NL9401678A - Methode van de zichzelf stabiliserende lus (Z.Z.S.L.). - Google Patents

Methode van de zichzelf stabiliserende lus (Z.Z.S.L.). Download PDF

Info

Publication number
NL9401678A
NL9401678A NL9401678A NL9401678A NL9401678A NL 9401678 A NL9401678 A NL 9401678A NL 9401678 A NL9401678 A NL 9401678A NL 9401678 A NL9401678 A NL 9401678A NL 9401678 A NL9401678 A NL 9401678A
Authority
NL
Netherlands
Prior art keywords
dna
gene
binding protein
rna
operon
Prior art date
Application number
NL9401678A
Other languages
English (en)
Inventor
Evert Hovius
Original Assignee
Evert Hovius
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Evert Hovius filed Critical Evert Hovius
Priority to NL9401678A priority Critical patent/NL9401678A/nl
Priority to AU37550/95A priority patent/AU3755095A/en
Priority to PCT/NL1995/000344 priority patent/WO1996012015A1/en
Publication of NL9401678A publication Critical patent/NL9401678A/nl

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/70Vectors or expression systems specially adapted for E. coli

Description

Methode van de zichzelf stabiliserende lus ( Z.Z.S.L.) .
Het gaat hier om een basis concept voor een nieuwe generatie medicijnen, bestaande uit eiwit mantels waarin zich DNA/RNA strengen bevinden , zonder mantelgen, welke de mogelijkheid bieden om stukken DNA buiten tc sluiten in de vorm van een lus. Het buiten gesloten DNA wordt niet getranscript.
flé Z.Z.S.L· wordt gevormd door het aanbrengen van een DNA/RNA streng ( afkomstig van virussen of zelf gesynthetiseerd )in het DNA van procaryoten of eucaryoten , waardoor een lus wordt gevormd bestaande uit een gedeelte van het ingebrachte DNA en het inefficiënte operon of gen. De lus wordt gestabiliseerd door een bindings-eiwit ( nader te onderzoeken ), waarvan het gen op de ingebrachte DNA streng ligt. De positieve regulator van het bindingseiwit bevindt zich voor het gen daarvan. De negatieve regulator wordt onder andere samen met het inefficiënte operon of gen buiten gesloten in de lus. De goede vorm van het inefficiënte operon of gen is aangebracht op de betreffende DNA streng voor de positieve regulator. Achter het gen van het bindingseiwit bevinden zich respectievelijk een leadersequentie, attenuat6r side, herkenningssequentie voor het bindingseiwit,negatieve regulator, attenuator side, leadersequentie gevolgd door een reeks initiatie signalen.
De DNA/RNA streng is zo samen gesteld dat het zich specifiek innestelt voor het inefficiënte operon of gen ( of wat men wil buiten sluiten in de lus ), doordat de stabiliteit van het totale DNA groter wordt.
Het gemanipuleerde DNA/RNA bevindt zich in een eiwit mantel waarvan de code niet op het DNA/RNA voorkomt, hier door kan het zich niet reproduseren. Voor de productie wordt gebruik gemaakt van procaryoten of eucaryoten waar het mantel gen is ingebouwd, de concentratie hiervan moet zo hoog mogelijk zijn* we kunnen nu het gemanipuleerde DNA/RNA inbrengen inde door ons gemanipuleerde cel. Het resultaat is een gesynthetiseerde virus zonder mantel gen geschikt voor het toepassen van de Z.Z.S.L.
Voorbeeld van het toepassen van de Z.Z.S.L. bij Ecolie bacteriën.
Stel dat het lactose operon gemuteerd is in een van structurele genen, dan wordt de goede vorm van het operon aan gebracht in een gemanipuleerd virus gevolgd door de sequenties gegeven in het voorafgaande. Dit virus nestelt zich specifiek voor het lactose operon en sluit deze buiten. Het RNA polymerase begint de transcriptie op het lactose operon op het virus DNA. Daarna wordt hetpposi-tieve regulator gen Al getranscript gevolgd door de transcriptie van het bindingsgeh B. Het bindingsgen B bevat geen normale terminatie side, maar wordt gevolgd door een leadersequentie dat twee fantasie codons bevat. Hierdoor stallen de ribosomen, waardoor het leadermessenger RNA een signaal doorgeeft aan het RNA polymerase om de transcriptie te stoppen. Het RNA polymerase bereikt de attenuator side en verlaat hier het DNA.Doordat het RNA polymerase hier het DNA verlaat, bereikt ze niet de lus gekop-pelt door het bindingseiwit B, waardoor ze geen gevaar vormt voor de lus.
Als de lus gevormd is moet de transcriptie hiervan voorkomen worden.Het RNA polymerase sqent het DNA af naar initiatie signalen met een snelheid van 1000 basen paren per seconde, hierdpor is het genoodzaakt dat de laatste sequentie van het virus DNA bestaat uit verscheidene initiatie signalen. Hierdoor wordt het RNA polymerase als het ware naar één kant gedreven n.l. het virus DNA op.
Het is nu noodzakelijk dat het RNA polymerase aan de tran scriptie begint, daar het anders met de transcriptie van het inefficiënte operon begint. Vandaar dat de initiatie signalen gevolgd worden door een leadersequentie dat twee fantasie codons bevat en een attenuator side. Hierdoor valt het RNA polymerase van het virus DNA af. ( glijbaan effect ). De attenuator side wordt gevolgd door de negatieve regulator A2 van het bindingseiwit B.
We zien nu dat A2 zich bevindt samen met de herken-ningssequentie van het bindingseiwit B tussen twee attenuator sides. Hierdoor vindt geen transcriptie plaats van A2, waardoor bindingseiwit B niet negatief gereguleerd wordt/ alsdan verankering van de lus#
Met behulp van de Z.Z.S.L. kunnen we stukjes DNA uit schakelen en inbouwen zonder het betreffende organisme te beschadigen· Doordat dit nieuwe medicijn bestaat uit DNA/RNA strengen in een eiwitmantel ( uit de natuur of zelf gesynthetiseerd ) kunnen we iedere cel( lees gastheer ) herkennen en manipuleren.

Claims (9)

  1. Het betreft hier een groep nieuwe medicijnen op genetische basis dat de huidige antibiotica kan vervangen, MET HET KENMERK , dat het bestaat uit DNA/RNA zonder mantelgen, zodanig gemanipuleert dat het op een specifieke plaats innestelt en ondermeer de volgende sequenties bevat in de hieronder aangegeven volgorde. li Het eventueel te vervangen operon of gen
  2. 2: Een positieve regulator van het bindingseiwit.
  3. 3: Een leadersequentie
  4. 4; Attenuator side.
  5. 5: Een herkenningssequentie voor het bindingseiwit.
  6. 6: Een negatieve regulator voor het bindingseiwit.
  7. 7: Attenuator side.
  8. 8: Leadersequentie.
  9. 9: Een initiatie rijke sequentie. Opmerkings Het gen voor het bindingseiwit bevindt zich tussen de positieve regulator en de leadersequentie ( tussen de punten 2 en 3 )· Waardoor een lus gevormt wordt in het DNA van de gastheer, bestaande uit een gedeelte van het virus-DNA te weten Je punten 5,6,7,8,9, en het operon of gen van Je gastheer. Het gemanipuleerde DNA/RNA bevindt zich in een eiwit-mantel ( uit de natuur of zelf gesynthetiseerd ) dat naar willekeur van het gestelde doel een gastheer kan herkennen.
NL9401678A 1994-10-12 1994-10-12 Methode van de zichzelf stabiliserende lus (Z.Z.S.L.). NL9401678A (nl)

Priority Applications (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
NL9401678A NL9401678A (nl) 1994-10-12 1994-10-12 Methode van de zichzelf stabiliserende lus (Z.Z.S.L.).
AU37550/95A AU3755095A (en) 1994-10-12 1995-10-10 Self stabilizing rna/dna loop
PCT/NL1995/000344 WO1996012015A1 (en) 1994-10-12 1995-10-10 Self stabilizing rna/dna loop

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
NL9401678 1994-10-12
NL9401678A NL9401678A (nl) 1994-10-12 1994-10-12 Methode van de zichzelf stabiliserende lus (Z.Z.S.L.).

Publications (1)

Publication Number Publication Date
NL9401678A true NL9401678A (nl) 1996-05-01

Family

ID=19864761

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
NL9401678A NL9401678A (nl) 1994-10-12 1994-10-12 Methode van de zichzelf stabiliserende lus (Z.Z.S.L.).

Country Status (3)

Country Link
AU (1) AU3755095A (nl)
NL (1) NL9401678A (nl)
WO (1) WO1996012015A1 (nl)

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FR2511033A1 (fr) * 1981-08-10 1983-02-11 Genex Corp Vecteurs d'expression permettant d'introduire un gene dans un organisme procaryote
WO1990000192A1 (en) * 1988-07-01 1990-01-11 Genencor, Inc. Aspartic proteinase deficient filamentous fungi

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FR2511033A1 (fr) * 1981-08-10 1983-02-11 Genex Corp Vecteurs d'expression permettant d'introduire un gene dans un organisme procaryote
WO1990000192A1 (en) * 1988-07-01 1990-01-11 Genencor, Inc. Aspartic proteinase deficient filamentous fungi

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
AMOUYAL EN VON WILCKEN-BERGMANN: "Repression of the E.coli lactose operon by cooperation between two individually unproductive "half-operator" sites", COMPTES RENDUS HEBDOMADAIRES DES SEANCES DE L'ACADEMIE DES SCIENCES, SERIE C: SCIENCES CHIMIQUES, vol. 315, MONTREUIL FR, pages 403 - 407 *

Also Published As

Publication number Publication date
AU3755095A (en) 1996-05-06
WO1996012015A1 (en) 1996-04-25

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR102604903B1 (ko) 내인성 및 공급원 DNA의 원-샷 가이드 RNA(ogRNA) 표적화를 위한 시스템 및 방법
KR100996016B1 (ko) 폴리뉴클레오티드
CA2378653A1 (en) Methods and compositions for preventing the formation of aberrant rna during transcription of a plasmid sequence
CN101189348B (zh) 用于产生合成启动子的系统
AU4526193A (en) Binding competent oligomers containing 2', 5' linkages
AU2019240068A1 (en) Viral and non-viral nanoplasmid vectors with improved production
Tolmachov et al. Silencing of transgene expression: a gene therapy perspective
Moffat Triplex DNA finally comes of age: more than three decades after it was first synthesized, triple-stranded DNA is showing promise as a tool for cleaving genomes precisely and blocking gene transcription
JP2023538964A (ja) 真核生物ゲノム工学のための合成小型crispr-cas(casmini)システム
AU2011347086A1 (en) DNA expression construct
Verbeek et al. Potential binding sites of the trans-activator FIS are present upstream of all rRNA operons and of many but not all tRNA operons
NL9401678A (nl) Methode van de zichzelf stabiliserende lus (Z.Z.S.L.).
Sergueev et al. E. coli cell-cycle regulation by bacteriophage lambda
CN115768444A (zh) 用于修饰靶核酸的组合物和方法
Bonhoeffer et al. Replication of the bacterial chromosome
EP2224010A1 (en) Improved gene expression
Cavalieri et al. Nucleic acids and information transfer
Girod et al. Use of scaffold/matrix-attachment regions for protein production
Bull et al. Why is the polymerase chain reaction resistant to in vitro evolution?
US7812148B2 (en) Vectors comprising CpG islands without position effect varigation and having increased expression
CA3183129A1 (en) Rna scaffolds
Lengyel The process of translation as seen in 1969
Krzysztoń et al. Gene-circuit therapy on the horizon: Synthetic biology tools for engineered therapeutics
Etchegaray et al. DB or not DB in translation?
KR20220049619A (ko) 유전자 발현 조절 시스템