MX2011006063A - Metodo de evaluacion para identificar genes involucrados en ciclo de celulas vegetales. - Google Patents

Abstract

La presente invención se refiere a un método novedoso para evaluar proteínas relacionadas con y/o involucradas en ciclo de células vegetales. Además, se refiere a proteínas aisladas con el método, y al uso de aquellas proteínas, y/o los genes codificando aquellas proteínas para modular el rendimiento vegetal y crecimiento vegetal.

Description

METODO DE EVALUACION PARA IDENTIFICAR GENES INVOLUCRADOS EN CICLO DE CÉLULAS VEGETALES La presente invención se refiere .a un método novedoso para evaluar proteínas relacionadas con y/o involucradas en el ciclo de células vegetales. Además, se refiere a proteínas aisladas con el método, y al uso de aquellas proteínas, y/o los genes codificando aquellas proteínas para modular el rendimiento vegetal y crecimiento vegetal.

El conocimiento de la maquinaria del ciclo de células básicas es un prerrequisito para captar cómo las vías de señalización le afectan y regulan la proliferación celular durante el crecimiento vegetal y desarrollo en un ambiente en cambio. Los mecanismos subyacentes fundamentales de división celular se conservan entre todas las eucariotas, no obstante, debido a su estilo de vida sésil, las plantas han evolucionado características únicas. El análisis de secuencia de genoma vegetal reveló la existencia de un alto número inesperado de genes involucrados en proliferación celular (Capron y otros, 2003; Vandepoele y otros, 2002; Menges y otros, 2005; Schultz y otros, 2007), en comparación con otros organismos. El análisis de microarreglo (microarray) mostró que muchos de estos siguen un perfil de expresión dependiente del ciclo celular (Menges y otros, 2005), sosteniendo su papel en regulación del ciclo celular. Para elucidar cuáles máquinas moleculares están involucradas en división celular vegetal, se aislaron complejos celulares por TAP de cultivos de suspensión de célula Arabidopsis thaliana (Van Leene y otros, 2007; Van Leene y otros, 2008) usando proteínas de ciclo celular de "núcleo" como carnada. La serie de datos fue corregida para interacciones no específicas y dividida en una serie de datos de 'núcleo' de interacciones que fueron biológicamente confirmadas en por lo menos dos repeticiones independientes, y una serie de datos de 'no núcleo'. De manera sorprendente se descubrió que las series de datos, aparte de las proteínas de ciclo celular conocidas, también estaban comprendiendo proteínas de las cuales el papel en el ciclo celular nunca se había ilustrado antes. La robustez de ambas series de datos de núcleo y no núcleo se demuestra a través de diferentes análisis computacionales y a través de la interpretación biológica de la red. La ¡nteractoma sirve como una excelente herramienta generadora de hipótesis, y el poder de ella es alcanzado en particular cuando se integra con otros datos. Combinar los datos de ¡nteractoma con perfiles de expresión relacionados al ciclo celular da, por ejemplo, entendimiento en donde los complejos de CDK/ciclina son activos durante la división celular y cuándo. La prueba de datos de que los números altos de reguladores de ciclo celular en plantas no son la única consecuencia de redundancia, sino que diferentes reguladores de ciclo celular se combinan en complejos proveyendo diversidad funcional conduciendo a complejidad aumentada y flexibilidad del ciclo celular vegetal.

Un primer aspecto de la invención es un método para aislar proteínas novedosas relacionadas con el ciclo celular, comprendiendo (1) realizar un análisis de tap usando una proteína conocida de ciclo celular como carnada, (2) corregir los resultados para interacciones no específicas y (3) reconfirmar los resultados corregidos. Reconfirmar el resultado, como se usa aquí, se puede hacer al repetir el experimento de tap-tag (tap-etiqueta), o al llevar a cabo un tap-tag invertido, en donde la presa original ahora se usa como carnada. Otro aspecto de la invención es el uso de una proteína relacionada con el ciclo celular aislada con el método de la invención, para la modulación de crecimiento y/o rendimiento vegetal. En una modalidad preferida, dicha planta es una planta de cosecha, preferiblemente un monocotiledóneas o un cereal, incluso más preferible es un cereal seleccionado a partir del grupo que consiste de arroz, maíz, trigo, cebada, mijo, centeno, sorgo y avena. El uso, como se indica aquí, es el uso de la proteína, y/o el uso de un ácido nucleico codificando esta proteína, o el complemento de la misma. Está incluyendo, pero no se limita a ADN genómico, cADN, ARN mensajero (incluyendo las regiones 5' y 3' no traducidas) y ARNi; dicho uso puede resultar, como un ejemplo no limitante, en sobre-expresión, o represión de un gen blanco se puede obtener por transferencia de una construcción genética, destinada para dicha sobre-expresión o dicha represión de expresión en una planta. La transferencia de genes extranjeros en el genoma de una planta se llama transformación. La transformación de especies vegetales es una técnica casi de rutina conocida al experto en la técnica. De manera ventajosa, se puede usar cualquiera de varios métodos de transformación para introducir el gen de interés en una célula antecesora adecuada. Los métodos descritos para la transformación y regeneración de plantas de tejidos vegetales o células vegetales se pueden utilizar para transformación transitoria o estable. Los métodos de transformación incluyen, pero no se limitan a transformación mediada por "agrobacterium", el uso de liposomas, electroporación, químicos que aumentan la absorción de ADN libre, inyección del ADN directamente en la planta, bombardeo con pistola de partículas, transformación usando virus o polen o m icroproyecció n .

Preferiblemente, dichas proteínas relacionadas con el ciclo celular se seleccionan a partir de la lista que consiste de At1g56110, At3g17020, At3g21140, At5g60790, At4g38900, At3g49240, At5g24690, At1g06070, At4g34150, At1g20480, At5g20920, At3g15970, At5g13030, At1 g01880, At5g07310, At2g46610, At1 g10690, At3g04710, At3g24690, At4g16130, At2g05830, At1 g29220, At1 g55890, At1 g60650, At1g70830, At2g43140, At1 g77180, At5g18620, At5g02530, At5g14170, At1g52730, At2g33340, At 1 g03060, At3g62240, At4g38740, At5g61220, At3g53880, At3g56860, At 1 g01970, At 1 g 19520, At1g14620, At2g03820, At3g01280, At3g56690, At5g41190, At1g42440, At2g28450, At1 g09760, At1g10840, At3g11830, At5g54900, At1 g31760, At 1 g61870, At3g11760, At1g05805, At1g29200, At4g13850, At4g38780, At1g71380, At3g13640, At5g25060, At1g43700, At2g46020, At3g55760 y At5g21160 o una variante de las mismas. Las variantes, como se usan aquí, están incluyendo, pero no se limitan a homólogos, ortólogos y parálogos de dichas proteínas relacionadas con el ciclo celular. "Homólogos" de una proteína abarcan péptidos, oligopéptidos, polipéptidos, proteínas y enzimas teniendo sustituciones, omisiones y/o inserciones de aminoácido relativas a la proteína no modificada en cuestión y teniendo actividad biológica y funcional similar como la proteína no modificada de la cual se derivan. Los ortólogos y parálogos abarcan conceptos evolucionarlos usados para describir las relaciones ancestrales de genes. Los parálogos son genes dentro de la misma especie que se han originado a través de la duplicación de un gen ancestral; los ortólogos son genes de organismos diferentes que se han originado a través de especiación, y también se derivan de un gen ancestral común. Preferiblemente, dicho homólogo, ortólogo o parálogo tiene una identidad de secuencia a nivel de proteína de por lo menos 50%, 51%, 52%, 53%, 54% o 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, preferiblemente 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, más preferible, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, incluso más preferible 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, muy preferible 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o más como se mide en un BLASTp (Altschul y otros, 1997; Altschul y otros 2005).

Preferiblemente dicho uso es sobre-expresión del gen codificando la proteína relacionada con el ciclo celular, incluso más preferible es sobre-expresión de una proteína de ciclo celular de conformidad con la invención, seleccionada a partir del grupo que consiste de At1g56110, At3g17020, At3g21140, At5g25460, At5g60790 (SEC ID No. 1-5), o una variante de la misma. Preferiblemente, dicha sobre-expresión resulta en un aumento de crecimiento y/o rendimiento vegetal. El aumento de crecimiento y/o rendimiento vegetal se mide al comparar la planta de prueba, comprendiendo un gen usado de conformidad con la invención, con la planta parental, no transformada, crecida bajo las mismas condiciones como control. Preferiblemente, el aumento de crecimiento se mide como un aumento de producción de biomasa. "Rendimiento" se refiere a una solución en donde sólo una parte de la planta, preferiblemente una parte importante económica de la planta, tal como las hojas, raíces o semillas, se aumenta en biomasa. El término "aumento" como se usa aquí significa por lo menos un 5%, 6%, 7%, 8%, 9% o 10%, preferiblemente al menos 15% o 20%, más preferible 25%, 30%, 35% o 40% más rendimiento y/o crecimiento en comparación con plantas de control como se define en la presente. El aumento de crecimiento vegetal, como se usa aquí, preferiblemente se mide como aumento de cualquiera de una o más de biomasa total de planta, biomasa de hoja, biomasa de raíz y biomasa de semilla. En una modalidad preferida, dicho aumento es un aumento en biomasa de planta total. En una modalidad preferida, dicha planta es una planta de cosecha, preferiblemente una monocotiledónea o un cereal, incluso más preferible es un cereal seleccionado a partir del grupo que consiste de arroz, maíz, trigo, cebada, mijo, centeno, sorgo y avena.

Todavía otro aspecto de la invención es una proteína novedosa relacionada con el ciclo celular, aislada con el método de conformidad con la invención.

BREVE DESCRIPCIÓN DE LAS FIGURAS Figura 1: (A) Análisis de enriquecimiento sobre las series de datos de núcleo y no núcleo. Los enriquecimientos estadísticamente significativos están indicados con * (p-valor < 0.05) o con ** (p-valor < 0.01). Un análisis de enriquecimiento se realizó para genes que muestran expresión regulada por ciclo celular (Periódica), para genes que contienen un Unidad de consenso E2F o MSA en su promotor y para proteínas que contienen un sitio de fosforilación de consenso CDK. (B) Porcentaje del acervo genético entero (amplio de genoma), una colección de ciclo celular de 518 genes, proteínas de carnada (sin carnadas de reversa), y presas de núcleo y no núcleo (sin la colección de ciclo celular) teniendo al menos dos características. Los valores p se muestran en rojo. (C) La distribución de la transcripción PCC de la serie de datos de núcleo (curva roja) y no núcleo (curva verde), en comparación con la distribución promedio (curvas negra y gris) de 100 redes aleatorias que contienen un número igual de interacciones y genes.

Figura 2: Distribución del número de características relacionadas con el ciclo celular entre el acervo genético entero (amplio de genoma), una colección de 518 genes de ciclo celular, y proteínas de carnada (sin carnadas de reserva).

Figura 3: Perspectiva general de las subredes.

Figura 4: Peso fresco de líneas de control transformadas con vector vacío. Aproximadamente 100 plantas fueron analizadas para cada línea independiente (C1 y C 2 ) .

Figura 5: Distribución de plantas en función de su peso fresco. Las gráficas representan la frecuencia de planta perteneciendo a una cierta categoría de peso.

Figura 6: Distribución de plantas en función de su peso fresco. Las gráficas representan la frecuencia de planta perteneciendo a una cierta categoría de peso (% de plantas contra categoría de peso fresco, como en la figura 5). Las líneas analizadas son líneas independientes de aquellas presentadas en la figura 5.

EJEMPLOS Materiales y métodos a los ejemplos Clonación y purificación de TAP La clonación de transgenes codificando fusiones de tag bajo control del promotor 35S del virus mosaico de tabaco de coliflor constitutivo, transformación de cultivos de suspensión celular Arabidopsis, preparación de extracto de proteína, purificación de TAP, precipitación y separación de proteína se hicieron como se describió previamente (Van Leene y otros, 2007). El protocolo adaptado usado para purificación de complejos de proteína incorporando carnada etiquetada con GS se describe en cualquier otro lado (Van Leene y otros, 2008). Para identificación por espectrometría de masa, se i m p I e m e n ta ro n ajustes menores en comparación con protocolos previos descritos (Van Leene y otros, 2007), como se describe más adelante.

Proteólisis y aislamiento de péptido Después de decolorar, se lavaron bloques de gel durante 1 hora en H20, los puentes de disulfuro de polipéptido fueron reducidos durante 40 minutos en 25 mL de 6,66 mM de DTT en 50 mM de NH HC03 y en secuencia los grupos tiol fueron alquilados durante 30 minutos en 25 mL 55 mM de IAM en 50 mM de NH4HC03. Después de lavar los bloques de gel 3 veces con agua, líneas completas de los geles de proteína fueron cortadas en rebanadas, recolectadas en placas de microtitulación y tratadas esencialmente como se describió antes con modificaciones menores (Van Leene y otros, 2007). Por pozo de placa de microtitulación, se rehidrataron partículas de gel deshidratado en 20 pL regulador de digestión conteniendo 250 ng de tripsina (MS Gold; Promega, Madison, Wl), 50 mM de NH4HC03 y 10% de CH3CN (v/v) durante 30 minutos a 4°C. Después de agregar 10 µ? de un regulador que contiene 50 mM de 1 o NH4HC03 y 10% de CH3CN (v/v), proteínas fueron digeridas a 37°C durante 3 horas. Los péptidos resultantes se concentraron y desalaron con puntas de fase sólida de microcolumna (punta PerfectPureTM C18, 200 nL volumen de lecho; Eppendorf, Hamburgo, Alemania) y eludieron directamente en una placa blanco MALDI (Opti-TOFTM384 Inserto de Pozo; Applied Biosystems, Foster City, CA) usando 1.2 µ L de 50% de CH3CN: 0.1% de solución de CF3COOH saturada con ácido a-ciano-4-hidroxicinámico y fortalecida con 20 fmol/pL de Glu1 Fibrinopéptido B (Sigma Aldrich), 20 fmol/pL de des-Pro2-Badykinin (Sigma Aldrich), y 20 fmol/pL de Fragmento de hormona adrenocroticotrópica 18-39 humano (Sigma Aldrich).

Adquisición de espectro de masa Un instrumento MALDI tándem MS (4700 y 4800 analizador Proteomics, Applied Biosystems) se usó para adquirir huellas digitales de masa de péptido y espectro de fragmentación posterior 1 kV CID de péptidos seleccionados. Se obtuvieron espectro de masa de péptido y espectro de secuencia de péptido usando los ajustes en esencia como se presentó previamente (Van Leene y otros, 2007). Cada placa MALDI se calibró de acuerdo con las especificaciones del fabricante. Todo el espectro de huella digital de masa de péptido (PMF) se calibró internamente con tres estándares internos a m/z 963.516 (des-Pro2-Bradykinin), m/z 1570.677 (Glu 1 -Fibrinopéptido B), y m/z 2465,198 (Fragmento de hormona adrenocorticotrópica 18-39) resultando en una precisión de masa promedio de 5 ppm ± 10 ppm por cada mancha de péptido analizada en los blancos MALDI analizados. Usando el espectro de PMF individual, hasta dieciséis péptidos, excediendo una relación de señal-a-nariz de 20 que pasó a través de un filtro de exclusión de masa se sometieron a análisis de fragmentación.

Identificación de homología de proteina a base de MS Se procesaron espectro de PMF y el espectro de secuencia de péptido de cada muestra usando la suite de software acompañada (GPS Explorer 3.6, Applied Biosystems) con ajustes de parámetro en esencia como se describió previamente (Van Leene y otros, 2007). Se generaron archivos de búsqueda de datos y se sometieron a identificación de homología de proteína al usar un motor de búsqueda de base de datos local (Mascot 2.1 , Matrix Science). Una base de datos de proteína Arabidopsis no redundante in house llamado SNAPS Arabidopsis thaliana versión 0.4 (SNAPS = Ensamble No redundante Simple de Secuencias de Proteína, 77488 entradas de secuencia, 30468560 residuos; disponible en http://www.ptools.ua.ac.be/snaps) fue compilada de nueve bases de datos públicas. Se retuvieron identificaciones de homología de proteína del hit superior (primer rango) con una calificación relativa excediendo 95% de probabilidad. Se retuvieron identificaciones positivas adicionales (segundo rango y más) cuando la calificación excedió el umbral de 98% de probabilidad. Ya que se hicieron identificaciones con versiones diferentes de la base de datos SNAPS (Van Leene y otros, 2007), y con la meta de obtener más uniformidad entre las identificaciones, todas las identificaciones de la serie de datos de núcleo y no núcleo se volvieron a someter a Mascot e identificaron con el repertorio de secuencia de proteína a partir de la última base de datos TAIR (TAIR8.0). Además, se implemento una restricción adicional para reducir el número de falsas identificaciones positivas, y así, se descartaron identificaciones, para las cuales más de 50% de los péptidos correspondientes tuvieron un fallo-corte de tripsina.

Análisis de enriquecimiento GO Se hizo análisis de sobre- y bajo-representación de términos GO con la herramienta BiNGO (Maere y otros, 2005) en Cytoscape (Shannon y otros, 2003). Se eligió la prueba hipergeométrica a un valor de significancia de 0.05 con la corrección de velocidad de falso descubrimiento de Benjamini y Hochberg para múltiple prueba. El archivo de anotación de gen Arabidopsis en el análisis se descargó del sitio web de ontología genética el 4 de octubre de 2008.

Análisis de enriquecimiento de ciclo celular Para el análisis de enriquecimiento genético periódico, se compiló una lista de 1258 genes mostrando expresión regulada por ciclo celular y asociada con ciclo celular de dos series de datos (Menges y otros, 2003; Jensen y otros, 2006). Amplio de genoma corresponde a todos los 23834 genes presentes en la microarray Affymtetrix ATH1. Los genes que contienen moti vadores activadores E2F o M-específicos (MSA) en su secuencia promotora fueron determinados in silico al combinar datos de expresión de transcripción y genómicos comparativos (Vandepoele y otros, 2006). Aquí, amplio de genoma corresponde a 19173 genes para los cuales una serie de sonda única está disponible en la microarray ATH1. Las proteínas que contienen el sitio de fosforilación de consenso CDK [ST]PX[KR], un sello conocido de sustratos de CDK (De Veylder y otros, 1997), fueron consideradas como sustratos de CDK potenciales. La presencia del Unidad de consenso fue evaluada con la herramienta patmatch disponible en TAIR, y por tanto, amplio de genoma corresponde aquí a todas las 27235 proteínas presentes en la liberación TAIR8.0. Para todo el análisis de enriquecimiento, se calcularon los p-valores con la función de distribución cumulativa hipergeométrica del software Matlab 7.5. Las proteínas que no pudieron ser asignadas a un locus genético específico fueron descartadas de todo el análisis de enriquecimiento.

Traslape con bases de datos de proteína-proteína Para evaluar la novedad del ¡nteractoma de ciclo celular, se evaluó el traslape de las series de datos con las siguientes bases de datos que contienen interacciones de p ro te í n a- p rote í n a : TAIR (Huala y otros, 2001 ), InTact (Kerrien y otros, 2007), Reactome Arabidopsis (Tsesmetzis y otros, 2008), AtPID (Cui y otros, 2008), Reactome (Vastrik y otros, 2007) y el recurso de Bio-Array (BAR) para genómica funcional Arabidopsis (Geisler-Lee y otros, 2007).

Análisis de co-ex resión Los coeficientes de correlación Pearson de transcripción (PCC), representando el grado de co-expresión de pares genéticos, fueron calculados con base en un compendio de micro-array Arabidopsis ATH1 de 518 experimentos enfocados hacia crecimiento y desarrollo de ciclo celular o vegetal (tabla 7). Se comparó la distribución PCC de ambas series de datos con la distribución PCC de 100 series de datos aleatorias con un número igual de proteínas e interacciones elegidas de forma aleatoria.

Construcciones y transformación vegetal Se produjeron las construcciones de sobre-expresión al usar tecnología de clonación de entrada. El cADN de los genes de interés (tabla, hoja OE producido y LOF solicitado) se amplificó por PCR de ARN transcrito invertido extraído de ejidos de Arabidopsis thaliana ecotipo Columbia. Las reacciones de PCR se realizaron usando la polimerasa de ADN de alta fidelidad Phusion (Finnzymes) de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Los fragmentos de PCR, correspondientes a cADN completo de los genes de interés se introdujeron en pDONr 201 usando el sistema Gateway (Invitrogen) por sitios de recombinación aí/BXaífP y posteriormente recombinados en el vector de expresión pK7WG2 por recombinación de sitios arfL Xaf/R. La secuencia fue confirmada al secuenciar. Las construcciones que contienen los genes de interés bajo el control del promotor CaMV 35S se usaron para transformar Arabidopsis thaliana por el método "flowerdip" (Clough y Bent, 1998).

Condición de material y crecimiento vegetal Se identificaron líneas transgénicas por selección en medio MS ( M u ra sh ige de resistencia media y medio Skoog (Duchefa, Haarlem, Los Países Bajos), sacarosa 1%) suplementada con 50 mg/l de kanamicina y después transferida a tierra para producción de semilla. Una segunda selección en MS más kanamicina permitió la selección de líneas que contienen un sitio de inserción del transgen. Las plantas fueron crecidas bajo un régimen de un día de 16 horas y noche de 8 horas a 21°C.

Prueba de biomasa Para la medición de biomasa, la parte vegetativa de una planta de 20 días crecida en medio MS se cosechó y el peso fresco se midió al pesar aproximadamente 60 plantas de cada línea.

Ejemplo 1: Aislamiento de los complejos TAP Como carnadas se usó 73 proteínas reguladoras de ciclo celular de núcleo (Vandepoele y otros, 2002; Menges y otros, 2006; Pérez y otros, 2007), 4 proteínas mitóticas de punto de verificación (Menges y otros, 2005), 8 subunidades de complejo promotor de anafase (APC) y 6 activadores APC (Capron y otros, 2003), una subunidad de 26S proteasoma (Brukhin y otros, 2005), 10 proteínas involucradas en réplica de ADN o reparación (Schuitz y otros, 2007), y como prueba de concepto, 6 proteínas para experimentos TAP invertidos (tabla 1). De las 108 fusiones TAP, 102 se expresaron con éxito. En total, 303 purificaciones se realizaron con al menos dos purificaciones independientes por carnada.

Ejemplo 2: Identificación de las proteínas de presa Se identificaron proteínas purificadas vía MALI-TOFTOF. Las proteínas no específicas, determinadas por purificaciones de control, fueron sustraídas de las listas negras (tabla 2), generando una serie de datos no redundante de 857 interacciones entre 393 proteínas. Esta serie de datos se dividió en una serie de datos de 'núcleo' de 371 interacciones entre 196 proteínas, conteniendo interacciones que se confirmaron biológicamente en al menos 2 repeticiones independientes o en el experimento recíproco, y una serie de datos de 'no núcleo' con el resto de 486 interacciones entre 320 proteínas.

Ejemplo 3: Análisis de enriquecimiento Para evaluar la calidad del ¡nteractoma, se realizó análisis de enriquecimiento diferente en las presas de núcleo y no núcleo. En ambas series de datos, el término GO 'ciclo celular' fue altamente enriquecido (tabla 3). Los enriquecimientos GO adicionales demuestran que el ciclo celular está ligado a una miríada de procesos biológicos que incluyen crecimiento y desarrollo, respuesta a estrés y estímulo hormonal, producción de energía, remodelación de cromatina y otros. Después, se observó un enriquecimiento en la serie de datos de núcleo para genes expresados periódicamente durante el ciclo celular (figura 1A). Además, ambas series de datos se enriquecieron para genes con unidades activadoras E2F o M-específicas (MSA) en su promotor. Los enriquecimientos menos pronunciados para la serie de datos de no núcleo indican que es más afectado por interacciones ligando a la maquinaria de ciclo celular de núcleo con otras vías. Esto es apoyado por el hecho de que la serie de datos de no núcleo es más enriquecida para sustratos CDK potenciales, como se evaluó por la presencia de sitios de fosforilación CDK. El hecho de que estas interacciones a menudo no fueron confirmadas probablemente se debe a la naturaleza transitoria de, por ejemplo, interacciones de CDK/sustrato.

Ejemplo 4: Aislamiento de genes novedosos de ciclo celular En una búsqueda para nuevas proteínas relacionadas de ciclo celular, se integraron características diferentes relacionadas con ciclo celular (tabla 4). La distribución del número de características por gen muestra que una colección de genes conocidos de ciclo celular (tabla 5) está enriquecido para estas características en comparación con el acervo genético entero (figura 2). Un cambio claro entre el acervo genético entero y la colección de ciclo celular fue visible en 2 características, como fue el caso para la lista de carnada original, validando la elección de nuestras carnadas. En búsqueda para nuevas proteínas de ciclo celular, se partió de la lista de presa de núcleo y no núcleo y se sustrajo la colección de genes conocidos de ciclo celular. El porcentaje cumpliendo con el criterio de tener al menos 2 características se muestra (figura 1B), y todas las clases son significativamente enriquecidas en comparación con el acervo genético entero. Al filtrar para genes que contienen al menos 2 características, se generó una lista de 123 nuevos genes potenciales de ciclo celular a partir de la serie de datos de núcleo o no núcleo (tabla 6).

La robustez de los datos se ejemplifica más por la observación que 46% de las interacciones de serie de datos de núcleo y 8% de no núcleo están entre carnadas, ya que nuestras carnadas deben actuar en vías comunes. La evaluación de los datos para traslapar con bases de datos existentes de interacción de proteína-proteína aprendió que 66% de las interacciones de serie de datos de núcleo y 95% de no núcleo son nuevas.

Por el otro lado, esto implica que un tercio de la serie de datos de núcleo es validada por otros medios. Finalmente, las interacciones de ambas series de datos tienden a ser más coexpresadas en comparación con interacciones de series de datos aleatorias como se evaluó por el cálculo del coeficiente de correlación Pearson de transcripción (PCC) (figura 1C). El ¡nteractoma integrado de ciclo celular se puede accesar a través de un inicio de red Cytoscape y se provee como una tabla de pivote de matriz que permite fácil búsqueda del interactoma. Para demostrar la importancia biológica del interactoma, se discute más adelante una selección de subredes, cubriendo interacciones de tanto la serie de datos de núcleo como no núcleo (figura 3).

Ejemplo 5: Genes aislados de los complejos CDK Los jugadores clave en progresión de ciclo celular son complejos de kinasa dependiente de ciclina (CDK). CDKA;1 , el ortólogo Arabidopsis de levadura cdc2/cdc28, co-purif icado con todas las ciclinas tipo D y con ciclinas tipo A3, pero no con las ciclinas mitóticas tipo A1 , A2 o B. Combinar los datos de interactoma con datos de expresión (Menges y otros, 2005) se especula que en la reentrada de ciclo celular y temprano en fase G1 , CDK1 ;1 une a CYCD3;3 y CYCD5;1. Más en fase G1 y en el punto de verificación G1/S, CDKA;1 une una variedad de ciclinas tipo D, tales como CYCD4;1 , CYCD4;2, CYCD3;1 , CYCD6;1 y CYCD7;1. Además, CDKA;1 interactúa con ciclinas tipo A3 específicas de fase S. las otras ciclinas tipo A y B, de las cuales la mayoría posee un pico de expresión en el límite G2/M, unen las CDKs mitóticas de tipo B específicas de planta. Las ciclinas tipo B1 se asocian exclusivamente con CDKs tipo B2, mientras que el resto de ciclinas tipo A y B preferencia Imente unen CDKs tipo B1. Aunque las interacciones transitorias son más difíciles de evaluar con TAP, el interactoma contiene diferentes sustratos de CDK potenciales. Como se predice (Geisler-Lee y otros, 2007), CDKA;1 , está presente como un cubo altamente conectado en la red de núcleo. Co-purificó la proteína desconocida AT4G14310 que estuvo presente en complejos con CKS1, CKS2, CYCA3;1, CyCA3;4 y KRP2 y la purificación reversa confirmó interacción con CDKA;1 y CKS2 y reveló interacción con la proteína KCA2 de motor de kinesina específica involucrada en determinación de plano de división. Después, CDKA;1 fue derribado con el complejo de 26S proteasoma, purificado a través de RPN1a, posiblemente reflejando regulación de ciclo celular de la 26S proteasoma. CDKA;1 además interactuó con 3 proteínas de la vía de biosíntesis de UDP-xilosa, acolando regulación de ciclo celular con síntesis de pared celular (Siefert, 2004). Con 3 ciclinas tipo A, se recogió una proteína de reparación de ADN con CYCB1;3 se descubrió ?-tubulina y un componente de cuerpo de polo de husillo, 2 proteínas involucradas en nucleación microtubular durante, por ejemplo, ensamble de la banda de preprofase, una estructura específica de planta requerida para determinación de polaridad durante ciclo celular (Erhardt y otros, 2002). Además, algunas proteínas de remodelación de cromatina interesantes se identificaron con diferentes ciclinas: CHR17, una proteína ISWI regulada ascendente de E2F ( H ua nca- Ma m an i y otros, 2005) interactuó con CYCD3;2 y CYCD5;1. CHC1 asociada con CYCA1;1, CYCD7;1, CYCB2;3 y CKS2, y BRAHMA, una ATPasa de remodelacion de cromatina de SWI/SNF implicada en la formación y/o mantenimiento de células límite de cotiledón durante embriogénesis (Kwon y otros, 2006), se identificó con CYCB1;3 y CYCB2.3.

Ejemplo 6: Aislamiento de reguladores positivos del ciclo celular Para actividad completa las CDKs requieren, después de unión a ciclina, fosforilación de un residuo de treonina dentro del lazo T al activar con CDK kinasas (CAK). El genoma de Arabidopsis codifica 4 CAKs, a saber 3 CDKs de tipo D, homologas a CDK7 humana, y 1 kinasa CAK-activante independiente de ciclina (CAKAK) CDKF;1. Aquí se muestra que tanto CDKD;2 como CDKD;3 forman un complejo trimérico con CYCH;1 y el factor de ensamble de CAK MAT1. Como en arroz (Rohila y otros, 2006), CDKD;2 también es parte del complejo de TFIIH basal involucrado en la transcripción y reparación de ADN, como 3 miembros co-purificados (UVH6/XPD, AT1G55750 y AT4G17020). En este complejo, CDKD;2 activa transcripción a través de fosforilación del dominio de terminal C (CTD) de ARN polimerasa II. Con UVH6 y MAT1 como carnadas, se confirmó interacción con CDKD;2 y purificó dos proteínas más del complejo TFIIH. CDKD;2 co-purificó además proteínas involucradas en biosíntesis de nucleótido, a saber 3 pirofosfokinasas de ribosa-fosfato. Más ascendente, la CAKAK CDKF;1 monomérica activa CDKD;2 en una manera independiente de ciclina. Por el otro lado, CDKF; 1 también une CDKG;2. La clase de CDK tipo G tiene 2 miembros en Arabidopsis, y s homologa a la proteína humana ga lactosiltransferasa p58 asociada con citocinesis. Aquí se descubrió CYCL1, una ciclina con un dominio de empalme tipo SR (Forment y otros, 2002), como la pareja de ciclina reguladora de ambas CDKs de tipo G, validando la agrupación de CYCL1 con CDKG;2 en un análisis de expresión genética específica de tejido (Menges y otros, 2005). Ambas proteínas i n te ra ct u a nd o de núcleo y no núcleo insinúan una función de complejos de CDKG/CYCL en la regulación de transcripción y empalme, de modo que la activación de CDKF;1 podría conducir a casos de empalme alterados durante la proliferación celular.

Ejemplo 7: Aislamiento de reguladores negativos del ciclo celular La regulación negativa de progresión de ciclo celular se logra al acoplar proteínas pequeñas a los complejos de CDK/ciclina. Arabidopsis codifica 7 proteínas relacionadas con inhibidores mamíferos Kip/Cip, conocidas como proteínas relacionadas con Kip (KRPs). Aquí se muestra que todas las KRPs, excepto KRP1 , interactúan con CDKA;1 y ciclinas de tipo D. Con 3 KRPs, CDKB1 ;2 y 2 activadores de APC se descubrió un factor de transcripción AP2 responsivo de etileno (TF), y con KRP2 se escogió un TF de bZIP también encontrado con ciclinas de tipo B y CDKB1 ;2. En plantas, una segunda familia de proteínas inhibidoras de ciclo celular existen que son reguladas de manera ascendente por estrés abiótico y biótico, comprendiendo proteínas SIAMESE (SIM) y relacionadas con SIAMESE (SMR) (Peres y otros, 2007; Churchman y otros, 2006). SIM es una proteína nuclear que promueve la endoreduplicación en tricomas por supresión de mitosis. Se propuso que inhibe mitosis a través de inhibición de complejos de CDKA;1/CYCD (Churchman y otros, 2006). Sin embargo, en la serie de datos, SIM co-purifica CDKB1 ;1 y no CDKA;1 , de modo que la endoreduplicación se puede disparar directamente al inhibir complejos mitóticos de CDKB/ciclina. Después de SIM, también SMR1 y SMR2 se asocian con CDKB1;1, y el interactor CYCB2;4 de CDKB1;1 une AT2G28330, un miembro adicional de la familia SMR. En contraste, SMR3-5 une CDKA;1 y ciclinas tipo D. Aparte, con CDKA;1 y diferentes ciclinas tipo D como carnada, se escogió 2 nuevos miembros del clan SMR, AT5G40460 y AT1G10690, y purificaciones de reversa confirmaron estas interacciones. Ya que AT5G40460 fue casi inducido 20 veces en plantas sobre-expresando E2Fa y DPa (Vandepoele y otros, 2005), puede inhibir complejos de CDKA;1/CYCD durante la fase S previniendo re-iniciación de réplica de ADN. SMR1 co-purificó además bZIP69, un TF también encontrado con KRP3 y KRP5. Las importinas a menudo se co-purificaron tanto con KRPs como SMRs, apoyando la importancia de la regulación de su localización subcelular para su actividad.

Ejemplo 8: Aislamiento de genes involucrados en síntesis de nucleótido, replicación de ADN y reparación de ADN En el límite de G1/S, CDKs activan la vía de E2F/DP por fosforilación del RBR represor, induciendo transcripción de genes a saber involucrados en síntesis de nucleótido, replicación de ADN y reparación de ADN. Se demuestra que E2Fa y E2Fb se pueden asociar ambos con DPa y DPb, y que todas las proteínas E2F y DP co-purifican RBR. Ya que CDKB1;1 interactuaron con DEL3, una proteína E2F atípica carente del dominio de trans-activación, se propone que DEL3 sea regulada por actividad de CDKB1;1, consistente con un segundo pico de expresión de DEL3 a G2/M (Menges y otros, 2005). De manera interesante, la CDKB1;1 mitótica y no CDKA;1, co-purificaron con RBR, proveyendo más evidencia que la red de E2F/DP/RBR no sólo está activa en G1/S sino también en transiciones G2/M, como se sugirió previamente en plantas (Magyar y otros, 2005) y células mamíferas (Ishida y otros, 2001), o que los complejos mitóticos de CDK/ciclina están activos durante fase S como en levadura (Wuarin y otros, 2002). Además se identificó algunos complejos en replicación de ADN, como el complejo MCM, poseyendo actividad de helicasa para desenrollar ADN de doble cadena durante replicación de ADN. Este complejo se aisló con MCM6 como carnada, junto con lo recientemente publicado (Takahashi y otros, 2008) y gen 1 blanco de E2F altamente co-expresado (ETG1). La fracción co-purificada de antígeno 1 nuclear celular proliferante (PCNA1), una pinza deslizante para ADN polimerasa y de esta manera un actor clave en replicación de ADN, contuvo PCNA2, dos subunidades delta de ADN polimerasa (POLD1-2), de las cuales una también interactuó con CYCA2;3, una familia de repetición de a rmad il I o/be ta-ca te n i n a de función desconocida y una proteína de unión de ADN. Además, se prueba la existencia del complejo de factor C de replicación Ctf18 alternativo en plantas, requerido para cohesión hermana de cromátida en levadura (Mayer y otros, 2001 ) y un complejo de proteína involucrado en estabilización de ADN de una cadena durante replicación, reparación y transcripción, incluyendo RPA2, 2 proteínas RPA3 y una proteína de replicación putativa (Schultz y otros, 2007).

Ejemplo 9: Análisis de líneas de sobre-expresión Treinta y dos genes se clonaron en vectores de expresión usando clonación Gateway para producir plantas sobre-expresando los genes de interés bajo el control del promotor CaMV35S (tabla, hoja produjo OE y LOF solicitado). Etas construcciones se usaron para transformación de Arabidopsis thaliana usando el método "flowerdip". Se seleccionaron primo-transformantes para todas las construcciones y crecieron para producción de semilla. Las semillas de 11 construcciones (At5g25460, At3g01280, At1g31760, At3g21140, At3g17020, At1g05805, At1g10690, At1g56110, At5g24690, At5g60790, At1g09760) se cosecharon y usaron para seleccionar líneas teniendo un sitio de inserción del transgen. Se ha llevado a cabo una prueba de biomasa en estas poblaciones de segregación conteniendo un sitio de inserción, se espera encuentre ¾ de peso, 2/4 de plantas hemicigotos y ¾ homocigotos. Cuando la sobre-expresión de un transgen conduce a la producción de plantas más grandes, una fracción (¼ o ¾) de las plantas analizadas mostrará una biomasa aumentada. Este método permite una evaluación rápida de genes de los cuales la sobre-expresión da un efecto positivo en crecimiento vegetal. Las plantas entonces fueron crecidas bajo condición in vitro y el peso fresco de roseta de aproximadamente 60 plantas fue medido 20 días después de estratificación (tabla, hoja datos OE + promedio). Las plantas de control usadas en este experimento corresponden a plantas de segregación transformadas con un vector vacío (C1 y C2). Como se muestra en la figura 4, para estas dos líneas de control independientes, el peso fresco de la planta varia de 8 m a 28 mg con un promedio de 20 mg. Entre las 11 líneas sobre-expresando analizadas, se descubrió que para 5 (At1g56110, At3g17020, At3g21140, At5g25460, At5g60790) esta distribución de peso se cambia hacia plantas más grandes que en los controles (figura 5). Este cambio en rango de biomasa se descubrió para 3 de estas líneas en dos transformadores independientes (figura 6). La presencia de plantas más grandes en esta población de segregación prueba que estos 5 genes están involucrados en el control de crecimiento.

Tabla 1 : Visión general de proteínas de carnada usadas para elucidar el interactoma de ciclo celular de núcleo de Arabidopsis thaliana.

Topología = fusiones de tag de terminal C o N. Tag se refiere a la etiqueta aplicada siendo ya sea la tag de TAP tradicional desarrollada para Saccharomyces cerevisiae (15), o una etiqueta de afinidad dual optimizada (GS) (2). La expresión se indicó como ( + ) si la proteína de fusión de TAP se pudo detectar por análisis de western blot. El número total de purificaciones realizadas por carnada se muestra, con un mínimo de 2 experimentos.

Carnada Locus Categoría Topología Tag Expresado Purificaciones CDKA;1 AT3G48750 ciclo C + N TAP 11 celular de núcleo CDKB1;1 AT3G54180 ciclo C + N TAP celular de núcleo CDKB1;2 AT2G38620 ciclo C TAP celular de núcleo CDKB2;1 AT1G76540 ciclo N TAP celular de núcleo CDKB2;2 AT1 G20930 ciclo TAP celular de núcleo CDKC;1 AT1G20930 ciclo TAP celular de núcleo CDKC;2 AT5G64960 ciclo TAP celular de núcleo CDKD;1 AT1G73690 ciclo TAP celular de núcleo CDKD;2 AT1G66750 ciclo C + N TAP 10 celular de + GS Carnada Locus Categoría Topología Tag Expresado Purificaciones núcleo CDKD;3 AT1G18040 ciclo TAP celular de núcleo CDKE;1 AT5G63610 ciclo N TAP celular de núcleo CDKF;1 AT4G28980 ciclo C TAP celular de núcleo CDKG;1 AT5G63370 ciclo C GS celular de núcleo CDKG;2 AT1G67580 ciclo TAP celular de núcleo CKS1 AT2G27960 ciclo TAP 10 celular de + GS núcleo CKS2 AT2G27970 ciclo TAP celular de núcleo CYCA1 ;2 AT 1 G44110 ciclo C TAP celular de núcleo CYCA1 ;2 AT1 G77390 ciclo TAP Carnada Locus Categoría Topología Tag Expresado Purificaciones celular de núcleo CYCA2;1 AT5G25380 ciclo TAP celular de núcleo CYCA2;2 AT5G11300 ciclo C TAP celular de núcleo CYCA2;3 AT1 G15570 ciclo TAP celular de núcleo CYCA2;4 AT1G80370 ciclo TAP celular de núcleo CYCA3;1 AT5G43080 ciclo C TAP celular de núcleo CYCA3;2 AT 1 G 47210 ciclo N TAP celular de núcleo CYCA3;2 AT1G47220 ciclo GS celular de núcleo CYCA3;4 AT1G47230 ciclo TAP celular de núcleo Carnada Locus Categoría Topología Tag Expresado Purificaciones CYCB1 ;1 AT4G37490 ciclo TAP celular de + GS núcleo CYCB1 ;2 AT5G06150 ciclo TAP celular de núcleo CYCB1 ;3 AT3G11520 ciclo C TAP celular de núcleo CYCB1 ;4 AT2G26760 ciclo C TAP celular de núcleo CYCB2;1 AT4G17620 ciclo N TAP celular de núcleo CYCB2;2 AT4G35620 ciclo C TAP celular de núcleo CYCB2;3 AT1G20610 ciclo C TAP celular de núcleo CYCB2;4 AT1G76310 ciclo C GS celular de núcleo CYCB2;5 AT1G20590 ciclo TAP celular de Carnada Locus Categoría Topología Tag Expresado Purificaciones núcleo CYCB3;1 AT1G16330 ciclo TAP celular de núcleo CYCD1 ;1 AT1G70210 ciclo TAP celular de núcleo CYCD2;1 AT2G22490 ciclo TAP celular de núcleo CYCD3;1 AT4G34160 ciclo TAP celular de núcleo CYCD3;2 AT5G67260 ciclo TAP celular de núcleo CYCD3;3 AT3G50070 ciclo TAP celular de núcleo CYCD4;1 AT5G65420 ciclo TAP celular de núcleo CYCD4;2 AT5G10440 ciclo C TAP celular de núcleo CYCD5;1 AT4G37630 ciclo TAP Carnada Locus Categoría Topología Tag Expresado Purificaciones celular de núcleo CYCD6;1 AT4G03270 ciclo TAP celular de núcleo CYCD7;1 AT5G02110 ciclo GS celular de núcleo CYCH;1 AT5G27620 ciclo TAP celular de núcleo CYCT1;3 AT1G27630 ciclo C TAP celular de núcleo DEL1 AT3G48160 ciclo TAP celular de núcleo DEL2 AT5G14960 ciclo TAP celular de núcleo DEL3 AT3G01330 ciclo TAP celular de núcleo DPa AT5G02470 ciclo TAP celular de núcleo Carnada Locus Categoría Topología Tag Expresado Purificaciones DPb AT5G03415 ciclo N TAP celular de núcleo E2Fa AT2G36010 ciclo TAP celular de + GS núcleo E2Fb AT5G22220 ciclo TAP celular de núcleo E2Fc AT2G47870 ciclo TAP celular de núcleo KRP1 AT2G23430 ciclo TAP celular de núcleo KRP2 AT3G50630 ciclo TAP celular de núcleo KRP3 AT5G48820 ciclo TAP celular de núcleo KRP4 AT2G32710 ciclo TAP celular de núcleo KRP5 AT3G24810 ciclo TAP celular de Carnada Locus Categoría Topología Tag Expresado Purificaciones núcleo KRP6 AT3G19150 ciclo N TAP celular de núcleo KRP7 AT1G49620 ciclo N TAP celular de núcleo RBR AT3G12280 ciclo N TAP celular de núcleo WEE1 AT1G02970 ciclo TAP celular de núcleo Como AT5G03455 ciclo C TAP Cdc25 celular de núcleo MAT1 AT4G30820 ciclo N TAP celular de núcleo SIM AT5G04470 ciclo TAP celular de núcleo SMR1 AT3G10525 ciclo TAP celular de núcleo S R2 AT1G08180 ciclo TAP Carnada Locus Categoría Topología Tag Expresado Purificaciones celular de núcleo SMR3 AT5G02420 ciclo TAP celular de núcleo S R4 AT5G02220 ciclo C + N TAP celular de núcleo SMR5 AT1G07500 ciclo N GS celular de núcleo APC'2 AT2G04660 núcleo de N TAP APC APC4 AT4G21530 núcleo de C TAP APC APC7 AT2G39090 núcleo de N TAP APC APC8 AT3G48150 núcleo de N TAP APC APC10 AT2G18290 núcleo de N TAP APC APC11 AT3G05870 núcleo de TAP APC CDC16 AT1G78770 núcleo de TAP APC CDC27B AT2G20000 núcleo de C TAP Carnada Locus Categoría Topología Tag Expresado Purificaciones APC CCS52A1 AT4G22910 activador N TAP + 4 de APC CCS52A2 AT4G11920 activador N TAP + 6 de APC CCS52B AT5G13840 activador N TAP + 4 de APC CDC20.1 AT4G33270 activador N TAP + 2 de APC CDC20.3 AT5G27080 activador N TAP + 2 de APC CDC20.6 AT5G27945 activador C TAP de APC RPN 1 a AT2G20580 26S N TAP + 2 proteasoma CDC6 AT2G29680 replicación N TAP + 2 de ADN CDC6b AT1 G07270 replicación C TAP + 2 de ADN CTF8 AT5G52220 replicación N GS + 2 de ADN ETG1 AT2G40550 replicación C + N TAP + 4 de ADN MCM6 AT5G44635 replicación C TAP + 2 de ADN MCM7 AT4G02060 replicación C TAP + 2 Carnada Locus Categoría Topología Tag Expresado Purificaciones de ADN ORC1a AT4G 14700 replicación N TAP de ADN PCNA1 AT1 G07370 replicación N TAP de ADN RPA2 AT2G24490 replicación TAP de ADN UVH6 AT1 G03190 reparación C TAP de ADN BUB3 AT1G69400 punto de TAP verificación m itótico como AT3G19590 punto de N TAP BUB3 verificación m itótico como AT2G33560 punto de N TAP BUBR1 erificación m itótico como AT3G25980 punto de TAP MAD2 verificación m itótico DL3195C AT4G14310 reversa N TAP 2 F27G20.14AT1 G32310 reversa C GS 2 expresado AT5G40460 reversa C TAP 2 expresado AT1 G 10690 reversa N TAP 2 UV14 AT2G42260 reversa N TAP 2 Carnada Locus Categoría Topología Tag Expresado Purificaciones como AT3G57860 reversa Ñ TAP + 2 U V 14 Lista 2: Lista de identificaciones de control.

Las identificaciones de control determinadas por TAP simulado (7) o GS (3) purificaciones, y por purificaciones con extractos de cultivos expresando fusiones de TAP de GFP heterologa (7), RFP (2) o ß-glucuronidasa (5), o fusiones de GS de GFP heterologa (8), o ß-glucuronidasa (4). No se incluyeron proteínas ribosomales, actinas y tubulinas identificadas en estos experimentos de control. El número de experimentos de control se muestra entre corchetes.

Número de Nombre de proteína acceso AT1G01460 proteína de la familia fosfatidilinositol-4-fosfato-5-k¡nasa AT1G02400 giberelina 2-oxidasa, putativa / GA2-oxidasa, putativa AT1G02500 S-adenosilmetionina sintetasa 1 (SAM1 ) AT1G02930 glutationa S-transferasa , putativa AT1G04190 proteína que contiene (TPR) de repetición de tetratricopéptido AT1G04600 miosina, putativa AT1G04690 proteína de canal de potasio, putativa AT1G05320 relacionada con miosina Número de Nombre de proteína acceso AT1G05450 Inhibidor de proteasa/almacenaje de semilla/relacionado con proteína de transferencia de lípido (LTP) AT1G05970 proteína expresada AT1G06220 proteína de la familia de factor Tu de alargamiento AT1G06780 proteína de la familia 8 de glicosilo transferasa AT1G07920 factor de alargamiento 1-alfa AT1G07930 factor de alargamiento 1-alfa AT1G08520 subunidad chID de quelatasa de magnesio, cloroplasto, putativa AT1G09080 proteína de unión luminal 3 (BiP-3) (BP3) AT1G09450 relacionada con haspina AT1G09780 fosfoglicerato mutasa independiente de 2,3- bifosfoglicerato, putativa AT1G09980 proteína expresada AT1G10270 proteína que contiene repetición de pentatricopéptido (PPR) AT1G10390 proteína de la familia de nucleoporina AT1G10590 relacionado con proteína de unión a ADN AT1G11480 relacionado con factor de iniciación de traducción eucaríótica AT1G12410 subunidad proteolítica de CIp proteasa dependiente de ATP (ClpP2) AT1G13020 factor de iniciación de traducción eucariótico, putativo Número de Nombre de proteína acceso AT1G13440 glíceraldeh ido 3-fosfato deshidrogenasa , citosólico, putativo AT1G13610 proteina expresada AT1G13910 F16A14.12 (proteína de la familia de repetición rica en le uci na ) AT1G14315 proteína de caja F putativa AT1G14850 proteína de la familia de nucleoporina no repetitiva/negativa de WGA AT1G14980 10 kDa chaperonina (CPN 10) AT1G15730 factor L interactuando con PRLI, putativo (fragmento) AT1G16030 proteína de choque térmico 70, putativa AT1G16410 cítocromo P450, putativa AT1G16750 proteína expresada AT1G18370 proteína de la familia de motor de kinesina (NACK1) AT1G19290 proteína que contiene repetición de pentatricopéptido (PPR) AT1G19920 sulfato adenililtransferasa 2/ATP-sulfuilasa 2 AT1G21480 proteína de la familia de exostosina AT1G23410 proteína de extensión de ubiquitina, putativa / proteína 40S ribosomal S27A AT1G24300 proteína que contiene dominio de GYF AT1G24510 subunidad de épsilon de proteína de complejo T, putativa AT1G24938 proteína hipotética Número de Nombre de proteína acceso AT1G26750 proteína expresada AT1G27430 proteína que contiene dominio de GYF AT1G27970 factor 2 de transporte nuclear (NTF2), putativo AT1G29350 relacionado con kinasa AT1G29370 relacionado con kinasa AT1G31230 aspartato kinasa bifuncional / proteína que contiene dominio de piwi (fragmento) AT1G31770 proteína de la familia de transportador ABC AT1G34610 proteína de la familia de U I p 1 proteasa AT1G35380 proteína hipotética AT1G36120 transcriptasa de reversa putativa AT1G36280 a d e n i lo s u c ci n a to Masa, putativa / ad e n i los uccina sa , putativa AT1G36580 relacionada con 2,4-díenoil-CoA reductasa AT1G37200 proteína de la familia de retrotransposón tipo gitano AT1G44900 factor con licencia de replicación de ADN, putativo, similar a factor con licencia de replicación de ADN MCM2 AT1G48400 proteína de la familia de caja F AT1G48630 proteína de la familia de unión a guanina nucleótido / proteína kinasa activada AT1G49040 proteína defectuosa / SCD1 de citocinesis estomática (SCD1 ) Número de Nombre de proteína acceso AT1G51380 factor 4a de iniciación de traducción eucariótico, putativo AT1G51710 proteasa 6 específica de ubiquitina, putativa (UBP6) AT1G52450 relacionado con hidrolasa con terminal de ubiquitina ca rboxi lo AT1G52740 H2A de histona, putativo AT1G53240 malato deshidrogenasa [NAD], mitocondrial, putativo AT1G53550 proteína de la familia de caja F AT1G54270 factor 4a-2 de iniciación de traducción eucariótico AT1G55490 subunidad beta de proteína de unión a subunidad RuBisCo, cloroplasto AT1G56070 factor 2 de alargamiento, putativo AT1G56070 factor 2 de alargamiento, putativo AT1G56410 proteína de 70 kDa de cognado de choque térmico AT1G58265 relacionado con cítocromo P450 AT1G59610 proteína de tipo dinamina, putativa (ADL3) AT1G61210 proteína de la familia de repetición WD-40 / subunidad de katanina p80, putativa AT1G61300 próteína de resistencia a enfermedad (clase NBS-LRR), putati a AT1G61570 translocasa de membrana interna de importación a m itocondria (TI M 13) AT1G62020 complejo de proteína de coatomer, subunidad alfa, Número de Nombre de proteína acceso putativo AT1G62610 proteína de la familia de deshidrogenasa/reductasa de cadena corta (SDR) AT1G62630 proteína con resistencia a enfermedad (clase CC-NBS- LRR), putativa AT1G64520 subunidad reguladora de 26S proteasoma, putativa (RPN12) AT1G64550 proteína de la familia de transportador ABC AT1G65130 relacionada con hidrolasa de terminal de ubiquítina carboxílo AT1G65290 proteína de la familia portadora de acilo / proteína de la familia de ACP AT1G65540 proteína de la familia con mano de EF de unión a calcio AT1G65870 proteína de la familia responsiva a resistencia a enfermedad AT1 G66410 calmodulina AT1G66510 familia de la proteína AAR2 AT1G67090 cadena pequeña 1A de ribulosa bifosfato carboxilasa AT1G68750 proteína de la familia de fosfoenolpiruvato carboxilasa AT1G68910 proteína expresada similar a cadena pesada de miosina, tipo no músculo B AT1G70100 proteína expresada AT1G71220 U D P-g I u co s a : g I i co p ro te í n a g I u co s i 11 ra n sf e ra sa , putativa Número de Nombre de proteína acceso AT1G71270 proteína de la familia Vps52/Sac2 AT1G72000 beta-fructofuranosidasa , putativa / invertasa, putativa / sacarasa, putativa AT1G72730 factor 4A de iniciación de traducción eucariótico, putati o AT1G73720 proteína de la familia de transducina / proteína de la familia de repetición WD-40 AT1G75010 proteína que contiene repetición de MORN (nexo de ocupación y reconocimiento de membrana) AT1G76520 proteína de la familia portadora de eflujo de auxina AT1G76530 proteína de la familia portadora de eflujo de auxina AT1G77120 deshidrogenasa de alcohol (ADH) AT1G78130 similitud baja relacionada con transportador a tipo solterona III AT1G78390 9-c i s -e p o x i ca ro t e no id e dioxigenasa, putativa AT1G78900 subunidad A catalítica de ATP sintasa vacuolar AT1G79280 proteína expresada AT1G79550 fosfoglicerato kinasa, putativa AT1G79920 proteína de choque térmico 70, putativa AT1G79930 proteína de choque térmico, putativa AT1G80070 factor de empalme, putativo AT1G80270 proteína de unión a ADN, putativa AT1G80670 proteína de la familia de transducina / proteína de la Número de Nombre de proteína acceso familia de repetición WD-40 AT2G01210 proteína kinasa de transmembrana de repetición rica en leucina, putativa AT2G01350 proteína de la familia de quinolinato fosforibosil transferasa AT2G02160 proteína de la familia de dedo de zinc (tipo CCCH) AT2G03430 proteína de choque térmico, putativa AT2G05990 e no i I- [a ci lo-prot e í n a portadora] reductasa [NADH], cloroplasto, putativa AT2G06850 xi log I u ca n : xi log I ucos i lo transferasa AT2G07620 helicasa putativa AT2G07714 relacionado con factor de transcripción similar a proteínas de esterilidad 1 macho AT2G13680 calosa sintasa 5 ( 1 ,3-beta-glucano sintasa) AT2G14120 proteína 2b como dinamina AT2G14880 proteína que contiene dominio BAF60b de complejo SWIB AT2G16600 Peptídil-prolilo cis-trans ¡somerasa, citosólico / ciclofilina AT2G17130 subunidad 2 de isocitrato deshidrogenasa / subunidad 2 de NAD+ isocitrato deshidrogenasa AT2G18700 proteina de la familia 20 de glicosilo transferasa AT2G19070 proteína de la familia de transferasa Número de Nombre de proteína acceso AT2G19210 proteína kinasa de repetición rica en leucina, putativa AT2G20330 proteína de la familia de transducina / proteína de la familia de repetición WD-40 AT2G20420 beta-cadena de succinil-CoA ligasa [formando GDP], m i to co n d r i a I , putativa AT2G20580 subunidad 2 reguladora de 26S proteasoma (RPN1) AT2G20805 proteína hipotética AT2G21170 triosefosfato isomerasa, cloroplasto, putativo AT2G21390 complejo de proteína de coatomer, subunidad alfa, putativo AT2G21410 ATPasa de protón vacuolar, putativa AT2G21920 proteína hipotética (fragmento) AT2G22230 beta-hidroxiacil-ACP d esh i d ra tasa , putativa AT2G23930 ribonucleoproteína G nuclear pequeña, putativa AT2G24420 relacionado con ATPasa de reparación de ADN contiene 2 dominios de transmembrana AT2G26570 proteína expresada AT2G26890 proteína que contiene dominio de terminal N de choque térmico de ADN J AT2G27030 calmodulina AT2G27610 proteína que contiene repetición de pentatricopéptido (PPR) AT2G27870 proteína hipotética Número de Nombre de proteína acceso AT2G28000 subunidad alfa de proteína con unión a subunidad RuBisCo, cloroplasto AT2G28620 relacionado con proteína de motor de kinesina AT2G29540 ARN polímerasa 1(A) dirigida por ADN y subunidad de lll(C) 14 kDa (RPAC14) AT2G31680 proteína de unión a GTP relacionada con Ras, putativa AT2G32240 cadena pesada de miosina putativa AT2G33210 chaperonina, putativa AT2G33730 helicasa de ARN de caja DEAD, putativa AT2G34170 proteína expresada AT2G35605 proteína que contiene dominio BAF60b de complejo SWIB AT2G36060 proteína de la familia de enzima conjugando ubiquitina AT2G36260 proteína del complejo de ensamble de agrupación de hierro-azufre, putativa AT2G36460 fructosa-bifosfato aldolasa, putativa AT2G36810 proteína expresada AT2G37230 proteína que contiene repetición de pentatricopéptido (PPR) AT2G37420 relacionado con proteína de motor de kinesina AT2G38560 proteína que contiene dominio S-ll de factor de transcripción (TFIIS) AT2G38810 histona H2A, putativa Número de Nombre de proteína acceso AT2G39730 ribulosa bífosfato carboxilasa/oxígenasa activasa AT2G39990 subunidad 5 de factor 3 de iniciación de traducción eucariótica AT2G40070 proteína expresada AT2G40270 proteína de la familia de proteína kinasa AT2G41450 proteína de la familia de N-acetiltransferasa relacionada con GCN5 (GNAT) AT2G41800 proteína expresada AT2G42230 relacionado con chaperona C específica de tubulina AT2G42450 proteína de la familia de lipasa clase 3 AT2G42520 elícasa de ARN de caja DEAD, putativa AT2G43160 proteína que contiene dominio de homología de terminal N de epsína (ENTH) AT2G43750 cisteína sintasa, cloroplasto / O-acetilserína (tiol)-liasa AT2G44060 proteína de la familia abundante de embriogénesis tardía / proteína de la familia de LEA AT2G45030 factor de alargamiento mitocondrial, putativo AT2G45620 proteína de la familia de nucleotidiltransferasa AT2G46520 proteína con susceptibilidad a apoptosis celular, putativa / importina-alfa AT2G47110 proteína 6 de extensión de ubiquitina (UBQ6) / proteína S27A 40S ribosomal AT3G01040 proteína de la familia 8 de glicosilo transferasa Número de Nombre de proteína acceso AT3G01720 proteína expresada AT3G01740 proteína expresada AT3G02200 proteína de la familia de proteasoma AT3G02230 polipéptido-1 reversiblemente glicosílado AT3G02500 proteína desconocida AT3G02530 chaperonina, putativa AT3G02650 proteína que contiene repetición de pentatricopéptido (PPR) AT3G03300 relacionado con fábrica de helicasa carpelo de caja DEAD/DEAH AT3G03780 AtMS2/AtMS2 (Arabidopsis thaliana metionina sintasa 2) AT3G03960 chaperonina, putativa AT3G04120 g I ¡cera Id e h id ?-3-f osf a to desh id rog e n asa , citosólíco AT3G05810 proteína expresada AT3G07160 proteína de la familia 48 de glicosilo transferasa AT3G07630 proteína de la familia de prefenato deshidrasa AT3G07810 ri bo n u cleo prote í na nuclear heterogénea, putativa AT3G08030 proteína expresada AT3G08530 cadena pesada de clatrina, putativa AT3G08590 fosfoglicerato mutasa independiente de 2,3- bifosfoglicerato, putativa AT3G09170 proteína de la familia de Ulp1 proteasa AT3G09350 proteína de la familia de repetición de armadillo/beta- Número de Nombre de proteína acceso catenina AT3G09440 proteína 3 de 70 kDa de cognato de choque térmico AT3G10310 relacionado con proteína motor de kinesina AT3G10860 proteína de unión a ubiquínona de complejo de ubiquinol-citocromo C reductasa AT3G11130 cadena pesada de clatrina, putativa AT3G11400 factor 3G de iniciación de traducción eucariótico AT3G11770 proteína expresada AT3G11950 ATHST; preniltransferasa AT3G12580 proteína de choque térmico 70, putativa AT3G12800 proteína de la familia de des h id rogena sa/red u cta sa de cadena corta (SDR) AT3G13160 proteína que contiene repetición de pentatricopéptido (PPR) AT3G13460 proteína expresada AT3G13470 chaperonina, putativa AT3G13920 factor 4A-1 de iniciación de traducción eucariótico AT3G14990 proteína de biosíntesis de 4-metilo-5(b-hidroxetilo)-tiazol monofosfato AT3G15020 malato d e s h i d rog e n a s a [NAD], mitocondrial, putativa AT3G16230 proteína expresada similar a subunidad P50 de complejo ASC-1 AT3G16270 proteína expresada Número de Nombre de proteína acceso AT3G16540 DegP proteasa, putativa AT3G16640 proteína de la familia de tumor controlado de manera traslacional AT3G17300 proteína expresada AT3G17360 relacionado con proteína de motor de kinesina similar a proteína KLP2 AT3G17390 S -a d e n o s i I m e t io n i n a sintetasa, putativa AT3G18000 fosfoetanolamina N-meti Itra nsfera sa 1 AT3G18190 chaperonina, putativa AT3G18530 proteína expresada AT3G19050 relacionado con proteína de motor de kinesina AT3G20670 histona H2A, putativa AT3G20780 subunidad B de topoisomerasa 6 (TOP6B) AT3G21070 proteína de la familia de ATP-NAD kinasa AT3G22330 ARN helicasa de caja DEAD, putativa AT3G22890 sulfato adenililtransferasa 1 / ATP-sulfurilasa 1 AT3G23990 chaperonina (CPN60) (HSP60) AT3G24890 relacionado con sinaptobrevina AT3G26020 subunidad B' reguladora de serina/treonina proteína fosfatasa 2A (PP2A), putativa AT3G26380 proteína 27 de la familia de glicosilo hidrilasa AT3G27400 proteína de la familia de pectato Masa AT3G28925 proteína hipotética Número de Nombre de proteína acceso AT3G42100 relacionado con proteína que contiene Unidad de gancho de AT AT3G42270 proteína putativa AT3G43300 proteína de la familia de intercambio de nucleótido de guanina AT3G43810 calmodulina AT3G45770 o x i d o re d u ct a s a , proteína de la familia de deshidrogenasa de unión a zinc AT3G46560 translocasa de membrana interna de importación mitocondrial (TI 9) AT3G46990 proteína hipotética AT3G47850 prote ína expresada AT3G48250 proteína que contiene repetición de pentatricopéptido (PPR) AT3G48670 proteína que contiene dominio XH/XS / proteína que contiene dominio de dedo de zinc XS AT3G48870 Subunidad de unión a CIp proteasa ATP dependiente de ATP (CIpC) AT3G49640 proteína de la familia de regulación de nitrógeno AT3G50280 proteína de la familia de transferasa AT3G50370 proteína expresada AT3G51150 proteína de la familia de motor de kinesina AT3G51570 proteína con resistencia a enfermedad (clase TIR-NBS- Número de Nombre de proteína acceso LRR), putativa AT3G51950 proteína de la familia de dedo de zinc (tipo CCCH) / Unidad de regulación de ARN (RRM) AT3G52140 proteína que contiene repetición de tetraticopéptido (TPR) AT3G52930 f ructosa-bifosfato aldolasa, putativa AT3G54360 proteína Mel-18 de unión a ADN de proteina expresada AT3G54610 histona acetiltransferasa (GCN5) AT3G54940 cisteína proteinasa, putativa AT3G55000 tonel 1 a AT3G55005 tonel 1 b AT3G55290 proteína de la familia de deshidrogenasa/reductasa de cadena corta (SDR) AT3G55310 proteína de la familia de deshidrogenasa/reductasa de cadena corta (SDR) AT3G55460 factor de empalme como SC35, 30 kD (SCL30) AT3G55770 proteína que contiene dominio L I M | AT3G57290 factor 3E de iniciación de traducción eucariótico AT3G58510 ARN helicasa de caja DEAD, putativa (RH11) AT3G58610 re d u cto i so m e ra s a de ácido ketol AT3G59760 cisteína sintasa, mitocondrial, putativa AT3G62010 proteína expresada AT3G62250 proteína 5 con extensión de ubiquitina (UBQ5) / proteína Número de Nombre de proteina acceso S27A 40S ribosomal AT4G00020 proteina que contiene repetición de BRCA2 AT4G01290 proteína expresada AT4G01800 subunidad secA de preproteína translocasa, putativa AT4G02930 factor Tu de alargamiento, putativo AT4G03550 proteína de la familia 48 de glicosilo transferasa AT4G11150 subunidad E de ATP sintasa vacuolar AT4G11420 subunidad 10 de factor 3 de iniciación de traducción eucariótico AT4G12130 proteína de la familia de corte T de glicina AT4G12770 relacionado con auxilina AT4G12780 proteína como auxilina AT4G14060 relacionado con proteína mayor de látex AT4G14130 xi log I uca n : x¡ log I ucosi lo transferasa, putativa AT4G14140 ADN (citosína-5)-'met¡ltransferasa (METII) AT4G14260 proteína hipotética AT4G15640 proteína expresada AT4G15760 monooxigenasa , putativa ( 01) AT4G17150 proteína desconocida AT4G17440 proteína expresada AT4G17720 proteína que contiene Unidad de reconocimiento de ARN (RRM) AT4G18040 factor 4E 1 de iniciación de traducción eucariótico Número de Nombre de prote acceso AT4G18080 proteína hipotética AT4G19530 proteína con resistencia a enfermedad (clase TIR-NBS- LRR), putativa AT4G20160 proteína expresada AT4G20360 factor Tu de alargamiento AT4G20980 subunidad 7 de factor 3 de iniciación de traducción Eucariótico, putativa AT4G23670 relacionado con proteina mayor de látex AT4G23850 CoA ligasa de ácido graso-cadena larga / acilo-CoA sintetasa de cadena larga AT4G24100 proteína de la familia de proteína kinasa AT4G24280 proteína 70 de choque térmico, putativa AT4G24760 proteína expresada AT4G25580 relacionado con proteína responsiva a estrés AT4G26900 Imidazol glicerol fosfato sintasa hisHF, cloroplasto AT4G27440 Protoclorofilida reductasa B, cloroplasto AT4G28400 proteína fosfatasa 2C, putativa AT4G29800 baja similitud relacionado con patatina a precursor de patatina AT4G31805 factor de transcripción de familia WRKY AT4G31820 proteína de la familia de NPH3 responsiva fototrópica AT4G31990 aspartato aminotransferasa, cloroplasto / transaminasa A (ASP5) (??? ) Número de Nombre de proteína acceso AT4G32500 proteína de canal de potasio, putativa AT4G32551 proteína de la familia de repetición WD-40 (LEUNIG) AT4G33200 miosina, putativa AT4G34290 proteína que contiene dominio BAF60b de complejo SWIB AT4G34350 proteína de la familia LytB AT4G35260 subunidad 1 de isocitrato deshidrogenasa / subunidad 1 de NAD+ isocitrato deshidrogenasa AT4G35650 Isocitrato deshidrogenasa, putativa / NAD+ isocitrato deshidrogenasa, putativa AT4G35890 proteína que contiene dominio La AT4G35970 L-ascorbato peroxidasa, putativa AT4G36960 proteína que contiene Unidad de reconocimiento de ARN (RRM) AT4G37420 proteína hipotética AT4G37580 N -ace t i 11 ra nsfera sa , putativa / sin gancho 1 (HLS1) AT4G37910 proteína de choque térmico 70, mitocondrial, putativa AT4G38030 proteína hipotética AT4G38070 proteína de la familia de bHLH AT4G39580 proteína de la familia de caja F que contiene repetición de kelch AT5G01010 proteína expresada AT5G02490 proteína 2 de 70 kDa de cognato de choque térmico Número de Nombre de proteína acceso AT5G02500 proteina 1 de 70 kDa de cognato de choque térmico AT5G02590 proteína de la familia común de lumen de cloroplasto AT5G03340 proteína 48 de ciclo de división celular, putativa AT5G03650 enzima con ramificación de 1 ,4-alga-glucano AT5G03690 fructosa-bifosfato aldolasa, putativa AT5G04590 sulfito reductasa / ferredoxina AT5G05370 proteína de unión a ubiq uinol-citocromo C reductasa complejo ubiquinona AT5G05640 relacionado con nucleoproteína AT5G05780 subunidad 7 reguladora de 26S proteasoma no ATPasa AT5G06140 proteína que contiene dominio phox (PX) AT5G06400 proteína que contiene repetición de pentatricopéptido (PPR) AT5G06450 proteína expresada AT5G06850 proteína como antranilato fosforibosiltransferasa AT5G08415 proteína de la familia sintasa de ácido lipoico AT5G08670 cadena beta de ATP sintasa, mitocondrial AT5G08680 cadena beta de ATP sintasa, mitocondrial AT5G08690 cadena beta de ATP sintasa, mitocondrial AT5G09590 proteína de choque térmico 70 AT5G09900 subunidad reguladora de 26S proteasoma, putativa (RPN5) AT5G10160 beta-hidroxiacilo-ACP deshidratasa, putativa Número de Nombre de proteína acceso AT5G11110 proteína como sacarosa-fosfato sintasa AT5G11340 proteína de la familia N-acetiltransferasa relacionada con GCN5 (GNAT) AT5G12010 proteína expresada AT5G12240 proteína expresada AT5G12310 proteína de la familia de dedo de zinc (dedo RING d tipo C3HC4) AT5G13130 baja similitud de proteína hipotética a microrquidia AT5G14040 transportador de fosfato mitocondrial AT5G15580 proteína expresada AT5G15610 proteína de la familia de proteasoma AT5G15650 polipéptido-2 reversiblemente glicosilado AT5G15920 mantenimiento estructural de proteína de la familia de cromosomas (SMC) AT5G16070 chaperonina, putativa AT5G17680 proteína con resistencia a enfermedad (clase TIR-NBS- LRR), putativa AT5G17890 proteína que contiene dominio LIM / relacionado con proteína de resistencia a enfermedad AT5G17920 5-metilotetrahidropteroiltriglutamato-homocisteína metilotransferasa AT5G18110 proteína con unión a tapa novedosa (nCBP) AT5G18730 proteína hipotética Número de Nombre de prote acceso AT5G19310 regulador genético homeótico, putativo AT5G19550 aspartato a m ¡ notra n sf e ra sa , isozima 1 citoplásmica / transaminasa A AT5G20010 proteína nuclear de unión a GTP relacionada con Ras AT5G20020 proteína nuclear de unión a GTP relacionada con Ras AT5G20360 proteína que contiene dominio octicosa péptido/Phox/ Bem1 p (PB1 ) AT5G20720 chaperonina de 20 kDa, cloroplasto AT5G20890 chaperonina, putativa AT5G21274 calmodulina AT5G22650 proteína expresada AT5G23540 subunidad reguladora de 26S proteasoma, putativa AT5G23890 proteína expresada AT5G23930 relacionado con factor de terminación de transcripción mitocondrial AT5G24710 proteína de la familia de repetición WD-40 AT5G25230 proteína de la familia de factor Tu de alargamiento AT5G25940 relacionado con nodulina temprana AT5G26200 proteína de la familia portadora de sustrato mitocondrial AT5G26710 Glutamato-tARN ligasa, putativa AT5G26742 ARN helicasa de caja DEAD (RH3) AT5G26800 proteína expresada AT5G27390 proteína expresada Número de Nombre de proteína acceso AT5G27920 proteína de la familia de caja F AT5G28430 proteína hipotética AT5G28540 proteína 1 de unión luminal AT5G28850 proteína de la familia de mano EF de unión a calcio AT5G35360 acetilo-CoA carboxilasa, subunidad de biotina carboxilasa (CAC2) AT5G35260 factor 4E 2 de iniciación de traducción eucariótico AT5G36670 proteína putativa AT5G37150 relacionado con efector positivo de endonucleasa de empalme a tARN AT5G37470 proteína hipotética AT5G37510 NADH-ubiquinona d es h id rogen a sa , mitocondrial, putativa AT5G39320 UDP-glucosa 6-des h i d rog e na sa , putativa AT5G40060 proteína con resistencia a enfermedad (clase TIR-NBS- LRR), putativa AT5G40760 glucosa-6-fosfato 1 -deshidrogenasa / G6PD AT5G42020 proteína 2 de unión luminal AT5G42080 proteína de unión a GTP / f rag mopla st i na , putativa AT5G42950 proteína que contiene dominio GYF AT5G42980 tioredoxina tipo H 3 AT5G43780 sulfato adenililtransferasa 4 / ATP-sulf urilasa 4 AT5G44320 subunidad 7 de factor 3 de iniciación de traducción eucariótico, putativa Número de Nombre de proteína acceso AT5G44510 proteína con resistencia a enfermedad (clase TIR-NBS- LRR), putativa (TA01 ) AT5G45060 proteína con resistencia a enfermedad (clase TIR-NBS- LRR), putativa AT5G45140 ARN polimerasa dirigida con ADN, putativa AT5G47460 proteína que contiene repetición de pentatricopéptido (PPR) AT5G47890 subunidad de N ADH-ubiquinona oxidoreductasa B8, putativa AT5G48620 proteína con resistencia a enfermedad (clase CC-NBS- LRR), putativa (fragmento) AT5G49030 proteína de la familia de tARN sintetasa clase I (I, L, M V) AT5G49910 proteína 70 de choque térmico AT5G50370 adenilato kinasa, putativa AT5G50810 Translocasa de membrana interna de importación mitocondrial (TIM8) AT5G50920 subunidad de unión a CIp proteasa ATP dependiente de ATP (CIpC) AT5G51000 proteína de la familia de caja F AT5G51670 proteína expresada AT5G51795 relacionado con proteína de unión a ADN K i n 17 (fragmento) Número de Nombre de proteína acceso AT5G52040 Factor RSP41 de empalme rico en arginina/serina (RSP41 ) AT5G52400 proteína de la familia de citocromo P450 AT5G53460 glutamato sintasa [NADH], cloroplasto, putativo AT5G54640 histona H 2 A AT5G54670 proteína como kinesina (KATC) AT5G55190 proteína nuclear de unión a GTP relacionada con Ras AT5G56000 proteína 81 de choque térmico AT5G56030 proteína 81 de choque térmico AT5G56500 chaperonina, putativa AT5G57350 ATPasa 3, tipo membrana de plasma / bomba de protón 3 AT5G58070 lipocalina, putativa similar a lipocalina inducida por estrés de temperatura AT5G59220 proteína fosfatasa 2C, putativa AT5G59620 proteína putativa AT5G59880 factor 3 despolimerizante de actina (ADF3) AT5G60390 factor 1 -alfa de alargamiento AT5G60720 proteína expresada AT5G60980 proteína de la familia de factor 2 de transporte nuclear (NTF2) AT5G61780 proteína que contiene dominio tudor / proteína de la familia de nucleasa AT5G63020 proteína con resistencia a enfermedad (clase CC-NBS- Número de Nombre de proteína acceso LRR), putativa AT5G63400 adenilato kinasa AT5G63800 proteína de la familia 35 de glicosilo hidrolasa AT5G64760 subunidad reguladora de 26S proteasoma (RPN5) AT5G66470 proteína expresada Tabla 3: Sobre-representación de procesos biológicos entre las presas de la serie de datos de núcleo (A) y no núcleo (B) como se determinó con el plugin BiNGO de Cytoscape.

A. Sobre-representación de procesos biológicos entre las presas de la serie de datos de núcleo.

Parámetros de búsqueda: Archivo creado con BiNGO (c) el 22 de octubre de 2008 a las 16:17:17 ontología: proceso curador: GO Archivo de antología seleccionado: BiNGO. jar!/GO_ Biológica l_Process Archivo de anotación seleccionado: gene_association_2008okt04.tair Sobre-representación Prueba estadística seleccionada: prueba hipergeométrica Corrección seleccionada: corrección de velocidad de descubrimiento falsa de Benjamini & Hochberg (FDR) Nivel de importancia seleccionado: 0.05 Opción de prueba: Agrupación de prueba contra anotación entera Número de genes anotados en selección: 137 Número de genes anotados en anotación de red/entera: 25557 Resultados: GO-ID; Valor p i Valor p ; # # Descripción corr solee. 7049 2 , 30 E - 3 :7 17 E - 32 28 164 Ciclo celular 51726 1 , 11 E-28 1.74E-26 21 93 Regulación de ciclo celular 6260 2.90E-182.17E-16 16 116 iReplicación de ADN 6263 4.33 E - 183.38E-16 13 58 ^Replicación de ADN dependiente de ADN 74 8 , 10 E - 155.05E-13 9 26 Regulación de progresión a través de ciclo ¡celular 6259 7.00 E - 1 : 3.60E-12 21 463 Metabolismo de ADN 432858.43E- 143.60E-12 18 312 Catabolismo de biopolímero 30 I 639.23E-143.60E-12 17 268 Catabolismo de pro teína 9057 3.38E- I 3 1.10 E - I 1. 19 390 Catabolismo de macromolécula 6511 4.22F-131.10 F - 11 16 249 Catabolismo de pro teína dependiente de u b i q u ¡ t i n a 436324.22E- 13 i 1 10 E= - 1 I 16 249 Catabolismo de macromolécula dependiente de modificación 19941 4.22E-131 10E-11 16 249 Catabolismo de proteína dependiente de modificación 516C34.77E-131 15E-11 16 251 ¡Proteólisis durante catabolismo de proteína GO-ID Valor p ! Valor P # ¡ # Descripción corr selec. total celular 44257 ¡6, 86E- 131 ,53E- 11 16 i 257 ¡Catabolismo de proteína celular 44265 1 ,05E- 12 ¡2 , 19E- 11 18 ! 362 jCatabolismo de macro molécula celular 79 4.38E- 128 ,55E- 11 6 ¡ 10 jRegulación de actividad de proteína kinasa ¡dependiente de ciclina 6270 ¡1 ,19E- 11 ¡3 ,51 E- 10 6 i 2 Iniciación de replicación de ADN 278 ?3.69?- 116 ,40E- 10 8 ; 40 Ciclo celular mitótico 6469 2.27E- 103 ,38E- 09 5 8 ¡Regulación negativa de actividad de íproteína kinasa 45736 2.27E-10:3,38E-09 Regulación negativa de actividad de ¡proteína kinasa dependiente de ciclina 51348 2.27E-103.38G -09 8 Regulación negativa de actividad de íransferasa 8151 2.45E-103.47E-091 97 1129 ¡Proceso fisiológico celular 3 i 9056 3.36L !04,55E 09 582 ¡Catabolismo 45786 5.09E-1 ¡6.62E-09Í 9 ¡Regulación negativa de progresión a tra ¡de ciclo celular 42023 ¡5, 44E -106.79E- 09 6 19 'Endoreduplicación de ADN 43086 ¡1 ,01 E -09.1 ,22E- 08: 5 ; 10 Regulación negativa de actividad de enzima 44248 ¡1.30b -091 ,50E- 08. 18 ¡ 560 ¡Catabolismo celular 43283 ¡1 ,38E -091 ,54E- 08; 48 :3695 ¡Metabolismo de biopolímero 45859 ;1 ,99E - 09 ¡2 , 04 E - 08 6 : 23 Regulación de actividad de proteína kinasa 43549 ,99E -092.04E- 08; 6 . 23 ¡Regulación de actividad de kinasa 9987 2,03E -09-2.04E- 08 98 1185iProceso celular o 513382.64E -092.58E- 08Í 6 24 ¡Regulación de actividad de transferasa 507946.88 E -096.51 E- 08l 33 12040 Regulación de proceso celular GO-ID Valor P Valor P # # Descripción con selec. total 5' 3257.92E- 09 7.06E- 08 5 14 I n te rf a se 513297.92E- 09 7.06E- 08 5 14 Interfase de ciclo celular mito tico 51244 1.26E- 08 1 ,09E- 07 32 198 C Regulador de proceso fisiológico celular 50791 3.60E- 08 3.04E- 07 32 2070 Regulación de proceso fisiológico 7582 1 ,33E- 07 1 ,09E- 06 100 1306 Proceso fisiológico 50789;2,21 E-07 1.77E-06 33 2359 (Regulación de proceso biológico 50790,2, 72 E-072.12F-06 7 81 Metabolismo de nucleobase, nucleósido, nucleótido y ácido nucleico 4 170 1 , 23 b - 069. I / b - 06 60 6396¡Metabolismo de macromolécula 6508 .1.61 E-061 ,17E-05 16 718 Proteólisis 5130211 , 24E-058.77E-05 3 9 ¡Regulación de división celular 44238 H ,87E-051 ,30E-04 69 8433 ¡Metabolismo primario 51510¡2,85E-051 ,93E-04 2 2 ¡Regulación de crecimiento celular unidimensional 4423711 ,45E-04 ¡9,61 E-04 67 8584 ¡Metabolismo celular 80 !1 ,70E-041 ,06E-03 2 4 ¡Fase G1 de ciclo celular mitótico 82 1.70?-0 1 ,06E-03 2 4 Transición de G1/s de ciclo celular mitótico 51318 1.70?-041.06E-03 2 4 Fase G1 7346 2.82?-041 ,73E-03! 2 5 Regulación de progresión a través de ciclo c o I u I :.) r mitótico 48856 3.80E -042.28E -03 17 1248 Desarrollo de estructura anatómica 48519 4.57E -042.69E -03 6 182 ¡Regulación negativa de proceso biológico 9653 5,58E -04:3, 22 E -03! 10 526 Morfogénesis 51243 6.65E -04(3, 72E -03: 5 129 Regulación negativa de proceso fisiológico ¡celular 51301 6.67E- 043 72E-03 32 ¡visión celular 485236.89E-043.77E-03 130 Regulación negativa de proceso celular GO-ID Valor P Valor P # # Descripción corr selec. total 1558 7 ,82E- 044. 21 E- 03 2 8 ¡Regulación de crecimiento celular 43118 1 ,02E- 03 5.42E- 03 5 142 ¡Regulación negativa de proceso fisiológico 6281 1 ,09E- 03 5, 67E- 03 5 144 Reparación de ADN 9793 1 ,28E- 03 6.56E- 03 9 487 Desarrollo embriónico (sensu Magnoliophyta) 6974 1 ,47E- 03 7,39E- 03 5 154 ¡Respuesta a estímulo por daño de ADN 9790 2 ,01 E- 03 9, 94E- 03 9 520 Desarrollo embriónico 48316 2 28E- 03 1 , 11 E- 02 9 530 Desarrollo de semilla 48272 2 32E- 03 1 , 11 E- 02 3 49 ¡Morfogénesis de tricoma (sensu iMagnoliophyta) 48608 2 ,37E- 03 1 , 12E- 02 9 533 Desarrollo de estructura reproductiva 7148 2 43E- 03 1 , 13E- 02 6 252 ^Morfogénesis celular 6457 2 58E- 03 1 , 18E- 02 6 255 ¡Plegado de proteína 904 2 60E- 03 1 , 18E- 02 3 51 ¡Morfogénesis celular durante diferenciación 7017 2 ,66E- 03 1 , 19E- 02 4 107 Proceso a base de microtubo 7275 2 ,81 E- 03 1 , 23E- 02 19 1765 ¡Desarrollo 9965 2 ,94E- 03 1 , 27E- 02 4 110 ¡Morfogénesis de hoja 7018 3 ,23E- 03 1 , 37E- 02 3 55 Movimiento a base de microtubo 9934 3 ,26E- 03 1 , 37E- 02 2 16 Regulación de organización meristémica 8152 3 ,29E- 03 1 , 37E- 02 70 1004 Metabolismo 19952 3 ,72E- 03 1 53E- 02 11 794 Reproducción 48827 3 ,90E- 03 1 58E- 02 5 193 Desarrollo de hoja 16043 3 ,95E- 03 1 58E- 02 16 1420 Organización celular y biogénesis 9117 4 ,64E- 03 1 83E- 02 4 125 Metabolismo de nucleótido 35315 4 ,95E- 03 1 91 E- 02 3 64 Diferenciación celular de cabello 10026 4 ,95E- 03 1 91 E- 02 3 64 ¡Diferenciación de tricoma (sensu Magnoliophyta) GO-IDi Valor p \ Valor P # : # Descripción ? corr selec. total 514465.36= - 03;2,02E- 02 1 1 Regulación positiva de progresión a través de ciclo celular meiótico 51445 ¡5, 36E- 03:2, 02 E- 02 1 ; 1 Regulación de progresión a través de ciclo celular meiótico 30154 ½,56E- 032 07E- 02 5 210 ¦Diferenciación celular 9887 5.67E- 032 08 - 02 5 211 Morfogénesis de órgano 3070516, 86E- 03-2.49E- 02 3 72 Transporte intracelular dependiente de ¡citoesqueleto 484688.86E- 033.18 E- 02 3 : 79 desarrollo celular 100168.97 r. - 033.18E- 02 4 h 51 Morfogénesis de brote 7276 :9',80E- 03'3,44E- 02 4 , 155 Gametogénesis 7050 h ,07E- 023 51 b- 02 1 ; 2 Arresto de ciclo celular 42276 ¡1 ,07E- 023 51 E- 02 1 : 2 iReparación de ADN de postreplicación propensa a error 86 1.07E- 023.51 E- 02 1 : 2 ¡Transición de G2/M de ciclo celular mitótico 45020 1.07b- 023.51 E- 02 1 ; 2 Reparación de ADN propensa a error 184 1 ,07E- 023.51 E - 02 1 2 iCatabolismo de mARN, descomposición m odiada sin sentido 6358 1.07E- 023,51 E- 02 1 2 Regulación de transcripción global de promotor de polimerasa II de ARN 46907 ;1 , 10E- 023,58E- 02 7 ; 451 Transporte intracelular 9195 1.15E- 023.70E- 02 3 : 87 Biosíntesis de nucleótido 51649 1 , 18E- 023.75E- 02 7 - 457 Establecimiento de localización celular 51641 1 ,27E- 023.93E- 02 7 .464 Localización celular 9744 1.27E- 023.93E- 02 2 32 Respuesta a estimulo de sacarosa 40008 1 ,27E- 023.93E- 02 2 32 ¡Regulación de crecimiento 48366 1 ,59E- 024.76E- 02 4 : 179 Desarrollo de hoja 16288:1 ,60E- 024.76E- 02 2 36 C i t o c i n e s i s GO-ID Valor P Valor p j # # Descripción corr !selec. total 10071 1.60 E - 02 4.76E-02 1 3 Especificación de meristemo de raíz 48367 ¡1 ,60E- 02 4.76E-02 5 273 esarrollo de brote B. Sobre-representación de procesos biológicos entre las presas de la serie de datos de no núcleo.

Parámetros de búsqueda: Archivo creado con BiNGO (c) el 22 de octubre de 2008 a las 16:28:37 ontología: proceso curador: GO Archivo de antología seleccionado: BiNGO. jar!/GO_Biological_Process Archivo de anotación seleccionado: g ene_a ssociation_2008o kt04. ta i r Sobre-representación Prueba estadística seleccionada: prueba hipergeométrica Corrección seleccionada: corrección de velocidad de descubrimiento falsa de Benjamini & Hochberg (FDR) Nivel de importancia seleccionado: 0.05 Opción de prueba: Agrupación de prueba contra anotación entera Número de genes anotados en selección: 197 Número de genes anotados en anotación de red/entera: 25538 Resultados: GO- D Valor P Valor P # # Descripción corr selec. total 46686 :5, 78E- 13 3.14E- 10 22 396 ;R espuesta a ion de cadmio 100384.07?- 12 1 ,11 E- 09 22 437 Respuesta a ion metálico 100359, 76E- 12 1 ,77E- 09 22 457 iRespuesta a sustancia inorgánica 7049 4.69= - 11 6.38E- 09 14 166 Ciclo celular 51726 ¡2, 75E- 0 ·) ,;') 9E- 07 10 93 Regulación de ciclo celular 42221 H ,01 E- 089.16b 07 38 1789 ¡Respuesta a estímulo químico 6259 2.22E- 08Í1 ^SE06 18 462 etabolismo de ADN 8151 8.57E- OS 5.33E- 06 124 1129Proceso fisiológico celular 1 50896 1.42?-078.56E-06 56 3617 ¡Respuesta a estímulo 9987 2.38?-071.20E-05 127 1185 proceso celular 6 ; 42023 ¡2 , 76E -071.36o -05 5 ; 19 E n d o re d u p I ica ci ó n de ADN 6263 ? , 15 E 07. 1 ,36- 05 7 \ 58 Replicación de ADN dependiente de ADN 6260 ¡3 , 24 E - 07 ;1 ,36E -05 9 I 117 Replicación de ADN 6950 ;8,79E -073.42F -05 28 1300 Respuesta a estrés 74 ? ,50E -065.43E -05 5 ¡ 26 Regulación de progresión a través de ciclo celular 7582 2 , 21 E -Ofi 7.53E -05 133 1306 P'occso fisiológico 6970 |2 , 77 E -068.37G -05 14 397 iRespuesta a estrés osmótico 6139 !6 , 0 E -061.94 E -04 45 2973 ¡Metabolismo de nucleobase, nucleósido, nucleótido y ácido nucleico 9056 1.27 E -05;3,64E -04 16 582 Catabolismo 9628 :2 , 56 E -056.96E -04 23 1140 Respuesta a estímulo abiótico 9651 ¡3 , 21 E -057.96E -04 12 I 369 Respuesta a Estrés por sal 44248 b, 22E -05¡7,96E -04 15 I 560 Catabolismo celular GO-ID Valor P Valor P # # Descripción co rr se I ec . total 6454 3 40E- 05 8 04E- 04 6 79 Iniciación traslacional 79 5 21 E- 05 1 18E- 03 3 10 Regulación de actividad de proteína kinasa dependiente de ciclina 9057 5 47E- 05 1 19E- 03 12 390 Catabolismo de macromolécula 51510 5 92E- 05 1 24E- 03 2 2 Regulación de crecimiento celular unidimensional 44237 8 90E- 05 1 79E- 03 92 8580 Metabolismo celular 15980 1 10E- 04 2 15E- 03 7 140 Derivación de energía por oxidación de compuestos orgánicos 44265 1 25E- 04 2 35E- 03 11 362 Catabolismo de macromolécula celular 45333 1 33E- 04 2 41 E- 03 4 34 Respiración celular 43283 1 51 E- 04 2 66E- 03 48 3692 Metabolismo de biopolímero 9826 1 63E- 04 2 77E- 03 7 149 Crecimiento celular unidimensional 43044 1 77E- 04 2 91 E- 03 2 3 Remodelación de cromatina dependiente de ATP 7275 2 23E- 04 3 56E- 03 28 1765 Desarrollo 278 2 53E- 04 3 93E- 03 4 40 Ciclo celular mitótico 9266 3 13E- 04 4 74E- 03 10 338 Respuesta a estímulo de temperatura 9719 4 96E- 04 7 30E- 03 20 1131 Respuesta a estímulo endógeno 6084 5 43E- 04 7 77E- 03 3 21 Metabolismo de acetilo-CoA 6561 5 83E- 04 8 05E- 03 2 5 Biosíntesis de prolina 9737 5 92E- 04 8 05E- 03 8 241 Respuesta a estímulo de ácido abscísico 40007 6 59E- 04 8 74E- 03 8 245 Crecimiento 45859 7 14E- 04 9 04E- 03 3 23 Regulación de actividad de proteína kinasa 43549 7 14E- 04 9 04E- 03 3 23 Regulación de actividad de kinasa 43285 7 46E- 04 9 23E- 03 9 312 Catabolismo de biopolímero 7148 7 91 E- 04 9 46E- 03 8 252 Morfogénesis celular 51338 8 12E- 04 9 46E- 03 3 24 Regulación de actividad de transferasa GO-IDj Valor p Valor P # # Descripción co rr selec total 6092 8.18E- 04?9, 46E- 03 5 94 Vías principales de metabolismo de ^carbohidrato 16049,9, 82E- 041.111;- 02 7 ¡ 201 Crecimiento celular 43170 1.08 E - 031 ,20E- 02 69 6392 Metabolismo de macromolécula 8361 ¡1 ,13E- 031. 3 F - 02 7 ; 206 Regulación de tamaño celular 30163;1 , 17E- 031 ,24E- 02 8 268 Catabolismo de proteína 50789';1 ,18E- 031 ,24E- 02 32 i2359 Regulación de proceso biológico 50791 '1 ,25E- 031 ,30E- 02 29 2070 ¡Regulación de proceso fisiológico 6091 h ,29E- 031.30 G - 02 8 272 ¡Generación de metabolítos precursores y ¡energía 51244 ¡1 ,34E- 0311 ,33 E- 02 28 1980 Regulación de proceso fisiológico celular 16043 1.47 - 031 ,42 E- 02 22 ¡1419 ¡Organización celular y biogénesis 6560 ? ,61 E - 03 Í1 ,42 E- 02 2 8 Metabolismo de prolina 6469 1 ,61 E- 031 ,42 E- 02 2 8 ¡Regulación negativa de actividad de p r o t o i n a kinasa 45736 ¡1 ,61 E-03 1 ,42E-02 8 ¡Regulación negativa de actividad de ¡proteína kinasa dependiente de cicllna 51348 ¡1 ,61 E-03'1.42E-02 8 Regulación negativa de actividad de t ra n sf e r a sa 1558 ;1 ,61 E -031 ,42E- 02 2 8 ¡Regulación de crecimiento celular 48856 1 ,64E -031 ,42E- 02 20 1248 Desarrollo de estructura anatómica 9725 1 ,65E -03:1 ,42E- 02 14 729 Respuesta a estímulo hormonal 442384 ,81 E -03:1 ,53E- 02 85 8429ívletabol¡smo primario 8152 ,82E -031 ,53E- 02 98 1004 Metabolismo 0 9409 ? ,92E -031 ,59E- 02 7 226 Respuesta a frío 45786 ¡2 ,06E -031 ,64E- 02 2 9 ¡Regulación negativa de progresión a través ¡de ciclo celular GO-ID: Valor P Valor P # ¡ # ¡Descripción co rr selec total ! 51302 ;2,06E- 03:1 ,64E- 02 2 : 9 Regulación de división celular 507942.08E- 031 ,64E- 02 28 2040 'Regulación de proceso celular 511702.27E- 03 1 ,76E- 02 3 ! 34 ¡Importación nuclear 9790 2.47 E - 031 ,89E- 02 11 \ 520 ¡Desarrollo embriónico 43086 |2, 56 E- 03 1 ,93E- 02 2 j 10 :Regulación negativa de actividad de enzima 6395 2,59E- 03 1 ,93E- 02 4 : 74 ¦Empalme de ARN 6099 3,11 b- 032 26 E - 02 2 ; 11 Ciclo de ácido tricarboxílico 463563, 11 E- 032 ,26E- 02 2 ; 11 atabolismo de acetilo-CoA 6511 3 , 30 E 03:2 30b 02 7 ¡ 249 atabolismo de proteína dependiente de :u b i q u i t i n a 436323.30 E - 032.30E- 02 7 i 249 ¡Catabolismo de macromolécula dependiente de modificación 19941 ¡3 , 30 E - 03 ¡2 , 30 E - 02 7 ! 249 Catabolismo de proteína dependiente de modificación 516033.45E- 032.37E- 02 7 251 Proteólisís durante catabolismo de proteína celular 6270 3,71 E - 03½, 53E- 02 2 • 12 Iniciación de replícación de ADN 9064 3.88 F - 03'2,55E- 02 3 : 41 ¡Metabolismo de aminoácido de la familia de glutamina 9615 3.88E- 032.55E- 02 3 41 ¡Respuesta a virus 442573, 92E- 03:2 ,55E- 02 7 . 257 atabolismo de proteína celular 488273, 94E- 03:2.55E- 02 6 i 193 ¡Desarrollo de hoja 511694,16 E- 032 ,66E- 02 3 ; 42 Transporte nuclear 16071 ¡4 , 40 E - 032 ,78E- 02 5 ¡ 138 Metabolismo de mARN 9793 4.72E- 032, 95 E- 02 10 487 Desarrollo embriónico (sensu Ivlagnoliophyta) 9109 5.07E- 033.13 E - 02 2 I 14 atabolismo de coenzima 6800 5 22E- 03:3,19E- 02 7 ¡ 271 ^Metabolismo de especie de oxígeno y GO-ID Valor P Valor P # # Descripción co rr selec. total ¡oxigeno reactivo 398 5 ,38E- 03 3 25E- 02 3 46 Empalme de mARN nuclear, vía somite cirujano 48367 5 ,43E- 03 3 25E- 02 7 273 Desarrollo de brote 6096 5 ,71 E- 03 3 38E- 02 3 47 Glicolisis 9060 5 ,82E- 0 3 40E- 02 2 15 Respiración aeróbica 375 6 ,06E- 03 3 47E- 02 3 48 Empalme de ARN, vía reacciones de itransesterificación 377 6 ,06E- 03 3 47E- 02 3 48 Empalme de ARN, vía reacciones de transesterificación con adensina saliente como nucleófilo 9084 7 ,46E- 03 4 23E- 02 2 17 Biosíntesis de aminoácido de la familia de glutamina 42891 7 ,71 E- 03 4 24E- 02 1 1 Transporte antibiótico 7091 7 ,71 E- 03 4 24E- 02 1 1 Transición de metafase/anafase mitótica 30071 7 ,71 E- 03 4 24E- 02 1 1 Regulación de transición de metafase/anafase mitótica 48316 8 ,36E- 03 4 55E- 02 10 530 Desarrollo de semilla 48608 8 ,68E- 03 4 68E- 02 10 533 Desarrollo de estructura reproductiva 19952 8 ,92E- 03 4 76E- 02 13 794 Reproducción 6762 9 ,45E- 03 4 99E- 02 5 166 Metabolismo de coenzima Tabla 4: Visión general de características relacionadas con el ciclo celular usadas en el análisis computacional para buscar nuevas proteínas de ciclo celular.

Característica de ciclo celular Categoría # de Referencias genes Periodicidad Expresión genética 1258 (5, 6) Como MSA Unidad promotora 2295 ( 7) Como E 2 F a Unidad promotora 1809 ( 7) E2F10SPCNA Unidad promotora 2221 ( 7) OS_motifslandlla Unidad promotora 2310 ( 7) UP1 ATMSD Unidad promotora 3738 ( 7) rmGCGn Unidad promotora 2179 ( 7) Sitio de consenso de CDK Unidad de fosforilación 6321 (8) Cola [IM]R Unidad de secuencia de 116 ( 76. 77) p r o t e í n a Secuencia PEST Unidad de destrucción 2719 ( 78) Caja D Unidad de destrucción 2369 ( 79) Caja KEN Unidad de destrucción 410 ( 79) Caja GxEN Unidad de destrucción 300 (20) Caja A Unidad de destrucción 1779 (21) Tabla 5: Recolección de genes de ciclo celular.

Recolección de 518 genes anotados como ciclo celular por ontología genética, incluyendo todos los genes descritos como genes de ciclo celular de núcleo o relacionados con ciclo celular ( 19. 22-24). Los siguientes términos de GO se usaron para construir la colección: ciclo celular ( G 0 : 0007049 ) , división celular ( G 0 : 0051301 ) , proliferación celular (GO:0008283), segregación de cromosoma (GO:0007059), replicación de ADN (GO:0006260), replicación de ADN y ciclo de cromosoma (GO:0000067). Para cada gen, se muestra el número de características presentes relacionadas con el ciclo celular. Esta colección fue sustraída de las listas de presa para encontrar proteínas novedosas de ciclo celular.

Acceso Nombre # características AT2G31270 CDT1a ~~~ 8 AT5G13840 CCS52B 7 AT3G16320 cdc27a 7 AT1G07270 cdc6b 7 AT3G59550 Proteína SYN3 de familia de cohesión (SYN3) 7 AT5G25380 CYCA2;1 7 AT3G11450 DOMINIO DE TERMINAL N DE CHOQUE TÉRMICO DE 7 ADN J AT1G65470 Factor-1 de ensamble de ero m atina (FASCIATA1) 6 ( F AS 1 ), idéntico a F AS 1 AT1G77390 CYCA1;2 6 AT5G43080 CYCA3;1 6 AT3G11520 CYCB1 ;3 6 AT3G10690 Proteína de familia de subunidad A de ADN girasa 6 AT4G25540 Proteína MSH3 de reparación de desajuste de ADN; 6 AtMsn3 AT1G47870 E2Fc 6 AT4G28600 KAK (KAKTUS) 6 AT5G46280 MCM3 6 AT5G07280 Proteína como receptor, proteína como kinasa; 6 Acceso Nombre # características proteína kinasa como receptor AT5G61000 Proteína A1 de replicación; ARN helicasa putativa 6 AT5G42190 ASK2 (COMO 2 ARABIDOPSIS SKP-1); LIGASA DE 5 PROTEÍNA DE UBIQUITINA AT2G29680 cdc6 5 AT1 G18670 CKL3 5 AT1G70210 CYCD1 ; 1 5 AT4G37630 CYCD5;1 5 AT5G49160 ADN (citosina-5-)-metilotransferasa (AtHlM), idéntica 5 a SP:P34881 AT1G08130 ADN ligasa / polidesoxiribonucleótido sintasa [AtP] 5 idéntica a AT5G41880 Proteína como (Primasa) subunidad IV de ADN 5 polimerasa AT3G13170 ADN TO PO I S O M E R AS A VÍA (SP011-1), IDÉNTICA A 5 ATS P O 11- AT5G67100 Subunidad alfa catalítica de ADN polimerasa dirigida 5 por ADN AT5G02470 DPa 5 AT5G22220 E 2 F b 5 AT3G43210 Proteína de familia de kinesina motor (NACK2) 5 AT1 G18800 NRP2 (PROTEÍNA 2 RELACIONADA CON NRP1 ); 5 UNIÓN A ADN / CROMATINA AT2G37560 ORC2 5 Acceso Nombre # características AT1G26840 ORC6 5 AT5G 16270 Sim ¡I ¡ tud débil de proteína de la familia como 5 Rad21/Rec8 a familia de cohesión AT3G12280 RBR 5 AT5G61210 SNAP33 (PROTEÍNA 33 ASOCIADA CON 5 SINPTOSOMAL); T-SNARE AT5G48600 Proteína de la familia de mantenimiento estructural 5 de cromosomas (SMC), similar AT5G55220 Proteina de la familia de chaperona de tipo factor, 5 contiene perfiles Pfam AT3G60740 Cofactor D de plegado de tubulina 5 AT3G 19770 Proteína que contiene dominio de proteína 9 de 5 clasificación vacuolar AT5G05560 APC1 4 AT1G06590 APC5 4 AT3G28730 ATHMG (GRUPO DE ALTA MOVILIDAD, ESPECÍFICO 4 DE ESTRUCTURA) AT3G53230 CDC48, putativo 4 AT3G01610 CDC48C | PROTEÍNA DE LA FAMILIA DE ATPASA 4 TIPO A A A , CONTIENE AT1G18040 CDKD;3 4 AT5G03340 HOMÓLOGO E DE PROTEÍNA 48 DE CONTROL DE 4 DIVISIÓN CELULAR; ATPASA AT5G11300 CYCA2;2 4 AT1G15570 CYCA2;3 4 Acceso Nombre # características AT1G80370 CYCA2;4 4 AT2G26760 CYCB1 ;4 4 AT2G17620 CYCB2;1 4 AT4G35620 CYCB2;2 4 AT3G50070 CYCD3;2 4 AT3G05330 Baja similitud de familia de ciclina a proteína de 4 unión a microtubo TANGLED1 AT5G05490 DIF1/SYN1 4 AT1G69770 ADN (citosina-5)-met¡lotransferasa CMt3; 4 cromometilasa 3; AT4G02460 Proteína de reparación dispareja de ADN 4 AT1G67320 ADN primasa, familia de subunidad grande, contiene 4 perfil de Pfam PF04104; AT4G31210 Proteína de la familia de ADN topoisomerasa, similar 4 a ADN Topoisomerasa I AT5G63920 ADN topoisomerasa III 4 AT5G06110 Proteína que contiene dominio de terminal N de 4 choque térmico de ADNJ / división celular AT 1 G 78650 P rote í n a expresada, similitud débil a subunidad 3 4 delta de ADN polimerasa AT2G13330 F1404.9 4 AT2G23430 KRP1 · 4 AT2G20980 MCM10 4 AT2G29570 PCNA2 4 Acceso Nombre características AT4G14150 Proteína relacionada con kinesína asociada con 4 fragmoplasto (PAKRP1 ) AT3G23670 Proteína relacionada con kinesina asociada a 4 fragmoplasto, putativa, similar a AT5G58720 FACTOR I NTE R ACT U A N DO CON PRLI, PUTATIVO 4 AT1G53710 PROTEÍNA SERINA / TREONINA FOSFATASA 4 AT3G02920 Relacionado con proteína de replicación, similar a 4 proteína A de replicación 30kDa AT4 G 22970 S i m i I a r a proteína hipotética [Arabidopsis thaliana] 4 AT5G61460 Proteína como SMC 4 AT65660 SMP1 (SWELLMAP 1 ); UNIÓN A ÁCIDO NUCLEICO 4 AT5G62000 Proteína de la familia de factor B3 transcripcional / 4 factor responsivo a auxina AT5G 16750 Proteína de la familia de transducina / proteína de la 4 familia de repetición WD-40 contiene 8 AT2G14400 Gen de elemento transponible 4 AT2G42260 UVI4 4 AT1 G57820 VARIANTE EN METILACIÓN 1 4 AT3G02820 Proteína de la familia de nudillo de zinc (tipo CCHC), 4 contiene dominio Pfam AT5G22010 PROTEÍNA DE LA FAMILIA DE ATPASA TIPO AAA / 3 DOMINIO BRCT AT2G14120 ADL2b 3 AT5G57160 ATLIG4 (ARABIDOPSIS THALIANA ADN LIGASA IV) 3 Acceso Nombre # características AT5G45720 UNIÓN DE ATP / ADN POLIMERASA DIRIGIDA POR 3 ADN / AT1 G66730 PROTEÍNA DE LA FAMILIA DE ADN LIGASA 3 DEPENDIENTE DE ATP AT2G32590 Proteína de la familia estéril, baja similitud a 3 SP:Q9Y7R3 Condensina AT3G19590 Como 2 BUB3 3 AT4G22910 CCS52A1 3 AT4G 11920 CCS52A2 3 AT4G33270 cdc20-1 3 AT3G25100 CDC45 proteína como (ciclo 45 de división celular); 3 ciclo de división celular putativa AT3G09840 CDC48 3 AT1G20930 CDKB2;2 3 AT1G73690 CDKD;1 3 AT4G28980 CDKF;1 3 AT2G32900 Proteína de centrómero/cinetocoro, putativa (ZW10) 3 AT5G62410 Homólogo de proteína de ensamble de cromosoma 3 AT1G44110 C Y C A 1 ; 1 3 AT1G47210 CYCA3;2 3 AT4G37490 CYCB1;1 3 AT 1 G 76310 CYCB2;4 3 AT4G34160 CYCD3;1 3 AT4G34090 CYL1 3 Acceso Nombre # características AT3G20550 DDL (DAWDLE) 3 AT5G14960 DEL2 3 AT4G09140 Proteína MLH1 de reparación dispareja de ADN 3 AT3G 18524 Proteína MSH2 de reparación dispareja de ADN 3 (MSH2) idéntica a SP|024617 AT4G02070 Proteína MSH6-1 de reparación dispareja de ADN 3 (MSH6-1 ) (AGAA.3) AT5G55300 ADN topoisomerasa I 3 AT3G 17830 PROTEINA DE LA FAMILIA DE CHOQUE TERMICO DE AD J AT1 G80030 PROTEÍNA DE CHOQUE TÉRMICO DE ADNJ, PUTATIVA AT1G08840 EMB2411 | HELICASA DE REPLICACIÓN DE ADN, PUTATIVA, SIMILAR AT4G37120 Proteína expresada AT5G58870 FTSH9 (FTSH PROTEASA 9); PEPTIDASA DEPENDIENTE DE ATP/ AT1 G13980 GN (GNOM) AT5G24330 H i s to na- 1 is i na N-metiltransferasa AtX R 6 ; Proteína Set DOMINIO AT5G06830 IDÉNTICO A PROTEÍNA COMO CDK5RAP3 [ARABIDOPSIS AT1G49620 KRP7 AT1 G71830 Proteína de la familia de repetición rica en leucina / proteína de la familia de proteina kinasa Acceso Nombre # características AT 1 G 80080 Prote í na de la familia de repetición rica en leucina, 3 contiene repetición rica en leucina AT3G25980 Como AD2 3 AT5G51600 MAP65-3 3 AT1 G44900 MCM2 3 AT2G16440 MCM4 3 AT2G07690 MCM5 3 AT5G54260 MRE11 | REPARACIÓN DE ADN Y PROTEÍNA DE 3 MEIOSIS (MRE11 ) AT5G58230 MSI1 (SUPRESOR DE MULTICOPIA DE IRA1 ) 3 AT1 G61000 Proteína de la familia de Nuf2 contiene Pfam 3 PF03800: familia Nuf2 AT5G16690 ORC3 3 AT1 G72150 PATL1 (PATELLIN 1); TRANSPORTADOR 3 AT1G50840 ADN polimerasa como poli, putativa, similar a ADN 3 como Poli AT1G80190 PSF1 (replicación de ADN de complejo GINS) 3 AT2G45280 Proteína de reparación de ADN como RAD51C 3 putativa; apoyada por cADN: AT2G31970 RAD50 | PROTEÍNA DE REPARACIÓN- 3 RECOMBINACIÓN DE ADN (RAD50), AT5G08020 Proteína como factor A de replicación 3 AT2G21790 Subunidad grande de ribonucleósido-difosfato 3 reductasa; At R N R 1 ; Acceso Nombre # características AT3G27060 Cadena pequeña de ribonucleótido-difosfato 3 reductasa, putativa / AT3G27060 RPA2 3 AT4G 18590 RPA3 3 AT1 G30690 Proteína de la familia de factor SEC14 citosólico / 3 transferencia de fosfoglicérido AT1G74560 Similar a proteína de la familia de proteína de 3 ensamble de nucleosoma (NAP) AT5G04320 Similar a proteína desconocida [Arabidopsis thaliana] 3 AT5G49010 SLD5 (replicación de ADN) 3 AT5G51330 SWM (SWITCH1); FOSFOLIPASA C 3 AT4G02110 TOPBP1 3 AT2G01550 Gen de elemento transponible 3 AT2G15410 Gen de elemento transponible 3 AT4G33790 ACILO COA REDUCTASA, PUTATIVA 2 AT5G22420 ACILO COA REDUCTASA, PUTATIVA 2 AT4G 16420 ADA2B (PROPROZ1); UNIÓN A ADN / FACTOR DE 2 TRANSCRIPCIÓN AT1 G78580 Alfa, alfa-trehalosa-fosfato sintasa, formando UDP, 2 putativa AT1 G54960 ANP2 (PROTEÍNA K I NASA 2 RELACIONADA CON 2 ARABIDOPSIS NPK1) AT4G37750 ANT 2 AT1 G78770 APC6 2 AcceSO Nombre # características AT2G39090 A P C 7 2 AT3G48150 APC8 2 AT4G30080 ARF16 (FACTOR 16 CON RESPUESTA A AUXINA); 2 UNIÓN A MIRNA / AT1G50240 Proteína de la familia de repetición de 2 a r m a d i 11 o/ be ta -ca te n i n a , contiene perfil Pfam: AT1 G67370 ASY1 (ASYNAPTIC 1); UNIÓN A ADN 2 AT3G 12400 ATELC/ELC; unión a ubiquitina 2 AT3G52115 ATGR1 (RESPUESTA 1 GAMMA) 2 AT5G55230 ATMAP65-1 (PROTEÍNAS 65-1 ASOCIADAS CON 2 MICROTUBO) AT3G27730 ADN helicasa dependiente de ATP, putativa 2 AT6G40820 ATR 2 AT5G16850 ATTERT (TRANSCRI PTASA DE REVERSA DE 2 TELOMERASA) AT4G00020 BRCA2A (CANCER DE MAMA 2 COMO 2A, EMBRIO 2 SAC AT5G01630 BRCA2B_ATBRCA2(V)_BRCA2(V)_BRCA2B (cáncer 2 de mama 2 como AT2G 13680 CALS5 (CALOSA SINTASA 5); 1 ,3-BETA-GLUCANO 2 S I NT AS A AT2G20000 cdc27b 2 AT2G03670 CDC48B; ATP AS A 2 AT1G76540 CDKB2;1 2 Acceso Nombre # características AT5G64960 CDKC;2 2 AT5G63370 CDKG;1 2 AT3G02450 FTSH PROTEÍNA DE DIVISIÓN CELULAR, PUTATIVA 2 AT5G55280 Proteína FtsZ de división celular, cloroplasto, 2 putativa AT5G37630 Proteína de la familia de condensación de 2 cromosoma, contiene perfil pfam: AT1 G09600 CKL11 2 AT4G22940 CKL4 2 AT5G44290 CKL5 2 AT1 G03740 CKL6 2 AT1G 54610 CKL9 2 AT2G27970 CKS2 2 AT5G40840 Proteina SYN2 de familia de cohesión (SYN2) 2 AT4G02570 Cadena C de proteína NCBI de la familia de culina, 2 estructura de cristal del Ddb1- AT1G26830 Culin3a 2 AT5G06150 CYCB1.2 2 AT1 G34460 CYCB1 ;5 2 AT5G48640 CYCC1;1 2 AT2G26430 CYCL1 2 AT4G19560 CYCT1 ;2 2 AT5G45190 CYCT1;5 2 AT3G01330 DEL3 2 Acceso Nombre # características AT4G35520 Proteína de la familia de reparación dispareja de 2 ADN AT1 G65070 PROTEÍNA DE LA FAMILIA DE REPARACIÓN MUTS 2 DISPAREJA DE ADN AT 1 G67630 Familia de subunidad B de ADN polimerasa alfa, 2 contiene perfil Pfam: AT1G09815 Familia de subunidad 4 de ADN polimerasa delta, 2 contiene similitud a Swiss-AT5G64420 Familia V de ADN polimerasa, contiene dominio 2 PF04931 de Pfam: ADN AT 1 G 14460 Relacionado con ADN polimerasa, similitud débil a 2 ADN polimerasa 11 AT5G55310 ADN topoisomerasa I, putativa 2 AT5G44610 RELACIONADO CON POLIPÉPTIDO DE MEMBRANA 2 DE PLASMA DREPP AT2G36010 E2Fa 2 AT3G11220 ELP4 2 AT4G32700 Codifica un homólogo de Drosophila MUS308 y ADN 2 mam ífero AT5G64630 Codifica la segunda unidad más grande del factor- de 2 ensamble de cromatina AT4G24790 Proteína expresada; expresión apoyada por MPSS 2 AT3G24495 Proteína expresada; sitio de empalme de GC donador 2 en exón 11 ; apoyado por AT4G23940 FTSH PROTEASA, PUTATIVA 2 Acceso Nombre # características AT5G01230 Proteína de la familia de metilotransferasa como 2 FtsJ, contiene perfil Pfam AT1 G48270 GCR1 (RECEPTOR 1 ACOPLADO A PROTEÍNA G) 2 AT1G10270 GRP23 (PROTEÍNA23 RICA EN GLUTAMINA); UNIÓN 2 AT2G26890 GRV2 8 K AT A M A R 12 ) ; unión/ unión a proteína de 2 choque térmico AT4G32880 Factor de transcripción de cierre de caja horneo- 2 leucina (HB-8), idéntico a HD- AT5G46920 Intrón maturasa, proteína de familia tipo II 2 AT5G54670 Proteína C como kinesina (KATC) 2 AT3G19150 KRP6 2 AT5G44635 MCM6 2 AT4G02060 MCM7 2 AT3G09660 MCM8 2 AT2G14050 MCM9 2 AT1 G77320 MEM (DEFECTUOSO 1 DE MEIOSIS); COACTIVADOR 2 DE TRANSCRIPCIÓN AT3G22880 Proteína de recombinación meiótica, putativa 2 AT5G50110 RELACIONADO CON METILOTRANSFERASA 2 AT5G24020 MIND (ACUMULACIÓN Y REPLICACIÓN DE 2 CLOROPLASTO AT3G24320 Proteína de unión dispareja, putativa; similar a 2 proteína de unión dispareja AT5G49880 PROTEÍNA DE LA FAMILIA DE PUNTO DE 2 Acceso Nombre # características VERIFICACIÓN MITÓTICO AT2G35630 MOR1 | PROTEÍNA DE ORGANIZACIÓN 1 DE 2 MICROTUBO (MOR1 ), AT4G17380 MSH4, similar a proteína de reparación MSH2 2 dispareja de ADN AT 1 G 63680 P rote i n a de la familia de Mur ligasa, contiene perfil 2 Pfam: PF01225 Mur ligasa ' A 5G11510 MYB 3R4 2 AT3G02680 NBS 1 (SÍNDROME 1 DE RUPTURA DE NIJMEGEN) 2 AT3G57060 Subunidad de condensina no SMC, pro teína de la 2 familia de XCAP-D2/Cnd 1 , similar a AT4G14700 ORC1A 2 AT4G29910 OCR5 2 AT4G30825 Proteína que contiene de repetición de 2 pentatricopéptido (PPR), contiene Pfam AT5G14520 Relacionado con pescadillo 2 AT2G 13840 PROTEÍNA QUE CONTIENE DOMINIO PHP 2 AT3G63120 PLP 1 ; 1 2 AT 1 G 50230 P r ote í n a de la familia de proteína kinasa, contiene 2 dominio de proteína kinasa AT3G63130 Proteína 1 activadora de RAN GTPasa ( Ra n G AP 1 ) , 2 contiene Pfam AT1G16590 REV7 (SIN REVERSIÓN 7); UNIÓN A ADN 2 AT5G27740 RFC3 2 Acceso Nombre # características AT1 G2 690 R FC4 2 AT1 G77470 RFC5 2 AT1G48380 RHL1 (SIN CABELLO DE RAÍZ 1 ) 2 AT4G3395 R P D 1 (DETECTIVE 2 DE PRIMORDIO DE RAÍZ) 2 AT5G35770 SAP (APETALA ESTÉRIL); FACTOR DE 2 TRANSCRIPCIÓN AT1 G72160 PROTEÍNA DE LA FAMILIA DE FACTOR CITOSOLICO 2 SEC14/ AT4G09160 PROTEÍNA DE LA FAMILIA DE FACTOR 2 2 CITOSOLICO SEC14/ AT3G51670 Proteína de la familia de factor citosólico SEC14 / 2 transferencia de fosfoglicérido AT5G03730 S E R I N A/TR EO I N A-P ROT E í N A KINASA CTR1 2 AT4G14180 SIMILAR A OS04G0347800 [ORYZA SATIVA 2 (JAPONICA AT1 G08260 SIMILAR A POL2A. ADN POLIMERASA EPSILON 2 CATALÍTICO AT2G27170 Similar a condensina tipo SMC2, putativa (SMC2) 2 (TITAN3) AT5G24630 SIMILAR A PROTEÍNA DESCONOCIDA 2 [ARABIDOPSIS THALIANA] AT3G10440 SIMILAR A PROTEÍNA DESCONOCIDA 2 [ARABIDOPSIS THALIANA] AT3G17590 SNF5 homólogo BSH (bsh) m ARN , cds completo 2 AT1 G49040 Citocinesis estomática defectuosa / proteína SCD1 2 Acceso Nombre # características (SCD1) AT5G15920 Mantenimiento estructural de proteína de la familia 2 de cromosomas (SMC) (MSS2), AT1G04110 Proteína de la familia de subtilasa, contiene similitud 2 a proteasa como subtilisina AT3G04740 SWP (STRUWWELPETER) 2 AT1 G08560 Proteína KNOLLE relacionada con sintaxina 2 AT3G62980 TIR1 (RESPUESTA 1 A INHIBIDOR DE 2 TRANSPORTE); proteína de ubiquitina AT1G30660 Proteína que contiene dominio de toprim 2 AT1G30680 PROTEÍNA QUE CONTIENE DOMINIO DE TOPRIM 2 AT4G10710 Relacionado con regulador transcripcional 2 AT3G44540 PROTEÍNA DE LA FAMILIA DE TRANSDUCINA / 2 FAMILIA DE REPETICIÓN WD-40 AT2G15380 Gen de elemento transponible 2 AT2G15540 Gen de elemento transponible 2 AT2G18820 Gen de elemento transponible 2 AT2G28980 Gen de elemento transponible 2 AT4G04000 Gen de elemento transponible 2 AT3G54670 TTN8 | SIMILAR A MANTENIMIENTO ESTRUCTURAL 2 DE AT3G20060 UBC19 (ENZIMA 19 CONJUGADORA DE UBIQUITNA); 2 UBIQUITINA- AT1G50490 UBC20 2 Acceso Nombre # características AT1G02970 WEE1 2 AT5G08290 YLS8 (gen 8 específico de hoja amarilla); catalítico 2 AT4G02980 ABP1 (PROTEÍNA 1 DE UNIÓN A AUXINA DE 1 RETÍCULO ENDPLÁSM ICO) AT5G22500 ACYLO COA REDUCTASA, PUTATIVA / PROTEÍNA 1 CON ESTERILIDAD MACHO AT1G14830 ADL1C/ADL5 (PROTÉINA 5 COMO DINAMINA); unión ¦] a GTP / GTPasa AT4G33650 ADL2a 1 AT5G61960 AML1 (PROTEÍNA 1 COMO ARABIDOPSIS MEI2), 1 unión a ARN AT4G01540 ANAC068/NTM1 (NAC CON UNIDAD 1 DE 1 TRANSMEMBRANA); AT2G18290 APC10 1 AT2G04660 APC2 1 AT4G21530 APC4 1 AT3G54710 ATCDT1 B/CDT1/CDT1 B (HOMÓLOGO DE 1 ARABIDOPSIS DE LEVADURA AT2G20190 ATCLASP/CLASP; unión 1 AT4G 18820 UNIÓN A ATP / ADN POLIMERASA DIRIGIDA POR 1 ADN/ AT4G21800 Proteína de la familia de unión a ATP 1 AT3G49780 ATPSK3 | F ITOS U L FOC I N AS 3 (PSK3), IDÉNTICA A 1 AT1G58470 ATRBP1 (PROTEÍNA DE UNIÓN A ARABIDOPSIS 1 THALIANA ARN); Acceso Nombre # cara terísticas AT4G00100 ATRPS13A (PROTEINA S13A RIBOSOMAL); constituyente estructural de AT3G20780 ATTOP6B ( BRAS I NO EST E RO I D E INSENSIBLE 3, SIN CABELLO DE RAÍZ AT2G28350 Factor responsivo a auxina (ARF10) AT1 G69400 Como BUB3 1 AT5G27080 cdc20-3 AT5G03455 cdc25 AT2G38620 CDKB1 ;2 AT5G10270 CDKC;1 AT1G66750 CDKD;2 AT5G63610 CDKE;1 AT1G67580 CDKG;2 AT2G46520 PROTEÍ A CON SUSCEPTIBILIDAD A APOPTOSIS CELULAR, PUTATIVA / AT2G25170 Factor CHD3 de remodelación de cromatina (PICKEL) AT2G26280 CID7; UNIÓN A ATP / UNIÓN A ADN DAÑADO AT5G39420 CKL1 AT1G57700 CKL10 AT1G71530 CKL12 AT4G10010 CKL13 AT1 G33770 CKL14 AT1 G74330 CKL2 AT5G50860 CKL7 Acceso Nombre # ter AT2G27960 CKS1 AT1 G02980 Proteína de la familia de culina, similar a culina 1 (Homo sapiens) Gl:3139077; AT1 G69670 Culina3b AT5G46210 Culina4 AT1 G47220 CYCA3;3 AT1 G47230 CYCA3;4 AT1 G20590 CYCB2;5 AT1G16330 CYCB3;1 AT2G22490 CYCD2;1 AT5G67260 CYCD3;2 AT5G65420 CYCD4;1 AT4G03270 CYCD6;1 AT5G27620 CYCH;1 AT3G21870 PROTEÍNA DE LA FAMILIA DE CICLINA, SIMILAR A CICLINA 2 AT5G50375 Ciclopropilo isomerasa (CPI1) AT2G45080 CYCP3;1 (CICLINA P3;1 ); PROTEÍNA KINASA DEPENDIENTE DE CICLINA AT3G60550 CYCP3;2 AT5G61650 CYCP4;2 | PROTEÍNA DE LA FAMILIA DE CICLINA, SIMILAR A CICLINA 2 AT1G35440 CYCT1;1 AT1G27630 CYCT1 ;3 Acceso Nombre # características AT4G19600 CYCT1;4 ? AT1G01040 Fábrica de carpelo de helicasa de caja DEAD/DEAH / 1 CAF AT3G48160 DEL1 1 AT5G54090 Proteína de la familia de MutS de reparación 1 dispareja de ADN AT2G42120 Subunidad pequeña de ADN polimerasa delta 1 AT1G10520 ADN polimerasa lambda (POLL) 1 AT2G32000 PROTEÍNA DE LA FAMILIA DE ADN 1 TOPOISOMERASA AT5G63960 Subunidad catalítica de ADN polimerasa delta 1 dirigida con ADN, putativa AT2G27120 Subunidad catalítica de ADN polimerasa épsilon 1 dirigida con ADN, putativa AT2G22360 Proteína de la familia de choque térmico de ADNJ 1 AT3G60190 Proteína E como dinamina 1 AT5G13680 EL02 1 AT1G12360 CODIFICA PROTEÍNA A SEC1 Y EXPRESADA A LO 1 LARGO DE AT3G23580 CODIFICA UNA DE LAS 3 R I BO N U C L EÓTI DO 1 REDUCTASA (RNR) AT1G50250 FTSH1 (FTSH PROTEASA 1 ); PEPTIDASA 1 DEPENDIENTE DE ATP/ AT5G53170 FTSH11 (FTSH PROTEASA 11); PEPTIDASA 1 DEPENDIENTE DE ATP/ Acceso Nombre # características AT2G36250 FTSZ2-1 (FTSZ HOMÓLOGO 2-1 ); MOLÉCULA 1 ESTRUCTURAL AT3G52750 FTSZ2-2 (FtsZ2-2); molécula estructural 1 AT2G22475 PROTEÍNA CON DOMINIO GRAM - RESPONSIVO A 1 ABA ATMG01250 PROTEÍNA HIPOTÉTICA 1 AT5G08550 ILP1 (NIVEL AUMENTADO DE P O L I P L O I D Y 1 - 1 D ); 1 TRADUCCIÓN AT1G30010 INTRON MATURASA, PROTEÍNA DE LA FAMILIA 1 TIPO II AT4G21270 Proteína A como kinasa (KATA) 1 AT5G35520 Relacionado con proteína cinetocoro 1 AT3G50630 KRP2 1 AT5G48820 KRP3 1 AT2G32710 KRP4 1 AT3G24810 KRP5 1 AT2G26330 Proteina kinasa de repetición rica en leucina, 1 putativa (ERECtA), idéntica a AT3G56700 PROTEÍNA DE ESTERILIDAD MASCULINA, PUTATIVA 1 AT4G30820 MAT1 1 AT1G66170 MMD1 (MUERTE 1 DE MEIOCITO MACHO); UNIÓN A 1 ADN AT4G20900 MS5 (ESTÉRIL 5 MASCULINO) 1 AT1G79150 Iniciación de replicación de NOC3_ADN 1 AcceSO Nombre # características AT2G01840 Familia de retrotransposon no LR (LINE), tiene una 1 explosión de P-valor de 9.6e-34 AT2G35190 NPSN11 (TRAMPA DE PLANTA NOVEDOSA 11 ); 1 transportador de proteína AT1 G77620 N UC L EOS I DO/TR I FOSFATAS A/U N I ÓN A 1 NUCLEÓTIDO AT4G12620 ORC1 1 AT3G44550 OXIDOREDUCTASA, ACTUANDO EN EL GRUPO CH- 1 CH DE AT3G44560 OXIDOREDUCTASA, ACTUANDO EN EL GRUPO CH- 1 CH DE AT5G10480 P AS 2. ( P ASTI C C I N O 2) 1 AT1G07370 PCNA1 1 AT1G71440 PFI_TFC E_PFI ( P F I F F E RL I N G ) 1 AT2G18040 PIN1 1 AT5G22130 PNT1 (CACAHUATE 1 ); MANOSILO 1 TRANSFERASA/TRANSFERASA, AT3G20540 POLGAMMA1 (POLIMERASA GAMMA 1); UNIÓN A 1 ADN/ ADN- AT4G14713 PPD1 (VAINA 1) 1 AT1G49180 Proteína de la familia de proteína kinasa 1 AT3G12530 PSF2 (replicación de ADN de complejo GINS) 1 AT2G 7910 Transcriptasa de reversa de retroelemento no LTR 1 putativa AT4G36390 Proteína que contiene dominio SAM radical / que 1 Acceso Nombre # características contiene dominio TRAM AT 1 G63160 Factor de replicación, putativo; similar a Gl:4972952 1 de (músculo Mus) AT5G45400 Proteína de replicación, putativo; similar a proteina 1 A 70kDa de replicación AT4G 19130 Relacionado con proteína de replicación, similar a 1 proteina A 70kDa de replicación AT4G20520 Unión a ARN / ADN polimerasa dirigida por ARN 1 AT2G20580 RPN1 1 AT3G54220 SCR (ESPANTAPÁJAROS); FACTOR DE 1 TRANSCRIPCIÓN AT1G14750 SDS 1 AT1G22530 Proteína de la familia de factor citosólico SEC14 1 AT1 G34210 SERK2 (KINASA COMO RECEPTOR DE 1 EMBRIOGÉNESIS SOMÁTICA AT5G52800 SIMILAR A PREDICHO: PROTEINA HIPOTÉTICA 1 [RATTUS AT5G58650 SIMILAR A PROTEINA DESCONOCIDA 1 [ARABIDOPSIS TH AL I ANA] AT1 G75950 SKP1 (HOMÓLOGO DE ARABIDOPSIS SKP1 ); 1 proteína ligasa de ubiquitina AT3G47460 Condensina como SMC2, putativa/proteína de 1 ensamble de cromosoma AT2G02480 STI (STICHEL); UNIÓN DE ATP / ADN DIRIGIDO POR 1 ADN AcceSO Nombre # características AT5G07660 Mantenimiento estructural de proteína de la familia 1 de cromosomas (SMC) AT3G51770 Proteína que contiene repetición de tetratricopéptdo AT5G23070 Timidina kinasa, putativa, similar a timidina kinasa (Oryza sativa) AT3G01780 PLACA T AT4G07600 Gene de elemento transponible AT4G09710 Gen de elemento transponible AT4G14470 Gen de elemento transponible AT4G04230 Gen de elemento transponible AT3G18730 TSK (TONSOKU) AT1 G22275 Proteína desconocida AT5G42270 VAR1 (VARIEGADO 1 ); PEPTIDASA DEPENDIENTE DE ATP/ ATP AS A/ AT2G33880 WOX9 (STIMPY); factor de transcripción 1 AT1 G24490 ALB4 (ALBINA 4) 0 AT5G28640 AN3 0 AT3G05870 APC11 0 AT2G37630 AS1 /ATMYB91 /ATPHAN/MYB91 (HOJAS 0 ASIMÉTRICAS 1 , MYB AT3G21850 ASK9 (COMO 9 ARABIDOPSIS SKP1 ); proteína ligasa 0 de ubiquitina AT4G32200 ASY2; unión a ADN 0 AT3G33520 ATARP6; constituyente estructural de citoesqueleto 0 Acceso Nombre * características AT3G48190 Proteína AtATM mutada por ataxia-telangiectasia 1 AT5G05620 ATGCP2/TUBG2 ( G A M M A-T U B U L I N A ); molécula 0 estructural AT3G20475 Unión a ATP / unión a ADN dañada 0 AT 1 G 49250 P rote i n a de la familia de ADN ligasa dependiente de 0 ATP AT1G13590 ATPSK1 (PRECURSOR DE FITOSULFOCINA 1 ); 0 factor de crecimiento AT2G22860 ATPSK_ATPSK2 (PRECURSOR DE FITOSULFOCI A 0 2); factor de crecimiento AT5G65870 ATPSK5 (PRECURSOR DE FITOSULFOCINA 5); 0 factor de crecimiento AT4G37720 ATPSK6 (PRECURSOR DE FITOSULFOCINA 6); 0 factor de crecimiento AT1G14410 ATWHY1/PTAC1 (A. THALIANA WHIRLY 1 ); unión a 0 ADN / telomérico AT5G09790 ATXR5 (GRUPO 15 DE DOMINIO SET), unión a ADN 0 AT3G24730 Catalítico 0 AT3G48750 CDKA;1 0 AT3G54180 CDKB1 ;1 0 AT5G66130 Relacionado con proteína de punto de verificación de 0 ciclo celular, similitud débil a ciclo celular Q94G54 Proteina 6 de control de división celular 0 Q9C8M6 Proteína de control de división celular, putativa; 0 1591 -18846 Acceso Nombre # características Q9LFB3 Proteína como división celular 0 AT1G53050 CKL15 0 AT3G05050 CKL8 0 AT3G15170 CUC1 (COTILEDON 1 EN FORMA DE TAZA); factor 0 de transcripción AT1G20610 CYCB2;3 0 AT5G48630 CYCC1 ;2 0 AT5G10440 CYCD4;2 0 AT5G02110 CYCD7;1 0 AT2G01905 CYCJ18 0 Q38818 Ciclina 2 0 AT2G44740 PROTEÍNA DE LA FAMILIA DE CICLINA, SIMILAR CICLINA 2 AT5G07450 PROTEÍNA DE LA FAMILIA DE CICLINA, SIMILAR CICLINA 2 AT1 G22840 Citocromo c, putativo 0 AT4G26701 Unión a ADN / ADN topoisomerasa tipo I 0 AT3G 15960 Proteína de la familia Muts de reparación dispareja 0 de ADN AT5G22110 FAMILIA DE SUBUNIDAD B DE ADN POLIMERASA 0 EPSILON, CONTIENE AT5G64520 Relacionado con proteína de reparación de ADN 0 AT1G63990 ADN topoisomerasa VIA, putativa (SP011 -2) 0 AT4G39960 Proteína de la familia de choque térmico de ADNJ 0 Acceso Nombre # características AT5G62450 DOMIN01 fj AT5G03415 DPb 0 AT5G50320 EL03 0 Q9FMR4 Emb|CAB92117.1 0 AT1G24590 CODIFICA UN MIEMBRO DEL ERF (RESPUESTA A 0 ETILENO) AT5G26680 E N DO N U C L E AS A , PUTATIVA, SIMILAR A SWISS- 0 PROT:P39748 AT1 G22260 Proteína expresada 0 Q9M874 Proteína F16B3.31 0 Q9FX75 Proteína F19K19.10 0 QPFYF5 F1N21.20 Q81303 Proteina F6N15.14 (homólogo de BRCA2 putativo) 0 AT2G 14650 Proteína F9D12.11 (contiene similitud a 0 transcriptasas de reversa) AT3G24140 FMA (FAMA); unión a ADN / activador de 0 transcripción / factor de transcripción AT2G22942 Factor de crecimiento 0 AT5G42080 Proteína de unión a GTP / fragmoplastina, putativa 0 AT1 G47840 Hexokinasa, putativa 0 AT5G03410 Proteína como histidilo-tARN sintetasa 0 AT2G44950 HUB1 0 AT2G44960 HUB1 0 AT3G52630 Proteína hipotética 0 Acceso Nombre # características AT1G74350 Intrón maturasa, proteína de la familia tipo II 0 AT5G03150 JKD (JACKDAW); unión a ácido nucleico / unión a 0 proteína / proteína Q2V0Z5 Proteína de cinetocoro 0 AT2G30410 KIS (KIESEL); unión a proteína no plegada 0 ATMG00520 MATR 0 AT5G22260 MS1 (ESTERILIDAD 1 MASCULINA); unión a ADN 0 AT3G11980 MS2 (ESTERILIDAD 2 MASCULINA) 0 AT3G11980 ORC4 0 AT4G27650 PEL1 (PELOTA); factor de liberación de traducción 0 AT2G01500 PFS2 (MUY POCAS SEMILLAS 2); factor de 0 transcripción AT3G44735 PSK1 (PRECURSOR DE F I TO S U L FO C I N A 3); factor 0 de crecimiento Q9M8S3 Proteína de dedo de zinc de tipo CCHC putativa 0 AT4G39920 Proteína putativa 0 AT5G22370 Proteína putativa; similar a proteína desconocida 0 (emb|CAB92117.1 ) AT2G07660 Poliproteína pol de retroelemento putativa 0 080896 Proteína At2G32590 no caracterizada putativa 0 Q9M013 Proteína F7A7_150 no caracterizada putativa 0 Q82745 Proteína F7H19.150 no caracterizada putativa 0 Q9C953 Proteína T7P1.14 no caracterizada putativa 0 A4G20050 QRT3 (CUARTETO 3) 0 Acceso Nombre características AT2G06510 Proteína de replicación, putativa similar a proteína A 0 70 kDa de replicación AT4G29090 Transcriptasa de reversa, putativa / ADN polimerasa 0 dependiente de ARN AT2G25100 Proteína de la familia de ribonucleasa Hll 0 AT5G40942 RNR2B 0 AT2G36985 ROT4 (ROTUNDIFOLIA4) 0 AT4G18730 RPL16B (proteína L16B risobomal); constituyente 0 estructural de ribosoma AT1G17235 TFL11 (COMO ROTUNDIFOLIA 11 ) 0 AT4G37650 SHR (RAÍZ CORTA); factor de transcripción 0 AT5G04470 SIM 0 AT3G55490 Similar a TTN10 (TITAN 10) 0 AT5G62440 Sim ilar a producto de proteína sin nombre [Vitís 0 vinifera] (GB:CA064547.1 ) Q9FGA0 Similitud a proteína B de división inhibida de glucosa 0 AT1 G20330 SMT2 (ESTEROL M ET I LOT R A N S F E R AS A 2) 0 AT4G27330 SPL (SPOROCYTESLESS) 0 AT1 G02065 SPL8 (COMO 8 PROTEÍNA DE UNIÓN A PROMOTOR 0 DE ESCAMOSA) AT3G07800 Timidina kinasa, putativa, similar a timidina kinasa 0 (Oryza sativa) AT2G05610 Gen de elemento transponible 0 AT4G08830 Gen de elemento transponible 0 Acceso Nombre # características AT4G10580 Gen de elemento transponible 0 Q9FLP1 Proteína como factor disparador 0 AT1G19080 TTN10 (TITAN 10) 0 AT3G61650 TUBG1 (GAMMA-TUBULINA); MOLÉCULA 0 ESTRUCTURAL AT1G05560 UGT1 ( U D P-glucosi lo transferasa 75B1); UDP- 0 glicosilotransferasa / AT1G47200 WPP2 (proteína 2 de dominio WPP) 0 AT5G57450 XRCC3 | PROTEÍNA DE LA FAMILIA DE 0 REPARACIÓN DE ADN, CONTIENE SIMILITUD Tabla 6: Nuevas proteínas de ciclo celular candidatas.

Visión general de 40 nuevas proteínas putativas de ciclo celular identificadas en la serie de datos de núcleo que contiene por lo menos 2 de las características relacionadas con ciclo celular en la tabla S4. Se muestra el número de características identificadas por proteína.

Locus Descripción # de AT2G44580 DCC1 6~~ AT3G57860 Como UV14 5 AT4G38900 Proteína bZIP 5 AT1G32310 F27G20.14 5 Locus Descripción # de AT4G17020 Relacionado con factor de transcripción 4 AT5G09900 EMB2107, RPN5A, MSA 4 AT5G40460 Expresado 4 AT3G49240 EMB1796 4 AT2G17350 Similar a proteína hipotética [Vitis vinífera] 4 (GB:CAN62847.1 ) AT5G24690 Similar a RER1 (RELACIONADO 1 CON RETICULATA) 4 [Arabidopsis thaliana] AT4G25550 M7J2_80 4 AT3G15180 Relacionado con proteasoma 3 AT2G36130 Peptidilo-prol ilo cis-trans isomerasa, putativa / 3 ciclofilina, putativa / rotamasa AT3G16060 Proteína de la familia motor de kinesina 3 AT3G10180 Relacionado con proteína motor de kinesina 3 AT5G65460 KCA2 3 AT5G05780 RPN8A, AE 3 , ATHMOV34 3 AT1G06070 Factor de transcripción bZIP, putativo (bZIP69) 3 AT1G71380 ATGH9B3, ATCEL3 3 AT3G05530 ATS 6 A .2 , RPT5A 2 AT1G01880 Proteína de reparación de ADN, putativa 2 AT4G34150 Proteína que contiene dominio C2 2 AT5G13030 Similar a proteína hipotética Osl_021963 [Oryza sativa] 2 (GB:3AZ00731.1 ) AT4G14310 DL39C 2 Locus Descripción # de AT5G26360 Chaperonina, putativa 2 AT5G49510 Proteína de unión a VHL, putativa / prefoldina, putativa 2 AT3G20050 ATTCP-1 2 AT1G29150 RPN6, ATS9 2 AT3G15970 Proteína que contiene dominio 1 de unión a Ran / que 2 contiene dominio RanBPI AT4G28230 Similar a producto de proteina sin nombre [Vitis 2 vinifera] ( G B : C A041238.1 ) AT5G23540 Subunidad reguladora de 26S proteasoma, putativa 2 AT5G41190 Similar a proteína hipotética [Vitis vinifera] 2 (GB:CAN66411.1 ) AT2G03820 Proteína de la familia NMD3 de descomposición de 2 mARN mediado sin sentido AT1G20480 Proteína de la familia de 4-coumarato— CoA ligasa / 2 familia de 4-coumaroilo-CoA sintasa AT1G09270 Subunidad de importina alfa-1 , putativa (IMPA4) 2 AT1G23190 Fosfoglucomutasa, c i to p I á sm i ca , putativa / glucosa 2 fosfomutasa AT2G06990 HEN2 2 AT5G58290 RPT3 2 AT5G20920 EMB1401 , EIF2 BETA 2 AT1 G20200 EMB2719 2 Visión general de 82 nuevas proteínas putativas de ciclo celular identificadas en la serie de datos de no núcleo que contiene por lo menos 2 de las características relacionadas con ciclo celular en la tabla S4. Se muestra el número de características identificadas por proteína.

Locus Descripción AT5G18620 CHR17 6 AT4G38780 Factor de empalme, putativo 5 AT1G01970 Proteína que contiene repetición de pentatricopéptido 5 (PPR) AT4G38900 Proteína bZIP 5 AT4G17020 Relacionado con factor de transcripción 4 AT2G46020 ATBRM, CHR2, BRM 4 AT5G10800 Proteína que contiene unidad de reconocimiento de 4 ARN (RRM) AT5G40460 Expresado 4 AT1G36160 AT.-ACC 1 , EMB22, GK, P AS 3 , ACC1 4 AT1G77180 Familia de proteína de cromatina 4 AT1G16520 Similar a proteína desconocida [Arabidopsis thaliana] 4 (TAIR:AT1G56080.1 ) AT3G49240 EMB1796 4 AT4G24680 Similar a producto de proteína sin nombre [Vitis 4 vinífera] (GB:CA064289.1 ) AT2G25730 Unión / unión a hemo 4 Locus Descripción de unidades AT5G38480 RCI1 , GRF3 4 AT4G25550 M7J2_80 4 AT3G05190 Proteína de la familia de aminotransferasa clase IV 4 AT4G35740 RecQI3 4 AT3G62240 Proteína de la familia de dedo de zinc (tipo C2H2) 3 AT3G45970 EXP1 , ATEXPL1, ATHEXP BETA 2.1 , ATEXLA 1 3 AT3G56690 CIP111 3 AT3G56860 UBA2A 3 AT3G01280 Porína, putativa 3 AT3G20390 Proteína de la familia de endoribonucleasa L-PSP 3 AT5G03740 HDT3, HD2C 3 AT5G25210 Similar a proteína desconocida [Arabidopsis thaliana] 3 (TAIR:AT4G32030.1 ) AT1G48920 ATNUC-L1, PARL1 3 AT5G58150 Proteína kinasa de transmembrana de repetición rica 3 en leucina AT1G17340 Proteína de la familia de fosfinositída fosfatasa 3 AT1G23860 RSZP21 , SSRZ21 , SRZ-21 3 AT2G16950 Transportador de proteina 3 AT1G06070 Factor de transcripción bZIP, putativo (bZIP69) 3 AT1G71380 ATGH9B3, ATCEL3 3 AT2G44350 CSY4, ATCS 3 AT1G30860 Unión a proteína / unión a ión de zinc 3 AT3G47930 ATGLDH 3 11 o Locus Descripción # de unidades AT1G03060 Proteína de la familia de repetición WD-40 / 3 relacionado con beige AT4G21860 MSRB2 3 AT2G30470 HSI2 2 AT1G80720 Proteína de la familia de glicoprotei na mitocondrial / 2 proteína de la familia MAM33 AT1 G09760 U 2 A ' 2 AT1 G52360 Complejo de proteína de coatomer, subunidad beta 2 2 ( eta prima), putativo AT1G22300 GF14 EPSILON, GRF10 2 AT3G13640 ATRL11 2 AT5G12140 ATCYS1 2 AT1 G66340 EIN1 , ETR, ETR1 2 AT1 G42440 Similar a proteína desconocida [Arabidopsis thaliana] 2 (TAIR:AT1 G06720.1 ) AT4G09320 NDPK1 2 AT5G54900 ATRBP45A 2 AT1G09100 RPT5B 2 AT1G52730 Proteína de la familia de transducina / proteína de la 2 familia de repetición WD-40 AT3G49430 SRP34A 2 AT3G53880 Proteína de la familia de aldo/ceto reductasa 2 AT4G16630 Helícasa de caja DEAD/DEAH, putativa (RH28) 2 AT2G03820 Proteína de la familia NMD3 de descomposición Locus Descripción # de unidades mARN mediada sin sentido AT1G23190 Fosf ogl u com u ta s a , ci toplá sm i ca , putativa / glucosa 2 f osf om u ta , AT3G01540 ATDRH1 , DRH1 2 AT5G20920 EMB1401 , EIF2 BETA 2 AT4G14310 DL3195C 2 AT1 G09430 ACLA-3 2 AT2G33340 Proteína de la familia de transducina / proteína de la 2 familia de repetición WD-40 AT1G01880 Proteína de reparación de ADN putativa 2 AT5G62350 Invertasa/proteína de la familia de inhibidor de 2 pectina metiloesterasa/ homólogo DC 1.2 AT4G34150 Proteína que contiene dominio C2 2 AT5G46780 Proteína que contiene unidad VQ 2 AT5G26360 Chaperonina, putativa 2 AT4G38440 Similar a proteína hipotética [Vitis vinifera] 2 (GB:CAN83259.1 ) AT3G29800 Familia de ATPasa tipo AAA 2 AT5G58290 RPT3 2 AT3G20050 ATTCP-1 2 AT1G19520 NFD5 2 AT4G26870 Aspartilo-tARN sintetasa, putativa / aspartato-tARN 2 lígasa, putativa AT1G55080 Similar a proteína desconocida [Arabidopsis thaliana] 2 Locus Descripción # de unidades (TAIR:AT1G16520.1) AT5G12380 Anexina, putativa 2 AT4G28230 Similar a producto de proteína sin nombre [Vitis 2 vinifera] (G B: C A041238.1 ) AT2G06210 VIP6, ELF8 2 ATCG00480 ATP B 2 AT5G02530 ARN y proteína de unión a factor de exportación, 2 putativa AT1G31760 Proteína que contiene dominio BAF60b de complejo 2 SWIB AT5G06680 ATSPC98; SPC98 2| AT2G16570 ATASE 1 , ATASE 2 AT1G62390 Octicosapéptído/Phox/proteína que contiene dominio 2 Bem 1 p (PB1 ) AT1G43800 Acilo-(proteína portadora de acilo) desaturasa, 2 putativo / estearoilo-ACP Tabla 7. Visión general de experimentos de rr licroarray usados para calcular los PCCs de transcripción.

Lista de experimento usados para construir un compendio de micro-array de Arabidopsis ATH-1 de 518 experimentos enfocados en ciclo celular o crecimiento y desarrollo vegetal usados para calcular los coeficientes de correlación de Pearson de transcripción.

Descripción Referencia co-2; condición de día largo de 3 días; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE región apical; etapa de roseta xpress_dev_series_mutants_and_o ther_ecotypes/CEL/co-3-1.CEL col-0; condición de dia largo de 3 días; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE región apical; etapa de roseta xpress_dev_series_mutants_and_o ther_ecotypes/CEL/C 01-3-1. CEL ft-2; condición de día largo de 3 días; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE región apical; etapa de roseta xpress_dev_series_mutants_and_o ther_ecotypes/CEL/ft-3-1.CEL Ler; condición de día largo de 3 días; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE región apical; etapa de roseta xpress_dev_seríes_mutants_and_o ther_ecotypes/CEL/Ler-3-1.CEL lfy-12; condición de dia largo de 3 AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE días; región apical; etapa de roseta xpress_dev_series_mutants_and_o ther_ecotypes/CEL/lfy-3-1.CEL co-2; condición de día largo de 5 días; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE región apical; etapa de roseta xpress_dev_series_mutants_and_o trie r_ecotypes/CEL/co -5-1. CEL Col-0; condición de día largo de 5 AtGenExpress, share/nasc/AtGenE días; región apical; etapa de roseta xpress_dev_seríes_mutants_and_o ther_ecotypes/CEL/Col-5-1.CEL ft-2; condición de día largo de 5 días; AtG en Express ;/share/nasc/AtG en E región apical; etapa de roseta xpress_dev_series_mutants_and_o ther_ecotypes/CEL/ft-3-1.CEL Ler; condición de día largo de 5 días; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE región apical; etapa de roseta xpress_dev_series_mutants_and_o Descripción Referencia ther_ecoty es/CEL/Ler-5-1.CEL lfy-12; condición de día largo de 5 AtGen Ex press;/share/nasc/AtGenE días; región apical; etapa de roseta xpress_dev_series_mutants_and_o ther_ecotypes/CEL/lfy-5-1 CEL co-2; condición de día largo de 7 días; AtGen Ex press;/share/nasc/AtGenE región apical; etapa de roseta xpress_dev_series_mutants_and_o ther_ecotypes/CEL/co-7-1.CEL Col-0; condición de día largo de 7 AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE días; región apical; etapa de roseta xpress_dev_series_mutants_and_o ther_ecotypes/CEL/Col-7-1.CEL ft-2; condición de día largo de 7 días; AtGen Ex press;/share/nasc/AtGenE región apical; etapa de roseta xpress_dev_series_mutants_and_o ther_ecotypes/CEL/ft-7-1.CEL Ler; condición de día largo de 7 días; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE región apical; etapa de roseta xpress_dev_series_mutants_and_o ther_ecotypes/CEL/Ler-7-1.CEL lfy-12; condición de día largo de 7 AtGen Express ;/share/nasc/AtGenE días; región apical; etapa de roseta xpress_dev_ser¡es_mutants_and_o ther_ecotypes/CEL/lfy-7-1.CEL co-2; sin tratamiento; región apical; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE etapa de roseta xpress_dev_series_mutants_and_o ther_ecotypes/CEL/co-0-1.CEL Col-0; sin tratamiento; región apical; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE etapa de roseta xpress_dev_series_mutants_and_o ther_ecotypes/CEL/Col-0-1.CEL ft-2; sin tratamiento; región apical; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE Descripción Referencia etapa de roseta xpress_dev_series_mutants_and_o ther_ecotypes/CEL/ft-0-1.CEL Ler; sin tratamiento; región apical; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE etapa de roseta xpress_dev_series_mutants_and_o ther_ecotypes/CEL/Ler-0-1.CEL lfy-12; sin tratamiento; región apical; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE etapa de roseta xpress_dev_series_mutants_and_o ther_ecotypes/CEL/lfy-0-1.CEL Raíces wt; 7 días; luz continua; tierra AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_dev_series_roots/CEL/ATG E_3_A.CEL Raíces wt; 17 días; luz continua; tierra AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_dev_ser¡es_roots/CEUATG E_9_A.CEL Raíz wt; día largo de 15 días (16/8) 1 x AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE MS agar, 1% sacarosa xpress_dev_series_roots/CEL/ATG E_93_A.CEL Raíz wt 8 días luz continua 1x MS agar AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_dev_series_roots/CEL/ATG E_94_A.CEL Raíz wt 8 días luz continua 1x MS AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE agar, 1 % sacarosa xpress_dev_series_roots/CEL/ATG E_95_A.CEL Raíz wt 21 días luz continua 1 x MS AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE agar xpress_dev_series_roots/CEL/ATG E 98 A.CEL Descripción Referencia Raíz wt 21 días luz continua 1x MS AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE agar, 1% sacarosa xpress_dev_series_roots/CEL/ATG E_99_A.CEL Semillero wt, partes verdes 21 días luz AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE continua 1x MS agar xpress_dev_series_seedlings_and_ whole_plants/CEL/ATGE_100_A.CE L Semillero wt, partes verdes 21 días luz AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE continua 1x MS agar, 1% sacarosa xpress_dev_series_seedlings_and_ whole_plants/CEL/ATGE_101_A.CE L Montón del desarrollo wt, roseta entera AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE después de transición a floración, pero xpress_dev_series_seedlings_and_ antes de crecimiento acelerado 21 días whole_plants/CEL/ATGE_22_A.CEL luz continua 'tierra Wt como arriba 22 días luz continua AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE tierra xpress_dev_series_seedlings_and_ whole_plants/CEL/ATGE_23_A.CEL Wt como arriba 23 días luz continua AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE tierra press_dev_series_seedlings_and_ whole_plants/CEL/ATGE_24_A.CEL Semillero wt, partes verdes; 7 días; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE continua; tierra xpress_dev_series_seedlings_and_ whole_plants/CEL/ATGE_7_A2.CEL Semillero wt, partes verdes 8 días lu AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE continua 1 x MS agar xpress_dev_series_seedlings_and_ Descripción Referencia whole_plants/CEL/ATGE_96_A.CEL Semillero wt, partes verdes 8 días luz AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE continua 1x MS agar, 1 % sacarosa xpress_dev_series_seedlings_and_ whole_plants/CEL/ATGE_97_A.CEL Silicuas wt, c / semillas etapa 3; mid AtGen Express ;/s ha re/nasc/AtGenE globular a embriones con corazón xpress_dev_series_siliques_and_s temprano 8 semanas día largo (16/8) eeds/CEL/ATGE 76 B.CEL tierra Silicuas wt, el semillas etapa 4; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE embriones con corazón temprano a xpress_dev_series_siliques_and_s tardío 8 semanas día largo' (16/8 ) tierraeeds/CEL/ATGE_77_D.CEL Silicuas wt, c/semillas etapa 5; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE embriones con corazón tardío a xpress_dev_series_siliques_and_s torpedo med 8 semanas día largo eeds/CEL/ATGE_78_D.CEL (16/8) tierra Semillas wt, etapa 6, sin silicuas; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE embriones de torpedo rned a tardío 8 xpress_dev_series_siliques_and_s semanas día largo (16/8) tierra eed s/C E L/ATG E_79_A . C E L Semillas wt, etapa 7. sin silicuas; AtGenExpress;/share/nasc/AtG embriones de torpedo tardío a bastón xpress_dev_series_siliques temprano 8 semanas día largo (16/8) eed s/C E L/ATG E_81 _A . C E L tierra Semillas wt, etapa 8, sin silicuas; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE cotiledones de bastón a ondulados xpress_dev_series_síliques_and_s temprano eeds/CEL/ATGE_82_A.CEL Semillas wt, etapa 9, sin silicuas; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE Descripción Referencia cotiledones ondulados a embriones de x p r es s_d e v_s er i es_s i I i q u es_a n d_s cotiledones verdes tempranos, 8 eeds/CEL/ATGE_83_A.CEL semanas día largo (16/8) tierra Semillas w t , etapa 10, sin silicuas; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE embriones de cotiledones verdes 8 xpress_dev_series_sil¡ques_and_s semanas día largo (16/8) tierra eeds/CEL/ATGE 84 A. CEL Flores wt etapa 9 21+ días luz conti n ua AtG en Ex press ;/s ha re/nasc/ AtG en E tierra xpress_Developmental_series_flow ers_and_pollen/CEL/ATGE_31_A2. CEL Flores wt etapa 10/11 21 + días luz AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE continua tierra xpress_Developmental_series_flow ers_and_pollen/CEL/ATGE_32_A2. CEL Flores wt etapa 12 21 + días luz AtGen Ex press ;/share/nasc/AtGenE continua tierra xpress_Developmental_series_flow ers_and_pollen/CEL/ATG E_33_A.C EL Flores etapa 12, sépalos 21+ días luz A tG en E x p ress ; Is h a re/n a s el AtG e n E continua tierra xpress_Developmental_ser¡es_flow ers_and_pollen/CEL/ATGE_34_A.C EL Flores wt etapa 12, pétalos 21+ días A tG en E x pr es s ; /s h a re/n a s el AtG e n E luz continua tierra xpress_Developmental_series_flow ers_and_pollen/CEL/ATGE_35_A.C EL Descripción Referencia Flores wt etapa 12, estambres 21+ d í as At G en Ex p r es s ;/s h a re/n a s el A tG e n E luz continua tierra xpress_Developmental_series_flow ers_and_pollen/CEL/ATG E_36_A.C EL Flores wt etapa 12, carpelos 21+ días AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE luz continua tierra xpress_Developmental_series_flow ers_and_pollen/CEL/ATGE_37_A.C EL Flores wt, etapa 15 21+ días luz At G en Ex press ; Is h a re/n a s el A tG e n E continua tierra xpress_Developmental_series_flow ers_and_pollen/CEL/ATGE_39_A.C EL Flores wt etapa 15, pedicelos 21+ días AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE luz continua tierra xpress_Developmental_series_flow ers_and_pollen/CEL/ATGE_40_A.C EL Flores wt etapa 15, sépalos 21 + días AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE luz continua tierra xpress_Developmental_series_flow ers_and_pollen/CEL/ATGE_41_A.C EL Flores wt etapa 15, pétalos 21+ días AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE luz continua tierra xpress_Developmental_series_flow ers_and_pollen/CEL/ATGE_42_B.C EL Flores wt etapa 15, estambre 21+ días AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE luz continua tierra xpress_Develópmental_series_flow Descripción Referencia ers_and__pollen/CEL/ATGE_43_A.C EL Flores wt etapa 15, carpelos 21 + días AtG en Express ;/share/nasc/AtGenE luz continua tierra xpress_Developmental_series_flow ers_and_pollen/CEL/ATGE_45_A.C EL Polen maduro wt 6 semanas luz AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE continua tierra xpress_Developmental_series_flow ers_and_pollen/CEL/ATGE_73_A.C EL Flor wt 28 días día largo (16/8) tierra AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Developmental_ser¡es_flow ers_and_pollen/CEL/ATGE_92_A.C EL clv-3 flor etapa 12; gynoeceum m u I tiAtGenE press;/share/nasc/AtGenE ca r pe I o ; meristemo alargado; número xpress_Developmental_series_flow de órgano aumentado; 21 + días luz ers_and_pollen/CEL/ATG E_53_A.C continua tierra EL lfy-12 flor etapa 12; características de AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE brote; la mayoría de órganos como hoja xpress_Developmental_series_flow 21 + días luz continua tierra ers_and_pollen/CEL/ATGE_54_A.C EL ap1 -15 flor etapa 12; sépalos AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE reemplazados por órganos como hoja, xpress_Developmental_series_flow pétalos la mayoría carentes, 2° flores; ers_and pollen/CEL/ATGE_55_A.C 21 + días luz continua tierra EL Descripción Referencia ap2-6 flor etapa 12; no sépalos o AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE pétalos 21+ días luz continua tierra xpress_Developmental_series_flow ers_and_pollen/CEL/ATGE_56_A.C EL ap3-6 flor etapa 12; no pétales o AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE estambres 21+ días luz continua tierra xpress_Developmental_series_flow ers_and_pollen/CEL/ATGE_57_A.C EL ag-12 flor etapa 12; no estambres o AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE carpelos 21+ días luz continua tierra xpress_Developmental_series_flow ers_and_pollen/CEL/ATGE_58_A.C EL Ufo-1 flor etapa 12; órganos AtG en Express ;/share/nasc/AtG en E filamentosos en espiras dos y tres 21 + xpress_Developmental_seríes_flow días luz continua tierra ers_and_pollen/CEL/ATGE_59_A.C EL Cotiledones wt; 7 días; luz continua; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE tierra xpress_Developmental_series_leav es/CEL/ATGE_1_A.CEL Hoja de roseta wt #4, 1cm largo 10 AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE días luz continua tierra xpress_Developmental_ser¡es_leav es/CEL/ATGE_10_A.CEL g 11 - T hoja de roseta #4, 1cm largo 10 AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE días luz continua tierra xpress_Developmental_series_leav es/CEL/ATGE_11 _A .C EL Hoja de roseta wt #2, 17 días luz AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE Descripción Referencia continua tierra xpress_Developmental_series_leav es/CEL/ATGE_12_A.CEL Hoja de roseta wt #4 17 días luz AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE continua tierra xpress_Developmental_ser¡es_leav es/C E L/ATG E_13_A.CEL Hoja de roseta wt #6 17 días luz AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE continua tierra xpress_Developmental_series_leav es/CEL/ATGEll4_A.CEL Hoja de roseta wt #8 17 días luz AtGenExpress:/share/nasc/AtGenE continua tierra xpress_Developmental_series_leav es/C E L/ATG E_ 15_A.CEL Hoja de roseta wt #10 17 días luz AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE continua tierra xpress_Developmental_series_leav es/CEL/ATGE_16_A.CEL Hoja de rosea wt #12 17 día luz AtGenExpress, share/nasc/AtGenE continua tierra xpress_Developmental_series_leav es/CEL/ATG E_17_A.CEL g 11 - T hoja de roseta #12 17 días luz AtGen Express ;/share/nasc/AtGenE continua tierra xpress_Developmental_ser¡es_leav es/C EL/ATG E_18_A.CEL Hoja wt 7, pecíolo 17 días luz continua AtGen Ex press;/share/nasc/AtGenE tierra xpress_Developmental_series_leav es/CEL/ATGE_19_A.CEL Hoja wt 7, medio próximo 17 días luz AtGen Express ;/share/nasc/AtGenE continua tierra xpress_Developmental_series_leav es/CEL/ATG E 20 A.CEL Descripción Referencia Hoja wt 7, medio distal 17 días luz AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE continua tierra xpress_Developmental_series_leav es/CEL/ATGE_21_A.CEL Hojas senescentes wt 35 días luz AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE continua tierra xpress_Developmental_series_leav es/CEL/ATGE_25_A.CEL Hojas caulinares wt 21 + días luz AtGen Express ;/s haré/ nasc/AtG en E continua tierra xpress_Developmental_ser¡es_leav es/CEL/ATGE_26_A.CEL Hojas wt 1 + 2; 7 días; luz continua; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE tierra xpress_Developmental_series_leav es/CEL/ATGE_5_A.CEL Roseta vegetativa wt 7 días día corto AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE (10/14) tierra xpress_Developmental_series_leav es/CEL/ATGE_87_A.CEL Roseta vegetativa wt 14 días día corto AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE (10/14) tierra xpress_Developmental_series_leav es/CEL/ATGE_89_A.CEL Roseta vegetativa wt 21 días día corto AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE (10/14) tierra xpress_Developmental_seríes_leav es/CEL/ATGE_90_A.CEL Hoja wt 15 días día largo (16/8) 1x MS AtGen Ex press;/share/nasc/AtGenE agar, 1% sacarosa xpress_Developmental_series_leav es/CEL/ATGE_91_A.CEL Hipocotilo wt; 7 días; luz continua; AtGen Express ;/share/nasc/AtGenE tierra xpress_Developmental_seríes_sho Descripción Referencia ots_and_stems/CEL/ATGE_2_A.CE L Tallo wt, 2do internodo 21+ días luz AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE continua tierra xpress_Developmental_series_sho ots_and_stems/CEL/ATGE_27_A.C EL 1er nodo wt 21+ días luz continua AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE tierra xpress_Developmental_series_sho ots_and_stems/CEL/ATGE_28_A2. CEL Ápice de brote wt, inflorescencia AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE (después de crecimiento acelerado) 21 xpress_Developmental_seríes_sho días luz continua tierra ots_and_stems/CEL/ATG E_29_A2.

CEL Ápice de brote wt, hojas vegetativas + AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE jóvenes; 7 días, luz continua; tierra xpress_Developmental_series_sho ots_and_stems/CEL/ATG E_4_A.CE L Ápice de brote wt, vegetativo; 7 días; AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE luz continua; tierra xpress_Developmental_series_sho ots_and_stems/CEL/ATGE_6_A.CE L Ápice de brote wt, transición (antes de AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE crecimiento acelerado) 14 días luz xpress_Developmental_series_sho continua tierra ots_and_stems/CEL/ATGE_8_A.CE L Descripción Referencia clv3-7 ápice de brote, inflorescencia AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE (después de crecimiento acelerado) xpress_Developmental_series_sho 2 + días luz continua tierra ots_and_stems/CEL/ATG E_46_A.C EL lfy-12 ápice de brote, inflorescencia AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE (después de crecimiento acelerado) xpress_Developmental_series_sho 21+ días luz continua tierra ots_and_stems/CEL/ATGE_47_A.C EL ap1-15 ápice de brote, inflorescencia AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE (después de crecimiento acelerado) xpress_Developmental_series_sho 21+ días luz continua tierra ots_and_stems/CEL/ATGE_48_A.C EL ap2-6 ápice de brote, inflorescencia AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE (después de crecimiento acelerado) xpress_Developmental_seríes_sho 21 + días luz continua tierra ots_and_stems/CEL/ATG E_49_A.C EL ap3-6 ápice de brote, inflorescencia AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE (después de crecimiento acelerado) xpress_Developmental_series_sho 21+ días luz continua tierra ots_and_stems/CEL/ATGE_50_A.C EL ag-12 ápice de brote, inflorescencia AtG en Express ;/share/nasc/AtGenE (después de crecimiento acelerado) xpress_Developmental_series_sho 21+ luz continua tierra ots_and_stems/CEL/ATGE_51_A.C EL ufo-1 ápice de brote, inflorescencia AtG en Express ;/share/nasc/AtGenE (después de crecimiento acelerado) xpress_Developmental_series_sho Descripción Referencia 21+ días luz continua tierra ots_a n d_s t e m s/C E L/ATG E_52_A . C EL Centro inactivo de raíz; AGL41 ; centro Birnbaum_arexdb; inactivo, patrón no específico cuando raíces crecen viejas/largas; sólo QC y a etapas muy tempranas Líber de raíz; APL; pSE y mSE y CC en Birnbaum_arexdb; desarrollo entre los dos : pérdida de GFP en pSE maduro está acompañado por GFP fuerte en CC vecino; GFP reaparece en mSE inmaduro; Corteza de raíz; C1 (o 315.1 ) B i r n ba u m_a rexd b ; (AT1G09750 promotor); corteza; de alargamiento a por lo menos dif. De cabello de raíz inmaduro Epidermis de raíz; GL2; atrícoblasto; Birnbaum_arexdb; de QC y más Tejido de tierra de raíz; J 0571 ; tierra; Birnbaum_arexdb; endo + corteza + qc; de punta hasta arriba Tapa de raíz lateral; J 3411 ; tapa de Birnbaum_arexdb; raíz lateral más epidermis; de punta a exactamente dónde? Por lo menos la zona de diferenciación; GFP es aproximadamente 5X más débil en dif.

Zona Descripción Referencia Columela de raíz; PET111; columela - Birnbaum_arexdb; tier 2, 3, 4; Xilema de raíz; S18 (477.13) (promotor Bírnbaum_arexdb; AT5G 12870); células de xilema madurando; inicia desde alargamiento medio y para a medio camino; GFP cambia de pSE a mSE Endodermis de raíz; SCR; marca la QC Birnbaum_arexdb; y la endodermis al menos pasando la zona de cabello maduro; de QC hasta arriba? Al menos pasa zona de cabello maduro M icrod ¡sección de tejido; etapa I; todos Birnbaum_arexdb; los tejidos radiales; en donde la punta de la raíz alcanza su diámetro entero (aproximadamente 0.15 mm desde la punta de la raíz) M ¡crod ¡sección de tejido; etapa II; Birnbaum_arexdb; todos los tejidos radiales; en donde células transitan de ser ópticamente densas a una apariencia más transparente conforme comienzan expansión longitudinal Microdisección de tejido; etapa III; Birnbaum_arexdb; todos los tejidos radiales; en donde cabellos de raíz se alargan por Descripción Referencia completo (aproximadamente 0.45 a 2 mm desde la punta de raíz) Estela de raíz; WOL; estela; de QC y Birnbaum_arexdb comienza a desvanecerse de zona de alargamiento Campb-ColO-Suc Malcolm_Campbell_1 ;/share/nasc/ Malcolm_Campbell_1/CEL/MC001_ ATH1_A1-Campb-317.CEL Campb-ColO-noSuc Malcolm_Campbell_1 ;/share/nasc/ Malcolm_Campbell_1 /CEL/MC001_ ATH1_A4-Campb-320.CEL Campb-MYB61 -Suc Malcolm_Campbell_1 ;/share/nasc/ Malcolm_Campbell_1/CEL/MC001_ ATH1_A7-Campb-323.CEL Campb-MYB61 -noSuc Malcolm_Campbell_1 ;/share/nasc/ Malcolm_Campbell_1/CEL/MC001_ ATH1_A10-Campb-326.CEL Campb-MYB61 oe-Suc Malcolm_Campbell_1 ;/share/nasc/ Malcolm_Campbell_1/CEL/MC001_ ATH1_A13-Campb-329(new).CEL Campb-MYB61oe-noSuc Malcolm_Campbell_1 ;/share/nasc/ Malcolm_Campbell_1/CEL/MC001_ ATH1_A16-Campb-332.CEL col ; h ipoc otilo Malcolm__Campbell_2;/share/nasc/ Malcolm_Campbell_2/CEL/MC002_ ATH1 A10.1 -dubos-wth.CEL Descripción Referencia max4; hipocotilo Maleo m_Campbell_2;/share/nasc/ Maleo m_Campbell_2/CEL/MC002_ AT H 1 _ A11.1 -dubos-mxh.CEL axrl ;hipocotilo Maleo m_Campbell_2;/share/nasc/ Maleo m_Campbell_2/CEL/MC002_ AT H 1 _ _A12.1 -dubos-arh.CEL col ;xilema Maleo m_Campbell_2;/share/nasc/ Maleo m_Campbell_2/CEL/MC002_ AT H 1 _ A1.1 -dubos-wtx.CEL col;corcho Maleo m_Campbell_2;/share/nasc/ Maleo m_Campbell_2/CEL/MC002_ AT H 1 _ A2.1-dubos-wtc.CEL myb61 ko;xilema Maleo m_Campbell_2;/share/nasc/ Maleo m_Campbell_2/CEL/ C002_ AT H 1 _ A3.1-dubos-6kx.CEL myb61 ko;corcho Maleo m_Campbell_2;/share/nasc/ Maleo m_Campbell_2/CEL/MC002_ AT H 1 _ A4.1-dubos-6kc.CEL myb50 ko;xilema Maleo m_Campbell_2;/share/nasc/ Maleo m_Campbell_2/CEL/MC002_ AT H 1 _ A5.1 -dubos-5kx.CEL m y b 50 ; c o r c h o Maleo m_Campbell_2;/share/nasc/ Maleo m_Campbell_2/CEL/MC002_ AT H 1 _ _A6.1 -dubos-5kc.CEL ler; hipocotilo Maleo m_Campbell_2;/share/nasc/ Maleo m_Campbell_2/CEL/MC002_ Descripción Referencia ATH1_A70.1-dubos-wLh.CEL a b i 1 ; h i p o c o t i I o (origen ler) Malcolm_Campbell_2;/share/nasc/ Malcolm_Campbell_2/CEL/MC002_ ATH1_A8.1-dubos-aih.CEL aba 1 ; h ipocot i lo (origen ler) Malcolm_Campbell_2;/share/nasc/ Malcolm_Campbell_2/CEL/ C002_ ATH1_A9.1-dubos-aah.CEL Semillero; ColO; 10nM BL durante 1h AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ Brassinolide_timecource_wt_det2_ seedlings/CEL/RIKENG0DA16A.cel Semillero; ColO; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ durante 3h Brassinolide_timecource_wt_det2_ seedl¡ngs/CEL/RIKENG0DA17AC.c el Semillero; ColO; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ durante 30min Brassinolide_timecource_wt_det2_ seedlings/CEL/RI KENG0DA1AC.ee! Semillero; ColO; 10nM BL durante 3h AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ Brassinolide_timecource_wt_det2_ seedlings/CEL/RIKENGODA24A.cel Semillero; des-etiolado; tratamiento AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ simulado durante 30min Brassinolide_timecource_wt_det2_ seedlings/CEL/RIKENGODA31A.cel Semillero; des-etiolado; 10nM BL AtGen Express ;/share/nasc/AtGen_ durante 30min Brassinolide_timecource_wt_det2_ seedlings/CEL/RIKENGODA32A.cel Descripción Referencia Semillero; des-etiolado; tratamiento AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ simulado durante 1 h Brassinolide_timecource_wt_det2_ seedlings/CEL/RIKENGODA33A.cel Semillero; des-etiolado; 10nM BL AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ durante 1 h Brassinolide_timecource_wt_det2_ seedlings/CEL/RIKENGODA34A.cel Semillero; des-etiolado; tratamiento AtG en Express ;/s ha re/nasc/AtGen_ simulado durante 3h Brassinolide_timecource_wt_det2_ seedlings/CEL/RIKENGODA35A.cel Semillero; des-etiolado; 10nM BL AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ durante 3h Brassinolide_timecource_wt_det2_ seedlings/CEL/RIKENGODA36A.cel Semillero; ColO; 10nM BL durante AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ 30m in Brassinolide_timecource_wt_det2_ seedlings/CEL/RIKENGODA8A.cel Semillero; ColO; tratamiento simulado AtGen Express ;/s ha re/nasc/AtGen_ durante 1 h Brassinolide_timecource_wt_det2_ seedlings/CEL/RIKENGODA9AC.cel Planta completa; 10uM brasinazol 91 AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ (Brz91 ) (inhibidor de biosíntesis de effect_brassinosteroid_inhibitors_s brasinoesteroide) durante 12 h eeds/CEL/RIKENGODA10A4.cel Planta completa; tratamiento simulado AtGen Ex press;/share/nasc/AtGen_ durante 3h effect_brassinosteroid_inhibitors_s eeds/CEL/RIKENGODA1A4.cel Planta completa; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ durante 3h effect brassinosteroid inhibitors s Descripción Referencia eeds/CEL/RIKENGODA28A4.cel Planta completa; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ durante 12h effect_brassinosteroid_inhibitors_s eeds/CEL/RIKENGODA2A4.cel Panta completa; 3uM brasinazol 220 AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ (Brz220) (inhibidor de biosíntesis de effect_brassinosteroid_inhibítors_s brasinoesteroide) durante 3h eeds/CEL/RIKENGODA30A4.cel Planta completa; 10uM brasinazol 220 AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ (Brz220) (inhibidor de biosíntesis de effect_brassinosteroíd_inhibitors_s brasinoesteroide) durante 3h eeds/CEL/RIKENGODA7A4.cel Planta completa; 10uM paclobutrazol AtGen Express ;/s ha re/nasc/AtGen_ (inhibidor de biosíntesis GA) durante effect_GA_inhibitors_on_seeds/CE 3h L/RI KENGODA11 A2.cel Planta completa; 10uM paclobutrazol AtGen Ex press;/share/nasc/AtGen_ (inhibidor de biosíntesis GA) durante effect_GA_inhibitors_on_seeds/CE 12h L/RIKENGODA12A2.cel Planta completa; 10uM prohexadiona AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ (inhibidor de biosíntesis GA) durante effect_GA_inhíbitors_on_seeds/CE 3h L/RIKENGODA13A2.cel Planta completa; 10uM prohexadiona AtGen Ex press;/share/nasc/AtGen_ (inhibidor de biosíntesis GA) durante effect_GA_inhibitors_on_seeds/CE 12h L/RIKENGODA14A2.cel Planta completa; tratamiento simulado AtGen Ex press;/share/nasc/AtGen_ durante 3h effect_GA_¡nhibitors_on_seeds/CE L/RIKENGODA1 A2.cel Planta completa; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ Descripción Referencia durante 12h effect_GA_inhíbitors_on_seeds/CE L/RIKENGODA2A2.cel Planta complete; 10uM propiconazol AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ (inhibidor de biosíntesis GA) durante effect_GA_inhibitors_on_seeds/CE 3h L/RIKENGODA3A2.cel Planta completa; 10uM propiconazol AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ (inhibidor de biosíntesis GA) durante effect_GA_inhibítors_on_seeds/CE 12h L/RIKENGODA4A2.cel Planta completa; 10uM uniconazol AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ (inhibidor de biosíntesis GA) durante effect_GA_inhibitors_on_seeds/CE 3h L/RIKENGODA5A2.cel Planta completa; 10uM uniconazol AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ (inhibidor de biosíntesis GA) durante effect_GA_inhibitors_on_seeds/CE 12h L/RIKENGODA6A2.cel Planta completa; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ durante 3h Effect_of_proteasome_inhibitor_M G13_on_seedlings/CEL/RIKENGOD A1 A9.cel Planta completa; 10uM MG132 AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ (carbobenzoxilo-leucinílo-leucinilo- Effect_of_proteasome_inhibitor_M leucínal) durante 3h G13_on_seedlings/CEL/RIKENGOD A22A9.cel Semilla; sin tratamiento AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ exp_profilíng_early_germinating_s eeds/CEL/RIKENPRESTONOA.cel Semilla; ingerida en agua (1 hora) AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ Descripción Referencia exp_profiling_early_germ¡nating_s eeds/CEL/RIKENPRESTON1A.cel Semilla; ingerida en agua (3 horas) AtGenExpress;/share/nasc/AtGen_ exp_profiling_early_germinating_s eeds/CEL/RIKENPRESTON2A.cel Semillero; 10uM ABA durante 1 h AtGen Ex press;/share/nasc/AtGenE xpress_ABA_time_course_Jn_w¡ldty pe_seedlings/CEL/RIKENGODA13A .cel Semillero; tratamiento simulado AtGen Ex press;/share/nasc/AtGenE durante 3h xpress_ABA_time_course_in_wildty pe_seedlings/CEL/RIKE GODA17 A .cel Semillero; tratamiento simulado AtGen Express ;/share/nasc/AtGenE durante 30min xpress_ABA_time_course_in_wildty pe_seedlings/CEL/RIKENGODA1 A. cel Semillero; 10uM ABA durante 3h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_ABA_time_course_in_wildty pe_seedlings/CEL/RIKENGODA21A .cel ' Semillero; 10uM ABA durante 30min AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_ABA_time_course_in_wildty pe_seedlings/CEL/RIKENGODA5A. cel Semillero; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE Descripción Referencia durante 1 h xpress_ABA_time_course_in_wildty pe_seedlings/CEL/RIKENGODA9A. cel Semillero; 10uM ACC durante 1 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_ABA_time_course_in_wildty pe_seedlings/CEL/RIKENGODA15A .cel Semillero; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE durante 3h xpress_ABA_time_course_in_wildty pe_seedlings/CEL/RIKENGODA17A A. cel Semillero; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE durante 30min xpress_ABA_time_course_in_wildty pe_seedlings/CEL/RIKENGODA1AA .cel Semillero; 10uM ACC durante 3h AtG en Express ;/share/nasc/AtG en E xpress_ABA_time_course_¡ n_wi I d ty pe_seedlings/CEL/RIKENGODA23A .cel Semillero; 10uM ACC durante 30min AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_ABA_time_course_in_wildty pe_seedlings/CEL/RIKENGODA7A. cel Semillero; tratamiento simulado AtGen Express ;/s ha re/nasc/AtGenE durante 1 h xpress_ABA_time_course_in_wildty pe_seedlings/CEL/RIKENGODA9AA Descripción Referencia .cel Planta completa; 10uM 2,4,6-T (2,4,6- AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE trihidroxibenzamida) durante 3h xpress_Effect_of_auxin_inhibitors_ on_seedlings/CEL/RIKENGODA23A 3. cel Planta completa; 10uM NPA (ácido AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE naftiloftálmico) (inhibidor de transporte xpress_Effect_of_auxin_inhibitors_ de auxina) durante 3h on_seedlings/CEL/RIKENGODA26A 3 cel Planta completa; 10uM PCIB (ácido p - AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE clorofenoxiisobutírico) (inhibidor de xpress_Effect_of_auxin_inhibitors_ auxina) durante 3h on_seedlings/CEL/RIKENGODA24A 3. cel Planta completa; 10um TIBA (ácido AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE 2 , 3 , 5-triyod obe n zoi co ) (inhibidor de xpress_Effect_of_auxin_inhib¡tors_ transporte de auxina) durante 3h on_seedlings/CEL/RIKENGODA25A 3 cel Planta completa; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE durante 3h xpress_Effect_of_auxin_inhibitors_ on_seedlings/CEL/RIKENGODA1A3 .cel Planta entera; 100nM castasterona AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE durante 3h xpress_Effect_of_brassinosteroids _in_seedlings/CEL/RIKENGODA12 A6.cel Planta entera; 10nM brasinolida AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE Descripción Referencia durante 3h xpress_Effect_of_brassinosteroids _in_seedlings/CEL/RIKENGODA13 . A6.cel Planta entera; 10uM campestanol AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE durante 3h xpress_Effect_of_brass¡nostero¡ds _in_seedlings/CEL/RIKENGODA26 A6.cel Planta entera; 1 u M 3-deshidro-6- AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE desoxoteasterona durante 3h xpress_Effect_of_brass¡nostero¡ds _in_seedlings/CEL/RIKENGODA7A 6. c e I Planta entera; 1 uM 3- AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE deshidroteasterona durante 3h xpress_Effect_of_brass¡nosteroids _in_seedlings/CEL/RIKENGODA8A 6.cel Planta entera; 1 uM 6- AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE desoxocastasterona durante 3h xpress_Effect_of_brassinosteroids _in_seedlings/CEL/RIKENGODA11 A6.cel Planta entera; 1 uM 6- AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE desoxocatasterona durante 3h xpress_Effect_of_brassinostero¡ds _in_seedl¡ngs/CEL/RIKENGODA3A 6.cel Planta entera; 1 u M 6-desoxoteastero na AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE durante 3h xpress_Effect_of_brass¡nosteroids _¡n_seedlings/CEL/RIKENGODA5A Descripción Referencia 6.cel Planta entera: 1uM 6-desoxitifasterol AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE durante 3h xpress_Effect_of_brassinosteroids _in_seedlings/CEL/RIKENG0DA9A 6. cel Planta entera; 1uM catasterona duranteAtGenExpress;/share/nasc/AtGenE 3h xpress_Effect_of_brassinosteroids _in_seedl¡ngs/CEL/RIKENGODA4A 6.cel Planta entera; 1uM teasterona durante AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE 3h xpress_Effect_of_brassinostero¡ds _¡n_seedl¡ngs/CEL/RIKENGODA6A 6. cel Planta entera; 1uM tifasterol durante AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE 3h x ress_Effect_of_brass¡nosteroids _¡n_seedl¡ngs/CEL/RIKENGODA10 A6.cel Planta entera; tratamiento simulado AtGen Express ;/share/nasc/AtGenE durante 3h xpress_Effect_of_brassinosteroids _¡n_seedl¡ngs/CEL/RIKENGODA1A 6. cel Planta completa; 10uM AgN03 AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE (inhibidor de etileno) durante 3h xpress_Effect_of_ethylene_inh¡b¡to rs_on_seedlings/CEL/RIKENGODA 19A7.cel Planta completa; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE Descripción Referencia durante 3h xpress_Effect_of_ethylene_inhibito rs_on_seedlings/CEL/RIKENGODA 1 A7.cel Planta completa; 10uM AVG AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE ( a m i n oetox i v i n i I og I ici n a ) (inhibidor de xpress_Effect_of_ethylene_inhibito etileno) durante 3h rs_on_seedlings/CEL/RIKENGODA 20A7.cel Semillero; 1u IAA durante 1 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_IAA_time_course_in_wildty pe_seedlings/CEL/RIKENGODA110 A.cel Semillero; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE durante 3h xpress_l AA_time_course_in_wildty pe_seedlings/CEL/RIKENGODA117 AD.cel Semillero; 1 u M IAA durante 3h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_IAA_time_course_in_w¡ldty pe_seedlings/CEL/RIKENGODA118 A.cel Semillero; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE durante 30mint x pres s_l A A_t i m e_course_in_wildty pe_seedlings/CEL/RIKENGODA11A D.cel Semillero; 1 uM IAA durante 30min AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_IAA_time_course_in_wildty pe_seedlings/CEL/RIKENGODA12A Descripción Referencia . cel Semillero; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE durantel h x pres s_l A A_t i m e_course_in_w¡ldty pe_seedlings/CEL/RIKENGODA19A D.cel Semillero; 10uM MJ durante 1 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Methyl_Jasmonate_time_co urse_in_wildtype/CEL/RIKENGODA 14A.cel Semillero; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE durante 3h xpress_Methyl_Jasmonate_time_co u rs e_i n_wi I dtype/CEL/RIKENGODA 17AF.cel Semillero; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE durante 30min xpress_Methyl_Jasmonate_time_co u rs e_¡ n_w¡ I dtype/CEL/RIKENGODA 1 AF.cel Semillero; 10uM MJ durante 3h AtGen Ex press;/share/nasc/AtGenE xpress_Methyl_Jasmonate_time_co urse_in_wildtype/CEL/RIKENGODA 2A.cel Semillero; 10uM MJ durante 30min AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Methyl_Jasmonate_time_co urse_in_wildtype/CEL/RIKENGODA 6A.cel Semillero; tratamiento simulado AtGen Express ;/share/nasc/AtG en E Descripción Referencia durante 1 h xpress_Methyl_Jasmonate_t¡me_co urse_in_wildtype/CEL/RIKENGODA 9AF.cel Semillero; 1uM zeatina durante 1 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Zeatin_time_course_in_wil dtype_seedlings/CEL/RIKENGODA1 1 A.cel Semillero; 1uM zeatina durante 30min AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Zeatin_time_course_in_wil dtype_seedlings/CEL/RIKENGODA3 A.cel Semillero; 1uM zeatina durante 3h AtGenExpress;/share7nasc/AtGenE xpress_Zeatin_time_course_in_wil dtype_seedlings/CEL/RIKENGODA1 9A.cel Semillero; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE durante 1 h xpress_Zeatin_time_course_in_wil dtype_seedlings/CEL/RIKENGODA9 AG .cel Semillero; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE durante 30min xpress_Zeatin_time_course_in_wil dtype_seedlings/CEL/RIKENGODA1 AG .cel Semillero; tratamiento simulado AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE durante 3h xpress_Zeatin_time_course_in_wil dtype_seedlings/CEL/RIKENGODA1 Descripción Referencia 7AG.cel Semillas; tratamiento de agua durante AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE 3 horas xpress_Basic_hormone_treatment_ of_seeds/CEL/RIKENLI1 A.cel Semillas; tratamiento de agua durante AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE 6 horas xpress_Basic_hormone_treatment_ of_seeds/CEL/RIKENLI2A.cel Semillas; tratamiento de agua durante AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE 9 horas xpress_Basic_hormone_treatment_ of_seeds/CEL/RIKENLI3A.cel Semillas; tratamiento de 5 u M A tG e n Ex press ; /s h a re/n a se/ AtG e n E giberelina durante 3 horas xpress_Basic_hormone_treatment_ of_seeds/CEL/RIKEN LI4A.ce I Semillas; tratamiento de 5 uM AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE giberelina durante 6 horas xpress_Basic_hormone_treatment_ of_seeds/CEL/RIKENLI5A.cel Semillas; tratamiento de 5 uM AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE giberelina durante 9 horas xpress_Basic_hormone_treatment_ of_seeds/CEL/RIKENLI6A.cel ColO; planta completa; sin tratamiento AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Cytok¡nin_treatment_of_se edlings/CEL/N01 O.cel ColO; planta completa; 20uM t-zeatina AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE durante 3h xpress_Cytokinin_treatment_of_se edlings/CEL/N0192.cel ARR22-ox; planta completa; sin AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE Descripción Referencia tratamiento xpress_Cytokinin_treatment_of_se edlings/CEL/N028.cel ARR22-ox; planta completa; 20u t- AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE zeatina durante 3h xpress_Cytokinin_treatment_of_se edlings/CEL/N031.cel Semilla; 24 h ingerida en 3 uM ABA AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Effect_of_ABA_during_see d_inhibition/CEL/RIKENNAKABAYA SHI3A.cel Semilla; 24 h ingerida en 30 uM ABA AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Effect_of_ABA_during_see d_inhib¡tion/CEL/RIKENNAKABAYA SHI4A.cel Semilla; 24 h ingerida en agua AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Effect_of_ABA_during_see d_inhibition/CEL/RI ENNAKABAYA SHI2A.cel Semilla; sin tratamiento AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Effect_of_ABA_dur¡ng_see d_inhibition/CEL/RIKENNAKABAYA SHI1 A. cel Estrés de control-brotes-Oh AtGenExpress, share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Control _plants/CEL/0011.cel Estrés de control-raíces-Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Control Descripción Referencia _plants/CEL/0021.cel Estrés de control-brotes-0.5h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Control _plants/CEL/0111.cel Estrés de control-raíces-0.5h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Control _plants/CEL/0121.cel Estrés de control-brotes-1.Oh A tG en Ex pres s ; /s h a re/n a s el A tG e n E xpress_Stress_Treatments_Control _plants/CEL/0211.cel Estrés de control-raíces-1.Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Control _plants/CEL/0221.cel Estrés de control-brotes-3.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE x pres s_St res s_Treatm ents_Control _plants/CEL/0311.cel Estrés de control-raíces-3.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Control _plants/CEL/0321 cel Estrés de control-brotes-6.0h AtG e n E x pres s ; Is h a re/n a s el A t G en E xpress_Stress_Treatments_Control _plants/CEL/0411.cel Estrés de control-raíces-6.0h A tG en Ex pres s ; Is h a re/n a s el AtG e n E xpress_Stress_Treatments_Control _plants/CEL/0421.cel Estrés de control-brotes-12. Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE Descripción Referencia xpress_Stress_Treatments_Control _plants/CEL/0511.cel Estrés de control-raíces-12. Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Control _plants/CEL/0521.cel Estrés de control-brotes-24.0h AtGenExpressi/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Control _plants/CEL/0611.cel Estrés de control-raíces-24.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Control _plants/CEL/0621.cel Estrés de con t rol- brotes-0.25h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Control _plants/CEL/0711.cel Estrés de control-raíces-0.25h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE x ress_Stress_Treatments_Control _plants/CEL/0721.cel Estrés de control-brotes-4.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Control _plants/CEL/0811.cel Estrés de control-raíces-4.0h AtG en Express ;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Control _plants/CEL/0821.cel Estrés por frio(4?C)-brotes-0.5h AtGen Express ;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Cold_st ress/CEL/1111.cel 46 Descripción- Referencia Estrés por f r i o( 4?C )-ra í ees -0.5 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Cold_st ress/CEL/1121.cel Estrés por frío(4?C)-brotes-1.Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Cold_st ress/CEL/1211.cel Estrés por f r í o( 4 ? C )-ra í ees - 1.0 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Cold_st ress/CEL/1221.cel Estrés por f r í o( 4 ? C )-b ro tes- 3.0 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Cold_st ress/CEL/1311.cel Estrés por frío(4?C)-raíces- AtGen Express ;/share/nasc/AtG en E xpress_Stress_Treatments_Cold_st ress/CEL/1321.cel Estrés por frío(4?C)-brotes-6.0h AtGen Express ;/share/nasc/AtG en E xpress_Stress_Treatments_Cold_st ress/CEL/1411.cel Estrés por frío(4?C)-raíces-6.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Cold_st ress/CEL/1421.cel Estrés por frío(4?C)-brotes-12. Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Cold_st ress/CEL/1511.cel Estrés por f r i o( 4 ? C )-r a i ces- AtGen Express ;/share/nasc/AtG en E xpress_Stress_Treatments_Cold_st Descripción Referencia ress/CEL/1521.cel Estrés por frío(4?C)-brotes-24.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Cold_st ress/CEL/1611.cel Estrés por f r ío( 4 ? C )-ra i ees -24.0 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Cold_st ress/CEL/1621.cel Estrés os m ótico-b rote s-0.5 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Osmot¡ c_stress/CEL/2111.cel Estrés osmótico-raíces-0.5h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Osmot¡ c_stress/CEL/2121.cel Estrés osmótico-brotes-1.Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Osmoti c_stress/CEL/2211.cel Estrés os m ót ¡co-ra i ees- 1.0 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Osmoti c_stress/CEL/2221.cel Estrés osmót¡co-brotes-3.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Osmoti c_stress/CEL/2311.cel Estrés os m ót ¡co-ra i ees- 3.0 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Osmoti c_stress/CEL/2321.cel Estrés osmótico-brotes-6.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE Descripción Referencia x ress_Stress_Treatments_Osmot¡ c_stress/CEL/2411.cel Estrés osmótico-raíces-6.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Osmot¡ c_stress/CEL/2421.cel Estrés os m ótico-brotes- 12. Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Osmoti c_stress/CEL/2511.cel Estrés osmótico-racíes-12. Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Osmot¡ c_stress/CEL/2521.cel Estrés osmót¡co-brotes-24.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Osmot¡ c_stress/CEL/2611.cel Estrés os m ót ico-ra í ces-24.0 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Osmot¡ c_stress/CEL/2621.cel Estrés por sal-brotes-0.5h AtGenExpress, share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Salt_st ress/CEL/3111.cel Estrés por sal-raíces-0.5h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Salt_st ress/CEL/3121.cel Estrés por sal-brotes- AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Salt_st ress/CEL/3211.cel Descripción Referencia Estrés por sal-raíces-1.Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Salt_st ress/CEL/3221.cel Estrés por sal-brotes-3.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Salt_st ress/CEL/3311 cel Estrés por sal-raíces-3.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Salt_st ress/CEL/3321.cel Estrés por sal-brotes-6.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Salt_st ress/CEL/3411.cel Estrés por sal-raíces-6.0h AtGenExpress, share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Salt_st ress/CEL/3421.cel Estrés por sal-brotes-12. Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Salt_st ress/CEL/3511.cel Estrés por s a I -r a í ees- 12.0 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Salt_st ress/CEL/352 .cel Estrés por sa I - brotes-24.0 h AtGenExpress, share/nasc/AtGenE x ress_Stress_Treatments_Salt_st ress/CEL/3611.cel Estrés por sal-raíces-24.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Salt_st Descripción Referencia ress/CEL/3621.cel Estrés hídrico-brotes-0.5h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Drough t_stress/CEL/4111.cel Estrés hídrico-raíces-0.5h AtGen Express ;/share/nasc/AtG en E xpress_Stress_Treatments_Drough t_stress/CEL/4121.cel Estrés h í d r i co- brotes - 1.0 h AtGen Express ;/share/nasc/AtG en E xpress_Stress_Treatments_Drough t_stress/CEL/4211.cel Estrés h i d r i co-ra í ees- 1.0 h AtGen Express ;/share/nasc/AtG en E xpress_Stress_Treatments_Drough t_stress/CEL/4221.cel Estrés hídrico-brotes-3.0h AtGen Express ;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Drough t_stress/CEL/4311.cel Estrés h í d r i co-ra i ees- 3.0 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Drough t_stress/CEL/4321.cel Estrés hídrico-brotes-6.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Drough t_stress/CEL/4411.cel Estrés h i d r i co-ra í ees -6.0 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Drough t_stress/CEL/4421.cel Estrés hídrico-brotes-12. Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE Descripción Referencia xpress_Stress_Treatments_Drough t_stress/CEL/4511.cel Estrés hídrico-raíces-12. Oh AtG en Express ;/share/nasc/AtG en E xpress_Stress_Treatments_Drough t_stress/CEL/4521.cel Estrés hídrico-brotes-24.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress Stress_Treatments_Drough t_stress/CEL/4611.cel Estrés hídrico-raices-24.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Drough t_stress/CEL/4621.cel Estrés h í d r i co- brotes-0.25h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Drough t_stress/CEL/4711.cel Estrés h í d r ico-r a i ces-0.25h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Drough t_stress/CEL/4721 cel Estrés genotóxico-brotes-0.5h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Genoto x¡c_stress/CEL/5111.cel Estrés genotóxico-raíces- AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Genoto xic_stress/CEL/5121.cel Estrés genotóxico-brotes- AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_S tres s_Treatments_Ge noto xic stress/CEL/52 1.cel Descripción Referencia Estrés genotóxico-raíces-1.Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Genoto xic_stress/CEL/5221.cel Estrés genotóxico-brotes-3.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Genoto xic_stress/CEL/5311.cel Estrés ge not óx ico-ra í ees- 3.0 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Genoto xic_stress/CEL/5321.cel Estrés genotóxico-brotes-6.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Genoto x¡c_stress/CEL/5411.cel Estrés genotóxico-raíces- AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Genoto xic_stress/CEL/5421 cel Estrés g e notóx ico- brotes- 12.0 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Genoto xic_stress/CEL/551 l.cel Estrés genotóx ¡co-ra í ees - 12.0 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Genoto xic_stress/CEL/5521.cel Estrés genotóxico-brotes-24.0h AtGen Express ;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Genoto xic_stress/CEL/5611.cel Estrés genotóxico-raíces-24.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress Stress_Treatments_Genoto Descripción Referencia xic_stress/CEL/5621.cel Estrés oxidativo-brotes-0.5h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Oxidati ve_stress/CEL/6111.cel Estrés oxidativo-raíces-0.5h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Oxidati ve_stress/CEL/6122. cel Estrés oxidativo-brotes-1.Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Ox¡dati ve_stress/CEL/6211.cel Estrés oxidat¡vo-raíces-1.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Oxidat¡ ve_stress/CEL/6223.cel Estrés oxidativo-brotes-3.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE x ress_Stress_Treatments_Oxidati ve_stress/CEL/6311.cel Estrés ox i d a t i o-r a í ees- 3.0 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Oxidat¡ ve_stress/C EL/6322. cel Estrés oxidativo-brotes-6.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Oxidat¡ ve_stress/CEL/6411.cel Estrés ox i d a t i vo-ra í ees- 6.0 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Oxidati ve_stress/CEL/6421.cel Estrés ox i d a t i vo-b rotes- 12.0 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE Descripción Referencia xpress_Stress_Treatments_Ox¡dati ve_stress/CEL/6511 cel Estrés oxidativo-raíces-12. Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Oxidati ve_stress/CEL/6523.cel Estrés oxidativo-brotes-24.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress Stress Treatments Oxidati ve_stress/CEL/6611.cel Estrés oxidativo-raíces-24.0h AtGen Express ;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Oxidati ve_stress/CEL/6621.cel Estrés por U V- B- brote s -0.5 h AtGen Express ;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_UV- B_stress/CEL/7111.cel Estrés por U V- B-r a íces-0.5 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_UV- B_stress/CEL/7121.cel Estrés por UV-B-brotes-1.Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_UV- B_stress/CEL/7211.cel Estrés por UV-B-raices-1.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_UV- B_stress/CEL/7221.cel Estrés por UV-B-brotes-3.Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_UV- B stress/CEL/7311.cel Descripción Referencia Estrés por UV-B-raíces-3.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_UV- B_stress/CEL/7321.cel Estrés por UV-B-brotes-6.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_UV- B_stress/CEL/7411.cel Estrés por U V- B-r a í ce s-6.0 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_UV- B_stress/CEL/7421.cel Estrés por UV-B-brotes-12. Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_UV- B_stress/CEL/7511.cel Estrés por UV-B-raíces-12. Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_U - B_stress/CEL/7521 cel Estrés por UV-B-brotes-24.0h AtGen Express, share/nasc/AtG en E xpress_Stress_Treatments_UV- B_stress/CEL/7611.cel Estrés por UV-B-raíces-24.0h AtGenExpress, share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_UV- B_stress/CEL/7621 cel Estrés por U V- B -b rote s-0.25 h AtGen Ex press;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_UV- B_stress/CEL/7711.cel Estrés por UV- B-ra í ces-0.25 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_UV- Descripción Referencia B_stress/CEL/7721.cel Estrés lacerante-brotes-0.5h AtGen Ex press;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Wound¡ ng_stress/CEL/8111.cel Estrés lacerante-raíces-0.5h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Wou nd i ng_stress/CEL/8124. cel Estrés lacerante-brotes-1.Oh AtGen Express ;/share/nasc/AtGenE x r es s_S tres s_Trea tm en ts_W ou n d i ng_stress/CEL/8211 cel Estrés lacera nte-ra ices- 1.0 h AtGen Express ;/s ha re/nasc/AtG en E x p r es s_S tres s_Trea tm en t s_W ou n d i ng_stress/C EL/8224. cel Estrés lacerante-brotes-3.0h AtGen Express ;/share/nasc/AtG en E x pr es s_S tres s_Trea tm en ts_W ou nd i ng_stress/CEL/ 8313. cel Estrés lacera nte-ra íces-3.Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE x p r es s_S tres s_Trea tm en ts_W ou n d i ng_stress/CEL/ 8324. cel Estrés lacerante-brotes-6.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Woundi ng_stress/CEL/8411.cel Estrés lacerante-raíces-6.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE x p r e s s _ S t r e s s _ T r e a t m e n t s _ W o u n d i ng_stress/CEL/8423.cel Estrés lacerante-brotes-12. Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE Descripción Referencia x pres s_S t res s_Trea tm en ts_Wou n d i ng_stress/CEL/8511.cel Estrés I a cer a n te- r a ices - 12.0 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE x p res s_S tres s_Tre a tm en ts_Wou nd i ng_stress/CEL/8524.cel Estrés lacerante-brotes-24.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE x p r e s s _ S t r e s s _ T r e a t m e n t s _ W o u n d i ng_stress/CEL/8611.cel Estrés lacerante-raíces-24.0h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Wou nd i ng_stress/CEL/8621.cel Estrés lacerante-brotes-0.25h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE x p r e s s _ S t r e s s _ T r e a t m e n t s _ W o u n d i ng_stress/CEL/8712. cel Estrés la cera n te- r a íces-0.25 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Wound i ng_stress/CEL/8723.cel Estrés por calor-brotes-0.5h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Heat_st ress/CEL/9111.cel Estrés por calor-raíces-0.5h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Heat_st ress/CEL/9121.cel Estrés por ca I o r-b r otes- 1.0 h AtGen Ex pres s;/s haré/ nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Heat_st ress/CEL/9211.cel Descripción Referencia Estrés por calor-ra íces-1.Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE press_Stress_Treatments_Heat_st ress/CEL/9221.cel Estrés por ca I or- brote s- 3.0 h AtG en E x p r ess ;/s h a re/n as el AtG e n E xpress_Stress_Treatments_Heat_st ress/CEL/9311.cel Estrés por calor-ra íces-3. Oh AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Heat_st ress/CEL/9321.cel Estrés por calor(3h) + 3h recuparación- AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE brotes-6.0h xpress_Stress_Treatments_Heat_st ress/CEL/9411.cel Estrés por calor(3h) + 3h recuperación- AtGenExpress, share/nasc/AtGenE raíces-6.0h xpress_Stress_Treatments_Heat_st ress/CEL/9421 cel Estrés por calor(3h) + 9h recuperación- AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE brotes-12.0h xpress_Stress_Treatments_Heat_st ress/CEL/951 l.cel Estrés por ca I o r( 3 h ) + 9 h recuperación- At G e n Ex pr es s ;/s h a re/n a s el A tG en E raíces-12.0h xpress_Stress_Treatments_Heat_st ress/CEL/9521.cel Estrés por ca I or( 3 h ) + 21 h re c u pera ci ó n- At G en Ex pres s ;/s h a re/n a s el A tG e n E brotes-24.0 xpress_Stress_Treatments_Heat_st ress/CEL/9611.cel Estrés por ca I or( 3 h ) + 21 h recuperación- AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE raices-24.0h xpress_Stress_Treatments_Heat_st Descripción Referencia ress/CEL/962 cel Estrés por calor-brotes-0 ,25h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Heat_st ress/CEL/9711.cel Estrés por ca I o r-r a i ces-0.25 h AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE xpress_Stress_Treatments_Heat_st ress/CEL/9721.cel Estrés por calor(3h) + 1 h recu peración- AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE brotes-4.Oh x ress_Stress_Treatments_Heat_st ress/CEL/9811.cel Estrés por calor(3h)+1 h recuperación- AtGenExpress;/share/nasc/AtGenE raíces-4.0h xpress_Stress_Treatments_Heat_st ress/CEL/9821.cel estudio de iniciación de raíz lateral en Experimento interno células de periciclo de polo de xilema; ivsme_Col-0_NPA estudio de iniciación de raíz lateral en Experimento interno células de periciclo de polo de xilema; ivsme_Col-0_2hNAA estudio de iniciación de raíz lateral en Experimento interno células de periciclo de polo de xilema; ivsme_Col-0_6hNAA Sobre-expresión de dos prohibitinas en Experimento interno semilleros; olake_AtPHB3_overexp Sobre-expresión de dos prohibitinas en Experimento interno semilleros; olake_AtPHB4_overexp Descripción Referencia Sobre-expresión de dos prohibitinas en Experimento interno semilleros; olake_overexp_control Comparación de 3 mutantes (2 Experimento interno prohibitina, 1 auxina glucosilo-transferasa) a tipo silvestre en semilleros: olake_knockout_AtPHB3 Comparación de 3 mutantes (2 Experimento interno prohibitina, 1 auxina glucosilo-transferasa) a tipo silvestre en semilleros: olake_knockout_AtPHB4 Comparación de 3 mutantes (2 Experimento interno prohibitina, 1 auxina glucosilo-transferasa) a tipo silvestre en semilleros: olake_control Comparación de 3 mutantes (2 Experimento interno prohibitina, 1 auxina glucosilo-transferasa) a tipo silvestre en semilleros: olake_overexpression_UGTx Semilleros de ápice de brote wt Experimento interno landsberg erecta comparados con mutantes de hoja estrecha elongata2, 3, 4, angusta4, drl 1 -2;defle_Ler Semilleros de ápice de brote wt Experimento interno landsberg erecta comparados con mutantes de hoja estrecha elongata2, Descripción Referencia 3, 4, angusta4, drM -2;defle_elo2 Semilleros de ápice de brote wt Experimento interno landsberg erecta comparados con mutantes de hoja estrecha elongata2, 3, 4, angusta4, d r 11 -2 ; d ef I e_d r 11 -2 Semilleros de ápice de brote wt Experimento interno landsberg erecta comparados con mutantes de hoja estrecha elongata2, 3, 4, angusta4, d r 11 -2 ; d ef le_a n g4 Semilleros de ápice de brote wt Experimento interno landsberg erecta comparados con mutantes de hoja estrecha elongata2, 3, 4, angusta4, d r 11 -2 ; d ef I e_e I o 3 Semilleros de ápice de brote wt Experimento interno comparados con mutantes de hoja estrecha ELP3(2) y SWPI ( 1 );defle_Ws Semilleros de ápice de brote wt Experimento interno comparados con mutantes de hoja estrecha ELP3(2) y SWP1 (1 );defle_N3983 Semilleros de ápice de brote wt Experimento interno comparados con mutantes de hoja estrecha ELP3(2) y SWP1 (1 );defle_219E08 Semilleros de ápice de brote wt Experimento interno comparados con mutantes de hoja Descripción Referencia estrecha ELP3(2) y SWP1(1);defle_Swp1 Hojas wt landsberg erecta 6 Experimento interno comparadas con rotonda muíante de hoja amplia 2;defle_ron2 Hojas wt landsberg erecta 6 Experimento interno comparadas con rotonda muíante de hoja amplia 2;defle_Ler Wt landsberg erecta 6 comparadas con Experimento interno rotonda muíante de hoja amplia 1 ;defle_Ler Wl landsberg erecta 6 comparadas con Experimento interno rotonda muíante de hoja amplia 1 ;defle_ron1 Hojas wt perfilando en etapas Experimento interno diferentes de desarrollo (9, 15, 22 días); gebee_15 Hojas wt perfilando en etapas Experimento interno diferentes de desarrollo (9, 15, 22 días); gebee_22 Hojas wt perfilando en etapas Experimento interno diferentes de desarrollo (9, 15, 22 días); gebee_9 Metilo jasmonato perfilando en puntos Experimento interno de tiempo diferentes; lapau_ATL-MeJ A- 0.5 Descripción Referencia Metilo jasmonato perfilando en puntos Experimento interno de tiempo diferentes; lapau_ATL-MeJ A- 2 Metilo jasmonato perfilando en puntos Experimento interno de tiempo diferentes; lapau_ATL-MeJ A- 6 Metilo jasmonato perfilando en puntos Experimento interno de tiempo diferentes; lapau_ATL- DMSO-0.5 Metilo jasmonato perfilando en puntos Experimento interno de tiempo diferentes; lapau_ATL- DMSO-2 Metilo jasmonato perfilando en puntos Experimento interno de tiempo diferentes; lapau_ATL- DMSO-6 Metilo jasmonato perfilando en puntos Experimento interno de tiempo diferentes; lapau_ATL-MeJ A- CHX-6 DEL1 knockouts contra control Experimento interno (Columbia) en semilleros; livey_Wild-type_seedling_8d DEL1 knockouts contra control Experimento interno (Columbia) en semilleros; livey_DEL1 _KO_seedling_8d Sobre-expresión E2F contra control Experimento interno (Columbia WT) en semilleros; Descripción Referencia livey_W¡ld-type_seedling_8d Sobre-expresión E2F contra control Experimento interno (Columbia WT) en semilleros; livey_E2Fa-DPa_OE_seedling_8d Sobre-expresión DEL1 contra control Experimento interno (Columbia WT) en hoja; livey_Wild-type_leaf_15d Sobre-expresión DEL1 contra control Experimento interno (Columbia WT) en hoja; livey_DEL1_OE_leaf_15d Endociclo exp. En hoja - DEL1 Experimento interno knockout; livey_DEL1_KO_leaf_15d Endociclo exp. En hoja - CCS52A1 Experimento interno knockout; I i vey_CCS52A1 _KO_leaf_15d Endociclo exp. En hoja - CCS52B Experimento interno knockout; I i ey_CCS52B_KO_leaf_15d Endociclo exp. En hoja - CCKB1 DN; Experimento interno livey_CCKB1 ;1.DN_#9_15d Endociclo exp. En hoja - KRP2 sobre- Experimento interno expresión; hvey_KRP2_OE_#7_15d Endociclo exp. En hoja - DEL1 sobre- Experimento interno expresión; livey_DEL1 _OE_#2_15d WEE1 exp. - genotipo Experimento interno columbia ;livey_ROOT_TIP + 0h WEE1 exp. - genotipo Experimento interno columbia;! i vey_RO OT_T I P + 0 h_H U Descripción Referencia WEE1 exp. - genotipo Experimento interno columbia;livey_ROOT_TIP + 5h WEE1 exp. - genotipo Experimento interno columbia;livey_ROOT_TIP + 5h_HU WEE1 exp. - genotipo Experimento interno columbia;livey_ROOT_TIP + 1día WEE1 exp. - genotipo Experimento interno columbia;livey_ROOT_TIP + 1día_HU WEE1 exp. - genotipo Experimento interno WEE;li ey_ROOT_TIP + 0h WEE1 exp. - genotipo Experimento interno WEE;livey_ROOT_TIP + 0h_HU WEE1 exp. - genotipo Experimento interno WEE;livey_ROOT_TIP + 5h WEE1 exp. - genotipo Experimento interno WEE;li ey_ROOT_TIP + 5h_HU WEE1 exp. - genotipo Experimento interno WEE;livey_ROOT_TIP + 1 día WEE1 exp. - genotipo Experimento interno WEE;livey_ROOT_TIP + 1 día_HU estudio de iniciación de raíz lateral WT Experimento interno contra raíz solitaria mutante 1 (slr1 WT Oh estudio de iniciación de raíz lateral WT Experimento interno contra raíz solitaria mutante 1 (slr1 WT 2h Descripción Referencia estudio de iniciación de raíz lateral WT Experimento interno contra raíz solitaria mutante 1 (slr1) WT 6h estudio de iniciación de raíz lateral WT Experimento interno contra raíz solitaria mutante 1 { s I r 1 ) s I r 1 Oh estudio de iniciación de raíz lateral WT Experimento interno contra raíz solitaria mutante 1 (slr1) s I r 1 2h estudio de iniciación de raíz lateral WT Experimento interno contra raíz solitaria mutante 1 (slr1) slr1 6h Formación de tejido vascular - callo D B001 _ATH_A3- Brown-cal . C E L formado de hojas - 5 días después de tratamiento; 0.2mgl-1 auxina (2,4-D NA I A A ) 1.Omgl-1 BA Formación de tejido vascular - callo D B001 _ AT H_A4- B rown-ca I . C E L formado de hojas - 9 días después de tratamiento; 0.2mgl-1 auxina (2,4-D NA I A A) 1.Omgl-1 BA Análisis mutante de desarrollo BP001_ATH1_A1 -Pickett-ADD3-arrestado - hojas - add3 1.CEL Análisis mutante de desarrollo BP001_ATH1_A3-Pickett-a1.CEL arrestado - hojas - control Tumor inducido por Agrobacterium RD001 AT H 1 A1 -deeke-tum.CEL contra control; tejido de tumor inducido Descripción Referencia en la base de un tallo de inflorescencia con Agrobacterium tumefaciens Tumor inducido por Agrobacterium R D 001 _AT H 1 _A 2-d ee k e- 1 nf . C E L contra control; tallo de inflorescencia dañado en la base con una aguja de inyección (control) Proteina de unión a polycomb knockout KC001_ATH1_A1-Cain-WT1.CEL contra WT; WT Proteína de unión a polycomb knockout KC001_ATH1_A3-Cain-CDBI. CEL contra WT; CDB1 knockout Inactividad de brote E-MEXP-148 axillar_naftaleno_1 - ácido-acético tipo silvestre Inactividad de brote axilar_max4-1 E-MEXP-148 m u ta n te Inactividad de brote axilar_tipo E-MEXP-148 silvestre MPK4 en regulación de etileno E-MEXP-174 (hoja)_tipo silvestre_Landsberg erecta MKP4 en regulación de etileno E-MEXP-174 (hoja)_ctr1 m u ta n te_Co I u m b i a MPK4 en regulación de etileno E-MEXP-174 (hoja)_mpk4 mutante_Landsberg erecta MPK4 en regulación de etileno E-MEXP-174 (hoja)_ctr1 mpk4 doble mutante_Landsberg/Columbia Descripción Referencia Respuestas sistémicas de MAPK a E-MEXP-173 patógenos (hoja)_35S:mks1_eco_Landsberg Respuestas sistémicas de MAPK a E-MEXP-173 patógenos (hojas)_mpk4 mutante_eco_Landsberg Respuestas sistémicas de MAPK a E-MEXP-173 patógenos (hoja)_tipo silvestre_eco_Landsberg Formación de pared celular E-MEXP-265 secundaria_hipocotilo_eco_Landsberg Formación de pared celular E-MEXP-265 secundaria_hoja_eco_Landsberg Formación de pared celular E-MEXP-265 secundaria_base de tallo_eco_Landsberg Formación de pared celular E-MEXP-265 secundaria_medio inferior de tallo_eco_Landsberg Formación de pared celular E-MEXP-265 secundaria_pu nta de tallo_eco_Landsberg Formación de pared celular E-MEXP-265 secundaria_medio superior de tallo_eco_Landsberg Comparación de mutantes carentes de E-MEXP-694 Descripción Referencia subunidades CAF-1_fas2-1 _eco_La nd s berg erecta Comparación de mutantes carentes de E-MEXP-694 subunidades CAF-1_ms¡1-as_eco_Columbia Comparación de mutantes carentes de E-MEXP-694 subunidades CAF-1_tipo silvestre_eco_Columbia Comparación de mutantes carentes de E-MEXP-694 subunidades CAF-1_tipo silvestre_eco_Enkheim Comparación de mutantes carentes de E-MEXP-694 subunidades CAF-1_tipo silvestre_eco_Landsberg erecta AP2/ERF TF (bolita) ( hoja)_bol ita E-MEXP-809 muíante AP2/ERF TF (bolita) (hoja)_tipo E-MEXP-809 sil estre Comparación de Somervill e : Arreglos de tipo de tejido_tallo_invernadero tejido de Columbia-0 _genom a Comparación de Somervill e: Arreglos de tipo de tejido_hoja_invernadero tejido de Columbia-0 genoma Comparación de tej id o_f I or_cá m a ra de Somervill e: Arreglos de tipo de crecimiento tejido de Columbia-0 _genoma Comparación de Somervill e: Arreglos de tipo de tej ido_flor_invern adero tejido de Columbia-0 _genoma Descripción Referencia Comparación de tejido_tallo_cámara de Somerville: Arreglos de tipo de crecimiento tejido de Columbia-0_genoma Flor. _t i p o silvestre_Columbía_ O dias Weígel: Transición floral y desarrollo de f I o r' tem pra no Flor. _t i p o silvestre_Columbia_ 3 días Weigel: Transición floral y desarrollo de flor temprano Flor. _tipo silvestre_Colum bia_ 7 días Weigel: Transición floral y desarrollo de flor temprano Flor. _t i p o silvestre_Landsberg _0 días Weigel: Transición floral y desarrollo de flor temprano Flor. _tipo silvestre_Landsberg _3 días Weigel: Transición floral y desarrollo de flor temprano Flor. tipo silvestre_Landsberg _5 días Weigel: Transición floral y desarrollo de flor temprano Flor. tipo silvestre_Landsberg _7 días Weigel: Transición floral y desarrollo de flor temprano Flor. _mutante constans (co-2) 0 días Weigel: Transición floral y desarrollo de flor temprano Flor _mutante constans (co-2). _3 días Weigel: Transición floral y desarrollo de flor temprano Flor. _mutante constans (co-2)_ _5 días Weigel: Transición floral y desarrollo de flor temprano Flor-¦mutante constans (co-2)_ 7 días Weigel: Transición floral y desarrollo de flor temprano Flor. _mutante ft (ft-2)_0 días Weigel: Transición floral y desarrollo de flor temprano Descripción Referencia Flor_mutante ft (f t- 2 )_ 3 días Weigel: Transición floral y desarrollo de flor temprano Flor_mutante ft (f t-2 )_5 días Weigel: Transición floral y desarrollo de flor temprano Flor_mutante ft (f t-2 )_7 días Weigel: Transición floral y desarrollo de flor temprano Flor_mutante lfy-12 Columbia_0 días Weigel: Transición floral y desarrollo de flor temprano Flor_mutante lfy-12 Columb¡a_3 días Weigel: Transición floral y desarrollo de flor temprano Flor_mutante lfy-12 Columbía_5 días Weigel: Transición floral y desarrollo de flor temprano Flor_mutante lfy-12 Columbia_7 días Weigel: Transición floral y desarrollo de flor temprano Cotiledón de embrión micro- /share/nasc/Casson_laser-capture-diseccionado con captura de láser micro-dissected-(apical) embryonic_tissues/CEL/K1001_AT H1_A1 -Linds-cot.CEL Raíz de embrión micro-diseccionado /share/nasc/Casson_laser-capture-con captura de láser (basal) micro-dissected- em bryonic_tissues/CEL/K1001 _AT H1_A1 -Linds-roo.CEL Embrión globular m icro-d ¡ secc iona do /share/nasc/Casson_laser-capture-con captura de láser, tejido apical micro-dissected- embryonic_tissues/CEL/SC001_AT H1_A1 ,1-casso-gla.CEL Descripción Referencia Embrión globular micro-diseccionado /share/nasc/Casson_laser-capture-con captura de láser, tejido basal m i cro-d iss ected - embryonic_tissues/CEL/SC001_AT H1_A1.1 -casso-glb.CEL Embrión de etapa de corazón m icro- /share/nasc/Casson_laser-capture-diseccionado con captura de láser, micro-dissected-polo de cotiledón (apical) embryonic_tissues/CEL/SC001_AT H1_A3-1-casso-hec.CEL Embrión de etapa de corazón micro- /share/nasc/Casson_laser-capture-diseccionado con captura de láser, m icro-d issected-polo de raíz (basal) embryonic_tissues/CEL/SC001_AT H1_A4-1 -casso-her.CEL Agua-ColO-1 hr /share/nasc/De_Grauwe/CEL/DVOO 1_ATH1_A2-degra-Cc'1.CEL Agua-etr1 (mutante insensible a /share/nasc/De_Grauwe/CEL/D V00 etileno)-1 hr 1_ATH1_A7-degra-Ec1.CEL GA4-ColO-1 hr /share/nasc/De_Grauwe/CEL/D V00 1_ATH1_A4-degra-Cg1.CEL GA4-etr1 (mutante insensible a /share/nasc/De_Grauwe/CEL/DVOO etileno)-1 hr 1_ATH1_A9-degra-Eg1.CEL m s 1 ttg-jóven /share/nasc/Gema_Vizcay_ Barrena /CEL/ZW001_ATH1 _A1 - Wilson- mla.CEL m s 1 ttg-viejo /share/nasc/Gema_Vizcay_ Barrena /CEL/ZW001_ATH1_A2-Wilson- Rep2.CEL Descripción Referencia Ler-jóven /share/nasc/Gema_Vizcay_ Barrena /CEL/ZW001_ATH1_A3-Wilson- Rep2.CEL Ler-viejo /share/nasc/Gema_Vizcay_ Barrena /CEL/ZW001_ATH1_A4-Wilson- Ler.CEL Lerttg-jóven /share/nasc/Gema_Vizcay_ Barre na /CEL/ZW003_ATH1_C1- GVB_rep1.CEL Lerttg-viejo /share/nasc/Gema_Vizcay_ Barre na /CEL/ZW003_ATH 1_C2- GVB_rep1.CEL Control de muerte celular programado /share/nasc/Jod¡_Sw¡dz¡nski/CEL/J S001_ATH1_Control(3)new.CEL Calor de muerte celular programado /s h are/na se/ J od ¡_Swid z¡ n s k i/C E L/J S001_ATH1_Heat(4).CEL Senescencia de muerte celular /share/nasc/Jodi_Swidzinski/CEL/J programada S001_ATH1_Sen(3)new.CEL Wheeler-a05_SLD_SPH1 ARNi en eta pa /share/nasc/M ike_Wheeler/C EL/MW 1.05, hoja 001_ATH1_A1-Wheel-a05.CEL Wheeler-a14_SLD_SPH1 ARNi en et a pa /s h are/na se/ M i ke_W h eel er/C E L/M W 1.14, hoja 001_ATH1_A1-Wheel-a14.CEL Wheeler-w05_SLD_t¡po silvestre en /share/nasc/Mike_Wheeler/CEL/MW etapa 1.05, hoja 001 _AT H 1 _A 1 - W heel-w05. C E L Wheeler-w05_SLD_tipo silvestre en /share/nasc/Mike_Wheeler/CEL/MW etapa 1.14, hoja 001 _ATH 1 _A 1 - W heel-w14. C E L Descripción Referencia Ulm 1-1 4días-345nm /share/nasc/Ulm_UV-B- response_of_Arabidopsis/CEL/Ulm- 1-1_4days-345nm_Rep1_ATH1.CEL Ulm 1-4 días-305nm /share/nasc/Ulm_UV-B- response_of_Arabidops¡s/CEL/Ulm- 1 -1_4days-305nm_Rep _ATH1.CEL Ulm 1-9 días-345nm, 1 hr-305nm /share/nasc/Ulm_UV-B- response_of_Arabidopsis/CEL/Ulm- 1-1_9days-345nm,1hr- 305nm_Rep3_ATH1.CEL Ulm_1 -10_4d ías_345nm ,6h4-305nm /share/nasc/Ulm_UV-B- response_of_Arabidopsis/CEL/Ulm- 1-10_4days-345nm,6hr- 305nm_Rep1_ATH1.CEL microgametogénesisPolen /share/nasc/David_Honys/CEL/DHO bicelular 01_ATH1_A2-BCP1.CEL microgametogénesisPolen /share/nasc/David_Honys/CEL/DHO tricelular 01 ATH1 A3-TCP1.CEL microgametogénesisPolen_m¡croespora /share/nasc/David_Honys/CEL/DHO s de uninucleato 01 _ATH1_A1 -UNM1.CEL Pourtau_1-1_bajoN_senescencia de /share/nasc/Pourtau_sugar_acc_du hoja ring_early_leaf_senescence/CEL/P ourtau_1-1_lowN_Rep1_ATH1.CEL Pourtau_1-4_bajoN-glu_senescencia de/share/nasc/Pourtau_sugar_acc_du hoja_efecto de glucosa ring_early_leaf_senescence/CEL/P ourtau 1-4 lowN- Descripción Referencia glu_Rep1_ATH1.CEL Pourtau_1-7-altoN-glu_senescencia de /share/nasc/Pourtau_sugar_acc_du hoja_efecto de nitrógeno ring_early_leaf_senescence/CEL/P ourtau_1 -7_h¡ghN- glu_Rep1_ATH1.CEL Semilleros fumigados con ozono /share/nasc/Short_Functional_Gen omics_of_Ozone_Stress_¡n_Arabid opsis/CEL/ES001_ATH1_A1-mcain- ozo.CEL Semilleros fumigados con aire /share/nasc/Short_Functional_Gen omics_of_Ozone_Stress_in_Arabid opsis/CEL/ES001_ATH1_A2-mcain- con.CEL Referencias Altschul, S.F., Madden, T.L., Scháffer, A. 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Claims (10)

REIVINDICACIONES

1.- Un método para aislar proteínas novedosas relacionadas con ciclo celular, comprendiendo (1) realizar un análisis tap usando una proteína conocida de ciclo celular como carnada (2) corregir los resultados para interacciones no específicas y (3) reconfirmar los resultados corregidos.

2.- El uso de una proteína relacionada con ciclo celular aislada con el método de conformidad con la reivindicación 1, para modular crecimiento vegetal.

3.- El uso de una proteína relacionada con ciclo celular de conform idad con la reivindicación 2, por lo que dicha proteína se selecciona a partir de la II ¡sta que consiste de At 1 g 56110, At3g17020, At3g21140, At5g25460, At5g60790, At4g38900, At3g49240, At5g24690, At1 g06070, At4g34 50, At1g20480, At5g20920, At3g15970, At4g16 30, At5g13030, At1g01880, At5g07310, At2g46610, At1g10690, At3g04710, At3g24690, At4g16130, At2g05830, At1g29220, At1 g55890, At1g60650, At1 g70830, At2g43140, At1 g77180, At5g18620, At5g02530, At5g14170, At1 g52730, At2g3340, At1g03060, At3g62240, At4g38740, At5g61220, At3g53880, At3g56860, At1 gO 1970, At g 19520, At1 g14620, At2g03820, At3g01280, At3g56690, At3g56690, At5g41190, At5g03740, At1 g42440, At2g28450, At1g09760, At1 g10840, At3g11830, At5g54900, At1g31760, At1g61870, At3g11760, At1g05805, At1 g29200, At4g13850, At4g38780, At1 g 71380 , At3g13640, At5g25060, At1g43700, At2g46020, At3g55760 y At5g21160 o una variante de las mismas.

4. - El uso de una proteína relacionada con ciclo celular, por lo que dicha proteína se selecciona a partir del grupo que consiste de At1 g 56 10, At3g17020, At3g21140, At5g25460, At5g60790, o una variante de la misma, para promover crecimiento vegetal.

5. - El uso de una proteína relacionada con ciclo celular de conformidad con la reivindicación 4, por lo que dicho uso es sobre-expresión.

6.- El uso de conformidad con la reivindicación 4 ó 5, por lo que la promoción vegetal de crecimiento vegetal se mide como aumento de biomasa de planta.

7. - El uso de conformidad con cualquiera de las reivindicaciones 2-6, por lo que dicha planta es una planta de cosecha.

8. - El uso de conformidad con la reivindicación 7, por lo que dicha planta de cosecha es un cereal.

9. - El uso de conformidad con la reivindicación 8, por lo que dicho cereal se selecciona a partir del grupo que consiste de arroz, maíz, trigo, cebada, migo, centeno, sorgo y avena.

10. - Una proteína novedosa relacionada con ciclo celular con el método de conformidad con la reivindicación 1.