MXPA01012444A - Sintesis de oligonucleotido con acidos de lewis como activadores. - Google Patents
Sintesis de oligonucleotido con acidos de lewis como activadores.Info
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Abstract
Un proceso para sintetizar oligonucleotidos mediante quimica de fosforamidita, donde la mejora radica en el uso de acidos de Lewis como activadores, para la formacion del enlace fosforo-oxigeno.
Description
_-? •* * SÍNTESIS DE OLIGONUCLEOTIDO CON ÁCIDOS DE LEWIS COMO
ACTIVADORES
Campo Técnico 5 • La presente invención se relaciona con un proceso que utiliza ácidos de Lewis como activadores en la preparación de oligonucleótidos mediante química de fosforamidita.
Antecedentes de la Invención 10 La presente invención se relaciona en general con los campos de la química orgánica y la biología. En particular, la presente invención se dirige a composiciones y métodos para uso en la síntesis de oligonucleótidos. La química de fosforamidita (Beaucage, S.L., y 15 Lyer, R.P. Tetrahedron (1992), 48, 2223-2311) se ha vuelto la química de acoplamiento más ampliamente usada para la síntesis de los oligonucleótidos. Como es muy conocido para los expertos en la técnica, la síntesis de fosforamidita de los oligonucleótidos implica la activación de precursores de mo- 20 nómeros de fosforamidita de nucleósido mediante la reacción con un agente activante para formar intermediarios activados, seguido por la adición secuencial de los intermediarios activados para el crecimiento de la cadena de oligonucleótidos (generalmente anclados en un extremo a un soporte sólido con- >
25 veniente) para formar el producto de oligonucleótido. El te-
trazol se usa .comúnmente para la activación de los monómeros de fosforamidita de nucleósido; la activación se presenta por el mecanismo representado en el Esquema I. El tetrazol tiene un protón ácido el cual presumiblemente protona el nitrógeno básico del grupo di-isopropilaminofosfina, haciendo de este modo del grupo di-isopropilamino un grupo saliente. El ion de tetrazolio cargado negativamente realiza un ataque en el fósforo trivalente, formando una especie de tetrazolida de fósforo transitoria. El grupo 5' -OH del nucleósido pegado al soporte sólido ataca entonces a la especie de fósforo trivalente activo, dando como resultado la formación de un enlace in- ter-nucleótidos . El fósforo trivalente finalmente se oxida al fósforo pentavalente.
Esquema 1
1) repetición de ciclos 2) Disocia y desprotege con NH4OH ó CH3NH2/NH4OH
Las principales desventajas del tetrazol son su co- sto y su inestabilidad la cual incluye su potencial para explotar (Hojas de Datos de Seguridad o MSDS enlistan el 1H- tetrazol como un riesgo de explosión grave) . Debido a su inestabilidad inherente, el tetrazol sublimado generalmente se requiere para asegurar los rendimientos de acoplamiento de- seados. Además, el tetrazol (que típicamente se usa cerca de
su solubilidad saturada de 0.5M) tiende a precipitarse de la solución de acetonitrilo a temperaturas frías; esto puede conducir al bloqueo de válvulas en algunos sintetizadores de ADN automatizados. Otros activadores que funcionan casi tan eficientemente como el tetrazol tienen desventajas similares a las del tetrazol que se comentaron anteriormente. Estos activadores, que son todos donantes de protones, incluyen los siguientes miembros de la clase de tetrazol de activadores: 5- (p- nitrofenil) tetrazol (Froehler, B.C. y attcucci, M.D. , Tetrahedron Letters (1983), 24, 3171-3174); 5- (p- nitrofenil) tetrazol y DMAP (Pon, R.T. Tetrahedron Letters (1987), 28, 3643-3646); y 5- (tioetil) -lH-tetrazol ( right, P. y colaboradores, Tetrahedron Letters (1993), 34, 3373-3376). Además de la clase de activadores de tetrazol, lo siguientes activadores se han empleado: el trifluoroacetato de N- metilanilina (Fourrey, J.L. y Varenne, J., Tetrahedron Letters (1984) , 25, 4511-4514) ; el tricloroacetato de N- metilanilinio (Fourrey, J.L. y colaboradores, Tetrahedron Letters (1987), 28, 1769-1772); el sulfonato de 1- metilimidazoltrifluorometano (Arnold, L. y colaboradores, Co- llect. Czech. Chem. Commun. (1989), 54, 523-532); ácido octanoico o trietilamina (Stec, W.J. y Zon, G., Tetrahedron Letters (1984), 25, 5279-5282); 1-metilimidazol HCl, 5- trifluorometil-lH-tetrazol, N,N-dimetilanilina HCl, y N,N-
dimetilaminopiridina HCl (Hering, G. y colaboradores, Nucleo-sides and Nucleotides (1985), 4, 169-171). Sobre todo estos activadores tienen desempeño inferior en relación con el tetrazol . La Patente Japonesa JP 08301878 describe el uso de otro activador de protones. Se describe una mezcla de 1:1 de bencimidazol y eterato de BF3, en donde el componente BF3 actúa para aumentar la acidez del protón de bencimidazol necesario para la activación de la fosforamidita (intermedíarios) . El complejo BF3 de bencimidazol actúa de una manera similar al tetrazol descrito en el Esquema I . La presente invención no activa los intermediarios de fosforamidita con un donante de protón sino en vez de eso utiliza ácidos de Lewis para la activación. En particular, se usa el eterato BF3 en la presente invención. Las ventajas del eterato del BF3 sobre el complejo BF3 de bencimidazol incluyen la disponibilidad comercial y la facilidad de remoción del éter dietílico contra la remoción de bencimidazol . Además, los intermediarios de fosforamidita activa-da son muy sensibles a la humedad. Un exceso del 50 por ciento al 100 por ciento de las fosforamiditas muy valuable se requiere para poner en secuencia aún con solventes anhidros (<20 ppm de contenido de humedad) . La presencia de cantidad en traza de humedad da como resultado una pérdida de rendi-miento considerable y un aumento en impurezas de secuencia- miento suprimido. Además de activar los intermediarios de fosforamidita, los ácidos de Lewis pueden actuar como agotadores de humedad minimizando la descomposición de la fosfóra- midita. Por lo tanto, el uso de ácidos de Lewis para la acti- vación de los intermediarios de fosforamidita conduce a una eficiencia de acoplamiento mejorada, menor costo, y manejo y operación del material conveniente . La adición de un ácido de Lewis, sin embargo, fpuede bajar el pH de la mezcla de la reacción. Una acidez aumentada en la mezcla de la reacción puede causar la remoción de los grupos protectores N y O en el intermediario de fosforamidita conduciendo a productos indeseables y rendimientos reducidos . La adición de piridina por lo tanto puede ser usada para aumentar el pH a un nivel que puedan tolerar los grupos de pro- tección de fosforamidita. Es un objeto de la presente invención proporcionar nucleósidos para proporcionar los nucléosidos activados con ácido de Lewis para el uso en la síntesis, incluyendo la síntesis en fase sólida, que no presente todas las desventajas de la técnica anterior. Es otro objeto de la presente invención proporcionar métodos para la preparación y uso de los nucleósidos activados con ácido de Lewis como se describe posteriormente.
Compendio de la Invención En su principal modalidad, la presente invención describe un proceso para activar monómeros de fosforamidita de la fórmula I :
en donde B1 se selecciona del grupo que consiste en base purina y base pirimidina; R1 es una amina secundaria, una amina preferida es la di-isopropilamina; R2 se selecciona del grupo que consiste en alcoxilo, alquilo, alquilsulfonilalcoxilo, arilsulfonilalcoxilo, cianoalcoxilo, y haloalcoxilo; R3 es un grupo de protección hidroxilo, un grupo preferido es 4 , 4 ' -dimetoxitritilo; y R4 se selecciona del grupo que consiste en hidrógeno y -OR7, en donde R7 es un grupo de protección hidroxilo; que comprende tratar los monómeros de fosforamidita de la fórmula I con una cantidad opcional de piridina y un ácido de Lewis, los ácidos de Lewis preferidos se selecciona entre
|____JA_ _«_>«.___- -|-J, ¡f^ cloruro de aluminio, cloruro de bismuto (III) , trifluoruro de boro, cloruro «de hierro (II), cloruro de hierro (III), bromuro de magnesio, cloruro de magnesio, trifluorometansulfonato de magnesio, cloruro de manganeso (II) , bromuro de zinc, clo- ruro de zinc, y cloruro de zirconio (IV) .
Descripción Detallada de la Invención Todas las patentes, las solicitudes de patentas, y las referencias de la literatura citada en la especificación se incorporan mediante la presente por referencia completamente. En el caso de inconsistencias, será preponderante la presente descripción, incluyendo las definiciones. Definición de Términos Como se usa en la especificación y en las reivindi- caciones anexas, los siguientes términos tienen los significados especificados. El término "alcoxilo", como se usa en la presente, se refiere a un grupo alquilo, como se define en la presente, unido a la fracción molecular padre a través de un grupo oxi, como se define en la presente. Los ejemplos representativos de alcoxilo incluyen, pero no se limitan a, metoxilo, etoxilo, propoxilo, 2-propoxilo, butoxilo, butoxilo terciario, pentiloxilo, y similares. El término "alquilo", como se usa en la presente, se refiere a un hidrocarburo de cadena recta o ramificada que
_________i?___*__i¡__j_ -- áff contiene de 1 a 5 átomos de carbono. Los ejemplos representativos de alquilo incluyen, pero no se limitan a, metilo, etilo, n-propilo, iso-propilo, n-butilo, butilo secundario, isobutilo, butilo terciario, n-pentilo, y similares. El término "alquilcarbonilo" , como se usa en la presente, se refiere a un grupo alquilo, como se define en la presente, unido a la fracción molecular padre a través de un grupo carbonilo, como se define en la presente. Los ejejnplos representativos de alquilcarbonilo incluyen, pero no se limi-tan a,- acetilo, etilcarbonilo, y similares. El término "alquilcarboniloxilo" , como se usa en la presente, se refiere a un grupo alquilcarbonilo, como se define en la presente, unido a la fracción molecular padre a través de un grupo oxi, como se define en la presente. Los ejemplos representativos de alquilcarboniloxilo incluyen, pero no se limitan a, acetiloxilo, etilcarboniloxilo, t-butilcarboniloxilo, y similares. El término "alquilsulfonilo", como se usa en la presente, se refiere a un grupo alquilo, como se define en la presente, unido a la fracción molecular padre a través de un grupo sulfonilo, como se define en la presente. Los ejemplos representativos de alquilsulfonilo incluyen, pero no se limitan a, metiisulfonilo, etiisulfonilo, y similares. El término "alquilsulfonila coxilo" , como se usa en la presente, se refiere a un grupo alquilsulfonilo, como se
_*! __ -_, ___>_ . _ _«_ .____-,._«.„-»___.«. - - ^ •»--» — »>«-._--- J» ________ ____________^ — , fl _ -- jftpn^üj^j define en la presente, unido a la fracción molecular padre a través de un grupo alcoxilo, como se define en la presente. Los ejemplos representativos de alquilsulfonilalcoxilo incluyen, pero no se limitan a, 2-metilslfoniletoxilo, 2- etilsulfoniletoxilo, y similares. El término "amino", como se usa en la presente, se refiere a un grupo -NH2. El término "grupo de protección amino" o "grupo de protección-N" , se refiere a grupos que. pretenden proteger un grupo amino contra reacciones indeseables 'durante procedimientos sintéticos. Los grupos de protección de nitrógeno comúnmente usados se describen en Greene, T.W. & Wuts, P.G.M. (1991) . Protective Groups In Organic Synthesis (2- edición) . Nueva York: John Wiley & Sons. Los grupos de protección de nitrógeno preferidos son formilo, acetilo, benzoílo, pivaloí- lo, t-butilacetilo, fenilsulfonilo, bencilo, t- butiloxicarbonilo (Boc) , y benciloxicarbonilo (Cbz) . El término "arilo", como se usa en la presente, se refiere a un sistema de anillo monocíclico aromático, o a un sistema de anillo bicíclico fusionado en donde uno o ambos de los anillos fusionados son aromáticos. Los ejemplos representativos de arilo incluyen, pero no se limitan a, azuleno, indanilo, indenilo, naftilo, fenilo, tetrahidronaftilo, y similares. Los grupos arilo en esta invención se pueden susti-
-.___-_____..____.__ ^.jUhfcM» . , •* _ .___. ._ _ *,„ ..,__._. _____ ___,.- .»__.._,__,,fe, .;____„,»«„___>._.,._.»__ .tA^j,^ tuir con 1, 2, ó 3 sustituyentes seleccionados independientemente entre alquilo, ciano, halógeno, haloalquilo, y nitro. El término "arilalcoxilo" , como se usa en la presente, se refiere a un grupo arilo, como se define en la pre- senté, unido a la fracción molecular padre a través de un grupo alcoxilo, como se define en la presente. Los ejemplos representativos de arilalcoxilo incluyen, pero no se limitan a, 2-feniletoxilo, 2-naftiletoxilo, 2- (4-nitrofenil) et?>xilo, y similares. ' El término ."ariisulfonilo", como se usa en la presente, se refiere a un grupo arilo, como se define en la presente, unido a la fracción molecular padre a través de un grupo sulfonilo, como se define en la presente. Los ejemplos representativos de ariisulfonilo incluyen, pero no se limitan a, fenilsulfonilo, naftilsulfonilo, y similares. El término "arilsulfonilalcoxilo" , como se usa en la presente, se refiere a un grupo ariisulfonilo, como se define en la presente, unido a la fracción molecular padre a través de un grupo alcoxilo, como se define en la presente. Los ejemplos representativos de arilsulfonilalcoxilo incluyen, pero no se limitan a, 2-fenilsulfoniletoxilo, 3- feilsulfonilpropoxilo, y similares. El término "carbonilo", como se usa en la presente, s'e refiere a un grupo -C(0)-. El término "catecol", como se usa en la presente,
'*AA*afc*a»^*T''H'___mil? II .~,*»*H* t~,,.MA~* **? . ^..^^,^ ^„_ J¿^, i^ ^J^ se refiere a un grupo C6H4-1, 2- (0-) 2, en donde ambos átomos de oxígeno están unidos a M, como se define en la presente. El término "ciano", como se usa en la presente, se refiere a un grupo -CN. El término "cianoalcoxilo" , como se usa en la presente, se refiere a un grupo ciano, como se define en la presente, unido a la reacción molecular padre a través de un grupo alcoxilo, como se define en la presente. Los ejemplos representativos de cianoalcoxilo incluyen, pero no se limitan a, 2-cianoetoxilo, 3-cianopropoxilo, l-metil-2-cianoetoxilo, 1, 1-dimetil-2-cianoetoxilo, y similares. El término "halo" o "halógeno" , como se usa en la presente, se refiere a -Cl, -Br, -I, ó -F. El término "haloalcoxilo" , como se usa en la pre-senté, se refiere a cuando menos un halógeno, como se define en la presente, unido a la fracción molecular padre a través de un grupo alcoxilo, como se define en la presente. Los ejemplos representativos de haloalcoxilo incluyen, pero no se limitan a, 2, 2, 2-tricloroetoxilo, 1, l-dimetil-2 , 2, 2-tricloroetoxilo, trifluorometoxilo, y similares. El término "haloalquilo" , como se usa en la presente, se refiere a cuando menos un halógeno, "como se define en la presente, unido a la fracción molecular padre a través de un grupo alquilo, como se define en la presente. Los ejemplos representativos de haloalquilo incluyen, pero no se limitan a, clorometilo, 2-fluoroetilo, trifluorometilo, pentafluoroetilo, 2-cloro-3-fluoropentilo, y similares. El término "grupo de protección hidroxilo" o "grupo de protección-O" se refiere a grupos destinados a proteger un grupo hidroxilo contra reacciones indeseables durante los procedimientos sintéticos. Los grupos de protección hidroxilo comúnmente usados se describen en T.H. Greene and P.G.M. Wuts, Protective Groups in Organic Synthesis, 2- edijción, John Wiley & Sons, Nueva York (1991) , la cual se incorpora en la presente mediante referencia. Los ejemplos de grupos de protección hidroxilo incluyen, pero no se limitan a, metilé-teres sustituidos, por ejemplo, metoximetilo, benciloximeti-lo, 2-metoxietoximetilo, 2- (trimetilsilil) -etoximetilo, bencilo, y trifenilmetilo; tetrahidropiraniléteres; etiléteres sustituidos, por ejemplo, 2 , 2 , 2-tricloroetilo y t-butilo; sililéteres, por ejemplo, trimetilsililo, t-butildimetilsililo y t-butildifenilsililo,- acétales y cetales cíclicos, por ejemplo metilenacetal, acetonida y bencilidenacetal; ortoésteres cíclicos, por ejemplo metoximetileno; carbonatos cícli-eos; boronatos cíclicos; derivados de carbonilo, por ejemplo, acetilo, p-fenilazofeniloxicarbonilo, 9-fluorenilmetoxicar-bonilo, 2 , 4-dinitrofeniletoxicarbonilo, 2- (metiltiometoxi-metil) benzoílo, 2- (isopropiltiometoximetil) benzoílo, 2- (2,4-dinitrobencensulfeniloximetil) benzoílo, 4- (metiltiometoxi) butirilo, y levulinilo; derivados de tritilo, por ejemplo, 4,4' -dimetoxitritilo, 4,4' ,4' ' -tris- (benciloxi) tritilo, 4,4' ,4' ' -tris- (4, 5-dicloroftalimido) tritilo, 4,4' ,4' ' -tris- (levuliniloxi) tritilo, 3- (imidazolilmetil) -4,4' - dimetoxitritilo, 4-deciloxitritilo, 4-hexadeciloxitritilo, y 1, 1-bis- (4-metoxihenil) -1' -pirenilmetilo; grupos de xantenilo sustituidos, por ejemplo, pixil (9-fenilxanten-9-ilo) , 9- (p- metoxifenil)xanten-9-ilo) , y 9- (4-octadeciloxifenil)xanten-9- ilo. t El término "ácido de Lewis" , como se usa en la pre- senté, se refiere a una especie química, distinta de protón, que tiene un orbital vacante o acepta un par de electrones. Se entenderá que los ácidos de Lewis se pueden comprar o preparar como complejos incluyendo pero sin limitarse a, etera- tos, hidratos, y tioeteratos. Se entenderá además que los complejos comprados o preparados para la presente invención no contienen un protón ácido. Los ejemplos representativos de ácido de Lewis incluyen, pero no se limitan a, cloruro de aluminio, cloruro de bismuto (III) , trifluoruro de boro, cloruro de hierro (II) , cloruro de hierro (III) , bromuro de mag- nesio, cloruro de magnesio, trifluorometansulfonato de magnesio, cloruro de manganeso (II) , bromuro de zinc, cloruro de zinc, cloruro de zirconio (IV), y similares. El término "metilendioxilo" , como se usa en la presente, se refiere a un grupo -OC(R80) (R81)0-, en donde R80 y R81 se seleccionan independientemente de hidrógeno y alquilo. Los
-._ _ _,.¿A^ _.,a_¿.__„... f. __^^^ _Ür_-Ti >**»*»-*- -*- __- átomos de hidrógeno del grupo metilendioxilo están unidos a la fracción molecular padre a través de dos átomos de carbono adyacentes. Los ejemplos representativos de un grupo metilendioxilo incluyen, pero no se limitan a, 1, 3-dioxolanilo, 2,2- dimetil-1, 3-dioxolanilo, 2-metil-l, 3-dioxolanilo, y similares . El término "oxi", como se usa en la presente, se refiere a (-0-) . . El término "base purina" , como se usa en la présente, se refiere a una base orgánica seleccionada entre 9H- purin-6-ilamina (adenina) y 2-amino-l, 9-dihidro-6H-purin-6- ona (guanina) . El grupo amino unido a la adenina puede ser protegido con un grupo de protección de nitrógeno. El término "protón", como se usa en la presente, se refiere a H+. El término "base pirimidina" , como se usa en la presente, se refiere a una base orgánica seleccionada entre 2,4 (1H, 3H) -pirimidinodiona (uracilo), 5-metil-2 , 4 (1H, 3H) - pirimidinodiona (timina), y 4-amino-2 (1H) -pirimidinona (cito- sina) . El grupo amino unido a la citosina se puede proteger con un grupo de protección de nitrógeno. El término "sulfonilo", como se usa en la presente, se refiere a un grupo -S02- . El término "trifluorometano" , como se usa en la presente, se refiere a -CF3.
El término "trifluorometansulfonilo" , como se usa en la presente, se refiere a un grupo trifluorometano, como se define én la presente, unido a la fracción molecular padre a través de un grupo sulfonilo, como se define en la presen-te. El término "trifluorometansulfonilo" , como se usa en la presente, se refiere a un grupo trifluorometansulfonilo, como se define en la presente, unido a la fracción mole-cular padre a través de un grupo, oxi, como se define en la presente. Abreviaturas Se usan las siguientes abreviaturas: DMA para dime-tilacetamida, DMT para 4, 4' -dimetoxitritilo, EtOAc para acetilo de etilo, eq para equivalentes, MSDS para Hojas de Datos de Seguridad, NaHC03 para bicarbonato de sodio, Na2S04 para sulfato de sodio, y TLC para cromatografía de capa delgada. Métodos Sintéticos Los compuestos y procesos de la presente invención se entenderán mejor en relación con el siguiente esquema sin-tético que ilustra el método mediante el cual se pueden preparar los compuestos de la invención.
Esquema 1
equivalentes o de Lewis equivalentes piridina
Procedimiento general usando ácidos de Lewis como activadores ; Una solución de fosforamidita (i) (1.0 equivalentes) y nucleósido (ii) (1.0 equivalentes) en acetonitrilo o DMA (0.1 M) se trató con ácido de Lewis (Tabla 1). La solu-ción se mezcló a temperatura ambiente y se monitoreó mediante
ri____¡,.
s i cromatografía de capa delgada usando EtOAc : trietilamina (95:5) y el solvente de revelado. Después de un rango de menos de 5 minutos a 60 minutos (Tabla 1) , la mezcla de la reacción se amortiguó con NaHC03 acuoso, y se extrajo con EtOAc. La capa orgánica se lavó con NaHC03 acuoso, se secó (Na2S04) , y se evaporó al vacío para proporcionar el producto dímero (iii) en un rendimiento aproximadamente cuantitativo. 31P RMN (500 MHz, CD2Cl2) d 139.5, 139.7; j MS (ESI+) m/z: 1041.4 (M+) . 10 Procedimiento general usando ácidos de Lewis y piridina como activadores : Una solución de fosforamidita (i) (1.0 equivalentes) y nucleósido (ii) (0.1 equivalentes) en acetonitrilo o
15 DMA (0.1 M), se trató con piridina (2 equivalentes) seguida por la adición de un ácido de Lewis (2 equivalentes) . La solución se mezcló a temperatura ambiente y fue monitoreada mediante cromatografía de capa delgada usando EtOAc : trietilamina (95:5) como el solvente de revelado. Des- 20 pues de menos de 5 minutos, la mezcla de la reacción se amortiguó con NaHC03 acuoso y se extrajo con EtOAc. La capa orgánica se lavó con NaHC03 acuosa, se secó (Na2S0) , y se evaporó al vacío para proporcionar el producto dímero (iii) en un rendimiento aproximadamente cuantitativo. 25 31P RMN (500 MHz, CD2Cl2) 5 139.5, 139.7;
__«._.______-*.
MS (ESI+) m/z: 1041.4 (M+) .
Tabla 1
Se entenderá que el dímero (ii) se puede oxidar usando condiciones estándares conocidas para los expertos en la técnica para obtener el fosfato, (J. Am. Chem. Soc.,
(1976), 98, 3655-3661). El 5' -OH del dímero oxidado se puede desproteger y tratar con un monómero de fosforamidita activa-
I ___ . ___t_¿_ do con ácido de Lewis para formar un trímero. Esta secuencia de paso se puede repetir hasta que un oligonucleótido de longitud deseado ha sido sintetizado de manera que el .proceso de la presente invención se puede usar para preparar oligonucleótidos, incluyendo la síntesis en fase sólida de los mismos .
l__i__-d_._.___1._.___..___ __¡A .__..
Claims (20)
1. Una composición que comprende un ácido de Lewis, una cantidad opcional de piridina, y un compuesto de la fórmula I : en donde : B1 se selecciona del grupo que consiste en base purina y base pirimidina; R1 es -NR5R6, en donde R5 y R6 se seleccionan inde*-pendientemente del grupo que consiste en alquilo y arilalquilo; R2 se selecciona del grupo que consiste en alcoxilo, alquilo, alquilsulfonilalcoxilo, arilsulfonilalcoxilo, cianoalcoxilo, y haloalcoxilo; R3 es un grupo de protección hidroxilo; R4 se selecciona del grupo que consiste en hidrógeno y -OR7, en donde R7 es un grupo de protección hidroxilo. 2. Una composición de acuerdo con la reivindica-ción 1 que comprende el ácido de Lewis de la fórmula II: _______b __i_____r_ «___<_.'- -•- '"ttfc¿4__tt. _____ p. en donde : M se selecciona del grupo que consiste en aluminio, antimonio, bismuto, boro, cadmio, cobalto, cobre, cromo, oro, hafnio, iridio, hierro, lantano, magnesio, manganeso, mercurio, molibdeno, níquel, niobio, osmio, paladio, platino, fós-foro, renio, rutenio, escandio, plata, tantalio, telurio, estaño, tungsteno, titanio, vanadio, zinc, zirconio, e itrio; R10 se selecciona del grupo que consiste en alcoxilo, alquilcarboniloxilo, trifluorometansulfoniloxilo, ciano, y halógeno; R11 está ausente o se selecciona del grupo que consiste en alcoxilo, alquilcarboniloxilo, trifluorometansulfoniloxilo, ciano, y halógeno; o R10 y R11 tomados juntos forman un catecol en donde ambos átomos de oxígeno se unen a M; R12 está ausente o se selecciona del grupo que consiste en alcoxilo, alquilcarboniloxilo, trifluorometansulfoniloxilo, ciano, y halógeno; R13 está ausente o se selecciona del grupo que consiste en alcoxilo, alquilcarboniloxilo, trifluorometansulfo-niloxilo, ciano, y halógeno; y ^^*-«»'>'^a^^ .. j___ ^_...^ t- rr - - 1 ifirr- "-r •_!__;__ AfipA.
R14 está ausente o se selecciona del grupo que consiste en halógeno.
3. Una composición de acuerdo con la reivindicación 2 que comprende el ácido de Lewis de la fórmula II en donde : M se selecciona del grupo que consiste en aluminio, bismuto, boro, hierro, magnesio, manganeso, titanio, zinc, y zirconio; R10 se selecciona del grupo que consiste en alcoxilo, ciano, halógeno, y trifluorometansulfoniloxilo; y R11 se selecciona del grupo que consiste en alcoxilo, ciano, halógeno, y trifluorometansulfoniloxilo; o R10 y R11 tomados juntos forman un catecol en donde ambos átomos de oxígeno se unen a M; R12 está ausente o se selecciona del grupo que consiste en alcoxilo y halógeno; R13 está ausente o se selecciona del grupo que consiste en alcoxilo y halógeno; y R14 está ausente .
4. Una composición de acuerdo con la reivindicación 1 que comprende: el ácido de Lewis seleccionado del grupo que consiste en cloruro de aluminio, cloruro de bismuto (III) , tri- fluoruro de boro, cloruro de hierro (II) , cloruro de hierro hia__.._._ _ ._._!„» . t<MMfc. .., ?M*—***^.^ ** ^.^-.* .._.... -^^.^^^^.^^^^^ (III) , bromuro de magnesio, cloruro de magnesio, trifluorome-tansulfonato de magnesio, cloruro de manganeso (II) , bromuro de zinc, cloruro de zinc, y cloruro de zirconio (IV) .
5. Una composición de acuerdo con la reivindica-ción 1, en donde R5 y R6 se seleccionan independientemente del grupo que consiste en alquilo.
6. Una composición de acuerdo con la reivindicación 1 , en donde : R5 es isopropilo; y R6 es isopropilo.
7. Una composición de acuerdo con la reivindicación 1, en donde R2 se selecciona del grupo que consiste en cianoalcoxilo .
8. Una composición de acuerdo con la reivindicación 1, en donde R2 es 2-cianoetoxilo.
9. Una composición de acuerdo con la reivindicación 1, en donde: R1 es di-isopropilamino; y R2 es 2-cianoetoxilo.
10. Una composición de acuerdo con la reivindicación 1, en donde R3 se selecciona del grupo que consiste en 4,4' -dimetoxitritilo, 4,4' ,4' ' -tris- (benciloxi) tritilo, 4,4' ,4' ' -tris- (4, 5-dicloroftalimido) tritilo, 4 , 4 ' , 4 ' ' -tris- (levuliniloxi) tritilo, 3- (imidazolilmetil) -4,4' -dimetoxitritilo, pixil (9-fenilxanten-9-ilo) , 9- (p-metoxifenil) xanten-9-ilo) , 4-deciloxitritilo, 4-hexadeciloxitritilo, 9- (4-octadeciloxifenil)xanten-9-ilo, 1, 1-bis- (4-metoxihenil) -1' -pirenilmetilo; p-fenilazofeniloxicarbonilo, 9-fluorenilmetoxicarbonilo, 2 , 4-dinitrofeniletoxilcarbonilo, 4-(metiltiometoxi)butirilo, 2- (metiltiometoximetil) benzoílo, 2-(isopropiltiometoximetil) benzoílo, 2- (2 , 4-dinitrobencßnsul-feniloximetil) benzoílo, y levulinilo.
11. Una composición de acuerdo con la reivindicación 1, en donde R3 es 4,4' -dimetoxitritilo.
12. Una composición de acuerdo con la reivindicación 1 que comprende de 1 a 4 equivalentes molares de piridina.
13. Una composición de acuerdo con la reivindicación 1 que comprende: el ácido de Lewis seleccionado del grupo que consiste en cloruro de aluminio, cloruro de bismuto (III) , trifluoruro de boro, cloruro de hierro (II) , cloruro de hierro (III) , bromuro de magnesio, cloruro de magnesio, trifluorome-tansulfonato de magnesio, cloruro de manganeso (II) , bromuro de zinc, cloruro de zinc, y cloruro de zirconio (IV) ; de 0 a 4 equivalentes molares de piridina; y el compuesto de la fórmula I , en donde : R1 es di-isopropilamino; _.._*-..,_-_,._.i?__ .____*<_-____ __*__&, R2 es 2-cianoetoxi; y R3 es 4, 4' -dimetoxitritilo.
14. Un proceso para la preparación de un compuesto de la fórmula III: m, en donde B1 y B2 se seleccionan independientemente del grupo que consiste en una base purina y una base pirimidina; R2 se selecciona del grupo que consiste en alcoxilo, alquilo, alquilsulfonilalcoxilo, arilsulfonilalcoxilo, cianoalcoxilo, y haloalcoxilo; R3 es un grupo de protección hidroxilo; R4 se selecciona del grupo que consiste en hidrógeno y -OR7; R8 es -OR7; y R9 se selecciona del grupo que consiste en¡hidróge- no, y -OR7; o _iiAal_i_a.t____.____. __a_ . a^jA'-totwi-___i__-_»?_^_.JAj_^.JtJi._», _ _______ . _. , __ ^¿j.j__i Í-l- R8 y R9 tomados juntos forman un grupo metilendioxilo; este proceso comprende tratar una composición de acuerdo con la reivindicación 1, con un compuesto de la fór- muía IV:
15. Un proceso de acuerdo de acuerdo con la reivindicación 14, en donde R2 es alquilo.
16. Un proceso de acuerdo con la reivindicación 14, en donde R2 es cianoalcoxilo.
17. Un proceso de acuerdo con la reivindicación 14 , en donde : R2 es 2-cianoetoxilo; y R8 y R9 tomados juntos forman un grupo metilendioxilo.
18. Un proceso de acuerdo con la reivindicación 14, en donde: R2 es 2-cianoetoxilo; R3 es 4, 4' -dimetoxitritilo; R4 es hidrógeno; R8 y R9 tomados juntos forman un grupo metilendioxi - t____ii_u__. _-_..____*_t__^^____b_i_Mj?r*» - •"t^_p?t_M____mM___""'f''s''-->-- -**•».»_-.___„____ _ »___>___>-_ _. »_.___-«_<_» _ü__.¿-ii lo.
19. Un proceso de síntesis de oligonucleótidos , en el cual los precursores de monómeros de fosforamidita de ny- cleósido son activados mediante tratamiento con un ácido de Lewis para formar intermediarios activados y los intermediarios activados se añaden secuencialmente para formar un producto de oligonucléotido, en donde el mejoramiento comprende usar los ácidos de Lewis como un activador de monómero de fosforamidita.
20. Un proceso de acuerdo con la reivindicación 19, en donde, el ácido de Lewis se selecciona del grupo que consiste en cloruro de aluminio, cloruro de bismuto (III), trifluoruro de boro, cloruro de hierro (II) , cloruro de hierro (III) , bromuro de magnesio, cloruro de magnesio, trifluo- rometansulfonato de magnesio, cloruro de manganeso (II) , bromuro de zinc, cloruro de zinc, y cloruro de zirconio (IV) . tA¿,Ut_I_a_i.i i.._--- . .~__-_________M__l??||t?r?it?'Bt _ ' i -i ?^_^a¿ttiJM _^_M__i____y__--_'_--_-.--_--Í.
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