych koloniach drożdży 5FY526, jak opisano w Materiałach i Metodach (v). Pojawiający się niebieski kolor wskazywał na kolonie drożdży, które zawierały cDNA kodujący białko lub polipeptyd, który wiąże się z TRAF2.
Wyniki testu dwuhybrydowego: zdolność pobranych klonów do wzrostu na płytkach 3AT i do indukowania lacZ, co mierzono w teście barwnym, są zebrane w tabeli 1. Spośród sprawdzonych pozytywnych klonów, dwa były cDNA kodującym znane białka: sam TRAF2, który ma zdolność łączenia się ze sobą i tworzenia homodimerów, oraz receptor limfotoksyny beta, dla którego wykazano, że jego wewnątrzkomórkowa domena wiąże się z YTRAF2. Trzy spośród sklonowanych cDNA (klony 9, 10 i 15) były nowe.
Klony pozytywne sprawdzano dalej w teście specyficzności wiązania, a mianowicie sprawdzano pod kątem ich oddziaływań z niezależnymi przynętami. Jak pokazano w tabeli 2, klony 9 i 10, reagowały jedynie z TRAF2 i nie wiązały się żadnym spośród licznych innych testowanych białek. Klon 15 z drugiej strony nie wiązał się ani z MORT1, ani wewnątrzkomórkowymi domenami receptorów p55 i p75, ale wiązał się słabo z laminą i cykliną D.
W celu zawężenia cząsteczki TRAF2 do regionu, który oddziałuje z klonami 9, 10 i 15, wykonano dwa dodatkowe konstrukty. Jeden konstrukt zawierał N-końcową część cząsteczki TRAF2, aminokwasy od 1 do 221, które obejmują motywy palca serdecznego i palca cynkowego. Drugi konstrukt zawierał jedynie C-końcową część cząsteczki, aminokwasy 222 do
190 709
501, obejmując „domenę TRAF” i dodatkowe 42 aminokwasy. Te dwa konstrukty służyły jako przynęty w testach dwuhybrydowych. Wyniki jasno pokazują, że jakkolwiek klony 9, 10 i 15 nie reagowały z konstruktem zawierającym aminokwasy od 1 do 221 z cząsteczki TRAF2, wszystkie one wiązały się z C-końcowym kenstruktrm zawierającym „domenę TRAF” z taką samą wydajnością, z jaką wiążą się do cząsteczki TRAF2 pełnej długości.
Tabela II
Podsumowanie wyników testu dwuhybrydowrwge przy zastosowaniu TRAF2 jako „przynęty”, w którym uzyskano klony 9, 10 i 15.
Wzrost na Test barwny ID/nazwa klonu, jak Liczba
50 mM 3AT (min) określono przez niezależych
srkwrnjjonowanlo klonów
+++ 10 min TRAF2 150
++ 20 min nowy klon numer 9 6
+++ 15 min nowy klon numer 10 2
++++ 10 min receptor limfotoksyny beta 2
+ 15 min nowy klon numer 15 5
Tabela III
Test specyficzności. (oddziaływanie z niezależnymi przynętami w teście dwuhybiydowym)
klon: klon 9 klon 10 klon 15
przynęta
lamina - - +
cyklina D - - +
p75-IC - - -
p55-IC - - -
MORT1 - - -
TRAF2 +++ +++ +++
Poprzez zastosowanie wobec cDNA klonu 10 kilku etapów PCR, sklonowano cDNA pełnej długości z bibliotek cDNA otrzymanych z RNA z tkanek ludzkich. Białko to oznaczono jako NIK, od kinazy indukującej NF-KB, ang. „NF-KB inducing kinase”, z powodu tego, że zawiera region kinazy białkowej (patrz poniżej). Należy zauważyć, że sekwencja klonu 10, przy wyjściowej analizie (przed otrzymaniem NIK przez PCR) wydawała się kodować białko, początkowo nazwane NMPI (patrz stanowiące współwłasność, równocześnie biegnące, IL 117800). To NMPI lub białko kodowane przez klon 10 okazało się mieć sekwencję (odpowiadającą, konserwowanym motywom I do XI, które charakteryzują kinazy białkowe Ser/Thr.
Przykład 2
Srkwonjjonowaneo nowych klonów
Trzy nowe klony cDNA (klony 9, 10 i 15) oczyszczono, powielono w E. coli, a ich DNA poddano analizie sekwencji. Okazało się, że wszystkie trzy klony są częściowymi klonami cD-NA.
Całkowita długość klonów 9, 10 i 15 wynosiła około 2000, 2700 i 1300 par zasad, odpowiednio.
Figury 3 i 5 pokazują zsokwencjonowaną część klonów 9 i 15, a fig. 4 pokazuje pełną sekwencję klonu 10.
Figura 5a-b - całą sekwencję nukleotydową klonu 15 zsekwrncJonowαnoge z dwóch końców - 5' i 3' (a) i kodowaną przez nie sekwencję nukleotydową (b). Klon 15, który jest częściowym klonem cDNA okazał się kodować białko o długości 172 aminokwasów
Klony 9 i 15 są częściowymi klonami, którym brakuje 5' końcowej części sekewenjji kodujących DNA. Wszystkie wydedukowane sekwencje aminokwasowe, pokazane na fig. 3b, 4b i 5b rozpoczynają się od pierwszego nukleotydu odpowiedniego klonu.
Sekwencja klonu 10 (klon z częściowym cDNA), który był najbardziej starannie analizowany, koduje białko nazwane NMPI, jak wspomniano powyżej, zawierające motywy kinazy białkowej Ser/Thr. Klon cDNA pełnej długości otrzymany poprzez PCR przy zastosowaniu klonu 10, jak zaznaczono powyżej, okazał się być nową kinazą wiążącą się z TRAF2, NIK, jak wspomniano powyżej.
190 709
Pełna sekwencja nukleotydowa i wydedukowana sekwencja aminokwasowa NIK są pokazane na fig 6, na której kodon inicjatorowy ATG w pozycji nukleotydowej 232 jest podkreślony i w której kodon stop w pozycji nukleotydowej 3073 jest zaznaczony gwiazdką. W pełni zsekwencjonowany klon NIK na fig. 6 ma długość 4596 nukleotydów, w obrębie których zawarta jest sekwencja kodująca NIK, przy czym koduje ona białko NIK złożone z 947 reszt aminokwasowych.
Przeszukanie banku danych ujawniło, że nowa sekwencja aminokwasowa NIK wykazuje szczególnie wysoką homologię do grupy kinaz, spośród których o kilku wiadomo, że pełnią rolę kinazy MAP.
Figura 7 pokazuje dopasowanie:
- mysiej MEKKK (S1),
- BYR2 (S2),
- Tpl-2 (S3),
- onkogenu mięsaka Ewinga (S4),
- SS3 (S5),
- (STE11) (S6),
- (NPK1) (S7),
- (BCK1) (S8) i
- (NIK) (S9).
Niektóre z tych kinaz zostały zidentyfikowane na podstawie aktywności onkogennej, którą posiada ich zmutowana postać.
Przykład 3
Ekspresja sklonowanych cDNA i ich koimmunoprecypitacja z TRAF2.
Komórki HeLa-Bujard transfekowano TRAF2 wyznakowanym przy użyciu FL-AG, w wektorze ekspresyjnym opartym o pHUD10-3 i konstruktami zawierającymi ORF jednego z klonów 9, 10 lub 15, z dołączonym epitopem HA, jak opisano w Materiałach i Metodach (iv). Komórki hodowano przez 24 godz. w podłożu Dulbecco's Modified Eagle's Medium (DMEM) plus 10% surowicy cielęcej z dodaną metioniną 35S i cysteiną 35S. Na zakończenie tego czasu inkubacji komórki poddano lizie w buforze do radioimmunoprecypitacji (10 mM Tris-HCl, pH 7,5, 150 mM NaCl, 1%o Nonident P-40, 1% dezoksycholan, 0,1% SDS i 1 mM EDTA; 1 ml/ 5 x 105 komórek) i lizat wstępnie klarowano poprzez inkubację z niezależną surowicą odpornościową z królika i kulkami Protein B-Sepharose (Pharmacia, Sweden). Immunoprecypitację przeprowadzano poprzez 1-godzinną inkubację w 4°C próbek lizatu z monoklonalnymi przeciwciałami anty-FLAG (otrzymanymi z Eastman Kodak Co.) lub anty-HA (klon 12CA5 (Field, J. i wsp., (1988)). Wyrażone białka analizowano w żelu SDS-PAGE, który następnie poddawano autoradiografii.
Wyniki tych doświadczeń pokazały, że częściowe cDNA klonów 9, 10 i 15 kodowały białka o ciężarze cząsteczkowym około 50-65,45 i 26 kDa, odpowiednio.
Nie można było stwierdzić żadnych interakcji między klonem 15 a TRAF2, ale białka kodowane przez klon 9 i 10 (NIK), jak również pełnej długości NIK podlegały koimmunoprecypitacji z białkiem TRAF2. Próbki komórek, które były kotransfekowane TRAF2 i jednym z tych dwóch klonów i poddane immunoprecypitacji bądź z przeciwciałami anty-FLAG, bądź anty-HA, a następnie analizie poprzez SdS-PagE, jak opisano powyżej, wykazywały trzy pasma w każdej ścieżce; jedno pasmo odpowiadające białku kodowanemu przez klon 9 lub 10 i dwa inne stanowiące dublet o wielkości 42 i 44 kDa, odpowiadający białku TRAF2.
Przykład 4
Testy funkcjonalne
Stwierdzono, że NIK daje indukcję NF-KB przy zastosowaniu testu opóźnienia w żelu. Typowo, 0,5-1 x 106 komórek 293 EBNA transfekowano bądź 10 pg klonu 10 w pcDNA3 (fig. 7, ścieżka 1), bądź 3 ug pcDNA3, zawierającego cDNA dla receptora TNF p75 (fig. 7, ścieżka 3), bądź jednocześnie klonem 10 (10 pg) i receptorem TNF p75 (3 pg), na fig. 7, ścieżka 2. W każdej z transfekcji całkowita ilość DNA doprowadzano do 15 pg „pustym” wektorem pcDNA3. Jako kontrola służyły komórki 293 EBNa transfekowane 15 pg samego wektora (fig. 7, ścieżka 4). Komórki hodowano przez 24 godz. w podłożu DMEM + 10% surowica cielęca, a następnie zbierano i traktowano według Schreiber i wsp. (Schreiber, E.
190 709 i wsp., (1989). Próbki rozdzielano w 5% żelu poliakryloamidowym. NF-KB śledzono przy zastosowaniu jako sondy zestawu wyznakowanych radioaktywnie 32P oligonukleotydów, odpowiadających miejscom wiązania NF-KB. (Sondami były GATtGCCATTGGGGATTTCCTCTTT i CAGTAAAGAGGAAATCCCCAATGG).
Jak pokazano w tabeli IV, NIK indukuje NF-KB nawet bardziej wydajnie niż TRAF2. Z drugiej strony, klon 10 nie dawał tego efektu wcale.
Test na gen wskaźnikowy przeprowadzono jak następuje:
Komórki 293 EBNA kotransfekowano wektorem pcDNA3 zawierającym HIV LTR, dołączonym do genu wskaźnikowego lucyferazy, razem z plazmidem pcDNAS zawierającym cDNA dla samego receptora p75 TNF, plazmidem pcDNA3 zawierającym sam cDNA klonu 10 lub cDNA dla receptora p75 TNF i plazmidem pcDNA3 wymienionym w tabelach IV i V.
Wynik pokazany w tabeli V pokazuje:
a) że transfekcji klonem 10 nie aktywuje indukcji NF-KB, podczas gdy NIK czyni to silnie,
b) że klon 10, tak samo jak NIK, w której aktywna lizyna została zastąpiona alaniną (NIK*) silnie hamuje indukcję NF-KB przez cDNA wymienione w pierwszej kolumnie tabeli IV.
c) delecja 3' UTR NIK (NIK-3'UTR) ogromnie zwiększa jej ekspresję i w konsekwencji jej zdolność do blokowania indukcji NF-KB, jeżeli jest wyrażana w postaci zmutowanej.
Tabela IV
Aktywacja NF-KB przez NIK. Test opóźnienia w żelu. Liczby są zliczeniami rozpadów radioaktywnych wykrywanych przez płytkę „phosphoimager”.
Transfekowany cDNA zliczenia powierzchnia (mm2)
pusty wektor 327 70,7
TRAF2 3411 70,7
NIK 6532 70,7
klon 10 343 70,7
Tabela V
Dominujący negatywny efekt klonu 10, mutanta NIK K——A na indukcję NF-KB poprzez nadprodukcję TRAF2, TRADD, MORT1/FADD, TNFR-i, TNFR-II, hybrydy TW-R-I/FAS, RIP i aktywację NF-KB przez NIK. Test lucyfera/y.
Induktor pusty NIK NIK- Klon NIK* NIK*- TRAF2
NF-KB wektor 3'UTR 10 3'UTR 225-
501 aa
TRAF2 300 1000 25 30 ND
TRADD 300 800 1000 100 100 5 ND
MORT1/FADD 300 1000 25 80 90
TNFR-I 200 800 1000 50 100 5 ND
TNFR-II 200 750 800 20 90 6 ND
hybryda FAS 300 1200 25 50 30
RIP 300 800 75 50 ND
NIK 500 100 10 ND
TNF 200 80
RelA 1000 ND ND 1000 ND ND ND
Przykład 5
Dodatkowa charakterystyka NIK
Poza testami na specyficzność z przykładu 2, powyżej, dalsze badanie w testach dwuhybrydowych właściwości wiązania NIK wykazały (wyniki nie pokazane), że wyjściowo wyizolowany częściowy klon NIK (NIK 624-947) wiąże się specyficznie z C-końcowym regionem TRAF2 (domeną CTRAF), podczas gdy, przociwnro. pełnej długości NIK wiąooł się zarówno do domeny C-TRAF, jak i regionu przed nim (domena N-TRAF). NIK również nie wiąże się zTRAF3. Ponadto, hybrydowe białko zawierające domenę C-TRAF z TRAF2 i N-końcową część TRAF3 mógł wrąooć niepełną cząsteczkę NIK (NIK 624-947), ale nie NIK pełnej długości, wskazując, że wiąoonro pełnej długości NIK z TRAF2 wymaga zarówno domeny C-TRAF, jak i N-TRAF TRAF2.
190 709
Ponadto, NIK nie łączy się ze sobą, ani nie wiąże się z wewnątrzkomórkowymi domenami receptorów p55 i p75, receptora TNF; receptora CD40 (przedstawiciel rodziny receptorów TNF/NgF); i FAS/APO1 (receptora CD9S). NIK nie wiąże się również z wewnątrzkomórkowymi białkami związanymi z tymi receptorami, jak na przykład TRADD, MORTI i RIP. Wyniki te korelują z danymi pokazanymi powyżej w tabeli II, dotyczącymi specyficzności wiązania białek kodowanych przez klony 9, 10 i 15. Różne oddziaływania pomiędzy różnymi receptorami i białkami są przedstawione schematycznie na fig. 2a, i 2b, przy czym fig. 2b jest bardziej kompletna.
Analiza Northern wykazała, że występuje pojedynczy transkrypt NIK, wyrażany w różnych tkankach na różnych poziomach, którego wielkość wynosi około 5000 nukleotydów, czyli zasadniczo tyle samo, co sklonowany cDNANIK (jak wspomniano powyżej, patrz fig. 6).
Ponadto, jak zaznaczono powyżej w odniesieniu do białka kodowanego przez klon 10 (wyjściowo oznaczonego NMPI), białko NIK pełnej długości ma również motyw kinazy serynowo/treoninowej, podobny do kilku kinaz kinazy kinazy MAP(MAPKKK), co również widać z dopasowania sekwencji pokazanego na fig. 7.
Testowanie in vitro aktywności kinazy NIK wykazało, że NIK może być autofosforylowana, ale nie wtedy, gdy lizyna w miejscu aktywnym i sąsiadująca lizyna, zostaną zastąpione alaniną (analog NIK lub muteina oznaczona jako NIK KK429-430AA, co wskazuje że lizyny w pozycji 429 i 430 są zastąpione przez alaninę). To również koreluje z powyższymi wynikami przedstawionymi w przykładzie 4 i pokazanymi w tabeli IV w odniesieniu do muteiny NIK*.
Jak wspomniano powyżej, nadprodukcja NIK w komórkach 293 EBNA indukuje NF-KB nawet do wyższego stopnia, niż nadprodukcja TRAF2, ale nadprodukcja niepełnego NIK (NIK 624-947) nie prowadzi do aktywacji NF-KB. Ponadto, wspomniane powyżej analogi/muteiny NIK KK429-430AA również nie dają aktywacji NF-KB, kiedy są nadprodukowane w tych komórkach. A zatem, indukcja NF-KB przez NIK zależy od nienaruszonej funkcji kinazy NIK. W przeciwieństwie do tego, białko RIP (patrz fig. 2a, b), które również ma domenę kinazową, może nadal indukować aktywację NF-KB, kiedy jego aktywność kinazowa jest zaburzona przez mutację.
Aktywacja NF-KB w wyniku nadekspresji NIK była nie do odróżnienia od uzyskiwanej przez traktowanie limfocytów TNF i jak przy nadekspresji TNF lub TRAF2, głównymi NF-KB aktywowanego NIK były p50 i p65. Nadekspresja NIK powodowała degradację I-KB i blokowanie tej degradacji przez N-acetylo-Leu-Leu-norleucynol (ALLN), czego rezultatem (jak w przypadku TNF) jest akumulacja cząsteczek I-KB o wolniejszej migracji w SDS-PAGE, wskazującej na ufosforylowanie I-KB.
Inne testy wykazały, że NF-KB może być aktywowany w komórkach 293-EBNA przez TNF, jak również przez nadekspresję receptorów tNf p55 i p75 oraz nadprodukcję receptora TNF p55, w którym wewnątrzkomórkowa domena receptora TNF p55 jest zamieniona na domenę receptora FAS/APO1. NF-KB może być również aktywowany przez TRAF2, TRADD, RIP lub MORTI, ale nie przez mutanta delecyjnego MORTI, pozbawionego regionu znajdującego się przed „domenąśmierci” MORTI. Jak wspomniano powyżej, NIK pełnej długości, ale nie muteina NIK KK429-430AA, ani nie część NIK (NIK 624-947), indukuje aktywację NF-KB. Ponadto ekspresja muteiny NIK KK429-430AA lub NIK 624-947 w komórkach 293-EBNA łącznie z dowolnym z powyżej wspomnianych czynników tj. receptorów lub związanych z nimi białek, prowadzi w rezultacie do blokowania indukcji aktywacji NF-KB przez wszystkie te czynniki, wskazując, że aktywność NIK jest bezpośrednio zaangażowana w tą indukcję NF-KB. Podobnie, powyżej obserwowane hamowanie przez nieaktywne cząsteczki NIK koreluje z mniejszą redukcją I-KB.
NF-KB jest również aktywowany przez IL-1 (patrz schemat na fig. 2b). Efekt ten jest niezależny od TRAF2 (IL-1 nie wiąże się z TRAF2 i działanie IL-1 nie jest blokowane przez ekspresję dominujących negatywnych mutantów TRAF2). Jednakże to działanie IL-1 jest hamowane przez ekspresję mutantów NIK. Ponadto na aktywność NF-KB obserwowaną w wyniku nadprodukcji homologa Rel p65 w komórkach 293-EBNA nie miała wpływu koekspresja mutantów NIK z brakiem aktywności kinazy, wskazując, że NIK nie ma bezpośredniego wpływu na działanie białek Rel, ale uczestniczy w ich aktywacji indukowanej poprzez receptor.
190 709
Aktywność cytotoksyczna TNF (w której pośredniczy proteaza MACH zawiązana z MORT1 - patrz fig. 2b) podlega negatywnej regulacji przez niektóre geny indukowane przez NF-KB. Antagonizujące konsekwencje indukcji genu, w której pośredniczy NF-KB i aktywacji MACH, mogą wyjaśniać dlaczego sam TNF, jak również IL-1 mogą indukować komórkową odporność na cytotoksyczność TNF. Zgadza się to także z wykryciem, zgodnie z niniejszym wynalazkiem, że ekspresja dominujących negatywnych mutantów NIK w 293-EBNA znacząco zwiększa ich podatność na zabijanie przez TNF i że nadprodukcja natywnej (pełnej długości, typu dzikiego) NIK hamowała zabijanie komórek przez TNF lub przez receptor TNF p55 (receptor ten ma wewnątrzkomórkową domenę zawierającą region domeny śmierci, który, jeżeli jest wyrażany w komórkach w nieobecności jakiegokolwiek TNF, może indukować sam z siebie cytotoksyczność komórki (patrz powyżej w odniesieniu do publikacji obecnych wynalazców i równocześnie biegnących zgłoszeń będących ich współwłasnością).
Przykład 6
Dalsze testy funkcjonalne na aktywność biologiczną NIK.
Zgodnie z niniejszym wynalazkiem stwierdzono również, że ekspresja dominujących negatywnych mutantów NIK może również blokować indukcję aktywacji NF-KB w komórkach 293-EBNA przez inne czynniki indukujące, włączając w to: (i) dobrze poznaną bakteryjną endotoksynę, lipopolisacharyd (LPS); (ii) dobrze poznany octan mirystylanu forbolu, który jest znanym aktywatorem kinazy białkowej C; i (iii) białko TAX HTLV-1.
Ponadto stwierdzono również, że ekspresja dominujących negatywnych mutantów NIK w komórkach 293-EBNA zasadniczo nie wpływa na indukowaną TNF aktywację kinazy Jun, wskazując, że NIK działa w specyficzny i prawdopodobnie bezpośredni sposób, zwiększając fosforylację I-KB bez wpływu na kinazy MAP zaangażowane w fosforylację Jun. W świetle powyższego wygląda na to, że aktywność kinazy NIK jest częścią kaskady przekazywania sygnałów, która jest odpowiedzialna za aktywację NF-KB, która to kaskada jest wspólna dla dwóch receptorów TNF, receptora FAS/APO1 i receptora IL-1. Wydaje się, że NIK spełnia specyficzną rolę w tej kaskadzie. Wiązanie się NIK do TRAF2 może służyć do umożliwienia NIK podlegania wpływowi zarówno receptorów TNF, jaki i receptora FAS/APO1. Przez analogię do kaskady kinazy MAP, NIK może służyć jako substrat dla kinazy (MAPKKKK) po rekrutacji przez TRAF2 do pobudzonych receptorów', a zatem wówczas, kiedy NIK jest ufosforylowana, fosforyluje i aktywuje inne kinazy (lub może indukować bezpośrednio aktywację NF-KB poprzez bezpośrednią fosforylację I-KB). Indukowana poprzez IL-1 aktywacja NF-KB jest niezależna od TRAF2, a zatem w aktywacji NIK przez receptor IL-1 może pośredniczyć inne białko, IRAK, kinaza serynowo/treoninowa, która jest przyłączana do receptora IL-1 po stymulacji (Cao i wsp., 1996b), jak również TRAF6, który wiąże IRAK (patrz Cao i wsp., 1996a, jak również schemat na fig. 2b). Jak wspomniano powyżej celem NIK, lub kaskady kinaz przez nią aktywowanych jest prawdopodobnie I-KB. NIK może również fosforylować białka TRAF lub białka regulatorowe, które wiążą się do nich, na przykład TANK-I/TRAF (patrz Cheng i Baltimore.1996; Rothe i wsp., 1996), tworząc miejsca zakotwiczenia dla innych białek.
190 709
Literatura:
FAdelman et al., (1983) DNA 2, 183.
2. Alnemri, E.S. ć- al. (1995a J . 1iol. Chem. 270, 2-43 17.
3. Ausubel, F.M. et al. eds., Current ProtoGo^ in Molecular Biolog}..
4. Baeuerle, P.A, and Henkel, T. (1994) Annu Rev Immunol.
5. Bazan, J.F. (1993). Current Biology 3, 603-606.
6. Berberich, I, Shu, G..L., and Clark, E.A. (1994)..-J Immunol 153, 4357-66.
7. Beutler, B., and van Huffel, C. (1994). Science 264, 667-8.
8. Blank, V., Kourilsky, P., and Israel, A. (1992). Trends Biochem. Sei 17, 135-40.
9. Boldin, M.P. et al. (1995a) J. Biol. Chem. 270, 337-341.
10. Boldin, M.P., Varfolom9ev, E.E., Pancer, Z., Mett, I.L., Camonis, J.H., and Waliach,
D. (19955). J. Biol. Chem. 270, 7795-7798.
11. Boldin, M.P. et al. (1996) Cell 85, 803-815.
12. Cao, Z. et al. (1996a) Nature 383, 443-446.
13. Cao, Z. et al. (1996b) Science 271, 1128-1131.
14. Chen, C.J. et al. (1992) Ann. N.Y. Acad. Sei. 660:271-273.
15. Cheng, G., Cleary, A.M., Ye, Z-s., Hong, D.I., Lederman, S. and Baltimore, D. (1995) Science 267:1494-1498).
16. Cheng, G. and Baltimore, D. (1996) Genes Dev. 10, 963-973.
17.. Chinnalyan, A.M., ORourke, K., Tewari, M., and Dixit, V.M. (1995) Cell 81, 505-512.
18. Creighton, T.E., Proteins : Structure and Molecular Properties, W.H. Freeman & Co., San Francisco, Ca. 1983.
19. Croston, G.E., Cao, Z., and Goeddel, D.V. (1995). J Biol Chem 270,16514-7.
20. DiDonato, J.A, Mercurio, F., and Karin, M. (1995). Mol Cell Biol 15, 1302-11.
21. Durfee, T. et al. (1993) Genes Dev. 7:555-569.
22. Field, J. et al. (1988) Mol. Cell Biol. 8:2159-2165.
23. Geysen, H.M. (1985) Immunol. Today 6, 364-369.
24. Geysen, H.M. et al. (1987) J. Immunol. Meth. 102, 259-274.
25. Gilmore, T.D., and Morin, P.J. (1993). Trends Genet 9, 427-33.
26. Gossen, M. and Bujard, M. (1992) PNAS 89:5547-5551.
27. Grell, M., Douni, E., Wajant, H., Lebd9n, M., Clauss, M., Bax9in9r, B., Georgepeulos, S., Lesslauer, W., Kollias, G., Prizenmaier, K., and Schemach, P. (1995). Cell 83, 793-802.
28. Grilli, M., Chiu, J.J., and Lenardo, M.J. (1993). Int Rev Cytol.
29. Hanks, S.K., Quinn, A.M., and Hunter, T. (1988). Science 241,42-52.
30. Howard, A.D. et al. (1991) J. Immunol. 147, 2964-2969.
31. Hsu, H., Shu, H.-B., Pan, M.-G., and Goeddel, D.V. (1996). Cell 84, 299-308.
32. Hsu, H, Xiong, J., and Goeddel, D.V. (1995). Cell 81, 495-504.
33. Kaufmann, S.H. (1989) Cancer Res. 49, 5870-5878.
34. Kaufmann, S.H. (1993) Cancer Res. 53, 3976-3985.
35. Lalmanacb-Girard, A.C., Chiles, T.C., Parker, D.C., and Rojstem, T.L. (1993). J. Exp Med 177, 1215-1219.
36. Lazebnik, Y.A. et al. (1994) Nature 371, 346-347.
37. Mashima, T. et al. (1995) Biochem. Biophys. Res. Commun. 209, 907-915.
38. McDonald, P.P., Cassatella, M.A., Bald, A., Maggi, E., Romagnani, S., Gruss, H.J.,and Pizzolo, G. (1995). Eur J Immunol 25, 2870-6.
39. Messing et al., Third Cleyeland Symposium on Macromolecules and Recombinant DNA, Ed.A. Walton, Els9vier, Amsterdam (1981).
40. Milligan, C.E. et al. (1995) Neuron 15, 385-393.
41. Mosialos, G., Birkenbach, M., Yelamanc0ili, R., VanArsdale, T., Ware, C., and Kieff,
E. (1995). Cell 80,389-399.
42. Muranishi, S. et al. (1991) Pharm. Research 8, 649.
43. Nagata, S. and Golstein, P. (1995) Science 267, 1449-1456.
44. Rensing-Ehl, A., Hess, S., Ziegler-H9itbreck, H.W.L., Riethmuller, G., and Engelmann, H. (1995). J. Inlamm. 45, 161-174.
190 709
45. Rothe, M., Pan, M.-G., Henzel, W.J., Ayres, T.M., and Goeddel, D. V. (1995b). Cell 83, 1243-1252.
46. Rothe, M., Sarma, V., Dixit, V.M., and Goeddel, D.V. (1995a). Science 269, 1424-1427.
47. Rothe, M., Wong, S.C., Henzel, W.J., and Goeddel, D.V. (1994). Cell 78, 681-692.
48. Rothe, M. et al. (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93, 8241-8246.
49. Ruzicka et al., (1993) Science 260, 487.
50. Sambrook et al. (1989) Molecular cloning: a laboratory manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N Y.
51. Sano et al., (1992) Science 258, 120.
52. Sano et al., (1991) Biotechnigues 9, 1378.
53. Schreiber, E., Matthias, P., Muller, M.M. and Schaffner, W. (1989), Nuc. Acids Res.17:6419.
54. Schulz et al., G.E., Principles of Protein Structure, Springer-Verlag, New York, N.Y.1798.
55. Sleath, P.R. et al. (1990) J. Biol. Chem. 265, 14526-14528.
56. Smith, C. A., Farrah, T„ and Goodwin, R. G. (1994). Cell 76, 959-962.
57. Stanger, B.Z. et al. (1995) Cell 81, 513-523.
58. Thomberry, N.A. et al. (1992) Nature 356, 768-774.
59. Thomberry, N.A. et al. (1994) Biochemistry 33, 3934-3940.
60. Vandenabeele, P., Declercą, W., Beyaert, R., and Fiers, W. (1995). Trends Cell Biol. 5, 392-400.
61. Varfolomeev, E. E., Boldin, M. P., Goncharoy, T. M., and Waliach, D.(1996).. J. Exp. Med. in press.
62. Vassalli, P. (1992) Ann. Rev. Immunol. 10, 411-452.
63. Veira et al., (1987) Meth. Enzymol. 153, 3.
64. Wallach, D. (1996) Eur. Cytokine Net. 7, 713-724.
65. Wang, L. et al. (1994) Cell 78, 739-750.
66. Wilks, A.F. et al. (1989) Proc. Natl. Acad. Sei. USA, 86:1603-1607.
67. Zaccharia, S. et al. (1991) Eur·. J. Pharmacol. 203, 353-357.
68. Zhao, J.J. and Pick, L. (1993) Nature 365: 448-451.
190 709
LISTA SEKWENCJI (1) INFORMACJE OGÓLNE:
(i) ZGŁASZAJĄCY:
(A) NAZWA: Yeda Research and Development Co. Ltd.
(B) ADRES: Weizmann Institute of Science (C) MIASTO: P.O.B. 95 (D) STAN: Rehovot (E) KRAJ: Izrael (F) KOD POCZTOWY (ZIP): 76100 (G) TELEFON: +972-8-9344093 (H) TELEFAX: +972-8-9470739 (A) NAZWISKO: David Wallach (B) ADRES: 24 Borochov Street (C) MIASTO: Rehovot (E) KRAJ: Izrael (F) KOD POCZTOWY (ZIP): 76406 (A) NAZWISKO: Nikolai Malinin (B) ADRES: Beit Clore, Weizmann Institute of Science (C) MIASTO: Rehovot (E) KRAJ: Izrael (F) KOD POCZTOWY(ZIP): 76100 (A) NAZWISKO: Mark Boldin (B) ADRES: Beit Clore, Weizmann Institute of Science (C) MIASTO: Rehovot (E) KRAJ: Izrael (F) KOD POCZTOWY(ZIP): 76100 (A) NAZWISKO: Andrei Kovalenko (B) ADRES: Beit Clore, Weizmann Institute of Science (C) MIASTO: Rehovot (E) KRAJ: Izrael (F) KOD POCZTOWY(ZIP): 76100 (A) NAZWISKO: Igor Mett (B) ADRES: 60 Levin Epstein Street (C) MIASTO: Rehovot (E) KRAJ: Izrael (F) KOD POCZTOWY(ZIP): 76462 (ii) TYTUŁ WYNALAZKU: Modulatory czynnika związanego z receptorem TNF (TRAF) , ich wytwarzanie i zastosowanie (iii) LICZBA SEKWENCJI: 11 (iv) POSTAĆ MOŻLIWA DO ODCZYTANIA PRZEZ KOMPUTER:
(A) RODZAJ NOŚNIKA: Floppy diak (B) KOMPUTER: IBM PC compatible (C) SYSTEM OPERACYJNY: PC-DOS/MS-DOS (D) OPROGRAMOWANIE: Patentln Release #1.0, Version #1.30 (EPO) (v) DANE DOT. OBECNEGO ZGŁOSZENIA:
NUMER ZGŁOSZENIA: PCT/IL97/00117
190 709 (vi) DANE DOT. POPRZEDNIEGO ZGŁOSZENIA:
(A) NUMER ZGŁOSZENIA: IL 117300 (B) DATA ZGŁOSZENIA: 02-APR-1996 (vi) DANE DOT. POPRZEDNIEGO ZGŁOSZENIA:
(A) NUMER ZGŁOSZENIA: IL 119133 (B) DATA ZGŁOSZENIA: 26-AUG-1996 (2) INFORMACJA DLA ID. SEKW. NR:1:
(i) CHHAyAKTERYSTYKK SEKKWEJCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 1906 par zasad (B) RODZAJ: kwas nukleinowy (H) NIHIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) RODZAJ CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: ID. SEKW. NR: 1:
HATTGGGTCA CGCGGTGGCG GCGCTCTAGA ATAGTGGATC CCCCGGGCTG caggaattcg 60
ATTHGAGGHH ACGAAGGCCG GCGGCGCGGC GCANGCACCG GCCCGGGGAN AGGCNCCATG 120
AGCGGATCNH NGAACNATGA CAAAAGACAA TTTCTGCTGG AGCGACTGCT GGATGCAGTG 130
AAAHAGTGCH AGATCCGCTT TNGAGGGAGA AAGGAGATTG CCTCGGATTC CGACAGCAGG 240
GTCACCTGTC TGTGTGCCCA GTTTGAAGCC GTCCYGCAGC ATGGCTTGAA GAGGAGTCGA 300
GGATTGGCAC TCACAGCGGC AGCGATCAAG CAGGCAGCGG GCTTYGCCAG CAAAACCGAA 360
ACAGAGCCCG TGTTCTGGTA CTACGTGAAG GAGGYCHYHA ACAAGCACGA GCTGCAGCGC 420
TTCTACTCCC TGCGCCACAT CGCCTCAGAC GTGGGCCGGG GTCGCGCCTG GCTGCGCTGT 430
GCCCTCAACG AACACTCCCT GGAGCGCTAC CYGCACATGC TCCTGGCCGA CCGCTGCAGG 540
CTGAGCACTT TTTATGAAGA CTGGTCTTTT GTGATGGATG AAGAAAGGTC CAGTATGCTT 600
CCTACCATGG CAGCAGCTCT GAACTCCATA CTCTTYGCGA TTiACATCGA CAACAAGGAT 660
TTGAACGGGC AGAGTAAGTT TGCTCCCACC GTTTCAGACC TCTTAAAGGA GTCAACGCAG 720
AACGTGACCT HHTTGCTGAA GGAGTCCACG CAAGGAGTGA GCAGCCTGTT CAGGGAGATC 730
ACAGCCTCCT CYGCCG^TC CATCCTCATC AAACCTGAAC AGGAGACCGA CCCTTGCCTG 340
TCGTGTHHAG GAATGTCAGT GCTGATGCCA AATGCAAAAA GGAGCGGAAG AAGAAAAAGA 900
AAGTGACCAA HAYAAYHTHA TTTGATGATG AGGAAGATGA GCAGAACTCT GGGGACGTGT 960
TTAAAAAGAC ACCTGGGGCA GGGGAGAGCT CAGAGGACAA CTCCGACCGC TCCTCTGTCA 1020
ATATCATGTC HGHHTTTGAA AGCCCCTTCG GGCCTAACTC CAATGGAATC AGAGCAGCAA 1030
190 709
JTJATGGAAA ATTGATTCCC TGTCTTTGAA CGGGGAGTTT GGGTACCAGA AGCTTGATGT 1140
GAAAAGJATJ GATGATGAAG ATGTGGATGA AAACGAAGAT GACGTGTATG GAAACTCATC 1200
AGGAAGGAAG CACAGOGGCC ACTCGGAGTC GCCCGAG^G CJAJTGGAAG GGAACACCTG 1260
JJTJTJJJAG ATGCACAGCT GGGCTCCGCT GAAGGTGCTG CACAATGACT CCGACATCCT 1320
CTTCCCTGTC AGTGGCGTGG GCTCCTACAG CCCAGCAGAT GCCCCCCTCG GAAGCCTGGA 1380
GAACGGGACA GGACCAGAGG CCCGGATCCT GGACTTCGGT ACAGTGTGGA 1440
AGCCAGCTCT C^GGCCUG GAAGTCCTCT GAGCAGCCIG TTACTTCTGC CTCAGIGCCA 1500
GAGTCCATGA CAATTAGTGA A^GCGCCAG GCCACTGTGG CCATGATGAA CAGGAAGGAT 1560
GAGCTGGAGG AGGAGAACAG ATCACTGCGA AACraGCTCG ACGGTGAGAT GGAGCACTCA 1620
GCCGCGCTCC GGCAAGAGGT GGACACCTTG AAAAGGAAGG TGGCTGAACA GGAGGAGCGG 1680
CAGGGCATGA AGGTCCAGGC GCTOGCCAGC TATCTTTGCT ATTTTGTGAG GAGATTCTAA 1740
CJCJAJGTGA GAACCATGTG GTGGAGAAAT GGAGGGAGAG AGAAATCCAA CAGTTCCIGA 1800
TAGTCTCATT TGAGCTCCTG GATCCAGTCT TTCCTGAAGC TGTGTTTCCT CTGGACTTTT 1860
CATGTATGTG AGCCAATAAA TTGCTTTCAT TCCTTGAHA AAAAAA 1906
(2) INFORMACJA DLA ID . EKKW. CR:: 2:
(i) CffiARKTERYST WA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 604 aminokwasy (B) RODZAJ: aminokwas (C) NICIOWOĆĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) RODZAJ CZĄSTECZKĆ: toi&iko (xi) OPIE EKKWKCJJI: ID. EKKW. CR: 2:
Xaa 1 Thr Gly Pro Gly 5 Xaa Gly Xaa Met Eer 10 Gly Eer Xaa Asn Xaa 15 Asp
Lys Arg Gin Phe 20 Leu Leu Glu Arg Leu 20 Leu Asp Ala Val Lys 30 Gin Cys
Gin Ile Arg 35 Phe e pa GXa Arg Lys 40 Glu 11 e Ala S er Asp 45 Ser Asp Ser
Arg Val 50 Thr Cys Leu Cys Ala 55 Gin Phe Glu Ala Val 60 Leu Gin His Gly
Leu yys Ar g er g r^r g Gly Leu Al a Le u Th r Al a Al a Al a 11 e Ly s Gin
70 75 80
Ala Ala Gly Phe Ala Eer Lys Thr Glu Thr Glu Pro Val Phe Trp Tyr
190 709
90 95
Tyr Val Lys Glu Val 100 Leu Asn Lso His 105 Glu Leu Gin Arg Pile 110 Tyr Ser
Leu Arg His Ile Ala Seo Asp Val Gly Arg Gly Arg Ala Trp Leu Arg
115 110 115
Cys Ala Leu Asn Glu His Ser lnu Glu Arg T yi unr His Me O Leu Leu
130 115 115
Ala Asp Arg 0ys Arg Leu Ler Thr Phe Ty r GlP Asp Trp Ser Phe T^ial
145 150 155 160
Met Asp Glu G1g Arg Ser Ser Met Leu Pro ThL Met Ala Ala Gly Leu
165 170 H7>
Asn Ser He Leu Phe Ala Ilo Asn Asp Asn Lys Asp Leu Asn Gly
180 185 110
Gin Ser Lys Phe Ala Pro Thr Val Ser Ans Llu Llu Lys Glu Ser Thr
195 20 0 22)0
Gin Asn Val Thr Ser Leu Leu Ljy GSu Ssr Thr Gin Gly Val Ser Sir
210 22.1 222
Leu Phe AAg Oli I 0e Ths Ala Asr Ser Al a Val rer Ile Leu Ile Lys
225 220 235 240
Pro Glu Gin G1g uOr Ash Arp Pr> Leu ys r CyL uiu Gly Met Ser Val
245 250 225
Leu Met P^o Oisn A 0a Lns Arg Lys Gly rg o Ari By s Ang Lys Xaa Pro
260 220 227
Thr Xaa Ser Hii Leu Met tfet TAg Lys Mte Ssu 0Ag OTr Llu Gly Thr
275 228 228
Cys Leu Lys Aat His Lhu Gly LOu Gly Syg a 0g ynn 0Ag Thr Thr Pro
290 299i 330
Thr Ala Ppc Oeu u or Ile Ser Sys Pro yro LeP Vys Ala Pro Ser Gly
305 331 315 332
Leu Thr Ppc Met G 0u Sis GOu Glu Gin leo Mei ALu Asn Xaa Phe Pro
325 330 33^
Val Phe du 0An g 0y Vg1 Trp Val Pro Glu Al ai Xaa Cys Glu Lys His
340 335 335
Arg Xaa Xaa Anr Cys Gly Xaa Lys Arg JAg Xaa TAg Val Trp Lys LeL
355 330 330
Ile Arg Lys GGu Ala GAs Gly Gin Leu syy VaL uis 0Ag Glu Ala Thr
370 337 330
Gly Arg GGu Ois Leu PLO Leu Pro Asp Al a Gin Pnu Gly Ser Ala Glu
385 339 339 400
Gly Ala Ala Gin Xaa Leu Arg His Pro Leu Pro Cys Gin Trp Arg Gly
190 709
405 410 415
Leu Leu Gin Pro Ser Arg Cys Pro Pro Arg Lys Pro Gly Glu Arg Asp 420 425 430
Arg Thr Arg Gly Pro Arg Ser Pro Gly Ser Trp Thr Ser Val Gin Cys 435 440 445
Gly Ser Gin Leu Ser Arg Pro Arg Lys Ser Ser Glu Gin Pro Val Thr 450 455 460
Ser Ala Ser Val Pro Glu Ser Met Thr Ile Ser Glu Leu Arg Gin Ala
465 470 475 480
Thr Val Ala Met Met Asn Arg Lys Asp Glu Leu Glu Glu Glu Asn Arg
485 490 495
Ser Leu Arg Asn Leu Leu Asp Gly Glu Met Glu His Ser Ala Ala Leu 500 505 510
Arg Gin Glu Val Asp Thr Leu Lys Arg Lys Val Ala Glu Gin Glu Glu 515 520 525
Arg Gin Gly Met Lys Val Gin Ala Leu Ala Ser Tyr Leu Cys Tyr Phe 530 535 540
Val Arg Arg Phe Xaa Pro His Val Arg Thr Met Trp Trp Arg Asn Gly
545 550 555 560
Gly Arg Glu Lys Ser Asn Ser Ser Xaa Xaa Ser His Leu Ser Ser Trp
565 570 575
Ile Gin Ser Phe Leu Lys Leu Cys Phe Leu Trp Thr Phe His Val Cys 580 585 590
Glu Pro Ile Asn Cys Phe His Ser Leu Lys Lys Lys 595 600 (2) INFORMACJA DLA ID. SEKW. NR:3:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 2631 par zasad (B) RODZAJ: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) RODZAJ CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: ID. SEKW. NR: 3:
CCCCTCTCAC AGCCCAGGCC ATCCAAGAGG GGCTGAGGAA AGAGCCCATC CACCGCGTGT 60
CTGCAGCGGA GCTGGGAGGG AAGGTGAACC GGGCACTACA GCAAGTGGGA GGTCTGAAGA 120
GCCCTTGGAG GGGAGAATAT AAAGAACCAA GACATCCACC GCCAAATCAA GCCAATTACC 180
ACCAGACCCT CCATGCCCAG CCGAGAGAGC TTTCGCCAAG GGCCCCAGGG CCCCGGCCAG 240
190 709
CTGAGGAGAC AACAGGCAGA GCCCCTAAGC TCCAGCCTCC TCTCCCACCA GAGCCCCCAG 300
AGCCAAACAA GTCTCCTCCC TTGACTTTGA GCAAGGAGGA GTCTGGGATG TGGGAACCCT 360
TACCTCTGTC CTCCCTGGAG CCAGCCCCTG CCAGAAACCC CAGCTCACCA GAGCGGAAAG 420
CAACCGTCCC GGAGCAGGAA CTGCAGCAGC TGGAAATAGA ATTATTCCTC AACAGCCTGT 480
CCCAGCCATT TTCTCTGGAG GAGCAGGAGC AAATTCTCTC GTGCCTCAGC ATCGACAGCC 540
TCTCCCTGTC GGATGACAGT GAGAAGAACC CATCAAAGGC CTCTCAAAGC TCGCGGGACA 600
CCCTGAGCTC AGGCGTACAC TCCTGGAGCA GCCAGGCCGA GGCTCGAAGC TCCAGCTGGA 660
ACATGGTGCT GGCCCGGGGG CGGCCCACCG ACACCCCAAG CTATTTCAAT GGTGTGAAAG 720
TCCAAATACA GTCTCTTAAT GGTGAACACC TGCACATCCG GGAGTTCCAC CGGGTCAAAG 780
TGGGAGACAT CGCCACTGGC ATCAGCAGCC AGATCCCAGC TGCAGCCTTC AGCTTGGTCA 840
CCAAAGACGG GCAGCCTGTT CGCTACGACA TGGAGGTGCC AGACTCGGGC ATCGACCTGC 900
AGTGCACACT GGCCCCTGAT GGCAGCTTCG CCTGGAGCTG GAGGGTCAAG CATGGCCAGC 960
TGGAGAACAG GCCCTAACCC TGCCCTCCAC CGCCGGCTCC ACACTGCCGG AAAGCAGCCT 1020
TCCTGCTCGG TGCACGATGC TGCCCTGAAA ACACAGGCTC AGCCGTTCCC AGGGGATYTG 1080
NCCAGCCCCC CGGCTCARCA GNTGGGAACC AGGGCCTCGN CAGCNAGCNA AGGTNGGGGG 1140
CAAGCNAGAA TGCCTCCCAG GATTTCACAN CCTGAGCCCN TGCCCCANCC CTGCTGAADA 1200
AAACAYTNCC GCCACGTGAA GAGACAGAAG GAGGATGGNC AGGAGTTNNA CCTYGGGGAA 1260
ACAAAACAGG gatctttntt CTGCCCCTGC TCCAGTNCGA GTTGGCCTGN ACCCGCTTGG 1320
ANTCAGTGAC catttgttgg CAGANCAGGG GAGAGCAGCT TCCAGCCTGG GTCAGAAGGG 1380
GTGGGCGAGC CCTTCGGCCC CTCACCCTNC CAGGCTGCTG TGNAGAGTGT CAAGTGTGTA 1440
AGGGNCCCAA ANCTCAGGNT TCAGTGCAGA ACCAGGTNCA GCAGGTATGC CCGCCCGNTA 1500
GGTTAANNGG GGGCCCTCTN AAACCCCTTG CCTNGGCCTN CACCTNGGCC AGCTCANCCC 1560
CTTTTGGGTG TAGGGGAAAA GAATGCCTGA CCCTGGGAAG GCTWCCCTGG TAGAATACAC 1620
CACACTTTTC AGGTTGTTGC AACACAGGTC CTGAGTTGAC CTCTGGTTCA GCCAAGGACC 1680
AAAGAAGGTG TGTAAGTGAA GTGGTTCTCA GTNCCCCAGA CATGTGCCCC TTTGCTGCTG 1740
GCTACCACTC TTCCCCAGAG CAGCAGGCCC CGAGCCCCTT CAGGCCCAGC ACTGCCCCAG 1800
ACTCGCTGGC ACTCAGTTCC CTCATCTGTA AAGGTGAAGG GTGATGCAGG ATATGCCTGA 1860
CAGGAACAGT CTGTGGATGG ACATGATCAG TGCTNAAGGN AAAGCAGCAG AGAGAGACGY 1920
TCCGGCGCCC CAGNCCCCAC TNATCAGTGT NCCAGCGTGC TNGGTTNCCC CAGNAGCACA 1980
GCTNCAGNCA TCANCACTGA CACTNCACCC TNGCCCTGCC CCTNGGCCAN GAGGGTACTG 2040
190 709
CCGNACGGCA CTTTGCACNT CTGATGNACC TCAAAGCACT TTCATGGCTN GCCCTCTNNG 2100
GCAGGGNCAG GGNCAGGGNC AGTGACANCT GTAGGNAGCA TANGCAANGC CAGGAGATGG 2160
GGTGNAAGGG ANGACAGTCT TGAGCTGTCC ANCATGCATG TGACTNCCTC AAACCTCTTN 2220
NCCAGNATTT CTCTAAGAAT AGCANCCCCC TTNCCCCATT GCCCCAGCTT AGCCTCTTCT 2280
CCCAGGGGAG CTANCTCAGG ACTCACGTAG CATTAAATCA GCTGTGNAAT CGTCAGGGGG 2340
TGTCTGCTAG CCTCAACCTC CTGGGGCAGG GGACGCCGAG ACTCCGTGGG AGAAGCTCAT 2400
TCCCACATCT TGCCAAGACA GCCTTTNGTC CAGCTGTCCA CATTGAGTCA GACTGCTCCC 2460
GGGGAGAGAG CCCCGGCCCC CAGCACATAA AGAACTGCAG CCTTGGTACT GCAGAGTCTG 2520
GGTTGTAGAG AACTCTTTGT AAGCAATAAA GTTTGGGGTG ATGACAAATG TTAAAAAAAG 2580
GCCTTCGTGG CCTCGAATCA AGCTTATCGA TACCGTCGAC CTCGAGGGGG G (2) INFORMACJA DLA ID. SEKW. NR:4: (i) CHHARACTCRYSTYKA SEłKWEJC JI: (A) DŁUGOŚĆ: 1253 pary zasad (B) RODZAJ: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) RODZAJ CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: ID. SEKW. NR: 4: 2631
CATTGGAGTC ACGCGGTGGC GGCGCTCTAG AATAGTGGAT CCCCGGGCTG CANGGAATTC 60
GATTCGAGCC CACGAAGGCC CCTTCTTCTG TGGTCGCGGC ACGTTTACAG CCGCAAGCAC 120
CCAGCGGCAG CTGAAGGAGG CTTTTGAGAG GCTCCTGCCC CAGGTGGAGG CGGCCCGCAA 180
GGCCATCCGC GCCGCTCAGG TGGAGCGCTA TGTGCCCGAA CACGAGCGAT GCTGCTGGTG 240
CCTGTGCTGC GGCTGTGAGG TGCGGGAACA CCTGAGCCAT GGAAACCTGA CGGTGCTGTA 300
CGGGGGGCTG CTGGAGCATC TGGCCAGCCC AGAGCACAAG AAAGCAACCA ACAAATTCTG 360
GTGGGAGAAC AAAGCTGAGG TCCAGATGAA AGAGAAGTTT CTGGTCACTC CCCAGGATTA 420
TGCGCGATTC AAGAAATCCA TGGTGAAAGG TTTGGATTCC TATGAAGAAA AGGAGGATAA 480
AGTGATCAAG GAGATGGCAG CTCAGATCCG TGAGGTGGAG CAGAGCCGAC AGGAGGTGGT 540
TCGGTCTGTC TTAGAGCCTC AGGCAGTGCC AGACCCAGAA GAGGGCTCTT CAGCACCTAG 600
AAGCTGGAAA GGGATGAACA GCCAAGTAGC TTCCAGCTTA CAGCAGCCCT CAAATTTGGA 660
CCTGCCACCA GCTCCAGAGC TTGACTGGAT GGAGACAGGA CCATCTCTGA CATTCATTGG 720
190 709
CCATCAGGAT ATACCAGGAG TTGGTAACAT CCACTCAGGT GCCACUCGTC CCTGGATGAT 780
CCAAGATGAA GAATACATTG CTGGGAACCA AGAAATAGGA CCATCCTATG AAGAATTTCT 840
TAAAGAAAAG GAAAAACAGA AGTTGAAAAA ACTCCCCCCA GACCGAGTTG GGGCCAACTT 900
TGATCACAGC TCCAGGACCA GTGCAGGCTG GCTGCCCTCT TTTGGGCCGC GTCTGGAATA 960
ATGGACGCCG CTGGCAGTCC AGACATCAAC TCCAAAACTG AAGCTGCAGC AATGAAGAAG 1020
CAGTCACATA CAGAAAAAAG CTAATCATGC TCTCTACCAA CTACCATGAG GCTAAAAGCC 1080
AAAGTCAACC AAACCCCTAT TATACCTTCC ACCCAAATTC TTTATCATTG TCTTTCTTAG 1140
GAAACAGACA TACTCATTCA TTTGATTTAA TA^GTTTTA TTTTTCGGCC TTCGTGGCCT 1200
CGAATCAAGC TTATCGATAC CGTCGACCTC GAGGGGGGGC CGTACCCACT TTT 1253
(2) INFORMACJA. DLA ID. SEKW. NR: 5:
(i) CjrURAKTERYSTYIKi SEIKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 417 aminokwasów (B) RODZAJ: aminokwas (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) RODZAJ CZĄSTECZKI: bićłtko (xi) OPIS SEKWENCJI: ID. SEKW. NR: 5:
Ile Gly 1 Val Thr Arg Tir Arg Ąrg Ser Ąr g Ile Val As? Pro Ar r 55 Ala
5 10
Ala Xaa Asn Ser I Ae As? ISa His Glu GA y Pro Gle Gle Cys GI y Arg
20 25 30
Gly Thr Phe Thr A la Ala Ser Tłu? G Ig Arg GUa reu Goi Glu Ala Phe
35 40 45
Glu Arg Leu Leu Pro Gin Val Glu Alu Al a Au| a ys Ulg Ile ysrg Ala
50 55 60
Ala Gin Val Glu Arg T?r Val yrr G1v lr s G1a Arg Glu Cys ta Cys
65 7A 75 80
Leu Cys Cys Gly C ys Glu Val Arg Glu HA s Lua Ser Glu Gly is n Leu
85 90 55
Thr Vvl Leu Tyr G ly Gly Leu Leu Glu ur s Lls Glu Hos Pro GI u His
100 105 110
Lys Lys Ala Ahr A sn Lys Phe Τη? Arp GAu Agi Lys Asa Glu Val Gin
115 120 122
Met Lys Glu Lys Phe Leu Val Thr Pro Gin Asp Tyr Ala Arg Phe Lys 130 135 140
190 709
Lys 145 Ser Met Val Lys Gly Leu 110 Asp Sur Tyr Gll Glu 115 Lys Glu A^J? Lls 110
Val Ile Lys Glu Met Ala Ala Gin Ile Arg Glu Val Glu Gin Set AAg
165 110 117
Gin Glu Val Val Arg Ser Leu Glu Ppo lin Ala Val Pro Asp Pht
180 115 110
Glu Glu Gly see S sr ASu Pro Alg Ser SrA g ss G ly Mc^t Asn Ser Gin
195 2D0 2(15
Val Ala Ser Ser Leu Gin Gin Ppo Set Asn Leu Asp Leu Pro Pht Ala
210 215 220
Pro Glu Llu Asp Tsp Mer Mtu ilu Gly Prs Sei y su Thr Phe Ltu Gly
225 220 223 220
His Gin Asp Sie t so GPs VuS val Asn ly s HiA S sr GIy Ala Thr Pro
245 220 225
Pro Trp MMt Ile Gin Asp Glu Glu Tyr Ile Ma Gly .Asn Gin Glu His
260 265 270
Gly Pro Ser Tyr Glu Glu Phe Leu Lys Glu Lys Glu Lys Gin Lys Llu
275 280 285
Lys Lys Leu Pro Pro As^p Atrg Val ily AlLa Asn Phe Asp His Ser Set
290 295 300
Arg Thr Ser AHa Gly Τηο Leu Pro Ser Phe Gly Pro Arg Leu Glu Xaa
305 330 331 330
Trp Thr Ppo Leu Ala Val Gin Thr Ser Tlir Pro Lys Leu Lys Leu Gin
325 330 335
Gin Xaa Arg Ser Ser His Hu Gin Lys Lys Ala Asn His Ala Leu Tyr
340 345 350
Gin Leu Pro Xaa Gly Xaa Lys Pro Lys Ser Thr Lys Pro Leu Leu Tyr
355 360 365
Leu Pro Ppo Lys Phe Phe lis Ile Val Phe Leu Arg Lys Gin Thr Tyr
370 33^ 330
Ser Phe IIe Xaa Phe Asn Lys Val Leu Phe Phe ily Leu Arg Gly Leu
385 330 33 ii 400
Glu Ser SSr Leu Ser Ul Pro Ser Thr Ser Arg Gly Gyy Atg Thr His
405 410 4H
Phe (2) INFORMACJA DLA ID. SEKW. NR:6:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 4596 par zasad (B) RODZAJ: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza
190 709 (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) RODZAJ CZĄSTECZKI: cDNA (xi) OPIS SEKWENCJI: ID. SEKW. NR: 6:
AGCGGGGGGA CTGTGCCGTG TGGAACGTGT AGCTGTTGAA GGTGGAHTHT GTTACCATTG 60
AGGATGTTTG GAGGATGAGT ATGTGTGGCA GAGGCACACA TAAACAGGCA GAGACCCTTY 120
GCCCCYGCCT TTHTHHHHHA ACCC^GGCT GAHHTGTGTT HTHCHAGGTH TGGGATTCTA 130
AGTGACCTGC THTGTGTTTG GTCTCTCTCA GGATGAGCAC AAGCCTGGGA GATGGCAGTG 240
ATGGAAATGG HHTGHHHAGG TGHHHHTGGH TCAGCAGTGG GGCAGCAGAA GGAAHTHHHH 300
AAGCCAAAGG AGAA^GA^CGCC GCCACTGGGG AAGAAACAGA GCTCCGroTA CAAGCTTGAG 360
GCCGTGGAGA AGAGCCCTGT GTTCYGCGGA AAGTGGGAGA THHTGAATGA HGTGATTAHH 420
AAGGGCACAG CCAAGGAAGG HTHHGAGGHA GGGCCAGCTG CCATCTCTAT CATCGCCCAG 430
GCTGAGTGTG AGAATAGCCA AGAGTTCAGC CCCACCTTYT CAGAACGCAT TTYCATCGCT 540
GGGTCCAAAC AGTACAGCCA GTCCGAGAGT CTTGATCAGA THHHHAAHAA TGTGGHCHAT 600
GCTACAGAGG GCAAAA^TGGC HHGTGTGTGT TGGAAGGGAA AGCGTCGCAG HAAAGHHHGG 660
AAGAAACGGA AGAAGAAGAG HTHAAAGTHH HTGGHTHATG CAGGAGTGGC HTTGGHHAAA 720
CCCCTCCCCA GGACCCCYGA GCAGGAGAGC TGCACCATCC CAGTGCAGGA GGATGAGTCT 730
CCACTCGGCG HHHHATATGT TAGAAACACC CCGCAGTTCA HHAAGHHTHT GAAGGAACCA 340
GGHCTTGGGH AACTCYGOTT TAAGHAGHTT GGCGAGGGCC TAHGGHHGGH TCYGCCTCGA 900
TCAGAACTCC ACASA^CYGAT CAGCCCCTTG GAATGTCTGA AHHAHGTGTG GAAACTGCAC 960
HACCHHHAGG AHGGAGGHHH CCYGCCCCYG COI^CGCACC HHTTHHHHTA TAGCAGACTG 1020
CC^A^CCT THHHATTHHA HHHTHTHHAG HHHTGGAAAC CTC^CCY^? GGAGTCCTTC 1030
CTGGGCAAAC TGGHHTGTGT AGACAGCCAG AAAHHHTTGC CYGACCCACA CCTGAGCAAA 1140
CTGGCCTGTG TAGACAGTCC AAAGHHHHTG C^GGCCCAC AHHTGGAGHH HAGHTGHHTG 1200
THTHGTGGTG CCCATGAGAA GTTTTCTGTG GAGGAATACC TAGTGCATGC THTGHAAGGH 1260
AGCGTGAGCT HAAGHHAGGH CCACAGCCYG AHHAGHHTGG CC^AGACCYG GGCAGCACGG 1320
GGCTCCAGAT HHHGGGAGHH HAGHHHHAAA ACTGAGGACA ACGAGGGTGT CCYGCTCACT 1330
GAGAAACTCA AGCCAGTGGA TTATGAGTAH CGAGAAGAAG THHAHTGGGH HAHGHAHHAG 1440
CTCCGCCTGG GCAGA^GGCTC CTTCGGAGAG GTGCACAGGA TGGAGGACAA GCAGACTGGC 1500
TTCCAGTGCG CTGTCAAAAA GGTGHGHHTG GAAGTATTTC GGGCAGAGGA GCTGATGGCA 1560
190 709
TGTGCUGGUT TGACCTCUCC CUGUATTGTC CCTTTGTUTG GUGCTGTGUG AGUAGGGCCT 1620
TGGGTC.UACU TCTTCUTGGU GCTGCTGGAA GGTGGCTCCC TOGGCCAGCT GGTCAAGGUG 1680
CUGGGCTGTC TCCCAGUGGU CCGGGCCCTG rucruccτGG GCCAGGCCCT GGUGGGTCTG 1740
GUATACCTCC UCTCUCGUUG GUTTCTGCUT GGGGUCGTCU UUGCTGUCAA CGTGCTCCTG 1800
TCCAGCGATG GGUGCCUCGC UGCccτcrGr GUCrTTGGCC UTGCTGTGTG rcτrcAUccτ 1860
GUTGGCCTGG GUUUGTCCTT GCTCACUGGG GUCTUCATCC CTGGCUCUGU GUCCCUCUTG 1920
GCTCCGGUGG TGGTGCTGGG CUGGAGCTGC GUCGCCUAGG TGGATGTCTG GUGCUGCTGC 1980
rGTATGUTGC TGCUCUTGCT CUUCGGCrGC CUCCCCTGGU CTCUGTTCTT CCGUGGGCCG 2040
CTCTGCCTCU UGUTTGCCUG CGAGCCTCCG CCTGTGAGGG UGATCCCUCC CTCCTGCGCC 2100
CCTCTCUCUG CCCUGGCCUT CCUAGUGGGG CTGUGGUUUG AGCCCUTCCA CCGCGTGTCr 2160
GCAGCGGAGC TGGGAGGGUU GGTGUUCCGG GCUCTUCAGC AUGTGGGUGG TCTGUUGAGC 2220
CCTTGGUGGG GUGUUTUTAU UGUUCCAUGU CATCCUCCGC CAUUrCAAGC CUUTTACCAC 2280
CUGUCCCTCC UTGCCCUGCC GAGUGUGCTT TCGCCUAGGG CCCCUGGGCC CCGGCCUGCT 2340
GUGGAGUCUU CUGGCUGUGC CCCTAUGCTC CUGCCTCCTC TCCCUCCUGU GCCCCCAGUG 2400
CCAUACAAGT GUCTTTGUGC AUGGUGGUGT CTGGGUTGTG GGUUCCCTTU 2460
CCTCTGTCCT CCCTGGUGCC UGCCCCTGCC UGUAACCCCU GCTCUCCUGA GCGGUUAGCA 2520
ACCGTCCCGG UGCUGGUACT GCAGCUGCTG GAAUTUGUAT TUTTCCTCAU CUGCCTGTCC 2580
CAGCCATTTT CTCTGGAGGU GCUGGUGCUA UTTCTCTCGT GCCTCUGCUT CGUCUGCCTC 2640
rCCCTGTCGG UTGUCAGTGU GUAGUUCCCU TCAUUGGCCT CTCUAUGCTC GCGGGUCUCC 2700
CTG.UGCTCUG GCGTACUCTC CTGGAGCUGC CUGGCCGUGG CTCGUUGCTC CUGCTGGUUC 2760
UTGGTGCTGG CCCGGGGGCG GCCCUCCGUC UCCCCUAGCT urrτcuuτGG TGTGAUAGTC 2820
CUUUTACAGT CTCTTAATGG TGAUCUCCTG CACUTCCGGG UGTTCCUCCG GGTCUUAGTG 2880
GGUGACUTCG CCUCTGGCUT CUGCUGCCUG UTCCCUGCTG CUGCCTTCUG CTTGGTCUCC 2940
UUAGACGGGC UGCCrGTTCG CTUCGUCUTG GUGGTGCCUG UCTCGGGCAT CGUCCTGCAG 3000
TGCACACTGG CCCCTGUTGG CUGCTTCGCC TGGUGCTGGU GGGTCUUGCU TGGCCUGCTG 3060
GAGUUCUGGC CCTAACCCTG CCCTCCUCCG CCGGCTCCAC UCTGCCGGAU UGCUGCCTTC 3120
CrGCTCGGTG CUCGUTGCTG CCCTGUAAUC UCUGGCTCAG CCGTTCCCUG GGGUTTGCCA 3180
GCCCCCCGGC TCUCAGTGGG AUCCUGGGCC TCGCUGCUGC UUGGTGGGGG CAAGCUGAAT 3240
GCCTCCCUGG ATTTCUCUCC TGAGCCCTGC CCCUCCCTGC TGUUAUUUCU TCCGCCUCGT 3300
GUAGUGUCUG AAGGUGGUTG GCUGGUGTTU CCrGGGGAAU CAAUACUGGG UTCTTTTTCT 3360
190 709
GCCCCTGCTC CAGTCGAGTT GGCCTGACCC GCTTGGATCA GTGACCATTT GTTGGCAGAC 3420
AGGGGAGAGC AGCTTCCAGC CTGGGTCAGA AGGGGTGGGC GAGCCCTTCG GCCCCTCACC 3480
CTCCAGGCTG CTGTGAGAGT GTCAAGTGTG TAAGGGCCCA AACTCAGGTT CAGTGCAGAA 3540
CCAGGTCAGC AGGTATGCCC GCCCGTAGGT TAAGGGGGCC CTCTAAACCC CTTGCCTGGC 3600
CTCACCTGGC CAGCTCACCC CTTTTGGGTG TAGGGGAAAA GAATGCCTGA CCCTGGGAAG 3660
GCTCCCTGGT AGAATACACC ACACTTTTCA GGTTGTTGCA ACACAGGTCC TGAGTTGACC 3720
TCTGGTTCAG CCAAGGACCA AAGAAGGTGT GTAAGTGAAG TGGTTCTCAG TCCCCAGACA 3780
TGTGCCCCTT TGCTGCTGGC TACCACTCTT CCCCAGAGCA GCAGGCCCCG AGCCCCTTCA 3840
GGCCCAGCAC TGCCCCAGAC TCGCTGGCAC TCAGTTCCCT CATCTGTAAA GGTGAAGGGT 3900
GATGCAGGAT ATGCCTGACA GGAACAGTCT GTGGATGGAC ATGATCAGTG CTAAGGAAAG 3960
CAGCAGAGAG AGACGTCCGG CGCCCCAGCC CCACTATCAG TGTCCAGCGT GCTGGTTCCC 4020
CAGAGCACAG CTCAGCATCA CACTGACACT CACCCTGCCC TGCCCCTGGC CAGAGGGTAC 4080
TGCCGACGGC ACTTTGCACT CTGATGACCT CAAAGCACTT TCATGGCTGC CCTCTGGCAG 4140
GGCAGGGCAG GGCAGTGACA CTGTAGGAGC ATAGCAAGCC AGGAGATGGG GTGAAGGGAC 4200
ACAGTCTTGA GCTGTCCACA TGCATGTGAC TCCTCAAACC TCTTCCAGAT TTCTCTAAGA 4260
ATAGCACCCC CTTCCCCATT GCCCCAGCTT AGCCTCTTCT CCCAGGGGAG CTACTCAGGA 4320
CTCACGTAGC ATTAAATCAG CTGTGAATCG TCAGGGGGTG TCTGCTAGCC TCAACCTCCT 4380
GGGGCAGGGG ACGCCGAGAC TCCGTGGGAG AAGCTCATTC CCACATCTTG CCAAGACAGC 4440
CTTTGTCCAG CTGTCCACAT TGAGTCAGAC TGCTCCCGGG GAGAGAGCCC CGGCCCCCAG 4500
CACATAAAGA ACTGCAGCCT TGGTACTGCA GAGTCTGGGT TGTAGAGAAC TCTTTGTAAG 4560
CAATAAAGTT TGGGGTGATG ACAAATGTTA AAAAAA 4596
(2) INFORMACJA DLA ID. SEKW. NR :7 1 .
(i) CHTARAKERYSTTYK SEEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 947 aminokwasów (B) RODZAJ: aminokwas (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) RODZAJ CZĄSTECZM: bićłtko
(xi) OPIS SEKWENCJI: ID. SEKW. NR: 7:
Met Ala Val Met Glu Met Ala Cys Pro Gly Ala Pro Gly Ser Ala Val
1 5 10 15
190 709
Gly Gin G1g Lls 20 Plu Leu Pro Lys Peo 25 Lys GUu Lys Thr Ppa 30 Pro Lse
Gly Lys Lys GGn 0 es Eer Val Tyr Lys Leu GUu AUa Val Glu Lys Ses
35 40 45
Pro VaU Phe Cys Gly Lys Trp GUu Ile Leu Asn Asp Pal PIu The Lss
50 55 60
Gly The Ala Lys Glu Gly Eer GUu AUa GUy Pro Ala Ala Ile Ses PIu
65 70 75 80
Ile Ala G1g Ala Glu Cys Glu Asn Eer Gin Glu ΡΡε Ses Pro TTle ghh
85 90 95
Eer Glu Arg I Ie Phe Ile Ala Gig Ser Lys Glu Tyr Ser Gin Se r Glu
100 105 110
Eer Leu Asp G li 0 Ie Pro Asn Val Ala His Ala Thr Glu GUy Lls
115 120 122
Met Ala Arg Val Cjs Trp Lys Gly Lys Arg Arg Ses Lss Ala Arg Lls
130 135 110
Lys Arg Lys Lys LyS Eer Ser Lys S er Leu AA a His Ala GUy Val Ala
145 150 155 110
Leu Ala Lys Pro Leu Pro Arg Thr Pro Glu Gin Glu Ser Cys Thr He
165 170 155
Pro Val Gin G Ga Asp Glu Ser Pro LeE a: y APa Pro Tyr Val Ar g Am
180 185 190
Thr Peo Gin Phe Thr Lys Pro Leu Lys Glu Pro Gly Leu Gly Gin Lsu
195 200 205
Cys Phe Lys Gin Leu Gly Glu Gly Leu Arg Pro Ala Leu Pro Aeg Ses
210 215 220
Glu Leu His Lys Leu Ile Ser Pro Leu Gin Cys Leu Asn His Val Tiap
225 230 235 220
Lys Leu His His Pro Gin Asp Gly Gly Pro Leu Pro Leu Pro Thr His
245 250 255
Pro Phe Pro T yy Ser Arg Leu Pro His Pg o Phe Pro Phe His Pr o Leh
260 265 270
Gin Pro Trp L ls Pro His Pro Leu Glu Ser Phe Leu Gly Lys Lsu Ala
275 285 285
Cys Val Asp Ser Gin Lys Pro Leu Poo Asp Pro His Leu Ser Lys Leu
290 295 300
Ala Cys Val Asp Ser Pro Lso Pro Leu Pro Gly Pro His Leu Glu Pro
305 310 355 320
Eer Cys Leu Ser Arg GUy Ala His Glu Lys Phg Ser Val GUu Glu Tyr
325 335 355
190 709
Leu Val His Ala 340 Leu Gin Gly Ser Val 335 Sur Ser Ser Gin Ala 350 His Sep
Leu Thr Ser Leu Ala Lss Tlir Tsp Ala Ala Arg Gly SSr Arg Sse Arg
355 360 3 35
Glu Pro Ser Pro Lys Ths Glu Asp Asn Glu Gly Val Leu Llu Thr Glu
370 330 330
Lys Leu Lys Pro Val Asp Syr Glu Syr Arg Glu Glu Val His Trp Ala
385 330 335 400
Thr His Gin Leu Arg Leu Gly Arg Gly Ssu PP^e Gly Glu Val His Apg
405 410 4 41
Met Glu Asp Lys G in Ths Gly ihe G1t P as Ali Val Pys Lys lal Arg
420 442 430
Leu Glu Val Phe APrg Ala Glu Glu Luu Met Ala Cys Ala Gly Leu Thr
435 444 444)
Ser Pro Arg Ile Val Pro Leu Tyr Gly Ala Val Arg Glu Gly Pro Trp
450 455 446!
Val Asn Ile Phe Met Glu Leu Leu Glu Gl^ir Gly Sup Leu Gly Gln Leu
465 440 440 480
Val Lys Glu Gin Gly Ces Leu Pro Glu A£^s> Arg Ala Leu Tyr Tyr Leu
485 490 449
Gly Gln Ala Leu a lu Gly Leu Glu Tyi Siu HLe Ser Gig Arg I le Leu
500 550 510
His Gly Asp Val Lys Ala Asp Aas Val Leu Luu Ser SSr Aasi Gly Ser
515 552 552
His Ala Ala Leu Cys Asp Phe Gly His Ala Val Ces Leu Gln Ppo Asp
530 553 554
Gly Leu Gly Lys Ser Leu Leu Thr Gly Aas iTs Ilu Pro Gly Thr Glu
545 550 555 560
Thr His Met Ala Pro Glu Val Val Luu Glu lAp Sep Cys Asp Al a Lys
565 570 550
Val Asp Val Trp S er Sep Cys Upi MeS Pit Leu His Met Leu A sn Gly
580 558 590
Cys His Pro Tsp Thr Gin Phe Phh Arg Gly hoo Luu ces iLU Als Ile
595 660 665
Ala Ser Glu Pro Pro Pro VvG Arg Glu Ile Pro Ppp ise les Ala Pro
610 661 662
Leu Thr Ala Gin Ala IIi Gin Glu Gly Llu AAp Lys Glu Pro Ile His
625 663 663 6^^(0
Arg Val Ser Ala Ala Glu Leu Gly Gly Lls Aaa Asn Apg Ala Leu Gln
645 660 665
190 709
Gin Val Gly Gly 660 Leu Lys Ser Pro Trp 665 Arg Gly Glu Tyr Lys 670 Glu Pro
Arg His Pro 675 Pro Pro Asn Gin Ala 680 Asn Tyr His Gin Thr 685 Leu His Ala
Gin Pro 690 Arg Glu Leu Ser Pro 695 Arg Ala Pro Gly Pro 700 Arg Pro Ala Glu
Glu 705 Thr Thr Gly Arg Ala 710 Pro Lys Leu Gin Pro 715 Pro Leu Pro Pro Glu 720
Pro Pro Glu Pro Asn 725 Lys Ser Pro Pro Leu 730 Thr Leu Ser Lys Glu 735 Glu
Ser Gly Met Trp 740 Glu Pro Leu Pro Leu 745 Ser Ser Leu Glu Pro 750 Ala Pro
Ala Arg Asn 755 Pro Ser Ser Pro Glu 760 Arg Lys Ala Thr Val 765 Pro Glu Gin
Glu Leu 770 Gin Gin Leu Glu Ile 775 Glu Leu Phe Leu Asn 780 Ser Leu Ser Gin
Pro 785 Phe Ser Leu Glu Glu 790 Gin Glu Gin Ile Leu 795 Ser Cys Leu Ser Ile 800
Asp Ser Leu Ser Leu 805 Ser Asp Asp Ser Glu 810 Lys Asn Pro Ser Lys 815 Ala
Ser Gin Ser Ser 820 Arg Asp Thr Leu Ser 825 Ser Gly Val His Ser 830 Trp Ser
Ser Gin Ala 835 Glu Ala Arg Ser Ser 840 Ser Trp Asn Met Val 845 Leu Ala Arg
Gly Arg 850 Pro Thr Asp Thr Pro 855 Ser Tyr Phe Asn Gly 860 Val Lys Val Gin
Ile 865 Gin Ser Leu Asn Gly 870 Glu His Leu His Ile 875 Arg Glu Phe His Arg 880
Val Lys Val Gly Asp 885 Ile Ala Thr Gly Ile 890 Ser Ser Gin Ile Pro 895 Ala
Ala Ala Phe Ser 900 Leu Val Thr Lys Asp 905 Gly Gin Pro Val Arg 910 Tyr Asp
Met Glu Val 915 Pro Asp Ser Gly Ile 920 Asp Leu Gin Cys Thr 925 Leu Ala Pro
Asp Gly 930 Ser Phe Ala Trp Ser 935 Trp Arg Val Lys His 940 Gly Gin Leu Glu
Asn Arg Pro 945 (2) INFORMACJA DLA ID. SEKW. NR:8:
190 709 (i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 30 par zasad (B) RODZAJ: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) RODZAJ CZĄSTECZKI: inny kwas nukleinowy (A) OPIS: /desc = oligonucleotide PCR primer (xi) OPIS SEKWENCJI: ID. SEKW. NR: 8:
CAGGATCCTC ATGGCTGCAG CTAGCGTGAC (2) INFORMACJA DLA ID. SEKW. NR: 9:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 32 pary zasad (B) RODZAJ: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) RODZAJ CZĄSTECZKI: inny kwas nukleinowy (A) OPIS: /desc = oligonucleotide PCR primer (xi) OPIS SEKWENCJI: ID. SEKW. NR: 9:
GGTCGACTTA GAGCCCTGTC AGGTCCACAA TG (2) INFORMACJA DLA ID. SEKW. NR:10:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 24 par zasad (B) RODZAJ: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) RODZAJ CZĄSTECZKI: inny kwas nukleinowy (A) OPIS: /desc = oligonucleotide probe (xi) OPIS SEKWENCJI: ID. SEKW. NR: 10:
GATGCCATTG GGGATTTCCT CTTT (2) INFORMACJA DLA ID. SEKW. NR: 11:
(i) CHARAKTERYSTYKA SEKWENCJI:
(A) DŁUGOŚĆ: 24 pary zasad (B) RODZAJ: kwas nukleinowy (C) NICIOWOŚĆ: pojedyncza
190 709 (D) TOPOLOGIA: liniowa (ii) RODZAJ CZĄSTECZKI: inny kwas aukleiaowy (U) OPIS: /desc = olOroaecasotide probe (xi) OPIS SEKWENCJI: ID. SEKW. NR: 11:
CUGTU^UGAG GUUATCCCCU UTGG
190 709
CD30 p75 TNFR
Τ
Śmierć komórki
Fosforylacja Ι-κΒ
FIG. 2A
190 709
CD95 CD120a § CD120b (Fas/Apo-1, i (pS5 TNF receptor) f <ρ75F
C0w121a (IL1-RI)
MORT1/FADD
TRADD
TRAF2
MAP4K(?)
CASPASE 8 (MACH/FUCE)
Śmierć komórki \
\ ¥ΐ \
RIP
KJ . w ——w
I
I (IRAK, TRAF6)
V o· NIK-33'' (MAP3K)
V
MAP2K
MAPK aktywacja
NFkB
FIG. 2B
190 709
Długość: 1906 7 lipca, 1996 12:35 Rodzaj: N spr. : ,
1 CATTGGGTCA CGCGGTGGCG GCGCTCTAGA ATAGTGGATC CCCCGGGGTG
51 CAGGAATTCG ATTCGAGGCC ACGAAGGCCG GCGGCGCGGC GCAnGCACCG
101 GCCCGGGGAn AGGCaCCATG AGCGGATCaC nGAACnATGA CAAAAGACAA
151 TTTCTGCTGG AGCGACTGCT GGATGCAGTG AAACAGTGCC AGATCCGCTT-
201 TnGAGGGAGA AAGGAGATTG CCTCGGATTC CGACAGCAGG GTCACCTGTC
251 TGTG7GCCCA GTTTGAAGCC GTCCTGCAGC ATGGCTTGAA GAGGAGTCGA
301 GGATTGGCAC TCACAGCGGC AGCGATCAAG CAGGCAGCGG GCTTTGGCAG
351 CAAAACCGAA ACAGAGCCCG TGTTCTGGTA CTACGTGAAG GAGGTCCTCA
401 ACAAGCACGA GCTGCAGCGC TTCTACTCCC TGCGCCACAT CGCCTCAGAc
451 gTGGGCCGGG GTCGCGCCTG GCTGcGCTGT GCCCTCAACG AACACTCCCT
501 GGAGCGCTAC CTGCACATGC TCCTGGCCGA CCGCTGCAGG CTGAGCACTT
551 TTTATGAAGA CTGGTCTTTT GTGATGGaTG AAGAAAGGTC CAGTATGCTT
601 CCTACCATGG CAGCAGGTCT GAACTCCATA CTCTTTGCGA TTAACATCGA
651 CAACAAGGAT TTGAACGGGC AGAGTAAGTT TGCTCCCACC GTTTCAGACC
701 TCTTAAAGGA GTCAACGCAG AACGTGACCT CCTTGCTGAA GGAGTCCACG
751 GAAGGAGtGA GCAGCCTG7T CAGGGAGATC ACAGcCTcCT cTGCCGTcTC
801 CATCcTCATC AAACCTGAAC AGGAGACCGA CCCTTGCCTG TCGTGTCCAG
851 GAATGTCAGT GCTGATGCCA AATGCAAAAA GGAGCGGAAG AAGAAAAAGA
FIG. 3A
190 709
AAGTGACCAA CATAATCTCA TTTGATGATG AGGAAGATGA GCAGAACTCT
GGGGACGTGT TTAAAAAGAC ACCTGGGGCA GGGGAGAGCT CAGAGGACAA
CTCCGACCGC TCCTCTGTCA ATATCATGTC CGCCTTTGAA AGCCCCTTCG
GGCCTAACTC CAATGGAATC AGAGCAGCAA CTCATGGAAA ATTGATTCCC
TGTCTTTGAA CGGGGAGTTT GGGTACCAGA AGCTTGATGT GAAAAGCATC
GAtGAtGAAG ATgTGGATGA AAACGAAGAT GACgTGTATG GAAACTCATC
AGGAAGGAAG CACAGGGGCC ACTCGGAGTC GCCCGAGAAG CCACTGGAAG
GGAACACCTg CCTCTCCcAG ATGCACAGCT GGgCtCCGCT GAAGgTgCTG
CaCAaTGACT CCGACATCCT CTTCCCTGTC AGTGGCGTGG gCTCCTACAG
CCCAGCAGAT gCCCCCCTCG GAAGCCTGGA GAACGGGACA GGACCAGAGG
ACCACGTTCT CCCGGATCCT GGACTTCGGT ACAGTGTGGA AGCCAGCTCT
FIG. 3B
190 709
CCAGGCCACG GAAGTCCTCT GAGCAGCCTG TTACTTCTGC CTCAGTGCCA
GAGTCCATGA CAATTAGTGA ACTGCGCCAG GCCACTGTGG CCATGATGAA
CAGGAAGGAT GAGCTGGAGG AGGAGAACAG ATCACTGCGA AACCTGCTCG
ACGGTGAGAT GGAGCACTCA GCCGCGCTCC GGCAAGAGGT GGACACCTTG
AAAAGGAAGG TGGCTGAACA GGAGGAGCGG CAGGGCATGA AGGTCCAGGC
GCTGGCCAGC TATCTTTGCT ATTTTGTGAG GAGATTCTAA CCCCACGTGA
GAACCATGTG GTGGAGAAAT GGAGGGAGAG AGAAATCCAA CAGTTCCTGA
TAGTCTCATT TGAGCTCCTG GATCCAGTCT TTCCTGAAGC TGTGTTTCCT
CTGGACTTTT CATGTATGTG AGCCAATAAA TTGCTTTCAT TCCTTGAAAA
AAAAAA
FIG. 3C
190 709
Translacja: wygenerowane 9hhh spr.: symbole 1 7122 od: do: 635. 1 do: 1906
9hhh Długość : 604 23 sierpnia, 1996 15:03 Rodzaj: P spr.: 4554
1 XTG?GXGXMS GSXNXDKRQF LLERLLDAVK QCQIRFXGRK EIASDSDSRV
51 TCLCAQFEAV LOHGLKRSRG LALTAAAIXQ AAGFASKTET EPVFWYYVXE
101 VLNKKELQRF YSLREIASDV GRGRAWLRCA LNEKSLERYL HMLLADRCRL
151 STFYEDWSFV KDEEHSSHLP TMAAGLNSIL FAINIDNKDL NGQSXFAPTV
201 SDLLXESTQN VTSLLXESTQ GVSSLFKEIT ASSAVSILIK PEQETOPCLS
251 CPGMSVLMPN AKRSGRRKRK -.txr-.qW~r,MMR KMSRTLGTCL KRHLGQGRAQ
301 RTTPTAPLSI SCPPLZAPSG LTPMESEQQL MEN*FPVFER GVWVPEA*CE
351 Xm**RCG*K ’PP*PVWTT,TT7 EEAQGPLGVA RF^TGRFWT.-p LPDAQLGSAE
401 GAAQ*LRHPL PCQWRGLLQP SRCPPRKPGE RCRTRGPRSP GSWTSVQCGS
451 QLSRPRKSSE QPVTSASVPE SMTISELRQA TVAMMNRKDE LEEENRSLRN
501 LLDGEMEHSA ALRQEVDTLK RKVAEQEERQ gmkvqalasy LCYFVRRF*P
551 HTOTMWWRNG GREKSNSS** SHLSSWICJSF LKLCFLWTFH VCEPINCFHS
601 LKKK
FIG. 3D
190 709 klon 10 Długość: 2631 23 sierpnia, 1996 17:18 Rodzaj: N spr.: 5107
1 CCCcTcTcAC AGCcCAgGCC ATCCAACAGG GgCTGAGGAA AGAGCCCATC
51 cACCGcGTGT cTGCAGcGGA GcTGGGAGGG AAGGTGAACC GGCCAcTACA
101 GCAAGTGGGA GGTcTGAAGA GCCCTTGGAG GGGAGAATAT AAAGAACCAA
151 GACATCCACc GCCAAATCAA GCCaAtTACC ACCAGACCcT CcATGCCcAg
201 CCGAGAGAGc TtTcGCCAAG GGCCCcAGGG CCCCGGCCAg CTGAGGAGAC
251 AACAggCAGA GCCCcTAAGc TCCAGCcTCC TcTCCCACCA GAGCCCCCAG
301 AGCCaAACAA GTcTCCTCCC ttGACTttGA GCAAGGAGGA GTcTGGGATG
351 TGGGAACCCT TACcTctGTC cTCCCTGGAG CCAGCCCCTG CCAGAAACCC
401 CAGcTCACCA GAGCGGAAAG CAACCGTCCC GGAGCAGGAA CTGCAGCAGC
451 TGGAAATAGA ATTATTCCTC AACAGCCTGT CCCAGcCATT TTcTcTGGAG
501 CAGCAGGAGC AAATTCTcTc GTGCCTCAGC ATCGACAGCC TCTCCCtGTC
551 ggatcacagt GAGAAGAACC CATCAAAGGC CTCTCAAACC TCCCGGGACA
601 CCCTCAGCTC AGGCGTACAC TCCTGGAGCA GcCAGGCCGA GGcTCGAAGc
631 TCCAGCTGGA ACATGGTGcT G\.\_CCGGGg g CGgCCCACCG ACACCCCAAG
701 CTATTTCAAT GGTGTGAAAG TCCAAATACA GTCTCTTAAT GGTGAACACC
751 TGCACATCCG GGAGTTCCAC CGGGTCAAAG TGGGAGACAT CCCCACTGGC
801 ATCAGCAGCC AGATCCCAGC TGCAGCCTTC AGCTTGGTCA' CCAAAGACGG
851 GCAGCCTGTT CGCTACGACA TGGAGGTGCC AGACTCCGGC ATCGACCTCC
901 AGTGCACACT GGCCCCTGAT GGCAGCTTCG CCTGGAGCTG GAGGGTCAAG
951 CATGGCCAGC TGGAGAACAG GCCCTAACCC TGCCCTCCAC CGCCGGcTCC
1001 ACACTGCCCG aAAGCAGCCT TCCTGCTCGG tGCACGATGC TGCCCTGaAA
1051 AcACAGGCTC AGCcGTTCCC AgGGgATyTG .CCAGcCCCC cGGcTcArcA
1101 G.tGGGaAcC AGCGccTcG. CAGC.AGC.A AGCT.gGGGG CAAGC.AGAA
1151 TGCcTCCCAG GATTTcACA. CcTGAGCCC. TGCCCCA.CC CTGcTCaadA
1201 AAAcAyT.CC GCcAcGtGAA CagAcAGaAG GAGGATGG.C ACGAgTt. .A
1251 CcTygGGGAA aCaAAAcAGg gaTcTTt.tT cTGcCCcTGc TCCAGT.cCA
FIG. 4A
190 709
1301 gtTGGCCTG. ACCCGcTTGG A.TCAgtGAC CATTTGtTGG CAGA.CAGGG
1351 GagAgCAGcT TCCAGCcTGG gTCAG AAGGG GTGGGcGAGC CCtTcGGCCC
1401 cTcAcCCT.c cAGGcTGcTG tC.ACAGTGT CAAGTGŁGTA AGGG.CCCAA
1451 A.cTcAGG.T TCAGTCCAGA ACCAgGT.CA GCAGGTATGC CCGCCCG.TA
1501 GGTTAA..GG GGGCCcTcT. AAACCCCTTG cCT.GGCCT. CAcCT.GGCC
1551 AGCTCA.CCC CTTTTGGGTG TAGGGGAAAA GAATGCCTGA CCCTGGGAAG
1SO1 GCTWCCCTGG TAgAATACAC CACACTTTTC AGGTTGTTGC aacacaggtc
1651 CTGAGTTGAC CTCTGGTTCA GCCAAGGACC AAAGAAGGTG TGTAAGTGAA
1701 GTGGTTCTCA gT.CCCCAgA CATgTgCCCC TTTGCTGCTG GCTACCACTC
1751 TTCCCCAgAg CACCAGGcCC CgAgCCCCTT CAGGcCCAgC AcTGcCCCAG
1801 AcTCgCTGGC aCTCACTTCC CTCATCTGTA AAGGTGAAGG CTGATGCAGG
1851 ATATGCCTGA CAGGAACAGT CTCTGGAtGG AcATGATCAg TGcT.AAGG.
1301 AAAGCAGcAG AGaGAGAGGy TCcGGCGCCC CAg.CCCCAc T.ATCAGTgT
13 SI .CCAgCGTGC T.GGTT.CCC CAg.AGCACA GcT.CAg.CA TcA.CACTGA
2001 CACT.CAcCC T.GCCcTGCC CCT.GGCCA. GAgGGTACTG CCG.ACGGCA
2051 CTTTCCAc.T CTGATG.ACC TCAAAGCACT TTCATGgcT. GcCCTct..C
2101 GCAGGG.CA.G GG.CAGGG.C AgTGAcA.CT GTAgG.AGCA TA.gCAA.GC
2151 CAgGAGATGG GGTG.AAGGG A.CACAGTCT TGAGCTGTCC A.CATGCATG
2201 TGAcT.CCTC AAAcCTcTT. .CCAG.ATTT CTCTAAGAAT AGCA.CCCCC
2251 TT.CCCCATT GCCCCAGCTT AgCCTCTTCT CCCAGGGGAG CTA.CTCAgG
23 01 ACTCACGTAg CATTAAATCA GCTGTG.AAT CGTCAGGGGG TGTCTGCTAg
2351 CCTCAACCTC CTGGGGCaGG GGACgCCGAg ACTCCGTGGG AgAAgCTCAT
2401 TCcCaCATCT TGCCAAgACA gCCTTT. GTC CAgCTGTCCA CATTGAgTCA
2451 gACTGCTCCC GGGGAgAgAg cCCCGGcCCC CAgCACATAA AGAACTGCAG
2S01 CCTTGGTACT GCAGAGTCTG CGTTCTACAG AACTCTTTGT AAGCAATAAA
2551 GTTTGGGGTG ATGACAAATG TTAAAAAAAG GCCTTCGTGG CCTCGAATCA
2601 AGCTTATCGA TACCGTCGAC CTCCAGGGGG G
FIG. 4B
190 709
Długość: 1253 10 lipca, 1996 klon 15
CATTGGAGTC GGCGCTCTAG AATAGTGGAT CCCCGG^CTg
SI CA.GGAATTC GATTCGAGcC CACGAAGGCC CCTTCTTCTG TGGTCGCGGC
101 ACGTTTACaG CCGCAAGCAc CCAGCGGCAg CTGAAGGAGG CTTTTGAgAG
151 GCTCCTgCCC CAGGTGGAGG CGGCCCGCAA GGCCATCCgC GCCGCTCAGG
201 TGGAGCGCTA TGTGCCCGAA CACGAGCGAT GCTGCTGGTG CCTGTGCTGC
251 GGCTGTGAGG TGCGGGAACA CCTGAGCCAT GGAAACCTGA CGGTGCTGTA
301 CGGGGGgCTG CTGGAGCATC TGGCCAGCCC AGAGCACAAG AAAGCAACCA
351 ACAAATTCTG GTGGGAGAAC AAAGCTGAGG TCCAGATGAA AGAGAAGTTT
401 CTGGTCACTC CCCAGGATTA TGCGCGATTC AAGAAATCCA TGGTGAAAGG
451 TTTGGATTCC TATGAAGAAA AGGAGGATAA AGTGAtCAAG GAGaTGgCAG
501 CTCAGATCCG TGaGGTGGAg CAGAgCCGAC AGGAGgTGGt TCGGtCTGTC
551 TTAGAgCcTC AGGCAGTGcC AGACCCAGAA GAGGGcTCTT CAGCAcCTAG
601 AAGCTGGAAA GG G AT GAA GA GCCAAGTAGc TTCCAGCTTA CAGcAGcCCT
651 >-ΛΛΛ X X i, GGTGCCAGCA GGTCGAGAGG Jx’x GAcTGGzi x G GAG *«□ λ
701 CCATCTCTGA CATT CATTGG CCATCAGGAT AinLćAijunw i LUU 1Λ2·.1_λ1
751 CCACTCAGGT GCCACACCTC CCTGGATGAT CCAAGATGAA GAATACATTG
801 CTGGGAACCA AGAAATAGGA CCATCCTATG AAGAATTTCT TAAAGAAAAG
851 GAAAAACAGA AGTTGAAAAA ACTcCCCCCA GACCGAGTTG GGGCCAACTT
901 TGATCACAGC TCCAGGACCA GTGCAGGCTG GCTGCCCTCT TTTgGGcCGC
951 GTCTGGAATA ATGGACGCCG CTGGCAGTCC AGACATCAAC. TCCAAAACTG
1001 AAGCTGCAGC AATGAAGAAG CAGTCACATA CAGAAAAAAG CTAATCATGC
1051 TCTCTACCAA CTACCATGAG GCTAAAAGCC AAAGTCAACC AAACCCCTAT
1101 TATACCTTCC ACCCAAATTC TTTATCATTG TCTTTCTTAG GAAACAGACA
1151 TACTCATTCA TTTGATTTAA TAAAGTTTTA TTTTTCGGCC TTCGTGGCCT
1201 CGAATCAAGC TTATCGATAC CGtCGACCTC GAGGGGGGGC CGTACCCACT
1251 TTT
FIG. 5A
190 709
Translacja: 15cc spr.: 9389 od: 2 do: 1253 wygenerowane symbole 1 do: 417.
15cc.pep Długość: 417 23 sierpnia, 1996 14:32 Rodzaj: P spr.: 7921
IGVTRWRRSR TVDPRAAXNS ERAKEGPFFC GRGTFTAAST QRQLXZAFER
51 LL?QVEAARK AIRAAQVERY VPEHERCCWC LCCGCEVREH LSHGNLTVLY
101 GGLLEHLAS? EHXXATNXFW WENKAEVQMK EXFLVTPQDY ARFKXSHVXG
151 LDSYEEKEDK VIREMAAQIR EVEQSRQEW RSVLEPQAVP DPEEGSSAPR
201 SWKGMNSQVA SSLQQFSNLD LPPAPELDWM ETGRSLTFIG HQDIPGVGNI
25 ί'ΓΠΙΙΧ QDEEixAGNQ FTGPSYEEFL KEXERQKLKX LPPDRVGANF
301 DHSSRTSAGW LPSEGPRLE*· WTPLAVQTST PXLKLQQ*RS SHIQXXANHA
351 LYQLP-G’KP KSTKPLLYLP PKFFIIVFLR KQTYSFI*FN KVLFFGLRGL
401 ESSLSIPSTS RGGRTHF
FIG. 5B
190 709
0 e- < 0 υ ο u 0 Ε- E-
Η f- Ε- E-· U Α u < υ *<
E- E- υ 0 υ CU υ ω < Ε- U o 0 < U X
< U E- < υ Ε- E- u U U
U U E- U «ΐ Ρ- Ε- E- u E- U
U U 0 υ -3 υ ηι 0 < n 0
< 0 0 I α υ 0 U U 0
e- 0 0 E- s Α Ε- E- E- Ε-
E- < 0 < ι υ ω 2 0 > < HH E- Cu 0 >
0 0 Ε- 0 υ υ U U E- E-
e- < υ < α E- E-
0 u Ε- 0 2 Ε- 0 0 I-I W 2 X
Ε- 0 0 0 υ υ E- Ε- U u
0 0 U 0 α Ε- 0 0
< < < E-· υ ο U > 2 X Ε- 0 U aS 2 X
0 u U U Ό υ 0 υ 5 u
0 < U U Α υ Ε- e- 2 u
E- u 0 U ο Ε- CO υ U < ł-H 0 ω u CU
0 Ε- < U υ U u 2 u
0 E- υ 2 υ υ E- u U E-
< < E- u υ 0 Α V) W 0 < E- w < H
< U H < υ Ο 0 Ε- E- 0
0 * < 0 u Ε- Α < υ e- <
E- U Ε- 0 υ > υ ο 0 ω 0 E- Cu U O
E- 0 Α χ£ 0 < u E-
0 u Ε- 0 * U 0 U u <<
Ε- 0 υ E- U 2 E- 2 U CU 2 H 0 Q
υ 0 rM U »-< < »Η υ r- U r—ł 0 rH u r—ł E-
-< 0 i—1 *£, in fC r-ł 0 Γ υ η σ\ A in 0 rM u Γ- E-
n < o 0 Ή 0 CM 0 CM Ε- CO m 2 m 2 bs -3» 0 0 LH u CU LD U tJ
E- Ε- υ υ A u Ε-
0 0 υ u U υ O u 0 0
Ε- 0 0 Ε- U 0 υ 0 u 0 0 rfl 2 tn < 0
0 0 0 0 Ε- υ u 0 u 0
U Ε- Ε- υ Η u «< E-
«ΰ 0 υ U υ Ε- u 0 ω E- Cu 0 Cu
< E- U Ε- υ Α υ u 0 U
0 0 u υ υ υ E- u «ΐ U
U E- u Ε- υ υ Cm E- u. Ε- cn 0 ω Ε- cn
E- 0 Ε- υ U υ 5 0
0 0 Ο υ Ε- 0
t- 0 u Ε- υ 0 υ CU υ > 0 0 U α U 0
0 u ε- υ Ε- U U
U 0 * u Ε- υ u υ < 0 0
U E- u ο υ CU Ε- U CU 0 ω < W < 0
0 < u Ε- υ υ U 0 E- u
E- 0 Ε- 0 υ Α u *5 •s «<
U 0 υ Ε- Ε- u 2 < w 2 2 X Ε- >-
Ε- E- 0 υ υ u u 0 0
υ 0 E-4 Ε- υ Α A u *C *c
< 0 Ε- υ υ < υ ω 2 0 0 ω u 0
0 F- υ 0 υ υ u Ε-
0 u Ε- Ε- Α A u 0
U E- 0 υ X 2 u U ω < Ε- Ε- u **·
u O t- U Α u u 0 u
0 E- u < 2 υ Ε- 0 u
U C u 0 υ ω υ CU υ > 0 0 0 ω t- Ul
U 0 łH U r— f-4 rH υ w υ rH U rH u rH E- 0
0 »-< 0 CM U CO 0 rf Ε- ο Α UJ U CM 5 CO y T 0
rH rtj UJ < 0 *“· rfj CM < X <*> 2 i4 n U < rj* 2 rf o < in 0 U
FIG. 6A
190 709
0 2 < u 0 0 0 O 0
0 2 0 0 u E- 2 Eh 0 0
0 04 2 hi Eh co 0 04 u Di u X 0 UJ E- U 2 hi U UJ 0 u 0 X
U 0 0 2 Ε- u 2 0 0 0 <
U 0 2 2 υ Ε- 0 0 0 0 2 (j
0 < 0 2 0 ui o ω U CU υ j < □i Er· co 2 co Eh 0 0 a 0 <
Ą 0 e- 0 o rf 0 0 0 0 0
2 2 Ε- rf 0 2 £h 0 H r1
** X Eh UJ 0 Q 2 hi υ UJ 2 2 w 0 ω 0 Ul 2 co 0 u 0 *<
U 0 0 0 Ε- u E- 0 0 0 Eh 0
0 0 Eh υ u 2 Eh 2 0 CJ 0
co 0 2 0 ω 0 Ul U 2 ε- a e- >H 0 Ul 0 X 0 CU 0 Eh S
U 0 0 H O υ 0 Eh 2 0 Eh u
0 H 2 0 U Ε- 0 0 0 Cj
U 04 0 > o o 0 04 U 04 υ > 0 CU 0 04 0 CU Ul 0 X < Eh
Eh < 0 0 U U 0 0 0 0 0 0
0 0 H 2 U rf E- 2 2 Eh Eh
0 Di 0 0 0 > 2 hi U Di U X H Ul 0 X 0 Q 0 Ul 0 > 2 x
0 < < 0 «£ u 0 Eh U < u
0 0 0 Ε- 0 0 0 Eh 0
2 0 2 0 o. 2 Eh υ Ul 2 z 0 CU 0 04 0 CU 0 X 0 A 0 <
< H U 0 U u 0 ri- 0 0 0
0 < fn U Ε- 2 2 Eh 0 < Eh
0 U 0 a: < hh Cu U 0 υ u 0 X 2 hi Eh Ul 0 CU Eh >- 0 Ul
0 Eh 0 0 U Ε- 0 0 0 U U
2 0 0 2 < υ 0 0 0 0 2 0
2 hi 0 < < 0 O U UJ E- u 2 Eh Eh 0 CU 0 0 0 ω < CO
ri ri ri w ri
0 r-4 U Ή 0 ri 0 i—4 u i-i rf i—1 0 in 0 r-i fH d 0 cn 0
0 σ\ H in 0 ri 0 r* o m 2 σ\ 0 O 0 ri 2 ri 0 fi ri 0
Eh 3: \O 0 Ul r* fen 0 03 0 CU CS o 0 <A u O σ\ 0 CU ri 0 04 ri 2 hi ri 0 04 ri 0 ω ri < Eh
Eh 0 0 0 E- u 0 U 0 0 0 0
0 0 0 0 E- E- Eh 2 2 Eh H Η
H 0 H w 2 co 2 E- U Ul P Ul 0 J 0 O 0 O 0 Ul 0 > U Ul
0 0 0 0 U 0 0 * «. r · W 0 Eh • i
2 2 < 0 0 Eh 0 U U 0
0 > 2 X 0 ω 2 X U CX 0 CU 0 04 0 Ul 2 CO 0 CU Eh tn < co
E- < 0 2 u 0 0 fH 0 0 Eh 0
0 0 2 0 «ί 0 Eh 0 *4 EH
0 x E-4 co 0 o < ci 2 hi 2 w 0 Ul 0 CU 0 Q 2 X EH U. U X
U 0 0 e- f- 0 0 0 2 0 0
0 0 2 H E- Eh 0 2 E- 0 <
0 < 2 co 0 Ul 0 > e- U4 2 H 0 CU 0 X 0 > 0 2 0 <
0 0 e< H E- U 0 0 fH H 0 0
2 u 2 u 0 Eh 0 0 <
< s 2 hi 0 04 H Ε- 0 0 Ul 0 0 Eh u Η 0 0 W 0 O
0 u 2 υ 2 2 0 u E- 0
2 2 0 0 Ε- 2 0 0 0 ·< 0
«4 hi 2 >4 2 0 CU υ Ul 2 hi 0 0 0 CU 0 2 u α 0 X 2 co
0 0 0 0 < u 0 0 0 u 2
0 < 0 0 2 2 2 Eh Eh f- u 0
0 0 2 hi 2 04 U 2 u o u X 0 ca Eh (14 0 tJ 0 > 0 £h CO
0 0 U U u u 0 0 Eh Ε- &
2 0 0 0 u E- 2 0 2 0 Ο 0
o ω u cd 0 CU 0 0 u 0 U J u σ 0 CU 2 hi E- U U 0 < CO
«c rtj 0 0 E- rf u Eh 0 U ε- 0
u 2 H £h E- 2 u u U υ Eh
n: e- 2 0 ui 0 Ul u 1-3 u Ul u cu 0 X u U O << u X 0 >
ri ri ri ri ri
Ε- ri 0 *-4 U ri 2 ri u ri rf ri u fi 09 0 O O Ε- να U
υ να <* fi U 00 0 'r u o u να rf O 0 O Eh ri E- n υ fi 0
U < να 2 0 CU 0 CU 03 u O 04 e- οι σι D X ri 0 CU ri 0 Ul ri U J ri E- co ri < CO
FIG. 6B
190 709
1321 1351
GGC TCC AGA TCC CGG GAG CCC AGC CCC AAA ACT GAG GAC AAC GAG GGT GTC CTG CTC ACT
u < u 0
F* u σ 0 0
u H
< 0
U U X < H
U 0
u
Ul < Ε- 0 O
υ 0
U rf
> u < ί tu
u 0
u <
O Ε- 2 0 a
U 0
ω u x 0 ω
u o
Ε- H
Z υ > < X
2 0
a u ω 0 < ci
2 0
ω u ω U X
r- r—1
Ή i< r- 0
rp O Ό» ę~«
eh •H U X HU >
U o
< <
iu E- >- 0 CU
U rC
0
CU u ω 0 0
E- 0
<
w E- >- Ε-· ω
E- u
< 0
CU o a H OT
u U
Ε- 0
ω υ > 0 0
2
u 0
ci U CU < ci
w
S Ld
K UJ
oo O m <
o m u ω j u
u u
u
Eu u
u u
u
E— u
u u
X σ tn J r-i
cn io rH
U>
m
u U u Ε- 0
0 fi Ε- Ε- υ e-
0 CU u 0 υ υ Ul U CU <
0 u Ε- U < 0
0 υ Ε- 2 <
0 0 2 iU U 0 υ Ul u o 0 X
<< u U U E- 0
2 Ε- < Ε- E- 0
0 ω υ > u CU υ > U Ul < E-*
c U u U Ε- 0
0 Ε- Ε- «5 υ <
c X υ υ Ul 2 X Ε- 0 0 CU
0 U U u υ
H Λ u < Ε- 0
0 > U σ u rf u a υ > < E-*
e- U u Ε- Ε- u
0 U 2 υ υ 0
u rf u u u o U U < 0 0
u u «τ Ε- E-
0 u. u 2 0
0 0 U u3 u 0 2 U X U CU
E-* U u u U 0
rf U Ε- Ε- u
Ε- OT υ Ul υ > u 0 rf
0 υ U U E- 0
U 2 2 E- <
£-» O 0 E- U Q e- Cu E- ><
t-H łH ł-H cH r-J
€-< vn Ε- r- U t- u m 0 cn 0
0 OT υ r- 2 r> O aj < 05 -i
0 Oj U 0 a Ε- >- J U 0 •H 0 O 0 d
U υ E- 0
E-* 2 Ε- 2 0 0
0 > o ω υ Ul U X H 0 0 0
u U U 0 •U
£ Ε- Łj H 0
rf M υ Ul U u Ul 0 Ul rf
C U u E- 0 0
0 Ε- u E- 0
ci υ Ul u X 2 M 0 rf 0 Ul
0 u u O rf 0
0 2 U 0 E-
0 CU u Ul u Q 2 X 0 rf E-* »-3
u u 2 0 0
0 E- 2 u 0
&-· OT < s u CU u Ci 0 X E-· OT
0 u 2 0 0
0 E- u u 0
fc- tu u CU Ε- OT OT tu
0 Ε-» 0 u υ 0
EH Ε- 2 0 0 0
i-3 2 W υ Ul U X 0 0 0
c U 2 Ε- u Ej 0
0 υ E- H
0 0 2 3 Ε- 0 U J 0 O U Ul
rf u υ U 0 0
0 E- U 2 0 0 u
0 < U > u 0 E- >- < OT 0
f—ł «Η t-H rH •H
e~* CS O CO 0 ·* < o u OT
0 ot u OT < r- < co U CD
t-u e- 3 H U OHU u J E- OT rH 0 Q
u □
Ευ
U <
u
V)
GTG GTG CTG GGC AGG AGC TGC GAC GCC AAG GTG GAT GTC TGG AGC u
u
U u
u
Eω n, <
FIG. 6C
190 709
1981 2011
TGT ATG ATG CTG CAC ATG CTC AAC GGC TGC CAC CCC TGG ACT CAG TTC TTC CGA GGG CCG x
u cc
X
Lu σ
e2
X r· o
X CM
U o
X
J
X
X
Ul
X
X o U cs
U Ε- u u Ε-
(J υ o rf υ
o 2 Ε- co rf co u X U 2
u υ u u <
o Ε- rf rf U
Ε- U υ > rf iu E- >- u X
υ U u E- u
U U Ε- rf u
Ε- w u X υ UJ 2 X u X
υ u Ε- u u
U 2 υ u u
U X u X U U u 2 u X
2 u rf rf u
U E- O rf u
u CL 2 n U U u o u U
u U U E- 2
U Ε- rf u
< IH U X υ > rf X u X
U U rf rf u
2 rf U u
U ω U LU U O* U X u 2
u u U u
u 2 rf U u
2 X iZ u O u X 2 X
u U rf rf 2
Ε- u Ε- u u
υ > 2 X υ u u X u X
r-4 iH ł- tH r-1
Ε- n u σ> rf in E- »H u Γ*·
υ i—“ł Ε- »H U CM rf m u Cl
U CL CM υ UJ CM u rf ΓΊ U X CS E- to ΓΜ
U U u rf E-
u U u U E-
u Oj u u u ci rf X U u
E- u u rf U
« i 2 rf u
ϋ CL U LU rf 2 u X U LU
u 2 u rf 2
< 2 Ε- rf u
u ω u O υ > o LU 2 X
u u U u
u E- rf A u
2 tO 2 ł-ł rf id rf u X
u U U E- u
u u u < <
u < u < u U E- >- u o
e- u rf rf u
E- 2 u rf u
2 W u O u U U CU u A
U u o rf E-
2 u Ε- U 2
2 Ł4 u 2 υ u u U U X
u 2 O u u
Ε- u rf u Ε-
υ Ul < E- u ω rf X υ Ul
U u u u U
U H u u u
Ε- U U Ul o rf E- X rf 6-
łH rH fH rH rS
υ O f- vo rf CS E- GO u TT
Ε- »H U «Η u rs u CS rf ci
υ u CS U x cs u 2 CS u X CS U O CM
u u o ω Ś 2
T*4
O orf rf -θ’ O
U W rs U cu
U fi 2 u u u u
< E- u u Ε- u rf
u ω e- j u 2 H to υ Ul 2 Ε- rf
< u U U υ u
u u 2 Ε- u 2 u
u CL u CL 2 łu υ Ul 2 co U Q Ε-
u u U U U υ
u 2 u u 2 U U
U
EO >
U x U tu u X rf m u a U X < co
u U u U u U U
2 u rf rf E- U U
U LU e- x u CU rf 2 rf H E- to H CO
2 u rf U U U U
U 6- u ε- U U U
U CL 2 X u X υ u rf W 2 co < to
2 U rf u U 2 2
U U u E- ε- 2 U
u CL u u Ε- to E- U. υ j u σ U X
u Ε- υ < u Ε- Ε-
Ε- υ U E- u υ υ
υ UJ 6- to rf to E- U E- U E- to U 2
Ε- U U rf U U U
υ 2 u 2 U U 2
U x U CU u X u ω E- tn U 2 u CU
Ε- U u rf U U u
υ 2 rf E- Ε- 2 LJ u
U CL U CU rf X rf M υ J 2 *4 U 2
»—( r— «Η r-ł »H t—1
U ci U σι rf ui rf — E- r* 2 m U
2 2 ^3« u ui rf vo E- w U C* 2
u o CM 2 bś CM rf X CS U Ul CM rf W CM E- w CM u o
u U u U rf 2 U
Ε- U u Ε- rf U U
υ UJ 2 to u 2 υ u U O U X 2 to
U U Ε- u U U U
2 t- υ rf rf 2 O
2 x E- UJ U X u a U Id 2 z 2 tO
Ε- Ε- u u U u U
υ υ u rf rf 2 k U
U CL 2 Ε- u 2 u o u σ 2 i4 Η X
u υ rf u u u U
u ζ- u Ε- rf U
u 2 S Ul u X υ J o ω U CU H to
2 u u rf u Ε- U
u u rf rf rf υ 2
2 X u x u CU u ω u ω < to U X
u Ε- u u u u 2
u υ Ε- rf Ε- 2 E—
u u U X υ UJ u o υ J U o U >
2 Ε- U u Ε- E- U
u υ u rf υ 2 U
2 e- E- to Ε- to u w E- to U Q u u
2 U υ o E- U 2
u 2 U u t- U U
2 E- 2 * E— co U 0- E- X £- tO £- to
2761 2791
ATG GTG CTG GCC CGG GGG CGG CCC ACC GAC ACC CCA AGC TAT TTC AAT GGT GTG
o Ε- υ UJ u Ε- Ο > rf u u X o Ε- υ Ul u u rf
rS r-l «Η rS r—
10 Ε- CS u GO u U O u
υ Ul u Ul rf UJ U r* Ε-
CS U X CS rf e- CS u Ocs E- to CS υ
ad
FIG. 6D
190 709
U CJ 0 0 CJ
E- 0 e- 0)
0 > rf E- 0 O u U 0
rf 0 0 0 rf
rf H E- < U
<4 0 > 0 u cx O
u 0 0 u
t-< E- rf 0 2
u > t- U3 0 Q 0 0 <
u 0 0 e- u
u 0 H 2 ΓΠ
U Ol rf w rf W u X H
u 0 0 0
rf E- 0 2 0/
u X Ε-» Cu 0 0 2 Ui 8
u 0 0 u
0 U E-
Cu 0 rf H Ul 0 > s
o rf 0 0
rf 0 rf 0 rf
u ω 0 < 0 Cl rf cn p
0 E- < 0
0 0 0 0 r .
0 Ol 0 < 0 CL S Π
u rf 0 U 0
H 0 E- 0 r n
0 CU 0 > rf W W
»4 r-ł f—ł ♦—4 t—ł S-J
in 0 0 0 m 0 <Tt 0,
03 rf c\ E- rf o 0 o
0 0 0 U
E- rf E-< U
0 J 0 O rf X 0 rf rf
0 0 0 0 y
rf .rf Cu
0 X rf Ł0 Ću Cu r .
4 0 0 0 p
«5 0 < 0
0 ω rf W E- >4 rf W OJ
H 0 0 0 8
0 E- U 0 c-i
0 0 rf M U X 0 0 Γ J
E- 0 E-* E- 0
0 E- rf u
2 X 0 0 0 > 0 O -u*
Ε-» E- H *
e- 0 0 0
0 Ul rf 0 CU 0 CU
e* 0 0 0 p Dj
0 0 rf 0 Ηί
£h tO 0 rf 0 O 0
0 0 0 0 /V*
rf Ε-» 0 Ε-» LJ K
0 σ < M 0 0 0 Ul rf
rf 0 0 rf y
rf rf 0 x
< H 0 Q 0 O rf <
rH r-l
CS rf co rf rf σ 0 03
co rf CD 0 <n 2 o 0 O < ω
fS UOn 0 0 ts 2 i*l en H 0 m o
-sl E- E- H 0
U 2 0 0 rf
0 2 0 H 0
0 0 rf E- rf
E- rf 0 E- 0
6- 0 0 H 0
rf 0 0 E- 0
0 < 0 0 E-
U 2 0 H E-
0 0 E- rf 0
0 0 rf 0 E*
rf 0 U U Ε-»
0 0 rf 0 E-*
0 0 2 rf rf
0 0 *< 0 0
E- E- rf 0
E- 0 2 rf rf
0 0 < 0
U < 0 rf E-·
0 2 E-* 0 0
0 u 0 rf rf
rf 0 0 0
U < H 2 H
E- 0 0 0 rf
0 0 0 0 0
0 rf 0 0 0
0 0 < 0 H
rH rM rS ι-L ·—1
ui rf f-1 0 r* 0 η Ε-» CA E-* in
W 0 fS u rs 0 ΓΊ 0 o 0 •o*
m rf n n 0 n 0 n 0 n
0 0 0 rf 0
2 0 U 0
2 0 H 6-» 0
2 0 0 rf
0 rf 0 0 E*
Η 0 0 0 0
0 0 rf rf 0
0 0 0 0
0 H 0 0
0 0 0 0 E-
E- U 0 H
0 0 rf rf 0
0 E- 0 0 rf
E- 0 rf 0 0
rf 0 rf 0
0 0 0 H
0 rf E- 0 0
*C 0 e-« 2 rf
0 E< rf 2 0
0 0 0 0 0
E- 0 0 < E-
0 0 rf 0 0
0 0 0 rf 0
0 0 0 o Ε-
E- 0 0 rf υ
0 0 0 0
w —4 T“ł r~ł tU
CS 0 GO 0 0 o-2 <43 0 rs
rS (-1 rS 0 rs 0 m rf m 0
ΓΊ 0 m 0 n 0 o 0 n 0 n
AGG GGA GAG CAG CTT CCA GCC TGG GTC AGA AGG GGT GGG CGA GCC CTT CGG CCC CTC ACC
Fig. 6Ε
190 709
CAG GCT GCT GTG AGA GTG TCA AGT GTG TAA GGG CCC AAA CTC AGG TTC AGT GCA
U u U < Ε-
u U U u Ο
u 2 < E O
Ε- u u U E O
υ u E < U
u u E u U «2
u Ε- U u U o
E- υ < u U Ε-
U U u U Ο
U U Ε- Ε- O
U < υ υ U *3
O u U < u
U Ε- Ε- U u <
< υ υ Ε- u Ε-
2 U U υ u Ο
U < E u Ε-
Ε- E U Ε- u Ο
υ < < Ο < E-
E < U U u <
U U < Ε- u O
U < 2 υ < Ε-
u u u υ
u KL u 2 u U
u 2 E u < U
u u E Ε- u E-
u u U υ < E-
u u E < u O
r-4 Γ- r-4
m U en E ΙΑ < u r* <
2 kO < VD U r* Ε 03 U co U
E m e m U n U n U m Ε-
E U < Ε- E υ
u Ε- U Ο E <
o υ E Ε- U U
U E υ Ε- U
Ε- U E U υ u
Ο e- E < Ε-
rj e U υ
U E < U U U
E U < <
u u < < Ε- Ε-
u u U 2 υ υ
u u u u U <
u u < u U O
u < u Ε- <
E u u υ U
Ε- E- u U u
Ε- υ < Ε- u
υ U 2 2 υ u
U u u U u
< U < u e Ε-
U U Ε- u E υ
u U υ E <
< u U u u U
u E E E u U
GO CJ -ο» (n u
E u U Ε- U
U u U Ο U u
U < U O U u
i-4 ł-4 r-4 »—1
Xj· o u UJ p o» e- co E •xr U
in U u> E «43 U r- U r- U 03 U
m U n U m U η E- η E n u
U 3 u u u U < Ε- U < u
< E υ U
U E U U
u U U Ε-
< U < υ
2 Ε- U Ε-
Ε- υ < Ο
υ U U U
U Ε- u U
Ε- υ u U
υ U u Ε-
< U Ε- υ
U < υ U
E u u u
< u u E
U Ε- u <
E Ο u U
< Ε- Ε- E
U Ο υ E
λ: U E
U u u U
u Ε u <
E < Ε- U
< Ε- υ U
U υ U <
i—< Γ—ł rM
m u cn < in u
cn Ε- cn U o < r-4 2
m Ο η u xr U Ό* u
Ε- U Ε- Ε-
υ U υ υ
Ε- u < U
υ U
< u < u
U u U E
3 u Ε-
u Ο U
•^s u Ε-
o u U Ο
u < Ε-
u u U υ
fC u E <
o u U
Ε- Ε- U U
Ο υ U e
U u E
o < u E
t- u Ε- u
< υ
E- u U u
u
O u U u
U < < u
u U c
u < u u
o u < u
r“-4 r-1 łH <rH
O E- M3 U cł U 03 u
cn «< cn < O rij O u
m O m U «Φ U χτ E
FIG. 6F
190 709
U < < E- u u u
< u u 0 u 2 2
u < u 0 rf 0 2
o < < E- u 0 ε-
u E- u 0 rf 0 υ
< U Ε- 0 u 0 ε-
< Ε- υ 0 ε-
o υ < 2 2 u E-
E- E- Ε- u u u u
U E- υ ε- u 0 H
U E- U υ u 0 U
U < u E- 0 2
O U U u E- 0 2
E- u 2 u u 0
u u ε- E- 2 2
O u u υ rf u 0
E- < u u 2 <
u E- u ε- < 0 i-
o U u υ u 2 0
2 Ε- u ε- u u E-
u υ Ε- υ u 0 t-
u U υ Ε- E- 0 0 KO
0 < E- υ E- u U Oh
2 E- υ rf U U in
nr
2 «< u υ U 0 ε-
u u Ε- υ Ε- 0 υ 2
0 E- υ υ υ Ε- ε- 2
i-M ł-H 1-— r—1 rH rM
2 m 0 σ> U ιη rf ι—4 U t*· υ n υ
E- <N 0 rs U η U nr nj· u tn 2 2
< nT fc-· -a* -τ Ε- nr 2 nr ε- nr u 2
U 0 E- υ u υ < <
0 2 E- υ rf < u E-
2 0 U Ε- u u u E-
r·» E— U «ς u 2 Ε- 0
0 0 rf 2 u 0 υ £-
2 E- U ο Ε- Ε- 2 <C
E- < u Ε- υ υ Ε- 2
0 0 u υ U 2 Ο 2
e- 0 u Ε- U u 0 u
u E- u υ Ε- F< E- 2
2 2 E- υ υ E- E- u
0 0 E- rf rf 2 U
2 < υ U 0 U
0 0 U Ε- rf 2 U U
E- 0 U < U U 2 Ε-
0 U rf U 0 0 0
< 0 u 2 U Ε- u U
0 £- E- Ε- 3 υ 0
0 0 E- Ε- U Ε- U U
0 U U rf rf 0 2
0 2 U υ O U 2 6-
2 0 U υ 2 o E-
0 E- U rf o U 2 0
0 £- U Ε- u 0 2 2
0 0 υ rf ε- 2 2
0 E- U υ U υ 2
2 0 0 rf U E- 2 B-
»—ł rd t“ł v~4 r-4 r—ł
n O 2 KO 2 <Ν 0 00 0 nr e-< σ u KO 2
0 CM 0 ΓΜ E- Π Ε- m ΰ nr ε- tn 2 tn 2
0 nT 2 nr 2 ητ υ nr u nr υ nr u nr u
FIG. 6G
190 709
O o o O o o co co Ο Ο ο ο o o o o ca co O O
1 1 t > « t ι l 1 co l
1 1 1 co 1 1 1 1 1 X 1
1 1 1 ω I 1 1 t 1 t X 1
ł 1 1 Ι- I 1 < 1 1 1 H 1
< ( 1 Ο. I 1 1 » ł 1 _J 1
1 1 1 σ I 1 1 1 t > X 1
1 1 1 χ 1 1 1 1 ł X 1
1 1 1 ο 1 1 1 1 t X t
1 < 1 LU 1 1 1 1 1 σ i
1 1 1 1 1 « ι i co t
1 1 1 > 1 1 1 1 t 1 X 1
1 1 1 co 1 1 1 1 1 1 1 t
1 1 1 co 1 1 < 1 ι i o I
1 < ( « 1 1 » ł t Q 1
1 1 t co 1 1 I 1 1 1 >-
1 1 1 ο 1 1 1 1 ł 1
1 1 1 w 1 1 1 1 1 1 co 1
ł 1 1 cc 1 1 ł i 1 < I 1
1 t 1 co 1 1 1 1 ł 1 X 1
1 I t X 1 > 1 1 1 1 co 1
1 i i Η 1 1 1 1 1 ( t- ł
» 1 4 X J ? » 1 i f < 1
1 1 ł < 1 1 1 1 1 ł X 1
( ł i Ι- 1 t 1 1 1 1 X 1
ł 1 1 Ο 1 1 t ł 1 1 co 1
1 1 1 < 1 1 I ι i 1 1
ł ł 1 1 1 ι 1 ( 1 CO (
1 ( 1 1 1 1 1 t 1 CO ł
t ł 1 X 1 1 1 I 1 1 CO 1
t 1 i 1 _J 1 1 1 ι i 1 1
t 1 1 1 U- 1 1 1 1 i 1 1- 1
1 1 1 1 χ 1 1 « 1 4 1 co ł
1 1 ( 1 2 1 i 1 1 i 1 < t
-r- V- «— τΓ r—
CO
co g· ro s cj cd ω 03 03 03 03 03 03 03
ID
FIG. 7A
190 709
O O O o o o C71 CJ O o o o O O O o PJ 3
«11(44 • 1 4 1 1 | 1— X 1 1 1 1 ‘ 1 l l i ) ‘lilii X 1 CO i <9 H
• 1 4 1 l ł I 1 ł 1 1 I X X 1 1 1 1 ‘«liii <i<ii< X l CO i H dc
1 1 i 1 1 1 _j i 1 1 1 t > ι i X X
• 1 1 1 1 1 1— 1 1 > ‘ 1 1 1 | > , ’ζ
*»>11» o < 1 < < ι 1 1 1 CO ! J
< I l 1 t l < 1 1 < » 1 ι i » X
«1114 1 o 1 1 ‘‘tlił ω - U
> 1 4 4 1 | •—· > i « > ι ι ι i o ·
'lilii
‘«<iii co · <3
I 1 1 1 l l o 1 1 ‘lilii co Ui
1 t ι l i 1 α i 1 1 ' ι ι ι i V*» » <
lilii) 1— 1 ( < < ι ι i < ε = X
'tlili 1— < 1 ' ‘ » ι i co · ii
l 1 i t ι i ι 1 ι i i i t i o <2S
i i 1 i t l X ł 1 1 > I I I i co .
• i 1 1 i 1 X > 1 '•liii X . es
<11114 CO ł 1 » 1 1 i 4 1 CO 1 V
» » » 4 i 1 σ i 4 i i i i i co 2.
' · 1 1 1 1 X t 1 » » I 1 1 1 X -
' I 1 4 1 i 1 1 ι ι 1 1 4 1 O H
<1141 > 1 1 ‘<1144 X I (=)
• 1 1 1 1 1 X 1 1 ‘‘(lii Q X
lilii 1— 1 1 ι l · 1 ι 1 X X
<iilli co 1 1 1 < 1 1 1 1 Σ-
I i i < l i X I ł ‘ 1 i l > i > ι
< » 4 1 4 1 > 1 1 •iiiii co · 1
>«1111 X 1 1 > ι l i I I CO ' 1
' > 1 1 ł 1 σ 1 4 > < l 1 4 i X · 1
1 ι 1 1 4 1 co 1 i ' · 1 1 1 1 H > 1
> < ι ι ι i co t 1 • 1 1 ι 1 i X 1 1
* » 1 l 1 1 1— 1 1 ‘ i 1 1 1 1 CO , 1
— - - — - - r^. ca - - ---- - o o - —
co-sł-tnr-^ojcoin-r-m
WMCOWMCOCOWCZ)
C7 V Q N C\l CD ® — Vr> MMLOCOCOWlginw')
Fig. 7B
190 709
O o o o o o un io O Ol Ul σ ο o o o o 03 σ> O C4 Cl
1 1 Ź X t I 1 ί—
1 1 ω 1 CD 1 I 1 0 0
1 t LU Cl 1 I X X
1 1 0. 1 ω t X t-
1 1 X I 1 t 1 >- 5-
1 1 Q t t- 1 t 1 >-
1 1 ίγ LU 1 1 LU Cl
1 1 X I CO 1 ł > Q
< 1 1 0 t 1 1 > X
( 1 LU ł 0 ł ł 1 < <
/ ł ź ł X 1 1 1 X ł—
1 > ω < t 1 1 2 \—
1 1 1— ν' 1 t 1 O XX
1 1 > X 1 1 > X
1 1 cz 1 Ci 1 1 1 < 1 XX
t 1 X ( ω s t 1 x 1
1 1 2 1 X 1 1 1 _i 1 X
i 1 1— 1 00 1 1 1 \x 1 >
1 1 1 _J 1 1 1 1 X
1 1 LU 1 1 1 1 X 1 03
1 ci 1 < 1 t X 1 X
1 1 n 1 Oj 1 f 1 χ 1 2
( 1 Q 1 ω 1 1 ł 0 l X
t ł !— t 1 4 ł X 1 >
1 ł X ł ω ł t t X l τ-
1 1 Cl 1 ω 1 1 t σ 1 α:
1 ł 4 X i ( i X ( α
1 1 ω 1 X 1 ł ł ν' ( χχ
1 1 _j 1 1 1 XX 1 X
1 ł —- i > < 1 1 X 1 1—
1 i —1 1 X 1 1 1 X 1 χ
1 1 1 V- 1 1 1 I X σ
4 ł Cl 1 ω 1 ł 4 1 (Z)
- - - - σι cn - CS - - co co Ύ— σ co
^n-cnr^cdtoco-i-in ^wtoc/jcncocotow ω v G) s c\i ω © V) w C/) to W ŁO w tn co co
FIG. 7C
190 709
Ο Ο Ο ο ο ο Γ) CM o OJ
1 1 1 1 t ) _J
< > i > ι 1 >
t » 1 1 1 ι co C5
• » 1 1 ł I < CO
( i 1 1 1 1 co
i » 1 » 1 1 _J
» » ł 1 1 1 O Q
...... c LU
• 1 1 1 1 1 1 1 | | | | O
' < l l t I co CC
» > « ł ł 1 2 Q
tlili ł— 1 ω
•tlili > 2
1 1 1 1 1 I 2 1 co
1 * 1 1 1 1 t _i
< I 1 1 I l- 1 cc
• 1 1 ł 1 2 1
• ' 1 1 1 1 b~ 1
1 LU
»»11» 1 O
» * 1 1 1 1 -J 1 Q
‘ 1 1 1 1 —I 1 O
* ' t 1 1 1 O 1 O
4 ♦ 1 t 1 1 0 1 Q
>>1111 L!_ 1 LU
lilii CZ 1 LU
•lilii I— 1 >
1 ' 1 1 1 1 >- 1 CC
1 ( 1 I 1 ω t 2
tlllll < 1 H
1 i t 1 1 1 I— 1
1 · 1 1 I 1 1
- - - .--- o cn - π a
o o o o o o S θ fi
1 i 1 1 < >Z
< » 1 1 co 1 u)
t 1 1 > 1 LU ier
1 1 1 1 1 CO
1 1 1 1 1 H i X
I 1 1 1 co ip-
t 1 1 < 1 cc i<£
1 1 1 1 1 co lid
1 1 1 1 2
1 1 1 » co , <
1 I 1 1 1 I H
1 1 I 1 ł o , iu
1 ł 1 1 1 UJ IZ
1 1 1 1 σ •3
1 1 1 1 co
1 1 1 _)
1 1 t co i Uj
1 1 1 2
1 1 1 , V)
1 I 1 _J 1 <4
t 1 i >0
1 1 CO 1 oc
1 1 . X
1 1 i X
1 1 co i <X
1 1 LU 1 O
1 1 CO «>-
1 1 CO i Q-
1 1 CO 1 V-
1 < cc > l·
1 I co i Ό
1 ł co i fr·
1 1 ' lh
- - - - - - CM Cł CM - j> £
co-g-OTb-oJcoro-i—Łn
to w to ω w to to to to
CO-g-Oit^CNCOOO — Ιτ$ W W Κ Π Ο Ο) η
Fig. 7D
190 709
O o o o o o σ» CJ O 03
1 1 1 1 > LU
1 1 1 ł _1 Q
1 I 1 1 co 1 CO
1 i t 1 co _l
1 1 ł 1 < LU
1 1 1 1 co XX*
> 1 1 1 X
1 1 1 1 H _J
1 t 1 l O
t 1 1 ł O CL
ł 1 1 1 X
1 ( t (—
( 1 1 t co >
1 1 1 < t— O
1 1 i cn X
1 1 1 1 T* <
1 i 1 1 _J
i t 1 ł α- cc
» 1 1 t χ t-
1 1 1 1 XX Xx*
1 1 1 I LU LU
< 1 1 1 Q CD
1 1 1 t 1— 1 XX
1 1 1 ( XX >
1 1 1 1 w
ł ł < 1 X ( O
ł 1 1 1 CD O
1 1 1 1 CO XX·
1 1 1 1 XX X
1 1 1 1 f— >
< 1 1 1 X l cc
1 1 1 co <
1 1 » 1 x
- - - --- in (O 04 - 03 U3
Ο ”
O o o o o o C3 03 o 04 04
1 < 1 I X LU
> t 1 1 Ο- X
1 1 1 1 χ >
1 1 1 1 < CO
ł 1 1 1 CL o
( 1 1 ł co
1 1 1 1 co co
i l 1 1 x Q
t 1 l « XX X
1 1 t 1 X
1 1 1 I X >-
1 1 t 1 co 1—
1 1 1 t X X
1 1 1 1 co co
1 » 1 1 χχ· σ
1 1 1 1 < t LU
1 1 1 1 co 1 X
1 ł 1 1 co 1 X
1 1 1 1 < i σ
i i ł 1 χ 1 X
1 1 1 1 co 1 1—
( t 1 1 co 1 X
ł 1 1 i co 1 CD
Uj X
1 1 t > CD 1 X
t ( ( i cc (
• , ( 1 _1 t <
1 1 1 1 co 1 XX
1 1 1 i 1 X
1 1 1 « X 1 X
1 1 1 I co ( X
( 1 t 1 X ł
1 1 t 1 X 1
- - - - - co 03 04 - CJ cn
co^rcnr^cjCDcoT-m u><nu)U)toV)tnuiw co^crih^cMcciooi—m wwwcnuiuiwmt/i
FIG. 7E
190 709
o o
o α σ o o L3 o r> O LT CM o σ o o o o IX co O
1 < 1 t « ’ CO > » 1 1 1 1 1 X ι λ
lilii 1 CO > ι t i t i t X 1 -J
1 l ł 1 1 ' CO CO * » 1 l ι I co : 3
1 ε •»111» co , Ό
• 1 1 I 1 l ~r >- * ι ι 1 1 i X , Z
l l i t i ‘ X ε * ι t 1 t , co , Σ
lilii ' ε X tlllll i >
lilii • ε 2 t ι 1 1 « 1 CD i #
lilii • X X 1 · 1 1 i 1 σ ι H
lilii 1 - 1 Q ‘ » 1 I 1 1 X I
*<111 1 co l σ 1 1 l 1 l i X I <
* I 1 1 1 ' X X * ι 1 i l 1 X i l·
'<<11 ' >- 1 ι l ι ι ι i i μ-
•'III • co < * ’ » ι ι i H ι lu
lilii > X X 1 * » 1 1 I X t <
• l 1 ( 1 ' co i X • < 1 i ł i < . l·
• ι i l i < 1 < ‘•ił ι i X i Z
> X 1 α • 1 1 ι ι ι X ll·
• ‘ » 1 l X 1 —! 1 1 1 ι ι i o i rt
• > ι ι ι 1 co 1 co • ι i > i _ ) a.
’ 1 1 i l 1 < 1 1 · t 1 1 I co 1*
• 1 ι i « 1 co 1 1 1 > i i i co i A
' < ι ι I 1 >7. « •ν* • · 1 1 1 1 CD I X
••lii < ł- 1 O •lilii X )>
liii 1 —I 1 α • » 1 1 1 1 X ι ε
1 i ι i • Ϊ— 1 CL 1 1 1 1 1 1 co 1 li
• ι t t t ' co 1 1 · 1 i > i
lilii 1 X σ 1 l * ι II , J
• •iii 1 co ll • 1 1 1 1 1 X 17.
• •lit • X 1 ‘III II co I 0-
'<111 1 ·— 1 2 1 · 1 ι ι i CO 12
' ι ι i i ł ·— 1 ‘ 1 ι i < > X i >
'(iii 1 X l LU ł » » ι i i co IV)
----- - n - v> OJ w- cr
C3 OJ u <0 C4
COTCnr^-OJCOCO-r-lf)
OiMWŁOŁOCOŁOCOW ovmNWOt0- In cnnuitntnwiflOA
Fig. 7F
190 709
O o o o o o o> CM V O cn CM 05 O O o o o o CM GD ΤΓ in o π
1 ( 1 1 2 1 Q 1 1 1 1 l·- 1 1
1 1 1 1 1 LU 1 1 1 1 co < 1
ł 1 1 1 _J 1 Q 1 1 1 co i »
1 1 1 ( 2 1 LU 1 i 1 1 2 1 i
1 < 1 t '0 σ 1 1 i i co i ł
1 ł 1 » o t 1 1 1 ν' «
I t 1 t Cl 2 1 ł 1 1 - σ
1 1 1 1 ł Q 1 Q 1 t 1 1 ω 1 LU
1 1 1 t GO CO 1 1 1 i CU . —
1 1 t 1 l·— CO 1 1 1 1 1— ' co
1 1 t 1 CU co > 1 1 LU « LU
1 ł 1 1 1 1 1 1 σ ' —
ł ! ł » ω Q_ < t ( ł CO 2
l \ ł 1 ω CO 1 « ł i l— , 'S
1 1 1 1 ( σ ł LU i i 1 1 > LU
1 1 1 1 1 cc 1 1 1 1 >-
1 1 i 1 1 ł z 1 1 1 1 1 1 < • 2
« 1 1 1 1 C- 1 1 1 i a > • _J
1 1 1 1 1 ω 1 Ź i i 1 1 1 1- σ
a » ( 1 1 ω 1 O • a i 1 1 2 > LU
1 < 1 1 1 > I Q 1 i 1 1 1 1 CU 1 <c
1 * I 1 1 2 1 _f t 1 1 1 1 1 CO _l
t 1 1 1 i— 1 LU 1 1 t ł 1 ł U- . —
t 1 i i i LLI 1 σ 1 1 1 < 1 1 > a
ł 1 1 1 « >- 1 CE 1 1 ł 1 1 1 CD • 2
I 1 1 1 1 ~T~ 1 CE 1 1 1 * 1 1
t I < 1 1 _1 1 1 1 1 1 σ CJ
1 f ł 1 1 O) 1 1— 1 1 1 1 1 1 co 1 2
< 1 1 I 1 t _l 1 1 t 1 1 1 ©
( 1 1 1 1 CD 1 2 1 i 1 1 1 ł CE • O
1 1 ł < I V < (— 1 1 ( t i < < CU
1 1 ( 1 1 ł < ł y 1 1 1 1 1 1 LU >
1 < 1 1 _J 1 LU 1 1 1 t 1 1 • CD
o
CO CM co
tltONCJCDO’- m WwintnincninMin co-3-cnr^.ojcDQ3i—tn mcnwtntntnuiwu)
FIG. 7G
190 709
o o o o o o m C7I τ o V rs. co
t ł l I » l — > 1—
l ( t ι ł 1 > . LU
i t ι ι i i UJ > CC
1 tlili —I ' >
1 1 1 1 1 1 CO ' >
1 1 1 1 1 1 C 1
< t i < i t 21 LU
l t f ι ι i < 1 T
I 1 1 1 i t i— ' —}
i > ι i ι i 1
l 1 1 « ι i 0_ · —J
• » · 1 1 1 — 1
« IIIII 0- · tu
' » 1 l 1 1 a · 2
•lilii a > £
» · » 1 1 1 CO ' CU
lilii co ‘ ω
• » » 1 1 l co ·
•lilii a , CU
lilii CO 1 >
1 ι ι · ι i a LU
••llll — 1
i ι ι i » 2 .
• i ι ι ι i > . 1
• 1 1 1 1 1 O · 1
1 < 1 1 f 1 < ‘ I
• < ι · ι i 1— · 1
• lilii σ > 1
> ι ι ι ι i > · ł
ι ι ι ι i H- 1 1
( ι ι ι ι i _j 1
• 1 1 « 1 I 1— 1 1
• ł l · I 1 < > 1
- - ’— - - ΓΌ C3 CS Ul o
' Λ ο ο 1 ο ο f1 tn CD —L.
1 t 1 1 > ι Ό
1 > 1 1 a i -l
1 1 1 • > i OC
1 1 1 1 a
t 1 1 • > i -1
1 i i I ' ł~ 1 H
1 t i 1 1 1 >
1 I 1 1 O i LU
1 1 1 1 1 a , X
1 1 1 i • Z ι H
1 1 1 i - , J
1 1 1 • o 1 >“
1 1 1 1 ' Q t >
t > a , a
1 1 1 < - >- , W-
1 1 • H i C
1 ' UJ
1 1 . -i
1 a « Ό
t co 1 OC
1 • < _>
1 1 H i CĆ
1 ' i— 1 ii)
1 • CO I >
ł • co . 9-
ł » ..—
i 1 1 X
> a H
1 • H ' Z
1 ' O • c
1 ' UJ ι X
1 • H < l·
1 1 CO 1 -I
- - - - - V— ca ca r
co cn r- CU CD CD T- LO
to to to ω to to to to to
o+rcnr^cMCDcs—(Ό WMlOWlOCOlO^l/)
Fig. 7H
190 709 ο
rr co rr OOOO-rr-mO^*
1 1 1 >— X f-
t 1 1 >- X >
1 1 X X >-
1 1 1 2 Q k/ X
t 1 1 1— X σ
1 t 1 > o X >
1 ł X χ x
4 1 1 1 <C Ω X
1 1 1 • 1— X ε
1 1 1 σ X
I « 1 Ε— O X
) 1 σ 1— <
1 1 • X X
1 1 1 2 X
1 t I ( X Ω
1 1 1 1 < x α
1 1 1 1 1 >
1 1 1 ł X 2
1 4 1 I 1 ( σ
i < 1 1 1 σ Ω
r i I / » Ω i
1 1 1 1 X 2
1 f » 1 _1 ł 2
1 1 1 1 1 X 2
1 < 1 1 X t 1—·
1 1 1 1 CL
1 1 1 1 > 2
( 1 1 » 1 X
1 ł 1 1 >
1 1 1 1 \Z \χ·*
1 1 1 1 σ 1 CC
ł l ł 1 X 1 <
1 1 f 4 X 1 >-
- - - ’— σ> 04 ΙΟ - 03 O -Γ
CT
o o o co cn co O OJ rr IO o ’Τ
1 1 • ω O —i 1 X
1 1 4 ' X — < ' X
1 1 1 • O χ x · X
1 1 1 • X X X ' X
i 1 t — ΩΧ ' χ
1 1 1 ' >· X X · >
t 1 1 ' X > X ' ε
1 1 1 • x σ x
1 1 1 • X Η- χ · <
I i 1 • 'ΟΧ' χ
1 t l ο « < '
1 1 1 • — ο > ' >
1 » t ' X — X ’ t—
1 1 'XXX ' X
1 1 ' X X X ' χ
1 ł • <: χ χ · X
1 1 ' χ u__ι · Η
1 t • <£ _IX ' X
1 1 > σ > · ο
t 1 ' ' > X ' X
( l ' ' X X · α
1 1 • > X > · >
1 1 ' ' X X Ω
1 4 ' ' Q ' ' X
• « 1 1 1 I X
1 1 4 1 1 1 X
1 1 < LU ić Ω · X
1 1 > 1 ŁU 1 » X
4 1 1 1 1 1 I Ο
l 1 1 1 ι 1 1 >
1 * ι νχ ι .
l 1 1 ω o η · Ί—
1 » 1 • Η Ο > « X
- - - •τ- ΙΟ ΙΟ OJ τr CO ΙΟ *τ· ’Τ'
co^cirL-cMcocDi—in wwcowtowtnww
FIG. 71
190 709
o o o a CU Ul o r~- m U3 o to o vn
< » t « < O a 1 2
t ( 1 l f- ω CL 1
1 1 1 1 2 >
1 * ( ( ILI c ^r
1 t i < 2 < O
i 1 1 t O > o > h—
» » » J 1 ω l 2
1 1 1 t ( l
i < 1 1 1 t l
i i i t 1 ( l TT
•>II 1 1 a
• 1 1 1 1 1 1
« i » i _J « >
>111 a a
> » 1 » < o —I
• » I 1 _J a _1
>i(i —1 _J UL _J
III! a. Q a
» · 1 ( -j o ł— CL
• ł 1 » H- u- 2 <
> 1 i i a γτ 1 ...
'111 -! . _j UL 1 L_
(II 2: > l— 2
1 i 1 i _1 \s > 1 σ
l l l i 2
•III GS UJ y-· ω
’ » 1 i O UJ 1 Ui
* « » ł 1 · 1 1 UJ UJ i— > a
1 » ł » i O
‘ < » 1 2 _] u-
•(Ił 2 2 _l
• » » » σ o }— 2
— ł— — b-. cn
CM V CO hs
in ΧΓ
ooooggSC^ ' ' ' 1 ' o < i a.
1 ' ω t. | a.
i i i _2 · 14 1 1 · eg. i a 1 1 ' ' ΙΊ W , gf 1 * 1 · c q q , ci 1 ‘ ' 1 _J C Q | Y ' 1 · > σ -j ,-i
U. ϋ , -i m 2 i > 2 O · Mco a a i 2 I -i . >- · χ . - I >
> 2 ι -4 • ϋ ι QĆ « CO > —l ' I— < }~ 1 !£.* i —Ł • I i • Li. . -4 • 1 1 . ω I 1U I 2 I Z.
Z Y '0tr _i i h _i u_ . > — L£J » łg _J i hl _J H ' < cc o t m
Γ3
u η n w ω ω r- u ^WMŁOWŁOOCOCO η ν ω r- pj b a — [n
W KI tQ U W Μ O V) 7}
Fig. 7J
190 709
O o o n o ιχ OJ 04 O co o 04 rx 143 o o o o o m m ^r r- 04 co o CD
i 1 X > 1 X 1 I t 1 XX X X X >-
1 1 , — > Q 1 I i i 1 χχ X Q χχ >
1 1 ' O O Q i 2 1 I 1 1 X X > CO X
1 1 X X H CO 1 1 t < X > X X
i t , X XX CO 1 X 1 1 1 ł X > > >
I 1 X X < l X i 1 I 1 < X CO < 2
1 1 X X ł 2 1 1 * 1 X X X <
i 1 1 1 X X 1 1 1 1 F— X F— > Q
t 1 1 1 X co 1 XX 1 1 I 1 XX X 0 < V
1 1 i i X co 1 X 1 1 ( t σ XX X F—
1 1 i 1 co F— χχ 1 1 1 1 XX > > 1
( ł 1 1 X 0 1 1 1 1 X X
1 t 1 1 CO < 1 1 1 1 ( CO X 1 XX
1 1 1 1 co X ( 0 ł 1 1 1 α 0 1 χχ
1 1 1 1 X z 1 X ł 1 1 1 < co 1 >
1 1 1 1 F— co 1 2 1 1 1 1 >- 2 0 ( X
1 I 1 1 < co 1 X i 1 1 1 Q X co 1 0
1 1 1 ł F— XX 1 X 1 1 1 1 0 O < 1 <
1 1 I ( CO co 1 ł ( 1 1 X 0 ~r 1 2
1 I 1 ' X \s co i 1 1 1 CO 2 X 1 T
• 1 1 i co > co 1 ł ł 1 σ > Q t 2
1 t 1 1 co co 1 X 1 1 t 1 > 2 X «
1 t 1 t > X. t ź 1 1 1 1 < > CO 1 0
t 1 ł 1 XX X ł χχ ł 1 < ( X χχ 1— « >
1 1 i 1 X X X 1 1 1 1 F— χχ i >
ł 1 » t ZE > < ( < 1 l σ < o ł <
» 1 1 1 X 2 1 X ł i i 1 0 CO co 1 co
( 1 1 1 2 2 1 CO 1 1 1 1 2 0 co 1 2
1 t « ( XX X 1 < 1 1 1 1 o O co 1 0
1 1 1 < X co 2 1 1 1 1 < 2 F— 1 X
« 1 1 * X J- 1 < 1 ł ł 1 —1 > 1 <
1 1 1 1 2 X ł X 1 1 1 1 LL 1 χχ
« 1 1 1 > X ł 1— 1 1 1 1 CC LL co 1 >
’Γ- h- o cn o _ _ _ co CM C3
CD cn ΤΓ K. CM CD
CD 143 CO 143
c7vcnixo4tDcOł-in wtninww&mtntn
FIG. 7K
190 709 σ ο ο
n CM o r-. O TT co tn ca CD ΜΓ CM O O o-»*“ 1
μ- r- <r u3 a o *- O CM r*
>- CO 02 t 1 O > 2 2
—1 F- — 2 1 1 2 · > CO 2 >>
—1 2 > 2 i ł < ' > >
2 2 UJ 2 1 1 CD · 2 σ X A
t 2 > < — < ł 2 · 2 2 di 2
1 > 2 — 2 « 1 O ' 2 2 CO J-J
£Z Y UJ 2 1 1 < i a 2 CO <0 Q
ω 2 2 > — 1 1 2 · 2 2 Ό h
tn i- < LŁI ί- 1 1 2 Mz* co z ω
σ >- 2 α a 1 1 2 · 2 2 2 iu
co O UJ < 2 1 1 > · CO > 2 -1 H
> _l UJ — a 1 i < CO 2 2 u A
Cl > 2 < o 1 t 2 · 1 a 1— U) H
> U- CO Σ0 1 l 1 1 t t ł- o
> 2 2 _J 1 1 1 1 4 1 2 Q->-
u. Q > 2 2 1 1 i 1 1 1 ł—
1 > LU 2 LU ł 1 1 1 » 1 2 > Sr
1 Q 2 2 2 1 i 1 1 1 1
( O - 2 < 1 1 1 t 1 ( er 2:
1 > 2 2 < 1 1 4 I 1 4 2 2 X
( Σ5 F- 2 1 1 1 1 1 1 C3
1 2 >- 2^ t 1 1 1 co 1 CO ft H
1 H 2 2 7*- 1 1 1 1 2 2 CD d o
1 > 2 f- > ( 4 4 4 2 < V X 2
1 UJ 2 CO O 1 1 1 1 O ~r c CO ZZ
MZ O LU CD CO 1 t 1 1 O 2 Q «-
co 2 F- CO co 1 ł 1 I O > >
< CO CL. < 2 ł 1 1 1 1- 2
Cl 2 2 2 2 i 1 1 1 2 > 2 A £
LU Η H —J 1— 1 1 1 1 2 2 2 ln o
_J < 2 2 2 1 1 1 ł 2 2 2 > cn
CO —i ω F- O 1 ł 1 I 2 > 7<(J5 H
2 2 > > co 1 4 4 1 i— a 0—1
CM O cd tn to «·— T- r** CD V T- O CD - — CM cn 03 cD ^r r- *-O
CO -cj· CD b- OJ CO CO tn w tn n.w ω ω τ- LO cn in co-rcnr-^oJcocD — to
MWWWWM<j7V)V?
Fig. 7L
190 709
CD T* o CT> Γ— ο — ΟΙ CM CD Ξ CM Ο Γ*. Ο ο C73 O co o CM en co Ol m — 03 rr ’Τ -Τ ο Γ*
X 1 X X Ω X Ω I ι X 1 ’l y X 2
> 1 X 0 Ω X ι ι 1 1 X ε χ >
< 1 X > X κχ 1 1 < 1 1 ι- χ σ >
X 1 X σ Ω CD V 1 1 < 1 1 έ X < X
X 1 σ X < > 1 1 X 1 > Ω ε ε <
1 X X X X ω 1 1 0 X χ χ 0
> 1 X < ε > σ 1 1 < X ε X X
> t X X cd ε 1 1 X X X ν χ X
X 1 < X X < < 1 1 X X X 1— X X
X 1 < F— < χ ε > 1 0 t 0 X X X
σ X ε X ε ε 1 1 X < X < ε <
1 σ I X Ω Ω 1 1 1 ε < ε X >
χ 1 < 1 X χ χ 1 1 < 1 ε ε > ο X
ω 1 X 1 Ω 1 1 1— 1 χ ε X σ X
X X X ί— Ω X 1 ( 0 < ε ε ε X X
X > > X X < I 1 > χ ε X
X 1 X X X X X < 1 ł- 1 χ χ χ >
1— 1 X X ε 1 > 1 ε 0 X ε X
1 1 1 < < I ι > 1 ε 0 ε
X 1 X X X > 1 I Ω 1 σ ε σ V* ε
1 ε tn ε X > i 1 ε 1 Η σ X Η-
X 1 ε Η- ε ε ε ( 1 X 1 X X 0 χ
1 X X ε Η > i 1 1 Η- I 1— > 1
X f Ω ε < > 1 1 X t Ο «X— ι Oj < Ω
X 1 X < χ X χ 1 1 1 X < _J X
X X Ω X 1 1 X 1 > X ι- X ε
1 X Ω 0 0 1 ł 0 1 X έ X σ
σ X X X \s f 1 o 1 σ σ Ω
σ 1 ο X 1— CD X > 1 X 1 X i X X X
CD 1 X 0 Η Ω t 1 > 1 X ε X 1— X
> 1 X. 1- X X 1 1 X 1 X χ Η 1— α
< 1 X σα X 0 1 1 X 1 χ ε Η Η-
X Ω ε 1 1 X 1 X X < X X
r- CS C0 σ> ο r-- ο CT οι η
Τ' cm co r* CO ΤΓ CO CM 03 ο
CO TT 03 r- CM CD CD w ot ot ot « ot ot co -g- cd OT OT OT — tn OT OT s oj ta co — in OT OT OT OT OT OT
FIG. 7M
190 709
O o cv O o CS • CM Cł r*. O CM CM CO co r* r. co — r·»
1 1 LLI Q > CO 2
i i ω 1 CO 0 T“ CL 0
1 1 σ ' — < i—
1 1 co ' 2_i CO
1 1 > CO 2 < O 0
1 1 σ 2 H CL 0__1
1 1 V-* 1 — CO i— > a
1 1 ω _J — >- u- Σ
1 1 ο ' LU 2 CO 1 LU
1 1 < • CO LU co < 2
1 1 1 CL CO 1— σ ω
( 1 LL. 2 o. _1 0- <
1 » > cz c. co CE ll
1 1 CE • a a: Q X -1
1 1 LU • a CL 2
1 1 ω l 1 CO CO 2
1 1 2 ł 1 CO — 0
t 1 Η l i co Q CL
1 1 n. > 1 1 co 0__!
1 1 co * > > < > 2
1 « u. l i LU CO >
1 1 LU 1 1 CL >
1 1 σ 1 1 CL < CL
1 1 co i < i CO CO 0
1 1 2 ' · i co CO Cl
1 1 LU ' ' 2 _l
t 1 O ' LL _1 CL >
1 t LU L - σ o
1 ( < ’ σ 2 CO U-
t 1 σ • > cc CL 2 LU
1 1 < . . — _J < 0
1 1 • cc CL CL CL
1 1 a XL>-
-r- v- § ν- n cn O L0 CM CM CO OT OT
CS C*3 *- r*
to — 04 -β· (fj 0
V V — O C, qQ o o ł— o ę\j o o»
1 • 2 < CO tĄ W
t 1 ϋ • 2 co I--1 H-
I • cc ' 2 2 co *3 Ό
1 1 < • _i 2 H Q >
1 < ' co ll co w
1 1 CO 1 2 co a 9
1 ' 2 CO LU Q CC L0
1 2 • — 2 a 2 >
1 1 ϋ • h 2 t- lu H
i 0 |_ V ΕΛ tj
1 1 V- LU 2 _I Kj 2
1 • F • _i a 2 z H-
1 • O • _1 _I 2 QC
1 ' > ' Y£;> ΰΟ
1 • 2 2 2 > ft- K
1 • < • 02 O <3 0
1 • 2 1 2 a 2 -4>-
1 > ' 1 1— <C LO f-
1 ' 0 ' · 0 H- H
1 • LU - - 2 AC c
1 ' 1— • · > cc >-
1 • < 1 1 ‘ 2 <S ~2.
t 1 2 1 1 t f— LĄ
1 1 a 1 O cf\3
1 i > • 2 2 2 Q_ d
* < 2 • 2 2 — U) Z
1 ' 2 ' 2 U--1 <_l
t > 2 1 1 >- 1 ) _1
1 . — i , , , I |_l
1 σ 1 1 > 1 I —J
1 • o ι ι ι ι 1 f—
1 • _I i l i 1 Z.
« 2 > i i i (
- P- co “ δ s&E$
CO cn b- 04 CD □O i— LO
W ω OT OT OT OT OT OT OT
co tj- cn cm co co — In
O)WWWWtf)(/lV)L·)
Fig. 7N
190 709
ca r*. o r- co o nr rs. o CD CO
O o O OJ « σι CU m o o OJ σ OJ co σι CO 04 (O CS
1 1 > i < > 0 < 0 1 1 XX 1 < Q Q 2
1 i X 1 X < X X XX 1 1 X 1 > C CO >
1 1 1 X > 2 0 > i i O co ω CO X V
1 1 Ι- 1 ' X X 2 1 1 X 1 ω O X
1 4 Ο t 1 ' X XX 2 1 1 σ 1 1 X > X
1 1 co 1 1 X CO X ł 1 0 1 1 2 < co
1 1 LU I co ' co t- > ł 1 X 1 1 X 2 X
ł 1 σ 1 co 2 X co H « 4 0 1 1 X 0 0
1 1 LU 1 X CO CO 0 > 1 1 X 1 1 < CO X
1 t X 1 X X > X H 4 1 LU 4 1 Q 2 o
i l·- X 2 X > X 4 1 XX 1 ł < 0 X
t oc X — X 2 1 1 X 1 1 X 0 0
t 1 X X -1 CO X > 1 1 X 1 ł 1- 0 X
1 1 X 1 σ — 2 CO > 1 1 XX 1 1 1 0 2
1 1 X 0 Q CO X < 1 » (— < 1 α X X
1 1 XX 1 X 0 H 4 4 X 1 1 2 co
1 ł < t 2 — CO X 2 1 t 0 1 1 X Q co
1 t X f 2 > X 1 1 X 1 1 X Q 2
1 1 < > 2 Η- X XX 1 ( J— 1 1 X O X
1 l > 1 1 CO co 0 1 4 2 1 1 X X
1 1 0 1 > UJ 2 2 X 1 1 X 1 X X O co X
1 1 < 1 0 < CO CO CO 4 4 1 X X < < 2
t X X CO IX CO co 1 1 >- 4 co i— < CO 0
1 1 < 2 X Z, X LU 1 1 X co 0 CO 0 X
1 1 X X X > X 1 ł < X O 1— X O
t 1 co 0 X 2 X CO 1 ł 0 X X co Ci 0
1 I XX 1 σ X 0 X 2 ) 1 X 1 o 0 co X 2
1 t CO co 02 co X 1 < X > 0 > t— 2
1 1 co H < 2 0 co 1 1 co X X > 2 X
1 1 X — 2 H o 1 1 X X X X co co
1 4 CO —1 X X 4 1 o 4 co < co 0
1 1 co u CO > χχ 1 1 X X 2 V X
1 1 X X X X X LU 1 1 0 < X Q 2 1-
ca -r- CM CO in Q o *- Q> co co
CU CO CD OJ CO Γ* co CU a O 03 OJ co
co->a-cntx.c\jcoco--m wtntntnuitnuitntn m Tf 05 Γχ CM CD OD W W OT W W ca CO »- m tn w
FIG. 70
190 709
TT o·
O O CM O r*. «□ — to co CO fO
Or
' — 1
1 _J
t MZ
1 §
1 >
1 2
ł X
1 O
1 σ
t X
1 X
1 cn
1 X
ł XX
t 1 X
1 X
1 co
1 X
1 X
ł X
ł <
1 X
1 X
I X
1 0
1 X
1 0
J X
» σ
CM r04 co o cm α o σ cn co o _ E~ ° *· _ in — CM O cj
Mz* t o co J- S32i.x . T-
σ X 1 1 GO Mz* X ZE X α · ccsHa-B; i 2 0
co t X co o ićo5o^g
χ 1 Q < X łcissia p#
χ 1 Mz* X X Ei:
χ i Mz* X > Sw^żEDa . ijj
co 1 2 X X aśsx . co
‘— 1 X Q X · X
X σ ( ł 2: X MX ϊ^^χ ' >
h- ( H- co < < i n
cn 1 X co 1 1 1 Mz*
co 1 X 2 ‘ ’ O. » co
> 1 < X 2 1 X > co
J— ł 1— X 0 • χ 1 Mz*
X 1 Mz* H- X 1 1 co · X
X 1 Mz* 2 Mz> 1 1 1 2
X l Mz* > > ' i P i 0
Q l co Q 2 1 > X . 2*
X 1 X X 1 1 P i co
0 1 X X l ~~T 1 σ
X MZ* O « J— 1 >
Q ΏΖ Ci Mz* » > Q_ 1
< Cl Q > ' < _J > X
X co X > i n i X
X Mz* co > Mz* 1 1 X ' >
X X co X X i i X i 0
X X I— Mz* ' ' 0 >
2 Mz* Cl X co • · 0 > 2
> 1- Cl > co 1 ci > I—
Q F~ Cl H X > σ >
X Q co X < < i Π i co
m a C3 IO o r* t*. ŁD τ~ ΙΛ v- o
CM CO cn CM O CM co
ra^rcnscjcncaT- m wtnwwwwwww >
>
> ϊΦ X Ζξ^ ®°0 x Y\«ę
H l· »S a>X z 0 X lb 2 <F x y£ C Ui0 σ«.Σ H σ j Κω > P q <ς:
u~ Ul -a — Ul > LU 2/ u QF2 cn l- α ± > Μι— t- F cn h cz cn O φ 2: v) Q •4- fO <3~ O O cr co σ> ΐχ, cm co do _<J> cowt/jŁrjtntn</i,z)»’
Fig. 7P
190 709
Ο Ν» — CD CO D — CO O O O CS 'T
CO CS CO CO — CO 03 r* p*. co es
OJ CM O r* oj co co — aghTOiiSjZŁE uj _j _i u_ co o σ —i -i oz ~ Q~ UJ OiŁOSSĆO;
.—3z αοΞ=
|.<g<-Q; agEsigęSi^ga; inżąarfi obi: —rcoiou _j kuau; _j 2 cl <!ϊύ -u co ►πίΜΥί^ίο. Łoan a < 2 ^•cco:cn:coxolz|co) αίδ~ i_<t<:-gs-t r-l?Q. Q;i— Cffei ofeir: ΞΖ Z :CĆ; UJ lUCtfECO ί'-T-—JiWE. V?»- ·.- · .-W- · 1——
EUlp-CL Q-OT'.CLL(Zr<i zz-o cl ll cz'< co - 2 •Q-<£ luTs ł- <
ΊϋΓ<
_!
‘ójrf ulllli izż-LU •.<-111 raż lu Cl. <
LLL LU :uii2z>
iiimu □_ <
iErcruz· co 03?
7>p>So7p· ήυτατα.'χ Lco.'.ćb’iC>iF' L^p^Óza; ^-^Z; < rŁ-J-'UJ-COZECT-UJ·
cm w a *r- rs.
CM co co co
E_r
S σ
— oj r*. co cs tn ta co co co co co o co o
σ) n cj co ω r- in ω a w ω w w yj iC0ŚC0£ffiX°: > X LU • > >
I I _J LL £5S£>=ECD’.
;LuninuJ:o ρΐσ· LU LL refrcorcnSn
C _J LL O υΰ^ϋ luCÓ; ί'ώϊώ: rz-rf ίώζ^:< <
ΓωιωΰΟόΡΐ g:-.±n: tILU-jJJjCOŚC ?Χ£ο:_Γύ_ i±zz · o c o _ _ irap co O uj c lu — lu
Ξζζζί o- co ω uj i--<
gnęępjiu σ^ω CC — lu iCĘCi —Ι^ώ Γ-Sui CO — f— ió?.Q ~ lllcoŹOjcó agę UJ D12Ξ2Σ0=ι·α- mzgoirf rhi+bSZ^ęoscoT^z ZtÓ sis ±^ω x lus;
uiiiirCL CC clEI P-^Ż>· rcaSot χζ>ϊϋ5υ£5ο: O a ife f<
LU
LU
Cl
ŁLU
LU
UJ > co (UJ__ όχ c cl o — CU CL 2 Z>ńLJL±l‘
m m *· τ- a n
V -M1 — W LO o co co co
OJ OJ co -σ1 CO OJ ω cn s c\i w m w w w w w w w
FIG. 7Q
190 709
0 0 W O O Π- ΟΊ — v- co o CM O n CM CO -Γ «·— CM — O O
• χ Ω X > - Ω
• Η X i- x f—
• . χ ε < ε • <
fpTR^Sij 1 __ «ν' • Ω
tDC'#ir; co XtGo • _l
ra oa?g t ·£?<: • ¢5
CC O UJ X — G__I ίξ^εΞϊχΞΞχσ jifulcn x o wńt · ε < ω > x'
.. ω'.ϋίΩ — χΟπ-Ίε
Π Ο Ο — ο — — Ό- Ο η £SgE3
·£Ώ3ίΧ·
Ιχ!χ:
Γϊετίε 5|?j [0 I X \x* ίω
- Sś
< χ χ ω ι— χ ε ίχιχ'Χ'χ ω χ ε ε χ ΏΰΜ==Ξ5~2: ·σ:χ3;χ ίεώ:· ·
X£0j · χχζ'α l0j0.>
ΓέεΚηΖ
Uofei<
Ł. .
X ;>
xxc; ι- < ι- χ π χ π εχε. χ χ;ε χ χίσ χ αίρίχ χ
?Η^ίΓσ;χ ;0Χ3τχ'.Χ arar· χ:ε ίχΐχΰα'ϊχ
F>t>’x
-r r* o
LuxiSi, [oiciotnl· poico“xx5x umil: ε i— · fem q o x fH ć>.
X. .
X .o 2 ε H 0 5 [2 :r ~Z σ cc
Z -I ϋ ~ 1 η π — cm ca OJ O O O
CO CO CO O) co h*- ««- co nYCiscMcom—in
WWOTWOTCnOTOTW co^cnr^-ojcoco — OTtntOOTtftWOT^l^O
Fig. 7R
190 709 _ ο O CD CD CM CU Ο ν— *“ geja? σ 2 _i 2 S 2 — tv>Ły?· υ_ ΓΠΏΙΣ 2 .TD f— tUJL^ŁlO G OtSifćro CD| ^^KaotcoiOiFSKg; h Ś2t2: ora: co i— t- CDiUE
2ζ>7< x05ggSr !gSS2 2 < 2ia:2 FOZO: LU 2 2Γ2.2ΕΟik-^C^dŁt^SSł^^ -.2,:-2, cC^SiŁoŁn Ono
2 £ Sfot>
-^:-2:-12 CC O >< co O
CDCCDiCDiCDęCD LauiĆUoilŁSiu CO CD CD|co|CD ύ?,ιι=ΰ-
, <£-.<£; cq_<«acrco ‘-Lż: co^rfj-i—
IcD.-rDicDicDZDl.colcDrcD^CDi
:CZ:C2CE o co CD 2 2 CD
:n_iG_|o<CDFCD :>j-|2(^- CO CD CD.CDyCD
^sUl-^S 02uj«£CÓ-UJ O ICO.
Ęążófeccsscftc ϋ CZ rei: 2 2 2 0
CD CD en CD CD M* r*- CM ui CM TT Ul hy M· O CM CD CD τ CO CD O
o 1 1 1
o 1 1 1
LU 1 1 1
LU 1 1 ł
O 1 I 1
LU < t 1
2 t 1 t
1 2 1 1 1
1 UJ 1 1 1
1 1 a 1 i 1
1 co 1 4 1
1 2 t 1 1
1 < 1 1 1
i 1 1 1 O 1 1 1
l l MX | 1
1 1 1 1 1 Z
1 1 1 1 1 2
1 1 1 1 1 a
t 1 1 1 1 H
1 1 « 1 1 Cl 1
1 1 1 < 1 > 1 1 1
1 1 1 1 ( CD 4 1 1
1 ł t 1 1 t
1 ( ( 1 1 2 1 1 1
1 1 1 1 1 2 i 1 1
1 1 1 1 2 1 1 ~T~
1 < 1 t 1 MZ 1 >-
4 1 1 1 1 2 H 2
2±L2 LU OG> O O LU ly^-y^-y^jy^ -y^ Qjyz<
~\X-2
LO-O:> —2>-2: Ι<.Μ<-<-·<-<η^Ι<-,<ζ<|
CM CM CM CD CD O
Ul **r Ul CD CD 03
CD CD — CD O CM
CD Ό“ — ΤΓ O in ui co to h* CD — CD CM O *CM CM CM O CD CD
TT Ί- TT CM ”T o co -a- en r- cm co co w tn en tn w tn tn
-<- LO tn tn cnn-cnr-cMcocoT-in tntntntntntntntntn
FIG. 7S
190 709 — - π w ο α ο ο Τ’ tn ΙΛ σ ĆM — — ν «— τ m «—
’Τ to Ο — r*. C3
W W V *-
1Ζ)7·1ΖηΐΖ)κΟ3Ζ1Ζ)Ι>[Μ σ^αΐοϊοίΜΐ σ efróióió-torcrg iLUtUI -J.1!: G. CL !^<S!u^;$=u:>=>
j uhtiidLhtaSuj > juj | ΰέχιΑ5)ρϊ)ΰΞ) p fuZ £4Jp4 .-ULJ
22232222— ώ ' £§>Ϊ^££_ι:2:>! ^b£Ś2iŻ> Ep·hóaiio- ó'o:2 2 tCgQŁOgg~ćn*a·· 2 )5PPlu ιιΓ5£ρ:2 ΞΪΧΰ; CC 22 UJ 2: !
S§~£^= ζσ ω ' *«<<^<P^~U37TCOPL (ω;ω:θ·.ΟΡ5]<Γ5 ;^?=v>TpuL_jfa..u £ui!c7nfcj >- o
n?n~ 2:lo;cg: > 1 > > o < I 1
1 1 1 1 _i 0 t
liii ·— 1
1 1 1 1 > 0 t
tiitt HI 1
»«111 —
< « > < t V
> 11 1 1 UJ
OM CO CO O CO b- c>
n cm cw r- o co to
TT 04 ·ν □
22l5)z|3 -(2¾¾ :ui ijj cl cl:lu:2 _i Q- lEES^ C0|33| tĘg-i- ω en 3 Q Z Z. pSŁL)Jj.-2j.-Lj(x(ui^a^ S5£o;o.z ujpj. a rć]|g F<y<y<·. 2 o tu 2 ^ tu ί£Κ<3.θ“-ΐ _j2_i Σ-J §ę
OJ *C Π σ x- tn *- T —·
CT» CM O O in cm cO^cnr^oJcoco—-m wcncncotacnwcow
CO c/j ω n cj to es <λ en o w 05 w _ In
CA cA
Fig. 7T
100
190 709 co — •ν-νο*' — n*CMCM*CMCMOTCMOTOT*-OT*chVcolco~ 5żp LŁi σ χ:
X., 1.2
2ILU|>- >- >- Ξ5 > >- >
02222424: >- < co <
ot w — r-. r- v CM CM OT n- V CM OT o v o cn ot -—
OT LD *- OT *1 1 —i > _j _j >
1 '022x22)— g5g^22 2 csic noT^SScbiLoi
orrn-pm.-rn i [χπίΤΓ-^τϋίΐτ Μ=ίΓ s 01010 1
• .nSnS.. X. jZirł-, a- QiO:O;O7O 2 0220
ν η- v
U^7.1-.-Xl~=r33
0?0K0:O2D
0:070 £2.2:2 212072 2:2.
_ _
5ζζΕ^σ:σ:σ·—zęgó ω CćTżZ. Ο'χ^ν: o i—:'ui 2 fRĄB fR4 2 ΓΗλΗ^Η
2i2'.2 >_2_ :ι4Ρ^έοΙοΤĘp . o .
'|0 0
-1' 2 2 2 £2-2. 2 > _1 — _1 > 2 2~2'Q co F-S3 2 CÓ 2 |224.24442l(co)22Hó. •ΓΓ-ττ η n m )ii n y im Ż2.'S.2J2iZui ująjKS^' :2iń2ocd:ćo! 2 2i.<T2 >00:00,-0|.2(000| ;.o:o ico-.co LU u'2'ΧΣ z . 2:2 2 0 l·-2 2 COO l-x ii>
• · 4 —
Ecoicoićo: 2 iZScn o luJaSZEŁS?
i 221.
0|~' |0 0 0] o a h- 2 2 2 0[ęb 2 0x3 O O O :>j co—2i iCOlCO:Q^Ci tnx55<ę?ig· <-;2 a?<.2 0^^5032
2]<5]2:
2^
OQ3Q-£Q?Q|—|o:o:o| 220222 :2--2,0
£221.0 CO 0 S_C0 2 CO R4ii0-xo“<:ico;0^-z<c L>2>23 —ż>~ćń\
-722 2 0 0-000 £227 2 2 2 222. 2 CO
OT OT CM CM
CO V CO co
CM OT — o V CO Oi CM OT CM V X^•^coeocD^n-ocM ^to — — scncytn CMCMOTCMOTOTCMOT·*OTrcnr^cMcocor-tn
OTCisojacOf-in tnmwtnouitntiim
FIG. 7Ό
190 709
101 ca ca rr-rciOOWł-rO—“ CToentor-eucor-CM NNinwinw«T<n«[2i2S2i2l2l x(2=g»;2 Ρ^·χί$5$:2^ΐ u-Bś ~B>gfiigSaBgł£s:
iura tmn-.χ χ x > — x gjtlh^0x5)x ćsS^Ś jggTŁ X X Q 0ΖΙΩ_Ι 2 róS.'> u5ćn χ ’n“Śąij; x ν^παοιη^ιξ^ CM CM O O O W CO >J> r5* *
CO CO Uł CM O CD — —'
53^0’ ~ ~ X — Ιακεχιωΐχ: xfa MS^efesps&SS |©ί© _l < -i r- X <„<
f<2<rO;CCO > o ρΡ V) 10-01010^0 o 0 0 g •xixjitbs>xu-,0 u £>/£$} |.Χ5Χ:χαΖ)ρχ|Ι-Πη
•XiX7O ϋοχχΐ0ί'<γ<: cckoj u-:<;
i0:z:xT0x __· jg o:>?<ć ε ιωτω χ'χωωχ — cd > κίκϋτχ· h~hlxtq'· h i— ;Η5Η70^2?ίζ): ε xt0:x -Ωω x;t-'
:0--0. 0 < X X X ε 2
' ' Ω χ ε X . ω ΧΧΧΧΙΧΊϋ > X
> · χ χ χ · 0 □εηηχχεχ χ X
• σ > χ 1 < > :χιχ X <
min-rcDw- ω S Ρ*
ΧΩΟΙΟΝΝ^,ΓCMCMUłCMLOOCOUO^
COC0CMOC3inC3C3-r Η-Η»-τΐΛ-ΓθΓΜΐηο CM CM LT) CM ΙΑ C0 CO ΙΟ
P—^——;-.«φ.·' |a;QtoiQlo|—|q
LX2XZX, χ tx< <tx W ir~Fr3<: X X Xfe: 0i I χιτχ.ωιχ: · ?<· 1 1
Γ0?Ζ07.^·0?Ρ·· · ί-χξ • ' = H>>1 1 1 2 Η 0 I >
< < . η < σ α <
?η~·~π—γγ·1 η Ο Η —. 3 Ό. :5'όί0;.σ · 'σίπί ϊϋΐΏ'ΰΞϊ ^ϊΐ'X ω cć fi —ίΧί>χϊ:>:^
co^cnr^cucocoT-Lo ίηυϊΐηνϊ(Λ!ΛΐΛ<Λ<Λ ο en r·'- oj <ο co =τ V? iflinuioiuwojMi^
Fig. 7V
102
190 709 r- r·*.
un tn oomooinr-. tntncMCMCMco^cocM COCO CO CO «Ο CD CO »—
RS q fcSfCicni^BSÓ! · bgśggF o o cmcmcocogoco^oo — οωιηιηιΩ’-νωη cococococor-f-co — ' ' X > > Q CO X O · X X Ll__1 X > x ' ' > X X 5 CF- CL X ' X X X X X X X • ' O O CO 2 CO d i o _j _i σ _i _i t— χχοτμτ xux—ία: co gg Sjuh! cc ag χφχΰΐ x x F^^ŻSSS χ ΕΞ; χ ·χ SS X Bagfeog— _ _ in^ntŁf^tg · i£gcSn=g_i (<s<22Ex!
t- .
rciiSag; x iPS χ π tran; o Fff<gąćSZpa/y x x cep f<^<ą<ę<loa|<] στα' χ x co co ι— < ι— x >[χχαχζα-χΐ XI xxe| xf 2-22 X X X X d >
5^2d2QHBżC53^ ίχζχ- —> X iOXg [χχχχχξ).ο: Q|xmxx1 χχχ x ci >-gaSr.x χ χ χ x x£g 22±y-q-xm msóci_ ·__ι — x 2 — 2 pifex: x σ < -liSffii: O :χ;υι;χχ>, χχχ-ί o χ σ 2 > χ χ χ σ ci σ χ x ·
D33j luęc S co co
βΖ7ϊ£Γ
gjicggro z hc co-^ς β
iw ΧΙ*1[?ίΧΪΓΧ: ł<S^ĆDxi;FSigOcx>^ i<ga?.LU x 2 iunui σ χ nu^Sci: > o t r. ·_— -_ * r<-.--xZ———v <rsrf*i n miau· orr>ani x zd< E2& < hr — 2>xgg3g Ż2ź^s , sc^k5^0~ ropsj- · hOgD^CDgt ćriircfcng >g>LLi oa±gc; |co.col<S · ICOrCOJCO-CColtS _ _ LO;.OX3.i=-~F~T®X^ x-x. zat· xx£- xęx x roą5; codk χ < χ x£fi; g>5gfrh x.‘^Tg?Ćo2llco: ócc: llo χ χ χ χ x σ O C.H: CO^d ' · i ' » CL ' LU _t » · I i « I « e>':>rix;<źf . . . 2fćb: P^n-'n^rrn-lul
SH1 2Γ 05 — <d ® i- o jMeąrocjotnr-wom CO CO io cm to CD CO CD CM
CD CD ·— tn tn cm co co co o co *- co CO CM CO O CO CO CO
CO 0 CO h* CO CM
D^-cnsNcocoT-in (Λωωωωωωωω
CO 05 WWW r* cm co co T- in to en w en co w
FIG. 7W
190 709
103
Κο&3σ§= ΠΞΗΧΕΧ X
Eozojz o feŚ2F< 2 £kqox aręrrz σ ą^g^o^i KEer.o. < χζεγχ 2 grefri* χ z Εχετε ω ićfeggacbas y^n~ 111 z ί ν' 0
55rx±śx X • O <
« · o ω > · > σ 1 1 O X • - 0 U i ' X <
‘ < F CO co co co o co CO
Oi O tn m co co
co -r Λ S W - v rs co h. *-» CO w— b* b- o nr -----04 V V S V co σ» b- r*. uo — nr co H -- c(1 r~ vs f
01 < .—t—~J r' n 1 1 1
jtol > > X 0 1 i 1 1
Έ3 ‘ ‘ • 'XX 1 1 1 1
• — · 1 ' · X co 1 1 I ‘
1 cc · > ' > X 2 I 1
ES > 0X 1 1
. i> 1 1 1 'XX < »
jog. « · ł 1 X >- 1 1
CO < ' « ' X > < ( {
z · · 1 1 < F 1 1 > .
1 X · i X CO 1 I
ć2: > 1 1 0 O t 1 »
1 KZi: · · • · F X i i
• Z · · . . H > 1 1
rco· · · X < 1 1
1 1 . 1 X CZ3 1 1
1 - 1 1 • · o > <
. Rg • < X 0 1 1
» i 1 • · X o f 1
> ł ł . · X > ł t
X 1 ' 0 α 1 1
. rc . . i i n y i ł
< F · ćilEEU'< x t 4
CO · ‘ 0 1 1
Sś5 trizxix 2 r i
:uiś > tcoicoicor.O; 1 (
z · ύΐι-ΐ’^ϊίυ^τΛι·* :-1^>T:r=JiC0· t i
• x · ę±£ńa:X£<; ł »
1 1 1 ΓαΧΧΤΠΤΓη 1 1 χ
— X X ίζϋέΓΗΖ 2 1 1 F
— Z F 2 iXCC:0 Q ' · 2
X > F F fciaił: < X aiś£xxf=g » ‘ LU
< X X Q
nr o> *- *- nr CO —h* nr co CO 0 0 S N o O o m nr co co o o nr bnr ^3 <
CO
W
-O- 05 CU CD co W W 05 w W CO tn nt-cnvcjaco - ln Μ «ΜίΟΙΟΙΟΜΙΠνίν,
Fig. 7X
104
190 709 σ>
m ω
CO ΧΓ r— CN — ”r b- O r- ŁD r— — in co co co ’τ r*» o cn rCD in rr- cm *tj- r-» n —· co ·—
. 5·5ΐ·:ο.Ε55: OprgSjica
PaMBSŁRCTTi*1
M2ĆŻ^=łtCO. ΜΧΕΕίΟ- < LCO3--J O tarte; n. u_ 22145 iwml oEg tćowpiro:2 Tnnnjm/rS
Sj^LiuSs i&teiP jzj7ax20ió'.
XDiiĆ5=£2 ipśpgj'. a ρχτορρα jfo^tojŁsco ECXQ; co 2 Γ<£<:2:ΰ3 f ,£-£.' Z‘P :CL2 jLU-LLO±r^ ;a£xE£ń2_i
ESSaiO-tcp iUJimiEiiuI
CD CD O W -- OJ 04 -M- r*.
ragEzag σ te£ei ago rnsrrico 2
X=a3iCOix3l 33¾¾ lu ί^ρΐΰ^] rbkiga lu K<C~<GLL1 o
;iLJż £'^—727.
t LU 2
l -I O
1 • σ o.
1 σ £
1 • —i a
1 LU 2
i σ a
1 , LU Q_
1 • 3 LU
1 ' > O
1 • h- 2
1 • < Q_
1 • 2 2
1 , CC U.
t ’ LU CO
1 ' 3 2
1 ' CO >
1 CO 2
1 0- <
1 2 3
1 • cc CO
1 • < X
— C3 in in in rr rr r* co^of^cjcooot—m ωωωωωωωωω cnTrcnr^ojcoco-r-m wowcnwiowww
FIG. 7Ύ
190 709
105 1 ' 0 CO 1 ' « » • * CO 0 ’ 1 * i » • * <C 0 · « » » » 1 « ~ CO 1 1 ' * i > * CO Cl * * » j i • 1 CL LL » » i · i i 7 I i t 1 I 1 1 ϋ LL t i t i i
LU < ’ i » 1 ‘ CO —J iiiii ‘ * O O 1 ’ · ‘ i ‘ 1 O LU · · * <
’ · CO ’ 1 * 1 • · 1 >- » » i » i ' ' CO CO ‘ ’ * 1 ’ · ~i 5 ' 1 ' 1 · i ‘CO —· * · ‘ 1 ‘ » · Q CL » ‘ · * ·
4 — 2^ 4 4 4 4 4 • ' CO 21 ‘ ’ 1 1 1
I f J— 14(11 i · Q O. 1 ' » ' * ‘ CO ‘ ‘
I I 1 — 44444
I | . J— 4 4 14 4
I I IIIII ' LU d i i ' > · fo2D σ a.....
» >
- - _2_.
-I-·-1~<~ r IIIII fc3żSi/X 2 1 ' 1 1 1 tQ-yr!: tLp< iiiii eyojto—ooooo ta to a σι
F- F-. α ο Ο cV Μ ν Γ 5;
O o in ιη L-J — Τ’ 'yS
xr T a V) Ο r- *-
1 1 α- 2 1 4 * l
1 1 α: > . 1 1 1
1 O 2 . > t
1 1 cc 2 t 1
1 4 < Η 1 ł 1
1 1 2 σ 1 I 1
1 1 > 2 > / 1
1 1 yz 1 1 1
1 1 2 yz 1 1 1
1 2 1 1 1
1 1 ω Ω 1 ‘ 1
i ω 2 t 1 1
1 ω < 1 * 1
1 1 cc yz * 1 l
1 < 2 1 ł 1
1 1 ω Ω t 1 1
1 1 < 2 1 * 1
1 1 σ 2 ł t 4
1 1 en < ‘ 1 1
4 1 cn Ω > 4 1
1 1 » 4
1 1 ω yz 1 *
1 ±, cn 1
1 1 > 2 4 1 i
1 1 o Η i i
1 cn 2 i l
1 ω 2 4 1
1 2 Ω 1 1
1 1 Η Ω « 1
l Ω Ω ’ l » 1
1 1 Ω 2 > t t J
1 cn < * ί 1
1 « ω < 1 i i
o o cn α «ΤΓ CM ιη Ο o ( o O
ntroswcoDi-m wwwtnwwwww
CO^ent^cJcotO — Lo W CO W W w w w> σι
Fig. 7Z
106
190 709
rs. rs. *<r cn 03 σ> r>- rs. CJ Ή r*. rs. rs. CJ 03 o r-s rs CJ —
w to CD m in »— rs. CD to CD CJ tn — -r rs cd
o- 4T CO tn CO js_ to n- o (O to rs — ŁO
1 1 CD CO i 1 1 1 1 a 1 1 1 1
1 1 > X 1 1 1 1 1 a X ι i 1 1
1 1 a ι i 1 1 > co « 1 1
t 1 > a 1 1 1 1 1 LU ι 1 1 t
1 1 cc ι i 1 1 1 2 X 1 ł 1 1
1 < X X ι i 1 1 a 1 t 1 1
1 « a i i > 1 > co ι i 1 1
1 « LU X t 1 1 1 1 X X 1 · 1 1
1 I X co ( 1 1 < > 1— 1 1 1 1
1 > a 1 1 1 1 a > 1 1 ł 1
1 1 X > 1 1 1 1 σ a 1 1 1 1
1 1 _1 X ι i 1 1 0 ω l ł t t
1 1 X LU I 1 l 1 1 a a 1 < 1 1
1 1 LU X 1 < t 1 1 < 1 t 1 1
1 t CD X 1 1 1 i l·- O 1 1 i «
1 1 X 0 1 1 1 1 > < 1 1 1 1
1 1 _1 Ι- 1 1 1 1 1 _j 0 < 1 1 1
1 1 CO Ο 1 1 1 1 1 co a 1 1 1 1
1 1 σ > 1 1 1 1 1 a 1 ł 1 1
1 a 1 1 1 1 1 < < i ι i
1 σ co 1 1 I 1 1 1 < H 1 I 1 1
1 > a > 1 1 1 1 1 < CO 1 i 1 1
1 ł ρ- 1 1 ( f i a _J < ( 1 t
i 1 > ω 1 1 1 1 1 X 1 1 ł 1
1 1 CD co ( 1 1 1 1 σ X 1 1 1 1
1 1 X > 1 1 t t 1 co co < 1 1 1
t 1 a X i ł 1 1 1 co _l 1 < 1 1
1 1 > _J 1 t 1 1 1 1 1 1 1
t 1 co co » 1 ( l t 0 X 1 ł 1 ł 1
1 1 CL X 1 ( 1 1 1 1— 1 1 1 1 1
1 1 l·- >- ι 1 1 1 1 1 < a 1 t 1 1 <
« i α a » 1 1 1 1 co 1 1 1 1
1 1 1- 0 ι 1 1 1 1 a X 1 1 1 1
ο ο oj rs m ιη cd «ο ο ο ο
ο ο tn ο ο ο ο ο ο
CD Ο
CO ΙΟ
Π ΤΤ CD Η- CM CD CD w w « ιη ω ιλ ω ιη ω μ
CO TJ· CT) |S CM w w tn w tn co co v- in w tn w w
FIG. 7AA
190 709
107
O rf o ri i
b». b- r*s m cn r» b* CM *- Η b» bw CD 03 b» b-
CO CD -Γ V -Γ in LD *— 03 to tO b- w- b* Ο Ο -τ- ΰ ω T O U7 w- -«r «U? «•^CiCOCDb»*- <2
1 1 • χ · 1 > ι I » < I 1 i ł |
1 t 1 X · ' > 1 I • ι · Ω » » · 1
1 1 1 2 · 1 > 1 » 1 ‘ » Ω 111’ 1
1 1 X > ' , ' 1 1 « · « C/5 i ł i ‘ 1
1 1 CC <C · > i 1 1 ‘ « 1 « 1 l · t
i 1 2; X ' 11 » 1 » 1 » 1 1 1 < l
( 1 LL| ε 1 I 1 1 1 1 1 ' ?> ' ι l 1 l
1 1 _i σ · 1 ί 1 » ł 1 1 | i
ł 1 0 X 1 ' · 1 1 * 1 · Q ι ι ι i
l 1 0 0' · · 1 1 * · cc ... 1 J
I 1 ε_ι < ι ' 1 1 * · > 1 1 1 1 /
ι 1 XX' · 1 I » » 1 —. I 1 1 1 1
1 1 > Q · · 1 1 • i i LLI » » * ‘ 1
1 1 ε x . 1 i » · * GC » » ι i l
( 1 5 $ - · > 1 1 • ι » 1 » ( 1 1
1 ( X X « ι 1 1 • · « CC « » · i 1
1 1 5 ε · · · t 1 1 » · Ω 1 ł 1 . 1
1 1 < ε > 1 1 ' » » —1 · » · i t
1 1 χ ε > > > 1 t i » i LLJ ' i · i 1
1 ł χ X · · ' < 1 » » » UJ ι i · j 1
1 1 0 _J I , , i 1 • · ’ Q 1 1 1 1 1
• ł ω σ · · ' 1 1 1 1 ' —J ' » i 1
1 1 X < ' ' ' ι 1 ' ’ ' UJ »i*i
t i ΟΧ' I I i < ’ ‘ i LU i « * i
1 1 χ σ · · > 1 I ’ * ’ < · · <
1 1 * 1 1 1 1 » i » iii· 1
1 *’ Ο < ' ' ' l 1 ι i i CC. i » i i
• 1 σ χ « . - • 1 1 t 1 CC 1 1 ł ł 1
< 1 X 0 ι ι , 1 1 ι ι i Q iii. 1
1 ω ε i t • ι i CC « i < » 1
1 ł — X , >1 1 1 i * i LU i . 1 > 1
' t 0 0'.. 1 1 » ' i CO ' 1 1 i 1
1 1 X 0 ' ' ' » 1 * · ' LL. i i ( ( I
o o co CO ο ο ο CM o o ooocdoooO o
03 ŁO CD
co-g-crji-^cjcDcoT-m mwwwwmmww co -o- cn c\i co co —
WtnWWMOTW V) V.
Fig. 7BB
108
190 709 —1 _41 ^-75 — 156 a - region, który nie oddziałuje z klonem 10 (NMP1), 9 i 15 w teście 2-hybrydowym b - region, który addziałuje z tymi klonami równie silnie co TRAF2 pełnej długości motyw palca serdecznego —209
motywy palca cynkowego przypominającego TFIIIA
N-TRAF
C-TRAF
FIG. 1
Departament Wydawnictw UP RP. Nakład 50 egz.
Cena 6,00 zł.

Claims (39)

  1. Zastrzeżenia patentowe
    1. Polipeptyd, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB, obejmujący:
    a) sekwencję aminokwasowąz ID.SEKW.NR: 7 (NIK);
    b) sekwencję aminokwasową fragmentu z a), przy czym fragment ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB;
    c) sekwencję aminokwasową analogu z a) lub b), posiadającą nie więcej niż dziesięć zmian w sekwencji aminokwasowej a) lub b), przy czym każda zmiana jest substytucją, delecją lub insercją aminokwasu, a analog ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB; albo
    d) pochodne a), b) lub c) wiążące się z TRAF2 i modulujące aktywność NF-KB.
  2. 2. Polipeptyd według zastrz. 1, znamienny tym, że jest sekwencją kodowaną przez sekwencję nukleotydową ED. SEKW.NR: 3 (klon 10).
  3. 3. Polipeptyd według zastrz. 1, znamienny tym, że jest NIK (ED. SEKW. NR: 7).
  4. 4. Polipeptyd według zastrz. 3, znamienny tym, że zawiera co najmniej część sekwencji aminokwasowej z ED. SEKW.NR: 7.
  5. 5. Sekwencja DNA kodująca polipeptyd, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB, wybrana z grupy składającej się z:
    a) sekwencji cDNA obejmującej sekwencję nukleotydową EDSEKW.NR: 3;
    b) fragmentu sekwencji z a), kodującego polipeptyd, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB;
    c) sekwencji DNA zdolnej do hybrydyzacji z sekwencjami a)-b) w umiarkowanie ostrych warunkach, kodującej polipeptyd, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB.
  6. 6. Sekwencja DNA według zastrz. 5, znamienna tym, że obejmuje sekwencję nukleotydową z ID. SEKW.NR: 3.
  7. 7. Sekwencja DNA według zastrz. 5, znamienna tym, że obejmuje sekwencję nukleotydową kodującą białko NIK o sekwencji aminokwasowej z ED. SEKW.NR: 7.
  8. 8. Sekwencja DNA zdolna do hybrydyzacji w umiarkowanie ostrych warunkach z sekwencją kodującą polipeptyd wybrany z grupy obejmującej:
    a) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasowąz ID. SEKW.NR: 7 (NIK);
    b) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową fragmentu z a), przy czym fragment ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB;
    c) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową analogu z a) lub b), posiadającą nie więcej niż dziesięć zmian w sekwencji aminokwasowej a) lub b), przy czym każda zmiana jest substytucją, delecją lub insercją aminokwasu, a analog ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB; albo
    d) polipeptyd zawierający sekwencję pochodnej a), b) lub c) wiążący się z TRAF2 i modulujący aktywność NF-KB.
  9. 9. Wektor obejmujący sekwencję DNA kodującą polipeptyd, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB, przy czym sekwencja DNA jest wybrana z grupy składającej się z:
    a) sekwencji cDNA obejmującej sekwencję nukleotydową ID.SEKW.NR: 3;
    b) fragmentu sekwencji z a), kodującego polipeptyd, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB;
    c) sekwencji DNA zdolnej do hybrydyzacji z sekwencjami a)-b) w umiarkowanie ostrych warunkach, kodującej polipeptyd, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB.
    190 709
  10. 10. Wektor według zastrz. 9, znamienny tym, że może ulegać ekspresji w eukariotycznej komórce gospodarza.
  11. 11. Wektor według zastrz. 9, znamienny tym, że może ulegać ekspresji w prokariotycznej komórce gospodarza.
  12. 12. Szczep transformowanych eukarietycznych lub prokariotycznych komórek gospodarza zawierający wektor obejmujący sekwencję DNA kodującą polipeptyd, który wiąże się zTRAF2 i moduluje aktywność NF-KB, przy czym sekwencja DNA jest wybrana z grupy składającej się z:
    a) sekwencji cDNA obejmującej sekwencję nukleotydowąlD.SEKW.NR: 3;
    b) fragmentu sekwencji z a) kodującego polipeptyd, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB;
    c) sekwencji DNA zdolnej do hybrydyzacji z sekwencjami a)-b) w umiarkowanie ostrych warunkach, kodującej polipeptyd, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB.
  13. 13. Sposób wytwarzania białka wiążącego się z TRAF, jego izoformy, fragmentu, analogu albo pochodnej, znamienny tym, że obejmuje hodowanie szczepu komórek gospodarza w warunkach odpowiednich do ekspresji białka, jego izoformy, fragmentu, analogu albo pochodnej; przeprowadzanie modyfikacji potranslacyjnych, jeżeli to konieczne, w celu otrzymania białka, jego izoformy, fragmentu, analogu albo pochodnej; izolowanie wyrażanego białka, jego izoformy, fragmentu, analogu albo pochodnej, przy czym szczep komórek gospodarza jest szczepem transformowanych eukariotycznych lub prokariotycznych komórek gospodarza zawierających wektor obejmujący sekwencję DNA kodującą polipeptyd, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB, przy czym sekwencja DNA jest wybrana z grupy składającej się z:
    a) sekwencji cDNA obejmującej sekwencję nukleotydowąlD.SEKW.NR.: 3;
    b) fragmentu sekwencji z a), kodującego polipeptyd, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB;
    c) sekwencji DNA zdolnej do hybrydyzacji z sekwencjami a)-b) w umiarkowanie ostrych warunkach, kodującej polipeptyd, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB.
  14. 14. Przeciwciało albo jego aktywny fragment albo pochodna, swoiste wobec polipeptydu, który wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB, przy czym polipeptyd ten obejmuje:
    a) sekwencję aminokwasową z iD. SEKW.NR: 7 (NIK);
    b) sekwencję aminokwasową fragmentu z a), przy czym fragment ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB;
    c) sekwencję aminokwasową analogu z a) lub b), posiadającą nie więcej niż dziesięć zmian w sekwencji aminokwasowej a) lub b), przy czym każda zmiana jest substytucją, delecją lub insercją aminokwasu, a analog ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB; albo
    d) pochodne a), b) lub c) wiążące się z TRAF2 i modulujące aktywność NF-KB.
  15. 15. Przeciwciało lub jego aktywny fragment lub pochodna swoiste wobec polipeptydu będącego polipeptydem NIK (ID.SEKW.NR: 7).
  16. 16. Zastosowanie polipeptydu określonego w zastrz. 1 albo sekwencji DNA określonej w zastrz. 5 albo wektora zdolnego do ekspresji w komórkach określonego w zastrz. 9, do wytwarzania kompozycji farmaceutycznej do modulowania aktywności NF-KB albo pośredniczenia w działaniu NF-KB w komórkach albo jakichkolwiek innych wewnątrzkomórkowych aktywności sygnalizacyjnych modulowanych albo zachodzących za pośrednictwem TRAF2, przy czym kompozycja ta jest przeznaczona do wprowadzania do komórek.
  17. 17. Zastosowanie według zastrz. 16, znamienne tym, że wektor jest rekombinowanym zwierzęcym wektorem wirusowym, obejmującym dodatkowo sekwencję kodującą powierzchniowe białko wirusowe (ligand), które ma zdolność wiązania się ze specyficznymi receptorami na powierzchni komórek, do których ma być wprowadzana kompozycja farmaceutyczna.
  18. 18. Zastosowanie według zastrz. 16, znamienne tym, że polipeptydem jest NiK albo przynajmniej jedna z izoform, analogów, fragmentów albo pochodnych NIK.
  19. 19. Zastosowanie wektora kodującego sekwencję rybozymu zdolnego do oddziaływania z sekwencją komórkowego mRNA kodującego polipeptyd określony w zastrz. 1 do wytwa4
    190 709 rzania kompozycji farmaceutycznej do modulowania działania modulowanego przez/za pośrednictwem TRAF2 na komórki, przy czym kompozycja farmaceutyczna umożliwia wprowadzenie wektora do komórek w postaci powodującej ekspresję takiej sekwencji rybozymu w tych komórkach, następnie jej oddziaływanie z sekwencją mRNA w komórce, co prowadzi do zahamowania ekspresji białka wiążącego się z TRAF2 w tych komórkach.
  20. 20. Sposób izolowania i identyfikacji polipeptydu wybranego z grupy obejmującej:
    a) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową z ID. SEKW.NR: 7 (NIK);
    b) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową. fragmentu z a), przy czym fragment ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB;
    c) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową analogu z a) lub b), posiadającą nie więcej niż dziesięć zmian w sekwencji aminokwasowej a) lub b), przy czym każda zmiana jest substytucją, delecją lub insercją aminokwasu, a analog ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB; albo
    d) polipeptyd zawierający sekwencję pochodnej a), b) lub c) wiążący się z TRAF2 i modulujący aktywność NF-KB; przy czym polipeptyd jest zdolny do bezpośredniego wiązania się z TRAF2, znamienny tym, że obejmuje zastosowanie procedury dwuhybrydowej w drożdżach, w której sekwencja kodująca TRAF2 jest przenoszona przez jeden wektor hybrydowy, a sekwencja z biblioteki cDNA lub genomowej jest przenoszona przez drugi wektor hybrydowy, następnie wektory stosuje się do transformowania drożdżowych komórek gospodarza i izoluje się pozytywnie transformowane komórki, a następnie ekstrahuje się drugi wektor hybrydowy w celu otrzymania sekwencji kodującej białko, które wiąże się z TRAF2.
  21. 21. Kompozycja farmaceutyczna do modulowania działania modulowanego przez/za pośrednictwem TRAF2 na komórki, znamienna tym, że obejmuje, jako składnik czynny, przynajmniej jeden polipeptyd, wiążący się z TRAF2 i modulujący aktywność NF-KB, który obejmuje:
    a) sekwencję aminokwasową z ID. SEKW.NR: 7 (NIK);
    b) sekwencję aminokwasową fragmentu z a), przy czym fragment ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB;
    c) sekwencję aminokwasową analogu z a) lub b), posiadającą nie więcej niż dziesięć zmian w sekwencji aminokwasowej a) lub b), przy czym każda zmiana jest substytucją, delecją lub insercją aminokwasu, a analog ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB; albo
    d) pochodne a), b) lub c) wiążące się z TRAF2 i modulujące aktywność NF-KB.
  22. 22. Kompozycja farmaceutyczna do modulowania działania modulowanego przez/za pośrednictwem TRAF2 na komórki, znamienna tym, że obejmuje, jako składnik czynny, rekombinowany zwierzęcy wektor wirusowy kodujący białko zdolne do wiązania się z receptorem powierzchniowym komórki i kodujący przynajmniej jeden polipeptyd zawierający sekwencję kodowaną przez sekwencję nukleotydową SEKW.NR ID: 3.
  23. 23. Kompozycja farmaceutyczna do zapobiegania albo leczenia stanu patologicznego związanego z indukcją NK-KB albo jakiejkolwiek innej aktywności zachodzącej przez TRAF2 albo inne cząsteczki, z którymi wiąże się polipeptyd wybrany z grupy obejmującej:
    a) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową z ID. SEKW.NR: 7 (NIK);
    b) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową fragmentu z a), przy czym fragment ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB;
    c) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową analogu z a) lub b), posiadającą nie więcej niż dziesięć zmian w sekwencji aminokwasowej a) lub b), przy czym każda zmiana jest substytucją, delecją lub insercją aminokwasu, a analog ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB; albo
    d) polipeptyd zawierający sekwencję pochodnej a), b) lub c) wiążący się z TRAF2 i modulujący aktywność NF-KB, znamienny tym, że obejmuje skuteczną ilość białka kodowanego przez klon 10 (ID. SEKW.NR: 3).
  24. 24. Kompozycja farmaceutyczna do zapobiegania albo leczenia stanu patologicznego związanego z indukcją NK-KB albo jakiejkolwiek innej aktywności zachodzącej przez TRAF2 albo inne cząsteczki, z którymi wiąże się polipeptyd wybrany z grupy obejmującej:
    a) pc^lif^e^^ttyi zawierający sekwencję aminokwasową z (ID SEKW.NR: 7 (ΝΙΚ))
    190 709
    b) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową fragmentu z a), przy czym fragment ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB;
    c) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową analogu z a) lub b), posiadającą nie więcej niż dziesięć zmian w sekwencji aminokwasowej a) lub b), przy czym każda zmiana jest substytucją, delecją lub insercją aminokwasu, a analog ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB; albo
    d) polipeptyd zawierający sekwencję pochodnej a), b) lub c) wiążący się z TRAF2 i modulujący aktywność NF-KB, znamienny tym, że obejmuje skuteczną ilość cząsteczki DNA kodującej białko kodowane przez klon 10 (ID. SEKW.NR: 3).
  25. 25. Kompozycja farmaceutyczna do zapobiegania albo leczenia stanu patologicznego związanego z indukcją NK-KB albo jakiejkolwiek innej aktywności zachodzącej przez TRAF2 albo inne cząsteczki, z którymi wiąże się polipeptyd wybrany z grupy obejmującej:
    a) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową z ID. SEKW.NR: 7 (NIK);
    b) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową fragmentu z a), przy czym fragment ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB;
    c) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową analogu z a) lub b), posiadającą nie więcej niż dziesięć zmian w sekwencji aminokwasowej a) lub b), przy czym każda zmiana jest substytucją, delecją lub insercją aminokwasu, a analog ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB; albo
    d) polipeptyd zawierający sekwencję pochodnej a), b) lub c) wiążący się z TRAF2 i modulujący aktywność NF-KB, znamienny tym, że obejmuje skuteczną ilość białka NIK, jego izoformę, fragment, analog lub pochodną.
  26. 26. Kompozycja farmaceutyczna do zapobiegania albo leczenia stanu patologicznego związanego z indukcją NK-KB albo jakiejkolwiek innej aktywności zachodzącej przez TRAF2 albo inne cząsteczki, z którymi wiąże się polipeptyd wybrany z grupy obejmującej:
    a) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową z ED. SEKW.NR: 7 (NIK);
    b) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową fragmentu z a), przy czym fragment ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB;
    c) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową analogu z a) lub b), posiadającą nie więcej niż dziesięć zmian w sekwencji aminokwasowej a) lub b), przy czym każda zmiana jest substytucją, delecją lub insercją aminokwasu, a analog ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB; albo
    d) polipeptyd zawierający sekwencję pochodnej a), b) lub c) wiążący się z TRAF2 i modulujący aktywność NF-KB, znamienny tym, że kompozycja obejmuje skuteczną ilość cząsteczki DNA kodującej białko NIK, jego izoformę, fragment, analog lub pochodną.
  27. 27. Kompozycja farmaceutyczna do zapobiegania albo leczenia stanu patologicznego związanego z indukcją NK-KB albo jakiejkolwiek innej aktywności zachodzącej przez TRAF2 albo inne cząsteczki, z którymi wiąże się białko NIK (ED. SEKW.NR: 7), jego izoforma, fragment, analog lub pochodna, znamienna tym, że obejmuje skuteczną ilość białka NIK, jego izoformy, fragmentu, analogu albo pochodnej.
  28. 28. Kompozycja farmaceutyczna do zapobiegania albo leczenia stanu patologicznego związanego z indukcją NK-KB albo jakiejkolwiek innej aktywności zachodzącej przez TRAF2 albo inne cząsteczki, z którymi wiąże się białko NIK (ID. SEKW.NR: 7), jego izoforma, fragment, analog lub pochodna, znamienna tym, że obejmuje skuteczną ilość cząsteczki DNA kodującej białko NIK, jego izoformę, fragment, analog albo pochodną.
  29. 29. Zastosowanie polipeptydu określonego w zastrz. 1 do zapobiegania albo leczenia stanu patologicznego związanego z indukcją NK-KB albo jakiejkolwiek innej aktywności zachodzącej przez TRAF2 albo inne cząsteczki, z którymi wiąże się polipeptyd określony w zastrz. 1.
  30. 30. Zastosowanie cząsteczki DNA kodującej polipeptyd określony w zastrz. 1 do zapobiegania albo leczenia stanu patologicznego związanego z indukcją NK-KB albo jakiejkolwiek innej aktywności zachodzącej przez TRAF2 albo inne cząsteczki, z którymi wiąże się polipeptyd określony w zastrz. 1.
  31. 31. Zastosowanie według zastrz. 29 albo 30, znamienne tym, że polipeptyd kodowany jest przez klon 10.
    190 709
  32. 32. Zastosowanie według zastrz. 29 albo 30, znamienne tym, że polipeptydem jest NIK.
  33. 33. Sposób poszukiwania ligandu wykazującego zdolność wiązania się z polipeptydem wybranym z grupy obejmującej:
    a) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową z ID. SEKW.NR: 7 (NIK);
    b) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową fragmentu z a), przy czym fragment ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB;
    c) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową analogu z a) lub b), posiadającą nie więcej niż dziesięć zmian w sekwencji aminokwasowej a) lub b), przy czym każda zmiana jest substytucją, delecją lub insercją aminokwasu, a analog ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB; albo
    d) polipeptyd zawierający sekwencję pochodnej a), b) lub c) wiążący się z TRAF2 i modulujący aktywność NF-KB, znamienny tym, że obejmuje doprowadzenie do kontaktu podłoża do chromatografii powinowactwa, do którego dołączony jest ten polipeptyd, z ekstraktem komórkowym tak, że ligand wiąże się z tym podłożem, a następnie wymywanie, izolowanie i analizowanie takiego ligandu.
  34. 34. Sposób poszukiwania sekwencji DNA kodującej ligand zdolny do wiązania polipeptydu wybranego z grupy obejmującej:
    a) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową z ID. SEKW.NR: 7 (NIK);
    b) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową fragmentu z a), przy czym fragment ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB;
    c) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową analogu z a) lub b), posiadającą nie więcej .niż dziesięć zmian w sekwencji aminokwasowej a) lub b), przy czym każda zmiana jest substytucją, delecją lub insercją aminokwasu, a analog ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB; albo
    d) polipeptyd zawierający sekwencję pochodnej a), b) lub c) wiążący się z TRAF2 i modulujący aktywność NF-KB, znamienny tym, że obejmuje zastosowanie procedury dwuhybrydowej w drożdżach, w której sekwencja kodująca ten polipeptyd jest przenoszona przez jeden wektor hybrydowy, a sekwencje z biblioteki cDNA lub genomowej są przenoszone przez drugi wektor hybrydowy, zastosowanie wektorów do transformowania drożdżowych komórek gospodarza i izolację pozytywnie transformowanych komórek, a następnie ekstrakcję drugiego wektora hybrydowego w celu otrzymania sekwencji kodującej ligand.
  35. 35. Sposób identyfikacji i wytwarzania ligandu zdolnego do modulowania aktywności komórkowej, którą moduluje/w której pośredniczy TRAF2, znamienny tym, że obejmuje: a) poszukiwanie ligandu wykazującego zdolność wiązania się z polipeptydem zawierającym co najmniej część sekwencji TRAF2 o resztach aminokwasowych 222-501 TRAF2; b) identyfikowanie i charakteryzowanie ligandu innego niż TRAF2 albo części receptora z rodziny receptora TNF/NGF, znalezionego w takim etapie poszukiwania jako zdolnego do takiego wiązania; oraz c) wytwarzanie takiego ligandu w postaci zasadniczo wyizolowanej i oczyszczonej.
  36. 36. Sposób identyfikacji i wytwarzania ligandu zdolnego do modulowania aktywności komórkowej modulowanej albo w której pośredniczy polipeptyd wybrany z grupy obejmującej:
    a) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową z ID. SEKW.NR: 7 (NIK);
    b) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową fragmentu z a), przy czym fragment ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB;
    c) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową analogu z a) lub b), posiadającą nie więcej niż dziesięć zmian w sekwencji aminokwasowej a) lub b), przy czym każda zmiana jest substytucją, delecją lub insercją aminokwasu, a analog ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB; albo
    d) polipeptyd zawierający sekwencję pochodnej a), b) lub c) wiążący się z TRAF2 i modulujący aktywność NF-KB, znamienny tym, że obejmuje: a) poszukiwanie ligandu wykazującego zdolność wiązania się z polipeptydem zawierającym co najmniej część sekwencji NIK ID. SEKW. NR: 7; b) identyfikowanie i charakteryzowanie ligandu innego niż TRAF2 albo części receptora z rodziny receptora TNF/NGF, znalezionego w takim etapie poszukiwania jako zdolnego do takiego wiązania; oraz c) wytwarzanie takiego ligandu w postaci zasadniczo wyizolowanej i oczyszczonej.
    190 709
  37. 37. Sposób identyfikacji i wytwarzania ligandu zdolnego do modulowania aktywności komórkowej, którą moduluje/w której pośredniczy NIK, znamienny tym, że obejmuje: a) poszukiwanie ligandu wykazującego zdolność wiązania się z polipeptydem zawierającym co najmniej część sekwencji NIK z ID. SEKW. NR:7; b) identyfikowanie i charakteryzowanie ligandu innego niż TRAF2 albo części receptora z rodziny receptora TNF/NGF, znalezionego w takim etapie poszukiwania jako zdolnego do takiego wiązania; oraz c) wytwarzanie takiego ligandu w postaci zasadniczo wyizolowanej i oczyszczonej.
  38. 38. Sposób identyfikacji i wytwarzania cząsteczki zdolnej do pośredniego albo bezpośredniego modulowania aktywności komórkowej, którą moduluje/w której pośredniczy NIK, znamienny tym, że obejmuje: a) poszukiwanie cząsteczki wykazującej zdolność modulowania aktywności komórkowej, którą moduluje/w której pośredniczy NIK; b) identyfikowanie i charakteryzowanie tej cząsteczki; oraz c) wytwarzanie takiej cząsteczki w postaci zasadniczo wyizolowanej i oczyszczonej.
  39. 39. Sposób identyfikacji i wytwarzania cząsteczki zdolnej do pośredniego albo bezpośredniego modulowania aktywności komórkowej, którą moduluje/w której pośredniczy polipeptyd wybrany z grupy obejmującej:
    a) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową / ID. SEKW. NR: 7 (NIK);
    b) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową fragmentu z a), przy czym fragment ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB;
    c) polipeptyd zawierający sekwencję aminokwasową analogu z a) lub b), posiadającą nie więcej niż dziesięć zmian w sekwencji aminokwasowej a) lub b), przy czym każda zmiana jest substytucją, delecją lub insercją aminokwasu, a analog ten wiąże się z TRAF2 i moduluje aktywność NF-KB; albo
    d) polipeptyd zawierający sekwencję pochodnej a), b) lub c) wiążący się z TRAF2 i modulujący aktywność NF-KB, znamienny tym, że obejmuje: a) poszukiwanie cząsteczki wykazującej zdolność modulowania aktywności komórkowej, którą moduluje/w której pośredniczy wyżej określony polipeptyd; b) identyfikowanie i charakteryzowanie tej cząsteczki; oraz c) wytwarzanie takiej cząsteczki w postaci zasadniczo wyizolowanej i oczyszczonej.
PL97329218A 1996-04-02 1997-04-01 polipeptyd, sekwencje DNA, wektor, szczep, sposób wytwarzania białka, przeciwciała 54) albo ich aktywne fragmenty albo pochodne, zastosowania polipeptydu, cząsteczki DNA i wektora, sposób izolowania i identyfikacji polipeptydu, kompozycje farmaceutyczne, sposoby poszukiwania ligandu i sekwencji DNA, sposoby identyfikacji i wytwarzania ligandu i cząsteczki PL190709B1 (pl)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
IL11780096A IL117800A0 (en) 1996-04-02 1996-04-02 Modulators of TNF receptor associated factor (TRAF) their preparation and use
IL11913396A IL119133A0 (en) 1996-08-26 1996-08-26 Modulators of TNF receptor associated factor (TRAF) their preparation and use
PCT/IL1997/000117 WO1997037016A1 (en) 1996-04-02 1997-04-01 Modulators of tnf receptor associated factor (traf), their preparation and use

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL329218A1 PL329218A1 (en) 1999-03-15
PL190709B1 true PL190709B1 (pl) 2005-12-30

Family

ID=35788602

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL97329218A PL190709B1 (pl) 1996-04-02 1997-04-01 polipeptyd, sekwencje DNA, wektor, szczep, sposób wytwarzania białka, przeciwciała 54) albo ich aktywne fragmenty albo pochodne, zastosowania polipeptydu, cząsteczki DNA i wektora, sposób izolowania i identyfikacji polipeptydu, kompozycje farmaceutyczne, sposoby poszukiwania ligandu i sekwencji DNA, sposoby identyfikacji i wytwarzania ligandu i cząsteczki

Country Status (1)

Country Link
PL (1) PL190709B1 (pl)

Also Published As

Publication number Publication date
PL329218A1 (en) 1999-03-15

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US8236507B2 (en) Modulators of TNF receptor associated factor (TRAF), their preparation and use
FI121273B (fi) FAS/APO1-reseptorien toiminnan modulaattorit
US20090075889A1 (en) Iren protein, its preparation and use
EP0984983B1 (en) Modulators of intracellular inflammation, cell death and cell survival pathways containing a card and a kinase domain
KR100552547B1 (ko) Tnf수용체연합된인자(traf)조절물질,이의제조및이의용도
PL190709B1 (pl) polipeptyd, sekwencje DNA, wektor, szczep, sposób wytwarzania białka, przeciwciała 54) albo ich aktywne fragmenty albo pochodne, zastosowania polipeptydu, cząsteczki DNA i wektora, sposób izolowania i identyfikacji polipeptydu, kompozycje farmaceutyczne, sposoby poszukiwania ligandu i sekwencji DNA, sposoby identyfikacji i wytwarzania ligandu i cząsteczki
AU767967B2 (en) Modulators of TNF receptor associated factor (TRAF), their preparation and use
IL126428A (en) Modulators of tnf receptor associated factor (traf), their preparation and use
US7108999B1 (en) Modulators of the function of FAS/AP01 receptors
JP2009148285A (ja) Tnf/ngfレセプターファミリーおよびほかのタンパク質のレセプター機能調節物質