KR20230163512A - 고효능 폴리펩타이드-기반 단백질 억제를 위한 방법 및 조성물 - Google Patents
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Abstract
본 개시내용의 양상은 바이러스 스파이크 단백질과 같은 표적 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드 또는 이러한 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 조성물, 및 바이러스 감염 및/또는 바이러스 감염 후 증후군과 같은 질환의 치료 및 예방을 위한 이의 사용 방법에 관한 것이다.
Description
배경
관련 출원에 관한 상호 참조
본 출원은 2021년 3월 30일에 출원된 미국 가특허 출원 제63/168,107호에 대한 우선권을 주장하며, 상기 출원은 그 전체가 본원에 참조로 포함된다.
기술 분야
본 개시내용의 양상은 일반적으로 적어도 단백질 생물학, 분자 생물학, 바이러스학 및 의학 분야에 관한 것이다.
단백질은 소정의 유기체에서 광범위한 생물학적 기능을 수행하는 데 있어 주요 역할을 한다. 예를 들어, 코로나바이러스, HIV, 에볼라, RSV 및 인플루엔자 바이러스와 같은 바이러스에 의한 감염은 바이러스 스파이크 단백질이 숙주 세포의 표면 막 상의 수용체에 결합함으로써 매개된다. 바이러스 감염은 중증 급성 호흡기 증후군, 중동 호흡기 증후군, COVID-19 또는 호흡기 감염과 같은 생명을 위협하는 심각한 상태, 및 지속되어 바이러스 감염 후 증후군을 초래할 수 있는 기타 증상을 유발한다. 불행하게도, 단백질은 현대 의학에서 주요 치료 도구가 되지 못하였다. 실제로, 이러한 감염의 치료를 위한 소수의 치료 옵션만이 강력한 임상 시험에서 효과적인 것으로 입증되었다.
따라서, 특히 바이러스 감염 및/또는 바이러스 감염 후 증후군의 치료 및 예방을 위한 단백질 또는 폴리펩타이드-기반 치료제에 대한 조성물 및 방법에 대한 요구가 존재한다.
본 개시내용의 양상은 생체내에서 바이러스 스파이크 단백질을 포함하지만 이에 제한되지 않는 단백질을 표적화하는 폴리펩타이드, 이러한 폴리펩타이드를 포함하는 조성물, 및 코로나바이러스(예를 들어, MERS-CoV, SARS-CoV, SARS-CoV-2, HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43, HCoV-HKU1) 감염, 인간 면역결핍증 바이러스(HIV) 감염, 에볼라 감염, RSV 감염, 또는 인플루엔자 감염을 포함하지만 이에 제한되지 않는 대상체의 질환 또는 상태의 치료 및 예방을 위한 사용 방법에 관한 것이다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 표적 단백질의 상응하는 서열과 적어도 10% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 10% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 또는 34과 적어도 10 내지 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 적어도 10 내지 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 HIV 스파이크 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 서열번호 18과 적어도 10 내지 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 에볼라 바이러스 당단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 서열번호 20과 적어도 10 내지 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 HA 스파이크 단백질의 서열을 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 서열번호 25와 적어도 10 내지 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 RSV 당단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 서열번호 34와 적어도 10 내지 80% 동일성을 갖는다.
본 개시내용의 실시형태는 폴리펩타이드; 바이러스 스파이크 단백질; 단백질-상호작용 폴리펩타이드; 바이러스 스파이크 단백질-상호작용 폴리펩타이드; 코로나바이러스 스파이크 단백질-상호작용 폴리펩타이드; MERS-CoV 스파이크 단백질-상호작용 폴리펩타이드; SARS-CoV 스파이크 단백질-상호작용 폴리펩타이드; SARS-CoV-2 스파이크 단백질-상호작용 폴리펩타이드; HCoV-229E 스파이크 단백질-상호작용 폴리펩타이드; HCoV-NL63 스파이크 단백질-상호작용 폴리펩타이드; HCoV-HKU1 스파이크 단백질-상호작용 폴리펩타이드; HCoV-OC43 스파이크 단백질-상호작용 폴리펩타이드; HIV 스파이크 단백질-상호작용 폴리펩타이드; 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드; 인플루엔자 바이러스 HA 스파이크 단백질-상호작용 폴리펩타이드; RSV 당단백질-상호작용 폴리펩타이드;
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질환의 예방 방법; 바이러스 감염 및/또는 바이러스 감염 후 증후군의 예방 방법; 코로나바이러스 감염 및/또는 코로나바이러스 감염 후 증후군의 예방 방법; MERS-CoV 감염의 예방 방법; SARS-CoV 감염의 예방 방법; SARS-CoV-2 감염의 예방 방법; HCoV-229E 감염의 예방 방법; HCoV-NL63 감염의 예방 방법; HCoV-OC43 감염의 예방 방법; HCoV-HKU1 감염의 예방 방법; HIV 감염의 예방 방법; 에볼라 감염의 예방 방법; 인플루엔자 감염의 예방 방법; RSV 감염의 예방 방법;
질환의 중증도를 감소시키는 방법; 바이러스 감염 및/또는 바이러스 감염 후 증후군의 중증도를 감소시키는 방법; 코로나바이러스 감염 및/또는 코로나바이러스 감염 후 증후군의 중증도를 감소시키는 방법; MERS-CoV 감염의 중증도를 감소시키는 방법; SARS-CoV 감염의 중증도를 감소시키는 방법; SARS-CoV-2 감염의 중증도를 감소시키는 방법; HCoV-229E 감염의 중증도를 감소시키는 방법; HCoV-NL63 감염의 중증도를 감소시키는 방법; HCoV-OC43 감염의 중증도를 감소시키는 방법; HCoV-HKU1 감염의 중증도를 감소시키는 방법; HIV 감염의 중증도를 감소시키는 방법; 에볼라 감염의 중증도를 감소시키는 방법; 인플루엔자 감염의 중증도를 감소시키는 방법; RSV 감염의 중증도를 감소시키는 방법;
질환의 발병을 지연시키는 방법; 바이러스 감염 및/또는 바이러스 감염 후 증후군의 발병을 지연시키는 방법; 코로나바이러스 감염 및/또는 코로나바이러스 감염 후 증후군의 발병을 지연시키는 방법; MERS-CoV 감염의 발병을 지연시키는 방법; SARS-CoV 감염의 발병을 지연시키는 방법; SARS-CoV-2 감염의 발병을 지연시키는 방법; HCoV-229E 감염의 발병을 지연시키는 방법; HCoV-NL63 감염의 발병을 지연시키는 방법; HCoV-OC43 감염의 발병을 지연시키는 방법; HCoV-HKU1 감염의 발병을 지연시키는 방법; HIV 감염의 발병을 지연시키는 방법; 에볼라 감염의 발병을 지연시키는 방법; 인플루엔자 감염의 발병을 지연시키는 방법; RSV 감염의 발병을 지연시키는 방법;
질환의 발달을 억제하는 방법; 세포 내로의 바이러스의 진입을 억제하는 방법; 세포 내로의 코로나바이러스의 진입을 억제하는 방법; 세포 내로의 MERS-CoV 바이러스의 진입을 억제하는 방법; 세포 내로의 SARS-CoV 바이러스의 진입을 억제하는 방법; 세포 내로의 SARS-CoV-2 바이러스의 진입을 억제하는 방법; 세포 내로의 HCoV-229E 바이러스의 진입을 억제하는 방법; 세포 내로의 HCoV-NL63 바이러스의 진입을 억제하는 방법; 세포 내로의 HCoV-OC43 바이러스의 진입을 억제하는 방법; 세포 내로의 HCoV-HKU1 바이러스의 진입을 억제하는 방법; 세포 내로의 HIV 바이러스의 진입을 억제하는 방법; 세포 내로의 에볼라 바이러스의 진입을 억제하는 방법; 세포 내로의 인플루엔자 바이러스의 진입을 억제하는 방법; 세포 내로의 RSV의 진입을 억제하는 방법;
하나 이상의 단백질 사이의 상호작용을 조절하는 방법; 바이러스 스파이크 단백질과 숙주 세포막 사이의 상호작용을 조절하는 방법; 코로나바이러스 스파이크 단백질과 숙주 세포막 사이의 상호작용을 조절하는 방법; MERS-CoV 바이러스 스파이크 단백질과 숙주 세포막 사이의 상호작용을 조절하는 방법; SARS-CoV 바이러스 스파이크 단백질과 숙주 세포막 사이의 상호작용을 조절하는 방법; SARS-CoV-2 스파이크 단백질과 숙주 세포막 사이의 상호작용을 조절하는 방법; HCoV-229E 스파이크 단백질과 숙주 세포막 사이의 상호작용을 조절하는 방법; HCoV-NL63 스파이크 단백질과 숙주 세포막 사이의 상호작용을 조절하는 방법; HCoV-OC43 스파이크 단백질과 숙주 세포막 사이의 상호작용을 조절하는 방법; HCoV-HKU1 스파이크 단백질과 숙주 세포막 사이의 상호작용을 조절하는 방법; HIV 스파이크 단백질과 숙주 세포막 사이의 상호작용을 조절하는 방법; 에볼라 바이러스 당단백질과 숙주 세포막 사이의 상호작용을 조절하는 방법; 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 숙주 세포막 사이의 상호작용을 조절하는 방법; RSV 당단백질과 숙주 세포막 사이의 상호작용을 조절하는 방법;
하나 이상의 단백질 종에 의해 형성된 단백질 복합체의 전좌(translocation) 및 형성을 조절하는 방법; 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 바이러스 스파이크 단백질의 전좌 및 형성을 조절하는 방법; 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 코로나바이러스 스파이크 단백질의 전좌 및 형성을 조절하는 방법; 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 MERS-CoV 스파이크 단백질의 전좌 및 형성을 조절하는 방법; 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 SARS-CoV 스파이크 단백질의 전좌 및 형성을 조절하는 방법; 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 SARS-CoV-2 스파이크 단백질의 전좌 및 형성을 조절하는 방법; 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 HCoV-229E 스파이크 단백질의 전좌 및 형성을 조절하는 방법; 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 HCoV-NL63 스파이크 단백질의 전좌 및 형성을 조절하는 방법; 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 HCoV-OC43 스파이크 단백질의 전좌 및 형성을 조절하는 방법; 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 HCoV-HKU1 스파이크 단백질의 전좌 및 형성을 조절하는 방법; 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 HIV 스파이크 단백질의 전좌 및 형성을 조절하는 방법; 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 에볼라 바이러스 당단백질의 전좌 및 형성을 조절하는 방법; 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 전좌 및 형성을 조절하는 방법; 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 RSV 당단백질의 전좌 및 형성을 조절하는 방법;
대상체의 세포 내 및/또는 세포 표면 상의 하나 이상의 단백질 종에 의해 형성된 단백질 복합체의 양을 감소시키는 방법; 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 바이러스 스파이크 단백질의 양을 감소시키는 방법; 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 코로나바이러스 스파이크 단백질의 양을 감소시키는 방법; 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 MERS-CoV 스파이크 단백질의 양을 감소시키는 방법; 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 SARS-CoV 스파이크 단백질의 양을 감소시키는 방법; 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 SARS-CoV-2 스파이크 단백질의 양을 감소시키는 방법; 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 HCoV-229E 스파이크 단백질의 양을 감소시키는 방법; 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 HCoV-NL63 스파이크 단백질의 양을 감소시키는 방법; 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 HCoV-OC43 스파이크 단백질의 양을 감소시키는 방법; 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 HCoV-HKU1 스파이크 단백질의 양을 감소시키는 방법; 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 HIV 스파이크 단백질의 양을 감소시키는 방법; 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 에볼라 바이러스 당단백질의 양을 감소시키는 방법; 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 양을 감소시키는 방법; 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 RSV 당단백질의 양을 감소시키는 방법;
세포에 의한 하나 이상의 단백질 종에 의해 형성된 비-고유(non-native) 단백질 복합체의 프로테아솜 분해를 촉진하는 방법; 세포에 의한 바이러스 스파이크 단백질의 프로테아솜 분해를 촉진하는 방법; 세포에 의한 코로나바이러스 스파이크 단백질의 프로테아솜 분해를 촉진하는 방법; 세포에 의한 MERS-CoV 스파이크 단백질의 프로테아솜 분해를 촉진하는 방법; 세포에 의한 SARS-CoV 스파이크 단백질의 프로테아솜 분해를 촉진하는 방법; 세포에 의한 SARS-CoV-2 스파이크 단백질의 프로테아솜 분해를 촉진하는 방법; 세포에 의한 HCoV-229E 스파이크 단백질의 프로테아솜 분해를 촉진하는 방법; 세포에 의한 HCoV-NL63 스파이크 단백질의 프로테아솜 분해를 촉진하는 방법; 세포에 의한 HCoV-OC43 스파이크 단백질의 프로테아솜 분해를 촉진하는 방법; 세포에 의한 HCoV-HKU1 스파이크 단백질의 프로테아솜 분해를 촉진하는 방법; 세포에 의한 HIV 스파이크 단백질의 프로테아솜 분해를 촉진하는 방법; 세포에 의한 에볼라 바이러스 당단백질의 프로테아솜 분해를 촉진하는 방법 ; 세포에 의한 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 프로테아솜 분해를 촉진하는 방법; 세포에 의한 RSV 당단백질의 프로테아솜 분해를 촉진하는 방법;
핵산; 벡터; 세포; 약제학적 조성물; 및 키트를 포함한다. SARS-CoV-2 바이러스는 COVID-19를 유발하기 때문에, SARS-CoV-2와 관련하여 논의된 임의의 실시형태는 COVID-19와 관련하여 구현될 수 있다.
본 개시내용의 방법은 하기 단계 중 1; 2; 3; 4; 5; 6; 또는 그 이상을 포함할 수 있다: 폴리펩타이드를 대상체에게 투여하는 단계; 대상체에게 핵산을 투여하는 단계; 대상체에게 벡터를 투여하는 단계; 대상체에게 항바이러스제를 투여하는 단계;
대상체를 질환을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 바이러스 감염 및/또는 바이러스 감염 후 증후군을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 코로나바이러스 감염 및/또는 코로나바이러스 감염 후 증후군을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 MERS-CoV 감염을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 SARS-CoV 감염을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 SARS-CoV-2 감염을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 HCoV-229E 감염을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 HCoV-NL63 감염을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 HCoV-OC43 감염을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 HCoV-HKU1 감염을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 HIV 감염을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 에볼라 감염을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 인플루엔자 감염을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 RSV 감염을 갖는 것으로 진단하는 단계;
대상체를 질환의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 바이러스 감염 및/또는 바이러스 감염 후 증후군의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 코로나바이러스 감염 및/또는 코로나바이러스 감염 후 증후군의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 MERS-CoV 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 SARS-CoV 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 SARS-CoV-2 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 HCoV-229E 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 HCoV-NL63 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 HCoV-OC43 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 HCoV-HKU1 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 HIV 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 에볼라 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 인플루엔자 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 RSV 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계;
대상체를 질환을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 바이러스 감염 및/또는 바이러스 감염 후 증후군을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 코로나바이러스 감염 및/또는 코로나바이러스 감염 후 증후군을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 MERS-CoV 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 SARS-CoV 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 SARS-CoV-2 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 HCoV-229E 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 HCoV-NL63 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 HCoV-OC43 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 HCoV-HKU1 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 HIV 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 에볼라 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 인플루엔자 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계; 대상체를 RSV 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계;
대상체에게 질환에 대한 제2 요법을 제공하는 단계; 대상체로부터 샘플을 수득하는 단계; 샘플에서 바이러스를 검출하는 단계; 샘플에서 코로나바이러스를 검출하는 단계; 샘플에서 MERS-CoV 바이러스를 검출하는 단계; 샘플에서 SARS-CoV 바이러스를 검출하는 단계; 샘플에서 SARS-CoV-2 바이러스를 검출하는 단계; 샘플에서 HCoV-229E 바이러스를 검출하는 단계; HCoV-NL63 바이러스를 검출하는 단계; 샘플에서 HCoV-OC43 바이러스를 검출하는 단계; 샘플에서 HCoV-HKU1 바이러스를 검출하는 단계; 샘플에서 HIV 바이러스를 검출하는 단계; 샘플에서 에볼라 바이러스를 검출하는 단계; 샘플에서 인플루엔자 바이러스를 검출하는 단계; 샘플에서 RSV를 검출하는 단계;
대상체에게 바이러스 감염 및/또는 바이러스 감염 후 증후군에 대한 제2 요법을 제공하는 단계; 대상체에게 코로나바이러스 감염 및/또는 코로나바이러스 감염 후 증후군에 대한 제2 요법을 제공하는 단계; 대상체에게 MERS-CoV 감염에 대한 제2 요법을 제공하는 단계; 대상체에게 SARS-CoV 감염에 대한 제2 요법을 제공하는 단계; 대상체에게 SARS-CoV-2 감염에 대한 제2 요법을 제공하는 단계; 대상체에게 HCoV-229E 감염에 대한 제2 요법을 제공하는 단계; 대상체에게 HCoV-NL63 감염에 대한 제2 요법을 제공하는 단계; 대상체에게 HCoV-OC43 감염에 대한 제2 요법을 제공하는 단계; 대상체에게 HCoV-HKU1 감염에 대한 제2 요법을 제공하는 단계; 대상체에게 HIV 감염에 대한 제2 요법을 제공하는 단계; 대상체에게 에볼라 감염에 대한 제2 요법을 제공하는 단계; 대상체에게 인플루엔자 감염에 대한 제2 요법을 제공하는 단계; 대상체에게 RSV 감염에 대한 제2 요법을 제공하는 단계; 및 대상체에게 3가지 이상의 유형의 항-바이러스 요법을 제공하는 단계. 본 개시내용의 특정 실시형태는 전술한 요소 및/또는 단계 중 하나 이상을 배제할 수 있다.
본 개시내용의 조성물은 하기 성분 중 적어도 1, 2, 3, 4, 5개 이상을 포함할 수 있다: 폴리펩타이드, 단백질, 핵산, 벡터, 치료제, 항-바이러스제, 약제학적으로 허용되는 담체, 및 부형제. 이들 성분 중 하나 이상은 특정 실시형태로부터 구체적으로 배제될 수 있다.
본원에서는, 일부 양상에서, 표적 단백질 또는 이의 일부 및/또는 표적 단백질 또는 이의 일부의 고유(native) 상호작용 파트너를 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법이 개시되며, 여기서 상기 폴리펩타이드의 길이는 30개 초과의 아미노산이고, 폴리펩타이드 및 표적 단백질은 표적 단백질과 폴리펩타이드의 접촉시 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하고/하거나; 폴리펩타이드 및 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너는 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너와 폴리펩타이드의 접촉시 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하고/하거나; 폴리펩타이드, 표적 단백질 및 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너는 표적 단백질 및 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너와 폴리펩타이드의 접촉시 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절한다.
일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 10% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 20% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 30% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 40% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 50% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 60% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 70% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 상응하는 서열을 포함한다.
본원에서는, 일부 양상에서, 표적 단백질 또는 이의 일부 및/또는 표적 단백질 또는 이의 일부의 고유 상호작용 파트너를 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법이 개시되고, 여기서 상기 폴리펩타이드의 길이는 30개 초과의 아미노산이고, 상기 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하고/하거나; 상기 리펩타이드는 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하고/하거나; 상기 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인 및 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너와 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절한다.
일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 10% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 20% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 30% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 40% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 50% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 60% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 70% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인을 포함한다.
일부 실시형태에서, 표적 단백질은 바이러스 단백질이다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질은 바이러스 당단백질이다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질은 바이러스 스파이크 단백질이다. 일부 실시형태에서, 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절은 대상체에서 질환 또는 상태를 치료 또는 예방한다. 일부 실시형태에서, 질환 또는 상태는 바이러스 감염이다.
일부 실시형태에서, 비-고유 단백질 복합체는 프로테아솜 분해를 겪는다. 일부 실시형태에서, 비-고유 단백질 복합체의 형성은 표적 단백질의 동종올리고머화를 억제함으로써 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 억제한다. 일부 실시형태에서, 비-고유 단백질 복합체의 형성은 표적 단백질의 이종올리고머화를 억제함으로써 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 억제한다. 일부 실시형태에서, 비-고유 단백질 복합체의 형성은 표적 단백질의 동종올리고머화 및 이종올리고머화를 억제함으로써 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 억제한다.
본원에서는, 일부 양상에서:
코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법;
코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드는 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는, 방법.
서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 코로나바이러스 감염을 치료 또는 예방하는 방법; 및
코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 코로나바이러스 감염을 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성하는, 방법이 개시된다.
일부 실시형태에서, 비-고유 단백질 복합체는 프로테아솜 분해를 겪는다. 일부 실시형태에서, 생체내에서 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절은 대상체에서 코로나바이러스 감염을 치료 또는 예방한다. 일부 실시형태에서, 생체내에서 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절은 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 코로나바이러스 스파이크 단백질의 전좌 및 형성의 억제를 포함한다. 일부 실시형태에서, 생체내에서 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절은 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 코로나바이러스 스파이크 단백질의 양을 감소시킨다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드 및 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화는 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하여 코로나바이러스 감염을 치료 또는 예방한다. 일부 실시형태에서, 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 코로나바이러스 스파이크 단백질의 전좌 및 형성이 억제된다. 일부 실시형태에서, 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 코로나바이러스 스파이크 단백질의 양이 감소된다.
일부 실시형태에서, 코로나바이러스는 SARS-CoV, SARS-CoV-2, MERS-CoV, HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43, 또는 HCoV-HKU1을 포함한다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스는 SARS-CoV를 포함하고, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 SARS-CoV 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스는 SARS-CoV-2를 포함하고, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 SARS-CoV-2 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스는 MERS-CoV를 포함하고, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 MERS-CoV 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스는 HCoV-229E를 포함하고, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 HCoV-229E 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스는 HCoV-NL63을 포함하고, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 HCoV-NL63 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스는 HCoV-OC43을 포함하고, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 HCoV-OC43 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스는 HCoV-HKU1을 포함하고, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 HCoV-HKU1 스파이크 단백질을 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2와 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2와 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2와 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2와 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2를 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 4와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 4와 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 4와 적어도 85%를 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 4와 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 4와 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 4를 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 6과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 6과 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 6과 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 6과 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 6과 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 6을 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 8과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 8과 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 8과 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 8과 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 8을 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 10과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 10과 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 10과 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 10과 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 10과 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 10을 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 12와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 12와 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 12와 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 12와 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 12와 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 12를 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 14와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 14와 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 14와 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 14와 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 14와 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 14를 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 16과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 16과 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 16과 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 16과 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 16과 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 16을 포함한다.
일부 실시형태에서, 생체내에서 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법 및/또는 코로나바이러스 감염을 치료 또는 예방하는 방법은 대상체를 코로나바이러스 감염으로 진단하는 단계; 대상체를 코로나바이러스 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 또는 대상체를 코로나바이러스 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계를 추가로 포함한다. 일부 실시형태에서, 대상체는 코로나바이러스 감염을 가질 높은 위험이 있다. 일부 실시형태에서, 대상체는 코로나바이러스 감염을 갖지 않는다. 일부 실시형태에서, 대상체는 코로나바이러스 감염에 대해 음성인 것으로 테스트되었다. 일부 실시형태에서, 대상체는 코로나바이러스 감염을 갖는 것으로 진단되었다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 감염은 중증 급성 호흡기 증후군(SARS), 중동 호흡기 증후군, 또는 호흡기 감염을 유발한다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 감염은 COVID-19를 유발한다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 감염은 예방되고/되거나, 중증도가 감소되고/되거나, 발병이 지연된다.
일부 실시형태에서, 대상체에게 코로나바이러스 감염에 대한 유효량의 제2 요법이 제공된다. 일부 실시형태에서, 제2 요법은 항생제, 항바이러스제, 회복기 혈청, 면역 조절제, 항응고제, 유체, 산소, 코르티코스테로이드, 항체, GSnP-6, 시알릴 루이스 X 유사체(sialyl Lewis X analog), 항-증식제, 칼시뉴린 억제제, 항-신호전달 화합물, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 실시형태에서, 제2 요법은 항-SARS-CoV-2 약물을 포함한다. 일부 실시형태에서, 항-SARS-CoV-2 약물은 스테로이드, 아연, 비타민 C, 렘데시비르, 토실리주맙, 아나킨라, 베클로메타손, 베타메타손, 부데소니드 코르티손, 덱사메타손, 하이드로코르티손, 메틸프레드니솔론, 프레드니솔론, 프레드니손, 트리암시놀론, 아지트로마이신, AC-55541, 아피시딘, AZ3451, AZ8838, 바필로마이신 A1, CCT 365623, 다우노루비신, E-52862, 엔타카폰, GB110, H-89, 할로페리돌, 인도메타신, JQ1, 로라타딘, 메리메포딥, 메트포르민, 미도스타우린, 미갈라스타트, 마이코페놀산, PB28, PD-144418, 포나티닙, 리바비린, RS-PPCC, 룩솔리티닙, RVX-208, S-베라파밀, 실미타서팁, TMCB, UCPH-101, 발프로산, XL413, ZINC1775962367, ZINC4326719, ZINC4511851, ZINC95559591, 4E2RCat, ABBV-744, 카모스타트, 캅토프릴, CB5083, 클로람페니콜, 클로로퀸, 하이드록시클로로퀸, CPI-0610, 다브라페닙, DBeQ, dBET6, IHVR-19029, 리네졸리드, 리시노프릴, 미녹시딜, ML240, MZ1, 나파모스타트, 페보네디스타트, PS3061, 라파마이신(Sirolimus), 상글리페린 A, 사파니서팁(INK128/MlN128), FK-506(Tacrolimus), 테르나틴 4(DA3), 티게사이클린, 토미보서팁(eFT-508), 베르디넥소르, WDB002, 조타티핀(eFT226) 및 이들의 조합으로 이루어진 그룹으로부터 선택된다.
본원에서는, 일부 양상에서:
HIV 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 서열번호 18과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법;
HIV 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 HIV 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 18과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 HIV 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는, 방법;
서열번호 18과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 HIV 감염을 치료 또는 예방하는 방법; 및
HIV 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 18과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 HIV 감염을 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 HIV 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성하는, 방법이 개시된다.
일부 실시형태에서, 비-고유 단백질 복합체는 프로테아솜 분해를 겪는다. 일부 실시형태에서, 생체내에서 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절은 대상체에서 HIV 감염을 치료 또는 예방한다. 일부 실시형태에서, 생체내에서 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절은 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 HIV 스파이크 단백질의 전좌 및 형성의 억제를 포함한다. 일부 실시형태에서, 생체내에서 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절은 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 HIV 스파이크 단백질의 양을 감소시킨다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드 및 HIV 스파이크 단백질의 올리고머화는 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하여 HIV 감염을 치료 또는 예방한다. 일부 실시형태에서, 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 HIV 스파이크 단백질의 전좌 및 형성은 억제된다. 일부 실시형태에서, 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 HIV 스파이크 단백질의 양이 감소된다.
일부 실시형태에서, HIV 스파이크 단백질은 HIV gp160 스파이크 단백질을 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18과 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18과 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18과 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18과 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18을 포함한다.
일부 실시형태에서, 생체내에서 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법 및/또는 HIV 감염을 치료 또는 예방하는 방법은 대상체를 HIV 감염으로 진단하는 단계; 대상체를 HIV 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 또는 대상체를 HIV 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계를 추가로 포함한다. 일부 실시형태에서, 대상체는 HIV 감염을 가질 높은 위험이 있다. 일부 실시형태에서, 대상체는 HIV 감염을 갖지 않는다. 일부 실시형태에서, 대상체는 HIV 감염에 대해 음성인 것으로 테스트되었다. 일부 실시형태에서, 대상체는 HIV 감염을 갖는 것으로 진단되었다. 일부 실시형태에서, HIV 감염은 예방되고/되거나, 중증도가 감소되고/되거나, 발병이 지연된다.
일부 실시형태에서, 대상체에게 HIV 감염에 대한 제2 요법의 유효량이 제공된다. 일부 실시형태에서, 제2 요법은 항생제, 항바이러스제, 회복기 혈청, 면역 조절제, 항응고제, 유체, 산소, 코르티코스테로이드, 항체, GSnP-6, 시알릴 루이스 X 유사체, 항-증식제, 칼시뉴린 억제제, 항-신호전달 화합물, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 실시형태에서, 제2 요법은 항-HIV 약물을 포함한다. 일부 실시형태에서, 항-HIV 약물은 에파비렌즈(Sustiva), 릴피비린(Edurant), 에트라비린(Intelence), 델라비르딘(Rescriptor), 네비라핀(Viramune, Viramune XR), 도라비린(Pifeltroz), 아바카비르(Ziagen), 테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Vemlidy), 테노포비르(Viread), 엠트리시타빈(Emtriva), 라미부딘(Epivir), 지도부딘(Retrovir), 아바카비르/라미부딘/지도부딘(Trizivir), 아바카비르/라미부딘(Epzicom), 엠트리시타빈/테노포비르(Truvada), 아바카비르/라미부딘(Epzicom), 라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Cimduo, Temixys), 라미부딘/지도부딘(Combivir), 엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드(Descovy), 디다노신(Videx, Videx EC), 스타부딘(Zerit), 아타자나비르(Reyataz), 다루나비르(Prezista), 포삼프레나비르(Lexiva), 리토나비르(Norvir), 티프라나비르(Aptivus), 로피나비르/리토나비르(Kaletra), 아타자나비르/코비시스타트(Evotaz), 다루나비르/코비시스타트(Prezcobix), 인디나비르(Crixivan), 넬피나비르(Viracept), 사퀴나비르(Invirase), 빅테그라비르 나트륨/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마르(Biktarvy), 랄테그라비르(Isentress), 엘비테그라비르(Genvoya 및 Stribild), 돌루테그라비르(Tivicay), 코비시스타트(Tybost), 리토나비르(Norvir), 엔푸비르티드(Fuzeon), 마라비록(Selzentry), 이발리주맙-uiyk(Trogarzo), 마라비록(Selzentry), 포스템사비르(Rukobia), 도라비린/라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Delstrigo), 에파비렌즈/라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Symfi), 에파비렌즈/라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Symfi Lo), 에파비렌즈/엠트리시타빈/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Atripla), 엠트리시타빈/릴피비린/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Odefsey), 엠트리시타빈/릴피비린/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Complera), 엘비테그라비르/코비시스타트/엠트리시타빈/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Stribild), 엘비테그라비르/코비시스타트/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Genvoya), 아바카비르/돌루테그라비르/라미부딘(Triumeq), 빅테그라비르/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Biktarvy), 돌루테그라비르/라미부딘(Dovato), 돌루테그라비르/릴피비린(Juluca), 다루나비르/코비시스타트/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Symtuza), 아세틸-L-카르니틴, 유청 단백질, L-글루타민, L-아르기닌, 하이드록시메틸부티레이트(HMB), 프로바이오틱스, 비타민 및 미네랄, 및 이들의 조합으로 이루어진 그룹으로부터 선택된다.
본원에서는, 일부 양상에서:
에볼라 당단백질 또는 이의 일부를 서열번호 20과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 에볼라 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법:
에볼라 당단백질 또는 이의 일부를 에볼라 당단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 20과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 에볼라 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 에볼라 당단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 에볼라 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 억제하는, 방법:
서열번호 20과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 에볼라 감염을 치료 또는 예방하는 방법; 및
에볼라 당단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 20과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 에볼라 감염을 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 에볼라 당단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성하는, 방법이 개시된다.
일부 실시형태에서, 비-고유 단백질 복합체는 프로테아솜 분해를 겪는다. 일부 실시형태에서, 생체내에서 에볼라 당단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절은 대상체에서 에볼라 감염을 치료 또는 예방한다. 일부 실시형태에서, 생체내에서 에볼라 당단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절은 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 에볼라 당단백질의 전좌 및 형성의 억제를 포함한다. 일부 실시형태에서, 생체내에서 에볼라 당단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절은 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 에볼라 당단백질의 양을 감소시킨다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드 및 에볼라 당단백질의 올리고머화는 에볼라 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하여 에볼라 감염을 치료 또는 예방한다. 일부 실시형태에서, 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 에볼라 당단백질 전좌 및 형성이 억제된다. 일부 실시형태에서, 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 에볼라 당단백질의 양이 감소된다. 일부 실시형태에서, 에볼라 감염은 예방되고/되거나, 중증도가 감소되고/되거나, 발병이 지연된다.
일부 실시형태에서, 에볼라 당단백질은 에볼라 GP 당단백질을 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20과 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20과 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20과 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20과 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20을 포함한다.
일부 실시형태에서, 생체내에서 에볼라 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법 및/또는 에볼라 감염을 치료 또는 예방하는 방법은 대상체를 에볼라 감염으로 진단하는 단계; 대상체를 에볼라 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 또는 대상체를 에볼라 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계를 추가로 포함한다. 일부 실시형태에서, 대상체는 에볼라 감염을 가질 높은 위험이 있다. 일부 실시형태에서, 대상체는 에볼라 감염을 갖지 않는다. 일부 실시형태에서, 대상체는 에볼라 감염에 대해 음성인 것으로 테스트되었다. 일부 실시형태에서, 대상체는 에볼라 감염을 갖는 것으로 진단되었다.
일부 실시형태에서, 대상체에게 에볼라 감염에 대한 제2 요법의 유효량이 제공된다. 일부 실시형태에서, 제2 요법은 항생제, 항바이러스제, 회복기 혈청, 면역 조절제, 항응고제, 유체, 산소, 코르티코스테로이드, 항체, GSnP-6, 시알릴 루이스 X 유사체, 항-증식제, 칼시뉴린 억제제, 항-신호전달 화합물, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 실시형태에서, 제2 요법은 항-에볼라 약물을 포함한다. 일부 실시형태에서, 항-에볼라 약물은 아톨티비맙/마프티비맙/오데시비맙-ebgn(Inmazeb), 안수비맙-zykl(Ebanga), 파비피라비르(Avigan), 리바비린, BCX4430, 브린시도포비르, TKM-에볼라, AVI-7537, JK-05, 및 이들의 조합으로 이루어진 그룹으로부터 선택된다.
본원에서는, 일부 양상에서:
인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 서열번호 25와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드와 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법;
인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 25와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는, 방법;
서열번호 25와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 인플루엔자 감염을 치료 또는 예방하는 방법; 및
인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 25와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 인플루엔자 감염을 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성하는, 방법이 개시된다.
일부 실시형태에서, 비-고유 단백질 복합체는 프로테아솜 분해를 겪는다. 일부 실시형태에서, 생체내에서 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절은 대상체에서 인플루엔자 감염을 치료 또는 예방한다. 일부 실시형태에서, 생체내에서 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절은 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 전좌 및 형성의 억제를 포함한다. 일부 실시형태에서, 생체내에서 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절은 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 양을 감소시킨다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드 및 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화는 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하여 인플루엔자 감염을 치료 또는 예방한다. 일부 실시형태에서, 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 전좌 및 형성이 억제된다. 일부 실시형태에서, 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 양이 감소된다.
일부 실시형태에서, 인플루엔자는 인플루엔자 바이러스 A를 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 A 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 A는 인플루엔자 바이러스 A/H1을 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 A/H1 HA 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 A는 인플루엔자 바이러스 A/H3을 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 A/H3 HA 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자는 인플루엔자 바이러스 B를 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 B 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 B는 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아(Victoria)를 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아 HA 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 B는 인플루엔자 바이러스 B/야마가타(Yamagata)를 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 B/야마가타 HA 스파이크 단백질을 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 25와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 25와 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 25와 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 25와 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 25와 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 25를 포함한다.
일부 실시형태에서, 생체내에서 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법 및/또는 인플루엔자 바이러스 감염을 치료 또는 예방하는 방법은 대상체를 인플루엔자 감염으로 진단하는 단계; 대상체를 인플루엔자 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 또는 대상체를 인플루엔자 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계를 추가로 포함한다. 일부 실시형태에서, 대상체는 인플루엔자 감염을 가질 높은 위험이 있다. 일부 실시형태에서, 대상체는 인플루엔자 감염을 갖지 않는다. 일부 실시형태에서, 대상체는 인플루엔자 감염에 대해 음성인 것으로 테스트되었다. 일부 실시형태에서, 대상체는 인플루엔자 감염을 갖는 것으로 진단되었다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자 감염은 예방되고/되거나, 중증도가 감소되고/되거나, 발병이 지연된다.
일부 실시형태에서, 대상체에게 인플루엔자 감염에 대한 제2 요법의 유효량이 제공된다. 일부 실시형태에서, 제2 요법은 항생제, 항바이러스제, 회복기 혈청, 면역 조절제, 항응고제, 유체, 산소, 코르티코스테로이드, 항체, GSnP-6, 시알릴 루이스 X 유사체, 항-증식제, 칼시뉴린 억제제, 항-신호전달 화합물, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 실시형태에서, 제2 요법은 항-인플루엔자 약물을 포함한다. 일부 실시형태에서, 항-인플루엔자 약물은 오셀타미비르 포스페이트(Tamiflu), 자나미비르(Relenza), 페라미비르(Rapivab), 발록사비르 마르복실(Xofluza), 아만타딘, 리만타딘(Flumadine), 우미페노비르(Arbidol), 모록시딘, 플루티케어(fluticare), 아세트아미노펜, 클로르페니라민, 덱스트로메토르판, 슈도에페드린, 및 이들의 조합로 이루어진 그룹으로부터 선택된다.
본원에서는, 일부 양상에서:
RSV 당단백질 또는 이의 일부를 서열번호 34와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법;
RSV 당단백질 또는 이의 일부를 RSV 당단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 34와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 RSV 당단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 억제하는, 방법;
서열번호 34와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 RSV 감염을 치료 또는 예방하는 방법; 및
RSV 당단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 34와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 RSV 감염을 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 에볼라 당단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성하는, 방법이 개시된다.
일부 실시형태에서, 비-고유 단백질 복합체는 프로테아솜 분해를 겪는다. 일부 실시형태에서, 생체내에서 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절은 대상체에서 RSV 감염을 치료 또는 예방한다. 일부 실시형태에서, 생체내에서 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절은 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 RSV 당단백질의 전좌 및 형성의 억제를 포함한다. 일부 실시형태에서, 생체내에서 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절은 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 RSV 당단백질의 양을 감소시킨다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드 및 RSV 당단백질의 올리고머화는 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하여 RSV 감염을 치료 또는 예방한다. 일부 실시형태에서, 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 RSV 당단백질의 전좌 및 형성이 억제된다. 일부 실시형태에서, 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 RSV 당단백질이 감소된다. 일부 실시형태에서, RSV 감염은 예방되고/되거나, 중증도가 감소되고/되거나, 발병이 지연된다.
일부 실시형태에서, RSV 당단백질은 RSV F 당단백질을 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34와 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34와 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34와 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34와 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34를 포함한다.
일부 실시형태에서, 생체내에서 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법 및/또는 RSV 감염을 치료 또는 예방하는 방법은 대상체를 RSV 감염으로 진단하는 단계; 대상체를 RSV 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 또는 대상체를 RSV 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계를 추가로 포함한다. 일부 실시형태에서, 대상체는 RSV 감염을 가질 높은 위험이 있다. 일부 실시형태에서, 대상체는 RSV 감염을 갖지 않는다. 일부 실시형태에서, 대상체는 RSV 감염에 대해 음성인 것으로 테스트되었다. 일부 실시형태에서, 대상체는 RSV 감염을 갖는 것으로 진단되었다.
일부 실시형태에서, 대상체에게 RSV 감염에 대한 제2 요법의 유효량이 제공된다. 일부 실시형태에서, 제2 요법은 항-RSV 약물을 포함한다.
본원에 개시된 방법의 일부 실시형태에서, 0.1 내지 1000 mg/대상체의 체중 kg의 용량의 폴리펩타이드가 대상체에게 투여된다. 일부 실시형태에서, 0.1 내지 1000 μg/대상체의 체중 kg의 용량의 폴리펩타이드가 대상체에게 투여된다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터로부터 발현된다. 일부 실시형태에서, 벡터는 바이러스 벡터 또는 비-바이러스 벡터이다. 일부 실시형태에서, 벡터는 미니서클 DNA 벡터이다. 일부 실시형태에서, 1 x 108 내지 1 x 1018 벡터 카피/대상체의 체중 kg의 용량이 대상체에게 투여된다. 일부 실시형태에서, 약 1 x 1011 내지 약 1 x 1014 벡터 카피/대상체의 체중 kg의 용량이 대상체에게 투여된다. 일부 실시형태에서, 약 1 x 1012 내지 약 1 x 1015 벡터/대상체의 체중 kg의 용량이 대상체에게 투여된다. 일부 실시형태에서, 벡터는 대상체의 세포를 형질도입하고, 상기 대상체의 세포는 폴리펩타이드를 발현한다.
일부 실시형태에서, 조성물은 약제학적으로 허용되는 담체를 추가로 포함한다. 일부 실시형태에서, 약제학적으로 허용되는 담체는 리포솜, 중합체성 미셀, 미소구체 또는 나노입자를 포함한다.
일부 실시형태에서, 조성물의 단일 용량이 투여된다. 일부 실시형태에서, 조성물의 다중 용량이 투여된다. 일부 실시형태에서, 조성물은 대상체에게 1일 1회, 1일 1회 이상, 주 1회 이상, 월 1회 이상, 또는 년 1회 이상 전달된다. 일부 실시형태에서, 조성물은 전신적으로 또는 국소적으로 전달된다. 일부 실시형태에서, 조성물은 대상체에게 비강내로, 정맥내로, 복강내로, 기관내로, 근육내로, 내시경적으로, 경피적으로, 피하로, 국부적으로, 두개내로, 흡입에 의해, 주사에 의해, 주입에 의해 또는 관류에 의해 투여된다. 일부 실시형태에서, 조성물은 대상체에게 흡입에 의해 투여된다. 일부 실시형태에서, 조성물은 대상체에게 비강내로 투여된다.
본원에서는, 일부 양상에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물이 개시되고, 여기서 상기 폴리펩타이드의 길이는 30개 초과의 아미노산이고, 상기 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 10% 서열 동일성을 갖는다.
일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 10% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 20% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 30% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 40% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 50% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 60% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 70% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 동일성 표적 단백질의 서열과 적어도 90%을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열과 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 상응하는 서열을 포함한다.
본원에서는, 일부 양상에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물이 개시되고, 여기서 상기 폴리펩타이드의 길이는 30개 초과의 아미노산이고, 상기 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 10% 서열 동일성을 갖는다.
일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 10% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 20% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 30% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과적어도 40% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 50% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 60% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 70% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인을 포함한다.
일부 실시형태에서, 표적 단백질은 바이러스 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질은 바이러스 당단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질은 바이러스 스파이크 단백질을 포함한다.
본원에서는, 일부 양상에서, 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물; 및 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물이 개시된다.
일부 실시형태에서, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 SARS-CoV 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 SARS-CoV-2 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 MERS-CoV 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 HCoV-229E 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 HCoV-NL63 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 HCoV-OC43 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 HCoV-HKU1 스파이크 단백질을 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2와 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2와 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2와 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2와 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2를 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 4와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 4와 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 4와 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 4와 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 4와 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 4를 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 6과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 6과 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 6과 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 6과 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 6과 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 6을 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 8과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 8과 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 8과 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 8과 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 8과 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 8을 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 10과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 10과 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 10과 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 10과 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 10과 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 10을 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 12와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 12와 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 12와 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 12와 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 12와 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 12를 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 14와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 14와 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 14와 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 14와 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 14와 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 14를 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 16과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 16과 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 16과 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 16과 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 16과 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 16을 포함한다.
일부 실시형태에서, 조성물은 코로나바이러스 감염에 대한 제2 요법을 추가로 포함한다. 일부 실시형태에서, 제2 요법은 항생제, 항바이러스제, 회복기 혈청, 면역 조절제, 항응고제, 유체, 산소, 코르티코스테로이드, 항체, GSnP-6, 시알릴 루이스 X 유사체, 항-증식제, 칼시뉴린 억제제, 항-신호전달 화합물, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 실시형태에서, 제2 요법은 항-SARS-CoV-2 약물을 포함한다. 일부 실시형태에서, 항-SARS-CoV-2 약물은 아지트로마이신, AC-55541, 아피시딘, AZ3451, AZ8838, 바필로마이신 A1, CCT 365623, 다우노루비신, E-52862, 엔타카폰, GB110, H-89, 할로페리돌, 인도메타신, JQ1, 로라타딘, 메리메포딥, 메트포르민, 미도스타우린, 미갈라스타트, 마이코페놀산, PB28, PD-144418, 포나티닙, 리바비린, RS-PPCC, 룩솔리티닙, RVX-208, S-베라파밀, 실미타서팁 , TMCB, UCPH-101, 발프로산, XL413, ZINC1775962367, ZINC4326719, ZINC4511851, ZINC95559591, 4E2RCat, ABBV-744, 카모스타트, 캅토프릴, CB5083, 클로람페니콜, 클로로퀸(및/또는 하이드록시클로로퀸), CPI-0610, 다브라페닙, DBeQ, dBET6, IHVR-19029, 리네졸리드, 리시노프릴, 미녹시딜, ML240, MZ1, 나파모스타트, 페보네디스타트, PS3061, 라파마이신(Sirolimus), 상글리페린 A, 사파니서팁(INK128/MlN128), FK-506(Tacrolimus), 테르나틴 4(DA3), 티게사이클린, 토미보서팁(eFT-508), 베르디넥소르, WDB002, 조타티핀(eFT226), 및 이들의 조합으로 이루어진 그룹으로부터 선택된다.
본원에서는, 일부 양상에서, 서열번호 18과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물; 및 HIV 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 18과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물이 개시된다.
일부 실시형태에서, HIV 스파이크 단백질은 HIV gp160 스파이크 단백질을 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18과 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18과 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18과 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18과 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18을 포함한다.
일부 실시형태에서, 조성물은 추가로 HIV 감염에 대한 제2 요법을 포함한다. 일부 실시형태에서, 제2 요법은 항생제, 항바이러스제, 회복기 혈청, 면역 조절제, 항응고제, 유체, 산소, 코르티코스테로이드, 항체, GSnP-6, 시알릴 루이스 X 유사체, 항-증식제, 칼시뉴린 억제제, 항-신호전달 화합물, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 실시형태에서, 제2 요법은 항-HIV 약물을 포함한다. 일부 실시형태에서, 항-HIV 약물은 에파비렌즈(Sustiva), 릴피비린(Edurant), 에트라비린(Intelence), 델라비르딘(Rescriptor), 네비라핀(Viramune, Viramune XR), 도라비린(Pifeltroz), 아바카비르(Ziagen), 테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Vemlidy), 테노포비르(Viread), 엠트리시타빈(Emtriva), 라미부딘(Epivir), 지도부딘(Retrovir), 아바카비르/라미부딘/지도부딘(Trizivir), 아바카비르/라미부딘(Epzicom), 엠트리시타빈/테노포비르(Truvada), 아바카비르/라미부딘(Epzicom), 라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Cimduo, Temixys), 라미부딘/지도부딘(Combivir), 엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드(Descovy), 디다노신(Videx, Videx EC), 스타부딘(Zerit), 아타자나비르(Reyataz), 다루나비르(Prezista), 포삼프레나비르(Lexiva), 리토나비르(Norvir), 티프라나비르(Aptivus), 로피나비르/리토나비르(Kaletra), 아타자나비르/코비시스타트(Evotaz), 다루나비르/코비시스타트(Prezcobix), 인디나비르(Crixivan), 넬피나비르(Viracept), 사퀴나비르(Invirase), 빅테그라비르 나트륨/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마르(Biktarvy), 랄테그라비르(Isentress), 엘비테그라비르(Genvoya 및 Stribild), 돌루테그라비르(Tivicay), 코비시스타트(Tybost), 리토나비르(Norvir), 엔푸비르티드(Fuzeon), 마라비록(Selzentry), 이발리주맙-uiyk(Trogarzo), 마라비록(Selzentry), 포스템사비르(Rukobia), 도라비린/라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Delstrigo), 에파비렌즈/라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Symfi), 에파비렌즈/라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Symfi Lo), 에파비렌즈/엠트리시타빈/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Atripla), 엠트리시타빈/릴피비린/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Odefsey), 엠트리시타빈/릴피비린/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Complera), 엘비테그라비르/코비시스타트/엠트리시타빈/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Stribild), 엘비테그라비르/코비시스타트/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Genvoya), 아바카비르/돌루테그라비르/라미부딘(Triumeq), 빅테그라비르/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Biktarvy), 돌루테그라비르/라미부딘(Dovato), 돌루테그라비르/릴피비린(Juluca), 다루나비르/코비시스타트/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Symtuza), 아세틸-L-카르니틴, 유청 단백질, L-글루타민, L-아르기닌, 하이드록시메틸부티레이트(HMB), 프로바이오틱스, 비타민 및 미네랄, 및 이들의 조합으로 이루어진 그룹으로부터 선택된다.
본원에서는, 일부 양상에서, 서열번호 20과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물; 및 에볼라 당단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 20과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물이 개시된다.
일부 실시형태에서, 에볼라 바이러스 당단백질은 에볼라 GP 스파이크 단백질을 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20과 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20과 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20과 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20과 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20을 포함한다.
일부 실시형태에서, 조성물은 추가로 에볼라 감염에 대한 제2 요법을 포함한다. 일부 실시형태에서, 제2 요법은 항생제, 항바이러스제, 회복기 혈청, 면역 조절제, 항응고제, 유체, 산소, 코르티코스테로이드, 항체, GSnP-6, 시알릴 루이스 X 유사체, 항-증식제, 칼시뉴린 억제제, 항-신호전달 화합물, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 실시형태에서, 제2 요법은 항-에볼라 약물을 포함한다. 일부 실시형태에서, 항-에볼라 약물은 아톨티비맙/마프티비맙/오데시비맙-ebgn(Inmazeb), 안수비맙-zykl(Ebanga), 파비피라비르(Avigan), 리바비린, BCX4430, 브린시도포비르, TKM-에볼라, AVI-7537, JK-05, 및 이들의 조합으로 이루어진 그룹으로부터 선택된다.
본원에서는, 일부 양상에서, 서열번호 25와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물; 및 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 25와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물이 개시된다.
일부 실시형태에서, 인플루엔자는 인플루엔자 바이러스 A를 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 A 스파이크 단백질을 포함한다.
일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 A는 인플루엔자 바이러스 A/H1을 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 A/H1 HA 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 A는 인플루엔자 바이러스 A/H3를 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 A/H3 HA 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자는 인플루엔자 바이러스 B를 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 B 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 B는 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아를 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아 HA 스파이크 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 B는 인플루엔자 바이러스 B/야마가타를 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 B/야마가타 HA 스파이크 단백질을 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 25와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 25와 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 25와 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 25와 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 25와 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 25를 포함한다.
일부 실시형태에서, 조성물은 추가로 인플루엔자 감염에 대한 제2 요법을 포함한다. 일부 실시형태에서, 제2 요법은 항생제, 항바이러스제, 회복기 혈청, 면역 조절제, 항응고제, 유체, 산소, 코르티코스테로이드, 항체, GSnP-6, 시알릴 루이스 X 유사체, 항-증식제, 칼시뉴린 억제제, 항-신호전달 화합물, 또는 이들의 조합을 포함한다. 일부 실시형태에서, 제2 요법은 항-인플루엔자 약물을 포함한다. 일부 실시형태에서, 항-인플루엔자 약물은 오셀타미비르 포스페이트(Tamiflu), 자나미비르(Relenza), 페라미비르(Rapivab), 발록사비르 마르복실(Xofluza), 아만타딘, 리만타딘(Flumadine), 우미페노비르(Arbidol), 모록시딘, 플루티케어, 아세트아미노펜, 클로르페니라민, 덱스트로메토르판, 슈도에페드린, 및 이들의 조합으로 이루어진 그룹으로부터 선택된다.
본원에서는, 일부 양상에서, 서열번호 34와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물; 및 RSV 당단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 34와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물이 개시된다.
일부 실시형태에서, RSV 당단백질은 RSV F 당단백질을 포함한다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34와 적어도 80% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34와 적어도 85% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34와 적어도 90% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34와 적어도 95% 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34를 포함한다.
일부 실시형태에서, 조성물은 추가로 RSV 감염에 대한 제2 요법을 포함한다. 일부 실시형태에서, 제2 요법은 항-RSV 약물을 포함한다.
본원에 개시된 조성물의 일부 실시형태에서, 벡터는 바이러스 벡터 또는 비-바이러스 벡터이다. 일부 실시형태에서, 벡터는 미니서클 DNA 벡터이다. 일부 실시형태에서, 1 x 108 내지 1 x 1018 벡터 게놈/대상체의 체중 kg의 용량이 대상체에게 투여된다. 일부 실시형태에서, 약 1 x 1011 내지 약 1 x 1014 벡터 게놈/대상체의 체중 kg의 용량이 대상체에게 투여된다. 일부 실시형태에서, 약 1 x 1012 내지 약 1 x 1015 벡터 게놈/대상체의 체중 kg의 용량이 대상체에게 투여된다.
본원에 개시된 조성물의 일부 실시형태에서, 조성물은 추가로 약제학적으로 허용되는 담체를 포함한다. 일부 실시형태에서, 약제학적으로 허용되는 담체는 리포솜, 중합체성 미셀, 미소구체 또는 나노입자를 포함한다.
본원에 개시된 조성물의 일부 실시형태에서, 조성물의 단일 용량이 투여된다. 일부 실시형태에서, 조성물의 다중 용량이 투여된다. 일부 실시형태에서, 조성물은 대상체에게 1일 1회, 1일 1회 이상, 주 1회 이상, 월 1회 이상, 또는 년 1회 이상 전달된다. 일부 실시형태에서, 조성물은 전신적으로 또는 국소적으로 전달된다. 일부 실시형태에서, 조성물은 대상체에게 비강내로, 정맥내로, 복강내로, 기관내로, 근육내로, 내시경적으로, 경피적으로, 피하로, 국부적으로, 두개내로, 흡입에 의해, 주사에 의해, 주입에 의해 또는 관류에 의해 투여된다. 일부 실시형태에서, 조성물은 대상체에게 흡입에 의해 투여된다. 일부 실시형태에서, 조성물은 대상체에게 비강내로 투여된다.
"개체", "대상체" 및 "환자"는 상호교환적으로 사용되며 인간 또는 비인간을 지칭할 수 있다.
본원에서 사용된 바와 같이, "치료한다", "치료하는" 및 "치료" 또는 동등한 용어는 치료학적 처치 및 예방학적 또는 예방적 조치 둘 다를 지칭하고, 여기서 그 목적은 질환의 성장, 발달 또는 확산과 같은 원한지 않은 생리학적 변화 또는 장애를 예방하거나 둔화(경감)시키는 것이다. 본 개시내용의 목적을 위해, 유익하거나 원하는 임상 결과는 검출 가능한지 또는 검출 불가능한지에 관계없이 증상의 완화, 질환의 정도의 감소, 질환의 안정화된(즉, 악화되지 않는) 상태, 질환 진행의 지연 또는 감속, 질환 상태의 개선 또는 완화, 및 관해(부분적인지 또는 완전한지에 관계없이)를 포함한다. "치료"는 또한 치료를 받지 않은 경우 예상된 생존과 비교하여 연장된 생존을 의미한다. 치료를 필요로 하는 사람은 이미 상태 또는 장애를 갖는 사람뿐만 아니라, 상태 또는 장애를 갖기 쉬운 사람 또는 상태 또는 장애가 예방되어야 하는 사람을 포함한다. 치료 결과는 당업계에 공지된 방법, 예컨대 바이러스 존재량(viral load) 감소의 결정, 기능 회복의 결정, 또는 당업계에 공지된 다른 방법에 의해 결정될 수 있다.
본원 전반에 걸쳐, 용어 "약"은 값이 측정 또는 정량화 방법에 대한 고유한 오차 변동을 포함함을 나타내기 위해 사용된다.
용어 "포함하는"과 관련하여 사용되는 경우, 용어 "a" 또는 "an"의 사용은 "하나"를 의미할 수 있지만, 이것은 또한 "하나 이상", "적어도 하나" 및 "하나 초과"의 의미와 일치한다.
문구 "및/또는"은 "및" 또는 "또는"을 의미한다. 예시하기 위해, A, B, 및/또는 C는 다음을 포함한다: A 단독, B 단독, C 단독, A와 B의 조합, A와 C의 조합, B와 C의 조합, 또는 A, B와 C의 조합. 즉, "및/또는"은 포괄적 또는으로 작동한다.
단어 "포함하는"(및 예를 들어, "포함하다(comprise/comprises)"과 같은 '포함하는'의 임의의 형태), "갖는"(및 "갖다(have/has)"와 같은 '갖는'의 임의의 형태), "포함되는(including)"(및 "포함되다(includes/include)"와 같은 '포함되는'의 임의의 형태) 또는 "함유하는"(및 "함유하다(contains/contain)"과 같은 '함유하는'의 임의의 형태)은 포괄적이거나 개방형이며 추가의 인용되지 않은 요소 또는 방법 단계들을 배제하지 않는다.
이들의 사용을 위한 조성물 및 방법은 본원 명세서 전반에 걸쳐 개시된 임의의 성분 또는 단계를 "포함한다", "로 필수적으로 이루어진다", 또는 "로 이루어진다"일 수 있다. 개시된 임의의 성분 또는 단계로 "필수적으로 이루어진" 조성물 및 방법은 청구 범위를 본원 개시내용의 기본적이고 신규한 특징에 실질적으로 영향을 미치지 않는 특정된 물질 또는 단계로 제한한다. 본 명세서 및 청구범위에서 사용된 바와 같이, 단어 "포함하는"(및 예를 들어, "포함하다(comprise/comprises)"과 같은 '포함하는'의 임의의 형태), "갖는"(및 "갖다(have/has)"와 같은 '갖는'의 임의의 형태), "포함되는(including)"(및 "포함되다(includes/include)"와 같은 '포함되는'의 임의의 형태) 또는 "함유하는"(및 "함유하다(contains/contain)"과 같은 '함유하는'의 임의의 형태)은 포괄적이거나 개방형이며 추가의 인용되지 않은 요소 또는 방법 단계들을 배제하지 않는다. 용어 "포함하는"의 맥락에서 본원에 기술된 실시형태는 또한 용어 "로 이루어진" 또는 "로 필수적으로 이루어진"의 맥락에서 구현될 수 있는 것으로 고려된다.
치료, 진단 또는 생리학적 목적 또는 효과의 맥락에서 임의의 방법은 또한 기재된 치료, 진단, 생리학적 목적 또는 효과를 달성하거나 구현하기 위해 본원에 논의된 임의의 화합물, 조성물 또는 제제"의 용도"와 같은 "용도" 청구항 언어로 기재될 수 있다.
본 개시내용의 일 실시형태와 관련하여 논의된 임의의 제한은 본 개시내용의 임의의 다른 실시형태에 적용될 수 있다는 것이 구체적으로 고려된다. 또한, 본 개시내용의 임의의 조성물은 본 개시내용의 임의의 방법에서 사용될 수 있고, 본 개시내용의 임의의 방법은 본 개시내용의 임의의 조성물을 제조하거나 이용하기 위해 사용될 수 있다. 본원 실시예에 제시된 실시형태의 양상은 또한 상이한 실시예의 다른 곳, 또는 요약, 상세한 설명, 청구범위 및 도면의 설명과 같은 본 출원의 다른 곳에 논의된 실시형태의 맥락에서 구현될 수 있는 실시형태이다.
본원 개시내용의 다른 목적, 특징 및 이점은 하기 상세한 설명으로부터 명백해질 것이다. 그러나, 본 개시내용의 사상 및 범위 내의 다양한 변경 및 변형이 본 상세한 설명으로부터 당업자에게 명백하게 될 수 있기 때문에, 본 개시내용의 구체적 실시형태를 명시하고 있지만, 상세한 설명 및 구체적인 예는 단지 예로서 주어진 것임을 이해해야 한다.
하기 도면은 본 명세서의 일부를 형성하고, 본 발명의 특정한 양상을 추가로 입증하기 위해 포함된다. 본원에 제시된 구체적 실시형태의 상세한 설명과 함께 이들 도면 중 하나 이상을 참조하여 본 개시내용을 더 잘 이해할 수 있다.
도 1a 내지 1c. 폴리펩타이드-기반 단백질 억제의 개념. 도 1a. COVID-19 SARS2-S의 도메인 구성, SARS2-S 변이체 내의 돌연변이, 및 억제성 폴리펩타이드 CoV-F1(F1) 및 CoV-F2(F2)의 설계. SP: 신호 펩타이드; NTD: N-말단 도메인; RBD: 수용체-결합 도메인; SD1: 서브도메인 1; SD2: 서브도메인 2; FP: 융합 펩타이드; HR1: 헵타드 반복체 1; HR2: 헵타드 반복체 2; TM: 막횡단 도메인; CT: 세포질 테일. S1/S2(빨간색 화살표)에서의 절단은 N-말단 S1 단편 및 C-말단 S2 단편을 생성한다. F1 및 F2의 극단 N-말단에서의 신호 펩타이드 서열은 폴리펩타이드가 COVID-19 SARS2-S와 동일한 방식으로 전좌되도록 하였다. 극단 C-말단에서, SARS2-S는 C9-로돕신 항체 1D4에 의해 인식되는 C9 에피토프를 갖는 반면, F1 폴리펩타이드 및 F2 폴리펩타이드 둘 다는 FLAG-태그를 갖는다. F1은 SP, HR1, HR2, TM 및 CT(잔기 911 내지 1273; 서열번호 2)를 포함하는 반면, F2는 SP, HR2, TM 및 CT(잔기 985 내지 1273; 서열번호 27)를 함유한다. 도 1b. 코로나바이러스 스파이크 단백질을 표적화하는 폴리펩타이드-기반 억제를 위한 제안된 작용 방식. 상단 줄: 정상적인 상황에서, 스파이크 단백질은 합성되고 단량체로서 폴딩되고, 비리온에 앵커링된(anchored) 고유 스파이크 올리고머로 조립된다. 하단 줄: 억제성 폴리펩타이드는 조립 단계를 간섭하여 야생형 스파이크 단백질과의 비-고유 올리고머를 생성한다. 최종 결과는 새로운 비리온 상의 고유 스파이크 올리고머의 감소된 수이다.
도 2a 내지 2c. 플라스미드 DNA로부터 발현된 F1 폴리펩타이드는 3가지 코로나바이러스 스파이크 당단백질의 발현 및 표면 전좌를 유의미하게 감소시켰다. 도 2a. COVID-19 SARS2-S. 전세포 용해물(좌측) 또는 세포-표면 분획(우측) 중의 SARS2-S 단백질의 양을, SARS2-S-암호화 플라스미드 단독(열 #1)으로 또는 2배(열 #2) 또는 10배 몰비(열 #3)의 F1-암호화 플라스미드 또는 2배(열 #4) 또는 10배 몰비(열 #5)의 F2-암호화 플라스미드와 함께 형질감염된 HEK293T 세포에 대해 비교하였다. 도 2b. 2002 SARS-S. 전세포 용해물(좌측) 또는 세포-표면 분획(우측) 중의 SARS-S 단백질의 양을 SARS-S 암호화 플라스미드 단독(열 #1)으로, 또는 2배(열 #2) 또는 10배 몰비(열 #3)의 F1-암호화 플라스미드와 함께 형질감염된 HEK293T 세포에 대해 비교하였다. 도 2c. 2012 MERS-S. 전세포 용해물(좌측) 또는 세포-표면 분획(우측) 중의 MERS-S 단백질의 양을 MERS-S-암호화 플라스미드 단독(열 #1) 또는 2배(열 #2) 또는 10배 몰비(열 #3)의 F1-암호화 플라스미드와 함께 형질감염된 HEK293T 세포에 대해 비교하였다. 모든 패널의 경우, 비절단된 S 및 절단된 S2 단백질은 C9-로돕신 항체 1D4에 의해 검출되었다. 내인성 막 단백질 CNPase는 항-CNPase 항체에 의해 검출되었으며 내부 대조군으로서 역할을 하였다. 적어도 2회의 독립적인 실험의 대표적인 결과가 도시되었다.
도 3a 내지 3b. 코로나바이러스 스파이크 단백질의 서열 정렬. 도 3a. SARS2-S(SARS2), SARS-S(SARS) 및 SARS-CoV-2 B.1.1.7-S(SARS2α) 스파이크 단백질의 정렬. F1 폴리펩타이드에 포함된 잔기의 범위는 파란색 박스로 강조 표시되어 있다. 도 3b. SARS2-S(SARS2) 및 MERS-S(MERS) 단백질의 정렬. F1 폴리펩타이드에 포함된 잔기의 범위는 파란색 박스로 강조 표시되어 있다. S1과 S2 사이의 절단 부위는 빨간색 화살표로 도시되어 있다. S1 내에서, NTD와 RBD 도메인 사이의 경계는 녹색 수직 막대로 표시되어 있다. CLUSTAL Omega29를 사용하여 다중 서열 정렬을 수행하였다. 서열은 SARS2-S(GenBank 수탁 번호 AFR58740.1), SARS-S(GenBank 수탁 번호 QHD43416.1), B.1.1.7-S(SARS2α-S)(GenBank 수탁 번호 QQH18545.1) 및 MERS-S(GenBank 수탁 번호 QBM11748.1)이다.
도 4a 내지 4d. 대표적인 바이러스 당단백질의 서열 보존. 도 4a. SARS-S 및 MERS-S 단백질과 전장 SARS2-S의 비교. 도 4b. 대표적인 인간 코로나바이러스 스파이크 단백질과 SARS2-S F1 폴리펩타이드(잔기 911-1273)의 비교. 도 4c. A/H1N1, B/Vic 및 B/YM HA 단백질과 전장 A/H3N2 HA의 비교. 도 4d. A/H1N1, B/Vic 및 B/YM HA와 A/H3N2 HAi 폴리펩타이드의 비교. 모든 패널에는, 동일한 잔기의 수(동일성), 비교된 총 잔기("/" 뒤) 및 해당 백분율(괄호 안)이 도시되어 있다. 총 잔기는 서열 정렬 내의 다양한 갭으로 인해 약간씩 다르다. 서열은 SARS2-S(GenBank 수탁 번호 AFR58740.1), SARS-S(GenBank 수탁 번호 QHD43416.1), SARS2α-S(GenBank 수탁 번호 QQH18545.1), MERS-S(GenBank 수탁 번호 QBM11748.1), HCoV-HKU1-S(Uniprot 수탁 번호 Q0ZME7), HCoV-OC43-S(Uniprot 수탁 번호 P36334), HCoV-NL63-S(Uniprot 수탁 번호 Q6Q1S2) 및 HCoV-229E-S(Uniprot 수탁 번호 P15423)이다. 패널 c) 및 d)에서, HA 서열은 2019년 내지 2020년에 A/하와이/70/2019(A/H1N1), A/홍콩/45/2019(A/H3N2), B/워싱턴/02/2019(B/Vic) 및 B/푸켓/3073/2013(B/YM)의 4가지 독감 백신 스트레인(strain)으로부터 유래된 것이다.
도 5a 내지 5c. F1- 또는 F2-암호화 플라스미드가 COVID-19 SARS2-S(도 5a); 2002 SARS-S(도 5b); 및 2012 MERS-S(도 5c)에 대한 코로나바이러스 스파이크 단백질-암호화 플라스미드와 함께 공동 형질감염되었을 때의 F1 및 F2 폴리펩타이드의 단백질 발현 수준. 항-CNPase 항체에 의해 검출된 내인성 막-앵커링된 단백질 CNPase를 내부 대조군으로서 사용하였다. 2회 이상의 독립적인 실험으로부터의 대표적인 결과.
도 6a 내지 6e. 미니서클 DNA로부터 발현된 F1 폴리펩타이드는 단백질 수준에서 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하였다. 스파이크 단백질 COVID-19 SARS2-S(도 6a), 2002 SARS-S(도 6b) 및 2012 MERS-S(도 6c)의 mRNA 수준을 F1 암호화 플라스미드의 부재 또는 존재 하에 측정하였다. 도 6d. CFP 및 YFP가 각각 SARS2-S 및 F1의 극단 C-말단에 태그되어 각각 SARS2-C 및 F1Y를 생성하는 FRET 설정에 대한 다이어그램. 도 6e. F1Y 단독의 것과 비교한, SARS2-C와 F1Y의 FRET 비(형질감염을 위한 1:1 몰비). ****, 소정의 날짜의 각 실험 세트에 대한 SARS2C+F1Y 대 당일 F1Y 단독의 FRET 비를 비교하는 독립표본 t-검정(unpaired t-test)에서 p<0.0001. 괄호 안의 숫자는 각 분석에 포함된 세포의 수를 나타낸다. 3회의 독립적인 실험으로부터의 결과가 도시되어 있다.
도 7a 내지 7c. COVID-19 SARS2-S(도 7a) 2002 SARS-S(도 7b); 및 2012 MERS-S(도 7c)에 대한 코로나바이러스 스파이크 단백질-암호화 플라스미드로 공동 형질감염된 경우의 F1 및 F2의 mRNA 수준. 억제성 폴리펩타이드-암호화 플라스미드의 부재 하의 상응하는 단백질의 mRNA 수준을 기준선으로서 처리하여 이에 대하여 다른 샘플의 mRNA 수준을 정규화하였다. 오차 막대는 2회 이상의 독립적인 실험으로부터의 표준 편차(SD)를 나타낸다.
도 8a 내지 8d. 미니서클 DNA로부터 발현된 F1 폴리펩타이드는 3가지 코로나바이러스 스파이크 당단백질의 발현 및 표면 전좌를 유의미하게 감소시켰다. 도 8a 본 연구에 사용된 F1 미니서클 생산에 대한 다이어그램. 도 8b 내지 8d. COVID-19 SARS2-S(도 8b); 2002 SARS-S(도 8c); 및 2012 MERS-S(도 8d)에 대한 결과. 전세포 용해물(좌측) 또는 세포-표면 분획(우측) 중의 비절단된 S 단백질 및 절단된 S2 단백질의 양을 S-암호화 플라스미드 단독으로, 또는 4.5배 또는 22.5배 몰비의 F1 미니서클과 함께 형질감염된 HEK293T 세포에 대해 비교한다. 항-CNPase 항체에 의해 검출된 내인성 막-앵커링된 단백질 CNPase를 내부 대조군으로서 사용하였다. 2회 이상의 독립적인 실험으로부터의 대표적인 결과.
도 9a 내지 9b. 미니서클 DNA로부터 발현된 F1 폴리펩타이드는 온전한 슈도바이러스 상의 SARS2-S의 양을 유의미하게 감소시켰고 슈도바이러스 감염성을 손상시켰다. 도 9a. 절단된 S2 단백질의 양은 SARS2-S 암호화 플라스미드 및 상이한 비의 빈(empty) 미니서클 대조군 MN501A(열 #1 내지 4)으로 또는 상이한 비의 F1 미니서클(열 #5 내지 8)과 함께 형질감염된 HEK293T 세포로부터 생산된 온전한 슈도바이러스에 대해 비교하였다. ). 항-p24 항체에 의해 검출된 p24를 내부 대조군으로서 사용하였다. 2회의 독립적인 실험으로부터의 대표적인 결과. 도 9b. 2배 몰비의 F1 미니서클의 존재 하에 생성된 슈도바이러스는 hACE2 발현 HEK293T 세포를 감염시키는 능력을 상실하였다. 2배 몰비의 MN501A 미니서클의 존재 하에 생성된 슈도바이러스의 감염성은 각 공동 형질감염 비에 대해 100%로서 간주되었다. 적어도 2회의 독립적인 실험으로부터의 대표적인 결과가 도시되어 있다. 오차 막대는 2회의 독립적인 실험의 표준 편차(SD)를 나타낸다.
도 10. 일반화된 폴리펩타이드-기반 단백질 억제의 다이어그램. 도 10a. 동종올리고머의 경우, 정상적인 상황에서는 단백질이 먼저 합성되고 단량체로서 폴딩된 다음, 다수의 단량체(파란색 및 녹색으로 도시되어 있지만, 동일한 단백질 종의 상이한 단량체의 경우 동일한 모양으로 도시됨)가 고유 단백질 복합체로 조립된다. 폴리펩타이드-기반 단백질 간섭 상황에서, 고유 단백질 복합체 또는 이의 동족체 내의 표적 단백질(파란색으로 도시)의 하나 이상의 분절로부터 유래되거나 이를 함유하는 간섭 폴리펩타이드(파란색으로 도시)는 표적 단백질과 경쟁하여 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너(서열 및 구조가 표적 단백질과 동일, 녹색으로 도시됨)와 상호작용하고 고유 단백질 복합체 형성을 차단하여 비-고유 단백질 복합체를 생성함으로써, 조립된 고유 단백질 복합체의 수준을 조절한다. 도 10b. 이종올리고머의 경우, 정상적인 상황에서는 단백질이 먼저 합성되고 폴딩된 다음, 다수의 단백질 종(파란색과 주황색으로 도시되고 상이한 단백질 종마다 상이한 모양으로 도시됨)은 고유 단백질 복합체로 조립된다. 폴리펩타이드-기반 단백질 간섭 상황에서, 고유 단백질 복합체 또는 이의 동족체 내의 표적 단백질(파란색으로 도시됨)의 하나 이상의 분절로부터 유래되거나 이를 함유하는 간섭 폴리펩타이드(파란색으로 도시됨)는 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너(주황색으로 도시됨)와 상호작용하고 고유 단백질 복합체 형성을 차단하여 비-고유 단백질 복합체를 생성함으로써 조립된 고유 단백질 복합체의 수준을 조절한다. 도 10c. 표적 단백질(파란색과 녹색으로 도시됨) 및 다른 단백질 종(주황색으로 도시됨)의 다수 카피를 포함하는 이종올리고머 고유 단백질 복합체의 일부 유형의 경우, 정상적인 상황에서는 단백질이 먼저 합성되고 폴딩된 다음, 고유 단백질 복합체로 조립된다. 폴리펩타이드-기반 단백질 간섭 상황에서, 고유 단백질 복합체 또는 이의 동족체 내의 표적 단백질(파란색으로 도시됨)의 하나 이상의 분절로부터 유래되거나 이를 함유하는 간섭 폴리펩타이드(파란색으로 도시됨)는 표적 단백질과 경쟁하여 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너(녹색 및 주황색으로 도시됨)과 상호작용하고 고유 단백질 복합체 형성을 차단하여 고유 단백질 복합체를 생성함으로써 조립된 고유 단백질 복합체의 수준을 조절한다. 폴리펩타이드-기반 단백질 간섭은 표적 경로의 하향조절 또는 상향조절로 이어질 수 있다.
도 11. 억제성 폴리펩타이드 gp160i는 HIV-1 gp160 당단백질의 발현을 유의미하게 감소시켰다. 전세포 용해물 중의 비절단된 gp160 단백질 및 절단된 gp41 단백질의 양은 gp160-암호화 플라스미드 단독으로 또는 gp160i를 암호화하는 5배의 플라스미드와 함께 형질감염된 HEK293T 세포에 대해 비교하였다. 비절단된 gp160 및 절단된 gp41은 C9-로돕신 항체 1D4에 의해 검출되었으며, 내인성 막 단백질 CNPase는 항-CNPase 항체에 의해 검출되었고 내부 대조군으로서 역할을 하였다. 2회 이상의 독립적인 실험으로부터의 대표적인 결과.
도 12. 억제성 폴리펩타이드 GPi는 에볼라 GP 당단백질의 발현 및 전좌를 유의미하게 감소시켰다. 전세포 용해물(좌측)과 세포 표면(우측) 중의 비절단된 GP 단백질 및 절단된 GP2 단백질의 양은 GP-함유 플라스미드 단독으로, 또는 5배 또는 15배 몰비의 GPi를 암호화하는 플라스미드와 함께 형질감염된 HEK293T 세포에 대해 비교하였다. 비절단된 GP 및 절단된 GP2는 C9-로돕신 항체 1D4에 의해 검출되었고, 내인성 막 단백질 CNPase는 항-CNPase 항체에 의해 검출되었고 내부 대조군으로서 역할을 하였다. 2회 이상의 독립적인 실험으로부터의 대표적인 결과.
도 13. 억제성 폴리펩타이드 HAi는 인플루엔자 바이러스 A형 및 B형 당단백질 헤마글루티닌(HA)의 발현 및 전좌를 유의미하게 감소시켰다. 전세포 용해물(좌측) 및 세포 표면(우측) 중의 비절단된 HA 단백질의 양을 HA-암호화 플라스미드 단독으로 또는 HAi를 암호화하는 5배 플라스미드와 함께 형질감염된 HEK293T 세포에 대해 비교하였다. 비절단된 HA는 C9-로돕신 항체 1D4에 의해 검출되었고, 내인성 막 단백질 CNPase는 항-CNPase 항체에 의해 검출되었고 내부 대조군으로서 역할을 하였다. A/H1 HA에 대한 결과가 예로서 도시된다. 2회 이상의 독립적인 실험으로부터의 대표적인 결과.
도 14. 억제성 폴리펩타이드 Fi는 RSV A형 당단백질 F의 발현 및 전좌를 유의미하게 감소시켰다. 세포 용해물(좌측) 및 세포 표면(우측) 중의 비절단된 RSV F 단백질의 양을 RSV F-암호화 플라스미드 단독으로, 또는 Fi를 암호화하는 5배 또는 15배 몰비 플라스미드와 함께 형질감염된 HEK293T 세포에 대해 비교하였다. 비절단된 RSV F는 C9-로돕신 항체 1D4에 의해 검출되었고, 내인성 막 단백질 CNPase는 항-CNPase 항체에 의해 검출되어 내부 대조군으로서 역할을 하였다. 2회 이상의 독립적인 실험으로부터의 대표적인 결과.
도 15a 내지 15d. 미니서클 DNA로부터 발현된 F1 폴리펩타이드는 hACE2-마우스에서 진정한 SARS-CoV-2 바이러스의 복제를 효과적으로 차단하였다. 도 15a. hACE2-마우스에서 F1 폴리펩타이드의 생체내 보호 테스트의 실험 설정. 도 15b. 두 마우스 군의 체중 변화. 도 15c. 두 실험군의 마우스 폐 내의 SARS-CoV-2 바이러스 존재량을 도시하는 박스 플롯. 각 점은 1마리 마우스를 나타내고 "x"는 평균을 나타낸다. p-값은 두 군(n=6)의 바이러스 존재량을 비교하는 독립표본 양측 t-검정에 대해 보고된다. 도 15d. 두 실험군을 비교하는 접종 후 3일차의 마우스 폐 조직 절편의 H&E 염색.
도 16a 내지 16e. 본원에서 사용된 CoV-F1(F1)(도 16a), CoV-F2(F2)(도 16b), HIV gp160i(도 16c), 에볼라 GPi(도 16d), RSV Fi(도 16e) 및 인플루엔자 HAi(도 16f)의 아미노산 서열. 아미노산에 대한 단일-문자 코드가 사용된다. 서열은 SARS2-S(GenBank 수탁 번호 AFR58740.1), HIV-1 gp160(GenBank 수탁 번호 NP_057856.1); 자이르 EBOV GP(GenBank 수탁 번호 AAN37507.1); RSV A형 F(GenBank 수탁 번호 QKN22797.1); 및 인플루엔자 바이러스 A/홍콩/45/2019(H3N2) HA로부터 유래된다. 신호 펩타이드 서열은 N-말단에 볼드체로 강조 표시되어 있다. 각 폴리펩타이드의 극단 C-말단에 있는 FLAG 태그는 FLAG-태그 및 FLAG-태그 앞의 트윈-스트렙(twin-strep) 태그(도시되지 않음)를 포함한다. RSV Fi 내의 밑줄 표시된 잔기는 도입된 링커를 나타낸다.
도 1a 내지 1c. 폴리펩타이드-기반 단백질 억제의 개념. 도 1a. COVID-19 SARS2-S의 도메인 구성, SARS2-S 변이체 내의 돌연변이, 및 억제성 폴리펩타이드 CoV-F1(F1) 및 CoV-F2(F2)의 설계. SP: 신호 펩타이드; NTD: N-말단 도메인; RBD: 수용체-결합 도메인; SD1: 서브도메인 1; SD2: 서브도메인 2; FP: 융합 펩타이드; HR1: 헵타드 반복체 1; HR2: 헵타드 반복체 2; TM: 막횡단 도메인; CT: 세포질 테일. S1/S2(빨간색 화살표)에서의 절단은 N-말단 S1 단편 및 C-말단 S2 단편을 생성한다. F1 및 F2의 극단 N-말단에서의 신호 펩타이드 서열은 폴리펩타이드가 COVID-19 SARS2-S와 동일한 방식으로 전좌되도록 하였다. 극단 C-말단에서, SARS2-S는 C9-로돕신 항체 1D4에 의해 인식되는 C9 에피토프를 갖는 반면, F1 폴리펩타이드 및 F2 폴리펩타이드 둘 다는 FLAG-태그를 갖는다. F1은 SP, HR1, HR2, TM 및 CT(잔기 911 내지 1273; 서열번호 2)를 포함하는 반면, F2는 SP, HR2, TM 및 CT(잔기 985 내지 1273; 서열번호 27)를 함유한다. 도 1b. 코로나바이러스 스파이크 단백질을 표적화하는 폴리펩타이드-기반 억제를 위한 제안된 작용 방식. 상단 줄: 정상적인 상황에서, 스파이크 단백질은 합성되고 단량체로서 폴딩되고, 비리온에 앵커링된(anchored) 고유 스파이크 올리고머로 조립된다. 하단 줄: 억제성 폴리펩타이드는 조립 단계를 간섭하여 야생형 스파이크 단백질과의 비-고유 올리고머를 생성한다. 최종 결과는 새로운 비리온 상의 고유 스파이크 올리고머의 감소된 수이다.
도 2a 내지 2c. 플라스미드 DNA로부터 발현된 F1 폴리펩타이드는 3가지 코로나바이러스 스파이크 당단백질의 발현 및 표면 전좌를 유의미하게 감소시켰다. 도 2a. COVID-19 SARS2-S. 전세포 용해물(좌측) 또는 세포-표면 분획(우측) 중의 SARS2-S 단백질의 양을, SARS2-S-암호화 플라스미드 단독(열 #1)으로 또는 2배(열 #2) 또는 10배 몰비(열 #3)의 F1-암호화 플라스미드 또는 2배(열 #4) 또는 10배 몰비(열 #5)의 F2-암호화 플라스미드와 함께 형질감염된 HEK293T 세포에 대해 비교하였다. 도 2b. 2002 SARS-S. 전세포 용해물(좌측) 또는 세포-표면 분획(우측) 중의 SARS-S 단백질의 양을 SARS-S 암호화 플라스미드 단독(열 #1)으로, 또는 2배(열 #2) 또는 10배 몰비(열 #3)의 F1-암호화 플라스미드와 함께 형질감염된 HEK293T 세포에 대해 비교하였다. 도 2c. 2012 MERS-S. 전세포 용해물(좌측) 또는 세포-표면 분획(우측) 중의 MERS-S 단백질의 양을 MERS-S-암호화 플라스미드 단독(열 #1) 또는 2배(열 #2) 또는 10배 몰비(열 #3)의 F1-암호화 플라스미드와 함께 형질감염된 HEK293T 세포에 대해 비교하였다. 모든 패널의 경우, 비절단된 S 및 절단된 S2 단백질은 C9-로돕신 항체 1D4에 의해 검출되었다. 내인성 막 단백질 CNPase는 항-CNPase 항체에 의해 검출되었으며 내부 대조군으로서 역할을 하였다. 적어도 2회의 독립적인 실험의 대표적인 결과가 도시되었다.
도 3a 내지 3b. 코로나바이러스 스파이크 단백질의 서열 정렬. 도 3a. SARS2-S(SARS2), SARS-S(SARS) 및 SARS-CoV-2 B.1.1.7-S(SARS2α) 스파이크 단백질의 정렬. F1 폴리펩타이드에 포함된 잔기의 범위는 파란색 박스로 강조 표시되어 있다. 도 3b. SARS2-S(SARS2) 및 MERS-S(MERS) 단백질의 정렬. F1 폴리펩타이드에 포함된 잔기의 범위는 파란색 박스로 강조 표시되어 있다. S1과 S2 사이의 절단 부위는 빨간색 화살표로 도시되어 있다. S1 내에서, NTD와 RBD 도메인 사이의 경계는 녹색 수직 막대로 표시되어 있다. CLUSTAL Omega29를 사용하여 다중 서열 정렬을 수행하였다. 서열은 SARS2-S(GenBank 수탁 번호 AFR58740.1), SARS-S(GenBank 수탁 번호 QHD43416.1), B.1.1.7-S(SARS2α-S)(GenBank 수탁 번호 QQH18545.1) 및 MERS-S(GenBank 수탁 번호 QBM11748.1)이다.
도 4a 내지 4d. 대표적인 바이러스 당단백질의 서열 보존. 도 4a. SARS-S 및 MERS-S 단백질과 전장 SARS2-S의 비교. 도 4b. 대표적인 인간 코로나바이러스 스파이크 단백질과 SARS2-S F1 폴리펩타이드(잔기 911-1273)의 비교. 도 4c. A/H1N1, B/Vic 및 B/YM HA 단백질과 전장 A/H3N2 HA의 비교. 도 4d. A/H1N1, B/Vic 및 B/YM HA와 A/H3N2 HAi 폴리펩타이드의 비교. 모든 패널에는, 동일한 잔기의 수(동일성), 비교된 총 잔기("/" 뒤) 및 해당 백분율(괄호 안)이 도시되어 있다. 총 잔기는 서열 정렬 내의 다양한 갭으로 인해 약간씩 다르다. 서열은 SARS2-S(GenBank 수탁 번호 AFR58740.1), SARS-S(GenBank 수탁 번호 QHD43416.1), SARS2α-S(GenBank 수탁 번호 QQH18545.1), MERS-S(GenBank 수탁 번호 QBM11748.1), HCoV-HKU1-S(Uniprot 수탁 번호 Q0ZME7), HCoV-OC43-S(Uniprot 수탁 번호 P36334), HCoV-NL63-S(Uniprot 수탁 번호 Q6Q1S2) 및 HCoV-229E-S(Uniprot 수탁 번호 P15423)이다. 패널 c) 및 d)에서, HA 서열은 2019년 내지 2020년에 A/하와이/70/2019(A/H1N1), A/홍콩/45/2019(A/H3N2), B/워싱턴/02/2019(B/Vic) 및 B/푸켓/3073/2013(B/YM)의 4가지 독감 백신 스트레인(strain)으로부터 유래된 것이다.
도 5a 내지 5c. F1- 또는 F2-암호화 플라스미드가 COVID-19 SARS2-S(도 5a); 2002 SARS-S(도 5b); 및 2012 MERS-S(도 5c)에 대한 코로나바이러스 스파이크 단백질-암호화 플라스미드와 함께 공동 형질감염되었을 때의 F1 및 F2 폴리펩타이드의 단백질 발현 수준. 항-CNPase 항체에 의해 검출된 내인성 막-앵커링된 단백질 CNPase를 내부 대조군으로서 사용하였다. 2회 이상의 독립적인 실험으로부터의 대표적인 결과.
도 6a 내지 6e. 미니서클 DNA로부터 발현된 F1 폴리펩타이드는 단백질 수준에서 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하였다. 스파이크 단백질 COVID-19 SARS2-S(도 6a), 2002 SARS-S(도 6b) 및 2012 MERS-S(도 6c)의 mRNA 수준을 F1 암호화 플라스미드의 부재 또는 존재 하에 측정하였다. 도 6d. CFP 및 YFP가 각각 SARS2-S 및 F1의 극단 C-말단에 태그되어 각각 SARS2-C 및 F1Y를 생성하는 FRET 설정에 대한 다이어그램. 도 6e. F1Y 단독의 것과 비교한, SARS2-C와 F1Y의 FRET 비(형질감염을 위한 1:1 몰비). ****, 소정의 날짜의 각 실험 세트에 대한 SARS2C+F1Y 대 당일 F1Y 단독의 FRET 비를 비교하는 독립표본 t-검정(unpaired t-test)에서 p<0.0001. 괄호 안의 숫자는 각 분석에 포함된 세포의 수를 나타낸다. 3회의 독립적인 실험으로부터의 결과가 도시되어 있다.
도 7a 내지 7c. COVID-19 SARS2-S(도 7a) 2002 SARS-S(도 7b); 및 2012 MERS-S(도 7c)에 대한 코로나바이러스 스파이크 단백질-암호화 플라스미드로 공동 형질감염된 경우의 F1 및 F2의 mRNA 수준. 억제성 폴리펩타이드-암호화 플라스미드의 부재 하의 상응하는 단백질의 mRNA 수준을 기준선으로서 처리하여 이에 대하여 다른 샘플의 mRNA 수준을 정규화하였다. 오차 막대는 2회 이상의 독립적인 실험으로부터의 표준 편차(SD)를 나타낸다.
도 8a 내지 8d. 미니서클 DNA로부터 발현된 F1 폴리펩타이드는 3가지 코로나바이러스 스파이크 당단백질의 발현 및 표면 전좌를 유의미하게 감소시켰다. 도 8a 본 연구에 사용된 F1 미니서클 생산에 대한 다이어그램. 도 8b 내지 8d. COVID-19 SARS2-S(도 8b); 2002 SARS-S(도 8c); 및 2012 MERS-S(도 8d)에 대한 결과. 전세포 용해물(좌측) 또는 세포-표면 분획(우측) 중의 비절단된 S 단백질 및 절단된 S2 단백질의 양을 S-암호화 플라스미드 단독으로, 또는 4.5배 또는 22.5배 몰비의 F1 미니서클과 함께 형질감염된 HEK293T 세포에 대해 비교한다. 항-CNPase 항체에 의해 검출된 내인성 막-앵커링된 단백질 CNPase를 내부 대조군으로서 사용하였다. 2회 이상의 독립적인 실험으로부터의 대표적인 결과.
도 9a 내지 9b. 미니서클 DNA로부터 발현된 F1 폴리펩타이드는 온전한 슈도바이러스 상의 SARS2-S의 양을 유의미하게 감소시켰고 슈도바이러스 감염성을 손상시켰다. 도 9a. 절단된 S2 단백질의 양은 SARS2-S 암호화 플라스미드 및 상이한 비의 빈(empty) 미니서클 대조군 MN501A(열 #1 내지 4)으로 또는 상이한 비의 F1 미니서클(열 #5 내지 8)과 함께 형질감염된 HEK293T 세포로부터 생산된 온전한 슈도바이러스에 대해 비교하였다. ). 항-p24 항체에 의해 검출된 p24를 내부 대조군으로서 사용하였다. 2회의 독립적인 실험으로부터의 대표적인 결과. 도 9b. 2배 몰비의 F1 미니서클의 존재 하에 생성된 슈도바이러스는 hACE2 발현 HEK293T 세포를 감염시키는 능력을 상실하였다. 2배 몰비의 MN501A 미니서클의 존재 하에 생성된 슈도바이러스의 감염성은 각 공동 형질감염 비에 대해 100%로서 간주되었다. 적어도 2회의 독립적인 실험으로부터의 대표적인 결과가 도시되어 있다. 오차 막대는 2회의 독립적인 실험의 표준 편차(SD)를 나타낸다.
도 10. 일반화된 폴리펩타이드-기반 단백질 억제의 다이어그램. 도 10a. 동종올리고머의 경우, 정상적인 상황에서는 단백질이 먼저 합성되고 단량체로서 폴딩된 다음, 다수의 단량체(파란색 및 녹색으로 도시되어 있지만, 동일한 단백질 종의 상이한 단량체의 경우 동일한 모양으로 도시됨)가 고유 단백질 복합체로 조립된다. 폴리펩타이드-기반 단백질 간섭 상황에서, 고유 단백질 복합체 또는 이의 동족체 내의 표적 단백질(파란색으로 도시)의 하나 이상의 분절로부터 유래되거나 이를 함유하는 간섭 폴리펩타이드(파란색으로 도시)는 표적 단백질과 경쟁하여 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너(서열 및 구조가 표적 단백질과 동일, 녹색으로 도시됨)와 상호작용하고 고유 단백질 복합체 형성을 차단하여 비-고유 단백질 복합체를 생성함으로써, 조립된 고유 단백질 복합체의 수준을 조절한다. 도 10b. 이종올리고머의 경우, 정상적인 상황에서는 단백질이 먼저 합성되고 폴딩된 다음, 다수의 단백질 종(파란색과 주황색으로 도시되고 상이한 단백질 종마다 상이한 모양으로 도시됨)은 고유 단백질 복합체로 조립된다. 폴리펩타이드-기반 단백질 간섭 상황에서, 고유 단백질 복합체 또는 이의 동족체 내의 표적 단백질(파란색으로 도시됨)의 하나 이상의 분절로부터 유래되거나 이를 함유하는 간섭 폴리펩타이드(파란색으로 도시됨)는 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너(주황색으로 도시됨)와 상호작용하고 고유 단백질 복합체 형성을 차단하여 비-고유 단백질 복합체를 생성함으로써 조립된 고유 단백질 복합체의 수준을 조절한다. 도 10c. 표적 단백질(파란색과 녹색으로 도시됨) 및 다른 단백질 종(주황색으로 도시됨)의 다수 카피를 포함하는 이종올리고머 고유 단백질 복합체의 일부 유형의 경우, 정상적인 상황에서는 단백질이 먼저 합성되고 폴딩된 다음, 고유 단백질 복합체로 조립된다. 폴리펩타이드-기반 단백질 간섭 상황에서, 고유 단백질 복합체 또는 이의 동족체 내의 표적 단백질(파란색으로 도시됨)의 하나 이상의 분절로부터 유래되거나 이를 함유하는 간섭 폴리펩타이드(파란색으로 도시됨)는 표적 단백질과 경쟁하여 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너(녹색 및 주황색으로 도시됨)과 상호작용하고 고유 단백질 복합체 형성을 차단하여 고유 단백질 복합체를 생성함으로써 조립된 고유 단백질 복합체의 수준을 조절한다. 폴리펩타이드-기반 단백질 간섭은 표적 경로의 하향조절 또는 상향조절로 이어질 수 있다.
도 11. 억제성 폴리펩타이드 gp160i는 HIV-1 gp160 당단백질의 발현을 유의미하게 감소시켰다. 전세포 용해물 중의 비절단된 gp160 단백질 및 절단된 gp41 단백질의 양은 gp160-암호화 플라스미드 단독으로 또는 gp160i를 암호화하는 5배의 플라스미드와 함께 형질감염된 HEK293T 세포에 대해 비교하였다. 비절단된 gp160 및 절단된 gp41은 C9-로돕신 항체 1D4에 의해 검출되었으며, 내인성 막 단백질 CNPase는 항-CNPase 항체에 의해 검출되었고 내부 대조군으로서 역할을 하였다. 2회 이상의 독립적인 실험으로부터의 대표적인 결과.
도 12. 억제성 폴리펩타이드 GPi는 에볼라 GP 당단백질의 발현 및 전좌를 유의미하게 감소시켰다. 전세포 용해물(좌측)과 세포 표면(우측) 중의 비절단된 GP 단백질 및 절단된 GP2 단백질의 양은 GP-함유 플라스미드 단독으로, 또는 5배 또는 15배 몰비의 GPi를 암호화하는 플라스미드와 함께 형질감염된 HEK293T 세포에 대해 비교하였다. 비절단된 GP 및 절단된 GP2는 C9-로돕신 항체 1D4에 의해 검출되었고, 내인성 막 단백질 CNPase는 항-CNPase 항체에 의해 검출되었고 내부 대조군으로서 역할을 하였다. 2회 이상의 독립적인 실험으로부터의 대표적인 결과.
도 13. 억제성 폴리펩타이드 HAi는 인플루엔자 바이러스 A형 및 B형 당단백질 헤마글루티닌(HA)의 발현 및 전좌를 유의미하게 감소시켰다. 전세포 용해물(좌측) 및 세포 표면(우측) 중의 비절단된 HA 단백질의 양을 HA-암호화 플라스미드 단독으로 또는 HAi를 암호화하는 5배 플라스미드와 함께 형질감염된 HEK293T 세포에 대해 비교하였다. 비절단된 HA는 C9-로돕신 항체 1D4에 의해 검출되었고, 내인성 막 단백질 CNPase는 항-CNPase 항체에 의해 검출되었고 내부 대조군으로서 역할을 하였다. A/H1 HA에 대한 결과가 예로서 도시된다. 2회 이상의 독립적인 실험으로부터의 대표적인 결과.
도 14. 억제성 폴리펩타이드 Fi는 RSV A형 당단백질 F의 발현 및 전좌를 유의미하게 감소시켰다. 세포 용해물(좌측) 및 세포 표면(우측) 중의 비절단된 RSV F 단백질의 양을 RSV F-암호화 플라스미드 단독으로, 또는 Fi를 암호화하는 5배 또는 15배 몰비 플라스미드와 함께 형질감염된 HEK293T 세포에 대해 비교하였다. 비절단된 RSV F는 C9-로돕신 항체 1D4에 의해 검출되었고, 내인성 막 단백질 CNPase는 항-CNPase 항체에 의해 검출되어 내부 대조군으로서 역할을 하였다. 2회 이상의 독립적인 실험으로부터의 대표적인 결과.
도 15a 내지 15d. 미니서클 DNA로부터 발현된 F1 폴리펩타이드는 hACE2-마우스에서 진정한 SARS-CoV-2 바이러스의 복제를 효과적으로 차단하였다. 도 15a. hACE2-마우스에서 F1 폴리펩타이드의 생체내 보호 테스트의 실험 설정. 도 15b. 두 마우스 군의 체중 변화. 도 15c. 두 실험군의 마우스 폐 내의 SARS-CoV-2 바이러스 존재량을 도시하는 박스 플롯. 각 점은 1마리 마우스를 나타내고 "x"는 평균을 나타낸다. p-값은 두 군(n=6)의 바이러스 존재량을 비교하는 독립표본 양측 t-검정에 대해 보고된다. 도 15d. 두 실험군을 비교하는 접종 후 3일차의 마우스 폐 조직 절편의 H&E 염색.
도 16a 내지 16e. 본원에서 사용된 CoV-F1(F1)(도 16a), CoV-F2(F2)(도 16b), HIV gp160i(도 16c), 에볼라 GPi(도 16d), RSV Fi(도 16e) 및 인플루엔자 HAi(도 16f)의 아미노산 서열. 아미노산에 대한 단일-문자 코드가 사용된다. 서열은 SARS2-S(GenBank 수탁 번호 AFR58740.1), HIV-1 gp160(GenBank 수탁 번호 NP_057856.1); 자이르 EBOV GP(GenBank 수탁 번호 AAN37507.1); RSV A형 F(GenBank 수탁 번호 QKN22797.1); 및 인플루엔자 바이러스 A/홍콩/45/2019(H3N2) HA로부터 유래된다. 신호 펩타이드 서열은 N-말단에 볼드체로 강조 표시되어 있다. 각 폴리펩타이드의 극단 C-말단에 있는 FLAG 태그는 FLAG-태그 및 FLAG-태그 앞의 트윈-스트렙(twin-strep) 태그(도시되지 않음)를 포함한다. RSV Fi 내의 밑줄 표시된 잔기는 도입된 링커를 나타낸다.
본 개시내용은 폴리펩타이드-기반 억제를 위한 및 바이러스 감염(예를 들어, 코로나바이러스 감염, HIV 감염, 에볼라 감염, RSV 감염, 또는 인플루엔자 감염) 및/또는 바이러스 감염 후 증후군을 포함하지만 이에 제한되지 않는 질환의 치료 및 예방에서의 폴리펩타이드-기반 억제의 사용을 위한 조성물 및 방법을 제공함으로써 의학 및 바이러스학 분야의 특정 요구를 충족하고, 적어도 부분적으로, 폴리펩타이드-기반 억제가 바이러스 스파이크 단백질의 세포 표면 전좌를 감소시키고 바이러스 자손이 숙주 세포를 감염시키는 능력을 손상시키는 강력하고 혁신적인 전략이라는 놀라운 발견에 기반한다. 신규한 조성물 및 방법은 단백질에 대한 조절 폴리펩타이드 설계를 포함하며, 비가역적인 유전자 변형이 없는 시험관내 및 생체내에서의 단백질 수준의 번역 후 조절을 위한 혁신적이고 효율적인 해결책으로서 널리 적용 가능하다.
본원에서 기술된 바와 같이, COVID-19 SARS-CoV-2 및 인플루엔자 A/H3N2 바이러스 당단백질 서열에 기반하여 설계된 억제성 폴리펩타이드는 서열 동일성이 27% 정도로 낮음에도 불구하고 각각 다른 코로나바이러스 및 인플루엔자 스트레인의 당단백질에 대해 동등하게 효과적인 것으로 예상치 못하게 밝혀졌으며, 이는 상이한 계통(lineage)의 바이러스로부터의 당단백질에 대한 억제성 폴리펩타이드의 돌연변이 및 잠재적 활성에 대한 높은 둔감성을 강조한다. 실제로, 놀랍게도, 진정한 SARS-CoV-2 바이러스에 감염된 hACE2-마우스에서, 단 1회 용량의 억제성 폴리펩타이드-암호화 DNA가 마우스 폐에서 바이러스 복제를 효과적으로 방지한다는 것이 밝혀졌다. 더욱이, 적어도 부분적으로는 감소된 서열 크기로 인해, 억제성 폴리펩타이드를 암호화하는 미니서클은 에어로졸 생성 시 전단력에서 생존하여 편리하고 효과적인 비강 스프레이 전달을 허용할 수 있다. 따라서, 일부 실시형태에서, 본원에 개시된 조성물 및 관련 방법은 매우 효과적인 광범위한 항바이러스 치료제에 대한 기초를 제공할 수 있다. 더욱이, 이러한 접근법은 번역 후 본질적으로 임의의 단백질의 발현을 변경하는 일반적인 방법을 나타냄으로써 감염성 또는 비감염성 질환을 치료하기 위한 간단하고 고정밀한 접근법을 제공한다.
코로나바이러스를 포함한 RNA 바이러스의 경우, 바이러스의 높은 돌연변이율은 인간 집단들 간에 반복 감염을 위한 강력한 무기이다. 최근 SARS2-S 변종3, 4, 7, 8, 9으로 예시된 바와 같이, S1 영역에 축적된 돌연변이는 천연 감염 또는 백신에 의해 유발된 중화 항체로부터 회피할 수 있게 한다(도 1a). 이들 스파이크 단백질의 S2 영역은 일반적으로 진화에서 보다 불변적이다. 따라서, 바이러스 단백질의 고도로 보존된 서열을 이용하는 폴리펩타이드-기반 억제는 바이러스 병원체를 퇴치하기 위한, 높은 효능과 표적 특이성, 광범위한 적용범위(wide-spectrum coverage), 및 다른 바이러스 막 융합 당단백질을 포함하지만 이에 제한되지 않는 다른 바이러스 단백질에 대한 적응성을 갖춘 신규 치료제를 위해 사용될 수 있다.
더욱이, 본원에 기술된 폴리펩타이드-기반 억제는 고유 단백질 복합체의 번역 후 조절을 위한 일반적인 방법으로서, 상기 복합체 내의 상호작용이 표적 단백질 또는 이의 동족체(도 10), 예를 들어 HIV, 에볼라, RSV 및 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 복합체의 하나 이상의 분절로부터 유래되거나 이를 함유하는 폴리펩타이드로 조절될 수 있는 방법을 제공한다. 더 작은 유기 화합물과 비교해 상기 폴리펩타이드의 상호작용 표면이 상대적으로 더 크기 때문에, 이러한 폴리펩타이드-기반 억제는 치료제에 대한 높은 효능과 특이성을 제공하며 구조적 정보 없이도 폴리펩타이드를 쉽게 설계하거나 선택할 수 있다. 또한, 숙주 단백질의 하나 이상의 분절로부터 유래된 폴리펩타이드는 본질적으로 면역원성 불활성이다.
본 개시내용의 양상은 바이러스 단백질, 예컨대 코로나바이러스 스파이크 단백질, HIV 스파이크 단백질, 에볼라 바이러스 당단백질, RSV 당단백질 및 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질을 포함하지만 이에 제한되지 않는 바이러스 스파이크 단백질과 같은 단백질과 상호작용하고 일부 경우에 이를 간섭하는, 도 16 내지 16e에 의해 특징지어지는 것들과 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드(본원에서 "간섭 폴리펩타이드" 또는 "단백질-간섭 폴리펩타이드"로 지칭됨)를 포함하는 조성물 및 폴리펩타이드의 투여 방법에 기반하고; 그러나, 기타 바이러스 단백질 및 비-바이러스 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드도 고려되며 본 개시내용의 범위 내에 속한다. 본 개시내용의 특정 폴리펩타이드는 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 바이러스 스파이크 단백질의 전좌 및 형성을 억제한다. 본 개시내용의 특정 폴리펩타이드는 바이러스 스파이크 단백질의 보존된 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 바이러스 스파이크 단백질의 전좌 및 형성을 억제한다. 본 개시내용의 특정 폴리펩타이드는 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피 상의 바이러스 스파이크 단백질의 양을 감소시킨다. 본 개시내용의 특정 폴리펩타이드는 바이러스 스파이크 단백질의 보존된 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피 상의 바이러스 스파이크 단백질의 양을 감소시킨다. 일부 경우에, 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 바이러스 스파이크 단백질의 전좌 및 형성의 억제 및/또는 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피 상의 바이러스 스파이크 단백질 양의 감소는 바이러스 감염 및/또는 바이러스 감염 후 증후군을 치료 또는 예방한다. 따라서, 이러한 폴리펩타이드는 예를 들어 코로나바이러스 감염(예를 들어, MERS-CoV, SARS-CoV 및 SARS-CoV-2 감염) 및/또는 코로나바이러스 감염 후 증후군, 또는 폴리펩타이드-기반 단백질 억제가 유익할 수 있는 바이러스 감염과 무관한 기타 질환의 치료 또는 예방 방법에서 유용하다.
I. 단백질-상호작용 폴리펩타이드 조성물
본 개시내용의 양상은 생체내에서 바이러스 스파이크 단백질과 같은 바이러스 단백질을 포함하지만 이에 제한되지 않는 표적 단백질 및/또는 이의 고유 상호작용 파트너와 상호작용하고, 일부 경우에 이를 억제하거나 간섭하는 폴리펩타이드, 이러한 폴리펩타이드를 포함하는 조성물, 및 바이러스(예를 들어, 코로나바이러스, HIV, 에볼라, RSV, 인플루엔자) 감염을 포함하지만 이에 제한되지 않는 대상체의 질환 또는 상태의 치료 및 예방을 위해 이러한 폴리펩타이드를 사용하는 방법에 관한 것이다.
본원에 개시된 바와 같이, "와 상호작용하다"는 표적 단백질 및/또는 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너의 상응하는 올리고머화 도메인과 단백질-상호작용 폴리펩타이드의 올리고머화를 포함하지만 이에 제한되지 않는, 상호작용 표면에서의 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 표적 단백질 및/또는 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너 간의 임의의 접촉을 기술한다. 예를 들어, 일부 경우에, "와 상호작용하다"는 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 표적 단백질, 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너, 및/또는 단백질-상호작용 폴리펩타이드, 표적 단백질과 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너 간의 임의의 접촉을 설명할 수 있다. 일부 경우에, "와 상호작용하다"는 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 표적 단백질, 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너, 및/또는 단백질-상호작용 폴리펩타이드, 표적 단백질과 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너의 올리고머화를 설명할 수 있다. 특정 실시형태에서, "와 상호작용하다"는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 바이러스 단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 올리고머화를 포함하지만 이에 제한되지 않는, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 바이러스 단백질 간의 임의의 접촉을 설명할 수 있다.
일부 경우에, 상호작용 표면에서의 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 표적 단백질 및/또는 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너 간의 이러한 상호작용은 억제 또는 간섭일 수 있다. 본원에 개시된 바와 같이, "억제하다", "억제성", "억제", "간섭", "를 간섭하다" 및 관련 용어 및 문구는 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너와의 상호작용에 대한 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 표적 단백질의 경쟁을 포함하지만 이에 제한되지 않는, 고유 단백질 복합체 형성을 방지하는 단백질-상호작용 폴리펩타이드, 표적 단백질, 및/또는 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너 간의 접촉을 기술한다. 일부 경우에, "억제하다", "억제성", "억제", "간섭", "를 간섭하다" 및 관련 용어 및 문구는 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너의 상응하는 올리고머화 도메인과의 상호작용에 대한 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 표적 단백질의 경쟁을 포함하지만 이에 제한되지 않는, 고유 올리고머 단백질 복합체 형성을 방지하는 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 표적 단백질 및/또는 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너의 상응하는 올리고머화 도메인의 올리고머화를 설명할 수 있다. 특정 실시형태에서, "억제하다", "억제성", "억제", "를 간섭하다"는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드가 바이러스 단백질의 상응하는 올리고머화 도메인과 경쟁하도록 하는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 바이러스 단백질 간의 접촉을 설명할 수 있다.
본원에 개시된 바와 같이, "단백질-상호작용 폴리펩타이드"는 표적 단백질 및/또는 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너와 상호작용할 수 있고 일부 경우에 이를 억제하거나 간섭할 수 있는 임의의 폴리펩타이드를 기술한다. 예를 들어, 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 바이러스 스파이크 당단백질과 같은 바이러스 단백질 및/또는 다른 바이러스 단백질과 상호작용하거나, 이를 억제하거나 간섭하는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드일 수 있다.
본원에 개시된 바와 같이, "표적 단백질"은 본원에 개시된 단백질-상호작용 폴리펩타이드의 아미노산 서열이 유래되고 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 적어도 10% 아미노산 서열 동일성을 갖는 단백질을 지칭한다.
일부 경우에, "표적 단백질"은 동종올리고머 단백질 복합체의 단량체이고, 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 단백질 단량체의 접촉은 고유 동종올리고머 복합체 형성을 억제한다(예를 들어, 도 10a 참조). 이러한 경우에, 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 단량체와 경쟁하여 표적화된 단량체 및 추가 단량체에 의한 고유 동종올리고머 복합체 형성을 방지함으로써 단량체 및/또는 이의 생물학적 기능을 조절한다.
일부 경우에, "표적 단백질"은 고유 단백질이고, 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 고유 단백질의 고유 상호작용 파트너의 상호작용 또는 접촉은 고유 단백질과 고유 단백질의 고유 상호작용 파트너의 추가 상호작용을 방지한다(예를 들어, 도 10b 참조). 이러한 경우에, 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 고유 단백질의 고유 상호작용 파트너에의 결합에 대해 고유 단백질과 경쟁하여 고유 단백질에 의한 고유 이종올리고머 복합체 형성을 방지함으로써 고유 단백질 및/또는 이의 생물학적 기능을 조절한다.
일부 경우에, "표적 단백질"은 고유 단백질이고, 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 고유 단백질 및/또는 고유 단백질의 고유 상호작용 파트너의 상호작용 또는 접촉은 고유 단백질과 다른 고유 단백질 및/또는 고유 단백질의 고유 상호작용 파트너의 추가 상호작용을 방지한다(예를 들어, 도 10c 참조). 이러한 경우에, 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 고유 단백질 및/또는 고유 단백질의 고유 상호작용 파트너에의 결합에 대해 고유 단백질과 경쟁하여 고유 단백질에 의한 고유 이종올리고머 복합체 형성을 방지함으로써 고유 단백질 및/또는 이의 생물학적 기능을 조절한다.
본원에 개시된 단백질-상호작용 폴리펩타이드의 아미노산 서열은 고유 단백질 복합체의 조절을 달성하기 위해 하나 이상의 "표적 단백질"로부터 유래될 수 있다. 추가로. 하나 이상의 "단백질-상호작용 폴리펩타이드"를 사용하여 고유 단백질 복합체를 조절할 수 있고, 하나 이상의 "단백질-상호작용 폴리펩타이드"를 사용하여 하나 이상의 고유 단백질 복합체를 조절할 수 있다.
본원에 개시된 바와 같이, "표적 단백질의 고유 상호작용 파트너", "고유 단백질의 고유 상호작용 파트너" 등은 세포에서 고유 단백질과 회합하여 고유 단백질을 형성하는 하나 이상의 단백질을 지칭한다.
단백질-상호작용 폴리펩타이드는, 상호작용 표면에서 상호작용 폴리펩타이드의 결합 시, 표적 단백질의 동종올리고머화 또는 그 자체와의 상호작용을 차단 및 억제하거나 간섭할 수 있고/있거나, 단백질-상호작용 폴리펩타이드는, 상호작용 표면에서 상호작용 폴리펩타이드의 결합 시, 표적 단백질의 이종올리고머화, 또는 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너와의 상호작용을 차단 및 억제하거나 간섭할 수 있다. 이러한 상호작용의 결과로서, 고유 단백질 복합체 또는 이의 동족체 내의 표적 단백질의 하나 이상의 분절로부터 유래되거나 이를 함유할 수 있는 폴리펩타이드는 표적 단백질과 경쟁하고 비-고유 단백질 복합체를 생성함으로써, 조립된 고유 단백질 복합체의 수준을 조절한다. 이러한 폴리펩타이드-기반 단백질 억제 또는 간섭은 표적 경로의 하향조절 또는 상향조절을 유도할 수 있다.
본원에서 사용된 바와 같이, "조절하는", "조절하다", "조절" 및 문법적 동등어는 세포가 이의 단백질 구성성분의 양뿐만 아니라 활성도 조절할 수 있게 하는, 표적 단백질 및/또는 이의 생물학적 기능의 조절을 지칭한다, 고유 단백질 복합체는 다수의 독립적인 폴리펩타이드 서브유닛으로 이루어진다. 일부 동종올리고머 실시형태에서, 고유 단백질 복합체의 단백질 서브유닛은 동일하고; 다른 이종올리고머 실시형태에서, 고유 단백질 복합체의 단백질 서브유닛은 2가지 이상의 별개의 폴리펩타이드이다. 두 경우 모두에서, 폴리펩타이드들 간의 상호작용은 단백질 활성의 조절에서 중요하다.
일부 실시형태에서, 표적 단백질 및/또는 이의 생물학적 기능의 "조절"은 표적 단백질 및/또는 이의 생물학적 기능의 억제를 포함한다. 본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "감소시키다", "억제하다", "약화시키다", "저해하다" 및 문법적 동등어("더 낮은", "더 작은" 등을 포함)는 발생 또는 활성의 측정가능한 감소, 일부 경우에, 발생 또는 활성의 완전한 차단을 포함하는 통계학적으로 유의미한 감소를 지칭한다. 예를 들어, 활성은 고유 단백질 및/또는 고유 단백질 복합체의 하나 이상의 생물학적 활성을 지칭할 수 있고, 발생은 고유 단백질 복합체의 형성을 지칭할 수 있다. 예를 들어, "억제"는 활성 또는 발생의 약 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 100% 감소를 지칭할 수 있다. 이들 용어는 특정 처리, 예를 들어 본 개시내용의 방법을 거치지 않은 "대조군"에 상대적으로 사용될 수 있다. 일례에서, 대조군은 미처리 샘플 또는 대상체일 수 있다. 또 다른 예에서, 대조군은 처리된 샘플 또는 대상체와 상이한 처리를 받은 샘플 또는 대상체일 수 있다. 일부 실시형태에서, "처리된" 샘플 또는 대상체는 본 개시내용의 방법을 거친 것이다.
일부 실시형태에서, 표적 단백질 및/또는 이의 생물학적 기능의 "조절" 및/또는 "억제"는 비-고유 단백질 복합체 형성 시 표적 단백질 및/또는 고유 단백질 복합체의 손상된 생물학적 활성을 포함한다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질 및/또는 이의 생물학적 기능의 "조절" 및/또는 "억제"는 비-고유 단백질 복합체의 형성 시 비-고유 단백질 복합체의 프로테아솜 분해를 포함하며, 이는 느슨하게 팩킹되며 세포의 품질 제어 시스템에 실패한다.
따라서, 일부 실시형태에서, 생체내에서 코로나바이러스 스파이크 단백질, HIV 스파이크 단백질, 에볼라 당단백질, RSV 당단백질, 및/또는 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 같은 바이러스 단백질을 포함하지만 이에 제한되지 않는 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절은 생체내에서 코로나바이러스 스파이크 단백질, HIV 스파이크 단백질, 에볼라 당단백질, RSV 당단백질, 및/또는 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 같은 바이러스 단백질을 포함하지만 이에 제한되지 않는 표적 단백질, 또는 이의 생물학적 기능의 억제를 포함한다. 일부 실시형태에서, 생체내에서 코로나바이러스 스파이크 단백질, HIV 스파이크 단백질, 에볼라 당단백질, RSV 당단백질, 및/또는 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 같은 바이러스 단백질을 포함하지만 이에 제한되지 않는 표적 단백질, 또는 이의 생물학적 기능의 억제는 비-고유 단백질 복합체의 형성 시 표적 단백질 및/또는 표적 단백질을 포함하는 고유 단백질 복합체의 생물학적 활성의 손상을 포함한다. 일부 실시형태에서, 생체내에서 코로나바이러스 스파이크 단백질, HIV 스파이크 단백질, 에볼라 당단백질, RSV 당단백질, 및/또는 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 같은 바이러스 단백질을 포함하지만 이에 제한되지 않는 표적 단백질, 또는 이의 생물학적 기능의 억제는 비-고유 단백질 복합체의 형성 시 표적 단백질 및/또는 표적 단백질을 포함하는 고유 단백질 복합체의 프로테아솜 분해를 포함한다.
특정 양상은 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드에 관한 것이며, 상기 아미노산 서열은 표적 단백질의 상응하는 서열과 적어도 10% 서열 동일성을 갖는다. 특정 양상은 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드에 관한 것이며, 상기 아미노산 서열은 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 10% 서열 동일성을 갖는다.
특정 양상은 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 적어도 10 내지 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드에 관한 것이다. 특정 양상은 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드에 관한 것이며, 상기 아미노산 서열은 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 적어도 10 내지 80% 동일성을 갖는다.
특정 양상은 서열번호 18과 적어도 10 내지 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드에 관한 것이다. 특정 양상은 HIV 스파이크 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드에 관한 것이며, 상기 아미노산 서열은 서열번호 18과 적어도 10 내지 80% 동일성을 갖는다.
특정 양상은 서열번호 20과 적어도 10 내지 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드에 관한 것이다. 특정 양상은 에볼라 바이러스 당단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드에 관한 것이고, 상기 아미노산 서열은 서열번호 200과 적어도 10 내지 80% 동일성을 갖는다.
특정 양상은 서열번호 25와 적어도 10 내지 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드에 관한 것이다. 특정 양상은 인플루엔자 바이러스 HA 스파이크 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드에 관한 것이고, 상기 아미노산 서열은 서열번호 25와 적어도 10 내지 80% 동일성을 갖는다.
특정 양상은 서열번호 33과 적어도 10 내지 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드에 관한 것이다. 특정 양상은 RSV 당단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드에 관한 것이고, 상기 아미노산 서열은 서열번호 34와 적어도 10 내지 80% 동일성을 갖는다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400개 또는 그 이상의 아미노산, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 서열과 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 서열과 10% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 서열과 20% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 서열과 30% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 서열과 40% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 서열과 50% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 서열과 60% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 서열과 70% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 서열과 적어도 75% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 서열과 적어도 80% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 서열과 적어도 85% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 서열과 적어도 90% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 서열과 적어도 95% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 서열을 포함하거나, 이로 이루어지거나, 본질적으로 이로 이루어진다.
일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400개, 또는 그 이상의 아미노산, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 올리고머화 도메인과 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 올리고머화 도메인과 10% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 올리고머화 도메인과 20% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 올리고머화 도메인과 30% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 올리고머화 도메인과 40% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 올리고머화 도메인과 50% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 올리고머화 도메인과 60% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 올리고머화 도메인과 70% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 올리고머화 도메인과 적어도 75% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 올리고머화 도메인과 적어도 80% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 올리고머화 도메인과 적어도 85% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 올리고머화 도메인과 적어도 90% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖고, 상기 아미노산 서열은 적어도 30개의 아미노산을 갖고 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 올리고머화 도메인과 적어도 95% 서열 동일성을 갖는다. 일부 실시형태에서, 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드는 표적 단백질 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체의 올리고머화 도메인을 포함하거나, 이로 이루어지거나, 본질적으로 이로 이루어진다.
일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 2 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 2 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 20% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 2 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 30% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 2 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 40% 서열 동일성을 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 2 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 50% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 2 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 60% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 2 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 2 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 75% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 2 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 2 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 2 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 90% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 2 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 2 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 포함하거나, 이로 이루어지거나, 본질적으로 이로 이루어진다.
일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 4 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 4 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 20% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 4 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 30% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 4 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 40% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 4 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 50% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 4 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 60% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 4 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 4 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 75% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 4 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 4 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 4 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 90% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 4 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 4 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 포함하거나, 이로 이루어지거나, 본질적으로 이로 이루어진다.
일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 6 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 6 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 20% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 6 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 30% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 6 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 40% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 6 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 50% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 6 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 60% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 6 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 6 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 75% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 6 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 6 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 6 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 90% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 6 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 6 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 포함하거나, 이로 이루어지거나, 본질적으로 이로 이루어진다.
일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 8 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 8 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 20% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 8 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 30% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 8 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 40% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 8 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 50% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 8 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 60% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 8 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 8 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 75% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 8 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 8 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 8 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 90% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 8 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 8 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 포함하거나, 이로 이루어지거나, 본질적으로 이로 이루어진다.
일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 10 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 10 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 20% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 10 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 30% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 10 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 40% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 10 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 50% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 10 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 60% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 10 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 10 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 75% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 10 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 10 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 10 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 90% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 10 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 10 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 포함하거나, 이로 이루어지거나, 본질적으로 이로 이루어진다.
일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 12 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 12 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 20% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 12 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 30% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 12 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 40% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 12 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 50% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 12 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 60% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 12 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 12 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 75% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 12 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 12 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 12 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 90% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 12 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 12 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 포함하거나, 이로 이루어지거나, 본질적으로 이로 이루어진다.
일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 14 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 14 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 20% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 14 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 30% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 14 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 40% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 14 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 50% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 14 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 60% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 14 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 14 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 75% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 14 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 14 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 14 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 90% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 14 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 14 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 포함하거나, 이로 이루어지거나, 본질적으로 이로 이루어진다.
일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 16 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 16 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 20% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 16 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 30% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 16 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 40% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 16 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 50% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 16 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 60% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 16 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 16 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 75% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 16 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 16 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 16 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 90% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 16 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 16 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 포함하거나, 이로 이루어지거나, 본질적으로 이로 이루어진다.
일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 HIV 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 18, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 HIV 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 18 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 HIV 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 18 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 20% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 HIV 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 18 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 30% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 HIV 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 18 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 40% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 HIV 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 18 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 50% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 HIV 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 18 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 60% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 HIV 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 18 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 HIV 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 18 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 75% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 HIV 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 18 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 HIV 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 18 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 HIV 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 18 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 90% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 HIV 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 18 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 HIV 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 18 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 포함하거나, 이로 이루어지거나, 본질적으로 이로 이루어진다.
일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 에볼라 바이러스 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 20, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 에볼라 바이러스 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 20, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 에볼라 바이러스 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 20, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 20% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 에볼라 바이러스 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 20, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 30% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 에볼라 바이러스 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 20, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 40% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 에볼라 바이러스 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 20, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 50% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 에볼라 바이러스 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 20, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 60% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 에볼라 바이러스 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 20, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 에볼라 바이러스 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 20, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 75% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 에볼라 바이러스 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 20, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 에볼라 바이러스 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 20, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 에볼라 바이러스 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 20, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 90% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 에볼라 바이러스 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 20, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 에볼라 바이러스 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드 서열번호 20, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 포함하거나, 이로 이루어지거나, 본질적으로 이로 이루어진다.
일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 25, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 25 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 25 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 20% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 25 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 30% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 25 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 40% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 25 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 50% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 25 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 60% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 25 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 25 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 75% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 25 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 25 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 25 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 90% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 25 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 25 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 포함하거나, 이로 이루어지거나, 본질적으로 이로 이루어진다.
일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 RSV 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 34, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 RSV 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 34 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 RSV 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 34 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 20% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 RSV 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 34 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 30% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 RSV 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 34 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 40% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 RSV 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 34 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 50% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 RSV 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 34 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 60% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 RSV 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 34 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 RSV 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 34 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 75% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 RSV 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 34 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 RSV 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 34 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 RSV 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 34 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 90% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 RSV 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 34 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 RSV 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 서열번호 34 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 포함하거나, 이로 이루어지거나, 본질적으로 이로 이루어진다.
일부 실시형태에서, 단백질, 예를 들어 바이러스 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 추가로 신호 펩타이드 서열을 포함한다. 신호 펩타이드(때때로 신호 서열, 표적화 신호, 국소화 신호, 국소화 서열, 전이 펩타이드, 리더 서열 또는 리더 펩타이드로 지칭됨)는 새로 합성된 분비가능한 단백질의 N-말단에 존재하는 짧은 펩타이드(예를 들어, 16 내지 30개 아미노산 길이)이다. 신호 펩타이드는 세포가 단백질을 일반적으로 세포막으로 전좌시키도록 유도하는 기능을 한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 28 내지 32, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 28 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 28 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 75% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 28 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 28 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 28 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 90% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 28 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 28 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와적어도 99% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 28 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 포함한다.
일부 실시형태에서, 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는 아미노산 서열을 포함하는, 단백질, 예를 들어 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 추가로 서열번호 28, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 신호 펩타이드를 포함한다.
일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 29 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 29 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 75% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 29 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 29 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 29 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 90% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 29 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 29 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 99% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 29 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 포함한다.
일부 실시형태에서, 서열번호 18, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는 아미노산 서열을 포함하는, 단백질, 예를 들어 HIV 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 추가로 서열번호 29, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 신호 펩타이드를 포함한다.
일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 30 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 30 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 75% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 30 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 30 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 30 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 90% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 30 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 30 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 99% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 30 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 포함한다.
일부 실시형태에서, 서열번호 20, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는 아미노산 서열을 포함하는, 단백질, 예를 들어 에볼라 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 추가로 서열번호 30, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 신호 펩타이드를 포함한다.
일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 31 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 31 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 75% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 31 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 31 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 31 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 90% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 31 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 31 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 99% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 31 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 포함한다.
일부 실시형태에서, 서열번호 25, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는 아미노산 서열을 포함하는, 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 추가로 서열번호 31, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 신호 펩타이드를 포함한다.
일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 32 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 32 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 75% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 32 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 80% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 32 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 85% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 32 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 90% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 32 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 32 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 99% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 신호 펩타이드는 서열번호 32 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 포함한다.
일부 실시형태에서, 서열번호 34, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는 아미노산 서열을 포함하는, 단백질, 예를 들어 RSV 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드는 추가로 서열번호 32, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 신호 펩타이드를 포함한다.
A. 폴리펩타이드
본원에서 사용된 바와 같이, "폴리펩타이드", "펩타이드", 또는 "단백질"은 적어도 5개의 아미노산 잔기를 포함한 분자를 지칭한다. 본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "야생형"은 유기체에서 천연적으로 발생하는 분자의 내인성 버전을 지칭한다. 일부 실시형태에서는 단백질 또는 폴리펩타이드의 야생형 버전이 사용되지만, 본 개시내용의 많은 실시형태에서는 변형된 단백질 또는 폴리펩타이드가 사용된다. 상술된 용어는 상호교환적으로 사용될 수 있다. "변형된 단백질" 또는 "변형된 폴리펩타이드" 또는 "변이체"는 야생형 단백질 또는 폴리펩타이드에서 화학 구조, 특히 아미노산 서열이 변경된 단백질 또는 폴리펩타이드를 지칭한다. 일부 실시형태에서, 변형된/변이체 단백질 또는 폴리펩타이드는 적어도 하나의 변형된 활성 또는 기능을 갖는다(단백질 또는 폴리펩타이드는 다수의 활성 또는 기능을 가질 수 있음을 인지할 때). 변형된/변이체 단백질 또는 폴리펩타이드가 하나의 활성 또는 기능에서 변경될 수 있지만 면역원성과 같은 다른 측면에서 야생형 활성 또는 기능을 유지할 수 있다는 것이 특히 고려된다.
본원에서 사용된 바와 같이, "단백질성 분자" "단백질성 조성물" "단백질성 화합물" "단백질성 쇄" 또는 "단백질성 물질"은 일반적으로 약 30개 초과의 아미노산의 단백질 또는 유전자로부터 번역된 전장 내인성 서열; 약 100개 초과의 아미노산의 폴리펩타이드; 및/또는 약 30 내지 약 3000개 아미노산의 펩타이드를 지칭하지만, 이에 제한되지 않는다. 상술된 모든 "단백질성"이란 용어는 본원에서 상호교환적으로 사용될 수 있다.
단백질이 본원에서 구체적으로 언급되는 경우, 이는 일반적으로 고유(내인성) 또는 재조합(변형된) 단백질, 또는 임의로, 임의의 신호 서열이 제거된 단백질을 언급하는 것이다. 단백질은 고유인 유기체로부터 직접적으로 단리되거나, 재조합 DNA/외인성 발현 방법에 의해 생산되거나, 고체상 펩타이드 합성(SPPS) 또는 다른 시험관내 방법에 의해 생산될 수 있다. 특정 실시형태에서, 폴리펩타이드(예를 들어, 항체 또는 이의 단편)를 암호화하는 핵산 서열을 혼입시키는 단리된 핵산 분절 및 재조합 벡터가 있다. 용어 "재조합"은 폴리펩타이드와 관련하여 또는 특정 폴리펩타이드의 명칭으로 사용될 수 있고, 이는 일반적으로 시험관내에서 조작된 또는 이러한 분자의 복제 생성물인 핵산 분자로부터 제조된 폴리펩타이드를 지칭한다.
특정 실시형태에서, 단백질 또는 폴리펩타이드(야생형 또는 변형된)의 크기는 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 210, 220, 230, 240, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 525, 550, 575, 600, 625, 650, 675, 700, 725, 750, 775, 800, 825, 850, 875, 900, 925, 950, 975, 1000, 1100, 1200, 1300, 1400, 1500, 1750, 2000, 2250, 2500, 2750, 3000, 3250, 3500, 3750, 4000, 4250, 4500, 4750, 또는 5000개 아미노산 잔기 또는 그 이상, 및 그 내에서 추론가능한 임의의 범위, 또는 본원에서 기술되거나 인용된 상응하는 아미노산 서열의 유도체를 포함할 수 있지만, 이에 제한되지 않는다. 폴리펩타이드는 이들의 상응하는 야생형 형태보다 더 짧게 만드는 절두(truncation)에 의해 돌연변이될 수 있고, 또한, 폴리펩타이드는 이종 단백질 또는 폴리펩타이드 서열을 특정 기능(예를 들어, 표적화 또는 국소화, 향상된 면역원성, 정제 목적 등을 위해)과 융합 또는 접합시켜 변경될 수 있는 것으로 고려된다. 단백질은 하나 이상의 폴리펩타이드를 포함할 수 있다.
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "도메인"은 단백질 또는 폴리펩타이드의 임의의 별개의 기능적 또는 구조적 단위를 지칭하며, 일반적으로 당업자가 인식할 수 있는 구조 또는 기능을 갖는 아미노산의 서열을 지칭한다. 예를 들어, 도메인은 단백질 또는 폴리펩타이드의 올리고머화 도메인을 지칭할 수 있다. 콜라겐 삼중 나선, 코일드 코일 및 기타 올리고머화 도메인은 수많은 단백질의 서브유닛 조립을 중재한다. 올리고머화는 다가성 및 높은 결합 강도, 증가된 구조 안정화 및 상이한 도메인들의 조합된 기능이라는 기능적 이점을 초래한다. 도메인, 예를 들어 본원에 기술된 올리고머화 도메인은 보존될 수 있다. 진화 생물학에서, 보존된 서열은 종 전체에 걸쳐(병렬상동성(orthologous) 서열) 또는 게놈 내에서(직렬상동성(paralogous) 서열) 또는 공여자와 수용자 분류군 간에(이물(xenologous) 서열) 핵산((DNA 및 RNA) 또는 단백질의 동일하거나 유사한 서열이다. 보존은 자연 선택에 의해 서열이 유지되었음을 나타낸다. 고도로 보존된 서열은 계통수(phylogenetic tree)에서 멀리 떨어진 곳까지 상대적으로 변화되지 않은 채로 남아 있는 서열이다.
특정 실시형태에서 단백질성 조성물은 적어도 하나의 단백질, 폴리펩타이드 또는 펩타이드를 포함한다. 본원에 기술된 사실상 임의의 단백질, 폴리펩타이드, 또는 펩타이드 함유 성분은 본원에 개시된 조성물 및 방법에서 사용될 수 있음이 고려된다. 추가 실시형태에서, 단백질성 조성물은 생체적합성 단백질, 폴리펩타이드 또는 펩타이드를 포함한다. 본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "생체적합성"은 본원에 기술된 방법 및 양에 따라 소정의 유기체에게 적용 또는 투여될 때 유의미한 유해 효과를 일으키지 않는 물질을 지칭한다. 이러한 유해 또는 바람직하지 않은 효과는 유의미한 독성 또는 불리한 면역학적 반응과 같은 것들이다. 바람직한 실시형태에서, 생체적합성 단백질-, 폴리펩타이드-, 또는 펩타이드-함유 조성물은 일반적으로 독소, 병원체 및 유해한 면역원이 각각 본질적으로 없는 포유동물 단백질 또는 펩타이드 또는 합성 단백질 또는 펩타이드일 것이다.
단백질성 조성물은 표준 분자 생물학적 기술을 통한 단백질, 폴리펩타이드 또는 펩타이드의 발현, 천연 공급원으로부터 단백질성 화합물의 단리, 또는 단백질성 물질의 화학적 합성을 포함하는 당업자에게 공지된 임의의 기술에 의해 제조될 수 있다.
다양한 유전자에 대한 뉴클레오타이드뿐만 아니라 단백질, 폴리펩타이드 및 펩타이드 서열은 이전에 개시되었으며, 인지된 전산화된 데이터베이스에서 찾을 수 있다. 2가지 통상적으로 사용되는 데이터베이스는 미국 국립생물공학정보센터(National Center for Biotechnology Information)의 Genbank 및 GenPept 데이터베이스(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/에서의 월드 와이드 웹(World Wide Web) 상의) 및 The Universal Protein Resource (UniProt; uniprot.org에서의 월드 와이드 웹 상의)이다. 이들 유전자에 대한 암호화 영역은 본원에 개시된 기술을 사용하거나 당업자에게 공지된 바와 같이 증폭 및/또는 발현될 수 있다.
특정 실시형태에서, 단백질성 화합물은 정제될 수 있다. 일반적으로, "정제된"은 다양한 다른 단백질, 폴리펩타이드 또는 펩타이드를 제거하기 위해 분별된 특정 또는 단백질, 폴리펩타이드 또는 펩타이드 조성물을 지칭하는 것으로, 여기서 상기 조성물은 예를 들어 특정 또는 원하는 단백질, 폴리펩타이드 또는 펩타이드에 대해 당업자에게 공지된 바와 같은 단백질 검정에 의해 평가될 수 있을 때 이의 활성을 실질적으로 유지한다.
본 발명에서 사용하기에 적합한 단백질 및 펩타이드는 자가 단백질 또는 펩타이드일 수 있지만, 본 발명은 이러한 자가 단백질의 사용으로 명백하게 제한하지 않는다. 본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "자가 단백질, 폴리펩타이드 또는 펩타이드"는 유기체로부터 유래되거나 수득되는 단백질, 폴리펩타이드 또는 펩타이드를 지칭한다. 사용될 수 있는 유기체는 소, 파충류, 양서류, 어류, 설치류, 조류, 개, 고양이, 진균, 식품, 원핵 유기체, 바이러스 또는 박테리오파지를 포함하지만 이에 제한되지는 않으며, 선택된 동물 또는 인간 대상체가 선호된다. 그 다음, "자가 단백질, 폴리펩타이드 또는 펩타이드"는 선택된 동물 또는 인간 대상체에 적용하기 위한 조성물의 성분으로서 사용될 수 있다.
본 개시내용의 조성물에는 ml당 약 0.001 mg 내지 약 10 mg의 총 폴리펩타이드, 펩타이드, 및/또는 단백질이 존재하는 것으로 고려된다. 조성물 중의 단백질의 농도는 약, 적어도 약 또는 최대 약 0.001, 0.010, 0.050, 0.1, 0.2, 0.3, 0.4, 0.5, 0.6, 0.7, 0.8, 0.9, 1.0, 1.5, 2.0, 2.5, 3.0, 3.5, 4.0, 4.5, 5.0, 5.5, 6.0, 6.5, 7.0, 7.5, 8.0, 8.5, 9.0, 9.5, 10.0 mg/ml 또는 그 이상(또는 그 내에서 추론가능한 임의의 범위)일 수 있다.
B. 핵산
특정 실시형태에서, 핵산 서열은 본원에 기술된 폴리펩타이드 및/또는 이의 유도체, 뮤테인 또는 변이체를 암호화하는 혼입된 서열 또는 재조합 폴리뉴클레오타이드의 단리된 분절 및 재조합 벡터, 하이브리드화 프로브로서 사용하기에 충분한 폴리뉴클레오타이드, 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 식별, 분석, 돌연변이화 또는 증폭시키기 위한 PCR 프라이머 또는 시퀀싱 프라이머, 폴리뉴클레오타이드의 발현을 조절하기 위한 안티센스 올리고뉴클레오타이드, 및 본원에 기술된 상기한 것들의 상보적 서열과 같은 다양한 예로 존재할 수 있다. 핵산은 단일-가닥 또는 이중-가닥일 수 있고, RNA 및/또는 DNA 뉴클레오타이드 및 이의 인공 변이체(예를 들어, 펩타이드 핵산)를 포함할 수 있다.
용어 "폴리뉴클레오타이드"는 재조합이거나 총 게놈 핵산으로부터 단리된 핵산 분자를 언급한다. 용어 "폴리뉴클레오타이드" 내에 예를 들어, 플라스미드, 코스미드, 파지, 바이러스 등을 포함하여 올리고뉴클레오타이드(핵산 100 잔기 이하 길이), 재조합 벡터가 포함된다. 폴리뉴클레오타이드는, 특정 양상에서, 이들의 천연 발생 유전자 또는 서열을 암호화하는 단백질로부터 실질적으로 단리된, 조절 서열을 포함한다. 폴리뉴클레오타이드는 단일-가닥(암호화 또는 안티센스) 또는 이중-가닥일 수 있고, RNA, DNA(게놈, cDNA 또는 합성), 이들의 유사체, 또는 이들의 조합일 수 있다. 추가의 암호화 또는 비-암호화 서열이, 반드시 그럴 필요는 없지만, 폴리뉴클레오타이드 내에 존재할 수 있다.
이러한 경우, 용어 "유전자", "폴리뉴클레오타이드", 또는 "핵산"은 단백질, 폴리펩타이드, 또는 펩타이드(적절한 전사, 번역 후 변형, 또는 국소화에 필요한 임의의 서열을 포함함)를 암호화하는 핵산을 지칭하기 위한 사용한다. 당업계에서 이해할 수 있는 바와 같이, 이들 용어는 게놈 서열, 발현 카세트, cDNA 서열, 및 단백질, 폴리펩타이드, 도메인, 펩타이드, 융합 단백질, 및 돌연변이체를 발현하도록 개조될 수 있는 더 작은 조작된 핵산 분절을 포함한다. 폴리펩타이드의 전부 또는 일부를 암호화하는 핵산은 이러한 폴리펩타이드의 전부 또는 일부를 암호화하는 인접한 핵산 서열을 함유할 수 있다. 또한 특정 폴리펩타이드가 상이한 핵산 서열을 갖는 변이를 함유하는 핵산에 의해 암호화될 수 있지만, 그럼에도 불구하고, 동일한 또는 실질적으로 유사한 단백질을 암호화하는 것으로 고려된다.
특정 실시형태에서, 본원에 개시된 서열에 대해 상당한 동일성을 갖는 폴리뉴클레오타이드 변이체, 예를 들어 본원에 기술된 방법(예를 들어, 표준 파라미터를 사용하는 BLAST 분석)을 사용하여 본원에 제공된 폴리뉴클레오타이드 서열과 비교하여 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 또는 더 높은 서열 동일성(그 사이의 모든 값 및 범위를 포함)을 포함하는 것들이 있다. 특정 양상에서, 단리된 폴리뉴클레오타이드는 서열의 전체 길이에 걸쳐서 본원에 기술된 아미노산 서열에 대해 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 폴리펩타이드를 암호화하는 뉴클레오타이드 서열, 또는 상기 단리된 폴리뉴클레오타이드에 대해 상보적인 뉴클레오타이드 서열을 포함할 것이고, 일부 경우에, 본원에 기술된 아미노산 서열에 대해 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 동일성을 갖는 폴리펩타이드를 암호화하는 뉴클레오타이드 서열은 본원에 기술된 폴리펩타이드의 구조와 유사한 구조를 갖는 폴리펩타이드를 생성한다.
핵산 분절은, 암호화 서열 자체의 길이에 관계없이, 다른 핵산 서열, 예컨대 프로모터, 폴리아데닐화 신호, 추가의 제한 효소 부위, 다중 클로닝 부위, 다른 암호화 분절 등과 조합될 수 있어서, 이들의 전반적 길이는 상당히 가변적일 수 있다. 핵산은 임의의 길이일 수 있다. 이들은 예를 들어 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 75, 100, 125, 175, 200, 250, 300, 350, 400, 450, 500, 750, 1000, 1500, 3000, 5000개 또는 그 이상의 뉴클레오타이드 길이일 수 있고/있거나 하나 이상의 추가 서열, 예를 들어 조절 서열을 포함할 수 있고/있거나, 더 큰 핵산, 예를 들어 벡터의 일부일 수 있다. 따라서, 대부분 임의의 길이의 핵산 단편이 이용될 수 있는 것으로 고려되고, 총 길이는 바람직하게는 이의 제조 용이성 및 의도된 재조합 핵산 프로토콜에서의 용도에 의해 제한된다. 일부 경우에, 핵산 서열은 예를 들어 폴리펩타이드의 정제, 수송, 분비, 번역 후 변형을 허용하기 위해 또는 표적화 또는 효능과 같은 치료적 이득을 위해, 추가의 이종 암호화 서열과 함께 폴리펩타이드 서열을 암호화할 수 있다. 상기 논의한 바와 같이, 태그 또는 다른 이종 폴리펩타이드가 변형된 폴리펩타이드-암호화 서열에 첨가될 수 있고, 여기서 "이종"은 변형된 폴리펩타이드와 동일하지 않는 폴리펩타이드를 지칭한다.
변화는 핵산 내으로의 돌연변이에 의해 도입될 수 있고, 이를 통해 이것이 암호화하는 폴리펩타이드의 아미노산 서열에서의 변화가 유도된다. 돌연변이는 당업계에 공지된 임의의 기술을 사용하여 도입될 수 있다. 일 실시형태에서, 하나 이상의 특정 아미노산 잔기는 예를 들어 부위 지시된 돌연변이유발 프로토콜을 사용하여 변화된다. 또 다른 실시형태에서, 하나 이상의 무작위로 선택된 잔기는 예를 들어 무작위 돌연변이유발 프로토콜을 사용하여 변화된다. 그러나, 돌연변이 폴리펩타이드가 발현되고 원하는 특성에 대해 스크리닝되도록 할 수 있다.
돌연변이는 이것이 암호화하는 폴리펩타이드의 생물학적 활성에 유의미하게 영향을 주지 않으면서 핵산 내로 도입될 수 있다. 예를 들어, 비필수 아미노산 잔기에서의 아미노산 치환을 유도하는 뉴클레오타이드 치환이 이루어질 수 있다. 대안적으로, 하나 이상의 돌연변이는 이것이 암호화하는 폴리펩타이드의 생물학적 활성을 선택적으로 변화시키는 핵산 내로 도입될 수 있다(예를 들어, 문헌[Romain Studer et al., Biochem. J. 449:581-594 (2013)] 참조). 예를 들어, 돌연변이는 생물학적 활성을 정량적으로 또는 정성적으로 변화시킬 수 있다. 정량적 변화의 예는 활성의 증가, 감소, 또는 제거를 포함한다. 정성적 변화의 예는 항체의 항원 특이성의 변경을 포함한다.
C. 변이체 폴리펩타이드
유사하거나 개선된 특성을 갖는 분자를 여전히 수득하면서 본 발명에 따른 단백질 및/또는 단백질을 암호화하는 폴리뉴클레오타이드에 변형 및/또는 변화가 이루어질 수 있기 때문에, 이러한 생물학적 기능성 등가물도 본 발명에 포함된다.
생물학적 기능성 등가물은 "야생형" 또는 표준 단백질 또는 펩타이드 또는 "변이체" 단백질 또는 펩타이드를 암호화화하는 능력을 유지하면서 동시에 별개의 서열을 함유하도록 조작된 폴리뉴클레오타이드를 포함할 수 있다. 이것은 유전자 코드의 축퇴, 즉 동일한 아미노산을 암호화하는 다수의 코돈의 존재로 달성될 수 있다.
기능성 등가물의 관점에서, "생물학적 기능성 등가물" 단백질 및/또는 폴리뉴클레오타이드의 정의에 고유하게, 등가 생물학적 활성의 허용가능한 수준을 갖는 분자를 보유하면서 분자의 정의된 부분 내에서 이루어질 수 있는 변화의 수에 대한 한계가 존재한다는 개념은 당업자에 의해 잘 이해되고 있다. 따라서, 생물학적 기능성 등가물은, 예를 들어 생체내에서 표적 단백질과 상호작용하는 능력을 보유하는, 선택된 아미노산(또는 코돈)에서의 치환 또는 돌연변이를 갖는 이들 단백질(및 폴리뉴클레오타이드)로서 정의된다.
일반적으로, 분자의 길이가 짧을 수록, 기능을 보유하면서 분자 내에서 이루어질 수 있는 변화가 보다 적다. 보다 긴 폴리펩타이드는 중간 정도의 변화 수를 가질 수 있다. 전장 단백질은 더 큰 수의 변화에 대해 최대 허용성을 가질 것이다. 그러나, 구조에 매우 의존적인 특정 분자 또는 도메인은 변형을 거의 허용하지 않거나 전혀 허용하지 않는다는 것이 이해되어야만 한다. 일례에서, 폴리뉴클레오타이드는 보다 유의미한 변화를 갖는 생물학적 기능성 등가물일 수 있다(있고 이를 암호화할 수 있다). 특정 아미노산은 예를 들어 올리고머화 도메인, 기질 분자 상의 결합 부위, 수용체 등과 같은 구조와의 상호작용적 결합 능력의 분명한 손실 없이 단백질 구조 내의 다른 아미노산을 대체할 수 있다.
하기는 단백질의 아미노산을 변화시켜 동등한, 또는 심지어 개선된 2세대 변이체 폴리펩타이드 또는 펩타이드를 생성하는 것에 대한 논의이다. 예를 들어, 특정 아미노산은 항체의 항원-결합 영역 또는 기질 분자 상의 결합 부위와 같은 구조와의 상호작용적 결합 능력의 뚜렷한 상실의 존재 또는 부재 하에 단백질 또는 폴리펩타이드 서열 내의 다른 아미노산을 대체할 수 있다. 단백질의 기능적 활성을 한정하는 것은 단백질의 상호작용 능력 및 성질이기 때문에, 단백질 서열에서 및 이의 상응하는 DNA 암호화 서열에서 특정 아미노산 치환이 이루어질 수 있고, 그럼에도 불구하고, 유사한 또는 원하는 특성을 갖는 단백질을 생산할 수 있다. 따라서, 다양한 변화가 이들의 생물학적 유용성 또는 활성의 뚜렷한 손실 없이 단백질을 암호화하는 유전자의 DNA 서열에서 이루어질 수 있다는 것이 본 발명자에 의해 고려된다.
용어 "기능적으로 동등한 코돈"은 본원에서 아르기닌에 대한 6개의 상이한 코돈과 같은 동일한 아미노산을 암호화하는 코돈을 지칭하기 위해 사용된다. 또한 생물학적으로 동등한 아미노산을 암호화하는 코돈 또는 코돈들의 변화를 지칭하는 "중립 치환" 또는 "중립 돌연변이"가 고려된다.
본 개시내용의 아미노산 서열 변이체는 치환, 삽입, 또는 결실 변이체일 수 있다. 본 개시내용의 폴리펩타이드의 변이는 야생형과 비교하여 단백질 또는 폴리펩타이드의 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50개 또는 그 이상의 비-인접한 또는 인접한 아미노산에 영향을 줄 수 있다. 변이체는 본원에 제공되거나 인용된 임의의 서열과 적어도 적어도 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 또는 90%(그 사이의 모든 값 및 범위를 포함) 동일한 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 변이체는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20개, 또는 그 이상의 치환체 아미노산을 포함할 수 있다.
또한, 아미노산 및 핵산 서열이 추가 잔기, 예컨대 추가 N- 또는 C-말단 아미노산, 또는 5' 또는 3' 서열을 각각 포함할 수 있고, 서열이 단백질 발현에 관련된 생물학적 단백질 활성의 유지를 포함하는 상기 열거된 기준을 충족하는 한, 여전히 또한 본원에 개시된 서열 중 하나에 제시된 것과 본질적으로 동일할 수 있다는 것을 이해할 것이다. 말단 서열의 첨가는 특히, 예를 들어 암호화 영역의 5' 또는 3' 부분을 측접(flanking)하는 다양한 비-암호화 서열을 포함할 수 있는 핵산 서열에 적용된다.
결실 변이체는 전형적으로 고유 또는 야생형 단백질의 하나 이상의 잔기가 결여되어 있다. 개별 잔기가 결실되거나 다수의 인접한 아미노산이 결실될 수 있다. 정지 코돈을 암호화 핵산 서열 내로 (치환 또는 삽입에 의해) 도입하여 절두된 단백질을 생성할 수 있다. 예를 들어, 펩타이드를 다수의 인접한 아미노산의 절두 또는 결실에 의해 돌연변이시켜 이의 상응하는 내인성 형태보다 더 짧게 만들 수 있다는 것이 고려된다.
삽입 돌연변이는 전형적으로 폴리펩타이드 내의 비-말단 지점에 아미노산 잔기의 첨가를 포함한다. 이것은 하나 이상의 아미노산 잔기의 삽입을 포함할 수 있다. 말단 첨가가 또한 생성될 수 있고 본원에서 기술되거나 인용된 하나 이상의 펩타이드 또는 폴리펩타이드의 다량체 또는 연쇄체(concatemer)인 융합 단백질을 포함할 수 있다. 예를 들어, 펩타이드는 특정 기능(예를 들어, 표적화 또는 국소화를 위해, 향상된 활성을 위해, 정제 목적 등을 위해)을 갖는 이종 단백질 또는 폴리펩타이드 서열을 융합 또는 접합시킴으로써 변경될 수 있다는 것이 고려된다.
치환 변이체는 전형적으로 단백질 또는 펩타이드 내의 하나 이상의 부위에서 하나의 아미노산의 다른 아미노산으로의 교환을 함유하고, 다른 기능 또는 특성의 손실과 함께 또는 손실 없이 폴리펩타이드의 하나 이상의 특성을 조절하도록 설계될 수 있다. 치환은 보존적일 수 있으며, 즉 하나의 아미노산이 유사한 화학적 특성을 가진 아미노산으로 대체된다. "보존적 아미노산 치환"은 하나의 아미노산 부류의 구성원을 동일한 부류의 다른 구성원으로 교환하는 것을 포함할 수 있다. 보존적 치환은 당업계에 잘 알려져 있으며, 예를 들어 알라닌에서 세린; 아르기닌에서 라이신; 아스파라긴에서 글루타민 또는 히스티딘; 아스파르테이트에서 글루타메이트; 시스테인에서 세린; 글루타민에서 아스파라긴; 글루타메이트에서 아스파르테이트; 글라이신에서 프롤린; 히스티딘에서 아스파라긴 또는 글루타민; 이소류신에서 류신 또는 발린; 류신에서 발린 또는 이소류신; 라이신에서 아르기닌; 메티오닌에서 류신 또는 이소류신; 페닐알라닌에서 티로신, 류신 또는 메티오닌; 세린에서 트레오닌; 트레오닌에서 세린; 트립토판에서 티로신; 티로신에서 트립토판 또는 페닐알라닌; 발린에서 이소류신 또는 류신으로의 변화를 포함한다. 보존적 아미노산 치환은 비-천연 발생 아미노산 잔기를 포함할 수 있으며, 이는 일반적으로 생물학적 시스템에서의 합성보다는 화학적 펩타이드 합성에 의해 혼입된다. 이는 펩티도미메틱(peptidomimetics) 또는 아미노산 모이어티의 기타 반대의 또는 역전된 형태를 포함한다. 소위 "보존적" 변화는 단백질의 생물학적 활성을 방해하지 않는데, 이는 구조적 변화가 설계된 기능을 수행하는 단백질의 능력에 영향을 주는 것이 아니기 때문이다. 따라서, 본 발명의 목적을 여전히 충족시키면서 본원에 개시된 유전자 및 단백질의 서열에 다양한 변화가 이루어질 수 있다는 것이 본 발명자들에 의해 고려된다.
대안적으로, 치환은 비-보존적이어서, 폴리펩타이드의 기능 또는 활성이 영향을 받을 수 있다. 비-보존적 변화는 전형적으로 아미노산 잔기의 화학적으로 유사하지 않은 것으로의 치환, 예컨대 비극성 또는 비전하 아미노산의 극성 또는 하전된 아미노산으로의 치환 및 그 반대의 치환을 포함한다. 비-보존적 치환은 아미노산 부류 중 하나의 구성원을 다른 부류의 구성원으로 교환하는 것을 포함할 수 있다.
또한, 아미노산 및 핵산 서열이 추가 잔기, 예컨대 추가 N- 또는 C-말단 아미노산, 또는 5' 또는 3' 서열을 각각 포함할 수 있고, 서열이 단백질 발현에 관련된 생물학적 단백질 활성의 유지를 포함하는 상기 제시된 기준을 충족하는 한, 여전히 또한 본원에 개시된 서열 중 하나에 제시된 것과 본질적으로 같을 수 있다는 것이 이해될 것이다. 말단 서열의 첨가는 특히, 예를 들어 암호화 영역의 5' 또는 3' 부분을 측접하는 다양한 비-암호화 서열을 포함할 수 있는 핵산 서열에 적용된다.
본 개시내용의 아미노산 서열 변이체는 예를 들어 치환, 삽입, 또는 결실 변이체일 수 있다. 본 개시내용의 폴리펩타이드의 영역 또는 단편은 서열번호 1-25, 27, 33, 및 34 중 임의의 것에 대해 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400개 또는 그 이상의 아미노산 치환, 인접한 아미노산 첨가, 또는 인접한 아미노산 결실을 갖거나, 적어도 갖거나, 또는 최대로 갖는 아미노산 서열을 가질 수 있다는 것이 고려된다. 대안적으로, 본 개시내용의 폴리펩타이드의 영역 또는 단편은 서열번호 1-25, 27, 33, 및 34 중 임의의 것과 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100%(또는 그 내에서 추론가능한 임의의 범위) 동일하거나, 적어도 동일하거나, 최대로 동일한 아미노산 서열을 포함하거나 이로 이루어진 아미노산 서열을 가질 수 있다.
게다가, 일부 실시형태에서, 영역 또는 단편은 서열번호 1-25, 27, 33, 및 34(여기서, 위치 1은 서열번호의 N-말단에 있다) 중 임의의 것의 위치 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 또는 그 이상에서 시작하는 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400개, 또는 그 이상의 인접한 아미노산의 아미노산 영역을 포함한다. 본 개시내용의 폴리펩타이드는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 또는 50개 또는 그 이상의 변이체 아미노산을 포함할 수 있거나, 서열번호 1-25, 27, 33, 및 34 중 임의의 것의 적어도 또는 최대 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 300, 350, 400개 또는 그 이상의 인접한 아미노산, 또는 그 내에서 추론가능한 임의의 범위와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 53%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 유사하거나 동일하거나 상동일 수 있다.
본 개시내용의 폴리펩타이드는 서열번호 1-25, 27, 33, 중 34 중 임의의 것의 적어도, 최대 또는 정확히 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 또는 400개의 치환(또는 그 내에서 추론가능한 임의의 범위)을 포함할 수 있다.
치환은 서열번호 1-25, 27, 33, 및 34 중 임의의 것의 아미노산 위치 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 또는 400(또는 그 내의 추론가능한 임의의 범위)에 있을 수 있다.
당업자는 잘 알려진 기술을 사용하여 본원에 제시된 바와 같은 폴리펩타이드의 적합한 변이체를 결정할 수 있다. 당업자는 활성에 중요한 것으로 여겨지지 않은 영역을 표적화함으로써 활성을 파괴하지 않으면서 변화될 수 있는 분자의 적합한 영역을 식별할 수 있다. 당업자는 또한 유사한 단백질 또는 폴리펩타이드 중에서 보존된 분자의 아미노산 잔기 및 부분을 식별할 수 있을 것이다. 추가 실시형태에서, 생물학적 활성 또는 구조에 중요할 수 있는 영역은 생물학적 활성을 유의미하게 변경하지 않거나 단백질 또는 폴리펩타이드 구조에 불리하게 영향을 미치지 않으면서 보존적 아미노산 치환을 겪을 수 있다.
이러한 변화를 이루기 위해, 아미노산의 소수성 지수(hydropathy index)가 고려될 수 있다. 단백질의 소수성 프로파일은 각각의 아미노산에 수치 값("소수성 지수")을 할당한 다음, 펩타이드 쇄를 따라 이들 값을 반복적으로 평균화함으로써 계산된다. 각각의 아미노산은 이의 소수성 및 전하 특성에 기초하여 값을 할당받았다. 이들은 이소류신(+4.5); 발린(+4.2); 류신(+3.8); 페닐알라닌(+2.8); 시스테인/시스테인(+2.5); 메티오닌(+1.9); 알라닌(+1.8); 글리신(-0.4); 트레오닌(-0.7); 세린(-0.8); 트립토판(-0.9); 티로신(-1.3); 프롤린 (1.6); 히스티딘(-3.2); 글루타메이트(-3.5); 글루타민(-3.5); 아스파르테이트(-3.5); 아스파라긴(-3.5); 라이신(-3.9); 및 아르기닌(-4.5)이다. 단백질에 상호작용적 생물학적 기능을 부여하는데 있어 소수성 아미노산 지수의 중요성은 일반적으로 당업계에서 이해되고 있다(Kyte et al., J. Mol. Biol. 157:105-131 (1982)). 아미노산의 상대적 소수성 특성은 생성된 단백질 또는 폴리펩타이드의 2차 구조에 기여하고, 이는 결국 단백질 또는 폴리펩타이드와 다른 분자, 예를 들어 효소, 기질, 수용체, DNA, 항체, 항원 등의 상호작용을 한정하는 것으로 받아들여진다. 또한, 특정 아미노산은 유사한 소수성 지수 또는 점수를 갖는 다른 아미노산으로 치환될 수 있고, 여전히 유사한 생물학적 활성을 보유하는 것으로 공지되어 있다. 소수성 지수에 기초하여 변화를 이루는 데 있어, 특정 실시형태에서, 소수성 지수가 ±2 이내인 아미노산의 치환이 포함된다. 본 개시내용의 일부 양상에서, ±1 이내인 것들이 포함되고, 본 개시내용의 다른 양상에서, ±0.5 이내인 것들이 포함된다.
또한, 당업예에서는 유사한 아미노산의 치환은 친수성에 기초하여 효과적으로 이루어질 수 있는 것으로 이해된다. 본원에 참조로 포함된 미국 특허 제4,554,101호에는, 근접한 아미노산의 친수성에 의해 좌우되는 단백질의 최대 국소 평균 친수성(local average hydrophilicity)이 단백질의 생물학적 특성과 상관관계가 있다고 언급되어 있다. 특정 실시형태에서, 근접한 아미노산의 친수성에 의해 좌우되는 단백질의 최대 국소 평균 친수성은 이의 면역원성, 즉 단백질의 생물학적 특성과 상관관계가 있다. 하기 친수성 값이 이들 아미노산 잔기에 할당되었다: 아르기닌(+3.0); 라이신(+3.0); 아스파르테이트(+3.0±1); 글루타메이트(+3.0±1); 세린(+0.3); 아스파라긴(+0.2); 글루타민(+0.2); 글리신(0); 트레오닌(-0.4); 프롤린(-0.5±1); 알라닌(-0.5); 히스티딘(-0.5); 시스테인(-1.0); 메티오닌(-1.3); 발린(-1.5); 류신(-1.8); 이소류신(-1.8); 티로신(-2.3); 페닐알라닌(-2.5); 및 트립토판(-3.4). 유사한 친수성 값에 기초하여 변화를 이루어질 때, 특정 실시형태에서, 친수성 값이 ±2 이내인 아미노산의 치환이 포함되고, 다른 실시형태에서, ±1 이내인 것들이 포함되고, 또 다른 실시형태에서, ±0.5 이내인 것들이 포함된다. 일부 경우에, 친수성에 기초하여 1차 아미노산 서열로부터 에피토프를 식별할 수도 있다. 이들 영역은 또한 "에피토프 코어 영역"으로 지칭된다. 아미노산은 유사한 친수성 값을 갖는 또 다른 아미노산으로 치환될 수 있고, 여전히 생물학적으로 동등한 및 면역학적으로 동등한 단백질을 생산하는 것으로 이해된다.
추가로, 당업자는 유사한 폴리펩타이드 또는 단백질 내에서 활성 또는 구조에 중요한 잔기를 식별하는 구조-기능 연구를 검토할 수 있다. 이러한 비교의 관점에서, 유사한 단백질 내의 활성 또는 구조에 중요한 아미노산 잔기에 상응하는 단백질 내의 아미노산 잔기의 중요성을 예측할 수 있다. 당업자는 이러한 예측된 중요한 아미노산 잔기에 대한 화학적으로 유사한 아미노산 치환을 선택할 수 있다.
당업자는 또한 3차원 구조 및 아미노산 서열을 유사한 단백질 또는 폴리펩타이드 내의 해당 구조와 관련하여 분석할 수 있다. 이러한 정보의 관점에서, 당업자는 폴리펩타이드의 아미노산 잔기의 정렬을 이의 3차원 구조에 관해 예측할 수 있다. 당업자는 단백질의 표면 상에 있을 것으로 예측되는 아미노산 잔기의 변화를 생성하기 않도록 선택할 수 있는데, 이는 이러한 잔기가 다른 분자와의 중요한 상호작용에 관여할 수 있기 때문이다. 더욱이, 당업자는 각각의 원하는 아미노산 잔기에서 단일 아미노산 치환을 함유하는 변이체를 생성하고 테스트할 수 있다. 그 다음, 이들 변이체를 결합 및/또는 활성에 대한 표준 검정을 사용하여 스크리닝하여, 이러한 일상적인 실험으로부터 얻어진 정보를 산출할 수 있으며, 이는 당업자가 추가의 치환이 단독으로 또는 다른 돌연변이와 조합되어 회피되어야 하는 아미노산 위치를 결정할 수 있게 한다. 2차 구조를 결정하기 위해 이용가능한 다양한 도구는 월드 와이드 웹 상의 expasy.org/proteomics/protein_structure에서 찾을 수 있다.
본 개시내용의 일부 실시형태에서, (1) 단백질 분해에 대한 감수성을 감소시키고/시키거나, (2) 산화에 대한 감수성을 감소시키고/시키거나, (3) 단백질 복합체를 형성하기 위한 결합 친화도를 변경시키고/시키거나, (4) 리간드 또는 항원 결합 친화도를 변경시키고/시키거나, (5) 이러한 폴리펩타이드에 다른 물리화학적 또는 기능적 특징을 부여하거나 변형시키는 아미노산 치환이 이루어진다. 예를 들어 단일 또는 다중 아미노산 치환(특정 실시형태에서, 보존적 아미노산 치환)은 천연 발생 서열에서 이루어질 수 있다. 치환은 분자간 접촉을 형성하는 도메인(들)의 외부에 존재하는 항체의 해당 부분에서 이루어질 수 있다. 이러한 실시형태에서, 단백질 또는 폴리펩타이드의 구조적 특징을 실질적으로 변화시키지 않는 보존적 아미노산 치환(예를 들어, 고유 단백질을 특징짓는 2차 구조를 파괴하지 않는 하나 이상의 대체 아미노산)이 사용될 수 있다.
본원에서 사용된 바와 같이, "아미노 분자"는 당업자에게 공지된 임의의 아미노산, 아미노산 유도체 또는 아미노산 모방체를 지칭한다. 특정 실시형태에서, 단백질성 분자의 잔기는 아미노 분자 잔기의 서열을 중재하는 임의의 비아미노 분자 없이 연속성이다. 다른 실시형태에서, 서열은 하나 이상의 비아미노 분자 모이어티를 포함할 수 있다. 특정 실시형태에서, 단백질성 분자의 잔기들의 서열은 하나 이상의 비아미노 분자 모이어티에 의해 중재될 수 있다. 펩타이드 및 폴리펩타이드는 20개의 "천연" 아미노산 및 이의 번역 후 변형을 포함한다. 그러나, 시험관내 펩타이드 합성은 변형된 아미노산 및/또는 특이 아미노산의 사용을 허용한다.
따라서, 용어 "단백질성 조성물"은 천연적으로 합성된 단백질의 공통 아미노산 20개 중 적어도 하나, 또는 하기 표에 나타낸 것들을 포함하지만 이에 제한되지 않는 적어도 하나의 변형 또는 특이 아미노산을 포함하는 아미노 분자 서열을 포함한다.
하기 논의되는 생물학적 기능성 등가물 이외에도, 본 발명자들은 또한 구조적으로 유사한 화합물이 본 발명의 펩타이드 또는 폴리펩타이드의 핵심 부분을 모방하도록 제형화될 수 있음을 고려한다. 펩티도미메틱이라 명명될 수 있는 이러한 화합물은 본 발명의 펩타이드와 동일한 방식으로 사용될 수 있으므로 기능성 등가물이다.
단백질 2차 및 3차 구조의 요소를 모방하는 특정 모방체는 문헌[Johnson et al. (1993)]에 기술되어 있다. 펩타이드 모방체 사용의 기본이 되는 근거는 단백질의 펩타이드 백본이 주로 항체 및/또는 항원의 것들과 같은 분자 상호작용을 촉진하는 방식으로 아미노산 측쇄를 배향하도록 존재한다는 것이다. 따라서 펩타이드 모방체는 천연 분자와 유사한 분자 상호작용을 허용하도록 설계된다.
펩타이드 모방 개념의 일부 성공적인 적용은 항원성이 높은 것으로 알려진 단백질 내의 β-턴(β-turn)의 모방에 초점을 두고 있다. 폴리펩타이드 내의 가능성 있는 β-턴 구조는 본원에 논의된 바와 같은 컴퓨터-기반 알고리즘에 의해 예측될 수 있다. 턴의 성분 아미노산이 결정되면, 아미노산 측쇄의 필수 요소의 유사한 공간 배향을 달성하도록 모방체를 작제할 수 있다.
다른 접근법은 큰 단백질의 결합 부위를 모방하는 생물학적 활성 입체구조(conformation)를 생성하기 위한 매력적인 구조적 주형으로서 작은 다중디설파이드-함유 단백질을 사용하는 데 초점을 둔다(Vita et al. (1998)). 특정 독소에서 진화적으로 보존된 것으로 보이는 구조적 모티프는 작고(30 내지 40개 아미노산) 안정적이며 돌연변이에 대한 높은 허용성을 가진다. 이러한 모티프는 3개의 디설파이드에 의해 내부 코어에서 가교된 베타 시트와 알파 나선으로 구성된다.
베타 II 턴은 문헌[Weisshoff et al. (1999)]에서 사이클릭 L-펜타펩타이드 및 D-아미노산을 갖는 것들을 사용하여 성공적으로 모방되었다. 또한, 문헌[Johannesson et al. (1999)]은 리버스 턴(reverse turn) 유도 특성을 가진 바이사이클릭 트리펩타이드에 대해 보고하고 있다.
특정 구조를 생성하는 방법은 당업계에서 개시되었다. 예를 들어, 알파-나선 모방체는 미국 특허 제5,446,128호; 제5,710,245호; 제5,840,833호; 및 제5,859,184호에 개시되어 있다. 이들 구조는 펩타이드 또는 단백질을 열적으로 보다 안정적으로 만들고 또한 단백질가수분해성 분해에 대한 내성을 증가시킨다.
입체구조적으로 제한된 베타 턴 및 베타 벌지(Beta bulge)를 생성하는 방법은 예를 들어 미국 특허 제5,440,013호; 제5,618,914호; 및 제5,670,155호에 기술되어 있다. 베타-턴은 상응하는 백본 입체구조의 변화 없이 변화된 측면 치환체를 허용하고 표준 합성 절차에 의해 펩타이드 내로 혼입시키기에 적절한 말단을 갖는다. 다른 유형의 모방체 턴은 리버스 턴 및 감마 턴을 포함한다. 리버스 턴 모방체는 미국 특허 제5,475,085호 및 제5,929,237호에 개시되어 있고, 감마 턴 모방체는 미국 특허 제5,672,681호 및 제5,674,976호에 기술되어 있다.
II. 펩타이드의 외인성 전달
일부 양상에서, 본 개시내용의 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산 분자가 있다. 특정 실시형태에서, 핵산 벡터는 세포가 본원에 개시된 단백질성 조성물 및 펩타이드 변이체를 발현할 수 있도록 하는 외인성 핵산 서열을 포함하도록 작제될 수 있다. 이들 벡터의 성분 및 전달 방법에 대한 세부 사항은 하기 개시되어 있다.
다양한 실시형태에서, 본원에 개시된 폴리펩타이드를 암호화하는 DNA 작제물 또는 벡터가 제공된다. 유전자 변형도 세포 내로 도입될 수 있다. 이러한 변형은 예를 들어 폴리펩타이드를 발현하는 세포의 생성을 위해 세포를 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터로 형질도입하는 것을 포함한다.
본 개시내용에 따른 세포는, 본원에 개시된 단백질성 조성물 및 펩타이드 서열이 도입되는 임의의 세포를 포함한다. 세포가 본원에 개시된 단백질성 조성물 및 폴리펩타이드 서열을 발현할 수 있도록 하기 위해 외인성 핵산 서열을 포함하도록 작제된 DNA 작제물 또는 벡터는 본원에 기술된 바와 같이 도입 및 발현될 수 있다. 본원에 기술된 본 개시내용의 기본 개념은 세포 유형에 의해 제한되지 않음을 이해해야 한다. 본 개시내용에 따른 세포는 진핵 세포, 포유동물 세포, 동물 세포, 인간 세포 등을 포함한다. 또한, 세포는 기능적 단백질의 생산을 조절하는 데 유익하거나 바람직할 수 있는 임의의 세포를 포함한다.
A. 벡터
일부 실시형태에서, 본원에 개시된 폴리펩타이드는 폴리펩타이드 또는 이의 일부를 암호화하는 핵산을 프로모터에 작동 가능하게 연결하고, 작제물을 세포에 의해 흡수되고 발현되는 발현 벡터에 혼입함으로써 달성된다. 벡터는 복제 및 일부 경우에 진핵생물에서의 통합에 적합할 수 있다. 전형적인 클로닝 벡터는 원하는 핵산 서열의 발현 조절에 유용한 전사 및 번역 종결자, 개시 서열 및 프로모터를 함유한다. 예를 들어, 핵산은 플라스미드, 파지미드, 파지 유도체, 동물 바이러스 및 코스미드를 포함하지만 이에 제한되지 않는 벡터로 클로닝될 수 있다. 특히 관심대상의 벡터는 발현 벡터, 복제 벡터, 프로브 생성 벡터 및 시퀀싱 벡터를 포함한다. 일반적으로, 적합한 벡터는 적어도 하나의 유기체 내의 기능적인 복제 기점, 프로모터 서열, 편리한 제한 엔도뉴클레아제 부위, 및 하나 이상의 선택 마커를 함유한다(예를 들어, WO 01/96584; WO 01/29058; 및 미국 특허 제6,326,193호). 일부 실시형태에서, 적합한 벡터는 혈뇌 장벽을 통과할 수 있다.
특정 실시형태에서, 발현 벡터는 비-바이러스 벡터의 형태로 세포에 제공될 수 있다. 예를 들어, 비-바이러스 벡터는 미니서클 벡터를 포함할 수 있다. 미니서클은 유전자 요법을 위해 새롭게 개발된 DNA 운반체의 한 가지 유형이다. 미니서클의 주요 장점은 바이러스 또는 세균 유전자 요소가 최소이고 고수준 단백질 발현이 지속되는 깨끗한 유전자 배경을 포함하며, 미니서클의 작은 크기는 약물 전달을 위한 에어로졸에서 사용할 수 있도록 한다. 비-바이러스 벡터는 pcDNA3.1(+) 벡터를 포함할 수 있다. 비-바이러스 벡터는 서열번호 26과 적어도 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는 뉴클레오타이드 서열을 포함할 수 있다.
특정 실시형태에서, 발현 벡터는 바이러스 벡터의 형태로 세포에 제공될 수 있다. 바이러스 벡터 기술은 당업계에 잘 알려져 있으며, 예를 들어 문헌[Sambrook et al. (2001) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, New York)] 및 기타 바이러스학 및 분자생물학 매뉴얼에 기술되어 있다.
포유동물 세포로의 유전자 전달을 위한 다수의 바이러스 기반 시스템이 개발되었다. 벡터로서 유용한 바이러스는 레트로바이러스, 아데노바이러스, 아데노-관련 바이러스, 헤르페스 바이러스 및 렌티바이러스(자가 불활성화 렌티바이러스 벡터 포함)를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 예를 들어, 아데노바이러스는 유전자 전달 시스템을 위한 편리한 플랫폼을 제공한다. 선택된 유전자는 당업계에 공지된 기술을 사용하여 벡터에 삽입되고 레트로바이러스 입자에 패키징(packaging)될 수 있다. 그 다음, 재조합 바이러스는 단리되어 생체내 또는 생체외 대상체의 세포로 전달될 수 있다. 따라서, 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드 서열을 암호화하는 핵산은 예를 들어 렌티바이러스, 레트로바이러스, 감마-레트로바이러스, 아데노-관련 바이러스(AAV), 헤르페스 바이러스 또는 아데노 바이러스를 포함하는 바이러스 벡터와 같은 재조합 벡터를 사용하여 세포 내로 도입된다.
벡터는 또한 유전자 전달 및/또는 유전자 발현을 추가로 조정하거나 그 밖에 표적화된 세포에 유익한 특성을 제공하는 다른 성분 또는 기능을 포함할 수 있다. 이러한 다른 성분은 예를 들어 세포에 대한 결합 또는 표적화에 영향을 미치는 성분(세포 유형 또는 조직-특이적 결합을 매개하는 성분을 포함함); 세포에 의한 벡터 핵산의 흡수에 영향을 미치는 성분; 흡수 후 세포 내 폴리뉴클레오타이드의 국소화에 영향을 미치는 성분(예컨대, 핵 국소화를 매개하는 제제); 및 폴리뉴클레오타이드의 발현에 영향을 미치는 성분을 포함한다.
이러한 성분은 또한 벡터에 의해 전달된 핵산을 흡수하여 발현하는 세포를 검출하거나 선택하는 데 사용될 수 있는 검출가능 및/또는 선택 마커와 같은 마커를 포함할 수 있다. 이러한 성분은 벡터의 천연 특징(예컨대, 결합 및 흡수를 매개하는 성분 또는 기능을 갖는 특정 바이러스 벡터의 사용)으로서 제공될 수 있거나, 벡터는 이러한 기능을 제공하도록 변형될 수 있다. 매우 다양한 이러한 벡터는 당업계에 공지되어 있고 일반적으로 이용 가능하다. 벡터가 숙주 세포에서 유지될 때, 벡터는 자율적 구조로서 유사분열 동안 세포에 의해 안정적으로 복제되거나, 숙주 세포의 게놈 내에 혼입되거나, 숙주 세포의 핵 또는 세포질에서 유지될 수 있다.
벡터에 포함된 진핵 발현 카세트는 특히 단백질-암호화 서열에 작동 가능하게 연결된 진핵 전사 프로모터를 포함하는 조절 요소, 개재 서열을 포함하는 스플라이스 신호, 전사 종결/폴리아데닐화 서열, 전사 후 조절 요소 및 복제 기점을 (5'에서 3' 방향으로) 함유한다.
1. 프로모터/인핸서
"프로모터"는 전사의 개시 및 속도가 제어되는 핵산 서열의 영역인 제어 서열이다. 이는 조절성 단백질 및 분자가 결합할 수 있는 유전 요소, 예컨대 RNA 폴리머라제 및 핵산 서열에서 특이적 전사를 개시하기 위한 기타 전사 인자를 함유할 수 있다. 문구 "작동적으로 위치된", "작동적으로 연결된", "제어 하에" 및 "전사 제어 하에"는 프로모터가 핵산 서열과 관련하여 해당 서열의 전사 개시 및/또는 발현을 제어하기에 올바른 기능적 위치 및/또는 배향으로 있는 것을 의미한다.
프로모터는 일반적으로 RNA 합성을 위한 시작 부위를 위치시키는 기능을 하는 서열을 포함한다. 이에 대한 가장 잘 알려진 예는 TATA 박스이지만, TATA 박스가 결여된 일부 프로모터, 예를 들어 포유동물 말단 데옥시뉴클레오티딜 트랜스퍼라제 유전자에 대한 프로모터 및 SV40 후기 유전자에 대한 프로모터에서, 시작 부위 위에 있는 개별 요소 자체는 개시 위치를 고정시키는 데 도움이 된다. 추가 프로모터 요소는 전사 개시 빈도를 조절한다. 전형적으로, 이들은 시작 부위의 30 내지 110 bp 상류 영역에 위치하지만, 수많은 프로모터가 시작 부위의 하류에도 기능적 요소를 함유하는 것으로 나타났다. 암호화 서열을 프로모터"의 제어 하에" 있도록 하기 위해, 전사 리딩 프레임의 전사 개시 부위의 5' 말단을 선택된 프로모터의 "하류"(즉, 3')에 위치시킨다. "상류" 프로모터는 DNA의 전사를 자극하고 암호화된 RNA의 발현을 촉진한다.
프로모터 요소 사이의 간격은 종종 유연하고, 따라서 요소가 반전되거나 서로 상대적으로 이동할 때 프로모터 기능이 보존된다. 예를 들어, 티미딘 키나제 프로모터에서, 프로모터 요소들 사이의 간격은 활성이 감소하기 시작하기 전에 50 bp 간격으로 증가될 수 있다. 프로모터에 따라, 개별 요소가 협력적으로 또는 독립적으로 기능하여 전사를 활성화할 수 있는 것으로 보인다. 프로모터는 핵산 서열의 전사 활성화에 관여하는 시스-작용 조절성 서열을 지칭하는 "인핸서"와 함께 사용되거나 사용되지 않을 수 있다.
프로모터는 암호화 분절 및/또는 엑손의 상류에 위치한 5' 비-암호화 서열을 단리함으로써 수득할 수 있는, 핵산 서열과 천연적으로 연관된 것일 수 있다. 이러한 프로모터는 "내인성"으로 지칭될 수 있다. 유사하게, 인핸서는 해당 서열의 하류 또는 상류에 위치한, 핵산 서열과 천연적으로 연관된 것일 수 있다. 대안적으로, 암호화 핵산 분절을, 천연 환경에서는 핵산 서열과 정상적으로 연관되지 않는 프로모터를 의미하는 재조합 또는 이종 프로모터의 제어 하에 위치시킴으로써 특정 이점을 얻을 수 있을 것이다. 재조합 또는 이종 인핸서는 또한 천연 환경에서 핵산 서열과 정상적으로 연관되지 않는 인핸서를 지칭한다. 이러한 프로모터 또는 인핸서는 다른 유전자의 프로모터 또는 인핸서, 및 임의의 다른 바이러스, 또는 원핵 또는 진핵 세포로부터 단리된 프로모터 또는 인핸서, 및 "천연 발생"이 아닌 즉, 상이한 전사 조절 영역의 상이한 요소 및/또는 발현을 변경하는 돌연변이를 함유하는 프로모터 또는 인핸서를 포함할 수 있다. 프로모터 및 인핸서의 핵산 서열을 합성에 의해 생성하는 것 이외에도, 본원에 개시된 조성물과 관련하여 PCR™을 포함하는 재조합 클로닝 및/또는 핵산 증폭 기술을 사용하여 서열을 생성할 수 있다(각각 그 전체가 본원에 참조로 구체적으로 포함된 미국 특허 제4,683,202호 및 제5,928,906호 참조). 또한, 미토콘드리아 등과 같은 비-핵 소기관 내에서 서열의 전사 및/또는 발현을 지시하는 제어 서열도 사용될 수 있는 것으로 고려된다.
당연히, 발현을 위해 선택된 소기관, 세포 유형, 조직, 기관 또는 유기체에서 DNA 분절의 발현을 효과적으로 지시하는 프로모터 및/또는 인핸서를 사용하는 것이 중요할 것이다. 분자생물학 분야의 숙련가는 일반적으로 단백질 발현을 위한 프로모터, 인핸서 및 세포 유형 조합의 사용을 알고 있다(예를 들어, 그 전체가 본원에 참조로 구체적으로 포함된 문헌[Sambrook et al. 1989] 참조). 사용되는 프로모터는 항시적(constitutive), 세포-특이적, 조직-특이적, 유도성일 수 있고/있거나, 예컨대 재조합 단백질 및/또는 펩타이드의 대규모 생산에 유리한 도입된 DNA 분절의 높은 수준의 발현을 지시하는 적절한 조건 하에 유용할 수 있다. 프로모터는 이종성 또는 내인성일 수 있다.
추가로, 임의의 프로모터/인핸서 조합(예를 들어, epd.isb-sib.ch/에서 월드 와이드 웹을 통한 Eukaryotic Promoter Data Base EPDB에 따라)도 발현을 구동하는데 사용될 수 있다. 기타 잠재적 프로모터의 비제한적 예에는 초기 또는 후기 바이러스 프로모터, 예컨대 SV40 초기 또는 후기 프로모터, 사이토메갈로바이러스(CMV) 즉시 초기 프로모터, 라우스 육종 바이러스(RSV) 초기 프로모터; 예를 들어, 베타 액틴 프로모터(Ng, 1989; Quitsche et al., 1989), GADPH 프로모터(Alexander et al., 1988, Ercolani et al., 1988), 메탈로티오네인 프로모터(Karin et al., 1989; Richards et al., 1984)와 같은 진핵 세포 프로모터; 및 사이클릭 AMP 반응 요소 프로모터(cre), 혈청 반응 요소 프로모터(sre), 포르볼 에스테르 프로모터(TPA) 및 최소 TATA 박스 근처의 반응 요소 프로모터(tre)와 같은 병합된(concatenated) 반응 요소 프로모터가 포함된다. 인간 성장 호르몬 프로모터 서열(예를 들어, Genbank에 기재된 인간 성장 호르몬 최소 프로모터, 수탁 번호 X05244, 뉴클레오타이드 283-341) 또는 마우스 유선 종양 프로모터(ATCC로부터 입수 가능함, 카탈로그 번호 ATCC 45007)를 사용하는 것도 가능하다. 구체적 예는 포스포글리세레이트 키나아제(PGK) 프로모터일 수 있다.
일부 실시형태에서, 폴리뉴클레오타이드의 발현은 항시적 프로모터에 의해 조절된다. 일부 실시형태에서, 항시적 프로모터는 CAG(CAGGS 또는 CBA로도 알려짐), EF-1알파, 유비퀴틴 또는 CMV이다.
일부 실시형태에서, 폴리뉴클레오타이드의 발현은 세포-특이적 프로모터에 의해 조절된다. 일부 실시형태에서 세포-특이적 프로모터는 뉴런-특이적 프로모터이다. 일부 실시형태에서, 뉴런-특이적 프로모터는 인간 시냅신 I(SYN) 프로모터, 마우스 칼슘/칼모듈린-의존성 단백질 키나제 II(CaMKII) 프로모터, 래트 튜불린 알파 I(Ta1), 래트 뉴런-특이적 에놀라제(NSE) 프로모터, 인간 혈소판 유래 성장 인자-베타 사슬(PDGF) 프로모터, 또는 THY1(CD90) 프로모터를 포함한다. 일부 실시형태에서, 세포-특이적 프로모터는 인간 시냅신 I이다.
일부 실시형태에서, 폴리뉴클레오타이드의 발현은 조직-특이적 프로모터에 의해 조절된다. 일부 실시형태에서 조직-특이적 프로모터는 맥락총-특이적 프로모터이다. 일부 실시형태에서, 맥락총-특이적 프로모터는 Prlr 프로모터, Spint2 프로모터 또는 F5 프로모터를 포함한다. 일부 실시형태에서 조직-특이적 프로모터는 간-특이적 프로모터이다. 간-특이적 프로모터는 예를 들어 그 전체가 본원에 참조로 구체적으로 포함된 문헌[L.M. Kattenhorn et al., Hum. Gene Ther. 27(12):947-961 (2016)]에서 기술되었다.
2. 프로테아제 절단 부위/자가-절단 펩타이드 및 내부 리보솜 결합 부위
적합한 프로테아제 절단 부위 및 자가-절단 펩타이드는 당업자에게 공지되어 있다(예를 들어, 문헌[Ryan et al., 1997; Scymczak et al., 2004] 참조). 프로테아제 절단 부위의 예는 푸린(furin) 프로테아제, 포티바이러스 NIa 프로테아제(예를 들어, 담배 식각 바이러스 프로테아제), 포티바이러스 HC 프로테아제, 포티바이러스 P1(P35) 프로테아제, 비오바이러스(byovirus) Nla 프로테아제, 비오바이러스 RNA-2-암호화 프로테아제, 아프토바이러스 L 프로테아제, 엔테로바이러스 2A 프로테아제, 리노바이러스 2A 프로테아제, 피코르나 3C 프로테아제, 코모바이러스 24K 프로테아제, 네포바이러스 24K 프로테아제, RTSV(벼 튠그로 간상 바이러스(rice tungro spherical virus)), 3C-유사 프로테아제, PY＼ IF(파스닙 황색 반점 바이러스) 3C-유사 프로테아제, 트롬빈, 인자 Xa 및 엔테로키나제의 절단 부위이다. 높은 절단 엄격성으로 인해, TEV(담배 식각 바이러스) 프로테아제 절단 부위를 사용할 수 있다. 일부 실시형태에서, 프로테아제 절단 부위는 푸린 프로테아제의 절단 부위이다.
예시적인 자가-절단 펩타이드("시스-작용 가수분해 요소"로도 불림, CHYSEL; deFelipe(2002) 참조)는 포티바이러스 및 카디오바이러스 2A 펩타이드로부터 유래한다. 특정 자가-절단 펩타이드는 FMDV(구제역 바이러스), 말 비염(equine rhinitis) A 바이러스, 토세어 아시그나(Thosea asigna) 바이러스) 및 돼지 테스코바이러스로부터 유래된 2A 펩타이드로부터 선택될 수 있다.
특정 개시 신호도 폴리시스트론 메시지에서의 암호화 서열의 효율적인 번역을 위해 사용될 수 있다. 이들 신호는 ATG 개시 코돈 또는 근접한 서열을 포함한다. 예를 들어, 개시 신호는 GCCACCAUGGG를 포함하는 아미노산 서열을 갖는 코작(Kozak) 컨센서스 서열을 포함할 수 있다. 문헌[Kozak, 1987; Harte et al., 2012]을 참조한다. ATG 개시 코돈을 포함하는 외인성 번역 제어 신호가 제공될 필요가 있을 수 있다. 당업자는 이것을 쉽게 결정하고 필요한 신호를 제공할 수 있을 것이다. 전체 삽입체의 번역을 보장하기 위해 개시 코돈이 원하는 암호화 서열의 리딩 프레임과 "프레임 내(in-frame)"여야 한다는 것은 잘 알려져 있다. 외인성 번역 제어 신호 및 개시 코돈은 천연 또는 합성일 수 있다. 발현의 효율성은 적절한 전사 인핸서 요소를 포함함으로써 향상될 수 있다.
특정 실시형태에서, 내부 리보솜 진입 부위(IRES) 요소의 사용을 사용하여 다중유전자 또는 폴리시스트론 메시지를 생성한다. IRES 요소는 5' 메틸화된 캡 의존적 번역의 리보솜 스캐닝 모델을 우회할 수 있고 내부 부위에서 번역을 시작할 수 있다(Pelletier and Sonenberg, 1988). 피코르나바이러스 과의 두 구성원(소아마비 및 뇌심근염)의 IRES 요소(Pelletier and Sonenberg, 1988)뿐만 아니라 포유동물 메시지로부터의 IRES(Macejak and Sarnow, 1991)도 기술되었다. IRES 요소는 이종 오픈 리딩 프레임에 연결될 수 있다. 각각이 IRES에 의해 분리된 다수의 오픈 리딩 프레임이 함께 전사되어 폴리시스트론 메시지를 생성할 수 있다. IRES 요소 덕분에, 각각의 오픈 리딩 프레임은 효율적인 번역을 위해 리보솜에 접근할 수 있다. 단일 메시지를 전사하기 위해 다수의 유전자를 단일 프로모터/인핸서를 사용하여 효율적으로 발현시킬 수 있다(각각 본원에 참조로 포함된 미국 특허 제5,925,565호 및 제5,935,819호 참조).
3. 다중 클로닝 부위
벡터는 다중 제한 효소 부위를 함유하는 핵산 영역인 다중 클로닝 부위(MCS)를 포함하며, 이들 중 임의의 것은 벡터를 분해하기 위해 표준 재조합 기술과 함께 사용될 수 있다(예를 들어, 그 전체가 본원에 참조로 구체적으로 포함된 문헌[Carbonelli et al., 1999, Levenson et al., 1998, and Cocea, 1997]). "제한 효소 분해"는 핵산 분자의 특정 위치에서만 기능하는 효소를 이용한 핵산 분자의 촉매적 절단을 지칭한다. 이러한 제한 효소 중 다수는 상업적으로 이용 가능하다. 이러한 효소의 사용은 당업자에 의해 널리 이해되고 있다. 흔히, 벡터는 MCS 내를 절단하여 외인성 서열이 벡터에 라이게이션(ligation)될 수 있도록 하는 제한 효소를 사용하여 선형화되거나 단편화된다. "라이게이션"은 서로 인접할 수 있거나 서로 인접하지 않을 수 있는 2개의 핵산 단편들 사이에 포스포디에스테르 결합을 형성하는 과정을 지칭한다. 제한 효소 및 라이게이션 반응을 수반하는 기술은 재조합 기술 분야의 숙련가에게 잘 알려져 있다.
4. 스플라이싱 부위
대부분의 전사된 진핵 RNA 분자는 RNA 스플라이싱을 거쳐 1차 전사체로부터 인트론을 제거할 것이다. 게놈 진핵 서열을 함유하는 벡터는 단백질 발현을 위한 전사체의 적절한 프로세싱을 보장하기 위해 공여자 및/또는 수용자 스플라이싱 부위를 필요로 할 수 있다(예를 들어, 본원에 참조로 포함된 문헌[Chandler et al., 1997] 참조).
5. 종결 신호
벡터 또는 작제물은 적어도 하나의 종결 신호를 포함할 수 있다. "종결 신호" 또는 "종결자"는 RNA 폴리머라제에 의한 RNA 전사체의 특이적 종결에 관여하는 DNA 서열로 구성된다. 따라서, 특정 실시형태에서 RNA 전사체체의 생성을 종료하는 종결 신호가 고려된다. 종결자는 원하는 메시지 수준을 달성하기 위해 생체내에서 필수적일 수 있다.
진핵 시스템에서, 종결자 영역은 또한 폴리아데닐화 부위를 노출시키기 위해 새로운 전사체의 부위-특이적 절단을 허용하는 특정 DNA 서열을 포함할 수 있다. 이는 전사체의 3' 말단에 약 200 A 잔기(폴리A)의 스트레치를 첨가하는 전문화된 내인성 폴리머라제에 신호를 보낸다. 이러한 폴리A 테일로 변형된 RNA 분자는 보다 안정한 것으로 보이고 더 효율적으로 번역된다. 따라서, 진핵생물이 관련된 다른 실시형태에서, 종결자는 RNA 절단을 위한 신호를 포함하고, 종결 신호는 메시지의 폴리아데닐화를 촉진한다. 종결자 및/또는 폴리아데닐화 부위 요소는 메시지 수준을 향상시키고 카세트로부터 다른 서열로의 판독을 최소화하는 역할을 할 수 있다.
고려되는 종결자는 예를 들어 소 성장 호르몬 종결자와 같은 유전자의 종결 서열, 또는 예를 들어 SV40과 같은 바이러스 종결 서열을 포함하지만 이에 제한되지 않는, 본원에 기술되어 있거나 당업자에게 공지된 임의의 공지된 전사 종결자를 포함한다. 특정 실시형태에서, 종결 신호는 예컨대 서열 절두로 인한 전사가능 또는 번역가능 서열의 결여일 수 있다.
6. 폴리아데닐화 신호
발현, 특히 진핵생물 발현에서, 전형적으로 전사체의 적절한 폴리아데닐화를 수행하기 위한 폴리아데닐화 신호가 포함될 것이다. 폴리아데닐화 신호의 성질은, 성공적인 실시에 결정적인 것으로 여겨지지 않으며, 임의의 이러한 서열이 사용될 수 있다. 예시적인 실시형태는 편리하고 다양한 표적 세포에서 잘 기능하는 것으로 알려진 SV40 폴리아데닐화 신호 또는 소 성장 호르몬 폴리아데닐화 신호를 포함한다. 폴리아데닐화는 전사체의 안정성을 증가시키거나 세포질 수송을 촉진할 수 있다.
7. 전사 후 조절 요소
본 개시내용에서 사용하기 위한 벡터는 또한 하나 이상의 전사 후 조절 요소(PRE)를 포함할 수 있다. PRE의 예는 우드척 간염 바이러스 PRE(WPRE), B형 간염 바이러스 PRE 및 인간 사이토메갈로바이러스 즉시 초기 유전자의 인트론 A를 포함한다. 추가 예 및 세부 사항에 대해 문헌[Sun et al. 2009 and Mariati et al. 2010]을 참조한다. 특정 실시형태에서, PRE는 WPRE이다. WPRE는, 전사될 때, 바이러스 벡터에 의해 전달되는 유전자의 발현을 향상시키는 3차 구조를 생성하는 DNA 서열이다.
8. 복제 기점
숙주 세포에서 벡터를 증식시키기 위해, 벡터는 하나 이상의 복제 기점 부위(종종 "ori"로 지칭됨), 예를 들어 상술된 바와 같은 EBV의 oriP, 또는 복제가 개시되는 특정 핵산 서열인, 분화 프로그래밍에서 유사하거나 향상된 기능을 갖는 유전적으로 조작된 oriP에 상응하는 핵산 서열을 함유할 수 있다. 대안적으로, 상술된 바와 같은 다른 염색체-외 복제 바이러스의 복제 기점 또는 자율 복제 서열(ARS)이 사용될 수 있다.
B. 벡터 전달
유전자 변형 또는 외인성 핵산의 세포로의 도입은 본원에 기술된 바와 같이 또는 당업자에게 공지된 바와 같이 세포의 형질전환을 위한 핵산 전달을 위한 임의의 적합한 방법을 사용할 수 있다. 유전자를 세포에 도입하고 발현시키는 방법은 당업계에 공지되어 있다. 발현 벡터와 관련하여, 벡터는 당업계의 임의의 방법에 의해 숙주 세포, 예를 들어 포유동물, 세균, 효모 또는 곤충 세포 내로 용이하게 도입될 수 있다. 예를 들어, 발현 벡터는 물리적, 화학적 또는 생물학적 수단에 의해 숙주 세포로 전달될 수 있다.
이러한 방법은 DNA의 직접 전달, 예컨대 생체외 형질감염(Wilson et al., 1989, Nabel et al, 1989); 형질도입; 바이러스성 형질도입; 미세주입((Harland and Weintraub, 1985; 본원에 참조로 포함된 미국 특허 제5,789,215호)을 포함하는 주입(각각 본원에 참조로 포함된 미국 특허 제5,994,624호, 제5,981,274호, 제5,945,100호, 제5,780,448호, 제5,736,524호, 제5,702,932호, 제5,656,610호, 제5,589,466호 및 제5,580,859호); 전기천공(본원에 참조로 포함된 미국 특허 제5,384,253호; Tur-Kaspa et al., 1986; Potter et al., 1984); 인산칼슘 침전(Graham and Van Der Eb, 1973; Chen and Okayama, 1987; Rippe et al., 1990); DEAE 덱스트란에 이어서 폴리에틸렌 글리콜 사용(Gopal, 1985); 직접적인 음파 로딩(Fechheimer et al., 1987); 뉴클레오펙션(nucleofection); 리포펙션 또는 리포좀 매개 형질감염(Nicolau and Sene, 1982; Fraley et al., 1979; Nicolau et al., 1987; Wong et al., 1980; Kaneda et al., 1989; Kato et al., 1991) 및 수용체-매개 형질감염(Wu and Wu, 1987; Wu and Wu, 1988); 미세발사체 또는 나노입자 충격(PCT 출원 제WO 94/09699호 및 제95/06128호; 각각 본원에 참조로 포함된 미국 특허 제5,610,042호; 제5,322,783호, 제5,563,055호, 제5,550,318호, 제5,538,877호 및 제5,538,880호); 실리콘 카바이드 섬유와의 교반(Kaeppler et al., 1990; 각각 본원에 참조로 포함된 미국 특허 제5,302,523호 및 제5,464,765호); 아그로박테리움-매개 형질전환(각각 본원에 참조로 포함된 미국 특허 제5,591,616호 및 제5,563,055호); 원형질체의 PEG-매개 형질전환(Omirulleh et al., 1993; 각각 본원에 참조로 포함된 미국 특허 제4,684,611호 및 제4,952,500호); 건조/억제-매개 DNA 흡수(Potrykus et al., 1985); 열 충격(Froger and Hall, 2007); 및 이러한 방법들의 조합을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다. 이와 같은 기술을 적용함으로써, 소기관(들), 세포(들), 조직(들) 또는 유기체(들)가 안정적으로 또는 일시적으로 변형될 수 있다.
폴리뉴클레오타이드를 숙주 세포 내로 도입하기 위한 물리적 방법은 인산칼슘 침전, 리포펙션, 입자 충격, 미세주입, 전기천공 등을 포함한다. 벡터 및/또는 외인성 핵산을 포함하는 세포를 생산하는 방법은 당업계에 잘 알려져 있다(예를 들어, 문헌[Sambrook et al. (2001) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, New York] 참조).
관심대상의 폴리뉴클레오타이드를 숙주 세포 내로 도입하기 위한 생물학적 방법은 관심대상의 폴리뉴클레오타이드 또는 전이유전자(transgene)가 삽입될 수 있는 DNA 및 RNA 벡터의 사용을 포함할 수 있다. 바이러스 벡터는 포유동물, 예를 들어 인간 세포 내로 유전자를 삽입하기 위해 가장 널리 사용되는 방법이 되었다. 다른 바이러스 벡터는 렌티바이러스, 폭스바이러스, 단순 포진 바이러스 I, 아데노바이러스 및 아데노-관련 바이러스 등으로부터 유도될 수 있다(예를 들어, 미국 특허 제5,350,674호 및 제5,585,362호 등 참조).
폴리뉴클레오타이드를 숙주 세포 내로 도입하기 위한 화학적 수단은 거대분자 복합체, 나노캡슐, 미소구체, 비드, 및 수중유 에멀젼, 미셀, 혼합 미셀 및 리포좀을 포함하는 지질-기반 시스템과 같은 콜로이드 분산 시스템을 포함한다. 또한 나노입자가 고려된다. 시험관내 및 생체내 전달 비히클로 사용하기 위한 예시적인 콜로이드 시스템은 리포좀(예를 들어, 인공 막 소포)이다.
예를 들어, 유전자 치료 방법 및 아데노-관련 바이러스를 사용하여 대상체에게 유전자를 전달하는 방법은 각각 그 전체가 본원에 참조로 구체적으로 포함된 US 6,967,018, WO2014/093622, US2008/0175845, US 2014/0100265, EP2432490, EP2352823, EP2384200, WO2014/127198, WO2005/122723, WO2008/137490, WO2013/1421 14, WO2006/128190, WO2009/134681, EP2341068, WO2008/027084, WO2009/054994, WO2014059031, US 7,977,049 및 WO 2014/059029에 기술되어 있다.
1. 리포좀-매개 형질감염
한 가지 예시적인 전달 비히클은 지질 및/또는 리포좀이다. 지질 제형의 사용은 핵산을 숙주 세포로 도입하기 위해 고려된다(시험관내, 생체외 또는 생체내) 또 다른 양상에서, 핵산은 지질과 회합될 수 있다. 지질과 회합된 핵산은 리포좀의 수성 내부에 캡슐화될 수 있고, 리포좀의 지질 이중층 내에 산재되어 있으며, 리포좀과 올리고뉴클레오타이드 둘 다와 회합된 연결 분자를 통해 리포좀에 부착되거나, 리포좀에 포획되거나, 리포좀과 복합체화되거나, 지질을 함유하는 용액에 분산되거나, 지질과 혼합되거나, 지질과 조합되거나, 지질 중 현탁액으로서 함유되거나, 미셀에 함유되거나 미셀과 복합체화되거나, 또는 다른 방식으로 지질과 회합될 수 있다. 지질, 지질/DNA 또는 지질/발현 벡터 관련 조성물은 용액 중의 임의의 특정 구조로 제한되지 않는다. 예를 들어, 이중층 구조로, 미셀로서 또는 "붕괴된" 구조로 존재할 수 있다. 이들은 또한 단순히 용액에 산재되어 크기 또는 모양이 균일하지 않은 응집체를 형성하는 것이 가능하다. 지질은 천연 발생 또는 합성 지질일 수 있는 지방 물질이다. 예를 들어, 지질은 지방산, 알코올, 아민, 아미노 알코올 및 알데히드와 같은 장쇄 지방족 탄화수소 및 이의 유도체를 함유하는 화합물 부류뿐만 아니라 세포질에서 천연적으로 발생하는 지방 액적을 포함한다.
특정 실시형태에서, 핵산은 예를 들어 리포좀과 같은 지질 복합체에 포획될 수 있다. 리포좀은 인지질 이중층 막 및 내부 수성 매질을 특징으로 하는 소포 구조이다. 다중라멜라(multilamellar) 리포좀은 수성 매질로 분리된 다수의 지질층을 갖는다. 이들은 인지질이 과량의 수용액에 현탁될 때 자발적으로 형성된다. 지질 성분은 폐쇄된 구조의 형성 전에 자가-재배열을 거치며 지질 이중층들 사이에 물과 용해된 용질을 포획한다(Ghosh and Bachhawat, 1991). 사용되는 리포좀의 양은 리포좀의 성질뿐만 아니라, 예를 들어 사용되는 세포에 따라 달라질 수 있으며, 예를 들어 100만 내지 1000만 세포당 약 5 내지 약 20 ㎍ 벡터 DNA가 고려될 수 있다.
리포좀-매개 핵산 전달 및 외래 DNA의 시험관내 발현은 매우 성공적이었다(Nicolau and Sene, 1982; Fraley et al., 1979; Nicolau et al., 1987). 배양된 닭 배아, HeLa 및 간암 세포에서의 리포좀-매개 전달 및 외래 DNA 발현 가능성도 입증되었다(Wong et al., 1980).
특정 실시형태에서, 리포좀은 적혈구응집 바이러스(HVJ)와 복합체화될 수 있다. 이는 세포막과의 융합을 촉진하고 리포좀-캡슐화된 DNA의 세포 진입을 촉진하는 것으로 나타났다(Kaneda et al., 1989). 다른 실시형태에서, 리포좀은 핵 비-히스톤 염색체 단백질(HMG-1)과 함께 복합체화되거나 사용될 수 있다(Kato et al., 1991). 또 다른 실시형태에서, 리포좀은 HVJ 및 HMG 1 둘 다와 함께 복합체화되거나 사용될 수 있다. 다른 실시형태에서, 전달 비히클은 리간드 및 리포좀을 포함할 수 있다.
다양한 실시형태에서, 사용하기에 적합한 지질은 상업적 공급원으로부터 입수할 수 있다. 예를 들어, 리포펙타민은 미국 매사추세츠주 월섬 소재의 Thermo Fisher Scientific로부터 입수할 수 있고; 디미리스틸 포스파티딜콜린("DMPC")은 미국 미주리주 세인트 루이스 소재의 Sigma로부터 입수할 수 있고; 디세틸 포스페이트("DCP")는 미국 뉴욕주 플레인뷰 소재의 K & K Laboratories로부터 입수할 수 있고; 콜레스테롤("Choi")은 Calbiochem-Behring로부터 입수할 수 있으며; 디미리스틸 포스파티딜글리세롤("DMPG") 및 기타 지질은 미국 앨라배마주 버밍엄 소재의 Avanti Polar Lipids, Inc.,로부터 입수할 수 있다. 클로로포름 또는 클로로포름/메탄올 중 지질 원액은 약 -20℃에서 저장할 수 있다. 클로로포름은 메탄올보다 쉽게 증발하기 때문에 유일한 용매로서 사용할 수 있다. "리포좀"은 둘러싸인 지질 이중층 또는 응집체의 생성에 의해 형성된 다양한 단일 및 다중 라멜라 지질 비히클을 포괄하는 일반적인 용어이다. 리포좀은 인지질 이중층 막 및 내부 수성 매질을 갖는 소포 구조를 갖는 것으로 특징지어질 수 있다. 다중 라멜라 리포좀은 수성 매질에 의해 분리된 다수의 지질층을 갖는다. 이들은 인지질이 과량의 수용액에 현탁될 때 자발적으로 형성된다. 지질 성분은 폐쇄된 구조가 형성되기 전에 자가-재배열을 거치며 지질 이중층들 사이에 물과 용해된 용질을 포획한다((Ghosh et al. (1991) Glycobiology 5: 505-510). 그러나, 용액에서 정상적인 소포 구조와 상이한 구조를 갖는 조성물도 포함된다. 예를 들어, 지질은 미셀 구조를 가정하거나 단순히 지질 분자의 불균일한 응집체로서 존재할 수 있다. 리포펙타민-핵산 복합체도 고려된다.
2. 전기천공
특정 실시형태에서, 핵산은 전기천공을 통해 세포 내로 도입된다. 전기천공은 세포와 DNA의 현탁액을 고전압 전기 방전에 노출시키는 것을 포함한다. 수용자 세포는 기계적 상처에 의한 변형에 더 취약해질 수 있다. 또한, 사용되는 벡터의 양은 사용되는 세포의 성질에 따라 달라질 수 있으며, 예를 들어 100만 내지 1000만 세포당 약 5 내지 약 20 ㎍ 벡터 DNA가 고려될 수 있다.
전기천공을 사용한 진핵 세포의 형질감염은 상당히 성공적이었다. 마우스 전(pre)-B 림프구는 인간 카파-면역글로불린 유전자로 형질감염되었고(Potter et al., 1984), 래트 간세포는 이러한 방식으로 클로람페니콜 아세틸트랜스퍼라제 유전자로 형질감염되었다(Tur-Kaspa et al., 1986).
3. 인산칼슘
다른 실시형태에서, 핵산은 인산칼슘 침전을 사용하여 세포 내로 도입된다. 인간 KB 세포는 이 기술을 사용하여 아데노바이러스 5 DNA(Graham and Van Der Eb, 1973)로 형질감염되었다. 또한, 마우스 L(A9), 마우스 C127, CHO, CV-1, BHK, NIH3T3 및 HeLa 세포는 이러한 방식으로 네오마이신 마커 유전자로 형질감염되었고(Chen and Okayama, 1987), 래트 간세포는 다양한 마커 유전자로 형질감염되었다(Rippe et al., 1990).
4. DEAE-덱스트란
또 다른 실시형태에서, 핵산은 DEAE-덱스트란에 이어서 폴리에틸렌 글리콜을 사용하여 세포 내로 전달된다. 이러한 방식으로, 리포터 플라스미드가 마우스 골수종 및 적백혈병 세포 내로 도입되었다(Gopal, 1985).
C. 선택 또는 스크리닝가능한 마커
외인성 핵산을 숙주 세포 내로 도입하는 방법 또는 다른 방식으로 세포를 본 발명의 억제제에 노출시키는 방법과 관계없이, 숙주 세포에서 재조합 DNA 서열의 존재를 확인하기 위해서는 다양한 검정을 수행할 수 있다. 이러한 검정은 예를 들어 서던 및 노던 블로팅, RT-PCR 및 PCR과 같은 당업자에게 잘 알려진 "분자 생물학적" 검정; 예를 들어 면역학적 수단(ELISA 및 웨스턴 블롯) 또는 본 개시내용의 범위 내에 속하는 제제를 식별하기 위한 본원에 기술된 검정에 의해, 특정 펩타이드의 존재 또는 부재를 검출하는 것과 같은 "생화학적" 검정을 포함한다.
특정 실시형태에서, 외인성 핵산을 함유하는 세포는 발현 벡터 또는 외인성 핵산 내에 마커를 포함시킴으로써 시험관내 또는 생체내에서 식별될 수 있다. 이러한 마커는 발현 벡터를 함유하는 세포를 쉽게 식별할 수 있도록 세포에 식별가능한 변화를 부여할 것이다. 일반적으로, 선택 마커는 선택을 허용하는 특성을 부여하는 것일 수 있다. 양성 선택 마커는 마커의 존재가 선택을 허용하는 것인 반면, 음성 선택 마커는 이의 존재가 선택을 방지하는 마커이다. 양성 선택 마커의 예는 약물 내성 마커이다.
조건의 구현에 기반하여 형질전환체의 구별을 가능하게 하는 표현형을 부여하는 마커 이외에도, 비색 분석을 기본으로 하는 GFP와 같은 스크리닝가능한 마커를 포함하는 다른 유형의 마커도 고려된다. 대안적으로, 단순 포진 바이러스 티미딘 키나아제(tk) 또는 클로람페니콜 아세틸트랜스퍼라제(CAT)와 같은 음성 선별 마커로서 스크리닝가능한 효소를 사용할 수 있다. 당업자는 또한 가능하게는 FACS 분석과 함께 면역학적 마커를 사용하는 방법을 알고 있을 것이다. 사용되는 마커는 유전자 산물을 암호화하는 핵산과 동시에 발현될 수 있는 한, 중요한 것으로 여겨지지 않는다. 선택 및 스크리닝가능한 마커의 추가 예는 당업자에게 잘 알려져 있다.
선택 마커는 외래 DNA를 세포 내로 도입하기 위한 형질감염 또는 기타 절차의 성공을 나타내기 위해 실험실 미생물학, 분자생물학 및 유전공학에서 사용되는 한 가지 유형의 리포터 유전자를 포함할 수 있다. 선택 마커는 종종 항생제 내성 유전자이고; 외부 DNA를 도입하는 절차를 거친 세포는 항생제를 함유한 배지에서 성장하였으며, 성장할 수 있는 이러한 세포는 도입된 유전 물질을 성공적으로 흡수하고 발현하였다. 선택 마커의 예는 제네티신에 대한 항생제 내성을 부여하는 Tn5로부터의 Abicr 유전자 또는 Neo 유전자를 포함한다.
스크리닝가능한 마커는 연구자가 원하는 세포와 원하지 않는 세포를 구별할 수 있게 해주는 리포터 유전자를 포함할 수 있다. 본 발명의 특정 실시형태는 특정 세포 계통을 나타내기 위해 리포터 유전자를 이용한다. 예를 들어, 리포터 유전자는 동시 발현을 위한 심실- 또는 심방-선택적 유전자의 암호화 영역과 일반적으로 연관된 심실- 또는 심방-선택적 조절 요소의 제어 하에 그리고 발현 요소 내에 위치할 수 있다. 리포터는 특정 계통의 세포를 약물 또는 기타 선택 압력 하에 놓이게 하거나 다른 방식으로 세포 생존력을 위태롭게 하지 않으면서 단리할 수 있도록 한다.
이러한 리포터의 예는 세포 표면 단백질(예를 들어, CD4, HA 에피토프), 형광 단백질, 항원 결정기 및 효소(예를 들어, β-갈락토시다제)를 암호화하는 유전자를 포함한다. 벡터 함유 세포는 예를 들어 세포 표면 단백질에 대한 형광-태그된 항체 또는 벡터 암호화된 효소에 의해 형광 생성물로 전환될 수 있는 기질을 사용하여 FACS에 의해 단리될 수 있다.
구체적 실시형태에서, 리포터 유전자는 형광 단백질이다. 거의 전체 가시광선 스펙트럼에 걸친 형광 방출 스펙트럼 프로필을 특징으로 하는 광범위한 형광 단백질 유전 변이체가 개발되었다(비제한적인 예에 대해서는 표 1 참조). 원래의 에쿼리아 빅토리아(Aequorea victoria) 해파리 녹색 형광 단백질에서의 돌연변이 유발 노력으로 청색에서 황색까지의 다양한 색상의 새로운 형광 프로브가 생성되었으며, 이들 중 일부는 생물학적 연구에서 가장 널리 사용되는 생체내 리포터 분자이다. 주황색과 적색 스펙트럼 영역에서 방출하는 더 긴 파장의 형광 단백질은 해양 말미잘, 디스코소마 스트리아타(Discosoma striata), 및 산호충(Anthozoa) 부류에 속하는 암초 산호에서 개발되었다. 청록색, 녹색, 황색, 주황색 및 짙은 적색 형광 방출을 갖는 유사한 단백질을 생산하기 위해 또 다른 종들이 조사되었다. 형광 단백질의 명도 및 안정성을 개선함으로써 전반적인 유용성을 향상시키기 위한 개발 연구 노력이 진행 중이다.
표: 형광 단백질 특성
I. 바이러스
본 개시내용의 양상은 바이러스의 치료 또는 예방에 관한 것이다. 일부 실시형태에서, 바이러스 감염의 치료 또는 예방 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 하나 이상의 항바이러스제를 포함하는 조성물이 개시된다.
A. 코로나바이러스
특정 실시형태에서, 바이러스는 코로나비리다에(Coronaviridae) 과로부터 유래된다. 코로나비리다에는 외피가 있는, 포지티브-센스, 단일-가닥 RNA 바이러스의 과이다. 코로나바이러스는 코로나비리다에 및 오르토코로나비리나에(Orthocoronavirinae)(또한 코로나비리나에로도 지칭됨)의 일반적인 명칭이다. 코로나비리다에 과는 2개의 아과, 5개의 속, 23개의 아속 및 대략 40개의 종으로 구성된다. 이들은 포지티브-센스 단일-가닥 RNA 게놈 및 나선 대칭을 갖는 뉴클레오캡시드를 갖는 외피가 있는 바이러스이다.
몇몇 코로나바이러스는 동물을 이들의 일차 숙주로서 이용하며, 또한 사람을 감염시키도록 진화되었다. 알파, 베타, 감마, 및 델타로 알려진 코로나바이러스의 4가지 주요한 하위-그룹이 있고, 사람을 감염시킬 수 있는 7가지 코로나바이러스가 있다. 4가지의 가장 흔한 코로나바이러스는 사람을 이들의 천연 숙주로서 이용하고, HCoV-229E(알파 코로나바이러스); HCoV-NL63(알파 코로나바이러스); HCoV-OC43(베타 코로나바이러스); HCoV-HKU1(베타 코로나바이러스)을 포함한다. 3가지의 다른 인간 코로나바이러스는 MERS-CoV(MERS를 유발하는 베타 코로나바이러스); SARS-CoV(SARS를 유발하는 베타 코로나바이러스); 및 SARS-CoV-2(코로나바이러스 질환 2019, 또는 COVID-19를 유발하는 신규한 코로나바이러스)이다.
코로나바이러스는 이들의 표면으로부터 돌출되어 있는 고유한 곤봉-모양의 스파이크를 갖고, 이는 전자 현미경 사진에서 태양 코로나를 연상시키는 이미지를 생성하고, 이로부터 이들의 명칭이 유래되었다. 바이러스 입자의 평균 직경은 약 120 nm(.12 ㎛)이다. 외피의 직경은 약 80 nm(.08 ㎛)이고, 스파이크는 약 20 nm(.02 ㎛) 길이이다. 바이러스의 스파이킹된 외부 아래에 바이러스 외피에 싸인 둥근 코어가 있다. 코어는 바이러스가 세포 내로 주입되어 이들을 감염시킬 수 있는 유전 물질을 포함한다.
바이러스 외피는 막(M), 외피(E), 및 스파이크(S) 구조 단백질이 앵커링되어 있는 지질 이중층으로 이루어져 있다. 외피 내부에는, 연속적인 비즈-온-어-스트링(beads-on-a-string) 유형 입체구조인 포지티브-센스 단일-가닥 RNA 게놈에 결합되어 있는, 뉴클레오캡시드(N) 단백질의 다중 카피로부터 형성된 나선 대칭의 뉴클레오캡시드가 있다. 코로나바이러스의 게놈 크기는 대략적으로 26 내지 32 킬로베이스의 범위이다. 코로나바이러스에 대한 게놈 구성은 5'-리더-UTR-레플리카제/트랜스크립타제-스파이크(S)-외피(E)-막(M)-뉴클레오캡시드(N)-3'UTR-폴리(A) 테일이다. 게놈의 첫번째 3분의 2를 차지하는 오픈 리딩 프레임 1a 및 1b는, 레플리카제/트랜스크립타제 다단백질을 암호화한다. 레플리카제/트랜스크립타제 다단백질 자체가 절단되어 비구조 단백질을 형성한다. 후자의 리딩 프레임은 4개의 주요 구조 단백질: 스파이크, 외피, 막, 및 뉴클레오캡시드를 암호화한다. 이들 리딩 프레임 사이에는 보조 단백질에 대한 리딩 프레임이 산재되어 있다. 보조 단백질의 수 및 이들의 기능은 특정 코로나바이러스에 따라 다르다.
지질 이중층 외피, 막 단백질, 및 뉴클레오캡시드는 숙주 세포의 외부에 있을 경우 바이러스를 보호한다. 스파이크 단백질은 코어 내에서부터 바이러스 표면까지 연장되어 있고, 바이러스가 체내에서 특정 세포를 인식하고 이에 결합하게 한다. 스파이크가 숙주 세포 상의 수용체와 체결(engage)하는 경우, 케스케이드가 촉발되어, 바이러스의 세포와 병합이 초래되며, 이는 바이러스가 이의 유전 물질을 방출하고 세포의 과정을 급습하여(overtake) 새로운 바이러스를 생성할 수 있도록 한다.
감염은 바이러스 스파이크(S) 당단백질이 이의 상보적 숙주 세포 수용체에 부착되는 경우 시작된다. 부착 후, 숙주 세포의 프로테아제는 수용체-부착된 스파이크 단백질을 절단하고 활성화시킨다. 이용가능한 숙주 세포 프로테아제에 따라, 절단 및 활성화는 세포내이입 또는 숙주 막과 바이러스 외피의 직접 융합에 의해 바이러스가 숙주 세포로 진입하게 한다. 숙주 세포 내로 진입 시, 바이러스 입자는 코팅되지 않고, 이의 게놈은 세포 세포질에 진입한다. 코로나바이러스 RNA 게놈은 5' 메틸화된 캡 및 3' 폴리아데닐화된 테일을 갖고, 이는 RNA가 번역을 위해 숙주 세포의 리보솜에 부착되게 한다. 숙주 리보솜은 바이러스 게놈의 초기 중첩 오픈 리딩 프레임을 번역하고, 긴 다단백질을 형성한다. 다단백질은 다단백질을 다중 비구조 단백질로 절단하는 이의 자체 프로테아제를 갖고 있다.
바이러스 진입에 이어서 바이러스의 복제가 뒤따른다. 다수의 비구조 단백질은 합쳐져서 다중-단백질 레플리카제-트랜스크립타제 복합체(RTC)을 형성한다. 주요 레플리카제-트랜스크립타제 단백질은 RNA-의존성 RNA 폴리머라제(RdRp)이다. 이는 RNA 가닥으로부터의 RNA의 복제 및 전사에 직접적으로 관여한다. 복합체 내의 다른 비구조 단백질은 복제 및 전사 과정을 돕는다. 엑소리보뉴클레아제 비구조 단백질은 예를 들어 RNA-의존성 RNA 폴리머라제가 결여된 교정 기능을 제공하여 복제에 대한 추가 정확도를 제공한다. 복합체의 주요 기능 중 하나는 바이러스 게놈을 복제하는 것이다. RdRp는 포지티브-센스 게놈 RNA로부터 네가티브-센스 게놈 RNA의 합성을 직접적으로 매개한다. 이에 이어서 네가티브-센스 게놈 RNA로부터 포지티브-센스 게놈 RNA의 복제가 뒤따른다. 복합체의 다른 중요한 기능은 바이러스 게놈을 전사하는 것이다. RdRp는 포지티브-센스 게놈 RNA로부터 네가티브-센스 서브게놈 RNA 분자의 합성을 직접적으로 매개한다. 이에 이어서 이들의 상응하는 포지티브-센스 mRNA에 대한 이들 네가티브-센스 서브게놈 RNA 분자의 전사가 뒤따른다.
복제된 포지티브-센스 게놈 RNA는 후손 바이러스의 게놈이 된다. mRNA는 초기 중복 리딩 프레임 후에 바이러스 게놈의 마지막 3분의 1의 유전자 전사체이다. 이들 mRNA는 숙주의 리보솜에 의해 구조 단백질 및 다수의 보조 단백질로 번역된다. RNA 번역은 소포체 내부에서 일어난다. 바이러스 구조 단백질 S, E, 및 M은 분비 경로를 따라서 골지체 중간 구획으로 이동한다. 여기에서, M 단백질은 뉴클레오캡시드에 대한 이의 결합 후 바이러스의 조립을 위해 요구되는 최대 단백질-단백질 상호작용을 지시한다. 그 다음, 후손 바이러스는 분비성 소포를 통한 세포외배출에 의해 숙주 세포로부터 방출된다.
코로나바이러스 스파이크 단백질의 이의 보체 숙주 세포 수용체와의 상호작용은 바이러스의 조직 향성, 감염력, 및 종 범위를 결정하 데 중심이 된다. 코로나바이러스는 주로 상피 세포 수용체를 표적화한다. 이들은 예를 들어 에어로졸, 매개물, 또는 대변-구강 경로에 의해 전파될 수 있다. 인간 코로나바이러스는 기도의 상피 세포를 감염시키지만, 동물 코로나바이러스는 일반적으로 소화관의 상피 세포를 감염시킨다. 예를 들어, SARS-CoV-2와 같은 코로나바이러스는, 스파이크 단백질 수용체 결합 도메인(RBD)을 세포 표면 상의 안지오텐신-전환 효소 2(ACE2) 수용체에 결합시킴으로써, 에어로졸 경로를 통해 폐의 인간 상피 세포를 감염시킬 수 있다.
WHO는 코로나바이러스 감염 및/또는 코로나바이러스 감염-후 증후군으로 인해 심각한 질병을 경험할 위험이 가장 높은 2개의 그룹이 65세 이상의 성인 및 만성 폐 질환, 중증 심장 상태, 중증 비만, 저하된 면역계, 또는 당뇨병을 포함하는 다른 기저 건강적 상태를 갖는 사람이라고 보고하였다. 인간에서, 코로나바이러스는 전형적으로 경증 내지 중증 독감-유사 증상을 갖는 호흡기 감염을 유발하지만, 정확한 증상은 코로나바이러스의 유형에 따라 다양하다. 4가지의 흔한 인간 코로나바이러스는 사람에서 콧물, 두통, 기침, 인후통 및 열이 발생하게 할 수 있다. 심폐 질환 또는 약화된 면역계를 갖는 대상체를 포함하는 대상체의 하위부류에서, 바이러스 감염은 보다 중증의 하기도 감염, 예컨대 폐렴 또는 기관지염으로 진행될 수 있다. 비교하면, 중증 MERS 및 SARS 감염은 종종 폐렴으로 진행된다. MERS의 다른 증상은 열, 기침, 및 숨참을 포함하지만, SARS는 열, 오한 및 몸살을 야기할 수 있다.
코로나바이러스는 대부분 환자에서 열, 기침, 및 숨참을 촉발하는 다양한 증상을 유발한다. 드문 증상은 현기증, 피로, 통증, 오한, 인후통, 후각 상실, 미각 상실, 두통, 오심, 구토, 및 설사를 포함한다. 응급 징후 또는 증상은 호흡 곤란, 지속적인 흉통 또는 압박, 새로운 혼란(new confusion), 및/또는 청색 입술 또는 얼굴을 포함할 수 있다. 코로나바이러스 감염의 합병증은 폐렴, 장기 부전, 호흡 부전, 혈액 응고, 심장 상태, 예컨대 심근병증, 급성 신장 손상, 및/또는 추가 바이러스 및 세균 감염을 포함할 수 있다.
본 개시내용은 코로나비리다에 과의 임의의 바이러스의 감염의 치료 또는 예방을 포함한다. 구체적 실시형태에서, 본 개시내용은 알파-, 베타-, 감마-, 및 델타코로나바이러스의 4가지 속을 포함하는 코로나비리나에 아과의 임의의 바이러스의 감염의 치료 또는 예방을 포함한다. 구체적 실시형태에서, 본 개시내용은 사르베코바이러스 아속 및 중증 급성 호흡기 증후군-관련 코로나바이러스 종; 엠베코바이러스 아속 및 인간 코로나바이러스 HKU1 종; 베타코로나바이러스 1 종을 포함하는 베타코로나바이러스의 속의 임의의 바이러스의 감염의 치료 또는 예방을 포함한다. 구체적 실시형태에서, 본 개시내용은 중동 호흡기 증후군 코로나바이러스(MERS-CoV), 인간 코로나바이러스 229E(HCoV-229E), 인간 코로나바이러스 NL63(HCoV-NL63), 인간 코로나바이러스 OC43(HCoV-OC43), 인간 코로나바이러스 HKU1(HCoV-HKU1), 중증 급성 호흡기 증후군 코로나바이러스(SARS-CoV), 및 중증 급성 호흡기 증후군 코로나바이러스 2(SARS-CoV-2, COVID-19를 유발하는 바이러스) 스트레인을 포함하는 중증 급성 호흡기 증후군-관련 코로나바이러스 종의 임의의 바이러스 감염의 치료 또는 예방을 포함한다. 본 개시내용은 적어도 SARS-CoV 및 SARS-CoV-2를 포함하는, HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43, HCoV-HKU1, 중동 호흡기 증후군 코로나바이러스 또는 중증 급성 호흡기 증후군-관련 코로나바이러스 종의 임의의 분리주(isolate), 스트레인, 유형(A형, B형 및 C형을 포함; Forster et al., 2020, PNAS, doi.org/10.1073/pnas.2004999117에서 월드 와이드 웹에서 이용 가능), 집락, 또는 하위집락의 감염의 치료 또는 예방을 포함한다. 구체적 실시형태에서, 바이러스는 29000 내지 30000, 29100 내지 29900, 29200 내지 29900, 29300 내지 29900, 29400 내지 29900, 29500 내지 29900, 29600 내지 29900, 29700 내지 29900, 29800 내지 29900, 또는 29780 내지 29900개 염기쌍 길이의 게놈 길이를 갖는다.
본 개시내용의 양상은 예를 들어, MERS-CoV S 단백질, HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질을 포함하지만 이에 제한되지 않는 코로나바이러스 스파이크(S) 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드에 관한 것이다. 일부 실시형태에서, MERS-CoV S 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드가 개시된다. 일부 실시형태에서, HCoV-229E S 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드가 개시된다. 일부 실시형태에서, HCoV-NL63 S 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드가 개시된다. 일부 실시형태에서, HCoV-OC43S 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드가 개시된다. 일부 실시형태에서, HCoV-HKU1 S 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드가 개시된다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV S 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드가 개시된다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 S 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드가 개시된다.
코로나바이러스 스파이크 단백질과 같은 바이러스 막 융합 단백질은 바이러스 외피 상의 올리고머성 클래스 I 막횡단 당단백질이다. 코로나바이러스 스파이크 단백질은 절단되어 N-말단 S1 영역 및 C-말단 S2 영역을 생성한다. S1 영역은 세포 표면 수용체 ACE2에 대한 부착을 담당하는 NTD 및 RBD 도메인을 함유하고, S2 영역은 삼량체화되어 주로 대규모 입체구조적 변화를 통해 바이러스 외피와 숙주 막의 융합을 유도하기 위한 연장된 "스템(stem)" 도메인을 형성한다. 막 융합을 담당하는 S2 영역의 단편은 코로나바이러스들 간에 서열에서 고도로 보존되어 있다. 따라서, 일부 실시형태에서, S2 단편은 MERS-CoV S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, S2 단편은 HCoV-229E S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, S2 단편은 HCoV-NL63 S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, S2 단편은 HCoV-OC43S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, S2 단편은 HCoV-HKU1 S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, S2 단편은 SARS-CoV S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, S2 단편은 SARS-CoV-2 S 단백질로부터 유래된다.
S2 영역이 볼드체로 표시되어 있고 S2 단편이 볼드체 및 밑줄로 표시되어 있는 SARS-CoV-2 S 단백질의 서열은 서열번호 1로서 제공된다:
MFVFLVLLPLVSSQCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAIHVSGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYYHKNNKSWMESEFRVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTNGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIADTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQDVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSPRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPTNFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIG VTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT (서열번호 1).
일부 실시형태에서, 본 개시내용의 폴리펩타이드는 SARS-CoV-2 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 서열번호 2에 상응하는 서열번호 1의 밑줄 표시된 부분, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는다.
일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 S 단백질의 S2 영역, 예를 들어 서열번호 2에 상응하는 서열번호 1의 볼드체 및 밑줄 표시된 부분으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질, HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질을 포함하지만 이에 제한되지 않는 코로나바이러스 스파이크(S) 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-NL63 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-OC43 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-HKU1 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV-2 S 단백질과 상호작용한다.
일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 S 단백질의 S2 영역, 예를 들어 서열번호 2에 상응하는 서열번호 1의 볼드체 및 밑줄 표시된 부분으로부터 유래된 폴리펩타이드는 코로나바이러스 스파이크(S) 단백질, 예를 들어 MERS-CoV S 단백질, HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-NL63 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-OC43 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-HKU1 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV-2 S 단백질과 올리고머화한다.
S2 영역이 볼드체 표시되어 있고 S2 단편이 볼드체 및 밑줄 표시되어 있는 SARS-CoV S 단백질의 서열은 서열번호 3으로서 제공된다:
MPMGSLQPLATLYLLGMLVASVLASGSDLDRCTTFDDVQAPNYTQHTSSMRGVYYPDEIFRSDTLYLTQDLFLPFYSNVTGFHTINHTFGNPVIPFKDGIYFAATEKSNVVRGWVFGSTMNNKSQSVIIINNSTNVVIRACNFELCDNPFFAVSKPMGTQTHTMIFDNAFNCTFEYISDAFSLDVSEKSGNFKHLREFVFKNKDGFLYVYKGYQPIDVVRDLPSGFNTLKPIFKLPLGINITNFRAILTAFSPAQDIWGTSAAAYFVGYLKPTTFMLKYDENGTITDAVDCSQNPLAELKCSVKSFEIDKGIYQTSNFRVVPSGDVVRFPNITNLCPFGEVFNATKFPSVYAWERKKISNCVADYSVLYNSTFFSTFKCYGVSATKLNDLCFSNVYADSFVVKGDDVRQIAPGQTGVIADYNYKLPDDFMGCVLAWNTRNIDATSTGNYNYKYRYLRHGKLRPFERDISNVPFSPDGKPCTPPALNCYWPLNDYGFYTTTGIGYQPYRVVVLSFELLNAPATVCGPKLSTDLIKNQCVNFNFNGLTGTGVLTPSSKRFQPFQQFGRDVSDFTDSVRDPKTSEILDISPCSFGGVSVITPGTNASSEVAVLYQDVNCTDVSTAIHADQLTPAWRIYSTGNNVFQTQAGCLIGAEHVDTSYECDIPIGAGICASYHTVSLLRSTSQKSIVAYTMSLGADSSIAYSNNTIAIPTNFSISITTEVMPVSMAKTSVDCNMYICGDSTECANLLLQYGSFCTQLNRALSGIAAEQDRNTREVFAQVKQMYKTPTLKYFGGFNFSQILPDPLKPTKRSFIEDLLFNKVTLADAGFMKQYGECLGDINARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDDMIAAYTAALVSGTATAGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIG VTQNVLYENQKQIANQFNKAISQIQESLTTTSTALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILSRLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQAAPHGVVFLHVTYVPSQERNFTTAPAICHEGKAYFPREGVFVFNGTSWFITQRNFFSPQIITTDNTFVSGNCDVVIGIINNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYVWLGFIAGLIAIVMVTILLCCMTSCCSCLKGACSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT (서열번호 3).
일부 실시형태에서, 본 개시내용의 폴리펩타이드는 SARS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 서열번호 4에 상응하는 서열번호 3의 밑줄 표시된 부분, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는다.
일부 실시형태에서, SARS-CoV S 단백질의 S2 영역, 예를 들어 서열번호 4에 상응하는 서열번호 3의 볼드체 및 밑줄 표시된 부분으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질, HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질을 포함하지만 이에 제한되지 않는 코로나바이러스 스파이크(S) 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-NL63 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-OC43 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-HKU1 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV-2 S 단백질과 상호작용한다.
일부 실시형태에서, SARS-CoV S 단백질의 S2 영역, 예를 들어 서열번호 4에 상응하는 서열번호 3의 볼드체 및 밑줄 표시된 부분으로부터 유래된 폴리펩타이드는 코로나바이러스 스파이크(S) 단백질, 예를 들어 MERS-CoV S 단백질, HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-NL63 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-OC43 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-HKU1 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV-2 S 단백질과 올리고머화한다.
S2 영역이 볼드체 표시되어 있고 S2 단편이 볼드체 및 밑줄 표시되어 있는 SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 서열은 서열번호 5로서 제공된다:
MFVFLVLLPLVSSQCVNLTTRTQLPPAYTNSFTRGVYYPDKVFRSSVLHSTQDLFLPFFSNVTWFHAISGTNGTKRFDNPVLPFNDGVYFASTEKSNIIRGWIFGTTLDSKTQSLLIVNNATNVVIKVCEFQFCNDPFLGVYHKNNKSWMESEFRVYSSANNCTFEYVSQPFLMDLEGKQGNFKNLREFVFKNIDGYFKIYSKHTPINLVRDLPQGFSALEPLVDLPIGINITRFQTLLALHRSYLTPGDSSSGWTAGAAAYYVGYLQPRTFLLKYNENGTITDAVDCALDPLSETKCTLKSFTVEKGIYQTSNFRVQPTESIVRFPNITNLCPFGEVFNATRFASVYAWNRKRISNCVADYSVLYNSASFSTFKCYGVSPTKLNDLCFTNVYADSFVIRGDEVRQIAPGQTGKIADYNYKLPDDFTGCVIAWNSNNLDSKVGGNYNYLYRLFRKSNLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGVEGFNCYFPLQSYGFQPTYGVGYQPYRVVVLSFELLHAPATVCGPKKSTNLVKNKCVNFNFNGLTGTGVLTESNKKFLPFQQFGRDIDDTTDAVRDPQTLEILDITPCSFGGVSVITPGTNTSNQVAVLYQGVNCTEVPVAIHADQLTPTWRVYSTGSNVFQTRAGCLIGAEHVNNSYECDIPIGAGICASYQTQTNSHRRARSVASQSIIAYTMSLGAENSVAYSNNSIAIPINFTISVTTEILPVSMTKTSVDCTMYICGDSTECSNLLLQYGSFCTQLNRALTGIAVEQDKNTQEVFAQVKQIYKTPPIKDFGGFNFSQILPDPSKPSKRSFIEDLLFNKVTLADAGFIKQYGDCLGDIAARDLICAQKFNGLTVLPPLLTDEMIAQYTSALLAGTITSGWTFGAGAALQIPFAMQMAYRFNGIG VTQNVLYENQKLIANQFNSAIGKIQDSLSSTASALGKLQDVVNQNAQALNTLVKQLSSNFGAISSVLNDILARLDKVEAEVQIDRLITGRLQSLQTYVTQQLIRAAEIRASANLAATKMSECVLGQSKRVDFCGKGYHLMSFPQSAPHGVVFLHVTYVPAQEKNFTTAPAICHDGKAHFPREGVFVSNGTHWFVTQRNFYEPQIITTHNTFVSGNCDVVIGIVNNTVYDPLQPELDSFKEELDKYFKNHTSPDVDLGDISGINASVVNIQKEIDRLNEVAKNLNESLIDLQELGKYEQYIKWPWYIWLGFIAGLIAIVMVTIMLCCMTSCCSCLKGCCSCGSCCKFDEDDSEPVLKGVKLHYT (서열번호 5).
일부 실시형태에서, 본 개시내용의 폴리펩타이드는 SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 서열번호 6에 상응하는 서열번호 5의 밑줄 표시된 부분, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는다.
일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 S2 영역, 예를 들어 서열번호 6에 상응하는 서열번호 5의 볼드체 및 밑줄 표시된 부분으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질, HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질을 포함하지만 이에 제한되지 않은 코로나바이러스 스파이크(S) 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-NL63 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-OC43 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-HKU1 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV-2 S 단백질과 상호작용한다.
일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 S2 영역, 예를 들어 서열번호 6에 상응하는 서열번호 5의 볼드체 및 밑줄 표시된 부분으로부터 유래된 폴리펩타이드는 코로나바이러스 스파이크(S) 단백질, 예를 들어 MERS-CoV S 단백질, HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-NL63 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-OC43 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-HKU1 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, SARS-CoV-2 B.1.1.7 변이체 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV-2 S 단백질과 올리고머화한다.
S2 영역이 볼드체 표시되어 있고 S2 단편이 볼드체 및 밑줄 표시되어 있는 MERS-CoV S 단백질의 서열은 서열번호 7로서 제공된다:
MIHSVFLLMFLLTPTESYVDVGPDSAKSACIEVDIQQTFFDKTWPRPIDVSKADGIIYPQGRTYSNITITYQGLFPYQGDHGDMYVYSAGHATGTTPQKLFVANYSQDVKQFANGFVVRIGAAANSTGTVIISPSTSAIIRKIYPAFMLGSSVGNFSYGKMGRFFNHTLVLLPDGCGTLLRAFYCILEPRSGNYCPAGNSYTSFATYHTPATDCSDGNYNRNASLNSFKEYFNLRNCTFMYTYNITEDEILEWFGITQTAQGVHLFSSRYVDLYGGNMFQFATLPVYDTIKYYSIIPHSIRSIQSDRKAWAAFYVYKLQPLTFLLDFSVDGYIRRAIDCGFNDLSQLHCSYESFDVESGVYSVSSFEAKPSGSVVEQAEGVECDFSPLLFGTPPQVYNFKRLVFTNCNYNLTKLLSLFSVNDFTCSQISPAAIASNCYSSLILDYFSYPLSMKSDLSVSSAGPISQFNYKQSFSNPTCLILATVPHNLTTITKPLKYSYINKCSRLLSDDRTEVLQLVNANQYSPCVSIVPSTVWEDGDYYRKQLSPLEGGGWLVASGSTVAMTEQLQMGFGITVQYGTDTNSVCPKLEFANDTKIVSQLGNCVEYSLYGVSGRGVFQNCTAVGVPQQRFVYDAYQNLVGYYSDDGNYYCLRACVSVPVSVIYDKETKTHATLFGSVACEHISSTMSQYSRSTRSMLKRRDSTYGPLQTPVGCVLGLVNSSLFVEDCKLPLGQSLCALPDTPSTLTPRSVRSVPGEMRLASIAFNHPIQVDQLNSSYFKLSIPTNFSFGVTQEYIQTTIQKVTVDCKQYVCNGFQKCEQLLREYGQFCSKINQALHGANLRQDDSVRNLFESVKSSQSSPIIPGFGGDFNLTLLEPVSISTGSRSARSAIEDLLFDKVTIADPGYMQGYDDCMQQGPASARDLICAQYVAGYKVLPPLMDVNMEAAYTSSLLGSIAGVGWTAGLSSFAAIPFAQSIFYRLNGVG ITQQVLSENQKLIANKFNQALGAMQTGFTTTNEAFQKVQDAVNNNAQALSKLASELSNTFGAISASIGDIIQRLDVLEQDAQIDRLINGRLTTLNAFVAQQLVRSESAALSAQLAKDKVNECVKAQSKRSGFCGQGTHIVSFVVNAPNGLYFMHVGYYPSNHIEVVSAYGLCDSANPTNCIAPVNGYFIKTNNTRIVDEWSYTGSSFYAPEPITSLNTKYVAPQVTYQNISTNLPPPLLGNSTGIDFQDELDEFFKNVSTSIPNFGSLTQINTTLLDLTYEMLSLQQVVKALNESYIDLKELGNYTYYNKWPWYIWLSFIAGLVALALCVFFILCCTGCGTNCMGKLKCNRCCDRYEEYDLEPHKVHVH (서열번호 7).
일부 실시형태에서, 본 개시내용의 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, MERS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 서열번호 8에 상응하는 서열번호 7의 밑줄 표시된 부분, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는다.
일부 실시형태에서, MERS-CoV S 단백질의 S2 영역, 예를 들어 서열번호 8에 상응하는 서열번호 7의 볼드체 및 밑줄 부분으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질, HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질을 포함하지만 이에 제한되지 않는 코로나바이러스 스파이크(S) 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, MERS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, MERS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, MERS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-NL63 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, MERS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-OC43 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, MERS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-HKU1 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, MERS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, MERS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV-2 S 단백질과 상호작용한다.
일부 실시형태에서, MERS-CoV S 단백질의 S2 영역, 예를 들어 서열번호 8에 상응하는 서열번호 7의 볼드체 및 밑줄 표시된 부분으로부터 유래된 폴리펩타이드는 코로나바이러스 스파이크(S) 단백질, 예를 들어 MERS-CoV S 단백질, HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, MERS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, MERS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, MERS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-NL63 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, MERS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-OC43 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, MERS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-HKU1 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, MERS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, MERS-CoV S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV-2 S 단백질과 올리고머화한다.
S2 영역이 볼드체 표시되어 있고 S2 단편이 볼드체 및 밑줄 표시되어 있는 HCoV-229E S 단백질의 서열은 서열번호 9로서 제공된다:
MFVLLVAYALLHIAGCQTTNGLNTSYSVCNGCVGYSENVFAVESGGYIPSDFAFNNWFLLTNTSSVVDGVVRSFQPLLLNCLWSVSGLRFTTGFVYFNGTGRGDCKGFSSDVLSDVIRYNLNFEENLRRGTILFKTSYGVVVFYCTNNTLVSGDAHIPFGTVLGNFYCFVNTTIGNETTSAFVGALPKTVREFVISRTGHFYINGYRYFTLGNVEAVNFNVTTAETTDFCTVALASYADVLVNVSQTSIANIIYCNSVINRLRCDQLSFDVPDGFYSTSPIQSVELPVSIVSLPVYHKHTFIVLYVDFKPQSGGGKCFNCYPAGVNITLANFNETKGPLCVDTSHFTTKYVAVYANVGRWSASINTGNCPFSFGKVNNFVKFGSVCFSLKDIPGGCAMPIVANWAYSKYYTIGSLYVSWSDGDGITGVPQPVEGVSSFMNVTLDKCTKYNIYDVSGVGVIRVSNDTFLNGITYTSTSGNLLGFKDVTKGTIYSITPCNPPDQLVVYQQAVVGAMLSENFTSYGFSNVVELPKFFYASNGTYNCTDAVLTYSSFGVCADGSIIAVQPRNVSYDSVSAIVTANLSIPSNWTTSVQVEYLQITSTPIVVDCSTYVCNGNVRCVELLKQYTSACKTIEDALRNSARLESADVSEMLTFDKKAFTLANVSSFGDYNLSSVIPSLPTSGSRVAGRSAIEDILFSKLVTSGLGTVDADYKKCTKGLSIADLACAQYYNGIMVLPGVADAERMAMYTGSLIGGIALGGLTSAVSIPFSLAIQARLNYVA LQTDVLQENQKILAASFNKAMTNIVDAFTGVNDAITQTSQALQTVATALNKIQDVVNQQGNSLNHLTSQLRQNFQAISSSIQAIYDRLDTIQADQQVDRLITGRLAALNVFVSHTLTKYTEVRASRQLAQQKVNECVKSQSKRYGFCGNGTHIFSIVNAAPEGLVFLHTVLLPTQYKDVEAWSGLCVDGTNGYVLRQPNLALYKEGNYYRITSRIMFEPRIPTMADFVQIENCNVTFVNISRSELQTIVPEYIDVNKTLQELSYKLPNYTVPDLVVEQYNQTILNLTSEISTLENKSAELNYTVQKLQTLIDNINSTLVDLKWLNRVETYIKWPWWVWLCISVVLIFVVSMLLLCCCSTGCCGFFSCFASSIRGCCESTKLPYYDVEKIHIQ (서열번호 9).
일부 실시형태에서, 본 개시내용의 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, HCoV-229E S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 서열번호 10에 상응하는 서열번호 9의 밑줄 표시된 부분, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는다.
일부 실시형태에서, HCoV-229E S 단백질의 S2 영역, 예를 들어 서열번호 10에 상응하는 서열번호 9의 볼드체 및 밑줄 표시된 부분으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질, HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질을 포함하지만 이에 제한되지 않는 코로나바이러스 스파이크(S) 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-229E S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질. 일부 실시형태에서, HCoV-229E S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-229E S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-NL63 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-229E S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-OC43 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-229E S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-HKU1 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-229E S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-229E S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV-2 S 단백질과 상호작용한다.
일부 실시형태에서, HCoV-229E S 단백질의 S2 영역, 예를 들어 서열번호 10에 상응하는 서열번호 9의 볼드체 및 밑줄 표시된 부분으로부터 유래된 폴리펩타이드는 코로나바이러스 스파이크(S) 단백질, 예를 들어 MERS-CoV S 단백질, HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-229E S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-229E S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-229E S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-NL63 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-229E S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-OC43 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-229E S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-HKU1 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-229E S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-229E S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV-2 S 단백질과 올리고머화한다.
S2 영역이 볼드체 표시되어 있고 S2 단편이 볼드체 및 밑줄 표시되어 있는 HCoV-NL63 S 단백질의 서열은 서열번호 11로서 제공된다:
MKLFLILLVLPLASCFFTCNSNANLSMLQLGVPDNSSTIVTGLLPTHWFCANQSTSVYSANGFFYIDVGNHRSAFALHTGYYDANQYYIYVTNEIGLNASVTLKICKFSRNTTFDFLSNASSSFDCIVNLLFTEQLGAPLGITISGETVRLHLYNVTRTFYVPAAYKLTKLSVKCYFNYSCVFSVVNATVTVNVTTHNGRVVNYTVCDDCNGYTDNIFSVQQDGRIPNGFPFNNWFLLTNGSTLVDGVSRLYQPLRLTCLWPVPGLKSSTGFVYFNATGSDVNCNGYQHNSVVDVMRYNLNFSANSLDNLKSGVIVFKTLQYDVLFYCSNSSSGVLDTTIPFGPSSQPYYCFINSTINTTHVSTFVGILPPTVREIVVARTGQFYINGFKYFDLGFIEAVNFNVTTASATDFWTVAFATFVDVLVNVSATNIQNLLYCDSPFEKLQCEHLQFGLQDGFYSANFLDDNVLPETYVALPIYYQHTDINFTATASFGGSCYVCKPHQVNISLNGNTSVCVRTSHFSIRYIYNRVKSGSPGDSSWHIYLKSGTCPFSFSKLNNFQKFKTICFSTVEVPGSCNFPLEATWHYTSYTIVGALYVTWSEGNSITGVPYPVSGIREFSNLVLNNCTKYNIYDYVGTGIIRSSNQSLAGGITYVSNSGNLLGFKNVSTGNIFIVTPCNQPDQVAVYQQSIIGAMTAVNESRYGLQNLLQLPNFYYVSNGGNNCTTAVMTYSNFGICADGSLIPVRPRNSSDNGISAIITANLSIPSNWTTSVQVEYLQITSTPIVVDCATYVCNGNPRCKNLLKQYTSACKTIEDALRLSAHLETNDVSSMLTFDSNAFSLANVTSFGDYNLSSVLPQRNIRSSRIAGRSALEDLLFSKVVTSGLGTVDVDYKSCTKGLSIADLACAQYYNGIMVLPGVADAERMAMYTGSLIGGMVLGGLTSAAAIPFSLALQARLNYVA LQTDVLQENQKILAASFNKAINNIVASFSSVNDAITQTAEAIHTVTIALNKIQDVVNQQGSALNHLTSQLRHNFQAISNSIQAIYDRLDSIQADQQVDRLITGRLAALNAFVSQVLNKYTEVRGSRRLAQQKINECVKSQSNRYGFCGNGTHIFSIVNSAPDGLLFLHTVLLPTDYKNVKAWSGICVDGIYGYVLRQPNLVLYSDNGVFRVTSRVMFQPRLPVLSDFVQIYNCNVTFVNISRVELHTVIPDYVDVNKTLQEFAQNLPKYVKPNFDLTPFNLTYLNLSSELKQLEAKTASLFQTTVELQGLIDQINSTYVDLKLLNRFENYIKWPWWVWLIISVVFVVLLSLLVFCCLSTGCCGCCNCLTSSMRGCCDCGSTKLPYYEFEKVHVQ (서열번호 11).
일부 실시형태에서, 본 개시내용의 폴리펩타이드는 HCoV-NL63 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, HCoV-NL63 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 서열번호 12에 상응하는 서열번호 11의 밑줄 표시된 부분, 또는 이의 단편 또는 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는다.
일부 실시형태에서, HCoV-NL63 S 단백질의 S2 영역, 예를 들어 서열번호 12에 상응하는 서열번호 11의 볼드체 및 밑줄 표시된 부분으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질, HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질을 포함하지만 이에 제한되지 않는 코로나바이러스 스파이크(S) 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-NL63 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-NL63 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-NL63 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-NL63 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-NL63 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-OC43 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-NL63 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-HKU1 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-NL63 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-NL63 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV-2 S 단백질과 상호작용한다.
일부 실시형태에서, HCoV-NL63 S 단백질의 S2 영역, 예를 들어 서열번호 12에 상응하는 서열번호 11의 볼드체 및 밑줄 표시된 부분으로부터 유래된 폴리펩타이드는 코로나바이러스 스파이크(S) 단백질, 예를 들어 MERS-CoV S 단백질, HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-NL63 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-NL63 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-NL63 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-NL63 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-NL63 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-OC43 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-NL63 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-HKU1 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-NL63 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-NL63 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV-2 S 단백질과 올리고머화한다.
S2 영역이 볼드체 표시되어 있고 S2 단편이 볼드체 및 밑줄 표시되어 있는 HCoV-HKU1 S 단백질의 서열은 서열번호 13으로서 제공된다:
MFLIIFILPTTLAVIGDFNCTNSFINDYNKTIPRISEDVVDVSLGLGTYYVLNRVYLNTTLLFTGYFPKSGANFRDLALKGSIYLSTLWYKPPFLSDFNNGIFSKVKNTKLYVNNTLYSEFSTIVIGSVFVNTSYTIVVQPHNGILEITACQYTMCEYPHTVCKSKGSIRNESWHIDSSEPLCLFKKNFTYNVSADWLYFHFYQERGVFYAYYADVGMPTTFLFSLYLGTILSHYYVMPLTCNAISSNTDNETLEYWVTPLSRRQYLLNFDEHGVITNAVDCSSSFLSEIQCKTQSFAPNTGVYDLSGFTVKPVATVYRRIPNLPDCDIDNWLNNVSVPSPLNWERRIFSNCNFNLSTLLRLVHVDSFSCNNLDKSKIFGSCFNSITVDKFAIPNRRRDDLQLGSSGFLQSSNYKIDISSSSCQLYYSLPLVNVTINNFNPSSWNRRYGFGSFNLSSYDVVYSDHCFSVNSDFCPCADPSVVNSCAKSKPPSAICPAGTKYRHCDLDTTLYVKNWCRCSCLPDPISTYSPNTCPQKKVVVGIGEHCPGLGINEEKCGTQLNHSSCFCSPDAFLGWSFDSCISNNRCNIFSNFIFNGINSGTTCSNDLLYSNTEISTGVCVNYDLYGITGQGIFKEVSAAYYNNWQNLLYDSNGNIIGFKDFLTNKTYTILPCYSGRVSAAFYQNSSSPALLYRNLKCSYVLNNISFISQPFYFDSYLGCVLNAVNLTSYSVSSCDLRMGSGFCIDYALPSSRRKRRGISSPYRFVTFEPFNVSFVNDSVETVGGLFEIQIPTNFTIAGHEEFIQTSSPKVTIDCSAFVCSNYAACHDLLSEYGTFCDNINSILNEVNDLLDITQLQVANALMQGVTLSSNLNTNLHSDVDNIDFKSLLGCLGSQCGSSSRSLLEDLLFNKVKLSDVGFVEAYNNCTGGSEIRDLLCVQSFNGIKVLPPILSETQISGYTTAATVAAMFPPWSAAAGVPFSLNVQYRINGLG VTMDVLNKNQKLIANAFNKALLSIQNGFTATNSALAKIQSVVNANAQALNSLLQQLFNKFGAISSSLQEILSRLDNLEAQVQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDITLIKAGASRAIEKVNECVKSQSPRINFCGNGNHILSLVQNAPYGLLFIHFSYKPTSFKTVLVSPGLCLSGDRGIAPKQGYFIKQNDSWMFTGSSYYYPEPISDKNVVFMNSCSVNFTKAPFIYLNNSIPNLSDFEAELSLWFKNHTSIAPNLTFNSHINATFLDLYYEMNVIQESIKSLNSSFINLKEIGTYEMYVKWPWYIWLLIVILFIIFLMILFFICCCTGCGSACFSKCHNCCDEYGGHNDFVIKASHDD (서열번호 13).
일부 실시형태에서, 본 개시내용의 폴리펩타이드는 HCoV-HKU1 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, HCoV-HKU1 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 서열번호 14에 상응하는 서열번호 13의 밑줄 표시된 부분, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는다.
일부 실시형태에서, HCoV-HKU1 S 단백질의 S2 영역, 예를 들어 서열번호 14에 상응하는 서열번호 13의 볼드체 및 밑줄 표시된 부분으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질, HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질을 포함하지만 이에 제한되지 않는 코로나바이러스 스파이크(S) 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-HKU1 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-HKU1 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-HKU1 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-NL63 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-HKU1 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-OC43 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-HKU1 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-HKU1 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-HKU1 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-HKU1 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV-2 S 단백질과 상호작용한다.
일부 실시형태에서, HCoV-HKU1 S 단백질의 S2 영역, 예를 들어 서열번호 14에 상응하는 서열번호 13의 볼드체 및 밑줄 표시된 부분으로부터 유래된 폴리펩타이드는 코로나바이러스 스파이크(S) 단백질, 예를 들어 MERS-CoV S 단백질, HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-HKU1 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-HKU1 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-HKU1 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-NL63 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-HKU1 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-OC43 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-HKU1 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-HKU1 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-HKU1 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-HKU1 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV-2 S 단백질과 올리고머화한다.
S2 영역이 볼드체 표시되어 있고 S2 단편이 볼드체 및 밑줄 표시되어 있는 HCoV-OC43 S 단백질의 서열은 서열번호 15로서 제공된다:
MFLILLISLPTAFAVIGDLKCTSDNINDKDTGPPPISTDTVDVTNGLGTYYVLDRVYLNTTLFLNGYYPTSGSTYRNMALKGSVLLSRLWFKPPFLSDFINGIFAKVKNTKVIKDRVMYSEFPAITIGSTFVNTSYSVVVQPRTINSTQDGDNKLQGLLEVSVCQYNMCEYPQTICHPNLGNHRKELWHLDTGVVSCLYKRNFTYDVNADYLYFHFYQEGGTFYAYFTDTGVVTKFLFNVYLGMALSHYYVMPLTCNSKLTLEYWVTPLTSRQYLLAFNQDGIIFNAEDCMSDFMSEIKCKTQSIAPPTGVYELNGYTVQPIADVYRRKPNLPNCNIEAWLNDKSVPSPLNWERKTFSNCNFNMSSLMSFIQADSFTCNNIDAAKIYGMCFSSITIDKFAIPNGRKVDLQLGNLGYLQSFNYRIDTTATSCQLYYNLPAANVSVSRFNPSTWNKRFGFIEDSVFKPRPAGVLTNHDVVYAQHCFKAPKNFCPCKLNGSCVGSGPGKNNGIGTCPAGTNYLTCDNLCTPDPITFTGTYKCPQTKSLVGIGEHCSGLAVKSDYCGGNSCTCRPQAFLGWSADSCLQGDKCNIFANFILHDVNSGLTCSTDLQKANTDIILGVCVNYDLYGILGQGIFVEVNATYYNSWQNLLYDSNGNLYGFRDYIINRTFMIRSCYSGRVSAAFHANSSEPALLFRNIKCNYVFNNSLTRQLQPINYFDSYLGCVVNAYNSTAISVQTCDLTVGSGYCVDYSKNRRSRGAITTGYRFTNFEPFTVNSVNDSLEPVGGLYEIQIPSEFTIGNMVEFIQTSSPKVTIDCAAFVCGDYAACKSQLVEYGSFCDNINAILTEVNELLDTTQLQVANSLMNGVTLSTKLKDGVNFNVDDINFSPVLGCLGSECSKASSRSAIEDLLFDKVKLSDVGFVEAYNNCTGGAEIRDLICVQSYKGIKVLPPLLSENQISGYTLAATSASLFPPWTAAAGVPFYLNVQYRINGLG VTMDVLSQNQKLIANAFNNALYAIQEGFDATNSALVKIQAVVNANAEALNNLLQQLSNRFGAISASLQEILSRLDALEAEAQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDSTLVKFSAAQAMEKVNECVKSQSSRINFCGNGNHIISLVQNAPYGLYFIHFSYVPTKYVTARVSPGLCIAGDRGIAPKSGYFVNVNNTWMYTGSGYYYPEPITENNVVVMSTCAVNYTKAPYVMLNTSIPNLPDFKEELDQWFKNQTSVAPDLSLDYINVTFLDLQVEMNRLQEAIKVLNQSYINLKDIGTYEYYVKWPWYVWLLICLAGVAMLVLLFFICCCTGCGTSCFKKCGGCCDDYTGYQELVIKTSHDD (서열번호 15).
일부 실시형태에서, 본 개시내용의 폴리펩타이드는 HCoV-OC43 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, HCoV-OC43 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 서열번호 16에 상응하는 서열번호 15의 밑줄 표시된 부분, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는다.
일부 실시형태에서, HCoV-OC43 S 단백질의 S2 영역, 예를 들어 서열번호 16에 상응하는 서열번호 15의 볼드체 및 밑줄 표시된 부분으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질, HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질을 포함하지만 이에 제한되지 않는 코로나바이러스 스파이크(S) 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-OC43 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-OC43 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-OC43 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-NL63 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-OC43 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-OC43 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-OC43 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-HKU1 S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-OC43 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HCoV-OC43 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV-2 S 단백질과 상호작용한다.
일부 실시형태에서, HCoV-OC43 S 단백질의 S2 영역, 예를 들어 서열번호 16에 상응하는 서열번호 15의 볼드체 및 밑줄 표시된 부분으로부터 유래된 폴리펩타이드는 코로나바이러스 스파이크(S) 단백질, 예를 들어 MERS-CoV S 단백질, HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43, HCoV-HKU1 S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-OC43 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 MERS-CoV S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-OC43 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-OC43 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-NL63 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-OC43 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-OC43 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-OC43 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HCoV-HKU1 S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-OC43 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HCoV-OC43 S 단백질의 S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 SARS-CoV-2 S 단백질과 올리고머화한다.
B. 레트로바이러스
특정 실시형태에서, 바이러스는 레트로비리다에(Retroviridae) 과로부터 유래된다. 레트로바이러스는 레트로비리다에의 일반적인 명칭이다. 레트로비리다에는 외피가 있는 포지티브-센스, 단일 가닥 선형 RNA 바이러스 과이다. 레트로바이러스는 온코바이러스(Oncovirus), 렌티바이러스(Lentivirus), 스푸마바이러스(Spumavirus)의 3가지 아과로 분류된다. 레트로바이러스는 또한 전자현미경에서의 이들의 형태학적 유형에 기반하여 A형, B형, C형, D형으로 분류된다. A형 바이러스는 세포내에서 세포질 내로 또는 소포체 내에서 출아하고 감염성인 것으로 간주되지 않으며 전자 투명 코어를 가지고 있다. 이들은 내인성 바이러스이며 일부 동물 종은 이들의 염색체 DNA 내에 이들 A형 바이러스의 수천 개 카피를 가지고 있다. 이들의 기능은 아직 알려지지 않았다. B형 바이러스는 편심성(eccentric) 코어를 가지고 있으며 유선 종양 바이러스는 독점적으로 이 구조를 가지고 있다. 이들 바이러스는 일부 동물에서 내인성 및 외인성 바이러스로 존재하며, 발현될 경우 유선 종양을 유발할 수 있다. C형 바이러스는 중앙에 전자 고밀도 코어를 가지고 있으며, 대부분의 온코바이러스와 내인성 바이러스가 이 유형의 것이다. D형 바이러스는 막대 모양의 핵을 가지고 있으며 렌티바이러스는 이 유형의 것이다.
레트로바이러스의 비리온은 직경이 약 100 nm인 외피 입자로 구성된다. 외부 지질 외피는 당단백질로 구성된다. 비리온은 또한 길이가 7 내지 10 킬로베이스인 2개의 동일한 단일 가닥 RNA 분자를 함유한다. 두 분자는 상보적인 서열들 간의 염기쌍 결합에 의해 형성된 이량체로 존재한다. 두 RNA 분자 사이의 상호작용 부위는 키싱 스템-루프(kissing stem-loop)로서 식별되었다.
상이한 레트로바이러스의 비리온이 동일한 형태특징 또는 생물학을 갖지 않지만, 모든 비리온 성분은 매우 유사하다. 주요 비리온 성분은 다음과 같다:
외피: 지질(출아 과정 동안 숙주 원형질막으로부터 수득됨)뿐만 아니라 env 유전자에 의해 암호화된 당단백질로 구성됨. 레트로바이러스 외피는 3가지 뚜렷한 기능: 지질 이중층을 통한 세포외 환경으로부터 보호, 레트로바이러스가 엔도솜 막 수송(membrane trafficking)을 통해 숙주 세포에 진입하거나/숙주 세포를 빠져나갈 수 있도록 함 및 이들의 막과 융합하여 세포에 직접 진입하는 능력을 수행한다.
RNA: 이량체 RNA로 구성됨. 이는 5' 말단에 캡을 갖고 3' 말단에 폴리(A) 테일을 갖는다. 게놈 RNA(gRNA)는 숙주 RNA 폴리머라제 II(Pol II) 활성의 결과로 생성되며, 5' 메틸 캡 및 3' 폴리-A 테일을 첨가하여 숙주 mRNA로서 프로세싱된다. RNA 게놈은 또한 복제에 중요한 말단 비암호화 영역 및 유전자 발현을 위한 비리온 단백질을 암호화하는 내부 영역을 가지고 있다. 5' 말단은 R, U5, PBS 및 L의 4개 영역을 포함한다. R 영역은 성장하는 사슬에서 올바른 말단 간 전달을 보장하기 위해 역전사 동안 사용되는 게놈의 각 말단에 있는 짧은 반복 서열이다. 반면, U5는 R과 PBS 사이의 짧고 고유한 서열이다. PBS(프라이머 결합 부위)는 tRNA 프라이머의 3' 말단에 상보적인 18개의 염기로 구성된다. L 영역은 게놈 RNA의 패키징을 위한 신호를 제공하는 번역되지 않은 리더 영역이다. 3' 말단은 PPT(폴리퓨린 트랙), U3, R인 3개 영역을 포함한다. PPT는 역전사 과정에서 플러스 가닥 DNA 합성을 위한 프라이머이다. U3은 프로바이러스가 전사에 사용할 수 있는 신호 역할을 하는, PPT와 R 사이의 서열이다. R은 3' 말단에 있는 말단 반복 서열이다.
단백질: gag 단백질, 프로테아제(PR), pol 단백질 및 env 단백질로 구성됨. 그룹-특이적 항원(gag) 단백질은 비리온당 약 2000 내지 4000개 카피인, 바이러스 캡시드의 주요 성분이다. Gag는 매트릭스(MA) 및 뉴클레오캡시드(NC)를 포함하는 2개의 핵산 결합 도메인을 보유한다. 레트로바이러스 게놈 RNA를 특이적으로 인식하고 이에 결합하고 패키징하여 비리온을 조립하는 것은 Gag 단백질의 중요한 기능 중 하나이다. 세포 RNA와의 Gag 상호작용은 또한 조립의 양상을 조절한다. Gag의 발현만으로 원형질막으로부터 출아하는 미성숙 바이러스-유사 입자의 조립이 초래된다. 모든 레트로바이러스에서, Gag 단백질은 내부 구조 단백질의 전구체이다. 프로테아제(pro)는 상이한 바이러스에서 상이하게 발현된다. 이는 비리온 성숙 동안 단백질가수분해성 절단에서 기능하여 성숙한 gag 및 pol 단백질을 생성한다. 레트로바이러스 Gag 단백질은 비리온 조립의 여러 양상을 조정하는 역할을 담당한다. Pol 단백질은 바이러스 DNA의 합성 및 감염 후 숙주 DNA 내로의 통합을 담당한다. Env 단백질은 비리온의 회합 및 숙주 세포 내로의 진입에서 역할을 담당한다. env 유전자의 기능적 카피를 보유하는 것은 레트로바이러스를 레트로요소와 구별되게 만드는 것이다. 특정 세포 표면 수용체를 사용하여 표적 숙주 세포에 결합하는 레트로바이러스의 능력은 Env 단백질의 표면 성분(SU)에 의해 부여되는 반면, 막 융합을 통해 세포로 진입하는 레트로바이러스의 능력은 막-앵커링된 막횡단 성분(TM)에 의해 부여된다. 따라서, 레트로바이러스가 감염성일 수 있도록 하는 것은 Env 단백질이다.
레트로바이러스 게놈은 바이러스 입자로서 패키징된다. 이들 바이러스 입자는 단일 가닥의 포지티브-센스 선형 RNA 분자의 이량체이다. 레트로바이러스(및 일반적으로 오르터바이러스)는 RNA 게놈에서 5'-gag-pro-pol-env-3'의 배치를 따른다. gag 및 pol은 각각 캡시드 및 복제를 관리하는 다단백질을 암호화한다. pol 영역은 역전사효소, 프로테아제 및 인테그라제와 같은 바이러스 복제에 필요한 효소를 암호화한다. 바이러스에 따라, 유전자는 더 큰 다단백질 사슬로 겹쳐지거나 융합될 수 있다.
레트로바이러스는 숙주 세포 상의 수용체 단백질에 결합할 수 있는 당단백질을 함유하는 막을 갖고 있다. 세포 내에 3가지 효소: 프로테아제, 역전사효소 및 인테그라제를 가진 두 가닥의 RNA가 있다. 복제의 제1 단계는 수용체 단백질에 대한 당단백질의 결합이다. 일단 이들이 결합되면, 세포막은 분해되어 숙주 세포의 일부가 되고, RNA 가닥 및 효소는 세포로 진입한다. 세포 내에서, 역전사효소는 레트로바이러스 RNA로부터 상보적인 DNA 가닥을 생성하고 RNA는 분해된다; 이 DNA 가닥은 cDNA로 알려져 있다. 그 다음, cDNA가 복제되고, 두 가닥은 약한 결합을 형성하여 핵으로 진입한다. 일단 핵에 들어가면, DNA는 통합효소의 도움으로 숙주 세포의 DNA에 통합된다. 이 세포가 휴지기 상태로 있을 수 있거나, RNA가 DNA로부터 합성되어 새로운 레트로바이러스를 위한 단백질을 생성하는 데 사용될 수 있다. 리보솜 단위는 바이러스의 mRNA를 조면 소포체에서 단백질로 만들어질 수 있는 아미노산 서열로 번역하는 데 사용된다. 이 단계는 또한 바이러스 효소 및 캡시드 단백질을 만들 것이다. 바이러스 RNA는 핵에서 만들어질 것이다. 그 다음, 이 조각들은 함께 모여 새로운 레트로바이러스로서 세포막으로부터 떼어내 진다.
전사는 전통적으로 DNA로부터 RNA로만 발생하는 것으로 사료되었지만, 역전사효소는 RNA를 DNA로 전사한다. 레트로바이러스에서 용어 "레트로"는 정상적인 전사 방향의 역전(RNA로부터 DNA가 생성)을 의미한다. 이는 정보가 핵산으로부터 핵산으로 전달될 수 있지만 단백질로부터 단백질 또는 핵산으로 다시 전달될 수 없다는 분자 생물학의 중심 원리를 여전히 준수한다. 레트로바이러스 외부의 역전사효소 활성은 거의 모든 진핵생물에서 발견되었고, 레트로트랜스포존의 새로운 카피가 생성되고 숙주 게놈 내로 삽입될 수 있도록 한다. 이들 삽입체는 숙주의 효소에 의해 새로운 RNA 분자로 전사되고, 이는 세포질로 진입한다. 다음으로, 이들 RNA 분자 중 일부는 바이러스 단백질로 번역된다. 조면 소포체에서 글리코실화가 시작되고 env 유전자는 조면 소포체에서 스플라이싱된 mRNA로부터 외피 단백질의 분자로 번역된다. 외피 단백질 분자가 골지 복합체로 운반될 때, 이들 단백질 분자는 숙주 프로테아제에 의해 표면 당단백질 및 막횡단 당단백질로 나뉜다. 이들 2가지 당단백질 생성물은 긴밀한 관계를 유지하고, 추가 글리코실화 후에 원형질막으로 운반된다.
전세계적으로 3,500만 명 이상의 사람들이 AIDS를 유발하는 바이러스인 레트로바이러스 인간 면역결핍 바이러스(HIV)에 감염된다. 일단 체내에 있으면, HIV는 정상적으로는 감염으로부터 신체를 보호하는 면역 세포를 공격하고 파괴한다. 현재의 치료는 바이러스가 증식하는 것을 예방하는 데 도움이 된다.
치료의 부재 하에, HIV는 전형적으로 3단계를 거쳐 진행된다. 1단계는 급성 HIV 감염에 상응한다. 사람들은 이들의 혈중에 다량의 HIV를 갖고 매우 전염성이다. 일부 사람들은 감염 후 2 내지 4주 이내에 독감-유사 증상을 앓는다(급성 HIV 감염이라 불림). 이러한 증상은 수일 또는 수주 동안 지속될 수 있다. 가능한 증상은 발열, 두통, 오한, 발진, 야간 발한, 근육통 및 관절통, 인후통, 피로, 설사, 체중 감소, 기침, 림프절 부종 및 구강 궤양을 포함한다. 항원/항체 테스트 또는 핵산 테스트(NAT)만이 급성 감염을 진단할 수 있다.
2단계는 만성 HIV 감염에 상응한다. 이 단계는 무증상성 HIV 감염 또는 임상 잠복기로도 불린다. HIV는 여전히 활성이지만, 매우 낮은 수준으로 복제된다. 이 단계 동안에 사람들은 어떠한 증상도 갖지 않을 수 있거나 아플 수 있다. 다른 사람들은 증상성 HIV로 진행될 수 있으며 발열, 피로, 림프절 부종, 설사, 체중 감소, 구강 효모 감염(아구창), 대상포진(shingles, herpes zoster) 및 폐렴을 포함하는 증상을 가질 수 있다. HIV 의약을 복용하지 않으면, 이 기간은 10년 이상 지속될 수 있지만, 일부는 더 빨리 진행될 수 있다. 사람들은 이 단계에서 HIV를 전파할 수 있다. 이 단계의 종결시에, 혈중 HIV 양(바이러스 존재량이라 불림)이 증가하고 CD4 세포 수가 감소된다. 체내에서 바이러스 수준이 증가함에 따라 사람은 증상을 가질 수 있으며 사람은 3단계에 들어간다.
3단계는 HIV 감염의 가장 심각한 단계인 후천성 면역결핍 증후군(AIDS)에 상응한다. AIDS 환자는 이러한 심각하게 손상된 면역계 갖게 되어 이들은 점점 더 많은 기회 감염이라 불리는 중증 질병에 걸린다. 이러한 감염 중 일부의 징후 및 증상은 발한, 오한, 반복되는 발열, 만성 설사, 림프선 부종, 혀 또는 구강의 지속적인 백색 반점 또는 비정상적 병변, 지속적이고 설명할 수 없는 피로, 쇠약, 체중 감소 및 피부 발진 또는 돌기(bump)를 포함할 수 있다. 사람들은 CD4 세포 수가 200개 세포/mm 미만으로 저하될 때 또는 이들에서 특정 기회 감염이 발생하는 경우에 AIDS 진단을 받는다. AIDS에 걸린 사람들은 높은 바이러스 존재량을 가질 수 있고 매우 감염성일 수 있다. 치료를 받지 않으면, AIDS에 걸린 사람들은 전형적으로 약 3년 동안 생존한다.
HIV-1 테스트는 처음에 HIV-1에 대한 항체를 검출하기 위해 효소-결합 면역흡착 검정(ELISA)을 사용하여 수행된다. 초기 ELISA로부터 비-반응성 결과를 갖는 검체는, 감염된 파트너 또는 HIV 상태를 알 수 없는 파트너에 대한 새로운 노출이 발생하지 않는 한, HIV-음성으로 간주된다. 반응성 ELISA 결과를 갖는 검체는 이중으로 재테스트된다. 중복 테스트의 결과가 반응성인 경우, 검체는 반복적으로 반응성인 것으로 보고되며 보다 구체적인 보충 테스트(예를 들어, 폴리머라제 연쇄 반응(PCR), 웨스턴 블롯 또는 덜 통상적으로 면역형광 검정(IFA))과 함께 확인 테스트를 거친다. ELISA에 의해 반복적으로 반응성이고 IFA 또는 PCR에 의해 양성이거나 웨스턴 블롯에 의해 반응성인 검체는 HIV-양성으로 간주되며 HIV 감염을 나타낸다. 반복적으로 ELISA-반응성인 검체는 때때로 불확실한 웨스턴 블롯 결과를 제공하며, 이는 감염된 사람의 HIV에 대한 불완전한 항체 반응 또는 감염되지 않은 사람의 비특이적 반응일 수 있다.
HIV에 감염되기 위해서는, 감염된 혈액, 정액 또는 질 분비물이 신체에 유입되어야 한다. 이는 몇몇 방식으로 발생할 수 있다. 감염은 혈액, 정액 또는 질 분비물이 신체에 유입된 감염된 파트너와의 질, 항문 또는 구강 성교의 결과로서 발생할 수 있다. 바이러스는 때때로 성행위 동안 직장 또는 질에서 발생하는 구강 궤양 또는 작은 열상을 통해 신체에 진입할 수 있다. 감염은 오염된 IV 약물 비품(바늘 및 주사기)을 공유한 결과로서 발생할 수 있다. 감염은 수혈을 통한 전파의 결과로서 발생할 수 있다. 감염은 임신 또는 출산의 결과로서 또는 모유 수유를 통해 발생할 수 있다. 감염된 산모는 이들의 아기에게 바이러스를 전염시킬 수 있다.
어떠한 연령, 인종, 성별 또는 성적 취향의 어떠한 사람이라도 HIV/AIDS에 감염될 수 있다. 보호되지 않은 성관계, 성적 접촉으로 전파되는 질환 및 IV 약물 사용은 모두 HIV 감염 위험을 증가시키는 요인이다.
본 개시내용은 레트로비리다에 과의 임의의 바이러스의 감염의 치료 또는 예방을 포함한다. 특정 실시형태에서, 본 개시내용은 5개 속, 알파레트로바이러스, 베타레트로바이러스, 델타레트로바이러스, 엡실론레트로바이러스, 감마레트로바이러스 및 렌티바이러스를 포함하는 오르토레트로비리나에(Orthoretrovirinae) 아과 내의 임의의 바이러스의 감염의 치료 또는 예방을 포함한다. 구체적 실시형태에서, 본 개시내용은 인간을 감염시키고 시간이 지남에 따라 후천성 면역결핍 증후군(AIDS)을 유발하는 인간 면역결핍 바이러스 1 및 인간 면역결핍 바이러스 2 종을 포함하는 렌티바이러스 속의 임의의 바이러스의 감염의 치료 또는 예방을 포함한다.
본 개시내용의 양상은 HIV 스파이크(S) 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드에 관한 것이다. 잠재적인 HIV 치료제의 주요 표적은 Env로 알려진 스파이크-모양의 바이러스 단백질이다. Env는 HIV 바이러스 입자의 표면으로부터 뻗어있다. 상기 단백질은 당단백질 120(gp120)이라고 불리는 3개의 캡-유사 서브유닛 및 바이러스 막에 Env를 앵커링시키는 당단백질 41(gp41)이라고 불리는 3개의 스템-유사 서브유닛으로 구성된 3개의 이종이량체의 삼량체 구조이다. 몇몇 상이한 env 유전자의 구조 및 서열 분석은 Env 단백질이 1형 융합 기구임을 시사한다. 1형 융합 기구는 처음에 표적 세포 상의 수용체에 결합하여 입체구조적 변화를 촉발함으로써 융합 단백질의 결합을 허용한다. 융합 펩타이드는 숙주 세포막에 그 자체를 삽입하고 숙주 세포막을 바이러스 막에 매우 근접하게 하여 막 융합을 촉진한다.
env 유전자는 동종삼량체를 형성하고 숙주 세포 프로테아제인 퓨린에 의해 gp120 및 gp41로 절단되는 gp160 단백질을 암호화한다. 활성 융합 단백질을 형성하기 위해, 표면 단백질 gp120과 막횡단 단백질 gp41 폴리펩타이드는 비공유적으로 함께 결합된 상태로 유지되지만, 이러한 상호작용은 종종 안정하지 않아서 탈락된(shed), 가용성 gp120 및 막-결합된 gp41 스텀프(stump)를 유도한다.
Env 발현은 rev의 유전자 산물에 의해 조절된다. rev의 실험적 결실은 Env 단백질을 검출하지 못하게 하였고, 세포의 세포질에서 env mRNA 수준이 유의미하게 감소되었다. 그러나, 총 세포 RNA가 분석되었을 때, 총 env RNA는 rev 공동 발현의 존재 및 부재 하에 유의미한 차이가 없었다. rev 발현의 부재 하에서는 핵 env RNA의 현저한 증가가 있는 것으로 밝혀졌으며, 이는 rev가 env mRNA의 핵 외수송에서 중요한 역할을 한다는 것을 시사한다. Rev의 역할은, Rev가 트랜스로 작용하여 HIV-1의 env 유전자에 존재하는 특정 서열을 표적화함으로써 핵으로부터 불완전하게 스플라이싱된 HIV-1 RNA의 외수송을 개시한다는 것이 밝혀졌을 때 더욱 명확해졌다.
바이러스 외피의 표면에 노출된 당단백질 gp120은 이러한 수용체를 갖는 임의의 표적 세포, 특히 헬퍼 T 세포 상의 CD4 수용체에 결합한다. 숙주 세포에 결합하기 전에, gp120은 단백질에 묻혀 있고 당에 의해 보호되기 때문에 항체로부터 효과적으로 숨겨진 상태로 유지된다. gp120은 숙주 세포에 매우 근접해 있을 때에만 노출되며, 바이러스와 숙주 세포막 사이의 공간은 항체의 결합을 입체적으로 방해할 수 있을 만큼 충분히 작다.
당단백질 gp41은 gp120에 비-공유적으로 결합되고 HIV가 세포에 진입할 때 제2 단계를 제공한다. 이는 원래 바이러스 외피 내에 묻혀 있지만, gp120이 CD4 수용체에 결합할 때 gp120의 입체구조가 변화되어 gp41이 노출되고, 이때 숙주 세포와의 융합을 도울 수 있다.
gp41 단편이 볼드체 및 밑줄 표시되어 있는 HIV gp160 S 단백질의 서열은 서열번호 17로서 제공된다:
MRVKEKYQHLWRWGWRWGTMLLGMLMICSATEKLWVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDAKAYDTEVHNVWATHACVPTDPNPQEVVLVNVTENFNMWKNDMVEQMHEDIISLWDQSLKPCVKLTPLCVSLKCTDLKNDTNTNSSSGRMIMEKGEIKNCSFNISTSIRGKVQKEYAFFYKLDIIPIDNDTTSYKLTSCNTSVITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCNNKTFNGTGPCTNVSTVQCTHGIRPVVSTQLLLNGSLAEEEVVIRSVNFTDNAKTIIVQLNTSVEINCTRPNNNTRKRIRIQRGPGRAFVTIGKIGNMRQAHCNISRAKWNNTLKQIASKLREQFGNNKTIIFKQSSGGDPEIVTHSFNCGGEFFYCNSTQLFNSTWFNSTWSTEGSNNTEGSDTITLPCRIKQIINMWQKVGKAMYAPPISGQIRCSSNITGLLLTRDGGNSNNESEIFRPGGGDMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTKAKRRVVQREKR AVGIGALFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARQLLSGIVQQQNNLLRAIEAQQHLLQLTVWGIKQLQARILAVERYLKDQQLLGIWGCSGKLICTTAVPWNASWSNKSLEQIWNHTTWMEWDREINNYTSLIHSLIEESQNQQEKNEQELLELDKWASLWNWFNITNWLWYIKLFIMIVGGLVGLRIVFAVLSIVNRVRQGYSPLSFQTHLPTPRGPDRPEGIEEEGGERDRDRSIRLVNGSLALIWDDLRSLCLFSYHRLRDLLLIVTRIVELLGRRGWEALKYWWNLLQYWSQELKNSAVSLLNATAIAVAEGTDRVIEVVQGACRAIRHIPRRIRQGLERILL (서열번호 17).
일부 실시형태에서, 본 개시내용의 폴리펩타이드는 HIV gp160 S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, HIV gp160 S 단백질로부터 유래된 폴리펩타이드는 서열번호 18에 상응하는 서열번호 17의 볼드체 및 밑줄 표시된 부분, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는다.
일부 실시형태에서, HIV gp160 S 단백질, 예를 들어 서열번호 18에 상응하는 HIV gp160 S 단백질의 gp41 단편으로부터 유래된 폴리펩타이드는 레트로바이러스 스파이크(S) 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HIV gp160 S 단백질, 예를 들어 서열번호 18에 상응하는 HIV gp160 S 단백질의 gp41 단편으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HIV 스파이크(S) 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, HIV gp160 S 단백질, 예를 들어 서열번호 18에 상응하는 HIV gp160 S 단백질의 gp41 단편으로부터 유래된 폴리펩타이드는 레트로바이러스 스파이크(S) 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, HIV gp160 S 단백질, 예를 들어 서열번호 18에 상응하는 HIV gp160 S 단백질의 gp41 단편으로부터 유래된 폴리펩타이드는 HIV 스파이크(S) 단백질과 올리고머화한다.
C. 에볼라바이러스
특정 실시형태에서, 바이러스는 필로비리다에(Filoviridae) 과로부터 유래된다. 필로비리다에는 외피가 있는, 네가티브-센스, 단일 가닥 RNA 바이러스 과이다. 필로비리다에는 쿠에바바이러스(Cuevavirus), 디안로바이러스(Dianlovirus), 에볼라바이러스(Ebolavirus,), 마버그바이러스(Marburgvirus), 스트리아바이러스(Striavirus) 및 탐노바이러스(Thamnovirus)를 포함하는 6개 속으로 분류된다.
필로바이러스 생활 주기는 특이적 세포-표면 수용체에 대한 비리온 접착으로 시작하여, 세포막과 비리온 외피의 융합 및 바이러스 뉴클레오캡시드의 시토졸 내로의 방출이 뒤따른다. 바이러스 RNA-의존성 RNA 폴리머라제(RdRp, 또는 RNA 레플리카제)는 부분적으로 뉴클레오캡시드를 탈피복하여 유전자들을 포지티브 가닥 mRNA로 전사시키고, 이는 구조 및 비구조 단백질로 번역된다. 필로바이러스 RdRp는 게놈의 3' 말단에 위치한 단일 프로모터에 결합한다. 전사는 하나의 유전자 후에 종결하거나 하류의 그 다음 유전자로 계속된다. 이는 게놈의 3' 말단에 가까운 유전자가 가장 풍부하게 전사되는 반면, 유전체의 5' 말단을 향하는 유전자는 전사될 가능성이 거의 없음을 의미한다. 따라서, 유전자 순서는 간단하지만, 효과적인 전사 조절 형태이다. 생성된 가장 풍부한 단백질은 핵단백질이고, 세포 내 이의 농도는 RdRp가 유전자 전사로부터 게놈 복제로 전환될 때를 결정한다. 복제는 전장, 포지티브 가닥 항게놈(antigenome)을 생성하고, 이는 차례로 네가티브-가닥 바이러스 후손 게놈 카피로 전사된다. 새로이 합성된 구조 단백질 및 게놈은 자가-조립하고 세포막의 내부 근처에 축적된다. 비리온은 세포로부터 출아되어, 세포막으로부터 외피를 얻게 되어 여기에서 출아된다. 그 다음, 성숙한 자손 입자가 다른 세포를 감염시켜 주기를 반복한다.
에볼라 바이러스 질환(EVD) 및 에볼라 출혈열(EHF)로도 공지되어 있는 에볼라는 필로비리다에 과의 에볼라바이러스에 의해 유발되는 인간 및 다른 영장류의 바이러스 출혈열이다. EVD는 가장 흔히 사람 및 비인간 영장류(예컨대, 원숭이, 고릴라, 침팬지)에서 발생한다. 이는 에볼라바이러스 속의 바이러스 그룹: 에볼라 바이러스(자이르 에볼라바이러스(Zaire ebolavirus) 종), 수단 바이러스(수단 에볼라바이러스(Sudan ebolavirus) 종), 타이 포레스트 바이러스(타이 포레스트 에볼라 바이러스(Tai Forest ebolavirus) 종, 이전에는 코트디부아르 에볼라바이러스(Cote d'Ivoire ebolavirus)), 분디부교 바이러스(분디부교 에볼라바이러스(Bundibugyo ebolavirus) 종), 레스톤 바이러스(레스톤 에볼라바이러스(Reston ebolavirus) 종) 및 봄발리 바이러스(봄발리 에볼라바이러스(Bombali ebolavirus) 종)에 의한 감염으로 인해 유발된다. 이들 중, 4가지(에볼라, 수단, 타이 포레스트, 분디부교 바이러스)만이 사람에서 질환을 유발하는 것으로 공지되어 있다. 레스톤 바이러스는 비인간 영장류 및 돼지에게 질환을 유발하지만, 사람에서는 유발하지 않는 것으로 공지되어 있다. 박쥐에서 최근에 식별된 봄발리 바이러스가 동물 또는 사람에서 질환을 유발하는지는 알려져 있지 않다.
에볼라바이러스는 단일 가닥 비-감염성 RNA 게놈을 함유한다. 에볼라바이러스 게놈은 3'-UTR-NP-VP35-VP40-GP-VP30-VP24-L-5'-UTR을 포함한 7개의 유전자를 함유한다. 5가지 상이한 에볼라바이러스(BDBV, EBOV, RESTV, SUDV 및 TAFV)의 게놈은 서열 및 유전자 중복의 수와 위치가 상이하다. 모든 필로바이러스와 마찬가지로, 에볼라바이러스 비리온은 "U" 또는 "6"의 목양자의 지팡이 모양으로 보일 수 있는 사상체 입자이며, 이들은 코일형, 토로이드형 또는 분지형일 수 있다. 일반적으로, 에볼라 비리온은 폭이 80 나노미터(nm)이고 길이가 최대 14,000 nm일 수 있다.
징후 및 증상은 전형적으로 바이러스와 접촉한 후 2일 내지 3주 이내에 발열, 인후통, 근육통, 쇠약, 피로 및 두통으로 시작한다. 간 및 신장의 기능 저하와 함께, 일반적으로 구토, 설사, 복통 및 발진이 뒤따른다. 이때, 일부 사람은 내부 및 외부 둘 다에서 출혈이 시작한다. 이 질환은 사망 위험이 높아서, 감염된 사람의 25 내지 90%가 사망하며 평균은 약 50%이다. 이는 종종 체액 손실로 인한 쇼크 때문이며, 전형적으로 증상이 나타난지 6 내지 16일 후에 뒤따른다.
바이러스는 감염된 인간 또는 다른 동물로부터의 혈액과 같은 체액과의 직접적인 접촉을 통해 확산된다. 확산은 또한 최근 체액으로 오염된 품목과의 접촉으로 인해 발생할 수 있다. 인간을 포함하는 영장류 간의 공기를 통한 질환 확산은 실험실 또는 천연 조건에서 입증되지 않았다. EVD로부터 회복된 후 사람의 정액 또는 모유는 수 주 내지 수 개월 동안 바이러스를 전달할 수 있다. 과일 박쥐는 자연에서 바이러스의 영향을 받지 않으면서 바이러스를 확산시킬 수 있는 정상적인 보유자인 것으로 여겨진다.
EVD의 가능한 비특이적 실험실 지표는 낮은 혈소판 수; 초기에 백혈구 수가 감소한 후 백혈구 카운트의 증가; 간 효소 알라닌 아미노트랜스퍼라제(ALT) 및 아스파르테이트 아미노트랜스퍼라제(AST)의 수준 상승; 프로트롬빈 시간 연장, 부분 트롬보플라스틴 시간 및 출혈 시간과 같은 파종성 혈관내 응고(DIC)와 종종 일치하는 혈액 응고의 이상(異常)을 포함한다. EBOV와 같은 필로비리온은 전자현미경으로 검사된 세포 배양물에서 독특한 사상체 모양에 의해 식별될 수 있다.
EVD의 구체적인 진단은 바이러스를 단리하거나, RNA 또는 단백질을 검출하거나, 사람의 혈액에서 바이러스에 대한 항체를 검출함으로써 식별된다. 바이러스를 세포 배양에 의해 단리하고, 바이러스 RNA를 폴리머라제 연쇄 반응(PCR)에 의해 검출하고, 단백질을 효소 결합 면역흡착 분석(ELISA)에 의해 검출하는 것은 질환의 초기 병기에 가장 잘 사용되고 또한 인간의 유해에서 바이러스를 검출하기 위한 방법이다. 질환의 후기 병기 및 회복된 사람들에서는 바이러스에 대한 항체의 검출이 가장 신뢰할 수 있다. IgM 항체는 증상이 발생한지 2일 후에 검출 가능하며, IgG 항체는 증상이 발생한지 6일 내지 18일 후에 검출가능하다.
에볼라 환자를 돌보는 동안 적절한 감염 통제를 사용하지 않는 의료 종사자, 및 에볼라 환자와 밀접하게 접촉하는 가족 및 친구는 병에 걸릴 높은 위험이 있다. 에볼라는 사람들이 감염된 혈액 또는 체액과 접촉할 때 확산될 수 있다. 에볼라는 에볼라 환자를 돌보지 않거나 밀접 접촉(3피트 또는 1미터 이내)하지 않은 여행자 또는 일반 대중에게는 거의 위험하지 않다. 바이러스는 급성 감염 후 면역 특권 부위(immunologically privileged site)인 신체 영역에 잔류할 수 있다. 이는 에볼라 바이러스와 같은 바이러스 및 병원체가 체내의 다른 곳으로부터 제거된 후에도 생존자의 면역계로부터 보호되는 부위이다. 이들 영역은 고환, 안구의 내부, 태반 및 중추신경계, 특히 뇌척수액을 포함한다.
본 개시내용은 쿠에바바이러스, 디안로바이러스, 에볼라바이러스, 마버그바이러스, 스트리아바이러스 및 탐노바이러스의 6개의 속을 포함하는 필로비리다에 과의 임의의 바이러스 감염의 치료 또는 예방을 포함한다. 구체적 실시형태에서, 본 개시내용은 인간을 감염시키는, 에볼라 바이러스 종(자이르 에볼라바이러스 종), 수단 바이러스 종(수단 에볼라바이러스 종), 타이 포레스트 바이러스 종(타이 포레스트 에볼라 바이러스 종, 이전에는 코트디부아르 에볼라바이러스), 분디부교 바이러스 종(분디부교 에볼라바이러스 종)을 포함하는 에볼라바이러스 속의 임의의 바이러스 감염의 치료 또는 예방을 포함한다.
본 개시내용의 양상은 에볼라 바이러스(EBOV) 스파이크(S) 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드에 관한 것이다. EBOV는 점막 접촉 또는 피부 손상을 통해 인간을 감염시키는 것으로 사료된다. 감염 후, 내피 세포(혈관의 내부를 둘러싸고 있는 세포), 간 세포, 및 몇몇 유형의 면역 세포, 예컨대 대식세포, 단핵구, 수지상세포가 주요 공격 표적이다. 감염 후, 면역 세포는 바이러스를 인근 림프절로 운반하고, 여기에서 바이러스의 추가 복제가 발생한다. 여기로부터 바이러스는 혈류 및 림프계에 진입하여 신체 전체로 확산될 수 있다. 대식세포는 바이러스에 감염되는 최초의 세포이며, 이러한 감염은 프로그램된 세포 사멸을 초래한다. 림프구와 같은 다른 유형의 백혈구도 프로그램된 세포 사멸을 겪게 되어 혈액에서 비정상적으로 낮은 림프구 농도가 유도된다. 이는 EBOV에 감염된 사람들에게서 나타나는 약화된 면역 반응에 기여한다.
내피 세포는 바이러스에 노출된 후 3일 이내에 감염될 수 있다. 혈관 손상으로 이어지는 내피 세포의 파괴는 EBOV 당단백질에 기인할 수 있다. 이러한 손상은 에볼라 바이러스 당단백질(GP)의 합성으로 인해 발생하며, 이는 세포간 구조에 대한 세포 부착을 담당하는 특정 인테그린의 이용 가능성을 감소시키고 간 손상을 유발하여 부적절한 응고를 초래한다. 영향을 받은 사람들에게 발생하는 광범위한 출혈은 혈액 용적의 손실로 인한 종창 및 쇼크를 유발한다. EVD에서 흔히 나타나는 기능장애 출혈 및 응고는 대식세포 및 단핵구에 의한 과도한 조직 인자 생산으로 인한 응고 캐스케이드의 외인성 경로의 증가된 활성화에 기인하였다.
감염 후, 분비형 당단백질인 소형 가용성 당단백질(sGP 또는 GP)이 합성된다. EBOV 복제는 감염된 세포의 단백질 합성 및 숙주 면역 방어를 압도한다. GP는 바이러스를 내피 세포에 테더링하는 삼량체 복합체를 형성한다. sGP는 또 다른 유형의 백혈구인 호중구의 신호전달을 간섭하는 이량체 단백질을 형성한다. 이는 바이러스가 호중구 활성화의 초기 단계를 억제하여 면역계를 회피할 수 있게 한다.
GP 단편이 볼드체 및 밑줄 표시되어 있는 에볼라 바이러스 당단백질의 서열은 서열번호 19로서 제공된다:
MGVTGILQLPRDRFKRTSFFLWVIILFQRTFSIPLGVIHNSTLQVSDVDKLVCRDKLSSTNQLRSVGLNLEGNGVATDVPSATKRWGFRSGVPPKVVNYEAGEWAENCYNLEIKKPDGSECLPAAPDGIRGFPRCRYVHKVSGTGPCAGDFAFHKEGAFFLYDRLASTVIYRGTTFAEGVVAFLILPQAKKDFFSSHPLREPVNATEDPSSGYYSTTIRYQATGFGTNETEYLFEVDNLTYVQLESRFTPQFLLQLNETIYTSGKRSNTTGKLIWKVNPEIDTTIGEWAFWETKKNLTRKIRSEELSFTVVSNGAKNISGQSPARTSSDPGTNTTTEDHKIMASENSSAMVQVHSQGREAAVSHLTTLATISTSPQSLTTKPGPDNSTHNTPVYKLDISEATQVEQHHRRTDNDSTASDTPSATTAAGPPKAENTNTSKSTDFLDPATTTSPQNHSETAGNNNTHHQDTGEESASSGKLGLITNTIAGVAGLITGGRRTRR EAIVNAQPKCNPNLHYWTTQDEGAAIGLAWIPYFGPAAEGIYTEGLMHNQDGLICGLRQLANETTQALQLFLRATTELRTFSILNRKAIDFLLQRWGGTCHILGPDCCIEPHDWTKNITDKIDQIIHDFVDKTLPDQGDNDNWWTGWRQWIPAGIGVTGVIIAVIALFCICKFVF (서열번호 19).
일부 실시형태에서, 본 개시내용의 폴리펩타이드는 에볼라 바이러스 당단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, 에볼라 바이러스 당단백질로부터 유래된 폴리펩타이드는 서열번호 20에 상응하는 서열번호 19의 볼드체 및 밑줄 표시된 부분 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는다.
일부 실시형태에서, 에볼라 바이러스 당단백질, 예를 들어 서열번호 20에 상응하는 에볼라 바이러스 당단백질의 GP 단편으로부터 유래된 폴리펩타이드는 필로비리다에 당단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, 에볼라 바이러스 당단백질, 예를 들어 서열번호 20에 상응하는 에볼라 바이러스 당단백질의 GP 단편으로부터 유래된 폴리펩타이드는 에볼라 당단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, 에볼라 바이러스 당단백질, 예를 들어 서열번호 20에 상응하는 에볼라 바이러스 당단백질의 GP 단편으로부터 유래된 폴리펩타이드는 필로비리다에 당단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, 에볼라 바이러스 당단백질, 예를 들어 서열번호 20에 상응하는 에볼라 바이러스 당단백질의 GP 단편으로부터 유래된 폴리펩타이드는 에볼라 바이러스 당단백질과 올리고머화한다.
D. 오르토믹소바이러스
특정 실시형태에서, 바이러스는 오르토믹소비리다에(Orthomyxoviridae) 과로부터 유래된다. 오르토믹소비리다에는 외피가 있는, 네가티브-센스, 단일 가닥 선형 RNA 바이러스의 과이다. 이는 알파인플루엔자바이러스, 베타인플루엔자바이러스, 델타인플루엔자바이러스, 감마인플루엔자바이러스, 이사바이러스(Isavirus), 토고토바이러스(Thogotovirus) 및 콰란자바이러스(Quaranjavirus)의 7개 속을 포함한다. 알파인플루엔자바이러스, 베타인플루엔자바이러스, 델타인플루엔자바이러스 및 감마인플루엔자바이러스는 인간을 포함한 포유동물 및 조류에서 인플루엔자를 유발하는 바이러스를 포함한다. 알파인플루엔자바이러스, 베타인플루엔자바이러스 및 감마인플루엔자바이러스는 인간에서 인플루엔자를 유발하는 바이러스를 포함한다.
오르토믹소비리다에 과의 바이러스는 선형 네가티브-센스 단일 가닥 RNA의 6 내지 8개 분절을 함유한다. 이들은 10,000 내지 14,600개 뉴클레오타이드(nt)인 총 게놈 길이를 갖는다. 예를 들어, 인플루엔자 바이러스 A 게놈은 8개의 분절화된 네가티브-센스 RNA 조각(총 13.5킬로베이스)을 갖는다. 게놈 서열은 양쪽 말단에서 반복되는 말단 반복 서열을 갖는다. 말단은 5'말단에서 12 내지 13개 뉴클레오타이드 길이로 반복된다. 3'-말단이 동일한 뉴클레오타이드 서열; 동일한 과의 속에서 동일함; 대부분은 RNA(분절)에서 또는 모든 RNA 종에서. 말단은 3'말단에서 9 내지 11개 뉴클레오타이드 길이로 반복된다. 캡슐화된 핵산은 오로지 게놈 핵산이다. 각 비리온은 결함성 간섭 카피를 함유할 수 있다. M 및 NS 유전자는 선택적 스플라이싱을 통해 2개의 상이한 유전자를 생성한다.
인플루엔자바이러스 비리온은 다형성이다; 바이러스 외피는 구형 및 사상체 형태로 발생할 수 있다. 일반적으로, 바이러스의 형태특징은 입자의 직경이 100 내지 120 nm인 타원체 또는 입자의 직경이 80 내지 100 nm이고 길이가 최대 20 ㎛인 사상체이다. 외피에는 각각 다양한 표면 밀도로 표면으로부터 10 내지 14 nm 돌출된 약 500개의 별개의 스파이크-유사 돌기가 있다. 주요 당단백질(HA) 스파이크는 뉴라미니다제(NA) 스파이크의 클러스터에 의해 불규칙적으로 개재되어 있으며, HA 대 NA의 비는 약 10:1이다.
당단백질 스파이크가 앵커링된 지질 이중층 막으로 구성된 바이러스 외피는 뉴클레오캡시드; 각 말단에 루프를 갖는 상이한 크기 부류의 핵단백질을 둘러싸고 있고; 비리온 내의 배열은 불확실하다. 리보핵 단백질은 사상체이고 50 내지 130 nm 길이 및 9 내지 15 nm 직경의 범위이며 나선형 대칭을 이루고 있다.
전형적으로, 인플루엔자는 감염된 포유동물로부터 바이러스를 함유하는 에어로졸을 생성하는 기침 또는 재채기에 의해 공기를 통해 전파되고, 감염된 조류로부터 이의 배설물을 통해 전염된다. 인플루엔자는 또한 타액, 비강 분비물, 대변 및 혈액에 의해 전파될 수 있다. 감염은 이러한 체액 또는 오염된 표면과의 접촉을 통해 발생한다. 숙주의 외부에서, 독감 바이러스는 인체 온도에서 약 1주 동안, 0℃(32℉)에서 30일 이상 동안 및 매우 낮은 온도에서 무기한으로 감염성을 유지할 수 있다. 이들은 소독제 및 세제 의해 쉽게 불활성화될 수 있다.
바이러스는 폐 및 목의 상피 세포의 표면 상의 헤마글루티닌 당단백질과 시알산 당 사이의 상호 작용을 통해 세포에 결합한다. 세포는 세포내이입을 통해 바이러스를 내수송한다. 산성 엔도솜에서, 헤마글루티닌 단백질의 일부가 바이러스 외피를 액포의 막과 융합시켜 바이러스 RNA(vRNA) 분자, 보조 단백질 및 RNA-의존성 RNA 폴리머라제를 세포질로 방출한다. 이들 단백질과 vRNA는 복합체를 형성하고, 이는 세포 핵 내로 운반되고, 여기서 RNA-의존성 RNA 폴리머라제가 상보적인 포지티브-센스 cRNA를 전사하기 시작한다. cRNA는 세포질로 외수송되고 핵에서 번역되거나 잔류한다. 새로 합성된 바이러스 단백질은 골지체를 통해 세포 표면으로 분비되거나(뉴라미니다제 및 헤마글루티닌의 경우) 핵 내로 다시 운반되어 vRNA와 결합하고 새로운 바이러스 게놈 입자를 형성한다.
미래의 바이러스의 게놈을 형성하는 네가티브-센스 vRNA, RNA-의존성 RNA 트랜스크립타제 및 기타 바이러스 단백질은 바이러스 입자로 조립된다. 헤마글루티닌 및 뉴라미니다제 분자는 세포막에서 벌지로 클러스터화된다. vRNA 및 바이러스 코어 단백질은 핵을 떠나서 이러한 막 돌출부에 진입한다. 성숙한 바이러스는 숙주 인지질 막의 구체로서 세포로부터 출아하여, 이러한 막 코트에 의해 헤마글루티닌과 뉴라미니다제를 획득한다. 이전과 유사하게, 바이러스는 헤마글루티닌을 통해 세포에 부착하고, 뉴라미니다제가 숙주 세포로부터 시알산 잔기를 절단하면, 성숙한 바이러스가 이탈한다. 새로운 인플루엔자 바이러스의 방출 후, 숙주 세포는 사멸한다.
오르소믹소비리다에 바이러스는 핵에서 복제되는 2가지 RNA 바이러스 중 하나이다(다른 하나는 레트로비리다에이다). 이는 오르토믹소 바이러스의 기구가 자체적으로 mRNA를 만들 수 없기 때문이다. 이들은 캡 스내칭(cap snatching)으로 공지된 과정에서 바이러스 mRNA 합성을 개시하기 위한 프라이머로서 세포 RNA를 사용한다. 핵 내에 있으면, RNA 폴리머라제 단백질 PB2는 세포성 전-mRNA를 찾아 이의 5' 캡핑된 말단에 결합한다. 그 다음, RNA 폴리머라제 PA는 5' 말단 근처에서 세포 mRNA를 절단하고 이 캡핑된 단편을 바이러스 mRNA에서 나머지 바이러스 RNA 게놈을 전사하기 위한 프라이머로서 사용한다. 이는 번역을 위해 세포의 리보솜에 의해 인식되기 위해 mRNA가 5' 캡을 가질 필요가 있기 때문이다.
인플루엔자 바이러스의 4개 속이 있으며, 각각은 단일 종 또는 유형만을 포함한다. 인플루엔자 A 및 C는 다양한 종(인간을 포함)을 감염시키는 반면, 인플루엔자 바이러스 B는 거의 독점적으로 사람만을 감염시키고, 인플루엔자 D는 소 및 돼지를 감염시킨다.
인플루엔자 A 바이러스는 네가티브-센스, 단일 가닥, 분절화된 RNA 바이러스이다. 전체 인플루엔자 A 바이러스 게놈은 13,588개의 염기 길이이며, 스트레인에 따라 적어도 10개 내지 최대 14개의 단백질을 암호화하는 8개의 RNA 분절에 함유되어 있다. 바이러스 입자(비리온으로도 불림)는 직경이 80 내지 120나노미터이므로, 가장 작은 비리온은 타원형 모양을 취한다. 인플루엔자가 다형성이고 수십 마이크로미터를 초과하여 사상형 비리온을 생성할 수 있다는 사실 때문에, 각 입자의 길이는 상당히 다양하다. 이러한 다양한 모양에도 불구하고, 모든 A형 인플루엔자 바이러스의 비리온은 구성이 유사하다. 이들은 모두 2가지 주요 유형의 단백질을 함유하고 중심 코어를 감싸는 바이러스 외피로 구성된다.
바이러스 입자 외부에서 발견되는 2개의 큰 단백질은 헤마글루티닌(HA) 및 뉴라미니다제(NA)이다. HA는 표적 세포에의 비리온의 결합 및 표적 세포 내로의 바이러스 게놈 진입을 매개하는 단백질이다. NA는 점액에 존재하는 풍부한 비-생산성 부착 부위로부터의 방출뿐만 아니라 감염된 세포로부터의 자손 비리온의 방출에도 관여한다. 이들 단백질이 일반적으로 항바이러스제의 표적이 된다. 더욱이, 이들은 숙주의 항체가 결합하여 면역 반응을 촉발할 수 있는 항원 단백질이기도 하다. 인플루엔자 A 바이러스는 바이러스 외피의 표면 상의 이들 두 단백질의 유형에 기반하여 아형으로 분류된다. HA의 16개 아형 및 NA의 9개 아형이 공지되어 있지만, 인간에서는 H 1, 2 및 3과 N 1 및 2만이 흔히 발견된다.
비리온의 중심 코어는 유전 물질을 패키징하고 보호하는 바이러스 게놈 및 기타 바이러스 단백질을 함유한다. A형 인플루엔자 바이러스 게놈은 RNA의 단일 조각이 아니고; 대신, 이는 네가티브-센스 RNA의 분절화된 조각으로 이루어져 있고, 각 조각은 유전자 산물(단백질)을 암호화하는 1개 또는 2개의 유전자를 함유한다. 본원에서 사용된 네가티브-센스 RNA라는 용어는 RNA 게놈이 단백질로 직접 번역될 수 없다는 사실을 의미한다; 이는 단백질 산물로 번역되기 전에 먼저 포지티브-센스 RNA로 전사되어야 한다. 게놈의 분절화된 성질은 상이한 바이러스 스트레인들 간의 전체 유전자가 교환될 수 있도록 한다.
본원에 개시된 폴리펩타이드에 의해 치료 또는 예방될 수 있는 감염을 유발하는 인플루엔자 A 바이러스는 인플루엔자 A 바이러스 아형 H1N1, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H1N2, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H2N2, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H2N3, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H3N1, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H3N2, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H3N8, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H5N1, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H5N2, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H5N3, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H5N6, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H5N8, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H5N9, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H6N1, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H6N2, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H7N1, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H7N2, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H7N3, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H7N4, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H7N7, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H7N9, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H9N2, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H10N7, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H10N8, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H11N2, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H11N9, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H17N10, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H18N11, 또는 이들의 조합을 포함한다.
인플루엔자 B 바이러스 캡시드는 외피로 둘러싸여 있으며, 이의 비리온은 외피, 매트릭스 단백질, 핵단백질 복합체, 뉴클레오캡시드 및 폴리머라제 복합체로 이루어져 있다. 이는 때로는 구형이고 때로는 사상형이다. 이의 500개 정도의 표면 돌기는 헤마글루티닌 및 뉴라미니다아제로 구성된다. 인플루엔자 B 바이러스 게놈은 14,548개 뉴클레오타이드 길이이며 선형 네가티브-센스 단일 가닥 RNA의 8개 분절로 이루어져 있다. 다분절 게놈은 캡슐화되어 있으며, 각 분절은 분리된 뉴클레오캡시드에 있고 뉴클레오캡시드는 하나의 외피에 의해 둘러싸여 있다. 표면 당단백질 헤마글루티닌의 항원 특성에 기반하여 인플루엔자 B 바이러스의 2가지 순환 계통이 공지되어 있다. 계통은 B/야마가타/16/88-유사 바이러스 및 B/빅토리아/2/87-유사 바이러스로 명명되며, 이들 인플루엔자 B 바이러스 계통으로 인한 감염은 본원에 개시된 폴리펩타이드에 의해 치료 또는 예방될 수 있다.
인플루엔자 C 바이러스는 7개의 RNA 분절을 갖고 9개의 단백질을 암호화하는 반면, A형 및 B형은 8개의 RNA 분절을 갖고 적어도 10개의 단백질을 암호화한다. 인플루엔자 C 바이러스는 단 하나의 당단백질: 헤마글루티닌-에스테라제 융합체(HEF)만을 갖고 있다. 인플루엔자 바이러스 A 및 인플루엔자 바이러스 B와 달리, 인플루엔자 바이러스 C는 에스테라제 효소를 또한 발현한다. 이 효소는 A형 및 B형에 의해 생산되는 뉴라미니다제 효소와 유사하며 둘 다 숙주 세포 수용체를 파괴하는 기능을 한다.
잠복기 기간이라 불리는, 인플루엔자 바이러스에의 노출과 증상의 발달 사이의 기간은 1 내지 4일, 가장 흔하게는 1 내지 2일이다. 그러나, 많은 감염은 무증상성이다. 증상의 시작은 갑작스럽고, 초기 증상은 주로 발열, 오한, 두통, 근육통 또는 통증, 불편감, 식욕 부진, 활력 부족/피로 및 혼란을 포함하여 비특이적이다. 이러한 증상은 일반적으로 마른 기침, 인후통 또는 건성 인후, 쉰 목소리 및 코막힘 또는 콧물과 같은 호흡기 증상을 동반한다. 기침이 가장 흔한 증상이다. 오심,구토, 설사 및 위장염을 포함하는 위장 증상도 발생할 수 있다. 표준 인플루엔자 증상은 전형적으로 2 내지 8일 동안 지속된다.
감염된 사람은 호흡, 대화, 기침 및 재채기를 통해 인플루엔자 바이러스를 전파할 수 있으며, 이는 바이러스 입자를 함유하는 호흡기 비말 및 에어로졸을 공기 중으로 확산시킨다. 그 다음, 감염에 취약한 사람은 이들 입자와 접촉하게 됨으로써 인플루엔자와 접촉할 수 있다. 호흡기 비말은 비교적 크고, 인근 표면에 떨어져기 전에 2미터 미만을 이동한다. 에어로졸은 더 작고 공기 중에 더 오래 부유하고, 따라서 정착하는 데 더 오랜 시간이 걸리고 호흡기 비말보다 더 멀리 이동할 수 있다. 에어로졸의 흡입이 감염으로 이어질 수 있지만, 대부분의 전파는 상기도의 점막과 접촉하는 호흡기 비말을 통해 감염된 사람 주변 약 2미터 영역에서 이루어진다. 인플루엔자 바이러스는 비-다공성 표면에서 수시간 동안 생존할 수 있기 때문에, 오염된 손 및 표면을 통한 것과 같은 사람, 체액 또는 중간 물체(감염 매개물)와의 접촉을 통한 전파도 발생할 수 있다. 손이 오염된 경우, 얼굴을 만져서 감염이 유발될 수 있다. 인플루엔자는 일반적으로 증상의 시작 1일 전부터 이후 5 내지 7일까지 전파될 수 있다. 건강한 성인에서, 바이러스는 최대 3 내지 5일 동안 배출된다.
인플루엔자에 노출될 위험이 있는 사람은 의료 종사자, 사회 복지사, 및 인플루엔자에 취약한 사람과 함께 거주하거나 돌보는 사람을 포함한다. 장기 요양 시설에서, 독감이 도입된 후 급속도로 확산될 수 있다. 낮은 온도, 낮은 절대 및 상대 습도, 태양으로부터의 자외선 복사량 감소 및 인구 밀집을 포함하는 다양한 요인이 인플루엔자 전파를 촉진할 가능성이 높다.
증상에 기반한 진단은 계절성 전염병 동안 건강한 사람에서는 상당히 정확하며 폐렴, ARDS, 패혈증의 경우 또는 뇌염, 심근염 및 횡문근융해증이 발생하는 경우 의심되어야 한다. 인플루엔자는 다른 바이러스성 호흡기 질환과 유사하기 때문에, 확인을 위해 실험실 진단이 필수적이다. 테스트용 샘플을 수집하는 통상적인 방법은 비강 및 인후 면봉을 포함한다. 감염이 상기도를 깨끗하게 했으나 하기도는 그렇지 않은 경우, 샘플을 하기도로부터 채취할 수 있다. 인플루엔자 테스트는 독감 유행기 동안 인플루엔자와 유사한 증상으로 입원하였거나 인플루엔자 사례와 관련된 임의의 사람에게 권장된다. 중증 사례의 경우, 조기 진단이 환자의 결과를 향상시킨다. 인플루엔자를 식별할 수 있는 진단 방법은 바이러스 배양, 항체- 및 항원-검출 테스트 및 핵산-기반 테스트를 포함한다.
세포변성 효과를 모니터링하기 위해 바이러스를 포유동물 세포 또는 부화란의 배양물에서 3 내지 10일 동안 성장시킬 수 있다. 그 다음, 최종 확인을 항체 염색, 적혈구를 이용한 혈액흡착 또는 면역형광 현미경을 통해 수행할 수 있다. 세포변성 효과가 나타나기 전에 면역염색을 통해 감염을 식별할 수 있는 쉘 바이알(shell vial) 배양은 전통적인 배양보다 더 민감하며 결과가 1 내지 3일 내에 나타난다.
천연 감염 또는 백신접종 후 인플루엔자에 대한 항체 반응을 검출하기 위해 혈청학적 검정을 사용할 수 있다. 통상적인 혈청학적 분석은 HA 특이적 항체를 검출하는 적혈구응집반응 억제 검정, 항체가 바이러스를 중화하였는지 여부를 확인하는 바이러스 중화 검정 및 효소 결합 면역흡착 검정을 포함한다.
직접 형광 또는 면역형광 항체(DFA/IFA) 테스트는 샘플 중의 호흡 상피 세포를 형광-표지된 인플루엔자- 특이적 항체로 염색한 후, 형광 현미경으로 검사하는 것을 수반한다. 이들은 IAV와 IBV를 구별할 수 있지만 아형 A를 구분할 수는 없다.
핵산 기반 테스트(NAT)는 바이러스 핵산을 증폭시키고 검출한다. NAT 중에서, 역전사 폴리머라제 연쇄 반응은 가장 전통적이며, 빠르고 아형 IAV를 구분할 수 있기 때문에 인플루엔자 진단을 위한 표준으로 간주된다. 사용된 다른 NAT는 루프-매개 등온 증폭-기반 검정, 단순 증폭-기반 검정 및 핵산 서열-기반 증폭을 포함한다. 핵산 서열 시퀀싱 방법은 바이러스 샘플의 핵산 서열을 수득하여 바이러스 및 항바이러스제 내성을 식별함으로써 감염을 식별할 수 있다.
본 개시내용은 알파인플루엔자바이러스, 베타인플루엔자바이러스, 델타인플루엔자바이러스, 감마인플루엔자바이러스, 이사바이러스, 토고토바이러스 및 콰란자바이러스의 7개 속을 포함하는 오르토믹소비리다에 과의 임의의 바이러스 감염의 치료 또는 예방을 포함한다. 구체적 실시형태에서, 본 개시내용은 알파인플루엔자바이러스, 베타인플루엔자바이러스, 델타인플루엔자바이러스 및 감마인플루엔자바이러스를 포함하는, 척추동물을 감염시키는 오르토믹소비리다에 과의 속의 임의의 바이러스 감염의 치료 또는 예방을 포함한다. 구체적 실시형태에서, 본 개시내용은 알파인플루엔자바이러스, 베타인플루엔자바이러스 및 감마인플루엔자바이러스를 포함하는, 인간을 감염시키는 오르토믹소비리다에 과의 속의 임의의 바이러스 감염의 치료 또는 예방을 포함한다. 구체적 실시형태에서, 본 개시내용은 인플루엔자 바이러스 A 종 및 임의의 인플루엔자 바이러스 A 스트레인, 아형 또는 계통을 포함하는, 알파인플루엔자바이러스 속의 임의의 바이러스 감염의 치료 또는 예방을 포함한다. 특정 실시형태에서, 본 개시내용은 인플루엔자 바이러스 B 종 및 임의의 인플루엔자 바이러스 B 스트레인, 아형 또는 계통을 포함하는, 베타인플루엔자바이러스 속의 임의의 바이러스 감염의 치료 또는 예방을 포함한다. 구체적 실시형태에서, 본 개시내용은 인플루엔자 바이러스 C 종 및 임의의 인플루엔자 바이러스 C 스트레인, 아형 또는 계통을 포함하는, 감마인플루엔자바이러스 속의 임의의 바이러스 감염의 치료 또는 예방을 포함한다.
본 개시내용의 양상은 인플루엔자 바이러스 스파이크(S) 단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드에 관한 것이다. 인간에서, 인플루엔자 바이러스는 먼저 호흡기의 상피 세포를 감염시켜 감염을 유발한다. 감염 동안 질병은 주로, 감염에 대한 면역계의 반응에 의해 유발된 염증과 조합된 상피 세포 감염과 사멸에 의해 유발된 폐 염증 및 저하의 결과이다. 비-호흡기 기관이 관련될 수 있지만, 이러한 경우에 인플루엔자가 관여하는 메커니즘은 알려져 있지 않다. 중증 호흡기 질병은 기도 폐쇄, 폐포 구조 손실, 상피 세포 감염과 사멸로 인한 폐 상피 완전성 손실, 및 폐 구조를 유지하는 세포외 매트릭스의 분해를 포함하는 다수의 비독점적 메커니즘에 의해 유발될 수 있다. 특히, 폐포 세포 감염은 이것이 가스 교환 손상을 초래하고 바이러스가 내피 세포를 감염시켜 다량의 염증성 사이토카인을 생성하도록 하기 때문에 심각한 증상을 유도하는 것으로 보인다.
인플루엔자의 상태생리는 세포 내로 진입하는 동안 인플루엔자 바이러스가 결합하는 수용체에 의해 유의미하게 영향을 받는다. 포유동물 인플루엔자 바이러스는 호흡기 및 망막 상피 세포와 같은 다양한 호흡기 세포에서 가장 흔히 발견되는 α-2,6 연결에 의해 올리고사카라이드의 나머지 부분에 연결된 시알산에 우선적으로 결합한다. 조류 인플루엔자 바이러스(AIV)는 α-2,3 결합을 갖는 시알산을 선호하며, 이는 조류에서는 위장 상피 세포에서 가장 흔하고 인간에서는 하기도에서 가장 흔하다. 더욱이, HA 단백질이 결합 서브유닛인 HA1 및 융합 서브유닛인 HA2로 절단되는 것은 상이한 프로테아제에 의해 수행되어 어떤 세포가 감염될 수 있는지에 영향을 준다. 포유동물 인플루엔자 바이러스 및 저병원성 AIV의 경우, 절단은 세포외에서 이루어져서 적절한 프로테아제를 갖는 세포로 감염이 제한되는 반면, 고병원성 AIV의 경우 절단은 세포내에서 이루어지고 편재하는 프로테아제에 의해 수행되어 더욱 다양한 세포의 감염이 가능하고, 이로써 더욱 중증 질환의 원인이 된다.
HA2 단편이 볼드체 및 밑줄 표시되어 있는 인플루엔자 A/H1 HA S 단백질의 서열은 서열번호 21로서 제공된다:
MPMGSLQPLATLYLLGMLVASCLGTANADTLCIGYHANNSTDTVDTVLEKNVTVTHSVNLLEDKHNGKLCKLRGVAPLHLGKCNIAGWILGNPECESLSTARSWSYIVETSNSDNGTCYPGDFINYEELREQLSSVSSFERFEIFPKTSSWPNHDSDKGVTAACPHAGAKSFYKNLIWLVKKGNSYPKLNQTYINDKGKEVLVLWGIHHPPTIAAQESLYQNADAYVFVGTSRYSKKFKPEIATRPKVRDQEGRMNYYWTLVEPGDKITFEATGNLVVPRYAFTMERDAGSGIIISDTPVHDCNTTCQTPEGAINTSLPFQNVHPITIGKCPKYVKSTKLRLATGLRNVPSIQSR GLFGAIAGFIEGGWTGMVDGWYGYHHQNEQGSGYAADLKSTQNAIDKITNKVNSVIEKMNTQFTAVGKEFNHLEKRIENLNKKVDDGFLDIWTYNAELLVLLENERTLDYHDSNVKNLYEKVRNQLKNNAKEIGNGCFEFYHKCDNTCMESVKNGTYDYPKYSEEAKLNREKIDGVKLESTRIYQILAIYSTVASSLVLVVSLGAISFWMCSNGSLQCRICI (서열번호 21).
HA2 단편이 볼드체 및 밑줄 표시되어 있는 인플루엔자 A/H3 HA S 단백질의 서열은 서열번호 22로서 제공된다:
MPMGSLQPLATLYLLGMLVASCLGQKIPGNDNSTATLCLGHHAVPNGTIVKTITNDRIEVTNATELVQNSSIGEICDSPHQILDGGNCTLIDALLGDPQCDGFQNKKWDLFVERSRAYSNCYPYDVPDYASLRSLVASSGTLEFKNESFNWAGVTQNGKSFSCIRGSSSSFFSRLNWLTHLNYTYPALNVTMPNKEQFDKLYIWGVHHPGTDKDQISLYAQSSGRITVSTKRSQQAVIPNIGSRPRIRDIPSRISIYWTIVKPGDILLINSTGNLIAPRGYFKIRSGKSSIMRSDAPIGKCKSECITPNGSIPNDKPFQNVNRITYGACPRYVKQNTLKLATGMRNVPEKQTR GIFGAIAGFIENGWEGMVDGWYGFRHQNSEGRGQAADLKSTQAAIDQINGKLNRLIGKTNEKFHQIEKEFSEVEGRVQDLEKYVEDTKIDLWSYNAELLVALENQHTIDLTDSEMNKLFEKTKKQLRENAEDMGNGCFKIYHKCDNACIGSIRNETYDHNVYRDEALNNRFQIKGVELKSGYKDWILWISFAISCFLLCVALLGFIMWACQKGNIRCNICI (서열번호 22).
HA2 단편이 볼드체 및 밑줄 표시되어 있는 인플루엔자 B/빅토리아 HA S 단백질의 서열은 서열번호 23로서 제공된다:
MPMGSLQPLATLYLLGMLVASCLGTSNADRICTGITSSNSPHVVKTATQGEVNVTGVIPLTTTPTKSHFANLKGTETRGKLCPKCLNCTDLDVALGRPKCTGKIPSARVSILHEVRPVTSGCFPIMHDRTKIRQLPNLLRGYEHVRLSTHNVINAEDAPGRPYEIGTSGSCPNITNGNGFFATMAWAVPKNKTATNPLTIEVPYICTEGEDQITVWGFHSDSETQMAKLYGDSKPQKFTSSANGVTTHYVSQIGGFPNQTEDGGLPQSGRIVVDYMVQKSGKTGTITYQRGILLPQKVWCASGRSKVIKGSLPLIGEADCLHEKYGGLNKSKPYYTGEHAKAIGNCPIWVKTPLKLANGTKYRPPAKLLKER GFFGAIAGFLEGGWEGMIAGWHGYTSHGAHGVAVAADLKSTQEAINKITKNLNSLSELEVKNLQRLSGAMDELHNEILELDEKVDDLRADTISSQIELAVLLSNEGIINSEDEHLLALERKLKKMLGPSAVEIGNGCFETKHKCNQTCLDRIAAGTFDAGEFSLPTFDSLNITAASLNDDGLDNHTILLYYSTAASSLAVTLMIAIFVVYMVSRDNVSCSICL (서열번호 23).
HA2 단편이 볼드체 및 밑줄 표시되어 있는 인플루엔자 B/야마가타 HA S 단백질의 서열은 서열번호 24로서 제공된다:
MPMGSLQPLATLYLLGMLVASCLGTSNADRICTGITSSNSPHVVKTATQGEVNVTGVIPLTTTPTKSHFANLKGTETRGKLCPKCLNCTDLDVALGRPKCTGKIPSARVSILHEVRPVTSGCFPIMHDRTKIRQLPNLLRGYEHVRLSTHNVINAEDAPGRPYEIGTSGSCPNITNGNGFFATMAWAVPKNKTATNPLTIEVPYICTEGEDQITVWGFHSDSETQMAKLYGDSKPQKFTSSANGVTTHYVSQIGGFPNQTEDGGLPQSGRIVVDYMVQKSGKTGTITYQRGILLPQKVWCASGRSKVIKGSLPLIGEADCLHEKYGGLNKSKPYYTGEHAKAIGNCPIWVKTPLKLANGTKYRPPAKLLKER GFFGAIAGFLEGGWEGMIAGWHGYTSHGAHGVAVAADLKSTQEAINKITKNLNSLSELEVKNLQRLSGAMDELHNEILELDEKVDDLRADTISSQIELAVLLSNEGIINSEDEHLLALERKLKKMLGPSAVEIGNGCFETKHKCNQTCLDRIAAGTFDAGEFSLPTFDSLNITAASLNDDGLDNHTILLYYSTAASSLAVTLMIAIFVVYMVSRDNVSCSICL (서열번호 24).
일부 실시형태에서, 본 개시내용의 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 HA S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 HA S 단백질로부터 유래된 폴리펩타이드는 서열번호 25, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖고 볼드체 표시되어 있다.
일부 실시형태에서, 인플루엔자 HA S 단백질, 예를 들어 서열번호 25에 상응하는 인플루엔자 HA S 단백질의 HA2 단편으로부터 유래된 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 HA 스파이크(S) 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 A S 단백질, 인플루엔자 바이러스 B S 단백질, 또는 인플루엔자 바이러스 C S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 HA S 단백질은 인플루엔자 바이러스 A/H1 HA S 단백질, 인플루엔자 바이러스 A/H3 HA S 단백질, 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아 HA S 단백질, 및/또는 인플루엔자 바이러스 B/야마가타 HA S 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 HA S 단백질로부터 유래된 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 A S 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 A/H1 HA S 단백질 및/또는 인플루엔자 바이러스 A/H3 HA S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 HA S 단백질로부터 유래된 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 B S 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아 HA S 단백질 및/또는 인플루엔자 바이러스 B/야마가타 HA S 단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 HA S 단백질로부터 유래된 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 C S 단백질과 상호작용한다.
일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 HA S 단백질, 예를 들어 서열번호 25에 상응하는 인플루엔자 HA S 단백질의 HA2 단편으로부터 유래된 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 HA 스파이크(S) 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 A S 단백질, 인플루엔자 바이러스 B S 단백질, 또는 인플루엔자 바이러스 C S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 HA S 단백질은 인플루엔자 바이러스 A/H1 HA S 단백질, 인플루엔자 바이러스 A/H3 HA S 단백질, 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아 HA S 단백질, 및/또는 인플루엔자 바이러스 B/야마가타 HA S 단백질을 포함한다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 HA S 단백질로부터 유래된 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 A S 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 A/H1 HA S 단백질 및/또는 인플루엔자 바이러스 A/H3 HA S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 HA S 단백질로부터 유래된 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 B S 단백질, 예를 들어 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아 HA S 단백질 및/또는 인플루엔자 바이러스 B/야마가타 HA S 단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 HA S 단백질로부터 유래된 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 C S 단백질과 올리고머화한다.
E. 호흡기 세포융합 바이러스
특정 실시형태에서, 바이러스는 뉴모비리다에(Pneumoviridae) 과로부터 유래된다. 뉴모비리다에는 모노네가바이럴레스(Mononegavirales) 목의 네가티브-가닥 RNA 바이러스의 과이다. 뉴모비리다에는 메타뉴모바이러스(Metapneumovirus) 및 오르토뉴모바이러스(Orthopneumovirus)를 포함하는 2개의 속으로 분류된다.
뉴모바이러스는 숙주 세포의 세포질에서 복제된다. 먼저, 바이러스는 세포의 표면에 발현된 HN 당단백질 수용체에 결합한다. 그 다음, 융합 단백질의 작용을 통해, 바이러스가 숙주 원형질막에 융합되고 뉴클레오캡시드가 방출된다. 복제가 진행되기 전에, mRNA가 전사되고 바이러스 단백질이 번역된다. 전사는 바이러스로 암호화된 RNA-의존성 RNA 폴리머라제에 의존하며, 이는 3' 리더 영역에서 게놈에 결합한 다음, 순차적으로 각 유전자를 전사한다. 바이러스 단백질의 번역은 숙주 세포의 리보솜에 의해 수행된다. 새로 복제된 게놈 주위에 캡시드를 생성하기에 충분한 P, N, L 및 M2 단백질이 이용 가능해지면, 바이러스는 복제를 진행한다. 복제 후, P, L 및 M 단백질은 리보뉴클레오캡시드 형성에 참여한다. 비리온 조립이 완료되면, 비리온은 세포 외부로 출아하여 빠져나간다.
인간 호흡기 세포융합 바이러스(hRSV) 및 인간 오르토뉴모바이러스로도 불리는 호흡기 세포융합 바이러스(RSV)는 호흡기 감염을 유발하는 흔한 전염성 바이러스이다. 일부 양상에서, RSV는 RSV A형이다. 일부 양상에서, RSV는 RSV B형이다. 이는 네가티브-센스, 단일 가닥 RNA 바이러스이며, 이의 명칭은 감염된 세포가 융합할 때 형성되는 융합체로서 알려진 대형 세포로부터 유래된다. RSV는 유아에서 호흡기 입원의 흔한 원인이며, 재감염은 후생에도 흔하게 남아 있어 모든 연령 그룹에서 중요한 병원체이다. 감염률은 전형적으로 추운 겨울철 동안 더 높아서 유아에서는 세기관지염을, 성인에서는 감기를 그리고 노인 및 면역저하자에서는 폐렴과 같은 더욱 심각한 호흡기 질병을 유발한다.
RSV는 중간 크기(약 150 nm) 외피 바이러스이다. 게놈은 나선형 뉴클레오캡시드 내에 위치하며 매트릭스 단백질과 바이러스 당단백질을 함유하는 외피로 둘러싸여 있다. 게놈은 선형이며 약 15,000개 뉴클레오타이드의 길이이다. 대부분의 입자는 구형이지만, 사상형 종도 식별되었다. RSV 게놈은 11가지의 다백질: 지질 외피 단백질(당단백질(G), 융합 단백질(F), 소형 소수성 단백질(SH)), 내부 외피 표면 매트릭스 단백질(M), 리보뉴클레오캡시드 단백질(핵단백질(N), 인단백질(P), 대형 단백질(L), M2-1), 조절성 M2-2 및 비구조 단백질(NS-1 및 NS-2)을 암호화하는 10개의 유전자를 함유한다.
RSV 감염은 경미한 상기도 감염부터 입원 및 기계적 환기가 필요한 심각하고 잠재적으로 생명을 위협하는 하기도 감염(예를 들어, 세기관지염, 바이러스성 폐렴 또는 크룹)에 이르는 매우 다양한 징후 및 증상으로 나타날 수 있다. 대부분의 RSV 감염은 감기, 부비동 및/또는 상기도 징후 및 증상, 예컨대 비충혈, 콧물, 기침, 불쾌감, 인후통 및 미열을 포함한다. 비점막(비염) 및 인후(인두염)의 염증뿐만 아니라 안구 충혈(결막 감염)이 검사 시 나타날 수 있다.
RSV는, 감염된 사람이 기침 또는 재채기하고 비말이 다른 개체의 안구, 코, 입으로 전달되거나, 개체가 손을 씻기 전에 그 위에 바이러스가 있는 표면을 만진 다음, 얼굴을 만지거나, 개체가 바이러스와 직접 접촉할 때 확산될 수 있다. RSV에 감염된 사람은 일반적으로 3 내지 8일 동안 및 일부 경우에 최대 4주 동안 전염성이다. 중증 질환에 걸릴 위험이 가장 높은 사람은 미숙아, 선천성(출생 시) 심장 또는 만성 폐 질환을 갖는 미숙아, 의학적 상태 또는 의학적 처리로 인해 면역계가 저하된(약화된) 아동, 면역계가 저하된 성인, 및 노인, 특히 기저 심장 또는 폐 질환을 갖는 노인을 포함한다.
다양한 실험실 테스트가 제한 없이 항원 테스트, 분자 테스트, 바이러스 배양 및 혈청학적 테스트를 포함하는 RSV 감염의 진단을 위해 이용 가능하다. 흉부 x-선을 또한 수행하여 폐문주위 표지(perihilar markings), 반점형 과다팽창(patchy hyperinflation) 및/또는 무기폐(atelectasis)를 식별할 수 있다.
본 개시내용은 메타뉴모바이러스 및 오르토뉴모바이러스의 2개의 속을 포함하는 뉴모비리다에 과의 임의의 바이러스 감염의 치료 또는 예방을 포함한다. 구체적 실시형태에서, 본 개시내용은 인간을 감염시키는 인간 오르토뉴모바이러스 종(RSV A형 또는 B형)을 포함하는 오르토뉴모바이러스의 속의 임의의 바이러스 감염의 치료 또는 예방을 포함한다.
본 개시내용의 양상은 RSV 당단백질과 상호작용하는 폴리펩타이드에 관한 것이다. 코 또는 안구를 통한 전파 후에, RSV는 상부 및 하부 기도의 섬모 원주 상피 세포를 감염시킨다. RSV는 이들 기관지 세포 내에서 약 8일 동안 계속해서 복제된다. 처음 수일 후에, RSV-감염된 세포는 더욱 원형이 되고 궁극적으로 하부 기도의 더 작은 세기관지로 탈피될 것이다. 이러한 탈피 메커니즘은 또한 상기도로부터 하기도로의 바이러스 확산을 담당하는 것으로 사료된다. 감염은 염증 세포(예컨대, 단핵구 및 T 세포)의 이동 및 침윤, 상피 세포벽 괴사, 부종 및 점액 생성 증가를 포함하여 폐 내에서 일반화된 염증을 유발한다. 탈피된 상피 세포, 점액 마개 및 축적된 면역 세포는 함께 하부 기도의 폐쇄를 유발한다.
당단백질 F(표면 융합 단백질)는 바이러스 및 숙주 세포막의 융합뿐만 아니라 바이러스 입자들 사이의 융합체 형성을 담당한다. F 단백질은 다수의 입체구조 형태로 존재한다. 전융합 상태(PreF)에서, 단백질은 삼량체 형태로 존재한다. PreF는, 숙주 세포의 표면 상의 이의 표적에 결합한 후, 단백질이 그 자체가 숙주 세포막 내로 삽입될 수 있도록 하는 입체구조적 변화를 겪고 바이러스 및 숙주 세포막의 융합을 유도한다. 최종 입체구조적 변위는 더욱 안정하고 연장된 형태의 단백질을 초래한다(융합 후, PostF). RSV F 단백질은 또한 톨(toll)-유사 수용체 4에 결합하고 이를 활성화하여 선천성 면역 반응 및 신호전달을 개시한다.
바이러스 및 숙주 세포막의 융합 후, 바이러스 뉴클레오캡시드(바이러스 게놈을 함유) 및 관련 바이러스 폴리머라제는 숙주 세포 세포질 내로 전달된다. 전사 및 번역은 둘 다 세포질 내에서 발생한다. RNA-의존성 RNA 폴리머라제는 게놈을 메신저 RNA(mRNA)의 10개 분절로 전사하고, 이는 숙주 세포 기구에 의해 구조 단백질로 번역된다. 네가티브-센스 바이러스 게놈의 복제 동안, RNA-의존성 RNA 폴리머라제는 항게놈이라 불리는 포지티브-센스 상보체를 합성한다. 이러한 상보적 가닥은 게놈 네가티브-센스 RNA를 작제하기 위한 주형으로서 사용되고, 이는 뉴클레오캡시드로 패키징되고 조립 및 입자 출아를 위해 원형질막으로 운반된다.
F 단편 부분이 볼드체 및 밑줄 표시되어 있는 RSV F 당단백질의 서열은 서열번호 33으로서 제공된다:
MELPILKTNAIITILAAVTLCFASS QNITEEFYQSTCSAVSKGYLSALRTG WYTSVITIELSNIKENKCNGTDAKVKLIKQELDKYKNAVTELQLLMQSTPAANSRARRELPRFMNYTLNNTKNTNVTLSKKRKRRFLGFLLGVGSAIASGIAVSKVLHLEGEVNKIKSALLSTNKAVVSLSNGVSVLTSKVLDLKNYIDKQLLPIVNKQSCSISNIETVIEFQQKNNRLLEITREFSVNAGVTTPVSTYMLTNSELLSLINDMPITNDQKKLMSSNVQIVRQQSYSIMSIIKEEVLAYVVQLPLY GVIDTPCWKLHTSPLCTTNTKEGSNICLTRTDRGWYCDNAGSVSFFPQAETCKVQSNRVFCDTMNSLTLPSEVNLCNIDIFNPKYDCKIMTSKTDVSSSVITSLGAIVSCYGKTKCTASNKNRGIIKTFSNGCDYVSNKGVDTVSVGNTLYYVNKQEGKSLYVKGEPIINFYDPLVFPSDEFDASISQVNEKINQSLAFIRKSDELLHNVNAGKSTTNIMITTIIIVIIVILLALIAVGLLLYCKARSTPVTLSKDQLSGINNIAFSN (서열번호 33).
일부 실시형태에서, 본 개시내용의 폴리펩타이드는 RSV 당단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, RSV 당단백질로부터 유래된 폴리펩타이드는 서열번호 34에 포함된 서열번호 33의 볼드체 및 밑줄 표시된 부분, 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체와 적어도 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 52%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 100% 서열 동일성, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값을 갖는다.
일부 실시형태에서, RSV 당단백질, 예를 들어 서열번호 34로부터 유래된 폴리펩타이드는 뉴모비리다에 당단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, RSV 당단백질, 예를 들어 서열번호 34로부터 유래된 폴리펩타이드는 RSV 당단백질과 상호작용한다. 일부 실시형태에서, RSV 당단백질, 예를 들어 서열번호 34로부터 유래된 폴리펩타이드는 뉴모비리다에 당단백질과 올리고머화한다. 일부 실시형태에서, RSV 당단백질, 예를 들어 서열번호 34로부터 유래된 폴리펩타이드는 RSV 당단백질과 올리고머화한다.
IV. 항-바이러스 치료
본원에 기술된 조성물(예를 들어, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드) 또는 방법은, 바이러스 스파이크 단백질과 같은 바이러스 단백질과 상호작용하는 것 및 일부 경우에는 이를 억제하거나 간섭하는 것이 치료적 이득이 있을 수 있는 상태를 갖는 임의의 대상체에게 실시될 수 있다. 바이러스 단백질을 표적화하는 것이 치료적 이득이 있을 수 있는 상태는 예를 들어 세포에의 바이러스 입자의 결합 및 세포 내로의 바이러스 입자의 진입과 연관된 상태를 포함한다. 이러한 상태는 예를 들어 코로나바이러스 감염 또는 코로나바이러스 후 감염 증후군, HIV 감염, 에볼라 감염, RSV 감염 및/또는 인플루엔자 감염을 포함한다.
본원에서 사용된 바와 같이, "코로나바이러스 감염"은 코로나비리다에 과 구성원에 의해 유발되는 감염을 지칭한다. 예를 들어, 코로나바이러스 감염은 MERS-CoV 감염, HCoV-229E 감염, HCoV-NL63 감염, HCoV-OC43 감염, HCoV-HKU1 감염, SARS-CoV 감염, 및 SARS-CoV-2 감염을 포함할 수 있지만, 이에 제한되지 않는다. 따라서, 본 개시내용의 양상은 코로나바이러스 감염을 앓고 있거나, 가질 것으로 의심되거나, 가질 위험이 있는 대상체의 치료를 포함하는 방법에 관한 것이다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 감염은 MERS-CoV 감염이다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 감염은 HCoV-229E 감염이다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 감염은 HCoV-NL63 감염이다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 감염은 HCoV-OC43 감염이다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 감염은 HCoV-HKU1 감염이다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 감염은 SARS-CoV 감염이다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 감염은 SARS-CoV-2 감염이다.
본원에서 사용된 바와 같이, "HIV 감염"은 레트로바이러스 인간 면역결핍증 바이러스에 의해 유발된 감염을 지칭한다. 따라서, 본 개시내용의 양상은 HIV 감염을 앓고 있거나, 가질 것으로 의심되거나, 가질 위험이 있는 대상체의 치료를 포함하는 방법에 관한 것이다.
본원에서 사용된 바와 같이, "에볼라 감염"은 에볼라바이러스에 의해 유발된 감염을 지칭한다. 예를 들어, 에볼라 감염은 에볼라 바이러스 감염(자이르 에볼라바이러스), 수단 바이러스 감염, 타이 포레스트 바이러스 감염 및/또는 분디부교 바이러스 감염을 포함할 수 있지만, 이에 제한되지 않는다. 일부 실시형태에서, 에볼라 감염은 에볼라 바이러스 감염이다. 일부 실시형태에서, 에볼라 감염은 수단 바이러스 감염이다. 일부 실시형태에서, 에볼라 감염은 타이 포레스트 바이러스 감염이다. 일부 실시형태에서, 에볼라 감염은 분디부교 바이러스 감염이다. 따라서, 본 개시내용의 양상은 에볼라 감염을 앓고 있거나, 가질 것으로 의심되거나, 가질 위험이 있는 대상체의 치료를 포함하는 방법에 관한 것이다.
본원에서 사용된 바와 같이, "인플루엔자 감염"은 인플루엔자 바이러스에 의해 유발된 감염을 지칭한다. 예를 들어, 인플루엔자 바이러스는 알파인플루엔자바이러스, 베타인플루엔자바이러스, 및 감마인플루엔자바이러스를 포함하여, 인간을 감염시키는 오르토믹소비리다에 과의 속의 임의의 바이러스를 포함할 수 있다. 구체적 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스는 인플루엔자 바이러스 A 종 및 임의의 인플루엔자 바이러스 A 스트레인, 아형 또는 계통을 포함하는 알파인플루엔자바이러스를 포함한다. 구체적 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 A는 인플루엔자 A 바이러스 아형 H1N1, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H1N2, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H2N2, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H2N3, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H3N1, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H3N2, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H3N8, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H5N1, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H5N2, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H5N3, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H5N6, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H5N8, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H5N9, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H6N1, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H6N2, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H7N1, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H7N2, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H7N3, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H7N4, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H7N7, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H7N9, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H9N2, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H10N7, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H10N8, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H11N2, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H11N9, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H17N10, 인플루엔자 A 바이러스 아형 H18N11, 또는 이들의 조합을 포함한다. 구체적 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스는 인플루엔자 바이러스 B 종 및 임의의 인플루엔자 바이러스 B 스트레인, 아형 또는 계통을 포함하는 베타인플루엔자바이러스를 포함한다. 구체적 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 B는 인플루엔자 바이러스 B/야마가타 및/또는 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아를 포함한다. 구체적 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스는 인플루엔자 바이러스 C 및 임의의 인플루엔자 바이러스 C 스트레인, 아형 또는 계통을 포함하는 감마인플루엔자바이러스를 포함한다. 따라서, 본 개시내용의 양상은 인플루엔자 감염을 앓고 있거나, 가질 것으로 의심되거나, 가질 위험이 있는 대상체의 치료를 포함하는 방법에 관한 것이다.
본원에서 사용된 바와 같이, "RSV 감염"은 인간 오르토뉴모바이러스에 의해 유발된 감염을 지칭한다. 따라서, 본 개시내용의 양상은 RSV 감염을 앓고 있거나, 가질 것으로 의심되거나, 가질 위험이 있는 대상체의 치료를 포함하는 방법에 관한 것이다.
구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제 또는 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드의 유효량을 투여함으로써, 이를 필요로 하는 대상체에서 바이러스 감염, 예를 들어 코로나바이러스 감염, HIV 감염, 에볼라 감염, RSV 감염, 및/또는 인플루엔자 감염을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 포함한다. 구체적 실시형태에서, 유효량은 대상체에서 바이러스 감염을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키기에 유효하다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 바이러스에 감염된 대상체의 생존율을 증가시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 바이러스에 감염된 대상체의 회복 시간을 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 대상체에서 바이러스 감염의 증상을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 대상체에서 바이러스 감염에 의해 유발된 세포, 조직, 장기 또는 시스템 손상을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 추가로 포함한다.
구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제 또는 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드의 유효량을 투여함으로써, 이를 필요로 하는 대상체에서 바이러스 감염 후 증후군을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 유효량은 개체에서 바이러스 감염 후 증후군을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키기에 유효하다. 구체적 실시형태에서, 유효량은 대상체에서 바이러스 감염의 지속적인 증상을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키기에 유효하다. 구체적 실시형태에서, 유효량은 개체에서 바이러스 감염에 의해 유발된 세포, 조직, 장기 또는 시스템 손상의 만성 효과를 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키기에 유효하다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 바이러스 감염 후 증후군을 갖는 대상체의 생존율을 증가시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 바이러스 감염의 지속적인 증상을 갖는 대상체의 생존율을 증가시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 바이러스 감염에 의해 유발된 세포, 조직, 장기 또는 시스템 손상의 만성 효과를 갖는 대상체의 생존율을 증가시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 바이러스 감염 후 증후군을 갖는 대상체의 회복 시간을 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 바이러스 감염의 지속적인 증상을 갖는 대상체의 대상체의 회복 시간을 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 바이러스 감염에 의해 유발된 세포, 조직, 장기 또는 시스템 손상의 만성 효과를 갖는 대상체의 회복 시간을 감소시키는 것을 추가로 포함한다.
본원에 개시된 방법의 일부 실시형태에서, 대상체는 바이러스 감염을 가질 높은 위험이 있다. 일부 실시형태에서, 대상체는 바이러스 감염을 갖지 않거나 바이러스 감염에 대해 음성인 것으로 테스트되었다. 일부 실시형태에서, 대상체는 바이러스 감염을 갖는 것으로 진단되었다. 일부 실시형태에서, 대상체는 바이러스 감염의 증상을 갖는 것으로 진단된다. 일부 실시형태에서, 대상체는 바이러스 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단된다.
구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제 또는 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드의 유효량을 투여함으로써 대상체에서 코로나바이러스 감염을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 유효량은 대상체에서 코로나바이러스 감염을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키기에 유효하다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 코로나바이러스에 감염된 대상체의 생존존을 증가시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 코로나바이러스에 감염된 대상체의 회복 시간을 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 대상체에서 코로나바이러스 감염을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 대상체에서 코로나바이러스 감염에 의해 유발된 세포, 조직, 장기 또는 시스템 손상을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 추가로 포함한다.
구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드의 유효량을 투여함으로써, 이를 필요로 하는 대상체에서 코로나바이러스 감염 후 증후군을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 유효량은 개체에서 코로나바이러스 감염 후 증후군을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키기에 유효하다. 구체적 실시형태에서, 유효량은 개체에서 코로나바이러스 감염의 지속적인 증상을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키기에 유효하다. 구체적 실시형태에서, 유효량은 개체에서 코로나바이러스 감염에 의해 유발된 세포, 조직, 장기 또는 시스템 손상의 만성 효과를 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키기에 유효하다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 코로나바이러스 감염 후 증후군을 갖는 대상체의 생존율을 증가시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 코로나바이러스 감염의 지속적인 증상을 갖는 대상체의 생존율을 증가시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 코로나바이러스 감염에 의해 유발된 세포, 조직, 장기 또는 시스템 손상의 만성 효과를 갖는 대상체의 생존율을 증가시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물 코로나바이러스 감염 후 증후군을 갖는 대상체의 회복 시간을 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 코로나바이러스 감염의 지속적인 증상을 갖는 대상체의 회복 시간을 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 코로나바이러스 감염에 의해 유발된 세포, 조직, 장기 또는 시스템 손상의 만성 효과를 대상체의 회복 시간을 감소시키는 것을 추가로 포함한다.
이를 필요로 하는 대상체는 HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43, HCoV-HKU1, SARS-CoV, SARS-CoV-2, 또는 MERS-CoV와 같은 코로나비리다에 과의 바이러스에 의한 감염의 하나 이상의 증상을 갖는 대상체일 수 있다. HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43, HCoV-HKU1, SARS-CoV, SARS-CoV-2, 및/또는 MERS-CoV 감염의 흔한 초기 징후 및 증상은 열, 기침, 숨참 또는 호흡 곤란, 피로, 몸살, 오한, 인후통, 후각 상실, 미각 상실 두통, 설사, 또는 구토를 포함할 수 있다. 바이러스 감염이 진행됨에 따라, 개체에서 폐렴 또는 급성 호흡 곤란 증후군(ARDS)이 발생할 수 있다. 일부 실시형태에서, 바이러스는 SARS-CoV-2이고, 특정 실시형태에서 바이러스는 SARS-CoV, MERS-CoV, HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43, 또는 HCoV-HKU1이 아니다. 일부 실시형태에서, 바이러스는 SARS-CoV이고, 특정 실시형태에서 바이러스는 SARS-CoV-2, MERS-CoV, HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43, 또는 HCoV-HKU1이 아니다. 일부 실시형태에서, 바이러스는 MERS-CoV이고, 특정 실시형태에서 바이러스는 SARS-CoV, SARS-CoV-2, HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43, 또는 HCo-HKU1이 아니다. 일부 실시형태에서, 바이러스는 HCoV-229E이고, 특정 실시형태에서 바이러스는 SARS-CoV, SARS-CoV-2, MERS-CoV, HCoV-NL63, HCoV-OC43, 또는 HCoV-HKU1이 아니다. 일부 실시형태에서, 바이러스는 HCoV-NL63이고, 특정 실시형태에서 바이러스는 SARS-CoV, SARS-CoV-2, MERS-CoV, HCoV-229E, HCoV-OC43, 또는 HCoV-HKU1이 아니다. 일부 실시형태에서, 바이러스는 HCoV-OC43이고, 특정 실시형태에서 바이러스는 SARS-CoV, SARS-CoV-2, MERS-CoV, HCoV-229E, HCoV-NL63, 또는 HCoV-HKU1이 아니다. 일부 실시형태에서, 바이러스는 HCoV-HKU1이고, 특정 실시형태에서 바이러스는 SARS-CoV, SARS-CoV-2, MERS-CoV, HCoV-229E, HCoV-NL63, 또는 HCoV-OC43이 아니다.
본원에 개시된 방법의 일부 실시형태에서, 대상체는 코로나바이러스 감염 및/또는 코로나바이러스 감염 후 증후군을 가질 높은 위험이 있다. 일부 실시형태에서, 대상체는 코로나바이러스 감염을 갖지 않거나 코로나바이러스 감염에 대해 음성인 것으로 테스트되었다. 일부 실시형태에서, 대상체는 코로나바이러스 감염 및/또는 코로나바이러스 감염 후 증후군을 갖는 것으로 진단되었다. 일부 실시형태에서, 대상체는 코로나바이러스 감염 및/또는 코로나바이러스 감염 후 증후군의 증상을 갖는 것으로 진단된다. 일부 실시형태에서, 대상체는 코로나바이러스 감염 및/또는 코로나바이러스 감염 후 증후군을 가질 위험이 있는 것으로 진단된다. 일부 실시형태에서, 대상체는 중증 급성 호흡기 증후군(SARS), 중동 호흡기 증후군, 또는 호흡기 감염을 갖는다. 일부 실시형태에서, 대상체는 COVID-19를 갖는다.
구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 HIV S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제 또는 HIV S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화는 폴리뉴클레오타이드의 유효량을 투여함으로써, 이를 필요로 하는 대상체에서 HIV 감염을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 포함한다. 구체적 실시형태에서, 유효량은 대상체에서 HIV 감염을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키기에 유효하다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 HIV에 감염된 대상체의 생존율을 증가시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 HIV에 감염된 대상체의 회복 시간을 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물 대상체에서 HIV 감염의 증상을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 대상체에서 HIV 감염에 의해 유발된 세포, 조직, 기관, 또는 시스템 손상을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 추가로 포함한다.
이를 필요로 하는 대상체는 HIV 감염의 하나 이상의 증상을 갖는 대상체일 수 있다. HIV 감염의 흔한 초기 징후 및 증상은 발열, 두통, 오한, 발진, 야간 발한, 근육통 및 관절통, 인후통, 피로, 설사, 체중 감소, 기침, 림프절 부종, 구강 궤양, 구강 효모 감염(아구창), 대상포진(shingles, herpes zoster) 및 폐렴을 포함할 수 있다. 바이러스 감염이 진행됨에 따라, 개체에서 발한, 오한, 반복되는 발열, 만성 설사, 림프선 부종, 혀 또는 구강의 지속적인 백색 반점 또는 비정상적 병변, 지속적이고 설명할 수 없는 피로, 허약, 체중 감소 및 피부 발진 또는 돌기가 발생할 수 있다.
본원에 개시된 방법의 일부 실시형태에서, 대상체는 HIV 감염을 가질 높은 위험이 있다. 일부 실시형태에서, 대상체는 HIV 감염을 갖지 않거나 HIV 감염에 대해 음성인 것으로 테스트되었다. 일부 실시형태에서, 대상체는 HIV을 갖는 것으로 진단되었다. 일부 실시형태에서, 대상체는 HIV 감염의 증상을 갖는 것으로 진단된다. 일부 실시형태에서, 대상체는 HIV 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단된다.
구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제 또는 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드의 유효량을 투여함으로써, 이를 필요로 하는 대상체에서 에볼라 감염을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 포함한다. 구체적 실시형태에서, 유효량은 대상체에서 에볼라 감염을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키기에 유효하다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 에볼라에 감염된 대상체의 생존율을 증가시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 에볼라에 감염된 대상체의 회복 시간을 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 대사에에서 에볼라 감염의 증상을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 대상체에서 에볼라 감염에 의해 유발된 세포, 조직, 기관, 또는 시스템 손상을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 추가로 포함한다.
대상체는 에볼라바이러스에 의한 감염의 하나 이상의 증상을 갖는 대상체일 수 있다. 에볼라 감염의 흔한 초기 징후 및 증상은 발열, 인후통, 근육통, 쇠약, 피로 및 두통을 포함할 수 있다. 간 및 신장의 기능 저하와 함께, 일반적으로 구토, 설사, 복통 및 발진이 뒤따른다. 이때, 일부 사람은 내부 및 외부 둘 다에서 출혈이 시작한다.
본원에 개시된 방법의 일부 실시형태에서, 대상체는 에볼라 감염을 가질 높은 위험이 있다. 일부 실시형태에서, 대상체는 에볼라 감염을 갖지 않거나 에볼라 감염에 대해 음성인 것으로 테스트되었다. 일부 실시형태에서, 대상체는 에볼라를 갖는 것으로 진단되었다. 일부 실시형태에서, 대상체는 에볼라 감염의 증상을 갖는 것으로 진단된다. 일부 실시형태에서, 대상체는 에볼라 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단된다.
구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제 또는 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드의 유효량을 투여함으로써, 이를 필요로 하는 대상체에서 인플루엔자 감염을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 포함한다. 구체적 실시형태에서, 유효량은 대상체에서 인플루엔자 감염을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키기에 유효하다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 인플루엔자에 감염된 대상체의 생존율을 증가시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 인플루엔자에 감염된 대상체의 회복 시간을 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 대상체에서 인플루엔자 감염의 증상을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 대상체에서 인플루엔자 감염에 의해 유발된 세포, 조직, 기관, 또는 시스템 손상을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 추가로 포함한다.
대상체는 인플루엔자 바이러스 A, 인플루엔자 바이러스 B, 또는 인플루엔자 바이러스 C 바이러스와 같은 오르토믹소비리다에 과의 바이러스에 의한 감염의 하나 이상의 증상을 갖는 대상체일 수 있다. 인플루엔자 감염의 흔한 징후 및 증상은 발열, 오한, 두통, 근육통 또는 통증, 불편감, 식욕 부진, 활력 부족/피로 및 혼란을 포함할 수 있다. 이러한 증상은 일반적으로 마른 기침, 인후통 또는 건성 인후, 쉰 목소리 및 코막힘 또는 콧물과 같은 호흡기 증상을 동반한다. 기침이 가장 흔한 증상이다. 오심, 구토, 설사 및 위장염을 포함하는 위장 증상도 발생할 수 있다.
본원에 개시된 방법의 일부 실시형태에서, 대상체는 인플루엔자 감염을 가질 높은 위험이 있다. 일부 실시형태에서, 대상체는 인플루엔자 감염을 갖지 않거나 인플루엔자 감염에 대해 음성인 것으로 테스트되었다. 일부 실시형태에서, 대상체는 인플루엔자를 갖는 것으로 진단되었다. 일부 실시형태에서, 대상체는 인플루엔자 감염의 증상을 갖는 것으로 진단된다. 일부 실시형태에서, 대상체는 인플루엔자 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단된다.
구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 RSV 당단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제 또는 RSV 당단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드의 유효량을 투여함으로써, 이를 필요로 하는 대상체에서 RSV 감염을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 포함한다. 구체적 실시형태에서, 유효량은 대상체에서 RSV 감염을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키기에 유효하다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 RSV에 감염된 대상체의 생존율을 증가시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 RSV에 감염된 대상체의 회복 시간을 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 대상체에서 RSV 감염의 증상을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 추가로 포함한다. 구체적 실시형태에서, 방법 및 조성물은 대상체에서 RSV 감염에 의해 유발된 세포, 조직, 기관, 또는 시스템 손상을 치료, 예방, 이의 발병 지연 및/또는 이의 중증도를 감소시키는 것을 추가로 포함한다.
이를 필요로 하는 대상체는 RSV 감염의 하나 이상의 증상을 갖는 대상체일 수 있다. RSV 감염의 흔한 초기 징후 및 증상은 감기, 부비동 및/또는 상기도 징후 및 증상, 예컨대 비충혈, 콧물, 기침, 불쾌감, 인후통 및 미열을 포함할 수 있다.
본원에 개시된 방법의 일부 실시형태에서, 대상체는 RSV 감염을 가질 높은 위험이 있다. 일부 실시형태에서, 대상체는 RSV 감염을 갖지 않거나 RSV 감염에 대해 음성인 것으로 테스트되었다. 일부 실시형태에서, 대상체는 RSV를 갖는 것으로 진단되었다. 일부 실시형태에서, 대상체는 RSV 감염의 증상을 갖는 것으로 진단된다. 일부 실시형태에서, 대상체는 RSV 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단된다.
구체적 실시형태에서, 대상체는 바이러스 감염의 증상의 발병에 기반하여 및/또는 현재 바이러스 감염에 대한 양성 생물학적 테스트에 기반하여 바이러스 감염으로 진단될 수 있다. 구체적 실시형태에서, 현재 바이러스 감염에 대한 생물학적 테스트는 바이러스에 대한 검정이다. 구체적 실시형태에서, 대상체는 바이러스 감염의 증상의 발병 이후 경과한 시간의 양, 발열-감소 의약의 사용의 부재 하에 발열 없이 경과한 시간의 양 및 바이러스 감염의 다른 증상의 개선; 및/또는 적어도 특정 기간의 간격을 두고 수행된 현재 바이러스 감염에 대한 2회 연속의 음성 생물학적 테스트에 기반하여 바이러스 감염으로부터 회복된 것으로 간주될 수 있다. 구체적 실시형태에서, 바이러스 감염 증상이 처음 나타난 이후 적어도 10일이 경과하였고 발열-감소 의약 사용의 부재 하에 발열 없이 적어도 24시간이 경과하였고 바이러스 감염의 다른 증상이 개선되고 있는 경우; 및/또는 적어도 24시간 간격으로 수행된 현재 바이러스 감염에 대한 2회의 생물학적 테스트가 둘 다 음성인 경우 대상체는 바이러스 감염으로부터 회복된 것으로 간주될 수 있다. 구체적 실시형태에서, 대상체는 과거 바이러스 감염에 대한 생물학적 테스트에 기반하여 이전 바이러스 감염을 확인할 수 있다. 구체적 실시형태에서, 과거 바이러스 감염에 대한 생물학적 테스트는 바이러스 항체에 대한 검정이다. 구체적 실시형태에서, 바이러스 감염으로부터 회복된 것으로 간주된 대상체는 바이러스 감염의 지속적인 증상 및/또는 바이러스 감염에 의해 유발된 세포, 조직, 장기 또는 시스템 손상의 만성 효과에 기반하여 바이러스 감염 후 증후군으로 진단될 수 있다. 구체적 실시형태에서, 코로나바이러스 감염의 지속적인 증상 및/또는 코로나바이러스 감염에 의해 유발된 세포, 조직, 장기 또는 시스템 손상의 만성 효과는 지속적인 발열, 기침, 숨참, 호흡 곤란, 피로, 통증, 오한, 인후통, 후각 상실, 미각 상실, 두통, 설사, 구토, 폐렴, 급성 호흡 곤란 증후군(ARDS), 현기증, 기분 장애, 인지 장애, 근육 약화, 신경 손상, 관절통, 흉통, 심계항진, 발진, 탈모, 삶의 질 악화, 폐 손상, 심장 손상, 심장 부종, 신장 손상 또는 간 손상을 포함한다. 특정 실시형태에서, 이를 필요로 하는 대상체는 바이러스 감염의 하나 이상의 지속적인 증상을 갖는 대상체일 수 있다. 바이러스 감염 및/또는 바이러스 감염에 의해 유발된 세포, 조직, 장기 또는 시스템 손상의 만성 효과의 흔한 지속적인 증상은 지속적인 발열, 기침, 숨참, 호흡 곤란, 피로, 통증, 오한, 인후통, 후각 상실, 미각 상실, 두통, 설사, 구토, 폐렴, 급성 호흡 곤란 증후군(ARDS), 현기증, 기분 장애, 인지 장애, 근육 약화, 신경 손상, 관절통, 흉통, 심계항진, 발진, 탈모, 삶의 질 악화, 폐 손상, 심장 손상, 심장 부종, 신장 손상 또는 간 손상을 포함할 수 있다.
용어 "치료" 또는 "치료하는"은 (i) 질환을 예방, 즉 질환의 유도 전에 보호 조성물의 투여에 의해 질환의 증상이 발생하지 않도록 하는 것; (ii) 질환을 저해, 즉 유도성 사건 후 그러나 질환의 임상적 출현 또는 재출현 전에 보호 조성물의 투여에 의해 질환의 증상이 발생하지 않도록 하는 것; (iii) 질환을 억제, 임상 증상의 초기 출현 후 보호 조성물의 투여에 의해 임상 증상의 발생을 정지시키는 것; 및 (iv) 질환을 완화, 즉 임상 증상의 초기 출현 후 보호 조성물의 투여에 의해 임상 증상이 퇴행되도록 하는 것을 포함하여, 포유동물에서 질환의 임의의 치료를 의미한다.
본원에 제공된 요법은 치료제(예를 들어, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드)를 포함하는 조성물의 투여를 포함한다. 일부 실시형태에서, 본원에 제공된 요법은 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 및 약제학적으로 허용되는 부형제의 투여를 포함한다. 일부 실시형태에서, 본원에 제공된 요법은 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산 및 약제학적으로 허용되는 부형제의 투여를 포함한다. 일부 실시형태에서, 본원에 제공된 요법은 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산을 포함하는 벡터 및 약제학적으로 허용되는 부형제의 투여를 포함한다. 일부 실시형태에서, 본원에 제공된 요법은 HIV S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 및 약제학적으로 허용되는 부형제의 투여를 포함한다. 일부 실시형태에서, 본원에 제공된 요법은 HIV S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산 및 약제학적으로 허용되는 부형제의 투여를 포함한다. 일부 실시형태에서, 본원에 제공된 요법은 HIV S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산을 포함하는 벡터 및 약제학적으로 허용되는 부형제의 투여를 포함한다. 일부 실시형태에서, 본원에 제공된 요법은 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드 및 약제학적으로 허용되는 부형제의 투여를 포함한다. 일부 실시형태에서, 본원에 제공된 요법은 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산 및 약제학적으로 허용되는 부형제의 투여를 포함한다. 일부 실시형태에서, 본원에 제공된 요법은 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산을 포함하는 벡터 및 약제학적으로 허용되는 부형제의 투여를 포함한다. 일부 실시형태에서, 본원에 제공된 요법은 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 및 약제학적으로 허용되는 부형제의 투여를 포함한다. 일부 실시형태에서, 본원에 제공된 요법은 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산 및 약제학적으로 허용되는 부형제의 투여를 포함한다. 일부 실시형태에서, 본원에 제공된 요법은 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산을 포함하는 벡터 및 약제학적으로 허용되는 부형제의 투여를 포함한다. 일부 실시형태에서, 본원에 제공된 요법은 RSV 당단백질-상호작용 폴리펩타이드 및 약제학적으로 허용되는 부형제의 투여를 포함한다. 일부 실시형태에서, 본원에 제공된 요법은 RSV 당단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산 및 약제학적으로 허용되는 부형제의 투여를 포함한다. 일부 실시형태에서, 본원에 제공된 요법은 RSV 당단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 핵산을 포함하는 벡터 및 약제학적으로 허용되는 부형제의 투여를 포함한다.
본원에 개시된 바와 같이, "바이러스성 단백질-상호작용 폴리펩타이드"(또한 "바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드")는 바이러스성 단백질을 간섭할 수 있는 임의의 폴리펩타이드를 기술한다. 예를 들어, 바이러스성 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 "바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드"(또한 "바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드")일 수 있고 바이러스 당단백질과 상호작용할 수 있다. 일부 경우에, 이러한 바이러스 당단백질과의 상호작용은 바이러스 스파이크 단백질의 억제 또는 간섭일 수 있다. 구체적 예에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 "바이러스 스파이크 단백질-상호작용 폴리펩타이드"(또한 "바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드")이고 바이러스 스파이크 단백질과 상호작용할 수 있다. 일부 경우에, 이러한 바이러스 스파이크 단백질과의 상호작용은 바이러스 스파이크 단백질의 억제 또는 간섭일 수 있다.
본원에 개시된 바와 같이, "코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드"(또한 "코로나바이러스 스파이크 단백질-상호작용 폴리펩타이드")는 코로나바이러스 스파이크(S) 단백질과 상호작용할 수 있는 임의의 폴리펩타이드를 기술한다. 일부 경우에, 이러한 코로나바이러스 스파이크 단백질과의 상호작용은 코로나바이러스 스파이크 단백질의 억제 또는 간섭일 수 있다. 예를 들어, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43 S 단백질, HCoV-HKU1 S 단백질, MERS-CoV S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질과 상호작용할 수 있다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스는 SARS-CoV를 포함하고, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 SARS-CoV S 단백질을 포함하고, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43 S 단백질, HCoV-HKU1 S 단백질, MERS-CoV S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스는 SARS-CoV-2를 포함하고, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 SARS-CoV-2 S 단백질을 포함하고, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43 S 단백질, HCoV-HKU1 S 단백질, MERS-CoV S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스는 MERS-CoV를 포함하고, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 MERS-CoV S 단백질을 포함하고, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43 S 단백질, HCoV-HKU1 S 단백질, MERS-CoV S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스는 HCoV-229E를 포함하고, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 HCoV-229E S 단백질을 포함하고, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43 S 단백질, HCoV-HKU1 S 단백질, MERS-CoV S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스는 HCoV-NL63을 포함하고, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 HCoV-NL63 S 단백질을 포함하고, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43 S 단백질, HCoV-HKU1 S 단백질, MERS-CoV S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스는 HCoV-OC43을 포함하고, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 HCoV-OC43 S 단백질을 포함하고, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43 S 단백질, HCoV-HKU1 S 단백질, MERS-CoV S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스는 HCoV-HKU1을 포함하고, 코로나바이러스 스파이크 단백질은 HCoV-HKU1 S 단백질을 포함하고, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 HCoV-229E S 단백질, HCoV-NL63 S 단백질, HCoV-OC43 S 단백질, HCoV-HKU1 S 단백질, MERS-CoV S 단백질, SARS-CoV S 단백질, 및/또는 SARS-CoV-2 S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 SARS-CoV 스파이크 단백질, SARS-CoV-2 스파이크 단백질, MERS-CoV 스파이크 단백질, HCoV-229E 스파이크 단백질, HCoV-NL63 스파이크 단백질, HCoV-OC43 스파이크 단백질, HCoV-HKU1 스파이크 단백질, 또는 이들의 조합과 상호작용할 수 있다.
본원에 개시된 바와 같이, "HIV S 단백질-상호작용 폴리펩타이드"(또한 "HIV 스파이크 단백질-상호작용 폴리펩타이드")는 HIV 스파이크(S) 단백질과 상호작용할 수 있는 임의의 폴리펩타이드를 기술한다. 일부 경우에, 이러한 HIV 스파이크 단백질과의 상호작용은 HIV 스파이크 단백질의 억제 또는 간섭일 수 있다. 일부 실시형태에서, HIV S 단백질은 HIV-1 gp160을 포함하고, HIV S 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 HIV-1 gp160 S 단백질로부터 유래된다.
본원에 개시된 바와 같이, "에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드"(또한 "에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드")는 에볼라 당단백질과 상호작용할 수 있는 임의의 폴리펩타이드를 기술한다. 일부 경우에, 이러한 에볼라 당단백질과의 상호작용은 에볼라 당단백질의 억제 또는 간섭일 수 있다. 일부 실시형태에서, 에볼라 바이러스 당단백질은 에볼라 바이러스 GP를 포함하고, 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드는 에볼라 바이러스 GP 단백질로부터 유래된다.
본원에 개시된 바와 같이, "인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드"(또한 "인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질-상호작용 폴리펩타이드")는 인플루엔자 바이러스 스파이크(S) 단백질과 상호작용할 수 있는 임의의 폴리펩타이드를 기술한다. 일부 경우에, 이러한 인플루엔자 바이러스 S 단백질과의 상호작용은 인플루엔자 바이러스 S 단백질의 억제 또는 간섭일 수 있다. 예를 들어, 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 A 단백질, 인플루엔자 바이러스 B 단백질, 및/또는 인플루엔자 바이러스 C 단백질과 상호작용할 수 있다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자는 인플루엔자 바이러스 A를 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 A S 단백질을 포함하고, 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 A/H1 HA S 단백질, 인플루엔자 바이러스 A/H3 HA S 단백질, 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아 HA S 단백질, 또는 인플루엔자 바이러스 B/야마가타 HA S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자는 인플루엔자 바이러스 A/H1을 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 A/H1 HA S 단백질을 포함하고, 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 A/H1 HA S 단백질, 인플루엔자 바이러스 A/H3 HA S 단백질, 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아 HA S 단백질, 또는 인플루엔자 바이러스 B/야마가타 HA S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자는 인플루엔자 바이러스 A/H3을 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 A/H3 HA S 단백질을 포함하고, 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 A/H1 HA S 단백질, 인플루엔자 바이러스 A/H3 HA S 단백질, 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아 HA S 단백질, 또는 인플루엔자 바이러스 B/야마가타 HA S 단백질로부터 유래된다.
일부 실시형태에서, 인플루엔자는 인플루엔자 바이러스 B를 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 B S 단백질을 포함하고, 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 A/H1 HA S 단백질, 인플루엔자 바이러스 A/H3 HA S 단백질, 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아 HA S 단백질, 또는 인플루엔자 바이러스 B/야마가타 HA S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자는 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아를 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아 HA S 단백질을 포함하고, 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 A/H1 HA S 단백질, 인플루엔자 바이러스 A/H3 HA S 단백질, 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아 HA S 단백질, 또는 인플루엔자 바이러스 B/야마가타 HA S 단백질로부터 유래된다. 일부 실시형태에서, 인플루엔자는 인플루엔자 바이러스 B/야마가타를 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 B/야마가타 HA S 단백질을 포함하고, 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 A/H1 HA S 단백질, 인플루엔자 바이러스 A/H3 HA S 단백질, 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아 HA S 단백질, 또는 인플루엔자 바이러스 B/야마가타 HA S 단백질로부터 유래된다.
일부 실시형태에서, 인플루엔자는 인플루엔자 바이러스 C를 포함하고, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질은 인플루엔자 바이러스 C S 단백질을 포함하고, 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 A/H1 HA S 단백질, 인플루엔자 바이러스 A/H3 HA S 단백질, 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아 HA S 단백질, 또는 인플루엔자 바이러스 B/야마가타 HA S 단백질로부터 유래된다.
본원에 개시된 바와 같이, "RSV 당단백질-상호작용 폴리펩타이드"(또한 "RSV-상호작용 폴리펩타이드")는 RSV 당단백질과 상호작용할 수 있는 임의의 폴리펩타이드를 기술한다. 일부 경우에, 이러한 RSV 당단백질과의 상호작용은 RSV 당단백질의 억제 또는 간섭일 수 있다. 일부 실시형태에서, RSV 당단백질은 RSV F 단백질을 포함하고, RSV 당단백질-상호작용 폴리펩타이드는 RSV F 단백질로부터 유래된다.
일부 실시형태에서, 개시된 방법은 바이러스 감염, 예를 들어 코로나바이러스 감염, HIV 감염, 에볼라 감염, RSV 감염, 및/또는 인플루엔자 감염, 및/또는 바이러스 감염 후 증후군을 앓고 있는 대상체를 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 이용하여 치료하는 것을 포함한다. 본원에 개시된 바와 같이, 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드의 투여는 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 바이러스 스파이크 단백질 및/또는 바이러스 당단백질과 같은 바이러스 단백질의 전좌 및 형성을 억제할 수 있고/있거나 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 바이러스 스파이크 단백질 및/또는 바이러스 당단백질과 같은 바이러스 단백질의 양을 감소시킬 수 있다.
따라서, 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질 또는 이의 일부를 바이러스 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 당단백질 및/또는 스파이크 단백질과 같은 바이러스 단백질, 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서, 상기 아미노산 서열이 바이러스 단백질의 상응하는 서열과 적어도 10% 서열 동일성을 갖는, 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 바이러스 감염, 예를 들어 코로나바이러스 감염, HIV 감염, 에볼라 감염, RSV 감염, 및/또는 인플루엔자 감염, 및/또는 바이러스 감염 후 증후군을 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 아미노산 서열이 바이러스 단백질의 상응하는 서열과 적어도 10% 서열 동일성을 갖는, 방법이 개시된다. 일부 경우에, 바이러스 단백질 또는 이의 일부를 바이러스 단백질의 서열에 상응하는 아미노산을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것은 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 바이러스 단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 경쟁을 포함한다.
일부 경우에, 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 바이러스 스파이크 단백질 및/또는 바이러스 당단백질과 같은 바이러스 단백질의 전좌 및 형성의 억제 및/또는 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 바이러스 스파이크 단백질 및/또는 바이러스 당단백질과 같은 바이러스 단백질의 양의 감소는 바이러스 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 억제하는 폴리펩타이드 및 바이러스 단백질의 올리고머화 때문이다. 일부 경우에, 폴리펩타이드 및 바이러스 스파이크 단백질 및/또는 바이러스 당단백질과 같은 바이러스 단백질의 올리고머화는 바이러스 단백질을 억제하고 비-고유 단백질 복합체의 형성을 초래한다. 일부 경우에, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 바이러스 단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 올리고머화는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 바이러스 단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 경쟁을 포함하고, 폴리펩타이드와 바이러스 스파이크 단백질 및/또는 바이러스 당단백질과 같은 바이러스 단백질의 경쟁은 바이러스 단백질을 억제하고 비-고유 단백질 복합체의 형성을 초래한다.
따라서, 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질 또는 이의 일부를 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 상기 올리고머화 도메인과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 바이러스 스파이크 단백질 및/또는 바이러스 당단백질과 같은 바이러스 단백질, 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 바이러스 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 바이러스 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는, 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 바이러스 스파이크 단백질 및/또는 바이러스 당단백질과 같은 바이러스 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 상기 올리고머화 도메인과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 바이러스 감염 및/또는 바이러스 감염 후 증후군을 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 바이러스 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성하는, 방법이 개시된다. 일부 경우에, 바이러스 단백질 또는 이의 일부를 바이러스 단백질의 서열에 상응하는 아미노산을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것은 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 바이러스 단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 경쟁을 포함한다.
일부 실시형태에서, 개시된 방법은 코로나바이러스 감염, 예를 들어 MERS-CoV 감염, HCoV-229E 감염, HCoV-NL63 감염, HCoV-OC43 감염, HCoV-HKU1 감염, SARS-CoV 감염, 및/또는 SARS-CoV-2 감염, 및/또는 코로나바이러스 감염 후 증후군을 앓고 있는 대상체를 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 이용하여 치료하는 것을 포함한다. 본원에 개시된 바와 같이, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드의 투여는 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 코로나바이러스 스파이크 단백질의 전좌 및 형성을 억제할 수 있고/있거나 및/또는 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 코로나바이러스 스파이크 단백질의 양을 감소시킬 수 있다.
따라서, 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 적어도 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 80% 초과의 동일성, 예를 들어 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16을 포함한다. 일부 경우에, 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16에 상응하는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것은 폴리펩타이드와 코로나바이러스 스파이크 단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 경쟁을 포함한다. 일부 실시형태에서, 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 적어도 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 코로나바이러스 감염, 예를 들어 MERS-CoV 감염, HCoV-229E 감염, HCoV-NL63 감염, HCoV-OC43 감염, HCoV-HKU1 감염, SARS-CoV 감염, 및/또는 SARS-CoV-2 감염, 및/또는 코로나바이러스 감염 후 증후군을 치료 또는 예방하는 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 80% 초과의 동일성 12, 14, 또는 16, 예를 들어 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16을 포함한다.
일부 경우에, 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 코로나바이러스 스파이크 단백질 전좌 및 형성의 억제 및/또는 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 코로나바이러스 스파이크 단백질의 양의 감소는 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 억제하는 폴리펩타이드 및 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 때문이다. 일부 경우에, 폴리펩타이드 및 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화는 코로나바이러스 스파이크 단백질을 억제하고 비-고유 단백질 복합체의 형성을 초래한다. 일부 경우에, 폴리펩타이드와 코로나바이러스 스파이크 단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 올리고머화는 폴리펩타이드와 코로나바이러스 스파이크 단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 경쟁을 포함하고, 폴리펩타이드와 코로나바이러스 스파이크 단백질의 경쟁은 코로나바이러스 스파이크 단백질을 억제하고 비-고유 단백질 복합체의 형성을 초래한다.
따라서, 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는, 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 80% 초과의 동일성, 예를 들어 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16을 포함한다.
일부 실시형태에서, 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 10 내지 80% 동일성 예를 들어, 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 코로나바이러스 감염 및/또는 코로나바이러스 감염 후 증후군을 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성하는, 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 80% 초과의 동일성, 예를 들어 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16을 포함한다.
일부 실시형태에서, 개시된 방법은 HIV 감염을 앓고 있는 대상체를 HIV S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 HIV S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 이용하여 치료하는 것을 포함한다. 본원에 개시된 바와 같이, HIV S 단백질-상호작용 폴리펩타이드의 투여는 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 HIV 스파이크 단백질의 전좌 및 형성을 억제할 수 있고/있거나 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 HIV 스파이크 단백질의 양을 감소시킬 수 있다.
따라서, 일부 실시형태에서, HIV 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 서열번호 18과 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18과 80% 초과의 동일성, 예를 들어 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18을 포함한다. 일부 경우에, HIV 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 서열번호 18에 상응하는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것은 폴리펩타이드와 HIV 스파이크 단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 경쟁을 포함한다.
일부 실시형태에서, 서열번호 18과 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 HIV 감염을 치료 또는 예방하는 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18과 80% 초과의 동일성, 예를 들어 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18을 포함한다.
일부 경우에, 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 HIV 스파이크 단백질의 전좌 및 형성의 억제 및/또는 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 HIV 스파이크 단백질의 양의 감소는 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 억제하는 폴리펩타이드 및 HIV 스파이크 단백질의 올리고머화 때문이다. 일부 경우에, 폴리펩타이드 및 HIV 스파이크 단백질의 올리고머화는 HIV 스파이크 단백질을 억제하고 비-고유 단백질 복합체의 형성을 초래한다. 일부 경우에, 폴리펩타이드와 HIV 스파이크 단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 올리고머화는 폴리펩타이드와 HIV 스파이크 단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 경쟁을 포함하고, 폴리펩타이드와 HIV 스파이크 단백질의 경쟁은 HIV 스파이크 단백질을 억제하고 비-고유 단백질 복합체의 형성을 초래한다.
따라서, 일부 실시형태에서, HIV 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 HIV 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 18과 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는 대상체의 생체내에서 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 HIV 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는, 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18과 80% 초과의 동일성, 예를 들어 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18을 포함한다.
일부 실시형태에서, HIV 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 18과 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 HIV 감염을 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 HIV 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성하는, 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18과 80% 초과의 동일성, 예를 들어 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 18을 포함한다.
일부 실시형태에서, 개시된 방법은 에볼라 감염을 앓고 있는 대상체를 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 이용하여 치료하는 것을 포함한다. 본원에 개시된 바와 같이, 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드의 투여는 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 에볼라 바이러스 당단백질의 전좌 및 형성을 억제할 수 있고/있거나 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 에볼라 바이러스 당단백질의 양을 감소시킬 수 있다.
따라서, 일부 실시형태에서, 에볼라 바이러스 당단백질 또는 이의 일부를 서열번호 20과 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 에볼라 바이러스 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20과 80% 초과의 동일성, 예를 들어 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20을 포함한다. 일부 경우에, 에볼라 바이러스 당단백질 또는 이의 일부를 서열번호 20에 상응하는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것은 폴리펩타이드와 에볼라 바이러스 당단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 경쟁을 포함한다.
일부 실시형태에서, 서열번호 20과 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 에볼라 감염을 치료 또는 예방하는 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20과 80% 초과의 동일성, 예를 들어, 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20을 포함한다.
일부 경우에, 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 에볼라 바이러스 당단백질의 전좌 및 형성의 억제 및/또는 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 에볼라 바이러스 당단백질의 양의 감소는 에볼라 바이러스 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 억제하는 폴리펩타이드 및 에볼라 바이러스 당단백질의 올리고머화 때문이다. 일부 경우에, 폴리펩타이드 및 에볼라 바이러스 당단백질의 올리고머화는 에볼라 바이러스 당단백질을 억제하고 비-고유 단백질 복합체의 형성을 초래한다. 일부 경우에, 폴리펩타이드와 에볼라 바이러스 당단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 올리고머화는 폴리펩타이드와 에볼라 바이러스 당단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 경쟁을 포함하고, 폴리펩타이드와 에볼라 바이러스 당단백질의 경쟁은 에볼라 바이러스 당단백질을 억제하고 비-고유 단백질 복합체의 형성을 초래한다.
따라서, 일부 실시형태에서, 에볼라 바이러스 당단백질 또는 이의 일부를 에볼라 바이러스 당단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 20과 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 에볼라 바이러스 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 에볼라 바이러스 당단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 에볼라 바이러스 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 억제하는, 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20과 80% 초과의 동일성, 예를 들어, 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20을 포함한다.
일부 실시형태에서, 에볼라 바이러스 당단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 20과 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 에볼라 감염을 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 에볼라 바이러스 당단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성하는, 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20과 80% 초과의 동일성, 예를 들어, 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 20을 포함한다.
일부 실시형태에서, 개시된 방법은 인플루엔자 감염을 앓고 있는 대상체를 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 이용하여 치료하는 것을 포함한다. 본원에 개시된 바와 같이, 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드의 투여는 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 전좌 및 형성을 억제할 수 있고/있거나 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 양을 감소시킬 수 있다.
따라서, 일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 서열번호 25와 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 25와 80% 초과의 동일성, 예를 들어, 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 25를 포함한다. 일부 경우에, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 서열번호 25에 상응하는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것은 폴리펩타이드와 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 경쟁을 포함한다.
일부 실시형태에서, 서열번호 25와 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 인플루엔자 감염을 치료 또는 예방하는 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는서열번호 25와 80% 초과의 동일성, 예를 들어, 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성 을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 25를 포함한다.
일부 경우에, 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 전좌 및 형성의 억제 및/또는 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 양의 감소는 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 억제하는 폴리펩타이드 및 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 때문이다. 일부 경우에, 폴리펩타이드 및 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화는 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질을 억제하고 비-고유 단백질 복합체의 형성을 초래한다. 일부 경우에, 폴리펩타이드와 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 올리고머화는 폴리펩타이드와 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 경쟁을 포함하고, 폴리펩타이드와 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 경쟁은 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질을 억제하고 비-고유 단백질 복합체의 형성을 초래한다.
따라서, 일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 25와 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 억제하는, 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 25와 80% 초과의 동일성, 예를 들어, 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 25를 포함한다.
일부 실시형태에서, 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 25와 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 인플루엔자 감염을 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성하는, 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 25와 80% 초과의 동일성, 예를 들어, 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다.
일부 실시형태에서, 개시된 방법은 RSV 감염을 앓고 있는 대상체를 RSV 당단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 RSV 당단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 이용하여 치료하는 것을 포함한다. 본원에 개시된 바와 같이, RSV 당단백질-상호작용 폴리펩타이드의 투여는 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 RSV 당단백질의 전좌 및 형성을 억제할 수 있고/있거나 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 RSV 당단백질의 양을 감소시킬 수 있다.
따라서, 일부 실시형태에서, RSV 당단백질 또는 이의 일부를 서열번호 34와 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34와 80% 초과의 동일성, 예를 들어, 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34를 포함한다. 일부 경우에, RSV 당단백질 또는 이의 일부를 서열번호 34에 상응하는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것은 폴리펩타이드와 RSV 당단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 경쟁을 포함한다.
일부 실시형태에서, 서열번호 34와 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 RSV를 치료 또는 예방하는 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34와 80% 초과의 동일성, 예를 들어, 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34를 포함한다.
일부 경우에, 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 RSV 당단백질의 전좌 및 형성의 억제 및/또는 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 RSV 당단백질의 양의 감소는 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 억제하는 폴리펩타이드 및 RSV 당단백질의 올리고머화 때문이다. 일부 경우에, 폴리펩타이드 및 RSV 당단백질의 올리고머화는 RSV 당단백질을 억제하고 비-고유 단백질 복합체의 형성을 초래한다. 일부 경우에, 폴리펩타이드와 RSV 당단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 올리고머화는 폴리펩타이드와 RSV 당단백질의 상응하는 올리고머화 도메인의 경쟁을 포함하고, 폴리펩타이드와 RSV 당단백질의 경쟁은 RSV 당단백질을 억제하고 비-고유 단백질 복합체의 형성을 초래한다.
따라서, 일부 실시형태에서, RSV 당단백질 또는 이의 일부를 RSV 당단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 34와 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 RSV 당단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 억제하는, 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34와 80% 초과의 동일성, 예를 들어, 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34를 포함한다.
일부 실시형태에서, RSV 당단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 34와 10 내지 80% 동일성, 예를 들어 10% 동일성, 20% 동일성, 30% 동일성, 40% 동일성, 50% 동일성, 60% 동일성, 70% 동일성, 또는 80% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 RSV를 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 RSV 당단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성하는, 방법이 개시된다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34와 80% 초과의 동일성, 예를 들어, 85% 동일성, 90% 동일성, 95% 동일성, 또는 99% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함한다. 일부 실시형태에서, 폴리펩타이드는 서열번호 34를 포함한다.
일부 실시형태에서, 본원에 제공된 요법은 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 치료제와 추가 치료제의 조합의 투여를 포함한다. 일부 실시형태에서, 추가 치료제는 스테로이드, 아연, 비타민 C, 회복기 혈청, 렘데시비르, 토실리주맙, 아나킨라, 베클로메타손, 베타메타손, 부데소니드 코르티손, 덱사메타손, 하이드로코르티손, 메틸프레드니솔론, 프레드니솔론, 프레드니손, 트리암시놀론, 아지트로마이신, AC-55541, 아피시딘, AZ3451, AZ8838, 바필로마이신 A1, CCT 365623, 다우노루비신, E-52862, 엔타카폰, GB110, H-89, 할로페리돌, 인도메타신, JQ1, 로라타딘, 메리메포딥, 메트포르민, 미도스타우린, 미갈라스타트, 마이코페놀산, PB28, PD-144418, 포나티닙, 리바비린, RS-PPCC, 룩솔리티닙, RVX-208, S-베라파밀, 실미타서팁, TMCB, UCPH-101, 발프로산, XL413, ZINC1775962367, ZINC4326719, ZINC4511851, ZINC95559591, 4E2RCat, ABBV-744, 카모스타트, 캅토프릴, CB5083, 클로람페니콜, 클로로퀸, 하이드록시클로로퀸, CPI-0610, 다브라페닙, DBeQ, dBET6, IHVR-19029, 리네졸리드, 리시노프릴, 미녹시딜, ML240, MZ1, 나파모스타트, 페보네디스타트, PS3061, 라파마이신(Sirolimus), 상글리페린 A, 사파니서팁(INK128/MlN128), FK-506(Tacrolimus), 테르나틴 4(DA3), 티게사이클린, 토미보서팁(eFT-508), 베르디넥소르, WDB002, 조타티핀(eFT226), 또는 이들의 조합을 포함하지만 이에 제한되지 않는 바이러스 감염 치료용 제제를 포함한다.
일부 실시형태에서, 바이러스 감염 치료용 제제는 추가로 항레트로바이러스 요법(ART), 예컨대: 에파비렌즈(Sustiva), 릴피비린(Edurant), 에트라비린(Intelence), 델라비르딘(Rescriptor), 네비라핀(Viramune, Viramune XR), 및 도라비린(Pifeltro)를 포함하지만 이에 제한되지 않는 비-뉴클레오시드 역전사효소 억제제(NNRTI); 아바카비르(Ziagen), 테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Vemlidy), 테노포비르(Viread), 엠트리시타빈(Emtriva), 라미부딘(Epivir), 지도부딘(Retrovir), 아바카비르/라미부딘/지도부딘(Trizivir), 아바카비르/라미부딘(Epzicom), 엠트리시타빈/테노포비르(Truvada), 아바카비르/라미부딘(Epzicom), 라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Cimduo, Temixys), 라미부딘/지도부딘(Combivir), 엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드(Descovy), 디다노신(Videx, Videx EC), 및 스타부딘(Zerit)을 포함하지만 이에 제한되지 않는 뉴클레오시드 또는 뉴클레오타이드 역전사효소 억제제(NRTI); 아타자나비르(Reyataz), 다루나비르(Prezista), 포삼프레나비르(Lexiva), 리토나비르(Norvir), 티프라나비르(Aptivus), 로피나비르/리토나비르(Kaletra), 아타자나비르/코비시스타트(Evotaz, 또한 시토크롬 P450 억제제), 다루나비르/코비시스타트(Prezcobix, 또한 시토크롬 P450 억제제), 인디나비르(Crixivan), 넬피나비르(Viracept), 및 사퀴나비르(Invirase)를 포함하는 프로테아제 억제제(PI); 빅테그라비르 나트륨/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마르(Biktarvy), 랄테그라비르(Isentress), 엘비테그라비르(Genvoya 및 Stribild), 및 돌루테그라비르(Tivicay)를 포함하지만 이에 제한되지 않는 인테그라제 가닥 전달 억제제(INSTI); 코비시스타트(Tybost) 및 리토나비르(Norvir)를 포함하지만 이에 제한되지 않는 시토크롬 p450 억제제; 및 엔푸비르티드(Fuzeon) 및 마라비록(Selzentry)을 포함하지만 이에 제한되지 않는 진입 또는 융합 억제제; 이발리주맙-uiyk(Trogarzo)를 포함하지만 이에 제한되지 않는 부착 후 억제제; 마라비록(Selzentry)을 포함하지만 이에 제한되지 않는 케모카인 보조수용체 길항제; 포스템사비르(Rukobia)를 포함하지만 이에 제한되지 않는 gp120 부착 억제제; 도라비린/라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Delstrigo), 에파비렌즈/라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Symfi), 에파비렌즈/라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Symfi Lo), 에파비렌즈/엠트리시타빈/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Atripla), 엠트리시타빈/릴피비린/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Odefsey), 엠트리시타빈/릴피비린/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Complera)를 포함하지만 이에 제한되지 않는 NNRTI와 NRTI 조합; 엘비테그라비르/코비시스타트/엠트리시타빈/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Stribild) 및 엘비테그라비르/코비시스타트/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Genvoya)를 포함하지만 이에 제한되지 않는 NRTI, INSTI와 시토크롬 p450 억제제 조합; 아바카비르/돌루테그라비르/라미부딘(Triumeq), 빅테그라비르/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Biktarvy), 및 돌루테그라비르/라미부딘(Dovato)를 포함하지만 이에 제한되지 않는 NRTI와 INSTI 조합; 돌루테그라비르/릴피비린(Juluca)을 포함하지만 이에 제한되지 않는 NNRTI와 INSTI 조합; 다루나비르/코비시스타트/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Symtuza)를 포함하지만 이에 제한되지 않는 NRTI, PI와 시토크롬 p450 억제제 조합; 아세틸-L-카르니틴; 유청 단백질; L-글루타민; L-아르기닌; 하이드록시메틸부티레이트(HMB); 프로바이오틱스; 비타민 및 미네랄; 또는 이들의 조합을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다.
일부 실시형태에서, 바이러스 감염 치료용 제제는 추가로 아톨티비맙/마프티비맙/오데시비맙-ebgn(Inmazeb), 안수비맙-zykl(Ebanga), 파비피라비르(Avigan), 리바비린, BCX4430, 브린시도포비르, TKM-에볼라, AVI-7537, JK-05, 또는 이들의 조합을 포함하지만, 이에 제한되지 않는다.
일부 실시형태에서, 바이러스 감염 치료용 제제는 추가로 오셀타미비르 포스페이트(Tamiflu), 자나미비르(Relenza), 페라미비르(Rapivab), 발록사비르 마르복실(Xofluza), 아만타딘, 리만타딘(Flumadine), 우미페노비르(Arbidol), 모록시딘, 플루티케어, 아세트아미노펜, 클로르페니라민, 덱스트로메토르판, 슈도에페드린, 또는 이들의 조합을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.
V. 약제학적 조성물
일부 실시형태에서, 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 약제학적 조성물이 또한 개시된다. 예를 들어, 일부 실시형태에서 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 약제학적 조성물이 개시된다. 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드는 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함한다. 일부 실시형태에서, 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드는 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함한다. 일부 실시형태에서, 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드는 HIV S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 HIV S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함한다. 일부 실시형태에서, 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드는 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함한다. 일부 실시형태에서, 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드는 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함한다. 일부 실시형태에서, 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드는 RSV 당단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 RSV 당단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함한다.
따라서, 일부 실시형태에서 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 약제학적 조성물이 개시된다. 일부 실시형태에서 HIV S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 HIV S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 약제학적 조성물이 개시된다. 일부 실시형태에서 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 약제학적 조성물이 개시된다. 일부 실시형태에서 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 약제학적 조성물이 개시된다. 일부 실시형태에서 RSV 당단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 RSV 당단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드의 약제학적 조성물이 개시된다. 일부 실시형태에서, 약제학적 조성물은 하나 이상의 추가 치료제, 예를 들어, 본원에 개시된 제제들을 포함하지만 이에 제한되지 않는 바이러스 감염 치료용 제제를 추가로 포함한다. 본 개시내용의 조성물은 조성물은 생체내, 시험관내 또는 생체외 투여를 위해 사용될 수 있다.
일부 실시형태에서, 요법제는 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제일 수 있는 단백질-기반 요법제를 포함한다. 일부 실시형태에서, 요법제는 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 암호화하는 벡터를 포함하는 요법제일 수 있는 폴리뉴클레오타이드-기반 요법제를 포함한다. 예를 들어, 일부 실시형태에서, 요법제는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제일 수 있는 바이러스 단백질-기반 요법제를 포함한다. 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제는 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제이다. 일부 실시형태에서, 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제는 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제이다. 일부 실시형태에서, 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제는 HIV S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제이다. 일부 실시형태에서, 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제는 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제이다. 일부 실시형태에서, 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제는 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제이다. 일부 실시형태에서, 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제는 RSV 당단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제이다. 일부 실시형태에서, 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제는 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, HIV S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, RSV 당단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 및/또는 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제를 포함하지만 이에 제한되지 않는 2가지 이상의 단백질-상호작용 폴리펩타이드의 조합이다.
따라서, 일부 실시형태에서, 요법제는 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제일 수 있는 코로나바이러스 S 단백질-기반 요법제를 포함한다. 일부 실시형태에서, 요법제는 HIV S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제일 수 있는 HIV S 단백질-기반 요법제를 포함한다. 일부 실시형태에서, 요법제는 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제일 수 있는 에볼라 바이러스 당단백질-기반 요법제를 포함한다. 일부 실시형태에서, 요법제는 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제일 수 있는 인플루엔자 바이러스 S 단백질-기반 요법제를 포함한다. 일부 실시형태에서, 요법제는 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제일 수 있는 RSV 당단백질-기반 요법제를 포함한다. 일부 실시형태에서, 요법제는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체, 예를 들어 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 암호화하는 벡터; HIV S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 암호화하는 벡터; 에볼라 바이러스 당단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 암호화하는 벡터; 인플루엔자 바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 암호화하는 벡터; RSV 당단백질-상호작용 폴리펩타이드 또는 이의 단편 또는 기능적 유도체를 암호화하는 벡터; 또는 이들의 조합을 포함하는 요법제일 수 있는 폴리뉴클레오타이드-기반 요법제를 포함한다.
일부 실시형태에서, 요법제는 하나 이상의 질환 의약, 예를 들어, 하나 이상의 항-바이러스 의약을 포함한다. 이들 질환 요법제 중 어느 것이라도 포함될 수 있다. 이들 질환 요법제 중 어느 것이라도 제외될 수 있다. 이들 요법제의 조합이 또한 투여될 수 있다.
본원에 제공된 요법제는 제1 질환 요법제와 같은 치료적 조성물(예를 들어, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드)과 하나 이상의 추가 질환 요법(예를 들어, 항-바이러스 의약)의 조합의 투여를 포함할 수 있다. 요법제는 당업계에 공지된 임의의 적합한 방식으로 투여될 수 있다. 예를 들어, 요법제는 순차적으로(상이한 시간에) 또는 공동으로(동시에 또는 거의 동시에; 또한 "동시에" 또는 "실질적으로 동시에") 투여될 수 있다. 일부 실시형태에서, 요법제는 별도의 조성물로 투여될 수 있다. 일부 실시형태에서, 요법제는 동일한 조성물로 있을 수 있다. 상이한 요법제는 하나의 조성물 또는 하나 이상의 조성물로, 예컨대 2개의 조성물, 3개의 조성물, 또는 4개의 조성물로 투여될 수 있다. 제제의 다양한 조합이 사용될 수 있다.
일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 조성물(들) 및 하나 이상의 추가 질환 의약은 실질적으로 동시에 투여된다. 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 조성물(들), 및 하나 이상의 추가 질환 의약은 순차적으로 투여된다. 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 조성물(들)은 하나 이상의 추가 의약을 투여하기 전에 투여된다. 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 조성물(들)은 하나 이상의 추가 의약을 투여한 후에 투여된다.
일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 조성물(들)은 대상체에게 1회 전달된다. 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 조성물은 대상체에게 다수회, 예컨대 1일 1회, 1일 1회 이상, 주 1회, 주 1회 이상, 월 1회, 월 1회 이상, 년 1회 또는 년 1회 이상 전달된다. 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드는 대상체에게 다수회 투여된다. 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드는 대상체에게 1회 투여된다. 다수의 치료는 동일한 제형 및/또는 투여 경로(들)를 가질 수 있거나 그렇지 않을 수 있다.
일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 조성물은 질환, 예를 들어, 바이러스 감염 및/또는 바이러스 감염 후 증후군의 발병 후에 전달된다. 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 조성물은 질환, 예를 들어 바이러스 감염 및/또는 바이러스 감염 후 증후군의 발병 전에 전달된다.
A. 담체
일부 실시형태에서, 본 개시내용의 약제학적 조성물은 약제학적으로 허용되는 담체에 용해되거나 분산된 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 하나 이상의 조성물의 유효량을 포함한다. 문구 "약제학적" 및 "약리학적으로 허용되는"은 본원에서 상호교환적으로 사용되며 예를 들어 인간과 같은 대상체에게 적절하게 투여될 때 부작용, 알레르기 또는 기타 바람직하지 않은 반응을 일으키지 않고 본 개시내용의 치료 방법을 간섭하지 않는 분자 실체(entities) 및 조성물을 지칭한다. 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 적어도 하나의 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드 및/또는 추가 활성 성분은 그 전체가 본원에 참조로 구체적으로 포함되는 문헌[Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 21st Ed. Lippincott Williams and Wilkins, 2005]에 의해 예시된 바와 같이, 본 개시내용에 비추어 당업자에게 공지될 것이다. 더욱이, 대상체에게 투여하기 위해서는, 제제가 FDA 생물의약품 표준 사무국이 요구하는 멸균성, 발열성, 일반 안전성 및 순도 기준을 충족해야 한다는 것이 이해될 것이다.
본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "약제학적으로 허용되는 담체"는 당업자에게 공지된 바와 같은(예를 들어, 그 전체가 본원에 참조로 구체적으로 포함되는 문헌[Remington's Pharmaceutical Sciences, 18th Ed. Mack Printing Company, 1990, pp. 1289-1329] 참조), 임의의 및 모든 용매, 분산 매질, 코팅제, 계면활성제, 항산화제, 보존제(예를 들어, 항세균제, 항진균제), 등장화제, 흡수 지연제, 염, 보존제, 약물, 약물 안정화제, 겔, 결합제, 부형제, 붕해제, 윤활제, 감미제, 향미제, 염료, 이러한 유사 물질 및 이들의 조합을 포함한다. 임의의 통상적인 담체가 활성 성분과 양립할 수 없는 경우를 제외하고, 약제학적 조성물에서의 이의 사용이 고려된다. 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 조성물은 고체, 액체 또는 에어로졸 형태로 투여되는지 여부 및 주사과 같은 이러한 투여 경로를 위해 멸균될 필요가 있는지 여부에 따라 상이한 유형의 담체를 포함할 수 있다.
추가로 본 개시내용에 따르면, 투여에 적합한 본 개시내용의 조성물은 불활성 희석제와 함께 또는 없이 약제학적으로 허용되는 담체 중에서 제공될 수 있다. 담체는 동화될 수 있어야 하며 액체, 반고체, 즉 페이스트 또는 고체 담체를 포함한다. 임의의 통상적인 매질, 제제, 희석제 또는 담체가 수용자 또는 내부에 함유된 조성물의 치료 효과에 유해한 경우를 제외하고는, 본 개시내용의 방법을 실시하는 데 있어 담체의 사용이 적절하다. 담체 또는 희석제의 예는 지방, 오일, 물, 염수 용액, 지질, 리포좀, 수지, 결합제, 충전제, 알코올 등, 또는 이들의 조합을 포함한다. 조성물은 또한 하나 이상의 성분의 산화를 지체시키기 위해 다양한 항산화제를 포함할 수 있다. 추가로, 미생물 작용의 예방은 파라벤(예를 들어, 메틸파라벤, 프로필파라벤), 클로로부탄올, 페놀, 소르빈산, 티메로살 또는 이들의 조합을 포함하지만 이에 제한되지 않는 다양한 항세균제 및 항진균제와 같은 보존제에 의해 야기될 수 있다.
본 개시내용에 따르면, 조성물은 임의의 편리하고 실질적인 방식, 즉 용해, 현탁, 유화, 혼합, 캡슐화, 흡수 등에 의해 담체와 조합된다. 이러한 절차는 당업자에게 일상적이다. 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 조성물은 동결건조될 수 있다.
본 개시내용의 구체적 실시형태에서, 조성물은 반고체 또는 고체 담체와 철저하게 조합되거나 혼합된다. 혼합은 분쇄와 같은 임의의 편리한 방식으로 수행될 수 있다. 치료 활성의 상실, 즉 위장에서의 변성으로부터 조성물을 보호하기 위해 안정화제가 혼합 과정에서 첨가될 수도 있다. 조성물에 사용하기 위한 안정화제의 예는 완충제, 글리신 및 라이신과 같은 아미노산, 덱스트로스, 만노스, 갈락토스, 프럭토스, 락토스, 수크로스, 말토스, 소르비톨, 만니톨 등과 같은 탄수화물을 포함한다.
추가 실시형태에서, 본 개시내용은 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드, 하나 이상의 지질 및 수성 용매를 포함하는 조성물을 혼입하는 약제학적 지질 비히클 조성물의 사용을 포함할 수 있다. 본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "지질"은 특징적으로 물에 불용성이고 유기 용매로 추출될 수 있는 광범위한 물질 중 임의의 것을 포함하는 것으로 정의될 것이다. 이러한 광범위한 부류의 화합물은 당업자에게 잘 알려져 있고, 용어 "지질"이 본원에서 사용될 때, 이는 임의의 특정 구조로 제한되지 않는다. 예는 장쇄 지방족 탄화수소 및 이의 유도체를 함유하는 화합물을 포함한다. 지질은 천연 발생 또는 합성(즉, 사람에 의해 설계 또는 생산된)일 수 있다. 그러나, 지질은 일반적으로 생물학적 물질이다. 생물학적 지질은 당업계에 잘 알려져 있으며, 예를 들어 중성 지방, 인지질, 포스포글리세라이드, 스테로이드, 테르펜, 라이소지질(lysolipid), 글리코스핑고지질, 당지질, 설파타이드, 에테르 및 에스테르-결합된 지방산을 갖는 지질 및 중합가능한 지질, 및 이들의 조합을 포함한다. 물론, 당업자에 의해 지질로서 이해되는, 본원에 구체적으로 기술된 것들 이외의 화합물도 본 개시내용의 조성물 및 방법에 포함된다.
당업자는 조성물을 지질 비히클에 분산시키기 위해 사용될 수 있는 기술의 범위를 잘 알고 있을 것이다. 예를 들어, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 조성물(들)은 지질을 함유하는 용액에 분산되거나, 지질과 함께 용해되거나, 지질과 함께 유화되거나, 지질과 혼합되거나, 지질과 조합되거나, 지질에 공유 결합되거나, 지질 중의 현탁액으로서 함유되거나, 미셀 또는 리포좀에 함유되거나 이와 복합체화되거나, 또는 당업자에게 공지된 임의의 수단에 의해 지질 또는 지질 구조와 다른 방식으로 회합될 수 있다. 분산은 리포좀의 형성을 초래할 수 있거나 그렇지 않을 수 있다.
바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 조성물(들)은 유리 염기, 중성 또는 염 형태의 조성물로 제형화될 수 있다. 약제학적으로 허용되는 염은 산 부가염, 예를 들어, 단백질성 조성물의 유리 아미노 그룹에 의해 형성된 것들 또는 예를 들어 염산 또는 인산과 같은 무기산 또는 아세트산, 옥살산, 타르타르산 또는 만델산과 같은 유기산에 의해 형성된 것들을 포함한다. 유리 카르복실 그룹에 의해 형성된 염은 또한 예를 들어 나트륨, 칼륨, 암모늄, 칼슘 또는 수산화제2철과 같은 무기 염기; 또는 이소프로필아민, 트리메틸아민, 히스티딘 또는 프로카인과 같은 유기 염기로부터 유래될 수 있다. 제형화 시, 용액은 투여 제형과 양립가능한 방식으로 및 치료적으로 유효한 양으로 투여될 것이다. 제형은 폐로 전달하기 위한 주사가능한 용액 또는 에어로졸과 같은 비경구 투여를 위해 제형화된 형태 또는 약물 방출 캡슐 등과 같은 소화 투여를 위해 제형화된 형태와 같은 다양한 투여 형태로 용이하게 투여된다.
B. 투여 경로
본 개시내용의 치료제는 동일한 투여 경로 또는 상이한 투여 경로로 투여될 수 있다. 조성물의 투여 경로는 예를 들어 비강내로, 정맥내로, 대뇌내로, 두개내로, 근육내로, 피하로, 국소적으로, 경구로, 점막으로, 피내로, 경피로, 복강내로, 동맥내로, 안와내로, 이식에 의해, 질내로, 직장내로, 국소적으로, 척수강내로, 관절내로, 뇌실내로 또는 윤활강내로(intrasynovially); 흡입, 주사, 주입, 연속 주입, 표적 세포를 직접 세척하는 국소화 관류에 의해, 카테터를 통해, 세척액을 통해; 크림 또는 지질 조성물(예를 들어, 리포솜)로; 당업자에게 공지된 다른 방법 또는 전술한 방법들의 임의의 조합(예를 들어, 그 전체가 본원에 참조로 구체적으로 포함된 문헌[Remington's Pharmaceutical Sciences, 18th Ed. Mack Printing Company, 1990] 참조)에 의해 투여될 수 있다.
일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 조성물(들)은 전신으로 또는 국소로 전달된다. 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 조성물은 흡입에 의해 전달된다. 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 조성물은 비강내로 전달된다.
일부 실시형태에서, 본원에 개시된 바와 같은, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 조성물은 그 전체가 본원에 참조로 구체적으로 포함된 문헌[A.L. Lewis and J. Richard, Therapeutic Delivery 6(2):149-163 (2015)]에 기술된 바와 같이, 생체내 안정성 및/또는 세포에 의한 흡수 또는 흡수를 향상시키도록 제형화된다. 예를 들어, 조성물은 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제, 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드의 세포에 의한 흡수를 증가시키기 위해 흡수 증진제, 예를 들어 아실 카르니틴, 옥탄산나트륨, 카프산나트륨, SNAC, SNAD, 5-CNAC와 함께 제형화될 수 있다. 일부 실시형태에서, 생체내 안정성 및/또는 세포에 의한 흡수(uptake) 또는 흡착(absorption)을 향상시키기 위한 제형은 조성물의 투여 경로, 예를 들어 비강내, 경구 또는 주사에 의해 좌우될 것이다.
1. 비경구 경로
따라서, 일부 실시형태에서, 조성물(들)은 비경구 경로를 통해 투여될 수 있다. 본원에서 사용된 바와 같이, 용어 "비경구"는 소화관을 우회하는 경로를 포함한다. 구체적으로, 본원에 개시된 약제학적 조성물은, 예를 들어, 이에 제한되는 것은 아니지만, 안와-후방, 뇌내, 두개내, 정맥내, 피내, 근육내, 동맥내, 척수강내, 피하 또는 복강내로 투여될 수 있다. 미국 특허 제6,7537,514호, 제6,613,308호, 제5,466,468호, 제5,543,158호; 제5,641,515호; 및 제5,399,363호(각각 그 전체가 본원에 참조로 구체적으로 포함됨).
유리 염기 또는 약리학적으로 허용되는 염으로서의 활성 화합물의 용액은 하이드록시프로필셀룰로스와 같은 계면활성제와 적절하게 혼합된 물에서 제조될 수 있다. 분산액은 또한 글리세롤, 액체 폴리에틸렌 글리콜 및 이들의 혼합물 및 오일에서 제조될 수 있다. 일반적인 보관 및 사용 조건 하에, 이들 제제는 미생물의 성장을 방지하는 방부제를 함유한다. 주사 용도를 위해 적합한 약제학적 형태는 멸균 수성 용액 또는 분산액 및 멸균 주사가능한 용액 또는 분산액의 즉석 제조를 위한 멸균 분말(예를 들어, 그 전체가 본원에 참조로 구체적으로 포함되는 미국 특허 5,466,468 참조)을 포함한다. 모든 경우 형태는 멸균성이어야 하고, 용이하게 주사가능하게 존재하는 범위까지 유동적이어야 한다. 제조 및 저장 조건 하에 안정하여야 하고, 세균 및 진균과 같은 미생물의 오염 활성에 대항하여 보존되어야 한다. 담체는 예를 들어 물, 에탄올, 폴리올(즉, 글리세롤, 프로필렌 글리콜, 및 및 액체 폴리에틸렌 글리콜 등), 이의 적합한 혼합물, 및/또는 식물성 오일을 포함하는 용매 또는 분산 매질일 수 있다. 적절한 유동성은 예를 들어 레시틴과 같은 코팅의 사용, 분산의 경우 필요한 입자 크기의 유지 및 계면활성제의 사용에 의해 유지될 수 있다. 미생물 작용의 방지는 다양한 항세균제 및 항진균제, 예를 들어 파라벤, 클로로부탄올, 페놀, 소르브산, 티메로살 등에 의해 야기될 수 있다. 많은 경우에, 등장화제, 예를 들어 당 또는 염화나트륨을 포함하는 것이 바람직할 것이다. 주사용 조성물의 장시간 흡수는 흡수를 지연시키는 제제, 예를 들어 알루미늄 모노스테아레이트 및 젤라틴을 조성물에서 사용함으로써 달성될 수 있다.
예를 들어, 수용액에서의 비경구 투여를 위해, 용액은 필요한 경우 적절하게 완충되어야 하고 액체 희석제는 먼저 충분한 식염수 또는 글루코스로 등장성이 되게 해야 한다. 이들 특정 수용액은 특히 정맥내, 근육내, 피하 및 복강내 투여에 적합하다. 이와 관련하여, 사용될 수 있는 멸균 수성 매질은 본 개시내용의 관점에서 당업자에게 공지될 것이다. 예를 들어, 하나의 투여량을 등장성 NaCl 용액에 용해시키고 제안된 투입 부위에 주사할 수 있다(예를 들어, 문헌["Remington's Pharmaceutical Sciences" 15th Edition, pages 1035-1038 and 1570-1580] 참조). 일부 투여량 변동은 치료 대상체의 상태에 따라 필연적으로 발생할 것이다. 투여 책임자는, 임의의 사건에서, 개별 대상체에게 적절한 용량을 결정할 것이다. 또한, 인간 투여를 위해, 제제는 FDA 생물의약품 표준 사무국이 요구하는 멸균성, 발열성, 일반 안전성 및 순도 기준을 충족해야 한다.
멸균 주사가능한 용액은 활성 화합물을 요구되는 양으로 적합한 용매 중에 상기 열거된 다양한 다른 성분과 함께 도입하고, 필요한 경우, 후속적으로 예를 들어 여과 멸균을 수행할 수 있다. 일반적으로, 분산액은 다양한 멸균된 활성 성분을 기본 분산액 배지 및 상기 열거된 것들로부터 요구되는 다른 성분을 포함하는 멸균 비히클 내로 도입하여 제조한다. 멸균 주사가능한 용액의 제조를 위한 멸균 분말의 경우, 바람직한 제조 방법은 이전에 멸균 여과된 용액으로부터 활성 성분의 분말과 임의의 추가의 원하는 성분을 생성하는 진공 건조 및 동결건조 기술이다. 분말화 조성물은 안정화제와 함께 또는 안정화제 없이, 예를 들어 물 또는 염수 용액과 같은 액체 담체와 조합된다.
2. 소화 경로
본 개시내용의 특정 실시형태에서, 조성물은 소화 경로를 통해 투여되도록 제형화된다. 소화 경로는 조성물이 소화관과 직접 접촉하는 모든 가능한 투여 경로를 포함한다. 구체적으로, 본원에 개시된 약제학적 조성물은 경구로, 구강으로(buccally), 직장으로 또는 설하로 투여될 수 있다. 이와 같이, 이들 조성물은 불활성 희석제 또는 동화가능한 식용 담체와 함께 제형화될 수 있거나, 경질- 또는 연질-쉘 젤라틴 캡슐에 봉입될 수 있거나, 정제로 압착될 수 있거나, 또는 식단의 음식과 함께 직접 혼입될 수 있다.
특정 실시형태에서, 활성 화합물은 부형제와 함께 혼입될 수 있고 섭취가능한 정제, 구강 정제, 트로키제, 캡슐제, 엘릭시르제, 현탁액, 시럽, 웨이퍼 등의 형태로 사용될 수 있다(Mathiowitz et al, 1997; Hwang et al, 1998, 미국 특허 제5,641,515호, 제5,580,579호 및 제5,792,451호, 각각 그 전체가 본원에 참고로 구체적으로 포함됨). 정제, 트로키제, 환제, 캡슐제 등은 또한 다음을 함유할 수 있다: 예를 들어 트라가칸트 검, 아카시아, 옥수수 전분, 젤라틴 또는 이들의 조합과 같은 결합제; 예를 들어 인산이칼슘, 만니톨, 락토스, 전분, 스테아르산마그네슘, 사카린나트륨, 셀룰로스, 탄산마그네슘 또는 이들의 조합과 같은 부형제; 예를 들어, 옥수수 전분, 감자 전분, 알긴산 또는 이들의 조합과 같은 붕해제; 예를 들어 마그네슘 스테아레이트와 같은 윤활제; 예를 들어 수크로스, 락토스, 사카린 또는 이들의 조합과 같은 감미제; 예를 들어 페퍼민트, 윈터그린 오일, 체리 향료, 오렌지 향료 등과 같은 향미제. 투여 단위 형태가 캡슐인 경우, 이는 상기 유형의 물질 이외에도 액체 담체를 함유할 수 있다. 다양한 기타 물질이 코팅제로 존재할 수 있거나 그렇지 않으면 투여 단위의 물리적 형태를 변형할 수 있다. 예를 들어, 정제, 알약 또는 캡슐은 셸락, 당 또는 둘 다로 코팅될 수 있다. 투여 형태가 캡슐인 경우, 이는 상기 유형의 물질 이외에도 액체 담체와 같은 담체를 함유할 수 있다. 젤라틴 캡슐, 정제 또는 환제는 장용 코팅될 수 있다. 장용 코팅은 pH가 산성인 위 또는 상부 창자에서 조성물의 변성을 방지한다. 예를 들어 미국 특허 제5,629,001호를 참조한다. 소장에 도달하면, 그 안에서 염기성 pH는 코팅을 용해시키고 조성물이 방출되어 특화된 세포, 예를 들어 상피 장세포 및 파이어판(Peyer’s patch) M 세포에 의해 흡수되도록 한다. 엘릭시르의 시럽은 활성 화합물인 감미료로서 수크로스, 보존제로서 메틸 및 프로필파라벤, 염료 및 향미제, 예컨대 체리 또는 오렌지 향미를 함유할 수 있다. 물론, 임의의 투여 단위 형태를 제조하는 데 사용되는 임의의 물질은 약제학적으로 순수하고, 사용되는 양에서 실질적으로 무독성이어야 한다. 또한, 활성 화합물은 서방출 제제 및 제형에 포함될 수 있다.
경구 투여를 위해, 조성물(들)은 대안적으로 구강 청결제, 치약, 구강정, 경구 스프레이 또는 설하 경구-투여 제형의 형태로 하나 이상의 부형제와 함께 혼입될 수 있다. 예를 들어, 붕산나트륨 용액(Dobell's Solution)과 같은 적절한 용매에 필요한 양의 활성 성분을 혼입시켜 구강청결제를 제조할 수 있다. 대안적으로, 활성 성분은 붕산나트륨, 글리세린 및 중탄산칼륨을 함유하는 용액과 같은 경구 용액에 혼입되거나, 치약에 분산되거나, 물, 결합제, 연마제, 향미제, 발포제 및 습윤제를 포함할 수 있는 조성물에 치료적 유효량으로 첨가될 수 있다. 대안적으로, 조성물은 혀 아래에 놓여지거나 입안에서 용해될 수 있는 정제 또는 용액 형태로 만들어질 수 있다.
다른 소화관 투여 방식에 적합한 추가 제형은 좌제를 포함한다. 좌제는 일반적으로 직장에 삽입하기 위해 약제 처리된, 다양한 중량 및 모양의 고형 투여 형태이다. 삽입 후, 좌제는 공동 유체에서 연화되거나 용융되거나 용해된다. 일반적으로, 좌제의 경우 전통적인 담체는 예를 들어 폴리알킬렌 글리콜, 트리글리세리드 또는 이들의 조합을 포함할 수 있다. 특정 실시형태에서, 좌제는 예를 들어 약 0.5% 내지 약 10%(중량 기준) 및 바람직하게는 약 1% 내지 약 2%(중량 기준) 범위의 활성 성분을 함유하는 혼합물로부터 형성될 수 있다.
3. 기타 경로
본 개시내용의 다른 실시형태에서, 조성물(들)은 다양한 기타 경로를 통한 투여, 예를 들어 흡입에 의한 투여, 국소(즉, 경피) 투여 및/또는 점막 투여(비강내, 질 등)를 위해 제형화될 수 있다.
특정 실시형태에서, 조성물(들)은 점안액, 비강내 스프레이, 흡입 및/또는 기타 에어로졸 전달 비히클에 의해 전달될 수 있다. 비강 에어로졸 스프레이를 통해 조성물을 폐에 직접 전달하는 방법은 예를 들어 미국 특허 제5,756,353호 및 제5,804,212호(각각 전문이 참조로 본 명세서에 포함됨)에 기재되어 있다. 마찬가지로, 비강내 미세입자 수지(예를 들어, 문헌[Takenaga et al., 1998] 참조) 및 리소포스파티딜-글리세롤 화합물(예를 들어, 미국 특허 제5,725,871호 참조, 그 전체가 본원에 참고로 구체적으로 포함됨)을 사용하는 약물의 전달도 약제학 분야에 잘 알려져 있다. 마찬가지로, 폴리테트라플루오로에틸렌 지지체 매트릭스 형태의 경점막 약물 전달은 예를 들어 미국 특허 제5,780,045호(그 전체가 본원에 참고로 구체적으로 포함됨)에 기술되어 있다.
에어로졸이라는 용어는 액화 또는 가압 가스 추진제에 분산된 액체 입자의 미분된 고체의 콜로이드 시스템을 지칭한다. 흡입을 위한 본 개시내용의 전형적인 에어로졸은 액체 추진제, 또는 액체 추진제와 적합한 용매의 혼합물 중의 활성 성분의 현탁액으로 구성될 것이다. 적합한 추진제는 탄화수소 및 탄화수소 에테르를 포함한다. 적합한 용기는 추진제의 압력 요건에 따라 달라질 것이다. 에어로졸의 투여는 대상체의 연령, 체중 및 증상의 중증도 및 반응에 따라 달라질 것이다.
국소 투여용 약제학적 조성물은 연고, 페이스트, 크림 또는 분말과 같은 의약 적용을 위해 제형화된 활성 화합물을 포함할 수 있다. 연고는 국소 적용을 위한 모든 유성, 흡착성, 에멀젼 및 수용성 기재 조성물을 포함하는 반면, 크림 및 로션은 에멀젼 기재만을 포함하는 조성물이다. 국소 투여되는 의약은 피부를 통한 활성 성분의 흡착을 촉진하기 위한 침투 증진제를 함유할 수 있다. 적합한 침투 증진제는 글리세린, 알코올, 알킬 메틸 설폭사이드, 피롤리돈 및 루아로카프람을 포함한다. 국소 적용을 위한 조성물의 가능한 기재는 폴리에틸렌 글리콜, 라놀린, 콜드 크림 및 바셀린뿐만 아니라 임의의 다른 적합한 흡수성, 에멀젼 또는 수용성 연고 기재를 포함한다. 국소 제제는 또한 활성 성분을 보존하고 균질한 혼합물을 제공하기 위해 필요에 따라 유화제, 겔화제 및 항미생물 보존제를 포함할 수 있다. 본 개시내용의 경피 투여는 또한 "패치"의 사용을 포함할 수 있다. 예를 들어, 패치는 하나 이상의 활성 물질을 고정된 기간 동안 사전 결정된 속도로 연속적인 방식으로 공급할 수 있다.
C. 투약
대상체에게 투여되는 본 개시내용의 조성물(들)의 적절한 투여량은 체중, 중증도 및 상태의 경과, 치료되는 질환의 유형, 개체의 임상 상태, 이전 또는 동시 치료 개입, 개체의 임상 병력 및 치료에 대한 반응, 대상체의 특발성, 투여 경로 및 담당 의사의 재량과 같은 물리적 및 생리학적 요인에 의해 결정될 수 있다. 투여량 및 투여 경로에 따라, 바람직한 투여량 및/또는 유효량의 투여 횟수는 대상체의 반응에 따라 달라질 수 있다. 투여를 담당하는 전문의는, 임의의 상황에서, 조성물 중의 활성 성분(들)의 농도 및 개별 대상체에 대한 적절한 용량(들)을 결정할 것이다.
특정 실시형태에서, 약제학적 조성물은 예를 들어 최대 또는 적어도 약 0.000001 내지 최대 또는 적어도 약 10%(중량 기준)의 활성 화합물을 포함할 수 있다. 다른 실시형태에서, 활성 화합물은 단위 중량의 약 0.001% 내지 약 1%, 또는 예를 들어 약 0.01% 내지 약 0.1%, 및 그 내의 추론가능한 임의의 범위를 포함할 수 있다. 당연히, 각각의 치료적으로 유용한 조성물 중의 활성 화합물(들)의 양은 적합한 투여량이 화합물의 임의의 소정 단위 용량에서 수득되는 방식으로 제조될 수 있다. 용해도, 생체이용률, 생물학적 반감기, 투여 경로, 제품 유효 기간과 같은 요인뿐만 아니라, 기타 약리학적 고려사항도 이러한 약제학적 제형을 제조하는 기술 분야의 숙련가에 의해 고려될 것이며, 이와 같이 다양한 투여량 및 치료 용법(treatment regimen)이 바람직할 수 있다.
치료는 다양한 "단위 용량"을 포함할 수 있다. 단위 용량은 사전 결정된 양의 치료적 조성물을 함유하는 것으로 정의된다. 투여될 양, 특정 경로 및 제형은 임상 분야의 숙련가의 결정 기술 내에 있다. 단위 용량은 단일 주입으로 투여될 필요는 없지만 일정 기간 동안 연속 투입을 포함할 수 있다. 일부 실시형태에서, 단위 용량은 단일 투여가능한 용량을 포함한다.
치료 횟수와 단위 용량에 따라 투여될 양은 원하는 치료 효과에 의해 좌우된다. 유효 용량은 특정 효과를 달성하는 데 필요한 양을 의미하는 것으로 이해된다. 또한, 이러한 용량은 하루 동안 및/또는 다수의 날, 주 또는 개월 동안 다수회 투여될 수 있다.
일부 실시형태에서, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제의 단일 용량이 투여된다. 일부 실시형태에서, 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제의 다중 용량이 투여된다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제의 유효 용량이 투여된다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제는 적어도, 최대, 또는 약 0.1, 0.5, 1, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 100, 105, 110, 115, 120, 125, 130, 135, 140, 145, 150, 155, 160, 165, 170, 175, 180, 185, 190, 195, 및 200, 300, 400, 500, 1000 ㎍/kg, mg/kg, ㎍/일, 또는 mg/일 또는 그 내의 추론가능한 임의의 범위 또는 값의 용량으로 투여된다. 특정 실시형태에서, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제의 유효 용량은 약, 적어도 약 또는 최대 약 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 또는 100 μM 또는 그 내의 추론가능한 임의의 범위의 혈중 수준을 제공할 수 있는 용량이다. 특정 실시형태에서, 대상체에게 투여되는 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제는 체내에서 대사된 치료제로 대사되며, 이 경우 혈중 수준은 그 제제의 양을 나타낼 수 있다. 대안적으로, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제가 대상체에 의해 대사되지 않는 한, 본원에서 논의된 혈중 수준은 대사되지 않은, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제를 나타낼 수 있다.
일부 실시형태에서, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드의 단일 용량이 투여된다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드의 다중 용량이 투여된다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드의 유효 용량이 투여된다. 일부 실시형태에서, 코로나바이러스 S 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드는 적어도, 최대, 또는 약 1 x 108, 1 x 109, 1 x 1010, 1 x 1011, 1 x 1012, 1 x 1013, 1 x 1014, 1 x 1015, 1 x 1016, 1 x 1017, 또는 1 x 1018 폴리뉴클레오타이드 카피/대상체의 체중 kg, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 범위 또는 값의 용량으로 투여된다. 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드는 1 x 108 내지 1 x 1018 폴리뉴클레오타이드 카피/대상체의 체중 kg의 용량으로 투여된다. 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드는 1 x 1011 내지 1 x 1014 폴리뉴클레오타이드 카피/대상체의 체중 kg의 용량으로 투여된다. 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드는 1 x 1012 내지 1 x 1015 폴리뉴클레오타이드 카피/대상체의 체중 kg의 용량으로 투여된다.
일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드는 벡터에 포함된다. 일부 실시형태에서, 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드 요법제를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드 또는 바이러스 단백질-상호작용 폴리펩타이드와 같은 단백질-상호작용 폴리펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 벡터의 유효 용량이 투여된다. 일부 실시형태에서, 벡터는 적어도, 최대, 또는 약 1 x 108, 1 x 109, 1 x 1010, 1 x 1011, 1 x 1012, 1 x 1013, 1 x 1014, 1 x 1015, 1 x 1016, 1 x 1017, 또는 1 x 1018 벡터 카피/대상체의 체중 kg, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 범위 또는 값의 용량으로 투여된다. 일부 실시형태에서, 벡터는 1 x 108 내지 1 x 1018의 벡터 카피/대상체의 체중 kg의 용량으로 투여된다. 일부 실시형태에서, 벡터는 1 x 1011 내지 1 x 1014 벡터 카피/대상체의 체중 kg의 용량으로 투여된다. 일부 실시형태에서, 벡터는 1 x 1012 내지 1 x 1015 벡터 카피/대상체의 체중 kg의 용량으로 투여된다.
일부 실시형태에서, 하나 이상의 추가 질환 약물의 단일 용량이 투여된다. 일부 실시형태에서, 하나 이상의 추가 질환 약물의 다중 용량이 투여된다. 일부 실시형태에서, 하나 이상의 추가 질환 약물의 유효 용량이 투여된다. 일부 실시형태에서, 하나 이상의 추가의 질환 약물은 적어도, 최대, 또는 약 0.1, 0.5, 1, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 100, 105, 110, 115, 120, 125, 130, 135, 140, 145, 150, 155, 160, 165, 170, 175, 180, 185, 190, 195, 및 200, 300, 400, 500, 1000 ㎍/kg, mg/kg, ㎍/일, 또는 mg/일 또는 그 내의 추론가능한 임의의 범위 또는 값의 용량으로 투여된다. 특정 실시형태에서, 하나 이상의 추가 질환 약물의 유효 용량은 약, 적어도 약 또는 최대 약 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 또는 100 μM 또는 그 내의 추론가능한 임의의 범위의 혈중 수준을 제공할 수 있는 용량이다. 특정 실시형태에서, 대상체에 투여되는 하나 이상의 추가 질환 약물은 체내에서 대사된 치료제로 대사되며, 이 경우 혈중 수준은 그 제제의 양을 나타낼 수 있다. 대안적으로, 하나 이상의 추가 질환 약물이 대상체에 의해 대사되지 않는 한, 본원에서 논의된 혈중 수준은 대사되지 않은 질환 약물을 나타낼 수 있다.
일부 실시형태에서, 인간에게 투여되는 조성물의 치료적 유효량 또는 충분량은 하나 이상의 투여에 의한 것인지 관계없이 약 0.01 내지 약 50 mg/환자 체중 kg의 범위일 것이다. 일부 실시형태에서, 사용되는 요법제는 예를 들어 매일 투여되는 약 0.01 내지 약 45 mg/kg, 약 0.01 내지 약 40 mg/kg, 약 0.01 내지 약 35 mg/kg, 약 0.01 내지 약 30 mg/kg, 약 0.01 내지 약 25 mg/kg, 약 0.01 내지 약 20 mg/kg, 약 0.01 내지 약 15 mg/kg, 약 0.01 내지 약 10 mg/kg, 약 0.01 내지 약 5 mg/kg, 또는 약 0.01 내지 약 1 mg/kg이다. 일 실시형태에서, 본원에 기술된 요법제는 21일 주기 중 1일차에 약 100 mg, 약 200 mg, 약 300 mg, 약 400 mg, 약 500 mg, 약 600 mg, 약 700 mg, 약 800 mg, 약 900 mg, 약 1000 mg, 약 1100 mg, 약 1200 mg, 약 1300 mg 또는 약 1400 mg의 용량으로 대상체에게 투여된다. 용량은 단일 용량으로 투여되거나 주입과 같은 다중 용량(예를 들어, 2회 또는 3회 용량)으로 투여될 수 있다. 이러한 요법의 진행은 종래의 기술에 의해 쉽게 모니터링될 수 있다.
치료적 조성물의 정확한 양은 전문의의 판단에 의해 좌우되며 각 개체 고유의 것이다. 용량에 영향을 미치는 요인에는 환자의 신체적 및 임상적 상태, 투여 경로, 의도된 치료 목표(증상 완화 대 치유), 및 특정 치료 물질 또는 대상체가 받을 수 있는 다른 요법의 효능, 안정성 및 독성이 포함된다.
당업자는 ㎍/체중 kg 또는 mg/체중 kg의 투여량 단위가 ㎍/ml 또는 mM(혈중 수준)의 유사한 농도 단위로 전환되고 표현될 수 있음을 이해하고 인지할 것이다. 흡수는 종 및 장기/조직 의존적이라는 것도 이해된다. 흡수 및 농도 측정과 관련하여 적용가능한 환산 계수 및 생리학적 가정은 잘 알려져 있으며 당업자가 하나의 농도 측정을 다른 농도 측정으로 변환하고 본원에 기술된 용량, 효능 및 결과에 관해 합리적으로 비교하고 결론을 내릴 수 있게 한다.
VI. 키트
본 개시내용의 특정 양상은 또한 개시내용의 조성물 또는 개시내용의 방법을 구현하기 위한 조성물을 함유하는 키트에 관한 것이다. 일부 실시형태에서, 키트를 사용하여 샘플에서 바이러스를 중화시킬 수 있다. 특정 실시형태에서, 키트는 적어도 또는 최대 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 100, 500, 1,000개 이상의 프로브, 프라이머 또는 프라이머 세트, 합성 분자 또는 억제제, 또는 그 내의 추론가능한 임의의 값 또는 범위 및 조합을 함유한다. 일부 실시형태에서, 키트는 본원에 개시된 폴리펩타이드를 포함하는, 바이러스 스파이크 단백질과 같은 하나 이상의 바이러스 단백질과 상호작용할 수 있는 하나 이상의 폴리펩타이드를 함유한다. 예를 들어, 키트는 바이러스 스파이크 단백질과 같은 바이러스 단백질과 상호작용하고 이를 중화시키는, 적어도 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10개 또는 그 이상의 본원에 개시된 폴리펩타이드를 포함할 수 있다.
키트는 용기, 예컨대 튜브, 병, 바이알, 시린지, 또는 다른 적합한 용기 수단 내에 개별적으로 패키징 또는 배치될 수 있는 성분을 포함할 수 있다.
개별 성분은 또한 농축된 양으로 키트 내에 제공될 수 있고; 일부 실시형태에서, 성분은 다른 성분과 함께 용액 중에 있을 때와 동일한 농도로 개별적으로 제공된다. 성분의 농도는 1x, 2x, 5x, 10x, 또는 20x 또는 그 이상으로서 제공될 수 있다.
예후 또는 진단적 적용을 위해 본 개시내용의 프로브, 합성 핵산, 비합성 핵산, 합성 폴리펩타이드, 비합성 폴리펩타이드 및/또는 억제제를 사용하기 위한 키트는 본 개시내용의 일부로서 포함된다. 특정 양상에서, 음성 및/또는 양성 대조군 핵산, 폴리펩타이드, 프로브 및 억제제가 일부 키트 실시형태에 포함된다.
키트는 사용 지시서를 추가로 포함할 수 있다. 예를 들어, 일부 실시형태에서, 키트는 샘플에서 바이러스 항체를 검출하는 것에 대한 지시서를 포함한다. 일부 실시형태에서, 키트는 샘플에서 바이러스를 중화시키는 것에 대한 지시서를 포함한다.
본원에 기술된 임의의 방법 또는 조성물이 본원에 기술된 임의의 다른 방법 또는 조성물에 대해 구현될 수 있고, 상이한 실시형태들이 조합될 수 있다는 것이 고려된다. 원래 제출된 청구항들은 임의의 제출된 청구항 또는 제출된 청구항들의 조합에 다중 종속되는 청구항들을 포함하는 것으로 고려된다.
실시예
하기 실시예를 본 발명의 특정 실시형태를 나타내기 위해 포함시켰다. 하기 실시예에 개시된 기술이 본 개시내용의 실시에서 잘 기능하게 하기 위해 본 발명자들이 발견한 기술을 나타낸다는 것을 당업자가 인식하여야 한다. 그러나, 당업자는, 본 개시내용의 관점에서, 다수의 변화가 개시된 구체적 실시형태에서 이루어질 수 있고, 본 발명의 취지 및 범위를 벗어나지 않으면서 유사하거나 비슷한 결과를 여전히 수득한다는 것을 인식하여야 한다.
실시예 1
폴리펩타이드-기반 억제의 개념
코로나바이러스 스파이크 단백질, HIV-1 gp160, 에볼라 GP 및 인플루엔자 바이러스 HA와 같은 바이러스 당단백질(예를 들어, 막 융합 단백질)은 바이러스 외피의 올리고머 클래스 I 막횡단 당단백질이다.
코로나바이러스 스파이크(S) 단백질은 절단되어 N-말단 S1 영역 및 C-말단 S2 영역을 생성한다(도 1a). N-말단 S1 영역은 세포 표면 수용체에 대한 부착을 담당하는 N-말단 도메인(NTD) 및 수용체 결합 도메인(RBD)을 포함하고, C-말단 S2 영역은 삼량체화되어, 주로 대규모 입체구조적 변화를 통해 바이러스 외피와 숙주 막의 융합을 유도하기 위한 연장된 "스템" 도메인을 형성한다17-20. S1 영역은 천연 감염 또는 백신접종에 의해 유발된 중화 항체의 주요 표적이고, 따라서 탈출 변이체에 대한 지속적인 양성 선택 하에 있게 된다. 예를 들어, COVID-19의 발생 이후, B.1.1.7, B.1.351, P.1, B.1.6172 및 C.37 변이체 스트레인을 포함하여 광범위한 돌연변이를 갖는 SARS-CoV-2의 6가지 주요 변이체가 출현하였다(도 1a). SARS-CoV-2 스파이크(SARS2-S) 단백질의 돌연변이는 S1 영역에 집중되어 있다(도 1a). 반면에, 올리고머화 및 막 융합을 담당하는 C-말단 S2 영역은 상이한 코로나바이러스 스트레인들 간에 더 잘 보존되어 있다. SARS2-S와 유사하게, HIV-1 gp160, 에볼라 GP 및 인플루엔자 바이러스 HA는 모두 절단되어 수용체 결합을 담당하는 N-말단 구형 도메인 및 주로 막 융합을 위한 C-말단 연장된 도메인을 생성한다.
숙주 세포 내로 진입하면, 바이러스 게놈은 리보솜에 의한 새로운 코로나바이러스 스파이크 단백질의 합성을 안내하고, 이어서 이는 폴딩되고, 조립되고, 소포체(ER) 막으로 전좌된 후, 스파이크 단백질은 ER을 통해, 새로운 비리온을 생성하기 위해 새로 복제된 게놈 RNA와의 상호작용을 위한 골지체 중간체 구획으로 이동한다.
이론에 구애됨이 없이, 고유 야생형 스파이크 단백질과 동일한 올리고머성 계면을 유지하는 코로나바이러스 스파이크 단백질의 단편을 포함하는 폴리펩타이드, 예를 들어 SARS2-S S2 영역으로부터 유래된 폴리펩타이드는 폴리펩타이드와 고유 야생형 스파이크 단백질의 올리고머화 시 고유 야생형 스파이크 단백질과 비-고유 단백질 복합체를 형성할 수 있다. 예를 들어, 야생형 SARS2-S S2 영역과 동일한 올리고머성 계면을 포함하는 SARS2-S S2 영역의 분절을 포함하는 폴리펩타이드는 S2 영역에서 야생형 SARS2-S와 경쟁하여 야생형 SARS2-S와의 비-고유 단백질 복합체를 형성할 수 있다. 유사하게, HIV-1 gp160, 에볼라 GP 및 인플루엔자 바이러스 HA 막 융합 도메인의 분절을 포함하고 야생형 단백질과 동일한 올리고머성 계면을 포함하는 폴리펩타이드는 폴리펩타이드와 야생형 단백질의 올리고머화 계면에서 야생형 단백질과의 비-고유 단백질 복합체를 형성할 수 있다. 이러한 느슨하게 팩킹된 비-고유 단백질 복합체는 품질 관리 시스템에 실패하고 비-고유 단백질 복합체의 프로테아솜 분해를 초래한다. 최종 결과는 숙주 세포막 및 새로 생성된 바이러스 자손의 외피 상의 바이러스 단백질의 양이 유의미하게 저하되어 이들의 감염성이 손상된다는 것이다(도 1b). 또한, 보존된 S2 영역 또는 다른 보존된 바이러스 당단백질 영역의 단편을 포함하는 폴리펩타이드는 돌연변이에 대해 보다 내성이고 잠재적으로 싱이한 계통의 바이러스에 대항하여 "보편적"일 수 있다(즉, 범-바이러스 억제제).
이러한 "폴리펩타이드-기반 억제" 전략을 테스트하기 위해, 2가지 폴리펩타이드, CoV-F1(이하 F1; 서열번호 43) 및 CoV-F2(이하 F2; 서열번호 44)(도 1a, 도 3a, 도 16a, 도 16b)를 SARS2-S S2 단백질 서열로부터 유도하고 생성하였다. F1(서열번호 2)은 야생형 SARS2-S의 잔기 911 내지 1273을 포함하며 야생형 SARS2-S의 잔기 985 내지 1273을 포함하는 F2(서열번호 27)보다 약간 더 길다. 두 폴리펩타이드 모두 식별 용이성을 위한 C-말단 FLAG 에피토프 및 세포 표면 전좌를 위한 야생형 SARS2-S로부터의 N-말단 신호 펩타이드(SP)를 포함한다.
실시예 2
F1 폴리펩타이드는 다수의 코로나바이러스 스파이크 당단백질의 발현 및 표면 전좌를 잠재적으로 억제한다
원형질막으로의 SARS2-S 단백질의 세포 표면 전좌 및 발현에 미치는 F1 및 F2의 영향을 조사하였다. SARS2-S-암호화 플라스미드의 일시적인 형질감염은 HEK293T 전세포 용해물에서 우수한 수준의 단백질 검출을 초래하였으며, 발현된 단백질의 대부분이 절단되었다(도 2a). SARS2-S 단백질의 이러한 고효율 절단은 S1/S2 경계의 새로운 다염기성 절단 부위와 일치하였다17, 18, 24, 25. 더욱이, 절단된 SARS2-S 단백질의 S2 단편만이 비오틴에 의해 표지되고, 항-비오틴 항체에 의해 친화성-정제되고, 세포-표면 분획에서 검출되었으며(도 2a), 이는 적절하게 절단된 SARS2-S 단백질만이 세포 표면으로 전좌되었음을 시사한다. F1-암호화 플라스미드가 SARS2-S 암호화 플라스미드와 함께 심지어 2배 몰비로 공동 형질감염되었을 때에도, SARS2-S의 우세한 절단된 S2 밴드는 전세포 용해물 및 세포-표면 분획에서 거의 완전히 감소하였다(도 2a). 따라서, F1은 SARS2-S의 발현 및 세포 표면 전좌를 강력하게 억제하였다.
COVID-19 SARS-CoV-2 외에도, 지난 20년 동안 코로나바이러스의 2가지 주요 위협, 즉 2002년 내지 2003년 SARS-CoV 발병 및 2012년 내지 2014년 MERS-CoV1 발병이 목격되었다1,2. 이들 코로나바이러스의 스파이크 당단백질과 COVID-19 SARS2-S의 서열 비교로 광범위한 서열 동일성 수준이 밝혀졌다(도 3, 도 4). 스파이크 단백질의 N-말단 S1 영역, 특히 NTB 도메인은 매우 가변적인 반면, C-말단 S2 영역, 특히 F1 폴리펩타이드에 포함된 영역은 이러한 단백질들 간에 고도로 보존되어 있다. 예를 들어, 2002 SARS-CoV 스파이크 단백질(SARS-S)은 전장 COVID-19 SARS2-S와 77%의 아미노산 서열 동일성을 공유한다(도 3a, 도 4a). SARS2-S F1 폴리펩타이드에 포함된 영역(잔기 911-1273)만을 비교하면, 동일한 잔기가 94%로 증가한다(도 3a, 도 4b). MERS 스파이크 단백질(MERS-S)은 전장 SARS2-S와 단지 35%의 아미노산 서열 동일성을 공유하고, SARS2-S F1 폴리펩타이드와는 42%의 아미노산 서열 동일성을 공유한다(도 3b, 도 4). 결과적으로, 이들 스파이크 단백질을 사용하여 아미노산 돌연변이에 대한 F1-유도된 억제의 민감도를 테스트하였다.
2배 몰비에서 F1-암호화 플라스미드를 사용하더라도, 절단된 전장 SARS-S 및 MERS-S 밴드와 절단된 S2 밴드는 전세포 용해물 및 세포-표면 분획에서 거의 완전히 감소하였다(도 2b 내지 2c). 따라서, 낮은 서열 동일성에도 불구하고, F1은 또한 세포 표면으로의 SARS-S 및 MERS-S 당단백질의 적절한 전좌 및 조립을 강력하게 간섭한다.
또한, F1이 나타내는 강력한 억제 활성과 일치하여(도 2), 높은 수준의 F1이 세포 표면 분획에서 일관되게 검출되었지만(도 5), F2는 세포 표면 분획에서 낮은 수준으로만 검출되었다(도 5A). 이론에 구애됨이 없이, F2는 F1과 비교하여 N-말단에서 누락된 74개 잔기에 의해 불안정화될 수 있으며(도 1a), 이는 도 2a에 도시된 바와 같이 F2의 비-간섭과 일치한다.
실시예 3
F1은 단백질 수준에서 코로나바이러스 스파이크 단백질과 상호작용한다
SARS2-S 발현 및 전좌의 F1-매개 억제 메커니즘을 조사하기 위해, 본 발명자들은 COVID-19 SARS2-S(도 6a) 및 F1 또는 F2(도 7a), 2002 SARS-S(도 6b) 및 F1(도 7b)뿐만 아니라, 2012 MERS-S(도 6c) 및 F1(도 7c)의 mRNA 수준을 분석하였다. F1 또는 F2-암호화 플라스미드의 존재는 코로나바이러스 스파이크 단백질의 mRNA 수준을 유의미하게 변화시키지 않았으며, 이는 각각의 코로나바이러스 스파이크 단백질을 암호화하는 플라스미드만으로 형질감염된 샘플과 비교하여 상대적으로 일정한 수준(50% 내지 150%)에서 유지되었다(도 6). F1의 mRNA 수준은 내인성 GAPDH에 대해 정규화하였을 때 대략 26.5 내지 212였으며(도 7), 이는 F1-매개 억제의 높은 효능과 일치한다. F2의 mRNA 수준은 F1의 mRNA 수준과 비슷하였다. 이론에 구애됨이 없이, 이는 도 5a의 웨스턴 블롯 결과에 이해 시사되는 바와 같이, F2의 비-억제가 합성된 F2 폴리펩타이드의 불안정성으로 인한 것이라는 개념을 추가로 뒷받침한다. 이들 데이터는 다양한 코로나바이러스 스파이크 당단백질의 F1-매개 억제가 mRNA 수준에서 일어나는 것이 아님을 시사한다.
다음으로, 본 발명자들은 F1-매개 억제가 세포에서 비-고유 올리고머 단백질 복합체를 형성하기 위해 SARS2-S 단백질과의 직접적인 상호작용 또는 이와의 상호작용을 통해 단백질 수준에서 일어나는 것인지 여부를 조사하였다. SARS2-S 및 F1을 각각 SARS2-S에 대한 극단 C-말단의 단량체 녹색 형광 단백질(GFP) 변이체, CFP(SARS2C) 및 F1에 대한 YFP(F1Y)로 태그하였다(도 6d). SARS2C- 및/또는 F1Y-암호화 플라스미드를 사용하여 HEK293T 세포 플라스미드(1:1 몰비)를 일시적으로 형질감염시키고, 형질감염 후 48시간차에 3-큐브 접근법을 사용하여 CFP와 YFP 사이의 형광 공명 에너지 전달(FRET)을 모니터링하였다.14 F1-보유 플라스미드가 심지어 2배 몰 비에서도 SARS2-S-수송 플라스미드와 함께 공동 형질감염되었다는 사실에도 불구하고, 우세한 절단된 S2 밴드는 거의 완전히 감소하였다(도 2a). SRARS2C 및 F1Y에 의해 형성된 비-고유 올리고머는 매우 불안정할 것으로 예상되었지만, SARS2C 단백질과 F1Y 폴리펩타이드 사이의 FRET 신호(공동 형질감염 시 1:1 몰비에서)가 강력하게 검출되었으며, 여기서 SARS2C와 F1Y 사이의 FRET 비는 F1Y-단독 대조군보다 유의미하게 높았으며(독립표본 t-검정에서 p<0.0001, 도 6e), 이는 도 1b에 도시된 바와 같이 SARS2-S 단백질과 F1 폴리펩타이드 사이의 직접적인 단백질-단백질 상호작용 및 비-고유 올리고머의 형성을 뒷받침한다.
실시예 4
미니서클로부터 발현된 F1 폴리펩타이드는 코로나바이러스 스파이크 당단백질의 발현 및 표면 전좌를 잠재적으로 억제한다
2002년부터 2022년 사이에 심각한 발병 또는 팬데믹을 유발한 인간 코로나바이러스의 스파이크 당단백질의 발현 및 표면 전좌를 억제하는 F1의 고효능은 F1이 장기간에 걸쳐 상이한 코로나바이러스 계통에 대한 효과적인 치료제를 약속하고 있음을 시사한다. 따라서, 본 발명자들은 치료 목적을 위해 F1을 전달하는 편리한 방법을 식별하려고 노력하였다. F1은 표적 스파이크 단백질과 직접 상호작용하여 단백질 합성 및 폴딩과 동시에 비-고유 올리고머를 형성하기 때문에, 일부 실시형태에서, F1-암호화 유전자는 작용 부위로 전달된다.
미니서클은 유전자 요법을 위해 새로 개발된 DNA 운반체의 한 가지 유형이다26. 미니서클의 주요 특징은 바이러스 또는 세균 유전자 요소가 최소이고 게놈 통합 또는 염증의 위험이 거의 없거나 전혀 없고 고수준 단백질 발현이 지속되는 깨끗한 유전자 배경을 포함하고, 미니서클의 작은 크기는 세포 진입을 상당히 촉진하고/하거나 약물 전달을 위해 에어로졸을 사용할 수 있게 한다27. 후자는 코로나바이러스-유발된 호흡기 질환에 대항해 뚜렷한 이점이 될 수 있다.
F1 미니서클을 변형된 모(母) 미니서클 클로닝 벡터 pMC.CMV-MCS-SV40폴리A 내로 F1 암호화 서열을 삽입하여 생성하고(도 8a), COVID-19 SARS2-S(도 8b), 2002 SARS-S(도 8c) 및 2012 MERS-S(도 8d) 당단백질의 발현 및 표면 전좌를 억제하는 데 있어 이의 효능을 테스트하였다. 미니서클이 사용되지 않은 대조군과 비교하여, 4.5배 몰비에서의 F1 미니서클의 존재는 3가지 스파이크 단백질 모두의 세포 표면 전좌를 거의 완전히 없앴다(도 8b 내지 8d). 중요한 점은, 이러한 수준의 강력한 간섭이, 코로나바이러스 스파이크 단백질-암호화 유전자를 보유하는 pcDNA3.1 기반 플라스미드는 HEK293T 세포에서 효율적으로 복제되는 반면 F1 미니서클은 그렇지 않은 상황에서 달성되었다는 것이다. 따라서, F1 미니서클은 이들 코로나바이러스 스파이크 단백질의 적절한 조립 시 예기치 않게도 강력한 억제를 나타냈다.
실시예 5
미니서클-발현 F1은 온전한 슈도바이러스 상의 SARS2-S 단백질 수준을 감소시키고 슈도바이러스 감염성을 손상시킨다
F1 미니서클로부터 발현된 코로나바이러스 스파이크 단백질의 감소된 세포 표면 전좌의 결과를 조사하기 위해, 루시퍼라제 발현, env-결함 HIV-1 게놈 플라스미드 pRL4.3-Luc-RE를 사용하여 생성된 슈도바이러스 상의 SARS2-S 단백질 수준을 모 공벡터(MN501A)로부터 만들어진 대조군 미니서클 또는 F1 미니서클의 상이한 몰비의 존재 하에 비교하였다. 슈도바이러스 외피에 앵커링된 스파이크 단백질만이 고려되었음을 보장하기 위해, 웨스턴 블롯으로 분석하기 전에 QUICKTITER™ Lenti바이러스 역가 키트를 사용하여 청정한 상청액으로부터 온전한 슈도바이러스를 침전시켰다. 놀랍게도, 2배 몰비의 F1 미니서클만을 사용하더라도, 생성된 온전한 슈도바이러스에서 SARS2-S가 거의 검출되지 않았다(도 9a). 또한, 이들 슈도바이러스는 hACE2-발현 HEK293T 세포를 감염시키는 데 실패하였다(도 9b).
실시예 6
미니서클-발현된 F1은 인간화 HACE2 마우스 모델에서 강력한 항바이러스 활성을 나타낸다
hACE2-IRES-luc 마우스를 사용하여 F1 폴리펩타이드의 항바이러스 활성을 테스트하였다. 마우스를 두 군(n=6)으로 무작위 분류하였다. 0일차에, 마우스에게 104 PFU의 SARS-CoV-2 바이러스를 접종하였다. 접종 후 2시간차에, 대조군의 마우스를 PBS로 1회 처리한 반면, 처리군의 마우스는 각각 50 μL 항바이러스 F1 현탁액으로 처리하였다(도 15a).
실험 과정 동안, 두 군 모두 유사한 체중 변화를 경험하였다(도 15b). 접종 후 3일차에, 대조군 및 처리군의 평균 동물 체중은 각각 13.7% 및 17.1% 감소하였다(도 15b, 표 1).
SARS-CoV-2 감염된 마우스의 폐 내의 바이러스 존재량은 대조군에 비해 처리군에서 유의미하게 감소하였다(p =0.0027)(도 15c). 또한, 처리군에서 50 μL 항바이러스 F1 현탁액으로의 1회 처리는 hACE-마우스 폐 조직에서 SARS-CoV-2 바이러스에 의해 유발된 간질성 폐렴의 중증도를 유의미하게 완화시켰다(도 15d). 이러한 데이터는, 일부 실시형태에서, F1 폴리펩타이드가 생체내에서 SARS-CoV-2 바이러스의 감염 및 전파를 예방하는 데 매우 효과적이라는 것을 시사한다.
실시예 7
GP160
i
폴리펩타이드는 HIV 스파이크 당단백질의 발현 및 표면 전좌를 억제한다
본 발명자들은 또한 HIV-1 gp160 당단백질의 발현 및 gp160 당단백질의 세포 표면 전좌에 미치는 억제성 폴리펩타이드 gp160i(도 16c; 서열번호 45)의 영향을 평가하였다. gp160-암호화 플라스미드의 일시적인 형질감염은 HEK293T 전세포 용해물에서 우수한 수준의 단백질 검출을 초래하였으며, 발현된 단백질의 대부분이 절단되었다(도 11). HIV-1 gp160-암호화 플라스미드와 gp160i-암호화 플라스미드의 공동 형질감염은 특히 15배 몰비에서, 전세포 용해물 중의 절단된 gp41 분획을 감소시켰(도 11). 따라서, gp160i는 HIV-1 gp160 당단백질의 발현을 강력하게 억제한다.
실시예 8
GP
i
폴리펩타이드는 에볼라 스파이크 당단백질의 발현 및 표면 전좌를 억제한다
본 발명자들은 또한 에볼라 GP 당단백질의 발현 및 에볼라 GP 당단백질의 세포 표면 전좌에 미치는 억제성 폴리펩타이드 GPi(도 16D; 서열번호 46)의 영향을 평가하였다. 에볼라 GP-보유 플라스미드의 일시적인 형질감염은 HEK293T 전세포 용해물에서 우수한 수준의 단백질 검출을 초래하였고, 발현된 단백질의 대부분은 절단되었다(도 12). 더욱이, 절단된 에볼라 GP 단백질의 GP2 단편만이 비오틴에 의해 표지되고, 항비오틴 항체에 의해 친화성 정제되고, 세포 표면에서 검출되었으며(도 12), 이는 적절하게 절단된 에볼라 GP 당단백질만이 세포 표면으로 수송된다는 것을 시사한다. GPi-암호화 플라스미드가 GP-암호화 플라스미드와 공동 형질감염되었을 때, 절단된 GP2 밴드는 특히 15배 몰비에서 전세포 용해물 및 세포-표면 분획에서 감소하였다(도 12). 따라서, 에볼라 GPi는 에볼라 GP 당단백질의 발현 및 세포 표면으로의 전좌를 강력하게 억제한다.
실시예 9
F
i
폴리펩타이드는 RSV 스파이크 당단백질의 발현 및 표면 전좌를 억제한다
본 발명자들은 또한 RSV A형 F 당단백질의 발현 및 F 당단백질의 세포 표면 전좌에 미치는 억제성 폴리펩타이드 F(도 16e; 서열번호 47)의 영향을 평가했다. RSV F-암호화 플라스미드의 일시적인 형질감염은 HEK293T 전세포 용해물에서 우수한 수준의 단백질 검출을 초래하였으며, 발현된 단백질의 대부분이 절단되었다(도 14a). F1 암호화 플라스미드와 RSV F-암호화 플라스미드의 공동 형질감염은 전세포 용해물에서 절단된 분획을 감소시켰다(도 14a). 따라서, Fi는 RSV F 당단백질의 발현을 강력하게 억제한다.
Fi-암호화 플라스미드로 공동 형질감염되었을 때 RSV 당단백질의 감소된 세포 표면 전좌의 결과를 조사하기 위해, 상이한 몰비의 Fi-암호화 플라스미드 존재 하에 생성된 슈도바이러스 상의 RSV F 당단백질의 수준을 측정하였다. Fi-암호화 플라스미드와 F-암호화 플라스미드의 공동 형질감염은 생성된 온전한 슈도바이러스 상에서 검출된 RSV F 당단백질을 감소시켰다(도 14b).
실시예 10
HA
i
폴리펩타이드는 인플루엔자 바이러스 스파이크 당단백질의 발현 및 표면 전좌를 억제한다
본 발명자들은 또한 인플루엔자 HA 단백질의 발현 및 원형질막으로의 이의 전좌에 미치는 2019-2020 독감 백신 스트레인 A/홍콩/45/2019(H3N2) 바이러스의 HA 서열로부터 유래된 억제성 폴리펩타이드 HAi(도 16f; 서열번호 48)의 영향을 평가하였다. 인플루엔자 A/H1, A/H3, B/Vic 및 B/YM HA-암호화 플라스미드의 일시적인 형질감염은 HEK293T 전세포 용해물 및 세포-표면 분획에서 검출된 우수한 수준의 단백질을 생성하였다(도 13). 인플루엔자 HAi-암호화 플라스미드와 인플루엔자 A/H1, A/H3, B/Vic 및 B/YM HA-암호화 플라스미드의 공동 형질감염은 전세포 용해물 및 세포-표면 분획에서 인플루엔자 HA 분획을 감소시켰다(도 13). 특히, HAi 폴리펩타이드는 4가지 독감 백신 스트레인 A/하와이/70/2019(H1N1), A/홍콩/45/2019(H3N2), B/워싱턴/02/2019(B/빅토리아 계통(B/Vic)), B/푸켓/3073/2013(B/야마가타 계통(B/YM)) 모두의 HA 단백질의 발현 및 전좌를 강력하게 억제할 수 있었다. 중요한 점은, HAi 폴리펩타이드가 유래된 A/홍콩/45/2019 (H3N2) HA는 각각 A/하와이/70/2019(H1N1), B/워싱턴/02/2019(B/Vic) 및 B/푸켓/3073/2013(B/YM)으로부터의 HA 단백질과 43%, 27% 및 29%의 아미노산 서열 동일성을 공유한다는 점이다(도 4c, 도 4d). 따라서, 인플루엔자 HAi는 인플루엔자 HA의 발현 및 세포 표면으로의 이의 전좌를 강력하게 억제한다.
이들 데이터는 부분 서열의 사용이 서열 동일성 수준이 매우 낮은 경우에도 중요한 인간 병원체의 단백질 발현의 표적화된 감소를 위한 효과적인 방법임을 추가로 입증하였다.
실시예 11
예시적인 방법
플라스미드 및 작제물. SARS-CoV 스파이크(GenBank 수탁 번호 AFR58740.1), SARS-CoV-2 스파이크(GenBank 수탁 번호 QHD43416.1) 및 인간 ACE2(GenBank 수탁 번호 NM_021804)를 암호화하는 유전자를 보유한 pcDNA3.1 플라스미드는 팡 리(Fang Li) 박사19가 친절하게 제공한 것(각각 Addgene 플라스미드 #145031, 145032 및 145033)이다. MERS-CoV 스파이크(GenBank 수탁 번호 QBM11748.1), F1 또는 F2 폴리펩타이드를 암호화하는 유전자를 보유한 pcDNA3.1 플라스미드, HIV-1 gp160(GenBank 수탁 번호 NP_057856.1)을 암호화하는 유전자를 보유한 pEZT-BM 플라스미드; 자이르 EBOV GP(GenBank 수탁 번호 AAN37507.1); RSV F(GenBank 수탁 번호 QKN22797.1); A/하와이/70/2019(H1N1), A/홍콩/45/2019(H3N2), B/워싱턴/02/2019(B/Vic) 및 B/푸켓/3073/2013(B/YM))에 대한 HA 단백질, gp160i, GPi, Fi 및 HAi는 GENSCRIPT® Biotech(미국 뉴저지주 피스카터웨이)에 의해 합성되었다. 모 미니서클 벡터 pMC.CMV-MCS-SV40폴리A(Cat. #MN501A-1), ZYCY10P3S2T 이. 콜라이(E. coli) 미니서클 생산자 스트레인 28 컴피턴트 세포(competent cell)(Cat. #MN900A-1) 및 아라비노스 유도 용액(Cat. #MN850A-1)은 System Biosciences(미국 캘리포니아주 팔로 알토)에서 구입하였다. 루시퍼라제-발현, env-결함 HIV-1 게놈 플라스미드 pRL4.3-Luc-R-E-(카탈로그 번호 3418)는 미국 AIDS 분과, NIAID, NIH의 NIH AIDS Reagent Program을 통해 입수하였다. HEK293T 세포(카탈로그 번호 CRL-11268)는 아메리칸 타입 컬쳐 컬렉션(American Type Culture Collection)(미국 버지니아주 마나사스)에서 구입하고 5% CO2 세포 배양 인큐베이터 내에서 37℃로 10% 태아 소 혈청(GIBCO™)을 함유한 둘베코 변형 배지(Dulbecco's Modified Eagle Medium: DMEM)에서 유지시켰다.
시약. C9-로돕신 항체(1D4) HRP(Cat. # sc57432 HRP) 및 2',3-사이클린 뉴클레오타이드 3'-포스포디에스테라제(CNPase) 항체(카탈로그 번호 A01308) 및 CD147 항체(카탈로그 번호 ab108308)는 각각 SANTA CRUZ BIOTECHNOLOGY®, Inc.(미국 텍사스주 달라스), GENSCRIPT® Biotech(미국 뉴저지주 피스카터웨이) 및 ABCAM®(영국 캠브리지)에서 구입하였다. QUICKTITER™ Lenti바이러스 Titer 키트는 Cell Biolabs Inc(미국 캘리포니아주 샌 디에고)에서 구입하였다. PIERCE™ 세포 표면 단백질 비오틴화 및 단리 키트(Cat. # A44390)는 미국 매사추세츠주 월섬 소재의 THERMO SCIENTIFIC®에서 구입하였다. QUICK-RNA™ 미니프렙 키트(Cat. #R1054) 및 ZYMOPURE™ II 플라스미드 맥시프렙 키트(Cat. #D4203)는 미국 캘리포니아주 어바인 소재의 Zymo Research에서 구입하였다. ISCRIPT™ 역전사 슈퍼믹스(Cat. # 1708840)는 BIO-RAD®(미국 캘리포니아주 허큘리스)에서 구입하였다. BIMAKE™ SYBR Green qPCR Master Mix(Cat. # B21203)는 미국 텍사스주 휴스턴 소재의 Bimake에서 구입하였다. LIPOFECTAMINE™ 3000은 미국 캘리포니아주 칼스바드 소재의 INVITROGEN®에서 구입하였다. 시약 IN VIVO-JETPEI®(Cat. No.201-10G)은 프랑스 벡투라(Vectura) 소재의 POLYPLUS-TRANSFECTION® SA에서 구입하였다. ONE-GLO™ EX 루시퍼라제 키트는 미국 위스콘신주 매디슨 소재의 PROMEGA®에서 구입하였다. 아라비노스 유도 용액(Cat. No. MN850A-1)은 System Biosciences(미국 캘리포니아주 팔로 알토)에서 구입하였다.
세포 표면 비오틴화 및 단백질 정제. 세포 표면 비오틴화 및 단백질 정제는 제조사의 지침에 따라 PIERCE™세포 표면 단백질 비오틴화 및 단리 키트를 사용하여 수행하였다. 간략하게 말하면, HEK293T 세포 상의 세포 표면 단백질을 먼저 4℃에서 30분 동안 설포-NHS-SS-비오틴으로 표지한 다음, Tris-완충된 식염수를 첨가하여 정지시키고 추가로 세척하였다. 세포를 용해 완충액으로 용해시킨 후, 용해물을 원심분리에 의해 제거하였다. 비오틴화된 단백질의 결합을 허용하기 위해 청정한 용해물을 NEUTRAVIDIN™ 아가로스와 함께 배양하였다. 광범위한 세척 후, 결합된 단백질을 10mM DTT를 함유한 용출 완충액으로 용출시켰다. 청정한 용해물("전세포" 분획) 및 용출된 단백질("세포 표면" 분획)을 10% SDS-PAGE에서 실행하고 스파이크 단백질을 C9-로돕신 항체 1D4 HRP로 검출하였다. 항-CNPase 항체에 의해 검출된 내인성 막-앵커링된 단백질 CNPase 또는 항-CD147 항체에 의해 검출된 CD147을 내부 대조군으로 사용하였다.
총 RNA 분리 및 RT-qPCR. 총 RNA는 QUICK-RNA™ 미니프렙 키트를 사용하여 정제하였다. 역전사는 ISCRIPT™ Reverse Transcription Supermix를 사용하여 수행하였다. qPCR은 하기 프라이머와 함께 BIMAKE™SYBR Green qPCR 마스터 믹스를 사용하여 수행하였다:
1060(SARS-S 정방향): GTTCAAGGACGGCATCTACTT
1061(SARS-S 역방향): ACGCTCTGGGACTTGTTATTC
1062(SARS2-S 정방향) : GACAAAGTGCACCCTGAAGA
1063(SARS2-S 역방향): GGGCACAGGTTGGTGATATT
1089(MERS-S 정방향): GAACGCCTCTGAACTCTTT
1090(MERS-S 역방향): GTCCTCGGTGATGTTGTATGT
1091(F1 및 F2 정방향): GATTAGAGCCGCCGAGATTAG
1092(F1 및 F2 역방향): GGACTGAGGGAAAGACATGAG
F1 및 F2의 합성된 유전자는 포유동물 발현에 최적화되었고 SARS2-S를 암호화하는 유전자와 상이하기 때문에, qPCR 프라이머 1091 및 1092는 F1 및 F2에 고유한 한편, 1062 및 1063은 SARS2-S에 고유하였다.
미니서클 생산. 미니서클 모 벡터 pMC.CMV-MCS-SV40폴리A는 기능에 영향을 주지 않으면서 최종 미니서클의 크기를 단축시키도록 변형시켰다. F1 암호화 유전자를 미니서클 모 벡터 pMC.CMV-MCS-SV40폴리A(MN501A)에 클로닝하여 MN501A-F1을 생성하였다. MN501A 또는 MN501A-F1은 제조사의 지침에 따라 ZYCY10P3S2T 이. 콜라이 미니서클 생산 스트레인28 컴피턴트 세포 내로 형질전환시켰다. 아라비노스 유도 용액을 첨가하여 미니서클 DNA의 생산을 유도하였다. 제조사의 지침에 따라 ZYMOPURE™ II 플라스미드 맥시프렙 키트를 사용하여 미니서클 DNA를 정제하였다.
슈도바이러스 생성, 침전 및 농축. 슈도바이러스 생성은 확립된 프로토콜을 따랐다. HEK293T 세포를 전날 밤에 6웰 플레이트에 시딩하였다. 다음날, pcDNA3.1-SARS2-S(0.6 ㎍) 및 pRL4.3-Luc-R-E-(0.6 ㎍)를, LIPOFECTAMINE™ 3000을 사용하여 1웰 HEK293T 세포를 형질감염시키는 데 사용하였다. 표시된 몰비에서 MN501A 미니서클 또는 F1 미니서클을 형질전환 혼합물에 포함시켰다. 형질감염 후 16시간차에, HEK293T 세포에 신선한 배지를 공급하였다. 배지 교체 후 48시간차에, 6웰 플레이트의 각 웰의 상청액을 수거하고, 300g에서 5분 동안 원심분리하여 세포 잔사를 제거하였다. 제조사의 지침에 따라 QUICKTITER™ Lenti바이러스 Titer 키트를 사용하여 온전한 슈도바이러스를 정제하였다. 바이러스 용해물은, 스파이크 단백질에 대한 C9-로돕신 항체 1D4 HRP를 사용하고 내부 대조군 역할을 하는 p24에 대한 FITC-접합된 항-p24 mAb 및 HRP-접합된 항-FITC mAb를 사용하여 웨스턴 블롯으로 분석하였다. 슈도바이러스-함유 상청액의 일부를 PEG8000에 의해 농축시키고 세포 진입의 루시퍼라제 검정에 사용하였다.
재조합 슈도바이러스에 의한 세포 진입의 루시퍼라제 검정. HEK293T 세포를 전날 밤 100mm 접시에 시딩하였다. 다음날, HEK293T 세포를 LIPOFECTAMINE™ 3000을 사용하여 10 ㎍ pcDNA3.1-hACE2로 형질감염시켰다. 형질감염 후 16시간차에, 세포를 DMEM 배지에 재현탁시키고 10 μL 농축된 슈도바이러스가 이미 각 웰에 첨가된 96웰 백색 플레이트에 플레이팅하였다. 2시간 후, 각 웰에 20% FBS를 함유한 동등한 용적의 DMEM을 첨가하였다. 세포를 36시간 동안 추가로 항온배양한 다음, 동등한 용적의 ONE-GLO™ EX 루시퍼라제 검정 시약을 첨가하고 3분 동안 항온배양한 후, 발광 신호를 기록하였다.
SARS2C와 F1Y 사이의 FRET. Olympus PlanApoN 60X/1.42 NA 대물렌즈 및 1024x1024 FOV를 갖춘 1.9k x 1.9k pco.EDGE sCMOS_5.5 카메라를 사용하여 GE Healthcare 델타Vision LIVE 표면형광 이미지 복원 현미경에서 고품질/고해상도 자동 영상화를 수행하였다. 사용된 필터 세트는 CFP(438/24 여기, 470/24 방출) 및 YFP(513/17 여기, 559/38 방출)였다. 공여자 및 수용자 제어 채널을 각각 CFP-CFP 및 YFP-YFP를 사용하여 획득하였다. FRET 영상을 CFP-YFP 여기 및 방출 필터 쌍을 사용하여 획득하였다. 37℃ 및 5% CO2 환경 조건 하에 획득하기 전에 공여자 및 수용자에서 유사한 강도 프로파일을 사용하여 세포를 선택하였다. SoftWorx v7.0을 사용하여 정량적 영상 디콘볼루션을 위한 보수적인 복원 알고리즘을 적용하고 각 개별 채널에 대한 최대 픽셀 강도 투영 TIFF로 파일을 저장하기 전에, 전체 세포(약 12 ㎛)을 포괄하는 Z 스택(stack)(0.25 ㎛)을 획득하였다. FRET 비(FR)는 FRET의 부재 하의 YFP 방출 대비 FRET의 존재 하의 YFP 방출의 비로서 비율로 정의되는 3-큐브 접근법14을 사용하여 결정하였다:
FR=FA(D)/FA=[SFRET(DA)-RD1●SCFP(DA)]/RA1●[SYFP(DA)-RD2●SCFP(DA)],
여기서 RD1= SFRET(D)/SCFP(D); RD2=SYFP(D)/SCFP(D); RA1=SFRET(A)/SYFP(A)이고; SFRET, SCFP 및 SYFP와 괄호 안의 D, A, DA는 단독의 SARS2C(공여자(D)로서 CFP를 함유), F1Y(수용자(A)로서 YFP를 함유) 또는 SARS2C 및 F1Y 둘 다를 함유하는 플라스미드(공여자 및 수용체(DA) 둘 다)가 형질감염에서 사용되었을 경우의 FRET, CFP 또는 YFP 채널의 형광 신호를 나타낸다. 형질감염되지 않은 세포의 평균을 각 필터 큐브의 당일 형광 값에서 공제하였다. FRET 비의 정의에 따르면, FRET 비=1.0은 FRET가 부재함을 의미하고, FRET 비>1.0은 공유자 단백질과 수용자 단백질을 운반하는 단백질 사이에 FRET가 존재함을 나타낸다.
hACE2-마우스 모델에서의 항바이러스 활성. 체중이 약 17 내지 25g인 8~10주령 암컷 hACE2-IRES-luc 마우스. 총 12마리의 마우스를 특정 병원체 부재(specific pathogen free: SPF) 실험 동물실에서 사육하고 음식 및 물을 자유롭게 섭취하도록 하였다. 항바이러스 F1 현탁액은 F1-암호화 미니서클 DNA를 N/P 비 6 및 5% 글루코스 중 0.4 ㎍/μL의 최종 DNA 농도에서 IN VIVO-JETPEI®와 혼합하고 사용 전 15분 동안 실온에서 항온배양하여 제조하였다. 마우스를 두 군(n=6)으로 무작위 분류하였다. 0일차에, 마우스에게 104 PFU의 SARS-CoV-2(MT627325 스트레인)를 접종하였다. 접종 후 2시간차에, 대조군의 마우스를 PBS로 1회 처리하고, 처리군의 마우스를 50 μL 항바이러스 F1 현탁액으로 1회 처리하였다.
체중은 각 군에 대해 0일차 내지 3일차 동안 1일 1회 기록하였다. 하루에 한 번 기록되었다. 체중 변화 퍼센트는 하기 식에 의해 계산하였다:
100%×(체중최종 - 체중초기)/체중초기.
접종 후 3일차에, 마우스를 안락사시키고, 폐를 절개하였다. SARS-CoV-2의 바이러스 게놈 RNA를 QIAAMP® Viral RNA Minikit(QIAGEN®)을 사용하여 추출하였다. qPCR용 HISCRIPT® II Q RT SuperMix(VAZYME®)를 사용하여 역전사를 수행하였다. APPLIED BIOSYSTEMS™ QUANTSTUDIO™ 5 Real-Time PCR System을 사용하여 qPCR을 수행하여 바이러스 RNA 카피의 정량화를 수득하였다.
통계학적 분석. p-값은 생체내 항바이러스 연구 및 FRET 실험에 대한 두 군을 비교하는 독립표본 양측 t-검정으로부터 계산하였다.
* * *
본원에 개시되고 청구된 모든 방법을 본 개시내용의 관점에서 과도한 실험 없이 수행하고 실시할 수 있다. 본 개시내용의 조성물 및 방법이 바람직한 실시형태의 관점에서 개시되었지만, 본 개시내용의 개념, 취지 및 범위로부터 벗어나지 않고 본원에 기술된 방법에 및 본 방법의 단계 또는 순서에 변형을 적용할 수 있다는 것이 당업자에게 명백할 것이다. 보다 구체적으로, 동일하거나 유사한 결과가 성취되면서, 본원에 기술된 제제가 화학적으로 및 생리학적으로 관련된 특정 제제로 치환될 수 있다는 것이 명백할 것이다. 당업자에게 명백한 모든 이러한 유사한 치환 및 변형은 첨부된 청구범위에 의해 한정되는 본 개시내용의 취지, 범위 및 개념 내에 있는 것으로 간주된다.
참조문헌
하기 참조문헌은 예시적인 절차 또는 본원에 제시된 것들에 보충적인 다른 세부사항을 제공하는 정도로 본원에 참조로 구체적으로 포함된다.
SEQUENCE LISTING
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PROTEIN INHIBITION
<130> BAYM.P0333WO / 1001201776
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<151> 2021-03-30
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Asn Val Ser Thr Ser Ile Pro Asn Phe Gly Ser Leu Thr Gln Ile Asn
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His
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275 280 285
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305 310 315 320
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Ser Val Pro Ser Pro Leu Asn Trp Glu Arg Arg Ile Phe Ser Asn Cys
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Asn Phe Asn Leu Ser Thr Leu Leu Arg Leu Val His Val Asp Ser Phe
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Ser Cys Asn Asn Leu Asp Lys Ser Lys Ile Phe Gly Ser Cys Phe Asn
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Ser Ile Thr Val Asp Lys Phe Ala Ile Pro Asn Arg Arg Arg Asp Asp
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Asn Val Thr Ile Asn Asn Phe Asn Pro Ser Ser Trp Asn Arg Arg Tyr
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Gly Gly Glu Arg Asp Arg Asp Arg Ser Ile Arg Leu Val Asn Gly Ser
740 745 750
Leu Ala Leu Ile Trp Asp Asp Leu Arg Ser Leu Cys Leu Phe Ser Tyr
755 760 765
His Arg Leu Arg Asp Leu Leu Leu Ile Val Thr Arg Ile Val Glu Leu
770 775 780
Leu Gly Arg Arg Gly Trp Glu Ala Leu Lys Tyr Trp Trp Asn Leu Leu
785 790 795 800
Gln Tyr Trp Ser Gln Glu Leu Lys Asn Ser Ala Val Ser Leu Leu Asn
805 810 815
Ala Thr Ala Ile Ala Val Ala Glu Gly Thr Asp Arg Val Ile Glu Val
820 825 830
Val Gln Gly Ala Cys Arg Ala Ile Arg His Ile Pro Arg Arg Ile Arg
835 840 845
Gln Gly Leu Glu Arg Ile Leu Leu
850 855
<210> 18
<211> 345
<212> PRT
<213> HIV
<400> 18
Ala Val Gly Ile Gly Ala Leu Phe Leu Gly Phe Leu Gly Ala Ala Gly
1 5 10 15
Ser Thr Met Gly Ala Ala Ser Met Thr Leu Thr Val Gln Ala Arg Gln
20 25 30
Leu Leu Ser Gly Ile Val Gln Gln Gln Asn Asn Leu Leu Arg Ala Ile
35 40 45
Glu Ala Gln Gln His Leu Leu Gln Leu Thr Val Trp Gly Ile Lys Gln
50 55 60
Leu Gln Ala Arg Ile Leu Ala Val Glu Arg Tyr Leu Lys Asp Gln Gln
65 70 75 80
Leu Leu Gly Ile Trp Gly Cys Ser Gly Lys Leu Ile Cys Thr Thr Ala
85 90 95
Val Pro Trp Asn Ala Ser Trp Ser Asn Lys Ser Leu Glu Gln Ile Trp
100 105 110
Asn His Thr Thr Trp Met Glu Trp Asp Arg Glu Ile Asn Asn Tyr Thr
115 120 125
Ser Leu Ile His Ser Leu Ile Glu Glu Ser Gln Asn Gln Gln Glu Lys
130 135 140
Asn Glu Gln Glu Leu Leu Glu Leu Asp Lys Trp Ala Ser Leu Trp Asn
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Trp Phe Asn Ile Thr Asn Trp Leu Trp Tyr Ile Lys Leu Phe Ile Met
165 170 175
Ile Val Gly Gly Leu Val Gly Leu Arg Ile Val Phe Ala Val Leu Ser
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Ile Val Asn Arg Val Arg Gln Gly Tyr Ser Pro Leu Ser Phe Gln Thr
195 200 205
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210 215 220
Glu Gly Gly Glu Arg Asp Arg Asp Arg Ser Ile Arg Leu Val Asn Gly
225 230 235 240
Ser Leu Ala Leu Ile Trp Asp Asp Leu Arg Ser Leu Cys Leu Phe Ser
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Tyr His Arg Leu Arg Asp Leu Leu Leu Ile Val Thr Arg Ile Val Glu
260 265 270
Leu Leu Gly Arg Arg Gly Trp Glu Ala Leu Lys Tyr Trp Trp Asn Leu
275 280 285
Leu Gln Tyr Trp Ser Gln Glu Leu Lys Asn Ser Ala Val Ser Leu Leu
290 295 300
Asn Ala Thr Ala Ile Ala Val Ala Glu Gly Thr Asp Arg Val Ile Glu
305 310 315 320
Val Val Gln Gly Ala Cys Arg Ala Ile Arg His Ile Pro Arg Arg Ile
325 330 335
Arg Gln Gly Leu Glu Arg Ile Leu Leu
340 345
<210> 19
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<212> PRT
<213> Ebola
<400> 19
Met Gly Val Thr Gly Ile Leu Gln Leu Pro Arg Asp Arg Phe Lys Arg
1 5 10 15
Thr Ser Phe Phe Leu Trp Val Ile Ile Leu Phe Gln Arg Thr Phe Ser
20 25 30
Ile Pro Leu Gly Val Ile His Asn Ser Thr Leu Gln Val Ser Asp Val
35 40 45
Asp Lys Leu Val Cys Arg Asp Lys Leu Ser Ser Thr Asn Gln Leu Arg
50 55 60
Ser Val Gly Leu Asn Leu Glu Gly Asn Gly Val Ala Thr Asp Val Pro
65 70 75 80
Ser Ala Thr Lys Arg Trp Gly Phe Arg Ser Gly Val Pro Pro Lys Val
85 90 95
Val Asn Tyr Glu Ala Gly Glu Trp Ala Glu Asn Cys Tyr Asn Leu Glu
100 105 110
Ile Lys Lys Pro Asp Gly Ser Glu Cys Leu Pro Ala Ala Pro Asp Gly
115 120 125
Ile Arg Gly Phe Pro Arg Cys Arg Tyr Val His Lys Val Ser Gly Thr
130 135 140
Gly Pro Cys Ala Gly Asp Phe Ala Phe His Lys Glu Gly Ala Phe Phe
145 150 155 160
Leu Tyr Asp Arg Leu Ala Ser Thr Val Ile Tyr Arg Gly Thr Thr Phe
165 170 175
Ala Glu Gly Val Val Ala Phe Leu Ile Leu Pro Gln Ala Lys Lys Asp
180 185 190
Phe Phe Ser Ser His Pro Leu Arg Glu Pro Val Asn Ala Thr Glu Asp
195 200 205
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210 215 220
Phe Gly Thr Asn Glu Thr Glu Tyr Leu Phe Glu Val Asp Asn Leu Thr
225 230 235 240
Tyr Val Gln Leu Glu Ser Arg Phe Thr Pro Gln Phe Leu Leu Gln Leu
245 250 255
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260 265 270
Leu Ile Trp Lys Val Asn Pro Glu Ile Asp Thr Thr Ile Gly Glu Trp
275 280 285
Ala Phe Trp Glu Thr Lys Lys Asn Leu Thr Arg Lys Ile Arg Ser Glu
290 295 300
Glu Leu Ser Phe Thr Val Val Ser Asn Gly Ala Lys Asn Ile Ser Gly
305 310 315 320
Gln Ser Pro Ala Arg Thr Ser Ser Asp Pro Gly Thr Asn Thr Thr Thr
325 330 335
Glu Asp His Lys Ile Met Ala Ser Glu Asn Ser Ser Ala Met Val Gln
340 345 350
Val His Ser Gln Gly Arg Glu Ala Ala Val Ser His Leu Thr Thr Leu
355 360 365
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370 375 380
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385 390 395 400
Ala Thr Gln Val Glu Gln His His Arg Arg Thr Asp Asn Asp Ser Thr
405 410 415
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420 425 430
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450 455 460
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Lys Phe Val Phe
675
<210> 20
<211> 175
<212> PRT
<213> Ebola
<400> 20
Glu Ala Ile Val Asn Ala Gln Pro Lys Cys Asn Pro Asn Leu His Tyr
1 5 10 15
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<212> PRT
<213> Influenza
<400> 21
Met Pro Met Gly Ser Leu Gln Pro Leu Ala Thr Leu Tyr Leu Leu Gly
1 5 10 15
Met Leu Val Ala Ser Cys Leu Gly Thr Ala Asn Ala Asp Thr Leu Cys
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355 360 365
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Gln Phe Thr Ala Val Gly Lys Glu Phe Asn His Leu Glu Lys Arg Ile
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565 570 575
Ile
<210> 22
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<212> PRT
<213> Influenza
<400> 22
Met Pro Met Gly Ser Leu Gln Pro Leu Ala Thr Leu Tyr Leu Leu Gly
1 5 10 15
Met Leu Val Ala Ser Cys Leu Gly Gln Lys Ile Pro Gly Asn Asp Asn
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Tyr Ala Ser Leu Arg Ser Leu Val Ala Ser Ser Gly Thr Leu Glu Phe
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Ile Gly Ser Arg Pro Arg Ile Arg Asp Ile Pro Ser Arg Ile Ser Ile
245 250 255
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Gly Asn Leu Ile Ala Pro Arg Gly Tyr Phe Lys Ile Arg Ser Gly Lys
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Gly Met Val Asp Gly Trp Tyr Gly Phe Arg His Gln Asn Ser Glu Gly
370 375 380
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Ile Asn Gly Lys Leu Asn Arg Leu Ile Gly Lys Thr Asn Glu Lys Phe
405 410 415
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420 425 430
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Cys Asp Asn Ala Cys Ile Gly Ser Ile Arg Asn Glu Thr Tyr Asp His
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Asn Val Tyr Arg Asp Glu Ala Leu Asn Asn Arg Phe Gln Ile Lys Gly
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Val Glu Leu Lys Ser Gly Tyr Lys Asp Trp Ile Leu Trp Ile Ser Phe
530 535 540
Ala Ile Ser Cys Phe Leu Leu Cys Val Ala Leu Leu Gly Phe Ile Met
545 550 555 560
Trp Ala Cys Gln Lys Gly Asn Ile Arg Cys Asn Ile Cys Ile
565 570
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<211> 595
<212> PRT
<213> Influenza
<400> 23
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1 5 10 15
Met Leu Val Ala Ser Cys Leu Gly Thr Ser Asn Ala Asp Arg Ile Cys
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Gln Arg Gly Ile Leu Leu Pro Gln Lys Val Trp Cys Ala Ser Gly Arg
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340 345 350
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355 360 365
Leu Lys Glu Arg Gly Phe Phe Gly Ala Ile Ala Gly Phe Leu Glu Gly
370 375 380
Gly Trp Glu Gly Met Ile Ala Gly Trp His Gly Tyr Thr Ser His Gly
385 390 395 400
Ala His Gly Val Ala Val Ala Ala Asp Leu Lys Ser Thr Gln Glu Ala
405 410 415
Ile Asn Lys Ile Thr Lys Asn Leu Asn Ser Leu Ser Glu Leu Glu Val
420 425 430
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435 440 445
Ile Leu Glu Leu Asp Glu Lys Val Asp Asp Leu Arg Ala Asp Thr Ile
450 455 460
Ser Ser Gln Ile Glu Leu Ala Val Leu Leu Ser Asn Glu Gly Ile Ile
465 470 475 480
Asn Ser Glu Asp Glu His Leu Leu Ala Leu Glu Arg Lys Leu Lys Lys
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500 505 510
Lys His Lys Cys Asn Gln Thr Cys Leu Asp Arg Ile Ala Ala Gly Thr
515 520 525
Phe Asp Ala Gly Glu Phe Ser Leu Pro Thr Phe Asp Ser Leu Asn Ile
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Thr Ala Ala Ser Leu Asn Asp Asp Gly Leu Asp Asn His Thr Ile Leu
545 550 555 560
Leu Tyr Tyr Ser Thr Ala Ala Ser Ser Leu Ala Val Thr Leu Met Ile
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580 585 590
Ile Cys Leu
595
<210> 24
<211> 597
<212> PRT
<213> Influenza
<400> 24
Met Pro Met Gly Ser Leu Gln Pro Leu Ala Thr Leu Tyr Leu Leu Gly
1 5 10 15
Met Leu Val Ala Ser Cys Leu Gly Thr Ser Asn Ala Asp Arg Ile Cys
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Ile Arg Leu Ser Thr Gln Asn Val Ile Asp Ala Glu Lys Ala Pro Gly
145 150 155 160
Gly Pro Tyr Arg Leu Gly Thr Ser Gly Ser Cys Pro Asn Ala Thr Ser
165 170 175
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195 200 205
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245 250 255
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260 265 270
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275 280 285
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290 295 300
Gly Arg Ser Lys Val Ile Lys Gly Ser Leu Pro Leu Ile Gly Glu Ala
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Asp Cys Leu His Glu Glu Tyr Gly Gly Leu Asn Lys Ser Lys Pro Tyr
325 330 335
Tyr Thr Gly Lys His Ala Lys Ala Ile Gly Asn Cys Pro Ile Trp Val
340 345 350
Lys Thr Pro Leu Lys Leu Ala Asn Gly Thr Lys Tyr Arg Pro Pro Ala
355 360 365
Lys Leu Leu Lys Glu Arg Gly Phe Phe Gly Ala Ile Ala Gly Phe Leu
370 375 380
Glu Gly Gly Trp Glu Gly Met Ile Ala Gly Trp His Gly Tyr Thr Ser
385 390 395 400
His Gly Ala His Gly Val Ala Val Ala Ala Asp Leu Lys Ser Thr Gln
405 410 415
Glu Ala Ile Asn Lys Ile Thr Lys Asn Leu Asn Ser Leu Ser Glu Leu
420 425 430
Glu Val Lys Asn Leu Gln Arg Leu Ser Gly Ala Met Asp Glu Leu His
435 440 445
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Thr Ile Ser Ser Gln Ile Glu Leu Ala Val Leu Leu Ser Asn Glu Gly
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Ile Ile Asn Ser Glu Asp Glu His Leu Leu Ala Leu Glu Arg Lys Leu
485 490 495
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500 505 510
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515 520 525
Gly Thr Phe Asn Ala Gly Glu Phe Ser Leu Pro Thr Phe Asp Ser Leu
530 535 540
Asn Ile Thr Ala Ala Ser Leu Asn Asp Asp Gly Leu Asp Asn His Thr
545 550 555 560
Ile Leu Leu Tyr Tyr Ser Thr Ala Ala Ser Ser Leu Ala Val Thr Leu
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Met Leu Ala Ile Phe Ile Val Tyr Met Val Ser Arg Asp Asn Val Ser
580 585 590
Cys Ser Ile Cys Leu
595
<210> 25
<211> 221
<212> PRT
<213> Influenza
<400> 25
Gly Ile Phe Gly Ala Ile Ala Gly Phe Ile Glu Asn Gly Trp Glu Gly
1 5 10 15
Met Val Asp Gly Trp Tyr Gly Phe Arg His Gln Asn Ser Glu Gly Arg
20 25 30
Gly Gln Ala Ala Asp Leu Lys Ser Thr Gln Ala Ala Ile Asp Gln Ile
35 40 45
Asn Gly Lys Leu Asn Arg Leu Ile Gly Lys Thr Asn Glu Lys Phe His
50 55 60
Gln Ile Glu Lys Glu Phe Ser Glu Val Glu Gly Arg Val Gln Asp Leu
65 70 75 80
Glu Lys Tyr Val Glu Asp Thr Lys Ile Asp Leu Trp Ser Tyr Asn Ala
85 90 95
Glu Leu Leu Val Ala Leu Glu Asn Gln His Thr Ile Asp Leu Thr Asp
100 105 110
Ser Glu Met Asn Lys Leu Phe Glu Lys Thr Lys Lys Gln Leu Arg Glu
115 120 125
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130 135 140
Asp Asn Ala Cys Ile Gly Ser Ile Arg Asn Glu Thr Tyr Asp His Asn
145 150 155 160
Val Tyr Arg Asp Glu Ala Leu Asn Asn Arg Phe Gln Ile Lys Gly Val
165 170 175
Glu Leu Lys Ser Gly Tyr Lys Asp Trp Ile Leu Trp Ile Ser Phe Ala
180 185 190
Ile Ser Cys Phe Leu Leu Cys Val Ala Leu Leu Gly Phe Ile Met Trp
195 200 205
Ala Cys Gln Lys Gly Asn Ile Arg Cys Asn Ile Cys Ile
210 215 220
<210> 26
<211> 5428
<212> DNA
<213> Synthetic Polynucleotide
<400> 26
gacggatcgg gagatctccc gatcccctat ggtgcactct cagtacaatc tgctctgatg 60
ccgcatagtt aagccagtat ctgctccctg cttgtgtgtt ggaggtcgct gagtagtgcg 120
cgagcaaaat ttaagctaca acaaggcaag gcttgaccga caattgcatg aagaatctgc 180
ttagggttag gcgttttgcg ctgcttcgcg atgtacgggc cagatatacg cgttgacatt 240
gattattgac tagttattaa tagtaatcaa ttacggggtc attagttcat agcccatata 300
tggagttccg cgttacataa cttacggtaa atggcccgcc tggctgaccg cccaacgacc 360
cccgcccatt gacgtcaata atgacgtatg ttcccatagt aacgccaata gggactttcc 420
attgacgtca atgggtggag tatttacggt aaactgccca cttggcagta catcaagtgt 480
atcatatgcc aagtacgccc cctattgacg tcaatgacgg taaatggccc gcctggcatt 540
atgcccagta catgacctta tgggactttc ctacttggca gtacatctac gtattagtca 600
tcgctattac catggtgatg cggttttggc agtacatcaa tgggcgtgga tagcggtttg 660
actcacgggg atttccaagt ctccacccca ttgacgtcaa tgggagtttg ttttggcacc 720
aaaatcaacg ggactttcca aaatgtcgta acaactccgc cccattgacg caaatgggcg 780
gtaggcgtgt acggtgggag gtctatataa gcagagctct ctggctaact agagaaccca 840
ctgcttactg gcttatcgaa attaatacga ctcactatag ggagacccaa gctggctagc 900
gtttaaactt aagcttggta ccgagctcgg atccactagt ccagtgtggt ggaattctgc 960
agatatccag cacagtggcg gccgctcgag tctagagggc ccgtttaaac ccgctgatca 1020
gcctcgactg tgccttctag ttgccagcca tctgttgttt gcccctcccc cgtgccttcc 1080
ttgaccctgg aaggtgccac tcccactgtc ctttcctaat aaaatgagga aattgcatcg 1140
cattgtctga gtaggtgtca ttctattctg gggggtgggg tggggcagga cagcaagggg 1200
gaggattggg aagacaatag caggcatgct ggggatgcgg tgggctctat ggcttctgag 1260
gcggaaagaa ccagctgggg ctctaggggg tatccccacg cgccctgtag cggcgcatta 1320
agcgcggcgg gtgtggtggt tacgcgcagc gtgaccgcta cacttgccag cgccctagcg 1380
cccgctcctt tcgctttctt cccttccttt ctcgccacgt tcgccggctt tccccgtcaa 1440
gctctaaatc gggggctccc tttagggttc cgatttagtg ctttacggca cctcgacccc 1500
aaaaaacttg attagggtga tggttcacgt agtgggccat cgccctgata gacggttttt 1560
cgccctttga cgttggagtc cacgttcttt aatagtggac tcttgttcca aactggaaca 1620
acactcaacc ctatctcggt ctattctttt gatttataag ggattttgcc gatttcggcc 1680
tattggttaa aaaatgagct gatttaacaa aaatttaacg cgaattaatt ctgtggaatg 1740
tgtgtcagtt agggtgtgga aagtccccag gctccccagc aggcagaagt atgcaaagca 1800
tgcatctcaa ttagtcagca accaggtgtg gaaagtcccc aggctcccca gcaggcagaa 1860
gtatgcaaag catgcatctc aattagtcag caaccatagt cccgccccta actccgccca 1920
tcccgcccct aactccgccc agttccgccc attctccgcc ccatggctga ctaatttttt 1980
ttatttatgc agaggccgag gccgcctctg cctctgagct attccagaag tagtgaggag 2040
gcttttttgg aggcctaggc ttttgcaaaa agctcccggg agcttgtata tccattttcg 2100
gatctgatca agagacagga tgaggatcgt ttcgcatgat tgaacaagat ggattgcacg 2160
caggttctcc ggccgcttgg gtggagaggc tattcggcta tgactgggca caacagacaa 2220
tcggctgctc tgatgccgcc gtgttccggc tgtcagcgca ggggcgcccg gttctttttg 2280
tcaagaccga cctgtccggt gccctgaatg aactgcagga cgaggcagcg cggctatcgt 2340
ggctggccac gacgggcgtt ccttgcgcag ctgtgctcga cgttgtcact gaagcgggaa 2400
gggactggct gctattgggc gaagtgccgg ggcaggatct cctgtcatct caccttgctc 2460
ctgccgagaa agtatccatc atggctgatg caatgcggcg gctgcatacg cttgatccgg 2520
ctacctgccc attcgaccac caagcgaaac atcgcatcga gcgagcacgt actcggatgg 2580
aagccggtct tgtcgatcag gatgatctgg acgaagagca tcaggggctc gcgccagccg 2640
aactgttcgc caggctcaag gcgcgcatgc ccgacggcga ggatctcgtc gtgacccatg 2700
gcgatgcctg cttgccgaat atcatggtgg aaaatggccg cttttctgga ttcatcgact 2760
gtggccggct gggtgtggcg gaccgctatc aggacatagc gttggctacc cgtgatattg 2820
ctgaagagct tggcggcgaa tgggctgacc gcttcctcgt gctttacggt atcgccgctc 2880
ccgattcgca gcgcatcgcc ttctatcgcc ttcttgacga gttcttctga gcgggactct 2940
ggggttcgaa atgaccgacc aagcgacgcc caacctgcca tcacgagatt tcgattccac 3000
cgccgccttc tatgaaaggt tgggcttcgg aatcgttttc cgggacgccg gctggatgat 3060
cctccagcgc ggggatctca tgctggagtt cttcgcccac cccaacttgt ttattgcagc 3120
ttataatggt tacaaataaa gcaatagcat cacaaatttc acaaataaag catttttttc 3180
actgcattct agttgtggtt tgtccaaact catcaatgta tcttatcatg tctgtatacc 3240
gtcgacctct agctagagct tggcgtaatc atggtcatag ctgtttcctg tgtgaaattg 3300
ttatccgctc acaattccac acaacatacg agccggaagc ataaagtgta aagcctgggg 3360
tgcctaatga gtgagctaac tcacattaat tgcgttgcgc tcactgcccg ctttccagtc 3420
gggaaacctg tcgtgccagc tgcattaatg aatcggccaa cgcgcgggga gaggcggttt 3480
gcgtattggg cgctcttccg cttcctcgct cactgactcg ctgcgctcgg tcgttcggct 3540
gcggcgagcg gtatcagctc actcaaaggc ggtaatacgg ttatccacag aatcagggga 3600
taacgcagga aagaacatgt gagcaaaagg ccagcaaaag gccaggaacc gtaaaaaggc 3660
cgcgttgctg gcgtttttcc ataggctccg cccccctgac gagcatcaca aaaatcgacg 3720
ctcaagtcag aggtggcgaa acccgacagg actataaaga taccaggcgt ttccccctgg 3780
aagctccctc gtgcgctctc ctgttccgac cctgccgctt accggatacc tgtccgcctt 3840
tctcccttcg ggaagcgtgg cgctttctca tagctcacgc tgtaggtatc tcagttcggt 3900
gtaggtcgtt cgctccaagc tgggctgtgt gcacgaaccc cccgttcagc ccgaccgctg 3960
cgccttatcc ggtaactatc gtcttgagtc caacccggta agacacgact tatcgccact 4020
ggcagcagcc actggtaaca ggattagcag agcgaggtat gtaggcggtg ctacagagtt 4080
cttgaagtgg tggcctaact acggctacac tagaagaaca gtatttggta tctgcgctct 4140
gctgaagcca gttaccttcg gaaaaagagt tggtagctct tgatccggca aacaaaccac 4200
cgctggtagc ggtttttttg tttgcaagca gcagattacg cgcagaaaaa aaggatctca 4260
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atgaagtttt aaatcaatct aaagtatata tgagtaaact tggtctgaca gttaccaatg 4440
cttaatcagt gaggcaccta tctcagcgat ctgtctattt cgttcatcca tagttgcctg 4500
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ttcccaacga tcaaggcgag ttacatgatc ccccatgttg tgcaaaaaag cggttagctc 4860
cttcggtcct ccgatcgttg tcagaagtaa gttggccgca gtgttatcac tcatggttat 4920
ggcagcactg cataattctc ttactgtcat gccatccgta agatgctttt ctgtgactgg 4980
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ggcgtcaata cgggataata ccgcgccaca tagcagaact ttaaaagtgc tcatcattgg 5100
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gtaacccact cgtgcaccca actgatcttc agcatctttt actttcacca gcgtttctgg 5220
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ttgaatactc atactcttcc tttttcaata ttattgaagc atttatcagg gttattgtct 5340
catgagcgga tacatatttg aatgtattta gaaaaataaa caaatagggg ttccgcgcac 5400
atttccccga aaagtgccac ctgacgtc 5428
<210> 27
<211> 297
<212> PRT
<213> SARS-CoV-2
<400> 27
Asp Lys Val Glu Ala Glu Val Gln Ile Asp Arg Leu Ile Thr Gly Arg
1 5 10 15
Leu Gln Ser Leu Gln Thr Tyr Val Thr Gln Gln Leu Ile Arg Ala Ala
20 25 30
Glu Ile Arg Ala Ser Ala Asn Leu Ala Ala Thr Lys Met Ser Glu Cys
35 40 45
Val Leu Gly Gln Ser Lys Arg Val Asp Phe Cys Gly Lys Gly Tyr His
50 55 60
Leu Met Ser Phe Pro Gln Ser Ala Pro His Gly Val Val Phe Leu His
65 70 75 80
Val Thr Tyr Val Pro Ala Gln Glu Lys Asn Phe Thr Thr Ala Pro Ala
85 90 95
Ile Cys His Asp Gly Lys Ala His Phe Pro Arg Glu Gly Val Phe Val
100 105 110
Ser Asn Gly Thr His Trp Phe Val Thr Gln Arg Asn Phe Tyr Glu Pro
115 120 125
Gln Ile Ile Thr Thr Asp Asn Thr Phe Val Ser Gly Asn Cys Asp Val
130 135 140
Val Ile Gly Ile Val Asn Asn Thr Val Tyr Asp Pro Leu Gln Pro Glu
145 150 155 160
Leu Asp Ser Phe Lys Glu Glu Leu Asp Lys Tyr Phe Lys Asn His Thr
165 170 175
Ser Pro Asp Val Asp Leu Gly Asp Ile Ser Gly Ile Asn Ala Ser Val
180 185 190
Val Asn Ile Gln Lys Glu Ile Asp Arg Leu Asn Glu Val Ala Lys Asn
195 200 205
Leu Asn Glu Ser Leu Ile Asp Leu Gln Glu Leu Gly Lys Tyr Glu Gln
210 215 220
Tyr Ile Lys Trp Pro Trp Tyr Ile Trp Leu Gly Phe Ile Ala Gly Leu
225 230 235 240
Ile Ala Ile Val Met Val Thr Ile Met Leu Cys Cys Met Thr Ser Cys
245 250 255
Cys Ser Cys Leu Lys Gly Cys Cys Ser Cys Gly Ser Cys Cys Lys Phe
260 265 270
Asp Glu Asp Asp Ser Glu Pro Val Leu Lys Gly Val Lys Leu His Tyr
275 280 285
Thr Asp Tyr Lys Asp Asp Asp Asp Lys
290 295
<210> 28
<211> 23
<212> PRT
<213> Synthetic Polypeptide
<400> 28
Met Phe Val Phe Leu Val Leu Leu Pro Leu Val Ser Ser Gln Cys Val
1 5 10 15
Asn Leu Thr Thr Arg Thr Gln
20
<210> 29
<211> 30
<212> PRT
<213> Synthetic Polypeptide
<400> 29
Met Arg Val Lys Glu Lys Tyr Gln His Leu Trp Arg Trp Gly Trp Arg
1 5 10 15
Trp Gly Thr Met Leu Leu Gly Met Leu Met Ile Cys Ser Ala
20 25 30
<210> 30
<211> 32
<212> PRT
<213> Synthetic Polypeptide
<400> 30
Met Gly Val Thr Gly Ile Leu Gln Leu Pro Arg Asp Arg Phe Lys Arg
1 5 10 15
Thr Ser Phe Phe Leu Trp Val Ile Ile Leu Phe Gln Arg Thr Phe Ser
20 25 30
<210> 31
<211> 24
<212> PRT
<213> Synthetic Polypeptide
<400> 31
Met Pro Met Gly Ser Leu Gln Pro Leu Ala Thr Leu Tyr Leu Leu Gly
1 5 10 15
Met Leu Val Ala Ser Cys Leu Gly
20
<210> 32
<211> 25
<212> PRT
<213> Synthetic Polypeptide
<400> 32
Met Glu Leu Pro Ile Leu Lys Thr Asn Ala Ile Ile Thr Ile Leu Ala
1 5 10 15
Ala Val Thr Leu Cys Phe Ala Ser Ser
20 25
<210> 33
<211> 574
<212> PRT
<213> RSV
<400> 33
Met Glu Leu Pro Ile Leu Lys Thr Asn Ala Ile Ile Thr Ile Leu Ala
1 5 10 15
Ala Val Thr Leu Cys Phe Ala Ser Ser Gln Asn Ile Thr Glu Glu Phe
20 25 30
Tyr Gln Ser Thr Cys Ser Ala Val Ser Lys Gly Tyr Leu Ser Ala Leu
35 40 45
Arg Thr Gly Trp Tyr Thr Ser Val Ile Thr Ile Glu Leu Ser Asn Ile
50 55 60
Lys Glu Asn Lys Cys Asn Gly Thr Asp Ala Lys Val Lys Leu Ile Lys
65 70 75 80
Gln Glu Leu Asp Lys Tyr Lys Asn Ala Val Thr Glu Leu Gln Leu Leu
85 90 95
Met Gln Ser Thr Pro Ala Ala Asn Ser Arg Ala Arg Arg Glu Leu Pro
100 105 110
Arg Phe Met Asn Tyr Thr Leu Asn Asn Thr Lys Asn Thr Asn Val Thr
115 120 125
Leu Ser Lys Lys Arg Lys Arg Arg Phe Leu Gly Phe Leu Leu Gly Val
130 135 140
Gly Ser Ala Ile Ala Ser Gly Ile Ala Val Ser Lys Val Leu His Leu
145 150 155 160
Glu Gly Glu Val Asn Lys Ile Lys Ser Ala Leu Leu Ser Thr Asn Lys
165 170 175
Ala Val Val Ser Leu Ser Asn Gly Val Ser Val Leu Thr Ser Lys Val
180 185 190
Leu Asp Leu Lys Asn Tyr Ile Asp Lys Gln Leu Leu Pro Ile Val Asn
195 200 205
Lys Gln Ser Cys Ser Ile Ser Asn Ile Glu Thr Val Ile Glu Phe Gln
210 215 220
Gln Lys Asn Asn Arg Leu Leu Glu Ile Thr Arg Glu Phe Ser Val Asn
225 230 235 240
Ala Gly Val Thr Thr Pro Val Ser Thr Tyr Met Leu Thr Asn Ser Glu
245 250 255
Leu Leu Ser Leu Ile Asn Asp Met Pro Ile Thr Asn Asp Gln Lys Lys
260 265 270
Leu Met Ser Ser Asn Val Gln Ile Val Arg Gln Gln Ser Tyr Ser Ile
275 280 285
Met Ser Ile Ile Lys Glu Glu Val Leu Ala Tyr Val Val Gln Leu Pro
290 295 300
Leu Tyr Gly Val Ile Asp Thr Pro Cys Trp Lys Leu His Thr Ser Pro
305 310 315 320
Leu Cys Thr Thr Asn Thr Lys Glu Gly Ser Asn Ile Cys Leu Thr Arg
325 330 335
Thr Asp Arg Gly Trp Tyr Cys Asp Asn Ala Gly Ser Val Ser Phe Phe
340 345 350
Pro Gln Ala Glu Thr Cys Lys Val Gln Ser Asn Arg Val Phe Cys Asp
355 360 365
Thr Met Asn Ser Leu Thr Leu Pro Ser Glu Val Asn Leu Cys Asn Ile
370 375 380
Asp Ile Phe Asn Pro Lys Tyr Asp Cys Lys Ile Met Thr Ser Lys Thr
385 390 395 400
Asp Val Ser Ser Ser Val Ile Thr Ser Leu Gly Ala Ile Val Ser Cys
405 410 415
Tyr Gly Lys Thr Lys Cys Thr Ala Ser Asn Lys Asn Arg Gly Ile Ile
420 425 430
Lys Thr Phe Ser Asn Gly Cys Asp Tyr Val Ser Asn Lys Gly Val Asp
435 440 445
Thr Val Ser Val Gly Asn Thr Leu Tyr Tyr Val Asn Lys Gln Glu Gly
450 455 460
Lys Ser Leu Tyr Val Lys Gly Glu Pro Ile Ile Asn Phe Tyr Asp Pro
465 470 475 480
Leu Val Phe Pro Ser Asp Glu Phe Asp Ala Ser Ile Ser Gln Val Asn
485 490 495
Glu Lys Ile Asn Gln Ser Leu Ala Phe Ile Arg Lys Ser Asp Glu Leu
500 505 510
Leu His Asn Val Asn Ala Gly Lys Ser Thr Thr Asn Ile Met Ile Thr
515 520 525
Thr Ile Ile Ile Val Ile Ile Val Ile Leu Leu Ala Leu Ile Ala Val
530 535 540
Gly Leu Leu Leu Tyr Cys Lys Ala Arg Ser Thr Pro Val Thr Leu Ser
545 550 555 560
Lys Asp Gln Leu Ser Gly Ile Asn Asn Ile Ala Phe Ser Asn
565 570
<210> 34
<211> 268
<212> PRT
<213> RSV
<400> 34
Gly Val Ile Asp Thr Pro Cys Trp Lys Leu His Thr Ser Pro Leu Cys
1 5 10 15
Thr Thr Asn Thr Lys Glu Gly Ser Asn Ile Cys Leu Thr Arg Thr Asp
20 25 30
Arg Gly Trp Tyr Cys Asp Asn Ala Gly Ser Val Ser Phe Phe Pro Gln
35 40 45
Ala Glu Thr Cys Lys Val Gln Ser Asn Arg Val Phe Cys Asp Thr Met
50 55 60
Asn Ser Leu Thr Leu Pro Ser Glu Val Asn Leu Cys Asn Ile Asp Ile
65 70 75 80
Phe Asn Pro Lys Tyr Asp Cys Lys Ile Met Thr Ser Lys Thr Asp Val
85 90 95
Ser Ser Ser Val Ile Thr Ser Leu Gly Ala Ile Val Ser Cys Tyr Gly
100 105 110
Lys Thr Lys Cys Thr Ala Ser Asn Lys Asn Arg Gly Ile Ile Lys Thr
115 120 125
Phe Ser Asn Gly Cys Asp Tyr Val Ser Asn Lys Gly Val Asp Thr Val
130 135 140
Ser Val Gly Asn Thr Leu Tyr Tyr Val Asn Lys Gln Glu Gly Lys Ser
145 150 155 160
Leu Tyr Val Lys Gly Glu Pro Ile Ile Asn Phe Tyr Asp Pro Leu Val
165 170 175
Phe Pro Ser Asp Glu Phe Asp Ala Ser Ile Ser Gln Val Asn Glu Lys
180 185 190
Ile Asn Gln Ser Leu Ala Phe Ile Arg Lys Ser Asp Glu Leu Leu His
195 200 205
Asn Val Asn Ala Gly Lys Ser Thr Thr Asn Ile Met Ile Thr Thr Ile
210 215 220
Ile Ile Val Ile Ile Val Ile Leu Leu Ala Leu Ile Ala Val Gly Leu
225 230 235 240
Leu Leu Tyr Cys Lys Ala Arg Ser Thr Pro Val Thr Leu Ser Lys Asp
245 250 255
Gln Leu Ser Gly Ile Asn Asn Ile Ala Phe Ser Asn
260 265
<210> 35
<211> 21
<212> DNA
<213> Synthetic Polynucleotide
<400> 35
gttcaaggac ggcatctact t 21
<210> 36
<211> 21
<212> DNA
<213> Synthetic Polynucleotide
<400> 36
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<210> 37
<211> 20
<212> DNA
<213> Synthetic Polynucleotide
<400> 37
gacaaagtgc accctgaaga 20
<210> 38
<211> 20
<212> DNA
<213> Synthetic Polynucleotide
<400> 38
gggcacaggt tggtgatatt 20
<210> 39
<211> 21
<212> DNA
<213> Synthetic Polynucleotide
<400> 39
gaacgcctct ctgaactctt t 21
<210> 40
<211> 21
<212> DNA
<213> Synthetic Polynucleotide
<400> 40
gtcctcggtg atgttgtatg t 21
<210> 41
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<400> 41
gattagagcc gccgagatta g 21
<210> 42
<211> 21
<212> DNA
<213> Synthetic Polynucleotide
<400> 42
ggactgaggg aaagacatga g 21
<210> 43
<211> 386
<212> PRT
<213> SARS-CoV-2
<400> 43
Met Phe Val Phe Leu Val Leu Leu Pro Leu Val Ser Ser Gln Cys Val
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Asn Leu Thr Thr Arg Thr Gln Val Thr Gln Asn Val Leu Tyr Glu Asn
20 25 30
Gln Lys Leu Ile Ala Asn Gln Phe Asn Ser Ala Ile Gly Lys Ile Gln
35 40 45
Asp Ser Leu Ser Ser Thr Ala Ser Ala Leu Gly Lys Leu Gln Asp Val
50 55 60
Val Asn Gln Asn Ala Gln Ala Leu Asn Thr Leu Val Lys Gln Leu Ser
65 70 75 80
Ser Asn Phe Gly Ala Ile Ser Ser Val Leu Asn Asp Ile Leu Ser Arg
85 90 95
Leu Asp Lys Val Glu Ala Glu Val Gln Ile Asp Arg Leu Ile Thr Gly
100 105 110
Arg Leu Gln Ser Leu Gln Thr Tyr Val Thr Gln Gln Leu Ile Arg Ala
115 120 125
Ala Glu Ile Arg Ala Ser Ala Asn Leu Ala Ala Thr Lys Met Ser Glu
130 135 140
Cys Val Leu Gly Gln Ser Lys Arg Val Asp Phe Cys Gly Lys Gly Tyr
145 150 155 160
His Leu Met Ser Phe Pro Gln Ser Ala Pro His Gly Val Val Phe Leu
165 170 175
His Val Thr Tyr Val Pro Ala Gln Glu Lys Asn Phe Thr Thr Ala Pro
180 185 190
Ala Ile Cys His Asp Gly Lys Ala His Phe Pro Arg Glu Gly Val Phe
195 200 205
Val Ser Asn Gly Thr His Trp Phe Val Thr Gln Arg Asn Phe Tyr Glu
210 215 220
Pro Gln Ile Ile Thr Thr Asp Asn Thr Phe Val Ser Gly Asn Cys Asp
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Val Val Asn Ile Gln Lys Glu Ile Asp Arg Leu Asn Glu Val Ala Lys
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Asn Leu Asn Glu Ser Leu Ile Asp Leu Gln Glu Leu Gly Lys Tyr Glu
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Gln Tyr Ile Lys Trp Pro Trp Tyr Ile Trp Leu Gly Phe Ile Ala Gly
325 330 335
Leu Ile Ala Ile Val Met Val Thr Ile Met Leu Cys Cys Met Thr Ser
340 345 350
Cys Cys Ser Cys Leu Lys Gly Cys Cys Ser Cys Gly Ser Cys Cys Lys
355 360 365
Phe Asp Glu Asp Asp Ser Glu Pro Val Leu Lys Gly Val Lys Leu His
370 375 380
Tyr Thr
385
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<211> 312
<212> PRT
<213> SARS-CoV-2
<400> 44
Met Phe Val Phe Leu Val Leu Leu Pro Leu Val Ser Ser Gln Cys Val
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Asn Leu Thr Thr Arg Thr Gln Asp Lys Val Glu Ala Glu Val Gln Ile
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Lys Gly Val Lys Leu His Tyr Thr
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<210> 45
<211> 375
<212> PRT
<213> HIV
<400> 45
Met Arg Val Lys Glu Lys Tyr Gln His Leu Trp Arg Trp Gly Trp Arg
1 5 10 15
Trp Gly Thr Met Leu Leu Gly Met Leu Met Ile Cys Ser Ala Ala Val
20 25 30
Gly Ile Gly Ala Leu Phe Leu Gly Phe Leu Gly Ala Ala Gly Ser Thr
35 40 45
Met Gly Ala Ala Ser Met Thr Leu Thr Val Gln Ala Arg Gln Leu Leu
50 55 60
Ser Gly Ile Val Gln Gln Gln Asn Asn Leu Leu Arg Ala Ile Glu Ala
65 70 75 80
Gln Gln His Leu Leu Gln Leu Thr Val Trp Gly Ile Lys Gln Leu Gln
85 90 95
Ala Arg Ile Leu Ala Val Glu Arg Tyr Leu Lys Asp Gln Gln Leu Leu
100 105 110
Gly Ile Trp Gly Cys Ser Gly Lys Leu Ile Cys Thr Thr Ala Val Pro
115 120 125
Trp Asn Ala Ser Trp Ser Asn Lys Ser Leu Glu Gln Ile Trp Asn His
130 135 140
Thr Thr Trp Met Glu Trp Asp Arg Glu Ile Asn Asn Tyr Thr Ser Leu
145 150 155 160
Ile His Ser Leu Ile Glu Glu Ser Gln Asn Gln Gln Glu Lys Asn Glu
165 170 175
Gln Glu Leu Leu Glu Leu Asp Lys Trp Ala Ser Leu Trp Asn Trp Phe
180 185 190
Asn Ile Thr Asn Trp Leu Trp Tyr Ile Lys Leu Phe Ile Met Ile Val
195 200 205
Gly Gly Leu Val Gly Leu Arg Ile Val Phe Ala Val Leu Ser Ile Val
210 215 220
Asn Arg Val Arg Gln Gly Tyr Ser Pro Leu Ser Phe Gln Thr His Leu
225 230 235 240
Pro Thr Pro Arg Gly Pro Asp Arg Pro Glu Gly Ile Glu Glu Glu Gly
245 250 255
Gly Glu Arg Asp Arg Asp Arg Ser Ile Arg Leu Val Asn Gly Ser Leu
260 265 270
Ala Leu Ile Trp Asp Asp Leu Arg Ser Leu Cys Leu Phe Ser Tyr His
275 280 285
Arg Leu Arg Asp Leu Leu Leu Ile Val Thr Arg Ile Val Glu Leu Leu
290 295 300
Gly Arg Arg Gly Trp Glu Ala Leu Lys Tyr Trp Trp Asn Leu Leu Gln
305 310 315 320
Tyr Trp Ser Gln Glu Leu Lys Asn Ser Ala Val Ser Leu Leu Asn Ala
325 330 335
Thr Ala Ile Ala Val Ala Glu Gly Thr Asp Arg Val Ile Glu Val Val
340 345 350
Gln Gly Ala Cys Arg Ala Ile Arg His Ile Pro Arg Arg Ile Arg Gln
355 360 365
Gly Leu Glu Arg Ile Leu Leu
370 375
<210> 46
<211> 207
<212> PRT
<213> Ebola
<400> 46
Met Gly Val Thr Gly Ile Leu Gln Leu Pro Arg Asp Arg Phe Lys Arg
1 5 10 15
Thr Ser Phe Phe Leu Trp Val Ile Ile Leu Phe Gln Arg Thr Phe Ser
20 25 30
Glu Ala Ile Val Asn Ala Gln Pro Lys Cys Asn Pro Asn Leu His Tyr
35 40 45
Trp Thr Thr Gln Asp Glu Gly Ala Ala Ile Gly Leu Ala Trp Ile Pro
50 55 60
Tyr Phe Gly Pro Ala Ala Glu Gly Ile Tyr Thr Glu Gly Leu Met His
65 70 75 80
Asn Gln Asp Gly Leu Ile Cys Gly Leu Arg Gln Leu Ala Asn Glu Thr
85 90 95
Thr Gln Ala Leu Gln Leu Phe Leu Arg Ala Thr Thr Glu Leu Arg Thr
100 105 110
Phe Ser Ile Leu Asn Arg Lys Ala Ile Asp Phe Leu Leu Gln Arg Trp
115 120 125
Gly Gly Thr Cys His Ile Leu Gly Pro Asp Cys Cys Ile Glu Pro His
130 135 140
Asp Trp Thr Lys Asn Ile Thr Asp Lys Ile Asp Gln Ile Ile His Asp
145 150 155 160
Phe Val Asp Lys Thr Leu Pro Asp Gln Gly Asp Asn Asp Asn Trp Trp
165 170 175
Thr Gly Trp Arg Gln Trp Ile Pro Ala Gly Ile Gly Val Thr Gly Val
180 185 190
Ile Ile Ala Val Ile Ala Leu Phe Cys Ile Cys Lys Phe Val Phe
195 200 205
<210> 47
<211> 323
<212> PRT
<213> RSV
<400> 47
Met Glu Leu Pro Ile Leu Lys Thr Asn Ala Ile Ile Thr Ile Leu Ala
1 5 10 15
Ala Val Thr Leu Cys Phe Ala Ser Ser Gln Asn Ile Thr Glu Glu Phe
20 25 30
Tyr Gln Ser Thr Cys Ser Ala Val Ser Lys Gly Tyr Leu Ser Ala Leu
35 40 45
Arg Thr Gly Ser Gly Gly Ser Gly Val Ile Asp Thr Pro Cys Trp Lys
50 55 60
Leu His Thr Ser Pro Leu Cys Thr Thr Asn Thr Lys Glu Gly Ser Asn
65 70 75 80
Ile Cys Leu Thr Arg Thr Asp Arg Gly Trp Tyr Cys Asp Asn Ala Gly
85 90 95
Ser Val Ser Phe Phe Pro Gln Ala Glu Thr Cys Lys Val Gln Ser Asn
100 105 110
Arg Val Phe Cys Asp Thr Met Asn Ser Leu Thr Leu Pro Ser Glu Val
115 120 125
Asn Leu Cys Asn Ile Asp Ile Phe Asn Pro Lys Tyr Asp Cys Lys Ile
130 135 140
Met Thr Ser Lys Thr Asp Val Ser Ser Ser Val Ile Thr Ser Leu Gly
145 150 155 160
Ala Ile Val Ser Cys Tyr Gly Lys Thr Lys Cys Thr Ala Ser Asn Lys
165 170 175
Asn Arg Gly Ile Ile Lys Thr Phe Ser Asn Gly Cys Asp Tyr Val Ser
180 185 190
Asn Lys Gly Val Asp Thr Val Ser Val Gly Asn Thr Leu Tyr Tyr Val
195 200 205
Asn Lys Gln Glu Gly Lys Ser Leu Tyr Val Lys Gly Glu Pro Ile Ile
210 215 220
Asn Phe Tyr Asp Pro Leu Val Phe Pro Ser Asp Glu Phe Asp Ala Ser
225 230 235 240
Ile Ser Gln Val Asn Glu Lys Ile Asn Gln Ser Leu Ala Phe Ile Arg
245 250 255
Lys Ser Asp Glu Leu Leu His Asn Val Asn Ala Gly Lys Ser Thr Thr
260 265 270
Asn Ile Met Ile Thr Thr Ile Ile Ile Val Ile Ile Val Ile Leu Leu
275 280 285
Ala Leu Ile Ala Val Gly Leu Leu Leu Tyr Cys Lys Ala Arg Ser Thr
290 295 300
Pro Val Thr Leu Ser Lys Asp Gln Leu Ser Gly Ile Asn Asn Ile Ala
305 310 315 320
Phe Ser Asn
<210> 48
<211> 245
<212> PRT
<213> Influenza
<400> 48
Met Pro Met Gly Ser Leu Gln Pro Leu Ala Thr Leu Tyr Leu Leu Gly
1 5 10 15
Met Leu Val Ala Ser Cys Leu Gly Gly Ile Phe Gly Ala Ile Ala Gly
20 25 30
Phe Ile Glu Asn Gly Trp Glu Gly Met Val Asp Gly Trp Tyr Gly Phe
35 40 45
Arg His Gln Asn Ser Glu Gly Arg Gly Gln Ala Ala Asp Leu Lys Ser
50 55 60
Thr Gln Ala Ala Ile Asp Gln Ile Asn Gly Lys Leu Asn Arg Leu Ile
65 70 75 80
Gly Lys Thr Asn Glu Lys Phe His Gln Ile Glu Lys Glu Phe Ser Glu
85 90 95
Val Glu Gly Arg Val Gln Asp Leu Glu Lys Tyr Val Glu Asp Thr Lys
100 105 110
Ile Asp Leu Trp Ser Tyr Asn Ala Glu Leu Leu Val Ala Leu Glu Asn
115 120 125
Gln His Thr Ile Asp Leu Thr Asp Ser Glu Met Asn Lys Leu Phe Glu
130 135 140
Lys Thr Lys Lys Gln Leu Arg Glu Asn Ala Glu Asp Met Gly Asn Gly
145 150 155 160
Cys Phe Lys Ile Tyr His Lys Cys Asp Asn Ala Cys Ile Gly Ser Ile
165 170 175
Arg Asn Glu Thr Tyr Asp His Asn Val Tyr Arg Asp Glu Ala Leu Asn
180 185 190
Asn Arg Phe Gln Ile Lys Gly Val Glu Leu Lys Ser Gly Tyr Lys Asp
195 200 205
Trp Ile Leu Trp Ile Ser Phe Ala Ile Ser Cys Phe Leu Leu Cys Val
210 215 220
Ala Leu Leu Gly Phe Ile Met Trp Ala Cys Gln Lys Gly Asn Ile Arg
225 230 235 240
Cys Asn Ile Cys Ile
245
Claims (415)
- 표적 단백질 또는 이의 일부 및/또는 표적 단백질 또는 이의 일부의 고유(native) 상호작용 파트너를 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서,
상기 폴리펩타이드의 길이가 30개 초과의 아미노산이고,
상기 폴리펩타이드 및 상기 표적 단백질이 표적 단백질과 폴리펩타이드의 접촉시 비-고유(non-native) 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하고/하거나;
상기 폴리펩타이드 및 상기 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너가 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너와 폴리펩타이드의 접촉시 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하고/하거나;
상기 폴리펩타이드, 상기 표적 단백질 및 상기 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너가 표적 단백질 및 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너와 폴리펩타이드의 접촉시 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는, 방법. - 제1항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 서열과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 방법.
- 제1항 또는 제2항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 서열과 적어도 10% 서열 동일성을 갖는, 방법.
- 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 서열과 적어도 20% 동일성을 갖는, 방법.
- 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 서열과 적어도 30% 동일성을 갖는, 방법.
- 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 서열과 적어도 40% 동일성을 갖는, 방법.
- 제1항 내지 제6항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 서열과 적어도 50% 동일성을 갖는, 방법.
- 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 서열과 적어도 60% 동일성을 갖는, 방법.
- 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 서열과 적어도 70% 동일성을 갖는, 방법.
- 제1항 내지 제9항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 서열과 적어도 80% 동일성을 갖는, 방법.
- 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 서열과 적어도 85% 동일성을 갖는, 방법.
- 제1항 내지 제11항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 서열과 적어도 90% 동일성을 갖는, 방법.
- 제1항 내지 제12항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 서열과 적어도 95% 동일성을 갖는, 방법.
- 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 상응하는 서열을 포함하는, 방법.
- 표적 단백질 또는 이의 일부 및/또는 표적 단백질 또는 이의 일부의 고유 상호작용 파트너를 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서,
상기 폴리펩타이드의 길이가 30개 초과의 아미노산이고,
상기 폴리펩타이드가 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써, 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하고/하거나;
상기 폴리펩타이드가 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써, 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하고/하거나;
상기 폴리펩타이드가 표적 단백질의 올리고머화 도메인 및 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너와 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써, 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는, 방법. - 제15항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 방법.
- 제15항 또는 제16항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 10% 서열 동일성을 갖는, 방법.
- 제15항 내지 제17항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 20% 서열 동일성을 갖는, 방법.
- 제15항 내지 제18항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 30% 서열 동일성을 갖는, 방법.
- 제15항 내지 제19항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 40% 서열 동일성을 갖는, 방법.
- 제15항 내지 제20항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 50% 서열 동일성을 갖는, 방법.
- 제15항 내지 제21항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 60% 서열 동일성을 갖는, 방법.
- 제15항 내지 제22항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 70% 서열 동일성을 갖는, 방법.
- 제15항 내지 제23항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 80% 서열 동일성을 갖는, 방법.
- 제15항 내지 제24항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 85% 서열 동일성을 갖는, 방법.
- 제15항 내지 제25항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 90% 서열 동일성을 갖는, 방법.
- 제15항 내지 제26항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 95% 서열 동일성을 갖는, 방법.
- 제15항 내지 제27항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 표적 단백질의 올리고머화 도메인을 포함하는, 방법.
- 제1항 내지 제28항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질이 바이러스 단백질인, 방법.
- 제1항 내지 제29항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질이 바이러스 당단백질인, 방법.
- 제1항 내지 제30항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질이 바이러스 스파이크 단백질인, 방법.
- 제1항 내지 제31항 중 어느 한 항에 있어서, 생체내에서 상기 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절이 상기 대상체에서 질환 또는 상태를 치료 또는 예방하는, 방법.
- 제32항에 있어서, 상기 질환 또는 상태가 바이러스 감염인, 방법.
- 제1항 내지 제33항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 비-고유 단백질 복합체가 프로테아솜 분해를 겪는, 방법.
- 제1항 내지 제34항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 비-고유 단백질 복합체의 형성이 표적 단백질의 동종올리고머화를 억제함으로써 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는, 방법.
- 제1항 내지 제34항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 비-고유 단백질 복합체의 형성이 표적 단백질의 이종올리고머화를 억제함으로써 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는, 방법.
- 제1항 내지 제36항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 비-고유 단백질 복합체의 형성이 표적 단백질의 동종올리고머화 및 이종올리고머화를 억제함으로써 생체내에서 표적 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는, 방법.
- 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법;
- 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서,
상기 폴리펩타이드가 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써, 생체내에서 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는, 방법. - 제39항에 있어서, 상기 비-고유 단백질 복합체가 프로테아솜 분해를 겪는, 방법.
- 제38항 내지 제40항 중 어느 한 항에 있어서, 생체내에서 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절이 상기 대상체에서 코로나바이러스 감염을 치료 또는 예방하는, 방법.
- 제38항 내지 제41항 중 어느 한 항에 있어서, 생체내에서 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절이 상기 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 코로나바이러스 스파이크 단백질의 전좌 및 형성의 억제를 포함하는, 방법.
- 제38항 내지 제42항 중 어느 한 항에 있어서, 생체내에서 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절이 상기 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 코로나바이러스 스파이크 단백질의 양을 감소시키는, 방법.
- 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 코로나바이러스 감염을 치료 또는 예방하는 방법.
- 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 코로나바이러스 감염을 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성하는, 방법.
- 제45항에 있어서, 상기 비-고유 단백질 복합체가 프로테아솜 분해를 겪는, 방법.
- 제45항 또는 제46항에 있어서, 상기 폴리펩타이드 및 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화가 코로나바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하여 코로나바이러스 감염을 치료 또는 예방하는, 방법.
- 제44항 내지 제47항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질의 전좌 및 형성이 억제되는, 방법.
- 제44항 내지 제48항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질의 양이 감소되는, 방법.
- 제38항 내지 제49항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 코로나바이러스가 SARS-CoV, SARS-CoV-2, MERS-CoV, HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43, 또는 HCoV-HKU1을 포함하는, 방법.
- 제38항 내지 제50항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 코로나바이러스가 SARS-CoV를 포함하고 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질이 SARS-CoV 스파이크 단백질을 포함하는, 방법.
- 제38항 내지 제50항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 코로나바이러스가 SARS-CoV-2를 포함하고 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질이 SARS-CoV-2 스파이크 단백질을 포함하는, 방법.
- 제38항 내지 제50항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 코로나바이러스가 MERS-CoV를 포함하고 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질이 MERS-CoV 스파이크 단백질을 포함하는, 방법.
- 제38항 내지 제50항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 코로나바이러스가 HCoV-229E를 포함하고 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질이 HCoV-229E 스파이크 단백질을 포함하는, 방법.
- 제38항 내지 제50항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 코로나바이러스가 HCoV-NL63을 포함하고 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질이 HCoV-NL63 스파이크 단백질을 포함하는, 방법.
- 제38항 내지 제50항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 코로나바이러스가 HCoV-OC43을 포함하고 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질이 HCoV-OC43 스파이크 단백질을 포함하는, 방법.
- 제38항 내지 제50항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 코로나바이러스가 HCoV-HKU1을 포함하고 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질이 HCoV-HKU1 스파이크 단백질을 포함하는, 방법.
- 제38항 내지 제57항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 2와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 방법.
- 제58항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 2와 적어도 80% 동일성을 갖는, 방법.
- 제59항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 2와 적어도 85% 동일성을 갖는, 방법.
- 제60항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 2와 적어도 90% 동일성을 갖는, 방법.
- 제61항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 2와 적어도 95% 동일성을 갖는, 방법.
- 제62항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 2를 포함하는, 방법.
- 제38항 내지 제57항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 4와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 방법.
- 제64항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 4와 적어도 80% 동일성을 갖는, 방법.
- 제65항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 4와 적어도 85% 동일성을 갖는, 방법.
- 제66항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 4와 적어도 90% 동일성을 갖는, 방법.
- 제67항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 4와 적어도 95% 동일성을 갖는, 방법.
- 제68항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 4를 포함하는, 방법.
- 제38항 내지 제57항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 6과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 방법.
- 제70항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 6과 적어도 80% 동일성을 갖는, 방법.
- 제71항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 6과 적어도 85% 동일성을 갖는, 방법.
- 제72항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 6과 적어도 90% 동일성을 갖는, 방법.
- 제73항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 6과 적어도 95% 동일성을 갖는, 방법.
- 제74항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 6을 포함하는, 방법.
- 제38항 내지 제57항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 8과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 방법.
- 제76항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 8과 적어도 80% 동일성을 갖는, 방법.
- 제77항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 8과 적어도 85% 동일성을 갖는, 방법.
- 제78항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 8과 적어도 90% 동일성을 갖는, 방법.
- 제79항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 8과 적어도 95% 동일성을 갖는, 방법.
- 제80항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 8을 포함하는, 방법.
- 제38항 내지 제57항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 10과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 방법.
- 제82항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 10과 적어도 80% 동일성을 갖는, 방법.
- 제83항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 10과 적어도 85% 동일성을 갖는, 방법.
- 제84항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 10과 적어도 90% 동일성을 갖는, 방법.
- 제85항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 10과 적어도 95% 동일성을 갖는, 방법.
- 제86항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 10을 포함하는, 방법.
- 제38항 내지 제57항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 12와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 방법.
- 제88항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 12와 적어도 80% 동일성을 갖는, 방법.
- 제89항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 12와 적어도 85% 동일성을 갖는, 방법.
- 제90항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 12와 적어도 90% 동일성을 갖는, 방법.
- 제91항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 12와 적어도 95% 동일성을 갖는, 방법.
- 제92항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 12를 포함하는, 방법.
- 제38항 내지 제57항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 14와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 방법.
- 제94항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 14와 적어도 80% 동일성을 갖는, 방법.
- 제95항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 14와 적어도 85% 동일성을 갖는, 방법.
- 제96항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 14와 적어도 90% 동일성을 갖는, 방법.
- 제97항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 14와 적어도 95% 동일성을 갖는, 방법.
- 제98항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 14를 포함하는, 방법.
- 제38항 내지 제57항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 16과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 방법.
- 제100항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 16과 적어도 80% 동일성을 갖는, 방법.
- 제101항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 16과 적어도 85% 동일성을 갖는, 방법.
- 제102항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 16과 적어도 90% 동일성을 갖는, 방법.
- 제103항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 16과 적어도 95% 동일성을 갖는, 방법.
- 제104항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 16을 포함하는, 방법.
- 제44항 내지 제105항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 대상체를 코로나바이러스 감염으로 진단하는 단계;
상기 대상체를 코로나바이러스 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 또는
상기 대상체를 코로나바이러스 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계
를 추가로 포함하는 방법. - 제44항 내지 제106항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 코로나바이러스 감염을 가질 높은 위험이 있는, 방법.
- 제44항 내지 제107항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 코로나바이러스 감염을 갖지 않는, 방법.
- 제44항 내지 제108항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 코로나바이러스 감염에 대해 음성인 것으로 테스트된, 방법.
- 제44항 내지 제107항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 코로나바이러스 감염을 갖는 것으로 진단된, 방법.
- 제44항 내지 제110항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 코로나바이러스 감염이 중증 급성 호흡기 증후군(SARS), 중동 호흡기 증후군, 또는 호흡기 감염을 유발하는, 방법.
- 제111항에 있어서, 상기 코로나바이러스 감염이 COVID-19를 유발하는, 방법.
- 제44항 내지 제112항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체에게 코로나바이러스 감염에 대한 유효량의 제2 요법이 제공되는, 방법.
- 제113항에 있어서, 상기 제2 요법이 항생제, 항바이러스제, 회복기 혈청, 면역 조절제, 항응고제, 유체, 산소, 코르티코스테로이드, 항체, GSnP-6, 시알릴 루이스 X 유사체(sialyl Lewis X analog), 항-증식제, 칼시뉴린 억제제, 항-신호전달 화합물, 또는 이들의 조합을 포함하는, 방법.
- 제113항 또는 제114항에 있어서, 상기 제2 요법이 항-SARS-CoV-2 약물을 포함하는, 방법.
- 제115항에 있어서, 상기 항-SARS-CoV-2 약물이 스테로이드, 아연, 비타민 C, 렘데시비르, 토실리주맙, 아나킨라, 베클로메타손, 베타메타손, 부데소니드 코르티손, 덱사메타손, 하이드로코르티손, 메틸프레드니솔론, 프레드니솔론, 프레드니손, 트리암시놀론, 아지트로마이신, AC-55541, 아피시딘, AZ3451, AZ8838, 바필로마이신 A1, CCT 365623, 다우노루비신, E-52862, 엔타카폰, GB110, H-89, 할로페리돌, 인도메타신, JQ1, 로라타딘, 메리메포딥, 메트포르민, 미도스타우린, 미갈라스타트, 마이코페놀산, PB28, PD-144418, 포나티닙, 리바비린, RS-PPCC, 룩솔리티닙, RVX-208, S-베라파밀, 실미타서팁, TMCB, UCPH-101, 발프로산, XL413, ZINC1775962367, ZINC4326719, ZINC4511851, ZINC95559591, 4E2RCat, ABBV-744, 카모스타트, 캅토프릴, CB5083, 클로람페니콜, 클로로퀸, 하이드록시클로로퀸, CPI-0610, 다브라페닙, DBeQ, dBET6, IHVR-19029, 리네졸리드, 리시노프릴, 미녹시딜, ML240, MZ1, 나파모스타트, 페보네디스타트, PS3061, 라파마이신(Sirolimus), 상글리페린 A, 사파니서팁(INK128/MlN128), FK-506(Tacrolimus), 테르나틴 4(DA3), 티게사이클린, 토미보서팁(eFT-508), 베르디넥소르, WDB002, 조타티핀(eFT226) 및 이들의 조합으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는, 방법.
- 제44항 내지 제116항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 코로나바이러스 감염이 예방되고/되거나, 중증도가 감소되고/되거나, 발병이 지연되는, 방법.
- HIV 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 서열번호 18과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법.
- HIV 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 HIV 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 18과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서,
상기 폴리펩타이드가 HIV 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는, 방법. - 제119항에 있어서, 상기 비-고유 단백질 복합체가 프로테아솜 분해를 겪는, 방법.
- 제118항 내지 제120항 중 어느 한 항에 있어서, 생체내에서 상기 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절이 상기 대상체에서 HIV 감염을 치료 또는 예방하는, 방법.
- 제118항 내지 제121항 중 어느 한 항에 있어서, 생체내에서 상기 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절이 상기 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 HIV 스파이크 단백질의 전좌 및 형성의 억제를 포함하는, 방법.
- 제118항 내지 제122항 중 어느 한 항에 있어서, 생체내에서 상기 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절이 상기 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 HIV 스파이크 단백질의 양을 감소시키는, 방법.
- 서열번호 18과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 HIV 감염을 치료 또는 예방하는 방법.
- HIV 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 18과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 HIV 감염을 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 HIV 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성하는, 방법.
- 제125항에 있어서, 상기 비-고유 단백질 복합체가 프로테아솜 분해를 겪는, 방법.
- 제125항 또는 제126항에 있어서, 상기 폴리펩타이드 및 상기 HIV 스파이크 단백질의 올리고머화가 HIV 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하여 HIV 감염을 치료 또는 예방하는, 방법.
- 제124항 내지 제127항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 상기 HIV 스파이크 단백질의 전좌 및 형성이 억제되는, 방법.
- 제124항 내지 제128항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 상기 HIV 스파이크 단백질의 양이 감소되는, 방법.
- 제118항 내지 제129항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 HIV 스파이크 단백질이 HIV gp160 스파이크 단백질을 포함하는, 방법.
- 제118항 내지 제130항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 18과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 방법.
- 제131항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 18과 적어도 80% 동일성을 갖는, 방법.
- 제132항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 18과 적어도 85% 동일성을 갖는, 방법.
- 제133항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 18과 적어도 90% 동일성을 갖는, 방법.
- 제134항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 18과 적어도 95% 동일성을 갖는, 방법.
- 제135항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 18을 포함하는, 방법.
- 제124항 내지 제136항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 대상체를 HIV 감염으로 진단하는 단계;
상기 대상체를 HIV 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 또는
상기 대상체를 HIV 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계
를 추가로 포함하는 방법. - 제124항 내지 제137항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 HIV 감염을 가질 높은 위험이 있는, 방법.
- 제124항 내지 제138항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 HIV 감염을 갖지 않는, 방법.
- 제124항 내지 제139항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 HIV 감염에 대해 음성인 것으로 테스트된, 방법.
- 제124항 내지 제138항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 HIV 감염을 갖는 것으로 진단된, 방법.
- 제124항 내지 제141항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체에게 HIV 감염에 대한 유효량의 제2 요법이 제공되는, 방법.
- 제142항에 있어서, 상기 제2 요법이 항생제, 항바이러스제, 회복기 혈청, 면역 조절제, 항응고제, 유체, 산소, 코르티코스테로이드, 항체, GSnP-6, 시알릴 루이스 X 유사체, 항-증식제, 칼시뉴린 억제제, 항-신호전달 화합물, 또는 이들의 조합을 포함하는, 방법.
- 제142항 또는 제143항에 있어서, 상기 제2 요법이 항-HIV 약물을 포함하는, 방법.
- 제144항에 있어서, 상기 항-HIV 약물이 에파비렌즈(Sustiva), 릴피비린(Edurant), 에트라비린(Intelence), 델라비르딘(Rescriptor), 네비라핀(Viramune, Viramune XR), 도라비린(Pifeltroz), 아바카비르(Ziagen), 테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Vemlidy), 테노포비르(Viread), 엠트리시타빈(Emtriva), 라미부딘(Epivir), 지도부딘(Retrovir), 아바카비르/라미부딘/지도부딘(Trizivir), 아바카비르/라미부딘(Epzicom), 엠트리시타빈/테노포비르(Truvada), 아바카비르/라미부딘(Epzicom), 라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Cimduo, Temixys), 라미부딘/지도부딘(Combivir), 엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드(Descovy), 디다노신(Videx, Videx EC), 스타부딘(Zerit), 아타자나비르(Reyataz), 다루나비르(Prezista), 포삼프레나비르(Lexiva), 리토나비르(Norvir), 티프라나비르(Aptivus), 로피나비르/리토나비르(Kaletra), 아타자나비르/코비시스타트(Evotaz), 다루나비르/코비시스타트(Prezcobix), 인디나비르(Crixivan), 넬피나비르(Viracept), 사퀴나비르(Invirase), 빅테그라비르 나트륨/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마르(Biktarvy), 랄테그라비르(Isentress), 엘비테그라비르(Genvoya 및 Stribild), 돌루테그라비르(Tivicay), 코비시스타트(Tybost), 리토나비르(Norvir), 엔푸비르티드(Fuzeon), 마라비록(Selzentry), 이발리주맙-uiyk(Trogarzo), 마라비록(Selzentry), 포스템사비르(Rukobia), 도라비린/라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Delstrigo), 에파비렌즈/라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Symfi), 에파비렌즈/라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Symfi Lo), 에파비렌즈/엠트리시타빈/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Atripla), 엠트리시타빈/릴피비린/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Odefsey), 엠트리시타빈/릴피비린/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Complera), 엘비테그라비르/코비시스타트/엠트리시타빈/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Stribild), 엘비테그라비르/코비시스타트/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Genvoya), 아바카비르/돌루테그라비르/라미부딘(Triumeq), 빅테그라비르/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Biktarvy), 돌루테그라비르/라미부딘(Dovato), 돌루테그라비르/릴피비린(Juluca), 다루나비르/코비시스타트/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Symtuza), 아세틸-L-카르니틴, 유청 단백질, L-글루타민, L-아르기닌, 하이드록시메틸부티레이트(HMB), 프로바이오틱스, 비타민 및 미네랄, 및 이들의 조합으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는, 방법.
- 제124항 내지 제145항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 HIV 감염이 예방되고/되거나, 중증도가 감소되고/되거나, 발병이 지연되는, 방법.
- 에볼라 당단백질 또는 이의 일부를 서열번호 20과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 에볼라 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법.
- 에볼라 당단백질 또는 이의 일부를 에볼라 당단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 20과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 에볼라 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서,
상기 폴리펩타이드가 에볼라 당단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써, 생체내에서 에볼라 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 억제하는, 방법. - 제148항에 있어서, 상기 비-고유 단백질 복합체가 프로테아솜 분해를 겪는, 방법.
- 제147항 내지 제149항 중 어느 한 항에 있어서, 생체내에서 상기 에볼라 당단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절이 상기 대상체에서 에볼라 감염을 치료 또는 예방하는, 방법.
- 제147항 내지 제150항 중 어느 한 항에 있어서, 생체내에서 상기 에볼라 당단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절이 상기 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 에볼라 당단백질의 전좌 및 형성의 억제를 포함하는, 방법.
- 제147항 내지 제151항 중 어느 한 항에 있어서, 생체내에서 상기 에볼라 당단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절이 상기 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 에볼라 당단백질의 양을 감소시키는, 방법.
- 서열번호 20과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 에볼라 감염을 치료 또는 예방하는 방법.
- 에볼라 당단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 20과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 에볼라 감염을 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 에볼라 당단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성하는, 방법.
- 제154항에 있어서, 상기 비-고유 단백질 복합체가 프로테아솜 분해를 겪는, 방법.
- 제154항 또는 제155항에 있어서, 상기 폴리펩타이드 및 상기 에볼라 당단백질의 올리고머화가 에볼라 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하여 에볼라 감염을 치료 또는 예방하는, 방법.
- 제153항 내지 제156항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 상기 에볼라 당단백질 전좌 및 형성이 억제되는, 방법.
- 제153항 내지 제157항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 상기 에볼라 당단백질의 양이 감소되는, 방법.
- 제147항 내지 제158항 중 어느 한 항에 있어서, 에볼라 당단백질이 에볼라 GP 당단백질을 포함하는, 방법.
- 제147항 내지 제159항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 20과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 방법.
- 제160항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 20과 적어도 80% 동일성을 갖는, 방법.
- 제161항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 20과 적어도 85% 동일성을 갖는, 방법.
- 제162항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 20과 적어도 90% 동일성을 갖는, 방법.
- 제163항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 20과 적어도 95% 동일성을 갖는, 방법.
- 제164항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 20을 포함하는, 방법.
- 제153항 내지 제165항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 대상체를 에볼라 감염으로 진단하는 단계;
상기 대상체를 에볼라 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 또는
상기 대상체를 에볼라 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계
를 추가로 포함하는 방법. - 제153항 내지 제166항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 에볼라 감염을 가질 높은 위험이 있는, 방법.
- 제153항 내지 제167항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 에볼라 감염을 갖지 않는, 방법.
- 제153항 내지 제168항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 에볼라 감염에 대해 음성인 것으로 테스트된, 방법.
- 제153항 내지 제167항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 에볼라 감염을 갖는 것으로 진단된, 방법.
- 제153항 내지 제170항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체에게 에볼라 감염에 대한 유효량의 제2 요법이 제공되는, 방법.
- 제171항에 있어서, 상기 제2 요법이 항생제, 항바이러스제, 회복기 혈청, 면역 조절제, 항응고제, 유체, 산소, 코르티코스테로이드, 항체, GSnP-6, 시알릴 루이스 X 유사체, 항-증식제, 칼시뉴린 억제제, 항-신호전달 화합물, 또는 이들의 조합을 포함하는, 방법.
- 제171항 또는 제172항에 있어서, 상기 제2 요법이 항-에볼라 약물을 포함하는, 방법.
- 제173항에 있어서, 상기 항-에볼라 약물이 아톨티비맙/마프티비맙/오데시비맙-ebgn(Inmazeb), 안수비맙-zykl(Ebanga), 파비피라비르(Avigan), 리바비린, BCX4430, 브린시도포비르, TKM-에볼라, AVI-7537, JK-05, 및 이들의 조합으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는, 방법.
- 제153항 내지 제174항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 에볼라 감염이 예방되고/되거나, 중증도가 감소되고/되거나, 발병이 지연되는, 방법.
- 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 서열번호 25와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법.
- 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 일부를 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 25와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서,
상기 폴리펩타이드가 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써 생체내에서 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는, 방법. - 제177항에 있어서, 상기 비-고유 단백질 복합체가 프로테아솜 분해를 겪는, 방법.
- 제176항 내지 제178항 중 어느 한 항에 있어서, 생체내에서 상기 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절이 상기 대상체에서 인플루엔자 감염을 치료 또는 예방하는, 방법.
- 제176항 내지 제179항 중 어느 한 항에 있어서, 생체내에서 상기 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절이 상기 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 전좌 및 형성의 억제를 포함하는, 방법.
- 제176항 내지 제180항 중 어느 한 항에 있어서, 생체내에서 상기 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절이 상기 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 양을 감소시키는, 방법.
- 서열번호 25와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 인플루엔자 감염을 치료 또는 예방하는 방법.
- 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 25와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 인플루엔자 감염을 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성하는, 방법.
- 제183항에 있어서, 상기 비-고유 단백질 복합체가 프로테아솜 분해를 겪는, 방법.
- 제183항 또는 제184항에 있어서, 상기 폴리펩타이드 및 상기 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화가 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하여 인플루엔자 감염을 치료 또는 예방하는, 방법.
- 제182항 내지 제185항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 상기 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 전좌 및 형성이 억제되는, 방법.
- 제182항 내지 제186항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 상기 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 양이 감소되는, 방법.
- 제176항 내지 제187항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 인플루엔자가 인플루엔자 바이러스 A를 포함하고, 상기 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질이 인플루엔자 바이러스 A 스파이크 단백질을 포함하는, 방법.
- 제188항에 있어서, 상기 인플루엔자 바이러스 A가 인플루엔자 바이러스 A/H1을 포함하고, 상기 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질이 인플루엔자 바이러스 A/H1 HA 스파이크 단백질을 포함하는, 방법.
- 제188항에 있어서, 상기 인플루엔자 바이러스 A가 인플루엔자 바이러스 A/H3을 포함하고, 상기 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질이 인플루엔자 바이러스 A/H3 HA 스파이크 단백질을 포함하는, 방법.
- 제176항 내지 제187항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 인플루엔자가 인플루엔자 바이러스 B를 포함하고, 상기 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질이 인플루엔자 바이러스 B 스파이크 단백질을 포함하는, 방법.
- 제191항에 있어서, 상기 인플루엔자 바이러스 B가 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아(Victoria)를 포함하고, 상기 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질이 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아 HA 스파이크 단백질을 포함하는, 방법.
- 제191항에 있어서, 상기 인플루엔자 바이러스 B가 인플루엔자 바이러스 B/야마가타(Yamagata)를 포함하고, 상기 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질이 인플루엔자 바이러스 B/야마가타 HA 스파이크 단백질을 포함하는, 방법.
- 제176항 내지 제193항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 25와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 방법.
- 제194항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 25와 적어도 80% 동일성을 갖는, 방법.
- 제195항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 25와 적어도 85% 동일성을 갖는, 방법.
- 제196항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 25와 적어도 90% 동일성을 갖는, 방법.
- 제197항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 25와 적어도 95% 동일성을 갖는, 방법.
- 제198항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 25를 포함하는, 방법.
- 제182항 내지 제199항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 대상체를 인플루엔자 감염으로 진단하는 단계;
상기 대상체를 인플루엔자 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 또는
상기 대상체를 인플루엔자 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계
를 추가로 포함하는 방법. - 제182항 내지 제200항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 인플루엔자 감염을 가질 높은 위험이 있는, 방법.
- 제182항 내지 제201항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 인플루엔자 감염을 갖지 않는, 방법.
- 제182항 내지 제202항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 인플루엔자 감염에 대해 음성인 것으로 테스트된, 방법.
- 제182항 내지 제201항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 인플루엔자 감염을 갖는 것으로 진단된, 방법.
- 제182항 내지 제204항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체에게 인플루엔자 감염에 대한 유효량의 제2 요법이 제공되는, 방법.
- 제205항에 있어서, 상기 제2 요법이 항생제, 항바이러스제, 회복기 혈청, 면역 조절제, 항응고제, 유체, 산소, 코르티코스테로이드, 항체, GSnP-6, 시알릴 루이스 X 유사체, 항-증식제, 칼시뉴린 억제제, 항-신호전달 화합물, 또는 이들의 조합을 포함하는, 방법.
- 제205항 또는 제206항에 있어서, 상기 제2 요법이 항-인플루엔자 약물을 포함하는, 방법.
- 제207항에 있어서, 상기 항-인플루엔자 약물이 오셀타미비르 포스페이트(Tamiflu), 자나미비르(Relenza), 페라미비르(Rapivab), 발록사비르 마르복실(Xofluza), 아만타딘, 리만타딘(Flumadine), 우미페노비르(Arbidol), 모록시딘, 플루티케어(fluticare), 아세트아미노펜, 클로르페니라민, 덱스트로메토르판, 슈도에페드린, 및 이들의 조합로 이루어진 그룹으로부터 선택되는, 방법.
- 제179항 내지 제208항 중 어느 한 항에 있어서, 인플루엔자 감염이 예방되고/되거나, 중증도가 감소되고/되거나, 발병이 지연되는, 방법.
- RSV 당단백질 또는 이의 일부를 서열번호 34와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법.
- RSV 당단백질 또는 이의 일부를 서열번호 34와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드의 유효량과 접촉시키는 것을 포함하는, 대상체의 생체내에서 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는 방법으로서,
상기 폴리펩타이드가 RSV 당단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성함으로써, 생체내에서 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하는, 방법. - 제211항에 있어서, 상기 비-고유 단백질 복합체가 프로테아솜 분해를 겪는, 방법.
- 제210항 내지 제212항 중 어느 한 항에 있어서, 생체내에서 상기 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절이 상기 대상체에서 RSV 감염을 치료 또는 예방하는, 방법.
- 제210항 내지 제213항 중 어느 한 항에 있어서, 생체내에서 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절이 상기 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 RSV 당단백질의 전좌 및 형성의 억제를 포함하는, 방법.
- 제210항 내지 제214항 중 어느 한 항에 있어서, 생체내에서 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능의 조절이 상기 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 RSV 당단백질의 양을 감소시키는, 방법.
- 서열번호 34와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 RSV 감염을 치료 또는 예방하는 방법.
- RSV 당단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 34와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 포함하는 조성물의 치료적 유효량을 대상체에게 투여하는 것을 포함하는, 대상체에서 RSV 감염을 치료 또는 예방하는 방법으로서, 상기 폴리펩타이드가 RSV 당단백질의 올리고머화 도메인과 올리고머화하여 비-고유 단백질 복합체를 형성하는, 방법.
- 제217항에 있어서, 상기 비-고유 단백질 복합체가 프로테아솜 분해를 겪는, 방법.
- 제217항 또는 제218항에 있어서, 상기 폴리펩타이드 및 상기 RSV 당단백질의 올리고머화가 RSV 당단백질 또는 이의 생물학적 기능을 조절하여 RSV 감염을 치료 또는 예방하는, 방법.
- 제216항 내지 제219항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체의 세포 표면 및/또는 바이러스 외피로의 RSV 당단백질의 전좌 및 형성이 억제되는, 방법.
- 제216항 내지 제220항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체의 세포 표면 상 및/또는 바이러스 외피 상의 RSV 당단백질이 감소되는, 방법.
- 제210항 내지 제221항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 RSV 당단백질이 RSV F 당단백질을 포함하는, 방법.
- 제210항 내지 제222항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 34와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 방법.
- 제223항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 34와 적어도 80% 동일성을 갖는, 방법.
- 제224항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 34와 적어도 85% 동일성을 갖는, 방법.
- 제225항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 34와 적어도 90% 동일성을 갖는, 방법.
- 제226항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 34와 적어도 95% 동일성을 갖는, 방법.
- 제227항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 34를 포함하는, 방법.
- 제216항 내지 제228항 중 어느 한 항에 있어서,
상기 대상체를 RSV 감염으로 진단하는 단계;
상기 대상체를 RSV 감염의 증상을 갖는 것으로 진단하는 단계; 또는
상기 대상체를 RSV 감염을 가질 위험이 있는 것으로 진단하는 단계
를 추가로 포함하는 방법. - 제216항 내지 제229항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 RSV 감염을 가질 높은 위험이 있는, 방법.
- 제216항 내지 제230항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 RSV 감염을 갖지 않는, 방법.
- 제216항 내지 제231항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 RSV 감염에 대해 음성인 것으로 테스트된, 방법.
- 제216항 내지 제230항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체가 RSV 감염을 갖는 것으로 진단된, 방법.
- 제216항 내지 제233항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 대상체에게 RSV 감염에 대한 유효량의 제2 요법이 제공되는, 방법.
- 제234항에 있어서, 상기 제2 요법이 항-RSV 약물을 포함하는, 방법.
- 제216항 내지 제235항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 RSV 감염이 예방되고/되거나, 중증도가 감소되고/되거나, 발병이 지연되는, 방법.
- 제1항 내지 제236항 중 어느 한 항에 있어서, 0.1 내지 1000 mg/대상체의 체중 kg의 용량의 상기 폴리펩타이드가 상기 대상체에게 투여되는, 방법.
- 제1항 내지 제236항 중 어느 한 항에 있어서, 0.1 내지 1000 ㎍/대상체의 체중 kg의 용량의 상기 폴리펩타이드가 상기 대상체에게 투여되는, 방법.
- 제1항 내지 제236항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 상기 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터로부터 발현되는, 방법.
- 제239항에 있어서, 상기 벡터가 바이러스 벡터 또는 비-바이러스 벡터인, 방법.
- 제239항 또는 제240항에 있어서, 상기 벡터가 미니서클 DNA 벡터인, 방법.
- 제239항 내지 제241항 중 어느 한 항에 있어서, 1 x 108 내지 1 x 1018 벡터 카피/대상체의 체중 kg의 용량이 상기 대상체에게 투여되는, 방법.
- 제239항 내지 제242항 중 어느 한 항에 있어서, 약 1 x 1011 내지 약 1 x 1014 벡터 카피/대상체의 체중 kg의 용량이 상기 대상체에게 투여되는, 방법.
- 제239항 내지 제243항 중 어느 한 항에 있어서, 약 1 x 1012 내지 약 1 x 1015 벡터/대상체의 체중 kg의 용량이 상기 대상체에게 투여되는, 방법.
- 제239항 내지 제244항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 벡터가 대상체의 세포를 형질도입하고, 상기 대상체의 세포가 폴리펩타이드를 발현하는, 방법.
- 제1항 내지 제245항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 조성물이 약제학적으로 허용되는 담체를 추가로 포함하는, 방법.
- 제246항에 있어서, 상기 약제학적으로 허용되는 담체가 리포솜, 중합체성 미셀, 미소구체 또는 나노입자를 포함하는, 방법.
- 제1항 내지 제247항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 조성물의 단일 용량이 투여되는, 방법.
- 제1항 내지 제247항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 조성물의 다중 용량이 투여되는, 방법.
- 제249항에 있어서, 상기 조성물이 상기 대상체에게 1일 1회, 1일 1회 이상, 주 1회 이상, 월 1회 이상, 또는 년 1회 이상 전달되는, 방법.
- 제1항 내지 제250항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 조성물이 전신적으로 또는 국소적으로 전달되는, 방법.
- 제1항 내지 제250항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 조성물이 상기 대상체에게 비강내로, 정맥내로, 복강내로, 기관내로, 근육내로, 내시경적으로, 경피적으로, 피하, 국부적으로, 두개내로, 흡입에 의해, 주사에 의해, 주입에 의해 또는 관류에 의해 투여되는, 방법.
- 제1항 내지 제252항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 조성물이 상기 대상체에게 흡입에 의해 투여되는, 방법.
- 제1항 내지 제253항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 조성물이 상기 대상체에게 비강내로 투여되는, 방법.
- 표적 단백질 및/또는 표적 단백질의 고유 상호작용 파트너의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물로서,
상기 폴리펩타이드의 길이가 30개 초과의 아미노산이고,
상기 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 서열과 적어도 10% 서열 동일성을 갖는, 조성물. - 제255항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 서열과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제255항 또는 제256항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 서열과 적어도 10% 서열 동일성을 갖는, 조성물.
- 제255항 내지 제257항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 서열과 적어도 20% 서열 동일성을 갖는, 조성물.
- 제255항 내지 제258항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 서열과 적어도 30% 서열 동일성을 갖는, 조성물.
- 제255항 내지 제259항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 서열과 적어도 40% 서열 동일성을 갖는, 조성물.
- 제255항 내지 제260항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 서열과 적어도 50% 서열 동일성을 갖는, 조성물.
- 제255항 내지 제261항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 서열과 적어도 60% 서열 동일성을 갖는, 조성물.
- 제255항 내지 제262항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 서열과 적어도 70% 서열 동일성을 갖는, 조성물.
- 제255항 내지 제263항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 서열과 적어도 80% 서열 동일성을 갖는, 조성물.
- 제255항 내지 제264항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 서열과 적어도 85% 서열 동일성을 갖는, 조성물.
- 제255항 내지 제265항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 서열과 적어도 90% 서열 동일성을 갖는, 조성물.
- 제255항 내지 제266항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 서열과 적어도 95% 서열 동일성을 갖는, 조성물.
- 제255항 내지 제267항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 상응하는 서열을 포함하는, 조성물.
- 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물로서,
상기 폴리펩타이드의 길이가 30개 초과의 아미노산이고,
상기 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 10% 서열 동일성을 갖는, 조성물. - 제269항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제269항 또는 제270항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 10% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제269항 내지 제271항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 20% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제269항 내지 제272항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 30% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제269항 내지 제273항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 40% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제269항 내지 제274항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 50% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제269항 내지 제275항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 60% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제269항 내지 제276항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 70% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제269항 내지 제277항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 80% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제269항 내지 제278항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 85% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제269항 내지 제279항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 90% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제269항 내지 제280항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인과 적어도 95% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제269항 내지 제281항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드가 상기 표적 단백질의 올리고머화 도메인을 포함하는, 조성물.
- 제255항 내지 제282항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질이 바이러스 단백질을 포함하는, 조성물.
- 제255항 내지 제283항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질이 바이러스 당단백질을 포함하는, 조성물.
- 제255항 내지 제284항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표적 단백질이 바이러스 스파이크 단백질을 포함하는, 조성물.
- 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물.
- 코로나바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14, 또는 16과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물.
- 제287항에 있어서, 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질이 SARS-CoV 스파이크 단백질을 포함하는, 조성물.
- 제287항에 있어서, 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질이 SARS-CoV-2 스파이크 단백질을 포함하는, 조성물.
- 제287항에 있어서, 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질이 MERS-CoV 스파이크 단백질을 포함하는, 조성물.
- 제287항에 있어서, 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질이 HCoV-229E 스파이크 단백질을 포함하는, 조성물.
- 제287항에 있어서, 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질이 HCoV-NL63 스파이크 단백질을 포함하는, 조성물.
- 제287항에 있어서, 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질이 HCoV-OC43 스파이크 단백질을 포함하는, 조성물.
- 제287항에 있어서, 상기 코로나바이러스 스파이크 단백질이 HCoV-HKU1 스파이크 단백질을 포함하는, 조성물.
- 제286항 내지 제294항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 2와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제295항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 2와 적어도 80% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제296항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 2와 적어도 85% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제297항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 2와 적어도 90% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제298항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 2와 적어도 95% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제299항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 2를 포함하는, 조성물.
- 제286항 내지 제294항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 4와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제301항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 4와 적어도 80% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제302항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 4와 적어도 85% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제303항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 4와 적어도 90% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제304항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 4와 적어도 95% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제305항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 4를 포함하는, 조성물.
- 제286항 내지 제294항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 6과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제307항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 6과 적어도 80% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제308항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 6과 적어도 85% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제309항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 6과 적어도 90% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제310항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 6과 적어도 95% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제311항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 6을 포함하는, 조성물.
- 제286항 내지 제294항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 8과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제313항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 8과 적어도 80% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제314항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 8과 적어도 85% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제315항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 8과 적어도 90% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제316항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 8과 적어도 95% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제317항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 8을 포함하는, 조성물.
- 제286항 내지 제294항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 10과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제319항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 10과 적어도 80% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제320항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 10과 적어도 85% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제321항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 10과 적어도 90% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제322항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 10과 적어도 95% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제323항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 10을 포함하는, 조성물.
- 제286항 내지 제294항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 12와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제325항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 12와 적어도 80% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제326항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 12와 적어도 85% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제327항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 12와 적어도 90% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제328항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 12와 적어도 95% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제329항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 12를 포함하는, 조성물.
- 제286항 내지 제294항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 14와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성 갖는, 조성물.
- 제331항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 14와 적어도 80% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제332항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 14와 적어도 85% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제333항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 14와 적어도 90% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제334항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 14와 적어도 95% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제335항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 14를 포함하는, 조성물.
- 제286항 내지 제294항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 16과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제337항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 16과 적어도 80% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제338항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 16과 적어도 85% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제339항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 16과 적어도 90% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제340항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 16과 적어도 95% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제341항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 16을 포함하는, 조성물.
- 제286항 내지 제342항 중 어느 한 항에 있어서, 코로나바이러스 감염에 대한 제2 요법을 추가로 포함하는 조성물.
- 제343항에 있어서, 상기 제2 요법이 항생제, 항바이러스제, 회복기 혈청, 면역 조절제, 항응고제, 유체, 산소, 코르티코스테로이드, 항체, GSnP-6, 시알릴 루이스 X 유사체, 항-증식제, 칼시뉴린 억제제, 항-신호전달 화합물, 또는 이들의 조합을 포함하는, 조성물.
- 제343항 또는 제344항에 있어서, 상기 제2 요법이 항-SARS-CoV-2 약물을 포함하는, 조성물.
- 제345항에 있어서, 상기 항-SARS-CoV-2 약물이 아지트로마이신, AC-55541, 아피시딘, AZ3451, AZ8838, 바필로마이신 A1, CCT 365623, 다우노루비신, E-52862, 엔타카폰, GB110, H-89, 할로페리돌, 인도메타신, JQ1, 로라타딘, 메리메포딥, 메트포르민, 미도스타우린, 미갈라스타트, 마이코페놀산, PB28, PD-144418, 포나티닙, 리바비린, RS-PPCC, 룩솔리티닙, RVX-208, S-베라파밀, 실미타서팁, TMCB, UCPH-101, 발프로산, XL413, ZINC1775962367, ZINC4326719, ZINC4511851, ZINC95559591, 4E2RCat, ABBV-744, 카모스타트, 캅토프릴, CB5083, 클로람페니콜, 클로로퀸(및/또는 하이드록시클로로퀸), CPI-0610, 다브라페닙, DBeQ, dBET6, IHVR-19029, 리네졸리드, 리시노프릴, 미녹시딜, ML240, MZ1, 나파모스타트, 페보네디스타트, PS3061, 라파마이신(Sirolimus), 상글리페린 A, 사파니서팁(INK128/MlN128), FK-506(Tacrolimus), 테르나틴 4(DA3), 티게사이클린, 토미보서팁(eFT-508), 베르디넥소르, WDB002, 조타티핀(eFT226) 및 이들의 조합으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는, 조성물.
- 서열번호 18과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물.
- HIV 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 18과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물.
- 제348항에 있어서, 상기 HIV 스파이크 단백질이 HIV gp160 스파이크 단백질을 포함하는, 약제학적 조성물.
- 제347항 내지 제349항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 18과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제350항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 18과 적어도 80% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제351항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 18과 적어도 85% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제352항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 18과 적어도 90% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제353항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 18과 적어도 95% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제354항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 18을 포함하는, 조성물.
- 제347항 내지 제355항 중 어느 한 항에 있어서, HIV 감염에 대한 제2 요법을 추가로 포함하는 조성물.
- 제356항에 있어서, 상기 제2 요법이 항생제, 항바이러스제, 회복기 혈청, 면역 조절제, 항응고제, 유체, 산소, 코르티코스테로이드, 항체, GSnP-6, 시알릴 루이스 X 유사체, 항-증식제, 칼시뉴린 억제제, 항-신호전달 화합물, 또는 이들의 조합을 포함하는, 조성물.
- 제356항 또는 제357항에 있어서, 상기 제2 요법이 항-HIV 약물을 포함하는, 조성물.
- 제358항에 있어서, 상기 항-HIV 약물이 에파비렌즈(Sustiva), 릴피비린(Edurant), 에트라비린(Intelence), 델라비르딘(Rescriptor), 네비라핀(Viramune, Viramune XR), 도라비린(Pifeltroz), 아바카비르(Ziagen), 테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Vemlidy), 테노포비르(Viread), 엠트리시타빈(Emtriva), 라미부딘(Epivir), 지도부딘(Retrovir), 아바카비르/라미부딘/지도부딘(Trizivir), 아바카비르/라미부딘(Epzicom), 엠트리시타빈/테노포비르(Truvada), 아바카비르/라미부딘(Epzicom), 라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Cimduo, Temixys), 라미부딘/지도부딘(Combivir), 엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드(Descovy), 디다노신(Videx, Videx EC), 스타부딘(Zerit), 아타자나비르(Reyataz), 다루나비르(Prezista), 포삼프레나비르(Lexiva), 리토나비르(Norvir), 티프라나비르(Aptivus), 로피나비르/리토나비르(Kaletra), 아타자나비르/코비시스타트(Evotaz), 다루나비르/코비시스타트(Prezcobix), 인디나비르(Crixivan), 넬피나비르(Viracept), 사퀴나비르(Invirase), 빅테그라비르 나트륨/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마르(Biktarvy), 랄테그라비르(Isentress), 엘비테그라비르(Genvoya 및 Stribild), 돌루테그라비르(Tivicay), 코비시스타트(Tybost), 리토나비르(Norvir), 엔푸비르티드(Fuzeon), 마라비록(Selzentry), 이발리주맙-uiyk(Trogarzo), 마라비록(Selzentry), 포스템사비르(Rukobia), 도라비린/라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Delstrigo), 에파비렌즈/라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Symfi), 에파비렌즈/라미부딘/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Symfi Lo), 에파비렌즈/엠트리시타빈/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Atripla), 엠트리시타빈/릴피비린/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Odefsey), 엠트리시타빈/릴피비린/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Complera), 엘비테그라비르/코비시스타트/엠트리시타빈/테노포비르 디소프록실 푸마레이트(Stribild), 엘비테그라비르/코비시스타트/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Genvoya), 아바카비르/돌루테그라비르/라미부딘(Triumeq), 빅테그라비르/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Biktarvy), 돌루테그라비르/라미부딘(Dovato), 돌루테그라비르/릴피비린(Juluca), 다루나비르/코비시스타트/엠트리시타빈/테노포비르 알라페나미드 푸마레이트(Symtuza), 아세틸-L-카르니틴, 유청 단백질, L-글루타민, L-아르기닌, 하이드록시메틸부티레이트(HMB), 프로바이오틱스, 비타민 및 미네랄, 및 이들의 조합으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는, 조성물.
- 서열번호 20과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물.
- 에볼라 당단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 20과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물.
- 제361항에 있어서, 상기 에볼라 바이러스 당단백질이 에볼라 GP 스파이크 단백질을 포함하는, 약제학적 조성물.
- 제360항 내지 제362항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드는 서열번호 20과 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제363항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 20과 적어도 80% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제364항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 20과 적어도 85% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제365항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 20과 적어도 90% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제366항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 20과 적어도 95% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제367항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 20을 포함하는, 조성물.
- 제360항 내지 제368항 중 어느 한 항에 있어서, 에볼라 감염에 대한 제2 요법을 추가로 포함하는 조성물.
- 제369항에 있어서, 상기 제2 요법이 항생제, 항바이러스제, 회복기 혈청, 면역 조절제, 항응고제, 유체, 산소, 코르티코스테로이드, 항체, GSnP-6, 시알릴 루이스 X 유사체, 항-증식제, 칼시뉴린 억제제, 항-신호전달 화합물, 또는 이들의 조합을 포함하는, 조성물.
- 제369항 또는 제370항에 있어서, 상기 제2 요법이 항-에볼라 약물을 포함하는, 조성물.
- 제371항에 있어서, 상기 항-에볼라 약물이 아톨티비맙/마프티비맙/오데시비맙-ebgn(Inmazeb), 안수비맙-zykl(Ebanga), 파비피라비르(Avigan), 리바비린, BCX4430, 브린시도포비르, TKM-에볼라, AVI-7537, JK-05, 및 이들의 조합으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는, 조성물.
- 서열번호 25와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물.
- 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 25와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물.
- 제374항에 있어서, 상기 인플루엔자가 인플루엔자 바이러스 A를 포함하고, 상기 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질이 인플루엔자 바이러스 A 스파이크 단백질을 포함하는, 조성물.
- 제375항에 있어서, 상기 인플루엔자 바이러스 A가 인플루엔자 바이러스 A/H1을 포함하고, 상기 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질이 인플루엔자 바이러스 A/H1 HA 스파이크 단백질을 포함하는, 조성물.
- 제375항에 있어서, 상기 인플루엔자 바이러스 A가 인플루엔자 바이러스 A/H3를 포함하고, 상기 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질이 인플루엔자 바이러스 A/H3 HA 스파이크 단백질을 포함하는, 조성물.
- 제374항에 있어서, 상기 인플루엔자가 인플루엔자 바이러스 B를 포함하고, 상기 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질이 인플루엔자 바이러스 B 스파이크 단백질을 포함하는, 조성물.
- 제378항에 있어서, 상기 인플루엔자 바이러스 B가 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아를 포함하고, 상기 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질이 인플루엔자 바이러스 B/빅토리아 HA 스파이크 단백질을 포함하는, 조성물.
- 제378항에 있어서, 상기 인플루엔자 바이러스 B가 인플루엔자 바이러스 B/야마가타를 포함하고, 상기 인플루엔자 바이러스 스파이크 단백질이 인플루엔자 바이러스 B/야마가타 HA 스파이크 단백질을 포함하는, 조성물.
- 제373항 내지 제380항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 25와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제381항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 25와 적어도 80% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제382항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 25와 적어도 85% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제383항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 25와 적어도 90% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제384항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 25와 적어도 95% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제385항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 25를 포함하는, 조성물.
- 제373항 내지 제386항 중 어느 한 항에 있어서, 인플루엔자 감염에 대한 제2 요법을 추가로 포함하는 조성물.
- 제387항에 있어서, 상기 제2 요법이 항생제, 항바이러스제, 회복기 혈청, 면역 조절제, 항응고제, 유체, 산소, 코르티코스테로이드, 항체, GSnP-6, 시알릴 루이스 X 유사체, 항-증식제, 칼시뉴린 억제제, 항-신호전달 화합물, 또는 이들의 조합을 포함하는, 조성물.
- 제387항 또는 제388항에 있어서, 상기 제2 요법이 항-인플루엔자 약물을 포함하는, 조성물.
- 제389항에 있어서, 상기 항-인플루엔자 약물이 오셀타미비르 포스페이트(Tamiflu), 자나미비르(Relenza), 페라미비르(Rapivab), 발록사비르 마르복실(Xofluza), 아만타딘, 리만타딘(Flumadine), 우미페노비르(Arbidol), 모록시딘, 플루티케어, 아세트아미노펜, 클로르페니라민, 덱스트로메토르판, 슈도에페드린, 및 이들의 조합으로 이루어진 그룹으로부터 선택되는, 조성물.
- 서열번호 20과 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물.
- RSV 당단백질의 올리고머화 도메인에 상응하고 서열번호 34와 적어도 10% 동일성을 갖는 아미노산 서열을 갖는 폴리펩타이드를 암호화하는 벡터를 포함하는 약제학적 조성물.
- 제361항에 있어서, 상기 RSV 당단백질이 RSV F 단백질을 포함하는, 약제학적 조성물.
- 제360항 내지 제362항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 34와 적어도 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 또는 99% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제363항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 34와 적어도 80% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제364항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 34와 적어도 85% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제365항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 34와 적어도 90% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제366항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 34와 적어도 95% 동일성을 갖는, 조성물.
- 제367항에 있어서, 상기 폴리펩타이드가 서열번호 34를 포함하는, 조성물.
- 제360항 내지 제368항 중 어느 한 항에 있어서, RSV 감염에 대한 제2 요법을 추가로 포함하는 조성물.
- 제369항 또는 제370항에 있어서, 상기 제2 요법이 항-RSV 약물을 포함하는 조성물.
- 제255항 내지 제401항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 벡터가 바이러스 벡터 또는 비-바이러스 벡터인, 조성물.
- 제255항 내지 제402항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 벡터가 미니서클 DNA 벡터인, 조성물.
- 제255항 내지 제403항 중 어느 한 항에 있어서, 1 x 108 to 1 x 1018 벡터 게놈/대상체의 체중 kg의 용량이 상기 대상체에게 투여되는, 조성물.
- 제255항 내지 제404항 중 어느 한 항에 있어서, 약 1 x 1011 내지 약 1 x 1014 벡터 게놈/대상체의 체중 kg의 용량이 상기 대상체에게 투여되는, 조성물.
- 제255항 내지 제405항 중 어느 한 항에 있어서, 약 1 x 1012 내지 약 1 x 1015 벡터 게놈/대상체의 체중 kg의 용량이 상기 대상체에게 투여되는, 조성물.
- 제255항 내지 제406항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 조성물이 약제학적으로 허용되는 담체를 추가로 포함하는, 조성물.
- 제407항에 있어서, 상기 약제학적으로 허용되는 담체가 리포솜, 중합체성 미셀, 미소구체 또는 나노입자를 포함하는, 조성물.
- 제255항 내지 제408항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 조성물의 단일 용량이 투여되는, 조성물.
- 제255항 내지 제408항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 조성물의 다중 용량이 투여되는, 조성물.
- 제410항에 있어서, 상기 조성물이 상기 대상체에게 1일 1회, 1일 1회 이상, 주 1회 이상, 월 1회 이상, 또는 년 1회 이상 전달되는, 조성물.
- 제255항 내지 제411항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 조성물이 전신적으로 또는 국소적으로 전달되는, 조성물.
- 제255항 내지 제412항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 조성물이 상기 대상체에게 비강내로, 정맥내로, 복강내로, 기관내로, 근육내로, 내시경적으로, 경피적으로, 피하로, 국부적으로, 두개내로, 흡입에 의해, 주사에 의해, 주입에 의해 또는 관류에 의해 투여되는, 조성물.
- 제255항 내지 제413항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 조성물이 상기 대상체에게 흡입에 의해 투여되는, 조성물.
- 제255항 내지 제414항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 조성물이 상기 대상체에게 비강내로 투여되는, 조성물.
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