NL8700483A - QUANTIFICATION OF NUCLEIC ACID MOLECULES AND REAGENT SET USED THEREIN. - Google Patents
QUANTIFICATION OF NUCLEIC ACID MOLECULES AND REAGENT SET USED THEREIN. Download PDFInfo
- Publication number
- NL8700483A NL8700483A NL8700483A NL8700483A NL8700483A NL 8700483 A NL8700483 A NL 8700483A NL 8700483 A NL8700483 A NL 8700483A NL 8700483 A NL8700483 A NL 8700483A NL 8700483 A NL8700483 A NL 8700483A
- Authority
- NL
- Netherlands
- Prior art keywords
- fragment
- sniffing
- molecules
- nucleic acid
- gene
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Description
8730287302
ORION PHARMACEUTICALORION PHARMACEUTICAL
KWANTIFICERING VAN NUCLEINEZUUR MOLECULEN EN DE DAARBIJ GEBRUIKTE REAGENS SETQUANTIFICATION OF NUCLEIC ACID MOLECULES AND REAGENT SET USED THEREOF
De uitvinding heeft betrekking op de kwantificering van bepaalde nucleinezuur moleculen, meer in het bijzonder de mate van 5 versterking van genen en/'cf overeenkomstige boodschapper RNA moleculen waarbij de sandwich of oplossings hybridisatie methode wordt gebruikt, en op de gebruikte reagens set.The invention relates to the quantification of certain nucleic acid molecules, more particularly the degree of amplification of genes and / or corresponding messenger RNA molecules using the sandwich or solution hybridization method, and the reagent set used.
Het aantal kopieën van de individuele genen in het genoom is meestal 10 konstant. In enkele gevallen is er slechts een gen per haploid genoom en in andere gevallen meerdere, Onder bepaalde omstandigheden kan het aantal kopieën veranderen. De versterking van bepaalde genen is bijvoorbeeld gevonden verbonden te zijn met de ontwikkeling van kanker. Het is ook bekend dat externe factoren zoals pharmaceutics 15 en metalen enz. de versterking van bepaalde genen kunnen veroorzaken. Voor de ontwikkeling van een ziekte is het foutieve of vergrote expressleniveau van een gen, zoals een oncogen, d.w.z. de hoeveelheid boodschapper RNA en een cel, van grote betekenis.The number of copies of the individual genes in the genome is usually 10 constant. In some cases there is only one gene per haploid genome and in others several, In some circumstances the number of copies may change. For example, the enhancement of certain genes has been found to be linked to the development of cancer. It is also known that external factors such as pharmaceutics and metals etc. can cause the amplification of certain genes. For the development of a disease, the erroneous or increased expression level of a gene, such as an oncogene, i.e. the amount of messenger RNA and a cell, is of great significance.
Toegenomen aantallen van enkele chromosomen is de oorzaak van bepaalde 20 erfelijke ziekten of andere verstoringen, terwijl enkele erfelijke ziekten slechts duplicering vereisen van een recessief gen. In al zulke gevallen is het belangrijk om het aantal aanwezige chromosomen of genen te bepalen.Increased numbers of single chromosomes are the cause of certain 20 hereditary diseases or other disturbances, while some hereditary diseases require only duplication of a recessive gene. In all such cases it is important to determine the number of chromosomes or genes present.
25 Het aantal van bepaalde DNA moleculen, bijvoorbeeld de mate van versterking van bepaalde genen,wordt thans bepaald door het geëxtraheerde, te bestuderen DNA door middel van restrictie enzymen te knippen en door middel van het scheiden van de nucleotide fragmenten naar lengte door middel van agarose gel elektro-30 forese. Daarna wordt de enkelstrengs DNA overgebracht en gefixeerd aan een nitrocellulose filter, waarbij hybridisatie plaatsvindt door gebruik te maken van het te bestuderen gen of een deel van het gen als een snuffelmolecuul.The number of certain DNA molecules, for example the degree of amplification of certain genes, is now determined by cutting the extracted DNA to be studied by means of restriction enzymes and by separating the nucleotide fragments to length by means of agarose gel electro-30 forese. The single-stranded DNA is then transferred and fixed to a nitrocellulose filter, hybridization taking place using the gene to be studied or part of the gene as a sniffing molecule.
8700483 -2- 87302 1 ï'8700483 -2- 87302 1 ï '
De resultaten worden verkregen door middel van autoradiografie (Southern, J. Mol. BIOL. 98, p. 503-517, 1975). Bij elke parallels analyse is de hoeveelheid cellulair DNA het zelfde.The results are obtained by autoradiography (Southern, J. Mol. BIOL. 98, p. 503-517, 1975). The amount of cellular DNA is the same with each parallel analysis.
5 De intensiteiten van de hybridisatie banden , d.w.z. de signalen, worden vergeleken en de verhoudingen tussen de kopie aantallen· van de te bestuderen genen in de testmonsters worden bepaald.The intensities of the hybridization bands, i.e. the signals, are compared and the ratios between the copy numbers of the genes to be studied in the test samples are determined.
De methode levert slechts bij benadering aangegeven resultaten.The method provides approximate results only.
Analoog wordt RNA gemeten volgens de Northern-overbrengings of 10 stip-averbrengings methode.. Deze methoden zijn kwantitatief zeer onnauwkeurig (Thomas, methods in Enzymol., 100, pp. 255-266, 1983).Analogously, RNA is measured by the Northern transfer or dot transfer method. These methods are quantitatively inaccurate (Thomas, methods in Enzymol., 100, 255-266, 1983).
Bekende methoden zoals de Southern en Northern overbrengingsmethoden zijn langzaam en moeilijk uit te voeren. Aangezien ze slechts benaderde 15 resultaten leveren is hun diagnostische waarde twijfelachtig in gevallen waarin het belangrijk is om het aantal van bepaalde nucleine-zuur moleculen per gegeven eenheid , zoals een cel, te weten.Known methods such as the Southern and Northern transfer methods are slow and difficult to perform. Since they provide only approximate results, their diagnostic value is questionable in cases where it is important to know the number of certain nucleic acid molecules per given unit, such as a cell.
••
De sandwich of oplossings hybridisatie methoden, beschreven in 20 US octrooi no. 4,486,539 en in de Britse octrooiaanvrage no.The sandwich or solution hybridization methods described in U.S. Patent No. 4,486,539 and in British Patent Application No.
GB 2 169 403 zijn kwantitatief (Virtanen et al., Lancet JL, pp. 381-383, 1983). Bovendien vereist de methode volgens de onderhavige uitvinding een standaard nucleinezuur, waarvan het kopie aantal konstant is en de bepaling van het aantal van de relevante 25 nucleinezuur moleculen per gegeven eenheid, zoals een cel, kern, ribosoom of chromosoom, mogelijk maakt.GB 2 169 403 are quantitative (Virtanen et al., Lancet JL, pp. 381-383, 1983). In addition, the method of the present invention requires a standard nucleic acid, the copy number of which is constant and allows the determination of the number of the relevant nucleic acid molecules per given unit, such as a cell, nucleus, ribosome or chromosome.
Het doel van de onderhavige uitvinding is een nauwkeurige en snelle kwantitatieve methode voor nucleinezuur molecuul bepaling te 30 produceren, die ook sneller en eenvoudiger kan worden uitgevoerd dan de thans gebruikte. Het kan worden gebruikt voor kanker en prenatale diagnostieken, voor het detecteren van stoffen die gen versterking veroorzaken of voor het aantonen van de ontwikkeling van bijvoorbeeld geneesmiddelresistentie als mede voor de bepaling 35 van het expressie niveau van boodschapper RNA·.The object of the present invention is to produce an accurate and fast quantitative method for nucleic acid molecule determination, which can also be performed faster and simpler than currently used. It can be used for cancer and prenatal diagnostics, for detecting substances that cause gene amplification or for demonstrating the development of, for example, drug resistance, as well as for determining the expression level of messenger RNA.
870048¾ * ί .-3- 87302870048¾ * ί. -3- 87302
Tenminste twee bepalingen zijn nodig volgens de onderhavige uitvinding. Een bepaalt het nucleinezuur molecuul, dat aanwezig kan zijn in verscheiden kopieën, het test nucleinezuur. De andere bepaalt het essentiële nucleinezuur molecuul dat op gunstige wijze aanwezig is 5 in een konstent aantal, het standaard nucleinezuur. Bij de methode volgens de uitvinding duidt een nucleinezuur molecuul een bepaalde nucleotide volgorde van 10 - 12 nucleotiden aan of een gen dat enkele duizenden nucleotiden bevat. Het kan ook een boodschapper RNA of een nucleotide volgorde die aanzienlijk langer is dan een enkel gen, 10 d.w.z. een amplicon, betekenen.At least two determinations are required according to the present invention. One defines the nucleic acid molecule, which may be present in several copies, the test nucleic acid. The other determines the essential nucleic acid molecule which is advantageously present in a constant number, the standard nucleic acid. In the method of the invention, a nucleic acid molecule indicates a particular nucleotide sequence of 10-12 nucleotides or a gene containing several thousand nucleotides. It can also mean a messenger RNA or a nucleotide sequence significantly longer than a single gene, i.e. an amplicon.
De bepaling van de test en standaard nucleinezuren wordt uitgevoerd onder gebruikmaking van een anderzijds normale sandwich hybridisatie methode, die bijvoorbeeld is beschreven in het US octrooi no. 4,486,539 15 of een oplossings hybridisatie methode beschreven in de Britse octrooiaanvrage no. GB 2 169 403. De uitvinding heeft ook betrekking op een reagens set die nucleinezuur reagentia bevat die tenminste bestaan uit een test snuffelmolecuul paar en tenminste een standaard snuffelmolecuul paar.The assay and standard nucleic acids are determined using an otherwise normal sandwich hybridization method, which is described, for example, in US Patent No. 4,486,539, or a solution hybridization method described in British Patent Application No. GB 2 169 403. invention also relates to a reagent set containing nucleic acid reagents consisting of at least one test sniff molecule pair and at least one standard sniff molecule pair.
2020
De reagentia of snuffelmoleculen die worden gebruikt bij deze methode, worden bereid door gebruik te maken van recombinant-DNA technieken, uit nucleinezuren die voldoende homoloog zijn ten opzichte van de test en standaard nucleinezuren. Voldoende homologe nucleinezuren kunnen 25 ook synthetisch en semi-synthetisch worden bereid.The reagents or sniffing molecules used in this method are prepared using recombinant DNA techniques, from nucleic acids sufficiently homologous to the assay and standard nucleic acids. Sufficiently homologous nucleic acids can also be prepared synthetically and semi-synthetically.
De test en standaard nucleinezuren kunnen direkt uit.cellen worden geïsoleerd en geïdentificeerd door middel van verscheidene hybridisatie technieken. Zulke test en standaard nucleinezuren zijn 30 echter ook commercieel verkrijgbaar en uit verscheidene gen banken.The assay and standard nucleic acids can be isolated and identified directly from cells by various hybridization techniques. However, such assay and standard nucleic acids are also commercially available and from various gene banks.
Test en standaard nucleinezuren kunnen ofwel DNA of RNA zijn.Test and standard nucleic acids can be either DNA or RNA.
Snuffelmolecuul paren , geschikt voor de sandwich of oplossings hybridisatie methode worden bereid uit nucleinezuren die voldoende 35 homoloog zijn ten opzichte van de test en standaard nucleinezuren 8700483 ί » -4- 87302 door middel van recombinant-DNA technieken.De relevante nucleinezuren worden geknipt door middel van geschikte restrictie enzymen; tenminste twee van de resulterende restrictie segmenten die relatief dicht bij elkaar zijn gelegen worden gedoneerd via tenminste twee geschikte 5 vectoren. Een van de fragmenten, het detector snuffelmolecuul,wordt gemerkt met een geschikt detecteerbaar indentificatiemiddel en het andere, het vangend snuffelmolecuul,'wordt of gefixeerd aan een geschikte drager of een stof wordt hieraan gehecht, welke stof de scheiding van het resulterende hybride uit het hybridisatiemengsel 10 door middel van een andere stof mogelijk maakt, zoals de complementaire component van een affiniteits paar.Snuff molecule pairs suitable for the sandwich or solution hybridization method are prepared from nucleic acids that are sufficiently homologous to the assay and standard nucleic acids 8700483-4-4-87302 by recombinant DNA techniques. The relevant nucleic acids are cut by of suitable restriction enzymes; at least two of the resulting restriction segments located relatively close to each other are donated via at least two suitable vectors. One of the fragments, the detector sniffing molecule, is labeled with a suitable detectable identifier and the other, the capturing sniffing molecule, is either fixed to a suitable carrier or a substance attached to it, which substance separates the resulting hybrid from the hybridization mixture. 10 through another substance, such as the complementary component of an affinity pair.
De test en standaaard snuffelmolecuul paren kunnen worden samengesteld tot geschikte reagens sets, waarin de test en standaard 15 snuf felmolecuul paren zowel DNA of RNA zijn, of het test snuf fel molecuul paar is DNA en het standaard snuffelmolecuul paar RNA of vice versa. De voorbehandeling en de verdere behandeling van monsters voorafgaande aan de hybridisatie en de hybridisatie omstandigheden dienen daarom te passen bij de snuffelmolecuul paren die in de test 20 worden gebruikt.The test and standard sniff molecule pairs can be assembled into appropriate reagent sets, wherein the test and standard 15 sniff bright molecule pairs are either DNA or RNA, or the test sniff bright molecule pair is DNA and the standard sniff molecule pair RNA or vice versa. The pretreatment and further treatment of samples prior to the hybridization and the hybridization conditions should therefore be appropriate for the sniffing molecule pairs used in the assay.
De methode volgens de onderhavige uitvinding is in het bijzonder geschikt voor het direkt bepalen van het aantal nucleinezuur moleculen uit cellulaire homogenaten. De methode kan natuurlijk ook worden 25 gebruikt voor de bepaling van gezuiverde of zuivere nucleinezuren. Echter voor het uitvoeren van de methode volgens de uitvinding dient de meest geschikte voorbehandeling van het nucleinezuur monster te worden gekozen.The method of the present invention is particularly suitable for directly determining the number of nucleic acid molecules from cellular homogenates. The method can of course also be used for the determination of purified or pure nucleic acids. However, to perform the method of the invention, the most appropriate pretreatment of the nucleic acid sample should be selected.
30 Het is mogelijk om zowel DNA als RNA bepalingen uit te voeren onder toepassing van de methode volgens de uitvinding. Deoxyribonucleine zuren worden gedenatureerd om enkelvoudige strengen te verkrijgen indien nodig. Enkel-strengige boodschapper RNA moleculen die potentieel de hybridisatie test verstoren, kunnen worden gehydrolyseerd 35 bij voorbeeld door het koken met loog. Het monster wordt niet 8700483 87302 -5- gegedenatureerd met betrekking tot ribonucleinezuur bepalingen aangezien het dubbelstrengs deoxyribonucleinezuur niet interfereert met de RNA bepaling. Het is natuurlijk mogelijk om het DNA uiteen te doen vallen met deoxyribonuclease of het ofwel chemisch of mechanisch 5 te wijzigen, zodat het niet aan de hybridisatie reactie kan participeren. Derhalve dient in verband met de DNA en RNA bepalingen een geschikte methode voor de verdere behandeling van het monster te worden gekozen , of volgens een alternatieve wijze kan deze verdere behandeling worden weggelaten. De keuze van een geschikte methode 10 voor de verdere behandeling is natuurlijk afhankelijk van de methode die wordt gebruikt voor de voorbereidende behandeling van het nucleinezuur monster. Talrijke voorbehandelings- en verdere behandelingsmethoden van nucleinezuur monsters zijn beschreven in de literatuur, die een keuze van de meest geschikte methoden voor 15 ieder geval mogelijk maakt.It is possible to perform both DNA and RNA assays using the method of the invention. Deoxyribonucleic acids are denatured to obtain single strands if necessary. Single stranded messenger RNA molecules potentially interfering with the hybridization assay can be hydrolyzed, for example, by caustic boiling. The sample is not denatured 8700483 87302-5 with respect to ribonucleic acid assays since the double stranded deoxyribonucleic acid does not interfere with the RNA assay. It is, of course, possible to disrupt the DNA with deoxyribonuclease or to modify it either chemically or mechanically so that it cannot participate in the hybridization reaction. Therefore, in connection with the DNA and RNA assays, an appropriate method for further treatment of the sample should be selected, or alternatively, this further treatment may be omitted. The selection of a suitable method for further treatment naturally depends on the method used for the preliminary treatment of the nucleic acid sample. Numerous pretreatment and further treatment methods of nucleic acid samples have been described in the literature, allowing selection of the most suitable methods for each case.
Bepalingen waarbij zowel de test als standaard nucleinezuren ofwel DNA of RNA zijl kunnen worden uitgevoerd door gebruik van een onverdeeld monster. Bepalingen waarin de test nucleinezuren DNA zijn 20 en de standaard nucleinezuren RNA of vice versa, kunnen worden uitgevoerd bij gebruik van een verdeeld monster, aangezien verschillende methoden voor de verdere behandeling noodzakelijk zijn. Het monster kan natuurlijk worden verdeeld zelfs indien de test en standaard nucleinezuren van hetzelfde nucleinezuur type zijn.Assays in which both the assay and standard nucleic acids, either DNA or RNA, can be performed using an undivided sample. Assays in which the test nucleic acids are DNA and the standard nucleic acids RNA or vice versa can be performed using a divided sample, since different methods are required for further treatment. The sample can of course be divided even if the test and standard nucleic acids are of the same nucleic acid type.
2525
De hybridisatie test zelf wordt uitgevoerd door de onverdeelde monster oplossing gelijktijdig in kontakt te brengen met tenminste een test snuffelmolecuul paar en een standaard snuffelmolecuul paar. Indien de monster oplossing verdeeld is, wordt deze afzonderlijk 30 in kontakt gebracht met tenminste een test snuffelmolecuul paar en een standaard snuffelmolecuul paar. In zulke gevallen wordt de hoeveelheid test nucleinezuur bepaald in het ene reaktievat en de hoeveelheid standaard nucleinezuur in het andere.The hybridization test itself is performed by simultaneously contacting the undivided sample solution with at least one test sniff molecule pair and one standard sniff molecule pair. If the sample solution is divided, it is contacted separately with at least one test sniff molecule pair and one standard sniff molecule pair. In such cases, the amount of test nucleic acid is determined in one reaction vessel and the amount of standard nucleic acid in the other.
8700483 s % -6- 873028700483 s% -6- 87302
Ongeacht of het monster gedeeld is of niet kan men in ieder geval de hybridisatie onder de meest voordelige omstandigheden en tijd laten plaats vinden. Indien de reaktie(s) eenmaal heeft/hebben plaats gevonden, worden de resulterende test en standaard hybriden 5 gescheiden uit het hybridisatiemengsel(s) d.m.v. de drager en gewassen, of door middel van een isolatie reagens zoals het complementaire deel van een affiniteitspaar. Het aangehecht identificatiemiddel aan de test en standaard hybriden wordt gemeten en het resultaat wordt vergeleken met standaard curven. Op deze 10 manier kan het aantal te bestuderen nucleinezuur moleculen worden bepaald per gekozen eenheid.In any case, regardless of whether the sample is divided or not, the hybridization can be allowed to proceed under the most advantageous conditions and time. Once the reaction (s) has taken place, the resulting test and standard hybrids are separated from the hybridization mixture (s) by the carrier and washed, or by means of an isolation reagent such as the complementary part of an affinity pair. The attached identifier to the test and standard hybrids is measured and the result compared to standard curves. In this way, the number of nucleic acid molecules to be studied can be determined per chosen unit.
De methode volgens de uitvinding is van praktische diagnostische waarde, in het bijzonder voor de detectie van enkele typen kanker.The method according to the invention is of practical diagnostic value, in particular for the detection of some types of cancer.
15 In kleincellige longcarcinomen, wordt het c-myc gen dikwijls versterkt en het expressieniveau erven is aanzienlijk hoger dan in normaal weefsel. In gevallen van neuroblastomen wordt het N-myc gen versterkt.In small cell lung carcinomas, the c-myc gene is often amplified and the level of expression inherited is significantly higher than in normal tissue. In cases of neuroblastomas, the N-myc gene is amplified.
De methode volgens de onderhavige uitvinding kan ook worden gebruikt 20 voor het aantonen van de mutagene of-carcinogene effecten van bepaalde stoffen of de ontwikkeling van geneesmiddelresistentie.The method of the present invention can also be used to demonstrate the mutagenic or carcinogenic effects of certain substances or the development of drug resistance.
Het is bekend dat externe selectiedruk kan resulteren in een verhoogde expressie van een bepaald gen. Bij de behandeling van kanker ontwikkelen cellen resistentie ten opzichte van een bepaald geneesmiddel door 25 middel van versterking van het gen, waarvan het expressieprodukt het geneesmiddel inaktiveert. Een zo'n geval is methotrexaat, dat versterking van het gen voor de dihydrofolaat reductase (DHFR) induceert. Een verder voorbeeld is de versterking van het gen voor metallothionine onder invloed van cadmium.It is known that external selection pressure can result in an increased expression of a particular gene. In the treatment of cancer, cells develop resistance to a particular drug by enhancing the gene, the expression product of which inactivates the drug. One such case is methotrexate, which induces amplification of the dihydrofolate reductase (DHFR) gene. A further example is the amplification of the gene for metallothionine under the influence of cadmium.
3030
Het expressieniveau van een gen is belangrijk uit het oogpunt van het fenotype en funktie van de cel. Dit kan worden onderzocht door de hoeveelheid boodschapper RNA te meten die correleert aan de hoeveelheid proteïne waarvoor het codeert. Het transcriptieprodukt van een 35 oncogen bepaalt de wijze waarop het uiteindelijk tot expressie zal worden gebracht.The expression level of a gene is important from the viewpoint of the phenotype and function of the cell. This can be investigated by measuring the amount of messenger RNA that correlates with the amount of protein it encodes. The transcription product of an oncogene determines the way in which it will eventually be expressed.
8700483 # a -7- 873028700483 # a -7- 87302
De expressieniveaus van een oncogen variëren afhankelijk van het celtype, differentatieniveau en ontwikkelingsfase van de cel.The expression levels of an oncogene vary depending on the cell type, level of differentiation and stage of development of the cell.
Bijvoorbeeld, in een bepaald stadium van foetale ontwikkeling wordt het c-myc oncogen snel gekopieerd, terwijl in een ander stadium dit 5 heel langzaam gebeurd. De mate van versterking is dikwijls gecorreleerd met het expressieniveau van het gen,hoewel laatstgenoemde significant kan toenemen zonder de eerstgenoemde. In zulke gevallen wordt de rol van een oncogen het best bepaald door eerder het expressieniveau ervan dan het aantal kopieën te meten. In enkele gevallen kan de 10 kwantitatieve bepaling van het boodschapper RNA eenvoudiger en handiger zijn dan de kwantificering van het gen produkt zelf. Als voorbeeld kan het c-myc oncogen, een labiel proteïne dat gemakkelijk door middel van warmte kan worden gecoaguleerd,worden genoemd.For example, at some stage of fetal development, the c-myc oncogene is copied rapidly, while at another stage it is very slowly copied. The degree of amplification is often correlated with the expression level of the gene, although the latter may increase significantly without the former. In such cases, the role of an oncogene is best determined by measuring its level of expression rather than the number of copies. In some cases, the quantitative determination of the messenger RNA may be simpler and more convenient than the quantification of the gene product itself. As an example, c-myc oncogene, a labile protein that can be easily coagulated by heat, can be mentioned.
15 De methode volgens de uitvinding kan ook worden gebruikt voor het identificeren van numerieke chromosomale afwijkingen zoals het Down syndroom. Bij de prenatale diagnostiek is het ook mogelijk om te bepalen of de foetus afwijkingen vertoont, d.w.z. homozygoot voor een of ander recessief gen.is.The method of the invention can also be used to identify numerical chromosomal abnormalities such as Down syndrome. In prenatal diagnosis, it is also possible to determine whether the fetus has abnormalities, i.e. homozygous for some recessive gene.
2020
De methode volgens de uitvinding en de nucleinezuur reagentia die bij deze methode worden gebruikt worden hieronder uitvoeriger beschreven.The method of the invention and the nucleic acid reagents used in this method are described in more detail below.
Voorbeeld 1 25Example 1 25
Kwantificering van een versterkt oncogén (a) Nucleinezuur reagentia en hun bereiding 30 STANDAARD SNUFFELMOLECULEN ·Quantification of an amplified oncogene (a) Nucleic acid reagents and their preparation 30 STANDARD SNUFFLE MOLECULES ·
Cel standaard nucleinezuur. Het c-Ki-rasI gen is aanwezig in alle menselijke cellen. De snuffelmolecuul paren voor sandwich hybridisatie werden bereid door subcloneren van het HindiII fragment van het 35 c-Ki-rasI gen, dat een lengte van 3.8 kb meet, en waarvan de 8700483Cell standard nucleic acid. The c-Ki-rasI gene is present in all human cells. The snuff molecule pairs for sandwich hybridization were prepared by subcloning the Hindii fragment of the 35 c-Ki rasI gene, measuring 3.8 kb in length, of which the 8700483
tl Wtl W
873Q2 -8- restrictiekaart beschreven is door Chang et al., PNAS 79, pp. 4848-52, 1982. Het fragment is beschikbaar b.v. gedoneerd in het pBR322 plasmide (ATCC 41032) en kan b.v. worden verkregen uit de ATCC cultuur collectie.873Q2-8 restriction map is described by Chang et al., PNAS 79, pp. 4848-52, 1982. The fragment is available e.g. donated in the pBR322 plasmid (ATCC 41032) and may e.g. are obtained from the ATCC culture collection.
55
Verdere behandeling van het cel standaard nucleinezuur. De hiervoor beschreven pBR322 cloon werd behandeld met BglII en HindlII restrictie enzymen en de resulterende fragmenten werden geïsoleerd uit de agarose gel; dicht bij elkaar gelegen gezuiverde fragmenten werden gesub-10 cloneerd in twee geschikte vectoren voor de bereiding van de detector en de vangende snuffelmoleculen.Further treatment of the cell standard nucleic acid. The previously described pBR322 clone was treated with BglII and HindII restriction enzymes and the resulting fragments isolated from the agarose gel; closely spaced purified fragments were subcloned into two suitable vectors for the preparation of the detector and the scavenging molecules.
Standaard detector snuffelmolecuul. Een BglII-BglII fragment waarvan de gemeten lengte ongeveer 1,1 kb was, werd gesubcloneerd in de 15 BamHI restrictie enzymplaats van het pBR322 plasmide en gemerkt door 125 middel van een markeringstranslatie jnet I gemerkt dCTP.Standard detector sniffing molecule. A BglII-BglII fragment, the measured length of which was about 1.1 kb, was subcloned into the BamHI restriction enzyme site of the pBR322 plasmid and labeled by 125 by means of a marker translation Inet dCTP.
Standaard vangend snuffelmolecuul. Het BglII-HindlII fragment van ongeveer 0,5 kb werd in de M13 mplO en mpll faag vectoren gevoegd 20 tussen de restrictieplaatsen van de BamHI en HindlII restrictie enzymen en gefixeerd aan een nitrocellulose filter (150 ng DNA/dia 1 cm).Standard catching sniffing molecule. The approximately 0.5 kb BglII-HindII fragment was inserted into the M13 mplO and mplI phage vectors between the restriction sites of the BamHI and HindII restriction enzymes and fixed on a nitrocellulose filter (150 ng DNA / dia 1 cm).
TEST SNUFFELMOLECULEN 25TEST SNUFFLE MOLECULES 25
Test nucleinezuur. Een snuffelmolecuul paar voor de sandwich hybridisatie werd bereid uit een gedoneerd c-myc gen dat bij voorbeeld verkregen kan worden uit de ATCC cultuur collectie (ATCC 41010).Test nucleic acid. A snuff molecule pair for the sandwich hybridization was prepared from a donated c-myc gene, which can be obtained, for example, from the ATCC culture collection (ATCC 41010).
De restrictiekaart van het gen is beschreven door Watt et al., 30 PNAS 80. pp, 6307-6311, 1983.The gene restriction map is described by Watt et al., PNAS 80. pp, 6307-6311, 1983.
Verdere behandeling van het test nucleinezuur. Het c-myc gen werd behandeld met HindlII, Xbal en PstI restrictie enzymen en de fragmenten werden geïsoleerd uit de agarose gel, gezuiverd en gesubcloneerd in 35 geschikte vectoren teneinde dê detector en vanger snuffelmoleculen te bereiden.Further treatment of the test nucleic acid. The c-myc gene was treated with HindIII, Xbal and PstI restriction enzymes and the fragments isolated from the agarose gel, purified and subcloned into suitable vectors to prepare the detector and catcher sniffing molecules.
8700483 Μ -9- 873028700483 Μ -9- 87302
Tesfc detector snuffelmolecuul. De enkelstrengs staarten van het HindlII-Xbal restrictie fragment van het e-myc gen, waarvan de gemeten lengte 3,7 kb was, werden dubbelstrengs gemaakt door middel van DNA polymerase. De Hind III koppelaars werden ingevoegd door 5 middel van T4-DNA-ligase in de resulterende recht afgesneden DNA fragmenten; na phenol extractie werd het DNA behandeld met het HindlII restrictie enzym. Het DNA fragment werd vervolgens gedoneerd in het pBR322 plasmide op de restrictieplaats van het HindlII * restrictie enzym en gemerkt door middel van markeringstranslatie met 10 125I gelabeld dCTP.Tesfc detector sniffing molecule. The single stranded tails of the HindII-Xbal restriction fragment of the e-myc gene, the measured length of which was 3.7 kb, were double stranded by DNA polymerase. The Hind III linkers were inserted through T4 DNA ligase into the resulting straight cut DNA fragments; after phenol extraction, the DNA was treated with the HindII restriction enzyme. The DNA fragment was then donated into the pBR322 plasmid at the restriction site of the HindIII * restriction enzyme and labeled by marker translation with 125 I-labeled dCTP.
Test vanger snuffelmolecuul. Het 1,1 kb Xbal-PstI fragment van het c-myc gen werd gedoneerd in de M13 mplO en mpll faag clonerings vectoren tussen de restrictieplaatsen van de Xbal en PstI restrictie 15 enzymen en gefixeerd aan het nitrocellulose filter (150 ng DNA/dia 1 cm).Test catcher sniffing molecule. The 1.1 kb Xbal-PstI fragment of the c-myc gene was donated in the M13 mplO and mpll phage cloning vectors between the restriction sites of the Xbal and PstI restriction enzymes and fixed to the nitrocellulose filter (150 ng DNA / slide 1) cm).
(b) Bepaling van de standaard curve 20 Het monster dat werd gebruikt voor de bepaling van de standaard curve bestond uit een alkalisch gedenatureerde pBR322 cloon van het c-myc gen. De sandwich hybridisatie oplossing waaraan de hiervoor vermelde test snuffelmoleculen werden taegevoegd, bestond uit 4 x SSC, 1 x Denhardt oplossing, 200 ug/ml haring sperma DNA en 0,2 % SDS.(b) Determination of the standard curve. The sample used for the determination of the standard curve consisted of an alkaline denatured pBR322 clone of the c-myc gene. The sandwich hybridization solution to which the aforementioned test sniffing molecules were added consisted of 4 x SSC, 1 x Denhardt solution, 200 µg / ml herring sperm DNA and 0.2% SDS.
25 De hybridisatie vond plaats bij 65°C gedurende 17 - 19 uren, waarna de filters werden gewassen in de wasoplossing (0,1 x SSC 0,2 % SDS) bij 50°C. Het identificatiemiddel dat bevestigd was aan de sandwich hybriden werd daarna in de gammateller geteld.The hybridization took place at 65 ° C for 17-19 hours, after which the filters were washed in the wash solution (0.1 x SSC 0.2% SDS) at 50 ° C. The identifier attached to the sandwich hybrids was then counted in the gamma counter.
30 - 8700433 » » 87302 -10-30 - 8700433 »» 87302 -10-
Tabel 1Table 1
Monster tpm_ moleculen/test c-myc-filter 5 ___ 0 40 106 75 5 x 106 190 107 340 10 108 2200 (c) Bepaling van het aantal genen 15 De monsters bevatten 1) cellen van een menselijke placenta en 2)Sample tpm_ molecules / test c-myc filter 5 ___ 0 40 106 75 5 x 106 190 107 340 10 108 2200 (c) Determination of the number of genes 15 The samples contained 1) cells of a human placenta and 2)
Cola 320 cellen, die b.v. verkregen kunnen worden van de ATCC cultuur collectie (ATCC-CCC220). DNA werd geïsoleerd uit beide monsters, en dezelfde hoeveelheid cel DNA, gedenatureerd door koken met loog, werd aan beide tests toegevoegd. Alkalische denaturering hydroly-20' seerde ieder in het monster aanwezige RNA.Cola 320 cells, e.g. can be obtained from the ATCC culture collection (ATCC-CCC220). DNA was isolated from both samples, and the same amount of cell DNA, denatured by caustic boiling, was added to both tests. Alkaline denaturation hydrolysed any RNA present in the sample.
De test werd uitgevoerd door het toevoegen aan elk monster van zowel het c-myc al het c-Ki-rasI filter en de twee gelabelde reagentia, waardoor zowel de standaard als de test DNA voor elk monster kon 25 worden gemeten. Op basis van de c-Ki-rasI bepalingen werd iedere test bevonden dezelfde hoeveelheid DNA te bevatten waaruit kan worden afgeleid dat het c-myc gen in Colo 320 cellen in ongeveer 16 - 20 hoger kopie aantal aanwezig is dan in de normale situatie.The test was performed by adding to each sample both the c-myc and the c-Ki-rasI filter and the two labeled reagents, allowing both standard and test DNA to be measured for each sample. Based on the c-Ki-ras I assays, each test was found to contain the same amount of DNA from which it can be deduced that the c-myc gene is present in Colo 320 cells in approximately 16-20 higher copy number than in the normal situation.
De resultaten zijn weergegeven in Tabel 2.The results are shown in Table 2.
3030
Tabel 2 ___Table 2 ___
Monster c-Ki-rasI filter _c-myc filter _tpm*_tpm*_aantalSample c-Ki-rasI filter _c-myc filter _tpm * _tpm * _number
Menselijke placentacellen 486 340 107 35 Colo 320 cellen_432_3205_1.6 x 10° 8700483 φ. ·+ -11- 87502 * de verkregen waarneming uit het blanke filter werd van de waarnemingen afgetrokken.Human placental cells 486 340 107 35 Colo 320 cells_432_3205_1.6 x 10 ° 8700483 φ. + -11- 87502 * the resulting blank filter observation was subtracted from the observations.
VOORBEELD 2 5EXAMPLE 2 5
Kwantificering van versterkt genQuantification of amplified gene
(a) Nucleinezuur reagentia en hun bereiding 10 STANDAARD SNUFFELMOLECULEN(a) Nucleic acid reagents and their preparation 10 STANDARD SNUGLE MOLECULES
Cel standaard nucleinezuur. Het controle nucleinezuur werd genomen uit het promotor gebied van het matallothionine gen in de muis, d.w.z. het MT'gen, en het DNA dat zich in de onmiddelijke nabijheid in de 15 afleesvolgorde bevond. De struktuur van het MT gen is beschreven door Pavlakis en Hamer,PNAS 80, pp. 397-401, 1983. Het referentie nucleinezuur fragment is beschikbaar b.v. gedoneerd in de pBPV-MN.Tneo(432-12)vector (ATCC 37224) en kan b.v. worden verkregen uit de ATCC cultuur collectie.Cell standard nucleic acid. The control nucleic acid was taken from the promoter region of the mouse matallothionin gene, i.e., the MT gene, and the DNA in immediate proximity in the reading sequence. The structure of the MT gene has been described by Pavlakis and Hamer, PNAS 80, pp. 397-401, 1983. The reference nucleic acid fragment is available, e.g. donated in the pBPV-MN.Tneo (432-12) vector (ATCC 37224) and may e.g. are obtained from the ATCC culture collection.
2020
Verdere behandeling van het cel standaard nucleinezuur. Het hiervoor beschreven MT gen werd behandeld met Kpnl, BglII en EcoRI restrictie enzymen voor het subcloneren in het pAT153 plasmide. De Kpnl staart werd omgezet in een HindlII staart met een brugvormer.Further treatment of the cell standard nucleic acid. The MT gene described above was treated with Kpnl, BglII and EcoRI restriction enzymes for subcloning into the pAT153 plasmid. The Kpnl tail was converted into a HindlII tail with a bridge former.
2525
Standaard detector snuffelmolecuul. Het EcoRI-Kpnl-(HindlII) fragment met een lengte van ongeveer 1,2 kb, en gelokaliseerd in de aflees- richting van het promotor gebied van het metallothionine gen werd gedoneerd aan het pAT 153 plasmide tussen de restrictieplaatsen 30 van de EcoRI en HindlII restrictie enzymen en gemerkt door middel van 32 een markeringstranslatie met P-gemerkte nucleoside trifosfaten.Standard detector sniffing molecule. The EcoRI-Kpn1 (HindlII) fragment about 1.2 kb in length, located in the reading direction of the promoter region of the metallothionine gene, was donated to the pAT 153 plasmid between the restriction sites of the EcoRI and HindlII. restriction enzymes and labeled by 32 a marker translation with P-labeled nucleoside triphosphates.
Standaard vanger snuffelmolecuul. Het 0,8 kb Kpnl-BglII fragment dat het promotor gebied van het metallothionine gen en het gebied in 35 de afleesrichting hiernaar gelegen, bevat, werd gedoneerd in de 9700483 -12- 87302 M13 mpl8 en M13 mpl9 faag vectoren tussen de restrictieplaatsen van de Kpnl en BamHI restrictie enzymen en gefixeerd aan het nitrocellulose filter.Standard catcher sniffing molecule. The 0.8 kb Kpnl-BglII fragment containing the promoter region of the metallothionine gene and the region in the reading direction thereto was donated in the 9700483 -12- 87302 M13 mpl8 and M13 mpl9 phage vectors between the restriction sites of the Kpnl and BamHI restriction enzymes and fixed to the nitrocellulose filter.
5 TEST SNUFFELMOLECULEN-5 TEST SNUFFLE MOLECULES-
Test nucleinezuur. Het snuffelmolecuul paar voor de sandwich hybridisatie test werd bereid door toepassing van het commercieel beschikbare pMTVdhfr plasmide (Bethesda Research Laboratories; 10 product No. 5369SS), waarvan de struktuur beschreven is door Lee et al., Nature 294, pp. 228-232, 1981.Test nucleic acid. The sniff molecule pair for the sandwich hybridization assay was prepared using the commercially available pMTVdhfr plasmid (Bethesda Research Laboratories; 10 product No. 5369SS), the structure of which is described by Lee et al., Nature 294, pp. 228-232, 1981.
Verdere behandeling van test nucleinezuur. Het pMTVdhfr plasmide dat cDNA van het dihydrofolaat reductase (DHFR) gen bevatte, werd 15 behandeld met HindlII en BglII restrictie enzymen.Further treatment of test nucleic acid. The pMTVdhfr plasmid containing cDNA of the dihydrofolate reductase (DHFR) gene was treated with HindIII and BglII restriction enzymes.
Test detector snuffelmolecuul. Het HindlII-BglII fragment met een lengte van 0,75 kb en corresponderend met het gebied coderend voor het DHFR gen van het pMTVdhfr plasmide, werd in de plasmide pAT153 20 vector ingevoegd tussen de restrictieplaatsen van de HindlII enTest detector sniffing molecule. The HindII-BglII fragment, 0.75 kb in length and corresponding to the region encoding the DHFR gene of the pMTVdhfr plasmid, was inserted into the plasmid pAT153 vector between the restriction sites of the HindII and
BamHI restrictie enzymen en gemerkt door middel van een markerings-32 translatie met P-gemerkte nucleoside trifosfaten.BamHI restriction enzymes and labeled by a marker-32 translation with P-labeled nucleoside triphosphates.
Test vanger snuffelmolecuul. Een HindlII fragment van 1,4 kb, 25* gehaald uit het MMTV gen gebied van het pMTVdhfr plasmide, werd gedoneerd in de M13 mpl8 en M13 mpl9 faag vectoren.Test catcher sniffing molecule. A 1.4 kb HindIII fragment, 25 * extracted from the MMTV gene region of the pMTVdhfr plasmid, was donated into the M13 mpl8 and M13 mpl9 phage vectors.
(b) Bepaling van de standaard curve 30 Het voor de test gebruikte monster was gezuiverd DNA uit het pMTVdhfr plasmide. De test zelf werd uitgevoerd zoals beschreven in voorbeeld lb met als uitzondering dat een vloeistof scintillatieteller werd gebruikt voor het tellen. De resulterende standaard curve is weergegeven in Tabel 3.(b) Determination of the standard curve. The sample used for the test was purified DNA from the pMTVdhfr plasmid. The test itself was performed as described in Example 1b except that a liquid scintillation counter was used for counting. The resulting standard curve is shown in Table 3.
670 0483 87302 -13-670 0483 87302 -13-
Tabel 3Table 3
Monster_ tpm_~ moleculen/test DFRH filter 5____;__ 0 17 106 45 3 x 106 79 10 107 210 (c) Bepaling van het aantal genen 15 Cellijnen die waren getransfecteerd met verschillende hoeveelheden cDNA corresponderend met het mRNA van het DHFR gen werden gekweekt op eetcultuur platen en als monster gebruikt. De cellen werden gelyseerd onder toepassing van natrium dodecyl sulfaat en hun DNA werd afgeschoven door het door een fijne hypodermische naald van een 20 infectiespuit te persen. Een 250 x/1 monster overeenkomende met ongeveer 10^ cellen werd uit homogenaat genomen en 50 iA NaOH werd toegevoegd. Het monster werd gekookt en geneutraliseerd met azijnzuur en het hybridisatiemengsel. Het totale volume was 0,5 ml. Alle hiervoor beschreven snuffelmoleculen werden gelijktijdig toegevoegd en 25 een zogenaamd blancofilter werd toegevoegd als achtergrond controle. Hybridisatie, wassen en het tellen van de merken werden uitgevoerd zoals in Voorbeeld lb met als uitzondering dat een vloeistof scintillatieteller werd gebruikt voor de telling. De resultaten zijn weergegeven in Tabel 4.Sample_rpm_ ~ molecules / test DFRH filter 5 ____; __ 0 17 106 45 3 x 106 79 10 107 210 (c) Determination of the number of genes 15 Cell lines transfected with different amounts of cDNA corresponding to the mRNA of the DHFR gene were grown on food culture plates and used as sample. The cells were lysed using sodium dodecyl sulfate and their DNA was sheared by squeezing it through a fine hypodermic needle of an infection syringe. A 250 x / 1 sample corresponding to about 10 4 cells was taken from homogenate and 50 IA NaOH was added. The sample was boiled and neutralized with acetic acid and the hybridization mixture. The total volume was 0.5 ml. All the previously described sniffing molecules were added simultaneously and a so-called blank filter was added as background control. Hybridization, washing and mark counting were performed as in Example 1b except that a liquid scintillation counter was used for the counting. The results are shown in Table 4.
8700433 -14- 873028700433-14- 87302
Tabel 4Table 4
Cel MT Aantal cellen _OHFR__ tpm* in het monster tpm* Aantal moleculen Aantal 5 in het monster kopieënCell MT Number of cells _OHFR__ rpm * in the sample rpm * Number of molecules Number 5 in the sample copies
Controle cel (geen DHFR-cDNA) 182 1,05 x 106 21 < 106 10 Lijn I 138 0,9 x 106 80 3 x 10ó 3Control cell (no DHFR cDNA) 182 1.05 x 106 21 <106 10 Line I 138 0.9 x 106 80 3 x 10³ 3
Lijn II 210 1,25 x 106 732 5 x 107 40 * tpm: de afgelezen waarde verkregen bij het blanke filter is 15 afgetrokkenLine II 210 1.25 x 106 732 5 x 107 40 * rpm: the reading obtained from the blank filter has been subtracted 15
Het MT gen is een intern identificatiemiddel dat het aantal cellen, aanwezig in een monster meet. De resultaten tonen aan dat in deze test 10^ cellen een MT-specifiek signaal van 165 + 20 tpm gaven. De DHFR 20 reagentia meten de hoeveelheid DHFR-cDNA. Het aantal cellen werd bepaald uit het MT-specifieke signaal. Het was derhalve mogelijk om het aantal DHFR-cDNA kopieën in verschillende cellijnen te bepalen zoals weergegeven in Tabel 4.The MT gene is an internal identifier that measures the number of cells present in a sample. The results show that in this test 10 ^ cells gave an MT specific signal of 165 + 20 rpm. The DHFR 20 reagents measure the amount of DHFR cDNA. The number of cells was determined from the MT-specific signal. It was therefore possible to determine the number of DHFR cDNA copies in different cell lines as shown in Table 4.
25 VOORBEELD 325 EXAMPLE 3
Kwantificering van het boodschapper DNAQuantification of the messenger DNA
(a) Nucleinezuur reagentia en hun bereiding 30(a) Nucleic acid reagents and their preparation 30
Door toepassing van de test snuffelmoleculen, beschreven in Voorbeeld 2, is het ook mogelijk de hoeveelheid mRNA, afgeleid uit DHFR-cDNA, te meten. De struktuur van het pMTVdhfr plasmide is zodanig dat de transcriptie van het DHFR gen begint bij de MMTV promotor.De 35 resulterende boodschappers zijn ongeveer 1,0 kb lang. Hiervan zijn 8 7 0 ö 4 S 3 87302 -15- ongeveer 0,25 kb afkomstig van het MMTV promotor gebied en de rest' van DHFR-cDNA (Lee et al., Nature 294, pp. 228-232, 1981).Using the test sniffing molecules described in Example 2, it is also possible to measure the amount of mRNA derived from DHFR cDNA. The structure of the pMTVdhfr plasmid is such that transcription of the DHFR gene begins at the MMTV promoter. The resulting messengers are approximately 1.0 kb in length. Of these, 8 7 0 4 S 3 87 302-15 are about 0.25 kb from the MMTV promoter region and the remainder from DHFR cDNA (Lee et al., Nature 294, pp. 228-232, 1981).
STANDAARD SNUFFELMOLECULEN 5STANDARD SNUFFLE MOLECULES 5
Het cel standaard nucleinezuur, de standaard detector en het standaard vanger snuffelmolecuul waren zoals beschreven in Voorbeeld 2.The cell standard nucleic acid, the standard detector and the standard catcher molecule were as described in Example 2.
TEST SNUFFELMOLECULENTEST SNUFFLE MOLECULES
1010
Het test nucleinezuur, de test detector en het test vanger snuffelmolecuul waren zoals beschreven in Voorbeeld 2.The test nucleic acid, the test detector and the test catcher sniff molecule were as described in Example 2.
(b) Bepaling van de standaard curve 15 .(b) Determination of the standard curve 15.
Het voor de standaard curve bepaling gebruikte monster bestond uit boodschapper RNA overeenkomend met het dihydrofolaat reductase gen geproduceerd door middel van in vitro transcriptie. Het voor de transcriptie benodigde DNA werd bereid door middel van subclonering 2Q van het 1,4 kb Hind III fragment van de MMTV promotor van het p MTVdhfr plasmide en het 0,75 kb HindïII-BglII fragment (DHFR-cDNA) naast elkaar gelegen in het pSP64 plasmide (Promega Biotec) tussen de restrictieplaatsen van de HindiII en BamHI restrictie enzymen.The sample used for the standard curve assay consisted of messenger RNA corresponding to the dihydrofolate reductase gene produced by in vitro transcription. The DNA required for transcription was prepared by subcloning 2Q of the 1.4 kb Hind III fragment of the MMTV promoter of the p MTVdhfr plasmid and the 0.75 kb HindII-BglII fragment (DHFR cDNA) located side by side in the pSP64 plasmid (Promega Biotec) between the restriction sites of the Hindii and BamHI restriction enzymes.
Het RNA monster werd bewaard in 0,2 % SDS waterige oplossing.The RNA sample was stored in 0.2% SDS aqueous solution.
2525
De sandwich hybridisatie test werd uitgevoerd zoals beschreven in de Voorbeelden lb en 2b maar de denaturatie werd weggelaten.The sandwich hybridization test was performed as described in Examples 1b and 2b but the denaturation was omitted.
8700483 i > -16- 873028700483> -16- 87302
Tabel 5Table 5
Monster_ tpmSample_rpm
Moleculen/test DHFR filter 5 ____ 0 20 5 x 106 65 107 130 5 x 107 390 10 108 653 (c) Bepaling van het aantal boodschapper RNA moleculen 15 Het aantal boodschapper RNA moleculen overeenkomend met het DHFR gen werd bepaald uit de in Voorbeeld 2 beschreven cellijnen.Molecules / test DHFR filter 5 ____ 0 20 5 x 106 65 107 130 5 x 107 390 10 108 653 (c) Determination of the number of messenger RNA molecules The number of messenger RNA molecules corresponding to the DHFR gene was determined from the example shown in Example 2 described cell lines.
De cellen werden gelyseerd onder toepassing van natrium dadecyl sulfaat en hun DNA licht af geschoven door het persen door een fijne 20 hypodermische naald van een injectiespuit. Een 250 ul monster van het homogenaat werd genomen overeenkomende met ongeveer 5 x 10^ cellen. Het homogenaat werd daarna toegevoegd aan de sandwich hybridisatie test zonder denaturatie. De sandwich hybridisatie vond plaats zoals gegeven in de Voorbeelden 2c en lb, met als uitzondering 25 dat alleen de DHFR snuffelmoleculen werden toegevoegd aan de hybridisatie oplossing. In een parallel monster van 250 ajI homogenaat werd het cel aantal bepaald onder toepassing van het MT snuffel-molecuul zoals beschreven in Voorbeeld 2c.The cells were lysed using sodium dadecyl sulfate and their DNA lightly sheared by pressing through a fine hypodermic syringe needle. A 250 µl sample of the homogenate was taken corresponding to approximately 5 x 10 4 cells. The homogenate was then added to the sandwich hybridization test without denaturation. The sandwich hybridization took place as given in Examples 2c and 1b, with the exception that only the DHFR sniffing molecules were added to the hybridization solution. In a parallel sample of 250 µl homogenate, the cell number was determined using the MT sniffing molecule as described in Example 2c.
30 De resultaten zijn weergegeven in Tabel 6.The results are shown in Table 6.
8700403 -17- 873028700403-17- 87302
Tabel 6Table 6
Cel MT Cel aantal in _ DHFR__ tpm* het monster tpm* Aantal moleculen Aantal per 5 in het monster celCell MT Cell number in _ DHFR__ rpm * the sample rpm * Number of molecules Number per 5 in the sample cell
Lijn I 380 3,5 x 106 1465 3,45 x 108 100Line I 380 3.5 x 106 1465 3.45 x 108 100
Lijn II 430 4,2 x 106 4800 2 x 109 500 10 *tpm: dé aflezing verkregen bij het blanco filter is afgetrokken.Line II 430 4.2 x 106 4800 2 x 109 500 10 * rpm: the reading obtained from the blank filter has been subtracted.
De resultaten toonden aan dat de cellijn I per cel ongeveer 100 boodschapper RNA moleculen uit de DHFR genen produceerde en cellijn II 15 ongeveer 500 boodschapper RNA moleculen uit de DHFR genen produceerde.The results showed that cell line I per cell produced about 100 messenger RNA molecules from the DHFR genes and cell line II produced about 500 messenger RNA molecules from the DHFR genes.
VOORBEELD 4EXAMPLE 4
Kwantificering van versterkt gen door middel van oplossing -hybridisatie 20 (a) Nuclêinezuur reagentia en hun bereiding STANDAARD SNUFFELMOLECULEN ' 25 Het cel standaard nucleinezuur, de standaard detector en het standaard vanger snuffelmolecuul waren zoals beschreven in Voorbeeld 2.Quantification of amplified gene by solution hybridization 20 (a) Nucleic acid reagents and their preparation STANDARD SNUFF MOLECULES The cell standard nucleic acid, standard detector and standard catcher molecule were as described in Example 2.
Het 1,2 kb EcoRI-Kpnl-(HindlII) fragment in pAT153 werd gemerkt door 125 middel van markeringstranslatie met I-gemerkte deoxycytidine.The 1.2 kb EcoRI-Kpnl (HindIII) fragment in pAT153 was labeled by 125 by marker translation with I-labeled deoxycytidine.
De 0,8 kb Kpnl-BglII fragmenten in M13 mpl8 en M13 mpl9 werdenThe 0.8 kb Kpnl-BglII fragments in M13 mpl8 and M13 mpl9 were
30 TM30 TM
gemodificeerd met biotin onder gebruik making van het Photoprobe réagens (Vector Laboratories, CA, USA, produkt No SP-1000); 8700433 .modified with biotin using the Photoprobe reagent (Vector Laboratories, CA, USA, product No SP-1000); 8700433.
87302 -18-87302 -18-
TEST SNUFFELMOLECULENTEST SNUFFLE MOLECULES
Het test nucleinezuur, de test detector en het test vangend snuffelmolecuul waren zoals beschreven in Voorbeeld 2. Het 5 0,75 kb HindlII-BglII fragment in pAT153 werd gemerkt met 125 I-gemerkt deoxycytidine. De 1,4 kb HindlII fragmenten inThe test nucleic acid, the test detector and the test capture snuff molecule were as described in Example 2. The 0.75 kb HindIII-BglII fragment in pAT153 was labeled with 125 I-labeled deoxycytidine. The 1.4 kb HindII fragments in
M13 mpl8 en M13 mpl9 werdem gebiotinyleerd onder gebruik making TMM13 mpl8 and M13 mpl9 were biotinylated using TM
van Photoprobe zoals hiervoor.from Photoprobe as before.
10 (b) Bepaling van de standaard curve10 (b) Determination of the standard curve
Een cel standaard curve werd bereid onder toepassing van een bekende hoeveelheid cellen, waarvan het hybridisatie signaal gemeten werd onder toepassing van de standaard snuffelmoleculen 15 die het MT-gen herkennen. Een test nucleinezuur standaard curve werd bereid met het pMTVdhfr plasmide en de test snuffelmoleculen die dit plasmide herkennen. Hybridisaties worden uitgevoerd in 200 1 van een oplossing die bestond uit 0,6 M NaCl, 20 mMA cell standard curve was prepared using a known amount of cells, the hybridization signal of which was measured using the standard sniffing molecules recognizing the MT gene. A test nucleic acid standard curve was prepared with the pMTVdhfr plasmid and the test sniffing molecules recognizing this plasmid. Hybridizations are performed in 200 L of a solution consisting of 0.6 M NaCl, 20 mM
fosfaatbuffer, pH 7,5, ImM EDTA, 4 % polyethyleen glycol (PEG 6000) 20 gedurende 1,5 uur bij 70°C. Na de reaktie werden 50 1 streptavidin- agarose (Bethesda Research Laboratories, Maryland, USA, produkt No. 5943SA), en 1 M NaCl, 10 mM natriumfosfaat, pH 7,5, 1 mM EDTA toegevoegd tot een eindvolume van 500 1.. De hybriden werden verzameld op de streptavidin - agarose bij 37°C gedurende 15 min.phosphate buffer, pH 7.5, ImM EDTA, 4% polyethylene glycol (PEG 6000) for 1.5 hours at 70 ° C. After the reaction, 50 l of streptavidin agarose (Bethesda Research Laboratories, Maryland, USA, product No. 5943SA), and 1 M NaCl, 10 mM sodium phosphate, pH 7.5, 1 mM EDTA were added to a final volume of 500 l. The hybrids were collected on the streptavidin agarose at 37 ° C for 15 min.
25 De agarose werd eenmaal gewassen gedurende 5 min. met de gebuf.ferde 1 M NaCl oplossing bij 37°C en tweemaal gedurende 2 min. met 15 mM NaCl, 1,5 mM natriumcitraat bij 55°C. De hoeveelheid gebonden hybriden werd bepaald door de agarose te meten in een gamma teller (Syvanen et al., Nucleic Acids Res. 14, 5037-5048, 1966).The agarose was washed once for 5 min with the buffered 1 M NaCl solution at 37 ° C and twice for 2 min with 15 mM NaCl, 1.5 mM sodium citrate at 55 ° C. The amount of bound hybrids was determined by measuring the agarose in a gamma counter (Syvanen et al., Nucleic Acids Res. 14, 5037-5048, 1966).
30 De resultaten zijn weergegeven in de tabellen 7 en 8.30 The results are shown in Tables 7 and 8.
8700483 -19- 873028700483-19- 87302
Tabel 7Table 7
Monster_ tpm_ _ cellen/test MT snuffelmoleculen 5 _^_____ 0,8 x IQ6 162 1,6 x 106 216 3 x 106 298 10Sample_ rpm_ _ cells / test MT sniffing molecules 5 _ ^ _____ 0.8 x IQ6 162 1.6 x 106 216 3 x 106 298 10
Tabel 8Table 8
Monster_ tpm_ moleculen/test DHFR snuffelmoleculen 15 __:_;___ IQ6 148 5 x 106 .394 5 x 107 2240 20 (c) Bepaling van het aantal genenSample_rpm_ molecules / test DHFR sniffing molecules 15 __: _; ___ IQ6 148 5 x 106 .394 5 x 107 2240 20 (c) Determination of the number of genes
Monsters van de in Voorbeeld 2 beschreven cellijnen werden op analoge wijze behandeld, met uitzondering dat het volume per monster dat 6 25 met ongeveer 2 x 10 cellen overeenkomt, 125 1 was. De bepalingen van het cellen aantal en het aantal test nucleinezuur moleculen werden uitgevoerd in afzonderlijke buizen door middel, van het toevoegen van het celmonster, de geschikte detector en vanger snuffelmoleculen, en de componenten van het hybridisatiemengsel tot een 30 eindvolume van 200 1. Controlebepalingen zonder cel standaard of test DNA werden opgenomen. Hybridisatie, verzameling van hybriden, wassen en het meten werd uitgevoerd zoals beschreven in voorbeeld 4b.Samples of the cell lines described in Example 2 were treated analogously, except that the volume per sample corresponding to about 2 x 10 cells was 125 liters. The cell number and the number of test nucleic acid molecules were determined in separate tubes by adding the cell sample, the appropriate detector and catcher sniffing molecules, and the hybridization mixture components to a final volume of 200 l. Control assays without cell standard or test DNA were included. Hybridization, hybridization, washing and measuring were performed as described in Example 4b.
De resultaten werden afgelezen uit standaard curven die parallel werden bereid zoals beschreven in Voorbeeld 4b. De resultaten zijn 35 vermeld in Tabel 9.The results were read from standard curves prepared in parallel as described in Example 4b. The results are shown in Table 9.
8700433 5 v -20- 873028700433 5V -20- 87302
Tabel 9Table 9
Cel _MT_;_ DHFR_ tpm* Aantal cellen in tpm* Aantal moleculen Aantal het monster in het monster kopieënCell _MT _; _ DHFR_ rpm * Number of cells in rpm * Number of molecules Number of the sample in the sample copies
Controle cel 253 2,3 x 10^ 73 < 10^Control cell 253 2.3 x 10 ^ 73 <10 ^
Lijn I 210 1,5 x 106 233 3,8 x 106 3Line I 210 1.5 x 106 233 3.8 x 106 3
Lijn II 237 2,1 x 106 3059 8,8 x 107 42 *tpm: waarden van de controlebepalingen zonder cel standaard of test nucleinezuur zijn afgetrokken.Line II 237 2.1 x 106 3059 8.8 x 107 42 * rpm: values of the controls without cell standard or test nucleic acid have been subtracted.
Claims (13)
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
FI860836A FI76119C (en) | 1986-02-27 | 1986-02-27 | Quantitative determination of nucleic acid molecules and reagent packaging used in the process |
FI860836 | 1986-02-27 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
NL8700483A true NL8700483A (en) | 1987-09-16 |
NL195097C NL195097C (en) | 2004-03-17 |
Family
ID=8522222
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
NL8700483A NL195097C (en) | 1986-02-27 | 1987-02-26 | Quantification of nucleic acid molecules and the reagent set used. |
Country Status (26)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JPS62205800A (en) |
KR (1) | KR870008033A (en) |
AT (1) | AT393511B (en) |
AU (1) | AU603562B2 (en) |
BE (1) | BE1001168A4 (en) |
CA (1) | CA1287558C (en) |
CH (1) | CH675593A5 (en) |
DD (1) | DD270383A5 (en) |
DE (1) | DE3706285A1 (en) |
DK (1) | DK174784B1 (en) |
ES (1) | ES2061411A6 (en) |
FI (1) | FI76119C (en) |
FR (1) | FR2594849B1 (en) |
GB (1) | GB2187283B (en) |
HU (1) | HU201808B (en) |
IE (1) | IE66904B1 (en) |
IL (1) | IL81695A (en) |
IS (1) | IS3197A7 (en) |
IT (1) | IT1202581B (en) |
LU (1) | LU86792A1 (en) |
NL (1) | NL195097C (en) |
NO (1) | NO175380C (en) |
NZ (1) | NZ219421A (en) |
PT (1) | PT84368B (en) |
SE (1) | SE468816B (en) |
ZA (1) | ZA871401B (en) |
Families Citing this family (18)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5714380A (en) | 1986-10-23 | 1998-02-03 | Amoco Corporation | Closed vessel for isolating target molecules and for performing amplification |
IL86724A (en) | 1987-06-19 | 1995-01-24 | Siska Diagnostics Inc | Method and kits for the amplification and detection of nucleic acid sequences |
EP0304845A3 (en) * | 1987-08-28 | 1991-03-06 | Profile Diagnostic Sciences Inc. | Method and kit for assaying gene expressions |
DE68921918T2 (en) * | 1988-05-09 | 1995-09-07 | Univ Temple | Procedure for predicting the effectiveness of antineoplastic treatment in individual patients. |
AU629845B2 (en) * | 1988-08-30 | 1992-10-15 | Abbott Laboratories | Detection and amplification of target nucleic acid sequences |
WO1990014440A1 (en) * | 1989-05-18 | 1990-11-29 | The United States Of America, Represented By The Secretary, United States Department Of Commerce | RNA PROBE FOR DETECTING c-fes mRNA |
US5232829A (en) * | 1989-09-29 | 1993-08-03 | Hoffmann-La Roche Inc. | Detection of chlamydia trachomatis by polymerase chain reaction using biotin labelled lina primers and capture probes |
DK138090D0 (en) * | 1990-06-06 | 1990-06-06 | Novo Nordisk As | DIAGNOSTIC METHOD OF ANALYSIS |
EP0534640B1 (en) * | 1991-09-23 | 1996-10-02 | Pfizer Inc. | Process for detecting specific mRNA and DNA in cells |
US6300058B1 (en) | 1992-01-29 | 2001-10-09 | Hitachi Chemical Research Center, Inc. | Method for measuring messenger RNA |
GB9210916D0 (en) * | 1992-05-21 | 1992-07-08 | Isis Innovation | Nucleic acid quantification |
US5580971A (en) * | 1992-07-28 | 1996-12-03 | Hitachi Chemical Company, Ltd. | Fungal detection system based on rRNA probes |
CA2140763A1 (en) * | 1992-07-28 | 1994-02-03 | Masato Mitsuhashi | Gene detection system |
ES2055661B1 (en) * | 1993-01-20 | 1995-03-01 | Univ Malaga | DETERMINATION OF THE GENE EXPRESSION BY SPECIFIC CAPTURE OF RNA AND ITS DIRECT QUANTIFICATION BY CAPILLARY ELECTROPHORESIS IN A FREE ZONE. |
GB9309966D0 (en) * | 1993-05-14 | 1993-06-30 | Nordion Int Inc | Detection of prostrate-specific antigen in breast tumors |
GB9415489D0 (en) * | 1994-08-01 | 1994-09-21 | Nordion Int Inc | Detection of prostate-specific antigen in amniotic fluid |
AT401062B (en) * | 1994-09-26 | 1996-06-25 | Immuno Ag | Method for quantifying nucleic acids |
EP2557178B1 (en) * | 2010-03-31 | 2014-11-26 | Yamaguchi Technology Licensing Organization, Ltd. | Method for detecting pneumonia causative bacteria using nucleic acid chromatography |
Family Cites Families (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4442203A (en) * | 1981-06-30 | 1984-04-10 | Massachusetts Institute Of Technology | Gene amplification assay for detecting tumor promoters |
FI63596C (en) * | 1981-10-16 | 1983-07-11 | Orion Yhtymae Oy | MICROBIA DIAGNOSIS FOERFARANDE SOM GRUNDAR SIG PAO SKIKTSHYBRIDISERING AV NUCLEINSYROR OCH VID FOERFARANDET ANVAENDA KOMBINATIONER AV REAGENSER |
DE3382068D1 (en) * | 1982-03-15 | 1991-01-31 | Univ Columbia | METHOD FOR INTRODUCING CLONED AMPLIFICABLE GENES IN EUKARYOTIC CELLS AND FOR THE PRODUCTION OF PROTEIN PRODUCTS. |
CA1252046A (en) * | 1982-11-04 | 1989-04-04 | Martin J. Cline | Methods for oncogenic detection |
FI71768C (en) * | 1984-02-17 | 1987-02-09 | Orion Yhtymae Oy | Enhanced nucleic acid reagents and process for their preparation. |
US4675283A (en) * | 1984-07-19 | 1987-06-23 | Massachusetts Institute Of Technology | Detection and isolation of homologous, repeated and amplified nucleic acid sequences |
FI72146C (en) * | 1985-01-02 | 1987-04-13 | Orion Yhtymae Oy | Procedure for Identifying Nucleic Acids. |
FR2583771B1 (en) * | 1985-06-21 | 1988-12-09 | Centre Nat Rech Scient | DNA SEQUENCES OF ARCHAEBACTERIA HOMOLOGATED TO ONCOGEN V-MYC, PROTEINS ENCODED BY THESE SEQUENCES, PROCESSES FOR OBTAINING SAME AND IMMUNOLOGICAL APPLICATIONS |
-
1986
- 1986-02-27 FI FI860836A patent/FI76119C/en not_active IP Right Cessation
-
1987
- 1987-02-25 JP JP62042442A patent/JPS62205800A/en active Granted
- 1987-02-26 PT PT84368A patent/PT84368B/en unknown
- 1987-02-26 ES ES08700776A patent/ES2061411A6/en not_active Expired - Fee Related
- 1987-02-26 IS IS3197A patent/IS3197A7/en unknown
- 1987-02-26 DK DK198700993A patent/DK174784B1/en not_active IP Right Cessation
- 1987-02-26 DE DE19873706285 patent/DE3706285A1/en active Granted
- 1987-02-26 CH CH756/87A patent/CH675593A5/de not_active IP Right Cessation
- 1987-02-26 IT IT19501/87A patent/IT1202581B/en active
- 1987-02-26 LU LU86792A patent/LU86792A1/en unknown
- 1987-02-26 AT AT431/87A patent/AT393511B/en not_active IP Right Cessation
- 1987-02-26 AU AU69275/87A patent/AU603562B2/en not_active Expired
- 1987-02-26 GB GB8704517A patent/GB2187283B/en not_active Expired - Lifetime
- 1987-02-26 NO NO870794A patent/NO175380C/en unknown
- 1987-02-26 IE IE49687A patent/IE66904B1/en not_active IP Right Cessation
- 1987-02-26 NL NL8700483A patent/NL195097C/en not_active IP Right Cessation
- 1987-02-26 HU HU87750A patent/HU201808B/en unknown
- 1987-02-26 NZ NZ219421A patent/NZ219421A/en unknown
- 1987-02-26 CA CA000530691A patent/CA1287558C/en not_active Expired - Lifetime
- 1987-02-26 KR KR870001680A patent/KR870008033A/en not_active Application Discontinuation
- 1987-02-26 ZA ZA871401A patent/ZA871401B/en unknown
- 1987-02-26 SE SE8700821A patent/SE468816B/en not_active IP Right Cessation
- 1987-02-26 BE BE8700177A patent/BE1001168A4/en not_active IP Right Cessation
- 1987-02-26 FR FR878702541A patent/FR2594849B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1987-02-27 DD DD87300286A patent/DD270383A5/en unknown
- 1987-02-27 IL IL81695A patent/IL81695A/en not_active IP Right Cessation
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
NL8700483A (en) | QUANTIFICATION OF NUCLEIC ACID MOLECULES AND REAGENT SET USED THEREIN. | |
US5741677A (en) | Methods for measuring telomere length | |
Hendrix et al. | High prevalence of latently present cytomegalovirus in arterial walls of patients suffering from grade III atherosclerosis. | |
KR101110396B1 (en) | Method of detecting variation and kit to be used therein | |
Zipeto et al. | Human cytomegalovirus (CMV) DNA in plasma reflects quantity of CMV DNA present in leukocytes | |
Nagai et al. | Semiquantitative analysis of telomerase activity in cervical cancer and precancerous lesions. | |
EA020795B1 (en) | Genetic markers associated with interferon-alpha response | |
CN112795625B (en) | Method for detecting multiple nucleic acids based on CRISPR technology | |
Nakamura et al. | Telomere lengths at birth in trisomies 18 and 21 measured by Q-FISH | |
KR20110004918A (en) | Primer set for amplification of obesity gene, reagent for amplification of obesity gene comprising the primer set, and use of the primer set | |
Dutta et al. | Mosaic Down syndrome with a marker: molecular cytogenetic characterization of the marker chromosome | |
Kalkuhl et al. | p21Ras downstream effectors are increased in activity or expression in mouse liver tumors but do not differ betweenRas-mutated andRas-wild-type lesions | |
CN102453766A (en) | Polymorphism detection probe, polymorphism detection method, evaluation of drug efficacy, and polymorphism detection kit | |
Minkley Jr | Transcription of the early region of bacteriophage T7: specificity and selectivity in the in vitro initiation of RNA synthesis | |
KR101068605B1 (en) | Primer set for amplification of nat2 gene, reagent for amplification of nat2 gene comprising the same, and use of the same | |
CN113913498B (en) | Method for detecting target mutation based on CRISPR technology | |
Chen et al. | Diagnosis of human cytomegalovirus intrauterine infection using fetal cells from maternal blood | |
KR100675403B1 (en) | In vitro detecting method for gestational diabetes mellitus and the detecting kit | |
Merzouki et al. | Accurate and differential quantitation of HIV-1 tat, rev and nef mRNAs by competitive PCR | |
KR100705746B1 (en) | Primer for detection of Human Papillomavirus | |
CN113913498A (en) | Method for detecting target mutation based on CRISPR technology | |
CN116716400A (en) | Double-catalysis hairpin self-assembled sequence group, kit and application thereof | |
CN117385083A (en) | Composition, method and application for detecting triazole drug-resistant aspergillus fumigatus | |
CN117248017A (en) | Human NRAS gene mutation detection kit and application thereof | |
Hanano et al. | PCR-based quantification of Pneumocystis carinii in in vitro systems |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
BA | A request for search or an international-type search has been filed | ||
BB | A search report has been drawn up | ||
BC | A request for examination has been filed | ||
CNR | Transfer of rights (patent application after its laying open for public inspection) |
Free format text: SANGTEC MEDICAL AB |
|
CNR | Transfer of rights (patent application after its laying open for public inspection) |
Owner name: SANGTEC MOLECULAR DIAGNOSTICS AB |
|
NP1 | Patent granted (not automatically) | ||
V4 | Discontinued because of reaching the maximum lifetime of a patent |
Effective date: 20070226 |